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Alignment Overview

Query: NF21101_low_2 (Length: 516)

Name: NF21101_low_2
Description: NF21101
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21101_low_2
NF21101_low_2
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (17-498)||(38006209-38006695)
chr5 (40-218)||(35194014-35194192)
chr5 (67-319)||(12834490-12834752)
chr5 (67-314)||(12866472-12866729)
chr5 (17-283)||(4582981-4583256)
chr5 (17-239)||(8453376-8453598)
chr5 (17-169)||(3573087-3573239)
chr5 (40-320)||(4920711-4921000)
chr5 (17-223)||(35311685-35311891)
chr5 (28-210)||(12447255-12447437)
chr5 (17-184)||(30115346-30115513)
chr5 (17-280)||(2412681-2412952)
chr5 (40-240)||(22694903-22695105)
chr5 (40-220)||(42987502-42987683)
chr5 (28-181)||(27088414-27088566)
chr5 (51-283)||(5908640-5908881)
chr5 (28-213)||(17853322-17853507)
chr5 (17-282)||(6155873-6156145)
chr5 (40-223)||(18206903-18207087)
chr5 (40-219)||(40517691-40517871)
chr5 (61-223)||(15890113-15890275)
chr5 (17-211)||(1218619-1218812)
chr5 (17-211)||(2985010-2985204)
chr5 (98-283)||(29245903-29246096)
chr5 (61-223)||(30996502-30996665)
chr5 (40-202)||(6092559-6092722)
chr5 (17-320)||(13401919-13402229)
chr5 (28-153)||(42717722-42717847)
chr5 (28-230)||(28045528-28045731)
chr5 (98-223)||(27302755-27302880)
chr5 (47-142)||(33862285-33862380)
chr5 (49-213)||(20973526-20973680)
chr5 (17-141)||(3564830-3564954)
chr5 (158-223)||(28569041-28569106)
chr5 (139-223)||(12250955-12251039)
chr5 (81-169)||(33420405-33420492)
chr5 (157-223)||(12712577-12712643)
chr5 (157-223)||(23045011-23045077)
chr5 (173-220)||(33728024-33728071)
chr5 (129-223)||(12457492-12457586)
chr5 (157-223)||(12773841-12773907)
chr5 (230-283)||(6092481-6092534)
chr5 (98-223)||(6369640-6369764)
chr5 (157-230)||(38972925-38972998)
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (40-272)||(14186210-14186434)
chr8 (40-320)||(17469141-17469417)
chr8 (28-209)||(1012491-1012674)
chr8 (28-230)||(43113638-43113840)
chr8 (28-223)||(20399465-20399661)
chr8 (88-314)||(11254935-11255161)
chr8 (28-223)||(24870043-24870238)
chr8 (17-295)||(29108761-29109048)
chr8 (28-274)||(34139321-34139574)
chr8 (28-223)||(45235938-45236134)
chr8 (40-294)||(34776951-34777208)
chr8 (28-223)||(27932286-27932482)
chr8 (51-213)||(32302956-32303120)
chr8 (51-213)||(24927845-24928008)
chr8 (28-230)||(24568813-24569014)
chr8 (28-124)||(35215378-35215474)
chr8 (28-230)||(1063380-1063583)
chr8 (17-241)||(36131916-36132141)
chr8 (17-223)||(34021341-34021545)
chr8 (155-230)||(27777210-27777285)
chr8 (40-169)||(2075907-2076037)
chr8 (160-295)||(39445515-39445658)
chr8 (137-274)||(14687382-14687527)
chr8 (17-138)||(17220579-17220701)
chr8 (130-223)||(30481440-30481533)
chr8 (160-211)||(2075864-2075915)
chr8 (157-237)||(37960965-37961047)
chr8 (40-169)||(4230792-4230922)
chr8 (130-223)||(8545368-8545461)
chr8 (40-117)||(29089595-29089672)
chr8 (230-314)||(4230650-4230734)
chr8 (194-283)||(5858603-5858700)
chr8 (51-133)||(28977223-28977306)
chr8 (162-224)||(41188738-41188800)
chr8 (194-240)||(9642351-9642399)
chr8 (173-230)||(35215555-35215612)
chr8 (155-237)||(40789590-40789674)
chr8 (137-181)||(28345474-28345518)
chr8 (65-124)||(39445686-39445746)
[»] chr4 (51 HSPs)
chr4 (17-288)||(19534324-19534597)
chr4 (51-325)||(5902530-5902807)
chr4 (40-325)||(47550263-47550557)
chr4 (28-240)||(6482036-6482251)
chr4 (28-240)||(1724311-1724525)
chr4 (40-237)||(12825465-12825664)
chr4 (17-283)||(37107280-37107553)
chr4 (28-320)||(26564711-26565011)
chr4 (17-223)||(48459349-48459556)
chr4 (17-190)||(37348992-37349165)
chr4 (40-320)||(11027963-11028253)
chr4 (51-220)||(6382295-6382466)
chr4 (28-223)||(7985145-7985337)
chr4 (49-223)||(32596204-32596378)
chr4 (28-223)||(32585367-32585564)
chr4 (17-227)||(39046821-39047031)
chr4 (49-223)||(47239405-47239580)
chr4 (40-142)||(425715-425817)
chr4 (28-180)||(13770518-13770670)
chr4 (28-200)||(39188395-39188565)
chr4 (51-325)||(43893130-43893412)
chr4 (51-213)||(44317436-44317600)
chr4 (51-213)||(7608872-7609035)
chr4 (17-223)||(31752324-31752531)
chr4 (51-227)||(21423763-21423940)
chr4 (27-127)||(9230163-9230265)
chr4 (51-213)||(11122899-11123062)
chr4 (157-283)||(15987214-15987348)
chr4 (51-213)||(31918588-31918752)
chr4 (27-190)||(28695195-28695358)
chr4 (61-210)||(55826656-55826807)
chr4 (49-141)||(42774661-42774754)
chr4 (139-223)||(14605945-14606029)
chr4 (49-204)||(42299691-42299846)
chr4 (17-117)||(29755456-29755556)
chr4 (130-185)||(42907868-42907923)
chr4 (129-223)||(9929187-9929281)
chr4 (157-240)||(47103747-47103832)
chr4 (157-283)||(29527821-29527943)
chr4 (51-118)||(39375182-39375249)
chr4 (112-202)||(53906346-53906436)
chr4 (157-230)||(21544588-21544661)
chr4 (157-230)||(25941147-25941220)
chr4 (194-230)||(3737822-3737858)
chr4 (98-141)||(13015353-13015396)
chr4 (157-223)||(45065258-45065324)
chr4 (171-223)||(15733546-15733598)
chr4 (139-223)||(30266350-30266434)
chr4 (139-223)||(30285754-30285838)
chr4 (129-169)||(37926540-37926580)
chr4 (194-230)||(43309529-43309565)
[»] chr7 (55 HSPs)
chr7 (28-283)||(27850283-27850540)
chr7 (17-240)||(3920406-3920631)
chr7 (17-240)||(18825872-18826097)
chr7 (40-220)||(16078904-16079084)
chr7 (17-237)||(5376953-5377175)
chr7 (28-283)||(12980255-12980519)
chr7 (42-223)||(26622844-26623025)
chr7 (28-230)||(45379984-45380188)
chr7 (28-211)||(2630604-2630788)
chr7 (40-211)||(26004505-26004674)
chr7 (40-227)||(30650521-30650709)
chr7 (17-223)||(24425249-24425454)
chr7 (51-213)||(21702560-21702723)
chr7 (28-233)||(46127192-46127394)
chr7 (49-213)||(17851753-17851918)
chr7 (40-320)||(7779898-7780187)
chr7 (98-223)||(3226965-3227090)
chr7 (40-220)||(16866059-16866240)
chr7 (63-230)||(18125240-18125408)
chr7 (49-211)||(17885364-17885527)
chr7 (51-218)||(35074370-35074539)
chr7 (40-220)||(45885787-45885968)
chr7 (47-218)||(25782931-25783102)
chr7 (51-227)||(25905529-25905706)
chr7 (28-221)||(37182153-37182346)
chr7 (63-320)||(24753088-24753342)
chr7 (98-223)||(38152836-38152961)
chr7 (98-283)||(41103605-41103792)
chr7 (40-219)||(44794051-44794230)
chr7 (17-200)||(37579130-37579313)
chr7 (17-223)||(44734376-44734583)
chr7 (40-220)||(45708887-45709065)
chr7 (28-227)||(38139807-38140008)
chr7 (40-180)||(23328500-23328641)
chr7 (98-223)||(39456034-39456157)
chr7 (112-223)||(10072429-10072540)
chr7 (61-190)||(44658501-44658631)
chr7 (98-223)||(25979936-25980061)
chr7 (106-223)||(43507402-43507519)
chr7 (64-320)||(16811644-16811895)
chr7 (17-88)||(26004675-26004746)
chr7 (28-182)||(37196058-37196213)
chr7 (61-223)||(39316906-39317069)
chr7 (157-230)||(32546200-32546273)
chr7 (28-141)||(5916171-5916280)
chr7 (17-223)||(41741469-41741675)
chr7 (28-134)||(44986007-44986113)
chr7 (157-223)||(18683982-18684048)
chr7 (157-223)||(3157091-3157157)
chr7 (157-240)||(22973396-22973481)
chr7 (144-283)||(23475226-23475361)
chr7 (129-239)||(4101522-4101634)
chr7 (230-283)||(44658418-44658471)
chr7 (160-237)||(10995837-10995916)
chr7 (157-238)||(31426016-31426099)
[»] chr6 (35 HSPs)
chr6 (17-240)||(24602856-24603081)
chr6 (49-247)||(27738666-27738867)
chr6 (17-275)||(14505949-14506203)
chr6 (17-230)||(11762308-11762521)
chr6 (40-320)||(12141270-12141559)
chr6 (40-223)||(12678113-12678296)
chr6 (28-220)||(2367199-2367392)
chr6 (40-320)||(32853729-32854018)
chr6 (28-311)||(7393822-7394101)
chr6 (40-325)||(10142427-10142721)
chr6 (17-177)||(14032419-14032579)
chr6 (51-295)||(24225594-24225853)
chr6 (63-320)||(27534592-27534858)
chr6 (40-223)||(5863402-5863586)
chr6 (88-223)||(12309506-12309641)
chr6 (17-116)||(14410959-14411058)
chr6 (98-274)||(32053032-32053210)
chr6 (51-213)||(3483952-3484115)
chr6 (40-320)||(10187994-10188276)
chr6 (28-213)||(30816131-30816319)
chr6 (147-295)||(14410807-14410950)
chr6 (129-247)||(13769047-13769167)
chr6 (112-223)||(32532498-32532609)
chr6 (40-118)||(14245133-14245211)
chr6 (60-213)||(14254864-14255017)
chr6 (165-283)||(9442441-9442566)
chr6 (158-240)||(28079696-28079780)
chr6 (155-241)||(29199884-29199972)
chr6 (230-320)||(31496518-31496608)
chr6 (230-320)||(31501904-31501994)
chr6 (130-223)||(256511-256604)
chr6 (158-223)||(20349068-20349133)
chr6 (157-237)||(18908896-18908978)
chr6 (135-227)||(19366990-19367082)
chr6 (194-247)||(20610975-20611030)
[»] chr3 (42 HSPs)
chr3 (17-295)||(53631767-53632053)
chr3 (40-273)||(830895-831129)
chr3 (17-227)||(22535856-22536067)
chr3 (17-237)||(42758237-42758459)
chr3 (17-211)||(31126826-31127020)
chr3 (28-240)||(4016044-4016258)
chr3 (28-240)||(4557305-4557519)
chr3 (17-283)||(34119521-34119793)
chr3 (27-223)||(54317017-54317213)
chr3 (28-230)||(19111609-19111810)
chr3 (51-320)||(39655187-39655465)
chr3 (49-295)||(44639168-44639423)
chr3 (359-489)||(26461477-26461607)
chr3 (40-220)||(44172511-44172692)
chr3 (40-220)||(44179211-44179392)
chr3 (49-227)||(44106807-44106986)
chr3 (40-320)||(10823616-10823896)
chr3 (49-223)||(48390836-48391010)
chr3 (40-326)||(39728556-39728851)
chr3 (40-311)||(17146077-17146353)
chr3 (40-230)||(52198039-52198231)
chr3 (40-320)||(52572494-52572783)
chr3 (17-230)||(29842170-29842384)
chr3 (51-320)||(29284232-29284510)
chr3 (51-244)||(44953431-44953627)
chr3 (40-240)||(49025566-49025768)
chr3 (51-327)||(7469685-7469970)
chr3 (28-179)||(30682695-30682846)
chr3 (51-213)||(44252643-44252806)
chr3 (40-283)||(49579949-49580201)
chr3 (49-227)||(23580722-23580900)
chr3 (49-223)||(34025848-34026023)
chr3 (155-283)||(23546899-23547029)
chr3 (49-190)||(20086903-20087044)
chr3 (49-223)||(34154312-34154483)
chr3 (51-133)||(23547081-23547164)
chr3 (61-213)||(23154093-23154245)
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[»] scaffold0036 (1 HSPs)
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[»] chr2 (33 HSPs)
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[»] chr1 (41 HSPs)
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chr1 (51-230)||(34610970-34611150)
chr1 (17-141)||(34060121-34060245)
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chr1 (49-199)||(23966767-23966919)
chr1 (130-283)||(48125646-48125795)
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chr1 (157-227)||(10450074-10450144)
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[»] scaffold0022 (1 HSPs)
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Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 354; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 38006695 - 38006209
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38006695 aatatgctcgttttaacaattgttagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 38006596  T
Q  117 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 216  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38006595 tgacatattaacataaattaattttcaacattcgggacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatatatctgttacgcgtcccatacccgtatt 38006496  T
Q  217 ttgaaattgggaaacccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttac 316  Q
    ||||||||||| |    ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |    
T  38006495 ttgaaattgggga----aaacccaaacccagtcaaaatggagaaaacccgtcaaatcggatttggttagggcgggtaacaacaggtataggttttgttgc 38006400  T
Q  317 catgac---------tacctttttcttattcttttagagatgattaatggaatcaaaacacaactaagatcctaattttcctccataacctacgccttct 407  Q
    ||||||         ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38006399 catgactacacatgatacctttttcttattcttttagagacgattaatggaatcaaaacacaactaagatcctaattttcctccataacctacgccttct 38006300  T
Q  408 ctctcattattcattaccaccattacacaaaacaacacaaactcattcgttacaacgttgtctctctcatttcacaaacacaccaccctct 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38006299 ctctcattattcattaccaccattacacaaaacaacacaaactcattcgttacaacgttgtctctctcatttcacaaacacaccaccctct 38006209  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 40 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 35194192 - 35194014
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaatt 139  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  35194192 tagaccaattgatttagtttattctttaaatatcaatggtagtttttataacacagcaattatcaaacaaaataacatagcatattaacataaagtaatt 35194093  T
Q  140 ttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatttt 218  Q
    ||| |||||| ||| | ||||| ||||| | | ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  35194092 ttctacattcgggacgggtttgagtatgagtttggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttt 35194014  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 12834752 - 12834490
Alignment:
Q  67 aaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatgg-catattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggt 164  Q
    |||||| |||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| | || |||||    
T  12834752 aaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatagacatatcaacataaattaattttttacatttgggacgggtatgggt 12834653  T
Q  165 atgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgg-gaa-------acccaaacccaaacctaatcaaaatga 256  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||       ||||| ||||||||| | ||||||||     
T  12834652 atgggttcggggtaggtacctatatacctgttacccgtcccatatccatgttttgaaattggagaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaatgg 12834553  T
Q  257 agaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccat 319  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12834552 ggaaaacccgtcaaattgagtttggttcggacgggtaaccacatgtatgggttttgttaccat 12834490  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12866729 - 12866472
Alignment:
Q  67 aaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatgg-catattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggt 164  Q
    |||||| |||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | || |||||    
T  12866729 aaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatagacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggt 12866630  T
Q  165 atgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgg-gaa-------acccaaacccaaacctaatcaaaatga 256  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||       ||||| ||||||||| | ||||||||     
T  12866629 atgggttcgcggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccatgttttgaaatcggagaaaactcatacccatacccaaacccagtcaaaatgg 12866530  T
Q  257 agaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgtt 314  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  12866529 ggaaaacccgtcaaattggatttggttcggacgggtaaccacatgtatgggttttgtt 12866472  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 4582981 - 4583256
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataac 115  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||    
T  4582981 aatatgctcactttaacatttgatagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 4583080  T
Q  116 atggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtat 215  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | || |||||||||| | |||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||| |    
T  4583081 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggtttggggtgggaacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgt 4583180  T
Q  216 tttgaaattggg--aaacccaaac------ccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 283  Q
    |||||||| |||  ||||||| ||      ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||  |||||||    
T  4583181 tttgaaatcggggaaaacccatacccatatccaaacccaatcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggtt 4583256  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8453598 - 8453376
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    ||||||||| |||||||| ||| | |||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||     
T  8453598 aatatgctcattttaacatttgtttgaccgaatgatttagttactcctttaaatatcaatggtaatttttataacatgacaattattaaacaaaataac- 8453500  T
Q  117 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggag-tttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtat 215  Q
     | |||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||| |||| |||||   | |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  8453499 -gacatattaacataaactaattttctacatttgggacgagttttgagtatgactttggggtgtgtacctatatatctgttacccatcccatacccgtgt 8453401  T
Q  216 tttgaaattgggaaa-cccaaaccc 239  Q
    |||||||| |||||| |||||||||    
T  8453400 tttgaaatcgggaaagcccaaaccc 8453376  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 3573087 - 3573239
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  3573087 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttgaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacagaataaca 3573186  T
Q  117 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatggg 169  Q
    || ||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||    
T  3573187 tgacatatcaacataaaataattttctacattcgggaggggtttgagtatggg 3573239  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 40 - 320
Target Start/End: Original strand, 4920711 - 4921000
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  4920711 tagacaaaatgatttagttgatcatttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaat 4920810  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaa 236  Q
    |||  |||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||| || |||  ||||||| |    
T  4920811 tttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtggatacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaacccata 4920910  T
Q  237 c------ccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 320  Q
    |      ||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| || || ||||| ||  |||| ||||||||| |||||    
T  4920911 cccataaccaaacccagtcaaaacggagaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatg 4921000  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 35311685 - 35311891
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataac 115  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||    
T  35311685 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 35311784  T
Q  116 atggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtat 215  Q
    ||  ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | || || ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35311785 ata-catatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggagtgggtacctatatatctgttacccgtcccatacccgtgt 35311883  T
Q  216 tttgaaat 223  Q
    ||||||||    
T  35311884 tttgaaat 35311891  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Original strand, 12447255 - 12447437
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 127  Q
    ||||||| ||| |||| | |||||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12447255 tttaacatttgttagatcgattgatttaactgctcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatattaa 12447354  T
Q  128 cataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacc 210  Q
    |||||| || ||||| | |||  ||| | |||||||||| || ||||||||||||||| |||| |  ||||| ||||||||||    
T  12447355 cataaagtagttttctatatttgggacgggtttgggtataggttcggggtgggtacctatatacccattacctgtcccatacc 12447437  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 184
Target Start/End: Original strand, 30115346 - 30115513
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  30115346 aatatgctcactttaacatttgttagactgatcgatttagttgctcctttaaatataaatggtggtttttataacacggcaattatcaaacaaaataaca 30115445  T
Q  117 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacc 184  Q
    | |||||| |||||||| |||||||   ||||| ||| | |||||  |||||| ||||| ||||||||    
T  30115446 tagcatatcaacataaaataattttatgcattcgggacgggtttgaatatgggttcgggatgggtacc 30115513  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 2412952 - 2412681
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    |||||||||  ||||| | ||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||| | || || |||||||||||||||||||    
T  2412952 aatatgctcactttaatatttgttagaccgattaatttagttgctcctttaaatatcaattgtagtttttatgacacaacaattatcaaacaaaataaca 2412853  T
Q  117 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 216  Q
    || ||||| || ||||| ||||||||  ||| | ||| |||||||||||| || || || ||||||| | |||| | ||||    |||||||||||| ||    
T  2412852 tgacatatcaatataaagtaattttctgcatacgggacgagtttgggtattggttcaggatgggtacatatatacccgttatttatcccatacccgtgtt 2412753  T
Q  217 ttgaaattggg--------aaacccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttg 280  Q
    |||||||||||        ||||||| ||||||||  ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  2412752 ttgaaattgggaaaaattcaaacccatacccaaactcaatcaaaatggggaaaatccgtcaaattgaatttg 2412681  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 40 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22695105 - 22694903
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || |||| |||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  22695105 tagacaaaatgatatagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacattacatatcaacataaaataat 22695006  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat-tgggaaacccaaac 237  Q
    |||  |||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||  ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||    
T  22695005 tttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctctatacccgttagtcgtcccatacccgtattttgagatcggggaaacccatac 22694906  T
Q  238 cca 240  Q
    |||    
T  22694905 cca 22694903  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 40 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 42987683 - 42987502
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  42987683 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataat 42987584  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttga 220  Q
    |||  |||||  ||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  42987583 tttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcgggatgggtacctatatatccgttacacgtcccatacccgtgttttga 42987502  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 27088566 - 27088414
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 127  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||| |  || ||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  27088566 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagtttttataacataacaattatcaaacaaaataacat-acatatcaa 27088468  T
Q  128 cataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggt 181  Q
    |||||| |||||||| ||||||  || | ||||||||||||| |||||||||||    
T  27088467 cataaaataattttctacattcgagacgggtttgggtatgggttcggggtgggt 27088414  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 5908881 - 5908640
Alignment:
Q  51 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 149  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||  |||||     
T  5908881 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaattttttacattt 5908782  T
Q  150 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--------aaacccaaacccaa 241  Q
     ||| | ||||||||||||| | |||||| |||| | |||| | |||||||||||||||||||| ||| || || |||        | ||||| ||||||    
T  5908781 gggacgggtttgggtatgggtttggggtgtgtacatatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaactcatacccatacccaa 5908682  T
Q  242 acctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 283  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||    
T  5908681 acccaatcaaaatggggaaaacccgtcaaattgggtttggtt 5908640  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 17853507 - 17853322
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatatta 126  Q
    ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  17853507 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacata-catatca 17853409  T
Q  127 acataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgt 213  Q
    ||||||| |||||||  |||||  ||| | || |||||||||| |||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17853408 acataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggagtgggtatctatatatccgttacccgtcccatacccgt 17853322  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6156145 - 6155873
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataat-acgactattatcaaacaaaataac 115  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||  | ||||||| || ||||||||||||| |||| |  ||||||| |  | ||| ||||||||||||||||||    
T  6156145 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttatttgctcctttaaatatcaatgatattttttattaccatgacaattatcaaacaaaataac 6156046  T
Q  116 atggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtat 215  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||   || |  |||||||||||| ||||||||||||| | |||| |  ||||| |||| |||||||| |    
T  6156045 atgtcatataaacataaagtaattttcaacatttgtgacggttttgggtatgggttcggggtgggtacatatatacc--ttacctgtcctatacccgtgt 6155948  T
Q  216 tttgaaattggg--aaacccaa------acccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggt 282  Q
    |||||||| |||  ||||||||      ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||  |||||||    
T  6155947 tttgaaatcggggaaaacccaaacacatacccaaacccagtcaaaacgaagaaaacccgttaaatttgatttggt 6155873  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 223
Target Start/End: Original strand, 18206903 - 18207087
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgac-tattatcaaacaaaataacatggcatattaacata-aattaa 137  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| | | || |||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  18206903 tagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcattagtagtttttataacacggcaaattattaaacaaaataacatggcatatcaacatagaagtaa 18207002  T
Q  138 ttttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    ||||| |||||| ||| | |||||  |||||| || |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||  |||||||||    
T  18207003 ttttctacattcgggacgggtttgaatatgggttc-gggtgggtacctatatacctgttacctgtcccatacacgagttttgaaat 18207087  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 219
Target Start/End: Original strand, 40517691 - 40517871
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  40517691 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataat 40517790  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttg 219  Q
    |||  || ||  ||| | ||||| ||||||| |||||||||||| || |||| | ||||||| |||||||||||| |||||    
T  40517791 tttttacctttgggacgggtttgagtatgggttcggggtgggtaactatatacccgttacccatcccatacccgtgttttg 40517871  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 223
Target Start/End: Original strand, 15890113 - 15890275
Alignment:
Q  61 tcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtt 159  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||| || |||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | ||     
T  15890113 tccttcaaatatcaatggtagttttcattaatatgacaattatcaaataaaataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggta 15890212  T
Q  160 tgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15890213 tgggtatgggttcggg-tgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaat 15890275  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 211
Target Start/End: Original strand, 1218619 - 1218812
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  1218619 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttttaacatgacaattatcaaacaaaataaca 1218718  T
Q  117 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccataccc 211  Q
    |  || || |||||||| |||||||  |||||  ||| | || |||||||||| |||| |||||||||| |||| | |||||| |||||||||||    
T  1218719 t-acaaatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggagtgggtacctatatacccgttacctgtcccataccc 1218812  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 211
Target Start/End: Original strand, 2985010 - 2985204
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    |||||||||  ||||| | ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||| || || ||||||||| |||||||||    
T  2985010 aatatgctcactttaatatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagtttttataacacaacaattatcaaataaaataaca 2985109  T
Q  117 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccataccc 211  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| | ||||  ||    |||||||||||  ||||| || |||||| |||| | ||||||||||||| ||||    
T  2985110 tgacatatcaatataaaataattttctatattcgagacagatttgggtatggtttcgggatgagtacctatatacccgttacccgtcccaaaccc 2985204  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 98 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 29246096 - 29245903
Alignment:
Q  98 attatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgtta 197  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||  |||||  ||| | || |||||||||| | ||||||||||||| ||||  |||||    
T  29246096 attatcaaacaaaataacatgacataccaacataaaataattttttacatttgggatgggtatgggtatgggtttggggtgggtacctatatacatgtta 29245997  T
Q  198 cccgtcccatacccgtattttgaaattgg-gaa-------acccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 283  Q
      |||||||||||||| ||||||||| || |||       ||||| ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||| |||||||    
T  29245996 ttcgtcccatacccgtgttttgaaatcggagaaaactcatacccatacccaaacctagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgagtttggtt 29245903  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 61 - 223
Target Start/End: Original strand, 30996502 - 30996665
Alignment:
Q  61 tcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtt 159  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||  |||||  ||| | |||    
T  30996502 tcctttaaatatcaacggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacttaaagtaattttttacatttgggacgggtt 30996601  T
Q  160 tgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    ||||| || | ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||| ||| |||| ||||    
T  30996602 tgggtgtgtgttcggggtgggtacctatatacccgttacctgtcccatactcgtgttttaaaat 30996665  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 6092722 - 6092559
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || |   | ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  6092722 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacattgcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaat 6092623  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgt 202  Q
    |||  |||||  ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  6092622 tttttacatttgggacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgt 6092559  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 13402229 - 13401919
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggttttta-taatacgactattatcaaacaaaataac 115  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||| ||| || ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  13402229 aatatgctcattttaacatttgttagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatagtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 13402130  T
Q  116 atggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtat 215  Q
    ||  ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | || | ||| |||| |||| ||||||||||  ||| | ||||||||| |||||||||| |    
T  13402129 at-acatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatcggt-tgggttcggagtgggtacctaaatacccgttacccgttccatacccgtgt 13402032  T
Q  216 tttgaaattgggaa--------acccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtatagg 307  Q
    ||  |||| |||||        ||||| ||||||||||| |||||| | | |||| |||||||||||  ||||||| || || |||||  |  |||| ||    
T  13402031 ttgaaaatcgggaaaaactcatacccatacccaaacctagtcaaaacggaaaaaatccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccgcgggtatggg 13401932  T
Q  308 ttttgttaccatg 320  Q
    ||||||| |||||    
T  13401931 ttttgttgccatg 13401919  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 42717847 - 42717722
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatc-aaacaaaataacatggcatatta 126  Q
    ||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||| | |    
T  42717847 tttaacatttgttagaccggttgatttagtttctcctttaaatatcaatgatagtttttataacacgacaattatcaaaacaaaatatcatggcatgtca 42717748  T
Q  127 acataaattaattttcaacattcagga 153  Q
    |||| || ||||||||  |||||||||    
T  42717747 acat-aagtaattttctgcattcagga 42717722  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Original strand, 28045528 - 28045731
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat--aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatatt 125  Q
    ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||| | ||||||||  || |  || ||||| ||||||||||||||| |||||     
T  28045528 tttaacatttgttagacgtaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttatttaacataacaattataaaacaaaataacatgacatatc 28045627  T
Q  126 aacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattg 225  Q
    |||||||| |||||||  |||||  ||| | || |||||||||| || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||  ||| ||||||| | |    
T  28045628 aacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttc-gggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatattcgtgttttgaattag 28045726  T
Q  226 ggaaa 230  Q
    |||||    
T  28045727 ggaaa 28045731  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27302880 - 27302755
Alignment:
Q  98 attatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgtta 197  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||  ||| | || ||  |||||  ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  27302880 attatcaaacaaaataacatgacatattaacataaagtaattttttacgtttgggacgtgtatgactatggattcggggtgggtacctatatatttgtta 27302781  T
Q  198 cccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
     ||||| |||| |||| |||||||||    
T  27302780 tccgtctcatatccgtgttttgaaat 27302755  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 33862380 - 33862285
Alignment:
Q  47 attgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttc 142  Q
    ||||||||||||  || ||||||||| ||| || ||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  33862380 attgatttagttggtcatttaaatatcaatcgtagtttttacaacatgacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacataaaatagttttc 33862285  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20973680 - 20973526
Alignment:
Q  49 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacat 147  Q
    ||||||||||  | ||||| |||| |||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||  ||||    
T  20973680 tgatttagttgatactttacatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataccatgacatatcaacataaagtaattttttacat 20973581  T
Q  148 tcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgt 213  Q
    |           |||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||    
T  20973580 t-----------tgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccatcccatacccgt 20973526  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 3564954 - 3564830
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggttttta-taatacgactattatcaaacaaaataac 115  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||| | ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  3564954 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 3564855  T
Q  116 atggcatattaacataaattaatttt 141  Q
    ||  ||||| |||||||| |||||||    
T  3564854 at-acatatcaacataaagtaatttt 3564830  T

