View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21242_low_9 (Length: 557)

Name: NF21242_low_9
Description: NF21242
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21242_low_9
NF21242_low_9
[»] chr3 (13 HSPs)
chr3 (1-557)||(26731656-26732212)
chr3 (1-557)||(26690345-26690901)
chr3 (1-554)||(26694506-26695059)
chr3 (22-555)||(26675179-26675715)
chr3 (1-471)||(26750802-26751272)
chr3 (1-461)||(26698488-26698948)
chr3 (1-461)||(26733651-26734111)
chr3 (1-471)||(26713630-26714100)
chr3 (1-471)||(26736866-26737336)
chr3 (1-471)||(26743877-26744347)
chr3 (21-125)||(47212387-47212491)
chr3 (359-395)||(47212117-47212153)
chr3 (208-260)||(47212252-47212304)
[»] chr7 (10 HSPs)
chr7 (20-438)||(21108145-21108563)
chr7 (20-438)||(21098526-21098944)
chr7 (1-471)||(21130226-21130705)
chr7 (1-443)||(18658416-18658867)
chr7 (195-443)||(21123126-21123377)
chr7 (1-443)||(21111294-21111745)
chr7 (22-125)||(29213149-29213252)
chr7 (421-453)||(41814598-41814630)
chr7 (209-260)||(29213014-29213065)
chr7 (363-395)||(29212879-29212911)
[»] chr4 (2 HSPs)
chr4 (206-437)||(39132242-39132476)
chr4 (1-70)||(39132031-39132100)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 549; Significance: 0; HSPs: 13)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 549; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 557
Target Start/End: Original strand, 26731656 - 26732212
Alignment:
Q  1 tttcttgctgaagttagcgtcattggaaggcttaaccacatgaatttgattggtatgtgggggtattgtgcagagggaaaacacagattgttagtttttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26731656 tttcttgctgaagttagcgtcattggaaggcttaaccacatgaatttgattggtatgtgggggtattgtgcagagggaaaacacagattgttagtttttg 26731755  T
Q  101 agtacatggaaaaaggttctttagcggataatttctcatcaaatgcacttaattggggtaagaggtataaaattgctctcggaactgcaaagtgtcttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26731756 agtacatggaaaaaggttctttagcggataatttgtcatcaaatgcacttaattggggtaagaggtataaaattgctctcggaactgcaaagtgtcttgc 26731855  T
Q  201 atatttacatgaagaatgtttggagtggattttgcattgtgacataaagccgcaaaacatactaattgactctgattaccaacccaaggtagcggatttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26731856 atatttacatgaagaatgtttggagtggattttgcattgtgacataaagccgcaaaacatactaattgactctgattaccaacccaaggtagcggatttt 26731955  T
Q  301 gggttgtctaagttactacaaaggaacaatcttgataattcaagtttctcaaggatgagaggaacaagaggttacatggcacctgaatggattttcaact 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26731956 gggttgtctaagttactacaaaggaacaatcttgataattcaagtttctcaaggatgagaggaacaagaggttacatggcacctgaatggattttcaact 26732055  T
Q  401 tgccaatcacttccaaggtagatgtttatagctatggagttgtgctgctagagatgattaccgggaagagtgcaatgataagtatcttaatcacagatgg 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26732056 tgccaatcacttccaaggtagatgtttatagctatggagttgtgctgctagagatgattaccgggaagagtgcaatgacaagtatcttaatcacagatgg 26732155  T
Q  501 agaaaagactcataatgagagtttggtaacatgggtgagagagaaaagaaggaaatt 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26732156 agaaaagactcataatgagagtttggtaacatgggtgagagagaaaagaaggaaatt 26732212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 541; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 557
Target Start/End: Original strand, 26690345 - 26690901
Alignment:
Q  1 tttcttgctgaagttagcgtcattggaaggcttaaccacatgaatttgattggtatgtgggggtattgtgcagagggaaaacacagattgttagtttttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26690345 tttcttgctgaagttagcgtcattggaaggcttaaccacatgaatttgattggtatgtgggggtattgtgcagagggaaaacacagattgttagtttttg 26690444  T
Q  101 agtacatggaaaaaggttctttagcggataatttctcatcaaatgcacttaattggggtaagaggtataaaattgctctcggaactgcaaagtgtcttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26690445 agtacatggaaaaaggttctttagcggataatttgtcatcaaatgcacttaattggggtaagaggtataaaattgctctcggaactgcaaagtgtcttgc 26690544  T
Q  201 atatttacatgaagaatgtttggagtggattttgcattgtgacataaagccgcaaaacatactaattgactctgattaccaacccaaggtagcggatttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26690545 atatttacatgaagaatgtttggagtggattttgcattgtgacataaagccgcaaaacatactaattgactccaattaccaacccaaggtagcggatttt 26690644  T
