View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21087_low_27 (Length: 391)

Name: NF21087_low_27
Description: NF21087
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21087_low_27
NF21087_low_27
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (1-386)||(7070391-7070776)
chr7 (5-386)||(25406010-25406391)
chr7 (5-377)||(3323991-3324363)
chr7 (1-386)||(25351948-25352333)
chr7 (1-365)||(44015865-44016229)
chr7 (3-251)||(16884073-16884321)
chr7 (3-251)||(24262016-24262264)
chr7 (3-251)||(12405483-12405731)
chr7 (3-229)||(9185872-9186098)
chr7 (3-142)||(18412804-18412943)
chr7 (3-142)||(21988066-21988205)
chr7 (3-142)||(5817987-5818127)
chr7 (3-142)||(21645171-21645310)
chr7 (3-142)||(49090823-49090962)
chr7 (46-133)||(48490293-48490380)
chr7 (46-130)||(6593726-6593810)
chr7 (46-130)||(18391364-18391448)
chr7 (46-274)||(22135627-22135855)
chr7 (46-274)||(40550654-40550882)
chr7 (46-121)||(1048525-1048600)
chr7 (46-133)||(6047449-6047536)
chr7 (46-121)||(7093697-7093772)
chr7 (46-121)||(7350887-7350962)
chr7 (46-121)||(38394961-38395036)
chr7 (46-133)||(47675330-47675417)
chr7 (46-133)||(31157521-31157608)
chr7 (46-121)||(44725552-44725627)
chr7 (48-121)||(36427-36500)
chr7 (46-115)||(13289735-13289804)
chr7 (54-115)||(24816607-24816668)
chr7 (1-70)||(23083697-23083766)
chr7 (46-115)||(26213702-26213771)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (1-386)||(13879335-13879720)
chr6 (1-386)||(25942265-25942650)
chr6 (1-386)||(17694051-17694436)
chr6 (1-385)||(5165043-5165427)
chr6 (1-304)||(22350171-22350472)
chr6 (3-251)||(14738265-14738513)
chr6 (3-146)||(33331244-33331387)
chr6 (295-386)||(22351348-22351439)
chr6 (5-141)||(9035447-9035583)
chr6 (46-130)||(16553567-16553651)
chr6 (46-130)||(16630123-16630207)
chr6 (42-134)||(25462698-25462790)
chr6 (46-130)||(34165775-34165859)
chr6 (46-133)||(5408262-5408349)
chr6 (46-133)||(5412587-5412674)
chr6 (46-121)||(26067631-26067706)
chr6 (46-130)||(16651828-16651912)
chr6 (46-274)||(33309704-33309932)
chr6 (46-121)||(30444261-30444336)
chr6 (3-92)||(24432179-24432268)
chr6 (46-134)||(12158206-12158294)
chr6 (46-130)||(16567877-16567961)
chr6 (3-71)||(21198222-21198289)
chr6 (105-150)||(4567662-4567707)
chr6 (1-162)||(10456828-10456989)
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (5-386)||(16756464-16756845)
chr8 (5-386)||(28328504-28328885)
chr8 (1-386)||(28891360-28891745)
chr8 (1-385)||(33033238-33033621)
chr8 (36-331)||(4819474-4819769)
chr8 (5-372)||(15945265-15945635)
chr8 (118-386)||(21034464-21034732)
chr8 (3-251)||(10684957-10685205)
chr8 (3-251)||(35744536-35744784)
chr8 (1-82)||(26269506-26269587)
chr8 (3-252)||(26300484-26300733)
chr8 (3-142)||(18853965-18854104)
chr8 (46-162)||(31577530-31577646)
chr8 (5-62)||(4819425-4819482)
chr8 (3-142)||(23800319-23800458)
chr8 (46-133)||(34255698-34255785)
chr8 (46-274)||(15069437-15069665)
chr8 (46-134)||(17848536-17848624)
chr8 (34-130)||(41366174-41366270)
chr8 (57-250)||(5591656-5591849)
chr8 (46-133)||(4732546-4732633)
chr8 (46-121)||(27828008-27828083)
chr8 (46-121)||(43080625-43080700)
chr8 (46-115)||(18811737-18811806)
chr8 (7-96)||(28314855-28314944)
chr8 (1-88)||(10380249-10380336)
chr8 (46-109)||(29542940-29543003)
chr8 (9-65)||(29281318-29281374)
[»] chr3 (48 HSPs)
chr3 (5-386)||(6303907-6304288)
chr3 (1-374)||(10204891-10205264)
chr3 (1-386)||(22625179-22625564)
chr3 (1-372)||(54189120-54189491)
chr3 (1-386)||(10897601-10897986)
chr3 (1-386)||(29913155-29913540)
chr3 (1-386)||(16458062-16458446)
chr3 (1-386)||(10611977-10612362)
chr3 (1-385)||(47882088-47882472)
chr3 (47-374)||(10098041-10098368)
chr3 (3-251)||(8516240-8516488)
chr3 (3-251)||(32479486-32479734)
chr3 (3-251)||(16263509-16263757)
chr3 (3-142)||(28489976-28490115)
chr3 (3-142)||(3324350-3324489)
chr3 (24-135)||(9602655-9602766)
chr3 (46-274)||(4309746-4309974)
chr3 (34-130)||(10210092-10210188)
chr3 (46-133)||(7763159-7763246)
chr3 (46-133)||(27421573-27421660)
chr3 (46-133)||(37407577-37407664)
chr3 (46-130)||(4599912-4599996)
chr3 (46-130)||(9635316-9635400)
chr3 (46-130)||(10057136-10057220)
chr3 (46-130)||(10059358-10059442)
chr3 (46-130)||(10061580-10061664)
chr3 (46-130)||(10063802-10063886)
chr3 (46-130)||(10066024-10066108)
chr3 (46-274)||(29811616-29811844)
chr3 (46-121)||(18098407-18098482)
chr3 (46-121)||(23199331-23199406)
chr3 (46-135)||(5192814-5192903)
chr3 (46-115)||(5898362-5898431)
chr3 (57-250)||(22834212-22834405)
chr3 (46-130)||(5259515-5259599)
chr3 (46-121)||(5192597-5192672)
chr3 (46-121)||(6065029-6065104)
chr3 (46-121)||(6717413-6717488)
chr3 (46-133)||(32891978-32892065)
chr3 (1-70)||(20631002-20631071)
chr3 (46-274)||(456701-456929)
chr3 (46-121)||(10957559-10957634)
chr3 (46-121)||(43227024-43227099)
chr3 (54-115)||(15821886-15821947)
chr3 (51-115)||(15830439-15830503)
chr3 (9-91)||(5329783-5329865)
chr3 (1-30)||(10098006-10098035)
chr3 (60-121)||(23634392-23634453)
[»] chr2 (16 HSPs)
chr2 (5-386)||(39680642-39681023)
chr2 (1-386)||(2736801-2737186)
chr2 (1-386)||(22716433-22716818)
chr2 (1-386)||(20053960-20054345)
chr2 (1-372)||(28456702-28457074)
chr2 (1-122)||(17932981-17933102)
chr2 (212-385)||(10941921-10942094)
chr2 (212-385)||(10947790-10947963)
chr2 (3-251)||(19348423-19348671)
chr2 (3-251)||(25402796-25403044)
chr2 (3-135)||(10446246-10446378)
chr2 (9-133)||(7974295-7974416)
chr2 (54-133)||(21519938-21520017)
chr2 (46-274)||(36560377-36560605)
chr2 (46-121)||(19503572-19503647)
chr2 (46-274)||(35217206-35217434)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (1-386)||(9522321-9522706)
chr1 (1-372)||(2400424-2400795)
chr1 (1-385)||(14997634-14998016)
chr1 (3-251)||(41397385-41397633)
chr1 (3-252)||(19359530-19359779)
chr1 (46-133)||(8348307-8348394)
chr1 (3-142)||(47099620-47099759)
chr1 (34-274)||(27338357-27338597)
chr1 (46-274)||(28202936-28203163)
chr1 (46-250)||(31657975-31658179)
chr1 (46-274)||(51750852-51751080)
chr1 (46-121)||(3805367-3805442)
chr1 (3-78)||(9024665-9024740)
chr1 (46-121)||(16227136-16227211)
chr1 (46-121)||(47178330-47178405)
chr1 (60-142)||(17346316-17346398)
chr1 (46-251)||(775843-776048)
chr1 (46-121)||(20301099-20301174)
chr1 (54-133)||(50168551-50168630)
chr1 (48-121)||(13126975-13127048)
chr1 (46-274)||(28841237-28841465)
chr1 (46-133)||(45654900-45654987)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (1-386)||(16921-17306)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (1-386)||(15312914-15313299)
chr4 (1-383)||(16633089-16633471)
chr4 (1-124)||(4559064-4559187)
chr4 (222-365)||(4558925-4559068)
chr4 (3-222)||(5147047-5147266)
chr4 (3-251)||(9225097-9225345)
chr4 (3-94)||(21549539-21549630)
chr4 (2-151)||(38983907-38984056)
chr4 (54-274)||(5872562-5872782)
chr4 (3-249)||(16624700-16624946)
chr4 (46-130)||(5136983-5137067)
chr4 (46-130)||(7123599-7123683)
chr4 (46-130)||(8394309-8394393)
chr4 (46-133)||(16933384-16933471)
chr4 (46-121)||(12740925-12741000)
chr4 (46-121)||(12749131-12749206)
chr4 (46-121)||(22781973-22782048)
chr4 (46-121)||(52094555-52094630)
chr4 (46-274)||(22133853-22134081)
chr4 (34-85)||(4588888-4588939)
chr4 (46-91)||(22045951-22045996)
chr4 (26-142)||(18241541-18241656)
chr4 (54-121)||(11007812-11007879)
chr4 (46-121)||(12402332-12402407)
chr4 (3-118)||(31480688-31480803)
chr4 (46-115)||(5206856-5206925)
chr4 (46-91)||(9175708-9175753)
chr4 (114-154)||(7442853-7442893)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (1-386)||(25446083-25446468)
chr5 (1-384)||(10627957-10628340)
chr5 (1-302)||(28788402-28788703)
chr5 (1-385)||(31781660-31782045)
chr5 (3-251)||(31397685-31397933)
chr5 (3-251)||(33790461-33790709)
chr5 (3-251)||(37557317-37557565)
chr5 (3-251)||(27448968-27449216)
chr5 (3-222)||(24556307-24556526)
chr5 (3-222)||(24597339-24597558)
chr5 (3-241)||(43596267-43596505)
chr5 (3-241)||(43629061-43629299)
chr5 (306-386)||(28786995-28787075)
chr5 (46-162)||(32584715-32584831)
chr5 (34-121)||(13694322-13694409)
chr5 (46-274)||(6745883-6746111)
chr5 (46-130)||(16408226-16408310)
chr5 (46-130)||(16545331-16545415)
chr5 (46-130)||(29721266-29721350)
chr5 (46-130)||(40381007-40381091)
chr5 (5-71)||(34841763-34841830)
chr5 (46-274)||(10750513-10750741)
chr5 (46-274)||(15356085-15356313)
chr5 (46-274)||(23665861-23666089)
chr5 (46-133)||(20505442-20505529)
chr5 (2-65)||(16566898-16566961)
chr5 (46-121)||(18467652-18467727)
chr5 (46-121)||(31543701-31543776)
chr5 (46-121)||(34478655-34478730)
chr5 (46-331)||(9788414-9788699)
chr5 (46-115)||(42427624-42427693)
chr5 (46-133)||(13486913-13487000)
chr5 (46-96)||(26173705-26173755)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (3-251)||(570-818)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (3-251)||(15002-15250)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (3-251)||(149648-149896)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (1-73)||(50406-50478)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (3-142)||(1653-1792)
[»] scaffold0842 (1 HSPs)
scaffold0842 (3-142)||(3996-4135)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (3-142)||(18741-18880)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (46-133)||(115491-115578)
[»] scaffold1899 (1 HSPs)
scaffold1899 (46-274)||(439-667)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (46-121)||(72753-72828)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (46-274)||(22941-23169)
[»] scaffold1908 (1 HSPs)
scaffold1908 (49-250)||(137-338)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (3-94)||(30333-30424)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (3-94)||(42420-42511)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 7070776 - 7070391
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7070776 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 7070677  T
Q  101 gccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7070676 gccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 7070577  T
Q  201 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7070576 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttca 7070477  T
Q  301 gacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgctact 386  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  7070476 gacattgcctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagcctcccttgatact 7070391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 25406391 - 25406010
Alignment:
Q  5 attcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25406391 attcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccc 25406292  T
Q  105 tctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatcta 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25406291 tctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacaataggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatcta 25406192  T
Q  205 tgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagaca 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25406191 tgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagaca 25406092  T
Q  305 ctgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgctact 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  25406091 ctgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagcctcccttgatact 25406010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 377
Target Start/End: Original strand, 3323991 - 3324363
Alignment:
Q  5 attcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3323991 attcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccc 3324090  T
Q  105 tctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatcta 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3324091 tctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacaataggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatcta 3324190  T
Q  205 tgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagaca 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3324191 tgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagaca 3324290  T
Q  305 ctgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3324291 ctgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagcctcc 3324363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 25352333 - 25351948
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25352333 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagt 25352234  T
Q  101 gccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25352233 gccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 25352134  T
Q  201 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25352133 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttca 25352034  T
Q  301 gacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgctact 386  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  25352033 gacattgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagtttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatact 25351948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Original strand, 44015865 - 44016229
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44015865 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttagttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagt 44015964  T
Q  101 gccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44015965 gccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaagaacttaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 44016064  T
Q  201 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  44016065 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccactattcggtaaaagtagagttgttgtttca 44016164  T
Q  301 gacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacaca 365  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  44016165 gacattgtctatgtgccaaggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacaca 44016229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 251
Target Start/End: Original strand, 16884073 - 16884321
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||    
T  16884073 acattcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgc 16884172  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatc 202  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| || |     || || |||||||| |||||||  ||||| ||    
T  16884173 cctccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaaggactttggtaatgaacaaagtaacaacaaagccttatcctcatcttccatgttaacctc 16884272  T
Q  203 tatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctcc 251  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||    
T  16884273 aatgttggccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctcc 16884321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24262264 - 24262016
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||    
T  24262264 acattcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgc 24262165  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatc 202  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| || |     || || |||||||| |||||||  ||||| ||    
T  24262164 cctccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaaggactttggtaatgaacaaagtaacaacaaagccttatcctcatcttccatgttaacttc 24262065  T
Q  203 tatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctcc 251  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||    
T  24262064 aatgttggccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctcc 24262016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 251
Target Start/End: Original strand, 12405483 - 12405731
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| | ||  |||||||||||||  || ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||    
T  12405483 acattcaagccttcactaccttcatcaaccttcatgtccttgaacttggtcaattttttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgc 12405582  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatc 202  Q
    |||| || |||||||  ||  |||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| || |     || || |||||||| |||||||  ||||| ||    
T  12405583 cctccttaccataaatgatggtatccttgaaatgctcaaaggactttggtaatgaacaaagtaacaacaaagccttatcctcatcttccatgttaacttc 12405682  T
Q  203 tatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctcc 251  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||    
T  12405683 aatgttggccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgtaagttgctcc 12405731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9186098 - 9185872
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    ||||||||||||||   ||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || | |||||||||  ||||||    
T  9186098 acattcaagccttcaataccttcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggaccttctccaaagtagtagtgc 9185999  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatc 202  Q
    |||| || |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| | ||| || |     || || |||||||| ||||||| |||||||||    
T  9185998 cctccttaccataaaggatgatatccttgaaatgctcaaaagactttggtaatgaacaaagtaacaacaaagccttatcctcatcttccatattaacatc 9185899  T
Q  203 tatgttcgccaaatcatcaataatctt 229  Q
     ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9185898 aatgttggccaaatcatcaagaatctt 9185872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Original strand, 18412804 - 18412943
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| | ||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||    
T  18412804 acattcaagccttcactaccttcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgc 18412903  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaa 142  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||| ||||||    
T  18412904 cctccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaa 18412943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Original strand, 21988066 - 21988205
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||    
T  21988066 acattcaagccttcaccaccttcatccaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacttccttcaaagtagtagtgc 21988165  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaa 142  Q
    ||||||| |||||||| ||  ||||| |||||| ||||||    
T  21988166 cctctttaccataaaggatggtatccgtgaaatgctcaaa 21988205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 5818127 - 5817987