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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28569106 - 28569041
Alignment:
Q  158 tttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||  | |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  28569106 tttgggtatgggttcggggtgggtacctatatccccgttacccgtcccgtacccgcattttgaaat 28569041  T

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Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 223
Target Start/End: Original strand, 12250955 - 12251039
Alignment:
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    |||| |||||||||  | ||||||||||||| || | |||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12250955 tttctacattcaggtagggtttgggtatgggttcagagtgggtacatatatctctgttacccgtccggtacccgtattttgaaat 12251039  T

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Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 33420492 - 33420405
Alignment:
Q  81 gtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatggg 169  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| | |||||| ||||||| || | |||||||||||||    
T  33420492 gtttttataacacgacaattatcaaataaaataacatgacatatcaatataaaat-attttctacattcaagacgggtttgggtatggg 33420405  T

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Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12712643 - 12712577
Alignment:
Q  157 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12712643 gtttgggtatgggttcgaggtgggtacatatatctccgttatccgtcccgtacccgtattttgaaat 12712577  T

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Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23045077 - 23045011
Alignment:
Q  157 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| | ||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23045077 gttttggtatgggttcggggtgggtacatatatctccgttacccatcccgtacccgtattttgaaat 23045011  T

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Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 33728071 - 33728024
Alignment:
Q  173 ggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttga 220  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  33728071 ggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttga 33728024  T

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Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 223
Target Start/End: Original strand, 12457492 - 12457586
Alignment:
Q  129 ataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||||| | |||| ||| ||   | ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12457492 ataaattgattttctacattcgggacgggtttgggtatgagttcggagtgagtgtttatatctatgttacctgtcccatacccgtattttgaaat 12457586  T

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Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12773907 - 12773841
Alignment:
Q  157 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||| | ||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12773907 gtttgagtatgggttcgaggtgggtacatatatctccgttatccgtcccgtacccgtattttgaaat 12773841  T

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Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 6092534 - 6092481
Alignment:
Q  230 acccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 283  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||    
T  6092534 acccatacccaaacccaatcaaaacggggaaaacccgttaaattgaatttggtt 6092481  T

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Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 223
Target Start/End: Original strand, 6369640 - 6369764
Alignment:
Q  98 attatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgtta 197  Q
    ||||||||||||||||||| | |  || |||||||| |||||||  |||||  ||| | |||   ||||||| ||||||||||||| | ||||   ||||    
T  6369640 attatcaaacaaaataacacgacgcatcaacataaagtaattttttacattttggacgggttaaagtatgggttcggggtgggtacatatatacacgtta 6369739  T
Q  198 cccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||    
T  6369740 ccc-tcccatactcgtattttgaaat 6369764  T

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Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Original strand, 38972925 - 38972998
Alignment:
Q  157 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa 230  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||  | ||||||  |||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  38972925 gtttgagtatgggttcggggtgggtacctatattcccgttacctatcccatacccatgttttgaaatcgggaaa 38972998  T

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Target: chr8 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 272
Target Start/End: Original strand, 14186210 - 14186434
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14186210 tagaccaattgatttagttactcctttaaatatcaatggtagttt----aacacgactgttatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaatt 14186305  T
Q  140 ttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaacccaaaccc 239  Q
    ||| |||||||||| | ||||||||||||| || ||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||    |||| |    
T  14186306 ttctacattcaggacgggtttgggtatgggttcagggtgagtacctatatatccgttacccatcccatacccgtgttttgaaatcgagaa----aaactc 14186401  T
Q  240 aaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaat 272  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  14186402 aaacccaatcaaaacggagaaaacccgtcaaat 14186434  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 40 - 320
Target Start/End: Original strand, 17469141 - 17469417
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaatt 139  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  17469141 tagacccattgatttagtttctcctttaaatatcaatggtagcttttataacaaggcaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacataaagtagtt 17469240  T
Q  140 ttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaacccaaaccc 239  Q
    |||  || |  ||| | ||||||||||||| | ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    |||||    
T  17469241 ttctgcagttgggacgggtttgggtatgggtttggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaa----aaccc 17469336  T
Q  240 aaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 320  Q
    ||||| | |||||| |  ||||| |||||||||||  ||||||| ||  | ||||| ||  |||| ||||||||| |||||    
T  17469337 aaacccagtcaaaacggggaaaatccgtcaaattgggtttggttcgggtgggtaactacgggtatgggttttgttgccatg 17469417  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 209
Target Start/End: Original strand, 1012491 - 1012674
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 127  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1012491 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtactttttataacacagcaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 1012590  T
Q  128 cataaatta--attttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 209  Q
    |||||| ||   ||||   ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||    
T  1012591 cataaagtagttttttttgcattcgggacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccattacccgtcccatac 1012674  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 43113840 - 43113638
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 127  Q
    ||||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||| |||||| |||| | |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||    
T  43113840 tttaacatttgttataccgattgatttagttgctccttcaaatatcaatgatagtttttataacacgacaattatctaacaaaataacataacatatcaa 43113741  T
Q  128 cataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 227  Q
    ||| || || |||||  |||||  || |  |||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  43113740 catgaagtagttttctgcattcgagacggatttgggtatgagttcggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatgcccgtgttttgaaatcggg 43113641  T
Q  228 aaa 230  Q
    |||    
T  43113640 aaa 43113638  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 223
Target Start/End: Original strand, 20399465 - 20399661
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatc-aaacaaaataacatggcatatta 126  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||| |||  |||||||||||| |||| | |||||||||| ||||| |||||  ||| |||||||||||| |||| |    
T  20399465 tttaacatttgttagaccgattgatttggttggtcctttaaatatcaatgctagtttttataacacgacaattatataaaaaaaataacatggtatatca 20399564  T
Q  127 acataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    ||||||| |||||||   ||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20399565 acataaaataattttttgcattcgggacgggtttgggaatgggttcggggtgggtatctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaat 20399661  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 88 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11255161 - 11254935
Alignment:
Q  88 taatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgt 187  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||  |||||  ||| | || |||||||||| |||  |||||||||| |    
T  11255161 taatatgacaattatcaaacaaaataacata-catatcaacacaaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcgtagtgggtacctat 11255063  T
Q  188 atatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa-cccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttagg 286  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||  |||||| |||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  11255062 atacctgttatccgtcccatacccgtgtttggaaagcgggaaaacccatacccaaacctagtcaaaacggaaaaaacccgtcaaattggatttggttcgg 11254963  T
Q  287 acgagtaacaacatgtataggttttgtt 314  Q
    ||  |||||  ||||||| |||||||||    
T  11254962 acaggtaaccgcatgtatgggttttgtt 11254935  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24870238 - 24870043
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 127  Q
    ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||  ||| | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  24870238 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagttttattaacatgacaattatcaaacaaattaacatgacatatcaa 24870139  T
Q  128 cataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    |||||| |||||||  |||||  ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  24870138 cataaagtaattttttacatttgggacgggtttaggtatgggctcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcacatacccgtgttttaaaat 24870043  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29109048 - 29108761
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataac 115  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||  | ||||||| ||  ||||| |||||| |||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||||||     
T  29109048 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccttcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataat 29108949  T
Q  116 atggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtat 215  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | || |||||||||| ||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||| | |    
T  29108948 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggtgggtacatatatacccgttacccgtcccatacccatgt 29108849  T
Q  216 tttgaaattgggaa--------acccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaac 295  Q
    ||| |||| |||||        ||||| ||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  29108848 tttaaaatcgggaaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcggacgagtaac 29108761  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Original strand, 34139321 - 34139574
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 127  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||  || ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  34139321 tttaacatttgttagaccgattgatttgtttactcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatggtctatcaa 34139420  T
Q  128 cataaattaattttcaa-cattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgg 226  Q
    |||||| |||||||    ||||| ||| | ||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||  |||| ||| |||| |||| |||| ||    
T  34139421 cataaagtaatttttttgcattcgggacgggtttgggtatggt-tcggggtgggtacctatatacctgttacatgtcctatatccgtgtttttaaatcgg 34139519  T
Q  227 g-------aaacccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattg 274  Q
    |       |||| || ||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||    
T  34139520 ggaaaaccaaacacatacccaaacccagtcaaaacgaggaaaacccgtcaaattg 34139574  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 223
Target Start/End: Original strand, 45235938 - 45236134
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatatta 126  Q
    ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||  ||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  45235938 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacataacatatca 45236037  T
Q  127 acataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    |||||||||||||||  |||||  ||| | || ||| |||||| ||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45236038 acataaattaattttttacatttgggacgggtatggatatgggttcggggtgggtacctatatacccattacccgtcccatacccgtgttttgaaat 45236134  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 34776951 - 34777208
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || |   | ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  34776951 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacattgcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataat 34777050  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaa 236  Q
    |||  |||||  ||| |  |||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||| |||||||||| |||||| || |||  ||||||| |    
T  34777051 tttttacatttgggatggatttgggtatgggttcggggtgggtacctaaatacctgttactcgttccatacccgtgttttgagatcgggaaaaacccata 34777150  T
Q  237 cccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaa 294  Q
    |||||||| | |||||| |   ||||||||| ||||||  ||||||| ||||| ||||    
T  34777151 cccaaacccagtcaaaacgggaaaaacccgttaaattgggtttggttcggacgggtaa 34777208  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 223
Target Start/End: Original strand, 27932286 - 27932482
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatatta 126  Q
    ||||||| ||| |||||  | ||||||| ||  |||||||||||| |||| | |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  27932286 tttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 27932385  T
Q  127 acataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    ||||||| |||||||  |||||  ||| |  | || ||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27932386 acataaaataattttttacatttgggacggatatgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttactcgtcccatacccgtgttttgaaat 27932482  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 51 - 213
Target Start/End: Original strand, 32302956 - 32303120
Alignment:
Q  51 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttca-acatt 148  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||   |||||    
T  32302956 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaatagtttttttacatt 32303055  T
Q  149 caggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgt 213  Q
      ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  32303056 tgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgt 32303120  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 51 - 213
Target Start/End: Original strand, 24927845 - 24928008
Alignment:
Q  51 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 149  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||| || ||||  |||||     
T  24927845 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaagatgacaattatcaaacaaaataacataacatatccacataaagtagttttttacattt 24927944  T
Q  150 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgt 213  Q
     ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||    
T  24927945 gggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtctcatacccgt 24928008  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Original strand, 24568813 - 24569014
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 127  Q
    ||||||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||| ||  | |||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  24568813 tttaacatttgttagaccgatttatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttataacacatcaattatcaaacaaaataac-tgacatatcaa 24568911  T
Q  128 cataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 227  Q
    |||||| || |||||  ||||| ||| |  |||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| | | |||| ||||||||||| | || |||||| |||    
T  24568912 cataaagtagttttctccattcgggacggatttgagtatgggttcggggtggatacctatatacccgctacctgtcccatacccatgttgtgaaatcggg 24569011  T
Q  228 aaa 230  Q
    |||    
T  24569012 aaa 24569014  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 124
Target Start/End: Original strand, 35215378 - 35215474
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatat 124  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||| || ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35215378 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgctccattaaatatcaagggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatggcatat 35215474  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Original strand, 1063380 - 1063583
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatatta 126  Q
    ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  || ||||||||| ||||||  ||||||| || | ||| ||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  1063380 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcgtttaaatatcaatggtaatttttatcaacatgacaattatcaaacaaaataacaagacatatca 1063479  T
Q  127 acataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgg 226  Q
    ||||||| |||||||  ||| |  ||| |  |||||||||| | ||||||||||||| | |||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  1063480 acataaagtaattttttacacttgggatggatttgggtatgagttcggggtgggtacttatatacccgttaaccgtcccatacccgtgttttgaaatcgg 1063579  T
Q  227 gaaa 230  Q
    ||||    
T  1063580 gaaa 1063583  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 36132141 - 36131916
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    ||||||||| |||||||| ||| | |||| ||| ||||| || || |||||||| | ||||||  ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  36132141 aatatgctcattttaacatttgtttgaccgattaatttaattgcttctttaaattttaatggtaatttttataacacggcaattatcaaacaaaataaca 36132042  T
Q  117 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 216  Q
    || |||| ||||||||| ||| ||||  ||||| ||| |  |||| ||||| | ||||||||| |||||||||  |  |||||| |||||||| ||| ||    
T  36132041 tgacata-taacataaaataactttctgcattcgggacggatttgtgtatgagttcggggtggatacctgtatgccctttacccatcccatactcgtgtt 36131943  T
Q  217 ttgaaattggg--aaacccaaacccaa 241  Q
    ||||||| |||  |||| |||||||||    
T  36131942 ttgaaataggggaaaactcaaacccaa 36131916  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 34021341 - 34021545
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    |||||||||  ||||||| ||| ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| || |||||||||  | ||| |||||||||||||||||||    
T  34021341 aatatgctcactttaacatttgttagattaattgatttcgttgctcctttaaatatcaatagtagtttttatataatgacaattatcaaacaaaataaca 34021440  T
Q  117 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 216  Q
    |  ||||| |||||||| | ||||||  ||||||||| |||| || |||| || | |||||| |||||| |||  ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  34021441 t-acatatcaacataaa-tgattttctgcattcaggacgagtctgtgtattggtttggggtgtgtacctatattcctgttactcgttccatatccgtatt 34021538  T
Q  217 ttgaaat 223  Q
    || ||||    
T  34021539 ttaaaat 34021545  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27777285 - 27777210
Alignment:
Q  155 gagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| || ||||||||| ||||||    
T  27777285 gagtttgggtatgggttcggggtgggtacctgtatctctgttacctgtcccgtacctgtgttttgaaatcgggaaa 27777210  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 2076037 - 2075907
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  2076037 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaat 2075938  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatggg 169  Q
    |||  |||||  ||| | |||||||||||||    
T  2075937 tttttacatttgggacgggtttgggtatggg 2075907  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 39445658 - 39445515
Alignment:
Q  160 tgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaa--------acccaaacccaaacctaatcaa 251  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| || | | |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||        ||||| ||||||||||| ||||    
T  39445658 tgggtatgagttcggggtgggtacctataaacccgttacctgtcccatacccgtgttttgaaatcgggaaaaacccatacccatacccaaacctagtcaa 39445559  T
Q  252 aatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaac 295  Q
    || |  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39445558 aacggggaaaatccgtcaaattgagtttggttcggacgagtaac 39445515  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 274
Target Start/End: Original strand, 14687382 - 14687527
Alignment:
Q  137 attttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaaccca 234  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||  ||||| | ||||||||||| || ||||||||| |||  |||||||    
T  14687382 attttccacattcaggacgagtttgggtatgggttcggggtggatacatatatccctgtttctcgtcccatacctgtgttttgaaatcggggaaaaccca 14687481  T
Q  235 a------acccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattg 274  Q
    |      ||||||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  14687482 aatccatacccaaacccaatcaaagtggggaaaacccgccaaattg 14687527  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 138
Target Start/End: Original strand, 17220579 - 17220701
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataac 115  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||  | ||||||| ||  ||||| |||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||    
T  17220579 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccttcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 17220678  T
Q  116 atggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||    
T  17220679 atgacatatcaacataaagtaat 17220701  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30481533 - 30481440
Alignment:
Q  130 taaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||     |||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  30481533 taaattaattttttacattcgggacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatcctcattactcgtctcatactcgtattttgaaat 30481440  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 211
Target Start/End: Original strand, 2075864 - 2075915
Alignment:
Q  160 tgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccataccc 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  2075864 tgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccataccc 2075915  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 37961047 - 37960965
Alignment:
Q  157 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaac 237  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||  ||||||||||    
T  37961047 gtttgggtatgagttcggggtgtgtacctatatacctgttacctgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaacccaaac 37960965  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 4230922 - 4230792
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggttttta-taatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||| | ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||    ||| |||||||| ||||    
T  4230922 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataatgtatcaacataaagtaat 4230823  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatggg 169  Q
    |||  |||||  ||| | |||||||||||||    
T  4230822 tttttacatttgggacgggtttgggtatggg 4230792  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8545461 - 8545368
Alignment:
Q  130 taaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    |||||| |||||| |||||  ||| ||||||| ||||||| |||||||||||| || |||  | ||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  8545461 taaattgattttctacatttgggacgagtttgagtatgggttcggggtgggtatctatatccccgttactcgttccatacccgtgttttgaaat 8545368  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 40 - 117
Target Start/End: Original strand, 29089595 - 29089672
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacat 117  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||| | ||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||    
T  29089595 tagacccattaatttagttgctcctttaaatatcaatgatagttttaataacacaataattatcaaacaaaataacat 29089672  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4230734 - 4230650
Alignment:
Q  230 acccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgtt 314  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| || || ||||| |||||||| | |||||||    
T  4230734 acccatacccaaacccagtcaaaatggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacatgtatggattttgtt 4230650  T

