View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21165_low_1 (Length: 876)

Name: NF21165_low_1
Description: NF21165
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21165_low_1
NF21165_low_1
[»] chr3 (36 HSPs)
chr3 (21-693)||(19465376-19466047)
chr3 (21-747)||(19381916-19382642)
chr3 (21-747)||(19394172-19394896)
chr3 (21-746)||(18872143-18872855)
chr3 (21-583)||(18017045-18017607)
chr3 (21-593)||(17942977-17943549)
chr3 (21-670)||(19335035-19335686)
chr3 (12-685)||(18166170-18166844)
chr3 (21-547)||(19352415-19352941)
chr3 (12-585)||(17725949-17726523)
chr3 (12-585)||(19027178-19027752)
chr3 (21-667)||(19425713-19426362)
chr3 (21-664)||(19354738-19355384)
chr3 (21-667)||(19376645-19377289)
chr3 (23-587)||(19415209-19415773)
chr3 (21-622)||(19456320-19456918)
chr3 (21-587)||(18147853-18148407)
chr3 (21-583)||(17950858-17951408)
chr3 (21-587)||(19462215-19462769)
chr3 (21-619)||(16678233-16678827)
chr3 (21-547)||(18116991-18117505)
chr3 (21-583)||(19400752-19401311)
chr3 (21-583)||(18109465-18110015)
chr3 (21-539)||(25464073-25464594)
chr3 (21-587)||(14894801-14895367)
chr3 (21-547)||(19437981-19438495)
chr3 (196-580)||(18104706-18105078)
chr3 (21-165)||(18104369-18104513)
chr3 (403-580)||(24493200-24493375)
chr3 (746-799)||(18872060-18872113)
chr3 (744-797)||(19394923-19394976)
chr3 (744-799)||(19382669-19382724)
chr3 (403-580)||(24496648-24496815)
chr3 (642-697)||(19439803-19439858)
chr3 (749-799)||(19439938-19439991)
chr3 (749-799)||(25464874-25464924)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (21-583)||(8460589-8461151)
chr8 (749-796)||(8461395-8461442)
[»] chr4 (2 HSPs)
chr4 (21-587)||(15536556-15537122)
chr4 (21-583)||(2708988-2709550)
[»] chr6 (1 HSPs)
chr6 (21-580)||(13665366-13665927)
[»] scaffold0274 (2 HSPs)
scaffold0274 (21-552)||(21608-22140)
scaffold0274 (21-552)||(2016-2547)
[»] scaffold0271 (1 HSPs)
scaffold0271 (21-552)||(11524-12055)
[»] scaffold0648 (1 HSPs)
scaffold0648 (21-552)||(2545-3078)
[»] scaffold0640 (1 HSPs)
scaffold0640 (21-552)||(6429-6957)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 545; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 545; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 19465376 - 19466047
Alignment:
Q  21 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgataaatatagaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  19465376 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatctcacaatagtttgactggaacaattccaaaaacgattggaggcatgattaatatggaa 19465475  T
Q  121 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggtgttgaatttatcttgcaataattttg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19465476 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatggctctctaa-actttttggaggtgttgaatttatcttgcaataattttg 19465574  T
Q  221 atggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtaccat 320  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19465575 atggaaaaattccaataggaactcaacttcaaagttttaatgtatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtaccat 19465674  T
Q  321 aacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagttggatttgca 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  19465675 aacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctaaggacgggagttggatttgca 19465774  T
Q  421 gcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagctctatgttg 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||     
T  19465775 gcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggaataggtgacaagctctatgtta 19465874  T
Q  521 ctttgacggtaaagttaaatagctttcacagaaattgagctcctgccagttaaggttagtgaaacctttttcaagttttattagtcaaactatagagtat 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  19465875 ctttgacggtaaagttaaatagctttcgcagaaattgagctcctaccagttaaggttagtgaaacctacttcaagttttatcagtcaaactatagaatat 19465974  T
Q  621 ttctttcattacgtaattctaatcaaaacttacatccatttcatttgttttgtattttatcaggtgattatgc 693  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  19465975 ttctttcattatgcaattctaatcaaaacttacatccatttcatttgtttcatattttatcaggtgattatgc 19466047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 531; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 747
Target Start/End: Original strand, 19381916 - 19382642
Alignment:
Q  21 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgataaatatagaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19381916 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatctcacaataatttcattggaacaattccaaagacgattggaggcatgataaatatggaa 19382015  T
Q  121 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggtgttgaatttatcttgcaataattttg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19382016 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcaaagcatggctctcttaaactttttggaggtgttgaatttatcttgcaataattttg 19382115  T
Q  221 atggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtaccat 320  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19382116 atggaaaaatcccaacaggaactcaacttcaaagttttaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtaccat 19382215  T
Q  321 aacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagttggatttgca 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  19382216 aacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaagatgatgaatctataatagagtcgttgtatctaggcatgggagttggatttgga 19382315  T
Q  421 gcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagctctatgttg 520  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||     
T  19382316 gtaggtttttgggggatttgtggttctttatttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatctatggagtaggtgacaagctctatgtta 19382415  T
Q  521 ctttgacggtaaagttaaatagctttcacagaaattgagctcctgccagttaaggttagtgaaacctttttcaagttttattagtcaaactatagagtat 620  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||     
T  19382416 ttttgacggtaaagttaaatagctttcgcagaaattgagctgctgccagttaaggttagtgaaacctacttcaagttttattaatcaaactatagagtaa 19382515  T
Q  621 ttctttcattacgtaattctaatcaaaacttacatccatttcatttgttttgtattttatcaggt--gattatgcttgtcgcgcagtttgtggattgtta 718  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||  |||||||||||  ||||||    
T  19382516 ttgtttcattacgcaattctaatcaaaacttacatccattttatttgtttcgtattttatcaggtgagattatgcatgt--cgcagtttgtgccttgtta 19382613  T
Q  719 tccaaatcgtggattgagttttccaaata 747  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19382614 tccaaatcgtggatagagtttaccaaata 19382642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 747
Target Start/End: Original strand, 19394172 - 19394896
Alignment:
Q  21 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgataaatatagaa 120  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||| |||||| ||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| | |||    
T  19394172 ggaattatttcggcttattcaagttcaaacgttaaatctatctcacaataatttcattggaacaataccgaacacgattggaggcatgaaaaatttggaa 19394271  T
Q  121 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggtgttgaatttatcttgcaataattttg 220  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||     |||||| |||||| ||| |||||||    
T  19394272 tctctcgatctttccaataataagttttatggtgaaattcctcaaagcatggctctcttaaactttttgggttatttgaatctatcttacaacaattttg 19394371  T
Q  221 atggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtaccat 320  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||      
T  19394372 acggaaaaatcccaataggaactcaacttcaaagttttaatgcatcgagttatattgggaatcctaaactatgtggagctccacttagtaattgtaccgc 19394471  T
Q  321 aacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagttggatttgca 420  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  19394472 agaagaagaaaatcctaaaactgcaaagccatctacagagaatgaagatgaagactctataaaagaatcattgtatctagggatgggagttggatttgca 19394571  T
Q  421 gcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagctctatgttg 520  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  19394572 gtaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatgctttcgggttatatatggagtaggtgacaagctctatgtta 19394671  T
Q  521 ctttgacggtaaagttaaatagctttcacagaaattgagctcctgccagttaaggttagtgaaacctttttcaagttttattagtcaaactatagagtat 620  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  19394672 ttttgacggtaaagttaaatagctttcgcagaaattgaggtcctgccaattaaggttagtgaaacctacttcaagttttatcactcaaactataaagtat 19394771  T
Q  621 ttctttcattacgtaattctaatcaaaacttacatccatttcatttgttttgtattttatcaggtgattatgcttgtcgcgcagtttgtggattgttatc 720  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||| |||||||||    
T  19394772 ttgtttcattatgtaattctaataaaaacttacatccatttcatttgtttcatattttatcaggtgattatgcatgt--cacagtttgtgcattgttatc 19394869  T
Q  721 caaatcgtggattgagttttccaaata 747  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19394870 caattcgtggatagagttttccaaata 19394896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 18872855 - 18872143
Alignment:
Q  21 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgataaatatagaa 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||   |||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||| |||    
T  18872855 ggaattgtttcagcttgttcaagttcaaacattaaacttatctcataatagtttcgttggaacaattccaaagacgattagaggcatgaacaatatggaa 18872756  T
Q  121 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggtgttgaatttatcttgcaataattttg 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||||||||||| ||| | |||||    
T  18872755 tctctcgatctctctagtaataagttttgtggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttatgggttatttgaatttatcttacaacagttttg 18872656  T
Q  221 atggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtaccat 320  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  18872655 aaggaaaaattccaattggaactcaacttcaaagttttaatgcatcgagttgcattgggaatcctaaactatgcggagatcctctcaataattgtaccac 18872556  T
