View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2097_high_3 (Length: 565)

Name: NF2097_high_3
Description: NF2097
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2097_high_3
NF2097_high_3
[»] chr5 (43 HSPs)
chr5 (18-306)||(15159648-15159935)
chr5 (412-552)||(14717605-14717745)
chr5 (412-548)||(30863257-30863393)
chr5 (412-548)||(33760471-33760607)
chr5 (412-552)||(6600137-6600277)
chr5 (412-548)||(6739956-6740092)
chr5 (412-548)||(8215904-8216040)
chr5 (412-548)||(26593281-26593417)
chr5 (412-548)||(30297750-30297886)
chr5 (416-548)||(39002030-39002162)
chr5 (412-548)||(11000729-11000865)
chr5 (412-552)||(14952324-14952464)
chr5 (412-548)||(16095961-16096096)
chr5 (412-548)||(19659502-19659638)
chr5 (412-552)||(20408533-20408673)
chr5 (412-548)||(35342184-35342320)
chr5 (412-548)||(38964115-38964250)
chr5 (416-548)||(40074954-40075086)
chr5 (412-548)||(41282346-41282482)
chr5 (412-557)||(23128914-23129059)
chr5 (412-548)||(3352003-3352139)
chr5 (412-548)||(6251976-6252112)
chr5 (412-548)||(27457198-27457334)
chr5 (412-548)||(31710286-31710422)
chr5 (412-548)||(39824560-39824696)
chr5 (412-548)||(4015875-4016011)
chr5 (412-548)||(11692148-11692284)
chr5 (412-552)||(19398194-19398334)
chr5 (412-548)||(20079259-20079395)
chr5 (416-548)||(42993522-42993654)
chr5 (416-548)||(43166274-43166406)
chr5 (416-544)||(1052541-1052669)
chr5 (412-548)||(8689576-8689712)
chr5 (412-552)||(27116100-27116240)
chr5 (412-548)||(28078406-28078542)
chr5 (412-548)||(30208403-30208539)
chr5 (450-548)||(6331381-6331479)
chr5 (432-548)||(16752120-16752236)
chr5 (416-548)||(8694870-8695002)
chr5 (412-548)||(11935450-11935585)
chr5 (432-548)||(26035367-26035483)
chr5 (432-544)||(444962-445074)
chr5 (412-548)||(27509982-27510111)
[»] chr4 (54 HSPs)
chr4 (412-548)||(33807781-33807917)
chr4 (412-548)||(8882014-8882150)
chr4 (412-548)||(42273806-42273942)
chr4 (412-548)||(55517186-55517322)
chr4 (412-547)||(49118616-49118751)
chr4 (412-548)||(26017427-26017563)
chr4 (412-548)||(28264647-28264783)
chr4 (412-552)||(32317953-32318093)
chr4 (412-548)||(40988637-40988773)
chr4 (412-548)||(4544986-4545122)
chr4 (412-548)||(12196473-12196609)
chr4 (412-552)||(23135007-23135147)
chr4 (412-548)||(31591080-31591215)
chr4 (412-548)||(31973595-31973731)
chr4 (412-552)||(48551765-48551905)
chr4 (412-548)||(48707734-48707870)
chr4 (412-547)||(44490324-44490459)
chr4 (412-546)||(32118720-32118854)
chr4 (412-548)||(5227394-5227530)
chr4 (412-548)||(11795155-11795291)
chr4 (412-548)||(17847097-17847232)
chr4 (412-548)||(28159954-28160090)
chr4 (412-548)||(28812288-28812423)
chr4 (412-552)||(30467004-30467144)
chr4 (416-548)||(19496107-19496239)
chr4 (412-548)||(24458632-24458768)
chr4 (412-548)||(30141109-30141245)
chr4 (412-548)||(33174021-33174157)
chr4 (412-548)||(35930044-35930179)
chr4 (412-548)||(48149503-48149639)
chr4 (412-547)||(39995168-39995303)
chr4 (412-550)||(25734224-25734362)
chr4 (412-548)||(2055282-2055418)
chr4 (412-548)||(14564800-14564936)
chr4 (412-548)||(23553069-23553204)
chr4 (412-548)||(15985014-15985150)
chr4 (412-548)||(17993018-17993154)
chr4 (412-548)||(37381850-37381986)
chr4 (412-548)||(50542355-50542491)
chr4 (413-548)||(10588584-10588719)
chr4 (412-548)||(50276139-50276272)
chr4 (412-548)||(9339124-9339263)
chr4 (412-548)||(22298521-22298658)
chr4 (432-548)||(24623152-24623268)
chr4 (412-520)||(31208776-31208884)
chr4 (412-548)||(33693334-33693470)
chr4 (412-548)||(39700049-39700185)
chr4 (412-548)||(51371048-51371184)
chr4 (432-548)||(19168816-19168932)
chr4 (412-552)||(25730240-25730380)
chr4 (471-548)||(56555200-56555277)
chr4 (412-492)||(20534225-20534305)
chr4 (432-536)||(42549643-42549747)
chr4 (412-441)||(56555166-56555195)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (412-552)||(37838297-37838437)
chr2 (412-548)||(16246194-16246330)
chr2 (412-548)||(27328588-27328724)
chr2 (412-548)||(40854613-40854749)
chr2 (412-548)||(921026-921162)
chr2 (412-548)||(28650427-28650563)
chr2 (412-548)||(34253146-34253282)
chr2 (417-548)||(771981-772112)
chr2 (412-548)||(11949427-11949563)
chr2 (412-548)||(41500503-41500639)
chr2 (412-547)||(33865268-33865403)
chr2 (412-548)||(1106560-1106696)
chr2 (412-548)||(7378967-7379103)
chr2 (412-548)||(9276578-9276714)
chr2 (412-548)||(17134233-17134369)
chr2 (412-552)||(17484551-17484691)
chr2 (412-548)||(7297235-7297371)
chr2 (416-548)||(2456014-2456146)
chr2 (416-548)||(36211050-36211182)
chr2 (412-548)||(36444229-36444365)
chr2 (412-548)||(38751052-38751188)
chr2 (412-547)||(19180427-19180561)
chr2 (418-548)||(3430631-3430761)
chr2 (412-548)||(2056930-2057066)
chr2 (416-548)||(2314980-2315112)
chr2 (412-540)||(33106970-33107098)
chr2 (412-544)||(42629970-42630102)
chr2 (412-548)||(43249413-43249549)
chr2 (412-548)||(2094411-2094547)
chr2 (412-548)||(8899686-8899821)
chr2 (412-548)||(12759751-12759886)
chr2 (416-548)||(25087801-25087933)
chr2 (416-548)||(29737752-29737884)
chr2 (412-548)||(37732194-37732330)
chr2 (412-548)||(45124123-45124259)
chr2 (432-548)||(8396572-8396688)
chr2 (448-552)||(37654108-37654212)
chr2 (451-548)||(41178059-41178156)
chr2 (432-548)||(19916008-19916124)
chr2 (412-548)||(9331760-9331896)
chr2 (412-503)||(14630663-14630754)
chr2 (412-501)||(23671812-23671901)
chr2 (496-548)||(23672958-23673010)
[»] chr1 (63 HSPs)
chr1 (412-548)||(46825535-46825671)
chr1 (412-552)||(49094712-49094852)
chr1 (412-548)||(12143076-12143212)
chr1 (412-548)||(23767415-23767551)
chr1 (412-548)||(41106020-41106156)
chr1 (412-548)||(7651666-7651802)
chr1 (412-548)||(19315644-19315780)
chr1 (412-548)||(25988272-25988408)
chr1 (412-548)||(28425364-28425500)
chr1 (412-548)||(36157679-36157814)
chr1 (412-548)||(38473627-38473763)
chr1 (412-548)||(7553017-7553153)
chr1 (412-552)||(8141487-8141627)
chr1 (412-548)||(49814304-49814440)
chr1 (412-548)||(7608767-7608903)
chr1 (412-552)||(9962751-9962891)
chr1 (412-548)||(18892333-18892469)
chr1 (412-548)||(19274563-19274699)
chr1 (412-548)||(26549392-26549528)
chr1 (412-548)||(33325731-33325867)
chr1 (412-548)||(33674021-33674157)
chr1 (412-548)||(46051454-46051590)
chr1 (412-552)||(48669397-48669537)
chr1 (412-550)||(45350718-45350854)
chr1 (412-552)||(45670487-45670627)
chr1 (412-548)||(23228195-23228331)
chr1 (412-548)||(26069896-26070032)
chr1 (412-552)||(34971080-34971220)
chr1 (412-552)||(37216896-37217036)
chr1 (412-548)||(48802332-48802468)
chr1 (414-548)||(24204474-24204608)
chr1 (413-550)||(41982237-41982374)
chr1 (412-552)||(9878785-9878925)
chr1 (412-552)||(21965065-21965205)
chr1 (412-548)||(36781173-36781309)
chr1 (412-548)||(46095076-46095212)
chr1 (412-548)||(50533387-50533523)
chr1 (412-548)||(50689947-50690083)
chr1 (412-548)||(52146997-52147133)
chr1 (412-547)||(5400876-5401010)
chr1 (412-548)||(16705874-16706010)
chr1 (412-548)||(52349925-52350061)
chr1 (412-548)||(17983899-17984035)
chr1 (412-552)||(18782090-18782230)
chr1 (412-548)||(43396679-43396815)
chr1 (432-552)||(48319067-48319187)
chr1 (412-548)||(52067652-52067788)
chr1 (448-548)||(12964650-12964750)
chr1 (412-547)||(18917529-18917664)
chr1 (431-552)||(9974842-9974963)
chr1 (412-548)||(40721346-40721483)
chr1 (412-548)||(6711444-6711580)
chr1 (432-548)||(33194672-33194788)
chr1 (412-552)||(21929521-21929666)
chr1 (432-548)||(16506809-16506925)
chr1 (412-552)||(25800644-25800781)
chr1 (412-552)||(33714362-33714500)
chr1 (432-548)||(30281635-30281751)
chr1 (412-512)||(44978769-44978868)
chr1 (474-548)||(50099224-50099298)
chr1 (504-548)||(44979281-44979325)
chr1 (508-548)||(32373650-32373690)
chr1 (508-548)||(17989864-17989904)
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (412-552)||(37933642-37933782)
chr8 (412-547)||(15847117-15847252)
chr8 (412-552)||(38107099-38107239)
chr8 (412-548)||(513312-513447)
chr8 (412-548)||(2533276-2533412)
chr8 (412-552)||(259978-260117)
chr8 (412-552)||(655804-655943)
chr8 (412-552)||(841539-841678)
chr8 (412-548)||(3875912-3876048)
chr8 (412-548)||(35443315-35443451)
chr8 (412-548)||(36400071-36400207)
chr8 (412-548)||(1293490-1293626)
chr8 (416-548)||(9056343-9056475)
chr8 (412-548)||(28707447-28707583)
chr8 (412-548)||(35884431-35884567)
chr8 (412-548)||(43806534-43806670)
chr8 (412-537)||(41536528-41536653)
chr8 (412-552)||(440840-440980)
chr8 (412-548)||(22683989-22684125)
chr8 (412-548)||(38633711-38633847)
chr8 (412-552)||(40301894-40302034)
chr8 (412-550)||(38208754-38208893)
chr8 (412-543)||(13797098-13797228)
chr8 (412-547)||(28496356-28496490)
chr8 (412-552)||(4649150-4649290)
chr8 (412-548)||(24430572-24430708)
chr8 (412-548)||(33651845-33651981)
chr8 (416-548)||(12010553-12010688)
chr8 (432-548)||(7434890-7435006)
chr8 (432-548)||(23935237-23935353)
chr8 (412-536)||(23972296-23972420)
chr8 (416-547)||(39513344-39513475)
chr8 (432-548)||(6016209-6016325)
chr8 (412-548)||(42988228-42988363)
chr8 (412-548)||(36218782-36218917)
chr8 (432-548)||(29485291-29485406)
chr8 (474-548)||(24193356-24193429)
chr8 (412-476)||(24193131-24193195)
chr8 (487-546)||(8137180-8137239)
[»] chr7 (45 HSPs)
chr7 (412-548)||(1469494-1469630)
chr7 (412-548)||(47281125-47281261)
chr7 (412-552)||(33884319-33884459)
chr7 (412-548)||(38427564-38427700)
chr7 (412-548)||(44544413-44544549)
chr7 (412-548)||(47219149-47219285)
chr7 (412-548)||(47294292-47294428)
chr7 (416-548)||(8162717-8162849)
chr7 (412-548)||(31684135-31684271)
chr7 (412-548)||(35600123-35600259)
chr7 (412-552)||(37393999-37394139)
chr7 (412-548)||(47271985-47272121)
chr7 (416-552)||(4923216-4923352)
chr7 (412-552)||(11050262-11050402)
chr7 (412-548)||(11476557-11476693)
chr7 (412-548)||(23842309-23842445)
chr7 (412-548)||(30798369-30798505)
chr7 (412-548)||(30876263-30876399)
chr7 (412-548)||(40851278-40851414)
chr7 (412-539)||(2960641-2960768)
chr7 (412-548)||(43752777-43752913)
chr7 (412-548)||(27364340-27364476)
chr7 (412-548)||(41113381-41113517)
chr7 (412-548)||(42979339-42979475)
chr7 (412-548)||(43968260-43968396)
chr7 (412-548)||(45723492-45723628)
chr7 (412-548)||(48628809-48628945)
chr7 (412-529)||(221298-221415)
chr7 (412-547)||(7336065-7336199)
chr7 (412-547)||(29248347-29248482)
chr7 (412-548)||(41139409-41139549)
chr7 (416-551)||(44800415-44800550)
chr7 (432-550)||(37354284-37354402)
chr7 (412-548)||(30971942-30972078)
chr7 (416-548)||(47579091-47579224)
chr7 (432-548)||(3797544-3797660)
chr7 (412-552)||(18353144-18353284)
chr7 (412-548)||(47119995-47120133)
chr7 (432-548)||(27774112-27774228)
chr7 (463-548)||(40520922-40521007)
chr7 (492-548)||(39034066-39034122)
chr7 (412-461)||(42888940-42888989)
chr7 (509-545)||(43025119-43025155)
chr7 (501-540)||(12583313-12583352)
chr7 (503-548)||(29739785-29739829)
[»] chr3 (54 HSPs)
chr3 (412-548)||(1687655-1687791)
chr3 (412-552)||(35346472-35346612)
chr3 (412-548)||(1017048-1017184)
chr3 (412-552)||(10618481-10618621)
chr3 (412-548)||(20086315-20086451)
chr3 (412-548)||(20813442-20813578)
chr3 (412-548)||(21564500-21564636)
chr3 (412-548)||(33151700-33151836)
chr3 (412-548)||(21656522-21656658)
chr3 (412-552)||(21890170-21890310)
chr3 (416-548)||(36314977-36315109)
chr3 (412-548)||(38446480-38446616)
chr3 (412-548)||(50287570-50287706)
chr3 (412-547)||(20760072-20760207)
chr3 (412-547)||(42016878-42017013)
chr3 (412-548)||(31122666-31122802)
chr3 (412-552)||(32650821-32650961)
chr3 (412-546)||(26455588-26455722)
chr3 (412-548)||(3697150-3697286)
chr3 (416-548)||(19664545-19664677)
chr3 (416-548)||(41250890-41251022)
chr3 (412-548)||(42107100-42107236)
chr3 (412-548)||(47329176-47329312)
chr3 (412-548)||(51562166-51562302)
chr3 (417-548)||(22852000-22852131)
chr3 (412-547)||(35608132-35608267)
chr3 (419-548)||(12748395-12748524)
chr3 (412-548)||(20913755-20913891)
chr3 (412-548)||(20921873-20922009)
chr3 (412-548)||(29677480-29677616)
chr3 (412-548)||(37247960-37248096)
chr3 (412-552)||(40922166-40922306)
chr3 (412-548)||(44798272-44798407)
chr3 (412-548)||(52821050-52821186)
chr3 (448-548)||(19268525-19268625)
chr3 (412-548)||(48651252-48651388)
chr3 (412-548)||(53925980-53926116)
chr3 (412-548)||(1448736-1448869)
chr3 (412-548)||(27070740-27070876)
chr3 (412-548)||(53196018-53196154)
chr3 (416-548)||(55164120-55164252)
chr3 (412-548)||(45380261-45380397)
chr3 (432-548)||(50977868-50977984)
chr3 (432-548)||(51081000-51081116)
chr3 (432-548)||(51475267-51475383)
chr3 (412-548)||(39069730-39069866)
chr3 (452-548)||(28699689-28699785)
chr3 (412-548)||(33473240-33473376)
chr3 (432-548)||(50364908-50365024)
chr3 (416-537)||(38924003-38924124)
chr3 (475-548)||(44152704-44152777)
chr3 (432-548)||(34019464-34019580)
chr3 (488-548)||(47473234-47473294)
chr3 (448-521)||(42641215-42641288)
[»] scaffold1986 (1 HSPs)
scaffold1986 (412-548)||(118-254)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (412-548)||(6503722-6503858)
chr6 (412-552)||(17943036-17943176)
chr6 (412-552)||(30379017-30379157)
chr6 (416-548)||(1915348-1915480)
chr6 (412-548)||(3408193-3408329)
chr6 (412-548)||(10256241-10256377)
chr6 (412-552)||(26393010-26393150)
chr6 (412-548)||(2390269-2390405)
chr6 (412-548)||(2707463-2707599)
chr6 (412-548)||(8178250-8178386)
chr6 (412-548)||(12626640-12626776)
chr6 (412-552)||(17428273-17428413)
chr6 (412-548)||(29050276-29050412)
chr6 (412-548)||(9382523-9382659)
chr6 (412-548)||(11133877-11134014)
chr6 (412-548)||(1077241-1077377)
chr6 (412-548)||(26230933-26231069)
chr6 (412-546)||(3258808-3258942)
chr6 (412-541)||(2598100-2598229)
chr6 (412-552)||(16193310-16193450)
chr6 (431-552)||(35223919-35224040)
chr6 (412-550)||(26196322-26196460)
chr6 (432-547)||(26936612-26936727)
chr6 (412-537)||(6785102-6785224)
chr6 (412-550)||(25820550-25820688)
chr6 (412-552)||(10931149-10931292)
chr6 (412-498)||(31375971-31376057)
chr6 (412-469)||(12612972-12613029)
chr6 (412-490)||(12612849-12612927)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (412-548)||(218889-219026)
[»] scaffold0693 (1 HSPs)
scaffold0693 (412-550)||(5028-5166)
[»] scaffold0727 (1 HSPs)
scaffold0727 (412-548)||(5190-5325)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (412-548)||(252439-252575)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (412-547)||(47967-48102)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (412-552)||(13095-13235)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (412-552)||(59609-59749)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (412-550)||(11360-11498)
[»] scaffold0542 (1 HSPs)
scaffold0542 (432-548)||(1994-2110)
[»] scaffold1562 (1 HSPs)
scaffold1562 (412-492)||(599-679)
[»] scaffold1158 (1 HSPs)
scaffold1158 (412-492)||(1914-1994)
[»] scaffold0952 (1 HSPs)
scaffold0952 (412-492)||(3372-3452)
[»] scaffold0717 (1 HSPs)
scaffold0717 (412-492)||(1877-1957)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (499-548)||(289-338)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (502-548)||(19785-19831)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 43)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 18 - 306
Target Start/End: Original strand, 15159648 - 15159935
Alignment:
Q  18 atttgtagtatgaataataattattaaatctagttcacaatgcttaaactaaatgacgtcctattgggaaagtaggtacatatattgactagtatttaag 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15159648 atttgtagtatgaataataattattaaatctagttcacaatgcttaaactaaatgatgtactattgggaaagtaggtatatatattgactagtatttaag 15159747  T
Q  118 aacatctatatgttaaactacttttagggaagnnnnnnnnggcctattaacaaccatgcagtttttcctacttcagaacaaggcctatgaaatagcagta 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15159748 aacatctatatgttaaactacttttagggaagaaaaaaaaggcctattaacaaccatgcagtttttcctacttcagaacaaggcctatgaaatagcagta 15159847  T
Q  218 attgccttaggcaaggttatttgatcttagaattcctatttaaaatttgacaacatactttgatattaacttcataaaaaaactatgtg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15159848 attgccttaggcaaggttatttgatcatagaattcctatttaaaatttgacaacatacttt-atattaacttcataaaaaaactatgtg 15159935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 14717745 - 14717605
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14717745 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 14717646  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14717645 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 14717605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 30863393 - 30863257
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30863393 aatcgtttcaaacaagtcataatgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 30863294  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30863293 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 30863257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 33760471 - 33760607
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33760471 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattacttctttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 33760570  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33760571 tagtcatctttttagtcatgacaaatggtggataatg 33760607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Original strand, 6600137 - 6600277
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6600137 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaat 6600236  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6600237 tagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgttct 6600277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 6739956 - 6740092
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6739956 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 6740055  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6740056 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 6740092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 8216040 - 8215904
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8216040 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 8215941  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8215940 tagtcatctttttaggaatgacaaatggtggataatg 8215904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 26593281 - 26593417
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26593281 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaacttatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 26593380  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26593381 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 26593417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 30297750 - 30297886
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30297750 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttcaactcatctttggtaccaaatctggctcctagcacccacttaaaat 30297849  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30297850 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 30297886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 416 - 548
Target Start/End: Original strand, 39002030 - 39002162
Alignment:
Q  416 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 515  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39002030 gtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 39002129  T
Q  516 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39002130 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 39002162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 11000729 - 11000865
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11000729 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 11000828  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  11000829 tagtcatctttttaggcctggcaagtggtggataatg 11000865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 14952464 - 14952324
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952464 aatcgtttcaaacaagtcttgttgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaat 14952365  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14952364 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgttct 14952324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 16095961 - 16096096
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16095961 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctt-ggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 16096059  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16096060 tagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 16096096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 19659502 - 19659638
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19659502 aatcgtttcaaataagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttttttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaatacccacttaaaat 19659601  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19659602 tagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatg 19659638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 20408673 - 20408533
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20408673 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatatttggtaccaaatctagctcctaacacccgcttaaaat 20408574  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20408573 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgttct 20408533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 35342320 - 35342184
