View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20974_low_3 (Length: 487)

Name: NF20974_low_3
Description: NF20974
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20974_low_3
NF20974_low_3
[»] chr7 (49 HSPs)
chr7 (1-487)||(41765123-41765606)
chr7 (262-487)||(41757298-41757523)
chr7 (1-147)||(48928609-48928754)
chr7 (1-126)||(48928342-48928466)
chr7 (4-142)||(5657529-5657667)
chr7 (1-143)||(21991610-21991752)
chr7 (1-142)||(8861260-8861401)
chr7 (4-117)||(29173540-29173653)
chr7 (1-126)||(22687230-22687355)
chr7 (2-142)||(4582894-4583034)
chr7 (1-144)||(30055499-30055643)
chr7 (1-144)||(32821098-32821241)
chr7 (4-146)||(26524375-26524517)
chr7 (1-116)||(12165753-12165868)
chr7 (1-147)||(18797299-18797443)
chr7 (4-115)||(26980325-26980436)
chr7 (3-141)||(24211717-24211855)
chr7 (1-105)||(35353120-35353225)
chr7 (12-142)||(34362205-34362334)
chr7 (1-94)||(32593234-32593326)
chr7 (2-143)||(43686015-43686155)
chr7 (1-144)||(12390675-12390818)
chr7 (1-142)||(6546494-6546635)
chr7 (1-142)||(15612804-15612944)
chr7 (1-126)||(33688307-33688431)
chr7 (1-142)||(37109847-37109988)
chr7 (9-126)||(37347013-37347130)
chr7 (1-145)||(17842631-17842775)
chr7 (6-126)||(31520774-31520893)
chr7 (3-126)||(7334785-7334908)
chr7 (4-126)||(25691592-25691715)
chr7 (1-142)||(10359260-10359400)
chr7 (1-142)||(27283719-27283860)
chr7 (2-143)||(32432431-32432567)
chr7 (1-126)||(38258536-38258661)
chr7 (1-144)||(9355871-9356014)
chr7 (1-60)||(11071263-11071322)
chr7 (1-140)||(27421425-27421563)
chr7 (1-143)||(31579109-31579256)
chr7 (1-126)||(23111181-23111306)
chr7 (1-62)||(10481660-10481721)
chr7 (78-140)||(8299192-8299254)
chr7 (3-45)||(34362149-34362191)
chr7 (4-140)||(44413427-44413564)
chr7 (97-148)||(40381934-40381985)
chr7 (97-126)||(3953747-3953776)
chr7 (97-126)||(23402374-23402403)
chr7 (1-46)||(44598737-44598782)
chr7 (11-63)||(38053540-38053592)
[»] chr3 (47 HSPs)
chr3 (4-147)||(22450954-22451097)
chr3 (4-142)||(4015451-4015589)
chr3 (1-126)||(11357408-11357534)
chr3 (1-144)||(33378829-33378969)
chr3 (1-145)||(21193594-21193738)
chr3 (1-142)||(37203058-37203199)
chr3 (1-144)||(35844315-35844458)
chr3 (1-144)||(48354930-48355073)
chr3 (1-143)||(11466814-11466956)
chr3 (1-131)||(40935993-40936123)
chr3 (1-126)||(52040966-52041092)
chr3 (1-126)||(43975932-43976054)
chr3 (2-144)||(34132924-34133066)
chr3 (1-143)||(40552303-40552445)
chr3 (1-142)||(51213025-51213166)
chr3 (4-119)||(44186548-44186663)
chr3 (1-140)||(46297806-46297945)
chr3 (4-126)||(27480426-27480548)
chr3 (4-126)||(29099362-29099484)
chr3 (9-142)||(37157699-37157831)
chr3 (1-143)||(26941304-26941446)
chr3 (1-126)||(53229196-53229322)
chr3 (5-143)||(7327530-7327669)
chr3 (1-143)||(3655246-3655388)
chr3 (1-120)||(45174516-45174637)
chr3 (1-94)||(2007972-2008065)
chr3 (1-94)||(42506119-42506212)
chr3 (1-145)||(39282641-39282784)
chr3 (4-110)||(3362276-3362382)
chr3 (5-144)||(4761697-4761838)
chr3 (4-126)||(20373343-20373465)
chr3 (4-144)||(47481511-47481651)
chr3 (4-126)||(22446111-22446234)
chr3 (4-126)||(32373479-32373599)
chr3 (1-60)||(53176127-53176186)
chr3 (3-95)||(21009848-21009940)
chr3 (2-126)||(24489007-24489131)
chr3 (1-84)||(24708161-24708242)
chr3 (12-126)||(25579746-25579860)
chr3 (1-126)||(44891514-44891629)
chr3 (97-144)||(40640637-40640684)
chr3 (1-64)||(43348327-43348389)
chr3 (1-39)||(29163912-29163950)
chr3 (6-42)||(46994710-46994746)
chr3 (1-83)||(14586714-14586796)
chr3 (78-144)||(55343405-55343471)
chr3 (48-141)||(11835702-11835790)
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (1-149)||(7235078-7235225)
chr6 (4-143)||(8513232-8513371)
chr6 (1-140)||(6088910-6089049)
chr6 (1-126)||(33618850-33618975)
chr6 (1-141)||(20768087-20768225)
chr6 (2-143)||(3879983-3880124)
chr6 (1-144)||(4318866-4319009)
chr6 (11-144)||(18498431-18498565)
chr6 (1-126)||(15491631-15491756)
chr6 (1-148)||(29182157-29182304)
chr6 (2-126)||(21017156-21017280)
chr6 (4-140)||(30353404-30353540)
chr6 (4-145)||(1945830-1945972)
chr6 (3-144)||(5627389-5627530)
chr6 (1-142)||(33893046-33893186)
chr6 (3-143)||(7055260-7055400)
chr6 (1-81)||(6091226-6091306)
chr6 (97-144)||(19631747-19631794)
[»] chr4 (49 HSPs)
chr4 (1-144)||(38011852-38011995)
chr4 (5-142)||(28003060-28003197)
chr4 (12-143)||(35025669-35025800)
chr4 (4-126)||(34948170-34948292)
chr4 (1-126)||(49375982-49376108)
chr4 (1-126)||(33816603-33816728)
chr4 (1-142)||(55241174-55241315)
chr4 (1-144)||(25701127-25701270)
chr4 (12-126)||(7703533-7703647)
chr4 (1-144)||(29584270-29584411)
chr4 (1-142)||(19089523-19089664)
chr4 (1-145)||(27396613-27396757)
chr4 (1-126)||(5048035-5048160)
chr4 (1-125)||(23761089-23761213)
chr4 (1-144)||(35021105-35021248)
chr4 (4-126)||(4598009-4598130)
chr4 (1-126)||(50764748-50764871)
chr4 (1-126)||(19440718-19440843)
chr4 (12-140)||(47253751-47253878)
chr4 (1-132)||(32592103-32592234)
chr4 (1-143)||(37663811-37663951)
chr4 (1-145)||(55477961-55478109)
chr4 (6-140)||(36493763-36493897)
chr4 (14-143)||(37287732-37287862)
chr4 (9-142)||(39397918-39398051)
chr4 (12-144)||(30002705-30002837)
chr4 (1-120)||(32579466-32579587)
chr4 (1-143)||(25184112-25184254)
chr4 (1-140)||(33341397-33341539)
chr4 (4-117)||(54499311-54499425)
chr4 (5-144)||(34361566-34361704)
chr4 (2-116)||(17167739-17167853)
chr4 (2-116)||(17173316-17173430)
chr4 (1-148)||(9139241-9139386)
chr4 (1-126)||(37775685-37775808)
chr4 (1-126)||(879618-879743)
chr4 (1-126)||(46888227-46888352)
chr4 (1-88)||(4934272-4934360)
chr4 (1-124)||(6864053-6864176)
chr4 (3-144)||(32912652-32912793)
chr4 (1-148)||(42199723-42199870)
chr4 (97-146)||(38812263-38812312)
chr4 (48-144)||(4205114-4205210)
chr4 (76-145)||(17272008-17272077)
chr4 (97-140)||(20097494-20097537)
chr4 (4-34)||(1815409-1815439)
chr4 (97-146)||(2704508-2704557)
chr4 (67-144)||(7152242-7152319)
chr4 (97-142)||(38811813-38811858)
[»] chr5 (52 HSPs)
chr5 (9-126)||(33908249-33908366)
chr5 (1-142)||(14409361-14409501)
chr5 (1-126)||(26268090-26268215)
chr5 (1-144)||(19119857-19120000)
chr5 (4-144)||(8741923-8742064)
chr5 (1-142)||(7693230-7693371)
chr5 (1-149)||(27330299-27330445)
chr5 (4-123)||(5837574-5837693)
chr5 (1-126)||(699166-699291)
chr5 (1-126)||(30969358-30969483)
chr5 (1-142)||(31786680-31786821)
chr5 (4-145)||(36860420-36860561)
chr5 (1-140)||(25500960-25501099)
chr5 (6-144)||(5112352-5112490)
chr5 (1-126)||(22980809-22980934)
chr5 (2-142)||(36866762-36866902)
chr5 (2-142)||(40133385-40133525)
chr5 (4-143)||(1429182-1429321)
chr5 (4-143)||(9200232-9200371)
chr5 (1-143)||(39572818-39572960)
chr5 (1-142)||(23116256-23116397)
chr5 (4-148)||(8466739-8466882)
chr5 (1-144)||(38528271-38528413)
chr5 (1-144)||(12910348-12910496)
chr5 (1-141)||(32563150-32563290)
chr5 (4-144)||(24886100-24886242)
chr5 (4-118)||(22019656-22019770)
chr5 (4-126)||(27318524-27318646)
chr5 (6-144)||(35826522-35826660)
chr5 (11-143)||(8436965-8437097)
chr5 (1-84)||(25668707-25668790)
chr5 (4-142)||(15724490-15724626)
chr5 (1-63)||(15992574-15992636)
chr5 (5-126)||(11898018-11898139)
chr5 (1-126)||(35511511-35511636)
chr5 (4-88)||(21088803-21088887)
chr5 (1-126)||(22255197-22255323)
chr5 (2-144)||(22974117-22974259)
chr5 (1-141)||(31705646-31705785)
chr5 (1-143)||(35933901-35934036)
chr5 (1-84)||(6824513-6824598)
chr5 (1-103)||(28416561-28416663)
chr5 (3-61)||(43308688-43308746)
chr5 (48-149)||(13956426-13956527)
chr5 (4-144)||(14919565-14919706)
chr5 (1-64)||(7208898-7208960)
chr5 (4-74)||(23954826-23954897)
chr5 (9-81)||(5829962-5830034)
chr5 (67-142)||(16004476-16004552)
chr5 (97-144)||(22616492-22616539)
chr5 (97-141)||(10237415-10237459)
chr5 (4-64)||(35504443-35504503)
[»] chr1 (49 HSPs)
chr1 (1-126)||(14758053-14758178)
chr1 (1-144)||(15168083-15168233)
chr1 (1-126)||(31621592-31621717)
chr1 (1-126)||(47279201-47279326)
chr1 (1-110)||(40884841-40884950)
chr1 (1-144)||(16415639-16415783)
chr1 (1-140)||(15752027-15752166)
chr1 (1-143)||(2959743-2959885)
chr1 (1-142)||(3309144-3309284)
chr1 (1-142)||(38823210-38823351)
chr1 (4-140)||(33725642-33725778)
chr1 (5-144)||(11742394-11742532)
chr1 (1-126)||(27533019-27533144)
chr1 (12-144)||(1547281-1547413)
chr1 (1-142)||(21289661-21289809)
chr1 (1-126)||(27267238-27267361)
chr1 (1-126)||(4330291-4330418)
chr1 (1-144)||(34012416-34012559)
chr1 (1-144)||(48620631-48620774)
chr1 (1-143)||(10182047-10182189)
chr1 (1-143)||(18422646-18422788)
chr1 (4-123)||(9903096-9903215)
chr1 (1-64)||(27227524-27227587)
chr1 (1-144)||(39393377-39393520)
chr1 (1-123)||(10922742-10922864)
chr1 (1-142)||(42721035-42721176)
chr1 (3-143)||(19899810-19899950)
chr1 (1-105)||(32216088-32216192)
chr1 (1-144)||(3534926-3535069)
chr1 (1-144)||(15382927-15383070)
chr1 (1-144)||(32267028-32267171)
chr1 (1-126)||(47682533-47682657)
chr1 (4-126)||(28564823-28564945)
chr1 (1-142)||(30326991-30327132)
chr1 (4-126)||(7079105-7079238)
chr1 (1-140)||(41926161-41926300)
chr1 (2-140)||(238553-238690)
chr1 (1-143)||(30254419-30254560)
chr1 (1-144)||(37618931-37619078)
chr1 (1-60)||(25160710-25160769)
chr1 (4-146)||(8222123-8222262)
chr1 (4-140)||(28769651-28769786)
chr1 (4-126)||(37451298-37451419)
chr1 (4-113)||(51128884-51128993)
chr1 (3-103)||(46931446-46931546)
chr1 (3-126)||(23999359-23999482)
chr1 (96-144)||(4150489-4150537)
chr1 (1-74)||(27563944-27564017)
chr1 (97-142)||(43579242-43579287)
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (4-143)||(27082891-27083030)
chr8 (2-148)||(36695017-36695163)
chr8 (1-142)||(5299996-5300137)
chr8 (1-142)||(13307622-13307763)
chr8 (1-144)||(34894964-34895107)
chr8 (1-144)||(38643975-38644118)
chr8 (1-142)||(6098568-6098709)
chr8 (1-142)||(12876108-12876249)
chr8 (6-126)||(37970574-37970694)
chr8 (4-126)||(1204942-1205064)
chr8 (2-144)||(9864145-9864287)
chr8 (1-143)||(16446925-16447067)
chr8 (1-126)||(465857-465982)
chr8 (1-126)||(10555252-10555377)
chr8 (4-143)||(34952084-34952223)
chr8 (4-126)||(11727039-11727161)
chr8 (1-153)||(1150155-1150306)
chr8 (1-142)||(33906223-33906352)
chr8 (5-144)||(16222860-16222999)
chr8 (1-126)||(23854481-23854606)
chr8 (9-144)||(40862416-40862551)
chr8 (1-144)||(43643645-43643788)
chr8 (1-142)||(41362517-41362655)
chr8 (5-147)||(31933940-31934082)
chr8 (1-64)||(39099169-39099232)
chr8 (18-142)||(4133077-4133199)
chr8 (1-61)||(1149682-1149742)
chr8 (3-143)||(30654635-30654775)
chr8 (1-60)||(7891007-7891066)
chr8 (1-64)||(1954039-1954103)
chr8 (74-145)||(24823395-24823466)
chr8 (1-62)||(44869576-44869637)
chr8 (2-90)||(43025753-43025841)
chr8 (1-115)||(41911038-41911153)
chr8 (1-43)||(33197947-33197989)
chr8 (1-59)||(35459761-35459819)
chr8 (102-143)||(7998361-7998402)
chr8 (96-140)||(6446708-6446752)
chr8 (78-142)||(15009241-15009305)
chr8 (104-144)||(39099262-39099302)
[»] chr2 (39 HSPs)
chr2 (4-148)||(36641980-36642124)
chr2 (2-145)||(4166919-4167062)
chr2 (1-143)||(19424690-19424832)
chr2 (1-141)||(13711465-13711605)
chr2 (1-148)||(33551048-33551195)
chr2 (4-140)||(41463915-41464051)
chr2 (4-143)||(4264142-4264281)
chr2 (1-140)||(33660430-33660569)
chr2 (1-142)||(19313852-19313992)
chr2 (1-140)||(43770901-43771039)
chr2 (1-142)||(4478368-4478510)
chr2 (1-146)||(29242200-29242345)
chr2 (1-126)||(4763644-4763772)
chr2 (6-144)||(39167430-39167568)
chr2 (11-144)||(2325442-2325575)
chr2 (1-144)||(31570796-31570939)
chr2 (2-116)||(3176965-3177079)
chr2 (1-144)||(18494342-18494473)
chr2 (4-126)||(26357593-26357715)
chr2 (1-110)||(27350001-27350109)
chr2 (4-143)||(5881533-5881677)
chr2 (1-142)||(41465509-41465642)
chr2 (1-110)||(37905740-37905849)
chr2 (1-126)||(44285965-44286090)
chr2 (3-143)||(11366445-11366585)
chr2 (1-115)||(41051267-41051382)
chr2 (1-143)||(17071799-17071941)
chr2 (1-118)||(33902092-33902207)
chr2 (1-105)||(43648307-43648411)
chr2 (1-61)||(45327801-45327861)
chr2 (1-143)||(17054158-17054300)
chr2 (11-110)||(33709304-33709403)
chr2 (1-116)||(19289385-19289500)
chr2 (1-42)||(41960940-41960981)
chr2 (2-142)||(44913662-44913803)
chr2 (9-61)||(7006991-7007043)
chr2 (97-126)||(6177791-6177820)
chr2 (29-126)||(35958925-35959022)
chr2 (1-41)||(31861953-31861993)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (2-143)||(133-274)
scaffold0002 (1-121)||(94427-94547)
scaffold0002 (1-41)||(408473-408512)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (1-140)||(7889-8028)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (1-140)||(43959-44098)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (1-140)||(154689-154828)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (1-140)||(11908-12050)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (51-143)||(42347-42439)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (3-126)||(146062-146185)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (1-94)||(267331-267425)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 396; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 487
Target Start/End: Original strand, 41765123 - 41765606
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  41765123 atctgatgaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtattgactt 41765222  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaattattaacattgcaatattg---atgttacacaaacgcttttttaaaatgttgt 197  Q
     | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41765223 tatcagaaaagtcattctcatgacttcaccatggaattttccttaattat-aacattgcaatattgcacatgttacacaaaagcttttttaaaatgttgt 41765321  T
Q  198 gacctacactgtggtatacaatttttgtgctgcttctattttcaggggccagaggtctcgaatgcagttccaaacttgtacaagaattcgattcgtgcgt 297  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41765322 gacctacattgtggtatacaatttttg-----cttctattttcaggggccagaggtctcgaatgcagttccaaacttgtacaagaattcgattcgtgcgt 41765416  T
Q  298 tttgcaatgccaacacctcagaggaattcaagccagtaaaagatgtatctattccagaaatcaatgttcgaaccggcataattgatgatcttcttggtgg 397  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41765417 tttgcaatgccaacacctcagagggattcaagccagtaaaagatgtatctattccagaaatcaatgttcgaaccggcataattgatgatcttcttggcgg 41765516  T
Q  398 accatcaccatctaagagatcaattttggctttcttcgctggtgggcttcatggggatattaggaatgttctacttgaacattgggaaca 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41765517 accatcaccatctaagagatcaattttggctttcttcgctggtgggcttcatggggatattaggaatgttctacttgaacattgggaaca 41765606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 262 - 487
Target Start/End: Original strand, 41757298 - 41757523
Alignment:
Q  262 cagttccaaacttgtacaagaattcgattcgtgcgttttgcaatgccaacacctcagaggaattcaagccagtaaaagatgtatctattccagaaatcaa 361  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  41757298 cagttccaaacttgtacaaaaattcaatccgagcgctttgcaatgcgaacacatcagagggattcaagcctgcaaaggatgtatctattccagaaaccaa 41757397  T
Q  362 tgttcgaaccggcataattgatgatcttcttggtggaccatcaccatctaagagatcaattttggctttcttcgctggtgggcttcatggggatattagg 461  Q
    | ||| |||||| | |||  ||| | || |||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    |||||    
T  41757398 tcttcaaaccggtacaatacatggtattgttggcgggccatcaccatctaagcgatcagttttggctttcttcgccggtggggttcatgggcccgttagg 41757497  T
Q  462 aatgttctacttgaacattgggaaca 487  Q
      ||||||||||||||||||||||||    
T  41757498 cctgttctacttgaacattgggaaca 41757523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 48928609 - 48928754
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  48928609 atctgatgaattgataatactatg-ggactgaacttttgatggcaccgtacaaatagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgactt 48928707  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||||    
T  48928708 caccagaaaagtcattctcatgacttcaccataaaattttctttaat 48928754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 48928342 - 48928466
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  48928342 atctgatgaattgataatactatg-ggactgaacttttgatggcaccgtacaaatagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgactt 48928440  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  48928441 caccagaaaagtcattctcatgactt 48928466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 142
Target Start/End: Original strand, 5657529 - 5657667
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||||||    
T  5657529 tgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcac 5657628  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
     |||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  5657629 tagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 5657667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 21991752 - 21991610
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| | ||| ||||||| |||||||||  ||||    
T  21991752 atctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgacactgtacaaacagtggggtgttactcgcaacaattttgatgctatagtgttaactt 21991653  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  21991652 caccataaaaatcattctcatgacttcaccctagaattttcct 21991610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 8861401 - 8861260
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||  ||||||||||| |||||||||  ||||    
T  8861401 atctgattaattgatgatactatggggacttaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttattcataacacttttgatgctatagtgttaactt 8861302  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    | | |||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  8861301 cgcgagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 8861260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 29173653 - 29173540
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  29173653 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgatactacagtgttaacttcac 29173554  T
Q  104 cagaaaagtcattc 117  Q
    ||||||||||||||    
T  29173553 cagaaaagtcattc 29173540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 22687355 - 22687230
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||  |||||| ||| |||||||  ||||||||  ||||    
T  22687355 atctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgataccactgcacaaacagtggagtgttactcacaacatttttgatgttatagtgttaactt 22687256  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  22687255 catcagaaaagtcattctcatgactt 22687230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 4583034 - 4582894
Alignment:
Q  2 tctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttc 101  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||| |  |||||    
T  4583034 tctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtattaacttc 4582935  T
Q  102 accagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    ||||||||||||||| || |||||| || || |||||||||    
T  4582934 accagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 4582894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 30055643 - 30055499
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||  ||||    
T  30055643 atctgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatattatagtgttaactt 30055544  T
Q  101 ca-ccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    || | | |||||||||||| ||||||| || || |||||||||||    
T  30055543 catcaaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcctt 30055499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 32821098 - 32821241
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||  |||| |||  ||||    
T  32821098 atctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttatattgttaactt 32821197  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  32821198 caccaaaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattttcctt 32821241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 26524375 - 26524517
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |||  | |||| ||| |||||||  ||||||||  || ||||    
T  26524375 tgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccactgcacaaacaatggagtgttagtcacaacatttttgatgttatagtgttaacatcac 26524474  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaa 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  26524475 cagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccttaa 26524517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 12165868 - 12165753
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||    
T  12165868 atctgatgaattgatgatacttaagggacttaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacactttggatgctatagtgttaactt 12165769  T
Q  101 caccagaaaagtcatt 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  12165768 caccagaaaagtcatt 12165753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18797443 - 18797299
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||| |||| ||||  ||   ||||||  ||||    
T  18797443 atctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacattttt--tatgttagtgttaactt 18797346  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 147  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  18797345 caccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccttaat 18797299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 26980436 - 26980325
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||||    
T  26980436 tgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgccactgtacaaaccgtggggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaacttcac 26980337  T
Q  104 cagaaaagtcat 115  Q
    || |||||||||    
T  26980336 cataaaagtcat 26980325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 24211855 - 24211717
Alignment:
Q  3 ctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttca 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||| |||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||    
T  24211855 ctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccattctataaacagtagggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 24211756  T
Q  103 ccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttc 141  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| || || ||||||||    
T  24211755 ccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttc 24211717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 35353225 - 35353120
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaa-cttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgact 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  35353225 atctgatgaattggtgatactatggggacagaaacttttgattccatcgtacaaacaatggggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgact 35353126  T
Q  100 tcacca 105  Q
    ||||||    
T  35353125 tcacca 35353120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 142
Target Start/End: Original strand, 34362205 - 34362334
Alignment:
Q  12 tgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaag 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||  | |||||||    
T  34362205 tgatgatactatgagaactgaacttt-gatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactttcctagaaaag 34362303  T
Q  112 tcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    |||||||||| | || || || |||||||||    
T  34362304 tcattctcataatttcaccatagaattttcc 34362334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 32593234 - 32593326
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgt 94  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  32593234 atctgatgaattgatgatactgtgag-actgaacttttgataccaccatataaacagtggggtgctactcactacacttttaatgctatagtgt 32593326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 43686155 - 43686015
Alignment:
Q  2 tctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttc 101  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||  |||||    
T  43686155 tctgatgaattgttgatactatagggactgaacttttgatgccattgtacaaacagt-gggtgttactcacaacatttttgatattatagtgttaacttc 43686057  T
Q  102 accagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
    |||  |||||||||| || |||||| || || ||||||||||    
T  43686056 acccaaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcct 43686015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 12390675 - 12390818
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||    
T  12390675 atctgatgaattgataatactatggggacataacttttgatgtcactgcacaaacagtgggatgttactcattacacttttgatgttatagtgttaactt 12390774  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    ||||| |||||||  ||| ||||||| || || |||||||||||    
T  12390775 caccaaaaaagtcgatctgatgacttcaccatagaattttcctt 12390818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 6546635 - 6546494
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   | | |||||||||||  || ||||||| |||||||||  |||| | ||||||||||| |||||||||  ||||    
T  6546635 atctgatgaattgatgatactatggatagtaaacttttgatgttactgtacaaatagtggggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtgttaactt 6546536  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||||| || || |||||||||    
T  6546535 cactagaaaaatcattcttatgacttcaccatagaattttcc 6546494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 15612804 - 15612944
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||  |||| ||||||  ||||||||  ||||    
T  15612804 atctgatgaattgatgatattatagggactgaacttttgatgccactctacaaacactggggtgttactcataacac-tttgatgttatagtgttaactt 15612902  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||| || || |||||||||    
T  15612903 cacaagaaacgttattctcatgacttcaccatagaattttcc 15612944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 33688307 - 33688431
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||  |||||  |||||||||||  ||||||||  ||||    
T  33688307 atctgatgaattgatgatactatagagactgaacttttgatgccactggacaaacagtaggatgttactcataacacttttgatgttatagtgttaactt 33688406  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
     |||||||||||||||||||| ||||    
T  33688407 -accagaaaagtcattctcataactt 33688431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 37109988 - 37109847
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||    
T  37109988 atctgatgaattgatgatattataatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactt 37109889  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||| || || |||||||||    
T  37109888 caccaaaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattttcc 37109847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 37347130 - 37347013
Alignment:
Q  9 aattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||  ||||| || | |||||||  |||||| |  ||||||||| ||    
T  37347130 aattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcattatatttttgatggtatagtattaacttcaccaaaa 37347031  T
Q  109 aagtcattctcatgactt 126  Q
    || ||||| |||||||||    
T  37347030 aaatcattttcatgactt 37347013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 17842631 - 17842775
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| ||  |||||||| ||||||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||    
T  17842631 atctgatgaattgatgatattataatgactgagcttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactt 17842730  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 145  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||| || || ||||||||||||    
T  17842731 caccaaaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattttcctta 17842775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 126
Target Start/End: Original strand, 31520774 - 31520893
Alignment:
Q  6 atgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacca 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||  |||||||| | |||||||  |||||| |  |||||||||    
T  31520774 atgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggagtgttactcactatatttttgatggtatagtattaacttcacca 31520872  T
Q  106 gaaaagtcattctcatgactt 126  Q
     |||||||||| |||||||||    
T  31520873 aaaaagtcattttcatgactt 31520893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 7334908 - 7334785
Alignment:
Q  3 ctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||| ||||  ||| ||  ||||||||  ||||||    
T  7334908 ctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatattttatgttatagtgttaacttca 7334809  T
Q  103 ccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
     || |||||||||||||| |||||    
T  7334808 tcaaaaaagtcattctcacgactt 7334785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Original strand, 25691592 - 25691715
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggt-gccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttca 102  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||    |||||| | |||||||||  ||||||||  ||||||    
T  25691592 tgatgaattgataatactataagaactgaactgttgatgccactgtacaaacagtgaggtaattactcacaatacttttgatgttatagtgttaacttca 25691691  T
Q  103 ccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  25691692 cgagaaaagtcattctcatgactt 25691715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 10359260 - 10359400
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || ||  |||||||||||||||||| |||||   |  | ||    
T  10359260 atctgatgaattgatgatactatcag-actgaacttttgatgtcactgtataaatagtaggatgttactcactacacttttgatgctataagattaattt 10359358  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
     ||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||    
T  10359359 taccagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttcc 10359400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 27283860 - 27283719
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||    
T  27283860 atctgataaattgataatactatgaggactgaacttttgatttcattgtacaaacggtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 27283761  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    ||||| |||| ||||| | || |||| || || |||||||||    
T  27283760 caccaaaaaaatcatttttataacttcaccatagaattttcc 27283719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 32432567 - 32432431
Alignment:
Q  2 tctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||  |||||| ||| ||||||||     ||||  |||||    
T  32432567 tctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatggggtgttactcacaacatttttgata-----gtgttaacttc 32432473  T
Q  102 accagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
    ||||||||| ||||| || |||||| || || ||||||||||    
T  32432472 accagaaaaatcattttcgtgacttcaccatagaattttcct 32432431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 38258661 - 38258536
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||| ||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||    
T  38258661 atctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacggtgtggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactt 38258562  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    ||||| |||| ||||| | |||||||    
T  38258561 caccaaaaaaatcatttttatgactt 38258536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 9355871 - 9356014
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||| | |||| |||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    ||||||||| |||| || |||||||||  | ||    
T  9355871 atctgatgaattaacgataatatgagaactaaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtattgctcactacattttttatgctatagtgttaaatt 9355970  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||| || ||  ||||||||||    
T  9355971 caccaaaatggtcattctcatgacttcaccataaaattttcctt 9356014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 11071322 - 11071263
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtgg 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  11071322 atctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgg 11071263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 27421425 - 27421563
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||    
T  27421425 atctgataaatttatgatattat-aggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 27421523  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 140  Q
    ||||| |||| ||||| ||| ||||| || || |||||||    
T  27421524 caccaaaaaaatcattatcacgacttcaccatagaatttt 27421563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 31579109 - 31579256
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgta-----caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtc 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||      |||||||||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||     
T  31579109 atctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcattgtataaattaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtt 31579208  T
Q  96 gacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
     ||||||||| |||| | ||||| ||||||| || || ||||||||||    
T  31579209 aacttcaccaaaaaaattattcttatgacttcaccatagaattttcct 31579256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 23111306 - 23111181
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||  |||||| | | |||||||  ||||||||  ||||    
T  23111306 atctaatgaattgatgatactacgatggttgaacttttgatgccattgtacaaatagtggtgtgttactcacaatatttttgatgttatagtgttaactt 23111207  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||    
T  23111206 caccagaaaaatcattttcatgactt 23111181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 10481721 - 10481660
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtgggg 62  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||    
T  10481721 atctgatgaattgatgatactataaagactgaatttttgatgtcattgtacaaacagtgggg 10481660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 8299254 - 8299192
Alignment:
Q  78 ttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 140  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| || || |||||||    
T  8299254 ttttgatactatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 8299192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 45
Target Start/End: Original strand, 34362149 - 34362191
Alignment:
Q  3 ctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 45  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  34362149 ctgatgaattgatgatactataagaactgaacttttgatgcca 34362191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Original strand, 44413427 - 44413564
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttca- 102  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||  ||  ||||||||| |||||||  |||||||| | |||||||  ||||||||  ||||||     
T  44413427 tgatgaattgaagatactatggagaccgaacttttgatttcagtgtacaaacattggggtgttactcactatatttttgatgttatagtgttaacttcat 44413526  T
Q  103 ccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 140  Q
      | |||||||||| ||||||||| || || |||||||    
T  44413527 taaaaaaagtcattttcatgactttaccatagaatttt 44413564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 40381985 - 40381934
Alignment:
Q  97 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaatt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||||    
T  40381985 acttcaccagaaaagtcattctcataacttcaccgtagaattttccttaatt 40381934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 3953776 - 3953747
Alignment:
Q  97 acttcaccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3953776 acttcaccagaaaagtcattctcatgactt 3953747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 126
Target Start/End: Original strand, 23402374 - 23402403
Alignment:
Q  97 acttcaccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23402374 acttcaccagaaaagtcattctcatgactt 23402403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 44598782 - 44598737
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 46  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  44598782 atctgatgaatttatgatactatggggattgaatttttgatgccac 44598737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 38053592 - 38053540
Alignment:
Q  11 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggt 63  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||    
T  38053592 ttgatgacactatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggt 38053540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 47)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22451097 - 22450954
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22451097 tgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccaccatacaaacagtgaggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcac 22450998  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 147  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  22450997 cagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttccttaat 22450954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 4015589 - 4015451
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||     
T  4015589 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactctacaaacagttgggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcat 4015490  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  4015489 cagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 4015451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 11357408 - 11357534
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagt-ggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgact 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||  |||    
T  11357408 atctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgcaactgtacaaacagtgggggtgttactcactatacttttgatgctatagtgttaact 11357507  T
Q  100 tcaccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  11357508 tcaccagaaaagtcattctcatgactt 11357534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 33378829 - 33378969
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33378829 atctgatgaattgataatactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaatattggggtactactcactacacttttgatactatagtgttgactt 33378928  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    |||   ||||||||||||||| ||||  | || |||||||||||    
T  33378929 cac---aaaagtcattctcataactttgccatagaattttcctt 33378969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 21193738 - 21193594
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| | | |||||  ||||    
T  21193738 atctgatgaattaatgataccatggggactgaacttttgatgtcactctacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgattcaacagtgttaactt 21193639  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  21193638 caccagaaaagtcattctcatgactttaccatagaattttcctta 21193594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 37203199 - 37203058
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||  ||||    
T  37203199 atcttatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaactt 37203100  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    || || |||| ||||| | ||||||| || || |||||||||    
T  37203099 catcaaaaaaatcatttttatgacttcaccatagaattttcc 37203058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 35844458 - 35844315
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||  |||||| ||| ||||| |  ||||||||  ||||    
T  35844458 atctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcacaacatttttgttgttatagtgttaactt 35844359  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  35844358 caccagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttcctt 35844315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 48355073 - 48354930
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||| |||| |||| ||| ||||||||  ||||    
T  48355073 atctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttgatgccattgtacaaacaatggggtgttactcattacatttttaatattatagtgttaactt 48354974  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  48354973 caccataaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 48354930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 11466956 - 11466814
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||  |||  |||||| |  ||||    
T  11466956 atctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttgcgatgttatagtcttaactt 11466857  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||    
T  11466856 catcagaaaagtcattctcaagacttcaccatagaattttcct 11466814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 40936123 - 40935993
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||  |||| | ||||||||||| |||||||||  ||||    
T  40936123 atctgatgaatagatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtataaacaatgaggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtgttaactt 40936024  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaa 131  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  40936023 caccagaaaaatcattctcatgacttcacaa 40935993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 52040966 - 52041092
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaaca-gtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgact 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||| |  ||||||||||||||||||  |||||| |  |||    
T  52040966 atctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgccactatacaaacatttggggagttactcactacacttttgatgttatagtattaact 52041065  T
Q  100 tcaccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  52041066 tcaccagaaaagtcattctcatgactt 52041092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 43975932 - 43976054
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  43975932 atctgatgaattgatgatattatgaggattaaacttttgatgtcatcgtacaaatagtggagtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgactt 43976031  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
       || ||||||||||||||||||||    
T  43976032 ---caaaaaagtcattctcatgactt 43976054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 34133066 - 34132924
Alignment:
Q  2 tctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttc 101  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||  | |||    
T  34133066 tctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtgttaatttc 34132967  T
Q  102 accagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    |||| |||||||||| || |||||| |  || |||||||||||    
T  34132966 accaaaaaagtcattttcgtgacttcattatagaattttcctt 34132924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 40552303 - 40552445
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||    
T  40552303 atctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 40552402  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  40552403 ctccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcct 40552445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 51213025 - 51213166
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||| |||| |||| ||  || |||||  ||||    
T  51213025 atctgatgagttgatgatactatgaggactcaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttgctcattacattttttatgttacagtgttaactt 51213124  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  51213125 caccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 51213166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Original strand, 44186548 - 44186663
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  44186548 tgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtataaacagcggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcac 44186647  T
Q  104 cagaaaagtcattctc 119  Q
    || |||| ||||||||    
T  44186648 caaaaaaatcattctc 44186663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 46297806 - 46297945
