View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21191_low_2 (Length: 667)

Name: NF21191_low_2
Description: NF21191
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21191_low_2
NF21191_low_2
[»] chr7 (39 HSPs)
chr7 (18-658)||(21647390-21648030)
chr7 (18-362)||(21710853-21711200)
chr7 (18-216)||(21786689-21786887)
chr7 (18-216)||(21789447-21789645)
chr7 (18-326)||(21773048-21773359)
chr7 (18-216)||(21697718-21697916)
chr7 (18-213)||(21717026-21717221)
chr7 (18-319)||(21727620-21727921)
chr7 (393-658)||(21786048-21786308)
chr7 (18-207)||(21682959-21683148)
chr7 (363-551)||(21682243-21682431)
chr7 (489-645)||(21788779-21788929)
chr7 (18-227)||(15714897-15715106)
chr7 (135-362)||(21624065-21624295)
chr7 (18-203)||(21666606-21666791)
chr7 (499-651)||(15714164-15714316)
chr7 (18-215)||(21653160-21653357)
chr7 (498-617)||(21629534-21629653)
chr7 (498-617)||(21652732-21652851)
chr7 (18-211)||(21657742-21657935)
chr7 (18-210)||(21793094-21793286)
chr7 (18-213)||(21994524-21994719)
chr7 (393-577)||(21726433-21726617)
chr7 (18-209)||(21630061-21630252)
chr7 (18-209)||(21705588-21705779)
chr7 (385-447)||(21710660-21710724)
chr7 (393-647)||(21714734-21714983)
chr7 (498-617)||(21764601-21764717)
chr7 (18-209)||(21765214-21765405)
chr7 (472-551)||(21709042-21709121)
chr7 (372-433)||(21623966-21624028)
chr7 (498-584)||(21705218-21705304)
chr7 (498-577)||(21657045-21657127)
chr7 (499-567)||(21807626-21807694)
chr7 (247-326)||(21726935-21727014)
chr7 (273-326)||(21682861-21682914)
chr7 (393-576)||(21772551-21772736)
chr7 (135-207)||(21727033-21727105)
chr7 (18-50)||(21803853-21803885)
[»] scaffold0182 (2 HSPs)
scaffold0182 (572-647)||(25909-25984)
scaffold0182 (112-209)||(26558-26655)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 617; Significance: 0; HSPs: 39)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 617; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 21648030 - 21647390
Alignment:
Q  18 aaaatctggacacatctcatatgctatcaggttgagataagtagcagctgatgtgtcgttcacaacgatctcaggtagagttagctttgcaatcaaccat 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21648030 aaaatctggacacatctcatatgctatcaggttgagataagtagtagctgatgagtcgtccacaacgatctcaggtagagttagctttgcaatcaaccat 21647931  T
Q  118 ccttcagagaaatccaagtctcttggacttcgagtcatgcttgacttaagtcttattcctacttttcttagatcttgtatgctcctgtatgtcatcatcg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21647930 ccttcagagaaatccaagtctcttggacttcgagtcatgcttgacttaagtcttattcctacttttcttagatcttgtatgctcctgtatgtcataatcg 21647831  T
Q  218 agatgctttcatttggactcttagaccatttctctttggaagcttcatattctctaatctatgttttaatcgaaaatggattggatcagaacaataaaat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21647830 agatgctttcatttggactcttagaccatttctctttggaagcttcatattctctaatctatgttttaatcgaaaatggattggatcagaacaataaaat 21647731  T
Q  318 ttaaaaattgatttcctcttacaataatatatattacattttgcacctccactctgtaattataataatggtagcaaatttagaaacggaaaaaggaaaa 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21647730 ttaaaaattgatttcctcttacaataatatatattacattttgcacctccactctgtaattataataatggtagcaaatttagaaacggaaaaaggcaaa 21647631  T
Q  418 atctgtttctaattttgtcgttaagttttaataagacaaaaatttagtaacaaattttacttttgtctctaatttctttcgtaccttggaattagatgga 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21647630 atctgtttctaattttgtcgttaagttttaataagacaaaaatttagtaacaaattttacttttgtctctaatttctttcgtaccttggaattagatgga 21647531  T
Q  518 ttgaggatgagtttacgctgaagatcaaaaagatcagtgggtgtctctgattgggactcacttggtaatggtattgatacactgtgttctccttctcctt 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21647530 ttgaggatgagtttacgctgaagatcaaaaagatgagtgggtgtctctgattgggactcacttggtaatggtattgatacactgtgttctccttctcctt 21647431  T
Q  618 ttccttttgaaaccatttccttctccttctttgatgatgtc 658  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21647430 ttccttttgaaaccatttccttctccttctttgatgatgtc 21647390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21711200 - 21710853
