View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21119_high_18 (Length: 321)

Name: NF21119_high_18
Description: NF21119
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21119_high_18
NF21119_high_18
[»] chr4 (44 HSPs)
chr4 (21-311)||(1649327-1649617)
chr4 (35-311)||(16145858-16146134)
chr4 (21-311)||(33222850-33223140)
chr4 (39-311)||(11207281-11207553)
chr4 (22-311)||(3264844-3265133)
chr4 (22-311)||(29453587-29453876)
chr4 (21-311)||(15003414-15003704)
chr4 (21-311)||(15245856-15246146)
chr4 (21-311)||(44661916-44662206)
chr4 (24-311)||(20890918-20891204)
chr4 (21-311)||(15070345-15070635)
chr4 (21-310)||(51606232-51606521)
chr4 (21-289)||(42702835-42703103)
chr4 (39-311)||(8386362-8386634)
chr4 (39-311)||(19778583-19778855)
chr4 (138-311)||(15359140-15359313)
chr4 (162-311)||(27900459-27900608)
chr4 (39-283)||(15364336-15364580)
chr4 (39-311)||(18297155-18297427)
chr4 (39-311)||(23955697-23955969)
chr4 (39-311)||(29039194-29039466)
chr4 (39-292)||(14303787-14304039)
chr4 (39-311)||(12476550-12476822)
chr4 (21-311)||(14159424-14159714)
chr4 (21-311)||(14652240-14652530)
chr4 (39-311)||(12523626-12523898)
chr4 (39-311)||(14680517-14680789)
chr4 (39-311)||(14851156-14851428)
chr4 (161-311)||(16752665-16752815)
chr4 (21-311)||(27711268-27711558)
chr4 (39-309)||(40472990-40473260)
chr4 (39-311)||(14266689-14266961)
chr4 (39-292)||(16355254-16355507)
chr4 (76-217)||(18164333-18164474)
chr4 (21-289)||(7090365-7090632)
chr4 (39-311)||(8053413-8053685)
chr4 (21-311)||(16252235-16252525)
chr4 (57-311)||(15149796-15150050)
chr4 (21-311)||(18227236-18227526)
chr4 (21-130)||(15415210-15415319)
chr4 (21-202)||(14927158-14927339)
chr4 (21-144)||(15319515-15319638)
chr4 (21-88)||(15359330-15359397)
chr4 (180-310)||(55375409-55375539)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (21-311)||(10136-10426)
[»] chr8 (51 HSPs)
chr8 (21-311)||(1266237-1266527)
chr8 (21-311)||(22061926-22062216)
chr8 (21-311)||(21324902-21325193)
chr8 (21-309)||(21681965-21682253)
chr8 (21-311)||(31416967-31417257)
chr8 (21-289)||(16265133-16265401)
chr8 (22-311)||(804166-804455)
chr8 (21-311)||(12304756-12305046)
chr8 (21-311)||(23654925-23655215)
chr8 (22-311)||(6603657-6603946)
chr8 (36-289)||(20007863-20008116)
chr8 (21-311)||(29303919-29304209)
chr8 (22-311)||(14565141-14565430)
chr8 (22-311)||(6679110-6679399)
chr8 (35-311)||(20010393-20010669)
chr8 (22-289)||(28982356-28982623)
chr8 (22-289)||(28987576-28987843)
chr8 (21-311)||(19851409-19851699)
chr8 (21-311)||(19857445-19857735)
chr8 (21-310)||(31571336-31571625)
chr8 (21-311)||(21840415-21840705)
chr8 (22-229)||(27347225-27347432)
chr8 (39-311)||(19485363-19485635)
chr8 (39-311)||(20018243-20018515)
chr8 (29-309)||(20388105-20388385)
chr8 (39-311)||(17674516-17674788)
chr8 (39-311)||(19112706-19112978)
chr8 (21-311)||(19977965-19978255)
chr8 (21-311)||(21250940-21251230)
chr8 (39-311)||(21167030-21167302)
chr8 (49-311)||(32600170-32600432)
chr8 (39-292)||(21922247-21922500)
chr8 (39-292)||(22120686-22120939)
chr8 (39-311)||(23650057-23650329)
chr8 (21-311)||(15533378-15533668)
chr8 (21-311)||(30313637-30313927)
chr8 (21-292)||(22046372-22046642)
chr8 (21-311)||(22164684-22164974)
chr8 (168-311)||(22051008-22051151)
chr8 (21-311)||(22133534-22133824)
chr8 (39-292)||(22987217-22987470)
chr8 (72-288)||(23948938-23949154)
chr8 (21-311)||(22032030-22032320)
chr8 (49-237)||(16408612-16408800)
chr8 (21-311)||(21394358-21394648)
chr8 (21-311)||(21788851-21789141)
chr8 (72-237)||(15441230-15441395)
chr8 (76-292)||(20396637-20396853)
chr8 (182-311)||(22377946-22378075)
chr8 (182-311)||(22384121-22384250)
chr8 (196-310)||(22315364-22315478)
[»] chr5 (53 HSPs)
chr5 (21-311)||(20821299-20821589)
chr5 (18-311)||(22236152-22236445)
chr5 (21-311)||(24735843-24736133)
chr5 (21-311)||(24737017-24737307)
chr5 (21-311)||(24749786-24750076)
chr5 (21-311)||(28924000-28924290)
chr5 (21-311)||(22461798-22462088)
chr5 (21-311)||(28895174-28895464)
chr5 (21-311)||(22381045-22381335)
chr5 (21-309)||(22502525-22502813)
chr5 (21-303)||(23080329-23080611)
chr5 (22-311)||(24798629-24798918)
chr5 (22-311)||(14887223-14887512)
chr5 (21-311)||(20773606-20773896)
chr5 (21-311)||(23442525-23442815)
chr5 (22-311)||(37545728-37546018)
chr5 (22-311)||(20342129-20342418)
chr5 (39-311)||(21890991-21891263)
chr5 (21-311)||(17269565-17269855)
chr5 (22-311)||(25847922-25848211)
chr5 (39-311)||(27610236-27610508)
chr5 (39-292)||(22333138-22333391)
chr5 (39-310)||(41770724-41770995)
chr5 (21-301)||(21564208-21564488)
chr5 (39-311)||(22134550-22134822)
chr5 (39-311)||(27518289-27518561)
chr5 (39-311)||(34566376-34566648)
chr5 (39-311)||(14999971-15000243)
chr5 (39-311)||(16356384-16356656)
chr5 (39-311)||(27668722-27668994)
chr5 (39-311)||(40708662-40708934)
chr5 (21-311)||(20468328-20468618)
chr5 (39-292)||(29476324-29476577)
chr5 (39-311)||(19769842-19770114)
chr5 (39-311)||(27685632-27685904)
chr5 (48-292)||(22348316-22348558)
chr5 (39-311)||(26738937-26739209)
chr5 (39-250)||(20573403-20573614)
chr5 (21-311)||(21984537-21984827)
chr5 (21-311)||(23573606-23573896)
chr5 (39-311)||(23516423-23516695)
chr5 (21-286)||(21662297-21662561)
chr5 (39-291)||(23471111-23471363)
chr5 (39-309)||(18775659-18775929)
chr5 (39-235)||(21343666-21343862)
chr5 (72-286)||(21665758-21665971)
chr5 (21-311)||(25423053-25423343)
chr5 (75-292)||(37291747-37291964)
chr5 (39-311)||(23440107-23440379)
chr5 (72-292)||(20798675-20798895)
chr5 (21-130)||(21404700-21404809)
chr5 (21-109)||(21625382-21625470)
chr5 (100-262)||(21498317-21498479)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (21-311)||(154-444)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (21-311)||(13414-13704)
scaffold0298 (21-311)||(17184-17474)
scaffold0298 (21-310)||(19946-20235)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (21-311)||(322667-322957)
scaffold0004 (22-303)||(117532-117813)
scaffold0004 (39-311)||(385800-386072)
scaffold0004 (21-310)||(111984-112273)
scaffold0004 (21-311)||(203521-203811)
[»] chr3 (56 HSPs)
chr3 (21-311)||(13322930-13323220)
chr3 (21-311)||(18134624-18134914)
chr3 (21-311)||(10420323-10420613)
chr3 (24-303)||(12360828-12361107)
chr3 (22-311)||(47123506-47123795)
chr3 (21-303)||(11304059-11304341)
chr3 (35-311)||(13972398-13972674)
chr3 (35-311)||(15953246-15953522)
chr3 (21-311)||(15227210-15227500)
chr3 (21-311)||(11961312-11961602)
chr3 (24-310)||(16329938-16330224)
chr3 (21-310)||(16836789-16837072)
chr3 (21-310)||(8759361-8759650)
chr3 (39-311)||(10383548-10383820)
chr3 (36-287)||(14571424-14571675)
chr3 (35-289)||(16381227-16381481)
chr3 (21-311)||(44776808-44777098)
chr3 (21-310)||(13941585-13941874)
chr3 (21-310)||(41177083-41177372)
chr3 (35-311)||(14086248-14086524)
chr3 (39-311)||(10005169-10005441)
chr3 (39-311)||(10905779-10906051)
chr3 (39-292)||(13252259-13252512)
chr3 (39-311)||(15589681-15589953)
chr3 (39-311)||(20062343-20062615)
chr3 (39-311)||(48425016-48425288)
chr3 (21-311)||(16492470-16492760)
chr3 (39-311)||(5425219-5425490)
chr3 (39-311)||(16635342-16635614)
chr3 (39-311)||(43162666-43162938)
chr3 (21-311)||(17489401-17489691)
chr3 (39-292)||(15725241-15725494)
chr3 (39-311)||(14876788-14877060)
chr3 (39-311)||(15348534-15348806)
chr3 (39-311)||(12497817-12498089)
chr3 (83-311)||(12850557-12850785)
chr3 (39-311)||(15338838-15339110)
chr3 (39-311)||(16412571-16412843)
chr3 (39-311)||(16756874-16757146)
chr3 (39-311)||(53385307-53385579)
chr3 (39-311)||(15402799-15403071)
chr3 (39-309)||(15208460-15208730)
chr3 (21-310)||(9522270-9522559)
chr3 (39-311)||(6600316-6600588)
chr3 (21-165)||(31945033-31945177)
chr3 (21-163)||(31689049-31689191)
chr3 (39-311)||(26792688-26792960)
chr3 (72-310)||(15247749-15247987)
chr3 (21-311)||(16691711-16692001)
chr3 (57-311)||(16371000-16371254)
chr3 (39-292)||(16807234-16807487)
chr3 (21-87)||(12854360-12854426)
chr3 (182-310)||(15576472-15576600)
chr3 (189-310)||(15016034-15016155)
chr3 (182-310)||(8274689-8274817)
chr3 (234-310)||(13975335-13975411)
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (21-303)||(19854261-19854543)
chr1 (21-311)||(20940185-20940475)
chr1 (35-311)||(19664998-19665274)
chr1 (21-311)||(20856883-20857173)
chr1 (21-311)||(22433238-22433528)
chr1 (21-311)||(20244147-20244437)
chr1 (21-303)||(31550311-31550593)
chr1 (21-311)||(20294359-20294649)
chr1 (39-289)||(20075203-20075453)
chr1 (22-311)||(37677027-37677317)
chr1 (83-311)||(20836010-20836241)
chr1 (22-253)||(20395173-20395404)
chr1 (39-311)||(41354591-41354863)
chr1 (39-311)||(16350721-16350993)
chr1 (156-311)||(11382676-11382831)
chr1 (21-311)||(17045137-17045427)
chr1 (39-311)||(33391151-33391423)
chr1 (21-311)||(50620366-50620656)
chr1 (39-311)||(19106332-19106604)
chr1 (39-311)||(21830268-21830540)
chr1 (48-292)||(16369271-16369515)
chr1 (39-311)||(51333615-51333887)
chr1 (39-292)||(21836915-21837168)
chr1 (140-311)||(41307891-41308062)
chr1 (21-311)||(20249797-20250087)
chr1 (21-237)||(50612612-50612828)
chr1 (21-237)||(16078829-16079045)
chr1 (21-237)||(21747482-21747698)
chr1 (21-311)||(19760988-19761278)
chr1 (57-311)||(20136761-20137015)
chr1 (21-118)||(24476927-24477024)
chr1 (39-172)||(21163245-21163378)
chr1 (182-310)||(46518829-46518957)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (21-311)||(27482-27772)
scaffold0139 (21-311)||(1202-1491)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (21-311)||(452-742)
scaffold0124 (21-311)||(10851-11141)
scaffold0124 (182-310)||(7864-7992)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (21-311)||(61266-61556)
scaffold0067 (21-311)||(52232-52522)
scaffold0067 (56-311)||(67654-67909)
[»] chr6 (56 HSPs)
chr6 (21-311)||(10469044-10469334)
chr6 (21-311)||(14131374-14131664)
chr6 (21-311)||(15459132-15459422)
chr6 (21-311)||(21471397-21471687)
chr6 (21-289)||(22796849-22797117)
chr6 (21-311)||(25750605-25750895)
chr6 (21-311)||(27560812-27561102)
chr6 (21-311)||(19879094-19879384)
chr6 (21-309)||(21564329-21564617)
chr6 (21-311)||(24364208-24364498)
chr6 (21-311)||(34645781-34646071)
chr6 (21-309)||(8766345-8766633)
chr6 (113-311)||(14381662-14381860)
chr6 (21-311)||(18794486-18794776)
chr6 (21-310)||(28283009-28283298)
chr6 (56-311)||(25768022-25768277)
chr6 (21-311)||(11287793-11288083)
chr6 (21-311)||(11280700-11280990)
chr6 (104-309)||(17415365-17415570)
chr6 (39-311)||(5839414-5839686)
chr6 (39-311)||(28263392-28263664)
chr6 (39-311)||(28342141-28342413)
chr6 (39-311)||(29592115-29592387)
chr6 (39-311)||(16626912-16627184)
chr6 (39-310)||(1543280-1543551)
chr6 (39-292)||(25112366-25112619)
chr6 (39-311)||(24313363-24313635)
chr6 (39-311)||(27187250-27187522)
chr6 (39-311)||(27261718-27261990)
chr6 (141-311)||(18800858-18801028)
chr6 (39-292)||(2875017-2875270)
chr6 (39-311)||(28292567-28292839)
chr6 (39-237)||(17032376-17032574)
chr6 (21-310)||(25610057-25610346)
chr6 (39-311)||(12497840-12498112)
chr6 (39-311)||(12505169-12505441)
chr6 (39-311)||(12510789-12511061)
chr6 (39-311)||(19864501-19864773)
chr6 (21-309)||(22078885-22079173)
chr6 (48-311)||(18197742-18198005)
chr6 (21-311)||(27331628-27331918)
chr6 (21-311)||(27392368-27392658)
chr6 (21-145)||(1640595-1640719)
chr6 (21-309)||(21833178-21833466)
chr6 (182-303)||(25750903-25751024)
chr6 (39-311)||(16963562-16963834)
chr6 (21-144)||(18787684-18787807)
chr6 (21-288)||(22762673-22762940)
chr6 (21-292)||(23078265-23078536)
chr6 (39-292)||(16927854-16928107)
chr6 (183-310)||(1640730-1640857)
chr6 (39-309)||(25765487-25765756)
chr6 (21-289)||(18408160-18408428)
chr6 (39-144)||(22433811-22433916)
chr6 (182-309)||(16098007-16098134)
chr6 (196-310)||(1648980-1649094)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (35-311)||(23293535-23293811)
chr2 (21-311)||(23276339-23276629)
chr2 (22-311)||(31830222-31830511)
chr2 (21-292)||(24653908-24654179)
chr2 (22-311)||(1063315-1063604)
chr2 (21-311)||(11358464-11358754)
chr2 (22-309)||(20832549-20832836)
chr2 (21-310)||(12573916-12574205)
chr2 (21-258)||(24944930-24945167)
chr2 (35-311)||(27365669-27365945)
chr2 (21-310)||(27787304-27787593)
chr2 (39-311)||(10868431-10868703)
chr2 (21-309)||(23087013-23087301)
chr2 (39-311)||(27217597-27217869)
chr2 (39-311)||(16981733-16982005)
chr2 (39-311)||(17063298-17063570)
chr2 (39-311)||(21145620-21145892)
chr2 (39-311)||(22325446-22325718)
chr2 (39-311)||(44386159-44386431)
chr2 (39-311)||(9609717-9609989)
chr2 (39-311)||(16924841-16925113)
chr2 (39-311)||(16998581-16998853)
chr2 (48-311)||(24878585-24878848)
chr2 (39-311)||(17066959-17067228)
chr2 (39-311)||(27370850-27371122)
chr2 (39-309)||(24675070-24675340)
chr2 (39-311)||(24261951-24262223)
chr2 (39-311)||(24709614-24709886)
chr2 (39-292)||(24708091-24708344)
chr2 (39-311)||(22757053-22757325)
chr2 (21-311)||(23138600-23138890)
chr2 (21-311)||(23550390-23550680)
chr2 (39-311)||(21325856-21326128)
chr2 (48-311)||(23063667-23063930)
chr2 (21-311)||(23188571-23188861)
chr2 (21-274)||(27377098-27377351)
chr2 (117-292)||(24825891-24826066)
chr2 (197-310)||(22276018-22276131)
chr2 (39-198)||(41609047-41609206)
chr2 (21-115)||(24833359-24833453)
chr2 (57-103)||(25128246-25128292)
chr2 (57-103)||(28144562-28144608)
chr2 (57-130)||(30211688-30211761)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (21-303)||(195764-196045)
scaffold0011 (21-311)||(148533-148823)
scaffold0011 (21-229)||(68575-68783)
scaffold0011 (39-311)||(26586-26858)
scaffold0011 (182-310)||(122004-122132)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (21-309)||(61-349)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (21-311)||(14304-14594)
scaffold0203 (21-202)||(9039-9220)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (21-311)||(57870-58159)
scaffold0053 (21-311)||(49086-49376)
[»] chr7 (54 HSPs)
chr7 (21-311)||(15102638-15102928)
chr7 (21-311)||(16950508-16950798)
chr7 (21-311)||(13665475-13665760)
chr7 (18-311)||(6413430-6413723)
chr7 (35-311)||(11388465-11388740)
chr7 (21-311)||(14129795-14130085)
chr7 (21-311)||(14433613-14433903)
chr7 (21-311)||(14264281-14264571)
chr7 (22-311)||(11306300-11306589)
chr7 (21-309)||(14286415-14286703)
chr7 (22-311)||(49152224-49152513)
chr7 (36-311)||(16072331-16072606)
chr7 (21-311)||(26288074-26288363)
chr7 (21-303)||(1452-1734)
chr7 (21-311)||(19147133-19147423)
chr7 (21-311)||(20746532-20746822)
chr7 (39-311)||(8212165-8212437)
chr7 (21-310)||(23199781-23200070)
chr7 (21-310)||(23505908-23506197)
chr7 (21-311)||(13021279-13021569)
chr7 (21-310)||(18053991-18054280)
chr7 (21-311)||(12206837-12207127)
chr7 (21-311)||(12455625-12455914)
chr7 (39-311)||(11553161-11553433)
chr7 (21-311)||(14332318-14332608)
chr7 (39-311)||(10870934-10871206)
chr7 (39-292)||(11237291-11237544)
chr7 (39-311)||(8198567-8198839)
chr7 (39-311)||(23516828-23517100)
chr7 (35-177)||(15340432-15340574)
chr7 (39-311)||(8707544-8707816)
chr7 (39-311)||(12687440-12687712)
chr7 (39-311)||(14954559-14954831)
chr7 (39-311)||(15161116-15161388)
chr7 (39-311)||(44791410-44791682)
chr7 (21-292)||(15154730-15155001)
chr7 (39-311)||(18177681-18177953)
chr7 (39-311)||(18551817-18552089)
chr7 (21-144)||(15479342-15479465)
chr7 (156-311)||(26118642-26118797)
chr7 (39-311)||(13686002-13686275)
chr7 (39-311)||(17375-17647)
chr7 (21-310)||(14037728-14038017)
chr7 (21-310)||(14347758-14348047)
chr7 (39-311)||(15203818-15204090)
chr7 (90-311)||(15624542-15624763)
chr7 (21-129)||(26118803-26118911)
chr7 (182-310)||(4440010-4440138)
chr7 (243-310)||(15340575-15340642)
chr7 (219-311)||(35964909-35965001)
chr7 (196-310)||(14936443-14936557)
chr7 (196-310)||(15364036-15364150)
chr7 (57-103)||(21674800-21674846)
chr7 (57-103)||(45146513-45146559)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (35-311)||(19097-19373)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (21-311)||(21724-22014)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (21-311)||(96055-96345)
scaffold0029 (21-311)||(112522-112812)
scaffold0029 (39-311)||(109864-110136)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (21-311)||(42386-42676)
scaffold0010 (21-311)||(47452-47742)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (21-311)||(6146-6437)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (21-311)||(31373-31663)
scaffold0106 (55-311)||(14036-14292)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (21-311)||(13954-14244)
scaffold0034 (99-311)||(5006-5218)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (21-311)||(260271-260561)
scaffold0005 (21-311)||(164762-165052)
scaffold0005 (74-311)||(308675-308912)
scaffold0005 (39-311)||(278883-279155)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (35-311)||(20099-20375)
scaffold0114 (35-289)||(43482-43736)
scaffold0114 (35-289)||(44494-44748)
scaffold0114 (38-223)||(36035-36220)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (21-311)||(39702-39992)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (21-311)||(2714-3004)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (21-310)||(1223-1512)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (21-310)||(25919-26208)
scaffold0113 (21-311)||(16639-16929)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (35-309)||(27203-27476)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (21-311)||(42746-43036)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (35-311)||(47101-47377)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (35-311)||(49260-49536)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (44-311)||(1577-1844)
scaffold0120 (21-311)||(5986-6276)
scaffold0120 (182-310)||(22818-22946)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (21-311)||(26224-26514)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (21-303)||(16774-17056)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (21-311)||(90985-91275)
scaffold0001 (39-311)||(448040-448312)
scaffold0001 (21-292)||(162076-162347)
scaffold0001 (154-226)||(175359-175431)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (21-286)||(4217-4482)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (35-289)||(3868-4122)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (39-309)||(38942-39212)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (35-311)||(18590-18866)
scaffold0326 (35-88)||(3631-3684)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (21-309)||(12836-13124)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (21-311)||(7089-7379)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (21-311)||(9761-10046)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (21-311)||(248576-248866)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (21-311)||(7291-7577)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (35-311)||(26119-26395)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (21-309)||(51918-52206)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (72-311)||(4764-5003)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (21-311)||(5967-6256)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (21-303)||(3838-4120)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (21-311)||(18812-19102)
scaffold0090 (154-311)||(23107-23264)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (35-311)||(33730-34006)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (21-311)||(14049-14338)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (21-262)||(1140-1381)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (39-311)||(27948-28220)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (21-311)||(5055-5345)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (39-311)||(7358-7630)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (35-311)||(50567-50843)
scaffold0028 (48-311)||(8475-8738)
scaffold0028 (39-277)||(43135-43373)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (21-311)||(10792-11082)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (39-311)||(180198-180470)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (54-241)||(13376-13563)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (48-311)||(3130-3393)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (21-311)||(25124-25414)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (21-311)||(491-781)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (21-202)||(2028-2208)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (36-217)||(136097-136278)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (39-311)||(395-667)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (35-311)||(37179-37455)
scaffold0026 (138-311)||(27390-27563)
scaffold0026 (138-311)||(38227-38400)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (57-311)||(1-255)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (21-292)||(639-910)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (156-311)||(5311-5466)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (21-311)||(15132-15422)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (21-303)||(28830-29112)
scaffold0064 (21-303)||(40821-41103)
[»] scaffold0518 (2 HSPs)
scaffold0518 (126-309)||(10837-11020)
scaffold0518 (21-65)||(10787-10831)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (39-288)||(4013-4262)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (21-292)||(54-325)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (21-292)||(32824-33095)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (39-311)||(6918-7192)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (21-310)||(127253-127542)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (39-311)||(5995-6267)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (39-283)||(601-845)
scaffold0044 (21-311)||(14323-14613)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (21-151)||(45807-45938)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (57-311)||(313-567)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (57-311)||(16986-17240)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (21-311)||(65369-65658)
scaffold0042 (39-229)||(39924-40114)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (21-311)||(229006-229296)
scaffold0012 (39-311)||(219470-219742)
scaffold0012 (182-310)||(33049-33177)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (39-292)||(14858-15111)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (39-311)||(6353-6625)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (21-149)||(3483-3611)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (39-292)||(64103-64356)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (21-292)||(25791-26062)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (21-311)||(1102-1392)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (21-311)||(871-1161)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (213-311)||(1287-1385)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (21-222)||(15456-15656)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (90-311)||(16518-16739)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (39-311)||(33626-33898)
scaffold0109 (21-311)||(8559-8849)
[»] scaffold1508 (1 HSPs)
scaffold1508 (35-130)||(871-966)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (172-311)||(1908-2047)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (72-311)||(13030-13269)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (39-310)||(877-1147)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (39-309)||(749-1018)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (72-309)||(9357-9594)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (48-237)||(16947-17136)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (183-292)||(7522-7631)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (189-289)||(1-101)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (159-309)||(835-985)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (123-311)||(7855-8043)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (72-292)||(49507-49727)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (21-311)||(5644-5933)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (21-311)||(4458-4748)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (72-222)||(4567-4717)
scaffold0023 (21-109)||(18993-19081)
scaffold0023 (48-125)||(36985-37062)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (39-292)||(16488-16741)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (57-216)||(117053-117212)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (78-292)||(1025-1239)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (123-309)||(21932-22118)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (154-311)||(9066-9223)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (72-237)||(5235-5400)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (21-136)||(9182-9297)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (99-152)||(8771-8824)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (39-115)||(6254-6330)
[»] scaffold0720 (1 HSPs)
scaffold0720 (21-82)||(1-62)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (182-303)||(24004-24125)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (234-310)||(14791-14867)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (182-310)||(13032-13160)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (182-310)||(14781-14909)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (56-103)||(10654-10701)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (196-310)||(5879-5993)
scaffold0447 (196-310)||(10493-10607)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (196-310)||(8488-8602)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (182-310)||(964-1092)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (182-310)||(3283-3411)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 44)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1649617 - 1649327
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  1649617 acatcatcccttggaattacatgtgaaggatccgctacatacttccgtagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaacc 1649518  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1649517 caactctatatgccacagttccaatcctctctgatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacacccgt 1649418  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || || |||| |||||||    
T  1649417 cataggagtaactcttagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaaggtccttcctccgcttgtcgtggtaactcttatgtcgactctgc 1649327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 35 - 311
Target Start/End: Original strand, 16145858 - 16146134
Alignment:
Q  35 aataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcc 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16145858 aataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcc 16145957  T
Q  135 acagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactc 234  Q
    ||||||||||  |||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16145958 acagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactc 16146057  T
Q  235 tcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  16146058 tcagaaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgc 16146134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 33222850 - 33223140
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||  ||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  33222850 acatcatcctttggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatgttcgaaagatggggtggcaaac 33222949  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||   | ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  33222950 caactctatatgccactgttccaactctctttgaaatctgatacggaccaatgaactttggtgtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 33223049  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  33223050 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagttcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 33223140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11207553 - 11207281
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11207553 acatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccactg 11207454  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    | ||||  |||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  11207453 taccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcag 11207354  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  11207353 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 11207281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 22 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3265133 - 3264844
Alignment:
Q  22 catcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaacc 121  Q
    ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||    
T  3265133 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 3265034  T
Q  122 aactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtc 221  Q
    ||||||||||||||| || ||||  |||||  | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  3265033 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 3264934  T
Q  222 ataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  3264933 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 3264844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 22 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 29453876 - 29453587
Alignment:
Q  22 catcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaacc 121  Q
    ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||    
T  29453876 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 29453777  T
Q  122 aactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtc 221  Q
    ||||||||||||||| || ||||  |||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||    
T  29453776 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 29453677  T
Q  222 ataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  29453676 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 29453587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15003704 - 15003414
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15003704 acatcatctattggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 15003605  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||||||||||||| |||||||  |||||  |||||||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||    
T  15003604 ccactctatatgccactgttccaactctctcagatatctgatatggatcaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgt 15003505  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||    ||||||||||||||||| || || || |||| |||||||    
T  15003504 cataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggattttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgc 15003414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 15245856 - 15246146
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15245856 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 15245955  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
      ||||| |||||||| ||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  15245956 gcactctgtatgccactgttccaaccctctctgttatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 15246055  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||   |||| ||||| |||||||| || || || |||| |||||||    
T  15246056 cataggggtaactctcagaaatacatgatctccctcctgaaactcaaaggccttcctacgtttgtcatggtaactcttttgtcgactctgc 15246146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 44662206 - 44661916
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||    
T  44662206 acatcatcccttggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 44662107  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||  || || || ||||||||    
T  44662106 caactctatatgccactgttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgt 44662007  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || || ||||||| |||||||    
T  44662006 caaaggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcacggtaactcttctgtcgactctgc 44661916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 311
Target Start/End: Original strand, 20890918 - 20891204
Alignment:
Q  24 tcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaa 123  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||| || |||     
T  20890918 tcatcccttggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgttggaaacccat 20891017  T
Q  124 ctctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcat 223  Q
    | ||||||||||| ||||||| ||||||  | |||||||||| |||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||     
T  20891018 c-ctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacgaaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaa 20891116  T
Q  224 aggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  20891117 aggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 20891204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 15070345 - 15070635
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15070345 acatcatctcttggaatcacatgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 15070444  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | || || |||||||| |||||||  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||| |  |||||||  | || |||||||||||    
T  15070445 ccaccctgtatgccactgttccaactctctcaaatatctggtatggaccaataaacttcgtagtcaacttcataaacttcaacacacgacctacacccgt 15070544  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  15070545 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 15070635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 51606521 - 51606232
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |    
T  51606521 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 51606422  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  51606421 caactctatatgccaccgttccgattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 51606322  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    ||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| || |||||||| || || ||||||| ||||||    
T  51606321 catcggagtcactcttataaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgtttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 51606232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 289
Target Start/End: Original strand, 42702835 - 42703103
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |    
T  42702835 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 42702934  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  42702935 caactctatatgccaccgttccgattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 42703034  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatg 289  Q
    ||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| || ||||||||    
T  42703035 catcggagtcactcttataaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgtttgtcatg 42703103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 8386362 - 8386634
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  8386362 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 8386461  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  8386462 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 8386561  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  8386562 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 8386634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19778855 - 19778583
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| |    
T  19778855 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 19778756  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  19778755 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 19778656  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  19778655 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 19778583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15359313 - 15359140
Alignment:
Q  138 gttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctca 237  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15359313 gttccaaccctctctgatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgatttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcg 15359214  T
Q  238 gaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||    
T  15359213 gaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgaaaactcttctgtcgactctgc 15359140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 162 - 311
Target Start/End: Original strand, 27900459 - 27900608
Alignment:
Q  162 tacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaa 261  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27900459 tacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgttctacactcgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaa 27900558  T
Q  262 attcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    | ||||| || || |||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  27900559 actcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttctatcgactctgc 27900608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 283
Target Start/End: Original strand, 15364336 - 15364580
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||| ||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  15364336 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacatatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 15364435  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  15364436 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 15364535  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgctt 283  Q
    ||| || || || || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15364536 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgctt 15364580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 18297155 - 18297427
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  18297155 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 18297254  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  18297255 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 18297354  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  18297355 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 18297427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 23955697 - 23955969
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |||| ||| ||||||| |||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  23955697 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttatgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 23955796  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  23955797 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 23955896  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  23955897 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 23955969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 29039466 - 29039194
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  29039466 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccg 29039367  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  29039366 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaa 29039267  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  29039266 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 29039194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 14304039 - 14303787
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  14304039 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 14303940  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  14303939 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcgg-gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaa 14303841  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgata 292  Q
    ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14303840 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 14303787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 12476550 - 12476822
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||| ||||| || ||||  || ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||  || ||||| |    
T  12476550 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgatacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 12476649  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  12476650 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 12476749  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  12476750 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 12476822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 14159424 - 14159714
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||||||   ||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |  | ||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  14159424 acatcatcactctgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttccgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14159523  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||||  || ||||| |||||||| || ||  |||||||||| |||||||| ||| | |  ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||    
T  14159524 ccactcggtaagccaccgttccaattctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 14159623  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  14159624 catgggagtaactctcaggaacacatgatctcctccttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttatgtcgactctgc 14159714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 14652240 - 14652530
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||  ||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||| ||||||||| |  || |||||||||||||| |||||  |||    
T  14652240 acatcatctctttgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaac 14652339  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||    
T  14652340 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 14652439  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || | |||| ||||||| ||| || ||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  14652440 cacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 14652530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 12523626 - 12523898
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || || || || ||||| |||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  12523626 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatccaactcgatacgccaccg 12523725  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  12523726 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 12523825  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || || |||| |||||||    
T  12523826 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacggttatcatgataactcttttgtcgactctgc 12523898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 14680517 - 14680789
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  14680517 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 14680616  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||  | |  |||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  14680617 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttatttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 14680716  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || |  |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  14680717 aaacacgtggtctcgttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 14680789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14851428 - 14851156
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| |    
T  14851428 acatgagatggatccggaacatacttccgaatttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccg 14851329  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||| | | ||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| | |||| ||||| |     
T  14851328 ttccaattctttcctatatctgatacggaccaataaacctcggagttaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccggtcacatgagtgactctaaa 14851229  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| |||||||| || || ||||| ||||| |  || |||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  14851228 aaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtttttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 14851156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 161 - 311
Target Start/End: Original strand, 16752665 - 16752815
Alignment:
Q  161 atacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctga 260  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16752665 atacggaccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctga 16752764  T
Q  261 aattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||  ||||||| ||||| ||||| || |||||||||| |||||||    
T  16752765 aactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgc 16752815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 27711268 - 27711558
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||| || |||||||| ||||||||  | |  ||||||||||| || ||||  || ||||||| |||||| || || ||||    
T  27711268 acatcgtcactttgaattacatgagatggatccggaacatacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 27711367  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||||  || ||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  27711368 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27711467  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| ||||||| ||| || || || || || || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  27711468 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 27711558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 309
Target Start/End: Original strand, 40472990 - 40473260
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || || |  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||  |    
T  40472990 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccatcg 40473089  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  40473090 ttccaactctttccaatatctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 40473189  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactct 309  Q
    ||| || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || || |||| |||||    
T  40473190 aaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactct 40473260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14266961 - 14266689
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| |  ||||||||||| || || |  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  14266961 acatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 14266862  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||     
T  14266861 ttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcatacaccagtcataggggtgactctcaa 14266762  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| |  || || || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  14266761 aaacatgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 14266689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16355507 - 16355254
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  16355507 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 16355408  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  16355407 ttccaagtctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 16355308  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgata 292  Q
    ||| || || |  || || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||    
T  16355307 aaacacgtggtttccttcttgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgata 16355254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18164474 - 18164333
Alignment:
Q  76 acacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaa 175  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18164474 acacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaa 18164375  T
Q  176 cttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacc 217  Q
    ||| | ||||| |||||| |||||||| || | |||||||||    
T  18164374 ctttggagtcagcttcttagacttcaatgcacatcctacacc 18164333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 289
Target Start/End: Original strand, 7090365 - 7090632
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  7090365 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 7090464  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||||  || ||||| |||||||  || ||| |||||||||||| | |||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||    
T  7090465 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacg-agcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcatccaacaccagt 7090563  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatg 289  Q
    || |||||| ||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  7090564 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatg 7090632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8053685 - 8053413
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || ||||||| |||||| || || ||||| || |  || ||||  |    
T  8053685 acatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccacacggtaagccatcg 8053586  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  8053585 ttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 8053486  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || |||||||||||||||||  |||||||||| || ||||| || || |||| |||||||    
T  8053485 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctcttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgc 8053413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16252525 - 16252235
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||| ||||||||| | |  ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| || |    
T  16252525 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaatc 16252426  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  16252425 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 16252326  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || | |||| ||||||| ||| || || || || || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  16252325 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 16252235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15150050 - 15149796
