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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21215_high_13 (Length: 389)

Name: NF21215_high_13
Description: NF21215
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21215_high_13
NF21215_high_13
[»] chr7 (2 HSPs)
chr7 (66-380)||(6199384-6199698)
chr7 (181-380)||(9067096-9067297)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (16-377)||(17535503-17535876)
chr8 (16-380)||(26907479-26907841)
[»] scaffold0208 (1 HSPs)
scaffold0208 (16-380)||(539-906)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 66 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 6199698 - 6199384
Alignment:
Q  66 caacatatattactagttaaattgaaaagctgtaaagctaaatccatgatcgattgaccata--ggatgcaacattcgtatttataagattgaaacacat 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6199698 caacatatattactagttaaattgaaaagttgtaaagctaaatccatgatcgattgaccatataggatgcaacattcatatttataagattgaaacacat 6199599  T
Q  164 tattcttaaagtaattagttatgatcagccatctacataaagcatatatttatatactataataggacttcatgtaatgcatattatctacaatataatc 263  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6199598 tattctcaaagtagttagttatgatcagccatctacataaagcatatatttata--ctataataggaattcatgtaaggcatattatctacaatataatc 6199501  T
Q  264 aagttcaaacaataacacactttatattatttatcgattatgatcataacatgaatatacagtatatgtatccattagctaatcactttaataacataaa 363  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6199500 aagttcaaacaataacacactctatattatttatcgattatgatcataacatgaatatacagtatatgtatccattagctaaacactttaataacataaa 6199401  T
Q  364 atagccaatgatgatgt 380  Q
    |||||||||||||||||    
T  6199400 atagccaatgatgatgt 6199384  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 181 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 9067297 - 9067096
Alignment:
Q  181 gttatgatcagccatctacataaagcatatatttatatactataataggacttcatgtaatgcatattatctacaatataatcaagttcaaacaataaca 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9067297 gttatgatcagccatctacataaagcatatatttata--ctataataggaattcatgtaaggcatattatgtacaatataatcaagttcaaacaataaca 9067200  T
Q  281 cactttatattatttatcgattatgatcataacatgaatatacagtat----atgtatccattagctaatcactttaataacataaaatagccaatgatg 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9067199 cactttatattatttatcgattatgatcataacatgaatatacagtatatgcatgtatccattagctaatcactttaataacataaaatagccaatgatg 9067100  T
Q  377 atgt 380  Q
    ||||    
T  9067099 atgt 9067096  T

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Target: chr8 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 377
Target Start/End: Original strand, 17535503 - 17535876
Alignment:
Q  16 cacaaaaacacctctccaattgacaaactcaactaggttcacgaagcatg----------caacatatattactagttaaattgaaaagctgtaaagcta 105  Q
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T  17535503 cacacaaacacctctccaactaacaaactcaattaggttcatgaagcatgagccaaaccacaacatatattactagttaaattgaaaagttgtaaagcta 17535602  T
Q  106 aatccatgatcgattgaccataggatgcaacattcgtatttataagattgaaacacattattcttaaagtaattagttatgatcagccatctacataaag 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| || | || |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17535603 aatccataatcgattgaccataggattcaatatacataattataagaatgaaacacattattatcaaagtaattagttatgaccagccatctacataaag 17535702  T
Q  206 catatatttatatactataataggacttcatgtaatgcatattatctacaatataatcaagttcaaacaataacacactttatattatttatcgattatg 305  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17535703 catatatt--tatactataataggaattcatgtaaggcatattatctacattgtaatcaagttcaaacaataaaacactttatattatttatcgattatg 17535800  T
Q  306 atcataacatgaa-------tatacagtatatgtatccattagctaatcactttaataacataaaatagccaatgatga 377  Q
    |||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  17535801 atcataacatgaatattgagtatacagtatatgtatccattagctaatcactttaat---ataaaatagccaatgatga 17535876  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 380
Target Start/End: Original strand, 26907479 - 26907841
Alignment:
Q  16 cacaaaaacacctctccaattgacaaactcaactaggttcacgaagcatg-----------caacatatattactagttaaattgaaaagctgtaaagct 104  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26907479 cacaaaaacacctctccaactaacaaactcaattaggttcacgaagcatgaggccaaaccacaacatatattactagttaaattgaaaagctgtaaagct 26907578  T
Q  105 aaatccatgatcgattgaccataggatgcaacattcgtatttataagattgaaacacattattcttaaagtaattagttatgatcagccatctacataaa 204  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || | || ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  26907579 aaatccataatcgattgaccataggatgcaatatacataattacaagattgaaacacattattatcaaagtaattagttatgatcaaccacctagataaa 26907678  T
Q  205 gcatatatttatatactataataggacttcatgtaatgcatattatctacaatataatcaagttcaaacaataacacactttatattatttatcgattat 304  Q
    ||||  |||  ||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||| || | ||||||| |||||        |||||||||||||||||||||||||    
T  26907679 gcatccatt--tatacaataataggaattcatgttaggcatattatcttcattgtaatcaaattcaa--------acactttatattatttatcgattat 26907768  T
Q  305 gatcataacatgaatatacagtatatgtatccattagctaatcactttaataacataaaatagccaatgatgatgt 380  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  26907769 gatcataacatgaatatacaatatacgtatccattagctaatcactttaataa---aaaatagccaatgatgatgt 26907841  T

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Target: scaffold0208 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 380
Target Start/End: Original strand, 539 - 906
Alignment:
Q  16 cacaaaaacacctctccaattgacaaactcaactaggttcacgaagcatg-----------caacatatattactagttaaattgaaaagctgtaaagct 104  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  539 cacagaaacacctctccaactaacaaactcaattaggttcacgaaacatgaggccaaaccacaacatatattactagttaaattgaaaagctgtaaagct 638  T
Q  105 aaatccatgatcgattgaccataggatgcaacattcgtatttataagattgaaacacattattcttaaagtaattagttatgatcagccatctacataaa 204  Q
    |||||  |  ||||||||||| ||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  639 aaatctgtactcgattgaccacaggatgcaatatacataattataagattgaaacacattattatcaaagtaattagttatgatcagccatctacataaa 738  T
Q  205 gcatatatttatatactataataggacttcatgtaatgcatattatctacaatataatcaagttcaaacaataacacactttatattatttatcgattat 304  Q
    ||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  739 gcatacatt--tatacaataataggaattcatgtaaggcatattat-tacactgtaatcaagttcaaacaataaaacac--tatattatttatcgattat 833  T
Q  305 gatcataacatgaatatacagtatatgtatccattagctaatcactttaataacataaaatagccaatgatgatgt 380  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  834 gatcataacatgaatatacaatatatgtatccattagctaatcactttaataa---aaaatagccaatgatgatgt 906  T

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