View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21068_low_4 (Length: 572)

Name: NF21068_low_4
Description: NF21068
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21068_low_4
NF21068_low_4
[»] chr6 (93 HSPs)
chr6 (1-432)||(26885414-26885845)
chr6 (3-373)||(26657311-26657678)
chr6 (3-373)||(26763282-26763649)
chr6 (8-176)||(27215806-27215974)
chr6 (1-338)||(27680297-27680631)
chr6 (1-335)||(26803793-26804124)
chr6 (1-338)||(28787585-28787922)
chr6 (1-338)||(28793706-28794043)
chr6 (1-176)||(31285906-31286081)
chr6 (1-335)||(27603211-27603539)
chr6 (8-176)||(26144222-26144390)
chr6 (222-373)||(25075432-25075583)
chr6 (9-176)||(27426272-27426439)
chr6 (9-176)||(27529964-27530131)
chr6 (8-176)||(26057276-26057444)
chr6 (8-176)||(26077246-26077414)
chr6 (1-176)||(26647826-26648001)
chr6 (1-176)||(26753794-26753969)
chr6 (1-183)||(27717152-27717334)
chr6 (8-176)||(25512245-25512413)
chr6 (8-176)||(25581076-25581244)
chr6 (1-338)||(25491820-25492154)
chr6 (8-176)||(25484413-25484581)
chr6 (8-176)||(26862934-26863102)
chr6 (1-176)||(26624618-26624793)
chr6 (1-176)||(26730595-26730770)
chr6 (7-186)||(26938382-26938561)
chr6 (1-149)||(27704941-27705089)
chr6 (222-373)||(26850277-26850428)
chr6 (222-348)||(26637193-26637319)
chr6 (222-348)||(26743159-26743285)
chr6 (218-338)||(26624811-26624931)
chr6 (218-338)||(26730788-26730908)
chr6 (1-181)||(27697241-27697421)
chr6 (1-176)||(26825166-26825341)
chr6 (228-338)||(27609633-27609743)
chr6 (228-338)||(27717012-27717122)
chr6 (221-326)||(27697114-27697219)
chr6 (221-373)||(26951295-26951447)
chr6 (221-369)||(26960677-26960825)
chr6 (1-176)||(27609780-27609955)
chr6 (209-338)||(26648010-26648139)
chr6 (209-338)||(26753978-26754107)
chr6 (222-338)||(27591528-27591644)
chr6 (225-373)||(27663681-27663829)
chr6 (221-340)||(2186369-2186488)
chr6 (221-373)||(26863123-26863279)
chr6 (227-338)||(31286114-31286225)
chr6 (220-334)||(27704780-27704894)
chr6 (225-373)||(26978936-26979084)
chr6 (222-338)||(27676127-27676243)
chr6 (9-186)||(29842642-29842819)
chr6 (222-338)||(26813102-26813218)
chr6 (220-352)||(27529806-27529938)
chr6 (220-326)||(25484607-25484713)
chr6 (220-338)||(26144416-26144534)
chr6 (1-143)||(27676313-27676455)
chr6 (503-556)||(26885918-26885971)
chr6 (1-130)||(28296446-28296575)
chr6 (1-130)||(28515498-28515627)
chr6 (220-338)||(25546531-25546649)
chr6 (220-338)||(26057470-26057588)
chr6 (220-338)||(26077440-26077558)
chr6 (1-130)||(27591727-27591856)
chr6 (1-186)||(27663865-27664049)
chr6 (1-130)||(28326825-28326954)
chr6 (1-130)||(28504461-28504590)
chr6 (9-186)||(29827341-29827518)
chr6 (220-312)||(28141089-28141181)
chr6 (6-130)||(28244147-28244271)
chr6 (223-326)||(25581273-25581376)
chr6 (221-312)||(29827541-29827632)
chr6 (1-186)||(2186173-2186358)
chr6 (220-326)||(25512439-25512545)
chr6 (227-373)||(26938581-26938727)
chr6 (220-338)||(29673528-29673646)
chr6 (1-130)||(28182456-28182585)
chr6 (220-373)||(26825376-26825533)
chr6 (26-127)||(28097152-28097253)
chr6 (1-130)||(28186741-28186870)
chr6 (221-312)||(29842528-29842619)
chr6 (9-143)||(25075222-25075356)
chr6 (221-307)||(28096993-28097079)
chr6 (222-312)||(29469759-29469849)
chr6 (1-74)||(26978727-26978800)
chr6 (220-292)||(28150726-28150798)
chr6 (503-549)||(26657820-26657866)
chr6 (503-549)||(26763791-26763837)
chr6 (1-74)||(26960472-26960545)
chr6 (503-556)||(27663479-27663532)
chr6 (220-277)||(29759026-29759083)
chr6 (15-183)||(26812889-26813057)
chr6 (504-556)||(27602986-27603038)
[»] chr1 (9 HSPs)
chr1 (1-373)||(28131974-28132336)
chr1 (1-196)||(28126315-28126510)
chr1 (220-373)||(28126162-28126315)
chr1 (9-188)||(26137243-26137422)
chr1 (220-352)||(266848-266980)
chr1 (1-176)||(267000-267175)
chr1 (221-338)||(26137434-26137551)
chr1 (225-338)||(5921988-5922101)
chr1 (15-85)||(5922220-5922290)
[»] scaffold1870 (1 HSPs)
scaffold1870 (1-338)||(116-450)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (1-338)||(8834-9168)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (51-363)||(17991688-17992000)
chr2 (7-87)||(3281012-3281092)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (9-176)||(60924-61091)
[»] chr4 (13 HSPs)
chr4 (9-176)||(18075116-18075283)
chr4 (222-373)||(18653960-18654111)
chr4 (222-373)||(18678040-18678191)
chr4 (218-373)||(18729978-18730133)
chr4 (222-373)||(18722553-18722704)
chr4 (222-373)||(18697883-18698034)
chr4 (222-373)||(18688097-18688248)
chr4 (1-118)||(18730218-18730335)
chr4 (1-142)||(18654167-18654308)
chr4 (1-118)||(18678274-18678391)
chr4 (1-142)||(18688316-18688457)
chr4 (1-118)||(18722799-18722916)
chr4 (1-90)||(18698142-18698231)
[»] scaffold0349 (2 HSPs)
scaffold0349 (1-183)||(2192-2374)
scaffold0349 (228-338)||(2052-2162)
[»] scaffold0277 (4 HSPs)
scaffold0277 (1-186)||(12325-12510)
scaffold0277 (7-186)||(3362-3541)
scaffold0277 (223-338)||(3216-3331)
scaffold0277 (223-338)||(12179-12294)
[»] chr8 (6 HSPs)
chr8 (7-176)||(29272498-29272667)
chr8 (245-338)||(29272351-29272444)
chr8 (221-338)||(16371647-16371764)
chr8 (1-186)||(35984646-35984837)
chr8 (57-130)||(12590144-12590217)
chr8 (220-312)||(12590286-12590378)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (6-130)||(44309-44433)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (1-184)||(56946-57129)
[»] chr3 (2 HSPs)
chr3 (69-181)||(615211-615323)
chr3 (220-278)||(615341-615399)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (69-125)||(13717615-13717671)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (19-130)||(238571-238682)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 93)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 26885414 - 26885845
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26885414 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 26885513  T
Q  101 ggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagattaatactcaataccgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26885514 ggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttggagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagattaatactcaataccgt 26885613  T
Q  201 tcagcaagaaatcatgttgatgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgta 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26885614 tcagcgagaaatcatgttgatgtgacattacatgacttggtagaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgta 26885713  T
Q  301 gtaggttatggtgtcacgatgatatagttcatgttttacagaagaacactgtaagattgatatttatgaacaannnnnnnnnnnnnnnnnaaccatgact 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 |||||||| |    
T  26885714 gtaggttatggtgtcacgatgatatagttcatgttttacagaagaacactgtaagattgatatttatgaacaattttttgttttagttttaaccatgatt 26885813  T
Q  401 ttgctctttatggacttatcatctcatactag 432  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26885814 tttctctttatggacttatcatctcatactag 26885845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 373
Target Start/End: Original strand, 26657311 - 26657678
Alignment:
Q  3 caagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagagg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  |||||||| |||| || ||  ||||    
T  26657311 caagagatacttaaagtaagctatgatgatttggaggaagaggagcaaagtgtctttttagatatagcttgttttttcaaaggatgtagattgagtgagg 26657410  T
Q  103 tcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagattaatactcaataccgttc 202  Q
    ||||||| | ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||  || |      
T  26657411 tcgaagagacacttcttgctcactatggtcattgcataaaacatcatgttggagtgttggttgaaaaatctctcatagagattaatacacaaagccatcg 26657510  T
Q  203 agcaagaaatcatgttgatgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagt 302  Q
      |   | || ||| ||||||| ||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26657511 gtc---atataatgatgatgtggcattacacgatttgatagaggacatgggtaaagaaatcgtccgacaagaatcaagtaaagagcccggagaacgtagt 26657607  T
Q  303 aggttatggtgtcacgatgatatagttcatgttttacagaagaacactgtaagattgatatttatgaacaa 373  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||| |||||||||    
T  26657608 aggttatggtgtcacaatgacatagttcatgttttacagaaagataccgtaagattgatatctatgaacaa 26657678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 373
Target Start/End: Original strand, 26763282 - 26763649
Alignment:
Q  3 caagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagagg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  |||||||| |||| || ||  ||||    
T  26763282 caagagatacttaaagtaagctatgatgatttggaggaagaggagcaaagtgtctttttagatatagcttgttttttcaaaggatgtagattgagtgagg 26763381  T
Q  103 tcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagattaatactcaataccgttc 202  Q
    ||||||| | ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||  || |      
T  26763382 tcgaagagacacttcttgctcactatggtcattgcataaaacatcatgttggagtgttggttgaaaaatctctcatagagattaatacacaaagccatcg 26763481  T
Q  203 agcaagaaatcatgttgatgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagt 302  Q
      |   | || ||| ||||||| ||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26763482 gtc---atataatgatgatgtggcattacacgatttgatagaggacatgggtaaagaaatcgtccgacaagaatcaagtaaagagcccggagaacgtagt 26763578  T
Q  303 aggttatggtgtcacgatgatatagttcatgttttacagaagaacactgtaagattgatatttatgaacaa 373  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||| |||||||||    
T  26763579 aggttatggtgtcacaatgacatagttcatgttttacagaaagataccgtaagattgatatctatgaacaa 26763649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 27215806 - 27215974
Alignment:
Q  8 gatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaa 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27215806 gatacttaaagtcagctatgatgctctggaggaaaaggagaagagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaaaggtcaaa 27215905  T
Q  108 gatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27215906 gatatacttcatgcccattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggccgaaaaatctctc 27215974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 27680297 - 27680631
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| | | ||||||  ||    
T  27680297 tccaaaagatacttaaggtgagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttcttgacatcgcttgctgcttcaaaggatatcaatggaagga 27680396  T
Q  101 ggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagattaatactcaataccgt 200  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||  | |||||||||| | ||||||| |||| | |||| |    
T  27680397 gttcgaagatatactttgtgctcattatgaccattgcataacacatcatctaggagtgttggctggaaaatctctcgttaagattagtacttattaccct 27680496  T
Q  201 tcagcaagaaatcatgttgatgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgta 300  Q
    || |   ||  |  |  |||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||| || |||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  27680497 tcgg---gatctattaatgatgtgagattacatgacttgataaaggacatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaacgaa 27680593  T
Q  301 gtaggttatggtgtcacgatgatatagttcatgtttta 338  Q
    ||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||    
