View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21257_low_22 (Length: 250)

Name: NF21257_low_22
Description: NF21257
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21257_low_22
NF21257_low_22
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (4-242)||(32-273)
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (4-242)||(13675432-13675672)
chr8 (4-242)||(21986898-21987138)
chr8 (4-242)||(21996432-21996672)
chr8 (7-242)||(14893186-14893425)
chr8 (3-242)||(9324182-9324423)
chr8 (3-242)||(21334970-21335211)
chr8 (1-242)||(2689427-2689672)
chr8 (13-242)||(21201992-21202223)
chr8 (13-242)||(21212408-21212639)
chr8 (7-242)||(14880836-14881075)
chr8 (7-242)||(31998392-31998631)
chr8 (7-242)||(31990803-31991042)
chr8 (7-242)||(33773279-33773516)
chr8 (7-234)||(20530022-20530253)
chr8 (7-234)||(11429621-11429851)
chr8 (4-124)||(12900457-12900580)
chr8 (7-229)||(26361491-26361717)
chr8 (4-129)||(3988296-3988424)
chr8 (4-124)||(21461894-21462017)
chr8 (31-229)||(14438107-14438309)
chr8 (51-234)||(23014227-23014413)
chr8 (4-84)||(17269564-17269644)
chr8 (1-124)||(18537440-18537565)
chr8 (43-142)||(12840642-12840744)
chr8 (39-143)||(6760588-6760696)
chr8 (4-41)||(16582828-16582865)
chr8 (173-234)||(17269502-17269563)
[»] chr5 (45 HSPs)
chr5 (4-242)||(18208606-18208846)
chr5 (4-242)||(18217944-18218184)
chr5 (4-242)||(21682859-21683099)
chr5 (4-234)||(21754214-21754447)
chr5 (4-234)||(21763501-21763734)
chr5 (7-242)||(30942635-30942874)
chr5 (7-242)||(30952057-30952296)
chr5 (3-242)||(32071112-32071353)
chr5 (8-242)||(18361949-18362185)
chr5 (7-242)||(22172598-22172837)
chr5 (3-242)||(26191171-26191412)
chr5 (3-242)||(26201753-26201994)
chr5 (3-242)||(33939992-33940233)
chr5 (3-242)||(33950392-33950633)
chr5 (8-242)||(18390906-18391142)
chr5 (4-242)||(31917483-31917724)
chr5 (4-233)||(27578500-27578732)
chr5 (7-242)||(4037325-4037564)
chr5 (3-242)||(27412820-27413061)
chr5 (7-239)||(37818273-37818509)
chr5 (3-242)||(8764513-8764754)
chr5 (3-242)||(11410257-11410498)
chr5 (1-235)||(36317124-36317362)
chr5 (7-239)||(13571025-13571261)
chr5 (7-234)||(19887034-19887265)
chr5 (7-242)||(27273527-27273766)
chr5 (7-242)||(34129835-34130074)
chr5 (7-243)||(19781273-19781512)
chr5 (7-234)||(37646677-37646909)
chr5 (7-242)||(42089851-42090091)
chr5 (7-234)||(37537566-37537798)
chr5 (7-242)||(37298160-37298399)
chr5 (3-239)||(23376107-23376350)
chr5 (29-229)||(20948535-20948739)
chr5 (29-229)||(20958904-20959108)
chr5 (7-242)||(204813-205051)
chr5 (24-242)||(20897625-20897849)
chr5 (7-234)||(22245290-22245520)
chr5 (11-240)||(20807910-20808143)
chr5 (43-229)||(19547631-19547821)
chr5 (48-143)||(20904011-20904109)
chr5 (201-242)||(21754115-21754156)
chr5 (201-242)||(21763402-21763443)
chr5 (201-234)||(22245202-22245235)
chr5 (201-233)||(36317038-36317070)
[»] chr4 (69 HSPs)
chr4 (4-242)||(16250118-16250358)
chr4 (4-234)||(5292060-5292293)
chr4 (4-234)||(5301719-5301952)
chr4 (4-234)||(21846965-21847198)
chr4 (4-234)||(21856557-21856790)
chr4 (4-234)||(21902828-21903061)
chr4 (4-234)||(21912420-21912653)
chr4 (4-234)||(27679725-27679958)
chr4 (4-234)||(27689380-27689613)
chr4 (7-242)||(17827149-17827388)
chr4 (7-242)||(17836540-17836779)
chr4 (4-242)||(10422454-10422695)
chr4 (3-242)||(40922515-40922756)
chr4 (8-242)||(17984025-17984261)
chr4 (8-242)||(18104575-18104811)
chr4 (7-242)||(16630204-16630443)
chr4 (3-242)||(6692890-6693131)
chr4 (3-242)||(6703296-6703537)
chr4 (7-242)||(15670751-15670989)
chr4 (4-234)||(3486599-3486832)
chr4 (4-234)||(3495922-3496155)
chr4 (4-242)||(16253907-16254148)
chr4 (1-231)||(13792181-13792414)
chr4 (1-235)||(16059048-16059286)
chr4 (7-242)||(13401939-13402178)
chr4 (7-234)||(2830665-2830896)
chr4 (1-234)||(30652351-30652582)
chr4 (4-234)||(17144408-17144642)
chr4 (16-234)||(17162268-17162490)
chr4 (4-242)||(7845889-7846130)
chr4 (1-230)||(14599803-14600035)
chr4 (7-242)||(4837151-4837391)
chr4 (7-242)||(41526971-41527207)
chr4 (7-239)||(16210126-16210360)
chr4 (7-234)||(44889698-44889929)
chr4 (1-235)||(6404974-6405211)
chr4 (24-240)||(16397922-16398141)
chr4 (7-229)||(518842-519068)
chr4 (7-229)||(521348-521574)
chr4 (7-242)||(53945264-53945502)
chr4 (10-233)||(8841863-8842090)
chr4 (35-229)||(17420482-17420680)
chr4 (4-108)||(7843009-7843113)
chr4 (3-124)||(16081428-16081552)
chr4 (12-166)||(26459168-26459324)
chr4 (132-234)||(11477582-11477685)
chr4 (201-242)||(3486890-3486931)
chr4 (201-242)||(3486983-3487024)
chr4 (201-242)||(3496213-3496254)
chr4 (201-242)||(3496306-3496347)
chr4 (201-242)||(5292351-5292392)
chr4 (201-242)||(5292444-5292485)
chr4 (201-242)||(5302010-5302051)
chr4 (201-242)||(5302103-5302144)
chr4 (201-242)||(21846773-21846814)
chr4 (201-242)||(21846866-21846907)
chr4 (201-242)||(21856365-21856406)
chr4 (201-242)||(21856458-21856499)
chr4 (201-242)||(21902636-21902677)
chr4 (201-242)||(21902729-21902770)
chr4 (201-242)||(21912228-21912269)
chr4 (201-242)||(21912321-21912362)
chr4 (201-242)||(27680016-27680057)
chr4 (201-242)||(27680109-27680150)
chr4 (201-242)||(27689671-27689712)
chr4 (201-242)||(27689764-27689805)
chr4 (201-242)||(44889602-44889643)
chr4 (201-233)||(30652264-30652296)
chr4 (201-233)||(41526892-41526924)
[»] chr2 (50 HSPs)
chr2 (4-234)||(4459057-4459290)
chr2 (4-234)||(4468682-4468915)
chr2 (4-234)||(5345781-5346014)
chr2 (4-242)||(32935854-32936094)
chr2 (4-242)||(38929575-38929816)
chr2 (4-242)||(45015384-45015625)
chr2 (4-234)||(5335929-5336162)
chr2 (7-242)||(45191508-45191747)
chr2 (3-242)||(18651890-18652131)
chr2 (3-242)||(18664008-18664249)
chr2 (8-242)||(2997768-2998004)
chr2 (4-242)||(38956917-38957158)
chr2 (3-242)||(9501826-9502067)
chr2 (3-242)||(9513192-9513433)
chr2 (4-242)||(29424024-29424265)
chr2 (3-239)||(17489365-17489603)
chr2 (4-242)||(24695652-24695890)
chr2 (7-234)||(28451006-28451236)
chr2 (4-242)||(37862181-37862422)
chr2 (1-242)||(21109885-21110126)
chr2 (7-234)||(22678819-22679050)
chr2 (7-234)||(16901289-16901521)
chr2 (7-234)||(16994680-16994912)
chr2 (7-234)||(22671680-22671910)
chr2 (7-242)||(44637725-44637964)
chr2 (9-234)||(3604717-3604946)
chr2 (61-242)||(12571268-12571452)
chr2 (24-242)||(41025992-41026214)
chr2 (7-229)||(27159074-27159300)
chr2 (7-229)||(27169422-27169648)
chr2 (7-242)||(69243-69481)
chr2 (8-229)||(19342999-19343224)
chr2 (7-229)||(22907945-22908171)
chr2 (7-166)||(22902888-22903049)
chr2 (61-229)||(15474683-15474855)
chr2 (43-151)||(40408125-40408235)
chr2 (201-242)||(4458865-4458906)
chr2 (201-242)||(4458958-4458999)
chr2 (201-242)||(4468490-4468531)
chr2 (201-242)||(4468583-4468624)
chr2 (201-242)||(5336403-5336444)
chr2 (201-242)||(5346163-5346204)
chr2 (201-242)||(5346256-5346297)
chr2 (201-234)||(5336220-5336253)
chr2 (209-242)||(5336319-5336352)
chr2 (201-234)||(5346072-5346105)
chr2 (7-56)||(12580178-12580227)
chr2 (201-234)||(33432473-33432506)
chr2 (201-234)||(33432564-33432597)
chr2 (7-108)||(38461308-38461407)
[»] chr7 (57 HSPs)
chr7 (4-239)||(14946785-14947023)
chr7 (4-234)||(43984339-43984572)
chr7 (4-239)||(15374378-15374617)
chr7 (3-242)||(5927807-5928048)
chr7 (3-242)||(6535156-6535397)
chr7 (3-242)||(6545477-6545718)
chr7 (3-242)||(8501721-8501962)
chr7 (3-242)||(8512191-8512432)
chr7 (3-242)||(26307787-26308028)
chr7 (3-242)||(32099052-32099293)
chr7 (3-242)||(46497786-46498027)
chr7 (3-242)||(46508398-46508639)
chr7 (8-242)||(16131068-16131304)
chr7 (8-242)||(16141617-16141853)
chr7 (3-242)||(5380961-5381202)
chr7 (3-242)||(5390599-5390840)
chr7 (3-242)||(26304227-26304468)
chr7 (3-242)||(26362350-26362591)
chr7 (4-234)||(27989772-27990006)
chr7 (3-242)||(32109489-32109730)
chr7 (3-242)||(44897970-44898211)
chr7 (3-242)||(44908395-44908636)
chr7 (4-242)||(9534388-9534628)
chr7 (8-242)||(11625518-11625754)
chr7 (3-242)||(14247650-14247893)
chr7 (4-242)||(9544671-9544911)
chr7 (1-235)||(15987811-15988048)
chr7 (7-242)||(19586418-19586657)
chr7 (4-242)||(42621763-42622004)
chr7 (7-234)||(24539616-24539848)
chr7 (11-234)||(19800779-19801006)
chr7 (7-234)||(45554236-45554467)
chr7 (1-231)||(2991035-2991267)
chr7 (7-234)||(8340887-8341115)
chr7 (22-239)||(7018572-7018792)
chr7 (22-239)||(7033934-7034154)
chr7 (7-233)||(5614605-5614835)
chr7 (7-233)||(9007625-9007854)
chr7 (4-146)||(13130604-13130749)
chr7 (17-229)||(41028283-41028499)
chr7 (7-234)||(10416663-10416894)
chr7 (7-229)||(13284859-13285085)
chr7 (7-229)||(12826530-12826756)
chr7 (7-229)||(31825402-31825628)
chr7 (7-166)||(12088074-12088235)
chr7 (7-217)||(12574879-12575092)
chr7 (7-229)||(42596066-42596292)
chr7 (10-168)||(12492204-12492364)
chr7 (10-168)||(12516009-12516169)
chr7 (24-186)||(12770810-12770973)
chr7 (171-242)||(12492101-12492172)
chr7 (171-242)||(12515906-12515977)
chr7 (201-242)||(27989676-27989717)
chr7 (201-242)||(43984147-43984188)
chr7 (201-242)||(43984240-43984281)
chr7 (74-124)||(40703346-40703399)
chr7 (74-108)||(40703212-40703246)
[»] chr3 (44 HSPs)
chr3 (4-234)||(4372219-4372452)
chr3 (4-234)||(4381960-4382193)
chr3 (3-242)||(1684403-1684644)
chr3 (4-239)||(20492705-20492943)
chr3 (4-242)||(11140-11381)
chr3 (1-242)||(10507818-10508062)
chr3 (4-239)||(4023280-4023517)
chr3 (3-242)||(5654778-5655019)
chr3 (3-242)||(8973518-8973759)
chr3 (3-242)||(8984073-8984314)
chr3 (3-242)||(9537807-9538048)
chr3 (3-242)||(9548133-9548374)
chr3 (3-242)||(6433406-6433647)
chr3 (4-242)||(19827381-19827623)
chr3 (10-242)||(16334575-16334809)
chr3 (6-234)||(25433788-25434020)
chr3 (3-242)||(6422979-6423220)
chr3 (4-215)||(10002578-10002792)
chr3 (4-237)||(12386909-12387146)
chr3 (7-234)||(4781600-4781831)
chr3 (7-234)||(20293725-20293955)
chr3 (7-234)||(2488026-2488258)
chr3 (1-186)||(10507004-10507192)
chr3 (43-234)||(13118632-13118827)
chr3 (7-242)||(14801580-14801821)
chr3 (7-234)||(20743862-20744093)
chr3 (7-242)||(51977639-51977878)
chr3 (7-229)||(24872377-24872603)
chr3 (7-233)||(49386533-49386763)
chr3 (1-233)||(11459819-11460053)
chr3 (8-166)||(38817119-38817278)
chr3 (3-124)||(682961-683085)
chr3 (7-121)||(24773557-24773674)
chr3 (7-119)||(24814630-24814742)
chr3 (48-186)||(23503061-23503203)
chr3 (51-124)||(11043908-11043984)
chr3 (201-242)||(4372027-4372068)
chr3 (201-242)||(4372120-4372161)
chr3 (201-242)||(4381768-4381809)
chr3 (201-242)||(4381861-4381902)
chr3 (106-229)||(17734822-17734946)
chr3 (106-229)||(19036091-19036215)
chr3 (3-56)||(16697958-16698011)
chr3 (115-229)||(24794121-24794236)
[»] chr1 (40 HSPs)
chr1 (4-242)||(2369571-2369812)
chr1 (7-242)||(27066751-27066990)
chr1 (3-242)||(16155555-16155796)
chr1 (3-242)||(21459300-21459541)
chr1 (3-242)||(25020140-25020381)
chr1 (4-242)||(18384015-18384256)
chr1 (4-242)||(30548774-30549015)
chr1 (7-242)||(20315102-20315341)
chr1 (4-239)||(2117529-2117768)
chr1 (7-234)||(18096071-18096302)
chr1 (4-238)||(42034889-42035126)
chr1 (11-234)||(20316846-20317073)
chr1 (4-203)||(13965757-13965958)
chr1 (7-234)||(49336428-49336658)
chr1 (11-234)||(20327328-20327555)
chr1 (7-239)||(22961578-22961813)
chr1 (7-234)||(25038548-25038778)
chr1 (7-234)||(25043760-25043990)
chr1 (43-234)||(26192276-26192471)
chr1 (4-242)||(37013023-37013265)
chr1 (7-242)||(4951101-4951339)
chr1 (7-234)||(41542980-41543211)
chr1 (32-239)||(8540935-8541145)
chr1 (32-239)||(8606174-8606384)
chr1 (7-229)||(1973837-1974063)
chr1 (7-229)||(1988624-1988850)
chr1 (24-242)||(21793420-21793644)
chr1 (7-233)||(34823648-34823877)
chr1 (37-234)||(25822346-25822546)
chr1 (7-143)||(12420179-12420319)
chr1 (53-234)||(19747437-19747621)
chr1 (24-233)||(21820630-21820845)
chr1 (7-229)||(52948850-52949076)
chr1 (7-131)||(25868128-25868256)
chr1 (4-108)||(21904477-21904581)
chr1 (7-108)||(34000674-34000774)
chr1 (7-108)||(22957265-22957365)
chr1 (9-93)||(22959167-22959252)
chr1 (74-124)||(22892368-22892421)
chr1 (201-234)||(25822601-25822634)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (4-243)||(29541116-29541358)
chr6 (3-242)||(3286518-3286759)
chr6 (3-242)||(12455725-12455966)
chr6 (3-242)||(16898618-16898859)
chr6 (3-242)||(20912954-20913195)
chr6 (3-242)||(31358233-31358474)
chr6 (3-242)||(31367963-31368204)
chr6 (8-242)||(18160733-18160969)
chr6 (8-242)||(18170545-18170781)
chr6 (4-242)||(20968513-20968754)
chr6 (3-242)||(14792274-14792515)
chr6 (3-242)||(16909271-16909512)
chr6 (3-242)||(24930182-24930423)
chr6 (3-242)||(24921146-24921387)
chr6 (6-238)||(17826527-17826762)
chr6 (1-235)||(22222628-22222866)
chr6 (1-235)||(22248463-22248701)
chr6 (1-242)||(790170-790414)
chr6 (7-234)||(26019561-26019792)
chr6 (7-234)||(16322001-16322231)
chr6 (7-234)||(16334149-16334379)
chr6 (4-234)||(18202226-18202459)
chr6 (7-234)||(30657031-30657262)
chr6 (7-234)||(1597837-1598069)
chr6 (7-242)||(26169086-26169322)
chr6 (1-239)||(15504109-15504351)
chr6 (7-234)||(18705477-18705707)
chr6 (7-234)||(18711412-18711642)
chr6 (24-242)||(9034088-9034308)
chr6 (29-229)||(34766041-34766245)
chr6 (7-229)||(8562454-8562680)
chr6 (7-141)||(12989010-12989148)
chr6 (48-242)||(27786700-27786896)
chr6 (1-217)||(19363764-19363984)
chr6 (7-225)||(24692498-24692717)
chr6 (7-166)||(18335663-18335822)
chr6 (7-143)||(7753875-7754015)
chr6 (20-196)||(28093346-28093519)
chr6 (32-136)||(6314664-6314771)
chr6 (171-232)||(7754043-7754104)
chr6 (7-79)||(24502731-24502802)
chr6 (201-233)||(22222920-22222952)
chr6 (201-233)||(22248755-22248787)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (3-242)||(233144-233385)
scaffold0014 (4-243)||(147377-147619)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (6-242)||(73885-74124)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (3-242)||(6998-7239)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (7-242)||(19442-19680)
[»] scaffold0277 (1 HSPs)
scaffold0277 (3-242)||(18518-18760)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (4-242)||(92034-92275)
[»] scaffold0553 (1 HSPs)
scaffold0553 (10-242)||(1-237)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (12-242)||(309184-309416)
scaffold0005 (1-230)||(217343-217575)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (7-234)||(20212-20444)
scaffold0234 (201-242)||(20499-20540)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (4-242)||(8782-9023)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (4-242)||(162-403)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (48-242)||(55044-55241)
[»] scaffold0591 (2 HSPs)
scaffold0591 (1-239)||(1622-1865)
scaffold0591 (4-124)||(3-126)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (7-242)||(110926-111165)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (4-234)||(8816-9050)
[»] scaffold0811 (2 HSPs)
scaffold0811 (20-233)||(2477-2693)
scaffold0811 (201-233)||(2749-2781)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (1-242)||(27928-28172)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (24-242)||(6184-6406)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (3-239)||(16115-16358)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (4-239)||(1113-1351)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (7-234)||(28171-28402)
scaffold0058 (7-234)||(49375-49605)
[»] scaffold0313 (3 HSPs)
scaffold0313 (29-229)||(6453-6657)
scaffold0313 (29-229)||(10235-10439)
scaffold0313 (77-229)||(20610-20766)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (7-203)||(8131-8331)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (4-108)||(30811-30915)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (7-166)||(395017-395180)
[»] scaffold0265 (1 HSPs)
scaffold0265 (24-233)||(11964-12179)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (24-233)||(55320-55531)
scaffold0018 (24-233)||(59269-59480)
scaffold0018 (24-233)||(60697-60908)
[»] scaffold0308 (1 HSPs)
scaffold0308 (7-155)||(19727-19877)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (1-229)||(39721-39953)
[»] scaffold0015 (2 HSPs)
scaffold0015 (7-229)||(196550-196777)
scaffold0015 (9-93)||(189943-190028)
[»] scaffold0764 (1 HSPs)
scaffold0764 (78-229)||(1-156)
[»] scaffold0360 (1 HSPs)
scaffold0360 (26-166)||(1017-1158)
[»] scaffold0057 (2 HSPs)
scaffold0057 (48-108)||(67027-67087)
scaffold0057 (113-229)||(66229-66346)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (3-57)||(15085-15139)


Alignment Details
Target: scaffold0172 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 273 - 32
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  273 aattaaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 174  T
Q  104 ctatg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    |||||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  173 ctatggtgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 74  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  73 cttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 32  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13675672 - 13675432
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13675672 aattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 13675573  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  13675572 ctatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 13675474  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13675473 cttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 13675432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 21986898 - 21987138
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21986898 aattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 21986997  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  21986998 ctatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 21987096  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21987097 cttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 21987138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 21996432 - 21996672
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21996432 aattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 21996531  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  21996532 ctatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 21996630  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21996631 cttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 21996672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 14893186 - 14893425
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14893186 taaagagtatagggaagagagaataaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 14893285  T
Q  106 atg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
    |||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  14893286 atgatgcttgagataacctctcaaatcctacaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaatactgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 14893385  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14893386 tgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 14893425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Original strand, 9324182 - 9324423
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  9324182 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 9324281  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  9324282 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 9324380  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9324381 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 9324423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21335211 - 21334970
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21335211 aaataaaaaagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 21335112  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  21335111 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 21335013  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21335012 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 21334970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 2689427 - 2689672
Alignment:
Q  1 tgaaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagttt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  2689427 tgaaattaaagagtatagtgaagagagaaagaacacacaaagatttatagtggctcgcccaatgtgggctagtccacttctcacaatcttgtgaaagttt 2689526  T
Q  101 ccac---tatgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagc-catgtattctctaagccttggcaggctt 196  Q
    ||||   |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||  |||  |||    
T  2689527 ccactattatgcttgagataacctctcaaatcttgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaacacatgtattctctaatcctcagcatactt 2689626  T
Q  197 gtaccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2689627 gcaccttcttgctcagttacccacttagacttttacaaactttgct 2689672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 242
Target Start/End: Original strand, 21201992 - 21202223
Alignment:
Q  13 gtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---atgc 109  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||    
T  21201992 gtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgc 21202091  T
Q  110 ttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttcttggt 209  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |    
T  21202092 ttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgct 21202190  T
Q  210 aagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21202191 aagttaaccacttagacttttacaacctttgct 21202223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 242
Target Start/End: Original strand, 21212408 - 21212639
Alignment:
Q  13 gtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---atgc 109  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||    
T  21212408 gtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgc 21212507  T
Q  110 ttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttcttggt 209  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |    
T  21212508 ttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgct 21212606  T
Q  210 aagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21212607 aagttaaccacttagacttttacaacctttgct 21212639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 14880836 - 14881075
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14880836 taaagagtatagggaagagagaataaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 14880935  T
Q  106 atg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
    |||   |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  14880936 atgatgcttgagataacctctcaaattctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattatgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 14881035  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    | ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  14881036 tgttgctaagttaaccacttaaacttttacaacctttgct 14881075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 31998392 - 31998631
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31998392 taaagagtatagggaagagagaataaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagaatttccact 31998491  T
Q  106 atg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
    |||   |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||    |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  31998492 atgatgcttgagataacctctcaaatcctgcatcttacaatctttgttcacatgaacaattacaattctgtattctctaagcctcggcaggcttgcacct 31998591  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31998592 tgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 31998631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 31990803 - 31991042
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31990803 taaagagtatagggaagagagaataaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtctactcctcacaatcttgtgagagtttccact 31990902  T
Q  106 atg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
    |||   |||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  31990903 atgatgcttgagataacctctcaaatcctgcatcttacaatctctgttcacctgaacaattacaattctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 31991002  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31991003 tgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 31991042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 33773279 - 33773516
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||  ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33773279 taaagagtataaggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 33773378  T
Q  106 ---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
       ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||  ||   |||| ||||    
T  33773379 atgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattctgtattctctaagcctcagc--tcttgcacct 33773476  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33773477 tgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 33773516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Original strand, 20530022 - 20530253
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||   || ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20530022 taaagagtataagaaaaagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccact 20530121  T
Q  106 ---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
       |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    ||||||||||||||||   |||||||  ||||    
T  20530122 atgatgcttgagataacctatcaaatcctgcaccttacaatctttgttctcctgaacaattacaattctgtattctctaagcctcaacaggcttacacct 20530221  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20530222 tgttgctaagttaaccacttagacttttacaa 20530253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Original strand, 11429621 - 11429851
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11429621 taaagagtatagggaagagagaataaacacacagagatttatagtggttcccccaaggtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 11429720  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacctt 203  Q
      ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| | || |||||| |||| || ||    ||||||||||||||||  ||| ||||| ||| |    
T  11429721 tgatgcttgagataaccactcaaatcctgcaccttacaatttgtgctcacctgaacagttgcacatctgtattctctaagcctcagcaagcttgcaccat 11429820  T
Q  204 cttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
     ||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  11429821 gttgctaagttgaccacttagacttttacaa 11429851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Original strand, 12900457 - 12900580
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12900457 aattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 12900556  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctc 124  Q
    ||   |||||||||||||||||||    
T  12900557 ctatgatgcttgagataacctctc 12900580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 26361491 - 26361717
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  26361491 taaatagtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccacta 26361590  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc- 201  Q
      |||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| | |||||||||| | |||||||| | | |||||||||| |||||  ||||||||  |||     
T  26361591 tgatgcttaagataacttctcaaatcctgcaccttacaa-ccttgttcacctgagcaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacct 26361689  T
Q  202 ttcttggtaagttacccacttagacttt 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26361690 ttcttgctaagttacccacttagacttt 26361717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 3988424 - 3988296
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3988424 aattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 3988325  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatc 129  Q
    ||   ||||||||||||||||||| ||||    
T  3988324 ctatgatgcttgagataacctctcaaatc 3988296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 21462017 - 21461894
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21462017 aattaaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 21461918  T
Q  104 cta---tgcttgagataacctctc 124  Q
    |||   ||||||||||||||||||    
T  21461917 ctatggtgcttgagataacctctc 21461894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14438309 - 14438107
Alignment:
Q  31 gaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---atgcttgagataacctctcgaa 127  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||| ||||| | |||| ||    
T  14438309 gaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgctttagatatcttctcaaa 14438210  T
Q  128 tcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc-ttcttggtaagttacccacttaga 225  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||| | |||||||| | | |||||||||| |||||  ||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  14438209 tccttcaccttacaa-ccttgttcacctgatcaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttaga 14438111  T
Q  226 cttt 229  Q
    ||||    
T  14438110 cttt 14438107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 51 - 234
Target Start/End: Original strand, 23014227 - 23014413
Alignment:
Q  51 tggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatcttt 147  Q
    |||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  23014227 tggttcccccaacgtgggttagtcaactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgt 23014326  T
Q  148 gttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    |||||||| |||| |||||    |||||||| |||||||   |||||||| |||||  || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23014327 gttcacctgaacacttacaattctgtattctttaagcctcaacaggcttgcaccttgctgttaagttaaccacttagacttttacaa 23014413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 17269644 - 17269564
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcac 84  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17269644 aattaaagagtctagggaagagagaaagaacacacagcgatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcac 17269564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 18537565 - 18537440
Alignment:
Q  1 tgaaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagttt 100  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||  ||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||    
T  18537565 tgaaagtaaagagtataaggaagagaataagaacacacata-atttatagtggttcatccaatgtgggttaatccactcctcacaatcttgtgagaattt 18537467  T
Q  101 ccact---atgcttgagataacctctc 124  Q
    |||||   |||||||| ||||||||||    
T  18537466 ccactataatgcttgaaataacctctc 18537440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 142
Target Start/End: Original strand, 12840642 - 12840744
Alignment:
Q  43 atttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---atgcttgagataacctctcgaatcctacacctta 139  Q
    |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||| |||||| ||||||  ||||||    
T  12840642 atttatagtggttcacccaatgtgggttaatccactcctcacaatcttgtgagaatttccattatgatgcttgagataccctctcaaatcctgtacctta 12840741  T
Q  140 caa 142  Q
    |||    
T  12840742 caa 12840744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 6760696 - 6760588
Alignment:
Q  39 agagatttgtagtggttcaccc-aatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---atgcttgagataacctctcgaatcctaca 134  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| |||| | ||    
T  6760696 agagatttatagtggttcgccccaatgtgggttagtccactccttacaatcttgtgagagtttccactatgatgtttgagataacctctcaaatcatgca 6760597  T
Q  135 ccttacaat 143  Q
    | |||||||    
T  6760596 ctttacaat 6760588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 16582865 - 16582828
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacaga 41  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16582865 aattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacaga 16582828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 173 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17269563 - 17269502
Alignment:
Q  173 tattctctaagccttggcaggcttgtaccttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    |||||||||| |||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  17269563 tattctctaatcctcagcaggtttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaa 17269502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 45)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 18208606 - 18208846
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18208606 aattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 18208705  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  18208706 ctatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 18208804  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18208805 cttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 18208846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 18217944 - 18218184