Alignment:
Q  57 acatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaata 156  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||| ||| | ||| |||||||  || ||| |||    
T  15150050 acatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgtcaccgttccaactctttccgata 15149951  T
Q  157 tctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctc 256  Q
    |||||||||||||||| ||  |   |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || || || || ||    
T  15149950 tctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 15149851  T
Q  257 ctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
     ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  15149850 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 15149796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18227526 - 18227236
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || || || || |||||||||||||  ||||| || |    
T  18227526 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatacggtggtaatc 18227427  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||  |   |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||    
T  18227426 ccactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 18227327  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| ||||||| ||| || || || || |||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  18227326 cacaggagtgactctcaaaaacacgtgctctccttcctgaaactcaagattcttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 18227236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 15415319 - 15415210
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| ||||||||||    
T  15415319 acattatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaggatgtggtggcaaac 15415220  T
Q  121 caactctata 130  Q
    | ||||||||    
T  15415219 ccactctata 15415210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14927339 - 14927158
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||| ||||||||||| |  || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  14927339 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14927240  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaa 202  Q
    | ||||  || ||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||  | | |||||| ||||| ||||||||    
T  14927239 ccactcagtacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaaattctttgacttcaa 14927158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 144
Target Start/End: Original strand, 15319515 - 15319638
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||| | |  || |||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||| | ||||||||    
T  15319515 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgtgacacaggaaacacatcatgcagatttgaaagatgtgctggcaaac 15319614  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaa 144  Q
    | ||||| |||||||| |||||||    
T  15319615 ccactctgtatgccactgttccaa 15319638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 15359397 - 15359330
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacac 88  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  15359397 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacac 15359330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 55375539 - 55375409
Alignment:
Q  180 gaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctac 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||| || || ||||| || | |||| | || |||| ||| |||||||||||  | ||||| |||| ||||||||| |    
T  55375539 gaagtcaacttcatacacttcaaagctcgaccaacaccagttacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 55375440  T
Q  280 gcttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
     ||| |||||||| || ||||||| ||||||    
T  55375439 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 55375409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 10426 - 10136
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10426 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 10327  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||  |  ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  10326 caactctatatgccacagttccaactctttctgaactctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 10227  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  10226 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgc 10136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 51)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 1266237 - 1266527
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  1266237 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgttacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 1266336  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1266337 caactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 1266436  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| || || |||| |||||||    
T  1266437 catcggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttttgtcgactctgc 1266527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22062216 - 22061926
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  22062216 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 22062117  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||    
T  22062116 caactctatatgccacagttccaaccctctctgatatttgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgt 22062017  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  22062016 cataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 22061926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21325193 - 21324902
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaa-gatgaggtggcaaa 119  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||| |||||||||    
T  21325193 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatgatgtggtggcaaa 21325094  T
Q  120 ccaactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccg 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  21325093 ccaactctatatgccactgttccaaccctctatgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccg 21324994  T
Q  220 tcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||    
T  21324993 tcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgc 21324902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 21682253 - 21681965
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  21682253 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgtttcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 21682154  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  21682153 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 21682054  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactct 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  21682053 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactct 21681965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 31417257 - 31416967
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||     
T  31417257 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgtagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaag 31417158  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  31417157 caactctatatgccactgttccaaccctttctgaaatctaatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 31417058  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| | ||||| ||||| || || ||||||| |||||||    
T  31417057 cataagagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttatccgcttatcatggtaactcttctgtcgactctgc 31416967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16265401 - 16265133
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||    
T  16265401 acatcatccctttgaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 16265302  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  16265301 caactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacatccaacacccgt 16265202  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatg 289  Q
    || |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16265201 caaaggagtgaccctcagaaagacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatg 16265133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 804455 - 804166
Alignment:
Q  22 catcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaacc 121  Q
    ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||    
T  804455 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 804356  T
Q  122 aactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtc 221  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||  | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  804355 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 804256  T
Q  222 ataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  804255 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgc 804166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 12304756 - 12305046
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||    
T  12304756 acatcatcccttggaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 12304855  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||| | |||||||||  |||||||||| || ||||| ||||||||    
T  12304856 caactctatatgccactgtttcaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaggcacgtccaacacccgt 12304955  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  12304956 caaaggagtgaccctaagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 12305046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 23654925 - 23655215
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  23654925 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 23655024  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | | | ||||| |||| |||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  23655025 ccaatatatataccactgttcaaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 23655124  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| || || ||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || || |||| || |||||||    
T  23655125 cataggagtaactctcagaaacaaatgatctccgtcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgc 23655215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 22 - 311
Target Start/End: Original strand, 6603657 - 6603946
Alignment:
Q  22 catcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaacc 121  Q
    ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||    
T  6603657 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 6603756  T
Q  122 aactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtc 221  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||  | || |||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||    
T  6603757 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatttgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 6603856  T
Q  222 ataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  6603857 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 6603946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 36 - 289
Target Start/End: Original strand, 20007863 - 20008116
Alignment:
Q  36 ataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcca 135  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  20007863 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtagcaaacccactctatatgcca 20007962  T
Q  136 cagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactct 235  Q
    | ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20007963 ctgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaatgaactttggagtcaccttgttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactct 20008062  T
Q  236 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatg 289  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || |||||  |||| ||||||||||||||    
T  20008063 cagaaacacatgatctccctcttggaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 20008116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 29304209 - 29303919
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | ||| ||||| |||||||||  |||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  29304209 acatcatccctaggaatcacatgtgaaggatcctctacatacttcctaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 29304110  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||  | |||||||||||||| |||| ||| | |||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||    
T  29304109 caactctataagccactgttccaattctctctgaaatctgatacggacctatgatctttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgt 29304010  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || || || |||| |||||||    
T  29304009 cattggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgc 29303919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 311
Target Start/End: Original strand, 14565141 - 14565430
Alignment:
Q  22 catcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaacc 121  Q
    ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||  || || || ||||||||||| |||||||||||    
T  14565141 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacaaatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 14565240  T
Q  122 aactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtc 221  Q
    ||||||||||||||| || ||||  |||||  | |||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14565241 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatatggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 14565340  T
Q  222 ataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  14565341 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgc 14565430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 311
Target Start/End: Original strand, 6679110 - 6679399
Alignment:
Q  22 catcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaacc 121  Q
    ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||    
T  6679110 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 6679209  T
Q  122 aactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtc 221  Q
    ||||||||||||||| || ||||  |||||  | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||| || || |||||||||    
T  6679210 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtc 6679309  T
Q  222 ataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  6679310 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 6679399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20010669 - 20010393
Alignment:
Q  35 aataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcc 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  20010669 aataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcc 20010570  T
Q  135 acagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactc 234  Q
    || ||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||    
T  20010569 actgttccaaccctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacccacacccgtcatcggagtgactc 20010470  T
Q  235 tcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  ||||  ||||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  20010469 tcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcttacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 20010393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 289
Target Start/End: Original strand, 28982356 - 28982623
Alignment:
Q  22 catcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaacc 121  Q
    ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||| | ||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  28982356 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 28982455  T
Q  122 aactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtc 221  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||  | ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||    
T  28982456 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtc 28982555  T
Q  222 ataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatg 289  Q
    |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  28982556 aacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatg 28982623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 289
Target Start/End: Original strand, 28987576 - 28987843
Alignment:
Q  22 catcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaacc 121  Q
    ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||| | ||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  28987576 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 28987675  T
Q  122 aactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtc 221  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||  | ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||    
T  28987676 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtc 28987775  T
Q  222 ataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatg 289  Q
    |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  28987776 aacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatg 28987843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 19851409 - 19851699
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| || |  ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19851409 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacgtactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 19851508  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||| | |||||||| ||||||| ||||||  ||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| || || |||||| ||||    
T  19851509 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgt 19851608  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||  ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |||| || || ||||||| |||||||    
T  19851609 caacggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctgc 19851699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 19857445 - 19857735
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| || |  ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19857445 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacgtactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 19857544  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||| | |||||||| ||||||| ||||||  ||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| || || |||||| ||||    
T  19857545 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgt 19857644  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||  ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |||| || || ||||||| |||||||    
T  19857645 caacggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctgc 19857735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31571625 - 31571336
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |    
T  31571625 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 31571526  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||  | ||||||||||| |||||||| || | |||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  31571525 caactctatatgccaccgttcctattctctctgaaatctgatacgggccaatgaatttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 31571426  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  31571425 catcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 31571336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 21840415 - 21840705
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  21840415 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtggaatacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaac 21840514  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
      ||||| |||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||  || | ||||||||| ||    
T  21840515 tcactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcagtgcacctcctacacctgt 21840614  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  21840615 tataggagtaactcttagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagtgccttccttcgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgc 21840705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 229
Target Start/End: Original strand, 27347225 - 27347432
Alignment:
Q  22 catcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaacc 121  Q
    ||||||| || | ||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| |||| ||||||    
T  27347225 catcatccctcggaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtgccaaacc 27347324  T
Q  122 aactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtc 221  Q
    |||| |||||||||| || |||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27347325 aactttatatgccactgtcccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 27347424  T
Q  222 ataggagt 229  Q
    | ||||||    
T  27347425 aaaggagt 27347432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19485635 - 19485363
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || || |  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  19485635 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 19485536  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    | ||||  || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  19485535 tcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 19485436  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  19485435 aaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 19485363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20018515 - 20018243
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || ||||||| |||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  20018515 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 20018416  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  20018415 ttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 20018316  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| |||||||    
T  20018315 aaacacgtggtctccttcctcaaattcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgc 20018243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 309
Target Start/End: Original strand, 20388105 - 20388385
Alignment:
Q  29 acttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactcta 128  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  20388105 acttggaataacatgcgaaggatctgctacatacttccgaaattgcgacacattaaacacatcatgcacattcgaaagatgtggtggcaaacccactcta 20388204  T
Q  129 tatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggag 228  Q
    |||| ||| || ||||  |||||  |||||| ||| |||||||| |||   |  ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||   |||    
T  20388205 tatgtcactgtcccaactctctcagatatctaatatggaccaataaaccgtggggtcaacttcttagacttcaaagcacgaccaacacctgtcactagag 20388304  T
Q  229 taactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactct 309  Q
    | ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||    
T  20388305 tgactctcagaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactct 20388385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 17674788 - 17674516
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  17674788 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 17674689  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  17674688 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 17674589  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  17674588 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 17674516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 19112706 - 19112978
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  19112706 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccactg 19112805  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  19112806 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 19112905  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  19112906 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 19112978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 19977965 - 19978255
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||| || |    
T  19977965 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 19978064  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||||  || ||||| |||||||   | ||| ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  19978065 ccactcgttacgccaccgttccaactatttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 19978164  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| ||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  19978165 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 19978255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 21250940 - 21251230
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |    
T  21250940 acatcatcactttggatcacatgggatggatctggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 21251039  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  21251040 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 21251139  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| ||||||| ||| || || || || |  ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  21251140 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttattgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcaactctgc 21251230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21167302 - 21167030
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||| || || |  |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  21167302 acatgagatggatccggaacatattttcgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaacccaactcgatacgccactg 21167203  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  21167202 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 21167103  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  21167102 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 21167030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 49 - 311
Target Start/End: Original strand, 32600170 - 32600432
Alignment:
Q  49 gatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcct 148  Q
    ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | ||||| || || |||| ||| ||||| |||||||  ||    
T  32600170 gatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagacgtggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactct 32600269  T
Q  149 ctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatga 248  Q
     ||| ||||||||||||||||||| ||  | |  ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || ||     
T  32600270 ttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtgg 32600369  T
Q  249 tcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || || |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||| |||||||    
T  32600370 tctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgc 32600432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21922500 - 21922247
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||  || ||||| |    
T  21922500 acatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccg 21922401  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||| |||||||||||||||||||  |  | | ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  21922400 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaatatatctcggagtcaacttcttcgacttcaaagcttgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 21922301  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgata 292  Q
    ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21922300 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 21922247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 22120939 - 22120686
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||  |  ||||||||||| || ||||  |  ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||  || ||||| |    
T  22120939 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacgttgttcaaatttgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 22120840  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||     
T  22120839 ttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttccttgacttcaatgcacgtcccacaccagtcataggagtgactctcaa 22120740  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgata 292  Q
    ||| || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22120739 aaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 22120686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 23650057 - 23650329
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||| |  ||| ||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |    
T  23650057 acatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcaacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcgataagccaccg 23650156  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || | | ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||| |||||||     
T  23650157 ttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcacaggagtgactctcaa 23650256  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| |  || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || |||| |||||||    
T  23650257 aaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgc 23650329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 15533378 - 15533668
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||  ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| || |    
T  15533378 acatcatcactttggatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 15533477  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |     
T  15533478 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagc 15533577  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| ||||||| ||| |  || ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||    
T  15533578 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgc 15533668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30313927 - 30313637
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || || || || ||||| |||||||| ||||| || |    
T  30313927 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatc 30313828  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  30313827 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 30313728  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| ||||||| ||| || || || || |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  30313727 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 30313637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 292
Target Start/End: Original strand, 22046372 - 22046642
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| || |    
T  22046372 acatcatcactt-tgatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22046470  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||  || ||| |||||||||||| |||||| ||| | | |||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  22046471 ctactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 22046570  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgata 292  Q
    ||  ||||| ||||||| ||| || || || || |||| ||| ||||||||||| || || || ||||||||    
T  22046571 cactggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatccttcctgcgtttatcatgata 22046642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22164974 - 22164684
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| || |    
T  22164974 acatcatcactttggatcacatgtgatggatccgggacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22164875  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| ||  ||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||    
T  22164874 ccactcgatgcgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttatttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 22164775  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || | |||| ||| ||| ||| |||   || || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  22164774 cacatgagtgactttcaaaaacacaatgtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 22164684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 168 - 311
Target Start/End: Original strand, 22051008 - 22051151
Alignment:
Q  168 ccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaa 267  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  22051008 ccaatgaacttcggagtcaacttccttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactttcaaaaatacatgatcaccctcttgaaactcaa 22051107  T
Q  268 gatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |  |||| || ||||| ||||| || |||||||||| |||||||    
T  22051108 gggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgc 22051151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22133824 - 22133534
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||| ||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| |  |    
T  22133824 acatcatcactttggatcacatgtgatggattcgggacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtattc 22133725  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||    
T  22133724 cgactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 22133625  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || | ||||  |||||| ||| |||   || || |||||||| |||||||| || |||| ||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  22133624 cacatgagtgtctctcaaaaacacaatgtctccttcctgaaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgc 22133534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 292
Target Start/End: Original strand, 22987217 - 22987470
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |  || || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| |    
T  22987217 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgtattacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccg 22987316  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||| || |   ||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||| |||||||| ||  |||| ||| | ||||  ||||| ||||| |     
T  22987317 ttccaattctttatgatatctgatacggaccaataaacttcagagtcaacttctttgacttcaatgcatgtccaacatcagtcactggagtgactctaaa 22987416  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgata 292  Q
    ||| |||||||| || || ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||    
T  22987417 aaatacatgatctccttcttgaaaatcaaggtctttcctacgcttatcatgata 22987470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 72 - 288
Target Start/End: Original strand, 23948938 - 23949154
Alignment:
Q  72 tgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaa 171  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  || ||||| || | ||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  23948938 tgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgctacgccaccgtactaattctttctgatatctgatacggaccaa 23949037  T
Q  172 tgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatc 271  Q
      ||| | | |||||||||||| || |||||||| ||||  | ||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||| || || || ||||| ||||| ||    
T  23949038 caaacctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtctaaaaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtc 23949137  T
Q  272 ctttctacgcttgtcat 288  Q
    ||| |||||||| ||||    
T  23949138 cttcctacgcttatcat 23949154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 22032030 - 22032320
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||| || || || || |||||||||||||| ||||| || |    
T  22032030 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgaaacatggaaaacatcgtgtaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22032129  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| ||| ||||  ||| |||  || ||| |||||||||||  |||||| ||  | | |||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  22032130 ctactcgatacgccaacgtttcaactctttccgatatctgatacaaaccaataaatctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 22032229  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| ||||||| ||| || || || || |||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || || |||| |||||||    
T  22032230 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccatcctaaaactcaagatccttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctgc 22032320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16408800 - 16408612
Alignment:
Q  49 gatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcct 148  Q
    ||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |||||||  ||    
T  16408800 gatccgggacacacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactct 16408701  T
Q  149 ctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctca 237  Q
     ||| ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| | |||| |||||||    
T  16408700 ttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctca 16408612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21394648 - 21394358
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||||||||||||| | |  ||||||||| ||||||| || || |||||| ||||||| ||||| || |    
T  21394648 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 21394549  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||||  || ||||| ||| | |  || ||| ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||    
T  21394548 ccactcggtacgccaccgttacgactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagt 21394449  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| ||||||| ||| || || || || || || || |||||||| ||  | ||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  21394448 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 21394358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21789141 - 21788851
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||||||||||||| | |  ||||||||| ||||||| || || |||||| ||||||| ||||| || |    
T  21789141 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 21789042  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||||  || ||||| ||| | |  || ||| ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||    
T  21789041 ccactcggtacgccaccgttacgactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagt 21788942  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| ||||||| ||| || || || || || || || |||||||| ||  | ||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  21788941 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 21788851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 237
Target Start/End: Original strand, 15441230 - 15441395
Alignment:
Q  72 tgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaa 171  Q
    ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || | ||| | ||| ||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||    
T  15441230 tgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaatcaaacacgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaa 15441329  T
Q  172 tgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctca 237  Q
    | ||  | | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| | || |||||| |||||||    
T  15441330 taaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagccacaggagtgactctca 15441395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20396853 - 20396637
Alignment:
Q  76 acacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaa 175  Q
    ||||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||| | ||||| |||| ||| |||||  || |||| || ||  ||||||||||| ||||||| ||    
T  20396853 acacatgaaatgcatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaacccactcgatacgccactatttcaattctttctgatatctgatacagaccaataaa 20396754  T
Q  176 -cttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctt 274  Q
     ||| || ||||  ||| | |||||||| || ||||||||||| |||| |||||| ||||| | ||| ||||| || || |||||||| ||||| || ||    
T  20396753 tcttaga-gtcagtttccttgacttcaatgcacgtcctacaccggtcacaggagtgactctaaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtcttt 20396655  T
Q  275 tctacgcttgtcatgata 292  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  20396654 tctacgcttatcatgata 20396637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22378075 - 22377946
Alignment:
Q  182 agtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgc 281  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||  ||||| || |||| ||| ||||||||  | |||||||| |||| ||| || ||||||    
T  22378075 agtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaatatctttcctacgc 22377976  T
Q  282 ttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||||| || || |||| |||||||    
T  22377975 ttatcatgataactcttttgtcgactctgc 22377946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22384250 - 22384121
Alignment:
Q  182 agtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgc 281  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||  ||||| || |||| ||| ||||||||  | |||||||| |||| ||| || ||||||    
T  22384250 agtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaatatctttcctacgc 22384151  T
Q  282 ttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||||| || || |||| |||||||    
T  22384150 ttatcatgataactcttttgtcgactctgc 22384121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 310
Target Start/End: Original strand, 22315364 - 22315478
Alignment:
Q  196 acttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagct 295  Q
    |||||||||| || |||||||| || | |||| | ||||||| ||| |||||||||||  ||||||| ||||  ||||| || | ||| |||||||| ||    
T  22315364 acttcaaagcacgacctacaccggttacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 22315463  T
Q  296 tttctgtcaactctg 310  Q
     ||||||| ||||||    
T  22315464 cttctgtctactctg 22315478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 53)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 20821299 - 20821589
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20821299 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 20821398  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| ||| ||  | |||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  20821399 caattctatacgccacagttccaaccctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 20821498  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  20821499 cataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcttacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgc 20821589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 18 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22236445 - 22236152
Alignment:
Q  18 tggacatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggca 117  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||    
T  22236445 tggacatcatccctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggca 22236346  T
Q  118 aaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacc 217  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  22236345 aaccaactctatatgacactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacc 22236246  T
Q  218 cgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  22236245 cgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgc 22236152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 24736133 - 24735843
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24736133 acatcatctctaggaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 24736034  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || |||||||||||    
T  24736033 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgt 24735934  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||| |||||||  || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  24735933 cataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgc 24735843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 24737307 - 24737017
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24737307 acatcatctctaggaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 24737208  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || |||||||||||    
T  24737207 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgt 24737108  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||| |||||||  || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  24737107 cataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgc 24737017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 24750076 - 24749786
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24750076 acatcatctctaggaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 24749977  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || |||||||||||    
T  24749976 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgt 24749877  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||| |||||||  || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  24749876 cataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgc 24749786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 28924290 - 28924000
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  28924290 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 28924191  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || ||  | |||||||| ||||| |||||||| | |||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||    
T  28924190 caactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 28924091  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  28924090 cataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgc 28924000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 22461798 - 22462088
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||| || |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22461798 acatcgtctcttggaatgacatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 22461897  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || ||  | ||||| || |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||    
T  22461898 caactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgt 22461997  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  22461998 cataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgc 22462088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 28895464 - 28895174
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  28895464 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 28895365  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||| |||| ||||||||  || ||  | |||||||| ||||| |||||||| | |||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||    
T  28895364 caactctatacgccagagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 28895265  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  28895264 cataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgc 28895174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 22381045 - 22381335
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| || ||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  22381045 acatcatctcttggaatcacatgtgacggatctgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 22381144  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  22381145 caactctataagccaccgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 22381244  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  22381245 catcggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 22381335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Original strand, 22502525 - 22502813
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||    
T  22502525 acatcatcccttggaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 22502624  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||  | |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22502625 caactctatatgccactgttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgt 22502724  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactct 309  Q
    || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||    
T  22502725 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactct 22502813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 23080611 - 23080329
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  23080611 acatcatcccttggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggtaaac 23080512  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  23080511 caactctataagccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcttacacccgt 23080412  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtc 303  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  23080411 cataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactatagggcctttctccgcttgtcatgataactcttctgtc 23080329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 24798918 - 24798629
Alignment:
Q  22 catcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaacc 121  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||    
T  24798918 catcatccctcgtaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 24798819  T
Q  122 aactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtc 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||  | ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24798818 aactctatatgccacagtaccaactctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtc 24798719  T
Q  222 ataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  24798718 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctccagaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 24798629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 22 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14887512 - 14887223
Alignment:
Q  22 catcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaacc 121  Q
    ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||    
T  14887512 catcatctctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 14887413  T
Q  122 aactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtc 221  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||  | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14887412 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 14887313  T
Q  222 ataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  14887312 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 14887223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 20773606 - 20773896
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  20773606 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatctggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 20773705  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || ||  | |||||||| ||||| |||||||| | |||||||||  |||||||||| || |||||||| |||||    