Alignment:
Q  18 aaaatctggacacatctcatatgctatcaggttgagataagtagcagctgatgtgtcgttcacaacgatctcaggtagagttagctttgcaatcaaccat 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || || ||||||| ||| |||    
T  21711200 aaaatctggacacatctcatacgctattaagttgaggaaagtagcagctgatgtgtcgtccacaacgatctcaggtaatgtcagttttgcaaccaatcat 21711101  T
Q  118 ccttcagagaaatccaagtctcttggacttcgagtcatgcttgacttaagtcttattcctacttttcttagatcttgtatgctcctgtatgtcatcatcg 217  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  21711100 ccttcggagaaatccatgtctcttggactttgtgtcttgctagacttaagtcttattcctatttttcttagatcttttatgctcctgtatgtcatcatct 21711001  T
Q  218 agatgctttcatttggactctta---gaccatttctctttggaagcttcatattctctaatctatgttttaatcgaaaatggattggatcagaacaataa 314  Q
     || | || ||| |  |||||||     |||||||| ||||  ||||||||    | || |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||    
T  21711000 tgacgtttacatctaaactcttatttctccatttctttttgttagcttcattggttttattctatgttttaaacagaaatggattggattagaacaataa 21710901  T
Q  315 aatttaaaaattgatttcctcttacaataatatatattacattttgca 362  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21710900 aatttaaaaatttatttcctcttacaataataaacattacattttgca 21710853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21786887 - 21786689
Alignment:
Q  18 aaaatctggacacatctcatatgctatcaggttgagataagtagcagctgatgtgtcgttcacaacgatctcaggtagagttagctttgcaatcaaccat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || | ||||   ||| ||    
T  21786887 aaaatctggacacatctcatatgctatcaggttgaggaaagtagcggctgaagtgtcgtccacaacgatctcaggaagagtcagttctgcagcgaacaat 21786788  T
Q  118 ccttcagagaaatccaagtctcttggacttcgagtcatgcttgacttaagtcttattcctacttttcttagatcttgtatgctcctgtatgtcatcatc 216  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21786787 ccttcggagaaatctatgtctcttggccttcgtgtcttgcttgacttaagtcttattcctacagctcttagatcttgtatgttccggtatgtcatcatc 21786689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21789645 - 21789447
Alignment:
Q  18 aaaatctggacacatctcatatgctatcaggttgagataagtagcagctgatgtgtcgttcacaacgatctcaggtagagttagctttgcaatcaaccat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || || |||   ||||||    
T  21789645 aaaatctggacacatctcatatgctatcaggttgaggaaagttgcggctgaagtgtcgtccacaacgatctcaggaagagtcagtttcgcagcgaaccat 21789546  T
Q  118 ccttcagagaaatccaagtctcttggacttcgagtcatgcttgacttaagtcttattcctacttttcttagatcttgtatgctcctgtatgtcatcatc 216  Q
    ||| |||||||||| | |||| |||| || || |||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21789545 cctgcagagaaatctacgtctgttggcctccgtgtcgcacttgacttaagtcttattccgactgctcttagatcttgtatgctcctgtatgtcatcatc 21789447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21773359 - 21773048
Alignment:
Q  18 aaaatctggacacatctcatatgctatcaggttgagataagtagcagctgatgtgtcgttcacaacgatctcaggtagagttagctttgcaatcaaccat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||| || | |||| | ||| ||    
T  21773359 aaaatctggacacatctcatatgctatcaggttgaggaatgtagtggctgatgagtcgtccacaacaatctcaggaagagtcagttctgcagtgaacaat 21773260  T
Q  118 ccttcagagaaatccaagtctcttggacttcgagtcatgcttgacttaagtcttattcctacttttcttagatcttgtatgctcctgtatgtcatcatcg 217  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||  ||| ||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  21773259 ccttcagagaaatctatgtctcttggccttctcgtcttgcttgacttaaaatttattcctacatctcttagatcttgtatgttccggtatgtcatcatct 21773160  T
Q  218 agatgctttcatttggac---tcttagaccatttctctttggaagcttcatattctctaatctatgttttaatcgaaaatggattggatcagaacaataa 314  Q
     ||   |||||| | |||   |||||  | | |||||||||  ||||||||  | |||||||||||||| || |  ||||||||||||||| |||| |||    
T  21773159 tgaccttttcatctcgactcttcttactcaaattctctttgttagcttcattgtttctaatctatgtttcaaacagaaatggattggatcataacattaa 21773060  T
Q  315 aatttaaaaatt 326  Q
    ||||| ||||||    
T  21773059 aatttcaaaatt 21773048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21697916 - 21697718
Alignment:
Q  18 aaaatctggacacatctcatatgctatcaggttgagataagtagcagctgatgtgtcgttcacaacgatctcaggtagagttagctttgcaatcaaccat 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | |||   ||||||    
T  21697916 aaaatcgggacacatctcatatgctatcagattgagataagtaaaggctaatgtgtcgtccacaacgatctcaggtagagtcagtgtcgcagcgaaccat 21697817  T
Q  118 ccttcagagaaatccaagtctcttggacttcgagtcatgcttgacttaagtcttattcctacttttcttagatcttgtatgctcctgtatgtcatcatc 216  Q
    |||||  ||||||||| ||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  21697816 ccttcgcagaaatccatgtctcttgggctttgtgtcttgcttgacttaagtcttattcctactgcttttagatcttgtatgttcctatatgtaatcatc 21697718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21717221 - 21717026
Alignment:
Q  18 aaaatctggacacatctcatatgctatcaggttgagataagtagcagctgatgtgtcgttcacaacgatctcaggtagagttagctttgcaatcaaccat 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |  ||| | ||||||    
T  21717221 aaaatctggacacatctcatatgcaatcaggttgaggaaagtagcggctgaagtgtcgtccacaacgatctcaggaagagtcagttcagcagtgaaccat 21717122  T
Q  118 ccttcagagaaatccaagtctcttggacttcgagtcatgcttgacttaagtcttattcctacttttcttagatcttgtatgctcctgtatgtcatc 213  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||| |||| || ||||| |||||    
T  21717121 ccttcggagaaatctatgtctcttggccttcgtgtcttgcttgacttaagtcttattcctaatgcttttagatcttttatgttcgtgtatatcatc 21717026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 21727921 - 21727620
Alignment:
Q  18 aaaatctggacacatctcatatgctatcaggttgagataagtagcagctgatgtgtcgttcacaacgatctcaggtagagttagctttgcaatcaaccat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||| || |||||||||||| || |||||||| | |||| | ||||||    
T  21727921 aaaatctggacacatctcatatgctatcaggttgaggaaagtagcggctgatatgttgtccacaacgatctcgggaagagttagttctgcagtgaaccat 21727822  T
Q  118 ccttcagagaaatccaagtctcttggacttcgagtcatgcttgacttaagtcttattcctacttttcttagatcttgtatgctcctgtatgtcatcatcg 217  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||| |||| ||  |||| ||||| | |    
T  21727821 ccttcggagaaatctatgtctcttggccttcgtctcttgcttgacttaagtcttattcctaatgcttttagatcttttatgttcgagtatatcatc-ttg 21727723  T
Q  218 agatgctttcatttggac---tcttagaccatttctctttggaagcttcatattctctaatctatgttttaatcgaaaatggattggatcagaacaataa 314  Q
    || |  |||||| || ||   |||||  ||||||||||||| |||||| ||  | | ||||||||||||||| | | || ||||||||||| || |||||    
T  21727722 agct--tttcatctgaacgcttcttactccatttctctttgtaagctttattgtttttaatctatgttttaaacaataacggattggatcaaaaaaataa 21727625  T
Q  315 aattt 319  Q
    |||||    
T  21727624 aattt 21727620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 393 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 21786308 - 21786048
Alignment:
Q  393 aaatttagaaacggaaaaaggaaaaatc-tgtttctaattttgtcgttaagttttaataagacaaaaatttagtaacaaattttacttttgtctcta--a 489  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |    
T  21786308 aaatttactaacggaaaaaggaaaaattatttttctagttttgtcgttaagttttaat--gacaaaaatttagtaacaaattttacttttttctcaaata 21786211  T
Q  490 tttctttcgtaccttggaattagatggattgaggatgagtttacgctgaagatcaaaaagatcagtgggtgtctctgattgggactcacttggtaatggt 589  Q
    ||||| | |||||||||   |||||| | |||||||||  |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| | || |||||| |      | ||    
T  21786210 tttctgttgtaccttggttgtagatgtaatgaggatgatattacgctgaagatcaagaagatgaaagggtgtctctaactgtgactcatt------tcgt 21786117  T
Q  590 attgatacactgtgttctccttctccttttccttttgaaaccatttccttctccttctttgatgatgtc 658  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  21786116 attgataaactatgttctccttctccttttctttttggaaccatgtccttctccttctctgatggtgtc 21786048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21683148 - 21682959
Alignment:
Q  18 aaaatctggacacatctcatatgctatcaggttgagataagtagcagctgatgtgtcgttcacaacgatctcaggtagagttagctttgcaatcaaccat 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||| | ||||||    
T  21683148 aaaatttggacacatctcatatgctatcaggttgaggaaagtagtggctgatgtgtcgtccacaacgatctcaggaagagttagttctgcagtgaaccat 21683049  T