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||| | |||||||  ||||||||  ||||    
T  46297806 atctaatgaattgatgatactacggggactgaacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactatatttttgatgttatagtgttaactt 46297905  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 140  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||    
T  46297906 caccagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatttt 46297945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Original strand, 27480426 - 27480548
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||| ||||| || |||||||||  |||||||| ||||| ||    
T  27480426 tgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaacaattggatgctactcattatacttttgatgttatagtgttgactttac 27480525  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    || |||  |||||||||||||||    
T  27480526 caaaaatatcattctcatgactt 27480548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 29099484 - 29099362
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  |||||| ||| |||| ||  ||||||||  |||||||    
T  29099484 tgatgaattgatgatactaaggggactgaactttagatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacgacattttttatgttatagtgttaacttcac 29099385  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  29099384 cagaaaagtcattctaatgactt 29099362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 37157831 - 37157699
Alignment:
Q  9 aattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaa 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||  |||||| || ||    
T  37157831 aattgatgatactatgatgactgaacttttgatgccactgtac-aacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaacttcatcaaaa 37157733  T
Q  109 aagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    ||| |||| ||||||||| || || |||||||||    
T  37157732 aagccattttcatgacttcaccatagaattttcc 37157699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 26941304 - 26941446
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||  ||||| || | |||||||  ||||||||  ||||    
T  26941304 atctgatgaattaatgataccatgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacagtggggtgttactcattataattttgattttatagtgttaactt 26941403  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||| || || ||||||||||    
T  26941404 caccaaaaaaatcattcttatgacttcaccatagaattttcct 26941446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 53229196 - 53229322
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtg-gggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgact 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||   ||||||||||||||||| |||||||||  | |    
T  53229196 atctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatgcaactgtacaaacattgagggtgttgctcactacacttttgatgctatagtgttaatt 53229295  T
Q  100 tcaccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||    
T  53229296 tcaccagaaaaataattttcatgactt 53229322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 143
Target Start/End: Original strand, 7327530 - 7327669
Alignment:
Q  5 gatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtg-tcgacttcac 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||| |||  |||||| |||||||||||  ||||||| |  |||||||    
T  7327530 gatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaataatggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgtttaacttcac 7327629  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
     | ||||||||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  7327630 taaaaaagtcattctcataacttcaccatagaattttcct 7327669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 3655246 - 3655388
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||    
T  3655246 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactt 3655345  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
     | || |||||||||| | ||||||| || ||  |||||||||    
T  3655346 tatcaaaaaagtcatttttatgacttcaccataaaattttcct 3655388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 45174637 - 45174516
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccact--cactacacttttgatactatagtgtcgac 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||  |||  ||| |||||||||||  ||||||||  ||    
T  45174637 atctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgctactgtacaaacagtgaagtgttactcacacaacacttttgatgttatagtgttaac 45174538  T
Q  99 ttcaccagaaaagtcattctca 120  Q
    ||||||| |||||| |||||||    
T  45174537 ttcaccaaaaaagttattctca 45174516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 2008065 - 2007972
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgt 94  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||| |  |||||||||    
T  2008065 atctgatgaattgatgatgctatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttaacgctatagtgt 2007972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 42506119 - 42506212
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||  ||||||||    
T  42506119 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtattactcattacaattttgatgttatagtgt 42506212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 39282784 - 39282641
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||   |||||| ||| |||||||  ||||||||  | ||    
T  39282784 atctgatgaatggatgataatatgagaactgaacttttgatgccactgtataaacagtggggtattactcac-acagttttgatgttatagtgttaattt 39282686  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 145  Q
     | ||||||| ||||| ||||||||| || || ||||||||||||    
T  39282685 tatcagaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattttcctta 39282641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 3362382 - 3362276
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  |||||||| | || |||| |||||||||  |||||||    
T  3362382 tgatgaattgatgataccatgaggagtgaacttttgatgccactgtacaaatagtgggatgttactcactatatttctgatgctatagtgttaacttcac 3362283  T
Q  104 cagaaaa 110  Q
    || ||||    
T  3362282 caaaaaa 3362276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 144
Target Start/End: Original strand, 4761697 - 4761838
Alignment:
Q  5 gatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||  ||||| |||| |||||||| |||||| |  ||||||||    
T  4761697 gatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaagtgttactcattacatttttgatattatagtattaacttcacc 4761796  T
Q  105 --agaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
      | |||||||| |||||||| || || || |||||||||||    
T  4761797 aaaaaaaagtcaatctcatgaattcaccatagaattttcctt 4761838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Original strand, 20373343 - 20373465
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||  |||| |||||||  |||||| |  |||||||    
T  20373343 tgatgaattgatgataccatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcgttacatttttgatgttatagtattaacttcac 20373442  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    || |||| ||||||| |||||||    
T  20373443 caaaaaaatcattcttatgactt 20373465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 47481651 - 47481511
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||   ||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||||    
T  47481651 tgatgaattgatgatactatgagggctaaacttttgatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 47481552  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    || |||  ||||||  ||||||| || ||  ||||||||||    
T  47481551 caaaaacatcattcctatgacttcaccataaaattttcctt 47481511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Original strand, 22446111 - 22446234
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatga-ggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttca 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||| | |||||||  |||| |||  ||||||    
T  22446111 tgatgaattgatgatactatgagggtttgaacttttgatgccactgtacaaa-agtggggtgttactcactatatttttgatgatataatgttaacttca 22446209  T
Q  103 cc-agaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    || | |||||||||| |||||||||    
T  22446210 ccaaaaaaagtcattttcatgactt 22446234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 32373599 - 32373479
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||   |||||||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||| ||||||||||| |||||||||  |||| |     
T  32373599 tgatgaattgatgataccattggggtggaacttttgatgccactgtacaaacagtggagt--tactcacaacacttttgatgctatagtgttaactttat 32373502  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
      |||||||||||||||||||||    
T  32373501 tggaaaagtcattctcatgactt 32373479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 53176186 - 53176127
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtgg 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||    
T  53176186 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgttattgtacaaacagtgg 53176127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 95
Target Start/End: Original strand, 21009848 - 21009940
Alignment:
Q  3 ctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtc 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||   |||||| |||||||||  ||||| |||| |||||||  |||||||||    
T  21009848 ctgatgaattgatgataatatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtc 21009940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 126
Target Start/End: Original strand, 24489007 - 24489131
Alignment:
Q  2 tctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttc 101  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  || ||||||||||  ||  |||||| ||| |||| |||||||||| |  |||||    
T  24489007 tctgatgaattgatgataatatggggactgaacttttgatgtcattgtgcaaacagtggaatgttactcacaacatttttaatactatagtcttaacttc 24489106  T
Q  102 accagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    || | |||| ||||| || ||||||    
T  24489107 acaaaaaaaatcattttcgtgactt 24489131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 24708161 - 24708242
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgat 84  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||  |||||| ||||  ||||||| || |||||||    
T  24708161 atctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcactgtac--acagtgaggtgttactcactgcagttttgat 24708242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 25579860 - 25579746
Alignment:
Q  12 tgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaag 111  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||| |  ||  | |||| ||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||     
T  25579860 tgatgataatatggggactgaacttttgatgtcactgtataaatagtagaatgttattcacaacacttttgatgctatagtattaacttcaccagaaaaa 25579761  T
Q  112 tcattctcatgactt 126  Q
    |||||||||| ||||    
T  25579760 tcattctcataactt 25579746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 44891629 - 44891514
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         |||||||| ||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||    
T  44891629 atctgattaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgcc---------acagtgggatgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 44891539  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||    
T  44891538 cacca-aaaagtcattttcatgactt 44891514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 144
Target Start/End: Original strand, 40640637 - 40640684
Alignment:
Q  97 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  40640637 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 40640684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 43348389 - 43348327
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtg 64  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  43348389 atctgatgaattgatgatactaaaag-actgaacttttgatgccactaaacaaacagtggggtg 43348327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 29163950 - 29163912
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 39  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29163950 atctgatgaattgatgatactaagaggactgaacttttg 29163912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 42
Target Start/End: Original strand, 46994710 - 46994746
Alignment:
Q  6 atgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 42  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46994710 atgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatg 46994746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 14586714 - 14586796
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttga 83  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||  ||| ||| ||| |||| ||||  |||||| ||||||||||    
T  14586714 atctgatgaattgatgatactaaggggacaaaacttttgatatcactgtataaatagtgaggtgttactcacaacacttttga 14586796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 144
Target Start/End: Original strand, 55343405 - 55343471
Alignment:
Q  78 ttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| || |||||| || || |||||||||||    
T  55343405 ttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcctt 55343471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 141
Target Start/End: Original strand, 11835702 - 11835790
Alignment:
Q  48 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttc 141  Q
    |||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||     ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| || || ||||||||    
T  11835702 gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgata-----gtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttc 11835790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 7235078 - 7235225
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  7235078 atctgatgaattgataatactatgag-actgaacttttgatggcaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgactt 7235176  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaatta 149  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| || || ||||||||| ||||||    
T  7235177 caccggaaaagtcattctcataacttcaccatagaattttccataatta 7235225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 8513371 - 8513232
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  8513371 tgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatattatagtgttaacttcac 8513272  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  8513271 cagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcct 8513232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 6089049 - 6088910
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  6089049 atctgatgaattgatgatactatggtgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggggcgttactcacaacacttttgatactatagtgttaactt 6088950  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 140  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||    
T  6088949 caccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaatttt 6088910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 33618975 - 33618850
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  33618975 atctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgccaccgtacaaataatgggttgctactcactacacttttgatgcgatagtgttgactt 33618876  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||    
T  33618875 caccagaaaagtatttcccatgactt 33618850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 20768225 - 20768087
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20768225 atctgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatgccacta-acaaacaatgga-tgctactcactacacttttgatgctatagtgttgactt 20768128  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttc 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  20768127 caccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttc 20768087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Original strand, 3879983 - 3880124
Alignment:
Q  2 tctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||| |||  |||||    
T  3879983 tctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggtgttactcacaacacttttgatactataatgttaacttc 3880082  T
Q  102 accagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  3880083 accagaaaagtcattctcgtgacttcaccatagaattttcct 3880124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 4318866 - 4319009
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||  ||||||||  ||||    
T  4318866 atctaatgaattgatgatactatgggggttgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcataacacttttgatgttatagtgttaactt 4318965  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  4318966 caccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 4319009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 18498565 - 18498431
Alignment:
Q  11 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagt-ggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||| ||    
T  18498565 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaactgtgggggtgttgctcactacacttttgatgctataatgttaacttcaccaggaa 18498466  T
Q  110 agtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||||||    
T  18498465 agtcattctcatgacttcactatagatttttcctt 18498431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 15491756 - 15491631
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||  || | |||  ||||    
T  15491756 atctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccactgtacaaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttacaatgttaactt 15491657  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15491656 cacgagaaaagtcattctcataactt 15491631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 29182304 - 29182157
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||    
T  29182304 atctgatgaattgatgataatatggagactgaacttttgatgacactgtataaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 29182205  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaatt 148  Q
    || ||  ||| ||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||    
T  29182204 catcaataaaatcattctcatgacttcaccataaaatttttcttaatt 29182157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 126
Target Start/End: Original strand, 21017156 - 21017280
Alignment:
Q  2 tctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||  |||||| ||| |||| |||||| | |||  |||||    
T  21017156 tctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccattgtacaaataatggggtgttactcacaacattttttatactacaatgttaacttc 21017255  T
Q  102 accagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    |||| |||||||||| || ||||||    
T  21017256 accaaaaaagtcattttcgtgactt 21017280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Original strand, 30353404 - 30353540
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||| |||||||||||| | |   |||| | |||||||||||  |||| |||  |||||||    
T  30353404 tgatgaattgatgatactatggagactgaactatcgatgccactgtacaaacagtgagatattactcgcaacacttttgatgttataatgttaacttcac 30353503  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  30353504 cagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 30353540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 1945972 - 1945830
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||||    
T  1945972 tgatgaattcatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 1945873  T
Q  104 c-agaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 145  Q
    | | |||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||    
T  1945872 caaaaaaagtcattcttatgacttcaccgtagaattttcctta 1945830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 5627530 - 5627389
Alignment:
Q  3 ctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttca 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||   |||||| |||||||||  ||||| || | |||| ||  ||||||||  ||||||    
T  5627530 ctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcattatattttttatgttatagtgttaacttca 5627431  T
Q  103 ccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||    
T  5627430 ccaaaaaagtcattcttatgacttcaccttagaattttcctt 5627389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 33893046 - 33893186
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||  ||  ||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||    
T  33893046 atctgatgaattgatgatactaag-ggactgaacttttaatatcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 33893144  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    ||| | |||| | ||||| ||||||| || || |||||||||    
T  33893145 cactaaaaaaattattctaatgactttaccatagaattttcc 33893186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 143
Target Start/End: Original strand, 7055260 - 7055400
Alignment:
Q  3 ctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttca 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||   |||||| |||| ||||  ||| | || | |||| ||  ||||||||  ||||||    
T  7055260 ctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtgaggtgttactaattatattttttatgttatagtgttaacttca 7055359  T
Q  103 ccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
    ||| |||| ||||||| ||||||| || ||  |||||||||    
T  7055360 ccaaaaaaatcattcttatgacttcaccataaaattttcct 7055400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 6091226 - 6091306
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacactttt 81  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  6091226 atctaatgaattgatgatactacgagtactgaacttttgatggcattgtacaaacaatggtgtgttactcactacattttt 6091306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 19631794 - 19631747
Alignment:
Q  97 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||    
T  19631794 acttcaccagaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcctt 19631747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 49)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 38011995 - 38011852
