View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2109_low_1 (Length: 687)

Name: NF2109_low_1
Description: NF2109
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2109_low_1
NF2109_low_1
[»] chr4 (32 HSPs)
chr4 (111-687)||(51641859-51642423)
chr4 (9-482)||(38460459-38460934)
chr4 (15-468)||(44050650-44051118)
chr4 (9-454)||(18578684-18579141)
chr4 (9-468)||(10422972-10423432)
chr4 (9-455)||(4774168-4774626)
chr4 (9-294)||(24415392-24415679)
chr4 (10-454)||(37394768-37395229)
chr4 (9-484)||(3407803-3408282)
chr4 (9-327)||(10374240-10374548)
chr4 (102-454)||(50904820-50905172)
chr4 (9-369)||(49563999-49564351)
chr4 (9-482)||(19069220-19069709)
chr4 (36-317)||(6186859-6187140)
chr4 (9-182)||(11506658-11506831)
chr4 (225-369)||(51492230-51492374)
chr4 (223-482)||(15995755-15996026)
chr4 (220-366)||(50278588-50278734)
chr4 (225-366)||(44674299-44674440)
chr4 (220-369)||(37016057-37016206)
chr4 (44-369)||(30043022-30043346)
chr4 (369-465)||(24414885-24414982)
chr4 (437-484)||(1089579-1089626)
chr4 (221-320)||(31598700-31598798)
chr4 (436-482)||(16984155-16984201)
chr4 (439-484)||(6175908-6175953)
chr4 (435-484)||(28234447-28234496)
chr4 (435-484)||(37563273-37563322)
chr4 (435-484)||(54634008-54634057)
chr4 (503-543)||(28320498-28320538)
chr4 (426-454)||(30043406-30043434)
chr4 (446-482)||(38464770-38464806)
[»] chr1 (49 HSPs)
chr1 (9-454)||(51666230-51666677)
chr1 (10-454)||(4517959-4518427)
chr1 (11-482)||(36072402-36072879)
chr1 (9-454)||(8459019-8459466)
chr1 (9-468)||(13177690-13178158)
chr1 (9-417)||(46978798-46979231)
chr1 (27-454)||(19495101-19495543)
chr1 (9-482)||(1655644-1656129)
chr1 (9-455)||(7966043-7966497)
chr1 (9-482)||(9710611-9711086)
chr1 (9-482)||(44469575-44470051)
chr1 (9-325)||(33168106-33168422)
chr1 (9-320)||(38690117-38690417)
chr1 (9-468)||(50113354-50113830)
chr1 (9-369)||(37018960-37019310)
chr1 (9-481)||(25039645-25040115)
chr1 (9-454)||(29352294-29352742)
chr1 (10-369)||(20353500-20353849)
chr1 (9-369)||(30909593-30909943)
chr1 (9-369)||(13633436-13633787)
chr1 (9-369)||(5081928-5082280)
chr1 (9-367)||(12643369-12643714)
chr1 (9-331)||(3944172-3944484)
chr1 (9-368)||(6558047-6558410)
chr1 (9-369)||(38771788-38772140)
chr1 (9-331)||(3993406-3993718)
chr1 (10-366)||(5141435-5141780)
chr1 (224-454)||(22345818-22346055)
chr1 (204-460)||(46886137-46886406)
chr1 (197-484)||(15051090-15051390)
chr1 (220-366)||(94559-94705)
chr1 (220-455)||(52805325-52805572)
chr1 (220-407)||(16281807-16282004)
chr1 (220-369)||(22527460-22527609)
chr1 (220-367)||(31780128-31780275)
chr1 (224-366)||(19521758-19521900)
chr1 (220-366)||(21144396-21144542)
chr1 (220-369)||(470835-470984)
chr1 (369-482)||(38689964-38690078)
chr1 (228-354)||(50617376-50617503)
chr1 (119-263)||(1179878-1180022)
chr1 (245-369)||(47714877-47715001)
chr1 (433-482)||(50617238-50617287)
chr1 (323-369)||(23359217-23359263)
chr1 (222-319)||(10165606-10165703)
chr1 (409-453)||(47715044-47715089)
chr1 (437-473)||(22528612-22528648)
chr1 (291-363)||(29261529-29261601)
chr1 (503-543)||(49874947-49874987)
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (9-452)||(18609797-18610242)
chr6 (9-482)||(23958923-23959399)
chr6 (9-454)||(29286264-29286711)
chr6 (9-437)||(29667387-29667827)
chr6 (9-454)||(25140669-25141117)
chr6 (9-451)||(7537250-7537709)
chr6 (14-482)||(2051061-2051545)
chr6 (9-482)||(28362281-28362771)
chr6 (9-454)||(31150629-31151076)
chr6 (9-484)||(13382660-13383150)
chr6 (9-369)||(1608451-1608803)
chr6 (191-465)||(26702448-26702721)
chr6 (9-275)||(2259338-2259593)
chr6 (227-482)||(11840022-11840290)
chr6 (197-483)||(18351385-18351684)
chr6 (42-325)||(34230682-34230956)
chr6 (220-368)||(3502429-3502577)
chr6 (220-361)||(31771505-31771646)
chr6 (174-369)||(20448506-20448701)
chr6 (273-439)||(2258362-2258540)
chr6 (250-369)||(8304596-8304715)
chr6 (203-369)||(20439753-20439919)
chr6 (221-369)||(20436063-20436211)
chr6 (221-325)||(19129180-19129281)
chr6 (436-482)||(13388702-13388748)
chr6 (497-543)||(26702747-26702793)
chr6 (43-124)||(20448386-20448466)
chr6 (435-484)||(26712079-26712128)
chr6 (439-484)||(27641715-27641760)
chr6 (436-484)||(28249916-28249964)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (9-465)||(41004578-41005045)
chr2 (9-482)||(43943722-43944210)
chr2 (10-417)||(12905622-12906037)
chr2 (9-482)||(81814-82302)
chr2 (9-455)||(28342583-28343032)
chr2 (9-414)||(439374-439792)
chr2 (9-452)||(41181474-41181919)
chr2 (9-468)||(24601686-24602160)
chr2 (9-468)||(24611954-24612428)
chr2 (9-468)||(9659604-9660081)
chr2 (9-454)||(41052683-41053142)
chr2 (9-433)||(45479385-45479811)
chr2 (9-454)||(1096630-1097092)
chr2 (9-484)||(7267008-7267486)
chr2 (9-369)||(24753588-24753938)
chr2 (9-454)||(39798004-39798451)
chr2 (9-369)||(41564054-41564406)
chr2 (9-482)||(3795370-3795859)
chr2 (9-331)||(5351295-5351607)
chr2 (9-331)||(10620171-10620483)
chr2 (9-331)||(209182-209494)
chr2 (230-482)||(25184606-25184870)
chr2 (111-369)||(38950232-38950480)
chr2 (220-369)||(39950936-39951085)
chr2 (220-369)||(10825377-10825526)
chr2 (220-366)||(32952892-32953038)
chr2 (9-183)||(1150595-1150769)
chr2 (220-366)||(29398071-29398213)
chr2 (189-319)||(3206956-3207086)
chr2 (145-331)||(18000430-18000606)
chr2 (9-114)||(38949750-38949855)
chr2 (222-352)||(25613379-25613508)
chr2 (35-137)||(25613583-25613685)
chr2 (497-543)||(82349-82395)
chr2 (436-482)||(23346813-23346859)
chr2 (76-129)||(27732940-27732993)
chr2 (235-320)||(43668329-43668414)
chr2 (436-484)||(22003395-22003443)
chr2 (426-478)||(34918489-34918541)
chr2 (59-115)||(43668499-43668555)
[»] chr7 (28 HSPs)
chr7 (12-349)||(12111394-12111729)
chr7 (14-482)||(34622532-34623002)
chr7 (10-454)||(10705309-10705765)
chr7 (9-482)||(19044326-19044815)
chr7 (9-482)||(20709821-20710310)
chr7 (9-454)||(47742553-47743001)
chr7 (9-425)||(18109357-18109775)
chr7 (9-454)||(15069914-15070363)
chr7 (9-369)||(42503402-42503753)
chr7 (9-484)||(603810-604288)
chr7 (9-295)||(47064858-47065148)
chr7 (9-369)||(30790570-30790922)
chr7 (9-331)||(45767424-45767736)
chr7 (9-331)||(43619877-43620189)
chr7 (227-482)||(34742168-34742435)
chr7 (9-181)||(29592839-29593011)
chr7 (220-454)||(5537907-5538152)
chr7 (220-369)||(17838400-17838549)
chr7 (221-454)||(40928719-40928965)
chr7 (230-466)||(29592592-29592841)
chr7 (220-468)||(13323480-13323741)
chr7 (220-305)||(10522280-10522365)
chr7 (369-454)||(36186425-36186511)
chr7 (330-369)||(12111360-12111399)
chr7 (497-543)||(36186560-36186606)
chr7 (437-482)||(34738397-34738442)
chr7 (436-484)||(15070386-15070434)
chr7 (436-484)||(18105404-18105452)
[»] chr8 (31 HSPs)
chr8 (9-482)||(43679430-43679905)
chr8 (9-452)||(43376843-43377302)
chr8 (9-443)||(2124250-2124703)
chr8 (37-443)||(4867385-4867803)
chr8 (9-305)||(7171881-7172177)
chr8 (9-481)||(35962341-35962816)
chr8 (9-329)||(22588006-22588316)
chr8 (9-449)||(23924032-23924474)
chr8 (9-454)||(39518-39966)
chr8 (9-369)||(31959611-31959975)
chr8 (105-442)||(39751134-39751473)
chr8 (9-369)||(30301292-30301644)
chr8 (9-484)||(7344120-7344599)
chr8 (9-331)||(32375849-32376161)
chr8 (9-331)||(8419602-8419914)
chr8 (9-365)||(22661138-22661484)
chr8 (258-468)||(23578482-23578704)
chr8 (9-181)||(41744160-41744332)
chr8 (124-369)||(20548938-20549173)
chr8 (225-468)||(34366958-34367214)
chr8 (226-366)||(41239010-41239150)
chr8 (230-454)||(41743925-41744162)
chr8 (174-352)||(30972593-30972771)
chr8 (14-113)||(39751659-39751758)
chr8 (222-369)||(31280969-31281118)
chr8 (369-436)||(22588324-22588392)
chr8 (261-369)||(29807044-29807152)
chr8 (381-433)||(7172550-7172603)
chr8 (68-137)||(31281193-31281262)
chr8 (435-484)||(184545-184594)
chr8 (309-369)||(7172465-7172525)
[»] chr3 (37 HSPs)
chr3 (9-482)||(6489362-6489852)
chr3 (9-433)||(66956-67392)
chr3 (9-482)||(4002055-4002545)
chr3 (12-449)||(21951866-21952305)
chr3 (9-354)||(46989686-46990035)
chr3 (9-416)||(9426705-9427114)
chr3 (9-482)||(48246445-48246920)
chr3 (9-454)||(13743328-13743775)
chr3 (9-484)||(6744890-6745368)
chr3 (9-416)||(2857546-2857955)
chr3 (9-468)||(36812884-36813360)
chr3 (9-484)||(30943220-30943700)
chr3 (9-484)||(3952778-3953257)
chr3 (9-331)||(8156706-8157018)
chr3 (9-366)||(50957243-50957604)
chr3 (220-482)||(600309-600584)
chr3 (9-184)||(14402569-14402744)
chr3 (9-184)||(2743789-2743964)
chr3 (220-366)||(50213619-50213765)
chr3 (196-369)||(7841254-7841427)
chr3 (220-366)||(36134048-36134194)
chr3 (220-369)||(42166177-42166326)
chr3 (220-369)||(47070627-47070776)
chr3 (230-369)||(52387958-52388097)
chr3 (220-369)||(2271513-2271663)
chr3 (266-455)||(14402808-14403009)
chr3 (227-369)||(9473721-9473863)
chr3 (220-369)||(16646939-16647087)
chr3 (223-291)||(2743678-2743746)
chr3 (221-319)||(7314585-7314683)
chr3 (314-369)||(2743556-2743611)
chr3 (435-484)||(8475857-8475906)
chr3 (314-369)||(4005003-4005058)
chr3 (436-482)||(34691658-34691704)
chr3 (441-482)||(30256002-30256043)
chr3 (435-484)||(41844357-41844406)
chr3 (59-115)||(35443507-35443563)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (9-454)||(24053215-24053672)
chr5 (9-369)||(7796736-7797086)
chr5 (9-417)||(24050126-24050547)
chr5 (50-468)||(25877668-25878098)
chr5 (9-468)||(33994713-33995174)
chr5 (9-439)||(30352504-30352939)
chr5 (9-369)||(13563800-13564150)
chr5 (9-454)||(38855776-38856224)
chr5 (9-482)||(34122557-34123047)
chr5 (9-484)||(37814613-37815091)
chr5 (9-454)||(27863464-27863912)
chr5 (9-369)||(25890153-25890503)
chr5 (9-369)||(1039356-1039719)
chr5 (9-339)||(28882177-28882497)
chr5 (67-454)||(34079753-34080143)
chr5 (9-454)||(11029069-11029516)
chr5 (88-482)||(7017545-7017941)
chr5 (9-252)||(4196792-4197023)
chr5 (9-239)||(14280542-14280762)
chr5 (10-165)||(28387821-28387975)
chr5 (220-366)||(38407308-38407454)
chr5 (243-482)||(28388307-28388559)
chr5 (220-369)||(7762008-7762157)
chr5 (293-452)||(4196618-4196790)
chr5 (220-366)||(41799534-41799679)
chr5 (59-367)||(6267635-6267932)
chr5 (160-369)||(43179605-43179814)
chr5 (9-139)||(43179429-43179559)
chr5 (231-354)||(16440192-16440315)
chr5 (401-454)||(31094597-31094651)
chr5 (497-543)||(25877561-25877607)
chr5 (369-484)||(14280825-14280942)
chr5 (222-312)||(30292292-30292382)
chr5 (435-484)||(30708866-30708915)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (12-369)||(21808-22144)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (9-482)||(15519-15995)
[»] scaffold0494 (2 HSPs)
scaffold0494 (9-454)||(4890-5339)
scaffold0494 (436-484)||(5362-5410)
[»] scaffold0219 (2 HSPs)
scaffold0219 (91-481)||(19743-20151)
scaffold0219 (9-93)||(19498-19582)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (9-468)||(22450-22923)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (115-466)||(8248-8602)
[»] scaffold0794 (1 HSPs)
scaffold0794 (9-182)||(1315-1488)
[»] scaffold0169 (2 HSPs)
scaffold0169 (288-454)||(1517-1695)
scaffold0169 (9-159)||(10828-10978)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (220-369)||(236001-236150)
scaffold0011 (435-468)||(236253-236286)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (225-369)||(12562-12706)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (435-484)||(715-764)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (436-484)||(50078-50126)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 360; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 111 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 51642423 - 51641859
Alignment:
Q  111 tatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatggac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  51642423 tatatatgtatgttcgttctatatgtaattgtgatgaatgtaagttgggatttaacttaatgatatgtaatgagttgtaatgtgttgtttaattatggac 51642324  T
Q  211 aatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattct 310  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51642323 aatttgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttct 51642224  T
Q  311 tgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggttaaaaactgaccgaaaaatggtttggaaatgctttagaatta 410  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  51642223 tgtttatgatcgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttgaaaatgctctggttaaaaactgaccgaaaaatggtttgaaaatgctttaaaatta 51642124  T
Q  411 tgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgccgnnnnnnnnnnnncgtattttactcg 509  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||  |||||          |||  |||||||||||| ||||||||||| ||            |||||||||||||    
T  51642123 tgcagaacccactatctgcataattg--ttcct----------ctactgaggttttccttaacatttaactgtcgagaaagcaaaaacgtattttactcg 51642036  T
Q  510 tgtgaaacaaccttatgcaacgtgtctacaacaaattttcaaaaatatttggaaggtacggtaatttgaattggaattttacttagtcatatggcagtgt 609  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  51642035 tgtgatacatccttatgcaatgtgccta-agcaaattttcaaaaatatttggtaggtacggtaatttgaattgaaatttgaattagtcatatggcagtgt 51641937  T
Q  610 ttctggcaaagattcattatgattactgccaacttttcccgtcttggttttgctgttgttttcacaatacaacttttc 687  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51641936 ttctggaaaagattcattatgattactgccaacttttcccgtcgtggttttgctgttgttttcacaaaacaacttttc 51641859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 9 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 38460934 - 38460459
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  38460934 gagatgaatgcgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgttggatttatgtttcagaatatggtggaaaataatat 38460835  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||| |||          ||||||||||    
T  38460834 attatatatgtatgtttgttgcatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatcatgtgtaatgagttgt----------ttaattatgg 38460745  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  38460744 acactttgtaacattttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaatcaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattatattttt 38460645  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaa 397  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||           ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38460644 cttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttgaaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactgaccgaaaaatggcttggaaa 38460545  T
Q  398 tgctttagaattatgcagaatccactg-ttgcataattgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||    
T  38460544 tgctttagaattatgcagaacccactgactgcataattgttttcctcggcagttaattaccgaggttttcctcgacagttaactgc 38460459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 15 - 468
Target Start/End: Original strand, 44050650 - 44051118
Alignment:
Q  15 aatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatatattata 114  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  44050650 aatacgcatggaaaacaacaagctatatgt-ttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatatattata 44050748  T
Q  115 tatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgt----ttaattatggac 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||    |  ||     ||||||||||||    
T  44050749 tatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgcaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaattatggac 44050848  T
Q  211 aatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattct 310  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44050849 actttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttct 44050948  T
Q  311 tgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaatg 399  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||           ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  44050949 tgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatg 44051048  T
Q  400 ctttagaattatgcagaatccactg-ttgcataattgttttcctcagcagttaactatcgaggttttcct 468  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  44051049 ctttagaattatgcagaacccactgtttgcataattgttttcctcggcagttaactaccgaggatttcct 44051118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 9 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 18579141 - 18578684
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  18579141 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggctaattgaagacgatagcgacgtcgaatttatgtttcggaatatggtagaagataatat 18579042  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  18579041 attatatatgtatgttagttctatatgcaattgcgttgaatgtaagaagtgatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtaatgtgttgtttaattatgg 18578942  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  18578941 acactatgtaacattttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaatcaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttta 18578842  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaa 397  Q
    |||||||||||  |||||| ||| |||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||           ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  18578841 cttgtttatgagtgagtttaaatgttgtataagttatattgcctttggaaatactctggttgaattacaagtaaaaactagccgaaaaatggcttggaaa 18578742  T
Q  398 tgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaact 454  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||| |||||    
T  18578741 tgcttaacaattatgcagaatccactgtctgcataaatgtttttctcggcagataact 18578684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 9 - 468
Target Start/End: Original strand, 10422972 - 10423432
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||   | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  10422972 gagacgaatacacatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcggcgattgcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 10423071  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||          ||||||||||    
T  10423072 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatctaatgatatgtaatgagttgt----------ttaattatgg 10423161  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  10423162 acacattgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaacctaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagata-tgtattttt 10423260  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaa 397  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||           ||||||||| ||||||||||| ||||||     
T  10423261 cttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttgaaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaatggcttggaat 10423360  T
Q  398 tgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaactatcgaggttttcct 468  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||    
T  10423361 tgctttagatttatgcaaaacccactgtctgcataattgttttcctcggcagttaactacctaggatttcct 10423432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 455
Target Start/End: Original strand, 4774168 - 4774626
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  4774168 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatggcttggcttatttgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 4774267  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    
T  4774268 gttatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgcatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtaatgtgttgtttatgcatgg 4774367  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| | | ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  4774368 acactatgtaacgatttaatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcgatttgatttaattatggacaattgtaaatgatattgtatttta 4774467  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaa 397  Q
    |||| ||||||| |||||| ||| |||||| | |||||||| |||| |||||||||||||           ||||||||   |||||||||| |||||||    
T  4774468 cttgcttatgactgagtttaaatgttgtataagttatattggctttggaaatgctctggttaaattacaggtaaaaactagtcgaaaaatggcttggaaa 4774567  T
Q  398 tgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaacta 455  Q
    ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4774568 tgcttaacaattatgcagaaaccactgtctgcataattgttttcctcggcagttaacta 4774626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24415679 - 24415392
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatat--gccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataat 106  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24415679 gagatgaatacacatggaaaacgacaagctatatatgccttgacttattgaagacgatagcgacgttgcatttatgtttcggaatatgatggaaaataat 24415580  T
Q  107 atattatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  24415579 atattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatatgtaatgagttgtaatgtgttgtttaattat 24415480  T
Q  207 ggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaa 294  Q
    ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24415479 ggacactatgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaa 24415392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 454
Target Start/End: Original strand, 37394768 - 37395229
Alignment:
Q  10 agatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatata 109  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  37394768 agatgaatacgcatggaaaacggcaagttgtatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagataatata 37394867  T
Q  110 ttatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctg----tttaatta 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||    |  ||     |||||||    
T  37394868 ttatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatta 37394967  T
Q  206 tggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatt 305  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37394968 tggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaatcaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatt 37395067  T
Q  306 attcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccg-aaaaatggtttg 393  Q
      ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| || ||||| |||||||||||||           ||||||||| ||| |||||||| |||    
T  37395068 tatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattatttttcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttg 37395167  T
Q  394 gaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaact 454  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||| ||||||    
T  37395168 aaaatg-tttagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttcctcggcaattaact 37395229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 9 - 484
Target Start/End: Original strand, 3407803 - 3408282
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  3407803 gagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 3407902  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  3407903 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 3407992  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaa-caaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattat 307  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  3407993 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtattta 3408092  T
Q  308 tcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccg-aaaaatggtttgga 395  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||           ||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  3408093 tcttgattatgaccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaaatggcttgga 3408192  T
Q  396 aatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgccg 484  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||  ||||||||| |||  | |||| |||||||||||| | || ||||||||||    
T  3408193 aatg-tttagaattatgcagaacccactgtctacataatcagttttcctcggcaagttactaccgaggttttcctcggcagttaactgccg 3408282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 10374548 - 10374240
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  10374548 gagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacatcagatttatgtttcgaaatatggtggaagataatat 10374449  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||          | |||||||||||||    
T  10374448 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga----------gttgtttaattatgg 10374359  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    |||  || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  10374358 acaccttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttcatttaattatggacaactgtaaaaggtattgtattttt 10374259  T
Q  309 cttgtttatgaccgagttt 327  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  10374258 cttggttatgaccgagttt 10374240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 102 - 454
Target Start/End: Original strand, 50904820 - 50905172
Alignment:
Q  102 ataatatattatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgttta 201  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||      ||    ||||||    
T  50904820 ataatatattatatttgtatgtttgttccatatgcaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgaaatga------at----tgttta 50904909  T
Q  202 attatggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattg 301  Q
    |||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  50904910 attatgaacactttgtatcgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatttca 50905009  T
Q  302 tattattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggt 390  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||           |||||| || |||||||||||     
T  50905010 tatttttcttgtttatgttcgagtttcaatgttgtatgatttatattgcatttagaaatgctctggtttaattacaggtaaaaattggccgaaaaatggc 50905109  T
Q  391 ttggaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaact 454  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  50905110 ttggaaatgcattagaattatgcagaactcactgtctg--taattgttttcctcggcagttaact 50905172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 49564351 - 49563999
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  49564351 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 49564252  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  49564251 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 49564162  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |    
T  49564161 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaatatattgtatttat 49564062  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatatt--gtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    |||  ||||| ||||||||||||  |   ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  49564061 cttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtt 49563999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 19069709 - 19069220
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  19069709 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcgggtttatgtttcggaatatggtggaagataatat 19069610  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||   |||       ||||||||||||    
T  19069609 attatacatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgcaatga---gta-------gtttaattatgg 19069520  T
Q  209 acaatttataacgt--------------tttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaa 294  Q
    ||| ||| ||| ||              ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19069519 acactttgtaatgttttgagtagtttaatttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaa 19069420  T
Q  295 gatattgtattattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccg-a 382  Q
    |||||| || |  ||||  ||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||           |||||||||  || |    
T  19069419 gatattttacttatcttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggtcgaa 19069320  T
Q  383 aaaatggtttggaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaact 480  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||    
T  19069319 aaaatggcttggaaatg-tttacaattatgcag-acccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactaccgaggttttcctcggcagttaact 19069222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 36 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 6187140 - 6186859
Alignment:
Q  36 gctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatatattatatatgtatgttcgttctatatg 135  Q
    ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6187140 gctatgtgtcttggcttattcacgacgatagcgacattggatttatgtttagcaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatg 6187041  T
Q  136 caattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatggacaatttataacgttttgatgaatttc 235  Q
    ||| || |  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||   | ||| |||||||||||||||    
T  6187040 caaatgcgtagaatgtcagtagagatttaatttaatgatatgtaatatgttgtaatgtgttgtttaattatggacaccctttaatgttttgatgaatttc 6186941  T
Q  236 aaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttat 317  Q
    |||| |  ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||| | | ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  6186940 aaacatacgtgtaattttaacgaaatgtcggattgatttaattattgactactataaaagataatgtatttttcttgtttat 6186859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Original strand, 11506658 - 11506831
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  11506658 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttgacttattaaagacaatagcgacgtcggatttatgttttgaaatatggtggaaaataatat 11506757  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatg 182  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||    
T  11506758 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtatggatttaatataatgatgtgtaatg 11506831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 225 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 51492374 - 51492230
Alignment:
Q  225 tgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccgag 324  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  ||||    
T  51492374 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtacttatcttgtttatgttcgag 51492275  T
Q  325 tttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    ||| ||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  51492274 ttttaatgttgtatgaattattttgcctttcgaaatgctctggtt 51492230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 223 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 15996026 - 15995755
Alignment:
Q  223 tttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccg 322  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||  ||||| |||    
T  15996026 tttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttatcttcattatgtccg 15995927  T
Q  323 agtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccg-aaaaatggtttggaaatgctttagaatta 410  Q
    | ||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||           ||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15995926 actttcaatcttgtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatg-tttagaatta 15995828  T
Q  411 tgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||    
T  15995827 tgcag-acccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactaccgaggttttcctcggcagttaactgc 15995755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 220 - 366
Target Start/End: Original strand, 50278588 - 50278734
Alignment:
Q  220 cgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatga 319  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  50278588 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttcaaccaaatgtcggtttgatttaattatgaataattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgt 50278687  T
Q  320 ccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctg 366  Q
    |||||||||||| ||||||   |||| |||||||| |||||||||||    
T  50278688 ccgagtttcaatgttgtatagattattttgcctttcgaaatgctctg 50278734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 225 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 44674440 - 44674299
Alignment:
Q  225 tgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccgag 324  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  44674440 tgatgaattttaaatgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtacttatcttgtttatgtccgag 44674341  T
Q  325 tttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctg 366  Q
    ||||||| |||||||| || | |||||||| |||||||||||    
T  44674340 tttcaatgttgtatgaattgttttgcctttcgaaatgctctg 44674299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 220 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 37016206 - 37016057
Alignment:
Q  220 cgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatga 319  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  37016206 cgttatgatgaatttcaaacgtttctgtaatttgaatcaaacgtcagtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgt 37016107  T
Q  320 ccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    ||||||||||||  ||||||| || | |||||||| ||||||||||||||    
T  37016106 ccgagtttcaatgatgtatgaattgttttgcctttcgaaatgctctggtt 37016057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 369
Target Start/End: Original strand, 30043022 - 30043346
Alignment:
Q  44 ccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatatattatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtg 143  Q
    |||||||||||| | | |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| | |     