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18217944 aattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 18218043  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  18218044 ctatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 18218142  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18218143 cttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 18218184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21683099 - 21682859
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21683099 aattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 21683000  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  21682999 ctatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcaacaggcttgcac 21682901  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21682900 cttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 21682859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21754447 - 21754214
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754447 aattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 21754348  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  21754347 ctatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 21754248  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21754247 cttcttgctaagttaaccacttagacttttacaa 21754214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21763734 - 21763501
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21763734 aattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 21763635  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  21763634 ctatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 21763535  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21763534 cttcttgctaagttaaccacttagacttttacaa 21763501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 30942635 - 30942874
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30942635 taaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 30942734  T
Q  106 atg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
    |||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  30942735 atgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatccttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 30942834  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30942835 tcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 30942874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 30952057 - 30952296
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30952057 taaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 30952156  T
Q  106 atg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
    |||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  30952157 atgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatccttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 30952256  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30952257 tcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 30952296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 32071353 - 32071112
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  32071353 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 32071254  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  32071253 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcatgtattctctaagcctcagcaggcttgca 32071155  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32071154 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 32071112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18362185 - 18361949
Alignment:
Q  8 aaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact-- 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||      
T  18362185 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 18362086  T
Q  106 -atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttc 204  Q
     ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  18362085 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctaaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 18361987  T
Q  205 ttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18361986 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 18361949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 22172598 - 22172837
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22172598 taaagagtatagggaagagagaataaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 22172697  T
Q  106 ---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
       ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  22172698 atgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 22172797  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22172798 tgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 22172837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Original strand, 26191171 - 26191412
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  26191171 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 26191270  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  26191271 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 26191369  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26191370 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 26191412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Original strand, 26201753 - 26201994
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  26201753 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 26201852  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  26201853 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 26201951  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26201952 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 26201994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 33940233 - 33939992
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  33940233 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 33940134  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  33940133 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 33940035  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33940034 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 33939992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 33950633 - 33950392
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  33950633 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 33950534  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  33950533 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 33950435  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33950434 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 33950392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18391142 - 18390906
Alignment:
Q  8 aaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact-- 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||      
T  18391142 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 18391043  T
Q  106 -atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttc 204  Q
     ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  18391042 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 18390944  T
Q  205 ttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18390943 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 18390906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 31917724 - 31917483
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  31917724 aattaaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccaatcctcacaatcttgtgagagttgcca 31917625  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  31917624 ctatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaaactttgttcacctgaacaattacaattctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 31917525  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31917524 cttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 31917483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 233
Target Start/End: Original strand, 27578500 - 27578732
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27578500 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacgcacaaagatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 27578599  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||| |||| ||    
T  27578600 ctaagatgcttgagataacctcttaaatcttgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaaccctgtattctctaagcctcagcagacttgcac 27578699  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttaca 233  Q
    ||| ||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  27578700 cttgttactaagttatccacttagacttttaca 27578732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 4037325 - 4037564
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4037325 taaagagtatagggaagagagaataaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 4037424  T
Q  106 ---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
       ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  4037425 atgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 4037524  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4037525 tgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 4037564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27413061 - 27412820
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27413061 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacctaatgtgggctagtccactcctcacaatcctgtgagagtttcc 27412962  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   |||||||||||||||| || | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  27412961 actaagatgcttgagataacctatcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 27412863  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27412862 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 27412820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 37818509 - 37818273
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37818509 taaagagtatagggaagagagaataaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 37818410  T
Q  106 ---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
       |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  37818409 atgatgcttgagagaacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 37818310  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaaccttt 239  Q
    | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37818309 tgttgctaagttaaccacttagacttttacaaccttt 37818273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Original strand, 8764513 - 8764754
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  8764513 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatatgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 8764612  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  8764613 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 8764711  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  8764712 ccttcttgctaagttaatcacttagacttttacaacctttgct 8764754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Original strand, 11410257 - 11410498
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  11410257 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcatccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 11410356  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  11410357 actaagatgcttgagatgacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 11410455  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11410456 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 11410498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 36317362 - 36317124
Alignment:
Q  1 tgaaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagttt 100  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36317362 tgaaaataaagaggatagggaagagaagaagaacacacaaagatttatagtggttcctccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagttt 36317263  T
Q  101 ccact---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca--tgtattctctaagccttggcaggct 195  Q
    |||||   ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||  |||||||    
T  36317262 ccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattac-gccaactgtattctctaagcctcagcaggct 36317164  T
Q  196 tgtaccttcttggtaagttacccacttagacttttacaac 235  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36317163 tgcatcttcttgctaagttacccacttagacttttacaac 36317124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 239
Target Start/End: Original strand, 13571025 - 13571261
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13571025 taaagagtatagggaagagagaataaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactccttacaatcttgtgagagtttccact 13571124  T
Q  106 ---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
       |||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  13571125 atgatgcttgagagaacctctcaaatcctgcaccttataatctttgttcacctgaacaattacaattctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 13571224  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaaccttt 239  Q
    | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13571225 tgttgctaagttaaccacttagacttttacaaccttt 13571261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Original strand, 19887034 - 19887265
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19887034 taaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcctct 19887133  T
Q  106 atg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
    |||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  19887134 atgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 19887233  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19887234 tgttgctaagttaaccacttagacttttacaa 19887265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 27273527 - 27273766
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27273527 taaagagtatagggaagagagaataaacacacaaagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcataatcttgtgagagtttccact 27273626  T
Q  106 atg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
    |||   |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  27273627 atgatgcttgagataacctctcaaattctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattttgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 27273726  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27273727 tgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 27273766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 34129835 - 34130074
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34129835 taaagaatatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcgtcacaatcttgtgagagtttccact 34129934  T
Q  106 atg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
    |||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  34129935 atgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatttttgttcacctgaacaactacaattatgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 34130034  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34130035 tgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 34130074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19781512 - 19781273
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19781512 taaagagtatagggaagagagaatcaacacacagaaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 19781413  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacctt 203  Q
      ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||| |||| |||||    ||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19781412 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcatcttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattttgtgttctctaagcctcggcaggcttgcacctt 19781313  T
Q  204 cttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgctt 243  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19781312 gttgctaagttaaccacttagactttcacaatctttgctt 19781273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Original strand, 37646677 - 37646909
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37646677 taaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttttgagagtttccact 37646776  T
Q  106 ---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagc-catgtattctctaagccttggcaggcttgtacc 201  Q
       ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||| |   ||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  37646777 atgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacattccttgttcacctgaacaattacaacatctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc 37646876  T
Q  202 ttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    || ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  37646877 ttgttgctaagttaaccacttagacttttacaa 37646909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 42089851 - 42090091
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtcca---ctcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| || |||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  42089851 taaagagtatagggaagagagaataaacacacagagatttatagtggttcccccgatgtgggttagtccagcactcctcacaatcttgtgagagtttcca 42089950  T
Q  104 ct--atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacc 201  Q
    ||  ||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||   |||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  42089951 cttgatgcttgagataacctcttaaatcctgcactttacagtctttgttcacctgaacacttacaattatgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc 42090050  T
Q  202 ttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    || ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  42090051 ttgttgctaagttaaccacttagacttttacaatctttgct 42090091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Original strand, 37537566 - 37537798
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37537566 taaagagtatagggaagagagaatcaacacatagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccatt 37537665  T
Q  106 ---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagc-catgtattctctaagccttggcaggcttgtacc 201  Q
       ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||| |   ||||||||||||||||  |||| |||| |||    
T  37537666 atgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacattccttgttcacctgaacaattacaacatctgtattctctaagcctcagcagacttgcacc 37537765  T
Q  202 ttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    || ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  37537766 ttgttgctaagttaaccacttagacttttacaa 37537798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 37298160 - 37298399
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||||  ||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37298160 taaagagtacagggaagagagaataaacacacgaagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 37298259  T
Q  106 ---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
       ||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||| |||||||||||| |||| ||| |    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  37298260 atgatgcttgagataaactctcaaatcatgcaccttacaaactttgttcacctgaacagttataattctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 37298359  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37298360 tattgataagttaaccacttagacttttacaacctttgct 37298399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 239
Target Start/End: Original strand, 23376107 - 23376350
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23376107 aaattaaagagtatagggaagagaagaagaacacacaaagatttatagtggttaacccaatatgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 23376206  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgt 198  Q
     ||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| || ||||| |||| | | |||||||||||||| |   ||||||||     
T  23376207 cctatgatgcttgagataacctctcaattcctgcaccttacaatc-ttgttcagctgaacaagtacaacaactgtattctctaagcgtcaacaggcttgc 23376305  T
Q  199 accttcttggtaagt----tacccacttagacttttacaaccttt 239  Q
     |||||||| |||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  23376306 tccttcttgctaagttacgtacccacttagacttttacaaccttt 23376350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20948739 - 20948535
Alignment:
Q  29 aagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---atgcttgagataacctctcg 125  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| ||||     
T  20948739 aagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 20948640  T
Q  126 aatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc-ttcttggtaagttacccactta 223  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||  ||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||    
T  20948639 aatcctacaccttacaa-ccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccactta 20948541  T
Q  224 gacttt 229  Q
    ||||||    
T  20948540 gacttt 20948535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20959108 - 20958904
Alignment:
Q  29 aagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---atgcttgagataacctctcg 125  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| ||||     
T  20959108 aagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 20959009  T
Q  126 aatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc-ttcttggtaagttacccactta 223  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||  ||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||    
T  20959008 aatcctacaccttacaa-ccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccactta 20958910  T
Q  224 gacttt 229  Q
    ||||||    
T  20958909 gacttt 20958904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 204813 - 205051
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 106  Q
    |||||||||||  |||||| |||  || |||||||  ||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  204813 taaagagtataaggaagagggaatcaatacacagaagtttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 204912  T
Q  107 ---tgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacctt 203  Q
       |||||||||||| ||||  | || | ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  204913 tgttgcttgagataatctcttaattcttgcaccttacaatctttgttctccttaacatttacaattttgtattctctaagcctcagcaggcttgcacctt 205012  T
Q  204 cttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
     ||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  205013 gttgctaagttaaccacttagaattttacaatctttgct 205051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 20897849 - 20897625
Alignment:
Q  24 agagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---atgcttgagataacc 120  Q
    |||||||||||||||| | | || || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||    
T  20897849 agagaaagaacacacaaaaagttatactggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgctttagataacc 20897750  T
Q  121 tctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaa-ttac-agccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac-cttcttggtaagttacc 217  Q
    |||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||||  ||||||||     
T  20897749 tctcaaatcttgcaccttacaatctttgttcacctgaacaatttacaaaacctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacttttcttactaagttaca 20897650  T
Q  218 cacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||||||||||| | ||||||    
T  20897649 cacttagacttttacaccttttgct 20897625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22245520 - 22245290
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 106  Q
    |||| ||||||| ||||||||||  |||||||| | |||| ||||||||| |||||||  || ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22245520 taaatagtatagggaagagagaataaacacacacaaatttatagtggttcccccaatgcgggttagtcaattcctcacaatcttatgagagtttccacta 22245421  T
Q  107 tg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacctt 203  Q
    ||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||| | || |||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  22245420 tgatgcttgagataacctctcaaatcatgcaccttacaatatgtgctcacctgaacacttacacctctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccat 22245321  T
Q  204 cttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22245320 gttgctaagttaaccacttagacttttacaa 22245290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20808143 - 20807910
Alignment:
Q  11 gagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttg-tagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatg- 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||  |||||||||  | ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||     
T  20808143 gagtatagggaagagagaatgaacacacataaattttatagtggttcctcgaatgtgggttagtccactcctcacactcttgtgagagtttccaccatga 20808044  T
Q  109 --cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttctt 206  Q
      |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||| |||| |||||    | ||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  20808043 tgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttagaatctgtattcacctgaacacttacaattctatattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgtt 20807944  T
Q  207 ggtaagttacccacttagacttttacaacctttg 240  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  20807943 gctaagttaaccacttagacttttacaatctttg 20807910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 43 - 229
Target Start/End: Original strand, 19547631 - 19547821
Alignment:
Q  43 atttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---atgcttgagataacctctcgaatcctacacctta 139  Q
    |||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  19547631 atttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctacacttta 19547730  T
Q  140 caatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc-ttcttggtaagttacccacttagacttt 229  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||| | | | |||||||| || ||  ||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19547731 caa-ccttgttcacctgaacaattacaacaactatattctcttagtctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagacttt 19547821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 143
Target Start/End: Original strand, 20904011 - 20904109
Alignment:
Q  48 tagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaat 143  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  20904011 tagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcccaatcttgtgaaagtttcaactatgatgcttgagataacctctcaaatccttcaccttacaat 20904109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21754156 - 21754115
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 21754115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21763443 - 21763402
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21763443 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 21763402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 201 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22245235 - 22245202
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22245235 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaa 22245202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 36317070 - 36317038
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttaca 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36317070 cttcttgctaagttacccacttagacttttaca 36317038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 69)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16250358 - 16250118
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16250358 aattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 16250259  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  16250258 ctatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 16250160  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16250159 cttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 16250118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Original strand, 5292060 - 5292293
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5292060 aattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 5292159  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  5292160 ctatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 5292259  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5292260 cttcttgctaagttaaccacttagacttttacaa 5292293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Original strand, 5301719 - 5301952
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5301719 aattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 5301818  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  5301819 ctatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 5301918  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5301919 cttcttgctaagttaaccacttagacttttacaa 5301952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21847198 - 21846965
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21847198 aattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 21847099  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  21847098 ctatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 21846999  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21846998 cttcttgctaagttaaccacttagacttttacaa 21846965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21856790 - 21856557
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21856790 aattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 21856691  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  21856690 ctatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 21856591  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21856590 cttcttgctaagttaaccacttagacttttacaa 21856557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21903061 - 21902828
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21903061 aattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 21902962  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  21902961 ctatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 21902862  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21902861 cttcttgctaagttaaccacttagacttttacaa 21902828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21912653 - 21912420
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21912653 aattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 21912554  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  21912553 ctatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 21912454  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21912453 cttcttgctaagttaaccacttagacttttacaa 21912420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Original strand, 27679725 - 27679958
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679725 aattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 27679824  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  27679825 ctatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 27679924  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  27679925 cttcttgctaagttaaccacttagacttttacaa 27679958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Original strand, 27689380 - 27689613
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27689380 aattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 27689479  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  27689480 ctatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 27689579  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  27689580 cttcttgctaagttaaccacttagacttttacaa 27689613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 17827149 - 17827388
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17827149 taaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 17827248  T
Q  106 atg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
    |||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  17827249 atgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatccttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 17827348  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17827349 tcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 17827388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 17836540 - 17836779
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17836540 taaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 17836639  T
Q  106 atg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
    |||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  17836640 atgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatccttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 17836739  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17836740 tcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 17836779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 10422695 - 10422454
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10422695 aattaaagagtatagagaagaatgaaagagcacacaaagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 10422596  T
Q  104 ctatg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
     ||||   |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  10422595 ttatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 10422496  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  10422495 cttcttgctaagttaaccacttagacttttataacctttgct 10422454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 40922756 - 40922515