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35342320 aatcgtttcaaacaagtctcattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaat 35342221  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35342220 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 35342184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 38964115 - 38964250
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38964115 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 38964214  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38964215 tagtcat-tttttaggcatgacaaatggtggataatg 38964250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 416 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 40075086 - 40074954
Alignment:
Q  416 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40075086 gtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 40074987  T
Q  516 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40074986 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 40074954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 41282482 - 41282346
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41282482 aatcatttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaat 41282383  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41282382 tagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatg 41282346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 412 - 557
Target Start/End: Original strand, 23128914 - 23129059
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23128914 aatcgtttcaaacaagtcatatcgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacaaccacttaaaat 23129013  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttctctgct 557  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  23129014 tagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctctttgct 23129059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 3352003 - 3352139
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3352003 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 3352102  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3352103 tagtcatctttttaggcatgacaaagggtggataatg 3352139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 6252112 - 6251976
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  6252112 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctgccttctaacacccacttaaaat 6252013  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6252012 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatg 6251976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 27457198 - 27457334
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27457198 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccactttaaat 27457297  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27457298 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 27457334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 31710422 - 31710286
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31710422 aatcgtttcaaacaagtcataatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaat 31710323  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31710322 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 31710286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 39824696 - 39824560
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39824696 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatgacatagttggtaattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 39824597  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39824596 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 39824560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 4015875 - 4016011
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4015875 aatcgtttcaagcaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacctacttaaaat 4015974  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4015975 tagtcatatttttaggcatgataaatggtggataatg 4016011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 11692148 - 11692284
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11692148 aatcgtttcaaacaagtcatattgcagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 11692247  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11692248 tagtcatctttttaggcatcacaaatggtggataatg 11692284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Original strand, 19398194 - 19398334
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  19398194 aatcatttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgtttctttgaactcatctttggtaccaaatctagcctctaacacccacttaaaat 19398293  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19398294 tagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgttct 19398334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 20079259 - 20079395
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20079259 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 20079358  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20079359 tagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatg 20079395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 416 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 42993654 - 42993522
Alignment:
Q  416 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 515  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42993654 gtttcaaacaattcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagt 42993555  T
Q  516 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  42993554 catctttttaggcatggtaaatggtggataatg 42993522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 416 - 548
Target Start/End: Original strand, 43166274 - 43166406
Alignment:
Q  416 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  43166274 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatctgactcataacacccacttaaaattagt 43166373  T
Q  516 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43166374 catctttttaggcatgacaaatgatggataatg 43166406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 416 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 1052669 - 1052541
Alignment:
Q  416 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1052669 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatccttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattact 1052570  T
Q  516 catctttttaggcatgacaaatggtggat 544  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1052569 catctttttaagcatggcaaatggtggat 1052541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 8689712 - 8689576
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8689712 aatcgtttcaaacaagtcataatgtagataacatagttggtaattgattccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 8689613  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8689612 tagtcatctttttaggcatggcaaatagtggataatg 8689576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Original strand, 27116100 - 27116240
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27116100 aatcattttaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacatccacttcaaat 27116199  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  27116200 tagtcatctttttaggcattacaaatcgtggataatgttct 27116240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 28078406 - 28078542
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28078406 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 28078505  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||| | ||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  28078506 tagtaaactaattaggcatgacaaatggtagataatg 28078542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 30208403 - 30208539
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  30208403 aatcatttcaaacaagttctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacctacttaaaat 30208502  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30208503 taatcatctttttaggcatgataaatggtggataatg 30208539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 450 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 6331479 - 6331381
Alignment:
Q  450 ggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6331479 ggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatg 6331381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 432 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 16752236 - 16752120
Alignment:
Q  432 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 531  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16752236 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggatcctaacatccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 16752137  T
Q  532 acaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||| ||||||    
T  16752136 acaaatggtgaataatg 16752120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 416 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 8695002 - 8694870
Alignment:
Q  416 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||  ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  8695002 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattgataattatttcattgaactcatctttagtaccaaatctggctcataatactcacttaaaattagt 8694903  T
Q  516 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  8694902 catgttcttaggcatgataaatggtggataatg 8694870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 11935585 - 11935450
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||| |||| ||||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  11935585 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgtttccttgatctcatctttga-accaaatgtggctcctaacactcacttaaaat 11935487  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11935486 tagccatctttttaggcataacaaatagtggataatg 11935450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 432 - 548
Target Start/End: Original strand, 26035367 - 26035483
Alignment:
Q  432 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 531  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  26035367 attgtagataccatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaatacccacttaaaatcagtcatctttttaggcacg 26035466  T
Q  532 acaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||    
T  26035467 acaaatggtggataatg 26035483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 432 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 445074 - 444962
Alignment:
Q  432 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 531  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  445074 attgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtatcaaatatgactcctaaaacccacttaaaatcagtcgtctttttaggcgtg 444975  T
Q  532 acaaatggtggat 544  Q
     ||||||||||||    
T  444974 gcaaatggtggat 444962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 27510111 - 27509982
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||| |   |||||||||    
T  27510111 aatcgtttcaaacaagtcctattgtaataagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaa------aactaa-aaggacttaaaat 27510019  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27510018 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 27509982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 54)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 33807781 - 33807917
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33807781 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 33807880  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33807881 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 33807917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 8882014 - 8882150
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8882014 aatcgtttcaaacaagtcctattctagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaat 8882113  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8882114 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 8882150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 42273942 - 42273806
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42273942 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 42273843  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42273842 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 42273806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 55517186 - 55517322
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55517186 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 55517285  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55517286 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 55517322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 412 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 49118751 - 49118616
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49118751 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 49118652  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49118651 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 49118616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 26017563 - 26017427
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26017563 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 26017464  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  26017463 tagtcatctttttaggcatgataaatagtggataatg 26017427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 28264783 - 28264647
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  28264783 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgtctcataacacccacttaaaat 28264684  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28264683 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 28264647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 32318093 - 32317953
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32318093 aatcatttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgtctcctaacacccacttaaaat 32317994  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32317993 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 32317953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 40988773 - 40988637
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40988773 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaat 40988674  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40988673 tagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatg 40988637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 4544986 - 4545122
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4544986 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttaaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 4545085  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4545086 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 4545122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 12196609 - 12196473
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12196609 aatcatttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 12196510  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12196509 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 12196473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Original strand, 23135007 - 23135147
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135007 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 23135106  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  23135107 tagtcatttttttaggcatgccaaatggtggctaatgttct 23135147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 31591215 - 31591080
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31591215 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 31591116  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31591115 tagtcat-tttttaggcgtgacaaatggtggataatg 31591080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 31973731 - 31973595
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31973731 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 31973632  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31973631 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 31973595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Original strand, 48551765 - 48551905
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48551765 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatggttggtaattgctttcttgaactcatctttggtacaaaatctgactcctaacacccacttaaaat 48551864  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48551865 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgttct 48551905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 48707734 - 48707870
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  48707734 aatcttttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccacttaaaat 48707833  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48707834 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 48707870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 44490459 - 44490324
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  44490459 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaagt 44490360  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44490359 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 44490324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 412 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 32118854 - 32118720
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32118854 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccccttaaaat 32118755  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 546  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32118754 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 32118720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 5227530 - 5227394
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||    
T  5227530 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctagtatccacttaaaat 5227431  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5227430 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 5227394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 11795155 - 11795291
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11795155 aatcgtttcaaacaagtcatattctagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 11795254  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11795255 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 11795291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 17847097 - 17847232
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17847097 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 17847196  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17847197 tagtcatc-ttttaggcatggcaaatggtggataatg 17847232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 28159954 - 28160090
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28159954 aatcatttcaaacaagtcttattgtagataccatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaat 28160053  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28160054 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 28160090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 28812288 - 28812423
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28812288 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaagtcatctttggtaccaaatctggctcctaaca-ccacttaaaat 28812386  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28812387 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 28812423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Original strand, 30467004 - 30467144
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  30467004 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaatttcttccttgaactcatctttggtaccaaatctcgctcctaacacccatttaaaat 30467103  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30467104 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgttct 30467144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 416 - 548
Target Start/End: Original strand, 19496107 - 19496239
Alignment:
Q  416 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19496107 gtttcaaacaagtcctattgtagataccatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggcgcctaacacccacttaaaattagt 19496206  T
Q  516 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19496207 catctttttaggcatgtcaaatggtggataatg 19496239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 24458632 - 24458768
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24458632 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcgtaacacccacttaaaat 24458731  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24458732 tagtcatctttttaggcatggcaaatggaggataatg 24458768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 30141109 - 30141245
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30141109 aatcgtttcaaacaagtcctattgttgatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatctggctcttaacacccacttaaaat 30141208  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  30141209 tagtcatctttttaggcattgcaaatgatggataatg 30141245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 33174021 - 33174157
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33174021 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagatttcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 33174120  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33174121 tagtcatctttttatgcatgacaaatggtggataatg 33174157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 35930179 - 35930044
