View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20973_high_11 (Length: 313)

Name: NF20973_high_11
Description: NF20973
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20973_high_11
NF20973_high_11
[»] chr7 (50 HSPs)
chr7 (26-306)||(13965733-13966013)
chr7 (26-306)||(26091863-26092143)
chr7 (29-306)||(26115658-26115935)
chr7 (26-306)||(49155205-49155485)
chr7 (26-306)||(40924882-40925162)
chr7 (33-306)||(21755316-21755589)
chr7 (49-297)||(16947560-16947808)
chr7 (68-294)||(12459544-12459770)
chr7 (47-297)||(13024258-13024507)
chr7 (47-298)||(14140591-14140842)
chr7 (45-298)||(11385513-11385766)
chr7 (45-300)||(13676361-13676616)
chr7 (47-298)||(14283460-14283711)
chr7 (47-300)||(15099689-15099942)
chr7 (74-298)||(15343343-15343567)
chr7 (50-300)||(12798590-12798840)
chr7 (65-298)||(14261350-14261583)
chr7 (77-298)||(19149923-19150144)
chr7 (77-298)||(20749322-20749543)
chr7 (47-297)||(18051039-18051289)
chr7 (65-298)||(12203904-12204137)
chr7 (77-291)||(15146061-15146275)
chr7 (61-289)||(15627444-15627672)
chr7 (77-291)||(11550240-11550454)
chr7 (77-291)||(44788489-44788703)
chr7 (119-291)||(14957472-14957644)
chr7 (77-291)||(8710523-8710737)
chr7 (77-291)||(13688959-13689173)
chr7 (77-291)||(14335314-14335528)
chr7 (77-291)||(11234351-11234565)
chr7 (77-291)||(18587309-18587523)
chr7 (77-294)||(18180658-18180875)
chr7 (119-294)||(14042610-14042785)
chr7 (119-294)||(14352640-14352815)
chr7 (77-291)||(15158195-15158409)
chr7 (77-291)||(17703593-17703807)
chr7 (119-291)||(9591282-9591454)
chr7 (77-291)||(12690420-12690633)
chr7 (77-196)||(16726579-16726698)
chr7 (140-193)||(13459049-13459102)
chr7 (140-192)||(7826917-7826969)
chr7 (140-192)||(27104975-27105027)
chr7 (140-192)||(27173298-27173350)
chr7 (140-185)||(4442951-4442996)
chr7 (230-291)||(8200966-8201027)
chr7 (68-145)||(12712770-12712847)
chr7 (140-185)||(14207343-14207388)
chr7 (140-185)||(14216033-14216078)
chr7 (149-207)||(38356-38414)
chr7 (61-99)||(15114312-15114350)
[»] chr5 (42 HSPs)
chr5 (33-306)||(20345110-20345383)
chr5 (33-306)||(25850900-25851173)
chr5 (33-306)||(14884258-14884531)
chr5 (25-306)||(22505507-22505788)
chr5 (47-297)||(23078186-23078436)
chr5 (47-300)||(23563449-23563702)
chr5 (59-294)||(22464790-22465025)
chr5 (77-291)||(20824296-20824510)
chr5 (80-300)||(28892256-28892476)
chr5 (71-294)||(20778753-20778976)
chr5 (65-298)||(21983476-21983709)
chr5 (47-297)||(17266615-17266865)
chr5 (65-298)||(21561324-21561557)
chr5 (66-291)||(21631699-21631924)
chr5 (77-291)||(14997050-14997264)
chr5 (77-291)||(29473384-29473598)
chr5 (77-294)||(23474053-23474270)
chr5 (77-294)||(25429279-25429496)
chr5 (77-294)||(26736038-26736255)
chr5 (80-291)||(21882635-21882846)
chr5 (77-291)||(22330198-22330412)
chr5 (77-291)||(37288807-37289021)
chr5 (77-291)||(41773703-41773917)
chr5 (119-291)||(18781975-18782147)
chr5 (77-220)||(21332297-21332440)
chr5 (77-291)||(16359363-16359577)
chr5 (77-291)||(27521267-27521481)
chr5 (77-291)||(27613217-27613431)
chr5 (77-291)||(27682711-27682925)
chr5 (77-291)||(34569355-34569569)
chr5 (77-291)||(40711641-40711855)
chr5 (119-291)||(19772821-19772993)
chr5 (77-291)||(23460832-23461046)
chr5 (119-276)||(22350795-22350952)
chr5 (119-291)||(27665843-27666015)
chr5 (77-291)||(22137529-22137743)
chr5 (138-275)||(20803474-20803611)
chr5 (71-196)||(21410090-21410215)
chr5 (119-240)||(23525963-23526084)
chr5 (140-192)||(23508626-23508678)
chr5 (140-192)||(24584152-24584204)
chr5 (230-291)||(21342878-21342939)
[»] chr4 (44 HSPs)
chr4 (26-306)||(11204310-11204590)
chr4 (26-306)||(3261872-3262152)
chr4 (25-306)||(29450614-29450895)
chr4 (33-306)||(44658951-44659224)
chr4 (42-298)||(20892953-20893209)
chr4 (45-300)||(16150556-16150811)
chr4 (45-300)||(16154702-16154957)
chr4 (77-298)||(27903307-27903528)
chr4 (33-207)||(7357280-7357454)
chr4 (65-300)||(14993484-14993719)
chr4 (47-297)||(51603891-51604141)
chr4 (65-294)||(15073285-15073514)
chr4 (47-293)||(53750569-53750815)
chr4 (47-260)||(15266736-15266949)
chr4 (74-294)||(14697027-14697247)
chr4 (77-294)||(14162396-14162613)
chr4 (77-294)||(15904-16121)
chr4 (191-300)||(15354283-15354392)
chr4 (77-291)||(14683496-14683710)
chr4 (77-291)||(8050492-8050706)
chr4 (77-291)||(12479529-12479743)
chr4 (77-291)||(14300848-14301062)
chr4 (77-291)||(19635065-19635279)
chr4 (119-291)||(16233903-16234075)
chr4 (119-291)||(23958676-23958848)
chr4 (77-276)||(8389356-8389555)
chr4 (77-291)||(16350423-16350637)
chr4 (77-291)||(17092018-17092232)
chr4 (77-291)||(27714265-27714479)
chr4 (77-291)||(40475969-40476183)
chr4 (119-291)||(19775704-19775876)
chr4 (138-291)||(18224376-18224529)
chr4 (77-220)||(16219188-16219331)
chr4 (77-220)||(16222508-16222651)
chr4 (106-163)||(15354234-15354291)
chr4 (145-276)||(15144829-15144960)
chr4 (119-276)||(13513294-13513451)
chr4 (138-291)||(16250780-16250933)
chr4 (140-192)||(14999674-14999726)
chr4 (256-300)||(15258847-15258891)
chr4 (140-192)||(15290350-15290402)
chr4 (122-186)||(18604733-18604797)
chr4 (140-192)||(12340059-12340111)
chr4 (149-206)||(18546820-18546877)
[»] chr8 (45 HSPs)
chr8 (26-306)||(16268745-16269025)
chr8 (26-306)||(28983891-28984171)
chr8 (26-306)||(28989110-28989390)
chr8 (48-297)||(31414075-31414324)
chr8 (47-298)||(22027822-22028073)
chr8 (47-306)||(22053843-22054102)
chr8 (47-301)||(29300968-29301222)
chr8 (65-298)||(19985168-19985401)
chr8 (65-298)||(21928416-21928649)
chr8 (65-298)||(22373857-22374090)
chr8 (157-306)||(27357516-27357665)
chr8 (65-298)||(20391074-20391307)
chr8 (119-294)||(22421506-22421681)
chr8 (77-294)||(21391433-21391650)
chr8 (77-294)||(21780759-21780976)
chr8 (141-294)||(22523538-22523691)
chr8 (122-290)||(22375071-22375239)
chr8 (81-291)||(19980962-19981172)
chr8 (77-294)||(21253937-21254154)
chr8 (149-294)||(21785999-21786144)
chr8 (77-294)||(22990037-22990254)
chr8 (77-276)||(22126531-22126730)
chr8 (77-291)||(19115395-19115609)
chr8 (77-291)||(20015835-20016049)
chr8 (45-294)||(22245555-22245804)
chr8 (45-294)||(22245973-22246222)
chr8 (119-291)||(32603140-32603312)
chr8 (77-291)||(17671594-17671808)
chr8 (77-291)||(22117747-22117961)
chr8 (119-291)||(18859572-18859744)
chr8 (119-291)||(22031098-22031270)
chr8 (119-291)||(22042822-22042994)
chr8 (119-291)||(30310758-30310930)
chr8 (77-276)||(19481644-19481843)
chr8 (80-291)||(21164113-21164324)
chr8 (77-291)||(22129189-22129403)
chr8 (119-291)||(15536378-15536550)
chr8 (140-192)||(20649990-20650042)
chr8 (140-192)||(21847972-21848024)
chr8 (140-192)||(16415180-16415232)
chr8 (140-192)||(22437384-22437436)
chr8 (62-99)||(21982499-21982536)
chr8 (62-99)||(21998985-21999022)
chr8 (116-192)||(21194163-21194239)
chr8 (62-98)||(21329759-21329795)
[»] chr1 (39 HSPs)
chr1 (26-306)||(48425833-48426113)
chr1 (26-306)||(52988701-52988981)
chr1 (26-306)||(38909976-38910256)
chr1 (33-306)||(31537154-31537427)
chr1 (33-306)||(37680009-37680282)
chr1 (39-293)||(20074872-20075126)
chr1 (39-306)||(20297341-20297610)
chr1 (26-297)||(24096765-24097036)
chr1 (47-300)||(22015916-22016169)
chr1 (65-300)||(18710351-18710586)
chr1 (74-297)||(19857243-19857466)
chr1 (59-294)||(20853943-20854178)
chr1 (74-300)||(20833098-20833324)
chr1 (65-298)||(21739225-21739458)
chr1 (65-298)||(21742741-21742974)
chr1 (41-158)||(21961135-21961252)
chr1 (74-298)||(16379031-16379255)
chr1 (119-294)||(21751988-21752163)
chr1 (228-306)||(12200478-12200556)
chr1 (80-291)||(22496460-22496671)
chr1 (77-291)||(24785058-24785272)
chr1 (77-291)||(16347796-16348010)
chr1 (77-291)||(21833246-21833460)
chr1 (77-291)||(21842156-21842370)
chr1 (77-291)||(51330693-51330907)
chr1 (119-291)||(17042258-17042430)
chr1 (119-291)||(20081619-20081791)
chr1 (138-291)||(33388291-33388444)
chr1 (77-276)||(41350869-41351068)
chr1 (77-291)||(19109312-19109526)
chr1 (74-180)||(21045322-21045428)
chr1 (77-267)||(21228757-21228947)
chr1 (77-196)||(22401631-22401750)
chr1 (140-192)||(20828656-20828708)
chr1 (140-192)||(20928097-20928149)
chr1 (140-192)||(20528096-20528148)
chr1 (119-174)||(22435976-22436031)
chr1 (143-192)||(41215127-41215176)
chr1 (140-191)||(22133016-22133067)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (26-306)||(514434-514714)
scaffold0001 (77-294)||(495975-496192)
scaffold0001 (143-300)||(441602-441759)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (26-306)||(20848134-20848414)
chr2 (47-297)||(19716656-19716906)
chr2 (45-300)||(23274144-23274399)
chr2 (50-298)||(23097660-23097908)
chr2 (47-297)||(12576907-12577157)
chr2 (47-189)||(19721219-19721361)
chr2 (113-298)||(23113276-23113461)
chr2 (77-291)||(17001560-17001774)
chr2 (77-291)||(24705151-24705365)
chr2 (119-291)||(11351422-11351594)
chr2 (119-294)||(23074420-23074595)
chr2 (77-291)||(22323011-22323225)
chr2 (77-291)||(24712594-24712808)
chr2 (74-300)||(24817506-24817732)
chr2 (77-291)||(44383239-44383453)
chr2 (119-291)||(23064973-23065145)
chr2 (104-291)||(21322962-21323149)
chr2 (119-294)||(22733485-22733660)
chr2 (80-291)||(22742638-22742849)
chr2 (77-291)||(9338142-9338356)
chr2 (77-291)||(9486776-9486990)
chr2 (77-291)||(10871410-10871624)
chr2 (77-291)||(16983800-16984014)
chr2 (77-291)||(27373829-27374043)
chr2 (77-294)||(23105397-23105614)
chr2 (122-291)||(27220576-27220745)
chr2 (80-291)||(24678047-24678258)
chr2 (104-291)||(45673708-45673895)
chr2 (66-196)||(19817502-19817632)
chr2 (77-291)||(24264930-24265144)
chr2 (77-291)||(24874419-24874633)
chr2 (119-291)||(24657369-24657541)
chr2 (80-291)||(23029133-23029344)
chr2 (138-276)||(21142771-21142909)
chr2 (66-196)||(30208578-30208708)
chr2 (119-291)||(23204874-23205046)
chr2 (117-192)||(22739363-22739438)
chr2 (116-185)||(22280771-22280840)
chr2 (119-186)||(23676583-23676650)
chr2 (140-185)||(25131275-25131320)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (26-306)||(41678-41958)
[»] chr3 (69 HSPs)
chr3 (26-298)||(10408519-10408791)
chr3 (26-306)||(47126487-47126767)
chr3 (33-300)||(28756868-28757135)
chr3 (47-298)||(16327036-16327287)
chr3 (47-298)||(11958508-11958759)
chr3 (47-298)||(16831855-16832106)
chr3 (100-298)||(12509863-12510061)
chr3 (47-300)||(31692512-31692765)
chr3 (47-300)||(31941452-31941705)
chr3 (45-300)||(12357852-12358107)
chr3 (49-300)||(18131676-18131926)
chr3 (45-299)||(12180894-12181148)
chr3 (65-295)||(11949270-11949500)
chr3 (59-272)||(13317873-13318086)
chr3 (65-298)||(14290877-14291110)
chr3 (71-297)||(16378285-16378511)
chr3 (65-300)||(16825624-16825861)
chr3 (59-300)||(10417384-10417625)
chr3 (25-298)||(17188925-17189198)
chr3 (45-297)||(8744715-8744967)
chr3 (45-300)||(17494195-17494451)
chr3 (25-298)||(24189855-24190128)
chr3 (47-297)||(13944576-13944826)
chr3 (65-298)||(12857841-12858073)
chr3 (140-300)||(12272887-12273047)
chr3 (65-298)||(15230154-15230387)
chr3 (65-298)||(15236022-15236255)
chr3 (195-300)||(14575535-14575640)
chr3 (65-189)||(35982841-35982965)
chr3 (80-294)||(12843474-12843688)
chr3 (77-294)||(15262175-15262392)
chr3 (66-291)||(15013115-15013340)
chr3 (77-291)||(10008148-10008362)
chr3 (77-291)||(10908758-10908972)
chr3 (77-291)||(12889257-12889471)
chr3 (77-291)||(13255238-13255452)
chr3 (77-291)||(15358631-15358845)
chr3 (77-291)||(15713424-15713638)
chr3 (77-275)||(24185754-24185952)
chr3 (77-291)||(15345613-15345827)
chr3 (77-291)||(15586760-15586974)
chr3 (77-291)||(16638321-16638535)
chr3 (77-291)||(43165223-43165437)
chr3 (77-291)||(48427995-48428209)
chr3 (77-298)||(15065612-15065833)
chr3 (77-289)||(14578776-14578988)
chr3 (80-291)||(14873939-14874150)
chr3 (77-291)||(15399885-15400099)
chr3 (77-291)||(20059422-20059636)
chr3 (119-291)||(16754111-16754283)
chr3 (80-291)||(6603283-6603494)
chr3 (77-291)||(3688491-3688705)
chr3 (77-291)||(26790781-26790995)
chr3 (77-291)||(53382386-53382600)
chr3 (119-291)||(16694712-16694884)
chr3 (119-275)||(16804357-16804513)
chr3 (138-291)||(5422359-5422512)
chr3 (80-196)||(23079388-23079504)
chr3 (119-180)||(11861033-11861094)
chr3 (140-192)||(8271830-8271882)
chr3 (140-192)||(13964786-13964838)
chr3 (140-192)||(30150014-30150066)
chr3 (140-192)||(15944026-15944078)
chr3 (140-192)||(22150168-22150220)
chr3 (62-99)||(2247196-2247233)
chr3 (140-192)||(6150284-6150336)
chr3 (140-192)||(17201292-17201344)
chr3 (63-99)||(12508907-12508943)
chr3 (230-294)||(17492396-17492460)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (33-306)||(11752-12025)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (33-306)||(404-677)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (26-306)||(29877-30157)
[»] chr6 (42 HSPs)
chr6 (41-306)||(24367178-24367443)
chr6 (68-294)||(10466113-10466339)
chr6 (47-300)||(14377160-14377413)
chr6 (45-298)||(18797476-18797729)
chr6 (47-300)||(19437786-19438039)
chr6 (65-300)||(19455807-19456042)
chr6 (59-300)||(15462120-15462361)
chr6 (65-300)||(24515676-24515911)
chr6 (65-298)||(21474386-21474619)
chr6 (65-281)||(19465971-19466187)
chr6 (50-298)||(21567238-21567486)
chr6 (65-298)||(19486556-19486789)
chr6 (65-298)||(25770630-25770863)
chr6 (45-298)||(34642828-34643081)
chr6 (77-294)||(23081213-23081430)
chr6 (77-282)||(5836502-5836707)
chr6 (76-301)||(30678297-30678522)
chr6 (119-294)||(18405260-18405435)
chr6 (122-298)||(18182686-18182862)
chr6 (170-294)||(20010821-20010945)
chr6 (80-291)||(22436662-22436873)
chr6 (77-291)||(2872076-2872290)
chr6 (74-291)||(23085096-23085313)
chr6 (119-291)||(16574683-16574855)
chr6 (119-291)||(16620525-16620697)
chr6 (119-291)||(16924956-16925128)
chr6 (77-291)||(29589713-29589927)
chr6 (77-291)||(24293056-24293270)
chr6 (122-291)||(27190229-27190398)
chr6 (122-291)||(27258842-27259011)
chr6 (119-291)||(27559285-27559457)
chr6 (77-291)||(28312423-28312637)
chr6 (119-291)||(28260513-28260685)
chr6 (119-291)||(28285231-28285403)
chr6 (119-291)||(28339262-28339434)
chr6 (145-291)||(19867480-19867626)
chr6 (119-291)||(25115345-25115517)
chr6 (119-196)||(22829702-22829779)
chr6 (140-192)||(16379710-16379762)
chr6 (140-192)||(16647306-16647358)
chr6 (59-122)||(20010758-20010821)
chr6 (140-192)||(16100907-16100959)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (48-306)||(39436-39694)
scaffold0010 (174-300)||(44656-44782)
scaffold0010 (81-294)||(4870-5083)
scaffold0010 (119-291)||(14382-14554)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (47-297)||(5247-5497)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (45-300)||(8563-8818)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (47-298)||(30428-30679)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (58-298)||(67221-67461)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (45-300)||(325656-325911)
scaffold0004 (84-298)||(200607-200821)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (52-297)||(251574-251819)
scaffold0009 (119-186)||(230026-230093)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (45-300)||(5309-5564)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (45-300)||(9872-10127)
scaffold0243 (119-294)||(24119-24294)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (45-300)||(20763-21018)
scaffold0222 (47-294)||(589-836)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (45-300)||(29573-29828)
scaffold0067 (45-298)||(64702-64955)
scaffold0067 (45-298)||(49280-49533)
scaffold0067 (45-298)||(58314-58567)
[»] scaffold1530 (1 HSPs)
scaffold1530 (45-300)||(532-787)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (48-298)||(263177-263427)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (48-298)||(203332-203582)
scaffold0003 (119-291)||(424266-424438)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (45-300)||(8562-8817)
scaffold0235 (45-300)||(18776-19031)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (47-294)||(40013-40260)
scaffold0114 (74-294)||(17478-17698)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (62-296)||(932-1166)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (50-300)||(6987-7237)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (74-300)||(22071-22297)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (47-300)||(98685-98938)
scaffold0020 (65-298)||(175939-176171)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (47-294)||(17586-17833)
scaffold0348 (58-294)||(4962-5198)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (47-298)||(10928-11179)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (45-300)||(954-1209)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (45-300)||(983-1238)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (45-300)||(151516-151771)
scaffold0011 (77-294)||(23665-23882)
scaffold0011 (140-192)||(73792-73844)
scaffold0011 (140-192)||(78173-78225)
scaffold0011 (140-192)||(182047-182099)
scaffold0011 (140-185)||(175708-175753)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (49-294)||(6361-6606)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (65-298)||(65418-65651)
scaffold0053 (65-123)||(62892-62950)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (47-296)||(164503-164752)
scaffold0023 (77-294)||(47115-47331)
scaffold0023 (80-291)||(30709-30920)
scaffold0023 (230-294)||(152036-152100)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (66-298)||(63640-63872)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (65-300)||(1431-1666)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (65-300)||(7693-7928)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (47-298)||(9889-10139)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (65-300)||(50054-50289)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (77-300)||(94026-94249)
scaffold0029 (45-298)||(115513-115766)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (74-300)||(9356-9582)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (47-297)||(53525-53775)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (65-298)||(12678-12911)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (47-300)||(36888-37141)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (50-298)||(650-898)
scaffold0476 (119-291)||(10744-10916)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (45-300)||(42647-42902)
scaffold0102 (104-291)||(50504-50691)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (65-298)||(11911-12144)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (116-300)||(1069-1253)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (91-298)||(1-208)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (45-300)||(2052-2307)
scaffold0034 (59-298)||(70323-70562)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (65-291)||(4424-4650)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (65-298)||(1392-1625)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (65-298)||(29478-29711)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (65-298)||(28405-28638)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (65-298)||(43539-43772)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (104-300)||(15072-15268)
scaffold0074 (74-291)||(6071-6288)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (74-300)||(53996-54222)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (47-300)||(34286-34539)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (65-300)||(5130-5365)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (45-300)||(5754-6009)
scaffold0035 (66-289)||(41229-41452)
[»] scaffold1056 (1 HSPs)
scaffold1056 (65-298)||(1672-1905)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (65-278)||(70079-70292)
scaffold0046 (131-298)||(60690-60857)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (104-300)||(20687-20883)
scaffold0261 (104-300)||(12507-12703)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (48-257)||(9124-9333)
[»] scaffold0523 (3 HSPs)
scaffold0523 (29-170)||(11827-11968)
scaffold0523 (122-298)||(2822-2998)
scaffold0523 (65-127)||(5562-5624)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (112-298)||(1-187)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (104-298)||(5553-5747)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (104-298)||(4248-4442)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (65-298)||(11781-12012)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (45-238)||(19069-19262)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (132-300)||(110559-110727)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (50-223)||(1953-2126)
[»] scaffold1426 (1 HSPs)
scaffold1426 (26-170)||(1688-1832)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (65-298)||(4012-4242)
scaffold0130 (138-291)||(7972-8125)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (154-298)||(49086-49230)
[»] scaffold2165 (1 HSPs)
scaffold2165 (39-162)||(897-1020)
[»] scaffold1517 (1 HSPs)
scaffold1517 (68-165)||(1610-1707)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (122-294)||(17833-18005)
scaffold0040 (77-275)||(111039-111237)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (61-300)||(5037-5276)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (77-294)||(14398-14615)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (77-294)||(216552-216769)
[»] scaffold2062 (1 HSPs)
scaffold2062 (45-189)||(977-1121)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (77-289)||(15111-15323)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (74-294)||(13608-13828)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (154-298)||(21802-21946)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (119-294)||(4389-4564)
scaffold0621 (119-265)||(1-147)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (65-184)||(51716-51835)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (77-294)||(6828-7045)
scaffold0270 (77-294)||(13958-14175)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (77-294)||(55602-55819)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (77-294)||(23430-23647)
scaffold0018 (74-300)||(9480-9706)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (77-217)||(15442-15582)
scaffold0293 (234-294)||(15377-15437)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (66-289)||(1959-2182)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (77-294)||(2395-2612)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (77-294)||(57746-57963)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (74-294)||(8365-8585)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (77-276)||(3524-3723)
[»] scaffold0605 (1 HSPs)
scaffold0605 (59-165)||(1364-1470)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (140-294)||(14039-14193)
scaffold0120 (119-220)||(11293-11394)
scaffold0120 (140-192)||(25235-25287)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (77-294)||(8178-8395)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (119-291)||(10332-10504)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (119-291)||(29102-29274)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (119-291)||(36456-36628)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (119-291)||(17240-17412)
scaffold0017 (104-291)||(194997-195184)
scaffold0017 (66-291)||(24264-24489)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (119-294)||(1944-2119)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (119-294)||(7913-8088)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (119-294)||(40681-40856)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (66-176)||(16730-16840)
scaffold0100 (173-301)||(21413-21541)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (74-300)||(26301-26527)
scaffold0042 (145-291)||(37020-37166)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (77-294)||(510-727)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (77-294)||(11424-11641)
scaffold0028 (121-294)||(17892-18065)
scaffold0028 (77-195)||(55058-55176)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (77-294)||(104182-104399)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (74-201)||(11076-11203)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (77-276)||(14884-15083)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (77-276)||(3397-3596)
scaffold0044 (119-276)||(17133-17290)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (77-291)||(41590-41804)
scaffold0022 (77-291)||(75310-75524)
scaffold0022 (145-276)||(34915-35046)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (77-291)||(10326-10540)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (200-298)||(26063-26161)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (77-291)||(22205-22419)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (77-291)||(7194-7408)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (78-291)||(8216-8429)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (77-289)||(942-1154)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (119-294)||(11054-11229)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (77-291)||(18608-18822)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (141-294)||(4538-4691)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (119-291)||(1206-1378)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (80-276)||(13-209)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (226-298)||(3451-3523)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (119-291)||(13298-13470)
scaffold0109 (77-291)||(41113-41327)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (120-291)||(31841-32012)
scaffold0080 (119-294)||(54592-54767)
scaffold0080 (119-291)||(10412-10584)
scaffold0080 (120-291)||(37307-37478)
scaffold0080 (119-291)||(13067-13239)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (149-294)||(24916-25061)
scaffold0218 (140-192)||(1147-1199)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (119-291)||(943-1115)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (200-275)||(1185-1260)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (77-294)||(8905-9119)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (77-276)||(21577-21776)
scaffold0081 (77-276)||(37001-37200)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (122-276)||(11533-11687)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (122-275)||(115-268)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (139-291)||(674-826)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (119-195)||(48719-48795)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (77-196)||(15711-15830)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (119-196)||(2917-2994)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (116-192)||(13502-13578)
scaffold0467 (140-192)||(816-868)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (140-192)||(5499-5551)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (140-192)||(26453-26505)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (140-192)||(35142-35194)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (140-192)||(24020-24072)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (140-192)||(8214-8266)
scaffold0021 (140-192)||(90559-90611)
scaffold0021 (140-192)||(21071-21123)
scaffold0021 (140-192)||(30647-30699)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (45-126)||(2754-2835)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (140-192)||(2628-2680)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (140-192)||(7057-7109)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (140-185)||(3563-3608)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (138-179)||(171188-171229)
[»] scaffold0848 (1 HSPs)
scaffold0848 (62-98)||(5116-5152)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (140-192)||(4097-4149)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (140-192)||(6199-6251)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (140-192)||(1268-1320)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (140-192)||(5000-5052)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (140-192)||(26833-26885)
scaffold0008 (140-192)||(131684-131736)
[»] scaffold0789 (1 HSPs)
scaffold0789 (119-186)||(1-68)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (45-96)||(384-435)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (61-95)||(1139-1173)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (234-291)||(12621-12678)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (230-294)||(3556-3620)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (140-192)||(15967-16019)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 253; Significance: 1e-141; HSPs: 50)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 26 - 306
Target Start/End: Original strand, 13965733 - 13966013
Alignment:
Q  26 atcagtacacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagag 125  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13965733 atcagttcacagtgtcctgagccgaagaaggctagaactggtgggaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagag 13965832  T
Q  126 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttgga 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13965833 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttgga 13965932  T
Q  226 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13965933 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataaccacttctcttgtttgtctggggtg 13966013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 26 - 306
Target Start/End: Original strand, 26091863 - 26092143
Alignment:
Q  26 atcagtacacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagag 125  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  26091863 atcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagag 26091962  T
Q  126 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttgga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26091963 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttgga 26092062  T
Q  226 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26092063 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtg 26092143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 29 - 306
Target Start/End: Original strand, 26115658 - 26115935
Alignment:
Q  29 agtacacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggta 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  26115658 agtacacagtgtcctgaaccgaagaagactagaactggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcacactcctaatgaggaccgactcatcagaggta 26115757  T
Q  129 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26115758 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgt 26115857  T
Q  229 atctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26115858 atctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtg 26115935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 26 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 49155485 - 49155205
Alignment:
Q  26 atcagtacacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagag 125  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  49155485 atcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagag 49155386  T
Q  126 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttgga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49155385 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttgga 49155286  T
Q  226 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49155285 tatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtg 49155205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 26 - 306
Target Start/End: Original strand, 40924882 - 40925162
Alignment:
Q  26 atcagtacacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagag 125  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  40924882 atcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagag 40924981  T
Q  126 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttgga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40924982 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttgga 40925081  T
Q  226 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40925082 tatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtg 40925162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 33 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21755589 - 21755316
Alignment:
Q  33 cacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 132  Q
    ||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21755589 cacagtgtcctgagccgaagaaggttagaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 21755490  T
Q  133 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatct 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21755489 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatct 21755390  T
Q  233 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21755389 gatatggaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgaggtg 21755316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 49 - 297
Target Start/End: Original strand, 16947560 - 16947808
Alignment:
Q  49 gaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtact 148  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16947560 gaagaaggctagaaccggtgggaaagtgtttgcattgaatggtacgcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtact 16947659  T
Q  149 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaa 248  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16947660 catttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggagaaa 16947759  T
Q  249 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  16947760 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttg 16947808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 68 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12459770 - 12459544
Alignment:
Q  68 gggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattg 167  Q
    ||||| |||||||  ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12459770 gggaaagtgtttgaattgaaaggtacgcagactacaaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatag 12459671  T
Q  168 atactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 267  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12459670 atactgatgctactaattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 12459571  T
Q  268 taagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  12459570 taagggttcagtaactacttctcttgt 12459544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 47 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13024507 - 13024258
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13024507 ccgaagaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactacaaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag-a 13024409  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13024408 ctcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggaga 13024309  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  13024308 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttg 13024258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 47 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 14140842 - 14140591
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14140842 ccgaagaaggttagaactggtgggaaggtatttgctttgactggtacgcagactactaatgaggaaagacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 14140743  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||    
T  14140742 ctcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgagtgtatctgatatgaagggaga 14140643  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14140642 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 14140591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 45 - 298
Target Start/End: Original strand, 11385513 - 11385766
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 144  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11385513 aaccaaagaagattagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacagacttatcagaggtacttgtttctttaatag 11385612  T
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||     
T  11385613 tactcctttaattgctattatagacactgatgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatttgatatgaaagga 11385712  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  11385713 gagatggttgttgaaactccagctaagggttcaggaactacttctcttgtttgt 11385766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 45 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13676616 - 13676361
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 144  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13676616 aaccgaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 13676517  T
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  13676516 tactcctttaattgctattatagacgctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagga 13676417  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13676416 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 13676361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 47 - 298
Target Start/End: Original strand, 14283460 - 14283711
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    |||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14283460 ccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggactgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagta 14283559  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
    ||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  14283560 ctcctttcattgctattatagacattggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggaga 14283659  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14283660 aatggttgttgaaactctagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 14283711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 47 - 300
Target Start/End: Original strand, 15099689 - 15099942
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    |||||||||  ||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15099689 ccgaagaaggttaggacaggtggtaaggtgtttgctttaactggtatgcagacagttaatgaggaccgacttatcagatgtacttgtttctttaatagta 15099788  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||    
T  15099789 ctcctttaattgctattatagatactggtgatactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttgtatctgatatgaaaggaga 15099888  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15099889 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 15099942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 74 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15343567 - 15343343
Alignment:
Q  74 gtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  15343567 gtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactg 15343468  T
Q  174 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 273  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15343467 gtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 15343368  T
Q  274 ttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |  |||||| |||||||||||||||    
T  15343367 taaagtaactacttctcttgtttgt 15343343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 50 - 300
Target Start/End: Original strand, 12798590 - 12798840
Alignment:
Q  50 aagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactc 149  Q
    |||||| |||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12798590 aagaaggctaggacaggtggcaaggtttttgcgttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactc 12798689  T
Q  150 ctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaat 249  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  12798690 ctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggaaaaat 12798789  T
Q  250 ggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  12798790 ggttgttgaaactcaagctaagggttcagtaactacttctcttatttgtct 12798840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Original strand, 14261350 - 14261583
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14261350 ggtggcaaggtatttgcgttgactggtacgcaaactatgaatgaggaccgacttatcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctatta 14261449  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| || || |||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  14261450 tagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgagcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactcc 14261549  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  14261550 agctaagggtttagtaactacttctcttgtttgt 14261583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 77 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19150144 - 19149923
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  19150144 tttgcgttgactggtacgcaaactgtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtt 19150045  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    ||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19150044 ctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttaggtctggttgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 19149945  T
Q  277 agtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  19149944 agtaactacttctcttgtttgt 19149923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 77 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20749543 - 20749322
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  20749543 tttgcgttgactggtacgcaaactgtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtt 20749444  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    ||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20749443 ctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttaggtctggttgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 20749344  T
Q  277 agtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  20749343 agtaactacttctcttgtttgt 20749322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 47 - 297
Target Start/End: Original strand, 18051039 - 18051289
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    |||||||||  ||||  |||||| || || ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18051039 ccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagta 18051138  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| |||| ||||||||||  ||| ||||||||||| || ||    
T  18051139 ctcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggttgggtttgattgtgtctgatatgaagggaga 18051238  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  18051239 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctggtttg 18051289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Original strand, 12203904 - 12204137
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||  ||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12203904 ggtggaaaggtgtttgcattgaccggtacatagacggttaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctatta 12204003  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | || ||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| | | ||   |||||  || |||||||||||||||||||     
T  12204004 tagacactggtgctacacattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactct 12204103  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  12204104 agctaagggttcaataactacttctcttgtttgt 12204137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 15146061 - 15146275
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   |||||||| ||  | | ||||||||| ||||   ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15146061 tttgctttgactggtactcagactgagaatgaggatcgcttgagcagaggtacatgttatattaatagaacacctttagttgctattattgatactggtg 15146160  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||| | | | | || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15146161 ctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttgctttgtcggatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 15146260  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  15146261 ggtgactacttctct 15146275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15627672 - 15627444
Alignment:
Q  61 aactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgct 160  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||  | || | |||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  15627672 aactagtgggaaagtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccggttgattataggtacatgcttctttgatagtactcctttaattact 15627573  T
Q  161 attattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaa 260  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||| |||||   || ||||||| | ||| | ||   |||||| | |||||||||| | ||||    
T  15627572 attattgatactggtgatacgcattgttttattgccgttgattgtgctcctatgttgggtcttgatatgtcgagtatgaatgaggaaatggttttcgaaa 15627473  T
Q  261 ctccagctaagggttcagtaaccacttct 289  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||    
T  15627472 ctccagctaagggttcggtgactacttct 15627444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 11550240 - 11550454
