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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21108_high_1 (Length: 685)

Name: NF21108_high_1
Description: NF21108
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21108_high_1
NF21108_high_1
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (323-671)||(35317099-35317447)
chr1 (20-321)||(13497069-13497368)
chr1 (20-321)||(32050291-32050590)
chr1 (22-312)||(49005414-49005701)
chr1 (19-313)||(45537406-45537697)
chr1 (20-321)||(18410753-18411053)
chr1 (20-321)||(28645107-28645407)
chr1 (20-321)||(32523299-32523599)
chr1 (19-321)||(38983872-38984173)
chr1 (20-321)||(42436198-42436497)
chr1 (82-321)||(24775977-24776214)
chr1 (82-321)||(43642563-43642800)
chr1 (19-321)||(2023575-2023874)
chr1 (24-321)||(42807252-42807543)
chr1 (82-312)||(2840887-2841115)
chr1 (19-122)||(2841110-2841214)
chr1 (20-120)||(41402913-41403014)
chr1 (250-312)||(20274938-20275000)
chr1 (19-63)||(24776235-24776279)
chr1 (19-63)||(43642498-43642542)
[»] chr5 (14 HSPs)
chr5 (323-671)||(33309984-33310331)
chr5 (20-315)||(5811857-5812151)
chr5 (20-321)||(1211988-1212287)
chr5 (22-321)||(23106843-23107140)
chr5 (20-321)||(16478706-16479006)
chr5 (20-321)||(16476119-16476418)
chr5 (20-312)||(22496296-22496569)
chr5 (20-321)||(36788995-36789295)
chr5 (20-321)||(22720614-22720913)
chr5 (20-321)||(28968858-28969157)
chr5 (19-321)||(39564538-39564836)
chr5 (20-321)||(1597983-1598281)
chr5 (82-321)||(25336598-25336835)
chr5 (19-313)||(40831005-40831296)
[»] chr7 (14 HSPs)
chr7 (19-321)||(19295816-19296116)
chr7 (19-321)||(6613180-6613479)
chr7 (19-321)||(21953503-21953793)
chr7 (20-321)||(18783924-18784223)
chr7 (20-321)||(34643133-34643432)
chr7 (20-321)||(42047132-42047431)
chr7 (20-321)||(42049835-42050135)
chr7 (20-321)||(35505374-35505673)
chr7 (20-315)||(46805296-46805590)
chr7 (20-321)||(44044864-44045163)
chr7 (19-311)||(9178656-9178948)
chr7 (20-321)||(37315398-37315697)
chr7 (20-321)||(35113887-35114186)
chr7 (250-315)||(47400310-47400375)
[»] chr3 (23 HSPs)
chr3 (19-321)||(37965314-37965613)
chr3 (19-321)||(47333728-47334029)
chr3 (19-321)||(28417682-28417981)
chr3 (19-312)||(4066030-4066320)
chr3 (19-321)||(3344331-3344630)
chr3 (20-321)||(26705432-26705731)
chr3 (19-313)||(22398347-22398638)
chr3 (19-321)||(10121995-10122295)
chr3 (20-312)||(33956515-33956804)
chr3 (20-321)||(35350120-35350419)
chr3 (19-312)||(33955210-33955500)
chr3 (20-321)||(1002328-1002627)
chr3 (20-321)||(43845336-43845635)
chr3 (20-321)||(54610692-54610991)
chr3 (30-321)||(30107195-30107484)
chr3 (22-193)||(45579403-45579574)
chr3 (185-321)||(38189938-38190073)
chr3 (211-321)||(23303395-23303508)
chr3 (211-321)||(23302738-23302851)
chr3 (19-102)||(23303652-23303734)
chr3 (250-321)||(45579650-45579720)
chr3 (20-66)||(38189860-38189906)
chr3 (531-612)||(25731771-25731852)
[»] chr4 (11 HSPs)
chr4 (20-321)||(36352526-36352826)
chr4 (20-311)||(34802584-34802874)
chr4 (22-321)||(27023843-27024142)
chr4 (20-321)||(5944393-5944694)
chr4 (20-321)||(7509996-7510295)
chr4 (20-321)||(27071564-27071863)
chr4 (20-321)||(27151656-27151955)
chr4 (20-312)||(9767902-9768192)
chr4 (22-321)||(48945793-48946083)
chr4 (20-321)||(4943719-4944018)
chr4 (211-321)||(25887936-25888049)
[»] scaffold0088 (3 HSPs)
scaffold0088 (19-321)||(11321-11622)
scaffold0088 (21-321)||(659-956)
scaffold0088 (19-321)||(24549-24840)
[»] chr2 (10 HSPs)
chr2 (20-321)||(39121812-39122111)
chr2 (20-327)||(9616883-9617186)
chr2 (24-321)||(6904963-6905254)
chr2 (20-321)||(42842330-42842629)
chr2 (19-312)||(4650764-4651056)
chr2 (20-321)||(12255968-12256267)
chr2 (20-321)||(40263949-40264246)
chr2 (24-315)||(4720051-4720332)
chr2 (19-321)||(3554308-3554615)
chr2 (211-315)||(42224587-42224694)
[»] scaffold1289 (1 HSPs)
scaffold1289 (19-321)||(714-1015)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (20-321)||(198225-198524)
[»] chr8 (13 HSPs)
chr8 (20-321)||(6417111-6417410)
chr8 (20-321)||(22514360-22514659)
chr8 (20-321)||(40557943-40558242)
chr8 (20-321)||(12501001-12501300)
chr8 (20-321)||(16428694-16428993)
chr8 (20-321)||(36895871-36896170)
chr8 (20-315)||(39621430-39621724)
chr8 (20-321)||(18384928-18385228)
chr8 (20-321)||(13279060-13279359)
chr8 (19-321)||(33441866-33442166)
chr8 (250-321)||(16888155-16888226)
chr8 (115-312)||(29088562-29088760)
chr8 (19-60)||(16885799-16885840)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (20-321)||(11619-11918)
[»] chr6 (6 HSPs)
chr6 (20-321)||(4270928-4271227)
chr6 (20-321)||(22510790-22511090)
chr6 (20-321)||(18902448-18902748)
chr6 (20-321)||(14180488-14180787)
chr6 (20-321)||(14175952-14176251)
chr6 (19-321)||(19421121-19421411)
[»] scaffold1788 (1 HSPs)
scaffold1788 (20-312)||(728-1018)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 323 - 671
Target Start/End: Original strand, 35317099 - 35317447
Alignment:
Q  323 aacttcaaaacccgtatgtcaactctatggcaaccaaagcatcaggttgatattaccttgatggaaccaaaccgtttcatgtttcagtcctttaactatg 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35317099 aacttcaaaacccgtatgtcaactctatggcaaccaaagcatcaggttgatattaccttgatggaaccaaaccgtttcatgtttcagttctttaactatg 35317198  T
Q  423 cagatatggaacgagtcatccaacaaggaccttggttgtttgatagctactcgctaatttggagcaaggtttctgatggaaaagattcgttcactatgca 522  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  35317199 cagatatggaacgagtcacccaacaaggaccttggttgtttgatagctacccgctaatttggagcaaggtttctgatggaaaagatccgttcactatgcc 35317298  T
Q  523 catagactcaattgaattatggatgcaagtccataatctcccctttgatttcatgactgagactatgggaattctgttgggcaatcatgttgggaaacta 622  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35317299 catagactcaattgaattatggatgcaagtccataatctccccttcggtttcatgactgagactatgggaattctgttgggcaatcatgttgggaaacta 35317398  T
Q  623 gtgaaatacgatcatgataacaactatggtaactggagaagatacatga 671  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35317399 gtgaaatacgatcatgataacaactatggtaactggagaagatacatga 35317447  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 13497368 - 13497069
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  13497368 agagatgaagtcgtgtttcgtagacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 13497270  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  13497269 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 13497175  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13497174 tcaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 13497075  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 32050590 - 32050291
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  32050590 agagatgaagtcgtgtttcgtagacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 32050492  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  32050491 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 32050397  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatattaat---gtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    | ||||  |||||||| |||| ||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  32050396 tcaatttgaccgttttaaaattaatattaactacgtctttaatattataaaatgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaatgtacaaaaaatta 32050297  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 49005701 - 49005414
Alignment:
Q  22 agatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaagaa 120  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||   ||  ||||||  ||||||||||||| | | |||||| ||||||    
T  49005701 agatgaagtagtgtttcgtagacatttttctttgcaatagaaaaaattacaaaaattacttagaata--gatatcagagaaccagagaacagaaaaagaa 49005604  T
Q  121 taactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaattatt 220  Q
     ||||||| |||||||||||| | |||||||| || || |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    ||  |||| |||||    
T  49005603 gaactatattttgtaattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctact-atttttatagaaaaatagtaccataacggttaat----atctattacttatt 49005509  T
Q  221 aattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaa 312  Q
    ||||  |||||||| |||| ||||||   ||  | |||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  49005508 aatttgaccgttttaaaattaatattatcaacttatttaatattataaaatgcgcattaaacgattatattatatttcatgtaacctacaaaaaa 49005414  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 45537697 - 45537406
Alignment:
Q  19 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 117  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||   ||  ||||||  ||||||||||||| | | |||||| |||    
T  45537697 cagagatgaagtagtgtttcgtagacatttttctttgcaatagaaaaaattagaaaaattacttagaata--gatatcagagaaccagagaacagaaaaa 45537600  T
Q  118 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 217  Q
    ||| | ||||| ||||| |||||| | |||||||| || || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||  |||||||    
T  45537599 gaagagctatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaat----atctattaatt 45537505  T
Q  218 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaat 313  Q
    |||||||   ||||||| |||| ||||||   ||  | |||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  45537504 attaatttggccgttttaaaattaatattatcaacatatttaatattataaaatgcgcattaaaagattatattatatttcatgcaacctacaaaaaat 45537406  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 18411053 - 18410753
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||    
T  18411053 agagatgaagttgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattaaagaaattacttagaatatagatatcagagaaccatataatagaaaaag 18410954  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatat-agaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 217  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| |  || |||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    ||  | |||||    
T  18410953 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctact-atttatataaaaaaaatagtaccataacggttaat----atctactaatt 18410859  T
Q  218 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 314  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||   || ||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18410858 attaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctacaaaaaatt 18410760  T
Q  315 agcttca 321  Q
    | |||||    
T  18410759 aacttca 18410753  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Original strand, 28645107 - 28645407
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaac-cagaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||||||||||||| | | || ||| ||||    