Q  301 gggttgtctaagttactacaaaggaacaatcttgataattcaagtttctcaaggatgagaggaacaagaggttacatggcacctgaatggattttcaact 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26690645 gggttgtctaagttactacaaaggaacaatcttgataattcaagtttctcaaggatgagaggaacaagaggttacatggcacctgaatggattttcaact 26690744  T
Q  401 tgccaatcacttccaaggtagatgtttatagctatggagttgtgctgctagagatgattaccgggaagagtgcaatgataagtatcttaatcacagatgg 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26690745 tgccaatcacttccaaggtagatgtttatagctatggagttgtgctgctagagatgattactgggaagagtgcaatgataagtatcttaatcacagatgg 26690844  T
Q  501 agaaaagactcataatgagagtttggtaacatgggtgagagagaaaagaaggaaatt 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26690845 agaaaagactcataatgagagtttggtaacatgggtgagagagaaaagaaggaaatt 26690901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 490; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 554
Target Start/End: Original strand, 26694506 - 26695059
Alignment:
Q  1 tttcttgctgaagttagcgtcattggaaggcttaaccacatgaatttgattggtatgtgggggtattgtgcagagggaaaacacagattgttagtttttg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26694506 tttcttgctgaacttagcgtcattggaaggcttaaccacatgaatttgattggtatgtgggggtattgtgcagagggaaaacacagattgttagtttttg 26694605  T
Q  101 agtacatggaaaaaggttctttagcggataatttctcatcaaatgcacttaattggggtaagaggtataaaattgctctcggaactgcaaagtgtcttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26694606 agtacatggaaaaaggttctttaactgataatttgtcatcaaatgcgcttaattggggtaagaggtacaaaattgctctcggaactgcaaagtgtcttgc 26694705  T
Q  201 atatttacatgaagaatgtttggagtggattttgcattgtgacataaagccgcaaaacatactaattgactctgattaccaacccaaggtagcggatttt 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26694706 ctatttacatgaagaatgtttggagtggattttgcattgtgacataaagccgcaaaacatactaattgactccaattaccaacccaaggtagcggatttt 26694805  T
Q  301 gggttgtctaagttactacaaaggaacaatcttgataattcaagtttctcaaggatgagaggaacaagaggttacatggcacctgaatggattttcaact 400  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26694806 gggttgtctaagttagtacaaaggaacaattttgataattcaagtttctcaaggatgagaggaacaagaggttacatgggacctgaatggattttcaact 26694905  T
Q  401 tgccaatcacttccaaggtagatgtttatagctatggagttgtgctgctagagatgattaccgggaagagtgcaatgataagtatcttaatcacagatgg 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||    
T  26694906 tgccaatcacttccaaggtagatgtttatagctatggagttgtgctgctagagatgattaccgggaagagtgcaatgacgggtatcttaatcacagacgg 26695005  T
Q  501 agaaaagactcataatgagagtttggtaacatgggtgagagagaaaagaaggaa 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26695006 agaaaagactcataatgagagtttggtaacatgggtgagagagaaaagaaggaa 26695059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 22 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 26675715 - 26675179
Alignment:
Q  22 attggaaggcttaaccacatgaatttgattggtatgtgggggtattgtgcagagggaaaacacagattgttagtttttgagtacatggaaaaaggttctt 121  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||||| ||||| |||| | | ||||| |||||||    
T  26675715 attggaatgctcaaccatatgaacttaattggcatgttggggtattgtttagccggaaaacacagattgttggttttagagttcgtagaaaagggttctt 26675616  T
Q  122 tagcggataatttctcatcaaatgcacttaattggggtaagaggtataaaattgctctcggaactgcaaagtgtcttgcatatttacatgaagaatgttt 221  Q
    |||| || ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  26675615 tagctgaaaacctctcatcaaatgcacttgattggggtaagaggtataacattgctctaggaaccgcaaaggctcttgcatatttacatgaagaatgttt 26675516  T
Q  222 ggagtggattttgcattgtgacataaagccgcaaaacatactaattgactctgattaccaacccaaggtagcggattttgggttgtctaagttactacaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||  |||||||||||||||||| || ||||     
T  26675515 ggagtggattttgcattgtgatataaagcctcaaaacatacttattgactctgattaccgacccaaaatagtagattttgggttgtctaagctattacat 26675416  T
Q  322 aggaacaatcttgataattcaagtttctcaaggatgagaggaacaagaggttacatggcacctgaatggattttcaacttgccaatcacttccaaggtag 421  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26675415 aggaacaatcttaataattcaagtttctcaaggatgagaggaacaagaggttacatggcacctgaatggattttcaacttgccaatcacttccaaggtag 26675316  T
