View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21239_low_41 (Length: 239)

Name: NF21239_low_41
Description: NF21239
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21239_low_41
NF21239_low_41
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (1-229)||(6539-6767)
scaffold0621 (1-218)||(8481-8702)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (1-230)||(19267-19497)
[»] chr7 (66 HSPs)
chr7 (1-230)||(18005649-18005879)
chr7 (1-230)||(44014181-44014407)
chr7 (1-229)||(67749-67977)
chr7 (1-230)||(16219605-16219835)
chr7 (10-230)||(811029-811249)
chr7 (10-229)||(47831811-47832030)
chr7 (1-218)||(16056343-16056560)
chr7 (1-229)||(22072917-22073148)
chr7 (1-218)||(12901338-12901557)
chr7 (66-229)||(34200790-34200951)
chr7 (1-229)||(15754777-15755004)
chr7 (66-229)||(16495406-16495567)
chr7 (66-229)||(11995983-11996144)
chr7 (66-229)||(28505254-28505415)
chr7 (56-230)||(2280061-2280238)
chr7 (110-205)||(12255789-12255886)
chr7 (107-229)||(38227485-38227606)
chr7 (43-218)||(1867924-1868101)
chr7 (111-229)||(3564363-3564481)
chr7 (107-229)||(18456408-18456529)
chr7 (107-229)||(12698835-12698958)
chr7 (73-214)||(13647344-13647487)
chr7 (47-218)||(14044761-14044935)
chr7 (47-218)||(14354791-14354965)
chr7 (73-229)||(18430713-18430870)
chr7 (1-214)||(20220077-20220290)
chr7 (73-229)||(27216861-27217018)
chr7 (107-229)||(9509193-9509315)
chr7 (73-229)||(456322-456479)
chr7 (73-229)||(11393291-11393448)
chr7 (73-229)||(11972497-11972654)
chr7 (73-229)||(14949126-14949283)
chr7 (73-229)||(15376717-15376874)
chr7 (73-229)||(16232521-16232678)
chr7 (73-229)||(18640273-18640430)
chr7 (73-229)||(20385127-20385284)
chr7 (73-229)||(21189599-21189756)
chr7 (73-229)||(24702239-24702396)
chr7 (73-229)||(32125492-32125649)
chr7 (73-229)||(41522918-41523075)
chr7 (73-229)||(41525380-41525537)
chr7 (14-125)||(9389599-9389709)
chr7 (73-229)||(17061919-17062076)
chr7 (107-217)||(26212012-26212122)
chr7 (111-229)||(48273393-48273511)
chr7 (56-215)||(19486686-19486847)
chr7 (107-215)||(10063813-10063921)
chr7 (73-229)||(16410060-16410217)
chr7 (73-229)||(24704689-24704843)
chr7 (111-219)||(24275182-24275289)
chr7 (111-230)||(15144037-15144154)
chr7 (73-229)||(44116510-44116667)
chr7 (107-229)||(16386242-16386365)
chr7 (56-210)||(15008441-15008597)
chr7 (73-229)||(3386334-3386491)
chr7 (114-217)||(10589055-10589158)
chr7 (118-229)||(16213685-16213795)
chr7 (114-229)||(40443395-40443509)
chr7 (1-64)||(16324175-16324238)
chr7 (182-229)||(13869347-13869394)
chr7 (182-229)||(20110557-20110604)
chr7 (163-229)||(27847881-27847947)
chr7 (182-229)||(13831374-13831421)
chr7 (73-219)||(38898380-38898528)
chr7 (112-148)||(16324135-16324171)
chr7 (162-214)||(18203831-18203882)
[»] chr1 (52 HSPs)
chr1 (1-230)||(22921757-22921987)
chr1 (56-230)||(33681010-33681185)
chr1 (72-230)||(22237630-22237789)
chr1 (79-226)||(21754052-21754198)
chr1 (56-230)||(20248282-20248454)
chr1 (1-230)||(52927870-52928088)
chr1 (1-214)||(21861457-21861672)
chr1 (19-214)||(21896162-21896358)
chr1 (66-217)||(20918620-20918769)
chr1 (66-230)||(14295507-14295672)
chr1 (55-230)||(21161719-21161892)
chr1 (20-214)||(50614023-50614219)
chr1 (20-214)||(50621851-50622047)
chr1 (44-218)||(16758664-16758841)
chr1 (1-214)||(50686630-50686846)
chr1 (10-226)||(16368184-16368401)
chr1 (10-214)||(41049933-41050138)
chr1 (10-125)||(35981586-35981700)
chr1 (111-229)||(50210212-50210330)
chr1 (107-229)||(22532273-22532395)
chr1 (120-214)||(35261086-35261180)
chr1 (73-214)||(45574846-45574989)
chr1 (52-125)||(49261448-49261521)
chr1 (73-229)||(21475091-21475248)
chr1 (114-229)||(34509784-34509899)
chr1 (73-229)||(13988867-13989024)
chr1 (73-229)||(21923295-21923452)
chr1 (14-125)||(20636957-20637067)
chr1 (107-229)||(21026684-21026806)
chr1 (107-229)||(27250724-27250846)
chr1 (111-219)||(21840778-21840885)
chr1 (73-229)||(23593739-23593896)
chr1 (73-229)||(29298138-29298294)
chr1 (73-229)||(29776689-29776846)
chr1 (73-229)||(31612314-31612471)
chr1 (73-229)||(433013-433168)
chr1 (66-181)||(22130863-22130976)
chr1 (55-214)||(16093825-16093987)
chr1 (162-229)||(20847205-20847271)
chr1 (66-165)||(51130632-51130729)
chr1 (73-229)||(22123071-22123229)
chr1 (168-219)||(20454610-20454660)
chr1 (73-212)||(26064959-26065100)
chr1 (73-219)||(16361928-16362075)
chr1 (73-229)||(13212865-13213023)
chr1 (157-205)||(38801433-38801481)
chr1 (182-229)||(21342097-21342144)
chr1 (182-229)||(21346962-21347009)
chr1 (182-229)||(21707168-21707215)
chr1 (182-229)||(21711710-21711757)
chr1 (182-230)||(21714545-21714593)
chr1 (182-229)||(15860123-15860170)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (1-222)||(5654-5875)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (1-230)||(100377-100607)
scaffold0023 (1-230)||(40062-40292)
scaffold0023 (73-229)||(94412-94569)
scaffold0023 (73-229)||(44455-44613)
scaffold0023 (156-230)||(101502-101576)
scaffold0023 (160-229)||(119879-119948)
scaffold0023 (73-219)||(17444-17591)
[»] chr2 (60 HSPs)
chr2 (1-230)||(25175853-25176083)
chr2 (1-228)||(28405981-28406210)
chr2 (1-203)||(7620-7824)
chr2 (1-218)||(18786790-18787009)
chr2 (79-229)||(22134175-22134323)
chr2 (72-229)||(7679589-7679746)
chr2 (66-229)||(23071905-23072066)
chr2 (1-214)||(23207296-23207511)
chr2 (1-214)||(23791292-23791508)
chr2 (73-229)||(22105413-22105571)
chr2 (107-229)||(298809-298932)
chr2 (73-215)||(19671848-19671991)
chr2 (56-230)||(23708561-23708738)
chr2 (107-229)||(23060517-23060639)
chr2 (1-214)||(25108906-25109122)
chr2 (73-229)||(18808944-18809101)
chr2 (73-229)||(23130863-23131020)
chr2 (73-229)||(23133330-23133487)
chr2 (73-229)||(23709536-23709693)
chr2 (73-229)||(23712017-23712174)
chr2 (73-229)||(34402526-34402683)
chr2 (73-229)||(39682314-39682471)
chr2 (107-229)||(22337119-22337241)
chr2 (107-229)||(23076446-23076568)
chr2 (107-229)||(23285869-23285987)
chr2 (107-229)||(23654381-23654503)
chr2 (135-229)||(38138-38231)
chr2 (107-229)||(23660027-23660148)
chr2 (73-219)||(24367785-24367932)
chr2 (73-214)||(20520152-20520295)
chr2 (76-229)||(23135591-23135745)
chr2 (73-229)||(571398-571555)
chr2 (73-229)||(6725996-6726153)
chr2 (73-229)||(26505380-26505537)
chr2 (73-229)||(26507858-26508015)
chr2 (73-229)||(28577100-28577257)
chr2 (107-229)||(22731229-22731351)
chr2 (73-219)||(21155064-21155211)
chr2 (44-152)||(24697536-24697645)
chr2 (73-229)||(24898199-24898357)
chr2 (73-229)||(24900682-24900840)
chr2 (73-229)||(24903159-24903317)
chr2 (73-229)||(24905636-24905794)
chr2 (73-229)||(24908111-24908269)
chr2 (114-229)||(20309112-20309225)
chr2 (169-229)||(23040247-23040306)
chr2 (73-229)||(32039502-32039659)
chr2 (111-229)||(23103396-23103512)
chr2 (73-219)||(32214925-32215072)
chr2 (156-229)||(8946661-8946733)
chr2 (56-214)||(22413078-22413240)
chr2 (73-229)||(45029858-45030015)
chr2 (73-228)||(43137301-43137457)
chr2 (171-219)||(24643054-24643101)
chr2 (182-229)||(22738249-22738296)
chr2 (79-214)||(23004767-23004905)
chr2 (182-229)||(38967375-38967422)
chr2 (73-229)||(24529532-24529690)
chr2 (162-212)||(23287384-23287433)
chr2 (163-212)||(26392403-26392451)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (10-230)||(2543-2763)
[»] chr8 (63 HSPs)
chr8 (19-230)||(23760751-23760962)
chr8 (1-230)||(21673707-21673936)
chr8 (1-229)||(38855140-38855368)
chr8 (10-229)||(6520372-6520590)
chr8 (10-219)||(21285611-21285820)
chr8 (56-230)||(26355643-26355816)
chr8 (19-218)||(983312-983512)
chr8 (66-229)||(5866230-5866391)
chr8 (66-229)||(21490999-21491160)
chr8 (1-214)||(37116366-37116582)
chr8 (66-229)||(17140920-17141081)
chr8 (1-214)||(17266880-17267096)
chr8 (66-229)||(21249388-21249550)
chr8 (66-229)||(21255226-21255388)
chr8 (107-229)||(22626740-22626861)
chr8 (38-215)||(13508009-13508188)
chr8 (1-214)||(20498581-20498796)
chr8 (107-229)||(16092337-16092459)
chr8 (19-214)||(24353039-24353235)
chr8 (38-215)||(13597541-13597720)
chr8 (107-229)||(21918995-21919117)
chr8 (44-214)||(17439436-17439609)
chr8 (107-229)||(22875069-22875190)
chr8 (73-215)||(17612069-17612213)
chr8 (114-229)||(28649046-28649161)
chr8 (107-229)||(7372782-7372904)
chr8 (107-229)||(20536212-20536334)
chr8 (114-229)||(31971261-31971375)
chr8 (107-229)||(26219718-26219838)
chr8 (1-152)||(22364744-22364895)
chr8 (73-229)||(1484403-1484560)
chr8 (73-229)||(5853296-5853453)
chr8 (73-229)||(14409448-14409605)
chr8 (73-229)||(20046199-20046356)
chr8 (73-229)||(20403228-20403385)
chr8 (73-229)||(22001754-22001911)
chr8 (114-229)||(16199647-16199761)
chr8 (107-229)||(18818404-18818526)
chr8 (107-229)||(21923923-21924045)
chr8 (120-229)||(6759262-6759371)
chr8 (120-229)||(23406383-23406492)
chr8 (156-229)||(18879276-18879348)
chr8 (73-219)||(16413320-16413467)
chr8 (107-229)||(26225288-26225408)
chr8 (73-229)||(4483282-4483438)
chr8 (73-229)||(15203235-15203392)
chr8 (114-229)||(21395984-21396097)
chr8 (114-229)||(21790477-21790590)
chr8 (73-229)||(41598189-41598346)
chr8 (73-229)||(4542377-4542534)
chr8 (114-229)||(21389454-21389567)
chr8 (114-229)||(21778780-21778893)
chr8 (74-214)||(19801387-19801527)
chr8 (162-229)||(45131047-45131113)
chr8 (171-229)||(19896266-19896323)
chr8 (182-229)||(25484382-25484429)
chr8 (105-152)||(40492844-40492891)
chr8 (44-214)||(19154816-19154989)
chr8 (182-219)||(45290809-45290846)
chr8 (73-229)||(14823775-14823931)
chr8 (182-217)||(15070571-15070606)
chr8 (182-229)||(19937120-19937167)
chr8 (66-157)||(21383887-21383978)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (1-230)||(14585-14815)
[»] chr3 (80 HSPs)
chr3 (1-230)||(15470927-15471156)
chr3 (1-230)||(16103783-16104012)
chr3 (1-230)||(16097331-16097561)
chr3 (14-230)||(12174164-12174377)
chr3 (79-226)||(32307684-32307830)
chr3 (10-229)||(14234491-14234712)
chr3 (80-230)||(49668044-49668194)
chr3 (82-230)||(9512923-9513067)
chr3 (82-230)||(9520898-9521042)
chr3 (66-229)||(13210283-13210444)
chr3 (79-226)||(1644642-1644787)
chr3 (56-214)||(52523669-52523831)
chr3 (107-229)||(27165251-27165373)
chr3 (1-214)||(37251055-37251270)
chr3 (107-229)||(12399213-12399335)
chr3 (107-229)||(53301545-53301668)
chr3 (56-215)||(24340665-24340826)
chr3 (114-229)||(18438538-18438653)
chr3 (107-215)||(23274705-23274813)
chr3 (107-226)||(14572596-14572714)
chr3 (107-229)||(14972858-14972980)
chr3 (107-229)||(17487860-17487982)
chr3 (107-229)||(17499342-17499464)
chr3 (1-214)||(22110239-22110454)
chr3 (107-229)||(36166599-36166719)
chr3 (107-215)||(42386428-42386536)
chr3 (73-214)||(43925977-43926121)
chr3 (107-219)||(21618460-21618570)
chr3 (107-229)||(13442278-13442400)
chr3 (107-230)||(14576828-14576950)
chr3 (135-229)||(11424783-11424876)
chr3 (107-229)||(24153204-24153325)
chr3 (52-125)||(1465350-1465423)
chr3 (56-215)||(37642207-37642368)
chr3 (73-229)||(7781351-7781508)
chr3 (73-229)||(17463179-17463336)
chr3 (73-229)||(17672627-17672784)
chr3 (114-229)||(20698437-20698552)
chr3 (73-229)||(29172587-29172744)
chr3 (73-229)||(34159327-34159484)
chr3 (73-229)||(45606911-45607068)
chr3 (73-229)||(55476492-55476649)
chr3 (73-228)||(16282815-16282971)
chr3 (107-229)||(23083356-23083478)
chr3 (73-219)||(38961895-38962042)
chr3 (164-229)||(28194694-28194759)
chr3 (76-229)||(28848618-28848772)
chr3 (73-214)||(43550482-43550625)
chr3 (73-229)||(8899095-8899252)
chr3 (73-229)||(9707611-9707768)
chr3 (73-229)||(16454285-16454442)
chr3 (111-226)||(606324-606441)
chr3 (111-229)||(6469178-6469295)
chr3 (111-229)||(25476384-25476502)
chr3 (107-229)||(26686891-26687013)
chr3 (111-229)||(40213720-40213837)
chr3 (107-221)||(43840944-43841058)
chr3 (73-219)||(12567571-12567718)
chr3 (73-219)||(13544036-13544183)
chr3 (116-229)||(55500943-55501055)
chr3 (73-229)||(13151794-13151952)
chr3 (73-229)||(13154259-13154417)
chr3 (1-124)||(49389518-49389642)
chr3 (73-214)||(53070657-53070799)
chr3 (73-229)||(10247727-10247884)
chr3 (73-229)||(17446659-17446815)
chr3 (111-229)||(15977516-15977633)
chr3 (73-219)||(50242833-50242980)
chr3 (56-203)||(22147467-22147616)
chr3 (56-171)||(2051141-2051260)
chr3 (171-229)||(17737237-17737294)
chr3 (73-228)||(41123892-41124045)
chr3 (182-229)||(8499519-8499566)
chr3 (182-229)||(10556986-10557033)
chr3 (182-229)||(15412430-15412477)
chr3 (182-229)||(45577952-45577999)
chr3 (122-229)||(12119780-12119886)
chr3 (1-63)||(43927304-43927366)
chr3 (182-229)||(44494810-44494857)
chr3 (168-212)||(13919350-13919393)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (1-230)||(2692-2924)
[»] chr5 (57 HSPs)
chr5 (1-229)||(21502043-21502273)
chr5 (1-229)||(21329385-21329614)
chr5 (56-230)||(21565545-21565720)
chr5 (1-230)||(26011923-26012154)
chr5 (67-230)||(22959489-22959650)
chr5 (1-214)||(20026828-20027043)
chr5 (56-229)||(19668902-19669073)
chr5 (66-229)||(19660791-19660952)
chr5 (1-214)||(22178107-22178323)
chr5 (107-229)||(21729059-21729181)
chr5 (107-229)||(21808384-21808506)
chr5 (73-214)||(22144068-22144211)
chr5 (107-229)||(23390491-23390613)
chr5 (132-229)||(36314581-36314678)
chr5 (107-229)||(24493573-24493694)
chr5 (108-229)||(8286838-8286960)
chr5 (66-125)||(21741486-21741545)
chr5 (107-229)||(13025315-13025436)
chr5 (107-229)||(13095499-13095620)
chr5 (107-229)||(22412188-22412309)
chr5 (73-229)||(264772-264929)
chr5 (107-226)||(1096474-1096593)
chr5 (73-229)||(10732944-10733101)
chr5 (73-229)||(11581203-11581360)
chr5 (114-229)||(24529224-24529339)
chr5 (73-229)||(29329935-29330092)
chr5 (73-229)||(39363385-39363542)
chr5 (111-229)||(9077956-9078074)
chr5 (127-229)||(21997549-21997651)
chr5 (107-217)||(22075035-22075145)
chr5 (107-229)||(25421536-25421658)
chr5 (56-215)||(40725871-40726032)
chr5 (73-229)||(20909013-20909170)
chr5 (73-229)||(42245369-42245526)
chr5 (73-218)||(20902012-20902159)
chr5 (79-181)||(29448054-29448159)
chr5 (73-229)||(2154617-2154775)
chr5 (73-229)||(29345981-29346138)
chr5 (109-213)||(25431414-25431518)
chr5 (76-229)||(39245137-39245291)
chr5 (73-229)||(29348454-29348611)
chr5 (73-229)||(29350927-29351084)
chr5 (73-229)||(36154787-36154941)
chr5 (171-229)||(20918052-20918109)
chr5 (73-229)||(32027394-32027551)
chr5 (182-229)||(10775790-10775837)
chr5 (73-219)||(18319037-18319185)
chr5 (162-229)||(21293020-21293086)
chr5 (182-229)||(23064512-23064559)
chr5 (163-214)||(26740697-26740747)
chr5 (182-229)||(38619435-38619482)
chr5 (161-214)||(37723922-37723975)
chr5 (107-167)||(20766115-20766175)
chr5 (173-229)||(31061069-31061124)
chr5 (163-217)||(26732884-26732937)
chr5 (182-230)||(26704074-26704122)
chr5 (182-230)||(26973807-26973855)
[»] chr4 (55 HSPs)
chr4 (10-229)||(39706187-39706405)
chr4 (1-218)||(12288097-12288316)
chr4 (79-230)||(12774010-12774160)
chr4 (56-230)||(8846359-8846550)
chr4 (110-218)||(52243192-52243302)
chr4 (66-229)||(15551821-15551982)
chr4 (47-214)||(13784-13953)
chr4 (56-218)||(43198495-43198661)
chr4 (1-214)||(53082039-53082254)
chr4 (1-214)||(46640343-46640558)
chr4 (14-125)||(15099457-15099567)
chr4 (14-125)||(15190424-15190534)
chr4 (111-221)||(16377522-16377630)
chr4 (107-229)||(16239965-16240086)
chr4 (114-229)||(7088881-7088996)
chr4 (66-195)||(16596686-16596813)
chr4 (73-229)||(44615289-44615446)
chr4 (107-229)||(7798778-7798900)
chr4 (107-229)||(22636439-22636561)
chr4 (107-229)||(6899895-6900016)
chr4 (107-229)||(8574864-8574984)
chr4 (107-229)||(16270231-16270352)
chr4 (108-229)||(52873363-52873484)
chr4 (73-229)||(12311-12468)
chr4 (73-229)||(15118356-15118513)
chr4 (73-229)||(18215278-18215435)
chr4 (107-226)||(23374354-23374473)
chr4 (73-229)||(44773091-44773248)
chr4 (73-229)||(52312511-52312668)
chr4 (107-229)||(12902761-12902883)
chr4 (107-229)||(14280317-14280438)
chr4 (107-229)||(54798749-54798871)
chr4 (73-219)||(19618176-19618323)
chr4 (73-229)||(44928883-44929041)
chr4 (73-229)||(50222343-50222500)
chr4 (73-229)||(51463872-51464029)
chr4 (107-229)||(7893707-7893829)
chr4 (107-229)||(44052833-44052955)
chr4 (111-228)||(14038653-14038770)
chr4 (156-229)||(3096297-3096369)
chr4 (76-229)||(18239426-18239580)
chr4 (73-229)||(1837513-1837670)
chr4 (73-229)||(19242700-19242857)
chr4 (111-219)||(14970751-14970858)
chr4 (168-229)||(17046491-17046552)
chr4 (73-229)||(3515008-3515165)
chr4 (118-229)||(23803316-23803426)
chr4 (73-219)||(15355328-15355476)
chr4 (171-229)||(7641286-7641343)
chr4 (171-229)||(12610951-12611008)
chr4 (116-229)||(14053306-14053418)
chr4 (73-229)||(44102215-44102372)
chr4 (110-151)||(15464929-15464970)
chr4 (162-205)||(17333305-17333347)
chr4 (168-214)||(6190481-6190527)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-218)||(10542-10760)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (1-229)||(62202-62428)
scaffold0028 (82-230)||(132661-132809)
scaffold0028 (73-229)||(136681-136838)
scaffold0028 (73-229)||(139150-139307)
scaffold0028 (73-229)||(144088-144245)
scaffold0028 (73-229)||(134212-134369)
scaffold0028 (73-229)||(141619-141776)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (10-175)||(2116-2281)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (10-229)||(12770-12989)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (10-229)||(6021-6240)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (2-229)||(6615-6843)
scaffold0333 (2-229)||(13995-14223)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (1-230)||(10429-10659)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (56-230)||(22613-22788)
scaffold0037 (73-229)||(82073-82230)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (1-230)||(129908-130138)
scaffold0010 (110-214)||(60713-60818)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (5-230)||(132-357)
[»] chr6 (66 HSPs)
chr6 (1-230)||(19652198-19652426)
chr6 (1-230)||(23019408-23019639)
chr6 (1-218)||(19668386-19668605)
chr6 (1-174)||(22080627-22080800)
chr6 (66-229)||(28496427-28496588)
chr6 (66-229)||(29808838-29808999)
chr6 (1-229)||(1561307-1561534)
chr6 (65-218)||(9098465-9098620)
chr6 (132-229)||(27333238-27333335)
chr6 (132-229)||(27393978-27394075)
chr6 (118-230)||(4185827-4185939)
chr6 (78-230)||(20109140-20109295)
chr6 (118-224)||(4186376-4186482)
chr6 (107-229)||(16496248-16496370)
chr6 (60-230)||(31155346-31155515)
chr6 (111-229)||(29060544-29060662)
chr6 (120-229)||(20076704-20076812)
chr6 (110-218)||(25644335-25644444)
chr6 (73-229)||(1595550-1595707)
chr6 (111-229)||(18409826-18409944)
chr6 (73-229)||(22782228-22782385)
chr6 (111-229)||(19303540-19303657)
chr6 (73-229)||(2291184-2291341)
chr6 (56-226)||(8227453-8227625)
chr6 (73-229)||(12742318-12742475)
chr6 (73-229)||(18334596-18334753)
chr6 (73-229)||(19005047-19005204)
chr6 (73-229)||(19858923-19859080)
chr6 (114-229)||(20638285-20638400)
chr6 (73-229)||(24422548-24422705)
chr6 (73-229)||(33861795-33861952)
chr6 (73-229)||(33864279-33864436)
chr6 (111-229)||(25629354-25629472)
chr6 (73-229)||(20556898-20557053)
chr6 (73-219)||(30676714-30676861)
chr6 (118-178)||(4668217-4668277)
chr6 (118-178)||(4675064-4675124)
chr6 (73-229)||(8055030-8055187)
chr6 (73-229)||(26924644-26924801)
chr6 (107-229)||(17287791-17287913)
chr6 (107-221)||(20360955-20361069)
chr6 (73-229)||(25754810-25754967)
chr6 (111-229)||(20593777-20593895)
chr6 (127-229)||(25656630-25656731)
chr6 (73-219)||(34963384-34963531)
chr6 (76-229)||(1540918-1541072)
chr6 (73-214)||(18456735-18456877)
chr6 (111-219)||(25688513-25688620)
chr6 (114-229)||(16920634-16920747)
chr6 (10-102)||(28103796-28103887)
chr6 (114-229)||(35245590-35245703)
chr6 (171-229)||(25714421-25714478)
chr6 (73-229)||(3852021-3852178)
chr6 (111-214)||(18461895-18461997)
chr6 (168-212)||(22831524-22831568)
chr6 (10-214)||(23076749-23076955)
chr6 (73-219)||(16448530-16448678)
chr6 (46-152)||(18696569-18696675)
chr6 (182-229)||(22780297-22780344)
chr6 (170-223)||(11185515-11185568)
chr6 (44-152)||(18706387-18706495)
chr6 (135-212)||(33443068-33443146)
chr6 (171-214)||(18821904-18821946)
chr6 (1-214)||(35008167-35008383)
chr6 (186-230)||(4738631-4738675)
chr6 (54-102)||(18896256-18896304)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (10-230)||(12942-13162)
scaffold0138 (1-152)||(18125-18277)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (1-230)||(32538-32768)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (1-232)||(160685-160916)
scaffold0001 (73-219)||(501095-501242)
scaffold0001 (73-229)||(85583-85741)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (10-229)||(933-1151)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (56-230)||(45735-45910)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (1-223)||(6822-7042)
scaffold0556 (1-151)||(8097-8248)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (10-219)||(1096-1305)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (1-218)||(7964-8180)
scaffold0218 (72-186)||(29242-29354)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (126-230)||(23897-24001)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (1-214)||(136255-136471)
scaffold0021 (1-214)||(144963-145179)
scaffold0021 (111-214)||(174785-174886)
scaffold0021 (163-229)||(121770-121835)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (1-214)||(6170-6386)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (66-229)||(11296-11457)
scaffold0046 (66-229)||(2001-2162)
scaffold0046 (114-229)||(28418-28533)
scaffold0046 (177-229)||(4556-4608)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (66-229)||(15665-15826)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (66-229)||(1025-1186)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (1-210)||(38339-38551)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (107-229)||(38697-38819)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (1-214)||(128857-129072)
scaffold0022 (1-210)||(78345-78555)
scaffold0022 (107-229)||(116431-116551)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (82-230)||(32101-32249)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (107-229)||(3146-3267)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (127-229)||(15792-15894)
scaffold0020 (1-45)||(15720-15765)
scaffold0020 (182-230)||(178897-178945)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-214)||(12587-12801)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (10-218)||(103536-103737)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (47-203)||(53482-53640)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (107-214)||(1051-1158)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (111-229)||(3185-3303)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (107-221)||(39489-39602)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (107-221)||(75210-75323)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (107-229)||(39862-39983)
scaffold0026 (107-221)||(25908-26021)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (1-214)||(97024-97240)
scaffold0006 (1-214)||(106302-106518)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (73-218)||(25121-25268)
scaffold0123 (44-152)||(619-727)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (107-229)||(1855-1977)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (66-229)||(34127-34288)
scaffold0175 (182-221)||(285-324)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (107-229)||(32952-33073)
scaffold0120 (107-229)||(45932-46053)
scaffold0120 (111-229)||(16117-16235)
scaffold0120 (171-229)||(17389-17446)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (1-214)||(19772-19987)
scaffold0080 (107-229)||(39917-40038)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (114-229)||(4853-4968)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (114-214)||(13147-13247)
scaffold0357 (110-218)||(16098-16206)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (110-218)||(27747-27855)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (56-205)||(11492-11643)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (56-205)||(38198-38349)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (111-229)||(17214-17334)
scaffold0056 (73-214)||(79288-79430)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (11-152)||(87-228)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (56-215)||(17969-18130)
scaffold0247 (73-219)||(2132-2280)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (1-212)||(7946-8161)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (111-226)||(26064-26179)
scaffold0122 (107-229)||(44702-44824)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (107-229)||(13215-13337)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (149-230)||(28806-28888)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (107-229)||(32946-33067)
scaffold0145 (107-229)||(38765-38886)
scaffold0145 (73-229)||(9750-9908)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (73-229)||(20748-20905)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (73-229)||(37822-37979)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (73-229)||(158454-158611)
scaffold0003 (111-229)||(339949-340064)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (107-229)||(3474-3596)
scaffold0292 (107-229)||(347-468)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (107-229)||(51917-52039)
scaffold0011 (107-229)||(167973-168095)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (111-219)||(10784-10891)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (76-229)||(13393-13547)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (107-229)||(8528-8646)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (73-229)||(4695-4852)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (118-178)||(9133-9193)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (114-229)||(10427-10540)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (73-229)||(13948-14105)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (73-229)||(16785-16942)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (114-229)||(1293-1406)
scaffold0106 (114-229)||(7270-7383)
scaffold0106 (168-229)||(15295-15355)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (73-214)||(20383-20524)
scaffold0031 (107-229)||(128755-128876)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (107-229)||(1043-1165)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (107-229)||(1956-2078)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (107-229)||(22887-23008)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (114-229)||(15466-15580)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (114-229)||(32071-32184)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (107-215)||(24297-24406)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (1-214)||(569-783)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (107-229)||(6116-6241)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-214)||(267679-267894)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (168-229)||(4890-4950)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (111-219)||(9253-9360)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (114-214)||(51601-51699)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (73-229)||(40401-40558)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (11-214)||(1696-1900)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (114-217)||(13513-13615)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (107-221)||(4520-4633)
scaffold0228 (107-221)||(12102-12215)
scaffold0228 (107-221)||(22054-22167)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (111-229)||(16599-16717)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (116-229)||(16286-16397)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (156-229)||(4716-4788)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (73-229)||(107-264)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (114-229)||(5132-5245)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (114-229)||(8483-8598)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (66-175)||(2398-2505)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (73-216)||(29946-30090)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (114-215)||(20928-21030)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (73-219)||(11299-11446)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (111-219)||(4308-4415)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (56-175)||(225465-225585)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (73-217)||(161093-161239)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (114-229)||(1053-1166)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (126-214)||(2694-2784)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (73-219)||(12253-12400)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (73-229)||(12065-12216)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (107-212)||(4545-4650)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (163-229)||(46999-47065)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (73-229)||(4215-4373)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (116-227)||(11447-11558)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (182-230)||(23842-23890)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (182-230)||(36453-36501)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (171-214)||(11982-12024)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (79-121)||(2261-2303)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (182-219)||(1395-1432)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (107-151)||(27912-27956)


Alignment Details
Target: scaffold0621 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6767 - 6539
Alignment:
Q  1 actaagttgttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6767 actaagttgttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt 6668  T
Q  101 atgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6667 atgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 6568  T
Q  201 tgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6567 tgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 6539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8702 - 8481
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatata--attgtatatacattatatga 97  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| ||| ||  ||||||  | ||||||||  |||||  |||||  |||||||||||||||  |||    
T  8702 actaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactg-atgtatatgaattgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttga 8604  T
Q  98 attatgt-tg-atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaag 195  Q
    ||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8603 attatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaag 8504  T
Q  196 ctgcatgagttggtctaagttga 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  8503 ctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19497 - 19267
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19497 actaagttgtttatcttgatgttgttgtttcagtaaccctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 19398  T
Q  100 tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19397 tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 19298  T
Q  200 atgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19297 atgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 19267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 66)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18005879 - 18005649
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005879 actaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 18005780  T
Q  100 tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18005779 tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttccatactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 18005680  T
Q  200 atgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18005679 atgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 18005649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 44014407 - 44014181
Alignment:
Q  1 actaagttgttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44014407 actaagttgttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgtttttaatggtatataactgtatatacattatatgaatt 44014308  T
Q  101 atgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgca 200  Q
    |||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  44014307 atgttgatatttgagat---gttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgca 44014211  T
Q  201 tgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44014210 tgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 44014181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 67977 - 67749
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  67977 actaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtgagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaat 67878  T
Q  100 tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 199  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  67877 tatgttgatatt-gagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 67779  T
Q  200 atgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  67778 atgagtcggtctaagttgattaagatgatg 67749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 16219605 - 16219835
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16219605 actaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaat 16219703  T
Q  100 tatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
    |||||| ||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||     
T  16219704 tatgtttgatgtttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagcta 16219803  T
Q  199 catgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16219804 catgagtcggtctaagttgaagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Original strand, 811029 - 811249
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gat 108  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  811029 ttatcttgctgttgtagtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 811127  T
Q  109 atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttgg 208  Q
     |||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  811128 gtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 811227  T
Q  209 tctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  811228 tctaagttgatgatgatgatgt 811249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 47832030 - 47831811
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gat 108  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47832030 ttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgtcgctaatgttatataattgtatatacattatatgaattatgtttgat 47831932  T
Q  109 atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttgg 208  Q
     |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  47831931 gtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatatgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 47831832  T
Q  209 tctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  47831831 tctaagttgattaagatgatg 47831811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16056560 - 16056343
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16056560 actaagttgtttatcttgatgttgttgtttcggtaagcctgaatga-tataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaat 16056462  T
Q  100 tatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  16056461 tatgtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttg-tttgcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtg 16056363  T
Q  199 catgagttggtctaagttga 218  Q
    ||| ||| ||||||||||||    
T  16056362 catcagtcggtctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22073148 - 22072917
Alignment:
Q  1 actaagttgtta-tcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |    
T  22073148 actaagttgtttgtcttgatgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tataatctaatgttgttgttaatgttatataattgcatatacattacatgagt 22073050  T
Q  100 t-atgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  22073049 ttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagc 22072950  T
Q  197 tgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||| ||  |||||||||||| | |||||||    
T  22072949 tgcatgggtcagtctaagttgattaagatgatg 22072917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12901557 - 12901338
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12901557 actaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaatta-tatgatttaatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattacatgaat 12901459  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||||| ||||  ||| ||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||  |  |||| |||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||    
T  12901458 tatgtatgat-gttgtgatgttgctgttttgcatttgatattgttatatcatgaattattttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagc 12901360  T
Q  197 tgcatgagttggtctaagttga 218  Q
    ||||||||| ||| ||||||||    
T  12901359 tgcatgagtcggtttaagttga 12901338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 66 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34200951 - 34200790
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  34200951 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 34200855  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  34200854 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 34200790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 15754777 - 15755004
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatga-tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaa 98  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||| |||| |  |||||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  15754777 actaagttgtttatcttgctgttaatattccagtaagactga-tgcatatgaatttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgac 15754875  T
Q  99 ttatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagct 197  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||    
T  15754876 ttatgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagct 15754972  T
Q  198 gcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||  |||||||||| ||| |||||||    
T  15754973 gcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatg 15755004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 66 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16495567 - 16495406
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16495567 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 16495471  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  16495470 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 16495406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 229
Target Start/End: Original strand, 11995983 - 11996144
