View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21213_low_1 (Length: 810)

Name: NF21213_low_1
Description: NF21213
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21213_low_1
NF21213_low_1
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (212-785)||(42422112-42422694)
chr7 (1-214)||(37026056-37026270)
chr7 (1-214)||(26601920-26602134)
chr7 (1-214)||(15914646-15914860)
chr7 (5-214)||(39432920-39433129)
chr7 (1-214)||(15949167-15949381)
chr7 (3-214)||(3924093-3924305)
chr7 (1-214)||(36875553-36875767)
chr7 (1-214)||(14298908-14299122)
chr7 (1-214)||(5049912-5050126)
chr7 (1-214)||(14287723-14287937)
chr7 (10-214)||(21642535-21642740)
chr7 (1-214)||(1948633-1948848)
chr7 (1-214)||(2446654-2446868)
chr7 (1-214)||(6795446-6795660)
chr7 (1-214)||(23612397-23612611)
chr7 (1-214)||(9642916-9643132)
chr7 (1-214)||(6020864-6021079)
chr7 (1-214)||(8185392-8185607)
chr7 (1-214)||(8192952-8193167)
chr7 (1-214)||(48353480-48353695)
chr7 (1-214)||(33850643-33850857)
chr7 (1-211)||(45433593-45433805)
chr7 (1-214)||(19089815-19090030)
chr7 (1-214)||(48347096-48347311)
chr7 (1-214)||(5056307-5056522)
chr7 (1-214)||(1378955-1379169)
chr7 (1-214)||(8142446-8142660)
chr7 (1-209)||(10831130-10831340)
chr7 (1-209)||(11024922-11025132)
chr7 (140-214)||(13774130-13774204)
chr7 (1-209)||(21901193-21901404)
chr7 (1-43)||(1942053-1942095)
chr7 (148-209)||(27954243-27954303)
chr7 (166-209)||(28442628-28442671)
[»] chr1 (32 HSPs)
chr1 (1-214)||(44241365-44241579)
chr1 (1-214)||(29001739-29001953)
chr1 (1-214)||(9869113-9869327)
chr1 (1-214)||(31072326-31072540)
chr1 (1-216)||(4599536-4599753)
chr1 (1-214)||(1174613-1174828)
chr1 (1-214)||(6238663-6238877)
chr1 (1-214)||(39053338-39053552)
chr1 (1-214)||(39059710-39059924)
chr1 (1-214)||(42091904-42092118)
chr1 (1-214)||(45015789-45016003)
chr1 (1-214)||(26621477-26621692)
chr1 (1-214)||(44916338-44916560)
chr1 (1-214)||(41305514-41305729)
chr1 (1-214)||(11913262-11913475)
chr1 (4-214)||(41297527-41297739)
chr1 (1-183)||(27240161-27240345)
chr1 (1-214)||(43686635-43686851)
chr1 (1-214)||(32797744-32797945)
chr1 (1-214)||(1115982-1116198)
chr1 (1-214)||(41299188-41299403)
chr1 (1-125)||(23764521-23764646)
chr1 (1-150)||(5445028-5445177)
chr1 (1-209)||(28413678-28413888)
chr1 (135-214)||(23762336-23762415)
chr1 (1-209)||(39806065-39806274)
chr1 (1-209)||(2824824-2825033)
chr1 (1-192)||(38672788-38672982)
chr1 (79-205)||(47646755-47646883)
chr1 (67-208)||(23251426-23251568)
chr1 (102-209)||(5357752-5357861)
chr1 (102-209)||(45620149-45620258)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (1-214)||(2653-2867)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (1-214)||(13671817-13672031)
chr6 (1-214)||(27670102-27670316)
chr6 (1-214)||(31547903-31548117)
chr6 (1-214)||(32328493-32328707)
chr6 (1-214)||(1428423-1428637)
chr6 (1-214)||(34711557-34711771)
chr6 (1-214)||(9864760-9864975)
chr6 (1-214)||(21262574-21262789)
chr6 (1-214)||(4186693-4186907)
chr6 (1-214)||(11058150-11058364)
chr6 (1-214)||(4020235-4020450)
chr6 (1-214)||(4026661-4026876)
chr6 (1-214)||(34655258-34655473)
chr6 (1-214)||(34648807-34649022)
chr6 (2-214)||(7069702-7069916)
chr6 (1-214)||(4738323-4738538)
chr6 (1-147)||(29906898-29907045)
chr6 (1-147)||(30117335-30117482)
chr6 (71-214)||(1167480-1167630)
chr6 (1-119)||(7062578-7062698)
chr6 (16-209)||(10081567-10081762)
chr6 (152-214)||(7062516-7062578)
chr6 (73-209)||(9846601-9846738)
chr6 (177-214)||(29907044-29907081)
chr6 (177-214)||(30117299-30117336)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (1-214)||(4973571-4973785)
chr5 (1-214)||(22359972-22360186)
chr5 (1-214)||(22313838-22314052)
chr5 (1-214)||(5876226-5876440)
chr5 (1-214)||(34357288-34357502)
chr5 (1-214)||(34359079-34359293)
chr5 (1-214)||(2957866-2958081)
chr5 (1-214)||(2966335-2966550)
chr5 (1-214)||(29980467-29980681)
chr5 (1-214)||(30041244-30041458)
chr5 (1-214)||(40958617-40958831)
chr5 (1-214)||(25894649-25894864)
chr5 (3-214)||(2438811-2439022)
chr5 (1-214)||(12505765-12505987)
chr5 (4-212)||(42150829-42151039)
chr5 (1-214)||(29414669-29414883)
chr5 (1-209)||(33794100-33794309)
chr5 (1-209)||(9843357-9843566)
chr5 (1-209)||(2156125-2156332)
chr5 (103-205)||(19853484-19853588)
chr5 (102-209)||(12918955-12919064)
chr5 (102-209)||(30580195-30580304)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (1-214)||(2021448-2021662)
chr2 (1-214)||(21341882-21342096)
chr2 (1-214)||(21331994-21332208)
chr2 (1-214)||(42931372-42931586)
chr2 (5-214)||(16856487-16856696)
chr2 (1-214)||(12950804-12951018)
chr2 (5-214)||(16817330-16817539)
chr2 (1-214)||(36782184-36782399)
chr2 (1-214)||(34834812-34835026)
chr2 (1-214)||(34841256-34841470)
chr2 (1-214)||(29484934-29485149)
chr2 (1-214)||(45011990-45012205)
chr2 (1-214)||(15852557-15852772)
chr2 (1-214)||(43267866-43268081)
chr2 (1-214)||(2157620-2157834)
chr2 (1-214)||(2164036-2164250)
chr2 (1-214)||(13901957-13902171)
chr2 (1-214)||(21067958-21068172)
chr2 (65-214)||(45700644-45700793)
chr2 (1-209)||(41455614-41455823)
chr2 (50-214)||(11909950-11910116)
chr2 (50-209)||(17784443-17784604)
chr2 (67-205)||(13162892-13163032)
chr2 (50-209)||(17789096-17789257)
[»] chr4 (17 HSPs)
chr4 (1-214)||(55462772-55462986)
chr4 (1-214)||(16405350-16405568)
chr4 (1-214)||(16838359-16838572)
chr4 (1-214)||(27590313-27590527)
chr4 (1-214)||(41372994-41373209)
chr4 (1-213)||(37368315-37368529)
chr4 (1-214)||(13594114-13594330)
chr4 (1-214)||(7780415-7780629)
chr4 (1-214)||(8103889-8104104)
chr4 (1-214)||(30238268-30238482)
chr4 (1-214)||(17456862-17457077)
chr4 (20-214)||(30211536-30211731)
chr4 (1-214)||(36754791-36755013)
chr4 (67-214)||(5660549-5660696)
chr4 (1-191)||(13003809-13004001)
chr4 (1-209)||(2947853-2948062)
chr4 (1-88)||(48914907-48914996)
[»] chr8 (17 HSPs)
chr8 (1-214)||(12768752-12768966)
chr8 (1-214)||(11358193-11358408)
chr8 (1-214)||(7311357-7311571)
chr8 (1-214)||(8013320-8013534)
chr8 (1-214)||(36005482-36005696)
chr8 (1-214)||(36425730-36425945)
chr8 (1-214)||(6464576-6464790)
chr8 (1-214)||(15012396-15012610)
chr8 (1-214)||(36075975-36076189)
chr8 (1-214)||(41242116-41242330)
chr8 (1-214)||(36021799-36022014)
chr8 (4-214)||(16710668-16710880)
chr8 (1-214)||(1238221-1238436)
chr8 (71-214)||(26250591-26250734)
chr8 (22-214)||(45068416-45068609)
chr8 (1-214)||(31017407-31017608)
chr8 (1-209)||(7933931-7934141)
[»] chr3 (20 HSPs)
chr3 (1-214)||(4311486-4311700)
chr3 (1-214)||(10941304-10941518)
chr3 (1-214)||(6036274-6036488)
chr3 (1-214)||(32746378-32746592)
chr3 (1-214)||(24179081-24179296)
chr3 (1-214)||(9570548-9570764)
chr3 (1-214)||(27501967-27502182)
chr3 (1-214)||(13014994-13015208)
chr3 (1-214)||(9577050-9577266)
chr3 (5-214)||(43995081-43995300)
chr3 (1-214)||(25893238-25893458)
chr3 (1-214)||(43931590-43931799)
chr3 (2-214)||(23068473-23068686)
chr3 (67-204)||(20651135-20651272)
chr3 (1-118)||(41353869-41353987)
chr3 (1-142)||(41354142-41354284)
chr3 (1-209)||(4590802-4591012)
chr3 (1-58)||(3577095-3577152)
chr3 (102-209)||(4644354-4644463)
chr3 (152-209)||(2785865-2785922)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (1-214)||(49699-49912)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (1-214)||(15179-15393)
[»] scaffold0936 (1 HSPs)
scaffold0936 (1-214)||(3264-3477)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (1-214)||(5005-5219)
[»] scaffold0510 (2 HSPs)
scaffold0510 (4-214)||(8881-9093)
scaffold0510 (1-214)||(2560-2775)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (73-214)||(12014-12155)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (1-98)||(99922-100020)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (1-191)||(24268-24460)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 403; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 212 - 785
Target Start/End: Original strand, 42422112 - 42422694
Alignment:
Q  212 atactataacttttaagattgacatttactttgtagaccaccaaggagtgataagcgttgtgttttatatataaacttcctctctattgtttaaaagctc 311  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42422112 atactataacttttaagattgccatttgctttgtaggccactaagaagtgataagcgctgcattttatatataaacttcctctctattgtttaaaagctc 42422211  T
Q  312 ccgatgttggactattttcaaagcagcacaagagctacatgctctcaacattcaatgagaccctattttcatcttcaca-tttttgaaaagccgacttat 410  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42422212 ccgatgttggaatattttcacaacagcacaagagctacatgctctcaacatttaatgagaccctattttcatcttcacaatttttgaaaagccgacttat 42422311  T
Q  411 gttatttagtatataatgaaacaactaatttttctgtttacgtgtaattatatcaattcacaatatcacttcataatctcatcatgtcttccatctcttc 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42422312 gttatttagtatataatgaaacaactaatttttctgtttacgtgtaattatatcaattcacaatatcacttcataatctcatcatgtcttccatctcttc 42422411  T
Q  511 actactttcaattcgt-aaaagctttcattttc-aaattaatactaaatcaatggctagtattacattggtccaacaagttggcacaatcttttcattgg 608  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42422412 actactttcaattcgtaaaaagctttcattttcaaaattaatactaaattaatggctagtattacattggtccaacaagttggcacaatcttttcattgg 42422511  T
Q  609 cgcaacttctaaagaaccctcaatagaactcttggtataaagaaaagtgatggcgaaacactccttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgtaaacatcaa 708  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||                   ||||||||||||||    
T  42422512 tgcaacttctaaagaaccctcaatagaactcttggtataaaaaaaagtgacggtgaaacactccttgtatatatataaatatatattttgtaaacatcaa 42422611  T
Q  709 cataatcaggaaatttagtctaaaatcaaaacaacaattcagtctaaaat------accaatgacggtggtagccttagacca 785  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      ||||||||| |||||||||||||||||    
T  42422612 cataatcaggaaatttagtctaaaatcaaaacaccaattcagtctaaaatcaaaacaccaatgacagtggtagccttagacca 42422694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 37026056 - 37026270
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37026056 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgactaactaagttgtaaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 37026155  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37026156 ggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacattgattctagtttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 37026255  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  37026256 cgtgtccaaacaata 37026270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 26601920 - 26602134
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26601920 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaaaacttgtta 26602019  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  26602020 ggattagaattccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaacatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactatt 26602119  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  26602120 cgtgtccaaacaata 26602134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 15914646 - 15914860
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15914646 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaaaacttgtta 15914745  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  15914746 ggattagagttccttgatcaagcgtcgcacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgacaacactatt 15914845  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  15914846 cgtgtccaaacaata 15914860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 39432920 - 39433129
Alignment:
Q  5 caaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtatt 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  39432920 caaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagtgcaaatgataaagttgagattaataaggtgtgaaacttgttaggatt 39433019  T
Q  105 agagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  39433020 agagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatgaattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacgccattcgtgt 39433119  T
Q  205 ccaaacaata 214  Q
    ||||||||||    
T  39433120 ccaaacaata 39433129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 15949167 - 15949381
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15949167 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaaaacttgtta 15949266  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  15949267 ggattagagttccttgatcaagcgtcgcatataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgacaacactatt 15949366  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  15949367 cgtgtccaaacaata 15949381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3924305 - 3924093
Alignment:
Q  3 accaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagt 101  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  3924305 accaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttagg 3924206  T
Q  102 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcg 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3924205 attagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcg 3924106  T
Q  202 tgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||    
T  3924105 tgtccaaacaata 3924093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 36875553 - 36875767
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  36875553 acaccaaatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgtta 36875652  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36875653 ggattggagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatatatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 36875752  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  36875753 cgtgtccaaacaata 36875767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 14298908 - 14299122
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14298908 acaccaaatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgtta 14299007  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14299008 ggattagagttccttgatcgaacgtcgcacgtaccctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 14299107  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  14299108 cgtgtccaaacaata 14299122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5050126 - 5049912
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5050126 acaccaaatatcattccaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgtta 5050027  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5050026 ggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 5049927  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  5049926 cgtgtccaaacaata 5049912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 14287723 - 14287937
