View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20974_high_1 (Length: 654)

Name: NF20974_high_1
Description: NF20974
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20974_high_1
NF20974_high_1
[»] chr7 (74 HSPs)
chr7 (1-645)||(41764484-41765140)
chr7 (361-645)||(29173639-29173922)
chr7 (378-645)||(31520519-31520786)
chr7 (389-645)||(32592996-32593251)
chr7 (360-642)||(48928057-48928356)
chr7 (389-645)||(26980422-26980678)
chr7 (360-642)||(12390409-12390689)
chr7 (389-582)||(35353287-35353480)
chr7 (382-645)||(18797426-18797706)
chr7 (385-585)||(37703283-37703483)
chr7 (389-639)||(9355615-9355882)
chr7 (389-645)||(31578853-31579126)
chr7 (385-585)||(17842369-17842569)
chr7 (385-585)||(37110050-37110250)
chr7 (389-585)||(37347197-37347393)
chr7 (385-645)||(30055626-30055903)
chr7 (389-585)||(46480918-46481114)
chr7 (356-585)||(24211917-24212147)
chr7 (391-569)||(44411331-44411509)
chr7 (389-645)||(15612548-15612821)
chr7 (393-585)||(32820846-32821038)
chr7 (382-585)||(4583095-4583298)
chr7 (382-585)||(23111368-23111571)
chr7 (391-585)||(10359005-10359199)
chr7 (385-585)||(27283920-27284122)
chr7 (389-645)||(6546618-6546891)
chr7 (430-645)||(12165851-12166074)
chr7 (389-582)||(32432631-32432824)
chr7 (382-645)||(10481704-10481984)
chr7 (360-585)||(5657240-5657466)
chr7 (385-645)||(7334893-7335169)
chr7 (389-585)||(8861461-8861657)
chr7 (389-645)||(21991735-21991999)
chr7 (389-645)||(15672548-15672824)
chr7 (406-645)||(11071305-11071558)
chr7 (389-585)||(26587881-26588069)
chr7 (393-645)||(22687338-22687599)
chr7 (393-585)||(25691337-25691529)
chr7 (385-556)||(37704387-37704558)
chr7 (471-636)||(38053586-38053751)
chr7 (397-576)||(43925286-43925459)
chr7 (9-216)||(41756550-41756757)
chr7 (494-645)||(38258644-38258812)
chr7 (471-585)||(43686216-43686330)
chr7 (455-645)||(33688117-33688324)
chr7 (393-585)||(44598842-44599034)
chr7 (391-545)||(34361967-34362123)
chr7 (505-642)||(48928469-48928623)
chr7 (360-473)||(38258867-38258980)
chr7 (575-645)||(37704256-37704326)
chr7 (575-645)||(10359206-10359277)
chr7 (531-585)||(37704333-37704387)
chr7 (575-645)||(43686139-43686209)
chr7 (575-641)||(44413371-44413437)
chr7 (575-645)||(44598765-44598835)
chr7 (576-645)||(27421373-27421442)
chr7 (575-645)||(4583018-4583088)
chr7 (575-645)||(8861384-8861454)
chr7 (575-645)||(32432551-32432621)
chr7 (576-645)||(5657474-5657543)
chr7 (575-642)||(25691536-25691603)
chr7 (575-625)||(26588076-26588126)
chr7 (588-642)||(27283846-27283900)
chr7 (583-645)||(32821053-32821115)
chr7 (600-645)||(17842603-17842648)
chr7 (600-645)||(23111289-23111334)
chr7 (588-645)||(24211840-24211897)
chr7 (600-645)||(37109971-37110016)
chr7 (454-517)||(27421219-27421282)
chr7 (533-585)||(27421313-27421365)
chr7 (576-636)||(46481122-46481182)
chr7 (581-634)||(43925211-43925264)
chr7 (359-435)||(12166215-12166291)
chr7 (600-636)||(37703515-37703551)
[»] chr1 (72 HSPs)
chr1 (389-644)||(14758162-14758425)
chr1 (393-645)||(11742155-11742407)
chr1 (378-645)||(15168216-15168500)
chr1 (393-644)||(2959869-2960137)
chr1 (406-645)||(16415766-16416022)
chr1 (385-585)||(37451482-37451682)
chr1 (394-645)||(27227273-27227541)
chr1 (361-585)||(32216252-32216476)
chr1 (359-645)||(34012135-34012433)
chr1 (359-585)||(19899521-19899748)
chr1 (385-645)||(15383053-15383331)
chr1 (393-642)||(27563692-27563958)
chr1 (382-645)||(8222248-8222528)
chr1 (393-645)||(47279309-47279578)
chr1 (393-645)||(7078850-7079119)
chr1 (389-645)||(31621331-31621609)
chr1 (358-585)||(46931606-46931834)
chr1 (382-585)||(10922924-10923127)
chr1 (393-645)||(4330401-4330670)
chr1 (389-645)||(30254543-30254816)
chr1 (393-585)||(238300-238492)
chr1 (393-585)||(48353740-48353931)
chr1 (380-641)||(40884937-40885216)
chr1 (385-585)||(23999544-23999745)
chr1 (385-585)||(28564562-28564760)
chr1 (385-585)||(32267231-32267431)
chr1 (400-645)||(25160752-25161015)
chr1 (388-645)||(9902836-9903110)
chr1 (356-645)||(27532732-27533036)
chr1 (385-645)||(51128979-51129254)
chr1 (353-645)||(15752149-15752458)
chr1 (389-645)||(27266984-27267255)
chr1 (385-585)||(27763089-27763290)
chr1 (389-585)||(47682277-47682473)
chr1 (389-645)||(38823334-38823607)
chr1 (393-642)||(3535055-3535312)
chr1 (429-645)||(30326775-30327008)
chr1 (391-641)||(10181792-10182060)
chr1 (385-585)||(28769850-28770050)
chr1 (358-585)||(22170908-22171135)
chr1 (411-585)||(1359740-1359914)
chr1 (382-645)||(42721159-42721435)
chr1 (398-586)||(3309349-3309538)
chr1 (393-645)||(33725398-33725656)
chr1 (385-585)||(39393581-39393781)
chr1 (406-645)||(41926283-41926532)
chr1 (434-645)||(37618729-37618948)
chr1 (389-537)||(1547516-1547664)
chr1 (378-568)||(21289817-21290004)
chr1 (447-645)||(18422771-18422986)
chr1 (389-547)||(31962851-31963010)
chr1 (468-585)||(38759730-38759847)
chr1 (510-645)||(48620757-48620900)
chr1 (575-645)||(32216175-32216245)
chr1 (575-645)||(47682480-47682550)
chr1 (575-645)||(238499-238569)
chr1 (576-645)||(39393503-39393573)
chr1 (575-636)||(1547408-1547469)
chr1 (588-645)||(28769772-28769829)
chr1 (584-645)||(3309267-3309329)
chr1 (588-645)||(10922847-10922904)
chr1 (588-645)||(28564780-28564837)
chr1 (588-645)||(32267154-32267211)
chr1 (588-645)||(46931531-46931588)
chr1 (389-449)||(48620922-48620982)
chr1 (587-645)||(22170831-22170889)
chr1 (588-642)||(23999470-23999524)
chr1 (133-215)||(26973807-26973889)
chr1 (588-645)||(19899768-19899825)
chr1 (588-645)||(27763310-27763367)
chr1 (600-645)||(37451405-37451450)
chr1 (389-425)||(38759847-38759883)
[»] chr3 (84 HSPs)
chr3 (389-645)||(11357169-11357425)
chr3 (382-645)||(43975673-43975949)
chr3 (395-645)||(22451083-22451350)
chr3 (384-585)||(46297545-46297746)
chr3 (389-645)||(52040710-52040983)
chr3 (378-645)||(48355056-48355340)
chr3 (361-645)||(26941020-26941321)
chr3 (360-642)||(33378544-33378843)
chr3 (393-645)||(53228944-53229213)
chr3 (385-645)||(40936106-40936365)
chr3 (393-645)||(22622510-22622779)
chr3 (389-645)||(33698268-33698541)
chr3 (389-645)||(39282767-39283040)
chr3 (385-645)||(42505859-42506136)
chr3 (385-645)||(44186301-44186562)
chr3 (389-583)||(40552047-40552241)
chr3 (389-585)||(1089886-1090081)
chr3 (352-585)||(21009552-21009786)
chr3 (385-585)||(54505999-54506200)
chr3 (389-585)||(4015652-4015847)
chr3 (382-585)||(24707896-24708099)
chr3 (389-646)||(2008047-2008327)
chr3 (389-585)||(37157899-37158096)
chr3 (385-585)||(3362447-3362647)
chr3 (389-645)||(14586468-14586731)
chr3 (389-645)||(37203182-37203456)
chr3 (385-585)||(47481714-47481915)
chr3 (393-645)||(29099470-29099730)
chr3 (389-645)||(44891612-44891885)
chr3 (393-585)||(7327274-7327466)
chr3 (385-585)||(25579931-25580131)
chr3 (389-645)||(22445853-22446125)
chr3 (393-645)||(32373585-32373853)
chr3 (429-585)||(34133127-34133283)
chr3 (430-645)||(46994490-46994722)
chr3 (391-585)||(4761438-4761632)
chr3 (385-585)||(27480142-27480350)
chr3 (382-573)||(51212558-51212743)
chr3 (389-645)||(21193721-21193995)
chr3 (382-645)||(3654980-3655263)
chr3 (389-645)||(29163933-29164190)
chr3 (389-585)||(11356946-11357134)
chr3 (385-583)||(24488745-24488944)
chr3 (389-582)||(36012333-36012528)
chr3 (446-585)||(54828546-54828685)
chr3 (429-642)||(38591816-38592046)
chr3 (389-585)||(20373051-20373228)
chr3 (389-645)||(11466939-11467198)
chr3 (396-567)||(50475021-50475199)
chr3 (471-645)||(43348372-43348563)
chr3 (462-585)||(45174698-45174821)
chr3 (575-645)||(27480370-27480440)
chr3 (462-585)||(11835494-11835611)
chr3 (464-572)||(53811597-53811701)
chr3 (575-645)||(51212972-51213042)
chr3 (575-645)||(35844441-35844512)
chr3 (575-645)||(24488953-24489023)
chr3 (575-645)||(34133050-34133120)
chr3 (575-645)||(46297753-46297823)
chr3 (588-645)||(20373300-20373357)
chr3 (574-645)||(45174620-45174692)
chr3 (588-645)||(4761653-4761710)
chr3 (574-645)||(53176169-53176240)
chr3 (591-646)||(54828708-54828763)
chr3 (576-642)||(1089811-1089877)
chr3 (575-645)||(4015575-4015645)
chr3 (576-645)||(11835619-11835689)
chr3 (385-447)||(35844577-35844639)
chr3 (591-645)||(37157822-37157876)
chr3 (587-645)||(24708118-24708178)
chr3 (581-645)||(3362368-3362434)
chr3 (583-645)||(40552258-40552320)
chr3 (588-645)||(21009806-21009863)
chr3 (151-216)||(36806094-36806159)
chr3 (586-645)||(36012252-36012312)
chr3 (586-645)||(25579854-25579913)
chr3 (522-585)||(35844519-35844581)
chr3 (587-645)||(7327485-7327543)
chr3 (163-217)||(49301577-49301631)
chr3 (547-585)||(53176246-53176284)
chr3 (363-416)||(13498678-13498731)
chr3 (378-423)||(34133312-34133357)
chr3 (151-216)||(36515067-36515132)
chr3 (600-645)||(47481637-47481682)
[»] chr5 (67 HSPs)
chr5 (389-645)||(24886228-24886484)
chr5 (393-645)||(14409123-14409378)
chr5 (389-645)||(22980917-22981190)
chr5 (378-645)||(33908357-33908640)
chr5 (389-645)||(699274-699547)
chr5 (389-645)||(31786424-31786697)
chr5 (435-645)||(1428983-1429196)
chr5 (385-645)||(31705386-31705663)
chr5 (382-585)||(2888216-2888419)
chr5 (389-645)||(35511260-35511528)
chr5 (389-645)||(7208642-7208915)
chr5 (393-645)||(38528019-38528288)
chr5 (382-585)||(5830093-5830296)
chr5 (361-585)||(40133586-40133810)
chr5 (389-641)||(12910483-12910752)
chr5 (389-645)||(22255306-22255579)
chr5 (385-585)||(35504566-35504766)
chr5 (389-645)||(32563273-32563537)
chr5 (361-585)||(36866963-36867187)
chr5 (382-585)||(36860625-36860828)
chr5 (389-585)||(15992318-15992514)
chr5 (385-585)||(17157805-17158005)
chr5 (382-645)||(22973853-22974133)
chr5 (379-585)||(35826254-35826458)
chr5 (389-583)||(8437168-8437362)
chr5 (389-645)||(42342855-42343118)
chr5 (393-645)||(8466868-8467119)
chr5 (390-585)||(8741664-8741860)
chr5 (389-585)||(19120060-19120256)
chr5 (389-645)||(22019756-22020020)
chr5 (393-616)||(25669739-25669969)
chr5 (393-645)||(9200357-9200617)
chr5 (389-585)||(5837756-5837952)
chr5 (382-645)||(27318259-27318538)
chr5 (385-645)||(27330428-27330705)
chr5 (389-645)||(23116008-23116273)
chr5 (393-585)||(35934097-35934289)
chr5 (389-645)||(39572943-39573208)
chr5 (351-581)||(13956104-13956332)
chr5 (389-572)||(25889584-25889767)
chr5 (393-645)||(30969106-30969375)
chr5 (389-645)||(7693354-7693618)
chr5 (351-645)||(23954542-23954840)
chr5 (393-645)||(25500708-25500977)
chr5 (378-645)||(43308427-43308703)
chr5 (393-585)||(15724689-15724881)
chr5 (378-585)||(21088535-21088740)
chr5 (389-530)||(28416329-28416470)
chr5 (389-645)||(14919317-14919579)
chr5 (385-487)||(43254154-43254256)
chr5 (389-526)||(26269069-26269206)
chr5 (459-645)||(6824329-6824530)
chr5 (527-585)||(26268275-26268333)
chr5 (575-645)||(35934019-35934090)
chr5 (575-645)||(26268198-26268268)
chr5 (575-645)||(28416508-28416578)
chr5 (575-645)||(36866886-36866956)
chr5 (575-645)||(40133509-40133579)
chr5 (578-645)||(5837679-5837746)
chr5 (575-645)||(8741867-8741937)
chr5 (582-644)||(19119984-19120046)
chr5 (578-645)||(5112297-5112364)
chr5 (575-645)||(15724612-15724682)
chr5 (600-645)||(13956368-13956413)
chr5 (576-645)||(21088748-21088817)
chr5 (593-645)||(35504489-35504541)
chr5 (586-645)||(15992532-15992591)
[»] chr4 (69 HSPs)
chr4 (361-645)||(28002772-28003073)
chr4 (389-585)||(33816330-33816526)
chr4 (378-642)||(32579573-32579854)
chr4 (385-585)||(3042820-3043020)
chr4 (382-645)||(25184237-25184517)
chr4 (361-645)||(35020817-35021122)
chr4 (385-585)||(36493499-36493699)
chr4 (390-645)||(5047781-5048052)
chr4 (385-645)||(37775791-37776059)
chr4 (360-585)||(6864236-6864461)
chr4 (359-645)||(19089237-19089540)
chr4 (389-645)||(33341522-33341795)
chr4 (385-645)||(37663551-37663828)
chr4 (382-645)||(1815425-1815704)
chr4 (389-585)||(47253941-47254137)
chr4 (406-645)||(55477722-55477978)
chr4 (352-636)||(30002418-30002710)
chr4 (382-645)||(879355-879635)
chr4 (389-585)||(7703710-7703906)
chr4 (382-585)||(7152011-7152214)
chr4 (359-645)||(19440432-19440735)
chr4 (378-645)||(25700859-25701144)
chr4 (389-583)||(49376170-49376364)
chr4 (389-585)||(34361305-34361502)
chr4 (389-585)||(55240919-55241115)
chr4 (389-645)||(50697365-50697639)
chr4 (389-645)||(23761196-23761468)
chr4 (389-585)||(32912393-32912590)
chr4 (389-639)||(46887972-46888238)
chr4 (389-585)||(17167914-17168110)
chr4 (389-585)||(17173491-17173687)
chr4 (389-582)||(37287932-37288126)
chr4 (391-585)||(50764921-50765115)
chr4 (405-576)||(34947925-34948096)
chr4 (385-585)||(29584010-29584210)
chr4 (384-645)||(32592217-32592486)
chr4 (385-645)||(17272088-17272365)
chr4 (389-558)||(39400236-39400405)
chr4 (389-645)||(9139369-9139624)
chr4 (389-644)||(4598117-4598379)
chr4 (385-585)||(26896288-26896489)
chr4 (389-554)||(4205216-4205381)
chr4 (389-524)||(35025381-35025515)
chr4 (385-645)||(42199853-42200131)
chr4 (400-645)||(27396740-27397000)
chr4 (393-582)||(46883932-46884116)
chr4 (389-645)||(4934026-4934289)
chr4 (471-642)||(38011981-38012169)
chr4 (389-507)||(23431834-23431952)
chr4 (393-480)||(38012568-38012655)
chr4 (510-585)||(35025531-35025606)
chr4 (575-645)||(33816550-33816620)
chr4 (574-636)||(7703642-7703704)
chr4 (575-636)||(47253873-47253934)
chr4 (578-645)||(36493708-36493775)
chr4 (575-645)||(17167837-17167907)
chr4 (575-645)||(17173414-17173484)
chr4 (575-645)||(34948114-34948184)
chr4 (580-645)||(29584222-29584287)
chr4 (580-636)||(35025618-35025674)
chr4 (575-645)||(54499254-54499325)
chr4 (575-645)||(55241122-55241191)
chr4 (482-545)||(56050171-56050234)
chr4 (575-629)||(39398049-39398103)
chr4 (588-645)||(6864159-6864216)
chr4 (588-645)||(32912610-32912667)
chr4 (594-645)||(50764854-50764905)
chr4 (591-645)||(3042743-3042797)
chr4 (600-645)||(49376091-49376136)
[»] chr2 (63 HSPs)
chr2 (389-645)||(7006744-7007000)
chr2 (378-645)||(41465625-41465909)
chr2 (361-582)||(26357781-26358002)
chr2 (360-645)||(41960964-41961266)
chr2 (361-585)||(4167123-4167347)
chr2 (384-585)||(35959097-35959294)
chr2 (385-645)||(43648047-43648324)
chr2 (361-585)||(2325156-2325380)
chr2 (382-585)||(11366179-11366383)
chr2 (389-645)||(18494087-18494359)
chr2 (378-585)||(19289118-19289325)
chr2 (393-585)||(44913865-44914060)
chr2 (389-645)||(43770654-43770918)
chr2 (389-645)||(33660183-33660447)
chr2 (400-585)||(4763832-4764017)
chr2 (389-585)||(3177140-3177336)
chr2 (381-645)||(37905832-37906116)
chr2 (393-585)||(33709042-33709234)
chr2 (434-645)||(4478493-4478717)
chr2 (407-582)||(19500739-19500914)
chr2 (429-645)||(27349794-27350018)
chr2 (389-645)||(31861976-31862249)
chr2 (382-645)||(39167168-39167442)
chr2 (393-645)||(5881663-5881922)
chr2 (394-645)||(29241956-29242217)
chr2 (363-645)||(31570514-31570813)
chr2 (451-645)||(19313975-19314182)
chr2 (400-645)||(33550800-33551065)
chr2 (433-585)||(4263926-4264079)
chr2 (481-645)||(45327844-45328025)
chr2 (378-574)||(13711671-13711867)
chr2 (356-645)||(19424415-19424707)
chr2 (451-585)||(44286150-44286284)
chr2 (494-645)||(17071648-17071816)
chr2 (395-544)||(41051112-41051260)
chr2 (494-645)||(17054007-17054175)
chr2 (481-585)||(36642189-36642293)
chr2 (393-483)||(33902317-33902407)
chr2 (493-585)||(18258197-18258289)
chr2 (389-498)||(18257344-18257453)
chr2 (389-448)||(45328028-45328087)
chr2 (575-645)||(3177063-3177133)
chr2 (575-645)||(4167046-4167116)
chr2 (512-582)||(41463779-41463849)
chr2 (575-645)||(44286073-44286143)
chr2 (575-645)||(44913787-44913857)
chr2 (575-645)||(36642110-36642182)
chr2 (393-505)||(41463400-41463512)
chr2 (575-633)||(33709241-33709299)
chr2 (582-642)||(4264093-4264153)
chr2 (587-642)||(4763758-4763813)
chr2 (583-645)||(33902190-33902252)
chr2 (583-636)||(2325395-2325448)
chr2 (588-645)||(19289345-19289402)
chr2 (587-642)||(26357704-26357759)
chr2 (588-643)||(35959023-35959077)
chr2 (600-645)||(13711588-13711633)
chr2 (533-585)||(33902267-33902319)
chr2 (586-645)||(19501760-19501818)
chr2 (588-645)||(11366403-11366460)
chr2 (412-457)||(17053960-17054005)
chr2 (412-457)||(17071601-17071646)
chr2 (575-628)||(18258296-18258349)
[»] chr8 (60 HSPs)
chr8 (361-645)||(33906335-33906634)
chr8 (389-645)||(16446669-16446942)
chr8 (361-645)||(34895090-34895386)
chr8 (385-645)||(1149422-1149699)
chr8 (382-645)||(43643382-43643662)
chr8 (389-643)||(4132480-4132750)
chr8 (393-645)||(27082636-27082905)
chr8 (389-645)||(37970313-37970586)
chr8 (389-583)||(7890751-7890945)
chr8 (385-585)||(8803606-8803807)
chr8 (393-585)||(23854229-23854421)
chr8 (389-645)||(38644101-38644374)
chr8 (406-645)||(16222986-16223242)
chr8 (378-645)||(35459494-35459778)
chr8 (385-582)||(11727227-11727425)
chr8 (360-585)||(1205127-1205352)
chr8 (389-645)||(5299740-5300013)
chr8 (385-585)||(40862619-40862820)
chr8 (393-585)||(1953786-1953978)
chr8 (389-645)||(34951851-34952098)
chr8 (393-645)||(465965-466224)
chr8 (389-559)||(35859160-35859330)
chr8 (393-585)||(36694764-36694956)
chr8 (389-585)||(44869697-44869893)
chr8 (413-641)||(6098331-6098581)
chr8 (378-555)||(12587812-12587989)
chr8 (382-645)||(10554991-10555269)
chr8 (389-645)||(31933680-31933953)
chr8 (431-585)||(1149756-1149906)
chr8 (389-585)||(12876309-12876506)
chr8 (393-585)||(30654381-30654573)
chr8 (429-585)||(9864348-9864504)
chr8 (393-641)||(39098917-39099182)
chr8 (385-543)||(18259321-18259479)
chr8 (395-537)||(24823194-24823336)
chr8 (385-530)||(33198057-33198202)
chr8 (510-645)||(7998417-7998553)
chr8 (389-484)||(41362723-41362818)
chr8 (471-585)||(13307823-13307936)
chr8 (575-645)||(41910985-41911055)
chr8 (575-645)||(1150102-1150172)
chr8 (361-485)||(43025974-43026099)
chr8 (519-582)||(43025905-43025968)
chr8 (575-645)||(9864271-9864341)
chr8 (575-645)||(11727147-11727217)
chr8 (575-645)||(36694963-36695033)
chr8 (576-645)||(41362638-41362707)
chr8 (513-585)||(41910907-41910978)
chr8 (576-642)||(1953987-1954053)
chr8 (583-645)||(1205050-1205112)
chr8 (583-645)||(12876232-12876294)
chr8 (583-645)||(30654588-30654650)
chr8 (580-645)||(44869620-44869686)
chr8 (464-555)||(34463704-34463792)
chr8 (583-645)||(7890962-7891024)
chr8 (588-645)||(8803827-8803884)
chr8 (584-645)||(43025825-43025886)
chr8 (594-642)||(13307749-13307797)
chr8 (378-423)||(9864533-9864578)
chr8 (385-425)||(13307939-13307979)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (353-642)||(7234783-7235092)
chr6 (357-585)||(20768283-20768511)
chr6 (385-645)||(33618958-33619234)
chr6 (393-585)||(3879730-3879922)
chr6 (361-645)||(6090941-6091243)
chr6 (389-585)||(1946035-1946233)
chr6 (389-645)||(33892799-33893063)
chr6 (393-585)||(5627592-5627785)
chr6 (389-645)||(8513357-8513618)
chr6 (406-585)||(4318626-4318805)
chr6 (391-585)||(29182365-29182556)
chr6 (400-585)||(21016916-21017095)
chr6 (396-645)||(6089032-6089286)
chr6 (389-533)||(7054559-7054704)
chr6 (575-645)||(15491739-15491809)
chr6 (500-585)||(30353256-30353341)
chr6 (575-645)||(4318812-4318883)
chr6 (575-645)||(7055205-7055275)
chr6 (527-585)||(7055140-7055198)
chr6 (576-645)||(20768208-20768275)
chr6 (575-645)||(21017102-21017172)
chr6 (576-645)||(30353349-30353418)
chr6 (584-645)||(3879938-3879999)
chr6 (593-645)||(29182287-29182339)
chr6 (405-460)||(33724062-33724117)
chr6 (588-642)||(5627518-5627572)
chr6 (588-645)||(1945958-1946015)
[»] scaffold0002 (6 HSPs)
scaffold0002 (395-645)||(408223-408490)
scaffold0002 (397-585)||(335-517)
scaffold0002 (394-557)||(93894-94056)
scaffold0002 (575-645)||(258-328)
scaffold0002 (575-645)||(94374-94444)
scaffold0002 (549-585)||(94331-94367)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (385-645)||(8011-8288)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (391-645)||(12033-12303)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (385-585)||(145799-146000)
scaffold0022 (588-645)||(146020-146077)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (389-585)||(44158-44353)
scaffold0061 (600-645)||(44081-44126)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (389-585)||(154434-154629)
scaffold0017 (588-645)||(154649-154706)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (389-645)||(267408-267673)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (441-625)||(100894-101058)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 481; Significance: 0; HSPs: 74)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 481; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 645
Target Start/End: Original strand, 41764484 - 41765140
Alignment:
Q  1 aaattcataacaagagaccctgagaaggcacatgtatttttcctttcttatagtgtagcaatgatggtccattatgtctatgtacgagactctcgtgctt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41764484 aaattcataacaaaagaccctgagaaggcacatgtatttttcctttcttatagtgtagcaatgatggtccattatgtctatgtacgagactctcgtgctt 41764583  T
Q  101 atgacctcttaaggataaccgtcaaagactacatcaatgtcctttccgaaaaatatccctattggaaccgaagtcatggagctgatcatttcatacttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41764584 atgacctcttaaggataaccgtcaaagactacatcaatgtcctttccgaaaaatatccctattggaaccgaagtcatggagctgatcatttcatacttgc 41764683  T
Q  201 ttgccatgattgggtaaatctatcactagccnnnnnnncttaaaaatcttagtacatgcattctagtctagagtaagtgaacacttcttagcattttcct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41764684 ttgccatgattgggtaaatctatcactagcatttttttcttaaaaatcttagtacatgcat-----tctagagtaagtgaacacttcttagcattttctt 41764778  T
Q  301 aaaagatatcatacatacatttattgtagtcaannnnnnnnattctatccattaattaatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttga 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| ||||||||||||||| ||| ||  ||||||  | ||||||||||||||||    
T  41764779 aaaagatatcatacatacatttattgtagtcaattttttttattctatcaattaattaatgggagtttctacggtggagtcgggaaattgacttttttga 41764878  T
Q  401 aaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttgg 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41764879 aaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaataataattcatccagtaatgcttgcaaaatcttgg 41764978  T
Q  501 acttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacac 583  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 |||||||||    
T  41764979 acttacatgtactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttctggggtgttacac 41765078  T
Q  584 ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41765079 ttaaaacaaggtagagtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 41765140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 361 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 29173922 - 29173639
Alignment:
Q  361 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 460  Q
    ||||||||| ||  || ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  29173922 gggagcttctacgatgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatg 29173823  T
Q  461 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 560  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29173822 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagttgatgatatta 29173724  T
Q  561 tgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||    
T  29173723 tgtgatagtcttaagtgtaacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtttgatgaattgatgat 29173639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 378 - 645
Target Start/End: Original strand, 31520519 - 31520786
Alignment:
Q  378 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 477  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  31520519 agttaggaaactgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatc 31520618  T
Q  478 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 577  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31520619 gagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 31520718  T
Q  578 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  31520719 ttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgat 31520786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Original strand, 32592996 - 32593251
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  ||    
T  32592996 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcaattcatttt-aaattgttgattgctgattaatgatccatagtaatttatctagtaatattt 32593094  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaa 588  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32593095 gtaacatcttggacttacatgtactattttaacgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacacttaaa 32593194  T
Q  589 acaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  32593195 acaaggtatgataaaattagattaaatgcagttttgataatctgatgaattgatgat 32593251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 360 - 642
Target Start/End: Original strand, 48928057 - 48928356
Alignment:
Q  360 tgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaat 459  Q
    |||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48928057 tgggagcttctacggtgcagttagaaaattgacttttttaaaaaaattaattttgatctaaatgttcgatttatttttaaattgttgattgttgattaat 48928156  T
Q  460 gatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatt 559  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48928157 gatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactatttcatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatatt 48928256  T
Q  560 atgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 642  Q
    ||| |||||||||||                 |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48928257 atgcgatagtcttaagcattacactttctgaggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgat 48928356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 26980678 - 26980422
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  26980678 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaacaataattcatctagtaatactt 26980579  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaa 588  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26980578 gcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacacttaaa 26980479  T
Q  589 acaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  26980478 acaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgat 26980422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 360 - 642
Target Start/End: Original strand, 12390409 - 12390689
Alignment:
Q  360 tgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaat 459  Q
    |||||||||| ||  || ||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  12390409 tgggagcttctacggtgaagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttatttcatttttaaattgtcaattactgattaat 12390508  T
Q  460 gatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatt 559  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  12390509 gataaatagtaattcatctagtaatggttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatgcaagctgagttgatgatatt 12390608  T
Q  560 atgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 642  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12390609 atgtg--agtcttaagtgttacacttaaaagaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 12390689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 389 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 35353480 - 35353287
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  35353480 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtgattcatctagtaatgctt 35353381  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 582  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35353380 gcaacatcttggacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgagatagtcttaagtgttaca 35353287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 382 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 18797706 - 18797426
Alignment:
Q  382 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 481  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18797706 agaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagt 18797607  T
Q  482 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 581  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797606 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 18797507  T
Q  582 -----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
                     ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18797506 actttgtgaggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgat 18797426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 385 - 585
Target Start/End: Original strand, 37703283 - 37703483
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37703283 aaattgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 37703382  T
Q  485 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 584  Q
    | |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37703383 gtttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtggtacact 37703482  T
Q  585 t 585  Q
    |    
T  37703483 t 37703483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 389 - 639
Target Start/End: Original strand, 9355615 - 9355882
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9355615 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgctt 9355714  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-------------- 574  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||                  
T  9355715 gcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgt 9355814  T
Q  575 ---gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaatt 639  Q
       |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9355815 ggggtgttacacttaaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 9355882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Original strand, 31578853 - 31579126
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31578853 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttattgtttgattcatttttaaattattgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 31578952  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac------- 581  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  31578953 gcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttat 31579052  T
Q  582 ----------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
              ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31579053 agggtgttatacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 31579126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 385 - 585
Target Start/End: Original strand, 17842369 - 17842569
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17842369 aaattgacttttttggaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctaataat 17842468  T
Q  485 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 584  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17842469 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacact 17842568  T
Q  585 t 585  Q
    |    
T  17842569 t 17842569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 385 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 37110250 - 37110050
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37110250 aaattgatttttttggaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 37110151  T
Q  485 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 584  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37110150 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacact 37110051  T
Q  585 t 585  Q
    |    
T  37110050 t 37110050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 389 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 37347393 - 37347197
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  37347393 tgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgctt 37347294  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37347293 gcaatatcttggacttacagatactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactt 37347197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 385 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 30055903 - 30055626
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| | | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30055903 aaattgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 30055804  T
Q  485 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca-- 582  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  30055803 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 30055704  T
Q  583 ---------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
                   |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  30055703 ttgtagggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgat 30055626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 389 - 585
Target Start/End: Original strand, 46480918 - 46481114
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  46480918 tgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgttttatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttt 46481017  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46481018 gcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttaatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 46481114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 356 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 24212147 - 24211917
Alignment:
Q  356 ttaatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgat 455  Q
    |||||| ||||||| ||  || ||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  24212147 ttaatgagagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat 24212048  T
Q  456 taatgatcaatatta-attcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatg 554  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  24212047 taatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatg 24211948  T
Q  555 atattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24211947 atattatgtgatagtcttaggtgttacactt 24211917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 391 - 569
Target Start/End: Original strand, 44411331 - 44411509
Alignment:
Q  391 acttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgc 490  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44411331 acttttttggaaaggttaattatgatcttaatgtttcattcatttttaaattgttgattactgattaatggtcaatattaattcatctagtaatgcttgc 44411430  T
Q  491 aaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagt 569  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44411431 aacatcttggacttacagataatattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagt 44411509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Original strand, 15612548 - 15612821
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  15612548 tgactttttttaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaacaataattcatctagtaatgctt 15612647  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-------------- 574  Q
    |||| ||||| ||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||                  
T  15612648 gcaacatcttagacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 15612747  T
Q  575 ---gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
       |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15612748 ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 15612821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 393 - 585
Target Start/End: Original strand, 32820846 - 32821038
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32820846 tttttttaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatgaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 32820945  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
     ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32820946 catcttagacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactt 32821038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 382 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 4583298 - 4583095
Alignment:
Q  382 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 481  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||| ||||||||| |||    
T  4583298 agaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgatgactgattcatgattaatagtaattcatccagt 4583199  T
Q  482 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 581  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4583198 aatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattatttgatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttac 4583099  T
Q  582 actt 585  Q
    ||||    
T  4583098 actt 4583095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 382 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 23111571 - 23111368
Alignment:
Q  382 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 481  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  23111571 agaaaactgacttttttaaaaaagttaactttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatttatgatcaatagtaattcttctagt 23111472  T
Q  482 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 581  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23111471 aatgctttcaacatctttgatttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 23111372  T
Q  582 actt 585  Q
    ||||    
T  23111371 actt 23111368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 391 - 585
Target Start/End: Original strand, 10359005 - 10359199
Alignment:
Q  391 acttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgc 490  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  10359005 acttttttgaaaaagttaattttgatcataatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaaatcatttagtaatgcttgc 10359104  T
Q  491 aaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10359105 aaaatcttggacttacaagtactaatttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgttgttatgtgatagtcttaagtgttacactt 10359199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 385 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 27284122 - 27283920
Alignment:
Q  385 aaattgactttttt-gaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttc-atttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagta 482  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| | ||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27284122 aaattgactttttttgaaaagattaattttgattttaatgtttgattttatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagta 27284023  T
Q  483 atgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 582  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27284022 atgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgataatattatgtgatagttttaagtgttaca 27283923  T
Q  583 ctt 585  Q
    |||    
T  27283922 ctt 27283920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 6546891 - 6546618
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6546891 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 6546792  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-------------- 574  Q
    ||   ||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||| | ||||                  
T  6546791 gcctcatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgataatattaagtgttatactttgt 6546692  T
Q  575 ---gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
       |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  6546691 ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 6546618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 430 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 12166074 - 12165851
Alignment:
Q  430 tcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcat 529  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  12166074 tcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgtcat 12165975  T
Q  530 ctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtc 621  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    ||  |||      |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||    
T  12165974 ctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattc 12165875  T
Q  622 ttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12165874 ttgttaatctgatgaattgatgat 12165851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 389 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 32432824 - 32432631
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    |||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  32432824 tgacttttttaaaaaagttacttttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattcatgattaataataattcatctagtaatgctt 32432725  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 582  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32432724 gcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagtgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 32432631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 382 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 10481984 - 10481704
Alignment:
Q  382 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 481  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||   || |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10481984 agaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatatttaatttatttttaaattgttaattactgattaacgatcaatagtaattcatctagt 10481885  T
Q  482 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 581  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10481884 aatacttgcaacatcttggacttacggatactattttattgttggaatctttgacatgcaaagagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 10481785  T
Q  582 -----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
                     ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10481784 actttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaagcgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 10481704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 360 - 585