T  30043022 ccttggcttattcagggcgataatgacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaagataatatattatatttgtattttcgttccatttgcaact-tc 30043120  T
Q  144 at-gaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttt 242  Q
    || |||||| |  || ||||| | |||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| || | | ||| |||||||| |||||||||| |     
T  30043121 atagaatgtcaccagagatttcatttaacgatatgtaatgtgttgtagtgtgttgtttaattatgg-cactctttaatgttttgataaatttcaaacatc 30043219  T
Q  243 tgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatt 342  Q
     ||||||||| |||   | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||  ||| | ||| ||||| || |    
T  30043220 cgtgtaattttaactctacgtcggattgatttaattatggataattgtaaaagataatacatttttcttgtttatgacttagtataaatgttgtacgaat 30043319  T
Q  343 tatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
      |||||||| | ||||||||||||||    
T  30043320 agtattgcctcttgaaatgctctggtt 30043346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 369 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 24414982 - 24414885
Alignment:
Q  369 taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaactatcgaggtttt 465  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||    
T  24414982 taaaaactgtccgataaatggcttggaaatgctttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgttttccccaaccgttaactaccgaggtttt 24414885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 484
Target Start/End: Original strand, 1089579 - 1089626
Alignment:
Q  437 tttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgccg 484  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  1089579 tttcctcggcagttaactaccgaggttttcctcggcatttaactgccg 1089626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 31598798 - 31598700
Alignment:
Q  221 gttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgac 320  Q
    |||||| |||||||||||| ||  |||||||| ||| || |||||  ||||||||||| ||  ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  31598798 gttttgttgaatttcaaacattcatgtaattttaacgaa-tgtcgaattgatttaattttgatcaattgtgaaagattatgtattgttcttgtttatgac 31598700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 436 - 482
Target Start/End: Original strand, 16984155 - 16984201
Alignment:
Q  436 ttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  16984155 ttttcctcggcagttaactatcgaggttttcctcggcagttaactgc 16984201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 439 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 6175953 - 6175908
Alignment:
Q  439 tcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgccg 484  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  6175953 tcctcggcagttaactaccgaggttttccttggcacttaactgccg 6175908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 28234496 - 28234447
Alignment:
Q  435 gttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgccg 484  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  28234496 gtttttctcggcagttaactaccgaggttttcctcggcatttaactgccg 28234447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 484
Target Start/End: Original strand, 37563273 - 37563322
Alignment:
Q  435 gttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgccg 484  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||    
T  37563273 gttttcctcggcagttaactaccgaggttttcctcggcagttaactgccg 37563322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 484
Target Start/End: Original strand, 54634008 - 54634057
Alignment:
Q  435 gttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgccg 484  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||    
T  54634008 gttttcctcggcagttaactaccgaggttttcctcggcagttaactgccg 54634057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 503 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 28320538 - 28320498
Alignment:
Q  503 ttactcgtgtgaaacaaccttatgcaacgtgtctacaacaa 543  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  28320538 ttactcgtgtgacacaaccttatgcaatgtgtcaacaacaa 28320498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 426 - 454
Target Start/End: Original strand, 30043406 - 30043434
Alignment:
Q  426 tgcataattgttttcctcagcagttaact 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30043406 tgcataattgttttcctcagcagttaact 30043434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 482
Target Start/End: Original strand, 38464770 - 38464806
Alignment:
Q  446 cagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  38464770 cagttaactaccgaggttttccttgacagttaactgc 38464806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 49)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 9 - 454
Target Start/End: Original strand, 51666230 - 51666677
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51666230 gagatgaatacacatggaacacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcgaatttatgtttcggaatatggtggaaaataatat 51666329  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||          | |||||||||||||    
T  51666330 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatgatgtgtaatga----------gttgtttaattatgg 51666419  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  51666420 acactttgtaactttttgatgaatttcaaacttttatgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaatatattgtattttt 51666519  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaa 397  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||           |||||| || ||||||||||| |||  ||    
T  51666520 cttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttggaaatgctttggtttaattacaggtaaaaattggccgaaaaatggcttgagaa 51666619  T
Q  398 tgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaact 454  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51666620 tgctttagaattatgcagaacccactgtgtgcataattgttttcctcagcagttaact 51666677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 10 - 454
Target Start/End: Original strand, 4517959 - 4518427
Alignment:
Q  10 agatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatata 109  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4517959 agatgaatacgcatggaaaatggcaagctatatgccttggcttattaaagactatagcaacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatata 4518058  T
Q  110 ttatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgt----------- 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||||||| ||||||||| |||               
T  4518059 ttatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatt--atataatgatgtgtaatgagttgtaatgtgttgtttaattatgga 4518156  T
Q  199 ---ttaattatggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaag 295  Q
       ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4518157 cacttaattatggacattttgtaacgttctgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaag 4518256  T
Q  296 atattgtattattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaa 384  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||           ||||||||| ||||||    
T  4518257 atattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttggaaatgctttggtttaattacaggtaaaaactggccgaaa 4518356  T
Q  385 aatggtttggaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaact 454  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4518357 aatggcttgaaaatgctttagaattatgcagaacctactgtctccataattgttttcctcggcagttaact 4518427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 36072879 - 36072402
Alignment:
Q  11 gatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatatat 110  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  36072879 gatgaatacgcatggaaaacaacaagctatatgccttggctaattgaagatgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatatat 36072780  T
Q  111 tatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatggac 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||| || |||||||| ||||||    
T  36072779 tatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtaatatgttgtttaatcatggac 36072680  T
Q  211 aatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattct 310  Q
    | | | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  36072679 actatctaatgttttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtattttact 36072580  T
Q  311 tgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaatgctttag 405  Q
    |||||||||| |||||| | | |||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||     ||||||     ||||||||| |||| |||||||||||    
T  36072579 tgtttatgactgagtttaactgttgtataagttatattgcctttggaaatgttctggtacaggtaaaaaaatttcgaaaaatgatttgaaaatgctttag 36072480  T
Q  406 aattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   |||  || ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||    
T  36072479 aattatgcagaatccactgtctgcataatcagttttttcggcagttaactaccgaggttttcctcggcagttaactgc 36072402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 9 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 8459466 - 8459019
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  || |||||||    
T  8459466 gagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcaaaatatggtagaagataatat 8459367  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||          ||||||||||    
T  8459366 attatacatgtatgttcgttctatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgt----------ttaattatgg 8459277  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8459276 acactttttaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattttt 8459177  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaa 397  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||           |||||||||  |||||||||| || ||||    
T  8459176 cttgtttatgaccaagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttggaaatgctatggtttaattacaggtaaaaactggtcgaaaaatggcttagaaa 8459077  T
Q  398 tgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaact 454  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8459076 tgctttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgttttcctcggcagttaact 8459019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 9 - 468
Target Start/End: Original strand, 13177690 - 13178158
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  13177690 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatggcttggcttaatcgcaacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 13177789  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||   |||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  13177790 attatatatgtatgttcattccatatgcaattgcattgaaagtaagtagggatttaatttaataatgtgtaatgagttgtaatgtgttgtttaactatgg 13177889  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |     
T  13177890 acactatgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattatatttta 13177989  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaa 397  Q
    |||||||||||| |||||| ||||   ||| | ||||||||||||| |||||||||||||           |||||||||  | |||||||| ||||||     
T  13177990 cttgtttatgactgagtttaaata--atataagttatattgcctttggaaatgctctggttaaattacaggtaaaaactggtcaaaaaatggcttggaag 13178087  T
Q  398 tgctttagaattatgcagaatccactgttgcataattgttttcctcagcagttaactatcgaggttttcct 468  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  13178088 tgctttataattatgcagaacccactgttgcataaatgtttttctcggcagttaactctcgaggttttcct 13178158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 9 - 417
Target Start/End: Original strand, 46978798 - 46979231
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  46978798 gagatgaatacacatggaaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcgaaatatggtggaaaataatat 46978897  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgt---------- 198  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||||| |||              
T  46978898 attatatatgtatgttcgttcctaatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatgatgtgtaatgaattgtaatgtgttgtttaattatgg 46978997  T
Q  199 ----ttaattatggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaa 294  Q
        ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46978998 acacttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaatcaaatgtctgtttgatttaattatggacaattgtaaaa 46979097  T
Q  295 gatattgtattattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaa 383  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |           |||||||||||||||    
T  46979098 gatattctatttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttggaaatgctctgatttaattacaagtaaaaactgaccgaa 46979197  T
Q  384 aaatggtttggaaatgctttagaattatgcagaa 417  Q
    |||| | ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  46979198 aaatagcttgaaaatgttttagaattatgcagaa 46979231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 27 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 19495543 - 19495101
Alignment:
Q  27 aaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatatattatatatgtatgttcg 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  19495543 aaacggcaagctatatgccttggcttattcgagacgatagcgacgttggatttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcg 19495444  T
Q  127 ttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatggacaatttataac---gtt 223  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| | | ||||     |    
T  19495443 ttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgacttgtaatgtgttgtttaattatggacactatgtaacacgcgt 19495344  T
Q  224 ttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  19495343 ttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttatttatgactga 19495244  T
Q  324 gtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaatgctttagaattatg 412  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||           ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| | |||||||    
T  19495243 gtttaaatgttgtatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaatagcttggaaatgcttaacaattatg 19495144  T
Q  413 cagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaact 454  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  19495143 cagaacccactgtctgcataatagtttttctcggcagttaact 19495101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 9 - 482
Target Start/End: Original strand, 1655644 - 1656129
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  1655644 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 1655743  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    
T  1655744 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtaatgatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtaatgtgttgtttatgcatgg 1655843  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    | | | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  1655844 atactatgtaacgatttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtccgtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttta 1655943  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctg-----------gttaaaaactgaccgaaaaatggtttggaaa 397  Q
    ||||||||||||  | ||| ||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||           | ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  1655944 cttgtttatgactaaatttaaatgttgtataagttatattgcctttggaaatgctctgattaaattacaggtaaaaactggccgaaaaatggcttgaaag 1656043  T
Q  398 tgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
    ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||    
T  1656044 tgcttaacaattatgcagaacccactgtctgcataaatgttttcctcggcagttaactaccgaggtttttctcgacagttaactgc 1656129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 9 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 7966497 - 7966043
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  7966497 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttg-cttattcgcgacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 7966399  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     ||||||||| |||||||||||||    
T  7966398 attacatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaaa----tgtaatgtgttgtttaattatgg 7966303  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgt-aaaagatattgtattat 307  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  7966302 acactatgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaaagatattgtatttt 7966203  T
Q  308 tcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaa 396  Q
     |||||||||||| |||||| ||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||           ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  7966202 acttgtttatgactgagtttaaatgttgtataagttatattgcctttggaaatgctctggttaaattacaggtaaaaactggccgaaaaatggcttggaa 7966103  T
Q  397 atgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaacta 455  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||   ||| |||||||||||||||    
T  7966102 gtgctttagaattatgcagaactcactgtctgcataatcaattttctcagcagttaacta 7966043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 9 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 9711086 - 9710611
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9711086 gagatgaatacgcatgaaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaagataatat 9710987  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||          | |||||||||||||    
T  9710986 attatatatgtatgttctttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga----------gttgtttaattatgg 9710897  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  9710896 acactttgtaacattttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcagtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttat 9710797  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaa 397  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||| |||| || ||||| ||||| |||| ||           ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9710796 cttgtttatgtcctagtttcaatgttgtatgaattattttacctttggaaatactcttgtttaattacaggtaaaaactgaccgaaaaatggcttggaaa 9710697  T
Q  398 tgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataatt-gttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| | || ||||||||    
T  9710696 tg-tttagaattatgcagaacccactgtctgcataattcgttttcctcggcagttaactcccgaagttttcctcggcagttaactgc 9710611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 482
Target Start/End: Original strand, 44469575 - 44470051
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  44469575 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 44469674  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||          | |||||||||||||    
T  44469675 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga----------gttgtttaattatgg 44469764  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |    
T  44469765 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttat 44469864  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccg-aaaaatggtttggaa 396  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||           ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44469865 cttgattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttgaaaatgctctggttcaattacaggtaaaaactgaccgaaaaaatggcttggaa 44469964  T
Q  397 atgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | || ||||||||    
T  44469965 atg-tttagaattatgcagaatccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactcccgaggttttcctcggcagttaactgc 44470051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 33168422 - 33168106
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33168422 gagatgaatacgcatggaaaacaacaagctatatgccttgacttattttagacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaaaataatat 33168323  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  33168322 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgagtgtaagtagggatttaatttaatgatatgtaatgagttgtaatgtgttgtttaattatgg 33168223  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| | | |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |     
T  33168222 acactatgtaacgttttgatgattttcaaactttcgtgtactttgaactaaatgtcggtttgatttaattatggacaactgtaaaagataatatattttc 33168123  T
Q  309 cttgtttatgaccgagt 325  Q
    |||||||||||| ||||    
T  33168122 cttgtttatgactgagt 33168106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 9 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 38690417 - 38690117
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  38690417 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcaaaatatggtggaaaataatat 38690318  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||          || ||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  38690317 attatatatgtatgtttgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagta-ggattta----------atataatgatgtgtaatgtgttgtttaattatgg 38690229  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38690228 acactttgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaatcaaatgtcggtttgatttaactatggacaattgtaaaagatattgtattttt 38690129  T
Q  309 cttgtttatgac 320  Q
    ||| ||||||||    
T  38690128 cttatttatgac 38690117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 9 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 50113830 - 50113354
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  50113830 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 50113731  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctg-----taatgtgctgtttaat 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||     | |||  |  |||  |    
T  50113730 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaataatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttt-gt 50113632  T
Q  204 tatggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 303  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50113631 tatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 50113532  T
Q  304 ttattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctg-----------gttaaaaactgaccg-aaaaatggtt 391  Q
    ||  ||||||||||| | |||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||||||||||           ||||||||||  ||| |||||||| |    
T  50113531 tttatcttgtttatgtctgagtttcaacgttgtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactagccgaaaaaatggat 50113432  T
Q  392 tggaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaactatcgaggttttcct 468  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  50113431 tgaaaatg-tttagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagtttttctcggcagttaactaccgagattttcct 50113354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 369
Target Start/End: Original strand, 37018960 - 37019310
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  37018960 gagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacataggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 37019059  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||          | |||||||||||||    
T  37019060 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgtgtaatga----------gttgtttaattatgg 37019149  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  37019150 acactttgtaacattttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttat 37019249  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||| |||| || |||||  |||| ||||||||    
T  37019250 cttgtttatatccgagtttcaatgttgtatgaattattttacctttgaaaatactctggtt 37019310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 481
Target Start/End: Original strand, 25039645 - 25040115
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  25039645 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatacgccttggcttattcgcgtcgataacgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 25039744  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||           ||||||||| ||||||   ||||    
T  25039745 attatatgtgtatgttcgttccatatacaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgat----------gtgtaatgtgttgtttatgcatgg 25039834  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| | | ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  25039835 acactatgtaacgatttgatgaattttaaacttttgtgtattttgaaccaaatatcagtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttta 25039934  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaa 397  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||||  | |||||||| |||| |||||| ||||||           ||||||||| ||||||||||    |||||    
T  25039935 cttgtttatgactgagtttaaatgttgtacaagttatattgtctttggaaatgttctggttaaattacaggtaaaaactggccgaaaaatg----ggaaa 25040030  T
Q  398 tgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactg 481  Q
    ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||| |||||||    
T  25040031 tgcttaacaattatgcagaacccactgtctgcataaatgttttcctcaacagttaactaccaaggttttcctcgacaattaactg 25040115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 29352742 - 29352294
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  29352742 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 29352643  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  29352642 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 29352553  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |    
T  29352552 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtatttat 29352453  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccg-aaaaatggtttggaa 396  Q
    |||  ||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||           |||||| || ||| |||||||||||||||    
T  29352452 cttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttgcaaatgctctggtttaattacaagtaaaaattggccgaaaaaatggtttggaa 29352353  T
Q  397 atgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaact 454  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  29352352 atg-tttagaattatgtagaatccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaact 29352294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 369
Target Start/End: Original strand, 20353500 - 20353849
Alignment:
Q  10 agatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatata 109  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  20353500 agatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatata 20353599  T
Q  110 ttatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgga 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||   |||       |||||||||||||    
T  20353600 ttatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtataatga---gta-------gtttaattatgga 20353689  T
Q  210 caatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattc 309  Q
    || ||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  20353690 cactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttgtc 20353789  T
Q  310 ttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    ||  ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20353790 ttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattatattacctttggaaatgctctggtt 20353849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 369
Target Start/End: Original strand, 30909593 - 30909943
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  30909593 gagatgaatacgcatggaaaacagcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 30909692  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||        |||||||||||    
T  30909693 attatatatgtatgttcgtttcatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------ctttaattatgg 30909782  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |    
T  30909783 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaacgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttat 30909882  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
     ||  ||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  30909883 gttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtt 30909943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 369
Target Start/End: Original strand, 13633436 - 13633787
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  13633436 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgatgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 13633535  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  13633536 attatatatgtatgtttgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttattgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 13633625  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaat-ttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattat 307  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| || | |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  13633626 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaatgttaaccaaaatgtcggttaaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtattta 13633725  T
Q  308 tcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||  |||||||    
T  13633726 tcttgattatgaccgagtttcaatattgtatgaattatttagcctttggaaattgtctggtt 13633787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 369
Target Start/End: Original strand, 5081928 - 5082280
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  5081928 gagatgaatacgcatggaaaacgacaaggtatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 5082027  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||   |||        |||||||||||    
T  5082028 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaaatatggatttaatttaatgatgtgtaagga---gta-------ctttaattatgg 5082117  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |    
T  5082118 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttat 5082217  T
Q  309 cttgtttatgac--cgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    |||  ||||| |   |||||||||| |||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||    
T  5082218 ctttattatgtctgagagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttgaaaatgctctggtt 5082280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12643714 - 12643369
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12643714 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaaaataatat 12643615  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||          | |||||||||||||    
T  12643614 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga----------gttgtttaattatgg 12643525  T
Q  209 acaatttataacgttttga---tgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatt 305  Q
    ||| || ||    | | ||   | ||||  |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12643524 acacttaat----tatagacacttaatt--aaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatt 12643431  T
Q  306 attcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctgg 367  Q
      ||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  12643430 tatcttgtttatgtctgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttggaaatgctctgg 12643369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3944484 - 3944172
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  3944484 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 3944385  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  3944384 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 3944295  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |    
T  3944294 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtatttat 3944195  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaat 331  Q
    |||  ||||| ||||||||||||    
T  3944194 cttcattatgtccgagtttcaat 3944172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 6558410 - 6558047
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  6558410 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaagataatat 6558311  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  6558310 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 6558221  T
Q  209 acaatttataacgt--------------tttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaa 294  Q
    ||| ||| ||| ||              ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  6558220 acactttgtaatgttttgagtggtttaatttgatgaatttcaaacatttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaa 6558121  T
Q  295 gatattgtattattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt 368  Q
    ||||||||| |  ||||  ||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  6558120 gatattgtacttatcttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttggaaatgctctggt 6558047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 38772140 - 38771788
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  38772140 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttatccgcgacgacggtgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 38772041  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  38772040 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 38771951  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |    
T  38771950 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaggatattgtatttat 38771851  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatatt--gtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    |||  ||||| ||||||||||||  |   ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  38771850 cttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtt 38771788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 331
Target Start/End: Original strand, 3993406 - 3993718
