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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21233_low_3 (Length: 828)

Name: NF21233_low_3
Description: NF21233
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21233_low_3
NF21233_low_3
[»] chr3 (4 HSPs)
chr3 (17-818)||(40146337-40147137)
chr3 (21-637)||(8103025-8103643)
chr3 (33-320)||(40409346-40409631)
chr3 (673-814)||(8102812-8102953)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (41-640)||(7637613-7638214)
chr4 (51-640)||(7629167-7629758)
chr4 (41-640)||(7615778-7616379)
chr4 (51-645)||(7606777-7607373)
chr4 (405-672)||(7655475-7655742)
chr4 (21-300)||(7655092-7655371)
chr4 (703-741)||(39082796-39082834)
[»] chr7 (3 HSPs)
chr7 (41-672)||(8935073-8935706)
chr7 (116-565)||(8934207-8934655)
chr7 (359-496)||(8929994-8930131)
[»] chr6 (3 HSPs)
chr6 (63-639)||(6501058-6501632)
chr6 (384-544)||(11969553-11969713)
chr6 (669-727)||(11969370-11969428)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 770; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 770; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 818
Target Start/End: Original strand, 40146337 - 40147137
Alignment:
Q  17 aaatacatggctgcattccaagtcctctctacccatacaatcaagtcaccaaattcaagtgatcaaaaaattgatttaactccatgggatctccggtacc 116  Q
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T  40146337 aaatacatggctgcattccaagtcctctctacccatacaatcaagtcaccaaattcaagtgatcaaaaaattgatttaactccatgggatctccggtacc 40146436  T
Q  117 tactaattgcacccaccaaaaagggtcttctttatcaccatcctctagtgccaaaccaaattcaacatctgaaacactctctatcttctacccttgcctt 216  Q
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T  40146437 tactaattgcacccaccaaaaagggtcttctttatcaccatcctctagtgccaaaccaaattcaacatctgaaacactctctatcttctacccttgcctt 40146536  T
Q  217 tttcccaccacttgcaggccgtctagaaataacagatcacaaggacaacaccgtttcatgttccgtcacatgcaacaatgcaggcgcgctctttgtccat 316  Q
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T  40146537 tttcccaccacttgcaggccgtctagaaataacagatcacaaggacaacaccgtttcatgttccgtcacatgcaacaatgcaggcgcgctctttgtccat 40146636  T
Q  317 gccgcggcagagaaacacttgtgtaggtgacatacttggatgcacctacgttcctcccatcgtcgattcattttttccattaaccagagttaaaaattac 416  Q
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T  40146637 gctgcggcagagaa-cacttgtgtaggtgacatacttggatgcacctacgttcctcccatcgtcgattcattttttccattaaccagagttaaaaattac 40146735  T
Q  417 gaaggcacatcacaaccattgttagttgtgcaagtgacagagttagttgacggcttcttcattggttttacatttaaccatgcggttgttgacggagagt 516  Q
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T  40146736 gaaggcacatcacaaccattgttagctgtgcaagtgacagagttagttgacggcttcttcattggttttacatttaaccatgcggttgttgacggagagt 40146835  T
Q  517 ccacatggcttttcattaactcatgggcgaaaatctcgcgtggttgttgcaatcaagtatccaaactcataacgctagaacgttggtttccaagtggtat 616  Q
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T  40146836 ccacatggcttttcattaattcatgggcgaaaatctcgcgtggttgttgcaatcaagtatccaaactcataacgctagaacgttggtttccaagtggtat 40146935  T
Q  617 tcaacatcccatacgatttccttttactatagagtcacaaaagaatgactctgatgataacgaaaaattcaattcatcagagaggttattccatttcaca 716  Q
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T  40146936 tcaacatcccatacgatttccttttactatagagccacaaaagaatgactctgatgataacgaaaagttcaatccatcagagaggttattccatttcaca 40147035  T
Q  717 aaggagaaaatcgctcaactgaaattgaaagccaacatggagattggtaccaacaaaatatcatccctccaatcactttttacacatctttggcgctctg 816  Q