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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 5858700 - 5858603
Alignment:
Q  194 gttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa--------cccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 283  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||        |||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5858700 gttacccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggaaaaacccaaacccatacccaaacccaatcaaaacggggaaaacccgtcaaattggatttggtt 5858603  T

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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 28977306 - 28977223
Alignment:
Q  51 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaa 133  Q
    ||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  28977306 atttagttgatcatttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaa 28977223  T

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Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41188800 - 41188738
Alignment:
Q  162 ggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaatt 224  Q
    |||||||| ||||||| ||| | | ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  41188800 ggtatgggttcggggttggtgcatatatctctgttactcgtcccatacccgtattttaaaatt 41188738  T

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Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9642399 - 9642351
Alignment:
Q  194 gttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaaccca 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||    
T  9642399 gttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaaacccaaaccca 9642351  T

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Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 230
Target Start/End: Original strand, 35215555 - 35215612
Alignment:
Q  173 ggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa 230  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  35215555 ggggtgggtacctatatactcgttacccgtctcatacccgtgttttgaaatcgggaaa 35215612  T

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Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 237
Target Start/End: Original strand, 40789590 - 40789674
Alignment:
Q  155 gagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaac 237  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| | |||  |||||||||||||  ||||  |||| ||||||||||  ||||||||||    
T  40789590 gagtttgggtataggttcggggtgggtacatatatccctgttacccgtccagtacctatattatgaaattggggaaaacccaaac 40789674  T

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Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 181
Target Start/End: Original strand, 28345474 - 28345518
Alignment:
Q  137 attttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggt 181  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  28345474 attttctacattcaggacaagtttgggtatgggttcggggtgggt 28345518  T

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Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 39445746 - 39445686
Alignment:
Q  65 ttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatat 124  Q
    |||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  39445746 ttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatat 39445686  T

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Target: chr4 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 51)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 288
Target Start/End: Original strand, 19534324 - 19534597
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19534324 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttagatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataaca 19534423  T
Q  117 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 216  Q
    || ||||| |||||||| |||||||| ||||||  || | ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  19534424 tgacatatcaacataaaataattttctacattcgtgacgggtttgggtatgagttcgaggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccagatt 19534523  T
Q  217 ttgaaattg--ggaaacccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggac 288  Q
    || |||| |  | |||| || ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19534524 ttaaaatcggagaaaactcatacccaaacccaatgaaaacggagaaaacccgtcaaattggatttggtttggac 19534597  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 51 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 5902807 - 5902530
Alignment:
Q  51 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 149  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||| || ||||  |||||     
T  5902807 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataagataacatatcaacataaagtagttttttacattt 5902708  T
Q  150 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaacccaaacctaa 247  Q
     ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||| || || |||  ||||||| ||||||||| |     
T  5902707 gggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaacccatacccaaacccag 5902608  T
Q  248 tcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatgactac 325  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||    
T  5902607 tcaaaacggggaaaacccgtcaaattgagtttggttcgggcgggtaaccacgggtataggttttgttgccatgcctac 5902530  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 47550557 - 47550263
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  47550557 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataat 47550458  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--------aaa 230  Q
    |||  |||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||        | |    
T  47550457 tttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaactcata 47550358  T
Q  231 cccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatgactac 325  Q
    || | ||||||||| | ||||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  47550357 cctatacccaaacccagtcaaaatggggaaaatccgccaaattgagtttggttcgggcgggtaaccacatgtatgggttttgtttccatgcctac 47550263  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6482251 - 6482036
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 127  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6482251 tttaacatttgttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaatgttagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 6482152  T
Q  128 cataaatta-attttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgg 226  Q
     ||||||||  ||||   ||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |  |||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  6482151 tataaattagtttttttgcatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatataccctttactcgtcccatacccgtgtttttaaattgg 6482052  T
Q  227 g--aaacccaaaccca 240  Q
    |  |||||||||||||    
T  6482051 ggaaaacccaaaccca 6482036  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1724525 - 1724311
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 127  Q
    ||||||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||| ||  | |||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  1724525 tttaacatttgttagaccgatttatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttataacacatcaattatctaacaaaataacatgacatatcaa 1724426  T
Q  128 cataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 227  Q
    |||||| || |||||  ||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  1724425 cataaagtagttttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatataaccgttacccgtcccatacccatgttttgaaatcggg 1724326  T
Q  228 --aaacccaaaccca 240  Q
      |||||||||||||    
T  1724325 gaaaacccaaaccca 1724311  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 40 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12825664 - 12825465
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  | |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||    
T  12825664 tagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaattttagtttttataacacgataattatcaaacaaaataacatgatatatcaacataaagtaatt 12825565  T
Q  140 ttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaac 237  Q
    |||  || || |||   |||||||||| || || |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||    
T  12825564 ttctgcactcgggacaggtttgggtataggttcagggtgggtacgtatatatccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaaacccaaac 12825465  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 37107280 - 37107553
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    ||||||||| |||||| | |||  ||||| |||||||||||| || |||||||||  |||||| |||||||||| | | | |||||||||||||||||||    
T  37107280 aatatgctcattttaatatttgtcagaccgattgatttagttgcttctttaaataccaatggtagtttttataacatggcaattatcaaacaaaataaca 37107379  T
Q  117 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 216  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||  ||||| |||    ||| |||||    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  37107380 tgacatatcaacataaagtaattttctgcattcgggatatattttggtataaattcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtt 37107479  T
Q  217 ttgaaattggg-aaacccaa------acccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 283  Q
    ||||||||||| ||||||||      || |||||| | ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||    
T  37107480 ttgaaattgggaaaacccaaactcatacacaaacccagtcaaaatgggaaaaacccgtcaaattaaatttggtt 37107553  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 320
Target Start/End: Original strand, 26564711 - 26565011
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 127  Q
    ||||||| ||| | |||| ||||||||||||  ||| |||||||| |||| | |||||||||| ||| |  |||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  26564711 tttaacatttgtttgaccgattgatttagttgttccgttaaatatcaatgatagtttttataacacggcagttatcaaacaaactaacatgacatatcaa 26564810  T
Q  128 cataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 227  Q
    |||||| || |||||  ||||  ||| | ||||||||||||  ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  26564811 cataaagtagttttctgcatttgggacgggtttgggtatggtttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgcgttttgaaatcggg 26564910  T
Q  228 --------aaacccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccat 319  Q
            |||| || ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  | ||||| ||  |||| ||||||||| ||||    
T  26564911 gaaagctcaaactcatacccaaacccagtcaaaacgaagaaaatccgtcaaattggatttggttcgggtgggtaaccacgggtatgggttttgttgccat 26565010  T
Q  320 g 320  Q
    |    
T  26565011 g 26565011  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 48459349 - 48459556
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataac 115  Q
    |||||||||  ||||||| ||  ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||    
T  48459349 aatatgctcactttaacattttttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 48459448  T
Q  116 atggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtat 215  Q
    ||  ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | || |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| | |    
T  48459449 ataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggatgggtatgggtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgttccatacccatgt 48459548  T
Q  216 tttgaaat 223  Q
    ||||||||    
T  48459549 tttgaaat 48459556  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 190
Target Start/End: Original strand, 37348992 - 37349165
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    |||||||||  ||||| | ||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||||||    
T  37348992 aatatgctcactttaagatttgttagaccgattaatttagttgctcctttaaatatcaacggtagtttttataacgcgagaattatcaaacaaaataaca 37349091  T
Q  117 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtata 190  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||  ||||| ||| | ||||||||||||| || |||||| ||||| ||||    
T  37349092 tggcatatcaacataaaataattttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcagggtggatacctatata 37349165  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 320
Target Start/End: Original strand, 11027963 - 11028253
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| ||||    
T  11027963 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatataaatagtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaatataaagtaat 11028062  T
Q  139 tttca-acattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaa 235  Q
    |||   |||||  |||   ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||| || |||  |||||||     
T  11028063 ttttttacatttgggacaggtttgggtatgagttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaacccat 11028162  T
Q  236 acccaaacctaa------tcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 320  Q
    ||||| ||| ||      |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||| |||||    
T  11028163 acccatacccaaatccagtcaaaacggagaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggtgggtaaccacgtgtatgggttttgttgccatg 11028253  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6382466 - 6382295
Alignment:
Q  51 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttca-acatt 148  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||   |||||    
T  6382466 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaatagtttttttacatt 6382367  T
Q  149 caggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttga 220  Q
      ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  6382366 tgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttga 6382295  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7985337 - 7985145
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggttttt-ataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatatta 126  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  7985337 tttaacatttgttagaccaattgatttagttgctcatttaaatatcaacggtagttttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacttatca 7985238  T
Q  127 acataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    ||||||| || |||||  ||||| ||| | ||||||||||||| ||||| || ||||    |||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  7985237 acataaaatacttttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcgggatgagtac----atacatgttatccgtcccatacccatgttttgaaat 7985145  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 32596378 - 32596204
Alignment:
Q  49 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacatt 148  Q
    ||||||||||  ||||| |||||| |||| | |||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||| |||| |||||||| |||||||| |||||    
T  32596378 tgatttagttgttccttcaaatattaatgctagtttttataacatgacaattatcaaaccaaatgacatggtatatcaacataaaataattttctacatt 32596279  T
Q  149 caggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    |  ||  |||||||||||| | | | |||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32596278 cgagacaagtttgggtatgagtttgaggtggggacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaat 32596204  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 223
Target Start/End: Original strand, 32585367 - 32585564
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtg-gtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatatt 125  Q
    ||||||||||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||| |  |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||| | |||||     
T  32585367 tttaacaattgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgattagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacaagacatata 32585466  T
Q  126 aacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    |||||||| ||| |||  |||||  ||| | ||||||||||||| || |||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  32585467 aacataaagtaagtttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcagggtgggtacctatatacccgttacctgtcccatacccgtgttttgaaat 32585564  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 227
Target Start/End: Original strand, 39046821 - 39047031
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataac 115  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| || ||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||    
T  39046821 aatatgctcattttaacatttgttagacggaatgatttagttaatcctttaaatatcaacggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 39046920  T
Q  116 atggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtat 215  Q
    ||  ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | || |||||||||| | || |||||||||| |||| | |||||  ||||||||||||| |    
T  39046921 ata-catatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggtttggagtgggtacctatatacccgttacatgtcccatacccgtgt 39047019  T
Q  216 tttgaaattggg 227  Q
    || |||||||||    
T  39047020 ttggaaattggg 39047031  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 47239580 - 47239405
Alignment:
Q  49 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacat 147  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||    
T  47239580 tgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacat 47239481  T
Q  148 tcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    |  |||   || |||||||||| || ||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  47239480 ttgggacaggtatgggtatgggttcagggtgggaacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttaaaat 47239405  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 142
Target Start/End: Original strand, 425715 - 425817
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaatt 139  Q
    |||||| ||||||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  425715 tagaccgattgatttagttgttcttttaaatatcaatggtagtttttataacatgacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacataaagtaatt 425814  T
Q  140 ttc 142  Q
    |||    
T  425815 ttc 425817  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 13770670 - 13770518
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 127  Q
    ||||||| ||| | |||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13770670 tttaacatttgtttgaccgattgatttagttgctccttcaaatattaatggtcgtttttataacacggtaattatcaaacaaaataacatggcttattaa 13770571  T
Q  128 cataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtggg 180  Q
    |||||| || ||||   ||||| ||| | ||||| ||||| | ||||||||||    
T  13770570 cataaaatagttttatgcattcgggacgggtttgagtatgagttcggggtggg 13770518  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 200
Target Start/End: Original strand, 39188395 - 39188565
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 127  Q
    ||||||| ||| |||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  39188395 tttaacatttgttagaacgattgatttagttttttctttaaatataaatggtagttttt-taacacgacagttatcaaacaaaataacatgacatatcaa 39188493  T
Q  128 cataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttaccc 200  Q
    ||||||  ||||||   ||||| ||| ||||||||  ||||| | ||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  39188494 cataaaacaattttatgcattcgggatgagtttggacatgggtttggggt-ggtacctatatatccgttaccc 39188565  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 325
Target Start/End: Original strand, 43893130 - 43893412
Alignment:
Q  51 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 149  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||  |||||     
T  43893130 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacattt 43893229  T
Q  150 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg-------aaacccaaacccaaa 242  Q
     ||| | |||||||||||   ||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||| || || |||       | ||||| |||||||    
T  43893230 gggacgggtttgggtatgaattcggggtggatacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaacccatacccatacccaaa 43893329  T
Q  243 cctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatgactac 325  Q
    || | |||||| |  |||||||||||||||||  ||||| | || || ||||| ||  |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  43893330 cccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggctcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgcctac 43893412  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 213
Target Start/End: Original strand, 44317436 - 44317600
Alignment:
Q  51 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttca-acatt 148  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| || |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||   |||||    
T  44317436 atttagttgatcctttaaatatcaatcgtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatt 44317535  T
Q  149 caggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgt 213  Q
      ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  44317536 tgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgt 44317600  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 213
Target Start/End: Original strand, 7608872 - 7609035
Alignment:
Q  51 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 149  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||   |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| | || ||||  |||||     
T  7608872 atttagttgatcctttaaatatcaatgacagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacatagagtagttttttacattt 7608971  T
Q  150 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgt 213  Q
     ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  7608972 gggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgt 7609035  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 31752324 - 31752531
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataac 115  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  || ||||||||| | || | |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||    
T  31752324 aatatgctcactttaacatttgatagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcattgttagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 31752423  T
Q  116 atggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtat 215  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | || |||||||||| |||||||||| |||| ||||   ||||| |||| ||||||||| |    
T  31752424 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggtgggaacctatatactcgttactcgtctcatacccgtgt 31752523  T
Q  216 tttgaaat 223  Q
    ||||||||    
T  31752524 tttgaaat 31752531  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 227
Target Start/End: Original strand, 21423763 - 21423940
Alignment:
Q  51 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 149  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||| || ||||  |||||     
T  21423763 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataatataacatatcaacataaagtagttttttacattt 21423862  T
Q  150 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 227  Q
     ||| | ||||| ||||||| | ||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||| ||| || ||||||    
T  21423863 gggacgggtttgtgtatgggtttggggtgggtacctatatacccgttacccgtctcatacccgtgtttcgagattggg 21423940  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Original strand, 9230163 - 9230265
Alignment:
Q  27 ttttaacaattggtagaccaattgatttagtttct--cctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatat 124  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  9230163 ttttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacagttatcaaacaaaataacatgacatat 9230262  T
Q  125 taa 127  Q
    |||    
T  9230263 taa 9230265  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 11123062 - 11122899
Alignment:
Q  51 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 149  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||  ||||||| || | ||| ||||| |||||||||||||   ||||| |||||||| || ||||  |||||     
T  11123062 atttagttgatcctttaaatatcaatggtactttttattaacatgacaattataaaacaaaataacaaaacatatcaacataaagtagttttttacattt 11122963  T
Q  150 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgt 213  Q
     ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  11122962 gggacgggtttgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgt 11122899  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15987348 - 15987214
Alignment:
Q  157 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat-tgggaa-------acccaaacccaaacctaat 248  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||| | ||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||       ||||| ||||||||| |||    
T  15987348 gtttgggtatgggttcggggtgggtatctatatacccgttacccatcccatacccgtgttttaaaatctgggaaaactcatacccatacccaaacccaat 15987249  T
Q  249 caaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 283  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  15987248 caaaatggagaaaacccgtcaaattgggtttggtt 15987214  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31918752 - 31918588
Alignment:
Q  51 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaatta-attttcaacatt 148  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||  ||||  |||||    
T  31918752 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatt 31918653  T
Q  149 caggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgt 213  Q
      ||| | ||||||||||||| |||||||||||| || |||| |  |||| ||||||||||||||    
T  31918652 tgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtaactatatacccattactcgtcccatacccgt 31918588  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 28695358 - 28695195
Alignment:
Q  27 ttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatatta 126  Q
    |||||||| ||| || ||| | |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  28695358 ttttaacatttgttaaaccgaatgatttagttgctcctttaaatattaatgatagtttttataacgtgacaattatcaaataaaataacattgcatatca 28695259  T
Q  127 acataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtata 190  Q
    |||||||  ||||| | | |||   || ||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||    
T  28695258 acataaagcaatttcctatatttgagacgagtttgggtatgagttcggggtgagtacctatata 28695195  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 55826807 - 55826656
Alignment:
Q  61 tcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttca-acattcaggaggagt 158  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||   |||||  ||| | ||    
T  55826807 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacgtgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggt 55826708  T
Q  159 ttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacc 210  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  55826707 ttggatatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacc 55826656  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 141
Target Start/End: Original strand, 42774661 - 42774754
Alignment:
Q  49 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaatttt 141  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  42774661 tgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaatttt 42774754  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14606029 - 14605945
Alignment:
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14606029 tttctacattcaggtagagtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccctgttacccgtctcgtacccgtattttgaaat 14605945  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 204
Target Start/End: Original strand, 42299691 - 42299846
Alignment:
Q  49 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacat 147  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||  || |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  | ||    
T  42299691 tgatttagttgctcatttaaatatcaacagtagtttttattaacaagacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacataaagtactttt-tatat 42299789  T
Q  148 tcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcc 204  Q
    |  ||| | ||||| ||||||| || |||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  42299790 ttgggacgtgtttgagtatgggttcagggtgggtacctatatacccgttacccgtcc 42299846  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 29755556 - 29755456
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    ||||| ||| |||||||| ||| |||| | |||||||||||| || |||||||||| |||||| || ||||||| |||   |||||||||||||||||||    
T  29755556 aatatactcattttaacatttgttagatcgattgatttagttacttctttaaatatcaatggtagtgtttataacacggtaattatcaaacaaaataaca 29755457  T
Q  117 t 117  Q
    |    
T  29755456 t 29755456  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 185
Target Start/End: Original strand, 42907868 - 42907923
Alignment:
Q  130 taaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacct 185  Q
    |||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42907868 taaattgattttctacattcgggacgagtttgggtatgggctcggggtgggtacct 42907923  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9929281 - 9929187
Alignment:
Q  129 ataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    ||||||| |||||| || ||||||| || |||||||| | | ||||||||||||||| |||   |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  9929281 ataaattgattttctactttcaggacgattttgggtaagagttcggggtgggtacctatatccatgttacccgtactatacccgtattttgaaat 9929187  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 240
Target Start/End: Original strand, 47103747 - 47103832
Alignment:
Q  157 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaaccca 240  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  47103747 gtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccgcgttacccgccccgtacccgtattttgaaattggggaaaacccaaaccca 47103832  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 283
Target Start/End: Original strand, 29527821 - 29527943
Alignment:
Q  157 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaacccaaacccaaacctaatcaaaatga 256  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||  | |||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||    ||||||||||  ||||||  |     
T  29527821 gtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccccgttacccgtcacgtacccgtattttgaaatcggggaa----aacccaaaccctatcaaagcgg 29527916  T
Q  257 agaaaacccgtcaaattgaatttggtt 283  Q
     ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  29527917 ggaaaacccgtcaaatcgaagttggtt 29527943  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 118
Target Start/End: Original strand, 39375182 - 39375249
Alignment:
Q  51 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatg 118  Q
    ||||||||  |||||||||||| | |||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  39375182 atttagttgttcctttaaatattagtggtagtttttataacacggcaattatcaaacaaaataacatg 39375249  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 53906436 - 53906346
Alignment:
Q  112 taacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgt 202  Q
    ||||||| ||||| ||||| || |||||||  |||||  ||| |||||| | |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  53906436 taacatgacatatcaacatgaagtaattttttacatttgggacgagtttagatatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgt 53906346  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Original strand, 21544588 - 21544661
Alignment:
Q  157 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa 230  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||  |  ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21544588 gtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccccattacctgtcccgtacccgtattttgaaatcgggaaa 21544661  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Original strand, 25941147 - 25941220
Alignment:
Q  157 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa 230  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | |  | |||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  25941147 gtttgggtatgggttcggggtgggtacctatcttcccgttacctgtcccgtacccgtgttttgaaatcgggaaa 25941220  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 230
Target Start/End: Original strand, 3737822 - 3737858
Alignment:
Q  194 gttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa 230  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3737822 gttacccgtcccatacccgtgttttgaaattgggaaa 3737858  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 13015396 - 13015353
Alignment:
Q  98 attatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaatttt 141  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  13015396 attatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataatttt 13015353  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 223
Target Start/End: Original strand, 45065258 - 45065324
Alignment:
Q  157 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||| | |||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  45065258 gtttgggtatgcgttcgggatgggtacatatatccctgttactcgtcccgtacccgtattttgaaat 45065324  T

