View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21086_low_3 (Length: 480)

Name: NF21086_low_3
Description: NF21086
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21086_low_3
NF21086_low_3
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (13-461)||(15019305-15019753)
chr2 (38-458)||(15012816-15013236)
chr2 (38-461)||(31968730-31969153)
chr2 (13-428)||(14528349-14528779)
chr2 (13-430)||(14542573-14543005)
chr2 (13-295)||(14512047-14512329)
chr2 (38-294)||(14533732-14533988)
chr2 (44-283)||(14519899-14520138)
chr2 (13-270)||(15004182-15004439)
chr2 (38-345)||(15007519-15007826)
chr2 (345-428)||(14519751-14519834)
chr2 (345-394)||(14533626-14533675)
chr2 (38-102)||(14547063-14547127)
chr2 (345-426)||(15004511-15004592)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (208-307)||(17357245-17357345)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 15019753 - 15019305
Alignment:
Q  13 aatatcagaggaataagcggcatcagatagaaaaaattgaaactttggcaataacatgttgtggggttgtgatgaaagtaaccaaggtgcnnnnnnnatc 112  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       ||     
T  15019753 aatatcagaggaataagaagcatcagatagaaagaattgaaactttggcaataacattttgtggggttgtgatgaaagtaaccaaggtgcttttttgatg 15019654  T
Q  113 atgatgcgaatgttggaatttgaaaagccataattttttaagaagttgatgactgattcaggcttatctggggtattgaaacgaacgtgcctgacgttga 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15019653 atgatgcgaatgttggagtttgaaaagccatagctttttaagaagttgatgactgagtcaggcctatctggggtattgaaacgaacgtgcctgaggttga 15019554  T
Q  213 aagctttgagagctgattcagttgagaaatcaaaattgttgataagataagatacagcaaaaggttgtgtgattgattctgattgagatgttgtgatgct 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15019553 aagctttgagagctgattcagttgagaaatcaaaattgttgataagataagatacagcaaaaggttgtgtgattgattctgattgagatgttgtgatgct 15019454  T
Q  313 gctgcatttgagtgaaagtgggaatgagaagtggttgttgaattttaaggttgttgatttagttgtgatgagacataaaacaagattctgggagaaaaac 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15019453 gctgcatttgagtgaaagtgggaatgagaagtggttgttgaattttaaggttgttgatttagttgtgatgagacataaaacaagattctgggagaaaaac 15019354  T
Q  413 aatttgttgaacatgggtgattttgagagtacaatgtgagtgttgttgt 461  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15019353 aatttgttggacatgggtgattttgagagttcaatgtgagtgttgttgt 15019305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 38 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 15013236 - 15012816
Alignment:
Q  38 gatagaaaaaattgaaactttggcaataacatgttgtggggttgtgatgaaagtaaccaaggtgcnnnnnnnatcatgatgcgaatgttggaatttgaaa 137  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||       || |||||||| ||||  || | |||||    
T  15013236 gatataaaaaattgaaacttaggcaataaccttttgtggggttgtgatgaaagtaaccatggtgcttttttgatgatgatgcgtatgtcagagtgtgaaa 15013137  T
Q  138 agccataattttttaagaagttgatgactgattcaggcttatctggggtattgaaacgaacgtgcctgacgttgaaagctttgagagctgattcagttga 237  Q
    | ||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15013136 aaccatggttttgaaagaagttgatgactgagtcaggattatctggggtattgaaacgaacttgcctgaggttgaaagctttgagagctgattcagttga 15013037  T
Q  238 gaaatcaaaattgttgataagataagatacagcaaaaggttgtgtgattgattctgattgagatgttgtgatgctgctgcatttgagtgaaagtgggaat 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15013036 gaaatcaaaattgttgataagataagatacagcaaaaggttgtgtgattgattctgattgagatgttgtgatgctgctgcatttgagtgagaatgggaat 15012937  T
Q  338 gagaagtggttgttgaattttaaggttgttgatttagttgtgatgagacataaaacaagattctgggagaaaaacaatttgttgaacatgggtgattttg 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  15012936 gagaagtggttgttgaattttaaggttgttgatttagttgttatgacacctaaaacaagattctgggagaaaaacaatttgttggacatggttgattctg 15012837  T
Q  438 agagtacaatgtgagtgttgt 458  Q
    ||||| ||| || ||||||||    
T  15012836 agagttcaaggtaagtgttgt 15012816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 38 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 31969153 - 31968730
Alignment:
Q  38 gatagaaaaaattgaaactttggcaataacatgttgtggggttgtgatgaaagtaaccaaggtgcnnnnnnnatcatgatgcgaatgttggaatttgaaa 137  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||       || | |||||| ||||  || |||||||    
T  31969153 gatataaaaaattgaaacttaggcaataaccttttgtggggttgtgatgaaagtaaccatggtgcttttttgatgaagatgcgtatgtcagagtttgaaa 31969054  T
Q  138 agccataattttttaagaagttgatgactgattcaggcttatctggggtattgaaacgaacgtgcctgacgttgaaagctttgagagctgattcagttga 237  Q
    | ||||  ||||  |||||| |||| || || ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31969053 aaccatggttttgaaagaaggtgataacagaatcaggattatctgaggtattgaaacgaacctgcttgaggttgaaagctttgagagctgattcagttga 31968954  T
Q  238 gaaatcaaaattgttgataagataagatacagcaaaaggttgtgtgattgattctgattgagatgttgtgatgctgctgcatttgagtgaaagtgggaat 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31968953 gaaatcaaaattgttgataagataagatacagcaaaaggttgtgtgattgattctgattgagatgttgtgatgctgctgcatttgagtgaaaatgggaat 31968854  T
Q  338 gagaagtggttgttgaattttaaggttgttgatttagttgtgatgagacataaaacaagattctgggagaaaaacaatttgttgaacatgggtgattttg 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  31968853 gagaagtggttgttgaattttaaggttgttgatttagttgtgatgacacctaaaacaagattatgggagaaaaacaatttgttggacatggttgattttg 31968754  T
Q  438 agagtacaatgtgagtgttgttgt 461  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  31968753 agagttcaatgtgagtgttgttgt 31968730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 14528779 - 14528349
Alignment:
Q  13 aatatcagaggaataagcggcatcagatagaaaaaattgaaactttggcaataacatgttgtggggttgtgatgaaagtaaccaaggtgcnnnnnnnatc 112  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||       |||    
T  14528779 aatatcagaggaagaagcagcattggatagaaaaaattgaaactttggcaaaaaccttttgtggggttgtgatgaaagtaaccatggtgctcttctgatc 14528680  T
Q  113 atgatgcgaatgttggaatttgaaaagccataattttttaagaagttgatgactgattcaggcttatctggggtattgaaacgaacgtgcctgacgttga 212  Q
    |||||||| ||||||   | ||||||||||| |||||  |||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  14528679 atgatgcgtatgttgtcgtgtgaaaagccatgattttgaaagaaggtgatgactgaatcaggtttatctgcggtattgaaacgaacttgcttgaggttga 14528580  T
Q  213 aagctttgagagctgattcagttgagaaatcaaaattgttgataagataagatacagcaaaaggttgtgtgattgattctgattgagatgttgtgatgct 312  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||| || || ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||     
T  14528579 aagctttgagagcagattcatgtgagaacccaaaattgttgatgagataagatgcagcgaatggatgtgtgactgattcagattgagatgttgtggtgca 14528480  T
Q  313 gctgcatttgagtgaaagtgggaatgagaagt---------------ggttgttgaattttaaggttgttgatttagttgtgatgagacataaaacaaga 397  Q
    |   | | ||||||||| ||||||||||||||               |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  14528479 gaatcttgtgagtgaaaatgggaatgagaagtgttggttgaaaagagggttgttgaattttgaggttgttgtttttgttgtgatgagacctaaaacaaca 14528380  T
Q  398 ttctgggagaaaaacaatttgttgaacatgg 428  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  14528379 ttctgggagagaaaccatttgttcaacatgg 14528349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 14543005 - 14542573
Alignment:
Q  13 aatatcagaggaataagcggcatcagatagaaaaaattgaaactttggcaataacatgttgtggggttgtgatgaaagtaaccaaggtgcnnnnnnnatc 112  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||       |||    
T  14543005 aatatcagaggaagaagcagcattggatagaaaaaattgaaactttggcaaaaaccttttgtggggttgtgatgaaagtaaccatggtgctcttctgatc 14542906  T
Q  113 atgatgcgaatgttggaatttgaaaagccataattttttaagaagttgatgactgattcaggcttatctggggtattgaaacgaacgtgcctgacgttga 212  Q
    |||||||| ||||||   | ||||||||||| |||||  |||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  14542905 atgatgcgtatgttgtcgtgtgaaaagccatgattttgaaagaaggtgatgactgaatcaggtttatctgcggtattgaaacgaacttgcttgaggttga 14542806  T
Q  213 aagctttgagagctgattcagttgagaaatcaaaattgttgataagataagatacagcaaaaggttgtgtgattgattctgattgagatgttgtgatgct 312  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||| || || ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||     