T  27680594 gtaggttatggcgtcaagaagatataattcatgtttta 27680631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Original strand, 26803793 - 26804124
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||  ||||   ||    
T  26803793 tccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcagagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaaggatgtggatgggagga 26803892  T
Q  101 ggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagattaatactcaataccgt 200  Q
    | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||  |||||||||||| | ||||||| ||||   |||| |    
T  26803893 gtttgaagatatacttcatgttcattatggccattgcataacacatcatctaggagtgttggctgaaaaatctctcattaagattagtacttgttaccat 26803992  T
Q  201 tcagcaagaaatcatgttgatgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgta 300  Q
    || |   ||  |  || || ||| | | ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||| || |||||||||  |||||| |||| | |||| |    
T  26803993 tcgg---gatctattgatgttgtaagagtacatgacttgataaaggacatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagatcctgaaaaacgaa 26804089  T
Q  301 gtaggttatggtgtcacgatgatatagttcatgtt 335  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  26804090 gtaggttatggcgtcatgaagatatagttcatgtt 26804124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 28787585 - 28787922
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||| | |||   ||    
T  28787585 tccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcaacaaagtgtttttctagacattgcatgttgcttcaaaggatgtgagtgggagga 28787684  T
Q  101 ggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagat---taatactcaatac 197  Q
    | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||  |||||||||||| | |||||   || ||||   |||    
T  28787685 gtttgaagatatacttcgtgctcattatggccattgcataacacatcatctaggagtgttggctgaaaaatctctcgttaagattagtagtacttcttac 28787784  T
Q  198 cgttcagcaagaaatcatgttgatgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaac 297  Q
    | ||| |   ||  |  |  |||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||| || ||||||||   ||||||||||||||||     
T  28787785 cattcgg---gatctatttatgatgtgagattacatgacttgatagaagacatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcgcctaaagagcctggagaaa 28787881  T
Q  298 gtagtaggttatggtgtcacgatgatatagttcatgtttta 338  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28787882 gaagtaggttatggtgtcaagatgatatagttaatgtttta 28787922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 28793706 - 28794043
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||| | |||   ||    
T  28793706 tccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcaacaaagtgtttttctagacattgcatgttgcttcaaaggatgtgagtgggagga 28793805  T
Q  101 ggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagat---taatactcaatac 197  Q
    | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||  |||||||||||| | |||||   || ||||   |||    
T  28793806 gtttgaagatatacttcgtgctcattatggccattgcataacacatcatctaggagtgttggctgaaaaatctctcgttaagattagtagtacttcttac 28793905  T
Q  198 cgttcagcaagaaatcatgttgatgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaac 297  Q
    | ||| |   ||  |  |  |||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||| || ||||||||   ||||||||||||||||     
T  28793906 cattcgg---gatctatttatgatgtgagattacatgacttgatagaagacatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcgcctaaagagcctggagaaa 28794002  T
Q  298 gtagtaggttatggtgtcacgatgatatagttcatgtttta 338  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28794003 gaagtaggttatggtgtcaagatgatatagttaatgtttta 28794043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 31285906 - 31286081
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||   |||| | ||    
T  31285906 tccaaaagatacttaaagtaagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttctggacattgcttgttgcttcaaaggatgcggatgggcgga 31286005  T
Q  101 ggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 176  Q
     ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||  ||||||||||||    
T  31286006 tgtcaaagatatactccatgctcattatggccattgcataacacatcatctagaagtgttggctgaaaaatctctc 31286081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27603539 - 27603211
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||  || |  ||     
T  27603539 tccacgagattcttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcagagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaaggatgtggattggaagt 27603440  T
Q  101 ggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagattaatactcaataccgt 200  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||  |||||||||||  |  |||||  ||||   |||| |    
T  27603439 ggttgaagatatacttcgtgctcattatggccattgcataacacatcatctaggagtgttggctgaaaaatctcttgttcagatttgtact---taccat 27603343  T
Q  201 tcagcaagaaatcatgttgatgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgta 300  Q
    || |   ||  |  |  | | |||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| || |||||||||  |||||||||||||||| | |    
T  27603342 tctg---gatctatttataaagtgacactgcataacttgatagaggacatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaa 27603246  T
Q  301 gtaggttatggtgtcacgatgatatagttcatgtt 335  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  27603245 gtaggttatggtgtcaagacgatatagttcatgtt 27603211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 26144222 - 26144390
Alignment:
Q  8 gatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaa 107  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||    
T  26144222 gatacttcaagtaagctatgatgctttgaaggaaaaggatcagagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaagggtgtgaatggacaaaggttaaa 26144321  T
Q  108 gatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 176  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  26144322 aaaatacttcatgctcattatggccattgcatagaacatcatgttggagtgttggctgaaaaatctctc 26144390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 222 - 373
Target Start/End: Original strand, 25075432 - 25075583
Alignment:
Q  222 gtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacgatg 321  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  25075432 gtgacattacatgacttgttagaggacatgggtaaagaaatcgtccgacatgaatcaattaaagagcctggagaacgtagtaggttgtggtatcacgatg 25075531  T
Q  322 atatagttcatgttttacagaagaacactgtaagattgatatttatgaacaa 373  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||  |||||| | ||||||||||||||    
T  25075532 atatatttgatgttttacagaacaacaaagtaagaataatatttatgaacaa 25075583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27426439 - 27426272
Alignment:
Q  9 atacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaag 108  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| |||    
T  27426439 atacttaaagtgagctatgattctttggaggaagaggagcaaagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaaggttgtaaatgggaaaaggtcaaag 27426340  T
Q  109 atatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 176  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||| ||||    
T  27426339 aaatacttcatgctcattatggtcattgcataaatcatcatgttgaagtgctagttgaaaaatgtctc 27426272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27530131 - 27529964
Alignment:
Q  9 atacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaag 108  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  27530131 atacttaaagtgagctatgattctttggagaaagaagagcaaagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaagggtgtaaatggccagaggtcaaag 27530032  T
Q  109 atatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 176  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||    
T  27530031 aaatacttcatgctcattatggtcattgcatagtacatcatgttgcagttttggctgaaaaatctctc 27529964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 26057276 - 26057444
Alignment:
Q  8 gatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaa 107  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  26057276 gatacttcaagtaagctatgatgctttgaaggaaaaggatcagagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaaaggttaaa 26057375  T
Q  108 gatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 176  Q
     | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  26057376 aaaatacttcatgctcattatggccatcccatagaacatcatgttggagtgttggctgaaaaatctctc 26057444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 26077246 - 26077414
Alignment:
Q  8 gatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaa 107  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  26077246 gatacttcaagtaagctatgatgctttgaaggaaaaggatcagagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaaaggttaaa 26077345  T
Q  108 gatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 176  Q
     | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  26077346 aaaatacttcatgctcattatggccatcccatagaacatcatgttggagtgttggctgaaaaatctctc 26077414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 26647826 - 26648001
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||| ||||   ||    
T  26647826 tccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcagagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaaggatgtagatgggagga 26647925  T
Q  101 ggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 176  Q
    | | ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  26647926 gtttgaagatatacttcgttatcattatggccattgcataacacatcatcttggagtgttggctgaaaaatctctc 26648001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 26753794 - 26753969
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||| ||||   ||    
T  26753794 tccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcagagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaaggatgtagatgggagga 26753893  T
Q  101 ggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 176  Q
    | | ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  26753894 gtttgaagatatacttcgttatcattatggccattgcataacacatcatcttggagtgttggctgaaaaatctctc 26753969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 27717334 - 27717152
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||  |||    
T  27717334 tccaaaagatacttaaagtaagttatgatgctttggaggaagagcagcaaagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaaagatgtaaatgggaaga 27717235  T
Q  101 ggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaaga 183  Q
     | | || |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27717234 tgccaaatatatacttaattctcattatggccattgcataacacatcatctaggagtgttggttgaaaaatctctcataaaga 27717152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 25512245 - 25512413
Alignment:
Q  8 gatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaa 107  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||| || || ||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||  ||    
T  25512245 gatacttcaagtaagctatgatgctttgaaggaaaaggatcagagtgtctttctagacattgcttgttacttcaaagggtataaatggacaaaagtaaaa 25512344  T
Q  108 gatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 176  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  25512345 aaaatacttcatgctcattatggccattgcatagaacatcatgttggagtgttggctgaaaaatctctc 25512413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 25581076 - 25581244