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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15733598 - 15733546
Alignment:
Q  171 tcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    ||||||||||||| | ||| || |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15733598 tcggggtgggtacatatatctccgttacccgtctcgtacccgtattttgaaat 15733546  T

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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30266434 - 30266350
Alignment:
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    |||| |||||||||  | ||||||||||||| ||||||||| ||| | |||  | |||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  30266434 tttctacattcaggtagggtttgggtatgggttcggggtggatacatatatccccgttacccgtcctgtacccgtattatgaaat 30266350  T

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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 223
Target Start/End: Original strand, 30285754 - 30285838
Alignment:
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    |||| |||||||||  | ||||||||||||| ||||||||| ||| | |||  | |||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  30285754 tttctacattcaggtagggtttgggtatgggttcggggtggatacatatatccccgttacccgtcctgtacccgtattatgaaat 30285838  T

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Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 129 - 169
Target Start/End: Original strand, 37926540 - 37926580
Alignment:
Q  129 ataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatggg 169  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  37926540 ataaattaatttactacattcaggatgagtttgggtatggg 37926580  T

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Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 194 - 230
Target Start/End: Original strand, 43309529 - 43309565
Alignment:
Q  194 gttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa 230  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  43309529 gttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgggaaa 43309565  T

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Target: chr7 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 55)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27850540 - 27850283
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 127  Q
    ||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  27850540 tttaacatttgttagatcgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgaaagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcat 27850441  T
Q  128 cataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 227  Q
    | |||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||| || | | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  27850440 cgtaaagtaattttctacattcgggacgggtttgggtatgggttcgggatgggtacctatacacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggg 27850341  T
Q  228 --aaacccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 283  Q
      ||||||| ||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||  |||||||    
T  27850340 gaaaacccatacccaaacccaatcaaaacggggaaaaaccgtcaaattgggtttggtt 27850283  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 240
Target Start/End: Original strand, 3920406 - 3920631
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||||| ||| ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||| | | | |||||||||||||||||||    
T  3920406 aatacgctcattttaacatttgttagaccgattcatttagttgttcctttaaatatcaatggtagtttttataacatggcaattatcaaacaaaataaca 3920505  T
Q  117 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 216  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| || ||    
T  3920506 tggcatatcaacataaaataattttctacattcgggacagttttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttatccgtcccataccagtgtt 3920605  T
Q  217 ttgaaattggg--aaacccaaaccca 240  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||    
T  3920606 ttgaaatcggggaaaacccaaaccca 3920631  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18826097 - 18825872
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||| ||||||||||||  || |||| |||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  18826097 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcttttatatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataaca 18825998  T
Q  117 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 216  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||   |||  ||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  18825997 tggcatatcaacgtaaaataattttctgtatttgggatgggtttgggtacgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtt 18825898  T
Q  217 ttgaaattggg--aaacccaaaccca 240  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||    
T  18825897 ttgaaatcggggaaaacccaaaccca 18825872  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 40 - 220
Target Start/End: Original strand, 16078904 - 16079084
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaatt 139  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  16078904 tagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaagggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacgtaaagtaatt 16079003  T
Q  140 ttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttga 220  Q
    |||   ||||| || |||||||||||| || | |||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  16079004 ttctgtattcatgacgagtttgggtataggtttggggtgggcacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttga 16079084  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 237
Target Start/End: Original strand, 5376953 - 5377175
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    ||||||||| |||||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  5376953 aatatgctcattttaacatttgttaaaccgattgatttagttgctcctttaaatatcattggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaattaca 5377052  T
Q  117 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 216  Q
    ||  |||| |||||||| ||||||||  ||||| |||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||| || ||    
T  5377053 tgatatatcaacataaagtaattttctgcattcgggacagatttgggtatgggttcggggtgggtacctatataccctttacccgtcccatacctgtgtt 5377152  T
Q  217 ttgaaattggg--aaacccaaac 237  Q
    ||||||| |||  ||||||||||    
T  5377153 ttgaaatcggggaaaacccaaac 5377175  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 283
Target Start/End: Original strand, 12980255 - 12980519
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 127  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12980255 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagtttttataacacgaaaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 12980354  T
Q  128 cataaatta-attttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgg 226  Q
    |||||| ||  ||||   ||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  12980355 cataaaatattttttttgcatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccattacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgg 12980454  T
Q  227 g--------aaacccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 283  Q
    |        ||||||| ||||||||| | ||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||    
T  12980455 ggaaaaccaaaacccatacccaaacccagtcaaaatggggaaaacccgttaaattgagtttggtt 12980519  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 223
Target Start/End: Original strand, 26622844 - 26623025
Alignment:
Q  42 gaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaatttt 141  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  26622844 gaccaattgatttaattgctcctttaaatatcaatggtagtttttataacacaacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacataaaataatttt 26622943  T
Q  142 caacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
       |||||   | ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |  |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26622944 ttgcattcgaaacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccattacccatcccatacccgtgttttgaaat 26623025  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Original strand, 45379984 - 45380188
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatatta 126  Q
    ||||||| ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  45379984 tttaacatttgttagacgaactgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatgtca 45380083  T
Q  127 acataaattaattttca-acattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattg 225  Q
    ||||||| |||||||   |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45380084 acataaagtaatttttttacatttgggacgagtttaggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtattttgaaatcg 45380183  T
Q  226 ggaaa 230  Q
    |||||    
T  45380184 ggaaa 45380188  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 2630788 - 2630604
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 127  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2630788 tttaacatttgatagaccgattgatttagttgctcatttaaatatcaatggtagtttttataatacggcaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 2630689  T
Q  128 cataaatta-attttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccataccc 211  Q
    |||||| ||  ||||   ||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||| || |||| | || |||||||||||||||    
T  2630688 cataaagtagtttttttgcattcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtatctatatacccgtcacccgtcccataccc 2630604  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 40 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 26004674 - 26004505
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaatt 139  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||| | |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26004674 tagaccgattgatttagtcgctcctttaaatatcaatgatagtttttataagaagacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacataaagtaatt 26004575  T
Q  140 ttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccataccc 211  Q
    |||  ||||| ||  |||||  |||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  26004574 ttctgcattcggggcgagtt--ggtatgggttcggggtgggtatctatatacctgttacccgtcccataccc 26004505  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 40 - 227
Target Start/End: Original strand, 30650521 - 30650709
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | | | ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  30650521 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaat 30650620  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 227  Q
    |||  |||||  ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  30650621 tttttacatttgggacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagattggg 30650709  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 24425249 - 24425454
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    |||||||||  ||||||| ||| ||||||  |||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||    
T  24425249 aatatgctcactttaacatttgttagaccggttgattta-tttgtcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgataattatcaaacagaataaca 24425347  T
Q  117 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 216  Q
    |||||||| |||||| | |||||||   ||||  | | | ||||||  ||||| || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  24425348 tggcatatcaacatatagtaattttatgcatttggaacgggtttggaaatggggtcagggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtt 24425447  T
Q  217 ttgaaat 223  Q
    |||||||    
T  24425448 ttgaaat 24425454  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 51 - 213
Target Start/End: Original strand, 21702560 - 21702723
Alignment:
Q  51 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 149  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||  |||||     
T  21702560 atttagttgatcctttaaatataaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacattt 21702659  T
Q  150 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgt 213  Q
     ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  21702660 gggacgggttggggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgt 21702723  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 46127394 - 46127192
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 127  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||       
T  46127394 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcctttaaatatcaatggtagttattataacacgacaatgatcaaacaaaataacatgacatat--- 46127298  T
Q  128 cataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 227  Q
    |||||| ||||||||  ||||  ||| | ||||| ||||| | |||| |||||||||| || | |||||| |||||||||||||||  ||| |||| |||    
T  46127297 cataaaataattttctgcatttgggacgggtttgagtatgagatcggtgtgggtacctatacacctgttatccgtcccatacccgtgattttaaatcggg 46127198  T
Q  228 aaaccc 233  Q
    ||||||    
T  46127197 aaaccc 46127192  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 49 - 213
Target Start/End: Original strand, 17851753 - 17851918
Alignment:
Q  49 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacat 147  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||  ||||    
T  17851753 tgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacat 17851852  T
Q  148 tcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgt 213  Q
    |  ||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17851853 ttgggatgggtttgggtatgggttcgggatgggtacctatatatccgttacccgtcccatacccgt 17851918  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 320
Target Start/End: Original strand, 7779898 - 7780187
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||     
T  7779898 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataaa 7779997  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--------aaa 230  Q
    |||  |||||  ||| | |||||||||| || ||||||||||||||| |||| |  ||| ||||||||||||||| |||||| || |||        | |    
T  7779998 tttttacatttgggacgggtttgggtataggttcggggtgggtacctatatacccattatccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaacccata 7780097  T
Q  231 cccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 320  Q
    |||| ||||||||| | |||||| |  ||||| |||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||  |||| ||||||||| |||||    
T  7780098 cccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaatccgtcaaattgagtttggttcggatgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatg 7780187  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 98 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3227090 - 3226965
Alignment:
Q  98 attatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgtta 197  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | || || ||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||    
T  3227090 attatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggatgtgtatgagtatgggttcggggtgggtacctatattcctgtta 3226991  T
Q  198 cccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  3226990 cccgtcccatacccgtgttttgaaat 3226965  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 220
Target Start/End: Original strand, 16866059 - 16866240
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||||||  || ||||||||| |||| | |||||||| || | | | ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  16866059 tagacaaaatgatttagttaatcatttaaatatcaatgatagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaat 16866158  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttga 220  Q
    |||  |||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16866159 tttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttactcgtcccatacccgtgttttga 16866240  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 63 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18125408 - 18125240
Alignment:
Q  63 ctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttg 161  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||  |||||  ||| | |||||    
T  18125408 ctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttg 18125309  T
Q  162 ggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa 230  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||| || || ||||||    
T  18125308 ggtatgcgttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcgggaaa 18125240  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 211
Target Start/End: Original strand, 17885364 - 17885527
Alignment:
Q  49 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttata-atacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacat 147  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||  | | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||    
T  17885364 tgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattgacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaattttttacat 17885463  T
Q  148 tcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccataccc 211  Q
    |  ||| | || |||||||||| ||||||| || |||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  17885464 ttgggacgggtatgggtatgggttcggggttggaacctatatacccgttacccgtcccataccc 17885527  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 51 - 218
Target Start/End: Original strand, 35074370 - 35074539
Alignment:
Q  51 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttca-acatt 148  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||   |||||    
T  35074370 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatt 35074469  T
Q  149 caggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatttt 218  Q
      ||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  35074470 tgggacgggtttgggtatgggttcgggttgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttt 35074539  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 45885968 - 45885787
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||| ||||  |||||||||||| |||| | |||||||| || | | | ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  45885968 tagacaaaatgattaagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaat 45885869  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttga 220  Q
    |||  |||||  ||| |  ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45885868 tttttacatttgggacggattttggtatgggttcggggtgggtacctatatacttgttacccgtcccatacccgtgttttga 45885787  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25783102 - 25782931
Alignment:
Q  47 attgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaaca 146  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||| | |||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||  ||    
T  25783102 attgatttagttgctcctttaaatattgatgatagtttttataacactgcaattatcaaacaaaataatatgagatattaacataaagtaattttctgca 25783003  T
Q  147 ttcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatttt 218  Q
    ||| ||| |  ||| |||||| | ||||||||||||||| |||| |  ||| ||||| ||||||||| ||||    
T  25783002 ttcgggacggattttggtatgagttcggggtgggtacctatatacccattatccgtctcatacccgtgtttt 25782931  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 227
Target Start/End: Original strand, 25905529 - 25905706
Alignment:
Q  51 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 149  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||  |||||     
T  25905529 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataattttttacattt 25905628  T
Q  150 aggagga-gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 227  Q
     ||| || ||||||||||| | ||||||| ||||||| | || | ||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  25905629 gggacgatgtttgggtatgagttcggggt-ggtacctatgtacccgttacccgtcccatacctgtgttttgagattggg 25905706  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 221
Target Start/End: Original strand, 37182153 - 37182346
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatatta 126  Q
    ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  37182153 tttaacatttgttagacacaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 37182252  T
Q  127 acataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaa 221  Q
    ||||||  |||||||  |||||  ||| | || |||||||||| || || || |||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||||    
T  37182253 acataagataattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttc-ggatgagtacctatatacccgctacccgtcccatacccgtgttttgaa 37182346  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 63 - 320
Target Start/End: Original strand, 24753088 - 24753342
Alignment:
Q  63 ctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttg 161  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | |||||    
T  24753088 ctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttg 24753187  T
Q  162 ggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaa-------acccaaacccaaacctaatcaaaat 254  Q
    ||||           ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||| || |||||       ||||| | ||||||| | ||||||     
T  24753188 ggta-----------tgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcgggaaaacccatacccatatccaaacccagtcaaaac 24753276  T
Q  255 gaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 320  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||| ||||||||| |||||    
T  24753277 ggagaaaatccgtcaaattgaatttggttcggacgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatg 24753342  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 98 - 223
Target Start/End: Original strand, 38152836 - 38152961
Alignment:
Q  98 attatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgtta 197  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | |||| |||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||    
T  38152836 attatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttaggtatgggttcggggtgggtacctatatagccgtta 38152935  T
Q  198 cccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
     |||| |||||||| | |||||||||    
T  38152936 tccgttccatacccatgttttgaaat 38152961  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 98 - 283
Target Start/End: Original strand, 41103605 - 41103792
Alignment:
Q  98 attatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgtta 197  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||| |||||||| |||||||  ||||| |||| | ||||  ||||||| ||||||||||||| | |||| | ||||    
T  41103605 attatcaaacaaaataacaagagatatcaacataaaataattttttacatttaggacgggtttatgtatgggttcggggtgggtacttatatacccgtta 41103704  T
Q  198 cccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 283  Q
     ||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||| ||||| ||| | |||||| |   |||| ||||||||| | ||||||||    
T  41103705 accgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaaacccatacccacacccagtcaaaacgggaaaaatccgtcaaatcggatttggtt 41103792  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 44794230 - 44794051
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggttttta-taatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||||||  || ||||| ||| |||||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  44794230 tagacaaaatgatttagttgatcatttaagtatcaatggtagtttttagtaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataat 44794131  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttg 219  Q
    |||  |||||  |||   ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||||||| |||||    
T  44794130 tttttacatttgggacaggtttgggtatgggttcggggtgggtacct-tatactcgttacccgtctcatacccgtgttttg 44794051  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 200
Target Start/End: Original strand, 37579130 - 37579313
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    |||||||||  ||||||| ||| ||||   |||||||||||| ||| ||||||||| |||| |  ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  37579130 aatatgctcactttaacatttgttagatggattgatttagttgctcatttaaatatcaatgataatttttataacatgacaattatcaaacaaaataaca 37579229  T
Q  117 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttaccc 200  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||  ||||   ||    ||||||||| || ||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  37579230 tggcatagcaacataaagtaattttctgcatttgagacagctttgggtataggttcggggtgggtacctatatacccgttaccc 37579313  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 44734583 - 44734376
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataac 115  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||||  | ||||||| ||  ||||| |||||| |||| | |||||||| || | ||| ||||||||| ||||||||    
T  44734583 aatatgctcgctttaatatttgttagacgtaatgatttaattgatccttcaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaataaaataac 44734484  T
Q  116 atggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtat 215  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| |  | || ||||||| ||||||||||||||| |||| |  ||||| ||||||||||||| |    
T  44734483 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacggatatgtgtatgggttcggggtgggtacctatatacccattaccggtcccatacccgtgt 44734384  T
Q  216 tttgaaat 223  Q
    ||||||||    
T  44734383 tttgaaat 44734376  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 45709065 - 45708887
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||| || |    
T  45709065 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtaatttttattaatatgacaattatcaaacaaaataatataacatatcaacataaagtatt 45708966  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttga 220  Q
    ||   |||||  ||| | |||| |||||| | ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  45708965 tt---acattttggacgggtttaggtatgagttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtccaatacccgtgttttga 45708887  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 38140008 - 38139807
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatatta 126  Q
    ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  38140008 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 38139909  T
Q  127 acataaattaa-ttttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattg 225  Q
    | ||||| ||| ||||  |||||   || | |||||| |||||| ||||||||||||| | ||||    ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  38139908 atataaaataatttttttacatttgagacgggtttggttatgggttcggggtgggtacttatatactcattacccgtcccatactcgtgttttgaaattg 38139809  T
Q  226 gg 227  Q
    ||    
T  38139808 gg 38139807  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 180
Target Start/End: Original strand, 23328500 - 23328641
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacat-aaattaat 138  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||| |  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||| ||| ||||    
T  23328500 tagaccgattgatttagttattcctttaaatatcaatgataatttttatagcacgacaattatcaaacaaaataacaagacatgtcaacataaaaataat 23328599  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtggg 180  Q
    ||||  ||||| ||| | |||||||||| || ||||||||||    
T  23328600 tttctccattcgggacgggtttgggtataggatcggggtggg 23328641  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39456157 - 39456034
Alignment:
Q  98 attatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgtta 197  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| | ||||  ||| | || || ||||||  ||||||||||||||| |||| | ||||    
T  39456157 attatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaattttta-catttgggacgggtatgagtatggt-tcggggtgggtacctatatacccgtta 39456060  T
Q  198 cccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    |||||||||||||| | |||||||||    
T  39456059 cccgtcccatacccatgttttgaaat 39456034  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 223
Target Start/End: Original strand, 10072429 - 10072540
Alignment:
Q  112 taacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccataccc 211  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| |  | |||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||    
T  10072429 taacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgttccataccc 10072528  T
Q  212 gtattttgaaat 223  Q
    || |||||||||    
T  10072529 gtgttttgaaat 10072540  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 44658631 - 44658501
Alignment:
Q  61 tcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtt 159  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||  |||||  | | | |||    
T  44658631 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaatatttttttacatttggtacgggtt 44658532  T
Q  160 tgggtatgggctcggggtgggtacctgtata 190  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||| ||||    
T  44658531 tgggtatgggttcgggataggtacctatata 44658501  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25980061 - 25979936
Alignment:
Q  98 attatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgtta 197  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||  |||||  | | |  |||||||||| | | ||||||||||| | |||||| ||||    
T  25980061 attatcaaacaaaataacatgacatttcaacataaaataattttttacatttggaaaggatttgggtatgagtttggggtgggtacatatatatccgtta 25979962  T
Q  198 cccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    |||||| |||||| || |||||||||    
T  25979961 cccgtctcatacctgtgttttgaaat 25979936  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 223
Target Start/End: Original strand, 43507402 - 43507519
Alignment:
Q  106 acaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtccc 205  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| |||| | |||||||| || |||||||| ||| |||| | |||||||||| |    
T  43507402 acaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgagtataggtatgggttcagggtgggtgcctatatacccgttacccgtctc 43507501  T
Q  206 atacccgtattttgaaat 223  Q
    |||||| | |||||||||    
T  43507502 atacccatgttttgaaat 43507519  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 320
Target Start/End: Original strand, 16811644 - 16811895
Alignment:
Q  64 tttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgg 162  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| || | | | ||||||||||||||||||||   |||| |||||||| |||||||  |||||  ||| |  |||||    
T  16811644 tttaaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataatatatcaacataaagtaattttttacatttgggacggctttgg 16811743  T
Q  163 gtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaacccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaa 262  Q
    ||||||| || ||||||||| || |||| |  ||| ||||| ||||||||| |||||| || ||| |    ||| ||||||  | |||||||| ||||||    
T  16811744 gtatgggttc-gggtgggtatctatatacccattatccgtctcatacccgtgttttgagatcgggga----aaatccaaactcagtcaaaatggagaaaa 16811838  T
Q  263 cccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 320  Q
    || |||||||||| || |||| || |||||||| ||  |||| ||||||||| |||||    
T  16811839 cctgtcaaattgagttaggttcgggcgagtaaccacgagtat-ggttttgttgccatg 16811895  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 26004746 - 26004675
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat 88  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  26004746 aatatgctcattttaacatttgttagaccgattgatttagtcgctcctttaaatatcaatggtagtttttat 26004675  T