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  38011995 atctgatgaattgataatattatggggactgaacttttgatggcaccgtacaaacagtggggtgctattcactacacttttgatgttatagtgttgactt 38011896  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  38011895 caccagaaaagtcattctcatgatttcaccatagaattttcctt 38011852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 142
Target Start/End: Original strand, 28003060 - 28003197
Alignment:
Q  5 gatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  28003060 gatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtactactgactacacttttgatgctatagtgttgacttcacc 28003159  T
Q  105 agaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    |||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  28003160 agaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 28003197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 143
Target Start/End: Original strand, 35025669 - 35025800
Alignment:
Q  12 tgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaag 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||     
T  35025669 tgatgatactacgaggactgaacttttgatgtcaacgtataaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaa 35025768  T
Q  112 tcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
    ||||| ||||||||| |  || ||||||||||    
T  35025769 tcattttcatgacttcagcatagaattttcct 35025800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Original strand, 34948170 - 34948292
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||| |    
T  34948170 tgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccactttacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcgc 34948269  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  34948270 cagaaaagtcattctcatgactt 34948292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 49376108 - 49375982
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||    
T  49376108 atctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaagcagtggggtgttactcacgacacttttgatgctataatgttaactt 49376009  T
Q  101 caccag-aaaagtcattctcatgactt 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  49376008 caccagaaaaagtcattctcatgactt 49375982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 33816603 - 33816728
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | ||| |||||    
T  33816603 atctgataaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccaccgtataaatagtgaggtgctactcactacacttttgatgctacaatgttgactt 33816702  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  33816703 caccagaaaaatcattctcatgactt 33816728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 55241174 - 55241315
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| | ||| |||||||| |||||| |  ||||    
T  55241174 atctgataaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcgcaacaattttgataatatagtattaactt 55241273  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  55241274 cactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 55241315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 25701127 - 25701270
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||  |||| |||  ||||    
T  25701127 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtagggtgttactcactacacttttgatgttataatgttaactt 25701226  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
     |||| |||||||||| ||||||||| || ||  ||||||||||    
T  25701227 taccaaaaaagtcattatcatgacttcaccataaaattttcctt 25701270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 7703647 - 7703533
Alignment:
Q  12 tgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaag 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||    
T  7703647 tgatgatactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactgacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaag 7703548  T
Q  112 tcattctcatgactt 126  Q
    |||||||||||||||    
T  7703547 tcattctcatgactt 7703533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 29584270 - 29584411
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||  ||||||||  ||||    
T  29584270 atctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccattgtacaaacagtgaggtgttactca--acacttttgatgttatagtgttaactt 29584367  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||    
T  29584368 caccagaaaagtcattcccacgacttcaccatagaattttcctt 29584411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 19089523 - 19089664
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||  ||||    
T  19089523 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatattatagtgttaactt 19089622  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    || || |||||| ||||| ||||||| || || |||||||||    
T  19089623 catcaaaaaagttattcttatgacttcaccatagaattttcc 19089664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 27396757 - 27396613
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||| |||||  |||||  |||||||| || ||||| |||  ||||    
T  27396757 atctgatgaattgatgatactatgaggacgaaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggtgttactcataacacttttaatgctataatgttaactt 27396658  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||    
T  27396657 caccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttttctta 27396613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 5048035 - 5048160
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||| || |||||    
T  5048035 atctcatgaattgatgatactatgggaactgaacttttgatatcatcgtacaaacagtgtggtcctactcactacacttttgatgttatagagttgactt 5048134  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||    
T  5048135 caccagaaaaatcattctcataactt 5048160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 23761213 - 23761089
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||    
T  23761213 atctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactatacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 23761114  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgact 125  Q
     || |||| ||||||||||||||||    
T  23761113 tacaagaatagtcattctcatgact 23761089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 35021105 - 35021248
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||  |||| |||  ||||    
T  35021105 atctaatgaattgatgatactacgaggacgaaacttttgacgccaatgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttataatgttaactt 35021204  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  35021205 caccagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcctt 35021248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 4598130 - 4598009
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||  ||||||||  |||||||    
T  4598130 tgatgaattgatgagtctaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacac-tttgatgttatagtgttaacttcac 4598032  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  4598031 cagaaaagtcattctaatgactt 4598009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 50764871 - 50764748
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    ||||||  ||||    
T  50764871 atctaatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgat--gttagtgttaactt 50764774  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    || || |||||| |||||||||||||    
T  50764773 catcaaaaaagttattctcatgactt 50764748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 19440718 - 19440843
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||  | ||| |||| |||||||  ||||||||  || |    
T  19440718 atctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacggtggagtgttaatcattacatttttgatgttatagtgttaacat 19440817  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19440818 caccaaaaaagtcattctcatgactt 19440843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 47253878 - 47253751
Alignment:
Q  12 tgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaag 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||| ||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||    
T  47253878 tgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtataaacaatggg-tgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaacttcaccaaaaaag 47253780  T
Q  112 tcattctcatgacttgacaatggaatttt 140  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||    
T  47253779 tcattctcatgacttcaccatagaatttt 47253751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 32592234 - 32592103
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||  |||| | |||||||||||||| ||||||  ||||    
T  32592234 atctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtcactatacaaacagtggagtgttactctcaacacttttgatactgtagtgttaactt 32592135  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaat 132  Q
    || || |||||||||| | ||||||| |||||    
T  32592134 catcaaaaaagtcattataatgacttcacaat 32592103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 37663811 - 37663951
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||| |||| |||| ||    ||||||  ||||    
T  37663811 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacagttttaat--gttagtgttaactt 37663908  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
    || || |||||||||||| ||||||| || || ||||||||||    
T  37663909 catcaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcct 37663951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 55477961 - 55478109
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgt----acaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcg 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    ||||||||||| |||  ||||  |||| |||||||  ||||||||      
T  55477961 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaaacagtggagtgttactcgttacatttttgatgttatagtgtta 55478060  T
Q  97 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 145  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  55478061 acttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcctta 55478109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 140
Target Start/End: Original strand, 36493763 - 36493897
Alignment:
Q  6 atgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacca 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||  |||||||| | |||||||  |||||| |  |||||||||    
T  36493763 atgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcactatatttttgatggtatagtattaacttcacca 36493862  T
Q  106 gaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 140  Q
     |||||| ||| ||||||||| || || |||||||    
T  36493863 aaaaagttattttcatgacttcaccatagaatttt 36493897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 37287862 - 37287732
Alignment:
Q  14 atgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc-agaaaagt 112  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||| ||| | ||||||    
T  37287862 atgatattatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactttaccaaaaaaagt 37287763  T
Q  113 cattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
    ||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  37287762 cattctcattacttcaccatagaattttcct 37287732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 39398051 - 39397918
Alignment:
Q  9 aattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaa 108  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||  ||||||||| ||    
T  39398051 aattgatgatactgagaagactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcacaacacttttaatgttatagtgttaacttcaccataa 39397952  T
Q  109 aagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    |||||||||| ||||||| || || |||||||||    
T  39397951 aagtcattctaatgacttcaccatagaattttcc 39397918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 144
Target Start/End: Original strand, 30002705 - 30002837
Alignment:
Q  12 tgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaag 111  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||     
T  30002705 tgatgatactaagaagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgatgctacagtgttaacttcaccagaaaaa 30002804  T
Q  112 tcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    ||||| | ||||||| || || || ||||||||    
T  30002805 tcattttaatgacttcaccatagagttttcctt 30002837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 32579587 - 32579466
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaa---acagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcga 97  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||| ||||||| ||||||||||  |||| ||| ||    
T  32579587 atctgatgaactgataatactatgag-actaaacttttgatggcaccgtacaacaaacactggggtgctactcactgcacttttgatgttataatgttga 32579489  T
Q  98 cttcaccagaaaagtcattctca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  32579488 cttcaccagaaaagtcattctca 32579466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 25184254 - 25184112
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||  ||||||||||| | |||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||    
T  25184254 atctgatgagttgatgatactatgaagattgaactttggatgtcattgtacaaacagtagagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 25184155  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  25184154 caccaaaatagtcattctcatgacttcaccatagaattttcct 25184112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 33341539 - 33341397
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcacta----cacttttgatactatagtgtcg 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| | |    || |||||||  ||||||||      
T  33341539 atctgatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttcctcgcaacaatcaattttgatgatatagtgtta 33341441  T
Q  97 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 140  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||    
T  33341440 atttcaccagaaaaatcattctcatgacttcactatagaatttt 33341397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 117
Target Start/End: Original strand, 54499311 - 54499425
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc-gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttca 102  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||   |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  54499311 tgatgaattgatgatactatagagactgaacttttgatgtcattagtacaaacggtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttca 54499410  T
Q  103 ccagaaaagtcattc 117  Q
    |||||||||||||||    
T  54499411 ccagaaaagtcattc 54499425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 144
Target Start/End: Original strand, 34361566 - 34361704
Alignment:
Q  5 gatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||    
T  34361566 gatgaattgatgatattatgagg-ctgaacttttaatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcacc 34361664  T
Q  105 agaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    | |||||||||||| ||||||| || || |||||||||||    
T  34361665 aaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcctt 34361704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 17167853 - 17167739
Alignment:
Q  2 tctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttc 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||| |||  |||||    
T  17167853 tctgatgaattaatgatactatggagaatgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattataatgttaacttc 17167754  T
Q  102 accagaaaagtcatt 116  Q
    | |||||||||||||    
T  17167753 atcagaaaagtcatt 17167739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 17173430 - 17173316
Alignment:
Q  2 tctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttc 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||| |||  |||||    
T  17173430 tctgatgaattaatgatactatggagattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattataatgttaacttc 17173331  T
Q  102 accagaaaagtcatt 116  Q
    | |||||||||||||    
T  17173330 atcagaaaagtcatt 17173316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 9139386 - 9139241
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||  |||||||  | |||| || |||||  ||  ||||    
T  9139386 atctgatgagttgatgatactatggggattgaactttttatgtcactgtacaaacggtggggtgttactcact--attttttatgctataacgttaactt 9139289  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaatt 148  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| || || |||||||||||||||    
T  9139288 caccaaaaaagtcaatttcatgacttcaccatagaattttccttaatt 9139241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 37775808 - 37775685
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| |||| ||| |||||||   ||||    
T  37775808 atctgatgaattgatgatactaaggggg--gaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttaatattatagtgctaactt 37775711  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    ||||| |||| ||||| | |||||||    
T  37775710 caccaaaaaaatcattttaatgactt 37775685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 879618 - 879743
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||| ||  ||||||||| || ||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||    
T  879618 atctgatgagttgatgatactatgaagattaaacttttgatgtcattgtacaaacaatgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtttactt 879717  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||    
T  879718 caccaaaaaaattattctcatgactt 879743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 46888227 - 46888352
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||   |||||||||| |||||||  |||||| |  ||||    
T  46888227 atctgatgaattaacgatagtatggggactgaacttttgatgccgctgtacaaatagtggggtattactcactacaattttgatgttatagtattaactt 46888326  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    || ||||||||| ||| || ||||||    
T  46888327 catcagaaaagttattttcttgactt 46888352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 4934272 - 4934360
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagt-ggggtgccactcactacacttttgatacta 88  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||  |||||||||| |||| ||||||    
T  4934272 atctgatgaaatgatgatactatgaggattgaacttttgatgccagtgtacaaacaatgggggtgttactcactacattttttatacta 4934360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 6864176 - 6864053
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||| ||| || ||  | ||| || | |||||||  |||||||   ||||    
T  6864176 atctgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgctattgtacaaaaagttggatgttattcattaaatttttgatgttatagtgataactt 6864077  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgac 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  6864076 caccaaaaaagtcattctcatgac 6864053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 144
Target Start/End: Original strand, 32912652 - 32912793
Alignment:
Q  3 ctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttca 102  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||  ||   |||||| | | |||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||    
T  32912652 ctgataaattgatgatattatgagtgctgaacttttgatatcattctacaaatactagggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 32912751  T
Q  103 ccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||||||    
T  32912752 ccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcctt 32912793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 42199870 - 42199723
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||   |||||| | ||||||   ||||| |||| |||||||  |||||| |  ||||    
T  42199870 atctgatgaattgatgatactatgagggctgaactttttatgtcattctacaaataatggggtattactcattacatttttgatgttatagtattaactt 42199771  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaatt 148  Q
    ||||| |||| ||||||| |||| || || || || ||||||| ||||    
T  42199770 caccaaaaaaatcattcttatgatttcaccatagatttttcctaaatt 42199723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 146
Target Start/End: Original strand, 38812263 - 38812312
Alignment:
Q  97 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaa 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  38812263 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccttaa 38812312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 4205210 - 4205114
Alignment:
Q  48 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    |||||||||||||||||  | |||  ||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| || |||||| || || |||||||||||    
T  4205210 gtacaaacagtggggtgttattcagaacatttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcctgacttcaccatagaattttcctt 4205114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 17272077 - 17272008
Alignment:
Q  76 acttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 145  Q
    |||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||    
T  17272077 acttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattcccacgacttcaccatagaattttcctta 17272008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 140
Target Start/End: Original strand, 20097494 - 20097537
Alignment:
Q  97 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  20097494 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 20097537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 1815439 - 1815409
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaac 34  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1815439 tgatgaattgatgatactatgaggactgaac 1815409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 2704557 - 2704508
Alignment:
Q  97 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaa 146  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  ||||||||||||    
T  2704557 acttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccataaaattttccttaa 2704508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 144
Target Start/End: Original strand, 7152242 - 7152319
Alignment:
Q  67 actcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    |||||||| |||||||||  |||| |||  |||| |||||||||||||||  |||||||| || || |||||||||||    
T  7152242 actcactatacttttgatgttataatgttaactttaccagaaaagtcattagcatgacttcaccatagaattttcctt 7152319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 38811858 - 38811813
Alignment:
Q  97 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||    
T  38811858 acttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcc 38811813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 33908366 - 33908249
Alignment:
Q  9 aattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  33908366 aattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggagtgctactcactacacttttgatgatatagtgttgacttcaccagaa 33908267  T
Q  109 aagtcattctcatgactt 126  Q
    |  |||||||||||||||    
T  33908266 agttcattctcatgactt 33908249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 14409361 - 14409501
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||| |||||    
T  14409361 atctgatgaattgatgatactatgag-actgaacttttgatgccaccgtattaagagtggggtgctactcactacatttttgatgttatagtgttgactt 14409459  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||    
T  14409460 caccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcc 14409501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 26268215 - 26268090
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||| |||||||||  ||||    
T  26268215 atctgatgaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactcaaaacacttttgatgctatagtgttaactt 26268116  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  26268115 caccagaaaaatcattctcatgactt 26268090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 19120000 - 19119857
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||||| |||||||||  ||||    
T  19120000 atctgatgaattgatgacactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactagcaacacttttgatgctatagtgttaactt 19119901  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  19119900 caccacaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 19119857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 144
Target Start/End: Original strand, 8741923 - 8742064
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtgggg-tgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttca 102  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  8741923 tgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccattgtacaaacaatgggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttca 8742022  T
Q  103 ccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  8742023 ccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 8742064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 7693371 - 7693230
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||    
T  7693371 atctaatgaattgatgatactaagaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtgggatgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 7693272  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| || || |||||||||    
T  7693271 caccagaaaagtcattttaatgacttcaccatagaattttcc 7693230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 27330445 - 27330299
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||  |||||  |||||||||||  ||||||||  ||||    
T  27330445 atctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccattgtacaaacagtaaggtgttactca--acacttttgatgttatagtgttaactt 27330348  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaatta 149  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||    
T  27330347 caccagaaaagtcattcccacgacttcaccatagaattttccttaatta 27330299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 5837693 - 5837574
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||   ||||||    
T  5837693 tgatgaattgatgatactatggagactgaaattttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaccttcac 5837594  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatga 123  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5837593 cagaaaagtcattctcatga 5837574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 699291 - 699166
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||| | |||| || |||||||||  ||||    
T  699291 atctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactagattttttatgctatagtgttaactt 699192  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    || |||||||||||||||||| ||||    
T  699191 catcagaaaagtcattctcataactt 699166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 30969358 - 30969483
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||    
T  30969358 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtataaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 30969457  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    ||||||| || |||||||||||||||    
T  30969458 caccagataaatcattctcatgactt 30969483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 31786680 - 31786821
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     ||||||||| |||| || |||||||||  ||||    
T  31786680 atctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggcagtgctcactacatttttcatgctatagtgttaactt 31786779  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||| || || |||||||||    
T  31786780 caccaaaaaagtcattctcactacttcactatagaattttcc 31786821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 36860561 - 36860420
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||  |||||||    
T  36860561 tgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttttatactatagtgttaacttcac 36860462  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 145  Q
    ||||||| ||||| || |||||| || || ||||||||||||    
T  36860461 cagaaaaatcattttcgtgacttcaccatagaattttcctta 36860420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 25500960 - 25501099
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| ||||  | |||| ||||||||||| |||||||||  ||||    
T  25500960 atctgatgaattgatgatactatagggacttaacttttgatggcagtgtacaaacagtgaggtgttattcacaacacttttgatgctatagtgttaactt 25501059  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 140  Q
     ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  25501060 taccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 25501099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 144
Target Start/End: Original strand, 5112352 - 5112490
Alignment:
Q  6 atgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacca 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| | |||| ||  |||||| |  |||||||||    
T  5112352 atgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcacca 5112451  T
Q  106 gaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
     |||||||||| ||||||||| || ||  ||||||||||    
T  5112452 aaaaagtcattttcatgacttcaccataaaattttcctt 5112490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 22980934 - 22980809
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||   |||||||  | |||||||||||||||||  ||||    
T  22980934 atctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcattgctcaaacagtggggtattactcactgtatttttgatactatagtgttaactt 22980835  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22980834 caccagaaaagtcattctcataactt 22980809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 36866902 - 36866762
Alignment:
Q  2 tctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttc 101  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||| | | |||||||| ||||||||  |||||    
T  36866902 tctgatgaattgttgatactatcgggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaatatttttgatattatagtgttaacttc 36866803  T
Q  102 accagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    ||||||||| ||||| || |||||| || || |||||||||    
T  36866802 accagaaaaatcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 36866762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 40133525 - 40133385
Alignment:
Q  2 tctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttc 101  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||| |||  |||||    
T  40133525 tctgatgaattgttgatattatggggactgaacttttgatgccattgtacaaatagtggggtgttactcacaacatttttgatactataatgttaacttc 40133426  T
Q  102 accagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    |||| |||||||||| || |||||| || || |||||||||    
T  40133425 accacaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 40133385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 143
Target Start/End: Original strand, 1429182 - 1429321
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| | ||||||| |||||||||  |||||||    
T  1429182 tgatgaattgatgatactatggagactgaatttttgatgccagtgtacaaacagtggggtgttactcactatatttttgatgctatagtgttaacttcac 1429281  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
    || || ||||||| ||||||||| || || || |||||||    
T  1429282 caaaagagtcattttcatgacttcaccatagatttttcct 1429321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 9200371 - 9200232
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||||||    
T  9200371 tgatgaattgatgatactaagaggactaaacttttgatgtcactgtacaaactgtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcac 9200272  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
    ||||||||| ||| | ||||||| || ||  |||||||||    
T  9200271 cagaaaagttattttaatgacttcaccataaaattttcct 9200232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 39572960 - 39572818
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||  |||||| ||| |||| ||| |||||| |  ||||    
T  39572960 atctgatgaatttatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgcacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatattatagtattaactt 39572861  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
     || |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  39572860 aactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcct 39572818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 23116256 - 23116397
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||| |||  ||||    
T  23116256 atctgatgaattgatgatactatgtaaactgaacttttgattccactgtacaaacagtggggtgctactcactacagttttgatgttataatgttaactt 23116355  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    ||  | |||||||||| ||||||| | || || |||||||||    
T  23116356 cataaaaaaagtcattttcatgacgtcaccatagaattttcc 23116397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 8466882 - 8466739
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||||||  | |||| |||||||||||  || |||||  |||||||    
T  8466882 tgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgataccactgtacaaagag-ggggtgttattcacaacacttttgatgttacagtgttaacttcac 8466784  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaatt 148  Q
    ||||||||||||||||||||| | |  || |||||||||||||||    
T  8466783 cagaaaagtcattctcatgacctcatcatagaattttccttaatt 8466739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 38528271 - 38528413
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||    
T  38528271 atctgatgaattgatgatactatgag-actgaacttttgatgtcactgtataaacaatggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaactt 38528369  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    || |||||||  |||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  38528370 catcagaaaaaccattttcatgacttcaccatagaattttcctt 38528413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 12910496 - 12910348
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc-----accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtc 95  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |     || |||||||||||||||||  || ||||| | |||||||  |||||| |     
T  12910496 atctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtactgtacaaacagtggggtgttacgcactatatttttgatgttatagtttt 12910397  T
Q  96 gacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  12910396 aacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcctt 12910348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 32563290 - 32563150
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||    
T  32563290 atctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgtcactgtacagacagtggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 32563191  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttc 141  Q
    || ||||||| ||||| | ||||||| || || ||||||||    
T  32563190 catcagaaaaatcattttaatgacttcaccatagaattttc 32563150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 24886242 - 24886100
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||  |||||| |  |||||||    
T  24886242 tgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtattaacttcac 24886143  T
Q  104 c--agaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    |  | ||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||    
T  24886142 caaaaaaaagtcattctcatgatttcaccataaaattttcctt 24886100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 22019770 - 22019656
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||  |||||||| |||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  22019770 tgatgaagtgatgatactaaggggacttaacttttgatgtcactatacaaacaatggggtgttactcacaacacttttgattctatagttttaacttcac 22019671  T
Q  104 cagaaaagtcattct 118  Q
    |||||||||||||||    
T  22019670 cagaaaagtcattct 22019656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Original strand, 27318524 - 27318646
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| |||  |||||||||| |||| ||  | ||||||  |||||||    
T  27318524 tgatgaattgatgatactgtgagaactaaacttttgatgtcattgtacaaacagtggtgtgttactcactacattttttatgttttagtgttaacttcac 27318623  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  27318624 cagaaaaatcattctcatgactt 27318646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 144
Target Start/End: Original strand, 35826522 - 35826660
Alignment:
Q  6 atgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacca 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||  ||||| |||| |||||||  |||||| |  ||||||| |    
T  35826522 atgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatgaagtgttactcagtacatttttgatgttatagtattaacttcacaa 35826621  T
Q  106 gaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
     |||||||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  35826622 aaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttcctt 35826660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 8437097 - 8436965
Alignment:
Q  11 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaa 110  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||||| ||  |||||||||  | ||||||| ||||    
T  8437097 ttgatgatataatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatgggatgttactcactacactttggaagctatagtgttaatttcaccaaaaaa 8436998  T
Q  111 gtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
     ||||||||||||||| ||| | ||||| ||||    
T  8436997 atcattctcatgacttcacattagaattgtcct 8436965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 25668790 - 25668707
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgat 84  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  25668790 atctaatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgttcaaacagtggggtgttactcacaacacttttgat 25668707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 15724626 - 15724490
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||  |||||| | |||||||||  ||||||||  |||||||    
T  15724626 tgatgaattgatgatattatg-ggactgaacttt-gatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaacttcac 15724529  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    || ||||||||||||||| |||| || || |||||||||    
T  15724528 caaaaaagtcattctcataacttcaccatagaattttcc 15724490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 15992574 - 15992636
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggt 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15992574 atctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggt 15992636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 11898139 - 11898018
Alignment:
Q  5 gatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  ||| |||||  ||||| | |||||||||| ||||| | |  |||| |||    
T  11898139 gatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcactgtacaactagtagggtgttactcagtgcacttttgatgctataatattaactttacc 11898040  T
Q  105 agaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    |||||||| ||| |||||||||    
T  11898039 agaaaagttattatcatgactt 11898018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 35511511 - 35511636
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||  |||||||||| | |||||  |||| |||  ||||    
T  35511511 atctgatgaattggtgatagtatgatgactgaacttttgatgtcactttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttataatgttaactt 35511610  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    || |||||| |||||| |||||||||    
T  35511611 catcagaaacgtcattttcatgactt 35511636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 88
Target Start/End: Original strand, 21088803 - 21088887
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatacta 88  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||    
T  21088803 tgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgtcactcacaacattttttatacta 21088887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 22255323 - 22255197
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactaca-cttttgatactatagtgtcgact 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||  ||||| ||||  |||||||  |||| |||  |||    
T  22255323 atctgatgaattgatgataatatgagaactgaacttttgatgccattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttgatgttataatgttaact 22255224  T
Q  100 tcaccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    |||||| |||||| ||| | |||||||    
T  22255223 tcaccaaaaaagttatttttatgactt 22255197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 144
Target Start/End: Original strand, 22974117 - 22974259
Alignment:
Q  2 tctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttc 101  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||  |  |||||||||||||| ||  ||||| |||  |||||||  ||||||||  |||||    
T  22974117 tctgatgagttgatgataatatgagaattgaacttttgatgttattgtacaaacagtgggatgttactcattacttttttgatgttatagtgttaacttc 22974216  T
Q  102 accagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    |||| |||| |||||||||| |||| || || |||||||||||    
T  22974217 accaaaaaaatcattctcataacttcaccatagaattttcctt 22974259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 31705646 - 31705785
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||  |||||||| || |||||  ||||  |||| |||||||  ||||||||  ||||    
T  31705646 atctgatgaattgatgatacta-gaggactggacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaactt 31705744  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttc 141  Q
    ||||| |||| ||||| | ||||||| || || ||||||||    
T  31705745 caccaaaaaaatcatttttatgacttcaccatagaattttc 31705785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 35934036 - 35933901
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  ||     |||| ||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||    
T  35934036 atctgatgaattgatgatactatggtgactggacttttgatgccac--ta-----agtgaggtgttactcacaacacttttgattctatagtgttaactt 35933944  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
    || || |||| ||||||||||||||| || ||  |||||||||    
T  35933943 catcaaaaaaatcattctcatgacttcaccatacaattttcct 35933901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 6824513 - 6824598
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaac--ttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgat 84  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||    
T  6824513 atctgataaattgatgatactatgaagactgaacacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgat 6824598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 28416561 - 28416663
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| || |  || |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||||| | |||||||||| ||||||||  ||||    
T  28416561 atctgatgaattgatgatattaaggagattgaacttttgattccactgtacaaacagtgggatgttactcacaatacttttgatattatagtgttaactt 28416660  T
Q  101 cac 103  Q
    |||    
T  28416661 cac 28416663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Original strand, 43308688 - 43308746
Alignment:
Q  3 ctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggg 61  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  43308688 ctgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacgaacagtggg 43308746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 149
Target Start/End: Original strand, 13956426 - 13956527
Alignment:
Q  48 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 147  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||  |||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  13956426 gtacaaacagtgaggtgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcatgagaaaagtcattttcatgacttcaccgtagaattttccttaat 13956525  T
Q  148 ta 149  Q
    ||    
T  13956526 ta 13956527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 144
Target Start/End: Original strand, 14919565 - 14919706
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttca- 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || |||||||| ||||  ||||| |||| |||||||  |||| |||  ||||||     
T  14919565 tgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatataaacagtgaggtgttactcattacatttttgatgttataatgttaacttcat 14919664  T
Q  103 ccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    | | |||| | ||||||||||||| || ||  ||||||||||    
