View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21236_high_2 (Length: 466)

Name: NF21236_high_2
Description: NF21236
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21236_high_2
NF21236_high_2
[»] chr4 (47 HSPs)
chr4 (162-448)||(25618072-25618357)
chr4 (15-310)||(35096028-35096330)
chr4 (15-448)||(32429056-32429487)
chr4 (15-310)||(35090915-35091217)
chr4 (15-317)||(30019743-30020054)
chr4 (165-448)||(34279276-34279567)
chr4 (13-356)||(18670838-18671178)
chr4 (165-356)||(3409464-3409662)
chr4 (165-327)||(54859062-54859232)
chr4 (15-125)||(18737162-18737272)
chr4 (15-327)||(14643630-14643934)
chr4 (285-447)||(54859001-54859163)
chr4 (15-122)||(34279588-34279695)
chr4 (285-431)||(14643585-14643731)
chr4 (15-125)||(18716489-18716599)
chr4 (285-431)||(47071609-47071755)
chr4 (224-356)||(18716696-18716828)
chr4 (203-327)||(47071586-47071710)
chr4 (14-123)||(34128333-34128442)
chr4 (224-356)||(18737369-18737501)
chr4 (15-122)||(54859254-54859361)
chr4 (285-431)||(30019695-30019833)
chr4 (15-121)||(47071408-47071514)
chr4 (266-448)||(3424136-3424318)
chr4 (285-431)||(22118925-22119071)
chr4 (165-327)||(22118855-22119026)
chr4 (15-119)||(3424799-3424904)
chr4 (285-391)||(3409488-3409594)
chr4 (285-448)||(35091133-35091296)
chr4 (285-448)||(35096246-35096409)
chr4 (226-310)||(18671107-18671191)
chr4 (285-391)||(18671048-18671154)
chr4 (165-254)||(34128218-34128314)
chr4 (225-310)||(3424215-3424300)
chr4 (203-327)||(34601929-34602047)
chr4 (226-310)||(18716757-18716841)
chr4 (361-428)||(34601887-34601954)
chr4 (226-310)||(3409451-3409535)
chr4 (226-310)||(18737430-18737514)
chr4 (226-272)||(47071668-47071714)
chr4 (375-448)||(34128145-34128218)
chr4 (43-104)||(34602060-34602121)
chr4 (392-431)||(3409388-3409427)
chr4 (392-431)||(18716865-18716904)
chr4 (392-431)||(18737538-18737577)
chr4 (226-272)||(54859058-54859104)
chr4 (40-121)||(3409695-3409781)
[»] chr3 (51 HSPs)
chr3 (15-310)||(6857957-6858259)
chr3 (15-310)||(8458311-8458614)
chr3 (15-310)||(6852854-6853156)
chr3 (15-310)||(8464750-8465052)
chr3 (15-310)||(10672840-10673142)
chr3 (13-447)||(49784494-49784926)
chr3 (15-310)||(4049807-4050110)
chr3 (15-310)||(5481390-5481692)
chr3 (15-310)||(10591197-10591499)
chr3 (15-310)||(31076304-31076606)
chr3 (15-310)||(1302146-1302449)
chr3 (15-310)||(10584760-10585062)
chr3 (15-310)||(31081409-31081711)
chr3 (15-310)||(10677953-10678257)
chr3 (15-310)||(4054941-4055244)
chr3 (15-310)||(5457913-5458216)
chr3 (15-310)||(33702501-33702804)
chr3 (15-204)||(33703299-33703489)
chr3 (15-431)||(29827429-29827826)
chr3 (13-122)||(3187551-3187660)
chr3 (15-118)||(20891059-20891162)
chr3 (13-121)||(18024246-18024354)
chr3 (285-448)||(5481311-5481474)
chr3 (285-448)||(4050026-4050189)
chr3 (285-448)||(4055160-4055323)
chr3 (285-448)||(8458530-8458693)
chr3 (285-448)||(10672761-10672924)
chr3 (285-448)||(10677874-10678037)
chr3 (392-448)||(20891474-20891530)
chr3 (285-356)||(1302159-1302230)
chr3 (285-356)||(5457926-5457997)
chr3 (285-448)||(6852775-6852938)
chr3 (285-448)||(6857878-6858041)
chr3 (285-448)||(8464968-8465131)
chr3 (285-448)||(10584681-10584844)
chr3 (285-448)||(10591118-10591281)
chr3 (285-356)||(31076317-31076388)
chr3 (285-356)||(31081422-31081493)
chr3 (285-356)||(33702514-33702585)
chr3 (226-333)||(20891281-20891402)
chr3 (285-327)||(18024091-18024133)
chr3 (394-448)||(33702422-33702476)
chr3 (392-448)||(1302067-1302123)
chr3 (392-448)||(31081330-31081386)
chr3 (226-285)||(20891354-20891413)
chr3 (171-204)||(18024195-18024228)
chr3 (392-448)||(31076223-31076279)
chr3 (285-344)||(20891281-20891340)
chr3 (170-204)||(20891182-20891216)
chr3 (226-283)||(18023468-18023525)
chr3 (392-428)||(5457854-5457890)
[»] chr1 (40 HSPs)
chr1 (17-448)||(43358755-43359183)
chr1 (15-310)||(28574297-28574599)
chr1 (15-310)||(28598309-28598611)
chr1 (15-310)||(3468067-3468370)
chr1 (15-431)||(10186362-10186783)
chr1 (26-360)||(21431533-21431865)
chr1 (15-153)||(3465473-3465611)
chr1 (17-327)||(19310826-19311132)
chr1 (15-258)||(44523985-44524226)
chr1 (13-331)||(1187826-1188134)
chr1 (269-431)||(10185891-10186053)
chr1 (15-133)||(17414621-17414740)
chr1 (285-431)||(19311031-19311177)
chr1 (15-124)||(35626172-35626281)
chr1 (165-335)||(16051335-16051512)
chr1 (285-448)||(16051403-16051566)
chr1 (285-431)||(13654527-13654673)
chr1 (15-138)||(13654335-13654461)
chr1 (285-431)||(1188029-1188175)
chr1 (285-391)||(21431561-21431667)
chr1 (15-76)||(16051206-16051267)
chr1 (174-327)||(13654468-13654628)
chr1 (224-414)||(35626336-35626525)
chr1 (287-431)||(35653093-35653237)
chr1 (285-356)||(3468286-3468357)
chr1 (285-448)||(28574515-28574678)
chr1 (344-433)||(44523928-44524017)
chr1 (285-448)||(28598527-28598690)
chr1 (203-293)||(35653172-35653262)
chr1 (226-323)||(10185907-10186004)
chr1 (261-331)||(1188219-1188289)
chr1 (226-310)||(3701367-3701451)
chr1 (13-57)||(29681588-29681632)
chr1 (13-57)||(48366213-48366257)
chr1 (167-204)||(17414583-17414620)
chr1 (393-428)||(17414365-17414400)
chr1 (285-367)||(3701369-3701451)
chr1 (285-327)||(44523975-44524017)
chr1 (318-431)||(1188217-1188330)
chr1 (250-310)||(3696233-3696293)
[»] chr5 (26 HSPs)
chr5 (15-356)||(2022964-2023301)
chr5 (15-310)||(9877441-9877743)
chr5 (15-310)||(9872326-9872628)
chr5 (15-327)||(13556189-13556509)
chr5 (15-310)||(39908958-39909260)
chr5 (15-310)||(39903845-39904147)
chr5 (15-431)||(35368682-35369095)
chr5 (285-448)||(13556127-13556290)
chr5 (15-131)||(4555653-4555769)
chr5 (285-431)||(43540623-43540768)
chr5 (226-310)||(2023230-2023314)
chr5 (183-356)||(43379556-43379731)
chr5 (165-327)||(43540668-43540834)
chr5 (285-448)||(9872247-9872410)
chr5 (285-448)||(9877362-9877525)
chr5 (50-121)||(43540857-43540928)
chr5 (37-109)||(25184114-25184186)
chr5 (285-356)||(39909176-39909247)
chr5 (285-391)||(2023171-2023277)
chr5 (15-69)||(43378437-43378491)
chr5 (392-447)||(24091812-24091867)
chr5 (285-447)||(39904063-39904225)
chr5 (285-367)||(43379601-43379683)
chr5 (167-204)||(4555772-4555809)
chr5 (388-448)||(39909279-39909339)
chr5 (88-144)||(43378485-43378541)
[»] chr2 (18 HSPs)
chr2 (15-310)||(45120386-45120689)
chr2 (15-310)||(14917284-14917586)
chr2 (15-310)||(17720428-17720730)
chr2 (15-316)||(42780184-42780481)
chr2 (15-305)||(30283357-30283645)
chr2 (15-428)||(716267-716674)
chr2 (162-365)||(20892197-20892406)
chr2 (285-428)||(42780391-42780534)
chr2 (15-123)||(16284437-16284546)
chr2 (285-448)||(45120605-45120768)
chr2 (285-448)||(14917205-14917368)
chr2 (285-356)||(30283365-30283436)
chr2 (285-447)||(17720350-17720512)
chr2 (392-448)||(39178924-39178980)
chr2 (392-448)||(17720022-17720078)
chr2 (383-431)||(20892157-20892205)
chr2 (315-356)||(39178847-39178888)
chr2 (392-448)||(30283273-30283329)
[»] scaffold0223 (3 HSPs)
scaffold0223 (15-310)||(1921-2223)
scaffold0223 (285-356)||(1934-2005)
scaffold0223 (392-448)||(1842-1898)
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (15-310)||(26986891-26987193)
chr8 (15-310)||(34108229-34108533)
chr8 (15-310)||(14314813-14315115)
chr8 (15-310)||(14318517-14318819)
chr8 (15-310)||(18494079-18494380)
chr8 (17-327)||(43956735-43957051)
chr8 (15-310)||(26981777-26982080)
chr8 (13-313)||(10340866-10341163)
chr8 (15-367)||(25953019-25953363)
chr8 (285-448)||(43956673-43956836)
chr8 (15-123)||(18608724-18608832)
chr8 (285-431)||(18608491-18608636)
chr8 (165-327)||(18608535-18608703)
chr8 (16-87)||(18885065-18885136)
chr8 (285-448)||(34108449-34108612)
chr8 (285-448)||(14318438-14318601)
chr8 (285-356)||(18494092-18494163)
chr8 (285-448)||(26986812-26986975)
chr8 (165-311)||(1781968-1782118)
chr8 (285-431)||(1782036-1782179)
chr8 (285-356)||(14314826-14314897)
chr8 (285-448)||(26981698-26981861)
chr8 (285-356)||(10340882-10340953)
chr8 (45-115)||(1781869-1781939)
chr8 (392-448)||(18494000-18494056)
chr8 (226-315)||(25953012-25953101)
chr8 (392-448)||(14314734-14314790)
[»] chr7 (30 HSPs)
chr7 (15-310)||(12856789-12857091)
chr7 (15-310)||(26051021-26051323)
chr7 (15-310)||(26056134-26056436)
chr7 (15-310)||(26060380-26060682)
chr7 (15-310)||(26065493-26065795)
chr7 (15-310)||(12851674-12851978)
chr7 (15-163)||(14610364-14610512)
chr7 (15-110)||(11056625-11056720)
chr7 (15-123)||(4181478-4181585)
chr7 (15-295)||(5440217-5440492)
chr7 (15-295)||(5449227-5449502)
chr7 (13-122)||(37459938-37460047)
chr7 (285-448)||(12851894-12852057)
chr7 (15-76)||(35352434-35352495)
chr7 (285-448)||(12857007-12857170)
chr7 (285-448)||(26051239-26051402)
chr7 (285-448)||(26056352-26056515)
chr7 (285-448)||(26060598-26060761)
chr7 (285-448)||(26065711-26065874)
chr7 (165-311)||(35352221-35352375)
chr7 (203-310)||(14610524-14610631)
chr7 (285-356)||(14610547-14610618)
chr7 (165-258)||(4181357-4181457)
chr7 (285-354)||(5440217-5440286)
chr7 (285-354)||(5449227-5449296)
chr7 (165-273)||(37459802-37459917)
chr7 (13-57)||(5436692-5436736)
chr7 (378-422)||(37459771-37459815)
chr7 (285-327)||(4181347-4181389)
chr7 (388-428)||(14610650-14610690)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (15-310)||(21275773-21276075)
chr6 (13-431)||(21936467-21936886)
chr6 (13-425)||(21937568-21937983)
chr6 (15-367)||(24509703-24510061)
chr6 (165-428)||(20751922-20752192)
chr6 (204-364)||(24508708-24508868)
chr6 (15-130)||(20752207-20752322)
chr6 (15-130)||(24508917-24509032)
chr6 (15-121)||(2887490-2887596)
chr6 (15-121)||(2889212-2889318)
chr6 (285-448)||(11183010-11183173)
chr6 (15-122)||(11183263-11183370)
chr6 (285-367)||(24508764-24508846)
chr6 (346-431)||(12909533-12909618)
chr6 (346-431)||(12934640-12934725)
chr6 (224-331)||(11183068-11183175)
chr6 (285-448)||(21275991-21276154)
chr6 (226-331)||(24508682-24508787)
chr6 (285-387)||(24509918-24510022)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (15-327)||(173358-173662)
scaffold0005 (285-431)||(173561-173707)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (285-431)||(144288-144434)
scaffold0006 (15-138)||(144096-144222)
scaffold0006 (174-327)||(144229-144389)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 47)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 162 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 25618357 - 25618072
Alignment:
Q  162 aactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgacatgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccact 261  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  25618357 aactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgacatgagagaaaacacctctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcatccagt 25618258  T
Q  262 tgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaag 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25618257 tgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttcattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaa 25618158  T
Q  362 gttcatgaagaacccttttgtcaaaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25618157 gttcattaagaacccttttgtcaaaggttacaatgtatatgaaaga-tctcatgaacagttacaactcttagttctaaagtgattcc 25618072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Original strand, 35096028 - 35096330
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35096028 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 35096127  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  35096128 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 35096227  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 307  Q
    ||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  35096228 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 35096327  T
Q  308 tta 310  Q
    |||    
T  35096328 tta 35096330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 32429487 - 32429056
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||  ||    
T  32429487 tattttacagatttatggttccaacaattcactcatgcattaaagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatccaa 32429388  T
Q  115 caaaattctgtccaaa-ttgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgac-------at 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||           |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  32429387 caaaattctgtccaaaattgtgtgttgttgtgtg-----------tccaactaatgcacaaatgccaagcatttatagtgcattatatgactcttcaaat 32429299  T
Q  207 gagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttt 306  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  32429298 gagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccctttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatgattc 32429199  T
Q  307 attaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca-aaggttacaatgtatatgaat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||| |   | |  |   | | || ||| ||||||||||||||    
T  32429198 attaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcattgtcatggttcattatctatcaataaataataatgttccaatgtatatgaat 32429099  T
Q  406 gattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32429098 gatttccatgaagagttacaactcttggttctaaagtgattcc 32429056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Original strand, 35090915 - 35091217
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  35090915 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaattttgatgaattatgttgttaatgtaa 35091014  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  35091015 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtatggtttttgtctcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 35091114  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 307  Q
    ||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  35091115 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 35091214  T
Q  308 tta 310  Q
    |||    
T  35091215 tta 35091217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 30020054 - 30019743
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30020054 tatttcacatatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 30019955  T
Q  115 caaaattctgtcc-aaattgtgtgtagttgtgtggt--ttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------ac 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  | || | | || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||       ||    
T  30019954 caaaattctgtccaaaattgtgtgttgttgtgttgttctgttctctgtcaaactaatgcccaaatgccaaacatttatagtgcattatatgacccttcac 30019855  T
Q  205 atgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggt 304  Q
    |||||||||| ||  | | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||   |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||    
T  30019854 atgagagaaagcacccatttgacttgaatc-atgttatggttcattaagcacctttttgccaaaggttatgatcatacacacttgaatcaatgcaaaggt 30019756  T
Q  305 ttattaagcaccc 317  Q
    | |||||||||||    
T  30019755 tcattaagcaccc 30019743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 165 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 34279567 - 34279276
Alignment:
Q  165 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacc 257  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| || ||| | ||||    
T  34279567 taatgctcaaatgtcgagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacactcatttgacttgaatcaatgttatggttaattgaacacc 34279468  T
Q  258 cacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgc 357  Q
    |  || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34279467 cttttaccaaaggttatgatcatatacacttaaatcaatgttaaggtttattaagcactcatttgccaaaggttataatcatatacacttgaatcaatgc 34279368  T
Q  358 aaaggttcatgaagaacccttttgtc-aaaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
     ||||||||| ||| |||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||    
T  34279367 taaggttcattaagcacccatttgtcaaaagattctaatgtatatgaatgattcccatgaagaattgaaacttttggttctaaagtgattcc 34279276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 356
Target Start/End: Original strand, 18670838 - 18671178
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||     
T  18670838 aatattttacagatttatggttccaacaagtcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgc 18670937  T
Q  113 aacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatcc-aactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------ac 204  Q
    |||| |||||||        || | || |||| |  || |||| | ||| || |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||       ||    
T  18670938 aacataattctg--------gtttcta-ttgtct--ttgttgtgtgtccaaattaattcccaaatgccaagcatttatagtccattatatgacccttcac 18671026  T
Q  205 atgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggt 304  Q
    |||||||||| ||  | | ||||||||||||||| |||| |||||||||| | |  || | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18671027 atgagagaaagcacccatttgacttgaatcaatgctatggttcattaagccctcttttaccaaaggttatcttcatatacacttgaatcaatgttatggt 18671126  T
Q  305 ttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatg 356  Q
    | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18671127 tcattaagcaccattttgccaaaggttataaccatatacacttaaatcaatg 18671178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 165 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3409662 - 3409464
Alignment:
Q  165 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacc 257  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||       ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3409662 taatgcccaaatgtcaaatatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacactcctttgacttgaatcaatgctatgattcattaagcacc 3409563  T
Q  258 cacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatg 356  Q
    |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  3409562 cctttgccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttcattaagtacccttttgccaaaggttataactatacacatttgaatcaatg 3409464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 165 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 54859232 - 54859062
Alignment:
Q  165 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacattcc-tgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcac 256  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||  || | |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  54859232 taatgcccaaatatcaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacaccccctttgacttgaatcaatgttatggttcattaagcat 54859133  T
Q  257 ccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaa 327  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  54859132 ccatttgccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatgtttcattaagcacccttttgccaaa 54859062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 125
Target Start/End: Original strand, 18737162 - 18737272
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||    
T  18737162 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgaattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaa 18737261  T
Q  115 caaaattctgt 125  Q
    |||||||||||    
T  18737262 caaaattctgt 18737272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 14643934 - 14643630
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  14643934 tattttagagatttatggttccagcaattcacctatacattagagaattgatggatgatttagagtaagagaattaggaagaattatgttgttgatgtaa 14643835  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 207  Q
    |||||||||       || | ||||         ||||  ||| |  || |||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||       |||||    
T  14643834 caaaattct------tttttctgta---------ttttgttatgttaaattaatgcacaaatatcaaacatttatagcgcattatatgacccttcacatg 14643750  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 307  Q
