View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2125_high_3 (Length: 615)

Name: NF2125_high_3
Description: NF2125
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2125_high_3
NF2125_high_3
[»] chr1 (44 HSPs)
chr1 (1-610)||(44406412-44407017)
chr1 (1-610)||(18814256-18814876)
chr1 (1-610)||(34687624-34688244)
chr1 (1-610)||(34692152-34692772)
chr1 (1-599)||(31619726-31620335)
chr1 (1-600)||(41829654-41830262)
chr1 (1-600)||(41962532-41963143)
chr1 (1-610)||(52309871-52310491)
chr1 (1-600)||(48340366-48340962)
chr1 (201-600)||(52521221-52521620)
chr1 (1-610)||(17671493-17672107)
chr1 (1-610)||(50561079-50561706)
chr1 (232-610)||(38844801-38845179)
chr1 (1-534)||(47135437-47135982)
chr1 (1-475)||(51965460-51965946)
chr1 (232-594)||(36682328-36682680)
chr1 (232-610)||(45005059-45005427)
chr1 (274-610)||(10694417-10694753)
chr1 (255-610)||(12245488-12245830)
chr1 (13-240)||(38845211-38845434)
chr1 (263-513)||(16031287-16031527)
chr1 (1-236)||(13662373-13662619)
chr1 (1-236)||(28565683-28565932)
chr1 (1-236)||(12714514-12714760)
chr1 (1-240)||(16031567-16031818)
chr1 (1-240)||(45004770-45005019)
chr1 (383-583)||(17709424-17709624)
chr1 (34-236)||(28631382-28631595)
chr1 (1-222)||(36681281-36681512)
chr1 (1-211)||(24294566-24294787)
chr1 (1-210)||(39760143-39760363)
chr1 (1-213)||(12245831-12246054)
chr1 (1-211)||(43254677-43254898)
chr1 (1-211)||(50395091-50395312)
chr1 (1-107)||(52521675-52521781)
chr1 (15-198)||(15317298-15317493)
chr1 (1-106)||(10763419-10763524)
chr1 (1-106)||(18111623-18111728)
chr1 (1-106)||(29840795-29840900)
chr1 (2-106)||(42682424-42682527)
chr1 (254-345)||(17709621-17709712)
chr1 (553-600)||(16031234-16031281)
chr1 (274-338)||(33361407-33361471)
chr1 (274-338)||(48340015-48340079)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (1-610)||(17469780-17470384)
chr7 (1-610)||(17582830-17583434)
chr7 (1-610)||(8925520-8926121)
chr7 (1-610)||(11499891-11500512)
chr7 (1-610)||(23766049-23766669)
chr7 (13-596)||(5962741-5963336)
chr7 (1-610)||(42687585-42688207)
chr7 (1-610)||(33638284-33638905)
chr7 (56-610)||(14308941-14309507)
chr7 (1-610)||(17482369-17483001)
chr7 (1-610)||(17570213-17570845)
chr7 (1-610)||(23299333-23299953)
chr7 (1-610)||(47174508-47175115)
chr7 (1-610)||(27734659-27735279)
chr7 (232-610)||(17478187-17478566)
chr7 (232-610)||(17574648-17575027)
chr7 (232-610)||(19521426-19521802)
chr7 (138-610)||(42826967-42827428)
chr7 (232-610)||(33031135-33031511)
chr7 (232-610)||(42918136-42918516)
chr7 (1-412)||(9149394-9149818)
chr7 (103-379)||(41262184-41262453)
chr7 (1-240)||(17477922-17478171)
chr7 (1-240)||(17575043-17575292)
chr7 (1-240)||(19521159-19521408)
chr7 (1-240)||(33030829-33031079)
chr7 (1-236)||(42244840-42245086)
chr7 (1-236)||(38434534-38434780)
chr7 (1-236)||(42996481-42996727)
chr7 (448-610)||(9149815-9149977)
chr7 (1-236)||(4481371-4481617)
chr7 (412-601)||(41261998-41262182)
chr7 (1-107)||(42827499-42827605)
chr7 (1-211)||(47573462-47573683)
chr7 (1-211)||(6911484-6911705)
chr7 (1-186)||(47163585-47163783)
chr7 (1-106)||(3795543-3795648)
chr7 (103-240)||(42917972-42918106)
chr7 (1-107)||(9226344-9226451)
chr7 (1-57)||(42917827-42917883)
chr7 (113-168)||(9226272-9226323)
chr7 (66-107)||(42917920-42917961)
chr7 (274-338)||(27735566-27735630)
chr7 (274-338)||(33639192-33639256)
[»] chr4 (44 HSPs)
chr4 (1-601)||(2776340-2776937)
chr4 (1-598)||(22115684-22116281)
chr4 (1-610)||(37701218-37701840)
chr4 (1-600)||(54331274-54331884)
chr4 (1-599)||(14829143-14829752)
chr4 (1-552)||(21353147-21353693)
chr4 (1-610)||(5271896-5272516)
chr4 (12-610)||(19831018-19831626)
chr4 (1-610)||(13628100-13628724)
chr4 (1-610)||(53342457-53343079)
chr4 (1-599)||(34056195-34056804)
chr4 (1-610)||(33502622-33503239)
chr4 (1-610)||(7643413-7644033)
chr4 (1-610)||(17699224-17699845)
chr4 (1-609)||(23478958-23479568)
chr4 (1-610)||(40622195-40622820)
chr4 (35-610)||(28973144-28973731)
chr4 (1-610)||(55998333-55998938)
chr4 (1-610)||(8530864-8531487)
chr4 (1-610)||(41983854-41984474)
chr4 (1-610)||(36857136-36857737)
chr4 (16-610)||(17740103-17740710)
chr4 (1-610)||(47557047-47557666)
chr4 (13-470)||(28134826-28135293)
chr4 (1-477)||(35495298-35495784)
chr4 (242-610)||(38008561-38008930)
chr4 (312-610)||(36514961-36515259)
chr4 (1-250)||(38007892-38008152)
chr4 (15-254)||(39742723-39742973)
chr4 (12-236)||(3839360-3839595)
chr4 (422-610)||(7847505-7847693)
chr4 (1-236)||(26870284-26870530)
chr4 (232-426)||(7842627-7842811)
chr4 (1-211)||(740430-740651)
chr4 (1-188)||(1944540-1944738)
chr4 (1-211)||(15520764-15520985)
chr4 (1-106)||(53991383-53991488)
chr4 (1-106)||(35707764-35707869)
chr4 (1-107)||(47720204-47720310)
chr4 (529-610)||(35495222-35495303)
chr4 (521-610)||(39742615-39742704)
chr4 (1-106)||(574283-574388)
chr4 (274-512)||(56541122-56541360)
chr4 (274-338)||(13627749-13627813)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (1-610)||(1072877-1073497)
chr6 (1-610)||(18598599-18599220)
chr6 (1-601)||(18311819-18312414)
chr6 (1-610)||(35041121-35041721)
chr6 (1-610)||(34855968-34856585)
chr6 (1-610)||(14887552-14888171)
chr6 (1-610)||(2521177-2521798)
chr6 (1-610)||(17939535-17940153)
chr6 (13-610)||(4424511-4425118)
chr6 (1-610)||(22373457-22374075)
chr6 (35-610)||(30044255-30044841)
chr6 (1-610)||(34321105-34321728)
chr6 (103-600)||(21799672-21800164)
chr6 (1-610)||(33321067-33321687)
chr6 (1-610)||(15275671-15276269)
chr6 (195-610)||(7222528-7222944)
chr6 (232-516)||(14831772-14832056)
chr6 (1-344)||(25540086-25540440)
chr6 (471-610)||(11933096-11933235)
chr6 (1-240)||(14831498-14831748)
chr6 (471-610)||(33814485-33814624)
chr6 (1-107)||(11934808-11934914)
chr6 (1-211)||(13456858-13457078)
chr6 (2-168)||(4425521-4425698)
chr6 (495-610)||(25540450-25540565)
chr6 (37-107)||(1931987-1932057)
chr6 (553-601)||(14832059-14832107)
chr6 (103-168)||(1932068-1932129)
chr6 (274-338)||(7219385-7219449)
[»] chr5 (39 HSPs)
chr5 (1-610)||(7285672-7286292)
chr5 (1-610)||(17996575-17997183)
chr5 (1-610)||(20757956-20758560)
chr5 (1-610)||(38934472-38935077)
chr5 (1-610)||(3150208-3150828)
chr5 (1-610)||(3028749-3029370)
chr5 (1-599)||(33610755-33611364)
chr5 (1-599)||(2195160-2195769)
chr5 (1-610)||(4882267-4882887)
chr5 (1-608)||(27065867-27066485)
chr5 (1-608)||(21030103-21030722)
chr5 (1-610)||(26320681-26321299)
chr5 (1-610)||(3396740-3397362)
chr5 (1-610)||(30689304-30689928)
chr5 (35-610)||(34373988-34374570)
chr5 (159-610)||(1851564-1852015)
chr5 (1-610)||(19447998-19448610)
chr5 (1-610)||(33706378-33707003)
chr5 (103-601)||(10511978-10512471)
chr5 (35-607)||(35539531-35540109)
chr5 (1-610)||(20349918-20350550)
chr5 (232-610)||(20995501-20995878)
chr5 (232-610)||(41781089-41781457)
chr5 (232-600)||(33930061-33930419)
chr5 (1-240)||(41780823-41781073)
chr5 (1-240)||(20995918-20996168)
chr5 (1-236)||(9702247-9702493)
chr5 (1-240)||(33929789-33930039)
chr5 (1-236)||(3210178-3210424)
chr5 (1-211)||(19395351-19395572)
chr5 (1-211)||(31295677-31295898)
chr5 (1-107)||(1852047-1852154)
chr5 (482-600)||(12420211-12420329)
chr5 (2-106)||(12588400-12588503)
chr5 (1-73)||(10513253-10513325)
chr5 (1-107)||(290546-290648)
chr5 (65-107)||(10512482-10512524)
chr5 (103-168)||(290659-290720)
chr5 (274-338)||(3028392-3028456)
[»] chr8 (47 HSPs)
chr8 (1-599)||(23522265-23522856)
chr8 (1-610)||(6477087-6477707)
chr8 (1-600)||(14078434-14079044)
chr8 (1-608)||(33423855-33424472)
chr8 (13-610)||(38961954-38962562)
chr8 (13-610)||(38992298-38992906)
chr8 (35-610)||(44599509-44600094)
chr8 (4-610)||(42810527-42811148)
chr8 (35-610)||(38993490-38994077)
chr8 (1-599)||(19395167-19395777)
chr8 (1-610)||(41628664-41629282)
chr8 (164-610)||(27273180-27273625)
chr8 (1-610)||(45293165-45293791)
chr8 (138-610)||(44382394-44382867)
chr8 (222-610)||(9761273-9761661)
chr8 (2-600)||(19247886-19248498)
chr8 (2-600)||(19321070-19321682)
chr8 (1-464)||(30826224-30826702)
chr8 (1-512)||(41156412-41156935)
chr8 (103-610)||(3751001-3751507)
chr8 (232-610)||(41977514-41977892)
chr8 (305-610)||(36597629-36597934)
chr8 (232-610)||(22946394-22946758)
chr8 (392-610)||(22332321-22332539)
chr8 (1-240)||(22333085-22333335)
chr8 (1-240)||(22946778-22947016)
chr8 (1-236)||(12250167-12250413)
chr8 (1-236)||(39444794-39445040)
chr8 (439-600)||(5835818-5835979)
chr8 (232-392)||(22332887-22333047)
chr8 (1-236)||(39204404-39204650)
chr8 (1-240)||(41977232-41977482)
chr8 (1-230)||(12760248-12760488)
chr8 (295-474)||(12760495-12760672)
chr8 (1-236)||(29433812-29434058)
chr8 (1-236)||(23626312-23626558)
chr8 (1-211)||(23966513-23966734)
chr8 (1-211)||(37029611-37029832)
chr8 (491-610)||(42785443-42785562)
chr8 (1-211)||(6300610-6300831)
chr8 (1-168)||(41907630-41907800)
chr8 (1-211)||(44940215-44940436)
chr8 (492-610)||(41533453-41533571)
chr8 (1-211)||(42060788-42061008)
chr8 (522-610)||(30826699-30826787)
chr8 (195-248)||(36597929-36597982)
chr8 (192-240)||(16668790-16668838)
[»] chr3 (42 HSPs)
chr3 (1-610)||(35087444-35088064)
chr3 (1-610)||(50770853-50771473)
chr3 (1-600)||(6103742-6104352)
chr3 (1-581)||(48976712-48977303)
chr3 (1-610)||(31368621-31369243)
chr3 (1-610)||(32755544-32756162)
chr3 (1-610)||(49113094-49113713)
chr3 (35-610)||(16341717-16342304)
chr3 (1-610)||(54512806-54513433)
chr3 (1-610)||(52462537-52463158)
chr3 (1-573)||(52853087-52853668)
chr3 (1-610)||(21699193-21699799)
chr3 (1-610)||(55294387-55295005)
chr3 (1-610)||(50741381-50742021)
chr3 (1-610)||(11597566-11598190)
chr3 (1-610)||(48520646-48521248)
chr3 (13-415)||(51248401-51248802)
chr3 (362-610)||(8242891-8243139)
chr3 (297-610)||(54934151-54934454)
chr3 (342-610)||(18741834-18742103)
chr3 (360-610)||(40824276-40824526)
chr3 (1-236)||(16495918-16496164)
chr3 (1-236)||(54792945-54793191)
chr3 (1-236)||(11383146-11383386)
chr3 (1-230)||(40827021-40827261)
chr3 (460-608)||(51248802-51248950)
chr3 (1-211)||(39796478-39796699)
chr3 (1-211)||(5252379-5252600)
chr3 (1-107)||(23193496-23193602)
chr3 (1-107)||(8242728-8242834)
chr3 (485-599)||(23194712-23194826)
chr3 (1-106)||(22477736-22477841)
chr3 (12-106)||(11951096-11951190)
chr3 (244-512)||(23936793-23937060)
chr3 (1-106)||(35436867-35436971)
chr3 (1-107)||(36165130-36165237)
chr3 (537-610)||(50802806-50802879)
chr3 (537-610)||(50872998-50873071)
chr3 (550-610)||(2843529-2843589)
chr3 (103-168)||(35436984-35437045)
chr3 (103-167)||(12157959-12158019)
chr3 (573-610)||(54648497-54648534)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (1-599)||(25977-26586)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-599)||(9957-10566)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (1-610)||(26821684-26822304)
chr2 (1-610)||(16723957-16724577)
chr2 (13-610)||(30570156-30570766)
chr2 (3-610)||(33663404-33664020)
chr2 (35-610)||(42885474-42886058)
chr2 (35-610)||(33907326-33907915)
chr2 (35-610)||(26827598-26828183)
chr2 (1-610)||(21097763-21098373)
chr2 (1-610)||(18092328-18092950)
chr2 (1-600)||(45204637-45205246)
chr2 (35-610)||(11706711-11707298)
chr2 (1-608)||(1514595-1515218)
chr2 (232-610)||(36632658-36633036)
chr2 (303-600)||(19126302-19126598)
chr2 (1-515)||(4811612-4812136)
chr2 (232-610)||(45399103-45399471)
chr2 (246-610)||(35285899-35286249)
chr2 (62-361)||(30572285-30572597)
chr2 (1-240)||(35286318-35286568)
chr2 (419-599)||(19167477-19167657)
chr2 (1-236)||(17091841-17092087)
chr2 (388-600)||(11448193-11448405)
chr2 (1-236)||(17025656-17025902)
chr2 (1-236)||(17037333-17037579)
chr2 (4-231)||(28379990-28380228)
chr2 (442-610)||(27364444-27364612)
chr2 (1-240)||(36633064-36633314)
chr2 (1-211)||(1993075-1993283)
chr2 (4-232)||(45398809-45399048)
chr2 (1-205)||(19167654-19167871)
chr2 (1-211)||(14323334-14323555)
chr2 (1-211)||(28502215-28502436)
chr2 (493-610)||(5252901-5253018)
chr2 (1-188)||(10821234-10821432)
chr2 (1-211)||(6342850-6343071)
chr2 (13-163)||(30566920-30567081)
chr2 (1-106)||(9916812-9916917)
chr2 (1-168)||(14753246-14753423)
chr2 (558-600)||(4812146-4812188)
chr2 (1-46)||(16883988-16884033)
chr2 (1-46)||(17041678-17041723)
chr2 (274-338)||(18093228-18093292)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (35-610)||(48842-49427)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (1-543)||(447-1000)
scaffold0122 (562-610)||(5099-5147)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (1-610)||(12535-13157)
[»] scaffold0242 (2 HSPs)
scaffold0242 (145-610)||(3026-3490)
scaffold0242 (35-187)||(3483-3646)
[»] scaffold0115 (1 HSPs)
scaffold0115 (206-610)||(190-596)
[»] scaffold1634 (1 HSPs)
scaffold1634 (255-610)||(639-993)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (234-610)||(176734-177108)
scaffold0010 (232-610)||(120176-120554)
scaffold0010 (192-240)||(120102-120150)
[»] scaffold0079 (2 HSPs)
scaffold0079 (1-394)||(10430-10836)
scaffold0079 (519-600)||(10351-10432)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (246-600)||(101005-101349)
scaffold0016 (1-229)||(100629-100867)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (330-610)||(11020-11299)
scaffold0032 (330-610)||(4571-4850)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (1-253)||(26514-26777)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (1-236)||(152135-152381)
scaffold0006 (1-188)||(64662-64860)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (1-236)||(52948-53194)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (466-610)||(14944-15088)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (4-240)||(29974-30220)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (1-107)||(1363-1469)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (1-107)||(61325-61431)
scaffold0051 (138-168)||(61473-61503)
[»] scaffold1891 (1 HSPs)
scaffold1891 (1-70)||(46-115)
[»] scaffold0385 (1 HSPs)
scaffold0385 (33-103)||(4301-4373)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 493; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 493; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 44406412 - 44407017
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44406412 cattttgtctaatgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtcaatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatcta 44406511  T
Q  101 cacattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatcttta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  44406512 cacattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgatcttttcctacagtagatcttta 44406607  T
Q  201 taatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatg 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  44406608 taatgctttggtaattgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacaatgcaatttgttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatg 44406707  T
Q  301 acatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttaca 400  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44406708 tcatttctaaaaggaacacgggaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtttcacttgataacggcaaagagagcaagttaca 44406807  T
Q  401 aaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatat 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44406808 aaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatat 44406907  T
Q  501 gcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcac 600  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  44406908 gcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgattcgcactttcaactaatcaccttaactctaatcatagactatattatcttcactcac 44407007  T
Q  601 ctatgctact 610  Q
    | ||| ||||    
T  44407008 caatgttact 44407017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 18814256 - 18814876
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18814256 cattttgtctgatgtaagtattggcaaaaattcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 18814355  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
     ||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  18814356 tacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgagaaaaataaaacatgctattttcc 18814451  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18814452 tacagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctca 18814551  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18814552 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaa 18814651  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18814652 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaa 18814751  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18814752 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactag 18814851  T
Q  586 attatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||  ||||||||    
T  18814852 attatcttcactcactgatgctact 18814876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 34687624 - 34688244
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34687624 cattttgtctgatgtaagtattggcaaaaattcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 34687723  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
     ||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  34687724 tacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgagaaaaataaaacatgctattttcc 34687819  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34687820 tacagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctca 34687919  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34687920 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaa 34688019  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34688020 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaa 34688119  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34688120 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactag 34688219  T
Q  586 attatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||  ||||||||    
T  34688220 attatcttcactcactgatgctact 34688244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 442; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 34692152 - 34692772
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34692152 cattttgtctgatgtaagtattggcaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatataacgttaatctg 34692251  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||    
T  34692252 cacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgagaaaaataaaatatgctattttcc 34692347  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  34692348 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacaatgcaatttgttttgtacctagcacttctta 34692447  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34692448 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacgaaaaacaatcacactcatcaacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaa 34692547  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34692548 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatagttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaa 34692647  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34692648 gccacctaaaaatatgtacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcataatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactag 34692747  T
Q  586 attatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||    
T  34692748 attatattcactcactgatgctact 34692772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 599
Target Start/End: Original strand, 31619726 - 31620335
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||  |||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31619726 cattttgtccgatgtaagtattgacaaaaattcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaatctaactattatgtaacgttaatctg 31619825  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
     ||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  31619826 tacattgttggtttcttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgagaaaaataaaacatgctattttcc 31619921  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31619922 tacagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatatacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctca 31620021  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  31620022 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacattcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgatagcggcaa 31620121  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31620122 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgccgataacatgtgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaa 31620221  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31620222 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactag 31620321  T
Q  586 attatcttcactca 599  Q
    ||||||||||||||    
T  31620322 attatcttcactca 31620335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 41830262 - 41829654
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgtta-atct 99  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  41830262 cattttgtctgatgtaagtattggcaaaaattcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgtaatatgt 41830163  T
Q  100 gca-------------cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcct 186  Q
     ||             |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  41830162 acattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctattgagaaaaataaaacatgctattttcct 41830067  T
Q  187 acagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaa 286  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41830066 acggtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactacaatttgttttgtacctagcacttctcaa 41829967  T
Q  287 atgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaa 386  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  41829966 atgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacattcatcgacaaacaagctcaaaaaagatataagtgtcgcttgataacggcaaa 41829867  T
Q  387 gagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaag 486  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  41829866 gagagcaagttaaaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtaataagttaattttt-atctagagaag 41829768  T
Q  487 ccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactaga 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41829767 ccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactaga 41829668  T
Q  587 ttatcttcactcac 600  Q
    ||||||||||||||    
T  41829667 ttatcttcactcac 41829654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 41963143 - 41962532
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41963143 cattttgtctgatgtaagtattggcaaaaattcctttttggttagtgtatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatcta 41963044  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctctt-gaacaaaataaaacatgctcttttc 184  Q
     ||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| | |||||    
T  41963043 tacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttagagaaaaatgaaacatgttattttc 41962948  T
Q  185 ctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctc 284  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||     
T  41962947 ctacagtaaatctttacgatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttcta 41962848  T
Q  285 aaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggca 384  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  41962847 aaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacatggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggca 41962748  T
Q  385 aagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagaga 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  41962747 aagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggtcaatggtttaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagaga 41962648  T
Q  485 agccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagacta 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  41962647 agccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcacctttactttaatcctagacta 41962548  T
Q  585 gattatcttcactcac 600  Q
    ||||||||||||||||    
T  41962547 gattatcttcactcac 41962532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 52309871 - 52310491
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52309871 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtctatgacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 52309970  T
Q  101 cacattggt---------------tccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||||||| |               |||||||||||||| ||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |    
T  52309971 cacattgttggttccttcattgattccaattagtatcaagttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaatagaacatgttctttttc 52310066  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtac--atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttct 283  Q
    ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||     
T  52310067 tacaacaaatctttataatgttttggtaaatgttttagaaatgtacttatatatataacatctaattaacactgcagtttgttt-gtacctagcacttcc 52310165  T
Q  284 caaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggc 383  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52310166 caaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaatagggaaaaaaatcacactcatcgacaaacaaaatcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggc 52310265  T
Q  384 aaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagag 483  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||    
T  52310266 aaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggtcaattgttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataggctaatttttgatccagag 52310365  T
Q  484 aagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagact 583  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||     
T  52310366 aagccacctaaaaatatgcatgttcaagtcgttcccaaataaaga-ttggtgttcatgattcgcactttcagcagatcaccttaactctaatcctagaca 52310464  T
Q  584 agattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  52310465 agattatctttactcaccgatgctact 52310491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 600
Target Start/End: Original strand, 48340366 - 48340962
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  48340366 cattttgtctgatgtaaatattgacaaaaataactttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaacctaaatattatgtaacgttgatctg 48340465  T
