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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF21235_high_5 (Length: 761)
Name: NF21235_high_5
Description: NF21235
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF21235_high_5 |
 |  |
|
| [»] scaffold0006 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0189 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0662 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0702 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0238 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1480 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0005 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0069 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 297; Significance: 1e-166; HSPs: 66)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 19 - 380
Target Start/End: Original strand, 42151294 - 42151654
Alignment:
| Q |
19 |
gaaagaggagaacccacctcttaattctaggatcgtgatttctcctaaagccttctctttgctcctagttcctcgaaatctagcnnnnnnnccgattctc |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
42151294 |
gaaagaggagaacctacctcttaattctaggatcgtgatttctcctaaagccttctctttgcacctagttcctccaaatctagcttttttcccgattctc |
42151393 |
T |
 |
| Q |
119 |
tcttactattcttcatctcattcaaatcattgatttttcatcacagttaaaaagagtgtgttgaaaagtgtggattaaaatttgtgttgatagcatttct |
218 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
42151394 |
tcttactaatcttcatctcattcaaatcattgatttttcatctcagataaaaagagtgtgttgaaaagtctggattaaaatttgtgt-gctagcatttct |
42151492 |
T |
 |
| Q |
219 |
cttcttgaaaaataggtgtgaaggtcaattatcatttttgtccttcataacttgataagcctttaaatccttattttaccattaaatcgaatagcaagat |
318 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
42151493 |
cttcttgaaaaataggtgtgaaggtcaattatcatttttgtccttcataacttgataagcctttaaatccttattttaccattaaatcgaatagcaacat |
42151592 |
T |
 |
| Q |
319 |
aatcaaattgtgattgagttgacttacttttgttaatgcttctaaaaggtttttattcttag |
380 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42151593 |
aatcaaattgtgattgagttgacttacttttgttaatgcttctaaaaggtttttattcttag |
42151654 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 379 - 729
Target Start/End: Original strand, 346344 - 346694
Alignment:
| Q |
379 |
agggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc |
478 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
346344 |
agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattccc |
346443 |
T |
 |
| Q |
479 |
gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta |
578 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
346444 |
gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta |
346543 |
T |
 |
| Q |
579 |
ttataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaa |
678 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
346544 |
ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa |
346643 |
T |
 |
| Q |
679 |
ggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccct |
729 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
346644 |
ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct |
346694 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 379 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 6171863 - 6171513
Alignment:
| Q |
379 |
agggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc |
478 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6171863 |
agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgagaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc |
6171764 |
T |
 |
| Q |
479 |
gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta |
578 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6171763 |
gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta |
6171664 |
T |
 |
| Q |
579 |
ttataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaa |
678 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
6171663 |
ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa |
6171564 |
T |
 |
| Q |
679 |
ggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccct |
729 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
6171563 |
ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct |
6171513 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 382 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 2050935 - 2050586
Alignment:
| Q |
382 |
gtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg |
481 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2050935 |
gtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgagaataaaatgataggaatgtatatacctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg |
2050836 |
T |
 |
| Q |
482 |
tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctatta |
581 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
2050835 |
tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataattttcctatta |
2050736 |
T |
 |
| Q |
582 |
taatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaagga |
681 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
2050735 |
taattcctatttttatgattcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagga |
2050636 |
T |
 |
| Q |
682 |
atattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccctta |
731 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2050635 |
atgttattcctaaaaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccctta |
2050586 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 375 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 4559635 - 4559278
Alignment:
| Q |
375 |
tcttagggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttat |
474 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
4559635 |
tcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccaagaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactttattttat |
4559536 |
T |
 |
| Q |
475 |
tcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagttta |
574 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4559535 |
tcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagttta |
4559436 |
T |
 |
| Q |
575 |
cctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatatt |
674 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4559435 |
cctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatatt |
4559336 |
T |
 |
| Q |
675 |
ctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacacccttag |
732 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4559335 |
ccaaggaatgttattcttagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttag |
4559278 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 374 - 729
Target Start/End: Original strand, 14777492 - 14777847
Alignment:
| Q |
374 |
ttcttagggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaatttta |
473 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14777492 |
ttctaagggtgtgtttgtttcaatttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaatttta |
14777591 |
T |
 |
| Q |
474 |
ttcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagttt |
573 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14777592 |
ttcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggtgggaataaaattcctatggagatgggaataaattcataaatagttt |
14777691 |
T |
 |
| Q |
574 |
acctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatat |
673 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14777692 |
acctattataatccctatttttatagttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatat |
14777791 |
T |
 |
| Q |
674 |
tctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccct |
729 |
Q |
| |
|
|| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
14777792 |
tccaaggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccct |
14777847 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 376 - 731
Target Start/End: Original strand, 42674657 - 42675012
Alignment:
| Q |
376 |
cttagggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt |
475 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42674657 |
cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt |
42674756 |
T |
 |
| Q |
476 |
cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttac |
575 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42674757 |
cccgggcataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggaaatgggaataaattcataaatagtttac |
42674856 |
T |
 |
| Q |
576 |
ctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattc |
675 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
42674857 |
ctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcctatctttatattc |
42674956 |
T |
 |
| Q |
676 |
taaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccctta |
731 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42674957 |
caagaaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta |
42675012 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 379 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 11071677 - 11071327
Alignment:
| Q |
379 |
agggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc |
478 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11071677 |
agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgatttccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc |
11071578 |
T |
 |
| Q |
479 |
gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta |
578 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11071577 |
gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaatagtttaccta |
11071478 |
T |
 |
| Q |
579 |
ttataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaa |
678 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
11071477 |
ttataatccatatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatatttcaa |
11071378 |
T |
 |
| Q |
679 |
ggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccct |
729 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
11071377 |
ggaatgttattcctatgaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct |
11071327 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 378 - 729
Target Start/End: Original strand, 41729128 - 41729479
Alignment:
| Q |
378 |
tagggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc |
477 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
41729128 |
tagggtgtgtttgtttcaagttataattttttattcccgggaataaaatgataggaatggatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattgc |
41729227 |
T |
 |
| Q |
478 |
cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacct |
577 |
Q |
| |
|
| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41729228 |
cagatataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagtttccatggagatgagaataaattcataaatagtttacct |
41729327 |
T |
 |
| Q |
578 |
attataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattcta |
677 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
41729328 |
attataatccctatttttatggttactaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca |
41729427 |
T |
 |
| Q |
678 |
aggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccct |
729 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
41729428 |
aggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct |
41729479 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 380 - 724
Target Start/End: Original strand, 9733846 - 9734190
Alignment:
| Q |
380 |
gggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg |
479 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
9733846 |
gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcctt |
9733945 |
T |
 |
| Q |
480 |
ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctat |
579 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9733946 |
ggtataaaatgttcctgggaataaaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctat |
9734045 |
T |
 |
| Q |
580 |
tataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaag |
679 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
9734046 |
tataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagccaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag |
9734145 |
T |
 |
| Q |
680 |
gaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacac |
724 |
Q |
| |
|
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gaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttaaaacaaacac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
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Target Start/End: Original strand, 5770109 - 5770458
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Q |
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T |
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578 |
Q |
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T |
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678 |
Q |
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5770309 |
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5770408 |
T |
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728 |
Q |
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5770409 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
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Target Start/End: Original strand, 21737388 - 21737765
Alignment:
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Q |
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T |
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Q |
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| T |
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T |
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Q |
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T |
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737 |
Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 376 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 17966058 - 17965707
Alignment:
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T |
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| Q |
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575 |
Q |
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| T |
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cccgggtataaaatgttcctaggaatagaaaaaatttcccatgaaaaagggtgggaataaagttcccatagagatgggaataaattcataaatagtttac |
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T |
 |
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675 |
Q |
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T |
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Q |
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T |
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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 382 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 37192591 - 37192240
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T |
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| Q |
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581 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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Q |
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T |
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Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 379 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 37534024 - 37533675
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T |
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578 |
Q |
| |
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T |
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| Q |
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678 |
Q |
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T |
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Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 379 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 2521747 - 2521434
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Q |
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T |
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| Q |
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578 |
Q |
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| T |
2521647 |
gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaaattcctatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta |
2521548 |
T |
 |
| Q |
579 |
ttataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaa |
678 |
Q |
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ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaatttccatctttatattccaa |
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T |
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|
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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 381 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 41750599 - 41750276
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T |
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gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctatt |
580 |
Q |
| |
|
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gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctatt |
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T |
 |
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680 |
Q |
| |
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41750300 |
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aatgttattcctaggaataaattt |
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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 384 - 726
Target Start/End: Original strand, 28311701 - 28312042
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taaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattata |
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Q |
| |
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|
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T |
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| Q |
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Q |
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Q |
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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 385 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 26310335 - 26309993
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ataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattat |
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Q |
| |
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ataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattat |
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T |
 |
| Q |
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aatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaa |
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Q |
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aatccctatttttatggttcctaagaatattataaagctaaccaaccatatttttcctaaatttcttgtaataaaattcccatctttatattccaaggaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 384 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 37233496 - 37233155
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taaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattata |
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taaaatgttcctgggaatagaaaatcgttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatag-ttacctattata |
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atccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaat |
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attattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacac |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 384 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 638660 - 638318
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Q |
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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 480 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 13760938 - 13760692
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Q |
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T |
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679 |
Q |
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| T |
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13760739 |
T |
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| Q |
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726 |
Q |
| |
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13760738 |
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13760692 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 380 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 1988382 - 1988073
Alignment:
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479 |
Q |
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T |
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| Q |
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579 |
Q |
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| T |
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679 |
Q |
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| T |
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T |
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Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 372 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 45694267 - 45693908
Alignment:
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Q |
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T |
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| Q |
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571 |
Q |
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| T |
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Q |
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| T |
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732 |
Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 379 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 40570092 - 40569733
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Q |
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T |
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| Q |
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575 |
Q |
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675 |
Q |
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| T |
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| Q |
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736 |
Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 379 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 39819768 - 39819414
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478 |
Q |
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39819669 |
T |
 |
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572 |
Q |
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| T |
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39819569 |
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672 |
Q |
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| T |
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39819469 |
T |
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727 |
Q |
| |
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| T |
39819468 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 377 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 7007647 - 7007307
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Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
477 |
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576 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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676 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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Q |
| |
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| T |
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aagaaatgttattcctaataataaatttggtaaacttaaaacaaacacaccct |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 377 - 735
Target Start/End: Original strand, 5002834 - 5003190
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|
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T |
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| Q |
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576 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
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Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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Q |
| |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 382 - 587
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| |
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T |
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| Q |
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581 |
Q |
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Q |
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taatcc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 395 - 561
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Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 378 - 721
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Q |
| |
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tagggtgcgtttgttttaagttatatttgtagctttttggaaataaaatgatagaaataaatttgtttatgtttgttacaagtttgctaaattttatttt |
4875749 |
T |
 |
| Q |
478 |
cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacct |
577 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
578 |
attataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttc-ctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattct |
676 |
Q |
| |
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| T |
4875650 |
attataatccctatttttatggttcctcggcatattataatgttaagaaaacatatttttttctaaatacattggaataaaattcacatctttatattcc |
4875551 |
T |
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aaagaatattattcctaagaataaatttgacaaacttgaaacaaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 445 - 721
Target Start/End: Original strand, 41297983 - 41298255
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| |
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T |
 |
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ggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaat |
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| |
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 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 379 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 6571759 - 6571602
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agggtgtatttgtttaaagttatatttgttgatttccggaaataaaatgataggaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattctc |
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T |
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gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaa |
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|
| T |
6571659 |
aggtataaaatgttccggggaatataaaaaatttcccaagaaaaagggtaggaataaa |
6571602 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 444 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 13539675 - 13539399
Alignment:
| Q |
444 |
ctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttccca |
543 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13539675 |
ctatgtttgttacaaatttattaaattttattcgcaggtataaaatgtttatgggaatggaaaaaatttctcacagaaactagtgggaataaagttccca |
13539576 |
T |
 |
| Q |
544 |
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643 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||| |||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
13539575 |
tgaacatgggaatagattcatgtgta-attatctattataatccttatttttatggtttctgagaatactataatgttaagcaaacatcttttttctaaa |
13539477 |
T |
 |
| Q |
644 |
tttcttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaa |
721 |
Q |
| |
|
| | || |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||| |||| | || |||||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13539476 |
tattttagaataaaattctcatctttatgttccaagaaatgttatcaccaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaa |
13539399 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 572 - 725
Target Start/End: Original strand, 3254284 - 3254437
Alignment:
| Q |
572 |
ttacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttat |
671 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
3254284 |
ttacttattataacccttatttttatggtttctaggaatattatgaagttaaccaaacatattttttctaaataccttagaataaaattctcatttttat |
3254383 |
T |
 |
| Q |
672 |
attctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacaca |
725 |
Q |
| |
|
|||| || |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
3254384 |
attccaaagaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttaaaacaaacaca |
3254437 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 577 - 713
Target Start/End: Original strand, 11763597 - 11763733
Alignment:
| Q |
577 |
tattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattct |
676 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| || |||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
11763597 |
tattataatccctatttttatggttcttaggaatattataaaattaatcaaacatattttttctagataccttggaataaaattctcatctttatattcc |
11763696 |
T |
 |
| Q |
677 |
aaggaatattattcctaataataaatttgataaactt |
713 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
11763697 |
aaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaactt |
11763733 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 379 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 25455096 - 25454914
Alignment:
| Q |
379 |
agggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc |
478 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| | ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
25455096 |
agggtgtgtttgtttcaagttatatttgtagattcctgagaataaaatcataaaaatacatatgtctatgtttgttacaagtttactaaatttcattctc |
25454997 |
T |
 |
| Q |
479 |
gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaat--aaagttcccatggagatgggaataaa |
559 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| || || ||| |||||||||||| ||| | ||||||| |
|
|
| T |
25454996 |
gagtataaaatgttcctgggaatagaaaagttttctcaaaaaaaatggagggaataaaaagttcccatgaagacgagaataaa |
25454914 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 520 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 13790221 - 13790018
Alignment:
| Q |
520 |
aaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcata-aatagtttacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaa |
618 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
13790221 |
aaaacggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaaatcatgtaata--ttacctattataatccctatttttaaggttccttggaatattataat |
13790124 |
T |
 |
| Q |
619 |
cctaaccaaacat-atttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaa |
717 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
13790123 |
gttaatcaaacatctttttttttaaataccttagaataaaatttacatctatatatttcaaggaatgttattcctacaaataaatttgataaacttgaaa |
13790024 |
T |
 |
| Q |
718 |
caaaca |
723 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
13790023 |
caaaca |
13790018 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 370 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 25725107 - 25724918
Alignment:
| Q |
370 |
tttattcttagggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaa- |
468 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||| |||| ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||| || ||||| |||| |
|
|
| T |
25725107 |
tttatacttggggtgcgtttgtttcaagttatctttggaaattcttgggaacaaaatgatagaaatacgtattcctatgtttgttgcaggtttattaaaa |
25725008 |
T |
 |
| Q |
469 |
ttttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataa |
558 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
25725007 |
ttttattgctgggtataaaatgtttctgggaatagaaaaagtttcccaaagaaaagggtgggaataaagttctcatgaagatgagaataa |
25724918 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 379 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 1623454 - 1623217
Alignment:
| Q |
379 |
agggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc |
478 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| || ||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||| |||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
1623454 |
agggtatgtttgttttaaattatatttgttgattcctaagagtaaaataatagaaatatatatgtctatgtt-gttacgagtttattaaatttgattccc |
1623356 |
T |
 |
| Q |
479 |
gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta |
578 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| | | ||| ||| ||| |||||||| | || || ||||||||| | ||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||| | |
|
|
| T |
1623355 |
ggttataaaatgttcctgagtacagagaaatttttccaaagaacatggcgggaataaagtttcaatgaatatgagaataaattcatatgtag-ttaccaa |
1623257 |
T |
 |
| Q |
579 |
ttataatccctatttttatggtttctaggaatattataaa |
618 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
1623256 |
ttataatctctatttttatggttcctacgaataatataaa |
1623217 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 380 - 561
Target Start/End: Original strand, 8868664 - 8868842
Alignment:
| Q |
380 |
gggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg |
479 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||| ||| |||| | ||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
8868664 |
gggtgcgtttgtttcaagttatt-ttgtagattcctaggaataaattgatagaaatacatattcttatgtttgttacaggattagtaaattttattccta |
8868762 |
T |
 |
| Q |
480 |
ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaatt |
561 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
8868763 |
ggtagaaaatgttcctggga-taggaata-tttcccaaagaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgggtataaatt |
8868842 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 371 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 24499520 - 24499400