    | ||||||||  | | ||||||||||||||| || | |||||||| ||| |  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  14643749 atagaaaacacccatttgacttgaatcaatgctaaggttcattaaacactcctttgtcaaatgttatgatcatatacacttgaatcaatgttaaggttca 14643650  T
Q  308 ttaagcacccttttgccaaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14643649 ttaagcacccttttgccaaa 14643630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 285 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 54859163 - 54859001
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||  | | ||||| ||| ||||||||| ||    
T  54859163 acttgaatcaatgttatggttcattaagcatccatttgccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatgtttcattaagcacccttttgcca 54859064  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattc 447  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| | || ||| |||||||||||    
T  54859063 aaggttccaatgtatatgaatgattccaatgaagagttacaatttttggttgtaaagtgattc 54859001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 34279695 - 34279588
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  34279695 tattttacagatttatggtttcaggaattcactcatgcattagagaattgatggttgatttagagtaagagaacgaggaagaattatgttgttaatgtaa 34279596  T
Q  115 caaaattc 122  Q
    ||||||||    
T  34279595 caaaattc 34279588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 285 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 14643731 - 14643585
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||| ||| | |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  14643731 acttgaatcaatgctaaggttcattaaacactcctttgtcaaatgttatgatcatatacacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacccttttgcca 14643632  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 431  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14643631 aaggttccaatgtatatgaatgattcccatgaatagttacaactctt 14643585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 125
Target Start/End: Original strand, 18716489 - 18716599
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||||||||||| ||    
T  18716489 tattttacagatttatggttccagcaattcactcttgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgggggagaattatgttgttaatgcaa 18716588  T
Q  115 caaaattctgt 125  Q
    |||||||||||    
T  18716589 caaaattctgt 18716599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 285 - 431
Target Start/End: Original strand, 47071609 - 47071755
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||| || ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||| |||| ||    
T  47071609 acttgaatcaatgcaatggttcattaagcatccatttgccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttcattaagcacccatttgcca 47071708  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 431  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47071709 aaggttccaatgtatatgaatgattttcatgaagagttacaactctt 47071755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 224 - 356
Target Start/End: Original strand, 18716696 - 18716828
Alignment:
Q  224 tgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgc 323  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| | |  || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||    
T  18716696 tgacttgaatcaatgatatggttcattaagctctcttttaccaaaagttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttcattaagcactatttggc 18716795  T
Q  324 caaatgttataaccatatacacttgaatcaatg 356  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18716796 caaaggttataaccatatacacttgaatcaatg 18716828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 203 - 327
Target Start/End: Original strand, 47071586 - 47071710
Alignment:
Q  203 acatgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatg 302  Q
    ||||||||||||||| |  | |||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47071586 acatgagagaaaacacttttttgacttgaatcaatgcaatggttcattaagcatccatttgccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatg 47071685  T
Q  303 gtttattaagcacccttttgccaaa 327  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||    
T  47071686 gttcattaagcacccatttgccaaa 47071710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 34128442 - 34128333
Alignment:
Q  14 atattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgta 113  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| |||||||| |    
T  34128442 atattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagaaaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgca 34128343  T
Q  114 acaaaattct 123  Q
    ||||||||||    
T  34128342 acaaaattct 34128333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 224 - 356
Target Start/End: Original strand, 18737369 - 18737501
Alignment:
Q  224 tgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgc 323  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| | |  || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||    
T  18737369 tgacttgaatcaatgatatggttcattaagctctcttttaccaaaagttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttcattaagcacaatttagc 18737468  T
Q  324 caaatgttataaccatatacacttgaatcaatg 356  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  18737469 caaaggttataacaatatacacttgaatcaatg 18737501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 54859361 - 54859254
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| | ||||| ||||||||||||| |    
T  54859361 tattttacggatttatggttccagcaattcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagagcaagagaatgagggagaatcatgttgttaatgtga 54859262  T
Q  115 caaaattc 122  Q
    ||||||||    
T  54859261 caaaattc 54859254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 285 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 30019833 - 30019695
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||       ||    
T  30019833 acttgaatca-tgttatggttcattaagcacctttttgccaaaggttatgatcatacacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcacc-------ca 30019742  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 431  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  30019741 aaggttccaatgtatatgaaagattcccatgaagagttacaactctt 30019695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 47071408 - 47071514
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  47071408 tattttacaaatttatggttcaaacaattcactcattcattagagaattgatagataatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 47071507  T
Q  115 caaaatt 121  Q
    |||||||    
T  47071508 caaaatt 47071514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 266 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 3424318 - 3424136
Alignment:
Q  266 aaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttc 365  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||  | |||||    
T  3424318 aaaggttatgatcatatcgacttaaatcaatgttatggttcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatacacatttgaatcaatgtcatggttc 3424219  T
Q  366 atgaagaacccttttgtca-aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    || |   | |  |   | | || ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3424218 attatctatcaataaataataatgttccaatgtatatg-atggttctcatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcc 3424136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 285 - 431
Target Start/End: Original strand, 22118925 - 22119071
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||| |||  ||||||| ||||||||||| |||||| || |||   | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||| ||    
T  22118925 acttgaatgaataatatggttcattaagcacccctttgccgaaggttgcgatcatatacacttgaatcaatgctaaggttcattaagcacccatttgcca 22119024  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 431  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  22119025 aaggttccaatgtaaatgaatgattttcaggaagagttgcaactctt 22119071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 165 - 327
Target Start/End: Original strand, 22118855 - 22119026
Alignment:
Q  165 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaa--cattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagca 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||       |||||||||||  ||  ||| |||||||||| |||  |||| |||||||||||    
T  22118855 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtatattatatgacccttcacatgagagaaaatacacccctttgacttgaatgaataatatggttcattaagca 22118954  T
Q  256 cccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaa 327  Q
    |||  ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||    
T  22118955 cccctttgccgaaggttgcgatcatatacacttgaatcaatgctaaggttcattaagcacccatttgccaaa 22119026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 3424904 - 3424799
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaaga-attatgttgttaatgta 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| | |||  |||||||||||| |||    
T  3424904 tattttacagatttatgtttccagtaactcactcatgcattagagaattaatggatgatttagagtaagagaatgagggagatcttatgttgttaaagta 3424805  T
Q  114 acaaaa 119  Q
    ||||||    
T  3424804 acaaaa 3424799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 285 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 3409594 - 3409488
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||||||||| ||    
T  3409594 acttgaatcaatgctatgattcattaagcacccctttgccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttcattaagtacccttttgcca 3409495  T
Q  385 aaggtta 391  Q
    |||||||    
T  3409494 aaggtta 3409488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 285 - 448
Target Start/End: Original strand, 35091133 - 35091296
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  35091133 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 35091232  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  35091233 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcc 35091296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 285 - 448
Target Start/End: Original strand, 35096246 - 35096409
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  35096246 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 35096345  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  35096346 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaactttttgttctaaagtgattcc 35096409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 310
Target Start/End: Original strand, 18671107 - 18671191
Alignment:
Q  226 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttatta 310  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||   |||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  18671107 acttgaatcaatgttatggttcattaagcaccattttgccaaaggttataaccatatacacttaaatcaatgtcatggttcatta 18671191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 285 - 391
Target Start/End: Original strand, 18671048 - 18671154
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||| ||||| ||    
T  18671048 acttgaatcaatgctatggttcattaagccctcttttaccaaaggttatcttcatatacacttgaatcaatgttatggttcattaagcaccattttgcca 18671147  T
Q  385 aaggtta 391  Q
    |||||||    
T  18671148 aaggtta 18671154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 34128314 - 34128218
Alignment:
Q  165 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagc 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34128314 taatggccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgacccttcacattagagaaaacactcatttgacttgaatcaatgttatagttcattaagc 34128218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3424300 - 3424215
Alignment:
Q  225 gacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttatta 310  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||| ||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  3424300 gacttaaatcaatgttatggttcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatacacatttgaatcaatgtcatggttcatta 3424215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 34602047 - 34601929
Alignment:
Q  203 acatgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatg 302  Q
    |||||||| |||||| || | ||||||||||||||| |||  |||||||| || ||| |||  ||||||||||||||||||       ||||||||||||    
T  34602047 acatgagaaaaaacactcatttgacttgaatcaatgctatagttcattaaacatccatttgtcaaaggttatgatcatata------tatcaatgttatg 34601954  T
Q  303 gtttattaagcacccttttgccaaa 327  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||    
T  34601953 gttcattaagcacccctttgccaaa 34601929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 310
Target Start/End: Original strand, 18716757 - 18716841
Alignment:
Q  226 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttatta 310  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    | || ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18716757 acttgaatcaatgttatggttcattaagcactatttggccaaaggttataaccatatacacttgaatcaatgtcatggttcatta 18716841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 34601954 - 34601887
Alignment:
Q  361 ggttcatgaagaacccttttgtcaaaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaact 428  Q
    ||||||| ||| |||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34601954 ggttcattaagcacccctttgccaaagattcaaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaact 34601887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3409535 - 3409451
Alignment:
Q  226 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttatta 310  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||| ||||||||| |  ||| ||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  3409535 acttgaatcaatgttatggttcattaagtacccttttgccaaaggttataactatacacatttgaatcaatgtcatggttcatta 3409451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 310
Target Start/End: Original strand, 18737430 - 18737514
Alignment:
Q  226 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttatta 310  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    | || ||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18737430 acttgaatcaatgttatggttcattaagcacaatttagccaaaggttataacaatatacacttgaatcaatgtcatggttcatta 18737514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 272
Target Start/End: Original strand, 47071668 - 47071714
Alignment:
Q  226 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggtt 272  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  47071668 acttgaatcaatgttatggttcattaagcacccatttgccaaaggtt 47071714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 34128218 - 34128145
Alignment:
Q  375 ccttttgtcaaaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||   |||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  34128218 ccttttgccaaaggttccaatatatatgaaagattctcacagagagttacaacttttggttctaaaatgattcc 34128145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 34602121 - 34602060
Alignment:
Q  43 tcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgtt 104  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||| ||||    
T  34602121 tcactcatgcataagaaaattgatggatgatttagagtaaaagaatgagggagaattgtgtt 34602060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 3409427 - 3409388
Alignment:
Q  392 caatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 431  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3409427 caatgtatatgaatggttctcatgaagagttacaaatctt 3409388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 431
Target Start/End: Original strand, 18716865 - 18716904
Alignment:
Q  392 caatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 431  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  18716865 caatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaactctt 18716904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 431
Target Start/End: Original strand, 18737538 - 18737577
Alignment:
Q  392 caatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 431  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  18737538 caatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaactctt 18737577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 54859104 - 54859058
Alignment:
Q  226 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggtt 272  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  54859104 acttgaatcaatgttatgtttcattaagcacccttttgccaaaggtt 54859058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 3409781 - 3409695
Alignment:
Q  40 aattcactcatgcattagagaatt----gatggatgatttagaataatagaatgatgaaga-attatgttgttaatgtaacaaaatt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| ||| ||||||| | |||  |||||||||||| ||| |||||||    
T  3409781 aattcactcatgcattagagaattaatatatggatgatttagagtaagagaatgagggagatcttatgttgttaaagtatcaaaatt 3409695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 51)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 6858259 - 6857957
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6858259 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 6858160  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  6858159 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 6858060  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 307  Q
    ||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  6858059 agagaaatcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcatcaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 6857960  T
Q  308 tta 310  Q
    |||    
T  6857959 tta 6857957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Original strand, 8458311 - 8458614
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8458311 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 8458410  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgccc-aaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       ||||    
T  8458411 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 8458510  T
Q  207 gagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttt 306  Q
    |||||||||||   || | |||||||||||||  |||||||||||| |||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||     
T  8458511 gagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaccacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgttatggttc 8458610  T
Q  307 atta 310  Q
    ||||    
T  8458611 atta 8458614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 6853156 - 6852854
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6853156 tattttacagatttatggttccagcaattcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 6853057  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  6853056 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 6852957  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 307  Q
    ||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  6852956 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcatcaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 6852857  T
Q  308 tta 310  Q
    |||    
T  6852856 tta 6852854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Original strand, 8464750 - 8465052
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8464750 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 8464849  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  8464850 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 8464949  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 307  Q
    ||||||| ||   || | |||||||||||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||| | |||||| |||||| ||||||| |||||| |    
T  8464950 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcaccattttgccaaaggttataaccatatatacttgagtcaatgtcatggttca 8465049  T
Q  308 tta 310  Q
    |||    
T  8465050 tta 8465052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10673142 - 10672840
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10673142 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 10673043  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  10673042 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 10672943  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 307  Q