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||   ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11995983 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgatatttgag---ttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggtttgcatac 11996079  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    || |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  11996080 tgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 11996144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 229
Target Start/End: Original strand, 28505254 - 28505415
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||| ||| ||  || ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  28505254 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgctgatttatatccgatattattatatcatgatggtttgcatac 28505350  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  28505351 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatg 28505415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 56 - 230
Target Start/End: Original strand, 2280061 - 2280238
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 153  Q
    ||||||||  |||||  |||||||| |||||  ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |    
T  2280061 atgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgct 2280160  T
Q  154 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg-atgatgatgatgt 230  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  2280161 gttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatgatgt 2280238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 110 - 205
Target Start/End: Original strand, 12255789 - 12255886
Alignment:
Q  110 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12255789 tttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcatgaattgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 12255886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38227606 - 38227485
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  38227606 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgagtc 38227508  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||    
T  38227507 ggtctaagtagatgaagatgatg 38227485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 218
Target Start/End: Original strand, 1867924 - 1868101
Alignment:
Q  43 ttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattg 141  Q
    |||| ||||| | ||||||||  |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  1867924 ttaagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttcatttgcatt-gatattg 1868022  T
Q  142 ttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 218  Q
    |||||||||||  || |||  |||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1868023 ttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Original strand, 3564363 - 3564481
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 209  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  3564363 ttgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 3564461  T
Q  210 ctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  3564462 ctaagttgatgaagatgatg 3564481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 18456408 - 18456529
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||     
T  18456408 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatcg-ttatttaactaagctgcatgagtc 18456506  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  18456507 ggtctaagttgattaagatgatg 18456529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12698958 - 12698835
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga--tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| ||   |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12698958 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 12698860  T
Q  205 ttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    | ||||||||||||||| |||||||    
T  12698859 tcggtctaagttgatgaagatgatg 12698835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13647487 - 13647344
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |||||||| ||    
T  13647487 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcct 13647388  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 214  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13647387 atgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 13647344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14044935 - 14044761
Alignment:
Q  47 tatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgtta 144  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  14044935 tatgatttaatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgtta 14044837  T
Q  145 tatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 218  Q
    ||||| ||  || |||   ||||| |||||||||| || |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14044836 tatcaggagctgttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14354965 - 14354791
Alignment:
Q  47 tatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgtta 144  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  14354965 tatgatttaatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgtta 14354867  T
Q  145 tatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 218  Q
    ||||| ||  || |||   ||||| |||||||||| || |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14354866 tatcaggagctgttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18430870 - 18430713
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| |||   ||||||| |    
T  18430870 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-t 18430772  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  18430771 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18430713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 20220077 - 20220290
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| |||  ||||| | ||||||||  |||||  |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20220077 actaagttgcttatcttactgttgttgttccagtaagcctgatttag-atgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaat 20220175  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | |||| |||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||    
T  20220176 tatatatgatgtttgagatgttgat---ttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagc 20220272  T
Q  197 tgcatgagttggtctaag 214  Q
    || |||||| ||||||||    
T  20220273 tgtatgagtcggtctaag 20220290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27217018 - 27216861
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  27217018 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 27216920  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  27216919 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 27216861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9509315 - 9509193
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgat-ttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9509315 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 9509217  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  9509216 cggtctaagttgatgaagatgatg 9509193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 456479 - 456322
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  456479 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 456381  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  456380 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 456322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 11393291 - 11393448
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  11393291 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 11393389  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  11393390 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11972654 - 11972497
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  11972654 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 11972556  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  11972555 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11972497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 14949126 - 14949283
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  14949126 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 14949224  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  14949225 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 14949283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 15376717 - 15376874
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  15376717 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 15376815  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  15376816 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15376874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16232678 - 16232521
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  16232678 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 16232580  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  16232579 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 16232521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18640430 - 18640273
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  18640430 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 18640332  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  18640331 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18640273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 20385127 - 20385284
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  20385127 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 20385225  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  20385226 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20385284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 21189599 - 21189756
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  21189599 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 21189697  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  21189698 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21189756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24702396 - 24702239
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  24702396 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 24702298  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  24702297 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24702239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32125649 - 32125492
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  32125649 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 32125551  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  32125550 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 32125492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41523075 - 41522918
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  41523075 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 41522977  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  41522976 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 41522918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41525537 - 41525380
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  41525537 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 41525439  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  41525438 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 41525380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 125
Target Start/End: Original strand, 9389599 - 9389709
Alignment:
Q  14 cttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttg 113  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||| |||  |||  |||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  9389599 cttgatgttgtcattccagtaagcctggattg-tatattctaatattgatgataatgttatataattgtatatacattgtatgaattatgttgatatatg 9389697  T
Q  114 agatgttgttga 125  Q
    ||||||||||||    
T  9389698 agatgttgttga 9389709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 17061919 - 17062076
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 170  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||| ||| |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| |  |||| |||||| ||     
T  17061919 atataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctattttgtatactg-ctg 17062017  T
Q  171 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  17062018 agttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17062076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26212122 - 26212012
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  26212122 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgtatgagt 26212024  T
Q  206 tggtctaagttg 217  Q
     |||||||||||    
T  26212023 cggtctaagttg 26212012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 48273511 - 48273393
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  48273511 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcataagtcggt 48273413  T
Q  210 ctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  48273412 ctaagttgattaagatgatg 48273393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 56 - 215
Target Start/End: Original strand, 19486686 - 19486847
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 153  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| ||| |  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||    
T  19486686 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 19486785  T
Q  154 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 215  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |  |||  |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19486786 gttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 19486847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 215
Target Start/End: Original strand, 10063813 - 10063921
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||     
T  10063813 atatttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatcatgatgttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtc 10063912  T
Q  207 ggtctaagt 215  Q
     ||||||||    
T  10063913 agtctaagt 10063921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16410217 - 16410060
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  16410217 atataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 16410119  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  16410118 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 16410060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24704843 - 24704689
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 170  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| || || |  |||| ||||||| |     
T  24704843 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgtt--tttgtatactgt-tg 24704747  T
Q  171 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  24704746 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24704689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24275289 - 24275182
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 209  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24275289 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 24275192  T
Q  210 ctaagttgat 219  Q
    ||||||||||    
T  24275191 ctaagttgat 24275182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 230
Target Start/End: Original strand, 15144037 - 15144154
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgat-ttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 209  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||| | ||||| || || | ||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15144037 ttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgag-atgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 15144134  T
Q  210 ctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  15144135 ctaagttga-gatgatgatgt 15144154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44116667 - 44116510
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| ||||   ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  44116667 atataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ct 44116569  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  44116568 gtgttgctgttg-ttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44116510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 16386242 - 16386365
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||| |||| | || | |||||  |||| ||||| |||||| | |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16386242 atatttaagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 16386341  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  16386342 cggtctaagttgttgaagatgatg 16386365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 15008441 - 15008597
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga-- 152  Q
    ||||||||  |||||  ||||| |||||||| |||||  |||||||| | |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||      
T  15008441 atgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgaggtgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaac 15008539  T
Q  153 tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtc 210  Q
    || |||  |||||  |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  15008540 tgttttatatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 15008597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3386491 - 3386334
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| | || ||||| || ||| | ||||| | |    
T  3386491 atataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactat-t 3386393  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  3386392 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 3386334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10589158 - 10589055
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 212  Q
    |||||||||||||||||| | |||||  |||| ||||| || ||| | ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  10589158 agatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcgatcta 10589060  T
Q  213 agttg 217  Q
    |||||    
T  10589059 agttg 10589055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16213795 - 16213685
Alignment:
Q  118 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagtt 216  Q
    |||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16213795 gttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16213698  T
Q  217 gatgatgatgatg 229  Q
    ||| | |||||||    
T  16213697 gattaagatgatg 16213685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40443509 - 40443395
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 213  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||| || ||||  |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  40443509 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-tttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaa 40443411  T
Q  214 gttgatgatgatgatg 229  Q
    | || ||| |||||||    
T  40443410 gatgttgaagatgatg 40443395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 16324238 - 16324175
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttg 64  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  16324238 actaagttgttgatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgttg 16324175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13869394 - 13869347
Alignment:
Q  182 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  13869394 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13869347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20110604 - 20110557
Alignment:
Q  182 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  20110604 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20110557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 229
Target Start/End: Original strand, 27847881 - 27847947
Alignment:
Q  163 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||| |||||||    
T  27847881 actgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatg 27847947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13831421 - 13831374
Alignment:
Q  182 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  13831421 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatg 13831374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 219
Target Start/End: Original strand, 38898380 - 38898528
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgtc 168  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   |||||| |    
T  38898380 atataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactg-c 38898478  T
Q  169 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 219  Q
    | ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  38898479 tgtgtcgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 38898528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 16324171 - 16324135
Alignment:
Q  112 tgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatc 148  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  16324171 tgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 16324135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18203882 - 18203831
Alignment:
Q  162 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 214  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  18203882 tactgtctatgttgttgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcgatctaag 18203831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 52)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 22921757 - 22921987
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22921757 actaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaat 22921856  T
Q  100 tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  22921857 tttgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgc 22921956  T
Q  200 atgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22921957 atgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 22921987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 56 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 33681185 - 33681010
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg 154  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33681185 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 33681086  T
Q  155 atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  33681085 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 72 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22237789 - 22237630
Alignment:
Q  72 tatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 170  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  22237789 tatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgccta 22237690  T
Q  171 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22237689 tgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21754198 - 21754052
Alignment:
Q  79 ttgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 178  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  21754198 ttgtatatacattaaatggattatgttgataattgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttg 21754100  T
Q  179 ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatg 226  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21754099 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 21754052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 56 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20248454 - 20248282
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg 154  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20248454 atgttgtttataatgatatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttaag---ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatg 20248358  T
Q  155 atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20248357 atttgcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 20248282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 52927870 - 52928088
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52927870 actaagttgtttatcttgctattgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaat 52927968  T
Q  100 tatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
    |||||| |||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  52927969 tatgtttgatatttgagatg------------attcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctg 52928056  T
Q  199 catgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  52928057 catgagtcggtctaagttgaagatggtgatgt 52928088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 21861457 - 21861672
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||  |||||    
T  21861457 actaagttgtttatcttgctattgttgtttcagtaagcctgaat-attatgatatgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaat 21861555  T
Q  100 tatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagct 197  Q
    ||| | ||| | |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| |||||||    
T  21861556 tatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagct 21861655  T
Q  198 gcatgagttggtctaag 214  Q
    |||||||| ||||||||    
T  21861656 gcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Original strand, 21896162 - 21896358
Alignment:
Q  19 tgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgaga 116  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||  |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| | |||||||    
T  21896162 tgttgttgtttcagtaagcctgaat-attatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgaga 21896260  T
Q  117 tgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 214  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  21896261 tgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 66 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20918769 - 20918620
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  20918769 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 20918673  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg 217  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20918672 tgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 230
Target Start/End: Original strand, 14295507 - 14295672
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14295507 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 14295603  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa---gttgatgatgatgatgt 230  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||| |||||||||||    
T  14295604 tacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21161892 - 21161719
Alignment:
Q  55 aatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 153  Q
    |||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| || |||   |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21161892 aatgatgtcgttgatgttatataagtgtataaacattgtatgatttatgttgatgatatgaa--gttgatgaattgcattcgatattgttatatcacgat 21161795  T
Q  154 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  21161794 gatttgcatactgt-tttgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgatgatgatgatgt 21161719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 214
Target Start/End: Original strand, 50614023 - 50614219
Alignment:
Q  20 gttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat-gttgatatttgagatg 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | ||||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||    ||| |||||||||    
T  50614023 gttgttacttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatg 50614121  T
Q  119 ttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 214  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50614122 ttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 214
Target Start/End: Original strand, 50621851 - 50622047
Alignment:
Q  20 gttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat-gttgatatttgagatg 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | ||||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||    ||| |||||||||    
T  50621851 gttgttacttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatg 50621949  T
Q  119 ttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 214  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50621950 ttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16758841 - 16758664
Alignment:
Q  44 taatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgt 142  Q
    ||||||||| |  |||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||   ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  16758841 taatatgatttgttgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgt 16758742  T
Q  143 tatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 218  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16758741 tatatcatgaactggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 50686846 - 50686630
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  50686846 actaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatccgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaat 50686748  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||  |  |||    |||| ||||||||| ||| |||  |||||||| |    
T  50686747 tatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatcatgaactattttatgaactgcctatgttgccgtttgtttattaactaaac 50686648  T
Q  197 tgcatgagttggtctaag 214  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  50686647 tgcatgagtcggtctaag 50686630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 226
Target Start/End: Original strand, 16368184 - 16368401
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gat 108  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||    |||    
T  16368184 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaacgat 16368282  T
Q  109 atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
     || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  || ||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||     
T  16368283 gtt-gagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaattgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 16368380  T
Q  207 ggtctaagttg-atgatgatg 226  Q
    |||||||| || |||||||||    
T  16368381 ggtctaagatgaatgatgatg 16368401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 214
Target Start/End: Original strand, 41049933 - 41050138
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat 108  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||  |||||  ||||| |||||||| |||||  |||||||| | ||||    
T  41049933 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatttgacgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgat 41050031  T
Q  109 atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
     || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |  |||  |||||| ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||     
T  41050032 gtt-gagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtc 41050130  T
Q  207 ggtctaag 214  Q
    ||||||||    
T  41050131 ggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 125
Target Start/End: Original strand, 35981586 - 35981700
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgata 109  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||  |||  |||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35981586 ttatcttgatgttgtcattccagtaagcctggattg-tatattctaatgttgatgataatgttatataattgcatatacattatatgaattatgttgata 35981684  T
Q  110 tttgagatgttgttga 125  Q
    ||||||||||||||||    
T  35981685 tttgagatgttgttga 35981700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Original strand, 50210212 - 50210330
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  50210212 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 50210310  T
Q  210 ctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  50210311 ctaagttgatgaagatgatg 50210330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22532395 - 22532273
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  22532395 atatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaaattgcatgagt 22532297  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  22532296 tggtctaagttgatgaagatgatg 22532273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 120 - 214
Target Start/End: Original strand, 35261086 - 35261180
Alignment:
Q  120 tgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 214  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35261086 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 214
Target Start/End: Original strand, 45574846 - 45574989
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||||| | |||| |||| ||||| || ||| |||||||| ||    
T  45574846 atataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatactgcct 45574945  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 214  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45574946 atgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45574989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 49261521 - 49261448
Alignment:
Q  52 tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttga 125  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49261521 tctaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatataaattatgttgatatttgagatgttgttga 49261448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 21475091 - 21475248
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  21475091 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 21475189  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21475190 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 21475248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34509899 - 34509784
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 212  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34509899 agatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 34509801  T
Q  213 agttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||| |||||||    
T  34509800 agttgatgaagatgatg 34509784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13989024 - 13988867
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  13989024 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 13988926  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  13988925 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13988867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 21923295 - 21923452
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  21923295 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 21923393  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  21923394 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21923452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 20637067 - 20636957
Alignment:
Q  14 cttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttg 113  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||||  |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  20637067 cttgatgttgtcattccagtaagcctgaattg-tattttttaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatgaattatgtttgtatttg 20636969  T
Q  114 agatgttgttga 125  Q
     |||||||||||    
T  20636968 ggatgttgttga 20636957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21026806 - 21026684
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||  ||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21026806 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 21026708  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  21026707 cggtctaagttgttgacgatgatg 21026684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 27250724 - 27250846
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27250724 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgagt 27250822  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  27250823 cggtctaagttgttgaagatgatg 27250846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 111 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21840885 - 21840778
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 209  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21840885 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 21840788  T
Q  210 ctaagttgat 219  Q
    ||||||||||    
T  21840787 ctaagttgat 21840778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 23593739 - 23593896
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  23593739 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 23593837  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  23593838 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23593896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29298294 - 29298138
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  29298294 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatactgt-t 29298197  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  29298196 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29298138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29776846 - 29776689
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |  ||| | ||||||| |    
T  29776846 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactgt-t 29776748  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  29776747 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29776689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31612471 - 31612314
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  |||  |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | |    
T  31612471 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-t 31612373  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  31612372 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 31612314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 433168 - 433013
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| || |||||  |||| |||||| ||    
T  433168 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcct 433069  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  433068 gtgttgc----cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 433013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 181
Target Start/End: Original strand, 22130863 - 22130976
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  22130863 taatgttatataattgtatatgcattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttggatac 22130959  T
Q  165 tgtctatgttgctgttg 181  Q
    || ||||||||||||||    
T  22130960 tgcctatgttgctgttg 22130976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 214
Target Start/End: Original strand, 16093825 - 16093987
Alignment:
Q  55 aatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatga 152  Q
    ||||||| | ||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16093825 aatgttgattttaatgtgatatatttgtatatacattacatgaattacctatgatgtttgagatgttgtttgatttgcatt-gatattgttatatcatga 16093923  T
Q  153 --tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 214  Q
      || |||  |||||| |||||||||| || |||  ||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  16093924 gctgttttctatactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaag 16093987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 229