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35930179 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccatgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 35930080  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35930079 tagtcatctttttaggcatgacaaa-ggtggataatg 35930044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 48149639 - 48149503
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  48149639 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctgacacccacttaaaat 48149540  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48149539 tactcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 48149503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 412 - 547
Target Start/End: Original strand, 39995168 - 39995303
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39995168 aatcgtttcaaacaagttctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaaaacccacttaaaat 39995267  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 547  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39995268 taatcatctttttaggcatggcaaatggtggataat 39995303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 412 - 550
Target Start/End: Original strand, 25734224 - 25734362
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25734224 aatcatttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttaattgaactcatctttcgtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 25734323  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgtt 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25734324 tagtcatctttttaggcatgacaaacggtggataatgtt 25734362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 2055418 - 2055282
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2055418 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttgataattgcttccttaaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaagt 2055319  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2055318 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 2055282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 14564936 - 14564800
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14564936 aatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatttttcgtaccaaatctggctcctaacacccagttaaaat 14564837  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  14564836 tagtcatctttttaggcatggcaaacggtggataatg 14564800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 23553204 - 23553069
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23553204 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcataattgttaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaaca-ccacttaaaat 23553106  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23553105 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 23553069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 15985150 - 15985014
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15985150 aatcgtttcaaacaagtcatattctagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctggctcctaacacctacttaaaat 15985051  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15985050 cagtaatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 15985014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 17993018 - 17993154
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| || |||||||||||  || ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17993018 aatcgtttcaaacaagtcctattgtaaatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatcttttctatcaaatttggctcttaacacccacttaaaat 17993117  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17993118 tagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatg 17993154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 37381986 - 37381850
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  37381986 aatcatttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatttttggtaccatatctggttcctaacacccacttaaaat 37381887  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37381886 tagtcatctttttagacatgacaaatggtggataatg 37381850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 50542355 - 50542491
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50542355 aatcgttttaaacaaatcttattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 50542454  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  50542455 taatcatctttttaggcatggtaaatggtggataatg 50542491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 413 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 10588719 - 10588584
Alignment:
Q  413 atcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaatt 512  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10588719 atcgtttcaaacaagtcgtattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaact 10588620  T
Q  513 agtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  |||||||    
T  10588619 agtcatctttttaggcatggtaaatggcagataatg 10588584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 50276139 - 50276272
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  50276139 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgattcctaacacccacttaaaat 50276238  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||   |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  50276239 tag---tctttttaggcatggcaaacggtggataatg 50276272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 9339124 - 9339263
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatc---tttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaa 508  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9339124 aatcatttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaa 9339223  T
Q  509 aattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  9339224 aattagtcatctttttatgcatgacaaatggtgaataatg 9339263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 22298658 - 22298521
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22298658 aatcgtttcaaacaagccctattgtagatagcataattggtaattgtttccttaaactcatctttgatatcaaatctggctcctaacacccacttaaaat 22298559  T
Q  512 tagtcatct-ttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22298558 tagtcatcttttttaggcatagcaaatggtggataatg 22298521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 432 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 24623268 - 24623152
Alignment:
Q  432 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 531  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  24623268 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagttatttttttaggcatg 24623169  T
Q  532 acaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||    
T  24623168 acaaatggtggataatg 24623152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 412 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 31208884 - 31208776
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31208884 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcccaacacccacttaaaat 31208785  T
Q  512 tagtcatct 520  Q
    |||||||||    
T  31208784 tagtcatct 31208776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 33693334 - 33693470
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  33693334 aatcgtttcaaacaagtcctgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgattcctaacacccacttaaaat 33693433  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    || |||||||||||| |||| |||||| | |||||||    
T  33693434 tattcatctttttagacatggcaaatgatagataatg 33693470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 39700185 - 39700049
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  39700185 aatcgtttcaaacaagtcttattatagataacataattggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcttaacactcacttaaaat 39700086  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  39700085 tagtcatctttttaggcatgacaaattgtgaataatg 39700049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 51371048 - 51371184
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  51371048 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaattcatctttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaat 51371147  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  51371148 tagtcatttttttagacatggcaaatggtgaataatg 51371184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 432 - 548
Target Start/End: Original strand, 19168816 - 19168932
Alignment:
Q  432 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 531  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19168816 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatttgactcataacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 19168915  T
Q  532 acaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||    
T  19168916 acaaatggtggataatg 19168932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 25730380 - 25730240
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  25730380 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgattccttgaactcatctttggcactaaatccgactcctaacatccacttaaaat 25730281  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  25730280 tagtcatctttttaggcatagcaaatagtggataatgttct 25730240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 471 - 548
Target Start/End: Original strand, 56555200 - 56555277
Alignment:
Q  471 atctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56555200 atctttggtaccaaatctggctcctgacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 56555277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 412 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 20534305 - 20534225
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggct 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20534305 aatcgtttcaaacaagtcctattgttgatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctggct 20534225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 432 - 536
Target Start/End: Original strand, 42549643 - 42549747
Alignment:
Q  432 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 531  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  42549643 attgtagataacatagttggtaattgcttcattgaacttatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaatcaatcatctttttaggcatg 42549742  T
Q  532 acaaa 536  Q
    |||||    
T  42549743 acaaa 42549747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 441
Target Start/End: Original strand, 56555166 - 56555195
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagata 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56555166 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagata 56555195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 37838437 - 37838297
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37838437 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 37838338  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37838337 tagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgttct 37838297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 16246194 - 16246330
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16246194 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 16246293  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16246294 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatg 16246330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 27328724 - 27328588
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27328724 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 27328625  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27328624 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 27328588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 40854749 - 40854613
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40854749 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacatccacttaaaat 40854650  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40854649 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 40854613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 921162 - 921026
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  921162 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 921063  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  921062 tagtcatctttttatgcatgacaaatggtggataatg 921026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 28650427 - 28650563
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28650427 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaatttcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 28650526  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28650527 tagtcatctttttagacatgacaaatggtggataatg 28650563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 34253282 - 34253146
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34253282 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaatat 34253183  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34253182 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 34253146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 417 - 548
Target Start/End: Original strand, 771981 - 772112
Alignment:
Q  417 tttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtc 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  771981 tttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtc 772080  T
Q  517 atctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  772081 atctttttaggcatggcaaatggtggataatg 772112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 11949427 - 11949563
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  11949427 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaatat 11949526  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11949527 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 11949563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 41500503 - 41500639
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41500503 aatcgtttcaaacaagtcctattgtacatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccgcttaaaat 41500602  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41500603 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 41500639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 547
Target Start/End: Original strand, 33865268 - 33865403
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33865268 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 33865367  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 547  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33865368 tagtcatttttttaggcatgacaaatggtggataat 33865403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 1106560 - 1106696
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1106560 aatcatttcaaataagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 1106659  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1106660 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatg 1106696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 7379103 - 7378967
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7379103 aatcgtttcaaacaagtcataatgtagatagaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 7379004  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7379003 tagtcctctttttaggcatgacaaatggtggataatg 7378967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 9276714 - 9276578
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9276714 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 9276615  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9276614 tagctatctttttatgcatgacaaatggtggataatg 9276578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 17134369 - 17134233
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  17134369 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaag 17134270  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  17134269 tagtcatctttttaggaatggcaaatgatggataatg 17134233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Original strand, 17484551 - 17484691
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  17484551 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatttgactcctaacaaccacttaaaat 17484650  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  17484651 tagtcatctttttaagcatggaaaatggtggataatgttct 17484691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 7297235 - 7297371
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattg-cttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaa 510  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7297235 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgtcttc-ttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaacacccacttaaaa 7297333  T
Q  511 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7297334 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 7297371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 416 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 2456146 - 2456014
Alignment:
Q  416 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  2456146 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttaactcctaacacccacttaaaattagt 2456047  T
Q  516 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2456046 catctttttaggcatgacaaatggtgaataatg 2456014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 416 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 36211182 - 36211050
Alignment:
Q  416 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 515  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36211182 gtttcaaacaagtcctattctagataacatagtttgtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattagt 36211083  T
Q  516 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36211082 catctttttaggcatggcaaatggtggataatg 36211050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 36444229 - 36444365
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  36444229 aatcgtttcaaacaagtcctatagtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcataacacctacttaaaat 36444328  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36444329 tagtcatctttttaagcatggcaaatggtggataatg 36444365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 38751188 - 38751052
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  38751188 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagtatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatgtggctcctaacatccacttaaaat 38751089  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38751088 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 38751052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 412 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 19180561 - 19180427
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19180561 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagtatagttagtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctc-taacacccacttaaaat 19180463  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19180462 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 19180427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 418 - 548
Target Start/End: Original strand, 3430631 - 3430761
Alignment:
Q  418 ttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtca 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3430631 ttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcataacacccacttaaaattagtca 3430730  T
Q  518 tctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  3430731 tctttttaggcatggcaaatggtgtataatg 3430761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 2057066 - 2056930
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2057066 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatccagctcctaacacccacttaaaat 2056967  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  2056966 tagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatg 2056930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 416 - 548
Target Start/End: Original strand, 2314980 - 2315112
Alignment:
Q  416 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 515  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2314980 gtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaattagt 2315079  T
Q  516 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  2315080 catctttttaggcatggtaaatggtggataatg 2315112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 540
Target Start/End: Original strand, 33106970 - 33107098
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33106970 aatcgtttcaaacgagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaat 33107069  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggt 540  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33107070 tagtcatctttttaggcatgaaaaatggt 33107098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 42630102 - 42629970
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42630102 aatcgtttcaaacaagtcctatcatagatagcataattgataattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaat 42630003  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggat 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42630002 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggat 42629970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 43249413 - 43249549
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43249413 aatcgtttcgaacaagtcctattgatgatagcatagttggtaattgtttccttgaatacatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 43249512  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43249513 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 43249549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 2094411 - 2094547