T  28645107 agagatgaagtcgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattaaagaaattacttagaatatagatatcagagaaccatagaatagaaaaag 28645206  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatat-agaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 217  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| |  || |||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    ||  | |||||    
T  28645207 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctact-atttatataaaaaaaatagtaccataacggttaat----atctactaatt 28645301  T
Q  218 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 314  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||   || ||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  28645302 attaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctacaaaaaatt 28645400  T
Q  315 agcttca 321  Q
    | |||||    
T  28645401 aacttca 28645407  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Original strand, 32523299 - 32523599
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaac-cagaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||||||||||||| | | || ||| ||||    
T  32523299 agagatgaagtcgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattaaagaaattacttagaatatagatatcagagaaccatagaatagaaaaag 32523398  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatat-agaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 217  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| |  || |||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    ||  | |||||    
T  32523399 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctact-atttatataaaaaaaatagtaccataacggttaat----atctactaatt 32523493  T
Q  218 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 314  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||   || ||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  32523494 attaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctacaaaaaatt 32523592  T
Q  315 agcttca 321  Q
    | |||||    
T  32523593 aacttca 32523599  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 321
Target Start/End: Original strand, 38983872 - 38984173
Alignment:
Q  19 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaac-cagaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 117  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||    
T  38983872 cagagatgaagttgtgtttcgtagacatttttctttgcaatagaaaaaattacagaaattacttagaatatagatattagagaaccaaagaacagaaaaa 38983971  T
Q  118 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 217  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||| | ||||  || || || | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||  ||||||     
T  38983972 gaagaactatattttgtgattgttgtgtacttctacccaaaagtgctact-atttatatagaaaaatagtaccataacggttaat----atctattaatc 38984066  T
Q  218 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 314  Q
    |||||||  | |||||| |||| ||||||   || || |||||  ||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  38984067 attaatttgatcgttttaaaattaatattatcaacgtatttaaaattataaaatatgcattaaacgattagattatatttgatgtaacctaaaaaaaatt 38984166  T
Q  315 agcttca 321  Q
    | |||||    
T  38984167 aacttca 38984173  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 42436497 - 42436198
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  42436497 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 42436399  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  42436398 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 42436304  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42436303 tcaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 42436204  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 24776214 - 24775977
Alignment:
Q  82 agaatatagatatcagagaactaaataacagataaagaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaa 181  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||| ||||||| ||||| |||||| | |||||||| || || |||||| | |||||||||||||    
T  24776214 agaatatagatatcagagaaccagagaacagaaaaagaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctact-atttatatagaaa 24776116  T
Q  182 aatagtaccataacggttgatattaattgattaattattaattgaaccgttttgaaatcaat---attaatgtctttaattttataaaatgtgcattaaa 278  Q
    |||| ||||||||||||| ||    ||  ||||||||||||||  ||| |||| |||| |||   || || || |||||| |||||||||||||||||||    
T  24776115 aatattaccataacggttaat----atctattaattattaatttgaccattttaaaattaatataatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaa 24776020  T
Q  279 tgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaattagcttca 321  Q
     | ||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  24776019 cgtttagattatatttcatgtaacctacaaaaaattaacttca 24775977  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 82 - 321
Target Start/End: Original strand, 43642563 - 43642800
Alignment:
Q  82 agaatatagatatcagagaactaaataacagataaagaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaa 181  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||| ||||||| ||||| |||||| | |||||||| ||  | |||||| | |||||||||||||    
T  43642563 agaatatagatatcagagaaccagagaacagaaaaagaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacccataagcgctact-atttatatagaaa 43642661  T
Q  182 aatagtaccataacggttgatattaattgattaattattaattgaaccgttttgaaatcaat---attaatgtctttaattttataaaatgtgcattaaa 278  Q
    |||| || |||||||||| ||    ||  ||||||||||||||  |||||||| |||| |||   || || || |||||| |||||||||||||||||||    
T  43642662 aatattatcataacggttaat----atctattaattattaatttgaccgttttaaaattaatataatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaa 43642757  T
Q  279 tgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaattagcttca 321  Q
     | ||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  43642758 cgtttagattttatttcatgtaacctacaaaaaattaacttca 43642800  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 2023874 - 2023575
Alignment:
Q  19 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaaccagaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||   |     | |||||||| ||||||| | | |||| | ||||    
T  2023874 cagagataaagtagtgtttcgtagacatttttctttgcaattgaaaaaattacagaaattatttata-atagatattagagaaccatagaacaaaaaaag 2023776  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || || |||| ||||| |||||| | |||||| | || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||    |||||    
T  2023775 aagaattatattttgtgattgttgtgtactcgaacccaaaaactctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctatt----aatta 2023681  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    ||||||  |||||||| |||| |||||||   | || |||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2023680 ttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacaattatattatatttcatgtaacctacaaaaaatta 2023581  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 42807543 - 42807252
Alignment:
Q  24 atgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaagaata 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||  |||  |||||||||||||||||||||  || ||     ||| || |    
T  42807543 atgaagttgtgtttcatagacattttcctttgcaatagaaaaaattacataaataacttagaatatagatatcagagaacagaagaa-----aaaaaaga 42807449  T
Q  123 actataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaattattaa 222  Q
    | ||||  |||| |||||| | ||||||||||| || |||||| || |||||| |||||||||||||| |||  ||| ||||  |||    |||||||||    
T  42807448 attatatattgtgattgttgtgtactcgtatccaaaagcgctacta-tttataaagaaaaatagtaccgtaaaagttaatatctatt----aattattaa 42807354  T
Q  223 ttgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaattagctt 319  Q
    ||  |||||||| |||| |||||||   |  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  42807353 tttgaccgttttaaaattaatattatcaacttctttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctataaaaaattatctt 42807254  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 2841115 - 2840887
Alignment:
Q  82 agaatatagatatcagagaactaaataacagataaagaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaa 181  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||| ||||||| ||||| |||||| | |||| ||| |  || | |||| | |||||| ||||||    
T  2841115 agaatatagatattagagaaccaaagaacagaaaaagaagaactatattttgtgattgttgtgtacttgtaccaaaaagtgctact-atttatgtagaaa 2841017  T
Q  182 aatagtaccataacggttgatattaattgattaattattaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaa 278  Q
    |||||||||||||||||| ||    ||  |||||| |||||||  |||||||| |||| ||||||   || || |||||  ||||||||| |||||||||    
T  2841016 aatagtaccataacggttaat----atctattaatcattaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaaaattataaaatatgcattaaa 2840921  T
Q  279 tgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaa 312  Q
     ||||  ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  2840920 cgattagattatatttgatgtaacctacaaaaaa 2840887  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 2841214 - 2841110
Alignment:
Q  19 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaac-cagaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||    
T  2841214 cagagatgaagtcgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattacagaaattacttagaatatagatattagagaaccaaagaacagaaaaa 2841115  T
Q  118 gaata 122  Q
    |||||    
T  2841114 gaata 2841110  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 120
Target Start/End: Original strand, 41402913 - 41403014
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaac-cagaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||   ||  ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||    
T  41402913 agagatgaagtcgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattaaacaaattacttagaatatagatatcagagaaccagagaacagaaaaag 41403012  T
Q  119 aa 120  Q
    ||    
T  41403013 aa 41403014  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 20275000 - 20274938
Alignment:
Q  250 gtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaa 312  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||  |||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20275000 gtctttaatattataaaatgtacattaaaaaattagattatatttcatgtaacctacaaaaaa 20274938  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 24776279 - 24776235
Alignment:
Q  19 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaa 63  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24776279 cagagatgaagtcgtatttcgtagacatttttctttgcaatagaa 24776235  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 63
Target Start/End: Original strand, 43642498 - 43642542
Alignment:
Q  19 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaa 63  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  43642498 cagagatgaagtcgtatttcgtagacatttttctttgcaatagaa 43642542  T