Target Start/End: Original strand, 20847205 - 20847271
Alignment:
Q  162 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  20847205 tactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 20847271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 51130729 - 51130632
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  51130729 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 51130633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 22123071 - 22123229
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaatta--tgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||  |||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |  ||| | ||||||| |    
T  22123071 atataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-t 22123169  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  22123170 gtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgatg 22123229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 219
Target Start/End: Original strand, 20454610 - 20454660
Alignment:
Q  168 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20454610 ctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20454660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26065100 - 26064959
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtct 169  Q
    ||||| ||||||||  ||||  |||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |  |||   ||||| ||    
T  26065100 atatatttgtatatgtattacttgaattatatatgatctttgagatgttgttgatttgcattgg-tattgttatatcatgaattattttatgtactgcct 26065002  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 212  Q
    ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  26065001 atgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtcta 26064959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16362075 - 16361928
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   ||||||| |    
T  16362075 atataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatactgt-t 16361977  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 219  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16361976 gtgttgctgtcg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16361928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 13212865 - 13213023
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 168  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||     
T  13212865 atataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt- 13212963  T
Q  169 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |  || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  13212964 tgcgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13213023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 205
Target Start/End: Original strand, 38801433 - 38801481
Alignment:
Q  157 ttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38801433 ttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 38801481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21342144 - 21342097
Alignment:
Q  182 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  21342144 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21342097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21347009 - 21346962
Alignment:
Q  182 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  21347009 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21346962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21707215 - 21707168
Alignment:
Q  182 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  21707215 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21707168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21711757 - 21711710
Alignment:
Q  182 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  21711757 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21711710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21714593 - 21714545
Alignment:
Q  182 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  21714593 gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgt 21714545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 229
Target Start/End: Original strand, 15860123 - 15860170
Alignment:
Q  182 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||    
T  15860123 gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 15860170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5875 - 5654
Alignment:
Q  1 actaagttgttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5875 actaagtttttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt 5776  T
Q  101 atgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  5775 atgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttcatactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgca 5676  T
Q  201 tgagttggtctaagttgatgat 222  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  5675 tgagtcggtctaagttgatgat 5654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 100607 - 100377
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  100607 actaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctaaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaat 100508  T
Q  100 tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  100507 tatgttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 100408  T
Q  200 atgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  100407 atgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 100377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 40062 - 40292
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40062 actaagttgtttaccttgatgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatcttatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 40161  T
Q  100 tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40162 tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcctactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgc 40261  T
Q  200 atgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  40262 atgagtcagtctaagttgatgatgatgatgt 40292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 94569 - 94412
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  94569 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 94471  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  94470 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 94412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44613 - 44455
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt--gcatactgtc 168  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||  | |||||||     
T  44613 atataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt- 44515  T
Q  169 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  44514 tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 101576 - 101502
Alignment:
Q  156 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  101576 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatgt 101502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 119948 - 119879
Alignment:
Q  160 catactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  119948 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 119879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 219
Target Start/End: Original strand, 17444 - 17591
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  17444 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 17542  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 219  Q
     ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17543 gtgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 60)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25176083 - 25175853
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  25176083 actaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattatatatacgttatatgaat 25175984  T
Q  100 tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25175983 tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 25175884  T
Q  200 atgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  25175883 atgaatctgtctaagttgatgatgatgatgt 25175853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28406210 - 28405981
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28406210 actaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaatggtatataattgtatatacattttatgaat 28406111  T
Q  100 tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  28406110 taagttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttg 28406011  T
Q  199 catgagttggtctaagttgatgatgatgat 228  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28406010 catgagtcggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 7620 - 7824
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||    
T  7620 actaagttgtttatcatgttgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatttaatgttgttgttaatgtgatataattgtatatacattacttgaat 7718  T
Q  100 tatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagct 197  Q
    ||| | ||| | |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  7719 tatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagct 7818  T
Q  198 gcatga 203  Q
    ||||||    
T  7819 gcatga 7824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 18786790 - 18787009
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18786790 actaagttgtttatcatgctgttgttgtttcagtaagcctaaatta-tatgattgaatgttattgataatgttatatagttgtatatacattacatgaat 18786888  T
Q  100 tatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    |||||| ||| || | || |||||||||||||||| || |||||||||||||||  || ||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  18786889 tatgtttgatgtt-gtgacgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaactggtttgcatactacctatgttactgattgttatttaactaagc 18786987  T
Q  197 tgcatgagttggtctaagttga 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  18786988 tgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 229
Target Start/End: Original strand, 22134175 - 22134323
Alignment:
Q  79 ttgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 178  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22134175 ttgtatatacattaaatggattatgttgataaatgagatgttattga-ttgcattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 22134273  T
Q  179 ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    || | |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  22134274 tt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatg 22134323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7679746 - 7679589
Alignment:
Q  72 tatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 170  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||  ||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7679746 tatataattatatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttacatt-gatattgttatatcatgatgatttgcatactgccta 7679648  T
Q  171 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  7679647 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 66 - 229
Target Start/End: Original strand, 23071905 - 23072066
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||| ||| ||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  23071905 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgctgatttatattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 23072001  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  23072002 tgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatg 23072066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23207511 - 23207296
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||| |||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  23207511 actaagttgcttatcttactgttgttgttcaagtaagcctgaatta-tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaat 23207413  T
Q  100 tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagct 197  Q
    ||| |  |   ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  23207412 tatttataatgttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagct 23207313  T
Q  198 gcatgagttggtctaag 214  Q
    |||||||| ||||||||    
T  23207312 gcatgagtcggtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23791508 - 23791292
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  23791508 actaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaat 23791410  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | | || |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  || |||   ||||| |||||||| |||| | |  ||||||||||    
T  23791409 tatatataatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagc 23791310  T
Q  197 tgcatgagttggtctaag 214  Q
    | ||||||| ||||||||    
T  23791309 tacatgagtcggtctaag 23791292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22105571 - 22105413
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |||||||| ||    
T  22105571 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcct 22105472  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  22105471 atgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 22105413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 298809 - 298932
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||| ||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  298809 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 298908  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||||| | |||||||    
T  298909 cggtctaagttgattaagatgatg 298932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19671991 - 19671848
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctat 171  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||   ||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19671991 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatattgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttttgcatactgcctat 19671892  T
Q  172 gttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 215  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19671891 gttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 19671848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 230
Target Start/End: Original strand, 23708561 - 23708738
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttg--atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 153  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| ||   || |||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||| |    
T  23708561 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgtt 23708660  T
Q  154 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg-atgatgatgatgt 230  Q
    | ||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  23708661 gttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttgaaagatgatgatgt 23708738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23060639 - 23060517
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23060639 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 23060541  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  23060540 cggtctaagttgatgaagatgatg 23060517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25109122 - 25108906
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  ||||   |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  25109122 actaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaat 25109024  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | |||| |||||||| ||||||| ||   || ||||||||||||||||||  |  |||   ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||    
T  25109023 tatatatgatgtttgagatattgttgattttgctttgatattgttatatcatgaactattttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagc 25108924  T
Q  197 tgcatgagttggtctaag 214  Q
    | ||||||| ||||||||    
T  25108923 tacatgagtcggtctaag 25108906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18809101 - 18808944
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  18809101 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 18809003  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  18809002 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18808944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23131020 - 23130863
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  23131020 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 23130922  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  23130921 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23130863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23133487 - 23133330
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  23133487 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 23133389  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  23133388 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23133330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 23709536 - 23709693
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  23709536 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 23709634  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  23709635 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23709693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 23712017 - 23712174
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  23712017 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 23712115  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  23712116 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23712174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 34402526 - 34402683
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  34402526 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 34402624  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  34402625 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 34402683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39682471 - 39682314
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  39682471 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 39682373  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  39682372 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 39682314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22337241 - 22337119
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   |||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22337241 atatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 22337143  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  22337142 cggtctaagttgatgaagatgatg 22337119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23076568 - 23076446
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23076568 atatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 23076470  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||| ||||| |||||||    
T  23076469 cggtctaagtggatgaagatgatg 23076446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23285987 - 23285869
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| || || |  |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  23285987 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc-tgtt--tttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 23285892  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  23285891 ggtctaagttgatgaagatgatg 23285869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 23654381 - 23654503
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| |||||||| ||||| || ||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23654381 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 23654479  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  23654480 cggtctaagttgttgaagatgatg 23654503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 229
Target Start/End: Original strand, 38138 - 38231
Alignment:
Q  135 gatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  38138 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 38231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23660148 - 23660027
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  || || | |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||     
T  23660148 atatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttgtttaactaagatacatgagtc 23660050  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  23660049 ggtctaagttgatgaagatgatg 23660027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24367932 - 24367785
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  24367932 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24367834  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 219  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24367833 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24367785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 214
Target Start/End: Original strand, 20520152 - 20520295
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtct 169  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||||  |    
T  20520152 atatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcat 20520250  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 214  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20520251 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 76 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23135745 - 23135591
Alignment:
Q  76 taattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatg 172  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||    
T  23135745 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtg 23135647  T
Q  173 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  23135646 ttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23135591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 571555 - 571398
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  | | |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  571555 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 571457  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  571456 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 571398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6726153 - 6725996
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  6726153 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 6726055  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  6726054 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 6725996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26505537 - 26505380
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |  ||| | |||||| ||    
T  26505537 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ct 26505439  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  26505438 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 26505380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26508015 - 26507858
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |  ||| | |||||| ||    
T  26508015 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ct 26507917  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  26507916 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 26507858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28577257 - 28577100
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||  ||||||| |||||| |||||||||| || ||| | ||||||| |    
T  28577257 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgt-t 28577159  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  28577158 gcgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 28577100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 22731229 - 22731351
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| | |||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22731229 atatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 22731327  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||| ||||||| |||||||    
T  22731328 cggtctaacttgatgaagatgatg 22731351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 219
Target Start/End: Original strand, 21155064 - 21155211
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  21155064 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 21155162  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 219  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21155163 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21155211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 152
Target Start/End: Original strand, 24697536 - 24697645
Alignment:
Q  44 taatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgt 142  Q
    ||||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||| | | |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24697536 taatatgattttatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaagtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgt 24697635  T
Q  143 tatatcatga 152  Q
    ||||||||||    
T  24697636 tatatcatga 24697645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 24898199 - 24898357
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  24898199 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24898297  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaa-gctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  24898298 gtgttgctgttg-ttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24898357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 24900682 - 24900840
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  24900682 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24900780  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaa-gctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  24900781 gtgttgctgttg-ttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24900840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 24903159 - 24903317
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  24903159 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24903257  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaa-gctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  24903258 gtgttgctgttg-ttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24903317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 24905636 - 24905794
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  24905636 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24905734  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaa-gctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  24905735 gtgttgctgttg-ttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24905794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 24908111 - 24908269
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  24908111 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24908209  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaa-gctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  24908210 gtgttgctgttg-ttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24908269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20309225 - 20309112
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 213  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20309225 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 20309128  T
Q  214 gttgatgatgatgatg 229  Q
    | || ||| |||||||    
T  20309127 gatgttgaagatgatg 20309112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 169 - 229
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040306
Alignment:
Q  169 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23040247 tatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 23040306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 32039502 - 32039659
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  32039502 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 32039600  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  32039601 gtgttactgttg-ttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatg 32039659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Original strand, 23103396 - 23103512
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtc 210  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||  | || ||||| || |||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23103396 ttgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctg-tttgtatactgcctatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23103493  T
Q  211 taagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||| || ||| |||||||    
T  23103494 taagatgttgaagatgatg 23103512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 219
Target Start/End: Original strand, 32214925 - 32215072
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  32214925 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 32215023  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 219  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32215024 gtgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 32215072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8946733 - 8946661
Alignment:
Q  156 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  8946733 tttgtatactgcctatgttgctattg-ttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 8946661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 214
Target Start/End: Original strand, 22413078 - 22413240
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcg--atattgttatatcatga 152  Q
    ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| || ||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  22413078 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatgtt-gagatgttgttgatttgcatttgatatattgttatatcatga 22413176  T
Q  153 --tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 214  Q
      || |||  |||||| |||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22413177 gctgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22413240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 45029858 - 45030015
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||| ||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||| |    
T  45029858 atataaatgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgt-t 45029956  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  45029957 gtgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 45030015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 43137457 - 43137301
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  | | |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| |  ||    
T  43137457 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatta-ct 43137359  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgat 228  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  43137358 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 219
Target Start/End: Original strand, 24643054 - 24643101
Alignment:
Q  171 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 219  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24643054 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24643101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 229
Target Start/End: Original strand, 22738249 - 22738296
Alignment:
Q  182 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  22738249 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 22738296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23004905 - 23004767
Alignment:
Q  79 ttgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttg 175  Q
    |||||||| |||||| || ||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||  |  |||   ||||  ||||||||    
T  23004905 ttgtatatgcattatgtggattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcctgaactattttatgtactacctatgttg 23004806  T
Q  176 ctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 214  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23004805 ctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 23004767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38967422 - 38967375
Alignment:
Q  182 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  38967422 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 38967375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 24529532 - 24529690
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatat--ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 168  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||  |||||| |||||| | ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||      
T  24529532 atataattgtatatgcattatttgaattatatatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactga- 24529630  T
Q  169 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  24529631 tgtgttgttgttg-ttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24529690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287384
Alignment:
Q  162 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 212  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  163 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 212  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Original strand, 2543 - 2763
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgata 109  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2543 ttatcttgctgatgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgata 2642  T
Q  110 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  2643 tttgagatgttgttgatttgcattcaatattgttataacatgatgatttacatactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 2742  T
Q  210 ctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2743 ctaagttgatgatgatgatgt 2763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 63)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 23760751 - 23760962
Alignment:
Q  19 tgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatg 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760751 tgttgttgtttcagtaagcctgaataaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatg 23760850  T
Q  119 ttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 218  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23760851 ttgttgatttgaattcaatattgttatatcatgatgatttacatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 23760950  T
Q  219 tgatgatgatgt 230  Q
     |||||||||||    
T  23760951 agatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21673936 - 21673707
Alignment:
Q  1 actaagttgttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  21673936 actaagttgttatcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattaaataaatt 21673837  T
Q  101 atgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgca 200  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| | ||||    
T  21673836 atattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgca 21673737  T
Q  201 tgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21673736 tgagtcggtctaagttgatgatgatcatgt 21673707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 38855140 - 38855368
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855140 actaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattatatgaat 38855238  T
Q  100 tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38855239 tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 38855338  T
Q  200 atgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  38855339 atgagtcggtctaagttgattaagatgatg 38855368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6520590 - 6520372
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgata 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  6520590 ttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgttgatg 6520492  T
Q  110 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 209  Q
    |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  6520491 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 6520392  T
Q  210 ctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  6520391 ctaagttgattaagatgatg 6520372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21285820 - 21285611
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gat 108  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  21285820 ttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tataatctaatattgttgttaatgatatataattgtatatacattacatgaactatgtttgat 21285722  T
Q  109 atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttgg 208  Q
     |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  21285721 gtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcgg 21285622  T
Q  209 tctaagttgat 219  Q
    |||||||||||    
T  21285621 tctaagttgat 21285611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 56 - 230
Target Start/End: Original strand, 26355643 - 26355816
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga 155  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26355643 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattaaatggaatatgttgatggctgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcgtgatga 26355741  T
Q  156 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26355742 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 26355816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 218
Target Start/End: Original strand, 983312 - 983512
Alignment:
Q  19 tgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagat 117  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||| || | |||    
T  983312 tgttgttgtttcagtaagtctgaatta-tatgattgaatgttgttgataatgttatatagctgtatatacattacatgaattatgtttgatgtt-gtgat 983409  T
Q  118 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 215  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  983410 gttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaacttgtttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 983509  T
Q  216 tga 218  Q
    |||    
T  983510 tga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 66 - 229
Target Start/End: Original strand, 5866230 - 5866391
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  5866230 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 5866326  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  5866327 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 5866391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 66 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21491160 - 21490999
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21491160 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggtttgcatac 21491064  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  21491063 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 21490999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37116582 - 37116366
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||  |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  37116582 actaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatttag-atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaat 37116484  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  37116483 tatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagc 37116384  T