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||    
T  14287723 acaccaaatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaatcttgtta 14287822  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14287823 ggattagagttccttgatcgaacgtcgcacgtaccctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 14287922  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  14287923 cgtgtccaaacaata 14287937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 214
Target Start/End: Original strand, 21642535 - 21642740
Alignment:
Q  10 atcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagag 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  21642535 atcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagag 21642634  T
Q  109 ttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaa 208  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21642635 ttccttgatcaagcatcacacataacctaatgaacaaacatggattctagcttttcattgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaa 21642734  T
Q  209 acaata 214  Q
    ||||||    
T  21642735 acaata 21642740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1948848 - 1948633
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1948848 acaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagataaagttgagattaatagggcgtgaaacttgtt 1948749  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  1948748 aggattagagttccttaatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagattttctttgagattatcacgtatccctcgacaacactat 1948649  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  1948648 tcgtgtccaaacaata 1948633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 2446654 - 2446868
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2446654 acaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgtta 2446753  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2446754 ggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 2446853  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  2446854 cgtgtccaaacaata 2446868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 6795446 - 6795660
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6795446 acaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgtta 6795545  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6795546 ggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 6795645  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  6795646 cgtgtccaaacaata 6795660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 23612397 - 23612611
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23612397 acacgaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattacaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgtta 23612496  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  23612497 ggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactatt 23612596  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  23612597 cgtgtccaaacaata 23612611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9643132 - 9642916
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  9643132 acaccaaatatcattctaagttaaaaagataatatgtttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgtaaaacttgt 9643033  T
Q  98 tagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacacca 197  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9643032 taggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacacca 9642933  T
Q  198 ttcgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||||    
T  9642932 ttcgtgtccaaacaata 9642916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6021079 - 6020864
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  6021079 acaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtt 6020980  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  6020979 aggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgacaacactat 6020880  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  6020879 tcgtgtccaaacaata 6020864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8185607 - 8185392
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  8185607 acaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtt 8185508  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  8185507 aggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactat 8185408  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  8185407 tcgtgtccaaacaata 8185392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8193167 - 8192952
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  8193167 acaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtt 8193068  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  8193067 aggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactat 8192968  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  8192967 tcgtgtccaaacaata 8192952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 48353695 - 48353480
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  48353695 acaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtt 48353596  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  48353595 aggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactat 48353496  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  48353495 tcgtgtccaaacaata 48353480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33850857 - 33850643
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  33850857 acaccaaatatcattctaagttaaaagtcaatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaatagtaaaagttgagagtagtaaggcgttaaacttgtta 33850758  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  33850757 ggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgactatacatgtattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacaccatt 33850658  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  33850657 cgtgtccaaacaata 33850643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 45433593 - 45433805
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaa-cttgtt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  45433593 acaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagtttcaagagtaaaagttgagagtaataaggcgtaaaaacttgtt 45433692  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  45433693 aggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagattttctttgatattatcatgtatccctcgacaacaccat 45433792  T
Q  199 tcgtgtccaaaca 211  Q
    |||||||||||||    
T  45433793 tcgtgtccaaaca 45433805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 19089815 - 19090030
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  19089815 acaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaacttgtt 19089914  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  19089915 aggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctaacttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactat 19090014  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  19090015 tcgtgtccaaacaata 19090030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 48347311 - 48347096
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  48347311 acaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcatgaaacttgtt 48347212  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  48347211 aggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactat 48347112  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  48347111 tcgtgtccaaacaata 48347096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5056522 - 5056307
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    ||||||| |||||||  |||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5056522 acaccaattatcatttcaagtaaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgtt 5056423  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5056422 aggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccat 5056323  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  5056322 tcgtgtccaaacaata 5056307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 1378955 - 1379169
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1378955 acaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaaaacttgtta 1379054  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1379055 ggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgagcatacatggattctagcttgtctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 1379154  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  1379155 cgtgtccaaacaata 1379169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8142660 - 8142446
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | || ||| ||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8142660 acaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattacaaatgatacaattgagattaatagggcgtaaaacttgtta 8142561  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8142560 ggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgagcatacatggattctagcttgtctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 8142461  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  8142460 cgtgtccaaacaata 8142446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10831340 - 10831130
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| |||   |||     
T  10831340 acaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagttgcaaaagtaaaagttgagagtaataaggcgt-aaaaacgttg 10831242  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacacca 197  Q
    | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||  |||    |||||||||||||||| |||||||| |  |    
T  10831241 gaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagagttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaagatta 10831142  T
Q  198 ttcgtgtccaaa 209  Q
    ||| ||||||||    
T  10831141 ttcatgtccaaa 10831130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11025132 - 11024922
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| |||   |||     
T  11025132 acaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagttgcaaaagtaaaagttgagagtaataaggcgt-aaaaacgttg 11025034  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacacca 197  Q
    | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||  |||    |||||||||||||||| |||||||| |  |    
T  11025033 gaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagagttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaagatta 11024934  T
Q  198 ttcgtgtccaaa 209  Q
    ||| ||||||||    
T  11024933 ttcatgtccaaa 11024922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13774204 - 13774130
Alignment:
Q  140 gatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  13774204 gatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacatcattcgtgtccaaacaata 13774130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21901404 - 21901193
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||| || | || |  |||||||||| ||||| ||||| |||   |||    
T  21901404 acaccatatatcattctaagttgaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaatttcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgt-aaaaacgtt 21901306  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacacc 196  Q
    || || ||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||| |      
T  21901305 agaatcagagttccttgattaagcgtcaaacataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaagatt 21901206  T
Q  197 attcgtgtccaaa 209  Q
    |||||||||||||    
T  21901205 attcgtgtccaaa 21901193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 1942053 - 1942095
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgt 43  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1942053 acaccaaatatcattataagttaaacgataatttgttgtttgt 1942095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 209
Target Start/End: Original strand, 27954243 - 27954303
Alignment:
Q  148 atggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 209  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27954243 atggattctagctttactc-gatattatcacatattcctcaacaacatcattcgtgtccaaa 27954303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 209
Target Start/End: Original strand, 28442628 - 28442671
Alignment:
Q  166 ttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 209  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  28442628 ttgatattatcacatatcgctcaacaacatcattcgtgtccaaa 28442671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 32)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 44241365 - 44241579
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44241365 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgatgaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 44241464  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44241465 ggattagagttcattgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 44241564  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  44241565 cgtgtccaaacaata 44241579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 29001739 - 29001953
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29001739 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataaggcgtaaaacttgtta 29001838  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  29001839 ggattagagttccttggtcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactatt 29001938  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    | |||||||| ||||    
T  29001939 catgtccaaataata 29001953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 9869113 - 9869327
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9869113 acaccaaatatcattctaagttaaaagataattggtagtttgttttaatgactaagttgcaaatgataaaattgagattaataaggtgtgaaacttgtta 9869212  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||    
T  9869213 ggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacatcttt 9869312  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  9869313 cgtgtccaaacaata 9869327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 31072326 - 31072540
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31072326 acaccaaatatcattctaagctaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaattgagattaataaggcatgaaacttgtta 31072425  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  31072426 ggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggactctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacaccatt 31072525  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  31072526 cgtgtccaaacaata 31072540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 4599536 - 4599753
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  4599536 acaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaacttgtt 4599635  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4599636 aggattagagttccttgattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccat 4599735  T