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Target: chr5 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 14)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 323 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 33310331 - 33309984
Alignment:
Q  323 aacttcaaaacccgtatgtcaactctatggcaaccaaagcatcaggttgatattaccttgatggaaccaaaccgtttcatgtttcagtcctttaactatg 422  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33310331 aacttcaaaacctgtatgtcaactctatggcaaccaaagcatcaggttgatattac-ttgatggaaccaaaccgtttcatgtttcagttctttaactatg 33310233  T
Q  423 cagatatggaacgagtcatccaacaaggaccttggttgtttgatagctactcgctaatttggagcaaggtttctgatggaaaagattcgttcactatgca 522  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  33310232 cagatatggaacgagtcacccaacaaggaccttggttgtttgatagctacccgctaatttggagcaaggtttctgatggaaaagatccgttcactatgcc 33310133  T
Q  523 catagactcaattgaattatggatgcaagtccataatctcccctttgatttcatgactgagactatgggaattctgttgggcaatcatgttgggaaacta 622  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33310132 catagactcaattgaattatggatgcaagtccataatctccccttcggtttcatgactgagactatgggaattctgttgggcaatcatgttgggaaacta 33310033  T
Q  623 gtgaaatacgatcatgataacaactatggtaactggagaagatacatga 671  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33310032 gtgaaatacgatcatgataacaactatggtaactggagaagatacatga 33309984  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 315
Target Start/End: Original strand, 5811857 - 5812151
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| || | ||   ||  ||||||||||||||||||||| | | |||| | | ||    
T  5811857 agagatgaagtcgtgtttgatagacgtttttctttgcaatagaaaaaaataaaaaaattacttagaatatagatatcagagaaccagagaacaaaaatag 5811956  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| || || |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||    ||  ||||||||    
T  5811957 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctact-atttatatagaaaaatagtatcataacggttaat----atctattaatta 5812051  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    ||||||  |||||||| |||| ||||||   || || |||| | |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5812052 ttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttagtattataaaatgtgtattaaataattagattatatttcatgtaacctacaaaaaatta 5812151  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Original strand, 1211988 - 1212287
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||| ||||||| | || || || |||||||||||||||| ||||||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  1211988 agagatgaagttgtgtttcgttgagattttcctttgcaatagaaaaa-ttatagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 1212086  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    |||||    
T  1212087 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaatt----aatta 1212181  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    | |||| ||||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1212182 tcaatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaatgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 1212281  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 321
Target Start/End: Original strand, 23106843 - 23107140
Alignment:
Q  22 agatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaagaa 120  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||||||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |||    
T  23106843 agatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttatagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacgaa 23106941  T
Q  121 taactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaattatt 220  Q
     ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    ||||||     
T  23106942 gaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaatt----aattatc 23107036  T
Q  221 aattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaattagc 317  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  23107037 aatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaac 23107136  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16479006 - 16478706
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
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T  16479006 agagatgaagtcgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattaaagaaattacttagaatatagatatcagagaaccatagaatagaaaaag 16478907  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatat-agaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 217  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| |  || |||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    ||  | |||||    
T  16478906 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctact-atttatataaaaaaaatagtaccataacggttaat----atctactaatt 16478812  T
Q  218 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 314  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||   || ||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  16478811 attaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctacaaaaaatt 16478713  T
Q  315 agcttca 321  Q
    | |||||    
T  16478712 aacttca 16478706  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16476418 - 16476119
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||||||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  16476418 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttatagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 16476320  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||    ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    |||||    
T  16476319 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatatctacta-tttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaatt----aatta 16476225  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    | |||| ||||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16476224 tcaatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 16476125  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 22496296 - 22496569
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||   ||  ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||    
T  22496296 agagatgaagtcgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattaaacaaattacttagaatatagatatcagagaaccagagaacagaaaaag 22496395  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| || || | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||  ||||||||    
T  22496396 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagtgctact-atttatatagaaaaatagtaccataacggttaat----atctattaatta 22496490  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatattaatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaa 312  Q
    ||||||  |||||||| |||               ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22496491 ttaatttgaccgttttaaaa---------------ttaatattataaaatgtgtattaaatgattatattatatttcatgtaacctacaaaaaa 22496569  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Original strand, 36788995 - 36789295
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  36788995 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 36789093  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    |||||||||| ||||| ||| || | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   ||||||||    
T  36789094 aataactatattttgtgattattgtatactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaa---attaatta 36789189  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  36789190 tcaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatattttatgtaacgtacaaaaaatta 36789289  T
Q  316 gcttca 321  Q
     |||||    
T  36789290 acttca 36789295  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Original strand, 22720614 - 22720913
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||| ||||| || ||| |||||| || |    
T  22720614 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagataccagagcaccaaagaacagaaaacg 22720712  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    |||||||| | ||||| |||||| ||||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  22720713 aataactacattttgtgattgttgtttactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 22720807  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22720808 tcaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacggttaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 22720907  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Original strand, 28968858 - 28969157
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||| ||||||  | ||||| || |||||||||||||||| ||||||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  28968858 agagatgaagttgtgttttgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttatagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 28968956  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    |||||    
T  28968957 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaatt----aatta 28969051  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    | |||| || |||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28969052 tcaatttaatcgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 28969151  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 321
Target Start/End: Original strand, 39564538 - 39564836
Alignment:
Q  19 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 117  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||  ||||||| ||||| ||| |||||| |||    
T  39564538 cagagatgaaatagtgtttcgtagacatttttctttgcaatagaaaaaattacagaaattacttagaata--gatatcatagaaccaaagaacagaaaaa 39564635  T
Q  118 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatat-taattgattaat 216  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||| | |||||| | || ||  ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||     |||    
T  39564636 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcg-acccaaaaacgctacta-tttatataaaaaaatagtaccataacggttaatatctaat-----aat 39564728  T
Q  217 tattaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaat 313  Q
    ||||||||  |||||||| |||| || ||||   | || |||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39564729 tattaatttgaccgttttaaaattaacattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacaattagattatatttcatgtaacctacaaaaaat 39564828  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Original strand, 1597983 - 1598281
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||   |   |||||| |  ||| ||||||| | | |||||| ||||    
T  1597983 agagatgaagtagtgtttcgtagacatttttctttgcaattgaaaaaattacagaaattatttagaataaa--tattagagaaccagagaacagaaaaag 1598080  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || || |||| ||||| |||||| | |||||| | || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||    |||||    
T  1598081 aagaattatattttgtgattgttgtgtactcgaacccaaaaactctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctatt----aatta 1598175  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    ||||||  |||||||| |||| |||||||   | || |||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1598176 ttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacaattatattatatttcatgtaacctacaaaaaatta 1598275  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 82 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 25336835 - 25336598
Alignment:
Q  82 agaatatagatatcagagaactaaataacagataaagaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaa 181  Q
    ||||||||||||| |||| || ||| |||||| || |||  |||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || ||||||||||||    
T  25336835 agaatatagatattagagcaccaaagaacagaaaacgaagtactatattttgtgattgttgtatactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaa 25336737  T
Q  182 aatagtaccataacggttgatattaattgattaattattaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaa 278  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  25336736 aatagtaccataacggttaatat--at--attaattatcaatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaa 25336641  T
Q  279 tgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaattagcttca 321  Q
      |||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  25336640 caattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaacttca 25336598  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40831296 - 40831005
Alignment:
Q  19 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 117  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||   |   ||||||  ||||| ||||||| | | |||| | |||    
T  40831296 cagagatgaagtagtgtttcgtagacatttttctttgcaattgaaaaaattacagaaattatttagaata--gatattagagaaccagagaacataaaaa 40831199  T
Q  118 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 217  Q
    ||| || |||| ||||| |||||| | |||||| | || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||    ||||    
T  40831198 gaagaattatattttgtgattgttgtgtactcgaacccaaaaactctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctatt----aatt 40831104  T
Q  218 attaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaat 313  Q
    |||||||   ||||||| |||| |||||||   | || |||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40831103 attaatttggccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacaattatattatatttcatgtaacctacaaaaaat 40831005  T