Q  321 aacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagttggatttgca 420  Q
    || ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||| |||  || |||| ||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  18872555 aaaagaagaaaatcctaaaactgcaaagccatctacaaagaatgaagattatgcttctataagagaatcaatgtatcttggcatgggagttggatttgca 18872456  T
Q  421 gcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagctctatgttg 520  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  18872455 gtaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatacttttggtttatatatggagtaggtgacaagctctatgtta 18872356  T
Q  521 ctttgacggtaaagttaaatagctttcacagaaattgagctcctgccagttaaggttagtgaaacctttttcaagttttattagtcaaactatagagtat 620  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||       ||||||||||||   ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  18872355 ctttgatgataaagttaaatagctttcgcagatattgagctcctgcca-------ttagtgaaacctacgtcaagttttattaatcaaaccatagagtat 18872263  T
Q  621 ttctttcattacgtaattctaatcaaaacttacatccatttcatttgttttgtattttatcaggtgattatgcttgtcgcgcagtttgtggattgttatc 720  Q
    || ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||| |||||||||    
T  18872262 ttgtttcat----taattctaatcaaaacttacatccatttcatttgtttcatattttatcaggtgattatgcatgt--cacagtttgtgcattgttatc 18872169  T
Q  721 caaatcgtggattgagttttccaaat 746  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||    
T  18872168 caaatcgtggatagagtttcccaaat 18872143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 583
Target Start/End: Original strand, 18017045 - 18017607
Alignment:
Q  21 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgataaatatagaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  18017045 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaatcattaaacttatctcacaatagtttcaaaggaacaattccgaagacgattggaggcatgaaaaaaatggaa 18017144  T
Q  121 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggtgttgaatttatcttgcaataattttg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18017145 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatggctctcttaaactttttgggggtgttgaatttatcttgcaataattttg 18017244  T
Q  221 atggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtaccat 320  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18017245 atggaaaaatcccaacaggaactcaacttcaaagtcgtgatgcatcaagttatattgggaatcctaaactgtgcggggctcctcttaataattgtaccat 18017344  T
Q  321 aacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagttggatttgca 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  18017345 aacagaagaaaatcctaaaactgcaatgccatctacagagaatgaggatgatgaatctataaaagaatcattgtatctaggcatgggagttggctttgca 18017444  T
Q  421 gcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagctctatgttg 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  || |||||      
T  18017445 gcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttctcattagaaaatggaggcatgcatattttcggtttatatatggagtgggtaacagactttatgtaa 18017544  T
Q  521 ctttgacggtaaagttaaatagctttcacagaaattgagctcctgccagttaaggttagtgaa 583  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||| | | ||| ||||||||    
T  18017545 ctttgatggtaaagttaaatagctttcgtagaagttgagcttctgctaataaagattagtgaa 18017607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 593
Target Start/End: Original strand, 17942977 - 17943549
Alignment:
Q  21 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgataaatatagaa 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  17942977 ggaattgtttcggcttattcaagttcaaacattgaacttatctcacaataatttgactggaagaattccaaagaccattggaggcatgacaaatatggaa 17943076  T
Q  121 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggtgttgaatttatcttgcaataattttg 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17943077 tctctagatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatggctctcttaaattttttgggggtgttgaatttatcttgcaataattttg 17943176  T
Q  221 atggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtaccat 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  17943177 atggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagttttaatgcatcgagttacattgggaatcctaaactatgtggagctcctcttaataattgtaccac 17943276  T
Q  321 aacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagttggatttgca 420  Q
     | ||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||| || |  ||||| ||||||||||||    
T  17943277 gaaagaagaaaatcctaaaactgcaaagccgtccacagagaatgaagatgatgactctataaaagaatcactgtaccttggcatgggggttggatttgca 17943376  T
Q  421 gcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagctctatgttg 520  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  || ||| ||| ||||| |||||||||     
T  17943377 gcaggtttttgggggatttgtggttctttgttttttattagaaaatggaggcatgcatgctttcggtttattgatagagtgggcgacaaactctatgtta 17943476  T
Q  521 ctttgacggtaaagttaaatagctttcacagaaattgagctcctgccagttaaggttagtgaaacctttttca 593  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||  ||||||||||||| |||||| |||||    
T  17943477 ctttgatcgtaaagttaaatagctttcgcagaaactgagctgctgttagttaaggttagttaaacctatttca 17943549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 670
Target Start/End: Original strand, 19335035 - 19335686
Alignment:
Q  21 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgataaatatagaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19335035 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattaaacttatctcacaatagtttcattggaacaattcagaagacgattggaggcatgataaatatggaa 19335134  T
Q  121 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggtgttgaatttatcttgcaataattttg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||  ||||||||     ||||||||||||| ||| | |||||    
T  19335135 tctctcgatctctctaataataagttttatggtgaaattcctcggagcatgtctgtcttaacctttttgggttatttgaatttatcttacaacagttttg 19335234  T
Q  221 atggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtaccat 320  Q
    | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19335235 aaggaaaaatcccaactggaacacaacttcaaagttttaatgcatcgagttacattgggaatcctaaactgtgcggagctcctctcaataattgtaccat 19335334  T
Q  321 aacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagttggatttgca 420  Q
     | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| || ||  ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  19335335 gaaagaagaaaatcctaaaactgcaatgccatcaacagataatgaagatgacgactctttaagagaatcattgtatctagggatgagagttggatttgca 19335434  T
Q  421 gcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagctctatgttg 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||| |||||||||| ||||||||     
T  19335435 gcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattagaaaatggaggcatgcttactttcggtttgtttatagagtgggtgacaagatctatgtta 19335534  T
Q  521 ctttgacggtaaagttaaatagctttcacagaaattgagctcctgc--cagttaaggttagtgaaacctttttca-agttttattagtcaaactatagag 617  Q
    ||||||  |||||||| || |  ||| | |||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  |||| |||||||||| ||  |||||||||    
T  19335535 ctttgatcgtaaagttgaacatgtttaaaagaaattgagctcctgctatagttaaggttagtggaacctacttcatagttttattaatctgactatagag 19335634  T
Q  618 tatttctttcattacgtaattctaatcaaaacttacatccatttcatttgttt 670  Q
    ||||| ||| |||  |||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||    
T  19335635 tatttgttttattttgtaattctatgcaaaacttata-ccatttcatttgttt 19335686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 685
Target Start/End: Original strand, 18166170 - 18166844
Alignment:
Q  12 agtagcataggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgata 111  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||  |||||||| || ||   |||||||||||||| |    
T  18166170 agtaccattggaaatgtttcggcttgttcaagttcaaacgttaaacttatctcacaataatttgatcggaacaataccaaaagagattggaggcatgaaa 18166269  T
Q  112 aatatagaatctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggtgttgaatttatcttgca 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| |     ||||||||||||| ||    
T  18166270 aatatggaatctctcgacctctctagtaataagttttatggtgaaattcctcagagcatctctctcttaacctttttaggttatttgaatttatcttaca 18166369  T
Q  212 ataattttgatggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataa 311  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  18166370 ataactttgacggaataatcccaataggaactcaacttcaaagttttaatgcatcaagttatattgagaatcctaaactatgtggagctcctcttagtaa 18166469  T
Q  312 ttgtaccataacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagtt 411  Q
    |||||||| || |||| ||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||| |||||||| || |||| |||||  ||||| ||||  |||||||||    
T  18166470 ttgtaccacaaaagaaaaaaattctaaaactgcaacgccgtctacaaagaatgaagatgatgactctataagagaatggttgtacctaggcatgggagtt 18166569  T
Q  412 ggatttgcagcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagc 511  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  || |||  ||||||||||    
T  18166570 ggatttgcagtaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattagaaaatggagacatgcatactttcggtttattgatagagttggtgacaagc 18166669  T
Q  512 tctatgttgctttgacggtaaagttaaatagctttcacagaaattgagctcctgccagttaaggttagtgaaacctttttc-aagttttattagtcaaac 610  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||  |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||     
T  18166670 tctatgttactttgaacgtaaagttaaatagctttctcagaaactgagttcatgctggttaaggttagtgaaacctacttcaaagttttattaatcaaaa 18166769  T
Q  611 tatagagtatttctttcattacgtaattctaatcaaaacttacatccatttcatttgttttgtattttatcaggt 685  Q
    ||| |||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18166770 tattgagtatttgtttccttatgtaattctattcaaaacttacatccatttcatttgtttcatattttatcaggt 18166844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 21 - 547
Target Start/End: Original strand, 19352415 - 19352941
Alignment:
Q  21 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgataaatatagaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||| | |||| | ||||| ||||||||| || ||   |||||||||||||| |||| | |||    
T  19352415 ggaattgtttcggcttgctcaacttcaaacgttaaacttatatcacaacaatttgattggaacaataccaaaagagattggaggcatgaaaaatgtggaa 19352514  T
Q  121 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggtgttgaatttatcttgcaataattttg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||   || ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||      
T  19352515 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattccgcagaccatggctcgcctaaactttttagaggttttaaatttatcttgcaataatttca 19352614  T
Q  221 atggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtaccat 320  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19352615 atggaaaaatcccaactggaacacaacttcaaagttttaatgcatcaagttacattgggaatcctagactatgtggagctcctcttaataattgtaccat 19352714  T
Q  321 aacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagttggatttgca 420  Q
     | ||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  19352715 gaaagaagaaaatcctaagactgcaacgccatcaacagagaatgaaggtgatgactccataaaagaatcattgtatctaggcatgggagttggatttgca 19352814  T
Q  421 gcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagctctatgttg 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||      
T  19352815 gcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattagaaaatggaggcatgcatattttcggtttatatatggagtgggtaacaggctttatgtaa 19352914  T
Q  521 ctttgacggtaaagttaaatagctttc 547  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||    
T  19352915 ctttaatggtaaagttaaatagctttc 19352941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 12 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 17726523 - 17725949
Alignment:
Q  12 agtagcataggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgata 111  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||| |    
T  17726523 agtaacatcggaattatttcggcttgttcaagttcaaacattaaacttatctcacaataatttcattggaacaataccgaaaacaattggaggcatgaaa 17726424  T
Q  112 aatatagaatctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggtgttgaatttatcttgca 211  Q
    ||| | ||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     ||||||||||||| ||    
T  17726423 aatttggaatctctcgacctctccaacaataatttttctggtgaaattcctcagagcatgtcttcgttacactttttgggttatttgaatttatcttaca 17726324  T
Q  212 ataattttgatggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataa 311  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  17726323 acaagtttgatggaaaaatcccaataggaactcaacttcaaagttttaatgcatcgagttatattgggaatcattatctatgcggagctcctcttaataa 17726224  T
Q  312 ttgtaccataacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagtt 411  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| | ||  |   |||||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  17726223 ttgtaccatagaagaagaaaatcctaaaaattcaaagttgtctacaaagaatgaagatgatgactctatcaaagaatcattgtatctagggatgggagtt 17726124  T
Q  412 ggatttgcagcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagc 511  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||||||||    
T  17726123 ggatttgcagtaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattagaaaatggaggcatgcatacttttggtttattgatggagtaggtgacaagc 17726024  T
Q  512 tctatgttgctttgacggtaaagttaaatagc-tttcacagaaattgagctcctgccagttaaggttagtgaaac 585  Q
    |||||||| |||| |  ||||||||||||||| |||  ||||||| ||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  17726023 tctatgttactttaattgtaaagttaaatagctttttgcagaaatagagttcttgttagttaaggttagtgaaac 17725949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 12 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 19027752 - 19027178
Alignment:
Q  12 agtagcataggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgata 111  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||| |    
T  19027752 agtaacatcggaattatttcggcttgttcaagttcaaacattaaacttatctcacaataatttcattggaacaataccgaaaacaattggaggcatgaaa 19027653  T
Q  112 aatatagaatctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggtgttgaatttatcttgca 211  Q
    ||| | ||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     ||||||||||||| ||    
T  19027652 aatttggaatctctcgacctctccaacaataatttttctggtgaaattcctcagagcatgtcttcgttacactttttgggttatttgaatttatcttaca 19027553  T
Q  212 ataattttgatggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataa 311  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  19027552 acaagtttgatggaaaaatcccaataggaactcaacttcaaagttttaatgcatcgagttatattgggaatcattatctatgcggagctcctcttaataa 19027453  T
Q  312 ttgtaccataacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagtt 411  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| | ||  |   |||||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  19027452 ttgtaccatagaagaagaaaatcctaaaaattcaaagttgtctacaaagaatgaagatgatgactctatcaaagaatcattgtatctagggatgggagtt 19027353  T
Q  412 ggatttgcagcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagc 511  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||||||||    
T  19027352 ggatttgcagtaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattagaaaatggaggcatgcatacttttggtttattgatggagtaggtgacaagc 19027253  T
Q  512 tctatgttgctttgacggtaaagttaaatagc-tttcacagaaattgagctcctgccagttaaggttagtgaaac 585  Q
    |||||||| |||| |  ||||||||||||||| |||  ||||||| ||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  19027252 tctatgttactttaattgtaaagttaaatagctttttgcagaaatagagttcttgttagttaaggttagtgaaac 19027178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 21 - 667
Target Start/End: Original strand, 19425713 - 19426362
Alignment:
Q  21 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgataaatatagaa 120  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||||||||| || ||   |||||||||||||| |||||| |||    
T  19425713 ggaattgtttaggcttgttcagcttcaaacgttaaacttatctcacaataatttgattggaacaataccaaaagtgattggaggcatgaaaaatatggaa 19425812  T
Q  121 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggtgttgaatttatcttgcaataattttg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||   | |||||||||||||||||||||||      
T  19425813 tctctcgatctctctaataataagttttgtggtgaaattcctcagagcatgtctgtcttaacctttttgggttttttgaatttatcttgcaataatttaa 19425912  T
Q  221 atggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtaccat 320  Q
    | ||||||||||||| |||||| |||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19425913 acggaaaaatcccaactggaacacaacttcaaagaattaatgcatcgagttacattgggaatcctaaactatgcggagctcctctcaataattgtaccat 19426012  T
Q  321 aacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagttggatttgca 420  Q
     | ||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  19426013 gaaagaagaaaatcctaaaactgcaacaccatctacaaagaatgaagatgatgactctatcaaagaatcattgtatctagggatgggagttggatttgca 19426112  T
Q  421 gcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagctctatgttg 520  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |  || ||| | |||| ||| ||||||||     
T  19426113 gtaggtttctgggggatttgtggttctttgttccttattagaaaatggaagcatgcatactttcggtttgttgatagagtgcgtgataagatctatgtta 19426212  T
Q  521 ctttgacggtaaagttaaatagctttcacagaaattgagctcctgc--cagttaaggttagtgaaacctttttca-agttttattagtcaaactatagag 617  Q
    ||||||  |||||||||||  | ||| | ||||||||||| |||||   |||||||||||||| |||||  |||| |||||||||  ||  |||||| ||    
T  19426213 ctttgatcgtaaagttaaaccgatttaaaagaaattgagcacctgctatagttaaggttagtggaacctacttcatagttttattgatctgactataaag 19426312  T
Q  618 tatttctttcattacgtaattctaatcaaaacttacatccatttcatttg 667  Q
    ||||  ||| |||  |||||||||  |||||| || ||||||||||||||    
T  19426313 tattcgttttattttgtaattctatgcaaaacctatatccatttcatttg 19426362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 21 - 664
Target Start/End: Original strand, 19354738 - 19355384
Alignment:
Q  21 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccga-agacgattggaggcatgataaatataga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||  |||| ||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  19354738 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaaccttaaacttatctcataataacttgaatggaacaataccaagaga-gattggaggcatgaaaaatatgga 19354836  T
Q  120 atctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggtgttgaatttatcttgcaataatttt 219  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| |     ||||||||||||| ||| ||||||    
T  19354837 atctcttgacctctctagtaataagttttatggtgacattcctcagagcatgtctctcttaacctttttaggttatttgaatttatcttacaacaatttt 19354936  T
Q  220 gatggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtacca 319  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19354937 gacggaaaaatcccaataggaactcaacttcaaagttttaatgcatcaagttacgttggaaatcctaaactatgcggagctcctctcaataattgtacca 19355036  T
Q  320 taacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagttggatttgc 419  Q
      | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19355037 agaaagaagaaaatcctaaaactgcaatgccatctacaaaaaatgaagatgacgactctatcaaagaatcattgtatctaggcatgggagttggatttgc 19355136  T
Q  420 agcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagctctatgtt 519  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  || ||| | |||||||| ||||||||    
T  19355137 agtaggtttctgggggatttgccgttctttgtttctaattagaaaatggaggcatgcatactttcggtttgttgatagagtgcgtgacaagatctatgtt 19355236  T
Q  520 gctttgacggtaaagttaaatagctttcacagaaattgagctcctgcca--gttaaggttagtgaaacctttttca-agttttattagtcaaactataga 616  Q
     ||||||  |||||||||||  | ||| | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||  |||| |||||||||  ||  |||||| |    
T  19355237 actttgatcgtaaagttaaacgggtttaaaagaaattgagctcctgctattgttaaggttagtggaacctacttcatagttttattgatctgactataaa 19355336  T