Q  118 ccttcagagaaatccaagtctcttggacttcgagtcatgcttgacttaagtcttattcctacttttcttagatcttgtatgctcctgtat 207  Q
    ||||| | |||||| | |||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||| |||| || |||||    
T  21683048 ccttcggtgaaatctatgtcttttggccttcgtgtcttgcttgacttaagtcttattcctagtgcttttagatcttttatgttcatgtat 21682959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 363 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 21682431 - 21682243
Alignment:
Q  363 cctccactctgtaattataataatggtagcaaatttagaaacggaaaaaggaaaaatctgtttctaattttgtcgttaagttttaataagacaaaaattt 462  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |     
T  21682431 cctccacttggtaattataataatcgtagcaaatttagaaacggaaaaaggcaaaatctgtttcaaattttgtcgtta-gttttaataagacaaaaaat- 21682334  T
Q  463 agtaacaaattttacttttgtctctaa--tttctttcgtaccttggaattagatggattgaggatgagtttacgctgaagatcaaaaagat 551  Q
    || |||||| |||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||   |||||  | |||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  21682333 agaaacaaactttacttttgtctctaagatttctattataccttgggtgtagatttaatgaggatgatattacgctgaagatcaagaagat 21682243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 489 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 21788929 - 21788779
Alignment:
Q  489 atttctttcgtaccttggaattagatggattgaggatgagtttacgctgaagatcaaaaagatcagtgggtgtctctgattgggactcacttggtaatgg 588  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||| |      ||     
T  21788929 atttctattgtaccttggaattagatgtagtgaggatgattttacgctgaagatcaagaagatgagtgggtgtctctaactgggactcatt------tgt 21788836  T
Q  589 tattgatacactgtgttctccttctccttttccttttgaaaccatttccttctcctt 645  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21788835 tattgatacactatgttctccttctccctttccttttggaaccatgtccttctcctt 21788779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15715106 - 15714897
Alignment:
Q  18 aaaatctggacacatctcatatgctatcaggttgagataagtagcagctgatgtgtcgttcacaacgatctcaggtagagttagctttgcaatcaaccat 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||  |||| || ||||  ||||  ||| ||||| || || |||   ||||||    
T  15715106 aaaatctggacaaatctcatatgctatctggttgaggaaagtagcggctgtagtgttgtccacacggatccgaggaagagtcagtttcgcagcaaaccat 15715007  T
Q  118 ccttcagagaaatccaagtctcttggacttcgagtcatgcttgacttaagtcttattcctacttttcttagatcttgtatgctcctgtatgtcatcatcg 217  Q
    ||| |||||||||| |  ||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  15715006 cctgcagagaaatctatctctgttggcctttgtgtcttgcttgacttaagtcttattcctactgctcttagatcttgtatgctcctgtatgtaatcagcg 15714907  T
Q  218 agatgctttc 227  Q
     |||| ||||    
T  15714906 ggatgttttc 15714897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 135 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21624295 - 21624065
Alignment:
Q  135 gtctcttggacttcgagtcatgcttgacttaagtcttattcctacttttcttagatcttgtatgctcctgtatgtcatcatcgagatgctttcatttgga 234  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||  || | |||||| |  |    
T  21624295 gtctcttggacttcgtgtcttgcttgatccaagtcttattcctccagttcttagattttgtatgttcctgtatgtcgtcatcttgacgttttcatctaaa 21624196  T
Q  235 ctctt---agaccatttctctttggaagcttcatattctctaatctatgttttaatcgaaaatggattggatcagaacaataaaatttaaaaattgattt 331  Q
    |||||   |  |||| ||||||||  ||||| ||    | ||||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  21624195 ctcttcatactccatatctctttgttagctttattgcttttaatctataatttaatcggaaatagattggatcataacaataaaatttcaaaatttattt 21624096  T
Q  332 cctcttacaataatatatattacattttgca 362  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21624095 cctcttacaataataaatattacattttgca 21624065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21666791 - 21666606
Alignment:
Q  18 aaaatctggacacatctcatatgctatcaggttgagataagtagcagctgatgtgtcgttcacaacgatctcaggtagagttagctttgcaatcaaccat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||  || |||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || || |||   ||||||    