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  3993406 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 3993505  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  3993506 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 3993595  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |    
T  3993596 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtatttat 3993695  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaat 331  Q
    |||  ||||| ||||||||||||    
T  3993696 cttcattatgtccgagtttcaat 3993718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 366
Target Start/End: Original strand, 5141435 - 5141780
Alignment:
Q  10 agatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatata 109  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || || ||||||||    
T  5141435 agatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcgttggcttattcgcgacgatagcgacgtcagatgtatgtttcggaatatgatggaagataatata 5141534  T
Q  110 ttatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgga 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||||| ||||||| |||| ||||          | ||||||| ||||||||||| ||    
T  5141535 ttatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgtagaatgtcagtagagatttaatttaacgata----------tataatgtgttgtttaattattga 5141624  T
Q  210 caatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattc 309  Q
    || | | ||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||    
T  5141625 cactatttaacgttttaatgaatttcaaacattcgagtaattcgaaccccttgtcggtttgatttaattatggacaactgtaaaagata-tgtaattttc 5141723  T
Q  310 ttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctg 366  Q
    ||||||||| | |||| | ||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  5141724 ttgtttatgcctgagtataaatgttgtatgagttatattgcctttggaaatgttctg 5141780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 224 - 454
Target Start/End: Original strand, 22345818 - 22346055
Alignment:
Q  224 ttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccga 323  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     | ||||    
T  22345818 ttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttacttatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttg-----gtccga 22345912  T
Q  324 gtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctg-----------gttaaaaactgaccgaaaaatggtttggaaatgctttagaattatg 412  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||           | |||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  22345913 gtttcaatgttgtatgatttatattgcctttggaaatgctctggcttaattacaggtaaaaactggtcgaaaaatggcttggaaatgcattagaattatg 22346012  T
Q  413 cagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaact 454  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22346013 cagaacccactgtctgcataattgttttcctcggcagttaact 22346055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 204 - 460
Target Start/End: Original strand, 46886137 - 46886406
Alignment:
Q  204 tatggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 303  Q
    |||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46886137 tatggacactttgtaatgtttcgatgaatttcaaacgtttgtgtaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 46886236  T
Q  304 ttattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccg-aaaaatggtt 391  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||           ||||||||  ||| |||||||| |    
T  46886237 tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttggaaaggctctggtttaattacaggtaaaaactagccgaaaaaatggct 46886336  T
Q  392 tggaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaactatcgag 460  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  46886337 tggaaatg-tttagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactaccgag 46886406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 197 - 484
Target Start/End: Original strand, 15051090 - 15051390
Alignment:
Q  197 gtttaattatggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaaga 296  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15051090 gtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaaga 15051189  T
Q  297 tattgtattattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccg-aaa 384  Q
    ||||||| |  ||||  ||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||           ||||||||| ||| |||    
T  15051190 tattgtacttatcttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaa 15051289  T
Q  385 aatggtttggaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||  | ||||  | ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||    
T  15051290 aatggcttggaaatg-tttagaattatgcagaactcactgtctgcataatcagatttcgccggcagttaactaccgaggttttcctcggcagttaactgc 15051388  T
Q  483 cg 484  Q
    ||    
T  15051389 cg 15051390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 220 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 94705 - 94559
Alignment:
Q  220 cgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatga 319  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  94705 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgt 94606  T
Q  320 ccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctg 366  Q
    |||||||||||| |||||||| || | |||||||| |||||||||||    
T  94605 ccgagtttcaatgttgtatgaattgttttgcctttcgaaatgctctg 94559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 220 - 455
Target Start/End: Original strand, 52805325 - 52805572
Alignment:
Q  220 cgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatga 319  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  52805325 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttatttatgt 52805424  T
Q  320 ccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaatgctttagaat 408  Q
    | |||||||||| || ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||           ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  52805425 cagagtttcaatgttatatgaattattttgcctttggaaatactctggtttaattacaggtaaaagctgaccgaaaaatggcttggaaatg-tttagaat 52805523  T
Q  409 tatgcagaatccactgt-tgcataa-ttgttttcctcagcagttaacta 455  Q
     |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  52805524 catgcagagcccactgtctgcataatttgttttcctcggcaattaacta 52805572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 220 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 16282004 - 16281807
Alignment:
Q  220 cgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatga 319  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  16282004 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccagatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaaaatattgtatttttcttgtttatgt 16281905  T
Q  320 ccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaatgctttagaa 407  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |          ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16281904 ccgagttttaatgttgtatgaattattttgcctttcgaaatgctctgctttaattacagtaaaaactgaccgaaaaatagtttggaaatgttttagaa 16281807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 220 - 369
Target Start/End: Original strand, 22527460 - 22527609
Alignment:
Q  220 cgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatga 319  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||     
T  22527460 cgttatgatgaattttaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaacatattgtatttatcttgtttatgt 22527559  T
Q  320 ccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    |||||||||||| |||||||| || | |||||||| ||||||||||||||    
T  22527560 ccgagtttcaatgttgtatgaattgttttgcctttcgaaatgctctggtt 22527609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 220 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 31780275 - 31780128
Alignment:
Q  220 cgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatga 319  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  31780275 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaacctaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgt 31780176  T
Q  320 ccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctgg 367  Q
    |||||||||||| |||||||| || | ||||| || ||||||||||||    
T  31780175 ccgagtttcaatgttgtatgaattgttttgccattcgaaatgctctgg 31780128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 224 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 19521900 - 19521758
Alignment:
Q  224 ttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccga 323  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  19521900 ttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcgatttgatttaattatagacaattgtaaaagatatagtatttttcttgtttatgtccga 19521801  T
Q  324 gtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctg 366  Q
    ||||||||  ||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  19521800 gtttcaatgctgtatgaattattttgcctttcgaaatgctctg 19521758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 220 - 366
Target Start/End: Original strand, 21144396 - 21144542
Alignment:
Q  220 cgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatga 319  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  21144396 cgttatgacgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcgatttgatttaattatagacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgt 21144495  T
Q  320 ccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctg 366  Q
     ||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||    
T  21144496 tcgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttcgaaattctctg 21144542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 220 - 369
Target Start/End: Original strand, 470835 - 470984
Alignment:
Q  220 cgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatga 319  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||     
T  470835 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtataatttgaaccaaatgtcggtttgattaaattatgaacaatggtaaaagatattgtacttatcttgtttatgt 470934  T
Q  320 ccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    |||||||||||| |||||||| || | |||||||| ||||||||||||||    
T  470935 ccgagtttcaatgttgtatgaattgttttgcctttcgaaatgctctggtt 470984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 369 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 38690078 - 38689964
Alignment:
Q  369 taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaactatcgaggttttcc 467  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  38690078 taaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgctttagaattatgtagaaaccactgtctgcataattgttttcctcggcagttaactaccgaggttttcc 38689979  T
Q  468 ttgacatttaactgc 482  Q
    ||| || ||||||||    
T  38689978 ttggcagttaactgc 38689964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 228 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 50617503 - 50617376
Alignment:
Q  228 tgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgt-attattcttgtttatgaccgagtt 326  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||  || || ||||||||| | |||||    
T  50617503 tgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaaatatggacaattgtaaaaaatattgtgtttttttttgtttatgtcagagtt 50617404  T
Q  327 tcaatattgtatgatttatattgccttt 354  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  50617403 tcaatgttgtatgaattattttgccttt 50617376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 119 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 1180022 - 1179878
Alignment:
Q  119 tatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatggacaatttata 218  Q
    |||||||||||||| ||||| || |  |||||| || |   |||||| ||||  |||| ||||| | ||||||||| ||||||||| |||||| | | ||    
T  1180022 tatgttcgttctatctgcaactgcgtagaatgtcagcaaatatttaatttaacaatatttaatgtgttgtaatgtgttgtttaattgtggacactcttta 1179923  T
Q  219 acgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgt 263  Q
    | ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||    
T  1179922 atgttttgatgaatttcaaacattcgtgtaattttaacgaaatgt 1179878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 369
Target Start/End: Original strand, 47714877 - 47715001
Alignment:
Q  245 tgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgattta 344  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||  | ||||||||| |||||| || ||||||||||| |||| | ||| ||||| || | |    
T  47714877 tgtaattttaatgaaatgtcggattgattcaattatggacagctataaaagataatgtatttttgttgtttatgactgagtataaatgttgtacgactaa 47714976  T
Q  345 tattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    |||||  | | ||||||||||||||    
T  47714977 tattgtttctggaaatgctctggtt 47715001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 50617287 - 50617238
Alignment:
Q  433 ttgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  50617287 ttgttttcctcggcagttaactcccgaggttttccttgacagttaactgc 50617238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 369
Target Start/End: Original strand, 23359217 - 23359263
Alignment:
Q  323 agtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23359217 agtttcaatcttgtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtt 23359263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 319
Target Start/End: Original strand, 10165606 - 10165703
Alignment:
Q  222 ttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatga 319  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| | | |||| || ||||||  || ||| |||||| ||||||    
T  10165606 ttttgttgaatttcaaacattcgtgtaattttaacaaaatgttgaattgatttaatttttgtcaatggtgaaagattatgcattgttcttgcttatga 10165703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 409 - 453
Target Start/End: Original strand, 47715044 - 47715089
Alignment:
Q  409 tatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaac 453  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  47715044 tatgcagaacccactgtctgcataattgctttcctcagcagttaac 47715089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 437 - 473
Target Start/End: Original strand, 22528612 - 22528648
Alignment:
Q  437 tttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgaca 473  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22528612 tttcctcggcagttaactatcgaggttttcctcgaca 22528648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 29261601 - 29261529
Alignment:
Q  291 aaaagatattgtattattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgct 363  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| || ||| ||| |||||| | ||||||| |||||  |||||||    
T  29261601 aaaagatattgtattttacttgtttatgactgaatttaaatgttgtataagttatattacctttgaaaatgct 29261529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 503 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 49874987 - 49874947
Alignment:
Q  503 ttactcgtgtgaaacaaccttatgcaacgtgtctacaacaa 543  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  49874987 ttactcgtgtgacacaaccttatgcaatgtgtcaacaacaa 49874947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 9 - 452
Target Start/End: Original strand, 18609797 - 18610242
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18609797 gagataaatatgcatggaaaacgacaagttatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaaaattatat 18609896  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||| |||          ||||||||||    
T  18609897 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatcatgtgtaatgagttgt----------ttaattatgg 18609986  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18609987 acactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaattcgaaccagatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattttt 18610086  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaa 397  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||           ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18610087 cttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttgaaaatgctctggtttaattacatgtaaaaactgaccgaaaaatggcttggaaa 18610186  T
Q  398 tgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaa 452  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18610187 tgctttagaattatgcagaacccactatctgcatagttgttttcctcggcagttaa 18610242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 9 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 23959399 - 23958923
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  23959399 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcacgacgatagcgacgttggatttatgtttcggaatatggtgtaagataatat 23959300  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||           ||||||||| |||||||||||||    
T  23959299 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgat----------gtgtaatgtgttgtttaattatgg 23959210  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |     
T  23959209 acactatgtaacattttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatgaacaattgtaaaaaatattgtatttta 23959110  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaa 397  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||           ||||| |||  |||||||||| |||||||    
T  23959109 cttgtttatgactgagtttaaatgttgtataagttatattgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaatctggtcgaaaaatggcttggaaa 23959010  T
Q  398 tgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataa-ttgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  23959009 tgctttagaattatgcagaatccactgtctgcataaccagtttttctcggcagttaactaccgaggttttcctcggcatttaactgc 23958923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 9 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 29286711 - 29286264
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    |||| |||||| ||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  29286711 gagacgaatacacatagaaaacggcaaactatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 29286612  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||          ||||||||||    
T  29286611 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagaggtttaatttaatgatgtgtaatgagttgt----------ttaattatgg 29286522  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29286521 acactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattttt 29286422  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaa 397  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||           ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  29286421 cttgtttaagaccgagtttcaacgttgtatgatttatattgcctttgaaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaa 29286322  T
Q  398 tgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaact 454  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29286321 tgctttagaattatgcagaacctactgtctgcataattgttttcctcggcagttaact 29286264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 9 - 437
Target Start/End: Original strand, 29667387 - 29667827
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  29667387 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgtgacgatagcgatgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagttaatat 29667486  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  29667487 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtaatgtgttgtttaattatgg 29667586  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  29667587 acactgtgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttta 29667686  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaa 397  Q
    |||||||||||| |||||| ||  |||||| | |||||||||||||  ||||||||||||           ||||||||| ||||||||||| ||||||     
T  29667687 cttgtttatgactgagtttaaaagttgtataagttatattgcctttgaaaatgctctggttaaattacagataaaaactggccgaaaaatggcttggaag 29667786  T
Q  398 tgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgtt 437  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||    
T  29667787 tgctttggaattatgcaaaacccactgtctgcataaatgtt 29667827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 9 - 454
Target Start/End: Original strand, 25140669 - 25141117
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25140669 gagacgaatacacatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgtgacgatagcgacgtcgcatttatgtttcggaatatggtgaaagataatat 25140768  T
Q  109 attatata-tgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatg 207  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||          |||||||||    
T  25140769 attatataatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgt----------ttaattatg 25140858  T
Q  208 gacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattat 307  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  25140859 gacactttgtaacgtgttgatgaatttcaaacgtttgtttaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaatgatattgtatttt 25140958  T
Q  308 tcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaa 396  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||           |||||  || ||||||||||| ||| ||    
T  25140959 tcttgtttatggccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttggaaatgttctggtttaattacaggtaaaacttggccgaaaaatggcttgaaa 25141058  T
Q  397 atgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaact 454  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25141059 atgctttagaattatgcagaacccactgtctccataattgttttcctcggcagttaact 25141117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 7537709 - 7537250
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  7537709 gagacgaatacgcatggaaaacagcaagttatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 7537610  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgt----ttaatt 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||  |||    |  ||     ||||||    
T  7537609 attatatatgtatgttcgttccatatgcatttgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgcaatgatttgtttaattatggacacttaatt 7537510  T
Q  205 atggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 304  Q
    ||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7537509 atggacactttgtaatgtttagatgaatttcaaacgtttgtgtaattttaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 7537410  T
Q  305 tattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttg 393  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||           ||||||||| ||||||||||| |||    
T  7537409 ttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaatggcttg 7537310  T
Q  394 gaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagtta 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||| |||||||    
T  7537309 gaaatgctttagaattatgcagaattcactgtctgcataatcagttttcctcggcagtta 7537250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 14 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 2051545 - 2051061
Alignment:
Q  14 gaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatatattat 113  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  2051545 gaatacgcatggaaaacggcaagttatatgtcttggcttattcgcgacgatggcgacgtcggatttatgtttcgaaatatggtggaagataatatattat 2051446  T
Q  114 atatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgt----ttaattatgga 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||    |  ||     ||||||||  |    
T  2051445 atatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatgaacacttaattattaa 2051346  T
Q  210 caatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattc 309  Q
    || ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  2051345 cactttttatcgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaactgtaaaagatattgtatttttc 2051246  T
Q  310 ttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctg-----------gttaaaaactgaccgaaaaatggtttggaaat 398  Q
    ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||           | ||||||||| ||||||||| | ||| ||||    
T  2051245 ttggttatgatcgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttggaaatgctctgttttaattacagataaaaactggccgaaaaattgcttgaaaat 2051146  T
Q  399 gctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
    || ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| | || ||||||||    
T  2051145 gcattagaattatgcataacccactgtctgcataattgttttcctctgcagataactaccgaggttttcctcggcagttaactgc 2051061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 9 - 482
Target Start/End: Original strand, 28362281 - 28362771
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    |||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  28362281 gagatgaataagcatggaaaatggcaagctatatgccttggcttatttgcgatgatagcgacgtcgaatttatgtttcagaatatggtggaagataatat 28362380  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctg----tttaatt 204  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||    || ||    |||||||    
T  28362381 attatatatgtatgttcgatcgatatgcaattgtgtagaatgtatgtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaatgatggacatttaatt 28362480  T
Q  205 atggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 304  Q
    ||| ||| ||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  28362481 atgaacactttgtaacgttttgttgaatttcaatcggttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaattttagacaactgtaaaagatattgtat 28362580  T
Q  305 tattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttg 393  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||           ||||||||| ||||||||||| |||    
T  28362581 ttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttatatgatttatattacctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaatggcttg 28362680  T
Q  394 gaaatgctttagaattatgcagaatccactg-ttgcataat--tgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||  ||||||||   | ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  28362681 gaaatg-tttagaattatgcagaacacactgcctgcataatccagatttcctctgcagttaactatcgaggttttcctcggcagttaactgc 28362771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 9 - 454
Target Start/End: Original strand, 31150629 - 31151076
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||    
T  31150629 gagatgaatacgcttggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgttttagaatatggtggaagataatat 31150728  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||          ||||||||||    
T  31150729 attatatatgtatgtttgatcgatatgcaattgcgttgaatgtatgtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgt----------ttaattatgg 31150818  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  31150819 acactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaattggaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttac 31150918  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctg-----------gttaaaaactgaccgaaaaatggtttggaaa 397  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||           | |||||||||  |||||||||| |||||||    
T  31150919 cttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttggaaatgctctggattaattataggtaaaaactgggcgaaaaatggcttggaaa 31151018  T
Q  398 tgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataa-ttgttttcctcagcagttaact 454  Q
    |  ||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  31151019 t-atttagaattatgcagaacccacagtctgcataatttgttttccttggcagttaact 31151076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 13383150 - 13382660
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  13383150 gagatgaatacgcatggaaaacgtcaagttatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 13383051  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||   |||       ||||||||||||    
T  13383050 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgcaatga---gta-------gtttaattatgg 13382961  T
Q  209 acaatttataacgt--------------tttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaa 294  Q
    ||| ||| ||| ||              ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13382960 acactttgtaatgttttgagtagtttaatttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaa 13382861  T
Q  295 gatattgtattattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaa 383  Q
    ||||||||| |  ||||  ||||| |||||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||           |||||||||  ||||    
T  13382860 gatattgtagttatctttattatgtccgagtttcaaacttgtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggtcgaa 13382761  T
Q  384 aaatggtttggaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactg 481  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||    
T  13382760 aaatggcttggaaatg-tttacaattatgcag-acccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactaccgaggttttcctcggcagttaactg 13382663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1608803 - 1608451
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  1608803 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 1608704  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  1608703 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 1608614  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  1608613 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttat 1608514  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatatt--gtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    |||  ||||| ||||||||||||  |   ||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  1608513 cttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacttttggaaatgctctggtt 1608451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 191 - 465
Target Start/End: Original strand, 26702448 - 26702721
Alignment:
Q  191 tgtgctgtttaattatggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgt 290  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26702448 tgtgttgtttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaaccaaatgtcggttt-atttaattatggacaattgt 26702546  T
Q  291 aaaagatattgtattattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctg-gttaaaaactgaccgaaaaatgg 389  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||  ||  |   |||||| |    
T  26702547 aaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgaatttctatgttgtatgatttatactgcctttggaaatgctctgatttaattac--atgtaaaaattg 26702644  T
Q  390 tttggaaa---tgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaactatcgaggtttt 465  Q
     | | |||    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  26702645 gtcgaaaaatgggctttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgttttcct---cagttaactatcgaggtttt 26702721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 2259593 - 2259338
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2259593 gagatgaatacgcatagaaaacgacaagctatatgcattggcttattaaagacgaaagcgacgtcagatttatgtttcgaaatatggtggaaaataatat 2259494  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||| |  | |||||||||||| |||||||          || |||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  2259493 attatatatgcatgtttgttccatatgcaa-tacgttgaatgtaagtaaggattta----------atttaataagttgtaatgtgttgtttaattatgg 2259405  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgattta 275  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||    
T  2259404 acactatgtaacgttttgatgaatttcaacattttgtgcattttgaaccaaatgtcggtttcattta 2259338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 227 - 482
Target Start/End: Original strand, 11840022 - 11840290
Alignment:
Q  227 atgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccgagtt 326  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||    
T  11840022 atgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaatcaaatgtcggtttgatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgttcgagtt 11840121  T
Q  327 tcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaatgctttagaattatgcag 415  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||           ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  11840122 tcaatgttgtatgaattattttgcctttggaaatgttctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaattatgcag 11840221  T
Q  416 aatccactg-ttgcataat-tgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
    |   |||||  ||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  11840222 agctcactgcctgcataatcagatttcctcggcagttaactaccgaggttttcctcgacagttaactgc 11840290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 197 - 483
Target Start/End: Original strand, 18351385 - 18351684
Alignment:
Q  197 gtttaattatggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaaga 296  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18351385 gtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaaga 18351484  T
Q  297 tattgtattattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccg-aaa 384  Q
    ||||||| |  ||||  ||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||           ||||||||| ||| |||    
T  18351485 tattgtacttatcttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttgaaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaa 18351584  T
Q  385 aatggtttggaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  | |||| || ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||    
T  18351585 aatggctcggaaatg-tttagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagatttcttcggcagttaactaccgaggttttcctcggcagttaactgc 18351683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 42 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 34230956 - 34230682
Alignment:
Q  42 tgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatatattatatatgtatgttcgttctatatgcaattg 141  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||  |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  34230956 tgccttggcttattcaagaggatagtgacgtccgatttatgttttagaatatggtagaagataatatattatatatgtatgttcgttccatctgcaactg 34230857  T