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T  40147036 aaggagaaaatcgctcaactgaaattgaaagccaacatggagattggtaccaacaaaatatcatccctccaatcactttttacacatctttggcgctctg 40147135  T
Q  817 tg 818  Q
    ||    
T  40147136 tg 40147137  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 21 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 8103643 - 8103025
Alignment:
Q  21 acatggctgcattccaagtcctctctacccatacaatcaagtcaccaaattcaagtgatcaaaaaattgatttaactccatgggatctccggtacctact 120  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||  |   |||||    
T  8103643 acatggctgccatccgagtcctctctacagatacaataaaggcaccaaattcaactgatgaaaaaattgatcttactccatgggatctcaaggttctact 8103544  T
Q  121 aattgcacccaccaaaaagggtcttctttatcaccatcctctagtgccaaaccaaattcaacatctgaaacactctctatcttctacccttgcctttttc 220  Q
      ||| ||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  8103543 tgttgaacccacccataagggtctcctttaccaccatcctctagagtcaaaccaaattccacagctaaaacaatctctatcatctactcttgcttttttc 8103444  T
Q  221 ccaccacttgcaggccgtctagaaataacagatcacaaggacaacaccgtttcatgttccgtcacatgcaacaatgcaggcgcgctctttgtccatgccg 320  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||||||      
T  8103443 ccactacttgcaggccgtctagaaataacagaccatgaagacaacaccatgtcgtgttcggtcacgtgcaacaatgccggtgtactctttgtccatgcta 8103344  T
Q  321 cggcagagaaacacttgtgtaggtgacatacttggatgcacctacgttcctcccatcgtcgattcattttttccattaaccagagttaaaaattacgaag 420  Q
    |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  || ||||||||| |||| | | | || | ||||| |||||||    
T  8103343 caactgag-aacacttgtgtaggtgacatacttggatgcacctatattcctcccattctcaattcattttatccactgaacggaatcaaaaactacgaag 8103245  T
Q  421 gcacatcacaaccattgttagttgtgcaagtgacagagttagttgacggcttcttcattggttttacatttaaccatgcggttgttgacggagagtccac 520  Q
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T  8103244 gcacatcacaaccattgtttgccgtgcaagtgacagagttagttgacggcatctttattggttttacttttaaccatgtggttgttgatggaacttcggc 8103145  T
Q  521 atggcttttcattaactcatgggcgaaaatctcgc---gtggttgttgcaatcaagtatccaaactcataacgctagaacgttggtttccaagtggtatt 617  Q
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T  8103144 atggtatttcattaattcgtgggctgaaatctcacgtggtggttgttgcaatcaaacatccaaactctcaacacttgaacgttggtttccagatggtatt 8103045  T
Q  618 caacatcccatacgatttcc 637  Q
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T  8103044 caatgtcccatacgatttcc 8103025  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 33 - 320
Target Start/End: Original strand, 40409346 - 40409631
Alignment:
Q  33 tccaagtcctctctacccatacaatcaagtcaccaaattcaagtgatcaaaaaattgatttaactccatgggatctccggtacctactaattgcacccac 132  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||   ||||||| | | |||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||    
T  40409346 tccaagttctctctaccgatacaataaaggcaccaaattcaacaaatcaaaataatcatttgactccatgggatctccagttcctactagttgcacgcac 40409445  T
Q  133 caaaaagggtcttctttatcaccatcctctagtgccaaaccaaattcaacatctgaaacactctctatcttctacccttgcctttttcccaccacttgca 232  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40409446 caaaaag--tcttcttcatcaccatcctctagtgccaaaccaaattcaacatctgaaacactctctatcctctgcccttgcctttttcccaccacttgca 40409543  T
Q  233 ggccgtctagaaataacagatcacaaggacaacaccgtttcatgttccgtcacatgcaacaatgcaggcgcgctctttgtccatgccg 320  Q
    ||||||||||| | |||||| || || ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  40409544 ggccgtctagagagaacagaccataaagacaacaccatttcgtgttgtgtcacatgcaacaatgcaggtgcgctctttgtgcatgccg 40409631  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 673 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 8102953 - 8102812