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||  | ||||    
T  5818127 acattcaagccttcaccaccctcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttgtacctcctccaaagtagtggtgc 5818028  T
Q  103 cct-ctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaa 142  Q
    ||| |||| |||||||| ||  |||||||||||| ||||||    
T  5818027 cctccttttccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaa 5817987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Original strand, 21645171 - 21645310
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| | ||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||    
T  21645171 acattcaagccttcactaccttcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgc 21645270  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaa 142  Q
    |||| || |||||||  ||  ||||||| |||| ||||||    
T  21645271 cctccttaccataaatgatggtatccttaaaatgctcaaa 21645310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Original strand, 49090823 - 49090962
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || ||| |||||||||||||||| || |||||||||||  | ||||    
T  49090823 acattcaagtcttcaccaccttcatcaaccttcaagtcattgaacttggtcaattccttgtttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtggtgc 49090922  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaa 142  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||| ||||||    
T  49090923 cctccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaa 49090962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 48490380 - 48490293
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaa 133  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  48490380 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatccttgaa 48490293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 130
Target Start/End: Original strand, 6593726 - 6593810
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatcctt 130  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  6593726 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 6593810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 130
Target Start/End: Original strand, 18391364 - 18391448
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatcctt 130  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  18391364 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 18391448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22135855 - 22135627
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaagga 145  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| |||||  |||| |||||    ||||| ||    
T  22135855 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaaga 22135756  T
Q  146 cctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagt 245  Q
      | |||| |||||||| || | |||  |||||||||||||| || || |  || || || ||| |||| ||||| |  || || ||||||||||| |||    
T  22135755 tttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagt 22135656  T
Q  246 tgctccattataggttttgactccaccat 274  Q
    |||||||| || |  |||||||| |||||    
T  22135655 tgctccatgatggcctttgactctaccat 22135627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 40550882 - 40550654
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaagga 145  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| |||||  |||| |||||    ||||| ||    
T  40550882 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaaga 40550783  T
Q  146 cctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagt 245  Q
      | |||| |||||||| || | |||  |||||||||||||| || || |  || || || ||| |||| ||||| |  || || ||||||||||| |||    
T  40550782 tttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagt 40550683  T
Q  246 tgctccattataggttttgactccaccat 274  Q
    |||||||| || |  |||||||| |||||    
T  40550682 tgctccatgatggcctttgactctaccat 40550654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 121
Target Start/End: Original strand, 1048525 - 1048600
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| |||||    
T  1048525 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcat 1048600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 6047536 - 6047449
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaa 133  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||||| || ||  ||||||||||    
T  6047536 acttggtaaactcgttgattctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacaatgccttctttgccatatagaatggtatccttgaa 6047449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 121
Target Start/End: Original strand, 7093697 - 7093772
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| |||||    
T  7093697 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcat 7093772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 121
Target Start/End: Original strand, 7350887 - 7350962
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| |||||    
T  7350887 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcat 7350962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 38395036 - 38394961
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| |||||    
T  38395036 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcat 38394961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 133
Target Start/End: Original strand, 47675330 - 47675417
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaa 133  Q
    ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||| | |||||  ||||||||||    
T  47675330 acttggtcaactccctggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccacagagcatggtatccttgaa 47675417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 133
Target Start/End: Original strand, 31157521 - 31157608
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaa 133  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  31157521 acttggtcaactccttagttctcaaagctgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatgatatctttgaa 31157608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 44725627 - 44725552
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||| ||||||||||| |||||    
T  44725627 acttggtcaacttcttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaagataacagtgccttctttgccatagagcat 44725552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 48 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 36500 - 36427
Alignment:
Q  48 ttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| || | |||||| || |||||||| |||||    
T  36500 ttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaatttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcat 36427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 115
Target Start/End: Original strand, 13289735 - 13289804
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccata 115  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  13289735 acttggtcaactccttggttctcaaagttgtttgaacttcttccaatgtgacagtgccttctttgccata 13289804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 115
Target Start/End: Original strand, 24816607 - 24816668
Alignment:
Q  54 aactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccata 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||| |||||    
T  24816607 aactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttcttttccata 24816668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 23083697 - 23083766
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaa 70  Q
    ||||| |||| ||||| ||| |||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23083697 agacactcaaaccttcaccaatattgtcaaccttcaagttgttgaacttggttaactctttcgttctcaa 23083766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 26213771 - 26213702
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccata 115  Q
    ||||||| | ||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  26213771 acttggtcagctcattggttcttaaagccacttgaacttcttccatggtgacagtgccttctttgccata 26213702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 13879720 - 13879335
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13879720 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagt 13879621  T
Q  101 gccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13879620 gccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacaataggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 13879521  T
Q  201 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13879520 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttca 13879421  T
Q  301 gacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgctact 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13879420 gacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagcctcccttgatact 13879335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 25942650 - 25942265
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25942650 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagt 25942551  T
Q  101 gccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25942550 gccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 25942451  T
Q  201 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25942450 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttca 25942351  T
Q  301 gacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgctact 386  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  25942350 gacattgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagtttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatact 25942265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Original strand, 17694051 - 17694436
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17694051 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggtcaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagt 17694150  T
Q  101 gccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  17694151 gccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaagtctttatccttgtcttctagattaaca 17694250  T
Q  201 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17694251 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccattcgataaaagtagagttgttgtttca 17694350  T
Q  301 gacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgctact 386  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  17694351 gacattttctatgtgccaaagacttggttatgtataattaatcaagtttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatact 17694436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 5165043 - 5165427
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  5165043 agactttcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagatgcttgaactttctccaaagtgatagt 5165142  T
Q  101 gccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 200  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5165143 gtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaaggatcaaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttgcagattaaca 5165242  T
Q  201 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttca 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||     
T  5165243 tctacgttcgccaaatcatcaataatcttattgaatttcgtcaattgatccattataggttttgattccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcg 5165342  T
Q  301 gacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgctac 385  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  5165343 gacattgtctatgtgccaaggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgctac 5165427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 22350171 - 22350472
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  22350171 agacattaaagccttctccactatcatcaactttcaactctttgaacttggtcaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgataat 22350270  T
Q  101 gccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 200  Q
    ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22350271 gccatctttgccataaatcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcatacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 22350370  T
Q  201 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||    
T  22350371 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattatagg--ttgactccaccattcggtaaaagtagatttgttgtctca 22350468  T
Q  301 gaca 304  Q
    ||||    
T  22350469 gaca 22350472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14738513 - 14738265
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| | ||  |||||||||||||  || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||   |||||    
T  14738513 acattcaagccttcactaccttcatcaaccttcatgtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagcagtgc 14738414  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatc 202  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| || |     || || |||||||| |||||||  ||||| ||    
T  14738413 cctccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaaggactttggtaatgaacaaagtaacaacaaagccttatcctcatcttccatgttaacttc 14738314  T
Q  203 tatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctcc 251  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||    
T  14738313 aatgttggccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgtaagttgctcc 14738265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 33331387 - 33331244
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||    
T  33331387 acattcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgc 33331288  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggac 146  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||    
T  33331287 cctccttaccataaagaatggtatccttgaaatgctcaaaggac 33331244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 386
Target Start/End: Original strand, 22351348 - 22351439
Alignment:
Q  295 gtttcagacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgctact 386  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  22351348 gtttccgacattgactatgtgccaaagatttggtcatgtataatgaatcaagtttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatact 22351439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 141
Target Start/End: Original strand, 9035447 - 9035583
Alignment:
Q  5 attcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccc 104  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||  || |||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||  |||||||||||  ||||  ||    
T  9035447 attcaagccttcaccaccttcatcaaccttcatgtccttgaacttggttaattccttggttttcaaagccacttgaaactcctccaaagtagtagtttcc 9035546  T
Q  105 tctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaa 141  Q
    || || |||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  9035547 tcctttccataaaggatgatatccttaaaattctcaa 9035583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 16553651 - 16553567
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatcctt 130  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  16553651 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 16553567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 16630207 - 16630123
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatcctt 130  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  16630207 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 16630123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 134
Target Start/End: Original strand, 25462698 - 25462790
Alignment:
Q  42 ttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaa 134  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || | |||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  25462698 ttgaactcggtcaactccttggttctcaaagtcgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttaccataaagcatgatatctttgaaa 25462790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 34165859 - 34165775
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatcctt 130  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  34165859 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 34165775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 133
Target Start/End: Original strand, 5408262 - 5408349
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaa 133  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||  ||||||||||    
T  5408262 acttggtcaactccttggttcttaaatccgcttgaacttcttccaaggtgatagtgccttcttttccatagagcatggtatccttgaa 5408349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 133
Target Start/End: Original strand, 5412587 - 5412674
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaa 133  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||  ||||||||||    
T  5412587 acttggtcaactccttggttcttaaatccgcttgaacttcttccaaggtgatagtgccttcttttccatagagcatggtatccttgaa 5412674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 121
Target Start/End: Original strand, 26067631 - 26067706
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| |||||    
T  26067631 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcat 26067706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 16651912 - 16651828
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatcctt 130  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  16651912 acttggtcaactccttggttcttaaagccacttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 16651828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 33309932 - 33309704
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaagga 145  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| |||||  |||| |||||    ||||| ||    
T  33309932 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaaga 33309833  T
Q  146 cctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagt 245  Q
      | |||| |||||||| || | |||  |||||||||||||| || || |  || || || ||| |||| ||||| |  || || ||||||||||| |||    
T  33309832 tttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagt 33309733  T
Q  246 tgctccattataggttttgactccaccat 274  Q
    |||||||| || |  |||||||| |||||    
T  33309732 tgctccatgatggcctttgactctaccat 33309704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 30444336 - 30444261
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  30444336 acttggtcaactccttggttctcaaagccacttgaacttcttcctaggtgacagtgccttctttgccatagagcat 30444261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 24432268 - 24432179
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaa 92  Q
