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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21163_high_1 (Length: 749)

Name: NF21163_high_1
Description: NF21163
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21163_high_1
NF21163_high_1
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (17-743)||(46072729-46073455)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 711; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 711; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 743
Target Start/End: Complemental strand, 46073455 - 46072729
Alignment:
Q  17 aggtataagttcattcgggaattataatgccctcgatatggatttggatttgaatttcagcaggccgtgagtgttaaccttcaattgaatgtgcaggatg 116  Q
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T  46073455 aggtataagttcattcgggaattataatgccctcgatatggatttggatttgaatttcagcaggccgtgagtgttaaccttcaattgaatgtgcaggatg 46073356  T
Q  117 ggaaccacaaacttttaaatcgtccaggaagaacagagctgaattcaaagagcagaacatattgaattttctagacgacgacgagaaagctgtacgtgga 216  Q
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T  46073355 ggaaccacaaacttttaaatcgtccaggaagaacagagctgaattcaaagagcagaacatattgaattttctagacgacgacgagaaagctgtacgtgga 46073256  T
Q  217 ttaatactattcatgtataaatttgtgcgtgatttttatattatatatgcatgtatcaaagctcttatgttaaggaagtttagatgtaggtagagaagtc 316  Q
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T  46073255 ttaatactattcatgtataaatttgtgcgtgatttttatattatatatgcatgtatcaaagctcttatgttaaggaagtttagatgtaggtagagaagtc 46073156  T
Q  317 acacctagctgattgaacttcttactctagaaccattttgtacagaatttctctgtaaatagcgatatagctgttattcattaacaatttttattatact 416  Q
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T  46073155 acacctagctgatcgaacttcttactctagaaccattttgtacagaatttctctgtaaatagtgatatagctgttattcattaacaatttttattatact 46073056  T
Q  417 taatacttaattttggatttatcagtgcccttttacattcttctgcattgtttcctattttgatacggaacagtctttattaacattaacattattagac 516  Q
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T  46073055 taatacttaattttggatttatcagtgcccttttacattcttctgcattgtttcctattttgatacggaacagtctttattaacattaacattattagac 46072956  T
Q  517 taagatatttatatttacacttccttgtgatttttaaatattgtacaactacccacttaaaatgggaaaagttagaagcgcattatctgaatagaacata 616  Q
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T  46072955 taagatatttatatttacacttccttgagatttttaaatattgtacaactacccacttaaaatgggaaaagttagaagcgcattatctgaatagaacata 46072856  T
Q  617 aagggatatttgttatattgaagttctcaaatacgggaaagtctgttctattaccaattacagtataaagtaggaagtttattgtaattatttttgtttg 716  Q
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T  46072855 aagggatatttgttatattgaagttctcaaatacgggaaagtctgttctattaccaattacagtataaagtaggaagtttattgtaattatttttgtttg 46072756  T
Q  717 gggcgggggagaggggatattcttcga 743  Q
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T  46072755 gggcgggggagaggggatattattcga 46072729  T

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