View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21167_low_7 (Length: 437)

Name: NF21167_low_7
Description: NF21167
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21167_low_7
NF21167_low_7
[»] chr4 (64 HSPs)
chr4 (210-423)||(27581260-27581473)
chr4 (13-210)||(2481408-2481605)
chr4 (13-211)||(45424534-45424732)
chr4 (13-214)||(54189537-54189738)
chr4 (13-209)||(19913630-19913826)
chr4 (15-209)||(38055154-38055348)
chr4 (13-210)||(28032712-28032909)
chr4 (13-210)||(50055101-50055298)
chr4 (17-209)||(23776463-23776655)
chr4 (13-210)||(15241028-15241225)
chr4 (13-210)||(37464717-37464914)
chr4 (13-210)||(53717464-53717661)
chr4 (16-207)||(1756767-1756958)
chr4 (5-208)||(11639570-11639773)
chr4 (13-211)||(20877042-20877240)
chr4 (13-211)||(50353796-50353994)
chr4 (13-210)||(15669179-15669376)
chr4 (13-210)||(27488648-27488845)
chr4 (13-205)||(16700782-16700974)
chr4 (13-211)||(14987787-14987985)
chr4 (5-211)||(23704201-23704407)
chr4 (13-211)||(44784917-44785115)
chr4 (13-210)||(6611360-6611557)
chr4 (13-209)||(6688627-6688817)
chr4 (13-197)||(33703850-33704034)
chr4 (13-208)||(40428720-40428915)
chr4 (13-215)||(43289960-43290162)
chr4 (13-207)||(54412627-54412821)
chr4 (13-206)||(1617084-1617277)
chr4 (13-206)||(31969681-31969874)
chr4 (13-206)||(35490773-35490966)
chr4 (13-210)||(48909842-48910039)
chr4 (13-208)||(47632032-47632228)
chr4 (13-211)||(8932178-8932376)
chr4 (13-211)||(30423565-30423762)
chr4 (13-214)||(37968757-37968958)
chr4 (13-206)||(52139203-52139396)
chr4 (13-205)||(53875658-53875850)
chr4 (13-206)||(8591092-8591285)
chr4 (13-205)||(19164973-19165164)
chr4 (5-210)||(55344817-55345022)
chr4 (13-210)||(44379187-44379384)
chr4 (13-210)||(27536104-27536297)
chr4 (13-211)||(53353050-53353256)
chr4 (13-202)||(27583632-27583821)
chr4 (13-205)||(30171581-30171773)
chr4 (17-197)||(38071327-38071504)
chr4 (35-203)||(28360433-28360602)
chr4 (16-202)||(40680041-40680227)
chr4 (13-207)||(44375844-44376038)
chr4 (57-210)||(50053439-50053592)
chr4 (13-210)||(16703821-16704014)
chr4 (13-129)||(23269046-23269162)
chr4 (121-211)||(23265865-23265955)
chr4 (57-211)||(44548185-44548340)
chr4 (13-88)||(53408137-53408213)
chr4 (58-140)||(51780763-51780845)
chr4 (13-64)||(23261886-23261937)
chr4 (13-104)||(9595902-9595982)
chr4 (153-210)||(9595975-9596031)
chr4 (13-50)||(50055301-50055338)
chr4 (57-199)||(17493340-17493482)
chr4 (13-67)||(48748197-48748251)
chr4 (62-118)||(55344724-55344780)
[»] chr1 (48 HSPs)
chr1 (13-209)||(52696788-52696984)
chr1 (13-210)||(25897370-25897567)
chr1 (5-210)||(1168499-1168704)
chr1 (13-210)||(26580282-26580479)
chr1 (13-210)||(1170456-1170653)
chr1 (13-210)||(39260358-39260555)
chr1 (13-210)||(52753159-52753356)
chr1 (13-205)||(8120870-8121062)
chr1 (13-209)||(42370807-42371003)
chr1 (13-211)||(16052091-16052289)
chr1 (13-211)||(20089466-20089664)
chr1 (13-207)||(26663257-26663451)
chr1 (13-203)||(29078519-29078709)
chr1 (13-210)||(29288145-29288340)
chr1 (13-207)||(5215384-5215578)
chr1 (13-210)||(1940759-1940956)
chr1 (5-206)||(8079713-8079914)
chr1 (13-210)||(33510480-33510677)
chr1 (13-206)||(46760966-46761159)
chr1 (15-203)||(38829072-38829260)
chr1 (17-209)||(40092488-40092680)
chr1 (13-209)||(970536-970734)
chr1 (13-209)||(12682817-12683013)
chr1 (13-210)||(17591687-17591881)
chr1 (13-211)||(32671574-32671772)
chr1 (13-211)||(43905649-43905847)
chr1 (17-210)||(41928511-41928704)
chr1 (13-190)||(17587517-17587694)
chr1 (13-206)||(19715173-19715366)
chr1 (13-211)||(46409430-46409630)
chr1 (13-211)||(7145202-7145400)
chr1 (13-210)||(2347652-2347850)
chr1 (17-209)||(15203109-15203301)
chr1 (13-209)||(51359229-51359424)
chr1 (16-211)||(13996738-13996933)
chr1 (13-204)||(15717787-15717977)
chr1 (13-206)||(2473722-2473915)
chr1 (16-209)||(23498457-23498650)
chr1 (19-211)||(49146167-49146359)
chr1 (13-210)||(15554164-15554353)
chr1 (13-207)||(6765458-6765652)
chr1 (13-172)||(40149497-40149656)
chr1 (40-208)||(29695673-29695842)
chr1 (13-211)||(38171827-38172012)
chr1 (77-210)||(52086263-52086396)
chr1 (58-192)||(23322897-23323031)
chr1 (135-211)||(5675100-5675176)
chr1 (57-210)||(5217840-5217992)
[»] chr3 (41 HSPs)
chr3 (13-210)||(22174988-22175185)
chr3 (13-210)||(15520629-15520826)
chr3 (13-210)||(50528922-50529119)
chr3 (13-208)||(20699144-20699339)
chr3 (16-203)||(44609334-44609521)
chr3 (13-211)||(20842346-20842544)
chr3 (13-210)||(37698141-37698338)
chr3 (16-211)||(42307906-42308101)
chr3 (17-209)||(25999382-25999574)
chr3 (16-211)||(15520143-15520338)
chr3 (16-207)||(38856089-38856280)
chr3 (13-203)||(21581042-21581232)
chr3 (13-209)||(25494283-25494479)
chr3 (13-211)||(8042599-8042797)
chr3 (13-210)||(29445481-29445678)
chr3 (13-211)||(32244112-32244310)
chr3 (13-210)||(35226440-35226637)
chr3 (13-210)||(38933939-38934135)
chr3 (13-210)||(46452160-46452357)
chr3 (13-210)||(54870172-54870369)
chr3 (16-211)||(12117659-12117854)
chr3 (13-210)||(24835697-24835894)
chr3 (13-210)||(54534326-54534521)
chr3 (13-209)||(2895179-2895379)
chr3 (13-199)||(42104969-42105155)
chr3 (13-211)||(32359251-32359449)
chr3 (11-210)||(34700334-34700533)
chr3 (19-209)||(26122808-26122998)
chr3 (13-210)||(53028218-53028407)
chr3 (55-208)||(35643212-35643365)
chr3 (13-182)||(44688782-44688950)
chr3 (14-170)||(16354379-16354535)
chr3 (69-203)||(50529827-50529961)
chr3 (13-203)||(48925001-48925189)
chr3 (75-211)||(49128041-49128177)
chr3 (13-180)||(12915930-12916096)
chr3 (13-89)||(24366143-24366219)
chr3 (5-82)||(13696914-13696991)
chr3 (153-211)||(24366084-24366142)
chr3 (16-49)||(50528883-50528916)
chr3 (176-206)||(40240485-40240515)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (13-211)||(15655908-15656106)
chr7 (13-211)||(43067975-43068173)
chr7 (13-209)||(33359092-33359288)
chr7 (13-212)||(30181026-30181225)
chr7 (13-214)||(12101180-12101381)
chr7 (13-210)||(24792334-24792531)
chr7 (13-208)||(20346487-20346682)
chr7 (13-205)||(42673467-42673655)
chr7 (13-211)||(3511319-3511517)
chr7 (13-211)||(42964998-42965196)
chr7 (16-207)||(7164184-7164375)
chr7 (13-211)||(42204150-42204349)
chr7 (18-211)||(4347269-4347462)
chr7 (16-209)||(22649699-22649892)
chr7 (13-204)||(1803029-1803220)
chr7 (13-211)||(5280856-5281054)
chr7 (13-211)||(933281-933479)
chr7 (13-211)||(36890832-36891029)
chr7 (13-210)||(33846531-33846723)
chr7 (13-205)||(4477323-4477515)
chr7 (13-209)||(25748485-25748681)
chr7 (13-211)||(6394747-6394945)
chr7 (13-206)||(9452591-9452784)
chr7 (13-209)||(12097592-12097788)
chr7 (17-210)||(32041539-32041732)
chr7 (13-202)||(43156718-43156907)
chr7 (13-204)||(38866547-38866738)
chr7 (20-208)||(8630665-8630853)
chr7 (13-207)||(17753600-17753794)
chr7 (16-207)||(46134309-46134500)
chr7 (13-206)||(46891341-46891535)
chr7 (13-172)||(48865665-48865827)
chr7 (13-211)||(16894509-16894697)
chr7 (62-211)||(19828266-19828415)
chr7 (13-211)||(43021582-43021776)
chr7 (113-211)||(37704976-37705074)
chr7 (57-211)||(43405016-43405170)
chr7 (57-211)||(37005857-37006011)
chr7 (64-209)||(36849590-36849735)
chr7 (57-211)||(15655458-15655612)
chr7 (73-202)||(20163824-20163953)
chr7 (57-209)||(30075277-30075426)
chr7 (120-191)||(27691435-27691506)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (16-210)||(16307023-16307217)
chr6 (13-211)||(3347535-3347733)
chr6 (13-209)||(26946888-26947084)
chr6 (13-211)||(18613535-18613733)
chr6 (13-210)||(2837543-2837740)
chr6 (13-210)||(6086611-6086808)
chr6 (13-209)||(30691850-30692046)
chr6 (13-210)||(21893453-21893650)
chr6 (13-209)||(26704351-26704547)
chr6 (17-207)||(3955782-3955972)
chr6 (13-206)||(17261085-17261278)
chr6 (13-209)||(9459562-9459758)
chr6 (13-205)||(34887304-34887496)
chr6 (13-209)||(20726790-20726982)
chr6 (13-210)||(11167238-11167435)
chr6 (13-206)||(28199520-28199714)
chr6 (13-198)||(1153603-1153788)
chr6 (22-210)||(35198282-35198469)
chr6 (45-210)||(52834-52999)
chr6 (13-204)||(30698941-30699132)
chr6 (13-138)||(33464399-33464524)
chr6 (13-111)||(53005-53103)
chr6 (130-212)||(33463697-33463779)
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (17-211)||(9008073-9008267)
chr5 (13-211)||(16069351-16069549)
chr5 (13-210)||(1579035-1579232)
chr5 (13-210)||(1605583-1605780)
chr5 (13-210)||(27679181-27679378)
chr5 (13-211)||(33491208-33491406)
chr5 (16-211)||(27420856-27421051)
chr5 (13-203)||(3386498-3386688)
chr5 (13-211)||(24105683-24105881)
chr5 (13-204)||(16737459-16737650)
chr5 (5-211)||(4120935-4121141)
chr5 (13-211)||(31883142-31883340)
chr5 (16-211)||(35782659-35782854)
chr5 (16-210)||(33991139-33991333)
chr5 (13-202)||(1165613-1165802)
chr5 (13-210)||(8374351-8374547)
chr5 (13-211)||(3921579-3921777)
chr5 (13-211)||(19358524-19358722)
chr5 (17-209)||(5202972-5203164)
chr5 (13-211)||(20992158-20992356)
chr5 (17-210)||(38598466-38598659)
chr5 (13-209)||(31410476-31410672)
chr5 (16-172)||(26602957-26603113)
chr5 (13-164)||(27025001-27025152)
chr5 (74-211)||(20992354-20992495)
chr5 (68-201)||(33284642-33284775)
chr5 (13-59)||(35420436-35420482)
chr5 (73-197)||(31638157-31638281)
chr5 (177-209)||(26603108-26603140)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (13-210)||(24113178-24113375)
chr8 (13-209)||(14422702-14422898)
chr8 (13-204)||(2042536-2042727)
chr8 (13-211)||(18594534-18594732)
chr8 (13-210)||(39206584-39206781)
chr8 (13-209)||(29938060-29938256)
chr8 (13-206)||(13110406-13110599)
chr8 (13-205)||(144397-144589)
chr8 (13-211)||(6144285-6144483)
chr8 (16-210)||(10836770-10836964)
chr8 (13-210)||(22260642-22260839)
chr8 (16-209)||(35118046-35118239)
chr8 (13-210)||(39218775-39218972)
chr8 (13-209)||(33278399-33278595)
chr8 (16-212)||(36491153-36491349)
chr8 (13-208)||(34842377-34842572)
chr8 (13-211)||(4035844-4036042)
chr8 (13-203)||(34679469-34679659)
chr8 (13-210)||(7774762-7774959)
chr8 (16-205)||(41575516-41575705)
chr8 (13-209)||(38167167-38167363)
chr8 (13-207)||(7791412-7791606)
chr8 (13-211)||(34998908-34999106)
chr8 (13-202)||(44804956-44805145)
chr8 (16-210)||(7811993-7812187)
chr8 (13-209)||(5320563-5320759)
chr8 (55-211)||(40117906-40118062)
chr8 (55-210)||(33287079-33287234)
chr8 (17-206)||(8021721-8021902)
chr8 (69-211)||(26783801-26783943)
chr8 (13-206)||(28639280-28639475)
chr8 (16-204)||(42571598-42571783)
chr8 (13-205)||(66191-66384)
chr8 (13-129)||(9807339-9807455)
chr8 (57-211)||(2322068-2322222)
chr8 (121-206)||(9806875-9806960)
chr8 (80-203)||(5005171-5005294)
chr8 (57-206)||(39220258-39220407)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (13-209)||(22963-23159)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (13-211)||(33906059-33906257)
chr2 (13-209)||(31517227-31517423)
chr2 (16-209)||(3873259-3873452)
chr2 (13-210)||(18806896-18807093)
chr2 (13-210)||(2178781-2178978)
chr2 (16-211)||(26323201-26323396)
chr2 (21-211)||(1108275-1108464)
chr2 (13-206)||(28329851-28330042)
chr2 (13-210)||(5733395-5733592)
chr2 (13-210)||(39635448-39635645)
chr2 (16-210)||(4232157-4232351)
chr2 (13-206)||(4016039-4016232)
chr2 (13-210)||(42937715-42937913)
chr2 (13-210)||(6174840-6175037)
chr2 (13-206)||(850997-851190)
chr2 (16-211)||(19901153-19901347)
chr2 (13-211)||(30270691-30270889)
chr2 (13-202)||(16066306-16066495)
chr2 (13-205)||(1482915-1483106)
chr2 (13-193)||(19383947-19384127)
chr2 (15-210)||(16588790-16588985)
chr2 (57-207)||(30420223-30420373)
chr2 (16-205)||(429817-430006)
chr2 (13-208)||(44947561-44947749)
chr2 (57-210)||(42446625-42446778)
chr2 (64-170)||(22101210-22101316)
chr2 (57-205)||(3585291-3585439)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (13-210)||(36701-36898)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (5-208)||(3708-3911)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (13-211)||(10233-10431)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (13-206)||(145257-145450)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (13-210)||(18-215)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (13-206)||(18-212)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (13-207)||(307-501)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 64)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 210 - 423
Target Start/End: Original strand, 27581260 - 27581473
Alignment:
Q  210 tttgtggtgtacgtggatgataaagatgatgaatatatgaggcggtttgtggtcccaatatcgtacttgaagcaacctatgtttcaggccttgttgtgtt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27581260 tttgtggtgtacgtggatgataaggatgatgaatatatgaggcggtttgtggtcccaatatcgtacttgaagcaacctatgtttcaggccttgttgtgtt 27581359  T
Q  310 gtgctgaggaagagtttggttttgaacacccaatgggaaatattgttattccatgttccattgactattttgttactcttacttctcgtttcaatgtctc 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27581360 gtgctgaggaagagtttggttttgaacatccaatgggaaatattgttattccatgttccattgactattttgttactcttacttctcgtttcaatgtctc 27581459  T
Q  410 ataagtatatatat 423  Q
    ||||||||||||||    
T  27581460 ataagtatatatat 27581473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 2481408 - 2481605
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2481408 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 2481507  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2481508 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 2481605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 45424534 - 45424732
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45424534 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 45424633  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45424634 taaactatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 45424732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 54189738 - 54189537
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  54189738 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 54189639  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccttt 212  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54189638 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttt 54189539  T
Q  213 gt 214  Q
    ||    
T  54189538 gt 54189537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 19913630 - 19913826
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  19913630 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 19913729  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19913730 taagctgttttaatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 19913826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38055348 - 38055154
Alignment:
Q  15 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38055348 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgata 38055249  T
Q  115 agctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055248 aaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 38055154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 28032712 - 28032909
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  28032712 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgatactatga 28032811  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  28032812 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatctaaacagggcct 28032909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 50055101 - 50055298
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  50055101 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaccatga 50055200  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50055201 taagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 50055298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 23776463 - 23776655
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaag 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23776463 aggttacataaattcataagatccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 23776562  T
Q  117 ctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23776563 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 23776655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 15241028 - 15241225
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  15241028 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 15241127  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15241128 taaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcct 15241225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 37464914 - 37464717
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37464914 aaggaggttacataaattcataagctctttgttaaaccggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 37464815  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  37464814 taaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcct 37464717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 53717464 - 53717661
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  53717464 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataagcagcttatgaaactatga 53717563  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53717564 taagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 53717661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 207
Target Start/End: Original strand, 1756767 - 1756958
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1756767 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 1756866  T
Q  116 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 207  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1756867 tctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 1756958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Original strand, 11639570 - 11639773
Alignment:
Q  5 gagaagcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 104  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11639570 gagaatcaaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 11639669  T
Q  105 aactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 204  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  11639670 aactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataaaccaatccaaacg 11639769  T
Q  205 gggc 208  Q
    ||||    
T  11639770 gggc 11639773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 20877240 - 20877042
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  20877240 aaggaggttacgtaaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 20877141  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  20877140 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctt 20877042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 50353994 - 50353796
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  50353994 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatca 50353895  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50353894 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacagaagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 50353796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15669376 - 15669179
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||     
T  15669376 aaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggacggtaagctgaaaatttaggcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaactatga 15669277  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15669276 taagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagtcttatgtgattagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 15669179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 27488648 - 27488845