Target Start/End: Original strand, 5657240 - 5657466
Alignment:
Q  360 tgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatctt-aatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaa 458  Q
    |||||||||| ||| || |||||  ||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||| |   |||||||||||||| |||||| || |||||    
T  5657240 tgggagcttctacaatgcagttatgaaactgacatttttgaaaaagttaattttaatctttaatgatttattcatttttaaatttttgattactcattaa 5657339  T
Q  459 tgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 558  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5657340 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgctgatat 5657439  T
Q  559 tatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  5657440 catgcgatagtcttaagtattacactt 5657466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 385 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 7335169 - 7334893
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  7335169 aaattgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattattgatttctgattaatgattaatagtaattcatctagtaat 7335070  T
Q  485 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------- 574  Q
    |||||||| |||||||| |||||  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||              
T  7335069 gcttgcaacatcttggatttacaggtactattttattgtcggaatctttaacattcaaac-tagttgatgatattatctgataatcttaagtgttacact 7334971  T
Q  575 -------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
           |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7334970 ctgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaagctgatgagttgatgat 7334893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 389 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 8861657 - 8861461
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  8861657 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttagtgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatttcatctagtaatgcat 8861558  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8861557 gcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatggtcttgagtgttacactt 8861461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 21991999 - 21991735
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    | | |||||||||| ||||||||||     |||||    
T  21991999 tgacttttttgaaaaggttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatt----aatgatgatcaatagtaattcatct-----tgctt 21991909  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-------------- 574  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||                  
T  21991908 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 21991809  T
Q  575 ---gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  21991808 ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 21991735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Original strand, 15672548 - 15672824
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | |||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15672548 tgacttttttgaaaaaattaattttaaccttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgatgcatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 15672647  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatac---tatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtctta------------ 573  Q
    |||| || |||||||||||  |||   ||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||                
T  15672648 gcaacattttggacttacaggtactattattttatcgttggcatctttaacattcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 15672747  T
Q  574 -----agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
         ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  15672748 tgtggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgat 15672824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 406 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 11071558 - 11071305
Alignment:
Q  406 ttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggactta 505  Q
    |||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  11071558 ttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggactta 11071459  T
Q  506 catatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-----------------ttacacttaaa 588  Q
    ||  || ||||| |||||||   |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||                 |||||||||||    
T  11071458 caggtattattttatcgttg---tctttaacatgcgaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaa 11071362  T
Q  589 acaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11071361 acaaggtaggataaaattagattaagcgtagtgttgttaatctgatgaattgatgat 11071305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 389 - 585
Target Start/End: Original strand, 26587881 - 26588069
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  26587881 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcct 26587980  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||        |||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  26587981 gcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatcttt--------aacagagttgttgatatcatgtgatagtcttgagtgttacactt 26588069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 393 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 22687599 - 22687338
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22687599 ttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtatgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctattaatgcttgcaa 22687500  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag----------------- 575  Q
     ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||        |||| ||||| |||||| ||| ||||||||| ||                     
T  22687499 catcttggacttacatgtactattttatcgttggcatcctt--------aacagagttgttgatatcatgagatagtcttgagtgttacactttgtgggg 22687408  T
Q  576 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  22687407 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattattgttaatctgatgaattgatgat 22687338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 393 - 585
Target Start/End: Original strand, 25691337 - 25691529
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    |||||| ||||  |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  25691337 ttttttaaaaaatttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaa 25691436  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
     || ||| |||||||| |  ||||| ||||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  25691437 cattttgaacttacatgtgttattttatcgttaacatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactt 25691529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 385 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 37704558 - 37704387
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    ||||||||||||||| |||   |||| ||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  37704558 aaattgacttttttggaaaaactaatcttgattttaatgtttgattcatttgtaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctggtaat 37704459  T
Q  485 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgat 556  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  37704458 gcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgat 37704387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 471 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 38053751 - 38053586
Alignment:
Q  471 attcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 570  Q
    ||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||| || ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  38053751 attcatcaaataatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgttggaatctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 38053652  T
Q  571 ttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 636  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  38053651 ttaagtgttacacttataacaaagtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatga 38053586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 397 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 43925459 - 43925286
Alignment:
Q  397 ttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatc 496  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  43925459 ttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc 43925360  T
Q  497 ttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 576  Q
    ||||||       || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  43925359 ttggac------gtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgattgtattaagt 43925286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 216
Target Start/End: Original strand, 41756550 - 41756757
Alignment:
Q  9 aacaagagaccctgagaaggcacatgtatttttcctttcttatagtgtagcaatgatggtccattatgtctatgtacgagactctcgtgcttatgacctc 108  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||| | |||||||||||| || |||| || || |   | |    
T  41756550 aacaagagaccccgagaaggcacatgtatttttccttccttttagtgtggcaaagatggtccaatttgtctatgtacgcgattctcatgattttagtccc 41756649  T
Q  109 ttaaggataaccgtcaaagactacatcaatgtcctttccgaaaaatatccctattggaaccgaagtcatggagctgatcatttcatacttgcttgccatg 208  Q
     |||||| |||| ||| ||| || ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  41756650 ataaggaaaaccatcacagattatatcaatgtggtttccgaaaaatatcccttttggaaccgaagccttggagctgatcatttcatgctttcttgccatg 41756749  T
Q  209 attgggta 216  Q
    ||||||||    
T  41756750 attgggta 41756757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 494 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 38258812 - 38258644
Alignment:
Q  494 atcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca----------- 582  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  38258812 atcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggt 38258713  T
Q  583 ------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
          |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38258712 gttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 38258644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 471 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 43686330 - 43686216
Alignment:
Q  471 attcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 570  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43686330 attcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtt 43686231  T
Q  571 ttaagtgttacactt 585  Q
    |||||||||||||||    
T  43686230 ttaagtgttacactt 43686216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 455 - 645
Target Start/End: Original strand, 33688117 - 33688324
Alignment:
Q  455 ttaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatg 554  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  33688117 ttaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctg 33688216  T
Q  555 atattatgtgatagtctt-----------------aagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaa 637  Q
    |||| || ||||||||||                  ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  33688217 atatcatatgatagtcttgaatgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaagtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaa 33688316  T
Q  638 ttgatgat 645  Q
    ||||||||    
T  33688317 ttgatgat 33688324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 393 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 44599034 - 44598842
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgct---gattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttg 489  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||| | | | |||||||| ||||||||||||  |   ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  44599034 ttttttgaaaaaattaattttaatcttaacgattgattcatttt-aaattgttgattattattgattaatgatcaatagt--ttcatctagtaatgcttg 44598938  T
Q  490 caaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
     || ||||| ||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  44598937 taacatcttagacttacatgtattattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaggtgttacactt 44598842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 391 - 545
Target Start/End: Original strand, 34361967 - 34362123
Alignment:
Q  391 acttttttgaaaaggttaattttga-tctt-aatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||| | ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  34361967 acttttttgaaaaagttaattttaaatctttaatgtttgattcatttttaaattgttaatgactgattaatgatcaaaagtaattcatctagtaatgttt 34362066  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaaca 545  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||  || |||||||||||||||    
T  34362067 gcaatatcttggacttacagatactattttatcgttgatatttttaacatgcaaaca 34362123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 505 - 642
Target Start/End: Original strand, 48928469 - 48928623
Alignment:
Q  505 acatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaa 587  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||                 |||||||||||||    
T  48928469 acatgtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcattacactttctgaggtgttacacttaa 48928568  T
Q  588 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 642  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48928569 aataatgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgat 48928623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 360 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 38258980 - 38258867
Alignment:
Q  360 tgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaat 459  Q
    |||||||||| ||  || ||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38258980 tgggagcttctacggtgcagtcagaaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 38258881  T
Q  460 gatcaatattaatt 473  Q
    |||||||| |||||    
T  38258880 gatcaatagtaatt 38258867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 37704326 - 37704256
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37704326 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgataaattgatgat 37704256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Original strand, 10359206 - 10359277
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattaga-ttaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10359206 gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagatttaagtgtagtcttgttgatctgatgaattgatgat 10359277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 531 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 37704387 - 37704333
Alignment:
Q  531 tttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37704387 tttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactt 37704333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 43686209 - 43686139
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  43686209 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgat 43686139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 575 - 641
Target Start/End: Original strand, 44413371 - 44413437
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattga 641  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  44413371 gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagccttgttaatttgatgaattga 44413437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 44598835 - 44598765
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||    
T  44598835 gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaatttatgat 44598765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 576 - 645
Target Start/End: Original strand, 27421373 - 27421442
Alignment:
Q  576 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||    
T  27421373 tgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaatttatgat 27421442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 4583088 - 4583018
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  4583088 gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgat 4583018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 8861454 - 8861384
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | | ||||||||||||| ||||||||||    
T  8861454 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattgttgttaatctgattaattgatgat 8861384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 32432621 - 32432551
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | |||||||| |||||||||||||||||    
T  32432621 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattatattaactgtattcttgttagtctgatgaattgatgat 32432551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 576 - 645
Target Start/End: Original strand, 5657474 - 5657543
Alignment:
Q  576 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | | |||||||| |||||||||||||||    
T  5657474 tgttacacttaaaacaaagtaggataaaattaaattaagtgtatttttgttaatatgatgaattgatgat 5657543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 575 - 642
Target Start/End: Original strand, 25691536 - 25691603
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 642  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||    
T  25691536 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtatttttgttaatatgatgaattgat 25691603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 575 - 625
Target Start/End: Original strand, 26588076 - 26588126
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgt 625  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  26588076 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgt 26588126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 588 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 27283900 - 27283846
Alignment:
Q  588 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 642  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  27283900 aacaaggtaggataaaattagattaagtatagtcttgttaatctgataaattgat 27283846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Original strand, 32821053 - 32821115
Alignment:
Q  583 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  32821053 cttaaaacaaggtaggataaaactaaattaactgtagtcttgttaatctaatgaattgatgat 32821115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 600 - 645
Target Start/End: Original strand, 17842603 - 17842648
Alignment:
Q  600 taaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17842603 taaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 17842648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 600 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 23111334 - 23111289
Alignment:
Q  600 taaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  23111334 taaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgat 23111289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 24211897 - 24211840
Alignment:
Q  588 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24211897 aacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgat 24211840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 600 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 37110016 - 37109971
Alignment:
Q  600 taaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37110016 taaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 37109971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 454 - 517
Target Start/End: Original strand, 27421219 - 27421282
Alignment:
Q  454 attaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactattt 517  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27421219 attaatgatcaatattatttcatcttgtaacatttgcaacatcttggacttacatgtactattt 27421282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 533 - 585
Target Start/End: Original strand, 27421313 - 27421365
Alignment:
Q  533 taacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  27421313 taacatgcaaacagagttgctgatatcatacgatagtcttaagtgttacactt 27421365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 576 - 636
Target Start/End: Original strand, 46481122 - 46481182
Alignment:
Q  576 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 636  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||    
T  46481122 tgttacacttaaaacaatgtagaataaaattacatcaagtatagtcttgttaatctgatga 46481182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 581 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 43925264 - 43925211
Alignment:
Q  581 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgat 634  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | | |||||| ||||||    
T  43925264 cacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattattgttagtctgat 43925211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 359 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 12166291 - 12166215
Alignment:
Q  359 atgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcattt 435  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |  ||| |||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  12166291 atgggagcttctacactgcagtcatgaaactgacttttctaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcattt 12166215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 600 - 636
Target Start/End: Original strand, 37703515 - 37703551
Alignment:
Q  600 taaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 636  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  37703515 taaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatga 37703551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 72)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 389 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 14758425 - 14758162
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14758425 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 14758326  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa--------gtgtta 580  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||        ||||||    
T  14758325 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaatttctggggtgtta 14758226  T
Q  581 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatga 644  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14758225 cacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctaatgaattgatga 14758162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 393 - 645
Target Start/End: Original strand, 11742155 - 11742407
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11742155 ttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 11742254  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaa 592  Q
     ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11742255 catcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaattgttacacttaaaacaa 11742354  T
Q  593 ggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11742355 ggtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgat 11742407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 378 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 15168500 - 15168216
Alignment:
Q  378 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 477  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15168500 agttaggaaactgatttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatc 15168401  T
Q  478 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 577  Q
    || |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15168400 taataatgcttgcaacatcttgtacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagccttaagtg 15168301  T
Q  578 ttac-----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||                 ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15168300 ttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaactgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 15168216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 393 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 2960137 - 2959869
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2960137 ttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 2960038  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt-------------- 578  Q
     |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||                  
T  2960037 catcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacaatttgtggga 2959938  T
Q  579 ---tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatga 644  Q
       ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  2959937 tgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatga 2959869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 406 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 16416022 - 16415766
Alignment:
Q  406 ttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggactta 505  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16416022 ttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggactta 16415923  T
Q  506 catatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaa 588  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||                 || |||||||||||    
T  16415922 catgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacaatatgtggggtattacacttaaa 16415823  T
Q  589 acaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16415822 acaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgat 16415766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 385 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 37451682 - 37451482
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37451682 aaattgacttttttgaaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 37451583  T
Q  485 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 584  Q
    | |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37451582 gtttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 37451483  T
Q  585 t 585  Q
    |    
T  37451482 t 37451482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 394 - 645
Target Start/End: Original strand, 27227273 - 27227541
Alignment:
Q  394 tttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaa 493  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  27227273 tttttggaaaagttaattttgatattaatgtttaattcatttttaaatggttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 27227372  T
Q  494 atcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gt 576  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||                 ||    
T  27227373 atcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatatcatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtggggt 27227472  T
Q  577 gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  27227473 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgat 27227541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 361 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 32216476 - 32216252
Alignment:
Q  361 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 460  Q
    ||||||||| ||  || ||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32216476 gggagcttctacggtgcagtcagaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 32216377  T
Q  461 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 560  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  32216376 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatatta 32216277  T
Q  561 tgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  32216276 tgtgatagtcttaagtgttacactt 32216252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 359 - 645
Target Start/End: Original strand, 34012135 - 34012433
Alignment:
Q  359 atgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaa 458  Q
    ||||||||||| ||  || ||| || ||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34012135 atgggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaa 34012234  T
Q  459 tgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 558  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  34012235 tgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatat 34012334  T
Q  559 tatgtgata--gtctta----------agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||  || |||           ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  34012335 tatgtgatagtgtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgat 34012433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 359 - 585
Target Start/End: Original strand, 19899521 - 19899748
Alignment:
Q  359 atgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaa 458  Q
    ||||||||||| ||| || |||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19899521 atgggagcttctacagtgcagttaggaaactgacttttttggaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaa 19899620  T
Q  459 tgatcaatatta-attcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgata 557  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  19899621 tgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttggtgata 19899720  T
Q  558 ttatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19899721 ttatgtgatagtcttaagtgttacactt 19899748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 385 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 15383331 - 15383053
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggtt-catttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaa 483  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15383331 aaattgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattgctgattaataatcaatagtaattcatctagtaa 15383232  T
Q  484 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca- 582  Q
    ||||||||| |||||||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  15383231 tgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcatacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacac 15383132  T
Q  583 ----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
                    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15383131 tttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 15383053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 393 - 642
Target Start/End: Original strand, 27563692 - 27563958
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27563692 ttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcttttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaatacttgcaa 27563791  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg--------------- 577  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||                   
T  27563792 catcttggacttacatatactattttatcgtttgcatctttaacatgcaaacagagttgatgaaattatatgatagtcttaagtgttcctctttgtgggg 27563891  T
Q  578 --ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 642  Q
      ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27563892 tattatacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 27563958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 382 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 8222528 - 8222248
Alignment:
Q  382 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggtt-catttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctag 480  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8222528 agaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatat-aattcatctag 8222430  T
Q  481 taatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 580  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8222429 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgtta 8222330  T
Q  581 ca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||                 |||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  8222329 cactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgat 8222248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 393 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 47279578 - 47279309
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  47279578 ttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctaataatgtttgcaa 47279479  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac--------- 583  Q
     |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||             
T  47279478 catcttggacttacagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatggga 47279379  T
Q  584 --------ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
            ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  47279378 tgttacaattaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 47279309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 393 - 645
Target Start/End: Original strand, 7078850 - 7079119
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  7078850 ttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaa 7078949  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------g 575  Q
     ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||                 |    
T  7078950 tatcttagacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtcttatactttgtgggg 7079049  T
Q  576 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  7079050 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgat 7079119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Original strand, 31621331 - 31621609
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttt-taaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgct 487  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  31621331 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcattttttaaattgttgattgatgattaatgatcaatagtagttcatctactaatgct 31621430  T
Q  488 tgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatct-----ttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg----- 577  Q
    ||||| || ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||     |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||         
T  31621431 tgcaacatattgaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatagttgttgatattatgcgatagtcttaagtgtcaca 31621530  T
Q  578 -----------ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
               || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31621531 cttctggggtattgcacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 31621609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 358 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 46931834 - 46931606
Alignment:
Q  358 aatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgatta 457  Q
    |||||||||||| ||  || ||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46931834 aatgggagcttctacggtgcagtaaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatta 46931735  T
Q  458 atgatcaatatta-attcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgat 556  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  46931734 atgatcaataatatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgat 46931635  T
Q  557 attatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46931634 attatgtgatagtcttaagtgttacactt 46931606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 382 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 10923127 - 10922924
Alignment:
Q  382 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 481  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10923127 agaaaactgactcttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagt 10923028  T
Q  482 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 581  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| || ||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10923027 aatgcttgcaacattttggacttacagatactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacagtcttaagtgttac 10922928  T
Q  582 actt 585  Q
    ||||    
T  10922927 actt 10922924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 393 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 4330670 - 4330401
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4330670 ttttttggaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttatattgttgattactgattaatgatcaattgtaattcatctagtaatgcttgcaa 4330571  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt-------------- 578  Q
     || |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||                  
T  4330570 catattggacttacaagtactattttatctttgacatctttaacatgcaaaaagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgggg 4330471  T
Q  579 ---tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
       |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4330470 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgataaattgatgat 4330401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 30254816 - 30254543
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30254816 tgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgctt 30254717  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca------ 582  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||          
T  30254716 gcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgttattatgtgacagtcttaagtgttacactttat 30254617  T
Q  583 -----------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
               |||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30254616 agggtgttatgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtctagtcttgttaatctgatgaattgatgat 30254543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 393 - 585
Target Start/End: Original strand, 238300 - 238492
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  238300 ttttttgaaaaagttgattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgtggattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 238399  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
     |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  238400 catcttggacttacagatattattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 238492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 393 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 48353931 - 48353740
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48353931 ttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaa 48353832  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
     |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  48353831 tatcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtctt-agtgttacactt 48353740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 380 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 40885216 - 40884937
Alignment:
Q  380 ttagaaaattgacttttttgaaaaggttaa-ttttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatct 478  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| | |||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  40885216 ttagaaaattgacttttttaaaaatgttaacttttaaccttaatattcgattcatttttgaattattgattgctaattaatgatcaatagtaattcatct 40885117  T
Q  479 agtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 578  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40885116 agtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcatcggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgt 40885017  T
Q  579 tac-----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattga 641  Q
    |||                 |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40885016 tacacttttcggaatgttacacttaaaacaagataggataaaactagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattga 40884937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 385 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 23999745 - 23999544
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaa 483  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  23999745 aaattgacctttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaa 23999646  T
Q  484 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 583  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23999645 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 23999546  T
Q  584 tt 585  Q
    ||    
T  23999545 tt 23999544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 385 - 585
Target Start/End: Original strand, 28564562 - 28564760
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28564562 aaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 28564661  T
Q  485 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 584  Q
    | |||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28564662 gtttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag--ttaagtgttacact 28564759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 385 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 32267431 - 32267231
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  32267431 aaattgacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgttcaatagtaattcatctagtaat 32267332  T
Q  485 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 584  Q
    |||||||| ||||||||| ||||  |||||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32267331 gcttgcaacatcttggacctacaggtactattttatagttggaatatttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttgagtgttacact 32267232  T
Q  585 t 585  Q
    |    
T  32267231 t 32267231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 400 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 25161015 - 25160752
Alignment:
Q  400 aaaaggttaattttgatcttaatgttcggtt-catttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatctt 498  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  25161015 aaaaggttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatctt 25160916  T
Q  499 ggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttac 581  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||                 |||||||    
T  25160915 ggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttac 25160816  T