Alignment:
Q  673 ataacgaaaaattcaattcatcagagaggttattccatttcacaaaggagaaaatcgctcaactgaaattgaaagccaacatggagattggtaccaacaa 772  Q
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T  8102953 ataacgaaaaactcaacccatcagttaggttatttcatttcacaaaggagaaaatctctcaattgaaattgaaagccaacttagaaacgggtacgaacaa 8102854  T
Q  773 aatatcatccctccaatcactttttacacatctttggcgctc 814  Q
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T  8102853 aatatcttcccttcaagcactttttgcacacctttggtgctc 8102812  T

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Target: chr4 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 41 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 7638214 - 7637613
Alignment:
Q  41 ctctctacccatacaatcaagtcaccaaattcaagtgatcaaaaaattgatttaactccatgggatctccggtacctactaattgcacccaccaaaaagg 140  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||  |||| |||||||||||||||||||| |||||  ||  | ||| ||||||||    
T  7638214 ctctccaccgatacaatcaaggcaccaaaatcaagtgagcaaacaatccatttgactccatgggatctccggtatctacttgttttaaccaacaaaaagg 7638115  T
Q  141 gtcttctttatcaccatcctctagtgccaaaccaaattcaacatctgaaacactctctatcttctacccttgcctttttcccaccacttgcaggccgtct 240  Q
    | |||||||||| ||||||  | ||  | |||||||| ||||  |||| ||||||||| || ||  ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  7638114 gccttctttatcgccatccggttgtagctaaccaaatccaacggctgagacactctctgtcctcagcccttgcctttttccaacctcttgccggccgtct 7638015  T
Q  241 agaaataacagatcacaaggacaacaccgtttcatgttccgtcacatgcaacaatgcaggcgcgctctttgtccatgccgcggcagagaaacacttgtgt 340  Q
      ||||||| || ||||  |||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  7638014 caaaataacggaacacagagacaacactgtttcgtgttccgttatatgcaacaatgcaggtgtactctttgtccatgccgcagcagag-aatacttgtgt 7637916  T
Q  341 aggtgacatacttggatgcacctacgttcctcccatcgtcgattcattttttccattaaccagagttaaaaattacgaaggcacatcacaaccattgtta 440  Q
     |  ||||| || | |  ||||||||| ||||| || || |||| ||| ||| | ||| ||  ||| | ||  || |||||||||||| ||||||||||     
T  7637915 tgcagacatcctagaacccacctacgtacctccaattgttgatttattatttgctttatccgaagtaagaagctatgaaggcacatcaaaaccattgttg 7637816  T
Q  441 gttgtgcaagtgacagagttagttgacggcttcttcattggttttacatttaaccatgcggttgttgacggagagtccacatggcttttcattaactcat 540  Q
    |  || ||||| || ||| ||||||||||  | ||||||||||   ||||||||||||  || ||||||||| |||||   |||| |||||| || || |    
T  7637815 gcagttcaagtaacggagctagttgacggtattttcattggttgctcatttaaccatgttgtcgttgacggaaagtccgtgtggcatttcatcaattcct 7637716  T
Q  541 gggcgaaaatctcgcgtggttgttg-ca--atcaagtatccaaactcataacgctagaacgttggtttccaagtggtattcaacatcccatacgatttcc 637  Q
    ||||  ||||||| ||| ||||||| ||  ||||| |||| |||| |  ||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||  || |||||||||||    
T  7637715 gggctgaaatctcacgtagttgttgtcatcatcaaatatctaaacccccaacactagagcgttggtttccaaatggtgttcaacggcctatacgatttcc 7637616  T
Q  638 ttt 640  Q
    |||    
T  7637615 ttt 7637613  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 51 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 7629758 - 7629167
Alignment:
Q  51 atacaatcaagtcaccaaattcaagtgatcaaaaaattgatttaactccatgggatctccggtacctactaattgcacccaccaaaaagggtcttcttta 150  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||| |  |||||  || || ||| ||||||||| ||||||||    
T  7629758 atacaatcaaggcaccaaaatcaagtgaccaaacaatccatttgactccatgggatctccgctttctacttgtttcaaccaacaaaaagggccttcttta 7629659  T