    |||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| || |||||||||||  | || |||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  24432268 acattcaagctttcaccaccctcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcgattccttggttctcaaagccgattggacctcctccaaa 24432179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 46 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 12158294 - 12158206
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaa 134  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| || || || |||| |||||| ||||||||||||| |||  |||||| ||||    
T  12158294 acttggtcaactccttggttctcaaagccgtttgaacatcttctaaggtgacagtgccttctttgccataaatcattgtatcctcgaaa 12158206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 46 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 16567961 - 16567877
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatcctt 130  Q
    ||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  16567961 acttggtcaacttcttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacaatgccttctttgccatagagcatggtatcctt 16567877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 71
Target Start/End: Original strand, 21198222 - 21198289
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaa 71  Q
    |||||||||||||| ||| || || |||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  21198222 acattcaagccttcacca-taccaccaaccttcaaatctttgaacttgattaactcctaggttctcaaa 21198289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 4567707 - 4567662
Alignment:
Q  105 tctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctag 150  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4567707 tctttaccataaagcatagtatccttgaagttctcaaaggatctag 4567662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 10456828 - 10456989
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |  | || |||||  |||||| || ||| |||||||  || |||||||| |||||||| || |||| | |    
T  10456828 agacactcaagccttcaccactatcatcagctctgaattctttagacttggctagctccttggttcaaaatgccgcttggacttcctctaaggtgacact 10456927  T
Q  101 gccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacaca 162  Q
    ||| || ||| ||||||||||  |||| |||||   | |||| || |||||||||| |||||    
T  10456928 gccttcgttgtcataaagcatggtatcattgaaggacccaaaagatctaggtaaagtacaca 10456989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 354; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 386
Target Start/End: Original strand, 16756464 - 16756845
Alignment:
Q  5 attcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756464 attcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccc 16756563  T
Q  105 tctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatcta 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756564 tctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacaataggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatcta 16756663  T
Q  205 tgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagaca 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756664 tgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagaca 16756763  T
Q  305 ctgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgctact 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16756764 ctgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagcctcccttgatact 16756845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 28328885 - 28328504
Alignment:
Q  5 attcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28328885 attcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccc 28328786  T
Q  105 tctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatcta 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28328785 tctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacaataggtgtaagactttatcctcgtcttccagattaacatcta 28328686  T
Q  205 tgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagaca 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28328685 tgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcaggca 28328586  T
Q  305 ctgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgctact 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  28328585 ctgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagcctcccttgatact 28328504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 28891745 - 28891360
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28891745 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagt 28891646  T
Q  101 gccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 200  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28891645 gctctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatccttgtcttccagattaaca 28891546  T
Q  201 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttca 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  28891545 tctatgttcgcgaaatcatcaataatcttattgaactccttcagttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttca 28891446  T
Q  301 gacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgctact 386  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  28891445 gacattgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcattagcctcccttgatact 28891360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 33033621 - 33033238
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  33033621 agacattcaagccttctccactatcattaaccttcaactctttgatcttggttaactctttggttctcaaaactgcttgaacttcctccaaagtgatagt 33033522  T
Q  101 gccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 200  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  33033521 gccttctttgccataaagcattgtatccttgaaattctcaaataacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcatcttccagatttaca 33033422  T
Q  201 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  33033421 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataagtttcgactccaccattcggtaaaagta-agttgttgcttca 33033323  T
Q  301 gacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgctac 385  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  33033322 gacattgtctatgtgccaaggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacagtagtagtctcccttgctac 33033238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 36 - 331
Target Start/End: Original strand, 4819474 - 4819769
Alignment:
Q  36 aactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaat 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4819474 aactctttgaacttggttaactctttggttcttaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaat 4819573  T
Q  136 tctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4819574 tctcaaaggacctaggtaaagcacacattaggtgtaagtctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcattaataatcttattgaa 4819673  T
Q  236 ctccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgccaaagacttggtcat 331  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4819674 ctccgtcatttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgccaaagacttggtcat 4819769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 5 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 15945635 - 15945265
Alignment:
Q  5 attcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15945635 attcaagccttctccactatcattaaccttcaactccttgaatttggttagctttttggttctcaaagccgcttggacttcctccaaagtgatagtgccc 15945536  T
Q  105 tctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatcta 204  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15945535 tctttgccataaagcattgtattcttgaaattctcaaaggacctaggtaattcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattcacatcta 15945436  T
Q  205 tgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttg---actccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcag 301  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  15945435 tgttctccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagtttctccattataggttttgagtacgccaccattcagtaaaagtagagttgttgtttcag 15945336  T
Q  302 acactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtag 372  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||    
T  15945335 acattgtctatgtgccaaggacttggtcatgtacgatgaatcatgtttattccacatagacacagtagtag 15945265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 118 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 21034732 - 21034464
Alignment:
Q  118 gcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatc 217  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21034732 gcatagtatccttgaaattctcaagggacctaggtaaagcacacagtaggtgaaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatc 21034633  T
Q  218 atcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgcc 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  21034632 atcaataatcttaatgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagtcattgtctatgtgcc 21034533  T
Q  318 aaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgctact 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  21034532 aaagacttggtcatgtataatgaatcaagtttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatact 21034464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 10685205 - 10684957
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||    
T  10685205 acattcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgc 10685106  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatc 202  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| || |     || || |||||||| |||||||  ||||| ||    
T  10685105 cctccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaaggactttggtaatgaacaaagtaacaacaaagccttatcctcatcttccatgttaacttc 10685006  T
Q  203 tatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctcc 251  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||    
T  10685005 aatgttggccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctcc 10684957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 251
Target Start/End: Original strand, 35744536 - 35744784
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||    
T  35744536 acattcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgc 35744635  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatc 202  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| || |     || || |||||||| |||||||  ||||| ||    
T  35744636 cctccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaaggactttggtaatgaacaaagtaacaacaaagccttatcctcatcttccatgttaacttc 35744735  T
Q  203 tatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctcc 251  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||    
T  35744736 aatgttggccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctcc 35744784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 26269506 - 26269587
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaac 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  26269506 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttgatcaactctttggttctcaaagcttcttgaac 26269587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 26300484 - 26300733
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| | ||  ||||||| |||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||    
T  26300484 acattcaagccttcactaccttcatcaatcttcaagtccttgaacttggtcaattcattggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgc 26300583  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatc 202  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||| |||||| ||| | ||||| | ||| || |     || || |||||||| |||||||  ||||| ||    
T  26300584 cctccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaaagactttggtaatgaacaaagtaacaacaaagccttatcctcatcttccatgttaacttc 26300683  T
Q  203 tatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctcca 252  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||| || || |||| || ||||||||    
T  26300684 aatgttggccaaatcatcaagaatcttgttaaattccgccaattgctcca 26300733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 18854104 - 18853965
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||    
T  18854104 acattcaagccttcaccaccttcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgc 18854005  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaa 142  Q
    |||| || |||||||| ||  ||||| |||||| ||||||    
T  18854004 cctccttaccataaaggatggtatccctgaaatgctcaaa 18853965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 162
Target Start/End: Original strand, 31577530 - 31577646
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaagga 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||   ||||| ||    
T  31577530 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaatagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattcaaaaga 31577629  T
Q  146 cctaggtaaagcacaca 162  Q
     || |||||||||||||    
T  31577630 tctcggtaaagcacaca 31577646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 62
Target Start/End: Original strand, 4819425 - 4819482
Alignment:
Q  5 attcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttg 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4819425 attcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttg 4819482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 23800458 - 23800319
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| || ||||||||||| || |  |||||||||||||||| ||| || |||||||||||  | ||||    
T  23800458 acattcaagccttcaccaccttcatcaactttcaagtccttgaacttggtcaatttcttggttctcaaagccgtttggacctcctccaaagtagtggtgc 23800359  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaa 142  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||| ||||||    
T  23800358 cctccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaa 23800319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 133
Target Start/End: Original strand, 34255698 - 34255785
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaa 133  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  34255698 acttggtcaactccttggttcttaaagccacttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatgatatccttgaa 34255785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15069665 - 15069437
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaagga 145  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| |||||  |||| |||||    ||||| ||    
T  15069665 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaaga 15069566  T
Q  146 cctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagt 245  Q
      | | || |||||||| || | |||  ||||||||||| || || || |  || || || ||| |||| |||||||  || || ||||||||||| |||    
T  15069565 tttcgatagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagt 15069466  T
Q  246 tgctccattataggttttgactccaccat 274  Q
    |||||||| || |  ||||||||||||||    
T  15069465 tgctccatgatggcctttgactccaccat 15069437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 17848624 - 17848536
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaa 134  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| | || |||||||||||| ||||||||||||    
T  17848624 acttggtttgctccttggttctcaaagcagcttgaacttcttccaaggtgacagtgcctttttagccataaagcatgatatccttgaaa 17848536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 130
Target Start/End: Original strand, 41366174 - 41366270
Alignment:
Q  34 tcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatcctt 130  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| | ||||||||| |||||  |||||||    
T  41366174 tcaagtctttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacggtgccttttttgccatagagcatggtatcctt 41366270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 57 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 5591849 - 5591656
Alignment:
Q  57 tctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaag 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||    ||||| || || |||| ||    
T  5591849 tctttggttctcaaagccgcttgaatttcttccaaggtgacggtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgatctcggtagag 5591750  T
Q  157 cacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctc 250  Q
    |||||| || | |||  | |||||| ||||| || |  |  || || |||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||    
T  5591749 cacacaacaagagtatagttttatcttcgtcctcaatttgcacctcaatgttctccaaatcatcaagaattttgttgaactccgtcaattgctc 5591656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 4732633 - 4732546
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaa 133  Q
    ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||    
T  4732633 acttggtcaactccttggtttttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgctatagagcatggtatccttgaa 4732546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 27828083 - 27828008
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| |||||    
T  27828083 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatatagcat 27828008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 43080700 - 43080625
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| |||||    
T  43080700 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcat 43080625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 18811806 - 18811737
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccata 115  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| || ||||||||    
T  18811806 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccata 18811737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 96
Target Start/End: Original strand, 28314855 - 28314944
Alignment:
Q  7 tcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtga 96  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||  | || |||||||   | ||||| ||||||||||||||||    
T  28314855 tcaagccttcaccactatcatcaaccttcaagcccttcaacttggttaatgccttagttctcagctctgcttggacttcctccaaagtga 28314944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 10380249 - 10380336
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctc 88  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||  | ||||||||| |||||| ||||||||| || ||   ||||||||||||    
T  10380249 agacattcaagccttcacgagtatcatcaaacttcaagaccttgaacttgattaactttttggttcttaatgctatttgaacttcctc 10380336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 46 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 29543003 - 29542940
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctcttt 109  Q
    ||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||    
T  29543003 acttggtcaactccttgggtcttaaagccgcttgaacttcctccatggtgacagtgccttcttt 29542940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 29281374 - 29281318
Alignment:
Q  9 aagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggtt 65  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||| || |||||||  |||||||||||||||    