Q  199 tcgtgtccaaacaatact 216  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4599736 tcgtgtccaaacaatact 4599753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 1174613 - 1174828
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  1174613 acaccaaatatcattctaagttgaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtgaaacttgtt 1174712  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1174713 aggattagagttccttgagcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccat 1174812  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  1174813 tcgtgtccaaacaata 1174828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 6238663 - 6238877
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6238663 acaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactagattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgtta 6238762  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6238763 ggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 6238862  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  6238863 cgtgtccaaacaata 6238877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 39053552 - 39053338
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39053552 acaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtta 39053453  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  39053452 ggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactatt 39053353  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  39053352 cgtgtccaaacaata 39053338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 39059924 - 39059710
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39059924 acaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtta 39059825  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  39059824 ggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactatt 39059725  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  39059724 cgtgtccaaacaata 39059710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 42091904 - 42092118
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  42091904 acaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgtta 42092003  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42092004 ggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 42092103  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  42092104 cgtgtccaaacaata 42092118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 45015789 - 45016003
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  45015789 acaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgtta 45015888  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45015889 ggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 45015988  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  45015989 cgtgtccaaacaata 45016003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 26621477 - 26621692
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| || | || |  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  26621477 acaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaatttcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaacttgtt 26621576  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26621577 aggattagggttccttgattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccat 26621676  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  26621677 tcgtgtccaaacaata 26621692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 44916338 - 44916560
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagtt---------gcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaa 91  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||         | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44916338 acaccaaatatcattctaaattaaaagatagtttgttgtttgttttaaaaactaagttaactatgttgaaatgataaagttgagattaataaggcgtgaa 44916437  T
Q  92 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 191  Q
    ||||||||| |||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  44916438 acttgttaggattagaattccttaaccaaacgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgaca 44916537  T
Q  192 acaccattcgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  44916538 acaccattcgtgtccaaacaata 44916560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41305729 - 41305514
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  41305729 acaccaaatatcattctaagtttaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaacttgtt 41305630  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41305629 aggattagagttccttgattaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccat 41305530  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    || |||||||||||||    
T  41305529 tcatgtccaaacaata 41305514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11913475 - 11913262
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgt 97  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| |||||||| ||   ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11913475 acaccaaatatcattctaagtttaaaagatagattgtttgtttgtttaaa---ctaagttgcgaataataaaattgagattaataaggcgtgaaacttgt 11913379  T
Q  98 tagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacacca 197  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11913378 taggattagagttccttgaccaagcatcacatgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacacca 11913279  T
Q  198 ttcgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||||    
T  11913278 ttcgtgtccaaacaata 11913262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 214
Target Start/End: Original strand, 41297527 - 41297739
Alignment:
Q  4 ccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagt 101  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||     
T  41297527 ccaaatatcattctaagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaacttgttagg 41297626  T
Q  102 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcg 201  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  41297627 attagagttccttgatcgatcctcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgacaacaccattcg 41297726  T
Q  202 tgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||    
T  41297727 tgtccaaacaata 41297739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 27240345 - 27240161
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27240345 acaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaataaggcgtgaaacttgtt 27240246  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 183  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27240245 aggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 27240161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 43686635 - 43686851
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgt 97  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  43686635 acaccaaataccattccaagttaaaaagataatctgtttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgtaaaacttgt 43686734  T
Q  98 tagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacacca 197  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  43686735 taggattagagttccttgatcgagcgtctcatttaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacacca 43686834  T
Q  198 ttcgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||||    
T  43686835 ttcgtgtccaaacaata 43686851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 32797744 - 32797945
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaa-cttgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||            || ||||| ||||| ||| |||||||    
T  32797744 acaccaaatatcattctaagttaaa-gataatttgttgtttgttttagaaactaagttgcaa------------gagtaatagggcgtaaaaacttgtta 32797830  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  32797831 ggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacacaatt 32797930  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  32797931 cgtgtccaaacaata 32797945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1116198 - 1115982
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||   |||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  1116198 acaccaaatatcattctaagttaaaagctaatttgttgtttgttt-agtaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggtgtgaaacttctta 1116100  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaac---acc 196  Q
      ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||   |||    
T  1116099 tgattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgactatacatggattctaccttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacactacc 1116000  T
Q  197 attcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  1115999 atttgtgtccaaacaata 1115982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41299403 - 41299188
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  41299403 acaccaaatatcattctaagttaaaagataatttatttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaacttgtt 41299304  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  41299303 aggattagagttccttgattaagcgtcacatataacctaatgaccattcatggattcaagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacaccat 41299204  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    || | |||||||||||    
T  41299203 tcttttccaaacaata 41299188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 23764646 - 23764521
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23764646 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaaaacttgtta 23764547  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtc 125  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  23764546 ggattagagttccttgatcaagcgtc 23764521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 5445177 - 5445028
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5445177 acaccaactatcattctaagttaaa-gataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagattaataaggtgtgaaacttgtta 5445079  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatg 150  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  5445078 ggattagagttccttgatcaagcctcacacataacctaatgaccatacatg 5445028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28413888 - 28413678
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| |||   |||     
T  28413888 acaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagttgcaaaagtaaaagttgagagtaataaggcgt-aaaaacgttg 28413790  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacacca 197  Q
    | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||     ||||||||||||||| |||||||| |  |    
T  28413789 gaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcattttaccaatattatcacgtatcgctcaacaagatta 28413690  T
Q  198 ttcgtgtccaaa 209  Q
    ||||||||||||    
T  28413689 ttcgtgtccaaa 28413678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 135 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23762415 - 23762336
Alignment:
Q  135 ctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23762415 ctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaata 23762336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 39806065 - 39806274
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  |  ||| |||||| ||||||||||| |||   |||     
T  39806065 acaccaaatatcattttaagttaaa-gataatttgttgttcgttttagaaactaagttgcaagagtaaaaattgagagtaataaggcgt-aaaaacgttg 39806162  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacacca 197  Q
    | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||| ||| |||    |||||||||||||||| |||||||| |  |    
T  39806163 gaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattccagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaagatta 39806262  T
Q  198 ttcgtgtccaaa 209  Q
    ||||||||||||    
T  39806263 ttcgtgtccaaa 39806274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2825033 - 2824824
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||   || |  |||||||||| ||||||||||| |||   ||| |    
T  2825033 acaccaaatatcattctaagttaaaagataatatgttgtttgttttagtaaccaagtataaaagtgaaagttgagagtaataaggcgt-aaaaacgttgg 2824935  T
Q  101 tattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
     |||||||||||||||| | |||||| || ||| ||||| ||  |||| ||| |||||||| |||     ||||||||||||||| |||||||| |  ||    
T  2824934 aattagagttccttgattatgcgtcaaacataacctaataatcacatatatgaattctagcgttttacccatattatcacgtatcgctcaacaagattat 2824835  T
Q  199 tcgtgtccaaa 209  Q
    || ||||||||    
T  2824834 tcatgtccaaa 2824824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 38672982 - 38672788
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagtta-aacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  |  |||||||||| ||||||||||| |||    ||    
T  38672982 acaccaaatatcattctaagtttgaaagataatttgttgttcgttttagaaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggcgt-aaaaacatt 38672884  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaa 192  Q
     | |||||||||||||||| |||||||| || ||| || || ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||||||||    
T  38672883 ggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctgataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaa 38672788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 79 - 205
Target Start/End: Original strand, 47646755 - 47646883
Alignment:
Q  79 aataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacat--ggattctagcttttctttgatattatc 176  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||| ||||  |||||  ||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||  | |||||||||    
T  47646755 aataaggcgtaaaacttgttatgattagagttcgttgaccaagaatcacatataacctaatgatcacatatacggattctagcttttaatcgatattatc 47646854  T
Q  177 acgtatccctcaacaacaccattcgtgtc 205  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  47646855 acgtatccctcgacaacatcattcatgtc 47646883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 208
Target Start/End: Original strand, 23251426 - 23251568
Alignment:
Q  67 aaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatc--atacatggattctagcttttc 164  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| |||  ||| |||||||||||| |||     
T  23251426 aaagttgagagtaataaggcgtaaaaac-gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcgcatatatggattctagcgtttt 23251524  T
Q  165 tttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaa 208  Q
       |||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  23251525 accgatattatcacgtatcgctcaacaagattattcgtgtccaa 23251568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5357861 - 5357752
Alignment:
Q  102 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||||  || |||||||||||| |||     ||||||||||||||| |||||||| |  |||    
T  5357861 attagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcattttcccaatattatcacgtatcgctcaacaagattatt 5357762  T
Q  200 cgtgtccaaa 209  Q
    ||||||||||    
T  5357761 cgtgtccaaa 5357752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 45620258 - 45620149
Alignment:
Q  102 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||||| ||||  || |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||| |||| |  |||    
T  45620258 attagagttccttgattaagcttcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcgacaagattatt 45620159  T
Q  200 cgtgtccaaa 209  Q
    ||||||||||    
T  45620158 cgtgtccaaa 45620149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 175; Significance: 9e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 2653 - 2867
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2653 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagctgcaaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 2752  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  2753 ggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattatagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacaccatt 2852  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    ||| |||||||||||    
T  2853 cgtatccaaacaata 2867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13672031 - 13671817
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13672031 acaccaaatatcattataagttaaacgataatttgttgtttatttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataatgcgtgaaacttgtta 13671932  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  13671931 ggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactatt 13671832  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
     ||||||||||||||    
T  13671831 agtgtccaaacaata 13671817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 27670102 - 27670316
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  27670102 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataaagtgtgaaacttgtta 27670201  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27670202 ggattagagttccttgatcaagtgtcacacgtaacctaataatcatacatgaattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacatcatt 27670301  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  27670302 cgtgtccaaacaata 27670316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 31547903 - 31548117
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31547903 acaccaaatatcattcttagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtta 31548002  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  31548003 ggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcacacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactatt 31548102  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  31548103 cgtgtccaaacaata 31548117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 32328707 - 32328493
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32328707 acaccagatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgtta 32328608  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32328607 ggattagagttccttgatcgagcgtcacatataacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 32328508  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  32328507 cgtgtccaaacaata 32328493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1428637 - 1428423
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1428637 acaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaataaggcgtaaaacttgtta 1428538  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1428537 ggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 1428438  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  1428437 cgtgtccaaacaata 1428423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34711771 - 34711557
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  34711771 acaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgtta 34711672  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34711671 ggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 34711572  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  34711571 cgtgtccaaacaata 34711557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9864975 - 9864760
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  9864975 acaccaaataccattctaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtt 9864876  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  9864875 aggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacttaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaatactat 9864776  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  9864775 tcgtgtccaaacaata 9864760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21262789 - 21262574
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  21262789 acaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaacttgtt 21262690  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21262689 aggattagagttccttgattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagtttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccat 21262590  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  21262589 tcgtgtccaaacaata 21262574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 4186693 - 4186907
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||    
T  4186693 acaccaaatataattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtagaacttgtta 4186792  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  4186793 ggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctaacttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacaccatt 4186892  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  4186893 cgtgtccaaacaata 4186907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11058364 - 11058150
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11058364 acaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgtta 11058265  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11058264 ggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 11058165  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  11058164 cgtgtccaaacaata 11058150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4020450 - 4020235
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  4020450 acaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtt 4020351  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  4020350 aggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactat 4020251  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  4020250 tcgtgtccaaacaata 4020235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4026876 - 4026661
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  4026876 acaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtt 4026777  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  4026776 aggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactat 4026677  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  4026676 tcgtgtccaaacaata 4026661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 34655258 - 34655473
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  34655258 acaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtt 34655357  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  34655358 aggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactat 34655457  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  34655458 tcgtgtccaaacaata 34655473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 34648807 - 34649022
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| || || | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  34648807 acaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtatctcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtt 34648906  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  34648907 aggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactat 34649006  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  34649007 tcgtgtccaaacaata 34649022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7069916 - 7069702
Alignment:
Q  2 caccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7069916 caccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtta 7069817  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  7069816 ggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacactatt 7069717  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  7069716 cgtgtccaaacaata 7069702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4738538 - 4738323
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  4738538 acaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtt 4738439  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  4738438 aggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacactat 4738339  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||| ||||||||||||    
T  4738338 tcgagtccaaacaata 4738323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 29906898 - 29907045
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29906898 acactaaatatcattctaagttaaaatataatttgttgtttgttttagtaactaaattgctaataataaaattgagattaataaggcgtgaaacttgtta 29906997  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatac 147  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  29906998 ggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatac 29907045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 30117482 - 30117335
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30117482 acactaaatatcattctaagttaaaatataatttgttgtttgttttagtaactaaattgctaataataaaattgagattaataaggcgtgaaacttgtta 30117383  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatac 147  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  30117382 ggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaaggaccatac 30117335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1167630 - 1167480
Alignment:
Q  71 ttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttt-------t 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||| | ||||||||| |||       |    
T  1167630 ttgagattaataaggcgtgaaacttgttaggattagaattctttgatcaagcgtcacacataacctgatgatcatatacggattctagttttttttttat 1167531  T
Q  164 ctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 214  Q
     ||| ||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||| ||||    
T  1167530 tttttatattatcatgtatccctcaacaatatcgttcgtgtccaaataata 1167480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 7062698 - 7062578
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  7062698 acaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtt 7062599  T
Q  99 agtattagagttccttgatca 119  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  7062598 aggattagagttccttgatca 7062578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10081762 - 10081567
Alignment:
Q  16 ctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagtt-gagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttcctt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||   |||| || |||| ||||||||||| |||   ||| | |||||||||||||    
T  10081762 ctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagaaactaagttgcaagagtaaaatttgagagtaataaggcgtaaaaac-gttggaattagagttcctt 10081664  T
Q  115 gatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 209  Q
    ||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||    ||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  10081663 gattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacatatcgctcaacaagattattcgtgtccaaa 10081567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7062578 - 7062516
Alignment:
Q  152 attctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  7062578 attctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaata 7062516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 209
Target Start/End: Original strand, 9846601 - 9846738
Alignment:
Q  73 gagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacat--ggattctagcttttctttgat 170  Q
    |||||||||||||||| |||   ||| | |||||||||| ||||| |||||||| || ||| || || |||| | ||  |||||||||| |||  | |||    
T  9846601 gagattaataaggcgtaaaagc-gttggaattagagttcgttgattaagcgtcaaacataacctgataatcacatatacggattctagcattttatcgat 9846699  T
Q  171 attatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 209  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  9846700 attatcacgtatcgctcgacaacatcattcgtgttcaaa 9846738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 214
Target Start/End: Original strand, 29907044 - 29907081
Alignment:
Q  177 acgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 214  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29907044 acgtgtccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 29907081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30117336 - 30117299
Alignment:
Q  177 acgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 214  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30117336 acgtgtccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 30117299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 4973571 - 4973785
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4973571 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaaatgataaaattgagattaataaggggtgaaacttgtta 4973670  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  4973671 ggatcagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacataatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgacaacatcatt 4973770  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  4973771 cgtgtccaaacaata 4973785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 22359972 - 22360186
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22359972 acaccaaatattattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaaaacttgtta 22360071  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  22360072 ggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactatt 22360171  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  22360172 cgtgtccaaacaata 22360186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 22313838 - 22314052
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22313838 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttatttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaaaacttgtta 22313937  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  22313938 ggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccgtacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactatt 22314037  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  22314038 cgtgtccaaacaata 22314052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 5876226 - 5876440
