View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21181_low_14 (Length: 318)

Name: NF21181_low_14
Description: NF21181
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21181_low_14
NF21181_low_14
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (15-311)||(15673387-15673684)
chr6 (16-311)||(23347747-23348043)
chr6 (29-311)||(8873107-8873390)
chr6 (30-311)||(13755042-13755324)
chr6 (33-311)||(25317434-25317713)
chr6 (33-311)||(26204928-26205207)
chr6 (21-310)||(19348842-19349125)
chr6 (42-255)||(33629688-33629900)
chr6 (171-262)||(1682765-1682856)
chr6 (76-302)||(19256669-19256895)
chr6 (32-94)||(4596465-4596528)
chr6 (176-285)||(4406736-4406845)
chr6 (168-276)||(4474414-4474522)
chr6 (189-229)||(14528110-14528150)
chr6 (168-240)||(24749364-24749436)
chr6 (176-256)||(33745819-33745899)
[»] chr3 (16 HSPs)
chr3 (15-310)||(23601335-23601631)
chr3 (15-311)||(6176759-6177056)
chr3 (15-311)||(2813781-2814078)
chr3 (29-311)||(7146617-7146900)
chr3 (30-301)||(29308984-29309257)
chr3 (15-311)||(25873392-25873690)
chr3 (45-310)||(9378689-9378955)
chr3 (33-311)||(30167626-30167905)
chr3 (42-255)||(49732270-49732483)
chr3 (87-309)||(28675212-28675434)
chr3 (171-255)||(13448197-13448281)
chr3 (45-255)||(24227408-24227617)
chr3 (42-119)||(32004570-32004647)
chr3 (168-286)||(19824101-19824219)
chr3 (30-72)||(6517893-6517936)
chr3 (42-119)||(13448069-13448145)
[»] chr4 (15 HSPs)
chr4 (15-311)||(8487262-8487559)
chr4 (15-311)||(23873757-23874054)
chr4 (15-302)||(20673271-20673561)
chr4 (30-310)||(2630975-2631256)
chr4 (15-311)||(55298185-55298479)
chr4 (17-201)||(12776599-12776783)
chr4 (15-177)||(33312961-33313124)
chr4 (33-311)||(7663519-7663798)
chr4 (42-310)||(23279197-23279465)
chr4 (42-255)||(47540515-47540728)
chr4 (42-255)||(3130316-3130529)
chr4 (42-250)||(8655415-8655623)
chr4 (42-220)||(1121016-1121194)
chr4 (32-153)||(25875129-25875250)
chr4 (42-119)||(5817654-5817731)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (15-311)||(32353578-32353875)
chr1 (15-311)||(38231249-38231546)
chr1 (15-310)||(3692190-3692485)
chr1 (15-311)||(48073712-48074010)
chr1 (29-311)||(37530140-37530425)
chr1 (15-311)||(14119326-14119624)
chr1 (42-310)||(36928757-36929025)
chr1 (33-310)||(36305364-36305642)
chr1 (42-295)||(4644603-4644856)
chr1 (42-255)||(21527751-21527964)
chr1 (42-255)||(14365962-14366174)
chr1 (42-295)||(48266015-48266268)
chr1 (33-276)||(47115868-47116112)
chr1 (42-147)||(25639908-25640013)
chr1 (42-119)||(52336252-52336329)
chr1 (30-296)||(30970904-30971171)
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (15-309)||(33547434-33547729)
chr2 (15-311)||(43627060-43627358)
chr2 (33-309)||(13549704-13549981)
chr2 (15-311)||(9949545-9949842)
chr2 (33-309)||(22052207-22052484)
chr2 (29-241)||(26681457-26681670)
chr2 (15-234)||(31594116-31594336)
chr2 (33-310)||(31085919-31086197)
chr2 (29-229)||(35694209-35694410)
chr2 (33-311)||(45421098-45421377)
chr2 (108-295)||(26180222-26180409)
chr2 (102-296)||(31774334-31774528)
chr2 (32-100)||(32145482-32145550)
[»] chr7 (17 HSPs)
chr7 (15-311)||(13439615-13439912)
chr7 (15-309)||(30385762-30386056)
chr7 (15-285)||(28326918-28327189)
chr7 (15-310)||(45235512-45235808)
chr7 (135-309)||(45942534-45942708)
chr7 (15-212)||(3632365-3632561)
chr7 (19-295)||(12379022-12379299)
chr7 (29-293)||(3104479-3104744)
chr7 (42-295)||(46623294-46623547)
chr7 (33-310)||(15653987-15654265)
chr7 (42-295)||(43104901-43105154)
chr7 (42-123)||(21277520-21277601)
chr7 (42-119)||(9546327-9546404)
chr7 (168-235)||(38780607-38780674)
chr7 (186-256)||(43571887-43571957)
chr7 (168-256)||(5020908-5020996)
chr7 (29-123)||(38730079-38730175)
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (29-311)||(2871767-2872049)
chr8 (30-310)||(16421292-16421572)
chr8 (46-313)||(412645-412911)
chr8 (42-310)||(7451942-7452210)
chr8 (206-311)||(35405459-35405564)
chr8 (42-172)||(35405334-35405464)
chr8 (42-253)||(19385049-19385260)
chr8 (32-129)||(28542582-28542680)
chr8 (170-240)||(30501686-30501756)
chr8 (42-123)||(12218486-12218567)
chr8 (183-309)||(27083346-27083472)
chr8 (190-250)||(34642101-34642161)
[»] chr5 (10 HSPs)
chr5 (33-311)||(32917897-32918176)
chr5 (29-298)||(6264492-6264762)
chr5 (42-311)||(34480546-34480815)
chr5 (15-227)||(34858058-34858271)
chr5 (33-309)||(15499929-15500206)
chr5 (42-255)||(10487243-10487456)
chr5 (46-256)||(587110-587320)
chr5 (189-298)||(31862330-31862439)
chr5 (46-286)||(6020332-6020572)
chr5 (45-114)||(4399470-4399539)
[»] scaffold0287 (1 HSPs)
scaffold0287 (15-212)||(13524-13720)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (33-311)||(7255-7534)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (42-253)||(134975-135186)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (42-253)||(312802-313013)
scaffold0002 (42-253)||(328256-328467)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (86-123)||(12339-12376)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 15 - 311
Target Start/End: Original strand, 15673387 - 15673684
Alignment:
Q  15 acaaaacacaccataaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 113  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15673387 acaaaacacaccagaacaacattagccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 15673486  T
Q  114 aaccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaaccc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15673487 aaccaacctagagacagcagcttaatcttatctaataaacaagggatgggggtaacaaaatgattaaacaaacggttattacgttcattccaaacaaccc 15673586  T
Q  214 aggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatct 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15673587 aggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaaatattatct 15673684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23348043 - 23347747
Alignment:
Q  16 caaaacacaccataaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttca 114  Q
    ||||| |||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23348043 caaaatacactagaaaaacattagtcaatacccaaacaaacaagagggcgtgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttca 23347944  T
Q  115 accaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaaccca 214  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23347943 accaacctagagacaacaacttaatcttatctggtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaaccca 23347844  T
Q  215 ggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatct 311  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23347843 ggcacataaaagccatattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccgcctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaaatattatct 23347747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 29 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8873390 - 8873107
Alignment:
Q  29 aaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagaga 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  8873390 aaaaacattagccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcagccaacctaaaga 8873291  T
Q  128 cagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagc 227  Q
    || || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8873290 catcaacttaaccttatcaagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacagacggttatttcgttcattccaaacaacccagacacatagaagc 8873191  T
Q  228 caaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatct 311  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  8873190 catattagttgcataaaagaacgtctaacagcaccaccacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatcgaaaatattatct 8873107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 30 - 311
Target Start/End: Original strand, 13755042 - 13755324
Alignment:
Q  30 aaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagac 128  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13755042 aaaacattagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagac 13755141  T
Q  129 agcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagcc 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  13755142 agcagtttaatcttatctagtaaacaatggatgggggtaacaacctgattaaacatacggttgttacgctcattccacacaacccagacacatagaagtc 13755241  T
Q  229 aaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatct 311  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13755242 atattagttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgatatattatct 13755324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 33 - 311
Target Start/End: Original strand, 25317434 - 25317713
Alignment:
Q  33 acattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagc 131  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| |    
T  25317434 acattagccaatatccaaacaaacaagagggcttgacgaccactgctgagttccaaaaacaaaggtagtttttttaactttaagccaacctaaagacaac 25317533  T
Q  132 agcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaa 231  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| | ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  25317534 atcttaatcttatctaataaacaagggatgggggtaacaacctgattaaagagacggttatttctttcattccacacaactcatgcacaaagaagccaaa 25317633  T
Q  232 ttagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatct 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||    
T  25317634 ttagttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctgtcaaatgagtaaactgtaaaaaatgatcgaaaatattatct 25317713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 33 - 311
Target Start/End: Original strand, 26204928 - 26205207
Alignment:
Q  33 acattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagc 131  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| |    
T  26204928 acattagccaatatccaaacaaacaagagggcttgacgaccactgctgagttccaaaaacaaaggtagtttttttaactttaagccaacctaaagacaac 26205027  T
Q  132 agcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaa 231  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| | ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  26205028 atcttaatcttatctaataaacaagggatgggggtaacaacctgattaaagagacggttatttctttcattccacacaactcatgcacaaagaagccaaa 26205127  T
Q  232 ttagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatct 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||    
T  26205128 ttagttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctgtcaaatgagtaaactgtaaaaaatgatcgaaaatattatct 26205207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 19348842 - 19349125
Alignment:
Q  21 cacaccataaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaa 119  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||          | ||||    
T  19348842 cacaacataaagacattagccaatacccatacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagttccaaaaacaaaggtagcttta---------agccaa 19348932  T
Q  120 cctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcac 219  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19348933 cctaaagacaacatcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaccatgattaaacatacggttatttcgttcattccaaacaacccaggcac 19349032  T
Q  220 atagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaa--ctgtaaaaaatgatctgaagtattatc 310  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||   |||||||||||||| ||| |||||||    
T  19349033 agagaagccatattagttgcataaaagaccgtctagcaacaccaccacctgtcaaatgagtaaattgtgtaaaaaatgatcggaaatattatc 19349125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 255
Target Start/End: Original strand, 33629688 - 33629900
Alignment:
Q  42 atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagcttaatct 141  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||  |||| ||  || | ||    
T  33629688 atactcaaacacacaagagggcatgaccaccactgttgagtaccaaacacaaaagtag-ttttttagctttcaaccaagctaaggacaacaatttgacct 33629786  T
Q  142 tatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcat 241  Q
    | ||||  ||||  || ||||| || |  | || ||||||||  || ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  33629787 tgtctaacaaacggggaatgggagttattatattattaaacaggcgattatttcgttaattccacacaacccaggcacagagaagccaaataagttgcat 33629886  T