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||     ||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11550240 tttgctttgactggtactcagacagaggatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 11550339  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11550340 ctactcattgctttattgcttttgattgtgtatctgccttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 11550439  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  11550440 ggtgactacttctct 11550454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 44788489 - 44788703
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44788489 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 44788588  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| ||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44788589 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 44788688  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  44788689 ggtgactacttctct 44788703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 14957644 - 14957472
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  14957644 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 14957545  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  14957544 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 14957472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 8710737 - 8710523
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8710737 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 8710638  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8710637 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 8710538  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  8710537 ggtgactacttctct 8710523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 13689173 - 13688959
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13689173 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 13689074  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13689073 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtgtctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 13688974  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  13688973 ggtgactacttctct 13688959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 14335528 - 14335314
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14335528 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 14335429  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14335428 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 14335329  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  14335328 ggtgactacttctct 14335314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 11234351 - 11234565
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11234351 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattaatactggtg 11234450  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11234451 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttttctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 11234550  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  11234551 ggtgactacttctct 11234565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 18587309 - 18587523
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18587309 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgttattattgatactggtg 18587408  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18587409 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 18587508  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  18587509 ggtgactacttctct 18587523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18180875 - 18180658
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18180875 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgttattattgatactggtg 18180776  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||  ||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18180775 ctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 18180676  T
Q  277 agtaaccacttctcttgt 294  Q
     || || |||||||||||    
T  18180675 ggtgactacttctcttgt 18180658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14042785 - 14042610
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   ||||||||    
T  14042785 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctattaagttgg 14042686  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    || | | | | ||  |||| || || || |||||||| ||||||| |||||||||||  || || |||||||||||    
T  14042685 gtcttgctatgtcaaatataaatggagagatggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgactacttctcttgt 14042610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14352815 - 14352640
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   ||||||||    
T  14352815 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctattaagttgg 14352716  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    || | | | | ||  |||| || || || |||||||| ||||||| |||||||||||  || || |||||||||||    
T  14352715 gtcttgctatgtcaaatataaatggagagatggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgactacttctcttgt 14352640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 15158195 - 15158409
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15158195 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 15158294  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15158295 ctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttc 15158394  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  15158395 ggtgactacttctct 15158409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 17703593 - 17703807
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    |||||||| ||  | ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  17703593 tttgctttggctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtg 17703692  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17703693 ctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagttaagggttc 17703792  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  17703793 ggtgactacttctct 17703807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 9591454 - 9591282
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |  | ||||  | |   | ||    
T  9591454 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcaattgtgtttctgcttcgg 9591355  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  9591354 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 9591282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 12690633 - 12690420
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||     ||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  12690633 tttgctttgactggtactcagacagaggatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattatt-atactagtg 12690535  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||||||||| ||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||   | || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12690534 ctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgagttgagagatggtcgttgaaactccagctaagggttc 12690435  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  12690434 ggtgactacttctct 12690420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 196
Target Start/End: Original strand, 16726579 - 16726698
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  16726579 tttgctttggctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgatatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtg 16726678  T
Q  177 ctactcattgttttattgct 196  Q
    |||| ||||| |||||||||    
T  16726679 ctacacattgctttattgct 16726698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13459102 - 13459049
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttatt 193  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13459102 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatt 13459049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 7826969 - 7826917
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7826969 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 7826917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Original strand, 27104975 - 27105027
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27104975 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 27105027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27173350 - 27173298
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27173350 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 27173298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 4442996 - 4442951
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcatt 185  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4442996 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 4442951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 8201027 - 8200966
Alignment:
Q  230 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  8201027 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 8200966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 68 - 145
Target Start/End: Original strand, 12712770 - 12712847
Alignment:
Q  68 gggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagt 145  Q
    ||||| |||||||| ||| | |||||||| || || ||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12712770 gggaaagtgtttgccttggcgggtacgcaaaccacaaatcaagatagacttatcagaggtacttgtttctttaatagt 12712847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14207388 - 14207343
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcatt 185  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  14207388 aatagtactcctttaattgcaattattaatactggcgctactcatt 14207343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14216078 - 14216033
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcatt 185  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  14216078 aatagtactcctttaattgcaattattaatactggcgctactcatt 14216033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 207
Target Start/End: Original strand, 38356 - 38414
Alignment:
Q  149 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgc 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||| || |||| |||||    
T  38356 cctttaattgctattatagatactggagctacgcattcttttatttctcttgattgtgc 38414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 15114350 - 15114312
Alignment:
Q  61 aactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagac 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15114350 aactggtgggaaggtttttgctttgactggtacgtagac 15114312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 42)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 33 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20345383 - 20345110
Alignment:
Q  33 cacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 132  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20345383 cacagtgtcctgagccgaagaaggctagaactggtgggaaggtatttgctttaactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 20345284  T
Q  133 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatct 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20345283 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatct 20345184  T
Q  233 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20345183 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataaccacttctcttgtttgtctggggtg 20345110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 33 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 25851173 - 25850900
Alignment:
Q  33 cacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 132  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25851173 cacagtgtcctgagccgaagaaggctagaactggtgggaaggtatttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgtcttatcagaggtacttg 25851074  T
Q  133 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatct 232  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25851073 tttctttaatagtactcatttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatct 25850974  T
Q  233 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25850973 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaaggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtg 25850900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 33 - 306
Target Start/End: Original strand, 14884258 - 14884531
Alignment:
Q  33 cacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 132  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14884258 cacagtgtcctgagccgaggaagactagaattggtgggaaagtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 14884357  T
Q  133 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatct 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  14884358 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttagatgtgtct 14884457  T
Q  233 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14884458 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtg 14884531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 25 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22505788 - 22505507
Alignment:
Q  25 catcagtacacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcaga 124  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22505788 catcagttcacagtgtcctgaaccgaagaaggttagaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcaaa 22505689  T
Q  125 ggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttgg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22505688 ggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttgg 22505589  T
Q  225 atgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22505588 atgtatctaatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctggggtg 22505507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 47 - 297
Target Start/End: Original strand, 23078186 - 23078436
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23078186 ccgaagaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactagtacgcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 23078285  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  23078286 ctcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgcaattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaagggaga 23078385  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  23078386 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttg 23078436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 47 - 300
Target Start/End: Original strand, 23563449 - 23563702
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    |||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23563449 ccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctttgaccggtacgcaaacaactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 23563548  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  23563549 ctcctttaattgatattatagaaactggtgctactcaatgtttaattgctattgaatgtgcatataagttgggtatggatatatctgatatgaaaggaga 23563648  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23563649 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 23563702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 59 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22465025 - 22464790
Alignment:
Q  59 agaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 158  Q
    |||| ||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22465025 agaattggagggaaggttttcgctttgactggtacccagactaccaacgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 22464926  T
Q  159 ctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttga 258  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22464925 ctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggcctaattgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttga 22464826  T
Q  259 aactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  22464825 aactccagccaagggttcagtaactacttctcttgt 22464790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 20824510 - 20824296
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  20824510 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 20824411  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| |||||||| |||||| | || ||||| |||||||||||| ||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20824410 ctacacattgtttcattgctttagagtgtgcatataagttgggtctgattatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttc 20824311  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
    |||||| ||||||||    
T  20824310 agtaactacttctct 20824296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 80 - 300
Target Start/End: Original strand, 28892256 - 28892476
Alignment:
Q  80 gctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgcta 179  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  28892256 gctttgactggtactcagactactaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatggtactcctttaattgctattatagacactggtgcta 28892355  T
Q  180 ctcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagt 279  Q
    | |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28892356 cgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagt 28892455  T
Q  280 aaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    ||| |||||||| || |||||    
T  28892456 aactacttctctggtgtgtct 28892476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 71 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20778976 - 20778753
Alignment:
Q  71 aaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgata 170  Q
    ||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  20778976 aaggtattcgctttgactggtaatcagactactaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagaca 20778877  T
Q  171 ctggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaa 270  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||  |   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  20778876 ctggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggcctaattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaa 20778777  T
Q  271 gggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    ||||||||| || |||||||||||    
T  20778776 gggttcagtgactacttctcttgt 20778753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Original strand, 21983476 - 21983709
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21983476 ggtggaaaggtgtttgcattgactgttacgcagacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattactatta 21983575  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| | | ||   |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  21983576 ttgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactcc 21983675  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21983676 agctaagggttcagtaactacttctctcgtttgt 21983709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 47 - 297
Target Start/End: Original strand, 17266615 - 17266865
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    |||||||||  ||||  |||||| || || |||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17266615 ccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacctagactgctaatgaggaccgtctcatcaaaggtacttgtttctttaatagta 17266714  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| |||| ||||||||||  ||| ||| | |||||||| ||    
T  17266715 ctcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggttgggtttgtttgtgtctaacatgaaaggaga 17266814  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17266815 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 17266865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Original strand, 21561324 - 21561557
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21561324 ggtggaaaggtgtttgcattgactggtatgcaaacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtacttctttaattgctatta 21561423  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||| ||| | | ||   |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  21561424 ttgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttaggtatggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactcc 21561523  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21561524 agctaagggttcagtaactacttctctcgtttgt 21561557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 66 - 291
Target Start/End: Original strand, 21631699 - 21631924
Alignment:
Q  66 gtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||  | || |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21631699 gtgggaaagtgtttgctttgactggtacacagacagtgaatgaggaccggttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattat 21631798  T
Q  166 tgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcca 265  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21631799 taatactggtgctacgcattgttttattgctgttgattgtgcttctaagttgggtcttgttatgtcgaatatgaatggggaaatggttgtcgaaactcca 21631898  T
Q  266 gctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    ||||||||||| || || ||||||||    
T  21631899 gctaagggttcggtgactacttctct 21631924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 14997050 - 14997264
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||    || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14997050 tttgctttgactggtacgcagacggagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 14997149  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  14997150 ctacacattgttttattgcttttgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttc 14997249  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  14997250 ggtgactacttctct 14997264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 29473384 - 29473598
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29473384 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 29473483  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29473484 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttc 29473583  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  29473584 ggtgactacttctct 29473598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23474270 - 23474053
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||| |||||||||| ||||||    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| || |||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  23474270 tttgcattgactggtatgcagacagaaaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgattgtacacctttagttgctattattgataccggtg 23474171  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||| ||| | |  |  ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23474170 ctacacattgttttattgctattgattgtacttctaagttgggtctggctatgacgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 23474071  T
Q  277 agtaaccacttctcttgt 294  Q
     || || |||||||||||    
T  23474070 ggtgactacttctcttgt 23474053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25429496 - 25429279
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    || ||||| ||  | ||||||||||||||||   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  25429496 tttgctttgactggtacacagacatagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtg 25429397  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| | |||   |||||||||| | | | | | ||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25429396 ctacgcattgttttattgcttttgattttgctactaagttgggtcttgttatgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 25429297  T
Q  277 agtaaccacttctcttgt 294  Q
     || || |||||||||||    
T  25429296 ggtgactacttctcttgt 25429279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Original strand, 26736038 - 26736255
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    || ||||| ||  | ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26736038 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtg 26736137  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||| | | | | ||  ||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||     
T  26736138 ctacacattgttttatttctattgattgtgcttctatgttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttt 26736237  T
Q  277 agtaaccacttctcttgt 294  Q
     || || |||||||||||    
T  26736238 ggtgactacttctcttgt 26736255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21882846 - 21882635
Alignment:
Q  80 gctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgcta 179  Q
    |||||| ||||||| ||||| |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  21882846 gctttggctggtacacagacaaagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttggtattattgatactggtgcta 21882747  T
Q  180 ctcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagt 279  Q
    | ||||||||||||||| | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  21882746 cgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 21882647  T
Q  280 aaccacttctct 291  Q
     || ||||||||    
T  21882646 gactacttctct 21882635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 22330198 - 22330412
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22330198 tttgctttgactggtactcagacagataacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 22330297  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22330298 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 22330397  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  22330398 ggtgactacttctct 22330412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 37288807 - 37289021
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37288807 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 37288906  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37288907 ctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttttctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 37289006  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  37289007 ggtgactacttctct 37289021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 41773917 - 41773703
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41773917 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 41773818  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41773817 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 41773718  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  41773717 ggtgactacttctct 41773703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 18782147 - 18781975
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  18782147 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 18782048  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  18782047 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgttgaaactccagctaagggttccgtgactacttctct 18781975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 77 - 220
Target Start/End: Original strand, 21332297 - 21332440
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21332297 tttgctttgactggtactcagatagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtg 21332396  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggt 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  21332397 ctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggt 21332440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16359577 - 16359363
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16359577 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 16359478  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16359477 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 16359378  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  16359377 ggtgactacttctct 16359363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 27521481 - 27521267
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27521481 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 27521382  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27521381 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttggtttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 27521282  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  27521281 ggtgactacttctct 27521267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 27613431 - 27613217
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27613431 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 27613332  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27613331 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttc 27613232  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  27613231 ggtgactacttctct 27613217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 27682711 - 27682925
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27682711 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 27682810  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | | ||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27682811 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 27682910  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  27682911 ggtgactacttctct 27682925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 34569569 - 34569355
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34569569 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 34569470  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34569469 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 34569370  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  34569369 ggtgactacttctct 34569355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 40711855 - 40711641
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40711855 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatcttaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 40711756  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40711755 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 40711656  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  40711655 ggtgactacttctct 40711641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19772993 - 19772821
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  19772993 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 19772894  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  19772893 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctct 19772821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 23461046 - 23460832
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||||||  ||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  23461046 tttgctttgactggtacttagaccgagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctgtattaataatactcctttagttgctattattgatattggtg 23460947  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| |||  |||||||||| | || ||||| | ||  |||||| | ||| | ||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23460946 ctacccatgtttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 23460847  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  23460846 ggtgactacttctct 23460832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 22350952 - 22350795
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | ||  ||||    
T  22350952 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgg 22350853  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22350852 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 22350795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Original strand, 27665843 - 27666015
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  27665843 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 27665942  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||  |||||||||| || || ||||||||    
T  27665943 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactacttctct 27666015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22137743 - 22137529
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22137743 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataatggtg 22137644  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
     ||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22137643 atacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 22137544  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  22137543 ggtgactacttctct 22137529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20803611 - 20803474
Alignment:
Q  138 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 237  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | || ||||  | ||  |||||| | | | | ||||||||    
T  20803611 ttaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgggtctcgctttgtctgatat 20803512  T
Q  238 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggtt 275  Q
    ||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20803511 gaatggaaagatggttgtcgaaactccagctaagggtt 20803474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 21410215 - 21410090
Alignment:
Q  71 aaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgata 170  Q
    ||||||||||||||  |||||||  ||||    |||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||    
T  21410215 aaggtgtttgctttagctggtacttagacagagaatgaggatcgtctgatcagaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactatcatagata 21410116  T
Q  171 ctggtgctactcattgttttattgct 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||    
T  21410115 ctggtgctacatattgttttattgct 21410090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23526084 - 23525963
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| | || |||||    
T  23526084 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcaacacattgttttattgctttcgattgtgcttctacgttgg 23525985  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaa 240  Q
    || | ||| | |||||||||||    
T  23525984 gtcttgatatgtctgatatgaa 23525963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23508678 - 23508626
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23508678 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 23508626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 24584204 - 24584152
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24584204 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 24584152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 291
Target Start/End: Original strand, 21342878 - 21342939
Alignment:
Q  230 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  21342878 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21342939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 44)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 26 - 306
Target Start/End: Original strand, 11204310 - 11204590
Alignment:
Q  26 atcagtacacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagag 125  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11204310 atcagttcacagtgtcctgagccgaaaaaggctagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcanactaccaatgaggaccgacttatcagag 11204409  T
Q  126 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttgga 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11204410 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttaggtttgga 11204509  T
Q  226 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11204510 tgtatctggtatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctggggtg 11204590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 26 - 306
Target Start/End: Original strand, 3261872 - 3262152
Alignment:
Q  26 atcagtacacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagag 125  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3261872 atcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagag 3261971  T
Q  126 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttgga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3261972 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttgga 3262071  T
Q  226 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3262072 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtg 3262152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 25 - 306
Target Start/End: Original strand, 29450614 - 29450895
Alignment:
Q  25 catcagtacacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcaga 124  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  29450614 catcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcaga 29450713  T
Q  125 ggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttgg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29450714 ggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttgg 29450813  T
Q  225 atgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29450814 atgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtg 29450895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 33 - 306
Target Start/End: Original strand, 44658951 - 44659224
Alignment:
Q  33 cacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44658951 cacagtgtcctgaaccgaagaagactagaactggtggaaaggtgtttgctttgaatggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 44659050  T
Q  133 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatct 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44659051 tttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatct 44659150  T
Q  233 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44659151 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtg 44659224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20893209 - 20892953
Alignment:
Q  42 ctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaa 141  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20893209 ctgagccgaagaaggttagaactggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaa 20893110  T
Q  142 tagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20893109 tagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaa 20893010  T
Q  242 ggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20893009 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 20892953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 45 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16150811 - 16150556
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 144  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| || | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16150811 aaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgtagaccactagtgaggatcgacttatcagatgtacttgtttctttaatag 16150712  T
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16150711 tactcctttagttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttgtttctgatatgaaaggg 16150612  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16150611 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtct 16150556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 45 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16154957 - 16154702
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 144  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| || | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16154957 aaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgtagaccactagtgaggatcgacttatcagatgtacttgtttctttaatag 16154858  T
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16154857 tactcctttagttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttgtgtctgatatgaaaggg 16154758  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16154757 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtct 16154702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 77 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27903528 - 27903307
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  27903528 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacatgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 27903429  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| ||  | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27903428 ctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattatatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagccaagggttc 27903329  T
Q  277 agtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||| |||||||| ||||||    
T  27903328 agtaactacttctctagtttgt 27903307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 33 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7357454 - 7357280
Alignment:
Q  33 cacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 132  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7357454 cacagtgtcctgagccgaagaaggctagaactagtgggaaggtgtttgcattgactggtacacagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 7357355  T
Q  133 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7357354 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgc 7357280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 65 - 300
Target Start/End: Original strand, 14993484 - 14993719
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14993484 ggtggcaaggtgtttgctttgaatggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 14993583  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | |||||| |||||  ||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14993584 tagatactagtgctcttcattatttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 14993683  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14993684 agctaagggttcactaactacttctcttgtttgtct 14993719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 47 - 297
Target Start/End: Original strand, 51603891 - 51604141
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    |||||||||  ||||  |||||| || || ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51603891 ccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagta 51603990  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||  ||||||||  ||| |||||||||||||| ||    
T  51603991 ctcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaactgggtttgattgtgtctgatatgaaaggaga 51604090  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  51604091 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 51604141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 65 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15073514 - 15073285
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15073514 ggtggcaaggtgttttctttgactggtacacaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctatta 15073415  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||||| | ||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15073414 tagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcacataagttggctctggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactcc 15073315  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15073314 agctaagggttcagtaactacttctcttgt 15073285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 47 - 293
Target Start/End: Original strand, 53750569 - 53750815
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    |||||||||  ||||  |||||| || || ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53750569 ccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagta 53750668  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||  ||||||||  ||| |||||||||||||| ||    
T  53750669 ctcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaactgggtttgattgtgtctgatatgaaaggaga 53750768  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttg 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  53750769 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttg 53750815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 47 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15266949 - 15266736
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    |||||||||  ||| || ||||| |||||||||||||| ||  ||||||| || || | ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15266949 ccgaagaaggttaggaccggtggcaaggtgtttgctttaaccagtacgcaaacaactagtgaagacagacttatcagaggtagttgtttctttaatagta 15266850  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  15266849 ctcctttaattgctattatagacactggtactactcattgtttcattgatgttgattgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggaga 15266750  T
Q  247 aatggttgttgaaa 260  Q
    ||||||||||||||    
T  15266749 aatggttgttgaaa 15266736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 74 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14697247 - 14697027
Alignment:
Q  74 gtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 173  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| ||  | || | |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14697247 gtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattataggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactg 14697148  T
Q  174 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 273  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||    
T  14697147 gtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaggg 14697048  T
Q  274 ttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    ||| || || |||||||||||    
T  14697047 ttcggtgactacttctcttgt 14697027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14162613 - 14162396
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||   || ||||| || || |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  14162613 tttgcattgacgggtacccagactgagaacgaggatcgcctgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataccggtg 14162514  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||| ||||| | |||||||| | | | | | ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14162513 ctacgcatagttttattgctcttgattgtgcttctaagttggatcttgctatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttc 14162414  T