    ||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  10672942 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 10672843  T
Q  308 tta 310  Q
    |||    
T  10672842 tta 10672840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 447
Target Start/End: Original strand, 49784494 - 49784926
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgt 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| |  |||||||||||||||||     
T  49784494 aatattttccagatttatggttccagcaattcactcatgaattagagaattgatagatgatttaaagtaaaagaatgagggggaattatgttgttaatgc 49784593  T
Q  113 aacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgac-------a 205  Q
    |||||||||||||||||| |         |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |    
T  49784594 aacaaaattctgtccaaaat---------tgtgtg-ttgttgtatgtccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcaca 49784683  T
Q  206 tgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtt 305  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49784684 tgagagaaaacactcatttgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccatttgccaaagcttatgatcatatacacttgaatcaatgatatggtt 49784783  T
Q  306 tattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca-aaggttacaatgtatatgaa 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |   | |  |   | | || ||| |||||||||||||    
T  49784784 tattatgcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgtcatggttcattatctatcaataaataataatgttccaatgtatatgaa 49784883  T
Q  405 tgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattc 447  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  49784884 tgatttccatgaagagttacaacttttggttttaaagtgattc 49784926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Original strand, 4049807 - 4050110
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4049807 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 4049906  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtgg-tttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||    
T  4049907 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttttgtatcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 4050006  T
Q  207 gagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttt 306  Q
    |||||||||||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||     
T  4050007 gagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttc 4050106  T
Q  307 atta 310  Q
    ||||    
T  4050107 atta 4050110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5481692 - 5481390
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5481692 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 5481593  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  5481592 caaaattctgtccaagttgtgtgtagttgtgtggtttttttatcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 5481493  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 307  Q
    ||||||| ||    | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  5481492 agagaaagcacctatttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 5481393  T
Q  308 tta 310  Q
    |||    
T  5481392 tta 5481390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10591499 - 10591197
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10591499 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaggaattatgttgttaatgtaa 10591400  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  10591399 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 10591300  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 307  Q
    ||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  || | ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  10591299 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttaccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 10591200  T
Q  308 tta 310  Q
    |||    
T  10591199 tta 10591197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31076606 - 31076304
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31076606 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 31076507  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||       |||||    
T  31076506 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatgttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttataatgcattatatgactcttcacatg 31076407  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 307  Q
    ||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  31076406 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 31076307  T
Q  308 tta 310  Q
    |||    
T  31076306 tta 31076304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1302449 - 1302146
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1302449 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 1302350  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggt-ttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acat 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||    
T  1302349 caaaattttgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 1302250  T
Q  207 gagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttt 306  Q
    |||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||     
T  1302249 gagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttc 1302150  T
Q  307 atta 310  Q
    ||||    
T  1302149 atta 1302146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10585062 - 10584760
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10585062 tattttacagatttatggttctagctattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaggaattatgttgttaatgtaa 10584963  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  10584962 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 10584863  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 307  Q
    ||||||||||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| | |||||||||||| |||||| |    
T  10584862 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatatttgaatcaatgtcatggttca 10584763  T
Q  308 tta 310  Q
    |||    
T  10584762 tta 10584760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31081711 - 31081409
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31081711 tattttacagatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 31081612  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||       |||||    
T  31081611 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatgttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttataatgcattatatgactcttcacatg 31081512  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 307  Q
    ||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  31081511 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 31081412  T
Q  308 tta 310  Q
    |||    
T  31081411 tta 31081409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10678257 - 10677953
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10678257 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 10678158  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg---------aca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||    
T  10678157 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgtgactcttcaca 10678058  T
Q  206 tgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtt 305  Q
    ||| ||||| ||    | | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10678057 tgaaagaaagcacctttttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggtt 10677958  T
Q  306 tatta 310  Q
     ||||    
T  10677957 catta 10677953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Original strand, 4054941 - 4055244
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4054941 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattaaagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 4055040  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtgg-tttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acat 206  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||    
T  4055041 caaaattctatccaaattgtgtgtagttgtgtggttttttgtatcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 4055140  T
Q  207 gagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttt 306  Q
    |||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||     
T  4055141 gagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttc 4055240  T
Q  307 atta 310  Q
    ||||    
T  4055241 atta 4055244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5458216 - 5457913
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5458216 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 5458117  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggt-ttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acat 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||    
T  5458116 caaaattctgtccaagttgtgtgtagttgtgtggttttttttatcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 5458017  T
Q  207 gagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttt 306  Q
    |||||||| ||    | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| || |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||     
T  5458016 gagagaaagcacctatttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaagggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttc 5457917  T
Q  307 atta 310  Q
    ||||    
T  5457916 atta 5457913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 33702804 - 33702501
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33702804 tattttacatatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 33702705  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggt-ttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||    
T  33702704 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttttgtctattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 33702605  T
Q  207 gagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttt 306  Q
    |||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | | |||| |||||||||||||| ||||||     
T  33702604 gagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccttatatacttgaatcaatgtcatggttc 33702505  T
Q  307 atta 310  Q
    ||||    
T  33702504 atta 33702501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 204
Target Start/End: Original strand, 33703299 - 33703489
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33703299 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 33703398  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtgg-tttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgac 204  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33703399 caaaattatgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgac 33703489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 431
Target Start/End: Original strand, 29827429 - 29827826
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| | ||||||| ||| |||||| ||    
T  29827429 tattttacagatttat-----cagcaattcactcatgcattagagaattgatgaatgatttagagtaagagaatgagggagaattaggttattaatgcaa 29827523  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgac------atga 208  Q
    |||||||||          ||| ||      || |||||||    | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||      ||||    
T  29827524 caaaattct----------tgttta------tgttttttgt----caaactaatgcccaaatgccaagcatttataatgcattatatgactttcacatga 29827603  T
Q  209 gagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttat 308  Q
     ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||| || |||| ||    
T  29827604 tagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatgattcattaagcaccattttgccaaagattatgaccatacacacttgaatcaatgctaaggttcat 29827703  T
Q  309 taagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtcaaaggttacaatgtatatgaatgat 408  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  |||| |||||||| |||| |||||||| |||    
T  29827704 taagcaccaatttgtcaaatgttataatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaaacacctgtttgccaaaggttccaatctatatgaaagat 29827803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 3187660 - 3187551
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3187660 aatattttacagatttatggttcgagcaattcactcatgcattaaagaattgatagatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgt 3187561  T
Q  113 aacaaaattc 122  Q
     |||||||||    
T  3187560 cacaaaattc 3187551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Original strand, 20891059 - 20891162
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  20891059 tattttatagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagcgaatgagggagaattatgttgtttatgtaa 20891158  T
Q  115 caaa 118  Q
    ||||    
T  20891159 caaa 20891162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 18024354 - 18024246
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgt 112  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18024354 aatattttacagatttattgttctaacaattcattcatgcattagagaattgatgaatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgt 18024255  T
Q  113 aacaaaatt 121  Q
    |||||||||    
T  18024254 aacaaaatt 18024246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 285 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 5481474 - 5481311
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  5481474 acttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 5481375  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5481374 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcc 5481311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 285 - 448
Target Start/End: Original strand, 4050026 - 4050189
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  4050026 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 4050125  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4050126 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcc 4050189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 285 - 448
Target Start/End: Original strand, 4055160 - 4055323
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  4055160 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 4055259  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4055260 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcc 4055323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 285 - 448
Target Start/End: Original strand, 8458530 - 8458693
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  8458530 acttgaatcaatgccatgattcattaaccacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgttatggttcattattaataataaataat 8458629  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8458630 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttagttctaaagtgattcc 8458693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 285 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 10672924 - 10672761
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  10672924 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 10672825  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10672824 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcc 10672761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 285 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 10678037 - 10677874
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  10678037 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 10677938  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10677937 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcc 10677874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 392 - 448
Target Start/End: Original strand, 20891474 - 20891530
Alignment:
Q  392 caatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20891474 caatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcc 20891530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 285 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1302230 - 1302159
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatg 356  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  1302230 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatg 1302159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 285 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5457997 - 5457926
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatg 356  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5457997 acttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaagggttataaccatatatacttgaatcaatg 5457926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 285 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 6852938 - 6852775
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||||||  ||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  6852938 acttgaatcaatgccatgattcatcaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 6852839  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  6852838 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcc 6852775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 285 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 6858041 - 6857878
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||||||  ||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  6858041 acttgaatcaatgccatgattcatcaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 6857942  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  6857941 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcc 6857878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 285 - 448
Target Start/End: Original strand, 8464968 - 8465131
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  8464968 acttgaatcaatgtcatgattcattaagcaccattttgccaaaggttataaccatatatacttgagtcaatgtcatggttcattattaataataaataat 8465067  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  8465068 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcc 8465131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 285 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 10584844 - 10584681
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  10584844 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatatttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 10584745  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10584744 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcc 10584681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 285 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 10591281 - 10591118
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  10591281 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttaccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 10591182  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10591181 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcc 10591118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 285 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 31076388 - 31076317
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatg 356  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  31076388 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatg 31076317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 285 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 31081493 - 31081422
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatg 356  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  31081493 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatg 31081422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 285 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 33702585 - 33702514