Q  242 aaaagaacgtctag 255  Q
    ||||||||||||||    
T  33629887 aaaagaacgtctag 33629900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 171 - 262
Target Start/End: Original strand, 1682765 - 1682856
Alignment:
Q  171 acatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacacc 262  Q
    |||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1682765 acattattaaacagacgattatttcgttcattccacacaacccaggcacagagaagccaaataagttgcataaaagaacgtctagcaccacc 1682856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 76 - 302
Target Start/End: Original strand, 19256669 - 19256895
Alignment:
Q  76 gttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatg 175  Q
    ||||||| ||| | |||||  ||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||| ||| |||| |||||  || || |  ||||||||||     
T  19256669 gttgagtaccatacacaaaaataggttttatagctttcaaccatcctaaagacaacatattaaccttgtctaataaacggggaatagacgtaacaacatt 19256768  T
Q  176 attaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaa 275  Q
    |||||| |  |  ||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||| | ||||||| |    
T  19256769 attaaagaggcaattatttcgttcattccaaacaacctagacacacagaagccaaatgagttgcataaaagagcgtctagctttaccagcccctgtcaga 19256868  T
Q  276 tgagtgaactgtaaaaaatgatctgaa 302  Q
     ||||  | || |||||||||||||||    
T  19256869 agagtacattgcaaaaaatgatctgaa 19256895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 94
Target Start/End: Original strand, 4596465 - 4596528
Alignment:
Q  32 aacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaa 94  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  4596465 aacattagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccgctgttgagagccaaaaacaaa 4596528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 285
Target Start/End: Original strand, 4406736 - 4406845
Alignment:
Q  176 attaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaa 275  Q
    |||||||| ||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||| |||||||||||   |||| ||||| ||| |    
T  4406736 attaaacagacgattgtttcgttcattccacacaacccaggcacaaagaagtcatattagctgcagaaacgaacgtctagctttaccaccacctatcata 4406835  T
Q  276 tgagtgaact 285  Q
    ||||| ||||    
T  4406836 tgagtaaact 4406845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 276
Target Start/End: Original strand, 4474414 - 4474522
Alignment:
Q  168 acaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcac 267  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||  |||| || ||||| | ||| |||||||| || || |||||||| |||||| ||||   ||||  ||    
T  4474414 acaacattattaaacatgtggttattacgttcggtccacacgacccaagtacaaagaagccagatgagctgcataaaggaacgtttagctttaccaaaac 4474513  T
Q  268 ctgtcaaat 276  Q
    |||||||||    
T  4474514 ctgtcaaat 4474522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 229
Target Start/End: Original strand, 14528110 - 14528150
Alignment:
Q  189 ttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagcca 229  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  14528110 ttattacgttcattccacacaaccaaggcacaaagaagcca 14528150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 240
Target Start/End: Original strand, 24749364 - 24749436
Alignment:
Q  168 acaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgca 240  Q
    ||||||| ||| ||||  ||||| || ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||    
T  24749364 acaacattattgaacaaccggttgtttcgttcattccagacaacccaagtacacagaagccaaattagctgca 24749436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 256
Target Start/End: Original strand, 33745819 - 33745899
Alignment:
Q  176 attaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagc 256  Q
    |||||||| ||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || || || | ||| |||||||||||    
T  33745819 attaaacagacgattatttcgctcattccacacaacccaagcacaaagaagccatatgagctgaagaaatgaacgtctagc 33745899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 16)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Original strand, 23601335 - 23601631
Alignment:
Q  15 acaaaacacaccataaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23601335 acaaaacacaacataaaaacattagccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgttgagtcccaaaaacaaagatagcttttttagctttc 23601434  T
Q  114 aaccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaaccc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23601435 aaccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaaccc 23601534  T
Q  214 aggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatc 310  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23601535 aggcacaaagaagccagattagttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaaatattatc 23601631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 15 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 6177056 - 6176759
Alignment:
Q  15 acaaaacacaccataaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6177056 acaaaacacaccagaaaaacattagtcaatacccaaacaaacaagagggcgtgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 6176957  T
Q  114 aaccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaaccc 213  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6176956 aaccaacctagagacaacagcttaatcttatctagtaaacaagagatgagggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaaccc 6176857  T
Q  214 aggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatct 311  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6176856 aggcacataaaagccatattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaaatattatct 6176759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 15 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 2814078 - 2813781
Alignment:
Q  15 acaaaacacaccataaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 113  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2814078 acaaaacacactagaaaaacattagccaatacccaaacaaacaagagggcatgaccaccattgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 2813979  T
Q  114 aaccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaaccc 213  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  2813978 aaccaacctagagacaacaacttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccagactaccc 2813879  T
Q  214 aggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatct 311  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  2813878 aggcacatagaagtcatattagttgcataaacgaacgtctagcaacaccaccacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatttgaaatattatct 2813781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 29 - 311
Target Start/End: Original strand, 7146617 - 7146900
Alignment:
Q  29 aaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagaga 127  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7146617 aaaaacattagcaaatacccaaacaaacaagggggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagaga 7146716  T
Q  128 cagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagc 227  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7146717 catcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgttcattccaaacaacccaggcacaaagaagc 7146816  T
Q  228 caaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatct 311  Q
    || || ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7146817 catataagttgcaaaaaagaacgtctagcagcaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaaatattatct 7146900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 30 - 301
Target Start/End: Original strand, 29308984 - 29309257
Alignment:
Q  30 aaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagac 128  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29308984 aaaacattacccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagac 29309083  T
Q  129 agcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggg-gtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagc 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||     
T  29309084 agcagcttaatcttagctagtaaacaagagatggggggtaacaacatgattaaacatacggttgttacgctcattccacacaacccagacacatagaagt 29309183  T
Q  228 caaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctga 301  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309184 catattagttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctga 29309257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25873690 - 25873392
Alignment:
Q  15 acaaaacacaccataaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 113  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25873690 acaagacacagcataaaaacattagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagttccaaaaacaaagatagcttttttagctttc 25873591  T
Q  114 aaccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaaccc 213  Q
    | |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25873590 agccaacctaaagacatcaacttaaccttatcaagtaaacacgggatgggggtaacaacatgattaaacagacgattattacgttcattccaaacaaccc 25873491  T
Q  214 aggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaa-aaaatgatctgaagtattatct 311  Q
    || ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  25873490 agacacatagaagccatatgagttgcataaaagaacgcctagcagcaccaccacctgccaaatgagtgaactgtaaaaaaatgatcggaaatattatct 25873392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 9378689 - 9378955
Alignment:
Q  45 cccaaacaaacaagagggct-tgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagcttaatctta 143  Q
    ||||||||||  |||||||| | |||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| || ||||| |||     
T  9378689 cccaaacaaaagagagggctataaccaccattgttgtgtaccaataacaaaggtagcttttttaacttttagccaacctaaagacaacatcttaaccttg 9378788  T
Q  144 tctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcataa 243  Q
    |||| |||||  |||||||| |||||||||| |||||||| ||| |  || | |||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||    
T  9378789 tctaataaacgggggatgggagtaacaacattattaaacagacgatagtttcattcattccaaacaacccaggcacacagaagtcatatgagttgcataa 9378888  T
Q  244 aagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatc 310  Q
    ||||||| ||| ||  |||| ||| ||||| |||||| |||||||| ||||| || ||| |||||||    
T  9378889 aagaacgactatcattaccaccacttgtcatatgagtaaactgtaacaaatggtcggaaatattatc 9378955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30167905 - 30167626
Alignment:
Q  33 acattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagc 131  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||  | || ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |    
T  30167905 acattagccaatacccaaacaaacaagagggcatgaccaccactgccgggtaccataaacaaaagtagcttttctagctttcaaccaacctaaggacaac 30167806  T
Q  132 agcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaa 231  Q
    | |||||  || ||||  ||||  || ||| | || |  |||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  30167805 atcttaactttgtctaacaaacggggaatgagagttattacattattaaacagacgattattgcgttcattccacacaacccatgcacaaagaagccata 30167706  T
Q  232 ttagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatct 311  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||    
T  30167705 taagttgcataaaagaacgtctagaaacagcaccacccgtcaaataagtaaactgaagaaaatgatcggaaatattatct 30167626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 49732483 - 49732270
Alignment:
Q  42 atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagcttaatct 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||  || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||| || ||| | ||    
T  49732483 atacccaaacacacaagagggcatgaccaccactgctgagtaccaaacacaaaagtagcttttttagctttcaaccaagctaaggacaacatcttgacct 49732384  T
Q  142 tatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcat 241  Q
    | ||||  ||||  || ||| | || |  |||| |||||||| ||| ||||| || || ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  49732383 tgtctaacaaacggggaatgagagttattacattattaaacagacgattatttcgctcgttccacacaacccgggcacagagaagccaaataagttgcat 49732284  T
Q  242 aaaagaacgtctag 255  Q
    ||||||||||||||    
T  49732283 aaaagaacgtctag 49732270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 28675434 - 28675212
Alignment:
Q  87 aaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatac 186  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| ||||  || | ||| ||||| |||||||||| |||||| |  |    
T  28675434 aaaacaaaagtagcttttttaactttcaaccagcctaaagacaacatcttaaccttgtctaacaatcgaggaatgggagtaacaacattattaaataggc 28675335  T
Q  187 ggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactg 286  Q
    | ||||| |||| |||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||| |||||| || ||    
T  28675334 gattatttcgttaattccacacaacacagacacacagaagtcaaatgagttgcataaaagaacgtctagctttaccatcacctatcatatgagtaaattg 28675235  T
Q  287 taaaaaatgatctgaagtattat 309  Q
     || ||||| || ||| ||||||    
T  28675234 caataaatggtccgaaatattat 28675212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 171 - 255
Target Start/End: Original strand, 13448197 - 13448281
Alignment:
Q  171 acatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctag 255  Q
    |||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13448197 acattattaaacagacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacagagaagccaaataagttgcataaaagaacgtctag 13448281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 255
Target Start/End: Original strand, 24227408 - 24227617
Alignment:
Q  45 cccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagcttaatcttat 144  Q
    |||||||| |||| |||||  ||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||  |||| || |||||  || |    
T  24227408 cccaaacagacaaaagggcacgaccaccattgctgagtactaaaaacaaaagtaatttttttagctttcaaccaacctaacgacaacatcttaactttgt 24227507  T
Q  145 ctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcataaa 244  Q
    ||| ||| |  || ||||| ||||||| ||   |||| |  || |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||    
T  24227508 ctaataagctgggaatgggagtaacaatatttctaaagaggcgattattacgttcatttcatacaacccaagcacacagaa-ccaaatgagttgcatgaa 24227606  T
Q  245 agaacgtctag 255  Q
    ||  |||||||    
T  24227607 agggcgtctag 24227617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 119
Target Start/End: Original strand, 32004570 - 32004647
Alignment:
Q  42 atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaa 119  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||  || ||||| ||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  32004570 atacccaaacatacaagagggcatgaccaccactgctgagtaccaaacacaaaagtagttcttttagctttcaaccaa 32004647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 19824219 - 19824101
Alignment:
Q  168 acaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcac 267  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||| |||| ||| | ||||||||  || |||||||| | ||| |||||| ||||   |||| |||    
T  19824219 acaacattattaaacaggcggttattacgttcgttccacacaatccaagtacatagaattcagattagttgtaaaaaggaacgtttagctttaccaacac 19824120  T
Q  268 ctgtcaaatgagtgaactg 286  Q
    ||||||||| ||| |||||    
T  19824119 ctgtcaaataagtaaactg 19824101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 6517936 - 6517893
Alignment:
Q  30 aaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccacc 72  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  6517936 aaaacattagccaatatccaaacaaacaagagggcttgaccacc 6517893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 119
Target Start/End: Original strand, 13448069 - 13448145
Alignment:
Q  42 atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaa 119  Q
    |||| |||||| ||||||| ||  |||||||  |||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13448069 atactcaaacacacaagagagcaagaccaccactgttgagtaccaaacacaaaagtag-ttttttagctttcaaccaa 13448145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 15 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8487559 - 8487262
Alignment:
Q  15 acaaaacacaccataaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8487559 acaaaacacaccagaaaaacattagtcaatacccaaacaaacaagagggcgtgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 8487460  T
Q  114 aaccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaaccc 213  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8487459 aaccaacctagagacaacagcttaatcttatctaataaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcagtccaaacaaccc 8487360  T
Q  214 aggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatct 311  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  8487359 aggcacataaaagccatattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctgtcaaataagtgaactgtaagaaatgatctgaaatattatct 8487262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23874054 - 23873757
Alignment:
Q  15 acaaaacacaccataaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 113  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23874054 acaaaacacaacagaaaaaccttagccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 23873955  T
Q  114 aaccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaaccc 213  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23873954 aaccaacctagagacaacagcttaatcttatcaagtaaacaggggatgggggtcacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaaccc 23873855  T
Q  214 aggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatct 311  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23873854 aggcacaaagaagccagattagttgcataaaagaacgtctagcagcacctccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaaatattatct 23873757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 302
Target Start/End: Original strand, 20673271 - 20673561
Alignment:
Q  15 acaaaacacaccataaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  20673271 acaaaacacaacataaaaacattagcaaatacccaaacaaacaagagagcttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggaagcttttttagcttta 20673370  T
Q  114 aaccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaaccc 213  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  20673371 taccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattatgttcattccaaacaacct 20673470  T
Q  214 aggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtc-aaatgagtgaactgt-aaaaaatgatctgaa 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20673471 aggcacatagaagccatattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccaactgtcaaaatgagtgaactgtaaaaaaatgatctgaa 20673561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 30 - 310
Target Start/End: Original strand, 2630975 - 2631256
Alignment:
Q  30 aaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagac 128  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2630975 aaaacattagccaatacctaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagtcctaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagac 2631074  T
Q  129 agcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagcc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2631075 agcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacaaacggttgttacgctcattccacacaacccatgcacatagaagcc 2631174  T
Q  229 aaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatc 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  2631175 atattagttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccacctgtcaaatgagtgaactggaaaaaatgatctgatatattatc 2631256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 311
Target Start/End: Original strand, 55298185 - 55298479
Alignment:
Q  15 acaaaacacaccataaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 113  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55298185 acaaaacacaacagaaaaaccttagccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 55298284  T
Q  114 aaccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaaccc 213  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55298285 aaccaacctagagacaacaacttaatcttatcaagtaaacaggggataggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaaccc 55298384  T
Q  214 aggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatct 311  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  55298385 aggcacaaagaagccagattagttgcataaaagaacgt---gcagcaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgagctgaaatattatct 55298479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12776783 - 12776599
Alignment:
Q  17 aaaacacaccataaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaa 115  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12776783 aaaacacaacagaaaaacattagccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagctcttttagctttcaa 12776684  T
Q  116 ccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12776683 ccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggat-ggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcat 12776599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 177
Target Start/End: Original strand, 33312961 - 33313124
Alignment:
Q  15 acaaaacacaccataaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 113  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  33312961 acaaaacacaacagaaaatcattagccaatgcccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaagtaacttttttaactttc 33313060  T
Q  114 aaccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgat 177  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33313061 aaccaacctaaagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggagtaacaacatgat 33313124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 7663798 - 7663519
Alignment:
Q  33 acattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagc 131  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||  || || || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |    
T  7663798 acattagccaatacccaaacaaacaagagagcatgaccaccactgatgggtaccaaaaacaaaagtagcttttctagctttcaaccaacctaaggacaac 7663699  T
Q  132 agcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaa 231  Q
    | ||||| ||| ||||  ||||  || ||| | || |  |||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  7663698 atcttaaccttgtctaacaaacggggaatgagagttattacattattaaacagacgattattgcgttcattccacacaacccatgcacaaagaagccata 7663599  T
Q  232 ttagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatct 311  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||| ||| || || | ||||||||| ||| ||||||||    
T  7663598 taagttgcataaaagaacgtctagaaacaaaaccacctgtcaaataagtaaaatgaataaaatgatcggaaatattatct 7663519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 310
Target Start/End: Original strand, 23279197 - 23279465
Alignment:
Q  42 atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagcttaatct 141  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| | ||| |||| ||  | || ||||| ||    
T  23279197 atacccaaacaaacaagagggcaagaccaccactgttgggtaccgaaaacaaaagtagcttttttaccttttagccaccctaaaggaaacatcttaacct 23279296  T
Q  142 tatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcat 241  Q
    | |||| |||||  |||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||| || ||||||||    
T  23279297 tgtctaataaacgggggatgggagtaacaacattattaaacagacgattatttcgttcgttccacacaacccacacacaaagaagccatataagttgcat 23279396  T
Q  242 aaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatc 310  Q
    |||||| | |||||    | ||  ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||| |||||||    
T  23279397 aaaagagcatctagagtgagcactacctgtcaaataagtaaactgtaaaaaatggtcagaaatattatc 23279465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 255
Target Start/End: Original strand, 47540515 - 47540728
Alignment:
Q  42 atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagcttaatct 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||  || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||  |||| || ||| | ||    
T  47540515 atacccaaacacacaagagggcatgaccaccactgctgagtaccaaacacaaaagtagcttttttagctttcaaccaagttaaggacaacatcttgacct 47540614  T
Q  142 tatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcat 241  Q
    | ||||  ||||  |  ||| | || |  |||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  47540615 tgtctaacaaacgggaaatgagagttattacattattaaacagacgattatttcgttcattccacacaacccaggcacagagaagccaaataagttgcat 47540714  T
Q  242 aaaagaacgtctag 255  Q
    ||||||||||||||    
T  47540715 aaaagaacgtctag 47540728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 3130529 - 3130316
Alignment:
Q  42 atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagcttaatct 141  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||  ||||||||  |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||  |||| ||  || | ||    
T  3130529 atacccaaacacacaagagggcaagaccaccactgttgagtatcaaacacaaaagtagtttttttagctttcaaccaagctaaggacaacaatttgacct 3130430  T
Q  142 tatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcat 241  Q
    | ||||  || |  || ||| | || |  |||| |||||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3130429 tgtctaacaagcggggaatgagagttattacattattaaacagacgattattttgttcattccacacaacccaggcacaaagaagccaaataagttgcat 3130330  T
Q  242 aaaagaacgtctag 255  Q
    ||||||||||||||    
T  3130329 aaaagaacgtctag 3130316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8655623 - 8655415
Alignment:
Q  42 atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagcttaatct 141  Q
    ||||||||||| |  ||||||   |||||||  || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||| || ||| | ||    
T  8655623 atacccaaacacatgagagggtaagaccaccactgctgagtaccaaacacaaaagtagcttttttagccttcaaccaagctaaggacaacatcttgacct 8655524  T
Q  142 tatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcat 241  Q
    ||||||  ||||  || ||||| || |  |||| ||||||||  || ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8655523 tatctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacaggcgattatttcgctcattccacacaacccaggcacagagaagccaaataagttgcat 8655424  T
Q  242 aaaagaacg 250  Q
    |||||||||    
T  8655423 aaaagaacg 8655415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1121194 - 1121016
Alignment:
Q  42 atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagcttaatct 141  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| || |||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||  |||| || ||| | ||    
T  1121194 atacccaaacaaacaagagggcatgaccaccactgttgggtaccaaaaacaaagatagcttttttaattttcaatcaacctaaggacaacatctttacct 1121095  T
Q  142 tatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcaca 220  Q
    | ||||  ||||  |||||| | || |  |||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  1121094 tgtctaacaaacgggggatgtgagttattacattattaaacagacgattatttcgttcattccacacaatccaggcaca 1121016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 32 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 25875250 - 25875129
Alignment:
Q  32 aacattagccatacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagc 131  Q
    |||||||||||   |||||||||||| |||| |||||||||  || || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  25875250 aacattagccaattccaaacaaacaaaagggtttgaccaccactgatgcgtgccaaaaacaaaggtagtttttttagctttcaaccaacctaaagacaac 25875151  T
Q  132 agcttaatcttatctagtaaac 153  Q
    | ||||| ||| |||| |||||    
T  25875150 atcttaaccttgtctaataaac 25875129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 5817731 - 5817654
Alignment:
Q  42 atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaa 119  Q
    ||||||||||| | ||||||||  |||||||  || ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  5817731 atacccaaacacataagagggcaagaccaccactgctgagtaccaaacacaaaagtagtttttttagctttcaaccaa 5817654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 15 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 32353875 - 32353578
Alignment:
Q  15 acaaaacacaccataaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 113  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32353875 acaaaacacaacagaaaaacattagccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 32353776  T
Q  114 aaccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaaccc 213  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32353775 aaccaacctagagacaacagcttaatcttatcaagtaaacaagggatgggggtaacaacataattaaacatacggttattacgttcattccaaacaaccc 32353676  T
Q  214 aggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatct 311  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  32353675 aggcacaaagaagccagattagttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccacctatcaaatgagtgaactataaaaaatgatctgaaatattatct 32353578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 311
Target Start/End: Original strand, 38231249 - 38231546
Alignment:
Q  15 acaaaacacaccataaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 113  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38231249 acaaaacacaccaggaaaacattagccaatacccaaacaaacaagagggcgtgaccaccactgatgagtcccaaaaacgaaggtagcttttttagctttc 38231348  T
Q  114 aaccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaaccc 213  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38231349 aaccaacctagagacaacagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaactc 38231448  T
Q  214 aggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatct 311  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  38231449 aggcacatagaagtcatattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctgtcaaaaaagtgaaatgtaaaaaatgatatgaaatattatct 38231546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Original strand, 3692190 - 3692485
Alignment:
Q  15 acaaaacacaccataaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 113  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3692190 acaaaacacaacataaaa-cattagccaatactcaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 3692288  T
Q  114 aaccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaaccc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| |||||||    
T  3692289 aaccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacaaacggttgctacgctcattccacacaaccc 3692388  T
Q  214 aggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatc 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||    
T  3692389 aggcacatagaagccatattagttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccacctgtcaaatgagtgaactggaaaaaatgatatgatatattatc 3692485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 48074010 - 48073712
Alignment:
Q  15 acaaaacacaccataaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 113  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48074010 acaaaacacaacagaaaaaccttagccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 48073911  T
Q  114 aaccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaaccc 213  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48073910 aaccaacctagagacaacagcttaaccttatcaagtaaacaggggatgggggtaacaacgtgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaaccc 48073811  T
Q  214 aggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaa-aaaatgatctgaagtattatct 311  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  48073810 aggcacaaagaagccagattagttgcataaaagaacgtctaacagcaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaaatgagctgaaatattatct 48073712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 29 - 311
Target Start/End: Original strand, 37530140 - 37530425
Alignment:
Q  29 aaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagaga 127  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  37530140 aaaaacattagccaatatccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcagccaacctaaaga 37530239  T
Q  128 cagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagc 227  Q
    || || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37530240 catcaacttaaccttatcaagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacaaacgattattaagttcattccaaacaacccagacacatagaagc 37530339  T
Q  228 caaattagttgcataaaagaacgtctagc--aacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatct 311  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  37530340 catattagttgcataaaagaacgtctagcagaacaccaccacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatcgaaaatattatct 37530425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 311
Target Start/End: Original strand, 14119326 - 14119624
Alignment:
Q  15 acaaaacacaccataaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 113  Q
    |||| ||||| || |||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14119326 acaagacacaacagaaaaacattacccaatattcaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagtttcgaaaacaaaggtaacttttttagctttc 14119425  T
Q  114 aaccaacctaga-gacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacc 212  Q
    | |||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14119426 agccaacctaaaagacaacatcttaatcttatctagtaaacaagggacgggggtaacaacatgattaaacagacgattatttcgttcattccaaacaacc 14119525  T
Q  213 caggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatct 311  Q
    ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  14119526 cagacacataaaagccatattagttgcataaaagaccgtctagcaacaccaccacctgtcaaatgagtaaactgtaaaaaatgatcggaaatattatct 14119624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 310
Target Start/End: Original strand, 36928757 - 36929025
Alignment:
Q  42 atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagcttaatct 141  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||| | ||    
T  36928757 atacccaaacaaacaagagggcttaaccaccactgttgggtaccaaaaacaaagatagcttttttagctttcaaccaacctaaggacaacatctttacct 36928856  T
Q  142 tatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcat 241  Q
    | ||||  |||| ||||||||| || | ||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  36928857 tgtctaacaaacgagggatgggagttataacattattaaacagacgattatttcgttcattccacacaacccaagcacaaagtagccaaataagttgcat 36928956  T
Q  242 aaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatc 310  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||| || || | ||||||||||||| |||||||    
T  36928957 aaaagaacgtctagaaacagcaccacctgtcaaataagtaaattgaagaaaatgatctgaaatattatc 36929025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Original strand, 36305364 - 36305642
Alignment:
Q  33 acattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagc 131  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||  ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  36305364 acattagccaatagccaaacaaacaagagggcatgaccaccactgttgggtactgaaaacaaagatagcttttttagctttcaaccaacctaaggacaac 36305463  T
Q  132 agcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaa 231  Q
    | ||| | ||| ||||  ||||   | ||||| || |  |||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| |    
T  36305464 atctttaccttgtctaacaaacggagaatgggagttattacattattaaacagacgattatttcgttcattccacacaacccagacacaaagtagccata 36305563  T
Q  232 ttagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatc 310  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||| || || | ||||||||||||| |||||||    
T  36305564 taagttgcataaaagaacgtctagaaacagcaccacctgtcaaataagtaaattgaagaaaatgatctgaaatattatc 36305642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 295
Target Start/End: Original strand, 4644603 - 4644856
Alignment:
Q  42 atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagcttaatct 141  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||  || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||| || ||| | ||    
T  4644603 atacccaaacacacaagagggcacgaccaccactgctgagtaccaaacacaaaagtagctttttttgctttcaaccaacctaaggacaacatcttgacct 4644702  T
Q  142 tatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcat 241  Q
    | ||||  ||||  || ||||  || |  |||| |||||||| | | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  4644703 tgtctaacaaactgggaatggaagttattacattattaaacagatgattatttcgttcattccacacaacccaggcacagagaagccaaacaagttgcat 4644802  T
Q  242 aaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatg 295  Q
    |||||||||||||| |  | || || ||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  4644803 aaaagaacgtctagaattagcaccatctgtcaaataagtaaactgtagaaaatg 4644856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 255
Target Start/End: Original strand, 21527751 - 21527964
Alignment:
Q  42 atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagcttaatct 141  Q
    ||||||||||| | ||||||||  |||||||  || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  || | || ||| | ||    
T  21527751 atacccaaacacataagagggcaagaccaccactgctgagtaccaaacacaaaagtagcttttttagccttcaaccaagctaaggataacatcttgacct 21527850  T
Q  142 tatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcat 241  Q