Q  617 gtatttctttcattacgtaattctaatcaaaacttacatccatttcat 664  Q
    |||||| ||| |||  |||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  19355337 gtatttgttttattttgtaattctatgcaaaacttatatccatttcat 19355384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 21 - 667
Target Start/End: Original strand, 19376645 - 19377289
Alignment:
Q  21 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgataaatatagaa 120  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||   ||||||||| || ||    |||||| ||||||  ||||| |||    
T  19376645 ggaattgtttcaccttgttcaagttcaaacgttaaacttatctcacaataattttgttggaacaataccaaaagatattggatgcatgaagaatatggaa 19376744  T
Q  121 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggtgttgaatttatcttgcaataattttg 220  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||  ||||||||     |||||| |||||| ||| |||||||    
T  19376745 tctcttgacctctctagtaataagttttatggtgaaattcctcagaccatgtctatcttaacctttttgggttatttgaatctatcttacaacaattttg 19376844  T
Q  221 atggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtaccat 320  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  19376845 atggaaaaattccaataggaactcaacttcaaagttttaatgcatcgagttacattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtacc-- 19376942  T
Q  321 aacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagttggatttgca 420  Q
      |||||||| |  |||||| ||||   | |||||||  ||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  19376943 -gcagaagaagaatctaaaaatgcaacacaatctacaaggaatgaggatagtgaatccataagagaatcattgtatctaggcatgggagttggatttgca 19377041  T
Q  421 gcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagctctatgttg 520  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||  |||||||| |||||||||     
T  19377042 gtaggtttctgggggatttgcggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcagtttattaatagagtaggtgacaaactctatgtta 19377141  T
Q  521 ctttgacggtaaagttaaatagctttcacagaaattgagctcctgccagttaaggttagtgaaacctttttca-agttttattagtcaaactatagagta 619  Q
    ||||||  ||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    || |||||||||  ||  | |||| ||||    
T  19377142 ctttgatcgtaaagttaaacaggtttcaaagaaattaagctcctgccagttaaggtcagtgtaacctacaacacagttttattgatctgattataaagta 19377241  T
Q  620 tttctttcattacgtaattctaatcaaaacttacatccatttcatttg 667  Q
    ||| ||| |||  ||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  19377242 tttgttttattttgtaatactatgcaaaacttaaatccatttcatttg 19377289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 23 - 587
Target Start/End: Original strand, 19415209 - 19415773
Alignment:
Q  23 aattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgataaatatagaatc 122  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||  |||||| | ||||| |||||| |||||    
T  19415209 aattatttcgacttgttcaaatacaaacattaaacttatctcacaataatttgactggaacaattcctaagctgattggtgacatgaaaaatatggaatc 19415308  T
Q  123 tctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggtgttgaatttatcttgcaataattttgat 222  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||    || |||||||||| ||| | ||||||     
T  19415309 tctagacctctcaaataataagttctacggtgaaattcctcagagcatgtctttcttaacctttttggattatttaaatttatcttacaacagttttgac 19415408  T
Q  223 ggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtaccataa 322  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19415409 ggaaaaatcccaataggaactcaacttcaaagttttaacgcatcaagttacaacgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtaccatca 19415508  T
Q  323 cagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagttggatttgcagc 422  Q
     |||||||||||||| |||||||  |||||| ||| ||||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||     
T  19415509 aagaagaaaatcctacaactgcaacgccatcaacaaagaatgaagattatgattctatgaaagattcattgtatctaggaatgggagtgggatttgcagt 19415608  T
Q  423 aggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagctctatgttgct 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  || ||| ||  | ||| ||||||||| ||    
T  19415609 aggtttctgggggatttgtggttctatttttcttattagaaaatgcaggcatgcatacttccggtttattgatagagtggccggcaatctctatgttact 19415708  T
Q  523 ttgacggtaaagttaaatagctttcacagaaattgagctcctgccagttaaggttagtgaaacct 587  Q
    |||   ||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |  ||||||||||||| ||||||    
T  19415709 ttggtcgtaaagttaaatagctttcgcagaaactgagctgcagttagttaaggttagttaaacct 19415773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 21 - 622
Target Start/End: Original strand, 19456320 - 19456918
Alignment:
Q  21 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgataaatatagaa 120  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||   ||| || || |||||||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  19456320 ggaattgtttcggtttgttcaggttcaaacattaaacttatctcacaataatttctttggtaccataccgaagacaattggaggtatgaaaaatatggaa 19456419  T
Q  121 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggtgttgaatttatcttgcaataattttg 220  Q
    ||||||||  | || || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||     ||||||||||| | |||||||||||    
T  19456420 tctctcgaattttccaaaaataagttttgtggtgaaattccacagagcatgtctctcttaacctttttgggttatttgaatttatcatacaataattttg 19456519  T
Q  221 atggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtaccat 320  Q
    |  |||||||||| || | ||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19456520 acagaaaaatcccgatagcaacgcaacttcaaagttttaacgcatcgagctacattggaaatccaaaattatgcggagctcctcttaataattgtaccaa 19456619  T
Q  321 aacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagttggatttgca 420  Q
       ||||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||| ||| |||||||| || |||| ||||||| ||| ||| |   |||||||||||||||||    
T  19456620 ggaagaagaaaatcctaagactgcaac-ccatccacagagattgaagatgatgactctataagagaatcaatgtttctcggcttgggagttggatttgca 19456718  T
Q  421 gcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagctctatgttg 520  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||| | |||||||      
T  19456719 gtaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatacttttgggttatatatggagtgggtaacagggtctatgtaa 19456818  T
Q  521 ctttgacggtaaagttaaatagctttcacagaaattgagctcctgccagttaaggttagtgaaacctttttcaagttttattagtcaaactatagagtat 620  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||   |||| ||||| |||  ||||||||||||||||    
T  19456819 ctttgatggtaaagttaaatagctttcgcagaaattgaactcctg-cagtaaaggttagtgaaactgctttc-agtttaattgatcaaactatagagtat 19456916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 21 - 587
Target Start/End: Original strand, 18147853 - 18148407
Alignment:
Q  21 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgataaatatagaa 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||   ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  18147853 ggaattgtttcagcttgttcaagttcaaacattaaacttatctcacaataattttgttggaacaataccgaagacgattggaggcatgaaaaatatgaaa 18147952  T
Q  121 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggt-gttgaatttatcttgcaataatttt 219  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||| ||| |  ||||||||||| |  |||||||||    
T  18147953 tctctcgacctctctaataacaagttttttggtgaaattcctcagggcatgtctctctta-acctttttgagttatttgaatttatcatataataatttt 18148051  T
Q  220 gatggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtacca 319  Q
    || |||| |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18148052 gacggaagaatcccgatcggaacacaacttcaaagttttaatgcatcgagctacattggcaatcctaaactatgcggagctccccttaataattgtacca 18148151  T
Q  320 taacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagttggatttgc 419  Q
        |||||||||||||  || ||            |||||||||| ||||||||||| |||| ||| || |||||| |||  |||||||| ||||||||    
T  18148152 cggaagaagaaaatcctggaaatg------------cagagaatgaagatgatgaatctataagagagtcgttgtatttaggcatgggagtgggatttgc 18148239  T
Q  420 agcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagctctatgtt 519  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |  || ||| ||||||| | |||||||||    
T  18148240 agtaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcgtactttcggttagttgatagagtgggtgactatctctatgtt 18148339  T
Q  520 gctttgacggtaaagttaaatagctttcacagaaattgagctcctgccagttaaggttagtgaaacct 587  Q
     || |||  ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18148340 actgtgatcgtaaagttaaatagctttcgccgaagctgagctcctgctagttaaggttagttaaacct 18148407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 21 - 583
Target Start/End: Original strand, 17950858 - 17951408
Alignment:
Q  21 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgataaatatagaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||    |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  17950858 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattaaacttatctcacaacaattttgtgggaacaataccgaaaacgattggaggcatgaaaaatatggaa 17950957  T
Q  121 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggtgtt-gaatttatcttgcaataatttt 219  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||   ||||||| || | || ||||||||| |  |||||||||    
T  17950958 tctctcgacctctctaataacaagttttttggtgaaattcctcatggtatgtctctcttgacctttttg-agttatttgaatttatcatataataatttt 17951056  T
Q  220 gatggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtacca 319  Q
    ||||||||||||||  | || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  17951057 gatggaaaaatcccggtcggtacacaacttcaaagttttaatgcatcgagctacattggcaatcttaaattatgtggatctcctcttaataattgttcca 17951156  T
Q  320 taacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagttggatttgc 419  Q
        ||||||||||||||||| ||||            ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||    
T  17951157 cggaagaagaaaatcctaaaaatgca------------gagaatgaggatgatgaatctctaaaagaatcattgtaccttggtatgggagtgggatttgc 17951244  T