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatg 356  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  33702585 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccttatatacttgaatcaatg 33702514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 333
Target Start/End: Original strand, 20891281 - 20891402
Alignment:
Q  226 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatac--------------acttgaatcaatgttatggtttattaa 311  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||              ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  20891281 acttgaatcaatgatatggttcattaagcaaccatttgccaaaggttatgatcatatacatcagatttgttttacttgaatcaatgctatggttcattaa 20891380  T
Q  312 gcacccttttgccaaatgttat 333  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  20891381 gcacccttttgccaaaggttat 20891402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 285 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 18024133 - 18024091
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18024133 acttgaatcaatgttatggtttattaaacacccttttgccaaa 18024091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 394 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 33702476 - 33702422
Alignment:
Q  394 atgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33702476 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcc 33702422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 1302123 - 1302067
Alignment:
Q  392 caatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1302123 caatatatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcc 1302067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 31081386 - 31081330
Alignment:
Q  392 caatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  31081386 caatgtatatgaatggttcccatgaagagtcacaacttttggttctaaagtgattcc 31081330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Original strand, 20891354 - 20891413
Alignment:
Q  226 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatataca 285  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||    
T  20891354 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatggtcatataca 20891413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18024228 - 18024195
Alignment:
Q  171 ccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgac 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18024228 ccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgac 18024195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 392 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 31076279 - 31076223
Alignment:
Q  392 caatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  31076279 caatgtatatgaatggtttccatgaagagtcacaacttttggttctaaagtgattcc 31076223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 344
Target Start/End: Original strand, 20891281 - 20891340
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatataca 344  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  20891281 acttgaatcaatgatatggttcattaagcaaccatttgccaaaggttatgatcatataca 20891340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 204
Target Start/End: Original strand, 20891182 - 20891216
Alignment:
Q  170 cccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgac 204  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20891182 cccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac 20891216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18023525 - 18023468
Alignment:
Q  226 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatata 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || | || |||||||| ||||||    
T  18023525 acttgaatcaatgatatgattcattaagcacccctttaccaacggttatgaccatata 18023468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 392 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 5457890 - 5457854
Alignment:
Q  392 caatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaact 428  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5457890 caatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaact 5457854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 40)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 448
Target Start/End: Original strand, 43358755 - 43359183
Alignment:
Q  17 ttttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaaca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  43358755 ttttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggataatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaaca 43358854  T
Q  117 aaattctgtccaaa-ttgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgac-------atga 208  Q
    |||||| ||||||| |||||||| || |||||           ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||       ||||    
T  43358855 aaattcagtccaaaattgtgtgttgtagtgtg-----------tccaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattataggactcttcacatga 43358943  T
Q  209 gagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttat 308  Q
    |||||| || || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43358944 gagaaagcactcatttgacttgaatcaatgctatgattcattaagcacccctttgccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttcat 43359043  T
Q  309 taagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca-aaggttacaatgtatatgaatga 407  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||| |  || |  |   | | || ||| ||||||||||||||||    
T  43359044 t-agcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatatcatggttcattatcaatcaataaataataatgttccaatgtatatgaatga 43359142  T
Q  408 ttctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43359143 ttctcatgaagagttacaactcttggttctaaagtgattcc 43359183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Original strand, 28574297 - 28574599
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28574297 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 28574396  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  28574397 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 28574496  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 307  Q
    ||||||||||    | | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  28574497 agagaaaacacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 28574596  T
Q  308 tta 310  Q
    |||    
T  28574597 tta 28574599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Original strand, 28598309 - 28598611
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28598309 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 28598408  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  28598409 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 28598508  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 307  Q
    ||||||||||    | | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  28598509 agagaaaacacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 28598608  T
Q  308 tta 310  Q
    |||    
T  28598609 tta 28598611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Original strand, 3468067 - 3468370
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3468067 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 3468166  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtgg-tttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||    
T  3468167 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttttgtatcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 3468266  T
Q  207 gagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttt 306  Q
    |||||||| ||   || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||     
T  3468267 gagagaaagcacatctttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttc 3468366  T
Q  307 atta 310  Q
    ||||    
T  3468367 atta 3468370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 10186783 - 10186362
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10186783 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 10186684  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttt-tgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgac-------at 206  Q
    |||||||||||||||| | | ||| ||| | || | || ||| | || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       ||    
T  10186683 caaaattctgtccaaaat-tatgttgttat-tgttcttctgtgt-tcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcacat 10186587  T
Q  207 gagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttt 306  Q
    |||||||| ||  | | ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  10186586 gagagaaagcacccatttgacttgaaccaatgctatggttcattaagcacccctttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgctatggttc 10186487  T
Q  307 attaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtcaaaggttacaatgtatatgaatg 406  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||  |||| |||| ||| |||| ||||  ||| ||| ||||||||||||| |    
T  10186486 attaagcacccttttgccaaaagttacaaccatataaacttcaatcaatgataaggctcattaagcacccctttgctaaaagtttcaatgtatatgaaag 10186387  T
Q  407 attctcatgaagagttacaactctt 431  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  10186386 attcccatgaagagttacaactctt 10186362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 21431865 - 21431533
Alignment:
Q  26 tttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgt 125  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||      
T  21431865 tttatggttccatcaattcactgatgcattagagaattgatggatgatttagattaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct-- 21431768  T
Q  126 ccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacat 218  Q
          ||| | | ||| | || || || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||     
T  21431767 ------tgt-tcttgttttctg-ttgttctctgtccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaagcac 21431676  T
Q  219 tcc-tgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcaccc 317  Q
     || | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  21431675 cccctttgacttaaatcaatgttatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatacacacttgaatcaatgttaaggttcatcaagcaccc 21431576  T
Q  318 ttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaa 360  Q
     ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21431575 atttgccaaaggttataattatatacacttgaatcaatgcaaa 21431533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 153
Target Start/End: Original strand, 3465473 - 3465611
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3465473 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 3465572  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttt 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3465573 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttt 3465611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 327
Target Start/End: Original strand, 19310826 - 19311132
Alignment:
Q  17 ttttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaaca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  19310826 ttttacagatttatggttccagcaattcattcatgcattagagaattgatggatgatttatagtaagagaatgagggagaattatattgttaatgtaaca 19310925  T
Q  117 aaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatgag 209  Q
    ||| |||||||||         | || ||| | |||||  | || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||       |||||||    
T  19310926 aaactctgtccaa---------aattatgttgcttttg--tgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattacatgacccttcacatgag 19311014  T
Q  210 agaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttatt 309  Q
    ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||    
T  19311015 agaaagcacccctttgacttgaatcaatgttatagttcattaagcacccttttaccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgctaaggttcatt 19311114  T
Q  310 aagcacccttttgccaaa 327  Q
    | |||||| |||||||||    
T  19311115 atgcacccctttgccaaa 19311132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 44524226 - 44523985
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  44524226 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttaaagtaagagaatgatggagaattatgttgttaatgcaa 44524127  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgac---------a 205  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||||        ||||   || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||         |    
T  44524126 caatattctgttcaaattgtgtgttgttg--------ttgt---tcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcacata 44524038  T
Q  206 tgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcaccc 258  Q
    |||| |||||||  | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44524037 tgagggaaaacacccatttgacttgaatcaatgttatggttcattaagcaccc 44523985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Original strand, 1187826 - 1188134
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  1187826 aatattttacagatttatggttctaccaattcactcatgcattaaagaattgatggatgatttagagtaagagaatga-ggagatttatgttgttaatgt 1187924  T
Q  113 aacaaaattc-tgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------ac 204  Q
    |||||||||| ||| |    ||||| | ||||||             || || ||||||||||||| |||||| ||||  || ||||||||       ||    
T  1187925 aacaaaattcttgttc----tgtgttttgttgtg-------------tcaaattaatgcccaaatggcaagcacttattatggattatatgactctacac 1188007  T
Q  205 atgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggt 304  Q
    ||||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  1188008 atgagagtaaacacccctttgacttgaattaatgttatggttcattaaacacccatttgccaaaggttatgatcatatacacttgtatcaatgctaaggt 1188107  T
Q  305 ttattaagcacccttttgccaaatgtt 331  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||    
T  1188108 tcattaatcatccttttgccaaatgtt 1188134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 269 - 431
Target Start/End: Original strand, 10185891 - 10186053
Alignment:
Q  269 ggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatg 368  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  10185891 ggttatgatcatatatacttgaatcaatgatatggttcattaagcacctttttgccaaaggttataaccatatacacttgaatcaacgctaaggttcatt 10185990  T
Q  369 aagaacccttttgtcaaaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 431  Q
    ||| |||| ||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  10185991 aagcacccatttgctaaaggtttcaatgtatatgaaagattcccataaagagttacaattctt 10186053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 17414740 - 17414621
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  17414740 tattttccagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 17414641  T
Q  115 caaaattc-tgtccaaattg 133  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  17414640 caaaattcatgtccaaattg 17414621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 285 - 431
Target Start/End: Original strand, 19311031 - 19311177
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| |||| ||    
T  19311031 acttgaatcaatgttatagttcattaagcacccttttaccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgctaaggttcattatgcacccctttgcca 19311130  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 431  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19311131 aaggttccaatgtatatgaaagattcccatgaagagttacaactctt 19311177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 124
Target Start/End: Original strand, 35626172 - 35626281
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  35626172 tattttatagatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 35626271  T
Q  115 caaaattctg 124  Q
    ||||||||||    
T  35626272 caaaattctg 35626281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 165 - 335
Target Start/End: Original strand, 16051335 - 16051512
Alignment:
Q  165 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacc 257  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||| |||||||  | | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||     
T  16051335 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgaccattcacatgagtgaaaacacccttttgacttgaatcaatgatatggttcattaagcact 16051434  T
Q  258 cacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataa 335  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | || ||| |||||||||||||    
T  16051435 catttgccaaatgttatgatcatatacacttgaatcaatgctatggttcattaagtatccatttaccaaatgttataa 16051512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 285 - 448
Target Start/End: Original strand, 16051403 - 16051566
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| | || |||  ||    
T  16051403 acttgaatcaatgatatggttcattaagcactcatttgccaaatgttatgatcatatacacttgaatcaatgctatggttcattaagtatccatttacca 16051502  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    || |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  16051503 aatgttataatgtatatgaatgattcccataaagagttataacttttggttctaaagtgattcc 16051566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 285 - 431
Target Start/End: Original strand, 13654527 - 13654673
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||| | |||| |||||||| |||||||||| |||||| ||| |||  |||| ||    
T  13654527 acttgaatcaatgttatggttcattaagtacccttttgccaagggttatgatcatacacacttgagtcaatgcaaaagttcattaagcacctatttgcca 13654626  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 431  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  13654627 aaggttccaatgtatatgaaagactctcatgaagagttacaactctt 13654673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 138
Target Start/End: Original strand, 13654335 - 13654461
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaat--aatagaatgatgaagaattatgttgttaatgt 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    || ||||||| | ||||||||||||||||||     
T  13654335 tattttacagatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagaattaatggatgatttagagagcaagagaatgagggagaattatgttgttaatgc 13654434  T
Q  113 aacaaaattctgtcc-aaattgtgtgt 138  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  13654435 aacaaaattctatccaaaattgtgtgt 13654461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 285 - 431
Target Start/End: Original strand, 1188029 - 1188175
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  | ||||||| ||    
T  1188029 acttgaattaatgttatggttcattaaacacccatttgccaaaggttatgatcatatacacttgtatcaatgctaaggttcattaatcatccttttgcca 1188128  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 431  Q
    || ||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  1188129 aatgttccaatgtatatgaaagattcccatgaatagttacaactctt 1188175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 285 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 21431667 - 21431561
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| |||| |||| ||    
T  21431667 acttaaatcaatgttatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatacacacttgaatcaatgttaaggttcatcaagcacccatttgcca 21431568  T
Q  385 aaggtta 391  Q
    |||||||    
T  21431567 aaggtta 21431561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 76
Target Start/End: Original strand, 16051206 - 16051267
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgattta 76  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16051206 tattttacagatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgattta 16051267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 174 - 327
Target Start/End: Original strand, 13654468 - 13654628
Alignment:
Q  174 aatgtcaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcga 266  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||       |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||| |    
T  13654468 aatgccaagtatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatggttcattaagtacccttttgcca 13654567  T
Q  267 aaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaa 327  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||  |  ||| ||||||||||  |||||||||    