Q  142 tgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatggacaatttataacgttttgatgaatttcaaa-ct 240  Q
    ||  |||||| ||||| ||||||| |||| ||| |||||||          || |||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||| |     
T  34230856 tgtagaatgttagtagagatttaatttaacgatgtgtaatg----------tgttgtttaattatggacactctttaatgttttgatgaatttcaaagca 34230767  T
Q  241 tttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccgagt 325  Q
    ||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||    
T  34230766 ttcatgtaattttaacgaaatgtcggtttgatttaattatagacaattgtaaaagataatgtatttttattctttatgactgagt 34230682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 220 - 368
Target Start/End: Original strand, 3502429 - 3502577
Alignment:
Q  220 cgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatga 319  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  3502429 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgg 3502528  T
Q  320 ccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt 368  Q
    || ||||||||| |||||||| || | |||||||| |||||||||||||    
T  3502529 ccaagtttcaatgttgtatgaattgttttgccttttgaaatgctctggt 3502577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 361
Target Start/End: Original strand, 31771505 - 31771646
Alignment:
Q  220 cgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatga 319  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  31771505 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaaaatattgtatttttcttgtttatgt 31771604  T
Q  320 ccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatg 361  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  31771605 ccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttcgaaatg 31771646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 174 - 369
Target Start/End: Original strand, 20448506 - 20448701
Alignment:
Q  174 tatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatt 273  Q
    ||||||||||  || |||||| |||||||||||||||| | | ||| ||||| ||||||||||||| ||  | |||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  20448506 tatgtaatgatatgaaatgtgttgtttaattatggacactctttaatgtttttatgaatttcaaacattcctctaattttaacgaaatgtcggattgatt 20448605  T
Q  274 taattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||| | |||  ||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  20448606 taattatggacaactgtaaaagataatgtattcttcttgtttatgactaagtataaatggtgtatgagttatattgcctctgtaaatgctctggtt 20448701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 273 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 2258540 - 2258362
Alignment:
Q  273 ttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt---- 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||        
T  2258540 ttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgactgagtttaaatgttgtatgagttatattgcctttgaaaatgctctggtttaa 2258441  T
Q  369 -------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgtttt 439  Q
           ||||| ||||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  2258440 ttacaagtaaaatctgactgaaaaatgacttgaaaattctttagaattatgcagaattcactgtctgcataattgtttt 2258362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 250 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 8304715 - 8304596
Alignment:
Q  250 tttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattg 349  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||   ||| ||||||||  |||||||    
T  8304715 tttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagataatgtatttttcttgtttatgactgagtgcaaatgttgtatgaggtatattg 8304616  T
Q  350 cctttagaaatgctctggtt 369  Q
     |||| ||||||||||||||    
T  8304615 gctttggaaatgctctggtt 8304596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 203 - 369
Target Start/End: Original strand, 20439753 - 20439919
Alignment:
Q  203 ttatggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgt 302  Q
    ||||||||| | | ||| ||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  20439753 ttatggacactctttaatgttttcatgaatttcaaacattcctgtaattttaacaaaatgtcggattgatttaattatggacaactgtaaaagataatgt 20439852  T
Q  303 attattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    |||  |||||||||||||  ||| | |||  ||||||| || |||||||| | ||||||||||||||    
T  20439853 attcctcttgtttatgactaagtataaatggtgtatgagttgtattgcctctggaaatgctctggtt 20439919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 221 - 369
Target Start/End: Original strand, 20436063 - 20436211
Alignment:
Q  221 gttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgac 320  Q
    ||||| ||||||||||||| ||  |||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  20436063 gttttcatgaatttcaaacattcatgtaattttaataaaatgtcggattgatttaatcatggacaactgtaaaagataatgtattcctcttgtttatgac 20436162  T
Q  321 cgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
      ||| | |||  ||||||| || ||||  || | ||||||||||||||    
T  20436163 taagtataaatggtgtatgaattgtattttctctggaaatgctctggtt 20436211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 221 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19129281 - 19129180
Alignment:
Q  221 gttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgac 320  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||    
T  19129281 gttttgatgaatttcaaacattcgtgtaatttcaacgaaatgtcagattgatttaattatggacaactgtaaaagataatg---cattcttgtttatgac 19129185  T
Q  321 cgagt 325  Q
     ||||    
T  19129184 tgagt 19129180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 436 - 482
Target Start/End: Original strand, 13388702 - 13388748
Alignment:
Q  436 ttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  13388702 ttttcctcggcagttaactaccgaggttttcctcgacagttaactgc 13388748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 497 - 543
Target Start/End: Original strand, 26702747 - 26702793
Alignment:
Q  497 cgtattttactcgtgtgaaacaaccttatgcaacgtgtctacaacaa 543  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  26702747 cgtattttactcgtgtgacacagccttatgcaatgtgtcaacaacaa 26702793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 124
Target Start/End: Original strand, 20448386 - 20448466
Alignment:
Q  43 gccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatatattatatatgtatgtt 124  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||   |||||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||| ||||    
T  20448386 gccttggcttattcgtgacgatagcgacgtttcatttatgtttaggtatatgttg-aagataatatattatatatgtgtgtt 20448466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 26712128 - 26712079
Alignment:
Q  435 gttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgccg 484  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||    
T  26712128 gttttcctcggcagttaactaccgaggttttcctcggcagttaactgccg 26712079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 439 - 484
Target Start/End: Original strand, 27641715 - 27641760
Alignment:
Q  439 tcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgccg 484  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||    
T  27641715 tcctcagcagttaactaccgaggttttcctcgacactgaactgccg 27641760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 28249964 - 28249916
Alignment:
Q  436 ttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgccg 484  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||    
T  28249964 ttttcctcggcagttaactaccgaggttttcctcggcagttaactgccg 28249916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 9 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 41005045 - 41004578
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  41005045 gagatgaatacgcatggaaaacgacaagctacatgccctggcttattaaagacgattgggacgtcagatttatgtttcagaatatgttgaaaaattatat 41004946  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  41004945 attatatatgtatgttcattccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagtgatttaatataatgatgtgtaatgagttgtaatgtgttgtttaattatgg 41004846  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||    
T  41004845 acactttgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttaaaccaaatgttggtttgatttaattatagacaattgtaaaagatattatattttt 41004746  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaa 397  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||           ||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  41004745 cttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgtctttggaaatgcttcggtttaattacaggtaaaaactgaccg-aaaatggctttgaaa 41004647  T
Q  398 tgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaactatcgaggtttt 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  41004646 tgctttagaattatgcagaatccactgtctgcataatatttttcctcggcagttaactaccgaagtttt 41004578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 9 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 43944210 - 43943722
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||   || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  43944210 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcattggcttattcgcgatgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 43944111  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||   ||||    
T  43944110 aatatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgaattgtaatgtgttgtttatgcatgg 43944011  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43944010 acactttgtaacgttttgatgaatttcaaacttttttgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattttt 43943911  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttata--ttgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttgga 395  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||           ||||||||||||||||||||| |||||    
T  43943910 cttgtttatgaccgagttttaatgttgtatgatttatattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactgaccgaaaaatggcttgga 43943811  T
Q  396 aatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattg-ttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| | | |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||    
T  43943810 aatgctttagaattatgcataacccattctctgcataattgtttttcctcggcagttaactaccgagtttttcctcgacagttaactgc 43943722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 10 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 12906037 - 12905622
Alignment:
Q  10 agatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatata 109  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12906037 agatgaatacgcatggaaaacaacaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatata 12905938  T
Q  110 ttatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgga 209  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  12905937 ttatatatgtatgtttgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtacggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtaatgtgttgtttaattattga 12905838  T
Q  210 caatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattc 309  Q
    || | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  12905837 cactatgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaatatattgtattttac 12905738  T
Q  310 ttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt--------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaatgct 401  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  12905737 ttgtttatgactgagtttaaatgttgtatgagttatattgcctttggaaatgctctggttaaattagtaaaaactggtcgaaaaatggcttggaaatgct 12905638  T
Q  402 ttagaattatgcagaa 417  Q
    ||||||||||||||||    
T  12905637 ttagaattatgcagaa 12905622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 9 - 482
Target Start/End: Original strand, 81814 - 82302
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  81814 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatcccttgacttattaaagacgataacgacgtcggatttatgtttcggaatatggttgaaaataatat 81913  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgt---aatgtgc-tgtttaatt 204  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| || ||||||||| |||   | | |||    ||||||    
T  81914 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtatgcatttaatataatcatgtgtaatgagttgtttaattatgcacacttaatt 82013  T
Q  205 atggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 304  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  82014 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaatcaaatgtcggtttgatttaa-tatggacaattgtaaaagatattgtat 82112  T
Q  305 tattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttg 393  Q
    | ||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||    
T  82113 ttttcttgtttatgaccaagttttgatgttggatgatttatactgcctttagaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactgaccgaaaaatggtttg 82212  T
Q  394 gaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
     |||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||    
T  82213 aaaatgctttagaattatgcagaactcattgtctgcataattgttttcctcagcagttaactacggaggttttcctcgacagttaactgc 82302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 9 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 28343032 - 28342583
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgttt-cggaatatggtgaaaaataata 107  Q
    |||| |||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  28343032 gagacgaatacacatgtaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgttttcggaatatggtggaagataata 28342933  T
Q  108 tattatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatg 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||      ||    ||||||||||||    
T  28342932 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga------at----tgtttaattatg 28342843  T
Q  208 gacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattat 307  Q
     ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28342842 aacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttt 28342743  T
Q  308 tcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaa 396  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||           ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  28342742 tcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttggaaatgttctggtttaattacagataaaaactggccgaaaaatagtttggaa 28342643  T
Q  397 atgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaacta 455  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28342642 attctttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgttttcctcggcagttaacta 28342583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 9 - 414
Target Start/End: Original strand, 439374 - 439792
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  439374 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccctggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaaagtaatat 439473  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctg----tttaatt 204  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| || ||||||||| |||    |  ||     ||||||    
T  439474 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaaggagggatttaatataatcatgtgtaatgagttgtttaattatgaacacttaatt 439573  T
Q  205 atggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 304  Q
    ||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  439574 atggatactttgtaacgctttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 439673  T
Q  305 tattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttg 393  Q
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||           ||||||||||||||||||||| |||    
T  439674 --ttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttggaaatgcgctggtttaattacaggtaaaaactgaccgaaaaatggcttg 439771  T
Q  394 gaaatgctttagaattatgca 414  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  439772 gaaatgctttagaattatgca 439792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 9 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 41181919 - 41181474
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  41181919 gagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcattggcttatacgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 41181820  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||          ||||||||||    
T  41181819 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgt----------ttaattatgg 41181730  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  41181729 acactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaactgtaaaagatattgtattttt 41181630  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaa 397  Q
    |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||           ||||||||| || |||||||| |||||||    
T  41181629 cttagttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactgcccaaaaaatggcttggaaa 41181530  T
Q  398 tgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaa 452  Q
    ||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  41181529 tgcattagaattatgcataacccactgtctgcataattgttttcctcggcagttaa 41181474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 9 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 24602160 - 24601686
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    |||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  24602160 gagacgaatacggatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcaacgtcggatttatttttcggaatatggtggaagataatat 24602061  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgt----ttaatt 204  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||    |  ||     ||||||    
T  24602060 attatatat--atgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 24601963  T
Q  205 atggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 304  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24601962 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtctgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 24601863  T
Q  305 tattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttg 393  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||           ||||||||||||||||||||| |||    
T  24601862 ttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactgaccgaaaaatggcttg 24601763  T
Q  394 gaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaactatcgaggttttcct 468  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||    
T  24601762 gaaatgcttttgaattatgtagaatccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactaccgaagatttcct 24601686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 9 - 468
Target Start/End: Original strand, 24611954 - 24612428
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    |||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  24611954 gagacgaatacggatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcaacgtcggatttatttttcggaatatggtggaagataatat 24612053  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgt----ttaatt 204  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||    |  ||     ||||||    
T  24612054 attatatat--atgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 24612151  T
Q  205 atggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 304  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24612152 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtctgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 24612251  T
Q  305 tattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttg 393  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||           ||||||||||||||||||||| |||    
T  24612252 ttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactgaccgaaaaatggcttg 24612351  T
Q  394 gaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaactatcgaggttttcct 468  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||    
T  24612352 gaaatgcttttgaattatgtagaatccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactaccgaagatttcct 24612428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 468
Target Start/End: Original strand, 9659604 - 9660081
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  9659604 gagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgtgacgatagcgacgtcgagtttatgtttcggaatatggtggaagataatat 9659703  T
Q  109 attatatat--gtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgt----ttaa 202  Q
    ||| |||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||    |  ||     ||||    
T  9659704 attttatatttgtatgttcgttcaatatgcaattgcgttgaatgtaagtaggtatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaa 9659803  T
Q  203 ttatggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgt 302  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9659804 ttatggacactgtgtaacgttttgatgaatttcaagcgtttgtgtaattttaaccaaatgtcgttttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgt 9659903  T
Q  303 attattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtt 391  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||           ||||||||| ||||||||||| |    
T  9659904 atttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttggaaatgctctggtttaattaaaggtaaaaactggccgaaaaatggct 9660003  T
Q  392 tggaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaactatcgaggttttcct 468  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||    
T  9660004 tggaaatgttttagaattatgcataacccactgtctgcataattgttttcctcggcaattaactaccaaggttttcct 9660081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 41053142 - 41052683
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    |||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  41053142 gagacgaatacgcattgaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 41053043  T
Q  109 att-atatatgtatgttcgttc--tatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgt----tta 201  Q
    ||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||   |||||||||||||| ||||||     |||| ||||||||  |||    |  ||     |||    
T  41053042 atttatatatgtgtgttcgttccatatatgcaattgcattgaatgtaagtaggaatttaa-----tgatgtgtaatgaattgtttaattatggacactta 41052948  T
Q  202 attatggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattg 301  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41052947 attatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattg 41052848  T
Q  302 tattattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggt 390  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||           ||||||||| |||||||||||     
T  41052847 tatttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttggaaatactctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaatggc 41052748  T
Q  391 ttggaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaact 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  41052747 ttggaaatgctttagaattatgcagaacccactgtctgcataattattttcctcggcaattaact 41052683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 433
Target Start/End: Original strand, 45479385 - 45479811
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  45479385 gagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatatcggcgtcggatttatgtttcagaatatggtggaagataatat 45479484  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||          || |||||||||||||    
T  45479485 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatg----------tgttgtttaattatgg 45479574  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |     
T  45479575 acactatgtaacgttttgatgaatttcaaacttttttgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttta 45479674  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaa 397  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||           ||||||||| ||||||||| | ||| |||    
T  45479675 cttgtttatgactgagtttaaatgttgtattagttatattgcctttggaaatgctctggttaaattacaagtaaaaactggccgaaaaatagcttgaaaa 45479774  T
Q  398 tgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat 433  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  45479775 tgctttagaattatgcagaacccactgtctgcataat 45479811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 9 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 1097092 - 1096630
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||| | ||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  1097092 gagacgaatacgcatggaaaacggcaagttatatgcttgggcttatttgcgacgatagcgacgtcgaatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 1096993  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctg----tttaatt 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    |  ||     ||||||    
T  1096992 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatatgtaatgagttgtttaattatgaacacttaatt 1096893  T
Q  205 atggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 304  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1096892 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtagtttgaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatactgtat 1096793  T
Q  305 tattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccg-aaaaatggttt 392  Q
    |  ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||           ||||||||| ||| |||||||| ||    
T  1096792 ttatcttgtttatgtccgagttttaatgttgtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggctt 1096693  T
Q  393 ggaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaact 454  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||| | ||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  1096692 ggaaatg-tttagaattatgcataacccactgtcttcataatcagttttcctcggcagttaact 1096630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 484
Target Start/End: Original strand, 7267008 - 7267486
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  7267008 gagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatacctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 7267107  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  7267108 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 7267197  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |    
T  7267198 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtaggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttat 7267297  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccg-aaaaatggtttggaa 396  Q
    |||  ||||| |||||||||||| |||||| | |||| |||||||| |||||||||||||           ||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  7267298 cttcattatgtccgagtttcaatcttgtataaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaa 7267397  T
Q  397 atgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgccg 484  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||    
T  7267398 atgctttacaattatgcag-acccactgtctgcataatcagatttcctcggcagttaactaccgagattttccttggcagttaactgccg 7267486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 369
Target Start/End: Original strand, 24753588 - 24753938
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| || |||||||   |||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24753588 gagatgaatacgtatggaaaacggcaagctatatgcttttgcttattcgcgacgacggcgacatcgtatttatgtttcggaatatggtggaaaataatat 24753687  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||          ||||||||||    
T  24753688 attatatatgtatgtttgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgt----------ttaattatgg 24753777  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |    
T  24753778 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaaaaattgtaaaagatattgtatttat 24753877  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24753878 cttgtttatgtcccagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtt 24753938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 454
Target Start/End: Original strand, 39798004 - 39798451
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  39798004 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 39798103  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  39798104 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 39798193  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaat-ttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattat 307  Q
    ||  ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| || | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||      
T  39798194 ac--tttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaatgttaaccaaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgcattta 39798291  T
Q  308 tcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccg-aaaaatggtttgga 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||| |||||  ||||||           ||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  39798292 tcttgattatgaccgagtttcaatattgtatgaattatttaacctttggaaattgtctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttgga 39798391  T
Q  396 aatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaact 454  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  39798392 aatg-tctagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaact 39798451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 369
Target Start/End: Original strand, 41564054 - 41564406
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  41564054 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 41564153  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  41564154 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 41564243  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  41564244 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttat 41564343  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatatt--gtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    |||  ||||| ||||||||||||  |   ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41564344 cttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtt 41564406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 3795859 - 3795370
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  3795859 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgtgacgacggcgacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaagataatat 3795760  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  3795759 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 3795670  T
Q  209 acaatttataacgt--------------tttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaa 294  Q
    ||| ||| ||| ||              ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  3795669 acactttgtaatgttttgagtagtttaatttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaa 3795570  T
Q  295 gatattgtattattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgacc-ga 382  Q
    ||||||||| |  ||||  ||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||           ||||||||| ||  |    
T  3795569 gatattgtacttatcttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccaaa 3795470  T
Q  383 aaaatggtttggaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaact 480  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||  | |||||||||| | || ||||||    
T  3795469 aaaatggcttggaaatg-tttagaattatgcag-acccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaacttccaaggttttcctcggcagttaact 3795372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 331
Target Start/End: Original strand, 5351295 - 5351607
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  5351295 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 5351394  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  5351395 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 5351484  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |    
T  5351485 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtatttat 5351584  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaat 331  Q
    |||  ||||| ||||||||||||    
T  5351585 cttcattatgtccgagtttcaat 5351607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 10620483 - 10620171
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  10620483 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 10620384  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  10620383 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 10620294  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |    
T  10620293 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtatttat 10620194  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaat 331  Q
    |||  ||||| ||||||||||||    
T  10620193 cttcattatgtccgagtttcaat 10620171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 209494 - 209182
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  209494 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 209395  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||   |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  209394 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtatggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 209305  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |    
T  209304 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtatttat 209205  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaat 331  Q
    |||  ||||| ||||||||||||    
T  209204 cttcattatgtccgagtttcaat 209182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 230 - 482
Target Start/End: Original strand, 25184606 - 25184870
Alignment:
Q  230 aatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccgagtttca 329  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25184606 aatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatatcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttca 25184705  T
Q  330 atattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaatgctttagaattatgcagaat 418  Q
    || ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||           ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||     
T  25184706 atgttgtatgatttatattgcctttgaaaatactctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaattatacagaac 25184805  T
Q  419 ccactg-ttgcataattgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
    |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||    
T  25184806 ccactgtttacataattgttttcctcggcagttaactaccgaggttttcctcggcagttaactgc 25184870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 111 - 369
Target Start/End: Original strand, 38950232 - 38950480
Alignment:
Q  111 tatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatggac 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||   ||       ||||||||||||||    
T  38950232 tatatatgtatgttcgttccatatgtaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgag---ta-------gtttaattatggac 38950321  T
Q  211 aatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattct 310  Q
    | ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||    
T  38950322 actttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatct 38950421  T
Q  311 tgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    |  ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  38950422 tcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattatattacctttggaaatgctctggtt 38950480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 220 - 369
Target Start/End: Original strand, 39950936 - 39951085
Alignment:
Q  220 cgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatga 319  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  39950936 cgttatgatgaattttaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgt 39951035  T
Q  320 ccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    |||||||||||| |||||||| || | |||||||| ||||||||||||||    
T  39951036 ccgagtttcaatgttgtatgaattgttttgcctttcgaaatgctctggtt 39951085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 220 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 10825526 - 10825377
Alignment:
Q  220 cgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatga 319  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  10825526 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtctgtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgt 10825427  T
Q  320 ccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    | |||||||||| |||||||| || | |||||||| ||||||||||||||    
T  10825426 ctgagtttcaatgttgtatgaattgttttgcctttcgaaatgctctggtt 10825377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 220 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 32953038 - 32952892
Alignment:
Q  220 cgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatga 319  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||     
T  32953038 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaaaatattgtatttttcttgttgatgt 32952939  T
Q  320 ccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctg 366  Q
    | |||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  32952938 ctgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttcgaaatgctctg 32952892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 183
Target Start/End: Original strand, 1150595 - 1150769
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||| |||    
T  1150595 gagataaatacgcatggaaaacggcaaactatacgccttggtttatttgtgacgatagcgacgtcggatttatgttttggaatatgatggaagatactat 1150694  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatga 183  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  1150695 attatatatgtatgttcgttccatatgcaatttcattgaatgtaagtagtgatttaatttaatgatgtgtaatga 1150769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 220 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 29398213 - 29398071
Alignment:
Q  220 cgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatga 319  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    |||||     
T  29398213 cgttatgatgaatttcaaacatttgtgtaatttgaactaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaaaatattgtatttttc----ttatgt 29398118  T
Q  320 ccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctg 366  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  29398117 ccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttcgaaatgctctg 29398071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 3207086 - 3206956
Alignment:
Q  189 aatgtgctgtttaattatggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaatt 288  Q
    |||||| | ||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3207086 aatgtgatttttaattatggacaccatgcaacgttttgatgaatttcaaacttttgtatactttgaactaaatgtcggtttgatttaattatagacaatt 3206987  T
Q  289 gtaaaagatattgtattattcttgtttatga 319  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  3206986 gtaaaagataatgtatctttcttgtttatga 3206956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 145 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18000606 - 18000430
Alignment:
Q  145 tgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttg 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||   ||       ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  18000606 tgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgag---ta-------gtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctg 18000517  T
Q  245 tgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccgagtttcaat 331  Q
    | |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||    
T  18000516 tttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaat 18000430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 114
Target Start/End: Original strand, 38949750 - 38949855
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  38949750 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagttatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 38949849  T
Q  109 attata 114  Q
    ||||||    
T  38949850 attata 38949855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 222 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 25613508 - 25613379
Alignment:
Q  222 ttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgacc 321  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||| | | ||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||     
T  25613508 ttttgatgaatttcaaacattcttgtaatttaaacaaaatgcctgattgatttaattttggtcaattgtaaaagattatgtatt-ttcttgtttatgact 25613410  T
Q  322 gagtttcaatattgtatgatttatattgcct 352  Q
    || ||| |||  ||||||| || ||||||||    
T  25613409 gattttaaatgatgtatgagttgtattgcct 25613379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 25613685 - 25613583
Alignment:
Q  35 agctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatatattatatatgtatgttcgttctatat 134  Q
    |||||| ||||||| ||||||   |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||  | ||| |||||||||||||| | | ||||||||| || |    
T  25613685 agctatgtgccttgacttattcgtgacgatagcgacgtaggatttatgtttatgaatataattaaagataatatattatatctttgtgttcgttccatct 25613586  T
Q  135 gca 137  Q
    |||    
T  25613585 gca 25613583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 497 - 543
Target Start/End: Original strand, 82349 - 82395
Alignment:
Q  497 cgtattttactcgtgtgaaacaaccttatgcaacgtgtctacaacaa 543  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||    
T  82349 cgtattttactcgtgtgacataaccttatgcaatgtgtcaacaacaa 82395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 436 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 23346859 - 23346813
Alignment:
Q  436 ttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  23346859 ttttcctcggcagttaactaccgaggttttccttggcagttaactgc 23346813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 129
Target Start/End: Original strand, 27732940 - 27732993
Alignment:
Q  76 atttatgtttcggaatatggtgaaaaataatatattatatatgtatgttcgttc 129  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  27732940 atttatgtataggaatatggttaaaaataatatattatatctttgtgttcgttc 27732993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 43668414 - 43668329
Alignment:
Q  235 caaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgac 320  Q
    ||||| |||||||||||| ||  |||| || | ||||||||||| ||| || |||| ||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  43668414 caaacatttgtgtaattttaatgaaatatcagattgatttaattttggtcagttgtgaaagattatgtattgttcttgtttatgac 43668329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 484
Target Start/End: Original strand, 22003395 - 22003443
Alignment:
Q  436 ttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgccg 484  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||    
T  22003395 ttttcctcggcagttaactaccgaggttttcctcggcagttaactgccg 22003443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 426 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 34918541 - 34918489
Alignment:
Q  426 tgcataattgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaa 478  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||    
T  34918541 tgcataaatattttcctcagcagttaactatcaatgttttcctcgacagttaa 34918489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 43668555 - 43668499
Alignment:
Q  59 gacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatatattatat 115  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||  || ||||||||||||||    
T  43668555 gacgatagtgacgtaggatttatgtttaggcatatggttgaagataatatattatat 43668499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 28)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 12 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 12111729 - 12111394
Alignment:
Q  12 atgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatatatt 111  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  12111729 atgaatacacatggaaaacgacaagctatatgccttggtttattaaagatgatagcgacgtcggatttatatttcggaatatggtggaaaataatat--t 12111632  T
Q  112 atatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatggaca 211  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  12111631 atatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatttaatgatatgtaatgagttgtaatgtattgtttaattatggaca 12111532  T
Q  212 atttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattctt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  12111531 atttataacgttttgatgaattttaaactttggtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattataaaagatattgtatttttctt 12111432  T
Q  312 gtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattg 349  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12111431 gtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattg 12111394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 14 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 34623002 - 34622532
Alignment:
Q  14 gaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatatattat 113  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  34623002 gaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatgatggaagataatatattat 34622903  T
Q  114 atatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatggacaat 213  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||||| |||          ||||||||||||| |    
T  34622902 atatgtatgttcgtttcatatgcaattgcgttgaatgtaagtagaagtttaatttaatgatgtgtaatgagttgt----------ttaattatggacact 34622813  T
Q  214 ttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgt 313  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  34622812 ttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaatatattgtatttttcttat 34622713  T
Q  314 ttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaatgctt 402  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||           ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34622712 ttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttggaaatgctctggtttaattacatgtaaaaactgaccgaaaaatggcttggaaatgctt 34622613  T
Q  403 tagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||    
T  34622612 tagaattatgcagaacccactgtctgcataattgttttccttggctgttaactaccgaggatttcctcgacagttaactgc 34622532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 10 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 10705765 - 10705309
Alignment:
Q  10 agatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatata 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||    
T  10705765 agatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgccttggctaattgaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaagatgatata 10705666  T
Q  110 ttatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  10705665 ttatatatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttattgatgtgtaatgagttgtaatgtattgtttaattatgga 10705566  T
Q  210 caatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattc 309  Q
    || | | |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  10705565 cactatgtaacattttgatgaattttaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattttac 10705466  T
Q  310 ttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaat 398  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||           |||||| |||||||||||||  |||||| |    
T  10705465 ttgtttatgactgagtttaaatgttgtataagttatattgcctttagaaatgctttggttaaattacatgtaaaaattgaccgaaaaatgacttggaagt 10705366  T
Q  399 gctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaact 454  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||| ||| ||||||||||    
T  10705365 gctttagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttctcggcagttaact 10705309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 19044815 - 19044326
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    |||| ||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  19044815 gagaagaatatgcatggaaaacggcaagttatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcagatttatgtttcgaaatatggtggaagataatat 19044716  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgt----ttaatt 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||  |||    |  ||     ||||||    
T  19044715 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgtgtaatgatttgtttaattatggacacttaatt 19044616  T
Q  205 atggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 304  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19044615 atggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaactgtaaaagatattgtat 19044516  T
Q  305 tattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttg 393  Q
    | |||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||           ||||||||  ||||||||||| |||    
T  19044515 ttttcttggttatgacccaatttcaatgttgtatgatttatattgcctttggaaattctctggtttaattacaggtaaaaactagccgaaaaatggcttg 19044416  T
Q  394 gaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| | || ||||||||    
T  19044415 gaaatgcattagaattatgcaaaacccactatctgcataattgttttcctcggcagttaactaccgaagttttcctcggcaattaactgc 19044326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 482
Target Start/End: Original strand, 20709821 - 20710310
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    |||| ||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  20709821 gagaagaatatgcatggaaaacggcaagttatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcagatttatgtttcgaaatatggtggaagataatat 20709920  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgt----ttaatt 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||  |||    |  ||     ||||||    
T  20709921 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgtgtaatgatttgtttaattatggacacttaatt 20710020  T
Q  205 atggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 304  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20710021 atggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaactgtaaaagatattgtat 20710120  T
Q  305 tattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttg 393  Q
    | |||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||           ||||||||  ||||||||||| |||    
T  20710121 ttttcttggttatgacccaatttcaatgttgtatgatttatattgcctttggaaattctctggtttaattacaggtaaaaactagccgaaaaatggcttg 20710220  T
Q  394 gaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| | || ||||||||    
T  20710221 gaaatgcattagaattatgcaaaacccactatctgcataattgttttcctcggcagttaactaccgaagttttcctcggcaattaactgc 20710310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 454
Target Start/End: Original strand, 47742553 - 47743001
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  47742553 gagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgccttggcttattcgcgacgatggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 47742652  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||          | |||||||||||||    
T  47742653 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga----------gttgtttaattatgg 47742742  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  47742743 acactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgcatttat 47742842  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgacc-gaaaaatggtttggaa 396  Q
    ||||||| || ||  |||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||           ||||||||| ||  |||||||| ||||||    
T  47742843 cttgtttttgtccatgtttcaatgttgtatgaattattttgcctttgaaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccaaaaaaatggcttggaa 47742942  T
Q  397 atgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaact 454  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||||    
T  47742943 atg-tttagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttcctcgacagttaact 47743001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 425
Target Start/End: Original strand, 18109357 - 18109775
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  18109357 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 18109456  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  18109457 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 18109546  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaa-caaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattat 307  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  18109547 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtattta 18109646  T
Q  308 tcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccg-aaaaatggtttgga 395  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||           ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  18109647 tcttgattatgaccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacagataaaaactggccgaaaaaatggtttgga 18109746  T
Q  396 aatgctttagaattatgcagaatccactgt 425  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  18109747 aatg-tttagaattatgcagaacccactgt 18109775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 454
Target Start/End: Original strand, 15069914 - 15070363
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15069914 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 15070013  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  15070014 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 15070103  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaa-caaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattat 307  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  15070104 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtattta 15070203  T
Q  308 tcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccg-aaaaatggtttgga 395  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||           ||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  15070204 tcttgattatgaccgagtttcaatcttgtatgaattatttagcctttggaaatgctctggtttatttacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttgga 15070303  T
Q  396 aatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaact 454  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  15070304 aatg-tctagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttcctcngcagttaact 15070363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 369
Target Start/End: Original strand, 42503402 - 42503753
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  42503402 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctacatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 42503501  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  42503502 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 42503591  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaa-caaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattat 307  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||      
T  42503592 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaaatgttggtttaatttaatcatgaacaattataaaagatattgtattta 42503691  T
Q  308 tcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||| | |||||| || |||||||||||    
T  42503692 tcttgattatgaccgagtttcaatcttgcatgaattatttagcctttggagatgctctggtt 42503753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 604288 - 603810
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  604288 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 604189  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  604188 attatatatgtatgtttgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 604099  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  604098 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcgatttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttat 603999  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccg-aaaaatggtttggaa 396  Q
    |||  |||||  ||||||||||| |||||||| |||| || ||||| |||||| ||||||           ||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  603998 cttcattatgttcgagtttcaatcttgtatgaattattttacctttggaaatgttctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaa 603899  T
Q  397 atgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgccg 484  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||  |||||| |||| | |||||||||| | || ||||||||||    
T  603898 atac-ttagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagatttccttggcagtttactaccaaggttttcctcggcagttaactgccg 603810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 295
Target Start/End: Original strand, 47064858 - 47065148
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  47064858 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggtttattaaagatgatagcgacgtcaaatttatgtttcgaaatatggtggaaaataatat 47064957  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctg----tttaatt 204  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||| |||    |  ||    |||||||    
T  47064958 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacatttaatt 47065057  T
Q  205 atggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaag 295  Q
    ||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47065058 atggatactttgtaacattttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttaaatcaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaag 47065148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 369
Target Start/End: Original strand, 30790570 - 30790922
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  30790570 gagatgaatacgcatggaaaacagcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 30790669  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  30790670 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 30790759  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |    
T  30790760 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattctatttat 30790859  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatatt--gtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    |||  ||||| ||||||||||||  |   ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30790860 cttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtt 30790922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 331
Target Start/End: Original strand, 45767424 - 45767736
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  45767424 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 45767523  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  45767524 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 45767613  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |    
T  45767614 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtatttat 45767713  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaat 331  Q
    |||  ||||| ||||||||||||    
T  45767714 cttcattatgtccgagtttcaat 45767736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 43620189 - 43619877
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  43620189 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 43620090  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  43620089 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 43620000  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |    
T  43619999 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtatttat 43619900  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaat 331  Q
    |||  ||||| | ||||||||||    
T  43619899 cttcattatgtctgagtttcaat 43619877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 227 - 482
Target Start/End: Original strand, 34742168 - 34742435
Alignment:
Q  227 atgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccgagtt 326  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  34742168 atgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaatcaaatgtcgatttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgtccgagtt 34742267  T
Q  327 tcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctct-----------ggttaaaaactgaccgaaaaatggtttggaaatgctttagaattatgcag 415  Q
    ||||| |||||||| || | |||||||| ||||||||||            | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  34742268 tcaatgttgtatgaatt-ttttgcctttcgaaatgctctactttaattacaggtaaaaactgaccgaaaaatggcttggaaatgttttagaatcatgcag 34742366  T
Q  416 aatccactgt-tgcataa-ttgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
    | | |||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||  |||||||||||| | || ||||||||    
T  34742367 agttcactgtctgcataatttgttttcctcgacagttaacttccgaggttttcctcggcagttaactgc 34742435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 29593011 - 29592839
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||     
T  29593011 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagttatatgccttggcttattcgcaacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagataatac 29592912  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaat 181  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  29592911 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaat 29592839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 220 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 5538152 - 5537907
Alignment:
Q  220 cgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatga 319  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||     
T  5538152 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtataatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtataagatattttatttttcttgtttatgt 5538053  T
Q  320 ccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt---------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaatgctttagaatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| || ||||| ||||||||||| |         ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |    
T  5538052 ccgagtttcaatgttgtatgaattattttccctttcgaaatgctctgctttaattacgtaaaaactgaccgaaaaatggcttgaaaatgttttagaatca 5537953  T
Q  411 tgcagaatccactgt-tgcataa-ttgttttcctcagcagttaact 454  Q
    ||||||   |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5537952 tgcagagctcactgtctacataatttgttttcctcggcagttaact 5537907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 220 - 369
Target Start/End: Original strand, 17838400 - 17838549
Alignment:
Q  220 cgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatga 319  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  17838400 cgttatgatgaattttaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgt 17838499  T
Q  320 ccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    |||||||||||| |||||||| || | |||||||| ||||||||||||||    
T  17838500 ccgagtttcaatgttgtatgaattgttttgcctttcgaaatgctctggtt 17838549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 221 - 454
Target Start/End: Original strand, 40928719 - 40928965
Alignment:
Q  221 gttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgac 320  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  40928719 gttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttgattatgac 40928818  T
Q  321 cgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccg-aaaaatggtttggaaatgctttagaat 408  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||           ||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  40928819 cgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatg-tttagaat 40928917  T
Q  409 tatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaact 454  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  40928918 tatgcagaactcactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaact 40928965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 230 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 29592841 - 29592592
Alignment:
Q  230 aatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccgagtttca 329  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  29592841 aatttcaaaagtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaaaatattgtatttatcttgtttatgtccgagtttca 29592742  T
Q  330 atattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccg-aaaaatggtttggaaatgctttagaattatgcagaa 417  Q
    || |||||||| |||| || ||||| |||||||||||||           ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  29592741 atcttgtatgaattatttttcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggtttggaaatg-tttaaaattatgcagaa 29592643  T
Q  418 tccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaactatcgaggttttc 466  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| ||  |||||||||| ||| ||||||    
T  29592642 tccactgtctgcataatcagttttcttcgacagttaactaccgaagttttc 29592592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 220 - 468
Target Start/End: Original strand, 13323480 - 13323741
Alignment:
Q  220 cgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatga 319  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||     
T  13323480 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaacgaaatgccggtttaatttaattatggaaaattgtaaaaaatattgtatttttcttgttaatgt 13323579  T
Q  320 ccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctg-----------gttaaaaactgaccgaaaaatggtttggaaatgctttagaat 408  Q
    |  ||||||||  |||||||| |||| || ||||| |||||||||||           | ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13323580 ctcagtttcaacgttgtatgaattattttacctttcgaaatgctctgctttaattacaggtaaaaactgcccgaaaaatggcttggaaatgttttagaat 13323679  T
Q  409 tatgcagaatccactgt-tgcataa-ttgttttcctcagcagttaactatcgaggttttcct 468  Q
    |||| |||   || | | ||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13323680 tatgaagagctcattatctgcataatttgttttgctcagcagttaactcccgaggttttcct 13323741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 220 - 305
Target Start/End: Original strand, 10522280 - 10522365
Alignment:
Q  220 cgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatt 305  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10522280 cgttatgatgaattttaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatt 10522365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 369 - 454
Target Start/End: Original strand, 36186425 - 36186511
Alignment:
Q  369 taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaact 454  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  36186425 taaaaactgaccgaaaaatggcttgaaaatgctttagaattatgcagaactcactgtatgtataattgttttcctcggcagttaact 36186511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 12111399 - 12111360
Alignment:
Q  330 atattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12111399 atattgtatgatttatattgcctttgaaaatgctctggtt 12111360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 497 - 543
Target Start/End: Original strand, 36186560 - 36186606
Alignment:
Q  497 cgtattttactcgtgtgaaacaaccttatgcaacgtgtctacaacaa 543  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  36186560 cgtattttactcgtgtgacacagccttatgcaatgtgtcaacaacaa 36186606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 34738442 - 34738397
Alignment:
Q  437 tttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  34738442 tttcctcggcagttaactaccgaggttttcctcggcatttaactgc 34738397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 15070434 - 15070386
Alignment:
Q  436 ttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgccg 484  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||    
T  15070434 ttttcctcggcagttaactaccgaggttttcctcggcagttaactgccg 15070386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 18105452 - 18105404
Alignment:
Q  436 ttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgccg 484  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||    
T  18105452 ttttcctcggcagttaactaccgaggttttcctcggcagttaactgccg 18105404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 31)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 9 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 43679905 - 43679430
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43679905 gagatgaacacgcatggaaaacgacaagttatatgccttgacttattaaagacgatagagacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaaaataatat 43679806  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| |||          |||||||||     
T  43679805 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagcagggatttaatataatgatgtgtaatgagttgt----------ttaattatga 43679716  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43679715 acactttgtaacgttttgatgaattttaaacttttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattttt 43679616  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaa 397  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  | ||||           |||||| |  || ||||||| ||||||||    
T  43679615 cttgtttatgaccgagtttcaattttgtatgatttatattgcctttggaaatattttggtttaattacatgtaaaaattagccaaaaaatgatttggaaa 43679516  T
Q  398 tgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| || |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  43679515 tgctttagaattatgcaaaacccactgtctgtataattattttcttcggcagttaactaccgaggttttccttaacaattaactgc 43679430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 9 - 452
Target Start/End: Original strand, 43376843 - 43377302
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  43376843 gagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcattggtttattcgcgacgatagtgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 43376942  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgt----ttaatt 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||    |  ||     ||||||    
T  43376943 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 43377042  T
Q  205 atggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 304  Q
    | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43377043 aaggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaacttgaaccaaatttcggtttcatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 43377142  T
Q  305 tattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttg 393  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||           ||||||||| ||||||||||| |||    
T  43377143 ttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaatggcttg 43377242  T
Q  394 gaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaa 452  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  43377243 gaaatgctttagaattatgtagaacccactgtctgcataattgttttcctcggcagttaa 43377302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 2124703 - 2124250
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  2124703 gagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacaatagcgactttggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 2124604  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgt----ttaatt 204  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||    |  ||     ||||||    
T  2124603 attatatatgtattttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggacttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 2124504  T
Q  205 atggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 304  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  2124503 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaatgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaactatggacaactgtaaaagatattatat 2124404  T
Q  305 tattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt--------------taaaaactgaccgaaaaatggt 390  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||              |||||| || |||||||||||     
T  2124403 ttttcttggttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttggaaatgctctggtttaaatattccaggtaaaaagtggccgaaaaatggc 2124304  T
Q  391 ttggaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctc 443  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  2124303 ttggaaatgcattagaattatgcagaacccactgtctgcataattgttttcctc 2124250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 37 - 443
Target Start/End: Original strand, 4867385 - 4867803
Alignment:
Q  37 ctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatatattatatatgtatgttcgttctatatgc 136  Q
    |||| ||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  4867385 ctatgtgcattggcttattcgagatgataacgacgtcggatttatgtttcggattatggtggaaaataatatattatatacgtatgttcgttccatatcc 4867484  T
Q  137 aattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatggacaatttataacgttttgatgaatttca 236  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||| | | | ||| ||||||||||||||||    
T  4867485 aattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgataagtaatgagttgtaatctgttgtttaattatggagactatgtaatgttttgatgaatttca 4867584  T
Q  237 aacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccgagtttcaatattgt 336  Q
    |||||||||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  4867585 aacttttgtgtattttaaatcaaatgttggtttgatttaattatggacaatggtgaaagatattgtatttttcttgtttatgactgagtttaaatgttgt 4867684  T
Q  337 atgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaatgctttagaattatgcagaatccactgt 425  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||           ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  4867685 atgagttatattgcctttggaaatgctctagtttaattacaagtaaaaactggccaaaaaatggcttggaaatgctttagaattatgcaaaacccactgt 4867784  T
Q  426 -tgcataattgttttcctc 443  Q
     |||||| |||||||||||    
T  4867785 ctgcatagttgttttcctc 4867803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 305
Target Start/End: Original strand, 7171881 - 7172177
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7171881 gagatgaatacgcatggaaaatggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaaaataatat 7171980  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  7171981 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcattgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgtgtactgagttgtaatgtgttgtttaattatgg 7172080  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatt 305  Q
    ||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7172081 acactatgtaacgttttcatgaatttcaaacttttgtgtattttgaacaaaatgtgggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatt 7172177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 9 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 35962816 - 35962341
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  35962816 gagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 35962717  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||          | ||||||||||||     
T  35962716 attatatacgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgcaatga----------gttgtttaattatgc 35962627  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  35962626 acactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatttcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttat 35962527  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccg-aaaaatggtttggaa 396  Q
    |||||||||  |||||||| ||| |||||||| |||| |||||||| | ||| |||||||           |||||| || ||| |||||||| ||| ||    
T  35962526 cttgtttatatccgagttttaatgttgtatgaattattttgccttttgtaatactctggtataattacacgtaaaaattggccgaaaaaatggcttgaaa 35962427  T
Q  397 atgctttagaattatgcagaatccactg-ttgcataat-tgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactg 481  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | || |||||||    
T  35962426 atg-tttagaattatgcagaacccactgcctgcataatcagttttcctcggcagttaactcccgaggttttcctcggcagttaactg 35962341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 329
Target Start/End: Original strand, 22588006 - 22588316
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  22588006 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgtcttggctaattgaagacgatagcgacgtcggatttatgttttgaaatatggtggaagataatat 22588105  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||          | |||||||||||||    
T  22588106 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga----------gttgtttaattatgg 22588195  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  22588196 acactttgtaacgttttgatcaatttcaaacgtttgtgtaatttgaacctaatgtcggtttgatttaattatggataattgtaaaagatattgtattttt 22588295  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttca 329  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  22588296 cttgtttatgatcgagtttca 22588316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 9 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 23924474 - 23924032
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23924474 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaaaataatat 23924375  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||          | |||||||||||||    
T  23924374 attatatatgtatgttcgttccatatgcagttgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga----------gttgtttaattatgg 23924285  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |    
T  23924284 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttat 23924185  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaa 397  Q
    ||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||           ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  23924184 cttttttatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttggaaatgctctagtttaattacaggtaaaaactgaccgaaaaatggcttgaaaa 23924085  T
Q  398 tgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagt 449  Q
    || |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||  ||||||||| |||||    
T  23924084 tg-tttagaattatgcataatccattgtctgcataatcagttttcctcggcagt 23924032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 39966 - 39518
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39966 gagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgtctttgcttattcgcaacgacggcgatgtcggatttatgtttcggaatatggtggaaaataatat 39867  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||          | |||||||||||||    
T  39866 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga----------gttgtttaattatgg 39777  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  39776 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaatgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttat 39677  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccg-aaaaatggtttggaa 396  Q
    |||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||           |||||| || ||| |||||||| ||||||    
T  39676 cttgtttatgtctgaggttcaatcttgtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaattggccgaaaaaatggcttggaa 39577  T
Q  397 atgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaact 454  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  39576 atg-tttagaattatgcagaactcactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaact 39518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 9 - 369
Target Start/End: Original strand, 31959611 - 31959975
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31959611 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgttttggaatatggtggaaaataatat 31959710  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctg----tttaatt 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||    |  ||     ||||||    
T  31959711 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtatggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacaattaatt 31959810  T
Q  205 atggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 304  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  31959811 atggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtgggtttaatttaatcatgaacaattgtaaaagatattgtat 31959910  T
Q  305 tattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  31959911 ttatcttgtttatgtccgagtttcaatcttatatgaattattttgcctttggaaatgctctggtt 31959975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 105 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 39751473 - 39751134
Alignment:
Q  105 atatattatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaatt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||          ||||||    
T  39751473 atatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattacgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgt----------ttaatt 39751384  T
Q  205 atggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 304  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  39751383 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcagtttgatttaattacggacaactgtaaaagatattgtat 39751284  T
Q  305 tattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctg-----------gttaaaaactgaccgaaaaatggtttg 393  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||           ||||||||||| || |||||| | |||    
T  39751283 ttttcttggttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgtctttggaaatgctctggtttaattatagttaaaaactggccaaaaaatagcttg 39751184  T
Q  394 gaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcct 442  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  39751183 gaaatgcattataaatatgcagaatccactgtctgcataactgttttcct 39751134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 30301644 - 30301292
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  30301644 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 30301545  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  30301544 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 30301455  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  30301454 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttat 30301355  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatatt--gtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    |||  ||||| ||||||||||||  |   ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30301354 cttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtt 30301292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 484
Target Start/End: Original strand, 7344120 - 7344599
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  7344120 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcaacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 7344219  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  7344220 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 7344309  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | | | |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  7344310 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctatttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttat 7344409  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatatt--gtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttgga 395  Q
    |||  ||||| ||||||||||||  |   ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||           ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  7344410 cttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaatggcttgga 7344509  T
Q  396 aatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgccg 484  Q
    ||| | |||||||||||||||| |  |||| ||||||||    ||||||| ||||||||||  |||||||||||| | || ||||||||||    
T  7344510 aatac-ttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactcccgaggttttcctcggcagttaactgccg 7344599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 32376161 - 32375849
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  32376161 gagatgaatacgcatgggaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgatggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 32376062  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  32376061 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 32375972  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |    
T  32375971 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcgatttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtatttat 32375872  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaat 331  Q
    |||  |||||  |||||||||||    
T  32375871 cttcattatgttcgagtttcaat 32375849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 8419914 - 8419602
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  8419914 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 8419815  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  8419814 attatatatgtacgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 8419725  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |    
T  8419724 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtatttat 8419625  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaat 331  Q
    |||  ||||| ||||||||||||    
T  8419624 cttcattatgtccgagtttcaat 8419602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Original strand, 22661138 - 22661484
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || || ||||    
T  22661138 gagatgaatatgcatggaaaacggcaagccatatgccttggcttattcacgacgatagcgacgtcgggtctatgtttcggaatatggtggaagatgatat 22661237  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||| ||||| ||||||| |||| ||||          ||||||||| |||||||||||||    
T  22661238 attatatatgtatgttcgttccatatgcaactgcgcagaatgtcagtagagatttaatttaacgata----------tgtaatgtgttgtttaattatgg 22661327  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| | | ||| |||||||||||| |||||| || ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||    
T  22661328 acactctttaatgttttgatgaatctcaaacattcgtgtaattttaacgaaatatcggtttgatttaattatggacaaccgtaaaagataatgtattttt 22661427  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctct 365  Q
    |||||||||||| |||| | ||| |||||  | | ||| ||||||| ||||||||||    
T  22661428 cttgtttatgactgagtataaatgttgtacaactaataatgcctttggaaatgctct 22661484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 258 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 23578704 - 23578482
Alignment:
Q  258 aaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttaga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  23578704 aaatgtcggtttgatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgacagagtttcaatgttgtataatttatattgcctttgga 23578605  T
Q  358 aatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcag 445  Q
    |||||||||||           ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  23578604 aatgctctggtttaattacaggtaaaaactggctgaaaaatggtttggaaatgctttagaattatgcagaacccactgtctgcataatttttttcctcgg 23578505  T
Q  446 cagttaactatcgaggttttcct 468  Q
     ||||||||  | ||||||||||    
T  23578504 tagttaactgccaaggttttcct 23578482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 41744332 - 41744160
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  41744332 gagatgaatacgcatggaaaacgacaagttatatgccttggcttattcatgacgatagcgacgtcggatttatatttcggaatatggtggaagataatat 41744233  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaat 181  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  41744232 attatatatgtatattcgctccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggacttaatttaatgatgtgtaat 41744160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Original strand, 20548938 - 20549173
Alignment:
Q  124 tcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatggacaatttataacgtt 223  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||          ||||||||||||| ||| ||| |||    
T  20548938 tcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtaaggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgt----------ttaattatggacactttgtaatgtt 20549027  T
Q  224 ttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccga 323  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||    
T  20549028 ttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatttcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatatccga 20549127  T
Q  324 gtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  20549128 gtttcaatcttgtatgaattattttgtctttggaaatgctctggtt 20549173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 225 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 34367214 - 34366958
Alignment:
Q  225 tgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccgag 324  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  34367214 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgtccgag 34367115  T
Q  325 tttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaatgctttagaattatgc 413  Q
    |||||||  ||||||| || | |||||||| |||||||||||||           ||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||| ||||    
T  34367114 tttcaatgctgtatgaattgttttgcctttcgaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaaggcttggaaatgttttagaatgatgc 34367015  T
Q  414 agaatccactg-ttgcataat-tgttttcctcagcagttaactatcgaggttttcct 468  Q
    |||   |||||  ||||||||  | |||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  34367014 agagctcactgcctgcataatcagatttcatcggcagttaactaccgaggttttcct 34366958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 226 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 41239150 - 41239010
Alignment:
Q  226 gatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccgagt 325  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||     
T  41239150 gatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaatcaaatgtcggtttgatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttgtcttgtttatgtccgaga 41239051  T
Q  326 ttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctg 366  Q
    |||||| |||||||| |||| |||| ||| |||||||||||    
T  41239050 ttcaatgttgtatgaattattttgcatttcgaaatgctctg 41239010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 230 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 41744162 - 41743925
Alignment:
Q  230 aatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccgagtttca 329  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  41744162 aatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaatcatggacaattgtaaaaaatattgtatttatcttgtttatgttcgagtttca 41744063  T
Q  330 atattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccg-aaaaatggtttggaaatgctttagaattatgcagaa 417  Q
    || |||||| | |||| |||||||| |||||||||||||           ||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  41744062 atcttgtataaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacatgtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatg-tttaaaattatgcagaa 41743964  T
Q  418 tccactgt-tgcataatt-gttttcctcagcagttaact 454  Q
     ||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  41743963 cccactgtctgcataattagttttcttcggcagttaact 41743925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 174 - 352
Target Start/End: Original strand, 30972593 - 30972771
Alignment:
Q  174 tatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatt 273  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | | | | ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| |  ||||||    
T  30972593 tatgtaatgatgtgtaatgtgttgtttaattatgtatactctgtaatgttttgatgaatttcaaacattcgtgtaattttaacgaaatgttgaattgatt 30972692  T
Q  274 taattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcct 352  Q
    ||||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| | |||  ||||||| || ||||||||    
T  30972693 taattatcgacaaccgtaaaagataatgtatttttcttgtttatgactgagtataaatgatgtatgagttgtattgcct 30972771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 39751758 - 39751659
Alignment:
Q  14 gaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatatattat 113  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  39751758 gaatacgcatggaaaacggcaaactatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatatattat 39751659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 222 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31281118 - 31280969
Alignment:
Q  222 ttttgatgaatttcaaacttttgtgtaa--tttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatga 319  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||| ||||||| | ||||||||||||  | ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  31281118 ttttgatgaatttcaaacattcgtgtaaaattttaacgaaatgtcagattgatttaattacagtcaattgtaaaagattatgtattgttcttgtttatga 31281019  T
Q  320 ccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    |||| | | |||  ||||||| || ||||| || | ||||||||||||||    
T  31281018 ccgattataaatggtgtatgagttgtattgtctctggaaatgctctggtt 31280969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 369 - 436
Target Start/End: Original strand, 22588324 - 22588392
Alignment:
Q  369 taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgt 436  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  22588324 taaaaactgaccgaaaaattgattgaaaatgctttagaattatacagaacccactgtctgcataattgt 22588392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 369
Target Start/End: Original strand, 29807044 - 29807152
Alignment:
Q  261 tgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaat 360  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||  | | | |||| ||||||| || |||||||| | |||||    
T  29807044 tgtcggatagatttaattatgaacaattgtaaaagatcatgtaatgttcttgtttatgacttattataaatagtgtatgagttgtattgcctctggaaat 29807143  T
Q  361 gctctggtt 369  Q
    ||| |||||    
T  29807144 gctatggtt 29807152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 381 - 433
Target Start/End: Original strand, 7172550 - 7172603
Alignment:
Q  381 gaaaaatggtttggaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat 433  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7172550 gaaaaacggcttggaaatgctttagaattatgcagaagccactgtctgcataat 7172603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 31281262 - 31281193
Alignment:
Q  68 gacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatatattatatatgtatgttcgttctatatgca 137  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||||| || ||||    
T  31281262 gacgtaggatttatgtttcagaatatggttgaagataatatattatatctttatgttcgttccatctgca 31281193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 484
Target Start/End: Original strand, 184545 - 184594
Alignment:
Q  435 gttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgccg 484  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||    
T  184545 gttttcctcggcagttaactaccgaggttttcctcggcagttaactgccg 184594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 369
Target Start/End: Original strand, 7172465 - 7172525
Alignment:
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| |||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  7172465 cttgtttatgactaagtttaaatgttgtataagttatattgcctttgaaaatgctctggtt 7172525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 37)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 9 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 6489852 - 6489362
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  6489852 gagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgtgacgatagcgtcgtcggatttatatttcggaatatggtggaagataatat 6489753  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgt----ttaatt 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||    |  ||     |||| |    
T  6489752 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgttgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaagt 6489653  T
Q  205 atggacaattta-taacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 303  Q
    ||||||| |||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6489652 atggacacttttgtaacgtttcaatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagataatgta 6489553  T
Q  304 ttattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggttt 392  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||           ||||||||| ||||||||||| ||    
T  6489552 tttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttggaaatgctctggtttaattagcggtaaaaactggccgaaaaatggctt 6489453  T
Q  393 ggaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||    
T  6489452 ggaaatgctttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgttttcctcggcagttaactaccgaggatttcctcggcagttaactgc 6489362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 9 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 67392 - 66956
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  67392 gagatgaatacgcatgaaaaacggcaagctatatgtcttggcttattaaagacaatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaaaataatac 67293  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  67292 attatatatgtatgttcgttccatatgtgattgcgttgaatgtaagtagggatttcatttaatgatgtgtaatgagttgtaatgtgttgtttaattatgg 67193  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  67192 acactatgtaccgttttgatgaatttcaaacttttgtgtagtttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttta 67093  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaa 397  Q
    ||||||||| |  |||||| ||| |||||||| ||||||||| ||| | | |||||||||           ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  67092 cttgtttataagtgagtttaaatgttgtatgaattatattgcatttgggattgctctggtttaattacaggtaaaaactgaccgaaaaatggcttggaaa 66993  T
Q  398 tgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat 433  Q
    ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  66992 tgcttaacaattatgcagaacccactgtctgcataat 66956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 9 - 482
Target Start/End: Original strand, 4002055 - 4002545
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||   |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4002055 gagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaaaatggtggaaaataatat 4002154  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctg----tttaatt 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |    |  ||     ||| ||    
T  4002155 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttatttaattatggacacttagtt 4002254  T
Q  205 atggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 304  Q
    || |||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4002255 atagacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 4002354  T
Q  305 tattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccg-aaaaatggttt 392  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||           ||||||||  ||| |||||||| ||    
T  4002355 ttatcttgtttatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaacttgccgaaaaaatggctt 4002454  T
Q  393 ggaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    |||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | || ||||||||    
T  4002455 ggaaatg-tttagaattatgcagaacttgctgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactcccgaggttttcctcggcagttaactgc 4002545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 21952305 - 21951866
Alignment:
Q  12 atgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatatatt 111  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||   || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||    
T  21952305 atgaatacgcatggaaaacggcaagctatgtgccttggcttattcgcgatgatagcgacgtcggatttaggtttcggaatatggtggaagatgatatatt 21952206  T
Q  112 atatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatggaca 211  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| |||          ||||| |||||||    
T  21952205 atatttgtatgttcgttccatatgcaattgcattgaatgtaactagggatttaatttaatgacgtgtaatgagttgt----------ttaatcatggaca 21952116  T
Q  212 atttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattctt 311  Q
      || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21952115 cattgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaattttaatcaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttctt 21952016  T
Q  312 gtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaatgc 400  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||           | ||||||| ||||||||||| |||||| ||     
T  21952015 gtttatgttcgagtttcaatgttgtatgatttatattgcatttggaaatgctctggtttaattacaagtcaaaactggccgaaaaatggcttggaattgt 21951916  T
Q  401 tttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagt 449  Q
    ||||||||| ||||||| |  |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21951915 tttagaattctgcagaacctgctgtctgcataattgttttcctcggcagt 21951866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 46990035 - 46989686
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  46990035 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatgacgacgtcggatttatgttttggaatatggtggaagataatat 46989936  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctg----tttaatt 204  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||    |  ||     ||||||    
T  46989935 attatatatgtatgttcgttccacatgcaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 46989836  T