Q  101 cacatt---------------ggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||     ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  48340466 cacattattggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattataac----gttgttttcataatctcctgaacaaaataaaacaagctcttttcc 48340561  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    ||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  |    
T  48340562 tacaacaaatctttatgatgctttgataaatgttttagaaatgtacatatatataacatctaattaaccctgcaatatgttttgtacctagcacttccta 48340661  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    ||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||    
T  48340662 aatgatatatcaaagacatttttaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataaatgtcgcttgataacgacaa 48340761  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  48340762 agagagcaagttaaaaaaaatacttaggcggccaatggttcaa--------------atatgttagaggtaggtggcaagttaatttttgatctagagaa 48340847  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  48340848 gccacctaaaaatatgcacgatcaagtcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttgaacatatcaccttatctctaatcttagactag 48340947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 201 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 52521620 - 52521221
Alignment:
Q  201 taatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  52521620 taatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatg 52521521  T
Q  301 acatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttaca 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52521520 acatttctaaaaggaacacggaaaacaattacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttaca 52521421  T
Q  401 aaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatat 500  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||  | ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52521420 aaaaatacttaggcagccaatgtttcaaattttgctgagaagatatgttagaggcaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatat 52521321  T
Q  501 gcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcac 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52521320 gcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcacaatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagacaagattatcttcactcac 52521221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 17671493 - 17672107
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  17671493 cattttgtctaatgtaaatattggcaaaaatccatttttggttagtctatgacacttgtagtatcttttatagacataactattatgtaacgttaatctg 17671592  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||| ||||||||||||||||||| |||    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17671593 cacattgttggttccttcattggttctaattagtatcatgttaattataa----tgttgttttcccaatctcttgaacaaaatagaacatgctcttttcc 17671688  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtaca----tatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcattt 281  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||| || ||    
T  17671689 tacagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacacatatatatataacatctaattaacacaacaatttgttttgtacctaacactt 17671788  T
Q  282 ctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacg 381  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           ||    
T  17671789 tccaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacagaaaacaatcacacttatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtg----------tcg 17671878  T
Q  382 gcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctag 481  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  17671879 gcaaagagagcaagttaagaaaaattcttaggcggtcaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgacctag 17671978  T
Q  482 agaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctaga 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  17671979 agaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcattcccaaaaaaagatttggtgttcatgatctgcactttcaacagatcaccttaattctaatcctata 17672078  T
Q  582 ctagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
     ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17672079 gtagattatcttcactcactgatgctact 17672107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 50561079 - 50561706
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  50561079 cattttgtctgatgtaaataatggcaaaaatccctttttggttagtctatgacacttgcagtattttttataaacctaa-tattatgta-cgttaatctg 50561176  T
Q  101 cacattggt---------------tccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    || |||| |               |||||| ||||||| ||||| |    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  50561177 catattgttggttccttcatttattccaataagtatcaagttaaatt---ataatgttgttttcctaatctcttgaacaaaatagaacatgttcttttcc 50561273  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtac----------atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtaccta 275  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||          ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50561274 tacaacaaatctttataatgctttggtaaatattttagaaatgtacttatatatatatatatataacatctaattaacactgcaatttgttttgtaccta 50561373  T
Q  276 gcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttg 375  Q
    ||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  50561374 gcacttcccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaatagggaaaaaaatcacactcatcgacaaaaaa-ctcaaaa-aggtataagtgtcgcttg 50561471  T
Q  376 ataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttg 475  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  50561472 ataactgcaaagagagtaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatggttcaacttttgctgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttg 50561571  T
Q  476 atctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaat 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  50561572 atctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacaaatcaccttaactctaat 50561671  T
Q  576 cctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  50561672 cctaaacaagattatcttcactcaccgatgctact 50561706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 232 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 38845179 - 38844801
Alignment:
Q  232 atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 331  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38845179 atatatataacttctaattaacaatgcaatttgttttatacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacgatca 38845080  T
Q  332 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38845079 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcacagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 38844980  T
Q  432 ttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagattt 531  Q
    ||  || ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38844979 tttccgagaacatatgtttgaggtaggtgataatttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagattt 38844880  T
Q  532 ggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  38844879 ggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcagtcaccgattctact 38844801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 534
Target Start/End: Original strand, 47135437 - 47135982
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47135437 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatcatgtttaggttagtctatgacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatcta 47135536  T
Q  101 cacattggt---------------tccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||||||| |               |||||||||||||| ||||||| |         ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  47135537 cacattgttggttccttcattgattccaattagtatcaagttaattat---------tgttttcctaatctcttgaacaaaatagaacatgttcttttcc 47135627  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtac------atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcat 279  Q
    ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      ||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||     
T  47135628 tacaacaaatctttataatgttttggtaaatgttttagaaatgtacttatatatatatataacatctaattaacacaacaatttgttttgtacctagcac 47135727  T
Q  280 ttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataa 379  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47135728 ttcccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaatagggaaaaaaatcaaactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataa 47135827  T
Q  380 cggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatct 479  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  47135828 cggcaaagatagcaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaattttttatct 47135927  T
Q  480 agagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggt 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  47135928 agagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttcccaaataaaaatttggt 47135982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 51965946 - 51965460
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51965946 cattttgtctgatgtaaatattagcaaaaatccctttttggttagtgtataacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 51965847  T
Q  101 cacattggt---------------tccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||||||| |               |||||||||||||| ||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |    
T  51965846 cacattgttggttccttcattgattccaattagtatcaagttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaatagaacatgttcttttgc 51965751  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtac--atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttct 283  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||     
T  51965750 tacaacagatctttataatgctttggtaaatgttttaaaaatgtacttatatatataacatctaattaacactacaatttgttttgtacgtagcacttcc 51965651  T
Q  284 caaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggc 383  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51965650 caaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacatggaaaa-aatcacactcatcaacaaacaaactcaagaaaggtataagtgtcgcttgataacggc 51965552  T
Q  384 aaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttg 475  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  51965551 aaagagagcaagttacgaaaaatacttacgcggtcaatgattcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgagaagctaatttttg 51965460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 232 - 594
Target Start/End: Original strand, 36682328 - 36682680
Alignment:
Q  232 atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 331  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36682328 atatatataacatctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcactttccaaatgagatatcaaggacattgctaaaaggaacacggaaaacaatca 36682427  T
Q  332 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||          |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36682428 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcg----------gcaaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggccaatggttcaactt 36682517  T
Q  432 ttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagattt 531  Q
    ||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||    
T  36682518 ttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgacctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcattcccaaataaatattt 36682617  T
Q  532 ggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttc 594  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  36682618 ggtgttcatgattcgcactttcaacatattactttaattctaatcctatactagattatcttc 36682680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 232 - 610
Target Start/End: Original strand, 45005059 - 45005427
Alignment:
Q  232 atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 331  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45005059 atatatataacatctaattaacaccgcaatttgttttgtacctagcactttccaaatgagatatcaaggacattgctaaaaggaacacggaaaacaatca 45005158  T
Q  332 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||          |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45005159 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaatgtataagtgtcg----------gcaaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggccaatggttcaactt 45005248  T
Q  432 ttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagattt 531  Q
    ||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||    
T  45005249 ttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgacctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcattcccaaataaatattt 45005348  T
Q  532 ggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  45005349 ggtgttcatgatccgcactttcaacatattactttaattctaatcctatactagattatcttcactcactgatgctact 45005427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 274 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 10694753 - 10694417
Alignment:
Q  274 tagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgct 373  Q
    ||||||||||||||  || ||||||  ||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  10694753 tagcatttctcaaacaaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaggtgcaaaacaatcacactcatcgacaagcaaactcaaaaaaggtataagtgtcgct 10694654  T
Q  374 tgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  10694653 tgataacggcaaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttt 10694554  T
Q  474 tgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactcta 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  10694553 tgatctagagaagccacctaaaaatatgcaagttcaagtcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactcta 10694454  T
Q  574 atcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||  |||||||    
T  10694453 atcctagacaatattatcttcattcaccggtgctact 10694417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 255 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 12245830 - 12245488
Alignment:
Q  255 ctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaa 354  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12245830 ctgcaatttgttttgtacctagcactttccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacacgaaaaacaatcacactcatcgacaaacaaactcaa 12245731  T
Q  355 aaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttac-aaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagag 453  Q
    |||||||||||||| ||          |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    ||    
T  12245730 aaaaggtataagtgtcg----------gcaaagagagcaagttacgaaaaaatacttaggcggccaatggttcaacttttgccgagaacatatg----ag 12245645  T
Q  454 gtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttc 553  Q
    ||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| || || |||    
T  12245644 gtaggtgataagctaattttttacctaaagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcattcccaaataaagatttggtattcatgatccgcacgttc 12245545  T
Q  554 aacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12245544 aacatatcaccttaattctaatcatatactagattatcttcactcactgatgctact 12245488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 38845434 - 38845211
Alignment:
Q  13 tgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattggttcc 112  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || |||||    
T  38845434 tgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtctatgaagcttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgattgttagttcc 38845335  T
Q  113 aattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttataatgctttggt 212  Q
    |||||||||||||||||||||    | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38845334 aattagtatcatgttaattgt----actattgttttcctaatatcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttataatgctttggt 38845239  T
Q  213 aaatgttttagaaatgtacatatatata 240  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  38845238 aaatattttaaaaatgtatatatatata 38845211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 263 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 16031527 - 16031287
Alignment:
Q  263 tgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggta 362  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16031527 tgttttgtacctagcactttccaaattagatatcaaggacatttctaaaaggaacacggtaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcgaaaaaggta 16031428  T
Q  363 taagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgat 462  Q
    |||||| ||          |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  16031427 taagtgtcg----------gcaaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggccaatgattcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgat 16031338  T
Q  463 aagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtc 513  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16031337 aagctaatttttgacctagagaagccacctaaaaatatgcacattcaagtc 16031287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13662619 - 13662373
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13662619 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatccatttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaacctgactattatataacgttaatctg 13662520  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  13662519 cacattgttggttgcttcattggttccaattagtatcatgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaaccaaatagaacatgctattttcc 13662424  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13662423 tacagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttaaaaatgtacatata 13662373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28565932 - 28565683
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaa---tccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaat 97  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28565932 cattttgtctgatgtaaatattggaaaaaaaaatctctttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaacctaactattatgtaacattaat 28565833  T
Q  98 ctgcacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttt 182  Q
    ||||||||||               |||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28565832 ctgcacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaaccaaatagaacatgctcttt 28565737  T
Q  183 tcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 236  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28565736 tcctacagcaaatctttataatgatttggtaaatgttttaaaaatgtacatata 28565683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 12714514 - 12714760
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12714514 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatatg 12714613  T
Q  101 ca---------------cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||               |||||||| ||||||||||||||||||||    | |||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  12714614 cacattgttggttccttcattggtttcaattagtatcatgttaatt----ataatgttattttcataatctcttgaaccaaatagaacatgttcttttcc 12714709  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12714710 tacagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttataaatgtacatata 12714760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16031818 - 16031567
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattgga-aaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatct 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||| || ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16031818 cattttgtataatgtaaatattgggcaaaaattccattttggttactctatgacacttgcagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatct 16031719  T
Q  100 gcacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttc 184  Q
    ||||||||               |||||||||||||||||||||||| |||    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16031718 gcacattgttggttccttaattggttccaattagtatcatgttaattataa----tgttgttttcccaatctcttgaacaaaatagaacatgttcttttc 16031623  T
Q  185 ctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatata 240  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16031622 ctacagcaaatctctataatgttttggtaaatgttttagaaatgtatatatatata 16031567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 45004770 - 45005019
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45004770 cattttgtctaatgtaaatattg-acaaaatccatttttgattagtctatgacacttgcagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 45004868  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               ||| |||||||||||||||||||| |||    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45004869 cacattgttggttccttcattggtttcaattagtatcatgttaattataa----tgttgttttctcaatctcttgaacaaaatagaacatgctcttttcc 45004964  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatata 240  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  45004965 tacaacaaatctttataatgctttgataaatgttttagaaatatatatatatata 45005019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 383 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 17709624 - 17709424
Alignment:
Q  383 caaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctaga 482  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  17709624 caaagagagcaagttacggaaaatacttaggcggccaatgcttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtaataagctaatttttgatctata 17709525  T
Q  483 gaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagac 582  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17709524 gaaggcacataaaaatatgcacgttcaagccgttcccaaataaagatattgtgttcatgatccacactttgaacagatcaccttaactctaatcctagac 17709425  T
Q  583 t 583  Q
    |    
T  17709424 t 17709424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 28631382 - 28631595
Alignment:
Q  34 ctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattg---------------gttccaattag 118  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||||    
T  28631382 cttttttgttagtctatgacacttgtagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcgttggttccaattag 28631481  T
Q  119 tatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgt 218  Q
    ||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  28631482 tatcatgttaattataaa----gttgttttcctaatctcttgaacaaaatagaatatgctcttttcccacatcaaatctttataatgctttggtaaatgt 28631577  T
Q  219 tttagaaatgtacatata 236  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28631578 tttagaaatgtacatata 28631595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 36681281 - 36681512
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36681281 cattttgtctaatgtaaatattg-acaaaatccatttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 36681379  T
Q  101 ca---------------cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||               |||||||| ||||||||||||||||||||    | ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  36681380 cacattgttggttccttcattggtttcaattagtatcatgttaatt----ataatgttgttttctcaatctcttgaacaaaatagaacatgttcttttcc 36681475  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgtttta 222  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36681476 tacaacaaatctttataatgctttgataaatgtttta 36681512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 24294566 - 24294787
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24294566 cattttgtctaatgtaaatattggcaaaactctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactagtatgtaacgttaatctg 24294665  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||| ||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  24294666 cacattgttggtttcttcattggttcaaattagtatcatgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaatagaacatgctctttttc 24294761  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttgg 211  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24294762 tacagcaaatctttataatgctttgg 24294787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39760363 - 39760143
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39760363 cattttgtctaatgtaaatattggcaaaagtctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactagtatgtaacgttaatctg 39760264  T
Q  101 cac---------------attggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||               |||||||| |||||||||||||||||||    | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  39760263 cacattgttggtttcttcattggttcaaattagtatcatgttaatt----ataatgttgtttttctaatctcttgaacaaaatagaacatgctctttttc 39760168  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttg 210  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  39760167 tacagcaaatctttataatgctttg 39760143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12246054 - 12245831
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12246054 cattttgtctgatgtaaatattgacaaaaatccctttttggttagtctatgacgcttgcattctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatatg 12245955  T
Q  101 ca---------------cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||               |||||||| ||||||||||||||||||||    | ||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  12245954 cacattgttggttccttcattggtttcaattagtatcatgttaatt----ataatgttgtttttccaatctcttgaataaaatagaacatgctcttttcc 12245859  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggta 213  Q
    | ||  ||||||||||||||||||||||    
T  12245858 tccaacaaatctttataatgctttggta 12245831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 43254898 - 43254677
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43254898 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 43254799  T
Q  101 ca---------------cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||               ||||||||| |||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  43254798 cacattattggttccttcattggttcaaattagtatcatgttaatt----ataatgttgttttcctaatcttttgaacaaaatagaacatgccctttttc 43254703  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttgg 211  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||    
T  43254702 tacagcagatctttataatgctttgg 43254677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 50395312 - 50395091
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50395312 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 50395213  T
Q  101 ca---------------cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||               ||||||||| |||||||||||||||||||    | |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  50395212 cacattattggttccttcattggttcaaattagtatcatgttaatt----ataatgttattttcctaatcttttgaacaaaatagaacatgccctttttc 50395117  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttgg 211  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||    