Q  151 tcaccatcctctagtgccaaaccaaattcaacatctgaaacactctctatcttctacccttgcctttttcccaccacttgcaggccgtctagaaataaca 250  Q
    || ||||||  | ||  ||| |||||| ||||  |||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||     
T  7629658 tcgccatccggttgtagcaacccaaatccaacggctgagacactctctatcctctgccctttccttttttcaacctcttgctggccgtcttgaaataacg 7629559  T
Q  251 gatcacaaggacaacaccgtttcatgttccgtcacatgcaacaatgcaggcgcgctctttgtccatgccgcggcagagaaacacttgtgtaggtgacata 350  Q
    || ||||||||||| || || || ||||| || | ||||||||||||||| |  |||||| |||| || || || ||| || |||||||| | ||||||     
T  7629558 gaacacaaggacaatactgtctcgtgttctgttatatgcaacaatgcaggtgtactctttatccacgctgcagccgag-aatacttgtgttgctgacatc 7629460  T
Q  351 cttggatgcacctacgttcctcccatcgtcgattcattttttccattaaccagagttaaaaattacgaaggcacatcacaaccattgttagttgtgcaag 450  Q
    || | |     |||||| ||||  || ||||||||| | ||| | || |   ||| |||||  ||||||||||| ||| |||||||||| | ||| ||||    
T  7629459 ctagaaccggtctacgtacctcaaattgtcgattcactatttgcctttataggagataaaagctacgaaggcacgtcaaaaccattgttggctgttcaag 7629360  T
Q  451 tgacagagttagttgacggcttcttcattggttttacatttaaccatgcggttgttgacggagagtccacatggcttttcattaactcatgggcgaaaat 550  Q
    | || ||| ||||||||||  |||| |||||||  ||||| |||||||  |||||||||||| |||||   |||| |||||| || ||||||||  ||||    
T  7629359 taacggagctagttgacggtgtctttattggttgcacattcaaccatgttgttgttgacggaaagtccgtgtggcatttcatcaattcatgggctgaaat 7629260  T
Q  551 ctcgcgtggttgttg-ca--atcaagtatccaaactcataacgctagaacgttggtttccaagtggtattcaacatcccatacgatttccttt 640  Q
    ||| ||| ||||||| ||  ||||| |||| ||||    |||    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7629259 ctcacgtagttgttgtcatcatcaaatatctaaacctccaacatctgaacgttggtttccaaatggtattcaacttcccatacgatttccttt 7629167  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 41 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 7616379 - 7615778
Alignment:
Q  41 ctctctacccatacaatcaagtcaccaaattcaagtgatcaaaaaattgatttaactccatgggatctccggtacctactaattgcacccaccaaaaagg 140  Q
    ||||||||  ||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||  |||||   | || ||| |  |||||    
T  7616379 ctctctactgatacaattaaggcaccaaaatcaagtaatcaaactattgatttgactccatgggatctccggtttctacttggtacaaccaacccaaagg 7616280  T
Q  141 gtcttctttatcaccatcctctagtgccaaaccaaattcaacatctgaaacactctctatcttctacccttgcctttttcccaccacttgcaggccgtct 240  Q
    |||||||||||||||||||  | |   | |||||||| ||||  |||| ||||||| | || ||| ||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||    
T  7616279 gtcttctttatcaccatccagttgaagctaaccaaatccaacggctgagacactctttgtcctctgcccttgcctttttccaacctctttccggccgtct 7616180  T
Q  241 agaaataacagatcacaaggacaacaccgtttcatgttccgtcacatgcaacaatgcaggcgcgctctttgtccatgccgcggcagagaaacacttgtgt 340  Q
      ||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||| |  |||||| ||||||| || || ||| || ||||||||    
T  7616179 caaaataacggagcacaatgacaacaccgtctcgtgttctgttatatgcaacaatgcaggtgtactctttatccatgctgcagctgag-aatacttgtgt 7616081  T
Q  341 aggtgacatacttggatgcacctacgttcctcccatcgtcgattcattttttccattaaccagagttaaaaattacgaaggcacatcacaaccattgtta 440  Q
     | |||||| || | |   ||||| || ||||| || || |||||||||||  | |||||| | ||| |||  ||||||||||| ||| |||| |||||     
T  7616080 tgctgacatcctagaacctacctatgtacctccaattgttgattcatttttcgctttaaccggggttgaaagctacgaaggcacctcaaaaccgttgttg 7615981  T
Q  441 gttgtgcaagtgacagagttagttgacggcttcttcattggttttacatttaaccatgcggttgttgacggagagtccacatggcttttcattaactcat 540  Q
