View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21087_high_13 (Length: 468)

Name: NF21087_high_13
Description: NF21087
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21087_high_13
NF21087_high_13
[»] chr7 (14 HSPs)
chr7 (1-452)||(25352362-25352813)
chr7 (1-452)||(25406424-25406875)
chr7 (1-452)||(3323507-3323958)
chr7 (1-374)||(7070805-7071178)
chr7 (2-357)||(44015480-44015835)
chr7 (308-452)||(7071368-7071512)
chr7 (353-452)||(44013250-44013349)
chr7 (167-452)||(16883597-16883882)
chr7 (167-452)||(24262455-24262740)
chr7 (167-452)||(21644707-21644992)
chr7 (167-452)||(9186277-9186562)
chr7 (167-452)||(18412328-18412613)
chr7 (167-279)||(12405180-12405292)
chr7 (368-452)||(49090358-49090442)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (1-452)||(13879749-13880200)
chr6 (1-452)||(25942679-25943130)
chr6 (1-452)||(17693575-17694022)
chr6 (1-452)||(22349691-22350142)
chr6 (3-153)||(5164863-5165013)
chr6 (167-452)||(14738704-14738989)
chr6 (167-452)||(33332208-33332493)
chr6 (368-452)||(24432654-24432738)
chr6 (368-451)||(29485258-29485341)
[»] chr3 (22 HSPs)
chr3 (1-452)||(10097526-10097977)
chr3 (1-452)||(10204411-10204862)
chr3 (1-452)||(6304321-6304772)
chr3 (1-452)||(16458475-16458926)
chr3 (1-452)||(22624699-22625150)
chr3 (1-452)||(10898015-10898466)
chr3 (1-452)||(29912675-29913126)
chr3 (1-452)||(54189520-54189969)
chr3 (1-452)||(10611497-10611948)
chr3 (4-452)||(47881608-47882056)
chr3 (170-452)||(28490308-28490590)
chr3 (167-452)||(8515764-8516049)
chr3 (167-452)||(32479010-32479295)
chr3 (167-452)||(2673352-2673637)
chr3 (170-452)||(3324671-3324953)
chr3 (170-279)||(9602982-9603091)
chr3 (160-272)||(27734441-27734553)
chr3 (60-129)||(9602872-9602941)
chr3 (368-452)||(16263032-16263116)
chr3 (368-452)||(1309541-1309625)
chr3 (60-108)||(3324561-3324609)
chr3 (368-452)||(9603180-9603264)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (1-452)||(2737215-2737666)
chr2 (1-452)||(22715953-22716404)
chr2 (1-452)||(20053480-20053931)
chr2 (1-452)||(17933131-17933582)
chr2 (1-358)||(39681056-39681413)
chr2 (2-452)||(28456222-28456672)
chr2 (353-452)||(39683610-39683709)
chr2 (167-452)||(19347948-19348233)
chr2 (167-279)||(25402493-25402605)
chr2 (417-452)||(45568816-45568851)
chr2 (170-279)||(10446560-10446669)
chr2 (60-108)||(10446450-10446498)
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (1-452)||(16755980-16756431)
chr8 (1-452)||(28328918-28329369)
chr8 (1-452)||(28891774-28892225)
chr8 (1-452)||(21038440-21038891)
chr8 (2-452)||(33033651-33034102)
chr8 (2-452)||(15945666-15946124)
chr8 (2-349)||(26269129-26269476)
chr8 (167-452)||(18866802-18867087)
chr8 (167-452)||(10685396-10685681)
chr8 (167-452)||(18856407-18856692)
chr8 (167-452)||(35744059-35744345)
chr8 (167-452)||(26300020-26300305)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (1-452)||(49926-50377)
[»] chr5 (11 HSPs)
chr5 (1-452)||(25446497-25446948)
chr5 (5-452)||(10628373-10628820)
chr5 (25-451)||(31781180-31781606)
chr5 (167-452)||(27448492-27448777)
chr5 (167-452)||(33789985-33790270)
chr5 (167-452)||(43595791-43596076)
chr5 (167-452)||(43628585-43628870)
chr5 (2-74)||(28788733-28788805)
chr5 (167-452)||(31398124-31398409)
chr5 (167-452)||(37557756-37558041)
chr5 (368-452)||(28836962-28837046)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (1-452)||(9522735-9523189)
chr1 (2-452)||(2399944-2400394)
chr1 (5-295)||(14998049-14998339)
chr1 (167-452)||(41396909-41397194)
chr1 (167-279)||(19359970-19360082)
chr1 (368-452)||(47100151-47100235)
[»] chr4 (6 HSPs)
chr4 (1-452)||(15313328-15313779)
chr4 (2-452)||(4559217-4559666)
chr4 (8-452)||(16633507-16633951)
chr4 (167-452)||(9225536-9225821)
chr4 (68-114)||(5146909-5146955)
chr4 (242-354)||(21549881-21549993)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (1-452)||(17335-17786)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (167-452)||(15441-15726)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (170-452)||(1177-1459)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (167-279)||(19071-19183)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 440; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Original strand, 25352362 - 25352813
Alignment:
Q  1 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25352362 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 25352461  T
Q  101 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25352462 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 25352561  T
Q  201 cacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25352562 caagttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctgggtgctcttatcacatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 25352661  T
Q  301 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25352662 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 25352761  T
Q  401 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25352762 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 25352813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Original strand, 25406424 - 25406875
Alignment:
Q  1 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25406424 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 25406523  T
Q  101 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25406524 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggagattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 25406623  T
Q  201 cacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25406624 caagttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctgggtgctcttatcacatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 25406723  T
Q  301 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25406724 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 25406823  T
Q  401 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25406824 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 25406875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 3323958 - 3323507
Alignment:
Q  1 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3323958 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 3323859  T
Q  101 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3323858 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggagaatcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 3323759  T
Q  201 cacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 300  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3323758 caagttgggaacctggaaagagctgggtcttggactccgggtgctcttatcacatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 3323659  T
Q  301 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3323658 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaagatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 3323559  T
Q  401 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3323558 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 3323507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Original strand, 7070805 - 7071178
Alignment:
Q  1 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7070805 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 7070904  T
Q  101 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7070905 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaagttcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 7071004  T
Q  201 cacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 300  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7071005 caagttgggaacctgaaaagatctgggtcttggactctgggtgctcttatcacatctgtccgagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 7071104  T
Q  301 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttg 374  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  7071105 tggagttgttcgccttggcaacaataaagcttgtaaaattcaaggtattggtaccatccgtctcaaaatgtttg 7071178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 2 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 44015835 - 44015480
Alignment:
Q  2 gggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaaga 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  44015835 gggaaaggcaagaatttcaggtcaaagtctaggtcgaagggtggtggtaataaaacacagtacaaatattttatttgtcacaatccaggccacttcaaga 44015736  T
Q  102 aggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgac 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44015735 aggattgtccggagagaaagggcaatggaagtggtaatccatccgttcagcttgcaagtgaagaggaaggttatgagagtgttggagcactaactgtgac 44015636  T
Q  202 acgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggt 301  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44015635 aagttgggaacctgaaaagggctgggtcttggactatgggtgctcttatcacatatgtctgagaaaggagtactttgaaacattagagctgaaagaaggt 44015536  T
Q  302 ggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactat 357  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44015535 ggagttgttcgcctcggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactat 44015480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 308 - 452
Target Start/End: Original strand, 7071368 - 7071512
Alignment:
Q  308 gttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggt 407  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  7071368 gttcgccttggcaacaataaagcttgtaaaattcaaggtattggtaccatccgtctcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaaggatgagaggt 7071467  T
Q  408 atattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7071468 atattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 7071512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 353 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 44013349 - 44013250
Alignment:
Q  353 actatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  44013349 actatccgtcttaaaatgtttgatgaccgtgatttccttttgaaggatgtgaggtatattcctgaacttaagataaatttaatatctataagcatgtttg 44013250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 16883882 - 16883597
Alignment:
Q  167 gaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaa 266  Q
    ||||||||||||||||| || || |||   || ||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||| ||  | || ||||    
T  16883882 gaaggttatgagagtgcgggtgcgctagtggtaacaagttgggaaccggagaagagttgggttttggactcgggatgctcttatcacatgagccctagaa 16883783  T
Q  267 aggagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggtggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaa 366  Q
    |||| || ||||| || ||    || |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| |   | || || ||    
T  16883782 aggaatattttgagactttgattctaaaagaaggaggagttgttcgactcggaaataacaaagcttgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaa 16883683  T
Q  367 aatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
     ||||||||||  ||||| |||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16883682 gatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtatgttcccgaacttaagcgaaatttaatttccataagcatgtttg 16883597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 452
Target Start/End: Original strand, 24262455 - 24262740
Alignment:
Q  167 gaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaa 266  Q
    ||||||||||||||||| || || |||   || ||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||| ||  | || ||||    
T  24262455 gaaggttatgagagtgcgggtgcgctagtggtaacaagttgggaaccggagaagagttgggttttggactcgggatgctcttatcacatgagccctagaa 24262554  T
Q  267 aggagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggtggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaa 366  Q
    |||| || ||||| || ||    || |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| |   | || || ||    
T  24262555 aggaatattttgagactttgattctaaaagaaggaggagttgttcgactcggaaataacaaagcttgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaa 24262654  T
Q  367 aatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