T  20773706 caactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacgcccgt 20773805  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  | || |||||||| | ||| || || | |||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  20773806 cataggagtaaccctcagaaaaacatggcccccttcctgaaactgaagctctttccgacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgc 20773896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23442815 - 23442525
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  23442815 acatcatctctcggaataacatacgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaa 23442716  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||| | |||||||| ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  23442715 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagataactgatacggaccaatgaactttggagtcaacatcttagacttcaacacacgtcctacacccgt 23442616  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  23442615 cataggagtgactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagagccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 23442525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 37546018 - 37545728
Alignment:
Q  22 catcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaacc 121  Q
    ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||    
T  37546018 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 37545919  T
Q  122 aactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtc 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||  | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  37545918 aactctatatgccacagtaccaactctctcagaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 37545819  T
Q  222 ataggagtaactctcag-aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    | |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  37545818 aaaggagtgaccctcagaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactgttctgtcgactctgc 37545728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 311
Target Start/End: Original strand, 20342129 - 20342418
Alignment:
Q  22 catcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaacc 121  Q
    ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  20342129 catcatccctcggaatcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaacc 20342228  T
Q  122 aactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtc 221  Q
    ||||||||||||||| || ||||  |||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  20342229 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacctgtc 20342328  T
Q  222 ataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    | ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  20342329 aaaggggtgactctcagaaaaacatgatcacgctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 20342418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21891263 - 21890991
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  21891263 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 21891164  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21891163 ttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacatcctacaccagtcataggtgtaactctcag 21891064  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||| || || |||| || |||||||    
T  21891063 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgc 21890991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 17269855 - 17269565
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||| | |||||||||||| |  || ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| |    
T  17269855 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatctgctacatacttccggagttgtgacacgtgaaatacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 17269756  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17269755 caactctatatgccaccgtcccgatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 17269656  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  17269655 catcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 17269565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 311
Target Start/End: Original strand, 25847922 - 25848211
Alignment:
Q  22 catcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaacc 121  Q
    ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||  ||||||||| | | ||| || ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  25847922 catcatccctcggaatcacatgtgaaggatccgcaacatacttctgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaacc 25848021  T
Q  122 aactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtc 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||  | |||||||||||||||||||| || | |||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  25848022 aactctgtatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtccaacacccgtc 25848121  T
Q  222 ataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  25848122 aaaggagtgactctcaaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 25848211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 27610236 - 27610508
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || ||||||| ||| || ||||| ||||| ||||  || ||||| |    
T  27610236 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagttgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 27610335  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  27610336 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 27610435  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  27610436 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 27610508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 39 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 22333391 - 22333138
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  22333391 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 22333292  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  22333291 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 22333192  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgata 292  Q
    ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22333191 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 22333138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Original strand, 41770724 - 41770995
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || ||||||| |||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  41770724 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 41770823  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  41770824 ttccaactctttccaaaatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 41770923  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| ||||||    
T  41770924 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 41770995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 21564488 - 21564208
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21564488 acatcatctcttggaatagcatgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 21564389  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||||||||||||| || | ||  || ||  |||||||||| |||||||| |||   | |||||| ||||| ||||||||||| || |  ||||  ||    
T  21564388 ccactctatatgccactgtccaaactctatcagatatctgatatggaccaataaaccgtggagtcaaattcttagacttcaaagcacgactaacacgtgt 21564289  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctg 301  Q
    || | |||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  21564288 cacatgagtgactctcagaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtcctttcttcgcttgtcatgataactcttctg 21564208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 22134550 - 22134822
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  || ||||| |    
T  22134550 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccactg 22134649  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  22134650 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 22134749  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||| |||||||    
T  22134750 aaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgc 22134822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 27518289 - 27518561
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || ||||  || ||||||| |||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  27518289 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgtgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 27518388  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  27518389 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 27518488  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| ||  | || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  27518489 aaacacgaggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 27518561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 34566376 - 34566648
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  34566376 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccg 34566475  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  34566476 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaa 34566575  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  34566576 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 34566648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15000243 - 14999971
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  15000243 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 15000144  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  15000143 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 15000044  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || || |||||||| ||||||| ||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  15000043 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgc 14999971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 16356384 - 16356656
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| |  ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  16356384 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggagaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccg 16356483  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  16356484 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaa 16356583  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  16356584 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 16356656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27668994 - 27668722
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  |||||||| || || || |  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  27668994 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 27668895  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  27668894 ttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 27668795  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  27668794 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 27668722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 40708662 - 40708934
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  40708662 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 40708761  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  40708762 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 40708861  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| ||  | || || || || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  40708862 aaacacgcggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 40708934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20468618 - 20468328
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| ||||  || ||||| || |||||||  ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  20468618 acatcatctcttgggatcacatgagacggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 20468519  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| ||| ||||| ||| | || || || ||||||||| |||||||||| ||| |   |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||    
T  20468518 ccactcaatacgccactgtttctattctttctaatatctgacacggaccaataaacctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 20468419  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| ||||||| ||| ||||| || || |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| || ||| |||||||||||    
T  20468418 cacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaattcaaggtctttcctacgtttatcatgataactcttcagtcaactctgc 20468328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 29476577 - 29476324
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  29476577 acatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 29476478  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||| |||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||     
T  29476477 ttccaactctttccaatacctgatatggaccaatgaacttcgtggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacatccgtcataggagtgactctcaa 29476378  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgata 292  Q
    ||| || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29476377 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 29476324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 19769842 - 19770114
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || ||||||| |||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  19769842 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 19769941  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    |||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  19769942 ttccgactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 19770041  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  19770042 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 19770114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27685904 - 27685632
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  |||||||| || || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  27685904 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacgtggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 27685805  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  27685804 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaa 27685705  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || || |||||||| || |||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  27685704 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 27685632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 48 - 292
Target Start/End: Original strand, 22348316 - 22348558
Alignment:
Q  48 ggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcc 147  Q
    |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  || ||||| |||||||  |    
T  22348316 ggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaggccaccgttccaactc 22348415  T
Q  148 tctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatg 247  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || ||    
T  22348416 tttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtg 22348515  T
Q  248 atcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgata 292  Q
     || || ||| |||| |||||||  ||||||||||| || |||||    
T  22348516 gtctccttcccgaaactcaagat--tttctacgcttatcgtgata 22348558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26739209 - 26738937
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| | ||| ||||| |||| ||| ||||| |    
T  26739209 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcttgcaaattcgaaagatgcgttggtaaacccactcgatacgccaccg 26739110  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||||||| || | ||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  26739109 ttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacatccaacaccagtcacaggagtgaccctcaa 26739010  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| | |||||| |  || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  26739009 aaatatatgatctctttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 26738937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 250
Target Start/End: Original strand, 20573403 - 20573614
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| |    
T  20573403 acatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccg 20573502  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||     
T  20573503 ttccaattctttccgatatctgatacggaccaataaaccttgaagtcaacttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcagtggagtgactctcaa 20573602  T
Q  239 aaaaacatgatc 250  Q
    ||| ||||||||    
T  20573603 aaatacatgatc 20573614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21984827 - 21984537
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || ||||||||||||||| || | |  ||||||||||||||||| || || || |||||||| || ||||| || |    
T  21984827 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacctctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgcggtggtaatc 21984728  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||   || ||| ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  |    
T  21984727 ccactcgatacgccaccgttccagctctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccaat 21984628  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| ||||||| ||| || || || ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||    
T  21984627 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccctcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataacttttttgtcgactctgc 21984537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 23573606 - 23573896
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| || |    
T  23573606 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23573705  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  23573706 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23573805  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| ||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  23573806 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 23573896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 23516423 - 23516695
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| | ||||||||| |  |||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| |    
T  23516423 acatgagatggatccgggaaatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcgatatgccaccg 23516522  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||  |||||| |||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  23516523 ttccaactctttctgatatctaatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 23516622  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  23516623 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 23516695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 21662561 - 21662297
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | ||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| |  |||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  21662561 acatcatccctcggaatcacatgcgatggatccgatacatatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaac 21662462  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||||||| | ||  |||||||  || ||| |||||||||||  |||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||  |    
T  21662461 ccactctatacgtcattgttccaactctttccgatatctgatac-aaccaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctat 21662363  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtc 286  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||  | || ||||||||||| || || |||||||||||    
T  21662362 cataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttcttgaaattcaaggtctttcctacgcttgtc 21662297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 291
Target Start/End: Original strand, 23471111 - 23471363
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| | ||| ||||| |||| ||| ||||| |    
T  23471111 acatgtgatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcgttggtaaacccactcgatacgccaccg 23471210  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||| || ||  ||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||   |||| |||||||     
T  23471211 ttccaattctttctgatacctgatacggaccaataaacctccaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacttgagtgactctcaa 23471310  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgat 291  Q
    ||| |||||||| || || ||||| ||||| || |  |||||||| |||||||    
T  23471311 aaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtcttgcctacgcttatcatgat 23471363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 39 - 309
Target Start/End: Original strand, 18775659 - 18775929
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| || || |||| |||   ||| |    
T  18775659 acatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacatcaccg 18775758  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| |||||||  || ||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  18775759 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcagggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 18775858  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactct 309  Q
    ||| || || || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||| |||||    
T  18775859 aaagacgtggtctccctcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactct 18775929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21343862 - 21343666
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| |    
T  21343862 acatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccg 21343763  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactct 235  Q
    ||||||  || ||  |||||| |||||||||||| ||  | | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  21343762 ttccaactctttctgatatcttatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 21343666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 21665971 - 21665758
Alignment:
Q  72 tgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaa 171  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| | ||  |||||||  || ||| |||||||||||  |||||    
T  21665971 tgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaacccactctatacgtcattgttccaactctttccgatatctgataca-accaa 21665873  T
Q  172 tgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatc 271  Q
    | ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||||  | || ||||||||||| ||    
T  21665872 taaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttcttgaaattcaaggtc 21665773  T
Q  272 ctttctacgcttgtc 286  Q
     || |||||||||||    
T  21665772 tttcctacgcttgtc 21665758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 25423053 - 25423343
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||||||||| ||||| |  ||| ||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  25423053 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatagttccgaagttgcaacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 25423152  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||   ||| ||||| |||||||  || ||| ||||||||||||| ||||| ||  | | ||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||    
T  25423153 ccacctgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatctcggagtcaacttctttcacttcaacgcacgtccaacaccagt 25423252  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || | |||| ||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || || |||| |||||||    
T  25423253 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgc 25423343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 75 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 37291964 - 37291747
Alignment:
Q  75 gacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatga 174  Q
    |||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||| |    
T  37291964 gacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataa 37291865  T
Q  175 acttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctt 274  Q
    |||| |  |||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || || || || || || || |||||||| ||    
T  37291864 acttcggggtcaacttttttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttt 37291765  T
Q  275 tctacgcttgtcatgata 292  Q
     |||| ||| ||||||||    
T  37291764 cctacacttatcatgata 37291747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 23440107 - 23440379
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| || ||  ||| ||| ||||| |    
T  23440107 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccctctcgatacgccaccg 23440206  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  23440207 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcattgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaa 23440306  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || ||||| | |||||| || || ||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  23440307 aaacacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 23440379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 292
Target Start/End: Original strand, 20798675 - 20798895
Alignment:
Q  72 tgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaa 171  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| || || | || ||||||||| | |||||  || ||  |||| |||||||||||||    
T  20798675 tgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccaatcgatatgccaccggtccaactctttctgatatttgatacggaccaa 20798774  T
Q  172 tgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatc 271  Q
    | ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || || || || || ||||| ||||||||    
T  20798775 taaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatc 20798874  T
Q  272 ctttctacgcttgtcatgata 292  Q
     || || ||||| ||||||||    
T  20798875 tttcctgcgcttatcatgata 20798895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Original strand, 21404700 - 21404809
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| || ||||| |  ||||||||||| |  || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  21404700 acatcatctcttggaatcacatgagatggatctgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgtggtggtaaac 21404799  T
Q  121 caactctata 130  Q
    | ||||||||    
T  21404800 ccactctata 21404809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 109
Target Start/End: Original strand, 21625382 - 21625470
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatg 109  Q
    |||||||| || | ||| |||||||||||||||  ||||||||| |  |  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21625382 acatcatctctcggaatcacatgcgaaggatccactacatactttcaaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatg 21625470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21498479 - 21498317
Alignment:
Q  100 tcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgactt 199  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||  ||  |||| |||||||  || ||  ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| |||||    
T  21498479 tcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacaccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgactt 21498380  T
Q  200 caaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaa 262  Q
    |||  | ||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||  |||||||| ||||| |||||    
T  21498379 caattcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaactacatgatctccctcttgaaa 21498317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 154 - 444
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  154 acatcatctcttgaaataacatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggaggcaaac 253  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||| || ||||||| ||||||    
T  254 caactctatatgccacagttccaactctttctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaagttcttcaacttcaacgcacgtcctatacccgt 353  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  354 cataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccctcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgc 444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 13704 - 13414
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| ||||||||||    
T  13704 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaac 13605  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  13604 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 13505  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  13504 cataggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgc 13414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 17474 - 17184
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| ||||||||||    
T  17474 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaac 17375  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  17374 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 17275  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  17274 cataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgc 17184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 19946 - 20235
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19946 acatcatctcttggaataacatgcaaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 20045  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||||| |||||||| ||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20046 ccactctgtatgccactgttccaaccttctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtaaacttcttcgacttcaacgcacgtcctacacccgt 20145  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||    
T  20146 cataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctg 20235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 322667 - 322957
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  322667 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccactacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 322766  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  322767 caactctatatgccattgttccaaccctctctgatatctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 322866  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  322867 cataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgc 322957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 303
Target Start/End: Original strand, 117532 - 117813
Alignment:
Q  22 catcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaacc 121  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  117532 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 117631  T
Q  122 aactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtc 221  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||| |||| ||||    
T  117632 aactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacactcgtc 117731  T
Q  222 ataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtc 303  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  117732 ataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtc 117813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 385800 - 386072
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  385800 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 385899  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  |||||  ||||||| || | ||| || ||||| | ||||||||||||  ||||||| || |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  385900 ttccaactctctcagatatctggtatgaacctataaacttcggagtcaacttcttatacttcaacgcacaacctacacccgtcgtaggagtgactctcag 385999  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| | |||||| ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| || || ||||||  |||||||    
T  386000 aaatagatgatctccctcttgaaactcaagggtctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtggactctgc 386072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 111984 - 112273
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| ||||  || ||||| || |||||||  ||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  111984 acatcatctcttgggatcacatgagatggatccgaaacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 112083  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||    
T  112084 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctgggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 112183  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    || |||||| ||||||| ||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||| || || |||| ||||||    
T  112184 cacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtccttcttacgcttatcatgatatctcttttgtcgactctg 112273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 203811 - 203521
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | ||| |||||||| ||||||  |||||||||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||    
T  203811 acatcatccctcggaatcacatgcgatggatccaatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 203712  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||||||||||||| |||||||  || |   ||||||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| | ||||||||| || ||  |||| ||    
T  203711 ccactctatatgccactgttccaactcttttagatatctgatacggaccaataaacctcggcgtcaacttctttggcttcaaagcacggccagcacctgt 203612  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || | |||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || ||||| || |||||  | ||||||| |||||||    
T  203611 cacaagagtgactcttagaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctgcgcttatcgtgataaatcttctgtcgactctgc 203521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 56)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 13323220 - 13322930
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||| || ||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  13323220 acatcatctcttggaataacatgcgacggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatggaatacaccatgcaaattcgaaagatgtggtggaaaac 13323121  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  13323120 caatcctatatgccactgttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgt 13323021  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  13323020 cataggagtaactctcagaaacacatggtctccctcctgaaacccaagatctttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgc 13322930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18134914 - 18134624
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||    
T  18134914 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaac 18134815  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||    
T  18134814 caactctataagccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtcctacaccagt 18134715  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  18134714 cataggagtaactctcagaaatacaagatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgc 18134624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 10420613 - 10420323
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10420613 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 10420514  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    ||| |||||| ||||||||||| |  || ||  | |||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||    
T  10420513 caattctatacgccacagttccgactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgt 10420414  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  10420413 cataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgc 10420323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 24 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12361107 - 12360828
Alignment:
Q  24 tcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaa 123  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  12361107 tcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaa 12361008  T
Q  124 ctctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcat 223  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||| || ||||||||||  |||||    
T  12361007 ctctatatgccactgttccaaccttctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgatttcaatgcacgtcctacacatgtcat 12360908  T
Q  224 aggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtc 303  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  12360907 agaagtaactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtc 12360828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 311
Target Start/End: Original strand, 47123506 - 47123795
Alignment:
Q  22 catcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaacc 121  Q
    ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||  |||||| |||| | ||| || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||    
T  47123506 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacctccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 47123605  T
Q  122 aactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtc 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||  | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47123606 aactctatatgccacagtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtc 47123705  T
Q  222 ataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| | |||||||    
T  47123706 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgc 47123795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 11304341 - 11304059
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  11304341 acatcatcactaggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacaagaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 11304242  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||    
T  11304241 caactctatatgccactattccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgt 11304142  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtc 303  Q
    ||||||   |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||  ||||||||||||| || || |||||||    
T  11304141 catagggaaaactctcagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagagccttcatacgcttgtcatggtaactcttctgtc 11304059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 35 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 13972674 - 13972398
Alignment:
Q  35 aataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcc 134  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  13972674 aataatatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgcc 13972575  T
Q  135 acagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactc 234  Q
    ||||||||||  || ||  | |||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || |||||||| ||||||||||| ||||    
T  13972574 acagttccaactctttctgaaatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactc 13972475  T
Q  235 tcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||  || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  13972474 tcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgc 13972398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 35 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15953522 - 15953246
Alignment:
Q  35 aataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcc 134  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||    
T  15953522 aataacatgcgaatgatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgcc 15953423  T
Q  135 acagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactc 234  Q
    || ||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  15953422 actgttccaaccctctcagatatctgatacgaaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcgtacacccgtcataggagtaaatc 15953323  T
Q  235 tcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||| || || || |||| |||||||    
T  15953322 tcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgc 15953246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 15227210 - 15227500
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15227210 acatcatctctcgaaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 15227309  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||||||||||||| |||||||  |||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  15227310 ccactctatatgccactgttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgt 15227409  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| ||||||| ||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  15227410 cacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgc 15227500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11961602 - 11961312
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||     
T  11961602 acatcatctcttggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgggggcaaat 11961503  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||| |||||  ||||||  |||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||| || |||| ||||| |||    
T  11961502 caactctataagccactattccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcctcgacttcaatgcacgtcgtacactcgt 11961403  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  11961402 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 11961312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16330224 - 16329938
Alignment:
Q  24 tcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaa 123  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  16330224 tcatcccttggaatcacatgcgaaggatccgccacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaa 16330125  T
Q  124 ctctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcat 223  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||  | |||||||||||||| |||||||| | |||||||| | |||||||||| || ||||| ||||| ||||     
T  16330124 ctctatatgccactgttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaactacctcgacttcaatgcacgtccaacacctgtcaa 16330025  T
Q  224 aggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||| || || || |||| ||||||    
T  16330024 aggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctttgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctg 16329938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16837072 - 16836789
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| || |      | || ||||||||||    
T  16837072 acatcatctctcggaataagatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagt------ggtgtggtggcaaac 16836979  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16836978 caactctatatgtcaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 16836879  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| || ||||| ||||| || |||||||||| ||||||    
T  16836878 catcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctg 16836789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8759650 - 8759361
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |    
T  8759650 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatctgctacatacttccgcagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 8759551  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  8759550 caactctatatgccaccgttccgattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 8759451  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  8759450 catcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 8759361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 10383548 - 10383820
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||| || || || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  10383548 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 10383647  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    | ||||  |||||  | |||||||||||||||||||| || | |||||||||  ||||||||||||| || || |||||||||| |||||| || |||||    
T  10383648 taccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgaccctcag 10383747  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  10383748 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 10383820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 36 - 287
Target Start/End: Original strand, 14571424 - 14571675
Alignment:
Q  36 ataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcca 135  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| | |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||    
T  14571424 ataacatgcgaaggatccgctacgtacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatatggtggcaagcccactctatatgcca 14571523  T
Q  136 cagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactct 235  Q
    | ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| ||||| | |||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14571524 ctgttccaaccctctcagatatctgataaggaccaataaacttaggagtcaaattcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactct 14571623  T
Q  236 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtca 287  Q
    || ||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||    
T  14571624 caaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtca 14571675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16381481 - 16381227
Alignment:
Q  35 aataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcc 134  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16381481 aataacatgcgaaggatctgctacatatttccgaagctgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgcc 16381382  T
Q  135 acagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactc 234  Q
    || || |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16381381 accgtcccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactc 16381282  T
Q  235 tcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatg 289  Q
    | | ||| ||||||||||| ||| |||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  16381281 ttaaaaatacatgatcaccatcccgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatg 16381227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 44776808 - 44777098
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |    
T  44776808 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 44776907  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  44776908 caactctatatgccaccgttccgatcctctctgaaatctgatacgggccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacctgt 44777007  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||  |||| || | ||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  44777008 catcggagtgactcttagaaatacatgatcaccctcttggaactcaagggccttcctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 44777098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 13941585 - 13941874
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |    
T  13941585 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 13941684  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  13941685 caactctatatgccaccgttccgattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 13941784  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  13941785 catcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 13941874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 41177083 - 41177372
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |    
T  41177083 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 41177182  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  41177183 caactctatatgccaccgttccgattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 41177282  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  41177283 catcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 41177372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 311
Target Start/End: Original strand, 14086248 - 14086524
Alignment:
Q  35 aataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcc 134  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||    
T  14086248 aataatatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagcc 14086347  T
Q  135 acagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactc 234  Q
    || || || |  |||||  |||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || |||||||| ||||||||||| ||||    
T  14086348 actgtcccgactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactc 14086447  T
Q  235 tcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||  || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  14086448 tcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgc 14086524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 10005169 - 10005441
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||  || ||||| |    
T  10005169 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 10005268  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  10005269 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 10005368  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  10005369 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 10005441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 10905779 - 10906051
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  || ||||| |    
T  10905779 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 10905878  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  10905879 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 10905978  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  10905979 aaacacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 10906051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 292
Target Start/End: Original strand, 13252259 - 13252512
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||  || ||||| |    
T  13252259 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 13252358  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  13252359 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 13252458  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgata 292  Q
    ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  13252459 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgata 13252512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15589953 - 15589681
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || ||||||| |||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  15589953 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 15589854  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  15589853 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 15589754  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  15589753 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 15589681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20062615 - 20062343
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || ||||||| |||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  20062615 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 20062516  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||     