Q  205 atggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 304  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46989835 atggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaatgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 46989736  T
Q  305 tattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgccttt 354  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||   |||||||| |||| ||||||||    
T  46989735 ttatcttgtttatgtccgagtttcacatttgtatgaattattttgccttt 46989686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 9427114 - 9426705
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  9427114 gagatgaatacgcatggaaaacggcaaactatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 9427015  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  9427014 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 9426925  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |    
T  9426924 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttat 9426825  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccg-aaaaatggtttggaa 396  Q
    |||  ||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||           ||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  9426824 cttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaa 9426725  T
Q  397 atgctttagaattatgcaga 416  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  9426724 atgctttataattatgcaga 9426705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 9 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 48246920 - 48246445
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  48246920 gagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgctttggcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 48246821  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||          | |||||||||||||    
T  48246820 attatatatgtatgtttgttccatatgcaactgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga----------gttgtttaattatgg 48246731  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| |||  |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  48246730 acactttgtaattttttgatgaatttcaaaagtttgtgtaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttat 48246631  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgacc-gaaaaatggtttggaa 396  Q
     ||| ||||| | |||||||||| || ||||| |||| ||||||||  ||||||||||||           |||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  48246630 attgcttatgtctgagtttcaatgttttatgaattattttgcctttgaaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactgaccggaaaaatggcttgaaa 48246531  T
Q  397 atgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcat-aattgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
    ||| ||||||||||||||  |  |||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  48246530 atg-tttagaattatgca-cacacactgtctgcataaacagttttcctcggcagttaactaccgaggttttcctcgacagttaactgc 48246445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 13743775 - 13743328
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  13743775 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 13743676  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  13743675 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 13743586  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |    
T  13743585 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattt-aaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttat 13743487  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccg-aaaaatggtttggaa 396  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||           ||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  13743486 cttgattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttggaaatgctctagtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaa 13743387  T
Q  397 atgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaact 454  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  13743386 atg-tttagaattatgcagaacccactgtctacataatcagttttcctcggcagttaact 13743328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 484
Target Start/End: Original strand, 6744890 - 6745368
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||   |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  6744890 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgtctttgcttattcgcgacgacggcaacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 6744989  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||   ||       ||||||||||||    
T  6744990 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgag---ta-------gtttaattatgg 6745079  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  6745080 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttat 6745179  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccg-aaaaatggtttggaa 396  Q
    |||  ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||           ||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  6745180 cttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaa 6745279  T
Q  397 atgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgccg 484  Q
    || | |||||||||||||||| |  |||| ||||||||    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  6745280 atac-ttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggttttccttggcagttaactgccg 6745368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 416
Target Start/End: Original strand, 2857546 - 2857955
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  2857546 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaaaatggtggaaaataatat 2857645  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  2857646 attatatatgtatgttcattccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 2857735  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| |||  |||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |    
T  2857736 acactttgtaatgttaagatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttat 2857835  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccg-aaaaatggtttggaa 396  Q
    |||  ||||| || ||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||           ||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  2857836 cttcattatgtccaagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaa 2857935  T
Q  397 atgctttagaattatgcaga 416  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  2857936 atgctttacaattatgcaga 2857955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 36813360 - 36812884
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  36813360 gagatgaatacgtgtggaaaacggcaagctatatgtctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaatataatat 36813261  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctg----tttaatt 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||    |  ||     ||||||    
T  36813260 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatataatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacaattaatt 36813161  T
Q  205 atggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 304  Q
    ||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  36813160 atggaaactttgtaatgttttaatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtataagatattgtat 36813061  T
Q  305 tattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccg-aaaaatggttt 392  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||| |||||||| |||||||||||||           ||||||||| ||| |||||||| ||    
T  36813060 ttatcttgtttatgtccgagtttcaatcttgtatggattattttgcctttggaaatgctctggtttaactacaggtaaaaactggccgaaaaaatggctt 36812961  T
Q  393 ggaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaactatcgaggttttcct 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||   |||| |||| |||  ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  36812960 ggaaatg-tttagaattatgcagaatttgctgtctgcacaatcagttttcctcggcagtttactaccgaggttttcct 36812884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 30943700 - 30943220
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  30943700 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 30943601  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  30943600 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 30943511  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  30943510 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttat 30943411  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatatt--gtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccg-aaaaatggtttgg 394  Q
    |||  ||||| ||||||||||||  |   ||||| ||||||| | ||| |||||||||||||           ||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  30943410 cttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacttttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttgg 30943311  T
Q  395 aaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgccg 484  Q
    |||| | |||||||||||||||| |  |||| ||||||||    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||    
T  30943310 aaatac-ttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggttttcctcggcagttaactgccg 30943220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 484
Target Start/End: Original strand, 3952778 - 3953257
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  3952778 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcaacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 3952877  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  3952878 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 3952967  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | | | |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  3952968 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctatttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttat 3953067  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatatt--gtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttgga 395  Q
    |||  ||||| ||||||||||||  |   ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||           ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3953068 cttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaatggcttgga 3953167  T
Q  396 aatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgccg 484  Q
    ||| | |||||||||||||||| |  |||| ||||||||    ||||||| ||||||||||  |||||||||||| | || ||||||||||    
T  3953168 aatac-ttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactcccgaggttttcctcggcagttaactgccg 3953257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 8157018 - 8156706
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  8157018 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 8156919  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  8156918 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 8156829  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |    
T  8156828 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtatttat 8156729  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaat 331  Q
    |||  ||||| ||||||||||||    
T  8156728 cttcattatgtccgagtttcaat 8156706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 366
Target Start/End: Original strand, 50957243 - 50957604
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||   |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  50957243 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgtctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttttgtttcggaatatggtggaagataatat 50957342  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  50957343 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 50957432  T
Q  209 acaatttataacgtt--------------ttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaa 294  Q
    ||| |||  || |||              |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  50957433 acactttggaatgttttgagtagtttaatttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtctgtttaatttaattatgaacaattgtaaaa 50957532  T
Q  295 gatattgtattattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctg 366  Q
    ||||||||| |  ||||  ||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  50957533 gatattgtacttatcttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttggaaatgctctg 50957604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 220 - 482
Target Start/End: Original strand, 600309 - 600584
Alignment:
Q  220 cgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatga 319  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  600309 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgt 600408  T
Q  320 ccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaatgctttagaat 408  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||           |||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  600409 ccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttaaaaatgctctggtttaattacaggtaaaaattggccgaaaaatggcttggaaatgttttagaat 600508  T
Q  409 tatgcagaatccactg-ttgcataat-tgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
     |||||||   |||||  ||||| ||  | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  600509 catgcagagctcactgcctgcatgatcagatttcctcggcagttaactaccgaggttttcctcgacagttaactgc 600584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 184
Target Start/End: Original strand, 14402569 - 14402744
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14402569 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaaaataatat 14402668  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgag 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  14402669 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgacgtgtaatgag 14402744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 2743964 - 2743789
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  2743964 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 2743865  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgag 184  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  2743864 attatatacgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgag 2743789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 220 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 50213765 - 50213619
Alignment:
Q  220 cgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatga 319  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||     
T  50213765 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgcatttttcttgtttatgt 50213666  T
Q  320 ccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctg 366  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  50213665 ccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttcgaaatgctctg 50213619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 196 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 7841427 - 7841254
Alignment:
Q  196 tgtttaattatggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaag 295  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7841427 tgtttaattatggacactttgtaacgttttgatgaattttaaacgtttgtgtaattttaaccaaatgtcggtttaatttacttatggacaattgtaaaag 7841328  T
Q  296 atattgtattattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    ||| ||||||  ||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  7841327 atactgtatttatcttgtttatgtctgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtt 7841254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 220 - 366
Target Start/End: Original strand, 36134048 - 36134194
Alignment:
Q  220 cgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatga 319  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  36134048 cgttatgatgaattttaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgt 36134147  T
Q  320 ccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctg 366  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  36134148 ccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttcgaaatgctctg 36134194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 369
Target Start/End: Original strand, 42166177 - 42166326
Alignment:
Q  220 cgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatga 319  Q
    |||| |||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  42166177 cgttatgataaatttcaaacattagtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgt 42166276  T
Q  320 ccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    |||||||||||| |||||||| || | ||||||||  |||||||||||||    
T  42166277 ccgagtttcaatgttgtatgaattgttttgcctttcaaaatgctctggtt 42166326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 47070776 - 47070627
Alignment:
Q  220 cgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatga 319  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||     
T  47070776 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaacgtcggtttgatttaattatggacaattggaaaagatattgtatttatcttgtttatgt 47070677  T
Q  320 ccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
     ||||||||||| |||||||| || | |||||||| ||||||||||||||    
T  47070676 tcgagtttcaatgttgtatgaattgttttgcctttcgaaatgctctggtt 47070627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 230 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 52388097 - 52387958
Alignment:
Q  230 aatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccgagtttca 329  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  52388097 aatttcaaacgtttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggtcaattgtaaaagatattgtatttatattgtttatgtccgagtttca 52387998  T
Q  330 atattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    || |||||||| ||   |||||||| ||||||||||||||    
T  52387997 atgttgtatgaattggtttgcctttcgaaatgctctggtt 52387958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 220 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2271663 - 2271513
Alignment:
Q  220 cgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattat-tcttgtttatg 318  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  2271663 cgttatgatgaattttaaacgtttgtctaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattttatcttgtttatg 2271564  T
Q  319 accgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
     || ||||||||| |||||||| || | |||||||| ||||||||||||||    
T  2271563 tccaagtttcaatgttgtatgaattgttttgcctttcgaaatgctctggtt 2271513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 266 - 455
Target Start/End: Original strand, 14402808 - 14403009
Alignment:
Q  266 gtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctct 365  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  14402808 gtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttggaaatgctct 14402907  T
Q  366 ggt-----------taaaaactgaccg-aaaaatggtttggaaatgctttagaattatgcagaatccactgttgcataat-tgttttcctcagcagttaa 452  Q
    |||           ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  14402908 ggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggtttggaaatg-tttagaattatgcagaactcactgttgcataatcagttttcctcggcagttaa 14403006  T
Q  453 cta 455  Q
    |||    
T  14403007 cta 14403009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 227 - 369
Target Start/End: Original strand, 9473721 - 9473863
Alignment:
Q  227 atgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccgagtt 326  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  | ||||||||| |||||||    
T  9473721 atgaatttcaaacgtttgtgtaacttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggataattgtaatagatattgtatttatattgtttatgtccgagtt 9473820  T
Q  327 tcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    ||||| |||||||| || | |||||||| |||||| |||||||    
T  9473821 tcaatgttgtatgaattgttttgcctttcgaaatgatctggtt 9473863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 220 - 369
Target Start/End: Original strand, 16646939 - 16647087
Alignment:
Q  220 cgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatga 319  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||| ||||||     
T  16646939 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttaaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaatcgtaaaagatattatatttatctt-tttatgt 16647037  T
Q  320 ccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    | |||||||||| |||||||| || | |||||||| ||||||||||||||    
T  16647038 ctgagtttcaatgttgtatgaattgttttgcctttcgaaatgctctggtt 16647087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 2743746 - 2743678
Alignment:
Q  223 tttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgta 291  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  2743746 tttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgta 2743678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 7314683 - 7314585
Alignment:
Q  221 gttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatga 319  Q
    |||||| |||||||||||| || || |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||    
T  7314683 gttttgttgaatttcaaacattcgtataattttaacaaaatgtcgaattgatttaattttggtcaattgtgaaagattatgtattgttcttatttatga 7314585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 314 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2743611 - 2743556
Alignment:
Q  314 ttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2743611 ttatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtt 2743556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 435 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 8475906 - 8475857
Alignment:
Q  435 gttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgccg 484  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||    
T  8475906 gttttcctcagcagttaactaccgaggttttcctcggcagttaactgccg 8475857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 4005058 - 4005003
Alignment:
Q  314 ttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| || | |||||||| ||||||||||||||    
T  4005058 ttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattgttttgcctttcgaaatgctctggtt 4005003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 436 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 34691704 - 34691658
Alignment:
Q  436 ttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  34691704 ttttcctcggcagttaactaccgaggttttcctcgacagttaactgc 34691658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 441 - 482
Target Start/End: Original strand, 30256002 - 30256043
Alignment:
Q  441 ctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  30256002 ctcagcagttaactatcgaggttttcctcggcagttaactgc 30256043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 484
Target Start/End: Original strand, 41844357 - 41844406
Alignment:
Q  435 gttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgccg 484  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||    
T  41844357 gttttcctcggcagttaactaccgaggttttcctcggcagttaactgccg 41844406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 35443563 - 35443507
Alignment:
Q  59 gacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatatattatat 115  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||    
T  35443563 gacgataacaacgtaggatttatgtttaggcatatggttgaaaataatatattatat 35443507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 9 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 24053672 - 24053215
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  24053672 gagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgccttggcgaattgaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaagataatat 24053573  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  24053572 attatatatgtatgttctttctatatgcaattgcgttgaatgtaattagggatataatttaatgatgtgtaatgagttgtaatatgttgtttaattatgg 24053473  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  24053472 acactatgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatgtaattatggacaattgtaaaagatattgtatttta 24053373  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaa 397  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||||| | |||||||||||||  ||||||||||||           ||||||||| ||||||||||| ||| |||    
T  24053372 cttgtttatgactgagtttaaatgttgtataagttatattgcctttgaaaatgctctggttaaattacaggtaaaaactggccgaaaaatggcttgaaaa 24053273  T
Q  398 tgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaact 454  Q
    ||||| | ||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  24053272 tgcttgacaattatgcagaactcactgtctgcataagtgtttttctcggcagttaact 24053215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 9 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 7797086 - 7796736
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  7797086 gagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgctttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 7796987  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||          ||||||||||    
T  7796986 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgt----------ttaattatgg 7796897  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  7796896 acactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattataaaagatattgtattttt 7796797  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7796796 cttgtttataaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttggaaatgctctggtt 7796736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 9 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 24050547 - 24050126
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  24050547 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcgaattgaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaagataatat 24050448  T
Q  109 at--tatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattat 206  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  24050447 atattatatatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatataatttaatgatgtgtaatgagttgtaatgtgttgtttaattat 24050348  T
Q  207 ggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatta 306  Q
    ||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24050347 ggatactatgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattt 24050248  T
Q  307 ttcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtta-----------aaaactgaccgaaaaatggtttgga 395  Q
    | |||||||||||| || ||| ||| |||||| | ||||||| ||||| | |||||||||||||           ||||||| ||||||||||| |||||    
T  24050247 tacttgtttatgactgaatttaaatgttgtataagttatatttcctttggtaatgctctggttaaattacatgtgaaaactggccgaaaaatggcttgga 24050148  T
Q  396 aatgctttagaattatgcagaa 417  Q
    ||||||| | ||||||||||||    
T  24050147 aatgcttaacaattatgcagaa 24050126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 50 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 25878098 - 25877668
Alignment:
Q  50 cttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatatattatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaat 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |    
T  25878098 cttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaaaataatatattatatatgtatgtttgttccatatgcaattgtgatg--t 25878001  T
Q  150 gtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgt----ttaattatggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgt 245  Q
    ||||||||||||||||  |||| |  ||||||||| |||    |  ||     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25878000 gtaagtagggatttaatataatcacgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgt 25877901  T
Q  246 gtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttat 345  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  25877900 gtaatttgaaccaaatgtcggtt--atttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccaagtttcaatgttgtatgatttat 25877803  T
Q  346 attgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat 433  Q
    ||||| |||  ||||||||||||           ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  25877802 attgcttttgaaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaatgctttagaattatgcagaacccactgtctgcataaa 25877703  T
Q  434 tgttttcctcagcagttaactatcgaggttttcct 468  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  25877702 tgttttcctcggcagttaactaccgaagttttcct 25877668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 468
Target Start/End: Original strand, 33994713 - 33995174
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||    
T  33994713 gagatgaatacgcatggacaacggcaaactatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcttaatatggtggaagataatat 33994812  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||           ||||||||| ||||||   ||||    
T  33994813 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgat----------gtgtaatgtgttgtttatgcatgg 33994902  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| | | ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  33994903 acactatgtaacgatttgaagaatttcaaacttttttgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttta 33995002  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaaa 397  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||           ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  33995003 cttgtttatgactgagtttaaatgttgtataagttatattgcctttggaaatgttctggttaaattacatgtaaaaactggccgaaaaatggcttggaaa 33995102  T
Q  398 tgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaactatcgaggttttcct 468  Q
    ||||| | ||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  33995103 tgcttaacaattatgcataacccactgtctgcataaatgttttcctcggcagttaactcccgaggttttcct 33995174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 30352939 - 30352504
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    |||||||||| |||||  ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  30352939 gagatgaatatgcatgaaaaacggcaagttatatgccttggcttgttaaagacgatagcgacgtcgtatttatgtttcggaatattgtggaaaataatat 30352840  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||||   ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30352839 attatatatgtatgttttttccatatgcaattgcattgaatgtaagtaaagatttaatttattgatatgtaatgagttgtaatgtgctgtttaattatgg 30352740  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| ||    
T  30352739 acactgtgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgctggtttgatttaattatggaca-----aaaagatattgtattttt 30352645  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctg-----------gttaaaaactgaccgaaaaatggtttggaaa 397  Q
    ||  |||||||| |||||| ||| |||||||  ||||||||| ||| |||||||||||           | |||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  30352644 ct--tttatgactgagtttaaatgttgtatggcttatattgcatttggaaatgctctgatttatttacagataaaaactgatcgaaaaatggcttgaaaa 30352547  T
Q  398 tgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgtttt 439  Q
    ||||| | ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  30352546 tgcttaacaattatgcaaaattcactgtctgcataattgtttt 30352504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 13564150 - 13563800
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  13564150 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttatttgcgatgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 13564051  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||          | |||||||||||||    
T  13564050 attatatatgtatgttcgatccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga----------gttgtttaattatgg 13563961  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |    
T  13563960 acactttgtaatgttttaatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttat 13563861  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    |||  ||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  13563860 cttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtt 13563800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 38856224 - 38855776
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  38856224 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 38856125  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  38856124 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggattgaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 38856035  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaat-ttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattat 307  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| || | |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||      
T  38856034 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaatgttaaccaaaatgtcggtttaatttaattacgaacaattgtaaaagatattgtattta 38855935  T
Q  308 tcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaaaaatggtttggaa 396  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||  ||||||           ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38855934 tcttgattatgaccgagtttcaatattgtatgaattatttagcctttggaaattgtctggtttaattacaggtaaaaactgaccgaaaaatggcttggaa 38855835  T
Q  397 atgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaact 454  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  38855834 atg-tctagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaact 38855776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 34123047 - 34122557
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  34123047 gagatgaatacgcatggaaaacggtaagttatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcagatttatgtttcagaatatggtggaagataatat 34122948  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgt----ttaatt 204  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||| |||    |  ||     ||||||    