Q  277 agtaaccacttctcttgt 294  Q
     ||||| |||||||||||    
T  14162413 ggtaactacttctcttgt 14162396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Original strand, 15904 - 16121
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||   || ||||| ||  | ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15904 tttgcattgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtg 16003  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||   |||||||||| |   | | ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16004 ctacgcatttttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttactatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 16103  T
Q  277 agtaaccacttctcttgt 294  Q
     || || |||||||||||    
T  16104 ggtgactacttctcttgt 16121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 191 - 300
Target Start/End: Original strand, 15354283 - 15354392
Alignment:
Q  191 attgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctc 290  Q
    |||| |||||| ||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15354283 attgatattgattgtgtatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctacgggttcagtaactacttctc 15354382  T
Q  291 ttgtttgtct 300  Q
    ||||||||||    
T  15354383 ttgtttgtct 15354392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 14683710 - 14683496
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |   ||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14683710 tttgctttgactggtactcagacaaaggatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 14683611  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||||||||| ||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14683610 ctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttc 14683511  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  14683510 ggtgactacttctct 14683496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 8050492 - 8050706
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8050492 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 8050591  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8050592 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 8050691  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  8050692 ggtgactacttctct 8050706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 12479743 - 12479529
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12479743 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 12479644  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12479643 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 12479544  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  12479543 ggtgactacttctct 12479529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 14300848 - 14301062
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14300848 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 14300947  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14300948 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 14301047  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  14301048 ggtgactacttctct 14301062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19635279 - 19635065
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19635279 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 19635180  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19635179 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 19635080  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  19635079 ggtgactacttctct 19635065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Original strand, 16233903 - 16234075
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  16233903 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16234002  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  16234003 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 16234075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 23958848 - 23958676
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  23958848 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 23958749  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  23958748 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 23958676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 77 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 8389555 - 8389356
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8389555 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 8389456  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8389455 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 8389356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 16350423 - 16350637
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    |||||||| ||  | ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  16350423 tttgctttggctggtacacagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtg 16350522  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||  ||||||||||||||| | || ||||  | ||  |||||| | ||| | || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16350523 ctatgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtcggatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 16350622  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  16350623 ggtgactacttctct 16350637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 17092018 - 17092232
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17092018 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 17092117  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17092118 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgccttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 17092217  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  17092218 ggtgactacttctct 17092232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 27714479 - 27714265
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27714479 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 27714380  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27714379 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttc 27714280  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  27714279 ggtgactacttctct 27714265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 40476183 - 40475969
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||    || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40476183 tttgctttgactggtacgcagacggagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 40476084  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  40476083 ctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtggtcgaaactccagctaagggttc 40475984  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  40475983 ggtgactacttctct 40475969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Original strand, 19775704 - 19775876
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  19775704 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 19775803  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  19775804 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctct 19775876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 138 - 291
Target Start/End: Original strand, 18224376 - 18224529
Alignment:
Q  138 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 237  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  18224376 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 18224475  T
Q  238 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  18224476 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 18224529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16219331 - 16219188
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||||||  ||||    |||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16219331 tttgctttgactggtacttagacagaaaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtg 16219232  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggt 220  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  16219231 ctacacactgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggt 16219188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16222651 - 16222508
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||||||  ||||    |||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16222651 tttgctttgactggtacttagacagaaaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtg 16222552  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggt 220  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  16222551 ctacacactgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggt 16222508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 163
Target Start/End: Original strand, 15354234 - 15354291
Alignment:
Q  106 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatt 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15354234 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgatatt 15354291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 276
Target Start/End: Original strand, 15144829 - 15144960
Alignment:
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| ||     
T  15144829 tactcctttagttgctattattgatactggtgctaagcattgttttattgttttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 15144928  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15144929 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 15144960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 13513451 - 13513294
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |  | ||||  | |   | ||    
T  13513451 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcaattgtgtttctgcttcgg 13513352  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13513351 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 13513294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 291
Target Start/End: Original strand, 16250780 - 16250933
Alignment:
Q  138 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 237  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  16250780 ttaataatactcatttagttgctattattgatactaatgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgccttgggtcttgatttgtctgatat 16250879  T
Q  238 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  16250880 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 16250933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 14999726 - 14999674
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14999726 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 14999674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15258891 - 15258847
Alignment:
Q  256 tgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  15258891 tgaaactccagctaagagttcagtaactacttctcttgtttgtct 15258847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Original strand, 15290350 - 15290402
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15290350 aatagtactcctttgattgcaattattgatagtggtgctactcattcttttat 15290402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 186
Target Start/End: Original strand, 18604733 - 18604797
Alignment:
Q  122 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattg 186  Q
    ||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18604733 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 18604797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Original strand, 12340059 - 12340111
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  12340059 aatagtactcctttgattgcgattattgatattggtcctactcattcttttat 12340111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 206
Target Start/End: Original strand, 18546820 - 18546877
Alignment:
Q  149 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtg 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||| || |||| ||||    
T  18546820 cctttaattgctattatagatactggagctacgcattcttttatttctcttgattgtg 18546877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 45)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 26 - 306
Target Start/End: Original strand, 16268745 - 16269025
Alignment:
Q  26 atcagtacacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagag 125  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16268745 atcagttcacagtgtcctgagccgaagaaggctagaactggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagag 16268844  T
Q  126 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttgga 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16268845 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttgga 16268944  T
Q  226 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  16268945 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgcttgtctggggtg 16269025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 26 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 28984171 - 28983891
Alignment:
Q  26 atcagtacacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagag 125  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28984171 atcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctctgactggtacacagactcctaatgaggaccgacttatcagag 28984072  T
Q  126 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttgga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28984071 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcactgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttgga 28983972  T
Q  226 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28983971 tatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtg 28983891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 26 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 28989390 - 28989110
Alignment:
Q  26 atcagtacacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagag 125  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28989390 atcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctctgactggtacacagactcctaatgaggaccgacttatcagag 28989291  T
Q  126 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttgga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28989290 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcactgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttgga 28989191  T
Q  226 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28989190 tatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgatactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtg 28989110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 48 - 297
Target Start/End: Original strand, 31414075 - 31414324
Alignment:
Q  48 cgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 147  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31414075 cgaagaaggctagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtatgcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 31414174  T
Q  148 tcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaa 247  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31414175 tcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgctaatgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggagaa 31414274  T
Q  248 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  31414275 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttg 31414324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 47 - 298
Target Start/End: Original strand, 22027822 - 22028073
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    |||||||||  |||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22027822 ccgaagaaggttagaaccggtggaaaagtgtttgcattgaccggtacgcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 22027921  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||    
T  22027922 ctcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttttatcttatatgaaaggaga 22028021  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  22028022 aatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgt 22028073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 47 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22054102 - 22053843
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    |||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22054102 ccgaagaaggatagaactggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagta 22054003  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||    
T  22054002 ctcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggaga 22053903  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22053902 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctgaggtg 22053843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 47 - 301
Target Start/End: Original strand, 29300968 - 29301222
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    ||||||||| |||| |  |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29300968 ccgaagaaggctaggatcggtgggaaagtgttttcattgacgggtacgcagactacaaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 29301067  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||    
T  29301068 ctcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgcttgtatctgatatgaaaggaga 29301167  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctg 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29301168 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 29301222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19985401 - 19985168
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19985401 ggtggcaaggtatttgcattgactagtacgcagactgtgaataaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 19985302  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  19985301 tagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtttggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactcc 19985202  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19985201 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 19985168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21928649 - 21928416
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21928649 ggtggcaaggtgtttgctttgactagtaagcaaactgtgaatgaagaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 21928550  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21928549 tagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaatggcgaaatggttgttgaaactcc 21928450  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21928449 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 21928416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22374090 - 22373857
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22374090 ggtggcaaggtgtttgctttgactggtacccaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 22373991  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | |||||||||||||||||| |||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| | | | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22373990 tagatactggtgctactcatagtttcattgatgttgattgtgcatataagttgggtctagttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactcc 22373891  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22373890 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 22373857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 157 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27357665 - 27357516
Alignment:
Q  157 tgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgtt 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27357665 tgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgtt 27357566  T
Q  257 gaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27357565 gaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctggggtg 27357516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20391307 - 20391074
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20391307 ggtggaaaggtgtttgcattgactggtacgcagacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatttctatta 20391208  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||| || | ||||  |||||||||||| ||| | | ||   ||| |  || ||||||||||||||||||||    
T  20391207 ttgatactggtgctacacattgattcattgctgttaattgtgaatataagttgggtctggttatgtcaagtattagtggagaaatggttgttgaaactcc 20391108  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20391107 agctaagggttcagtaactacttctctcgtttgt 20391074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 119 - 294
Target Start/End: Original strand, 22421506 - 22421681
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  22421506 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagctgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 22421605  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    || | | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  22421606 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 22421681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Original strand, 21391433 - 21391650
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    || ||||| ||  | |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21391433 tttgctttgactggtacacagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtg 21391532  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| |||||||||||| ||  ||| |||||   |||||||||| | |   | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21391533 ctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 21391632  T
Q  277 agtaaccacttctcttgt 294  Q
     || ||||||||||||||    
T  21391633 ggtgaccacttctcttgt 21391650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Original strand, 21780759 - 21780976
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    || ||||| ||  | |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21780759 tttgctttgactggtacacagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtg 21780858  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| |||||||||||| ||  ||| |||||   |||||||||| | |   | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21780859 ctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 21780958  T
Q  277 agtaaccacttctcttgt 294  Q
     || ||||||||||||||    
T  21780959 ggtgaccacttctcttgt 21780976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 141 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22523691 - 22523538
Alignment:
Q  141 atagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaa 240  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  |||||||    
T  22523691 atagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaa 22523592  T
Q  241 aggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
     || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  22523591 tggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 22523538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 122 - 290
Target Start/End: Original strand, 22375071 - 22375239
Alignment:
Q  122 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtt 221  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||     
T  22375071 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgatattgattgtgcttctaagttgggtc 22375170  T
Q  222 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctc 290  Q
    | | | | ||  ||||||| || || ||||| || ||||||||| |||||||||| || || |||||||    
T  22375171 ttgctatgtcgaatatgaatggagagatggtcgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctc 22375239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 81 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19981172 - 19980962
Alignment:
Q  81 ctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 180  Q
    ||||||||||||| |||||    |||||||| || || ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19981172 ctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcggctgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 19981073  T
Q  181 tcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagta 280  Q
     ||||||||||||||| | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  19981072 gcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtg 19980973  T
Q  281 accacttctct 291  Q
    || ||||||||    
T  19980972 actacttctct 19980962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21254154 - 21253937
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21254154 tttgctttgactggtacacagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtg 21254055  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| |||| ||||||||||  ||| |||||   |||||||||| | |   | ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21254054 ctacgcattattttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttc 21253955  T
Q  277 agtaaccacttctcttgt 294  Q
     || || |||||||||||    
T  21253954 ggtgactacttctcttgt 21253937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 149 - 294
Target Start/End: Original strand, 21785999 - 21786144
Alignment:
Q  149 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaa 248  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||   |||||||||| | |   | ||||||||||| || ||||    
T  21785999 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 21786098  T
Q  249 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21786099 tggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgt 21786144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22990254 - 22990037
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22990254 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgacagtacacctttagttgctattattgatactagtg 22990155  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||  |||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||| | | | | ||  ||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22990154 ctaaacattgttttattgctattgattgtgcttcaaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcgaagggttc 22990055  T
Q  277 agtaaccacttctcttgt 294  Q
     || || |||||||||||    
T  22990054 ggtgactacttctcttgt 22990037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 276
Target Start/End: Original strand, 22126531 - 22126730
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22126531 tttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 22126630  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22126631 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 22126730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19115609 - 19115395
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19115609 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 19115510  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19115509 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttc 19115410  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
    ||| || ||||||||    
T  19115409 agtgactacttctct 19115395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 20015835 - 20016049
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20015835 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 20015934  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20015935 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 20016034  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  20016035 ggtgactacttctct 20016049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 294
Target Start/End: Original strand, 22245555 - 22245804
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 144  Q
    |||| |||||||||  |||| |||| |  ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| ||  | || |||||||| ||||  ||| ||||    
T  22245555 aacctaagaagactcaaactagtggtagagtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttattttgatag 22245654  T
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    ||| |||||||||  ||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  ||||||| ||     
T  22245655 tacacctttaatttatattattcatattagtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatgga 22245754  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
     | |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  22245755 tagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 22245804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 294
Target Start/End: Original strand, 22245973 - 22246222
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 144  Q
    |||| |||||||||  |||| |||| |  ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| ||  | || |||||||| ||||  ||| ||||    
T  22245973 aacctaagaagactcaaactagtggtagagtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttattttgatag 22246072  T
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    ||| |||||||||  ||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  ||||||| ||     
T  22246073 tacacctttaatttatattattcatattagtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatgga 22246172  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
     | |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  22246173 tagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 22246222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 32603312 - 32603140
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  32603312 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 32603213  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  32603212 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 32603140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 17671594 - 17671808
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17671594 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 17671693  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17671694 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 17671793  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  17671794 ggtgactacttctct 17671808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 22117747 - 22117961
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    |||||||| |   | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22117747 tttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcatttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 22117846  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||  |||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22117847 ctacgcattgttttattgctttcgatcgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 22117946  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  22117947 ggtgactacttctct 22117961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 18859744 - 18859572
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  18859744 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 18859645  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  18859644 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 18859572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22031270 - 22031098
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  22031270 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 22031171  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||| || || ||||||||    
T  22031170 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctct 22031098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22042994 - 22042822
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||| ||||  | |   ||||    
T  22042994 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttatttcttttgattgtgtttctgctttgg 22042895  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||| | ||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  22042894 gtcttgatttttctgatatgattggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22042822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Original strand, 30310758 - 30310930
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  30310758 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 30310857  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  30310858 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttcggtgactacttctct 30310930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 276
Target Start/End: Original strand, 19481644 - 19481843
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19481644 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 19481743  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19481744 ctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 19481843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 80 - 291
Target Start/End: Original strand, 21164113 - 21164324
Alignment:
Q  80 gctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgcta 179  Q
    |||||||||||||| |||||    |||||||| ||  | ||||||||||| ||||   || ||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21164113 gctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattgatcatactcctttagttgctattattgatactgatgcta 21164212  T
Q  180 ctcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagt 279  Q
    | ||||||||||||||| |  | ||||| | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21164213 cgcattgttttattgctttcaattgtgcttcttctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagt 21164312  T
Q  280 aaccacttctct 291  Q
     || ||||||||    
T  21164313 gactacttctct 21164324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 22129189 - 22129403
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||| || ||||||| ||||| |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22129189 tttgctctggctggtactcagacaaagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctagattaataatactgctttagttgctattattgatactggtg 22129288  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
     ||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22129289 ttacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggacagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 22129388  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  22129389 ggtgactacttctct 22129403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15536550 - 15536378
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   |||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || | ||  | |   ||||    
T  15536550 atcagaggtacttgctatattaatgatactccgttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattatgtttctgccttgg 15536451  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  15536450 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 15536378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Original strand, 20649990 - 20650042
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20649990 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 20650042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Original strand, 21847972 - 21848024
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21847972 aatagtactcttttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 21848024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16415232 - 16415180
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16415232 aatagtattccattgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 16415180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 22437436 - 22437384
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  22437436 aatagtactcctttgattgcgattattgatactgatgttactcattcttttat 22437384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 99
Target Start/End: Original strand, 21982499 - 21982536
Alignment:
Q  62 actggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagac 99  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21982499 actggtgtgaaggtttttgctttgactggtacgcagac 21982536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 99
Target Start/End: Original strand, 21998985 - 21999022
Alignment:
Q  62 actggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagac 99  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21998985 actggtgtgaaggtttttgctttgactggtacgcagac 21999022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 192
Target Start/End: Original strand, 21194163 - 21194239
Alignment:
Q  116 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||| ||||||  |||||| | ||||| |||| ||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21194163 cttatccgaggtatgtgtttcatcaatagcactcatttgattggaattattgatattggtgctactcattcttttat 21194239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 21329795 - 21329759
Alignment:
Q  62 actggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcaga 98  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  21329795 actggtgggaaggtttttgctttgactagtacgcaga 21329759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 39)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 26 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 48426113 - 48425833
Alignment:
Q  26 atcagtacacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagag 125  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  48426113 atcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagag 48426014  T
Q  126 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttgga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48426013 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttgga 48425914  T
Q  226 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48425913 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtg 48425833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 26 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 52988981 - 52988701
Alignment:
Q  26 atcagtacacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagag 125  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52988981 atcagttcacaatgtcctgaaccgaagaaggttagaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagag 52988882  T
Q  126 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttgga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52988881 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttgga 52988782  T
Q  226 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52988781 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtg 52988701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 26 - 306
Target Start/End: Original strand, 38909976 - 38910256
Alignment:
Q  26 atcagtacacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagag 125  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  38909976 atcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtttttgccttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagag 38910075  T
Q  126 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttgga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38910076 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttgga 38910175  T
Q  226 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38910176 tgtatctgatatgaaagggaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtg 38910256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 33 - 306
Target Start/End: Original strand, 31537154 - 31537427
Alignment:
Q  33 cacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 132  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31537154 cacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctctgactggtacgcagactcctaatgaagaccgacttatcagaggtacttg 31537253  T
Q  133 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatct 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  31537254 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtgtct 31537353  T
Q  233 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31537354 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtg 31537427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 33 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37680282 - 37680009
Alignment:
Q  33 cacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 132  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37680282 cacagtgtcctgagccgaggaagactagaattggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggacagacttatcagaggtacttg 37680183  T
Q  133 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatct 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  37680182 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctattcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatatatct 37680083  T
Q  233 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37680082 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtg 37680009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 39 - 293
Target Start/End: Original strand, 20074872 - 20075126
Alignment:
Q  39 gtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctt 138  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20074872 gtcctgagccgaagaaggttagaactgggggcaagatgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctt 20074971  T
Q  139 taatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatg 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20074972 taatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatg 20075071  T
Q  239 aaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttg 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20075072 aaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 20075126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 39 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20297610 - 20297341
Alignment:
Q  39 gtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttga-ctggtacgcag-actaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttc 136  Q
    |||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20297610 gtcctgagtcgaagaaggttagaactggtgggaaggtgtttggtttgagctggttattaccactaccaatgaggaccgacttatcagaggtactggtttc 20297511  T
Q  137 tttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297510 tttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgata 20297411  T
Q  237 tgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20297410 tgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtg 20297341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 26 - 297
Target Start/End: Original strand, 24096765 - 24097036
Alignment:
Q  26 atcagtacacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagag 125  Q
    |||||| ||||| || || | ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24096765 atcagttcacagtgtactcagccgaagaaggctagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactaatgaggactgacttatcagag 24096864  T
Q  126 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttgga 225  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24096865 gtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttgga 24096964  T
Q  226 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 297  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  24096965 tgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttg 24097036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 47 - 300
Target Start/End: Original strand, 22015916 - 22016169
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    |||||||||  ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22015916 ccgaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 22016015  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  22016016 ctcatttaattgctattatagatactggtgatactcattgtttcattgatgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggaga 22016115  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22016116 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 22016169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 65 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18710586 - 18710351
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18710586 ggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 18710487  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    |  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18710486 taaacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgcgtctggttgtatctgatatgagaggggaaatggttgttgaaactcc 18710387  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18710386 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 18710351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 74 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 19857466 - 19857243
Alignment:
Q  74 gtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 173  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  19857466 gtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaactgctattatagatactg 19857367  T
Q  174 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 273  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19857366 gtgctactcattgtttcattgttattgaatgtgcttataagttgggtatggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 19857267  T
Q  274 ttcagtaaccacttctcttgtttg 297  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  19857266 ttcagtaactacttctcttgtttg 19857243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 59 - 294
Target Start/End: Original strand, 20853943 - 20854178
Alignment:
Q  59 agaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 158  Q
    |||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20853943 agaacttgagggaaggttttcgctttgactggtacccagactaccaacgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 20854042  T