T  29281374 aagccttcaccattatcatcaaacttcaagtccttgaactatgttaactctttggtt 29281318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 48)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 6304288 - 6303907
Alignment:
Q  5 attcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6304288 attcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccc 6304189  T
Q  105 tctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatcta 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6304188 tctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacaataggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatcta 6304089  T
Q  205 tgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagaca 304  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6304088 tgttcgccaaattatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagaca 6303989  T
Q  305 ctgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgctact 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  6303988 ctgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagcctcccttgatact 6303907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Original strand, 10204891 - 10205264
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10204891 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagt 10204990  T
Q  101 gccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10204991 gccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctgggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 10205090  T
Q  201 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttca 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10205091 tctatgttcgccaaatcattaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacggtaaaagtagagttgttgtttca 10205190  T
Q  301 gacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcc 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10205191 gacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagcc 10205264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Original strand, 22625179 - 22625564
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22625179 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagt 22625278  T
Q  101 gccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22625279 gccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 22625378  T
Q  201 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  22625379 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttca 22625478  T
Q  301 gacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgctact 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  22625479 gacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagtttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatact 22625564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 54189491 - 54189120
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54189491 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggtcaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagt 54189392  T
Q  101 gccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54189391 gccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacaacaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 54189292  T
Q  201 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttca 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  54189291 tctatgttcgccaaattatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttca 54189192  T
Q  301 gacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtag 372  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  54189191 gacattgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagtttattccacatagacacagcagtag 54189120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 10897986 - 10897601
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10897986 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggtcaactctttggttctcaaaactgcttgaacttcctccaaagtgatagt 10897887  T
Q  101 gccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10897886 gccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 10897787  T
Q  201 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10897786 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctcgattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttca 10897687  T
Q  301 gacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgctact 386  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  10897686 gacattgcctatgggccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagtttattccacatagacacagcagtagcctcccttgatact 10897601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Original strand, 29913155 - 29913540
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29913155 agacattcaagccttctccactatcttcaaccttcaactctttgaacttggtcaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagt 29913254  T
Q  101 gccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 200  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29913255 gccctatttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacggtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 29913354  T
Q  201 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  29913355 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttca 29913454  T
Q  301 gacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgctact 386  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  29913455 gacattgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagtttattcctcatagacacagcagtagactcccttgatact 29913540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 16458446 - 16458062
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  16458446 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaact-tttggttctcaaaactgcttgaacttcctccaaagtgatagt 16458348  T
Q  101 gccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16458347 gccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggatttatcttcgtcttccagattaaca 16458248  T
Q  201 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  16458247 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgctagttgctccattataggttttgactccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttca 16458148  T
Q  301 gacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgctact 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  16458147 gacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatact 16458062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Original strand, 10611977 - 10612362
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10611977 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaaatctttgaacttggtcaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagt 10612076  T
Q  101 gccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10612077 gccgtctttgccatagagcatagtatcctttaaattctcaaaggaccaaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 10612176  T
Q  201 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10612177 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatttgataaaagtagagttgttgtttca 10612276  T
Q  301 gacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgctact 386  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||| |||| ||| ||||    
T  10612277 gacattgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagtttattccacatagacacaacaatagtctcccttgatact 10612362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 47882088 - 47882472
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  47882088 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggtcaactctttggttctcaaagttgcttgaacttcctccaaagtgatagt 47882187  T
Q  101 gccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47882188 gccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctgggtaaagcccacagtaggtgtaaggctttatcatcgtcttccagattaaca 47882287  T
Q  201 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttca 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  47882288 tctatgttctccaaatcatcaataatcttattgaactccgtctgttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttca 47882387  T
Q  301 gacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgctac 385  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  47882388 gacattgtctatgtgctaaggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttatttcacatagacacaacagtagtctcccttgctac 47882472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 47 - 374
Target Start/End: Original strand, 10098041 - 10098368
Alignment:
Q  47 cttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggac 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10098041 cttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggac 10098140  T
Q  147 ctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagtt 246  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  10098141 ctgggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcattaataatcttattgaactccgtcaatt 10098240  T
Q  247 gctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaag 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10098241 gctccattataggttttgactccaccatacggtaaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaag 10098340  T
Q  347 cttattgcacatagacacagcagtagcc 374  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  10098341 cttattccacatagacacagcagtagcc 10098368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 251
Target Start/End: Original strand, 8516240 - 8516488
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||    
T  8516240 acattcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgc 8516339  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatc 202  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| || |     || || |||||||| |||||||  ||||| ||    
T  8516340 cctccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaaggactttggtaatgaacaaagtaacaacaaagccttatcctcatcttccatgttaacctc 8516439  T
Q  203 tatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctcc 251  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||    
T  8516440 aatgttggccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctcc 8516488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 251
Target Start/End: Original strand, 32479486 - 32479734
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||    
T  32479486 acattcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgc 32479585  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatc 202  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| || |     || || |||||||| |||||||  ||||| ||    
T  32479586 cctccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaaggactttggtaatgaacaaagtaacaacaaagccttatcctcatcttccatgttaacctc 32479685  T
Q  203 tatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctcc 251  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||    
T  32479686 aatgttggccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctcc 32479734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 251
Target Start/End: Original strand, 16263509 - 16263757
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||    
T  16263509 acattcaagccttcaccaccttcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgc 16263608  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatc 202  Q
     ||| || |||||||| ||  |||||||||||| |||||| ||| | | ||| | ||| || |     || || |||||||| ||||||| |||||| ||    
T  16263609 tctccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaaagactttgataatgaacaaagtaacaacaaagccttatcctcatcttccatattaacttc 16263708  T
Q  203 tatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctcc 251  Q
     ||||| ||||||||||||| ||| ||||| || |||| || |||||||    
T  16263709 aatgttggccaaatcatcaagaattttattaaattccgccaattgctcc 16263757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 28490115 - 28489976
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| | ||  |||||||||||||  || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||    
T  28490115 acattcaagccttcactaccttcatcaaccttcatgtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgc 28490016  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaa 142  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||| ||||||    
T  28490015 cctccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaa 28489976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 3324489 - 3324350
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||| |||| || |||||||||||  | ||||    
T  3324489 acattcaagccttcaccaccttcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaacgcctcttggacctcctccaaagtagtggtgc 3324390  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaa 142  Q
    | || || |||||||| ||  |||||||||||| ||||||    
T  3324389 cttccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaa 3324350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 9602766 - 9602655
Alignment:
Q  24 tcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataa 123  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||  | |||||||| || |||||||| ||      
T  9602766 tcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtggtgccctccttaccataaaggatgg 9602667  T
Q  124 tatccttgaaat 135  Q
    ||||||||||||    
T  9602666 tatccttgaaat 9602655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 274
Target Start/End: Original strand, 4309746 - 4309974
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaagga 145  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| |||||  |||| |||||    ||||| ||    
T  4309746 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatggtatctttgaacgattcaaaaga 4309845  T
Q  146 cctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagt 245  Q
      | |||| |||||||| || | |||  ||||||||||| || || || |  || || || ||| |||| |||||||  || || ||||||||||| |||    
T  4309846 tttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagt 4309945  T
Q  246 tgctccattataggttttgactccaccat 274  Q
    |||||||| || |  ||||||||||||||    
T  4309946 tgctccatgatggtctttgactccaccat 4309974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 10210188 - 10210092
Alignment:
Q  34 tcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatcctt 130  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  10210188 tcaagtctttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 10210092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 7763246 - 7763159
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaa 133  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  7763246 acttggttaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacaatgccttctttgccatagagcatggtatccttgaa 7763159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 27421660 - 27421573
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaa 133  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||| ||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  27421660 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttctttcaaagtgacaatgccttctttgccatagagcatggtatccttgaa 27421573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 37407664 - 37407577
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaa 133  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  37407664 acttggtcaactccttggttcttaaagccggttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatgatatccttgaa 37407577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 130
Target Start/End: Original strand, 4599912 - 4599996
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatcctt 130  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  4599912 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 4599996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 130
Target Start/End: Original strand, 9635316 - 9635400
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatcctt 130  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  9635316 acttggtcaactcattggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 9635400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 10057220 - 10057136
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatcctt 130  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  10057220 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 10057136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 10059442 - 10059358
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatcctt 130  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  10059442 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 10059358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 10061664 - 10061580
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatcctt 130  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  10061664 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 10061580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 10063886 - 10063802
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatcctt 130  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  10063886 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 10063802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 10066108 - 10066024
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatcctt 130  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  10066108 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 10066024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 29811844 - 29811616
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaagga 145  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| | | ||||||||| |||||  ||||||||||    ||||| ||    
T  29811844 acttggtcaactctttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgtcttatttgccatagagcatggtatccttgaaggattcaaatga 29811745  T
Q  146 cctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagt 245  Q
     || |||| |||||||| || | |||  || || || ||||| || || |  || || |||||| ||||||||||||  || || ||||||||||| | |    
T  29811744 tctcggtagagcacacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgttaat 29811645  T
Q  246 tgctccattataggttttgactccaccat 274  Q
    |||||||| |  |  ||||||||||||||    
T  29811644 tgctccatcacggtctttgactccaccat 29811616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 121
Target Start/End: Original strand, 18098407 - 18098482
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| |||||    
T  18098407 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcat 18098482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 121