Q  582 acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25160815 acttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttattaatctaatgaattgatgat 25160752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 388 - 645
Target Start/End: Original strand, 9902836 - 9903110
Alignment:
Q  388 ttgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgct 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9902836 ttgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtagtgct 9902935  T
Q  488 tgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt--------- 578  Q
    ||||  |||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||             
T  9902936 tgcagcatcttggacttactggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttg 9903035  T
Q  579 --------tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
            ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  9903036 tggggtgttacacttgaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgat 9903110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 356 - 645
Target Start/End: Original strand, 27532732 - 27533036
Alignment:
Q  356 ttaatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgat 455  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| |  ||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27532732 ttaatgggagcttctacggtgcagtcatgaaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaa-ttgttgattactgat 27532830  T
Q  456 taatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatga 555  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||    
T  27532831 taatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttgcaaacagaattgctga 27532930  T
Q  556 tattatgtgatagtctt-----------------aagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaat 638  Q
    ||| |||||||||||||                 | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27532931 tatcatgtgatagtcttgagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt-gattaagtgtattcttgttaatctgatgaat 27533029  T
Q  639 tgatgat 645  Q
    |||||||    
T  27533030 tgatgat 27533036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 385 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 51129254 - 51128979
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||  | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51129254 aaattgacttttttgaaaaagttaattt--attttaatacttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 51129157  T
Q  485 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------- 574  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||              
T  51129156 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaattgttacact 51129057  T
Q  575 -------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
           |||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  51129056 ttgtggggtgttacacttataacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgat 51128979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 353 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 15752458 - 15752149
Alignment:
Q  353 taattaatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgct 452  Q
    ||||| ||||||||||| ||  || ||| |||||||||| |||||  ||||  ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||    
T  15752458 taatttatgggagcttctacggtgcagtcagaaaattgattttttaaaaaaaattaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattact 15752359  T
Q  453 gattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttga 552  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||  |||||||||||||| || |||||  ||||||| || ||||||||||||||| |||| |    
T  15752358 gattaatgatcaatagtaattcatctagtaaaaattgcaacttcttggacttacatgtattattttgtcgttggaatttttaacatgcaaacagagttaa 15752259  T
Q  553 tgatattatgtgatagtcttaagtgttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatg 635  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||                 |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15752258 tgatattatgtgatactcttaagtgttacactttatggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatg 15752159  T
Q  636 aattgatgat 645  Q
    ||||||||||    
T  15752158 aattgatgat 15752149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Original strand, 27266984 - 27267255
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27266984 tgactttttggaaaag-ttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattattgattattgattaattatcaatagtaattcatctagtaatgctt 27267082  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-------------- 574  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||                  
T  27267083 gcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttgcactttgt 27267182  T
Q  575 ---gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
       |||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27267183 ggggtgttacactcaaaacaaggta-gattaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 27267255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 385 - 585
Target Start/End: Original strand, 27763089 - 27763290
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaa 483  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  27763089 aaattgacatttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatatttatctagtaa 27763188  T
Q  484 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 583  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27763189 tgcttgcaacatcttgaacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgattatattatgtgatagtcttaagtattacac 27763288  T
Q  584 tt 585  Q
    ||    
T  27763289 tt 27763290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 389 - 585
Target Start/End: Original strand, 47682277 - 47682473
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||   ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  47682277 tgacttttttgaacaagttaattttaatcttaatgtttaattcttttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgctt 47682376  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    |||| |||||||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47682377 gcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactt 47682473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 38823607 - 38823334
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38823607 tgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatatttgtttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 38823508  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac------- 581  Q
    |||| || || ||||||||  || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||           
T  38823507 gcaacattttagacttacaggtattattttatcgttggcatctctaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 38823408  T
Q  582 ----------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
              |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  38823407 tgggtgttacacttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 38823334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 393 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 3535312 - 3535055
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    |||||| |||| |||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3535312 tttttttaaaaagttagttttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 3535213  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatat----tatgtgatagtctt----aagtgttacact 584  Q
     |||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    || ||| ||  |||      ||||||||||    
T  3535212 catcttggacttaaaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtaagtgttacactttgtggggtgttacact 3535113  T
Q  585 taaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 642  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  3535112 taaaacaaggcaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgat 3535055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 429 - 645
Target Start/End: Original strand, 30326775 - 30327008
Alignment:
Q  429 ttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggca 528  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| |||||||| |    
T  30326775 ttcatttttaaattgttgattactgattgatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtattattttatcgttggaa 30326874  T
Q  529 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagatt 611  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||                 |||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  30326875 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagatt 30326974  T
Q  612 aagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30326975 aagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgat 30327008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 391 - 641
Target Start/End: Original strand, 10181792 - 10182060
Alignment:
Q  391 acttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgc 490  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10181792 acttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgc 10181891  T
Q  491 aaaatcttggacttac-atatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa--------------- 574  Q
    || || |||||||||| |  |||||||  || |||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||                   
T  10181892 aacattttggacttacaaggtactattgtattgttgtcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 10181991  T
Q  575 --gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattga 641  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  10181992 gggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattga 10182060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 385 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 28770050 - 28769850
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  28770050 aaattgatttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagcaat 28769951  T
Q  485 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 584  Q
    | |||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28769950 gtttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagaggtgatgatattatgtgatagtcttaagcgttacact 28769851  T
Q  585 t 585  Q
    |    
T  28769850 t 28769850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 358 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 22171135 - 22170908
Alignment:
Q  358 aatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgatta 457  Q
    |||||||||||| ||  || | |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||    
T  22171135 aatgggagcttctacggtgcaattagaaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactaatta 22171036  T
Q  458 atgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgata 557  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22171035 atgatcaatagtaatttatctaataatgtttgcaacatcttagacttacaagaattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgata 22170936  T
Q  558 ttatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22170935 ttatgtgatagtcttaagtgttacactt 22170908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 411 - 585
Target Start/End: Original strand, 1359740 - 1359914
Alignment:
Q  411 tttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatat 510  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||  |    
T  1359740 tttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcgatagtaattcatccagtaatgcttgcaacattttgaacttacaggt 1359839  T
Q  511 actatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1359840 actattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgataatcttaagtgttacactt 1359914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 382 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 42721435 - 42721159
Alignment:
Q  382 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 481  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  42721435 agaaaattga-ttttttaaaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactcattaatgatcaatagtaattaatctagt 42721337  T
Q  482 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg---- 577  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||        
T  42721336 aataattgcaacatcttggacttacatgtaatattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattacgtgataatcttaagtgttat 42721240  T
Q  578 -------------ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
                 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42721239 actttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 42721159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 398 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 3309538 - 3309349
Alignment:
Q  398 tgaaaaggttaattttga-tcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatc 496  Q
    |||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  3309538 tgaaaaagttaattttaaatctaaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatc 3309439  T
Q  497 ttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactta 586  Q
    ||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  3309438 ttggacttacgggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacactta 3309349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 393 - 645
Target Start/End: Original strand, 33725398 - 33725656
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcattttta-aattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgca 491  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||            |||||| |||||    
T  33725398 ttttttgaaaaagtttattttgatcttaatgttcgattcatttttttaattgttgattgctgattaatgatcaata------------gtaatgtttgca 33725485  T
Q  492 aaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa----------------- 574  Q
    | || |||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||                     
T  33725486 acattttggtcttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaaatgttacactttctggg 33725585  T
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33725586 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgat 33725656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 385 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 39393781 - 39393581
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39393781 aaattgacttttttaaaaaagttaattttaattttaatgttttattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 39393682  T
Q  485 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 584  Q
    | |||||| |||||||| ||||   |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  39393681 gtttgcaacatcttggatttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgctaatatcatatgatagtcttaagtgttacact 39393582  T
Q  585 t 585  Q
    |    
T  39393581 t 39393581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 406 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 41926532 - 41926283
Alignment:
Q  406 ttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggactta 505  Q
    |||||| |||| |||||||| | |||| ||||||||  ||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  41926532 ttaattatgattttaatgtttgattcaattttaaatcattgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttg-aatatcttggactta 41926434  T
Q  506 catatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgat-agtctta----------agtgttacacttaaaacaagg 594  Q
    ||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| |||          ||||||||||||||||||| |    
T  41926433 caagtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatttaataagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaag 41926334  T
Q  595 tagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  41926333 taggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgat 41926283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 434 - 645
Target Start/End: Original strand, 37618729 - 37618948
Alignment:
Q  434 ttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatcttt 533  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  37618729 ttttaaattgttgattattgattaatggtcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatcttt 37618828  T
Q  534 aacatgcaaacatagttgatgatattat----gtgatagtcttaa----gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgt 625  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    ||| ||  ||| |     |||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  37618829 aacatgcaaacagagttgatgatattatatgagtgttacactttatgggatgttatgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtattgt 37618928  T
Q  626 taatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  37618929 taatctgatgaattgatgat 37618948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 389 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 1547664 - 1547516
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1547664 tgacttttttgaaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgctt 1547565  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaaca 537  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  1547564 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggtatctttaaca 1547516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 378 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 21290004 - 21289817
Alignment:
Q  378 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 477  Q
    ||||| |||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21290004 agttaaaaaactgacttttttagaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatc 21289905  T
Q  478 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatag 568  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |  |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||    
T  21289904 tagtaatgtttgcaacatcttggacttataagtgttattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagagt---tgatattatgtgatag 21289817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 447 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 18422986 - 18422771
Alignment:
Q  447 attgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacat 546  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| |||||||| |||||||||||||||||      
T  18422986 attgttgattaatgatcaatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatcttggacttacatgtgcttttttatcgttggaatctttaacatgcaaacgg 18422887  T
Q  547 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact-----------------taaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaat 629  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||                 || ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18422886 aggtgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcatataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaat 18422787  T
Q  630 ctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||||    
T  18422786 ctgatgaattgatgat 18422771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 389 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 31963010 - 31962851
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaa-ttgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgct 487  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  31963010 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtagttcatctaataatgct 31962911  T
Q  488 tgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacata 547  Q
    ||||| |||||  ||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  31962910 tgcaacatcttaaacttacatatattattttatcgttgatttctttaacatgcaaacata 31962851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 468 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 38759847 - 38759730
Alignment:
Q  468 ttaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgata 567  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| || |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  38759847 ttaattaatctagtaatgcttgcaacatcttggagttacatatattattttatagttgacacctttaacatgcaaacatagttggtgatattatctgata 38759748  T
Q  568 gtcttaagtgttacactt 585  Q
    |||| |||||||||||||    
T  38759747 gtctcaagtgttacactt 38759730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 510 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 48620900 - 48620757
Alignment:
Q  510 tactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagt----cttaa----gtgttacacttaaaacaaggtagggta 601  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  ||    |||      |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  48620900 tactatttattcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggata 48620801  T
Q  602 aaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  48620800 aaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 48620757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 32216245 - 32216175
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  32216245 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatttgattaagtttagttttgttaatctaatgaattgatgat 32216175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Original strand, 47682480 - 47682550
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47682480 gtgttacacttaaaacaaggcagaataaaattagtttaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 47682550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Original strand, 238499 - 238569
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||| ||||    
T  238499 gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgattaattgttgat 238569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 576 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 39393573 - 39393503
Alignment:
Q  576 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  39393573 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagatgaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgat 39393503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 575 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 1547469 - 1547408
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 636  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  1547469 gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatctgatga 1547408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 28769829 - 28769772
Alignment:
Q  588 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  28769829 aacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgat 28769772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 584 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 3309329 - 3309267
Alignment:
Q  584 ttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  3309329 ttaaaacaaagtaggttaaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 3309267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 10922904 - 10922847
Alignment:
Q  588 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10922904 aacaaggtatgataaaataagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgat 10922847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Original strand, 28564780 - 28564837
Alignment:
Q  588 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  28564780 aacaaggcatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgat 28564837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 32267211 - 32267154
Alignment:
Q  588 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||    
T  32267211 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgggttgatgat 32267154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 46931588 - 46931531
Alignment:
Q  588 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46931588 aacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgat 46931531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 48620982 - 48620922
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgatt 449  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  48620982 tgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcattttaaaattgttgatt 48620922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 587 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 22170889 - 22170831
Alignment:
Q  587 aaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||    
T  22170889 aaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtgttattaatctaatgaattgatgat 22170831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 23999524 - 23999470
Alignment:
Q  588 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 642  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  23999524 aacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgat 23999470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26973889 - 26973807
Alignment:
Q  133 atcaatgtcctttccgaaaaatatccctattggaaccgaagtcatggagctgatcatttcatacttgcttgccatgattgggt 215  Q
    ||||||||| || | | ||||||||| ||||||||  |||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  26973889 atcaatgtcattgctggaaaatatccatattggaatagaagccttggagctgatcatttcatgctagcttgccatgactgggt 26973807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Original strand, 19899768 - 19899825
Alignment:
Q  588 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19899768 aacaatgtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgat 19899825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Original strand, 27763310 - 27763367
Alignment:
Q  588 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27763310 aactaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgat 27763367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 600 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 37451450 - 37451405
Alignment:
Q  600 taaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  37451450 taaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgataaattgatgat 37451405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 389 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 38759883 - 38759847
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgtt 425  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38759883 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtt 38759847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 84)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Original strand, 11357169 - 11357425
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11357169 tgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 11357268  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaa 588  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11357269 gcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaa 11357368  T
Q  589 acaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11357369 ataaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 11357425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 382 - 645
Target Start/End: Original strand, 43975673 - 43975949
Alignment:
Q  382 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 481  Q
    |||||| ||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43975673 agaaaactgactcttttgaaaaaattaatcttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 43975772  T
Q  482 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgca---aacatagttgatgatattatgtgatagtctta----- 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| |||||| |||         
T  43975773 aatgcttgcaaaatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacaacatagttgatgatattatgcgatagtgttacactt 43975872  T
Q  574 -----agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
          ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  43975873 tctggggtgttacacttaaaacaagataagataaaattagattaagtgcaattttgttaatctgatgaattgatgat 43975949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 395 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 22451350 - 22451083
Alignment:
Q  395 ttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaa 494  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  22451350 ttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaatttttgattgctgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaaca 22451251  T
Q  495 tcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca------------ 582  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||                
T  22451250 tcttggacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacgatagtgttaaatgttacacttactggggtg 22451151  T
Q  583 -----cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
         |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22451150 ttacacttaaaacaaggtaaggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgat 22451083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 384 - 585
Target Start/End: Original strand, 46297545 - 46297746
Alignment:
Q  384 aaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaa 483  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46297545 aaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 46297644  T
Q  484 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 583  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46297645 tgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 46297744  T
Q  584 tt 585  Q
    ||    
T  46297745 tt 46297746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Original strand, 52040710 - 52040983
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  52040710 tgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaataatcattcatctagtaatgttt 52040809  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg----------- 577  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||               
T  52040810 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactatgt 52040909  T
Q  578 ------ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  52040910 ggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgat 52040983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 378 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 48355340 - 48355056
Alignment:
Q  378 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 477  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  48355340 agttaggaaattgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgcttactgattaatgatcaataataattcatc 48355241  T
Q  478 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 577  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48355240 tagtaatacttgcaacatcttggacttacagatactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 48355141  T
Q  578 ttacac-----------------ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||                 ||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48355140 ttacactttgtggtatgttacatttataacaaggtaggataaaattagactaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgat 48355056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 361 - 645
Target Start/End: Original strand, 26941020 - 26941321
Alignment:
Q  361 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 460  Q
    ||||||||| ||  || ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| | | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26941020 gggagcttctacggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaacgcttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 26941119  T
Q  461 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 560  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26941120 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatatta 26941219  T
Q  561 tgtgatagtcttaagtgttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatg 643  Q
    | ||||||| ||||||||||||                 |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  26941220 tatgatagttttaagtgttacactttatgaggtattacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatg 26941319  T
Q  644 at 645  Q
    ||    
T  26941320 at 26941321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 360 - 642
Target Start/End: Original strand, 33378544 - 33378843
Alignment:
Q  360 tgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaat 459  Q
    |||||||||| ||  || ||| || ||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  33378544 tgggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttgattattgattaat 33378643  T
Q  460 gatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatt 559  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33378644 gatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgagatt 33378743  T
Q  560 atgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 642  Q
    ||| |||||||||||                 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33378744 atgcgatagtcttaagtattacacttcttggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 33378843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 393 - 645
Target Start/End: Original strand, 53228944 - 53229213
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53228944 ttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaa 53229043  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagt---------------- 576  Q
     |||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||                    
T  53229044 catcttgaacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatactatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggg 53229143  T
Q  577 -gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
     ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53229144 agttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaactgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 53229213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 385 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 40936365 - 40936106
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| | | || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  40936365 aaattgacttttttgaaaaagttaatttcaatcttaatgattgatttatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtaatttatctagtaat 40936266  T
Q  485 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 584  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40936265 gcttgcaacatcttagacttgcatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgctaatatcatgtgatagtcttaagtgttacact 40936166  T
Q  585 taaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||| || || || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  40936165 taaaa-aaagttggataaaattatattaagtgtattcttgttaatctgatgaatagatgat 40936106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 393 - 645
Target Start/End: Original strand, 22622510 - 22622779
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22622510 ttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaatagttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 22622609  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------g 575  Q
     ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||                 |    
T  22622610 catcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacgctttgtgggg 22622709  T
Q  576 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22622710 tgttacacttgaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgat 22622779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 33698541 - 33698268
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33698541 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgactgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 33698442  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac------- 581  Q
    |||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||           
T  33698441 gcaatatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgccgatatcatgcgatagtcttaagtgttacactttgt 33698342  T
Q  582 ----------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
              ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  33698341 ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 33698268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 39283040 - 39282767
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  39283040 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgctt 39282941  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac------- 581  Q
    |||| || ||||| ||||| ||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  39282940 gcaacattttggatttacagatactattttattgttgacatctttaacaggcaaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 39282841  T
Q  582 ----------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
              |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39282840 ggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatggatgat 39282767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 385 - 645
Target Start/End: Original strand, 42505859 - 42506136
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| | | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42505859 aaattgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 42505958  T
Q  485 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca-- 582  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  42505959 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 42506058  T
Q  583 ---------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
                   |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42506059 ttgtggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 42506136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 385 - 645
Target Start/End: Original strand, 44186301 - 44186562
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  44186301 aaattgattttttcgaaaatgttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatttatctagtaat 44186400  T
Q  485 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatag-tcttaagtgttacac 583  Q
    |||||||| ||||| |||||| |  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| | |   ||||||||     
T  44186401 gcttgcaacatcttagacttagaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagttgtggggtgttacat 44186500  T
Q  584 ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||    
T  44186501 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatttgatgaattgatgat 44186562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 389 - 583
Target Start/End: Original strand, 40552047 - 40552241
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40552047 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgctt 40552146  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 583  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  40552147 gcaacatcatggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacaatcctaagtgttacac 40552241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 389 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 1090081 - 1089886
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1090081 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 1089982  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1089981 gcaaaatcttggattta-atgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactt 1089886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 352 - 585
Target Start/End: Original strand, 21009552 - 21009786
Alignment:
Q  352 ttaattaatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgc 451  Q
    |||||||||||||| ||| ||  || ||| || ||| |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  21009552 ttaattaatgggagtttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattac 21009651  T
Q  452 tgattaatgatcaatatta-attcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagtt 550  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||    
T  21009652 tgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatattgtt 21009751  T
Q  551 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21009752 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 21009786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 385 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 54506200 - 54505999
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaa 483  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  54506200 aaattgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaa 54506101  T
Q  484 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 583  Q
    ||||||||| || ||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54506100 tgcttgcaacattttggacttataaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagtagatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 54506001  T
Q  584 tt 585  Q
    ||    
T  54506000 tt 54505999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 389 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 4015847 - 4015652
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4015847 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 4015748  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  4015747 gcaacatcttggacttacatgtactattttaccgttggcatctttaacatgcaaaca-agttgttgatacaatgcgatagtcttaagtgtgacactt 4015652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 382 - 585
Target Start/End: Original strand, 24707896 - 24708099
Alignment:
Q  382 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 481  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| |    
T  24707896 agaaaattgatttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaatttatctaat 24707995  T
Q  482 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 581  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  24707996 aatgcttgcaacttcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgattgttttaagtgttac 24708095  T
Q  582 actt 585  Q
    ||||    
T  24708096 actt 24708099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 389 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 2008327 - 2008047