Q  420 agcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagctctatgtt 519  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||     
T  17951245 agtaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattcgaaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagtgggtaacaggctctatgta 17951344  T
Q  520 gctttgacggtaaagttaaatagctttcacagaaattgagctcctgccagttaaggttagtgaa 583  Q
     |||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||| ||  ||||||||||||    
T  17951345 actttgaaggtaaagttaaatagcttttgcagaagttgagcttctgctagaaaaggttagtgaa 17951408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 21 - 587
Target Start/End: Original strand, 19462215 - 19462769
Alignment:
Q  21 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgataaatatagaa 120  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  19462215 ggaattatttcggcttgttaaagttcaaacattaaacttatctcacaataatttcattggaactataccgaagacgattggaggcatgaaaaatatggaa 19462314  T
Q  121 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggt-gttgaatttatcttgcaataatttt 219  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| | | |  ||||||||||| | ||||||||||    
T  19462315 tctctcgatttttctaataataagctttgtggtgaaattcctcggagcatgtctctctta-acttttttgggttatttgaatttatcatacaataatttt 19462413  T
Q  220 gatggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtacca 319  Q
    || |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  19462414 gacggaaaaatcccaatagcaacgcaacttcaaagttttaatgcatcaagctacattggcaatccaaaattatgcggtgctcctcttaataactgtacca 19462513  T
Q  320 taacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagttggatttgc 419  Q
        |||||||||||||  ||             |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| || |||||| |||  |||||||| ||||||||    
T  19462514 cggaagaagaaaatcctggaa------------atacagagaatgaagatgatgaatctataagagagtcgttgtatttaggcatgggagtgggatttgc 19462601  T
Q  420 agcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagctctatgtt 519  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |  || ||| |||||||   |||||||||    
T  19462602 agtaggtttctggggcatttgtggttctttgtttcttattcggaaatggaggcatgcgtactttcggttagttgatagagtgggtgactttctctatgtt 19462701  T
Q  520 gctttgacggtaaagttaaatagctttcacagaaattgagctcctgccagttaaggttagtgaaacct 587  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  19462702 actttgaccgtaaagttaaatagctttcgcagaaactgagctcctgctagttaaggttagttaaacct 19462769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 21 - 619
Target Start/End: Original strand, 16678233 - 16678827
Alignment:
Q  21 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgataaatatagaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||| ||| | ||||| ||| || ||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  16678233 ggaattgtttcggcttgttcaagtccaaaccttaaacttatctcacaataatttcagtggaaaaataccaaagacgattggtggcatgaaaaatatggaa 16678332  T
Q  121 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggtgttgaatttatcttgcaataattttg 220  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||| ||| |||||||||     |||||||| |||||||| |||||||    
T  16678333 tctctcgacttctctaataataagttttctggtgaaattcctcagagtgcgtctctcttaaactttttgggttatttgaatttgtcttgcaacaattttg 16678432  T
Q  221 atggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtaccat 320  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| || || ||||||      
T  16678433 acggaaaaatcccgataggaactcaacttcaaagttttaatgcatcgagctacattggcaatccaaaattatgcggagctcctctcaaaaactgtacc-- 16678530  T
Q  321 aacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagttggatttgca 420  Q
     ||| |||||||||||||||   ||   ||||||||||| | ||| ||| ||||  |  ||||||||||||||||||| |   |||||||||| |||||     
T  16678531 -acaaaagaaaatcctaaaaacacaacaccatctacagaaagtgaagataatgatactctaaaagaatcattgtatctgggcttgggagttggttttgcg 16678629  T
Q  421 gcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagctctatgttg 520  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||  |||||  |||||| ||| |||||||| |||||      
T  16678630 gtaggtttctggggtatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcacacatactatcaatttattgatggagtgggcgacaagctgtatgtaa 16678729  T
Q  521 ctttgacggtaaagttaaatagctttcacagaaattgagctcctgccagttaaggttagtgaaacctttttcaagttttattagtcaaactatagagta 619  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||   ||| ||||||||||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16678730 ctttgatggtaaagttaaataactttcacagaagttgagttcctaatagtgaaggttagtg-gacctattttaagttttattaatcaaactatagagta 16678827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 21 - 547
Target Start/End: Original strand, 18116991 - 18117505
Alignment:
Q  21 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgataaatatagaa 120  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  18116991 ggaattatttcggcttgttaaagttcaaacattaaacttatctcacaataatttcattggaactataccgaagacgattggaggcatgaaaaatatggaa 18117090  T
Q  121 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggt-gttgaatttatcttgcaataatttt 219  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | | |  ||||||||||| | ||||||||||    
T  18117091 tctctcgatttttctaataataagctttgtggtgaaattcctcagagcatgtctctctta-acttttttgggttatttgaatttatcatacaataatttt 18117189  T
Q  220 gatggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtacca 319  Q
    || |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18117190 gacggaaaaatcccaatagcaacgcaacttcaaagttttaatgcatcaagctacattggcaatccaaaattatgcggcgctcctcttaataactgtacca 18117289  T
Q  320 taacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagttggatttgc 419  Q
        |||||||||||||  ||             |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  18117290 cggaagaagaaaatcctggaa------------atacagagaatgaagatgatgaatctataagagagtcattgtatctaggcatgggagtgggatttgc 18117377  T
Q  420 agcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagctctatgtt 519  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |  || ||| ||||||| | |||||||||    
T  18117378 agtaggtttctgggggatttgtggttctatgtttcttattaggaaatggaggcatgcgtactttcggttagttgatagagtgggtgactatctctatgtt 18117477  T
Q  520 gctttgacggtaaagttaaatagctttc 547  Q
     ||||||  |||||||||||||||||||    
T  18117478 actttgatcgtaaagttaaatagctttc 18117505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 21 - 583
Target Start/End: Original strand, 19400752 - 19401311
Alignment:
Q  21 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgataaatatagaa 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||||||||| || ||   | |||||| ||||| | |||| |||    
T  19400752 ggaattgtttcgacttgttcaagttcaaacgttaaacttatctcacaataatttgattggaacaataccaaaagtggttggagacatgaaacatatggaa 19400851  T
Q  121 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggtgttgaatttatcttgcaataattttg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19400852 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatggctctcttaaactttttagaggttttgaatttatcttgcaataattttg 19400951  T
Q  221 atggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctct---------taataa 311  Q
    | |||| ||||||||| ||| ||||| |||||| |||  || ||||||| |  ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||         ||| ||    
T  19400952 acggaacaatcccaataggatctcaaattcaaacttttgatccatcaagcttcattggaaatccaaagttatgcggagctcctcttaaaaattgtaaaaa 19401051  T
Q  312 ttgtaccataacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagtt 411  Q
    ||||||||    ||||||||||||||||| ||            |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |  ||||||||     
T  19401052 ttgtaccaaggaagaagaaaatcctaaaaatg------------cagagaatgaagatgacgaatctataaaagaatcgttgtaccttggcatgggagtg 19401139  T
Q  412 ggatttgcagcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagc 511  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| ||    
T  19401140 ggatttgcagtaggtttctgggggatttgtggttctttgtttctcattagaaaatggaggcatgcatattttcggttcatatatggagtgggtaacaggc 19401239  T
Q  512 tctatgttgctttgacggtaaagttaaatagctttcacagaaattgagctcctgccagttaaggttagtgaa 583  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||| ||| ||||||||||||    
T  19401240 tctatgtaactttgatggtaaagttaaatagctttcatagaagttgagcttttgctagtaaaggttagtgaa 19401311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 21 - 583
Target Start/End: Original strand, 18109465 - 18110015
Alignment:
Q  21 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgataaatatagaa 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||    |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  18109465 ggaattgtttctgcttgttcaagttcaaacattaaacttatctcacaacaattttgtgggaacaataccgaaaacgattggaggcatgaaaaatatggaa 18109564  T
Q  121 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggtgttgaatttatcttgcaataattttg 220  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||   ||||||||     ||||||||||| |  ||||||||||    
T  18109565 tctctcgacctctctaataacaagttttttggtgaaattccccagggtatgtctctcttgacctttttgggttatttgaatttatcatataataattttg 18109664  T
Q  221 atggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtaccat 320  Q
    |||||||||||||| | || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||     
T  18109665 atggaaaaatcccagtcggtacacaacttcaaagttttaatgcatcgagctacattggcaatccaaaattatgtggatctcctcttaataattgtaccac 18109764  T
Q  321 aacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagttggatttgca 420  Q
       |||||||||| |||||| |            || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||||||    
T  18109765 ggaagaagaaaattctaaaatt------------actgagaatgaggatgatgaatctataaaagaatcattgtaccttggtatgggagtgggatttgca 18109852  T
Q  421 gcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagctctatgttg 520  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||      