Q  197 tgcatgagttggtctaag 214  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  37116383 tgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17141081 - 17140920
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||| ||| || ||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||    
T  17141081 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgatgatttacattcgatattattatgtcatgatggattgcatac 17140985  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  17140984 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 17140920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 17266880 - 17267096
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| | ||||    
T  17266880 actaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtgagcctgaatta-tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaagaat 17266978  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   | |||   ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||    
T  17266979 tatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaaccgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagc 17267078  T
Q  197 tgcatgagttggtctaag 214  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  17267079 tgcatgagtcggtctaag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21249550 - 21249388
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21249550 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgaattgcatac 21249454  T
Q  165 tgtctatgttgct-gttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||  |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  21249453 tgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 21249388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21255388 - 21255226
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21255388 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgaattgcatac 21255292  T
Q  165 tgtctatgttgct-gttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||  |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  21255291 tgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 21255226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22626861 - 22626740
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  22626861 atatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 22626763  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  22626762 ggtctaagttgatgaagatgatg 22626740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 215
Target Start/End: Original strand, 13508009 - 13508188
Alignment:
Q  38 ctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcg 135  Q
    ||||||||  ||||| | ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  13508009 ctgaattatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcg 13508108  T
Q  136 atattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 215  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13508109 atattattatatcatgatgttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13508188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20498796 - 20498581
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| | |||| ||||| ||||  || |||||| | ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||  |||||    
T  20498796 actaagttgtttatcttgatgttgatgtttcggtaagactgatgta-tatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaat 20498698  T
Q  100 tatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagct 197  Q
    ||| | ||| | |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| |    
T  20498697 tatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctattttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagtt 20498598  T
Q  198 gcatgagttggtctaag 214  Q
    |||||||| ||||||||    
T  20498597 gcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 16092337 - 16092459
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16092337 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 16092435  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  16092436 cggtctaagttgatgaagatgatg 16092459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24353235 - 24353039
Alignment:
Q  19 tgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagat 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  ||||   |||||| ||||||| ||||| ||||||| | |  ||| ||||||||    
T  24353235 tgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatacgatgtttgagat 24353137  T
Q  118 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 214  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24353136 gttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 215
Target Start/End: Original strand, 13597541 - 13597720
Alignment:
Q  38 ctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcg 135  Q
    ||||||||  ||||| | ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||||||| ||||||||| | |||| ||||    
T  13597541 ctgaattatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcg 13597640  T
Q  136 atattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 215  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13597641 atattattatatcatgatgttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13597720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 21918995 - 21919117
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21918995 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 21919093  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  21919094 cggtctaagttgttgaagatgatg 21919117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 214
Target Start/End: Original strand, 17439436 - 17439609
Alignment:
Q  44 taatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgt 142  Q
    ||||||||| |||||||| |  |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17439436 taatatgatttaatgttgataataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgt 17439535  T
Q  143 tatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 214  Q
    ||||||||||  || |||   ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| || |||||    
T  17439536 tatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaag 17439609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22875190 - 22875069
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| || |||||||| | | ||||||||||||||||||||||     
T  22875190 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctgtgttgctgct-gctatttaactaagctgcatgagtc 22875092  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||| ||||||| |||||||    
T  22875091 ggtctaaattgatgaagatgatg 22875069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 215
Target Start/End: Original strand, 17612069 - 17612213
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 170  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  17612069 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgcatactgccta 17612168  T
Q  171 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 215  Q
    ||||| || | |||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17612169 tgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 17612213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Original strand, 28649046 - 28649161
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 212  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28649046 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgcttttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 28649144  T
Q  213 agttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||| |||||||    
T  28649145 agttgatgaagatgatg 28649161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7372904 - 7372782
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7372904 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 7372806  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  7372805 cggtctaagttgatgaagatgatg 7372782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20536334 - 20536212
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20536334 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 20536236  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  20536235 cggtctaagttgatgaagatgatg 20536212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31971375 - 31971261
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 213  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31971375 agatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 31971277  T
Q  214 gttgatgatgatgatg 229  Q
    |||| ||| |||||||    
T  31971276 gttgttgaagatgatg 31971261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26219838 - 26219718
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  |  |||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  26219838 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactattttgtatactg-ctgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 26219741  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  26219740 ggtctaagttgattatgatgatg 26219718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 22364895 - 22364744
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  ||| |  |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  22364895 actaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgttaataaagtgatataaatgtatatgcattacatgaat 22364797  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 152  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||    
T  22364796 tatatatgatgtttgagatgttgttgattttc-tttgatattgttatatcatga 22364744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1484560 - 1484403
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  1484560 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 1484462  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  1484461 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 1484403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 5853296 - 5853453
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  5853296 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 5853394  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  5853395 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 5853453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 14409448 - 14409605
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  14409448 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 14409546  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  14409547 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 14409605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 20046199 - 20046356
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  20046199 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 20046297  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  20046298 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20046356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20403385 - 20403228
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  20403385 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 20403287  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  20403286 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20403228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22001911 - 22001754
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  22001911 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 22001813  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  22001812 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 22001754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Original strand, 16199647 - 16199761
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 213  Q
    |||||| | ||||||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16199647 agatgtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-tttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 16199745  T
Q  214 gttgatgatgatgatg 229  Q
    | || ||| |||||||    
T  16199746 gatgttgaagatgatg 16199761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 18818404 - 18818526
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| ||||| |||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18818404 atatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 18818502  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  18818503 cggtctaagttgatgaagatgatg 18818526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 21923923 - 21924045
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| | || ||||| || ||| | | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21923923 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 21924021  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  21924022 cggtctaagttgatgaagatgatg 21924045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6759371 - 6759262
Alignment:
Q  120 tgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 218  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6759371 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 6759273  T
Q  219 tgatgatgatg 229  Q
    ||| |||||||    
T  6759272 tgaagatgatg 6759262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23406492 - 23406383
Alignment:
Q  120 tgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 218  Q
    |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23406492 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 23406394  T
Q  219 tgatgatgatg 229  Q
    ||| |||||||    
T  23406393 tgaagatgatg 23406383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 229
Target Start/End: Original strand, 18879276 - 18879348
Alignment:
Q  156 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18879276 tttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 18879348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 219
Target Start/End: Original strand, 16413320 - 16413467
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  16413320 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 16413418  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 219  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16413419 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16413467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 26225288 - 26225408
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||  || |||| ||| ||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  26225288 atatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgttttgtatattgt-tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 26225385  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  26225386 ggtctaagttgattaagatgatg 26225408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4483438 - 4483282
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  4483438 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 4483340  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  4483339 gtgttgctgttg-ttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 4483282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 15203235 - 15203392
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  15203235 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 15203333  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||    
T  15203334 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatg 15203392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Original strand, 21395984 - 21396097
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 213  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21395984 agatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21396081  T
Q  214 gttgatgatgatgatg 229  Q
    | || ||| |||||||    
T  21396082 gatgttgaagatgatg 21396097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Original strand, 21790477 - 21790590
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 213  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21790477 agatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21790574  T
Q  214 gttgatgatgatgatg 229  Q
    | || ||| |||||||    
T  21790575 gatgttgaagatgatg 21790590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41598346 - 41598189
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  ||    
T  41598346 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ct 41598248  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  41598247 gtgttgctgttg-ttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 41598189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 4542377 - 4542534
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| |||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||  ||| |    
T  4542377 atataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatcttgt-t 4542475  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  4542476 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 4542534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Original strand, 21389454 - 21389567
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 213  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21389454 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21389551  T
Q  214 gttgatgatgatgatg 229  Q
    | || ||| |||||||    
T  21389552 gatgttgaagatgatg 21389567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Original strand, 21778780 - 21778893
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 213  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21778780 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21778877  T
Q  214 gttgatgatgatgatg 229  Q
    | || ||| |||||||    
T  21778878 gatgttgaagatgatg 21778893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 74 - 214
Target Start/End: Original strand, 19801387 - 19801527
Alignment:
Q  74 tataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctat 171  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| |||| || |||||| |||| ||||| || |||| ||||||| | |    
T  19801387 tataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgt 19801485  T
Q  172 gttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 214  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19801486 gttgctattg-ttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 229
Target Start/End: Original strand, 45131047 - 45131113
Alignment:
Q  162 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  45131047 tactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 45131113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19896323 - 19896266
Alignment:
Q  171 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  19896323 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 19896266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 229
Target Start/End: Original strand, 25484382 - 25484429
Alignment:
Q  182 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  25484382 gttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatg 25484429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 152
Target Start/End: Original strand, 40492844 - 40492891
Alignment:
Q  105 tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 152  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  40492844 tgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatga 40492891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 214
Target Start/End: Original strand, 19154816 - 19154989
Alignment:
Q  44 taatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgt 142  Q
    ||||||||| |||||||| |  |||||  ||||| |||||||| |||||| |||||||| |  ||| ||| || ||||||||| | ||| | |||||| |    
T  19154816 taatatgatttaatgttgatactaatgtaatatatttgtatatgcattatctgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattagcacttgatattat 19154915  T
Q  143 tatatcatgat--gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 214  Q
    ||||||  |||  | |||  |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19154916 tatatctggatatgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 19154989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 219
Target Start/End: Original strand, 45290809 - 45290846
Alignment:
Q  182 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45290809 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45290846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14823931 - 14823775
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| ||||||| |    
T  14823931 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 14823833  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||| |||| |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||    
T  14823832 gtgttgttgtt-gttatttaactttgctgcatgag-tggtctaaattgattaagatgatg 14823775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15070606 - 15070571
Alignment:
Q  182 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15070606 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 229
Target Start/End: Original strand, 19937120 - 19937167
Alignment:
Q  182 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||    
T  19937120 gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 19937167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 21383978 - 21383887
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatt 157  Q
    ||||| |||||||||  ||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  21383978 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 21383887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 14585 - 14815
Alignment:
Q  1 actaagttgt-tatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14585 actaagttgtatatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgtttttgttaatggtatataatagtatatacattatatgaat 14684  T
Q  100 tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  14685 tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttcttactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgc 14784  T
Q  200 atgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14785 atgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 14815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 80)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15471156 - 15470927
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15471156 actaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatctaa-gttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaat 15471059  T
Q  100 tatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15471058 tatgtttgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctg 15470959  T
Q  199 catgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15470958 catgagtcggtctaagttgaagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16104012 - 16103783
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| || |||  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16104012 actaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagact-aatccatatgaattgatgttgtttataatgttatataattttatatacattaaatgaat 16103914  T
Q  100 tatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16103913 tatgtttgatatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctg 16103815  T
Q  199 catgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16103814 catgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 16103783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16097561 - 16097331
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16097561 actaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaat 16097463  T
Q  100 tatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  16097462 tatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctg 16097363  T
Q  199 catgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16097362 catgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 16097331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Original strand, 12174164 - 12174377
Alignment:
Q  14 cttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatattt 112  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| |  ||||||   |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  12174164 cttgctgttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaatcaatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatattt 12174262  T
Q  113 gagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 212  Q
    ||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12174263 gagttgttgtt---ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 12174359  T
Q  213 agttgatgatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12174360 agttgatgatgatgatgt 12174377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32307830 - 32307684
Alignment:
Q  79 ttgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 178  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32307830 ttgtatatacattaaatggattatgttgataattgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 32307732  T
Q  179 ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatg 226  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32307731 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 32307684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14234712 - 14234491
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatt--tcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-g 106  Q
    |||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||  | | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  14234712 ttatcttgttgttgttgttgttcagtaagcctgaattgtt-taatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg 14234614  T
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    || |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |     
T  14234613 atgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatc 14234514  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     |||||||||||| | |||||||    
T  14234513 agtctaagttgattaagatgatg 14234491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 80 - 230
Target Start/End: Original strand, 49668044 - 49668194
Alignment:
Q  80 tgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatg-ttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 178  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49668044 tgtatatactttaaatggattatgttgataaatgagatgtttgttg-attgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 49668142  T
Q  179 ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  49668143 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 49668194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9513067 - 9512923
Alignment:
Q  82 tatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttg 181  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  9513067 tatatacattaaatggattatgttgataaatgagatgttg----attgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgttt 9512972  T
Q  182 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  9512971 gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 9512923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9521042 - 9520898
Alignment:
Q  82 tatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttg 181  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  9521042 tatatacattaaatggattatgttgataaatgagatgttg----attgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgttt 9520947  T
Q  182 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  9520946 gttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 9520898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 66 - 229
Target Start/End: Original strand, 13210283 - 13210444
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  13210283 taatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttaag---ttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 13210379  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  13210380 tgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 13210444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Original strand, 1644642 - 1644787
Alignment:
Q  79 ttgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 178  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  1644642 ttgtatatacattaaatggattatgttgataattgagatattgttga-ttgtattcgatattgttatataatgatgatttgcatactgcctatgttgttg 1644740  T
Q  179 ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatg 226  Q
    || |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  1644741 tt-gttatttaactaagcaacataagttggtctaagttgatgacgatg 1644787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 56 - 214
Target Start/End: Original strand, 52523669 - 52523831
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga- 152  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  52523669 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaa 52523768  T
Q  153 -tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 214  Q
     || ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52523769 ctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27165373 - 27165251
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  27165373 atatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttgttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 27165274  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  27165273 ggtctaagttgattaagatgatg 27165251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 37251055 - 37251270
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||||| |||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  37251055 actaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagtctgaatta-tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaat 37251153  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | |||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  37251154 tatttatgatgtt-gagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagc 37251252  T
Q  197 tgcatgagttggtctaag 214  Q
    ||||||| | ||||||||    
T  37251253 tgcatgactcggtctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12399335 - 12399213
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12399335 atatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 12399237  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  12399236 cggtctaagttgttgaagatgatg 12399213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 53301545 - 53301668
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgt-tgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    ||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  53301545 atatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagt 53301644  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||||| | |||||||    
T  53301645 cggtctaagttgattaagatgatg 53301668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 215
Target Start/End: Original strand, 24340665 - 24340826
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 153  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24340665 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgat 24340764  T
Q  154 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 215  Q
    | | |||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24340765 gttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 24340826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18438653 - 18438538
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 212  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18438653 agatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctacatgagtcggtcta 18438555  T
Q  213 agttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||| |||||||    
T  18438554 agttgatgaagatgatg 18438538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23274813 - 23274705
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||     
T  23274813 atatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtc 23274714  T
Q  207 ggtctaagt 215  Q
     ||||||||    
T  23274713 agtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14572714 - 14572596
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    |||||| |||||||||||| |  || | |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  14572714 atatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 14572616  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatg 226  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  14572615 ggtctaagttgatgttgatg 14572596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14972980 - 14972858
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14972980 atatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 14972882  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  14972881 cggtctaagttgatgaagatgatg 14972858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17487982 - 17487860
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17487982 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 17487884  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  17487883 cggtctaagttgatgaagatgatg 17487860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17499464 - 17499342
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17499464 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 17499366  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  17499365 cggtctaagttgatgaagatgatg 17499342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 22110239 - 22110454
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||| | | ||||||  |||||  |||||| ||||||  ||||| ||||||    
T  22110239 actaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtatgatttgaagttgttaataatgtgatataaatgtatacgcattacatgaat 22110337  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    | | | ||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  22110338 tctatatgat-gttgagatgctgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagc 22110436  T
Q  197 tgcatgagttggtctaag 214  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  22110437 tgcatgagtcggtctaag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 36166719 - 36166599
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  36166719 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactg-ctgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 36166622  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  36166621 ggtctaagttgattaagatgatg 36166599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42386536 - 42386428
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  42386536 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaactgcatgagt 42386438  T
Q  206 tggtctaagt 215  Q
     |||||||||    
T  42386437 cggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 43926121 - 43925977
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtct 169  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| ||    
T  43926121 atataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatgtactgcct 43926022  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 214  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43926021 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21618570 - 21618460
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  21618570 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 21618473  T
Q  207 ggtctaagttgat 219  Q
    |||||||||||||    
T  21618472 ggtctaagttgat 21618460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13442400 - 13442278
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13442400 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 13442302  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  13442301 cggtctaagttgatgaagatgatg 13442278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 230
Target Start/End: Original strand, 14576828 - 14576950
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || | |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||     
T  14576828 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtttatactgtctatgttgctgttg-ttatttaactaagttgaatgagtc 14576926  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  14576927 ggtctaagttgatgttgatgatgt 14576950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 229
Target Start/End: Original strand, 11424783 - 11424876
Alignment:
Q  135 gatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  11424783 gatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 11424876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 24153204 - 24153325
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||  |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||     
T  24153204 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgctatcg-ttatttaactaagctgcatgagtc 24153302  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  24153303 ggtctaagttgattaagatgatg 24153325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 125
Target Start/End: Original strand, 1465350 - 1465423
Alignment:
Q  52 tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttga 125  Q
    |||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1465350 tctaatgttgatgataatgttatacaattgtatatacattacatgaattatgttgatatttgagatgttgttga 1465423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 56 - 215
Target Start/End: Original strand, 37642207 - 37642368
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 153  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||    
T  37642207 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 37642306  T
Q  154 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 215  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |  |||  |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  37642307 gttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 37642368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 7781351 - 7781508
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  7781351 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 7781449  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  7781450 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 7781508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17463336 - 17463179
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  17463336 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 17463238  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  17463237 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17463179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17672784 - 17672627
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  17672784 atataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 17672686  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  17672685 atgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17672627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Original strand, 20698437 - 20698552
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 212  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| |||  ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20698437 agatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20698535  T