T  21666791 aaaatctggacacatctcatatgctatcttattgaggaaaatagtggctgatgtgtcgtccacaacgatctcaggaagagtcagtttcgcagcgaaccat 21666692  T
Q  118 ccttcagagaaatccaagtctcttggacttcgagtcatgcttgacttaagtcttattcctacttttcttagatcttgtatgctcct 203  Q
    ||| | |||||||| ||||||||  | | ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||    
T  21666691 cctgcggagaaatctaagtctctcagccatcgtgtcttgcttgacttaactcttattcctactgcttttagatcttgtatgttcct 21666606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 499 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 15714316 - 15714164
Alignment:
Q  499 taccttggaattagatggattgaggatgagtttacgctgaagatcaaaaagatcagtgggtgtctctgattgggactcacttggtaatggtattgataca 598  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||   ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||    
T  15714316 taccttggaattagatgtaatgaggatatatttacgctgtagatcaagaagatgagtgggtgtctctgactgtgactcatttcgtaatggtattgataca 15714217  T
Q  599 ctgtgttctccttctccttttccttttgaaaccatttccttctccttctttga 651  Q
    || | || ||||||||||||||  |||| ||||   | |||||||||||||||    
T  15714216 ctatattgtccttctccttttctgtttggaaccccgttcttctccttctttga 15714164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21653357 - 21653160
Alignment:
Q  18 aaaatctggacacatctcatatgctatcaggttgagataagtagcagctgatgtgtcgttcacaacgatctcaggtagagttagctttgcaatcaaccat 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||  | | ||||    
T  21653357 aaaatcaggacacatctcatatgctatcaagttgaggaaagtagtggctgaagtgtcgtccacaacgatctcaggaagaattagttttgcggtaagccat 21653258  T
Q  118 ccttcagagaaatccaagtctcttggacttcgagtcatgcttgacttaagtcttattcctacttttcttagatcttgtatgctcctgtatgtcatcat 215  Q
    |||||  ||||||  | |||| |||| || || || | ||||||||||| ||||| |||| ||  | |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  21653257 ccttcgtagaaattaatgtcttttggcctacgtgtgaagcttgacttaaatcttactcctgctgcttttagatcttgtatgttcctatatgtcatcat 21653160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 498 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 21629653 - 21629534
Alignment:
Q  498 gtaccttggaattagatggattgaggatgagtttacgctgaagatcaaaaagatcagtgggtgtctctgattgggactcacttggtaatggtattgatac 597  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||| || |||||||||| ||||| ||| ||| ||||| | || |||||| |||||| |||||||||| |    
T  21629653 gtaccttggaattagatgtagtgaggatgactttgcgttgaagatcaagaagatgagttggtttctctaactgtgactcatttggtactggtattgatgc 21629554  T
Q  598 actgtgttctccttctcctt 617  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  21629553 actatgttctccttctcctt 21629534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 498 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 21652851 - 21652732
Alignment:
Q  498 gtaccttggaattagatggattgaggatgagtttacgctgaagatcaaaaagatcagtgggtgtctctgattgggactcacttggtaatggtattgatac 597  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||| |||| || ||||||||| ||||| ||||||||||| ||| || |||||| ||||| | ||||| |||||    
T  21652851 gtaccttggaattagatgtagttaggatgattttatgcagaagatcaagaagatgagtgggtgtctttgactgtgactcatttggttaaggtatcgatac 21652752  T
Q  598 actgtgttctccttctcctt 617  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  21652751 actatgttctccttctcctt 21652732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21657935 - 21657742
Alignment:
Q  18 aaaatctggacacatctcatatgctatcaggttgagataagtagcagctgatgtgtcgttcacaacgatctcaggtagagttagctttgcaatcaaccat 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||   |||||  ||| |  ||||| ||||  ||| ||||| || | ||||   ||||||    
T  21657935 aaaatctggacacatctcatatgctatcaggttgcggaacgtatgggctgaactgttggacacaatgatcataggaagagtcagttctgcagagaaccat 21657836  T
Q  118 ccttcagagaaatccaagtctcttggacttcgagtcatgcttgacttaagtcttattcctacttttcttagatcttgtatgctcctgtatgtca 211  Q
    ||| |  ||||||| | ||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21657835 cctccgcagaaatctatgtctcttagcctttgtgtcatgcttgacttaagtcttattcctactgcttttagatcttgtatgttcctgtatgtca 21657742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21793286 - 21793094