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattg-------ctgattaatgatcaatattaattcatctagt 481  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2008327 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattactgattaatgatcaatattatttcatctagt 2008228  T
Q  482 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 581  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2008227 aatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttac 2008128  T
Q  582 ----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatg 646  Q
                    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  2008127 actttgtggagtgtacacttaaaacgaggtaggataaaattagattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatg 2008047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 389 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 37158096 - 37157899
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  37158096 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgctt 37157997  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaac-atagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    || | || |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37157996 gcgacatattggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 37157899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 385 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 3362647 - 3362447
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  3362647 aaattgacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaat 3362548  T
Q  485 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 584  Q
    |||||||| || ||||||||  |  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3362547 gcttgcaacatattggacttctaagtacaattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtcttaagtgttacact 3362448  T
Q  585 t 585  Q
    |    
T  3362447 t 3362447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Original strand, 14586468 - 14586731
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  14586468 tgacttttttgaaaaaattaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcagtagtaatttatctagtaatgctt 14586567  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattat----gtgatagtctt----aagtgtta 580  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    ||| ||  |||      ||||||    
T  14586568 gcaacatcttggacttac-cgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatcatacgagtgttacactttgtggggtgtta 14586666  T
Q  581 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  14586667 cacttaaaacaaggtaggataaagttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 14586731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 37203456 - 37203182
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  37203456 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgctt 37203357  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaac-atagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt-- 585  Q
    || | || |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  37203356 gcgatatattggacttacaggtactattttatcattgacatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttg 37203257  T
Q  586 ---------------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
                   |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  37203256 tggggtgatacactaaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttatgaattgatgat 37203182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 385 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 47481915 - 47481714
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaa 483  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  47481915 aaattgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaa 47481816  T
Q  484 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 583  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  |||||||| |||||||  |||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47481815 tgcttgcaacatcttgaacttacaagtactattttatcgttgaaatctttaatatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 47481716  T
Q  584 tt 585  Q
    ||    
T  47481715 tt 47481714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 393 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 29099730 - 29099470
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29099730 ttttttgaaaaagttaattttaatattaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaa 29099631  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagt----ctt----aagtgttacact 584  Q
     |||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||    |||      ||||||||||    
T  29099630 catcttggacttaaaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgaaagttacactttgtggggtgttacact 29099531  T
Q  585 taaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||| |||| | | |||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  29099530 taaaataaggcacgataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgat 29099470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 44891885 - 44891612
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  44891885 tgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgctt 44891786  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac------- 581  Q
    |||| ||||| |||||  |  |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||           
T  44891785 gcaacatcttagacttgtaggtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 44891686  T
Q  582 ----------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
              ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  44891685 ggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgattaattgatgat 44891612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 393 - 585
Target Start/End: Original strand, 7327274 - 7327466
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||  | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7327274 ttttttaaaaaagttaattttaatcttaataattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 7327373  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
     ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7327374 catcttagacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 7327466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 385 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 25580131 - 25579931
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25580131 aaattgacttttttaaaaaagttaatcttaatcttaatgattggttcatttttaaattgttgattgcggattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 25580032  T
Q  485 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 584  Q
    |||||||| ||||| || ||| |  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  25580031 gcttgcaatatcttagatttataggtacagttttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtaatagtcttaagtgttacact 25579932  T
Q  585 t 585  Q
    |    
T  25579931 t 25579931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Original strand, 22445853 - 22446125
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  22445853 tgacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatatttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaatactt 22445952  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtct----------------t 572  Q
    |||| || ||||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||                |    
T  22445953 gcaacattttggacttaaaggtactattttatcgttggtatctttaatatgcaaaaatagttgatgatattatatgatagtcttgagtgttatacattgt 22446052  T
Q  573 aagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||    
T  22446053 gagtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttatttatatgatgaattgatgat 22446125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 393 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 32373853 - 32373585
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| || |   |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  32373853 ttttttgaaaaagttaattttaatcttattgatgaattcatttt-aaattgttgattactgattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaa 32373755  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag----------------- 575  Q
     ||||| ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||                     
T  32373754 catcttagacttacaagtactattttatcgttgacatctttaatatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtcacactttgtggga 32373655  T
Q  576 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  32373654 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgat 32373585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 429 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 34133283 - 34133127
Alignment:
Q  429 ttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggca 528  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  34133283 ttcatttttaaattgttgattaccgattcatgattactagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggca 34133184  T
Q  529 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34133183 tctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 34133127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 430 - 645
Target Start/End: Original strand, 46994490 - 46994722
Alignment:
Q  430 tcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcat 529  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| || || || ||    
T  46994490 tcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaat 46994589  T
Q  530 ctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagatta 612  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||                 |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  46994590 ctttagcatgcaaacataattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggcgttacacttataacaaggtaggataaaattagatta 46994689  T
Q  613 agtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||| |||||||||||||  |||| ||||||||    
T  46994690 agtgtagtcttgttaatcatatgagttgatgat 46994722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 391 - 585
Target Start/End: Original strand, 4761438 - 4761632
Alignment:
Q  391 acttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgc 490  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||    
T  4761438 actttttttaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcattttcaaattgttgatttctgattaatgattaatagtaattcatctggtaatgtttgc 4761537  T
Q  491 aaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    || || ||||||||| |  |||||||| || || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4761538 aacattttggacttataggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttatactt 4761632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 385 - 585
Target Start/End: Original strand, 27480142 - 27480350
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    ||||||| |||||| ||||   |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  27480142 aaattgattttttttaaaaatataattttgttcttaatgttcgattcatttttaaattgttgatcgctgattaataatcaatagtaattcatctagtaat 27480241  T
Q  485 gcttgcaaa----atcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaac----atagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 576  Q
    | ||| ||     || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27480242 gtttgtaattaacattttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatatatagttgatgatattatgcgatagtcttaagt 27480341  T
Q  577 gttacactt 585  Q
    |||||||||    
T  27480342 gttacactt 27480350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 382 - 573
Target Start/End: Original strand, 51212558 - 51212743
Alignment:
Q  382 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 481  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  51212558 agaaaactgacatttttgaaaaagttaattttgatcttaat------ttcatttttaaattgttgatttttaattaatgatcaatagtaattcatctagt 51212651  T
Q  482 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtctta 573  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  51212652 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagcctta 51212743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 21193995 - 21193721
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  21193995 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatttagtaatggtt 21193896  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtctt---------------- 572  Q
    |||| |||||| ||||||   |||||||| |||||  | |||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||                    
T  21193895 gcaacatcttgaacttacggctactattttatcgtgagaatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtctttaagtgttatccttta 21193796  T
Q  573 --aagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||    
T  21193795 tggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattaatgat 21193721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 382 - 645
Target Start/End: Original strand, 3654980 - 3655263
Alignment:
Q  382 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttc-atttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcat--ct 478  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||  ||    
T  3654980 agaaaactgatttttttgaaaatgttaattttgattttaatgtttgattttatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatatct 3655079  T
Q  479 agtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 578  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || |  ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  3655080 agtaatgcttgcaacatcttggacttatatgtgttattttatcgatggaatctttaacatgcaaacagagctgatgatatcatgtgatagttttaagtgt 3655179  T
Q  579 taca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||                 |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  3655180 tacattttgtggtgtgttacgcttctaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 3655263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 29164190 - 29163933
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    |||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29164190 tgacttttctaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgatt-------aatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 29164098  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagtgtta 580  Q
    | || ||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    ||  |||      ||||||    
T  29164097 gtaacatcttagacttacaagtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtgtta 29163998  T
Q  581 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  29163997 cacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgat 29163933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 389 - 585
Target Start/End: Original strand, 11356946 - 11357134
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||        |||||||    
T  11356946 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttggattcatttttaaattgttgattactaattaatgatgaatagtaatt--------aatgctt 11357037  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  11357038 gcaacatcttggacttacaaatactattttatcattggcatatttaacatacaaccagagttgatgatattatatgatagtcttgagtgttacactt 11357134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 385 - 583
Target Start/End: Original strand, 24488745 - 24488944
Alignment:
Q  385 aaattgactttt-ttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaa 483  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||| || |||||||| | |||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| |||| |||| ||||||||||    
T  24488745 aaattgacttttatttaaaaagttaattttaatattaatgtttgattcatttttaaattattgattattgattcatgattaatagtaatgcatctagtaa 24488844  T
Q  484 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 583  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | ||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24488845 tgcttgcaacatcttgaacttactgacactattttattgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttacac 24488944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 389 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 36012528 - 36012333
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaa-ttttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgct 487  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36012528 tgacttttttgaaaaagttaaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgct 36012429  T
Q  488 tgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaac-atagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 582  Q
    ||||  || |||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  36012428 tgcagcattttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacaagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttaca 36012333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 446 - 585
Target Start/End: Original strand, 54828546 - 54828685
Alignment:
Q  446 gattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaaca 545  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||||    
T  54828546 gattactgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatagttggaatttttaacatacaaaca 54828645  T
Q  546 tagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  54828646 tagttgatgatattatttgatagttttaagtgttacactt 54828685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 429 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 38592046 - 38591816
Alignment:
Q  429 ttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggca 528  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | || |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||    
T  38592046 ttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatttgtttaataatgcttgcaacatcttggatttacaaatacttttttatcgttgtca 38591947  T
Q  529 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-----------------ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagatt 611  Q
    ||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||                 |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  38591946 tctttgacatgcaaatagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtcacgttttgtggggtattacacttgaaacaagataggataaaattagatt 38591847  T
Q  612 aagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 642  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  38591846 aagtgtagtcttgttaatctgatgagttgat 38591816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 389 - 585
Target Start/End: Original strand, 20373051 - 20373228
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||              
T  20373051 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatct---------- 20373140  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
             |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20373141 ---------tggacttatatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactt 20373228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 11467198 - 11466939
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||       ||    
T  11467198 tgacttttttgaaaaagttaattttattcttaatgattgattcatttttaaattgttgatt-------aatgatcaatagtaattcatcta-------tt 11467113  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt--- 585  Q
    |||| ||||| ||||| ||  ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||       
T  11467112 gcaacatcttagacttgcaggtactattttgtcgttggtatcttaaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 11467013  T
Q  586 --------------aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
                  ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  11467012 ggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 11466939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 396 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 50475199 - 50475021
Alignment:
Q  396 tttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgat-------caatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||       ||||| ||||||||||||||||||||    
T  50475199 tttgaaaaatttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgattaatgatcaatactaattcatctagtaatgctt 50475100  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgata 567  Q
    |||| ||||||||||||||  || ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  50475099 gcaacatcttggacttacaagtattattttatccttgacatctttaatatgcaaacagatttgatgatattatatgata 50475021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 471 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 43348563 - 43348372
Alignment:
Q  471 attcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 570  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||    
T  43348563 attcatttagtaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtc 43348464  T
Q  571 ttaag-----------------tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||                 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  43348463 ttaagtgtcacactttatgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 43348372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 462 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 45174821 - 45174698
Alignment:
Q  462 tcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattat 561  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||    
T  45174821 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgttactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcat 45174722  T
Q  562 gtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
     | |||||||||||||||||||||    
T  45174721 attatagtcttaagtgttacactt 45174698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Original strand, 27480370 - 27480440
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27480370 gtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgat 27480440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 462 - 585
Target Start/End: Original strand, 11835494 - 11835611
Alignment:
Q  462 tcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattat 561  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||      |||||||| | |||||||||||| ||    
T  11835494 tcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttaacat------catgcaaatagagttgatgatatcat 11835587  T
Q  562 gtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  11835588 gtgatagtcttaattgttacactt 11835611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 464 - 572
Target Start/End: Original strand, 53811597 - 53811701
Alignment:
Q  464 aatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgt 563  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||   || ||||| |||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  53811597 aatagtaattcatctaggaatgcctgcaacatcttggacttacgagtattattttatcgttggtatctttaacatgcaa----agttgatgatattatgt 53811692  T
Q  564 gatagtctt 572  Q
    |||||||||    
T  53811693 gatagtctt 53811701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Original strand, 51212972 - 51213042
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51212972 gtgttacacttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgat 51213042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 35844512 - 35844441
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  35844512 gtgttacacttaaaactaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 35844441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Original strand, 24488953 - 24489023
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  24488953 gtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgat 24489023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 34133120 - 34133050
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||    
T  34133120 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgat 34133050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Original strand, 46297753 - 46297823
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  46297753 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaagtttgattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgat 46297823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Original strand, 20373300 - 20373357
Alignment:
Q  588 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20373300 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgat 20373357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 574 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 45174692 - 45174620
Alignment:
Q  574 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  45174692 agtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 45174620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Original strand, 4761653 - 4761710
Alignment:
Q  588 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  4761653 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgat 4761710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 574 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 53176240 - 53176169
Alignment:
Q  574 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||| | ||||||  |||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  53176240 agtgttatatttaaaatgaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgat 53176169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 591 - 646
Target Start/End: Original strand, 54828708 - 54828763
Alignment:
Q  591 aaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatg 646  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  54828708 aaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttcatatgatgaattgatgatg 54828763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 576 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 1089877 - 1089811
Alignment:
Q  576 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 642  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||| |||| ||||||| |||||||    
T  1089877 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatttaatgtagtcctgttgatctgataaattgat 1089811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 4015645 - 4015575
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |  | |||||||||| |||||||||||||||    
T  4015645 gtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagactaattatattcttgttaatatgatgaattgatgat 4015575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 576 - 645
Target Start/End: Original strand, 11835619 - 11835689
Alignment:
Q  576 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaa-attagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | |||||||| |||| ||||||||||    
T  11835619 tgttacacttaaaacaaggtaggataaatattagattaagtgtatttttgttaatatgataaattgatgat 11835689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 35844639 - 35844577
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttga 447  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | || ||||||||||||||||    
T  35844639 aaattgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttga 35844577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 37157876 - 37157822
Alignment:
Q  591 aaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  37157876 aaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttataaattgatgat 37157822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 587 - 645
Target Start/End: Original strand, 24708118 - 24708178
Alignment:
Q  587 aaacaaggtagggtaaaattagattaa--gtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24708118 aaacaaggtaggataaaattagatcaaaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 24708178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 581 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 3362434 - 3362368
Alignment:
Q  581 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagatta--agtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  3362434 cacttaaaataaggtaggataaaattagattaatagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgat 3362368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Original strand, 40552258 - 40552320
Alignment:
Q  583 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||| |||||| || | |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40552258 cttataacaagctaagataaaattaaattaagtgtagtgttgttaatctgatgaattgatgat 40552320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Original strand, 21009806 - 21009863
Alignment:
Q  588 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||| || | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21009806 aacaagttatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgat 21009863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 216
Target Start/End: Original strand, 36806094 - 36806159
Alignment:
Q  151 aaatatccctattggaaccgaagtcatggagctgatcatttcatacttgcttgccatgattgggta 216  Q
    |||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  36806094 aaatatgcatattggaatagaagttatggagctgatcatttcatgctttcttgtcatgattgggta 36806159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 36012312 - 36012252
Alignment:
Q  586 aaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  36012312 aaaacaaggtaggataaaaattagattaggtgtattcttgttcatctgatgaattgatgat 36012252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 25579913 - 25579854
Alignment:
Q  586 aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| || || |||||||    
T  25579913 aaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatctaataaactgatgat 25579854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 522 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 35844581 - 35844519
Alignment:
Q  522 gttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  35844581 gttgacatctttaacatggaaacaaagttactgatatcatgtgata-tcttaagtgttacactt 35844519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 645
Target Start/End: Original strand, 7327485 - 7327543
Alignment:
Q  587 aaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||| |||||||| ||||| || |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  7327485 aaagaaggtaggataaaaataaattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgat 7327543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 217
Target Start/End: Original strand, 49301577 - 49301631
Alignment:
Q  163 tggaaccgaagtcatggagctgatcatttcatacttgcttgccatgattgggtaa 217  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49301577 tggaacagaactcatggtgctgaccacttcatgcttgcttgccatgattgggtaa 49301631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 547 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 53176284 - 53176246
Alignment:
Q  547 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53176284 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 53176246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 13498731 - 13498678
Alignment:
Q  363 gagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgat 416  Q
    ||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  13498731 gagcttctacagtgtagtcagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttgat 13498678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 34133357 - 34133312
Alignment:
Q  378 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatg 423  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  34133357 agttaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatg 34133312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 36515132 - 36515067
Alignment:
Q  151 aaatatccctattggaaccgaagtcatggagctgatcatttcatacttgcttgccatgattgggta 216  Q
    |||||| | ||||||||  ||||| |||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  36515132 aaatatgcttattggaatagaagttatggagctgaccatttcatgctttcttgtcatgattgggta 36515067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 600 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 47481682 - 47481637
Alignment:
Q  600 taaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  47481682 taaaattatattaagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgat 47481637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 67)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 24886484 - 24886228
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24886484 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 24886385  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaa 588  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24886384 gcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttata 24886285  T
Q  589 acaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  24886284 ataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgagttgatgat 24886228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 393 - 645
Target Start/End: Original strand, 14409123 - 14409378
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    |||||||||||  |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  14409123 ttttttgaaaaatttaattttaattttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgaataatgatcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaa 14409222  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag---tgttacacttaaaa 589  Q
     ||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||    
T  14409223 catcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagagtagttacacttaaaa 14409322  T
Q  590 caaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409323 caaggtagaataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 14409378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 22981190 - 22980917
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22981190 tgactttttaaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgatt 22981091  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt---------- 578  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||              
T  22981090 gcaacatcttggacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgt 22980991  T
Q  579 -------tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
           |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22980990 gaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 22980917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 378 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 33908640 - 33908357
Alignment:
Q  378 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 477  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  33908640 agttagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaatt-atc 33908542  T
Q  478 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 577  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  33908541 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgacgatattatgcgatagtcttaagtg 33908442  T
Q  578 ttacac-----------------ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||                 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33908441 ttacactttctggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgaataattgatgat 33908357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 699547 - 699274
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  699547 tgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgctt 699448  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtctta--------------- 573  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
T  699447 gcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgt 699348  T
Q  574 --agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
      |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  699347 ggagtgttacacttaaaataaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 699274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Original strand, 31786424 - 31786697
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31786424 tgacttttttgaaaaagttaattttgatattaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgctt 31786523  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-------------- 574  Q
    |||| |||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||                  
T  31786524 gcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgt 31786623  T
Q  575 ---gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
       ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31786624 agggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 31786697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 435 - 645
Target Start/End: Original strand, 1428983 - 1429196
Alignment:
Q  435 tttaaattgttga---ttgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatct 531  Q
    |||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  1428983 tttaaattgttgaatattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatct 1429082  T
Q  532 ttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatct 631  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  1429083 ttaacatgcaaataaagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaattt 1429182  T
Q  632 gatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||    
T  1429183 gatgaattgatgat 1429196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 385 - 645
Target Start/End: Original strand, 31705386 - 31705663
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31705386 aaattgacttttttgaaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 31705485  T
Q  485 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca-- 582  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  31705486 gcttgcaacatcttggacttatatgtactattttatctttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatggtcttaagtgttacatt 31705585  T
Q  583 ---------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
                   |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31705586 ttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 31705663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 382 - 585
Target Start/End: Original strand, 2888216 - 2888419
Alignment:
Q  382 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 481  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2888216 agaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagt 2888315  T
Q  482 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 581  Q
    |||||||| || ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2888316 aatgcttgtaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatctgatagtcttaagtgttac 2888415  T
Q  582 actt 585  Q
    ||||    
T  2888416 actt 2888419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Original strand, 35511260 - 35511528
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  35511260 tgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgctt 35511359  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgata--gtctta----------agt 576  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  || |||           ||    
T  35511360 gcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtgtgttacattttgtggggt 35511459  T
Q  577 gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35511460 gttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattggtgat 35511528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Original strand, 7208642 - 7208915
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  7208642 tgactttttttaaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatactt 7208741  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac----- 583  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||         
T  7208742 gcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgaaaatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 7208841  T
Q  584 ------------ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
                ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7208842 gaggtgttacgtttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 7208915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 393 - 645
Target Start/End: Original strand, 38528019 - 38528288
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38528019 ttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 38528118  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------g 575  Q
     ||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||                 |    
T  38528119 catcttggacttacaagtactattttatcgttgatatctttaacatgtaaatagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggg 38528218  T
Q  576 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38528219 tgttacacttgaaacaaggtaagataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 38528288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 382 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 5830296 - 5830093
Alignment:
Q  382 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggtt-catttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctag 480  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5830296 agaaaattgacattttggaaaag-ttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctag 5830198  T
Q  481 taatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 580  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5830197 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgtta 5830098  T
Q  581 cactt 585  Q
    |||||    
T  5830097 cactt 5830093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 361 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 40133810 - 40133586
Alignment:
Q  361 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 460  Q
    ||||||||| ||  || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  40133810 gggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatg 40133711  T
Q  461 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 560  Q
    || |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40133710 attaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatatta 40133611  T