Alignment:
| Q |
371 |
ttattcttagggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaatt |
470 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24499520 |
ttattcttaaagtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattcatagaaataaaatgatagaaatatatat--ctatgtttgttataagtttactaaatt |
24499423 |
T |
 |
| Q |
471 |
ttattcccgggtataaaatgttc |
493 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24499422 |
ttattccatggtataaaatgttc |
24499400 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 379 - 564
Target Start/End: Original strand, 14403232 - 14403419
Alignment:
| Q |
379 |
agggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc |
478 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||| || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
14403232 |
agggtgtgtttgtttgaagttgtatttgttgattcctggaaataaaatgataaaaatatacatgcctacatttattacaagtttaataaattttattctc |
14403331 |
T |
 |
| Q |
479 |
gggtataaaatgttcctggga---atagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcat |
564 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | | ||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
14403332 |
aggtataaaatgttcctgaaatagaaagaaaaattttaccaaagaaaatggtgtgaataaagttttcatgg-ggtgagaataaattcat |
14403419 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 459 - 561
Target Start/End: Original strand, 3254142 - 3254245
Alignment:
| Q |
459 |
gtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaa-aatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaata |
557 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
3254142 |
gtttactaaattttattctcgcgtacaaaatgtttctgggaatagaaaattttttcccaaaggaaatggtgggaataaagttcccatgaagatgagaata |
3254241 |
T |
 |
| Q |
558 |
aatt |
561 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
3254242 |
aatt |
3254245 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 419 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 4685211 - 4684945
Alignment:
| Q |
419 |
aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgtt-cctgggaatagaaaaaatttcc-ca |
516 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| || |||| ||||||||||| | | |||||||| ||| ||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
4685211 |
aataaaatgatagaaatatacatgtttatgtttgttataaatttattaaattttatttcagagtataaaacgtttcctggcaatagaaaaaaaaaaatca |
4685112 |
T |
 |
| Q |
517 |
aagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattata |
616 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||| | | | | |||||||| |
|
|
| T |
4685111 |
aagaaaagggtgtgaataaagttcccatgaagatgggaacaaattcatgtgta----acctattataattcatatttttatggatccgaag-atattata |
4685017 |
T |
 |
| Q |
617 |
aacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaatattat |
688 |
Q |
| |
|
| ||| |||| |||||||| |||||| || | |||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||| |
|
|
| T |
4685016 |
atgttaagcaaatatatttttactaaatacctaggaataaaattctcatctttatgttctaaagaatgttat |
4684945 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 419 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 37851890 - 37851692
Alignment:
| Q |
419 |
aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatt--tccca |
516 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| || | | |||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
37851890 |
aataaaatgatagaaatataccttcttatgtttgctagaagtttactaa-ttttattttcgggtataaaatgtttctaggaatagaaaaaaaaaattcca |
37851792 |
T |
 |
| Q |
517 |
aagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattata |
616 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
37851791 |
aagaaaatggtgagaataaagttcccatgaagatgagaataaattcatgtgta-actacctattataattcatatttttatgattcctaaaaatattata |
37851693 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 383 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 13761013 - 13760941
Alignment:
| Q |
383 |
tgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgtta |
455 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
13761013 |
tgtgtttgtttcaagttataattattgattttcgggaataaaatgataggaatatatgtacctatgtttgtta |
13760941 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 621 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 1623181 - 1623078
Alignment:
| Q |
621 |
taaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaa |
720 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||| |||| || |||||| |
|
|
| T |
1623181 |
taaccaaacatatattttctaaata-cttgaaataaaattctcatctttatattccaagaaatgttattactaggaataaatttagtaaaattgaaacaa |
1623083 |
T |
 |
| Q |
721 |
acaca |
725 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
1623082 |
acaca |
1623078 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 451 - 561
Target Start/End: Original strand, 516463 - 516572
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| Q |
451 |
tgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagat |
550 |
Q |
| |
|
||||| || |||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||| |||| |||||| ||||| || |||| |
|
|
| T |
516463 |
tgttataattttagtaaattttatttctgggtataaaatgtttttgggaatataaaaaaatt-ccaaagaaaatggtgagaataaaattcccgtgaagat |
516561 |
T |
 |
| Q |
551 |
gggaataaatt |
561 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |
|
|
| T |
516562 |
gagaataaatt |
516572 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 419 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 25625418 - 25625328
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| Q |
419 |
aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaa |
509 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| | ||| ||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
25625418 |
aataaaatgatagaaatatgaatgtctaggtttgttgcaaatttactagattttattctgaggtataaaatgttcatgggaatagaaaaaa |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 651 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 14253326 - 14253254
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aaataaaattcccatctttatattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaaca |
723 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| |||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||| |
|
|
| T |
14253326 |
aaataaaattctcatccttatattccaaagaatgttattcctaaaaataaatttggtaaatttaaaacaaaca |
14253254 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 608 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 14253397 - 14253340
Alignment:
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608 |
aatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccat |
665 |
Q |
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| T |
14253397 |
aatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaatattttggaataaaatttccat |
14253340 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 652 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 25444999 - 25444922
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| Q |
652 |
aataaaattcccatctttatattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccct |
729 |
Q |
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||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |
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25444999 |
aataaaattatcatctttatattccaaaaaatgttattccttaaaataaatttgacaaacttaaaacatacacaccct |
25444922 |
T |
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Target: chr2; HSP #64
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377 |
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476 |
Q |
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|||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| || |||||||||||| | ||| || || | |||||||||||||||||| |||||||||||| |
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| T |
1723225 |
ttagagtgtgtttgtttcaagttatgtttgtatatttccatgaataaaatgatggaaatatacatttcaatgtttgttacaagtttattaaattttattc |
1723324 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
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Target Start/End: Complemental strand, 25625120 - 25625054
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| Q |
656 |
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722 |
Q |
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25625120 |
aaattcacatttttatatgttaagaaatgttattcctaaaaataaatttgataaatttaaaacaaac |
25625054 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 652 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 45212731 - 45212662
Alignment:
| Q |
652 |
aataaaattcccatctttatattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaa |
721 |
Q |
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|||||||||| |||||||| ||| || |||| | |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |
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45212731 |
aataaaattctcatctttacatttcaaagaatgtaattcctaaaaataaatttgataaatttaaaacaaa |
45212662 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 48)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 377 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 38364155 - 38363804
Alignment:
| Q |
377 |
ttagggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc |
476 |
Q |
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||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
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ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc |
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T |
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| Q |
477 |
ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc |
576 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38364055 |
ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc |
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T |
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577 |
tattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattct |
676 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38363955 |
tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc |
38363856 |
T |
 |
| Q |
677 |
aaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccc |
728 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
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|
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38363855 |
aaggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccc |
38363804 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 377 - 731
Target Start/End: Original strand, 35818421 - 35818775
Alignment:
| Q |
377 |
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476 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc |
35818520 |
T |
 |
| Q |
477 |
ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc |
576 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35818521 |
ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc |
35818620 |
T |
 |
| Q |
577 |
tattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattct |
676 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
35818621 |
tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattcc |
35818720 |
T |
 |
| Q |
677 |
aaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccctta |
731 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
35818721 |
aaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta |
35818775 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 377 - 731
Target Start/End: Original strand, 37392543 - 37392897
Alignment:
| Q |
377 |
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476 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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ttagggtgtatttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattc |
37392642 |
T |
 |
| Q |
477 |
ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc |
576 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37392643 |
ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc |
37392742 |
T |
 |
| Q |
577 |
tattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattct |
676 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
37392743 |
tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc |
37392842 |
T |
 |
| Q |
677 |
aaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccctta |
731 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37392843 |
aaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta |
37392897 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 376 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 25837986 - 25837631
Alignment:
| Q |
376 |
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475 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtacatgcctatgtttgttacaagtttacaaaattttatt |
25837887 |
T |
 |
| Q |
476 |
cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttac |
575 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25837886 |
cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaattttcccaaaaaaaagggtggcaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttac |
25837787 |
T |
 |
| Q |
576 |
ctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattc |
675 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25837786 |
ctattataatccctatttttatggttcataggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc |
25837687 |
T |
 |
| Q |
676 |
taaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccctta |
731 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25837686 |
caaggaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta |
25837631 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 375 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 12710721 - 12710363
Alignment:
| Q |
375 |
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474 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
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12710622 |
T |
 |
| Q |
475 |
tcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagttta |
574 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12710621 |
tccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagttta |
12710522 |
T |
 |
| Q |
575 |
cctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatatt |
674 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12710521 |
cctattataatccttatttttatggttcctaggaatattataaagctaacgaaacatatttttcctacatttcttggaataaaattcccatctttatatt |
12710422 |
T |
 |
| Q |
675 |
ctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacacccttagt |
733 |
Q |
| |
|
| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12710421 |
ccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagt |
12710363 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 376 - 731
Target Start/End: Original strand, 16313503 - 16313858
Alignment:
| Q |
376 |
cttagggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt |
475 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgatttccgggaataaaatgataggaatgtatatacctatgtttgttacaagtttactaaattttatt |
16313602 |
T |
 |
| Q |
476 |
cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttac |
575 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
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cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaataattttc |
16313702 |
T |
 |
| Q |
576 |
ctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattc |
675 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16313703 |
ctattataatccctatttttatgattcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattc |
16313802 |
T |
 |
| Q |
676 |
taaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccctta |
731 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16313803 |
caaggaatgttattcctaaaaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccctta |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 380 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 18298183 - 18297836
Alignment:
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380 |
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Q |
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|
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|
|
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gggtttgtttgtttcaagttataatttttgattctcgggaataaaatgataggaatgtatatacctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg |
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T |
 |
| Q |
480 |
ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctat |
579 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggaaatgagaataaattcataaatagtttacctat |
18297984 |
T |
 |
| Q |
580 |
tataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaag |
679 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
18297983 |
tataatccctatttttatggttcctagaaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag |
18297884 |
T |
 |
| Q |
680 |
gaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacacc |
727 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18297883 |
gaatgttattcctagaaataaatttgataaacttgaaacaaacacacc |
18297836 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 379 - 729
Target Start/End: Original strand, 32660932 - 32661283
Alignment:
| Q |
379 |
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478 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
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agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcctgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattccc |
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T |
 |
| Q |
479 |
gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaag-aaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacct |
577 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32661032 |
gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacct |
32661131 |
T |
 |
| Q |
578 |
attataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattcta |
677 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
32661132 |
attataatccctatttttatggttcttaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatctttatattcca |
32661231 |
T |
 |
| Q |
678 |
aggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccct |
729 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
32661232 |
aggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 386 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 3050074 - 3049731
Alignment:
| Q |
386 |
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485 |
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| |
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|
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| T |
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 |
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
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aaatgttcctgggaatagaaaaaaatttccaaagaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataat |
3049875 |
T |
 |
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ccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaatat |
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Q |
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Q |
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578 |
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Target: chr8; HSP #12
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Q |
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26061917 |
T |
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Target: chr8; HSP #17
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tacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttata |
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ttctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacac |
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Target: chr8; HSP #20
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gtgtgtttgtttgaagttatatttgttgattcctgagaataaaataatagaaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg |
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Q |
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T |
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726 |
Q |
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21137433 |
atgttatt-ctagtaataaatttgataaactaaaaacaaacacac |
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T |
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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
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Target Start/End: Complemental strand, 7317445 - 7317156
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T |
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| Q |
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578 |
Q |
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T |
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Q |
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T |
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Target: chr8; HSP #22
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Target Start/End: Original strand, 33444627 - 33444969
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Q |
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T |
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Q |
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T |
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680 |
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T |
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| Q |
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Q |
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Target: chr8; HSP #23
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Target Start/End: Complemental strand, 35394464 - 35394159
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T |
 |
| Q |
477 |
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Q |
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T |
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Q |
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T |
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| Q |
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Q |
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 |
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Q |
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T |
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Target: chr8; HSP #25
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T |
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Q |
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T |
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685 |
Q |
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T |
 |
| Q |
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Q |
| |
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Target: chr8; HSP #26
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T |
 |
| Q |
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616 |
Q |
| |
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T |
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Q |
| |
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| T |
19161077 |
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T |
 |
| Q |
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593 |
Q |
| |
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|
|
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T |
 |
| Q |
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691 |
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| |
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| T |
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T |
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726 |
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| |
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41432498 |
taaaaataaatttgataaacttaaaacaaacacac |
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Target: chr8; HSP #28
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T |
 |
| Q |
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| |
|
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|
|
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Q |
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T |
 |
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ataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaattt----cttg |
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Q |
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T |
 |
| Q |
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700 |
Q |
| |
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| |
|
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T |
 |
| Q |
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aaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataa |
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Q |
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 |
| Q |
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Q |
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| T |
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tccctatttttgaggttccttgaaacattataatgttaaccaaacatcttttttctaaataccttggaataaaatttacatctatatatttcaaggaatg |
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T |
 |
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Q |
| |
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ttattcctagaaataaatttggcaaacttgaaacaaacacacccttaatttt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
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| |
|
||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||| |
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ctatgtttgttacgattttattaaattttatttccgaatataaaatgttcttcagaatagaaaaaaatttccaagaaaaagggtgggaataaagttccca |
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T |
 |
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tggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatat---ttttcct |
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Q |
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aaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccc |
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Q |
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31117787 |
aaatactttgaaataaaattctcatctttatattccaatgaatgttattcctaaatataaatttgataaacttgaaacaaacacaccc |
31117874 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 379 - 729
Target Start/End: Original strand, 16218942 - 16219290
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379 |
agggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc |
478 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||| ||||| | || | || | |||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16218942 |
agggtgcgtttgtttcaaattatattcgtagttttctgggaataaaacgatagaaatatgtatgcctatgtttgttacaagtttactagattttattccg |
16219041 |
T |
 |
| Q |
479 |
gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta |
578 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| ||||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||||| |
|
|
| T |
16219042 |
gggtttaaaacgttctcaggaatagtaaaatttccccaaagaaaa-ggtgggaataatcttcccatgaagatgggaataaatccacgtgta-attaccta |
16219139 |
T |
 |
| Q |
579 |
ttataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaa |
678 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||| | | ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||| ||| || |
|
|
| T |
16219140 |
ttataatccccattttcatggttcccaagaatattataatgttaaccaaacatcttttttctaaataccttggaataaaattctcatctttaagttccaa |
16219239 |
T |
 |
| Q |
679 |
ggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccct |
729 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16219240 |
ggaacgttattcctaggaataaattggataaacttaaaacaaacacaccct |
16219290 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
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Target Start/End: Original strand, 40197076 - 40197205
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| Q |
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479 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
40197076 |
gggtatgtttgtttcaagttataattgttgattcccggaaataaaatgatagaaatgtatatgtttatgtttgttataagtttactaaaatttattcttt |
40197175 |
T |
 |
| Q |
480 |
ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaa |
509 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
40197176 |
gatataaaatgtttctgggaatagaaaaaa |
40197205 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
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485 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||| |||| ||||| | ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
38437519 |
gtttgttttaagttatatttgtatattcctgaaaataaaacgataggaatacatatatctatgtttgttacaagtttacaaaattttattttcgggtata |
38437420 |
T |
 |
| Q |
486 |
aaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaa |
536 |
Q |
| |
|
||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38437419 |
aaacgttcctgagaatagaaaatttttcccaaagaaaagggtggaaataaa |
38437369 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
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Query Start/End: Original strand, 418 - 561
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517 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
14763969 |
gaataaaatgatagaaatatacatgcatatgtttgtttcaagtttactaaattttattcacgggtataaaatgttcatgagaatagaaaaaaaat-tcaa |
14764067 |
T |
 |
| Q |
518 |
agaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaatt |
561 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
14764068 |
tgaaaaaggtgggaataaagttcacatgaagatgataataaatt |
14764111 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
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Target Start/End: Complemental strand, 25899702 - 25899556
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| Q |
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ggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg |
480 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25899702 |
ggtgtgtttgtttcaaattatatttgtagattcctgggaataaaatcataaaaatgcatgtgtctatgtttgttgcaagtttattaaattttatttccgg |
25899603 |
T |
 |
| Q |
481 |
gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtg |
528 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
25899602 |
gtat-aaatgttcctcggaatagaaaagtttttccaaagaaaatggtg |
25899556 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 448 - 727
Target Start/End: Original strand, 37981857 - 37982134
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547 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||||| |||| || ||||||| |||| ||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
37981857 |
gtttgtttcaagtttacaaaattt-attcttggatataaaacgttcttgggaattaaaaaaaaatc--aaggaaaagggtggaaataaagttcctatgaa |
37981953 |
T |
 |
| Q |
548 |
gatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcct--aaatt |
645 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| ||| || || || | ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||| ||||||| ||||| | |||| |
|
|
| T |
37981954 |
aatgagaataaatttatatgtaatt-acttgttataatccctatttttatggttcccataaatattataatgttaagcaaacatcttttttttttaaata |
37982052 |
T |
 |
| Q |
646 |
tcttgaaataaaa-ttcccatctttatattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacacc |
727 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
37982053 |
ccttggaataaaaattctcatctttatgttc-aaggaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc |
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T |
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Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 573 - 732
Target Start/End: Original strand, 33533585 - 33533744
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573 |
tacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttata |
672 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||| ||| ||||||| ||| | |||||| ||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
33533585 |
tacctattataattcctatttttaaggttcttgagaatatcataatgttaatcaaacatctttattctaaatacattggaataaaattcacatctttata |
33533684 |
T |
 |
| Q |
673 |
ttctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacacccttag |
732 |
Q |
| |
|
||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33533685 |
ttcaaaggaataatattcctaggaataaatttgacaaacttgaaacaaacacacccttag |
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T |
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Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 622 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 25899488 - 25899381
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622 |
aaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaa |
721 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| || |||| ||||||| |
|
|
| T |
25899488 |
aaccaaacatcttttttctaaataccttagaataaaattcctatctttatattccaaggaatgttattcctaaaaataaatttgttacacttgaaacaaa |
25899389 |
T |
 |
| Q |
722 |
cacaccct |
729 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
25899388 |
cacaccct |
25899381 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 449 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 12650137 - 12649859
Alignment:
| Q |
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tttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggag |
548 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||||||||||| | | ||||||||| ||| ||| ||||| |||| || | ||||||||| |||| ||||||||||||||| | |
|
|
| T |
12650137 |
tttgttacaagattattaaattttatttctgtgtataaaatattcatggaaatag-aaaatttacgcaaagaaaatagtgggaataaagttcccatgaaa |
12650039 |