Q  213 agttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||| |||||||    
T  20698536 agttgatgaagatgatg 20698552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 29172587 - 29172744
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  29172587 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 29172685  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  29172686 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29172744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34159484 - 34159327
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  34159484 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 34159386  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  34159385 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 34159327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 45606911 - 45607068
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  45606911 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 45607009  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  45607010 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 45607068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 55476649 - 55476492
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  55476649 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 55476551  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  55476550 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 55476492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 228
Target Start/End: Original strand, 16282815 - 16282971
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  16282815 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 16282913  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgat 228  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  16282914 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 23083356 - 23083478
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||  || ||| | |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23083356 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgagt 23083454  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  23083455 cggtctaagttgatgaagatgatg 23083478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 219
Target Start/End: Original strand, 38961895 - 38962042
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  38961895 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 38961993  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 219  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38961994 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 38962042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 164 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28194759 - 28194694
Alignment:
Q  164 ctgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  28194759 ctgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 28194694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 76 - 229
Target Start/End: Original strand, 28848618 - 28848772
Alignment:
Q  76 taattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatg 172  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||    
T  28848618 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtg 28848716  T
Q  173 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  28848717 ttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 28848772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 214
Target Start/End: Original strand, 43550482 - 43550625
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| ||||||||  |    
T  43550482 atataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgcat 43550581  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 214  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43550582 atgttgctgtca-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43550625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8899252 - 8899095
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  8899252 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 8899154  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  8899153 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatg 8899095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 9707611 - 9707768
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  9707611 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 9707709  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  9707710 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 9707768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 16454285 - 16454442
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  16454285 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 16454383  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  16454384 gtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 16454442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 226
Target Start/End: Original strand, 606324 - 606441
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||   | ||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||    
T  606324 ttgagatgttgttgaattgcatt-gatattgttatatcatgaactgatttatgtgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 606422  T
Q  209 tctaagttg-atgatgatg 226  Q
    | |||| || |||||||||    
T  606423 tataagatgaatgatgatg 606441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Original strand, 6469178 - 6469295
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 209  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  6469178 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 6469275  T
Q  210 ctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  6469276 ctaagttgattaagatgatg 6469295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Original strand, 25476384 - 25476502
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  || ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||    
T  25476384 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgttgttt-tttaactaagctacatgagtcggt 25476482  T
Q  210 ctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  25476483 ctaagttgatgaagatgatg 25476502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26687013 - 26686891
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26687013 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 26686915  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     |||||||||||| || |||||||    
T  26686914 cggtctaagttgaagaagatgatg 26686891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Original strand, 40213720 - 40213837
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| || || |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  40213720 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactg-ctgtgttgatgttg-ttatttaactaagctacatgagtcggt 40213817  T
Q  210 ctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  40213818 ctaagttgattaagatgatg 40213837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 43841058 - 43840944
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43841058 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 43840960  T
Q  206 tggtctaagttgatga 221  Q
     ||| |||||||||||    
T  43840959 cggtttaagttgatga 43840944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12567718 - 12567571
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||| || ||    
T  12567718 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattg-ct 12567620  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 219  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12567619 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12567571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13544183 - 13544036
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||| || ||    
T  13544183 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattg-ct 13544085  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 219  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13544084 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13544036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500943
Alignment:
Q  116 atgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 214  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 55500958  T
Q  215 ttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||| | |||||||    
T  55500957 ttgattaagatgatg 55500943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 13151794 - 13151952
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  13151794 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 13151892  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaa-gctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  13151893 gtgttgctgttg-ttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13151952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 13154259 - 13154417
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  13154259 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 13154357  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaa-gctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  13154358 gtgttgctgttg-ttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13154417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 49389518 - 49389642
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49389518 actaagttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaaatgaat 49389616  T
Q  100 tatg-ttgatatttgagatgttgttg 124  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||    
T  49389617 tatgtttgatagttgagatgttgttg 49389642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 214
Target Start/End: Original strand, 53070657 - 53070799
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| || || || ||| | ||||||| |    
T  53070657 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactgt-t 53070755  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 214  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53070756 atgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 10247727 - 10247884
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  10247727 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 10247825  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     || |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  10247826 gtgctgctgttg-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 10247884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 17446659 - 17446815
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  17446659 atataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 17446757  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||    
T  17446758 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag-tcgtctaagttgattaagatgatg 17446815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15977633 - 15977516
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 209  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15977633 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 15977536  T
Q  210 ctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  15977535 ctaagttgattaagatgatg 15977516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 50242980 - 50242833
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  ||    
T  50242980 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatacta-ct 50242882  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 219  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50242881 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 50242833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 203
Target Start/End: Original strand, 22147467 - 22147616
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 153  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||    
T  22147467 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 22147566  T
Q  154 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatga 203  Q
    | ||||||||| | ||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||    
T  22147567 gttttgcataccgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatga 22147616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 171
Target Start/End: Original strand, 2051141 - 2051260
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga- 152  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  2051141 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaa 2051240  T
Q  153 -tgatttgcatactgtctat 171  Q
     || ||||||||||| ||||    
T  2051241 ctgttttgcatactgcctat 2051260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17737294 - 17737237
Alignment:
Q  171 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  17737294 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17737237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41124045 - 41123892
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  41124045 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 41123947  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgat 228  Q
     ||||| ||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  41123946 gtgttgttgtt----atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8499566 - 8499519
Alignment:
Q  182 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  8499566 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 8499519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10557033 - 10556986
Alignment:
Q  182 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  10557033 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 10556986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15412477 - 15412430
Alignment:
Q  182 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  15412477 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15412430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 229
Target Start/End: Original strand, 45577952 - 45577999
Alignment:
Q  182 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  45577952 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 45577999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 229
Target Start/End: Original strand, 12119780 - 12119886
Alignment:
Q  122 ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatg 220  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  12119780 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttg-ttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 12119877  T
Q  221 atgatgatg 229  Q
    | |||||||    
T  12119878 aagatgatg 12119886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 43927366 - 43927304
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgtt 63  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  43927366 actaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgtt 43927304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44494857 - 44494810
Alignment:
Q  182 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||    
T  44494857 gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatg 44494810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13919393 - 13919350
Alignment:
Q  168 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 212  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13919393 ctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 2692 - 2924
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatata----cattatat 95  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    |||| |||    
T  2692 actaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctattgttgttgttaatggtata--attgtatatatatacattttat 2789  T
Q  96 gaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaag 195  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  2790 gaattaagctgatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaag 2889  T
Q  196 ctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  2890 ctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 2924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 57)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 21502043 - 21502273
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21502043 actaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaat 21502142  T
Q  100 tatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
    |||| ||||| ||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  21502143 tatgtttgatgtttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctg 21502242  T
Q  199 catgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  21502243 catgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21502273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 21329385 - 21329614
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21329385 actaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaat 21329483  T
Q  100 tatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
    |||||| ||| |||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21329484 tatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 21329583  T
Q  199 catgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  21329584 catgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21329614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 56 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21565720 - 21565545
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg 154  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21565720 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 21565621  T
Q  155 atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    ||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21565620 atttggatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 21565545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 26011923 - 26012154
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26011923 actaagttgtttatcttgttattgttgtttcagtaagcctgaacta-tataatctgatgttgttgttgatgttatataattgtatatacattacatgaat 26012021  T
Q  100 tatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  26012022 tatgtttgatgtttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgctttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctg 26012121  T
Q  199 catgagttggtctaagttg-atgatgatgatgt 230  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  26012122 catgagtcggtctaagttgaaagatgatgatgt 26012154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 67 - 230
Target Start/End: Original strand, 22959489 - 22959650
Alignment:
Q  67 aatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatact 165  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959489 aatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgatttgcatact 22959585  T
Q  166 gtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22959586 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 22959650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 20026828 - 20027043
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20026828 actaagttgtttatcttgttgtagttgtttcagtaagcctgaatta-tatgttttaatgttgttgataatgctatatagttgtatatacattacatgaat 20026926  T
Q  100 tatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    |||||| ||| || | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20026927 tatgtttgatgtt-gtgatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagc 20027025  T
Q  197 tgcatgagttggtctaag 214  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  20027026 tgcatgagtcggtctaag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 56 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19669073 - 19668902
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg 154  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19669073 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacaggacttatgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcgatattgttatatcacgatg 19668977  T
Q  155 atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19668976 atttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19668902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 229
Target Start/End: Original strand, 19660791 - 19660952
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| ||  |||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  19660791 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttatattcgatatcattatatcaagatggtttgcatac 19660887  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  19660888 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 19660952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 22178107 - 22178323
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||   ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  22178107 actaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaaacctaaatta-tatgattggatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaat 22178205  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||  || |||  |||||| |||||||| |||| |||  |||||||||     
T  22178206 tatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagt 22178305  T
Q  197 tgcatgagttggtctaag 214  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  22178306 tgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 21729059 - 21729181
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21729059 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 21729157  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  21729158 cggtctaagttgttgaagatgatg 21729181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 21808384 - 21808506
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21808384 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 21808482  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  21808483 cggtctaagttgttgaagatgatg 21808506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22144211 - 22144068
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 170  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| | |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||  |||    
T  22144211 atataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactaccta 22144112  T
Q  171 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 214  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22144111 tgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 23390491 - 23390613
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23390491 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 23390589  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  23390590 cggtctaagttgatgaagatgatg 23390613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 132 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 36314678 - 36314581
Alignment:
Q  132 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  36314678 ttcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 36314581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24493694 - 24493573
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||     
T  24493694 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttacttaaccaagctgcatgagtc 24493596  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  24493595 ggtctaagttgatgaagatgatg 24493573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 229
Target Start/End: Original strand, 8286838 - 8286960
Alignment:
Q  108 tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt--gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || |||  | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8286838 tatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 8286936  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  8286937 cggtctaagttgatgaagatgatg 8286960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 66 - 125
Target Start/End: Original strand, 21741486 - 21741545
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttga 125  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21741486 taatgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttga 21741545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13025436 - 13025315
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||   ||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||     
T  13025436 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactatgctgcatgagtc 13025338  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  13025337 ggtctaagttgatgaagatgatg 13025315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13095620 - 13095499
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||   ||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||     
T  13095620 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactatgctgcatgagtc 13095522  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  13095521 ggtctaagttgatgaagatgatg 13095499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22412309 - 22412188
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||| |  | |||||||||||||||| |||||||     
T  22412309 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttg-ttatcgttatttaactaagctacatgagtc 22412211  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  22412210 ggtctaagttgattaagatgatg 22412188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 264772 - 264929
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  264772 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 264870  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  264871 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 264929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1096593 - 1096474
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| | ||| || ||| |||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1096593 atatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 1096495  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatg 226  Q
     ||||||||||||||| ||||    
T  1096494 cggtctaagttgatgaagatg 1096474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 10732944 - 10733101
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  10732944 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 10733042  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  10733043 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 10733101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 11581203 - 11581360
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||  ||| |||||| ||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  11581203 atataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 11581301  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  11581302 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11581360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24529339 - 24529224
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 212  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24529339 agatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 24529241  T
Q  213 agttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||| |||||||    
T  24529240 agttgatgaagatgatg 24529224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29330092 - 29329935
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  29330092 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 29329994  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  29329993 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29329935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39363542 - 39363385
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  39363542 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 39363444  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  39363443 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 39363385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9078074 - 9077956
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||    
T  9078074 ttgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgggtcagt 9077976  T
Q  210 ctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  9077975 ctaagttgatgaagatgatg 9077956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 229
Target Start/End: Original strand, 21997549 - 21997651
Alignment:
Q  127 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgat 225  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  21997549 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 21997647  T
Q  226 gatg 229  Q
    ||||    
T  21997648 gatg 21997651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22075145 - 22075035
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  22075145 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgaatgagt 22075047  T
Q  206 tggtctaagttg 217  Q
     |||||||||||    
T  22075046 cggtctaagttg 22075035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25421658 - 25421536
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25421658 atatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 25421560  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  25421559 cggtctaagttgatgaagatgatg 25421536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 56 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 40726032 - 40725871
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 153  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||    
T  40726032 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 40725933  T
Q  154 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 215  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||| |  |||  |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  40725932 gctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 40725871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20909170 - 20909013
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  20909170 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 20909072  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  20909071 gtgttgcttttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20909013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 42245369 - 42245526
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  42245369 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 42245467  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  42245468 gtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 42245526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 218
Target Start/End: Original strand, 20902012 - 20902159
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatat--ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 168  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||  |||||| |||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |    
T  20902012 atataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-c 20902110  T
Q  169 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 218  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20902111 tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20902159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 29448159 - 29448054
Alignment:
Q  79 ttgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttg 175  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||| ||||||||    
T  29448159 ttgtatatgcattacatgaattacgtatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttg 29448060  T
Q  176 ctgttg 181  Q
    ||||||    
T  29448059 ctgttg 29448054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 2154617 - 2154775
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatat--ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 168  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||  |||||| |||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||     
T  2154617 atataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt- 2154715  T
Q  169 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  2154716 tgtgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 2154775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29346138 - 29345981
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  29346138 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 29346040  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     || |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  29346039 gtgatgctgttg-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29345981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25431518 - 25431414
Alignment:
Q  109 atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttg 207  Q
    |||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  25431518 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagatgcatgagtcg 25431420  T
Q  208 gtctaa 213  Q
    ||||||    
T  25431419 gtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39245291 - 39245137
Alignment:
Q  76 taattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatg 172  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||| || ||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||    
T  39245291 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtg 39245193  T
Q  173 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  39245192 ttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 39245137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29348611 - 29348454
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  29348611 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 29348513  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     || |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  29348512 gtgatgctgttc-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29348454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29351084 - 29350927
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  29351084 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 29350986  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     || |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  29350985 gtgatgctgttc-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29350927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 36154787 - 36154941
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  36154787 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 36154885  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||| ||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  36154886 gtgttgttgtt----atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 36154941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 229
Target Start/End: Original strand, 20918052 - 20918109
Alignment:
Q  171 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  20918052 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20918109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32027551 - 32027394
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  32027551 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 32027453  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  32027452 gtgttgttgttg-ttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 32027394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 229
Target Start/End: Original strand, 10775790 - 10775837
Alignment:
Q  182 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  10775790 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 10775837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 219
Target Start/End: Original strand, 18319037 - 18319185
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 168  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |    
T  18319037 atataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-c 18319135  T
Q  169 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 219  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  18319136 tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 18319185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 229
Target Start/End: Original strand, 21293020 - 21293086
Alignment:
Q  162 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||| |||||||    
T  21293020 tactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatg 21293086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23064559 - 23064512
Alignment:
Q  182 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  23064559 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 214
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740747
Alignment:
Q  163 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38619482 - 38619435
Alignment:
Q  182 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  38619482 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 38619435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37723975 - 37723922
Alignment:
Q  161 atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 214  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  37723975 atactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 37723922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 167
Target Start/End: Original strand, 20766115 - 20766175
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 167  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||    
T  20766115 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt 20766175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31061124 - 31061069
Alignment:
Q  173 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  31061124 ttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 31061069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 217
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732937
Alignment:
Q  163 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg 217  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26704122 - 26704074
Alignment:
Q  182 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||    
T  26704122 gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatgt 26704074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26973855 - 26973807
Alignment:
Q  182 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||    
T  26973855 gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatgt 26973807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 55)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Original strand, 39706187 - 39706405
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgata 109  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  39706187 ttatcttgctgttgttgttttagtaagcctgaatta-tatgatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgttgatg 39706285  T
Q  110 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 209  Q
    |||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  39706286 tttatgatgttcatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 39706385  T
Q  210 ctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  39706386 ctaagttgattaagatgatg 39706405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 12288097 - 12288316