Target Start/End: Original strand, 23199331 - 23199406
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  23199331 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcat 23199406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 46 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 5192903 - 5192814
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaat 135  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| |||||  |||| |||||||    
T  5192903 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaaat 5192814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 46 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 5898431 - 5898362
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccata 115  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||||||    
T  5898431 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccata 5898362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 57 - 250
Target Start/End: Original strand, 22834212 - 22834405
Alignment:
Q  57 tctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaag 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||    ||||| || || |||| ||    
T  22834212 tctttggttctcaaagccgcttgaatttcttccaaggtgacggtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgatctcggtagag 22834311  T
Q  157 cacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctc 250  Q
    |||||| || | |||  | |||||| ||||| || |  |  || || |||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||    
T  22834312 cacacaacaagagtatagttttatcttcgtcctcaatttgcacctcaatgttctccaaatcatcaagaattttgttgaactccgtcaattgctc 22834405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 130
Target Start/End: Original strand, 5259515 - 5259599
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatcctt 130  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  5259515 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacaatgccttctttgccatagagcatggtatcctt 5259599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 5192672 - 5192597
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| |||||    
T  5192672 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcat 5192597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 121
Target Start/End: Original strand, 6065029 - 6065104
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| |||||    
T  6065029 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcat 6065104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 6717488 - 6717413
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  6717488 acttggtcaactccttggttcttaaagccacttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcat 6717413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 32892065 - 32891978
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaa 133  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||  |||||| ||||| ||||| |||||  ||||||||||    
T  32892065 acttggtcaactccttggttctcaaagccggttgaacttcttccaaggtggcagtgccttctttcccatagagcatggtatccttgaa 32891978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 20631071 - 20631002
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaa 70  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||| | |||||||||| ||||||||    
T  20631071 agacactcaagccttcaccactatcatcaaccttcaagtctctcaactcgattaactctttagttctcaa 20631002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 46 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 456929 - 456701
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaagga 145  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| |||||  |||| |||||    ||||| ||    
T  456929 acttggtcaactcattggttctcaaagccgctcgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaaga 456830  T
Q  146 cctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagt 245  Q
      | |||| |||||||| || | |||  |||||||||||||| || || |  || || || ||| |||| ||||| |  || || ||||||||||| |||    
T  456829 tttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagt 456730  T
Q  246 tgctccattataggttttgactccaccat 274  Q
    |||||||| || |  |||||||| |||||    
T  456729 tgctccatgatggcctttgactctaccat 456701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 121
Target Start/End: Original strand, 10957559 - 10957634
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | |||| || |||||||| |||||    
T  10957559 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacaatgccttccttgccatagagcat 10957634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 43227099 - 43227024
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || | |||| | ||||||||||| |||||    
T  43227099 acttggtcaactccttggttctcaaagcctcttgaacttcttccaaggtaacagtgtcttctttgccatagagcat 43227024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 115
Target Start/End: Original strand, 15821886 - 15821947
Alignment:
Q  54 aactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccata 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||||||    
T  15821886 aactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacggtgccttctatgccata 15821947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 115
Target Start/End: Original strand, 15830439 - 15830503
Alignment:
Q  51 gttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccata 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  ||| || |||||||||||    
T  15830439 gttaactccttggttctcaaagccgcttgaactttttccaaggtggcagttccttctttgccata 15830503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 91
Target Start/End: Original strand, 5329783 - 5329865
Alignment:
Q  9 aagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaa 91  Q
    |||||||| ||||||||| |||  ||||| | ||||||||||||||| |  |||| |||||||||| | || |||||||||||    
T  5329783 aagccttcaccactatcaccaaatttcaagtatttgaacttggttaatttcttggatctcaaagcctcatggacttcctccaa 5329865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Original strand, 10098006 - 10098035
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaa 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10098006 agacattcaagccttctccactatcatcaa 10098035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 23634453 - 23634392
Alignment:
Q  60 ttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||| || ||||| ||||| |||||    
T  23634453 ttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagttccttcttttccatatagcat 23634392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 39681023 - 39680642
Alignment:
Q  5 attcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39681023 attcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccc 39680924  T
Q  105 tctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatcta 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39680923 tctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacaataggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatcta 39680824  T
Q  205 tgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagaca 304  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39680823 tgttcgtcaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcaggca 39680724  T
Q  305 ctgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgctact 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  39680723 ctgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagcctcccttgatact 39680642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 2737186 - 2736801
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  2737186 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagctgcttaaacttcctccaaagtgatagt 2737087  T
Q  101 gccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2737086 gccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctgggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 2736987  T
Q  201 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2736986 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttca 2736887  T
Q  301 gacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgctact 386  Q
    || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  2736886 gaaattgcctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagcctcccttgatact 2736801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Original strand, 22716433 - 22716818
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22716433 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactttttggttctcaaaactgcttgaacttcctccaaagtgatagt 22716532  T
Q  101 gccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22716533 gccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 22716632  T
Q  201 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  22716633 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttca 22716732  T
Q  301 gacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgctact 386  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  22716733 gacattgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagtttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatact 22716818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Original strand, 20053960 - 20054345
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20053960 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagttgcttgaacttcctccaaagtgatagt 20054059  T
Q  101 gccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20054060 gccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatgctcgtcttccagattaaca 20054159  T
Q  201 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  20054160 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttca 20054259  T
Q  301 gacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgctact 386  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||| ||||    
T  20054260 gacattgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagtttattccacatagacacaacagtagtctcccttgatact 20054345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 28456702 - 28457074
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||| || |||| || |||||||||||| ||||    
T  28456702 agacattcaagccttcttcactatcatcaaccttcaactcctttaatttggttagctctttggttctcaaaaccacttggacatcctccaaagtgctagt 28456801  T
Q  101 gccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtg-taaggctttatcctcgtcttccagattaac 199  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||| ||    
T  28456802 gccctctttgccataaagcattgtatccttgaaattatcaaaggacctaggtaaaacacacagtagggggtaaggatttatcctcatcttccatatttac 28456901  T
Q  200 atctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttc 299  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  28456902 atctatgttctccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttattccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagaattgttgtttc 28457001  T
Q  300 agacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtag 372  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||    
T  28457002 agacattgtctatgtgacaaggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagaaacaacagtag 28457074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 17933102 - 17932981
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17933102 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggtcaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 17933003  T
Q  101 gccctctttgccataaagcata 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17933002 gccctctttgccataaagcata 17932981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Original strand, 10941921 - 10942094
Alignment:
Q  212 caaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagacactgtcta 311  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10941921 caaatcatctatgatcttgttaaactatgtcagttgctccattatatattttgactccaccatccagtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtcta 10942020  T
Q  312 tgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgctac 385  Q
     ||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  10942021 cgtgccaaagactttgtcatatacaatgaatctagtttattccatatagacacatcagtagtctcccttgctac 10942094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Original strand, 10947790 - 10947963
Alignment:
Q  212 caaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagacactgtcta 311  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10947790 caaatcatctatgatcttgttaaactatgtcagttgctccattatatattttgactccaccatccagtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtcta 10947889  T
Q  312 tgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgctac 385  Q
     ||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  10947890 cgtgccaaagactttgtcatatacaatgaatctagtttattccatatagacacatcagtagtctcccttgctac 10947963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 251
Target Start/End: Original strand, 19348423 - 19348671
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||    
T  19348423 acattcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgc 19348522  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatc 202  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| || |     || || |||||||| |||||||  ||||| ||    
T  19348523 cctccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaaggactttggtaatgaacaaagtaacaacaaagccttatcctcatcttccatgttaacttc 19348622  T
Q  203 tatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctcc 251  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||    
T  19348623 aatgttggccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctcc 19348671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 251
Target Start/End: Original strand, 25402796 - 25403044
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| | ||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| || || ||||||||  ||||||    
T  25402796 acattcaagccttcactaccttcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttcttaaagccgcttggacctcttccaaagtagtagtgc 25402895  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatc 202  Q
    |||| || |||||||| ||  ||||||| |||| |||||| ||| | ||||| | ||| || |     || || |||||| | |||||||  ||||| ||    
T  25402896 cctccttaccataaaggatggtatccttaaaatgctcaaaagactttggtaatgaacaaagtaataacaaagccttatccccatcttccatgttaacttc 25402995  T
Q  203 tatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctcc 251  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||| || || ||||||| |||||||    
T  25402996 aatgttggccaaatcatcaagaatcttgttaaattccgtcaattgctcc 25403044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 10446378 - 10446246
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| ||||  | |||||||||||| || ||||||||||| || || ||| |||||||||||||||| || |||| ||||||  | ||||    
T  10446378 acattcaagccttcaccacctttatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttgattctcaaagccgcttggacctccttcaaagtagtggtgc 10446279  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaat 135  Q
    |||| || |||||||| ||  ||||||||||||    
T  10446278 cctccttaccataaaggatggtatccttgaaat 10446246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 133
Target Start/End: Original strand, 7974295 - 7974416
Alignment:
Q  9 aagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctt 108  Q
    |||||||| |||  |||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||| || |  |||||||||||||||||   ||||||||||  || |    
T  7974295 aagccttcaccaacatcatcaaccatcaaatctttgaacttagtcaactctttggttttctactccgcttgaacttcctcc---gtgatagtgctttcct 7974391  T
Q  109 tgccataaagcataatatccttgaa 133  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||    
T  7974392 tgccataaaacatgatatccttgaa 7974416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 133
Target Start/End: Original strand, 21519938 - 21520017
Alignment:
Q  54 aactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaa 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  21519938 aactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatgatatctttgaa 21520017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 274
Target Start/End: Original strand, 36560377 - 36560605
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaagga 145  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| |||||  |||| |||||    ||||| ||    
T  36560377 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaaga 36560476  T
Q  146 cctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagt 245  Q
      | |||| |||||||| || | |||  |||||||||||||| || || |  || || || ||| |||| ||||| |  || || ||||||||||| |||    
T  36560477 tttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagt 36560576  T
Q  246 tgctccattataggttttgactccaccat 274  Q
    |||||||| || |  |||||||| |||||    
T  36560577 tgctccatgatggcctttgactctaccat 36560605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 121
Target Start/End: Original strand, 19503572 - 19503647
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| |  |||||||| |||||    
T  19503572 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttacttgccatagagcat 19503647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 274
Target Start/End: Original strand, 35217206 - 35217434
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaagga 145  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| |||||  |||| |||||    ||||| ||    
T  35217206 acttggtcaaatccttggttctcaaagctgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaaga 35217305  T
Q  146 cctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagt 245  Q
      | |||| |||||||| || | |||  |||||||||||||| || || |  || || || ||| |||| ||||| |  || || ||||||||||| |||    
T  35217306 tttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagt 35217405  T
Q  246 tgctccattataggttttgactccaccat 274  Q
    |||||||| || |  |||||||| |||||    
T  35217406 tgctccatgatggcctttgactctaccat 35217434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 9522706 - 9522321
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9522706 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttcttaaagctgcttgcacttcctccaaagtgatagt 9522607  T
Q  101 gccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9522606 gccctttttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaagacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 9522507  T
Q  201 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9522506 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaacttcgtcagttgctccattataggttttgactccaccattcgataaaagtagagttgttgtttca 9522407  T