T  13654568 agggttatgatcatacacacttgagtcaatgcaaaagttcattaagcacctatttgccaaa 13654628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 224 - 414
Target Start/End: Original strand, 35626336 - 35626525
Alignment:
Q  224 tgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgc 323  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| | |||||  |||| ||| |||||||| ||| || |||||||||||| || |||| |||||  ||| |||||     
T  35626336 tgacttgcatcaatgttatggttcatttaacacccttttgccaaaagttatgattatacactcttgaatcaatgctaaggttcattaaatacc-ttttgt 35626434  T
Q  324 caaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtcaaaggttacaatgtatatgaatgattctcat 414  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||| ||| |||  |||| ||||| ||  |||||||||||| |||| ||||    
T  35626435 caaaggttataatcatatacacttgaatcaaagcagaagttcattaagtacctatttgccaaagattctaatgtatatgaaagattttcat 35626525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 287 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 35653237 - 35653093
Alignment:
Q  287 ttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtcaaa 386  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||| |||| ||||| | |||||||||||||||| || | || |||| | ||| |||| |||  ||||    
T  35653237 ttgaatcaatgatatggttcattaagcactcctttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatcgatcctaaagttcgttaagcaccccttttccaaa 35653138  T
Q  387 ggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 431  Q
    || | |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  35653137 ggctccaatatatatgaatgattcccatgaagtgttacaactctt 35653093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 285 - 356
Target Start/End: Original strand, 3468286 - 3468357
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatg 356  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  3468286 acttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatg 3468357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 285 - 448
Target Start/End: Original strand, 28574515 - 28574678
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  28574515 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 28574614  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28574615 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcc 28574678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 344 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 44524017 - 44523928
Alignment:
Q  344 acttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtcaaaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttag 433  Q
    |||||||||||||  | ||||||| ||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44524017 acttgaatcaatgttatggttcattaagcacccctttgacaaaggtttaaatgtatatgaatgattcccatgaagagttacaactcttag 44523928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 285 - 448
Target Start/End: Original strand, 28598527 - 28598690
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  28598527 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 28598626  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  28598627 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaattgattcc 28598690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 203 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 35653262 - 35653172
Alignment:
Q  203 acatgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatc 293  Q
    ||||||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35653262 acatgagagaaaacactcatttgaattgaatcaatgatatggttcattaagcactcctttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatc 35653172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 323
Target Start/End: Original strand, 10185907 - 10186004
Alignment:
Q  226 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgc 323  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||   |||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||| |||||    
T  10185907 acttgaatcaatgatatggttcattaagcacctttttgccaaaggttataaccatatacacttgaatcaacgctaaggttcattaagcacccatttgc 10186004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 331
Target Start/End: Original strand, 1188219 - 1188289
Alignment:
Q  261 ttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgtt 331  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||    
T  1188219 ttgccaaaggttatgataatatacacttgtatcaatgttaagattcattaagcatccttttgccaaatgtt 1188289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3701451 - 3701367
Alignment:
Q  226 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttatta 310  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| | | || | ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3701451 acttgaatcaatattatggttcattaagcatcaatttaccaaaggttgtgatcagatacacttgaatcaatgctatggttcatta 3701367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 57
Target Start/End: Original strand, 29681588 - 29681632
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattag 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29681588 aatattttacagatttatggttccagcaattcactaatgcattag 29681632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 48366257 - 48366213
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattag 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48366257 aatattttacagatttatggttccagcaattcactaatgcattag 48366213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17414620 - 17414583
Alignment:
Q  167 atgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgac 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17414620 atgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac 17414583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 17414400 - 17414365
Alignment:
Q  393 aatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaact 428  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17414400 aatgtatatgaatgattctaatgaagagttacaact 17414365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 285 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3701451 - 3701369
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcat 367  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||| ||||| ||| | | || |||||||||||||||||| | |||||||    
T  3701451 acttgaatcaatattatggttcattaagcatcaatttaccaaaggttgtgatcagatacacttgaatcaatgctatggttcat 3701369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 285 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 44524017 - 44523975
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  44524017 acttgaatcaatgttatggttcattaagcacccctttgacaaa 44523975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 431
Target Start/End: Original strand, 1188217 - 1188330
Alignment:
Q  318 ttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtcaaaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaa 417  Q
    |||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||  ||| ||||| ||| | ||||||| |||| ||| ||||  ||| ||| |||||  ||||     
T  1188217 ttttgccaaaggttatgataatatacacttgtatcaatgttaagattcattaagcatccttttgccaaatgttccaattcatacgaaagattcctatgac 1188316  T
Q  418 gagttacaactctt 431  Q
    ||||||||||||||    
T  1188317 gagttacaactctt 1188330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3696293 - 3696233
Alignment:
Q  250 taagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttatta 310  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  3696293 taagcacctatttgccaaaggttatgactatataaacttgaatcaatattatggttcatta 3696233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 26)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 356
Target Start/End: Original strand, 2022964 - 2023301
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2022964 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 2023063  T
Q  115 caaaattctgtcc-aaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acat 206  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||           ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       ||||    
T  2023064 caaaattctgtccaaaattatgtgttgttgtgtg-----------tccaactaatgcccatatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 2023152  T
Q  207 gagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttt 306  Q
    |||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  2023153 gagagaaagca-ccctttgacttgaatcaatgttatgattcattaaacacccatttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatgattc 2023251  T
Q  307 attaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatg 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  2023252 attaagcacccttttgccaaaggttataaccatacacacttgaatcaatg 2023301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9877743 - 9877441
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9877743 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 9877644  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  9877643 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 9877544  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 307  Q
    ||||||| ||    | | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  9877543 agagaaagcacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 9877444  T
Q  308 tta 310  Q
    |||    
T  9877443 tta 9877441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9872628 - 9872326
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9872628 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaattgtgaagaattatgttgttaatgtaa 9872529  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  9872528 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 9872429  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 307  Q
    ||||||| ||    | | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  9872428 agagaaagcacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 9872329  T
Q  308 tta 310  Q
    |||    
T  9872328 tta 9872326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 13556509 - 13556189
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13556509 tattttacatatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 13556410  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttt-tgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acat 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||    
T  13556409 caaacttctgtccaaattgtgtgtagttgtgtccttttctgtatgtccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 13556310  T
Q  207 gagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttt 306  Q
    |||||||| ||  | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||     
T  13556309 gagagaaagcacccatttgacttgaatcaatgctatgattcattaagcacctttttgccaaaggttataatcatatacacttgaatcaatgcaaatgttc 13556210  T
Q  307 attaagcacccttttgccaaa 327  Q
    ||||||||||  |||||||||    
T  13556209 attaagcacctatttgccaaa 13556189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Original strand, 39908958 - 39909260
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39908958 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 39909057  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  39909058 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtgatttttgttttttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 39909157  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 307  Q
    ||||||| ||    | | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  39909158 agagaaagcacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 39909257  T
Q  308 tta 310  Q
    |||    
T  39909258 tta 39909260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Original strand, 39903845 - 39904147
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39903845 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 39903944  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  39903945 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgttttttcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 39904044  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 307  Q
    ||||||| ||    | | |||||||||||||  ||||||||||||||||    |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  39904045 agagaaagcacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcactattttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 39904144  T
Q  308 tta 310  Q
    |||    
T  39904145 tta 39904147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 15 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 35369095 - 35368682
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| || ||| ||    
T  35369095 tattttacagatttatggttacaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgaggaagaattatgtttttgatgcaa 35368996  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgac-------atg 207  Q
    |||||||||        ||| | | |||||||| || |||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||    
T  35368995 caaaattct--------tgttttt-gttgtgtg-ttgttgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgacttttcacatg 35368906  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 307  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |    
T  35368905 agagaaaacactcatttgacttgaatcaatgttatgattcattaaacacctttttatcaaatgttatgatcatatacacttgaatcaatgctaaggttca 35368806  T
Q  308 ttaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtcaaaggttacaatgtatatgaatga 407  Q
    |||||||||  |||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| || | |||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  35368805 ttaagcacctctttgtcaaaggttataatcatatacacttaaatcaatgctaaggttcattaagcactcatttgccaaaggttccaatgtatatgaaaga 35368706  T
Q  408 ttctcatgaagagttacaactctt 431  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  35368705 ttctcataaagagttacaactctt 35368682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 285 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 13556290 - 13556127
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||  |||| ||    
T  13556290 acttgaatcaatgctatgattcattaagcacctttttgccaaaggttataatcatatacacttgaatcaatgcaaatgttcattaagcacctatttgcca 13556191  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  13556190 aaggttccaatgtatatgaaagattcccatgaagagttacaactcttggttttaaagtgattcc 13556127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 131
Target Start/End: Original strand, 4555653 - 4555769
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4555653 tattttacagatttatggtaccaataattcactcatgcattagagaattaatggatgatttagagtaatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 4555752  T
Q  115 caaaattctgtccaaat 131  Q
    ||||||| |||||||||    
T  4555753 caaaattgtgtccaaat 4555769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 285 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 43540768 - 43540623
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||| |||| |||| ||    
T  43540768 acttgagtcaatgttatggttcattaagcacc-ttttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatactaagattcattaagcacccctttgcca 43540670  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 431  Q
    |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  43540669 aaggttccaatgtatatgaataattaccatgaagagttacaactctt 43540623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 310
Target Start/End: Original strand, 2023230 - 2023314
Alignment:
Q  226 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttatta 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  2023230 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatacacacttgaatcaatgtcatggttcatta 2023314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 183 - 356
Target Start/End: Original strand, 43379556 - 43379731
Alignment:
Q  183 catttatagtgcattatatgaca--tgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcat 280  Q
    ||||||||||||||||||||||   | | | |||||| || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  || | |||| ||||||||||    
T  43379556 catttatagtgcattatatgacccttcacataaaacactcattttacttgaatcaatgttatgattcactaagcactcttttaccaaagtttatgatcat 43379655  T
Q  281 atacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatg 356  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||| || |  ||| ||||| ||||| | ||||||| ||| ||||||||    
T  43379656 atacacttgaatcaatgctacggttcattaaacatcactttaccaaaagttatgatcatatacgcttaaatcaatg 43379731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 43540834 - 43540668
Alignment:
Q  165 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacc 257  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||       ||||||||| ||  || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  43540834 taatgcccagatgccaagtatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaacac--tcatttgacttgagtcaatgttatggttcattaagcacc 43540737  T
Q  258 cacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaa 327  Q
       |||  |||||||||||||||||||||||||||||||  || | || ||||||||||| |||||||||    
T  43540736 tt-ttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatactaagattcattaagcacccctttgccaaa 43540668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 285 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 9872410 - 9872247
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  9872410 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 9872311  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  9872310 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcc 9872247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 285 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 9877525 - 9877362
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  9877525 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 9877426  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  9877425 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcc 9877362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 50 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 43540928 - 43540857
Alignment:
Q  50 tgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaacaaaatt 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  43540928 tgcattagagaattgatagatgatttagagtaagagaatgatggagaactatgttgttaatgtaacaaaatt 43540857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 109
Target Start/End: Original strand, 25184114 - 25184186
Alignment:
Q  37 agcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaa 109  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  25184114 agcaattcactaatacattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatggtgaagaaatatgttgttaa 25184186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 285 - 356
Target Start/End: Original strand, 39909176 - 39909247
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatg 356  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  39909176 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatg 39909247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 285 - 391
Target Start/End: Original strand, 2023171 - 2023277
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||  | | ||||| ||| ||||||||| ||    
T  2023171 acttgaatcaatgttatgattcattaaacacccatttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccttttgcca 2023270  T
Q  385 aaggtta 391  Q
    |||||||    
T  2023271 aaggtta 2023277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Original strand, 43378437 - 43378491
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatgga 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  43378437 tattttacagatttatggttccagcaattcactaatgcattaaagaattgatgga 43378491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 392 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 24091867 - 24091812
Alignment:
Q  392 caatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattc 447  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24091867 caatgtatatgaaagattctcataaagagttacaactcttggttctaaagtgattc 24091812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 285 - 447
Target Start/End: Original strand, 39904063 - 39904225
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||||||  ||| || |||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  39904063 acttgaatcaatgccatgattcattaagcactattttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 39904162  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattc 447  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  39904163 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattc 39904225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 285 - 367
Target Start/End: Original strand, 43379601 - 43379683
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcat 367  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||| ||||| |||||  |||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  43379601 acttgaatcaatgttatgattcactaagcactcttttaccaaagtttatgatcatatacacttgaatcaatgctacggttcat 43379683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 204
Target Start/End: Original strand, 4555772 - 4555809
Alignment:
Q  167 atgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgac 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4555772 atgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgac 4555809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 388 - 448
Target Start/End: Original strand, 39909279 - 39909339
Alignment:
Q  388 gttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    ||| ||||||||||||||| ||  || |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  39909279 gttccaatgtatatgaatggtttacacgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcc 39909339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 144
Target Start/End: Original strand, 43378485 - 43378541
Alignment:
Q  88 tgatgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgt 144  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||    
T  43378485 tgatggagaattatgttgataatgtaacaatattgtgtccaaattatgtgttgttgt 43378541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 18)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Original strand, 45120386 - 45120689
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45120386 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattggagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 45120485  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtgg-tttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||    
T  45120486 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 45120585  T
Q  207 gagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttt 306  Q
    |||||||| ||   || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||     
T  45120586 gagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttc 45120685  T
Q  307 atta 310  Q
    ||||    
T  45120686 atta 45120689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14917586 - 14917284
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14917586 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 14917487  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  14917486 caaaattctgtccaagttgtgtgtagttgtgtggtttttgtatcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 14917387  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 307  Q
    ||||||||||    | | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  14917386 agagaaaacagctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 14917287  T
Q  308 tta 310  Q
    |||    
T  14917286 tta 14917284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17720730 - 17720428
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17720730 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 17720631  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  17720630 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 17720531  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 307  Q
    ||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||| ||||||||| |||||| |    
T  17720530 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttcaatcaatgtcatggttca 17720431  T
Q  308 tta 310  Q
    |||    
T  17720430 tta 17720428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Original strand, 42780184 - 42780481
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  42780184 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatggtgaagaattatgtag-taatgtaa 42780282  T
Q  115 caaaattctgtcc-aaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acat 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||           |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||       ||||    
T  42780283 caaaattctgtccaaaattgtgtgttgttgtgtg-----------tccaactaatgcccaactgtcaatcatttatagtgcattatatgactcttcacat 42780371  T
Q  207 gagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttt 306  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42780372 gagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatggttcattaagccaccatttgccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttc 42780471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 30283645 - 30283357
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  30283645 tattttacagatttatggttctagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagagtaagagaaggatggagaattatgttgttaatgtaa 30283546  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||         ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||       |||||    
T  30283545 caaaattctgtccaaattgtgtttagttgtgtgtttt---------caactaatgcccaaatgccaaacatttatagtgcattatatgactcttcacatg 30283455  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtt 305  Q
    | ||||||||  ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||| |||| | |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30283454 aaagaaaacacccctttaacttgaatcaatattatggttcattaagcacccttttgccaaagattataaccatatatacttgaatcaatgtcatggtt 30283357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 428
Target Start/End: Original strand, 716267 - 716674
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||| | |     
T  716267 tattttacagatttagggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgaaggagaattatgttgttaaagaag 716366  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgac-------atg 207  Q
    ||||||||        |||| | | ||| | ||    ||||   ||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||       |||    
T  716367 caaaattc--------ttgtttat-gttttctg----ttgtcagtcacactaatgcccaaatgccaaacatttatagtgcattatatgacctttcatatg 716453  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 307  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | | |||||| ||||   |||| |||||||||||||||| || |||||||||||| || | || |    
T  716454 agagaaaacatccctttgacttgaatcaatgttacggtccattaaacacctttttgccaaaggttatgatcatacactcttgaatcaatgctaagcttca 716553  T
Q  308 ttaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtcaaaggttacaatgtatatgaatga 407  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||  |||  | |||||| ||||||||||||| ||    
T  716554 ttaagcacccctttaccaaaggttataatcatatacacttgaatcaatgcaaaggtttattaaacacctatttacctaaggttccaatgtatatgaaaga 716653  T
Q  408 ttctcatgaagagttacaact 428  Q
    ||| ||| |||||||||||||    
T  716654 ttcacataaagagttacaact 716674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 162 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 20892406 - 20892197
Alignment:
Q  162 aactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagc 254  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||       | ||||||||||| || | ||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  20892406 aactaatgcccaaatgtcaagtatttatagtgcattatatgactcttcacacgagagaaaacactcatttgatttgaatcaatgtt-tggttcattaagc 20892308  T
Q  255 acccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaa 354  Q
    |||   |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  ||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  20892307 acctttttggcaaatgttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttcattaatcactcacttgccaaatgtcatgatcatatacacttgaatcaa 20892208  T
Q  355 tgcaaaggttc 365  Q
    | |||| ||||    
T  20892207 tacaaatgttc 20892197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 285 - 428
Target Start/End: Original strand, 42780391 - 42780534
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||  ||||  |    
T  42780391 acttgaatcaatgttatggttcattaagccaccatttgccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttcattaagcacctatttgcta 42780490  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaact 428  Q
    || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42780491 aaagttccaatgtatatgaaagattctcatgaagagttacaact 42780534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 16284437 - 16284546
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatga-tttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgta 113  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||| ||||||| | |||||||| ||||||||| |    
T  16284437 tattttactgatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagagttgatgaatgattttagagtaagagaatgagggagaattatattgttaatgca 16284536  T
Q  114 acaaaattct 123  Q
    ||||||||||    
T  16284537 acaaaattct 16284546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 285 - 448
Target Start/End: Original strand, 45120605 - 45120768
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  45120605 acttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 45120704  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  45120705 aatgtttcaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttaattctaaagtgattcc 45120768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 285 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 14917368 - 14917205
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  14917368 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 14917269  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14917268 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcc 14917205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 285 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 30283436 - 30283365
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatg 356  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  30283436 acttgaatcaatattatggttcattaagcacccttttgccaaagattataaccatatatacttgaatcaatg 30283365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 285 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 17720512 - 17720350
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  17720512 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttcaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 17720413  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattc 447  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17720412 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattc 17720350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 392 - 448
Target Start/End: Original strand, 39178924 - 39178980
Alignment:
Q  392 caatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39178924 caatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttagttctaaagtgattcc 39178980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 17720078 - 17720022
Alignment:
Q  392 caatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  17720078 caatgtatatgaatagttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcc 17720022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 383 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 20892205 - 20892157
Alignment:
Q  383 caaaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 431  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20892205 caaatgttccaatgtatatgaatggttctcatgaagagttacaactctt 20892157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 315 - 356
Target Start/End: Original strand, 39178847 - 39178888
Alignment:
Q  315 cccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatg 356  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  39178847 cccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatg 39178888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 392 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 30283329 - 30283273
Alignment:
Q  392 caatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  30283329 caatgtacatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaaatgattcc 30283273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 3)
Name: scaffold0223
Description:

Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 2223 - 1921
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2223 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 2124  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 207  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  2123 taaaattctgtccaagttgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 2024  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 307  Q
    ||||||||||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  2023 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 1924  T
Q  308 tta 310  Q
    |||    
T  1923 tta 1921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 285 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2005 - 1934
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatg 356  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  2005 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatg 1934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 1898 - 1842
Alignment:
Q  392 caatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  1898 caatgtatatgaatggttcccatgaagagatacaacttttggttctaaagtgattcc 1842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26987193 - 26986891
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26987193 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26987094  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  26987093 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 26986994  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 307  Q
    ||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  26986993 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 26986894  T
Q  308 tta 310  Q
    |||    
T  26986893 tta 26986891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Original strand, 34108229 - 34108533
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34108229 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 34108328  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttg--tatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------aca 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||    
T  34108329 caaaattctgtccaagttgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcaca 34108428  T
Q  206 tgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtt 305  Q
    ||||||||| ||   || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  34108429 tgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggtt 34108528  T
Q  306 tatta 310  Q
     ||||    
T  34108529 catta 34108533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14315115 - 14314813
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14315115 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 14315016  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  14315015 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtctcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 14314916  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 307  Q
    ||||||||||    | | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  14314915 agagaaaacacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 14314816  T
Q  308 tta 310  Q
    |||    
T  14314815 tta 14314813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14318819 - 14318517
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14318819 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 14318720  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  14318719 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtctcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 14318620  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 307  Q
    ||||||||||    | | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  14318619 agagaaaacacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 14318520  T
Q  308 tta 310  Q
    |||    
T  14318519 tta 14318517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18494380 - 18494079
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18494380 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 18494281  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  18494280 caaaattctatccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 18494181  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 307  Q
    ||||||| ||  | | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  18494180 agagaaagca-ccttttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 18494082  T
Q  308 tta 310  Q
    |||    
T  18494081 tta 18494079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 43957051 - 43956735
Alignment:
Q  17 ttttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaaca 116  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43957051 ttttacaaatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgatgaagaattatgttgttaatgcaaca 43956952  T
Q  117 aaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatgag 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  43956951 aaattatgtccaaattgtgtgtagttgtgt-gtttttgtatgtccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgag 43956853  T
Q  210 agaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttatt 309  Q
    ||||| || || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |  ||| |||    
T  43956852 agaaagcactcatttgacttgaatcaatgctatgattcattaagcacctttttgccaaaggttataatcatatacatttgaatcaatgtaaatgttcatt 43956753  T
Q  310 aagcacccttttgccaaa 327  Q
    |||||||  |||||||||    
T  43956752 aagcacctatttgccaaa 43956735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26982080 - 26981777
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26982080 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26981981  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggt-ttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       ||||    
T  26981980 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgactcttcacat 26981881  T
Q  207 gagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttt 306  Q
    |||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | | |||| |||||||||||||| ||||||     
T  26981880 gagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccgtatatacttgaatcaatgtcatggttc 26981781  T
Q  307 atta 310  Q
    ||||    
T  26981780 atta 26981777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 10341163 - 10340866
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgt 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||     
T  10341163 aatattttacagatttatgattccagcaattcactcatgcattagagaatttatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgc 10341064  T
Q  113 aacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------aca 205  Q
    |||||||||||||||||| |   ||||        |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||       |||    
T  10341063 aacaaaattctgtccaaaat---tgta-------tgtttttatatgtccaactaatgcccaaatgccaagcatttatggtgcattatatgactcttcaca 10340974  T