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  40922756 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 40922657  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  40922656 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 40922558  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40922557 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 40922515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 17984025 - 17984261
Alignment:
Q  8 aaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact-- 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||      
T  17984025 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 17984124  T
Q  106 -atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttc 204  Q
     ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  17984125 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 17984223  T
Q  205 ttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17984224 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 17984261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 18104575 - 18104811
Alignment:
Q  8 aaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact-- 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||      
T  18104575 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 18104674  T
Q  106 -atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttc 204  Q
     ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  18104675 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 18104773  T
Q  205 ttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18104774 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 18104811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16630443 - 16630204
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16630443 taaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 16630344  T
Q  106 ---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
       ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  16630343 atgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 16630244  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16630243 tgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 16630204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 6693131 - 6692890
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6693131 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 6693032  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  6693031 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttctcctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 6692933  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6692932 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 6692890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 6703537 - 6703296
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6703537 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 6703438  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  6703437 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttctcctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 6703339  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6703338 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 6703296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15670989 - 15670751
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 106  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15670989 taaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcaccctatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 15670890  T
Q  107 tg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacctt 203  Q
    ||   |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  15670889 tgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacctt 15670790  T
Q  204 cttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
     ||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  15670789 gttgcttagttaaccacttagacttttacaacatttgct 15670751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Original strand, 3486599 - 3486832
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3486599 aattaaagagtatagagaagaaggaaatagcacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcta 3486698  T
Q  104 ctatg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    |||||   |||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  3486699 ctatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 3486798  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3486799 cttcttgctaagttaaccacttagacttttacaa 3486832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Original strand, 3495922 - 3496155
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3495922 aattaaagagtatagagaagaaggaaatagcacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcta 3496021  T
Q  104 ctatg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    |||||   |||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  3496022 ctatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 3496121  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3496122 cttcttgctaagttaaccacttagacttttacaa 3496155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16254148 - 16253907
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16254148 aattaaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtctactcctcacaattttgtgagagtttcca 16254049  T
Q  104 ctatg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    |||||   |||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  16254048 ctatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcacctcacaatctttgttcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 16253949  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16253948 cttgttgctaagttaactacttagacttttacaacctttgct 16253907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 13792181 - 13792414
Alignment:
Q  1 tgaaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagttt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13792181 tgaaattaaagagtatagggaagagaagaagaacacacaaagatttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagttt 13792280  T
Q  101 ccact---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattac-agccatgtattctctaagccttggcaggctt 196  Q
    |||||   ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| || |||||| |   |||||||||||||||||  ||||||||    
T  13792281 ccactatgatgcttgagataacctctcaaatcatgcaccttacaatc-ttgttcacctgaaaaattacaaaaaatgtattctctaagcctcagcaggctt 13792379  T
Q  197 gtaccttcttggtaagttacccacttagactttta 231  Q
    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13792380 gcaccttctttctaagttacccacttagactttta 13792414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16059286 - 16059048
Alignment:
Q  1 tgaaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagttt 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  16059286 tgaaattaaagagtataaggaagagagaaagaacacacaaagatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtaagaattt 16059187  T
Q  101 ccact---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca--tgtattctctaagccttggcaggct 195  Q
    |||||   ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||  |||||||    
T  16059186 ccactatgatgtttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattac-gccaactgtattctctaagcctcagcaggct 16059088  T
Q  196 tgtaccttcttggtaagttacccacttagacttttacaac 235  Q
    || ||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||    
T  16059087 tgcaccttctttctaagttacctatttagacttttacaac 16059048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 13401939 - 13402178
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||| ||||||| ||||| |  ||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13401939 taaaaagtatagggaagataagaagaacacacaaaaatttatagtggttcaccaaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 13402038  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
      ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| || |||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  13402039 cgatgcttgagataacctctcaaattccgcaccttacaatctttgttcaactgaacaattacaccaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 13402138  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13402139 tcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 13402178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2830896 - 2830665
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2830896 taaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 2830797  T
Q  106 atg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
    |||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  2830796 atgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatatgtgttcacctgaacacttacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 2830697  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  2830696 tgttgctaagttaaccacttagacttttacaa 2830665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30652582 - 30652351
Alignment:
Q  1 tgaaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagttt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30652582 tgaaattaaagagtatagggaagagagaaagaacactcaaagatttatagtggttcccccaatgttggttagtcaactcctcacaatcttgtgagagttt 30652483  T
Q  101 ccact---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca--tgtattctctaagccttggcaggct 195  Q
    |||||   ||| ||||||||||||||| |||      |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||| |  |||||||    
T  30652482 ccactatgatgtttgagataacctctcaaat------ccttgcaatctttgttcacctgaacaattac-gccaactgtattctctaagcatcagcaggct 30652390  T
Q  196 tgtaccttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30652389 tgtaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaa 30652351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17144642 - 17144408
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||  ||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17144642 aattaaagaatatagagaagaaggaaagagaacatagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagttttca 17144543  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    ||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| | | |||||||||||| |||  ||||||||| |    
T  17144542 ctacgatgcttgagataacctctcaaatcctacaccttacaatccttgttcaccggaacaattacaacaactgtattctctaaacctcagcaggcttgca 17144443  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    |||| ||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  17144442 ccttattgctaaggtaaccacttagacttttacaa 17144408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17162490 - 17162268
Alignment:
Q  16 tagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---atgcttg 112  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   |||||||    
T  17162490 tagagaagaaggaaagagcacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggatagtccactcctcataatcttctgagagtttccactatgatgcttg 17162391  T
Q  113 agataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttcttggtaa 211  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| |||    
T  17162390 agataacctatcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgaaccttgttgctaa 17162291  T
Q  212 gttacccacttagacttttacaa 234  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  17162290 gttaaccacttagacttttacaa 17162268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 7845889 - 7846130
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  7845889 aattaaagagtatagagaagagggaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttatgagagtttccc 7845988  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| | ||||||||| || | |||||    |||||| |||||||||  ||||| ||| ||    
T  7845989 ctatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatttatgttcacctgaatacttacaattctgtattttctaagcctcagcaggattgcac 7846088  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  7846089 cttgttgctaagttaaccacttaaacttttacaacctttgct 7846130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 14599803 - 14600035
Alignment:
Q  1 tgaaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagttt 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14599803 tgaaattaaagagtataaggaagaaagaaagaacacacaaatatttatagtggttcacctaatgtgggctggtccactcctcacaatcctatgagagttt 14599902  T
Q  101 ccactatg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttg 197  Q
    | ||||||   |||||||||||||||  |||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    | ||||||    
T  14599903 caactatgatacttgagataacctcttaaatcctgcatcttacaacctttgttcacctgaacaattataaccatgtattctctaagccacaactggcttg 14600002  T
Q  198 taccttcttggtaagttacccacttagactttt 230  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14600003 caccttcttgctaagttacccacttagactttt 14600035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 4837151 - 4837391
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttg-tagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  4837151 taaagagtatagggaagagagaatcaatacacagagattttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttctatt 4837250  T
Q  106 ---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc 201  Q
       ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||    ||||||||| |||    
T  4837251 atgatgtttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctctaagcaacagcaggcttgcacc 4837350  T
Q  202 ttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    || ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4837351 ttgtttctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 4837391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 41527207 - 41526971
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 106  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  41527207 taaagagtatagggaagagaagaagaacacacataaatttatagtggttcacccaatgt-ggttagtccacttctcacaatcttg--agagtttccacta 41527111  T
Q  107 tg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagc-catgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
    ||   ||  |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||   | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  41527110 tgatgctaaagataacctctcaaatcttgcaccttacaatctttgttcacctgaacagttacacaacctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 41527011  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41527010 tcttgctaagttacccacttagacttttacaatctttgct 41526971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 239
Target Start/End: Original strand, 16210126 - 16210360
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16210126 taaagagtatagggaagagagaataaacacaaagagatttatagtggttc-cccaatgtgggttagtccactcctctaaatcttgtgagagtttccacta 16210224  T
Q  107 tg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacctt 203  Q
    ||   |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  16210225 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgtaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacacctctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccat 16210324  T
Q  204 cttggtaagttacccacttagacttttacaaccttt 239  Q
     ||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  16210325 gttgctaagttaaccacttatacttttacaatcttt 16210360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 44889929 - 44889698
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||| |||| |||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44889929 taaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtagttcccccaatgggtgttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 44889830  T
Q  106 atg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
    |||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||| || |||| ||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  44889829 atgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatatgtgttcaactgaacacttacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 44889730  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  44889729 tgttgctaagttaaccacttagacttttacaa 44889698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 6404974 - 6405211
Alignment:
Q  1 tgaaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagttt 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||  || |||||||| |||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6404974 tgaaattaaatagtatagggaagagaagaaaaacacacaaagatttatagtggttcaaacaatatgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagttt 6405073  T
Q  101 ccact---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggctt 196  Q
    ||| |   ||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||| |||||||||| || ||||||| | | ||||||||||||||||  |||  |||    
T  6405074 ccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaaaaattacaacaattgtattctctaagcctcagcaatctt 6405172  T
Q  197 gtaccttcttggtaagttacccacttagacttttacaac 235  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6405173 gcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaac 6405211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16398141 - 16397922
Alignment:
Q  24 agagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---atgcttgagataacc 120  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||| ||||| |||||    
T  16398141 agagaaagaacacacagaaatttatagtggttcatccaatgtggtttagtccactcctcacgatcttgtgagagttttcactatgatgtttgaggtaacc 16398042  T
Q  121 tctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttcttggtaagttaccca 219  Q
    |||| |||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||  ||||| ||| |||||||||||    
T  16398041 tctcaaatcctgcactttacaatc-ttgttcacctgaacaattacatcaattgtattctctaagcctcagcaggcttacacctttttgctaagttaccca 16397943  T
Q  220 cttagacttttacaacctttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16397942 cttagacttttacaacctttg 16397922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 518842 - 519068
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  518842 taaatagtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccacta 518941  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc- 201  Q
      |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||  ||||||||  |||     
T  518942 tgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaa-ccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacct 519040  T
Q  202 ttcttggtaagttacccacttagacttt 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  519041 ttcttgctaagttacccacttagacttt 519068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 521348 - 521574
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  521348 taaatagtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccacta 521447  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc- 201  Q
      |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||  ||||||||  |||     
T  521448 tgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaa-ccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacct 521546  T
Q  202 ttcttggtaagttacccacttagacttt 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  521547 ttcttgctaagttacccacttagacttt 521574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 53945264 - 53945502
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  53945264 taaagagtatagggaagagagaataaacgcacagagatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 53945363  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacctt 203  Q
      ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   || ||||||||||| ||||| |  | ||||||||||||||  |||| |||| | | |    
T  53945364 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaattcgtgctcacctaaacacttacacctctttattctctaagcctcagcagacttgcatcat 53945463  T
Q  204 cttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
     ||  ||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  53945464 gtttctaagttgaccacttagacttttacaatctttgct 53945502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8842090 - 8841863
Alignment:
Q  10 agagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---a 106  Q
    ||||||||| |||||||  | |||||||| || |||| |||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |    
T  8842090 agagtatagggaagagaagatgaacacacggaaatttatagtggttcacccactatgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagttttcactatga 8841991  T
Q  107 tgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc-ttc 204  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||| |||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||  ||||||||  ||| |||    
T  8841990 tgcttgagataacctctcaaattctgcactttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttc 8841892  T
Q  205 ttggtaagttacccacttagacttttaca 233  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8841891 ttgctaagttacccacttagacttttaca 8841863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 229
Target Start/End: Original strand, 17420482 - 17420680
Alignment:
Q  35 acacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---atgcttgagataacctctcgaatcct 131  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||| ||||||    
T  17420482 acacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacagttttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcct 17420581  T
Q  132 acaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc-ttcttggtaagttacccacttagacttt 229  Q
     |||||||||| | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||  ||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17420582 gcaccttacaa-ccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagacttt 17420680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Original strand, 7843009 - 7843113
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7843009 aattaaagagtatagagaagagggaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 7843108  T
Q  104 ctatg 108  Q
    |||||    
T  7843109 ctatg 7843113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 124
Target Start/End: Original strand, 16081428 - 16081552
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16081428 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 16081527  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctc 124  Q
    |||   |||||||||||||||||||    
T  16081528 actaagatgcttgagataacctctc 16081552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 26459324 - 26459168
Alignment:
Q  12 agtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---atg 108  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||   |||    
T  26459324 agtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacagttttgtgagattttccactatgatg 26459225  T
Q  109 cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattaca 166  Q
     |||||||||| |||| |||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  26459224 tttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaa-ccttgttcacctgaacaattaca 26459168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11477685 - 11477582
Alignment:
Q  132 acaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagc-catgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttcttggtaagttacccacttagactttt 230  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  11477685 acaccttacgatctttgttcacttgaacaattacaactcatgtattctataagccttggcagacttgcaccttcttgctaagttacctacttacactttt 11477586  T
Q  231 acaa 234  Q
    ||||    
T  11477585 acaa 11477582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Original strand, 3486890 - 3486931
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3486890 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 3486931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Original strand, 3486983 - 3487024
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3486983 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 3487024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Original strand, 3496213 - 3496254
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3496213 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 3496254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Original strand, 3496306 - 3496347
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3496306 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 3496347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Original strand, 5292351 - 5292392
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5292351 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 5292392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Original strand, 5292444 - 5292485
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5292444 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 5292485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Original strand, 5302010 - 5302051
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5302010 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 5302051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Original strand, 5302103 - 5302144
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5302103 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 5302144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21846814 - 21846773
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21846814 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 21846773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21846907 - 21846866
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21846907 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 21846866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21856406 - 21856365
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21856406 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 21856365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21856499 - 21856458
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21856499 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 21856458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21902677 - 21902636
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21902677 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 21902636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21902770 - 21902729
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21902770 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 21902729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21912269 - 21912228
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21912269 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 21912228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21912362 - 21912321
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21912362 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 21912321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Original strand, 27680016 - 27680057
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27680016 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 27680057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Original strand, 27680109 - 27680150
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27680109 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 27680150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Original strand, 27689671 - 27689712
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27689671 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 27689712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Original strand, 27689764 - 27689805
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27689764 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 27689805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 44889643 - 44889602
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44889643 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 44889602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30652296 - 30652264
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttaca 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30652296 cttcttgctaagttacccacttagacttttaca 30652264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41526924 - 41526892
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttaca 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41526924 cttcttgctaagttacccacttagacttttaca 41526892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 50)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4459290 - 4459057
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4459290 aattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 4459191  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  4459190 ctatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttcacctgaacaattacaatcatgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 4459091  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  4459090 cttcttgctaagttaaccacttagacttttacaa 4459057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4468915 - 4468682
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4468915 aattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 4468816  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  4468815 ctatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 4468716  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  4468715 cttcttgctaagttaaccacttagacttttacaa 4468682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Original strand, 5345781 - 5346014
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5345781 aattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 5345880  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  5345881 ctatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatcttcgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 5345980  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5345981 cttcttgctaagttaaccacttagacttttacaa 5346014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 32935854 - 32936094
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32935854 aattaaagagtatatggaagagagaaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgaaagtttcca 32935953  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  32935954 ctatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 32936052  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32936053 cttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 32936094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 38929575 - 38929816
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38929575 aattaaagagtatagagaagaaggaaaaaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 38929674  T
Q  104 ctatg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    |||||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  38929675 ctatggtgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaactttgtattctctaagcctcaacaggcttgcac 38929774  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38929775 cttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 38929816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 45015625 - 45015384
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45015625 aattaaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 45015526  T
Q  104 cta---tgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    |||   |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| |  ||||||||| ||    
T  45015525 ctatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcttcagcaggcttgcac 45015426  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45015425 cttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 45015384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Original strand, 5335929 - 5336162
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5335929 aattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtctactcctcacaatcttgtgagagtttcca 5336028  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  5336029 ctatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatcttcgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 5336128  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5336129 cttcttgctaagttaaccacttagacttttacaa 5336162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 45191747 - 45191508
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45191747 taaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 45191648  T
Q  106 ---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
       ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  45191647 atgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 45191548  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45191547 tgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 45191508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18652131 - 18651890