Q  159 ctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttga 258  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20854043 ctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggcctaattgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttga 20854142  T
Q  259 aactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  20854143 aactccagccaagggttcagtaactacttctcttgt 20854178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 74 - 300
Target Start/End: Original strand, 20833098 - 20833324
Alignment:
Q  74 gtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 173  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||    
T  20833098 gtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatattattcctttaattgctattatagacactg 20833197  T
Q  174 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 273  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20833198 gtgctactcattgtttcattgttattgaatgttcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagataaggg 20833297  T
Q  274 ttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||    
T  20833298 ttcattaactacttctcttgtttgtct 20833324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Original strand, 21739225 - 21739458
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21739225 ggtggcaagctgttttctttgactggtacgcaaacggttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatttctatta 21739324  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| | | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21739325 tagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtcttgttttatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 21739424  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21739425 agctaagggttcagtaactacttttcttgtttgt 21739458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Original strand, 21742741 - 21742974
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21742741 ggtggcaaggtatttgcgttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctatta 21742840  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21742841 tagacactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactcc 21742940  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  21742941 agctaagggttcggtaactacgtctcttgtttgt 21742974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 41 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 21961252 - 21961135
Alignment:
Q  41 cctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttcttta 140  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21961252 cctgagccgaagaaggttagaactggtggaaaggtatttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttcttta 21961153  T
Q  141 atagtactcctttaattg 158  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21961152 atagtactcctttaattg 21961135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 74 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16379255 - 16379031
Alignment:
Q  74 gtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 173  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||    || ||||| ||  | ||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16379255 gtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacatgttactttgatggtactcctttaattgctattattgatattg 16379156  T
Q  174 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 273  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||   | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||    
T  16379155 gtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcatgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaggg 16379056  T
Q  274 ttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    ||| || || |||||||||||||||    
T  16379055 ttcggtgactacttctcttgtttgt 16379031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 119 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21752163 - 21751988
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   ||||||||    
T  21752163 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 21752064  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    || | | | | ||| ||||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  21752063 gtcttgctatgtctaatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 21751988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 228 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12200556 - 12200478
Alignment:
Q  228 tatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12200556 tatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtg 12200478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 291
Target Start/End: Original strand, 22496460 - 22496671
Alignment:
Q  80 gctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgcta 179  Q
    |||||||||||||| |||||    |||||||| ||  | ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22496460 gctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 22496559  T
Q  180 ctcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagt 279  Q
    | ||||||||||||||| | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  22496560 cgcattgttttattgctttcgattgtgcttctacattgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 22496659  T
Q  280 aaccacttctct 291  Q
     || ||||||||    
T  22496660 gactacttctct 22496671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 24785058 - 24785272
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  24785058 tttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatacttgtg 24785157  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||| | |   |||||| | | | ||||||||||||| || || ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24785158 ctacacattgttttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttatctgatatgaatggagagatggtcgttgaaattccagctaagggttc 24785257  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  24785258 ggtgactacttctct 24785272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 16347796 - 16348010
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16347796 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 16347895  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16347896 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 16347995  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  16347996 ggtgactacttctct 16348010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21833460 - 21833246
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21833460 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 21833361  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||| ||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21833360 ctacgcattgttttatggctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 21833261  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  21833260 ggtgactacttctct 21833246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21842370 - 21842156
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||    || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  21842370 tttgctttgactggtacgcagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtg 21842271  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||  | |   || ||| | ||| | ||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21842270 ctacgcattgttttattgcttttgattgtgtttctgctttaggtcttgatttgtctgatatgaatggagagattgttgtcgaaactccagctaagggttc 21842171  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  21842170 ggtgactacttctct 21842156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 51330693 - 51330907
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51330693 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 51330792  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51330793 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 51330892  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  51330893 ggtgactacttctct 51330907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Original strand, 17042258 - 17042430
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  17042258 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 17042357  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    |  | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  17042358 gccttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 17042430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Original strand, 20081619 - 20081791
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | || ||||| | ||  ||||    
T  20081619 atcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtactacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 20081718  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  20081719 gtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 20081791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 138 - 291
Target Start/End: Original strand, 33388291 - 33388444
Alignment:
Q  138 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 237  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  33388291 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 33388390  T
Q  238 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  33388391 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 33388444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 276
Target Start/End: Original strand, 41350869 - 41351068
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41350869 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 41350968  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41350969 ctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 41351068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19109526 - 19109312
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19109526 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgacactggtg 19109427  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||  ||||||||||||||   ||| ||||| | |   ||| || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19109426 ctatgcattgttttattgcctatgattgtgcttctgctttgagtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 19109327  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  19109326 ggtgactacttctct 19109312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 74 - 180
Target Start/End: Original strand, 21045322 - 21045428
Alignment:
Q  74 gtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 173  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| ||  | || | |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21045322 gtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattataggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactg 21045421  T
Q  174 gtgctac 180  Q
    |||||||    
T  21045422 gtgctac 21045428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 267
Target Start/End: Original strand, 21228757 - 21228947
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21228757 tttgctttggctggtactcagacggagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaatattactcctttagttgctattattgatactggtg 21228856  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 267  Q
    |||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  21228857 ctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 21228947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22401750 - 22401631
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    || ||||| ||  | ||||||| ||||||||   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22401750 tttgctttgactggtacacagacagagaacgaggatcgcttgatcagagatacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtg 22401651  T
Q  177 ctactcattgttttattgct 196  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  22401650 ctacgcattgttttattgct 22401631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Original strand, 20828656 - 20828708
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20828656 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 20828708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 20928149 - 20928097
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20928149 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 20928097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 20528148 - 20528096
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20528148 aatagtactcctttgattgcaattattgatcctggtgctactcattcttttat 20528096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 174
Target Start/End: Original strand, 22435976 - 22436031
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactgg 174  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22435976 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactgg 22436031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 192
Target Start/End: Original strand, 41215127 - 41215176
Alignment:
Q  143 agtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41215127 agtactccttggattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 41215176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 191
Target Start/End: Original strand, 22133016 - 22133067
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttta 191  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  22133016 aatagtaatcctttgattgcaattattgataccggtgctactcattctttta 22133067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 26 - 306
Target Start/End: Original strand, 514434 - 514714
Alignment:
Q  26 atcagtacacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagag 125  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  514434 atcagttcacagtgtcctgaaccgaagaaggttagaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagag 514533  T
Q  126 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttgga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  514534 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttgga 514633  T
Q  226 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  514634 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtg 514714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 496192 - 495975
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||    
T  496192 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtagacctttagttgctattattgatactagtg 496093  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||| | | | | ||  ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  496092 ctacacattgttttattgctattgattgtgcttcgaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 495993  T
Q  277 agtaaccacttctcttgt 294  Q
     || || |||||||||||    
T  495992 ggtgactacttctcttgt 495975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 143 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 441759 - 441602
Alignment:
Q  143 agtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaag 242  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||| |   | | ||  ||||||| |    
T  441759 agtactcctttagttgctattattgatactggtgctacggattgttttattgctcttgattgtgcttctaaattgggtcttactatgtcaaatatgaatg 441660  T
Q  243 gggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||    
T  441659 gagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtct 441602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 26 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20848414 - 20848134
Alignment:
Q  26 atcagtacacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagag 125  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20848414 atcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagag 20848315  T
Q  126 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttgga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20848314 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttgga 20848215  T
Q  226 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20848214 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtg 20848134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 47 - 297
Target Start/End: Original strand, 19716656 - 19716906
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    |||||||||  |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19716656 ccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagta 19716755  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||    
T  19716756 ctcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatttgaaaggaga 19716855  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19716856 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 19716906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 45 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23274399 - 23274144
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 144  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| || ||||||||| ||||||||| ||| || || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23274399 aaccgaagaaggttaggactggtggtaaagtgtttgctctgactggtatgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 23274300  T
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  23274299 tactcctttaattgctattatagacaccggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggg 23274200  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23274199 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 23274144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 50 - 298
Target Start/End: Original strand, 23097660 - 23097908
Alignment:
Q  50 aagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactc 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23097660 aagaagattagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacaggcttataagaggtacttgattctttaatagtactc 23097759  T
Q  150 ctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaat 249  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| | |||||||||| ||| |||| |||| |||||||| || ||    
T  23097760 ctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatttaagttgggtctggttgtaactgacatgaaaggagagat 23097859  T
Q  250 ggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23097860 ggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 23097908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 47 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12577157 - 12576907
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    |||||||||  ||||  |||||| || || ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12577157 ccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgcctcatcagaggtacttgtttctttaatagta 12577058  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||  ||||||||  ||| |||||||||||||| ||    
T  12577057 ttcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcctataaactgggtttgattgtgtctgatatgaaaggaga 12576958  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||    
T  12576957 aatggttgttgaaactccagctaagggttcaatgactacttctctggtttg 12576907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 47 - 189
Target Start/End: Original strand, 19721219 - 19721361
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    |||||||||  |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19721219 ccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagta 19721318  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttt 189  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19721319 ctcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttt 19721361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 113 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 23113461 - 23113276
Alignment:
Q  113 cgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctata 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||| ||||    
T  23113461 cgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgtttcattgttgttgattgtgcatata 23113362  T
Q  213 agttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    | |||||| ||| | | ||   |||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  23113361 aattgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctctcgtttgt 23113276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 17001774 - 17001560
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17001774 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 17001675  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| ||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17001674 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 17001575  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  17001574 ggtgactacttctct 17001560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 24705151 - 24705365
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||  | ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24705151 tttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgatattattgatactggtg 24705250  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||||     
T  24705251 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatgcagagatggttgtcgaaactccagctaagggttt 24705350  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     ||||| ||||||||    
T  24705351 ggtaactacttctct 24705365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Original strand, 11351422 - 11351594
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| | ||  ||||    
T  11351422 atcagaggtacttgctatattaataatactcatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 11351521  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  11351522 gtctagatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 11351594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23074595 - 23074420
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||    
T  23074595 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctattaagttgg 23074496  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    || | | | | ||||||||||| || || |||||| | |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  23074495 gtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 23074420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 22323011 - 22323225
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22323011 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 22323110  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22323111 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 22323210  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  22323211 ggtgactacttctct 22323225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 24712808 - 24712594
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24712808 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 24712709  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24712708 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 24712609  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  24712608 ggtgactacttctct 24712594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 300
Target Start/End: Original strand, 24817506 - 24817732
Alignment:
Q  74 gtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 173  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||| | || |||||||| |||   ||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24817506 gtgtttgctttgactggtacacagatagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgtcattttgaaagtactcctttagttgatattattgatactg 24817605  T
Q  174 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 273  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||| |     | ||  ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24817606 gtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttacaatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaaggg 24817705  T
Q  274 ttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    ||| || || |||||||| || |||||    
T  24817706 ttcggtgactacttctctagtgtgtct 24817732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 44383239 - 44383453
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44383239 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 44383338  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44383339 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgttttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 44383438  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  44383439 ggtgactacttctct 44383453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 23065145 - 23064973
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||    
T  23065145 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctattaagttgg 23065046  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | | | | ||||||||||| || || |||||| | |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  23065045 gtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 23064973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 291
Target Start/End: Original strand, 21322962 - 21323149
Alignment:
Q  104 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 203  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |    
T  21322962 aatgaggatcgcctaatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 21323061  T
Q  204 gtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    |||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  21323062 gtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgattggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21323149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 294
Target Start/End: Original strand, 22733485 - 22733660
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||   ||||||||    
T  22733485 atcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcgttgatttattgcttttgattgtgctactaagttgg 22733584  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    || | |   | ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||| || || |||||||||||    
T  22733585 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgt 22733660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 80 - 291
Target Start/End: Original strand, 22742638 - 22742849
Alignment:
Q  80 gctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgcta 179  Q
    |||||||||||||| |||||    |||||||| ||  | ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22742638 gctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattggtactggtgcta 22742737  T
Q  180 ctcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagt 279  Q
    | ||||||||||||||| | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  22742738 cgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 22742837  T
Q  280 aaccacttctct 291  Q
     || ||||||||    
T  22742838 gactacttctct 22742849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 9338356 - 9338142
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9338356 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 9338257  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9338256 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 9338157  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  9338156 ggtgactacttctct 9338142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 9486990 - 9486776
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9486990 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 9486891  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9486890 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 9486791  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  9486790 ggtgactacttctct 9486776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 10871624 - 10871410
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10871624 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 10871525  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  10871524 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttc 10871425  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  10871424 ggtgactacttctct 10871410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16984014 - 16983800
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16984014 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 16983915  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16983914 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 16983815  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  16983814 ggtgactacttctct 16983800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 27374043 - 27373829
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||| ||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27374043 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagatgtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 27373944  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27373943 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 27373844  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  27373843 ggtgactacttctct 27373829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Original strand, 23105397 - 23105614
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   || ||||| ||  | | |||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  23105397 tttgctttgactggtacacagactgagaacgaggatcgtttgaccagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgttactggtg 23105496  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| |||||||||||| ||  ||| |||||   |||||||||| | |   | ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23105497 ctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttc 23105596  T
Q  277 agtaaccacttctcttgt 294  Q
     || || |||||||||||    
T  23105597 ggtgactacttctcttgt 23105614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 122 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 27220745 - 27220576
Alignment:
Q  122 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtt 221  Q
    ||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   ||||||     
T  27220745 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 27220646  T
Q  222 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  27220645 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 27220576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 24678258 - 24678047
Alignment:
Q  80 gctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgcta 179  Q
    |||||||||||||| |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   | |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  24678258 gctttgactggtacacagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatatgaataatactcctttagttgctattaatgatactggtgcta 24678159  T
Q  180 ctcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagt 279  Q
      ||||||||||||||| | || ||||| | ||  |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  24678158 ggcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtctagatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaacttcagctaagggttcggt 24678059  T
Q  280 aaccacttctct 291  Q
     || ||||||||    
T  24678058 gactacttctct 24678047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 291
Target Start/End: Original strand, 45673708 - 45673895
Alignment:
Q  104 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 203  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| | || |    
T  45673708 aatgaggatcgattgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataatggagctacgcattgttttattgctttcgatt 45673807  T
Q  204 gtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    |||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  45673808 gtgattctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 45673895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 19817632 - 19817502
Alignment:
Q  66 gtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 165  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||| |||||  | |||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||     
T  19817632 gtgggaatgtgtttgctttagctggtactcagacatcgaatgaggatcgtctgatcagaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactactac 19817533  T
Q  166 tgatactggtgctactcattgttttattgct 196  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  19817532 agatactggtgctacacattgctttattgct 19817502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 24265144 - 24264930
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24265144 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 24265045  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||  ||  | |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24265044 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgagtggatagatggttgtcgaaactccggctaagggttc 24264945  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  24264944 ggtgactacttctct 24264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 24874419 - 24874633
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  24874419 tttgctttgactggtactcagacggagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagtttctattattgatactggtg 24874518  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  24874519 ctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaggtttc 24874618  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  24874619 ggtgactacttctct 24874633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Original strand, 24657369 - 24657541
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| | || ||||  | ||  ||||    
T  24657369 atcagaggtacttgctatattaataatactccattagttgctattattgatacagctgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgg 24657468  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
     | | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  24657469 atcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 24657541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 291
Target Start/End: Original strand, 23029133 - 23029344
Alignment:
Q  80 gctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgcta 179  Q
    |||||||||||||| || || |  |||||||| ||  | ||||||||||| | ||   |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23029133 gctttgactggtactcaaaccaagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatcttatattaataatactcccttagttgctattattgatactggtgcta 23029232  T
Q  180 ctcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagt 279  Q
    | ||||||||||||||| | || ||||| | |   |||||| | | | | ||||||||||| || |  |||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  23029233 cgcattgttttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagtgatggttgtcgaaaatccagctaagggttcggt 23029332  T
Q  280 aaccacttctct 291  Q
     || ||||||||    
T  23029333 gactacttctct 23029344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 276
Target Start/End: Original strand, 21142771 - 21142909
Alignment:
Q  138 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 237  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  21142771 ttaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgttttgggtcttgatttgtctgatat 21142870  T
Q  238 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    ||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21142871 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 21142909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 66 - 196
Target Start/End: Original strand, 30208578 - 30208708
Alignment:
Q  66 gtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 165  Q
    ||||||||||| | |||||  ||||||| |||||    |||||||| |  || |||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  30208578 gtgggaaggtgatcgctttagctggtactcagacagtgaatgaggatcatctgatcaaaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactattat 30208677  T
Q  166 tgatactggtgctactcattgttttattgct 196  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30208678 agatactggtgctacacattgttttattgct 30208708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 23205046 - 23204874
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||  || ||||| |  | ||||  | |   ||||    
T  23205046 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgcatttttgctttccattgtgtttctgctttgg 23204947  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  23204946 gtcttgatgtgtctgatatgaatggagagatggttgtcgatactccagctaagggttcggtgactacttctct 23204874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 192
Target Start/End: Original strand, 22739363 - 22739438
Alignment:
Q  117 ttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    ||||||||||||  |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22739363 ttatcagaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 22739438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 22280840 - 22280771
Alignment:
Q  116 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcatt 185  Q
    |||||||||||||  |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22280840 cttatcagaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctagtcatt 22280771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23676650 - 23676583
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattg 186  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  23676650 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattg 23676583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 25131320 - 25131275
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcatt 185  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25131320 aatagtactcatttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 25131275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 26 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 41958 - 41678
Alignment:
Q  26 atcagtacacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagag 125  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  41958 atcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagag 41859  T
Q  126 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttgga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41858 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttgga 41759  T
Q  226 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41758 tatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtg 41678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 69)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 26 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 10408791 - 10408519
Alignment:
Q  26 atcagtacacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagag 125  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  10408791 atcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccaacttatcagag 10408692  T
Q  126 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttgga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10408691 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttgga 10408592  T
Q  226 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10408591 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 10408519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 26 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 47126767 - 47126487
Alignment:
Q  26 atcagtacacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagag 125  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  47126767 atcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggtaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaacgaggaccgacttatcagag 47126668  T
Q  126 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttgga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47126667 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttgga 47126568  T
Q  226 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47126567 tatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtg 47126487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 33 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 28757135 - 28756868
Alignment:
Q  33 cacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 132  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28757135 cacagtgtcctgagccgaagaagactagaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 28757036  T
Q  133 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatct 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28757035 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatct 28756936  T
Q  233 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28756935 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 28756868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 47 - 298
Target Start/End: Original strand, 16327036 - 16327287
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16327036 ccgaagaaggttagaactggtggaaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttattagaggtacttgtttctttaatagta 16327135  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  16327136 ctcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggaga 16327235  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16327236 aatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 16327287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 47 - 298
Target Start/End: Original strand, 11958508 - 11958759
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11958508 ccgaagaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 11958607  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  11958608 atcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggaga 11958707  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11958708 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 11958759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 47 - 298
Target Start/End: Original strand, 16831855 - 16832106
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16831855 ccgaagaaggttagaactggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagta 16831954  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||    
T  16831955 ctcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaagaaga 16832054  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16832055 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 16832106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 100 - 298
Target Start/End: Original strand, 12509863 - 12510061
Alignment:
Q  100 taccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctatt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12509863 taccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctatt 12509962  T
Q  200 gaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||    
T  12509963 gaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagatttcagcaaccacttctctggtttgt 12510061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 47 - 300
Target Start/End: Original strand, 31692512 - 31692765
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    |||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31692512 ccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 31692611  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  31692612 ctcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagtcgggtctggttgtatctgatatgaaaggaga 31692711  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  31692712 aatggttgttgaaacttcagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtct 31692765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 47 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 31941705 - 31941452
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    |||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31941705 ccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctttgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 31941606  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  31941605 ctcctttaattgctattatagatactgatgctactcattttttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggaga 31941506  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||    
T  31941505 aatggttgttgaaactccagctaagggtctagtaactacttctcttgtgtgtct 31941452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 45 - 300
Target Start/End: Original strand, 12357852 - 12358107
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 144  Q
    |||||||||||  ||| || ||||| || ||||||||| ||||||||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12357852 aaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 12357951  T
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    ||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  12357952 tacacctttaattgctattatagacactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagga 12358051  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12358052 aaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 12358107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 49 - 300
Target Start/End: Original strand, 18131676 - 18131926
Alignment:
Q  49 gaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtact 148  Q
    |||||||  |||||| ||||| || |||||| || ||||||||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18131676 gaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttactctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtact 18131775  T
Q  149 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaa 248  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18131776 cctttaattgctattatagac-ctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaa 18131874  T