Q  301 gacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgctact 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  9522406 gacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagtttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatact 9522321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 2400424 - 2400795
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2400424 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttttcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagt 2400523  T
Q  101 gccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 200  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2400524 gccatctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcgtcgtcttccagattaaca 2400623  T
Q  201 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  2400624 tctatgttcgccaaatcatcaataattttattgaactctgtcagttgctccattatagattttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttca 2400723  T
Q  301 gacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtag 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||    
T  2400724 gacattgtctatgtgccaaagacttagtcatgtattatgaattaagtttattccatatagacacaacagtag 2400795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 14998016 - 14997634
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14998016 agacattcaagccttctccactatcatcaacctttaactccttgaatttggttagctctttggttctcaaagccgcttagacttcctccaaagtgatagt 14997917  T
Q  101 gccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  14997916 gccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacaataggtgtaaggctttatcttcatcttccagatttaca 14997817  T
Q  201 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  14997816 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatttggtaaaagtagagttgttgtttca 14997717  T
Q  301 gacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgctac 385  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||  |||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  14997716 gacattgtctatgtgccaaggacttggtcatgtacaa--aatcaagtctattccacatagacacaacagtagtctcccttgctac 14997634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 251
Target Start/End: Original strand, 41397385 - 41397633
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| | ||  |||||||||||||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||    
T  41397385 acattcaagccttcactaccttcatcaaccttcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgc 41397484  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatc 202  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| || |     || || |||||||| |||||||  ||||| ||    
T  41397485 cctccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaaggactttggtaatgaacaaagtaacaacaaagccttatcctcatcttccatgttaacttc 41397584  T
Q  203 tatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctcc 251  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||    
T  41397585 aatgttggccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgtaagttgctcc 41397633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19359779 - 19359530
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| | ||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |  |||||||||||  ||||||    
T  19359779 acattcaagccttcactaccttcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggaactcctccaaagtagtagtgc 19359680  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatc 202  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||| |||||| ||| | ||||| | ||| || |     || || |||||||| |||||||  ||||| ||    
T  19359679 cctccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaaagactttggtaatgaacaaagtaacaacaaagccttatcctcatcttccatgttaacttc 19359580  T
Q  203 tatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctcca 252  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||| || || |||| || ||||||||    
T  19359579 aatgttggccaaatcatcaagaatcttgttaaattccgccaattgctcca 19359530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 133
Target Start/End: Original strand, 8348307 - 8348394
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaa 133  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  8348307 acttggttaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaagataatagtgccttatttgccatagagcatgatatctttgaa 8348394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 47099759 - 47099620
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| ||||  || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || ||||||| |||  | || |    
T  47099759 acattcaagccttcaccaccttcttcaaccttcaagtccttgaacttggttaattccttggttctcaaagtcgcttggacctcctccagagtagtggttc 47099660  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaa 142  Q
    |||| || |||||||  ||  |||||||||||| ||||||    
T  47099659 cctccttaccataaatgatggtatccttgaaatgctcaaa 47099620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 274
Target Start/End: Original strand, 27338357 - 27338597
Alignment:
Q  34 tcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaa 133  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||| ||||| |||||  |||| |||||    
T  27338357 tcaagtctttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttcccatagagcatggtatctttgaa 27338456  T
Q  134 attctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattg 233  Q
        ||||| ||  | |||| |||||||| || | |||  ||||||||||| || || || |  || || || ||  |||| |||||||  || || |||    
T  27338457 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattatccaagtcatcaaggattttgttg 27338556  T
Q  234 aactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccat 274  Q
    |||||||| ||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  27338557 aactccgtaagttgctccatgatggtctttgactccaccat 27338597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 274
Target Start/End: Original strand, 28202936 - 28203163
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaagga 145  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| || | |||||| ||||||||||| |||||  |||| |||||    ||||| ||    
T  28202936 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaatttcatccaaggt-acagtgccttctttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaaga 28203034  T
Q  146 cctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagt 245  Q
      | |||| |||||||| || | |||  |||||||| || || || || |  || || || ||| |||| |||||||  || || |||||||||||||||    
T  28203035 tttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcttcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtcagt 28203134  T
Q  246 tgctccattataggttttgactccaccat 274  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||    
T  28203135 tgctccatgatggcttttgactccaccat 28203163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31658179 - 31657975
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaagga 145  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||||| |||||  ||||||||||    ||||| ||    
T  31658179 acttggtcaattccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacaatgccttctttgccatagagcatggtatccttgaaggattcaaatga 31658080  T
Q  146 cctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagt 245  Q
     || |||| |||||||| || | |||  |||||||| | ||| || || || || || |||||| ||||||||||||  || || ||||||||||| | |    
T  31658079 tctcggtagagcacacaacaagagtatagctttatctttgtcctcaagcttcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgttaat 31657980  T
Q  246 tgctc 250  Q
    |||||    
T  31657979 tgctc 31657975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 51751080 - 51750852
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaagga 145  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| |||||  |||| |||||    ||||| ||    
T  51751080 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaaga 51750981  T
Q  146 cctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagt 245  Q
      | |||| |||||||| || | |||  ||||||||||| || || || |  || || || ||| |||| |||||||  || || ||||||||||| |||    
T  51750980 tttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagt 51750881  T
Q  246 tgctccattataggttttgactccaccat 274  Q
    |||||||| || |  |||||||| |||||    
T  51750880 tgctccatgatggcctttgactctaccat 51750852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 121
Target Start/End: Original strand, 3805367 - 3805442
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||| | ||||||||||| |||||    
T  3805367 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttctaaggtgacagtgtcttctttgccatagagcat 3805442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 9024740 - 9024665
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgctt 78  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  9024740 acattcaagccttcaccaccctcatcaaccttcaagtccttaaacttggtcaattctttggttctcaaagtcgctt 9024665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 16227211 - 16227136
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| |||||    
T  16227211 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcat 16227136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 47178405 - 47178330
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| |||||    
T  47178405 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaatgtaacagtgccttccttgccatagagcat 47178330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 17346398 - 17346316
Alignment:
Q  60 ttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaa 142  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || |||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  17346398 ttggttctcaaagtcgcttggacctcctccaaagtaatggtgcgctcctttccataaaggatggtatccttgaaattctcaaa 17346316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 776048 - 775843
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaagga 145  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||  | |||||||| || |||||||| ||  |||||||||||| |||||| ||    
T  776048 acttggtcaacttcttggttctcaaagccgattggatctcctccaaagtagtggtgccctccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaaaga 775949  T
Q  146 cctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagt 245  Q
    | | ||||| | ||| || |     || || |||||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||| ||| || || || |||| || |    
T  775948 ctttggtaatgaacaaagtaacaacaaagccttatcctcatcttccatattaacttcaatgttggccaaatcatcaagaattttgttaaattccgccaat 775849  T
Q  246 tgctcc 251  Q
    ||||||    
T  775848 tgctcc 775843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 20301174 - 20301099
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| |||||    
T  20301174 acttggtcaattccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcat 20301099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 133
Target Start/End: Original strand, 50168551 - 50168630
Alignment:
Q  54 aactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaa 133  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| | |||| ||||| ||||| |||||  ||||||||||    
T  50168551 aactccttggttctcaaagccgtttgaacttcttccaaggtgacaatgccttcttttccatagagcatggtatccttgaa 50168630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 48 - 121
Target Start/End: Original strand, 13126975 - 13127048
Alignment:
Q  48 ttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||| || ||||||||||| |||||    
T  13126975 ttggtcaactccttggttctcaaagctgcttgaacttcttccaaggtaacagtaccttctttgccatagagcat 13127048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 28841465 - 28841237
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaagga 145  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || | |||| | || |||||||| |||||  |||| |||||    ||||| ||    
T  28841465 acttggtcaactccttggttctcaaagcctcttgaacttcttccaaggtaacagtgtcttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaaga 28841366  T
Q  146 cctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagt 245  Q
      | |||| |||||||| || | |||   |||||||||| || || || || || || || ||| |||| |||||||  || || ||||||||||| |||    
T  28841365 tttcggtagagcacacaacaagagtataactttatcctcatcctcaagtttcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagt 28841266  T
Q  246 tgctccattataggttttgactccaccat 274  Q
    |||||||| || |  |||||||| |||||    
T  28841265 tgctccatgatggcctttgactctaccat 28841237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 46 - 133
Target Start/End: Original strand, 45654900 - 45654987
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaa 133  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||  ||| | || | | ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  45654900 acttgattaactccttggttctcaaagccttttgaacttcttccaatttgacaatgtcttttttgccatagagcatgatatccttgaa 45654987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 17306 - 16921
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  17306 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaaatctttgaacttggtcaattctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtaatagt 17207  T
Q  101 gccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 200  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17206 gccctctttgccatagagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 17107  T
Q  201 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttca 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17106 tctatgttcaccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgattccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttca 17007  T
Q  301 gacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgctact 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  17006 gacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatact 16921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 15313299 - 15312914
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15313299 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaagtctttgaacttggtcaactctttggttatcaaagttgcttgaacttcctccaaagtgatagt 15313200  T
Q  101 gccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15313199 gccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 15313100  T
Q  201 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15313099 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtaagttgctccattataggttttgactccatcattcgataaaagtagagttgttgtttca 15313000  T
Q  301 gacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgctact 386  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  15312999 gacattgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataataaatcaagtttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatact 15312914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 16633471 - 16633089
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||    
T  16633471 agacattcaagccttatccactatcatcaaccttcaactccttgaatttggttaactctttggttctcaaagttgcttagacttcctccaaagtgatagt 16633372  T
Q  101 gccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |    
T  16633371 gccctctttgccataaagcattgtattcttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcgtcgtcgtccaaattcaaa 16633272  T
Q  201 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  16633271 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccatcagttactccattgtgggttttgactccaccattcggtataagtagagttgttgtttca 16633172  T
Q  301 gacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgct 383  Q
     ||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  16633171 aacattgtgtatgtgccaaggacttggtcatgtacaatgaatcaattttatttcacatagacacatcagtagtctcccttgct 16633089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 4559187 - 4559064
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4559187 agacattcaagccttctccactatcattaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 4559088  T
Q  101 gccctctttgccataaagcataat 124  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  4559087 gccctcttttccataaagcataat 4559064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 222 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 4559068 - 4558925
Alignment:
Q  222 ataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgccaaag 321  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||      
T  4559068 ataatcttattgaacttcgtcagttgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtaccaagt 4558969  T
Q  322 acttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacaca 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4558968 acttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacaca 4558925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 5147047 - 5147266
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  5147047 acattcaagccttcaccaccttcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattgtttggttctcaaagccgcttggacttcctccaaagtagtagtgc 5147146  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatc 202  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||| |||||| ||| | ||||| | ||| || |     || || |||||||| ||||||| |||||| ||    
T  5147147 cctccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaaagactttggtaatgaacaaagtaacaacaaagccttatcctcatcttccatattaacttc 5147246  T
Q  203 tatgttcgccaaatcatcaa 222  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  5147247 aatgttggccaaatcatcaa 5147266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 9225345 - 9225097
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    ||||||||||||||   ||  |||||||||||||  || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||    
T  9225345 acattcaagccttcagtaccttcatcaaccttcatgtcattgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgc 9225246  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatc 202  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| || |     || || |||||||| |||||||  ||||| ||    
T  9225245 cctccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaaggactttggtaatgaacaaagtaacaacaaagccttatcctcatcttccatgttaacttc 9225146  T
Q  203 tatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctcc 251  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||    
T  9225145 aatgttggccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgtaagttgctcc 9225097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 21549630 - 21549539
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagt 94  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  21549630 acattcaagccttcgccactttcttcaaccttcaaatccttgaacttggttaactccttggttctcaaaggtgcttgaacctcctccaaagt 21549539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 151