T  20062515 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactctcaa 20062416  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  20062415 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 20062343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 48425016 - 48425288
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  48425016 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 48425115  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  48425116 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 48425215  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  48425216 aaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 48425288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16492760 - 16492470
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |    
T  16492760 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16492661  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||| ||||||| ||  | | |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  16492660 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccaatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgactttaaagctcgtccaacaccagt 16492561  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| ||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  16492560 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 16492470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5425490 - 5425219
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  5425490 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 5425391  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  5425390 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctca- 5425292  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||  || || || || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  5425291 aagcacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 5425219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 16635342 - 16635614
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  16635342 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccg 16635441  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  16635442 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaa 16635541  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  16635542 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 16635614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 43162666 - 43162938
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  43162666 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccg 43162765  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  43162766 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaa 43162865  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  43162866 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 43162938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 17489401 - 17489691
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |    
T  17489401 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 17489500  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  17489501 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 17489600  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| ||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  17489601 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 17489691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15725494 - 15725241
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  15725494 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 15725395  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  15725394 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctaaa 15725295  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgata 292  Q
    ||| || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15725294 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 15725241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14877060 - 14876788
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||  |||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  14877060 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcagtggtaatccaactcgatacgccaccg 14876961  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||     
T  14876960 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtaactctcaa 14876861  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  14876860 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 14876788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15348806 - 15348534
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || ||||||| |||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  15348806 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 15348707  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  15348706 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 15348607  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  15348606 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 15348534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 12497817 - 12498089
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  12497817 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 12497916  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  12497917 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 12498016  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  12498017 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 12498089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 83 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12850785 - 12850557
Alignment:
Q  83 aaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaa 182  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||||||| || |||||||| ||||| | |    
T  12850785 aaacacatcatgcaaattccaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtatggaccaataaacttcgga 12850686  T
Q  183 gtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgct 282  Q
    ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||  |||| ||||| |||||  ||||| | ||||    
T  12850685 gtcaacttcttagacttcaacgcacgacctatacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatcttcctcttgaaactcaagggcctttattcgct 12850586  T
Q  283 tgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||| || || ||||||| |||||||    
T  12850585 tgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 12850557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 15338838 - 15339110
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || || |  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || || || |    
T  15338838 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagctaccg 15338937  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||     
T  15338938 ttccaattctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactctcaa 15339037  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || |||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || || |||| |||||||    
T  15339038 aaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgc 15339110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16412843 - 16412571
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  || |||||||| || ||||  |  |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  16412843 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaaaacgttgtccaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 16412744  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  16412743 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 16412644  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||    
T  16412643 aaatacgtggtctccttcatgaaactcaaggtcattcctacgcttatcatgataactcttttgccaactctgc 16412571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16757146 - 16756874
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || || |  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  16757146 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 16757047  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    | ||||  || ||||| || ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  16757046 tcccaactctttccaaaatatgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 16756947  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| |  || || || |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||    
T  16756946 aaacatgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgc 16756874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 53385579 - 53385307
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || || |  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  53385579 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 53385480  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    | ||||  || ||||| |||||||| |||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||     
T  53385479 tcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaactttttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcacaggagtgactctcaa 53385380  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  53385379 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 53385307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15403071 - 15402799
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || ||||| || |||||||| || |  ||||||||||| || || |  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  15403071 acatgagatggatctggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccg 15402972  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||     
T  15402971 ttccaattctttccaatatctgatacggaccaatgaacatcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactctcaa 15402872  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| || || |||| |||||||    
T  15402871 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaaaatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgc 15402799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 309
Target Start/End: Original strand, 15208460 - 15208730
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | ||||| |||| |||  |||| |    
T  15208460 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggttgtaaacccactcgatactccaccg 15208559  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||| || ||  ||||||||| ||||||||| ||| | | ||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  15208560 ttccaattctttctgatatctgattcggaccaataaacctcggagtcaacttcttttacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 15208659  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactct 309  Q
    ||| |||||||| || || ||||| ||||  |  || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||    
T  15208660 aaatacatgatctccttcttgaaactcaatgtttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactct 15208730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 9522270 - 9522559
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||| ||||    
T  9522270 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaaac 9522369  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||||  || ||||| |||||||  || |   ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  9522370 ccactcggtacgccaccgttccaactctttttgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 9522469  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    || |||||| ||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || |||| ||||||    
T  9522470 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaagtcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 9522559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 6600316 - 6600588
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || || |  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  6600316 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 6600415  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    | ||||   | ||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  6600416 tcccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 6600515  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || ||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  6600516 aaacacgtggtctccttccttgaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 6600588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 165
Target Start/End: Original strand, 31945033 - 31945177
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  31945033 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 31945132  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacg 165  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| ||  ||||||||||||    
T  31945133 caactttatatgccactgttccaaccctttctgatatctgatacg 31945177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 31689191 - 31689049
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||| |||||    
T  31689191 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgtcaaac 31689092  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgata 163  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||  ||||||||||    
T  31689091 caactctatatgccactgttccaaccctttctgatatctgata 31689049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26792960 - 26792688
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||| | ||||  || ||||  |    
T  26792960 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaatccactcggtaagccatcg 26792861  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| |     
T  26792860 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacactagtcataggagtgactcttaa 26792761  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || || |||||||| || |||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  26792760 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 26792688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 310
Target Start/End: Original strand, 15247749 - 15247987
Alignment:
Q  72 tgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaa 171  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| | ||||| |||| ||| ||||| |||||||| || ||| |||||| |||||||||||    
T  15247749 tgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggttgtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatatctaatacggaccaa 15247848  T
Q  172 tgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatc 271  Q
    |  || | | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| |||||||| || || ||||| |||   |     
T  15247849 tacacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcattgtt 15247948  T
Q  272 ctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
     || |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||    
T  15247949 tttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctg 15247987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 16691711 - 16692001
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||| ||||||||||| |  || |||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| || |    
T  16691711 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16691810  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | || | ||||||||| ||||||| ||| ||| |||| |||||||  ||||| ||  | | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||    
T  16691811 ccacacgatatgccaccgttccaaccctttccgatatttgatacgacccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 16691910  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| ||||||| ||| || || || || |||||||| |||||||||||  | ||||| |||||||| || ||||||| |||||||    
T  16691911 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcttgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgc 16692001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 311
Target Start/End: Original strand, 16371000 - 16371254
Alignment:
Q  57 acatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaata 156  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| || ||||  || ||  |||    
T  16371000 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgacatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcaatacgccaccgtcccaactctttctgata 16371099  T
Q  157 tctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctc 256  Q
    |||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || |  ||  | ||    
T  16371100 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtagtcttcttc 16371199  T
Q  257 ctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
     |||||||||||||| || |||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  16371200 ttgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 16371254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16807487 - 16807234
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  16807487 acatgagatggatccggaacataattccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 16807388  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||   | | | |||||||||||||||| |  ||  |   |||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  16807387 ttccaaattttttcgatatctgatacggaccgaaaaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 16807288  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgata 292  Q
    ||| || || || || || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16807287 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgata 16807234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 12854426 - 12854360
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaaca 87  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  12854426 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaaca 12854360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 182 - 310
Target Start/End: Original strand, 15576472 - 15576600
Alignment:
Q  182 agtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgc 281  Q
    |||||||||| |  |||||||||| || || || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  ||||||| |||| ||||||||| | |    
T  15576472 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctc 15576571  T
Q  282 ttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15576572 ttatcatgatagctcttctgtctactctg 15576600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15016155 - 15016034
Alignment:
Q  189 ttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcat 288  Q
    ||||||||||| |  || | ||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || || || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  15016155 ttcttcgactttagtgctcatccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcat 15016056  T
Q  289 gatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    |||| || || |||| ||||||    
T  15016055 gataactcttttgtctactctg 15016034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8274817 - 8274689
Alignment:
Q  182 agtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgc 281  Q
    |||||||||| |  |||||||||| || || || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  | ||||| |||| ||||||||| | |    
T  8274817 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 8274718  T
Q  282 ttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    || |||||||| || ||||||| ||||||    
T  8274717 ttatcatgataactcttctgtctactctg 8274689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 234 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13975411 - 13975335
Alignment:
Q  234 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    |||| ||| |||||||||||  | ||||| |||| ||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13975411 ctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctg 13975335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Original strand, 19854261 - 19854543
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  19854261 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatttggtggcaaac 19854360  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||  | ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19854361 caactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgt 19854460  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtc 303  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  19854461 cataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtc 19854543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20940475 - 20940185
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||| ||| || |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  20940475 acatcatctcttggaataacgtgcgaaagatacgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 20940376  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20940375 caactctatatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 20940276  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||    
T  20940275 cataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgc 20940185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 35 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19665274 - 19664998
Alignment:
Q  35 aataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcc 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19665274 aataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcc 19665175  T
Q  135 acagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactc 234  Q
    || ||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  19665174 actgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactc 19665075  T
Q  235 tcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  | || ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  19665074 tcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgc 19664998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20857173 - 20856883
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20857173 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 20857074  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || ||  | ||||| || |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||    
T  20857073 caactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgt 20856974  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||    
T  20856973 cataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaacgcaaggtccttcctacgcttgtcgtgatagctcttttgtcgactctgc 20856883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22433528 - 22433238
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | ||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  22433528 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatattcgaaagatgtggtggcaaac 22433429  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||  | |||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  22433428 caactctataggccacagttgcaaccctctctgaaatctgatacgaaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgt 22433329  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||   |||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  22433328 cataggagtaaccctcaggaacacatgatcaccctcctgaaactcaaggggctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 22433238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 20244147 - 20244437
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  20244147 acatcatctctcggaataacatgcgaaagatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaac 20244246  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||  | |||||||| ||||| |||||||| | |||||||||  |||||||||| ||  |||| ||||||||    
T  20244247 caactctataggccactgttccaaccctctctgaaatctgatatggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcatgtcccacacccgt 20244346  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  20244347 cataggagtaaccctcagaaagacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 20244437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 31550593 - 31550311
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  31550593 acatcatcccttggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 31550494  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    ||||||| |||||||| || ||||  |||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||    
T  31550493 caactctgtatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgt 31550394  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtc 303  Q
    || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  31550393 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtc 31550311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 20294359 - 20294649
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||    
T  20294359 acatcatcccttggaatcacatgcgaaggatccgccacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 20294458  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| || ||||  |||||  | |||||||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20294459 caactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatatggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgt 20294558  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  20294559 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcttgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 20294649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 39 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 20075453 - 20075203
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| | ||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  20075453 acatgcgaaggatctgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactg 20075354  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    |||| |  |||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||    
T  20075353 ttcccactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgacccttag 20075254  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  20075253 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatg 20075203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 311
Target Start/End: Original strand, 37677027 - 37677317
Alignment:
Q  22 catcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaacc 121  Q
    ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||    
T  37677027 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 37677126  T
Q  122 aactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtc 221  Q
    |||||| |||||||| || ||||  |||||  | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  37677127 aactctgtatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 37677226  T
Q  222 ataggagtaactctc-agaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    | |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  37677227 aaaggagtgaccctcaagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 37677317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 83 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20836241 - 20836010
Alignment:
Q  83 aaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaa 182  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  | ||||||||||||||||||||||| | |    
T  20836241 aaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttgga 20836142  T
Q  183 gtcaactt---cttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctac 279  Q
    ||||||||   ||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||  |||| | ||    
T  20836141 gtcaacttcttcttcgacttaaatgtacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctaaaacttaagggccttccaac 20836042  T
Q  280 gcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||||||| || || |||| |||||||    
T  20836041 gcttgtcatgataactcttatgtcgactctgc 20836010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20395404 - 20395173
Alignment:
Q  22 catcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaacc 121  Q
    ||||||| || | ||| ||||| |||||||||| |||||||||||| | ||| || | ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  20395404 catcatccctcggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaatatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 20395305  T
Q  122 aactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtc 221  Q
    |||||||||||||||  ||||||  |||||  | |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| ||||||||||||| || || |||||||||    
T  20395304 aactctatatgccactattccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaaattcctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtc 20395205  T
Q  222 ataggagtaactctcagaaaaacatgatcacc 253  Q
    | |||||| || || |||||||||||||||||    
T  20395204 aaaggagtgaccctaagaaaaacatgatcacc 20395173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 41354863 - 41354591
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || || |  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  41354863 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 41354764  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    | ||||  || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  41354763 tcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 41354664  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  41354663 aaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 41354591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16350993 - 16350721
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || || |  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  16350993 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 16350894  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  16350893 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 16350794  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  16350793 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 16350721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 311
Target Start/End: Original strand, 11382676 - 11382831
Alignment:
Q  156 atctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccct 255  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11382676 atctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccct 11382775  T
Q  256 cctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  11382776 cctgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 11382831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 17045427 - 17045137
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| || |    
T  17045427 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 17045328  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||  | |  ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||    
T  17045327 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggt 17045228  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| ||||||| ||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  17045227 cacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 17045137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 33391423 - 33391151
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || ||||||| |||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  33391423 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 33391324  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  33391323 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 33391224  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  33391223 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 33391151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 50620656 - 50620366
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| ||||    
T  50620656 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaac 50620557  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| |||||||||  ||||||  || ||  ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||    
T  50620556 ccactcgatatgccaccattccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 50620457  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| ||||||| ||| || |||||  |||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  50620456 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 50620366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 19106332 - 19106604
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || || |  || |||||||||||||| ||| | || ||||||| ||| ||||| |    
T  19106332 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatccaactcgatacgccaccg 19106431  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||| |||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  19106432 ttccaactctttccgatatctgatatggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 19106531  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  19106532 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctccgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 19106604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 21830268 - 21830540
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  21830268 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 21830367  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  21830368 ttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 21830467  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || ||||| |||||||| |||| |||||| || ||||| || || |||| |||||||    
T  21830468 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgc 21830540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 48 - 292
Target Start/End: Original strand, 16369271 - 16369515
Alignment:
Q  48 ggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcc 147  Q
    |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |  || ||||| |||||||  |    
T  16369271 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaacacggtacgccaccgttccaactc 16369370  T
Q  148 tctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatg 247  Q
    | ||  ||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||  |||| |||||| ||||||| ||| |||||    
T  16369371 tttctgatatctgatatagaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacttgtcacaggagtgactctcaaaaatacatg 16369470  T
Q  248 atcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgata 292  Q
    ||| || || || |||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  16369471 atctccttcttggaattcaaggtctttcctacgcttatcatgata 16369515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 51333887 - 51333615
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||| | |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  51333887 acatgagatggatccagaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 51333788  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  51333787 ttccaactctttccaatatatgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 51333688  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || |  || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  51333687 aaacacgtggtctccttattggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 51333615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 292
Target Start/End: Original strand, 21836915 - 21837168
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||  | |  ||||||||||| || ||||  || ||||||| |||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  21836915 acatgagatggatccggaacatacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 21837014  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  21837015 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 21837114  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgata 292  Q
    ||| || || || || || || || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  21837115 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgctgatcatgata 21837168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 140 - 311
Target Start/End: Original strand, 41307891 - 41308062
Alignment:
Q  140 tccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcaga 239  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41307891 tccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttttagacttcaatgcacgtcatacacccgtcataggagtaaccctcaga 41307990  T
Q  240 aaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || ||||| || ||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  41307991 aacacatggtctccctcttgaaactcaaggggctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 41308062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 20249797 - 20250087
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||    
T  20249797 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaac 20249896  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||||  || ||||| |||||||  || ||  |||||| ||||||| |||| || || | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||    
T  20249897 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaacaataaatttcggagtcaacttctttgacttcaacgctcgtccaacaccagt 20249996  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| ||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || |||| |||||||    
T  20249997 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgc 20250087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 50612828 - 50612612
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| ||||    
T  50612828 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaac 50612729  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| |||||||||  ||||||  || ||  ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||    
T  50612728 ccactcgatatgccaccattccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 50612629  T
Q  221 cataggagtaactctca 237  Q
    || |||||| |||||||    
T  50612628 cacaggagtgactctca 50612612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16079045 - 16078829
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| || |    
T  16079045 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgtagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16078946  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| ||| |||||  ||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||    
T  16078945 ccactcgatacgccaccattccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 16078846  T
Q  221 cataggagtaactctca 237  Q
    || |||||| |||||||    
T  16078845 cacaggagtgactctca 16078829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Original strand, 21747482 - 21747698
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  21747482 acatcatcactttggattacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 21747581  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||||  || ||||| |||||||  || ||| |||||||||||| |||||| ||  | | | |||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||    
T  21747582 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaatctcggattcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 21747681  T
Q  221 cataggagtaactctca 237  Q
    || |||||| |||||||    
T  21747682 cacaggagtgactctca 21747698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19761278 - 19760988
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| ||||  || ||||| || |||||||  ||||||| ||| |  ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  19761278 acatcatctcttgggatcacatgagacggatccgaaacatactaccgaagttgcgatacatgaaacatatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaac 19761179  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||| || ||  ||||||||||||| ||||| ||  | | |||||||||||| |||||||| || ||||| |||||  |    
T  19761178 ccactcgatacgccaccgttccaattctttcggatatctgatacggtccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccaat 19761079  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || | |||| ||||||| ||| ||||| || || || ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  19761078 cacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 19760988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 311
Target Start/End: Original strand, 20136761 - 20137015
Alignment:
Q  57 acatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaata 156  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||| |||||||| | ||| ||||| || ||||  || ||| |||    
T  20136761 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgccgtggtaaaccaacacgatacgccactgtcccaactctttccgata 20136860  T
Q  157 tctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctc 256  Q
    |||||||| ||||||| ||  | | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||  | || || ||    
T  20136861 tctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttc 20136960  T
Q  257 ctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
     ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || || |||| |||||||    
T  20136961 ttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgc 20137015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 118
Target Start/End: Original strand, 24476927 - 24477024
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaa 118  Q
    |||||||| || | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24476927 acatcatctctcggaatcacatgcgagggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgaaaattcgagagatgtggtggcaa 24477024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 172
Target Start/End: Original strand, 21163245 - 21163378
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || | ||| || |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||  || ||||| |    
T  21163245 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaatgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 21163344  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaat 172  Q
    ||||||  || ||| |||||||||||||||||||    
T  21163345 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaat 21163378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 310
Target Start/End: Original strand, 46518829 - 46518957
Alignment:
Q  182 agtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgc 281  Q
    |||||||||| |  |||||||||| || || ||||| |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  | ||||| |||| |||||| || | |    
T  46518829 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctc 46518928  T
Q  282 ttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  46518929 ttatcatgatagctcttctgtctactctg 46518957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 27482 - 27772
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  27482 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaac 27581  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||    
T  27582 caactctatatgccactgttccaaccctctctgatatcttatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcgatgcacgtcctacacctgt 27681  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  27682 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgc 27772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1491 - 1202
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| |||  |||||    
T  1491 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcattcaaattcgaaagatgtggtttcaaac 1392  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||| | |||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  1391 ctactttttatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaat-aacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacccgt 1293  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||| | | ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  1292 cataggaatgattctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgc 1202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 742 - 452
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  742 acatcatctcttggaataacatgcaaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 643  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  642 caactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 543  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  542 cataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgc 452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 10851 - 11141
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| ||||||||||    
T  10851 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaac 10950  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  10951 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 11050  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  11051 cataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgc 11141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7992 - 7864
Alignment:
Q  182 agtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgc 281  Q
    |||||||||| |  |||||||||| || || || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||| |||| |||||| || | |    
T  7992 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctc 7893  T
Q  282 ttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  7892 ttatcatgatagctcttctgtctactctg 7864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 61556 - 61266
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  61556 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 61457  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||||||||||||| ||||||| ||| |   ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  61456 ccactctatatgccactgttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccat 61357  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  61356 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 61266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 52522 - 52232
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  52522 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaatttcgaaagatgaggtggcaaac 52423  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||||||||||||| ||||||| ||| |   ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  52422 ccactctatatgccactgttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccat 52323  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  52322 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 52232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 56 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 67909 - 67654
Alignment:
Q  56 tacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaat 155  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |   ||    
T  67909 tacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaacccttttagat 67810  T
Q  156 atctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccct 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  67809 atctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccct 67710  T
Q  256 cctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  67709 cctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 67654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 56)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 10469334 - 10469044
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  10469334 acatcatcccttggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaac 10469235  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||    
T  10469234 caactctatatgccacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgt 10469135  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  10469134 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 10469044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14131664 - 14131374
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  14131664 acatcatctctaggaataacaggcgaaggatccgttacatacttccgtaactgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgttgtggcaaac 14131565  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||||||||||||| |||||||  |||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||    
T  14131564 ccactctatatgccactgttccaactctctcagatatctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacctgt 14131465  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  14131464 cataggagtgaccctcagaaacacatgatctccttcctgaaactccaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgc 14131374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 15459132 - 15459422
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  15459132 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgatacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 15459231  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||||||| |||||||||||||  || ||  | |||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||    
T  15459232 ccactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgt 15459331  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  15459332 cataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgc 15459422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 21471397 - 21471687
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21471397 acatcatctcttggaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 21471496  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||||||| |||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||    
T  21471497 ccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtacggatcaataaacttcggagtcaacttcttagatttcaacgcacgtcctacccccgt 21471596  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  21471597 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 21471687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 22797117 - 22796849
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22797117 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 22797018  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||||||||||||| ||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||| ||||| | |||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||    
T  22797017 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatatgatacagaccaataaacttaggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgt 22796918  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatg 289  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||    
T  22796917 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 22796849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 25750605 - 25750895
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  25750605 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagatgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 25750704  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||    
T  25750705 ccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcttacacccgt 25750804  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || | |||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  25750805 cacaagagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 25750895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27561102 - 27560812