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27488648 aaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 27488747  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  27488748 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaagccaatccaaacggggcct 27488845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16700974 - 16700782
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  16700974 aaggaggttacataaatttataagctccttgttaagctagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 16700875  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 205  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16700874 taagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 16700782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 14987985 - 14987787
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  14987985 aaggaggttacataaattcataagctcattgttaagcaagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 14987886  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14987885 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaatggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 14987787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 211
Target Start/End: Original strand, 23704201 - 23704407
Alignment:
Q  5 gagaagcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 104  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23704201 gagaatcaaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatga 23704300  T
Q  105 aactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 204  Q
    ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||     
T  23704301 aactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgtgagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaaca 23704400  T
Q  205 gggcctt 211  Q
    |||||||    
T  23704401 gggcctt 23704407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 44784917 - 44785115
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  44784917 aaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaagtttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatga 44785016  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44785017 taagctatttttatttgtttacccaaacacttttacaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 44785115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 6611360 - 6611557
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  6611360 aaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatgacataaacagcttatgaaactatga 6611459  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6611460 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggggcct 6611557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 6688627 - 6688817
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||     
T  6688627 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcag------aaactatga 6688720  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6688721 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagtcaatccaaacggggcc 6688817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 33704034 - 33703850
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  33704034 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 33703935  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaat 197  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  33703934 taagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataaactcacataagctcaaaataagtcaat 33703850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Original strand, 40428720 - 40428915
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  40428720 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatggtataagcagcttatgaaactatga 40428819  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 208  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  40428820 taagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggc 40428915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 215
Target Start/End: Original strand, 43289960 - 43290162
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43289960 aaggaggttacataaattcataagctccttattaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 43290059  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccttt 212  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  43290060 taagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgtgagtagataagcacataaaagctcaaaataagccaatccaaacggagcctat 43290159  T
Q  213 gtg 215  Q
    |||    
T  43290160 gtg 43290162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 54412821 - 54412627
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  54412821 aaggaggttacataaattcatatgctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattagaatatgacataagcagcttatgaaactatga 54412722  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 207  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54412721 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 54412627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1617277 - 1617084
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  1617277 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagcttatgaaactatga 1617178  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 206  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1617177 taagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 1617084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 31969874 - 31969681
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  31969874 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatga 31969775  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 206  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  31969774 taaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataaatcaattcaaacggg 31969681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Original strand, 35490773 - 35490966
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  35490773 aaggtggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatga 35490872  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 206  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35490873 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatgagagtggataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 35490966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 48910039 - 48909842
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48910039 aaggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggtttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 48909940  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  48909939 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacagggcct 48909842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 47632228 - 47632032
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47632228 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 47632129  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacacc-ttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 208  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  47632128 gaagctatttttatttatttacccaaacaccttttaaaaaggtttatgagagtagataagtccacataaactcaaaataagccaatccaaacggggc 47632032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 8932178 - 8932376
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  8932178 aaggaggttacataaattcataagttccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgt 8932277  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8932278 taagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccgcataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 8932376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 30423565 - 30423762
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30423565 aaggaggttacataaattc-taagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttatgcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 30423663  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  30423664 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataagccaatccaaacgggacctt 30423762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 37968757 - 37968958
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37968757 aaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 37968856  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccttt 212  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |||    
T  37968857 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatctaaatggggcattt 37968956  T
Q  213 gt 214  Q
    ||    
T  37968957 gt 37968958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 52139396 - 52139203
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52139396 aaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 52139297  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 206  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  52139296 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaatagataaacccacataagttcaaaataagccaatccaaacggg 52139203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 53875850 - 53875658
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  53875850 aaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttataaaactatga 53875751  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 205  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  53875750 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtatataagcccacataagcttaaaataagccaatccaaacgg 53875658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Original strand, 8591092 - 8591285
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  8591092 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaacatatggcataagcagcttatgaaactatga 8591191  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 206  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||    
T  8591192 taagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatagaagtagataaacccacataaactcaaaataagccaagtcaaacggg 8591285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 19164973 - 19165164
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  19164973 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccg-agggtaagctgaaaatttaggcttattaaa-tatggcataagcagcttatgaaactatga 19165070  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacacc-ttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 205  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19165071 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 19165164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 210
Target Start/End: Original strand, 55344817 - 55345022
Alignment:
Q  5 gagaagcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || || |||     
T  55344817 gagaatcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggatggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggtataaacaactcatgc 55344916  T
Q  105 aactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 204  Q
    || |||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55344917 aaatatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaattcaaacg 55345016  T
Q  205 gggcct 210  Q
    ||||||    
T  55345017 gggcct 55345022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 44379187 - 44379384
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  44379187 aaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatga 44379286  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44379287 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatggaagtagataagcctatataaactcaaaataagtcaatccaaacagggcct 44379384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 27536104 - 27536297
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  27536104 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatga 27536203  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27536204 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgggag----taagcccgtataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 27536297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 53353256 - 53353050
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttat----taaaatatggcataagcagcttatgaaact 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53353256 aaggaggttacataaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatatattaaaatatggcataagcagcttatgaaact 53353157  T
Q  109 atggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccaca----taagctcaaaataagtcaatccaaacg 204  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||| |    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  53353156 atgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacatatgggagtagataagcccatataattaagctcaaaataagccaatccaaacg 53353057  T
Q  205 gggcctt 211  Q
    |||||||    
T  53353056 gggcctt 53353050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 202
Target Start/End: Original strand, 27583632 - 27583821
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  27583632 aaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgcaactatga 27583731  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaa 202  Q
    |||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27583732 taagttatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaa 27583821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 30171773 - 30171581
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  30171773 aaggaggttaaataaattcataagctccttgttaaaccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggtataagcagcttatgaaactatga 30171674  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 205  Q
    |||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30171673 taagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatggaataagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 30171581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 197
Target Start/End: Original strand, 38071327 - 38071504
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  38071327 aggttacataaattcataagctccttgttaagcccc---gtaaactgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaa 38071423  T
Q  117 ctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaat 197  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38071424 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggattatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaat 38071504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 28360602 - 28360433
Alignment:
Q  35 agctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaata-tggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttattta 133  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| ||||||||    
T  28360602 agctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttataaaaataatggcataagcagcttataaaactatgataaactatttttatttattta 28360503  T
Q  134 cccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28360502 cccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagaaaagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 28360433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Original strand, 40680041 - 40680227
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40680041 gaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 40680140  T
Q  116 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaa 202  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||  ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  40680141 gctatttttatttatttatccaaatacctttaaaaagacttatggaagtagataagctcacataaattcaaaataagtcaatccaaa 40680227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 44376038 - 44375844
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||     
T  44376038 aaggaggttacataaattcataagctcttttttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaactatga 44375939  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 207  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| |||||||  ||||| |  |||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  44375938 taaactatttttatttatttacccgaacacctataaaaatggctattggaatagataagcccacataagcttaaaataagccaatccaaacgggg 44375844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 57 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 50053592 - 50053439
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggctt 156  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  50053592 taagatgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacatttaaaaaggctt 50053493  T
Q  157 atgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50053492 atgggagtagataagtccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 50053439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16704014 - 16703821
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16704014 aagggggttacataaatttataggctccttgttaagccggaggataaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 16703915  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    ||| || ||||| ||||||||  |||||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||  |||||||||||    |||||||||||||||| |||||    
T  16703914 taaactatttttatttatttattcaaacaactttaaaaaagcttatggaagtagataagttcacataagctc----taagtcaatccaaacgaggcct 16703821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 129
Target Start/End: Original strand, 23269046 - 23269162
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  23269046 aaggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatga 23269145  T
Q  113 taagctgtttttgttta 129  Q
    |||||| ||||| ||||    
T  23269146 taagctatttttattta 23269162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 121 - 211
Target Start/End: Original strand, 23265865 - 23265955
Alignment:
Q  121 ttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  23265865 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctt 23265955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 57 - 211
Target Start/End: Original strand, 44548185 - 44548340
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggctt 156  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| || ||||| ||| | || |||| ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44548185 taagcttaaaatttgggcttaataaaatagggcataaacaacttataaaattgtgataagatgtttttattgatttatccaaacacctttaaaaaggctt 44548284  T
Q  157 atgcgagtagataagcccacataagctcaaaataa-gtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||    
T  44548285 atgttagtagataagcccacataagctccaaataaggccaattcaaacggggcctt 44548340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 53408213 - 53408137
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaa-ggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgg 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53408213 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgg 53408137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 58 - 140
Target Start/End: Original strand, 51780763 - 51780845
Alignment:
Q  58 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaac 140  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  51780763 aagcttaaaatttgggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataagctatttttattgatttatccaaac 51780845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 64
Target Start/End: Original strand, 23261886 - 23261937
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctga 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23261886 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctga 23261937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Original strand, 9595902 - 9595982