Q  422 atgtttatagctatggagttgtgctgctagagatgattaccgggaagagtgcaatgataagtatcttaatcaca---gatggagaaaagactcataatga 518  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||| ||| ||   |||||  |||||||   ||||||  |  | | ||||||||    
T  26675315 atgtttatagttatggaattgtggtgttggagatgattaccggaaagagtccaacgacctgtatcgaaatcacagatgatggaatagtgtcacataatga 26675216  T
Q  519 gagtttggtaacatgggtgagagagaaaagaaggaaa 555  Q
    ||| || ||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  26675215 gaggttagtaacatggattaaagagaaaagaaggaaa 26675179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 26751272 - 26750802
Alignment:
Q  1 tttcttgctgaagttagcgtcattggaaggcttaaccacatgaatttgattggtatgtgggggtattgtgcagagggaaaacacagattgttagtttttg 100  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||| ||    
T  26751272 tttcttgccgaagttagcatcattggaaggcttaaccacatgaatttgattggtatgtggggttattgtgctgagggaaagcatagattgttggtttatg 26751173  T
Q  101 agtacatggaaaaaggttctttagcggataatttctcatcaaatgcacttaattggggtaagaggtataaaattgctctcggaactgcaaagtgtcttgc 200  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| | |||||    
T  26751172 agtacatggaaaagggtactttagctgataatctctcatcaaatgaacttgattggggtaagaggtataacattgctatgggaactgcaaagggacttgc 26751073  T
Q  201 atatttacatgaagaatgtttggagtggattttgcattgtgacataaagccgcaaaacatactaattgactctgattaccaacccaaggtagcggatttt 300  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26751072 gtatttacacgaagaatgtttggagtggattttgcattgcgatataaaaccgcaaaacatacttgttgactccgattaccaaccgaaggtagctgatttt 26750973  T
Q  301 gggttgtctaagttactacaaaggaacaatcttgataattcaagtttctcaaggatgagaggaacaagaggttacatggcacctgaatggattttcaact 400  Q
    ||  |||| ||| || |  | ||| |  | ||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  26750972 ggtctgtccaagctattgaatagggatgaccttgataattcaaatttctcgaggattcgagggacaagaggttacatggcacctgaatgggttttcaaca 26750873  T
Q  401 tgccaatcacttccaaggtagatgtttatagctatggagttgtgctgctagagatgattaccgggaagagt 471  Q
    ||| ||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||  || | |||||||||||||| ||||||    
T  26750872 tgcaaatcacttctaaagtggacgtttatagctatggagtcgttgtgttggagatgattaccggaaagagt 26750802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 26698948 - 26698488
Alignment:
Q  1 tttcttgctgaagttagcgtcattggaaggcttaaccacatgaatttgattggtatgtgggggtattgtgcagagggaaaacacagattgttagtttttg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||    
T  26698948 tttcttgctgaagttagcatcattggaaggcttaatcacatgaatttgataggaatgtggggttattgtgccgagggaaaacacagattgttggtttatg 26698849  T
Q  101 agtacatggaaaaaggttctttagcggataatttctcatcaaatgcacttaattggggtaagaggtataaaattgctctcggaactgcaaagtgtcttgc 200  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| || |||| |||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||    
T  26698848 agtacatggaaaatggtactttagctgataatctctcatcaagtgaacttgattggggtaaaaggtataacattgctatgggaactgcaaagggtcttgc 26698749  T
Q  201 atatttacatgaagaatgtttggagtggattttgcattgtgacataaagccgcaaaacatactaattgactctgattaccaacccaaggtagcggatttt 300  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  26698748 ttatttacacgaagagtgtttggagtggattttgcattgcgatataaagccacaaaacatacttgttgactcggattatcaacctaaggtagcagatttt 26698649  T
Q  301 gggttgtctaagttactacaaaggaacaatcttgataattcaagtttctcaaggatgagaggaacaagaggttacatggcacctgaatggattttcaact 400  Q
    || ||||||||| || |  | |||||  | ||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  26698648 ggtttgtctaagctattgaataggaatgaccttgataattcaaatttctcgaggattcgagggacaagaggttacatggcacctgaatgggttttcaaca 26698549  T
Q  401 tgccaatcacttccaaggtagatgtttatagctatggagttgtgctgctagagatgattac 461  Q
    ||| ||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||    
T  26698548 tgcaaattacttcaaaagtggatgtttatagctatggagttgtggtgttggagataattac 26698488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 26734111 - 26733651
Alignment:
Q  1 tttcttgctgaagttagcgtcattggaaggcttaaccacatgaatttgattggtatgtgggggtattgtgcagagggaaaacacagattgttagtttttg 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||    
T  26734111 tttcttgttgaagttagcatcattggaaggcttaatcacatgaatttgataggaatgtggggttattgtgccgagggaaaacacagattgttggtttatg 26734012  T
Q  101 agtacatggaaaaaggttctttagcggataatttctcatcaaatgcacttaattggggtaagaggtataaaattgctctcggaactgcaaagtgtcttgc 200  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| || |||| |||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||    
T  26734011 agtacatggaaaatggtactttagctgataatctctcatcaagtgaacttgattggggtaaaaggtataacattgctatgggaactgcaaagggtcttgc 26733912  T
Q  201 atatttacatgaagaatgtttggagtggattttgcattgtgacataaagccgcaaaacatactaattgactctgattaccaacccaaggtagcggatttt 300  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  26733911 ttatttacacgaagagtgtttggagtggattttgcattgcgatataaagccacaaaacatacttgttgactcggattatcaacctaaggtagcagatttt 26733812  T
Q  301 gggttgtctaagttactacaaaggaacaatcttgataattcaagtttctcaaggatgagaggaacaagaggttacatggcacctgaatggattttcaact 400  Q
    || ||||||||| || |  | |||||  | ||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  26733811 ggtttgtctaagctattgaataggaatgaccttgataattcaaatttctcgaggattcgagggacaagaggttacatggcacctgaatgggttttcaaca 26733712  T
Q  401 tgccaatcacttccaaggtagatgtttatagctatggagttgtgctgctagagatgattac 461  Q
    ||| ||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||    
T  26733711 tgcaaattacttcaaaagtggatgtttatagctatggagttgtggtgttggagataattac 26733651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 26714100 - 26713630
Alignment:
Q  1 tttcttgctgaagttagcgtcattggaaggcttaaccacatgaatttgattggtatgtgggggtattgtgcagagggaaaacacagattgttagtttttg 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| |||| ||    
T  26714100 tttcttgcagaagttagcatcattggaaggcttaaccacatgaatttgattggaatgtggggttattgtgctgagggaaaacataaattgttggtttatg 26714001  T
Q  101 agtacatggaaaaaggttctttagcggataatttctcatcaaatgcacttaattggggtaagaggtataaaattgctctcggaactgcaaagtgtcttgc 200  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||||| ||||| |||   |||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  26714000 agtacatggaaaatggtactttagctgataatctcttatcaaatgaacttgattggggaaagagatatggtattgctataggaactgcaaaatgtcttgc 26713901  T
Q  201 atatttacatgaagaatgtttggagtggattttgcattgtgacataaagccgcaaaacatactaattgactctgattaccaacccaaggtagcggatttt 300  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||| |||||| | ||| ||||| || ||||||    
T  26713900 ttatttacatgaagagtgtttggagtggattttgcattgcgatataaagccgcaaaacatacttgttgactatgattatcgacctaaggttgcagatttt 26713801  T
Q  301 gggttgtctaagttactacaaaggaacaatcttgataattcaagtttctcaaggatgagaggaacaagaggttacatggcacctgaatggattttcaact 400  Q
    || ||||||||| || |  |||||||  | | |||||||||||  |||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  26713800 ggtttgtctaagctattgaaaaggaatgagcatgataattcaaacttctcaaggattcgagggacacgaggttacatggcacctgaatgggttttcaaca 26713701  T
Q  401 tgccaatcacttccaaggtagatgtttatagctatggagttgtgctgctagagatgattaccgggaagagt 471  Q
    ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||    
T  26713700 tgcaaatcacttcaaaagtggatgtttatagctatggagttgtggtgttggagatgattaccggaaagagt 26713630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 26737336 - 26736866
Alignment:
Q  1 tttcttgctgaagttagcgtcattggaaggcttaaccacatgaatttgattggtatgtgggggtattgtgcagagggaaaacacagattgttagtttttg 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| |||| ||    
T  26737336 tttcttgcagaagttagcatcattggaaggcttaaccacatgaatttaattggaatgtggggttattgtgctgagggaaaacataaattgttggtttatg 26737237  T
Q  101 agtacatggaaaaaggttctttagcggataatttctcatcaaatgcacttaattggggtaagaggtataaaattgctctcggaactgcaaagtgtcttgc 200  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||   |||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  26737236 agtacatggaaaatggtactttagctgataatctctcatcaaatgaacttgattggggaaagagatatggtattgctataggaactgcaaaatgtcttgc 26737137  T