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Target: chr7 (Bit Score: 215; Significance: 1e-117; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 321
Target Start/End: Original strand, 19295816 - 19296116
Alignment:
Q  19 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaaccagaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  19295816 cagagatgaagtcgtgttgcataggcatctttctttgcaatagaaaaa-ttatagaaacaaccagaatatagatatcagagaaccagataacagataaag 19295914  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  19295915 aatagctataatttgtgattgttgtttactcgtatcccaagacgctactaatt-atatagaaaaatagtaccataacagttaatattaattaattaatta 19296013  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatattaatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaattagct 318  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  19296014 ttaatttaaccgttttaaaatcaatattaacgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatactaaaaactagct 19296113  T
Q  319 tca 321  Q
    |||    
T  19296114 tca 19296116  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 6613479 - 6613180
Alignment:
Q  19 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 117  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||  ||||||||||||| | | |||||| |||    
T  6613479 cagagatgaagtagtgtttcgtagacatttttctttgcaatagaaaaaattacagaaattacttagaata--gatatcagagaaccagagaacagaaaaa 6613382  T
Q  118 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 217  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||  |||||||    
T  6613381 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtatccaaaagcgctact-atttatatagaaaaatagtaccataacggttaat----atctattaatt 6613287  T
Q  218 atta-attgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaat 313  Q
    |||| |||| |||||||| |||| ||||||   || || |||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6613286 attacattg-accgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctacaaaaaat 6613188  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 321
Target Start/End: Original strand, 21953503 - 21953793
Alignment:
Q  19 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaaccagaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||          |||||||||||||| ||||||| | | |||||| ||||    
T  21953503 cagagatgaagtcgtgtttcgtagatatttttctttgcaatagaaaaaatta----------cagaatatagatattagagaaccagagaacagaaaaag 21953592  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| || || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |  ||||||||    
T  21953593 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctact-atttatatagaaaaatagtaccataacggttaata--act--attaatta 21953687  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    ||||||  | |||||| |||| ||||||   || || |||||| ||||||||||| || |||| ||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21953688 ttaatttgatcgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtacactaaacgattagattatatttcatttaacctacaaaaaatta 21953787  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Original strand, 18783924 - 18784223
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||||||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  18783924 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttatagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 18784022  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    |||||    
T  18784023 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaatt----aatta 18784117  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    | |||| ||||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18784118 tcaatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 18784217  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Original strand, 34643133 - 34643432
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
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T  34643133 agagatgaagtcgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattaaagaaattacttagaatatagatatcagagaaccatagaatagaaaaag 34643232  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||| ||| |  || |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    ||  | ||||||    
T  34643233 aagaactatattttgtgattgttgtgtacttgtacctaaaagcgctact-atttatataaaaaaatagtaccataacggttaat----atctactaatta 34643327  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    ||||||  |||||||| |||| ||||||   || ||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  34643328 ttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctacaaaaaatta 34643426  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 42047431 - 42047132
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||||||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  42047431 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttatagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 42047333  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    |||||    
T  42047332 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaatt----aatta 42047238  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    | |||| ||||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42047237 tcaatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 42047138  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 42050135 - 42049835
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||||||||||||| | | || ||| ||||    
T  42050135 agagatgaagtcgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattaaagaaattacttagaatatagatatcagagaaccatagaatagaaaaag 42050036  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatat-agaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 217  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| |  || |||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    ||  | |||||    
T  42050035 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctact-atttatataaaaaaaatagtaccataacggttaat----atctactaatt 42049941  T
Q  218 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 314  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||   || ||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  42049940 attaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctacaaaaaatt 42049842  T
Q  315 agcttca 321  Q
    | |||||    
T  42049841 aacttca 42049835  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 35505673 - 35505374
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  35505673 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 35505575  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  35505574 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 35505480  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35505479 tcaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 35505380  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 46805590 - 46805296
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||| || | ||   ||  ||||||||||||||||||||| | | |||| | | ||    
T  46805590 agagatgaagtcgtgtttggtagacgtttttctttgcaatagaaaaaaataaaaaaattacttagaatatagatatcagagaaccagagaacaaaaatag 46805491  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| ||| || | |||||||| || || |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    ||  ||||||||    
T  46805490 aagaactatattttgtgattattgtgtactcgtacccaaaagcgctacta-tttatatagaaaaatagtatcataacggttaat----atctattaatta 46805396  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    ||||||  |||||||| |||| ||||||   || || |||| | |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46805395 ttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttagtattataaaatgtgtattaaataattagattatatttcatgtaacctacaaaaaatta 46805296  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Original strand, 44044864 - 44045163
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||| ||||| || ||| |||||| || |    
T  44044864 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagataccagagcaccaaagaacagaaaacg 44044962  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    |||||||| | ||||| |||||| ||||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  44044963 aataactacattttgtgattgttgtttactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 44045057  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44045058 tcaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacggttaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 44045157  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 311
Target Start/End: Original strand, 9178656 - 9178948
Alignment:
Q  19 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaac-cagaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 117  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  | ||||||||||||||||||| | | |||||| |||    
T  9178656 cagagatgaagtcttgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattacagaaattacttaaaatatagatatcagagaaccagagaacagacaaa 9178755  T
Q  118 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 217  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||| | |||||||| |  || | |||| | ||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||    ||  |||||||    
T  9178756 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtaccgaaaagtgctact-atttatataaaaaaatagttccataatggttaat----atctattaatt 9178850  T
Q  218 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatg-taacatacaaaaa 311  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||   || || |||||| ||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  9178851 attaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatatgcattaaaagattagattatatttcatgttaacctacaaaaa 9178948  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Original strand, 37315398 - 37315697
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  37315398 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 37315496  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  37315497 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 37315591  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    | ||||  | |||| | |||| |||||||   |  |||||||| |||||||| ||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37315592 tcaatttgatcgttctaaaattaatattatcaacatctttaatattataaaacgtgcattaaacaattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 37315691  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 35114186 - 35113887
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  35114186 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 35114088  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  35114087 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttagatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 35113993  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    | ||||  | |||| | |||| |||||||   |  |||||||| |||||||| ||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35113992 tcaatttgatcgttctaaaattaatattatcaacatctttaatattataaaacgtgcattaaacaattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 35113893  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 315
Target Start/End: Original strand, 47400310 - 47400375
Alignment:
Q  250 gtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||    
T  47400310 gtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaaattaaaaaaaatta 47400375  T