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9595902 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccg-----------gagagtttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatga 9595982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 210
Target Start/End: Original strand, 9595975 - 9596031
Alignment:
Q  153 gcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  9595975 gcttatgagagtagataagcccacataaactc-aaataagccaatccaaacggggcct 9596031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 50055338 - 50055301
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcc 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055338 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcc 50055301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17493482 - 17493340
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggctt 156  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||   |||| | ||||| || |||||| ||||| || | ||||| ||||    
T  17493482 taagctcaaaatttgagcttattaaaacatggtataagcagcttataaaattagaataagatatttttattgatttactcaaacgcccttaaaaatgctt 17493383  T
Q  157 atgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcc 199  Q
    ||  ||||||||| |  || ||||  |||||||||||||||||    
T  17493382 ataggagtagatatgttcatataaattcaaaataagtcaatcc 17493340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 48748251 - 48748197
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaa 67  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||    
T  48748251 aaggagattacataaattcataagctccttattaagacggagggtatgctgaaaa 48748197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 118
Target Start/End: Original strand, 55344724 - 55344780
Alignment:
Q  62 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagct 118  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| |||| ||||||    
T  55344724 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataaacaactcatgaaaatatgataagct 55344780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 48)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 52696984 - 52696788
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52696984 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 52696885  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52696884 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 52696788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25897567 - 25897370
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25897567 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 25897468  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25897467 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatatgcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 25897370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1168704 - 1168499
Alignment:
Q  5 gagaagcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 104  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1168704 gagaatcaaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 1168605  T
Q  105 aactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 204  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1168604 aactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 1168505  T
Q  205 gggcct 210  Q
    ||||||    
T  1168504 gggcct 1168499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 26580282 - 26580479
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26580282 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 26580381  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26580382 taagctatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 26580479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 1170456 - 1170653
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  1170456 aaggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 1170555  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1170556 taagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacaaaagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 1170653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 39260358 - 39260555
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  39260358 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatga 39260457  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39260458 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 39260555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 52753159 - 52753356
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  52753159 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatga 52753258  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52753259 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 52753356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8121062 - 8120870
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  8121062 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaaactgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 8120963  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 205  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8120962 taaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 8120870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 42370807 - 42371003
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  42370807 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagcttatgaaactatga 42370906  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42370907 taagttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 42371003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 16052289 - 16052091
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16052289 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 16052190  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16052189 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataagccaatccaaacggggcctt 16052091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 20089664 - 20089466
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  20089664 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 20089565  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20089564 taagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 20089466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26663451 - 26663257
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  26663451 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacagcttatgaaactatga 26663352  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 207  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26663351 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 26663257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 29078709 - 29078519
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29078709 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 29078610  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 203  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29078609 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 29078519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29288340 - 29288145
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29288340 aaggaggttacata--ttcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 29288243  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29288242 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 29288145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5215578 - 5215384
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  5215578 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatga 5215479  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 207  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5215478 taagctatttttacttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgaaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 5215384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 1940759 - 1940956
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||     
T  1940759 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataaacaacttatgaaactatga 1940858  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1940859 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 1940956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 206
Target Start/End: Original strand, 8079713 - 8079914
Alignment:
Q  5 gagaagcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 104  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8079713 gagaatcaaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccagagggtaagctgaaaacttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatga 8079812  T
Q  105 aactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 204  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8079813 aactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 8079912  T
Q  205 gg 206  Q
    ||    
T  8079913 gg 8079914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 33510677 - 33510480
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33510677 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 33510578  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    ||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33510577 taaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 33510480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 46761159 - 46760966
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  46761159 aaggaagttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatga 46761060  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 206  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46761059 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcaagtagataagctcatataagttcaaaataagtcaatccaaacggg 46760966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 38829260 - 38829072
Alignment:
Q  15 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggta 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  38829260 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcacaagcagcttatgaaactatgata 38829161  T
Q  115 agctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 203  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38829160 agctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccgacataagctcaaaataagccaatccaaac 38829072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 40092680 - 40092488
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40092680 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 40092581  T
Q  117 ctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40092580 atatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataagtcaatccaaacagggcc 40092488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 970536 - 970734
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac--tat 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  970536 aaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatat 970635  T
Q  111 ggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
    | ||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  970636 gataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 970734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12683013 - 12682817
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12683013 aaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctaaagatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 12682914  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  12682913 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagtcaatccaaacagggcc 12682817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17591881 - 17591687
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  17591881 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctggaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 17591782  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  17591781 taagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataag-ccacataagctc--aataagccaatccaaacggggcct 17591687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 32671772 - 32671574
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  32671772 aagggggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatga 32671673  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32671672 taagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 32671574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 43905847 - 43905649
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43905847 aaggaggttacgtaaattcataagctccttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 43905748  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  43905747 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccaaataagctcaaaataagccaatccaaacggagcctt 43905649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Original strand, 41928511 - 41928704
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  41928511 aggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaa 41928610  T
Q  117 ctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  41928611 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagtccacataagttcaaaataagccaatccaaacggggcct 41928704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Original strand, 17587517 - 17587694
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  17587517 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaatatga 17587616  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaata 190  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  17587617 taagctgtttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagctcacataagctcaaaata 17587694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Original strand, 19715173 - 19715366
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  19715173 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaacaatga 19715272  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 206  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19715273 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataaaccaatccaaacggg 19715366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 46409630 - 46409430
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaa--gccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46409630 aaggaggtcacataaattcataagctccttgttaattgtcgaagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactat 46409531  T
Q  111 ggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46409530 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagattagataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggagcct 46409431  T
Q  211 t 211  Q
    |    
T  46409430 t 46409430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 7145400 - 7145202
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7145400 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 7145301  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctc-aaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    ||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  7145300 taaactatttttgtttatttaccc-aacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaatacacataagctcaaaaataagtcaatccaaacgggacctt 7145202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2347850 - 2347652
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaa-tatggcataagcagcttatgaaactatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  2347850 aaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaatatgacataagcagcttatgaaactatg 2347751  T
Q  112 gtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
     ||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  2347750 ataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccgcataaactcaaaataaacaaatccaaacggggcct 2347652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15203301 - 15203109
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15203301 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggttggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataag 15203202  T
Q  117 ctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  15203201 ctatttttatttatttaccctaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacaaaagcttaaaataagtcaattcaaacggggcc 15203109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 51359229 - 51359424
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  51359229 aaggaggttacataaattcataaactccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaccttatgaaactatga 51359328  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51359329 taagctatttttaattatttacccaaa-acctttaagaaggcttatggcagtaaataagcccgcataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 51359424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 211
Target Start/End: Original strand, 13996738 - 13996933
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  13996738 gaggttacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaccattataa 13996837  T
Q  116 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13996838 gctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataatttcaaaataagccaatccaaacagggcctt 13996933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15717977 - 15717787
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15717977 aaggaggttacataaaatcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaattatggcataagcagcttatgaaactat-g 15717879  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 204  Q
     ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15717878 aaagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgaaattagataggccaacataaactcaaaataagtcaatccaaacg 15717787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2473915 - 2473722
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  2473915 aaggaggtaacataaattcataagctccttgttaagtaggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactataa 2473816  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 206  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  2473815 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggcgtagataagcccacataagctcaaaataaaccgatccaaacggg 2473722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23498650 - 23498457
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | |    
T  23498650 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcaacttatgaaactatgatga 23498551  T
Q  116 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||    
T  23498550 actatttttatttatttacccaaacaccttgaaaaaggcttgtggaagtagataagcccacataagcttaaaataagccaattcaaacagggcc 23498457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 49146359 - 49146167
Alignment:
Q  19 gttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagct 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49146359 gttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagatgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagct 49146260  T
Q  119 gtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| |||||  |||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  49146259 atttttatttatttatccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtatataaatccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggagcctt 49146167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 15554164 - 15554353
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||           
T  15554164 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcatcagcagtttatgaa------- 15554256  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
     | ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  15554257 -atgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatccaaacggggcct 15554353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 6765652 - 6765458
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||     
T  6765652 aaggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctcatgaaaatatga 6765553  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 207  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||   |||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6765552 taaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataaaagtagataaattcacataaactcaaaataagccaatccaaacgggg 6765458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 40149656 - 40149497
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  40149656 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttataaaactatga 40149557  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagc 172  Q
    |||  | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  40149556 taaattatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 40149497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 40 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29695842 - 29695673
Alignment:
Q  40 cttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaa 139  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  | ||||| |||||||| |||||    
T  29695842 cttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaattatttttatttatttatccaaa 29695743  T
Q  140 caccttcaaaaaggc-ttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 208  Q
    |||||| |||||    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  29695742 cacctttaaaaaaaaattatgggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacagggc 29695673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 38172012 - 38171827
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||     
T  38172012 aaggaggttacataaattcataagctcattcttaagccggaggataagctgaaaatttaggca-------------cataagcagcttatgaaactatga 38171926  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||  |||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  38171925 taaactgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgtgagtagataagttcacataaattcaaaataagtcaatgcaaacggagcctt 38171827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 77 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 52086396 - 52086263
Alignment:
Q  77 attaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccac 176  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||  | ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |||||    
T  52086396 attaaattatggcataagcagcttatgaaattatgataagttatttttactgatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagcagataaacccac 52086297  T
Q  177 ataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  52086296 ataagcttaaaataagtcaatccaaacagggcct 52086263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 192
Target Start/End: Original strand, 23322897 - 23323031
Alignment:
Q  58 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggctta 157  Q
    ||||| |||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| || |||||  ||||| |||| ||||| | |||    
T  23322897 aagcttaaaatttgcgcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaattatgataaactatttttattgatttattcaaacgccttaaaaaaagttta 23322996  T
Q  158 tgcgagtagataagcccacataagctcaaaataag 192  Q
    || ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  23322997 tgggagtagataagcctatataagctcaaaataag 23323031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 5675176 - 5675100
Alignment:
Q  135 ccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    ||||||| |||  |||| |||||||  |||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5675176 ccaaacatctttcaaaaagcttatgttagtagataagctaacataagcttaaaataagccaatccaaacggggcctt 5675100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 210
Target Start/End: Original strand, 5217840 - 5217992
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggctt 156  Q
    |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |    |||||| ||||| || |||||||||||    ||  |||  ||||    
T  5217840 taagctcaaaattatggcttataaaaatatggtataagcggcttatgaaattggtataagctatttttatt-atttacccaaatgtatttgaaagagctt 5217938  T
Q  157 atgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||  ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  5217939 atgttagtagataagctctcataagcttaaaataagccaatccaaacgaggcct 5217992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 22174988 - 22175185
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22174988 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 22175087  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22175088 taagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 22175185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15520826 - 15520629
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15520826 aaggaggttacaaaaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 15520727  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15520726 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 15520629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 50529119 - 50528922
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50529119 aaggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 50529020  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50529019 taagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 50528922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20699339 - 20699144
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20699339 aaggaggttacaaaaattcctaagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 20699240  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20699239 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 20699144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Original strand, 44609334 - 44609521
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44609334 gaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 44609433  T
Q  116 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 203  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44609434 gctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcaagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatccaaac 44609521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 20842346 - 20842544
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  20842346 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcagcttatgaaactatga 20842445  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20842446 taagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 20842544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 37698141 - 37698338
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  37698141 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 37698240  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37698241 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 37698338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 211
Target Start/End: Original strand, 42307906 - 42308101
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42307906 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 42308005  T
Q  116 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42308006 gctatttttatttatttacccaaacgcctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 42308101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25999574 - 25999382
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25999574 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 25999475  T
Q  117 ctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25999474 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 25999382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 211
Target Start/End: Original strand, 15520143 - 15520338
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  15520143 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaacgatgataa 15520242  T
Q  116 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    | | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15520243 gttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 15520338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38856280 - 38856089
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38856280 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 38856181  T
Q  116 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 207  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38856180 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 38856089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21581232 - 21581042
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21581232 aaggatgttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 21581133  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 203  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21581132 taagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 21581042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 25494283 - 25494479
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25494283 aaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagcaggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 25494382  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25494383 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 25494479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 8042797 - 8042599
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8042797 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 8042698  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    ||| || |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  8042697 taaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataagcccatccaaacggggcctt 8042599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29445678 - 29445481
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  29445678 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataaacagcttatgaaactatga 29445579  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29445578 taagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 29445481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 32244310 - 32244112
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32244310 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 32244211  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  32244210 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctt 32244112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35226637 - 35226440
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35226637 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaggctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 35226538  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  35226537 taagctgattttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataagcccacataagctcaaaataggccaatccaaacagggcct 35226440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 38934135 - 38933939
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  38934135 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactggaaatttagacttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 38934036  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38934035 taagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataag-ccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 38933939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 46452160 - 46452357
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  46452160 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtgagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatga 46452259  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  46452260 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatccaaacggggcct 46452357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 54870172 - 54870369
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  54870172 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaacgatga 54870271  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54870272 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataaactcaaaataagccaatccaaacggggcct 54870369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 211
Target Start/End: Original strand, 12117659 - 12117854
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  12117659 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatgataa 12117758  T
Q  116 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  12117759 actatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcctt 12117854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 24835697 - 24835894
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  24835697 aaggagtttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactataa 24835796  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24835797 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagttgataagtctatataagctcaaaataaatcaatccaaacggggcct 24835894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 54534326 - 54534521
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||     
T  54534326 aaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaa-tatggcataagcagcttat-aaaccatga 54534423  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54534424 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 54534521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2895379 - 2895179
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcata----agctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaact 108  Q
    |||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2895379 aaggaggttatataaattcatatataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaact 2895280  T
Q  109 atggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 208  Q
    ||| |||  | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2895279 atgataatttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaattcaaatggggc 2895180  T
Q  209 c 209  Q
    |    
T  2895179 c 2895179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Original strand, 42104969 - 42105155
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  42104969 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcatgagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 42105068  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcc 199  Q
    ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42105069 taaactatttttatttttttatccaaacacctttaaaaatgtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcc 42105155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 32359449 - 32359251
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32359449 aaggaggttacataaattcataagctctttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 32359350  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    ||| || ||||| ||||||||| |||||||||| | ||| |||||||  | |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  32359349 taaactatttttatttatttactcaaacacctttataaaagcttatggaaatagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctt 32359251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 34700533 - 34700334
Alignment:
Q  11 caaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34700533 caaaggaggttatataaattcataagcttcttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactat 34700434  T
Q  111 ggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    | |||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  34700433 gataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatggaagtaaataaacccacataagctcaaaataaaccaatctaaacggggcct 34700334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26122998 - 26122808
Alignment:
Q  19 gttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagct 118  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26122998 gttacgtaaattcataagctacttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagct 26122899  T
Q  119 gtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  26122898 atttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctcatgggaatagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaactgggcc 26122808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 53028407 - 53028218
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||     
T  53028407 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaaatatga 53028308  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| ||||| |||||||        ||||  |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53028307 taagctatttttatttattt--------acctctaaaaagacttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacagggcct 53028218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 35643365 - 35643212
Alignment:
Q  55 ggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggc 154  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  35643365 ggtaagctcaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaagcacctttaaaaaggc 35643266  T
Q  155 ttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 208  Q
    |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35643265 ttatggaagtagataagttcacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 35643212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 44688950 - 44688782
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  44688950 aaggaggttgcataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatg-cataagcagcttatgaaactatga 44688852  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagc 182  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  44688851 taagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagc 44688782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 16354535 - 16354379
Alignment:
Q  14 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  16354535 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagcaggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaacatggcattagcagcttatgaaactatgat 16354436  T
Q  114 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataa 170  Q
    ||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||    
T  16354435 aagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagtgtagataa 16354379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 69 - 203
Target Start/End: Original strand, 50529827 - 50529961
Alignment:
Q  69 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagat 168  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  50529827 ttaggctcattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagat 50529926  T
Q  169 aagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 203  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50529927 aagtccacataaactcaaaataagtcaatccaaac 50529961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Original strand, 48925001 - 48925189
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  48925001 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctaaaaatttagacttattaaaatatgacataaacagcttatgaaactatga 48925100  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 203  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||  || || ||||| |||||||  ||||||||| |||| |||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  48925101 taaactatttttatttatttacccaa--acttttaaaaaagcttatggaagtagataaacccatataaactctaaataagccaatccaaac 48925189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 49128177 - 49128041
Alignment:
Q  75 ttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccc 174  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||| || ||||||||||||| ||| |||||| |||||  ||||||||||||||    
T  49128177 ttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagttatttttattgatttacccaaacatctttaaaaagacttataggagtagataagccc 49128078  T
Q  175 acataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  49128077 acataagtttaaaataagtcaatccaaacggggcctt 49128041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 12916096 - 12915930
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||     
T  12916096 aagggggttacataaattcataaactctttcttaaaccggagggtaagctgaaaacttaagcttatttaaatatgacataagcagtttatgaaattatga 12915997  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataa 180  Q
    ||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12915996 taaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagatttatg-gagtaaataagcccacataa 12915930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 24366219 - 24366143
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggc 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24366219 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggc 24366143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 13696991 - 13696914
Alignment:
Q  5 gagaagcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaa 82  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13696991 gagaatcaaaggaggttacacaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaa 13696914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 24366142 - 24366084
Alignment:
Q  153 gcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24366142 gcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaaaggggcctt 24366084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 49
Target Start/End: Original strand, 50528883 - 50528916
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagc 49  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50528883 gaggttacataaattcataagctccttgttaagc 50528916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 40240515 - 40240485
Alignment:
Q  176 cataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40240515 cataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 40240485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 183; Significance: 8e-99; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 15656106 - 15655908
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15656106 aaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 15656007  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15656006 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagcagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 15655908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 43067975 - 43068173
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  43067975 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagaagcttatgaaactatga 43068074  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43068075 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 43068173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 33359092 - 33359288
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33359092 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 33359191  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33359192 taagctatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 33359288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 30181026 - 30181225
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30181026 aagggggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 30181125  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccttt 212  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30181126 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttt 30181225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 12101180 - 12101381
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12101180 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccatagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 12101279  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccttt 212  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  12101280 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaatggggccttt 12101379  T
Q  213 gt 214  Q
    ||    
T  12101380 gt 12101381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 24792334 - 24792531
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24792334 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 24792433  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  24792434 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaagccaatccaaacggggcct 24792531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20346682 - 20346487
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20346682 aaggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 20346583  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 208  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20346582 taatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 20346487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 42673655 - 42673467
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42673655 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 42673556  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 205  Q
    |||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42673555 taagctgtt----tttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctccaaataagtcaatccaaacgg 42673467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 3511517 - 3511319
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3511517 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 3511418  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  3511417 taagctatttttatctatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagacaatccaaacgggacctt 3511319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 42964998 - 42965196
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42964998 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 42965097  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  42965098 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaaaggggcctt 42965196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7164375 - 7164184
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7164375 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 7164276  T
Q  116 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 207  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7164275 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 7164184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 42204349 - 42204150
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42204349 aaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 42204250  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacacc-ttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42204249 taagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 42204150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 4347462 - 4347269
Alignment:
Q  18 ggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4347462 ggttacataaattcataagctccttgttaagctcgagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagc 4347363  T
Q  118 tgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4347362 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagtttatgggagtagataagcccacataagcttaaaataagtcaatccaaacggggcctt 4347269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 22649699 - 22649892
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  22649699 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataa 22649798  T
Q  116 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22649799 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcc 22649892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 1803220 - 1803029
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||     
T  1803220 aaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatcgtataagcagcttatgaaactatga 1803121  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 204  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1803120 taagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 1803029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 5281054 - 5280856
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5281054 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 5280955  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  5280954 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgtgaatagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctt 5280856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 933479 - 933281
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  933479 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 933380  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  933379 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacatgagctcaaaataagccaattcaaacagggcctt 933281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 36890832 - 36891029
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  36890832 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaacttaggcttattgaaatatggcataagcaacttatgaaactatga 36890931  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36890932 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctc-aaataagtcaatccaaacggggcctt 36891029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 33846531 - 33846723
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||     
T  33846531 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccc-----taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaactatga 33846625  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33846626 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 33846723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 4477323 - 4477515
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  4477323 aaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatga 4477422  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 205  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4477423 taagctatttttatttatttacccaaacacctttgaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 4477515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25748681 - 25748485
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25748681 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 25748582  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |  | ||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  25748581 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactaatataagctcaacttaagccaatccaaacggggcc 25748485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 6394945 - 6394747
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  6394945 aaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatga 6394846  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    ||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  6394845 taaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatctaaacggggcctt 6394747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 9452784 - 9452591
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||     
T  9452784 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatagacagcttatgaaactatga 9452685  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 206  Q
    ||| || |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9452684 taaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagaatagataagttcacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 9452591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 12097592 - 12097788
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  12097592 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagtagcttatgaaactatga 12097691  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  12097692 taatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaacttaagccaatccaaatggggcc 12097788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 32041732 - 32041539
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaag 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32041732 aggttacataaatttataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataag 32041633  T
Q  117 ctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  32041632 ctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataagccaatccaaacggggcct 32041539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 43156907 - 43156718
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  43156907 aaggaggttacataaattcataagttctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatttgccataaacagcttatgaaactatga 43156808  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaa 202  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43156807 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaa 43156718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 38866738 - 38866547
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  38866738 aaggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataaacagcttatgaaactatga 38866639  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 204  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38866638 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaattatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagtcgatccaaacg 38866547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8630853 - 8630665
Alignment:
Q  20 ttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctg 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  8630853 ttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaacta 8630754  T
Q  120 tttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 208  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||    
T  8630753 tttttatttatttacccgaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatcaacccacataacctcaaaataaacaaatccaaacggggc 8630665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17753794 - 17753600
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17753794 aaggagattacataaattcataagctccttgttaagttgaagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgt 17753695  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 207  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17753694 taagctatttttatttatttacccaaacaccttctaaaaggcttataggagtagataagcttgtataagctcaaaataagctaatccaaacgggg 17753600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 207
Target Start/End: Original strand, 46134309 - 46134500
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||    
T  46134309 gaggttacataaattaataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcgtaaacagcttatgaaactataataa 46134408  T
Q  116 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 207  Q
     || ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||  ||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46134409 actatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagagttataggagtagataaactcacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 46134500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Original strand, 46891341 - 46891535
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  46891341 aaggaggttacataaactcataagctccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggctaattaaaatatgacataagcagcttataaaactatga 46891440  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacacc-ttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 206  Q
     || || ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46891441 caaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaggtttataggagtagataagcctatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 46891535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 48865827 - 48865665
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48865827 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcctgatgttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 48865728  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacacctt---caaaaaggcttatgcgagtagataagc 172  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||    
T  48865727 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaaggcttatggaagtagataagc 48865665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 16894509 - 16894697
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16894509 aaggatgttacataaattcataagctccctgttaagttgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 16894608  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    ||| || ||||| ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||          |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16894609 taaactatttttatttgtttacccaaatacctttaaaaaagcttatgggagtagataa----------gctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 16894697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 62 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 19828415 - 19828266
Alignment:
Q  62 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcg 161  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  19828415 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcaatttatgaaactatgataagctatttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatggg 19828316  T
Q  162 agtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19828315 agtagataagccaacataaactcaaaataagccaattcaaacggggcctt 19828266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 43021582 - 43021776
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |  |    |||||| ||||||||||||||||||||||      
T  43021582 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagagtaagctgaaaatttagaccga----aatatgccataagcagcttatgaaactataa 43021677  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||   |||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  43021678 taagttatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagacttattgaagtagataagtccacataaacttaaaataagccaatccaaatggggcctt 43021776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 113 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 37705074 - 37704976
Alignment:
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37705074 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaacccaaacggggcctt 37704976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 57 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 43405170 - 43405016
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggctt 156  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||| | | || || ||||||||| || | |||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||||| |||    
T  43405170 taagctaaaaaattgggcttattaaaatatagtagaaacaacttatgaaattacgataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagactt 43405071  T
Q  157 atgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  43405070 ataggagtagataagccaacataagcttaaaataagtcaattcaaacggggcctt 43405016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 211
Target Start/End: Original strand, 37005857 - 37006011
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggctt 156  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||  | |||||||||||| |||| |||||  |||    
T  37005857 taagctaaaaaattagccttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagctatttttactgatttacccaaacgcctttaaaaaaactt 37005956  T