    |  || ||||| || ||| ||||||||||  | || |||||||   | || |||||||  || ||||||||||||||    |||| |||||| || ||||    
T  7615980 gcagttcaagtaacggagctagttgacggtatttttattggttgctcgttcaaccatgttgtcgttgacggagagtctgtgtggcatttcatcaattcat 7615881  T
Q  541 gggcgaaaatctcgcgtggttgttg-ca--atcaagtatccaaactcataacgctagaacgttggtttccaagtggtattcaacatcccatacgatttcc 637  Q
    ||||  |||| || ||| ||||||| ||  ||||| |||| |||| |  ||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  7615880 gggctgaaatatcacgtagttgttgtcatcatcaaatatctaaacccccaacactagagcgttggtttccaaatggtgttcaacagcccatacgatttcc 7615781  T
Q  638 ttt 640  Q
    |||    
T  7615780 ttt 7615778  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 51 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 7607373 - 7606777
Alignment:
Q  51 atacaatcaagtcaccaaattcaagtgatcaaaaaattgatttaactccatgggatctccggtacctactaattgcacccaccaaaaagggtcttcttta 150  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| |  |||||  || || ||| ||||||||| ||||||||    
T  7607373 atacaatcaaggcaccaaaatcaagtgatcaaacaatccatttgactccatgggatctccgttttctacttgtttcaaccaacaaaaagggccttcttta 7607274  T
Q  151 tcaccatcctctagtgccaaaccaaattcaacatctgaaacactctctatcttctacccttgcctttttcccaccacttgcaggccgtctagaaataaca 250  Q
    ||| |||||  | ||  ||| |||||| ||||   ||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  7607273 tcatcatccggtggttgcaacccaaatccaacggttgagacactctctatcctctgccctttcctttttccaacctcttgccggccgccttgaaataacg 7607174  T
Q  251 gatcacaaggacaacaccgtttcatgttccgtcacatgcaacaatgcaggcgcgctctttgtccatgccgcggcagagaaacacttgtgtaggtgacata 350  Q
    || || |  |||||||  || ||||||||||| | |||||| |||||||| |  |||||| |||| || |  |||||| || | | |||| | ||||||     
T  7607173 gaacatagagacaacattgtctcatgttccgttatatgcaataatgcaggtgtactctttatccacgctgtagcagag-aatattcgtgttgctgacatc 7607075  T
Q  351 cttggatgcacctacgttcctcccatcgtcgattcattttttccattaaccagagttaaaaattacgaaggcacatcacaaccattgttagttgtgcaag 450  Q
    || | |     |||||| ||||  || ||||||||||||||| | || | | ||| |||||| || |||||||| ||| |||||||||| | ||| |||     
T  7607074 ctggaaccggtctacgtacctctaattgtcgattcattttttgccttcatcggagataaaaactatgaaggcacgtcaaaaccattgttggctgttcaaa 7606975  T
Q  451 tgacagagttagttgacggcttcttcattggttttacatttaaccatgcggttgttgacggagagtccacatggcttttcattaactcatgggcgaaaat 550  Q
    | || ||| ||||||||||  | ||||||||||   | || |||||||  || ||||||||| |||||   |||| |||||| || ||||||||  ||||    
T  7606974 taacggagctagttgacggtattttcattggttgctccttcaaccatgttgtcgttgacggaaagtccgtgtggcatttcatcaattcatgggctgaaat 7606875  T
Q  551 ctcgcgtggttgtt---gcaatcaagtatccaaactcataacgctagaacgttggtttccaagtggtattcaacatcccatacgatttccttttacta 645  Q
     || || |||||||   |  ||||| ||||||||| |  ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  7606874 atcacgcggttgttgtggtgatcaaatatccaaacccccaacactagagcgttggtttccaaatggtattcaacttcccatacgatttcctttcacta 7606777  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 405 - 672
Target Start/End: Original strand, 7655475 - 7655742
Alignment:
Q  405 gttaaaaattacgaaggcacatcacaaccattgttagttgtgcaagtgacagagttagttgacggcttcttcattggttttacatttaaccatgcggttg 504  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||| || ||| ||||||||||| |||||||||| ||||  || |||||||  || |    
T  7655475 gttagaaactacgaaggcacatcaaaaccattgttggctgttcaagtcacggagctagttgacggcatcttcattggctttaatttcaaccatgtcgtag 7655574  T
Q  505 ttgacggagagtccacatggcttttcattaactcatgggcgaaaatctcgcgtggttgttgcaatcaagtatccaaactcataacgctagaacgttggtt 604  Q