     ||||||||||  ||||| |||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24262655 gatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtatgttcccgaacttaagcgaaatttaatttccataagcatgtttg 24262740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 21644992 - 21644707
Alignment:
Q  167 gaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaa 266  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||   || ||| |||||||||  || ||||| ||||| ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||    
T  21644992 gaaggttatgagagtgcgggtgcactagtggttacaagttgggaactggagaagagttgggttttggactcgggatgctcttaccacatgtgtcctagaa 21644893  T
Q  267 aggagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggtggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaa 366  Q
    |||| || ||||| || ||    || |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| |   | || || ||    
T  21644892 aggaatattttgagactttgactctaaaagaaggaggagttgttcgactcggaaataacaaagcttgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaa 21644793  T
Q  367 aatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
     ||||||||||  ||||| |||||||| | | ||||||||| | |||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21644792 gatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatttaatttccctaagcatgtttg 21644707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 452
Target Start/End: Original strand, 9186277 - 9186562
Alignment:
Q  167 gaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaa 266  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||   || ||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||    
T  9186277 gaaggttatgagagtacgggtgcactagtggttacaagttgggaaccggagaagagttgggttttggactcgggatgctcttatcacatgtgtcctagaa 9186376  T
Q  267 aggagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggtggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaa 366  Q
    || | || ||||| || || |  || |||||||| ||||| ||| | || || ||||| || || || ||| | ||||| ||||| |   | || || ||    
T  9186377 agaaatattttgagactttggctctaaaagaaggaggagttgtttgactcggaaataacaaagcgtgcaaagtccaaggcatgggcatcgttcgtctaaa 9186476  T
Q  367 aatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
     ||||||||||  ||||| |||||||| ||| |||||| || | |||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  9186477 gatgtttgatggccgtgaattccttttaaaggatgtgaagtttgttcccgaacttaagcgaaatttaatttccctaagcatgtttg 9186562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 18412613 - 18412328
Alignment:
Q  167 gaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaa 266  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||   || ||| ||||| || | || ||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||    
T  18412613 gaaggttatgagagtacgggtgcactagtggttacaagttggaaatcggagaagagttgggttttggactcgggatgctcttatcacatgtgtcctagaa 18412514  T
Q  267 aggagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggtggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaa 366  Q
    |||| || ||||| || ||    || |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| |   | || || ||    
T  18412513 aggaatattttgagactttgactctaaaagaaggaggagttgttcgactcggaaataacaaagcttgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaa 18412414  T
Q  367 aatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
     ||||||||||  ||||| |||||||| | | ||||||||| | |||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  18412413 gatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatttaatttccctaagcatgtttg 18412328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12405292 - 12405180
Alignment:
Q  167 gaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaa 266  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||   || ||| |||||||||| || ||||| || || ||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||    
T  12405292 gaaggttatgagagtgtgggtgcactagtggtaacaagttgggaaccggagaagagttgagttttggactcgggatgctcttatcacatgtgtcctagaa 12405193  T
Q  267 aggagtactttga 279  Q
    |||| || |||||    
T  12405192 aggaatattttga 12405180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 368 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 49090442 - 49090358
Alignment:
Q  368 atgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    ||||||||||   |||| |||||||| | | ||||||||| | |||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  49090442 atgtttgatggctgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatttaatttccttaagcatgtttg 49090358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 440; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Original strand, 13879749 - 13880200
Alignment:
Q  1 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13879749 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 13879848  T
Q  101 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13879849 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 13879948  T
Q  201 cacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13879949 caagttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctgggtgctcttatcacatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 13880048  T
Q  301 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13880049 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 13880148  T
Q  401 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13880149 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 13880200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Original strand, 25942679 - 25943130
Alignment:
Q  1 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25942679 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 25942778  T
Q  101 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25942779 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggtaatccatccgttcagattgcaagtaaagatgagggttatgagagtgctggagcactaactgtga 25942878  T
Q  201 cacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 300  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  25942879 caagttgggaacctgaaaagggctgggtcttggactctgggtgctcttatcacatctgtccgagaaaggagtactttgaaacgttagagctgggagaagg 25942978  T
Q  301 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 400  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25942979 tggagtagttcgccttggcaacaataaagcttgtaaaattcaaggtattggtactatccgtctcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaaggat 25943078  T
Q  401 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25943079 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 25943130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 17694022 - 17693575
Alignment:
Q  1 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  17694022 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtagaagggtgatggaaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcacaatccaggtcactaaaag 17693923  T
Q  101 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17693922 aaagattgtccggagagaaaggacaatggaggtggtaatccatccgttcaacttgtaagtaaagatgagggttatgagagtgctggagcactaactgtga 17693823  T
Q  201 cacgttgggaacctgaaaa-gagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaag 299  Q
    || |||||||||||||||| | |||||||||||||     | ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  17693822 caagttgggaacctgaaaaagggctgggtcttgga-----gatgctcttatcacatctgtccgagaaaggagtactttgaaactttagagctggaagaag 17693728  T
Q  300 gtggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaa 399  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17693727 gtgaagtagttcgccttggcaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgtctcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagga 17693628  T
Q  400 tgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17693627 tgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 17693575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 22350142 - 22349691
Alignment:
Q  1 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22350142 agggaaagacaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggaaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcacaatccaggtcacttcaag 22350043  T
Q  101 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 200  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22350042 aaggattgtccgtagagaaatgtcaatggaggtggtaatccatccgttcagtttgcaagttaagaggaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 22349943  T
Q  201 cacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 300  Q
    || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  22349942 caagttgggaacctgaaaagggttgggtcttggactctaggtgctcttatcacatatgtccgagaaaggagtactttgaaacattagagctggaagaagg 22349843  T
Q  301 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 400  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  22349842 tggagtagttcgccttggcaataataacgcttgtaaaattcaaggtatgaggagtatccgtctcaaaatatttgatgaccgtgatttccttttgaaggat 22349743  T
Q  401 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  22349742 gtgaggtatattcctgaacttaggttaaatttaatatctataagcatgtttg 22349691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 5165013 - 5164863
Alignment:
Q  3 ggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaagaa 102  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  5165013 ggaaaagcaagaattccaagtcaaagtttaggtcgtagggtggtggtaataaaacaaagtacaaatgttttatttgtcacaatccatatcacttcaagaa 5164914  T
Q  103 ggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagat 153  Q
    |||||||||  ||||||| | ||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  5164913 ggattgtcctcagagaaatggcaatggaagtggtagttcatccgttcagat 5164863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 167 - 452
Target Start/End: Original strand, 14738704 - 14738989
Alignment:
Q  167 gaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaa 266  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||   || ||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||    
T  14738704 gaaggttatgagagtgcgggtgcactagtggtaacaagttgggaaccggagaagagctgggttttggactcgggatgctcttatcacatgtgtcctagaa 14738803  T
Q  267 aggagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggtggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaa 366  Q
    |||| || ||||| || ||    || |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| |   | || || ||    
T  14738804 aggaatattttgagactttgattctaaaagaaggaggagttgttcgactcggaaataacaaagcttgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaa 14738903  T
Q  367 aatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
     ||||||||||  ||||| |||||||| | | ||||||||| | |||| ||||||| | | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  14738904 gatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgtaatttaatttccctaagcatgtttg 14738989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 452
Target Start/End: Original strand, 33332208 - 33332493
Alignment:
Q  167 gaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaa 266  Q
    ||||||||||||||||| || || |||   || ||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||    
T  33332208 gaaggttatgagagtgcgggtgcgctagtggtaacaagttgggaaccggagaagagttgggttttggactcgggatgctcttatcacatgtgtcctagaa 33332307  T
Q  267 aggagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggtggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaa 366  Q
    |||| || ||||| || ||    || |||||||| ||||| ||||| ||  | ||||| || ||||| ||| | ||||| | ||| |   | || || ||    
T  33332308 aggaatattttgagactttgattctaaaagaaggaggagttgttcgactcagaaataacaaagcttgcaaagtccaaggcacgggcaacgttcgtctaaa 33332407  T
Q  367 aatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
     ||||||||||  ||||| |||||||| | | ||||||||| | |||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  33332408 gatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatttaatttccataagcatgtttg 33332493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 368 - 452
Target Start/End: Original strand, 24432654 - 24432738
Alignment:
Q  368 atgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| | | ||||||||| | |||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24432654 atgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatttaatttccataagcatatttg 24432738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 29485341 - 29485258
Alignment:
Q  368 atgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgttt 451  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| | | ||||||||| | |||| ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||    
T  29485341 atgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatttaatttccctaagcatgttt 29485258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 436; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 10097977 - 10097526
Alignment:
Q  1 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10097977 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 10097878  T
Q  101 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10097877 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 10097778  T
Q  201 cacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 300  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10097777 caagttggtaacctgaaaagagctgggtcttggactctgggtgctcttatcacatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 10097678  T
Q  301 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10097677 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 10097578  T
Q  401 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10097577 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 10097526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 10204862 - 10204411
Alignment:
Q  1 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10204862 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 10204763  T
Q  101 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10204762 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtagaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 10204663  T
Q  201 cacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 300  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10204662 caagttggtaacctgaaaagagctgggtcttggactctgggtgctcttatcacatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 10204563  T
Q  301 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10204562 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 10204463  T
Q  401 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10204462 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 10204411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Original strand, 6304321 - 6304772
Alignment:
Q  1 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6304321 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaaa 6304420  T
Q  101 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6304421 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggagaatcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 6304520  T
Q  201 cacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 300  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6304521 caagttgggaacctgaaaagagctgggtctttgactctgggtgctcttatcacatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 6304620  T
Q  301 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6304621 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 6304720  T
Q  401 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6304721 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 6304772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Original strand, 16458475 - 16458926
Alignment:
Q  1 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16458475 agggaaagacaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatattttatttgtcataatccaggtcacttcaag 16458574  T
Q  101 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16458575 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgcga 16458674  T
Q  201 cacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 300  Q
    || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||    
T  16458675 caagttgggaacctgaaaagggctaggtcttggactctgggtgctcttatcacatctgtccgagaaaggagtactttgaaacgttagaactggctgaagg 16458774  T
Q  301 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16458775 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtgttggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaaggat 16458874  T
Q  401 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16458875 gtgaagtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 16458926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 22625150 - 22624699
Alignment:
Q  1 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22625150 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcacaatccaggtcacttcaag 22625051  T
Q  101 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22625050 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggtaatccatccgttcagattgcaagtaaagatgagggttatgagagtgctggagcactaactgtga 22624951  T
Q  201 cacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 300  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  22624950 caagttgggaacctgaaaagggctgggtcttggactctgggtgctcttatcacatctgtccgagaaaggagtactttgaaacgttagagctgggagaagg 22624851  T
Q  301 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 400  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22624850 tggagtagttcgccttggcaacaataaagcttgtaaaattcaaggtattggtactatccgtctcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaaggat 22624751  T
Q  401 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22624750 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 22624699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Original strand, 10898015 - 10898466
Alignment:
Q  1 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10898015 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaaggctgatggcaataaaacatagtacaaatgttttatttgtcacaatccagctcacttcaag 10898114  T
Q  101 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10898115 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggtaatccttccgtttagattgcaagtaaagatgagggttatgagagtgctggagcactaactgtga 10898214  T
Q  201 cacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 300  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10898215 caagttgggaacctgaaaagggctgggtcttggactctggatgctcttatcacatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctggaagaagg 10898314  T
Q  301 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 400  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10898315 tggagtagttcgccttggcaataataaggcttgtaaaattcaaggtattggcactatccgtctcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaaggat 10898414  T
Q  401 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10898415 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 10898466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 29913126 - 29912675
Alignment:
Q  1 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  29913126 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcacaatccaggtcacttcaaa 29913027  T
Q  101 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 200  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29913026 aaggattgtccggaaagaaagggcaatggaggtggtaatccatccgttcagattgcaagtaatgaggaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 29912927  T
Q  201 cacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 300  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  29912926 caagttgggaacctgaaaagggctgggtcttggactctgggtgctcttatcacatctgtccgagaaaggagtactttgaaatgttagagctggaagaagg 29912827  T
Q  301 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 400  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29912826 tggagtagtttgccttggcaataataaggcctgtaaaattcaagttattggtactatccgtctcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaaggat 29912727  T
Q  401 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29912726 gtgaggtatattcctaaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 29912675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Original strand, 54189520 - 54189969
Alignment:
Q  1 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  54189520 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatct-ggtcacttcaag 54189618  T
Q  101 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 200  Q
    ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54189619 aagaattatccgaagagaaaggacaatggaggtggtaatccatccgttcagattgcaagtaaagatgagggttatgagagtgctggagcactaactgtga 54189718  T
Q  201 cacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 300  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  54189719 ca-gttgggaacctgaaaagggctgggtcttggacactgggtgctcttatcacatctgtccgagaaaggagtactttgaaacgttagagctgggagaagg 54189817  T
Q  301 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 400  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  54189818 tggagtagttcgccttggcaacaataaagcttgtaaaattcaaggtattggtactatccgtctcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaaggat 54189917  T
Q  401 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54189918 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 54189969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 10611948 - 10611497
Alignment:
Q  1 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10611948 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggaaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcacaatccaggtcacttcaag 10611849  T
Q  101 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||  | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10611848 aaagattgtccggagagaaaggacaatggaggtggtaatccatccgttcagcttgcaagagacgaggaaggttatgagagtgctcgagcactaactgtga 10611749  T
Q  201 cacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 300  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10611748 caagttgggaacctgaaaagggctgggtcttggactctgggtgctcttatcacatctgtccgagaaaggagtactttgaaacgttagagctggaagaagg 10611649  T
Q  301 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 400  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  10611648 tggagtagttcgccttggaaacaataaggcttgtaaaattcaaggtattggcactatccgtctcaaaatatttgatgcccgtgatttccttttgaaggat 10611549  T
Q  401 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
     ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10611548 atgaggtatattcctgaactgaagagaaatttaatatctataagcatgtttg 10611497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 4 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 47882056 - 47881608
Alignment:
Q  4 gaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaagaag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47882056 gaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtggtggtaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcacaatccaggtcacttcaagaag 47881957  T
Q  104 gattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgacac 203  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||| ||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  47881956 gattgtccggagagaaaaggcaatgaaagtggtaatccatccgttcagcttgcaagtgaagaggaaggttatgagagtgttggagcactaactatgacaa 47881857  T
Q  204 gttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggtgg 303  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  47881856 gttggaaacctgaaaagggttgggtcttggactctgggtgctcttatcacatctgtccgagaaaggagtactttgaaacattagagctaaaagaaggtgg 47881757  T
Q  304 agtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtg 403  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||| |    
T  47881756 agtagttcgccttggcaataataagacttgtaaaattcaaggtatgggcactatccgtctcaaaatgtttgatgaccttgatttgcttttgaaggatgcg 47881657  T
Q  404 aggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  47881656 aggtatattcctgaacttaaaagaaatttaatatctataagcatgtttg 47881608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 170 - 452
Target Start/End: Original strand, 28490308 - 28490590
Alignment:
Q  170 ggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaagg 269  Q
    |||||||||||||| || ||||||   || ||| |||||||||| || |||||||| || ||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  28490308 ggttatgagagtgcgggtgcactagtggtaacaagttgggaaccggagaagagctgagttttggactcgggatgctcttatcacatgtgtcctagaaatg 28490407  T
Q  270 agtactttgaaacgttagagctgaaagaaggtggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaat 369  Q
    | || ||||| || ||    || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||| | ||||||||||| |   | || || || ||    
T  28490408 aatattttgagactttgattcttaaagaaggaggagttgttcgacttggaaataacaaagcttgcaaagtccaaggtatgggcaacgttcgtctaaagat 28490507  T
Q  370 gtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| | | ||||||||| | |||| ||||||| | | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  28490508 gtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggttttttcccgaacttaagcgtaatttaatttccctaagcatgtttg 28490590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 8516049 - 8515764
Alignment:
Q  167 gaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaa 266  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||   || ||| |||||||||| || ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| ||  | || ||||    
T  8516049 gaaggttatgagagtgcgggtgcactagtggtaacaagttgggaaccggagaagagttaggttttggactcgggatgctcttatcacatgagccctagaa 8515950  T
Q  267 aggagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggtggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaa 366  Q
    |||| || ||||| || ||    || |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| |   | || || ||    
T  8515949 aggaatattttgagactttgattctaaaagaaggaggagttgttcgactcggaaataacaaagcttgcaaagtccaaggcatgggaaacgttcgtctaaa 8515850  T
Q  367 aatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
     ||||||||||  ||||| |||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  8515849 gatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtatgttcccgaacttaagcgaaatttaatttccataagcatgtttg 8515764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 32479295 - 32479010
Alignment:
Q  167 gaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaa 266  Q
    ||||||||||||||||| || || |||   || ||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||| ||  | || ||||    
T  32479295 gaaggttatgagagtgcgggtgcgctagtggtaacaagttgggaaccggagaagagttgggttttggactcgggatgctcttatcacatgagccctagaa 32479196  T
Q  267 aggagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggtggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaa 366  Q
    |||| || ||||| || ||    || |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| |   | || || ||    
T  32479195 aggaatattttgagactttgattctaaaagaaggaggagttgttcgactcggaaataacaaagcttgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaa 32479096  T
Q  367 aatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
     ||||||||||  ||||| |||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  32479095 gatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtatgttcccgaacttaagcgaaatttaatttccataagcatgtttg 32479010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 452
Target Start/End: Original strand, 2673352 - 2673637
Alignment:
Q  167 gaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaa 266  Q
    ||||||||||||||||| || || |||   || ||| |||||||||| || ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| ||  | || ||||    
T  2673352 gaaggttatgagagtgcgggtgcgctagtggtaacaagttgggaaccggagaagagttaggttttggactcgggatgctcttatcacatgagccctagaa 2673451  T
Q  267 aggagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggtggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaa 366  Q
    |||| || ||||| || ||    || |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| |   | || || ||    
T  2673452 aggaatattttgagactttgattctaaaagaaggaggagttgttcgactcggaaataacaaagcttgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaa 2673551  T
Q  367 aatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
     ||||||||||  ||||| |||||||| | | ||||||||| | |||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  2673552 gatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggttttttcccgaacttaagcgaaatttaatttccataagcatgtttg 2673637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 170 - 452
Target Start/End: Original strand, 3324671 - 3324953
Alignment:
Q  170 ggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaagg 269  Q
    ||||||||||| || || ||||||   || ||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||||||| | || ||||| || ||||    
T  3324671 ggttatgagagggcgggtgcactagtggtcacaagttgggaaccggagaagagttgggtgttggactcgggatgctcttattacatgtgtcctaggaagg 3324770  T
Q  270 agtactttgaaacgttagagctgaaagaaggtggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaat 369  Q
    | || ||||| || || |  || |||||||| ||||| ||| | || || ||||| || || || |||   ||||| ||||| ||  | || || || ||    
T  3324771 aatattttgatactttggctctaaaagaaggaggagttgtttgactcggaaataaaaaagcatgcaaagcccaaggcatgggcaccgttcgtctaaagat 3324870  T
Q  370 gtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| ||| ||||||||| | |||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  3324871 gtttgatggccgtgaattccttttaaaggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatttaatttccctaagcatgtttg 3324953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 279
Target Start/End: Original strand, 9602982 - 9603091
Alignment:
Q  170 ggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaagg 269  Q
    |||||||||||||| || ||||||   || ||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  9602982 ggttatgagagtgcgggtgcactagtggtcacaagttgggaaccggagaagagttgggttttggactcgggatgctcttatcatatgtgtcctagaaagg 9603081  T
Q  270 agtactttga 279  Q
    | || |||||    
T  9603082 aatattttga 9603091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 27734553 - 27734441
Alignment:
Q  160 caaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgt 259  Q
    |||||||||||||||||| ||||   ||||| || || | | | ||||||||||||||| ||||| |||  |||||||  | ||||| ||||| ||||||    
T  27734553 caaagatgaaggttatgaaagtgtgagagcattagctattagaagttgggaacctgaaacgagctaggttatggactcgggatgctcctatcaaatttgt 27734454  T
Q  260 ccaagaaaggagt 272  Q
    |||||||||||||    
T  27734453 ccaagaaaggagt 27734441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 129
Target Start/End: Original strand, 9602872 - 9602941
Alignment:
Q  60 agtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaagaaggattgtccggagagaaaggacaatgg 129  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||    
T  9602872 agtataaatgctttctttgtcataagcaaggtcacttcaagaaggattttccggatagagagggcaatgg 9602941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 368 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 16263116 - 16263032
Alignment:
Q  368 atgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| | | ||||||||| | |||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16263116 atgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatttaatttccctaagcatgtttg 16263032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 368 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 1309625 - 1309541
Alignment:
Q  368 atgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| | | ||||||||| | |||| ||||||| | | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  1309625 atgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgtaatttaatttccctaagcatgtttg 1309541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 108
Target Start/End: Original strand, 3324561 - 3324609
Alignment:
Q  60 agtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaagaaggattg 108  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3324561 agtataaatgctttctttgtcataagcaaggtcacttcaagaaggattg 3324609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 368 - 452
Target Start/End: Original strand, 9603180 - 9603264
Alignment:
Q  368 atgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||| ||||||||| |  |||  |||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  9603180 atgtttgatggccgtgaattccttttaaaggatgtgaggtttgctcccaaacttaagcgaaatttaatttccctaagcatgtttg 9603264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 432; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Original strand, 2737215 - 2737666
Alignment:
Q  1 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2737215 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 2737314  T
Q  101 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2737315 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 2737414  T
Q  201 cacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2737415 caagttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctgggtgctcttatcacatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 2737514  T
Q  301 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2737515 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 2737614  T
Q  401 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2737615 gtgaggtatattcctaaacttaggagaaatttaatatccgtaagcatgtttg 2737666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 22716404 - 22715953
Alignment:
Q  1 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22716404 agggaaagacaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatattttatttgtcataatccaggtcacttcaag 22716305  T
Q  101 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22716304 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgcga 22716205  T
Q  201 cacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 300  Q
    || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||    
T  22716204 caagttgggaacctgaaaagggctaggtcttggactctgggtgctcttatcacatctgtccgagaaaggagtactttgaaacgttagaactggctgaagg 22716105  T
Q  301 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22716104 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggttttggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaaggat 22716005  T
Q  401 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22716004 gtgaagtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 22715953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 20053931 - 20053480
Alignment:
Q  1 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20053931 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcacaatccaggtcacttcaag 20053832  T
Q  101 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20053831 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggtaatccatccgttcagcttgcaagtaaagaggaaggttatgagagtgttggagcactaactgtga 20053732  T
Q  201 cacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 300  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20053731 caagttgggaacctgaaaagggctgggtcttggactctgggtgctcttatcacatctgtccgagaaaggagtactttgaaacattagagctggaagaagg 20053632  T
Q  301 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 400  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  20053631 tggactagttcgccttggaaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggcactatccgtctcaaaatgtttgatgaccgtgatttccttttgaaggat 20053532  T
Q  401 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20053531 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatctataagcatgtttg 20053480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Original strand, 17933131 - 17933582
Alignment:
Q  1 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17933131 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctagatcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcacaatccaggtcacttcaag 17933230  T
Q  101 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 200  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  17933231 aaggattgtccggaaagaaagggcaatggaggtggaaatccatccgttcagattgcaagtaatgaggaaggttatgagagtgttggagcattaactgtga 17933330  T
Q  201 cacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 300  Q
    || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  17933331 caagttgggaacctgaaaagggttgggtcttggactctgggtgctcttatcacatctgtccgagaaaggagtactttgaaacgttagagttggaagaagg 17933430  T
Q  301 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 400  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  17933431 tggagtagttcgccttggcaataataaggcttgtaaaattcaaggtattggtactatccttctcaaaatgttttatgatcgtgatttccttttgaaggat 17933530  T
Q  401 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17933531 gttaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 17933582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 39681056 - 39681413
Alignment:
Q  1 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39681056 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 39681155  T
Q  101 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39681156 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggagaatcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 39681255  T
Q  201 cacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39681256 caagttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctgggtgctcttatcacatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 39681355  T
Q  301 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatc 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  39681356 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgagcactatc 39681413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 2 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 28456672 - 28456222
Alignment:
Q  2 gggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaaga 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  28456672 gggaaagacaagaattctaggtcaaagtataggtcgaggggtggtggtaataaaacaaagtacaaattttttatttgtcacaatctaggtcacttcaaga 28456573  T
Q  102 aggattgtccggagaga-aaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 200  Q
    | |||||||| |||||  ||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28456572 atgattgtcctgagagggaagga-aatggaagtggtagttcatccgttcagattgcaagtgaagacgaaggttatgagagtgttggagcactaactgtga 28456474  T
Q  201 cacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 300  Q
    || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  28456473 caagttgggaacctgaaaagggctaggtcttggactctggttgctcttatcacatctgtccgagaaatgagtactttgaaacattacagctgaaagaagg 28456374  T
Q  301 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 400  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28456373 tggagttgttcgccttggtaataataaggcttgcaaaattcaaggtatgggtactatccgtctcaaaatgtttgatgaccgtgatttccttttgaagaat 28456274  T
Q  401 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    |||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  28456273 gtgaggtatatttccgaacttgagagaaatttaatatctataagcatatttg 28456222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 353 - 452
Target Start/End: Original strand, 39683610 - 39683709
Alignment:
Q  353 actatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39683610 actatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaagagaaatttaatatccataagcatgtttg 39683709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 19348233 - 19347948
Alignment:
Q  167 gaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaa 266  Q
    ||||||||||||||||| || || |||   || ||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||    
T  19348233 gaaggttatgagagtgcaggtgcgctagtggtaacaagttgggaaccggagaagagttgggttttggactcgggatgctcttatcacatgtgtcctagaa 19348134  T
Q  267 aggagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggtggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaa 366  Q
    |||| || ||||| || ||    || |||||||| ||||| ||||| ||  | ||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| |   | || || ||    
T  19348133 aggaatattttgagactttgattctaaaagaaggaggagttgttcgactcagaaataacaaagcttgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaa 19348034  T
Q  367 aatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
     ||||||||||  ||||| |||||||| | | ||||||||| | |||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19348033 gatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatttaatttccataagcatgtttg 19347948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25402605 - 25402493
Alignment:
Q  167 gaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaa 266  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||   || ||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||    
T  25402605 gaaggttatgagagtgcgggtgcactagtggttacaagttgggaaccagagaagagttgggttttggactcgggatgctcttatcacatgtgtcctagaa 25402506  T
Q  267 aggagtactttga 279  Q
    |||| || |||||    
T  25402505 aggaatattttga 25402493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 417 - 452
Target Start/End: Original strand, 45568816 - 45568851
Alignment:
Q  417 aacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45568816 aacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 45568851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 279
Target Start/End: Original strand, 10446560 - 10446669
Alignment:
Q  170 ggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaagg 269  Q
    |||||||||||||| || ||||||   || ||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||| || ||||| || ||||    
T  10446560 ggttatgagagtgcgggtgcactagtggtcacaagttgggaaccggagaagagttgggttttggactcgggatgctcttatcacatgtgtcccaggaagg 10446659  T
Q  270 agtactttga 279  Q
    | || |||||    
T  10446660 aatattttga 10446669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 108
Target Start/End: Original strand, 10446450 - 10446498
Alignment:
Q  60 agtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaagaaggattg 108  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  10446450 agtataaatgctttctttgtcataagcaaggtcacttcaagaaggattg 10446498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 428; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 16756431 - 16755980
Alignment:
Q  1 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756431 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 16756332  T
Q  101 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756331 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggagaatcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 16756232  T
Q  201 cacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756231 caagttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctgggtgctcttatcacatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 16756132  T
Q  301 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756131 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggcactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 16756032  T
Q  401 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756031 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 16755980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Original strand, 28328918 - 28329369
Alignment:
Q  1 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28328918 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcactttaag 28329017  T
Q  101 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28329018 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggagaatcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 28329117  T
Q  201 cacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28329118 caagttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctgggtgctcttatcacatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 28329217  T
Q  301 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28329218 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggcactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 28329317  T
Q  401 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28329318 gtgaggtatattcctgaacttaagagaaatttaatatccataagcatgtttg 28329369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Original strand, 28891774 - 28892225
Alignment:
Q  1 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28891774 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 28891873  T
Q  101 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28891874 aaggattgtccagagagaaaggacaatggaggtggtaattcatccgttcagattgcaagtaaagatgagggttatgagagtgctggagcactaactgtga 28891973  T
Q  201 cacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 300  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28891974 caagttgggaacctgaaaagggctgggtcttggactctgggtgcacttatcatatctgttcgagaaaggaatactttgaaacgttagagctggaagaagg 28892073  T
Q  301 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28892074 tggagtagttcgccttggtaataataaagcttgtaaaattcaaggtattggtactatccgtctcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaaggat 28892173  T
Q  401 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28892174 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 28892225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Original strand, 21038440 - 21038891
Alignment:
Q  1 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21038440 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggaaataaaacatagtacaaatgttttatttgccataatccaggtcacttcaag 21038539  T
Q  101 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 200  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21038540 aaggattgtacggagagaaagggcaatggaggtggtaatccatccgttcagcttgcaagcgaagaggaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 21038639  T
Q  201 cacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 300  Q
    || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  21038640 caagttgggaacctgaaaagggttgggtcttggactctgggtgctcttatcacatctgtccgagaaaggattactttgaaacattagagctggaagaaag 21038739  T
Q  301 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 400  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  21038740 tggagtagttcgccttggcaataataaggcttgtaaaattcaaggtatggggactatccgtctcaaaatgtttgatgaccatgatttccttttgaaggat 21038839  T
Q  401 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  21038840 gtgaggtatattcctgaacttaggcaaaatttaatatctataagcatgtttg 21038891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 2 - 452
Target Start/End: Original strand, 33033651 - 33034102
Alignment:
Q  2 gggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaaga 101  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  33033651 gggaaaggcaagaattttaggtcaaagtctaggtccaagggtggtggcaataaaacacaatacaaatgttttatttgtcgcaatccaagtcacttcaaga 33033750  T
Q  102 aggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgac 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33033751 aggattgtccggagagaaagggcaatggaagtggtaatccatccgttcagattgcaagtgaagaggaatgttatgagagtgctggagcactaactgtgac 33033850  T
Q  202 acgttggg-aacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 300  Q
    | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33033851 aagttggggaacctgaaaagggctgggtcttggactctgggtgctcttatcacatatgttcgagaaaggagtactttgaaactttagagctgaaagaagg 33033950  T
Q  301 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 400  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |    
T  33033951 ttgagttgttcgccttggtaataataaggcttgcaaaattcaaggtatgggtattatccgtctcaaaatgtttaatgaccgtgatttccttttgaagggt 33034050  T
Q  401 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33034051 gtgaggtatattcctgaacttaagagaaatttaatatctataagcatgtttg 33034102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 2 - 452
Target Start/End: Original strand, 15945666 - 15946124
Alignment:
Q  2 gggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaaga 101  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||| |||||| || ||||| |||  |||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15945666 gggaaaggcaaaaaatccaagtcaaagcctaggttgacgggtggtggtgataaaacaaagtacacatgttttatttgtcacactccaggtcacttcaaga 15945765  T
Q  102 aggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagat-------tgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaa 194  Q