Alignment:
Q  18 aaaatctggacacatctcatatgctatcaggttgagataagtagcagctgatgtgtcgttcacaacgatctcaggtagagttagctttgcaatcaaccat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||  |||||  ||||| |||||| ||||  ||| ||||| || | |||| | ||||||    
T  21793286 aaaatctggacacatctcatatgctgtcaggttgaagaaagtagaggctgaactgtcggtcacaatgatcataggaagagtcagttctgcagtgaaccat 21793187  T
Q  118 ccttcagagaaatccaagtctcttggacttcgagtcatgcttgacttaagtcttattcctacttttcttagatcttgtatgctcctgtatgtc 210  Q
    || || |||||||  | |||| |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  21793186 ccatcggagaaatgtatgtcttttgggcttggtgtattgcttgacttaagtcttattcctacagcttttagatcttgtatgttcctgtgtgtc 21793094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21994719 - 21994524
Alignment:
Q  18 aaaatctggacacatctcatatgctatcaggttgagataagtagcagctgatgtgtcgttcacaacgatctcaggtagagttagctttgcaatcaaccat 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||   |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||| ||||| |  || ||| | ||||||    
T  21994719 aaaatctggacacatctcgtatgctatcaggttaaggatagtagcggctgatctatcgtccacaacgatctcaggaagagtcaatttcgcagtgaaccat 21994620  T
Q  118 ccttcagagaaatccaagtctcttggacttcgagtcatgcttgacttaagtcttattcctacttttcttagatcttgtatgctcctgtatgtcatc 213  Q
    ||||||| ||| || | |  |  |||| |||| |||  | |||||||||||| ||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||| ||||    
T  21994619 ccttcagcgaattctatgctttgtggatttcgtgtcgcggttgacttaagtcgtattcctactgctcttagactttgtacgctcctgtatgacatc 21994524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 393 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 21726617 - 21726433
Alignment:
Q  393 aaatttagaaacggaaaaaggaaaaatctgtttctaattttgtcgttaagttttaataagacaaa-aatttagtaacaaattttacttttgtctcta--a 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||| | ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||  |    
T  21726617 aaatttagaaacggaaaaaggaaaaatattttattaattttg-cattaagtttta--aagacaaataatttagtgacaaattttaattttttctctaata 21726521  T
Q  490 tttctttcgtaccttggaattagatggattgaggatgagtttacgctgaagatcaaaaagatcagtgggtgtctctgattgggactca 577  Q
    ||||| | |||||||||   |||||| | |||||||||  |||||| || |||||| ||||| |  |||||||| ||| |||||||||    
T  21726520 tttctgttgtaccttggttgtagatgtaatgaggatgatattacgccgacgatcaagaagatgaaagggtgtctttgactgggactca 21726433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21630252 - 21630061
Alignment:
Q  18 aaaatctggacacatctcatatgctatcaggttgagataagtagcagctgatgtgtcgttcacaacgatctcaggtagagttagctttgcaatcaaccat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||   |||||   || | |||||| ||||  ||| ||||| || | ||||   ||||||    
T  21630252 aaaatctggacacatctcatatgctatcaggttgaggaacatatgggctgaaccgttggtcacaatgatcataggaagagtcagttctgcagcgaaccat 21630153  T
Q  118 ccttcagagaaatccaagtctcttggacttcgagtcatgcttgacttaagtcttattcctacttttcttagatcttgtatgctcctgtatgt 209  Q
    ||| |  ||||||| | ||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||   | |||||||||||||| ||||||||||    
T  21630152 cctccgcagaaatctatgtctcttggcctttgtgtcatgcttgtcttaagtcttattcctacagcttttagatcttgtatgttcctgtatgt 21630061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21705779 - 21705588
Alignment:
Q  18 aaaatctggacacatctcatatgctatcaggttgagataagtagcagctgatgtgtcgttcacaacgatctcaggtagagttagctttgcaatcaaccat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||    || |||||||  |||  |||| | ||| || |||||| | ||||||    
T  21705779 aaaatctggacacatctcatatgctatcaggttgagtaaagtagaggctgcaaggttgttcacatagattacaggaatagtcagttttgcagtaaaccat 21705680  T
Q  118 ccttcagagaaatccaagtctcttggacttcgagtcatgcttgacttaagtcttattcctacttttcttagatcttgtatgctcctgtatgt 209  Q