Q  561 tgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  40133610 tgtgatagttttaagtgttacactt 40133586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 389 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 12910752 - 12910483
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12910752 tgacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgctt 12910653  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac------- 581  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||  || ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||           
T  12910652 gcaacatcttggacttacatgtattattgtattgttggcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgt 12910553  T
Q  582 ----------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattga 641  Q
              ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  12910552 ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcatgttaatctgatgaattga 12910483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 22255579 - 22255306
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22255579 tgactttttttaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaaggctt 22255480  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca------ 582  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||          
T  22255479 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatatttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagttttaagtgttacactttgt 22255380  T
Q  583 -----------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
               |||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22255379 gtggtgttacgcttataacaaaataggctaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 22255306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 385 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 35504766 - 35504566
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  35504766 aaattgacttttttgaaaaagtcaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaat 35504667  T
Q  485 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 584  Q
     ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35504666 acttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagatttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacact 35504567  T
Q  585 t 585  Q
    |    
T  35504566 t 35504566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 32563537 - 32563273
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
T  32563537 tgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttaattgctgattaatgatcaataataatttatctagtaattctt 32563438  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagtgtta 580  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    ||  |||       |||||    
T  32563437 gcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctataacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtgggctgtta 32563338  T
Q  581 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  32563337 cacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 32563273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 361 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 36867187 - 36866963
Alignment:
Q  361 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 460  Q
    ||||||||| ||  || ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  36867187 gggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatg 36867088  T
Q  461 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 560  Q
    || |||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36867087 attaatagtaattcatccagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatatta 36866988  T
Q  561 tgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  36866987 tgtgatagttttaagtgttacactt 36866963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 382 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 36860828 - 36860625
Alignment:
Q  382 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 481  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| |||||||| ||||    
T  36860828 agaaaattgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgcttgattcatttttaaattgttgattactaattcatgattaatagtaattcatttagt 36860729  T
Q  482 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 581  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36860728 aatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttac 36860629  T
Q  582 actt 585  Q
    ||||    
T  36860628 actt 36860625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 389 - 585
Target Start/End: Original strand, 15992318 - 15992514
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15992318 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 15992417  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15992418 gcaacatcttggacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttcctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactt 15992514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 385 - 585
Target Start/End: Original strand, 17157805 - 17158005
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17157805 aaattgacttttttgaaaaagtcaagtttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaat 17157904  T
Q  485 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 584  Q
    |||||||| |||||||||||| |  |||||||| |||||||  ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17157905 gcttgcaacatcttggacttaaaagtactattttatcgttgaaatctttatcatgcaaacagagttgataatattatgtgatggtcttaagtgttacact 17158004  T
Q  585 t 585  Q
    |    
T  17158005 t 17158005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 382 - 645
Target Start/End: Original strand, 22973853 - 22974133
Alignment:
Q  382 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 481  Q
    |||||| ||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22973853 agaaaactgattttttttaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagt 22973952  T
Q  482 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 581  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || |  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22973953 aatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgaaatctttaacatgcaaacagagttgataatattatgtaatagtcttaagtgttac 22974052  T
Q  582 a-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |                 |||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22974053 attttgtgaggtgttacgcttataacaagataggataaaattagattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgat 22974133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 379 - 585
Target Start/End: Original strand, 35826254 - 35826458
Alignment:
Q  379 gttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatct 478  Q
    ||||||||| ||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  35826254 gttagaaaactggttttttttaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatct 35826353  T
Q  479 agtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 578  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| ||    
T  35826354 agtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatatta--tgataatcttaagggt 35826451  T
Q  579 tacactt 585  Q
    |||||||    
T  35826452 tacactt 35826458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 389 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 8437362 - 8437168
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  8437362 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatatttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttt 8437263  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 583  Q
     ||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8437262 tcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacattcaaacagagttgatcatattatgtgataatcttaagtgttacac 8437168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 42343118 - 42342855
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  42343118 tgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgctt 42343019  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagtgtta 580  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    ||  |||      || |||    
T  42343018 gcaacatcttagacttacatgtcctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtgagtgttacactttgtggtgtatta 42342919  T
Q  581 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  42342918 cacttaaaacaa-gtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 42342855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 393 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 8467119 - 8466868
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    |||||| |||| |||||||||  | |||||||| | |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8467119 tttttttaaaaagttaattttatttttaatgtttgattcatttttaaactgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 8467020  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaa 592  Q
     || ||||||||||| ||| ||||| ||||||  || |||||| ||| ||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8467019 cattttggacttacaaataatattttatcgtt-acacctttaatatgtaaacagagttggtgatatcatatgatagtcttaagtgttacatttaaaacaa 8466921  T
Q  593 ggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||  |||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  8466920 ggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgat 8466868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 390 - 585
Target Start/End: Original strand, 8741664 - 8741860
Alignment:
Q  390 gacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttg 489  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  8741664 gacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatttcatctagtgatgcttg 8741763  T
Q  490 caaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgat-attatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  8741764 caacattttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctcataatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 8741860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 389 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 19120256 - 19120060
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19120256 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgatcactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 19120157  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    |||| ||||| |||||  |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19120156 gcaacatcttagactttgaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 19120060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 22020020 - 22019756
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22020020 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 22019921  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtctta--------agtgtta 580  Q
     ||| ||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||  ||  ||         ||||||    
T  22019920 acaacatcttagacttacaagtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtgagtgttatactttgtggggtgtta 22019821  T
Q  581 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||    
T  22019820 cacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaagtgatgat 22019756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 393 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 25669969 - 25669739
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25669969 ttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 25669870  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga----tagtctt---aagtgttacactt 585  Q
     || || ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    ||  |||    ||||||||||||    
T  25669869 cattttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtgagtgttacacttgtggagtgttacactt 25669770  T
Q  586 aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 616  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25669769 aaaacaaagtaggataaaattagattaagtg 25669739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 393 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 9200617 - 9200357
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    |||||||||||  |||||||| || ||||  || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9200617 ttttttgaaaaaattaattttaattttaaattttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 9200518  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagtgttacact 584  Q
     ||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    ||  |||     | |||||||||    
T  9200517 catcttagacttatagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtggaatgttacact 9200418  T
Q  585 taaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||    
T  9200417 taaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgat 9200357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 389 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 5837952 - 5837756
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| | | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5837952 tgacttttttgaaaaggttaattttaattttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgctt 5837853  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5837852 gcaacatcttggacttgcaggtactattttgtcgttgtcatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 5837756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 382 - 645
Target Start/End: Original strand, 27318259 - 27318538
Alignment:
Q  382 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaa-ttgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctag 480  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||    
T  27318259 agaaaactgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaaattgttgatttttgattaatgatcaatagtaattcatatag 27318358  T
Q  481 taatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 580  Q
    ||||| |||||| |||||  |||||  | |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27318359 taatgtttgcaacatcttaaactta--tgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 27318456  T
Q  581 ca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||                 ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  27318457 cactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgat 27318538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 385 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 27330705 - 27330428
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27330705 aaattgacttgtttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 27330606  T
Q  485 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------- 574  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |||| || ||||  |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| |||||||||||              
T  27330605 gcttgcaacatcttggacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacact 27330506  T
Q  575 -------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
           |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||    
T  27330505 tcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgat 27330428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Original strand, 23116008 - 23116273
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |        |||||||||    
T  23116008 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtca--------gtaatgctt 23116099  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-------------- 574  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||                  
T  23116100 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 23116199  T
Q  575 ---gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
       ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  23116200 ggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatattgttaatctgatgaattgatgat 23116273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 393 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 35934289 - 35934097
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  35934289 ttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgaatcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcaactagtaatgcttgcaa 35934190  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
     |||||||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35934189 catcttggacttaccggtactattttattgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 35934097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 39573208 - 39572943
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39573208 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 39573109  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag------------- 575  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||        |||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||                 
T  39573108 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggcatcttt--------aacagagttgttgatatcatgtgatagtctcgagtgttacactttgt 39573017  T
Q  576 ----tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  39573016 gggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgat 39572943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 351 - 581
Target Start/End: Original strand, 13956104 - 13956332
Alignment:
Q  351 attaattaatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattg 450  Q
    ||||||||| | ||||||| ||  || ||| |||||  ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |    | ||  ||||||||||||     
T  13956104 attaattaaagagagcttctacggtgcagtcagaaagctgatttttttgaaaatgttaattttgattttaatgtttgaaaaagtt--aaattgttgatta 13956201  T
Q  451 ctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagtt 550  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  13956202 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactaacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaattt 13956301  T
Q  551 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 581  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13956302 gatgatattatatgatagtcttaagtgttac 13956332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 389 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 25889767 - 25889584
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25889767 tgacttttctggaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 25889668  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtctt 572  Q
     ||| |||||||| |||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  25889667 tcaacatcttggatttacaggtactattttattgttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtcataatctt 25889584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 393 - 645
Target Start/End: Original strand, 30969106 - 30969375
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    |||||| |||| ||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||     
T  30969106 ttttttaaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgtggattactgattaatgattaatagtaactcatctagtaatacttgcag 30969205  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------g 575  Q
     |||||| ||||| | ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||                 |    
T  30969206 catcttgaacttatagatactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgagg 30969305  T
Q  576 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  30969306 tgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 30969375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 7693618 - 7693354
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    |||||||| | |||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  7693618 tgacttttctaaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgctt 7693519  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagtgtta 580  Q
    |||| ||||| ||||||||  || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||    ||  |||      ||||||    
T  7693518 gcaacatcttagacttacaagtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctaatatcatgtgagtgttacactttgtggggtgtta 7693419  T
Q  581 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| | | || ||||||||| |||||||||||||    
T  7693418 cacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagcgtattcatgttaatctaatgaattgatgat 7693354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 351 - 645
Target Start/End: Original strand, 23954542 - 23954840
Alignment:
Q  351 attaattaatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattg 450  Q
    ||||||||| ||||||||| |   || ||| || ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||     
T  23954542 attaattaaagggagcttctatggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgatt- 23954640  T
Q  451 ctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagtt 550  Q
          ||||||||||| ||||||||| ||||||| |      |||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  23954641 ------aatgatcaatagtaattcatcaagtaatgttc-----atcttgcacttacaaatattattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagtt 23954728  T
Q  551 gatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||                 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  23954729 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatga 23954828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 393 - 645
Target Start/End: Original strand, 25500708 - 25500977
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| | || | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  25500708 ttttttgaaaaagttaattttaatcttagtatttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaacagtatttcatctagtaatgcttgcaa 25500807  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------g 575  Q
     ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| | ||||| |||||| |||||||  ||||||                 |    
T  25500808 catcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatctaaagaaagttgctgatatcatgtgatgatcttaagtgttacactttgtgggg 25500907  T
Q  576 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  25500908 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtttattcttgttaatctgatgaattgatgat 25500977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 378 - 645
Target Start/End: Original strand, 43308427 - 43308703
Alignment:
Q  378 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 477  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| | || | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  43308427 agttaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttagtatttgattcgtttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatc 43308526  T
Q  478 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgata-----ttatgtgatagtctt 572  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| || || || |||||||||||||||  | |||||||||||     ||| ||| ||  |||    
T  43308527 tagtaatgcttgcaacatcttcgacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagaagagttgatgatatagtcttaagtgttacactt 43308626  T
Q  573 ----aagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
          |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  43308627 ttcagggtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaagtatagttttgttaagctgatgagttgatgat 43308703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 393 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 15724881 - 15724689
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  |||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  15724881 ttttttgaaaaagttaattttaactttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaa 15724782  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
     || |||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  15724781 tattttggacttacaagtactattttatagttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactt 15724689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 378 - 585
Target Start/End: Original strand, 21088535 - 21088740
Alignment:
Q  378 agttagaaaattgacttttttgaaaagg-ttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcat 476  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||   |||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||| | |||    ||| ||||| |||| ||||||||    
T  21088535 agttagaaaactgactttttaaaaaaaaattaactttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgattattt---attcatgattaatagtaattcat 21088631  T
Q  477 ctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 576  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21088632 ctagtaatgcttacaacatcttggatttacagatgttattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgataatcttaagt 21088731  T
Q  577 gttacactt 585  Q
    |||||||||    
T  21088732 gttacactt 21088740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 389 - 530
Target Start/End: Original strand, 28416329 - 28416470
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28416329 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcttttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatcaagtaatgctt 28416428  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatc 530  Q
    |||| |||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||    
T  28416429 gcaacatcttggacttaaaagtactattttatcgttggcatc 28416470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Original strand, 14919317 - 14919579
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| | |||||||||      | ||    
T  14919317 tgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattttagatttctgattaatgatcaatgt-aattcatct------gatt 14919409  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagt------------ 576  Q
    |||| ||||||||||||    ||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||                
T  14919410 gcaatatcttggactta----tacaattttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacaatttgt 14919505  T
Q  577 -----gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
         |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  14919506 gaggtgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatatgatgagttgatgat 14919579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 385 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 43254256 - 43254154
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43254256 aaattgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 43254157  T
Q  485 gct 487  Q
    |||    
T  43254156 gct 43254154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 389 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 26269206 - 26269069
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  26269206 tgacttttatgaaaaagttaattttaatcttaatgattggttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcagtagtaatttatctagtattgctt 26269107  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttgg 526  Q
     ||| |||||  |||||||  |||||||| ||| ||||    
T  26269106 acaacatcttaaacttacaggtactattttatccttgg 26269069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 459 - 645
Target Start/End: Original strand, 6824329 - 6824530
Alignment:
Q  459 tgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 558  Q
    ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  6824329 tgatcaatagtatctcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtattgttttatc-ttgacatctttaacatgcaaacagagttgct-atat 6824426  T
Q  559 tatgtgatagtcttaagtgttacac-----------------ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattga 641  Q
      |||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  6824427 cttgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaattga 6824526  T
Q  642 tgat 645  Q
    ||||    
T  6824527 tgat 6824530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 527 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 26268333 - 26268275
Alignment:
Q  527 catctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26268333 catctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 26268275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 35934090 - 35934019
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaat-tagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  35934090 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaactagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 35934019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 26268268 - 26268198
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26268268 gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaatttgattaattgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 26268198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Original strand, 28416508 - 28416578
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  28416508 gtgttacacttaaaataaggcagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 28416578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 36866956 - 36866886
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  36866956 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgat 36866886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 40133579 - 40133509
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  40133579 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgat 40133509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 578 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 5837746 - 5837679
Alignment:
Q  578 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  5837746 ttacacttaaaacaatgtaggattaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgat 5837679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Original strand, 8741867 - 8741937
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||    
T  8741867 gtgttacacttaaaacaaggtatgacaaaattagattaattgtattcttgttaatttgatgaattgatgat 8741937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 582 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 19120046 - 19119984
Alignment:
Q  582 acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatga 644  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  19120046 acttaaaacaaggtaggataaaattagagtaagtttattcttgttaatctgatgaattgatga 19119984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 578 - 645
Target Start/End: Original strand, 5112297 - 5112364
Alignment:
Q  578 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||    
T  5112297 ttacacttaaaacatggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgat 5112364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 15724682 - 15724612
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||| |||||||| |||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  15724682 gtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgat 15724612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 600 - 645
Target Start/End: Original strand, 13956368 - 13956413
Alignment:
Q  600 taaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13956368 taaaattagattaagtgaagttttgttaatctgatgaattgatgat 13956413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 576 - 645
Target Start/End: Original strand, 21088748 - 21088817
Alignment:
Q  576 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || | |||||||| | |||||||||| ||||    
T  21088748 tgttacacttaaaacaaggtaggataaagttagattaaatgtattcttgttagtatgatgaattgttgat 21088817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 593 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 35504541 - 35504489
Alignment:
Q  593 ggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  35504541 ggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgat 35504489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 645
Target Start/End: Original strand, 15992532 - 15992591
Alignment:
Q  586 aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15992532 aaatcaaggtagaataaaattagatcaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 15992591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 174; Significance: 3e-93; HSPs: 69)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 361 - 645
Target Start/End: Original strand, 28002772 - 28003073
Alignment:
Q  361 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 460  Q
    ||||||||| |||||| ||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28002772 gggagcttctacactgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgttgattaatg 28002871  T
Q  461 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 560  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28002872 atcaatagtaattcatctagtaatgttagcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 28002971  T
Q  561 tgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatg 643  Q
    ||||||||| ||||                 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28002972 tgtgatagttttaagtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatccgatgaattgatg 28003071  T
Q  644 at 645  Q
    ||    
T  28003072 at 28003073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 389 - 585
Target Start/End: Original strand, 33816330 - 33816526
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  33816330 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttt 33816429  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33816430 gcaacatcttggacttacatgaactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactt 33816526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 378 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 32579854 - 32579573
Alignment:
Q  378 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 477  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32579854 agttagaaaactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatc 32579755  T
Q  478 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa--- 574  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||       
T  32579754 tagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacatagttgatgatattataagatagtcttaagag 32579655  T
Q  575 --------------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 642  Q
                  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  32579654 ttacactttctgaggtcttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtacagtcatgttaatctgatgaactgat 32579573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 385 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 3043020 - 3042820
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3043020 aaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatactaattcatctagtaat 3042921  T
Q  485 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 584  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3042920 gcttgcaacatgttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacaagcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 3042821  T
Q  585 t 585  Q
    |    
T  3042820 t 3042820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 382 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 25184517 - 25184237
Alignment:
Q  382 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 481  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25184517 agaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtcgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagt 25184418  T
Q  482 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 581  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25184417 aatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttac 25184318  T
Q  582 a-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |                 |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25184317 actttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgat 25184237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 361 - 645
Target Start/End: Original strand, 35020817 - 35021122
Alignment:
Q  361 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 460  Q
    ||||||||| ||  || ||| |||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  35020817 gggagcttctacggtgtagtcagaaaactgactcttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaccgattaatg 35020916  T
Q  461 atcaatat----taattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgat 556  Q
    ||||||||    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35020917 atcaatatatagtaattcatctagtaatgtttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 35021016  T
Q  557 attatgtgatagtcttaagtgttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaatt 639  Q
    ||||||||||||||||||||||||||                 |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  35021017 attatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaatt 35021116  T
Q  640 gatgat 645  Q
    ||||||    
T  35021117 gatgat 35021122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 385 - 585
Target Start/End: Original strand, 36493499 - 36493699
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  36493499 aaattgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaat 36493598  T
Q  485 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 584  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36493599 gcttgcaatatcttagacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacact 36493698  T
Q  585 t 585  Q
    |    
T  36493699 t 36493699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 390 - 645
Target Start/End: Original strand, 5047781 - 5048052
Alignment:
Q  390 gacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttg 489  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||  ||||    
T  5047781 gacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgttcgattcatttttaaattgtttattgttgattactgatcaataataatttatctagtaaaacttg 5047880  T
Q  490 caaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg------------ 577  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||                
T  5047881 caacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagtttatgatatcatgtgatagtcttaagtgttacattttgcg 5047980  T
Q  578 ----ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
        ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5047981 ggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgcagtcttgttaatctcatgaattgatgat 5048052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 385 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 37776059 - 37775791
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37776059 aaattgacttttttaaaaaagttaatttcaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 37775960  T
Q  485 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagt 576  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    ||  |||      ||    
T  37775959 gcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtggggt 37775860  T
Q  577 gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  37775859 gttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 37775791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 360 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 6864461 - 6864236
Alignment:
Q  360 tgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaat 459  Q
    |||||||||| ||  || ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6864461 tgggagcttctacggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaat 6864362  T
Q  460 gatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatt 559  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6864361 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatatt 6864262  T
Q  560 atgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6864261 atgtgatagtcttaagtattacactt 6864236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 359 - 645
Target Start/End: Original strand, 19089237 - 19089540
Alignment:
Q  359 atgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaa 458  Q
    ||||||||||| ||  || ||| || |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| | | | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19089237 atgggagcttctacggtgcagtcaggaaattgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaa 19089336  T
Q  459 tgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 558  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  19089337 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatat 19089436  T
Q  559 tatgtgatagtcttaagtgttacact-----------------taaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattga 641  Q
    ||||||||||||||||||||||||||                 || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19089437 tatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcatatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattga 19089536  T
Q  642 tgat 645  Q
    ||||    
T  19089537 tgat 19089540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 33341795 - 33341522
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    |||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33341795 tgacttttttaaaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 33341696  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac------- 581  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||           
T  33341695 acaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 33341596  T
Q  582 ----------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
              ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  33341595 gaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgat 33341522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 385 - 645
Target Start/End: Original strand, 37663551 - 37663828
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||| |||| | | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37663551 aaattgacttttttaataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 37663650  T