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12288097 actaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatttaatgttgttggtaatgttatatagttgtatatacattacatgaat 12288195  T
Q  100 tatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    |||||| ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12288196 tatgtttgatgtt-gtgatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagc 12288294  T
Q  197 tgcatgagttggtctaagttga 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  12288295 tgcatgagtcggtctaagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 79 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12774160 - 12774010
Alignment:
Q  79 ttgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 178  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12774160 ttgtatatacattaaatggattatgttgataattgagatgttgttga-ttgtattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 12774062  T
Q  179 ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12774061 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 12774010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 56 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8846550 - 8846359
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgtta---------- 144  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||              
T  8846550 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttagcattcgata 8846451  T
Q  145 ------tatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
          | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8846450 ttgttatctcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 8846359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 218
Target Start/End: Original strand, 52243192 - 52243302
Alignment:
Q  110 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttg 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  52243192 tttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 52243291  T
Q  208 gtctaagttga 218  Q
    |||||||||||    
T  52243292 gtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 66 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15551982 - 15551821
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || | ||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  15551982 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttaccttcgatattattatatcatgatggattgcatac 15551886  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  15551885 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 15551821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 214
Target Start/End: Original strand, 13784 - 13953
Alignment:
Q  47 tatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgtta 144  Q
    |||||| | ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  13784 tatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgtta 13883  T
Q  145 tatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 214  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13884 tatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 56 - 218
Target Start/End: Original strand, 43198495 - 43198661
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga- 152  Q
    ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||     
T  43198495 atgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcatgaa 43198594  T
Q  153 -tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 218  Q
     || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43198595 ttgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 53082039 - 53082254
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  53082039 actaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaat 53082137  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | |||| ||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||  || |||   |||||  |||||||||||| |||  ||||||||||    
T  53082138 tatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagc 53082236  T
Q  197 tgcatgagttggtctaag 214  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  53082237 tgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 46640343 - 46640558
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||  | |||  |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  46640343 actaagttgcttatcttactgttattgtttcagtaaacctgaatta-tatgatttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtatatgcattacatgaat 46640441  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | |||| || |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  46640442 tatatatgatgtt-gagatgttattgattttcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagc 46640540  T
Q  197 tgcatgagttggtctaag 214  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  46640541 tgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 15099567 - 15099457
Alignment:
Q  14 cttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttg 113  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||| |||  |||  |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15099567 cttgatgttgtcattccagtaagcctggattg-tatattctaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttg 15099469  T
Q  114 agatgttgttga 125  Q
    ||||||||||||    
T  15099468 agatgttgttga 15099457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 15190534 - 15190424
Alignment:
Q  14 cttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttg 113  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||| |||  |||  |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15190534 cttgatgttgtcattccagtaagcctggattg-tatattctaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttg 15190436  T
Q  114 agatgttgttga 125  Q
    ||||||||||||    
T  15190435 agatgttgttga 15190424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Original strand, 16377522 - 16377630
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtc 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16377522 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-tttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16377619  T
Q  211 taagttgatga 221  Q
    |||||||||||    
T  16377620 taagttgatga 16377630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 16239965 - 16240086
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  16239965 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttgctattg-ttatttaattaagttgcatgagtt 16240063  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  16240064 ggtctaagttgatgaagatgatg 16240086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7088996 - 7088881
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 212  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7088996 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 7088898  T
Q  213 agttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||| |||||||    
T  7088897 agttgatgaagatgatg 7088881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16596813 - 16596686
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16596813 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgatgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 16596717  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaag 195  Q
    |  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16596716 tacctatgttgctgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44615446 - 44615289
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |    
T  44615446 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 44615348  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  44615347 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44615289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7798900 - 7798778
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7798900 atatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 7798802  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  7798801 cggtctaagttgatgaagatgatg 7798778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22636561 - 22636439
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22636561 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 22636463  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  22636462 cggtctaagttgatgaagatgatg 22636439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6900016 - 6899895
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||   ||| || |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||     
T  6900016 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactaagatgcatgagtc 6899918  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  6899917 ggtctaagttgatgaagatgatg 6899895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 8574864 - 8574984
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  8574864 atatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 8574961  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||| || | |||||||    
T  8574962 ggtctaagttaattaagatgatg 8574984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 16270231 - 16270352
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||     
T  16270231 atatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaattaagctgcatgagtc 16270329  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||| ||||||| |||||||    
T  16270330 ggtctaacttgatgaagatgatg 16270352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 229
Target Start/End: Original strand, 52873363 - 52873484
Alignment:
Q  108 tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  52873363 tatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 52873461  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  52873462 ggtctaagttgatgaagatgatg 52873484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 12311 - 12468
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  12311 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 12409  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  12410 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 12468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 15118356 - 15118513
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  15118356 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 15118454  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  15118455 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15118513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 18215278 - 18215435
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  18215278 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 18215376  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  18215377 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18215435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 226
Target Start/End: Original strand, 23374354 - 23374473
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23374354 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 23374452  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatg 226  Q
     | ||||||||| ||| ||||    
T  23374453 cgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 44773091 - 44773248
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  44773091 atataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 44773189  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  44773190 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44773248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 52312668 - 52312511
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  52312668 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 52312570  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  52312569 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 52312511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12902883 - 12902761
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||| |||||| || | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12902883 atatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 12902785  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  12902784 cggtctaagttgttgaagatgatg 12902761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14280438 - 14280317
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14280438 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 14280341  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||||| | |||||||    
T  14280340 cggtctaagttgattaagatgatg 14280317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 54798749 - 54798871
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  54798749 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttg-ttattcaactaagctgcatgagt 54798847  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||||| | |||||||    
T  54798848 cggtctaagttgattaagatgatg 54798871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 219
Target Start/End: Original strand, 19618176 - 19618323
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| ||    
T  19618176 atataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactg-ct 19618274  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 219  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19618275 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19618323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 44928883 - 44929041
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||||||| |||| ||||||| || ||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  44928883 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgctt 44928982  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  44928983 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44929041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 50222343 - 50222500
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||| |    
T  50222343 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgt-t 50222441  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  50222442 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 50222500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 51463872 - 51464029
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  ||    
T  51463872 atataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ct 51463970  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  51463971 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 51464029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7893829 - 7893707
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  7893829 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgaat 7893731  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  7893730 cggtctaagttgatgaagatgatg 7893707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44052955 - 44052833
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  44052955 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgttg-ttatttaactgagctgcatgagt 44052857  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     || |||||||||||| |||||||    
T  44052856 cggcctaagttgatgaagatgatg 44052833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14038770 - 14038653
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||  |||| || ||| | ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  14038770 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcagt 14038672  T
Q  210 ctaagttgatgatgatgat 228  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  14038671 ctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 156 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3096369 - 3096297
Alignment:
Q  156 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  3096369 tttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 3096297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 229
Target Start/End: Original strand, 18239426 - 18239580
Alignment:
Q  76 taattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatg 172  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||    
T  18239426 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtg 18239524  T
Q  173 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  18239525 ctgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18239580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 1837513 - 1837670
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    ||||||| |||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| | |||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  1837513 atataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 1837611  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  1837612 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 1837670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19242857 - 19242700
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  19242857 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 19242759  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  19242758 gtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 19242700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 219
Target Start/End: Original strand, 14970751 - 14970858
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 209  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14970751 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattg-ctgttttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagttggt 14970848  T
Q  210 ctaagttgat 219  Q
    ||||||||||    
T  14970849 ctaagttgat 14970858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 168 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17046552 - 17046491
Alignment:
Q  168 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  17046552 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 17046491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3515165 - 3515008
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| || || || ||| | |||||| ||    
T  3515165 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactg-ct 3515067  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  3515066 gtgttgctgttgttt-tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 3515008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 229
Target Start/End: Original strand, 23803316 - 23803426
Alignment:
Q  118 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagtt 216  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23803316 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23803413  T
Q  217 gatgatgatgatg 229  Q
    ||| | |||||||    
T  23803414 gattaagatgatg 23803426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 219
Target Start/End: Original strand, 15355328 - 15355476
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 168  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |    
T  15355328 atataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-c 15355426  T
Q  169 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 219  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15355427 tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15355476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 229
Target Start/End: Original strand, 7641286 - 7641343
Alignment:
Q  171 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  7641286 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 7641343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12611008 - 12610951
Alignment:
Q  171 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  12611008 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 12610951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 229
Target Start/End: Original strand, 14053306 - 14053418
Alignment:
Q  116 atgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 215  Q
    |||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||     
T  14053306 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaaga 14053404  T
Q  216 tgatgatgatgatg 229  Q
    || ||| |||||||    
T  14053405 tgttgaagatgatg 14053418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44102372 - 44102215
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||| | ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  ||    
T  44102372 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ct 44102274  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  44102273 gtgttattgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44102215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 151
Target Start/End: Original strand, 15464929 - 15464970
Alignment:
Q  110 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatg 151  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15464929 tttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 15464970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 17333347 - 17333305
Alignment:
Q  162 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17333347 tactgtctatgttgctgttgttta-ttaactaagctgcatgagt 17333305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6190527 - 6190481
Alignment:
Q  168 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 214  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6190527 ctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10760 - 10542
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  10760 actaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tataatctaatgttgttgttaatgtcatataattgtatatacattacatgaat 10662  T
Q  100 tatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||  ||||||    
T  10661 tatgttcgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctg 10562  T
Q  199 catgagttggtctaagttga 218  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  10561 catgagtcggtctaagttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 62428 - 62202
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  62428 actaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgttatgaactaatgatgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaat 62329  T
Q  100 tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  62328 tatgttgatatttgagatgttgttg---tgcattcgatattattataccatgatgtttttcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgc 62232  T
Q  200 atgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||| ||| ||||| || ||||||||||    
T  62231 atgagtcggtttaagtcgaagatgatgatg 62202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 132809 - 132661
Alignment:
Q  82 tatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgtt 180  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||    
T  132809 tatatacattaaatggattatgttgataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtt 132711  T
Q  181 ggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  132710 tgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 132661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 136838 - 136681
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |    
T  136838 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 136740  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  136739 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 136681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 139307 - 139150
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |    
T  139307 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 139209  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  139208 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 139150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 144245 - 144088
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |    
T  144245 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 144147  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  144146 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 144088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 134369 - 134212
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |    
T  134369 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 134271  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||    
T  134270 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatg 134212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 141776 - 141619
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |    
T  141776 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 141678  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  141677 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 141619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Original strand, 2116 - 2281
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgata 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2116 ttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatccaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgctgata 2215  T
Q  110 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttg 175  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2216 tttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttg 2281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12989 - 12770
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gat 108  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  12989 ttatcttgctgttgttgttccagtaagcctgaatta-tatgatctaatgttgttattaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 12891  T
Q  109 atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttgg 208  Q
     |||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  12890 gtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcgg 12791  T
Q  209 tctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  12790 tctaagttgatgattatgatg 12770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Original strand, 6021 - 6240
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gat 108  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  6021 ttatcttgctgttattgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 6119  T
Q  109 atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttgg 208  Q
     |||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  6120 gtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 6219  T
Q  209 tctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  6220 tctaagttgattaagatgatg 6240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6843 - 6615
Alignment:
Q  2 ctaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6843 ctaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaatta-tatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaatt 6745  T
Q  101 atgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 199  Q
    ||||| ||| |||   ||| || | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6744 atgtttgatgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgc 6645  T
Q  200 atgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  6644 atgagtcggtctaagttgattaagatgatg 6615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14223 - 13995
Alignment:
Q  2 ctaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14223 ctaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaatta-tatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaatt 14125  T
Q  101 atgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 199  Q
    ||||| ||| |||   ||| || | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  14124 atgtttgatgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgc 14025  T
Q  200 atgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  14024 atgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 10429 - 10659
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10429 actaagttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaat 10527  T
Q  100 tatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10528 tatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 10627  T
Q  199 catgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    ||| ||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  10628 cataagtcggtctaagttgaagatggtgatgt 10659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 56 - 230
Target Start/End: Original strand, 22613 - 22788
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg 154  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22613 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 22712  T
Q  155 atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  22713 atttgcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaggtgatgatgt 22788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 82230 - 82073
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  ||    
T  82230 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ct 82132  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  82131 gtgttgctgttg-ttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 82073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 130138 - 129908
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  130138 actaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttacaatgttatataattgtatatacattacatgaat 130040  T
Q  100 tatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  130039 tatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatg 129940  T
Q  199 catgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  129939 catgagtcggtctaagttgatgatgaagatgt 129908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 214
Target Start/End: Original strand, 60713 - 60818
Alignment:
Q  110 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttg 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  || |||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |    
T  60713 tttgagatgttgttgatttgcatt-gatattggtatatcatgagctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 60811  T
Q  208 gtctaag 214  Q
    || ||||    
T  60812 gtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 357 - 132
Alignment:
Q  5 agttgttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  357 agttgttatcttgctgttgttgttctagtgagactga-tacatatgaattgatgttgtttataatattatataattgtatatacattacatgaattatgt 259  T
Q  105 t-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatga 203  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  258 ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatga 159  T
Q  204 gttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
     | ||||||||||||||||||||||||    
T  158 atcggtctaagttgatgatgatgatgt 132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 66)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19652426 - 19652198
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  19652426 actaagttgtttatcttgctgttattgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatactttaaatggat 19652328  T
Q  100 tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  19652327 tatgttgatgtttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgc 19652229  T
Q  200 atgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19652228 atgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 19652198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23019639 - 23019408
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23019639 actaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaacta-tataatctaatgtcgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaat 23019541  T
Q  100 tatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  23019540 tatgtttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctg 23019441  T
Q  199 catgagttggtctaagttg-atgatgatgatgt 230  Q
    ||| ||| |||||||| || | |||||||||||    
T  23019440 cataagtcggtctaagatgaaagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19668605 - 19668386
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||  || |||||| || |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19668605 actaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctgatgta-tatgatgtagtgttgttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaat 19668507  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    || || |||| || | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19668506 tacgtatgatgtt-gtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagc 19668408  T
Q  197 tgcatgagttggtctaagttga 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  19668407 tgcatgagtcggtctaagttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 22080627 - 22080800
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  22080627 actaagttgcttatcttgctcttgttgtttcagtaagcctaaattgatatgacctaatgatgttgttaatgttatataaatgtatatacattatattaat 22080726  T
Q  100 tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgtt 174  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22080727 tatgacgatgtttgagatgttgtt-ctgtgcattcgatattgttatatcatgatgttttgcatactgcctatgtt 22080800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 66 - 229
Target Start/End: Original strand, 28496427 - 28496588
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  28496427 taatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 28496523  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    || ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||    
T  28496524 tgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatg 28496588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 66 - 229
Target Start/End: Original strand, 29808838 - 29808999
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  29808838 taatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 29808934  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    || ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||    
T  29808935 tgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatg 29808999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1561534 - 1561307
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatga-tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaa 98  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||| |||| |  |||||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  1561534 actaagttgtttatcttgctgttaatattccagtaagactga-tgcatatgaatttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgac 1561436  T
Q  99 ttatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagct 197  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||    
T  1561435 ttatgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagct 1561339  T
Q  198 gcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||  |||||||||| ||| |||||||    
T  1561338 gcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatg 1561307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 65 - 218
Target Start/End: Original strand, 9098465 - 9098620
Alignment:
Q  65 ttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgca 161  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| || | || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || ||||||    
T  9098465 ttaatgttatataattatatatacattacatgaattatgtttgatgtt-gtgaagttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgttttgca 9098563  T
Q  162 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 218  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9098564 tactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 229
Target Start/End: Original strand, 27333238 - 27333335
Alignment:
Q  132 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  27333238 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 27333335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 229
Target Start/End: Original strand, 27393978 - 27394075
Alignment:
Q  132 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  27393978 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 27394075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 118 - 230
Target Start/End: Original strand, 4185827 - 4185939
Alignment:
Q  118 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg 217  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  4185827 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttg 4185926  T
Q  218 atgatgatgatgt 230  Q
    ||||||| |||||    
T  4185927 atgatgacgatgt 4185939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 78 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20109295 - 20109140
Alignment:
Q  78 attgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttg 175  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||    
T  20109295 attgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttgttttgcatactgcctatgttg 20109196  T
Q  176 ctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg-atgatgatgatgt 230  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  20109195 ctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatgatgt 20109140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 118 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4186482 - 4186376
Alignment:
Q  118 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg 217  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  4186482 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttg 4186383  T
Q  218 atgatga 224  Q
    |||||||    
T  4186382 atgatga 4186376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16496370 - 16496248
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16496370 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 16496272  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  16496271 cggtctaagttgttgaagatgatg 16496248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 230
Target Start/End: Original strand, 31155346 - 31155515
Alignment:
Q  60 tgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt 158  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||  |||| |||||||||| || |||   |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  31155346 tgttgttgatgttatataaatgtataaacattgcatgatttatgttgatgatatgaa--gttgatgaattgcattcgatattgttatatcacgatgactt 31155443  T
Q  159 gcatactgtctatgttgctg-ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    ||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| |||||||||   || |||||||||||||||||||    
T  31155444 gcatactgttta-gttgctgttttgttatttaactaagttgcatgagtcaatccaagttgatgatgatgatgt 31155515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29060662 - 29060544
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  29060662 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 29060564  T
Q  210 ctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||| |||||| |||||||    
T  29060563 ctaagctgatgaagatgatg 29060544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20076812 - 20076704
Alignment:
Q  120 tgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 219  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20076812 tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20076714  T
Q  220 gatgatgatg 229  Q
    || |||||||    
T  20076713 gaagatgatg 20076704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25644444 - 25644335
Alignment:
Q  110 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttgg 208  Q
    |||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||| | || ||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  25644444 tttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcgg 25644345  T