Q  201 atatttacatgaagaatgtttggagtggattttgcattgtgacataaagccgcaaaacatactaattgactctgattaccaacccaaggtagcggatttt 300  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| ||||| || ||||||    
T  26737136 ttatttacatgaagagtgtttggagtggattttgcattgcgatataaagccgcaaaacatacttgttgactctgattatcgacctaaggttgcagatttt 26737037  T
Q  301 gggttgtctaagttactacaaaggaacaatcttgataattcaagtttctcaaggatgagaggaacaagaggttacatggcacctgaatggattttcaact 400  Q
    || ||||||||| || |  | |||||  | | |||||||||||  |||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  26737036 ggtttgtctaagctattgaacaggaatgagcatgataattcaaacttctcaaggattcgagggacacgaggttacatggcacctgaatgggttttcaaca 26736937  T
Q  401 tgccaatcacttccaaggtagatgtttatagctatggagttgtgctgctagagatgattaccgggaagagt 471  Q
    ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| || ||||||    
T  26736936 tgcaaatcacttcaaaagtggatgtttatagctatggagttgtggtgttggagatgattacaggaaagagt 26736866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 26744347 - 26743877
Alignment:
Q  1 tttcttgctgaagttagcgtcattggaaggcttaaccacatgaatttgattggtatgtgggggtattgtgcagagggaaaacacagattgttagtttttg 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  |    
T  26744347 tttcttgctgaagtaagcatcattggaaggcttaaccacatgaacttaattggtatgtggggctattgtgctgagggaaaacatagattgttggtttacg 26744248  T
Q  101 agtacatggaaaaaggttctttagcggataatttctcatcaaatgcacttaattggggtaagaggtataaaattgctctcggaactgcaaagtgtcttgc 200  Q
    ||| ||||||||| ||| ||||||| |||||| | |||||||||  |||| ||||| |||| |||||||| |||||| | |||||||||||| | |||||    
T  26744247 agtgcatggaaaacggtactttagccgataatctttcatcaaataaacttgattggagtaaaaggtataacattgctatgggaactgcaaagggccttgc 26744148  T
Q  201 atatttacatgaagaatgtttggagtggattttgcattgtgacataaagccgcaaaacatactaattgactctgattaccaacccaaggtagcggatttt 300  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26744147 ttatttacacgaagaatgtttggagtggattttgcattgtgatataaagccgcaaaacatacttgttgactctgattaccaaccgaaggtagcggatttt 26744048  T
Q  301 gggttgtctaagttactacaaaggaacaatcttgataattcaagtttctcaaggatgagaggaacaagaggttacatggcacctgaatggattttcaact 400  Q
    || ||||| ||| || || | ||| || |  ||||| ||||||  ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  26744047 ggtttgtccaagctattaaatagggacgactttgatcattcaaaattctcgaggattcgagggacaagaggttacatggcacctgagtgggttttcaaca 26743948  T
Q  401 tgccaatcacttccaaggtagatgtttatagctatggagttgtgctgctagagatgattaccgggaagagt 471  Q
    ||  ||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  || | |||||||||||||| ||||||    
T  26743947 tggaaatcacttcaaaagtggatgtttatagctatggagtcgttgtgttggagatgattaccggaaagagt 26743877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 47212491 - 47212387
Alignment:
Q  21 cattggaaggcttaaccacatgaatttgattggtatgtgggggtattgtgcagagggaaaacacagattgttagtttttgagtacatggaaaaaggttct 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||| || | || | ||||| |||||| || ||||||    
T  47212491 cattggaaagcttaaccacatgaatttgattgaaatgtggggttattgtgcagagggaaaacatagaatgcttgtgtatgagttcatggataatggttct 47212392  T
Q  121 ttagc 125  Q
    |||||    
T  47212391 ttagc 47212387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 47212153 - 47212117
Alignment:
Q  359 gaggaacaagaggttacatggcacctgaatggatttt 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47212153 gaggaacaagaggttacatggcacctgagtggatttt 47212117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 47212304 - 47212252
Alignment:
Q  208 catgaagaatgtttggagtggattttgcattgtgacataaagccgcaaaacat 260  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  47212304 catgaagagtgtttggagtggattttgcattgtgatgtgaagccacaaaacat 47212252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 10)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 438
Target Start/End: Original strand, 21108145 - 21108563
Alignment:
Q  20 tcattggaaggcttaaccacatgaatttgattggtatgtgggggtattgtgcagagggaaaacacagattgttagtttttgagtacatggaaaaaggttc 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| ||||| || ||||||||| | ||| | || ||||  |||||||||||||| |||||    