T |
 |
| Q |
549 |
atgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaaca--tatttttcctaaattt |
646 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |
|
|
| T |
12650038 |
atgaaaataaattcacatgta-actacctattataatctctattttttaagttcctaagaatattataatgttaatcaaacatcttttttttttaaataa |
12649940 |
T |
 |
| Q |
647 |
cttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacacc |
727 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| || |||| ||||| | |||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12649939 |
tttgaaataaaattcacatcattgtattacaaggattgttattcgtagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc |
12649859 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 379 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 34672406 - 34672289
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| Q |
379 |
agggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc |
478 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
34672406 |
agggtgtgtttgtttgaagttgtatttgttgattcctgaaaataaaatgataaaaatatatatgcttacatttattacaagtttaataaattttattctc |
34672307 |
T |
 |
| Q |
479 |
gggtataaaatgttcctg |
496 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
34672306 |
agatataaaatgttcctg |
34672289 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
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607 |
gaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatcttt--atattctaaggaatattattcctaataataaattt |
704 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
34672207 |
gaatattataaagttaaccaaaaatattttttctaaaaaccttagtataaaatttccatctttttatatttcaaggactgttatttctaaaaataaattt |
34672108 |
T |
 |
| Q |
705 |
gataaacttcaaacaaacacaccct |
729 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
34672107 |
gataaacttaaaacaaacacaccct |
34672083 |
T |
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Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 575 - 726
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| Q |
575 |
cctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatatt |
674 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||| | || |||| | || ||| ||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
38437353 |
cctattataattcctatttttatggttcccagaaatactgtagtgttaaacaaacatcttttttctaaatatcttggaataaaattctcatccttatatt |
38437254 |
T |
 |
| Q |
675 |
ctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacac |
726 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
38437253 |
aaaaa-aatattatttttaagaatgaatttaataaacttgaaacaaacacac |
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T |
 |
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Target: chr8; HSP #44
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670 |
atattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacacccttagtttt |
736 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
35394139 |
atattccaaagaatgttattactaagaataaatttgataaacttgaaacaaacacacccttaatttt |
35394073 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
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| Q |
382 |
gtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaat |
421 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8635703 |
gtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccaggaat |
8635664 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
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| Q |
652 |
aataaaattcccatctttatattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacacc |
727 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| || | | ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
37124148 |
aataaaattctcatctttatattccaaatattgttatttttaacaataaatttgataaacttaaaataaacacacc |
37124073 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
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| Q |
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tatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaa |
518 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
32901787 |
tatgtttgtcacaagtttaaaaaaatttattcatgg-tataaaatgtttctgggaataggaaaattttcccaaa |
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T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
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aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaa |
518 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| | || ||||||||||||| || |||| |||||||||||| | ||||||||| |||| | ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
39075625 |
aataaaatgatagaaatatgcatccctatgtttgttataattttattaaattttattcgtgtgtataaaat-ttccaagaaatagaaaaaaaaattcaaa |
39075527 |
T |
 |
| Q |
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gaaaagggtggaaataaagttc |
540 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
39075526 |
gaaaagggtgctaataaagttc |
39075505 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 57)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 378 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 45045699 - 45045341
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| Q |
378 |
tagggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc |
477 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
45045699 |
tagggtgtgtttgttttaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttatttc |
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T |
 |
| Q |
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cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacct |
577 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45045599 |
cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacct |
45045500 |
T |
 |
| Q |
578 |
attataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattcta |
677 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
45045499 |
attataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca |
45045400 |
T |
 |
| Q |
678 |
aggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacacccttagtttt |
736 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
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aggaatattattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacacatccatagtttt |
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T |
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Q |
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Target: chr7; HSP #3
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T |
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Q |
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676 |
Q |
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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
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Target Start/End: Complemental strand, 27248367 - 27248013
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T |
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Q |
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T |
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676 |
Q |
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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
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Target Start/End: Original strand, 45265049 - 45265399
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Target: chr7; HSP #6
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667 |
Q |
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| T |
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tagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatct |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
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578 |
Q |
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677 |
Q |
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Q |
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Target: chr7; HSP #9
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Q |
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aaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccctta |
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 |
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ttataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
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Target: chr7; HSP #13
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Q |
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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
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Target Start/End: Complemental strand, 48341430 - 48341086
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682 |
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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
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Target Start/End: Original strand, 27419223 - 27419571
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Q |
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| Q |
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578 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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Q |
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Target: chr7; HSP #16
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Q |
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Q |
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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
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Target Start/End: Complemental strand, 25098141 - 25097796
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578 |
Q |
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Q |
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Target: chr7; HSP #18
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Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
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Target Start/End: Original strand, 34930466 - 34930814
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578 |
Q |
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34930566 |
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T |
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678 |
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34930765 |
T |
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| Q |
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Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 380 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 40212960 - 40212656
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ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctat |
579 |
Q |
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ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttctcatggagatgggaataaattcataaatagtttatctat |
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T |
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Q |
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T |
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40212660 |
gaata |
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Target: chr7; HSP #21
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Query Start/End: Original strand, 384 - 728
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 384 - 729
Target Start/End: Original strand, 38396370 - 38396714
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T |
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Target: chr7; HSP #23
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Q |
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T |
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Q |
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Target: chr7; HSP #25
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T |
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| Q |
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Q |
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T |
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| Q |
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T |
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T |
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| Q |
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T |
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577 |
Q |
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|
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T |
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T |
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T |
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Q |
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T |
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Q |
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| |
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 |
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| |
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T |
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Q |
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Target: chr7; HSP #30
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T |
 |
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581 |
Q |
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 |
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Target: chr7; HSP #31
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Q |
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 |
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attataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattcta |
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Q |
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Target: chr7; HSP #33
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atatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccct |
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45722881 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 383 - 728
Target Start/End: Original strand, 6656476 - 6656819
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482 |
Q |
| |
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| T |
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6656573 |
T |
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582 |
Q |
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T |
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583 |
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682 |
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| T |
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6656772 |
T |
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| Q |
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728 |
Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 377 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 11000777 - 11000483
Alignment:
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Q |
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T |
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575 |
Q |
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| T |
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T |
 |
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665 |
Q |
| |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 378 - 637
Target Start/End: Original strand, 41684020 - 41684278
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477 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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577 |
Q |
| |
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| T |
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41684218 |
T |
 |
| Q |
578 |
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637 |
Q |
| |
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|
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attataatctctatttttatggttcctataaatattataaaattaaccaaacatattttt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 464 - 733
Target Start/End: Original strand, 31921811 - 31922079
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| Q |
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Q |
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T |
 |
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661 |
Q |
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| T |
31921911 |
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31922007 |
T |
 |
| Q |
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733 |
Q |
| |
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|
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31922008 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 380 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 45440979 - 45440637
Alignment:
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478 |
Q |
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|
| T |
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gggtgtgtttgtttcaagttataattgtagattcttgggaataaaatcataaaaaacatacatgcatatgtttgttacaagtttactaaattttattccc |
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T |
 |
| Q |
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578 |
Q |
| |
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| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| |
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| T |
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gagtataaaatgttcctcggaatataaaaattttcccaaagaaagtagtgggaataaagttctcatggagatgggaaaaaaatcatgtata-attaccta |
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T |
 |
| Q |
579 |
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678 |
Q |
| |
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| T |
45440780 |
ttataatccctagttttaaggttacttggaatattataatgttaatcaaacatcttttt-ttaaatatcttggaataaaatttacatc--tatattctaa |
45440684 |
T |
 |
| Q |
679 |
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726 |
Q |
| |
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| T |
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gaaatgttattactatgaataaatttggtaaac-tgaaacaaacacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 382 - 615
Target Start/End: Original strand, 6656226 - 6656457
Alignment:
| Q |
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481 |
Q |
| |
|
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6656226 |
gtgtgtttgtttcaagttatatttgttgatttttggaaataaaatgatatgaatatatatacctatgtttgttataagtttactaaattt-attttcgag |
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T |
 |
| Q |
482 |
tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctatta |
581 |
Q |
| |
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| T |
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tataaaatatttctggaaatagaaaagttttcccaataaaaagggtggaaataaagtttccatggagatgggaataaaatcataaatag-ttacctatta |
6656423 |
T |
 |
| Q |
582 |
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615 |
Q |
| |
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||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||| |
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| T |
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taatctgtatttttttggttcctaagaatattat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 445 - 737
Target Start/End: Original strand, 40385692 - 40385984
Alignment:
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543 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||||||| |
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| T |
40385692 |
tatgtttgttagaagtttactgaattttattcctgtctataaaatgtttctgggaatagaaaaaatatcccaaaaagaaatggtgggaataaagttccca |
40385791 |
T |
 |
| Q |
544 |
tggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaa |
643 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||| |||| || | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |
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| T |
40385792 |
ttaagatggaaataaactcatgtgtaact-acctattataatccatatttttatggttcttaggaatattataatgttaaccaaatatcttttttttaaa |
40385890 |
T |
 |
| Q |
644 |
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737 |
Q |
| |
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| ||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||| ||| | ||||||| |||| |||| |
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|
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40385891 |
taccttaaaataaaattctcatctttatattccaaaaaatgttattactaagaataaatttgatacacttgaaagagacacacctttagatttt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
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Query Start/End: Original strand, 449 - 722
Target Start/End: Original strand, 22156248 - 22156520
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Q |
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|
||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| || |
|
|
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T |
 |
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646 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| || |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
647 |
cttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaac |
722 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
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22156520 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 449 - 722
Target Start/End: Original strand, 22212163 - 22212435
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547 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| || |
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| T |
22212163 |
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T |
 |
| Q |
548 |
gatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggtttctag-gaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaattt |
646 |
Q |
| |
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|||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| || |
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|
| T |
22212263 |
gatgagaataagttcatatgta-attacatattataatccatatttttatgg-ttctcgtgaatattatactgttaaacaaacat-ttttttctatatac |
22212359 |
T |
 |
| Q |
647 |
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722 |
Q |
| |
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|
|
| T |
22212360 |
cttagaataaaattcttatctttatattccaaaaaatgttattcctaaaaataaatttgataaatttgaaacaaac |
22212435 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 391 - 728
Target Start/End: Original strand, 43445894 - 43446229
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Q |
| |
|
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tttcaagttatatttatagattcttgcgaataaaattataaaaatgtatatgcctatatttgttataagtttactaaattttattctcgaatataaaatg |
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T |
 |
| Q |
491 |
ttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatcccta |
590 |
Q |
| |
|
||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| | || || |||||||||||| | |||| |
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|
| T |
43445994 |
ttcatgagaataaaaaagttttcccaaagaaaatggtgggaataaagttctcatggagatgagaataaaattatgtgta-attacctattatatttccta |
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T |
 |
| Q |
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tttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaatattattc |
690 |
Q |
| |
|
| |||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||| |
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|
| T |
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tctttaatgttctttagaatattataatgttaaccaaacatattttt-ctaaataccttaaaataaaattcctatctttatattccgataaatgttattc |
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T |
 |
| Q |
691 |
ctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccc |
728 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||| || |||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
43446192 |
atagaaatcaatttggtacactttaaacaaacaaaccc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 416 - 729
Target Start/End: Original strand, 5543167 - 5543479
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515 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||| |||||| |
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|
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gggaataaaacgatataaatatacatgtttatgtttgttacaagtttactaaattttattctctcgtataaaactttcttgggaatagaaattttttccc |
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T |
 |
| Q |
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614 |
Q |
| |
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aaagaaaaatagtgggaataaagttcccatgaagatgggaacaaattcatgtgta-attacctattataatccatatttttatggttcccgggaacatta |
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T |
 |
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714 |
Q |
| |
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5543464 |
T |
 |
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aaacaaacacaccct |
729 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
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aaacaaacacaccct |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 437 - 689
Target Start/End: Original strand, 38528764 - 38529012
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|
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 |
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gttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttt |
636 |
Q |
| |
|
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38528862 |
gttctcatgaagatgagaataaatttatgtgta-attgcatattataatccctatttttaaagtttctcagaatattataatgttaaccaaacat-tttt |
38528959 |
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 |
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689 |
Q |
| |
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|
|
| T |
38528960 |
ttttaaataagttgaaataaaatttacatttttatattccaagaaatgttatt |
38529012 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 577 - 732
Target Start/End: Original strand, 17276355 - 17276511
Alignment:
| Q |
577 |
tattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaa-ccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattc |
675 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
17276355 |
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17276454 |
T |
 |
| Q |
676 |
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732 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
17276455 |
caaggaatgttattcctagaaataaattttgtaaaattgaaacaaacacacccttag |
17276511 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 576 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 31598598 - 31598449
Alignment:
| Q |
576 |
ctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattc |
675 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| || | ||| ||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
31598598 |
ctattataaatcctatttttatgattcccaggtatattataatgttaaacaaacatcttttttttaaataccttgaaataaaattcctatctttatattc |
31598499 |
T |
 |
| Q |
676 |
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725 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
31598498 |
caagaaatgttattcccaaaaataaatttggtaaacttaaaacaaacaca |
31598449 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 468 - 633
Target Start/End: Original strand, 43569773 - 43569937
Alignment:
| Q |
468 |
attttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaa |
567 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| | | |||| ||||| || || || |||||||||| |||||| ||| |||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
43569773 |
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43569872 |
T |
 |
| Q |
568 |
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633 |
Q |
| |
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|| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
43569873 |
ta-attatctattataatccctatttttatgatttctaaaaatattataaagttaatcaaacatat |
43569937 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 380 - 617
Target Start/End: Original strand, 47246064 - 47246300
Alignment:
| Q |
380 |
gggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgata--ggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc |
477 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
47246064 |
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47246163 |
T |
 |
| Q |
478 |
cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacct |
577 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||| | ||||| | || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| || || || |
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| T |
47246164 |
caggtataaaatgttcttaggaattg-aattttttttaaaagaaaagggtgagaataaagttcccatgaatatgagaataaattcatgtgtaaactatct |
47246262 |
T |
 |
| Q |
578 |
attataatccctatttttatggtttctaggaatattataa |
617 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |
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|
| T |
47246263 |
attataatccctatttttaagg--tctaggagtattataa |
47246300 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 375 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 45723283 - 45723211
Alignment:
| Q |
375 |
tcttagggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctat |
447 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
45723283 |
tcttacggtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattcccgagaataaaatgataggaatatatatgcctat |
45723211 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 419 - 509
Target Start/End: Original strand, 10902689 - 10902779
Alignment:
| Q |
419 |
aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaa |
509 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
10902689 |
aataaaatgatagaaatatacatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttatttttggatataaaatgtttttgggaatagaaaaaa |
10902779 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 31598742 - 31598623
Alignment:
| Q |
386 |
gtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtata |
485 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| | | |||||| | ||||||| ||||| ||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
31598742 |
gtttgtttcaagttatattcatagattcctgaaaataaaacgatagaaatacaaatgcttatatttgttacaagtttactaaattttattacaaggtata |
31598643 |
T |
 |
| Q |
486 |
aaatgttcctgggaatagaaa |
506 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
31598642 |
aaacgttcct-ggaatagaaa |
31598623 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 732
Target Start/End: Original strand, 16916182 - 16916237
Alignment:
| Q |
677 |
aaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacacccttag |
732 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16916182 |
aaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttag |
16916237 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 418 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 30871221 - 30871130
Alignment:
| Q |
418 |
gaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaa |
509 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
30871221 |
gaataaaatgatagaaatatacatttttatgtttgttacaagtttattaagttttattttcggatatcaaatgtttgtgggaatagaaaaaa |
30871130 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 667 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 24769298 - 24769241
Alignment:
| Q |
667 |
tttatattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacac |
724 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24769298 |
tttatattttaaaaaatattattcttaaaaataaatttgataaatttcaaacaaacac |
24769241 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 417 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 20601355 - 20601297
Alignment:
| Q |
417 |
ggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt |
475 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || | |||||||||| || |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
20601355 |
ggaataaaatgataggaatgtacattctaatgtttgttataaatttattaaattttatt |
20601297 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 222
Target Start/End: Original strand, 26863023 - 26863080
Alignment:
| Q |
165 |
ttaaaaagagtgtgttgaaaagtgtggattaaaatttgtgttgatagcatttctcttc |
222 |
Q |
| |
|
||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
26863023 |
ttaaagagagtttgatgaaaagtgtgtattaaaatgtgtgttgctagcattcctcttc |
26863080 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 376 - 738
Target Start/End: Original strand, 11239116 - 11239478
Alignment:
| Q |
376 |
cttagggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt |
475 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
11239116 |
cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttatt |
11239215 |
T |
 |
| Q |
476 |
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575 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11239216 |
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11239315 |
T |
 |
| Q |
576 |
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675 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
11239316 |
ctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattc |
11239415 |
T |
 |
| Q |
676 |
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738 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11239416 |
caaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagtttttt |
11239478 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 379 - 729
Target Start/End: Original strand, 8476307 - 8476657
Alignment:
| Q |
379 |
agggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc |
478 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8476307 |
agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctgtgtttgttacaagtttactaaattttattccc |
8476406 |
T |
 |
| Q |
479 |
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578 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
8476407 |
gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta |
8476506 |
T |
 |
| Q |
579 |
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678 |
Q |
| |
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|
|
| T |
8476507 |
ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaatttccatctttatattccaa |
8476606 |
T |
 |
| Q |
679 |
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729 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
8476607 |
ggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct |
8476657 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 375 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 40908341 - 40907986
Alignment:
| Q |
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tcttagggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttat |
474 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40908341 |
tcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttat |
40908242 |
T |
 |
| Q |
475 |
tcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagttta |
574 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
40908241 |
tcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaataattta |
40908142 |
T |
 |
| Q |
575 |
cctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatatt |
674 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40908141 |
cctattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatatt |
40908043 |
T |
 |
| Q |
675 |
ctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccctta |
731 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40908042 |
tcaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta |
40907986 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 379 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 26849094 - 26848744
Alignment:
| Q |
379 |
agggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc |
478 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26849094 |
agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc |
26848995 |
T |
 |
| Q |
479 |
gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta |
578 |
Q |
| |
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|
| T |
26848994 |
gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcctaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggaaatgggaataaattcataaatagtttaccta |
26848895 |
T |
 |
| Q |
579 |
ttataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaa |
678 |
Q |
| |
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| T |
26848894 |
ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaa |
26848795 |
T |
 |
| Q |
679 |
ggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccct |
729 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |
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|
| T |
26848794 |
ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct |
26848744 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 376 - 731
Target Start/End: Original strand, 48339753 - 48340108
Alignment:
| Q |
376 |
cttagggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt |
475 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
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48339852 |
T |
 |
| Q |
476 |
cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttac |
575 |
Q |
| |
|
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|
| T |
48339853 |
ccttggtataaaatgttcatgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttac |
48339952 |
T |
 |
| Q |
576 |
ctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattc |
675 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
48339953 |
ctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattc |
48340052 |
T |
 |
| Q |
676 |
taaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccctta |
731 |
Q |
| |
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|
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
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Target Start/End: Original strand, 6231501 - 6231850
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Q |
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T |
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579 |
Q |
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T |
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679 |
Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
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Target Start/End: Original strand, 47114857 - 47115202
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T |
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| Q |
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579 |
Q |
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T |
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580 |
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679 |
Q |
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T |
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Q |
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Target: chr3; HSP #8
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T |
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576 |
Q |
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20297668 |
T |
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676 |
Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
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Target Start/End: Original strand, 33217917 - 33218262
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T |
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Q |
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T |
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Q |
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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
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Target Start/End: Complemental strand, 44952381 - 44952030
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T |
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cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacct |
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Q |
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ttggtataaaatgtttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacct |
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T |
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676 |
Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
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Target Start/End: Complemental strand, 1099267 - 1098923
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581 |
Q |
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T |
 |
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681 |
Q |
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T |
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Q |
| |
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atgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc |
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Target: chr3; HSP #12
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579 |
Q |
| |
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T |
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T |
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| Q |
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Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
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Target Start/End: Original strand, 28124436 - 28124779
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|||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
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T |
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ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctat |
579 |
Q |
| |
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T |
 |
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679 |
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28124636 |
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28124735 |
T |
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| Q |
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723 |
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gaatgttaatcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaaca |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 399 - 725
Target Start/End: Original strand, 31611004 - 31611330
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Q |
| |
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Target: chr3; HSP #15
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gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta |
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| |
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ttataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaa |
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ggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacacc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
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Query Start/End: Original strand, 401 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 46360002 - 46359673
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Q |
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T |
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Target: chr3; HSP #17
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T |
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570 |
Q |
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670 |
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729 |
Q |
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T |
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Target: chr3; HSP #18
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T |
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Q |
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694 |
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T |
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Q |
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Target: chr3; HSP #19
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T |
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Q |
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576 |
Q |
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676 |
Q |
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T |
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T |
 |
| Q |
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576 |
Q |
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T |
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676 |
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T |
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| Q |
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Q |
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Target: chr3; HSP #22
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Target Start/End: Complemental strand, 29512546 - 29512324
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Q |
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| |
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T |
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Q |
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T |
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| Q |
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Q |
| |
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Q |
| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
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Query Start/End: Original strand, 419 - 727
Target Start/End: Original strand, 26849194 - 26849492
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Q |
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|
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|
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T |
 |
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gaaaag-ggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataa |
617 |
Q |
| |
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T |
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acctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaa |
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Q |
| |
|
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Target: chr3; HSP #26
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| |
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T |
 |
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gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta |
578 |
Q |
| |
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| T |
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gggtataaaacgttcctagcaatagaaaaattttcccaaagaaaatggtgggaataaagttctcatgaagatgggaatgatttcatatgta-attaccta |
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T |
 |
| Q |
579 |
ttataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaa |
678 |
Q |
| |
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| T |
28770408 |
ttataatccctatttttatggttcccgataatattataacgttaaacaaacatcatttttctatataccttggaataaaattctcatcattatgttccaa |
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T |
 |
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ggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccc |
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Q |
| |
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||||| ||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||| |
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28770508 |
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Query Start/End: Original strand, 465 - 657
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565 |
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657 |
Q |
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19533030 |
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19532939 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 399 - 706
Target Start/End: Original strand, 1246921 - 1247225
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498 |
Q |
| |
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|
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| T |
1246921 |
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1247020 |
T |
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499 |
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598 |
Q |
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| T |
1247021 |
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1247117 |
T |
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| Q |
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698 |
Q |
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| T |
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1247217 |
T |
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| Q |
699 |
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706 |
Q |
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| T |
1247218 |
aaatttga |
1247225 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 416 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 27823309 - 27822994
Alignment:
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515 |
Q |
| |
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| T |
27823309 |
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27823210 |
T |
 |
| Q |
516 |
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615 |
Q |
| |
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| T |
27823209 |
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27823111 |
T |
 |
| Q |
616 |
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711 |
Q |
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| T |
27823110 |
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27823011 |
T |
 |
| Q |
712 |
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728 |
Q |
| |
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| T |
27823010 |
ttgaaacaaacacaccc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 382 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 40584669 - 40584336
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481 |
Q |
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| T |
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gtgtatttgttttaagttatatttgtagattcctgagaataaaatcataaaaatgcatatgtctatgttttctacaagtttattaaattttattttcgga |
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T |
 |
| Q |
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581 |
Q |
| |
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| T |
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40584481 |
T |
 |
| Q |
582 |
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681 |
Q |
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| T |
40584480 |
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40584381 |
T |
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| Q |
682 |
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726 |
Q |
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| T |
40584380 |
atgttattcttaggaataaatttgttacacttgaaacaaacacac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 383 - 559
Target Start/End: Original strand, 12930945 - 12931119
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482 |
Q |
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| T |
12930945 |
tgtgtttgtttcaagttata-ttgtagattgttgggaataaaatcataaaaatgcatatggctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg-t |
12931042 |
T |
 |
| Q |
483 |
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559 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |
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|
| T |
12931043 |
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12931119 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 369 - 563
Target Start/End: Original strand, 33647692 - 33647886
Alignment:
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468 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||| |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| | ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
33647692 |
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33647791 |
T |
 |
| Q |
469 |
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563 |
Q |
| |
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||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |
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| T |
33647792 |
ttttattcctgggtataaaacgtttctgagaatataaaaaaatttccaaagaaaagagtggaaataaagtttccttgaagatgagaataaattca |
33647886 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 377 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 18461015 - 18460827
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| Q |
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474 |
Q |
| |
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| T |
18461015 |
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18460916 |
T |
 |
| Q |
475 |
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563 |
Q |
| |
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|
|
| T |
18460915 |
tctttggtataaaatgtttctgggaatagaaaaattttcccaaagaaaatggtggaaataaagttctcttggagatgaaaataaattca |
18460827 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 379 - 674
Target Start/End: Original strand, 2565459 - 2565744
Alignment:
| Q |
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478 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||| || |
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| T |
2565459 |
agggtgtgttcgttttaagttatatttgttgattcttaggaataaaataatagaaatatatatacctgtgtttgttacaagtttgttaaattt-atttcc |
2565557 |
T |
 |
| Q |
479 |
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576 |
Q |
| |
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| T |
2565558 |
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2565657 |
T |
 |
| Q |
577 |
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674 |
Q |
| |
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|
| T |
2565658 |
tattataa----------tatggttcatatgaatattataaagttaactaaacatattttt-ttaaataccttgaaataaaattctcatctttgtatt |
2565744 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 381 - 722
Target Start/End: Original strand, 38140365 - 38140710
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381 |
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476 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |||| ||||| | ||||||||||||| || ||||| | | |||||||||| |||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
38140365 |
ggtgtgtttattttaagttatatttgtagattcatgagaataaaatgatatatatatatatatatgtcaatgtttgttataagtttactataatttattg |
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T |
 |
| Q |
477 |
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574 |
Q |
| |
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| T |
38140465 |
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38140562 |
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 |
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575 |
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674 |
Q |
| |
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| T |
38140563 |
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38140662 |
T |
 |
| Q |
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722 |
Q |
| |
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| T |
38140663 |
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38140710 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 419 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 32071472 - 32071256
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518 |
Q |
| |
|
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| T |
32071472 |
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T |
 |
| Q |
519 |
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618 |
Q |
| |
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| T |
32071377 |
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32071280 |
T |
 |
| Q |
619 |
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Q |
| |
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| T |
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gttaaccaaacatattttttctaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 372 - 726
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471 |
Q |
| |
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|||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
472 |
tattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagt |
571 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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ttacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacct-aaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatcttta |
670 |
Q |
| |
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| T |
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t-acctattataatctttatttttaaggttccttggaatattctaaagtttaaccaaacatattttttttaaataccttagaataaaattctcatcttta |
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T |
 |
| Q |
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tattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacac |
726 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||| |
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|
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tattccaaggaatgttattcttatgaataaatttggtaaacttgaaacaaacacac |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 504 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 49216246 - 49216027
Alignment:
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| |
|
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703 |
Q |
| |
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T |
 |
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Q |
| |
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|| |||||| |||||||||| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 572 - 734
Target Start/End: Original strand, 6832114 - 6832276
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| |
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 |
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attctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacacccttagtt |
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| |
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Target: chr3; HSP #40
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Query Start/End: Original strand, 379 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 45826848 - 45826687
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| |
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 |
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gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcc |
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45826749 |
tgatataaaatgttcctgggaatagaagaacattcacaaagaaaaggatgggaaaaaagttcc |
45826687 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 422 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 27094044 - 27093769
Alignment:
| Q |
422 |
aaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaa |
521 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
27094044 |
aaaatgattgaaatatatatgcctatgtttgttataagtttactatatcttattctcgggtataaaatgtttatgggaatagaaaaaaaaatccagagaa |
27093945 |
T |
 |
| Q |
522 |
aa-gggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacc |
620 |
Q |
| |
|
|| || || |||||||||| | || |||| ||||||||||| | || || ||| |||||||||| ||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
27093944 |
aatggttgaaaataaagtt-tcttgtagattggaataaattcgt-----gtgtaacta--------cctatttttaatgttccttggaatattatattgt |
27093859 |
T |
 |
| Q |
621 |
taaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaac |
711 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
27093858 |
taatcaaacatcttttt-cttaataccttgaaataaaattcacatctttatattctaaggaatattatttttaagaataaatttgataaac |
27093769 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 573 - 727
Target Start/End: Original strand, 31267540 - 31267694
Alignment:
| Q |
573 |
tacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttata |
672 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||||| | || |||||| ||||| |||||| ||| |||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
31267540 |
tacctattataatccttatttttaaagtttatggaaatattataatgttgactaaacatcttttttctaaataccttaaaatgaaattcacatctttata |
31267639 |
T |
 |
| Q |
673 |
ttctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacacc |
727 |
Q |
| |
|
|| |||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31267640 |
ttttaagaaatgttattcctaaaaataaatccgataaacttaaaacaaacacacc |
31267694 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 652 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 6927890 - 6927817
Alignment:
| Q |
652 |
aataaaattcccatctttatattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacaca |
725 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
6927890 |
aataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctagtaataaatttgataaacttaaaacaaacaca |
6927817 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 376 - 733
Target Start/End: Original strand, 28693422 - 28693784
Alignment:
| Q |
376 |
cttagggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt |
475 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |||||||||||| | | |||||||| |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
28693422 |
cttagagtgtgtttgtttcaagttatattcatagattcccgagaataaaaaaataaaaatatgtatgcttatgtttgttataagtcaattaaattttatt |
28693521 |
T |
 |
| Q |
476 |
cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccc-----aaagaaaagggt--ggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaat |
568 |
Q |
| |
|
| | |||||||| | ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| || |||||||||| |||| ||||| |||| | |||||| | |
|
|
| T |
28693522 |
catgagtataaaacgatcctgagaatagaaaaattttctcaaagaaaagaaaagggtgggggaataaagttctcatgaagatgagaat-atttcatatgt |
28693620 |
T |
 |
| Q |
569 |
agtttacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctt |
668 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||| ||||| ||| | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
28693621 |
ag-ttgtctattataatttttatttttatggtttccggaaatattataatgttaaataaacatcttttttctataaaccttgaaataaaattctcatctt |
28693719 |
T |
 |
| Q |
669 |
tatattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacacccttagt |
733 |
Q |
| |
|
| || |||||| |||||| ||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28693720 |
aaagtttcaaggaaaattatttctaggaataaatttagtaaatttgaaacaaacacacccttagt |
28693784 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 375 - 442
Target Start/End: Original strand, 43715303 - 43715370
Alignment:
| Q |
375 |
tcttagggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatg |
442 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
43715303 |
tcttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgaaaataaaatgatagaaatgtatatg |
43715370 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 552 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 18460750 - 18460582
Alignment:
| Q |
552 |
ggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttga |
651 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| |||| |
|
|
| T |
18460750 |
ggaataaattcatatgtagtt-accgattataatccctgtttttatggtt-ctatgaatattataaagttaaccaaatatatttcttttaaataccttgt |
18460653 |
T |
 |
| Q |
652 |
aataaaattcccatctttatattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaac |
722 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
18460652 |
aatcaaattctcatctttatatttcgaaaaatgttattcgtagaaataaatttgataaacttgaaacaaac |
18460582 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 438 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 29512705 - 29512631
Alignment:
| Q |
438 |
atatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaattt |
512 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
29512705 |
atatgcctacgtttgtttcaagtttactaaattttattcctgagtataaaatgttcatcggaatagaaaaaattt |
29512631 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 377 - 504
Target Start/End: Original strand, 6831954 - 6832079
Alignment:
| Q |
377 |
ttagggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc |
476 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||| || |||||||| | | || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6831954 |
ttagggtgtgtttgtttcaacttatatttgtagattcctggaaataaaatcacaaaaaac-acatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttatt- |
6832051 |
T |
 |
| Q |
477 |
ccgggtataaaatgttcctgggaataga |
504 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
6832052 |
ccaggtataaaatattcctgggaataga |
6832079 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 377 - 506
Target Start/End: Original strand, 28139717 - 28139846
Alignment:
| Q |
377 |
ttagggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc |
476 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||||| | || |||| ||||||||| ||||| ||| || |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
28139717 |
ttagggtgcgtttgtttcaagttatattcgtatattcttaggaataaaaagatagaaatatacatgcttatgtttgttacaagattagtaaattttattt |
28139816 |
T |
 |
| Q |
477 |
ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaa |
506 |
Q |
| |
|
||| ||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
28139817 |
tcggatataaaacgttcttgggaatagaaa |
28139846 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 486
Target Start/End: Original strand, 39932559 - 39932631
Alignment:
| Q |
416 |
gggaataaaatgataggaatgtatat--gcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa |
486 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39932559 |
gggaataaaatgatagaaatgtatatatgtttatgtttgttataagtttactaaattttattcccggatataa |
39932631 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 378 - 476
Target Start/End: Original strand, 55435390 - 55435488
Alignment:
| Q |
378 |
tagggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc |
476 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
55435390 |
tagggtgtatttgtttcaagttatttttgtagatacctgggaataaaatgataggaatatgcattctcatgtttgttacaagtttgttaaattttattc |
55435488 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 419 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 33497889 - 33497768
Alignment:
| Q |
419 |
aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaat-agaaaaaatttcccaa |
517 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| || |||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||| || || ||||||||| || |||| | |||||| ||| || |
|
|
| T |
33497889 |
aataaaatgatagaaatatacatgcttatatttgttacaaatttattaaattttattctaggatacaaaatgttcatgagaataaaaaaaaaaatcctaa |
33497790 |
T |
 |
| Q |
518 |
agaaaagggtggaaataaagtt |
539 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
33497789 |
agaaaagggtgagaataaagtt |
33497768 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 647 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 32071074 - 32070994
Alignment:
| Q |
647 |
cttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacacc |
727 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||||| || |||||||| |||| |
|
|
| T |
32071074 |
cttggaataaaattctcatctttatattccaagaaatgttattcataggaataaatttgataaatttaaaacaaacccacc |
32070994 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 446
Target Start/End: Original strand, 9320405 - 9320446
Alignment:
| Q |
405 |
tgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgccta |
446 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
9320405 |
tgttgattctcgggaataaaatgataggaatgtatataccta |
9320446 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 438 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 13643083 - 13642886
Alignment:
| Q |
438 |
atatgcctatgtttgttacaagtttac-taaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaa |
536 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||| || ||| |||| ||| | |||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| |||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
13643083 |
atatgtctatgtttgttacaagttaacctaatttttgttcttgattataaaatgttcttaggaatagaaaagtttttccaaaaaaaatggtgg-aataaa |
13642985 |
T |
 |
| Q |
537 |
gttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttt |
636 |
Q |
| |
|
||| ||||| | ||| ||||||| | || | ||||||||||||||| |||||| || |||| || |||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13642984 |
gtttccatgaaaatgagaataaaattatgtgga-attacctattataatctctatttgtaaggttcct-tgaatattataaagttaaccaaacagatttt |
13642887 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 723
Target Start/End: Original strand, 33650217 - 33650357
Alignment:
| Q |
583 |
aatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaa |
682 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| | ||| ||| |||||||||| |||||||| ||| || || |
|
|
| T |
33650217 |
aatctctatttttatggtttccgagaatattataatgttaagcaaacatttttttattcaataccttagaataaaattctcatctttagatttcaaataa |
33650316 |
T |
 |
| Q |
683 |
tattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaaca |
723 |
Q |
| |
|
| |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
33650317 |
tgttattcataaaaataaatttggtaaacttgaaacaaaca |
33650357 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 572 - 617
Target Start/End: Original strand, 21925641 - 21925686
Alignment:
| Q |
572 |
ttacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataa |
617 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
21925641 |
ttacatattataatccctatttttatggtttttgagaatattataa |
21925686 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 77)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 380 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 14788795 - 14788439
Alignment:
| Q |
380 |
gggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg |
479 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
14788795 |
gggtgtgtttgtttcaagttataatttttgattcccgggaataaaataataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattatattcccg |
14788696 |
T |
 |
| Q |
480 |
ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctat |
579 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14788695 |
ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctat |
14788596 |
T |
 |
| Q |
580 |
tataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaag |
679 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
14788595 |
tataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatattttgcctaaattccttgaaataaaattcccatctttatattccaag |
14788496 |
T |
 |
| Q |
680 |
gaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacacccttagtttt |
736 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
14788495 |
gaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttaaaacaaacacacccttaatttt |
14788439 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 380 - 728
Target Start/End: Original strand, 20260086 - 20260434
Alignment:
| Q |
380 |
gggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg |
479 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20260086 |
gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcctgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg |
20260185 |
T |
 |
| Q |
480 |
ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctat |
579 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20260186 |
ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctat |
20260285 |
T |
 |
| Q |
580 |
tataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaag |
679 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
20260286 |
tataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaagcaaacatatttttcctaaatttcttggaataaaattcccatctttatattccaag |
20260385 |
T |
 |
| Q |
680 |
gaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccc |
728 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20260386 |
gaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc |
20260434 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 379 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 46666781 - 46666431
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478 |
Q |
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T |
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| Q |
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578 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
579 |
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678 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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729 |
Q |
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46666481 |
ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 381 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 25789834 - 25789482
Alignment:
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Q |
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T |
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| Q |
481 |
gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctatt |
580 |
Q |
| |
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| T |
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gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctatt |
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T |
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| Q |
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680 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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733 |
Q |
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25789534 |
aatgttattcctagaaataaatttgataaacttgaaacaaacacacccatagt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 375 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 52630850 - 52630494
Alignment:
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Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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tcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagttta |
574 |
Q |
| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
575 |
cctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatatt |
674 |
Q |
| |
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| T |
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52630551 |
T |
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| Q |
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Q |
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52630550 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 378 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 9115911 - 9115561
Alignment:
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T |
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| Q |
478 |
cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacct |
577 |
Q |
| |
|
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| T |
9115811 |
ttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacct |
9115712 |
T |
 |
| Q |
578 |
attataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattcta |
677 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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aggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccc |
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Q |
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9115611 |
aggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 379 - 731
Target Start/End: Original strand, 12190176 - 12190528
Alignment:
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gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta |
578 |
Q |
| |
|
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T |
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| Q |
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678 |
Q |
| |
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T |
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| Q |
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Q |
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12190476 |
ggaatgttattcttaggaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccctta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 377 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 8332089 - 8331734
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T |
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| Q |
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576 |
Q |
| |
|
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|
|
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T |
 |
| Q |
577 |
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676 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
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aaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacacccttag |
732 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 377 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 2430571 - 2430223
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T |
 |
| Q |
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ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc |
576 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
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ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataatttact |
2430372 |
T |
 |
| Q |
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tattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattct |
676 |
Q |
| |
|
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| T |
2430371 |
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T |
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| Q |
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Q |
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|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 375 - 727
Target Start/End: Original strand, 1597337 - 1597689
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tcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagttta |
574 |
Q |
| |
|
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|
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T |
 |
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674 |
Q |
| |
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1597636 |
T |
 |
| Q |
675 |
ctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacacc |
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Q |
| |
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1597637 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 382 - 726
Target Start/End: Original strand, 9831872 - 9832216
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tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctatta |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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tataaaatgttcctgggaatagaaaaattttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctatta |
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 |
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taatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaagga |
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Q |
| |
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atattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacac |
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Q |
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atgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacacac |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
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Query Start/End: Original strand, 383 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 36361851 - 36361506
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 |
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tattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccct |
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| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 382 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 32824992 - 32824644
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Q |
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T |
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T |
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Q |
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T |
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T |
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579 |
Q |
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T |
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679 |
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Target: chr1; HSP #15
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578 |
Q |
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T |
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Q |
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Target: chr1; HSP #16
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T |
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Q |
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T |
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Q |
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Q |
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Q |
| |
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Q |
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Q |
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Target: chr1; HSP #21
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ataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattat |
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T |
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Q |
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gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta |
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 |
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ttataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaa |
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ggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacacccttagtt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 379 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 35187529 - 35187181
Alignment:
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Q |
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agggtgtgtttttttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgtttatgtttgttacaagtttactaaaatttattcct |
35187430 |
T |
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479 |
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578 |
Q |
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| T |
35187429 |
tggtataaaatgttcgtgggaatagaaaaaatttcccaaggagaagggtgggaataaagttcccatggagataagaataagttcataaatagtttaccta |
35187330 |
T |
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| Q |
579 |
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678 |
Q |
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| T |
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35187230 |
T |
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| Q |
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726 |
Q |
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35187229 |
gaaatattattcctaagaataaatttggtaaactttgaaacaaacacac |
35187181 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 377 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 39329683 - 39329410
Alignment:
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T |
 |
| Q |
477 |
ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc |
576 |
Q |
| |
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| T |
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ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccatgaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc |
39329484 |
T |
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577 |
tattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttg |
650 |
Q |
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39329410 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 379 - 729
Target Start/End: Original strand, 5806290 - 5806625
Alignment:
| Q |
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478 |
Q |
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T |
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| Q |
479 |
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578 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
579 |
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678 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
679 |
ggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccct |
729 |
Q |
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| T |
5806575 |
ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 377 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 6978845 - 6978550
Alignment:
| Q |
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476 |
Q |
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T |
 |
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477 |
ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc |
576 |
Q |
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| T |
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T |
 |
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672 |
Q |
| |
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tattataatccctaattttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaatttcttggaataaaattctcatctttata |
6978550 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 379 - 727
Target Start/End: Original strand, 32202330 - 32202660
Alignment:
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478 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta |
578 |
Q |
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| T |
32202412 |
tggtataaaatgtttatgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta |
32202511 |
T |
 |
| Q |
579 |
ttataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaa |
678 |
Q |
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| T |
32202512 |
ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaatttcttggaataaaattctcatctttatattccaa |
32202611 |
T |
 |
| Q |
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727 |
Q |
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| T |
32202612 |
ggaatgttattcctaaaaataaatttgataaacttgaaacaaacacacc |
32202660 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 386 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 13653917 - 13653581
Alignment:
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Q |
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|
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T |
 |
| Q |
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585 |
Q |
| |
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| T |
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aaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcatatgtag-ttacctattataat |
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T |
 |
| Q |
586 |
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684 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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722 |
Q |
| |
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| T |
13653618 |
ttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 391 - 727
Target Start/End: Original strand, 37436632 - 37436966
Alignment:
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Q |
| |
|
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|
|
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T |
 |
| Q |
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ttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatcccta |
590 |
Q |
| |
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|
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| T |
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T |
 |
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690 |
Q |
| |
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| T |
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37436929 |
T |
 |
| Q |
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727 |
Q |
| |
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||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
37436930 |
ttaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 379 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 29091739 - 29091395
Alignment:
| Q |
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478 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
29091739 |
agggtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattcctgataataaaatgataaaaatatatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattctc |
29091640 |
T |
 |
| Q |
479 |
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578 |
Q |
| |
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| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||||| |
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| T |
29091639 |
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29091546 |
T |
 |
| Q |
579 |
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678 |
Q |
| |
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| T |
29091545 |
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29091446 |
T |
 |
| Q |
679 |
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729 |
Q |
| |
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||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
29091445 |
ggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 375 - 713
Target Start/End: Original strand, 52699461 - 52699798
Alignment:
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474 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
52699461 |
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T |
 |
| Q |
475 |
tcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagttta |
574 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
52699561 |
tcccgggtataaaacgttcctgggaatagaacatttttcccaaagaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcatgagtaattt- |
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T |
 |
| Q |
575 |
cctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatatt |
674 |
Q |
| |
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| T |
52699660 |
cctattataattcctattttcatggttcccaggaatattataatgttaagcaaacttattttttctaaataccttggaataaaattctcatctttatatt |
52699759 |
T |
 |
| Q |
675 |
ctaaggaatattattcctaataataaatttgataaactt |
713 |
Q |
| |
|
| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |
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|
| T |
52699760 |
ccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaactt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 379 - 683
Target Start/End: Original strand, 49822916 - 49823199
Alignment:
| Q |
379 |
agggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc |
478 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49822916 |
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T |
 |
| Q |
479 |
gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta |
578 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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---------------ctgagaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgataataaattcataaataatttaccta |
49823094 |
T |
 |
| Q |
579 |
ttataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaa |
678 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaacctaaccaaacatattttttctaaattccatggaataaaattcccatctttatattccaa |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 379 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 47037530 - 47037324
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Q |
| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
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gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta |
578 |
Q |
| |
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|
|
| T |
47037430 |
tggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta |
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T |
 |
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579 |
ttataat |
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Q |
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| T |
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ttataat |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 381 - 729
Target Start/End: Original strand, 24116338 - 24116683
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| |
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T |
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T |
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729 |
Q |
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24116635 |
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T |
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Target: chr1; HSP #36
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T |
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729 |
Q |
| |
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47031658 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 433 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 46960646 - 46960349
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Q |
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T |
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631 |
Q |
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T |
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Q |
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T |
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Target: chr1; HSP #38
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T |
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577 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
578 |
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677 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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728 |
Q |
| |
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Target: chr1; HSP #39
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T |
 |
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585 |
Q |
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| T |
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T |
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Target: chr1; HSP #40
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Target Start/End: Original strand, 1227936 - 1228225
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T |
 |
| Q |
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637 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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726 |
Q |
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1228135 |
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T |
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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 383 - 726
Target Start/End: Original strand, 31806759 - 31807093
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Q |
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T |
 |
| Q |
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582 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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682 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
683 |
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726 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||||||| ||||| ||| |||||||| |
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|
| T |
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tattattcttagaaataaatttgatcaacttgaaataaacacac |
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Target: chr1; HSP #42
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Q |
| |
|
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38519064 |
gtgtgtttgtttcaagttatatttgtagatttttggaaataaatcaatagaaatacagatgcttatgtttgttacaagtttactaaattttattcccagg |
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T |
 |
| Q |
482 |
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580 |
Q |
| |
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| T |
38519164 |
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38519260 |
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 |
| Q |
581 |
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680 |
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| |
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| T |
38519261 |
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38519360 |
T |
 |
| Q |
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725 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
38519361 |
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Target: chr1; HSP #43
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T |
 |
| Q |
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Q |
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| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |
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gatataaaatgttcctgggaatagaaaaattttaccaagaaaaagggtg |
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Target: chr1; HSP #44
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| |
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|
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tttcaagttatatatgtagattcctgggaataaaatgatagaaatatacatgtctatgtttgttacaagtttaataaattatattcacggatataaaatg |
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T |
 |
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Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
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Q |
| |
|
|||| |||||||||||| | || ||||| | ||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |
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|
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gtttgtttcaagttatattcgtagattcttgaaaataaaatgataggaatatacatgtctatgtttattacaagtttactaaattttattttc-ggtata |
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T |
 |
| Q |
486 |
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584 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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tccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaaca---tatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaagga |
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Q |
| |
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| | || ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||| | ||||| |||||| || || |||||| ||||||||| ||| |||| |
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T |
 |
| Q |
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Q |
| |
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||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
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atattattcctaaaaataaatttgataaacttaaaacaaacacaccct |
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| |
|
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 |
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aacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaa |
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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Q |
| |
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acaaatacac |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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|
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677 |
Q |
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| T |
13521197 |
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13521099 |
T |
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| Q |
678 |
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723 |
Q |
| |
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| T |
13521098 |
gtgaatgttatttttaagaataaatttggtaaacttaaatcaaaca |
13521053 |
T |
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Target: chr1; HSP #48
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Q |
| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
481 |
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580 |
Q |
| |
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13931985 |
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T |
 |
| Q |
581 |