T  50395116 tacagcagatctttataatgctttgg 50395091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 52521781 - 52521675
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52521781 cattttgtctgatgtaagtattggcaaaaatccatttttggttagtttatgaaacttgcactctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatttg 52521682  T
Q  101 cacattg 107  Q
    |||||||    
T  52521681 cacattg 52521675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 198
Target Start/End: Original strand, 15317298 - 15317493
Alignment:
Q  15 taaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcaca---------- 104  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||              
T  15317298 taaatattggcaaaaatacctttttggttagtcaatgacacttgcagtctcttttataaacccaactattatgtaacgttaatatgcacattgttggttc 15317397  T
Q  105 -----ttggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttg-ttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctt 198  Q
         |||||||||||||||||||||||||||    | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  15317398 ctttgttggttccaattagtatcatgttaatt----ataatgttgtttttcataatctcttgaacaaaatagaacatgctcttttcctacataaaatctt 15317493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 10763419 - 10763524
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||| ||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10763419 cattttatctgatgtaagtattagcaaaaatccctttttggttagtctatgacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 10763518  T
Q  101 cacatt 106  Q
    ||||||    
T  10763519 cacatt 10763524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 18111623 - 18111728
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18111623 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattacgtaacgttaatctg 18111722  T
Q  101 cacatt 106  Q
    ||||||    
T  18111723 cacatt 18111728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 29840900 - 29840795
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  29840900 cattttatctgatgtaaatattagcaaaaatccctttttggttagtctatgacacttgcagtcttttttataaatctaactattatgtaactttaatctg 29840801  T
Q  101 cacatt 106  Q
    ||||||    
T  29840800 cacatt 29840795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 106
Target Start/End: Original strand, 42682424 - 42682527
Alignment:
Q  2 attttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgc 101  Q
    ||||| ||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42682424 attttatctgatgtaaatattagcaaaa-tccctttttggttagtctatgacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgc 42682522  T
Q  102 acatt 106  Q
    |||||    
T  42682523 acatt 42682527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 254 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17709712 - 17709621
Alignment:
Q  254 tctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaa 345  Q
    ||||||| ||||||||| || |||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17709712 tctgcaacttgttttgttcccagcacttcccaaatgagatatcaaagacatttctaaaaggaacatgaaaaacaatcacactcatcgacaaa 17709621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 553 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 16031281 - 16031234
Alignment:
Q  553 caacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcac 600  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16031281 caacatatcaccttaattctaatcctatactagattatcttcactcac 16031234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 338
Target Start/End: Original strand, 33361407 - 33361471
Alignment:
Q  274 tagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcat 338  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||||||||  || ||||||||||| |||||    
T  33361407 tagcatttcccaaatgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcat 33361471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 338
Target Start/End: Original strand, 48340015 - 48340079
Alignment:
Q  274 tagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcat 338  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| || | ||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  48340015 tagcatttctcaaatgaggtgtcaagaacaattatgaaaggaaaacgcaaaacaatcactctcat 48340079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 489; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 489; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 17469780 - 17470384
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17469780 cattttgtctaatgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtcaatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 17469879  T
Q  101 cacattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatcttta 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17469880 cacattggtttcaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatcttta 17469975  T
Q  201 taatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatg 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17469976 taatgctttggtaattgttttagaaatgtacatatatataacttctaattgacactgcaattttttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatg 17470075  T
Q  301 acatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttaca 400  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17470076 acatttctaaaaggaatacggaaa-caatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtttcacttgataacgacaaagagagcaagttaca 17470174  T
Q  401 aaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatat 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17470175 aaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttatcgtgaacatatgttagaggtggatgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatat 17470274  T
Q  501 gcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcac 600  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17470275 gcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtcttcatgattcgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcac 17470374  T
Q  601 ctatgctact 610  Q
    | ||| ||||    
T  17470375 caatgttact 17470384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 489; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 17583434 - 17582830
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17583434 cattttgtctaatgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtcaatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 17583335  T
Q  101 cacattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatcttta 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17583334 cacattggtttcaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatcttta 17583239  T
Q  201 taatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatg 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17583238 taatgctttggtaattgttttagaaatgtacatatatataacttctaattgacactgcaattttttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatg 17583139  T
Q  301 acatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttaca 400  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17583138 acatttctaaaaggaatacggaaa-caatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtttcacttgataacgacaaagagagcaagttaca 17583040  T
Q  401 aaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatat 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17583039 aaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttatcgtgaacatatgttagaggtggatgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatat 17582940  T
Q  501 gcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcac 600  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17582939 gcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtcttcatgattcgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcac 17582840  T
Q  601 ctatgctact 610  Q
    | ||| ||||    
T  17582839 caatgttact 17582830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 8926121 - 8925520
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8926121 cattttgtctgatgtaagtattggcaaaaattcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 8926022  T
Q  101 cacattg---gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatct 197  Q
     ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  8926021 tacattgtcggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttga-caaaataaaacatgctattttcctacaataaatct 8925927  T
Q  198 ttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtca 297  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8925926 ttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatatca 8925827  T
Q  298 atgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagtt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8925826 atgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcg------aagttcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagtt 8925733  T
Q  398 acaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaa 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8925732 acaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaagccacctaaaaa 8925633  T
Q  498 tatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcact 597  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  8925632 tatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccacactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactagattagcttcact 8925533  T
Q  598 cacctatgctact 610  Q
    |||  ||||||||    
T  8925532 cactgatgctact 8925520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 11499891 - 11500512
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatcccttttt-ggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatct 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11499891 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatccattttttggtttgtctatgaaacttgcaatatcttttataaacctaactattatgtaacgttaatct 11499990  T
Q  100 gcacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttc 184  Q
    ||||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11499991 gcacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaatatgctcttttc 11500086  T
Q  185 ctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  11500087 ctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtatctagcacttctc 11500186  T
Q  285 aaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggca 384  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11500187 aaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggca 11500286  T
Q  385 aagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagaga 484  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11500287 aagagagcaagtaacaaaaaatacttaggcggctaatggttcaaattttgccgagaacttatgttagaggtaagtgataagttaatttttgatctagaga 11500386  T
Q  485 agccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagacta 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  11500387 agccacctaaaaatatgcacgttcaaatcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcattttcaatagatcaacttaactctaatcctagacta 11500486  T
Q  585 gattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  11500487 gattatcttcactcaccgatgctact 11500512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 23766669 - 23766049
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23766669 cattttgtctgatgtaagtattggcaaaaattcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatttg 23766570  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
     ||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  23766569 tacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgagaaaaataaaacatgctattttcc 23766474  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23766473 tacagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctaacacttctca 23766374  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  23766373 aatgagatatcaatgacattttgaaaaggaacacggaaaataatcacactcatcgactaacaagctcaaaaaatgtataattgtcgcttgataacggcaa 23766274  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23766273 agagagcaagttacaaaaaatacttaggtggccaatggttcaaattttgacgagaacatgtgttagatgtaggtgataagttaattttttatctagagaa 23766174  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  23766173 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcactttaacattaatcctagactag 23766074  T
Q  586 attatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||  ||||||||    
T  23766073 attatcttcactcactgatgctact 23766049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 596
Target Start/End: Original strand, 5962741 - 5963336
Alignment:
Q  13 tgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattg----- 107  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||         
T  5962741 tgtaaatattggcaaaaatatctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacattaatttgcacattgttggt 5962840  T
Q  108 ----------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatct 197  Q
              ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||   |||||||    
T  5962841 tccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatttttttttcctattttaaatct 5962936  T
Q  198 ttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtca 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||    
T  5962937 ttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttgtaattaacactgcaatttgttttatacctagcaattctcaaatgagatatca 5963036  T
Q  298 atgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagtt 397  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  5963037 atgacatttctaaagggaacacggaaaaaaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagagtcgcttgataacgacaaagagagcaagtt 5963136  T
Q  398 acaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaa 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5963137 acaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaa 5963236  T
Q  498 tatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgta-ctttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcac 596  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5963237 tatgcacgttcaagttgtttccaaataaagatttagtgttcatgatccgcacctttcaacatatcaccttaactctaatcctatactagattatcttcac 5963336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 42687585 - 42688207
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42687585 cattttgtctggtgtaaatattggcaaaaatctctttttggttattctatgaaacctgcaatctcttttataaacctgactattatgtaacgttaatctg 42687684  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||||||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||      
T  42687685 cacattgttggttccttcattggttccaattagtttcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaaaataatattttaa 42687780  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||    
T  42687781 tacagtaaatatttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttataaatagcacttctca 42687880  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||| | |||    
T  42687881 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaataagctctaaaaaggtatgagtgtcgcttgataatgacaa 42687980  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42687981 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttaatctagagaa 42688080  T
Q  486 gc--cacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagact 583  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  42688081 gccacacctaaaaataagcacgttcaagtcgtttacaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctaaact 42688180  T
Q  584 agattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  42688181 agattatcttcactcaccgatgctact 42688207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 33638905 - 33638284
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33638905 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaattcctttttggttagtctatgacacttgcaatcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 33638806  T
Q  101 cacattggt--------------tccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcct 186  Q
    ||||||| |              |||||||||||||| |||||||    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  33638805 cacattgttggttccttcatgattccaattagtatcaagttaatt----acaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaatagaacatgttcttttccc 33638710  T
Q  187 acagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtac--atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctc 284  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||| |    
T  33638709 acagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacttatatatataacatctaattaacacttcaatttgttttgtacctagaacttccc 33638610  T
Q  285 aaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggca 384  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33638609 aaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacagggaaaaaaatcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggca 33638510  T
Q  385 aagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagaga 484  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  33638509 aagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaattttttatctagaga 33638410  T
Q  485 agccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagacta 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  33638409 agccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaaaatttggtgttcatgatccgcactttcaacaaatcaccttaactctaatcctagacaa 33638310  T
Q  585 gattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  33638309 gattatcttcactcaccgatgttact 33638284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 610
Target Start/End: Original strand, 14308941 - 14309507
Alignment:
Q  56 ttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaat 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    |    
T  14308941 ttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgtacattgttagttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----t 14309036  T
Q  141 gttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatata 240  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14309037 gttgttttcctaatctcttgagaaaaataaaacatgctattttcctacggtaaatctttacaatgttttggtaaatgttttagaaatgtacatatatata 14309136  T
Q  241 acttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcg 340  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14309137 acttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcg 14309236  T
Q  341 acaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||    
T  14309237 acaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcagtcaatggttcaaattttgccgaga 14309336  T
Q  441 acatatgttagaggtacgtgataagttaa-tttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttca 539  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||    
T  14309337 acatatgttagaggtaggtgataagttaatttttttatgtagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaattcctttccaaataaagatttagtgttca 14309436  T
Q  540 tgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14309437 tgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactagattatcttcactcactaatgctact 14309507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 17482369 - 17483001
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    | |||||||||    
T  17482369 cattttttctgatgtaaatattggcaaaaatcccattttggttagtttatgaaacttgcaatctctttcataaacctaactatta----atgttaatctg 17482464  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||||||||| ||||||||||||| |||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17482465 cacattgttggttccttcattggttccaattaatatcatgttaattataa----tgttgttt-cctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 17482559  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatata----------------acttctaattaactctgcaatttgttttg 269  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||                ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17482560 tacaacaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtatatatatatatatatatatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttg 17482659  T
Q  270 tacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgg 369  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||     
T  17482660 tacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatccacaaacaagctcaaaaaaggtatgagtgt 17482759  T
Q  370 cgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaa-aatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagtta 468  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17482760 cgcttgataacgacaaagagagcaagttacaaaaaaatacttaggcggtcaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagtta 17482859  T
Q  469 atttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaa 568  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| | |||| |||    
T  17482860 attttttatctagagaagctacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttcccaaataaagatttggtattcatgatccgcactttcaacaaaacaccataa 17482959  T
Q  569 ctctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  17482960 ctctaatcctagactagattatcttcactcatcgatgctact 17483001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 17570845 - 17570213
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    | |||||||||    
T  17570845 cattttttctgatgtaaatattggcaaaaatcccattttggttagtttatgaaacttgcaatctctttcataaacctaactatta----atgttaatctg 17570750  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||||||||| ||||||||||||| |||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17570749 cacattgttggttccttcattggttccaattaatatcatgttaattataa----tgttgttt-cctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 17570655  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatata----------------acttctaattaactctgcaatttgttttg 269  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||                ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17570654 tacaacaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtatatatatatatatatatatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttg 17570555  T
Q  270 tacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgg 369  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||     
T  17570554 tacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatccacaaacaagctcaaaaaaggtatgagtgt 17570455  T
Q  370 cgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaa-tacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagtta 468  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17570454 cgcttgataacgacaaagagagcaagttacaaaaaaatacttaggcggtcaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagtta 17570355  T
Q  469 atttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaa 568  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| | |||| |||    
T  17570354 attttttatctagagaagctacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttcccaaataaagatttggtattcatgatccgcactttcaacaaaacaccataa 17570255  T
Q  569 ctctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  17570254 ctctaatcctagactagattatcttcactcatcgatgctact 17570213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 23299953 - 23299333
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23299953 cattttgtctgatttaaatattgacaaaaatccctttttggttagtctatgacacttaaagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatatg 23299854  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||| ||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  23299853 cacattgttggttccttcattggttcaaattagtatcatgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaatagaacatgttcttttcc 23299758  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtac--atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttct 283  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  23299757 tacaggaaatatttataatgttttggtaaatgttttagaaatgtacttatatatataacatcaaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttcc 23299658  T
Q  284 caaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggc 383  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23299657 caaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacagggaaaa-aatcacactcatcaacatacaaactcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggc 23299559  T
Q  384 aaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagag 483  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  23299558 aaagagagaaagttacgaaaaatactttggcggtcaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttt-gatctagag 23299460  T
Q  484 aagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagact 583  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  23299459 aagccacctaaaaatatgcatgttcaagtcattcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagaca 23299360  T
Q  584 agattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  23299359 agattatcttcactcaccgatgctact 23299333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 47174508 - 47175115
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47174508 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtctatgacacttgaagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatatg 47174607  T
Q  101 cacattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatcttta 200  Q
    |||||||       || ||  |||||||||| |||    |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  47174608 cacattg-------ttggttccatgttaattataa----tgttgttttaataatctcttgaacaaaatagaacattctctttttctacagtaagtcttta 47174696  T
Q  201 taatgctttggtaaatgttttagaaatgtaca----------tatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  47174697 taatgctttggtaaatgttttagaaatgtacacacacacatatatatataacatctaattaacactgcaatttgttttgtacctaacacttcccaaatga 47174796  T
Q  291 gatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagaga 390  Q
    ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  47174797 gatatcaaggacatttctaaatggaacacggaaaacaatcacactcatcgagaaacaagctcagaaaaggtataagtgtcgcttgataacgacaaagaga 47174896  T
Q  391 gcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccac 490  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  47174897 gcaagttaagaaaaatacttaggcggccaatggttcaacttttgcagagaacatatgttagaggtaggtgataaactaatttttgatctagagaagccac 47174996  T
Q  491 ctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattat 590  Q
    |||||| |||||||  |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47174997 ctaaaattatgcac-atcaaatcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatctgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattat 47175095  T
Q  591 cttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||||| | ||||||||    
T  47175096 cttcactcatcgatgctact 47175115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 27735279 - 27734659