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5876226 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaaaacttgtta 5876325  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  5876326 ggattagagttccttgatcaagcgtcgcacataacctaatgaccatacatggattctagattttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactatt 5876425  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  5876426 cgtgtccaaacaata 5876440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34357502 - 34357288
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  34357502 acaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgtta 34357403  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34357402 ggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 34357303  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  34357302 cgtgtccaaacaata 34357288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34359293 - 34359079
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  34359293 acaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgtta 34359194  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34359193 ggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 34359094  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  34359093 cgtgtccaaacaata 34359079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 2957866 - 2958081
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  2957866 acaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtt 2957965  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  2957966 aggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactat 2958065  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  2958066 tcgtgtccaaacaata 2958081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 2966335 - 2966550
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  2966335 acaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtt 2966434  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  2966435 aggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactat 2966534  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  2966535 tcgtgtccaaacaata 2966550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 29980467 - 29980681
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  29980467 acaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaaaacttgtta 29980566  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29980567 ggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 29980666  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  29980667 cgtgtccaaacaata 29980681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30041458 - 30041244
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30041458 acaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaaaacttgtta 30041359  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30041358 ggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 30041259  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  30041258 cgtgtccaaacaata 30041244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 40958831 - 40958617
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  40958831 acaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttatttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaacacttgtta 40958732  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  40958731 ggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtattcctcgacaacactatt 40958632  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  40958631 cgtgtccaaacaata 40958617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25894864 - 25894649
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  25894864 acaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtt 25894765  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  25894764 aggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatcgattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactat 25894665  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  25894664 tcgtgtccaaacaata 25894649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 2438811 - 2439022
Alignment:
Q  3 accaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagt 101  Q
    |||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  2438811 accaaaaatcattataagttaaaagaaaatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaagtgagattaataaggcgtgaaacttgttagg 2438910  T
Q  102 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcg 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |    
T  2438911 attagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatga-catgcatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacatcatttg 2439009  T
Q  202 tgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||    
T  2439010 tgtccaaacaata 2439022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12505987 - 12505765
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttt------taa--taactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaa 91  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||| |||      |||  |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12505987 acaccaaataccattttaagttaaaagatagtttgttgtttatttagaaactaagttaactatgttgcgaataataaagttgagattaataaggcgtgaa 12505888  T
Q  92 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 191  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12505887 acttgttaggattagagttccttgatcaagagtcccacgtaacctaatgattatacatggattctagcttctctttgatattatcacgtatccctcgaca 12505788  T
Q  192 acaccattcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  12505787 acatcattcgtgtccaaacaata 12505765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 212
Target Start/End: Original strand, 42150829 - 42151039
Alignment:
Q  4 ccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagt 101  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||     
T  42150829 ccaaatatcattctaagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaacttgttagg 42150928  T
Q  102 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcg 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  42150929 attagagttccttaatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagtttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcg 42151028  T
Q  202 tgtccaaacaa 212  Q
    |||||||||||    
T  42151029 tgtccaaacaa 42151039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29414883 - 29414669
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||  || |   ||    ||||| |||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  29414883 acaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaagcaaatataaaattgaaagtcgagagtaatagggcgtaaaacttatta 29414784  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | |||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  29414783 ggattagaatttcttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacatcatt 29414684  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    | ||| |||||||||    
T  29414683 catgttcaaacaata 29414669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 33794100 - 33794309
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||| | |||     
T  33794100 acaccaaatatcattctaagttaaa-gataatttgttgtatgttttagaaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggcgtaaaaat-gttg 33794197  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacacca 197  Q
    | |||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||  || |||||||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||||| |  |    
T  33794198 gaattagagttctttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttactgatattatcacgtatcgctcaacaagatta 33794297  T
Q  198 ttcgtgtccaaa 209  Q
    ||||| ||||||    
T  33794298 ttcgtatccaaa 33794309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 9843357 - 9843566
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| || |   || |  |||||||||| ||||| ||||| |||    || |    
T  9843357 acaccaaatatcattctaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaaccaaatataaaagtgaaagttgagagtaatagggcgtaaaaaca-ttgg 9843455  T
Q  101 tattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||||  || |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||| |  ||    
T  9843456 aattagagttccttgatcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaagattat 9843555  T
Q  199 tcgtgtccaaa 209  Q
    |||||||||||    
T  9843556 tcgtgtccaaa 9843566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2156332 - 2156125
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||   ||||||| |||| ||||   || |  |||||||||| ||||||||||| |||   |||     
T  2156332 acaccaaatatcattctaagtttaaaagataatttgtt---tgttttagtaaccaagtgtaaaagtgaaagttgagagtaataaggcgtaaaaac-gttg 2156237  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacacca 197  Q
    | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||||  || |||||||||||  |||    |||||||||||||||| |||||||| |  |    
T  2156236 gaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagtgttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaagatta 2156137  T
Q  198 ttcgtgtccaaa 209  Q
    ||||||||||||    
T  2156136 ttcgtgtccaaa 2156125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19853588 - 19853484
Alignment:
Q  103 ttagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattc 200  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| ||||  || |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19853588 ttagagttcgttgattaagcgtcaaacataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcactcaacaacatcattc 19853489  T
Q  201 gtgtc 205  Q
     ||||    
T  19853488 atgtc 19853484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12919064 - 12918955
Alignment:
Q  102 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    |||||||||||||| | |||||||| || ||| ||||| | ||  || |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  12919064 attagagttccttggttaagcgtcaaacataacctaataaccacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaagactatt 12918965  T
Q  200 cgtgtccaaa 209  Q
    ||||||||||    
T  12918964 cgtgtccaaa 12918955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 30580304 - 30580195
Alignment:
Q  102 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||  || |||||||||||| |||  | ||||||||||||||||  || || ||| ||||    
T  30580304 attagagttcgttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttatcgatattatcacgtatcggtcgacgacatcatt 30580205  T
Q  200 cgtgtccaaa 209  Q
    ||||||||||    
T  30580204 cgtgtccaaa 30580195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 167; Significance: 5e-89; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2021662 - 2021448
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  2021662 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggtgtaaaacttgtta 2021563  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  2021562 ggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactatt 2021463  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  2021462 cgtgtccaaacaata 2021448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21342096 - 21341882
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21342096 acaccaaatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttaatgactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtta 21341997  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21341996 ggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 21341897  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    | |||||||||||||    
T  21341896 catgtccaaacaata 21341882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21332208 - 21331994
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21332208 acaccaaatatcattctaagttaaaagatagttggttgtttgttttaatgactaaatttcaaatgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtta 21332109  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21332108 ggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 21332009  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    | |||||||||||||    
T  21332008 catgtccaaacaata 21331994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 42931586 - 42931372
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42931586 acaccaaatatcattccaagttaacagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtta 42931487  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  42931486 ggattagagttccttgatcaaatgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactatt 42931387  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  42931386 cgtgtccaaacaata 42931372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16856696 - 16856487
Alignment:
Q  5 caaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||    
T  16856696 caaatatcattcaaagttaaa-gataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaanacttgttaggat 16856598  T
Q  104 tagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtg 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16856597 tagagtttcttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgacaacaccattcgtg 16856498  T
Q  204 tccaaacaata 214  Q
    |||||||||||    
T  16856497 tccaaacaata 16856487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 12950804 - 12951018
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12950804 acaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaataaggcgtaaaacttgtta 12950903  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12950904 ggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 12951003  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  12951004 cgtgtccaaacaata 12951018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16817539 - 16817330
Alignment:
Q  5 caaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||    
T  16817539 caaatatcattcaaagttaaa-gataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaacacttgttaggat 16817441  T
Q  104 tagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtg 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16817440 tagagtttcttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgacaacaccattcgtg 16817341  T
Q  204 tccaaacaata 214  Q
    |||||||||||    
T  16817340 tccaaacaata 16817330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36782399 - 36782184