T  14919665 caaaaaaaataattctcatgacttcaccatataattttcctt 14919706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 7208898 - 7208960
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtg 64  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||| || |||||    
T  7208898 atctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatgtcaatgtacaaacggtagggtg 7208960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 74
Target Start/End: Original strand, 23954826 - 23954897
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac-cgtacaaacagtggggtgccactcacta 74  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||    
T  23954826 tgatgaattgatgatactatggaaactgaacttttgatgccactagtaaaaacagtggggtgttactcacta 23954897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 5830034 - 5829962
Alignment:
Q  9 aattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacactttt 81  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||| || |||||  ||||| |||| ||||    
T  5830034 aattgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcattacattttt 5829962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 142
Target Start/End: Original strand, 16004476 - 16004552
Alignment:
Q  67 actcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtc-attctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    |||||| ||| |||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||    
T  16004476 actcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcaattctcatgactttaccatagaattttcc 16004552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22616539 - 22616492
Alignment:
Q  97 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  22616539 acttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcctt 22616492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 10237459 - 10237415
Alignment:
Q  97 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttc 141  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  10237459 acttcactagaaaagtcattttcatgacttcacaatagaattttc 10237415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 35504503 - 35504443
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtg 64  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| || | ||||||| ||| ||||    
T  35504503 tgatgaattgatgatactataatgattgaacttttgatgtcatcatacaaacggtgaggtg 35504443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 49)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 14758178 - 14758053
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  14758178 atctaatgaattgatgaaactatggggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagttgtgtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgactt 14758079  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  14758078 caccagaaaagtcattctcatgactt 14758053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 15168233 - 15168083
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaa-------acagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtg 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  15168233 atctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccaccgtacaacgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtg 15168134  T
Q  94 tcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||| |||| || || |||||||||||    
T  15168133 ttgacttcaccagaaaaagcattctcatcacttcacgatagaattttcctt 15168083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 31621592 - 31621717
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||||| |||||    
T  31621592 atctgatgaattgatgatactatggggactgaatttttgatgccaccgtacaaatagcggggtgctactcaatacacctttgatgttatagtgttgactt 31621691  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  31621692 cactagaaaagtcattctcatgactt 31621717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 47279326 - 47279201
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||| |||  ||||    
T  47279326 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttcgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatagtataatgttaactt 47279227  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||    
T  47279226 caccaaaaaaatcattctcatgactt 47279201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 40884950 - 40884841
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||| |||||    
T  40884950 atctgatgaattgaagatactatagggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgttatggtgttgactt 40884851  T
Q  101 caccagaaaa 110  Q
    ||||||||||    
T  40884850 caccagaaaa 40884841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16415783 - 16415639
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtg-gggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgact 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  16415783 atctaatgaattgatgatactatgatggctgaacttttgatgccactgtacaaacatttagggtgttactcactacacttttgatgctatagtgttaact 16415684  T
Q  100 tcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||    
T  16415683 tcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccttagaattttcctt 16415639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 15752166 - 15752027
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||||| | |||| ||  ||||||||  ||||    
T  15752166 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtgaggtgttactcactatattttttatgttatagtgttaactt 15752067  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 140  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  15752066 caccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 15752027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 2959885 - 2959743
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  ||| |||||| |||||||  ||||||||  ||||    
T  2959885 atctgatgaattgatgacactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttacttactacagttttgatgttatagtgttaactt 2959786  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
    || ||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||    
T  2959785 catcagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcct 2959743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 3309284 - 3309144
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||    
T  3309284 atctgatgaattgatgatactatgaagattgaacttttgataccactgtacaaacagt-gggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 3309186  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
     ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  3309185 taccagaaaagtcattctcatgactttaccatagaattttcc 3309144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 38823351 - 38823210
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  |||| | ||| ||||||| |||||||||  ||||    
T  38823351 atctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgacactgtacaaatagtggggtgttactcgcaacaattttgatgctatagtgttaactt 38823252  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
     ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  38823251 aaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 38823210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Original strand, 33725642 - 33725778
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||||    
T  33725642 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccaaagaaatagtgggctgctactcaatacacttttgatgatatagcgttgacttcac 33725741  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 140  Q
     ||||||||||||||| |||||| || || |||||||    
T  33725742 tagaaaagtcattctcttgactttaccatagaatttt 33725778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 144
Target Start/End: Original strand, 11742394 - 11742532
Alignment:
Q  5 gatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc 104  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  11742394 gatgaattgatgatattatg-ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttacttacaacacttttgataatatagtgttaacttcacc 11742492  T
Q  105 agaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||  ||||||||||    
T  11742493 agaaaagtcattctcataacttcacgataaaattttcctt 11742532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 27533019 - 27533144
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  || ||| | ||||||||| |||||||||  ||||    
T  27533019 atctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaagagtgggttgttacccacaatacttttgatgctatagtgttaactt 27533118  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  27533119 caccagaaaagtcattctcataactt 27533144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 1547413 - 1547281
Alignment:
Q  12 tgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaag 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||  |||||| ||| |||| ||  ||||||||  |||||||||||||||    
T  1547413 tgatgatactatgagaactgaacttttgatgccactgcacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatgttatagtgttaacttcaccagaaaag 1547314  T
Q  112 tcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  1547313 tcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 1547281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 21289809 - 21289661
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacactt-------ttgatactatagtg 93  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||       || ||  |||||||    
T  21289809 atctgatgaattgatgatactatagggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacattttttattatttatgatatagtg 21289710  T
Q  94 tcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  21289709 ttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcacaatagatttttcc 21289661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 27267238 - 27267361
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |  ||||||  ||||    
T  27267238 atctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttaatgccactgtacaaacagtggggtgtcactcactacattttttatgc--tagtgttaactt 27267335  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||    
T  27267336 caccaaaaaaatcattctcatgactt 27267361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 4330418 - 4330291
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagt-ggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcga-c 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||  | |    
T  4330418 atctgataaattgatgatactatgatgactgaacttttgatcccactgtacaaacattgggggtgttactcactacacttttgatgctatagtgtttatc 4330319  T
Q  99 ttcaccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  4330318 ttcatcagaaaagtcattctcataactt 4330291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 34012416 - 34012559
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||  |||||||||| | |||||  ||||||||  ||||    
T  34012416 atctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttatagtgttaactt 34012515  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    || || ||| |||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  34012516 catcataaacgtcattttcatgacttcaccatagaattttcctt 34012559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 48620774 - 48620631
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  |||| |||  ||||    
T  48620774 atctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatattgttaactt 48620675  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    ||| |||||||||||| | || |||| |  || |||||||||||    
T  48620674 cacaagaaaagtcattttaataacttcaacatagaattttcctt 48620631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 10182047 - 10182189
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||| | |||| ||  || ||| |  ||||    
T  10182047 atctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggcgtgttacgcactatattttttatgttacagttttaactt 10182146  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| || || ||||||||||    
T  10182147 caccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcct 10182189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 18422788 - 18422646
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||  ||||  || | |||||||  ||||||||  ||||    
T  18422788 atctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcgttatatttttgatgttatagtgttaactt 18422689  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||| || || ||||||||||    
T  18422688 caccaaaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattttcct 18422646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 123
Target Start/End: Original strand, 9903096 - 9903215
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||     
T  9903096 tgatgaattgatgatagtatgtggattgaacttttgatgtcactgtacaaacagcggggtgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcat 9903195  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatga 123  Q
    || |||||||||| ||||||    
T  9903196 caaaaaagtcattttcatga 9903215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 27227524 - 27227587
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtg 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  27227524 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtgaggtg 27227587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 39393520 - 39393377
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||   |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||    
T  39393520 atctgatgaatttatgatactatggggattaaacttttgatgccactgtacaaacaatgaagtattactcacaacacttttgatgctatagtgttaactt 39393421  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    ||  ||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||    
T  39393420 cattagaaaagtcattctcataacttcaccgtagaattttcctt 39393377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 10922864 - 10922742
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||   ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||    
T  10922864 atctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtcttactcattacattttttatgttatagtgttaactt 10922765  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatga 123  Q
    ||||| |||| ||||||||||||    
T  10922764 caccaaaaaaatcattctcatga 10922742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 42721176 - 42721035
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||| | |||| ||  ||||| |   ||||    
T  42721176 atctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgttactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgatatagggctaactt 42721077  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||| || || |||||||||    
T  42721076 caccaaaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattttcc 42721035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 143
Target Start/End: Original strand, 19899810 - 19899950
Alignment:
Q  3 ctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttca 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||  ||||  |||| |||||||  ||||||||  ||||||    
T  19899810 ctgatgaattgatgatactatgagggttgaacttttgatgccattctacaaacagtgaggtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaacttca 19899909  T
Q  103 ccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
    ||| |||| ||||| | ||||||| || || ||||||||||    
T  19899910 ccaaaaaaatcattattatgacttcaccatagaattttcct 19899950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 32216192 - 32216088
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||  ||||||||  ||||    
T  32216192 atctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttatagtgttaactt 32216093  T
Q  101 cacca 105  Q
    |||||    
T  32216092 cacca 32216088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 3535069 - 3534926
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||| ||| | |||||||||  ||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||    
T  3535069 atctgatgaattgataatattaaggggactgaacttttgatgtcactgcacaaacagtaaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 3534970  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    ||| |||||| | ||||| ||||||| | ||| |||||||||||    
T  3534969 cactagaaaattaattctaatgacttcataatagaattttcctt 3534926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 15383070 - 15382927
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||  |||||||| ||||| ||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  | ||    
T  15383070 atctgatgaattgatgatactacgatgactgaacttttgatgacattgtacaaacggtgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaattt 15382971  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    ||||| |||||||||| | || |||| || || |||||||||||    
T  15382970 caccaaaaaagtcatttttataacttcaccatagaattttcctt 15382927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 32267171 - 32267028
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||  |||| |||  ||||    
T  32267171 atctgatgggttgatgataatatgaggagtgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatattgttaactt 32267072  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    ||| | |||||||||||| ||||||| || ||  ||||||||||    
T  32267071 cacaaaaaaagtcattcttatgacttcaccataaaattttcctt 32267028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 47682533 - 47682657
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggg-gtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgact 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||  |||||| ||| |||| || |  ||||||  |||    
T  47682533 atctgatgaattgatgatactatgaggaatgaacttttgataccactgtacaagcagtgggagtgttactcacaacattttttatgc--tagtgttaact 47682630  T
Q  100 tcaccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||    
T  47682631 tcaccaaaaaagtcactctcatgactt 47682657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Original strand, 28564823 - 28564945
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||     
T  28564823 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtaaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcat 28564922  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    || |||| ||||| |||| ||||    
T  28564923 caaaaaaatcattttcataactt 28564945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 30326991 - 30327132
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| || ||||   ||||| |||| |||||||  ||||||||  | ||    
T  30326991 atctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgctattgtacaaacggttgggtattactcattacatttttgatgttatagtgttaaatt 30327090  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    ||| | |||||||||| | ||||||| || || |||||||||    
T  30327091 cacaaaaaaagtcatttttatgacttcactatagaattttcc 30327132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Original strand, 7079105 - 7079238
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac-----------agtggggtgccactcactacacttttgatactatagt 92  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||           |||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  7079105 tgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaggtgttagtggggtgttactcacaacacttttgatattatagt 7079204  T
Q  93 gtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  7079205 gttaacttcaccaaaaaagtcattatcatgactt 7079238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 41926300 - 41926161
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |   |||||||| | |||||||  |||||| |  ||||    
T  41926300 atctgatgaattgatgatactatagggactgaacttgtgatgccactgtacaaacagtgggatattactcactatatttttgatgttatagtattaactt 41926201  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 140  Q
    || || |||| ||||| |||| |||| || || |||||||    
T  41926200 catcaaaaaaatcattttcataacttcaccatagaatttt 41926161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Original strand, 238553 - 238690
Alignment:
Q  2 tctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttc 101  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || ||  |||||| ||| |||| ||||||||||||  |||||    
T  238553 tctgattaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt-ggatgttactcacaacatttttaatactatagtgttaacttc 238651  T
Q  102 accagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 140  Q
    |||| |||||| ||| || |||||| || || |||||||    
T  238652 accaaaaaagttattttcgtgacttcactatagaatttt 238690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 30254560 - 30254419
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||   ||||| |||| |||||||  |||| |||  ||||    
T  30254560 atctgatgaattgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt-gtgtattactcattacatttttgatgttatattgttaactt 30254462  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
    || || |||||||||||| || |||| || || ||||||||||    
T  30254461 caacaaaaaagtcattcttataacttcaccatagaattttcct 30254419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 37618931 - 37619078
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgata--ctatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtg--ccactcactacacttttgatactatagtgtcg 96  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||    ||||| || | |||||||  ||||||||      
T  37618931 atctgatgaattgatgatatactatgagaactgaacttttgatgtcattttacaaacagtggggtgttttactcattaaatttttgatgttatagtgtta 37619030  T
Q  97 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||| || || |||||||||||    
T  37619031 acttcaccaaaaaagtcattcttataacttcaccatagaattttcctt 37619078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 25160769 - 25160710
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtgg 60  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  25160769 atctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacggtgg 25160710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 8222262 - 8222123
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||   ||| ||| ||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||||    