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27735279 cattttgtttgatgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtttatgacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 27735180  T
Q  101 cac---------------attggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||               |||| ||||||||||||||  ||||||| |||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27735179 cactttgttggttacttcattgattccaattagtatctagttaattataa----tgttgttttcataatctcttgaacaaaataaaacatgttcttttcc 27735084  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtac--atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttct 283  Q
    ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||      
T  27735083 tacaacaaatctttata-tgctttggtaaatgttttagaaatgtacttatatatataacatctgattaacaatgcaatttgttttgtacctagcactttc 27734985  T
Q  284 caaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggc 383  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  27734984 caaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacagggaaaaaattcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggtataagtgtcacttgataacggc 27734885  T
Q  384 aaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagag 483  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  27734884 aaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggtcaacggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgat-agctaatttttgatctagag 27734786  T
Q  484 aagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagact 583  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  27734785 aagccacctaaaaatatgcatgttcaaatcgttcccaaataaagatttggtattcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagaca 27734686  T
Q  584 agattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  27734685 agattatcttcactcaccgatgctact 27734659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 232 - 610
Target Start/End: Original strand, 17478187 - 17478566
Alignment:
Q  232 atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 331  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17478187 atatatataacttctaattaacagtgcaatttgttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 17478286  T
Q  332 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaa-aatacttaggcggccaatggttcaaat 430  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17478287 cactcatccacaaacaagctcaaaaaaggtatgagtgtcgcttgataacgacaaagagagcaagttacaaaaaaatacttaggcggtcaatggttcaaat 17478386  T
Q  431 tttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatt 530  Q
    |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17478387 tttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttcccaaataaagatt 17478486  T
Q  531 tggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||| |||||||| || |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  17478487 tggtattcatgatccgcactttcaacaaaacaccataactctaatcctagactagattatcttcactcatcgatgctact 17478566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 232 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 17575027 - 17574648
Alignment:
Q  232 atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 331  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17575027 atatatataacttctaattaacagtgcaatttgttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 17574928  T
Q  332 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaa-tacttaggcggccaatggttcaaat 430  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  17574927 cactcatccacaaacaagctcaaaaaaggtatgagtgtcgcttgataacgacaaagagagcaagttacaaaaaaatacttaggcggtcaatggttcaaat 17574828  T
Q  431 tttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatt 530  Q
    |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17574827 tttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttcccaaataaagatt 17574728  T
Q  531 tggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||| |||||||| || |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  17574727 tggtattcatgatccgcactttcaacaaaacaccataactctaatcctagactagattatcttcactcatcgatgctact 17574648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 232 - 610
Target Start/End: Original strand, 19521426 - 19521802
Alignment:
Q  232 atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 331  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19521426 atatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttttaaaaggaacacggaaaacaatca 19521525  T
Q  332 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 431  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19521526 cattcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgtttgataatcgcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggcc-atggttcaaatt 19521624  T
Q  432 ttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagattt 531  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19521625 ttgccgagaacatatgttagaggta-gtgataagttaatttttgatctagataagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaaaattt 19521723  T
Q  532 ggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19521724 ggtgttcatgatccgcactttcaacggatcaccttaactctaattctagactagattatcttcactcacagatgctact 19521802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 138 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 42827428 - 42826967
Alignment:
Q  138 aatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatat 237  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42827428 aatgttgttttcccaatctctt-aacaaaatagaacatgctcttttcctacaacaaatttttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtatatatat 42827330  T
Q  238 ataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactca 337  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42827329 ataacgtctaattaacactgcaatttgttttgtacctatcactttccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcg 42827230  T
Q  338 tcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcg 437  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||    
T  42827229 tcgataaacaagctcaaaaaaggtataagtg----------tcggcaaagagaacaagttacgaaaaatacttaggcggccaacggtttaacttttgccg 42827140  T
Q  438 tgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgtt 537  Q
      ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  42827139 ataacatatgttagaggtaggtgataagctaattttttacctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaaatcattctcaaataaagacttggtgtt 42827040  T
Q  538 catgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  42827039 catgatccgcactttcaacagatcaccttaattctaatcctatactagattatcttcactcactgatgctact 42826967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 232 - 610
Target Start/End: Original strand, 33031135 - 33031511
Alignment:
Q  232 atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 331  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33031135 atatatataacttctaattaacagtgcaatttgttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 33031234  T
Q  332 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 431  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  33031235 cactcaacgacaaacatgctcaaaaaaagtataagtgtcgcttgataacgacaaagagagcaagttacaaaaaaaacttaggcggtcaatgattcaaatt 33031334  T
Q  432 ttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagattt 531  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  33031335 ttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatttagataagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttcccaaataaagattt 33031434  T
Q  532 ggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  33031435 ggtgttcatgatctgcactttcaacatatcaccttaactctaatcttgaact--attatcttcactcaccgatgctact 33031511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 232 - 610
Target Start/End: Original strand, 42918136 - 42918516
Alignment:
Q  232 atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 331  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  42918136 atatatataacatctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacatcccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacatgaaaaacaatca 42918235  T
Q  332 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaa-ggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttac-aaaaaatacttaggcggccaatggttcaaa 429  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||     
T  42918236 tactcatcgacaaacaagctcaaaaaaaggtataagggtcgcttgataacggcaaagggagcaagttatgaaaaaatacttaggcggtcaatggttcaac 42918335  T
Q  430 ttttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagat 529  Q
    |||||  | |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  42918336 ttttgctgagaacatatgttagaggtaggtgaaaagctaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttcccaaataaagat 42918435  T
Q  530 ttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  42918436 ttggtgttcatgatgtgcactttcaacagaccaccttaactctaatcctagacaagattatcttcactcaccgatgctact 42918516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Original strand, 9149394 - 9149818
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgca--atctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatc 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9149394 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaattactttttggttagtctatgacacttgcagcattt-ttttataaacctaactattatgtaacgttaatc 9149492  T
Q  99 tgcacattggt---------------tccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctctttt 183  Q
    ||||||||| |               |||||||| ||||| ||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  9149493 tgcacattgttggttccttcattgattccaattaatatcaagttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaatagaacatgttctttt 9149588  T
Q  184 cctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtac--atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcattt 281  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  9149589 cctataacaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacttatatatataacatctaattaacactgaaatttgtgttgtacctagcactt 9149688  T
Q  282 ctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacg 381  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9149689 cccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacagggaaaa-aatcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacg 9149787  T
Q  382 gcaaagagagcaagttacaaaaaatacttag 412  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9149788 ataaagagagcaagttacgaaaaatacttag 9149818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 103 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 41262453 - 41262184
Alignment:
Q  103 cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttata 202  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  41262453 cattggttctaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatatcttgaacaaaataaaatatgttcttttcctacggtaaatctttata 41262358  T
Q  203 atgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgac 302  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  41262357 atgttttggtaaatattttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactacaatgtgttttatacctagcacttctcaaatgagatatcaatgac 41262258  T
Q  303 atttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataa 379  Q
    ||||   |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  41262257 attt---aaagaaagacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagcgcaaaaaaggtataagtgtctcttgataa 41262184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 17477922 - 17478171
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17477922 cattttttctgatgtaaatattggcaaaaatcccattttggttagtttatgaaacttgcaatctctttcataaacctaactattatgtaatgttaatctg 17478021  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||||||||||||||||||||||| |||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17478022 cacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattataa----tgttgttt-cctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 17478116  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatata 240  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17478117 tacaacaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatata 17478171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17575292 - 17575043
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17575292 cattttttctgatgtaaatattggcaaaaatcccattttggttagtttatgaaacttgcaatctctttcataaacctaactattatgtaatgttaatctg 17575193  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||||||||||||||||||||||| |||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17575192 cacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattataa----tgttgttt-cctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 17575098  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatata 240  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17575097 tacaacaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatata 17575043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 19521159 - 19521408
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19521159 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctctttttcgttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 19521258  T
Q  101 caca---------------ttggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||||               ||||| |||||||||||||||||||| |||| |     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19521259 cacattgttggttccttctttggtgccaattagtatcatgttaatggtaata-----tgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 19521353  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatata 240  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||    
T  19521354 tatagtaaatctttataatgctttgggaaatgttttataaatatatatatatata 19521408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 33030829 - 33031079
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  33030829 cattttgtctgatgtaaatactgacaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacttaactattatgtaacgttaatcta 33030928  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33030929 cacattgttggttccttcgttggttccaattagtatcatgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaacataaatcatgctcttttcc 33031024  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatata 240  Q
    ||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33031025 tacaacaaatctttataatgttttgataaatgttttagaaatgtacatatatata 33031079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 42245086 - 42244840
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42245086 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtctattactcttgcagtctcttttataaacataactattatgtaacgttaatctg 42244987  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||||||||||||||||||||||| |||    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42244986 cacattgttggttcattcattggttccaattagtatcatgttaattataa----tgttgctttcctaatctcttgaacaaaatagaacatgctcttttcc 42244891  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 236  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42244890 tacaataaatttttataatgttttggtaaatgttttagaaatgtacatata 42244840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 38434780 - 38434534
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38434780 cattttatctgatgtaaatattgacaaaaatcccttttttgttagtctatgacacttgtagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 38434681  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38434680 cacattgttggttccttcgttggttccaattagtatcatgttaattataaa----gttgttttcctaatctcttgaacaaaatagaacatgctcttttcc 38434585  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 236  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38434584 cacatcaaatctttataatgctttggtaaatgttatagaaatgtacatata 38434534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 42996481 - 42996727
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42996481 cattttatctgatgtaaatattggcaaaaatcccttttttgttagtctatgacacttgtagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatatg 42996580  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               ||| |||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42996581 cacattgttggttccttcgttggtttcaattagtatcatgttaattataaa----gttgttttcctaatctcttgaacaaaatagaacatgctcttttcc 42996676  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 236  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42996677 tacatcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtaaatata 42996727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 448 - 610
Target Start/End: Original strand, 9149815 - 9149977
Alignment:
Q  448 ttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgt 547  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |     
T  9149815 ttagaggtaggtgataagctaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatctgc 9149914  T
Q  548 actttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  9149915 actttcaacataccaccttaattctaatcctagacaagattatcttcactcaccgatgctact 9149977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4481617 - 4481371
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  4481617 cattttgtctgatgtaaatattgacaaaaatccatttttggctagtctatgacacttgtagtctcttttataaacctaactattaggtaacgttaatcta 4481518  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||| |||| |||||||| ||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4481517 cacattgttgattccttcattggttctaatttgtatcatgataattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaatagaacatgctcttttcc 4481422  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 236  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4481421 aacaacaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 4481371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 412 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 41262182 - 41261998
Alignment:
Q  412 ggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 511  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||     |||||||||||||||||||| |||||||    
T  41262182 ggcggccaatggttcaaattttgcctagtacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatc-----aagccacctaaaaatatgcatgttcaag 41262088  T
Q  512 tcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacc 601  Q
    ||||||  ||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41262087 tcgtttctaaataaagatttgatgtttatgatccacactttcaacagatcactttaactctaatcctagactagattatcttcactcacc 41261998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 42827605 - 42827499
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42827605 cattttgtctaatgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 42827506  T
Q  101 cacattg 107  Q
    |||||||    
T  42827505 cacattg 42827499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 47573683 - 47573462
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47573683 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 47573584  T
Q  101 ca---------------cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||               ||||||||| |||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  47573583 cacattattggttccttcattggttcaaattagtatcatgttaatt----ataatgttgttttcctaatcttttgaacaaaatagaacatgccctttttc 47573488  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttgg 211  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||    
T  47573487 tacagcagatctttataatgctttgg 47573462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 6911705 - 6911484
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6911705 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 6911606  T
Q  101 ca---------------cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||               ||||||||| |||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  6911605 cacattattggttccttcattggttcaaattagtatcatgttaatt----ataatgttgttttcctaatcttttgaacaaaatagaacatgccctttttc 6911510  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttgg 211  Q
    ||||| | |||||||||||| |||||    
T  6911509 tacagcagatctttataatgttttgg 6911484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 47163783 - 47163585
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaactt--gcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatc 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47163783 cattttgtctgatgtaaatattgataaaaatccatttttggttagtttatgacacttttgcagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatc 47163684  T
Q  99 tgcaca---ttggttc------------caattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctctttt 183  Q
    ||||||   |||||||            ||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||    
T  47163683 tgcacattgttggttccttcattgttttcaattagtatcatgttaatt----ataatgttgttttcctaatctcttatacaaaatagaatatgctctttt 47163588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 3795543 - 3795648
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  3795543 cattttatctgatgtaaatattagcaaaaatccctttttggttagtctatgacacttgcagtcttttttataaatctaactattatgtaactttaatctg 3795642  T
Q  101 cacatt 106  Q
    ||||||    
T  3795643 cacatt 3795648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 103 - 240
Target Start/End: Original strand, 42917972 - 42918106
Alignment:
Q  103 cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctctt-gaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttat 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| |||||  ||||||||||    
T  42917972 cattggttccaattaatatcatgttaatt----aaaatgttgtttttctaatgtctttgaacaaaatagaacatgttcttttactacaacaaatctttat 42918067  T
Q  202 aatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatata 240  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  42918068 aatgctttggtaaatcttttagtaatgtacttatatata 42918106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 9226451 - 9226344
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaa-acttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatct 99  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  9226451 cattttttctgatgtaaatattgggaaaaattcctttttggttagtctatgaacacttgcagtctcttttataaatctaactattatgtaatgttaatat 9226352  T
Q  100 gcacattg 107  Q
    ||||||||    
T  9226351 gcacattg 9226344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 42917827 - 42917883
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaactt 57  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  42917827 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatccttttttggttagtctatgacactt 42917883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 9226323 - 9226272
Alignment:
Q  113 aattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaat 168  Q
    ||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9226323 aattagtatcatgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaat 9226272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 66 - 107
Target Start/End: Original strand, 42917920 - 42917961
Alignment:
Q  66 ttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattg 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42917920 ttttataaacctcactattatgtaacgttaatatgcacattg 42917961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27735630 - 27735566
Alignment:
Q  274 tagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcat 338  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||||||||  || ||||||||||| |||||    
T  27735630 tagcatttcacaaatgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcat 27735566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 33639256 - 33639192
Alignment:
Q  274 tagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcat 338  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||||||||  || ||||||||||| |||||    
T  33639256 tagcatttcccaaatgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcat 33639192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 489; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 489; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 601
Target Start/End: Original strand, 2776340 - 2776937
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2776340 cattttgtctaatgtaaatattggcaaaaatccctttttgattagtcaatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattttgtaacgttaatctg 2776439  T
Q  101 cacattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatcttta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2776440 cacgttggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttgtcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatcttta 2776535  T
Q  201 taatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatg 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2776536 taatgctttggtaattgttttagaaatgtacatatatataacttctaattgacactgcaatttattttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatg 2776635  T
Q  301 acatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttaca 400  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2776636 acatttctaaaaggaatacggaaaacaatcacactcattgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtttcacttgataacggcaaagagagcaagttaca 2776735  T
Q  401 aaaaatactt-aggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaata 499  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2776736 aaaaatacttaaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaata 2776835  T
Q  500 tgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactca 599  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2776836 tgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgattcgcactttcaacagatcaccttaactctaatcccagactagattatcttcactca 2776935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 468; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 22116281 - 22115684
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttata----aacctaactattatgtaacgttaa 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |     ||||||||||||||||||||||||    
T  22116281 cattttgtctaatgtaaatattggcaaaaacccctttttggttagtcaatgaaacttgcaatcccttttttttttgaacctaactattatgtaacgttaa 22116182  T
Q  97 tctgcacattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22116181 tctgcacattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttgtcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatc 22116086  T
Q  197 tttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtc 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  22116085 tttataatgctttggtaattgttttagaaatgtacatatatataacttctaattgacactgcaatttgttttgtacctagcacttctcaaatgagatatc 22115986  T