Q  209 tctaagttga 218  Q
    ||||||||||    
T  25644344 tctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1595707 - 1595550
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  1595707 atataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 1595609  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  1595608 atgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 1595550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Original strand, 18409826 - 18409944
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  18409826 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgttg-ttatttaactgagctgcatgagtcggt 18409924  T
Q  210 ctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  18409925 ctaagttgatgaagatgatg 18409944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22782385 - 22782228
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  22782385 atataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 22782287  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  22782286 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 22782228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Original strand, 19303540 - 19303657
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtc 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19303540 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtc 19303638  T
Q  211 taagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||| |||||| |||||||    
T  19303639 taagatgatgaagatgatg 19303657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 2291184 - 2291341
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  2291184 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 2291282  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  2291283 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 2291341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 56 - 226
Target Start/End: Original strand, 8227453 - 8227625
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 153  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||    
T  8227453 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 8227552  T
Q  154 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatg 226  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||| |  |||  |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||    
T  8227553 gttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatg 8227625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12742475 - 12742318
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  12742475 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 12742377  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  12742376 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 12742318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 18334596 - 18334753
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  18334596 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 18334694  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  18334695 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18334753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19005204 - 19005047
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  19005204 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 19005106  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  19005105 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 19005047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 19858923 - 19859080
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  19858923 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 19859021  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  19859022 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 19859080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Original strand, 20638285 - 20638400
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 212  Q
    |||||||| | ||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20638285 agatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagttggtcta 20638383  T
Q  213 agttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||| |||||||    
T  20638384 agttgatgaagatgatg 20638400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24422705 - 24422548
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  24422705 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24422607  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  24422606 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24422548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33861952 - 33861795
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  33861952 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 33861854  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  33861853 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 33861795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33864436 - 33864279
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  33864436 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 33864338  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  33864337 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 33864279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Original strand, 25629354 - 25629472
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||  | |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  25629354 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgttg-taatttaactaagctgcatgagtcggt 25629452  T
Q  210 ctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  25629453 ctaagttgatgaagatgatg 25629472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 20556898 - 20557053
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtcta 170  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| ||| |||| |||||||| ||||||| |||||| ||||  |||| || ||| | ||||||| |     
T  20556898 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaaatt-gagacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgt-tg 20556995  T
Q  171 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20556996 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 20557053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 219
Target Start/End: Original strand, 30676714 - 30676861
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||| | |||||| ||    
T  30676714 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactg-ct 30676812  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 219  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30676813 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 30676861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 178
Target Start/End: Original strand, 4668217 - 4668277
Alignment:
Q  118 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 178  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  4668217 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctg 4668277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 178
Target Start/End: Original strand, 4675064 - 4675124
Alignment:
Q  118 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 178  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  4675064 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctg 4675124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8055187 - 8055030
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | |    
T  8055187 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttt-t 8055089  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  8055088 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 8055030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 26924644 - 26924801
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | |    
T  26924644 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-t 26924742  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  26924743 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 26924801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 17287791 - 17287913
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| ||  |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17287791 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 17287889  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||||| | |||||||    
T  17287890 cggtctaagttgattaagatgatg 17287913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 221
Target Start/End: Original strand, 20360955 - 20361069
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20360955 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 20361053  T
Q  206 tggtctaagttgatga 221  Q
     | |||||||||||||    
T  20361054 cgatctaagttgatga 20361069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25754967 - 25754810
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  ||    
T  25754967 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ct 25754869  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  25754868 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 25754810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20593895 - 20593777
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||||||||||  |||||||||| |||||||||| | |||    
T  20593895 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgttt-ttatttaactgagctgcatgattcggt 20593797  T
Q  210 ctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  20593796 ctaagttgatgaagatgatg 20593777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25656731 - 25656630
Alignment:
Q  127 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgat 225  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||    
T  25656731 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 25656634  T
Q  226 gatg 229  Q
    ||||    
T  25656633 gatg 25656630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34963531 - 34963384
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  34963531 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 34963433  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 219  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  34963432 gtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 34963384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 229
Target Start/End: Original strand, 1540918 - 1541072
Alignment:
Q  76 taattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatg 172  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||| | ||    
T  1540918 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgt-tgtg 1541016  T
Q  173 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||    
T  1541017 ttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatg 1541072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18456877 - 18456735
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | |    
T  18456877 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-t 18456779  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 214  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18456778 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25688620 - 25688513
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 209  Q
    |||||| |||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |    
T  25688620 ttgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcgat 25688523  T
Q  210 ctaagttgat 219  Q
    ||||||||||    
T  25688522 ctaagttgat 25688513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Original strand, 16920634 - 16920747
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 213  Q
    |||||||| ||||| | ||| |||||  |||| ||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  16920634 agatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaa 16920731  T
Q  214 gttgatgatgatgatg 229  Q
    | || ||| |||||||    
T  16920732 gatgttgaagatgatg 16920747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Original strand, 28103796 - 28103887
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat 102  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  28103796 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattatgtgaattat 28103887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35245703 - 35245590
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 213  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  35245703 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 35245606  T
Q  214 gttgatgatgatgatg 229  Q
    | || ||| |||||||    
T  35245605 gatgttgaagatgatg 35245590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714421
Alignment:
Q  171 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  25714478 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 25714421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 3852021 - 3852178
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| |||||||  ||||| | || ||||| || ||| | ||||| | |    
T  3852021 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatactat-t 3852119  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  3852120 gtgttgctgttg-ttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 3852178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18461997 - 18461895
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 209  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18461997 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 18461900  T
Q  210 ctaag 214  Q
    |||||    
T  18461899 ctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22831568 - 22831524
Alignment:
Q  168 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 212  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22831568 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22831524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23076955 - 23076749
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||  ||||| | ||||||||  |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||||    
T  23076955 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatag-atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgat 23076857  T
Q  109 atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat--gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
     ||| || ||||||||| |  || | |||||| |||||||  |||  | |||   ||||| |||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||     
T  23076856 gtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 23076757  T
Q  207 ggtctaag 214  Q
    ||||||||    
T  23076756 ggtctaag 23076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 219
Target Start/End: Original strand, 16448530 - 16448678
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 168  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |    
T  16448530 atataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-c 16448628  T
Q  169 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 219  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16448629 tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 16448678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18696675 - 18696569
Alignment:
Q  46 atatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgtta 144  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| || |||||||| |||| |||| || ||||||||||    
T  18696675 atatgatttaatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttggagatgttattgatttgcttt-gatattgtta 18696577  T
Q  145 tatcatga 152  Q
    ||||||||    
T  18696576 tatcatga 18696569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 229
Target Start/End: Original strand, 22780297 - 22780344
Alignment:
Q  182 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  22780297 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 22780344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11185568 - 11185515
Alignment:
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatg 223  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  11185568 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgatg 11185515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18706495 - 18706387
Alignment:
Q  44 taatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgt 142  Q
    ||||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||| ||||||| |||| |||| || ||||||||    
T  18706495 taatatgatttgatgttgttaataatgtcatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagatgttattgatttgcttt-gatattgt 18706397  T
Q  143 tatatcatga 152  Q
    ||||||||||    
T  18706396 tatatcatga 18706387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 33443146 - 33443068
Alignment:
Q  135 gatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 212  Q
    |||||||||||||| |||  || |||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33443146 gatattgttatatcttgagatgttttatatactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 214
Target Start/End: Original strand, 18821904 - 18821946
Alignment:
Q  171 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 214  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18821904 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 35008383 - 35008167
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||  ||  ||||| | ||||||||  |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  35008383 actaagttgcttatcttactgttattgtttcagtaagcctgatatag-atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatattcattacatgaat 35008285  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat--gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | |||| ||| || |||| |||| |  || | |||||| |||||||  |||  | |||   ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||    
T  35008284 tatatatgatgtttaagttgtttttgattatcacttgatattattatatctggatatgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagc 35008185  T
Q  197 tgcatgagttggtctaag 214  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  35008184 tgcatgagtcggtctaag 35008167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 230
Target Start/End: Original strand, 4738631 - 4738675
Alignment:
Q  186 tttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  4738631 tttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatgatgacgatgt 4738675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 102
Target Start/End: Original strand, 18896256 - 18896304
Alignment:
Q  54 taatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat 102  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18896256 taatgttgttagtaatgggatataattgtatatgcattatgtgaattat 18896304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13162 - 12942
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gat 108  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||    
T  13162 ttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgg-ataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgat 13064  T
Q  109 atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttgg 208  Q
     |||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  13063 gtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 12964  T
Q  209 tctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  12963 tctaagttgaagatgatgatgt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 18125 - 18277
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  18125 actaagttgcttatctcactgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgttttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaat 18223  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 152  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  18224 tatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatga 18277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 32768 - 32538
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32768 actaagttgtttatcttgttgttattgtttcagtaagcctgaatta-tataatctaatgtttttgttaatgttatatagttgtatatacattacatgaat 32670  T
Q  100 tatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  32669 tatgtttgatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctg 32571  T
Q  199 catgagttggtctaagttg-atgatgatgatgt 230  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  32570 catgagtcggtctaagttgaaagatgatgatgt 32538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 160916 - 160685
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||| |||| |    
T  160916 actaagttgtttatcttgttgttgttgtttcggtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatatattacatgact 160818  T
Q  100 tatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  160817 tatgtttgatatttgacatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctg 160719  T
Q  199 catgagttggtctaagttgatgatgatgatgtcc 232  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  160718 catgagtcggtctaagttgatgatgatgatgtcc 160685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 501242 - 501095
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| || ||    
T  501242 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattg-ct 501144  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 219  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  501143 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 501095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 85583 - 85741
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 168  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| || ||| |||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||     
T  85583 atataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt- 85681  T
Q  169 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||    
T  85682 tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatg 85741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Original strand, 933 - 1151
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gat 108  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  933 ttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgtaa--atctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 1030  T
Q  109 atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttgg 208  Q
     |||  ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  1031 gtttatgatgttgatgacttgcattcgatgttgttatatcatgatgatctgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 1130  T
Q  209 tctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  1131 tctaagttgattaagatgatg 1151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 56 - 230
Target Start/End: Original strand, 45735 - 45910
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg 154  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  45735 atgttgtttataatgttatataattgtatatacatcacatgaattatgtttgataattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcatgatg 45834  T
Q  155 atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45835 atttgcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 45910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7042 - 6822
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| |  ||||||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |    
T  7042 actaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattaatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgact 6944  T
Q  100 tatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
    |||||| ||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  6943 tatgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctg 6847  T
Q  199 catgagttggtctaagttgatgatg 223  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||    
T  6846 catgagtcggtctaagatgatgatg 6822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 8248 - 8097
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8248 actaagttgtttatcctgctgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaat 8150  T
Q  100 tatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatg 151  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  8149 tatgtttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatg 8097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1305 - 1096
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gat 108  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||| ||||  || |||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  1305 ttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgta-tatgatttgatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattccatgaattatgtttgat 1207  T
Q  109 atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttgg 208  Q
     ||||| |||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  1206 gtttgaaatgttgatgacctgtattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 1107  T
Q  209 tctaagttgat 219  Q
    |||||||||||    
T  1106 tctaagttgat 1096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 7964 - 8180
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7964 actaagttgtttatcttgctgttgtt---tcagtaagcctgaatta-tatgatttaatgttgttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaat 8059  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | |||| || | ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||  || |||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  8060 tatatatgatgtt-gtgatgttgttgatttgtatttgatattgttatatcatgaactggtttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagc 8158  T
Q  197 tgcatgagttggtctaagttga 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  8159 tgcatgagtcggtctaagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 29242 - 29354
Alignment:
Q  72 tatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 170  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||| ||| |||| |||||   ||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||  |||    
T  29242 tatataattgtatatacagtacatgacttaagtttgataattgag---ttgctgatttacattcgatattattatatcatgatagtttgaatactaccta 29338  T
Q  171 tgttgctgttggttat 186  Q
    |||||||||| |||||    
T  29339 tgttgctgtttgttat 29354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 126 - 230
Target Start/End: Original strand, 23897 - 24001
Alignment:
Q  126 attgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  23897 attgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgaagatgat 23996  T
Q  226 gatgt 230  Q
    |||||    
T  23997 gatgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 136255 - 136471
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatct-aatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaa 98  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  136255 actaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgattttaatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattacatgaa 136353  T
Q  99 ttatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaag 195  Q
    ||||||  |||   || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||||  ||||| |||||| |||||| |||  |||||||||    
T  136354 ttatgtacgat-gatgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaag 136452  T
Q  196 ctgcatgagttggtctaag 214  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  136453 ttgcatgagtcggtctaag 136471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 144963 - 145179
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatct-aatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaa 98  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  144963 actaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgattttaatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattacatgaa 145061  T
Q  99 ttatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaag 195  Q
    ||||||  |||   || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||||  ||||| |||||| |||||| |||  |||||||||    
T  145062 ttatgtacgat-gatgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaag 145160  T
Q  196 ctgcatgagttggtctaag 214  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  145161 ttgcatgagtcggtctaag 145179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 174886 - 174785
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtc 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||  | || ||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  174886 ttgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 174789  T
Q  211 taag 214  Q
    ||||    
T  174788 taag 174785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121770
Alignment:
Q  163 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 121770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 6170 - 6386
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  6170 actaagttgcttatctcactgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaat 6268  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||  || |||  |||||| ||||||||||||| |||  |||||||||     
T  6269 tatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagt 6368  T
Q  197 tgcatgagttggtctaag 214  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  6369 tgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 66 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11457 - 11296
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11457 taatgttatataatagtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 11361  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  11360 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 11296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 66 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2162 - 2001
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2162 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 2066  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    || |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  2065 tgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 2001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28533 - 28418
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 212  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28533 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 28435  T
Q  213 agttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||| |||||||    
T  28434 agttgatgaagatgatg 28418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4556
Alignment:
Q  177 tgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 4556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 66 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15826 - 15665
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  15826 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgtatac 15730  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||    
T  15729 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 66 - 229
Target Start/End: Original strand, 1025 - 1186
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  1025 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 1121  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  1122 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 1186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 38551 - 38339
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||   ||||||  |||||  ||||||| ||||| ||||||    
T  38551 actaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatttgatgttgagattaatgtgatatatatgtatatgcattacatgaat 38453  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  || |||  |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  38452 tatatatgatgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagc 38353  T
Q  197 tgcatgagttggtc 210  Q
    ||||||||| ||||    
T  38352 tgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 38697 - 38819
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  38697 atatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagta 38796  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  38797 ggtctaagttgattaagatgatg 38819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 128857 - 129072
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||  |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  128857 actaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatttag-atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatgaat 128955  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  128956 tatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagc 129054  T
Q  197 tgcatgagttggtctaag 214  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  129055 tgcatgagtcggtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 78555 - 78345
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  78555 actaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaat 78457  T
Q  100 tatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    |||    ||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  || ||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  78456 tataaacgatgtt-gagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagc 78359  T
Q  197 tgcatgagttggtc 210  Q
    ||||||||| ||||    
T  78358 tgcatgagtcggtc 78345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 116551 - 116431
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||| || |||| ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  116551 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 116454  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  116453 ggtctaagttgattaagatgatg 116431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 32249 - 32101
Alignment:
Q  82 tatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgtt 180  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| ||||    
T  32249 tatatacattaaatggattatgttgataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtt 32151  T
Q  181 ggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32150 tgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 32101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 3146 - 3267
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  3146 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 3244  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  3245 ggtctaagttgatgaagatgatg 3267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 127 - 229
Target Start/End: Original strand, 15792 - 15894
Alignment:
Q  127 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  15792 ttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15891  T
Q  227 atg 229  Q
    |||    
T  15892 atg 15894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 15720 - 15765
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaatta 45  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15720 actaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatta 15765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 178945 - 178897
Alignment:
Q  182 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||    
T  178945 gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatgt 178897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12801 - 12587
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||   ||| || | ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||  |||||    
T  12801 actaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtct-aatgtgtattatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattac-tgaat 12704  T
Q  100 tatgttga--tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagct 197  Q
    ||| |  |  |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  12703 tatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagct 12604  T
Q  198 gcatgagttggtctaag 214  Q
     ||||||| ||||||||    
T  12603 acatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Original strand, 103536 - 103737
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgata 109  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||     
T  103536 ttatcttcctgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatttaatgttgttgttaatgttatgtagttgtatatacattacatgaattatgt--at- 103631  T
Q  110 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttg 207  Q
         ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||  |||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||| |    
T  103632 -----gatgttgttgttttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttttatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcg 103726  T
Q  208 gtctaagttga 218  Q
    |||||||||||    
T  103727 gtctaagttga 103737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 203
Target Start/End: Original strand, 53482 - 53640
Alignment:
Q  47 tatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgtta 144  Q
    |||||| | ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  53482 tatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgtta 53581  T
Q  145 tatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatga 203  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  53582 tatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatga 53640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 107 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1158 - 1051
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    ||||||||||||||| ||| | | ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  1158 atatttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 1059  T
Q  207 ggtctaag 214  Q
    ||||||||    
T  1058 ggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Original strand, 3185 - 3303
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 209  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  3185 ttgagatgttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 3283  T
Q  210 ctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  3284 ctaagttgatgaagatgatg 3303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 107 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39602 - 39489
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||     
T  39602 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 39504  T
Q  207 ggtctaagttgatga 221  Q
    |||||||||||||||    
T  39503 ggtctaagttgatga 39489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 107 - 221
Target Start/End: Original strand, 75210 - 75323
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||     
T  75210 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 75308  T
Q  207 ggtctaagttgatga 221  Q
    |||||||||||||||    
T  75309 ggtctaagttgatga 75323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39983 - 39862
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||||||  |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  39983 atatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactaagcttcatgagtt 39885  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  39884 ggtctaagttgatgaagatgatg 39862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26021 - 25908
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||||||  |||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||     