Alignment:
Q  8 gatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaa 107  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||   | ||||| | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  25581076 gatacttcaagttagctatgatgctttggaaccaaaggagaagagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaaaggttaaa 25581175  T
Q  108 gatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 176  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  25581176 aaaatacttcatgctcattatggccattgcatagaacatcatgttggagtgttggctgaaaaatctctc 25581244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 25492154 - 25491820
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||| || ||  |||||| ||||||||| || |||||| | ||    
T  25492154 tccaaaagatacttagagtgagctatgatgctttggaggaaaaggagcagagtatctttctagacatgacttgtttcttcaaaggttggaaatgggcgga 25492055  T
Q  101 ggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagattaatactcaataccgt 200  Q
     ||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||| ||| |  |||||   |||||||| || |||| || | ||||  ||||| |    
T  25492054 tgtcaaaaatatacttcatgatcattatggccattgcgtaaactatcatcttggaaagttggctaaaaaatctttcataaatataactactatataccct 25491955  T
Q  201 tcagcaagaaatcatgttgatgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgta 300  Q
    |  | |   | ||||| |||    ||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  25491954 ttgggatatattcatgatgaa---acattacataacttgatagagcacatgggtaaagaagtcgttcgacaagaatcacgtaatgatcctggagaacgta 25491858  T
Q  301 gtaggttatggtgtcacgatgatatagttcatgtttta 338  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  25491857 gtaggttgtggtgtcccgatgatatggttcaagtttta 25491820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 25484413 - 25484581
Alignment:
Q  8 gatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaa 107  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||| || || ||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||  ||    
T  25484413 gatacttcaagtaagctatgatgctttgaaggaaaaggatcagagtgtctttctagacattgcttgttacttcaaagggtataaatggacaaaagtaaaa 25484512  T
Q  108 gatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 176  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||    
T  25484513 aaaatacttcatgctcattatggccattgcatagaacatcatgttggagtgttggctgaaaaatgtctc 25484581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 26862934 - 26863102
Alignment:
Q  8 gatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||  |||| |||  |||||    
T  26862934 gatacttaaagtaagctatgatgctttggaagaagagcagcaaagtgtctttctagatattgcttgttgtttcaaagggggtagctggatagaattcgaa 26863033  T
Q  108 gatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 176  Q
    ||||||||| |   |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  26863034 gatatacttaaatatcattatggccgatgcataaaacatcatgttggagtgttggctgaaaaatctctc 26863102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 26624618 - 26624793
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||  |||||  ||    
T  26624618 tccaaaagatacttaaagtgagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttctagatattgcttgttgctcgaaaggatgtggatggaggga 26624717  T
Q  101 ggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 176  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| || |||| ||||    
T  26624718 gttcgaagatatgcttcgtgctcattatggccattgcataacacatcatctaggagtgttggttgacaaatgtctc 26624793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 26730595 - 26730770
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||  |||||  ||    
T  26730595 tccaaaagatacttaaagtgagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttctagatattgcttgttgctcgaaaggatgtggatggaggga 26730694  T
Q  101 ggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 176  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| || |||| ||||    
T  26730695 gttcgaagatatgcttcgtgctcattatggccattgcataacacatcatctaggagtgttggttgacaaatgtctc 26730770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 186
Target Start/End: Original strand, 26938382 - 26938561
Alignment:
Q  7 agatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcga 106  Q
    ||||||||| |||||||| ||||  ||| || ||||| || || |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| || | | ||||| ||    
T  26938382 agatacttagagtaagctttgattgtttggatgaagaagaacaaagtgtctttctggatattacgtgttgcttcaatgggtgtagattggctgaggttga 26938481  T
Q  107 agatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagatta 186  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||  | ||||||||| |||||||||    
T  26938482 agataaacttcatgctcattatggtcattgcataaaaaatcatgttggagtgttggttaataaatctctcataaagatta 26938561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 27705089 - 27704941
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||| || || ||||||    
T  27705089 tccaaaagatacttagagtgagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttcttgacattgcttgttgcttaaaagggtatagattgacaga 27704990  T
Q  101 ggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcat 149  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  27704989 ggttgaaaatatacttcattctcattatgaccattgtataacacatcat 27704941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 222 - 373
Target Start/End: Original strand, 26850277 - 26850428
Alignment:
Q  222 gtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacgatg 321  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||   || |||||||| ||||||   ||||    
T  26850277 gtgacattacatgacttgatagaggacatgggtaaagaaatcgtccgacaagaatcaattaaagagcctggaaggcgcagtaggttgtggtgttgtgatg 26850376  T
Q  322 atatagttcatgttttacagaagaacactgtaagattgatatttatgaacaa 373  Q
    |||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  26850377 atattgttcatgttttacaagaaaacacagtaagattgatttctatgaacaa 26850428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 222 - 348
Target Start/End: Original strand, 26637193 - 26637319
Alignment:
Q  222 gtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacgatg 321  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  26637193 gtgacattacatgacttgatagaggatatgggtatagaaatcgtccgacaagaatcacgtaataagcctggagaacgcagtaggttgtggtgtcatgacg 26637292  T
Q  322 atatagttcatgttttacagaagaaca 348  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  26637293 atatagttcatgttttacagaaaaaca 26637319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 222 - 348
Target Start/End: Original strand, 26743159 - 26743285
Alignment:
Q  222 gtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacgatg 321  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  26743159 gtgacattacatgacttgatagaggatatgggtatagaaatcgtccgacaagaatcacgtaataagcctggagaacgcagtaggttgtggtgtcatgacg 26743258  T
Q  322 atatagttcatgttttacagaagaaca 348  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  26743259 atatagttcatgttttacagaaaaaca 26743285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 218 - 338
Target Start/End: Original strand, 26624811 - 26624931
Alignment:
Q  218 tgatgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcac 317  Q
    |||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| || |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  26624811 tgatatgaccttacatgacttgatagaggacatgggtaaagcaatcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaacgaagtagattatggtgtcaa 26624910  T
Q  318 gatgatatagttcatgtttta 338  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  26624911 gatgatatatttcatgtttta 26624931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 218 - 338
Target Start/End: Original strand, 26730788 - 26730908
Alignment:
Q  218 tgatgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcac 317  Q
    |||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| || |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  26730788 tgatatgaccttacatgacttgatagaggacatgggtaaagcaatcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaacgaagtagattatggtgtcaa 26730887  T
Q  318 gatgatatagttcatgtttta 338  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  26730888 gatgatatatttcatgtttta 26730908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 27697421 - 27697241
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||   |  ||||  |||    
T  27697421 tccaaaagatacttagagtgagctatgatgctttggaagaagaggagcaaagtgtctttctggacattgcttgttgcttcaaaggacatggatgggaaga 27697322  T
Q  101 ggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaa 181  Q
     | | || |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||||||  |||||||||||| ||||    
T  27697321 tgccaaatatatgcttcatgctcattatggccattccataacacatcatctagcagtgttggctgaaaaatctctcataaa 27697241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 26825166 - 26825341
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| | || ||||| || || || || ||||||||||||||||    ||  |||   ||    
T  26825166 tccaagagatacttagagtaagctatgatgctttggaagaagagcaacaaagtgttttcctcgacattgcttgttgcttcaaagaacatagttgggagga 26825265  T
Q  101 ggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 176  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  26825266 gttcgaagatatacttcgtactcattacggccattgcataaaacatcatgttcaagtgttggcagaaaaatctctc 26825341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 228 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27609743 - 27609633
Alignment:
Q  228 ttacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacgatgatatag 327  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27609743 ttacatgacttgatagaggacatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcaattaaagagcctggagaaagaagtaggttatgctgtcaggatgatatag 27609644  T
Q  328 ttcatgtttta 338  Q
    ||| |||||||    
T  27609643 ttcgtgtttta 27609633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 228 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27717122 - 27717012
Alignment:
Q  228 ttacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacgatgatatag 327  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27717122 ttacatgacttgatagaggacatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcaattaaagagcctggagaaagaagtaggttatgctgtcaggatgatatag 27717023  T
Q  328 ttcatgtttta 338  Q
    ||| |||||||    
T  27717022 ttcgtgtttta 27717012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 27697219 - 27697114
Alignment:
Q  221 tgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacgat 320  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||    
T  27697219 tgtgacattacatgacttgatagaggacatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcaactaaagagcctggagaaagaagtaggttatgctgtcaggat 27697120  T
Q  321 gatata 326  Q
    ||||||    
T  27697119 gatata 27697114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 373
Target Start/End: Original strand, 26951295 - 26951447
Alignment:
Q  221 tgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacgat 320  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||| | || |||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||| |||| ||  |||    
T  26951295 tgtgacattacatgacttgatagaggatatgggtatagaaatcatccgacaagaatcaattagagaacctggagaacgcagtaggttgtggtctcgtgat 26951394  T