Q  485 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca-- 582  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  37663651 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 37663750  T
Q  583 ---------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
                   |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37663751 ttgtggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 37663828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 382 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 1815704 - 1815425
Alignment:
Q  382 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 481  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1815704 agaaaattgactttttaaaaaag-ttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaattgtaattcatctagt 1815606  T
Q  482 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 581  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1815605 aatgtttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 1815506  T
Q  582 a-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |                 |||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  1815505 actttgtggggtgttacccttaaaacaaggtaggataaaattagagtaaatgtagtcttgttaatatgatgaattgatgat 1815425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 389 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 47254137 - 47253941
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47254137 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 47254038  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    |||| ||||| ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47254037 gcaacatcttagacttgcatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 47253941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 406 - 645
Target Start/End: Original strand, 55477722 - 55477978
Alignment:
Q  406 ttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggactta 505  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55477722 ttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactta 55477821  T
Q  506 catatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaa 588  Q
     || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |                 |||||||||||| |    
T  55477822 aatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttcagtgttacacgttgtggggtgttacacttata 55477921  T
Q  589 acaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55477922 acaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 55477978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 352 - 636
Target Start/End: Original strand, 30002418 - 30002710
Alignment:
Q  352 ttaattaatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgc 451  Q
    |||||| ||||||||||| ||  || |||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |    
T  30002418 ttaatttatgggagcttctacggtgcagttatgaaattgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgtttattac 30002517  T
Q  452 tgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttg 551  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  30002518 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttg 30002617  T
Q  552 atgatattatgtga----tagtctt----aagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 636  Q
     |||||| ||||||    ||  |||      ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  30002618 ctgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 30002710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 382 - 645
Target Start/End: Original strand, 879355 - 879635
Alignment:
Q  382 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 481  Q
    |||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  879355 agaaaactgactttttaaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattacttattaatgatcaataataattcatctagt 879454  T
Q  482 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa------- 574  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| || ||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||           
T  879455 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaaatgttac 879554  T
Q  575 ----------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
              ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  879555 actttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattatgtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgat 879635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 389 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 7703906 - 7703710
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  7703906 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgataaatagtaattcatctagtaatgctt 7703807  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    |||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  7703806 gcaacatcttcgacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactt 7703710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 382 - 585
Target Start/End: Original strand, 7152011 - 7152214
Alignment:
Q  382 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 481  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  7152011 agaaaactgacttttttgaaaaagttatttttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaat 7152110  T
Q  482 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||     
T  7152111 aatgcttgcaaaatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtattaagtgttat 7152210  T
Q  582 actt 585  Q
    ||||    
T  7152211 actt 7152214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 359 - 645
Target Start/End: Original strand, 19440432 - 19440735
Alignment:
Q  359 atgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaa 458  Q
    ||||||||||| ||  || ||| || ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  19440432 atgggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattaatttttaaattattgattactgattaa 19440531  T
Q  459 tgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 558  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19440532 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatat 19440631  T
Q  559 tatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattga 641  Q
    ||||| |||  |||||                 ||||||| |||| |||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19440632 tatgttataaacttaagggttacacgttgtggggtgttacgcttataacaagctaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattga 19440731  T
Q  642 tgat 645  Q
    ||||    
T  19440732 tgat 19440735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 378 - 645
Target Start/End: Original strand, 25700859 - 25701144
Alignment:
Q  378 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 477  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  25700859 agttaggaaattgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtacattattgattaatgatcaatagtaattcatc 25700958  T
Q  478 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag-- 575  Q
    ||  ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||      
T  25700959 taacaatgcttgcaaaatcttagatttacggatactattttatcgttgacttctttaacatgcaaacaaagttgatgatgttatgtgataatcttaagtg 25701058  T
Q  576 ----------------tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
                    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  25701059 ttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatttagtgtagtcctgttaatctgatgaattgatgat 25701144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 389 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 49376364 - 49376170
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  49376364 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattcttgattactgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgctt 49376265  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 583  Q
     |||  |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49376264 tcaacttcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacac 49376170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 389 - 585
Target Start/End: Original strand, 34361305 - 34361502
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaatgct 487  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  34361305 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgct 34361404  T
Q  488 tgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    ||||| |||||||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  34361405 tgcaacatcttggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagctttaagtgttacactt 34361502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 389 - 585
Target Start/End: Original strand, 55240919 - 55241115
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||    
T  55240919 tgacttttttgaaaaatttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgattaatagtaatttatctagtaatgttt 55241018  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  55241019 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgacatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 55241115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 50697639 - 50697365
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    |||||||||||||||  |||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50697639 tgacttttttgaaaaaattaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 50697540  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaaca-tgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa------------- 574  Q
     ||| |||||||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||                 
T  50697539 acaacatcttggaattacaggtactattttatcgttggaatctttaacattgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttgcactttg 50697440  T
Q  575 ----gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
        ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50697439 tgtggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 50697365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 23761468 - 23761196
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23761468 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgctt 23761369  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-------------- 574  Q
    |||| |||||||||||| |  ||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||                  
T  23761368 gcaacatcttggacttataggtacaattttatcgttggtatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaaatgtgacactttat 23761269  T
Q  575 ---gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
       |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  23761268 gaggtgttacacttaaaacaaggta-gataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 23761196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 389 - 585
Target Start/End: Original strand, 32912393 - 32912590
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaatgct 487  Q
    |||||||||||||||  || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  32912393 tgacttttttgaaaaaattcattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgct 32912492  T
Q  488 tgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||  ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32912493 tgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatacaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 32912590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 389 - 639
Target Start/End: Original strand, 46887972 - 46888238
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46887972 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 46888071  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtctta--------------- 573  Q
    | || |||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |                   
T  46888072 gtaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgatagtctaagtgttacgttttgtg 46888171  T
Q  574 -agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaatt 639  Q
      ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  46888172 gggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaatt 46888238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 389 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 17168110 - 17167914
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    |||||||||||||||  ||| |||| || |||||||| | |||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  17168110 tgacttttttgaaaaaattacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactaattaatgataaatagtaattcatctagtgatgctt 17168011  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17168010 gcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 17167914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 389 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 17173687 - 17173491
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    |||||||||||||||  ||| |||| || |||||||| | |||||||||||||| |||||| || ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  17173687 tgacttttttgaaaaaattacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgatgctt 17173588  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17173587 gcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 17173491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 389 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 37288126 - 37287932
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttga-tcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgct 487  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  37288126 tgacttttttgaaaaagttaattttaaatcttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgctcaatagtaattcatctaataatgct 37288027  T
Q  488 tgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 582  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  37288026 tgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatcttcaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgctagtcttaagtgttaca 37287932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 391 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 50765115 - 50764921
Alignment:
Q  391 acttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgc 490  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50765115 acttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgc 50765016  T
Q  491 aaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    || ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | || |||||| |||||    
T  50765015 aacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacttgcaaacatagttgctgatatcatgtgataatattgagtgtttcactt 50764921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 405 - 576
Target Start/End: Original strand, 34947925 - 34948096
Alignment:
Q  405 gttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggactt 504  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34947925 gttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaacgatcaatagtatttcatctagtaatgcttgcaacatcttggactt 34948024  T
Q  505 acatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 576  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  34948025 acatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagt 34948096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 385 - 585
Target Start/End: Original strand, 29584010 - 29584210
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29584010 aaattgacttgtttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 29584109  T
Q  485 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 584  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |||| || ||||  |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  29584110 gcttgcaacatcttggacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacact 29584209  T
Q  585 t 585  Q
    |    
T  29584210 t 29584210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 384 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 32592486 - 32592217
Alignment:
Q  384 aaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaa 483  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  32592486 aaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaacgatcaatagtaattcatttagtaa 32592387  T
Q  484 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattat----gtgatagtctt----aag 575  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||  |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||    ||| ||  |||      |    
T  32592386 tgctttcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgtagacatctttaacatgcaaacaaagttgctgaaatcatatgagtgttacactttgtgggg 32592287  T
Q  576 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  32592286 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 32592217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 385 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 17272365 - 17272088
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17272365 aaattgacttatttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattaccgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 17272266  T
Q  485 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------- 574  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||| ||||||| | ||||| |||||| ||| |||||||||||              
T  17272265 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttgaaatctttaatatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacact 17272166  T
Q  575 -------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
           |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||    
T  17272165 tcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgat 17272088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 389 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 39400405 - 39400236
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39400405 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtcattcatctagtaatgctt 39400306  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 558  Q
    |||| |||||| ||||| |  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  39400305 gcaacatcttgaacttaaaggtaccattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 39400236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 9139624 - 9139369
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  9139624 tgacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaatta--gattattgattaatgatcaatagtaattcgtctagtaatgctt 9139527  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtctt----aagtgttacact 584  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||   | || ||| ||| ||  |||      |||||||| |    
T  9139526 gcaacatcttggacttacatgtactacgttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagt---ttatcttaagtgttacactttgtagggtgttacagt 9139430  T
Q  585 taaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9139429 taaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgat 9139369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 389 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 4598379 - 4598117
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    |||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  4598379 tgactttttgtaaaatgttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattaatctaataatgctt 4598280  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagtgtta 580  Q
    |||| |||||||| ||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||    ||  |||      ||||||    
T  4598279 gcaacatcttggatttaaatgtattattttatcgttggcatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtgtta 4598180  T
Q  581 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatga 644  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  4598179 cacttaaaacaa-gcaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatga 4598117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 385 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 26896489 - 26896288
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaa 483  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  26896489 aaattgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgttcgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaa 26896390  T
Q  484 tgcttgcaaaatctt-ggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 582  Q
    || |||||| || || |||||||||  |||||||| |||||||  || ||||||||||||| | | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  26896389 tgtttgcaacattttcggacttacaagtactattttatcgttgaaat-tttaacatgcaaatagacttgatcatattatgcgatagtcttaagtgttaca 26896291  T
Q  583 ctt 585  Q
    |||    
T  26896290 ctt 26896288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 389 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 4205381 - 4205216
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| || |||||||| | |||||||||||||| |||||| || ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  4205381 tgacttttttgaaaaagttacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgatgctt 4205282  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatg 554  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4205281 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatg 4205216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 389 - 524
Target Start/End: Original strand, 35025381 - 35025515
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35025381 tgacttttatgaaaaagttaattttgat-ttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 35025479  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgtt 524  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  35025480 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcgtt 35025515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 385 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 42200131 - 42199853
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaa 483  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||| || ||||| | || ||||||||||| |||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||    
T  42200131 aaattgacctttttgaaaaagttaattt-gattttgatgtttgattaatttttaaattattgattactgattaatgaacagtagtatattcatctagtaa 42200033  T
Q  484 tgcttgcaaaatcttggacttacata-tactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 582  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   || ||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42200032 tgcttgcaacatcttggacttacaaggtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 42199933  T
Q  583 -----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
                     |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42199932 ctttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 42199853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 400 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 27397000 - 27396740
Alignment:
Q  400 aaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttg 499  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  27397000 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattac--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttg 27396903  T
Q  500 gacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag-----------------tgttaca 582  Q
    |||||| |  ||| | || ||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||| ||| ||| ||||||||                 |||||||    
T  27396902 gacttataggtaccactttatcgttgacatctttaacatgcaaacagcgttgctgatatcatgcgatggtcttaagtgtgacactttatgggatgttaca 27396803  T
Q  583 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  27396802 cttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 27396740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 393 - 582
Target Start/End: Original strand, 46883932 - 46884116
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    |||||||||||  |||||||| || |||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46883932 ttttttgaaaaaattaatttttattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 46884031  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 582  Q
     |||  ||||||||  ||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46884032 catc--ggacttac--atactattttatctttggaatttttaacatgcaaacaaaatttatgatattatgtgatagt-ttaagtgttaca 46884116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Original strand, 4934026 - 4934289
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaa-ttgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgct 487  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||   || ||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||     
T  4934026 tgacttttttgaacaagttaattttgatcttaatgtttaatttatttttaaaatttttgattactgattaatgattaatagaaattcatctattaatgcg 4934125  T
Q  488 tgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac------ 581  Q
    ||||| ||           |  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||          
T  4934126 tgcaacat-----------aggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttg 4934214  T
Q  582 -----------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
               ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  4934215 tgaggtgttggacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaaatgatgat 4934289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 471 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 38012169 - 38011981
Alignment:
Q  471 attcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 570  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38012169 attcatctagtaatatttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatttttaacgtgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 38012070  T
Q  571 ttaag-----------------tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 642  Q
    |||||                 |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38012069 ttaagcgttacactttctgggatgttacacttaaaacaaggtataataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 38011981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 389 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 23431952 - 23431834
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23431952 tgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgatgcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctactaatgctt 23431853  T
Q  489 gcaaaatcttggacttaca 507  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  23431852 gcaacatcttggacttaca 23431834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 393 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 38012655 - 38012568
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctag 480  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38012655 ttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgatttatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctag 38012568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 510 - 585
Target Start/End: Original strand, 35025531 - 35025606
Alignment:
Q  510 tactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35025531 tactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactt 35025606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Original strand, 33816550 - 33816620
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  33816550 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgataaattgatgat 33816620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 574 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 7703704 - 7703642
Alignment:
Q  574 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  7703704 agtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 7703642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 575 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 47253934 - 47253873
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  47253934 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatga 47253873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 578 - 645
Target Start/End: Original strand, 36493708 - 36493775
Alignment:
Q  578 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  36493708 ttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgat 36493775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 17167907 - 17167837
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  17167907 gtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgat 17167837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 17173484 - 17173414
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  17173484 gtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgat 17173414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Original strand, 34948114 - 34948184
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  34948114 gtgttgcactttaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgat 34948184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 580 - 645
Target Start/End: Original strand, 29584222 - 29584287
Alignment:
Q  580 acacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||    
T  29584222 acacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgat 29584287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 580 - 636
Target Start/End: Original strand, 35025618 - 35025674
Alignment:
Q  580 acacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 636  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35025618 acacttaaaacaagataggataaaattatattaaatgcagtcttgttaatctgatga 35025674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Original strand, 54499254 - 54499325
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||    
T  54499254 gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaaattagattaagtatattcttgttaatatgatgaattgatgat 54499325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Original strand, 55241122 - 55241191
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||| || ||||||| ||||||||||    
T  55241122 gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttctt-atctgataaattgatgat 55241191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 482 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 56050234 - 56050171
Alignment:
Q  482 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaaca 545  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  56050234 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaagtctttaacatgcaaaca 56050171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 575 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 39398103 - 39398049
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaat 629  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  39398103 gtgttacacttaaaataaggcaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat 39398049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 6864216 - 6864159
Alignment:
Q  588 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6864216 aacaaggtatgataaaattaaattaaatgtagtcttgttaatctgataaattgatgat 6864159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Original strand, 32912610 - 32912667
Alignment:
Q  588 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32912610 aacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgat 32912667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 594 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 50764905 - 50764854
Alignment:
Q  594 gtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  50764905 gtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctaatgaattgatgat 50764854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 591 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 3042797 - 3042743
Alignment:
Q  591 aaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||| | |||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  3042797 aaggtatgataaaattatattaagtgtaatcttgttaatatgatgaattgatgat 3042743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 600 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 49376136 - 49376091
Alignment:
Q  600 taaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  49376136 taaaattagatcaagcgtaatcttgttaatctgatgaattgatgat 49376091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 169; Significance: 3e-90; HSPs: 63)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Original strand, 7006744 - 7007000
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  7006744 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcataatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgctt 7006843  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaa 588  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7006844 gcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatattcttaagtgttacacttaaa 7006943  T
Q  589 acaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||    
T  7006944 acaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatcttataaattgatgat 7007000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 378 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 41465909 - 41465625
Alignment:
Q  378 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 477  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  41465909 agttagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcaattttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcata 41465810  T
Q  478 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 577  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41465809 tagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatagtcttaagtg 41465710  T
Q  578 ttac-----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||                 ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41465709 ttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagttcagtcttgtgaatctaatgaattgatgat 41465625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 361 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 26358002 - 26357781
Alignment:
Q  361 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 460  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26358002 gggagcttctacattgcagttagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 26357903  T
Q  461 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 560  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  26357902 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaaatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacacatttgataatatta 26357803  T
Q  561 tgtgatagtcttaagtgttaca 582  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  26357802 tgtgatagttttaagtgttaca 26357781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 360 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 41961266 - 41960964
Alignment:
Q  360 tgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaat 459  Q
    |||||||||| ||  || ||| || ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41961266 tgggagcttctacggtgcagtcaggaaactgaattttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaat 41961167  T
Q  460 gatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatt 559  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  41961166 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatatt 41961067  T
Q  560 atgtgatagtcttaagtgttac-----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 642  Q
    |||||||| |||||||||||||                 |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41961066 atgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 41960967  T
Q  643 gat 645  Q
    |||    
T  41960966 gat 41960964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 361 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 4167347 - 4167123
Alignment:
Q  361 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 460  Q
    ||||||||| ||  || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  4167347 gggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatg 4167248  T
Q  461 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 560  Q
    || |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4167247 attaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatatta 4167148  T
Q  561 tgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  4167147 tgtgatagttttaagtgttacactt 4167123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 384 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 35959294 - 35959097
Alignment:
Q  384 aaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaa 483  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35959294 aaaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 35959195  T
Q  484 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 583  Q
    ||||||||| |||||||    |||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35959194 tgcttgcaacatcttgg----acatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaactgttacac 35959099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 385 - 645
Target Start/End: Original strand, 43648047 - 43648324
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43648047 aaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 43648146  T
Q  485 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------- 574  Q
    | |||| | ||||||||||||||  | |||||| |||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||              
T  43648147 gtttgcgacatcttggacttacaagtgctattttatcgttgaaatctttaacatggaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttatact 43648246  T
Q  575 -------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
           |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43648247 ttgtgtggtgttacacttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgat 43648324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 361 - 585
Target Start/End: Original strand, 2325156 - 2325380
Alignment:
Q  361 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 460  Q
    ||||||||| ||  || ||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||     
T  2325156 gggagcttctacggtgcagtcagaaaattgattttttttaaaaagttaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaata 2325255  T
Q  461 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 560  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  2325256 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatatta 2325355  T
Q  561 tgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2325356 tgtgatagtcttaagtgttacactt 2325380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 382 - 585
Target Start/End: Original strand, 11366179 - 11366383
Alignment:
Q  382 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctag 480  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  11366179 agaaaattgatttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctag 11366278  T
Q  481 taatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 580  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11366279 taatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 11366378  T
Q  581 cactt 585  Q
    |||||    
T  11366379 cactt 11366383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Original strand, 18494087 - 18494359
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18494087 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgctt 18494186  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg----------- 577  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||               
T  18494187 acaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtcgttgatatcatgtgatagtcttaagtgtgactctttgt 18494286  T
Q  578 -----ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
         |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| || |||||||||||||||||||    
T  18494287 gaggtttacacttaatacaaggtaggataaaattagatcaagtgtattctagtgaatctgatgaattgatgat 18494359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 378 - 585
Target Start/End: Original strand, 19289118 - 19289325
Alignment:
Q  378 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 477  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19289118 agttaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttaatttctgattaatgatcaatagtaattcatc 19289217  T
Q  478 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 577  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||| || || || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19289218 tagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtattattttattgtcggaatctttaacatgcacacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 19289317  T
Q  578 ttacactt 585  Q
    ||||||||    
T  19289318 ttacactt 19289325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 393 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 44914060 - 44913865
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcat---ctagtaatgcttg 489  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||   ||| |||||||||    
T  44914060 ttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcattttctaataatgcttg 44913961  T
Q  490 caaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44913960 caacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 44913865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Original strand, 43770654 - 43770918
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  43770654 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctaattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgctt 43770753  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagtgtta 580  Q
    |||| |||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    ||  |||    | ||||||    
T  43770754 gcaacatcttgaacttaaagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtgaggtgtta 43770853  T