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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 37196213 - 37196058
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatatta 126  Q
    ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  || |||| |||| |||||| |||||||| || | |||  |||||||||||||||||||  ||||| |    
T  37196213 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttatatatcaatggtagtttttattaacatgacagttatcaaacaaaataacataacatatca 37196114  T
Q  127 acataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggta 182  Q
    ||||||| |||||||  ||||| | || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  37196113 acataaagtaattttttacatttatgacgggtttgggtatggattcggggtgggta 37196058  T

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Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 223
Target Start/End: Original strand, 39316906 - 39317069
Alignment:
Q  61 tcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtt 159  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||   || |  |     
T  39316906 tccttcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgagacggata 39317005  T
Q  160 tgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    |||||||| | || || ||| ||| | |||| | | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  39317006 tgggtatgagttcaggatggatacatatatacccgctacccgtcccatacccgtgttttgaaat 39317069  T

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Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Original strand, 32546200 - 32546273
Alignment:
Q  157 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa 230  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||  | ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  32546200 gtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccccgttacccgttccgtacccgtattttgaaatcgggaaa 32546273  T

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Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 5916280 - 5916171
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 127  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||| | || ||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||  | |||||||||||||||||    ||||||| |    
T  5916280 tttaacatttgttagaccgattgattgatttactcctttaaatatcaatggtagttttgataacacagcaattatcaaacaaaataa----gcatattga 5916185  T
Q  128 cataaattaatttt 141  Q
    |||||| |||||||    
T  5916184 cataaaataatttt 5916171  T

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Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 41741675 - 41741469
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataac 115  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||  | ||||||| ||  ||| |||||||| |||||| |||||||| || | ||  ||||||||||||||||||    
T  41741675 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccgttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 41741576  T
Q  116 atggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtat 215  Q
    ||| ||||| |  ||||| |||||||  |||||  ||| | || ||  |||||| || ||||||||||||  ||| | |||| ||||| ||||||||| |    
T  41741575 atgacatatcagtataaagtaattttttacatttgggacgggtatgaatatgggttc-gggtgggtacctacatacccgttatccgtctcatacccgtgt 41741477  T
Q  216 tttgaaat 223  Q
    ||||||||    
T  41741476 tttgaaat 41741469  T

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Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 44986113 - 44986007
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggttttta-taatacgactattatcaaacaaaataacatggcatatta 126  Q
    ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  44986113 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat-acatatca 44986015  T
Q  127 acataaat 134  Q
    ||||||||    
T  44986014 acataaat 44986007  T

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Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 223
Target Start/End: Original strand, 18683982 - 18684048
Alignment:
Q  157 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||| | |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18683982 gtttgggtatgggttcgaggtggatacatatatccctgttacccgtcccgtacccgtattttgaaat 18684048  T

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Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 223
Target Start/End: Original strand, 3157091 - 3157157
Alignment:
Q  157 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||| |||  | |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  3157091 gtttgggtataggttcggtgtgggtacctatatccccgttatccgtcccatacccatattttgaaat 3157157  T

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Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 240
Target Start/End: Original strand, 22973396 - 22973481
Alignment:
Q  157 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat--tgggaaacccaaaccca 240  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||   |||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  22973396 gtttgggtatgggttcgaggtgggtacagatatccccattacccgtcccgtacccgtattttgaaatcgtggaaaacccaaaccca 22973481  T

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Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23475361 - 23475226
Alignment:
Q  144 acattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaacccaaacccaaac 243  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||| |||  |||||||| | |||  |  |||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||    |||||||||    
T  23475361 acattcgggacgggtttgggtatgggttcgaagtgggtacatatatccccattacccatcccaaacccgtgttttgaaatcgggaaa----aacccaaac 23475266  T
Q  244 ctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 283  Q
    | | |||||  |  |||||||||||||||||| |||||||    
T  23475265 ccagtcaaagcggggaaaacccgtcaaattgagtttggtt 23475226  T

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Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 239
Target Start/End: Original strand, 4101522 - 4101634
Alignment:
Q  129 ataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat--tgg 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||| || || ||||||| | |||  |||| |||| |||  |||| || |||||||||  |||    
T  4101522 ataaattgattttcaacattcaggacgggttagggtatgggttcaggatgggtacatatatccctgtaacccatcctgtacctgtgttttgaaatcatgg 4101621  T
Q  227 gaaacccaaaccc 239  Q
     ||||||||||||    
T  4101622 aaaacccaaaccc 4101634  T

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Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 44658471 - 44658418
Alignment:
Q  230 acccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 283  Q
    ||||| ||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  44658471 acccatacccaaacccagtcaaaacgaggaaaacccgtcaaattggatttggtt 44658418  T

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Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 160 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 10995916 - 10995837
Alignment:
Q  160 tgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaac 237  Q
    |||||||||| ||||||||||||  | ||   |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  ||||||||||    
T  10995916 tgggtatgggttcggggtgggtatatataaccctgttacccgtcccatacccgtgtcttgaaatcggggaaaacccaaac 10995837  T

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Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 238
Target Start/End: Original strand, 31426016 - 31426099
Alignment:
Q  157 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaacc 238  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||| | |||  | |||||||||| |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||    
T  31426016 gtttgggtatgcgttcggggtggatacatatatccccgttacccgtctcatacccgtatttttaaatcggggaaaacccaaacc 31426099  T

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Target: chr6 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 35)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24603081 - 24602856
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  24603081 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgtcaattatcaaacaaaataaca 24602982  T
Q  117 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 216  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||||  || | ||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||| | ||    
T  24602981 tggcacatcaacataaagtaattttctacattcgtgatgggtttgggtatgggttcggggtgggtatctatatacctgttacccgtcacatacccatgtt 24602882  T
Q  217 ttgaaat-tggg-aaacccaaaccca 240  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||    
T  24602881 ttgaaatctgggaaaacccaaaccca 24602856  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 247
Target Start/End: Original strand, 27738666 - 27738867
Alignment:
Q  49 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacat 147  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||  ||||    
T  27738666 tgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcatacaaaataacataacatatcaacataaagtaattttttacat 27738765  T
Q  148 tcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaacccaaacct 245  Q
    |  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||| ||||| ||||    
T  27738766 ttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatatctgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaaacccatacccatacct 27738865  T
Q  246 aa 247  Q
    ||    
T  27738866 aa 27738867  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 275
Target Start/End: Original strand, 14505949 - 14506203
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||| |||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  14505949 aatatgctcactttaacatttgttagactgattgatttagttgctcctttcaatatcaatgttagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacg 14506048  T
Q  117 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 216  Q
    || ||||| |||| ||| || |||||  ||||  ||| | ||||  ||||||| |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||| || ||    
T  14506049 tgacatatcaacacaaagtagttttctgcatttgggacgggtttaagtatgggttcggggtgggtacctaaatacttgttacccgtcccatacctgtgtt 14506148  T
Q  217 ttgaaattgggaaacccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattga 275  Q
    ||||||| ||| |    ||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  14506149 ttgaaatcgggga----aaacccaaacccagtcaaaatggggaaaacccgtcaaattga 14506203  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 230
Target Start/End: Original strand, 11762308 - 11762521
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    ||||||||  ||||||||| || |||| | | | |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||    
T  11762308 aatatgcttattttaacaaatgttagatccaataatttagttgctcctataaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatataacaaaataaca 11762407  T
Q  117 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 216  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||| | ||||||||||| | |||||||||  |||| |||| | |||||||||||||||||| | ||    
T  11762408 tggcatatcaacataaagtaattttctacatttgggatgggtttgggtatgagttcggggtggacacctatatacccgttacccgtcccatacccttgtt 11762507  T
Q  217 ttgaaattgggaaa 230  Q
    | ||||| ||||||    
T  11762508 tagaaatcgggaaa 11762521  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 40 - 320
Target Start/End: Original strand, 12141270 - 12141559
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| ||||    
T  12141270 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgttagtttttattaagatgacaattatcaaacaaaataacataacgtatcaacataaaataat 12141369  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaaccca-- 234  Q
    |||  |||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | || |||||||||||| |||| |||||| ||||||  |||||||      
T  12141370 tttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgtcacccgtcccatatccgtgttttgagattggggaaaacccata 12141469  T
Q  235 ----aacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 320  Q
         ||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| | | |||| ||||||||| |||||    
T  12141470 cccgtacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgaatttggttcgggcgggtaaccataggtatgggttttgttgccatg 12141559  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 40 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12678296 - 12678113
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaatt 139  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  12678296 tagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgataatttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaatataaaataatt 12678197  T
Q  140 ttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    |||   |||| ||| | ||||||||||||| || |||||||||||| |||| |  |||||||||||||||| || | |||||||    
T  12678196 ttctcaattcgggacgggtttgggtatgggttcagggtgggtacctatataccctttacccgtcccatacctgtgtcttgaaat 12678113  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Original strand, 2367199 - 2367392
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatatta 126  Q
    ||||||| ||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  |||||      
T  2367199 tttaacatttgttagacaaaatgatttagtttatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcc 2367298  T
Q  127 acataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttga 220  Q
    ||||||| |||||||   ||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  2367299 acataaagtaattttttccatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttga 2367392  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 40 - 320
Target Start/End: Original strand, 32853729 - 32854018
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||| || | | | ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  32853729 tagacaaaatgatttagttgatcatttaaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaat 32853828  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaa 236  Q
    |||  |||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||| || |||  ||||||| |    
T  32853829 tttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaacccata 32853928  T
Q  237 c------ccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 320  Q
    |      ||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| || ||  |||| ||  |||| ||||||||| |||||    
T  32853929 cccataaccaaacccagtcaaaacggagaaaacccgtcaaattgggtttggttcggtcggataaccacgggtatgggttttgttgccatg 32854018  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 7394101 - 7393822
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 127  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||||| |||   ||||||||||||||||| |||  |||  ||    
T  7394101 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcctttaaatatcaatgttagtttttataacacggtaattatcaaacaaaataatatgatataccaa 7394002  T
Q  128 cataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 227  Q
    |||||| ||| |||   ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| |  ||| ||||| | ||| ||| ||||||||| |||    
T  7394001 cataaaataaatttatgcattcaggatgagtttgagtatgggttcggggtggatacctatatacccattatccgtctcttactcgtgttttgaaatcggg 7393902  T
Q  228 aaacccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggtttt 311  Q
     |    ||| ||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||| ||||||    
T  7393901 ga----aaatccaaacccaatcaaaatggggaaaatccgtcaaattggatttgattcggacgtgtaaccaaatgtatgggtttt 7393822  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 40 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10142721 - 10142427
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  10142721 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataat 10142622  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--------aaa 230  Q
    |||  |||||  |||   ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||| |||||| || |||        | |    
T  10142621 tttttacatttgggacaggtttgggtatgagttcggggtgggtacctatatacccgttacctgtcccatacccgttttttgagatcggggaaaacccata 10142522  T
Q  231 cccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatgactac 325  Q
    |||| ||||||||| | |||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |  ||  |||| ||| |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  10142521 cccatacccaaacccagtcaaaacgaggaaaacccgccaaattgagtttggttcgagcggataaccacaagtatgggttttgttgccatgcctac 10142427  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 14032419 - 14032579
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  14032419 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagtttttataacacaacaattatcaaacaaaataaca 14032518  T
Q  117 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggt 177  Q
    || ||||| |||||||| |||||||   ||||  ||| | ||||||||||||| |||||||    
T  14032519 tgacatatcaacataaagtaattttatgcatttgggacgggtttgggtatgggttcggggt 14032579  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 51 - 295
Target Start/End: Original strand, 24225594 - 24225853
Alignment:
Q  51 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 149  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||  |||||     
T  24225594 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataattttttacattt 24225693  T
Q  150 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--------------aaacccaa 235  Q
     ||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || |||              | ||||||    
T  24225694 gggacgggtttgggcatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatatccgtgttttgagatcggggaaaatccatacccatacccaa 24225793  T
Q  236 acccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaac 295  Q
    ||||||||| |||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24225794 acccaaacccaatcaaaacggggaaaacctgtcaaattgaatttggttcggacgggtaac 24225853  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 63 - 320
Target Start/End: Original strand, 27534592 - 27534858
Alignment:
Q  63 ctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttg 161  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||  |||||  ||| | |||||    
T  27534592 ctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttg 27534691  T
Q  162 ggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--------aaacccaaacccaaacctaatcaaaa 253  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||| || || |||        | ||||| ||||||||| ||||||||    
T  27534692 ggtatggattcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaactcatacccatacccaaacccaatcaaaa 27534791  T
Q  254 tgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 320  Q
     |  |||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| ||  |||| ||||||||| |||||    
T  27534792 cggggaaaacccgtcaaattgagtttggttcggacggttaaccacgggtatgggttttgttgccatg 27534858  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5863586 - 5863402
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||  ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || |    
T  5863586 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaatatt 5863487  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    |||  |||||  ||| | ||||||||||||| ||| |||||||| || |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5863486 tttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcgaggtgggtatctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaat 5863402  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 88 - 223
Target Start/End: Original strand, 12309506 - 12309641
Alignment:
Q  88 taatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgt 187  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | |||||||||| || ||||||||||||| | |    
T  12309506 taatatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatcggttcggggtgggtacatat 12309605  T
Q  188 atatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12309606 atacctgttacccgttccatacccgtgttttgaaat 12309641  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 14411058 - 14410959
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14411058 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaatgatggtttttataacacgacaattatcaaacaaaataaca 14410959  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 98 - 274
Target Start/End: Original strand, 32053032 - 32053210
Alignment:
Q  98 attatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgtta 197  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||  |||||  ||| | ||||||||||||| | ||||||||||| | |||| | ||||    
T  32053032 attatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtatttttttacattttggacgggtttgggtatgggtttggggtgggtacatatatacccgtta 32053131  T
Q  198 cccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattg 274  Q
    ||||||||||| || | ||||||||| |||  ||||||| ||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||    
T  32053132 cccgtcccatatccatgttttgaaatcggggaaaacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattg 32053210  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3484115 - 3483952
Alignment:
Q  51 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 149  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||| || ||||  |||||     
T  3484115 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaagatgacaattatgaaacaaaataacataacatatccacataaagtagttttttacattt 3484016  T
Q  150 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgt 213  Q
     ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||    
T  3484015 gggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccatcccatacccgt 3483952  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 10188276 - 10187994
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| |||||| |||||||||||||   |||| |||||||| ||||    
T  10188276 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcgaacaaaataacataatatatcaacataaaataat 10188177  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--------aaa 230  Q
    |||  |||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||       |||||||||||||||||| |||||| || |||        | |    
T  10188176 tttttacatttgggatgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctata-------tacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaacccata 10188084  T
Q  231 cccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 320  Q
    |||| ||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||  ||||||| || || ||||| ||  |||| ||||||||| |||||    
T  10188083 cccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatg 10187994  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Original strand, 30816131 - 30816319
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 127  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||| | ||||||||||| | |||||| |||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||  ||||| ||    
T  30816131 tttaacatttgttagaccgattgatttaggtgctcctttaaatgtcaatggtagtttttataacacggcaattatccaacaaaataacatcacatatcaa 30816230  T
Q  128 cataaatta---attttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgt 213  Q
    |||||| ||    ||||   ||||| ||| | |||||| |||||| ||||||||||| ||| |||| |  |||||| ||||||||||||    
T  30816231 cataaagtagtttttttttgcattcgggacgggtttggatatgggttcggggtgggttcctatatacccattacccatcccatacccgt 30816319  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 14410950 - 14410807
Alignment:
Q  147 ttcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat-tgggaaacccaaacccaaacct 245  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||     |||| |||||||    
T  14410950 ttcaggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatctggga-----aaactcaaacct 14410856  T
Q  246 aatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaac 295  Q
    | |||||| |  ||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||||    
T  14410855 agtcaaaacg-ggaaaatccgtcaaattagatttggtttggacgggtaac 14410807  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 129 - 247
Target Start/End: Original strand, 13769047 - 13769167
Alignment:
Q  129 ataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg- 227  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| | |||||| |||||| || |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | ||||||| | |||     
T  13769047 ataaattgattttctacattcaggacgggtttggatatgggttctgggtgggtacctatatgtccgttacccgtcccatacccatgttttgaagtcgggg 13769146  T
Q  228 -aaacccaaacccaaacctaa 247  Q
     ||||| ||||||| ||||||    
T  13769147 aaaaccgaaacccatacctaa 13769167  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 223
Target Start/End: Original strand, 32532498 - 32532609
Alignment:
Q  112 taacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccataccc 211  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | || || ||||||| ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||    
T  32532498 taacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccattacccgtcccataccc 32532597  T
Q  212 gtattttgaaat 223  Q
    || |||||||||    
T  32532598 gtgttttgaaat 32532609  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 118
Target Start/End: Original strand, 14245133 - 14245211
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatg 118  Q
    |||||| | |||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  14245133 tagaccgaatgatttagtcgctcctttaaatattaatggtagtttttataacacgacaattttcaaacaaaataacatg 14245211  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 213
Target Start/End: Original strand, 14254864 - 14255017
Alignment:
Q  60 ctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtt 159  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||| ||  | | | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |   ||||  ||| || ||    
T  14254864 ctcctttaaatatcaatgatagtttttataacacatcaaatttcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagttattatttgcatttgggacgaatt 14254963  T
Q  160 tgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgt 213  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||    
T  14254964 tgggtatgggttcatggtgggtacctatatttccgttacacgtcccatacccgt 14255017  T

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Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 283
Target Start/End: Original strand, 9442441 - 9442566
Alignment:
Q  165 atgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa--cccaaacccaaacctaa-----tcaaaatgaa 257  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||| ||| ||     |||||| |      
T  9442441 atgggttcggagtgggtacctctatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgggaaaatcccatacccatacccaaaccagtcaaaacggg 9442540  T
Q  258 gaaaacccgtcaaattgaatttggtt 283  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  9442541 gaaaacccgtcaaattgagtttggtt 9442566  T

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Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28079780 - 28079696
Alignment:
Q  158 tttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaaccca 240  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||  | |||||||||||| ||||| | ||||||||| |||  |||||||||||||    
T  28079780 tttgggtatgggttcggggtgggtacctatatccccgttacccgtcccgtacccatgttttgaaatcggggaaaacccaaaccca 28079696  T