T  14542805 aagctttgagagcagattcatgtgagaacccaaaattgttgatgagataagatgcagcgaatggatgtgtgactgattcagattgagatgttgtggtgca 14542706  T
Q  313 gctgcatttgagtgaaagtgggaatgagaagt---------------ggttgttgaattttaaggttgttgatttagttgtgatgagacataaaacaaga 397  Q
    |   | | ||||||||| | ||||||||||||               |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||| |    
T  14542705 gaatcttgtgagtgaaatttggaatgagaagtgttggttgaaaagagggttgttgaattttgaggttgttgtttttgttgtgttgagacctaaaacaaca 14542606  T
Q  398 ttctgggagaaaaacaatttgttgaacatgggt 430  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  14542605 ttctgggagagaaaccatttgttcaacatgggt 14542573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 14512329 - 14512047
Alignment:
Q  13 aatatcagaggaataagcggcatcagatagaaaaaattgaaactttggcaataacatgttgtggggttgtgatgaaagtaaccaaggtgcnnnnnnnatc 112  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||       |||    
T  14512329 aatatcagaggaagaagcagcattggatagaaaaaattgaaactttggcaaaaaccttttgtggggttgtgatgaaagtaaccatggtgctcttctgatc 14512230  T
Q  113 atgatgcgaatgttggaatttgaaaagccataattttttaagaagttgatgactgattcaggcttatctggggtattgaaacgaacgtgcctgacgttga 212  Q
    |||||||| ||||||   | ||||||||||| |||||  |||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||||    
T  14512229 atgatgcgtatgttgtcgtgtgaaaagccatgattttgaaagaaggtgatgactgaatcaggtttatctgcggtattgaaacgaacatgcttgtagttga 14512130  T
Q  213 aagctttgagagctgattcagttgagaaatcaaaattgttgataagataagatacagcaaaaggttgtgtgattgattctgat 295  Q
    ||| ||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| || || ||||||| ||||||||||    
T  14512129 aagatttgagagctgattcatgtgtgaaaccaaaattgttgatgagataagatgcagcgaatggatgtgtgactgattctgat 14512047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14533988 - 14533732
Alignment:
Q  38 gatagaaaaaattgaaactttggcaataacatgttgtggggttgtgatgaaagtaaccaaggtgcnnnnnnnatcatgatgcgaatgttggaatttgaaa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||       || |||||||| |||||||| |||| ||    
T  14533988 gatagaaaaaattgaaactttggcaataaccttttgtggggttgtgatgaaagtaaccaaggtgccttttggatgatgatgcgtatgttggagtttggaa 14533889  T
Q  138 agccataattttttaagaagttgatgactgattcaggcttatctggggtattgaaacgaacgtgcctgacgttgaaagctttgagagctgattcagttga 237  Q
    | ||||  ||||  |||||| |||| || || ||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||  |||    
T  14533888 aaccatggttttgaaagaaggtgataacagaatcagcattatctggggtattgaaacgaacctgcttgttgttgaaagctttgagagcagattcatgtga 14533789  T
Q  238 gaaatcaaaattgttgataagataagatacagcaaaaggttgtgtgattgattctga 294  Q
    |||  ||||||||||||| || || |||||||  || || |||||| ||||||||||    
T  14533788 gaatccaaaattgttgatgaggtatgatacagagaatggatgtgtgtttgattctga 14533732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14520138 - 14519899
Alignment:
Q  44 aaaaattgaaactttggcaataacatgttgtggggttgtgatgaaagtaaccaaggtgcnnnnnnnatcatgatgcgaatgttggaatttgaaaagccat 143  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||       || |||||||| |||||    | |||||||||||    
T  14520138 aaaaattgaaactttggcaataccattttgtggggttgtgatgaaagtaaccatggtgcttttgtgatgatgatgcgtatgttatcgtgtgaaaagccat 14520039  T
Q  144 aattttttaagaagttgatgactgattcaggcttatctggggtattgaaacgaacgtgcctgacgttgaaagctttgagagctgattcagttgagaaatc 243  Q
      ||||  |||||| |||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |    
T  14520038 ggttttgaaagaaggtgataacagaatcaggattatctggggtattgaaacgaacctgtctgttgttgaaagctttgagagccgattcatgtgagaaacc 14519939  T
Q  244 aaaattgttgataagataagatacagcaaaaggttgtgtg 283  Q
    ||| |||||||  || || ||||||||||| |||||||||    
T  14519938 aaatttgttgacgaggtatgatacagcaaatggttgtgtg 14519899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 270
Target Start/End: Original strand, 15004182 - 15004439
Alignment:
Q  13 aatatcagaggaataagcggcatcagatagaaaaaattgaaactttggcaataacatgttgtggggttgtgatgaaagtaaccaaggtgcnnnnnnnatc 112  Q
    ||||||||||||| ||||  | |  |||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||       ||     
T  15004182 aatatcagaggaagaagcacctttggatagaaaaaattgaaactttgacaataaacctttgtggggttgcgatgaaagtaaccaaggtgcttttgtgatg 15004281  T