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Target: chr3 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 23)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 37965613 - 37965314
Alignment:
Q  19 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 117  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||  ||||||||||||| | | |||||| |||    
T  37965613 cagagatgaagtagtgtttcgtagacatttttctttgcaatagaaaaaattacagaaattacttagaata--gatatcagagaaccagagaacagaaaaa 37965516  T
Q  118 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 217  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||  |||||||    
T  37965515 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtatccaaaagcgctact-atttatatagaaaaatagtaccataacggttaat----atctattaatt 37965421  T
Q  218 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 314  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||   || || |||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37965420 attaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctacaaaaaatt 37965321  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 321
Target Start/End: Original strand, 47333728 - 47334029
Alignment:
Q  19 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||||||||||||| | | |||| | |||    
T  47333728 cagagatgaagtcgtgtttcgtagacatttttctttgcaatagaaaaaattacagaaattacttagaatatagatatcagagaaccagagaacataaaaa 47333827  T
Q  118 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 217  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||  |||||||    
T  47333828 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtatccaaaagcgctact-atttatatagaaaaatagtaccataacggttaat----atctattaatt 47333922  T
Q  218 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 314  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||   || || |||||| || |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  47333923 attaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattttaaaatatgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctacaaagaatt 47334022  T
Q  315 agcttca 321  Q
    | |||||    
T  47334023 aacttca 47334029  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 321
Target Start/End: Original strand, 28417682 - 28417981
Alignment:
Q  19 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 117  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   ||  ||||||  ||||||||||||| | | |||||| |||    
T  28417682 cagagatgaagtagtgtttcgtagacatttttctttgcaatagaaaaaattataaaaattacttagaata--gatatcagagaaccagagaacagaaaaa 28417779  T
Q  118 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 217  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||  |||||||    
T  28417780 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtatccaaaagtgctact-atttatatagaaaaatagtaccataacggttaat----atctattaatt 28417874  T
Q  218 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 314  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||   || || |||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28417875 attaatttgaccgttttaaaattaatattataaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctacaaaaaatt 28417974  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Original strand, 4066030 - 4066320
Alignment:
Q  19 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 117  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||  ||||||||||||| | | |||||| |||    
T  4066030 cagagatgaagtagtgtttcgtagacatttttctttgcaatagaaaaaattacagaaattacttagaata--gatatcagagaaccagagaacagaaaaa 4066127  T
Q  118 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 217  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||  |||||||    
T  4066128 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtatccaaaagcgctact-atttatatagaaaaatagtaccataacggttaat----atctattaatt 4066222  T
Q  218 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaa 312  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||   || || |||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  4066223 attaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctacaaaaaa 4066320  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 321
Target Start/End: Original strand, 3344331 - 3344630
Alignment:
Q  19 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaaccagaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||   ||  |||||||||||| ||||||| | | |||||| ||||    
T  3344331 cagagatgaagtcgtgtttcgtagacatttttctttgcaatagaaaaagttacaaaaattactggaatatagatattagagaaccagagaacagaaaaag 3344430  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| || || |||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||    |||||    
T  3344431 aagaactata-tttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctacta-tatatatagaaaaataataccataacggttaatatctatt----aatta 3344524  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    |||| |  |||||||| |||| |||||||   | || |||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3344525 ttaagttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctacaaaaaatta 3344624  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Original strand, 26705432 - 26705731
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  26705432 agagatgaagtcgtgtttcgtagacatttttctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 26705530  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  26705531 aagaactatattttgtgattgttatgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 26705625  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26705626 tcaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 26705725  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22398638 - 22398347
Alignment:
Q  19 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 117  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||   ||  ||||||  ||||||||||||| | |||||||| |||    
T  22398638 cagagatgaagtagtgtttcgtagacatttttctttgcaatagaaaaaattacaaaaattacttagaata--gatatcagagaaccagataacagaaaaa 22398541  T
Q  118 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 217  Q
    ||| | ||||| ||||| |||||| | |||||||| || || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||  |||||||    
T  22398540 gaagagctatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaat----atctattaatt 22398446  T
Q  218 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaat 313  Q
    |||||||   ||||||| |||| ||||||   ||  | |||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22398445 attaatttggccgttttaaaattaatattatcaacatatttaatattataaaatgcgcattaaaagattatattatatttcatgtaacctacaaaaaat 22398347  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 321
Target Start/End: Original strand, 10121995 - 10122295
Alignment:
Q  19 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||| ||| ||||  |    ||||||||||||||| || || ||| |||||| ||     
T  10121995 cagagatgaagtcgtgtttcgtagacattttcatttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcaaagcaccaaagaacagaaaac 10122093  T
Q  118 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 217  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    ||||    
T  10122094 gaaaaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatt 10122188  T
Q  218 attaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 314  Q
    || |||| ||||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10122189 atcaatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatt 10122288  T
Q  315 agcttca 321  Q
    | |||||    
T  10122289 aacttca 10122295  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 33956515 - 33956804
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||  ||||||| ||||||| | |||||| |||     
T  33956515 agagatgaagtagtgtttcgtagacatttttctttgcaatagaaaaaattacagaaattacttagaata--gatatcaaagaactagagaacagaaaaaa 33956612  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaag-gcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 217  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| | |||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||    ||||    
T  33956613 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgta-ctcaagagctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctatt----aatt 33956706  T
Q  218 attaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaa 312  Q
    |||||||  ||||| || |||| |||||||   | || |||||| |||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  33956707 attaatttgaccgtgttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcatttaacgattaaattatatttcatgtaacatacaaaaaa 33956804  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Original strand, 35350120 - 35350419
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  35350120 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 35350218  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  35350219 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 35350313  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35350314 tcaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 35350413  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Original strand, 33955210 - 33955500
Alignment:
Q  19 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 117  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||   ||  ||||||  ||||||||||||| | | |||||| |||    
T  33955210 cagagatgaagtagtgtttcgtagacatttttctttgcaatagaaaaaattacaaaaattacttagaata--gatatcagagaaccagagaacagaaaaa 33955307  T
Q  118 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 217  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||| | |||||||| || || |||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||    ||  |||||||    
T  33955308 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctact-atttgtatagaaaaatagtactataacggttaat----atctattaatt 33955402  T
Q  218 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaa 312  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||   ||  | |||||| |||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  33955403 attaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacttatttaatattataaaatgtgcatttaactattagattatatttcatgtaacctacaaaaaa 33955500  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Original strand, 1002328 - 1002627
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  1002328 agagatgaagtcgtgtttcgtagatattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 1002426  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    |||||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  1002427 aataactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 1002521  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    | ||||  || ||||| |||| ||||| |   | ||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1002522 tcaatttgactgttttaaaattaatatcatcaacgtctttaatattataaaacatgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 1002621  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 43845635 - 43845336
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  43845635 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 43845537  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  43845536 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 43845442  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    | ||||  | |||| | |||| |||||||   |  |||||||| |||||||| ||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43845441 tcaatttgatcgttctaaaattaatattatcaacatctttaatattataaaacgtgcattaaacaattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 43845342  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 54610991 - 54610692
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  54610991 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 54610893  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  54610892 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 54610798  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    | ||||  | |||| | |||| |||||||   |  |||||||| |||||||| ||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54610797 tcaatttgatcgttctaaaattaatattatcaacatctttaatattataaaacgtgcattaaacaattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 54610698  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 30107484 - 30107195
Alignment:
Q  30 tcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaagaataactata 128  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| |||| | |||||| || ||| | |||||    
T  30107484 tcgtgtttcgtagacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcactagagaacagaaaacgaagagctata 30107386  T
Q  129 atttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaattattaattgaac 228  Q
     ||||| |||||| | ||||| || || || || | | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||| ||||  ||    
T  30107385 ttttgtgattgttgtatactcatacccaaaagctcaacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aattatcaatttgac 30107291  T
Q  229 cgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaattagcttca 321  Q
    |||||| |||| |||||||   |   ||||||| |||||||| ||||||||||  |||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  30107290 cgttttaaaattaatattataaacaactttaatattataaaaagtgcattaaacaattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaattaacttca 30107195  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 193
Target Start/End: Original strand, 45579403 - 45579574
Alignment:
Q  22 agatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaac-cagaatatagatatcagagaactaaataacagataaagaa 120  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||    
T  45579403 agatgaagtcgtgttacgtagacatttttctttgcaatagaaaaaattacagaaataacttagaatatagatatcagagaaccagagaacagaaaaagaa 45579502  T
Q  121 taactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccata 193  Q
     || |||| ||||| | |||| | |||||||| || || |||||| | |||||||| ||||  ||||||||||    
T  45579503 gaattatattttgtgagtgttgtgtactcgtacccaaaagcgctact-atttatatggaaaggtagtaccata 45579574  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 185 - 321
Target Start/End: Original strand, 38189938 - 38190073
Alignment:
Q  185 agtaccataacggttgatattaattgattaattattaattgaaccgttttgaaatcaatattaat---gtctttaattttataaaatgtgcattaaatga 281  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||    |||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  38189938 agtaccataacggttaatataaatt----aattatcaatttgaccgttttaaaattaatattaactacgtctttaatattataaaatgtgcattaaacga 38190033  T
Q  282 ttgtattatatttcatgtaacatacaaaaaattagcttca 321  Q
    ||  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  38190034 ttaaattatatttcatgtaatgtacaaaaaattaacttca 38190073  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23303508 - 23303395
Alignment:
Q  211 attaattattaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacataca 307  Q
    ||||||| ||||||  |||||||| |||| |||||||   |  |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  23303508 attaattgttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacatctttaatattataaaatgtacattaaacgattagattatatttcatgtaacctaca 23303409  T
Q  308 aaaaattagcttca 321  Q
    |||||||| |||||    
T  23303408 aaaaattaacttca 23303395  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23302851 - 23302738
Alignment:
Q  211 attaattattaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacataca 307  Q
    ||||||| ||||||  |||||||| |||| |||||||   |  |||||||| |||| |||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  23302851 attaattgttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacatctttaatattattaaatgtacattaaacgattagattatatttcatgtaacctaca 23302752  T
Q  308 aaaaattagcttca 321  Q
    |||||||| |||||    
T  23302751 aaaaattaacttca 23302738  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 23303734 - 23303652
Alignment:
Q  19 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaac-cagaatatagatatcagagaac 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||  |||  ||||||||||||||| |||||    
T  23303734 cagagatgaagtcgtgtttcgtagacctttttctttgcaat--aaaaaattatagaaataacttagaatatagatatcaaagaac 23303652  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 321
Target Start/End: Original strand, 45579650 - 45579720
Alignment:
Q  250 gtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaattagcttca 321  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  45579650 gtctttaatattataaaatgtgcattaaatggatagattatatttcatgtaaccta-aaaaaattaacttca 45579720  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 66
Target Start/End: Original strand, 38189860 - 38189906
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaa 66  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  38189860 agagatgaagtcgtgtttcgtagacattttcctttgcaatagaaaaa 38189906  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 531 - 612
Target Start/End: Original strand, 25731771 - 25731852
Alignment:
Q  531 caattgaattatggatgcaagtccataatctcccctttgatttcatgactgagactatgggaattctgttgggcaatcatgt 612  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |  || |||||||   | ||||||||  ||||||||||||||||    
T  25731771 caattgaattataggtgcaagtccataatctccctttcggatttatgactgtatcaatgggaatcttgttgggcaatcatgt 25731852  T