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Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29199972 - 29199884
Alignment:
Q  155 gagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaacccaa 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||| | |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||    
T  29199972 gagtttgggtatgggttcggggtagatacatatatccctgttacccgtcccgtacccgtattttgaaatcggggaaaatccaaacccaa 29199884  T

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Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 320
Target Start/End: Original strand, 31496518 - 31496608
Alignment:
Q  230 acccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 320  Q
    ||||| ||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||  |||| ||||||||| |||||    
T  31496518 acccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgagtttggtttggacgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatg 31496608  T

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Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 320
Target Start/End: Original strand, 31501904 - 31501994
Alignment:
Q  230 acccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 320  Q
    ||||| ||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||  |||| ||||||||| |||||    
T  31501904 acccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgagtttggtttggacgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatg 31501994  T

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Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 256604 - 256511
Alignment:
Q  130 taaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||  |  ||||||||| | ||||| | |||||||||    
T  256604 taaattgattttctacatttaggaggggtttgggtatgggtttggggtgggtacctatatgcccattacccgtctcgtacccatgttttgaaat 256511  T

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Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 158 - 223
Target Start/End: Original strand, 20349068 - 20349133
Alignment:
Q  158 tttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||  | ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20349068 tttgggtatgagttcggggtgggtacctatatccccgttactcgtcccatacccgtgttttgaaat 20349133  T

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Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 237
Target Start/End: Original strand, 18908896 - 18908978
Alignment:
Q  157 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaac 237  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||| | |||   |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  18908896 gtttgggtatgagtttggggtgggtacatatatccttgttacccgtcccatatccgtattttgaaatcggggaaaacccaaac 18908978  T

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Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 227
Target Start/End: Original strand, 19366990 - 19367082
Alignment:
Q  135 taattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 227  Q
    |||||||| ||||||| || | ||||||||||||| | | |||||| | || |||   ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  19366990 taattttctacattcaagaagggtttgggtatgggtttgaggtgggcaactatattcatgttacccgtctcatacccgtgttttaaaattggg 19367082  T

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Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 194 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 20611030 - 20610975
Alignment:
Q  194 gttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaacccaaacctaa 247  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  || |||||||||| ||||||    
T  20611030 gttacccgtcccctacccgtattttgaaatcggggaaaccccaaacccatacctaa 20610975  T

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Target: chr3 (Bit Score: 101; Significance: 8e-50; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Original strand, 53631767 - 53632053
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    |||||||||  |||| || ||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  53631767 aatatgctcactttatcatttgttagaccgatcgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttataacacggcaattatcaaacaaaataaca 53631866  T
Q  117 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 216  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| | |||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||| ||| ||    
T  53631867 tggcatatcaacataaagtaattttctagattcgggacgagtttgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtctcatacacgtgtt 53631966  T
Q  217 ttgaaatt--gggaaacccaaacccaaacct------aatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaac 295  Q
    || |||||  || |||| |||||||| ||||      | |||||| || |||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  53631967 ttaaaatttgggaaaactcaaacccatacctatacccattcaaaacgaggaaaacccgtcaaattaagtttggttcgaacgagtaac 53632053  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 40 - 273
Target Start/End: Original strand, 830895 - 831129
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaatt 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  830895 tagaccaattgatttagtttctccttaaaatatcaatgatagtttttataagacggcaattatcaaacaaaataacatagcatattaacataaagtaatt 830994  T
Q  140 ttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaa--acccaaac 237  Q
    |||  ||||| ||| || |||||||||||| || |||||||||||  ||||   |||| ||||| ||||||||| ||||||||  |||||  ||||| ||    
T  830995 ttctgcattcgggacgaatttgggtatgggttcagggtgggtacc-atatactcgttatccgtctcatacccgtgttttgaaaacgggaaatacccatac 831093  T
Q  238 ccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaatt 273  Q
    ||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  831094 ccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaatt 831129  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22536067 - 22535856
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataac 115  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||    
T  22536067 aatatgctcactttaacatttgttagacagaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 22535968  T
Q  116 atggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtat 215  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||  ||||| |||| |||| || ||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||| |    
T  22535967 atgacatatcaacataaaataattttttacatttaggacgagtatgtgtatgggttcggggtgggtgcctgtatacccgttacccgtcccatatccgtgt 22535868  T
Q  216 tttgaaattggg 227  Q
    ||||||||||||    
T  22535867 tttgaaattggg 22535856  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 237
Target Start/End: Original strand, 42758237 - 42758459
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||  |||||||| || ||||||||||||| |||| | |||||||||| | | | |||||||||||||||||||    
T  42758237 aatacgctcattttaacatttgttagaccggttgatttaattgctcctttaaatatcaatgatagtttttataacatggcaattatcaaacaaaataaca 42758336  T
Q  117 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 216  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||  | ||| ||| | ||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  42758337 tggcatatcaacataaagtaattttcttcgttcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgcatacctatatacctgttacccgtcccatacctgtgtt 42758436  T
Q  217 ttgaaat--tgggaaacccaaac 237  Q
    |||||||   |||||||||||||    
T  42758437 ttgaaatcgggggaaacccaaac 42758459  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 31127020 - 31126826
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31127020 aatatgctcactttaacatttgttagactgattgatttagttgctcctttcaatatcaatgttagtttttataatacgacaattatcaaacaaaataaca 31126921  T
Q  117 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccataccc 211  Q
    |||||||| |||| ||  || |||||  ||||  ||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  31126920 tggcatatcaacacaatgtagttttctgcatttgggacgagtttgggtatgagttcggggtggatacctatatacatgttacccgtcccataccc 31126826  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 4016258 - 4016044
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 127  Q
    ||||||| ||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||  || || |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  4016258 tttaacatttgttagaccgatttatttagttgctcctttaaatatcgatagtagtttttataacacatcaattatcaaacaaaataacatgacatatcaa 4016159  T
Q  128 cataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 227  Q
    |||||  || |||||  ||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| | |||| ||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  4016158 cataaggtagttttctgcattcgggacgagtttgggtatgggttcggagtgggtacctatatacccgttatccgtcccatacccatgttttgaaatcggg 4016059  T
Q  228 --aaacccaaaccca 240  Q
      |||||||||||||    
T  4016058 gaaaacccaaaccca 4016044  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 4557519 - 4557305
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 127  Q
    ||||||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  4557519 tttaacatttgttagaccgatttatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttataacacatcaattatcaaacaaaataacatgacatatcaa 4557420  T
Q  128 cataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 227  Q
    |||||| ||||||||  ||||| |||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| | ||||||||  |||    
T  4557419 cataaagtaattttctgcattcgggatagatttgggtatgggttcggggtgggtacctatatactcgttacccgtcccatacccatgttttgaaaacggg 4557320  T
Q  228 --aaacccaaaccca 240  Q
      |||||||||||||    
T  4557319 gaaaacccaaaccca 4557305  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 34119521 - 34119793
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| |||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |    
T  34119521 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcatttcaatatcaatgttagtttttataacacgacaattatcaaacaaaata--a 34119618  T
Q  117 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 216  Q
    |||||||| |||| ||| || |||||  ||||  ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||    
T  34119619 tggcatatcaacacaaagtagttttctgcatttgggacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttatccgtctcatacccgtgtt 34119718  T
Q  217 ttgaaattggg--------aaacccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 283  Q
    || |||| |||        |||| || ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||    
T  34119719 ttaaaatcgggaaaaactcaaactcatacccaaacccaatcaaaatggggaaaacccgtcaaattagatttggtt 34119793  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 223
Target Start/End: Original strand, 54317017 - 54317213
Alignment:
Q  27 ttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatatta 126  Q
    |||||||| ||| |||||   ||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54317017 ttttaacatttgttagacatgttgatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttataacacggcaattatcaaacaaaataacatggcatatca 54317116  T
Q  127 acataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    ||||||| ||||||||  | ||  ||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||  || |||||||||    
T  54317117 acataaagtaattttcttcgtttgggacgggtttgggaatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcctatacttgtgttttgaaat 54317213  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Original strand, 19111609 - 19111810
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 127  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  19111609 tttaacatttgttataccaattgatttagttactcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgaaaattatcaaacaaaataacatgacata-taa 19111707  T
Q  128 cataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 227  Q
    |||||| |||||||| |||||  | | | ||||||| ||||| |  |||||||||| | |||| | |||| || |||| ||||||| ||||||||| |||    
T  19111708 cataaagtaattttctacattttgtacgggtttgggcatgggtttagggtgggtacttatatacccgttatccatcccgtacccgtgttttgaaatcggg 19111807  T
Q  228 aaa 230  Q
    |||    
T  19111808 aaa 19111810  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 51 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 39655465 - 39655187
Alignment:
Q  51 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 149  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||  |||||     
T  39655465 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacattt 39655366  T
Q  150 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--------aaacccaaacccaa 241  Q
      || | ||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||        | ||||| ||||||    
T  39655365 gagacgggtttgggtatgggtttggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaacccatacccatacccaa 39655266  T
Q  242 acctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 320  Q
    ||| |||||||| |  |||||||||||||||||  ||||||| || || ||||| ||  |||| ||||||||| |||||    
T  39655265 acccaatcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatg 39655187  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 49 - 295
Target Start/End: Original strand, 44639168 - 44639423
Alignment:
Q  49 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacat 147  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||  ||||    
T  44639168 tgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataattttttacat 44639267  T
Q  148 tcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat-tgggaa-------acccaaaccc 239  Q
    |  | | | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||       ||||| ||||    
T  44639268 ttggaacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatatgggaaaacccatacccataccc 44639367  T
Q  240 aaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaac 295  Q
    ||||| | ||||||||  ||||||| |||||||||  ||| ||| ||||| |||||    
T  44639368 aaacccagtcaaaatggggaaaaccagtcaaattgggtttcgttcggacgggtaac 44639423  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 359 - 489
Target Start/End: Original strand, 26461477 - 26461607
Alignment:
Q  359 atcaaaacacaactaagatcctaattttcctccataacctacgccttctctctcattattcattaccaccattac--acaaaacaacacaaactcattcg 456  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |   |||||||||||||| || || ||    
T  26461477 atcaaaacacaattaagatcctaattttgctccataacttacgccttctctctcattattcattaccaccaccattgacaaaacaacacaa-ctgat-cg 26461574  T
Q  457 ttacaacgttgtctctctcatttcacaaacaca 489  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  26461575 ttacaacgttgcctctctcatttctcaaacaca 26461607  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 40 - 220
Target Start/End: Original strand, 44172511 - 44172692
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| | |||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  44172511 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcagtggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaat 44172610  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttga 220  Q
    |||  |||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  44172611 tttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttga 44172692  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 40 - 220
Target Start/End: Original strand, 44179211 - 44179392
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| | |||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  44179211 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcagtggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaat 44179310  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttga 220  Q
    |||  |||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  44179311 tttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttga 44179392  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44106986 - 44106807
Alignment:
Q  49 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacat 147  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||  ||||    
T  44106986 tgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatattaacataaagtaattttttacat 44106887  T
Q  148 tcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 227  Q
    |  ||| | ||||| ||||||| ||||||| | ||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||    
T  44106886 ttgggacgggtttgagtatgggttcggggtagatacctatatatccgttacgcgtcccatacccgtgttttaagattggg 44106807  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 10823896 - 10823616
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  10823896 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaat 10823797  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattg--ggaaacccaaa 236  Q
    |||  |||||  ||||  ||||||||||||| ||||   |||||| | |||| | |||| |  || ||||||||| |||||| || |  | ||||||| |    
T  10823796 tttttacatttgggagaggtttgggtatgggttcgg---gggtacttatatacccgttatcaatctcatacccgtgttttgagatcggagaaaacccata 10823700  T
Q  237 cccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 320  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| || || ||||| ||  ||||  |||||||| |||||    
T  10823699 cccaaacctagtcaaaatggaaaaaactcgtcaaattgaatttggtttgggcgggtaacgacgggtatgagttttgttgccatg 10823616  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 49 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 48391010 - 48390836
Alignment:
Q  49 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacatt 148  Q
    ||||||||||  || ||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  || ||    
T  48391010 tgatttagttgatcttttaaatatcaatggtagtttttttaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaattttttacgtt 48390911  T
Q  149 caggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    | ||| | || |||||||||| || || ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48390910 cgggacgggtatgggtatgggttcaggatgggtacctatattcccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaat 48390836  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 326
Target Start/End: Original strand, 39728556 - 39728851
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||||||  || ||||||||| |||| | |||||||| || |  || ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  39728556 tagacaaaatgatttagttaatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacagaacaattatcaaacaaaataacattacatatcaacataaagtaat 39728655  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattg-ggaa-------a 230  Q
    |||  |||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| | ||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||       |    
T  39728656 tttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccgttacccatcccatacccgtattttgagatcgaggaaaacctata 39728755  T
Q  231 cccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatgactacc 326  Q
    | || ||||||||| | |||||| |  ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  |||| ||||||||| ||||| |||||    
T  39728756 ctcatacccaaacccagtcaaaacggggaaaatccgtcaaattggatttggttcggacgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgcctacc 39728851  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 17146353 - 17146077
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  17146353 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaat 17146254  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgg--gaaacccaaa 236  Q
    |||  |||||  ||| | ||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||| | |||||| |||||   ||||||| |    
T  17146253 tttttacatttgggaagggtttgtgtatgggttcggggtggatacctatataactgttacccgttccatacccatgttttgagattggaaaaaacccata 17146154  T
Q  237 cccaaacctaa---tcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggtttt 311  Q
    |||| ||| ||   |||||| |  | ||||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||| ||| ||||||    
T  17146153 cccatacccaaatgtcaaaacg-gggaaacccgtcaaattggatttggtttggacgggtgaccacatatatgggtttt 17146077  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 230
Target Start/End: Original strand, 52198039 - 52198231
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataa-catggcatattaacataaattaa 137  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| |||    
T  52198039 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataaacatagcatatcaacgtaaagtaa 52198138  T
Q  138 ttttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa 230  Q
    ||||  |||||  | | | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| || |||||| || ||||||    
T  52198139 ttttttacatttggaacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacctgtgttttgagatcgggaaa 52198231  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 320
Target Start/End: Original strand, 52572494 - 52572783
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||||||  | |||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  52572494 tagacaaaatgatttagttgatactttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatattaacataaagtaat 52572593  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattg-ggaa-------a 230  Q
    |||  |||||  ||| | | ||| ||||||  ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||| || | ||||       |    
T  52572594 tttttacatttgggacgggcttgagtatggattcggggtgggtccctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcgaggaaaactcata 52572693  T
Q  231 cccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 320  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||| || ||  |||| ||  |||| ||||||||| |||||    
T  52572694 cccatacccaaacccagtcaaaatggggaaaacctgtcaaattgagtttggttcgggcggataaccacgggtatgggttttgttgccatg 52572783  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 230
Target Start/End: Original strand, 29842170 - 29842384
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataac 115  Q
    |||||||||  || |||| ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||    
T  29842170 aatatgctcacttcaacatttgttagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 29842269  T
Q  116 atggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtat 215  Q
    ||| || || |||||||| |||||||  |||||   || | || || ||||||| ||||||||||||||| |||  | |||||| ||||||||||||| |    
T  29842270 atgacaaatcaacataaagtaattttttacatttgagacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatattcccgttaccagtcccatacccgtgt 29842369  T
Q  216 tttgaaattgggaaa 230  Q
    ||| |||| ||||||    
T  29842370 tttaaaatcgggaaa 29842384  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 51 - 320
Target Start/End: Original strand, 29284232 - 29284510
Alignment:
Q  51 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 149  Q
    ||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||  ||||      
T  29284232 atttagttgatcttttaaatattaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacatct 29284331  T
Q  150 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaa--------acccaaacccaa 241  Q
     ||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||| || || |||||        ||||| ||||||    
T  29284332 gggacgggtttgggtatgggttcgggctgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcgggaaaaacccatacccatacccaa 29284431  T
Q  242 acctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 320  Q
    ||| | |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| || || ||||| ||  ||||  |||||||| |||||    
T  29284432 acccagtcaaaacggagaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgagttttgttgccatg 29284510  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 51 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 44953627 - 44953431
Alignment:
Q  51 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 149  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||  |||||     
T  44953627 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacattt 44953528  T
Q  150 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaacccaaacc 244  Q
     ||| | ||||| ||||| | |||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||| || |||  ||||||| |||||||||    
T  44953527 gggacgggtttgagtatgagttcggggtgagtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaacccatacccaaacc 44953431  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 240
Target Start/End: Original strand, 49025566 - 49025768
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || |  || ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| ||||    
T  49025566 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacataacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacacaaagtaat 49025665  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaa 236  Q
    |||  |||||  ||| | ||||||||||||| || || || |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||  |||||||||    
T  49025666 tttttacatttgggacgggtttgggtatgggttc-ggatgtgtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaacccaaa 49025764  T
Q  237 ccca 240  Q
    ||||    
T  49025765 ccca 49025768  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 51 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 7469970 - 7469685
Alignment:
Q  51 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 149  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||| || | ||  |||||     
T  7469970 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaagatgacaattatcaaacaaaataacataacatatccacataaagtagtgttttacattt 7469871  T
Q  150 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat-tgggaa-------acccaaacccaa 241  Q
     ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||| || ||  |||||       ||||| ||||||    
T  7469870 gggacgggtttgtgtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcagggaaaacccatacccatacccaa 7469771  T
Q  242 acctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatgactacct 327  Q
    ||| | |||||| |  |||||||||||||||||  ||||||| || || ||||| ||  |||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  7469770 acccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgcctacct 7469685  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 179
Target Start/End: Original strand, 30682695 - 30682846
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 127  Q
    ||||||| ||| |||| | | ||||||| || ||||||||||||| |||| | |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  30682695 tttaacatttgttagaacgaatgatttaattgctcctttaaatatcaatgatagtttttataacatgaccattatcaaacaaaataacatgacatatcaa 30682794  T
Q  128 cataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgg 179  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||| |||||    
T  30682795 cataaagtaattttctacattcaggacgggtttgagtataggttcgaggtgg 30682846  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 51 - 213
Target Start/End: Original strand, 44252643 - 44252806
Alignment:
Q  51 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 149  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||  | |||     
T  44252643 atttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttatattt 44252742  T
Q  150 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgt 213  Q
     ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  44252743 gggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacacgtcccatacccgt 44252806  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 283
Target Start/End: Original strand, 49579949 - 49580201
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| || |||||||||||||||||  ||||| || ||||| ||||    
T  49579949 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaatcatcaaacaaaataacataacatatcaatataaagtaat 49580048  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--------aaa 230  Q
    |||  |||||  ||| | ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| |||||| || |||        | |    
T  49580049 tttttacatttgggacgggtttgagtatgggttcgaggtgggtacctatatactcgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaacccata 49580148  T
Q  231 cccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 283  Q
    |||| ||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  49580149 cccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattggatttggtt 49580201  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 49 - 227
Target Start/End: Original strand, 23580722 - 23580900
Alignment:
Q  49 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacat 147  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||| || |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||  ||||    
T  23580722 tgatttagttgatcctttaaatatcaatagtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacata-catatcaacataaaataattttttacat 23580820  T
Q  148 tcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 227  Q
    |  |||  ||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| | |||||||||  ||||| ||| |||||||||||||    
T  23580821 ttgggataagtgtgggtatgggttcggagtgggtacctatatacccgttacccgtttcatactcgtgttttgaaattggg 23580900  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 49 - 223
Target Start/End: Original strand, 34025848 - 34026023
Alignment:
Q  49 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacat 147  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||  ||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||    
T  34025848 tgatttagttgatcctttaaatatcaatggtaatttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacat 34025947  T
Q  148 tcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    |  ||| | || |||||||| | |||||||||  |||| ||||   ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  34025948 ttgggacgggtatgggtatgagttcggggtggaaacctatatactcgttacccgtcccatacctgtgttttgaaat 34026023  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 155 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23547029 - 23546899
Alignment:
Q  155 gagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaacccaaacctaatcaaa 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||| || || |||  ||||||| ||||||||| | |||||    
T  23547029 gagtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaacccatacccaaacccagtcaaa 23546930  T
Q  253 atgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 283  Q
    | |  |||||||||| ||||||  |||||||    
T  23546929 acggggaaaacccgttaaattgggtttggtt 23546899  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 190
Target Start/End: Original strand, 20086903 - 20087044
Alignment:
Q  49 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacat 147  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||    
T  20086903 tgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaagcaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacat 20087002  T
Q  148 tcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtata 190  Q
    |  ||| | || || ||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  20087003 ttgggacgggtatgagta-gggttcggggtgggtacctatata 20087044  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 223
Target Start/End: Original strand, 34154312 - 34154483
Alignment:
Q  49 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggttttta-taatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaa-ttttcaaca 146  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||     ||||| |||||||| ||| ||||  |||    
T  34154312 tgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataa-----catatcaacataaagtaatttttttaca 34154406  T
Q  147 ttcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    ||  ||| | || |||||||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||  ||||||| | |||||||||    
T  34154407 tttgggacgggtatgggtatgggttcggggtgggtacctatattcttgttacccgtttcatacccatgttttgaaat 34154483  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23547164 - 23547081
Alignment:
Q  51 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaa 133  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  23547164 atttagttgatcctttaaatataaatgctagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatattaacataaa 23547081  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23154245 - 23154093
Alignment:
Q  61 tcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtt 159  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||  |||||  |||   ||     
T  23154245 tcctttaaatatcaacggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat-acatatcaacataaagtaattttttacatttgggataggta 23154147  T
Q  160 tgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgt 213  Q
    || ||||||| |||| |||||||||| ||||   ||||||||| ||||||||||    
T  23154146 tgagtatgggttcggagtgggtacctatatactcgttacccgttccatacccgt 23154093  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 6738538 - 6738434
Alignment:
Q  98 attatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgtta 197  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | || || ||||||  | ||||||||||||| |||| | ||||    
T  6738538 attatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgagtatggatttggggtgggtacctatatacccgtta 6738439  T
Q  198 cccgt 202  Q
    |||||    
T  6738438 cccgt 6738434  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 41937216 - 41937077
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 127  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||||||  || ||| ||||| |||| | || ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||| | ||    
T  41937216 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcatttcaatatcaatgttagtctttataacacgacaattatcaaacaaaataatatgacatgtcaa 41937117  T
Q  128 cataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatg 167  Q
    || ||| || |||||  ||||   || |||||||||||||    
T  41937116 cacaaagtagttttctgcatttgagacgagtttgggtatg 41937077  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 48305726 - 48305656
Alignment:
Q  157 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 227  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| |||| | | ||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  48305726 gtttgggtataggttcggggtgggtacctatatacccgatactcgttccatacccgtgttttgaaattggg 48305656  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 23910385 - 23910337
Alignment:
Q  101 atcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  23910385 atcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaattttctacattc 23910337  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30904899 - 30904835
Alignment:
Q  158 tttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||  | | |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  30904899 tttgggtatgggttcggggtgggtacctatatccccg-tacccgtcccgtacccgtgttttgaaat 30904835  T