Q  113 atgatgcgaatgttggaatttgaaaagccataattttttaagaagttgatgactgattcaggcttatctggggtattgaaacgaacgtgcctgacgttga 212  Q
    |||||||| |||||      |||||| |||| |||||  |||||| |||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||    
T  15004282 atgatgcgtatgttatcgagtgaaaaaccatgattttgaaagaaggtgataacagaatcaggattatctggggtattgaaacgaacctgcttgttgttga 15004381  T
Q  213 aagctttgagagctgattcagttgagaaatcaaaattgttgataagataagatacagc 270  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||    
T  15004382 aagctttgagagttgattcagttgagaaaccaaaattgttgacaaggtatgatacagc 15004439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15007826 - 15007519
Alignment:
Q  38 gatagaaaaaattgaaactttggcaataacatgttgtggggttgtgatgaaagtaaccaaggtgcnnnnnnnatcatgatgcgaatgttggaatttgaaa 137  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |       || |||||||| |||||    | |||||    
T  15007826 gatagaaaatattcaaactttggcaataacattttgtggggttgtgatgaaagtaaccatggttcttttctaatgatgatgcgtatgttttcgtgtgaaa 15007727  T
Q  138 agccataattttttaagaagttgatgactgattcaggcttatctggggtattgaaacgaacgtgcctgacgttgaaagctttgagagctgattcagttga 237  Q
    |||||| |||||  |||||| |||  ||||| | |||||| ||  |||||||||||||||| ||  ||  |||||||||||| ||||| |||| || |||    
T  15007726 agccatgattttgaaagaaggtgagaactgaattaggcttttcaagggtattgaaacgaacctgtttgttgttgaaagctttaagagcagattgaggtga 15007627  T
Q  238 gaaatcaaaattgttgataagataagatacagcaaaaggttgtgtgattgattctgattgagatgttgtgatgctgctgcatttgagtgaaagtgggaat 337  Q
    |||| ||||||||| ||| || || ||| |||| || || || ||| | |||||||||   ||||||||| |||||   | | ||||||||| |||||||    
T  15007626 gaaaccaaaattgtcgatgaggtaggatgcagcgaatgggtgagtgttggattctgatgttgatgttgtggtgctgaatcttgtgagtgaaattgggaat 15007527  T
Q  338 gagaagtg 345  Q
    ||||||||    
T  15007526 gagaagtg 15007519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 345 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 14519834 - 14519751
Alignment:
Q  345 ggttgttgaattttaaggttgttgatttagttgtgatgagacataaaacaagattctgggagaaaaacaatttgttgaacatgg 428  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| || |||||||    
T  14519834 ggttgttgaattttggggttgttgattttgttgtgatgagacataaaacaacattctgggaaagaaacagtttcttcaacatgg 14519751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 14533675 - 14533626
Alignment:
Q  345 ggttgttgaattttaaggttgttgatttagttgtgatgagacataaaaca 394  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14533675 ggttgttgaattttggggttgttgattttgttgtgatgaaacataaaaca 14533626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 14547127 - 14547063
Alignment:
Q  38 gatagaaaaaattgaaactttggcaataacatgttgtggggttgtgatgaaagtaaccaaggtgc 102  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |  || |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  14547127 gatagaaaaaattcaaacttgggcaaaattatattgtggggttgtaatgaaagtaaccatggtgc 14547063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 426
Target Start/End: Original strand, 15004511 - 15004592
Alignment:
Q  345 ggttgttgaattttaaggttgttgatttagttgtgatgagacataaaacaagattctgggagaaaaacaatttgttgaacat 426  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||| || |||||||  ||| ||||||| |||| |||| || |||||    
T  15004511 ggttgttgaattttggggttgttgattttgtggtgatgatacctaaaacagcattgtgggagagaaaccatttcttcaacat 15004592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 307
Target Start/End: Original strand, 17357245 - 17357345
Alignment:
Q  208 gttgaaagctttgagagctgatt-cagttgagaaatcaaaattgttgataagataagatacagcaaaaggttgtgtgattgattctgattgagatgttgt 306  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||  | |||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||| |||||| | ||||||| |  ||||||||    
T  17357245 gttgaaagctttgaaagcagatttcaggagtgaaaccaaaattgtcgatgagatacgatacagcaaatggtggtgtgactaattctgactctgatgttgt 17357344  T
Q  307 g 307  Q
    |    
T  17357345 g 17357345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University