Q  249 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18131875 cggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 18131926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 45 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12181148 - 12180894
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 144  Q
    |||||||||||  ||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| | || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12181148 aaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctttgactggtacgtaaaccactagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 12181049  T
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||     
T  12181048 tactcctttagttgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctgtttgtatctaatatgaaagga 12180949  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtc 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12180948 gaaatggttgttgacactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtc 12180894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 65 - 295
Target Start/End: Original strand, 11949270 - 11949500
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||| || || | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11949270 ggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcaacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 11949369  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11949370 tagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtggttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 11949469  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtt 295  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  11949470 agctaagggttcagtaactacttttcttgtt 11949500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 59 - 272
Target Start/End: Original strand, 13317873 - 13318086
Alignment:
Q  59 agaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 158  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13317873 agaactggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 13317972  T
Q  159 ctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttga 258  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13317973 ctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggcttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttga 13318072  T
Q  259 aactccagctaagg 272  Q
    ||||||||||||||    
T  13318073 aactccagctaagg 13318086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Original strand, 14290877 - 14291110
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14290877 ggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaaccgtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctatta 14290976  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | || ||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14290977 tagacactagtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 14291076  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14291077 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 14291110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 71 - 297
Target Start/End: Original strand, 16378285 - 16378511
Alignment:
Q  71 aaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgata 170  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  16378285 aaggtatttgcttggactggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtgcttgtttctttaatagtactcctttaattgctatcatagaca 16378384  T
Q  171 ctggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaa 270  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16378385 ctggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatattaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaa 16378484  T
Q  271 gggttcagtaaccacttctcttgtttg 297  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  16378485 gggttcagtaactacttctcttgtttg 16378511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 65 - 300
Target Start/End: Original strand, 16825624 - 16825861
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaata--gtactcctttaattgctat 162  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16825624 ggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacggtgaatgaggactgacttatcagaggtacttgtttctttaatatagtactcctttaattgctat 16825723  T
Q  163 tattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaact 262  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16825724 tatagatactagtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggataaatggttgttgaaact 16825823  T
Q  263 ccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16825824 ccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 16825861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 59 - 300
Target Start/End: Original strand, 10417384 - 10417625
Alignment:
Q  59 agaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 158  Q
    |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10417384 agaactggaggaaaagtatttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 10417483  T
Q  159 ctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttga 258  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||| |||||| | || ||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10417484 ctattatagacaccggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttga 10417583  T
Q  259 aactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||    
T  10417584 aactccagccaagggttcagtgactacttctctggtgtgtct 10417625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 25 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 17189198 - 17188925
Alignment:
Q  25 catcagtacacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcaga 124  Q
    ||||||| ||||| || || | || ||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||    
T  17189198 catcagttcacagtgtactcagccaaagaagattagaaccggtgggaaagtgtttgcgttgactggtacgcaaactactaatgaggacaggcttatcaga 17189099  T
Q  125 ggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttgg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||||||||     
T  17189098 ggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacacgggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataaattgggtttga 17188999  T
Q  225 atgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
     ||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  17188998 ttgtatctgatatggagggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtttgt 17188925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 45 - 297
Target Start/End: Original strand, 8744715 - 8744967
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 144  Q
    |||||||||||  ||||  |||||| || || ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  8744715 aaccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatag 8744814  T
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| |||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||     
T  8744815 tactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggttgggtttgattgtgtctgatatgaaagga 8744914  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8744915 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 8744967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 45 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17494451 - 17494195
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 144  Q
    |||||||||||  ||| || ||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |  | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17494451 aaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccattagtgaggacatgcttatcagaggtacttgtttctttaatag 17494352  T
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  17494351 tactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataaattgggtctggttgtatctgatatgaaagga 17494252  T
Q  245 gaaatggttgttg-aaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  17494251 gaaatggttgttgaaaactccagctaagggttcagtaactaattctcttgtttgtct 17494195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 24190128 - 24189855
Alignment:
Q  25 catcagtacacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcaga 124  Q
    ||||||| ||||| || || | || ||||||| |||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||    
T  24190128 catcagttcacagtgtactcagccaaagaagattagaaccggtgggaaagagtttgcgttgactggtacgcagactactaacgaggacaggcttatcaga 24190029  T
Q  125 ggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttgg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||||||||     
T  24190028 ggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataaattgggtttga 24189929  T
Q  225 atgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
     ||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||    
T  24189928 ttgtatctgatatgaagggagagatggttgttgagactccagctaagggttcagtgactacttttctcgtttgt 24189855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 47 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13944826 - 13944576
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    |||||||||  ||||  |||||| || || ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13944826 ccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagta 13944727  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||  ||||||||  ||| ||||||||| |||| ||    
T  13944726 ctcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaactgggtttgattgtgtctgatatggaaggaga 13944627  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  13944626 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctagtttg 13944576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Original strand, 12857841 - 12858073
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12857841 ggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggac-gacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 12857939  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | ||||||||||||| | ||||||| |||||| | |  ||||| |||||||||| | ||| | ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  12857940 tagatactggtgctagttattgtttcattgctgtggtttgtgcatataagttggttctggttatatctgatatgaatggagaaacggttgttgaaactcc 12858039  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12858040 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 12858073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 140 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12273047 - 12272887
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatga 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| | ||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  12273047 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgactatgcatttaagttgggtctggttgtatctgatatga 12272948  T
Q  240 aaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12272947 aaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 12272887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15230387 - 15230154
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||    ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15230387 ggtggaaaggtgtttgcattgaccggtacacggacggttaatgaggattgacttatcataggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 15230288  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | || ||||||||||| |||||||| |||||| |||| | ||| |||||||||||| ||| | | ||   |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  15230287 tagacactggtgctacacattgtttcattgctgttgattttgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactcc 15230188  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15230187 agctaagggttcattaactacttctcttgtttgt 15230154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15236255 - 15236022
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||    ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15236255 ggtggaaaggtgtttgcattgaccggtacacggacggttaatgaggattgacttatcataggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 15236156  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | || ||||||||||| |||||||| |||||| |||| | ||| |||||||||||| ||| | | ||   |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  15236155 tagacactggtgctacacattgtttcattgctgttgattttgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactcc 15236056  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15236055 agctaagggttcattaactacttctcttgtttgt 15236022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 195 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14575640 - 14575535
Alignment:
Q  195 ctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14575640 ctattgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 14575541  T
Q  295 ttgtct 300  Q
    ||||||    
T  14575540 ttgtct 14575535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 65 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 35982965 - 35982841
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35982965 ggtggcaaggtgtttgctttgactgttacgcaaacggtgaatgaggaccgacttatcagagatacttgtttctttaatagtactcttttaattgctatta 35982866  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttt 189  Q
    | ||||||||| |||||||||||||    
T  35982865 tagatactggtactactcattgttt 35982841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 294
Target Start/End: Original strand, 12843474 - 12843688
Alignment:
Q  80 gctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgcta 179  Q
    |||||||||||||| |||||    |||||||| ||  | ||||||||||||||||  ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12843474 gctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgttattttgatagtatacctttagttgctattattgatactggtgcta 12843573  T
Q  180 ctcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagt 279  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | | | | | ||  ||||||| || || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12843574 cgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttggatcttgctatgtcaaatatgaatggagagatgattgttgaaactccagctaatggttcagt 12843673  T
Q  280 aaccacttctcttgt 294  Q
     || |||||||||||    
T  12843674 gactacttctcttgt 12843688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15262392 - 15262175
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    || ||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15262392 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtg 15262293  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15262292 ctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaatggttc 15262193  T
Q  277 agtaaccacttctcttgt 294  Q
     || || |||||||||||    
T  15262192 ggtgactacttctcttgt 15262175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 291
Target Start/End: Original strand, 15013115 - 15013340
Alignment:
Q  66 gtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 165  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||||  | |||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15013115 gtgggaaggtgtttgctttagctggtactcagacagcgaatgaggatcgtctaatcagaggtacatgtttcattaatagcactcctttaattactattat 15013214  T
Q  166 tgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcca 265  Q
     |||||| ||| ||| |||| |||||||| |  ||| |||||   |||||||||| | | | | ||   |||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  15013215 agatactagtgttacacatttttttattgttgctgattgtgctactaagttgggtcttgttatgtcgtctatgaatggggaaatggttgtcgaaacccca 15013314  T
Q  266 gctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    ||||||||||| || || ||||||||    
T  15013315 gctaagggttcggtgactacttctct 15013340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 10008362 - 10008148
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10008362 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 10008263  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10008262 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 10008163  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  10008162 ggtgactacttctct 10008148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 10908972 - 10908758
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10908972 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 10908873  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10908872 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 10908773  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  10908772 ggtgactacttctct 10908758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 12889471 - 12889257
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12889471 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 12889372  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12889371 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 12889272  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  12889271 ggtgactacttctct 12889257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 13255452 - 13255238
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13255452 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 13255353  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13255352 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 13255253  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  13255252 ggtgactacttctct 13255238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15358845 - 15358631
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||    || ||||| |   | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15358845 tttgctttgactggtacgcagacggagaacgaggatcatttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 15358746  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15358745 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 15358646  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  15358645 ggtgactacttctct 15358631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 15713424 - 15713638
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15713424 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 15713523  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15713524 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 15713623  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  15713624 ggtgactacttctct 15713638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24185952 - 24185754
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||     ||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24185952 tttgctttgactggtactcagacagaggatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 24185853  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggtt 275  Q
    |||||||||| ||||||||| | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24185852 ctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggtt 24185754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 15345613 - 15345827
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15345613 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 15345712  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15345713 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 15345812  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  15345813 ggtgactacttctct 15345827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 15586760 - 15586974
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15586760 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 15586859  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15586860 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttc 15586959  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  15586960 ggtgactacttctct 15586974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16638535 - 16638321
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16638535 tttgctttgactgggactcagacagaaaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 16638436  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||| ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16638435 ctacgcattgctttattgcttttgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 16638336  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  16638335 ggtgactacttctct 16638321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 43165437 - 43165223
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43165437 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 43165338  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43165337 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 43165238  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  43165237 ggtgactacttctct 43165223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 48428209 - 48427995
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48428209 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 48428110  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48428109 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 48428010  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  48428009 ggtgactacttctct 48427995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15065833 - 15065612
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||  | |||| ||||||||| |   |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  15065833 tttgctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcaaaggtacttgctatattaataatactcatttagttgctattattgatactggtg 15065734  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||| | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15065733 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttcttctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaatctccagctaagggttc 15065634  T
Q  277 agtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
     || || |||||||| ||||||    
T  15065633 ggtgactacttctctcgtttgt 15065612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 77 - 289
Target Start/End: Original strand, 14578776 - 14578988
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   |||||||| |   | ||||||| ||| |||||  || ||| ||| |||||| || ||||||||||| || |||    
T  14578776 tttgctttgactggtactcagactgagaatgaggatcatttgatcagagctacatgttttattgataatacacctttagttactattattgatcctagtg 14578875  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |     | ||  ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14578876 ctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttcccatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 14578975  T
Q  277 agtaaccacttct 289  Q
    |||||| ||||||    
T  14578976 agtaactacttct 14578988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 291
Target Start/End: Original strand, 14873939 - 14874150
Alignment:
Q  80 gctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgcta 179  Q
    |||||||||||||| |||||    |||||||| ||  | |||| |||||| ||||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  14873939 gctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcataggtacatgttatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgcaa 14874038  T
Q  180 ctcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagt 279  Q
    | ||||||||||||||| | || ||||| | ||  |||||| | ||| | ||| ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  14874039 cacattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgatatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 14874138  T
Q  280 aaccacttctct 291  Q
     || ||||||||    
T  14874139 gactacttctct 14874150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 15399885 - 15400099
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||||||| ||||    || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15399885 tttgctttgactggtacgtagacggagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttggttgctattattgatactggtg 15399984  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15399985 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcttagggttc 15400084  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  15400085 ggtgactacttctct 15400099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 20059422 - 20059636
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20059422 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 20059521  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20059522 ctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 20059621  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  20059622 ggtgactacttctct 20059636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Original strand, 16754111 - 16754283
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  16754111 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16754210  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||  | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  16754211 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 16754283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 80 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 6603494 - 6603283
Alignment:
Q  80 gctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgcta 179  Q
    ||||||||||| || ||||| |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6603494 gctttgactgggacccagacaaagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 6603395  T
Q  180 ctcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagt 279  Q
    | ||||| ||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||||| || || ||||||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  6603394 cccattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggt 6603295  T
Q  280 aaccacttctct 291  Q
     || ||||||||    
T  6603294 gactacttctct 6603283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 3688705 - 3688491
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3688705 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 3688606  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| |||||||||||||||   || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  3688605 ctacgcattgttttattgcttccgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttc 3688506  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  3688505 ggtgactacttctct 3688491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 26790781 - 26790995
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26790781 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 26790880  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||| | | || ||||  |     |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  26790881 ctacgcattgttttattgttttcgattgtgtttccgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttc 26790980  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  26790981 ggtgactacttctct 26790995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 53382386 - 53382600
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53382386 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 53382485  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||||| || || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  53382486 ctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttc 53382585  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  53382586 ggtgactacttctct 53382600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16694884 - 16694712
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |  |||||    
T  16694884 atcagaggtacttgctatattaataatactcccttagttgttattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgcgttgg 16694785  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  16694784 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttctgtgactacttctct 16694712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 275
Target Start/End: Original strand, 16804357 - 16804513
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||| |||||||||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  16804357 atcagatgtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16804456  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggtt 275  Q
    || | ||| | | ||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16804457 gtcttgatttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtt 16804513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 291
Target Start/End: Original strand, 5422359 - 5422512
Alignment:
Q  138 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 237  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || || |  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  5422359 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgcgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 5422458  T
Q  238 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    ||| || || |||||||| ||||||||  |||||||||| || || ||||||||    
T  5422459 gaatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactacttctct 5422512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 196
Target Start/End: Original strand, 23079388 - 23079504
Alignment:
Q  80 gctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgcta 179  Q
    |||||||||||||| |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  23079388 gctttgactggtactcagaccgaaaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatacttgtgcaa 23079487  T
Q  180 ctcattgttttattgct 196  Q
    | |||||||||||||||    
T  23079488 cacattgttttattgct 23079504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 119 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 11861094 - 11861033
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 180  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11861094 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 11861033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Original strand, 8271830 - 8271882
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8271830 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 8271882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Original strand, 13964786 - 13964838
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13964786 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 13964838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 30150066 - 30150014
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30150066 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 30150014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Original strand, 15944026 - 15944078
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15944026 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactcattcttttat 15944078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Original strand, 22150168 - 22150220
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22150168 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctagtcattcttttat 22150220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 99
Target Start/End: Original strand, 2247196 - 2247233
Alignment:
Q  62 actggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagac 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2247196 actggtgggaaggtttttgctttgactggtacgcagac 2247233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Original strand, 6150284 - 6150336
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6150284 aatagtactcatttgattgcaattattgatattggtgctactcattcttttat 6150336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 17201344 - 17201292
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  17201344 aatagtactccattgattgcaattattgatactagtgctactcattcttttat 17201292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 99
Target Start/End: Original strand, 12508907 - 12508943
Alignment:
Q  63 ctggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagac 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  12508907 ctggtgggaaggtgtttgctttaactggtacacagac 12508943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 17492460 - 17492396
Alignment:
Q  230 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||    
T  17492460 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcgaagagttcggtgactacttctcttgt 17492396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 33 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12025 - 11752
Alignment:
Q  33 cacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 132  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12025 cacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacacagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 11926  T
Q  133 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatct 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11925 tttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatct 11826  T
Q  233 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11825 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtg 11752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 33 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 677 - 404
Alignment:
Q  33 cacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  677 cacagtgtcctgaaccgaagaaggttagaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 578  T
Q  133 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatct 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  577 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctagtcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatct 478  T
Q  233 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  477 gatatgaaaggggaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtg 404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 26 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 30157 - 29877
Alignment:
Q  26 atcagtacacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagag 125  Q
    |||||| | ||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30157 atcagttcgcagtgtcctgagccgaagaaggttagaaatggtggaaaggtgtttgcattgattggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagag 30058  T
Q  126 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttgga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30057 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttgga 29958  T
Q  226 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  29957 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaagaaccacttctcttgtttgtctggggtg 29877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 42)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 41 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24367443 - 24367178
Alignment:
Q  41 cctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttcttta 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367443 cctgaaccgaagaaaactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttcttta 24367344  T
Q  141 atagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaa 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||| |||||||||||||    
T  24367343 atagtactcctttaattgctattattaatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatatcagttgggtccggatatatctgatatgaa 24367244  T
Q  241 aggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24367243 aggggaaatggttgttgaaactccagctaaggattcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtg 24367178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 68 - 294
Target Start/End: Original strand, 10466113 - 10466339
Alignment:
Q  68 gggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattg 167  Q
    ||||| |||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10466113 gggaaagtgtttgtattgatcggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatag 10466212  T
Q  168 atactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 267  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10466213 atactgttgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 10466312  T
Q  268 taagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  10466313 taagggttcagtaactacttctcttgt 10466339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 47 - 300
Target Start/End: Original strand, 14377160 - 14377413
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    |||||||||  |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14377160 ccgaagaaggttagaaccggtggaaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 14377259  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
     |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  14377260 atcctttaattgctattatagacactggtgttactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggttgtatctgatatgaaaggaga 14377359  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  14377360 aatggttgttgaaactccagcaaagggtttagtagctacttctcttgtttgtct 14377413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 45 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18797729 - 18797476
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 144  Q
    |||| ||||||  |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797729 aaccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 18797630  T
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||     
T  18797629 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctgacatgaaagga 18797530  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18797529 gagatggttgttgaaactctagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgt 18797476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 47 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19438039 - 19437786
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    |||||||||  ||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| || || | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19438039 ccgaagaaggttaggactagtggtaaggtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtaaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 19437940  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | | ||||||||||||||| || ||    
T  19437939 ctcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgagtctagttgtatctgatatgaagggaga 19437840  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19437839 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 19437786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 65 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19456042 - 19455807
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||| || || | ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456042 ggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactattgaggattttcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 19455943  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19455942 tagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggtgaaatggttgttgaaactcc 19455843  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19455842 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 19455807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 59 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15462361 - 15462120
Alignment:
Q  59 agaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 158  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15462361 agaactggaggaaaagtatttgccttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 15462262  T
Q  159 ctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttga 258  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15462261 ctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttga 15462162  T
Q  259 aactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  15462161 aactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtct 15462120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 65 - 300
Target Start/End: Original strand, 24515676 - 24515911
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| || |||||| || ||||||||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24515676 ggtggtaacgtgttttctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 24515775  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24515776 tagacactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 24515875  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    || |||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  24515876 agttaagtgttcattaactacttctcttgtttgtct 24515911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21474619 - 21474386
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21474619 ggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacttctaatgaggaccgacttatcagaggtatttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 21474520  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| | | |||||||||||  |  |||||||||||||||||||    
T  21474519 tagatactggtgctactcattgtttgattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatagaaaaatggttgttgaaactcc 21474420  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  21474419 agctaagggttcagtaactacttctcatgtttgt 21474386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 65 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 19466187 - 19465971
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||| || || | ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19466187 ggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactattgaggattttcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 19466088  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19466087 tagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 19465988  T
Q  265 agctaagggttcagtaa 281  Q
    |||||||||||||||||    
T  19465987 agctaagggttcagtaa 19465971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 50 - 298
Target Start/End: Original strand, 21567238 - 21567486
Alignment:
Q  50 aagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactc 149  Q
    ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21567238 aagaagattagaaccggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaataaggacatgcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactt 21567337  T
Q  150 ctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaat 249  Q
     || |||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||| ||| |||||||||||  |||| |||| |||||||| || ||    
T  21567338 attcaattgctattatagacactggtactactcattgtttcattgctttagaatgtgcatattagttgggtttgattgtaactgacatgaaaggagagat 21567437  T
Q  250 ggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21567438 ggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 21567486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Original strand, 19486556 - 19486789
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19486556 ggtggaaagttgtttgcattgactggtacgcaaacatttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgttatta 19486655  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| |||   | ||   |||||   | ||||||||||||||||||||    
T  19486656 ttgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggtcatgtcaagtatgagtagagaaatggttgttgaaactcc 19486755  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  19486756 agctaagggtttagtaactacttctcttgtttgt 19486789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25770863 - 25770630
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||| ||| |||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25770863 ggtggcaaggtgtttcctttgactagtaagcaaactgttaataaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 25770764  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | |||| |||||||| ||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| | | ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  25770763 tagatattggtgctattcattgtttcattgttgttgattgtgcttataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaatctcc 25770664  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    ||| ||||||||| | || |||||||||||||||    
T  25770663 agcaaagggttcaatcactacttctcttgtttgt 25770630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 45 - 298
Target Start/End: Original strand, 34642828 - 34643081
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 144  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||  | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34642828 aaccgaagaaggttaggaccggtgggaaagtgtttgccttggctggtacgcaaaccgcgaatgaagatagacttatcagaggtacttgtttctttaatag 34642927  T
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    ||  |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | || ||||| |||||  ||||||||  ||| ||||||||||||||     
T  34642928 tatccctttaatcgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcttataaactgggtttgattgtgtctgatatgaaagga 34643027  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  34643028 gaaatggtcgttgaaactccggctaagggttcagtgactacttctcttgtttgt 34643081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23081430 - 23081213
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||| ||| |||||    |||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23081430 tttgctttgactgatactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtg 23081331  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| | | | ||  |||| || || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23081330 ctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggttttgctatgtcaaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 23081231  T
Q  277 agtaaccacttctcttgt 294  Q