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Target: scaffold0036 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 240
Target Start/End: Original strand, 33267 - 33481
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 127  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||| || |||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  33267 tttaacaattgttagaccgattgatttagttgttcctttaaatatcaatcgtagtttttataacacaacaattaccaaacaaaataacatggcatgtcaa 33366  T
Q  128 cataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 227  Q
    |||||| || |||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  33367 cataaagtagttttctgcattcgggacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggg 33466  T
Q  228 --aaacccaaaccca 240  Q
      |||||||||||||    
T  33467 gaaaacccaaaccca 33481  T

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Target: chr2 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 33)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 6028104 - 6027852
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggttttt-ataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatatta 126  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  6028104 tttaacatttgttagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagttttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatggcttatca 6028005  T
Q  127 acataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgg 226  Q
    ||||||| || |||||  ||||||||| | || || ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||| ||    
T  6028004 acataaaatacttttctgcattcaggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgtctcatacccatgttttaaaatcgg 6027905  T
Q  227 gaaacccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 283  Q
    | |    ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||  |||||||    
T  6027904 gga----aaacccaaacccaatcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggtt 6027852  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 51 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 24414324 - 24414046
Alignment:
Q  51 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 149  Q
    ||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||  |||||     
T  24414324 atttagttgatcatttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacattt 24414225  T
Q  150 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgg--------gaaacccaaacccaa 241  Q
     ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||        || ||||| ||||||    
T  24414224 gggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaaccgatacccatacccaa 24414125  T
Q  242 acctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 320  Q
    ||| |||||||| |  |||||||||||||||||  ||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||||| |||||    
T  24414124 acccaatcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacaggtatgggttttgttgccatg 24414046  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 40 - 320
Target Start/End: Original strand, 37999369 - 37999652
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||||||  | |||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  37999369 tagacaaaatgatttagttgattctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaat 37999468  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaa 236  Q
    |||  |||||  ||| | ||||||||||| | ||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||||| |||||| || |||  ||||||| |    
T  37999469 tttttacatttgggacgggtttgggtatgagttcggggtgggtacttatatacccgttacccgtctcatacccgtgttttgagatcggggaaaacccata 37999568  T
Q  237 cccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 320  Q
    |||| ||| | ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||   ||| ||||||||| |||||    
T  37999569 cccatacccagtcaaaatgggggaaacccgtcaaattgaatttggttcgggcgactaaccacggatatgggttttgttgccatg 37999652  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 51 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8916129 - 8915959
Alignment:
Q  51 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 149  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||  |||||     
T  8916129 atttagttaatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataattttttacattt 8916030  T
Q  150 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttga 220  Q
     ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8916029 gggacgggtttgagtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgttttga 8915959  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 31942400 - 31942210
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 127  Q
    ||||||| ||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |     
T  31942400 tttaacatttgttagaccgactgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatggcatatcag 31942301  T
Q  128 cataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatttt 218  Q
    |||||| || |||||  ||||   ||   |||||| |||||| | ||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  31942300 cataaagtagttttctgcatttgtgacaggtttggttatgggtttggggtgggtacttatatacctgttacccgtctcatacccgtgtttt 31942210  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 49 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13705555 - 13705380
Alignment:
Q  49 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacat 147  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||    
T  13705555 tgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaatttttcacat 13705456  T
Q  148 tcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    |  ||| | |||| |||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  13705455 ttgggacgggtttaggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacctgtctcatacccgtgttttgaaat 13705380  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10208624 - 10208445
Alignment:
Q  49 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacat 147  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||  ||||    
T  10208624 tgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatattaacataaagtaattttttacat 10208525  T
Q  148 tcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 227  Q
    |  |||   ||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  10208524 ttgggactggtttgagtatgggttcggggtaggtacctatatatccattacccgtcccatacccgtgttttaagattggg 10208445  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 40 - 295
Target Start/End: Original strand, 45115444 - 45115710
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||| ||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||    
T  45115444 tagacaaaatgatttaattgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataatgtaat 45115543  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattg-ggaa-------- 229  Q
    |||  |||||  ||| | ||||   |||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||            
T  45115544 tttttacatttgggatgggtttaactatgggttcgggatgggtacctatatacctgttacccgtctcatacccgtgttttgaaatcgaggaaaactcata 45115643  T
Q  230 -acccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaac 295  Q
     ||||| ||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  45115644 tacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattggatttggttcggacaagtaac 45115710  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 14540649 - 14540851
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||     || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14540649 aatatgctcactttaacatttgttagactgattgatttagttgctcctttaaatatc----gtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataaca 14540744  T
Q  117 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 216  Q
    || ||||| |||||||| |||||||| || ||| ||| |  |||| ||||||  || | |||||| ||| |||| | |||||| ||| ||||||||| ||    
T  14540745 tgacatatcaacataaagtaattttctacgttcgggacggatttgagtatggattccgagtgggtgcctatatacccgttacctgtctcatacccgtgtt 14540844  T
Q  217 ttgaaat 223  Q
    |||||||    
T  14540845 ttgaaat 14540851  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7314863 - 7314667
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatatta 126  Q
    ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| || | ||   |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  7314863 tttaacatttgatagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgatatttatcaaacaaaataacatgacatatca 7314764  T
Q  127 acataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    ||||||| |||||||  |||||  ||| | || |||||||||| |||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  7314763 acataaaataattttttacatttgggacgggtgtgggtatgggttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtcccatactcgtattttaaaat 7314667  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 51 - 320
Target Start/End: Original strand, 30846842 - 30847121
Alignment:
Q  51 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttca-acatt 148  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||   ||| |    
T  30846842 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagtttttttacaat 30846941  T
Q  149 caggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--------aaacccaaaccca 240  Q
      ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||| || || |||        | ||||| |||||    
T  30846942 tgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaacccatacccataccca 30847041  T
Q  241 aacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 320  Q
    |||| | |||||| |  |||||||||||||||||  ||||||| || || ||||| ||  |||| ||||||||| |||||    
T  30847042 aacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatg 30847121  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 314
Target Start/End: Original strand, 13830622 - 13830904
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttata-atacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||  | | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  13830622 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttatttacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaat 13830721  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattg-ggaa-------a 230  Q
    |||  |||||  |||   ||||| ||||||| ||||||||||||| | |||| | |||| ||||||||||||||| |||||| || | ||||       |    
T  13830722 tttttacatttgggacaggtttgagtatgggttcggggtgggtacttatatacccgtta-ccgtcccatacccgtgttttgagatcgaggaaaacccata 13830820  T
Q  231 cccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgtt 314  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| || || ||||| ||  |||| |||||||||    
T  13830821 cccatacccaaacccagtcaaaatggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgtt 13830904  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 36128299 - 36128020
Alignment:
Q  51 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaatta-attttcaacatt 148  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||  ||||  |||||    
T  36128299 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatt 36128200  T
Q  149 caggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--------aaacccaaaccca 240  Q
      ||| | ||||||||||||| |||||||| |||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||| || || |||        | ||||| |||||    
T  36128199 tgggacgggtttgggtatgggttcggggtgagtacctatatacccgttacccatcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaccacatacccataccca 36128100  T
Q  241 aacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 320  Q
    |||| | |||||| |  ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||| |||||    
T  36128099 aacccagtcaaaacggggaaaatccgtcaaattaggtttggttcggacgagtaaccacgggtatgggttttgttgccatg 36128020  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 325
Target Start/End: Original strand, 9632283 - 9632566
Alignment:
Q  51 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 149  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||| ||| ||||||||||  ||||| |||||||| || ||||  |||||     
T  9632283 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattataaaaaaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacattt 9632382  T
Q  150 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaacc------caa 241  Q
     ||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||| ||| || || |||  ||||||| |||      |||    
T  9632383 gggacgggtttgggtatgggttcggggtggatacctatatacccattacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaacccatacccatactcaa 9632482  T
Q  242 acctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatgactac 325  Q
    ||| | |||||| |   ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| ||  |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  9632483 acccattcaaaacgggaaaaacccgtcaaattgagtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgcctac 9632566  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 42798192 - 42798011
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaa- 137  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||     
T  42798192 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaat 42798093  T
Q  138 ttttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttg 219  Q
    ||||  |||||  |||   ||||| ||||||| ||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||||| |||||    
T  42798092 ttttttacatttgggacaggtttgtgtatgggttcggggtgggtacttatatacccgttacccgtctcatacccgtgttttg 42798011  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 19105066 - 19104751
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||| || ||||||||| ||| |||||||||  || || |||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||    
T  19105066 aatatgctcactttaacatttgttagaccgatcgatttagttgctcttttaaatatcgatagtagtttttataacacggcaattattaaacaaaataaca 19104967  T
Q  117 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccata----cccg 212  Q
    || ||  | |||||||| ||||||||  ||||| ||| | ||||| ||||||  ||| ||||| ||||| |||| | ||||| | |||||||    ||||    
T  19104966 tgacacgtcaacataaagtaattttctgcattcgggacgggtttgagtatggattcgaggtggatacctatatacccgttacacatcccatacaggcccg 19104867  T
Q  213 tattttgaaattggg--aaacccaa------acccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtat 304  Q
    | ||| ||||| |||  ||||||||      ||||||||| |||||||| | | ||||||| ||||||||  |||| || |||   ||||| ||||||||    
T  19104866 tgtttggaaatcggggaaaacccaaactcatacccaaacccaatcaaaacggaaaaaacccatcaaattgggtttgattcggattggtaaccacatgtat 19104767  T
Q  305 aggttttgttaccatg 320  Q
    |||||||||| |||||    
T  19104766 aggttttgttgccatg 19104751  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 37106562 - 37106762
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataac 115  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||    
T  37106562 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 37106661  T
Q  116 atggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtat 215  Q
    ||   |||| |||||||| |||||||  |||||  ||| |      |||||||| |||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |    
T  37106662 atat-atatcaacataaagtaattttttacatttgggacg------ggtatgggttcggagtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgt 37106754  T
Q  216 tttgaaat 223  Q
    ||||||||    
T  37106755 tttgaaat 37106762  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 223
Target Start/End: Original strand, 45256697 - 45256893
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatatta 126  Q
    ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| ||||||  ||||||| || | ||| ||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  45256697 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtaatttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacaagacatatca 45256796  T
Q  127 acataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    | ||||| |||||||  |||||  ||| | |||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |  ||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  45256797 aaataaagtaattttttacatttgggacgggtttaggtatgggttcggggtgggtacttatatacccattaaccgtctcatacccgtgttttgaaat 45256893  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12194042 - 12193839
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatatta 126  Q
    ||||||| ||| |||||  | |||| |||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||  ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  12194042 tttaacatttgttagacggaatgatgtagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 12193943  T
Q  127 acataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgg 226  Q
    ||||||| |||||||  |||||  ||| | || ||| |||||  ||| |||||||| || |||| |  ||||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  12193942 acataaagtaattttttacatttgggacgggtatggatatggattcgaggtgggtatctatatacccattacccgtcccatacccgtgttctgaaatcgg 12193843  T
Q  227 gaaa 230  Q
    ||||    
T  12193842 gaaa 12193839  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 192
Target Start/End: Original strand, 10920531 - 10920684
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  10920531 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaat 10920630  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatc 192  Q
    |||  |||||  ||| |  |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  10920631 tttttacatttgggacggatttgggtatgggttcggggtggatacctatatatc 10920684  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 16226929 - 16226851
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatg 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16226929 tagaccaattgatttagttgctaatttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaataaaataacatg 16226851  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 275
Target Start/End: Original strand, 3547170 - 3547290
Alignment:
Q  157 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgg--gaaacccaaacccaaacctaatcaaaat 254  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||| |||  |||||| |    
T  3547170 gtttggatatgggttcggggtgggtacatatatctccgttacccgtcccgtacccgtattttgaaatcggtaaaaacccaaatccatacccgatcaaatt 3547269  T
Q  255 gaagaaaacccgtcaaattga 275  Q
    || ||||| ||||||||||||    
T  3547270 gaggaaaatccgtcaaattga 3547290  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 35248489 - 35248386
Alignment:
Q  138 ttttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat--tgggaaacccaa 235  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |  ||||||||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||||||    
T  35248489 ttttctacattcaggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctttatcccctttacccgtcccatacccgtgttttgtaatcgtggaaaacccaa 35248390  T
Q  236 accc 239  Q
    ||||    
T  35248389 accc 35248386  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 272
Target Start/End: Original strand, 14331531 - 14331648
Alignment:
Q  157 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaacccaaacctaatcaaaat 254  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| | |||  | ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  ||||||| ||||||||||| |||||      
T  14331531 gtttgggtatgggttcggagtgggtacatatatccccgttacccgtcccatacctgtatttttaaataggggaaaacccatacccaaacctagtcaaacc 14331630  T
Q  255 gaagaaaacccgtcaaat 272  Q
    |  |||||||||||||||    
T  14331631 ggggaaaacccgtcaaat 14331648  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 37472955 - 37472854
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggttttta-taatacgactattatcaaacaaaataac 115  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  37472955 aatatgctcactttaacatttgttagacagaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 37472856  T
Q  116 at 117  Q
    ||    
T  37472855 at 37472854  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4961564 - 4961480
Alignment:
Q  129 ataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgt 213  Q
    ||||||| |||||| | |||| ||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  4961564 ataaattcattttctatattcgggacgagtttgggtatgggttcgaggtgtgtacctatatccctgttacacgtcccatacccgt 4961480  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 37472840 - 37472673
Alignment:
Q  161 gggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--------aaacccaaacccaaacctaatcaaa 252  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||        | || || ||||||||| | |||||    
T  37472840 gggtatgggttcgaagtgggtacctaaatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaaatccatactcatacccaaacccagtcaaa 37472741  T
Q  253 atgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 320  Q
    | |  |||||||||||||||||| ||||||| || || |||||  |  |||| |||||||||||||||    
T  37472740 acggggaaaacccgtcaaattgagtttggttcgggcgggtaactgcgggtatgggttttgttaccatg 37472673  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 218
Target Start/End: Original strand, 25210355 - 25210442
Alignment:
Q  131 aaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatttt 218  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||| |||| |||||||| | ||||||||||| | |||    |||||||||||||||||||| ||||    
T  25210355 aaattgattttctacattcgggaggggttttggtatgggtttggggtgggtacatatatcctcgttacccgtcccatacccgtgtttt 25210442  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 240
Target Start/End: Original strand, 15546784 - 15546833
Alignment:
Q  193 tgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaaccca 240  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||    
T  15546784 tgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaaacccaaaccca 15546833  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24051705 - 24051643
Alignment:
Q  161 gggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| | |||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  24051705 gggtatgggttcggggtaggtacatatatccctgttacccgtcccatactcgtattttaaaat 24051643  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 38342604 - 38342538
Alignment:
Q  157 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||  | |||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  38342604 gtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccccgttacccgtcccgtatccgtattttaaaat 38342538  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6164553 - 6164473
Alignment:
Q  162 ggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaaccca 240  Q
    |||||| | ||||||||||||| | |||  | |||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6164553 ggtatgagttcggggtgggtacatatatcaccgttacccgtcccgtacccaaattttgaaattggggaaaacccaaaccca 6164473  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 129 - 189
Target Start/End: Original strand, 35965311 - 35965371
Alignment:
Q  129 ataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtat 189  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  35965311 ataaattgattttctacattcgggacgggtttgggtatgggttcggagtgggtacatgtat 35965371  T