Q  321 gatatagttcatgttttacagaagaacactgtaagattgatatttatgaacaa 373  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  26951395 gatattgttcatgttttacaagaaaacacagtaagattgatatctgtgaacaa 26951447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 369
Target Start/End: Original strand, 26960677 - 26960825
Alignment:
Q  221 tgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacgat 320  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||  ||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||  |||    
T  26960677 tgtgacattacatgacttgatagaggatatgggtatggaaattgttcgacaggaatcaattaaagagcctggaaaacgcagtaggttgtggtgtcgtgat 26960776  T
Q  321 gatatagttcatgttttacagaagaacactgtaagattgatatttatga 369  Q
    ||||||||||||||||||||  | || |  ||||||||||||| |||||    
T  26960777 gatatagttcatgttttacaagaaaaaaaagtaagattgatatatatga 26960825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27609955 - 27609780
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||  |||    
T  27609955 tccaaaagatacttaaagtgagctatgattctttggaagaagaggagcaaagtgtctttctggacattgcttgttgcttcaaaggatataattgggaaga 27609856  T
Q  101 ggtcgaag-atatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 176  Q
     | | ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||||||    
T  27609855 tg-caaagtatacacttcattctcattatggccattccataacacatcatctaggagtgttggctgaaaaatctctc 27609780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 209 - 338
Target Start/End: Original strand, 26648010 - 26648139
Alignment:
Q  209 aaatcatgttgatgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggtta 308  Q
    |||||||| | || ||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| ||| | || || ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26648010 aaatcatggttatctgagattacatgacttgataaaggacatgggtaaggaagtagtccgacaagaatcacgtaaagagcctggagaacaaagtaggtta 26648109  T
Q  309 tggtgtcacgatgatatagttcatgtttta 338  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  26648110 tggtgtcaagatgaaatagttcatgtttta 26648139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 209 - 338
Target Start/End: Original strand, 26753978 - 26754107
Alignment:
Q  209 aaatcatgttgatgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggtta 308  Q
    |||||||| | || ||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| ||| | || || ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26753978 aaatcatggttatctgagattacatgacttgataaaggacatgggtaaggaagtagtccgacaagaatcacgtaaagagcctggagaacaaagtaggtta 26754077  T
Q  309 tggtgtcacgatgatatagttcatgtttta 338  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  26754078 tggtgtcaagatgaaatagttcatgtttta 26754107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 222 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27591644 - 27591528
Alignment:
Q  222 gtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacgatg 321  Q
    |||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||| |||| || |||||||||  |||||||||||||||| | || |||||||||| ||| ||||    
T  27591644 gtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatg 27591545  T
Q  322 atatagttcatgtttta 338  Q
    |||||||||||||||||    
T  27591544 atatagttcatgtttta 27591528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 225 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27663829 - 27663681
Alignment:
Q  225 acattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacgatgata 324  Q
    ||||||||||||||| | ||| | ||||||| |||||| || || |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||| |||| |||||||    
T  27663829 acattacatgacttgatagagtatatgggtatagaaatagtccgacaagaatcaattaaagagcctggagagcgcactaggttgtggcgtcatgatgata 27663730  T
Q  325 tagttcatgttttacagaagaacactgtaagattgatatttatgaacaa 373  Q
    ||| |||||||||| |  | ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27663729 tagctcatgttttaaaacaaaacacagtaagattgatatctatgaacaa 27663681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 221 - 340
Target Start/End: Original strand, 2186369 - 2186488
Alignment:
Q  221 tgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacgat 320  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| ||||  || ||     
T  2186369 tgtgacattacatgacttgatagaggaaatgggtaaagaaatcgtacgacaagaatcaccaaaagagcctggaaaacgtagtaggttgtggtcccatgaa 2186468  T
Q  321 gatatagttcatgttttaca 340  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  2186469 gatatagttcctgttttaca 2186488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 221 - 373
Target Start/End: Original strand, 26863123 - 26863279
Alignment:
Q  221 tgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacgat 320  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||   ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  26863123 tgtgagattacatgacttgatagaggacatgggcaaagaaatcgtccgacaagaatctcctaaagagccgggtgaacgaagtaggttatggtgtcatgat 26863222  T
Q  321 gatatagttcatgttttacagaagaacact----gtaagattgatatttatgaacaa 373  Q
    |||||| | || |||||| |  | ||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  26863223 gatataatccacgttttagaagaaaacactgtgagtaagattgatatttatgaacaa 26863279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 227 - 338
Target Start/End: Original strand, 31286114 - 31286225
Alignment:
Q  227 attacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacgatgatata 326  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| || |||||||||  ||||||||| |||||| | |||||| |||||||||| |||||||||    
T  31286114 attacatgacttgatagaggacatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagccaggagaaagaagtaggctatggtgtcaagatgatata 31286213  T
Q  327 gttcatgtttta 338  Q
    ||||||| ||||    
T  31286214 gttcatgcttta 31286225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 220 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27704894 - 27704780
Alignment:
Q  220 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacga 319  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||    
T  27704894 atgtgacattacataacttgatagaggatatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcaattaaagagcctggagaaagaagtaggttatgctgccatga 27704795  T
Q  320 tgatatagttcatgt 334  Q
    |||||||||| ||||    
T  27704794 tgatatagttaatgt 27704780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 225 - 373
Target Start/End: Original strand, 26978936 - 26979084
Alignment:
Q  225 acattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacgatgata 324  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||   ||  ||    
T  26978936 acattacattacttgatagaggatatgggtatagaaatcgtccgacaagaatcaattaaagaacctggagaacgcagtaggttgtggtgtcgtaatagta 26979035  T
Q  325 tagttcatgttttacagaagaacactgtaagattgatatttatgaacaa 373  Q
    ||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||| | |||||||    
T  26979036 tagttcatgttttacaagaaaacacagtaagtttgatatctgtgaacaa 26979084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 222 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27676243 - 27676127
Alignment:
Q  222 gtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacgatg 321  Q
    |||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||| | || || |||||||||  |||||||||||||||| | || |||||||||| ||| ||||    
T  27676243 gtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtggtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatg 27676144  T
Q  322 atatagttcatgtttta 338  Q
    |||||||||||||||||    
T  27676143 atatagttcatgtttta 27676127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 29842819 - 29842642
Alignment:
Q  9 atacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaag 108  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| || ||  |||| ||||| || || ||||||||||||||||||| | | | |  |||||| ||||    
T  29842819 atacttaaaataagctttgatgctttggaggaagacgaacaaggtgtttttctcgacattgcttgttgcttcaaagggtatgatttgggagaggttgaag 29842720  T
Q  109 atatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagatta 186  Q
    |||| |||  |||| || |||| || |||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  29842719 atattctttgtgcttatcatggtcaatgcatagaatatcatattggagtgttggtcgaaaaaactctcataaagatta 29842642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 222 - 338
Target Start/End: Original strand, 26813102 - 26813218
Alignment:
Q  222 gtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacgatg 321  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||| || |  |||||||||  | |||| || |||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  26813102 gtgacattacatgacttgatagagcacacgggtaaagaaattgtccaacaagaatcacctgaagaaccaggagaacgaagtaggctatggtgtcaagatg 26813201  T
Q  322 atatagttcatgtttta 338  Q
    |||||||||||||||||    
T  26813202 atatagttcatgtttta 26813218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 220 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 27529938 - 27529806
Alignment:
Q  220 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacga 319  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| || |||||||||    | |||||||||||||| |||||||| |||| | |       
T  27529938 atgtgacattacatgacttgatagaggacatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacccgatgagcctggagaacgcagtaggttgtggtttgagcg 27529839  T
Q  320 tgatatagttcatgttttacagaagaacactgt 352  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  27529838 tgatatagttcatgttttaaaaaaaaacactgt 27529806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 220 - 326
Target Start/End: Original strand, 25484607 - 25484713
Alignment:
Q  220 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacga 319  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    ||  ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  25484607 atgtgaccttacatgacttgatagaggacatgggtaaagaagtcgttcgacaagaatctcccaagaagcctggagaacgcagtaggttgtggtttcacga 25484706  T
Q  320 tgatata 326  Q
    |||||||    
T  25484707 tgatata 25484713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 220 - 338
Target Start/End: Original strand, 26144416 - 26144534
Alignment:
Q  220 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacga 319  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    ||  ||||||||||||| |||||||| |||| || |||    
T  26144416 atgtgaccttacatgacttgatagaggacatgggtaaagaaatcgtccgacaagaatctcccaacaagcctggagaacgcagtaggttgtggtttcccga 26144515  T
Q  320 tgatatagttcatgtttta 338  Q
    |||||||||| | ||||||    
T  26144516 tgatatagttaacgtttta 26144534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 27676455 - 27676313
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    ||||| ||||||||| | | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||| || |  |||    
T  27676455 tccaaaagatacttagactgagctatgatgctttggacgaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaaggatgtagattggaaga 27676356  T
Q  101 ggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaa 143  Q
     |||||| | |||||||||  |||||||||  || ||||||||    
T  27676355 agtcgaacagatacttcatcatcattatggttatagcataaaa 27676313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 503 - 556