    ||||||  ||||  || ||||| || |  |||| ||||||||  || ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21527851 tatctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacagtcgattatttcgctcattccacacaacccaggcacagagaagccaaataagttgcat 21527950  T
Q  242 aaaagaacgtctag 255  Q
    ||||||||||||||    
T  21527951 aaaagaacgtctag 21527964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 14366174 - 14365962
Alignment:
Q  42 atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagcttaatct 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||  || ||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||| || ||| | ||    
T  14366174 atacccaaacacacaagagggcatgaccaccactgctgagtaccaaacacaaaa-tagcttttttagctttcaaccaagctaaggacaacatcttgacct 14366076  T
Q  142 tatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcat 241  Q
    | ||||  ||||  || ||| | || |  |||| |||||||| ||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||    
T  14366075 tgtctaacaaacggggaatgagagttattacattattaaacagacgattatttcgctcattccacacaacccaagcacagagaagctaaataagttgcat 14365976  T
Q  242 aaaagaacgtctag 255  Q
    ||||||||||||||    
T  14365975 aaaagaacgtctag 14365962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 48266268 - 48266015
Alignment:
Q  42 atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagcttaatct 141  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||  || | |||  |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||  |||| || ||| | ||    
T  48266268 atacccaaacacacaagagggtatgaccaccactgctaagtatcaaacacaaaagtagtttttttagctttcaaccaagctaaggacaacatcttgacct 48266169  T
Q  142 tatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcat 241  Q
    |  |||  ||||  || ||| | || |  |||| |||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  48266168 tgcctaacaaacggggaatgagagttattacattattaaacagacgattatttcgctcattccacacaacccagacacagagaagccaaataagttgcat 48266069  T
Q  242 aaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatg 295  Q
    |||| ||| |||||    | ||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||    
T  48266068 aaaataacatctagacttagcatcacctgtcaaataagtaaactgaagaaaatg 48266015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 276
Target Start/End: Original strand, 47115868 - 47116112
Alignment:
Q  33 acattagcc-atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagc 131  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||  || || || |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||  |||  |||| |    
T  47115868 acattagcctatacccaaacacacaagagggcatgaccaccactgctgggtaccaaaagcaaaaatagcttttttagctttcaaccattctaaggacaac 47115967  T
Q  132 agcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaa 231  Q
    | ||| | ||| |||   ||||| || ||| | || |  |||| |||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||| |||||||| | ||| || |    
T  47115968 atctttaccttgtctgacaaacagggaatgagagttattacattattaaacagacgattattttgttcattccacacaactcaggcacaaaaaagtcata 47116067  T
Q  232 ttagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaat 276  Q
    | | |||||||||||||||||||| |  | || ||||||||||||    
T  47116068 taaattgcataaaagaacgtctagaattaacaccacctgtcaaat 47116112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25640013 - 25639908
Alignment:
Q  42 atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagcttaatct 141  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||  || || || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||  |||| || ||||| ||    
T  25640013 atacccaaacaaacaagagggtatgaccaccactgctgggtaccaaaaacaaaagtagcttttctagctttcaactaacttaaggacaacatcttaacct 25639914  T
Q  142 tatcta 147  Q
    ||||||    
T  25639913 tatcta 25639908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 119
Target Start/End: Original strand, 52336252 - 52336329
Alignment:
Q  42 atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaa 119  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||  || ||||| ||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  52336252 atacccaaacacacaagagggcatgaccaccactgctgagtaccaaacacaaaaatagcttttttatctttcaaccaa 52336329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 30971171 - 30970904
Alignment:
Q  30 aaaacattagcc-atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagac 128  Q
    |||||||||||| |||||||| |||   | |||||| |||||||  || ||||||||||||  |||  |  | |||||||||| || |||||||| ||||    
T  30971171 aaaacattagcctatacccaagcaagttaaagggctagaccaccactgctgagttccaaaagtaaaaatgacatttttagcttgcagccaacctaaagac 30971072  T
Q  129 agcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagcc 228  Q
    |  | |||||||||||  || | ||| || ||||| |||| |||||  |||||||  ||  |||| || |||| ||| |||||||| ||||| || ||||    
T  30971071 aataacttaatcttataaagcagacagggaatgggagtaaaaacattgttaaacaatcgactattgcgctcatgccacacaacccaagcacaaaggagcc 30970972  T
Q  229 aaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatga 296  Q
    | || |||||||| ||||||| | ||||   |||  |||||| || |||||||||||| || ||||||    
T  30970971 agatgagttgcatgaaagaacatttagctttaccgccacctgccatatgagtgaactgaaacaaatga 30970904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 309
Target Start/End: Original strand, 33547434 - 33547729
Alignment:
Q  15 acaaaacacaccataaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 113  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33547434 acaaaacacaacagaaaaaccttagccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 33547533  T
Q  114 aaccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaaccc 213  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33547534 aaccaacctagagacaacagcttaaccttatcaagtaaacaggggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaaccc 33547633  T
Q  214 aggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattat 309  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  33547634 aggcacaaagaagccagattagttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgagctgaaatattat 33547729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 311
Target Start/End: Original strand, 43627060 - 43627358
Alignment:
Q  15 acaaaacacaccataaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagctttt-ttagcttt 112  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  43627060 acaaaaaacaacagaaaaacattagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaatgtagctttttttagcttt 43627159  T
Q  113 caaccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacc 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43627160 caaccaacctagagacaacagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgttcattccaaacaacc 43627259  T
Q  213 caggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatct 311  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  43627260 caggcacaaagaagccatataagttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatatgaaatattatct 43627358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 33 - 309
Target Start/End: Original strand, 13549704 - 13549981
Alignment:
Q  33 acattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagc 131  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||| ||||| |    
T  13549704 acattagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagttccaaaaacaaaggtagcttttttaactttaagtcaacctaaagacaac 13549803  T
Q  132 agcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaa 231  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13549804 atcttaatcttatctaataaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacagacggttatttcgttcattccacacaacccaggcacaaagaagccaaa 13549903  T
Q  232 ttagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattat 309  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13549904 taagttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctgtcaaatgagtaaactgtaaaaaatgatcggaaatattat 13549981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9949842 - 9949545
Alignment:
Q  15 acaaaacacaccataaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 113  Q
    |||| ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  9949842 acaagacacagcaaaaagacattagccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagtgtcaaaaacaaaggtagcttttttagctttt 9949743  T
Q  114 aaccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaaccc 213  Q
    | |||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9949742 agccaacctaaagacatcaacttaaccttatcaagtaaacaagggatgggggtaaccacatgattaaacagacgattattacgttcattccaaacaaccc 9949643  T
Q  214 aggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatct 311  Q
    || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  9949642 agacacatagaagccatataagttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccaccagccaaaagagtgaactgtaaaaaatgatcggaaatattatct 9949545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 33 - 309
Target Start/End: Original strand, 22052207 - 22052484
Alignment:
Q  33 acattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagc 131  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |    
T  22052207 acattagccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagttccaaaaacaaaagtagcttttttagctttaagccaacctaaagacaac 22052306  T
Q  132 agcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaa 231  Q
    | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  22052307 aacttaatcttatctaataaacaatggatgggggtaacaacatgattaaactgacggttatttcgttcattccagataacccagacacatagaagccaaa 22052406  T
Q  232 ttagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattat 309  Q
    | ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||    
T  22052407 tgagttgcaaaaaagaccgtctagcaacaccaccacctgacaaatgagtaaactgaagaaaatgatcggaaatattat 22052484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 241
Target Start/End: Original strand, 26681457 - 26681670
Alignment:
Q  29 aaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagaga 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  26681457 aaaaacattagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcagccaacctaaaga 26681556  T
Q  128 cagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagc 227  Q
    || || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26681557 caacaacttaaccttatcaagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacagacggttatttcgttcattccaaacaacccagacacatagaagc 26681656  T
Q  228 caaattagttgcat 241  Q
    || |||||||||||    
T  26681657 catattagttgcat 26681670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 234
Target Start/End: Original strand, 31594116 - 31594336
Alignment:
Q  15 acaaaacacaccataaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 113  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31594116 acaagacacaacagaaaaacattagccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 31594215  T
Q  114 aaccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaaccc 213  Q
    | |||||||| ||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31594216 agccaacctaaagacatcaatttaaccttatcaagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacagacggttatttcgttcattccaaacaaccc 31594315  T
Q  214 aggcacatagaagccaaatta 234  Q
    || ||||||||||||| ||||    
T  31594316 agacacatagaagccatatta 31594336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31086197 - 31085919
Alignment:
Q  33 acattagcc-atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagc 131  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  31086197 acattagcctatatccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgttgtataccaaaaacaaatgtagcttttttagctttcaactaacctaaagacaac 31086098  T
Q  132 agcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaa 231  Q
      ||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||| || |    
T  31086097 gtcttaatcttgtctaataaacacgggatgggagtaacaacattattaaacatgcggttatttcgttaattccaaacaacccaggcacacaaaaggcata 31085998  T
Q  232 ttagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatc 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  31085997 tgagttgcataaaagaacgtctagcattaccaccacctgacaaatgagtaaactgtaaaaaatgatcagaaatattatc 31085919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 229