    |||||||||| |||||| | | ||||||| |||| | |||||||||||||||       || |||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15945766 aggattgtcctgagagatatggcaatggaagtggtagttcatccgttcagatatggcaatggaagtgaagaggaaggttattagagtgctggagcactaa 15945865  T
Q  195 ctgtgacacgttgggaacctgaaaagag-ctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctga 293  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||| || | |||  |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15945866 ctgtgacaagttgggaacctgaaaaaaggctgggtcgtggactctgggtgctcttatcacatctttccgggaaaggagtactttcaaactttagagctga 15945965  T
Q  294 aagaaggtggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttcctttt 393  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15945966 aagaaggtggagttgttcgccttggtaataataaagcttgcaaaattcaaggtttgggcaccatccatctcaaaatgtttgatgaccgtgatttcctttt 15946065  T
Q  394 gaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15946066 gaagaatgtgaggtatattcctaaacttaagagaaatttaatatctataagcatgtttg 15946124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 2 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 26269476 - 26269129
Alignment:
Q  2 gggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaaga 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  26269476 gggaaagacaagaattccaggtcaaagtctaggtccaagggtggtggtaataaaacttggtacaaatgttttatttgtcacaatctaggtcacttcaaga 26269377  T
Q  102 aggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgac 201  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||  ||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  26269376 aggattgtccagagagaatgggcaatggaagtggtaatccatccgttcagattgcaagtgaagagaaaggttatgcgagtgctggaacactaactgtgac 26269277  T
Q  202 acgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggt 301  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26269276 aagttgggaacctgaaaagggctgggtcttggactctagatgctcttatcacatctgtccgagaaaggactactttgaaactttagagctgaaagaaggt 26269177  T
Q  302 ggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatg 349  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26269176 ggggtagttcgccttggtaataataaggcttgcaaaattcaaggtatg 26269129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 167 - 452
Target Start/End: Original strand, 18866802 - 18867087
Alignment:
Q  167 gaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaa 266  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||   || ||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||    
T  18866802 gaaggttatgagagtgcaggtgcactagtggttacaagttgggaaccggagaagagctgggttttggactcgggatgctcttatcacatgtgtcctagaa 18866901  T
Q  267 aggagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggtggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaa 366  Q
    |||| || ||||| || ||    || |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| |   | || || ||    
T  18866902 aggaatattttgagactttgattctaaaagaaggaggagttgttcgactcggaaataacaaagcttgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaa 18867001  T
Q  367 aatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
     ||||||||||  ||||| |||||||| | | ||||||||| | |||| ||||||| | | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  18867002 gatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgtaatttaatttccctaagcatgtttg 18867087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 452
Target Start/End: Original strand, 10685396 - 10685681
Alignment:
Q  167 gaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaa 266  Q
    ||||||||||||||||| || || |||   || ||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||| ||  | || ||||    
T  10685396 gaaggttatgagagtgcgggtgcgctagtggtaacaagttgggaaccggagaagagttgggttttggactcgggatgctcttatcacatgagccctagaa 10685495  T
Q  267 aggagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggtggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaa 366  Q
    |||| || ||||| || ||    || |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| |   | || || ||    
T  10685496 aggaatattttgagactttgattctaaaagaaggaggagttgttcgactcggaaataacaaagcttgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaa 10685595  T
Q  367 aatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
     ||||||||||  ||||| |||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  10685596 gatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtatgttcccgaacttaagcgaaatttaatttccataagcatgtttg 10685681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 452
Target Start/End: Original strand, 18856407 - 18856692
Alignment:
Q  167 gaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaa 266  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||   || ||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||    
T  18856407 gaaggttatgagagtgcgggtgcactagtggttacaagttgggaaccggagaagagctgggttttggactcgggatgctcttatcacatgtgtcctagaa 18856506  T
Q  267 aggagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggtggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaa 366  Q
    |||| || ||||| || ||    || |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| |   | || || ||    
T  18856507 aggaatattttgagactttgattctaaaagaaggaggagttgttcgactcggaaataacaaagcttgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaa 18856606  T
Q  367 aatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
     ||||||||||  ||||| |||||||| | | ||||||||| | |||| ||||||| | | |||||||| ||| || | |||||||    
T  18856607 gatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgtaatttaatttccctatgtatgtttg 18856692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 35744345 - 35744059
Alignment:
Q  167 gaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaa 266  Q
    ||||||||||||||||| || || |||   || ||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  35744345 gaaggttatgagagtgcgggtgcgctagtggtaacaagttgggaaccggagaagagttgggttttggactcgggatgctcatatcacatgtgtcctagaa 35744246  T
Q  267 aggagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggt-ggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactca 365  Q
    |||| || ||||| || ||    || ||||||||  ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| |   | || || |    
T  35744245 aggaatattttgagactttgattctaaaagaaggaaggagttgttcgactcggaaataacaaagcttgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaa 35744146  T
Q  366 aaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    | ||||||||||  ||||| |||||||| | | ||||||||| | |||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  35744145 agatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatttaatttccataagcatgtttg 35744059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 26300305 - 26300020
Alignment:
Q  167 gaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaa 266  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||   || ||| |||||||||| || ||||| ||||| |||||||   | ||||||||||| || ||||  ||||    
T  26300305 gaaggttatgagagtgcgggtgcactagtggttacaagttgggaaccggagaagagttgggttttggacttgggatgctcttatcacatgtgtcatagaa 26300206  T
Q  267 aggagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggtggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaa 366  Q
    |||| || ||||| || ||    || |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| |   | ||  | ||    
T  26300205 aggaatattttgagactttgactctaaaagaaggaggagttgttcgactcggaaataacaaagcttgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtgtaaa 26300106  T
Q  367 aatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
     ||||||||||  ||||| |||||||| | | ||||||||| | |||| ||||||| | | |||||||| ||||||| ||||||||    
T  26300105 gatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgtaatttaatttccataaccatgtttg 26300020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 404; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 50377 - 49926
Alignment:
Q  1 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50377 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttattagtcataatccaggtcacttcaag 50278  T
Q  101 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50277 aaggattgtccagagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactatga 50178  T
Q  201 cacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 300  Q
     | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50177 gaagttgggaacctgaaaagagctaggtcttagactctgggtgctcttatcacatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 50078  T
Q  301 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50077 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtataggaactatacgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 49978  T
Q  401 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49977 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 49926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Original strand, 25446497 - 25446948
Alignment:
Q  1 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25446497 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcacaatccaggtcacttcaag 25446596  T
Q  101 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25446597 aaggattgtccggagtgaaaggacaatggaggtggtaatccatccgttcagattgcaagtaaagatgagggttatgatagtgctggagcactaactgtga 25446696  T
Q  201 cacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 300  Q
    || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25446697 caagttgggaacctgaaaagggttgggtcttggactctgggtgctcttatcacatctgtccgagaaaggagtactttgaaacgttagagctggaagaagg 25446796  T
Q  301 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 400  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  25446797 tggagtagttcgccttggcaacaataaagcttgtaaaattcaaggtattggtactatccgtctcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaatgat 25446896  T
Q  401 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25446897 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 25446948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 5 - 452
Target Start/End: Original strand, 10628373 - 10628820
Alignment:
Q  5 aaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaagaagg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||   || ||||||||||||||    
T  10628373 aaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtggtggtcataaaacaaagtacaaatgttttatttgtcacaacatagatcacttcaagaagg 10628472  T
Q  105 attgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacg 204  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  10628473 attgtcctgagaggaagggcaatggaagtggtaattcatccgttcagattgcaagtgaagaggaaggttatgagagtgttggagcactaactgtgacaag 10628572  T
Q  205 ttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggtgga 304  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10628573 ttgggaacctaaaaagggttgggtcttggactctgggtgttcttatcacatttgtccgagaaaggagtactttgaaactttagagctgaaagaaggtgga 10628672  T
Q  305 gtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtga 404  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  10628673 gttgtttgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgagtactattcgtctcaaaatgtttgatgaccgtgatttctttttgaagaatgtga 10628772  T
Q  405 ggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10628773 ggtatattcctgaacttaagagaaatttaatatctataagcatgtttg 10628820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 25 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 31781606 - 31781180
Alignment:
Q  25 aaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaagaaggattgtccggagagaaaggac 124  Q
    |||||||||  ||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| |    
T  31781606 aaagtctagtccgaagggtggttgtaataaaacaaagtacaaatgttttatttgtcacaatccaggtcacttcaagaatgattgtcatgagaggaagggc 31781507  T
Q  125 aatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagct 224  Q
    |||||  |||| | |||||||| ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |    
T  31781506 aatggcagtggtagttcatccgatcaaattgcaagtgaagaggaaggttatgagagtgttggagcactaaccgtgacaagttgggaacctgaaaagggtt 31781407  T