Target Start/End: Original strand, 26885918 - 26885971
Alignment:
Q  503 gttaaaagggaactagcaacattgaaatggtatatctgaactgtcccgcaatgg 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26885918 gttaaaagggaactagcaacattgaaatgatatatctgaactgtcccgcaatgg 26885971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 28296575 - 28296446
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| | | ||| ||||| || || ||||| ||||||||||| | | ||| || |||    
T  28296575 tccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggaggaagatgagaaaaatgtttttcttgacatcgcttgctgcttcaaaggatatgaattgaaaga 28296476  T
Q  101 ggtcgaagatatacttcatgctcattatgg 130  Q
      | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  28296475 acttgaaaatatacttcatgctcattatgg 28296446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 28515498 - 28515627
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| | | ||| ||||| || || ||||| ||||||||||| | | ||| || |||    
T  28515498 tccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggaggaagatgagaaaaatgtttttcttgacatcgcttgctgcttcaaaggatatgaattgaaaga 28515597  T
Q  101 ggtcgaagatatacttcatgctcattatgg 130  Q
      | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  28515598 acttgaaaatatacttcatgctcattatgg 28515627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 220 - 338
Target Start/End: Original strand, 25546531 - 25546649
Alignment:
Q  220 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacga 319  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| || ||||||||    ||  ||||||||||||| |||||||| |||| || |||    
T  25546531 atgtgaccttacatgacttgatagaggacatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatctcccaacaagcctggagaacgcagtaggttgtggtttcgcga 25546630  T
Q  320 tgatatagttcatgtttta 338  Q
    |||||||||| | ||||||    
T  25546631 tgatatagttaacgtttta 25546649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 220 - 338
Target Start/End: Original strand, 26057470 - 26057588
Alignment:
Q  220 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacga 319  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| || ||||||||    ||  ||||||||||||| |||||||| |||| || |||    
T  26057470 atgtgaccttacatgacttgatagaggacatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatctcccaataagcctggagaacgcagtaggttgtggtttcgcga 26057569  T
Q  320 tgatatagttcatgtttta 338  Q
    |||||||||| | ||||||    
T  26057570 tgatatagttaacgtttta 26057588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 220 - 338
Target Start/End: Original strand, 26077440 - 26077558
Alignment:
Q  220 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacga 319  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| || ||||||||    ||  ||||||||||||| |||||||| |||| || |||    
T  26077440 atgtgaccttacatgacttgatagaggacatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatctcccaagaagcctggagaacgcagtaggttgtggtttcgcga 26077539  T
Q  320 tgatatagttcatgtttta 338  Q
    |||||||||| | ||||||    
T  26077540 tgatatagttaacgtttta 26077558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 27591856 - 27591727
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgta-aatggacag 99  Q
    ||||| ||||||||| | | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||| |     
T  27591856 tccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaaggatgtagattggaga- 27591758  T
Q  100 aggtcgaagatatacttcatgctcattatgg 130  Q
    | ||| || | ||||||||||||||||||||    
T  27591757 aagtcaaacagatacttcatgctcattatgg 27591727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 27664049 - 27663865
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||| || |||||  | || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||    
T  27664049 tccaaaagatacttaaagtaagctttgatactttggaagaagaacaacagagtgtctttttggatattgcttgttgcttcaaaggatgtgattgg-caga 27663951  T
Q  101 ggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagatta 186  Q
     ||   ||| | ||||||   ||||||||||||||  || | ||||||||||  ||||||||| ||  |||||||| |||||||||    
T  27663950 agtttcagagacacttcaatttcattatggccattcaatgacacatcatgttagagtgttggttgatgaatctctcataaagatta 27663865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 28326825 - 28326954
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| | ||| ||||| || || ||||| |||||||| || | | ||| || |||    
T  28326825 tccaagcgatacttaaagtaagctttgatgctttggatgaagatgagcagaatgtttttctcgacattgcttgctgcttcaatggatatgaattgaaaga 28326924  T
Q  101 ggtcgaagatatacttcatgctcattatgg 130  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||    
T  28326925 acttgaagatatacttcatgctcattatgg 28326954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 28504461 - 28504590
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| | ||| ||||| || || ||||| |||||||| || | | ||| || |||    
T  28504461 tccaagcgatacttaaagtaagctttgatgctttggatgaagatgagcagaatgtttttctcgacattgcttgctgcttcaatggatatgaattgaaaga 28504560  T
Q  101 ggtcgaagatatacttcatgctcattatgg 130  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||    
T  28504561 acttgaagatatacttcatgctcattatgg 28504590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 186
Target Start/End: Original strand, 29827341 - 29827518
Alignment:
Q  9 atacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaag 108  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||| |||||||| || ||  |||| ||||| || || ||||||||||||||||||| | | | |  ||||||| |||    
T  29827341 atacttaaaataagttttgatgctttggaggaagatgaacaaggtgtttttctcgacattgcttgttgcttcaaagggtatgatttgggagaggtcaaag 29827440  T
Q  109 atatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagatta 186  Q
    |||| |||  ||||||| |||| ||  ||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  29827441 atattctttgtgctcatcatggtcaaagcatagaatatcatattggagtgttggtcgaaaaaactctcatacagatta 29827518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 220 - 312
Target Start/End: Original strand, 28141089 - 28141181
Alignment:
Q  220 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggt 312  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||   |||||||||||  |||| ||||| |||||||    
T  28141089 atgtgacattacatgacttgatagaggagatgggtaaagaaattgttcgacaagaatcaccaaaagagcctgggaaacggagtagattatggt 28141181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 130
Target Start/End: Original strand, 28244147 - 28244271
Alignment:
Q  6 gagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcg 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||||||||| | ||| | || |||  | |    
T  28244147 gagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcagaatgtttttctcgacattgcttgctgcttcaaaggatataatttgaaagaacttg 28244246  T
Q  106 aagatatacttcatgctcattatgg 130  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  28244247 aagatatactttatgctcattatgg 28244271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 326
Target Start/End: Original strand, 25581273 - 25581376
Alignment:
Q  223 tgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacgatga 322  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    ||  | ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  25581273 tgaccttacatgacttgatagaggacatgggtaaagaaatcgtccgacaagaatctcccaagaaccctggagaacgcagtaggttgtggtttcacgatga 25581372  T
Q  323 tata 326  Q
    ||||    
T  25581373 tata 25581376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 312
Target Start/End: Original strand, 29827541 - 29827632
Alignment:
Q  221 tgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggt 312  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| || || |||||||||   |||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  29827541 tgtgacattacatgacttgatagaagacatgggtaaagaaattgtacgacaagaatcaccgaaagagcctggaaagcgtagtaggttgtggt 29827632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 2186173 - 2186358
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgta-aatggacag 99  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||| || ||  | ||| ||||||| || || |||||||  |||||||| |||| | |||| ||    
T  2186173 tccaacagatacttaaagtcagctttgatgctttgcaggaggaagataagagtctctttctcgacattgcttgttttttcaaaggatgtagactgga-ag 2186271  T
Q  100 aggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagatta 186  Q
    || || ||||||||||| |||||||||||    ||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  2186272 agttccaagatatacttgatgctcattatacttattgcatcaaaaatcatattggagtgttggttgaaaaatcactcataaagatta 2186358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 326
Target Start/End: Original strand, 25512439 - 25512545
Alignment:
Q  220 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacga 319  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||    ||  ||||||||||||| |||||||| |||| || |||    
T  25512439 atgtgaccttacatgacttgatagaggacatgggtaaagaaaccgtccgacaagaatctcccaacaagcctggagaacgcagtaggttgtggtttcgcga 25512538  T
Q  320 tgatata 326  Q
    |||||||    
T  25512539 tgatata 25512545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 373
Target Start/End: Original strand, 26938581 - 26938727
Alignment:
Q  227 attacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacgatgatata 326  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||   |||||| |||||||||| | ||| || |||| | || | ||||||    
T  26938581 attacatgacttgattgaggacatgggtaaagaaattgttagacaagaatcagtcaaagaggctggagaacgcactagattgtggtttgacaaagatata 26938680  T
Q  327 gttcatgttttacagaagaacactgtaagattgatatttatgaacaa 373  Q
    |||||||| ||| |  | || || ||||||||||||  |||||||||    
T  26938681 gttcatgtattaaaagaaaatacggtaagattgataagtatgaacaa 26938727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 29673646 - 29673528
Alignment:
Q  220 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacga 319  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| | |||||| ||  | |||| |||||| |||||||||||||||||| |  |||    
T  29673646 atgtgacattacatgatttggtagaggatatgggaaaagaaattgttagacaagaagcacctgaagatcctggaaaacgtagtaggttatggttttccga 29673547  T
Q  320 tgatatagttcatgtttta 338  Q
     |||||| |||| ||||||    
T  29673546 agatataattcaagtttta 29673528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 28182456 - 28182585
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| || ||||| | ||| |||||||| ||  |||||| ||| ||||| | | | | || |||    
T  28182456 tccaagagatacttaaagttagctatgatgctctggaggatgatgagcagaatgtttttctggacatttcttgtttcttaaaaggatatgatttgaaaga 28182555  T
Q  101 ggtcgaagatatacttcatgctcattatgg 130  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  28182556 agttgaagatatatttcatgctcattatgg 28182585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 373
Target Start/End: Original strand, 26825376 - 26825533
Alignment:
Q  220 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacga 319  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||| | || || ||| |||||  ||||||||| || ||||| || ||| | ||||||||| |    
T  26825376 atgtgacattacatgacttgataaaggacatgggcaaagaagtagtccgacaacaatcatctaaagagcccggtgaacgcagcaggctgtggtgtcacaa 26825475  T
Q  320 tgatatagttcatgttttacagaagaacac----tgtaagattgatatttatgaacaa 373  Q
    ||||||  |||||||||| |||   |||||     |||||||||||||||||||||||    