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  2094411 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttgatactaaatttggctccaaacacccacttaaaat 2094510  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2094511 tagtcatctttttaagcatggcaaatggtggataatg 2094547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 8899821 - 8899686
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  8899821 aatcgtttcaa-caagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccatgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaac 8899723  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8899722 tagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatg 8899686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 12759751 - 12759886
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  12759751 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttcgtaccaaatttgcctc-taacacccacttaaaat 12759849  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12759850 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 12759886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 416 - 548
Target Start/End: Original strand, 25087801 - 25087933
Alignment:
Q  416 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 515  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||  ||| |||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25087801 gtttcaaacaagtcttattgtatataacatagttgataattgcttccttgaactcatctctggtactaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 25087900  T
Q  516 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25087901 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 25087933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 416 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 29737884 - 29737752
Alignment:
Q  416 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||| |||||||||||    
T  29737884 gtttcaaacaagtcctattgtcgatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaagatccatttaaaattagt 29737785  T
Q  516 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29737784 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 29737752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 37732194 - 37732330
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||  |||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37732194 aatcgtttcaaacaagtcttattgtaaataacatagttggtaattgctttcttgaactcatttttggtatcaaatctgactcctaacacccacttaaaat 37732293  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  37732294 tagtcatctttttatgtatgacaaatggtggataatg 37732330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 45124259 - 45124123
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  45124259 aatcgtttcaaacaaatcttattgtagatagcatagttggtaattgtttccttaaactcatctttggtatcaaatcagactcttaacacccacttaaaat 45124160  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45124159 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 45124123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 432 - 548
Target Start/End: Original strand, 8396572 - 8396688
Alignment:
Q  432 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 531  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8396572 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaaaacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 8396671  T
Q  532 acaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||    
T  8396672 acaaatggtggataatg 8396688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 448 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 37654212 - 37654108
Alignment:
Q  448 ttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 547  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  37654212 ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaatcagtcatctttttaggcatgacaaatgatgaataat 37654113  T
Q  548 gttct 552  Q
    |||||    
T  37654112 gttct 37654108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 451 - 548
Target Start/End: Original strand, 41178059 - 41178156
Alignment:
Q  451 gtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  41178059 gtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatttttttaggcatggtaaatggtggataatg 41178156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 432 - 548
Target Start/End: Original strand, 19916008 - 19916124
Alignment:
Q  432 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 531  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||    
T  19916008 attgtagatagcatagttggtaattggttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaatatcaatcatctttttaggcttg 19916107  T
Q  532 acaaatggtggataatg 548  Q
    |||||| ||||||||||    
T  19916108 acaaattgtggataatg 19916124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 9331896 - 9331760
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||   ||  | ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||    
T  9331896 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagtattgttggtaattgcttcccagatattatcttaggtaccaaatttggctcctaacacccacctaagat 9331797  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9331796 tagctatctttttatgcatgacaaatggtggataatg 9331760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 412 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 14630754 - 14630663
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacaccca 503  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14630754 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacaccca 14630663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 412 - 501
Target Start/End: Original strand, 23671812 - 23671901
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacc 501  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  23671812 aatcgtttcaaacaagtcttattatagataacatggttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacc 23671901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 496 - 548
Target Start/End: Original strand, 23672958 - 23673010
Alignment:
Q  496 aacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23672958 aacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggaaaatg 23673010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 63)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 46825671 - 46825535
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46825671 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 46825572  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46825571 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 46825535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Original strand, 49094712 - 49094852
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49094712 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 49094811  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49094812 tagtcatctttttaggcataacaaatggtggataatgttct 49094852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 12143212 - 12143076
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12143212 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 12143113  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12143112 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 12143076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 23767415 - 23767551
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767415 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 23767514  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767515 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 23767551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 41106156 - 41106020
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41106156 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 41106057  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41106056 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 41106020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 7651802 - 7651666
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7651802 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttgataattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 7651703  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7651702 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 7651666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 19315780 - 19315644
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19315780 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 19315681  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19315680 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 19315644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 25988272 - 25988408
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25988272 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattggttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 25988371  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25988372 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 25988408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 28425364 - 28425500
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28425364 aatcgtttcaaacaagtcctattgcagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 28425463  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28425464 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 28425500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 36157679 - 36157814
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36157679 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattgg-aattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 36157777  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36157778 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 36157814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 38473627 - 38473763
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38473627 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaat 38473726  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38473727 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 38473763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 7553017 - 7553153
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7553017 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 7553116  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7553117 tagtcatctttttagccatgacaaatggtggataatg 7553153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Original strand, 8141487 - 8141627
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  8141487 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataatttgtaattgcttctttgaactcatctttagtaccaaatctgacttgtaacacccacttaaaat 8141586  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8141587 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 8141627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 49814440 - 49814304
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49814440 aatcgtttcaaataagtcatattctagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 49814341  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49814340 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 49814304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 7608767 - 7608903
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7608767 aatcgtttcaaacaagtcctattatagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatcttttgtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 7608866  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7608867 tagtcatgtttttaggcatgacaaatggtggataatg 7608903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 9962891 - 9962751
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  9962891 aatcgtttcaaacaagttctgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctagttcctaacacccacttaaaat 9962792  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9962791 tagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgttct 9962751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 18892469 - 18892333
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  18892469 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctggcttctaacacccactgaaaat 18892370  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18892369 tagtcatccttttaggaatgacaaatggtggataatg 18892333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 19274699 - 19274563
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19274699 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagctggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 19274600  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19274599 tagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatg 19274563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 26549528 - 26549392
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26549528 aatcgttttaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggttcctaacacccacttaaaat 26549429  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26549428 tagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatg 26549392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 33325867 - 33325731
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  33325867 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttaaactcatctttggtatcaaatctggcttctaagacccacttaaaat 33325768  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33325767 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 33325731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 33674157 - 33674021
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33674157 aatcgtgtcaaacaagtcctattgtagatagcatagctggtaattgcttccttgaactcatctttcgtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 33674058  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33674057 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 33674021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 46051590 - 46051454
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  46051590 aatcgtttcaaacaagtcctgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaac 46051491  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46051490 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 46051454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Original strand, 48669397 - 48669537
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  48669397 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtgattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccacttaaaat 48669496  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  48669497 tagtcatctttttaggcatgacaaataatggataatgttct 48669537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 412 - 550
Target Start/End: Original strand, 45350718 - 45350854
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45350718 aatcgtttcaaacaa--cctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgatctcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 45350815  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgtt 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45350816 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgtt 45350854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Original strand, 45670487 - 45670627
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcat-gcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaa 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  45670487 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagtttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgattcctaacacc-acttaaaa 45670585  T
Q  511 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45670586 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 45670627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 23228195 - 23228331
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  23228195 aatcgtttcaaacaagtactattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccatttaaaat 23228294  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23228295 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatg 23228331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 26070032 - 26069896
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26070032 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgtttccttgaactcatttttggtatcaaatccggctcctaacacccacttaaaat 26069933  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26069932 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 26069896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 34971220 - 34971080
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  34971220 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacatagttggtaattgtttctttgaactcatatttggtatcaaatctgactcctaacactcacttaaaat 34971121  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34971120 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgttct 34971080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 37217036 - 37216896
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  37217036 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaactctagctcataacacccacttaaaat 37216937  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  37216936 tagtcatctttttagacatggcaaatggtggataatgttct 37216896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 48802332 - 48802468
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  48802332 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatatggctcctaacacctacttaaaat 48802431  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  48802432 tagtcatctttgtaggcatgataaatggtggataatg 48802468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 414 - 548
Target Start/End: Original strand, 24204474 - 24204608
Alignment:
Q  414 tcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaatta 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  24204474 tcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcgtctttggtaccaaatctggctcctaatacccacttaaaatga 24204573  T
Q  514 gtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  24204574 gtcatctttttaggcatggcaaatgatggataatg 24204608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 413 - 550
Target Start/End: Original strand, 41982237 - 41982374
Alignment:
Q  413 atcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaatt 512  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  41982237 atcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttgataattacttctttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccatttaaaatt 41982336  T
Q  513 agtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgtt 550  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41982337 agtcatatttttaggcatgacaaatggtggataatgtt 41982374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Original strand, 9878785 - 9878925
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||| || ||||||||||||||||||||    
T  9878785 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagataaaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccatatcgggttcctaacacccacttaaaat 9878884  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9878885 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 9878925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 21965205 - 21965065
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21965205 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatgacataattggtaattgcttcattaaactcatctttggtaccaaatctgactccttacacccacttaaaat 21965106  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21965105 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtgtataatgttct 21965065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 36781173 - 36781309
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36781173 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaat 36781272  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  36781273 tagtcgtctttttgggcatggcaaatggtggataatg 36781309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 46095076 - 46095212
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  46095076 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttgatatcaaatctgtctcctaacatccacttaaaat 46095175  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  46095176 tagtcatctttttaaacatgacaaatggtggataatg 46095212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 50533523 - 50533387
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50533523 aatcgtttcaaacaagtcctattatagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacccacttaaaat 50533424  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  50533423 tagtcatctttttaggcatgtcaaattttggataatg 50533387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 50690083 - 50689947
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50690083 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 50689984  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  50689983 tagtcatctttttaggcatagcaaatgatggataatg 50689947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 52147133 - 52146997
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52147133 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtatatagcatagtttgtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatctggttcctaacacccacttaaaat 52147034  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52147033 tattcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 52146997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 5401010 - 5400876