     ||||||| ||||||| |||| |||||| || || |||||  |||| || |||||||||    ||||| |||| ||   |  |||||| || ||||||||    
T  7655575 ctgacggacagtccacgtggcatttcatcaattcgtgggctgaaatgtcacgtggttgtcatcatcaaatatctaactccccaacgctggagcgttggtt 7655674  T
Q  605 tccaagtggtattcaacatcccatacgatttccttttactatagagtcacaaaagaatgactctgatg 672  Q
    ||||| ||| |||||||  || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7655675 tccaaatggaattcaacgacctatacgatttcctttaactatagagccacaaaagaatcactctgatg 7655742  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Original strand, 7655092 - 7655371
Alignment:
Q  21 acatggctgcattccaagtcctctctacccatacaatcaagtcaccaaattcaagtgatcaaaaaattgatttaactccatgggatctccggtacctact 120  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||   || |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||||    
T  7655092 acatgggtgcattccaagtactctccaccaatacaatcaaggcattgaaatcaagtaatcataaaatcgatttaactccatgggatctccaatttctact 7655191  T
Q  121 aattgcacccaccaaaaagggtcttctttatcaccatcctctagtgccaaaccaaattcaacatctgaaacactctctatcttctacccttgcctttttc 220  Q
       | || |||  ||||| || |||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||  |||| ||||||| |||| ||  ||||| ||||||||    
T  7655192 ttatccaaccaataaaaaaggccttctttatcaccatcctttagcatcagaccaaattcaacggctgacacactctttatcctcagccctttcctttttc 7655291  T
Q  221 ccaccacttgcaggccgtctagaaataacagatcacaaggacaacaccgtttcatgttccgtcacatgcaacaatgcagg 300  Q
    | ||| ||||| || |||||  |||| ||||| ||| | |||| ||  || || ||||| || |||||||| ||||||||    
T  7655292 caacctcttgccggtcgtctcaaaattacagaacacgaagacagcattgtctcgtgttctgtaacatgcaataatgcagg 7655371  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 703 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 39082834 - 39082796
Alignment:
Q  703 tattccatttcacaaaggagaaaatcgctcaactgaaat 741  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  39082834 tattccatttcacaaaggagaaaatcgcggaactgaaat 39082796  T

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Target: chr7 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 3)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 672
Target Start/End: Original strand, 8935073 - 8935706
Alignment:
Q  41 ctctctacccatacaatcaagtcaccaaattcaagtgatcaaaaaattgatttaactccatgggatctccggtacctactaattgcacccaccaaaaagg 140  Q
    ||||||||  ||||||| ||| || |||| |||||||||||||  ||  |||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||| ||||||||    
T  8935073 ctctctactgatacaattaaggcaacaaaatcaagtgatcaaacgatccatttgactccatgggatctccggtcactacttattccaaccaacaaaaagg 8935172  T
Q  141 gtcttctttatcaccatcctctagtgccaaaccaaattcaacatctgaaacactctctatcttctacccttgcctttttcccaccacttgcaggccgtct 240  Q
    | ||| |||||||||||||  | ||  | |||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  8935173 gccttttttatcaccatccggttgtatctaaccaaatccaacggctgagacactctctatcttcaacccttgcctttttccaacctcttgccggccgtct 8935272  T
Q  241 agaaataacagatcacaaggacaacaccgtttcatgttccgtcacatgcaacaatgcaggcgcgctctttgtccatgccgcggcagagaaacacttgtgt 340  Q
      ||||||| ||  || | ||||| || || || || ||||| | ||||||||||||||| |  |||||||||||||||    ||||| || ||||||||    
T  8935273 caaaataacggaataccaagacaaaactgtctcgtgctccgttatatgcaacaatgcaggtgtactctttgtccatgccagatcagag-aatacttgtgt 8935371  T
Q  341 aggtgacatacttggatgcacctacgttcctcccatcgtcgattcattttttccattaaccagagttaaaaattacgaaggcacatcacaaccattgtta 440  Q
     | |||||| || | |  ||||||||| || || || || |||||||||||| | ||||||   |||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||     