T  26825476 tgatattattcatgttttgcagggaaacacagtgagtaagattgatatttatgaacaa 26825533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 28097253 - 28097152
Alignment:
Q  26 tgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcat 125  Q
    ||||||||| |||||||| |||   ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||| |||  |||||||    
T  28097253 tgatgctttggaggaagatgagaggagtgtttttctcgacattgcttgttgcttcaaagggtataaattgaaagaggtggaagatatgctttgtgctcat 28097154  T
Q  126 ta 127  Q
    ||    
T  28097153 ta 28097152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 28186741 - 28186870
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||  || || | ||| ||||| || || ||||| ||||||||||| | | ||| || |||    
T  28186741 tccaagagatactcaaagtaagctttgatgctttgggggaagcagaacaaaatgtttttctcgacatcgcttgctgcttcaaaggatatgaattgaaaga 28186840  T
Q  101 ggtcgaagatatacttcatgctcattatgg 130  Q
      | |||||| |||||||||||||||||||    
T  28186841 acttgaagatgtacttcatgctcattatgg 28186870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 221 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 29842619 - 29842528
Alignment:
Q  221 tgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggt 312  Q
    ||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||| || || | ||||||||  |||||||||||| | | ||||||||| ||||    
T  29842619 tgtgacactacatgacttgatagaagacatgggtaaagaaattgtacgaccagaatcaacgaaagagcctggaaagcatagtaggttgtggt 29842528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 143
Target Start/End: Original strand, 25075222 - 25075356
Alignment:
Q  9 atacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaag 108  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||  | || ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||  ||||| ||| | || | |||||||    
T  25075222 atacttaaagtaagctttgacgctttggacgaagaacaacagagtgtctttttggatattgcttgtttctttaattggtgtgaatcggcatatgtcgaag 25075321  T
Q  109 atatacttcatgctcattatggccattgcataaaa 143  Q
    | |||||| |   ||||||||| ||||||||||||    
T  25075322 agatacttgaatatcattatggtcattgcataaaa 25075356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 28097079 - 28096993
Alignment:
Q  221 tgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggtt 307  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||  | |||||||||   ||||| |||||| ||||||| |||||    
T  28097079 tgtgacattacatgacttgatagaagacatgggtaaagaaattgtaagacaagaatcaccaaaagaacctggaaaacgtagcaggtt 28096993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 312
Target Start/End: Original strand, 29469759 - 29469849
Alignment:
Q  222 gtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggt 312  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||  | |||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  29469759 gtgacattacatgatttgatagaggatatggggaaagaaattgttagacaagaatcacctgaagatcctggaaaacgcagtaggttatggt 29469849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 26978727 - 26978800
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgt 74  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  | || ||||||||| ||||||| ||||||    
T  26978727 tccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaacagagtgtctttttggatattgcttgt 26978800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Original strand, 28150726 - 28150798
Alignment:
Q  220 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctgg 292  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| || || |||||||||   |||||||||||    
T  28150726 atgtaacattacatgacttgatagaagacatgggtaaagaaattgtacgacaagaatcaccaaaagagcctgg 28150798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 503 - 549
Target Start/End: Original strand, 26657820 - 26657866
Alignment:
Q  503 gttaaaagggaactagcaacattgaaatggtatatctgaactgtccc 549  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26657820 gttaaaagggaaccagtaacattgaaatgatatatctgaattgtccc 26657866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 503 - 549
Target Start/End: Original strand, 26763791 - 26763837
Alignment:
Q  503 gttaaaagggaactagcaacattgaaatggtatatctgaactgtccc 549  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26763791 gttaaaagggaaccagtaacattgaaatgatatatctgaattgtccc 26763837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 26960472 - 26960545
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgt 74  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||  | || ||||||||| ||||||| ||||||    
T  26960472 tccaaaagatacttaaagtaagctatgacgctttggctgaagaacaacagagtgtctttttggatattgcttgt 26960545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 503 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 27663532 - 27663479
Alignment:
Q  503 gttaaaagggaactagcaacattgaaatggtatatctgaactgtcccgcaatgg 556  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||| || ||||||    
T  27663532 gttaaaagggaactagtaaaattgaaatgatatatctgaattgttcctcaatgg 27663479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29759083 - 29759026
Alignment:
Q  220 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatc 277  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  29759083 atgtgacattgcatgatttggtagaggatatgggtaaagaaattgttagacaagaatc 29759026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 183
Target Start/End: Original strand, 26812889 - 26813057
Alignment:
Q  15 aaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatac 114  Q
    |||||||||| ||||||||| ||  |||| ||  | ||||| ||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  || | || | |||||| | ||||    
T  26812889 aaagtaagctttgatgctttggacaaagaagaaaagagtgtttttttggatattgtatgttgctttaaagggtgtccattggcatatgtcgaaaaaatac 26812988  T
Q  115 ttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaaga 183  Q
    | |||  |||||||||  |||||||||||   ||  ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  26812989 tccattttcattatggatattgcataaaaagccacattggagtgttggttgaaaaatctctcataaaga 26813057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 504 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 27603038 - 27602986
Alignment:
Q  504 ttaaaagggaactagcaacattgaaatggtatatctgaactgtcccgcaatgg 556  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || || |||| |||||| ||||||    
T  27603038 ttaaaagggaactaggaacattgaaatgatacatttgaattgtccctcaatgg 27602986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 160; Significance: 5e-85; HSPs: 9)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28132336 - 28131974
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    |||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||      
T  28132336 tccatgagatatttaaagtaagttacgatgctttggaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaggggtatagattgacaat 28132237  T
Q  101 ggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagattaatactcaataccgt 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||| | |    
T  28132236 ggtcgaagagatacttcatgctcataatggccattgcataaaacatcatgttggagtgttggtcgaaaaatctctcatagagattaagactcgata-ctt 28132138  T
Q  201 tcagcaagaaatcatgttgatgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgta 300  Q
    ||        ||   |||||||||||||||||||||||| | || ||||  |||||||||||||| |   |||||||  |||| || ||||||||||| |    
T  28132137 tc--------atgtcgttgatgtgacattacatgacttgatagaagacacaggtaaagaaatcgtccataaagaatcgtgtaaggaacctggagaacgca 28132046  T
Q  301 gtaggttatggtgtcacgatgatatagttcatgttttacagaagaacactgtaagattgatatttatgaacaa 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  28132045 gtaggttatggtgtcacaatgatatagttcatg-tctacagaaaaacacggtaagattgatatctatgaacaa 28131974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 28126510 - 28126315
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||    
T  28126510 tccaagagatatttaaactaagctatgatgctttggaggaagatgagcaaagtgtctttctcgatatagcttgctgcttcaaagggtatagattgacaga 28126411  T
Q  101 ggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagattaatactcaata 196  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  28126410 ggttgaaaagatacttcatgctcattatggccattgcataaagcatcatgttggagtgttggttgaaaaatctctcattgagattaatactcaata 28126315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28126315 - 28126162
Alignment:
Q  220 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacga 319  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |    
T  28126315 atgtgacattacatgacttgatagaggatacgggtaaagaaatcgtccggaaagaatcacgtaaagagcctggagaacgcaacaggttatggtgtcacaa 28126216  T
Q  320 tgatatagttcatgttttacagaagaacactgtaagattgatatttatgaacaa 373  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  28126215 tgatatagttcatgttctacagaaaaacacggtaagattgatatctatgaacaa 28126162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 188
Target Start/End: Original strand, 26137243 - 26137422
Alignment:
Q  9 atacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaag 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |||||  | || ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||     
T  26137243 atacttagagtaagctatgatgctttggacgaagaacaacaaagtgtatttttggatattgcttgttgcttcaaagggtgtaaattgacagaagtccaaa 26137342  T
Q  109 atatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagattaat 188  Q
    | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||| || ||| ||||| | |||||||||    
T  26137343 agatacttcatgctcgttatgaccattgcataaaaagtcatgttggagtgttggttgataaagctctcatgaagattaat 26137422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 220 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 266980 - 266848
Alignment:
Q  220 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacga 319  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| | || || |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  266980 atgtgacattacatgacatgatagaggacatgggtaaagaagtggtccgccaagaatcacctaaagagcctggagaacgaagtaggttatggtgtcaaga 266881  T
Q  320 tgatatagttcatgttttacagaagaacactgt 352  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  266880 tgatatagttcatgttttaaataaaaacactgt 266848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 267175 - 267000
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||| | | |||||  |||    
T  267175 tccaaaagatacttaaagtgagctatgatggtttggaagaagaggagcagagtgtctttttagacattgcttgttgcttcaaaggatatgaatgggaaga 267076  T
Q  101 ggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 176  Q
     | | || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||||||    
T  267075 tgccaaacatatacttcattctcattatggccactgcataacacatcatctaggagtgttggctgaaaaatctctc 267000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 338
Target Start/End: Original strand, 26137434 - 26137551
Alignment:
Q  221 tgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacgat 320  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| || || |||||||||   ||||| |||||| |||| |||||||| |||| ||| ||     
T  26137434 tgtggcattacatgacttgatagaggatatgggtaaagaaattgtccgacaagaatcacccaaagaacctggaaaacgcagtaggttgtggtttcatgaa 26137533  T
Q  321 gatatagttcatgtttta 338  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26137534 gatatagttcatgtttta 26137551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5922101 - 5921988