    ||| || |||||||||||    
T  23081230 agtgactacttctcttgt 23081213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 282
Target Start/End: Original strand, 5836502 - 5836707
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  5836502 tttgctttgactggtactcagacatataatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtg 5836601  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||  |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5836602 ctacgcattgttttattgcttttgattgtgcttatactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 5836701  T
Q  277 agtaac 282  Q
     |||||    
T  5836702 ggtaac 5836707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 301
Target Start/End: Original strand, 30678297 - 30678522
Alignment:
Q  76 gtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggt 175  Q
    |||||||||||||||||| || ||    |||||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  30678297 gtttgctttgactggtacacaaacagtgaatgaggatcggttgatcagaggtacatgtttctttaatagtacttctttaattgctattattgatatttgt 30678396  T
Q  176 gctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggtt 275  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||| | | | | ||   |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30678397 gctacgcgttgttttattgctactgattgtgcttctaagttgggtcttgttatgtcatgtatggatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggtt 30678496  T
Q  276 cagtaaccacttctcttgtttgtctg 301  Q
      || || |||||||| || ||||||    
T  30678497 tggttactacttctctagtgtgtctg 30678522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 119 - 294
Target Start/End: Original strand, 18405260 - 18405435
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||    
T  18405260 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagctgctattattgatactggtgctatgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 18405359  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    || | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  18405360 gtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 18405435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 122 - 298
Target Start/End: Original strand, 18182686 - 18182862
Alignment:
Q  122 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtt 221  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||| | ||||||||||     
T  18182686 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctacacatttccttattgctattgattgtgcttctaagttgggtc 18182785  T
Q  222 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    | | | | ||  ||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  18182786 ttgctatgtcaaatatgaatggagagatggtagtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtttgt 18182862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 170 - 294
Target Start/End: Original strand, 20010821 - 20010945
Alignment:
Q  170 actggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagcta 269  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||  |    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20010821 actggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcttataagttgggcctaatcgtatctaatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagcca 20010920  T
Q  270 agggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  20010921 agggttcagtaactacttctcttgt 20010945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22436873 - 22436662
Alignment:
Q  80 gctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgcta 179  Q
    |||||||||||||| |||||    |||||||||||  | ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22436873 gctttgactggtactcagaccgagaatgaggaccgcttgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactagtgcta 22436774  T
Q  180 ctcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagt 279  Q
    | ||||||||||||||| | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  22436773 cgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 22436674  T
Q  280 aaccacttctct 291  Q
     || ||||||||    
T  22436673 gactacttctct 22436662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 2872076 - 2872290
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2872076 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 2872175  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2872176 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 2872275  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  2872276 ggtgactacttctct 2872290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Original strand, 23085096 - 23085313
Alignment:
Q  74 gtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 173  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||    |||||||||||| | || |||||||| ||||  ||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  23085096 gtgtttgctttgactagtatgcagacagagaatgaggaccgattgattagaggtacatgttattttgatagtactcctttagtttctattattgaaactg 23085195  T
Q  174 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 273  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||| | ||| | |||||||||| |   | | ||   |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23085196 gtgctacacattgttttattgttgttgattatgcttctaagttgggtcttactatgtcaagtatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaaggg 23085295  T
Q  274 ttcagtaaccacttctct 291  Q
    ||| || || ||||||||    
T  23085296 ttcggtgactacttctct 23085313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16574855 - 16574683
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  16574855 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16574756  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  16574755 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 16574683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Original strand, 16620525 - 16620697
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  16620525 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16620624  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  16620625 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 16620697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Original strand, 16924956 - 16925128
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||  | ||  ||||    
T  16924956 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgg 16925055  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||||||    
T  16925056 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgtcgaaactccagctaagggatcggtgactacttctct 16925128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 29589713 - 29589927
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29589713 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 29589812  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29589813 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 29589912  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  29589913 ggtgactacttctct 29589927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 24293056 - 24293270
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24293056 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 24293155  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||  ||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24293156 ctacgcacggttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 24293255  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  24293256 ggtgactacttctct 24293270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 27190398 - 27190229
Alignment:
Q  122 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtt 221  Q
    ||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   ||||||     
T  27190398 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtc 27190299  T
Q  222 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    | ||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  27190298 ttgagttgtcagatatgaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 27190229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 291
Target Start/End: Original strand, 27258842 - 27259011
Alignment:
Q  122 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtt 221  Q
    ||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   ||||||     
T  27258842 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtc 27258941  T
Q  222 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    | ||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  27258942 ttgagttgtcagatatgaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 27259011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Original strand, 27559285 - 27559457
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  27559285 atcagaggtacttgttatattaataatactccatttgttgctattattgataatggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 27559384  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  27559385 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 27559457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 28312637 - 28312423
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28312637 tttgctttgactgggactcagacagaaaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 28312538  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||| ||||||||| |  | ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28312537 ctacgcattgctttattgctttcaattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 28312438  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  28312437 ggtgactacttctct 28312423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Original strand, 28260513 - 28260685
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  28260513 atcagaggtacttgctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 28260612  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||  | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  28260613 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 28260685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 28285403 - 28285231
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  28285403 atcagaggtacttgctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 28285304  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||  | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  28285303 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 28285231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Original strand, 28339262 - 28339434
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  28339262 atcagaggtacttgctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 28339361  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||  | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  28339362 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 28339434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19867626 - 19867480
Alignment:
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| | ||  |||||  | | | | ||| ||||||| |      
T  19867626 tactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctaccttgggccttgttatgtcttatatgaatgaa 19867527  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  19867526 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 19867480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 25115517 - 25115345
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   | ||    
T  25115517 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtactacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgcttcgg 25115418  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || ||| |||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  25115417 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 25115345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 119 - 196
Target Start/End: Original strand, 22829702 - 22829779
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgct 196  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  22829702 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgcgttattgct 22829779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Original strand, 16379710 - 16379762
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16379710 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 16379762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Original strand, 16647306 - 16647358
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16647306 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 16647358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 122
Target Start/End: Original strand, 20010758 - 20010821
Alignment:
Q  59 agaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatca 122  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20010758 agaactggagggaaggtattcgctttgactggtactcagactaccaacgaggatcgacttatca 20010821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16100959 - 16100907
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16100959 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactcatttttttat 16100907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 48 - 306
Target Start/End: Original strand, 39436 - 39694
Alignment:
Q  48 cgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 147  Q
    ||||||||  ||| || ||||| || ||||||||| ||||||||||||| || || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39436 cgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 39535  T
Q  148 tcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaa 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39536 tcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaa 39635  T
Q  248 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgtggtg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39636 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtg 39694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 174 - 300
Target Start/End: Original strand, 44656 - 44782
Alignment:
Q  174 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 273  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44656 gtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccaactaaggg 44755  T
Q  274 ttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  44756 ttcagtaactacttctcttgtttgtct 44782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 81 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5083 - 4870
Alignment:
Q  81 ctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 180  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5083 ctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgattaattagaggtacatgttattttgatagtatacctttagttgctattattgatactggtgctac 4984  T
Q  181 tcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagta 280  Q
     |||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| | | | ||  ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  4983 acattgttttatttctattgattgtgcttctaagttgggttttgttatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttagta 4884  T
Q  281 accacttctcttgt 294  Q
    || |||||||||||    
T  4883 actacttctcttgt 4870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 14554 - 14382
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | || || |  | |   ||||    
T  14554 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgctttattgctttcgattgcgtttctgctttgg 14455  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||| | |||| |||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  14454 gtcttgatttgtctggtatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 14382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 47 - 297
Target Start/End: Original strand, 5247 - 5497
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5247 ccgaagaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactacaaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 5346  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  5347 ctcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtatggatgtatctgatatgaaaagaga 5446  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  5447 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttg 5497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 45 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8818 - 8563
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 144  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8818 aaccgaagaaggttagtaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcatactactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 8719  T
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  8718 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttgtatctgatataaaagga 8619  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8618 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 8563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 47 - 298
Target Start/End: Original strand, 30428 - 30679
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30428 ccgaagaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagacaacaaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaaaagta 30527  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  30528 ctcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgatattgaatgtgcatataagttgggtttggttgtatctgatatgaaaggggt 30627  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30628 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 30679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 58 - 298
Target Start/End: Original strand, 67221 - 67461
Alignment:
Q  58 tagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatt 157  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67221 tagaactggtggaaaagtgtttgcattgactggtatgcagactaccaatgaggaccgactcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatt 67320  T
Q  158 gctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttg 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  67321 gctattattgatactggtgctactcattgttttattgccttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatccgatatgaaaggagaaatggttgttg 67420  T
Q  258 aaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  67421 aaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 67461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 45 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 325911 - 325656
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 144  Q
    |||| ||||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  325911 aaccaaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctttgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatat 325812  T
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  325811 tactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggg 325712  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  325711 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 325656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 84 - 298
Target Start/End: Original strand, 200607 - 200821
Alignment:
Q  84 tgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactca 183  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  200607 tgactggtacgcagacggttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactagtgctacaca 200706  T
Q  184 ttgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaacc 283  Q
    |||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| | | ||   |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  200707 ttgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaact 200806  T
Q  284 acttctcttgtttgt 298  Q
    |||||||| ||||||    
T  200807 acttctctcgtttgt 200821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 52 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 251819 - 251574
Alignment:
Q  52 gaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 151  Q
    |||| |||| || |||||| | |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  251819 gaaggctaggaccggtggggaagtgtttgcatggactggtacgcagactactaatgaggaccggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtacttct 251720  T
Q  152 ttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatgg 251  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  251719 ttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatgg 251620  T
Q  252 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  251619 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttg 251574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 186
Target Start/End: Original strand, 230026 - 230093
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattg 186  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  230026 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 230093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 45 - 300
Target Start/End: Original strand, 5309 - 5564
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 144  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5309 aaccgaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactactgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 5408  T
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  5409 tactcctttaattgctattatagacgctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctaatatgaaaggg 5508  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5509 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 5564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 45 - 300
Target Start/End: Original strand, 9872 - 10127
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 144  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || || | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9872 aaccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatag 9971  T
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  9972 tactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatttgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggg 10071  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  10072 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgtct 10127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 119 - 294
Target Start/End: Original strand, 24119 - 24294
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||   |||||| |    
T  24119 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttag 24218  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    || | | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  24219 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 24294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 45 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21018 - 20763
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 144  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| || || | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21018 aaccgaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactattgaggatctacttatcagaggtacttgtttctttaatag 20919  T
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  20918 tactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggtcgtatctgatatgaaaggg 20819  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20818 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 20763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 47 - 294
Target Start/End: Original strand, 589 - 836
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    |||||||||  |||||| | |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  589 ccgaagaaggttagaaccgatgggaaagtgtttgcattgactggtacacagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 688  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||| |  |  |||||||||||||||| ||    
T  689 ctcctttaattgctattatagaaactggtgctacacaatgtttaattgctatagaatgtgcatataagatgggtataaaaatatctgatatgaaaggaga 788  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  789 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 45 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29828 - 29573
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 144  Q
    |||||||||||  ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29828 aaccgaagaaggttaggacaggtggtaaggtgtttgctttgactggtacgcagacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 29729  T
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  29728 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcaatgtttgattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttgtatctgatatgaaagga 29629  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29628 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 29573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 45 - 298
Target Start/End: Original strand, 64702 - 64955
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 144  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  64702 aaccgaagaaggttagaactggtaggaaagtgtttgctttggctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatag 64801  T
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||||||||     
T  64802 tactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcgtataagttgaatttgattgtatctgatatgaaagga 64901  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  64902 gaaatggctgttgaaactccagcaaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 64955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 45 - 298
Target Start/End: Original strand, 49280 - 49533
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 144  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49280 aaccgaagaaggttagaactggtaggaaagtgtttgctttggctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatag 49379  T
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||||||||     
T  49380 tactcctttaattgctattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagaatgtgcgtataagttgaatttgattgtatctgatatgaaagga 49479  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49480 gaaatggctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 49533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 45 - 298
Target Start/End: Original strand, 58314 - 58567
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 144  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  58314 aaccgaagaaggttagaactggtaggaaagtgtttgctttggctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatag 58413  T
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||||||||     
T  58414 tactcctttaattgctattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagaatgtgcgtataagttgaatttgattgtatctgatatgaaagga 58513  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  58514 gaaatggctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 58567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 45 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 787 - 532
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 144  Q
    |||||||||||  ||| |  ||||| || ||||||||| ||||||||||||| || || | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  787 aaccgaagaaggttaggatcggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtaaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 688  T
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  687 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggg 588  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  587 gaaatggttgttgaaactccatctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 48 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 263427 - 263177
Alignment:
Q  48 cgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 147  Q
    ||||||||  ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  263427 cgaagaaggttagaactagtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacaggcttattagaggtacttgtttctttaatagtac 263328  T
Q  148 tcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaa 247  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  263327 tcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaa 263228  T
Q  248 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  263227 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 263177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 48 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 203582 - 203332
Alignment:
Q  48 cgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 147  Q
    ||||||||  ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  203582 cgaagaaggttagaactagtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacaggcttattagaggtacttgtttctttaatagtac 203483  T
Q  148 tcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaa 247  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  203482 tcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaa 203383  T
Q  248 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  203382 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 203332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 424438 - 424266
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    || ||||  | |   |||     
T  424438 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcctacgattgtgtttctgctttga 424339  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  424338 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 424266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 45 - 300
Target Start/End: Original strand, 8562 - 8817
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 144  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8562 aaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 8661  T
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    || |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||     
T  8662 taatcctttaattgctattatagacactagtgctactcaatgtttcattgctatcgaatgtgcttataagttaggtctggttgtatctgatatgaaagga 8761  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  8762 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtct 8817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 45 - 300
Target Start/End: Original strand, 18776 - 19031
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 144  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18776 aaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 18875  T
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    || |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||     
T  18876 taatcctttaattgctattatagacactagtgctactcaatgtttcattgctatcgaatgtgcttataagttaggtctggttgtatctgatatgaaagga 18975  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18976 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtct 19031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 47 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 40260 - 40013
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    |||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40260 ccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgtcttattagaggtacttgtttctttaatagta 40161  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||    
T  40160 ctcctttaattgctattatagacacaggtgctactcattgttttattgctttagaaagtgcatataagttggggttgattgtatctgatatgaaaggaga 40061  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  40060 aatggttgttgaaactccagccaagggtttagtaactacttctcttgt 40013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 74 - 294
Target Start/End: Original strand, 17478 - 17698
Alignment:
Q  74 gtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 173  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||    |||||||| ||  | ||||||||||||||||   |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  17478 gtgtttgctttaactggtacacagacagaaaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatacacctttagttgctattattgatacag 17577  T
Q  174 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 273  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||  ||| |||||   |||||||||| |     |  |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17578 gtgctacgcattgtttcatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttatcatgcctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaaggg 17677  T
Q  274 ttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
     ||  | || |||||||||||    
T  17678 ctcgctgactacttctcttgt 17698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 62 - 296
Target Start/End: Original strand, 932 - 1166
Alignment:
Q  62 actggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgcta 161  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  932 actggtggtaaggtgtttgctttgaccggtacgcaaacaactaatgaggacagacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcccttaattgcta 1031  T
Q  162 ttattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaac 261  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1032 ttatagacactagtgctactcattgttttattgctattgattgtgcatataagttgggtctggctgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaac 1131  T
Q  262 tccagctaagggttcagtaaccacttctcttgttt 296  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1132 tccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 1166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 50 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 7237 - 6987
Alignment:
Q  50 aagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactc 149  Q
    ||||||| ||| || ||||| || ||||||||| | ||||| ||||| || || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7237 aagaagattaggaccggtggtaaagtgtttgctctaactggcacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactc 7138  T
Q  150 ctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaat 249  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  7137 ctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggttgtttctgatatgaaaggggaaat 7038  T
Q  250 ggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  7037 ggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtct 6987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 74 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22297 - 22071
Alignment:
Q  74 gtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 173  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22297 gtgtttgcattgactggtactcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattggtattatagatactg 22198  T
Q  174 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 273  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  22197 gtgttactcattgtttcattgctattgaatgtgcatatatgttgggtttggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactttagctaagtg 22098  T
Q  274 ttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22097 ttcagtaactacttctcttgtttgtct 22071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 47 - 300
Target Start/End: Original strand, 98685 - 98938
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    |||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| || || || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  98685 ccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctctgactggtacacaaaccactagtgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagta 98784  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| || ||    
T  98785 ctcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattactattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctaatatgaagggaga 98884  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  98885 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtct 98938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 176171 - 175939
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  176171 ggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaataaagaccgacttatcagaggtacttatttcttta-tagtactcctttaattgctatta 176073  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  176072 tagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactcc 175973  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  175972 agctaagggttcactaactacttctcttgtttgt 175939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 47 - 294
Target Start/End: Original strand, 17586 - 17833
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17586 ccgaagaaggttagaactggtgggaaaatgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggatcgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagta 17685  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||| |||||| | ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  17686 ctcctttaattgctattatagacattggtgctacttattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggaga 17785  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  17786 aatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgt 17833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 58 - 294
Target Start/End: Original strand, 4962 - 5198
Alignment:
Q  58 tagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatt 157  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4962 tagaaccggtggaaaagtgtttgctttgactatgacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatactactcctttaatt 5061  T
Q  158 gctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttg 257  Q
    | |||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5062 gatattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttg 5161  T
Q  258 aaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  5162 aaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgt 5198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 47 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 11179 - 10928
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    ||||||||| |||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11179 ccgaagaaggctaggaccggagggaaggtgtttgcgttgactggtacgcagactattaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 11080  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  | | ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  11079 ctcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatttttttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggaga 10980  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10979 aatacttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 10928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 45 - 300
Target Start/End: Original strand, 954 - 1209
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 144  Q
    |||||| ||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||| || || | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  954 aaccgaggaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctttgactggtatgcaaaccactagtgaggatcgaattatcagaggtacttgtttctttaatag 1053  T
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||     
T  1054 tactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatatgatatgaaagga 1153  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  1154 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtct 1209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 45 - 300
Target Start/End: Original strand, 983 - 1238
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 144  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983 aaccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctttgaccggtacgcaaacaactaatgaggacagacttatcagaggtacttgtttctttaatag 1082  T
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||     
T  1083 tactcctttaattgctattatagctactggtgctactcattatttcattgttgttgattgtgcgcataagttgggtctgattgtatctgatatgaaagga 1182  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1183 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 1238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 45 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 151771 - 151516
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 144  Q
    |||||||||||  ||| || ||||| || ||||||||| ||||||||||||| || || | ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  151771 aaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggacaggcttattagaggtatttgtttctttaatag 151672  T
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  151671 tactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggttgtatcttatatgaaagga 151572  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  151571 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 151516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Original strand, 23665 - 23882
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    |||||||| |   | ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23665 tttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcatttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtg 23764  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23765 ctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 23864  T
Q  277 agtaaccacttctcttgt 294  Q
     || || |||||||||||    
T  23865 ggtgactacttctcttgt 23882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Original strand, 73792 - 73844
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73792 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattgttttat 73844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Original strand, 78173 - 78225
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78173 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattgttttat 78225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 182099 - 182047
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  182099 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 182047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 185
Target Start/End: Original strand, 175708 - 175753
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcatt 185  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  175708 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 175753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 49 - 294
Target Start/End: Original strand, 6361 - 6606
Alignment:
Q  49 gaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtact 148  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6361 gaagaaggttagaactggtggaaaggtatttgctttgactggtacacagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctataatagtact 6460  T
Q  149 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaa 248  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  6461 cctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaa 6560  T
Q  249 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  6561 tggttgttgaaactccggctaagggttcagtgactacttctcttgt 6606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Original strand, 65418 - 65651
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  65418 ggtggaaaagtgtatgcattgactggtacgcagactaccaatgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtacacctttaattgctatta 65517  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  65518 tagacactggtgctactcattgtttccttgctttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 65617  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  65618 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 65651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 123
Target Start/End: Original strand, 62892 - 62950
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcag 123  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||    
T  62892 ggtggcaaagtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcag 62950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 47 - 296
Target Start/End: Original strand, 164503 - 164752
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    |||||||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  164503 ccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgaccggtacgtagactactagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 164602  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||    
T  164603 ctcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgccattgaatgtgcttataagttgggtctggttatatctgataagaaagggga 164702  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgttt 296  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||    
T  164703 aatggttgttgaaactccagcaaatggttcaataactacttctcttgttt 164752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Original strand, 47115 - 47331
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||   || ||||| ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||    
T  47115 tttgcattgactggtactcagactgagaacgaggatcgctttatcagaggtacttgttattttaatagtacacctttagttactattattgattctggtg 47214  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||   |||||||||| |   | | ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  47215 ctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtctttctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccatctaa-ggttc 47313  T
Q  277 agtaaccacttctcttgt 294  Q
     || || |||||||||||    
T  47314 ggtgactacttctcttgt 47331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 80 - 291
Target Start/End: Original strand, 30709 - 30920
Alignment:
Q  80 gctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgcta 179  Q
    |||||||||||||| ||||||   |||||||| ||  | ||||||||  | ||||   || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30709 gctttgactggtactcagactgagaatgaggatcgcttgatcagaggagcatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 30808  T