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | ||| ||||||||||| || | |||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |    
T  27561102 acatcatctctcggaatgacatgcgaagggtctgctacatacttccgcaactgtgacacgtggaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 27561003  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27561002 caactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 27560903  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  27560902 catcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 27560812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 19879094 - 19879384
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  19879094 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaac 19879193  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | || ||||| ||||| |||||||  |||||  |||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| || ||||| || || |||||||| |     
T  19879194 ccaccctataagccactgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagatttcaatgcacggcctacacctgc 19879293  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||| |||||||  || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  19879294 cataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgc 19879384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 21564617 - 21564329
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  21564617 acatcatctctaggaataatatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattctaaagatgaggcggcaaac 21564518  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || |||||||| ||    
T  21564517 ccactctatacgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgt 21564418  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactct 309  Q
    || |||||| |||||||  || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  21564417 caaaggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgtttgtcatgatagctcttctgtcgactct 21564329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 24364208 - 24364498
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||    
T  24364208 acatcatcccttggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 24364307  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| || ||||  |||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||  || || || ||||||||    
T  24364308 caactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgt 24364407  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  24364408 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 24364498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 34646071 - 34645781
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  34646071 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatcaggtacgtacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 34645972  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    ||| |||||| |||||||||||||  |||||  |||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || || ||||| ||    
T  34645971 caattctatacgccacagttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacgacccacacctgt 34645872  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||| || ||||  || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  34645871 cataggagtgaccctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgc 34645781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 8766633 - 8766345
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |  ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  8766633 acatcatctattggaataacatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 8766534  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||||| || ||||| ||||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||| || |||||||| |  ||    
T  8766533 ccactctgtaagccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacccttgt 8766434  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactct 309  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||    
T  8766433 catagaagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactct 8766345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 113 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14381860 - 14381662
Alignment:
Q  113 tggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  14381860 tggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcct 14381761  T
Q  213 acacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| || ||||||| |||||||    
T  14381760 acacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttctgtccactctgc 14381662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 18794486 - 18794776
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18794486 acatcatctctaggaataacatgcgacggatccggtacatactttcgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 18794585  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| ||||||||| ||||||| |||||   |||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || |||||||| ||    
T  18794586 ccactcgatatgccactgttccaaccctcttagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaaggcacggcctacacctgt 18794685  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||| |||||||  || |||||||| ||||| ||||| | ||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18794686 cataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactgaaggtctttcctacgattgtcatgatagctcttctgtcgactctgc 18794776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 28283298 - 28283009
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| |    
T  28283298 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcgtgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 28283199  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  28283198 caactctatatgccaccgtcccgatcctctctgaaatctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 28283099  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  28283098 catcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 28283009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 56 - 311
Target Start/End: Original strand, 25768022 - 25768277
Alignment:
Q  56 tacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaat 155  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||    
T  25768022 tacatacttccgaagctgcgacacgtgaaacacatcatgcaaattggaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagat 25768121  T
Q  156 atctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccct 255  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| || |    
T  25768122 atctggtacggaccaataaactttgaagtcaatttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgtcataagagtgactctcagaaacacatgatctcctt 25768221  T
Q  256 cctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  25768222 cttgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 25768277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11288083 - 11287793
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||    
T  11288083 acatcatctcttggaataacatgcgaagaatccggtacatagttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaac 11287984  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | || ||||| ||||| |||||||  |||||  |||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || |||||||||||    
T  11287983 ccaccctataagccactgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgt 11287884  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||| || |||||||  || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11287883 cataggggtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgc 11287793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11280990 - 11280700
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||    
T  11280990 acatcatctcttggaataacatgcgaagaatccggtacatagttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaac 11280891  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | || ||||| ||||| |||||||  |||||  |||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| || || || ||  |||||||||| ||    
T  11280890 ccaccctataagccactgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcatgtcctacacctgt 11280791  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||| || | |||||  || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11280790 cataggtgtgattctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgc 11280700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 104 - 309
Target Start/End: Original strand, 17415365 - 17415570
Alignment:
Q  104 aagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaa 203  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||     
T  17415365 aagatgcggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaat 17415464  T
Q  204 gcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtc 303  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |||| || || |||||||    
T  17415465 gcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtc 17415564  T
Q  304 aactct 309  Q
     |||||    
T  17415565 gactct 17415570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5839686 - 5839414
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |    
T  5839686 acatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatacgccactg 5839587  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  5839586 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcaa 5839487  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||    || || || || ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || ||||||| |||||||    
T  5839486 aaacgtgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgc 5839414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 28263664 - 28263392
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || || |  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  28263664 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 28263565  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    | ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  28263564 tcccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 28263465  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  28263464 aaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 28263392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 28342413 - 28342141
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || || |  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  28342413 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 28342314  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    | ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  28342313 tcccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 28342214  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  28342213 aaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 28342141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 29592387 - 29592115
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  29592387 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccg 29592288  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  29592287 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 29592188  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  29592187 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 29592115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16627184 - 16626912
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || ||||||| |||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  16627184 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 16627085  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  16627084 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 16626985  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  16626984 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 16626912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1543551 - 1543280
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || || |  || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  || ||||| |    
T  1543551 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 1543452  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||     
T  1543451 ttccaactctttccaatatctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcataggagtgactctcaa 1543352  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    ||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||| ||||||    
T  1543351 aaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 1543280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 292
Target Start/End: Original strand, 25112366 - 25112619
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||| | |  ||||||||||| || || |  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  25112366 acatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 25112465  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    |||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  25112466 ttccgactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 25112565  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgata 292  Q
    ||| || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25112566 aaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 25112619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 24313635 - 24313363
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  24313635 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 24313536  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  24313535 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 24313436  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || || |||||||| || ||| |||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  24313435 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 24313363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 27187250 - 27187522
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || || |  || ||||||||||||||  | || ||||| ||||  || ||||| |    
T  27187250 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaacccactcggtaagccaccg 27187349  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  27187350 ttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 27187449  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  27187450 aaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 27187522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27261990 - 27261718
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || || |  || ||||||||||||||  | || ||||| ||||  || ||||| |    
T  27261990 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaacccactcggtaagccaccg 27261891  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  27261890 ttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 27261791  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  27261790 aaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 27261718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 141 - 311
Target Start/End: Original strand, 18800858 - 18801028
Alignment:
Q  141 ccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaa 240  Q
    |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18800858 ccaaccctctctgatatctgatatggaccaatgaactttgaagtcaactgcttcgacttcaattcacgtcttacacccgtcataggagtaactctcagaa 18800957  T
Q  241 aaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    | |||||||| ||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||| || || || |||| |||||||    
T  18800958 atacatgatccccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgc 18801028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 2875270 - 2875017
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  2875270 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccactg 2875171  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  2875170 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttatttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 2875071  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgata 292  Q
    |||  | || || || || ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  2875070 aaactcgtggtctccttcttgaaactcaaaatcttttctacgcttatcatgata 2875017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 28292839 - 28292567
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || || |  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  28292839 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 28292740  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    | ||||  || ||||| |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  28292739 tcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttaacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 28292640  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || |||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  28292639 aaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgc 28292567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 237
Target Start/End: Original strand, 17032376 - 17032574
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  || ||||| |    
T  17032376 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 17032475  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctca 237  Q
    ||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  17032476 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcccacaccagtcataggagtgactctca 17032574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25610346 - 25610057
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| ||||    
T  25610346 acatcatcactttggatcacatgggatggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgcgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 25610247  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaa-cttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccg 219  Q
    |||| | ||| ||||| |||||||  || ||| |||||| |||||||||||| || || |||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  25610246 caacacgatacgccaccgttccaactctttccgatatctaatacggaccaataaatctcggaa-tcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccgg 25610148  T
Q  220 tcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    ||| ||| || ||||||| ||| |  || || || || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || || |||| ||||||    
T  25610147 tcacaggtgtgactctcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 25610057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 12497840 - 12498112
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  12497840 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 12497939  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||| ||||||| ||||||||||| ||  | | |||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  12497940 ttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaa 12498039  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  12498040 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 12498112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 12505169 - 12505441
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||| |||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  12505169 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgaaaaatcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 12505268  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||| ||||||| ||||||||||| ||  | | |||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  12505269 ttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaa 12505368  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  12505369 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 12505441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12511061 - 12510789
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  12511061 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 12510962  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||| ||||||| ||||||||||| ||  | | |||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  12510961 ttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaa 12510862  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  12510861 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 12510789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 19864501 - 19864773
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  19864501 acatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatgaaagacatcatacaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 19864600  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||| |||||| ||||| |     
T  19864601 ttccaaatctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 19864700  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||| | ||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  19864701 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctgc 19864773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 22079173 - 22078885
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||| ||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  22079173 acatcatcactttggatcacatgggatggatcaggaacatacttccgaagttgctacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22079074  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| ||| ||||| || ||||  || ||| ||||||||||||||| ||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  |    
T  22079073 ccactcgatacgccaccgtaccaactctttccgatatctgatacggacgaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccaat 22078974  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactct 309  Q
    || |||||| ||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||| || ||| |||| |||||||| || || |||| |||||    
T  22078973 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctaagcttatcatgataactcttttgtcgactct 22078885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 48 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18198005 - 18197742
Alignment:
Q  48 ggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcc 147  Q
    |||||| | ||||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| |||  ||| |    
T  18198005 ggatccagaacatacttccgaagttgcgaaacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggcaaacccactcgatacgccactgtttaaattc 18197906  T
Q  148 tctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatg 247  Q
    | ||| |||||| |||| ||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||  | ||||||||||  |||| | |||| ||| ||||||| |||||    
T  18197905 tttccgatatcttatacagaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaattcgcgtcctacacttgtcacaagagtgactttcagaaatacatg 18197806  T
Q  248 atcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||  ||||| ||||| | ||| || || | |||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  18197805 atatccctcttgaaacttaaggtctttccgacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 18197742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27331918 - 27331628
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||| | ||||||||||| |  |||||||||| |||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  27331918 acatcatcactttggatcacatgggatggatccagaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 27331819  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||||  || ||||| |||||||  || ||  |||||||||| |||||||| ||  | | |||||||||| |  ||||||| || ||||| ||||| ||    
T  27331818 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagt 27331719  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| ||||||| ||| || ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  27331718 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgc 27331628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27392658 - 27392368
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||| | ||||||||||| |  |||||||||| |||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  27392658 acatcatcactttggatcacatgggatggatccagaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 27392559  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||||  || ||||| |||||||  || ||  |||||||||| |||||||| ||  | | |||||||||| |  ||||||| || ||||| ||||| ||    
T  27392558 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagt 27392459  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| ||||||| ||| || ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  27392458 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgc 27392368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 145
Target Start/End: Original strand, 1640595 - 1640719
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  1640595 acatcatctcttggaataacatgtgaaggatccgctacgtacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaat 1640694  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaat 145  Q
    | |||||||||||||| || |||||    
T  1640695 ccactctatatgccactgtcccaat 1640719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 21833466 - 21833178
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| || |    
T  21833466 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 21833367  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| ||| |||||  ||||||  || ||| |||||||||||||||| || ||  | | |||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||    
T  21833366 ccactcgatacgccaccattccaactctttccgatatctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacctccaacaccagt 21833267  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactct 309  Q
    || |||||| ||||||| ||| |  || |  || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| || || |||| |||||    
T  21833266 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtttccttcttgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactct 21833178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 182 - 303
Target Start/End: Original strand, 25750903 - 25751024
Alignment:
Q  182 agtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgc 281  Q
    |||| ||||||| || ||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||    
T  25750903 agtccacttcttagatttcaacgcacgtcctacacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgc 25751002  T
Q  282 ttgtcatgatagcttttctgtc 303  Q
    |||||||| || || |||||||    
T  25751003 ttgtcatggtaactcttctgtc 25751024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16963834 - 16963562
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || |  ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||  |    
T  16963834 acatgagatggatccggtacatactttcgaagttgcgacacatgtaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaacacgatacgccatcg 16963735  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||   | ||| |||||||||| |||||||| ||  | | ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  16963734 ttccaactatttccgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 16963635  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  16963634 aaacacttggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 16963562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 144
Target Start/End: Original strand, 18787684 - 18787807
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |  ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| | ||||||||    
T  18787684 acatcaactcttggaataacatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaatatgtgatggcaaac 18787783  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaa 144  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  18787784 ccactctatatgccactgttccaa 18787807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 22762940 - 22762673
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || ||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||    || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  22762940 acatcatcactttggatcacatgggagggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacaaagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22762841  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||  ||| ||||  |||||||  || ||| ||||||||| ||||||||| ||  | |  ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  22762840 ccacttgatacgccatcgttccaactctttccgatatctgattcggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 22762741  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcat 288  Q
    || |||||| ||||||| ||| || || || || || ||||| ||||||||  | |||||||| ||||    
T  22762740 cacaggagtgactctcacaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctgtcctacgcttatcat 22762673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 292
Target Start/End: Original strand, 23078265 - 23078536
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||| || || || || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  23078265 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgtaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23078364  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| ||| ||||| |||  ||  || ||| |||||||||||| || ||| ||  | | |||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||    
T  23078365 ccactcgatacgccaccgtttaaactctttccgatatctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgcccaacaccagt 23078464  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgata 292  Q
    || |||||| ||||||| ||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||    
T  23078465 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgata 23078536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16928107 - 16927854
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || |  ||||||||||| || |  || ||  ||||||||||||| ||||| || ||||  | ||| ||||| |    
T  16928107 acatgagatggatccggtacatactttcgaagttgcgacacatgtaatatatcgtgcgaattcgaaagatgcggtggtaatccaagacgatacgccaccg 16928008  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  |||| | |||| |||||||     
T  16928007 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacactagtcacaagagtgactctcaa 16927908  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgata 292  Q
    ||| || || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||    
T  16927907 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgata 16927854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 310
Target Start/End: Original strand, 1640730 - 1640857
Alignment:
Q  183 gtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgct 282  Q
    |||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||| ||| || ||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  1640730 gtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggggtgactcttagaaacacatgatctccttcctaaaattcaaggtcctttctacgct 1640829  T
Q  283 tgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||    
T  1640830 tgtcatgataactcttctgtcgactctg 1640857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 25765756 - 25765487
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||  |  | ||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||| |||  |||| |    
T  25765756 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttacgacacatggaacacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacaccaccg 25765657  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||| ||||||||||| ||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| | | || |||||||     
T  25765656 ttccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcaca-gcgtgactctcaa 25765558  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactct 309  Q
    ||  || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||    
T  25765557 aagcacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactct 25765487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18408428 - 18408160
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || | ||||||| ||||||| || |  ||||||||||||||||| |  || ||||||||||| || ||||| || |    
T  18408428 acatcatcactttggatcacatgggatgaatccggtgcatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 18408329  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | || | ||| ||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||    
T  18408328 ccacccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 18408229  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatg 289  Q
    || | |||| ||||||| ||| || || ||  | || ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  18408228 cacacgagttactctcaaaaatacgtggtcttcttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatg 18408160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 144
Target Start/End: Original strand, 22433811 - 22433916
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  22433811 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 22433910  T
Q  139 ttccaa 144  Q
    ||||||    
T  22433911 ttccaa 22433916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 309
Target Start/End: Original strand, 16098007 - 16098134
Alignment:
Q  182 agtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgc 281  Q
    |||||||||| |  |||||||||| || || ||||| |||| |||  | ||||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||| ||||||||| | |    
T  16098007 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctc 16098106  T
Q  282 ttgtcatgatagcttttctgtcaactct 309  Q
    || |||||||| || ||||||| |||||    
T  16098107 ttatcatgataactcttctgtctactct 16098134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1649094 - 1648980
Alignment:
Q  196 acttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagct 295  Q
    |||||||||| || || || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  | ||||| |||| ||||||||| | ||| |||||||||||    
T  1649094 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagct 1648995  T
Q  296 tttctgtcaactctg 310  Q
     ||||||| ||||||    
T  1648994 cttctgtctactctg 1648980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 35 - 311
Target Start/End: Original strand, 23293535 - 23293811
Alignment:
Q  35 aataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcc 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23293535 aataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttagaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcc 23293634  T
Q  135 acagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactc 234  Q
    || ||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23293635 actgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactc 23293734  T
Q  235 tcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||    
T  23293735 tcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttccgtcgactctgc 23293811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 23276339 - 23276629
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| || |  ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  23276339 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 23276438  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||  |||||||||| || ||||| |||||| |    
T  23276439 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcgacttactcgacttcaatgcacgtcccacacccat 23276538  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| || || |||| |||||||    
T  23276539 cataggagtaaatctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctgc 23276629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 22 - 311
Target Start/End: Original strand, 31830222 - 31830511
Alignment:
Q  22 catcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaacc 121  Q
    ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||    
T  31830222 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 31830321  T
Q  122 aactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtc 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||  | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31830322 aactctatatgccacagtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtc 31830421  T
Q  222 ataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| | |||||||    
T  31830422 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgc 31830511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 292
Target Start/End: Original strand, 24653908 - 24654179
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  24653908 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctaaatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 24654007  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | || |  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||    
T  24654008 caactctatatgccactgttccaaccttcactgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcaagtcctacacccgt 24654107  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgata 292  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||| ||||||||    
T  24654108 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttatcatgata 24654179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 311
Target Start/End: Original strand, 1063315 - 1063604
Alignment:
Q  22 catcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaacc 121  Q
    ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||| |    
T  1063315 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagc 1063414  T
Q  122 aactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtc 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||    
T  1063415 aactctatatgccacagtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 1063514  T
Q  222 ataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  1063515 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 1063604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11358754 - 11358464
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||    
T  11358754 acatcatcccttggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 11358655  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| || ||||   ||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||| || || ||||||||    
T  11358654 caactctatatgccactgtaccaactttctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgt 11358555  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  11358554 caaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 11358464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 309
Target Start/End: Original strand, 20832549 - 20832836
Alignment:
Q  22 catcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaacc 121  Q
    ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||    
T  20832549 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 20832648  T
Q  122 aactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtc 221  Q
    ||||||||||||||| || ||||  |||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||    
T  20832649 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 20832748  T
Q  222 ataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactct 309  Q
    | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||    
T  20832749 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactct 20832836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 12573916 - 12574205
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |    
T  12573916 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 12574015  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12574016 caactctatatgccaccgtcccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 12574115  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    ||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  12574116 catcggggtaacccttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 12574205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 24944930 - 24945167
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||| | || || || ||||||||||| ||||||||||    
T  24944930 acatcatctcttggaataacatgcgaaggctccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacccatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 24945029  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||   | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||    
T  24945030 caactctatatgccactgttccaaccctctttgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgt 24945129  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcct 258  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  24945130 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcct 24945167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 35 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27365945 - 27365669
Alignment:
Q  35 aataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcc 134  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  27365945 aataatatgcgaaggattcggtacatacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgcc 27365846  T
Q  135 acagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactc 234  Q
    ||||||||||  || ||  | |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| || || || || || |||||||| ||||||||||| || |    
T  27365845 acagttccaactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgaccc 27365746  T
Q  235 tcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||  || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27365745 tcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgc 27365669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 27787304 - 27787593
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |    
T  27787304 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 27787403  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27787404 caactctatatgccaccgttccgattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 27787503  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  27787504 catcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 27787593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 10868431 - 10868703
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  10868431 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccactg 10868530  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  10868531 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 10868630  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||    
T  10868631 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctgc 10868703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Original strand, 23087013 - 23087301
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  23087013 acatcatctcttgggataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 23087112  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
      |||||||| ||||| |||||||  |||||  |||||||||| |||||||| ||| | |  |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  23087113 acactctatacgccactgttccaactctctcagatatctgatatggaccaataaacctcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgt 23087212  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactct 309  Q
    || | |||| ||||||| ||| ||||| || || || ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||    
T  23087213 cacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggacctttctacacttgtcatgataactcttctgtcgactct 23087301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 27217597 - 27217869
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  27217597 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 27217696  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  27217697 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 27217796  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  27217797 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 27217869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 16981733 - 16982005
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  16981733 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 16981832  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  16981833 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 16981932  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  16981933 aaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 16982005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 17063298 - 17063570
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  17063298 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 17063397  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  17063398 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 17063497  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  17063498 aaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 17063570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21145892 - 21145620
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||  |    
T  21145892 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgataagccatcg 21145793  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||| || |||| ||||| |  ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  21145792 ttccaactctttccaatatctgatacagatcaataaacttcggggtcaacttctttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcaa 21145693  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  21145692 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 21145620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22325718 - 22325446
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || ||||||| |||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  22325718 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 22325619  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  22325618 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttgtttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 22325519  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  22325518 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 22325446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 44386431 - 44386159
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||  || ||||| |    
T  44386431 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 44386332  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  44386331 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 44386232  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  44386231 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 44386159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 9609717 - 9609989
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  9609717 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccg 9609816  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  9609817 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaa 9609916  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  9609917 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 9609989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 16924841 - 16925113
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  16924841 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 16924940  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  16924941 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 16925040  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  16925041 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 16925113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 16998581 - 16998853
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  16998581 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 16998680  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  16998681 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 16998780  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  16998781 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 16998853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 24878848 - 24878585
Alignment:
Q  48 ggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcc 147  Q
    |||||||| |||||||| || |  ||||||| ||| || ||||  || |||||||||||||| ||||| ||||| |||   || ||||| |||||||  |    
T  24878848 ggatccggaacatactttcgaagttgcgacagatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttggtaagccaccgttccaactc 24878749  T
Q  148 tctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatg 247  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || ||    
T  24878748 tttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtg 24878649  T
Q  248 atcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
     || || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  24878648 gtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 24878585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 17066959 - 17067228
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||  || || ||||||||||| || || ||||| ||||   | ||||| |    
T  17066959 acatgagatggatccggaacatactttcg-aagtgcgacacatgaaaaacgtg-tgcaa-ttcgaaagatgcggcggtaaacccactcgtaaagccaccg 17067055  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  17067056 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 17067155  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  17067156 aaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 17067228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 27370850 - 27371122
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || ||||||| |||||| || || ||| | ||||  || ||||| |    
T  27370850 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaatccactcggtaagccaccg 27370949  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  27370950 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacatcctacaccagtcataggagtgactctcaa 27371049  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||    
T  27371050 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctgc 27371122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 309
Target Start/End: Original strand, 24675070 - 24675340
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  24675070 acatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatccaactcgatacgccaccg 24675169  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| || |||||||     
T  24675170 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggggtgactctcaa 24675269  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactct 309  Q
    ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||    
T  24675270 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 24675340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 24261951 - 24262223