Q  206 tgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtt 305  Q
    ||||| ||| ||   || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10340973 tgagaaaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatgattcattaagcacccttttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatgatt 10340874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 25953363 - 25953019
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25953363 tattgtacatatttatggttcaagcaattcactcatgcattagacaattgatggatgatttagagtatgagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 25953264  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 207  Q
    |||||||||||||||         | |||||| ||| |||| | ||||| |        |||| ||| ||||||||||||||||||||       |||||    
T  25953263 caaaattctgtccaa---------aattgtgttgttattgtttgtccaaat-------taatgccaaacatttatagtgcattatatgaccattcacatg 25953180  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttg-cgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttt 306  Q
    ||||||||||  | | |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  25953179 agagaaaacacccatttgacttaaatcaattttatggttcattaagcatccttttgccaaaatgttatgatcatatacacttgaatcaatattaaggttc 25953080  T
Q  307 attaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcat 367  Q
    || |||||| |  ||||||||  | || |  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25953079 atcaagcactcaattgccaaagctcatgataatatacacttgaatcaatgcaagggttcat 25953019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 285 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 43956836 - 43956673
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| |||  |||| ||    
T  43956836 acttgaatcaatgctatgattcattaagcacctttttgccaaaggttataatcatatacatttgaatcaatgtaaatgttcattaagcacctatttgcca 43956737  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  43956736 aagattccaatgtatatgaaagatttccatgaagagttacaactcttgattctaaagtgattcc 43956673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 18608832 - 18608724
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18608832 tattttacagatttatcgttccgtcaattaactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 18608733  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  18608732 caaaattct 18608724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 285 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 18608636 - 18608491
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||| |||| ||    
T  18608636 acttgaatcaatgttatggttcattaagcacccctttgccaaaggttatgaacatatacacttgaatcactgctatggttcatcaagcacccctttgcca 18608537  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 431  Q
    ||| |  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18608536 aagatcccaat-tatatgaatgattcccatgaagagttacaactctt 18608491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 165 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 18608703 - 18608535
Alignment:
Q  165 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgac------atgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcaccc 258  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||      |||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18608703 taatgcctaaatgccaaacatttgtagtgcattatatgaccttcacatgagagaaaacacccctttaacttgaatcaatgttatggttcattaagcaccc 18608604  T
Q  259 acttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaa 327  Q
      |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||| |||||||||    
T  18608603 ctttgccaaaggttatgaacatatacacttgaatcactgctatggttcatcaagcacccctttgccaaa 18608535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Original strand, 18885065 - 18885136
Alignment:
Q  16 attttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaa 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  18885065 attttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagagtaagagaa 18885136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 285 - 448
Target Start/End: Original strand, 34108449 - 34108612
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  34108449 acttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 34108548  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  34108549 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcc 34108612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 285 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 14318601 - 14318438
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  14318601 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 14318502  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14318501 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcc 14318438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 285 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18494163 - 18494092
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatg 356  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18494163 acttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatg 18494092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 285 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 26986975 - 26986812
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  26986975 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 26986876  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26986875 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcc 26986812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 311
Target Start/End: Original strand, 1781968 - 1782118
Alignment:
Q  165 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacc 257  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||       ||||||||||| | |  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  1781968 taatgtccaaatgtcaaacatttatagtgcagtatacgacctttcacatgagagaaaatactattttgacttgaatcaatgttatggttcattaagcacg 1782067  T
Q  258 cacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaa 311  Q
    || || | ||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1782068 cattttctaaatgttat---catatacacttgaatcaatgttatggttcattaa 1782118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 285 - 431
Target Start/End: Original strand, 1782036 - 1782179
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| | |||||||||   ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||  ||   |||| ||    
T  1782036 acttgaatcaatgttatggttcattaagcacgcattttctaaatgttat---catatacacttgaatcaatgttatggttcattaatcactgatttgcca 1782132  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 431  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  1782133 aaggttccaatacatatgaatgattcacgtaaagagttacaactctt 1782179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 285 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 14314897 - 14314826
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatg 356  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14314897 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatg 14314826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 285 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 26981861 - 26981698
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  26981861 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccgtatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 26981762  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26981761 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcc 26981698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 285 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10340953 - 10340882
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatg 356  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  10340953 acttgaatcaatgctatgattcattaagcacccttttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatg 10340882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 115
Target Start/End: Original strand, 1781869 - 1781939
Alignment:
Q  45 actcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaac 115  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  1781869 actcatgaattagagaattggtggatgattttgagtaagagaatgagggataattatgttgttaatgtaac 1781939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 18494056 - 18494000
Alignment:
Q  392 caatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  18494056 caatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaattgattcc 18494000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 25953101 - 25953012
Alignment:
Q  226 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcac 315  Q
    |||||||||||| ||| | ||||| |||||| || |||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||  | |||| |||||||||    
T  25953101 acttgaatcaatattaaggttcatcaagcactcaattgccaaagctcatgataatatacacttgaatcaatgcaagggttcattaagcac 25953012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 392 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 14314790 - 14314734
Alignment:
Q  392 caatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  14314790 caatgtatacgaatggttcccattaagagttacaacttttggttctaaagtaattcc 14314734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 30)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Original strand, 12856789 - 12857091
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12856789 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 12856888  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  12856889 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 12856988  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 307  Q
    ||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  12856989 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 12857088  T
Q  308 tta 310  Q
    |||    
T  12857089 tta 12857091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Original strand, 26051021 - 26051323
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26051021 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26051120  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  26051121 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcctaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 26051220  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 307  Q
    ||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  26051221 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 26051320  T
Q  308 tta 310  Q
    |||    
T  26051321 tta 26051323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Original strand, 26056134 - 26056436
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26056134 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26056233  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  26056234 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcctaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 26056333  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 307  Q
    ||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  26056334 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 26056433  T
Q  308 tta 310  Q
    |||    
T  26056434 tta 26056436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Original strand, 26060380 - 26060682
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26060380 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26060479  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  26060480 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcctaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 26060579  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 307  Q
    ||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  26060580 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 26060679  T
Q  308 tta 310  Q
    |||    
T  26060680 tta 26060682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Original strand, 26065493 - 26065795
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26065493 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26065592  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  26065593 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcctaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 26065692  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 307  Q
    ||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  26065693 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 26065792  T
Q  308 tta 310  Q
    |||    
T  26065793 tta 26065795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Original strand, 12851674 - 12851978
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12851674 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 12851773  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatc--caactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------aca 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       |||    
T  12851774 caaaattttgtccaaattgtgtgtagttgtatggtttttgtatatcttcaactaatgcccaaatgtcaagtatttatagtgcattatatgactcttcaca 12851873  T
Q  206 tgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtt 305  Q
    ||||||||| ||    | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12851874 tgagagaaagcacctatttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggtt 12851973  T
Q  306 tatta 310  Q
     ||||    
T  12851974 catta 12851978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 163
Target Start/End: Original strand, 14610364 - 14610512
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14610364 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 14610463  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaa 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14610464 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaa 14610512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 110
Target Start/End: Original strand, 11056625 - 11056720
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  11056625 tattttacagatttatggttccaacaattcactcatgcattaaagaattgatggatgatttaaagtaagagaatgataaagaattatgttgttaat 11056720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 4181585 - 4181478
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||    
T  4181585 tattttacgggtttatggttcgagcaat-cactcatgcattagagaattgatggatgatttagattaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaa 4181487  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  4181486 caaaattct 4181478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5440492 - 5440217
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  5440492 tattttacagatgtatggttccagcaatttactcaagctttagagaattgatcgatgatttagagtaagggaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 5440393  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatcc-aactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acat 206  Q
     |||| |   ||    ||||      |  ||| |||||||| | ||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||    
T  5440392 taaaaat---tc----ttgt------tcttgttgtttttgtgtgtccaaattaaagcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgacccttcacat 5440306  T
Q  207 gagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaa 295  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || | ||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  5440305 gagagaaaacacccatttgacttgaatcaatgttatggttcattaatcacccctttcccaaaagttatgaccatatacacttaaatcaa 5440217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5449502 - 5449227
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  5449502 tattttacagatgtatggttccagcaatttactcaagctttagagaattgatcgatgatttagagtaagggaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 5449403  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatcc-aactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acat 206  Q
     |||| |   ||    ||||      |  ||| |||||||| | ||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||    
T  5449402 taaaaat---tc----ttgt------tcttgttgtttttgtgtgtccaaattaaagcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgacccttcacat 5449316  T
Q  207 gagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaa 295  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || | ||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  5449315 gagagaaaacacccatttgacttgaatcaatgttatggttcattaatcacccctttcccaaaagttatgaccatatacacttaaatcaa 5449227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 37460047 - 37459938
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgt 112  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||||||| ||||    
T  37460047 aatattttacagatatatggtttcagcaattcgctaatgcatcagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgtgggagaattatgttgttcatgt 37459948  T
Q  113 aacaaaattc 122  Q
    |||| |||||    
T  37459947 aacataattc 37459938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 285 - 448
Target Start/End: Original strand, 12851894 - 12852057
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  12851894 acttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 12851993  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12851994 aatgtaacaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcc 12852057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 35352495 - 35352434
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgattta 76  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35352495 tattttatagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatggttta 35352434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 285 - 448
Target Start/End: Original strand, 12857007 - 12857170
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  12857007 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 12857106  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12857107 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcc 12857170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 285 - 448
Target Start/End: Original strand, 26051239 - 26051402
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  26051239 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 26051338  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26051339 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcc 26051402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 285 - 448
Target Start/End: Original strand, 26056352 - 26056515
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  26056352 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattatcaataataaataat 26056451  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26056452 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcc 26056515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 285 - 448
Target Start/End: Original strand, 26060598 - 26060761
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  26060598 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 26060697  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26060698 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcc 26060761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 285 - 448
Target Start/End: Original strand, 26065711 - 26065874
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  26065711 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattatcaataataaataat 26065810  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26065811 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcc 26065874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 35352375 - 35352221
Alignment:
Q  165 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgac--------atgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcac 256  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||        |||||||||||  |  || |||||||| |||| | | || ||||||||||||    