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Target: chr4 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 11)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Original strand, 36352526 - 36352826
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
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T  36352526 agagataaagtcgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattaaagaaattacttagaatatagatatcatagaaccaaagaacagaaaaag 36352625  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
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T  36352626 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctact-atttatatagaaaaatagtaccataacggttaat----atctattaatta 36352720  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
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T  36352721 ttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacaattagattatatttcatgtaacctacaaaaaatta 36352820  T
Q  316 gcttca 321  Q
     |||||    
T  36352821 acttca 36352826  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 34802874 - 34802584
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
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T  34802874 agagatgaagtcgtgtttcgtagacgtgtttctttgcaatagaaaaaattaaagaaattacttagaatatagatattagagaaccagagaacagaaaaag 34802775  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||| | |||||| | |||||||| || || |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||    ||  |||||| |    
T  34802774 aagaactatattttatgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctacta-tttatacagaaaaatagtaccataacggttaat----atctattaataa 34802680  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaa 311  Q
    ||||||  | |||||| |||| ||||||   || || |||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34802679 ttaatttgaacgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctacaaaaa 34802584  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 321
Target Start/End: Original strand, 27023843 - 27024142
Alignment:
Q  22 agatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaa-ttatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaaga 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||| | ||   ||  |||||||||| |||||||||| | | |||| | |||||    
T  27023843 agatgaagtcgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaaattaaaaaaattacttagaatatagaaatcagagaaccagagaacaaaaaaaga 27023942  T
Q  120 ataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaattat 219  Q
    | ||||||| ||||| |||||| | |||||||| || || | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||  |||||||||    
T  27023943 agaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagtgctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaat----atctattaattat 27024037  T
Q  220 taattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaattag 316  Q
    |||||  ||| |||| |||| ||||||   || || |||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||     
T  27024038 taatttgaccattttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatataacctacaaaaaattaa 27024137  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 5944694 - 5944393
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaac-cagaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
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T  5944694 agagatgaagtcgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattaaagaaattacttagaatatagatatcagagaaccatagaataaaaaaag 5944595  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatt-tatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 217  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| |  || |||||| || || |||| | ||||||||||||||||||||| ||    ||  | |||||    
T  5944594 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctactatttatataaaaaaaaatagtaccataacggttaat----atctactaatt 5944499  T
Q  218 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 314  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||   || ||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  5944498 attaatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctacaaaaaatt 5944400  T
Q  315 agcttca 321  Q
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T  5944399 aacttca 5944393  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 7510295 - 7509996
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
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T  7510295 agagacgaagtcgtgtttcatagacattttcctttacaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccagagaacagaaaacg 7510197  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
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T  7510196 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 7510102  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7510101 tcaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 7510002  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 27071863 - 27071564
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
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T  27071863 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 27071765  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  27071764 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 27071670  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27071669 tcaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 27071570  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 27151955 - 27151656
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||| ||||||||| || ||| |||||| || |    
T  27151955 agagatgaagttgtgtttcattgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatataaatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 27151857  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    |||||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||    
T  27151856 aataactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatat-aatt---taatta 27151762  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    | ||||  || ||||| |||| |||||||   | ||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27151761 tcaatttgacagttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtgatttaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 27151662  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 9767902 - 9768192
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    | |||||||||||||||| || | | |||||| || |    
T  9767902 agagttgaagtcgtgtttcatagacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttaaaatatagatatcagagcaccagagaacagaaaacg 9768000  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  9768001 aaaaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatcaatt----aatta 9768095  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaa 312  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||||||    
T  9768096 tcaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaagttatatttcatgtaacgtacaaaaaa 9768192  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 48946083 - 48945793
Alignment:
Q  22 agatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaagaa 120  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| | ||  |||  |||||||||||||||||        ||||||| ||||||    
T  48946083 agatgaagttgtgtttcgtagacattttcctttgcaatagaaaaaattacataaataacttagaatatagatatcaga--------taacagaaaaagaa 48945992  T
Q  121 taactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaattatt 220  Q
     ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || || || ||| || ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||  |||    |||||||    
T  48945991 gaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaagctctacta-tttatatagaaaagtagtaccataacgattaatatctatt----aattatt 48945897  T
Q  221 aattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaattagc 317  Q
    ||||  |||||||| | || |||||||   |  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  48945896 aatttgaccgttttaatattaatattatcaacttctttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctataaaaaattatc 48945797  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 4944018 - 4943719
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  4944018 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 4943920  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  4943919 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 4943825  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    | ||||  | |||| | |||| |||||||   |  |||||||| |||||||| ||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4943824 tcaatttgatcgttctaaaattaatattatcaacatctttaatattataaaacgtgcattaaacaattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 4943725  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 211 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 25888049 - 25887936
Alignment:
Q  211 attaattattaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacataca 307  Q
    ||||||| ||||||  |||||||| |||| |||||||   |  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  25888049 attaattgttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacttctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctaca 25887950  T
Q  308 aaaaattagcttca 321  Q
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T  25887949 aaaaattaacttca 25887936  T

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Target: scaffold0088 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 11622 - 11321
Alignment:
Q  19 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 117  Q
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T  11622 cagagatgaagtcgtgtttcatagacgtttttctttgcaatagaaaaaattaaagaaattacttagaatatagatatcagagaaccagagaacagaaaaa 11523  T
Q  118 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 217  Q
    ||||||||||| ||||| ||| || | |||||||| || || |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||  |||||||    
T  11522 gaataactatattttgtgatttttgtgtactcgtacccaaaagcgcgact-atttatatagaaaaatagtaccataacggttaat----atctattaatt 11428  T
Q  218 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 314  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||   ||  | |||||| |||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11427 attaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacatatttaatattataaaatgtgcattaaacacttagattatatttcatgtaacctacaaaaaatt 11328  T
Q  315 agcttca 321  Q
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T  11327 aacttca 11321  T

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Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 321
Target Start/End: Original strand, 659 - 956
Alignment:
Q  21 gagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagca-accagaatatagatatcagagaactaaataacagataaaga 119  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    |  ||||||  ||||||||||||| | | |||||| |||||    
T  659 gagatgaagtagtgttttgtagacatttttctttgcaatagaaaaaattacagaaattgattagaata--gatatcagagaaccagagaacagaaaaaga 756  T
Q  120 ataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaattat 219  Q
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T  757 agaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacagttaatatc---tg-ttaattat 851  T
Q  220 taattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaattag 316  Q
    |||||  |||||||| |||| |||||||   | || |||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  852 taatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtttttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctacaaaaaattaa 951  T

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Target: scaffold0088; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 321
Target Start/End: Original strand, 24549 - 24840
Alignment:
Q  19 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaac-cagaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 117  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    |  |||  |||||||||||||        |||||| |||    
T  24549 cagagatgaagtagtgttttgtagacatatttctttgcaatagaaaaaattacagaaattgcttaga--atagatatcagag--------aacagaaaaa 24638  T
Q  118 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 217  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||| | |||||||   | || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||  |||||||    
T  24639 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgttctcaaaagcgctact-atttatatagaaaaatagtaccataacggttaat----atctattaatt 24733  T
Q  218 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 314  Q
    |||||||   | ||||| |||| ||||||   || || |||||| | ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24734 attaatttggcagttttaaaattaatattatcaacgtatttaatatgataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctagaaaaaatt 24833  T