T  8935372 tgctgacattctagaacccacctacgtaccaccaattgttgattcattttttgctttaaccgatgttagaagctacgaaggcacatcaaaaccattgttg 8935471  T
Q  441 gttgtgcaagtgacagagttagttgacggcttcttcattggttttacatttaaccatgcggttgttgacggagagtccacatggcttttcattaactcat 540  Q
    |  || ||||| || |||||| |||||||  | ||||||||||   |||||||||| || ||  |||||||| ||||    |||| |||||| || || |    
T  8935472 gcagttcaagtaactgagttaattgacggtattttcattggttgctcatttaaccacgctgtcattgacggaaagtctgtgtggcatttcatcaattctt 8935571  T
Q  541 gggcgaaaatctcgcgtggttgttg-ca--atcaagtatccaaactcataacgctagaacgttggtttccaagtggtattcaacatcccatacgatttcc 637  Q
    ||||  ||||||| ||| ||||||| ||  ||||| |||| ||||    ||| |||||||||||||||||   |||| ||||||  || |||||||||||    
T  8935572 gggctgaaatctcacgtagttgttgtcatcatcaaatatctaaacctccaacactagaacgttggtttccggatggtgttcaacggccaatacgatttcc 8935671  T
Q  638 ttttactatagagtcacaaaagaatgactctgatg 672  Q
    ||| ||| | |||  |||||||||| |||||||||    
T  8935672 tttcactttggagcaacaaaagaatcactctgatg 8935706  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 116 - 565
Target Start/End: Original strand, 8934207 - 8934655
Alignment:
Q  116 ctactaattgcacccaccaaaaagggtcttctttatcaccatcctctagtgccaaaccaaattcaacatctgaaacactctctatcttctacccttgcct 215  Q
    ||||| ||| || ||| ||||||||| ||||||||| |||||||  | ||  | |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8934207 ctacttattccaaccaacaaaaagggccttctttattaccatccggttgtatctaaccaaatccaacagctaagacactctctatcttcaacccttgcct 8934306  T
Q  216 ttttcccaccacttgcaggccgtctagaaataacagatcacaaggacaacaccgtttcatgttccgtcacatgcaacaatgcaggcgcgctctttgtcca 315  Q
    |||||| ||| ||||  || |||||  ||||||| ||  || | ||||| || || || || ||||| | ||||||||||||||  |  |||||||||||    
T  8934307 ttttccaacctcttgtcggtcgtctcaaaataacggaataccaagacaaaactgtctcgtgctccgttatatgcaacaatgcagatgtactctttgtcca 8934406  T
Q  316 tgccgcggcagagaaacacttgtgtaggtgacatacttggatgcacctacgttcctcccatcgtcgattcattttttccattaaccagagttaaaaatta 415  Q
    ||||    ||||| || |||||||| | |||||| || | |  ||||||||| ||||| || || |||||||||||| | |||||| | |||| ||  ||    
T  8934407 tgccagatcagag-aatacttgtgttgctgacattctagaacccacctacgtacctccaattgttgattcattttttgctttaaccggtgttagaagcta 8934505  T
Q  416 cgaaggcacatcacaaccattgttagttgtgcaagtgacagagttagttgacggcttcttcattggttttacatttaaccatgcggttgttgacggagag 515  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |  || ||||| || |||||| |||||||  | ||||||||||   |||||||||| || ||  |||||||| ||    
T  8934506 cgaaggcacatcaaaaccattgttggcagttcaagtaacggagttaattgacggtattttcattggttgctcatttaaccacgctgtcattgacggaaag 8934605  T
Q  516 tccacatggcttttcattaactcatgggcgaaaatctcgcgtggttgttg 565  Q
    ||    |||| |||||| || ||||||||  ||||||| ||| |||||||    
T  8934606 tctgtgtggcatttcatcaattcatgggctgaaatctcacgtagttgttg 8934655  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 496
Target Start/End: Original strand, 8929994 - 8930131
Alignment:
Q  359 cacctacgttcctcccatcgtcgattcattttttccattaaccagagttaaaaattacgaaggcacatcacaaccattgttagttgtgcaagtgacagag 458  Q
    ||||||||| ||||| || || |||||||||||| | |||||| | |||| ||  ||||||| ||||||| |||||||||| |   | ||||| || |||    
T  8929994 cacctacgtacctccaattgttgattcattttttgctttaaccggtgttagaagctacgaagtcacatcaaaaccattgttggcatttcaagtaactgag 8930093  T
Q  459 ttagttgacggcttcttcattggttttacatttaacca 496  Q
    ||| |||||||  | ||||||||||   ||||||||||    
T  8930094 ttaattgacggtattttcattggttgctcatttaacca 8930131  T