Target Start/End: Original strand, 35694209 - 35694410
Alignment:
Q  29 aaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagaga 127  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||    
T  35694209 aaaaacattagccaatatccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagttccaaaaacaaaggtagtttttttagctttcagctaacctaaaga 35694308  T
Q  128 cagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagc 227  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  35694309 cagcgtcttaatcttatctagtaaacaagggatggggataacaacatgattaaacacacggttatttcgttcattccaaacaactcaagcacgtagaagc 35694408  T
Q  228 ca 229  Q
    ||    
T  35694409 ca 35694410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 311
Target Start/End: Original strand, 45421098 - 45421377
Alignment:
Q  33 acattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagc 131  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  || || || ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |    
T  45421098 acattagccaatacccaaacaaacaagagggcatgaccaccactgctgggtaccataaacaaaagtagcttttctagctttcaaccaacctaaggacaac 45421197  T
Q  132 agcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaa 231  Q
    | |||||  || ||||  ||||  || ||| | || |  |||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  45421198 atcttaactttgtctaacaaacgtggaatgtgagttattacattattaaacagacgattattgcgttcattccacacaacccatgcacaaagaagccata 45421297  T
Q  232 ttagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatct 311  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||| ||| || || | |||||||||  || ||||||||    
T  45421298 taagttgcataaaagaacgtctagaaacattaccacctgtcaaataagtaaattgaataaaatgatcgtaaatattatct 45421377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 26180409 - 26180222
Alignment:
Q  108 gctttcaaccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaa 207  Q
    ||||||| | |||||| ||||| || ||||| ||| |||| |||||  |||||||| |||||||||| |||| | |  || ||||| |||| ||| || |    
T  26180409 gctttcagctaacctaaagacatcatcttaaccttgtctaataaacgggggatgggagtaacaacattattataaaggcgattatttcgtttatttcata 26180310  T
Q  208 caacccaggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatg 295  Q
    |||| |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||  ||| || |||||||||||    
T  26180309 caactcaggcacacagaagccatatgagttgcagaaaagaacgcctagcattaccaccacctgccaaaaaagtaaattgtaaaaaatg 26180222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 296
Target Start/End: Original strand, 31774334 - 31774528
Alignment:
Q  102 tttttagctttcaaccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcat 201  Q
    ||||||||||||| | | |||| ||||| || ||||| |||||| || ||||| || ||||| |||| |||||  |||||||  ||  |||| |  ||||    
T  31774334 tttttagctttcagcaatcctaaagacaacatcttaaccttatcaagcaaacagggaatgggagtaataacatttttaaacaagcgactattgccctcat 31774433  T
Q  202 tccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatga 296  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||||||| | ||||   |||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  31774434 tccacacaactcaagcacaaagaagtcagatgagttgcatgaaagaacatttagctttaccgccacctgtcatatgagtgaactgcaaaaaatga 31774528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 100
Target Start/End: Original strand, 32145482 - 32145550
Alignment:
Q  32 aacattagcc-atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagc 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  | | || || |||||||||||||||||    
T  32145482 aacattagcctatacccaaacaaacaagagggctagaccacact-gctgtgtaccaaaaacaaaggtagc 32145550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 17)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 311
Target Start/End: Original strand, 13439615 - 13439912
Alignment:
Q  15 acaaaacacaccataaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 113  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13439615 acaaaacacaacagaaaaaccttagccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaacactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 13439714  T
Q  114 aaccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaaccc 213  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13439715 aaccaacctagagacaacagcttaaccttatcaagtaaacaggggatgggggtaacaacgtgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaaccc 13439814  T
Q  214 aggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatct 311  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13439815 aggcacaaagaagccagattagttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgagctgaaatattatct 13439912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 309
Target Start/End: Original strand, 30385762 - 30386056
Alignment:
Q  15 acaaaacacaccataaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||  || ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30385762 acaagacacaccagaaaaacattagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccgcccctgctgaatcccaaaaacaaatgtagcatttttagctttc 30385861  T
Q  114 aaccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaaccc 213  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30385862 aaccaacctagagacaacaacttaatcttgtctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaaccc 30385961  T
Q  214 aggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattat 309  Q
    || ||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  30385962 agacacatagaagccatataagttgcat-aaagaatgtctagcaacaccaccacctgtcaaatgagtgaactgtaaaacatgatctgaaatattat 30386056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 285
Target Start/End: Original strand, 28326918 - 28327189
Alignment:
Q  15 acaaaacacaccataaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 113  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||  || ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28326918 acaaaaaacaacagaaaaacattagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccgccactgctgagtcccaaaaacaaatatagcttttttagctttc 28327017  T
Q  114 aaccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaaccc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28327018 aaccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacattcggttattacgttcattccaaacaaccc 28327117  T
Q  214 aggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaact 285  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28327118 aagcacaaagaagccaaataagttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccacctatcaaatgagtgaact 28327189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Original strand, 45235512 - 45235808
Alignment:
Q  15 acaaaacacaccataaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 113  Q
    |||| ||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45235512 acaagacacagcagaaaaacaatagccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaccacgactgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagcattc 45235611  T
Q  114 aaccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaaccc 213  Q
    | |||||||| ||||| |  ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  45235612 agccaacctaaagacatcgtcttaatcttttctaataaacaagggatggggataacaacatgattaaacaaacggttatttcattcattccaaacaaccc 45235711  T
Q  214 aggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatc 310  Q
    || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||| |||||||    
T  45235712 agacacatggaagccatattagttgcataaaagaacgtctagcaattccaccacctgtcaaatgagtaaactgtcaaaaattatcagaaatattatc 45235808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 135 - 309
Target Start/End: Original strand, 45942534 - 45942708
Alignment:
Q  135 ttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaatta 234  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  45942534 ttaatcttatctaataaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacaaatggttatttcgttcattccacacaacccagacacaaagaagccaaatta 45942633  T
Q  235 gttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattat 309  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  45942634 gttgcataaaagaatgtgtagcaacaccaccacctgtcaaatgagtaaactgtaaaaaatgatcggaaatattat 45942708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 212
Target Start/End: Original strand, 3632365 - 3632561
Alignment:
Q  15 acaaaacacaccataaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 113  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  3632365 acaaaacacaccagaaaaatattagtcaatacccaaacaaacaagagggcgtgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaagataacttttttagctttc 3632464  T
Q  114 aaccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacc 212  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3632465 aactaacctaaagacaacagcttaatcttatctaat-aacaaagaat-ggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacc 3632561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12379299 - 12379022
Alignment:
Q  19 aacacaccataaaaacattagcc-atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaacc 117  Q
    |||||| || || |||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  12379299 aacacaacagaacaacattagcctatgcccaaacaaacaagcgggtttgaccaccattgctgtgttccaaaaacaaagttagcttttttagctttcagcc 12379200  T
Q  118 aacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggc 217  Q
    |||||| ||||| || |||||  || |||| |||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||  |  ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  12379199 aacctaaagacaacaacttaacattgtctaataaacaggggatgggagtaactacattattaaacaggcatttatttcgttcattccacacaacgcaggc 12379100  T
Q  218 acatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatg 295  Q
    ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||   |||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  12379099 acacagaagccatacgagttgcataaaagaacgtctagctttaccaccacctgtaaaataagtaaactgtaaaaaatg 12379022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 293
Target Start/End: Original strand, 3104479 - 3104744
Alignment:
Q  29 aaaaacattagcc-atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagaga 127  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  3104479 aaaaacagtagcctatatccaaacaaacaagagggttagaccaccattgttgtgtaccatgaacaaaggtagcttttttagctttcagccaacctaaaga 3104578  T
Q  128 cagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagc 227  Q
    || || ||||| ||| ||||| ||||| || ||||| || | ||||| |||||| |  || || || ||||||||||||||||| |||||||| | |||     
T  3104579 caacatcttaaccttgtctagcaaacatggaatgggagttataacatcattaaataggcgattgtttcgttcattccaaacaacacaggcacacataaga 3104678  T
Q  228 caaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaa 293  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||  | || ||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  3104679 cataatagttgcataaaagaacgtctagcattagcaccacttgtcaaatgaataaactgtaaaaaa 3104744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 295
Target Start/End: Original strand, 46623294 - 46623547
Alignment:
Q  42 atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagcttaatct 141  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |  || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||| || ||||| ||    
T  46623294 atacccaaacaaacaagagggcatgaccaccactactgggtaccaaaaacaaaagtagcttttttagctttcaaccatcctaaggacaacatcttaacct 46623393  T
Q  142 tatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcat 241  Q
    | ||||  ||||  || ||| | || |  |||| |||||||| ||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  46623394 tgtctaacaaacggggaatgagagttattacattattaaacagacgattatttcgttcatttcacacgacccatgcacaaagaagccatataagttgcat 46623493  T
Q  242 aaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatg 295  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||| ||||| | ||||||    
T  46623494 aaaagaacgtctagaaacaacaccacctgtcaaataagtaaactgaagaaaatg 46623547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15654265 - 15653987
Alignment:
Q  33 acattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagc 131  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |  || || || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||| ||||| |    