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Target: chr2 (Bit Score: 95; Significance: 4e-46; HSPs: 10)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Original strand, 39121812 - 39122111
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
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T  39121812 agagatgaagtcgtgtttcgtagacatttttctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 39121910  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  39121911 aagaactatattttgtgattgttatgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 39122005  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39122006 tcaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 39122105  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
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Target Start/End: Complemental strand, 9617186 - 9616883
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Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||  |||  ||||||  ||||||||||||| | |||||| | ||||    
T  9617186 agagatgaaatcgtgtttcgtagacatttttctttgcaatagaaaaaattacataaataacttagaata--gatatcagagaaccacataacataaaaag 9617089  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| || ||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  |||    ||||     
T  9617088 aagaactatattttatgattgttgtgtactcgtatccaaaagcg-tacta-tttatacagaaaaatagtactataacggttaatatctatt----aattg 9616995  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    ||||||  |||||||| || | |||||||   | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9616994 ttaatttgaccgttttaaagttaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 9616895  T
Q  316 gcttcacaactt 327  Q
     ||||| |||||    
T  9616894 acttcataactt 9616883  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 6905254 - 6904963
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Q  24 atgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaagaata 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||  |||  |||||||||||||||||||||  || ||     ||| || |    
T  6905254 atgaagttgtgtttcatagacattttcctttgcaatagaaaaaattacataaataacttagaatatagatatcagagaacagaagaa-----aaaaaaga 6905160  T
Q  123 actataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaattattaa 222  Q
    |||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || |||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  |||    |||||||||    
T  6905159 actatattttgtgattgttgtgtactcgtatccaaaagcgctacta-tttataaagaaaaatagtaccgtaacggttaatatctatt----aattattaa 6905065  T
Q  223 ttgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaattagctt 319  Q
    ||  |||||||| |||| |||||||   |  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  6905064 tttgaccgttttaaaattaatattatcaacttctttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctataaaaaattatctt 6904965  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Original strand, 42842330 - 42842629
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Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    ||||||||||||| |||| |  ||| |||||| || |    
T  42842330 agagatgaagtcgtgtttcgtagtcattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatattagagcatcaaagaacagaaaatg 42842428  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| |||||||||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  42842429 aagaactatattttgtaattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 42842523  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42842524 tcaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtgcattaaacaattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 42842623  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Original strand, 4650764 - 4651056
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Q  19 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaac-cagaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 117  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||    
T  4650764 cagagatgaagttgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattacagaaattacttagaatatagatattagagaaccaaagaacagaaaaa 4650863  T
Q  118 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 217  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||| | ||||  || || || | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||  ||||||     
T  4650864 gaagaactatattttgtgattgttgtgtacttatacccaaaagtgctact-atttatatagaaaaatagtaccataacggttaat----atctattaatc 4650958  T
Q  218 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaa 312  Q
    |||||||  | |||||| |||| ||||||   || || |||||  ||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4650959 attaatttgatcgttttaaaattaatattatcaacgtatttaaaattataaaatatgcattaaacgattagattatatttgatgtaacctacaaaaaa 4651056  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Original strand, 12255968 - 12256267
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||| ||||| || ||| |||||| || |    
T  12255968 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagataccagagcaccaaagaacagaaaacg 12256066  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    |||||||| | ||||| |||||| ||||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  12256067 aataactacattttgtgattgttgtttactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 12256161  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12256162 tcaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacggttaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 12256261  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 40264246 - 40263949
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||||||||||| || || | |||||||| |||||||||||||| ||||   |   ||||||||||||||||||||| | | || ||| ||||    
T  40264246 agagatgaagtcgtgtttcgtatacgtttttctttgtaatagaaaaaattaaagaaattatttagaatatagatatcagagaaccatagaatagaaaaag 40264147  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| || || |||||| || || ||||| ||||||| ||   |||||||| ||||  |||    |||||    
T  40264146 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctacta-ttgatataaaaaaatacta---taacggttaatatctatt----aatta 40264055  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    ||| ||  |||||||| |||| |||||||   | || |||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40264054 ttattttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctacaaaaaatta 40263955  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 315
Target Start/End: Original strand, 4720051 - 4720332
Alignment:
Q  24 atgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaagaata 122  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||| | ||  |||  |||||||||||||||||||||        ||| |||||| |    
T  4720051 atgaagttgtgtttcgtagacattttcctttgcaatagaaaatattacataaataacttagaatatagatatcagagaac--------agaaaaagaaga 4720142  T
Q  123 actataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaattattaa 222  Q
    |||||| ||||| |||||| | ||||||| | | || | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||    |||||||||    
T  4720143 actatattttgtgattgttgtgtactcgttttcaaaagtgctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctatt----aattattaa 4720237  T
Q  223 ttgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    ||  |||||||| |||| |||||||   |  |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  4720238 tttgaccgttttaaaattaatattatcaacttctttaatattataaa-tgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctataaaaaatta 4720332  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 321
Target Start/End: Original strand, 3554308 - 3554615
Alignment:
Q  19 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||  |||  ||||||||||||||| ||||| | | |||| | |||    
T  3554308 cagagatgaagtcgtgtttcgtagacatttttctttgcaata--aaaagttacagaaataacttagaatatagatatcaaagaaccagagaacaaaaaaa 3554405  T
Q  118 gaataa-----ctataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgat 212  Q
    ||| ||     ||||| ||||| |||||| | || || || |  || | |||| || |||||||| ||||||||||| |||||| || ||||  ||  ||    
T  3554406 gaaaaaaaaaactatattttgtgattgttgtgtattcatacctaaaagtgctacta-tttatata-aaaaatagtactataacgattaatatatatatat 3554503  T
Q  213 taattattaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaa 309  Q
    ||||| ||||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  3554504 taattgttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctacaaa 3554603  T
Q  310 aaattagcttca 321  Q
    |||||| |||||    
T  3554604 aaattaacttca 3554615  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 211 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 42224694 - 42224587
Alignment:
Q  211 attaattattaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacataca 307  Q
    ||||||| ||||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  42224694 attaattgttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaacgattagattatatttcatgtaacctaca 42224595  T
Q  308 aaaaatta 315  Q
    ||||||||    
T  42224594 aaaaatta 42224587  T

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Target: scaffold1289 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1289
Description:

Target: scaffold1289; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 1015 - 714
Alignment:
Q  19 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 117  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||    
T  1015 cagagatgaagtagtgttttgtagacatatttctttgcaatagaaaaaattacagaaattacttagaatatagatattagagaaccaaagaacagaaaaa 916  T
Q  118 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 217  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||| | |||||||   | || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||  |||||||    
T  915 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcgttctcaaaagcgctact-atttatatagaaaaatagtaccataacggttaat----atctattaatt 821  T
Q  218 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 314  Q
    |||||||   | ||||| |||| ||||||   || || |||||| | ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  820 attaatttgtctgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatatgataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctataaaaaatt 721  T
Q  315 agcttca 321  Q
    | |||||    
T  720 aacttca 714  T

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Target: scaffold0009 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Original strand, 198225 - 198524
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||||||||||||| | | || ||| ||||    
T  198225 agagatgaagtcgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattaaagaaattacttagaatatagatatcagagaaccatagaatagaaaaag 198324  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| |  || |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    ||  | ||||||    
T  198325 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctact-atttatataaaaaaatagtaccataacggttaat----atctactaatta 198419  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    ||||||  |||||||| |||| ||||||   || ||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  198420 ttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctacaaaaaatta 198518  T