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Target: chr6 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 3)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 6501632 - 6501058
Alignment:
Q  63 caccaaattcaagtgatcaaaaaattgatttaactccatgggatctccggtacctactaattgcacccaccaaaaagggtcttctttatcaccatcctct 162  Q
    |||||| ||||  ||||||| ||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||| | ||| ||||| || |    
T  6501632 caccaacttcagctgatcaagaaattgacttgactccatgggatctccagttcctactaattgcacccaccaaaataggtcttttctatgaccattcttt 6501533  T
Q  163 agtgccaaaccaaattcaacatctgaaacactctctatcttctacccttgcctttttcccaccacttgcaggccgtctagaaataacagatcacaaggac 262  Q
    |||    ||||||||  |||  || | ||||||| |||| |||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||| || ||  || | |||    
T  6501532 agtagtcaaccaaatagaacgccttagacactctttatcctctgtccttgcctttttccaaccacttgcgggccgtctcaaaatgacggaaaacgaagac 6501433  T
Q  263 aacaccgtttcatgttccgtcacatgcaacaatgcaggcgcgctctttgtccatgccgcggcagagaaacacttgtgtaggtgacatacttggatgcacc 362  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||   ||||  ||||  |||  | ||||||  |||||  ||||    
T  6501432 aacaatgtttcatgttccatcacatgcaacaatgcaggtgtactctttgtccacgctgcaatagag-gacacacgtgatgttgacatcgttggacccacc 6501334  T
Q  363 tacgttcctcccatcgtcgattcattttttccattaaccagagttaaaaattacgaaggcacatcacaaccattgttagttgtgcaagtgacagagttag 462  Q
    ||| ||||||  |||||| ||||||||||||| || | | | | || ||| |||||||||| |||| |||||||| | |  |||||||||||||||||||    
T  6501333 taccttcctcttatcgtccattcattttttcctttcaacggggctagaaactacgaaggcatatcaaaaccattgcttgcagtgcaagtgacagagttag 6501234  T
Q  463 ttgacggcttcttcattggttttacatttaaccatgcggttgttgacggagagtccacatggcttttcattaactcatgggcgaaaatctcgcgtggttg 562  Q
    ||| |||  |||| ||||| |||| ||| ||||||| |||   ||  ||| ||||||  |||| ||| || |  || |||||  |||| || ||||||||    
T  6501233 ttggcggtgtctttattgggtttagattcaaccatgtggtcactggtggaaagtccatgtggcattttatcagttcctgggctgaaatttcacgtggttg 6501134  T
Q  563 ttgcaatcaagtatccaaactcataacgctagaacgttggtttccaagtggtattcaacatcccatacgatttcctt 639  Q
    ||| |||||| |||||||||||  | | |||||||||| |||||||| || |||||| | | |||||||||||||||    
T  6501133 ttgtaatcaaatatccaaactcccatcactagaacgtt-gtttccaaatgatattcagcgttccatacgatttcctt 6501058  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 384 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 11969713 - 11969553
Alignment:
Q  384 tcattttttccattaaccagagttaaaaattacgaaggcacatcacaaccattgttagttgtgcaagtgacagagttagttgacggcttcttcattggtt 483  Q
    |||||||||||| | | | |||||| ||| || ||||| |||||| | |||||| | |  || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |    
T  11969713 tcattttttccacttaacggagttagaaactatgaagggacatcagagccattgcttgcagtccaagtaacagagttagttgatggcatcttcattggct 11969614  T
Q  484 ttacatttaaccatgcggttgttgacggagagtccacatggcttttcattaactcatgggc 544  Q
    ||||| | || ||||  |  |||||||||| |||||| |||| |||||| || ||||||||    
T  11969613 ttacaatcaatcatgtcgccgttgacggagtgtccacttggcatttcatcaattcatgggc 11969553  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 669 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 11969428 - 11969370
Alignment:
Q  669 gatgataacgaaaaattcaattcatcagagaggttattccatttcacaaaggagaaaat 727  Q
    ||||| || |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11969428 gatgaaaaagaaaaactcaatccaccagagaggttattccatttcacaaagcagaaaat 11969370  T

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