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  18652131 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 18652032  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  18652031 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 18651933  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18651932 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 18651890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18664249 - 18664008
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  18664249 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 18664150  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  18664149 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 18664051  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18664050 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 18664008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 2997768 - 2998004
Alignment:
Q  8 aaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact-- 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||      
T  2997768 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 2997867  T
Q  106 -atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttc 204  Q
     ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  2997868 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 2997966  T
Q  205 ttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2997967 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 2998004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 38956917 - 38957158
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| || |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38956917 aattaaagagtatagagaagaaggagagaacacacagagaattatagtggttcatccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 38957016  T
Q  104 ctatg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    |||||   |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  38957017 ctatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 38957116  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  38957117 cttgttgctaagttaaccacttaaacttttacaacctttgct 38957158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Original strand, 9501826 - 9502067
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  9501826 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 9501925  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  9501926 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 9502024  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9502025 ccttcttgctaagttaatcacttagacttttacaacctttgct 9502067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Original strand, 9513192 - 9513433
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  9513192 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 9513291  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  9513292 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 9513390  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9513391 ccttcttgctaagttaatcacttagacttttacaacctttgct 9513433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29424265 - 29424024
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29424265 aattaaagagtatagagaagaaggaaagagcacacagataattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 29424166  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||| |||||||||||   |||||||| ||    
T  29424165 ctatgatgcttgagataacctctcaagtcatgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaactctgtactctctaagcctcaacaggcttgcac 29424066  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  29424065 cttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacatttgct 29424024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17489603 - 17489365
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  17489603 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 17489504  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | | ||||||||||||||  ||||||||| |    
T  17489503 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctatattctctaagcctcagcaggcttgca 17489405  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaaccttt 239  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17489404 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaccttt 17489365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 24695652 - 24695890
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  24695652 aattaaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccactc---acaatcttgtgagagtttcca 24695748  T
Q  104 ctatg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    |||||   |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  24695749 ctatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 24695848  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  24695849 cttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactttgct 24695890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28451236 - 28451006
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||| | |||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28451236 taaagagtatagggaagagagaatcaacacacataaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 28451137  T
Q  107 tg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacctt 203  Q
    ||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| | |||| ||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  28451136 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacatgaacacttacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacctt 28451037  T
Q  204 cttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  28451036 gttgctaagttaaccacttagacttttacaa 28451006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 37862181 - 37862422
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||  | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37862181 aattaaagagtatagagaagaaagaaagagcacacaaagaagtatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 37862280  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   ||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  37862281 ctatgatgcttgagatgacctctcaagtcctgcaccttacaatcattgttcacctgaacaattacaattctgtattctctaagcctcaacaggcttgcac 37862380  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||| ||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  37862381 ctttttgctaagttaaccactaaaacttttacaacctttgct 37862422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21110126 - 21109885
Alignment:
Q  1 tgaaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagttt 100  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||| ||| ||| |||    | |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21110126 tgaaattaaagagtataggaaaaagagaaggaatacaaaga----tttagtggttcacccaatgtggactagtccactcctcgcaatcttgtgagagttt 21110031  T
Q  101 ccactatg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagc-catgtattctctaagccttggcaggctt 196  Q
    | ||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||| ||||||||||| ||  ||||||||    
T  21110030 caactatgatgcttgagataacctctcaaatcctacaccttacaatctttgttcaactgaacaattacaacacatatattctctaagtctcagcaggctt 21109931  T
Q  197 gtaccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21109930 gcaccttcttgttaagttacccacttagacttttacaaactttgct 21109885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Original strand, 22678819 - 22679050
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22678819 taaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttccctcaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 22678918  T
Q  106 at---gcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
    ||   ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  22678919 ataatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatatgtgttcacctgaacacttacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 22679018  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22679019 tgttgctaagttaaccacttagacttttacaa 22679050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Original strand, 16901289 - 16901521
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16901289 taaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 16901388  T
Q  106 ---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc 201  Q
       ||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  16901389 atgatggttgagataacctctcaaatcctgcactttacaatccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc 16901488  T
Q  202 ttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    || ||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16901489 ttgttgctaagttaaccacttagaattttacaa 16901521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Original strand, 16994680 - 16994912
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16994680 taaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 16994779  T
Q  106 ---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc 201  Q
       ||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  16994780 atgatggttgagataacctctcaaatcctgcactttacaatccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc 16994879  T
Q  202 ttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    || ||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16994880 ttgttgctaagttaaccacttagaattttacaa 16994912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Original strand, 22671680 - 22671910
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22671680 taaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtcgttc-cccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 22671778  T
Q  106 at---gcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
    ||   ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  22671779 ataatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatatgtgttcacctgaacacttacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 22671878  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22671879 tgttgctaagttaaccacttagacttttacaa 22671910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 44637725 - 44637964
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagattt-gtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44637725 taaagagtatagggaagagagaatcaaaacatagagattttgtagtggttcccccaatgtgggttagcccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 44637824  T
Q  106 ---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
       ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| || |||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  44637825 ttgatgtttgagataacctctcaaatcctgcaccttaccatctgtgatcacctgaacacttacaacactgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 44637924  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44637925 tgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 44637964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 3604717 - 3604946
Alignment:
Q  9 aagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 107  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3604717 aagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 3604816  T
Q  108 g---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttc 204  Q
    |   |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |  |||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||  ||| ||||| |||||     
T  3604817 gatgcttgagataacctctcaaatcccgcaccttacaatatgcgttcacctgaacacttacaactttgtattctctaagcctcagcaagcttgcaccttg 3604916  T
Q  205 ttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3604917 ttgctaagttaaccacttagacttttacaa 3604946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 61 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12571452 - 12571268
Alignment:
Q  61 aatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaa 157  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12571452 aatgtgggttagtccactactcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctacaccttacaatctatgttcacctaa 12571353  T
Q  158 acaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||| |||||   |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  12571352 acacttacaattatgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaatctttgct 12571268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 242
Target Start/End: Original strand, 41025992 - 41026214
Alignment:
Q  24 agagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatg---cttgagataacc 120  Q
    ||||||||| | |||| ||| || |||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||   ||||||| ||||    
T  41025992 agagaaagagcgcacaaagagttatagtggttcatccaatgtgggttagtccactcttcacaatcttgcgagagtttccatcatgatgcttgagacaacc 41026091  T
Q  121 tctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccat-gtattctctaagccttggcaggcttgtaccttcttggtaagttaccca 219  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  41026092 tctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctaaacaattatatcaattgtattctctaagcctcatcaggcttgcaccttcttgctaagttaccca 41026191  T
Q  220 cttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  41026192 cttagacttttacaatctttgct 41026214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 27159074 - 27159300
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  27159074 taaatagtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccacta 27159173  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc- 201  Q
      |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||  ||||||||  |||     
T  27159174 tgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaa-ccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacct 27159272  T
Q  202 ttcttggtaagttacccacttagacttt 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  27159273 ttcttgctaagttacccacttagacttt 27159300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 27169422 - 27169648
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  27169422 taaatagtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccacta 27169521  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc- 201  Q
      |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||  ||||||||  |||     
T  27169522 tgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaa-ccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacct 27169620  T
Q  202 ttcttggtaagttacccacttagacttt 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  27169621 ttcttgctaagttacccacttagacttt 27169648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 69243 - 69481
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  69243 taaagagtgtatggaagagaagaagaacacacagagatttatagtggtttatccaatgttggctagtccactcctcacaatcttgtgagaatttcaacta 69342  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
      ||| ||||||||||||||| |||| | ||||||| |||  || ||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  69343 tgatgtttgagataacctctcaaatcatgcaccttaaaat-attattcacctgaacaattacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 69441  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  69442 tcttactaagttacccacttagaattttacaccctttgct 69481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19343224 - 19342999
Alignment:
Q  8 aaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact-- 105  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||      
T  19343224 aaagagtaaagagaagagaagaagaacacacataaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagatttttgactat 19343125  T
Q  106 -atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc-t 202  Q
     ||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||  ||| |    
T  19343124 gatgatttagataacttctcaaatcctacaccttacaa-ccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttacacctt 19343026  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttt 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19343025 tcttgctaagttacccacttagacttt 19342999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 22907945 - 22908171
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    ||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |     
T  22907945 taaagagtaaagagaggagaagaagaacacacataaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccatta 22908044  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc- 201  Q
      |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| | |||||||||| |  ||||||| | | |||||||||| |||||  ||||||||  |||     
T  22908045 tgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaa-ccttgttcacctgattaattacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacct 22908143  T
Q  202 ttcttggtaagttacccacttagacttt 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22908144 ttcttgctaagttacccacttagacttt 22908171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 22903049 - 22902888
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  22903049 taaatagtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccacta 22902950  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattaca 166  Q
      |||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  22902949 tgatgcttgagataacttctcaaatcatacacattacaa-ccttgttcacctgaacaattaca 22902888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 229
Target Start/End: Original strand, 15474683 - 15474855
Alignment:
Q  61 aatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaa 157  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||| |||||||||| |    
T  15474683 aatgtgggttagtccactccttacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcatgcaccttacaatc-ttgttcacctga 15474781  T
Q  158 acaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtac-cttcttggtaagttacccacttagacttt 229  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||| ||  ||  |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  15474782 acaattacaacaattgtattctctaagccttagcaggattacacttttcttgctaatttacccacttagacttt 15474855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 43 - 151
Target Start/End: Original strand, 40408125 - 40408235
Alignment:
Q  43 atttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---atgcttgagataacctctcgaatcctacacctta 139  Q
    |||| |||||||| |  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   ||| ||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  40408125 atttatagtggtttattcaatgtggtctagtccactcctcacaatcttgtgagattttccattatgatgtttgagataacctctcaactcctgcacctta 40408224  T
Q  140 caatctttgttc 151  Q
    ||| ||||||||    
T  40408225 caa-ctttgttc 40408235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4458906 - 4458865
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4458906 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 4458865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4458999 - 4458958
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4458999 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 4458958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4468531 - 4468490
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4468531 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 4468490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4468624 - 4468583
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4468624 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 4468583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Original strand, 5336403 - 5336444
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5336403 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 5336444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Original strand, 5346163 - 5346204
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5346163 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 5346204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Original strand, 5346256 - 5346297
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5346256 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 5346297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 201 - 234
Target Start/End: Original strand, 5336220 - 5336253
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5336220 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaa 5336253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 209 - 242
Target Start/End: Original strand, 5336319 - 5336352
Alignment:
Q  209 taagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5336319 taagttacccacttagacttttacaccctttgct 5336352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 201 - 234
Target Start/End: Original strand, 5346072 - 5346105
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5346072 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaa 5346105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 12580227 - 12580178
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttc 56  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  12580227 taaagagtatagggaagagagaatcaacacacagaaatttatagtggttc 12580178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 201 - 234
Target Start/End: Original strand, 33432473 - 33432506
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33432473 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaa 33432506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 201 - 234
Target Start/End: Original strand, 33432564 - 33432597
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33432564 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaa 33432597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 38461407 - 38461308
Alignment:
Q  7 taaagagtatagaga-agagagaa-agaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccac 104  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||| || || ||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  38461407 taaagagtatagagataga-agaatagaacacaca-agaattatattggttcatccaatgtggactaatccactcctcacaa--ctgtgagagtttccac 38461312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 57)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14947023 - 14946785
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14947023 aattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 14946924  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  14946923 ctatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaaactttattcacctgaacaattacaaccttgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 14946824  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaaccttt 239  Q
     || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14946823 tttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaccttt 14946785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 43984572 - 43984339
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43984572 aattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 43984473  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  43984472 ctatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatcttcgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 43984373  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  43984372 cttcttgctaagttaaccacttagacttttacaa 43984339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15374617 - 15374378
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15374617 aattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 15374518  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    ||   ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  15374517 ctatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatccttgttcacttgaacaattacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgca 15374418  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaaccttt 239  Q
    | || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15374417 cattgttgctaagttaaccacttagacttttacaaccttt 15374378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5928048 - 5927807
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  5928048 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 5927949  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  5927948 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 5927850  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5927849 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 5927807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 6535397 - 6535156
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6535397 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 6535298  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  6535297 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 6535199  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6535198 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 6535156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 6545718 - 6545477
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6545718 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 6545619  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  6545618 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 6545520  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6545519 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 6545477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8501962 - 8501721
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  8501962 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 8501863  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  8501862 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 8501764  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8501763 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 8501721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8512432 - 8512191
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  8512432 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 8512333  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  8512332 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 8512234  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8512233 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 8512191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26308028 - 26307787
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  26308028 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaaaagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 26307929  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  26307928 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctaaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 26307830  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26307829 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 26307787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 32099293 - 32099052
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  32099293 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 32099194  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  32099193 actaaaatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 32099095  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32099094 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 32099052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 46498027 - 46497786
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  46498027 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 46497928  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  46497927 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 46497829  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46497828 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 46497786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 46508639 - 46508398
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  46508639 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 46508540  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  46508539 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 46508441  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46508440 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 46508398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 16131068 - 16131304
Alignment:
Q  8 aaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact-- 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||      
T  16131068 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 16131167  T
Q  106 -atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttc 204  Q
     ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  16131168 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 16131266  T
Q  205 ttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16131267 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 16131304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 16141617 - 16141853
Alignment:
Q  8 aaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact-- 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||      
T  16141617 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 16141716  T
Q  106 -atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttc 204  Q
     ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  16141717 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 16141815  T
Q  205 ttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16141816 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 16141853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Original strand, 5380961 - 5381202
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  5380961 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaaaagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 5381060  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  5381061 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 5381159  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5381160 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 5381202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Original strand, 5390599 - 5390840
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  5390599 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaaaagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 5390698  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  5390699 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 5390797  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5390798 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 5390840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26304468 - 26304227
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  26304468 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaaaagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 26304369  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  26304368 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 26304270  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26304269 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 26304227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Original strand, 26362350 - 26362591
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  26362350 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaaaagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 26362449  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  26362450 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 26362548  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26362549 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 26362591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27990006 - 27989772
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27990006 aattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgcgttagtccactcctcacaatctcgtgagagtttcca 27989907  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    ||   ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  27989906 ctatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgca 27989807  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  27989806 ccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaa 27989772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 32109730 - 32109489
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  32109730 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 32109631  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  32109630 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 32109532  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  32109531 ccttcttgctaagttaaccacttagatttttacaacctttgct 32109489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 44898211 - 44897970
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  44898211 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 44898112  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  44898111 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 44898013  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  44898012 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaatctttgct 44897970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 44908636 - 44908395