Q  157 atgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    ||   ||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  37005957 atagaagtagataaactcacataagcttaaaataagccaatccaaacggagcctt 37006011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 209
Target Start/End: Original strand, 36849590 - 36849735
Alignment:
Q  64 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgag 163  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| | || ||||||| |||| || ||||| ||||||||||| |||||  | ||||  ||    
T  36849590 aaaatttgagcttattaaaatatgacataaacagtttatgaaattgtgataagctgattttattgatttatccaaacacctttaaaaaaacatatgttag 36849689  T
Q  164 tagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
    |||| || ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  36849690 tagacaaacccacataagcttcgaataagtcaatccaaacggggcc 36849735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 211
Target Start/End: Original strand, 15655458 - 15655612
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggctt 156  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| | ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |  || |||||| |||    
T  15655458 taagctcaaaatttgagcttattaaaatttggtataagcagtttataaaattgtggtaagctatttttattgatttatccaaatagttttaaaaagactt 15655557  T
Q  157 atgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||  |||||| |||| |||||||| | | |||||| ||||||||||| ||||||    
T  15655558 atgttagtagacaagctcacataagtttagaataagccaatccaaacgcggcctt 15655612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 20163953 - 20163824
Alignment:
Q  73 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagc 172  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||| ||||  || ||| |||||||| | |||| ||||| |||||   ||| ||||||    
T  20163953 gcttgttaaaatatgctataagcagcttatgaaactgtgataagctattttaattaattcacccaaacgcattcacaaaggattatgttggtaaataagc 20163854  T
Q  173 ccacataagctcaaaataagtcaatccaaa 202  Q
     || |||||| |||||||||||||||||||    
T  20163853 tcatataagcccaaaataagtcaatccaaa 20163824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 209
Target Start/End: Original strand, 30075277 - 30075426
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggctt 156  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||  |||||| ||||| || ||||||||||||   |   ||| |||||    
T  30075277 taagctcaaaattatggcttattaaaatatggtataagcggtttatgaaa-tata-taagctatttttatt-atttacccaaacgtatctgaaagggctt 30075373  T
Q  157 atgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
    |||  ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30075374 atgttagtagataaactcacataagcttaaaataagtcaatccaaacggggcc 30075426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 191
Target Start/End: Original strand, 27691435 - 27691506
Alignment:
Q  120 tttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataa 191  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  27691435 tttttatttatttacccaaacatctttaaaaagatttatgggagtagataagcccatataaattcaaaataa 27691506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 16307023 - 16307217
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16307023 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 16307122  T
Q  116 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16307123 gctgtttttatttatttatccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 16307217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 3347535 - 3347733
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  3347535 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 3347634  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3347635 taagctgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 3347733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 26946888 - 26947084
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  26946888 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 26946987  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26946988 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 26947084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 18613733 - 18613535
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  18613733 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatggaactatga 18613634  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18613633 taagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccgcataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 18613535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2837740 - 2837543
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  2837740 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatgagcagctcatgaaactatga 2837641  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2837640 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 2837543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 6086611 - 6086808
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  6086611 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 6086710  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6086711 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 6086808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 30692046 - 30691850
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30692046 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 30691947  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30691946 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 30691850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21893650 - 21893453
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21893650 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 21893551  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21893550 taagctatttttatatatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaatcgatccaaacggggcct 21893453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 26704351 - 26704547
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26704351 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 26704450  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26704451 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataaaccaatccaaacggggcc 26704547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 207
Target Start/End: Original strand, 3955782 - 3955972
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  3955782 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagtttatgaaactatgataag 3955881  T
Q  117 ctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 207  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3955882 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 3955972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Original strand, 17261085 - 17261278
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||      
T  17261085 aaggaggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaaatatta 17261184  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 206  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17261185 taagctatttttatttatttacccaaacacctttagaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 17261278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9459758 - 9459562
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9459758 aaggaggatacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 9459659  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||  | ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9459658 taagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatggaaatagataagctcacataaactcaaaataagccaatccaaacggggcc 9459562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 34887304 - 34887496
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  34887304 aaggaggtcacataaattcattagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagcttatgaaactatga 34887403  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 205  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34887404 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaggagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 34887496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20726982 - 20726790
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20726982 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 20726883  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
    ||||    || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20726882 taag----ttatttttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 20726790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11167435 - 11167238
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  11167435 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggtgggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 11167336  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||  | || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11167335 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgaaaataaataagcacacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 11167238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Original strand, 28199520 - 28199714
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||     
T  28199520 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcatatgaaactatga 28199618  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagta---gataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 206  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28199619 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg-gagtagatgataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 28199714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1153788 - 1153603
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1153788 aaggaggttacataaatacataagcaccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 1153689  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatc 198  Q
    ||| || |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  1153688 taatctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccaacataagcttaaaataagccaatc 1153603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35198469 - 35198282
Alignment:
Q  22 acataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtt 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  35198469 acataaattcataagttccttgttaagccggagagtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 35198370  T
Q  122 tttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  35198369 tttatttatttacccaaacacctttaaaaa-gcttatggaagtagataagcccacataagttcaaaataagccaattcaaacggggcct 35198282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 52999 - 52834
Alignment:
Q  45 taagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacacct 144  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  52999 taagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacct 52900  T
Q  145 tcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    | ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52899 ttaaaaatgcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 52834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Original strand, 30698941 - 30699132
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||     
T  30698941 aaggaggttacataaattcataagctcattgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctaataaaactatga 30699040  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 204  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||   | || |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  30699041 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaataaataagctcacataaactcataataagtcaatccaaacg 30699132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 33464524 - 33464399
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33464524 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 33464425  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaa 138  Q
    ||| || |||||  ||||||||||||    
T  33464424 taaactatttttacttatttacccaa 33464399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 53103 - 53005
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53103 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatg 53005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 130 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 33463779 - 33463697
Alignment:
Q  130 tttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccttt 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  33463779 tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacgggaccttt 33463697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 211
Target Start/End: Original strand, 9008073 - 9008267
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9008073 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 9008172  T
Q  117 ctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9008173 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 9008267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 16069549 - 16069351
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16069549 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 16069450  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16069449 taagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggacctt 16069351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1579232 - 1579035
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1579232 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 1579133  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1579132 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 1579035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 1605583 - 1605780
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1605583 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 1605682  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1605683 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 1605780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 27679181 - 27679378
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27679181 aaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 27679280  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27679281 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 27679378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 33491208 - 33491406
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  33491208 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcaaaagcagcttatgaaactatga 33491307  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33491308 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 33491406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 27421051 - 27420856
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27421051 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 27420952  T
Q  116 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
     || ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27420951 actatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 27420856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Original strand, 3386498 - 3386688
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3386498 aaggaggttacataaattcataggctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 3386597  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 203  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3386598 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatccaaac 3386688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 24105683 - 24105881
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  24105683 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgataatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 24105782  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  24105783 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggagcctt 24105881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Original strand, 16737459 - 16737650
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16737459 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 16737558  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 204  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16737559 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaattcaaacg 16737650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 4121141 - 4120935
Alignment:
Q  5 gagaagcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4121141 gagaatcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 4121042  T
Q  105 aactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 204  Q
    ||||||| |||  | |||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  4121041 aactatgataaattatttttacttatttacccaaacacctttaaaagggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccattccaaacg 4120942  T
Q  205 gggcctt 211  Q
    |||||||    
T  4120941 gggcctt 4120935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 31883340 - 31883142
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  31883340 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 31883241  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31883240 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggagcctt 31883142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 211
Target Start/End: Original strand, 35782659 - 35782854
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagc-cggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35782659 gaggttacataaattcataagctccttg-taagcacggagggtaggctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgata 35782757  T
Q  115 agctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35782758 agctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataaggcaatccaaacggggcctt 35782854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 33991333 - 33991139
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  33991333 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataa 33991234  T
Q  116 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33991233 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacataaactcaaaataagtcaattcaaacggggcct 33991139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 202
Target Start/End: Original strand, 1165613 - 1165802
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  1165613 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatga 1165712  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaa 202  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1165713 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataagtcaatccaaa 1165802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 8374351 - 8374547
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8374351 aaggaggttacataaat-cataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 8374449  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  8374450 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagcttaaaataaggcaatccaaacggggcct 8374547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 3921777 - 3921579
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3921777 aaggaggttacataaattcataagctcctttttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 3921678  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3921677 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccatataaactcaaaataaatcaatccaaacgggacctt 3921579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 19358722 - 19358524