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  24261951 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccg 24262050  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || |||||||| |||||| ||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  24262051 ttccaactctttccaatatatgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 24262150  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || || |||||||| || |||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  24262151 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 24262223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 24709614 - 24709886
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  |  ||||||| |||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  24709614 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtacaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 24709713  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  24709714 ttccaactctttccaatatctaatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 24709813  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  24709814 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 24709886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24708344 - 24708091
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  24708344 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgtcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 24708245  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||| ||||||||||||||||||  ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  24708244 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaaaaaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 24708145  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgata 292  Q
    ||| || || || || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  24708144 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgata 24708091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22757325 - 22757053
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  22757325 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 22757226  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  22757225 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 22757126  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || |  || ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  22757125 aaacacgtggtctctttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 22757053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 23138600 - 23138890
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  23138600 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23138699  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| ||||||||| |||||||  || ||  ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  23138700 ctactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 23138799  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || | |||| ||||||| ||| || || || || || ||||| || || || ||  ||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  23138800 cacaagagtgactctcaaaaatacctggtctccttcttgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 23138890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 23550390 - 23550680
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  23550390 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23550489  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| ||||||||| |||||||  || ||  ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  23550490 ctactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 23550589  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || | |||| ||||||| ||| || || || || || ||||| || || || ||  ||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  23550590 cacaagagtgactctcaaaaatacctggtctccttcttgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 23550680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21326128 - 21325856
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  21326128 acatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 21326029  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    | ||||  || ||| ||||||||||||||| ||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  21326028 tcccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 21325929  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  21325928 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 21325856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 48 - 311
Target Start/End: Original strand, 23063667 - 23063930
Alignment:
Q  48 ggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcc 147  Q
    ||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||| |||||||  |    
T  23063667 ggatctggtacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 23063766  T
Q  148 tctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatg 247  Q
    | ||  |||||||| |||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||| | |||||| ||    
T  23063767 tttcagatatctgaaacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaaaacgtg 23063866  T
Q  248 atcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
     || || || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || || |||| |||||||    
T  23063867 gtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtctactctgc 23063930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 23188571 - 23188861
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| || |    
T  23188571 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23188670  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaa-cttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccg 219  Q
      |||| ||| ||||  |||||||  || ||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  23188671 tcactcgatacgccatcgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatcttgg-agtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccag 23188769  T
Q  220 tcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| |||||| ||||||| ||| |  || || || |||||| | |||||||| || || ||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  23188770 tcacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcctgacactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 23188861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27377351 - 27377098
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||| | |||||||| || |  ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| || |    
T  27377351 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 27377252  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||| | ||| ||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||    
T  27377251 caacccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 27377152  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctt 274  Q
    || |||||| ||||||| ||| || || || || |||||||| |||||||||||    
T  27377151 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctt 27377098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24826066 - 24825891
Alignment:
Q  117 aaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacac 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||| || ||||| || ||  |||||||||||| |||||| ||| | | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  24826066 aaacccactcgatacgccaccgtcccaattctttctgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacac 24825967  T
Q  217 ccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgata 292  Q
    | |||| |||||| ||||| | ||| |||| ||| || |||| ||| ||||| || || |||||||| ||||||||    
T  24825966 cagtcacaggagtgactcttaaaaatacattatctccttcctaaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgata 24825891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 310
Target Start/End: Original strand, 22276018 - 22276131
Alignment:
Q  197 cttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagctt 296  Q
    ||||||||| || || ||||| |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||| ||||||||| | ||| |||||||| ||     
T  22276018 cttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactc 22276117  T
Q  297 ttctgtcaactctg 310  Q
    ||||||| ||||||    
T  22276118 ttctgtctactctg 22276131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 41609206 - 41609047
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||  |  |||||||| || || || |  || |||||||||||||| ||  | ||||| ||||  || ||||| |    
T  41609206 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggctgtaaacccactcggtaagccaccg 41609107  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgact 198  Q
    ||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||    
T  41609106 ttccaactctttccaaaatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgact 41609047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 24833453 - 24833359
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtgg 115  Q
    |||||||| |||  ||| ||||| || |||||||  ||||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  24833453 acatcatctcttcgaatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgg 24833359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 103
Target Start/End: Original strand, 25128246 - 25128292
Alignment:
Q  57 acatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcga 103  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  25128246 acatacttccgcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattcga 25128292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 103
Target Start/End: Original strand, 28144562 - 28144608
Alignment:
Q  57 acatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcga 103  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  28144562 acatacttccgtaactgagaaacatgaaacacatcatgaagattcga 28144608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 30211761 - 30211688
Alignment:
Q  57 acatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctata 130  Q
    ||||||||||| |  || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||    
T  30211761 acatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaacccactttata 30211688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 196045 - 195764
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  196045 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 195946  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||    
T  195945 caactctatatgccactgttccaaccttctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgt 195846  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtc 303  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  195845 cataggagtaaccctcag-aaaacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtc 195764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 148533 - 148823
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  148533 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 148632  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||||| |||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  148633 ctactctgtatgccactgttccaaccctctctcatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 148732  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || | |||  |||||||||| |||||||| || || ||| ||| |||||||    
T  148733 cataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcttagaacttaagggcctttctacggttgtcatggtaactcttccgtcgactctgc 148823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 68783 - 68575
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  68783 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 68684  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||||| |||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  68683 ccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 68584  T
Q  221 cataggagt 229  Q
    |||||||||    
T  68583 cataggagt 68575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26858 - 26586
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| |    
T  26858 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcatggaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccg 26759  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    || ||||||| ||  ||||||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||| |||| ||||||||||||||     
T  26758 tttcaatcctttctgatatctgatacgggccaataaacctcggagtcaacttctttcacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtaactctcaa 26659  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || ||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| ||||| || || || |||| |||||||    
T  26658 aaatacgtgatctccttcctggaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgc 26586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 122132 - 122004
Alignment:
Q  182 agtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgc 281  Q
    |||||||||| |  |||||||||| || || ||||| |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  | ||||| |||| ||||||||| | |    
T  122132 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 122033  T
Q  282 ttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    || |||||||| || ||||||| ||||||    
T  122032 ttatcatgataactcttctgtctactctg 122004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Original strand, 61 - 349
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  61 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 160  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||||| |||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  161 ccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaaagcacgtcatacacccgt 260  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactct 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  || |||||||||||||||| || || ||||||| |||||    
T  261 cataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcccttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactct 349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14594 - 14304
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  14594 acatcatctctcgaaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 14495  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  14494 caactttatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 14395  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||| |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||    
T  14394 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctaaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgc 14304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 9220 - 9039
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  9220 acatcatctctcgaaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 9121  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaa 202  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  9120 caactttatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaa 9039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 58159 - 57870
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  58159 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 58060  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  58059 caactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacagaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 57960  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||    
T  57959 catcggagtaactctcaaaaatacatgatcacccttctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaactttt-tgtcaactctgc 57870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 49376 - 49086
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49376 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgaaaattcgaaagatgtggtggcaaac 49277  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||| | |||||| | ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| || | ||||||||| ||    
T  49276 ccactttgtatgccgctgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacttcctacacctgt 49177  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||| || || |||| || |||||||    
T  49176 cataggtgttactctcagaaacacatgatttccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgc 49086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 54)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15102928 - 15102638
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15102928 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 15102829  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  15102828 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 15102729  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||| || || || |||| |||||||    
T  15102728 cataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgc 15102638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16950798 - 16950508
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||| |||| |||||    
T  16950798 acatcgtcacttgcaataacatgcaaatgatccgctacatacttccgaagctgcgacacataaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgccaaac 16950699  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  16950698 caactctatatgccactgttccaaccctttctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 16950599  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  16950598 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcatgggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 16950508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 13665475 - 13665760
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13665475 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 13665574  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||     ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13665575 caactctatatgccactgttccaaccctttctgaaatctgatacgg-----tgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgt 13665669  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||| |||||  |||| |||||||||| |||||| || ||||||| |||||||    
T  13665670 cataggagtaactctcagaaatacatgatcttcctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtgatgataactcttctgtcgactctgc 13665760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 311
Target Start/End: Original strand, 6413430 - 6413723
Alignment:
Q  18 tggacatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggca 117  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||  |||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||    
T  6413430 tggacatcatctctcggaataacatgcgaaggatccactacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggca 6413529  T
Q  118 aaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacc 217  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  | ||||||| || |||||||||||| | |||||||||  |||||||||| || |||||||||||    
T  6413530 aaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgattcgaaccaatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacc 6413629  T
Q  218 cgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  6413630 cgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaaaggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 6413723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 35 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11388740 - 11388465
Alignment:
Q  35 aataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcc 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11388740 aataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgcc 11388641  T
Q  135 acagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactc 234  Q
    || ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || |||||||| ||||||||||| ||||    
T  11388640 actgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactc 11388541  T
Q  235 tcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||  || ||||||||  |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11388540 tcaagaacacatgatc-tcctcttgaaactcatggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgc 11388465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 14129795 - 14130085
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |    
T  14129795 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 14129894  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||    
T  14129895 caactctatatgccatcgttccaatcctctctaaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgt 14129994  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| || ||||| ||||| || |||||||||| |||||||    
T  14129995 catcggagtaactctaaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgc 14130085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 14433613 - 14433903
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |    
T  14433613 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 14433712  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||    
T  14433713 caactctatatgccatcgttccaatcctctctaaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgt 14433812  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| || ||||| ||||| || |||||||||| |||||||    
T  14433813 catcggagtaactctaaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgc 14433903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14264571 - 14264281
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |  ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  14264571 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcaggcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 14264472  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||||||||||||| ||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  14264471 ccactctatatgccactgttccaaccctttcagatatctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 14264372  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  14264371 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 14264281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11306589 - 11306300
Alignment:
Q  22 catcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaacc 121  Q
    ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||    
T  11306589 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 11306490  T
Q  122 aactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtc 221  Q
    ||||||||||||||| || ||||  |||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  11306489 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 11306390  T
Q  222 ataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  11306389 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 11306300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 14286703 - 14286415
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  14286703 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatctgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 14286604  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |   | ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || | ||||||||| ||    
T  14286603 caactctatatgccactgttccaatcctatatgaaatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacctgt 14286504  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactct 309  Q
    ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||   |||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||    
T  14286503 catcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggtctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactct 14286415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 22 - 311
Target Start/End: Original strand, 49152224 - 49152513
Alignment:
Q  22 catcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaacc 121  Q
    ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||    
T  49152224 catcatctctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 49152323  T
Q  122 aactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtc 221  Q
    ||||||||||||||| || ||||  |||||  | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49152324 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtc 49152423  T
Q  222 ataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  49152424 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 49152513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 36 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16072606 - 16072331
Alignment:
Q  36 ataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcca 135  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |  ||||||    
T  16072606 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgcatgcca 16072507  T
Q  136 cagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactct 235  Q
    | ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16072506 ctgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactct 16072407  T
Q  236 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  16072406 cagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 16072331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26288363 - 26288074
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||| || || | |||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||    
T  26288363 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccactacatattttcgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaac 26288264  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||| ||  | |||||||||| ||||||||| || | |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  26288263 caactctatatgccactgttcaaaccctttctgaaatctgatacgtaccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcgcgtcctacacccgt 26288164  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| ||||||||||| || || || |||| |||||||    
T  26288163 cataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaa-tctagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctgc 26288074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1734 - 1452
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||| |||| | ||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  1734 acatcattccttggaataacatgcgaatgatctgctacatccttccgaagctgagacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 1635  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||| ||  | ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  1634 caactctatatgccagtgttccaaccctttcttaaatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 1535  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtc 303  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||||| || || |||||||    
T  1534 catagaagtaactttcacaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctcctcttgtcatggtaactcttctgtc 1452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 19147133 - 19147423
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19147133 acatcatctcttagaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 19147232  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
      ||||| |||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||    
T  19147233 tcactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgt 19147332  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  | || |||||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  19147333 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 19147423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 20746532 - 20746822
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  20746532 acatcatctcttagaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 20746631  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
      ||||| |||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||    
T  20746632 tcactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgt 20746731  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  | || |||||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  20746732 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 20746822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8212437 - 8212165
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||| |  || || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  8212437 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagttgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgccactg 8212338  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    | ||||  |||||  | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || |||||    
T  8212337 taccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 8212238  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  8212237 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 8212165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23200070 - 23199781
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||| | |||||||||||| |  || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |    
T  23200070 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 23199971  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||| ||  ||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23199970 caactctatatgtcatcgttccgatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 23199871  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  23199870 catcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 23199781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23506197 - 23505908
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||| | |||||||||||| |  || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |    
T  23506197 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 23506098  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||| ||  ||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23506097 caactctatatgtcatcgttccgatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 23505998  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  23505997 catcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 23505908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 13021279 - 13021569
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| ||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  13021279 acatcatctcttggaatcacatgtgaaagatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaac 13021378  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||  | ||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||| |||||||||| || |||  ||| |||||    
T  13021379 caactctataagccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaataaactttggagtccacttcctcgacttcaatgcacgttttacgcccgt 13021478  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || ||  ||||| | ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  13021479 cataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccgtcttgaaactctagggcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 13021569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18054280 - 18053991
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |    
T  18054280 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 18054181  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||  | ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18054180 caactctatatgccaccgttcctattctctctgaaatctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 18054081  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  18054080 catcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 18053991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12207127 - 12206837
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  12207127 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 12207028  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||||||||||||| ||| |||  |||||  ||||||| |||| |||||| ||||| |  ||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||    
T  12207027 ccactctatatgccactgttgcaactctctcagatatctggtacgaaccaataaacttcggcgtcaacttctttgatttcaaggcacgaccaacacctgt 12206928  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| ||||||| ||| ||||| || || || ||||| | |||||||||||||| |||||||||||| || || |||| |||||||    
T  12206927 cacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaacttaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctgc 12206837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 12455625 - 12455914
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  12455625 acatcatcccttggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgc-acacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaac 12455723  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    ||| |||||| ||||| |||| ||  |||||  | ||||||||| ||||||||||||| | | |||||||| |||||||||| || | ||| ||||||||    
T  12455724 caattctataagccactgttctaactctctctgaaatctgataccgaccaatgaactttggattcaacttcctcgacttcaatgcacatccaacacccgt 12455823  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  12455824 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 12455914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11553433 - 11553161
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| |    
T  11553433 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcgataagccaccg 11553334  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  11553333 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 11553234  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  11553233 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcaactctgc 11553161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 14332318 - 14332608
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || ||||||| |||||| ||||| ||||    
T  14332318 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 14332417  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||||  || ||||| |||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  14332418 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 14332517  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||| ||||||| ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || |||| |||||||    
T  14332518 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgc 14332608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 10870934 - 10871206
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||  || ||||| |    
T  10870934 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 10871033  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  10871034 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacctcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 10871133  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  10871134 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 10871206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 39 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11237544 - 11237291
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  11237544 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 11237445  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  11237444 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 11237345  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgata 292  Q
    ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11237344 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 11237291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 8198567 - 8198839
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || || |  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  8198567 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 8198666  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  8198667 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 8198766  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  8198767 aaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 8198839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23517100 - 23516828
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| | ||||||||| |  ||||||||||| || || |  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  23517100 acatgagatggatccggaatatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 23517001  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  23517000 ttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 23516901  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  23516900 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 23516828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 177
Target Start/End: Original strand, 15340432 - 15340574
Alignment:
Q  35 aataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcc 134  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15340432 aataacatgcgaaagatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcc 15340531  T
Q  135 acagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaact 177  Q
    || ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  15340532 accgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaact 15340574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 8707544 - 8707816
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  8707544 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 8707643  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  8707644 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 8707743  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || || |||||||| || |||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  8707744 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 8707816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 12687440 - 12687712
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| |    
T  12687440 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaaacccactcgataagccaccg 12687539  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||  ||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||| ||     
T  12687540 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactcgcaa 12687639  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  12687640 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 12687712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 14954559 - 14954831
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| |    
T  14954559 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaactcactcgataagccaccg 14954658  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||  |||||| |||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  14954659 ttccaactctttctgatatcttatacggaccaataaactttggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 14954758  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  14954759 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 14954831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15161388 - 15161116
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  15161388 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 15161289  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  15161288 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 15161189  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || || |||||||| || |||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  15161188 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 15161116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 44791682 - 44791410
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || ||||||| |||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  44791682 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 44791583  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  44791582 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaatttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 44791483  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  44791482 aaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 44791410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15155001 - 15154730
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| || || || ||||||||||||||  |||| ||||    
T  15155001 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaaac 15154902  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||||  || ||||| |||||||  || ||  ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  15154901 ccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15154802  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgata 292  Q
    ||||||||| ||||||| ||| || || || || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15154801 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgata 15154730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 18177681 - 18177953
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || || |  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  18177681 acatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 18177780  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| || |||||||| |||||||     
T  18177781 ttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgttctacaccagttataggagtgactctcaa 18177880  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
     || || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  18177881 gaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 18177953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18552089 - 18551817
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || ||||||| |||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  18552089 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 18551990  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  18551989 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 18551890  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || || || |||||||| || |||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  18551889 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 18551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 15479465 - 15479342
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  15479465 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacatgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 15479366  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaa 144  Q
    ||| |||||| |||||||||||||    
T  15479365 caattctatacgccacagttccaa 15479342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 156 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26118797 - 26118642
Alignment:
Q  156 atctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccct 255  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||| ||| || || |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26118797 atctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccct 26118698  T
Q  256 cctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  26118697 cctgaaactcaagctccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 26118642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 13686002 - 13686275
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatg-aaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccaca 137  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| ||| ||||  || |||||||||||||| |  || ||||| ||||  || |||||     
T  13686002 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcgacggtaaacccactcggtaagccacc 13686101  T
Q  138 gttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctca 237  Q
    |||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13686102 gttccaactctttccaatatttgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctca 13686201  T
Q  238 gaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
     ||| || || || || || || || |||||||| || |||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  13686202 aaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 13686275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 17647 - 17375
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  17647 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 17548  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||| ||||||||||||| ||||| ||  |   |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  17547 ttccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 17448  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||| |||||||    
T  17447 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataacttttttgtcgactctgc 17375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 14037728 - 14038017
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  14037728 acatcatcactttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14037827  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaa-cttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccg 219  Q
    | |||| ||| |||||  ||| ||  || ||| |||||||||| | |||||| || |||||  ||||||||||| |||||||| || || || ||||| |    
T  14037828 ccactcgatacgccaccattcaaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatcttgg-tgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccag 14037926  T
Q  220 tcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    |||||||||| ||||||| ||| || ||||| || || || || ||||| || || |||||||| |||||||| || || |||| ||||||    
T  14037927 tcataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 14038017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 14347758 - 14348047
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  14347758 acatcatcactttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14347857  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaa-cttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccg 219  Q
    | |||| ||| |||||  ||| ||  || ||| |||||||||| | |||||| || |||||  ||||||||||| |||||||| || || || ||||| |    
T  14347858 ccactcgatacgccaccattcaaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatcttgg-tgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccag 14347956  T
Q  220 tcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    |||||||||| ||||||| ||| || ||||| || || || || ||||| || || |||||||| |||||||| || || |||| ||||||    
T  14347957 tcataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 14348047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 15203818 - 15204090
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||  | || |    
T  15203818 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatactctaccg 15203917  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||| || ||    ||||||||| ||||||| ||| | | ||||||||| || |||||||| || || || ||||| |||| |  ||| ||||| |     
T  15203918 ttccaattctttctgtaatctgatacagaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcggccaacaccagtcacaaaagtgactctaaa 15204017  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| ||||| || || || ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  15204018 aaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 15204090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 90 - 311
Target Start/End: Original strand, 15624542 - 15624763
Alignment:
Q  90 tcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaact 189  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  || ||||| |||||||| || ||  |||||||||| | |||||| ||| | | |||||| |    
T  15624542 tcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatatctgatatgaaccaataaacctcggagtcaatt 15624641  T
Q  190 tcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatg 289  Q
    || | |||||||| || ||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| ||||| || || |||||||| ||||| || || ||| |||| |||||    
T  15624642 tccttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctaagcttatcatg 15624741  T
Q  290 atagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || |||| || |||||||    
T  15624742 ataactcttctatcgactctgc 15624763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 26118911 - 26118803
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||    
T  26118911 acatcatcccttggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 26118812  T
Q  121 caactctat 129  Q
    |||||||||    
T  26118811 caactctat 26118803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 310
Target Start/End: Original strand, 4440010 - 4440138
Alignment:
Q  182 agtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgc 281  Q
    |||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||||||| ||| |||||||||||  ||||||| ||||  ||||| || | |    
T  4440010 agtcaacttcctacacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctc 4440109  T
Q  282 ttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    || |||||||| || ||||||| ||||||    
T  4440110 ttatcatgataactcttctgtctactctg 4440138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 310
Target Start/End: Original strand, 15340575 - 15340642
Alignment:
Q  243 acatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| || |||||||||| ||||||    
T  15340575 acatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctg 15340642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 35965001 - 35964909
Alignment:
Q  219 gtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||| |||||| ||||||| ||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  35965001 gtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgc 35964909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 310
Target Start/End: Original strand, 14936443 - 14936557
Alignment:
Q  196 acttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagct 295  Q
    |||||||||| || || ||||| |||| | || | ||||||| ||| |||||||||||  ||||||| ||||  |||||||| | ||| |||||||| ||    
T  14936443 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 14936542  T
Q  296 tttctgtcaactctg 310  Q
     ||||||| ||||||    
T  14936543 cttctgtctactctg 14936557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 310
Target Start/End: Original strand, 15364036 - 15364150
Alignment:
Q  196 acttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagct 295  Q
    |||||||||| || || ||||| |||| | || | ||||||| ||| |||||||||||  ||||||| ||||  |||||||| | ||| |||||||| ||    
T  15364036 acttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 15364135  T
Q  296 tttctgtcaactctg 310  Q
     ||||||| ||||||    
T  15364136 cttctgtctactctg 15364150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 21674846 - 21674800
Alignment:
Q  57 acatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcga 103  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21674846 acatacttccgcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattcga 21674800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 103