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  44908636 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 44908537  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  44908536 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 44908438  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  44908437 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaatctttgct 44908395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 9534388 - 9534628
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    |||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9534388 aattaacgagtatagagaagaagaaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 9534487  T
Q  104 cta---tgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    |||   |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  9534488 ctatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 9534586  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9534587 cttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 9534628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 11625518 - 11625754
Alignment:
Q  8 aaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact-- 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||      
T  11625518 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 11625617  T
Q  106 -atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttc 204  Q
     ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  11625618 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 11625716  T
Q  205 ttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  11625717 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacttttgct 11625754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Original strand, 14247650 - 14247893
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14247650 aaattaaagagtgtagaaaagagagaaggaacacacaaatatttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttttgagagtttcc 14247749  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagc-catgtattctctaagccttggcaggcttgt 198  Q
    |||   ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| | | || ||||||||||| |  |||||||||     
T  14247750 actatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacttgaacaattacaacacctgaattctctaagcatcagcaggcttgc 14247849  T
Q  199 accttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14247850 accttcttgctaagatacccacttagacttttacaatctttgct 14247893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 9544671 - 9544911
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    |||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544671 aattaacgagtatagagaagaagaaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtctactcctcacaatcttgtgagagtttcca 9544770  T
Q  104 cta---tgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    |||   |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  9544771 ctatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 9544869  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9544870 cttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 9544911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 15987811 - 15988048
Alignment:
Q  1 tgaaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagttt 100  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15987811 tgaaaataaagagtatagggaagagaggaagaacacacaaagatttatagtggttcacccaatgtgagctagtccactcctcacaatcttgtgagagttt 15987910  T
Q  101 ccact---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggctt 196  Q
    | |||   ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||    
T  15987911 ctactatgatgtttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaat-gttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctctaagcctaagcaggctt 15988009  T
Q  197 gtaccttcttggtaagttacccacttagacttttacaac 235  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15988010 gcaccttcttgctaagttacccacttagaattttacaac 15988048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19586657 - 19586418
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19586657 taaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacattcttgtgagagtttccact 19586558  T
Q  106 atg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
    |||   |||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  19586557 atgatgcttgagataatctctcaaatcatgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 19586458  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19586457 tgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 19586418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 42622004 - 42621763
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||||| | ||| || ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42622004 aattaaagagtatagagaagaaggaaataacacatatagaattatagtggttcacccaacgtgtgctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 42621905  T
Q  104 ctatg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    |||||   |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  42621904 ctatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgttcatctgaacaataacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 42621805  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
     || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42621804 tttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 42621763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Original strand, 24539616 - 24539848
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24539616 taaatagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 24539715  T
Q  106 ---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagc-catgtattctctaagccttggcaggcttgtacc 201  Q
       ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |   ||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  24539716 atgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatccttgttcacctgaacaattacaacatctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc 24539815  T
Q  202 ttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    || ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24539816 ttgttgctaagttaaccacttagacttttacaa 24539848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19801006 - 19800779
Alignment:
Q  11 gagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---a 106  Q
    |||||||| ||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  19801006 gagtatagggaagaaagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatga 19800907  T
Q  107 tgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttctt 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  19800906 tgcttgagataacctctcaaatcctgcatcttacaatctttgttcacctgaacaattacaattctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgtt 19800807  T
Q  207 ggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19800806 gctaagttaaccacttagacttttacaa 19800779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 45554467 - 45554236
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45554467 taaagagtatagggaagagagaatcaacacacggagaatttatagtggttcccccaatgtaggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 45554368  T
Q  106 atg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
    |||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||    
T  45554367 atgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatatgtgttcacctgaacacttacaactctgtattctctaagtctcagcaggcttgcacct 45554268  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  45554267 tgttgctaagttaaccacttagacttttacaa 45554236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 2991035 - 2991267
Alignment:
Q  1 tgaaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagttt 100  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  2991035 tgaaattaatgagtatagggaagagagaaagaacacactaagatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactactcacaatattgtgagaattt 2991134  T
Q  101 ccactatg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagc-catgtattctctaagccttggcaggctt 196  Q
    ||||||||   |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||| | | | |||||  |||||||||  ||||||||    
T  2991135 ccactatgattcttgagataacctctcaaatcctacactttacaacctttgttcacttgaacaattataacacctgtat--tctaagcctcagcaggctt 2991232  T
Q  197 gtaccttcttggtaagttacccacttagactttta 231  Q
    | || |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  2991233 gcacattcttgctaagttacccacttagaatttta 2991267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8341115 - 8340887
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||| | |||| ||||||||| |||||||| || || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  8341115 taaagagtatagggaagagagaatcaacacacaaatatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcc--acaatcttgtgagagtttccacta 8341018  T
Q  107 tg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacctt 203  Q
    ||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  8341017 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattctctaaatcttggcaggcttgcacctt 8340918  T
Q  204 cttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  8340917 gttgataagttaaccacttagacttttacaa 8340887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 239
Target Start/End: Original strand, 7018572 - 7018792
Alignment:
Q  22 agagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgct---tgagataa 118  Q
    ||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |   ||||||||    
T  7018572 agagagagagaacacataaagatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgaaggtttccactatgatgtttgagataa 7018671  T
Q  119 cctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttcttggtaagttaccc 218  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || |||||||||||||   ||| |||| ||||| ||| ||||||| |     
T  7018672 cctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctcaacaattacaactctgcattctctaagcctcaacagtcttgcaccttattgctaagttaact 7018771  T
Q  219 acttagacttttacaaccttt 239  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  7018772 atttagacttttacaaccttt 7018792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 239
Target Start/End: Original strand, 7033934 - 7034154
Alignment:
Q  22 agagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgct---tgagataa 118  Q
    ||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |   ||||||||    
T  7033934 agagagagagaacacataaagatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgaaggtttccactatgatgtttgagataa 7034033  T
Q  119 cctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttcttggtaagttaccc 218  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || |||||||||||||   ||| |||| ||||| ||| ||||||| |     
T  7034034 cctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctcaacaattacaactctgcattctctaagcctcaacagtcttgcaccttattgctaagttaact 7034133  T
Q  219 acttagacttttacaaccttt 239  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  7034134 atttagacttttacaaccttt 7034154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 233
Target Start/End: Original strand, 5614605 - 5614835
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  5614605 taaatagtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccacta 5614704  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc- 201  Q
      |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||  | ||||||  |||     
T  5614705 tgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaa-ccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagtaggcttacacct 5614803  T
Q  202 ttcttggtaagttacccacttagacttttaca 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5614804 ttcttgctaagttacccacttagacttttaca 5614835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9007854 - 9007625
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||||||||||| |||||||  || |||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  9007854 taaagagtatagggaagagaagaataacacacaaagatttatagtggttcatccaatgtgggccagtccactcctcacaatcttgagagagtttccacta 9007755  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
      ||||||||||||||||||| |||| | ||| | |||| | |||||||  | |||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  9007754 tgatgcttgagataacctctcaaatcatgcacatgacaa-ccttgttcagttgaacaattacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 9007656  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttaca 233  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  9007655 tcttgttaagttacccacttagacttctaca 9007625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 13130749 - 13130604
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13130749 aattaaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttgca 13130650  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctt 146  Q
    ||   ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  13130649 ctatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctt 13130604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41028499 - 41028283
Alignment:
Q  17 agagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---atgcttga 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||    
T  41028499 agagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttga 41028400  T
Q  114 gataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc-ttcttggtaa 211  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||| | |  ||||||||| |||||  ||||||||  ||| |||||| |||    
T  41028399 gataacttctcaaatcctgcaccttacaa-ccttgttcacctgaacaattacaacaacagtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaa 41028301  T
Q  212 gttacccacttagacttt 229  Q
    ||||||||||||||||||    
T  41028300 gttacccacttagacttt 41028283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10416894 - 10416663
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||| | ||| |||||||||   ||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10416894 taaagaatgtagggaagagagactcaacacacggagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 10416795  T
Q  106 atg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
    |||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| |  | ||||||||||||||  |||| |||| ||||    
T  10416794 atgatgcttgagataacctctcaaatcatgcaccttacaatatgtgttcacctgaacacttacaactctatattctctaagcctcagcagtcttgcacct 10416695  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10416694 tgttgctaagttaaccacttagacttttacaa 10416663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 13284859 - 13285085
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| || |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  13284859 taaatagtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttataatggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccacta 13284958  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc- 201  Q
      |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||  ||||||||  |||     
T  13284959 tgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaa-ccttgttcacctgaacaattacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacct 13285057  T
Q  202 ttcttggtaagttacccacttagacttt 229  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||    
T  13285058 ttcttgatcagttacccacttagacttt 13285085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 12826530 - 12826756
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    ||||||||| ||| || |||  ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  12826530 taaagagtaaagataaaagaagaagaacacatagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactactcacaatcttgtgagattttccacta 12826629  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc- 201  Q
      |||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||  ||||| ||  |||     
T  12826630 tgatgcttgagataacttctcaaatcttgcaccttacaa-ccttgttcacctgaacaattacaacaattgtattctcttagcctcagcaggattacacct 12826728  T
Q  202 ttcttggtaagttacccacttagacttt 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  12826729 ttcttgctaagttacccacttagacttt 12826756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31825628 - 31825402
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  31825628 taaatagtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaattttgtgagattttccacta 31825529  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc- 201  Q
      |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||   | |||||||||| ||||   ||| ||||  |||     
T  31825528 tgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaa-ccttgttcacctgaacaattacaataactgtattctcttagccacagcaagcttacacct 31825430  T
Q  202 ttcttggtaagttacccacttagacttt 229  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  31825429 ttcttgctaagttaaccacttagacttt 31825402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 12088235 - 12088074
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    ||||||||| |||||||| |  ||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |     
T  12088235 taaagagtaaagagaagataagaagaacacacaaaaatttatagcggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccaata 12088136  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattaca 166  Q
      |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  12088135 agatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaa-ccttgttcacctgaacaattaca 12088074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12575092 - 12574879
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||||||||||  ||| ||||||  || |||||||||||| || |||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  12575092 taaagagtatatggaatagagaataaaaacacagagatttataatggttcccccaatgtgggttactccactcctcacgatcttgtgagagtttccacta 12574993  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
      ||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||| | | ||||||||| |||||| |  || |||| ||||    
T  12574992 tgatgtttgagataacctctcaaatcctgcactttacaatc-ttgttcacctgaacaattacatcaactgtattctccaagcctcgatagacttgcacct 12574894  T
Q  203 tcttggtaagttacc 217  Q
    ||||  |||||||||    
T  12574893 tctttttaagttacc 12574879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 42596292 - 42596066
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||| |||| ||||||||||  ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||| | |||||||| ||| ||||     
T  42596292 taaatagtaaagagaagagaagaagaacacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggtcagtctactcctcacagttttgtgagatttttcacta 42596193  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc- 201  Q
      |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| | |||||||| | |||||||||| | | |||||||||| |||||| | ||||||  |||     
T  42596192 tgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaa-ccttgttcacgtgaacaattacaacaactgtattctcttagccttagtaggcttacacct 42596094  T
Q  202 ttcttggtaagttacccacttagacttt 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  42596093 ttcttgctaagttacccacttagacttt 42596066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 12492364 - 12492204
Alignment:
Q  10 agagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---a 106  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||| | |||   |    
T  12492364 agagtatagggaagagagaataaacacacagagatttatagtggttcctccaatgtgggttactccactcctcacgatcttgtgagagttcctactatga 12492265  T
Q  107 tgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagc 168  Q
    || |||||||||||| || ||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12492264 tgtttgagataacctttcaaattctgcactttacaatc-ttgttcacctaaacaattacagc 12492204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 12516169 - 12516009
Alignment:
Q  10 agagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---a 106  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||| |||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||| |||||   |    
T  12516169 agagtatagggaagagagaataaacacacacagatttatagtggttcccccaatgtgggttactccactcctcacgatcttgtgagagttcccactatga 12516070  T
Q  107 tgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagc 168  Q
    || || |||||||||||| |||||  ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  12516069 tgtttaagataacctctcaaatcccgcactttacaatc-ttgttcacctgaacaattacagc 12516009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 12770973 - 12770810
Alignment:
Q  24 agagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---atgcttgagataacc 120  Q
    |||||||||||||| ||||  || ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  12770973 agagaaagaacacaaagag--ttatagtggttcacccgacatgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacc 12770876  T
Q  121 tctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagc-catgtattctctaagcct 186  Q
    |||| |||| | |||||||||| | |||||||||| |||| ||||| | | | ||||||||||||||    
T  12770875 tctcaaatcttgcaccttacaa-ccttgttcacctgaacagttacaacacctatattctctaagcct 12770810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 171 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12492172 - 12492101
Alignment:
Q  171 tgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  12492172 tgtattctctaagcctcggcatgcttgcagcttctttctaagttacccacttagtcttttacaatctttgct 12492101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 171 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12515977 - 12515906
Alignment:
Q  171 tgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  12515977 tgtattctctaagcctcggcatgcttgcagcttctttctaagttacccacttagtcttttacaatctttgct 12515906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27989717 - 27989676
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27989717 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 27989676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 43984188 - 43984147
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43984188 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 43984147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 43984281 - 43984240
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43984281 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 43984240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 40703399 - 40703346
Alignment:
Q  74 ccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---atgcttgagataacctctc 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  40703399 ccactcctcacaatcttgtgagaatttccactatgatgcttgagataacctctc 40703346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 40703246 - 40703212
Alignment:
Q  74 ccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40703246 ccactcctcacaatcttgtgagaatttccactatg 40703212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 44)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4372452 - 4372219
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4372452 aattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 4372353  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  4372352 ctatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatcttcgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 4372253  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  4372252 cttcttgctaagttaaccacttagacttttacaa 4372219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4382193 - 4381960
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4382193 aattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 4382094  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  4382093 ctatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatcttcgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 4381994  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  4381993 cttcttgctaagttaaccacttagacttttacaa 4381960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Original strand, 1684403 - 1684644
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  1684403 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 1684502  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||| |    
T  1684503 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcttgtattctctaagcctcggcaggcttgca 1684601  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1684602 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 1684644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20492943 - 20492705
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20492943 aattaaagagtataggaaagagagaaagaacacacagagatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 20492844  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  20492843 ctatgatgcttgagaaaacctctcaaatcctgcaccttacaaactttattcacctgaacaattacaaccttgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 20492744  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaaccttt 239  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20492743 cttgttgctaagttaaccacttagacttttacaatcttt 20492705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 11140 - 11381
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11140 aattaaaaagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 11239  T
Q  104 ctatg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    |||||   |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  11240 ctatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 11339  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  11340 cttgttgctaagttaaccacttagatttttacaacctttgct 11381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 10507818 - 10508062
Alignment:
Q  1 tgaaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagttt 100  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10507818 tgaaattaaagagtataagaaagagagaaagaacacacaaagatttataatggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagtgttt 10507917  T
Q  101 ccact---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttg 197  Q
    |||||   ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||   ||||  ||    
T  10507918 ccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgaaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaaccctgtattctctaagcctcaacaggtctg 10508017  T
Q  198 taccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10508018 caccttcttactaagttacccacttagacttttacaacctttgct 10508062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Original strand, 4023280 - 4023517
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  4023280 aattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagatttatagtggttcagccaatgtgggttagtccactcc-cacaatcttgagagagtttcca 4023378  T
Q  104 ctatgct---tgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||||| |   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  4023379 ctatgatatttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaataattacaaccctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 4023478  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaaccttt 239  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4023479 cttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaccttt 4023517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Original strand, 5654778 - 5655019
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  5654778 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 5654877  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  5654878 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 5654976  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5654977 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 5655019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8973759 - 8973518
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  8973759 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 8973660  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  8973659 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 8973561  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8973560 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 8973518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8984314 - 8984073
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  8984314 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 8984215  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  8984214 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 8984116  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8984115 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 8984073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9538048 - 9537807
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  9538048 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 9537949  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  9537948 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 9537850  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9537849 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 9537807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9548374 - 9548133
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  9548374 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 9548275  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  9548274 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 9548176  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9548175 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 9548133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 6433647 - 6433406
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6433647 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtaggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 6433548  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||| ||| |    
T  6433547 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggattgca 6433449  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6433448 ccttcttgctaagttagccacttagacttttacaacctttgct 6433406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 19827381 - 19827623
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19827381 aattaaagagtatagggaagagagaataaacacacagagaatttatagtggttcgcccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 19827480  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  19827481 actatgatgcttgagagaacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 19827580  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19827581 ccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 19827623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Original strand, 16334575 - 16334809
Alignment:
Q  10 agagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---a 106  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |    
T  16334575 agagtatagagaagaaggaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaaga 16334674  T
Q  107 tgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttctt 206  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  16334675 tgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttctt 16334773  T
Q  207 ggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16334774 gctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 16334809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25434020 - 25433788
Alignment:
Q  6 ttaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25434020 ttaaagagtatagagaagaaggaaagagcacacagagaattaaagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 25433921  T
Q  106 ---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc 201  Q
       ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  25433920 atgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatccttgttcacctgaacaattacaacaattgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc 25433821  T
Q  202 ttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
     | ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25433820 ctgttgctaagttacccacttaaacttttacaa 25433788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 6423220 - 6422979
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6423220 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 6423121  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||| |||||||||  ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  6423120 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcagcttacaatc-ttgttcaccagaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 6423022  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  6423021 ccttcttgctaagttagccacttagacttttacaacatttgct 6422979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 10002578 - 10002792
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10002578 aattaaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 10002677  T
Q  104 ctatg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    |||||   |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  10002678 ctatggtacttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 10002777  T
Q  201 cttcttggtaagtta 215  Q
    ||| ||| |||||||    
T  10002778 cttgttgctaagtta 10002792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12387146 - 12386909