T  18109853 gtaggtttctgggggatttgtggttctttgtttgttatcaggaaatggaggcatgcatactttcgttttatatatggagtgggtaacaggctctatgtaa 18109952  T
Q  521 ctttgacggtaaagttaaatagctttcacagaaattgagctcctgccagttaaggttagtgaa 583  Q
    | |||| ||||||||| |||||||||  | ||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  18109953 cattgatggtaaagttgaatagcttttgctgaagttgagcttctgctagtaaaggttagtgaa 18110015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 539
Target Start/End: Original strand, 25464073 - 25464594
Alignment:
Q  21 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgataaatatagaa 120  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||| |||||| |||    
T  25464073 ggaattggttcggctggttcaagttcaaacattaaacttatctcacaataatttcattggaacaataccgaaagagattggaggcatgaaaaatatggaa 25464172  T
Q  121 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggt-gttgaatttatcttgcaataatttt 219  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||| ||  ||| ||| ||||||| ||| |  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  25464173 tctctcgatctttctaataacaagctttgtggtggaattcctcaaagcctggttctcttaaacttttt-gagttatttgaatttatcttacaacaatttt 25464271  T
Q  220 gatggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtacca 319  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||  | |||||||    
T  25464272 gatggaaaaatcccaataggaactcaacttcaaagttttaatgcatcgagctacattggcaatccaaaattatgcggacttcctcttaaagagtgtacca 25464371  T
Q  320 taacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggat---gatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagttggatt 416  Q
     || ||||||||||||||||| ||||   || ||| || ||| ||| |||   ||||| || ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  25464372 caaaagaagaaaatcctaaaaatgcaacaccgtctgcaaagagtgaagataacgatgactctataaaagaatcattgtatctaggcttgggagttggatt 25464471  T
Q  417 tgcagcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagctctat 516  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||| ||||||    
T  25464472 tgcaataggtttctgggggatttgtggttctttgttttttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttattaatggagtgagtgacaaactctat 25464571  T
Q  517 gttgctttgacggtaaagttaaa 539  Q
    ||| ||||||  |||||||||||    
T  25464572 gttactttgatcgtaaagttaaa 25464594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 21 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 14895367 - 14894801
Alignment:
Q  21 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgataaatatagaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||||||||| || ||    |||||| ||||||  ||||| |||    
T  14895367 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacgttaaacttatctcacaataatttgattggaacaataccaaaagatattggacgcatgaagaatatggaa 14895268  T
Q  121 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggtgttgaatttatcttgcaataattttg 220  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||   |||||||     ||||||||||||| ||| |||||||    
T  14895267 tctcttgacctctctagtaataagttttatggtgaaattccgcagagcatgtctctcttaacatttttgggttatttgaatttatcttacaacaattttg 14895168  T
Q  221 atggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtaccat 320  Q
    | |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||     
T  14895167 acggaaaaattccaacaggaactcaacttcaaagttttaatgaatcgagctacattggaaatcctaaactatgcggagctcctgtaaccaattgtaccac 14895068  T
Q  321 aacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagttggatttgca 420  Q
    |  ||||||||||||||| |||| |  ||| | |||| ||| ||| || || || || |||| ||||||| ||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  14895067 agaagaagaaaatcctaacactgaaaagccttttacacagattgaagacgaggactctataagagaatcaatgtatcttggcatgggaattggatttgca 14894968  T
Q  421 gcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagctctatgttg 520  Q
    | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||     
T  14894967 gtaggtttttgggggatttctggttctttgtttcttattagaaaatggaggcatgcatactttcggtttattgatggagtaggtgacaagctctatgtta 14894868  T
Q  521 ctttgacggtaaagttaaatagctttcacagaaattgagctcctgccagttaaggttagtgaaacct 587  Q
    ||||||    ||||||||| | ||||   | |||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  14894867 ctttgatcccaaagttaaacaactttggaaaaaattgagctccggctagttaaggttagtgtaacct 14894801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 547
Target Start/End: Original strand, 19437981 - 19438495
Alignment:
Q  21 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgataaatatagaa 120  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||   ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  19437981 ggaattttttcagcttgttcaagttcaaacgttaaacttatctcacaataattttgttggaacaataccgaagacgattagaggcatgaaaaatatggaa 19438080  T
Q  121 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggtgttgaatttatcttgcaataattttg 220  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||||||||    ||||||||||| |  ||||||||||    
T  19438081 tctctcgatctatctaataacaagttttttggtgaaattcctcaaggcatgtctctcttaacctttttggattatttgaatttatcatataataattttg 19438180  T
Q  221 atggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtaccat 320  Q
    | |||| |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  19438181 acggaagaatcccgatcggaacgcaacttcaaagttttaatgcatcgagctacattggcaatcctaaattatgtggagttcctcttaataattgtaccac 19438280  T
Q  321 aacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagttggatttgca 420  Q
       ||||||||||||||||| ||            |||||||||| ||||||||||| |||| ||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  19438281 ggaagaagaaaatcctaaaaatg------------cagagaatgaagatgatgaatctataagagagtcgttgtatctaggcatgggagttggatttgca 19438368  T
Q  421 gcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagctctatgttg 520  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |  ||  || | ||||| | || ||||||     
T  19438369 gtaggtttttgggggatttgtggttctatgtttcttattaggaaatggaggcatgcgtactttcggttagttgatacagtgtgtgactatctttatgtta 19438468  T
Q  521 ctttgacggtaaagttaaatagctttc 547  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||    
T  19438469 ctttgatagtaaagttaaatagctttc 19438495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 196 - 580
Target Start/End: Original strand, 18104706 - 18105078
Alignment:
Q  196 ttgaatttatcttgcaataattttgatggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcg 295  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| |||| |||||| |  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  18104706 ttgaatttatcatataataattttgacggaagaatcccgaccggaacacaacttcaaagttttaatgcatcaagctacattggcaatcctaaactatgcg 18104805  T
Q  296 gagctcctcttaataattgtaccataacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgta 395  Q
    |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||  || ||||            ||||||||  |||||||||| |||| ||| || |||||    
T  18104806 gagctcctcttaataactgtaccaggaaagaagaaaatcctggaaatgca------------gagaatgaaaatgatgaatctataagagagtcgttgta 18104893  T
Q  396 tctagtaatgggagttggatttgcagcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatat 495  Q
    | |||  |||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||    
T  18104894 tttaggcatgggagtgggatttgcagtaggattcttggggattttcggttctatgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggttagttaat 18104993  T
Q  496 ggagcgggtgacaagctctatgttgctttgacggtaaagttaaatagctttcacagaaattgagctcctgccagttaaggttagt 580  Q
     ||| ||||||| | ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  18104994 agagtgggtgactatctctatgttactttgatcgtaaagttaaatagctttcgccgaaactgagctcctgctagttaaggttagt 18105078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 165
Target Start/End: Original strand, 18104369 - 18104513
Alignment:
Q  21 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgataaatatagaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  18104369 ggaattgtttcggcttgttcaacttcaaacattgaacttatctcacaataattttattggaacaataccgaagacgattggaagcatgaaaaatatggaa 18104468  T
Q  121 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcag 165  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18104469 tctctcgacctctctaataacaagttttttggtgaaattcctcag 18104513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 403 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 24493375 - 24493200
Alignment:
Q  403 atgggagttggatttgcagcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgg 502  Q
    ||||||||||| |||| || |||||| |||  ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||  |||||| ||    
T  24493375 atgggagttgggtttggagtaggtttttggttgatgtgtggtcctttatttcttattaggaaatggaggcacgcgtactaccggtttatcgatggagtgg 24493276  T
Q  503 gtgacaagctctatgttgctttgacggtaaagttaaatagctttcacagaaattgagctcctgccagttaaggttagt 580  Q
    |||||| | |||||||  |||||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  24493275 gtgacaggatctatgtaactttgatggtgaagtt--atagctttcacagaaaatgagttcctgctagttaaggttagt 24493200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 746 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 18872113 - 18872060
Alignment:
Q  746 taattgtatgagatgagatcatatgtgattgtaacactgttgcttctgaattca 799  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18872113 taattgtatgagatgagatcttatgtgattgtaacactgttgcttctgaattca 18872060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 744 - 797
Target Start/End: Original strand, 19394923 - 19394976
Alignment:
Q  744 aataattgtatgagatgagatcatatgtgattgtaacactgttgcttctgaatt 797  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19394923 aataattgtatgagatgagatcatatgtgattgtaacactgttgtttctgaatt 19394976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 744 - 799
Target Start/End: Original strand, 19382669 - 19382724
Alignment:
Q  744 aataattgtatgagatgagatcatatgtgattgtaacactgttgcttctgaattca 799  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19382669 aataattgtatgagatgagatcatatgtgattgtaatactgttgtttctgaattca 19382724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 403 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 24496815 - 24496648