T  35352375 taatgcccaaatgtcaagcatatatggtgcattatatgacccttcaaaatgagagaaaatgtctctttgacttgattcaacgatttggttcattaagcac 35352276  T
Q  257 ccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaa 311  Q
    ||| ||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  35352275 ccatttatcaaaggttatgattatatacacttgaatcaatgttatgattcattaa 35352221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 203 - 310
Target Start/End: Original strand, 14610524 - 14610631
Alignment:
Q  203 acatgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatg 302  Q
    |||||||||||| ||   || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||    
T  14610524 acatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatg 14610623  T
Q  303 gtttatta 310  Q
    ||| ||||    
T  14610624 gttcatta 14610631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 285 - 356
Target Start/End: Original strand, 14610547 - 14610618
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatg 356  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14610547 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatg 14610618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 4181457 - 4181357
Alignment:
Q  165 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacc 257  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||    | |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  4181457 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgactcttcatatgagagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 4181358  T
Q  258 c 258  Q
    |    
T  4181357 c 4181357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 5440286 - 5440217
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaa 354  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5440286 acttgaatcaatgttatggttcattaatcacccctttcccaaaagttatgaccatatacacttaaatcaa 5440217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 5449296 - 5449227
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaa 354  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5449296 acttgaatcaatgttatggttcattaatcacccctttcccaaaagttatgaccatatacacttaaatcaa 5449227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 37459917 - 37459802
Alignment:
Q  165 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacc 257  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       |||||||||||||||  | | ||| ||||||  |||||||| |||||||| |||     
T  37459917 taatgcccaaatgtcaagtatttatagtgcattatatgtccattcacatgagagaaaacacgcatttgatttgaattgatgttatggttcattaaacact 37459818  T
Q  258 cacttgcgaaaggtta 273  Q
    || |||| ||||||||    
T  37459817 catttgccaaaggtta 37459802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 5436736 - 5436692
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattag 57  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5436736 aatattttacagatttatggttcaagcaattcactaatgcattag 5436692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 378 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 37459815 - 37459771
Alignment:
Q  378 tttgtcaaaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagtt 422  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37459815 tttgccaaaggttacaatgtatatgaatgattcccatgaagagtt 37459771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 285 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 4181389 - 4181347
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaa 327  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  4181389 acttgaatcaatgttaaggttcattaagcacccctttgccaaa 4181347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 388 - 428
Target Start/End: Original strand, 14610650 - 14610690
Alignment:
Q  388 gttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaact 428  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  14610650 gttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaact 14610690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Original strand, 21275773 - 21276075
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21275773 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 21275872  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  21275873 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 21275972  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 307  Q
    ||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  21275973 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 21276072  T
Q  308 tta 310  Q
    |||    
T  21276073 tta 21276075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21936886 - 21936467
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21936886 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatagatgatttagagtatgagaatgatggagaattatgttgttaatgt 21936787  T
Q  113 aacaaaattctgtccaaa-ttgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgac------- 204  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||  || ||| ||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||           
T  21936786 aacaaagttcagtccaaaattgtgtgttgttgt-tg--ttgtgt-ta---aactaatgcccaaatgttaagcatttatagtgcattatatgacccttcac 21936694  T
Q  205 atgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggt 304  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||    
T  21936693 atgagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatggtttattaagcacctttttgccaaaggttatgatcatatacacttgaataaattctaaggt 21936594  T
Q  305 ttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtcaaaggttacaatgtatatgaa 404  Q
    | | ||| ||||| ||||||||| || || | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||  ||||||||| ||    
T  21936593 tcactaaacacccctttgccaaaggtcatgatcatataaacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcacccatttgccaaaggttcaaatgtatataaa 21936494  T
Q  405 tgattctcatgaagagttacaactctt 431  Q
     ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  21936493 agatttccataaagagttacaactctt 21936467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 425
Target Start/End: Original strand, 21937568 - 21937983
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgt 112  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  21937568 aatattatacaaatttatggttccagcaattcactcatgcatttgagaattgatggatgttttagaataagagagtgatggaaaattatgttgttaatgt 21937667  T
Q  113 aacaaaattctgtccaaa-ttgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgac------- 204  Q
    | ||||||| |||||||| |||||||| |||||   ||| |||| |    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||           
T  21937668 a-caaaattatgtccaaaattgtgtgttgttgtt--gttgttgtgtta--aactaatgcccaaatgccaaacatttatagtgcgttatatgacccttcac 21937762  T
Q  205 atgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggt 304  Q
    ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  21937763 atgagagaaaatacccctttgacttgaatcaatgtgatggttcattaaacacccttttgccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgataaagt 21937862  T
Q  305 ttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtcaaaggttacaatgtatatgaa 404  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||| ||||  ||| ||| ||||||||| |||    
T  21937863 taattaaacaccccttttccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaatgttcattaaccacccctttgctaaatgttccaatgtatacgaa 21937962  T
Q  405 tgattctcatgaagagttaca 425  Q
      ||| |||||||||||||||    
T  21937963 atattttcatgaagagttaca 21937983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 367
Target Start/End: Original strand, 24509703 - 24510061
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24509703 tattttacaaatttatggttccaacaattcactaatgcattagagaattgatggatgatttaaagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 24509802  T
Q  115 caaaattctgt-ccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acat 206  Q
    || |||| ||| | ||||| ||| || |  ||| ||| | |  | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||    
T  24509803 cataattttgtacaaaattatgtataat--tgttgttgtcg--tgttaaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgaaccttcacat 24509898  T
Q  207 gagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatg---atcatatacacttgaatcaatgttatgg 303  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  |||  ||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24509899 gagagaaaacacccatttgacttgaatcaatgttatggttcattaaacacacttttgtcaaatgttatgatcatcatatacacttgaattaatgttaagg 24509998  T
Q  304 tttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcat 367  Q
    || |||||  ||||||||| ||||  | || |  |||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  24509999 ttcattaa-tacccttttgtcaaagatcatgattatatacacttgaattaatgttaaggttcat 24510061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 165 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 20752192 - 20751922
Alignment:
Q  165 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacc 257  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||       ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20752192 taatgcctaaatgccaagtatttatagtgcattagatgacctttcacatgagagaaaacactcatttgacttgaatcaatgttatggttcattaagcacc 20752093  T
Q  258 cacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgc 357  Q
       |||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||| |||| |||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  20752092 attttgtcaaaggttatggccatatacacttgaatcaatgctaaggttcattaaacacccctttgtcaaaggttataataatatacacttgaaccaatgc 20751993  T
Q  358 aaaggttcatgaagaacccttttgtcaaaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaact 428  Q
     |||||| || ||| |||| ||||  |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  20751992 taaggtttattaagcacccatttgctaaaggttataatgtatatgaaaggttctcatgaagagttacaact 20751922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 204 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 24508868 - 24508708
Alignment:
Q  204 catgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatgg 303  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||    
T  24508868 catgagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcttatacacttgaattaatgctaagg 24508769  T
Q  304 tttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggtt 364  Q
    || ||||| ||||| ||| ||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24508768 ttcattaaacacccctttaccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggtt 24508708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 20752322 - 20752207
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20752322 tattttacagatttatggttccaacaattcactcatgcatcagagaattgatggatgacttatagtaagagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 20752223  T
Q  115 caaaattctgtccaaa 130  Q
    ||||||||| ||||||    
T  20752222 caaaattctttccaaa 20752207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 24509032 - 24508917
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24509032 tattttacaaatttatgattccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 24508933  T
Q  115 caaaattctgtccaaa 130  Q
    || |||| ||| ||||    
T  24508932 cataattttgtacaaa 24508917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 2887490 - 2887596
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||| ||||| ||    
T  2887490 tattttacagatttatgattccagcaattcactcatgcattagagagttgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttggtaatggaa 2887589  T
Q  115 caaaatt 121  Q
    |||||||    
T  2887590 caaaatt 2887596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 2889212 - 2889318
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||| ||||| ||    
T  2889212 tattttacagatttatgattccagcaattcactcatgcattagagagttgatgaatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttggtaatggaa 2889311  T
Q  115 caaaatt 121  Q
    |||||||    
T  2889312 caaaatt 2889318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 285 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 11183173 - 11183010
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| || || |||| |||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||| |||| ||    
T  11183173 acttgaatcagtgttatggttcattaaacatccctttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatcaaggctaaggttcattaagtacccctttgcca 11183074  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    || ||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||    
T  11183073 aatgttccaatgtatatgaaagatttccatgaagagttacaacatttggttctaaattgattcc 11183010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 11183370 - 11183263
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||| ||| |||||    
T  11183370 tattttacaggtttatggtttcagcaatttactcatgcattagagaattgattgatgatttagagtaagagaatgagagagaattatgttattattgtaa 11183271  T
Q  115 caaaattc 122  Q
    ||||||||    
T  11183270 caaaattc 11183263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 285 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 24508846 - 24508764
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcat 367  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24508846 acttgaatcaatgttatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcttatacacttgaattaatgctaaggttcat 24508764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 346 - 431
Target Start/End: Original strand, 12909533 - 12909618
Alignment:
Q  346 ttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtcaaaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 431  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||  ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12909533 ttgaatcaatgctaaggttcattaaacacctttttgccaaaggttccaatgtatatgaatgattctcatgaaaagttacaactctt 12909618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 346 - 431
Target Start/End: Original strand, 12934640 - 12934725
Alignment:
Q  346 ttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtcaaaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 431  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||  ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12934640 ttgaatcaatgctaaggttcattaaacacctttttgccaaaggttccaatgtatatgaatgattctcatgaaaagttacaactctt 12934725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 224 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 11183175 - 11183068
Alignment:
Q  224 tgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgc 323  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||| |||| |||||    
T  11183175 tgacttgaatcagtgttatggttcattaaacatccctttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatcaaggctaaggttcattaagtacccctttgc 11183076  T
Q  324 caaatgtt 331  Q
    ||||||||    
T  11183075 caaatgtt 11183068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 285 - 448
Target Start/End: Original strand, 21275991 - 21276154
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  21275991 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 21276090  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcc 448  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  21276091 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcc 21276154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24508787 - 24508682
Alignment:
Q  226 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgcca 325  Q
    |||||||| |||| || | |||||||| |||||  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||| ||| |||    
T  24508787 acttgaattaatgctaaggttcattaaacacccctttaccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggtttattaagcgcccatttacca 24508688  T
Q  326 aatgtt 331  Q
    ||||||    
T  24508687 aatgtt 24508682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 387
Target Start/End: Original strand, 24509918 - 24510022
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgtt---ataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttg 381  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||   || | ||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||  |||||||||    
T  24509918 acttgaatcaatgttatggttcattaaacacacttttgtcaaatgttatgatcatcatatacacttgaattaatgttaaggttcattaa-tacccttttg 24510016  T
Q  382 tcaaag 387  Q
    ||||||    
T  24510017 tcaaag 24510022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 327
Target Start/End: Original strand, 173358 - 173662
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  173358 tattttagagatttatggttccagcaattcacctatacattagagaattgatggatgatttagagtaagagaattaggaagaattatgttgttgatgtaa 173457  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 207  Q
    |||||||||       || | ||||         ||||  ||| |  || |||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||       |||||    
T  173458 caaaattct------tttttctgta---------ttttgttatgttaaattaatgcacaaatatcaaacatttatagcgcattatatgacccttcacatg 173542  T
Q  208 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 307  Q
    | ||||||||  | | ||||||||||||||| || | |||||||| ||| |  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  173543 atagaaaacacccatttgacttgaatcaatgctaaggttcattaaacactcctttgtcaaatgttatgatcatatacacttgaatcaatgttaaggttca 173642  T
Q  308 ttaagcacccttttgccaaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  173643 ttaagcacccttttgccaaa 173662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 285 - 431
Target Start/End: Original strand, 173561 - 173707
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||| ||| | |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  173561 acttgaatcaatgctaaggttcattaaacactcctttgtcaaatgttatgatcatatacacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacccttttgcca 173660  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 431  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  173661 aaggttccaatgtatatgaatgattcccatgaatagttacaactctt 173707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 285 - 431
Target Start/End: Original strand, 144288 - 144434
Alignment:
Q  285 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 384  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||| | |||| |||||||| |||||||||| |||||| ||| |||  |||| ||    
T  144288 acttgaatcaatgttatggttcattaagtacccttttgccaagggttatgatcatacacacttgagtcaatgcaaaagttcattaagcacctatttgcca 144387  T
Q  385 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 431  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  144388 aaggttccaatgtatatgaaagactctcatgaagagttacaactctt 144434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 138
Target Start/End: Original strand, 144096 - 144222
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaat--aatagaatgatgaagaattatgttgttaatgt 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    || ||||||| | ||||||||||||||||||     
T  144096 tattttacagatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagaattaatggatgatttagagagcaagagaatgagggagaattatgttgttaatgc 144195  T
Q  113 aacaaaattctgtcc-aaattgtgtgt 138  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  144196 aacaaaattctatccaaaattgtgtgt 144222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 174 - 327
Target Start/End: Original strand, 144229 - 144389
Alignment:
Q  174 aatgtcaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcga 266  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||       |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||| |    
T  144229 aatgccaagtatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatggttcattaagtacccttttgcca 144328  T
Q  267 aaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaa 327  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||  |  ||| ||||||||||  |||||||||    
T  144329 agggttatgatcatacacacttgagtcaatgcaaaagttcattaagcacctatttgccaaa 144389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University