Q  581 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  43770854 cacttaaaacaaggcaggataaaattaaattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgat 43770918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Original strand, 33660183 - 33660447
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33660183 tgacttttctgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 33660282  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattat----gtgatagtctt----aagtgtta 580  Q
    |||| ||||  |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    ||| ||  |||      ||||||    
T  33660283 gcaacatctcagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgggtgttacactttgtggggtgtta 33660382  T
Q  581 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||    
T  33660383 cacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcctgttaatctaatgaattgatgat 33660447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 400 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 4764017 - 4763832
Alignment:
Q  400 aaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttg 499  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4764017 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcaactagtaatgcttgcaatatcttg 4763918  T
Q  500 gacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4763917 gacttacaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaaaagaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 4763832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 389 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 3177336 - 3177140
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| || |||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  3177336 tgacttttttgaaaaagttacttttaattttaatgtttgatttattttcaaattgttgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtaatgctt 3177237  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3177236 gtaatatcttggacttacatgtactattttatagttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 3177140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 381 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 37906116 - 37905832
Alignment:
Q  381 tagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggtt-catttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatcta 479  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  37906116 tagaaaattgacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatcca 37906017  T
Q  480 gtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtt 579  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  37906016 gtaattcttgcaacatcttggacttacatgtgttattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttaatgatattatgcgatagttttaagtgtt 37905917  T
Q  580 aca-------------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||                   |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  37905916 acactttgtggggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 37905832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 393 - 585
Target Start/End: Original strand, 33709042 - 33709234
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33709042 ttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 33709141  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
     |||||||| |||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  33709142 catcttggatttacaagtactattttatcattgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactt 33709234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 434 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 4478717 - 4478493
Alignment:
Q  434 ttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatcttt 533  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||    
T  4478717 ttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgatactattttatcattggcatcttt 4478618  T
Q  534 aacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac------------acttaaaacaaggtagggt-aaaattagattaagtgcagt 620  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||            ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |    
T  4478617 aacatggaaacagagttggtgatatcatgtgatagacttaagtgttacactttgtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtatt 4478518  T
Q  621 cttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  4478517 cttgttaatctgatgaattgatgat 4478493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 407 - 582
Target Start/End: Original strand, 19500739 - 19500914
Alignment:
Q  407 taattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttac 506  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  19500739 taattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaaattac 19500838  T
Q  507 atatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 582  Q
    || |||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500839 atgtactattttatcgttaacatctttaacatgtaaatagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttaca 19500914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 429 - 645
Target Start/End: Original strand, 27349794 - 27350018
Alignment:
Q  429 ttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggca 528  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  27349794 ttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttggaa 27349893  T
Q  529 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagt 620  Q
    |||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||||    ||  |||      ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |    
T  27349894 tctttaacttgcaaacagagttcctgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtatt 27349993  T
Q  621 cttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27349994 cttgttaatctgatgaattgatgat 27350018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 31862249 - 31861976
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  31862249 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatatttgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtct 31862150  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca------ 582  Q
     ||| ||||||||||||||  |||||||| || || || ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||          
T  31862149 acaatatcttggacttacaagtactattttattgtcggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataattttaagtgttacactttgt 31862050  T
Q  583 -----------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
               |||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31862049 ggggtgttacgcttataacaatgtatgttaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 31861976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 382 - 645
Target Start/End: Original strand, 39167168 - 39167442
Alignment:
Q  382 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 481  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| || || |||| |||||||||||||    
T  39167168 agaaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgttttattcatttttaaattgttgattactgattcataattaatagtaattcatctagt 39167267  T
Q  482 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa------- 574  Q
    |||||| |||| |  |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  | |           
T  39167268 aatgctagcaacaatttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgatgatattatgtgatagttgttacactttg 39167367  T
Q  575 ----gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
         |||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||| | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  39167368 tgggatgttacacttaaaacaaggtataataaaattagaataagtgtattcttgttactctaatgaattgatgat 39167442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 393 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 5881922 - 5881663
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5881922 ttttatgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgaataatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 5881823  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagtgttacact 584  Q
     ||||| ||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||    ||  |||    | || |||||||    
T  5881822 catcttagacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaaattgttgatatcatgtgagtgttacactttgtgaggtattacact 5881723  T
Q  585 taaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||    
T  5881722 taaaacaaggtatgat-aaattagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgat 5881663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 394 - 645
Target Start/End: Original strand, 29241956 - 29242217
Alignment:
Q  394 tttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaa 493  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |           
T  29241956 tttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgttcaatagtaattcatctagtaattc------- 29242048  T
Q  494 atcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtctta-----------------agt 576  Q
    ||||||||||||||  |||||||  ||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||                  ||    
T  29242049 atcttggacttacaggtactattgtatcgttgacatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggt 29242148  T
Q  577 gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29242149 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgat 29242217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 363 - 645
Target Start/End: Original strand, 31570514 - 31570813
Alignment:
Q  363 gagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgat 462  Q
    ||||||| |||||| ||| |  ||| |||||||||| |||| ||||||||| || |||||| | | |||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  31570514 gagcttctacactgcagtcatgaaactgactttttttaaaaagttaattttcattttaatgattgattcatttttaaatatttgattactgattaatgat 31570613  T
Q  463 caatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatg 562  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  31570614 caatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacagagttgttgatatcatg 31570713  T
Q  563 tgatagtcttaagtgt-----------------tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||| ||||||||||||                 |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  31570714 tgacagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattcatgat 31570813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 451 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 19314182 - 19313975
Alignment:
Q  451 ctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggactt---acatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacata 547  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   |||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  19314182 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttataacatgtactattttatcgctgacatctttaacatgcaaacata 19314083  T
Q  548 gttgatgatattatgtgatagtctta----------agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaa 637  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  19314082 gttgctgatatcatgtgatagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattcgattaagtgtattcttgttaatctgatgaa 19313983  T
Q  638 ttgatgat 645  Q
    ||||||||    
T  19313982 ttgatgat 19313975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 400 - 645
Target Start/End: Original strand, 33550800 - 33551065
Alignment:
Q  400 aaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatga----tcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaat 495  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |    |||||| | |||||||||||||||||||||| ||    
T  33550800 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactggttaataaataatcaatagttattcatctagtaatgcttgcaacat 33550899  T
Q  496 cttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca------------- 582  Q
     |||||||| ||  |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||                 
T  33550900 attggactttcaagtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacg-tagtcttaagtgttacactttgtggggtgt 33550998  T
Q  583 ----cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
        |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33550999 tacgcttaaaacaacgtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 33551065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 433 - 585
Target Start/End: Original strand, 4263926 - 4264079
Alignment:
Q  433 tttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctt 532  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  4263926 tttttaaattgttgattactgatcaatgatcaatattatttcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttatatgtactattttattgttggcatctt 4264025  T
Q  533 taacatgcaaacatagttgatgatattatg-tgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  4264026 taacatgcaaacagagttgctgatatcatgttgatagtcttaagtgttacactt 4264079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 481 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 45328025 - 45327844
Alignment:
Q  481 taatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 580  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  45328025 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgcgatagtcttatgtgtta 45327926  T
Q  581 c-----------------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |                 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45327925 cactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 45327844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 378 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 13711867 - 13711671
Alignment:
Q  378 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 477  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||| || | |||| | | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13711867 agttataaaattgtcttttttgaaaaaattaattttaatttaaatgattgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatc 13711768  T
Q  478 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa 574  Q
    ||||| || |||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  13711767 tagtattgtttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgctggcatctttaacatgcatacagagttgctgatatcatgtcatagtcttaa 13711671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 356 - 645
Target Start/End: Original strand, 19424415 - 19424707
Alignment:
Q  356 ttaatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgat 455  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| |  ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  19424415 ttaatgggagcttctacggtgcagtcatcaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgat 19424514  T
Q  456 taatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatga 555  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||              |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  19424515 taatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcaggtact--------------atctttaacatgcaaacagagttgctga 19424600  T
Q  556 tattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaat 638  Q
    ||| |||||||||||||||                 |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  19424601 tatcatgtgatagtcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagcgtattcttgttaatctgatgaat 19424700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 451 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 44286284 - 44286150
Alignment:
Q  451 ctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagtt 550  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  44286284 ctgattaatgatcaatagtaattcatctaacaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttagcatatttaacatgcaaacaaagtt 44286185  T
Q  551 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44286184 gttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 44286150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 494 - 645
Target Start/End: Original strand, 17071648 - 17071816
Alignment:
Q  494 atcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca----------- 582  Q
    |||||||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  17071648 atcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggt 17071747  T
Q  583 ------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
          ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17071748 gttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 17071816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 395 - 544
Target Start/End: Original strand, 41051112 - 41051260
Alignment:
Q  395 ttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaa 494  Q
    |||||||||  |||||||| || |||||||| | ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |    
T  41051112 ttttgaaaaaattaattttaattttaatgtttgattcatttttgaattgttgattattgattaatgatcaataacaattcatctagcaatgcttacaaca 41051211  T
Q  495 tcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaac 544  Q
    ||||| |||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  41051212 tcttgaacttacaggtactattttatccttggcat-tttaacatgcaaac 41051260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 494 - 645
Target Start/End: Original strand, 17054007 - 17054175
Alignment:
Q  494 atcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca----------- 582  Q
    |||||||| |||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||               
T  17054007 atcttggatttacaggtactattttatcgttggaacctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtnttaagtgttacactttgtggggt 17054106  T
Q  583 ------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
          ||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17054107 gttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgat 17054175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 481 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 36642293 - 36642189
Alignment:
Q  481 taatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 580  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  36642293 taatgcttgcaacatcttgaacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctggtatcatgtgatagtcttaagtgtta 36642194  T
Q  581 cactt 585  Q
    |||||    
T  36642193 cactt 36642189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 393 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 33902407 - 33902317
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaa 483  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33902407 ttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattacagattaataatcaataataattcatctagtaa 33902317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 493 - 585
Target Start/End: Original strand, 18258197 - 18258289
Alignment:
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18258197 aatcttagacttgcagttactattttatcgttgggatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 18258289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 389 - 498
Target Start/End: Original strand, 18257344 - 18257453
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| || |||||  |   |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  18257344 tgacttttgtgaaaaagttaattttaatattaataatttattcattttaaaattgtcgattactgattaatgataaataataattcatctagtaatgctt 18257443  T
Q  489 gcaaaatctt 498  Q
    |||| |||||    
T  18257444 gcaacatctt 18257453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 389 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 45328087 - 45328028
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgat 448  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  45328087 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgat 45328028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 3177133 - 3177063
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||    
T  3177133 gtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgat 3177063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 4167116 - 4167046
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  4167116 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgat 4167046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 512 - 582
Target Start/End: Original strand, 41463779 - 41463849
Alignment:
Q  512 ctatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 582  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  41463779 ctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaaatgttaca 41463849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 44286143 - 44286073
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||    
T  44286143 gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattattgttaatctgatgaatttatgat 44286073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 44913857 - 44913787
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  44913857 gtgttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgat 44913787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 36642182 - 36642110
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaa--ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  36642182 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgat 36642110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 393 - 505
Target Start/End: Original strand, 41463400 - 41463512
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||| || |||  |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||    
T  41463400 tttttttaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattattaattattgattaatgatcaatagtaatttatctattaatgtttacaa 41463499  T
Q  493 aatcttggactta 505  Q
     ||||| ||||||    
T  41463500 catcttagactta 41463512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 575 - 633
Target Start/End: Original strand, 33709241 - 33709299
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctga 633  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  33709241 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagcgtattcttgttaatctga 33709299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 582 - 642
Target Start/End: Original strand, 4264093 - 4264153
Alignment:
Q  582 acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 642  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||    
T  4264093 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttcttaatatgatgaattgat 4264153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 587 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 4763813 - 4763758
Alignment:
Q  587 aaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 642  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  4763813 aaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgat 4763758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 33902252 - 33902190
Alignment:
Q  583 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  33902252 cttaaaacaaggtaggataaaattcgattaaatatagtcttgttaatctgatgaactgatgat 33902190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 636
Target Start/End: Original strand, 2325395 - 2325448
Alignment:
Q  583 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 636  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  2325395 cttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatga 2325448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Original strand, 19289345 - 19289402
Alignment:
Q  588 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19289345 aacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatgagttgatgat 19289402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 26357759 - 26357704
Alignment:
Q  587 aaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 642  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  26357759 aaacaaggtaggataaaattagattaagtgtgatcttgttaatatgatgaattgat 26357704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 588 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 35959077 - 35959023
Alignment:
Q  588 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatg 643  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35959077 aacaaggtaggataaa-ttatattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatg 35959023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 600 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 13711633 - 13711588
Alignment:
Q  600 taaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  13711633 taaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 13711588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 533 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 33902319 - 33902267
Alignment:
Q  533 taacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  33902319 taacatggaaacagagttaatgatattatgtgatactattaagtgttacactt 33902267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 645
Target Start/End: Original strand, 19501760 - 19501818
Alignment:
Q  586 aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19501760 aaaacaaagtagaataaaattagattaaatgtagt-ttgttaatctgatgaattgatgat 19501818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Original strand, 11366403 - 11366460
Alignment:
Q  588 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||| || | |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11366403 aacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttgttaacctgatgaattgatgat 11366460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 457
Target Start/End: Original strand, 17053960 - 17054005
Alignment:
Q  412 ttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgatta 457  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17053960 ttgatcttaatgtttgattcatttttacattgttgattactgatta 17054005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 457
Target Start/End: Original strand, 17071601 - 17071646
Alignment:
Q  412 ttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgatta 457  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17071601 ttgatcttaatgtttgattcatttttacattgttgattactgatta 17071646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 575 - 628
Target Start/End: Original strand, 18258296 - 18258349
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaa 628  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||  | |||||||||    
T  18258296 gtgttacacttaaaaaaatgtaggataaaattagattaagtttattcttgttaa 18258349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 167; Significance: 4e-89; HSPs: 60)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 361 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 33906634 - 33906335
Alignment:
Q  361 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 460  Q
    ||||||||| ||| || ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33906634 gggagcttctacagtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttactattcgattcatttttaaatt--tgattgctgattaatg 33906537  T
Q  461 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 560  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906536 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 33906437  T
Q  561 tgtgatagtcttaagtgttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatg 643  Q
    || |||||||||||||||||||                 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906436 tgcgatagtcttaagtgttacactttttggaatgttacccttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatg 33906337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Original strand, 16446669 - 16446942
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16446669 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgttagattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 16446768  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-------------- 574  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||                  
T  16446769 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacgctttgt 16446868  T
Q  575 ---gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
       ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446869 ggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 16446942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 361 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 34895386 - 34895090
Alignment:
Q  361 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 460  Q
    ||||||||| ||  || |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34895386 gggagcttctacggtgcagttaggaaattgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 34895287  T
Q  461 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 560  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  34895286 atcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtactattttttcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatta 34895187  T
Q  561 tgtgata--gtctta----------agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||  || |||           ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34895186 tgtgatagtgtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 34895090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 385 - 645
Target Start/End: Original strand, 1149422 - 1149699
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1149422 aaattgacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 1149521  T
Q  485 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca-- 582  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  1149522 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacact 1149621  T
Q  583 ---------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
                   |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1149622 ttgtggggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgat 1149699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 382 - 645
Target Start/End: Original strand, 43643382 - 43643662
Alignment:
Q  382 agaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagt 481  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43643382 agaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtcgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagt 43643481  T
Q  482 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 581  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43643482 aatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttac 43643581  T
Q  582 a-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |                 |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43643582 actttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgat 43643662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 389 - 643
Target Start/End: Original strand, 4132480 - 4132750
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4132480 tgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtgtaattcatttttaaattgttgattacaaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 4132579  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact---- 584  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        
T  4132580 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttatgtgttacactttgt 4132679  T
Q  585 ------------taaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatg 643  Q
                | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  4132680 ggggtgttacacttaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatg 4132750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 393 - 645
Target Start/End: Original strand, 27082636 - 27082905
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  27082636 ttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgattaatgataagtagtaattcatctagtaatgcttgcaa 27082735  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac----------- 581  Q
     ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||               
T  27082736 catcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgcgggg 27082835  T
Q  582 ------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
          |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  27082836 tgttagacttaaaacatggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgat 27082905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Original strand, 37970313 - 37970586
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  37970313 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgctt 37970412  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-------------- 574  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| || ||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||                  
T  37970413 gcaacatcttggacttacaggtactattttattgtaaggatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 37970512  T
Q  575 ---gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
       |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  37970513 ggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcatatgaattgatgat 37970586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 389 - 583
Target Start/End: Original strand, 7890751 - 7890945
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7890751 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 7890850  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 583  Q
    |||| || || ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7890851 gcaacattttagacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaccagagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacac 7890945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 385 - 585
Target Start/End: Original strand, 8803606 - 8803807
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaa 483  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  8803606 aaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttcattactgattaatgatcaatagtatattcatctggtaa 8803705  T
Q  484 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 583  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8803706 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtattaagtgttacac 8803805  T
Q  584 tt 585  Q
    ||    
T  8803806 tt 8803807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 393 - 585
Target Start/End: Original strand, 23854229 - 23854421
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23854229 ttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 23854328  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
     ||||||||||||||  |||||||| || || || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23854329 catcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagcagagttgatgatattatgtgattgtcttaagtgttacactt 23854421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 38644374 - 38644101
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38644374 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaatttttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 38644275  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac------- 581  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| || |||||||||| ||||||||           
T  38644274 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtcttgagtgttacactttat 38644175  T
Q  582 ----------acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
              ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  38644174 ggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 38644101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 406 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 16223242 - 16222986
Alignment:
Q  406 ttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggactta 505  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16223242 ttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagactta 16223143  T
Q  506 catatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac-----------------ttaaa 588  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||                 |||||    
T  16223142 catgtactattttatcattggaatctttaaaatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatactcttaagtgttacactttttggggtgttacgtttaaa 16223043  T
Q  589 acaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16223042 acaaggaaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgat 16222986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 378 - 645
Target Start/End: Original strand, 35459494 - 35459778
Alignment:
Q  378 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 477  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  35459494 agttagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatc 35459593  T
Q  478 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag-- 575  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||| || || |  ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||      
T  35459594 tagtaatgtttgcaacattttggacttacagatactattttattgtcgaaatctttaacatacaaacagaattgatgatattatgtaatagtcttaagtg 35459693  T
Q  576 ---------------tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
                   ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35459694 ttataatctgtgggatgttacatttataacaaagtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgat 35459778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 385 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 11727425 - 11727227
Alignment:
Q  385 aaattgac-ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaa 483  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||  | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11727425 aaattgacattttttaaaaaagttaattttaatcttaataattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 11727326  T
Q  484 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 582  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11727325 tgcttgcaacatcttagacttacatatactattttatcgttggcatctttaacattcaaacaaagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttaca 11727227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 360 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 1205352 - 1205127
Alignment:
Q  360 tgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaat 459  Q
    |||||||||| ||  || ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  1205352 tgggagcttctacggtgtagtcagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttgatcttgttgtttgattcatttttaaattgctgattagtgattaat 1205253  T
Q  460 gatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatt 559  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1205252 gatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatatt 1205153  T
Q  560 atgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1205152 atgcgatagtcttaagtgttacactt 1205127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Original strand, 5299740 - 5300013
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  5299740 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgctt 5299839  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-------------- 574  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||||| ||||||                  
T  5299840 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacaaaattgctgatatcatttgataatcttaagtgttacactttgt 5299939  T
Q  575 ---gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
       ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  5299940 ggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 5300013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 385 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 40862820 - 40862619
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcattttt-aaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaa 483  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  |||| |||||||||||||||    
T  40862820 aaattgacttttttgaaaaagttacttttaatcttaatgtttgattcattttttaaattgtcgattactgatttatgacaaatagtaattcatctagtaa 40862721  T
Q  484 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 583  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40862720 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacac 40862621  T
Q  584 tt 585  Q
    ||    
T  40862620 tt 40862619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 393 - 585
Target Start/End: Original strand, 1953786 - 1953978
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  1953786 ttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcattttaaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaa 1953885  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    ||||||||| |||||  |||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1953886 aatcttggatttacaggtactattttatcgttgacaactttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactt 1953978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Original strand, 34951851 - 34952098
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||    
T  34951851 tgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatgtagtaagactt 34951950  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaa 588  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |         |||||||||||||||    
T  34951951 gcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcg---------agtgttacacttaaa 34952041  T
Q  589 acaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  34952042 acaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatttgatgaattgatgat 34952098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 393 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 466224 - 465965
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  466224 ttttttgaataagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 466125  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagtgttacact 584  Q