Target Start/End: Original strand, 45146513 - 45146559
Alignment:
Q  57 acatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcga 103  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  45146513 acatacttccgcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattcga 45146559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 311
Target Start/End: Original strand, 19097 - 19373
Alignment:
Q  35 aataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcc 134  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| |  |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19097 aataacatgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacaacatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcc 19196  T
Q  135 acagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactc 234  Q
    || ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| || | |||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  19197 actgttccaaccctctccgatatctgatacgaaccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccc 19296  T
Q  235 tcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  19297 tcagaaatacatgatcaccatcctgaaactcaaggtcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 19373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22014 - 21724
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  22014 acatcatctctcggaataacatccgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 21915  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21914 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatcttatacggaccaatgaacttcggaatcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 21815  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  21814 cataggagtaaccctcagaaatacatggttaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 21724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 96345 - 96055
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  96345 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 96246  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    ||| |||||| |||||||||||||  || ||  | |||||||| ||||| |||||||| | |||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||    
T  96245 caattctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 96146  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  96145 cataggagtaaccctcaaaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgc 96055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 112522 - 112812
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  112522 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaac 112621  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | || ||||| ||||| |||||||  |||||  |||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || |||||||| ||    
T  112622 ccaccctataagccactgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgt 112721  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||| |||||||  || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  112722 cataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgc 112812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 110136 - 109864
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || || |  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |    
T  110136 acatgagagggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 110037  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  110036 ttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 109937  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||    
T  109936 aaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgc 109864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 42676 - 42386
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||| | || ||||||||||| ||||||||||    
T  42676 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 42577  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||    
T  42576 caactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacttcctacacccgt 42477  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||    
T  42476 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctgc 42386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 47742 - 47452
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||| | || ||||||||||| ||||||||||    
T  47742 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 47643  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||    
T  47642 caactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatttcctacacccgt 47543  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||    
T  47542 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctgc 47452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 6146 - 6437
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  6146 acataatctcttggaataacatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagaagagatggcaaac 6245  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  || ||  | |||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  6246 caaatctatatgccacagttccaaatctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 6345  T
Q  221 cataggagtaactctca-gaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  6346 cataggagtaaccctcaggaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgc 6437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 31373 - 31663
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  31373 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacaaaaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 31472  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  31473 caactctatatgccactgttccaaacctatcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 31572  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  31573 catagaagtaactctcagaaacacatgatatccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgc 31663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 311
Target Start/End: Original strand, 14036 - 14292
Alignment:
Q  55 gtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaa 154  Q
    ||||||||||| | |  ||||||||||||||||| |  |  |||||||||||||| ||||| || |  |||| ||| ||||| |||||||  || ||| |    
T  14036 gtacatacttcggaagttgcgacacatgaaacacatagttcaaattcgaaagatgcggtggtaatctcactcgatacgccaccgttccaactctttccga 14135  T
Q  155 tatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccc 254  Q
    ||||| |||| ||||||| ||  | | |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||| ||| ||| |  || || ||     
T  14136 tatctcatacagaccaataaatctcggagtcaactactttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactatcaaaaacatgtggtctcct 14235  T
Q  255 tcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || ||||| ||||||||  | |||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  14236 tcttgaaactcaagatctctcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 14292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14244 - 13954
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |    
T  14244 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaacc 14145  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14144 caactctatatgccactgttccaatcctttctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 14045  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || || || |||| |||||||    
T  14044 cataggagtaactcttaaaaacacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgc 13954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 99 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5218 - 5006
Alignment:
Q  99 ttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgact 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  5218 ttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgact 5119  T
Q  199 tcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagctttt 298  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| || ||    
T  5118 tcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactctt 5019  T
Q  299 ctgtcaactctgc 311  Q
    ||||| |||||||    
T  5018 ctgtcgactctgc 5006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 260271 - 260561
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||  ||||||||||    
T  260271 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatatggtggcaaac 260370  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
     ||||||||||||||| |||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||    
T  260371 aaactctatatgccaccgttctaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgattttaaagcacgtcctacacccgt 260470  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| || |||||||||| |||||||    
T  260471 catcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgc 260561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 165052 - 164762
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||  ||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||| ||||||||| |  || |||||||||||||| |||||  |||    
T  165052 acatcatctctttgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaac 164953  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||    
T  164952 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 164853  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || | |||| ||||||| ||| || ||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  164852 cacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 164762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 74 - 311
Target Start/End: Original strand, 308675 - 308912
Alignment:
Q  74 cgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatg 173  Q
    ||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||     
T  308675 cgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaata 308774  T
Q  174 aacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcct 273  Q
    ||||| |  || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||| |    
T  308775 aactttggggttaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctt 308874  T
Q  274 ttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  308875 ttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 308912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 279155 - 278883
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  279155 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 279056  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||| |||||||||||||||| || ||  | | |||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  279055 ttccaactctttccgatatctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcttgtcccacaccagtcacaggagtgactctcaa 278956  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  278955 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 278883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 35 - 311
Target Start/End: Original strand, 20099 - 20375
Alignment:
Q  35 aataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcc 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20099 aataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggcc 20198  T
Q  135 acagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactc 234  Q
    ||| ||||||  |||||  | |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  20199 acaattccaacactctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataagagtaaccc 20298  T
Q  235 tcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  20299 tcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 20375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 43482 - 43736
Alignment:
Q  35 aataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcc 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  43482 aataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggcc 43581  T
Q  135 acagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactc 234  Q
    |||||||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| |    
T  43582 acagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcataggagtaaccc 43681  T
Q  235 tcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatg 289  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  43682 tcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatg 43736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 44494 - 44748
Alignment:
Q  35 aataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcc 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  44494 aataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggcc 44593  T
Q  135 acagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactc 234  Q
    |||||||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| |    
T  44594 acagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcataggagtaaccc 44693  T
Q  235 tcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatg 289  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  44694 tcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatg 44748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 223
Target Start/End: Original strand, 36035 - 36220
Alignment:
Q  38 aacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccaca 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  36035 aacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcttgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccaca 36134  T
Q  138 gttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcat 223  Q
     ||||||  |||||  | |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  36135 attccaacactctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcat 36220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 39702 - 39992
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |  || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  39702 acatcatctctcggaataacatgagaaggatccgctacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgcaaattcgagagatgtggtggcaaac 39801  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||||| |||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |  || ||||||||||||||    
T  39802 ccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatcggatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttgagtgcgcgtcctacacccgt 39901  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || || ||||||| |||||||    
T  39902 cataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcctgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatagtaactcttctgtcgactctgc 39992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 2714 - 3004
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  2714 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatcttctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 2813  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||||| |||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||    
T  2814 ccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttctcagacttcaatgcacgtcctacacccgt 2913  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||| || |  ||||||| |||||||    
T  2914 cataggagtaactctcataaatacatgatatccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaacccttctgtcgactctgc 3004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1512 - 1223
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  1512 acatcatctctcggaataacattcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaatttcgaaagatgtggtggcaaac 1413  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | | | | |||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  1412 ctattttttatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 1313  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  1312 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 1223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26208 - 25919
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  |||||| |||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||    
T  26208 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacgcatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaac 26109  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||||| |||||||| ||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  26108 ccactctgtatgccactgttccaaccctttttgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacatcctacacccgt 26009  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  26008 cataggagtaactctcagaaatacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 25919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 16639 - 16929
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||    
T  16639 acatcatcccttggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 16738  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||| |||||||||||  |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||    
T  16739 caacactatatgccactattccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgt 16838  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || || ||||| | |||||||    
T  16839 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgc 16929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 35 - 309
Target Start/End: Original strand, 27203 - 27476
Alignment:
Q  35 aataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcc 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||    
T  27203 aataacatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaatcccactctgtatgcc 27302  T
Q  135 acagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactc 234  Q
    || ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27303 acggttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgacataggagtaactc 27402  T
Q  235 tcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactct 309  Q
    ||||||| |||||||  ||||| |||||||||||  |||| ||||||| |||||| || || ||||||| |||||    
T  27403 tcagaaatacatgatatccctcttgaaattcaag-gccttcctacgctcgtcatggtaactcttctgtcgactct 27476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 42746 - 43036
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| ||||||||||    
T  42746 acatcatcccttggaataacatgtgaaggatccgctagatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcaaaagatgtggtggcaaac 42845  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| | ||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  42846 caactctataagccactgttccaaccttctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 42945  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  42946 cataggagtgaccctaagaaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggactttctccgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgc 43036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 311
Target Start/End: Original strand, 47101 - 47377
Alignment:
Q  35 aataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcc 134  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  47101 aataacatgcgaaggatctgttacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcc 47200  T
Q  135 acagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactc 234  Q
    || ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  47201 actgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgttataggagtaaccc 47300  T
Q  235 tcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |||| |||||||| ||||| || || ||||||| |||||||    
T  47301 tcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttttcatggtaactcttctgtcgactctgc 47377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 49536 - 49260
Alignment:
Q  35 aataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcc 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  49536 aataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgatacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggcc 49437  T
Q  135 acagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactc 234  Q
    |||||||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||| | || |    
T  49436 acagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggaatgaccc 49337  T
Q  235 tcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  49336 tcagaaacacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 49260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1844 - 1577
Alignment:
Q  44 cgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttcca 143  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  1844 cgaagaatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgggaaaccaactctatatgccactgttcca 1745  T
Q  144 atcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaa 243  Q
    | ||| ||  ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  1744 accctttctgatatctgatacggactaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctccgaaata 1645  T
Q  244 catgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||  || ||||||| |||||  |||| |||| |||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  1644 catgatcttccacctgaaactcaagggccttcctacacttgtcatgataactcttctgtcgactctgc 1577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 5986 - 6276
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  5986 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 6085  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaa-cttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccg 219  Q
    | |||| ||| ||||| || ||||  || ||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  6086 ccactcgatacgccaccgtcccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatcttgg-agtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccag 6184  T
Q  220 tcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| ||| || ||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || || |||| |||||||    
T  6185 tcacaggtgtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgc 6276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 310
Target Start/End: Original strand, 22818 - 22946
Alignment:
Q  182 agtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgc 281  Q
    |||||||||| |  |||||||||| |  || ||||| |||| | || | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||| |||| ||||||||| | |    
T  22818 agtcaacttcctacacttcaaagcacaaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 22917  T
Q  282 ttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    || |||||||| || ||||||| ||||||    
T  22918 ttatcatgataactcttctgtctactctg 22946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 26224 - 26514
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||  ||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  26224 acatcatcccttggaatcacatgcgaaagatccgccacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 26323  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    || ||||||| ||||| ||||| | ||||||  | |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26324 cagctctataagccactgttcccaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgt 26423  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  26424 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcacttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 26514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17056 - 16774
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||    
T  17056 acatcatcccttggaatcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaac 16957  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||  | |||| |||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||| || || ||||||||    
T  16956 caactctatatgccactgttccaactctctctgaaatctaatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgt 16857  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtc 303  Q
    || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  16856 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtc 16774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 91275 - 90985
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||  | |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  91275 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatttgctacatacttccgcagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 91176  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||||| |||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  91175 ctactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctaatatggactaataaactttgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 91076  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  91075 cgtaggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 90985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 448040 - 448312
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| | ||||||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||  ||  ||||| |    
T  448040 acatgagatggatccggaaaatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttgatgcgccaccg 448139  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||| || ||| |||| |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||||||| || ||||| |||   || | |||||| ||||| |     
T  448140 ttccaattctttccgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaatagttacaggagtgactctaaa 448239  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || ||||| || || ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  448240 aaatacgtgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgatagctcttctgtcgactctgc 448312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 292
Target Start/End: Original strand, 162076 - 162347
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||| ||||||||| | |  ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  162076 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttctgaagttgcgaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 162175  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||||  || ||||| |||||||  || ||  ||||||||||||| ||||| ||  | | |||||| ||||| |||||| | || ||||| ||||| ||    
T  162176 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacgggccaataaatctcggagtcaagttctttgacttcgacgctcgtccaacaccagt 162275  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgata 292  Q
    ||||||||| ||||||| ||| || || ||  | || |||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  162276 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctacttcttgaaacacaagatcttttttacgcttatcatgata 162347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Original strand, 175359 - 175431
Alignment:
Q  154 atatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcatagg 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |   |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  175359 atatctgatacggaccaataaacttcgggatcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagg 175431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 4482 - 4217
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  4482 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 4383  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||   | |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  4382 caactctatatgccacagttccaaccctctttgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 4283  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtc 286  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||    
T  4282 cataggagtaactcttaaaaacacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtc 4217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 3868 - 4122
Alignment:
Q  35 aataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcc 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| | ||||||    
T  3868 aataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggaggcaaaacaactatgtatgcc 3967  T
Q  135 acagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactc 234  Q
    || ||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3968 actgttccaaccctctcagatatctgatacagaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactc 4067  T
Q  235 tcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatg 289  Q
    ||||||| |||||||| || || ||||| |||||  |||| ||||||||||||||    
T  4068 tcagaaacacatgatctccatcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 4122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 39 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 39212 - 38942
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||| || || || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  39212 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacttcgtgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 39113  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
     |||||  |||||  | |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||| || || || |||||||||| |||||| ||||||||    
T  39112 ctccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgaccgacacccgtcaaaggagtgactctcag 39013  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactct 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  39012 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatgataactcttctgtcgactct 38942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 35 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18866 - 18590
Alignment:
Q  35 aataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcc 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  18866 aataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggaaaacccactctgtatgcc 18767  T
Q  135 acagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactc 234  Q
    || |||| || ||||||  |||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  18766 actgttctaaccctctctgatatctgatacaaaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactc 18667  T
Q  235 tcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  18666 tcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 18590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 3684 - 3631
Alignment:
Q  35 aataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacac 88  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  3684 aataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacac 3631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13124 - 12836
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |    
T  13124 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccactacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaagc 13025  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||| | ||| |||||| | || |||||||| ||| ||||||||||    
T  13024 caactctgtatgccaccgttccaatcctctctgaaatctaatacggaccaatgaacttcggagttaacttccttgatttcaaagcacgttctacacccgt 12925  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactct 309  Q
    ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| || ||||||| || |||||    
T  12924 catcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctatcgactct 12836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 7379 - 7089
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  7379 acatcatctcttggaataacttgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 7280  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||||| || ||||| |||||||  |||||  ||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||    
T  7279 ccactctgtaagccactgttccaactctctcagatatctggtatggaccaatgaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgt 7180  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| | |||||  | |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  7179 cataggagtaaccctcagaaacacatgatctccctcttgacactcaagggcttttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgc 7089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 9761 - 10046
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  9761 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaac 9860  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||||| |||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||     
T  9861 ccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgc 9960  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||     | | |||||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  9961 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactca-----cgtcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 10046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 248576 - 248866
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  248576 acatcatcccttggaataacatgtgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 248675  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||| |||||  ||||||   ||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  248676 caactctataagccacttttccaactttctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 248775  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  248776 cataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggactttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 248866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 7577 - 7291
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||||||||    
T  7577 acatcatctcttggaataacatgcgaag--tccgctacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatatgtggtggcaaac 7480  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||   | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |    
T  7479 caactctatatgccactgttccaaccttct--gaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccat 7382  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||||||||||| || || |||| |||||||    
T  7381 catagaagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaacttaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctgc 7291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 35 - 311
Target Start/End: Original strand, 26119 - 26395
Alignment:
Q  35 aataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcc 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  26119 aataacttgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcc 26218  T
Q  135 acagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactc 234  Q
    || |||||||  |||||  ||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  26219 actgttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacggcctacacccgtcataggagtgactc 26318  T
Q  235 tcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||  ||||||||||||||| ||| || || ||||||| |||||||    
T  26319 tcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtaatggtaactcttctgtcgactctgc 26395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 52206 - 51918
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  52206 acatcatctcttggaataacatgcgaatgatcagctacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 52107  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||||| |||||||| ||||||| ||| ||  |||||||||| |||||| | ||||| | |||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||    
T  52106 ccactctgtatgccactgttccaaccctttcagatatctgatatggaccactaaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgt 52007  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactct 309  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||| || || ||||||| |||||    
T  52006 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactct 51918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 72 - 311
Target Start/End: Original strand, 4764 - 5003
Alignment:
Q  72 tgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaa 171  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||||||    
T  4764 tgcgacacatgaaacacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatcttatacggaccaa 4863  T
Q  172 tgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatc 271  Q
    ||||||| | |||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |    
T  4864 tgaactttggagtcaatttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggc 4963  T
Q  272 ctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  4964 ctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 5003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 6256 - 5967
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| || ||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  6256 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatcctctacatacttccgaagttgcgacacatgaaa-acatcaagcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 6158  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  6157 ccactctatatgccacagttccaactctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacccgt 6058  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||| || || || |||| |||||||    
T  6057 cataggagtaaccctcagaaacacatgagctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgc 5967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Original strand, 3838 - 4120
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  3838 acatcatctcttggaataacatgcgaaggaaccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 3937  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||||| || ||||| |||||||  |||||  |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||    
T  3938 ccactctgtaagccactgttccaacactctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgt 4037  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtc 303  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  | || |||||||||||||| || || |||||||    
T  4038 cataggagtgactatcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaaggactttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtc 4120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 18812 - 19102
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18812 acatcatctctaggaataacatgcgaaggatccggtacatacttccacaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 18911  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||||||| ||||| || ||||  |||||  |||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || |||||||| ||    
T  18912 ccactctatacgccactgtcccaactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgt 19011  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||| |||||||  || ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  19012 cataggagtgactctcaagaacacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctcttctgttgactctgc 19102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 154 - 311
Target Start/End: Original strand, 23107 - 23264
Alignment:
Q  154 atatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcacc 253  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || |||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||| || ||    
T  23107 atatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatggtctcc 23206  T
Q  254 ctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| ||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  23207 ctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctcttctgttgactctgc 23264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 34006 - 33730
Alignment:
Q  35 aataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcc 134  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||    
T  34006 aataatatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagcc 33907  T
Q  135 acagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactc 234  Q
    || || || |  |||||  |||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || |||||||| ||||||||||| ||||    
T  33906 actgtcccgactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactc 33807  T
Q  235 tcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||  || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  33806 tcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgc 33730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 14049 - 14338
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | ||||||||| |||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14049 acatcatccctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 14148  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||| | |||||||| ||||||| ||| ||  ||||||  |||| ||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  14149 ccactttgtatgccactgttccaa-cctttcagatatctagtacgaaccgataaacttcggagtcaacttcttcgacttcaacgcacgacctacacccgt 14247  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  14248 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctatgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 14338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 262
Target Start/End: Original strand, 1140 - 1381
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  1140 acatcatctctcggaataacatacgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 1239  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||||| |||||||| ||||||| |||||   ||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||    
T  1240 ccactctgtatgccactgttccaaccctctaagatatctgatacagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgt 1339  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaa 262  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  1340 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaa 1381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 27948 - 28220
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |    
T  27948 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatacgccactg 28047  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||  | | | |||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||     
T  28048 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctaggattcaacttctttgacttcacagcacgtccaacaccagtcaccggagtaactctcaa 28147  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  28148 aaacacatgatcaccctcttgaaattcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 28220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5345 - 5055
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | ||||||||||||| |||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  5345 acatcatctctcggaataacatgcgaatgatctgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 5246  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||| | |||||||  ||||||| |||||   |||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||  | |  |||||||||||    
T  5245 ccactatgtatgccagtgttccaaccctcttagatatctgatacgaaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacacacaacctacacccgt 5146  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  5145 cataggagtgattctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 5055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 7358 - 7630
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||| |    
T  7358 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaacccactcgctaagccaccg 7457  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  7458 ttccaactctctccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 7557  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || || |||| |||||||    
T  7558 aaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgc 7630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 35 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 50843 - 50567
Alignment:
Q  35 aataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcc 134  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||    
T  50843 aataatatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactacgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagcc 50744  T
Q  135 acagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactc 234  Q
    || || || |  |||||  |||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || |||||||| ||||||||||| ||||    
T  50743 actgtcccgactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactc 50644  T
Q  235 tcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||  || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||    
T  50643 tcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgttatgacagctcttctgtcgactctgc 50567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 311
Target Start/End: Original strand, 8475 - 8738
Alignment:
Q  48 ggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcc 147  Q
    |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||  ||||||  |    
T  8475 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaacccactcggtaagccacccttccaactc 8574  T
Q  148 tctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatg 247  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || ||    
T  8575 tttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtg 8674  T
Q  248 atcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
     || || |||| ||| |||||||| |||||||| || || ||||| || || |||| |||||||    
T  8675 gtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgc 8738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 277
Target Start/End: Original strand, 43135 - 43373
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || || |  || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |    
T  43135 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcagtatgccaccg 43234  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||     
T  43235 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcataggagtgactctcaa 43334  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttct 277  Q
    ||| || || || || |||||||| |||||||| |||||    
T  43335 aaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttct 43373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11082 - 10792
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||     
T  11082 acatcatctcttggaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaat 10983  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||||||||||||| |||||||   ||||  |||||||||| |||||||| ||| | |  |||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||    
T  10982 ccactctatatgccactgttccaactttctcagatatctgatatggaccaataaacctcggtgtcaacttcttcgatttcaaggcacgacctatacctgt 10883  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| ||||||| ||| ||||| || || || || || |||||||||||||||| |||||||||||| || || |||| |||||||    
T  10882 cacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgtaactcaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctgc 10792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 180198 - 180470
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  180198 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacttgaaagacatcatgaaaattcgaaagatgcggtggtaagccaactcgatacgccactg 180297  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||| ||  || ||  ||||||||||||||| ||| ||  | | |||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||  |||||||||||||     
T  180298 ttctaactctttctgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcaggtccaacaccagtcaccggagtaactctcaa 180397  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  180398 aaacacatgatcaccctcttgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 180470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13563 - 13376
Alignment:
Q  54 ggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctcca 153  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| ||||||      
T  13563 ggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgtcactgttccaaccctctcag 13464  T
Q  154 atatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaa 241  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13463 atatctgatacttaccaattaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaa 13376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 311
Target Start/End: Original strand, 3130 - 3393
Alignment:
Q  48 ggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcc 147  Q
    |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||||| |    
T  3130 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattc 3229  T
Q  148 tctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatg 247  Q
    | || ||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| |||||    
T  3230 tttcaaatatctgatacgaaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatg 3329  T
Q  248 atcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || ||||| | ||| || || |||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  3330 atctccttcttgaaacttaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 3393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25414 - 25124
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| || ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  25414 acatcatcccttggaatcacatgtgatggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 25315  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||||||  ||||| ||| |    |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||    
T  25314 ccactctatatgccactgttccaactctttccgatatctgatacgagccaataaacctcagcgtcaacttcttcgatttcaaagcacgaccaacacctgt 25215  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| ||||| ||||| ||||| || ||  | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||  | ||||||| |||||||    
T  25214 cacaggagtgactcttagaaacacatggtctcctgcttgaaattcaagatctttcctacgtttgtcgtgataagtcttctgtcgactctgc 25124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 491 - 781
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | ||||||||| |||||||||| |||||||||  | |  | ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  491 acatcatctctagaaataacatgtgaaggatccgctacatactttggaagttccgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 590  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||||| || ||||| ||||||| ||||||  | || ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| || || || || |  |||||||| ||    
T  591 ccactctgtaagccactgttccaaccctctctgaaatttgatacggaccgataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcactgcctacacctgt 690  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || |||| |||||||    
T  691 cataggagtaactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcacgatagctcttatgtcgactctgc 781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 2208 - 2028
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||||    
T  2208 acatcatctcttggaataacatgcgaagg-tccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgtaaaac 2110  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaa 202  Q
    | ||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  2109 ccactctgtatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaa 2028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 36 - 217