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  5401010 aatcttttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggtttctaacatccacttaaaat 5400911  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 547  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5400910 tagtcatctttttaggcatg-caaatggtggataat 5400876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 16706010 - 16705874
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16706010 aatcgtttcaaacaagtcttattttagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcgcctaaaacccacttaaaat 16705911  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16705910 tagtcatctttttaggcatggaaaatggtggataatg 16705874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 52349925 - 52350061
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| || |||||||||||  || ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  52349925 aatcgtttcaaacaagtcctattgtaaatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatcttttctatcaaatttggctcttaacacccacttaaaat 52350024  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52350025 tagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatg 52350061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 17983899 - 17984035
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||    
T  17983899 aatcgtttcaaccaagtcctaatgtaaataacatagtttgtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctgattcataacacccacttaaaat 17983998  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17983999 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatg 17984035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Original strand, 18782090 - 18782230
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || || ||||||||||||||    
T  18782090 aatcatttcaaacaagtcatattctagatagcatagttgataattgcttatttgaactcatctttggtacaaaatctggttcatagcacccacttaaaat 18782189  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18782190 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgttct 18782230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 43396815 - 43396679
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||   ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43396815 aatcgtttcaaacaaatcctactgtagatagcagagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 43396716  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||    
T  43396715 tagtcatctttttaagcatagcaaatgatggataatg 43396679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 432 - 552
Target Start/End: Original strand, 48319067 - 48319187
Alignment:
Q  432 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 531  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  48319067 attgtatatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatt 48319166  T
Q  532 acaaatggtggataatgttct 552  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  48319167 acaaatggtggataatgttct 48319187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 52067652 - 52067788
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52067652 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatggcataatttgtaattgcttccttgaactcatcgttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 52067751  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52067752 tattcatctttttagggatgacaaatggtggataatg 52067788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 448 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 12964750 - 12964650
Alignment:
Q  448 ttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 547  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  12964750 ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatgttgtataat 12964651  T
Q  548 g 548  Q
    |    
T  12964650 g 12964650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 412 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 18917664 - 18917529
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||  |||||||||| ||||| | |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18917664 aatcgtttcaaacaaatcatattgtagatagcatatttaataattgcttccttgaatttatctttggtaccaaatatgactcctaacacccacttaaaat 18917565  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 547  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18917564 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataat 18917529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 431 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 9974963 - 9974842
Alignment:
Q  431 tattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcat 530  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9974963 tattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtactaaatatggctcgtaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcat 9974864  T
Q  531 gacaaatggtggataatgttct 552  Q
    |  |||||||||||||||||||    
T  9974863 ggtaaatggtggataatgttct 9974842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 40721483 - 40721346
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacaccc-acttaaaa 510  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| || |||||    
T  40721483 aatcgtttccaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgctttcttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaatacccaacctaaaa 40721384  T
Q  511 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40721383 ttaattatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 40721346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 6711580 - 6711444
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |  ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6711580 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagacattatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaat 6711481  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  6711480 tagccatctttttacacatggtaaatggtggataatg 6711444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 432 - 548
Target Start/End: Original strand, 33194672 - 33194788
Alignment:
Q  432 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 531  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33194672 attgtagatagcatagttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 33194771  T
Q  532 acaaatggtggataatg 548  Q
     | |||||||| |||||    
T  33194772 gcgaatggtggttaatg 33194788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 21929666 - 21929521
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatcttt-------ggtaacaaatctggctcctaacacccac 504  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||       |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  21929666 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttcatctttggtaccaaatctggctcctaaaacccac 21929567  T
Q  505 ttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||    
T  21929566 ttaaaattagtcatctttttag--atggcaaatggtggataatcttct 21929521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 432 - 548
Target Start/End: Original strand, 16506809 - 16506925
Alignment:
Q  432 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 531  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  16506809 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcaaccttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagccatctttttaagcatg 16506908  T
Q  532 acaaatggtggataatg 548  Q
     ||||||||||||||||    
T  16506909 gcaaatggtggataatg 16506925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 25800781 - 25800644
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctt----tggtaacaaatctggctcctaacacccactta 507  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    ||||| |||||||      |||||||||||||    
T  25800781 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatcttaatttggtaccaaatct------taacacccactta 25800689  T
Q  508 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25800688 aaattagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgttct 25800644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Original strand, 33714362 - 33714500
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||| |||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||| | ||    
T  33714362 aatcgtttcaaacaaatcctattgtagataacatagttgataattgtttccttgaactcatctttgataccaaatctgactcctaaca-ccactt-acat 33714459  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33714460 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatattct 33714500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 432 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 30281751 - 30281635
Alignment:
Q  432 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 531  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||    
T  30281751 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaataccagttatctttttaggcatg 30281652  T
Q  532 acaaatggtggataatg 548  Q
      |||||||||||||||    
T  30281651 taaaatggtggataatg 30281635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 412 - 512
Target Start/End: Original strand, 44978769 - 44978868
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  44978769 aatcgtttcaaacaagtcagaatgtagatagcataattgataattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatctggctcctaata-ccacttaaaat 44978867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 474 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 50099298 - 50099224
Alignment:
Q  474 tttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||| ||||| || ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50099298 tttggtaccaaatatgacttttaacatccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 50099224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 504 - 548
Target Start/End: Original strand, 44979281 - 44979325
Alignment:
Q  504 cttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44979281 cttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 44979325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 508 - 548
Target Start/End: Original strand, 32373650 - 32373690
Alignment:
Q  508 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32373650 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 32373690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 508 - 548
Target Start/End: Original strand, 17989864 - 17989904
Alignment:
Q  508 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17989864 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatagtgaataatg 17989904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 37933782 - 37933642
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37933782 aatcgtttcaaacaagtcttatcgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 37933683  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37933682 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 37933642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 412 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 15847252 - 15847117
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15847252 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 15847153  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 547  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15847152 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataat 15847117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 38107239 - 38107099
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38107239 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 38107140  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38107139 taatcatctttttaggcatgataaatggtggataatgttct 38107099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 513447 - 513312
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  513447 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 513348  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  513347 tagtcat-tttttaggcgtgacaaatggtggataatg 513312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 2533412 - 2533276
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2533412 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctccaaacacccacttaaaat 2533313  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2533312 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 2533276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 260117 - 259978
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  260117 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 260018  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  260017 tagtcat-tttttaggcatgacagattgtggataatgttct 259978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Original strand, 655804 - 655943
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  655804 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 655903  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  655904 tagtcat-tttttaggcatgacagattgtggataatgttct 655943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Original strand, 841539 - 841678
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  841539 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 841638  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  841639 tagtcat-tttttaggcatgacagattgtggataatgttct 841678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 3876048 - 3875912
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3876048 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactatatctggttcctaacacccacttaaaat 3875949  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3875948 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 3875912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 35443451 - 35443315
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35443451 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 35443352  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  35443351 tagttatctttttaggcatggcaaatagtggataatg 35443315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 36400071 - 36400207
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |    
T  36400071 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgccttctaacacccacttaaact 36400170  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36400171 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 36400207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 1293626 - 1293490
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  1293626 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggtttctaacacccacttaaaat 1293527  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1293526 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 1293490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 416 - 548
Target Start/End: Original strand, 9056343 - 9056475
Alignment:
Q  416 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  9056343 gtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctgactcctaacatccacttaaaattagt 9056442  T
Q  516 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9056443 catctttttaggcatgataaatggtggataatg 9056475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 28707447 - 28707583
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28707447 aatcgtttcaaacaaatcctattgtagatatcataattggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcataacacccacttaaaat 28707546  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28707547 tagtcatcttttaaggcatgacaaatggtggataatg 28707583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 35884431 - 35884567
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35884431 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcgtaacacccacttaaaat 35884530  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  35884531 tagtcatctttttaggcatggcaaatggaggataatg 35884567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 43806534 - 43806670
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43806534 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacactcacttaaaat 43806633  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  43806634 tagtcatctttttaggcatggcaaatgatggataatg 43806670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 412 - 537
Target Start/End: Original strand, 41536528 - 41536653
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41536528 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaatttatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 41536627  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaat 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  41536628 tagtcatctttttaggcatgacaaat 41536653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 440980 - 440840
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  440980 aatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttcgtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 440881  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    || |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  440880 tactcatctttttagacatggcaaacggtggataatgttct 440840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 22683989 - 22684125
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22683989 aatcatttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 22684088  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22684089 tagtcatctttttagccatgacaaatggtgaataatg 22684125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 38633711 - 38633847
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  38633711 aatcgtttcaaacaagttctaatgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgatttctaacacccacttaaaat 38633810  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38633811 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 38633847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Original strand, 40301894 - 40302034
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  40301894 aatcgtttcaaaaaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaatttatctttggtaccaaatctagctcctaacactcacttaaaat 40301993  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40301994 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 40302034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 38208893 - 38208754
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38208893 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgctaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 38208794  T
Q  512 tagtcat-ctttttaggcatgacaaatggtggataatgtt 550  Q
    ||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  38208793 tagtcatccattttagacatggcaaatggtggataatgtt 38208754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 412 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 13797228 - 13797098
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  13797228 aatcgtttcaaacaaatcctattgtatatagcatagttggtaattgcttctttgaactcat-tttggtatcaaatctggctcctaacatccacataaaat 13797130  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtgga 543  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13797129 tagtcatctttttaggtatgacaaatggtgga 13797098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 412 - 547
Target Start/End: Original strand, 28496356 - 28496490
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||    
T  28496356 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctag-ttctaatacccacttaaaat 28496454  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28496455 tagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataat 28496490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 4649290 - 4649150
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||    
T  4649290 aatcgtttcaaacaagtccaattgtagatagcataattggtaattgtttccttgaactcgtctttggtaccaaatctgacttccaacatccacttaaaat 4649191  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4649190 tagtcatttttttaggcatggcaaatggtggataatgttct 4649150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 24430572 - 24430708
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||    
T  24430572 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagtatagttgataattgttttattgaactcatctttggtaccaaatctcactactaacacccacttaaaat 24430671  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24430672 tagtcatctttttaggcatgacaaaaggtggataatg 24430708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 33651981 - 33651845
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||| ||| ||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33651981 aatcgtttcaaacaagtcctatcgtagatagcatagtttgtaattgtttccttgaactcatctttcataccaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 33651882  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  33651881 tagtcatctttttagacatgacaaacggtggataatg 33651845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 416 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 12010688 - 12010553
Alignment:
Q  416 gtttcaaacaagtcctattgtag---atagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaatt 512  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12010688 gtttcaaacaagtcctattgtagtagatagcatagttggtaattgttgccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaatt 12010589  T
Q  513 agtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12010588 agtcatctttttatgcatggcaaatggtggataatg 12010553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 432 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 7435006 - 7434890
Alignment:
Q  432 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 531  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  7435006 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattagtcatctttataggcttg 7434907  T