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Target: chr1 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 41)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16433386 - 16433088
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    |||||||||  ||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||||    
T  16433386 aatatgctcactttaatatttgttagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttataat---acaattatcaaacaaaataaca 16433290  T
Q  117 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 216  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||  ||||  ||  | ||||||||||||| ||||   |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  16433289 tgacatatcaacataaagtaattttctgcatttggggtgggtttgggtatgggttcgg---gggtacctatatatccgttacccgtcccatacccgtgtt 16433193  T
Q  217 ttgaaattgggaaacccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttac 316  Q
    ||||||| ||  |    |||| |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||   |||||||||| || |    
T  16433192 ttgaaatcggaga----aaactcaaacccaatcaaaatggggaaaatccgtcaaattgagtttggttcggatgggtaaccacggatataggttttattgc 16433097  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 34673507 - 34673282
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  34673507 aatacgctcattttaacatttgttagaccggttgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttataacacggcaattatcaaacaaaataaca 34673408  T
Q  117 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 216  Q
    |||||||| |||||||| || |||||  | ||| | |   ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||| ||| ||||||||| ||    
T  34673407 tggcatatcaacataaagtagttttcttcgttcggaacaggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttaccagtctcatacccgtgtt 34673308  T
Q  217 ttgaaattggg--aaacccaaaccca 240  Q
    |||||||||||  |||||||||||||    
T  34673307 ttgaaattgggaaaaacccaaaccca 34673282  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 29871510 - 29871237
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    ||||||||| |||||| | ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| | |   |||||||||||||||||||    
T  29871510 aatatgctcattttaatatttgttagaccgattgatgtagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttataacatgggaattatcaaacaaaataaca 29871411  T
Q  117 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 216  Q
    || ||||| |||||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||| | || |||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||| | ||    
T  29871410 tgacatatcaacataaaataattttctacattcgggacgggtttgggtatgagttcagggtgggtacctatataccagttacctgtcccatacccatgtt 29871311  T
Q  217 ttgaaattg--ggaaacccaa------acccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggt 282  Q
    ||||||| |  | ||||||||      |||||||| || |||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  29871310 ttgaaatcggagaaaacccaaactcatacccaaacttagtcaaaacgaggaaaacccgtcaaattgagtttggt 29871237  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9983115 - 9982905
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| |||| | ||  |||||||||||||||||||    
T  9983115 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattaatttagttgctcctttgaatatcaatggtagttttgataacatgagaattatcaaacaaaataaca 9983016  T
Q  117 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 216  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||  ||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||| ||||| ||    
T  9983015 tgatatattaacataaagtaattttctgcattcgggatgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatactcgttacccatcccattcccgtgtt 9982916  T
Q  217 ttgaaattggg 227  Q
    |||||||||||    
T  9982915 ttgaaattggg 9982905  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 44615690 - 44615494
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 127  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44615690 tttaacatttgttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaataatagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 44615591  T
Q  128 cataaatta-attttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
     ||||| ||  ||||    |||  ||| | ||||||||||| | | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  44615590 gataaagtagtttttttggatttgggacgggtttgggtatgagtttggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgtttttaaat 44615494  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 223
Target Start/End: Original strand, 44792879 - 44793075
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 127  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44792879 tttaacatttgttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaataatagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 44792978  T
Q  128 cataaatta-attttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
     ||||| ||  ||||    |||  ||| | ||||||||||| | | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  44792979 gataaagtagtttttttggatttgggacgggtttgggtatgagtttggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgtttttaaat 44793075  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 320
Target Start/End: Original strand, 5180908 - 5181214
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataac 115  Q
    |||||||||  ||||| | ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||    
T  5180908 aatatgctcactttaaaatttgttagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 5181007  T
Q  116 atggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtat 215  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  | |       ||||||||| | ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  5181008 atgacatatcaacataaaataattttttacatttggaa------cgggtatgggtttggggtgggtgcctatatacccgttacccgtcccatacccgtat 5181101  T
Q  216 tttgaaattggg--aaacccaaacccaaacctaa------tcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtatagg 307  Q
    |||||||| |||  ||||||| ||||| ||||||      ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || || |||||  |  |||| ||    
T  5181102 tttgaaatcggggaaaacccatacccatacctaaacccagtcaaaatggggaaaacccgtcaaattgaatttggttcgggcgggtaaccgcgggtatggg 5181201  T
Q  308 ttttgttaccatg 320  Q
    ||||||| |||||    
T  5181202 ttttgttgccatg 5181214  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 40 - 220
Target Start/End: Original strand, 29936302 - 29936483
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||| ||| ||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  29936302 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattataaaaaaaaataacattacatatcaacataaagtaat 29936401  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttga 220  Q
    |||  |||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  29936402 tttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtattttga 29936483  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 223
Target Start/End: Original strand, 17134821 - 17135017
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatatta 126  Q
    ||||||| ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  17134821 tttaacatttgttagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 17134920  T
Q  127 acataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    ||||||| |||||||  ||||   ||| |||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  17134921 acataaagtaattttttacatatgggacgagtatgggtatgggttcggggatggtacctatatacccgttacccgtctcatacccgtgttttgaaat 17135017  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 35937042 - 35936775
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    |||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||   |||||||||||||||||||    
T  35937042 aatatgctcactttaacatttgttagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttgtaacacggaaattatcaaacaaaataaca 35936943  T
Q  117 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 216  Q
    || ||||| |||||||| |||||||| ||||||| || | ||||            ||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| |||  |    
T  35936942 tgacatatcaacataaagtaattttctacattcatgacgggttt------------ggggtgggtacctatatacccgttatccgtcccatactcgtgat 35936855  T
Q  217 ttgaaattggg--aaacccaa------acccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggac 288  Q
    ||||||| |||  ||||||||      ||||||||| | |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  35936854 ttgaaatcggggaaaacccaaactcatacccaaaccaagtcaaaatgagaaaaacccgtcagattgaatttggttcggac 35936775  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Original strand, 12494885 - 12495087
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 127  Q
    ||||||| ||| |||||| ||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| ||| | ||    
T  12494885 tttaacatttgttagaccgataaatttagttgctcctttaaatatcagtggtagtttttataacacgccaattataaaacaaaataacatgtcatgtcaa 12494984  T
Q  128 cataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 227  Q
    |||| | || ||||| |||||  ||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  12494985 catatagtagttttctacatttgggacgggtttgggtatgggttcgaggtgggtacctatatacccgttacacgtcccatatccgtgttttgaaatcggg 12495084  T
Q  228 aaa 230  Q
    |||    
T  12495085 aaa 12495087  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 19572656 - 19572426
Alignment:
Q  98 attatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgtta 197  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | || || ||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||    
T  19572656 attatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgtta 19572557  T
Q  198 cccgtcccatacccgtattttgaaattgggaa--------acccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacg 289  Q
    || ||||||||||||| ||||||||| |||||        ||||| ||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||   ||||||| || ||    
T  19572556 cctgtcccatacccgtgttttgaaatcgggaaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaatggggaaaacccgtcaaattaggtttggttcgggcg 19572457  T
Q  290 agtaacaacatgtataggttttgttaccatg 320  Q
     ||||| ||| |||| ||||||||| |||||    
T  19572456 ggtaaccacaagtatgggttttgttgccatg 19572426  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 40 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 36187423 - 36187129
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||     
T  36187423 tagacaaaatgatttagttgatcatttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataac 36187324  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--------aaa 230  Q
    |||  |||||  ||| | ||||||||||||| || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||| || |||        | |    
T  36187323 tttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcagggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaacccata 36187224  T
Q  231 cccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatgactac 325  Q
    |||| ||||||||| | |||||| |  ||||||||| |||||||| ||||||| || || ||||| ||  |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  36187223 cccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgccaaattgagtttggttcgggcgggtaacgacgggtatgggttttgttgccatgcctac 36187129  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 42439885 - 42439692
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatatta 126  Q
    ||||||| ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  42439885 tttaacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatca 42439786  T
Q  127 acataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttga 220  Q
    ||||||| |||||||  |||||  ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||| | ||||||    
T  42439785 acataaagtaattttttacatttgggatgagtttggatatgggttcggggtgggtacctatatacccgttactcgtcccatacccatgttttga 42439692  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 44632367 - 44632160
Alignment:
Q  11 tcgaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaa 110  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  44632367 tcgaacaatatgatcactttaacatttgttagacctattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagtttttataacacgacaattgtcaaacaaa 44632268  T
Q  111 ataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacc 210  Q
    |||| ||||||||| |||      |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||  ||  ||||| ||||  || | |||||||||||||||||||    
T  44632267 ataatatggcatatcaac-----gtaattttcgacatttaggacgagtttggatatggattcacggtggatacccatacacctgttacccgtcccatacc 44632173  T
Q  211 cgtattttgaaat 223  Q
    ||| |||||||||    
T  44632172 cgtgttttgaaat 44632160  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 49741221 - 49740977
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 127  Q
    ||||||| ||| || ||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  49741221 tttaacatttgttaaaccgatttatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttataacacatcaattatcaaacaaaataacataacatattaa 49741122  T
Q  128 cataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 227  Q
    |||||| || |||||  ||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||       ||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  49741121 cataaagtagttttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctata-------tacccgtcccatatccatgttttgaaattggg 49741029  T
Q  228 aaacccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 283  Q
     |    ||||| ||||| | |||||| |  ||||| |||||||||||| |||||||    
T  49741028 ga----aaacctaaacccagtcaaaaaggggaaaatccgtcaaattgagtttggtt 49740977  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18354295 - 18354099
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatatta 126  Q
    ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  18354295 tttaacatttgatagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 18354196  T
Q  127 acataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    ||||||| |||||||  |||||  ||| |||| ||||||| || |||||||||| || | |||| | |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18354195 acataaaataattttttacatttgggacgagtatgggtatcggttcggggtgggaacttatatacccgttacccgtcccatacccatgttttgaaat 18354099  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24236964 - 24236754
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  24236964 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataat 24236865  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaa 236  Q
    |||  |||||  ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| | ||| ||||| |||||||||| |||||| || |||  ||||||| |    
T  24236864 tttttacatttgggacgggtttgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttccccgttccatacccgtgttttgagatcggggaaaacccata 24236765  T
Q  237 cccaaacctaa 247  Q
    |||| ||||||    
T  24236764 cccatacctaa 24236754  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 230
Target Start/End: Original strand, 51421744 - 51421935
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 138  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||  |||||| |||||||| || | | | ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| | ||||    
T  51421744 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatagcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacatagagtaat 51421843  T
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa 230  Q
    |||  |||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  51421844 tttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatacatgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcgggaaa 51421935  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 51 - 213
Target Start/End: Original strand, 28297830 - 28297994
Alignment:
Q  51 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttca-acatt 148  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||   |||||    
T  28297830 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaatagtttttttacatt 28297929  T
Q  149 caggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgt 213  Q
      ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  28297930 tgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgt 28297994  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 227
Target Start/End: Original strand, 16408841 - 16409016
Alignment:
Q  49 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacat 147  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||    |||||| |||||||  ||||    
T  16408841 tgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacata----cataaagtaattttttacat 16408936  T
Q  148 tcaggag-gagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 227  Q
    |  |||| | |||| | |||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16408937 tt-ggagcgggtttagctatgggttcggggtcggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgttttgaaattggg 16409016  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 49250965 - 49250724
Alignment:
Q  51 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 149  Q
    ||||||||  || ||||||||| |||| | |||||||| || | ||| |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||| || ||||  |||||     
T  49250965 atttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttatcaacatgacaattatcaaacaaaatagcataacatatcaacataaagtagttttttacattt 49250866  T
Q  150 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--------aaacccaaacccaa 241  Q
     ||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||| |||||| || |||        | ||||| ||||||    
T  49250865 gggacgggtttgggtatgggttcgaggtggatacctatatacccattacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaactcatacccatacccaa 49250766  T
Q  242 acctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 283  Q
    ||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  49250765 acccagtcaaaacggagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 49250724  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 40087689 - 40087484
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataac 115  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||    
T  40087689 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 40087590  T
Q  116 atggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtat 215  Q
    |||  |||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | || || ||||| | ||||||||||||||| |||  | ||||| | ||||||||| || |    
T  40087589 atgatatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggtacctatattcccgttactcatcccatacctgtgt 40087490  T
Q  216 tttgaa 221  Q
    ||||||    
T  40087489 tttgaa 40087484  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 45866400 - 45866204
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatatta 126  Q
    ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||  ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  45866400 tttaacatttgttagacagaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 45866301  T
Q  127 acataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    ||||||| |||||||  |||||  ||| | || |||||||| | | ||||||||||||| ||||    ||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  45866300 acataaagtaattttttacatttgggatgggtatgggtatgagtttggggtgggtacctatatactcattacctgtctcatacccgtgttttgaaat 45866204  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23490915 - 23490800
Alignment:
Q  98 attatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgtta 197  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||| ||||  |||||  ||| | |||| |||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||    
T  23490915 attatcaaacaaaataacataacatatccacataaattagttttttacatttgggacgggttttggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgtta 23490816  T
Q  198 cccgtcccatacccgt 213  Q
    ||||||||||||||||    
T  23490815 cccgtcccatacccgt 23490800  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3628213 - 3628004
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataac 115  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  ||| |||||||| |||||| |||||||| || | ||  ||||||||||||||||||    
T  3628213 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttagttgatccgttaaatattaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 3628114  T
Q  116 atggcatattaacataaattaa--ttttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgt 213  Q
    ||| ||||| |||||||| |||  ||||  |||||  |||   |  || ||||||| |||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  3628113 atgacatatcaacataaagtaattttttttacatttgggactggaatgagtatgggttcggggtgggtacctacatacccgttacccgtcccatacccgt 3628014  T
Q  214 attttgaaat 223  Q
     |||||||||    
T  3628013 gttttgaaat 3628004  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 49 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17092153 - 17091991
Alignment:
Q  49 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacat 147  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||    
T  17092153 tgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaattttttacat 17092054  T
Q  148 tcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacc 210  Q
    |  ||| | || |||| ||||| |||||||| || ||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  17092053 ttgggacgggtatgggcatgggttcggggtgagtgcctatatacccgttacgcgtcccatacc 17091991  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 50426849 - 50426680
Alignment:
Q  49 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacat 147  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||  ||||    
T  50426849 tgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaaatttttacat 50426750  T
Q  148 tcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    |  |||       ||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  50426749 ttggga------cgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttatccgtctcatacccgtgttttgaaat 50426680  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 42708024 - 42707931
Alignment:
Q  49 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaatttt 141  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  42708024 tgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataatttt 42707931  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 230
Target Start/End: Original strand, 34610970 - 34611150
Alignment:
Q  51 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 149  Q
    ||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||| || | ||  |||||     
T  34610970 atttagttgatcttttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataatataacatatcaacataaagtagtattttacattt 34611069  T
Q  150 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa 230  Q
     ||| | ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||   |||||  ||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  34611070 gggacgggtttgggtatgggttcggggtgagtacctatatacacgttacatgtcccatacccgtgttttgagatcgggaaa 34611150  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 34060245 - 34060121
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggttttta-taatacgactattatcaaacaaaataac 115  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  34060245 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggttgtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 34060146  T
Q  116 atggcatattaacataaattaatttt 141  Q
    ||  ||||| |||||||| |||||||    
T  34060145 at-acatatcaacataaagtaatttt 34060121  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 190
Target Start/End: Original strand, 13390358 - 13390450
Alignment:
Q  98 attatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtata 190  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | || |||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  13390358 attatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgagttcggggtgggtacctatata 13390450  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 239
Target Start/End: Original strand, 39219234 - 39219346
Alignment:
Q  129 ataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg- 227  Q
    |||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  | |||||  || || ||||||| |||| |||| |||     
T  39219234 ataaattaattttctacatttagaacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacatgtatccccgttacttgttccgtacccgtgttttaaaatcgggg 39219333  T
Q  228 -aaacccaaaccc 239  Q
     ||||||||||||    
T  39219334 aaaacccaaaccc 39219346  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 141
Target Start/End: Original strand, 2514668 - 2514756
Alignment:
Q  54 tagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatatt-aacataaattaatttt 141  Q
    ||||| || |||||||||| |||||| |||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  2514668 tagttactactttaaatatcaatggtagtttttattacacggcaattatcaaacaaaataacatgacatgttcaacataaaataatttt 2514756  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 199
Target Start/End: Original strand, 23966767 - 23966919
Alignment:
Q  49 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataat-acgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttca-aca 146  Q
    ||||||||||  | |||||||||| ||| || ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||   |||    
T  23966767 tgatttagttgatactttaaatatcaatagtagtttttataaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaatttttttaca 23966866  T
Q  147 ttcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacc 199  Q
    ||  ||| | || || ||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  23966867 tttgggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacc 23966919  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 48125795 - 48125646
Alignment:
Q  130 taaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaa 229  Q
    |||||| |||||| ||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||    |||||||||||| ||||||| |||| ||||  ||||    
T  48125795 taaattgattttctacattcgcgacgagtttgggtatgggttcggggtggatacctatatcctcgttacccgtcccgtacccgtgttttaaaatcaggaa 48125696  T
Q  230 acccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 283  Q
        ||| ||||||  | |||||| |||||||||| || ||||| |||||||||    
T  48125695 ----aaatccaaactcagtcaaaacgaagaaaacctgttaaattaaatttggtt 48125646  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 24710721 - 24710985
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggttttta-taatacgactattatcaaacaaaataac 115  Q
    |||| |||| |||| ||| ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||| | ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  24710721 aataagctcattttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 24710820  T
Q  116 atggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtat 215  Q
    ||    ||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | ||||| |||           ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |    
T  24710821 ataatgtatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgagta-----------tgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgt 24710909  T
Q  216 tttgaaattggg--aaacccaaac------ccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 283  Q
    ||||| || |||  ||||||| ||      ||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24710910 tttgagatcggggaaaacccatactcatatccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgaatttggtt 24710985  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10450144 - 10450074
Alignment:
Q  157 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 227  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| | |||  |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  10450144 gtttgggtatgagttcggggtgggtacatatatccctgttacccgccccgtacccgtattttaaaattggg 10450074  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Original strand, 34085217 - 34085312
Alignment:
Q  135 taattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa 230  Q
    |||||||  ||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||| | ||   | ||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  34085217 taattttttacatttaggacgagtatgggtatgggttcggggtgggtacatataaccccgttacccatcccatactcgtgttttgaaatcgggaaa 34085312  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 223
Target Start/End: Original strand, 23058470 - 23058536
Alignment:
Q  157 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  | |||||||||| | ||| || ||||||||||    
T  23058470 gtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatccccgttacccgtctcgtactcgcattttgaaat 23058536  T

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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 194 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10778615 - 10778579
Alignment:
Q  194 gttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa 230  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10778615 gttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgggaaa 10778579  T

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Target: scaffold0022 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 275
Target Start/End: Original strand, 90483 - 90720
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaatt 139  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||  | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  90483 tagaccgattgatttatttgctcctttaaatatcaatggttgttttaataacacatcaattattaaacaaaataacatggcatatcaacataaaataatt 90582  T
Q  140 ttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaac 237  Q
    |||  ||||||||| || |||| ||||||| |||||| |||||||  |||| | |||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||  ||||||| ||    
T  90583 ttctgcattcaggacgaatttgtgtatgggttcggggagggtaccaatatacccgttaaccgtctcatacccgtgttttgaaatcggggaaaacccatac 90682  T
Q  238 ccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattga 275  Q
    ||||||| | |||||| |  ||||| ||||||||||||    
T  90683 ccaaacccagtcaaaacggggaaaatccgtcaaattga 90720  T

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Target: scaffold0519 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0519
Description:

Target: scaffold0519; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 88 - 314
Target Start/End: Original strand, 10232 - 10458
Alignment:
Q  88 taatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgt 187  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||  |||||  ||| | || |||||||||| |||  |||||||||| |    
T  10232 taatatgacaattatcaaacaaaataacata-catatcaacacaaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcgtagtgggtacctat 10330  T
Q  188 atatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa-cccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttagg 286  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||  |||||| |||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  10331 atacctgttatccgtcccatacccgtgtttggaaagcgggaaaacccatacccaaacctagtcaaaacggaaaaaacccgtcaaattggatttggttcgg 10430  T
Q  287 acgagtaacaacatgtataggttttgtt 314  Q
    ||  |||||  ||||||| |||||||||    
T  10431 acaggtaaccgcatgtatgggttttgtt 10458  T

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Target: scaffold0007 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 40 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 197529 - 197339
Alignment:
Q  40 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaatt 139  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| | |   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  197529 tagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttataacaaggtaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacataaagtaatt 197430  T
Q  140 ttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa 230  Q
    |||  ||||| ||| | |||||||||| |  ||||  ||||||||| |||  |||||||  ||| |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  197429 ttctgcattcgggacgggtttgggtatagattcggtttgggtacctatatgcctgttacttgtctcatatccgtgttttgaaatagggaaa 197339  T

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Target: scaffold0294 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 207
Target Start/End: Original strand, 14638 - 14828
Alignment:
Q  17 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 116  Q
    |||||||||  ||||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || || |  ||||||||||||||||| |    
T  14638 aatatgctcactttaacatttgttaaaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttacaacacaataattatcaaacaaaataata 14737  T
Q  117 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccat 207  Q
    |  ||||| ||||| || |||||||| |||||  ||| ||||||||||||| | ||  ||||||||||| |||| |  ||| |||||||||    
T  14738 tatcatatcaacattaaataattttctacatttgggacgagtttgggtatgtgttcaaggtgggtacctatatacccattatccgtcccat 14828  T

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Target: scaffold0135 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Original strand, 36029 - 36131
Alignment:
Q  27 ttttaacaattggtagaccaattgatttagtttct--cctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatat 124  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  36029 ttttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacagttatcaaacaaaataacatgacatat 36128  T
Q  125 taa 127  Q
    |||    
T  36129 taa 36131  T

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Target: scaffold0027 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 142
Target Start/End: Original strand, 6280 - 6394
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 127  Q
    ||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||||||||| | ||||||  ||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6280 tttaacatttgttagatcgattgatttagttgctcctttaaatttcaatggtaatttttatagcacgacaactatcaaacaaaataacatggcatatcaa 6379  T
Q  128 cataaattaattttc 142  Q
    |||||| ||| ||||    
T  6380 cataaagtaactttc 6394  T

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Target: scaffold0189 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:

Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 223
Target Start/End: Original strand, 4151 - 4327
Alignment:
Q  49 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaatta-attttcaaca 146  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||  |||    
T  4151 tgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtattttttttaca 4250  T
Q  147 ttcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    ||  ||| ||||||||||||||| | |  ||||||||   ||||   |||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  4251 tttgggacgagtttgggtatgggtttgaagtgggtacaaatatactcgttaccagtctcatacccgtgttttgaaat 4327  T

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Target: scaffold0005 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 223
Target Start/End: Original strand, 211349 - 211433
Alignment:
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  211349 tttctacattcaggtagagtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccctgttacccgtctcgtacccgtattttgaaat 211433  T

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Target: scaffold0244 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4661 - 4596
Alignment:
Q  162 ggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 227  Q
    |||||||| ||| |||||||| || |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4661 ggtatgggttcgtggtgggtagctatatccctgttacctgtcccatacccgtattttgaaattggg 4596  T

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Target: scaffold0013 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 105554 - 105495
Alignment:
Q  157 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  105554 gtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccctgttacccgtcccgtacccgtatt 105495  T

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Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 128206 - 128137
Alignment:
Q  157 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgg 226  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||  |  ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  128206 gtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccccattacccgtcccgtacccgtattatgaaattgg 128137  T

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Target: scaffold0009 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 107504 - 107410
Alignment:
Q  129 ataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    ||||| ||||||||||||||| | | |||||||  |||| | ||||||||||||| | ||| | || ||||||||||||||| || |||||||||    
T  107504 ataaagtaattttcaacattcggaacgagtttgaatatgagttcggggtgggtacttatatctatgctacccgtcccatacctgtgttttgaaat 107410  T

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Target: scaffold0014 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 14359 - 14297
Alignment:
Q  28 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataa 90  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||| ||  |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  14359 tttaacatttgttagaccgattgatttaattgttcctttaaatatcaatggtagtttttataa 14297  T

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Target: scaffold0182 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Original strand, 16970 - 17043
Alignment:
Q  157 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa 230  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||| | |||  | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16970 gtttggatatgagttcggggtgggtacatatatccccgtcacccgtcccatacacgtattttgaaatcgggaaa 17043  T

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Target: scaffold0008 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 223
Target Start/End: Original strand, 67734 - 67818
Alignment:
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    |||| |||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| | |||  | |||| ||||||| || ||||||||| ||||    
T  67734 tttctacattcaggtagggtttgggtataggctcggggtgggtacatatatccccgttatccgtcccgtatccgtattttaaaat 67818  T

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Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 223
Target Start/End: Original strand, 75577 - 75661
Alignment:
Q  139 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 223  Q
    |||| |||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| | |||  | |||| ||||||| || ||||||||| ||||    
T  75577 tttctacattcaggtagggtttgggtataggctcggggtgggtacatatatccccgttatccgtcccgtatccgtattttaaaat 75661  T

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