Alignment:
Q  225 acattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacgatgata 324  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||   |||||||||||| | || |||||||||||||| |  || ||||    
T  5922101 acattacatgatgtgatagaggacatgggaaaagaaattgttagacaagaatcaccgaaagagcctggaaagcgcagtaggttatggtgccctgaagata 5922002  T
Q  325 tagttcatgtttta 338  Q
    ||||||| ||||||    
T  5922001 tagttcaagtttta 5921988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 5922290 - 5922220
Alignment:
Q  15 aaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagg 85  Q
    ||||| |||| ||||||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5922290 aaagtgagctttgatgctttggaagaagaagagaaaagtgtttttcttgatattgcttgttgcttcaaagg 5922220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1870 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1870
Description:

Target: scaffold1870; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 116 - 450
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||| |||  |||||  ||    
T  116 tccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcaaagtgtttttctagacattgcctgttgcttcaaaggatgtggatggaagga 215  T
Q  101 ggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagattaatactcaataccgt 200  Q
    | | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  |||||||||||| | ||||||| || |   |    |    
T  216 gtttgaagatatactacgtgctcattatggccattgcataaaacatcatctaggagtgttggctgaaaaatctctcgttaagattagtagtacttcttat 315  T
Q  201 tcagcaagaaatcatgttgatgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgta 300  Q
    || |   ||  |  |  | |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||| || ||||||||   ||||||||| |||||| | |    
T  316 tcgg---gatctattaatcatgtgacattacatgactttatagaggacatgggtaaagaagtcgtacgacaagaatcgcctaaagagccaggagaaagaa 412  T
Q  301 gtaggttatggtgtcacgatgatatagttcatgtttta 338  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  413 gtaggttatggtgtcaagatgatatagttaatgtttta 450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 8834 - 9168
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||| |||  |||||  ||    
T  8834 tccacgagatacttaaagtaagttatgatgctttggaggaagagcagcaaagtgtttttctagacattgcctgttgcttcaaaggatgtggatggaagga 8933  T
Q  101 ggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagattaatactcaataccgt 200  Q
    | | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  |||||||||||| | ||||||| || |   |    |    
T  8934 gtttgaagatatactacgtgctcattatggccattgcataaaacatcatctaggagtgttggctgaaaaatctctcgttaagattagtagtacttcttat 9033  T
Q  201 tcagcaagaaatcatgttgatgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgta 300  Q
    || |   ||  |  |  | |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||| || ||||||||   ||||||||| |||||| | |    
T  9034 tcgg---gatctattaatcatgtgacattacatgactttatagaggacatgggtaaagaagtcgtacgacaagaatcgcctaaagagccaggagaaagaa 9130  T
Q  301 gtaggttatggtgtcacgatgatatagttcatgtttta 338  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  9131 gtaggttatggtgtcaagatgatatagttaatgtttta 9168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 51 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 17992000 - 17991688
Alignment:
Q  51 agtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatg 150  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  |  || | || | |||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||   ||      
T  17992000 agtgtctttttggatattgcttgttgcttcaaagagcatgtattggcatatgtcgaagaaatgcttcatggtcattatggtcattgcataaaaagccacc 17991901  T
Q  151 ttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagattaatactcaataccgttcagcaagaaatcatgttgatgtgacattacatgacttggtggaggacat 250  Q
    | ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||  ||  | |    || ||||  |||| ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  17991900 tcgaagtgttggttgataaatctctcataaagattaatactaaatactattggggatctcatgatgtctatgttacagtacatgacttgatagaggacat 17991801  T
Q  251 gggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacgatgatatagttcatgttttacagaagaacact 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| || |||||| |  |||| |||||||||||||||||| | || ||     
T  17991800 gggtaaagaaatcgttcggcaagaatcacctaaagagcctggagaacggagtagattgtggtgttataatgacatagttcatgttttacaggaaaataca 17991701  T
Q  351 gtaagattgatat 363  Q
    |||||||| ||||    
T  17991700 gtaagattcatat 17991688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 87
Target Start/End: Original strand, 3281012 - 3281092
Alignment:
Q  7 agatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggt 87  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  3281012 agatacttaaagtgagttttgatgctttggaggaagacgagcaaagtgtttttctcgacattgcttgttgctttaaagggt 3281092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Original strand, 60924 - 61091
Alignment:
Q  9 atacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaag 108  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| |||    
T  60924 atacttaaagtgagctatgattctttggaggaagaggagcaaagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaaggttgtaaatgggaaaaggtcaaag 61023  T
Q  109 atatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 176  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||| ||||    
T  61024 aaatacttcatgctcattatggtcattgcataaatcatcatgttgaagtgctagttgaaaaatgtctc 61091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 13)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Original strand, 18075116 - 18075283
Alignment:
Q  9 atacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaag 108  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| |||    
T  18075116 atacttaaagtgagctatgattctttggaggaagaggagcaaagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaaggttgtaaatgggaaaaggtcaaag 18075215  T
Q  109 atatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 176  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||| ||||    
T  18075216 aaatacttcatgctcattatggtcattgcataaatcatcatgttgaagtgctagttgaaaaatgtctc 18075283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 222 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18654111 - 18653960
Alignment:
Q  222 gtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacgatg 321  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||| |||||| | | ||||||||||| ||||||| | |||    
T  18654111 gtgacattacatgacttgctagaggtcatgggtaaagaaatcgtccggaaagaatcacctaaacagcctgaaaagcgtagtaggttgtggtgtcgcaatg 18654012  T
Q  322 atatagttcatgttttacagaagaacactgtaagattgatatttatgaacaa 373  Q
    | ||||||||| |||||||| | ||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  18654011 acatagttcatattttacaggaaaacaaagtaagattgatatctatgaacaa 18653960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 222 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18678191 - 18678040
Alignment:
Q  222 gtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacgatg 321  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||   |||||||||| | | ||||||||||| ||||||| | |||    
T  18678191 gtgacattacatgacttgctagaggtcatgggtaaagaaatcgtccggaaagaatcacccaaagagcctgaaaagcgtagtaggttgtggtgtcgcaatg 18678092  T
Q  322 atatagttcatgttttacagaagaacactgtaagattgatatttatgaacaa 373  Q
    | ||||||||| |||||||| | ||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  18678091 acatagttcatattttacaggaaaacaaagtaagattgatatctatgaacaa 18678040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 218 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18730133 - 18729978
Alignment:
Q  218 tgatgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcac 317  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||   |||||||||| | | |||||| |||| ||||||| |    
T  18730133 tgatgtgacattacatgacttgctagaggtcatgggtaaagaaatcgtccggaaagaatcacccaaagagcctgaaaagcgtagtcggttgtggtgtcgc 18730034  T
Q  318 gatgatatagttcatgttttacagaagaacactgtaagattgatatttatgaacaa 373  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| | ||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  18730033 gatgacataattcatattttacaggaaaacaaagtaagattgatatctatgaacaa 18729978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 222 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18722704 - 18722553
Alignment:
Q  222 gtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacgatg 321  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||||||||||| | |||||||| |||| |||||||  ||||    
T  18722704 gtgacattacatgacttgctagaggtcatgggtaaagaaatcattcgtaaagaatcacctaaagagcctgaaaaacgtagtcggttgtggtgtcgtgatg 18722605  T
Q  322 atatagttcatgttttacagaagaacactgtaagattgatatttatgaacaa 373  Q
    | ||||||||| |||||| | | ||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  18722604 acatagttcatattttactggaaaacaaagtaagattgatatctatgaacaa 18722553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 222 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18698034 - 18697883
Alignment:
Q  222 gtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacgatg 321  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||   |||||||||| | | |||||| | || ||||||| |||||    
T  18698034 gtgacattacatgacttgctagaggccatgggtaaagaaatcgtccggaaagaatcacccaaagagcctgaaaagcgtagtcgattgtggtgtcgcgatg 18697935  T
Q  322 atatagttcatgttttacagaagaacactgtaagattgatatttatgaacaa 373  Q
    | ||| ||||| |||||||| | ||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  18697934 acataattcatattttacaggaaaacaaagtaagattgatatctatgaacaa 18697883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 222 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18688248 - 18688097
Alignment:
Q  222 gtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacgatg 321  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||| | | |||||| |||| |||||||  | ||    
T  18688248 gtgacattacatgacttgctagaggtcatgggtaaagaaattgtccggaaagaatcacctaaagagcctgaaaagcgtagtcggttgtggtgtcgtggtg 18688149  T
Q  322 atatagttcatgttttacagaagaacactgtaagattgatatttatgaacaa 373  Q
    | ||| ||||  |||||||| | ||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  18688148 acataattcaaattttacaggaaaacaaagtaagattgatatctatgaacaa 18688097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 18730335 - 18730218
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  | || ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| || | ||||    
T  18730335 tccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaacaaagtgtctttttggatattgcttgtttcttcaaaggatgtagattggcaga 18730236  T
Q  101 ggtcgaagatatacttca 118  Q
     |||||||| ||||||||    
T  18730235 agtcgaagagatacttca 18730218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 18654308 - 18654167
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||| || |||||  | || ||||||||| ||||||| |||||||  |||||||| |||| || | ||||    
T  18654308 tccaaaagatacttaaagtaagttttgatgctttggatgaagaacaacaaagtgtctttttggatattgcttgtttgttcaaaggatgtagattggcaga 18654209  T
Q  101 ggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaa 142  Q
     |||||||| ||||||||   |||||||||  ||||||||||    