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19358722 aaggagattacataaattcataagctccttgttaagttggagggtaagctgaaaatttaggcttactaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 19358623  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19358622 taagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataaggcaatccaaacggggcctt 19358524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5203164 - 5202972
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaag 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  5203164 aggtgacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaa 5203065  T
Q  117 ctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5203064 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaaccaacataaactcaaaataagtcaatccaaacggggcc 5202972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 20992158 - 20992356
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  20992158 aagggggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataatcagcttatgaaactatga 20992257  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  20992258 tatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagaccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcctt 20992356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Original strand, 38598466 - 38598659
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38598466 aggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 38598565  T
Q  117 ctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    || |||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  38598566 ctatttttacttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagctcacataagttcaaagtaagccaatccaaaccgggcct 38598659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31410672 - 31410476
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  31410672 aaggaggtcacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttataaaactatga 31410573  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| | |||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  31410572 taagctatttttatttgtttactcaaacacctttaaaaagacttatgggggtagataaacccatataaactcaaaataaatcaatccaaacgcggcc 31410476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Original strand, 26602957 - 26603113
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  26602957 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagagtaaactgaaaaattatgcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataa 26603056  T
Q  116 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagc 172  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  26603057 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagc 26603113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 27025152 - 27025001
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  27025152 aaggaggttacataaatttataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaaatggcataagcagcttatgaaactatga 27025053  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagt 164  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||| |||||| ||||    
T  27025052 taagctatttttatttatttacccgaacatctttaaaaagtcttatgggagt 27025001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 74 - 211
Target Start/End: Original strand, 20992354 - 20992495
Alignment:
Q  74 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcc 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20992354 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcc 20992453  T
Q  174 c----acataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20992454 catgtacataagctcaaaataagccaatccaaacagggcctt 20992495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 68 - 201
Target Start/End: Original strand, 33284642 - 33284775
Alignment:
Q  68 tttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtaga 167  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  33284642 tttaggcttattgaaatatggtataagcagtttataaaactatgataagctatttttatttatttacttaaacacctttaaaaaggcttatgggagtaga 33284741  T
Q  168 taagcccacataagctcaaaataagtcaatccaa 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33284742 taagcccatataagctcaaaataagtcaatccaa 33284775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 59
Target Start/End: Original strand, 35420436 - 35420482
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaa 59  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  35420436 aaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaa 35420482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 31638281 - 31638157
Alignment:
Q  73 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagc 172  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| | || |||| | ||||| |  ||||| |||||||| || | |||||||||||  ||||| |||||    
T  31638281 gcttattaaaatatgacataagaagcttataaaattgtgataagttatttttatcgatttatccaaacacttttacaaaggcttatgttagtaggtaagc 31638182  T
Q  173 ccacataagctcaaaataagtcaat 197  Q
     ||||||| |  |||||||||||||    
T  31638181 tcacataaacataaaataagtcaat 31638157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 177 - 209
Target Start/End: Original strand, 26603108 - 26603140
Alignment:
Q  177 ataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26603108 ataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 26603140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 24113178 - 24113375
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  24113178 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 24113277  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24113278 taatctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagggttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 24113375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14422898 - 14422702
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14422898 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 14422799  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  14422798 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggggcc 14422702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Original strand, 2042536 - 2042727
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  2042536 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 2042635  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 204  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2042636 taagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 2042727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 18594732 - 18594534
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  18594732 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 18594633  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18594632 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 18594534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39206781 - 39206584
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39206781 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 39206682  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39206681 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 39206584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29938256 - 29938060
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29938256 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 29938157  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29938156 taagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 29938060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13110599 - 13110406
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  13110599 aaggaggttacataaactcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttattaaactatga 13110500  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 206  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13110499 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcatatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 13110406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 144589 - 144397
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  144589 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 144490  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 205  Q
    ||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  144489 taaactatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacatatgctcaaaataagtcaatccaaacgg 144397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 6144285 - 6144483
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6144285 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 6144384  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||  | |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6144385 taagctatttttatttatttacccaaacactgttaaaaaggcatatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 6144483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 10836770 - 10836964
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  10836770 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataa 10836869  T
Q  116 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  10836870 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcct 10836964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 22260642 - 22260839
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  22260642 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactagga 22260741  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22260742 taagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagacttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 22260839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 35118046 - 35118239
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  35118046 gaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 35118145  T
Q  116 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35118146 gctatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 35118239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39218972 - 39218775
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  39218972 aaggaggtcacataaattcatcagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaagctatga 39218873  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    ||| |  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39218872 taaaccatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 39218775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33278595 - 33278399
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33278595 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 33278496  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
    ||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33278495 taaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgaaagtagataagtccatataaactcaaaataagccaatccaaacggggcc 33278399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36491349 - 36491153
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||    
T  36491349 gaggttacataaattcataagcttcttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaagttatgaaactatgataa 36491250  T
Q  116 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccttt 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  36491249 gctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaagacttatgcgattagataatcccacataagcttaaaataagccaatccaaatggggccttt 36491153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Original strand, 34842377 - 34842572
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34842377 aaggaggtcacataaattaataagctccttgttaagacggtgggtaagctggaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 34842476  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 208  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34842477 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 34842572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 4036042 - 4035844
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4036042 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 4035943  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  4035942 taagctatttttatttgtttacccaaacacctttaataaaacttatgggagtagataagcccatataagctaaaaataaaccaatccaaacggggcctt 4035844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Original strand, 34679469 - 34679659
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  34679469 aaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagcttatgaaactatga 34679568  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 203  Q
    ||| || ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  34679569 taaactatttttatttatttattcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaac 34679659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7774959 - 7774762
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  7774959 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttaataaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 7774860  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  7774859 taatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaacccgcataagctcaaaataagccaatctaaacgaggcct 7774762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 41575705 - 41575516
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  41575705 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 41575606  T
Q  116 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 205  Q
    ||  ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41575605 gcaatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtctacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 41575516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 38167167 - 38167363
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38167167 aaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 38167266  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
    ||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||    
T  38167267 taaactagttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataagcccacataaactcaaaataggccaatccaaacagggcc 38167363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7791606 - 7791412
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  7791606 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 7791507  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 207  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  7791506 taatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatccaaacgggg 7791412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 34998908 - 34999106
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  34998908 aaggagattaaataaattcataagctccttgttaagccggagggcaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactaaga 34999007  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  34999008 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccgtataagctcaaaataagccaatccatacgggacctt 34999106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 202
Target Start/End: Original strand, 44804956 - 44805145
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  44804956 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 44805055  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaa 202  Q
    |||||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  44805056 taagctatttttatttatttatctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataaacctacataagctcaaaataagccaattcaaa 44805145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7812187 - 7811993
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  7812187 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 7812088  T
Q  116 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  7812087 tctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactaatggaagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatcaaaacggggcct 7811993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5320759 - 5320563
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||     
T  5320759 aaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagttgaaaatttaggcttattgaaacatgacataagcaacttatgaaactatga 5320660  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
    |||  | ||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5320659 taaattatttttatttatttaccaaaacaactttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 5320563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 55 - 211
Target Start/End: Original strand, 40117906 - 40118062
Alignment:
Q  55 ggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggc 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  40117906 ggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggc 40118005  T
Q  155 ttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40118006 ttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 40118062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 55 - 210
Target Start/End: Original strand, 33287079 - 33287234
Alignment:
Q  55 ggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggc 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  33287079 ggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagc 33287178  T
Q  155 ttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33287179 atatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 33287234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 8021902 - 8021721
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaag 116  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||     
T  8021902 aggttatataaactcataagctccttgttaagccgga--------tgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaa 8021811  T
Q  117 ctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 206  Q
    || ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8021810 ctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 8021721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 69 - 211
Target Start/End: Original strand, 26783801 - 26783943
Alignment:
Q  69 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagat 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  26783801 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagat 26783900  T
Q  169 aagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26783901 aagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcctt 26783943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 28639475 - 28639280
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28639475 aaggaggttacataa--tcataagctctatgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 28639378  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggct----tatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 206  Q
    ||| || ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||    |||  |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  28639377 taaactatttttatttatttaccaaaacacctttaaaaaagcttgtatataggagtagataagctcacataagcttaaaataagccaattcaaacggg 28639280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 42571783 - 42571598
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 115  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  42571783 gaggttgcataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggc--attgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 42571686  T
Q  116 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 204  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42571685 gctatttttatt-atttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 42571598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 66191 - 66384