T  15654265 acattagccaatacccaagcaaacaagagggcatgaccatcactgctgggtaccaaaaacaaaagtagttttattagctttcaaccatcctaaagacaac 15654166  T
Q  132 agcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaa 231  Q
    | ||| | ||| ||||  ||||  || ||||| || |  |||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |    
T  15654165 atctttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacagacgattatttcgttcattccacacaactcatgcacaaagaagccata 15654066  T
Q  232 ttagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatc 310  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| ||| ||||| | |||||| || ||| |||||||    
T  15654065 taagttgcataaaagaacgtctagaaacagcaccacctatcaaataagtaaactgaagaaaatggtcggaaatattatc 15653987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 295
Target Start/End: Original strand, 43104901 - 43105154
Alignment:
Q  42 atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagcttaatct 141  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||  || | ||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| ||| | || ||||| ||    
T  43104901 atacccaaacaaacaagagggtttgactaccactgctcagagccaaaaacaaaacaagcttttttagctttcaaccatcctaaagaaaacatcttaacct 43105000  T
Q  142 tatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcat 241  Q
    | |||| |||||  || ||||| ||||| |||| ||||||||  || || ||  ||||||||||||||| ||| || || | ||||||||| |||| |||    
T  43105001 tgtctaataaacggggaatgggagtaaccacattattaaacaggcgattgttttgttcattccaaacaagccaagcgcacaaaagccaaatgagttacat 43105100  T
Q  242 aaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatg 295  Q
    |||||  |||| |||   |||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  43105101 aaaagcccgtcgagctctaccaccacctgtcaaatgagtaaactgcagaaaatg 43105154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 21277601 - 21277520
Alignment:
Q  42 atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaaccta 123  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  || || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21277601 atacccaaacaaacaagagggcatgaccaccactgctgggtaccaaaaacaaagatagcttttttagctttcaaccaaccta 21277520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 119
Target Start/End: Original strand, 9546327 - 9546404
Alignment:
Q  42 atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaa 119  Q
    ||||||||||| | ||||||||  |||||||  || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9546327 atacccaaacacataagagggcaagaccaccactgctgagtaccaaacacaaaagtagcttttttagctttcaaccaa 9546404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 38780674 - 38780607
Alignment:
Q  168 acaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattag 235  Q
    ||||||| ||| |||| |||| | |||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  38780674 acaacattattgaacagacggatgttacgttcgttccaaacaatccatgcacacagaagccaaattag 38780607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 256
Target Start/End: Original strand, 43571887 - 43571957
Alignment:
Q  186 cggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagc 256  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||| | ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  43571887 cggttattacgttcgttccacacaatccaagtacacagaatccaaattagctgcagaaaagaacgtttagc 43571957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 5020996 - 5020908
Alignment:
Q  168 acaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagc 256  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||| ||| ||||| || | ||| |||||| ||||    
T  5020996 acaacattattaaacaggcggttattacgttcgttccacacaatccaagtacatagaatccagattagctgtaaaaaggaacgtttagc 5020908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 123
Target Start/End: Original strand, 38730079 - 38730175
Alignment:
Q  29 aaaaacattagcc-atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagctttttt-agctttcaaccaaccta 123  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |  ||||||  | ||| || ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  38730079 aaaaacattagccgataaccaagcaaacaagagggttaaaccaccactattgtgtaccaaaaataaaagtagtttttttcagctttcaaccaaccta 38730175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 29 - 311
Target Start/End: Original strand, 2871767 - 2872049
Alignment:
Q  29 aaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagaga 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2871767 aaaaacattagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagaga 2871866  T
Q  128 cagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagc 227  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2871867 tagcagcttaatcttatctagtaaacaaggtatgggg-taacaacatgattaaacatctgattattacgttcattccaaacaacccaggcacaaagaagc 2871965  T
Q  228 caaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatct 311  Q
    || || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2871966 catataagttgcataaaagaacgtccagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaaatattatct 2872049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 30 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16421572 - 16421292
Alignment:
Q  30 aaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagac 128  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16421572 aaaatattagccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagat 16421473  T
Q  129 agcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagcc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  16421472 agcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaatatgattaaacaaacggttgttacgctcattccacacaacccaaacacatagaagcc 16421373  T
Q  229 aaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatc 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||    
T  16421372 atattagttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccacctgtcaaatgagtgaactg-gaaaaatgatctgatatattatc 16421292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 46 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 412911 - 412645
Alignment:
Q  46 ccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagcttaatcttatc 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  412911 ccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgttgaattccaaaaacaaaggtagtttttttagctttcagccaacctaaagacagcaacttaatcttatc 412812  T
Q  146 tagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcataaaa 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||    
T  412811 tagtaaacaagggatgggg-taacaacatgattaaacagacggttatttcgttcattccaaacaacccagacacaaagaagcaatattagttgcataaaa 412713  T
Q  246 gaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatctac 313  Q
    || ||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  412712 gaccgtttgacaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatcggaaatattatctac 412645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 42 - 310
Target Start/End: Original strand, 7451942 - 7452210
Alignment:
Q  42 atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagcttaatct 141  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||| | ||    
T  7451942 atacccaaataaacaagagggcttgaccaccactgttgggtaccaaaaacaaagatagcttttttagctttcaaccaacctaaggacaacatctttacct 7452041  T
Q  142 tatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcat 241  Q
    | ||||  ||||  |||||||| || | ||||| |||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||| || ||||| || ||||||||    
T  7452042 tgtctaacaaacgggggatgggagttataacattattaaacagacgattattttgttcattccacacaacccagtcacaaagtagccatataagttgcat 7452141  T
Q  242 aaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatc 310  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  7452142 aaaagaacgtctagaaacagcaccacctgtcaaataagtaaactgaagaaaatgatctgaaatattatc 7452210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 206 - 311
Target Start/End: Original strand, 35405459 - 35405564
Alignment:
Q  206 aacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagta 305  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||    
T  35405459 aacaacccagacacatagaaaccatataagttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctgtcaaatgagtaaactgaaaaaaatgatcggaaata 35405558  T
Q  306 ttatct 311  Q
    ||||||    
T  35405559 ttatct 35405564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 172
Target Start/End: Original strand, 35405334 - 35405464
Alignment:
Q  42 atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagcttaatct 141  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||    ||||||||    
T  35405334 atactcaaacaaacaagagggtttgatcaccactgctgaattccaaaaacaaaggtagcttttttagcttttagccaacctaaagacaatgtcttaatct 35405433  T
Q  142 tatctagtaaacaagggatgggggtaacaac 172  Q
    | |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  35405434 tttctaataaacaagggatgggggcaacaac 35405464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19385260 - 19385049
Alignment:
Q  42 atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagcttaatct 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||  || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||  |||| || ||| | ||    
T  19385260 atacccaaacacacaagagggcatgaccaccactgctgagtaccgaacacaaaagtagcttttttagcttttaaccaagataaggacaacatcttgacct 19385161  T
Q  142 tatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcat 241  Q
    | ||||  ||||  || ||| | || |  |||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | |||| |||| ||||||||    
T  19385160 tgtctaagaaacggggaatgagagttattacattattaaacagacgattatttcgttcattccacacaacacaggcacagataagctaaataagttgcat 19385061  T
Q  242 aaaagaacgtct 253  Q
    ||||||||||||    
T  19385060 aaaagaacgtct 19385049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 129
Target Start/End: Original strand, 28542582 - 28542680
Alignment:
Q  32 aacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagaca 129  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  || |||   |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28542582 aacattagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgaaagccaaaaacaaaacaagcttttttagctttcaaccatcctaaagaca 28542680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Original strand, 30501686 - 30501756
Alignment:
Q  170 aacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgca 240  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  30501686 aacattattaaacagacggttattacgttcattccacaaaacccaagcacaaagaagccagattaattgca 30501756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 12218567 - 12218486
Alignment:
Q  42 atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaaccta 123  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||||||  || ||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  12218567 atacccagacaaagaaaagggcatgaccaccactgctgagtaccaaaaataaagatagcttttctagctttcaaccaaccta 12218486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 309
Target Start/End: Original strand, 27083346 - 27083472
Alignment:
Q  183 atacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtga 282  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||| || || |||||||| ||||  || |||||| ||||   |||| ||||||||| || ||| |    
T  27083346 atacggttgttacgttcattccacacaacccaagtacacagtagtcaaattagctgcaggaacgaacgtttagctttaccaacacctgtcatataagtaa 27083445  T
Q  283 actgtaaaaaatgatctgaagtattat 309  Q
    |||| |  |||||||| ||| ||||||    
T  27083446 actgcaccaaatgatcggaaatattat 27083472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 34642161 - 34642101
Alignment:
Q  190 tattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacg 250  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| || ||||| || ||||||||    
T  34642161 tattacgttcattccacactacccagacacataggagccatataagttgtatgaaagaacg 34642101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 10)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 33 - 311
Target Start/End: Original strand, 32917897 - 32918176
Alignment:
Q  33 acattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagc 131  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| |    
T  32917897 acattagccaatacccaaacaaacaagaggacttgaccaccactgctgagttccaaaaacaaaggtagcttttttaactttaagccaacctaaagacaac 32917996  T