Alignment:
Q  403 atgggagttggatttgcagcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgg 502  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||  |||          
T  24496815 atgggagttggatttggaataggtttctggttgatctgtggtcctttgtttcgtattaggaaatgg-ggcatacatactatcagtttatcgatg------ 24496723  T
Q  503 gtgacaagctctatgttgctttgacggtaaagttaaatagctttcacagaaattgagctcctgccagttaaggttagt 580  Q
       |||||||||||||  |||||| |||||| |||||||  ||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24496722 ---acaagctctatgtaactttgatggtaaatttaaataattttcactaaaattgagctcctgctggttaaggttagt 24496648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 642 - 697
Target Start/End: Original strand, 19439803 - 19439858
Alignment:
Q  642 atcaaaacttacatccatttcatttgttttgtattttatcaggtgattatgcttgt 697  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||    
T  19439803 atcaaaacttacatccatttcatttgtttcatattttattaggggattatgcttgt 19439858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 749 - 799
Target Start/End: Original strand, 19439938 - 19439991
Alignment:
Q  749 ttgtatgagatgagatcatatgtg---attgtaacactgttgcttctgaattca 799  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19439938 ttgtatgagatgagatcatatgtgattattgtaacactattgcttctgaattca 19439991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 749 - 799
Target Start/End: Original strand, 25464874 - 25464924
Alignment:
Q  749 ttgtatgagatgagatcatatgtgattgtaacactgttgcttctgaattca 799  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||    
T  25464874 ttgtatgagatgatatcatatgtcattgtaccaatgttgctgctgaattca 25464924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 21 - 583
Target Start/End: Original strand, 8460589 - 8461151
Alignment:
Q  21 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgataaatatagaa 120  Q
    |||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||| | |||| |||    
T  8460589 ggaattatttcatcttgtccaagttcaaacattgaacttatctcacaataatttgattggaacaatacccaagatgattggaggcatgaaatatatggaa 8460688  T
Q  121 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggtgttgaatttatcttgcaataattttg 220  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8460689 tcactcgacctctctaataataagttttgtggtgaaattcctcagagcatggctctcttaaactttttagaggttttgaatttatcttgcaataattttg 8460788  T
Q  221 atggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtaccat 320  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||     
T  8460789 acggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagttttaatgcatcgagctacattggaaatcctaaactgtgcggagctcctcttagtagttgtaccac 8460888  T
Q  321 aacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagttggatttgca 420  Q
     | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  8460889 gaaagaagaaaatcctaaaactgcaatgccgtctacagagaatgaagatgatgactctataagagaatcattgtatcttggcatgggagttggatttgca 8460988  T
Q  421 gcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagctctatgttg 520  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||  |||||||||||||||||       
T  8460989 gtgggtttttgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactatcgatttattgatggaatgggtgacaagctctatggaa 8461088  T
Q  521 ctttgacggtaaagttaaatagctttcacagaaattgagctcctgccagttaaggttagtgaa 583  Q
     ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  8461089 ttttgatggtaaagttaattagatttcgcagaaattgagctcctgctagcaaaggttagtgaa 8461151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 749 - 796
Target Start/End: Original strand, 8461395 - 8461442
Alignment:
Q  749 ttgtatgagatgagatcatatgtgattgtaacactgttgcttctgaat 796  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||    
T  8461395 ttgtatgagatgagatcatttgtgattgtatcactgtttctgctgaat 8461442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 2)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 21 - 587
Target Start/End: Original strand, 15536556 - 15537122
Alignment:
Q  21 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgataaatatagaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||   ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  15536556 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacgttaaacttatctcacaataattttgttggaacaataccaaagacgattggcggcatgataaacatggaa 15536655  T
Q  121 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggtgttgaatttatcttgcaataattttg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | | |||  ||||||||     |||||||||||||||||||||||      
T  15536656 tctctcgatctctctaataataagttttatggtgaaattcctcaaaacatgtttgtcttaacctttttgggttatttgaatttatcttgcaataatttca 15536755  T
Q  221 atggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtaccat 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||     
T  15536756 atggaaaaatcccaattggaacacaacttcaaagttttaatgcatcgagttacattgagaatcctaaactgtgtggagctcctctcaataattgtaccaa 15536855  T
Q  321 aacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagttggatttgca 420  Q
     | |||||||||||| ||||| |||   ||||| ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||     
T  15536856 gaaagaagaaaatcccaaaaccgcaacaccatccacagagaatgaagatgatgactctaacaaagaatcattgtatctagggatgggagttggatttgcg 15536955  T
Q  421 gcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagctctatgttg 520  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||  ||||||||| ||||||||     
T  15536956 gtaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattagaaaatggaggcatgcatactttcggtttactgataaagtaggtgacaagatctatgtta 15537055  T
Q  521 ctttgacggtaaagttaaatagctttcacagaaattgagctcctgccagttaaggttagtgaaacct 587  Q
    ||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  15537056 ctttgatcgtaaagttaaacatgtttcacagaaattgagctcctgctagttaaggtcagtggaacct 15537122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 21 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 2709550 - 2708988
Alignment:
Q  21 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgataaatatagaa 120  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||| ||| || |||    
T  2709550 ggaattatttcaacttgttcaagttcaatcattgaacttatctcacaataatttgactggaacaatacccaagatgattggagacatgaaaaacatggaa 2709451  T
Q  121 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggtgttgaatttatcttgcaataattttg 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |  ||  || ||| ||||| || |||||||||||||||||||||     
T  2709450 tctctcgatctctctaacaataaattttttggtgaaattcctcagagcatggctatcataacctatttagaggttttaaatttatcttgcaataatttta 2709351  T
Q  221 atggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtaccat 320  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||| ||  || ||||||||||||||||||| || |||||       
T  2709350 atggaaaaatcccaatagggactcaacttcagagttttaatgcttcgagctacattgggaacccacaattatgcggagctcctcttaaaaactgtactgc 2709251  T
Q  321 aacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagttggatttgca 420  Q
    |  ||||||||||| |||||  ||| ||||||||| ||  || || || || ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2709250 agaagaagaaaatcataaaaaggcaatgccatctagaggaaaagaagacgacgaatctataagagaatcattgtatctaggcatgggagttggatttgca 2709151  T
Q  421 gcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagctctatgttg 520  Q
    | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||      
T  2709150 gtaggtttttgggggatttgtggtcctttgtttcttattaggaaatggaggaacacatactatcggtttattgatggagtaggtgacaagctctatgtaa 2709051  T
Q  521 ctttgacggtaaagttaaatagctttcacagaaattgagctcctgccagttaaggttagtgaa 583  Q
    |||||| | |||||||||| | |||||| |||||| ||||| || | ||||||||||||||||    
T  2709050 ctttgatgataaagttaaacaactttcatagaaatcgagcttctacaagttaaggttagtgaa 2708988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 21 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 13665927 - 13665366
Alignment:
Q  21 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgataaatatagaa 120  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||   |   ||||||| ||||| |  ||| |||    
T  13665927 ggaattatttcagcttgttcaagttcaaacattgaacttatctcacaataatttgactggaacaatacccctgctaattggagacatgaaacttatggaa 13665828  T
Q  121 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggtg--ttgaatttatcttgcaataattt 218  Q
    ||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  |||||||||      ||||||||||||  ||| |||||    
T  13665827 tctttggacttctctaataataagttttttggtgaaattcctcggagcatgtctatcttaacctttttggaatatatttgaatttatctcacaacaattt 13665728  T
Q  219 tgatggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtacc 318  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  13665727 tgacggaaaaatccctataggaactcaacttcaaagttttaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactttgtggagctcctcttaataattgtacc 13665628  T
Q  319 ataacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagttggatttg 418  Q
    || | |||||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||| ||||| || || ||||||||||||||| | || |  ||||| ||||||||||    
T  13665627 atgaaagaagaaaatcctagaactgcaacaccatctacaaagaatgaagatgacgactctataaaagaatcattgaaccttggcatgggggttggatttg 13665528  T
Q  419 cagcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagctctatgt 518  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  || ||| ||| ||||| |||||| |    
T  13665527 cagcaggtttctgggggatatgtggttctttgtttcttattagaaaatggaggcatgcatgctttcggttttttgatagagtgggcgacaatctctatat 13665428  T
Q  519 tgctttgacggtaaagttaaatagctttcacagaaattgagctcctgccagttaaggttagt 580  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||  |||||||||||||    
T  13665427 tactttgatggtaaagttaaatagctttcgcaggaactgagctgctgttagttaaggttagt 13665366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0274 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold0274