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12387146 aattaaagagtatagggaagagagaataaaaacacagagatttatagtggttcacccaacgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 12387047  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattaca-gccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    ||   |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||   | ||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  12387046 ctatgatgcttgagataacctttcaaatcctacaccttacaatttttgttcacctgaacagttacacaacctgtattctctaagccttagcagtcttgca 12386947  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacct 237  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12386946 ccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacct 12386909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Original strand, 4781600 - 4781831
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4781600 taaagagtatagggaagagagaatcaacacacggagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 4781699  T
Q  106 ---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
       ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  4781700 atgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacagttacaattctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 4781799  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  4781800 tgttgctaagttaaccacttagacttttacaa 4781831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20293955 - 20293725
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20293955 taaagagtatagggaagagagaatcaacacacagaaatttatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 20293856  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacctt 203  Q
      ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||    ||||||||||||||||  ||||||||  |||||    
T  20293855 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattctctaagcctcagcaggcttacacctt 20293756  T
Q  204 cttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
     ||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20293755 gttgctaagttaaccacttagatttttacaa 20293725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Original strand, 2488026 - 2488258
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2488026 taaagagtatagggaagagagaatcaacacacggagaatttatagtggttcatccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 2488125  T
Q  106 ---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc 201  Q
       ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  2488126 atgatgcttgagataacctctcaaatcttgcaccttacaatccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc 2488225  T
Q  202 ttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    || ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  2488226 ttgttgctaagttaaccacttagacttttacaa 2488258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 10507004 - 10507192
Alignment:
Q  1 tgaaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagttt 100  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10507004 tgaaattaaagagtataagaaagagagaaagaacacacaaagatttataatggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagtgttt 10507103  T
Q  101 ccact---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagcct 186  Q
    |||||   ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10507104 ccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgaaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaaccctgtattctctaagcct 10507192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 234
Target Start/End: Original strand, 13118632 - 13118827
Alignment:
Q  43 atttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---atgcttgagataacctctcgaatcctacacctta 139  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  13118632 atttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacgtta 13118731  T
Q  140 caatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||| |||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  13118732 caatccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcacccggttgctaagttaaccacttagacttttacaa 13118827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 14801580 - 14801821
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||| || |||  ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14801580 taaagagtatagggaagagagaatcaacacacggaaattaatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 14801679  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattac---agccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
      ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||   |   ||||||| | |||||||   |||||||| ||    
T  14801680 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaataattatgtattgtgtaagcctcaacaggcttgcac 14801779  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  14801780 cttgttgctaagttaaccacttagacttttacaatctttgct 14801821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Original strand, 20743862 - 20744093
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||| ||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20743862 taaagagtatagggaagagaaaatcaacacacagacaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagttttcact 20743961  T
Q  106 atg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
    |||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| |  |||||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  20743962 atgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatatgtgttcacctgaacacttacaactctgtattttctaagcctcagcagtcttgcacct 20744061  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20744062 tgttgctaagttaaccacttagacttttacaa 20744093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 51977639 - 51977878
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttg-tagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51977639 taaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagattttatagtggttcccccaatgtgggttagttcactcctcacaatctagtgagagtttccact 51977738  T
Q  106 atg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
    |||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||| | ||||||||| ||||  |||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  51977739 atgatgcttgagataacctctcaaatcttgcaccttacaatttgtgttcacctgaacacctacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 51977838  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    | |||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  51977839 tgttgcggagttaaccatttagacttttacaacctttgct 51977878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 24872377 - 24872603
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||| |||| ||| ||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  24872377 taaatagtaaagaaaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccacta 24872476  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc- 201  Q
      |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||  ||||||||  |||     
T  24872477 tgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaa-ccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacct 24872575  T
Q  202 ttcttggtaagttacccacttagacttt 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24872576 ttcttgctaagttacccacttagacttt 24872603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 233
Target Start/End: Original strand, 49386533 - 49386763
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  49386533 taaatagtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccacta 49386632  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc- 201  Q
      ||| |||||||||| |||| |||| | |||||||||| | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||  ||| ||||  |||     
T  49386633 tgatgtttgagataacttctcaaatcatgcaccttacaa-ccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaagcttacacct 49386731  T
Q  202 ttcttggtaagttacccacttagacttttaca 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49386732 ttcttgctaagttacccacttagacttttaca 49386763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11460053 - 11459819
Alignment:
Q  1 tgaaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagttt 100  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||  ||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11460053 tgaaaataaagagtataaggaagagaagaagaacacacaaag-tttatagtggttcacccattgtgggttagtccacttctcacaatcttatgagagttt 11459955  T
Q  101 ccactatgct---tgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggctt 196  Q
     ||||||| |   |||||||||||||| |||||| || | |||||| || ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||    
T  11459954 tcactatgatgtttgagataacctctcaaatcctgcatcctacaatatt-gttcacctaaacaattacaacaactgtattctctaagcctcagcaggctt 11459856  T
Q  197 gtaccttcttggtaagttacccacttagacttttaca 233  Q
    | ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  11459855 gcaccttcttgctaagttacccgcttacacttttaca 11459819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Original strand, 38817119 - 38817278
Alignment:
Q  8 aaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact-- 105  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  38817119 aaagagtaaagagaagag--aaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggttagtccacttctcacaatcttgtgagagtttccactat 38817216  T
Q  106 -atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattaca 166  Q
     ||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38817217 gatgtttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattaca 38817278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 124
Target Start/End: Original strand, 682961 - 683085
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  682961 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 683060  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctc 124  Q
    |||   |||||||||||||||||||    
T  683061 actaagatgcttgagataacctctc 683085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 24773674 - 24773557
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    ||||||||||||  |||||||||  |||||||| | |||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24773674 taaagagtataggaaagagagaatcaacacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 24773575  T
Q  106 --atgcttgagataacct 121  Q
      ||||||||||||||||    
T  24773574 tgatgcttgagataacct 24773557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 24814742 - 24814630
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 106  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||   |||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24814742 taaagagtaaagagaagagaagaagaacacacatgaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactactcacaatcttgtgagattttccacta 24814643  T
Q  107 tgcttgagataac 119  Q
    || | ||||||||    
T  24814642 tgatggagataac 24814630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 186
Target Start/End: Original strand, 23503061 - 23503203
Alignment:
Q  48 tagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatc 144  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| ||||| ||| || |||  | ||||||||||||    
T  23503061 tagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagttttcactatgatgcttaagataccctatcaaattttgcaccttacaatc 23503160  T
Q  145 tttgttcacctaaacaattacagcca--tgtattctctaagcct 186  Q
     ||||||| || ||||||||||  ||  ||||||||||||||||    
T  23503161 -ttgttcatctgaacaattacaaacaactgtattctctaagcct 23503203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 124
Target Start/End: Original strand, 11043908 - 11043984
Alignment:
Q  51 tggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---atgcttgagataacctctc 124  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  11043908 tggttcacccaatatgggctaatccactcctcacaatcttatgagaattttcactataatgcttgagataacctctc 11043984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4372068 - 4372027
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4372068 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 4372027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4372161 - 4372120
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4372161 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 4372120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4381809 - 4381768
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4381809 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 4381768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4381902 - 4381861
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4381902 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgct 4381861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17734946 - 17734822
Alignment:
Q  106 atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgta-cctt 203  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||| | | |||||||||| |||||   |||||||  |   ||    
T  17734946 atgcttgagataacttctcaaatcctacaccttacaa-ccttgttcgcctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcaccaggcttacatattt 17734848  T
Q  204 cttggtaagttacccacttagacttt 229  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  17734847 cttgctaagttacccacttagacttt 17734822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19036215 - 19036091
Alignment:
Q  106 atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgta-cctt 203  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||| | | |||||||||| |||||   |||||||  |   ||    
T  19036215 atgcttgagataacttctcaaatcctacaccttacaa-ccttgttcgcctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcatcaggcttacattttt 19036117  T
Q  204 cttggtaagttacccacttagacttt 229  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  19036116 cttgctaagttacccacttagacttt 19036091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 56
Target Start/End: Original strand, 16697958 - 16698011
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttc 56  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  16697958 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttc 16698011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24794236 - 24794121
Alignment:
Q  115 ataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacctt-cttggtaag 212  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||| | | |||||| ||| |||||   |||||||  ||||| |||| ||||    
T  24794236 ataacttctcaaatcctgcaccttacaacctt-gttcacctgaacaattacaacaactgtattatcttagcctcatcaggcttacacctttcttgctaag 24794138  T
Q  213 ttacccacttagacttt 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  24794137 ttacccacttagacttt 24794121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 40)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 2369571 - 2369812
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2369571 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttatagtggttcacctaatgtggactagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 2369670  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   |||||| |||||||||||  |||| | ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  2369671 ctatgatgctttagataacctctaaaatcatgcaccttacaatttttgttcacgtgaacaattacaaatatgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 2369770  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2369771 cttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 2369812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27066990 - 27066751
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27066990 taaagagtatagggaagagagaataaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 27066891  T
Q  106 atg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
    |||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  27066890 atgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattatgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 27066791  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27066790 tgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 27066751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16155796 - 16155555
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16155796 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 16155697  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  ||| ||||| |    
T  16155696 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcatgtattctctaagcctcagcaagcttgca 16155598  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16155597 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 16155555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21459541 - 21459300
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21459541 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 21459442  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  21459441 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 21459343  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21459342 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 21459300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25020381 - 25020140
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25020381 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcctgtgagagtttcc 25020282  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  25020281 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 25020183  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  25020182 ccttcttgctaagttaacctcttagacttttacaacctttgct 25020140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18384256 - 18384015
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18384256 aattaaatagtataaggaagagagaaagaacacacacatatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcta 18384157  T
Q  104 ctatg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    |||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  18384156 ctatgatgcttgagataacctctcaaatcctacaccttacaatctttgttcacataaacaattacaactttgtattctctaagcctgagcaggcttgcac 18384057  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    | | ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18384056 catgttgctaagttaaccacttagacttttacaacatttgct 18384015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 30548774 - 30549015
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30548774 aattaaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtaagagtttcca 30548873  T
Q  104 cta---tgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    |||   |||||||||||||||||| | |||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||  |||| |||| ||    
T  30548874 ctatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcacataacaatctttgttcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcctaagcagacttgcac 30548973  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30548974 cttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 30549015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 20315341 - 20315102
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20315341 taaagagtatagggaagagagaataaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 20315242  T
Q  106 ---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
       ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  20315241 atgatgtttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 20315142  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20315141 tgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 20315102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2117768 - 2117529
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcgg-ctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2117768 aattaaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtggggctagtccacttctcacaatcttgtgagagtttcc 2117669  T
Q  103 actatg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    ||||||   |||||||||||||||| | |||| |||||| ||||| |||||||||| || ||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  2117668 actatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcacctttcaatccttgttcacctgaaaaattacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 2117569  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaaccttt 239  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2117568 ccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaccttt 2117529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Original strand, 18096071 - 18096302
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  18096071 taaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttgcacta 18096170  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattaca-gccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
      ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  18096171 tgatgtttgagataacctctcaaatcctgcaccttagaatctttgttcacctgaacaattacacaacttgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 18096270  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18096271 tgttgctaagttaaccacttagacttttacaa 18096302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 42035126 - 42034889
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagag-aaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42035126 aattaaagagtataaagaa-agaggaaagaacacacagagaattatagtagttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 42035028  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   |||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  42035027 actatgatgcttgagataacctttcaagtcctgcaccttacaatctttgttcaccagaacaattacaattctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 42034928  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctt 238  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  42034927 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttgcaacctt 42034889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Original strand, 20316846 - 20317073
Alignment:
Q  11 gagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatg- 108  Q
    |||||||| ||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  20316846 gagtatagggaagaaagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagttcccactatga 20316945  T
Q  109 --cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttctt 206  Q
      |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||    
T  20316946 tgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctaaacaattacaattctgtattctctatgcctcagcaggcttgcaccttgtt 20317045  T
Q  207 ggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20317046 gctaagttaaccacttagacttttacaa 20317073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 13965958 - 13965757
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  13965958 aattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacaaagatttatagtggttcagccaatgtgggttagtccactcc-cacaatcttgagagagtttcca 13965860  T
Q  104 ctatgct---tgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||||| |   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||    
T  13965859 ctatgataattgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaaccatgtattctctaagcctcagcaggtttgcac 13965760  T
Q  201 ctt 203  Q
    |||    
T  13965759 ctt 13965757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 49336658 - 49336428
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  49336658 taaagagtatagggaagagagaataaacacacagagatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 49336559  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacctt 203  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| || |||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  49336558 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgtaccttacaatctgtgctcacctgaacacttacacctctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccat 49336459  T
Q  204 cttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
     ||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  49336458 gttgctaagttgaccacttagacttttacaa 49336428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Original strand, 20327328 - 20327555
Alignment:
Q  11 gagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatg- 108  Q
    |||||||| ||||| ||||  |||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  20327328 gagtatagggaagaaagaatcaacacatagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagttcccactatga 20327427  T
Q  109 --cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttctt 206  Q
      |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||    
T  20327428 tgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattatgtattctctatgcctcagcaggcttgcaccttgtt 20327527  T
Q  207 ggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20327528 gctaagttaaccacttagacttttacaa 20327555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22961813 - 22961578
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||||||||||  ||||||||||  |||||||| | |||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22961813 taaagagtataaggaagagagaatcaacacacataaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 22961714  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacctt 203  Q
      ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||||  ||||||||| ||||     
T  22961713 tgatgtttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctaaacacttaccactctatattctctaagcctcagcaggcttgcaccta 22961614  T
Q  204 cttggtaagttacccacttagacttttacaaccttt 239  Q
     ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22961613 gttgctaagttaaccacttagacttttacaaccttt 22961578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Original strand, 25038548 - 25038778
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||||||||||  ||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25038548 taaagagtatatggaagagagaatcaacacacagaaatttatagtggttcccccaatgtgtgttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 25038647  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacctt 203  Q
      ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||    ||||||||||||||||   |||||||| |||||    
T  25038648 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattctctaagcctcaacaggcttgcacctt 25038747  T
Q  204 cttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
     ||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  25038748 gttgctaagttaaccacttagatttttacaa 25038778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Original strand, 25043760 - 25043990
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||||||||||  ||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25043760 taaagagtatatggaagagagaatcaacacacagaaatttatagtggttcccccaatgtgtgttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 25043859  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacctt 203  Q
      ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||| |||| |||||    ||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  25043860 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcatcttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattttgtgttctctaagcctcggcaggcttgcacctt 25043959  T
Q  204 cttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
     ||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  25043960 gttgctaagttaaccacttagatttttacaa 25043990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 43 - 234
Target Start/End: Original strand, 26192276 - 26192471
Alignment:
Q  43 atttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---atgcttgagataacctctcgaatcctacacctta 139  Q
    |||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  26192276 atttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctta 26192375  T
Q  140 caatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||| ||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26192376 caatccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccctgttgctaagttaaccacttagacttttacaa 26192471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 37013265 - 37013023
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttg-tagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||      |||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37013265 aattaaagagtatagggaagagagaaggaacacaatttttttttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 37013166  T
Q  103 acta---tgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgt 198  Q
    ||||   || |  |||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||||| | | ||||||||||||||||  |||||||||     
T  37013165 actacgatgttatagataacctctcaaatcctgcactttacaatctt-gttcacttgaacaattacatcaactgtattctctaagcctcagcaggcttgc 37013067  T
Q  199 accttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37013066 accttcttgttaagttacccacttagacttttacaacctttgct 37013023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4951339 - 4951101
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||| | |||| ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  4951339 taaagagtatagggaagagagaatcaacacacataaatttatagtggttcccctaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgaaagtttccacta 4951240  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacctt 203  Q
      ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  |||||||| |||| |||||    ||||||||||||||||  |||| |||| |||||    
T  4951239 tgatgcttgagataacctctcaaatcatgcaccttacaatctgagttcacctgaacacttacaattttgtattctctaagcctcagcagacttgcacctt 4951140  T
Q  204 cttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
     ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  4951139 gttgctaagttaaccacttagacttttacaatctttgct 4951101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Original strand, 41542980 - 41543211
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttg-tagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||  || |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41542980 taaagagtatagggaagagagaatcaacacacatagattttataatggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 41543079  T
Q  106 atgct---tgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
    ||| |   |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||| | |||| ||||  | |||||||||||||||||  | ||||||| ||||    
T  41543080 atgatgtttgagataacccctcaaatcctgcaccttacaatctatgttcacatgaacacttactactatgtattctctaagcctcagtaggcttgcacct 41543179  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  41543180 tgttgctaagttaaccacttagacttttacaa 41543211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8541145 - 8540935
Alignment:
Q  32 aacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta---tgcttgagataacctctcgaat 128  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||| |||    
T  8541145 aacacacagagatttatagaggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaagattgtgagagtttccactacgatgcttgagataacatctcaaat 8541046  T
Q  129 cctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttcttggtaagttacccacttagactt 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| |  |||| |||| ||||| ||| ||||||| | |||||||| |    
T  8541045 cctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcatcagcagacttgcaccttgttgctaagttaactacttagacgt 8540946  T
Q  229 ttacaaccttt 239  Q
    |||||||||||    
T  8540945 ttacaaccttt 8540935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8606384 - 8606174
Alignment:
Q  32 aacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta---tgcttgagataacctctcgaat 128  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||| |||    
T  8606384 aacacacagagatttatagaggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaagattgtgagagtttccactacgatgcttgagataacatctcaaat 8606285  T
Q  129 cctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttcttggtaagttacccacttagactt 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| |  |||| |||| ||||| ||| ||||||| | |||||||| |    
T  8606284 cctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcatcagcagacttgcaccttgttgctaagttaactacttagacgt 8606185  T
Q  229 ttacaaccttt 239  Q
    |||||||||||    
T  8606184 ttacaaccttt 8606174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 1973837 - 1974063
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||| |||| ||||||||||  ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  1973837 taaatagtaaagagaagagaagaagaacacacataaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccacta 1973936  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc- 201  Q
      |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||  ||||||||  |||     
T  1973937 tgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaa-ccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacct 1974035  T
Q  202 ttcttggtaagttacccacttagacttt 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1974036 ttcttgctaagttacccacttagacttt 1974063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 1988624 - 1988850
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||| |||| ||||||||||  ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  1988624 taaatagtaaagagaagagaagaagaacacacataaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccacta 1988723  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc- 201  Q
      |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||  ||||||||  |||     
T  1988724 tgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaa-ccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacct 1988822  T