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678 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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726 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |
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13932171 |
tgaatgttattccttgaaataaatttgataaacttgaaacaaacacac |
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T |
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Target: chr1; HSP #49
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Q |
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19083203 |
T |
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560 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||| |||||||| |
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|
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T |
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Target: chr1; HSP #50
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478 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||| | || |||| ||||||| |||||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |
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|
| T |
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agggtgtgtttgtttcaaattatattcgtagatttttgggaatacaatgatagaaatatacatgtctatgtttgttataagtttactaaattttattcac |
19131091 |
T |
 |
| Q |
479 |
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560 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||| |||||||| |
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|
| T |
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gagtataaaatgttcctggaaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagtttccaggcatatgagaataaat |
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T |
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Target Start/End: Original strand, 17475360 - 17475502
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
519 |
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561 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||||||| || ||||||||| |||||| |
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gaaaagagtgggaataaagttccaatagagatgggagtaaatt |
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T |
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Target: chr1; HSP #52
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Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||| || ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||| | | |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
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614 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||||||||| |
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|
| T |
13440331 |
caaagaaaagggtggaaataaagtttccatgaagatgagaataaattcatatgta-actacctattataatccatattcttaaagttccatggaatatta |
13440233 |
T |
 |
| Q |
615 |
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661 |
Q |
| |
|
||| | ||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |
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| T |
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taatgttcaccgaacaccttttttctaaatatcttgaaataaaattc |
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Q |
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T |
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ataaacttcaaacaaacacaccctt |
730 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |
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ataaacttgaaacaaacacaccctt |
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T |
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Q |
| |
|
|||| |||| ||| || ||||| |||| |||| | | |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
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|
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T |
 |
| Q |
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577 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| | |||||| || |||||||||| |||| |||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| || ||| | |
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| T |
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T |
 |
| Q |
578 |
attataatccctatttttatggtt |
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Q |
| |
|
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|
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20505189 |
attataatccctatttttatggtt |
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T |
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Q |
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|
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T |
 |
| Q |
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taaatagtttacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattccc |
663 |
Q |
| |
|
|| || ||| ||||||||||||| |||||||| | || || |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||| | |
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|
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3939290 |
T |
 |
| Q |
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atctttatattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccc |
728 |
Q |
| |
|
| ||||||||| || |||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
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T |
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Target: chr1; HSP #56
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Q |
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|
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atatgtctatgtttgttacaaaattactaaattttattctttgacataaaatgttcctggcaatagaacaattttcctaaagaaaaagggtgggaataaa |
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T |
 |
| Q |
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gttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttt |
636 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||| || |||| || | |||||||||| |||| |||||| |||| |
|
|
| T |
29769426 |
gtttccatgaagatgaaaataaattcatgtgta-attacctattataatctatgtttctaaggttccttgaaatattataatgttaactaaacatttttt |
29769328 |
T |
 |
| Q |
637 |
---tcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaa---tattattc--ctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacac |
726 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
29769327 |
ttcttctaaatatcttgaaataaaattcacatctttatattccaaagaatgttattattcatataagaataaatttagtaaacttaaaacaaacacac |
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T |
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Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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tgtgtttgtttcaagttatatttgttgatttcttataataaaatgatagaaatatatatgtctatatttgttacaagtttactaaattttattcccgacg |
52186148 |
T |
 |
| Q |
483 |
ataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattat |
582 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||| |||||| ||||||||| || |||||| ||||||||| |
|
|
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52186149 |
ataaaatgtttctgggaatagaaa-----------------gggtgggaattaagttcacattgagatgtgaataaatttctacatagtt-acctattat |
52186230 |
T |
 |
| Q |
583 |
aatccctatttttatggtttctaggaatatta |
614 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
52186231 |
aatttctatttttatggtttctaagaatatta |
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T |
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Target: chr1; HSP #58
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| ||||| | || ||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
672 |
attctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacacc |
727 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19923755 |
gttctaagaaatgttatttctaaaaataaatttgatgaacttaaaacaaacacacc |
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T |
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ttacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttat |
671 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
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ttacctattataatccatatttttaacgttctttggaatattataatattaaccaaacatcttttttctaaatatctaagaataaaattcacatatttat |
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T |
 |
| Q |
672 |
attctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccctta |
731 |
Q |
| |
|
|||| || |||| ||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
37261599 |
attccaatgaatgttaatcataaaaataaatttgataaacttgaaacaaacacatcctta |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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508 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| |||| ||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||| |
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|
| T |
37261890 |
gattcctgagaataaaattatagaaatatacatgcatatgtttgttacaagtttattaaattttattccc-gacataaaatctttttgggaatagaaaaa |
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T |
 |
| Q |
509 |
atttcccaaagaaaagggtg-gaaataaagttcccatggagatgggaataaattcata |
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Q |
| |
|
|||||||||| |||||| || ||| ||||||| || | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| |
|
||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| || |||| |||||| | ||| | || |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |
|
|
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 |
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479 |
gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatg |
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Q |
| |
|
| ||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
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||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||| |||| | || | || | |||||||||||||||||||| |
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| T |
49627454 |
tacctattataatccatatttttatggttctttgaaatattataatgttaaccaaacattttttcttttaaatactctacaataaaattcccatctttat |
49627355 |
T |
 |
| Q |
672 |
attctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacacccttagt |
733 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||| |||||| ||| |||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
49627354 |
attccaagaaatgttattcttaaaaataaatttggtaaatttgaaacaaacacatccttagt |
49627293 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 606 - 713
Target Start/End: Original strand, 45813620 - 45813727
Alignment:
| Q |
606 |
ggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaatattattcctaataataaatttg |
705 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| ||| || ||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
45813620 |
ggaatattataatcttaacaaaatatcttttttctaaataccttaaaataaaattcacatctttatatttcaatgaatgttattcctaagaataaatttg |
45813719 |
T |
 |
| Q |
706 |
ataaactt |
713 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
45813720 |
ataaactt |
45813727 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #65
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Target Start/End: Original strand, 37336514 - 37336667
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| Q |
450 |
ttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggaga |
549 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| || |||||||||||| || |||||||| || |||| ||||||||| || | || |
|
|
| T |
37336514 |
ttgttacaagtttactaaattttattctcagatataaaatattattgggaatagaaatttctttccaaagaatagagtgggaataaagttttcacgaagg |
37336613 |
T |
 |
| Q |
550 |
tgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggtttct |
604 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37336614 |
agagaataaattcatgtata-attacctattataatctctatttttatggtttct |
37336667 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 652 - 732
Target Start/End: Original strand, 52186269 - 52186349
Alignment:
| Q |
652 |
aataaaattcccatctttatattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacacccttag |
732 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
52186269 |
aataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattccttaaaataaatttggtaaacttaaaacaaatacaccattag |
52186349 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 419 - 561
Target Start/End: Original strand, 33702381 - 33702524
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| Q |
419 |
aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggta-taaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaa |
517 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||| | || ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | | |||| || | |||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
33702381 |
aataaaatgatagaaatatatattcttaagtttgttacaaatttattaaattttatttttggggaattaaatttttcagggaatagaaaaaatttcccga |
33702480 |
T |
 |
| Q |
518 |
agaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaatt |
561 |
Q |
| |
|
| |||| |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
33702481 |
ataaaaaggtgagaataaaattcccatgacgatgagaataaatt |
33702524 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #68
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Target Start/End: Complemental strand, 3939583 - 3939515
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| Q |
409 |
gattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc |
477 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||| |||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3939583 |
gattcctgagaatagaatgatagaaatatacatgcttatgtttgttacaagtttgctaaattttattcc |
3939515 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 456 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 11078051 - 11077963
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| Q |
456 |
caagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccat |
544 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| |||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
11078051 |
caagtttattaaattttatttctggatataacatgtttttgggaatagaaaaattttccaaaaaaaaaaggtgaacataaagttcccat |
11077963 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 52276930 - 52276877
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| Q |
440 |
atgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcct |
495 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
52276930 |
atgcctatatttgttacaagtttactaaattttatt--cggatataaaatgttcct |
52276877 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 730
Target Start/End: Original strand, 17475511 - 17475659
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| Q |
583 |
aatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttc-ctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaagga |
681 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| ||| | ||||||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||| | || |
|
|
| T |
17475511 |
aatacctatttttatagttcccgggaatatcataatgttaagcaaacatctttttttctaaataccttggaataaaatttccatttttattttccataga |
17475610 |
T |
 |
| Q |
682 |
atattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccctt |
730 |
Q |
| |
|
|| |||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17475611 |
atgttattcttaggaataaatttgataaacttgaaacgaacacaccctt |
17475659 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 671 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 39329403 - 39329347
Alignment:
| Q |
671 |
tattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacacc |
727 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
39329403 |
tattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc |
39329347 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 516 - 596
Target Start/End: Original strand, 13048402 - 13048485
Alignment:
| Q |
516 |
aaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaa----taaattcataaatagtttacctattataatccctattttta |
596 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
13048402 |
aaagaaaagggtggaaataaagtttccatgaatatgggaataattaaattcatgtata-attacctattataatccttattttta |
13048485 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 516 - 596
Target Start/End: Original strand, 13053399 - 13053482
Alignment:
| Q |
516 |
aaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaa----taaattcataaatagtttacctattataatccctattttta |
596 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
13053399 |
aaagaaaagggtggaaataaagtttccatgaatatgggaataattaaattcatgtata-attacctattataatccttattttta |
13053482 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 696 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 1007571 - 1007534
Alignment:
| Q |
696 |
aataaatttgataaacttcaaacaaacacacccttagt |
733 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
1007571 |
aataaatttgataaacttgaaacaaacacacccatagt |
1007534 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 219
Target Start/End: Original strand, 40669045 - 40669091
Alignment:
| Q |
171 |
agagtgtgttgaaaagtgtggattaaaatttgtgttgatagcatttctc |
219 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
40669045 |
agagtgtgttgaaaagtgtg--ttaaaatgtgtgttgctagcatttctc |
40669091 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 679 - 724
Target Start/End: Original strand, 49824022 - 49824067
Alignment:
| Q |
679 |
ggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacac |
724 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
49824022 |
ggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacac |
49824067 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 43)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 377 - 732
Target Start/End: Original strand, 22935909 - 22936264
Alignment:
| Q |
377 |
ttagggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc |
476 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22935909 |
ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactttattttattc |
22936008 |
T |
 |
| Q |
477 |
ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc |
576 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22936009 |
ccaggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc |
22936108 |
T |
 |
| Q |
577 |
tattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattct |
676 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22936109 |
tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc |
22936208 |
T |
 |
| Q |
677 |
aaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacacccttag |
732 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22936209 |
aaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttag |
22936264 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 379 - 729
Target Start/End: Original strand, 4765559 - 4765909
Alignment:
| Q |
379 |
agggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc |
478 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
4765559 |
agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattccc |
4765658 |
T |
 |
| Q |
479 |
gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta |
578 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4765659 |
gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta |
4765758 |
T |
 |
| Q |
579 |
ttataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaa |
678 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| || |
|
|
| T |
4765759 |
ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttagaataaaattctcatctttatattccaa |
4765858 |
T |
 |
| Q |
679 |
ggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccct |
729 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
4765859 |
ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct |
4765909 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 377 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 28602629 - 28602268
Alignment:
| Q |
377 |
ttagggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc |
476 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28602629 |
ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc |
28602530 |
T |
 |
| Q |
477 |
ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc |
576 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28602529 |
ccgg-tataaaatgtttctgagaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc |
28602431 |
T |
 |
| Q |
577 |
tattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattct |
676 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
28602430 |
tattataatccctatttgtatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcctatctttatattcc |
28602331 |
T |
 |
| Q |
677 |
aaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacacccttagttttttc |
739 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
28602330 |
aaggaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagtattttc |
28602268 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 378 - 725
Target Start/End: Original strand, 19065503 - 19065850
Alignment:
| Q |
378 |
tagggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc |
477 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
19065503 |
tagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatttc |
19065602 |
T |
 |
| Q |
478 |
cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacct |
577 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19065603 |
cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacct |
19065702 |
T |
 |
| Q |
578 |
attataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattcta |
677 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
19065703 |
attataatccctatatttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatattttctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca |
19065802 |
T |
 |
| Q |
678 |
aggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacaca |
725 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
19065803 |
aggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacaca |
19065850 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 379 - 729
Target Start/End: Original strand, 12970529 - 12970879
Alignment:
| Q |
379 |
agggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc |
478 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12970529 |
agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc |
12970628 |
T |
 |
| Q |
479 |
gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta |
578 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12970629 |
gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcttaaggaaaagggtgggaataaagtttccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta |
12970728 |
T |
 |
| Q |
579 |
ttataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaa |
678 |
Q |
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578 |
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Q |
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Target: chr5; HSP #13
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|
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Target: chr5; HSP #14
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ggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacac |
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Target: chr5; HSP #15
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atattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccctt |
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Target: chr5; HSP #16
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T |
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Target: chr5; HSP #17
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Target Start/End: Complemental strand, 27481073 - 27480735
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487 |
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T |
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727 |
Q |
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27480775 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
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576 |
Q |
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T |
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Target: chr5; HSP #19
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T |
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Q |
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T |
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T |
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Q |
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T |
 |
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Q |
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T |
 |
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Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 382 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 20962659 - 20962373
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T |
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581 |
Q |
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T |
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| Q |
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Target: chr5; HSP #22
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
482 |
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581 |
Q |
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T |
 |
| Q |
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T |
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| Q |
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Q |
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|
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T |
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Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| |||| |||||| | |||||||| ||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
43346895 |
gggtgtgtttgtttcaagttatatttgtagattcctgaaaataaaatcataaaaatacatatgtatgtgtttgttacaagtttactaaattttattccca |
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T |
 |
| Q |
480 |
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579 |
Q |
| |
|
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|
| T |
43346995 |
ggtataaattgtttctggcaatagaaaagtttttccaatgaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgagaataaaattatgcgta-attacctat |
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T |
 |
| Q |
580 |
tataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaag |
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Q |
| |
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| ||||||||||||||| |||| || |||||||| | ||||||||| | ||||| |||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||| || |
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T |
 |
| Q |
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Q |
| |
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|
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Q |
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|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
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tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttgaaataaaattctcatctttaaattcc |
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T |
 |
| Q |
677 |
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Q |
| |
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|
| T |
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Q |
| |
|
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T |
 |
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618 |
Q |
| |
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T |
 |
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Q |
| |
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T |
 |
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Q |
| |
|
||||||| |
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|
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aaacaca |
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Target: chr5; HSP #26
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Q |
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T |
 |
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Q |
| |
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||| || |||||||||||||||||| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 398 - 713
Target Start/End: Original strand, 35348545 - 35348858
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gaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttat |
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Q |
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| T |
35348643 |
gaatagaaaat-tttcccaaagaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgagaataaattcacatgta-attacctattataattcatatttttat |
35348740 |
T |
 |
| Q |
598 |
ggtttctaggaatattataaacctaaccaaaca--tatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaatattattcctaat |
695 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
35348741 |
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35348840 |
T |
 |
| Q |
696 |
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713 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35348841 |
aataaatttgataaactt |
35348858 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 377 - 643
Target Start/End: Original strand, 40275751 - 40276017
Alignment:
| Q |
377 |
ttagggtgtgtttattt-caagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt |
475 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
40275751 |
ttagggtgtgttttttttcaagttatatttgtagatttttgggaataaaattataaaaatacatatgtctatgtttgttacaagtttgctaaattttatt |
40275850 |
T |
 |
| Q |
476 |
cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttac |
575 |
Q |
| |
|
||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | || || | || |
|
|
| T |
40275851 |
cccagatatgaaatattcctgggaatagaaaagttttcccaaagaaaatgatgggaataaagttcccatgaagatgggaataaaattatctcta-ataac |
40275949 |
T |
 |
| Q |
576 |
ctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaa |
643 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
40275950 |
ctattaaaatccctatttttaaggttccatggaatattataatattaaccaaacatcttttttctaaa |
40276017 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 423 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 30899583 - 30899478
Alignment:
| Q |
423 |
aaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaa |
522 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| || |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
30899583 |
aaatgatattaatatacatgcttatgtatgttacaagttttctaaattttattcctggatataaaatattcttgggaatagaaacaattttccaaagaaa |
30899484 |
T |
 |
| Q |
523 |
agggtg |
528 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
30899483 |
agggtg |
30899478 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 384 - 509
Target Start/End: Original strand, 41783624 - 41783749
Alignment:
| Q |
384 |
gtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggta |
483 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || | ||||| |||| |||||| ||| |||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |
|
|
| T |
41783624 |
gtgtttatttcaagttatatttatagattcttgggattaaaatcataaaaatgtacacgcatatgtttgttataagtttactaaattttattctcggata |
41783723 |
T |
 |
| Q |
484 |
taaaatgttcctgggaatagaaaaaa |
509 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
41783724 |
taaaatgtttctgaaaatagaaaaaa |
41783749 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 445 - 552
Target Start/End: Original strand, 19089782 - 19089889
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| Q |
445 |
tatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccat |
544 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
19089782 |
tatgtttgttataagtttattaaattttattcttgagtataaaacgtttttgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaatgatgggtataaagttctcat |
19089881 |
T |
 |
| Q |
545 |
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552 |
Q |
| |
|
| |||||| |
|
|
| T |
19089882 |
gaagatgg |
19089889 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 589 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 28429591 - 28429450
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| Q |
589 |
tatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttctt-gaaataaaattcccatctttatattctaaggaatatta |
687 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| | || | ||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
28429591 |
tatttttaaggtttctgagaatattataatgttaaccaaacatctttttttttaaatactttggaataaaattcacatctttatatttcaaggaatgtta |
28429492 |
T |
 |
| Q |
688 |
ttcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccct |
729 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
28429491 |
tttctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct |
28429450 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 419 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 28429733 - 28429664
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| Q |
419 |
aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaa |
488 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
28429733 |
aataaaatgatagaaatatacatgcctatatttgttacaagtttactaaattttattcccgaatataaaa |
28429664 |
T |
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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 381 - 509
Target Start/End: Original strand, 3913201 - 3913327
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| Q |
381 |
ggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg |
480 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||| ||||| ||| || ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
3913201 |
ggtgcgtttatttcaagttatattcgtagattcttgggaataaaacgatagaaatatacatgtgtatgtttattacaaatttactaaattttatt-ccag |
3913299 |
T |
 |
| Q |
481 |
gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaa |
509 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
3913300 |