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagg-taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatg 111  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  66191 aaggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccgaaagggtaagctgaaaatttaaacttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatt 66290  T
Q  112 gtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 205  Q
     |||| | ||||| ||||||||||||||||| || |||||| | |||| || |||||||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||||||    
T  66291 ataagttatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagacatatgggaatagataagcctacagaaactcaaaataagccaatctaaacgg 66384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 9807455 - 9807339
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  9807455 aaggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaagctatga 9807356  T
Q  113 taagctgtttttgttta 129  Q
    |||||| ||||| ||||    
T  9807355 taagctatttttattta 9807339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 211
Target Start/End: Original strand, 2322068 - 2322222
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggctt 156  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| | || |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  2322068 taagcttaaaatttaggcttatcaaaatatgatataagcagcttatgaaattgtgataagctgtttttattgatttacccaaacacctttaaaaaagctt 2322167  T
Q  157 atgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||  |||||||||  ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  2322168 atgttagtagataaatccatataagctccgaataagccaatccaaacggggcctt 2322222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 9806960 - 9806875
Alignment:
Q  121 ttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 206  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9806960 ttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcatatgggagtagataagcacatataaactcaaaataagtcaatccaaacggg 9806875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 5005294 - 5005171
Alignment:
Q  80 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacata 179  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||   |||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  5005294 aaaatatagcataagcagtttatgagagtagcataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacata 5005195  T
Q  180 agctcaaaataagtcaatccaaac 203  Q
    |||| || ||||| ||||||||||    
T  5005194 agcttaagataagccaatccaaac 5005171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 39220407 - 39220258
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggctt 156  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| |    |||||| ||||| || |||||| |||||||||| |||||| | |    
T  39220407 taagctcaaaatttgagcttattaaaatatagtatgagcagcttatgaaattggaataagctatttttattgatttactcaaacacctttaaaaagacat 39220308  T
Q  157 atgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 206  Q
    |||   |||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39220307 atggatgtagataagttcatataagctcaaaataagtcaattcaaacggg 39220258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 22963 - 23159
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22963 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 23062  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23063 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 23159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 163; Significance: 7e-87; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 33906059 - 33906257
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33906059 aaggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 33906158  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33906159 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagttcaaaataagtcaatccaaacagggcctt 33906257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 31517227 - 31517423
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  31517227 aaggaggttacataaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatga 31517326  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31517327 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccaaataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 31517423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 3873259 - 3873452
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3873259 gaggttatataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 3873358  T
Q  116 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 209  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3873359 gctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 3873452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 18806896 - 18807093
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  18806896 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatga 18806995  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18806996 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 18807093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 2178781 - 2178978
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2178781 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 2178880  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  2178881 taagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgcgaatagataagtccacataaacttaaaataaatcaatccaaacggggcct 2178978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 211
Target Start/End: Original strand, 26323201 - 26323396
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26323201 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 26323300  T
Q  116 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26323301 gctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaagacttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggggcctt 26323396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 1108464 - 1108275
Alignment:
Q  21 tacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |    
T  1108464 tacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataaactat 1108365  T
Q  121 ttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1108364 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcctt 1108275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Original strand, 28329851 - 28330042
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  28329851 aaggaggttacataaattcatatgctccttgttaagctag--ggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatga 28329948  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 206  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28329949 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggtgtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 28330042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 5733592 - 5733395
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  5733592 aaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 5733493  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||    
T  5733492 taagttgtttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggctgatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatctaaatggggcct 5733395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39635645 - 39635448
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  39635645 aaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 39635546  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  39635545 taagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataagctaatccaaacggggcct 39635448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 4232157 - 4232351
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4232157 gaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttgtgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 4232256  T
Q  116 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4232257 gctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataagccaatccaaacggggcct 4232351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4016232 - 4016039
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4016232 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 4016133  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 206  Q
    || | | ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4016132 tacgttatttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 4016039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 42937913 - 42937715
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggctt-attaaaatatggcataagcagcttatgaaactatg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42937913 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggctttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatg 42937814  T
Q  112 gtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
     ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  42937813 ataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggagcct 42937715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 6174840 - 6175037
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  6174840 aaggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaatgaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 6174939  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||  | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6174940 taaaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 6175037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 851190 - 850997
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  851190 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttataaaattatga 851091  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 206  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  851090 taagctctatttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagcttaaaataagcaaatccaaacggg 850997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 211
Target Start/End: Original strand, 19901153 - 19901347
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  19901153 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtgggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataa 19901252  T
Q  116 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    ||| |||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19901253 gctattttt-attatttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagagaagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 19901347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 30270691 - 30270889
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  30270691 aaggagattacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 30270790  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    ||| || ||||  |||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||| | || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  30270791 taaactattttattttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaactcatataagcttaaaataagccaatccaaacggggcctt 30270889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 202
Target Start/End: Original strand, 16066306 - 16066495
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16066306 aaggaggttacataaattcataagctccttattaaatcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 16066405  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaa 202  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16066406 taagctatttttatttatttacccaaacactttaaaaaagacttatgaaagcagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaa 16066495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 1482915 - 1483106
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  1482915 aaggatgttacataaattcataagctccttgttaagtcgaagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacaataa 1483014  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 205  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1483015 taagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaagcttatg-gagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcaaaacgg 1483106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 193
Target Start/End: Original strand, 19383947 - 19384127
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  19383947 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaacttatgaaactatga 19384046  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagt 193  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  19384047 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcatataaactcaaaataagt 19384127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Original strand, 16588790 - 16588985
Alignment:
Q  15 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggta 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  16588790 ggaggttacattaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactataata 16588889  T
Q  115 agctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||  ||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16588890 agctatttttatttatttacccaaacttctttaaaaagacttatgaaagtagataagcccacataaacacaaaataagccaatccaaacggagcct 16588985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 57 - 207
Target Start/End: Original strand, 30420223 - 30420373
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggctt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30420223 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaacctatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 30420322  T
Q  157 atgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 207  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30420323 atgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 30420373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 430006 - 429817
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  430006 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcgaattgtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatcgcataagcaacttatgaaattatgataa 429907  T
Q  116 gctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 205  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||  ||||||||||  ||| |||||||    
T  429906 gctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataaatccacataaattcaaaataagggaattcaaacgg 429817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Original strand, 44947561 - 44947749
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44947561 aaggaggttacataaattcataaacttcttgttaagccggagggtaaactgaaaatttagc-------aaatatggcataagcagcttatgaaactatga 44947653  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 208  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||  | ||||||| | |||||||| |||||||||| |||| |||| |||||    
T  44947654 taaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaatgcttatggcactagataaactcacataagatcaaaataagccaatacaaatggggc 44947749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 210
Target Start/End: Original strand, 42446625 - 42446778
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggctt 156  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  42446625 taagcttaaaatttgatcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttacctaaacacctttaaaaaggctt 42446724  T
Q  157 atgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||  ||||||||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||||||||    
T  42446725 atgttagtagataagttcgcataaactccgaataagccaatccaaacggggcct 42446778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 170
Target Start/End: Original strand, 22101210 - 22101316
Alignment:
Q  64 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgag 163  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||| ||||||| || |||||  |||| ||||| |||||||||||||  ||    
T  22101210 aaaatttgggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttatacaaatacctttaaaaaggcttatgttag 22101309  T
Q  164 tagataa 170  Q
    |||||||    
T  22101310 tagataa 22101316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3585439 - 3585291
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggctt 156  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||  ||||||| || ||||||| |||||| || || |||| ||    
T  3585439 taagctcataattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataaattgtttttattaatttaccaaaacacatttaataaggttt 3585340  T
Q  157 atgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 205  Q
    |||  ||| |||||  |||||||||||   |||||| | ||||||||||    
T  3585339 atgttagtggataaatccacataagctttgaataagccgatccaaacgg 3585291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 36898 - 36701
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  36898 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 36799  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36798 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 36701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 3911 - 3708
Alignment:
Q  5 gagaagcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 104  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3911 gagaatcaaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 3812  T
Q  105 aactatggtaagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 204  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  3811 aactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataaaccaatccaaacg 3712  T
Q  205 gggc 208  Q
    ||||    
T  3711 gggc 3708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10431 - 10233
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  10431 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagcttatgaaactatga 10332  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 211  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10331 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgagagtagataaacccatataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 10233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Original strand, 145257 - 145450
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  145257 aaggaggttacataaatttataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 145356  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 206  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  145357 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagtccacataaactcaaaataagtcaatccaaacggg 145450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 18 - 215
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggattattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 117  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  |||| |||| ||||||||||||    
T  118 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataaactcaacttaagccaatacaaacggggcct 215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Original strand, 18 - 212
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||     
T  18 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcatatgaaactatga 116  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagta---gataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 206  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  117 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg-gagtagatgataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Original strand, 307 - 501
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  307 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 406  T
Q  113 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 207  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  407 taatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatccaaacgggg 501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University