T  21108145 tcattggaaggcttaatcacatgaatttgatcgaaatgtggggatattgcgctgagggaaaatatagactattggtttacgagtacatggaaaatggttc 21108244  T
Q  120 tttagcggataatttctcatcaaatgcacttaattggggtaagaggtataaaattgctctcggaactgcaaagtgtctt-gcatatttacatgaagaatg 218  Q
    |||||| || || || ||  | |||  |||| ||||| |||| ||||| ||||||| | |   ||  |||| | || || |||||| |||||||||||||    
T  21108245 tttagccgaaaacttatcggctaataaacttgattggagtaaaaggtacaaaattgttttatcaatagcaa-gagttttagcatatctacatgaagaatg 21108343  T
Q  219 tttggagtggattttgcattgtgacataaagccgcaaaacatactaattgactctgattaccaacccaaggtagcggattttgggttgtctaagttacta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||| ||| | | ||| |||||| |||| |||||||| ||||| ||| | | |    
T  21108344 tttggagtggattttgcattgtgatataaagccacaaaacatacttcttgattctaacttccagcccaagttagccgattttggattgtcaaagctgcaa 21108443  T
Q  319 caaaggaacaatcttgataattcaagtttctcaaggatgagaggaacaagaggttacatggcacctgaatggattttcaacttgccaatcacttccaagg 418  Q
     | |||||||| ||| |||||||| |  |||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||    
T  21108444 aacaggaacaaccttaataattcatgcatctcaatgattagaggaacaagagggtatatggcacctgaatggattttcaatttgccaataacatctaagg 21108543  T
Q  419 tagatgtttatagctatgga 438  Q
    | ||||||||||| ||||||    
T  21108544 tggatgtttatagttatgga 21108563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 438
Target Start/End: Original strand, 21098526 - 21098944
Alignment:
Q  20 tcattggaaggcttaaccacatgaatttgattggtatgtgggggtattgtgcagagggaaaacacagattgttagtttttgagtacatggaaaaaggttc 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| ||||| || ||||||||| | ||| | || ||||  |||||||||||||| |||||    
T  21098526 tcattggaaggcttaatcacatgaatttgatcgaaatgtggggatattgcgctgagggaaaatatagactattggtttacgagtacatggaaaatggttc 21098625  T
Q  120 tttagcggataatttctcatcaaatgcacttaattggggtaagaggtataaaattgctctcggaactgcaaagtgtctt-gcatatttacatgaagaatg 218  Q
    |||||| || || || ||  | |||  |||| ||||| |||| ||||| ||||||||| |   ||  | || | || || |||||| |||||||||||||    
T  21098626 tttagccgaaaacttatcggctaataaacttgattggagtaaaaggtacaaaattgctttatcaataggaa-gagttttagcatatctacatgaagaatg 21098724  T
Q  219 tttggagtggattttgcattgtgacataaagccgcaaaacatactaattgactctgattaccaacccaaggtagcggattttgggttgtctaagttacta 318  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||  |||| ||| | | | |||||||| ||||||||||||| ||||||||| | | |    
T  21098725 tttggaatggattttacattgtgatataaagccgcaaaatatacttcttgattctaacttcgaacccaagttagcggattttggattgtctaagctgcaa 21098824  T
Q  319 caaaggaacaatcttgataattcaagtttctcaaggatgagaggaacaagaggttacatggcacctgaatggattttcaacttgccaatcacttccaagg 418  Q
     | || ||||||||  | ||||||||| | || | ||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || || |    
T  21098825 aacagaaacaatctcaacaattcaagtgtatctatgattagaggaacaagagggtatatggccccagaatggattttcaatttgccaataacatctaaag 21098924  T
Q  419 tagatgtttatagctatgga 438  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21098925 tagatgtttatagctatgga 21098944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 21130705 - 21130226
Alignment:
Q  1 tttcttgctgaagttagcgtcattggaaggcttaaccacatgaatttgattggtatgtgggggtattgtgcagagggaaaacacagattgttagtttttg 100  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||  || || || || ||| | || || | ||    
T  21130705 tttcttgctgaagtaagcatcattgaaaagcttaaccacatgaatttgattgaaatgtggggatattgtgttgaaggtaagcatagaattttggtatatg 21130606  T
Q  101 agtacatggaaaaaggttctttagcggataatttctcatcaaatgc------acttaattggggtaagaggtataaaattgctctcggaactgcaaagtg 194  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||  |      |||| |||||  ||| |||||| | |||||| | ||||| || | | |    
T  21130605 agtacatggaaaatggttctttagcggaaaatctttcatccaaaaccaacacacttgattggactaaaaggtatgatattgctttaggaacagcta-gag 21130507  T
Q  195 tctt-gcatatttacatgaagaatgtttggagtggattttgcattgtgacataaagccgcaaaacatactaattgactctgattaccaacccaaggtagc 293  Q
    | || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  |||| ||| | |  || |||||| ||||    