gtataaaatgtt-ttaggaatagaaaaaa |
3913327 |
T |
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Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 419 - 521
Target Start/End: Original strand, 15200585 - 15200685
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| Q |
419 |
aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaa |
518 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||| | || |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15200585 |
aataaaatgatataaatatatatgtctatgtttgttataaatttattaaattttattctcaggcataaaatgtttctggg-atagaaaaaa-ttcccaaa |
15200682 |
T |
 |
| Q |
519 |
gaa |
521 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
15200683 |
gaa |
15200685 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 379 - 525
Target Start/End: Original strand, 16720212 - 16720356
Alignment:
| Q |
379 |
agggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc |
478 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||||| | || |||||| ||||||| |||||| ||| || || | |||||||||| |||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
16720212 |
agggtgtgtttgtttcatgttatattcgtagattcctatgaataaa-tgatagaaatatacatacatatgtttgttgcaagtttactaaattttattatc |
16720310 |
T |
 |
| Q |
479 |
gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagg |
525 |
Q |
| |
|
||||||||||| || | ||||||||| || ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16720311 |
gggtataaaatatt-tttggaatagaacaattttcccaaaaaaaagg |
16720356 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 655 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 20962356 - 20962286
Alignment:
| Q |
655 |
aaaattcccatctttatattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacaca |
725 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
20962356 |
aaaatttccatctttatgttccaaggaatgttattcctatgaataaatttgataaacttaaaacaaacaca |
20962286 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 651 - 725
Target Start/End: Original strand, 36978404 - 36978478
Alignment:
| Q |
651 |
aaataaaattcccatctttatattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacaca |
725 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
36978404 |
aaataaaattctcatatttatattctaaagaatgttattcctataaataaatttaataaacttgaaacaaacaca |
36978478 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 28023840 - 28023719
Alignment:
| Q |
444 |
ctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaag-ttccc |
542 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| | |
|
|
| T |
28023840 |
ctatatttgttacaagttcattaaattttattctcacatataaaatgtgtttgggaatagaaaaaatttctcaaacaaaagggtgagaataaagtttctc |
28023741 |
T |
 |
| Q |
543 |
atggagatgggaataaattcat |
564 |
Q |
| |
|
| | ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
28023740 |
acgaagatgagaataaattcat |
28023719 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 419 - 478
Target Start/End: Original strand, 36978210 - 36978269
Alignment:
| Q |
419 |
aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc |
478 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
36978210 |
aataaaatgatagaaatatatatgtctatgtttgttacaaacttacaaaattttattccc |
36978269 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 700 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 7441607 - 7441568
Alignment:
| Q |
700 |
aatttgataaacttcaaacaaacacacccttagttttttc |
739 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
7441607 |
aatttgataaacttgaaacaaacacacccttatttttttc |
7441568 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 492
Target Start/End: Original strand, 35602876 - 35602935
Alignment:
| Q |
433 |
aatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgtt |
492 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |
|
|
| T |
35602876 |
aatgcatatgcatatatttgttacaagtttattaaattttatttccgaggataaaatgtt |
35602935 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 418 - 475
Target Start/End: Original strand, 830058 - 830115
Alignment:
| Q |
418 |
gaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt |
475 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
830058 |
gaataaaaagatatcaatatatatgaatatgtttgttacaagtttattaaattttatt |
830115 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 70)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 380 - 727
Target Start/End: Original strand, 27762899 - 27763246
Alignment:
| Q |
380 |
gggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg |
479 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27762899 |
gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg |
27762998 |
T |
 |
| Q |
480 |
ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctat |
579 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27762999 |
ggtataaaatgttcctgggaatagaaaatatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctat |
27763098 |
T |
 |
| Q |
580 |
tataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaag |
679 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
27763099 |
tataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcctatctttatattccaag |
27763198 |
T |
 |
| Q |
680 |
gaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacacc |
727 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
27763199 |
gaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacacacc |
27763246 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 380 - 729
Target Start/End: Original strand, 13229989 - 13230338
Alignment:
| Q |
380 |
gggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg |
479 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13229989 |
gggtgtgtttgtttcaagttataattttttattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg |
13230088 |
T |
 |
| Q |
480 |
ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctat |
579 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13230089 |
ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctat |
13230188 |
T |
 |
| Q |
580 |
tataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaag |
679 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
13230189 |
tataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag |
13230288 |
T |
 |
| Q |
680 |
gaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccct |
729 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
13230289 |
gaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct |
13230338 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 376 - 729
Target Start/End: Original strand, 39730289 - 39730642
Alignment:
| Q |
376 |
cttagggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt |
475 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39730289 |
cttagggtgtgtttgtttcaagttataatttttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttatt |
39730388 |
T |
 |
| Q |
476 |
cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttac |
575 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39730389 |
cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcacatggagatgggaataaattcataaatagtttac |
39730488 |
T |
 |
| Q |
576 |
ctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattc |
675 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
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Q |
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T |
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Q |
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Target: chr4; HSP #14
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
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Target Start/End: Original strand, 6279920 - 6280270
Alignment:
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Q |
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578 |
Q |
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T |
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678 |
Q |
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T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
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Alignment:
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Q |
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T |
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578 |
Q |
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| T |
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23686664 |
T |
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| Q |
579 |
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678 |
Q |
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T |
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Q |
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T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #17
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Q |
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T |
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| Q |
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580 |
Q |
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| T |
47670336 |
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T |
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Q |
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T |
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734 |
Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
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Target Start/End: Original strand, 39835306 - 39835656
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478 |
Q |
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T |
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578 |
Q |
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678 |
Q |
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Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 377 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 936204 - 935849
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T |
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Q |
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T |
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Q |
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T |
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Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
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Target Start/End: Original strand, 18405231 - 18405584
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T |
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576 |
Q |
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cttggtataaaatgttcctgggaataaaaaaaatttcc-aaggaaaagggtgagaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacc |
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T |
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676 |
Q |
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T |
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Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
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Target Start/End: Original strand, 41744222 - 41744568
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Q |
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T |
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727 |
Q |
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aatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 380 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 32953598 - 32953249
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T |
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ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctat |
579 |
Q |
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| T |
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tataatccctatttttatggttccttgaaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaat |
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T |
 |
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gaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccct |
729 |
Q |
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gaatattatttctagaaataaattagataaacttgaaacaaacataccct |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 379 - 721
Target Start/End: Original strand, 50672907 - 50673245
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gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta |
578 |
Q |
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T |
 |
| Q |
579 |
ttataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaa |
678 |
Q |
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T |
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Q |
| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
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Target Start/End: Original strand, 34049597 - 34049900
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Q |
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34049897 |
gaat |
34049900 |
T |
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Target: chr4; HSP #25
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Target Start/End: Complemental strand, 8322308 - 8321971
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Q |
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T |
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591 |
Q |
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T |
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T |
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Target: chr4; HSP #26
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Q |
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T |
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Q |
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T |
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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
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Target Start/End: Complemental strand, 27555493 - 27555151
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T |
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Q |
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T |
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Q |
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T |
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Target: chr4; HSP #28
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Target Start/End: Complemental strand, 27942814 - 27942465
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Q |
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T |
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T |
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Q |
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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
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Target Start/End: Complemental strand, 39498903 - 39498590
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Q |
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Target: chr4; HSP #30
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Query Start/End: Original strand, 377 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 39502242 - 39501929
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Q |
| |
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T |
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Target: chr4; HSP #31
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Target Start/End: Original strand, 25916034 - 25916295
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|
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T |
 |
| Q |
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Target: chr4; HSP #32
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| |
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T |
 |
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|
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|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 498 - 729
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T |
 |
| Q |
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Q |
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T |
 |
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| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
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Q |
| |
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T |
 |
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tataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaag |
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Q |
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tataatccttatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaataccttggaataaaattttcatctttaaattccaag |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 376 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 7259041 - 7258691
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ctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattc |
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Q |
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7258691 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 379 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 30415978 - 30415743
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Q |
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| T |
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30415743 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 419 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 52469734 - 52469427
Alignment:
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518 |
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52469435 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 379 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 51968853 - 51968505
Alignment:
| Q |
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478 |
Q |
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| T |
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| T |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 381 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 38414278 - 38414032
Alignment:
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Q |
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| T |
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T |
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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 418 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 38394943 - 38394634
Alignment:
| Q |
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517 |
Q |
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| T |
38394943 |
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| T |
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728 |
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| T |
38394645 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 377 - 638
Target Start/End: Original strand, 36858375 - 36858634
Alignment:
| Q |
377 |
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Q |
| |
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| T |
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36858472 |
T |
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| Q |
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573 |
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| T |
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36858569 |
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638 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 510 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 36858351 - 36858135
Alignment:
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| T |
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36858154 |
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728 |
Q |
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| T |
36858153 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 409 - 666
Target Start/End: Original strand, 47426269 - 47426520
Alignment:
| Q |
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| |
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606 |
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| T |
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47426460 |
T |
 |
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666 |
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| T |
47426461 |
gaatattataaagttaaccaaatatattttttctaaatacctttgaataaaattcccatc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 385 - 536
Target Start/End: Original strand, 10400810 - 10400961
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T |
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| T |
10400910 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 446 - 721
Target Start/End: Original strand, 37014451 - 37014724
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| |
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| Q |
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645 |
Q |
| |
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| T |
37014551 |
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37014648 |
T |
 |
| Q |
646 |
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721 |
Q |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 444 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 18405764 - 18405592
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T |
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| Q |
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617 |
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| T |
18405664 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 445 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 48060065 - 48059805
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Q |
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T |
 |
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ggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacata-tttttcctaaa |
643 |
Q |
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| T |
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T |
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tacatcgaaataaaattctcatcattatattctaaaaaatattattcgtaagaataaatttg |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 386 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 44309829 - 44309497
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485 |
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T |
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| T |
44309730 |
aaacgttctagagaatagaaaaaaatttcctaaagaaaagggtgggaataaagttcccatgaatatgaaaatttattaatgtgta-attatctgttataa |
44309632 |
T |
 |
| Q |
585 |
tccctatttttatggtttctag-gaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaat |
683 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
44309631 |
tccctattttta-gtattctcgagaatattataatgttaaccatacatatttttcctaaacactttgaaattaaattctcatctttatgttctaagaaat |
44309533 |
T |
 |
| Q |
684 |
attattcctaataataaatttgataaacttcaaaca |
719 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
44309532 |
attattcttaaaaataaatttagtaaacttcaaaca |
44309497 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 445 - 683
Target Start/End: Original strand, 24805150 - 24805394
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445 |
tatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtgg-aaataaagttccca |
543 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24805150 |
tatgtttgttacaaatttactaaattttattttcgggaataaaacattt-tgggaatagaaaaaatttcacaaagaaaatggtggaaaataaagttccca |
24805248 |
T |
 |
| Q |
544 |
tggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttt-------ctaggaatattataaacctaaccaaacatatttt |
636 |
Q |
| |
|
|| | |||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||| ||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
24805249 |
tgaatatgggaataaatccatgtgta-attacctattatattccctatttttatggtttatggttcccagtaatattataatgttaagcaaacatctttt |
24805347 |
T |
 |
| Q |
637 |
tcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaat |
683 |
Q |
| |
|
| |||||| ||| || |||||||| ||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
24805348 |
ttctaaataccttaaagtaaaattcacatctttatgttccaaggaat |
24805394 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 572 - 726
Target Start/End: Original strand, 10400973 - 10401126
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| Q |
572 |
ttacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttat |
671 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| || ||||| |||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
10400973 |
ttacctattataatccttatttttatggttccgaggaatattataaa-ctaaccaaacatgttttttctatatatcttggaataaaattctcatttttat |
10401071 |
T |
 |
| Q |
672 |
attctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacac |
726 |
Q |
| |
|
| | || |||| ||||| | | |||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
10401072 |
acttcaaagaatgttatttccagaaataaatttggtaaacttaaaacaaacacac |
10401126 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 422 - 544
Target Start/End: Original strand, 12275953 - 12276075
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| Q |
422 |
aaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaa |
521 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| || ||||| | ||||||||| | |
|
|
| T |
12275953 |
aaaatgatagaaatatatatgtttatgtttgttacaagtttactaaattttattcctggatataaaatgttcttggaaaaagaaatattttcccaaaaga |
12276052 |
T |
 |
| Q |
522 |
aagggtggaaataaagttcccat |
544 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
12276053 |
aaaggtgggaataaaattcccat |
12276075 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 374 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 26165445 - 26165261
Alignment:
| Q |
374 |
ttcttagggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaatttta |
473 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||| | ||||||||| ||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26165445 |
ttcttagggtgtgtttgtttcatgttatatttgtagattcctgagaataaaatcataaaaatgcacatgtttatgtttgttacaagtttactaaatttta |
26165346 |
T |
 |
| Q |
474 |
ttcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaa |
559 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
26165345 |
ttcatgaatataaaatgtt-cttagaatagaaaagttttcataaagaaaatagtgagaataaagttcccattaagatgagaataaa |
26165261 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 479 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 30790518 - 30790275
Alignment:
| Q |
479 |
gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta |
578 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||| |||||| | || || || || |
|
|
| T |
30790518 |
gggtataaaatgtttctgagaatagaaaagtttttccaatgaaaaggatgggaataaagtttccatgaagatggaaataaaattat-----gtgtaatta |
30790424 |
T |
 |
| Q |
579 |
ttataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaa |
678 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||| || |
|
|
| T |
30790423 |
ttataaattctatttttaaggttccttggaatattataatgttaaccaaacatcttttttttaaatactttggaataaatttctcatctttatattccaa |
30790324 |
T |
 |
| Q |
679 |
ggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccc |
728 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
30790323 |
-gaatgttactcctagaaataaatttgctaaacttgaaacaaacacaccc |
30790275 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 418 - 539
Target Start/End: Original strand, 22654515 - 22654638
Alignment:
| Q |
418 |
gaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatt--tccc |
515 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
22654515 |
gaataaaatgatagaaatatacatgcctatgtttattacaagttaactaatttttattctcgggtaaaaaatgttattgcgaatagaaaaactttctcca |
22654614 |
T |
 |
| Q |
516 |
aaagaaaagggtggaaataaagtt |
539 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22654615 |
aaaaaaaagggtgggaataaagtt |
22654638 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 621 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 38414010 - 38413902
Alignment:
| Q |
621 |
taaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaa |
720 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||| | |||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
38414010 |
taaccaaacatattttttctaaataccttggaattaaattctcatctttatattccaaggaatgttatttctaaaattaaatttggtaaacttgaaacaa |
38413911 |
T |
 |
| Q |
721 |
acacaccct |
729 |
Q |
| |
|
|||| |||| |
|
|
| T |
38413910 |
acacgccct |
38413902 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 479 - 617
Target Start/End: Original strand, 32384492 - 32384630
Alignment:
| Q |
479 |
gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaa-tttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacct |
577 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||| ||||| || | || |||| |
|
|
| T |
32384492 |
gggtataaaacgttcatggaaacagaaaaaaatttcccaaagaaaagggtgggaataaaattcccataaagattggaacaaatttatgtgcaatt-acct |
32384590 |
T |
 |
| Q |
578 |
attataatccctatttttatggtttctaggaatattataa |
617 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
32384591 |
attataatccctaattttatggtttccaggaatattataa |
32384630 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 419 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 18094285 - 18094087
Alignment:
| Q |
419 |
aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatt--tccca |
516 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| || | | |||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
18094285 |
aataaaatgatagaaatataccttcttatgtttgctagaagtttactaa-ttttattttcgggtataaaatgtttctaggaatagaaaaaaaaaattcca |
18094187 |
T |
 |
| Q |
517 |
aagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattata |
616 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
18094186 |
aagaaaatggtgagaataaagttcccatgaagatgagaataaattcatgtgta-actacctattataattcatatttttatgattcctaaaaatattata |
18094088 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 377 - 476
Target Start/End: Original strand, 9327242 - 9327342
Alignment:
| Q |
377 |
ttagggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttg-ttacaagtttactaaattttatt |
475 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9327242 |
ttagggtgtttttatttcaagttatatttgttgattcctaaaaataaaatgttagaaatatatatgtctatgtttgtttataagtttactaaattttatt |
9327341 |
T |
 |
| Q |
476 |
c |
476 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
9327342 |
c |
9327342 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 377 - 476
Target Start/End: Original strand, 9374001 - 9374101
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| Q |
377 |
ttagggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttg-ttacaagtttactaaattttatt |
475 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9374001 |
ttagggtgtttttatttcaagttatatttgttgattcctaaaaataaaatgttagaaatatatatgtctatgtttgtttataagtttactaaattttatt |
9374100 |
T |
 |
| Q |
476 |
c |
476 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
9374101 |
c |
9374101 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 579 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 14796439 - 14796295
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| Q |
579 |
ttataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaa |
678 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
14796439 |
ttataatctttatttttaaggttcctaaaaatatcataatgttaaacaaacatcttttttctaaatactttaaaataaaattcacatctttatattctaa |
14796340 |
T |
 |
| Q |
679 |
ggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaaca |
723 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
14796339 |
aaaatattattcctaaaaataaatttgacaaacttaaaataaaca |
14796295 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 384 - 440
Target Start/End: Original strand, 34237424 - 34237480
Alignment:
| Q |
384 |
gtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtata |
440 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
34237424 |
gtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtata |
34237480 |
T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 658 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 18405200 - 18405126
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| Q |
658 |
attcccatctttatattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacacccttag |
732 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18405200 |
attcccatctttatatttcaaggaatgttattcctaagaataaatttggcaaacttaaaacaaacacacccttag |
18405126 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 621 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 52414061 - 52413959
Alignment:
| Q |
621 |
taaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaa |
720 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||| |||| |||||||||| |||| || || ||| |
|
|
| T |
52414061 |
taaccaaacatattttttctaattcgcttgaaataaaattcacatctttatattccaagggttgttatttctaagaataaatttggtaaatttgaagcaa |
52413962 |
T |
 |
| Q |
721 |
aca |
723 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
52413961 |
aca |
52413959 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #64
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Query Start/End: Original strand, 652 - 728
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| Q |
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aataaaattcccatctttatattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccc |
728 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
36860028 |
aataaaatttccatttttatgttccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc |
36860104 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