Q  297 aatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagt 396  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||    
T  22115985 aatgacatttctaaaaggaatacgggaaacaatcacactcatcaacaaacaagctcaaaaaaggtataagtttcacttgataacgacaaagagagcaagt 22115886  T
Q  397 tacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaa 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22115885 tacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaa 22115786  T
Q  497 atatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcac 596  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22115785 atatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttaatgttcatgattcgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcac 22115686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 465; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 37701840 - 37701218
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37701840 cattttgtctgatgtaaatattgaaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 37701741  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  37701740 cacattgttggttccttcattggttcaaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaattaaacatgttcttttcc 37701645  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaat--gttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttct 283  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37701644 tacaataaatctttataatgctttggtaaatatgttttagaaatgtgcatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttct 37701545  T
Q  284 caaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggc 383  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37701544 caaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggc 37701445  T
Q  384 aaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagag 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37701444 aaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaattgttcaaattttaccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagag 37701345  T
Q  484 aagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagact 583  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37701344 aagccacctaaaaatatgcatgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctaaact 37701245  T
Q  584 agattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  37701244 agattatcttcactcaccgatgctact 37701218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 54331884 - 54331274
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  54331884 cattttgtctgatgtaagtattggcaaaaatccatttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaacaattacgtaacgttaatctg 54331785  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  54331784 cacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgtttttctaatctcttgagaaaaataaaacatgctattttcc 54331689  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54331688 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctca 54331589  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54331588 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaa 54331489  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54331488 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaa 54331389  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54331388 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactag 54331289  T
Q  586 attatcttcactcac 600  Q
    |||||||||||||||    
T  54331288 attatcttcactcac 54331274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 14829752 - 14829143
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14829752 cattttgtctgatgtaagtattggcaaaaattcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 14829653  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
     ||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  14829652 tacattgttggtttcttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgtagttttcctaatctcttgagaaaaataaaacatgctattttcc 14829557  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14829556 tacagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatatacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctca 14829457  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14829456 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaa 14829357  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14829356 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgccgataacatgtgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaa 14829257  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14829256 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactag 14829157  T
Q  586 attatcttcactca 599  Q
    ||||||||||||||    
T  14829156 attatcttcactca 14829143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 552
Target Start/End: Original strand, 21353147 - 21353693
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21353147 cattttgtctaatgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtcaatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 21353246  T
Q  101 cacattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatcttta 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21353247 cacattgttttcaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctattgaacaaaataaaacatgctcttttcctacggtaaatcttta 21353342  T
Q  201 taatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatg 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21353343 taatgctttggtaattgttttagaaatgtacatatatataacttctaattgacactgcaatttattttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatg 21353442  T
Q  301 acatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttaca 400  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21353443 acatttctaaaaggaatacg-aaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtttcacttgataacgacaaagagagcaagttaca 21353541  T
Q  401 aaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatat 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21353542 aaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtgggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatat 21353641  T
Q  501 gcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtacttt 552  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21353642 gcatgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgattcgcacttt 21353693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 5272516 - 5271896
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5272516 cattttgtctgatgtaagtattggcaaaaattcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 5272417  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
     ||||||               |||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  5272416 tacattgttggttccttcattggttctaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcttaatctcttgagaaaaataaaacatgctattttcc 5272321  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5272320 tacaataaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactacaatttgttttgtacctagcacttctca 5272221  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||    
T  5272220 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaatgtataaatgtcgcttgataacagcaa 5272121  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5272120 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaa 5272021  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  5272020 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactaa 5271921  T
Q  586 attatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||  ||||||||    
T  5271920 attatcttcactcactaatgctact 5271896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 19831626 - 19831018
Alignment:
Q  12 atgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattg---- 107  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||        
T  19831626 atgtaaatattgacaaaaatttctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataa-cctaactattatgtaatgttaatctgcacattgttgg 19831528  T
Q  108 -----------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatc 196  Q
               ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19831527 ttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatc 19831432  T
Q  197 tttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtc 296  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  19831431 tttataatgttttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctaacacttctcaaatgagatatc 19831332  T
Q  297 aatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagt 396  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19831331 aatgacatttctaaaaagaatacggaaagcaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacgacaaagagagcaagt 19831232  T
Q  397 tacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaa 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19831231 tacaaaaaatacttaggcggccaatgattcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatatagagaagccacctaaaa 19831132  T
Q  497 atatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcac 596  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19831131 atatgcacgttcaagtcgtttccaaataaatatttggtgttcatgatccacactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcac 19831032  T
Q  597 tcacctatgctact 610  Q
    ||||| ||||||||    
T  19831031 tcaccgatgctact 19831018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 13628100 - 13628724
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13628100 cattttgtctaatgtaaatattggcaaaaattcctttttggttagtctatgaaacttgcaatcacttttataaacctaactattatgtaacgttaatttg 13628199  T
Q  101 cacattggt---------------tccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttc- 184  Q
    ||||||| |               ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  13628200 cacattgttggttccttcattgattccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctctttttt 13628295  T
Q  185 ctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  13628296 ctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattttttttatacctagcacttctc 13628395  T
Q  285 aaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggca 384  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || |    
T  13628396 aaatgagatatcaatgagatttctaaaaggaaaatggaaaacaatcacactcatcgaaaaacaagctcaaaaaaggtataactgtcgcttgataatggaa 13628495  T
Q  385 aagagagcaagttac--aaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctaga 482  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13628496 aagagagcaagttacaaaaaaaatacttttgcggctaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctaga 13628595  T
Q  483 gaagccacctaaaa-atatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctaga 581  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  13628596 gaagccacctaaaatatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaatagatcaccttaactctaatcctaga 13628695  T
Q  582 ctagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13628696 ctagattatcttcactcaccgatgctact 13628724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 53342457 - 53343079
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  53342457 cattttgtctgatgtaaatattagcaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatttg 53342556  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
     ||||||               |||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53342557 tacattgttgattccttcattagttccaattagtattatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaatatgctcttttcc 53342652  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatat--atataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttct 283  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53342653 tacattaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttct 53342752  T
Q  284 caaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggc 383  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  53342753 caaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacatgggaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacgac 53342852  T
Q  384 aaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagag 483  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||  | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  53342853 aaatagagcaagttacaaaaaatacttaggcggtccatggttcaaatattgctgagaacatatgttagagataggtgataagttaatttttgatctagag 53342952  T
Q  484 aagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagact 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  53342953 aagccacctaaaaatatgcacgttcaattcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccacactttcaacaaatcaccttaactctaatcctaaact 53343052  T
Q  584 agattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  53343053 agattatcttcactcaccgatgctact 53343079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 34056804 - 34056195
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34056804 cattttgtctgatgtaagtattggcaaaaattcctttttggttaatctatgaaacttgcaatctcttttataaaactaactattatgtaacgttaatctg 34056705  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
     ||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  34056704 tacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgagaaaaataaaacatgctattttcc 34056609  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  34056608 tacagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatatacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctaa 34056509  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  34056508 aatgagatatcaatgacatttctaaaagaaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagatcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacgacaa 34056409  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34056408 agagagcaagttataaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgccgaaaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaa 34056309  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  34056308 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccacactttcaacaaatcaccttaactataatcctagacaag 34056209  T
Q  586 attatcttcactca 599  Q
    ||||| ||||||||    
T  34056208 attatattcactca 34056195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 33503239 - 33502622
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaa-tccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatct 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33503239 cattttgtctgatgtaaatattggaaaaaaatccctttttcgttagtctatgacacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatct 33503140  T
Q  100 gcacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttc 184  Q
    ||||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  33503139 gcacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgttgttttt 33503044  T
Q  185 ctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctc 284  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33503043 atacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacaatgcaatttgttttgtacctagcacttctc 33502944  T
Q  285 aaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggca 384  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  33502943 aaatgagatatcaatgacatttttaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaagaagctcaaaaaatgtataagtgtcgcttgataacggca 33502844  T
Q  385 aagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagaga 484  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  33502843 aagagagcaagtt--agaaaatacttaggcggctaat-gttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataaattaatttttgatctagaga 33502747  T
Q  485 agccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagacta 584  Q
    || ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  33502746 ag-cacctaataatatgcatgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaattctaatcctagacta 33502648  T
Q  585 gattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  33502647 gattatcttcactcaccgatgctact 33502622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 7644033 - 7643413
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7644033 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaacttccgttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttatagacctaactattatgtaacgttaatctg 7643934  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||||||||||||| ||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7643933 cacattgttggttccttcattggttccaattagtattatgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 7643838  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  7643837 tacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgcaacttctaattaatactgcaatttgttttgtacctagaacttctca 7643738  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  7643737 aataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcccactcatcgacaaacaagctcaaaaaaagtataagtgtcgcttgataacggcaa 7643638  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaa-tttttgatctagaga 484  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  7643637 agagagcaagttaca-aaaatacttaggcgcccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttgatctagaga 7643539  T
Q  485 agccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagacta 584  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7643538 agccgcctaataatatgcacgttcaagtcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactctaatcctagacta 7643439  T
Q  585 gattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7643438 gattatcttcactcaccgatgctact 7643413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 17699224 - 17699845
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattgg-aaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatct 99  Q
    ||||||||||  | |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17699224 cattttgtctggtttaaatattgataaaaaaaccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacataactattatgtaacgttaatct 17699323  T
Q  100 gcacatt---------------ggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttc 184  Q
    |||||||               | |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17699324 gcacatttttggttccttcattgcttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgaacgaaataaaacatgctcttttc 17699419  T
Q  185 ctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctc 284  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  17699420 ttacggtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtaagtatatataacttctaattaacactgcaatttgttttatacctagcacttctc 17699519  T
Q  285 aaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggca 384  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |    
T  17699520 aaatgagatatcaatgacatatctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtgtaagtgtcgtttgataacggaa 17699619  T
Q  385 aagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagaga 484  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17699620 aagagagcaagctacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgccaaaaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttaatctagaga 17699719  T
Q  485 agccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagacta 584  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  17699720 agccacctaaaaatatgcatcttcaagtcgtttctaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcacattaactctaatcctagacta 17699819  T
Q  585 gattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  17699820 gattatcttcactcaccgatgctact 17699845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 609
Target Start/End: Original strand, 23478958 - 23479568
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23478958 cattttgtctgatgtaagtattggcaaaaattcccttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 23479057  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
     ||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  23479058 tacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgagaaaaataaaacatgctattttcc 23479153  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    ||         |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  23479154 ta---------tttacaatgctttggtaaatgttttataaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttattttgtacctagcacttctaa 23479244  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  23479245 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaagatataagcgtcgcttgataacggcaa 23479344  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23479345 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtatgtgataagttaattttttatctagagaa 23479444  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23479445 gccgcctaaaaacatgcacgttcaagtcatttccaaataaagatttggtgttcatgatctgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactag 23479544  T
Q  586 attatcttcactcacctatgctac 609  Q
    |||||||||||||||  |||||||    
T  23479545 attatcttcactcactgatgctac 23479568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 40622195 - 40622820
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40622195 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtctatgacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatatg 40622294  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaa-catgctcttttc 184  Q
    |||||||               |||| ||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  40622295 cacattgttggttcattcattagttctaattagtatcatgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaaacatgttcttttc 40622390  T
Q  185 ctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtac----atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatt 280  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  40622391 ctacagcaaatctttataatgctttggtaaatgtcttagaaatgtacttatatatatataacatctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacg 40622490  T
Q  281 tctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataac 380  Q
    || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  40622491 tcccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacagggaaaaaaatcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataat 40622590  T
Q  381 ggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatcta 480  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  40622591 ggcaaatagagcaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatggttcaacttttgtcgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgatcta 40622690  T
Q  481 gagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctag 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || | ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  40622691 gagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttctcaaataaagatttggtcttcatgatccgcatttttaacagatcaccttaactctaatcctag 40622790  T
Q  581 actagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  40622791 acaagattatcttcactcaccgatgctact 40622820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 610
Target Start/End: Original strand, 28973144 - 28973731
Alignment:
Q  35 tttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattg---------------gttccaattagt 119  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||    
T  28973144 tttttagttagtctattaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaattagt 28973243  T
Q  120 atcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgtt 219  Q
    |||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28973244 atcatgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcatacaacaaatctttataatgctttggtaaatgtt 28973339  T
Q  220 ttagaaatgtacatat--atataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaac 317  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28973340 ttagaaatgtacatatatatataacttctaattaatactgcaatttgttttgtacctaacacttttcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaac 28973439  T
Q  318 acggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggc 417  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  28973440 acagaaaacaatcacactcatcgataaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcacttgataacggcaaagagagccagttataaaaaatacttaggcggc 28973539  T
Q  418 caatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttt 517  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  28973540 caatggttcaaa-tttgccgagaacagatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccatctaaaaatatgcacgttcaagtcgttc 28973638  T
Q  518 tcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
     |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  28973639 ccaaataaagatttggtgttcatgatctgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactaaattatattcactcaccgatgctact 28973731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 55998938 - 55998333
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  55998938 cattttgtctagtgtaaatattgacaaaaatccctttttggttagtatatgaaacttgcaatctcttttataaacttaactattatgttaaattaatctg 55998839  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||                |||||||||||| |||||||    
T  55998838 cacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttct---------------aataaaacatgcacttttcc 55998758  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  55998757 tacagtaaatctttataatgttttggtaaatgttttagaaatgtatatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttttacctagcacttctca 55998658  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55998657 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacagggaaaaaaattacactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaa 55998558  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55998557 agagagcaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaa 55998458  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |  || || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  55998457 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttgatgacccacacgttgaacagatcaccttaactctaatcctagactag 55998358  T
Q  586 attatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  55998357 attatcttcactcaccgatgctact 55998333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 8530864 - 8531487
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8530864 cattttgtctgatgtacatattgacaaaaatccctttttggttagtctatgacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaatgttaatctg 8530963  T