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  36782399 acaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgtt 36782300  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36782299 aggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccat 36782200  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  36782199 tcgtgtccaaacaata 36782184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34835026 - 34834812
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  34835026 acaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactagattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgtta 34834927  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34834926 ggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 34834827  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  34834826 cgtgtccaaacaata 34834812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34841470 - 34841256
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  34841470 acaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactagattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgtta 34841371  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34841370 ggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 34841271  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  34841270 cgtgtccaaacaata 34841256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 29484934 - 29485149
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  29484934 acaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtt 29485033  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  29485034 aggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactat 29485133  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  29485134 tcgtgtccaaacaata 29485149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 45011990 - 45012205
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  45011990 acaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtt 45012089  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  45012090 aggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactat 45012189  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  45012190 tcgtgtccaaacaata 45012205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 15852557 - 15852772
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  15852557 acaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtt 15852656  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15852657 aggattagagttccttgatcaagcgtcacacttaacctaatgatcacacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactat 15852756  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  15852757 tcgtgtccaaacaata 15852772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 43267866 - 43268081
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  43267866 acaccaattatcatttcaagttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgtt 43267965  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43267966 aggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccat 43268065  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  43268066 tcgtgtccaaacaata 43268081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 2157620 - 2157834
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2157620 acaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaaaacttgtta 2157719  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2157720 ggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctatcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 2157819  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  2157820 cgtgtccaaacaata 2157834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 2164036 - 2164250
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2164036 acaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaaaacttgtta 2164135  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2164136 ggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgattatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 2164235  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  2164236 cgtgtccaaacaata 2164250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13902171 - 13901957
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13902171 acaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaaaacttgtta 13902072  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13902071 ggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgagcatacatggattctagcttgtctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 13901972  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  13901971 cgtgtccaaacaata 13901957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21068172 - 21067958
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||    
T  21068172 acaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgtattagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggtgtgaaactt-tt 21068074  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || ||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21068073 aggattagagttccttgagcaggcatcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 21067974  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  21067973 tcgtgtccaaacaata 21067958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 45700793 - 45700644
Alignment:
Q  65 ataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttc 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45700793 ataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagaattagagttccttgatcaaacgtcacacataacctaatgatcatacctggattctagcttttc 45700694  T
Q  165 tttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  45700693 tttgatattatcacgtatccctcgacaacatcattcgtgtccaaacaata 45700644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 41455614 - 41455823
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||   || |  |||||||||| ||||||||||| |||   ||| |    
T  41455614 acaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagtgcaaaagtaaaagttgagagtaataaggcgt-aaaaacgttgg 41455712  T
Q  101 tattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
     |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||| | | |||    |||||||||||||||| |||||||| |  ||    
T  41455713 aattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattccaccgttttaccgatattatcacgtatcactcaacaagattat 41455812  T
Q  199 tcgtgtccaaa 209  Q
    |||||||||||    
T  41455813 tcgtgtccaaa 41455823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 50 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11910116 - 11909950
Alignment:
Q  50 aactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatga--tcatac 147  Q
    |||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  ||||| |||||   ||||     
T  11910116 aactaatttgcaagaataaaagtgagattaataaggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcatcccatataatccaatgaccacatat 11910017  T
Q  148 atggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 214  Q
    | ||||||||||||||  |  |||||||||||||||  || |||| |  ||||||||||||| ||||    
T  11910016 acggattctagcttttaatctatattatcacgtatcagtcgacaatattattcgtgtccaaataata 11909950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17784604 - 17784443
Alignment:
Q  50 aactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--ta 146  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||||  ||    
T  17784604 aactaatttgcaaagataaaagttgagagtaataaggcgtaaaagc-gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacata 17784506  T
Q  147 catggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 209  Q
     ||| |||||||| |||    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  17784505 tatgaattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcgacaacatcattcgtgtccaaa 17784443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 205
Target Start/End: Original strand, 13162892 - 13163032
Alignment:
Q  67 aaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttc 164  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||  || ||  |||  |||||||  |||| |  |||||||||||||     
T  13162892 aaagttgagagtaataaggcgtaaaacttgttaggattagagttcattgaccaagaatcgcatataacataatgatcacatatacagattctagctttta 13162991  T
Q  165 tttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtc 205  Q
     |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  13162992 atcaatattatcacgtatccctcgacaacatcattcatgtc 13163032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17789257 - 17789096
Alignment:
Q  50 aactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--ta 146  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || |||  |||| ||||  ||    
T  17789257 aactaatttgcaaagataaaagttgagagtaataaggcgtaaaagc-gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacataataatcacata 17789159  T
Q  147 catggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 209  Q
     |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||    
T  17789158 tatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcgacaacatcattcctgtccaaa 17789096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 17)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 55462986 - 55462772
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55462986 acaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtta 55462887  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  55462886 ggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactatt 55462787  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  55462786 cgtgtccaaacaata 55462772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 16405350 - 16405568
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16405350 acaccaaatatcgttctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataaggcgtaaaacttgtta 16405449  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttg----atattatcacgtatccctcaacaacac 195  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| | ||||||||| |||||||    
T  16405450 ggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatatatattataatgtatccctcgacaacac 16405549  T
Q  196 cattcgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16405550 cattcgtgtccaaacaata 16405568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16838572 - 16838359
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16838572 acaccaaatatcattctaagttaaa-gatgatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 16838474  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16838473 ggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctatcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacaccatt 16838374  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  16838373 cgtgtccaaacaata 16838359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 27590313 - 27590527
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27590313 acaccaaataccattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtta 27590412  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  27590413 ggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactatt 27590512  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  27590513 cgtgtccaaacaata 27590527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 41372994 - 41373209
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  41372994 acaccaattatcattctaagttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgtt 41373093  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  41373094 aggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacatcat 41373193  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  41373194 tcgtgtccaaacaata 41373209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 37368529 - 37368315
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  37368529 acaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtt 37368430  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  37368429 aggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactat 37368330  T
Q  199 tcgtgtccaaacaat 213  Q
    |||||||||||||||    
T  37368329 tcgtgtccaaacaat 37368315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 13594114 - 13594330
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  13594114 acaccaaatatcattctaagttaaaaagataatatgtttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgtaaaacttgt 13594213  T
Q  98 tagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacacca 197  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13594214 taggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacacca 13594313  T
Q  198 ttcgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||||    
T  13594314 ttcgtgtccaaacaata 13594330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 7780415 - 7780629
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  7780415 acactaaatatcattctaagttaaa-gatgatttgttgtttgttttagtaacgaaattgcaaatgataaaagttgagagtaatagggcgtaaaacttgtt 7780513  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  7780514 aggattagagttccttgattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacatcat 7780613  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  7780614 tcgtgtccaaacaata 7780629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 8103889 - 8104104
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  8103889 acaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtt 8103988  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  8103989 aggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcacacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactat 8104088  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  8104089 tcgtgtccaaacaata 8104104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 30238268 - 30238482
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30238268 acaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgtta 30238367  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||    
T  30238368 ggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatgtattctagcttttctttgatattatcatttatccctcgacaacactatt 30238467  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  30238468 cgtgtccaaacaata 30238482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 17456862 - 17457077
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  || ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  17456862 acaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgacaaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtt 17456961  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17456962 aggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactat 17457061  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    || |||||||||||||    