Description:

Target: scaffold0274; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 21 - 552
Target Start/End: Original strand, 21608 - 22140
Alignment:
Q  21 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgataaatatagaa 120  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  21608 ggaattatttcgtcttgttcaagttcaaacattaaatttatctcacaatcattttactggaacaataccaaagacgattggaggcatgaaaaatatggag 21707  T
Q  121 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggtgttgaatttatcttgcaataattttg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||     ||||| ||||||||||| ||||||     
T  21708 tctctcgatctctctaataataagttttgtggtgaaattcctcggagcatgtctcacttaaactttttgggttatttgaacttatcttgcaacaatttta 21807  T
Q  221 atggaaaaatcccaattgga-actcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtacca 319  Q
    | ||||  || |||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||  || |||||||| |||||||||| || | |||||    
T  21808 acggaactataccaaatggggactcaacttcaaagttttaatgcatcgagctatattgccaatccagaattatgcggaactcctcttaaaaactatacca 21907  T
Q  320 taacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagttggatttgc 419  Q
     |  ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||| ||   |||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  21908 cagaagaagaaaatcctaaaactgcaaagccatatacagagaatgaagatgatgactctgcaaaagagtcattgtatcttggcatgggggttggatttgc 22007  T
Q  420 agcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagctctatgtt 519  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||  || ||| |||||||||||||||||||    
T  22008 agttggtttctgggggatttttggttctttgtttctcattacaaaatggaggcatgcatactatcggtttattgatagagtgggtgacaagctctatgtt 22107  T
Q  520 gctttgacggtaaagttaaatagctttcacaga 552  Q
     ||| ||  ||||||||||| | |||| |||||    
T  22108 acttcgattgtaaagttaaacaactttgacaga 22140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0274; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 2547 - 2016
Alignment:
Q  21 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgataaatatagaa 120  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  2547 ggaattatttcgtcttgttcaagttcaaacattaaatttatctcacaatcattttactggaacaataccaaagacgattggaggcatgaaaaatatggag 2448  T
Q  121 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggtgtt-gaatttatcttgcaataatttt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| |||| ||||   | || ||| ||||||||||| ||||||    
T  2447 tctctcgatctctctaataataagttttgtggtgaaattcctcggagcatgtctcacttaaacttcttgggtttatttgaacttatcttgcaacaatttt 2348  T
Q  220 gatggaaaaatcccaattgga-actcaacttcaaagtttg-aatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtac 317  Q
     | ||||  || |||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| || |||||||  |||||  || |||||||| |||||||||| || |||||    
T  2347 aacggaactataccaaatggggactcaacttcaaagtttttaatgcatcgagctatattgccaatccagaattatgcggaactcctcttaaaaactgtac 2248  T
Q  318 cataacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagttggattt 417  Q
    ||   ||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||| |||||||| ||   |||||| ||||||||||| |  |||||  ||||||||    
T  2247 ca---cagaagaaaatcctataactgcaaagccatatacagagaatgaagatgatgactctgcaaaagagtcattgtatcttggcatggggattggattt 2151  T
Q  418 gcagcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagctctatg 517  Q
    ||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||  || ||| |||||||||||||||||    
T  2150 gcagttggtttctgggggattttcggttctttgtttctcattacaaaatggaggcatgcatactatcggtttattgatagagtgggtgacaagctctatg 2051  T
Q  518 ttgctttgacggtaaagttaaatagctttcacaga 552  Q
    || ||| ||  ||||||||||| | |||| |||||    
T  2050 ttacttcgattgtaaagttaaacaactttgacaga 2016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0271 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0271
Description:

Target: scaffold0271; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 21 - 552
Target Start/End: Original strand, 11524 - 12055
Alignment:
Q  21 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgataaatatagaa 120  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| ||     
T  11524 ggaattatttcgtcttgttcaagttcaaacattaaatttatctcacaatcattttactggaacaataccaaagaagattggaggcatgaaaaatatggag 11623  T
Q  121 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggtgttgaatttatcttgcaataattttg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||     ||||| ||||||||||| ||||||     
T  11624 tctctcgatctctctaataataagttttgtggtgaaattcctcagagcatgtctcacttaaacttcttgggttatttgaacttatcttgcaacaatttta 11723  T
Q  221 atggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtaccat 320  Q
    | ||||  || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||  || ||||| || |||||||||| |  |||||||     
T  11724 acggaactataccaatggggactcaacttcaaagttttaatgcatcgagctatattgccaatccagaattatgcagaactcctcttaaaagctgtaccac 11823  T
Q  321 aacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagttggatttgca 420  Q
    || ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||| ||   |||||| ||||||||||| |  |||||  |||||||||||    
T  11824 aaaagaagaaaatcctaaaactgcaaagccatatacagagaatgaagatgatgactctgcaaaagagtcattgtatcttggcatggggattggatttgca 11923  T
Q  421 gcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagctctatgttg 520  Q
    |  ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||  || ||| |||||||||||||||||||     
T  11924 gttggtttctgggggattttcggttctttgtttctcattacaaaatggaggcatgcatactatcggtttattgatagagtgggtgacaagctctatgtta 12023  T
Q  521 ctttgacggtaaagttaaatagctttcacaga 552  Q
    ||| ||  ||||||||||| | |||| |||||    
T  12024 cttcgattgtaaagttaaacaactttgacaga 12055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0648 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0648
Description:

Target: scaffold0648; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 3078 - 2545
Alignment:
Q  21 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgataaatatagaa 120  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  3078 ggaattatttcgtcttgttcaagttcaaacattaaatttatctcacaatcattttactggaacaataccaaagacgattggaggcatgaaaaatatggag 2979  T
Q  121 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggtgttgaatttatcttgcaataattttg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||     ||||| ||||||||||| ||||||     
T  2978 tctctcgatctctctaataataagttttgtggtgaaattcctcggagcatgtctcacttaaactttttgggttatttgaacttatcttgcaacaatttta 2879  T
Q  221 atggaaaaat-cccaattggaactcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtacca 319  Q
    | ||||  || || ||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||  || |||||||| |||||||||| || | |||||    
T  2878 acggaactataccaaatggggactcaacttcaaagttttaatgcatcgagctatattgccaatccagaattatgcggaactcctcttaaaaactatacca 2779  T
Q  320 taacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagttggatttgc 419  Q
     |  ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||| ||   |||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  2778 cagaagaagaaaatcctaaaactgcaaagccatatacagagaatgaagatgatgactctgcaaaagagtcattgtatcttggcatgggggttggatttgc 2679  T
Q  420 agcaggtttctggggg-atttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagctctatgt 518  Q
    ||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||  || ||| ||||||||||||||||||    
T  2678 agttggtttctgggggtatttttggttctttgtttctcattacaaaatggaggcatgcatactatcggtttattgatagagtgggtgacaagctctatgt 2579  T
Q  519 tgctttgacggtaaagttaaatagctttcacaga 552  Q
    | ||| ||  ||||||||||| | |||| |||||    
T  2578 tacttcgattgtaaagttaaacaactttgacaga 2545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0640 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0640
Description:

Target: scaffold0640; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 552
Target Start/End: Original strand, 6429 - 6957
Alignment:
Q  21 ggaattgtttcggcttgttcaagttcaaacattgaacttatcttacaatagtttgactggaacaattccgaagacgattggaggcatgataaatatagaa 120  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| ||     
T  6429 ggaattatttcgtcttgttcaagttcaaacattaaatttatctcacaatcattttactggaacaataccaaagatgattggaggcatgaaaaatatggag 6528  T
Q  121 tctctcgatctctctaataataagttttttggtgaaattcctcagagcatgtctctgttacactttttggaggtgttgaatttatcttgcaataattttg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||     ||||| ||||||||||| ||||||     
T  6529 tctctcgatctctctaataataagttttgtggtgaaattcctcagagcatgtctcacttaaacttcttgggttatttgaacttatcttgcaacaatttta 6628  T
Q  221 atggaaaaatcccaattggaactcaacttcaaagtttgaatgcatcaagttatattgggaatcctaaactatgcggagctcctcttaataattgtaccat 320  Q
    | ||||  || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||  || |||||||| |||||||||| || |||||||     
T  6629 acggaactataccaatggggactcaacttcaaagttttaatgcatcgagctatattgccaatccagaattatgcggaactcctcttaaaaactgtacca- 6727  T
Q  321 aacagaagaaaatcctaaaactgcactgccatctacagagaatgaggatgatgaatcgataaaagaatcattgtatctagtaatgggagttggatttgca 420  Q
      ||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||| |||||||| ||   |||||| ||||||||||| |  |||||  |||||||||||    
T  6728 --cagaagaaaatcctataactgcaaagccatatacagagaatgaagatgatgactctgcaaaagagtcattgtatcttggcatggggattggatttgca 6825  T
Q  421 gcaggtttctgggggatttgtggttctttgtttcttattaggaaatggaggcatgcatactttcggtttatatatggagcgggtgacaagctctatgttg 520  Q
    |  ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||  || ||| |||||||||||||||||||     
T  6826 gttggtttctgggggattttcggttctttgtttctcattacaaaatggaggcatgcatactatcggtttattgatagagtgggtgacaagctctatgtta 6925  T
Q  521 ctttgacggtaaagttaaatagctttcacaga 552  Q
    ||| ||  ||||||||||| | |||| |||||    
T  6926 cttcgattgtaaagttaaacaactttgacaga 6957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University