Q  532 acaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||    
T  7434906 acaaatggtggataatg 7434890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 432 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 23935353 - 23935237
Alignment:
Q  432 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 531  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23935353 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 23935254  T
Q  532 acaaatggtggataatg 548  Q
     ||||||||||||||||    
T  23935253 gcaaatggtggataatg 23935237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 412 - 536
Target Start/End: Original strand, 23972296 - 23972420
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  23972296 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctgactcctatcacccacttaaaat 23972395  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaa 536  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  23972396 tagtcatctttttagacatgacaaa 23972420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 416 - 547
Target Start/End: Original strand, 39513344 - 39513475
Alignment:
Q  416 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 515  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  39513344 gtttcaaataagtcctaatgtagataacatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaattagt 39513443  T
Q  516 catctttttaggcatgacaaatggtggataat 547  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  39513444 catctttttaggcatggcatatggtggataat 39513475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 432 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 6016325 - 6016209
Alignment:
Q  432 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 531  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6016325 attgtagatagcatagttggtaattgcttctttaaactcatctttgatactcaatttggctcctaacatccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 6016226  T
Q  532 acaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||    
T  6016225 acaaatggtggataatg 6016209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 42988228 - 42988363
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||| |||||||||| || |||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  42988228 aatcgtttcaaa-aagtcctattgtagataatatagttgataattgcttcatttaacttatatttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaat 42988326  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42988327 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatg 42988363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 36218782 - 36218917
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||  ||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  36218782 aatcgtttcaaacaagtcatgatgtagataatatagttgataattgcttctt-gaactcatctttggtaccaaatctgacttctagcacccacttaaaat 36218880  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36218881 tagccatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 36218917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 432 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 29485406 - 29485291
Alignment:
Q  432 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 531  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  29485406 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaatcagtcat-tttttaggcatg 29485308  T
Q  532 acaaatggtggataatg 548  Q
     |||||| |||||||||    
T  29485307 gcaaatgatggataatg 29485291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 474 - 548
Target Start/End: Original strand, 24193356 - 24193429
Alignment:
Q  474 tttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24193356 tttggtaccaaatctggctcctaacacc-acttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatg 24193429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 412 - 476
Target Start/End: Original strand, 24193131 - 24193195
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatcttt 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24193131 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatcttt 24193195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 487 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 8137239 - 8137180
Alignment:
Q  487 ctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 546  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  8137239 ctggctcctaacacctacttaaaattagtcatttttttaggcatagcaaatggtggataa 8137180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 45)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 1469494 - 1469630
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1469494 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgttaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 1469593  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1469594 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 1469630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 47281125 - 47281261
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47281125 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataccatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 47281224  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47281225 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 47281261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 33884459 - 33884319
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33884459 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 33884360  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33884359 tagccatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 33884319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 38427564 - 38427700
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38427564 aatcgtttcaaacaagtcctattatagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaat 38427663  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38427664 tagtcatctttttaggcatgacaaatggcggataatg 38427700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 44544549 - 44544413
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44544549 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaat 44544450  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44544449 tagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatg 44544413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 47219285 - 47219149
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47219285 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacatccacttaaaat 47219186  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47219185 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 47219149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 47294292 - 47294428
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47294292 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatcgttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatctggctcctaacacccacttataat 47294391  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47294392 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 47294428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 416 - 548
Target Start/End: Original strand, 8162717 - 8162849
Alignment:
Q  416 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8162717 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgttatcaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 8162816  T
Q  516 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8162817 catctttttaggcatgacaaattgtggataatg 8162849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 31684135 - 31684271
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31684135 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 31684234  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31684235 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 31684271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 35600123 - 35600259
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35600123 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaat 35600222  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35600223 tagttatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 35600259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Original strand, 37393999 - 37394139
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  37393999 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttgactcctaacacccagttaaaat 37394098  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37394099 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 37394139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 47272121 - 47271985
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47272121 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacccacttaaaat 47272022  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47272021 tagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataatg 47271985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 416 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 4923352 - 4923216
Alignment:
Q  416 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4923352 gtttcaaacaagtcctattgtggatagcatagttggtaattacttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaattagt 4923253  T
Q  516 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4923252 catctttttaggcatggcaaatggtggataatgttct 4923216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Original strand, 11050262 - 11050402
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  11050262 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatatttggtaattgcttccttgaattcatctttggtaccaaatctgcctcctaatacccacttaaaat 11050361  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  11050362 tagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgttct 11050402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 11476557 - 11476693
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11476557 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 11476656  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||    
T  11476657 tagtcatttttttaggcatggcgaatggtgggtaatg 11476693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 23842445 - 23842309
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23842445 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttcaaat 23842346  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  23842345 tagtcatctttttaggcatggcagatggtggataatg 23842309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 30798369 - 30798505
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30798369 aatcgtttcaaacaaatcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 30798468  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  30798469 tagtcatctttttaggcattgcaaatgatggataatg 30798505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 30876399 - 30876263
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30876399 aatcgtttcaaacaagtgctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatttttggtaccaaattgggctcctaacacccacttaaaat 30876300  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30876299 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 30876263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 40851414 - 40851278
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40851414 aatcgtttcaaacaagtcctattgtaggtagaatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 40851315  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40851314 tagtcatctttttaggcacgacaaatggtggataatg 40851278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 412 - 539
Target Start/End: Original strand, 2960641 - 2960768
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2960641 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 2960740  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatgg 539  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2960741 tagtcatctttttaggcatggcaaatgg 2960768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 43752777 - 43752913
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  43752777 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctgactcctaacatccacttaaaat 43752876  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  43752877 tagtcatcttttgaggcaggacaaatggtggataatg 43752913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 27364340 - 27364476
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27364340 aatcgtttcaaacagatcctattgtagataacatagttggtaattacttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 27364439  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27364440 tagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 27364476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 41113517 - 41113381
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41113517 aatcatttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 41113418  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||    
T  41113417 tagtcatctttttagacatggcaaatgatgaataatg 41113381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 42979339 - 42979475
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  42979339 aatcgtttcaaacaagtcctactgtagataacatagttggtaattgcttcgttgaactcatctttgatatcaaatctgactcctaacatccacttaaaat 42979438  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42979439 tagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatg 42979475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 43968260 - 43968396
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  43968260 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcgtagttggtaattgcttccttgaactcatctttgatatcaaatttggctcataatacccacttaaaat 43968359  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43968360 tagtcatctttataggcatgacaaatggtggataatg 43968396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 45723492 - 45723628
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45723492 aatcgtttcaaacaaatcatattgtagatagcataattagtaattgttttcttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 45723591  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45723592 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 45723628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 48628945 - 48628809
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||| ||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48628945 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcattttttgcaccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 48628846  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48628845 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 48628809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 412 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 221415 - 221298
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  221415 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 221316  T
Q  512 tagtcatctttttaggca 529  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  221315 tagtcttctttttaggca 221298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 412 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 7336199 - 7336065
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7336199 aatcgtttcaaaca-gttctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatcattgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 7336101  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 547  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7336100 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataat 7336065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 412 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 29248482 - 29248347
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29248482 aatcatttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgattccttgaactcatctttggcatcaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 29248383  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 547  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  29248382 tagtcatctttttaggcatggcaaattgtggataat 29248347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 41139409 - 41139549
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgc----ttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccactta 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  41139409 aatcgtttcaaacaagtcctattgtaaatagcatatatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacccgctta 41139508  T
Q  508 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41139509 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatg 41139549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 416 - 551
Target Start/End: Original strand, 44800415 - 44800550
Alignment:
Q  416 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 515  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44800415 gtttcaaacaagtcctgttgtagataacatagttggtaattgtttcattgaactcatctttggtaccaaatatggttcctaacacccacttaaaattagt 44800514  T
Q  516 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgttc 551  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  44800515 catctttttaggcatgatatatggtggataatgttc 44800550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 432 - 550
Target Start/End: Original strand, 37354284 - 37354402
Alignment:
Q  432 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 531  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37354284 attgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatttggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 37354383  T
Q  532 acaaatggtggataatgtt 550  Q
     ||||||||||||||||||    
T  37354384 gcaaatggtggataatgtt 37354402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 30971942 - 30972078
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30971942 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatggcatagttggtaattacttccttaaacccatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 30972041  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30972042 tagtcatctttttaagcatgacaaattgtggataatg 30972078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 416 - 548
Target Start/End: Original strand, 47579091 - 47579224
Alignment:
Q  416 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaatt-gcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattag 514  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  47579091 gtttcagacaagtcctattatagatagcataattggtaatttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaattaa 47579190  T
Q  515 tcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47579191 ccatctttttaggaatgacaaatggtggataatg 47579224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 432 - 548
Target Start/End: Original strand, 3797544 - 3797660
Alignment:
Q  432 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 531  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3797544 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 3797643  T
Q  532 acaaatggtggataatg 548  Q
      |||||||||||||||    
T  3797644 ttaaatggtggataatg 3797660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 18353284 - 18353144
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  18353284 aatcgtttcaaacaagtcctaaggtagatagcatagttggtaattgttttcttgaactcatctttgataccaaatctgactcctaacacctaattaaaat 18353185  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  18353184 tagtcatctttttagacatgataaatggtggataatgttct 18353144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 47120133 - 47119995
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgc--ttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaa 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  47120133 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagagagcatatagttggtaattgctttcttgaactcatatttggtaccaaatatgactcctaacacccacttaaa 47120034  T
Q  510 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47120033 attagttatctttttaggcatgataaatggtggataatg 47119995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 432 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 27774228 - 27774112
Alignment:
Q  432 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 531  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27774228 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcaaccttggtaccaaatctggctcctaaaacccacttaaaatcagccatctttttaggcatg 27774129  T
Q  532 acaaatggtggataatg 548  Q
     ||||||||||||||||    
T  27774128 gcaaatggtggataatg 27774112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 463 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 40521007 - 40520922
Alignment:
Q  463 ttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  40521007 ttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttagccatggcaaatggtggataatg 40520922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 492 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 39034122 - 39034066
Alignment:
Q  492 tcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39034122 tcctaacgcccacttaaaattaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 39034066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 412 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 42888989 - 42888940
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttc 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  42888989 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttc 42888940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 509 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 43025155 - 43025119