Q  180 ctcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagt 279  Q
    | ||||||||||||||| |||| ||||| | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  30809 cgcattgttttattgcttttgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 30908  T
Q  280 aaccacttctct 291  Q
     || ||||||||    
T  30909 gactacttctct 30920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 152100 - 152036
Alignment:
Q  230 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  152100 tctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 152036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 66 - 298
Target Start/End: Original strand, 63640 - 63872
Alignment:
Q  66 gtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  63640 gtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcttttaattgctattat 63739  T
Q  166 tgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcca 265  Q
     |||||||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  63740 agatactggtgttactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 63839  T
Q  266 gctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  63840 gctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 63872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 65 - 300
Target Start/End: Original strand, 1431 - 1666
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| || ||||| || |||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1431 ggtggtaaagtgttcgcgttgactggcatgcagactactagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 1530  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  1531 tagatactggtgctactcattgtttcattgctattgactgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatacgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 1630  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  1631 agctaagggttcggtaattacttctcttgtttgtct 1666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 65 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 7928 - 7693
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| || ||||| || |||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7928 ggtggtaaagtgttcgcgttgactggcatgcagactactagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 7829  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  7828 tagatactggtgctactcattgtttcattgctattgactgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatacgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 7729  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  7728 agctaagggttcggtaattacttctcttgtttgtct 7693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 47 - 298
Target Start/End: Original strand, 9889 - 10139
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    |||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9889 ccgaagaaggttagaactggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgat-ataggcttatcagaggtacttgtttctttaatagta 9987  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  9988 ctcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggaga 10087  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10088 aatggttgttgaaactccagctaagggtacagtaactacttctcttgtttgt 10139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 65 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 50289 - 50054
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50289 ggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 50190  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||  | | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  50189 tagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttggggctagttgtatctgatatgaaaggagaaattgttgttgaaactcc 50090  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50089 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 50054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 77 - 300
Target Start/End: Original strand, 94026 - 94249
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  94026 tttgctttgactggtacgcagactactaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 94125  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94126 ctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgcttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 94225  T
Q  277 agtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||||| |||||||| || |||||    
T  94226 agtaactacttctctggtgtgtct 94249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 115766 - 115513
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 144  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||| |||||||| ||| |||||| ||| || || ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  115766 aaccgaagaaggttaggaccggtgggaaagtgtttgccttggctggtatgcaaaccacaaatgaagatagacttatcagaggtacttgtttctttaatag 115667  T
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | || ||||| |||||  | ||||||  ||||||||||||||||||     
T  115666 tatccctttaattgctattatagatactggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcatataaactaggtttgattgtatctgatatgaaagga 115567  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  115566 gaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgt 115513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 74 - 300
Target Start/End: Original strand, 9356 - 9582
Alignment:
Q  74 gtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 173  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  9356 gtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttcattaatagtactcctttaattgctattatagacactg 9455  T
Q  174 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 273  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9456 gtgctactcattgtttcattgctattgaatgtacttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaacgggaaatagttgttgaaactccagctaaggg 9555  T
Q  274 ttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  9556 ttcagtaactacttctcttgtttgtct 9582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 47 - 297
Target Start/End: Original strand, 53525 - 53775
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    |||||||||  |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53525 ccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtatttgcattgactggtacgcagactactaatgaggaccaacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 53624  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||| |||||||| |||||   ||||||||| |||||||| ||    
T  53625 ctcctttaattgctattatagaaactggtgctactcattgtttcaatgctatagaaagtgcatataagttaggtttaattgtatctgaaatgaaaggaga 53724  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  53725 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 53775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12911 - 12678
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12911 ggtggcaaggtgtttgcgttaactggtacgcaaacggtgaatgaggaccaacttatcaggggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 12812  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12811 tagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 12712  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12711 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 12678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 47 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 37141 - 36888
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    |||||||||  ||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| || || ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37141 ccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgttttctttgaccggtacgcaaacaactaatgaagacagacttatcataggtacttgtttctttaatagta 37042  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  37041 ctcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgatgttgattgtgcatacaagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggaga 36942  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  36941 aatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtct 36888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 50 - 298
Target Start/End: Original strand, 650 - 898
Alignment:
Q  50 aagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactc 149  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  650 aagaagattagaaccggtgggaaagtgtttgcgttgactggtacgcagactactaatgaggacaagcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactc 749  T
Q  150 ctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaat 249  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||    
T  750 ctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagagat 849  T
Q  250 ggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  850 ggttgttgaaacttcagctaagggttcagtgactacttcccttgtttgt 898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 10916 - 10744
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||    
T  10916 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgttattgattgtgctactaagttgg 10817  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | | | | ||| ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  10816 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 10744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 156; Significance: 7e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 45 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 42902 - 42647
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 144  Q
    |||| ||||||| ||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42902 aacctaagaagattaggacaggtggcaaggtgtttgctttcactggtgcgcaaacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 42803  T
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  42802 tactcctttatttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgtagttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagga 42703  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  42702 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtct 42647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 291
Target Start/End: Original strand, 50504 - 50691
Alignment:
Q  104 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 203  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |    
T  50504 aatgaggatcgcctgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 50603  T
Q  204 gtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    |||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  50604 gtgcttctaccttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 50691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12144 - 11911
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12144 ggtggcaaggtatttgcgttgactggtacgcaaactgtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 12045  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| | | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  12044 tagatactggcgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactcc 11945  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11944 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 11911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1253 - 1069
Alignment:
Q  116 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  1253 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagt 1154  T
Q  216 tgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1153 tgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaattgttgttgaaactccagttaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 1069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 91 - 298
Target Start/End: Original strand, 1 - 208
Alignment:
Q  91 tacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttt 190  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  1 tacgcaaacaactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatacgggtgctactcattgtttc 100  T
Q  191 attgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctc 290  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  101 attgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctc 200  T
Q  291 ttgtttgt 298  Q
    ||||||||    
T  201 ttgtttgt 208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 45 - 300
Target Start/End: Original strand, 2052 - 2307
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 144  Q
    |||||||||||  ||| || ||||| || ||||||||| |||||||||||||  | || | |||| |    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2052 aaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaacccactagtgagaagatgcttatcagaggtacttgtttctttaatag 2151  T
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  2152 tattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgttcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggg 2251  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2252 gatatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 2307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 59 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 70562 - 70323
Alignment:
Q  59 agaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 158  Q
    |||||||| || || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70562 agaactggaggaaaagtatttgttttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 70463  T
Q  159 ctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttga 258  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||  ||||| | |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  70462 ctattatagacactggtgttactcattgtttctttgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaattgttgttga 70363  T
Q  259 aactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  70362 aactctagccaagggttcagtaactacttctctagtttgt 70323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 65 - 291
Target Start/End: Original strand, 4424 - 4650
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4424 ggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcagacggtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaatttctatta 4523  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||  || | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4524 tagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtcgggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactcc 4623  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4624 agctaagggttcagtaactacttctct 4650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Original strand, 1392 - 1625
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1392 ggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgaaaactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 1491  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||| | || | ||||| |||||||||||| ||  | | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  1492 tagatactggtgctacacattgtttcattgttgttaattgtgcatataagttgggtctgattatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactcc 1591  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  1592 agctaagggttcagtaattacttctcttgtttgt 1625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 29711 - 29478
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29711 ggtggcaaggtgtttgctctgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 29612  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | |||||| |||||||||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||| ||| | | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  29611 tagatactagtgctactcattgtttcattgcagttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactcc 29512  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  29511 agctaagggttcagtaactacttcacttgtttgt 29478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Original strand, 28405 - 28638
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28405 ggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgaaaactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 28504  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||| | || | ||||| |||||||||||| ||  | | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  28505 tagatactggtgctacacattgtttcattgttgttaattgtgcatataagttgggtctgattatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactcc 28604  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  28605 agctaagggttcagtaattacttctcttgtttgt 28638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Original strand, 43539 - 43772
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43539 ggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 43638  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| | | ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  43639 tagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggaaaaatggttgttgaaactcc 43738  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  43739 agctaagggtttagtaactacttctcttgtttgt 43772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 104 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15268 - 15072
Alignment:
Q  104 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 203  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15268 aatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttcttttatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaat 15169  T
Q  204 gtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  15168 gtgcatataagttgggtttgattgtatttgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagcaactacttctctagtttgtct 15072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 6288 - 6071
Alignment:
Q  74 gtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 173  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||    |||||||| ||  | || |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6288 gtgtttggtttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactg 6189  T
Q  174 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 273  Q
     |||||| |||||||||| ||||||| | ||||| | |||||||||| |   | | ||  |||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||    
T  6188 atgctacgcattgttttaatgctatttattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcgaatatgaaaggagagatgattgtcgaaactccagctaaggg 6089  T
Q  274 ttcagtaaccacttctct 291  Q
    ||| || || ||||||||    
T  6088 ttcggtgactacttctct 6071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 74 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 54222 - 53996
Alignment:
Q  74 gtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 173  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  54222 gtgtttgctttcactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactg 54123  T
Q  174 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 273  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54122 gtgttactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgtgtctggttgtatctgatatgaatgtagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 54023  T
Q  274 ttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||    
T  54022 ttcattaactacttctcttgtgtgtct 53996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 47 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 34539 - 34286
Alignment:
Q  47 ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 146  Q
    |||||||||  ||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34539 ccgaagaaggttaggacaggtggaaaggtgtttgccttgactggtacgcaaacagttaatgaggaccgacttattagaggtacttgtttctttaatagta 34440  T
Q  147 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 246  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||    
T  34439 ctcctttaactgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgaatatgtatataagttgggtccggttgtatctgatatgaaagtgga 34340  T
Q  247 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  34339 aatggttgttgaaattccagctaagggttcagtagctatttctcttgtttgtct 34286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 65 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5365 - 5130
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5365 ggtggcaaggtttttgcgttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctatta 5266  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5265 tagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 5166  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  5165 agctgaggtttcagtaactatttctcttgtttgtct 5130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 45 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6009 - 5754
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 144  Q
    |||||||||||  ||| || ||||| || ||||||||| | |||| |||||| || || |  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6009 aaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctaactgatacgcaaaccactagcgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatag 5910  T
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||      
T  5909 tactcctttaattgttattatagatactagtgctactcattgtttcattgctatttaatgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagaa 5810  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5809 gaaatggttgttgaaactccagctatgggttcagtaactacttctcttgtttgtct 5754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 289
Target Start/End: Original strand, 41229 - 41452
Alignment:
Q  66 gtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 165  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||| |||||  | |||||||| |  || ||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  41229 gtgggatggtgtttgctttagctggtactcagacagcgaatgaggatcatctgatcagaggtacatgttacattaatagtactcccttaattactattat 41328  T
Q  166 tgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcca 265  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||  |  || |||||| | | | | ||   |||||| |||||||||||||| |||||| |     
T  41329 agatactggtgctacacattgttttattgctgctgattgtgtttcgaaattgggtcttgttatgtcatctatgaatggggaaatggttgtcgaaacttcg 41428  T
Q  266 gctaagggttcagtaaccacttct 289  Q
    ||||||||||| || || ||||||    
T  41429 gctaagggttcggtgactacttct 41452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1056 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold1056
Description:

Target: scaffold1056; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 1905 - 1672
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1905 ggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacggtgaatgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 1806  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| | | ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  1805 tagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttcttgaaactcc 1706  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  1705 agctaagggttcagtaactacttcttttctttgt 1672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 65 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 70292 - 70079
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  70292 ggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacggtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctatta 70193  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| | | | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  70192 tagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactcc 70093  T
Q  265 agctaagggttcag 278  Q
    ||||||||||||||    
T  70092 agctaagggttcag 70079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 131 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 60857 - 60690
Alignment:
Q  131 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtat 230  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| | | | |||    
T  60857 tgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttatat 60758  T
Q  231 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  60757 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 60690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 104 - 300
Target Start/End: Original strand, 20687 - 20883
Alignment:
Q  104 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 203  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  20687 aatgaggaccgacttatcaaagctacttgtttctttcatagtactcctttaaatgttattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 20786  T
Q  204 gtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20787 gtgcatataaattgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 20883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 104 - 300
Target Start/End: Original strand, 12507 - 12703
Alignment:
Q  104 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 203  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  12507 aatgaggaccgacttatcaaagctacttgtttctttcatagtactcctttaaatgttattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 12606  T
Q  204 gtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||| ||||| |||| | ||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12607 gtgcatataaattggatctggttgtatcaaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 12703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 134; Significance: 9e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 48 - 257
Target Start/End: Original strand, 9124 - 9333
Alignment:
Q  48 cgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 147  Q
    ||||||||  ||| || ||||| || ||||||||| ||||||||||||| || || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9124 cgaagaaggttaggaccggtggtaatgtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 9223  T
Q  148 tcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaa 247  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  9224 tcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtcaggttgtatctgatatgaaaggggaa 9323  T
Q  248 atggttgttg 257  Q
    ||||||||||    
T  9324 atggttgttg 9333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 170
Target Start/End: Original strand, 11827 - 11968
Alignment:
Q  29 agtacacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggta 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11827 agtacacagtgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactaccagtgaggaccgacttatcagaggta 11926  T
Q  129 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgata 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11927 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgata 11968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 122 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 2998 - 2822
Alignment:
Q  122 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| | |||  ||||| ||||||||||||     
T  2998 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggggctactcattgtttcattgttgttgcttgtgcatataagttgggtc 2899  T
Q  222 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2898 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 2822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 5624 - 5562
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggt 127  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||    
T  5624 ggtggcaaagtgtttgcgttgactggtacgcaaacggtgaatgaggaccgacttatcagaggt 5562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 112 - 298
Target Start/End: Original strand, 1 - 187
Alignment:
Q  112 ccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctat 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||| | ||| |||| |||    
T  1 ccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctattcattgtttcattgctttagaaagtgcatat 100  T
Q  212 aagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  101 aagttgagtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggtttagtaactacttctcttgtttgt 187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 104 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 5747 - 5553
Alignment:
Q  104 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||  |    
T  5747 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgttt 5648  T
Q  204 gtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
     ||| |||||||||||| ||| | | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  5647 atgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttatttgt 5553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 104 - 298
Target Start/End: Original strand, 4248 - 4442
Alignment:
Q  104 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  4248 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 4347  T
Q  204 gtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||| |||||||||||| |   | | ||   |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  4348 gtgcatataagttgggtctacttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcttttgtttgt 4442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12012 - 11781
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12012 ggtggaaaggtgtttgcattgactggtacgcagacaattaatgaggaccgacttattagagatacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 11913  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    | ||   ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||  || | |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  11912 tagaccatggtgctacacattgtttcattgctattgattgtgcatataagttgggtctgattg--tcaggtatgagtggagaaatggttgttgaaactcc 11815  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  11814 agctaagggttcaataactacttctcttgtttgt 11781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 114; Significance: 8e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 19069 - 19262
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 144  Q
    |||||||||||  ||| || ||||| || ||||||||| ||||||||||||| || || | ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19069 aaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggacaggcttatcagaggtgcttgtttctttaatag 19168  T
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatg 238  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19169 tactcctttaattactattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggttgtatctgttatg 19262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 132 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 110727 - 110559
Alignment:
Q  132 gtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| ||| ||    
T  110727 gtttctttaatagtactcctttaattgctgttatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtgtc 110628  T
Q  232 tgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  110627 tgatatgaaaggagaaatggttgttaaaactccggctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 110559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 50 - 223
Target Start/End: Original strand, 1953 - 2126
Alignment:
Q  50 aagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactc 149  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1953 aagaagattagaaccggtgggaaagtgtttgctttgactagtacgcagactgctattgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactc 2052  T
Q  150 ctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttg 223  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||||    
T  2053 ctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagagtgtgcatataagttgggtttg 2126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1426 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold1426
Description:

Target: scaffold1426; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 170
Target Start/End: Original strand, 1688 - 1832
Alignment:
Q  26 atcagtacacagcgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagag 125  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||  ||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1688 atcagttcacagtgtcccgaaccgaagaaggttagaactgggggcaaagtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagag 1787  T
Q  126 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgata 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1788 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgata 1832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Original strand, 4012 - 4242
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  4012 ggtggaaaggtgtttgcattgaccggtacacagacggttaatgaggaccgacttataagaggtacttgtttctttaatagtactc---taattgctatta 4108  T
Q  165 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 264  Q
    |||| ||||||||||| | |||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| | | ||   |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  4109 ttgacactggtgctacactttgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactcc 4208  T
Q  265 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4209 agctaagggttcagtaactacttatcttgtttgt 4242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 291
Target Start/End: Original strand, 7972 - 8125
Alignment:
Q  138 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 237  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || |  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  7972 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttttgattgggtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 8071  T
Q  238 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    ||| || || |||||||| ||||||||||||||  |||| || || ||||||||    
T  8072 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaacgttcggtgactacttctct 8125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 154 - 298
Target Start/End: Original strand, 49086 - 49230
Alignment:
Q  154 aattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggtt 253  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  49086 aattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgatgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggtt 49185  T
Q  254 gttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49186 gttgaaaatcaagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 49230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2165 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold2165
Description:

Target: scaffold2165; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 162
Target Start/End: Original strand, 897 - 1020
Alignment:
Q  39 gtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctt 138  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  897 gtcctgaaccgaagaaggttagaactaggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagtctaccaatgaggaccaacttatcagaggtacttgtttctt 996  T
Q  139 taatagtactcctttaattgctat 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  997 taatagtactcctttaattgctat 1020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1517 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1517
Description:

Target: scaffold1517; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 68 - 165
Target Start/End: Original strand, 1610 - 1707
Alignment:
Q  68 gggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 165  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1610 gggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 1707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 122 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18005 - 17833
Alignment:
Q  122 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtt 221  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||     
T  18005 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctgttgattgtgcgtctaagttgggtc 17906  T
Q  222 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    |   | | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||||||    
T  17905 ttactatgtcgaatatgaatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgt 17833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 77 - 275
Target Start/End: Original strand, 111039 - 111237
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||  || ||||||   |||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  111039 tttgctttgactgaaactcagactgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttattttaatagtacacctttagttgctattattgatactggtg 111138  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggtt 275  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||   |||||||||| | | | | ||  ||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  111139 ctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagtgatggttgtcgaaactccagctaagggtt 111237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5276 - 5037
Alignment:
Q  61 aactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgct 160  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||  | || |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  5276 aactagtgggaaagtgtttgctttgactggtacgcagacattgaataaggaccggttgattagaggtacatgttactttgatagtactcttttaattgct 5177  T
Q  161 attattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaa 260  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||| | | | | |   ||||||| || || ||||| || ||||    
T  5176 attattgatactggtgctacgcattgttttattggtgttgattgtgcttctaagttgggtcttgttatgttaaatatgaatggagatatggtcgtcgaaa 5077  T
Q  261 ctccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| || |||||    
T  5076 ctccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtct 5037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Original strand, 14398 - 14615
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||| ||  | ||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14398 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttactttgatattactcctttaatagcttttattgatactggtg 14497  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||   |||||||||| | | | | ||  ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14498 ctacacattgttttatttctattgattgtgctcctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 14597  T
Q  277 agtaaccacttctcttgt 294  Q
     || || |||||||||||    
T  14598 ggtgactacttctcttgt 14615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Original strand, 216552 - 216769
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||| | | | ||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  216552 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcaattgatcagaggtacatgttactttgatagtactactttaattgctattattgatactggtg 216651  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||| | |  ||||| ||| | | | | ||  ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  216652 ctacacattgttttattgttattgattgtacttcaaagttaggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtagaaactccagctaagggttc 216751  T
Q  277 agtaaccacttctcttgt 294  Q
     || || |||||||||||    
T  216752 ggtgactacttctcttgt 216769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2062 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold2062
Description:

Target: scaffold2062; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 189
Target Start/End: Original strand, 977 - 1121
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 144  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  977 aaccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacaactagtaaggacagacttatcagaggtacttgtttctttaataa 1076  T
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttt 189  Q
    ||| ||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||    
T  1077 tacgcctttaattgctattatagacactagtgttactcattgttt 1121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 289
Target Start/End: Original strand, 15111 - 15323
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15111 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtactcctttagttgctattattaatactggtg 15210  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||| |   | | ||  ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15211 ctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcaaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttc 15310  T
Q  277 agtaaccacttct 289  Q
     || || ||||||    
T  15311 ggtgactacttct 15323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 74 - 294
Target Start/End: Original strand, 13608 - 13828
Alignment:
Q  74 gtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 173  Q
    |||||||||||||||||||| || ||    |||||||| ||  | ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13608 gtgtttgctttgactggtacacaaacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattg 13707  T
Q  174 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 273  Q
     |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |    
T  13708 atgctacacattgttctattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagag 13807  T
Q  274 ttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    ||| || || |||||||||||    
T  13808 ttcggtgactacttctcttgt 13828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 154 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21946 - 21802
Alignment:
Q  154 aattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggtt 253  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| | || ||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||     
T  21946 aattgctattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagagtgtgcatataaattgggtttgattatatctgatatgaaaggagaaatggtc 21847  T
Q  254 gttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21846 gttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgt 21802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 119 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4564 - 4389
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   ||||||||    
T  4564 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 4465  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    || | | | | ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||| || || |||||||||||    
T  4464 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccatctaagggttcggtgactacttctcttgt 4389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 147 - 1
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   ||||||||    
T  147 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 48  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcca 265  Q
    || | | | | ||| ||||||| || || |||||||| |||||||||    
T  47 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactcca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 51835 - 51716
Alignment:
Q  65 ggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 164  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |   ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51835 ggtggcaaggtgtttactttgactggtacgcagattgtgaatgaggactgacttatcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctatta 51736  T
Q  165 ttgatactggtgctactcat 184  Q
    | |||||| |||||||||||    
T  51735 tagatactcgtgctactcat 51716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7045 - 6828
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||  | ||||||||||| ||||  | | || |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  7045 tttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattgtgatcgtactcctttaactgttattattgatactggtg 6946  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  6945 ctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttt 6846  T
Q  277 agtaaccacttctcttgt 294  Q
     || || |||||||||||    
T  6845 ggtgactacttctcttgt 6828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14175 - 13958
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||  | ||||||||||| ||||  | | || |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14175 tttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattgtgatcgtactcctttaactgttattattgatactggtg 14076  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  14075 ctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttt 13976  T
Q  277 agtaaccacttctcttgt 294  Q
     || || |||||||||||    
T  13975 ggtgactacttctcttgt 13958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Original strand, 55602 - 55819
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||   || ||||| ||  | ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  55602 tttgcattgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtg 55701  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||   |||||||||| |   | | ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55702 ctacgcatttttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttactatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 55801  T
Q  277 agtaaccacttctcttgt 294  Q
     || || |||||||||||    
T  55802 ggtgactacttctcttgt 55819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Original strand, 23430 - 23647
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||||||| || |    |||||||| ||| | ||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  23430 tttgctttgactggtacgaaggcacagaatgaggatcgattaatcagaggtacgtgttattttgatagtactcctttagttgctattattgataatagtg 23529  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||  |||| | |||||||||| | | | | ||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23530 ctacgcattgttttattgctcttgatagtgcttctaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttc 23629  T
Q  277 agtaaccacttctcttgt 294  Q
     |  || |||||||||||    
T  23630 ggcgactacttctcttgt 23647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 300
Target Start/End: Original strand, 9480 - 9706
Alignment:
Q  74 gtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 173  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||| | || |||||||| |||   ||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  9480 gtgtttgctttgactggtacacagatagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgtcattttgaaagtactcctttagttgatattattgatactg 9579  T
Q  174 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 273  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||| |     | ||  ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9580 gtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttacaatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaaggg 9679  T
Q  274 ttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    ||| || || |||||||| || |||||    
T  9680 ttcggtgactacttctctagtgtgtct 9706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 77 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15582 - 15442
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||||||||| ||    |||||||| ||| | ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15582 tttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgattgatcagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattggtg 15483  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttg 217  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  15482 ctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttg 15442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15437 - 15377
Alignment:
Q  234 atatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| || || |||||||||||    
T  15437 atatgaaaggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgt 15377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 66 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 2182 - 1959
Alignment:
Q  66 gtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 165  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||  |||||  | |||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2182 gtgggaaggtgttttctttagctggtaatcagacagcgaatgaggatcgtctaatcagaggtacatgtttcattaatagtactcctttaattactattat 2083  T
Q  166 tgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcca 265  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||   |||||||||| |   | | ||  ||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  2082 agatactggtgctacgcattgttttattgttgctgattgtgctactaagttgggtcttattatgtcatatatgaatggggaaatggttgtcgaaacccca 1983  T
Q  266 gctaagggttcagtaaccacttct 289  Q
    ||||||||||| || || ||||||    
T  1982 gctaagggttcggtgactacttct 1959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Original strand, 2395 - 2612
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||| |||||||||| |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2395 tttgctctgactggtacacagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatacacctttagttgctattattgatactggtg 2494  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| |||| ||||||||||  |||||||||   |||||||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2495 ctacgcattcttttattgcttatgaatgtgctactaagttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagacatggttgtcgaaactccagctaagggttc 2594  T
Q  277 agtaaccacttctcttgt 294  Q
     || || |||||||||||    
T  2595 ggtgactacttctcttgt 2612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Original strand, 57746 - 57963
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||  ||  | ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  57746 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggctcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtg 57845  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||| ||| | | | | ||  ||||||| ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  57846 ctacacattgttttattgttattgattgtgcttctaagttaggtcttgctatgtcgaatatgaatggaaagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 57945  T
Q  277 agtaaccacttctcttgt 294  Q
     || || |||||||||||    
T  57946 ggtgactacttctcttgt 57963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 74 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 8585 - 8365
Alignment:
Q  74 gtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 173  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    || |||||  |  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8585 gtgtttgctttgactggtacacagacagagaacgaggattgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactg 8486  T
Q  174 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 273  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||| |||||   |||||||||| | |   | ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8485 gtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagttaaggg 8386  T
Q  274 ttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    ||| || || |||||||||||    
T  8385 ttcggtgactacttctcttgt 8365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3723 - 3524
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||   || ||||| ||  | ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  3723 tttgcattgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctatcattgatactggtg 3624  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||   |||||||||| | | | | ||| ||||||| || || |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3623 ctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttc 3524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0605
Description:

Target: scaffold0605; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 59 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 1470 - 1364
Alignment:
Q  59 agaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 158  Q
    |||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  1470 agaacttgagggaaggtattcgctttgactggtacacagactaccaacgaggatcgacttatcagaggtacttgtttcttgaatagtactcctttaatag 1371  T
Q  159 ctattat 165  Q
    |||||||    
T  1370 ctattat 1364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14193 - 14039
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatga 239  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||   |||||||||| | | | | ||||||||||    
T  14193 aatagtacacctttagttgctattattgatagtggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctgatatga 14094  T
Q  240 aaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    | || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  14093 atggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 14039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11394 - 11293
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||    
T  11394 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 11295  T
Q  219 gt 220  Q
    ||    
T  11294 gt 11293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 25287 - 25235
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25287 aatagtactcctttaattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 25235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 8395 - 8178
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    || ||||| ||  | ||||||||||||||||  | | ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||    
T  8395 tttgctttgactggtacacagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattgtgatagtacgcctttagttgctattattgatactagtg 8296  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||   | ||| |||  | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8295 ctacacattgttttattgcttttgattgtgctacttagtcgggacttgatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 8196  T
Q  277 agtaaccacttctcttgt 294  Q
     || || |||||||||||    
T  8195 ggtgactacttctcttgt 8178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Original strand, 10332 - 10504
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| | ||  ||||    
T  10332 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgccacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 10431  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || |  || | |||| |||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10432 gtctacatatgtctggtatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctct 10504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Original strand, 29102 - 29274
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | ||  ||||    
T  29102 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgataatggtgctacgcattgatttattgctttcgattgtgtttctactttgg 29201  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||| ||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  29202 gtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 29274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 36628 - 36456
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | || ||||  | ||  ||||    
T  36628 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttcattgctttcgattgtgtttctactttgg 36529  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  36528 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 36456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Original strand, 17240 - 17412
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | ||  ||||    
T  17240 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgg 17339  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  17340 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 17412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 291
Target Start/End: Original strand, 194997 - 195184
Alignment:
Q  104 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 203  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||   || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |    
T  194997 aatgaggatcgcctgattagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 195096  T
Q  204 gtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    |||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||  || || || ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  195097 gtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgattggagagatagttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 195184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 24489 - 24264
Alignment:
Q  66 gtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 165  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| ||||   | |||||||| |  || || |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24489 gtgggaaggtgtttgctttagcaggtactcagaaagcgaatgaggatcatctgataagaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactattat 24390  T
Q  166 tgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcca 265  Q
     |||||| | ||||| ||||||||||||| | |||| ||||  |  || |||| | | | | | ||  ||||||| || ||||||||||| ||||| ||     
T  24389 agatactagggctacacattgttttattgttgttgattgtgtttcgaaattggatcttgttatgtcatatatgaatggagaaatggttgtcgaaaccccg 24290  T
Q  266 gctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    |||||||||||||| || ||||||||    
T  24289 gctaagggttcagtgactacttctct 24264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 2119 - 1944
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||   ||||||||    
T  2119 atcagaagtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 2020  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    || |   | | ||| ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  2019 gtctttctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 1944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 294
Target Start/End: Original strand, 7913 - 8088
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||   |||| |||    
T  7913 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctattgattgtgctactaaggtgg 8012  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    || | | | | ||| |||| || || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||    
T  8013 gtcttgctatgtctaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgaaaacttctcttgt 8088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 294
Target Start/End: Original strand, 40681 - 40856
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |  ||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||    
T  40681 atcagaggtacttgctattttgatagtacacctttagttgccattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 40780  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    || | | | | ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||| || || |||||||||||    
T  40781 gtcttgttatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgt 40856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 176
Target Start/End: Original strand, 16730 - 16840
Alignment:
Q  66 gtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 165  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16730 gtgggaaagtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccggttgatcagaggtacatgtttctttaattgtactcctttaattgctattat 16829  T
Q  166 tgatactggtg 176  Q
    |||||||||||    
T  16830 tgatactggtg 16840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 301
Target Start/End: Original strand, 21413 - 21541
Alignment:
Q  173 ggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagg 272  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||  | | | | ||   |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21413 ggtgctacgcattgttttattgctactgattgtgcttctaagttgggccttgttatgtcatgtatggatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagg 21512  T
Q  273 gttcagtaaccacttctcttgtttgtctg 301  Q
    |||| || || |||||||| || ||||||    
T  21513 gttcggtgactacttctctagtgtgtctg 21541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26527 - 26301
Alignment:
Q  74 gtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 173  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    |||||||| ||| | || |||||||  ||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  26527 gtgtttgcttttactggtacgcagacagagaatgaggatcgattgattagaggtaaatgttattttgatagtactcttttagttgctattattgatattg 26428  T
Q  174 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 273  Q
    ||||||| || |||||||||| | |||| ||||| | |||||||||| |   | | ||  ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26427 gtgctacgcaatgttttattgttgttgattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaaggg 26328  T
Q  274 ttcagtaaccacttctcttgtttgtct 300  Q
    ||| || || |||||||| || |||||    
T  26327 ttcggtgactacttctctagtgtgtct 26301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 145 - 291
Target Start/End: Original strand, 37020 - 37166
Alignment:
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| ||||||||||||| ||     
T  37020 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatctgatatgaatgga 37119  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  37120 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 37166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Original strand, 510 - 727
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    || ||||| ||  | ||||||||||||||||   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  510 tttgctttgactggtacacagacatagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtg 609  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||||   ||| |||||| | |   | ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  610 ctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaaattgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttc 709  T
Q  277 agtaaccacttctcttgt 294  Q
     || || ||||| |||||    
T  710 tgtgactacttcacttgt 727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 11641 - 11424
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||| ||||||||||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11641 tttgctttgaatggtacgcagacggagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 11542  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||||||||| ||||||||   ||| ||||  | |   ||| || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11541 ctactcattgctttattgcctatgattgtgtttctgctttgagtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 11442  T
Q  277 agtaaccacttctcttgt 294  Q
     || || |||||||||||    
T  11441 ggtgactacttctcttgt 11424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18065 - 17892
Alignment:
Q  121 cagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggt 220  Q
    |||||||||||| |   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| ||||  | |   ||| ||    
T  18065 cagaggtacttgctatattaataatactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcctatgattgtgtttctgctttgagt 17966  T
Q  221 ttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
     | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  17965 cttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 17892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 55176 - 55058
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  55176 tttgctttgactggaactcagacggagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 55077  T
Q  177 ctactcattgttttattgc 195  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  55076 ctactcattgctttattgc 55058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 104399 - 104182
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   || ||||| ||  | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| || |||||||||||| |||||    
T  104399 tttgctttgactggtactcagactgggaacgaggatcgtttgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagtttctattattgataatggtg 104300  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||   | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||     
T  104299 ctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaatttgggtcctgttatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtta 104200  T
Q  277 agtaaccacttctcttgt 294  Q
     ||||| |||||||||||    
T  104199 ggtaactacttctcttgt 104182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11203 - 11076
Alignment:
Q  74 gtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 173  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| ||  | || |||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  11203 gtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttactttgatagtactcatttaattgttattattgatactg 11104  T
Q  174 gtgctactcattgttttattgctattga 201  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  11103 gtactactcattgttttattgctattga 11076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 77 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 15083 - 14884
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    || ||||| ||  | |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15083 tttgctttgactggtacacagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtg 14984  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||||   |||||||||| | |   | ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14983 ctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttc 14884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 77 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3596 - 3397
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3596 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 3497  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3496 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgccttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 3397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 17290 - 17133
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    ||||||||||||||||   ||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  17290 atcagaggtacttgttatattaataaaactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 17191  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17190 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 17133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 41804 - 41590
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgactt-atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggt 175  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||   |||||||| | |||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  41804 tttgctttgactgctactcagactgagaatgaggatc-acttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggt 41706  T
Q  176 gctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggtt 275  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||   |||||||||| | | | | |   |||||||  | || ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  41705 gctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtaaaatatgaatagagagatggttgtcaaaactccagctaagggtt 41606  T
Q  276 cagtaaccacttctct 291  Q
    | || || ||||||||    
T  41605 cggtgactacttctct 41590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 75524 - 75310
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgactt-atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggt 175  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||   |||||||| | |||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  75524 tttgctttgactgctactcagactgagaatgaggatc-acttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggt 75426  T
Q  176 gctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggtt 275  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||   |||||||||| | | | | |   |||||||  | || ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  75425 gctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtaaaatatgaatagagagatggttgtcaaaactccagctaagggtt 75326  T
Q  276 cagtaaccacttctct 291  Q
    | || || ||||||||    
T  75325 cggtgactacttctct 75310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 276
Target Start/End: Original strand, 34915 - 35046
Alignment:
Q  145 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 244  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| ||     
T  34915 tactcctttagttgctattattgatactggtgctaagcattgttttattgttttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 35014  T
Q  245 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35015 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 35046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 10540 - 10326
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||    || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10540 tttgttttgactggtacgcagacggagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 10441  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10440 ctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 10341  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  10340 ggtgactacttctct 10326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26161 - 26063
Alignment:
Q  200 gaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||||| |||||||||||  ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26161 gaatgtgcatataagttgggcctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtttgt 26063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22419 - 22205
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22419 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 22320  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22319 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 22220  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  22219 ggtgactacttctct 22205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 7408 - 7194
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7408 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 7309  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7308 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 7209  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  7208 ggtgactacttctct 7194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 8429 - 8216
Alignment:
Q  78 ttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgc 177  Q
    |||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8429 ttgctttgactggtactcagactgaggatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgc 8330  T
Q  178 tactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttca 277  Q
    ||||||||| ||||||||| | || ||||  | |   || ||| | ||  | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  8329 tactcattgctttattgctttcgattgtgtatctgctttaggtcttgaattgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcg 8230  T
Q  278 gtaaccacttctct 291  Q
    || || ||||||||    
T  8229 gtgactacttctct 8216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 77 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 1154 - 942
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   || ||||| ||  | || |||| ||| ||||   |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1154 tttgctttgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgattagagatacatgttatattaatagtacacctttagttgctattattgatactggtg 1055  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1054 ctacgcattgttttattgcttttgattgtgtttcttttttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 955  T
Q  277 agtaaccacttct 289  Q
     || || ||||||    
T  954 ggtgactacttct 942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 294
Target Start/End: Original strand, 11054 - 11229
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||| |||||   ||||||||    
T  11054 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagtttctattattgatactagtgctacacattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgg 11153  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    || | |   | ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  11154 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 11229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 18822 - 18608
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||   || ||||| ||  | ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  18822 tttgcattgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgatattattgatactagtg 18723  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18722 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 18623  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  18622 ggtgactacttctct 18608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 141 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4691 - 4538
Alignment:
Q  141 atagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaa 240  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||| | | | | ||| |||||||    
T  4691 atagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgttattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaa 4592  T
Q  241 aggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
     || || |||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||||| |||||    
T  4591 tggagagatggttgtcgaaactccagctgagggttcggtgactacttcccttgt 4538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Original strand, 1206 - 1378
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||| |||||||   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | || | ||  | ||  ||||    
T  1206 atcagaggaacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgtattgctttattgctttcgactttgtttctactttgg 1305  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  1306 gtcttgatttttctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 1378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 209 - 13
Alignment:
Q  80 gctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgcta 179  Q
    |||||||||||||| |||||    |||||||| ||  | ||||||||| | ||||   || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  209 gctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggttcatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 110  T
Q  180 ctcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    | ||||||||||||||| | || | ||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  109 cgcattgttttattgctttcgattatgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 13  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 226 - 298
Target Start/End: Original strand, 3451 - 3523
Alignment:
Q  226 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 298  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  3451 tgtatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgt 3523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Original strand, 13298 - 13470
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  13298 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctggtttgg 13397  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||| | ||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  13398 gtcttgatttgtctgatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 13470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 41327 - 41113
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  41327 tttgctttgactggtactcagacggagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgacactgggg 41228  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||| ||||||||| | || | ||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41227 ctacgcattgctttattgctttggattatgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 41128  T
Q  277 agtaaccacttctct 291  Q
     || || ||||||||    
T  41127 ggtgactacttctct 41113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 120 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 32012 - 31841
Alignment:
Q  120 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttggg 219  Q
    ||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| | || ||||| | |   |||||    
T  32012 tcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgttacgcattattttattgctttcgattgtgcttctgctttggg 31913  T
Q  220 tttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    | | | | | | ||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  31912 tcttgttttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctct 31841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 54767 - 54592
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||   ||||||||    
T  54767 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgg 54668  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    || |     | ||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  54667 gtcttttcatgtctaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 54592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Original strand, 10412 - 10584
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || | || ||||  | |   ||||    
T  10412 atcagaggtacttgctatattaataacactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattactttcgattgtgtttctgctttgg 10511  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  10512 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 10584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 120 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 37478 - 37307
Alignment:
Q  120 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttggg 219  Q
    ||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| | || ||||| | |   |||||    
T  37478 tcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgttacgcattattttattgctttcgattgtgcttctgctttggg 37379  T
Q  220 tttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    | | | | | | ||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  37378 tcttgttttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttctgttactacttctct 37307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Original strand, 13067 - 13239
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||| || ||||  | |   ||||    
T  13067 atcagaggtacttgctatattaataaaactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgatttataaatatcgattgtgtttctgctttgg 13166  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  13167 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 13239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 149 - 294
Target Start/End: Original strand, 24916 - 25061
Alignment:
Q  149 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaa 248  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||   |||||  ||| | |   | ||||||||||| || ||||    
T  24916 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagtcaggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 25015  T
Q  249 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||||||    
T  25016 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacatctcttgt 25061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Original strand, 1147 - 1199
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1147 aatagtactcctttgattgcaattatagatactggtgctactcattcttttat 1199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Original strand, 943 - 1115
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 218  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  943 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 1042  T
Q  219 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || | ||| | ||||| ||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||| || || ||||||||    
T  1043 gtcttgatttgtctgacatgaatggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttcggtgactacttctct 1115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1260 - 1185
Alignment:
Q  200 gaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggtt 275  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1260 gaatgtgcatataagttgggtctggttgtatccgatatgaaaggataaatggttgttgaaactccagctaagggtt 1185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9119 - 8905
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    || ||||| ||  | |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  9119 tttgctttgactggtacacagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtg 9020  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| ||||   ||||||||  | | |||||   |||||||||| | |   | ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9019 ctacacatt---ttattgcttattattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagccaagggttc 8923  T
Q  277 agtaaccacttctcttgt 294  Q
    ||| || |||||||||||    
T  8922 agtgactacttctcttgt 8905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 21776 - 21577
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||  | ||||||||||| ||||   |||||| |||||| ||| |||||||||||||||  ||||    
T  21776 tttgctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattaataatactcccttagttgctattattgatatcggtg 21677  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| |||| |||||||||| | || ||||| | ||  |||||| | | | | |||||| |||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21676 ctacgcattattttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatttgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 21577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 37200 - 37001
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||  | ||||||||||| ||||   |||||| |||||| ||| |||||||||||||||  ||||    
T  37200 tttgctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattaataatactcccttagttgctattattgatatcggtg 37101  T
Q  177 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    |||| |||| |||||||||| | || ||||| | ||  |||||| | | | | |||||| |||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37100 ctacgcattattttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatttgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 37001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 276
Target Start/End: Original strand, 11533 - 11687
Alignment:
Q  122 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtt 221  Q
    |||||||||||||   |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||||     
T  11533 agaggtacttgttatattaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 11632  T
Q  222 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 276  Q
    | ||| | ||||||||||| || || |||||| || |||||||||||||||||||    
T  11633 ttgatttgtctgatatgaatggagatatggttttttaaactccagctaagggttc 11687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 115
Alignment:
Q  122 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtt 221  Q
    |||||||||||||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | || ||||  | |   ||||||     
T  268 agaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttttttgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 169  T
Q  222 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggtt 275  Q
    | ||| | ||||||||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||    
T  168 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgtcgaaacttcagctaagggtt 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Original strand, 674 - 826
Alignment:
Q  139 taatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatg 238  Q
    ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | |||||||||    
T  674 taataatactcattaagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 773  T
Q  239 aaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    || || || |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  774 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggtaactacttctct 826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 48795 - 48719
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgc 195  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48795 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgc 48719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 196
Target Start/End: Original strand, 15711 - 15830
Alignment:
Q  77 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 176  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    |||||||| ||  | ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15711 tttgctttggctggtacacagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgcaattattgatactggtg 15810  T
Q  177 ctactcattgttttattgct 196  Q
    |||| |||||||| ||||||    
T  15811 ctacgcattgtttaattgct 15830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 2994 - 2917
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgct 196  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  2994 atcagaggtacttgttatattaataatactccattagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttttttgct 2917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 192
Target Start/End: Original strand, 13502 - 13578
Alignment:
Q  116 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||  |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13502 cttatcagaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 13578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Original strand, 816 - 868
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  816 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Original strand, 5499 - 5551
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5499 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 5551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 26505 - 26453
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26505 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 26453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 35194 - 35142
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35194 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 35142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 24072 - 24020
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24072 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 24020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8266 - 8214
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8266 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 8214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 90611 - 90559
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  90611 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 90559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Original strand, 21071 - 21123
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21071 aatagtactcctttgattgcaattattgatagtggtgctactcattcttttat 21123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Original strand, 30647 - 30699
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30647 aatagtactcctttgattgcaattattgatagtggtgctactcattcttttat 30699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 2835 - 2754
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagagg 126  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| || || | |||||| ||||||||||||||    
T  2835 aaccgaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagagg 2754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 2680 - 2628
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2680 aataatactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 2628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Original strand, 7057 - 7109
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  7057 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctacttattcttttat 7109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 3608 - 3563
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcatt 185  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  3608 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactcatt 3563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 171229 - 171188
Alignment:
Q  138 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgcta 179  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  171229 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 171188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0848 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0848
Description:

Target: scaffold0848; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 98
Target Start/End: Original strand, 5116 - 5152
Alignment:
Q  62 actggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcaga 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5116 actggtgggaaggtttttgctttgactggtacgcaga 5152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Original strand, 4097 - 4149
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4097 aatagtactccgttgattgcaattatcgatactggtgctactcattcttttat 4149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Original strand, 6199 - 6251
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6199 aatagtactactttgattgcaataattgatactggtgctactcattcttttat 6251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 1320 - 1268
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1320 aatagtactcttttgatttcaattattgatactggtgctactcattcttttat 1268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Original strand, 5000 - 5052
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  5000 aataatactcctttgattgcaattatcgatactggtgctactcattcttttat 5052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 26885 - 26833
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  26885 aatagtactcctttgattgcaattattgatactgttgctacttattcttttat 26833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Original strand, 131684 - 131736
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  131684 aatagaactcctttgattgcaattattgatacttgtgctactcattattttat 131736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0789 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0789
Description:

Target: scaffold0789; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 119 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 68 - 1
Alignment:
Q  119 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattg 186  Q
    |||||||||||||| |   |||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  68 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttaagtgctataattgatagtggtgctacgcattg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 96
Target Start/End: Original strand, 384 - 435
Alignment:
Q  45 aaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgca 96  Q
    |||||||||||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  384 aaccgaagaaggttaggaccggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgca 435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 95
Target Start/End: Original strand, 1139 - 1173
Alignment:
Q  61 aactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgc 95  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1139 aactggtgggaaggtttttgctttgactggtacgc 1173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 12678 - 12621
Alignment:
Q  234 atatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 291  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  12678 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 12621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3620 - 3556
Alignment:
Q  230 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 294  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| | |||||||||    
T  3620 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactgcagctaaggtttcggtaactatttctcttgt 3556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16019 - 15967
Alignment:
Q  140 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 192  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||    
T  16019 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgttacttattcttttat 15967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University