     ||||| ||||||||  || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    ||  |||      ||||||||||    
T  466124 catcttagacttacaggtattattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgata-tatgtgagtgttacactttgtggggtgttacact 466026  T
Q  585 taaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  466025 taaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 465965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 389 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 35859330 - 35859160
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35859330 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 35859231  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatt 559  Q
    |||| |||| | |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35859230 gcaacatctcgaacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatt 35859160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 393 - 585
Target Start/End: Original strand, 36694764 - 36694956
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    ||||||||||| |||| |||| || |||||||| | || ||||||||||| |||||| || ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  36694764 ttttttgaaaaagttacttttaattttaatgtttgatttatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaa 36694863  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
     |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36694864 catcttggatttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 36694956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 389 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 44869893 - 44869697
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44869893 tgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttggttactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 44869794  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    |||| ||||||||||||    |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  44869793 gcaatatcttggacttatcggtactattttatcgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacactt 44869697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 413 - 641
Target Start/End: Original strand, 6098331 - 6098581
Alignment:
Q  413 tgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttaca----- 507  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||         
T  6098331 tgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtac 6098430  T
Q  508 tatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaaac 590  Q
    |||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||||||    
T  6098431 tattgtattgtatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaac 6098530  T
Q  591 aaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattga 641  Q
    ||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  6098531 aagataggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattga 6098581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 378 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 12587989 - 12587812
Alignment:
Q  378 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatc 477  Q
    ||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  12587989 agttagagaactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatc 12587890  T
Q  478 tagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatga 555  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  12587889 tagtaatgcttgcaaaatctttgacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgatga 12587812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 382 - 645
Target Start/End: Original strand, 10554991 - 10555269
Alignment:
Q  382 agaaaattgacttttttgaaaagg-ttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatt--aattcatct 478  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||   |||||||||||| |  |||||||||    
T  10554991 agaaaattgacttttttgaaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtttattact---taatgatcaatagtgtaattcatct 10555087  T
Q  479 agtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc-------- 570  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| || || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||            
T  10555088 agtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcaagtgtta 10555187  T
Q  571 -------ttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
           | | ||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10555188 cgttttgtgaggtgttgcgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 10555269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Original strand, 31933680 - 31933953
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  31933680 tgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatatttgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgtct 31933779  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca------ 582  Q
    |||| ||||| ||||||||  |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||          
T  31933780 gcaatatcttagacttacaagtactattttattgttggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataattttaagtgttacactttgt 31933879  T
Q  583 -----------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
               |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31933880 gcggtattatgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgat 31933953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 431 - 585
Target Start/End: Original strand, 1149756 - 1149906
Alignment:
Q  431 catttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatc 530  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||||| |||    
T  1149756 catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggaatc 1149855  T
Q  531 tttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  1149856 tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgt----gtcttaagtgttacactt 1149906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 389 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 12876506 - 12876309
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    |||||||||| |||| |||| |||| || |||||||| | || ||||| ||| |||||||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  12876506 tgacttttttaaaaaagttacttttaattttaatgtttgatttattttcaaactgttgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtaatgcct 12876407  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactt 585  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12876406 gtaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactt 12876309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 393 - 585
Target Start/End: Original strand, 30654381 - 30654573
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaatgcttgca 491  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| || | |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  30654381 ttttttgaaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttt-aaattgttaattactgattaatgatcaataatatattcatttagtaatgcttgca 30654479  T
Q  492 aaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    | ||||||||||||||  |||||||| |||||||  || ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30654480 acatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatttttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 30654573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 429 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 9864504 - 9864348
Alignment:
Q  429 ttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggca 528  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | || | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||| ||||||||||    
T  9864504 ttcatttttaaattgttgattaccgattcatgattactagttattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgttggca 9864405  T
Q  529 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9864404 tctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 9864348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 393 - 641
Target Start/End: Original strand, 39098917 - 39099182
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    |||||| ||||  |||||||| || |||||||| | | |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39098917 ttttttaaaaaaattaattttaattttaatgtttgatgcatttttaaattattgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 39099016  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt-------------- 578  Q
     || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||                  
T  39099017 cattttggacttacatatactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgatactttgtggga 39099116  T
Q  579 ---tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattga 641  Q
       ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  39099117 tgttacacttaaaacagggtaagataaaattagattaagtgtatttttgttaatctgatgaattga 39099182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 385 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 18259479 - 18259321
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | | ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  18259479 aaattgacttttttgaaaaggttaattttaattttaatgattgattcatttttaaattgttgattactcattactgatcaacaataattcatctagtaat 18259380  T
Q  485 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaa 543  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  18259379 gcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaa 18259321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 395 - 537
Target Start/End: Original strand, 24823194 - 24823336
Alignment:
Q  395 ttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaa 494  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  24823194 ttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaca 24823293  T
Q  495 tcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaaca 537  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24823294 tcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaaca 24823336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 385 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 33198202 - 33198057
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| | | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  33198202 aaattgacttttttgaaaaagttaatcttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtgat 33198103  T
Q  485 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatc 530  Q
    |||||||| || || ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  33198102 gcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgttggcatc 33198057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 510 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 7998553 - 7998417
Alignment:
Q  510 tactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggt-aaaattag 608  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  7998553 tactattttatcgttggcatctttaatatagaaacagagttgttgatattatgtgatagtattaagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattag 7998454  T
Q  609 attaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  7998453 attaagtgtattcttgttaatctgatgtattgatgat 7998417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 389 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 41362818 - 41362723
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41362818 tgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactggttaatgatcaatagtaattcatctagtaat 41362723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 471 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 13307936 - 13307823
Alignment:
Q  471 attcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 570  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||   |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  13307936 attcatcttgtaatgcttgcaacatcttgaacttacgggtactattttatcgttgacat-tttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtc 13307838  T
Q  571 ttaagtgttacactt 585  Q
    |||||||||||||||    
T  13307837 ttaagtgttacactt 13307823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Original strand, 41910985 - 41911055
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  41910985 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 41911055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Original strand, 1150102 - 1150172
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1150102 gtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgat 1150172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 361 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 43026099 - 43025974
Alignment:
Q  361 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaag-gttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaat 459  Q
    ||||||||| | ||||  ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  43026099 gggagcttctaaactgcggttaggaaattgatttttttgaaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatcactgattcat 43026000  T
Q  460 gatcaatattaattcatctagtaatg 485  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  43025999 gatcaatagtaatttatctaataatg 43025974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 519 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 43025968 - 43025905
Alignment:
Q  519 atcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 582  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43025968 atcgttgacatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttaca 43025905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 9864341 - 9864271
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||    
T  9864341 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgat 9864271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 11727217 - 11727147
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||    
T  11727217 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatttgatgaattgatgat 11727147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Original strand, 36694963 - 36695033
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||    
T  36694963 gtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgat 36695033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 576 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 41362707 - 41362638
Alignment:
Q  576 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41362707 tgttacacttaaaacaaggtatgataaaattatatcaagtttagtcttgttaatctgatgaattgatgat 41362638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 513 - 585
Target Start/End: Original strand, 41910907 - 41910978
Alignment:
Q  513 tatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  41910907 tattttatcgttg-catctttaacatgcaaacagagttggtgatatcatgtgatagtattaagtgttacactt 41910978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 576 - 642
Target Start/End: Original strand, 1953987 - 1954053
Alignment:
Q  576 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 642  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  1953987 tgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagatttagtgtagtcatattaatctgatgaattgat 1954053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 1205112 - 1205050
Alignment:
Q  583 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||    
T  1205112 cttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtaatcttgttaatatgatgaactgatgat 1205050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 12876294 - 12876232
Alignment:
Q  583 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||    
T  12876294 cttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtatccttcttaatctgatgaattgatgat 12876232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Original strand, 30654588 - 30654650
Alignment:
Q  583 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  30654588 cttaaaacaatgtatggtaaaattaaattaagtgtagtcttgttaacctgatgaagtgatgat 30654650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 580 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 44869686 - 44869620
Alignment:
Q  580 acacttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||    
T  44869686 acacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattattgttaatctgataaattgatgat 44869620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 464 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 34463792 - 34463704
Alignment:
Q  464 aatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatga 555  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||| |  || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34463792 aatagtaattcatttagtaatgcttgcaacat---ggacttataggtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgatga 34463704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Original strand, 7890962 - 7891024
Alignment:
Q  583 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7890962 cttataacaaagtaagataaaactagattgagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 7891024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Original strand, 8803827 - 8803884
Alignment:
Q  588 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8803827 aacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgat 8803884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 584 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 43025886 - 43025825
Alignment:
Q  584 ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||    
T  43025886 ttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattcttcttagtctgatgaattgatgat 43025825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 594 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 13307797 - 13307749
Alignment:
Q  594 gtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 642  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  13307797 gtaggataaaattagattaagtgtattcttgctaatctgatgaattgat 13307749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 9864578 - 9864533
Alignment:
Q  378 agttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatg 423  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  9864578 agttaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatg 9864533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 385 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 13307979 - 13307939
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgtt 425  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13307979 aaattgactattttgaaaaagttaattttaatcttaatgtt 13307939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 156; Significance: 2e-82; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 353 - 642
Target Start/End: Original strand, 7234783 - 7235092
Alignment:
Q  353 taattaatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgct 452  Q
    ||||||||||||||||  ||  || ||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  7234783 taattaatgggagcttttacggtgtagtcaggaaaatgatttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgatttatttttaaattgttgattgtt 7234882  T
Q  453 g---attaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagt 549  Q
    |   |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7234883 gttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagt 7234982  T
Q  550 tgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctg 632  Q
    ||||||||||||| |||||||||||                 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7234983 tgatgatattatgcgatagtcttaagcgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctg 7235082  T
Q  633 atgaattgat 642  Q
    ||||||||||    
T  7235083 atgaattgat 7235092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 357 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 20768511 - 20768283
Alignment:
Q  357 taatgggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgatt 456  Q
    ||||||||||||| ||  || ||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20768511 taatgggagcttctacggtgcagtcaggaaattgatttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcaattcatttttaaattgttgattactgatt 20768412  T
Q  457 aatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgat 556  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20768411 aatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacataattgatgat 20768312  T
Q  557 attatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||    
T  20768311 attatgcgatgatcttaagtgttacactt 20768283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 385 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 33619234 - 33618958
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgat---taatgatcaatattaattcatctagt 481  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||    
T  33619234 aaattgactttttttaaaaagttaattttaatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgatcattaatgatcaatagtaattcatctagt 33619135  T
Q  482 aatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctt-----taacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 576  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  33619134 aatgcttgcaacatattggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatactcttaagt 33619035  T
Q  577 gttacacttaaa-------aca-aggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    || ||||||  |       |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33619034 gtcacacttctagggtgttacactggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 33618958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 393 - 585
Target Start/End: Original strand, 3879730 - 3879922
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaa 492  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3879730 ttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 3879829  T
Q  493 aatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
     ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3879830 catcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 3879922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 361 - 645
Target Start/End: Original strand, 6090941 - 6091243
Alignment:
Q  361 gggagcttccacactggagttagaaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 460  Q
    ||||||||| ||  || ||| |||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6090941 gggagcttctacggtgcagtcagaaaacttacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 6091040  T
Q  461 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 560  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  6091041 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtttgaatctttaatatgcaaacagagttgatgatatta 6091140  T
Q  561 tgtgatagtc-ttaagtgttaca-----------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 642  Q
    |||||||||| ||||||||||||                 |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  6091141 tgtgatagtctttaagtgttacactttgttgggtgttacgcttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgat 6091240  T
Q  643 gat 645  Q
    |||    
T  6091241 gat 6091243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 389 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 1946233 - 1946035
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaag-gttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaatgc 486  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  1946233 tgacttttttgaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctaataatgc 1946134  T
Q  487 ttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    ||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1946133 ttgtaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 1946035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Original strand, 33892799 - 33893063
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  33892799 tgacttttttgaaaaagttaattttaaccttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgttt 33892898  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga----tagtctt----aagtgtta 580  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||    ||  |||      ||||||    
T  33892899 gcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaactgagttgctgatatcatgtgagtgttacactttgtggggtgtta 33892998  T
Q  581 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  33892999 tacataaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 33893063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 393 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 5627785 - 5627592
Alignment:
Q  393 ttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaatgcttgca 491  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  5627785 ttttttaaaaaaattaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcacctagtaatgcttgca 5627686  T
Q  492 aaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    | ||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5627685 acatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactt 5627592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 8513618 - 8513357
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8513618 tgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatt-------aatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 8513526  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac----- 583  Q
    |||| || ||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||         
T  8513525 gcaagattttggacttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 8513426  T
Q  584 ------ttaaaacaaggtagggt-aaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
          ||||||||||||||| | |||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  8513425 agggtgttaaaacaaggtaggataaaaattagatcaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgat 8513357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 406 - 585
Target Start/End: Original strand, 4318626 - 4318805
Alignment:
Q  406 ttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggactta 505  Q
    |||||||| || |||||||| | || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  4318626 ttaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttt 4318725  T
Q  506 catatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    |   |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4318726 cccgtactatttcatcgttgacatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 4318805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 391 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 29182556 - 29182365
Alignment:
Q  391 acttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgc 490  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||| |||||    
T  29182556 acttttttgaaaaagttaattttagtcttaatgattgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcagta---attcatctagtaatacttgc 29182460  T
Q  491 aaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    || ||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29182459 aacatcttagacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacctgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 29182365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 400 - 585
Target Start/End: Original strand, 21016916 - 21017095
Alignment:
Q  400 aaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttg 499  Q
    |||| ||||||||| |||||||| || | ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  21016916 aaaaagttaattttaatcttaatatttgattcatttataaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 21017015  T
Q  500 gacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    ||| |||      ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21017016 gacgtac------tattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 21017095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 396 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 6089286 - 6089032
Alignment:
Q  396 tttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaat 495  Q
    ||||||||  |||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  6089286 tttgaaaaaattaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatt-------aatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacat 6089194  T
Q  496 cttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac-----------t 584  Q
     ||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||           |    
T  6089193 tttggacttactggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttataccttgtagagtgt 6089094  T
Q  585 taaaacaaggtagggt-aaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||   | ||||||||||||||||||||||||||    
T  6089093 taaaacaaggtaggataaaaattagatcaaggatattcttgttaatctgatgaattgatgat 6089032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 389 - 533
Target Start/End: Original strand, 7054559 - 7054704
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaatgct 487  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||| |||||||| |    
T  7054559 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatctttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatttagtaatgtt 7054658  T
Q  488 tgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatcttt 533  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||    
T  7054659 tgcaacatcttggacttacagttactattttatcgttggaatcttt 7054704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 15491809 - 15491739
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15491809 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgcattcttgttaatctgatgaattgatgat 15491739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 500 - 585
Target Start/End: Original strand, 30353256 - 30353341
Alignment:
Q  500 gacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30353256 gacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 30353341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Original strand, 4318812 - 4318883
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  4318812 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctaatgaattgatgat 4318883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Original strand, 7055205 - 7055275
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7055205 gtgttacacttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgat 7055275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 527 - 585
Target Start/End: Original strand, 7055140 - 7055198
Alignment:
Q  527 catctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7055140 catctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactt 7055198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 576 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 20768275 - 20768208
Alignment:
Q  576 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||    
T  20768275 tgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagt--aatcttgttaatctgatgaattaatgat 20768208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Original strand, 21017102 - 21017172
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||    
T  21017102 gtgttacacttaaaataacgtaggataaaattagattaagtttattcttgttagtctgatgaattgatgat 21017172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 576 - 645
Target Start/End: Original strand, 30353349 - 30353418
Alignment:
Q  576 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||    
T  30353349 tgttacacttaaaacaaggcatgataaaattagattaagtgtattcttgtttatatgatgaattgatgat 30353418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 584 - 645
Target Start/End: Original strand, 3879938 - 3879999
Alignment:
Q  584 ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||||||||||    
T  3879938 ttaaaacaaggtaggataaaattagaataagtatattcttgttagtctgatgaattgatgat 3879999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 593 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 29182339 - 29182287
Alignment:
Q  593 ggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  29182339 ggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgat 29182287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 460
Target Start/End: Original strand, 33724062 - 33724117
Alignment:
Q  405 gttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 460  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  33724062 gttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgcttaatgattaatg 33724117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 5627572 - 5627518
Alignment:
Q  588 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 642  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  5627572 aacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgat 5627518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 1946015 - 1945958
Alignment:
Q  588 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||    
T  1946015 aacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacttgatgaattcatgat 1945958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 140; Significance: 5e-73; HSPs: 6)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 395 - 645
Target Start/End: Original strand, 408223 - 408490
Alignment:
Q  395 ttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaa 494  Q
    |||||||||  |||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  408223 ttttgaaaaaattaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaca 408322  T
Q  495 tcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtg 577  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||                 |||    
T  408323 tcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttccactttgtgaggtg 408422  T
Q  578 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  408423 ttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 408490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 397 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 517 - 335
Alignment:
Q  397 ttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatc 496  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  517 ttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc 418  T
Q  497 ttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    ||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  417 ttggac------gtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 394 - 557
Target Start/End: Original strand, 93894 - 94056
Alignment:
Q  394 tttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaa 493  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||     
T  93894 tttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttt-aaattgttgattagtgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaac 93992  T
Q  494 atcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgata 557  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  93993 atcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaatttgatgata 94056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 328 - 258
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||    
T  328 gtgttacacttaaaataagataggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgatgat 258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Original strand, 94374 - 94444
Alignment:
Q  575 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  94374 gtgttacacttgaaacaagctagaataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctcatgaattgatgat 94444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 549 - 585
Target Start/End: Original strand, 94331 - 94367
Alignment:
Q  549 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  94331 ttgatgatattatgtaatagtcttaagtgttacactt 94367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 138; Significance: 8e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 385 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 8288 - 8011
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 484  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| | | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8288 aaattgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 8189  T
Q  485 gcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca-- 582  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  8188 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 8089  T
Q  583 ---------------cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
                   |||| | |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8088 ttgtggggtgttacgcttatagcaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 8011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 391 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 12303 - 12033
Alignment:
Q  391 acttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgc 490  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12303 acttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatt-atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgc 12205  T
Q  491 aaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa---------------- 574  Q
    || ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||                    
T  12204 aacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtgg 12105  T
Q  575 -gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
     ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  12104 ggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 12033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 385 - 585
Target Start/End: Original strand, 145799 - 146000
Alignment:
Q  385 aaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatatta-attcatctagtaa 483  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||  || |||||| ||||||    
T  145799 aaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttaattcatttttaaattttttattactgattaatgatcaattgtatattcatttagtaa 145898  T
Q  484 tgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 583  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  145899 tgcttgcaacatcttggacttacagacactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 145998  T
Q  584 tt 585  Q
    ||    
T  145999 tt 146000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Original strand, 146020 - 146077
Alignment:
Q  588 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  146020 aacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgat 146077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 389 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 44353 - 44158
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  44353 tgacttttttgaaaaagttgattttgattttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcattcagtaatgctt 44254  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44253 gcaacaacttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag-cttaagtgttacactt 44158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 600 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 44126 - 44081
Alignment:
Q  600 taaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  44126 taaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgat 44081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 389 - 585
Target Start/End: Original strand, 154434 - 154629
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  154434 tgacttttttgaaaaagttgattttgattttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcattcagtaatgctt 154533  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 585  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  154534 gcaacaacttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag-cttaagtgttacactt 154629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Original strand, 154649 - 154706
Alignment:
Q  588 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
    |||||| || | |||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  154649 aacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgat 154706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 103; Significance: 6e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 389 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 267673 - 267408
Alignment:
Q  389 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgctt 488  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||  |         |||||||||||||||| |||    
T  267673 tgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattggt---------taattcatctagtaattctt 267583  T
Q  489 gcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacac---- 583  Q
    |||  ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        
T  267582 gcagcatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttg 267483  T
Q  584 -------------ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 645  Q
                 ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  267482 tgggatgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgctaatctaatgaattgatgat 267408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 441 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 101058 - 100894
Alignment:
Q  441 ttgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatatactatttcatcgttggcatctttaacatgc 540  Q
    ||||||||| |||||||||||||  || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||            |||||| |||||||||||||    
T  101058 ttgttgattactgattaatgatc--tagtaatgcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacat------------cgttggaatctttaacatgc 100973  T
Q  541 aaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac--ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgt 625  Q
    ||||| ||||||||||||||||||        |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  100972 aaacagagttgatgatattatgtg--------aagtgttacacagttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgt 100894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University