Alignment:
Q  509 aattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggata 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43025155 aattagtcatctttttaggcatgacaaatgatggata 43025119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 501 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 12583352 - 12583313
Alignment:
Q  501 ccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggt 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12583352 ccacttaaaattagtcatctttttacgcatgaaaaatggt 12583313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 503 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 29739829 - 29739785
Alignment:
Q  503 acttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  29739829 acttaaaattagtcatc-ttttaggcatggtaaatggtggataatg 29739785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 54)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 1687791 - 1687655
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1687791 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 1687692  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1687691 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 1687655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Original strand, 35346472 - 35346612
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35346472 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatctggctcctaacacccacttaaaat 35346571  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35346572 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 35346612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 1017184 - 1017048
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1017184 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgtctcataacacccacttaaaat 1017085  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1017084 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 1017048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Original strand, 10618481 - 10618621
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10618481 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatgacataattggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatctgactcctaacacccacttaaaat 10618580  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10618581 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 10618621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 20086315 - 20086451
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20086315 aatcgtttcaaacaagtcctattatagatagcatacttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 20086414  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20086415 tagtcatctttttaggcatggaaaatggtggataatg 20086451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 20813442 - 20813578
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20813442 aatcgtttcaaacaagtcataatgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 20813541  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20813542 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 20813578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 21564636 - 21564500
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21564636 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatatggctcctaacacccacttaaaat 21564537  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21564536 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 21564500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 33151836 - 33151700
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33151836 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 33151737  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33151736 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 33151700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 21656658 - 21656522
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21656658 aatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 21656559  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21656558 tagtcacctttttaggcatgataaatggtggataatg 21656522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 21890310 - 21890170
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21890310 aatcgtttcaaacaagtcctattatagataacatatttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaacacccacttaaaat 21890211  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21890210 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatattct 21890170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 416 - 548
Target Start/End: Original strand, 36314977 - 36315109
Alignment:
Q  416 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36314977 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtatcaaatctggctcttaacacccacttaaaattagt 36315076  T
Q  516 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36315077 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 36315109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 38446616 - 38446480
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38446616 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 38446517  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  38446516 tagtcatctttttaggcatgacaaatagtagataatg 38446480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 50287706 - 50287570
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50287706 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattaaactcatatttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 50287607  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50287606 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 50287570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 547
Target Start/End: Original strand, 20760072 - 20760207
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  20760072 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccacttaaaat 20760171  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20760172 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 20760207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 42017013 - 42016878
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42017013 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 42016914  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42016913 tagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataat 42016878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 31122802 - 31122666
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  31122802 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaagacccgcttaaaat 31122703  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31122702 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 31122666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Original strand, 32650821 - 32650961
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32650821 aatcatttcaaacaagttctattatagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 32650920  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32650921 tagtcatctttctaggcatggcaaatggtggataatgttct 32650961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 412 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 26455722 - 26455588
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  26455722 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 26455623  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 546  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26455622 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 26455588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 3697286 - 3697150
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3697286 aatcctttcaaacaagtcctattgtagatagtatagttggtaattgcttcattgaattcatctttggtaccaaatctcgctcctaacacccacttaaaat 3697187  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3697186 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 3697150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 416 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 19664677 - 19664545
Alignment:
Q  416 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  19664677 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgactcataacatccacttaaaattagt 19664578  T
Q  516 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19664577 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 19664545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 416 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 41251022 - 41250890
Alignment:
Q  416 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 515  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41251022 gtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaattagt 41250923  T
Q  516 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41250922 catctttttaggcatggcaaatggtggataatg 41250890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 42107100 - 42107236
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42107100 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagtatagttggtaattacttccttgaactcatctttgacaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 42107199  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42107200 tagtcatctttttaggcatgtcaaatggtggataatg 42107236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 47329176 - 47329312
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47329176 aatcgtttccaacaagtcatatcgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 47329275  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  47329276 tagtcatctttttaggtatggcaaatggtggataatg 47329312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 51562302 - 51562166
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51562302 aatcgtttcaaacaagttctaatgtagataacatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 51562203  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51562202 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 51562166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 417 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 22852131 - 22852000
Alignment:
Q  417 tttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtc 516  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22852131 tttcaaataagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtc 22852032  T
Q  517 atctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22852031 atctgtttaggcatgacaaatggtggataatg 22852000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 412 - 547
Target Start/End: Original strand, 35608132 - 35608267
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  35608132 aatcgtttcaaataagtcctattgtagatagcataattggtaattggttccttgaactcatctttggtaccaaatcggactcctaacacccacttaaact 35608231  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35608232 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 35608267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 419 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 12748524 - 12748395
Alignment:
Q  419 tcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcat 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  12748524 tcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgttttctaacacccacttaaaattagtcat 12748425  T
Q  519 ctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12748424 ctttttaggcatggcaaatggtggataatg 12748395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 20913755 - 20913891
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  20913755 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacatccacttaaaat 20913854  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  20913855 tagtcatctttttaggcatggcgaatggtgaataatg 20913891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 20921873 - 20922009
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  20921873 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacatccacttaaaat 20921972  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  20921973 tagtcatctttttaggcatggcgaatggtgaataatg 20922009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 29677616 - 29677480
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||  || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29677616 aatcgtttcaaacaggtcctatcgtagatatcatagtttgtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccatttaaaat 29677517  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29677516 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 29677480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 37248096 - 37247960
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37248096 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 37247997  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| || ||||||    
T  37247996 tagtcatcttttcatgcatgacaaatgatgaataatg 37247960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Original strand, 40922166 - 40922306
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40922166 aatcgtttcaaacaagtcgtattgtagatagcatagttggtaattacttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaat 40922265  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    |||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  40922266 tagtaatttttttaggcatggaaaatggtggataatgttct 40922306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 44798407 - 44798272
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44798407 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacccacttaaaat 44798308  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44798307 tactcat-tttttaggcatgtcaaatggtggataatg 44798272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 52821050 - 52821186
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52821050 aatcgttttaaacaagtcctgttgtagataacatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtagtaaaactggctcctaacacccacttaaaat 52821149  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  52821150 tagtcatctttttaggcataacaaatgatggataatg 52821186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 448 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 19268625 - 19268525
Alignment:
Q  448 ttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 547  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19268625 ttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 19268526  T
Q  548 g 548  Q
    |    
T  19268525 g 19268525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 48651388 - 48651252
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48651388 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatctttgataccaaatctggcttctaacacccacttaaaat 48651289  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48651288 taatcgtctttttaggcatggcaaatggtggataatg 48651252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 53925980 - 53926116
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  53925980 aatcatttcaaataagtcatattgtagatagtatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatatgactcctaacacccacttaaaat 53926079  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53926080 tagtcatctttttaagcatgacaaatggtggataatg 53926116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 1448736 - 1448869
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||| ||||||||||||   || |||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1448736 aatcgtttcaaagaagtcctattgt---taccatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaat 1448832  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1448833 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 1448869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 27070740 - 27070876
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27070740 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgcctcctaacactcacttaaaat 27070839  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  27070840 tagtcatcttttcagacattataaatggtggataatg 27070876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 53196154 - 53196018
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53196154 aatcgtttcaaagaagtcttattgtagataacatagttggtaattatttccttgaactcatctttggtaccaaatctcgctcctaacacccacttaaaat 53196055  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53196054 tagttatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 53196018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 416 - 548
Target Start/End: Original strand, 55164120 - 55164252
Alignment:
Q  416 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 515  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55164120 gtttcaaataagtcatattgtagatagcatagttgctaattgcttccttgaactcatctttgatatcaaatctggctcctaacacctacttaaaattagt 55164219  T
Q  516 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  55164220 catctttttaggcatgataaatagtggataatg 55164252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 45380261 - 45380397
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcat-gcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaa 510  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  45380261 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagtttgataattgcttctttaaactcatctttggtaccaaatctggctcataaca-ccacttaaaa 45380359  T
Q  511 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  45380360 ttagtcatctttttatgcatggtaaatggtggataatg 45380397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 432 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 50977984 - 50977868
Alignment:
Q  432 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 531  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  50977984 attgtagatagcatagttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacgcccacttaaaatcagtcatgtttttaggcatg 50977885  T
Q  532 acaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||    
T  50977884 acaaatggtggataatg 50977868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 432 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 51081116 - 51081000
Alignment:
Q  432 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 531  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  51081116 attgtagatagcatagttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacgcccacttaaaatcagtcatgtttttaggcatg 51081017  T
Q  532 acaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||    
T  51081016 acaaatggtggataatg 51081000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 432 - 548
Target Start/End: Original strand, 51475267 - 51475383
Alignment:
Q  432 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 531  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51475267 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgcctcataacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 51475366  T
Q  532 acaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||    
T  51475367 acaaatggtggataatg 51475383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 39069866 - 39069730
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||  ||| |||||| ||| || |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39069866 aatcgtttcaaacaagtcatattgttaatagcatagttgataattgtttcctttaacttatctttggtaccaaatctggctcttaacacccacttaaaat 39069767  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  39069766 tagtcatcttttcatgcatggcaaatggtggataatg 39069730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 452 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 28699785 - 28699689
Alignment:
Q  452 taattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28699785 taattgcttccttgaactcatctttggcaccaaatctgactcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 28699689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 33473240 - 33473376
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||||  | |||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  33473240 aatcgtttcaaacaagttttattgtagataacatagttggtaattgtttccttgattttatctttggtaccaaatctggtttctaacacgcacttaaaat 33473339  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  33473340 tagtcatctttttagtcatgataaatggtggataatg 33473376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 432 - 548
Target Start/End: Original strand, 50364908 - 50365024
Alignment:
Q  432 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 531  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  50364908 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacactcacttaaaatcagtaatctttttaggcatg 50365007  T
Q  532 acaaatggtggataatg 548  Q
     |||||||||| |||||    
T  50365008 gcaaatggtgggtaatg 50365024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 416 - 537
Target Start/End: Original strand, 38924003 - 38924124
Alignment:
Q  416 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 515  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||  | ||||||||| ||||||||||||| |    
T  38924003 gtttcaaacaagtcctatcgtagataaaatagttggtaattgcttcgttgaacttatctttggtaccaaattggactcctaacatccacttaaaattaat 38924102  T
Q  516 catctttttaggcatgacaaat 537  Q
    ||||| |||| |||||||||||    
T  38924103 catctctttaagcatgacaaat 38924124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 475 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 44152777 - 44152704
Alignment:
Q  475 ttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44152777 ttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 44152704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 432 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 34019580 - 34019464
Alignment:
Q  432 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 531  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||  |||||||||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  34019580 attgtagatagcatagttgataattgcttacttgaactcactgttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaatcagccatatttttaggcatg 34019481  T
Q  532 acaaatggtggataatg 548  Q
     ||||||||||||||||    
T  34019480 tcaaatggtggataatg 34019464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 488 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 47473294 - 47473234
Alignment:
Q  488 tggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47473294 tggctcctaacatccacttaaaattagccatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 47473234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 448 - 521
Target Start/End: Original strand, 42641215 - 42641288
Alignment:
Q  448 ttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 521  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  42641215 ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaagtctgcctcctaacacccacttaaaatcaatcatctt 42641288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1986 (Bit Score: 113; Significance: 6e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1986
Description:

Target: scaffold1986; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 254 - 118
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcatagtcggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 155  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  154 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 113; Significance: 6e-57; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 6503858 - 6503722
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6503858 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaacccatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 6503759  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6503758 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 6503722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 17943176 - 17943036
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17943176 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcataattggtaattgcttccttaaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 17943077  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17943076 tagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgttct 17943036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 30379157 - 30379017
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30379157 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaat 30379058  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  30379057 tagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgttct 30379017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 416 - 548
Target Start/End: Original strand, 1915348 - 1915480
Alignment:
Q  416 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1915348 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaattaat 1915447  T
Q  516 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1915448 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 1915480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 3408329 - 3408193
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3408329 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagtatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 3408230  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3408229 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 3408193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 10256377 - 10256241
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10256377 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaat 10256278  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10256277 tagtcatctttttaggcattgcaaatggtggataatg 10256241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Original strand, 26393010 - 26393150
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26393010 aatcgtttcaaaaaacttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaat 26393109  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26393110 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 26393150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 2390405 - 2390269
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  2390405 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatagctcctaacacccacttataat 2390306  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2390305 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 2390269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 2707599 - 2707463
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2707599 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcgtctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaat 2707500  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2707499 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 2707463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 8178250 - 8178386
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8178250 aatcgtttcaaacatgtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 8178349  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8178350 tagtcatctttttaagcatggcaaatggtggataatg 8178386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 12626776 - 12626640
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12626776 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagaatagttggtaattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 12626677  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12626676 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 12626640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Original strand, 17428273 - 17428413
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17428273 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacatccacttaaaat 17428372  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17428373 tagtcatctttttaggcatgacaaacggtgaataatgttct 17428413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 29050412 - 29050276
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29050412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 29050313  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||    
T  29050312 tagtcatttttttaggcatggcgaatggtgggtaatg 29050276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 9382659 - 9382523
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9382659 aatcgtttcaaacaagtcctgatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 9382560  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9382559 tagtcatctttttaagcatgacaaatggtggataatg 9382523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 11134014 - 11133877
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttc-tttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaa 510  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11134014 aatcgtttcaaacaagtcctatcgtagatagcatagatggtaattgcttcctttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 11133915  T
Q  511 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  11133914 ttagtcatctttttagacataacaaatgatggataatg 11133877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 1077377 - 1077241
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1077377 aatcgtttcaaataagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggttcctaacacccacttaaaat 1077278  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1077277 taatcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 1077241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 26230933 - 26231069
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||  |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26230933 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtaaataacatagttggtagtttcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaat 26231032  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26231033 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 26231069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 546
Target Start/End: Original strand, 3258808 - 3258942
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcat-gcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaa 510  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3258808 aatcgtttcaaacaagttctattgtagataccatagtttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaaca-ccacttaaaa 3258906  T
Q  511 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 546  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3258907 ttagtcatctttttatgcatgacaaatggtggataa 3258942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 412 - 541
Target Start/End: Original strand, 2598100 - 2598229
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2598100 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgctttattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 2598199  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtg 541  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  2598200 tactcatctttttaggcatggcaaatggtg 2598229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 16193450 - 16193310
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||  ||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16193450 aatcgtttcaaacaagttctaatgcagataaaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 16193351  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16193350 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgttct 16193310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 431 - 552
Target Start/End: Original strand, 35223919 - 35224040
Alignment:
Q  431 tattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcat 530  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35223919 tattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctagctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcat 35224018  T
Q  531 gacaaatggtggataatgttct 552  Q
    | ||||| ||| ||| ||||||    
T  35224019 gtcaaattgtgtatattgttct 35224040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 412 - 550
Target Start/End: Original strand, 26196322 - 26196460
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcat-gcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaa 510  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  26196322 aatcggttcaaccaagtcctattgtagataacatagtttggtaattgcttccgtgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacaac-acttaaaa 26196420  T
Q  511 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgtt 550  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26196421 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgtt 26196460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 432 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 26936727 - 26936612
Alignment:
Q  432 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 531  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26936727 attgtagatagcatagttgataattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatccggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 26936628  T
Q  532 acaaatggtggataat 547  Q
    ||||||||||||||||    
T  26936627 acaaatggtggataat 26936612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 412 - 537
Target Start/End: Original strand, 6785102 - 6785224
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||   |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6785102 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacataattggt---tgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 6785198  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaat 537  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||    
T  6785199 tagtcatctttttagtcatgtcaaat 6785224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 412 - 550
Target Start/End: Original strand, 25820550 - 25820688
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||  ||| ||||||||| |||||||    
T  25820550 aatcgtttcaaacaattcctatcgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatgtttggtaccaaatctaactcataacacccatttaaaat 25820649  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgtt 550  Q
    |||||||  |||||| |||| |||||  |||||||||||    
T  25820650 tagtcataattttagtcatgtcaaattatggataatgtt 25820688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Original strand, 10931149 - 10931292
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  10931149 aatcgtatcaaacaagtcctaatgtggatagcatagttg-taattgttttcttgaactcatctttggtaccaaatctgacttctaacacccgcttaaaat 10931247  T
Q  512 tagtcatctttttag----gcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    |||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||    
T  10931248 tagtcatctttttaggcatgcatgagaaatggtggataatgttct 10931292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 412 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 31376057 - 31375971
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaac 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  31376057 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgttaattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatctggctcctaac 31375971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 412 - 469
Target Start/End: Original strand, 12612972 - 12613029
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaact 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  12612972 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaact 12613029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 412 - 490
Target Start/End: Original strand, 12612849 - 12612927
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctgg 490  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||   || ||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  12612849 aatcatttcaaacaagtcctattgtagatagcaaagttagtacttgcttcattgaactcatctttgctaccaaatctgg 12612927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 110; Significance: 4e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 219026 - 218889
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaaca-cccacttaaaa 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  219026 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacaccccacttaaaa 218927  T
Q  511 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  218926 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 218889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0693 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0693
Description:

Target: scaffold0693; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 412 - 550
Target Start/End: Original strand, 5028 - 5166
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  5028 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgttttcttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacaccctcttaaaat 5127  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgtt 550  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5128 tagtcatctttttagacatgacaaatggtggataatgtt 5166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0727 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0727
Description:

Target: scaffold0727; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 5325 - 5190
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5325 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcataattgttaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaaca-ccacttaaaat 5227  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5226 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 5190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Original strand, 252439 - 252575
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  252439 aatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatttttcgtaccaaatctggctcctaacacccagttaaaat 252538  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  252539 tagtcatctttttaggcatggcaaacggtggataatg 252575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 412 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 48102 - 47967
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||  |||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48102 aatcgttttaaacaagtccgattgtatatcacatagttggtaattgcttccttgaactcacctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaat 48003  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48002 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 47967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 13235 - 13095
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  13235 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcataattgataattccttccttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaatatccacttaaaat 13136  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  13135 tattcatctttttaggcatggcaaatgatggataatgttct 13095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 412 - 552
Target Start/End: Original strand, 59609 - 59749
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  59609 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcataattgataattccttccttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaatatccacttaaaat 59708  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 552  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  59709 tattcatctttttaggcatggcaaatgatggataatgttct 59749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 412 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 11498 - 11360
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 511  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||| || |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11498 aatcgttttaaataagacctattgtaggtagcatagttggtaattgcttccttaaacttatctatggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 11399  T
Q  512 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgtt 550  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11398 tagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgtt 11360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0542 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0542
Description:

Target: scaffold0542; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 432 - 548
Target Start/End: Original strand, 1994 - 2110
Alignment:
Q  432 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 531  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  1994 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacctacttaaaatcagtcatcttattaggcatg 2093  T
Q  532 acaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||    
T  2094 acaaatggtggataatg 2110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1562 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1562
Description:

Target: scaffold1562; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 412 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 679 - 599
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggct 492  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  679 aatcgtttcaaacaagtcctaatgttaatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggct 599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1158 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1158
Description:

Target: scaffold1158; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 412 - 492
Target Start/End: Original strand, 1914 - 1994
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggct 492  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1914 aatcgtttcaaacaagtcctaatgttaatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggct 1994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0952 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0952
Description:

Target: scaffold0952; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 412 - 492
Target Start/End: Original strand, 3372 - 3452
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggct 492  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3372 aatcgtttcaaataagtcctaatgttgatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggct 3452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0717 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0717
Description:

Target: scaffold0717; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 412 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 1957 - 1877
Alignment:
Q  412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggct 492  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  1957 aatcgtttcaaacaagtcctaatgttgatagcatagttgataattgcttccttgacctcatctttggtaccaaatctggct 1877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 499 - 548
Target Start/End: Original strand, 289 - 338
Alignment:
Q  499 acccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  289 acccacttaaaattattcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 502 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 19831 - 19785
Alignment:
Q  502 cacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19831 cacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatg 19785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University