T  34122947 attatatatatatgttcgttccatatgcaattgcattgaatgtaagtatgaatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 34122848  T
Q  205 atggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 304  Q
    ||| |||  || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34122847 atgaacaccttgtaaccttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 34122748  T
Q  305 tattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccg-aaaaatggttt 392  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||           ||||||||| ||| |||||||| ||    
T  34122747 ttatcttgtttatgtccgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttgaaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggctt 34122648  T
Q  393 ggaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| | || ||||||||    
T  34122647 gaaaat-atttagaattatgcagaatccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactaccgagcttttcctcggcagttaactgc 34122557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 37815091 - 37814613
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  37815091 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcacgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 37814992  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  37814991 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgaaagtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 37814902  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |    
T  37814901 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttat 37814802  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgacc-gaaaaatggtttggaa 396  Q
    |||  ||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||           ||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  37814801 cttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccggaaaaatggcttggaa 37814702  T
Q  397 atgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgccg 484  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||  | |||| || ||||||||||| | |||||||||| | || ||||||||||    
T  37814701 atg-tttagaactatgcagaacccactgtctgcattatcagatttcttcggcagttaactaccaaggttttcctcggcagttaactgccg 37814613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 9 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 27863912 - 27863464
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  27863912 gagatgaatacgcatgaaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacagcgacgtcggatttatgttttggaatatggtggaagataatat 27863813  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||          | |||||||||||||    
T  27863812 attatatatgtatgttcgttccatttgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga----------gttgtttaattatgg 27863723  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |    
T  27863722 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttat 27863623  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccg-aaaaatggtttggaa 396  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||| ||| |||| |||||||| |||||| ||||||           ||||||||| ||| |||||||| ||| ||    
T  27863622 cttgattatgtccgagtttcaatcttgtgtgaattattttgcctttggaaatgttctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttgaaa 27863523  T
Q  397 atgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaact 454  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  27863522 atg-tttagaattatgcagaacccactatctgcataatcagttttcctcggcagttaact 27863464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 25890503 - 25890153
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||| |||||||   |||||   |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25890503 gagatgaatacgcgtggaaaacagcaagcgatatgcctttgcttattcgcgacgacgtcgacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaaaataatat 25890404  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||          |||||||||     
T  25890403 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgt----------ttaattatga 25890314  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |    
T  25890313 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtataagatattgtatttat 25890214  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25890213 cttgtttatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtt 25890153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 369
Target Start/End: Original strand, 1039356 - 1039719
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1039356 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacatcggatttatgttt-ggaatatggtggaaaataatat 1039454  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgt--aat--gtgctgtttaatt 204  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||   ||    ||||||    
T  1039455 gttatatatgtatgttcgtaccatatgcagttgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatatgtaatgagttgttaaattattgacacttaatt 1039554  T
Q  205 atggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 304  Q
    || |||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1039555 atagacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 1039654  T
Q  305 tattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    |  || |||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||    
T  1039655 ttatcgtgtttatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttgaaaatgctctggtt 1039719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 28882497 - 28882177
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  28882497 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcatttgcttatttgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 28882398  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  28882397 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtggggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 28882308  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  28882307 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaacgaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttat 28882208  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatg 339  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  28882207 cttgattatgaccgagtttcaatcttgtatg 28882177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 67 - 454
Target Start/End: Original strand, 34079753 - 34080143
Alignment:
Q  67 cgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatatattatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaac 166  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||     
T  34079753 cgacggcggatttatgtttcagaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtaaggatttaat 34079852  T
Q  167 ttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcgg 266  Q
    |||||||| ||||||||| |||          ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||    
T  34079853 ttaatgatgtgtaatgagttgt----------ttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcgg 34079942  T
Q  267 tttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctg 366  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  34079943 tttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttatcttgattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttggaaatgctctg 34080042  T
Q  367 gt-----------taaaaactgaccg-aaaaatggtttggaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaa 452  Q
    ||           ||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  34080043 gtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatg-tttagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttcctctgcagttaa 34080141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 11029516 - 11029069
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11029516 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 11029417  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||   |||       ||||||||||||    
T  11029416 attatatatgtatgttcgtttcatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtgatga---gta-------gtttaattatgg 11029327  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaat-ttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattat 307  Q
    ||  ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| || | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||      
T  11029326 ac--tttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaatgttaaccaaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgcattta 11029229  T
Q  308 tcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccg-aaaaatggtttgga 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||  ||||||           |||||||||  || |||||||| |||||    
T  11029228 tcttgattatgaccgagtttcaatattgtatgaattatttagcctttggaaattgtctggtttaattacaggtaaaaactggtcgaaaaaatggcttgga 11029129  T
Q  396 aatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaact 454  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  11029128 aatg-tctagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaact 11029069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 88 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 7017941 - 7017545
Alignment:
Q  88 gaatatggtgaaaaataatatattatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctg 187  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||       
T  7017941 gaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgag--- 7017845  T
Q  188 taatgtgctgtttaattatggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaat 287  Q
    ||       ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  7017844 ta-------gtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaat 7017752  T
Q  288 tgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaact 376  Q
    |||||||||||||||| |  ||||  ||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||           ||||||||    
T  7017751 tgtaaaagatattgtacttatcttcattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacagataaaaact 7017652  T
Q  377 gaccg-aaaaatggtttggaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgaca 473  Q
    | ||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  7017651 ggccgaaaaaatggcttgaaaatg-tttagaattatgcag-acccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactaccgaggttttccttgaga 7017554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 4197023 - 4196792
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4197023 gagatgaatatgcatggaaaacgacaagctacatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtcgaaaataatat 4196924  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||          | |||||||||||||    
T  4196923 attatatatgta--ttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatcatatgtaatga----------gttgtttaattatgg 4196836  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaattt 252  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  4196835 acactttgtaacgttttgatgaataccaaacgtttgtgtaattt 4196792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 239
Target Start/End: Original strand, 14280542 - 14280762
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  14280542 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 14280641  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  14280642 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 14280731  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaac 239  Q
    ||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  14280732 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaac 14280762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 165
Target Start/End: Original strand, 28387821 - 28387975
Alignment:
Q  10 agatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatata 109  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  28387821 agatgaatacacatggaaaacgacaagttatatgcctttg-ttattcacgacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagataatata 28387919  T
Q  110 ttatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  28387920 ttatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgattgtaagtagggatttaa 28387975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 220 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 38407454 - 38407308
Alignment:
Q  220 cgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatga 319  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||     
T  38407454 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgccggtttgatttaattatggacaattctaaaagatattgtatttttcttgtttatgt 38407355  T
Q  320 ccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctg 366  Q
    | |||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||| ||||    
T  38407354 ctgagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttcgaaatgttctg 38407308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 243 - 482
Target Start/End: Original strand, 28388307 - 28388559
Alignment:
Q  243 tgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatt 342  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||| |||| ||||||| |||||||| |    
T  28388307 tgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaaaatattgtatttattttgtttatgtccgaatttcaatcttgtatgaat 28388406  T
Q  343 tatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccg-aaaaatggtttggaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgca 429  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||           ||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  28388407 tattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatg-tttaaaattatgcagaacccactgtctgca 28388505  T
Q  430 taat-tgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
    ||||  |||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||    
T  28388506 taatcagttttcttcggcagttaactaccgaggttttcctcggcagttaactgc 28388559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 220 - 369
Target Start/End: Original strand, 7762008 - 7762157
Alignment:
Q  220 cgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatga 319  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||     
T  7762008 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatctatcttgtttatgt 7762107  T
Q  320 ccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
     ||||||||||| |||||||| || | ||||||||  ||||||| |||||    
T  7762108 tcgagtttcaatgttgtatgaattgttttgcctttcaaaatgctttggtt 7762157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 293 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 4196790 - 4196618
Alignment:
Q  293 aagatattgtattatt-cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgacc 380  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||           |||||| |||||    
T  4196790 aagatattgtattttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaattgacc 4196691  T
Q  381 gaaaaatggtttggaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaa 452  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4196690 gaaaaatagcttggaaatgctttagaattatgcagaacccactgtctgcataattgttttcctcggcagttaa 4196618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 220 - 366
Target Start/End: Original strand, 41799534 - 41799679
Alignment:
Q  220 cgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatga 319  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||     
T  41799534 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaatcaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaa-aaattgtatttttcttgtttatgt 41799632  T
Q  320 ccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctg 366  Q
    || ||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  41799633 ccaagtttcaatgttgtatgaattattttgcctttcgaaatgctctg 41799679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 6267932 - 6267635
Alignment:
Q  59 gacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatatattatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagg 158  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || |  |||||| |||||     
T  6267932 gacgatggcgacgtcgaatttatgtt-cggaatatgatggaagataatatattatatatgtatttttgttccatctgcaactgcgtagaatgtcagtaga 6267834  T
Q  159 gatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaa 258  Q
    ||||||| ||||||||||||||||          || |||||||||||||||| | | ||| ||| ||||||||||||||| ||  || ||||| ||  |    
T  6267833 gatttaatttaatgatatgtaatg----------tgttgtttaattatggacactctttaatgttatgatgaatttcaaacattcttgcaattttaatga 6267744  T
Q  259 aatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaa 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  | ||| ||||| || |  |||||||||| |||    
T  6267743 aatgtcggattgatttaattatggataacggtaaaagataatgtatttttcttgtttatgactgaggataaatgttgtacgactagtattgcctttggaa 6267644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 160 - 369
Target Start/End: Original strand, 43179605 - 43179814
Alignment:
Q  160 atttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaa 259  Q
    |||||| ||||  |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||    
T  43179605 atttaatttaacaatatataatgtgttgtaatgtgttgtttaattatggacactctttaacgttttgatgaatttcaaacattcgtgtaattttaacgaa 43179704  T
Q  260 atgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaa 359  Q
    |||| || |||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||| | ||| ||||| || |  ||||||||||  |||    
T  43179705 atgttggattgtattaattatggacaagtgtaaaagataatatatttttcttgtttttgaccgagtataaatgttgtacgactagtattgcctttgaaaa 43179804  T
Q  360 tgctctggtt 369  Q
    ||||||||||    
T  43179805 tgctctggtt 43179814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 139
Target Start/End: Original strand, 43179429 - 43179559
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    |||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  43179429 gagatgaacacgcatggaaaacggtaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtttgatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 43179528  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaat 139  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  43179529 attatatatgtatgttcgttccatctgcaat 43179559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 354
Target Start/End: Original strand, 16440192 - 16440315
Alignment:
Q  231 atttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccgagtttcaa 330  Q
    |||| |||| || ||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||| || | | ||    
T  16440192 attttaaacattcgtgtaattttaacgaaatatcggattgatttaattatggtcaattctaaaatattatgtattgttcttgtttatgactgattataaa 16440291  T
Q  331 tattgtatgatttatattgccttt 354  Q
    |  ||||||| || ||||||||||    
T  16440292 tggtgtatgagttgtattgccttt 16440315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 401 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 31094651 - 31094597
Alignment:
Q  401 tttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaact 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  31094651 tttagaattatgcagaatccactgtctgcataattgttttcttcggcagttaact 31094597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 497 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 25877607 - 25877561
Alignment:
Q  497 cgtattttactcgtgtgaaacaaccttatgcaacgtgtctacaacaa 543  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25877607 cgtattttactcgtgtgacacaaccttatgcaatgtgtcaacaacaa 25877561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 369 - 484
Target Start/End: Original strand, 14280825 - 14280942
Alignment:
Q  369 taaaaactgaccgaaaaa-tggtttggaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgt-tttcctcagcagttaactatcgaggtttt 465  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||| |  |||| |||||||||   ||||||| || |||||||| |||||||||    
T  14280825 taaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactt-agaattatgcagaacctgctgtctgcataattaaatttcctcggccgttaactaccgaggtttt 14280923  T
Q  466 ccttgacatttaactgccg 484  Q
    ||| | || ||||||||||    
T  14280924 cctcggcagttaactgccg 14280942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 222 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 30292382 - 30292292
Alignment:
Q  222 ttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttg 312  Q
    ||||| |||||||| ||| || ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| || ||  |||||| ||||||    
T  30292382 ttttgttgaatttcgaacattcgtgtaattttaacgaaatgtcgaattgatttaattttggtcaattgtacaaaattatgtattgttcttg 30292292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 484
Target Start/End: Original strand, 30708866 - 30708915
Alignment:
Q  435 gttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgccg 484  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||    
T  30708866 gttttcctcggcagttaactatcgaggttttcttcggcagttaactgccg 30708915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22144 - 21808
Alignment:
Q  12 atgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatatatt 111  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||             
T  22144 atgaatacgcatggaaaatgacaagttatatgtcttggcttattaaagacaatagcgacgtcgaatttatgttttggaatatggtggaaaa--------- 22054  T
Q  112 atatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatggaca 211  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22053 atatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatgatgtgtaatgagttgtaatgtgttgtttaattatggaca 21954  T
Q  212 atttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattctt 311  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       
T  21953 ctttttaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattttt--- 21857  T
Q  312 gtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
             |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21856 ---------cgagtttcaatattgtatgatttatattgcttttggaaatgctctggtt 21808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 482
Target Start/End: Original strand, 15519 - 15995
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15519 gagatgaatacgtatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggggacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaaaataatat 15618  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||          ||||||||||    
T  15619 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgt----------ttaattatgg 15708  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattatt 308  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  15709 acactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaactaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttat 15808  T
Q  309 cttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccgaa-aaatggtttggaa 396  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||           ||||||||| ||||| |||||| || |||    
T  15809 cttgtttatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaacaaatggcttagaa 15908  T
Q  397 atgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgc 482  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||| |||||||||||| | || ||||||||    
T  15909 atg-tttagaattatgcagaactcactgtctgcataatcagttttcctcggaagttaactaccgaggttttcctcggcagttaactgc 15995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 454
Target Start/End: Original strand, 4890 - 5339
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  4890 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatat 4989  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||       ||||||||||||    
T  4990 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatga---gta-------gtttaattatgg 5079  T
Q  209 acaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaa-caaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattat 307  Q
    ||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  5080 acactttgtaatgttttcatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtattta 5179  T
Q  308 tcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccg-aaaaatggtttgga 395  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||           ||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  5180 tcttgattatgaccgagtttcaatcttgtatgaattatttagcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttgga 5279  T
Q  396 aatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaact 454  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  5280 aatg-tctagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaact 5339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 5410 - 5362
Alignment:
Q  436 ttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgccg 484  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||    
T  5410 ttttcctcggcagttaactaccgaggttttcctcggcagttaactgccg 5362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 178; Significance: 1e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 91 - 481
Target Start/End: Original strand, 19743 - 20151
Alignment:
Q  91 tatggtgaaaaataatatattatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaa 190  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||      
T  19743 tatggtggaagataatatattatatatgtatgctcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgcaatgagttgttt 19842  T
Q  191 tgtgctgt----ttaattatggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaa 286  Q
      |  ||     ||||||| || || ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19843 aattatgaacacttaattacggccactttgtaacgttttgatgaattttaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaa 19942  T
Q  287 ttgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaac 375  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||           |||||||    
T  19943 ttgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaac 20042  T
Q  376 tgaccg-aaaaatggtttggaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgac 472  Q
    |||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  20043 tgaccgaaaaaaaagcttggaaatgctttagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttcctcggcagtaaactaccgaggatttcctcgac 20142  T
Q  473 atttaactg 481  Q
    | |||||||    
T  20143 agttaactg 20151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 93
Target Start/End: Original strand, 19498 - 19582
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatat 93  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19498 gagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgctttggcttattcgcgacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatat 19582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 178; Significance: 1e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 22923 - 22450
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  22923 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttatttgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaaaatattat 22824  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctg----tttaatt 204  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||    |  ||     ||||||    
T  22823 attatatatgtatgttcgttccatttgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatt 22724  T
Q  205 atggacaatttataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 304  Q
    ||| ||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22723 atgaacactttgtaatgttttgatgaatttc-aacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtat 22625  T
Q  305 tattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccg-aaaaatggttt 392  Q
    |  ||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||           |||||| || ||| |||||||| ||    
T  22624 ttatcttgattatgtccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaattggccgaaaaaatggctt 22525  T
Q  393 ggaaatgctttagaattatgcagaatccactgttgcataat-tgttttcctcagcagttaactatcgaggttttcct 468  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  22524 ggaaatg-tttagaattatgcagaactcactg-tgcataatcagttttcctcggcagttaactaccgagattttcct 22450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 115 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 8602 - 8248
Alignment:
Q  115 tatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatgagctgtaatgtgctgtttaattatggacaatt 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||          ||||||||||||| ||    
T  8602 tatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgt----------ttaattatggacactt 8513  T
Q  215 tataacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtt 314  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| |    
T  8512 tgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgttggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttatcttgat 8413  T
Q  315 tatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaactgaccg-aaaaatggtttggaaatgctt 402  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||           ||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||    
T  8412 tatgcccgagtttcaatcttgtatgaattattttgcctttggaaatgctttggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatg-tt 8314  T
Q  403 tagaattatgcagaatccactgt-tgcataat-tgttttcctcagcagttaactatcgaggttttc 466  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  8313 tagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttccttggcagttaactaccgaggttttc 8248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0794 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0794
Description:

Target: scaffold0794; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Original strand, 1315 - 1488
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  1315 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttgacttattaaagacaatagcgacgtcggatttatgttttgaaatatggtggaaaataatat 1414  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaacttaatgatatgtaatg 182  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||    
T  1415 attatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtatggatttaatataatgatgtgtaatg 1488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 288 - 454
Target Start/End: Original strand, 1517 - 1695
Alignment:
Q  288 tgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggt-----------taaaaact 376  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||           ||||||||    
T  1517 tgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttgtatgatttatattgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaact 1616  T
Q  377 gaccgaaaaatggtttggaaatgctttagaattatgcagaatccactgt-tgcataattgttttcctcagcagttaact 454  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1617 ggccgaaaaatggcttggaaatgctatagaattatgcagaacccactgtctgcataattgttttcctcagcagttaact 1695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 159
Target Start/End: Original strand, 10828 - 10978
Alignment:
Q  9 gagatgaatacgcatgggaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  10828 gagatgaatacgcatggaaaacagcaagctatatgccttggcttattcgtgacgatagcgacgtcagatttatgtttcagaatatggtggaagataatat 10927  T
Q  109 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgtgatgaatgtaagtaggg 159  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  10928 attatatttgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtaggg 10978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 220 - 369
Target Start/End: Original strand, 236001 - 236150
Alignment:
Q  220 cgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatga 319  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  236001 cgttatgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcgatttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgt 236100  T
Q  320 ccgagtttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    | ||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||    
T  236101 ctgagtttcaatattgtatgaattgttttgcctttcgaaatgctctggtt 236150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 468
Target Start/End: Original strand, 236253 - 236286
Alignment:
Q  435 gttttcctcagcagttaactatcgaggttttcct 468  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  236253 gttttcctctgcagttaactatcgaggttttcct 236286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 225 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 12706 - 12562
Alignment:
Q  225 tgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattattcttgtttatgaccgag 324  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  12706 tgatgaattttaaacgtttgtgtaatttaaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgtccgag 12607  T
Q  325 tttcaatattgtatgatttatattgcctttagaaatgctctggtt 369  Q
    ||||||| |||||||| || | |||| ||| ||||||||||||||    
T  12606 tttcaatgttgtatgaattgttttgcttttcgaaatgctctggtt 12562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 484
Target Start/End: Original strand, 715 - 764
Alignment:
Q  435 gttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgccg 484  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||    
T  715 gttttcctcggcagttaactaccgaggttttcctgggcagttaactgccg 764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 50126 - 50078
Alignment:
Q  436 ttttcctcagcagttaactatcgaggttttccttgacatttaactgccg 484  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||    
T  50126 ttttcctcggcagttaactaccgaggttttcctcggcagttaactgccg 50078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University