T  26021 atatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagtc 25923  T
Q  207 ggtctaagttgatga 221  Q
    |||||||||||||||    
T  25922 ggtctaagttgatga 25908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 97240 - 97024
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||  ||  ||||| | ||||||||  |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  97240 actaagttgcttttcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatag-atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaat 97142  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  97141 tatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagc 97042  T
Q  197 tgcatgagttggtctaag 214  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  97041 tgcatgagtgggtctaag 97024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 106518 - 106302
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||  ||  ||||| | ||||||||  |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  106518 actaagttgcttttcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatag-atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaat 106420  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  106419 tatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagc 106320  T
Q  197 tgcatgagttggtctaag 214  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  106319 tgcatgagtgggtctaag 106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 73 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25268 - 25121
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtct 169  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  || |||  |||||| ||    
T  25268 atatatttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatatcgttatatcatgagctgttttatatactgcct 25170  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 218  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25169 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 727 - 619
Alignment:
Q  44 taatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgt 142  Q
    ||||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||||| |||| |||| || ||||||||    
T  727 taatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgcttt-gatattgt 629  T
Q  143 tatatcatga 152  Q
    ||||||||||    
T  628 tatatcatga 619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1977 - 1855
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1977 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 1879  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  1878 cggtctaagttgatgaagatgatg 1855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34288 - 34127
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||  ||| ||| | |||||| ||||   |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||    
T  34288 taatgttatataattgtatatatattacttgacttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgtatac 34192  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    || |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  34191 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 34127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 324 - 285
Alignment:
Q  182 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatga 221  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  324 gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatga 285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 32952 - 33073
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || |||| |||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  32952 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgttg-ttaattaactaagctgcatgagtc 33050  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  33051 ggtctaagttgatgaagatgatg 33073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 46053 - 45932
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || |||| |||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  46053 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgttg-ttaattaactaagctgcatgagtc 45955  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  45954 ggtctaagttgatgaagatgatg 45932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16235 - 16117
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 209  Q
    |||||||| |||||  ||||||| |||||| | ||||| || || ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16235 ttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 16137  T
Q  210 ctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  16136 ctaagttgatgaagatgatg 16117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 229
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17446
Alignment:
Q  171 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17389 tgttgctgttg-ttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 17446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 19772 - 19987
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||  |||||  |||||| ||||||| ||||| |||| |    
T  19772 actaagttgcttatcttactgttgttgttccagtaagcatgaatta-tatgatttgatgttattaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgagt 19870  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||    
T  19871 tatttatgatgct-gagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagc 19969  T
Q  197 tgcatgagttggtctaag 214  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  19970 tgcatgagtcggtctaag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40038 - 39917
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  40038 atatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaattaagctgcatgagtt 39940  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  39939 ggtctaagttgatgaagatgatg 39917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4968 - 4853
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4968 agatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaatctgcatgagtcggtcta 4870  T
Q  213 agttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||| ||| |||||||    
T  4869 agttgttgaagatgatg 4853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13247 - 13147
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 213  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  13247 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 13148  T
Q  214 g 214  Q
    |    
T  13147 g 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 218
Target Start/End: Original strand, 16098 - 16206
Alignment:
Q  110 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 209  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| |||    
T  16098 tttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 16197  T
Q  210 ctaagttga 218  Q
    |||||||||    
T  16198 ctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 218
Target Start/End: Original strand, 27747 - 27855
Alignment:
Q  110 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 209  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| |||    
T  27747 tttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 27846  T
Q  210 ctaagttga 218  Q
    |||||||||    
T  27847 ctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11643 - 11492
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 153  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||    
T  11643 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 11544  T
Q  154 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  11543 gttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagt 11492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Original strand, 38198 - 38349
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 153  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||    
T  38198 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 38297  T
Q  154 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  38298 gttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagt 38349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Original strand, 17214 - 17334
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt---gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttg 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  17214 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcg 17312  T
Q  208 gtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  17313 gtctaagttgatgaagatgatg 17334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 214
Target Start/End: Original strand, 79288 - 79430
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgtct 169  Q
    ||||| |||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| || ||| |||| ||||| || |||   ||||||||     
T  79288 atatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtcatgctgtttttatatactgtcg 79387  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 214  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  79388 -tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 228 - 87
Alignment:
Q  11 tatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgata 109  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||  ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||     
T  228 tatcttactgttgttgtttcagtaagcctaaattaa-atgatttgatgttgttaataatgttatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 130  T
Q  110 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 152  Q
    ||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  129 tttgagatgttattgatttgcatctgatattgttatatcatga 87  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 215
Target Start/End: Original strand, 17969 - 18130
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 153  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  17969 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgat 18068  T
Q  154 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 215  Q
    | | |||||| ||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18069 gttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 18130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 219
Target Start/End: Original strand, 2132 - 2280
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 168  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||  |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||     
T  2132 atataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt- 2230  T
Q  169 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 219  Q
    | ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2231 tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgat 2280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 7946 - 8161
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| || |||| || ||||  || |||||| | ||||||||  |||||  |||||||| |||||||||||  |||||    
T  7946 actaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtgagactgatgta-tatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaat 8044  T
Q  100 tatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaag 195  Q
    ||| | ||| | ||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||| ||||    
T  8045 tatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctgatttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaag 8144  T
Q  196 ctgcatgagttggtcta 212  Q
    ||||||| || ||||||    
T  8145 ctgcatgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 226
Target Start/End: Original strand, 26064 - 26179
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 209  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  26064 ttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 26162  T
Q  210 ctaagttgatgatgatg 226  Q
    |||||||||||| ||||    
T  26163 ctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 44702 - 44824
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44702 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 44800  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
      |||||||||||| | |||||||    
T  44801 cagtctaagttgattaagatgatg 44824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13337 - 13215
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13337 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 13239  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
      |||||||||||||| |||||||    
T  13238 cagtctaagttgatgaagatgatg 13215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 149 - 230
Target Start/End: Original strand, 28806 - 28888
Alignment:
Q  149 atgatgatttgcatactgtctatgttgctgttg-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28806 atgatgatttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 28888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33067 - 32946
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||     
T  33067 atatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaattaagctgcatgagtc 32969  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||| ||||||| |||||||    
T  32968 ggtctaacttgatgaagatgatg 32946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38886 - 38765
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |     
T  38886 atatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaattaagctgcatgactc 38788  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  38787 ggtctaagttgatgaagatgatg 38765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9908 - 9750
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatat--ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 168  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||  |||||| |||||||| ||||| | |||||| |||| ||||  || ||| | |||||||     
T  9908 atataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgt- 9810  T
Q  169 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  9809 tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 9750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20905 - 20748
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  20905 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 20807  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  20806 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37979 - 37822
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  37979 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 37881  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  37880 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 37822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 158454 - 158611
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  158454 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 158552  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  158553 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 158611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Original strand, 339949 - 340064
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtc 210  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  339949 ttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgttgt--gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 340045  T
Q  211 taagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||| || |||||||    
T  340046 taagttgacgaagatgatg 340064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3596 - 3474
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  3596 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgagt 3498  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  3497 cggtctaagttgatgaagatgatg 3474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 468 - 347
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    |||||| |||||||||||| || || | |||||| |||  ||||| |  |||| |||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  468 atatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctattttgtatactgcctatgttattgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 370  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||| ||| | |||||||    
T  369 ggtctaagtcgataaagatgatg 347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 52039 - 51917
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52039 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 51941  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  51940 cggtctaagttgatgaagatgatg 51917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 167973 - 168095
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| |  ||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  167973 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 168071  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  168072 cggtctaagttgttgaagatgatg 168095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 111 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10891 - 10784
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 209  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  10891 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 10794  T
Q  210 ctaagttgat 219  Q
    ||||||||||    
T  10793 ctaagttgat 10784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 76 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13547 - 13393
Alignment:
Q  76 taattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatg 172  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||    
T  13547 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtg 13449  T
Q  173 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  13448 ttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 8528 - 8646
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || |||  |||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||||     
T  8528 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgatactgcctatgttgctgtt----atttaactaagctgcatgagtc 8623  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  8624 ggtctaagttgatgaagatgatg 8646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4852 - 4695
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  4852 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ct 4754  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  4753 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatgatg 4695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 9193 - 9133
Alignment:
Q  118 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 178  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9193 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctg 9133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Original strand, 10427 - 10540
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 213  Q
    |||||||||||||||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10427 agatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaa 10524  T
Q  214 gttgatgatgatgatg 229  Q
    |||| ||| |||||||    
T  10525 gttgttgaagatgatg 10540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14105 - 13948
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  14105 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 14007  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  14006 gtgttgctgttg-ttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16942 - 16785
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  ||    
T  16942 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatacta-ct 16844  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  16843 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 16785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1406 - 1293
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 213  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||||||  ||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1406 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatg--ttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 1309  T
Q  214 gttgatgatgatgatg 229  Q
    | || ||| |||||||    
T  1308 gatgttgaagatgatg 1293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7383 - 7270
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 213  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7383 agatgttgatgaattgaatttgatataattatttcatgttg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 7286  T
Q  214 gttgatgatgatgatg 229  Q
    | || ||| |||||||    
T  7285 gatgttgaagatgatg 7270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 229
Target Start/End: Original strand, 15295 - 15355
Alignment:
Q  168 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||    
T  15295 ctatgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatg 15355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 214
Target Start/End: Original strand, 20383 - 20524
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 170  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||  |     
T  20383 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactga-tg 20481  T
Q  171 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 214  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20482 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 128876 - 128755
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 206  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   |  | | | ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  128876 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttttttttttttgttgcttttg-ttatttaactaagttgcatgagtt 128778  T
Q  207 ggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||| ||||| | |||||||    
T  128777 ggtctaatttgattaagatgatg 128755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 1043 - 1165
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| |  ||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1043 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 1141  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  1142 cggtctaagttgttgaagatgatg 1165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2078 - 1956
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||| ||||| |||||| | |||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  2078 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgttg-ttaattaactaagctgcatgagt 1980  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     |||||||| || ||| |||||||    
T  1979 cggtctaagatgttgaagatgatg 1956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23008 - 22887
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23008 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgg-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 22911  T
Q  206 tggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||||| | |||||||    
T  22910 cggtctaagttgattaagatgatg 22887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Original strand, 15466 - 15580
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 213  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  15466 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctcttg-ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 15564  T
Q  214 gttgatgatgatgatg 229  Q
    |||| ||| |||||||    
T  15565 gttgttgaagatgatg 15580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32184 - 32071
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 213  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||| || ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32184 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-tttgtttactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 32087  T
Q  214 gttgatgatgatgatg 229  Q
    |||| ||| |||||||    
T  32086 gttgttgaagatgatg 32071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 215
Target Start/End: Original strand, 24297 - 24406
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga--tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| ||   |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24297 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 24395  T
Q  205 ttggtctaagt 215  Q
    | |||||||||    
T  24396 tcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 783 - 569
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | || || |   ||||   |||| | ||||||| ||||| ||||||    
T  783 actaagttgtttatctaactgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatttgatcttttaaataatatgatattaatgtatatgcattacatgaat 685  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | |||| || | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  || ||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  684 tatatatgatgttgg-gatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagc 587  T
Q  197 tgcatgagttggtctaag 214  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  586 tgcatgagtcggtctaag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 6116 - 6241
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttg--gttatttaactaagctgcatga 203  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| | || ||||| || ||| | |||||  |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6116 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 6215  T
Q  204 gttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    || ||||||||||||||| |||||||    
T  6216 gtcggtctaagttgatgaagatgatg 6241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 267894 - 267679
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||| ||| ||| |||| |||||||||||||| || | |||||| | ||| ||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  267894 actaagttgcttagcttactgctgttgtttcagtaagcctggatga-tatgatttgatggtgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaat 267796  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | |||| || ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  ||||||  ||||||| |||| |||  |||||||||     
T  267795 tatatatgatgtt-gagatattgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagt 267697  T
Q  197 tgcatgagttggtctaag 214  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  267696 tgcatgagtcggtctaag 267679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 229
Target Start/End: Original strand, 4890 - 4950
Alignment:
Q  168 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4890 ctatgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 4950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 9360 - 9253
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 209  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| |||   ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  9360 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 9263  T
Q  210 ctaagttgat 219  Q
    ||||||||||    
T  9262 ctaagttgat 9253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 51699 - 51601
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 213  Q
    |||||||| ||||||| ||| | |||  |||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51699 agatgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 51602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40558 - 40401
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaatt--atgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||  ||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||| |    
T  40558 atataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgt-t 40460  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||    
T  40459 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatg 40401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Original strand, 1696 - 1900
Alignment:
Q  11 tatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgata 109  Q
    |||||| || ||||| || |||||||||||||||| |||||| | | ||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| || |||||| | ||||     
T  1696 tatcttactattgttgttccagtaagcctgaatta-tatgatttgacgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacataaattatatatgatg 1794  T
Q  110 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttg 207  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |  |||  |||||  |||||||  |||| |||   |||||||||||||||||| |    
T  1795 tt-gagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatactacctatgttaatgttagtttaataactaagctgcatgagtcg 1893  T
Q  208 gtctaag 214  Q
    |||||||    
T  1894 gtctaag 1900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13615 - 13513
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 213  Q
    |||||||| ||||| | | | |||||| | || ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13615 agatgttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 13517  T
Q  214 gttg 217  Q
    ||||    
T  13516 gttg 13513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4633 - 4520
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4633 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttg-ttatttaactaagc-gcatgagt 4536  T
Q  206 tggtctaagttgatga 221  Q
     |||||||||||||||    
T  4535 cggtctaagttgatga 4520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12215 - 12102
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12215 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttg-ttatttaactaagc-gcatgagt 12118  T
Q  206 tggtctaagttgatga 221  Q
     |||||||||||||||    
T  12117 cggtctaagttgatga 12102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22167 - 22054
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22167 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttg-ttatttaactaagc-gcatgagt 22070  T
Q  206 tggtctaagttgatga 221  Q
     |||||||||||||||    
T  22069 cggtctaagttgatga 22054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Original strand, 16599 - 16717
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 209  Q
    |||||||| |||||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16599 ttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 16697  T
Q  210 ctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||| ||||||| |||||||    
T  16698 ctaaattgatgaagatgatg 16717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16397 - 16286
Alignment:
Q  116 atgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 215  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  16397 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 16300  T
Q  216 tgatgatgatgatg 229  Q
    || ||| |||||||    
T  16299 tgttgaagatgatg 16286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4788 - 4716
Alignment:
Q  156 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  4788 tttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 4716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 264 - 107
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | |    
T  264 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-t 166  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||    
T  165 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatg 107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Original strand, 5132 - 5245
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 213  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||||||  ||| ||| |  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5132 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatg--ttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 5229  T
Q  214 gttgatgatgatgatg 229  Q
    | || ||| |||||||    
T  5230 gatgttgaagatgatg 5245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8598 - 8483
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 212  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||  || ||| | |||||  |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  8598 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattg-ttatttaaccaagctgcatgagtcggtcta 8500  T
Q  213 agttgatgatgatgatg 229  Q
    ||||||||| |||||||    
T  8499 agttgatgaagatgatg 8483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 175
Target Start/End: Original strand, 2398 - 2505
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2398 taatgttatataattgtatatacattaaatgacttaagtttgataattgag---ttgctgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 2494  T
Q  165 tgtctatgttg 175  Q
     ||||| ||||    
T  2495 ggtctaagttg 2505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 30090 - 29946
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  30090 atataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 29992  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagtt 216  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29991 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21030 - 20928
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 212  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| ||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||||  |||||| ||||||    
T  21030 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtcta 20931  T
Q  213 agt 215  Q
    |||    
T  20930 agt 20928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11446 - 11299
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  11446 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 11348  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 219  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  11347 gtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgat 11299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4415 - 4308
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 209  Q
    |||||| |||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  4415 ttgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatacta-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 4318  T
Q  210 ctaagttgat 219  Q
    ||||||||||    
T  4317 ctaagttgat 4308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 225585 - 225465
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 153  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | |    
T  225585 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatcacgct 225487  T
Q  154 gatttgcatactgtctatgttg 175  Q
    | ||||||||||| ||||||||    
T  225486 gttttgcatactgactatgttg 225465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 217
Target Start/End: Original strand, 161093 - 161239
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 168  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||| |||| ||| ||| | |||||| |    
T  161093 atataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatactg-c 161191  T
Q  169 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg 217  Q
    | ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  161192 tgtgtcgctgttgat-atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 161239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Original strand, 1053 - 1166
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 213  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||  |||| ||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  1053 agatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 1150  T
Q  214 gttgatgatgatgatg 229  Q
    | || ||| |||||||    
T  1151 gatgttgaagatgatg 1166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2784 - 2694
Alignment:
Q  126 attgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||| ||||||||||||| ||   || |||||||||||||||| ||||||||    
T  2784 attgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaag 2694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 219
Target Start/End: Original strand, 12253 - 12400
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaatta--tgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||||  |||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| || | ||||| || ||| | || ||| ||    
T  12253 atataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctg-ct 12351  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 219  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  12352 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgat 12400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12216 - 12065
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  12216 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatactg-ct 12118  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  12117 gtgttgctgtt-------taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 12065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4650 - 4545
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgat-ttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||| |||||| | ||||| || || | |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4650 atatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgttg-ttatttaactaagttgcatgagt 4552  T
Q  206 tggtcta 212  Q
     ||||||    
T  4551 cggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 47065 - 46999
Alignment:
Q  163 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  47065 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 46999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4373 - 4215
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 168  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |    
T  4373 atataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttgtatactg-c 4275  T
Q  169 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 229  Q
    | ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  4274 tgtgtcgctgtcg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 4215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 227
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11558
Alignment:
Q  116 atgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 214  Q
    |||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtttaag 11545  T
Q  215 ttgatgatgatga 227  Q
    ||| ||| |||||    
T  11546 ttgttgaagatga 11558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23890 - 23842
Alignment:
Q  182 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  23890 gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgt 23842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36501 - 36453
Alignment:
Q  182 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 230  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  36501 gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgt 36453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11982
Alignment:
Q  171 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 214  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12024 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 121
Target Start/End: Original strand, 2261 - 2303
Alignment:
Q  79 ttgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttg 121  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2261 ttgtatatacattaaatggattatgttgatattcgagatgttg 2303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 182 - 219
Target Start/End: Original strand, 1395 - 1432
Alignment:
Q  182 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 219  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  1395 gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 27956 - 27912
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatg 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||    
T  27956 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University