Target Start/End: Original strand, 136097 - 136278
Alignment:
Q  36 ataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcca 135  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |  |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  136097 ataacatccgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctatatgcca 136196  T
Q  136 cagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacc 217  Q
    |||||||||  |||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  136197 cagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacc 136278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 395 - 667
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||  || ||||| |    
T  395 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccactg 494  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  495 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 594  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  595 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 311
Target Start/End: Original strand, 37179 - 37455
Alignment:
Q  35 aataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcc 134  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  37179 aataacatgtgaaggatccactacatacttccgaagttgcgagacatgtaacacatcatgcaaatttgaaagatgaggtggcaaacccactctgtatgcc 37278  T
Q  135 acagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactc 234  Q
    || ||||||| ||| ||  ||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| || ||||    
T  37279 actgttccaaccctttcagatatctgatatagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggggtgactc 37378  T
Q  235 tcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    | ||||| |||||||| | | | ||||| ||||   |||| |||||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  37379 taagaaacacatgatctctcccttgaaactcaatggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 37455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27563 - 27390
Alignment:
Q  138 gttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctca 237  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27563 gttccaaccctctcagatatctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctca 27464  T
Q  238 gaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||| || || || ||||||| |||||||    
T  27463 gaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcgtggtaactcttctgtcgactctgc 27390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 38400 - 38227
Alignment:
Q  138 gttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctca 237  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38400 gttccaaccctctcagatatctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctca 38301  T
Q  238 gaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||| || || || ||||||| |||||||    
T  38300 gaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcttggtaactcttctgtcgactctgc 38227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 57 - 311
Target Start/End: Original strand, 1 - 255
Alignment:
Q  57 acatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaata 156  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  ||||||  || ||| |||    
T  1 acatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgaaaatttgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatatgccactattccaactctttccgata 100  T
Q  157 tctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctc 256  Q
    |||||||||||||||| ||  | | ||||||||| ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||  ||| | ||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  101 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaactttttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcaccggattgactctcaaaaacacatgataaccctc 200  T
Q  257 ctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
     ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || || |||| |||||||    
T  201 ttgaaactcaagatcctttctacggttatcatgataactcttttgtcgactctgc 255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 292
Target Start/End: Original strand, 639 - 910
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |    
T  639 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaagc 738  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    |||| | ||| |||||  |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  739 caacacgatacgccaccattccaaccctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 838  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgata 292  Q
    || |||||| ||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  839 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctatgcttatcatgata 910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 311
Target Start/End: Original strand, 5311 - 5466
Alignment:
Q  156 atctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccct 255  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  5311 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccct 5410  T
Q  256 cctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||||||| |||||  |||| || ||||| ||||| || |||||||||| |||||||    
T  5411 cctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgc 5466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15422 - 15132
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| ||||  || ||||| || |||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  15422 acatcatctcttgggatgacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 15323  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||| || ||  ||||||||||| ||||||| ||| |   |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||    
T  15322 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacagaccaattaaccttagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 15223  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || | |||| ||||||| | | |||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  15222 cacatgagtgactctcaaagatacatgatctccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 15132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 29112 - 28830
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||| | |  ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| | |||  |||    
T  29112 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatctgctacatacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaac 29013  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||||||||||||| || ||||  |||||  | |||||||| |||||||| |||   | |||||||||||| ||||||||||| || |  ||||| ||    
T  29012 ccactctatatgccactgtcccaactctctcagagatctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgt 28913  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtc 303  Q
    || | |||| ||||||| ||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  28912 cacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtc 28830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 41103 - 40821
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||| | |  ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| | |||  |||    
T  41103 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatctgctacatacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaac 41004  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||||||||||||| || ||||  |||||  | |||||||| |||||||| |||   | |||||||||||| ||||||||||| || |  ||||| ||    
T  41003 ccactctatatgccactgtcccaactctctcagagatctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgt 40904  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtc 303  Q
    || | |||| ||||||| ||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  40903 cacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtc 40821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 126 - 309
Target Start/End: Original strand, 10837 - 11020
Alignment:
Q  126 ctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcatag 225  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||||||||  |||||||    
T  10837 ctataggccactgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacatgtcatag 10936  T
Q  226 gagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactct 309  Q
     |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||    
T  10937 aagtaaccctaagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactct 11020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 65
Target Start/End: Original strand, 10787 - 10831
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttc 65  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10787 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttc 10831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 288
Target Start/End: Original strand, 4013 - 4262
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||| | ||||| |||  ||| ||||| |    
T  4013 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacaaatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaacccacttgatacgccaccg 4112  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  4113 ttccaatcctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 4212  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcat 288  Q
    ||| |||||||| || || | ||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  4213 aaatacatgatctccttcttaaaactcaaggtctttcctacgcttatcat 4262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 325 - 54
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  325 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 226  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
      |||| ||| ||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||  |   |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||    
T  225 tcactcgatacgccaccgttccaacactttccgatatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 126  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgata 292  Q
    || | |||| ||||| | ||| |||||||| || || ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||    
T  125 cacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgata 54  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 33095 - 32824
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  33095 acatcatcactttggatcacatgagatggatccgtaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 32996  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||||  || ||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||  ||||||| ||  |||| ||||| ||    
T  32995 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttaacttcaatgcaagtccaacaccagt 32896  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgata 292  Q
    || | |||| ||||||| ||| || ||||| || || | ||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  32895 cacaagagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttaaaactcaagatctttcctacgcttatcatgata 32824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 6918 - 7192
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaaga-tgaggtggcaaaccaactctatatgccaca 137  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||| || || || ||||| ||||  || |||||     
T  6918 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagaatgcggcggtaaacccactcggtaagccacc 7017  T
Q  138 gttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctca 237  Q
    |||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  7018 gttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctca 7117  T
Q  238 gaaaa-acatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
     |||| || || || || || ||||| |||||||| |||| |||||| || ||||| || || |||| |||||||    
T  7118 aaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgc 7192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 127542 - 127253
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  127542 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaac 127443  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| ||| |||||  ||||||  || ||  |||||||||||||| |||| ||  | | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||    
T  127442 ccactcgatacgccaccattccaactctttctgatatctgatacggatcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 127343  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    || | |||| ||||||| ||| || ||||| || || || || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||    
T  127342 cacatgagtgactctcaaaaacacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctg 127253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 5995 - 6267
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||| ||| |||||      
T  5995 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagctgcggtggtaatccaactcgatacgccacca 6094  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||| ||||| |     
T  6095 ttccaactctttctaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcaaacaccagtcacaggagtgactcttaa 6194  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || ||||| ||||| ||||||||||  || ||||| | |||||| || || |||| |||||||    
T  6195 aaacacgtggtctccctcttgaaactcaagatcctgcctgcgcttattatgataactcttttgtcgactctgc 6267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 283
Target Start/End: Original strand, 601 - 845
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| || |  ||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| || || ||||| |||   || ||||| |    
T  601 acatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccacttggtaagccaccg 700  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  701 ttccaactctttccaatatttgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 800  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgctt 283  Q
    ||| || || || || || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  801 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgctt 845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 14323 - 14613
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||| ||||||||||| |  | ||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| || |    
T  14323 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagtttcgacacatggaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 14422  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | || | ||| ||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||    
T  14423 ccacccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 14522  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| ||||||| ||| || || |  || |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  14523 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtatccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 14613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 151
Target Start/End: Original strand, 45807 - 45938
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatg-cgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaa 119  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |||    
T  45807 acatcatctcttgaaataacatggcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaatgatgtggtggaaaa 45906  T
Q  120 ccaactctatatgccacagttccaatcctctc 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  45907 ccaactctatatgccactgttccaaccctctc 45938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 567 - 313
Alignment:
Q  57 acatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaata 156  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||  |||||||||| ||  |||    
T  567 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccattccaatcctttctgata 468  T
Q  157 tctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctc 256  Q
    |||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || | |||| | ||||||| ||| ||||| || || ||    
T  467 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtccaacaccggttacaggattgactctcaaaaacacatggtccccttc 368  T
Q  257 ctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
     ||||| ||||  || || |||||||| ||||| ||| | || |||| |||||||    
T  367 ttgaaactcaatgtctttcctacgcttatcatggtagttgttttgtcgactctgc 313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 311
Target Start/End: Original strand, 16986 - 17240
Alignment:
Q  57 acatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaata 156  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||  ||| ||||| |||||||| || ||  |||    
T  16986 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttgatacgccaccgttccaattctttctgata 17085  T
Q  157 tctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctc 256  Q
    |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||   ||| | |||| ||||||| ||| || ||||| || ||    
T  17086 tctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacaaatcacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttc 17185  T
Q  257 ctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
     ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  17186 ttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 17240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 65369 - 65658
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||| | | ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| || |    
T  65369 acatcatcacttgga-tcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 65467  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||  || ||  ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| |||||||| || ||||| || || ||    
T  65468 ccactcgataagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacgccagt 65567  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| ||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  65568 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 65658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 39 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40114 - 39924
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| |  || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  40114 acatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaagacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaatccaactcaatacgccaccg 40015  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagt 229  Q
    ||||||  || ||| ||||| ||||||||||||| ||  | | |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| ||||||    
T  40014 ttccaactctttcccatatccgatacggaccaataaatctcggagtcaaattctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagt 39924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 229006 - 229296
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||  || || | |||||||||||| ||||| || |    
T  229006 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcatattcgaaagatgcggtggtaacc 229105  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | | ||  || ||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||  ||  | | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||    
T  229106 ctattcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaacaaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtcccacaccagt 229205  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
     |||||||| ||||||| ||| |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||| || || || |||| |||||||    
T  229206 aataggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaattcaaggtcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgc 229296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 219742 - 219470
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||  || || |||  ||| ||||| |    
T  219742 acatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatcccacttgatacgccaccg 219643  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  219642 ttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 219543  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || |||||  | || ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  219542 aaatacgtgatcttcttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 219470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 33177 - 33049
Alignment:
Q  182 agtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgc 281  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || || ||||| |||| |||  | || |||| ||| |||||||||||  | ||||| |||| ||||||||| | |    
T  33177 agtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 33078  T
Q  282 ttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    || |||||||| || ||||||| ||||||    
T  33077 ttatcatgataactcttctgtctactctg 33049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 292
Target Start/End: Original strand, 14858 - 15111
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||  || ||||| |    
T  14858 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaagcccactcggtacgccaccg 14957  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||| || ||  |||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| ||| |||     
T  14958 ttccaattctttctgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactatcaa 15057  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgata 292  Q
    ||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  15058 aaatacatgatctccttcatgaaactcaaggtctttcctaagcttatcatgata 15111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 6353 - 6625
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||  || || |||||||||||||| ||||  || || |||| |||| ||||      
T  6353 acatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatcccactcgatataccacca 6452  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    | ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  6453 tcccaactctttccaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 6552  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| || || || || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || || |||| |||||||    
T  6553 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgc 6625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 3611 - 3483
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |   ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  3611 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagtagcgacacatgatacacatcatgcaagttcgaaagatgaggtggcaaac 3512  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctc 149  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3511 caactctatatgccactgttccaaccctc 3483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 64356 - 64103
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  64356 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 64257  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || ||  ||||||||||||||||||||||  |   |||||||||||| ||||||||||| ||||| || || | || |||||| |||||||     
T  64256 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaatgaatctcacagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaactccagccacaggagtgactctcaa 64157  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgata 292  Q
    ||| || || || || || || || |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  64156 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgata 64103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 26062 - 25791
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| || |||||||  ||||||||||| |  || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  26062 acatcatcccttggaatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 25963  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||| |   ||| |  ||| | |||||||| || ||||| || || ||    
T  25962 ccactcgatacgccacggttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacatccgagttagtttccttgacttcaatgcacgtccaaccccagt 25863  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgata 292  Q
    ||||||||| ||||| | ||| ||||| |  || |||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||||||    
T  25862 cataggagtgactctaaaaaatacatggtttccttcctgaaactcaaagtccttcctacgcttatcatgata 25791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 1102 - 1392
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||||||||||||||| |  ||| |||||| |||||| || || |||||||||||||| ||||| |||     
T  1102 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcaacacataaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaat 1201  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | ||||  || ||||| |||||||  || ||| |||||||||||||| |||| ||  | | |||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||    
T  1202 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaacaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcgaacaccagt 1301  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| ||||| | ||| || || || || || ||||| |||||||| || |||| ||| ||||| || ||||| |||| |||||||    
T  1302 cacaggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacacttatcatggtaacttttttgtcgactctgc 1392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 871 - 1161
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||| || |||| ||| ||||| || |||||||  ||||||||||  |  |||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| ||||    
T  871 acatcgtcccttggaatcacatgagatggatccgaaacatacttccaaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcatattcgaaagatgcggtggtaaac 970  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | | || ||||||||| |||||||| || ||  |||||||||| |||||||| ||| | | | |||| |||||  | ||||| || ||||| ||||| ||    
T  971 ccaatcgatatgccactgttccaattctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggattcaatttctttcatttcaatgcacgtccaacaccagt 1070  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| ||||| | ||| ||||| || || |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || || |||||| |||||    
T  1071 cacaggagtgactctaaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcaaatctgc 1161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 213 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1385 - 1287
Alignment:
Q  213 acacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  1385 acacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcaactctgc 1287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 222
Target Start/End: Original strand, 15456 - 15656
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||||| ||||||||||| |  |||||| |||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||    
T  15456 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacccatgaaacacatcgtgcaaattcgaaa-atgtggtggtaaac 15554  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| ||||||||| |||||||  || ||| |||||||||||| |||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  15555 ctactcgatatgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 15654  T
Q  221 ca 222  Q
    ||    
T  15655 ca 15656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16739 - 16518
Alignment:
Q  90 tcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaact 189  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||||  || | | ||||||||||||||||| | ||| |   ||||||||    
T  16739 tcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccagtaaacctctgagtcaact 16640  T
Q  190 tcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatg 289  Q
    |||| |||||||| |  ||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||    
T  16639 tctttgacttcaatgtgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatg 16540  T
Q  290 atagcttttctgtcaactctgc 311  Q
     || || || ||||||||||||    
T  16539 gtaactcttttgtcaactctgc 16518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 33898 - 33626
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||| | || || |||| ||| ||||| |    
T  33898 acatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatcccactcgatacgccactg 33799  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || | | ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| | |||| ||| |||     
T  33798 ttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgactttcaa 33699  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
     || || || || || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  33698 taacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 33626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 8559 - 8849
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||| | ||||||||||  |  ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| || |    
T  8559 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 8658  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||  || | | ||||||||||||||||||| ||  | | ||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||    
T  8659 ccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 8758  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || | |||| ||| |||  || || || || || || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  8759 cacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 8849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1508 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1508
Description:

Target: scaffold1508; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 966 - 871
Alignment:
Q  35 aataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctata 130  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  966 aataacatgtgaaggatccgctacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctata 871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 311
Target Start/End: Original strand, 1908 - 2047
Alignment:
Q  172 tgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatc 271  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |    
T  1908 tgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggc 2007  T
Q  272 ctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    ||| ||| |||||||||| || || || |||| |||||||    
T  2008 cttcctatgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgc 2047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 13269 - 13030
Alignment:
Q  72 tgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaa 171  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| || ||||| ||||| |||| ||| || ||  |||| || || ||  |||||||||||| || ||    
T  13269 tgcgacacatgaaacacatcatgtaaattcaaaagttgtggtggtaaacccactccatacgctaccattcccattctttctgatatctgatacgaactaa 13170  T
Q  172 tgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatc 271  Q
    | ||  | |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| |||||||  || ||||| || || || ||||||||||||||    
T  13169 taaatctcgaagtcaatttcttagacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaataacacatggtctccttcttgaaattcaagatc 13070  T
Q  272 ctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
     || |||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  13069 tttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 13030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1147 - 877
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||  |||| || ||||||| |||| ||||      
T  1147 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgtaatacatcatgcaatttcgaaagttgctgtggtaatccaactcgatattccacct 1048  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    |||||    | ||  ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  1047 ttccatctttttcttatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctca- 949  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    |||||| || || || || || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| ||||||    
T  948 aaaaacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttttcatgataactcttttgtcgactctg 877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 1018 - 749
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || | ||| ||||| |    
T  1018 acatgggatggatccggtacatacttccgaagttgctccacatgaaacacatcctgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccacacgatacgccaccg 919  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||  || | | ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| | |||  |||||||     
T  918 ttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacacgagggactctca- 820  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactct 309  Q
    ||| || || || || || ||||| | |||||| || |||||||| |||||||| || || |||| |||||    
T  819 aaacacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 309
Target Start/End: Original strand, 9357 - 9594
Alignment:
Q  72 tgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaa 171  Q
    ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  || ||||| |||||||  || ||| ||||||||||| ||||||    
T  9357 tgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacagaccaa 9456  T
Q  172 tgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatc 271  Q
    | ||  | | ||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| |||||||  || || || || || || ||||| ||||| ||    
T  9457 taaatctaggagtcaccttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttgaaactcaaggtc 9556  T
Q  272 ctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactct 309  Q
     || |||||||| |||||||| || || |||| |||||    
T  9557 tttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 9594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 237
Target Start/End: Original strand, 16947 - 17136
Alignment:
Q  48 ggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcc 147  Q
    |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |||  ||  |    
T  16947 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcaatacgccaccgttaaaactc 17046  T
Q  148 tctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctca 237  Q
    | ||| |||||||||||| || ||| ||  | | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| | |||| |||||||    
T  17047 tttccgatatctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctca 17136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 292
Target Start/End: Original strand, 7522 - 7631
Alignment:
Q  183 gtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgct 282  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  7522 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 7621  T
Q  283 tgtcatgata 292  Q
    | ||||||||    
T  7622 tatcatgata 7631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 189 - 289
Target Start/End: Original strand, 1 - 101
Alignment:
Q  189 ttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcat 288  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  1 ttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcat 100  T
Q  289 g 289  Q
    |    
T  101 g 101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 985 - 835
Alignment:
Q  159 tgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcct 258  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| || || || || ||||    
T  985 tgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcagtgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcct 886  T
Q  259 gaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactct 309  Q
     ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||    
T  885 taaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 311
Target Start/End: Original strand, 7855 - 8043
Alignment:
Q  123 actctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtca 222  Q
    |||| ||| ||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  7855 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtca 7954  T
Q  223 taggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
      | ||| ||||||| ||| || || || || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||    
T  7955 ccgaagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgc 8043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 292
Target Start/End: Original strand, 49507 - 49727
Alignment:
Q  72 tgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaa 171  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  || ||||| |||||||  || ||| ||||||||||||| ||||    
T  49507 tgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggccaa 49606  T
Q  172 tgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatc 271  Q
    | ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |  ||| |||||| ||||| | ||| |  || || || || ||||| ||||| ||    
T  49607 taaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaacaatcacaggagtgactctaaaaaatatgtggtctccttcttgaaactcaaggtc 49706  T
Q  272 ctttctacgcttgtcatgata 292  Q
     || |||||||| ||||||||    
T  49707 tttcctacgcttatcatgata 49727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5933 - 5644
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| || |||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  5933 acatcatcccttggaatcacatgagatggatccggaacatacttccgatgttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 5834  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
      |||||||| || || || ||||  || |   | || ||||||| |||| | ||| | | || ||  ||||||||||| |  || ||||| ||||| ||    
T  5833 tcactctatacgcaactgtcccaactctttatgaaatatgatacgaaccattaaacctcggagacagtttcttcgactttagtgctcgtccaacaccggt 5734  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || |||||| ||||||| ||| ||||| || || || ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  5733 cacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcttgaaactcaagatccttt-tgcgcttatcatgataactcttttgtctactctgc 5644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4748 - 4458
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    ||||||||||||   || ||||| || |||||| | ||||||||||  |  ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| || |    
T  4748 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 4649  T
Q  121 caactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgt 220  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||  || | | ||||||||||||||||||| ||  | | ||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||    
T  4648 ccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 4549  T
Q  221 cataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
    || | |||| ||| |||  || || || || || || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  4548 cacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 4458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4717 - 4567
Alignment:
Q  72 tgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaa 171  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||| ||| ||||| |||||||| || ||| ||| ||||||||||||||    
T  4717 tgcgacagatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcgatggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatacctgatacggaccaa 4618  T
Q  172 tgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtca 222  Q
    | ||  | | ||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  4617 taaatctcggagtaaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtca 4567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 19081 - 18993
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatg 109  Q
    |||||||| || | |||||||||||| ||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  19081 acatcatctctcggaataacatgcgagggatctgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatg 18993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 37062 - 36985
Alignment:
Q  48 ggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaact 125  Q
    |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||| ||||||| |||| | ||||| || ||||||    
T  37062 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgtaagaggcggtggtaatccaact 36985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16741 - 16488
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 138  Q
    ||||| || |||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||||| ||||| ||   ||| |||||      
T  16741 acatgagatggatcccgaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtacaaattcgaaagatgcggtggtaaacctacatgatacgccacca 16642  T
Q  139 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 238  Q
    ||||||| || ||  |||||| |||||||||||| ||  | |  |||||||||||||||||||| || ||||| |||||  |||  ||||| || || |     
T  16641 ttccaattctttctgatatcttatacggaccaataaatctcggtgtcaacttcttcgacttcaatgcacgtccaacaccaatcactggagtgaccctaaa 16542  T
Q  239 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgata 292  Q
    ||| |||||||| || || ||||||  ||||||||  |||||||| ||||||||    
T  16541 aaatacatgatctccttcttgaaatataagatcctccctacgcttatcatgata 16488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 57 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 117212 - 117053
Alignment:
Q  57 acatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaata 156  Q
    ||||||||||| |  | ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  ||||| ||||| |||| ||| ||||| ||| |||| || ||  |||    
T  117212 acatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaatatacggtggtaaacccactcgatacgccaccgttacaattctttctgata 117113  T
Q  157 tctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacac 216  Q
    | |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  117112 tttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacac 117053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 78 - 292
Target Start/End: Original strand, 1025 - 1239
Alignment:
Q  78 acatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaact 177  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  || ||||  |||||||  || ||| ||||| ||||||||||||| ||      
T  1025 acatgaaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaacgttccaactctttccgatatccgatacggaccaataaatc 1124  T
Q  178 tggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttct 277  Q
    | | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| ||| || |||||||  || |||||||| || || |  || ||||| || |||||    
T  1125 tcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggggtgactctcaagaatacatgatctccttctttgaactcaaggtcttttct 1224  T
Q  278 acgcttgtcatgata 292  Q
    |||||| ||||||||    
T  1225 acgcttatcatgata 1239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 309
Target Start/End: Original strand, 21932 - 22118
Alignment:
Q  123 actctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtca 222  Q
    |||| ||| ||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||     
T  21932 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcg 22031  T
Q  223 taggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactct 309  Q
     |||||| ||||||| ||| || || || || || ||||| ||||||||||| || | ||| |||||||| || || |||| |||||    
T  22032 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcacttatcatgataactcttttgtcgactct 22118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 311
Target Start/End: Original strand, 9066 - 9223
Alignment:
Q  154 atatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcacc 253  Q
    ||||||||||| ||||||| ||  | | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| |||||||| ||    
T  9066 atatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatcccc 9165  T
Q  254 ctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctgc 311  Q
     || ||||| ||||| || || |||||||| ||||| || || || |||| |||||||    
T  9166 ttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgc 9223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 237
Target Start/End: Original strand, 5235 - 5400
Alignment:
Q  72 tgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctccaatatctgatacggaccaa 171  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||| || || |||| ||| ||||| |||||||  || ||  ||||||||||| ||||||    
T  5235 tgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacagaccaa 5334  T
Q  172 tgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctca 237  Q
    | ||  | | |||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| |||||||    
T  5335 taaatctcggagtcgacttccttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctca 5400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Original strand, 9182 - 9297
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtggcaaac 120  Q
    |||||||| || | ||||||||| |||||||||| |||||||||| | |  ||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||  |||||||| |    
T  9182 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacatatgaaccacatcatgcaaattcgaaagatatggtggcaatc 9281  T
Q  121 caactctatatgccac 136  Q
    | ||||| ||||||||    
T  9282 ccactctgtatgccac 9297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 152
Target Start/End: Original strand, 8771 - 8824
Alignment:
Q  99 ttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaatcctctcc 152  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8771 ttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaatactctcc 8824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 115
Target Start/End: Original strand, 6254 - 6330
Alignment:
Q  39 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcgaaagatgaggtgg 115  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  6254 acatgggatggatccggtacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgg 6330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0720 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0720
Description:

Target: scaffold0720; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 62 - 1
Alignment:
Q  21 acatcatcacttgtaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaactgcgacacatg 82  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||    
T  62 acatcatctcttggaataacacgcgaaggatctggtacatacttctgcaattgcgacacatg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 303
Target Start/End: Original strand, 24004 - 24125
Alignment:
Q  182 agtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgc 281  Q
    |||||||||| |  |||||||||| || || ||||| ||||  ||| ||||||| | ||| |||||||||||  ||||||| |||| ||||||||| | |    
T  24004 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcaccggattaactctaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctc 24103  T
Q  282 ttgtcatgatagcttttctgtc 303  Q
    || |||||||| || |||||||    
T  24104 ttatcatgataactcttctgtc 24125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14867 - 14791
Alignment:
Q  234 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    |||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||| || ||||||| ||||||    
T  14867 ctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaattcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctg 14791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 310
Target Start/End: Original strand, 13032 - 13160
Alignment:
Q  182 agtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgc 281  Q
    |||||||||| |  |||||||||| || || ||||| |||| |||  | |||||||  || |||||||||||  ||||||| |||| ||||||||| | |    
T  13032 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacagggttcactctcaacaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctc 13131  T
Q  282 ttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    || |||||||| || ||||||| ||||||    
T  13132 ttatcatgataactcttctgtctactctg 13160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 310
Target Start/End: Original strand, 14781 - 14909
Alignment:
Q  182 agtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgc 281  Q
    |||||||||| |  |||||||||| || || ||||| |||| |||| | || || | ||| |||||||||||  | ||||| |||| ||||||||| | |    
T  14781 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 14880  T
Q  282 ttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||||    
T  14881 ttatcatgataacttttctgtctactctg 14909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 103
Target Start/End: Original strand, 10654 - 10701
Alignment:
Q  56 tacatacttccgtaactgcgacacatgaaacacgtcatgaaaattcga 103  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  10654 tacatacttccgcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattcga 10701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 310
Target Start/End: Original strand, 5879 - 5993
Alignment:
Q  196 acttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagct 295  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||||||| | || |||| ||| |||||||||||  | ||| | |||| ||||||||| | ||| |||||||| ||    
T  5879 acttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 5978  T
Q  296 tttctgtcaactctg 310  Q
     ||||||| ||||||    
T  5979 cttctgtctactctg 5993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 310
Target Start/End: Original strand, 10493 - 10607
Alignment:
Q  196 acttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagct 295  Q
    |||||||||| || || ||||| |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  | ||||| |||| ||||||||| | ||| |||||||| ||    
T  10493 acttcaaagcacgaccaacaccggtcaaaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 10592  T
Q  296 tttctgtcaactctg 310  Q
     ||||||| ||||||    
T  10593 cttctgtctactctg 10607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 310
Target Start/End: Original strand, 8488 - 8602
Alignment:
Q  196 acttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgcttgtcatgatagct 295  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||||||| | || |||| ||| |||||||||||  | ||| | |||| ||||||||| | ||| |||||||| ||    
T  8488 acttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 8587  T
Q  296 tttctgtcaactctg 310  Q
     ||||||| ||||||    
T  8588 cttctgtctactctg 8602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1092 - 964
Alignment:
Q  182 agtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgc 281  Q
    |||||||||| |  |||||||||| || || ||||| |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  | ||||| |||| ||||||||| | |    
T  1092 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 993  T
Q  282 ttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    || |||||||| || || |||| ||||||    
T  992 ttatcatgataactcttatgtctactctg 964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 310
Target Start/End: Original strand, 3283 - 3411
Alignment:
Q  182 agtcaacttcttcgacttcaaagcccgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctacgc 281  Q
    |||||||||| |  |||||||||| || || | ||| |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  ||||||| || |  |||||||| | |    
T  3283 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaataccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcgatgtcctttctcctc 3382  T
Q  282 ttgtcatgatagcttttctgtcaactctg 310  Q
    || |||||||| || ||||||| ||||||    
T  3383 ttatcatgataactcttctgtctactctg 3411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University