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Target: chr8 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 13)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 6417410 - 6417111
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||||||||||||| | | || ||| ||||    
T  6417410 agagatgaagtcgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattaaagaaattacttagaatatagatatcagagaaccatagaatagaaaaag 6417311  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| |  || |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    ||  | ||||||    
T  6417310 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctact-atttatataaaaaaatagtaccataacggttaat----atctactaatta 6417216  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    ||||||  |||||||| |||| ||||||   || ||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  6417215 ttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctacaaaaaatta 6417117  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 22514659 - 22514360
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  22514659 agagatgaagtcgtgtttcgtagacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 22514561  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  22514560 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 22514466  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22514465 tcaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 22514366  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 40558242 - 40557943
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  40558242 agagatgaagtcgtgtttcgtagacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 40558144  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  40558143 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 40558049  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40558048 tcaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 40557949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Original strand, 12501001 - 12501300
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    |||| |||||| ||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||| ||||   |   ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||    
T  12501001 agagctgaagttgtgtttcgtaaacatttttctttgcaattgaaaaaattaaagaaattatttagaatatagatatcagagaaccatagaacagaaaaag 12501100  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| || ||  ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||    |||||    
T  12501101 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgta-ccaaaaacgctacta-ttgatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctatt----aatta 12501194  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    ||| ||  |||||||| |||| |||||||   | || |||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12501195 ttattttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctacaaaaaatta 12501294  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16428993 - 16428694
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||||||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  16428993 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttatagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 16428895  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    |||||    
T  16428894 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaatt----aatta 16428800  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    | |||| ||||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16428799 tcaatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 16428700  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Original strand, 36895871 - 36896170
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  36895871 agagatgaagtcgtgtttcgtagacattttcacttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 36895969  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||| ||  | | | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  36895970 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatatccaaaatctccacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 36896064  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    | |||| ||||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36896065 tcaatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 36896164  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 315
Target Start/End: Original strand, 39621430 - 39621724
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||   ||  ||||||||||||||||||||| | | |||| | | ||    
T  39621430 agagatgaagtcgtgtttggtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattaaaaaaattacttagaatatagatatcagagaaccagagaacaaaaatag 39621529  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| || || |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||    ||  ||||||||    
T  39621530 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctact-atttatatagaaaaatagtatcataacggttaat----atctattaatta 39621624  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    ||||||  |||||||| |||| ||||||   || || |||| | |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  39621625 ttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttagtattataaaatgtgtattaaataattagattatattttatgtaacctacaaaaaatta 39621724  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Original strand, 18384928 - 18385228
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaac-cagaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||||||||||||| | | || ||| ||||    
T  18384928 agagatgaagtcgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattaaagaaattacttagaatatagatatcagagaaccatagaatagaaaaag 18385027  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatat-agaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 217  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| |  || |||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    ||  | |||||    
T  18385028 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctact-atttatataaaaaaaatagtaccataacggttaat----atctactaatt 18385122  T
Q  218 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 314  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||   || ||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18385123 attaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctacaaaaaatt 18385221  T
Q  315 agcttca 321  Q
    | |||||    
T  18385222 aacttca 18385228  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Original strand, 13279060 - 13279359
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    ||||||||||||||| || || ||| |||||| || |    
T  13279060 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcaaagcaccaaagaacagaaaacg 13279158  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    |||||    
T  13279159 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaatt----aatta 13279253  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    | |||| ||||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13279254 tcaatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 13279353  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 33442166 - 33441866
Alignment:
Q  19 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||| || | | |||||| ||     
T  33442166 cagagatgaagtcgtgtttcgtagacattttcctttacaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccagagaacagaaaac 33442068  T
Q  118 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 217  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || || || ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    ||||    
T  33442067 gaagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaagctctgcta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatt 33441973  T
Q  218 attaattgaaccgttttgaaatcaatattaatgtc---tttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 314  Q
    || ||||  |||||||| |||| ||||||| |  |   |||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33441972 atcaatttgaccgttttaaaattaatattattaacaactttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatt 33441873  T
Q  315 agcttca 321  Q
    | |||||    
T  33441872 aacttca 33441866  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 321
Target Start/End: Original strand, 16888155 - 16888226
Alignment:
Q  250 gtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaattagcttca 321  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16888155 gtctttaatattataaaacgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctacaaaaaattaacttca 16888226  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 312
Target Start/End: Original strand, 29088562 - 29088760
Alignment:
Q  115 aaagaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgatta 214  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || || | |||| || ||||||||||||| |||||| |||||| || ||||  ||  ||||    
T  29088562 aaagaaaaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaagtgctacta-tttatatagaaaa-tagtactataacgattaatatatatatatta 29088659  T
Q  215 attattaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaa 311  Q
    |||  |||||  |||||||| |||| |||||||   | ||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29088660 attgctaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacgtacaaaaa 29088759  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 60
Target Start/End: Original strand, 16885799 - 16885840
Alignment:
Q  19 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaata 60  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16885799 cagagatgaagtcgtgtttcgtagacatttttctttgcaata 16885840  T

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Target: scaffold0007 (Bit Score: 83; Significance: 6e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 11918 - 11619
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||||||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  11918 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttatagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 11820  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    |||||    
T  11819 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaatt----aatta 11725  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    | |||| ||||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11724 tcaatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 11625  T

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Target: chr6 (Bit Score: 83; Significance: 6e-39; HSPs: 6)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Original strand, 4270928 - 4271227
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||||||||  |    |||||||||||||||||| || ||| |||||| || |    
T  4270928 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttatagaaatagtttagaatatagatatcagagcaccaaagaacagaaaacg 4271026  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||  | ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    |||||    
T  4271027 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaatt----aatta 4271121  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    | |||| ||||||||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4271122 tcaatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 4271221  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 22511090 - 22510790
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||| | ||   ||  |||||||||||  |||||||| | | |||||| ||||    
T  22511090 agagatgaagtcgtgtttcgtagacgtttttatttgcaatagaaaaaattaaaaaaattacttagaatatagattacagagaaccagagaacagaaaaag 22510991  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| |  || ||   |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    ||  ||||||||    
T  22510990 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatgaccaaaaatgctacta-tttatatagaaaaatagtatcataacggttaat----atctattaatta 22510896  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||   || || |||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22510895 ttaatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgtattaaatgattagattatatttcatgtaacctacaaaaaatta 22510796  T
Q  316 gcttca 321  Q
     |||||    
T  22510795 acttca 22510790  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Original strand, 18902448 - 18902748
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaac-cagaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||||||||||||| | | || ||| ||||    
T  18902448 agagatgaagtcgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattaaagaaattacttagaatatagatatcagagaaccatagaatagaaaaag 18902547  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatat-agaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 217  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| |  || |||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    ||  | |||||    
T  18902548 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctact-atttatataaaaaaaatagtaccataacggttaat----atctactaatt 18902642  T
Q  218 attaattgaaccgttttgaaatcaatatt---aatgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 314  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||   || ||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18902643 attaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctacaaaaaatt 18902741  T
Q  315 agcttca 321  Q
    | |||||    
T  18902742 aacttca 18902748  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 14180787 - 14180488
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |    ||||||||||||||| || || ||| |||||| || |    
T  14180787 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagatatcaaagcaccaaagaacagaaaacg 14180689  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
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T  14180688 aagaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaatt----aatta 14180594  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
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T  14180593 tcaatttaaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 14180494  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 14176251 - 14175952
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
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T  14176251 agagatgaagttgtgtttcgttgacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttagaatatagataccagagcaccatagaacggaaaacg 14176153  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
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T  14176152 aataactacattttgtgattgttatgtactcatacccaaaatctctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatttatt----aatta 14176058  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatta 315  Q
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T  14176057 tcaattttaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaatta 14175958  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 19421411 - 19421121
Alignment:
Q  19 cagagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaa 117  Q
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T  19421411 cagagatgaagtcgtgtttcgtagacgtttttctttgcaatagaaaaaattaaaaaaattacttagaatatagatatcagagaac--------agaaaaa 19421320  T
Q  118 gaataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatt 217  Q
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T  19421319 gaa---ctatattttatgattgttgtgtacttgtacccaaatgcgctacta-tttatatagaaaaatagtacgataacggttaatatctatt----aatt 19421228  T
Q  218 attaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaatt 314  Q
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T  19421227 attaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatatgtattaaatgattagattatatttcatgtaacttacaaaaaatt 19421128  T

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Target: scaffold1788 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1788
Description:

Target: scaffold1788; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 728 - 1018
Alignment:
Q  20 agagatgaagtcgtgtttcatagacatctttctttgcaatagaaaaaattatagaagcaacc-agaatatagatatcagagaactaaataacagataaag 118  Q
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T  728 agagttgaagtcgtgtttcatagacattttcctttgcaatagaaaaa-ttacagaaatagtttaaaatatagatatcagagcaccagaaaacagaaaacg 826  T
Q  119 aataactataatttgtaattgttatttactcgtatcccaaggcgctattaatttatatagaaaaatagtaccataacggttgatattaattgattaatta 218  Q
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T  827 aaaaactatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctacta-tttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaatt----aatta 921  T
Q  219 ttaattgaaccgttttgaaatcaatatta---atgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaacatacaaaaaa 312  Q
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T  922 tcaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaacgtacaaaaaa 1018  T

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