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| Q |
387 |
tttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttg-ttacaagtttactaaattttattc |
476 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9382289 |
tttatttgaagttatatttgttgattcctaaaaataaaatgttagaaatatatatgtctatgtttgtttataaatttactaaattttattc |
9382379 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 621 - 730
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| Q |
621 |
taaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaa |
720 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| || |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
12276151 |
taaccgaacatatgctttctaaatattttgaaataaaattcacatctttatattc-aaaaaatgttattcctataaataaatttagtaaacttgaaacaa |
12276249 |
T |
 |
| Q |
721 |
a-cacaccctt |
730 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |
|
|
| T |
12276250 |
atcacaccctt |
12276260 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #67
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Target Start/End: Complemental strand, 54478555 - 54478495
Alignment:
| Q |
445 |
tatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaa |
505 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
54478555 |
tatgtttgttataagtttactaaatttcattcatgggtataaaatgttattggaaatagaa |
54478495 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #68
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171 |
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221 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16458035 |
agagtgtgttgaaaagtgtgtgttagaatgtgtgttgctagcatttctctt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 409 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 37296724 - 37296662
Alignment:
| Q |
409 |
gattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattt |
471 |
Q |
| |
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|
| T |
37296724 |
gattcctggaaataaaatgatagaaatatacatgcttatgtttgttactagtttgctaaattt |
37296662 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 680 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 30415751 - 30415706
Alignment:
| Q |
680 |
gaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacaca |
725 |
Q |
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|
||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |
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| T |
30415751 |
gaatattattcctaagaataaatttagtaatcttcaaacaaacaca |
30415706 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 379 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 2657772 - 2657422
Alignment:
| Q |
379 |
agggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc |
478 |
Q |
| |
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||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2657772 |
agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatacctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc |
2657673 |
T |
 |
| Q |
479 |
gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta |
578 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
2657672 |
gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataattttccta |
2657573 |
T |
 |
| Q |
579 |
ttataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaa |
678 |
Q |
| |
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||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |
|
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| T |
2657572 |
ttataatccatatttttatgattactaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa |
2657473 |
T |
 |
| Q |
679 |
ggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccct |
729 |
Q |
| |
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||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
2657472 |
ggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccct |
2657422 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 383 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 18897989 - 18897641
Alignment:
| Q |
383 |
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482 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
18897989 |
tgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccggaaataaagtgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaaatttattccttggt |
18897890 |
T |
 |
| Q |
483 |
ataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattat |
582 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18897889 |
ataaaatgtttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattat |
18897790 |
T |
 |
| Q |
583 |
aatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaa |
682 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
18897789 |
aattcctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaa |
18897690 |
T |
 |
| Q |
683 |
tattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccctta |
731 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18897689 |
tgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccctta |
18897641 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 379 - 729
Target Start/End: Original strand, 7053569 - 7053927
Alignment:
| Q |
379 |
agggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc |
478 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7053569 |
agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcct |
7053668 |
T |
 |
| Q |
479 |
gggtataa--------aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatag |
570 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7053669 |
gggtataaaatgataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatag |
7053768 |
T |
 |
| Q |
571 |
tttacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatcttta |
670 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
7053769 |
tttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatattta |
7053868 |
T |
 |
| Q |
671 |
tattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccct |
729 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
7053869 |
tattccaaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct |
7053927 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 380 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 1317089 - 1316741
Alignment:
| Q |
380 |
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479 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
1317089 |
gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactttattttattccca |
1316990 |
T |
 |
| Q |
480 |
ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctat |
579 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1316989 |
ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaa-tttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaatagtttacctat |
1316891 |
T |
 |
| Q |
580 |
tataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaag |
679 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| || |
|
|
| T |
1316890 |
tataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaa |
1316791 |
T |
 |
| Q |
680 |
gaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccct |
729 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
1316790 |
gaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct |
1316741 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 377 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 14171087 - 14170740
Alignment:
| Q |
377 |
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476 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14171087 |
ttagggtgtgtttgtttcaagttataatttttgattcccgggaataaaatgataggaatctatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc |
14170988 |
T |
 |
| Q |
477 |
ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc |
576 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14170987 |
ctggatataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcc-aaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgg-aataaattcataaatagtttacc |
14170890 |
T |
 |
| Q |
577 |
tattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattct |
676 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14170889 |
tattacaatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc |
14170790 |
T |
 |
| Q |
677 |
aaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacac |
726 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14170789 |
aaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacac |
14170740 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 391 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 16968985 - 16968649
Alignment:
| Q |
391 |
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490 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16968985 |
tttcaagttataattgttgattcctgagaataaaatgataggaatctatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattctcgggtataaaatg |
16968886 |
T |
 |
| Q |
491 |
ttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatcccta |
590 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16968885 |
tttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcctatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatcccta |
16968786 |
T |
 |
| Q |
591 |
tttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaatattattc |
690 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||| |
|
|
| T |
16968785 |
tttttatggttcctaagaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaagaatgttattc |
16968686 |
T |
 |
| Q |
691 |
ctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacacc |
727 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16968685 |
ctagaaataaatttgataaacttgaaacaaacacacc |
16968649 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 457 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 8029297 - 8029025
Alignment:
| Q |
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Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8029297 |
aagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaat |
8029198 |
T |
 |
| Q |
557 |
aaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataa |
656 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8029197 |
aaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagccaaccaaacatatttttcctaaatttcttggaataa |
8029098 |
T |
 |
| Q |
657 |
aattcccatctttatattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccct |
729 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
8029097 |
aatttccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct |
8029025 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 379 - 617
Target Start/End: Original strand, 7344082 - 7344320
Alignment:
| Q |
379 |
agggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc |
478 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7344082 |
agggtgtgttcgtttcaaattataattgtaaatttccgagaataaaatgataggaatgtatatgcctatatttgttacaagtttactaaattttattccc |
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T |
 |
| Q |
479 |
gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta |
578 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7344182 |
aggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta |
7344281 |
T |
 |
| Q |
579 |
ttataatccctatttttatggtttctaggaatattataa |
617 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataa |
7344320 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 523 - 729
Target Start/End: Original strand, 10246259 - 10246465
Alignment:
| Q |
523 |
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622 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
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agggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctaattttatggttcctaggaatattataaagcta |
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T |
 |
| Q |
623 |
accaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaac |
722 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
10246359 |
accaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaac |
10246458 |
T |
 |
| Q |
723 |
acaccct |
729 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
10246459 |
acaccct |
10246465 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 376 - 732
Target Start/End: Original strand, 6705761 - 6706104
Alignment:
| Q |
376 |
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475 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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6705761 |
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6705860 |
T |
 |
| Q |
476 |
cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttac |
575 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||| |
|
|
| T |
6705861 |
cctaggtataaaatgttcctgggaatagaaaaatgttcccaaagaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataatttcatatgta-ttta- |
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T |
 |
| Q |
576 |
ctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattc |
675 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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-----------cctgtttttatagttcttaggaatattataaagttaaccaaatatattttttctaaataccttagaataaaattctcatctttatattt |
6706047 |
T |
 |
| Q |
676 |
taaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacacccttag |
732 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
6706048 |
caaggaatgttattcctagaaataaaattggtaaacttgaaacaaacatacccttag |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 383 - 675
Target Start/End: Original strand, 345833 - 346127
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| Q |
383 |
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481 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
345833 |
tgtgtttgttttaagttatattcgtagattcctaggaaataaaatgataggaatacacatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattctcgga |
345932 |
T |
 |
| Q |
482 |
tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctatta |
581 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | || ||| ||||||| |
|
|
| T |
345933 |
tataaaacgtttttaggaatagaaaatttttcccaaagaaaagggtgggaataaagttccaatggagatgagaataaattcatgagtaattt-cctatta |
346031 |
T |
 |
| Q |
582 |
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675 |
Q |
| |
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| T |
346032 |
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346127 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 386 - 735
Target Start/End: Original strand, 14781626 - 14781964
Alignment:
| Q |
386 |
gtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtata |
485 |
Q |
| |
|
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|
| T |
14781626 |
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14781725 |
T |
 |
| Q |
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585 |
Q |
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|
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| T |
14781726 |
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14781815 |
T |
 |
| Q |
586 |
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685 |
Q |
| |
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| T |
14781816 |
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14781915 |
T |
 |
| Q |
686 |
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735 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||| |||| | |||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
14781916 |
tattcccaggaataaatttggtaaa-atgaaacaaacacactctaagttt |
14781964 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 387 - 565
Target Start/End: Original strand, 21008031 - 21008208
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| Q |
387 |
tttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa |
486 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
21008031 |
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21008130 |
T |
 |
| Q |
487 |
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565 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||| | |||| |||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21008131 |
aatgttcttgggaatagaaaaaaaat-tcaaacaaaaaggtgggaataaagttctcatagagatgggaataaattcata |
21008208 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
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Target Start/End: Complemental strand, 8029405 - 8029316
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468 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
8029405 |
agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
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480 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||| | | ||| | ||||| || |||||||||||| ||| |||| |||| || |
|
|
| T |
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ggtgtgtttgtttcaagttatttttatagattcctgggaataaaatgatagaattatatcttcctatattagttacaagtttagtaacttttcttcctgg |
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T |
 |
| Q |
481 |
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557 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
10849884 |
gtgtaaaatgttcctgggaatagaaaaatgttcccaaagaaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgggaata |
10849961 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
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Query Start/End: Original strand, 609 - 713
Target Start/End: Original strand, 7344723 - 7344827
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708 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
7344723 |
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7344822 |
T |
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| Q |
709 |
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713 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
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7344823 |
aactt |
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T |
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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 609 - 723
Target Start/End: Original strand, 21008208 - 21008322
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atattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaatattattcctaataataaatttgata |
708 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
21008208 |
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21008307 |
T |
 |
| Q |
709 |
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723 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |
|
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| T |
21008308 |
aacttgaaacaaaca |
21008322 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 379 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 3869577 - 3869391
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| Q |
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agggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc |
478 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||| ||| | ||| ||| |||||||| | ||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
3869577 |
agggtgtgtttgtttcaagttatttttgtagatttctgggaataaaatgatagaaatatgtattactacgtttgttaaatgttcattaaattttatt--- |
3869481 |
T |
 |
| Q |
479 |
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566 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3869480 |
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3869391 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 473 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 8314873 - 8314609
Alignment:
| Q |
473 |
attcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtgga-aataaagttcccatggagatgg-gaataaattcataaatag |
570 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| |||| | || ||||||||| ||||| |||| | ||||||||||| | || |
|
|
| T |
8314873 |
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8314774 |
T |
 |
| Q |
571 |
tttacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatcttta |
670 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||| |||| || | | |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| ||| | || |
|
|
| T |
8314773 |
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8314675 |
T |
 |
| Q |
671 |
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736 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8314674 |
tattgcaagtaatgttaattctaggaataaatttgataaacttaaaacaaacgtacccttagtttt |
8314609 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 377 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 8314987 - 8314874
Alignment:
| Q |
377 |
ttagggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc |
476 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| ||| || || || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8314987 |
ttagggtatgtttgtttcaagttataattctagattcatgagaataaaatcataaaaacatacattcatatgtttgttacaagtttactaaattttattc |
8314888 |
T |
 |
| Q |
477 |
ccgggtataaaatg |
490 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |
|
|
| T |
8314887 |
ccgtatataaaatg |
8314874 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 507
Target Start/End: Original strand, 9760365 - 9760497
Alignment:
| Q |
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tcttagggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttat |
474 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||| ||||||||||| |||| || || | |||||||||||| | | | || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9760365 |
tcttagagtgcgtttgtttcaagttatctttgtagactcttgagaataaaatgatcgaattatacatgcctatttttgttataagtttactaaattttat |
9760464 |
T |
 |
| Q |
475 |
tcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaa |
507 |
Q |
| |
|
| | || |||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
9760465 |
ttcaggatataaaatgttcatgagaatagaaaa |
9760497 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 652 - 732
Target Start/End: Original strand, 9762312 - 9762392
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| Q |
652 |
aataaaattcccatctttatattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacacccttag |
732 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
9762312 |
aataaaattcacatatttataatccaaggaatgttattcctaataataaacttggtaaacttgaaacaaacacaccgttag |
9762392 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Original strand, 10246222 - 10246258
Alignment:
| Q |
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gggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccg |
416 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10246222 |
gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccg |
10246258 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:
Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 376 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 202000 - 201646
Alignment:
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475 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
202000 |
cttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt |
201901 |
T |
 |
| Q |
476 |
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575 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
201900 |
tccgggtataaaatattcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaataatttac |
201801 |
T |
 |
| Q |
576 |
ctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattc |
675 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
201800 |
ctattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttagaataaaattcccatctttatattc |
201702 |
T |
 |
| Q |
676 |
taaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccctta |
731 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
201701 |
caaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta |
201646 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 386 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 143678 - 143342
Alignment:
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gtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtata |
485 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
143678 |
gtttgtttcaagttaaatttgttgattcctgagaataaaatgatagaaatatatatgtatacgtttgttacaagtttactaaattttattcccggatata |
143579 |
T |
 |
| Q |
486 |
aaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataat |
585 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
143578 |
aaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcatatgtag-ttacctattataat |
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T |
 |
| Q |
586 |
ccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaat-aaaattcccatctttatattctaaggaata |
684 |
Q |
| |
|
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|
| T |
143479 |
ccctaattttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatattttttccaaataccttgaaataaaaattctcatctttatattccaaggaatg |
143380 |
T |
 |
| Q |
685 |
ttattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaac |
722 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
143379 |
ttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaac |
143342 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 416 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 119355 - 119051
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416 |
gggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccc |
515 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |
|
|
| T |
119355 |
gggaatacaatgatagaaatatacatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcatgagtataaaatgttcctgggaatagaaaattttttcc |
119256 |
T |
 |
| Q |
516 |
aaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattat |
615 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||| |
|
|
| T |
119255 |
aaagaaaagggtggaaataaagttttcaggcagatgagaataaa-tcatgtgta-actacctattataatccctattcttaaggttccggggaatattat |
119158 |
T |
 |
| Q |
616 |
aaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaatattattcctaataataaatttgataaacttca |
715 |
Q |
| |
|
| | |||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||| ||| |||||||||| ||||||| | |
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| T |
119157 |
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119059 |
T |
 |
| Q |
716 |
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723 |
Q |
| |
|
| |||||| |
|
|
| T |
119058 |
agcaaaca |
119051 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0189 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:
Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 385 - 726
Target Start/End: Original strand, 28957 - 29298
Alignment:
| Q |
385 |
tgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtat |
484 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28957 |
tgtttgtttcaagttataattgttgattttcgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtat |
29056 |
T |
 |
| Q |
485 |
aaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataa |
584 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
29057 |
aaaatgttcctgggaatagaaaaaatttctcaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggaaatgagaataaattcataaatagttttcctattataa |
29156 |
T |
 |
| Q |
585 |
tccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaata |
684 |
Q |
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| T |
29157 |
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29256 |
T |
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| Q |
685 |
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726 |
Q |
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| T |
29257 |
ttattcataggaataaatttgataaacttaaaataaacacac |
29298 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0662 (Bit Score: 157; Significance: 4e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0662
Description:
Target: scaffold0662; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 377 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 4542 - 4186
Alignment:
| Q |
377 |
ttagggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc |
476 |
Q |
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| T |
4542 |
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4443 |
T |
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| Q |
477 |
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572 |
Q |
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| T |
4442 |
ccgagtataaaatgttcctgggaatagaaaagttttctcaaagaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgaaaataaa---attaatagtgtaat |
4346 |
T |
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| Q |
573 |
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671 |
Q |
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| T |
4345 |
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4246 |
T |
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| Q |
672 |
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731 |
Q |
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| T |
4245 |
attccaaggaatgttattcataggaataaatttggtgcacttgaaacaaacacaccctta |
4186 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0702 (Bit Score: 156; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0702
Description:
Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 731
Target Start/End: Original strand, 3562 - 3916
Alignment:
| Q |
377 |
ttagggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc |
476 |
Q |
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| T |
3562 |
ttagggtgtgtttgtttcaagttatatttgtagatttctaggaataaaattataaaaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc |
3661 |
T |
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| Q |
477 |
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576 |
Q |
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| T |
3662 |
ccgagtataaaatgttcctgggaatagaaaagttttctcaaagaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgaaaataaaattatgtgta-attacc |
3760 |
T |
 |
| Q |
577 |
tattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaaca-tatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattc |
675 |
Q |
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| T |
3761 |
tattatattccctatttttaaggttccttggaatattataatgttaacgaaacattttttttcctaaataccttggaataaaattcctatctttatattc |
3860 |
T |
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| Q |
676 |
taaggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaacacaccctta |
731 |
Q |
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| T |
3861 |
caaggaatgttattcataggaataaatttggtgcacttgaaacaaacacaccctta |
3916 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0238 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0238
Description:
Target: scaffold0238; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 381 - 601
Target Start/End: Original strand, 23297 - 23516
Alignment:
| Q |
381 |
ggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg |
480 |
Q |
| |
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| T |
23297 |
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23396 |
T |
 |
| Q |
481 |
gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctatt |
580 |
Q |
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| T |
23397 |
gtataaaatattcctgggaatataaatttttttccaaagaaaacggtgggaataaagtttccatgaagatgaaaataaattcatgtgta-actacctatt |
23495 |
T |
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| Q |
581 |
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601 |
Q |
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| T |
23496 |
ataatccctatttttaaggtt |
23516 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1480 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1480
Description:
Target: scaffold1480; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 379 - 551
Target Start/End: Original strand, 384 - 556
Alignment:
| Q |
379 |
agggtgtgtttatttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc |
478 |
Q |
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| T |
384 |
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483 |
T |
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| Q |
479 |
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551 |
Q |
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| T |
484 |
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556 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0005 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:
Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 579 - 723
Target Start/End: Original strand, 43292 - 43436
Alignment:
| Q |
579 |
ttataatccctatttttatggtttctaggaatattataaacctaaccaaacatatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaa |
678 |
Q |
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| T |
43292 |
ttataatctttatttttaaggttcctaaaaatatcataatgttaaacaaacatcttttttctaaatactttaaaataaaattcacatctttatattctaa |
43391 |
T |
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| Q |
679 |
ggaatattattcctaataataaatttgataaacttcaaacaaaca |
723 |
Q |
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| T |
43392 |
aaaatattattcctaaaaataaatttgacaaacttaaaataaaca |
43436 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0069 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:
Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 443 - 551
Target Start/End: Original strand, 21853 - 21961
Alignment:
| Q |
443 |
cctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtggaaataaagttccc |
542 |
Q |
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| T |
21853 |
cctatgtttgttgcaagtttattaaattttattcctagatataaaatgttcctgggtatgaaataacattcccaaaaaaaattgtgggaataaagttccc |
21952 |
T |
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| Q |
543 |
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551 |
Q |
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| T |
21953 |
atgaagatg |
21961 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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