Q  101 cacattggt---------------tccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||||||| |               |||||||||||||| ||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  8530964 cacattgttgattccttcattgattccaattagtatcaagttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaatagaacatgttcttttcc 8531059  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtac--atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttct 283  Q
    ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  8531060 tacaacaaatctttataatgttttggtaaatgttttagaaatgtacttatatatataacatctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttcc 8531159  T
Q  284 caaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaa-aaggtataagtggcgcttgataacgg 382  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||     
T  8531160 caaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacaggggaaaaaatcacattcatcgacaaacaaactcaaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacga 8531259  T
Q  383 caaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctaga 482  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  8531260 caaagagaacaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatggttaaacttttgtcgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaattttttatctaga 8531359  T
Q  483 gaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagac 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  8531360 gaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaatagatcaccttaactctaatcatagac 8531459  T
Q  583 tagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||    
T  8531460 aagattatcttcactcaccgatgctact 8531487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 41984474 - 41983854
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41984474 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatccttttttggttagtctatgacacttgtagtctcttttataaacttaactattatgtaacgttaatctg 41984375  T
Q  101 cacattg--------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcct 186  Q
    |||||||              |||||||| ||||||||||||||| |||    |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  41984374 cacattgttggtttcttcattgttccaataagtatcatgttaattataa----tgttgttttcataatctcttgaacaagatagaacatgctcttttcgt 41984279  T
Q  187 acagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtac--atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctc 284  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||| |    
T  41984278 acagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtaattatatatataacatctaattagcactgcaatttgttttgcacctaacacttccc 41984179  T
Q  285 aaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggca 384  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |    
T  41984178 aaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcattagcaaacaagctcaaaaaatgtataagtgtcgcttgataatggga 41984079  T
Q  385 aagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagaga 484  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||    
T  41984078 aagagagcaagttatgaaaaatacataggcggtcaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaa-ttttaatctagaga 41983980  T
Q  485 agccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagacta 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  41983979 agccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgctctttcaacagatcaccttaactctaatcctaaacta 41983880  T
Q  585 gattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41983879 gattatcttcactcaccgatgctact 41983854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 36857136 - 36857737
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  36857136 cattttgtctaatgtaagtattggcaaaaatctctttttggttagtctatgaaacttacaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaattt- 36857234  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               ||||||||||||| ||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  36857235 cacattgttggttccttcgttggttccaattagtaccatgttaattgtaag----gttgttttcctaatctcttgagcaaaataaaacatgctattttcc 36857330  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  36857331 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataaaatctaattaacactgcaatttgttttgtatctagcacttctca 36857430  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  36857431 aatgagatatcaatgatatttctaagaggaacacggaaaaccatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacgacaa 36857530  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||| ||||                  ||||| ||||||||||    
T  36857531 agagagcaagttacaaaaaatacttaggtggccaatcgttcaaattttaccgagaacatatattag------------------ttttttatctagagaa 36857612  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||    
T  36857613 gccacctaaaaatatgcaggttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgatgcgcactttcaacagatcaccttaactctaattttagagtag 36857712  T
Q  586 attatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||    
T  36857713 attatcctcactcactaatgctact 36857737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 610
Target Start/End: Original strand, 17740103 - 17740710
Alignment:
Q  16 aaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattggt------ 109  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |          
T  17740103 aaatattgacaaaaatccctttttggttagtctatgacacttgtagtcttttttataaacctaactattttgtaacgttaatctgcacattgttggttcc 17740202  T
Q  110 ---------tccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatcttta 200  Q
             |||||||||||||| ||||||| |||    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  17740203 ttcattgattccaattagtatcaagttaattataa----tgttcttttcctaatctcttgaacaaaatagaatatgttcttttcctacagcaaatcttta 17740298  T
Q  201 taatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatata--acttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||    
T  17740299 taatgctttggtaaatgttttagaaatgtacttatatatagaacatctaattaacgctgcaatttgttttgtacctagcactttccaaatgagatatcaa 17740398  T
Q  299 tgacatttctaaaaggaacacggaaaacaa-tcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagtt 397  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17740399 ggacatttctaaaaggaacagggaaaaaaaatcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagtt 17740498  T
Q  398 acaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaa 497  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17740499 acaaaaaatacttaggcggtcaatgattaaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaa-ttttgatctagagaagccacctaaaaa 17740597  T
Q  498 tatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcact 597  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  17740598 tatgcacgttcaagtcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagaccaccttaactctaatcctagaaaatattatcttcact 17740697  T
Q  598 cacctatgctact 610  Q
    |||| ||||||||    
T  17740698 caccgatgctact 17740710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 47557666 - 47557047
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  47557666 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtctatgacacttgcagtcttttttataaacctgactgttatgtaacgttaatctg 47557567  T
Q  101 cacattggt---------------tccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||||||| |               |||||||||| ||| ||||||| |||    | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  47557566 cacattgttggttccttcattgattccaattagtttcaagttaattataa----ttttgttttccaaatctcttgaacaaaatagaacatattcttttcc 47557471  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtac--atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttct 283  Q
     |||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||     
T  47557470 cacaacaaatcttcataatgctttggtaaatattttagaaatgtacttatatatataacatctaattaacactgcaatttgttttgtaccttgcacttcc 47557371  T
Q  284 caaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggc 383  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47557370 caaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacatggaaaaaaatcacattcatcgacaaacaaactcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggc 47557271  T
Q  384 aaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagag 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  47557270 aaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggtcaatgatgcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaattttttatgtagag 47557171  T
Q  484 aagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagact 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  47557170 aagccacctaaaaatatgcacgttcaagtc---cacaaataaagatttggtgttcatgattcgcaatttcaacagatcaccttaactctaatcctagaca 47557074  T
Q  584 agattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  47557073 agattatcttcaatcaccgatgctact 47557047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 13 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 28135293 - 28134826
Alignment:
Q  13 tgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattg----- 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  28135293 tgtaaatattggcaaaaatccctttt-ggttagtttatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggt 28135195  T
Q  108 ----------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatct 197  Q
              ||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28135194 tctttcattggtttcaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgtttttctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatct 28135099  T
Q  198 ttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtca 297  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||    
T  28135098 ttataatgttttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactacaatttgttttatacctagcaattctcaaatgagatatca 28134999  T
Q  298 atgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagtt 397  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28134998 atgacatatctaaaaggaagacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagtt 28134899  T
Q  398 acaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaat 470  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28134898 acaaaaaataattaggcgaccaatggttcgaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaat 28134826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 35495784 - 35495298
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35495784 cattttgtctgatgtaaatattgacaaaaatacctttttggttagtatatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaaagttaatctg 35495685  T
Q  101 cacat---tggttcc------------aattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||   |||||||            |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35495684 cacataattggttccttcattgattcaaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgttcttttcc 35495589  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  35495588 tacggtaaatctttataatgcgttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctgattaacactgcaatttgttttgtac-tagcacttctaa 35495490  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  35495489 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaataagctcaaaaaaggaataagtgtcgcttgataacgacaa 35495390  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgat 477  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35495389 agagaacatgttacaaaaaatacttaggtggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtatgtgataagttaatttttgat 35495298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 242 - 610
Target Start/End: Original strand, 38008561 - 38008930
Alignment:
Q  242 cttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcga 341  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38008561 cttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttttcaaatgagatatcaatgacatttttaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcga 38008660  T
Q  342 caaacaagctcaaaa-aaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtga 440  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  38008661 caaacaagctcaaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacagtaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgccgaga 38008760  T
Q  441 acatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcat 540  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  38008761 acatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgctcccaaataaagatttggtgttcat 38008860  T
Q  541 gattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  38008861 gatccgcactttcaacatatcaccttaactctaatcctagacaagattatcttcactcaccgatgctact 38008930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 312 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 36515259 - 36514961
Alignment:
Q  312 aggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatactta 411  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36515259 aggaatacgggaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtttcacttgataacagcaaagagagcaagttacaaaaaatactta 36515160  T
Q  412 ggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36515159 ggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaaa 36515060  T
Q  512 tcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  36515059 tcatttccaaataaagatttggtgttcatgattcacacttttaacagatcaccttaactttaatcctagactagattatcttcactcaccgatgttact 36514961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 38007892 - 38008152
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38007892 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaattcctttttggttagcctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 38007991  T
Q  101 --ca-------------cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
      ||             ||||||||||||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38007992 ttcattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 38008087  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaatt 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38008088 tacagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttaaaaatgtacatatatataacttctaatt 38008152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 39742973 - 39742723
Alignment:
Q  15 taaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattggt----- 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |         
T  39742973 taaatattggcaaaaatccctttttggttagtcaatgaaacttgcaatctcttttataaacctgactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttc 39742874  T
Q  110 ----------tccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatcttt 199  Q
              ||||||||| |||||||||||| |||    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39742873 cttcattgtttccaattagcatcatgttaattctaa----tgttgttttcctaatatattgaacaaaataaaacatgctcttttcctacggtaaatcttt 39742778  T
Q  200 ataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaact 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39742777 ataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaact 39742723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3839595 - 3839360
Alignment:
Q  12 atgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattg---- 107  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  3839595 atgtaaatattggcaaaaattcctttttggttagtctatgattcttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttgg 3839496  T
Q  108 -----------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatc 196  Q
               |||||| ||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  3839495 ttccttcattggttccagttagtatcatgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctatagcaaatt 3839400  T
Q  197 tttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3839399 tttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 3839360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 422 - 610
Target Start/End: Original strand, 7847505 - 7847693
Alignment:
Q  422 ggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaa 521  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  7847505 ggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgacctagagaagccacctaaaaatatgcacattcaagtcgttcccaa 7847604  T
Q  522 ataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  7847605 ataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcactgatgctact 7847693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26870530 - 26870284
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26870530 cattttatctgatgtaaatattggcaaaaatcccttttttgttagtctatgacacttgtagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatatg 26870431  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               ||| |||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26870430 cacattgttggttccttcgttggtttcaattagtatcatgttaattataaa----gttgttttcctaatctcttgaacaaaatagaacatgctcttttcc 26870335  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 236  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26870334 tacatcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 26870284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 232 - 426
Target Start/End: Original strand, 7842627 - 7842811
Alignment:
Q  232 atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 331  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7842627 atatatataacatctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcactttccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacacggaaaataatca 7842726  T
Q  332 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttc 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||          || | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  7842727 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataag----------tatcagcaaagagagcaagttacgaaaaatacttagacggccaatggttc 7842811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 740651 - 740430
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  740651 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 740552  T
Q  101 ca---------------cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||               ||||||||| |||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  740551 cacattattggttccttcattggttcaaattagtatcatgttaatt----ataatgttgttttcctaatcttttgaacaaaatagaacatgccctttttc 740456  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttgg 211  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||    
T  740455 tacagcatatctttataatgctttgg 740430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 1944540 - 1944738
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1944540 cattttgtctgatgtaaatattgacaaaaatccctttttggttagtttatgacacttacagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 1944639  T
Q  101 ca---------------cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||               |||||||| ||||||||||||||||||||    | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1944640 cacattgttggttctttcattggtttcaattagtatcatgttaatt----ataatgttgtttttctaatctcttgaacaaaatagaacatgctcttttcc 1944735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 15520764 - 15520985
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15520764 cattttgtctgatgtaaatattgacaaaaatctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 15520863  T
Q  101 ca---------------cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||               ||||||||| |||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  15520864 cacattgttggttccttcattggttcaaattagtatcatgttaatt----ataatgttgttttcctaatcttttgaacaaaatagaacatgccctttttc 15520959  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttgg 211  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||    
T  15520960 tacagcagatctttataatgctttgg 15520985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 53991488 - 53991383
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53991488 cattttatctgatgtaaatattagcaaaaatccctttttggttagtctatgacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 53991389  T
Q  101 cacatt 106  Q
    ||||||    
T  53991388 cacatt 53991383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 35707869 - 35707764
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35707869 cattttatctgatgtaaatattagcaaaaatccctttttggttggtctatgacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 35707770  T
Q  101 cacatt 106  Q
    ||||||    
T  35707769 cacatt 35707764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 47720310 - 47720204
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||    
T  47720310 cattttgtctgatgtaaatattggaaaaaattcatttttggttagtctacgacacttgcagtctcttttataaatctaactattatgtgatgttaatatg 47720211  T
Q  101 cacattg 107  Q
    |||||||    
T  47720210 cacattg 47720204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 529 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 35495303 - 35495222
Alignment:
Q  529 tttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35495303 tttgatgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactctaatcctacactagattatcttcactcaccgatgctact 35495222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 521 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 39742704 - 39742615
Alignment:
Q  521 aataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  39742704 aataaagatttgatgttcatgatacacactttcaacatatcaccttaactctaatcatagactagattatcttcactcactgatgctact 39742615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 574388 - 574283
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||   |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  574388 cattttatctgatgtaaatattatcaaaaattcctttttagttagtctatgacacttgcagtcttttaaataaacctaactattatgtaacgttaatctg 574289  T
Q  101 cacatt 106  Q
    ||||||    
T  574288 cacatt 574283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 512
Target Start/End: Original strand, 56541122 - 56541360
Alignment:
Q  274 tagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgct 373  Q
    ||||||||| | ||||| || |||| |||  ||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||  | ||| ||||||  |||||||||||  |||    
T  56541122 tagcatttccccaatgatatatcaaggacggttctaaagggaaaacggaaaacgatgacactcattgatgaccaaactcaaacgaggtataagtgttgct 56541221  T
Q  374 tgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttt 473  Q
    |||| || ||| ||||||||| | |  ||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |  |||  |  ||||||| || ||| |||  |||| ||    
T  56541222 tgattactgcagagagagcaaatcatgaaaaatacttaggtgaccaatggttcaacttttgccaagaatgtgcgttagagataggtggtaaactaatctt 56541321  T
Q  474 tgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagt 512  Q
    | |||| ||  | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  56541322 taatcttgaacaaccacctaaaaacatgcacgttcaagt 56541360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 338
Target Start/End: Original strand, 13627749 - 13627813
Alignment:
Q  274 tagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcat 338  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||  ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  13627749 tagcatttctcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaaacgcaaaacaatcactctcat 13627813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 470; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 1073497 - 1072877
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1073497 cattttgtctgatgtaagtattggcaaaaattcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 1073398  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  1073397 cacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgagaaaaataaaacatgctattttcc 1073302  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1073301 tacagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctca 1073202  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1073201 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaa 1073102  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1073101 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaa 1073002  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1073001 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactag 1072902  T
Q  586 attatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||  ||||||||    
T  1072901 attatcttcactcactgatgctact 1072877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 18599220 - 18598599
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18599220 cattttgtctgatgtaagtattggcaaaaattcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 18599121  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  18599120 cacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgagaaaaataaaacatgctattttcc 18599025  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18599024 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctca 18598925  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18598924 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaa 18598825  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaat-ttttgatctagaga 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  18598824 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttttatctagaga 18598725  T
Q  485 agccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagacta 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18598724 agccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagacta 18598625  T
Q  585 gattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||    
T  18598624 gattatcttcactcactgatgctact 18598599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 601
Target Start/End: Original strand, 18311819 - 18312414
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18311819 cattttgtctaatgtaaatattggcaaaaatccctttttgtttagtcaatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 18311918  T
Q  101 cacattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatcttta 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18311919 cacattagttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatcttttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatcatta 18312014  T
Q  201 taatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatg 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  18312015 taatgctttggtaattgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttattttgtacctagcacttctcaaatgagataacaatg 18312114  T
Q  301 acatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttaca 400  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18312115 atatttctaaaaggaacacgggaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtttcacttgataacggcaaagagatcaagttaca 18312214  T