T  21130506 ttttagcatatctacatgaagaatgtttggaatggattttgcattgtgatataaagcctcaaaatatacttcttgattctaactttcagcccaagttagc 21130407  T
Q  294 ggattttgggttgtctaagttactacaaaggaacaatcttgataa---ttcaagtttctcaaggatgagaggaacaagaggttacatggcacctgaatgg 390  Q
     |||||||| ||||||||| ||| | |  | |||||||| |||||   |||| | ||||||| ||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||    
T  21130406 cgattttggattgtctaagctacaaaatcgaaacaatctcgataatagttcaggattctcaatgattagaggaacacgaggatatatggcacctgagtgg 21130307  T
Q  391 attttcaacttgccaatcacttccaaggtagatgtttatagctatggagttgtgctgctagagatgattaccgggaagagt 471  Q
    |||||||| || ||||| || || || || ||||||||||| || || |||||  || |||||||||| ||||| ||||||    
T  21130306 attttcaatttaccaataacatctaaagtggatgtttatagttacggggttgtcgtgttagagatgataaccggaaagagt 21130226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 18658867 - 18658416
Alignment:
Q  1 tttcttgctgaagttagcgtcattggaaggcttaaccacatgaatttgattggtatgtgggggtattgtgcagagggaaaacacagattgttagtttttg 100  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| || || || || ||| | || || | ||    
T  18658867 tttcttgctgaagtaagcatcattggacggcttaaccacatgaacttgattgatatgtggggatattgtgctgaaggtaagcatagacttttggtatatg 18658768  T
Q  101 agtacatggaaaaaggttctttagcggataatttctcat------caaatgcacttaattggggtaagaggtataaaattgctctcggaactgc-aaagt 193  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||| | ||||      | ||  ||||| | ||| |||| |||||| | |||||| | ||||| || |||||    
T  18658767 agtacatggaaaatggatctttagctgaaaatctttcatctaaaactaacacacttgactggagtaaaaggtatgatattgctttaggaacagctaaagt 18658668  T
Q  194 gtcttgcatatttacatgaagaatgtttggagtggattttgcattgtgacataaagccgcaaaacatactaattgactctgattaccaacccaaggtagc 293  Q
     ||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||| ||| | |  || || ||| ||||    
T  18658667 -tctagcttatctacatgaagaatgtttggaatggattttgcattgtgatataaagcctcaaaacatacttcttgattctaactttcaccctaagttagc 18658569  T
Q  294 ggattttgggttgtctaagttactacaaaggaacaatct---tgataattcaagtttctcaaggatgagaggaacaagaggttacatggcacctgaatgg 390  Q
     |||||||| || |||||| |   |    | |||| |||   | ||||||||   ||||||| ||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||    
T  18658568 agattttggattatctaagctgaaaacccgaaacagtcttaataataattcagaattctcaatgattagaggaacaagaggatatatggcccctgagtgg 18658469  T
Q  391 attttcaacttgccaatcacttccaaggtagatgtttatagctatggagttgt 443  Q
    |||||||| |||||||| || || || || ||||||||| | ||||| |||||    
T  18658468 attttcaatttgccaataacatctaaagtggatgtttatggttatggggttgt 18658416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21123377 - 21123126
Alignment:
Q  195 tcttgcatatttacatgaagaatgtttggagtggattttgcattgtgacataaagccgcaaaacatactaattgactctgattaccaacccaaggtagcg 294  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  |||| ||| | |  ||||||||| ||||     
T  21123377 tcttgcttatctacatgaagaatgtatggagtggattttgcattgtgatataaagcctcaaaatatacttcttgattctaactttcaacccaagttagca 21123278  T
Q  295 gattttgggttgtctaagttactacaaaggaacaatct---tgataattcaagtttctcaaggatgagaggaacaagaggttacatggcacctgaatgga 391  Q
    |||||||| ||||||||| |   |   || ||||||||   | ||||||||   ||||||| ||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  21123277 gattttggattgtctaagctgaaaagcagaaacaatcttaataataattcagaattctcaatgattagaggaacaagaggatatatggcccctgaatgga 21123178  T
Q  392 ttttcaacttgccaatcacttccaaggtagatgtttatagctatggagttgt 443  Q
    ||| ||| || ||||| || || || || ||||||||||| ||||| |||||    
T  21123177 tttccaatttaccaataacatctaaagtggatgtttatagttatggggttgt 21123126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21111745 - 21111294
Alignment:
Q  1 tttcttgctgaagttagcgtcattggaaggcttaaccacatgaatttgattggtatgtgggggtattgtgcagagggaaaacacagattgttagtttttg 100  Q
    |||||||| ||||| ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||| |  |||||||| |||||||| || || || || ||| | || || | ||    
T  21111745 tttcttgccgaagtaagtatcattggacggcttaaccacatgaacttgatagaaatgtggggatattgtgctgaaggtaagcatagacttttggtatatg 21111646  T