Target Start/End: Original strand, 38983907 - 38984056
Alignment:
Q  2 gacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtg 101  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||| || ||||||||  ||||||| || || ||||| |||||| ||    
T  38983907 gacattcaagcctttaccactatcatcaacattcaagtcattggacttgagtaactcattcgttctcaacaccgcttggacctcttccaaggtgataatg 38984006  T
Q  102 ccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctagg 151  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||||| | ||  |||||||||||    
T  38984007 ccctatttaccataaagcatattatgcttgaagtgcttgaaggacctagg 38984056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5872782 - 5872562
Alignment:
Q  54 aactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggta 153  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    ||||| || || ||||    
T  5872782 aactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatgatatccttgaaggattcaaatgatctcggta 5872683  T
Q  154 aagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccat 253  Q
     |||||||| || | |||  | ||| || ||||| || || |  || || |||||| ||||||||||||  || || ||||||||| | | |||||||||    
T  5872682 gagcacacaacaagggtatagttttgtcttcgtcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccattaattgctccat 5872583  T
Q  254 tataggttttgactccaccat 274  Q
     || |  ||||||||||||||    
T  5872582 catggtctttgactccaccat 5872562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16624946 - 16624700
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| || ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||  || |||||||||||  | || |    
T  16624946 acattcaagccttcaccaccttcatcaactttcaagtccttgaacttggtcaattccttggctctcaaagccgcttagacctcctccaaagtagtggttc 16624847  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatc 202  Q
    |||| ||  ||||||| ||  |||||||||||| ||| || ||| | ||||| | ||| || |     || || |||||||| ||||||| |||||| ||    
T  16624846 cctccttatcataaaggatggtatccttgaaatgctcgaaagactttggtaatgaacaaagtaacaacaaagcattatcctcatcttccatattaacttc 16624747  T
Q  203 tatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgct 249  Q
     ||||| ||||||||||||| ||| ||||| || |||| || |||||    
T  16624746 aatgttggccaaatcatcaagaattttattaaattccgccaattgct 16624700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 5137067 - 5136983
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatcctt 130  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  5137067 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 5136983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 7123683 - 7123599
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatcctt 130  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  7123683 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 7123599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 8394393 - 8394309
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatcctt 130  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  8394393 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 8394309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 133
Target Start/End: Original strand, 16933384 - 16933471
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaa 133  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  16933384 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatgatatctttgaa 16933471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 121
Target Start/End: Original strand, 12740925 - 12741000
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  12740925 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttcaaaggtgacagtgccttctttgccatagagcat 12741000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 121
Target Start/End: Original strand, 12749131 - 12749206
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  12749131 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttcaaaggtgacagtgccttctttgccatagagcat 12749206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 121
Target Start/End: Original strand, 22781973 - 22782048
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| |||||    
T  22781973 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcat 22782048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 121
Target Start/End: Original strand, 52094555 - 52094630
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||||| |||||    
T  52094555 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacaatgccttctttgccatagagcat 52094630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 46 - 274
Target Start/End: Original strand, 22133853 - 22134081
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaagga 145  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| |||||  |||| |||||    ||||| ||    
T  22133853 acttggtcaactgcttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaaga 22133952  T
Q  146 cctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagt 245  Q
      | |||| |||||||| || | |||  ||||||||||| || || || |  || || || ||| |||| |||||||  || || ||||||||||| |||    
T  22133953 tttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagt 22134052  T
Q  246 tgctccattataggttttgactccaccat 274  Q
    |||||||| || |  |||||||| |||||    
T  22134053 tgctccatgatggcctttgactctaccat 22134081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 4588939 - 4588888
Alignment:
Q  34 tcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttc 85  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4588939 tcaagtctttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttc 4588888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 91
Target Start/End: Original strand, 22045951 - 22045996
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaa 91  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22045951 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaa 22045996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 18241656 - 18241541
Alignment:
Q  26 atcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataata 125  Q
    |||||||||||| || |||||||| || || || ||  ||||||||||| |||| || |||||||||||  | |||||||| || |||||||| ||  ||    
T  18241656 atcaaccttcaagtccttgaacttagtcaattccttcattctcaaagccacttggacctcctccaaagtagtggtgccctccttaccataaag-atggta 18241558  T
Q  126 tccttgaaattctcaaa 142  Q
    |||||||||| ||||||    
T  18241557 tccttgaaatgctcaaa 18241541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 54 - 121
Target Start/End: Original strand, 11007812 - 11007879
Alignment:
Q  54 aactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| |||||    
T  11007812 aactccttggttctcaaagccacttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcat 11007879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 46 - 121
Target Start/End: Original strand, 12402332 - 12402407
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||| || || || |||||||| |||||||| || |||||    
T  12402332 acttggtcaacttcttggttctcaaatccgcttgaacttcttcaaaggtaatagtgccttctttgccgtagagcat 12402407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Original strand, 31480688 - 31480803
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    ||||||||||| || ||||| || |||||| | |  || |||||| |||| |  || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  | ||||    
T  31480688 acattcaagccctcaccactttcctcaaccctaatgtccttgaacatggtcatttccttggttctcaaagccgtttggacttcctccaaagtagtggtgc 31480787  T
Q  103 cctctttgccataaag 118  Q
    |||| || ||||||||    
T  31480788 cctccttaccataaag 31480803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 115
Target Start/End: Original strand, 5206856 - 5206925
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccata 115  Q
    ||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||    
T  5206856 acttggtcaacttcttggttcttaaagctgcttggacttcctccaaggtgatagtgtcttcttttccata 5206925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 91
Target Start/End: Original strand, 9175708 - 9175753
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaa 91  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  9175708 acttggtcaactccttgattctcaaagccgcttgaacttcttccaa 9175753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 7442893 - 7442853
Alignment:
Q  114 taaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaa 154  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  7442893 taaatcataatatccttgaaattcacaaatgacctaggtaa 7442853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 25446468 - 25446083
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25446468 agacattcaagccttctccactatcatcaaactttaactctttgaacttggttaactttttggttcttaaagctgtttgaacttcctccaaagtgatagt 25446369  T
Q  101 gccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25446368 gccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctgggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttctagattaaca 25446269  T
Q  201 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  25446268 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccacctttcgataaaagtagagttgttgtttca 25446169  T
Q  301 gacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgctact 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  25446168 gacactgtctatgtgccaaagacttgatcatgtataatgaatcaagtttattccacatagacatagcagtagcctcccttgatact 25446083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 10628340 - 10627957
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10628340 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagttgcttgaacttcctccaaagtgatagt 10628241  T
Q  101 gccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 200  Q
    | |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  10628240 gtcctctttgccataaaggattgtatccttgaaattctcaaatgacataggtaaagcacacagtaggtctaaggctttatcctcgtaatccagatttaca 10628141  T
Q  201 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttca 300  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  10628140 tctataatcgccaaatcaacaataatcttattgaactccgtcagttgctccattatcggttttgactccaccattcggttaaagtagagttgttgtttca 10628041  T
Q  301 gacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgcta 384  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||| |||| ||||||    
T  10628040 gacattgtctatgtgccaaggacttggtcatgcacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacaatagtctcccttgcta 10627957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 28788703 - 28788402
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28788703 agacattcaagccttctccactatcctcaaccttcaactctttgaacttggtcaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagt 28788604  T
Q  101 gccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 200  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28788603 gtcttctttgccataaagcataatatccttgaaattttcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 28788504  T
Q  201 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttca 300  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||    
T  28788503 tctatgttcgccaaatcatcaaaaatcttattaaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccgttcgataaaagtatggttgttgtttca 28788404  T
Q  301 ga 302  Q
    ||    
T  28788403 ga 28788402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 31781660 - 31782045
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  31781660 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactccttgaatttggttaactctttggttctcaaagttgcttgaccttcctccaaagtgatagt 31781759  T
Q  101 gccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaaca 200  Q
    ||||||||||||| ||  | |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  31781760 gccctctttgccaaaactctttgtattcttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcatacaacaggtgtaaggctttatcctcgtcttccatatttaca 31781859  T
Q  201 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattatagg-ttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttc 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  31781860 tctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaattccgtcagttgcttcattattggtttttgactcgaccattcggtaaaagtagagttgttgtttc 31781959  T
Q  300 agacactgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgctac 385  Q
    ||||| |||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||| |||| |||||||    
T  31781960 agacattgtctatgtgtccaggacttggtcatgtacaatgaatcaagtttattccacatagacacaacaatagtctcccttgctac 31782045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 31397933 - 31397685
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||    
T  31397933 acattcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgc 31397834  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatc 202  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| || |     || || |||||||| |||||||  ||||| ||    
T  31397833 cctccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaaggactttggtaatgaacaaagtaacaacaaagccttatcctcatcttccatgttaacctc 31397734  T
Q  203 tatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctcc 251  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||    
T  31397733 aatgttggccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctcc 31397685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 251
Target Start/End: Original strand, 33790461 - 33790709
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||    
T  33790461 acattcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgc 33790560  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatc 202  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| || |     || || |||||||| |||||||  ||||| ||    
T  33790561 cctccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaaggactttggtaatgaacaaagtaacaacaaagccttatcctcatcttccatgttaacttc 33790660  T
Q  203 tatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctcc 251  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||    
T  33790661 aatgttggccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctcc 33790709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 37557565 - 37557317
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||    
T  37557565 acattcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgc 37557466  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatc 202  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| || |     || || |||||||| |||||||  ||||| ||    
T  37557465 cctccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaaggactttggtaatgaacaaagtaacaacaaagccttatcctcatcttccatgttaacttc 37557366  T
Q  203 tatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctcc 251  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||    
T  37557365 aatgttggccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctcc 37557317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 251
Target Start/End: Original strand, 27448968 - 27449216
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| | ||  |||||||||||||  || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||     
T  27448968 acattcaagccttcactaccttcatcaaccttcatgtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgt 27449067  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatc 202  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| || |     || || |||||||| |||||||  ||||| ||    
T  27449068 cctccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaaggactttggtaatgaacaaagtaacaacaaagccttatcctcatcttccatgttaacttc 27449167  T
Q  203 tatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctcc 251  Q
     ||||| | ||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||    
T  27449168 aatgttggtcaaatcatcaagaatcttgttaaactccgtcaattgctcc 27449216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24556526 - 24556307
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||| || || ||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  | ||||    
T  24556526 acattcaagccttcaccaacatcatcaacctttaagtccttgaacttggtcaattatttggttctcaaagccgattggacttcctccaaagtagtggtgc 24556427  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatc 202  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||| |||||| ||| | ||||| | ||| || |    ||| || |||||||||||||||| || ||| ||    
T  24556426 cctccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaaagactttggtaatgaacaaagtaacaataaagccttatcctcgtcttccatataaacttc 24556327  T
Q  203 tatgttcgccaaatcatcaa 222  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  24556326 aatgttggccaaatcatcaa 24556307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24597558 - 24597339
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||| || || ||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  | ||||    
T  24597558 acattcaagccttcaccaacatcatcaacctttaagtccttgaacttggtcaattatttggttctcaaagccgattggacttcctccaaagtagtggtgc 24597459  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatc 202  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||| |||||| ||| | ||||| | ||| || |    ||| || |||||||||||||||| || ||| ||    
T  24597458 cctccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaaagactttggtaatgaacaaagtaacaataaagccttatcctcgtcttccatataaacttc 24597359  T
Q  203 tatgttcgccaaatcatcaa 222  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  24597358 aatgttggccaaatcatcaa 24597339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 241
Target Start/End: Original strand, 43596267 - 43596505
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| | ||  ||||||| |||||  || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||    
T  43596267 acattcaagccttcactaccttcatcaatcttcatgtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgc 43596366  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatc 202  Q
    |||| || |||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||| | ||||| | ||| || |     || || |||||||| |||||||  ||||| ||    
T  43596367 cctccttaccataaaggatggtattcttgaaatgctcaaaggactttggtaatgaacaaagtaacaacaaagccttatcctcatcttccatgttaacttc 43596466  T
Q  203 tatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgt 241  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  43596467 aatgttggccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgt 43596505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 241
Target Start/End: Original strand, 43629061 - 43629299