T  8222262 tgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgccattgt---aacggtgtggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 8222166  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaa 146  Q
     | ||| |||||| | ||||||| ||  | |||||||||||||    
T  8222165 taaaaaggtcatttttatgacttcaccgtagaattttccttaa 8222123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 28769786 - 28769651
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||| || |||||  ||||| |||| |||||||   |||||||  |||||||    
T  28769786 tgatgaattgatgatactatgaggaccgaacctttgatgccattgtacaaacggt-gggtgttactcattacatttttgatgtcatagtgttaacttcac 28769688  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 140  Q
     | |||||| ||| | ||||||| || || |||||||    
T  28769687 aaaaaaagttatttttatgacttcaccatagaatttt 28769651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 37451419 - 37451298
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||| || |||||  ||| | |||| |||||||  ||||||||  |||| ||    
T  37451419 tgataaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttacttattacatttttgatgttatagtgttaactttac 37451321  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    || |||||||||| | |||||||    
T  37451320 caaaaaagtcatttttatgactt 37451298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 51128993 - 51128884
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  |||||||    
T  51128993 tgatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcac 51128894  T
Q  104 cagaaaagtc 113  Q
     | |||||||    
T  51128893 taaaaaagtc 51128884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 46931546 - 46931446
Alignment:
Q  3 ctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttca 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    |||||||||||||||   ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||    
T  46931546 ctgatgaattgatgatattatgagggctgaatttttgatgccgttctacaaacagtggggtattactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 46931447  T
Q  103 c 103  Q
    |    
T  46931446 c 46931446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 23999482 - 23999359
Alignment:
Q  3 ctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttca 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||   |||||| |||||||||  ||||  || | |||| ||  | ||||||  ||||||    
T  23999482 ctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcgttatattttttatgttgtagtgttaacttca 23999383  T
Q  103 ccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    ||| |||| ||||||| |||||||    
T  23999382 ccaaaaaaatcattcttatgactt 23999359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 144
Target Start/End: Original strand, 4150489 - 4150537
Alignment:
Q  96 gacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  4150489 gacttcaccagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttcctt 4150537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 27563944 - 27564017
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcacta 74  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  | ||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||  ||||||||    
T  27563944 atctgatgaattgataatattatcggaactgaacttttgatgtcactatacaaacagtggagtgttactcacta 27564017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 43579287 - 43579242
Alignment:
Q  97 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  43579287 acttcactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 43579242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 143
Target Start/End: Original strand, 27082891 - 27083030
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  27082891 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttaatgccactgcacaaacagtggggtgttactcactacacttttgatgctatagtgttaacttcac 27082990  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| || || ||||||||||    
T  27082991 cagaaaagtcagtctgatgacttcaccatagaattttcct 27083030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 148
Target Start/End: Original strand, 36695017 - 36695163
Alignment:
Q  2 tctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||  |||||    
T  36695017 tctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattatagtgttaacttc 36695116  T
Q  102 accagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaatt 148  Q
    | ||||||||||||| || |||||| || || |||||||||||||||    
T  36695117 atcagaaaagtcattttcctgacttcaccatagaattttccttaatt 36695163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 5299996 - 5300137
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||| || ||||||||||| |||||||||  ||||    
T  5299996 atctgatgaattgatgatactataaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtagagtgctacttacaacacttttgatgctatagtgttaactt 5300095  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    ||  | |||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  5300096 cattaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 5300137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 13307763 - 13307622
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||    
T  13307763 atctgatgaattgataatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaatagtgaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 13307664  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||    
T  13307663 caccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcc 13307622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 34895107 - 34894964
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||  |||||||||| | |||||  ||||||||  ||||    
T  34895107 atctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttatagtgttaactt 34895008  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    || ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  34895007 catcagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcctt 34894964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 38644118 - 38643975
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||    
T  38644118 atctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccactagacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 38644019  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
     |||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  38644018 gaccaaaaaagtcattctcatgatttcaccatagaattttcctt 38643975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 6098568 - 6098709
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||| | ||||||| ||||||| |  ||||    
T  6098568 atctgatgaattgacgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactatatttttgatgctatagtattaactt 6098667  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||| || || |||||||||    
T  6098668 caccaaaaaagttattttcatgacttcaccatagaattttcc 6098709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 12876249 - 12876108
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||  |||||| ||| |||| ||| ||||||||  ||||    
T  12876249 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagttgggtgttactcacaacattttttatattatagtgttaactt 12876150  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    || ||||||||||||| || |||||| || || |||||||||    
T  12876149 catcagaaaagtcattttcgtgacttaaccatagaattttcc 12876108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 126
Target Start/End: Original strand, 37970574 - 37970694
Alignment:
Q  6 atgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacca 105  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||||||    
T  37970574 atgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatggcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 37970673  T
Q  106 gaaaagtcattctcatgactt 126  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  37970674 aaaaagtcattctcatgactt 37970694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 1205064 - 1204942
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||  |||||||||| |||| ||  ||||||||  |||||||    
T  1205064 tgatgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgatgtgttactcactacattttttatgttatagtgttaacttcac 1204965  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1204964 cagaaaagtcattctcatgactt 1204942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 9864287 - 9864145
Alignment:
Q  2 tctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttc 101  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||  | |||    
T  9864287 tctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtgttaatttc 9864188  T
Q  102 accagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    |||| |||||||||| || |||||| |  || |||||||||||    
T  9864187 accaaaaaagtcattttcgtgacttcattatagaattttcctt 9864145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 16446925 - 16447067
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||  ||||    
T  16446925 atctgatgaattgatgatagtatggggactaaacttttgatgccattatacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaactt 16447024  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
     | ||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||    
T  16447025 tatcagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcct 16447067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 465982 - 465857
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||| ||||  ||||    
T  465982 atctgatgaattgatgatactaaggggactgaatttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatcgtgttaactt 465883  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||    
T  465882 caccacaaaagtcattttaatgactt 465857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 10555252 - 10555377
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||    
T  10555252 atctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactt 10555351  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10555352 caccaaaaaagtcattctcatgactt 10555377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 143
Target Start/End: Original strand, 34952084 - 34952223
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||| ||    
T  34952084 tgatgaattgatgatactaaagggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggctgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaacttgac 34952183  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
    ||||||||||||| | ||||||| || || ||||||||||    
T  34952184 cagaaaagtcattttaatgactttactatagaattttcct 34952223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 11727161 - 11727039
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||  ||| || |||||||||||  ||||||||  |||||||    
T  11727161 tgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccactatacaaatagtggggtgttacttacaacacttttgatgttatagtgttaacttcac 11727062  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    || |||| |||||||||| ||||    
T  11727061 caaaaaaatcattctcataactt 11727039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 1150155 - 1150306
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||  ||||| ||  ||||    
T  1150155 atctgatgagttgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcgttgtacaaacagtgggatgttactcattacatttttgatgttatagcgttaactt 1150254  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaattattaa 153  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  1150255 caccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcc-taattattaa 1150306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 33906352 - 33906223
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||            | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  33906352 atctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttt------------ataaacagtggggtgctactcactacacttttaatactatagtgttgactt 33906265  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    ||||||||||||||||||||| | || || || |||||||||    
T  33906264 caccagaaaagtcattctcataatttcaccatagaattttcc 33906223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16222999 - 16222860
Alignment:
Q  5 gatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||  | |||||||| | |||| ||  ||||||||  | ||||||    
T  16222999 gatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaactgtggggaactactcactatattttttatgttatagtgttaaattcacc 16222900  T
Q  105 agaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    ||||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||    
T  16222899 agaaaagtcattctcatgatttcaccgtagaattttcctt 16222860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 23854481 - 23854606
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| |||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||    
T  23854481 atctaatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgcacaaacagttgggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactt 23854580  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23854581 caccaaaaaagtcattctcatgactt 23854606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 40862551 - 40862416
Alignment:
Q  9 aattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacactttt-gatactatagtgtcgacttcaccaga 107  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||    
T  40862551 aattgatgataccatgag-actgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttttgatattatagtgttaacttcaccaga 40862453  T
Q  108 aaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    ||||| ||| || |||||| || || |||||||||||    
T  40862452 aaagttattttcgtgacttcactatagaattttcctt 40862416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 43643645 - 43643788
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||  ||||||||||| | |||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||    
T  43643645 atctgatgagttgatgatactatgaagattgaactttggatgtcattgtacaaacagtagagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 43643744  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  43643745 caccaaaatagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 43643788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 41362655 - 41362517
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||| |||||||||  |||||||||| |||| || |  ||||||  ||||    
T  41362655 atctgatgaattgatgatactatgaggtctgaacttttgatgtcactatacaaatagtggggtgttactcactaca-tttttatgc--tagtgttaactt 41362559  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||| || || |||||||||    
T  41362558 caccaaaaaagtcattttcataacttcaccatagaattttcc 41362517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 147
Target Start/End: Original strand, 31933940 - 31934082
Alignment:
Q  5 gatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc 104  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||||||  ||||| || | ||||||||  |||||||  ||||||||    
T  31933940 gatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatgtcattgtataaagagtggggtgttactcattatatttttgatatcatagtgttaacttcacc 31934039  T
Q  105 agaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 147  Q
    | |||| |||||||||| |||| ||  | |||||||| |||||    
T  31934040 aaaaaaatcattctcataacttcacgttagaattttctttaat 31934082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 39099169 - 39099232
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtg 64  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||    
T  39099169 atctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgctagtgtacaaagagtggggtg 39099232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 142
Target Start/End: Original strand, 4133077 - 4133199
Alignment:
Q  18 tactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||   ||||||||   |||| || |  ||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  4133077 tactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtcaggtattactcactatcttttttatgc--tagtgttaacttcaccaaaaaagtcattc 4133174  T
Q  118 tcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    | |||||||||| ||  ||||||||    
T  4133175 tgatgacttgaccataaaattttcc 4133199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 1149682 - 1149742
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggg 61  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  1149682 atctgatgagttgatgatactatgaggacagaacttttgatgtcattgtacaaacagtggg 1149742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 143
Target Start/End: Original strand, 30654635 - 30654775
Alignment:
Q  3 ctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttca 102  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||    |||||||||||||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||    
T  30654635 ctgatgaagtgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcattcaacaaacagtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttca 30654734  T
Q  103 ccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
    ||| |||| ||| ||| ||||||| || ||  |||||||||    
T  30654735 ccaaaaaaatcactcttatgacttcaccataaaattttcct 30654775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 7891007 - 7891066
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtgg 60  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  7891007 atctgatgaattgatgatattatgaggaccgaacttttgatgccattgtacaaacggtgg 7891066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 1954039 - 1954103
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgat-gatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtg 64  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||| |||||    
T  1954039 atctgatgaattgatagatactatgagggctgaacttttgatgccactgtccaaatagtagggtg 1954103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 145
Target Start/End: Original strand, 24823395 - 24823466
Alignment:
Q  74 acacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 145  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||| || || | ||||||||||    
T  24823395 acacttttgatattatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcataactttaccatagtattttcctta 24823466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 44869637 - 44869576
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtgggg 62  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||  || ||||||||||||    
T  44869637 atctgataaattgatgatactatgacgattgaacttttgatgtcattgtgcaaacagtgggg 44869576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 43025841 - 43025753
Alignment:
Q  2 tctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactata 90  Q
    |||||||||||||||||| |||  | ||||||||||| || |||  ||||||| ||||||||   | |||| |||||||||||||||||    
T  43025841 tctgatgaattgatgatattatatgaactgaacttttaataccattgtacaaagagtggggtattaatcacaacacttttgatactata 43025753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 41911038 - 41911153
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagt-ggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgact 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| || ||   || ||| ||||||  |||||| |||||||||||  |||||| |  |||    
T  41911038 atctgatgaattgatgatactatgttgactgaatttttgatgctactgttataatagtgggggtgttactcacgacacttttgatgatatagtattaact 41911137  T
Q  100 tcaccagaaaagtcat 115  Q
    |||||| |||| ||||    
T  41911138 tcaccaaaaaaatcat 41911153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 33197989 - 33197947
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgc 43  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  33197989 atctgatgaattgatgatattatggagactgaacttttgatgc 33197947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 35459761 - 35459819
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtg 59  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||| |||||    
T  35459761 atctgatgagttgatgatattatgaggactgaacttttaatgtcattgtacaatcagtg 35459819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 7998402 - 7998361
Alignment:
Q  102 accagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  7998402 accagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcct 7998361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Original strand, 6446708 - 6446752
Alignment:
Q  96 gacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 140  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||    
T  6446708 gacttcaccagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaatttt 6446752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 15009305 - 15009241
Alignment:
Q  78 ttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    |||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||||    
T  15009305 ttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcc 15009241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 144
Target Start/End: Original strand, 39099262 - 39099302
Alignment:
Q  104 cagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  39099262 cagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 39099302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 39)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 36642124 - 36641980
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||  |||| | ||||||||||| ||||||| |  | |||||    
T  36642124 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtattaatttcac 36642025  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaatt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  36642024 cagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttttcttaatt 36641980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 4167062 - 4166919
Alignment:
Q  2 tctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttc 101  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||| | | ||||||||||||| |||  |||||    
T  4167062 tctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactataatgttaacttc 4166963  T