T  17457062 tcatgtccaaacaata 17457077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30211731 - 30211536
Alignment:
Q  20 gttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatc 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  30211731 gttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaattgagattaataaggcatgaaacttgttatgattagagttccttaatc 30211632  T
Q  119 aagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30211631 aagcgtcacacataacttaatgaccatacatggattctagattttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaaaaata 30211536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36755013 - 36754791
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagtt---------gcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaa 91  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||         | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36755013 acaccaaatatcattctaaattaaaagatagtttgttgtttgttttagtaactaagttaactatattgaaatgataaagttgagattaataaggcgtgaa 36754914  T
Q  92 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 191  Q
    |||| |||| |||  |||||||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  36754913 acttattaggattgaagttccttaatcaagcgtcacacattacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgaca 36754814  T
Q  192 acaccattcgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  36754813 acaccattcgtgtccaaacaata 36754791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5660696 - 5660549
Alignment:
Q  67 aaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctt 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  5660696 aaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcatcacatgtaacctaatgatcatatacggattctaacttttctt 5660597  T
Q  167 tgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||    
T  5660596 tgatataatcacgtatccctcgacaatatcattcgtgtccaaataata 5660549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 13004001 - 13003809
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |  |||||||||| ||||||||||| |||   |||     
T  13004001 acaccaaatatcattataagttaaaagacaatttgttgtttgttttagtaacaaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggcgt-aaaaacgttg 13003903  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 191  Q
    | |||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||    
T  13003902 gaattagagttctttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcactcaaca 13003809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 2947853 - 2948062
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| || |   || |  |||||||||| ||||| ||||| |||    || |    
T  2947853 acaccaaatatcattctaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaaccaaatataaaagtgaaagttgagagtaatagggcgtaaaaaca-ttgg 2947951  T
Q  101 tattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||||  || |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||| |  ||    
T  2947952 aattagagttccttgatcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaagattat 2948051  T
Q  199 tcgtgtccaaa 209  Q
    |||||||||||    
T  2948052 tcgtgtccaaa 2948062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 48914907 - 48914996
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgt 88  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | |||| || |||||| |||||||||||| |||||    
T  48914907 acaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgt 48914996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 159; Significance: 3e-84; HSPs: 17)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 12768752 - 12768966
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12768752 acaccaaatatcattctaagttaaatgataattcgttgtttgttttaataactaaattgcaaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 12768851  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  12768852 ggattagagttctttgatcaagcttcacacgtaacctaatgattatacatggattctagattttctttgatattatcatgtatccctcgacaagaccatt 12768951  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  12768952 cgtgtccaaacaata 12768966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11358408 - 11358193
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  11358408 acaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtt 11358309  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  11358308 aggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactat 11358209  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  11358208 tcgtgtccaaacaata 11358193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 7311357 - 7311571
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  7311357 acaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgtta 7311456  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7311457 ggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 7311556  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  7311557 cgtgtccaaacaata 7311571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8013534 - 8013320
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8013534 acaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgtta 8013435  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8013434 ggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 8013335  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  8013334 cgtgtccaaacaata 8013320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36005696 - 36005482
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  36005696 acaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgtta 36005597  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36005596 ggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 36005497  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  36005496 cgtgtccaaacaata 36005482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36425945 - 36425730
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  36425945 acaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtt 36425846  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  36425845 aggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactat 36425746  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  36425745 tcgtgtccaaacaata 36425730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6464790 - 6464576
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  6464790 acaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaactcgtta 6464691  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6464690 ggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 6464591  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  6464590 cgtgtccaaacaata 6464576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 15012396 - 15012610
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   |||| ||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  15012396 acaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagttactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaatagggtgtgaaacttgtta 15012495  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15012496 ggattagagttccttaatcaagcgtcacacggaacctaatgactatacatggattctatcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 15012595  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  15012596 cgtgtccaaacaata 15012610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 36075975 - 36076189
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  36075975 acaccaaatatcatttcaagttaaacaatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgtta 36076074  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36076075 ggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 36076174  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  36076175 cgtgtccaaacaata 36076189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41242330 - 41242116
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| |||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  41242330 acaccaaatatcttttcaagttaaatgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgtta 41242231  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41242230 ggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 41242131  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  41242130 cgtgtccaaacaata 41242116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36022014 - 36021799
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    ||||||| |||||||  |||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  36022014 acaccaattatcatttcaagtaaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgtt 36021915  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36021914 aggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccat 36021815  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  36021814 tcgtgtccaaacaata 36021799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16710880 - 16710668
Alignment:
Q  4 ccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagt 101  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| | |||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||  |||| ||| | |||||||||||     
T  16710880 ccaaatatcattctaagttgaaagatagtatgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagcaatagggcataaaacttgttagg 16710781  T
Q  102 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcg 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16710780 attagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatgaattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcg 16710681  T
Q  202 tgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||    
T  16710680 tgtccaaacaata 16710668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 1238221 - 1238436
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaagttg-caatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||| |||  || |  |||||||||| |||||  |||| |||||||||    
T  1238221 acaccaaatatcattctaagttaaaaaataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgaaaaagtaaaagttgagagtaatagagcgtaaaacttgtt 1238320  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  1238321 aggattagagttccttgatcaagcgtcacaaataacctgatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactat 1238420  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  1238421 tcgtgtccaaacaata 1238436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 71 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26250734 - 26250591
Alignment:
Q  71 ttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgat 170  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||    
T  26250734 ttgagattaataaggcgtgaaatttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaatctaataaccatacatggtttatagcttttctttgat 26250635  T
Q  171 attatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  26250634 attatcacgtatccctcgacaatatcattcgtgtccaaacaata 26250591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 45068609 - 45068416
Alignment:
Q  22 taaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaa 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||  ||| ||| ||||||| |||||||||| || |||||    
T  45068609 taaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaaacgtaaaatttgttaggattagagttctttaatcaa 45068510  T
Q  121 gcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  45068509 gcgtcgcacgtaacctaatgaccatacatggattctagtttttctttgatattatcatgtaaccctcgataacaccattcgtgtccgaacaata 45068416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 31017407 - 31017608
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttag 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||              || ||||||||||||||||| |||||    
T  31017407 acaccaaatatcattttaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaacaaagttgc--------------gaataataaggcgtgaaactagttag 31017492  T
Q  101 tattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcata--catggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
     |||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31017493 gattagagttctttaatcaagcgtcacatgtaacctaatgaccatatacatggattctaatttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccat 31017592  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||| ||||    
T  31017593 tcgtgtccaaaaaata 31017608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7934141 - 7933931
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaag-ttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||||| |||| || |   || |  |||||||||| ||||| ||||| |||    ||     
T  7934141 acaccaaatatcattctaaggttaaacgatagttgatggtttgttttagtaaccaaatataaaagtgaaagttgagagtaatagggcgtaaaaaca-ttg 7934043  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacacca 197  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||||  || |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||| |  |    
T  7934042 gaattagagttccttgatcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaagatta 7933943  T
Q  198 ttcgtgtccaaa 209  Q
    ||||||||||||    
T  7933942 ttcgtgtccaaa 7933931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 159; Significance: 3e-84; HSPs: 20)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4311700 - 4311486
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4311700 acaccaaatatcattctaagttaaatgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaaaacttgtta 4311601  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  4311600 ggattagagttccttgatcaatcgtcgcacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactatt 4311501  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  4311500 cgtgtccaaacaata 4311486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10941518 - 10941304
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10941518 acacctaatataattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaattgagattaataaggcgtgaaacttgtta 10941419  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10941418 ggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatatatggattctaacttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 10941319  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  10941318 cgtgtccaaacaata 10941304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 6036274 - 6036488
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6036274 acaccaaatataattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgaaaatgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtta 6036373  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  6036374 ggattagagttccttgatcaagcgtcactcgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactatt 6036473  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  6036474 cgtgtccaaacaata 6036488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 32746378 - 32746592