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| | ||  ||||||| |||||  || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||    
T  43629061 acattcaagccttcactaccttcatcaatcttcatgtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgc 43629160  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatc 202  Q
    |||| || |||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||| | ||||| | ||| || |     || || |||||||| |||||||  ||||| ||    
T  43629161 cctccttaccataaaggatggtattcttgaaatgctcaaaggactttggtaatgaacaaagtaacaacaaagccttatcctcatcttccatgttaacttc 43629260  T
Q  203 tatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgt 241  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  43629261 aatgttggccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgt 43629299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 306 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 28787075 - 28786995
Alignment:
Q  306 tgtctatgtgccaaagacttggtcatgtataatgaatcaagcttattgcacatagacacagcagtagcctcctttgctact 386  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  28787075 tgtctatgtgccaaagacttggccatgtataatgaatcaagtttattccacatagacacagcagtagtctcccttgatact 28786995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 32584831 - 32584715
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaagga 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || |||||||| || || |||||||||| |||  ||||| ||||   |||||| ||    
T  32584831 acttggttaactctttggttctcaattccgcttggacttcctcaaaggtgatagttccttccttgccataaatcatggtatccatgaaggactcaaaaga 32584732  T
Q  146 cctaggtaaagcacaca 162  Q
     ||||||||||||||||    
T  32584731 tctaggtaaagcacaca 32584715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 121
Target Start/End: Original strand, 13694322 - 13694409
Alignment:
Q  34 tcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| | || | ||||||||||| |||||    
T  13694322 tcaactccttgaacttggttaactcattggtcctcaaagccgcttggacttccttcaaagtgacaatgtcttctttgccatagagcat 13694409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6746111 - 6745883
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaagga 145  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| |||||  |||| |||||    ||||| ||    
T  6746111 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaaga 6746012  T
Q  146 cctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagt 245  Q
      | |||| |||||||| || | |||  ||||| ||||| || || || |  || || || ||| |||| |||||||  || || ||||||||||| |||    
T  6746011 tttcggtagagcacacaacaagagtatagctttttcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagt 6745912  T
Q  246 tgctccattataggttttgactccaccat 274  Q
    |||||||| || |  ||||||||||||||    
T  6745911 tgctccatgatggcctttgactccaccat 6745883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 16408310 - 16408226
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatcctt 130  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  16408310 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 16408226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 16545415 - 16545331
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatcctt 130  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  16545415 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 16545331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 29721350 - 29721266
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatcctt 130  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  29721350 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 29721266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 40381091 - 40381007
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatcctt 130  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  40381091 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 40381007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 71
Target Start/End: Original strand, 34841763 - 34841830
Alignment:
Q  5 attcaagccttctccactatcatcaacctt-caactctttgaacttggttaactctttggttctcaaa 71  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34841763 attcaagccttcaccactttcatcaacctttcaaatctttgaacttggttaactccttggttctcaaa 34841830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 10750741 - 10750513
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaagga 145  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| |||||  |||| |||||    ||||| ||    
T  10750741 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaaga 10750642  T
Q  146 cctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagt 245  Q
      | |||| |||||||| || | |||  |||||||||||||| || || |  || || || ||| |||| ||||| |  || || ||||||||||| |||    
T  10750641 tttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagt 10750542  T
Q  246 tgctccattataggttttgactccaccat 274  Q
    |||||||| || |  |||||||| |||||    
T  10750541 tgctccatgatggcctttgactctaccat 10750513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 274
Target Start/End: Original strand, 15356085 - 15356313
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaagga 145  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| |||||  |||| |||||    ||||| ||    
T  15356085 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaaga 15356184  T
Q  146 cctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagt 245  Q
      | |||| |||||||| || | |||  |||||||||||||| || || |  || || || ||| |||| ||||| |  || || ||||||||||| |||    
T  15356185 tttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagt 15356284  T
Q  246 tgctccattataggttttgactccaccat 274  Q
    |||||||| || |  |||||||| |||||    
T  15356285 tgctccatgatggcctttgactctaccat 15356313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23666089 - 23665861
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaagga 145  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| |||||  |||| |||||    ||||| ||    
T  23666089 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaaga 23665990  T
Q  146 cctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagt 245  Q
      | |||| |||||||| || | |||  |||||||||||||| || || |  || || || ||| |||| ||||| |  || || ||||||||||| |||    
T  23665989 tttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagt 23665890  T
Q  246 tgctccattataggttttgactccaccat 274  Q
    |||||||| || |  |||||||| |||||    
T  23665889 tgctccatgatggcctttgactctaccat 23665861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 133
Target Start/End: Original strand, 20505442 - 20505529
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaa 133  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  20505442 acttggtcaactccttagttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttcccatagagcatagtatctttgaa 20505529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 16566961 - 16566898
Alignment:
Q  2 gacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggtt 65  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||  ||||||| ||||||    
T  16566961 gacattcaagccttcaccactatcatcaagcttcaagtccttgaacttaattaactcattggtt 16566898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 18467727 - 18467652
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || | ||| || ||||||||||| |||||    
T  18467727 acttggtcaactccttgattctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtcccttctttgccatagagcat 18467652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 31543776 - 31543701
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| |||||    
T  31543776 acttggtcaactccttggttctcaaagctgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcat 31543701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 121
Target Start/End: Original strand, 34478655 - 34478730
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | |||| || |||||||| |||||    
T  34478655 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacaatgccttccttgccatagagcat 34478730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 331
Target Start/End: Original strand, 9788414 - 9788699
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaagga 145  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||| |||||  | ||||||||| |||||  ||||||| ||    ||||| ||    
T  9788414 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttctttcaaggtgacagtgcattatttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatga 9788513  T
Q  146 cctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagt 245  Q
     || |||| |||||||| || | |||  || || || ||||| || || |  || || |||||| ||||||||||||  || || |||||||||| || |    
T  9788514 tctcggtagagcacacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgccaat 9788613  T
Q  246 tgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagacactgtctatgtgccaaagacttggtcat 331  Q
    |||||||| |  |  ||||||||||||||     |  ||||||||||||| || ||  | || ||||| |||||||||||||||||    
T  9788614 tgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcat 9788699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 115
Target Start/End: Original strand, 42427624 - 42427693
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccata 115  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| | |||||||||    
T  42427624 acttggtcaactccttggttcttaaagtcgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttttttgccata 42427693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 46 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 13487000 - 13486913
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaa 133  Q
    ||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||| |  ||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||  ||||||||||    
T  13487000 acttggtcaactccttggtttttaaagccgcttgaacatattccaaggtgacagtgccttctttaccatagagcatggtatccttgaa 13486913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 26173755 - 26173705
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtga 96  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26173755 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtga 26173705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 818 - 570
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| | ||  |||||||||||||  || ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||    
T  818 acattcaagccttcactaccttcatcaaccttcatgtccttgaactgggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgc 719  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatc 202  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| || |     || || |||||||| |||||||  ||||| ||    
T  718 cctccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaaggactttggtaatgaacaaagtaacaacaaagccttatcctcatcttccatgttaacttc 619  T
Q  203 tatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctcc 251  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||    
T  618 aatgttggccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctcc 570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15250 - 15002
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||    
T  15250 acattcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgc 15151  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatc 202  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| || |     || || |||||||| |||||||  ||||| ||    
T  15150 cctccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaaggactttggtaatgaacaaagtaacaacaaagccttatcctcatcttccatgttaacttc 15051  T
Q  203 tatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctcc 251  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||    
T  15050 aatgttggccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctcc 15002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 149896 - 149648
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| | ||  ||||||||| |||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||    
T  149896 acattcaagccttcactaccttcatcaaccctcatgtccttgaacttggtcaattctttagttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgc 149797  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatc 202  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| || |     || || |||||||| |||||||  ||||| ||    
T  149796 cctccttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaaggactttggtaatgaacaaagtaacaacaaagccttatcctcatcttccatgttaacctc 149697  T
Q  203 tatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctcc 251  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||    
T  149696 aatgttggccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctcc 149648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 50406 - 50478
Alignment:
Q  1 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagc 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50406 agacattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagc 50478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Original strand, 1653 - 1792
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||| |||||||||| || |||||||||||  | ||||    
T  1653 acattcaagccttcaccaccttcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattcattggttctctaagccgcttggacctcctccaaagtagtggtgc 1752  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaa 142  Q
    ||||||| |||||||| ||  |||||||||||| ||||||    
T  1753 cctctttaccataaaggatggtatccttgaaatgctcaaa 1792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0842 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0842
Description:

Target: scaffold0842; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 4135 - 3996
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| | ||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||    
T  4135 acattcaagccttcactaccttcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgc 4036  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaa 142  Q
    |||| || |||||||  ||  |||||||||||| ||||||    
T  4035 cctccttaccataaaagatggtatccttgaaatgctcaaa 3996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 18880 - 18741
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgc 102  Q
    |||||||||||||| | ||  |||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||    
T  18880 acattcaagccttcactaccttcatcaaccttcaagtccttgaacttggtcaattcgttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgc 18781  T
Q  103 cctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaa 142  Q
    |||| || |||||||| ||  ||||||| |||| ||||||    
T  18780 cctccttaccataaaggatggtatccttaaaatgctcaaa 18741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 115578 - 115491
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaa 133  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  115578 acttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatccttgaa 115491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1899
Description:

Target: scaffold1899; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 667 - 439
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaagga 145  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| |||||  |||| |||||    ||||| ||    
T  667 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaaga 568  T
Q  146 cctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagt 245  Q
      | |||| |||||||| || | |||   |||||||||| || || || || || || || ||| |||| |||||||  || || ||||||||||| |||    
T  567 tttcggtagagcacacaacaagagtataactttatcctcatcctcaagtttcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagt 468  T
Q  246 tgctccattataggttttgactccaccat 274  Q
    |||||||| || |  |||||||| |||||    
T  467 tgctccatgatggcctttgactctaccat 439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 121
Target Start/End: Original strand, 72753 - 72828
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 121  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| |||||    
T  72753 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcat 72828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23169 - 22941
Alignment:
Q  46 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaagga 145  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| |||||  |||| |||||    ||||| ||    
T  23169 acttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaaga 23070  T
Q  146 cctaggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagt 245  Q
      | |||| |||||||| || | |||  |||||||||||||| || || |  || || || ||| |||| ||||| |  || || ||||||||||| |||    
T  23069 tttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagt 22970  T
Q  246 tgctccattataggttttgactccaccat 274  Q
    |||||||| || |  |||||||| |||||    
T  22969 tgctccatgatggcctttgactctaccat 22941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1908 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1908
Description:

Target: scaffold1908; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 338 - 137
Alignment:
Q  49 tggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaggacct 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||| | |||  ||||||||||| |||||  ||||||||||    ||||| || ||    
T  338 tggtcaactctttggttctcaaagttgattgaacttcttccaaggtgacactgcgttctttgccatagagcatggtatccttgaaggattcaaatgatct 239  T
Q  149 aggtaaagcacacagcaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgc 248  Q
     |||| |||||||| || | |||  ||||| || ||||| || || |  || || |||||| ||||||||||||  || || ||||||||||| | ||||    
T  238 cggtagagcacacaacaagagtatagctttgtcttcgtcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgttaattgc 139  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  138 tc 137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 30424 - 30333
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagt 94  Q
    |||||||||| ||| ||||  |||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  ||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  30424 acattcaagctttcgccaccctcatcaactttcaagtgcttgaacttggtcaattacttggttctcaaagccacttggacctcctccaaagt 30333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 94
Target Start/End: Original strand, 42420 - 42511
Alignment:
Q  3 acattcaagccttctccactatcatcaaccttcaactctttgaacttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagt 94  Q
    |||||||||| ||| ||||  |||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  ||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  42420 acattcaagctttcgccaccctcatcaactttcaagtgcttgaacttggtcaattacttggttctcaaagccacttggacctcctccaaagt 42511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University