    ||| ||| |||||| | |||| |||| || |  ||   ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21705679 cctgcagtgaaatctacgtctgttggcctccctgttgcgcttgccttaagtcttattcctactgctcttagatcttctatgcccctgtatgt 21705588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 385 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 21710724 - 21710660
Alignment:
Q  385 atggtagcaaatttagaaacggaaaaagg--aaaaatctgtttctaattttgtcgttaagtttta 447  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21710724 atggtagcaaatttagaaacgggaaaaggcaaaaaatctgtttctaattttgttgttaagtttta 21710660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 393 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 21714983 - 21714734
Alignment:
Q  393 aaatttagaaacggaaaaaggaaaaatctgtttctaattttgtcgttaagttttaataagacaaa-aatttagtaacaaatttt-acttttgtctcta-- 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||| | ||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||| | |||| ||||||      
T  21714983 aaatttagaaacggaaaaaggaaaaatattttattaattttg-cattaagtttta--aagacaaataatttagtgacaaattttaatttttttctctaat 21714887  T
Q  489 atttctttcgtaccttggaattagatggattgaggatgagtttacgctgaagatcaaaaagatcagtgggtgtctctgattgggactcacttggtaatgg 588  Q
    |||||| | |||||||||   |||||| | |||||||||  ||||| |||||||||| ||||| |  |||||||||| | || |||||| |      | |    
T  21714886 atttctgttgtaccttggttgtagatgtaatgaggatgatattacgttgaagatcaagaagatgaaagggtgtctctaactgtgactcatt------tcg 21714793  T
Q  589 tattgatacactgtgttctccttctccttttccttttgaaaccatttccttctccttct 647  Q
    |||||||| ||| || |||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||    
T  21714792 tattgataaactatgctctctttctgcttttctttttggaaccatgtccttcttcttct 21714734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 498 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 21764717 - 21764601
Alignment:
Q  498 gtaccttggaattagatggattgaggatgagtttacgctgaagatcaaaaagatcagtgggtgtctctgattgggactcacttggtaatggtattgatac 597  Q
    |||||||||| || |||| | ||||||||| |||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||| ||| ||    |||||||||    
T  21764717 gtaccttggacttggatgtagtgaggatgactttatgctgaagatctagaagatgagtgggtgtctctgactgtgactcatttgtta---ttattgatac 21764621  T
Q  598 actgtgttctccttctcctt 617  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  21764620 actatgttctccttctcctt 21764601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21765405 - 21765214
Alignment:
Q  18 aaaatctggacacatctcatatgctatcaggttgagataagtagcagctgatgtgtcgttcacaacgatctcaggtagagttagctttgcaatcaaccat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||  ||||    || |||||||  |||  |||| | ||| || |||||| | ||||||    
T  21765405 aaaatctggacacatctcatatgctatcaggttgagtaaattagaggctgcaaggttgttcacatagattacaggaatagtcagttttgcagtaaaccat 21765306  T
Q  118 ccttcagagaaatccaagtctcttggacttcgagtcatgcttgacttaagtcttattcctacttttcttagatcttgtatgctcctgtatgt 209  Q
    ||| ||| |||||| | |||| |||| || |  ||   ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21765305 cctgcagtgaaatctacgtctgttggcctccttgttgcgcttgtcttaagtcttattcctactgctcttagatcttctatgcccctgtatgt 21765214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 472 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 21709121 - 21709042
Alignment:
Q  472 ttttacttttgtctctaatttctttcgtaccttggaattagatggattgaggatgagtttacgctgaagatcaaaaagat 551  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| | | |||||| ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  21709121 ttttacttttatctctaatttctattgtaccttggaattagaagtagtgaggaggatattatgctgaagatcaaaaagat 21709042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 21624028 - 21623966
Alignment:
Q  372 tgtaattataataatg-gtagcaaatttagaaacggaaaaaggaaaaatctgtttctaatttt 433  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21624028 tgtaattataataacgcgtagcaaatttagaaacagaaaaaggcaaaatctgtttctattttt 21623966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 21705304 - 21705218
Alignment:
Q  498 gtaccttggaattagatggattgaggatgagtttacgctgaagatcaaaaagatcagtgggtgtctctgattgggactcacttggta 584  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  21705304 gtaccttggaattagatgtggtgaggatgattttacgttgaagatcaagaagatgtgtgggtgtttctgactgtgactcatttggta 21705218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 21657127 - 21657045
Alignment:
Q  498 gtaccttggaattagatggattgaggatgagtttacgctgaagatcaaaaagatcagtggg---tgtctctgattgggactca 577  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||| ||||||    
T  21657127 gtaccttggaataagatgtagtgaggatgagtttccgttgaagatcaagaagatgagtgggtattgtctctgattgtgactca 21657045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 499 - 567
Target Start/End: Original strand, 21807626 - 21807694
Alignment:
Q  499 taccttggaattagatggattgaggatgagtttacgctgaagatcaaaaagatcagtgggtgtctctga 567  Q
    ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  21807626 taccttggaattagatgtagggagcatgagtttacgctgaacatcaagaagatgagttggtgtctctga 21807694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21727014 - 21726935
Alignment:
Q  247 ttctctttggaagcttcatattctctaatctatgttttaatcgaaaatggattggatcagaacaataaaatttaaaaatt 326  Q
    |||||||||  ||||||||| | | ||||||||||||||| |  ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  21727014 ttctctttgttagcttcatagtttttaatctatgttttaaacagaaatggattggattataacaataaaattttaaaatt 21726935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21682914 - 21682861
Alignment:
Q  273 aatctatgttttaatcgaaaatggattggatcagaacaataaaatttaaaaatt 326  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  21682914 aatctatgttttaaacagaaatggattggatcataacaataaaattttaaaatt 21682861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 393 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 21772736 - 21772551
Alignment:
Q  393 aaatttagaaacggaaaaa-ggaaaaatctgtttctaattttgtcgttaagttttaataagacaaa-aatttagtaacaaattttacttttgt-ctctaa 489  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | ||  |||||||| | ||||||||||   ||||||| |||||||| |||||||||| |||| | ||||||    
T  21772736 aaatttagaaacggaaaaaaggaaaaatattttattaattttg-cattaagttttat--agacaaataatttagtgacaaattttaatttttttctctaa 21772640  T
Q  490 tttctttc--gtaccttggaattagatggattgaggatgagtttacgctgaagatcaaaaagatcagtgggtgtctctgattgggactc 576  Q
    | | |||   |||||||||   |||||| | ||||||||   |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| || |||||    
T  21772639 tatttttgttgtaccttggttgtagatgtaatgaggatggtattacgctgaagatcaagaagatgaaagggtgtctctgactgtgactc 21772551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 135 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21727105 - 21727033
Alignment:
Q  135 gtctcttggacttcgagtcatgcttgacttaagtcttattcctacttttcttagatcttgtatgctcctgtat 207  Q
    ||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||| |||| || |||||    
T  21727105 gtctcttggccttcgtatcttgcttgacttaagtcttattcctagtgcttttagatcttttatgttcatgtat 21727033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 21803853 - 21803885
Alignment:
Q  18 aaaatctggacacatctcatatgctatcaggtt 50  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21803853 aaaatctggacacatctcatatgcaatcaggtt 21803885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 572 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 25984 - 25909
Alignment:
Q  572 gactcacttggtaatggtattgatacactgtgttctccttctccttttccttttgaaaccatttccttctccttct 647  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||   |||| | |||| |||||||||||||    
T  25984 gactcatttggtaatggtattgatacactatattctccttctccgtttttctttggacccatgtccttctccttct 25909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26655 - 26558
Alignment:
Q  112 aaccatccttcagagaaatccaagtctcttggacttcgagtcatgcttgacttaagtcttattcctacttttcttagatcttgtatgctcctgtatgt 209  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||| ||||  || | || | ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26655 aaccatcctgcagagaaatctatgtctgttggctttggtgtaaagcttgccttaagacttattcctactgctcttagatcttctatgcccctgtatgt 26558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University