T  18654208 agtcgaagagatacttcaaagtcattatggttattgcataaa 18654167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 18678391 - 18678274
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  | || | ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| || | ||||    
T  18678391 tccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaacaaattgtctttttggatattgcttgtttcttcaaaggatgtagattggcaga 18678292  T
Q  101 ggtcgaagatatacttca 118  Q
     |||||||| ||||||||    
T  18678291 agtcgaagagatacttca 18678274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 18688457 - 18688316
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  | || ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| || | || |    
T  18688457 tccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaacaaagtgtctttttggatattgcttgtttcttcaaaggatgtatattggcaaa 18688358  T
Q  101 ggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaa 142  Q
     |||||||| |||||| |   |||||||||  ||||||||||    
T  18688357 agtcgaagagatacttaaacttcattatggttattgcataaa 18688316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 18722916 - 18722799
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||  | || ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| || | ||||    
T  18722916 tccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttgggcgaagaacaacaaagtgtctttttggatattgcttgtttcttcaaaggatgtagattggcaga 18722817  T
Q  101 ggtcgaagatatacttca 118  Q
     |||||||| ||||||||    
T  18722816 agtcgaagagatacttca 18722799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 18698231 - 18698142
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgta 90  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  | || ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  18698231 tccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaacaaagtgtctttttggatattgcttgtttcttcaaaggatgta 18698142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 2374 - 2192
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||  |||    
T  2374 tccaaaagatacttaaagtaagttatgatgctttggaggaagagcagcaaagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaaagatgtaaatgggaaga 2275  T
Q  101 ggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaaga 183  Q
     | | || |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  2274 tgccaaatatatacttaattctcattatggccattgcataacacatcatctaggagtgttggttgaaaaatctctcataaaga 2192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 228 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2162 - 2052
Alignment:
Q  228 ttacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacgatgatatag 327  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2162 ttacatgacttgatagaggacatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcaattaaagagcctggagaaagaagtaggttatgctgtcaggatgatatag 2063  T
Q  328 ttcatgtttta 338  Q
    ||| |||||||    
T  2062 ttcgtgtttta 2052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 12510 - 12325
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||| |||  |||||  ||    
T  12510 tccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcaaagtgtttttctagacattgcctgttgcttcaaaggatgtggatggaagga 12411  T
Q  101 ggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagatta 186  Q
    | | ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| | | ||||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  12410 gtttgaatatatacttcgtgctcattatggccatcgcataacacatcatctagtagtgttggctgaaaaatctctcgttaagatta 12325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3541 - 3362
Alignment:
Q  7 agatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcga 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||| |||  ||||   ||| | ||    
T  3541 agatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcaaagtgtttttctagacattgcctgttgcttcaaaggatgtggatgggaggagtttga 3442  T
Q  107 agatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagatta 186  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| | | ||||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  3441 atatatacttcgtgctcattatggccatcgcataacacatcatctagtagtgttggctgaaaaatctctcgttaagatta 3362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 223 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 3331 - 3216
Alignment:
Q  223 tgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacgatga 322  Q
    ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | |||||    
T  3331 tgacactacatgacttgataaaggacatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcgcccaaagagcctggagaaagaagtagattatggtgtgaagatga 3232  T
Q  323 tatagttcatgtttta 338  Q
    ||||||| ||||||||    
T  3231 tatagttaatgtttta 3216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 223 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12294 - 12179
Alignment:
Q  223 tgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacgatga 322  Q
    ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | |||||    
T  12294 tgacactacatgacttgataaaggacatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcgcccaaagagcctggagaaagaagtagattatggtgtgaagatga 12195  T
Q  323 tatagttcatgtttta 338  Q
    ||||||| ||||||||    
T  12194 tatagttaatgtttta 12179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 6)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29272667 - 29272498
Alignment:
Q  7 agatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcga 106  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||  ||| | | |    
T  29272667 agatacttaaagtaagttatgatgctttggaagaagagcaacaaagtgtctttctggacattgcttgttgcttcaaaggttgtgaatgggaagatgccaa 29272568  T
Q  107 agatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 176  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||||  ||||||||||||    
T  29272567 atatatacttcattctcattatggccattgcataacacatcatctaggagtattggctgaaaaatctctc 29272498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 29272444 - 29272351
Alignment:
Q  245 ggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacgatgatatagttcatgtttta 338  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| || || |||||| |||||| |||||||    
T  29272444 ggacatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcaattaaagagcctggagaaagaagtaggttatgctgccaggatgatctagttcgtgtttta 29272351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16371764 - 16371647
Alignment:
Q  221 tgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacgat 320  Q
    ||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||   || ||||| || ||||||||||||||||||| |  | ||    
T  16371764 tgtgacattacataacctggtagaagacatgggtaaagaaattgtccgacaagaatcaccaaaggagccaggcgaacgtagtaggttatggtttgtcaat 16371665  T
Q  321 gatatagttcatgtttta 338  Q
    ||| ||||||| ||||||    
T  16371664 gatgtagttcaagtttta 16371647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 35984646 - 35984837
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagg-----gtg-taaatg 94  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||| || |  |||      || |||||     
T  35984646 tccaaaagatacttaaagtaagttttgatgctttagaggaagatgagcaaagtgtttttcttgacattgcttgtttctacggaggaacaaatgataaatt 35984745  T
Q  95 gacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagatta 186  Q
    | |||| || ||| |||| ||||||||||||||||    |||||| ||| ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  35984746 ggcagatgtagaaaatatgcttcatgctcattatgatgcttgcatgaaatatcatattggagtattggttgaaaaatctctcataaagatta 35984837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 130
Target Start/End: Original strand, 12590144 - 12590217
Alignment:
Q  57 tttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatgg 130  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12590144 tttcttgatattgcttgttgcttcaaaggatggaaattgacaagggtcgaagaaatacttcatgctcatcatgg 12590217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 312
Target Start/End: Original strand, 12590286 - 12590378
Alignment:
Q  220 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggt 312  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||    || | |||||| ||||||||||||||||||    
T  12590286 atgtgacattacatgatttggtagaggatatggggaaagaaatagttagacaagaatcaccggaaaatcctggaaaacgtagtaggttatggt 12590378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 130
Target Start/End: Original strand, 44309 - 44433
Alignment:
Q  6 gagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcg 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||||||||| | ||| | || |||  | |    
T  44309 gagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcagaatgtttttctcgacattgcttgctgcttcaaaggatataatttgaaagaacttg 44408  T
Q  106 aagatatacttcatgctcattatgg 130  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  44409 aagatatactttatgctcattatgg 44433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 57129 - 56946
Alignment:
Q  1 tccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| | | ||| ||||| || ||  |||||| |||  |||| ||| | |  | |||    
T  57129 tccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggaggaagatgagaagaatgtttttctcgacatttcttgtttcttagaaggatgtgatttaaaaga 57030  T
Q  101 ggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagat 184  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||  ||  |||||||   |||||||||||| |||||||    
T  57029 agttgaagatatacttcatgctcattatggtagctgcatgaaacatcaaattagagtgttgcatgaaaaatctctcataaagat 56946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 181
Target Start/End: Original strand, 615211 - 615323
Alignment:
Q  69 gcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaa 168  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||  ||| ||| ||||  || | |||||||| ||||    
T  615211 gcttgttgcttcaaaggatggaaattgacaagggttgaagaaatacttcatgctcattatggtgatatcatgaaagatcacattaatgtgttggtggaaa 615310  T
Q  169 aatctctcttaaa 181  Q
    |||||||| ||||    
T  615311 aatctctcataaa 615323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 220 - 278
Target Start/End: Original strand, 615341 - 615399
Alignment:
Q  220 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatca 278  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||    
T  615341 atgtgacattacatgatttggtagaggatatggggaaagaaattgttagacaagaatca 615399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 125
Target Start/End: Original strand, 13717615 - 13717671
Alignment:
Q  69 gcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcat 125  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  13717615 gcttgttgcttcaaaggatataaatcgacaaaggtcaaagaaatacttcatgctcat 13717671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 238682 - 238571
Alignment:
Q  19 taagctatgatgctttagaggaagaggagcatagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttca 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| | | ||| ||||| || || || |||||||||||||| | ||||| ||||  ||||||| | || ||| |    
T  238682 taagctatgatgctttacaggaagaagagaaaattgtttttcttgacattgcatgttgcttcaaaggatataaattgacaagggtcgaacaaattcttta 238583  T
Q  119 tgctcattatgg 130  Q
    ||||||| ||||    
T  238582 tgctcatcatgg 238571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University