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32746378 acaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgtta 32746477  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  32746478 ggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactatt 32746577  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  32746578 cgtgtccaaacaata 32746592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 24179081 - 24179296
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24179081 acaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtt 24179180  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24179181 aggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactat 24179280  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  24179281 tcgtgtccaaacaata 24179296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9570764 - 9570548
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgca-atgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgt 97  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9570764 acaccaattatcattctaagtttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactaaattgcagatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgt 9570665  T
Q  98 tagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacacca 197  Q
    ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9570664 taggattagaattccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaatacca 9570565  T
Q  198 ttcgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||||    
T  9570564 ttcgtgtccaaacaata 9570548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27502182 - 27501967
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  27502182 acaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtt 27502083  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27502082 aggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactat 27501983  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  27501982 tcgtgtccaaacaata 27501967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 13014994 - 13015208
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  13014994 acaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgtaaaacttgtta 13015093  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  13015094 ggattagagtttcttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactatt 13015193  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  13015194 cgtgtccaaacaata 13015208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9577266 - 9577050
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgca-atgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgt 97  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9577266 acaccaattattattctaagtttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactaaattgcagatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgt 9577167  T
Q  98 tagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacacca 197  Q
    ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9577166 taggattagaattccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaatacca 9577067  T
Q  198 ttcgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||||    
T  9577066 ttcgtgtccaaacaata 9577050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 43995081 - 43995300
Alignment:
Q  5 caaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc---------aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 95  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43995081 caaatatcattctaagttaaaagatagtttgttgtttgttttagaaactaagttgactatgttgaaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 43995180  T
Q  96 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttc-tttgatattatcacgtatccctcaacaaca 194  Q
    || || ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  43995181 gtcaggattagagttccttaaccaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttcttttgatattattacgtatccctcgacaaca 43995280  T
Q  195 ccattcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  43995281 ccattcgtgtccaaacaata 43995300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 25893238 - 25893458
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  25893238 acaccaaataccattctaagttaaaaagttaattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtt 25893337  T
Q  99 agtattagagtt-----ccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaac 193  Q
    || |||||||||     |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25893338 aggattagagttaaattccttgatcaagcgtcacacgtaacttaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaat 25893437  T
Q  194 accattcgtgtccaaacaata 214  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  25893438 actattcgtgtccaaacaata 25893458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 43931590 - 43931799
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgca-atgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43931590 acaccaaataccattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcggataataaaattgagattaataaggcgtgaaacttgtta 43931689  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcac--acgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacacca 197  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||| |||||||||    
T  43931690 ggattagagttccttaatcaagcgtcacatacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttc-------ttatcacgtatccctcgacaacacca 43931782  T
Q  198 ttcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||| |||||||||    
T  43931783 ttcgtgttcaaacaata 43931799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 23068473 - 23068686
Alignment:
Q  2 caccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  23068473 caccaaatatcattctaagttaaaaagataatctgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgaaattaatagggcg-gaaacttgtt 23068571  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || |||||||||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23068572 aggattagagttctttgatcgagcatcgcacgtaacctaatgatcatacatggattcta-cttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccat 23068670  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  23068671 tcgtgtccaaacaata 23068686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 67 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20651272 - 20651135
Alignment:
Q  67 aaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctt 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  20651272 aaagttgagattaataaggcgtgaaactcgttaggattagagttccttgatcaagcatcacacgtaatttaatgatcatatacggattctaccttttctt 20651173  T
Q  167 tgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgt 204  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||    
T  20651172 tgatattatcacgtatcccttgacaatatcattcgtgt 20651135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 41353869 - 41353987
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  41353869 acaccaaatatcattttaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataggacgtaaaacttgtta 41353968  T
Q  100 gtattagagttccttgatc 118  Q
    | |||||||||||||||||    
T  41353969 ggattagagttccttgatc 41353987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 41354284 - 41354142
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  41354284 acaccaaatatcattctaagttgaaa-ataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtgaaacttgtt 41354186  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat 142  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  41354185 aggattagagttccttgagcaagcgtcacacgtaacctaatgat 41354142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 4590802 - 4591012
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| || |   || | ||||||||||| ||||| ||||| |||   |||     
T  4590802 acaccaattatcattccaagttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaaccaaatataaaagttaaagttgagagtaatagggcgtaaaaac-gttg 4590900  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacacca 197  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||||  || |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||| |  |    
T  4590901 gaattagagttccttgatcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaagatta 4591000  T
Q  198 ttcgtgtccaaa 209  Q
    ||||||||||||    
T  4591001 ttcgtgtccaaa 4591012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 3577152 - 3577095
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagtt 58  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3577152 acaccaaatattattctaagttaaatgataatttgttgtttgtttgaataactaagtt 3577095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4644463 - 4644354
Alignment:
Q  102 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    |||||||||||||| | |||||||| || |||  |||| ||||  || |||||||||||| |||    ||||||||||||||||  ||||||| || |||    
T  4644463 attagagttccttggttaagcgtcaaacataacataataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgttcaacaagactatt 4644364  T
Q  200 cgtgtccaaa 209  Q
    ||||||||||    
T  4644363 cgtgtccaaa 4644354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 209
Target Start/End: Original strand, 2785865 - 2785922
Alignment:
Q  152 attctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 209  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||    
T  2785865 attctagcttttaatcgatattatcacgtatccctcgacaaaatcatttgtgtccaaa 2785922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 151; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 49699 - 49912
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  49699 acaccaaatatcattctaagttaaa-gataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaaaacttgtta 49797  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  49798 ggattagagttccttcatcaagcgtcgcacataacctaatgaccatacacggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactatt 49897  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  49898 cgtgtccaaacaata 49912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 147; Significance: 4e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 15179 - 15393
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15179 acacaaaatatcattctaacttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaatagtaaaattgagattaataaggcgtgaaacttgtta 15278  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | |||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  15279 ggattagagttccttattccagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacaccgtt 15378  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  15379 cgtgtccaaacaata 15393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0936 (Bit Score: 143; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0936
Description:

Target: scaffold0936; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3477 - 3264
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3477 acactaaatatcattctaagttaaa-gatgatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 3379  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  3378 ggattagagttccttgatcaagcttcacacttaacctaattaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacatcatt 3279  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  3278 cgtgtccaaacaata 3264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 143; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5219 - 5005
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5219 acaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgtta 5120  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 199  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5119 ggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatt 5020  T
Q  200 cgtgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||||    
T  5019 cgtgtccaaacaata 5005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510 (Bit Score: 125; Significance: 6e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0510
Description:

Target: scaffold0510; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9093 - 8881
Alignment:
Q  4 ccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagt 101  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||     
T  9093 ccaaatatcattctaagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaacttgttagg 8994  T
Q  102 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcg 201  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8993 attagagttccttgatcgatcctcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgacaacaccattcg 8894  T
Q  202 tgtccaaacaata 214  Q
    |||||||||||||    
T  8893 tgtccaaacaata 8881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2775 - 2560
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  2775 acaccaaatatcattctaagttaaaagataatttatttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaacttgtt 2676  T
Q  99 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 198  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2675 aggattagagttccttgattaagcgtcacatataacctaatgaccattcatggattcaagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacaccat 2576  T
Q  199 tcgtgtccaaacaata 214  Q
    || |||||||||||||    
T  2575 tcatgtccaaacaata 2560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 110; Significance: 5e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 214
Target Start/End: Original strand, 12014 - 12155
Alignment:
Q  73 gagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatat 172  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12014 gagagtaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcataaatggattctagcttttctttgatat 12113  T
Q  173 tatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12114 tatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 12155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 83; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 99922 - 100020
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  99922 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtgaaacttgtt 100020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24460 - 24268
Alignment:
Q  1 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |  |||||||||| ||||||||||| |||   |||     
T  24460 acaccaaatatcattataagttaaaagacaatttgttgtttgttttagtaacaaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggcgt-aaaaacgttg 24362  T
Q  100 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 191  Q
    | |||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||    
T  24361 gaattagagttctttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcactcaaca 24268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University