Q  102 accagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 145  Q
    ||||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||||    
T  4166962 accagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcctta 4166919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 19424690 - 19424832
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||| |||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||    
T  19424690 atctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccactatataaacaatggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 19424789  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||  |||||||||    
T  19424790 caccagaaaagccattctcatgacttcaccataaaattttcct 19424832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 13711605 - 13711465
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||    
T  13711605 atctgatgaattgatgataccatgtggactaaacttttgatgtcactgtacaaactgtggggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaactt 13711506  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttc 141  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||    
T  13711505 caccagaaaagtcattctgatgacttcaccatagaattttc 13711465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 33551048 - 33551195
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||  ||||    
T  33551048 atctgatgaattgatgatactatgaagaccgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcactacatttttgatgttatagtgttaactt 33551147  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaatt 148  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| |||||    
T  33551148 cactaaaaaagtcattctcatgacttcaccgtagaattttccataatt 33551195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Original strand, 41463915 - 41464051
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||  |||||| |  |||||||    
T  41463915 tgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgattttatagtattaacttcac 41464014  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 140  Q
    || ||| |||||||||| ||||| || || |||||||    
T  41464015 caaaaatgtcattctcacgacttcaccatagaatttt 41464051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 143
Target Start/End: Original strand, 4264142 - 4264281
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||  |||| ||    
T  4264142 tgatgaattgataatactatggagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactttac 4264241  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
    ||||||||||||| | ||||||| || || ||||||||||    
T  4264242 cagaaaagtcattatgatgacttcaccatagaattttcct 4264281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 33660430 - 33660569
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||    
T  33660430 atctaatgaattgatgatactaagaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagttgggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 33660529  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 140  Q
     || |||||||||||| | ||||||| || || |||||||    
T  33660530 aactagaaaagtcattttaatgacttcaccatagaatttt 33660569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 19313992 - 19313852
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||  ||||  |||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||    
T  19313992 atctgatgaattgatgatactat-aggactgaacttttgatgtcactgtataaatagtaaggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaactt 19313894  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||    
T  19313893 caccagaaaagtcattctaatgacttcaccatagaattttcc 19313852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 43770901 - 43771039
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||    
T  43770901 atctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgccactgtataaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 43771000  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 140  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||| || || |||||||    
T  43771001 cacca-aaaaatcattctaatgacttcaccatagaatttt 43771039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 4478510 - 4478368
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||    
T  4478510 atctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccactgtacaaacaatggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 4478411  T
Q  101 caccagaaaagtcattctc-atgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    ||||| |||  ||||| || ||||||| || || |||||||||    
T  4478410 caccaaaaatatcattttctatgacttcactatagaattttcc 4478368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 29242200 - 29242345
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  || ||||| | |||| ||  |||||| |  ||||    
T  29242200 atctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgataccactgtacaaacagtggggtgttacgcactatattttttatgttatagttttaactt 29242299  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaa 146  Q
    ||||| ||||  |||| ||||||||| || || |||||||||||||    
T  29242300 caccaaaaaaaccattttcatgacttcaccatagaattttccttaa 29242345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 4763772 - 4763644
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcg---a 97  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |  |||||||| |   |    
T  4763772 atctgatgaattgattatactatgggaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactacagttttgttgatatagtgttgttaa 4763673  T
Q  98 cttcaccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4763672 cttcatcagaaaagtcattttcatgactt 4763644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 144
Target Start/End: Original strand, 39167430 - 39167568
Alignment:
Q  6 atgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||  |||||| | ||||||||||||||  |||  |||||| ||    
T  39167430 atgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaggtgttactcacaatacttttgatactattctgttaacttcatca 39167529  T
Q  106 gaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
     |||| |||||||| |||||| || ||  ||||||||||    
T  39167530 aaaaaatcattctcgtgacttcaccataaaattttcctt 39167568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 144
Target Start/End: Original strand, 2325442 - 2325575
Alignment:
Q  11 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||| |||| || ||||  |||| |||  ||||||| ||||||    
T  2325442 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccagtgtacaaacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatattgttaacttcacgagaaaa 2325541  T
Q  111 gtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    ||||||| ||| |||| || || |||||||||||    
T  2325542 gtcattcacataacttcaccatagaattttcctt 2325575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 31570796 - 31570939
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  || ||| |||||||||  ||| || |||||||| ||  ||||||||  | ||    
T  31570796 atctgatgaattcatgatactatgtggactgaacttttgatgtcactataaaaatagtggggtgttacttacaacacttttaatgttatagtgttaattt 31570895  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| || || |||||||||||    
T  31570896 caccagaaaagttattctcataacttcaccatagaattttcctt 31570939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 3177079 - 3176965
Alignment:
Q  2 tctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||  |||||  ||| |||||||| |||||| |  |||||    
T  3177079 tctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagttgcgtgttactcaaaacatttttgatattatagtattaacttc 3176980  T
Q  102 accagaaaagtcatt 116  Q
    | |||||||||||||    
T  3176979 atcagaaaagtcatt 3176965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 18494342 - 18494473
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |            ||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||    
T  18494342 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtc------------gtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactt 18494429  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 144  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || |  |||||||||||    
T  18494430 caccagaaaagtcattttcatgacttcaccacagaattttcctt 18494473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 26357715 - 26357593
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 103  Q
    |||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||     
T  26357715 tgatgaattgataactctataagaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcat 26357616  T
Q  104 cagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  26357615 cagaaaagtcattttcatgactt 26357593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 27350001 - 27350109
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||  |||||| ||| ||||||| |||||||||  ||||    
T  27350001 atctgatgaattgatgatactaag-ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgtggtgttactcacaacatttttgatgctatagtgttaactt 27350099  T
Q  101 caccagaaaa 110  Q
    ||||| ||||    
T  27350100 caccaaaaaa 27350109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 5881677 - 5881533
Alignment:
Q  4 tgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacac-----ttttgatactatagtgtcgac 98  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||| ||||     |||||||  |||| | || ||    
T  5881677 tgatgaattgatgatactaaggggactcaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgttttgatgttataatatcaac 5881578  T
Q  99 ttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||  |||||||||    
T  5881577 ttcaccagaaaagtcattttaatgacttcacaataaaattttcct 5881533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 41465642 - 41465509
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||| |||        | |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||  ||||    
T  41465642 atctaatgaattgatgatattatagggactgaacttttgataccagcgt--------tagggtgctactcactacacctttgatgctatagtgttaactt 41465551  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  41465550 caccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 41465509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 37905849 - 37905740
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||  ||||  |||| |||| ||  ||||||||  ||||    
T  37905849 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcgttacattttttatgttatagtgttaactt 37905750  T
Q  101 caccagaaaa 110  Q
    ||||| ||||    
T  37905749 caccaaaaaa 37905740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 44286090 - 44285965
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| | |    ||| | ||||||||||| |||||||||  ||||    
T  44286090 atctgatgaatttatgatactatgtggactaaacttttgatgccactatacaaacagtgagatattgctcgcaacacttttgatgctatagtgttaactt 44285991  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    || ||||||| |||||| ||||||||    
T  44285990 catcagaaaaatcattcgcatgactt 44285965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 143
Target Start/End: Original strand, 11366445 - 11366585
Alignment:
Q  3 ctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttca 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||   |||||| |||| | ||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  | ||||    
T  11366445 ctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattatacaaatagtgagatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaatttca 11366544  T
Q  103 ccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
    ||| |||||||||||| |||| || || || ||||||||||    
T  11366545 ccaaaaaagtcattcttatgatttcaccatagaattttcct 11366585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 41051267 - 41051382
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac-cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgact 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||  |  ||| ||||||||||| ||||||| |   ||    
T  41051267 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactggtacaaatagtgaagtgttatacacaacacttttgatgctatagtattagct 41051366  T
Q  100 tcaccagaaaagtcat 115  Q
    ||| ||||||||||||    
T  41051367 tcatcagaaaagtcat 41051382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 17071799 - 17071941
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||  ||||||| | || | ||  ||| |||||| ||||| |  ||||||||  ||||    
T  17071799 atctgatgaattgatgatactatgaataccgaacttttgatgtcattgtacaaataatgagatgttacttactacatttttgttgttatagtgttaactt 17071898  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||    
T  17071899 caccaaaaaagtcattcgcatgacttcaccatagaattttcct 17071941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 33902207 - 33902092
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||   |||||||||| ||||  ||   ||||||  ||||    
T  33902207 atctgatgaactgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattttacaaacagtggggtattactcactacattttt--tatgttagtgttaactt 33902110  T
Q  101 caccagaaaagtcattct 118  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33902109 caccagaaaagtcattct 33902092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 43648307 - 43648411
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||    
T  43648307 atctgatgagttgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcattatacaaacagtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 43648406  T
Q  101 cacca 105  Q
    |||||    
T  43648407 cacca 43648411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 45327861 - 45327801
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggg 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  45327861 atctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcaccgtataaacaatggg 45327801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 17054158 - 17054300
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  || | |||||||||| ||  ||||||||| || | ||  ||| |||||| |||||||  |||||| |  ||||    
T  17054158 atctgatgaattgatgatattatgaataccgnacttttgatgtcattgtacaaacaatgagatgttacttactacatttttgatgttatagtattaactt 17054257  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||    
T  17054258 caccaaaaaagtcattcgcatgacttcaccatagaattttcct 17054300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 110
Target Start/End: Original strand, 33709304 - 33709403
Alignment:
Q  11 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaa 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||  |||| | |||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||    
T  33709304 ttgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtactaacagtggagtgttactcgcaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccataaaa 33709403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 19289385 - 19289500
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||| |||||||  ||||| || | |||||||  ||||||||  ||||    
T  19289385 atctgatgagttgatgatactgtgagaacttaacttttgatgtcattgtacaaacaatggggtgttactcattatatttttgatgttatagtgttaactt 19289484  T
Q  101 caccagaaaagtcatt 116  Q
    || || ||||||||||    
T  19289485 catcaaaaaagtcatt 19289500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 41960981 - 41960940
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 42  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41960981 atctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatg 41960940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 44913803 - 44913662
Alignment:
Q  2 tctgatgaattgatgatactat-gaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac-agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgact 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||| ||   ||||||| |||| ||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||  |||    
T  44913803 tctgatgaattgatgatactatgggggattgaactttttatgtcattttacaaacaagtgaggtgttactcacaacatttttgatactacagtgttaact 44913704  T
Q  100 tcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 142  Q
    ||| || |||||||||| || |||||| || || |||||||||    
T  44913703 tca-cataaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 44913662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 61
Target Start/End: Original strand, 7006991 - 7007043
Alignment:
Q  9 aattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggg 61  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7006991 aattgatgatactatgggaactaaacttttgatgctactgtacaaacagtggg 7007043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 6177820 - 6177791
Alignment:
Q  97 acttcaccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6177820 acttcaccagaaaagtcattctcatgactt 6177791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 35959022 - 35958925
Alignment:
Q  29 ctgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    |||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||   |||| |||| |||| ||  ||||||| | ||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  35959022 ctgaacttttaatgtcattgtacaaacagtggggtgttgctcattacattttttatgttatagtggcaacttcaccaaaaaagtcatttttatgactt 35958925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 31861993 - 31861953
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgat 41  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  31861993 atctgatgaattgatgatactataatgactgaaattttgat 31861953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 274 - 133
Alignment:
Q  2 tctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  |||||| ||| |||| |||||| |||||  |||||    
T  274 tctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatactacagtgttaacttc 175  T
Q  102 accagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
    ||||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||    
T  174 accagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcct 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 94427 - 94547
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||  |||| |||  ||||    
T  94427 atctcatgaattgatgatagtatggggaccaaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttataatgttaactt 94526  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcat 121  Q
    || ||||||||||||| ||||    
T  94527 catcagaaaagtcattttcat 94547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 408473 - 408512
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgat 41  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  408473 atctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttgat 408512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 8028 - 7889
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||    
T  8028 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaactt 7929  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 140  Q
    || || |||||||||||| || |||| || || |||||||    
T  7928 catcaaaaaagtcattcttataacttcaccatagaatttt 7889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 44098 - 43959
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  ||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||  ||||    
T  44098 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactcattacatttttgatattatagcgttaactt 43999  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 140  Q
    ||||| ||||||| |||| | ||||| || || |||||||    
T  43998 caccaaaaaagtctttcttacgacttcaccatagaatttt 43959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 154689 - 154828
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  ||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||  ||||    
T  154689 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactcattacatttttgatattatagcgttaactt 154788  T
Q  101 caccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 140  Q
    ||||| ||||||| |||| | ||||| || || |||||||    
T  154789 caccaaaaaagtctttcttacgacttcaccatagaatttt 154828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 12050 - 11908
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg-tacaaacagt-ggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgac 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| | ||||||  |||||| |||||||| ||  ||| ||||  |     
T  12050 atctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgataccactgatacaaacaatgggggtgttactcacaacacttttaatgttatggtgttaat 11951  T
Q  99 ttcaccagaaaagtca-ttctcatgacttgacaatggaatttt 140  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||    
T  11950 ttcaccagaaaagtcatttctcatgacttcaccatagaatttt 11908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 42439 - 42347
Alignment:
Q  51 caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 143  Q
    |||| |||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||| || ||  |||||||||    
T  42439 caaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaattattctcatgacttcaccataaaattttcct 42347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Original strand, 146062 - 146185
Alignment:
Q  3 ctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttca 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||   |||||| | |||||||  ||||| |||| |||| ||  |||| |||  |||| |    
T  146062 ctgatgaattgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcattctacaaataatggggtgttactcattacattttttatgttataatgttaacttaa 146161  T
Q  103 ccagaaaagtcattctcatgactt 126  Q
    ||| |||| ||||||| |||||||    
T  146162 ccaaaaaaatcattcttatgactt 146185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 267425 - 267331
Alignment:
Q  1 atctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtac-aaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgt 94  Q
    |||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||||| ||| |||| ||||||| || ||  |||||||| | ||||||| |||||||||    
T  267425 atctaatgaattgatgatattatagagactgaacttttgatgacactgtacaaaacagttggatgttactcactatatttttgatgctatagtgt 267331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University