Q  225 gggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggtggagtagttcgccttggtaataa 324  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  31781406 gggtcttggactctggatgctcttatcacatctgtctgagaaaggagtactttgaaacattggagctgaaagaagatggagttgttcgccttggtaataa 31781307  T
Q  325 taaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttagg 424  Q
     |||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  31781306 caaggcttgtagaattcaaagtatgagtactaaccgtctcaaaatgtttaatgaccgtgatttccttttgaagaatgtgatgtatattcctgaacttaag 31781207  T
Q  425 agaaatttaatatccataagcatgttt 451  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  31781206 agaaatttaatatctataagcatgttt 31781180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 27448777 - 27448492
Alignment:
Q  167 gaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaa 266  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||   || ||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||    
T  27448777 gaaggttatgagagtgcgggtgcactagtggtaacaagttgggaaccggagaagagctgggttttggactcgggatgctcttatcacatgtgtcctagaa 27448678  T
Q  267 aggagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggtggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaa 366  Q
    | || || ||||| || ||    || |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| |   | || || ||    
T  27448677 atgaatattttgagactttgattctaaaagaaggaggagttgttcgactcggaaataacaaagcttgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaa 27448578  T
Q  367 aatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
     ||||||||||  ||||| |||||||| | | ||||||||| | |||| ||||||| | | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  27448577 gatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgtaatttaatttccctaagcatgtttg 27448492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 33790270 - 33789985
Alignment:
Q  167 gaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaa 266  Q
    ||||||||||||||||| || || |||   || ||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||    
T  33790270 gaaggttatgagagtgcgggtgcgctagtggtaacaagttgggaaccggagaagagttgggttttggactcgggatgctcttatcacatgtgtcctagaa 33790171  T
Q  267 aggagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggtggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaa 366  Q
    |||| || ||||| || ||    || |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| |   | |  || ||    
T  33790170 aggaatattttgagactttgattctaaaagaaggaggagttgttcgactcggaaataacaaagcttgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcatctaaa 33790071  T
Q  367 aatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
     ||||||||||  ||||| |||||||| | | ||||||||| | |||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  33790070 gatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatttaatttccataagcatgtttg 33789985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 43596076 - 43595791
Alignment:
Q  167 gaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaa 266  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||   || ||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||    
T  43596076 gaaggttatgagagtgcgggtgcactagtggtaacaagttgggaaccggagaagagctgggttttggactcgggatgctcttatcacatgtgtcctagaa 43595977  T
Q  267 aggagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggtggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaa 366  Q
    |||| || ||||| || ||    || |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| |   | || || ||    
T  43595976 aggaatattttgagactttgattctaaaagaaggaggagttgttcgactcggaaataacaaagcttgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaa 43595877  T
Q  367 aatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
     ||||||||||  ||||| |||||||| | | |||| |||| | |||| ||||||| | | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  43595876 tatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtaaggtttgttcccgaacttaagcgtaatttaatttccctaagcatgtttg 43595791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 43628870 - 43628585
Alignment:
Q  167 gaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaa 266  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||   || ||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||    
T  43628870 gaaggttatgagagtgcgggtgcactagtggtaacaagttgggaaccggagaagagctgggttttggactcgggatgctcttatcacatgtgtcctagaa 43628771  T
Q  267 aggagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggtggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaa 366  Q
    |||| || ||||| || ||    || |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| |   | || || ||    
T  43628770 aggaatattttgagactttgattctaaaagaaggaggagttgttcgactcggaaataacaaagcttgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaa 43628671  T
Q  367 aatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
     ||||||||||  ||||| |||||||| | | |||| |||| | |||| ||||||| | | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  43628670 tatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtaaggtttgttcccgaacttaagcgtaatttaatttccctaagcatgtttg 43628585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 74
Target Start/End: Original strand, 28788733 - 28788805
Alignment:
Q  2 gggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgtttta 74  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  28788733 gggaaaggcaaaaattccagatcaaagtctaggtcgaaggatggtggtaataaaacagagtacaaatgtttta 28788805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 452
Target Start/End: Original strand, 31398124 - 31398409
Alignment:
Q  167 gaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaa 266  Q
    ||||||||||||||||| || || |||   || ||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||| ||  | || ||||    
T  31398124 gaaggttatgagagtgcgggtgcgctagtggtaacaagttgggaaccggagaagagttgggttttggactcgggatgctcttatcacatgagccctagaa 31398223  T
Q  267 aggagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggtggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaa 366  Q
    ||||  | ||||| || ||    || |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| |   | || || ||    
T  31398224 aggaacattttgagactttgattctaaaagaaggaggagttgttcgactcggaaataacaaagcttgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaa 31398323  T
Q  367 aatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
     ||||||||||  ||||| |||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  31398324 gatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtatgttcccgaacttaagcgaaatttaatttccataagcatgtttg 31398409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 452
Target Start/End: Original strand, 37557756 - 37558041
Alignment:
Q  167 gaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaa 266  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||   || ||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||| ||   ||| ||||    
T  37557756 gaaggttatgagagtgcgggtgcactagtggtaacaagttgggaaccagagaagagttgggttttggactcgggatgctcttatcacatgattcctagaa 37557855  T
Q  267 aggagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggtggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaa 366  Q
     ||| || ||||| || ||    || |||||||| ||| | ||||| || || ||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| |   | || || ||    
T  37557856 tggaatattttgagactttgattctaaaagaaggaggaattgttcgactcggaaataacaaagcttgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaa 37557955  T
Q  367 aatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
     ||||||||||  ||||| |||||||| | | ||||||||| | |||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  37557956 gatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatttaatttccataagcatgtttg 37558041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 368 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 28837046 - 28836962
Alignment:
Q  368 atgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||| ||||||| | | |||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  28837046 atgtttgatggccgtgaattccttttaaaggatgtgagatttgttcccgaacttaagcgaaatttaatttccctaagcatgtttg 28836962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 361; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Original strand, 9522735 - 9523189
Alignment:
Q  1 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9522735 agggaaagccaagaattctaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 9522834  T
Q  101 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatga---aggttatgagagtgctggagcactaactg 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9522835 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggtaatccatccgttcagattgcaagtaaagaagaggaaggttatgagagtgctggagcactaactg 9522934  T
Q  198 tgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaaga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9522935 tgacaagttgggaacctgaaaagggatgggtcttggactctgggtgctcttatcacatctgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgtaaga 9523034  T
Q  298 aggtggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaag 397  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9523035 aggtggagtagttcgccttggcaataataatgcttgtaaaattcaaggtattggtactatccgtctcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaat 9523134  T
Q  398 aatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9523135 gatttgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 9523189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 2400394 - 2399944
Alignment:
Q  2 gggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaaga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2400394 gggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtggtggtaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcacaatccaggtcacttcaaga 2400295  T
Q  102 aggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgac 201  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2400294 aggactgtccggagagaaagggcaatggaagtggtaatccatccgttcagattgcaagtgaagaggaagcttatgagagtgctggagcactaactgtgac 2400195  T
Q  202 acgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggt 301  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2400194 aagttgggaacctgaaaagggctgggtcttggactctggatgctcttatcacatctgtccgagaaatgagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggt 2400095  T
Q  302 ggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatg 401  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  2400094 ggagtagttcgccttgataataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgtctcaaaatgtttgatgaccgtgatttccttttgaaggatg 2399995  T
Q  402 tgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2399994 tgaggtatattcctgaacttaagagaaatttaatatttataagcatgtttg 2399944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 295
Target Start/End: Original strand, 14998049 - 14998339
Alignment:
Q  5 aaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaagaagg 104  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||| |   |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||     
T  14998049 aaagacaagaaattcaggtcaaagtctatgtcgaagggtggtggtgataaaacaaa---caaatgttttatttgtcacacttcaggtcacttcaagaaga 14998145  T
Q  105 attgtccggagagaaaggacaatggaggtgg---aaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgac 201  Q
    ||||||| ||||||| || |||||   ||||   || |||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14998146 attgtcctgagagaaggggcaatgtgagtggtataagttcatccgttcagattgcaagtgaagaggaaggctatgagagtgttggagcactaactgtgac 14998245  T
Q  202 acgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaa 295  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14998246 aagttggaaacctgaaaagagctgggtcttgaactctggatgctcttatcacatctgttcaagaaaggagtactttgaaacattagagctgaaa 14998339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 167 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 41397194 - 41396909
Alignment:
Q  167 gaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaa 266  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||   || ||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||    
T  41397194 gaaggttatgagagtgcgggtgcactagtggtaacaagttgggaaccggagaagagttgggttttggactcgggatgctcttatcacatgtgtcctagaa 41397095  T
Q  267 aggagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggtggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaa 366  Q
    |||| || ||||| || ||    || |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| |   |  | || ||    
T  41397094 aggaatattttgagactttgattctaaaagaaggaggagttgttcgactcggaaataacaaagcttgcaaagtccaaggcatgggcaacgtttgtctaaa 41396995  T
Q  367 aatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
     ||||||||||  ||||| |||||||| | | ||||||||| | |||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  41396994 gatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatttaatttccataagcatgtttg 41396909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 279
Target Start/End: Original strand, 19359970 - 19360082
Alignment:
Q  167 gaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaa 266  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||   || ||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||    
T  19359970 gaaggttatgagagtgcgggtgcactagtggttacaagttgggaaccggagaagagttgggttttggactcgggatgctcttatcacatgtgtcctagaa 19360069  T
Q  267 aggagtactttga 279  Q
    |||| || |||||    
T  19360070 aggaatattttga 19360082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 452
Target Start/End: Original strand, 47100151 - 47100235
Alignment:
Q  368 atgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||| | |||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  47100151 atgtttgatgaccgtgaattcctattaaaggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatttaatttccctaagcatgtttg 47100235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Original strand, 15313328 - 15313779
Alignment:
Q  1 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15313328 agggaaaggcaagaattccaagtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacaaagtacaaatgttttatttgtcacaatccaggtcacttcaag 15313427  T
Q  101 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15313428 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggtaatccatccgttcaacttgcaagtaaagatgagggttgtgagagtgctggagcactaactgtga 15313527  T
Q  201 cacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 300  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15313528 caagttgggaacctgaaaagggctgggtcttggactctgggtgctcttatcacatctctccgagaaaggggtactttgaaacgttagagctggaagaagg 15313627  T
Q  301 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 400  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  15313628 tggagtagttcgccttggcaataataaggcttgtaaaattcaaggtattggcactatccgtctcaaaatgtttgatgaccgtgatttccttttgaaggat 15313727  T
Q  401 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15313728 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatctataagcatgtttg 15313779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 452
Target Start/End: Original strand, 4559217 - 4559666
Alignment:
Q  2 gggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaaga 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4559217 gggaaaggcaagaattccatgtcaaagtctaggtcgaagggtgttggtaataaaacacaatacaaatgttttatttgtcacaatccaggtcacttcaaga 4559316  T
Q  102 aggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgac 201  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4559317 aggattgtccagagagaaagggcaatggaagtggtaatccatccgttcagattgcaagtgaagaggaaggtgatgagagtgatggagcactaactgtgac 4559416  T
Q  202 acgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggt 301  Q
    | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4559417 aagttgggaacctgaaaagggatgggtcttggactctgggtgcgcttatcacatctgtcagagaatggagtactttgaaacattagagctgaaagaaggt 4559516  T
Q  302 ggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatg 401  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  4559517 ggagttgttcgccttgg-aataataaggcttttaaaattcaaagtataggtactatccgtctcaaaatgtttgatgaccgtgatttccttttgaaggatg 4559615  T
Q  402 tgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4559616 tgaggtatattcctgaacttaagagaaatttaatatctataagcatgtttg 4559666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 8 - 452
Target Start/End: Original strand, 16633507 - 16633951
Alignment:
Q  8 ggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaagaaggatt 107  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  16633507 ggcaagaatttcatgtcaaagtctaggtcgaagggttgtggtaataaaataaagtacaaatgttttatttctcacaatccaggtcacttcaagaaagatt 16633606  T
Q  108 gtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttg 207  Q
    ||||  ||||||||| ||||||| |||| | ||||| |||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||     
T  16633607 gtccaaagagaaagggcaatggaagtggtagttcattcgttcagagtgcaagtgaagaggaaggttatgagagtgcaggagcactaactgtgacaagttt 16633706  T
Q  208 ggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggtggagta 307  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||     
T  16633707 ggaacctgaaaagggttgggtcttggactctaggtgctcttttcacatttgtccgagaaaggagtactttgaaactttattgctgaaagaagctggagtt 16633806  T
Q  308 gttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggt 407  Q
     ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16633807 attcgccttggtaataataaggctttcaaaattcaaggtatgggtactatccatttcaaaatgtttgatgactgtgatttccttttgaagaatgtgaggt 16633906  T
Q  408 atattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    |||||| | || ||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16633907 atattcataaagttaagagaaaattaatatctataagcatgtttg 16633951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 452
Target Start/End: Original strand, 9225536 - 9225821
Alignment:
Q  167 gaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaa 266  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||   || ||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||    
T  9225536 gaaggttatgagagtgagggtgcactagtggtaacaagttgggaaccggagaagagctgggttttggactcgggatgctcttatcacatgtgtcctagaa 9225635  T
Q  267 aggagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggtggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaa 366  Q
    |||| || ||||| || ||    || |||||||| ||||| ||| | || || ||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| |   | || || ||    
T  9225636 aggaatattttgagactttgattctaaaagaaggaggagttgtttgactcggaaataacaaagcttgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaa 9225735  T
Q  367 aatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
     ||||||||||  ||||| |||||||| | | ||||||||| | |||| ||||||| | | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  9225736 gatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgtaatttaatttccctaagcatgtttg 9225821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 5146955 - 5146909
Alignment:
Q  68 tgttttatttgtcataatccaggtcacttcaagaaggattgtccgga 114  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  5146955 tgttttctttgtcataagcaaggtcacttcaagaaggattgtccgga 5146909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 354
Target Start/End: Original strand, 21549881 - 21549993
Alignment:
Q  242 tgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggtggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattc 341  Q
    |||||||||||| | || || | ||||||||| ||||| || |||||||| |||| | | ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||| |||    
T  21549881 tgctcttatcatgtgtgcccgaaaaaggagtattttgagactttagagctaaaagtatgcggagtcgttcggcttggaaacaacaaggcttgaaaagttc 21549980  T
Q  342 aaggtatgggtac 354  Q
    |||||||| ||||    
T  21549981 aaggtatgtgtac 21549993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 344; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Original strand, 17335 - 17786
Alignment:
Q  1 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtgatggcaataaaacacagtacaaatgttttatttgtcataatccaggtcacttcaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17335 agggaaaggcaagaattccaggtcaaagtctaggtcgaagggtggtgataataaaacacagtacaaatgttttatttgtcacaatccaggtcacttcaag 17434  T
Q  101 aaggattgtccggagagaaaggacaatggaggtggaaattcatccgttcagattgcaagcaaagatgaaggttatgagagtgctggagcactaactgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17435 aaggattgtccggagagaaagggcaatggaagtggtaatccatccgttcagattgcaagtacagaggaaggttatgaaagtgctagagcactaactgtga 17534  T
Q  201 cacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 300  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17535 caagttgggaacctgaaaagggctgggtcttggactctggatgctcttatcacatctgtccgagaaaggagtactttgaaacgttagagctgaaagaagg 17634  T
Q  301 tggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaat 400  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||    
T  17635 tggagtagttcgccttgggaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgtctcaaaatgtttgatgaccgtgatttccttgtgaaagat 17734  T
Q  401 gtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17735 gtgaggtatattcctgaacttaagagaaatttaatatccataagcatgtttg 17786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 167 - 452
Target Start/End: Original strand, 15441 - 15726
Alignment:
Q  167 gaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaa 266  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||   || ||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||    
T  15441 gaaggttatgagagtgcgggtgcactagtggtaacaagttgggaaccggagaagagttgggttttggactcgggatgctcttatcacatgtgtcctagaa 15540  T
Q  267 aggagtactttgaaacgttagagctgaaagaaggtggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaa 366  Q
    |||| || ||||| || ||    || |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| |   | || || ||    
T  15541 aggaatattttgagactttgattctaaaagaaggaggagttgttcgactcggaaataacaaagcttgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaa 15640  T
Q  367 aatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
     ||||||||||  ||||| |||||||| | | ||||||||| | |||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15641 gatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatttaatttccataagcatgtttg 15726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 1459 - 1177
Alignment:
Q  170 ggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaaagg 269  Q
    |||||||||||||| || ||||||   || ||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||| || ||||  ||||| |    
T  1459 ggttatgagagtgcgggtgcactagtggtcacaagttgggaaccggagaagagttgggttttggactcgggatgctcttatcacatgtgtcttagaaatg 1360  T
Q  270 agtactttgaaacgttagagctgaaagaaggtggagtagttcgccttggtaataataaggcttgtaaaattcaaggtatgggtactatccgactcaaaat 369  Q
    | || ||||| || || |  || |||||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||| || ||| | ||||| ||||| |   | || || || ||    
T  1359 aatattttgagactttggctctaaaagaaggaggagtagctcgactcggaaataacaaggcgtgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaagat 1260  T
Q  370 gtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttg 452  Q
    |||||||| || ||| |||||||| | | ||||||||| | |||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  1259 gtttgatggtcttgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatttaatttccctaagcatgtttg 1177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 279
Target Start/End: Original strand, 19071 - 19183
Alignment:
Q  167 gaaggttatgagagtgctggagcactaactgtgacacgttgggaacctgaaaagagctgggtcttggactctaggtgctcttatcatatttgtccaagaa 266  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||   || ||| |||||||||| || ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||    
T  19071 gaaggttatgagagtgcgggtgcactagtggttacaagttgggaaccggagaagagataggttttggactcgggatgctcttatcacatgtgtcctagaa 19170  T
Q  267 aggagtactttga 279  Q
    |||| || |||||    
T  19171 aggaatattttga 19183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University