Q  202 ttcttggtaagttacccacttagacttt 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1988823 ttcttgctaagttacccacttagacttt 1988850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21793644 - 21793420
Alignment:
Q  24 agagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---atgcttgagataacc 120  Q
    |||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||| ||||||||    
T  21793644 agagaaagaacacacaaaaagttatagtggttcacccaatgtggtttagtccactcctcacaatcttgtgggagtttccactatgatgctttagataacc 21793545  T
Q  121 tctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaa-ttac-agccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac-cttcttggtaagttacc 217  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||||  ||||||||     
T  21793544 tctcaaatcctacaccttacaatctttgttcacctgaacaatttacaaaacctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacttttcttattaagttaca 21793445  T
Q  218 cacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||||||||||| | ||||||    
T  21793444 cacttagacttttacaccttttgct 21793420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34823877 - 34823648
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||| || ||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||     
T  34823877 taaagagtatagagaagagaagaagaacacacaaaaatttatagtggttcatccaatgtgggttagtccatttctcacaatcttatgagagtttctacta 34823778  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
      ||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | | ||||||||||||||||   |||||||  ||||    
T  34823777 tgatgtttgagataaccgctcaaatcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaatgacaacaactgtattctctaagcctcaacaggcttacacct 34823679  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttaca 233  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  34823678 tcttgctaagttatccacttagacttttaca 34823648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 234
Target Start/End: Original strand, 25822346 - 25822546
Alignment:
Q  37 acagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatg---cttgagataacctctcgaatcctac 133  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |    
T  25822346 acagagatttatagtggttcctccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctctaatcttgc 25822445  T
Q  134 accttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttcttggtaagttacccacttagacttttaca 233  Q
    |||||||||| | || |||||| |||| || || |  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  25822446 accttacaatatgtgctcacctgaacacttgcacctctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgataagttaaccacttagactcttaca 25822545  T
Q  234 a 234  Q
    |    
T  25822546 a 25822546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 12420319 - 12420179
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12420319 taaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 12420220  T
Q  106 ---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaat 143  Q
       ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  12420219 atgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaat 12420179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 53 - 234
Target Start/End: Original strand, 19747437 - 19747621
Alignment:
Q  53 gttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgt 149  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||| | |||    
T  19747437 gttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataatctctcaaatcctgcactttacaatttgtgt 19747536  T
Q  150 tcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    |||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  19747537 tcacctgaacacttacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaggttaaccacttagacttttacaa 19747621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 233
Target Start/End: Original strand, 21820630 - 21820845
Alignment:
Q  24 agagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatg---cttgagataacc 120  Q
    ||||||||||||| || | | || ||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||    
T  21820630 agagaaagaacacgcaaaaagttatagtggtacacccaatgtgggttagtccactcctcccaatcttgtgaaagtttccactatgatacttgagataacc 21820729  T
Q  121 tctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaatt---acagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac-cttcttggtaagttac 216  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   ||| || ||||||||||||||||   |||||||| ||  |||||| ||||||||    
T  21820730 tctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaatttacacaacc-tgtattctctaagcctcaccaggcttgcacttttcttgctaagttac 21820828  T
Q  217 ccacttagacttttaca 233  Q
     |||||  |||||||||    
T  21820829 acacttctacttttaca 21820845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 52948850 - 52949076
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| | |||||||| |||||| |     
T  52948850 taaatagtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacagttttgtgagattttccatta 52948949  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc- 201  Q
      |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||  |||| |||  |||     
T  52948950 tgatgcttgagataacttctcaaattctgcaccttacaa-ccttgttcacctgaacaattacaacaattgtattctcttagcctcagcagacttacacct 52949048  T
Q  202 ttcttggtaagttacccacttagacttt 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  52949049 ttcttgctaagttacccacttagacttt 52949076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 25868256 - 25868128
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||| ||||||| ||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25868256 taaaaagtatagggaagagagaatcaacacacacagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtaagagtttccact 25868157  T
Q  106 ---atgcttgagataacctctcgaatcct 131  Q
       ||||||||||||||||||| ||||||    
T  25868156 atgatgcttgagataacctctcaaatcct 25868128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Original strand, 21904477 - 21904581
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||| |||||| ||  ||||||  |||| |||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21904477 aattaaagagtgtagagatgaaggaaagagaacacggagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 21904576  T
Q  104 ctatg 108  Q
    |||||    
T  21904577 ctatg 21904581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 34000774 - 34000674
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 106  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  34000774 taaagagtatagagaagagaagaagaacacacata-atttatagtggttcacccaatgtgggttagtctactcgtcacaatcttgtaagagtttccacta 34000676  T
Q  107 tg 108  Q
    ||    
T  34000675 tg 34000674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 22957365 - 22957265
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 106  Q
    |||||||||||   |||||| ||| |||||||| | |||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22957365 taaagagtataagaaagagaaaaataacacacata-atttatagtggttcatccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttgcacta 22957267  T
Q  107 tg 108  Q
    ||    
T  22957266 tg 22957265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 22959252 - 22959167
Alignment:
Q  9 aagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtg 93  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| || ||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  22959252 aagagtataaagaagagaaaaataacacacagagaatttataatggttcatccaatatgggttagtccactcctcacaatcttgtg 22959167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22892421 - 22892368
Alignment:
Q  74 ccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---atgcttgagataacctctc 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  22892421 ccactcctcacaatcttgtgagaatttccactatgatgcttgagataacctctc 22892368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 201 - 234
Target Start/End: Original strand, 25822601 - 25822634
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25822601 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaa 25822634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 29541358 - 29541116
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29541358 aattaaagagtatagagaagaaggaaagaacacatagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagttttca 29541259  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  29541258 ctatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 29541159  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgctt 243  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  29541158 cttcttgctaagttaaccacttagacttttagaacctttgctt 29541116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 3286759 - 3286518
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  3286759 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 3286660  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  3286659 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 3286561  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3286560 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 3286518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12455966 - 12455725
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  12455966 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 12455867  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  12455866 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 12455768  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12455767 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 12455725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16898859 - 16898618
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16898859 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 16898760  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  16898759 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 16898661  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16898660 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 16898618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 20913195 - 20912954
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  20913195 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 20913096  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  20913095 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 20912997  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20912996 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 20912954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 31358474 - 31358233
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  31358474 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 31358375  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  31358374 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 31358276  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31358275 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 31358233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 31368204 - 31367963
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  31368204 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 31368105  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  31368104 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 31368006  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31368005 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 31367963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18160969 - 18160733
Alignment:
Q  8 aaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact-- 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||      
T  18160969 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 18160870  T
Q  106 -atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttc 204  Q
     ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  18160869 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 18160771  T
Q  205 ttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18160770 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 18160733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18170781 - 18170545
Alignment:
Q  8 aaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact-- 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||      
T  18170781 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 18170682  T
Q  106 -atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttc 204  Q
     ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  18170681 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcttgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 18170583  T
Q  205 ttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18170582 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 18170545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 20968754 - 20968513
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20968754 aattaaagagtatagagaagaaggaaagaatacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 20968655  T
Q  104 cta---tgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    |||   |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  20968654 ctatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 20968555  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||| ||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  20968554 cttgtttctaagttaaccatttagacttttacaacctttgct 20968513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14792515 - 14792274
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  14792515 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggatagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 14792416  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  14792415 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 14792317  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14792316 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 14792274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16909512 - 16909271
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16909512 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 16909413  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  16909412 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgtttacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 16909314  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16909313 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 16909271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Original strand, 24930182 - 24930423
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24930182 aaataaaagagtatagagaggaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 24930281  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  24930282 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 24930380  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24930381 ccttcttgctaagttagccacttagacttttacaacctttgct 24930423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Original strand, 24921146 - 24921387
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24921146 aaataaaagagtatagagaggaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 24921245  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  24921246 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 24921344  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  24921345 ccttcttgctaagttagccacttagacttttacaacatttgct 24921387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17826762 - 17826527
Alignment:
Q  6 ttaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17826762 ttaaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 17826663  T
Q  106 ---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
       ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  17826662 atgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattataactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 17826563  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaacctt 238  Q
    | ||| ||| | | ||||||||| ||||||||||||    
T  17826562 tgttgctaaatgaaccacttagaattttacaacctt 17826527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 22222628 - 22222866
Alignment:
Q  1 tgaaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagttt 100  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22222628 tgaaaataaagagtatagggaagagaagaagaacgcacaaagatttatagtggttcccccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagagttt 22222727  T
Q  101 ccact---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca--tgtattctctaagccttggcaggct 195  Q
    |||||   ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||  |||||||    
T  22222728 ccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattac-gccaactgtattctctaagcctcagcaggct 22222826  T
Q  196 tgtaccttcttggtaagttacccacttagacttttacaac 235  Q
    || || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  22222827 tgcactttcttgctaagttacccacatagacttttacaac 22222866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 22248463 - 22248701
Alignment:
Q  1 tgaaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagttt 100  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22248463 tgaaaataaagagtatagggaagagaagaagaacgcacaaagatttatagtggttcccccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagagttt 22248562  T
Q  101 ccact---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca--tgtattctctaagccttggcaggct 195  Q
    |||||   ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||  |||||||    
T  22248563 ccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattac-gccaactgtattctctaagcctcagcaggct 22248661  T
Q  196 tgtaccttcttggtaagttacccacttagacttttacaac 235  Q
    || || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  22248662 tgcactttcttgctaagttacccacatagacttttacaac 22248701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 790170 - 790414
Alignment:
Q  1 tgaaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagttt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  790170 tgaaattaaagagtatagggaagagagaaaggacacacaaagatttatagtggttcctccaatgtgggttagtccactcctcacaattttgtgagagttt 790269  T
Q  101 ccact---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttg 197  Q
    |||||   ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | || |||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||    
T  790270 ccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatttgtgctcacctgaacacttacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttg 790369  T
Q  198 taccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
     | ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  790370 caacttgttgctaagttaaccacttagacttttacaatctttgct 790414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Original strand, 26019561 - 26019792
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26019561 taaagagtatagggaagagagaatcaacacacggagagtttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 26019660  T
Q  106 ---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
       ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  26019661 atgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacagttacaattctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 26019760  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26019761 tgttgctaagttaaccacttagacttttacaa 26019792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16322231 - 16322001
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 106  Q
    |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16322231 taaagagtataaggaagagagaataaacacacagagatttatggtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 16322132  T
Q  107 tg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacctt 203  Q
    ||   |||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||   |||||||| |||||    
T  16322131 tgatgcttgagataacctctcaaatcatgtaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattatgtattctctaagcctcaacaggcttgcacctt 16322032  T
Q  204 cttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16322031 gttgctaagttaaccacttagacttttacaa 16322001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16334379 - 16334149
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 106  Q
    |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16334379 taaagagtataaggaagagagaataaacacacagagatttatggtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 16334280  T
Q  107 tg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacctt 203  Q
    ||   |||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||   |||||||| |||||    
T  16334279 tgatgcttgagataacctctcaaatcatgtaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattatgtattctctaagcctcaacaggcttgcacctt 16334180  T
Q  204 cttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16334179 gttgctaagttaaccacttagacttttacaa 16334149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18202459 - 18202226
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    |||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||| || ||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18202459 aattaaagagtataggtaagagagaataaacacacagagaattatagtggtttccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 18202360  T
Q  104 ctatg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    |||||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| |||||||||  ||||||||| ||    
T  18202359 ctatgatgcttgagataacctctcaaatcttgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaactctgtattttctaagcctcagcaggcttgcac 18202260  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    ||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18202259 cttgttgctaatttaaccacttagacttttacaa 18202226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Original strand, 30657031 - 30657262
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30657031 taaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttccctcaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 30657130  T
Q  106 atg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
    |||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||  ||| ||||| ||||    
T  30657131 atgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatatgtgttcacctgaacacttacaaccctgtattctctaagcctcagcacgcttgcacct 30657230  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  30657231 tgttgctaagttaaccacttagacttttacaa 30657262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1598069 - 1597837
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598069 taaagagtatagggaagagagaatcaacacaccgagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 1597970  T
Q  106 ---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagc-catgtattctctaagccttggcaggcttgtacc 201  Q
       ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||| |   ||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  1597969 atgatgcttgagataacctctcaaaccctgcaccttacaatccttgttcacatgaacaattacaacatctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc 1597870  T
Q  202 ttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    || ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1597869 ttgttgctaagttaaccacttagacttttacaa 1597837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26169322 - 26169086
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  26169322 taaagagtatagggaagagagaataaacaca--gagatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtctccacta 26169225  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacctt 203  Q
      ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||| |||||    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  26169224 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatccgtgttctcctgaacacttacaattctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacctt 26169125  T
Q  204 cttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
     ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  26169124 gttgctaagttaaccacttagacttttacaatctttgct 26169086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15504351 - 15504109
Alignment:
Q  1 tgaaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagttt 100  Q
    ||||||||||||||| |   ||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||| ||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15504351 tgaaattaaagagtacatgcaagagagaaggaacacacaaagatttatagaggttcacctaatatgggctagtccacttcccacaatcttgtgagagttt 15504252  T
Q  101 ccact---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagc-catgtattctctaagccttggcaggctt 196  Q
    |||||   ||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  15504251 ccactatgatgcttgagataaccactcaaatcttgcaccttacaatctttgttcagctgaacaattacaacacatatattctctaagcctcagcaggctt 15504152  T
Q  197 gtaccttcttggtaagttacccacttagacttttacaaccttt 239  Q
      ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15504151 ccaccttcttgctaagttatccacttagacttttacaaacttt 15504109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Original strand, 18705477 - 18705707
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18705477 taaagagtatagggaagagagaataaacacacagaaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcaacta 18705576  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacctt 203  Q
      ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||    ||||||||||||||||  ||||| ||  |||||    
T  18705577 tgatgcttgagataacctctcaaatcttgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattctctaagcctcagcaggattacacctt 18705676  T
Q  204 cttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18705677 gttgctaagttaaccacttagacttttacaa 18705707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Original strand, 18711412 - 18711642
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18711412 taaagagtatagggaagagagaataaacacacagaaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcaacta 18711511  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacctt 203  Q
      ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||    ||||||||||||||||  ||||| ||  |||||    
T  18711512 tgatgcttgagataacctctcaaatcttgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattctctaagcctcagcaggtttacacctt 18711611  T
Q  204 cttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18711612 gttgctaagttaaccacttagacttttacaa 18711642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9034308 - 9034088
Alignment:
Q  24 agagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgct---tgagataacc 120  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |   ||||||||||    
T  9034308 agagaaagaacacacataaatttatagtggttcacccaatgtgagttagtccactccacacaatcttgtgggagtttccactatgatgtttgagataacc 9034209  T
Q  121 tctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttcttggtaagttacccac 220  Q
    |||| |||||| ||  |||||||||| |||| ||  |||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  9034208 tctcaaatcctgcaatttacaatctt-gttcgcccgaacaattacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttacccac 9034110  T
Q  221 ttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9034109 ttagacttttacaacctttgct 9034088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34766245 - 34766041
Alignment:
Q  29 aagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---atgcttgagataacctctcg 125  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| ||||     
T  34766245 aagaacacacataaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 34766146  T
Q  126 aatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc-ttcttggtaagttacccactta 223  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||  ||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||    
T  34766145 aatcctgcaccttacaa-ccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccactta 34766047  T
Q  224 gacttt 229  Q
    ||||||    
T  34766046 gacttt 34766041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 8562454 - 8562680
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| || |||||| |||||||| || |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||     
T  8562454 taaatagtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatattggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacagttttgtgagattttccacta 8562553  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc- 201  Q
      |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||  |||||||| ||||     
T  8562554 tgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaa-ccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttatacct 8562652  T
Q  202 ttcttggtaagttacccacttagacttt 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8562653 ttcttgctaagttacccacttagacttt 8562680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 141
Target Start/End: Original strand, 12989010 - 12989148
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12989010 taaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 12989109  T
Q  106 ---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttaca 141  Q
       ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  12989110 atgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttaca 12989148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 48 - 242
Target Start/End: Original strand, 27786700 - 27786896
Alignment:
Q  48 tagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatc 144  Q
    ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | || | |||||||||||     
T  27786700 tagtgattcatccaatatgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatacttgagataacctctcaactcttgcaccttacaat- 27786798  T
Q  145 tttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
     |||||||||| |||| ||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  27786799 attgttcacctgaacacttacaacgattgtattctctaagcctcagcaggcttgcacctt-ttgctaagttacccacttagactttcacaacatttgct 27786896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19363984 - 19363764
Alignment:
Q  1 tgaaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagttt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  19363984 tgaaagtaaagagtatagagaagagaagaagaacacacataaatttatagtggttcgcccaatgtgggttagtccacttctcacaatattgtgagagttt 19363885  T
Q  101 ccact---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagc-catgtattctctaagccttggcaggctt 196  Q
     ||||   ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |  ||||||||||| |||||  |||| |||    
T  19363884 tcactatgatgcttgagataacctctcaaatcatgcaccttacaatc-ttgttcgcctgaacaatttcaacaaatgtattctcttagcctcagcagactt 19363786  T
Q  197 gtacc-ttcttggtaagttacc 217  Q
     |||| |||||| |||||||||    
T  19363785 atacctttcttgctaagttacc 19363764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24692717 - 24692498
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    ||||||||| ||||||||||   |||||||||| | |||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  24692717 taaagagtaaagagaagaga---agaacacacataaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtcaactcctcacaatcttgtgagattttccacta 24692621  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc- 201  Q
      |||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| | |||||||||| |||||||||| | | |||| ||||| |||||  ||||||||  |||     
T  24692620 tgatgcttgagataacttctcaaatcatgcaccttacaa-ccttgttcacctgaacaattacaacaactgtactctcttagcctcagcaggcttacacct 24692522  T
Q  202 ttcttggtaagttacccacttaga 225  Q
    |||||| ||||||||| |||||||    
T  24692521 ttcttgctaagttacctacttaga 24692498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 18335822 - 18335663
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  18335822 taaagagta-agagaagagaaaaagaacacacagaaatttatagaggttcaaccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccacta 18335724  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattaca 166  Q
      |||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||    
T  18335723 tgatgcttaagataatttctcaaatcctacaccttacaacctt--ttcacctgaacaattaca 18335663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 143
Target Start/End: Original strand, 7753875 - 7754015
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacag-agatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||  | |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  7753875 taaagagtatagggaagagagaatcaacacacaacaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgtgagtttcctct 7753974  T
Q  106 ---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaat 143  Q
       ||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  7753975 atgatgttttagataacctctcaaatcctgcactttacaat 7754015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 28093519 - 28093346
Alignment:
Q  20 gaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---atgcttgagat 116  Q
    |||||||  ||||| ||||| | |||| |||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||||||    
T  28093519 gaagagaagaagaagacacataaatttatagtggttcacctaacatgggctaatccactcctcacaatcttgtgagaattttcactgtgatgcttgagat 28093420  T
Q  117 aacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggctt 196  Q