Q  132 agcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaa 231  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32917997 atcttaatcttatctaataaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacagacggttatttcgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaa 32918096  T
Q  232 ttagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatct 311  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  32918097 ttagttgcataaaagaccgtctagcaacaccaccacctgtcaaatgagtaaactgtaaaaaatgatcagaaatattatct 32918176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 29 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 6264762 - 6264492
Alignment:
Q  29 aaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagaga 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6264762 aaaaacattagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagttccaaaaacaaaagtagcttttttagctttcaaccaacctaaaga 6264663  T
Q  128 cagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagc 227  Q
    || || ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6264662 caacaacttaaccttataaagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacagacggttatttcgttcattccaaacaacccagacacatagaagc 6264563  T
Q  228 caaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatc 298  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6264562 catattagttgcataaaagaacgtttagcagcaccaccacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatc 6264492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 42 - 311
Target Start/End: Original strand, 34480546 - 34480815
Alignment:
Q  42 atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagcttaatct 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  34480546 atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagtgccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcagccaacctaaagacatcaacttaacct 34480645  T
Q  142 tatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcat 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  34480646 tatcaagtaaacaagggatgggggtaaccacatgattaaacagacgattattacgttcattccaaacaacccagacacatagaagccatataagttgcat 34480745  T
Q  242 aaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatct 311  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  34480746 aaaagaacgtctagcagcaccaccacctgccaaaagagtgaactgtaaaaaatgattggaaatattatct 34480815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34858271 - 34858058
Alignment:
Q  15 acaaaacacaccataaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 113  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34858271 acaaaacacaacagaaaaaccttagccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 34858172  T
Q  114 aaccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaaccc 213  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34858171 aaccaacctagagacaacagcttaatcttatcaagtaaacaggggataggggtaacaacatggttaaacatacggttattacgttcattccaaacaaccc 34858072  T
Q  214 aggcacatagaagc 227  Q
    ||||||| ||||||    
T  34858071 aggcacaaagaagc 34858058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 33 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15500206 - 15499929
Alignment:
Q  33 acattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagc 131  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||      
T  15500206 acattagccaatactcaaataaacaagagggtttgaccaccactgctgagttccaaaaacaaaagtagcttttttagctttaagccaacctaaagacaat 15500107  T
Q  132 agcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaa 231  Q
    | |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  15500106 aacttaatcttatctaataaacaattgatgggggtaacaacatgattaaacagatggttatttcgttcattccagataacccagacacatagaagccaaa 15500007  T
Q  232 ttagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattat 309  Q
    | ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||    
T  15500006 tgagttgcaaaaaagaccgtctagcaacaccaccacctgacaaatgagtaaactgaagaaaatgatcggaaatattat 15499929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 10487456 - 10487243
Alignment:
Q  42 atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagcttaatct 141  Q
    ||||||||||| | ||||||||  |||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||| || ||| | ||    
T  10487456 atacccaaacacataagagggcaagaccaccactgttgagtaccaaacacaaaagtagcttttttagctttcaaccaagctaaggacaacatcttgacct 10487357  T
Q  142 tatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcat 241  Q
    ||||||  ||||   | ||||  || |  |||| |||||||| ||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10487356 tatctaacaaacggagaatggaagttattacattattaaacagacgattatttcgctcattccacacaacccaggcacaaagaagccaaataagttgcat 10487257  T
Q  242 aaaagaacgtctag 255  Q
    ||||||||||||||    
T  10487256 aaaagaacgtctag 10487243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 256
Target Start/End: Original strand, 587110 - 587320
Alignment:
Q  46 ccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagcttaatcttatc 145  Q
    |||||||||||| |||||  ||| ||| |||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||  || ||    
T  587110 ccaaacaaacaaaagggcacgactaccattgttgtgtaccaaaaacaaaagtagtttttttaggtttcaaccaacctaatgacaacatcttaactttgtc 587209  T
Q  146 tagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcataaaa 245  Q
    || |||   ||| ||||| ||||||||||   |||| |  || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| |||    
T  587210 taataagagaggaatgggagtaacaacatttctaaagaggcgattattacgttcgttccatacaactcaagcacacaaaagccaaatgagttgcatgaaa 587309  T
Q  246 gaacgtctagc 256  Q
    || ||||||||    
T  587310 gagcgtctagc 587320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 189 - 298
Target Start/End: Original strand, 31862330 - 31862439
Alignment:
Q  189 ttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgta 288  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    ||| ||||||||| |||||| ||||| |    
T  31862330 ttattatgttcattccacaaaacccagacacaaagaagccatattagttgcatgaaagaccgtctagctttgccaccacctgtcatatgagtaaactgca 31862429  T
Q  289 aaaaatgatc 298  Q
    | ||||||||    
T  31862430 ataaatgatc 31862439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 286
Target Start/End: Original strand, 6020332 - 6020572
Alignment:
Q  46 ccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagcttaatcttatc 145  Q
    |||||||| | | |||||| ||||||| || || ||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||  || |     
T  6020332 ccaaacaagctaaagggctcgaccaccattcttaagttccaaaagtaaaagtagattttttagctttcagccaacctaaagacaacatcttaactttgtt 6020431  T
Q  146 tagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcataaaa 245  Q
     || ||||  || ||| | || |  | || ||||||||  || |||||||| |||||||| ||||||||| || | || ||||| || ||||||  ||||    
T  6020432 gagcaaacggggtatgtgagtgattatattattaaacaagcgattattacgctcattccacacaacccagacataaaggagccatataagttgctgaaaa 6020531  T
Q  246 gaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactg 286  Q
    |||| ||||||   |||  ||||||||| ||||||||||||    
T  6020532 gaacatctagctttacctccacctgtcatatgagtgaactg 6020572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 114
Target Start/End: Original strand, 4399470 - 4399539
Alignment:
Q  45 cccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttca 114  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||     ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4399470 cccaaacaaaccataggacttgaccaccacatctgagttccaaaaacaaaagtggcttttttagctttca 4399539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0287 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0287
Description:

Target: scaffold0287; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13720 - 13524
Alignment:
Q  15 acaaaacacaccataaaaacattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttc 113  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13720 acaaaacacaccagaaaaatattagtcaatacccaaacaaacaagagggcgtgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaagataacttttttagctttc 13621  T
Q  114 aaccaacctagagacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacc 212  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13620 aactaacctaaagacaacagcttaatcttatctaat-aacaaagaat-ggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacc 13524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 311
Target Start/End: Original strand, 7255 - 7534
Alignment:
Q  33 acattagcca-tacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagc 131  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||  || || || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |    
T  7255 acattagccaatacccaaacaaacaagagagcatgaccaccactgatgggtaccaaaaacaaaagtagcttttctagctttcaaccaacctaaggacaac 7354  T
Q  132 agcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaa 231  Q
    | ||||| ||| ||||  ||||  || ||| | || |  |||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  7355 atcttaaccttgtctaacaaacggggaatgagagttattacattattaaacagacgattattgcgttcattccacacaacccatgcacaaagaagccata 7454  T
Q  232 ttagttgcataaaagaacgtctagcaacaccatcacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtattatct 311  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||| ||| || || | ||||||||| ||| ||||||||    
T  7455 taagttgcataaaagaacgtctagaaacaaaaccacctgtcaaataagtaaaatgaataaaatgatcggaaatattatct 7534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 135186 - 134975
Alignment:
Q  42 atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagcttaatct 141  Q
    ||||||||||| |  |||||||  |||||||  || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||| || ||| | ||    
T  135186 atacccaaacacatgagagggcaagaccaccactgctgagtaccaaacacaaaagtagcttttttagccttcaaccaagctaaggacaacatcttgacct 135087  T
Q  142 tatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcat 241  Q
    ||||||  ||||  || ||||| || |  |||| ||||||||  || ||||| || |||||| | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  135086 tatctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacaggcgattatttcgctcattcgacacaacccaagcacagagaagccaaataagttgcat 134987  T
Q  242 aaaagaacgtct 253  Q
    ||||||||||||    
T  134986 aaaagaacgtct 134975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 313013 - 312802
Alignment:
Q  42 atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagcttaatct 141  Q
    ||||||||||| |  |||||||  |||||||  || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||| || ||| | ||    
T  313013 atacccaaacacatgagagggcaagaccaccactgctgagtaccaaacacaaaagtagcttttttagccttcaaccaagctaaggacaacatcttgacct 312914  T
Q  142 tatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcat 241  Q
    ||||||  ||||  || ||||| || |  |||| ||||||||  || ||||| || |||||| | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  312913 tatctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacaggcgattatttcgctcattcgacacaacccaagcacagagaagccaaataagttgcat 312814  T
Q  242 aaaagaacgtct 253  Q
    ||||||||||||    
T  312813 aaaagaacgtct 312802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 328467 - 328256
Alignment:
Q  42 atacccaaacaaacaagagggcttgaccaccgttgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagcttaatct 141  Q
    ||||||||||| |  |||||||  |||||||  || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||| || ||| | ||    
T  328467 atacccaaacacatgagagggcaagaccaccactgctgagtaccaaacacaaaagtagcttttttagccttcaaccaagctaaggacaacatcttgacct 328368  T
Q  142 tatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattagttgcat 241  Q
    ||||||  ||||  || ||||| || |  |||| ||||||||  || ||||| || |||||| | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  328367 tatctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacaggcgattatttcgctcattcgacacaacccaagcacagagaagccaaataagttgcat 328268  T
Q  242 aaaagaacgtct 253  Q
    ||||||||||||    
T  328267 aaaagaacgtct 328256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 12376 - 12339
Alignment:
Q  86 aaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaaccta 123  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12376 aaaaataaagatagcttttttagctttcaaccaaccta 12339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University