Q  101 agtacatggaaaaaggttctttagcggataatttctcatcaaatgc------acttaattggggtaagaggtataaaattgctctcggaactgcaa-agt 193  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||| | ||||| ||  |      |||| ||||| |||| |||||| | |||||| | ||||| || | |||    
T  21111645 agtacatggaaaatggatctttagctgaaaatctttcatctaaaactaacacacttgattggagtaaaaggtatgatattgctttaggaacagctagagt 21111546  T
Q  194 gtcttgcatatttacatgaagaatgtttggagtggattttgcattgtgacataaagccgcaaaacatactaattgactctgattaccaacccaaggtagc 293  Q
     |||||| ||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||  |||| ||| | |  || |||||| ||||    
T  21111545 -tcttgcttatctacatgaagaatgtctcgaatggatattgcattgtgatataaagcctcaaaatatacttcttgattctaactttcagcccaagttagc 21111447  T
Q  294 ggattttgggttgtctaagttactacaaaggaacaatct---tgataattcaagtttctcaaggatgagaggaacaagaggttacatggcacctgaatgg 390  Q
     |||||||| ||||||||| |   |   || ||||||||   | ||||||||   ||||||| ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  21111446 agattttggattgtctaagctgaaaagcagaaacaatcttaataataattcagaattctcaatgattagaggaacaagaggatatatggcccctgaatgg 21111347  T
Q  391 attttcaacttgccaatcacttccaaggtagatgtttatagctatggagttgt 443  Q
    |||| ||| |  ||||| || || || || ||||||||||| ||||| |||||    
T  21111346 atttccaattcaccaataacatctaaagtggatgtttatagttatggggttgt 21111294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 29213252 - 29213149
Alignment:
Q  22 attggaaggcttaaccacatgaatttgattggtatgtgggggtattgtgcagagggaaaacacagattgttagtttttgagtacatggaaaaaggttctt 121  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||| || | ||||| |||| | || |||||||    
T  29213252 attggaaagcttaaccacatgaatttgattgaattgtggggttattgtgcagagggaatacatagaatgtttgtctatgagttcatgtataatggttctt 29213153  T
Q  122 tagc 125  Q
    ||||    
T  29213152 tagc 29213149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 421 - 453
Target Start/End: Original strand, 41814598 - 41814630
Alignment:
Q  421 gatgtttatagctatggagttgtgctgctagag 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41814598 gatgtttatagctatggagttgtgctgctagag 41814630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29213065 - 29213014
Alignment:
Q  209 atgaagaatgtttggagtggattttgcattgtgacataaagccgcaaaacat 260  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  29213065 atgaagagtgtttggagtggattttgcattgtgatgtgaagccacaaaacat 29213014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 363 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 29212911 - 29212879
Alignment:
Q  363 aacaagaggttacatggcacctgaatggatttt 395  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29212911 aacaagaggttacatggcacctgagtggatttt 29212879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 206 - 437
Target Start/End: Original strand, 39132242 - 39132476
Alignment:
Q  206 tacatgaagaatgtttggagtggattttgcattgtgacataaagccgcaaaacatactaattgactctgattaccaacccaaggtagcggattttgggtt 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||  |||| ||| | || ||||||||| |||| || ||||| ||    
T  39132242 tacatgaagaatgtttggagtggattttacattgtgatataaagcctcaaaatatacttcttgattctaactatcaacccaagttagcagactttggatt 39132341  T
Q  306 gtctaagttactacaaaggaacaatct---tgataattcaagtttctcaaggatgagaggaacaagaggttacatggcacctgaatggattttcaacttg 402  Q
    ||||||| |   | | || |||||| |   |  |||||||   ||||||| ||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||| ||     
T  39132342 gtctaagctgagaaatagaaacaatgtcaatagtaattcagaattctcaatgattagaggaacaagaggatatatggctcctgaatgggttttcaattta 39132441  T
Q  403 ccaatcacttccaaggtagatgtttatagctatgg 437  Q
    ||||| || || || || ||||||||||| |||||    
T  39132442 ccaataacatctaaagtggatgtttatagttatgg 39132476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 39132031 - 39132100
Alignment:
Q  1 tttcttgctgaagttagcgtcattggaaggcttaaccacatgaatttgattggtatgtgggggtattgtg 70  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||| || |||||||| || ||||  |||||||| |||||||    
T  39132031 tttcttgctgaagtaagcatcatcggaaggctcaatcacatgaacttaattgaaatgtggggatattgtg 39132100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University