        |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||| || |||||||||    
T  28093419 ----tctcaaatcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaactacaacc-tgtattctctaagtctcggcaggctt 28093346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 136
Target Start/End: Original strand, 6314664 - 6314771
Alignment:
Q  32 aacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---atgcttgagataacctctcgaat 128  Q
    |||||||| | |||| |||| ||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||  ||||| |   |||||||||||| |||||| |||    
T  6314664 aacacacaaaaatttatagtagttcacccaatgtgggataatctactcctcacaatcttgtgagaaattccattatgatgcttgagataccctctcaaat 6314763  T
Q  129 cctacacc 136  Q
    ||| ||||    
T  6314764 cctgcacc 6314771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 232
Target Start/End: Original strand, 7754043 - 7754104
Alignment:
Q  171 tgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttcttggtaagttacccacttagacttttac 232  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  7754043 tgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttac 7754104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 79
Target Start/End: Original strand, 24502731 - 24502802
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactc 79  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  24502731 taaagagtatagggaagagagaatcaacacagaga-atttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactc 24502802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 233
Target Start/End: Original strand, 22222920 - 22222952
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttaca 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22222920 cttcttgctaagttacccacttagacttttaca 22222952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 233
Target Start/End: Original strand, 22248755 - 22248787
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttaca 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22248755 cttcttgctaagttacccacttagacttttaca 22248787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Original strand, 233144 - 233385
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  233144 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 233243  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  233244 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 233342  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  233343 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 233385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 147619 - 147377
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||   |    
T  147619 aattaaagagtatagagaagaaagaaagagcacacaaagaattatagtggttcatccaatgtcggttagtccactcctcacaatcttctgagagttatta 147520  T
Q  104 ctatgct---tgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||||| |   |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||   |||||||||||||||||  ||| ||||| ||    
T  147519 ctatgatgtttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgttcaactgaacaattacaattatgtattctctaagcctcagcatgcttgcac 147420  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgctt 243  Q
    |||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  147419 cttcctgctaagttaactacttagacttttacaacctttgctt 147377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Original strand, 73885 - 74124
Alignment:
Q  6 ttaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73885 ttaaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 73984  T
Q  106 atg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
    |||   |||||||||| ||||| | ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  73985 atggtgcttgagataatctctcaagtcctgaaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 74084  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  74085 tgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 74124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Original strand, 6998 - 7239
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6998 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 7097  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  7098 actaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttctcctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgca 7196  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7197 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 7239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19680 - 19442
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19680 taaagagtatagggaagagagaataaacacacagagatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 19581  T
Q  107 tgct---tgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacctt 203  Q
    || |   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||  | ||||||| |||||    
T  19580 tgatgcctgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattatgtattctctaagcctcagtaggcttgcacctt 19481  T
Q  204 cttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
     ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  19480 gttgctaagttaaccacttagacttttacaatctttgct 19442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Original strand, 18518 - 18760
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||| |||||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  18518 aaataaaagagtataaagaggaaggaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttcc 18617  T
Q  103 acta---tgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    ||||   |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  18618 actaagatgcttgagataacctctcaagtcccgcaccttacaatccttgttcacctgaacaattacaatcttgtattctctaagcctcagcaggcttgca 18717  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18718 ccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 18760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 92034 - 92275
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  92034 aattaaagagtaaagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgagctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 92133  T
Q  104 cta---tgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    |||   ||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  92134 ctatggtgcttgagataacctatcaagtcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattctgtattctctaagcctcagtaggcttgcac 92233  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  92234 cttgttgctaagttaactacttagacttttacaacctttgct 92275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Original strand, 1 - 237
Alignment:
Q  10 agagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact--- 105  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  1 agagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatg 100  T
Q  106 atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttct 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |    
T  101 atgcttgagataacctctcaaatcttgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattttgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgt 200  T
Q  206 tggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  201 tgctaagttaaccacttagtcttttacaacctttgct 237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 242
Target Start/End: Original strand, 309184 - 309416
Alignment:
Q  12 agtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---atg 108  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||    
T  309184 agtatatagaagaaagaaagaacacacaaagcgttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatg 309283  T
Q  109 cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttcttgg 208  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||     
T  309284 cttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcaacaggcttgcaccttcttgc 309382  T
Q  209 taagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  309383 taagttaaccacttagacttttacaacctttgct 309416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 217575 - 217343
Alignment:
Q  1 tgaaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagttt 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  217575 tgaaattaaagagtataaggaagaaagaaagaacacacaaatatttatagtggttcacctaatgtgggctggtccactcctcacaatcctatgagagttt 217476  T
Q  101 ccactatg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttg 197  Q
    | ||||||   |||||||||||||||  |||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    | ||||||    
T  217475 caactatgatacttgagataacctcttaaatcctgcatcttacaacctttgttcacctgaacaattataaccatgtattctctaagccacaactggcttg 217376  T
Q  198 taccttcttggtaagttacccacttagactttt 230  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  217375 caccttcttgctaagttacccacttagactttt 217343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Original strand, 20212 - 20444
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttg-tagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20212 taaagagtatagggaagagagaatcaacacgcagagattttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 20311  T
Q  106 ---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc 201  Q
       ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  20312 atgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc 20411  T
Q  202 ttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    || ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20412 ttgttgctaagttaaccacttagacttttacaa 20444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Original strand, 20499 - 20540
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20499 cttcttgctaagttacccacttatacttttacaacctttgct 20540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9023 - 8782
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9023 aattaaagagaatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtggactagtccactcctcacaatcttgtgagagttttca 8924  T
Q  104 cta---tgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    |||   || ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||  | || |||| ||    
T  8923 ctatggtgtttgagataacctctcaagtcctgcacctcacaatctttgttcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcctcagaagacttgcac 8824  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  8823 cttgttgctaagttaactacttagacttttacaacctttgct 8782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 162 - 403
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  162 aattaaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattattgtggttcacccaacgtgggctagtcaactcctcacaatcttgtgagagtttcca 261  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||| | |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||  |  || |||||| ||    
T  262 ctatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcatcttacaatatttgttcacctaaacaattacaactctgtattctctaaggttcagctggcttgcac 361  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||| ||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  362 cttgtttctaagttaaccacttagacatttacaacctttgct 403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 48 - 242
Target Start/End: Original strand, 55044 - 55241
Alignment:
Q  48 tagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatc 144  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  55044 tagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatc 55143  T
Q  145 tttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||  |||| |||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  55144 tttgttcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcctcagcagacttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgct 55241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0591 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0591
Description:

Target: scaffold0591; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1865 - 1622
Alignment:
Q  1 tgaaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagttt 100  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1865 tgaaaataaagagtataaggaagagaagaagaacacacaaagatttatagtggttcactgaatgtgggctagtcaactcctcacaatcttgtgagagttt 1766  T
Q  101 ccact---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagc-catgtattctctaagccttggcaggctt 196  Q
    |||||   |||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||    
T  1765 ccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttgcaatctttgttcacttgaacaattacagcacatgtattctctaagcttcagcaggctt 1666  T
Q  197 gtaccttcttggtaagttacccacttagac-ttttacaaccttt 239  Q
    | ||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  1665 gcaccttcttgctaagttacccgcgtagactttttacaaccttt 1622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0591; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 126 - 3
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  126 aattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 27  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctc 124  Q
    ||   |||||||||||||||||||    
T  26 ctatgatgcttgagataacctctc 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 110926 - 111165
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  110926 taaagagtatatggaagagagaataaacacaaagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagatttttcact 111025  T
Q  106 atg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
    |||   |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  111026 atgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccatacaatctttgttcacctgaacaattacaattctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 111125  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  111126 tgttgctaagttaaccacttagacttttataacctttgct 111165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9050 - 8816
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9050 aattaaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 8951  T
Q  103 actatg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgta 199  Q
    ||||||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||  ||| ||||| |    
T  8950 actatgatgcttgagataacctctcaaatcatgcaccttacaatatgtgttcacctgaacacttacaactctgtattctctaagcctcagcaagcttgca 8851  T
Q  200 ccttcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    |||| ||| ||||||| ||| |||| |||||||||    
T  8850 ccttattgctaagttaaccatttagtcttttacaa 8816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0811 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0811
Description:

Target: scaffold0811; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 2477 - 2693
Alignment:
Q  20 gaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---atgcttgagat 116  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  2477 gaagagaagaagaacacacaaagatttatagtggttcattcaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagat 2576  T
Q  117 aacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtaccttcttggtaagtta 215  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||| ||||| |    
T  2577 aacctctcaaatcctgcaccttacaat-gttgttcaactgaacaattacatcaactgtattctctaagcctcagcaggattgcaccttcttgctaagtga 2675  T
Q  216 cccacttagacttttaca 233  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2676 cccacttagacttttaca 2693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0811; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 233
Target Start/End: Original strand, 2749 - 2781
Alignment:
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttaca 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2749 cttcttgctaagttacccacttagacttttaca 2781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 27928 - 28172
Alignment:
Q  1 tgaaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagttt 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  27928 tgaaattaaagagtataaggaagagagaaataacacacaaagatttatagtgcttcatccaatttgggctagtccactcctcgcaatcttgtcagagttt 28027  T
Q  101 ccact---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttg 197  Q
    |||||   |||||||| ||||||  || |||||| || |||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||||||| |||||||  | ||||| |    
T  28028 ccactatgatgcttgacataacccttcaaatcctgcatcttacaatctttgttcacctgagtaattacaaccctgtattctttaagcctcagtaggctcg 28127  T
Q  198 taccttcttggtaagttacccacttagacttttacaacctttgct 242  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28128 caccttcttgctaagttacccacttagaattttacaagctttgct 28172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 242
Target Start/End: Original strand, 6184 - 6406
Alignment:
Q  24 agagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---atgcttgagataacc 120  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  6184 agagaaagaacacacaaagagttatagtggttcatccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactataatgcttgagataacc 6283  T
Q  121 tctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagc-catgtattctctaagccttggcaggcttgtac-cttcttggtaagttaccc 218  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| | | ||||||||| || |||  ||||||||  ||  |||||| ||||||||||    
T  6284 tctcaaatcctacaccttacaa-ccttgttcacctgaacaattacaacacctgtattctcaaaacctcagcaggcttacacttttcttgctaagttaccc 6382  T
Q  219 acttagacttttacaacctttgct 242  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
T  6383 acttagacttttacaccttttgct 6406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16358 - 16115
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358 aaattaaagagtatagggaagagaagaagaacacacaaagatttatagtggttaacccaatatgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcc 16259  T
Q  103 act---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgt 198  Q
     ||   ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| || ||||| |||| | | |||||||||||||| |   ||||||||     
T  16258 cctatgatgcttgagataacctctcaattcctgcaccttacaatc-ttgttcagctgaacaagtacaacaactgtattctctaagcgtcaacaggcttgc 16160  T
Q  199 accttcttggtaagt----tacccacttagacttttacaaccttt 239  Q
     |||||||| |||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  16159 tccttcttgctaagttacgtacccacttagacttttacaaccttt 16115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Original strand, 1113 - 1351
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||||| || ||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1113 aattaaatagtatagagaagaagcaaagaacacatagagaattatagtggttcacccaacgtgggatagtccactcctaacaatcttgtgagagtttcca 1212  T
Q  104 ct---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||  | |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | |||||||   ||| |||| ||    
T  1213 ctatgatgcttgagataacctctgaagtcctgcatcttacaatctttgttcacctgaacaattacaactctgtattatataagcctcaacagccttgcac 1312  T
Q  201 cttcttggtaagttacccacttagacttttacaaccttt 239  Q
    ||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1313 cttgttgctacgttaaccacttagacttttacaaccttt 1351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Original strand, 28171 - 28402
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    ||||||||| || ||||||| ||  |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28171 taaagagtaaagggaagagaaaatcaacacacatagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacagtcttgtgagagtttccact 28270  T
Q  106 atg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
    |||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| |  |||||| |||||||||  ||||||||| ||||    
T  28271 atgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatatgtgttcacctgaacacttacaactctgtattttctaagcctcagcaggcttgcacct 28370  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    | ||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  28371 tgttggttagttaactacttagacttttacaa 28402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Original strand, 49375 - 49605
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  49375 taaagagtatagggaagagaaaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccacaccttacagtcttgtgagagtttccact 49474  T
Q  106 ---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
       ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||  |||| |  | |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  49475 atgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatatgtgttcacctgaacacatacaactctatattttctaagcctcagcagacttgcacct 49574  T
Q  203 tcttggtaagttacccacttagacttttacaa 234  Q
    | ||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  49575 tgttgctaa-ttaaccacttagacttttacaa 49605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0313
Description:

Target: scaffold0313; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6657 - 6453
Alignment:
Q  29 aagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---atgcttgagataacctctcg 125  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| ||||     
T  6657 aagaacacacataaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 6558  T
Q  126 aatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc-ttcttggtaagttacccactta 223  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||  ||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||    
T  6557 aatcctgcaccttacaa-ccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccactta 6459  T
Q  224 gacttt 229  Q
    ||||||    
T  6458 gacttt 6453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10439 - 10235
Alignment:
Q  29 aagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---atgcttgagataacctctcg 125  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| ||||     
T  10439 aagaacacacataaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 10340  T
Q  126 aatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggcttgtacc-ttcttggtaagttacccactta 223  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||  ||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||    
T  10339 aatcctgcaccttacaa-ccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccactta 10241  T
Q  224 gacttt 229  Q
    ||||||    
T  10240 gacttt 10235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 77 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20766 - 20610
Alignment:
Q  77 ctcctcacaatcttgtgagagtttccact---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tg 172  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||| | | ||    
T  20766 ctcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaa-ccttgttcacctgaacaattacaacaactg 20668  T
Q  173 tattctctaagccttggcaggcttgtacc-ttcttggtaagttacccacttagacttt 229  Q
    |||||||| |||||  ||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20667 tattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagacttt 20610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 8331 - 8131
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||| | |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |     
T  8331 taaagagtatagggaagagagaatcaacaaatagagatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttatgagagtttccatta 8232  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattaca-gccatgtattctctaagccttggcaggcttgtacct 202  Q
      ||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||| |||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  8231 tgatgtttgagataacctctcaaatctggcaccttacaatccttgttcacttgaacaattacacaacatgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 8132  T
Q  203 t 203  Q
    |    
T  8131 t 8131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Original strand, 30811 - 30915
Alignment:
Q  4 aattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30811 aattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcca 30910  T
Q  104 ctatg 108  Q
    |||||    
T  30911 ctatg 30915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Original strand, 395017 - 395180
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  395017 taaagagtatagggaagagagaatcaacacacaaagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact 395116  T
Q  106 ---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattaca 166  Q
       ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| | ||||||||| |||| |||||    
T  395117 atgatgcttgagataacctctcaaatcctggaccttacaatatgtgttcacctgaacacttaca 395180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0265
Description:

Target: scaffold0265; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12179 - 11964
Alignment:
Q  24 agagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatg---cttgagataacc 120  Q
    ||||||||||||| || | | || ||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||    
T  12179 agagaaagaacacgcaaaaagttatagtggtacacccaatgtgggttagtccactcctcccaatcttgtgaaagtttccactatgatacttgagataacc 12080  T
Q  121 tctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaatt---acagccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac-cttcttggtaagttac 216  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   ||| || ||||||||||||||||   |||||||| ||  |||||| ||||||||    
T  12079 tctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaatttacacaacc-tgtattctctaagcctcaccaggcttgcacttttcttgctaagttac 11981  T
Q  217 ccacttagacttttaca 233  Q
     |||||  |||||||||    
T  11980 acacttctacttttaca 11964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 55531 - 55320
Alignment:
Q  24 agagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgct---tgagataacc 120  Q
    |||||||||||| ||| | | || || |||||||  |||||| || ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |   ||||||||||    
T  55531 agagaaagaacatacaaataattatattggttcattcaatgtgggttagtccactcctcacaat---gtgagagtttccactatgatgtttgagataacc 55435  T
Q  121 tctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattaca-gccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac-cttcttggtaagttaccc 218  Q
    |||| |||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||||| ||||||||||    
T  55434 tctcaaatcctgcaccttacaatctacgttcacctgaacaattacacaacctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacttttcttgctaagttaccc 55335  T
Q  219 acttagacttttaca 233  Q
    |||||||||||||||    
T  55334 acttagacttttaca 55320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 59480 - 59269
Alignment:
Q  24 agagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgct---tgagataacc 120  Q
    |||||||||||| ||| | | || || |||||||  |||||| || ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |   ||||||||||    
T  59480 agagaaagaacatacaaataattatattggttcattcaatgtgggttagtccactcctcacaat---gtgagagtttccactatgatgtttgagataacc 59384  T
Q  121 tctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattaca-gccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac-cttcttggtaagttaccc 218  Q
    |||| |||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||||| ||||||||||    
T  59383 tctcaaatcctgcaccttacaatctacgttcacctgaacaattacacaacctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacttttcttgctaagttaccc 59284  T
Q  219 acttagacttttaca 233  Q
    |||||||||||||||    
T  59283 acttagacttttaca 59269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 60908 - 60697
Alignment:
Q  24 agagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgct---tgagataacc 120  Q
    |||||||||||| ||| | | || || |||||||  |||||| || ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |   ||||||||||    
T  60908 agagaaagaacatacaaataattatattggttcattcaatgtgggttagtccactcctcacaat---gtgagagtttccactatgatgtttgagataacc 60812  T
Q  121 tctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattaca-gccatgtattctctaagccttggcaggcttgtac-cttcttggtaagttaccc 218  Q
    |||| |||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||||| ||||||||||    
T  60811 tctcaaatcctgcaccttacaatctacgttcacctgaacaattacacaacctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacttttcttgctaagttaccc 60712  T
Q  219 acttagacttttaca 233  Q
    |||||||||||||||    
T  60711 acttagacttttaca 60697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19877 - 19727
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact- 105  Q
    |||| |||| ||| ||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  19877 taaatagtaaagaaaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccacta 19778  T
Q  106 --atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacct 155  Q
      |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  19777 tgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaa-ccttgttcacct 19727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 39721 - 39953
Alignment:
Q  1 tgaaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagttt 100  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| | || |||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||  |||    
T  39721 tgaaaataaagagtaaagagaagagaaaaagaacacgcagaaacttatagtggttcacccaatgtgggttagtccccttctcacaatcttgtgagttttt 39820  T
Q  101 ccac---tatgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggctt 196  Q
    ||||    |||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||| |||||||||| ||||||||||   | | ||||||||||||||   || ||||    
T  39821 ccacgatgatgcttgagataacttctcaaatcacgcaccttacaatc-ttgttcacctgaacaattacaataactatattctctaagcctcaacatgctt 39919  T
Q  197 gtacc-ttcttggtaagttacccacttagacttt 229  Q
      ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  39920 acacctttcttgctaagttacccacttagacttt 39953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 196550 - 196777
Alignment:
Q  7 taaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 106  Q
    |||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  196550 taaagagtataaggaagagaaaaataacacacagag-tttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttacacta 196648  T
Q  107 tg---cttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca--tgtattctctaagccttggcaggcttg-tac 200  Q
    ||    |||||||| | ||||  ||||| ||| ||||||    |||| | || ||||  ||||  ||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  196649 tggtatttgagataccttctcagatccttcactttacaa-aaatgttaatctgaacatatacacacaattgtattctctaagcctcggcaggcttgcaac 196747  T
Q  201 cttcttgg-taagttacccacttagacttt 229  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  196748 cttcttggctaagttacccacttagacttt 196777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 93
Target Start/End: Original strand, 189943 - 190028
Alignment:
Q  9 aagagtatagagaagagagaaagaacacacagaga-tttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtg 93  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||    
T  189943 aagagtataaagaagagaaaaataacacacagagaatttatagtggttcacccaatatgggttagtccactcctcgcaatcttgtg 190028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0764 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0764
Description:

Target: scaffold0764; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Original strand, 1 - 156
Alignment:
Q  78 tcctcacaatcttgtgagagtttccact---atgcttgagataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgt 173  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||| | | |||    
T  1 tcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaa-ccttgttcacctgaacaattacaacaactgt 99  T
Q  174 attctctaagccttggcaggcttgtacc-ttcttggtaagttacccacttagacttt 229  Q
    ||||||| |||||  ||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  100 attctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagacttt 156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 1158 - 1017
Alignment:
Q  26 agaaagaacacacagagatttgtagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccact---atgcttgagataacctc 122  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||| ||||    
T  1158 agaaagaa-acacagaaatttatagtggttcactcaacgtaggctaatccattcctcacaatcttgtgagaatttccactatgatgcttgagataccctc 1060  T
Q  123 tcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattaca 166  Q
    || | |||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  1059 tcaactcctgcgccttacaatc-ttgttcacctgaacaattaca 1017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 48 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 67087 - 67027
Alignment:
Q  48 tagtggttcacccaatgtcggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatg 108  Q
    ||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  67087 tagtggttcactcaatgtgggttagtacactcctcacaatcttgtgagaattttcactatg 67027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 66346 - 66229
Alignment:
Q  113 agataacctctcgaatcctacaccttacaatctttgttcacctaaacaattacagcca-tgtattctctaagccttggcaggctt-gtaccttcttggta 210  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||| ||   |||||||   ||| | ||| ||    
T  66346 agataacctctcaaattctgcaccttacaatc-ttgttcacttaaacaattacaataattgtattctctaagactcatcaggcttacaaccattttgcta 66248  T
Q  211 agttacccacttagacttt 229  Q
    |||||||||||||||||||    
T  66247 agttacccacttagacttt 66229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 57
Target Start/End: Original strand, 15085 - 15139
Alignment:
Q  3 aaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttgtagtggttca 57  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  15085 aaataaaagagtatagagaagaaggaaagaacacacaaagagttatagtggttca 15139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University