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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21163_low_1 (Length: 749)

Name: NF21163_low_1
Description: NF21163
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21163_low_1
NF21163_low_1
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (17-743)||(46072729-46073455)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 711; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 711; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 743
Target Start/End: Complemental strand, 46073455 - 46072729
Alignment:
Q  17 aggtataagttcattcgggaattataatgccctcgatatggatttggatttgaatttcagcaggccgtgagtgttaaccttcaattgaatgtgcaggatg 116  Q
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T  46073455 aggtataagttcattcgggaattataatgccctcgatatggatttggatttgaatttcagcaggccgtgagtgttaaccttcaattgaatgtgcaggatg 46073356  T
Q  117 ggaaccacaaacttttaaatcgtccaggaagaacagagctgaattcaaagagcagaacatattgaattttctagacgacgacgagaaagctgtacgtgga 216  Q
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T  46073355 ggaaccacaaacttttaaatcgtccaggaagaacagagctgaattcaaagagcagaacatattgaattttctagacgacgacgagaaagctgtacgtgga 46073256  T
Q  217 ttaatactattcatgtataaatttgtgcgtgatttttatattatatatgcatgtatcaaagctcttatgttaaggaagtttagatgtaggtagagaagtc 316  Q
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T  46073255 ttaatactattcatgtataaatttgtgcgtgatttttatattatatatgcatgtatcaaagctcttatgttaaggaagtttagatgtaggtagagaagtc 46073156  T
Q  317 acacctagctgattgaacttcttactctagaaccattttgtacagaatttctctgtaaatagcgatatagctgttattcattaacaatttttattatact 416  Q
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T  46073155 acacctagctgatcgaacttcttactctagaaccattttgtacagaatttctctgtaaatagtgatatagctgttattcattaacaatttttattatact 46073056  T
Q  417 taatacttaattttggatttatcagtgcccttttacattcttctgcattgtttcctattttgatacggaacagtctttattaacattaacattattagac 516  Q
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T  46073055 taatacttaattttggatttatcagtgcccttttacattcttctgcattgtttcctattttgatacggaacagtctttattaacattaacattattagac 46072956  T
Q  517 taagatatttatatttacacttccttgtgatttttaaatattgtacaactacccacttaaaatgggaaaagttagaagcgcattatctgaatagaacata 616  Q
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T  46072955 taagatatttatatttacacttccttgagatttttaaatattgtacaactacccacttaaaatgggaaaagttagaagcgcattatctgaatagaacata 46072856  T
Q  617 aagggatatttgttatattgaagttctcaaatacgggaaagtctgttctattaccaattacagtataaagtaggaagtttattgtaattatttttgtttg 716  Q
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T  46072855 aagggatatttgttatattgaagttctcaaatacgggaaagtctgttctattaccaattacagtataaagtaggaagtttattgtaattatttttgtttg 46072756  T
Q  717 gggcgggggagaggggatattcttcga 743  Q
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T  46072755 gggcgggggagaggggatattattcga 46072729  T

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