Q  401 aaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatat 500  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18312215 aaaaatacttaggcagtcaatggttcaaattttgtcgataacatatgttagaggtaggtgataaattaatttttgatctagagaagccacctaaaaatat 18312314  T
Q  501 gcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcac 600  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18312315 gcatgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgattcgcactttcaacagatcaccttaa-tctaatcgtagactagattatcttcactcac 18312413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 35041121 - 35041721
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35041121 cattttgtctaatgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtcaatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatttg 35041220  T
Q  101 cacattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatcttta 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35041221 cacattgatttcaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacaataaatcttta 35041316  T
Q  201 taatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatg 300  Q
    |||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  35041317 taatgctttggtaattgtt----aaatgtacatatatataacttctaattgacactgcaatttgttttgtaccttgcacttctcaaatgagatatcaatg 35041412  T
Q  301 acatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttaca 400  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35041413 acatttctaaaaggaatacggaaa-caatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaatgtataagtttcacttgataacggcaaagagagcaagttaca 35041511  T
Q  401 aaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatat 500  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35041512 aaaaatacttaggtggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtgggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatat 35041611  T
Q  501 gcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcac 600  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35041612 gcacgttcaaatcgtttccaaataaagatttggtgttcatgattcgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcacttac 35041711  T
Q  601 ctatgctact 610  Q
    | ||| ||||    
T  35041712 caatgttact 35041721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 34855968 - 34856585
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34855968 cattttgtctgatgtaagtgttggcaaaaattcctttttggttagtctatgaaacttgtaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 34856067  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
     ||||||               |||||||||||||||||||||||| |||     ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||    
T  34856068 tacattgttggtttcttcattggttccaattagtatcatgttaattataac----gttgttttcctaatctcttgaa---aataaaacatgctattttcc 34856160  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34856161 tacagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctca 34856260  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34856261 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaa 34856360  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34856361 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggtcaatggttcaaattttgccgagaacatgtgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaa 34856460  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34856461 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactag 34856560  T
Q  586 attatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||  ||||||||    
T  34856561 attatcttcactcactgatgctact 34856585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 14888171 - 14887552
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14888171 cattttgtctgatgtaagtattggcaaaaattcctttttggttagtcta-gaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaatgttaatctg 14888073  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
     ||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||    
T  14888072 tacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgagaaaaataaaacatgttattttcc 14887977  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14887976 tgcagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctca 14887877  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||    
T  14887876 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacattcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgctttatatcgtcaa 14887777  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14887776 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatgtgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaa 14887677  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14887676 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatcctcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactag 14887577  T
Q  586 attatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||  ||||||||    
T  14887576 attatcttcactcactgatgctact 14887552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 2521177 - 2521798
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaat-ccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatct 99  Q
    |||||||||| |||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2521177 cattttgtctgatgtaagtattgacaaaaattccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaattt 2521276  T
Q  100 gcacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttc 184  Q
    | ||||||               ||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  2521277 gtacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatattaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgagaaaaataaaacatgctattttc 2521372  T
Q  185 ctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctc 284  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||     
T  2521373 ctacagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtgcatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttcta 2521472  T
Q  285 aaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggca 384  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||    
T  2521473 aaatgagatatcaatgacatttctaaaagaaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaagatgtaagtgtcgcttgataacgaca 2521572  T
Q  385 aagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagaga 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  2521573 aagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagaga 2521672  T
Q  485 agccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagacta 584  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  2521673 agccaccttaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatgtcaccttaactttaatcctagacta 2521772  T
Q  585 gattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||    
T  2521773 gattatcttcactcactgatgctact 2521798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 17939535 - 17940153
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17939535 cattttttctgatgtaaatattggcaaaaattctttttttgttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 17939634  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||||||| ||||||||||||||| |||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17939635 cacattgttaattccttcattggttccaatcagtatcatgttaattataa----tgttattttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctattttcc 17939730  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||    
T  17939731 tacaacaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgta--tatatataacttctaattaacactacaatttgttttgtacctagcacttatca 17939828  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||    
T  17939829 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtatgagtgtc-cttgataacgacaa 17939927  T
Q  386 agagagcaagttacaaaa-aatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagaga 484  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  17939928 agagagcaagttacaaaaaaatacttatgcggtcaatggtttaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaagttttgatctagaga 17940027  T
Q  485 agccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagacta 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17940028 agccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagacta 17940127  T
Q  585 gattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  17940128 gattatcttcactcaccgatgctact 17940153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 610
Target Start/End: Original strand, 4424511 - 4425118
Alignment:
Q  13 tgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacatt------ 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||          
T  4424511 tgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatctaacattaatctgcacattattggt 4424610  T
Q  107 ---------ggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatct 197  Q
             |||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4424611 tccttcattggttccaattagtatcat-ttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacaataaatct 4424705  T
Q  198 ttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtca 297  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||| |||    
T  4424706 ttataacgctttgataaatgttttagaaatgtgcatatatataacttctaattcacactgcaatatgttttatacctaacacttctcaaatgagatatca 4424805  T
Q  298 atgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagtt 397  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  4424806 atgacatttttaaaaggaacacggaaaacaattacactcatcgacaaacaagctcaaacaaggtataagtgtcgcttgataacgacaaagaaagcaagtt 4424905  T
Q  398 acaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaa 497  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  4424906 acaaaaaatacttaggcgaccaatggtacaaattttgctgagaacatatgtaagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaaggcacctagaaa 4425005  T
Q  498 tatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcact 597  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4425006 tatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactctaattgtagactagattatcttcact 4425105  T
Q  598 cacctatgctact 610  Q
     ||| ||||||||    
T  4425106 gaccgatgctact 4425118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 22374075 - 22373457
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22374075 cattttgtctgatgtaaatattcacaaaaatccctttttggttattctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatatg 22373976  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               ||||||||||||| |||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22373975 cacattgttggttccctcattggttccaattagtagcatgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaacataaatcatgctcttttcc 22373880  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| | ||||||    
T  22373879 tacaacaaatttttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactacaatttattttgtacctagtacttctca 22373780  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  22373779 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcaacaaacaagctcaataaaggtataagtgtcgcttgataacgacaa 22373680  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22373679 agagagcaagttaca-aaaatacttaagcggccaatggttcaaattttgtcgagaa-atatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatttagagaa 22373582  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  22373581 gccacctaaaaatatgcacgttcaggtcattcccaaataaagatttggtgttcatgatctgcactttcaacagatcaccttaactttaatcctagactag 22373482  T
Q  586 attatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||  ||||||||    
T  22373481 attatcttcactcactgatgctact 22373457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 610
Target Start/End: Original strand, 30044255 - 30044841
Alignment:
Q  35 tttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattg---------------gttccaattagt 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||    
T  30044255 tttttagttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaaccgaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaattagt 30044354  T
Q  120 atcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgtt 219  Q
    |||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30044355 atcatgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgtttttttcatacagcaaatctttataatgctttggtaaatgtt 30044450  T
Q  220 ttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacac 319  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30044451 ttagaaatgttcatatatataacttctaattaacagtgcaatttgttttgtacctagcacttttcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacac 30044550  T
Q  320 ggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggcca 419  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  30044551 agaaaacaatcacactcattgataaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgtttgataacgacaaagagagtcagttataaaaaatacttaggcggcca 30044650  T
Q  420 atggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacc-taaaaatatgcacgttcaagtcgtttt 518  Q
    |||||| ||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||      
T  30044651 atggtttaaa-tttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccaccggaaaaatatgcacgttcaagtcgttcc 30044749  T
Q  519 caaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  30044750 caaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactctaattctagactagattatattcactcactgatgctact 30044841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 34321105 - 34321728
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctctttt-ataaacctaactattatgtaacgttaatct 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||| ||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34321105 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaagccttttttggttagtatatgacacttgcagttttttttcataaacctaactattatgtaacgttaatct 34321204  T
Q  100 gcacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttc 184  Q
    ||||||||               |||||||||||||||||||||||| |||    ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  34321205 gcacattgttgattccttcattggttccaattagtatcatgttaattataa----tgttgcttttctaatctcttgaacaaaatagaacatgttcttttc 34321300  T
Q  185 ctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacat--atatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttc 282  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||| || |||    
T  34321301 ttacagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacttgtatatataatatttaattaacattgcaatttgttttgtacctaacacttc 34321400  T
Q  283 tcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacgg 382  Q
     |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34321401 ccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaagaacacagaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacgg 34321500  T
Q  383 caaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctaga 482  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||| |||| ||  |||||||| |||||||    
T  34321501 caaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggccaatggttcaacttttgctgagaacatatgttagaggtaggtgaaaaactaatttttcatctaga 34321600  T
Q  483 gaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagac 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  34321601 gaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagaa 34321700  T
Q  583 tagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
     | |||||||||||||||| ||||||||    
T  34321701 aaaattatcttcactcaccgatgctact 34321728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 103 - 600
Target Start/End: Original strand, 21799672 - 21800164
Alignment:
Q  103 cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttata 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  21799672 cattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgagaaaaataaaacatgctattttcctacggtaaatctttaca 21799767  T
Q  203 atgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgca-atttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  21799768 atgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcagtttttttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatga 21799867  T
Q  302 catttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttac-a 400  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  21799868 catttctaaaaggaacacggaaaataatcacactca-cgacaaacaagctcaaaaaagctataagtgtcgcttgataacggcaaagtgagcaagttacaa 21799966  T
Q  401 aaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatat 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  21799967 aaaaatacttaggcggccaatggtttaaattttgacgaaaacatgtattagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaagtcacataaaaatat 21800066  T
Q  501 gcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcac 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21800067 gcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttg--gttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactagattatcttcactcac 21800164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 33321687 - 33321067
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33321687 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtcaatgacacttgcagccttttttattaacctaactattatgtaacgttaatatg 33321588  T
Q  101 cacattggt---------------tccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgtttt-cctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttc 184  Q
    ||||||| |               |||||||||||||| ||||||| |||     |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  33321587 cacattgttggttccttcattgattccaattagtatcaagttaattataac----gttgtttttcctaatctcttgaacaaaattgaacatgttcttttc 33321492  T
Q  185 ctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatata--acttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttc 282  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||    
T  33321491 ctacagcaaatctttataatgttttggta--tgttttagaaatgtacttatatatagaacatctaattaacactgcaatttgttttgtacctaacacttc 33321394  T
Q  283 tcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacgg 382  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  33321393 ccaaatgagatatcaatgacatttctaataggaacagggaaaa-aatcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggtataaatgtcgcttgataacgg 33321295  T
Q  383 caaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctaga 482  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  33321294 caaaaagagcaagttacgaaaaatatttaggcggtcaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgatctaga 33321195  T
Q  483 gaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagac 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  33321194 gaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacaaatcaccttaactttaatcctagac 33321095  T
Q  583 tagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||    
T  33321094 aagattatcttcactcaccgatgctact 33321067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 15275671 - 15276269
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  15275671 cattttatctgatgtaaatattggtaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaaccttaatccg 15275770  T
Q  101 cacattg--------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcc-taatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||              |||| |||||||||| |||||||| |||    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15275771 cacattgttggttcctcattggttctaattagtatcgtgttaattataa----tgttgtttttcataatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 15275866  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatata--acttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttct 283  Q
    ||||  ||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  15275867 tacaacaaatctttataatg------------ttttagaaatgtacatatatatataacttctaattaacactgcaattcgttttgtatctagcacttct 15275954  T
Q  284 caaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggc 383  Q
    |||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  15275955 caa------------tgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaagtataagtgtcgcttgataacagc 15276042  T
Q  384 aaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagag 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15276043 aaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagag 15276142  T
Q  484 aagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagact 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  15276143 aagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttcccaactaaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacacatcaccttaactctaatcctagacg 15276242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 195 - 610
Target Start/End: Original strand, 7222528 - 7222944
Alignment:
Q  195 tctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatg 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  7222528 tctttataatgctttggtaaatgtttaagaaatgtacatatatataacttctaattaacactacaatttgttttgtacctagcacttctcaaatgagata 7222627  T
Q  295 tcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||| || ||||| |||||||    
T  7222628 tcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagttcaaaaaagatataagcgtcgcttgattacagcaaaaagagcaa 7222727  T
Q  395 gttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacct-a 493  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7222728 gttacaaaaaatacttaggcggtcaatggttcaaattttgccgagaacatatgttataggtaagtgataaattaatttttgatctagagaagccacctaa 7222827  T
Q  494 aaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatctt 593  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7222828 aaaatatgcacattcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcactttaactctaatcctagactagattatctt 7222927  T
Q  594 cactcacctatgctact 610  Q
    |||||||  ||||||||    
T  7222928 cactcactgatgctact 7222944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 232 - 516
Target Start/End: Original strand, 14831772 - 14832056
Alignment:
Q  232 atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 331  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  14831772 atatatataacatctaattaacacagcaatttgttttttacctagcacttcccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacagggaaaaaaatca 14831871  T
Q  332 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 431  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  14831872 cactcatcgacaaaaaaactcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaaagagagaaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatggttcaactt 14831971  T
Q  432 ttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtt 516  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14831972 ttgtcaagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcgcgttcaagtcgtt 14832056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 25540086 - 25540440
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25540086 cattttgtctgatgtaaatattgacaaaaatcccttttaggttagtctatgacacttgcagtcttttttataagcctaactattatgtaacgttaatctg 25540185  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||||||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  25540186 cacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaataaaatagaacatgttcttttcc 25540281  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    |||   |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  25540282 tacgacaaatctttataatgattaggtaactgttttagaaatgtacttatatataacatctaattaacactgcaatttgttttgtatctagcacttccca 25540381  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaa 344  Q
    | |||||| |||| ||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||    
T  25540382 agtgagatatcaaggacatttctaaaaggaagaggggaaaaaatcacactcatcgacaa 25540440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 471 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 11933235 - 11933096
Alignment:
Q  471 ttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaact 570  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  11933235 ttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaact 11933136  T
Q  571 ctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11933135 ctaatcctagactagattatcttcactcactgatgctact 11933096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 14831498 - 14831748
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14831498 cattttgtttgatgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtctatgacacttgctgttttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 14831597  T
Q  101 cacattggt---------------tccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||||||| |               |||||||||||||| ||||||| |||    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  14831598 cacattgttggttccttcattgattccaattagtatcaagttaattataa----tgttgtttacctaatctcttgaacaaaatagaacatgttattttcc 14831693  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatata 240  Q
    ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14831694 tacaacaaatctttataattctttggtaaatgttttagaaatgtacttatatata 14831748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 471 - 610
Target Start/End: Original strand, 33814485 - 33814624
Alignment:
Q  471 ttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaact 570  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  33814485 ttttgatctagagaagacacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaact 33814584  T
Q  571 ctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  33814585 ctaatcctagactagattatcttcactcactgatgctact 33814624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 11934914 - 11934808
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11934914 cattttgtctgatgtaagtattggtaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 11934815  T
Q  101 cacattg 107  Q
    |||||||    
T  11934814 cacattg 11934808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 13457078 - 13456858
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13457078 cattttgtcta-tgtaaatattggcaaaaatctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 13456980  T
Q  101 cac---------------attggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||               |||||||| |||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  13456979 cacattattggttcctttattggttcaaattagtatcatgttaatt----ataatgttgttttcctaatcttttgaacaaaatagaacatgccctttttc 13456884  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttgg 211  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||    
T  13456883 tacagcatatctttataatgctttgg 13456858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 168
Target Start/End: Original strand, 4425521 - 4425698
Alignment:
Q  2 attttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgc 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  4425521 attttgtctgatgtaaatattgggaaaaatccctttttggttagtctatgacacttacagtctcttttataaacctaactattatgtaatgttaatatgc 4425620  T
Q  102 aca---------------ttggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaat 168  Q
    |||               ||||||| |||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4425621 acattgttggttccttccttggttctaattagtatcatgttaatt----ataatgttgttttcctaatctcttgaacaaaat 4425698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 495 - 610
Target Start/End: Original strand, 25540450 - 25540565
Alignment:
Q  495 aaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttc 594  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  25540450 aaatatgcacgttcaagtcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatctacactttcaacagatcaccttaattctaatcctagacaagattatcttc 25540549  T
Q  595 actcacctatgctact 610  Q
    ||||||  ||||||||    
T  25540550 actcactgatgctact 25540565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 107
Target Start/End: Original strand, 1931987 - 1932057
Alignment:
Q  37 tttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattg 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  1931987 tttggttagtctatgacacttgcggtctcttttataaatctaactattatgtaatgttaatatgcacattg 1932057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 553 - 601
Target Start/End: Original strand, 14832059 - 14832107
Alignment:
Q  553 caacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacc 601  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14832059 caacagatcatcttaactctaatcctagacaagattatcttcactcacc 14832107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 168
Target Start/End: Original strand, 1932068 - 1932129
Alignment:
Q  103 cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaat 168  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1932068 cattggttctaattagtatcatgctaattataa----tgttgttttcctaatctcttaaacaaaat 1932129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 7219449 - 7219385
Alignment:
Q  274 tagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcat 338  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||  ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  7219449 tagcatttcccaaatgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaaacgcaaaacaatcactctcat 7219385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 462; Significance: 0; HSPs: 39)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 7285672 - 7286292
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7285672 cattttgtctgatgtaagtattggcaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 7285771  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  7285772 cacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgagaaaaataaaacatgctattttcc 7285867  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7285868 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatattttagaaatgtacatatatataacttctaattagcactgcaatttgttttgtacctagcacttctca 7285967  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7285968 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaa 7286067  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7286068 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatttcgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaa 7286167  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7286168 gccacctaaaaatatgcatgttcaagtcgtttccaaataaagagttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactag 7286267  T
Q  586 attatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||  ||||||||    
T  7286268 attatcttcactcactgatgctact 7286292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 17996575 - 17997183
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17996575 cattttgtctaatgtaaatattggcaaaaattcctttttggttagtcaatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 17996674  T
Q  101 cacattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatcttta 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |     
T  17996675 cacattggttccaatcagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaagcatgctcttttcctacagtaaatctatt 17996770  T
Q  201 taatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatg 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17996771 taatgctttggtaattgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatg 17996870  T
Q  301 acatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaag---tt 397  Q
    | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||   ||    
T  17996871 atatttctaaaaggaacacgggaaataatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtttcacttgataacggcaaagagagcaagttatt 17996970  T
Q  398 acaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17996971 acaaaaaatacttaggctgccaatggttcaaattttgtcaagaacatatgttagaggaggttaataagttaatttttgatttagagaagccacctaaaaa 17997070  T
Q  498 tatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcact 597  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17997071 tatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgattcgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcact 17997170  T
Q  598 cacctatgctact 610  Q
    |||| ||| ||||    
T  17997171 caccaatgatact 17997183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 20757956 - 20758560
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20757956 cattttgtctaatgtaaatattggcaaaaatcgctttttggttagtcaatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 20758055  T
Q  101 cacattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatcttta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20758056 cacattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatcttta 20758151  T
Q  201 taatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatg 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  20758152 taatgctttggtaattgttttagaaatgtacatatatataacttctaattgacactgcaatttgttttgtacctaacacttctcaaatgagatatcaatg 20758251  T
Q  301 acatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttaca 400  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  20758252 acatttctaaaaggaatacggaaa-caatcatactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtttcacttgataacggcaaagagagcagattaca 20758350  T
Q  401 aaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatat 500  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20758351 aaaaatacttaggcagccaattgttcaaattttgtcgtgaacatatgtcaaaggtatgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatat 20758450  T
Q  501 gcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcac 600  Q
    ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20758451 gcatgttcaagtcgtttccaagtaaagatttggtgttcatgattcgcattttcaacagatcatcttaactataatcctaaactagattatcttcactcac 20758550  T
Q  601 ctatgctact 610  Q
    | ||| ||||    
T  20758551 cgatgttact 20758560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 38934472 - 38935077
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38934472 cattttgtctaatgtaaatattgacaaaaatccatttttggttagtcaatgaaacttgcaatctcttttataaacctacctattatgtaacgttaatctg 38934571  T
Q  101 cacattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatcttta 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  38934572 cacattgatttcaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctattgagcaaaataaaacatgctattttcctatagtaagtattta 38934667  T
Q  201 taatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatg 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  38934668 taatgctttggtaattgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacattgcaatttgttttgtacctaacacttctcaaatgagatatcaatg 38934767  T
Q  301 acatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttaca 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38934768 acatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagtcaca 38934867  T
Q  401 aaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatat 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  38934868 aaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgagaacatgtgttagaggtaggtgataagttaatttttgatgtagagaagccatttaaaaatat 38934967  T
Q  501 gcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcac 600  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38934968 gcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatattcactcac 38935067  T
Q  601 ctatgctact 610  Q
     |||| ||||    
T  38935068 atatgttact 38935077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 3150828 - 3150208
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3150828 cattttgtcttgtgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaatgttaatctg 3150729  T
Q  101 cac---------------attggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||               |||||||| ||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3150728 cactttgttggttccttcattggttctaattagtttcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcctgaacaaaataaaacatgctcttttcc 3150633  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  3150632 tacagtaaatctttataatgctttgataaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactacaatttgttttatacctagcacttctca 3150533  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3150532 aatgagatatcaatgacatttctaaaagaaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaa 3150433  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3150432 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcagccaatgattcaaattttgccgagaacatatgttaaaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaa 3150333  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3150332 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgatctgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactag 3150233  T
Q  586 attatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  3150232 attatcttcactcaccgatgctact 3150208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 3028749 - 3029370
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  3028749 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatccctttttcgttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacttaactattatgtaacgttaatttg 3028848  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3028849 cacattgttagttccttcgttggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataatacatgctcttttcc 3028944  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3028945 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatatagcttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctca 3029044  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3029045 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcgtcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaa 3029144  T
Q  386 agagagcaagttac-aaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagaga 484  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  3029145 aaagagcaagttacaaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatcaagaga 3029244  T
Q  485 agccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagacta 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3029245 agccacctaaaaatatgcacgttcacgtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagacta 3029344  T
Q  585 gattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  3029345 gattatcttcactcaccgatgttact 3029370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 33611364 - 33610755
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33611364 cattttgtctgatgtaagtattggcaaaaattcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 33611265  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| ||||||    
T  33611264 cacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatttcttgagaaaaataaaatatgctattttcc 33611169  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33611168 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcatttctca 33611069  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33611068 aatgagatatgaatgacatttctaaaagaaacacggaaaacaatcatactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaa 33610969  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33610968 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaa 33610869  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33610868 gccacataaaaatatgcacgttgaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcataatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactag 33610769  T
Q  586 attatcttcactca 599  Q
    ||||| ||||||||    
T  33610768 attatattcactca 33610755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 599
Target Start/End: Original strand, 2195160 - 2195769
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2195160 cattttgtctgatgtaagtattgacaaaaattcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 2195259  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
     ||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  2195260 tacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgagaaaaataaaacatgctattttcc 2195355  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2195356 tacagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttcaaattatcactgcaatttgttttgtacctagcacttctca 2195455  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2195456 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacatggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaa 2195555  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2195556 agagagcaagttacaaaaaatacttaggtggccaatggttcaaattttgccaagaacatatgttataggtaggtgataagttaattttttatctagagaa 2195655  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2195656 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactag 2195755  T
Q  586 attatcttcactca 599  Q
    ||||||||||||||    
T  2195756 attatcttcactca 2195769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 4882267 - 4882887
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4882267 cattttgtctgatgtaaatattcgtaaaaatccctttttggttagtctattaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 4882366  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               ||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4882367 cacattgttggttccttcattggtttcaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatactcttttcc 4882462  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  4882463 tacagtaaatctttataatgttttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcagtttgttttgtacctaacacttctca 4882562  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||    
T  4882563 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacgaaaaacaatcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggtataagtgtcgcgtgataacgacaa 4882662  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4882663 agagagcaagttactaaaaatacttcggcggccaatggttcaagttttgtcgagaacatatgttagaggtaggtgataaattaatttttgatctagagaa 4882762  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4882763 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataacgatttgatgttcatgatccacactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactag 4882862  T
Q  586 attatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||    
T  4882863 attattttcactcaccaatgctact 4882887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 608
Target Start/End: Original strand, 27065867 - 27066485
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  27065867 cattttgtctggtgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaattattatgtaacgttaatcta 27065966  T
Q  101 cacattg----------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttc 184  Q
    |||||||                ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27065967 cacattgttggttctctttattggttccgattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgttcttttc 27066062  T
Q  185 ctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctc 284  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  27066063 ctacaataaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataagttctaattaacactgcagtttgttttatacctagcacttctc 27066162  T
Q  285 aaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggca 384  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||    
T  27066163 aaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacatggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaa-aggtataaatgtcgcttgataacagca 27066261  T
Q  385 aagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagaga 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27066262 aagagagcaagttacaaaaaatacttaggtggccaatggatcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagaga 27066361  T
Q  485 agccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagacta 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27066362 agccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactctaatcctatacta 27066461  T
Q  585 gattatcttcactcacctatgcta 608  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  27066462 gattatcttcactcaccgatgcta 27066485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 608
Target Start/End: Original strand, 21030103 - 21030722
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccct-ttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatct 99  Q
    |||||||||||  ||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21030103 cattttgtctagagtaaatattgacaaaaatcccccttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatct 21030202  T
Q  100 gcacattg--------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||||||||              ||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21030203 gcacattgttggttctttcattgttacaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatcttttgatcaaaatagaacatgctcttttcc 21030298  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  21030299 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtgcatagatataacttctaattaacactgcaattttttttatacctagcacttctca 21030398  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaa-aaggtataagtggcgcttgataacggca 384  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  21030399 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacgaaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacgaca 21030498  T
Q  385 aagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagaga 484  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21030499 aagagaacaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagaga 21030598  T
Q  485 agccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagacta 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21030599 agccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagacta 21030698  T
Q  585 gattatcttcactcacctatgcta 608  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  21030699 gattatcttcactcaccgatgcta 21030722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 26321299 - 26320681
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26321299 cattttgtctgatgtaagtattggcaaaaattcctgtttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 26321200  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
     ||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  26321199 tacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgctgttttcctaatctcttgagaaaaataaaacatgctattttcc 26321104  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26321103 tacagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttttaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctca 26321004  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26321003 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaataatcacactgatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaa 26320904  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26320903 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggacaatggttcaaattttgacgagaacatgtgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaa 26320804  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26320803 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttg--gttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactag 26320706  T
Q  586 attatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||  ||||||||    
T  26320705 attatcttcactcactgatgctact 26320681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 3397362 - 3396740
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  3397362 cattttgtctggtgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaacgattatgtaacattaatctg 3397263  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  3397262 cacattgttggttcattcattggttccaattagtatcaagttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttga-ctaaataaaacatgctattttcc 3397168  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| || ||||||    
T  3397167 tacaataaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttatatctaacacttctca 3397068  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3397067 aatgagatatcaatgatatttctaaaaggaacacggaaaaaattcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaa 3396968  T
Q  386 agagagcaagttacaa---aaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctaga 482  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3396967 agagagcaagttacaaaaaaaaatacttaggcggccaatgattcaaattttgccgagaacatatgttagaggtatgtgataagttaatttttgatctaga 3396868  T
Q  483 gaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagac 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3396867 gaagccacctaaaaatatgcacgttcaaggcgtttccaaataaagatttgatgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactctaatcctaaac 3396768  T
Q  583 tagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3396767 tagattttcttcactcatctatgctact 3396740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 30689304 - 30689928
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30689304 cattttgtctgatgtaagtattggcaaaaattcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 30689403  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
     ||||||               ||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||    
T  30689404 tacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatattaattgtaa----tgttgtttttctaatctcttgagaaaaataaaacatgttattttcc 30689499  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatat--atataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttct 283  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |    
T  30689500 tacagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtgcatatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttgt 30689599  T
Q  284 caaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggc 383  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30689600 caaatgagatatcaatgacatttttaaaaggaacacagaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggc 30689699  T
Q  384 aaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaa--tttttgatctag 481  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||    
T  30689700 agagagagcaagttacaaaaaatacttaggcgaccaatggttcaaattttgccgagaacgtatgttagaggtaggtgataagttaattttttttatctag 30689799  T
Q  482 agaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctaga 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  30689800 agaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccacactttcaacatatcaccttaactttaattctaga 30689899  T
Q  582 ctagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  30689900 ctagattattttcactcactgatgctact 30689928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 34374570 - 34373988
Alignment:
Q  35 tttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgca---------------cattggttccaattagt 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||||||||||    
T  34374570 tttttagttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcatattgttggttccttcattggttccaattagt 34374471  T
Q  120 atcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttataatg-ctttggtaaatgt 218  Q
     ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  34374470 gtcatgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacatcaaatctttataatggctttggtaaatgt 34374375  T
Q  219 tttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaaca 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  34374374 tttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttttcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaaga 34374275  T
Q  319 cggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggcc 418  Q
    |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  34374274 cggaaaacaatcaca----tcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaaagagagccagttataaaaaatacttaggcggcc 34374179  T
Q  419 aatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttt 518  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||      
T  34374178 aatggttcaaattt-gccgagaacagatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaaaccacctaaaaatatgcacgttcaaatcgttca 34374080  T
Q  519 caaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  34374079 caaataaagatttggtgttcatgatccgtactttcaacagatcaccttaactctaattctagactagattatattcactcaccgatgctact 34373988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 1852015 - 1851564
Alignment:
Q  159 tgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  1852015 tgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctctataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacattgg 1851916  T
Q  259 aatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaa 358  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1851915 aatttgttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacgaaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaa 1851816  T
Q  359 ggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacg 458  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  1851815 ggtataagtgtcgcttgataacgacaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggtggccaatggttcaaattttgtcgagaacatattttagaggtagg 1851716  T
Q  459 tgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacat 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  1851715 tgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcattttcaacag 1851616  T
Q  559 atcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  1851615 atcaccttaactctaatcctagactacattatcttcactcaccgatgctact 1851564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 19447998 - 19448610
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  19447998 cattttgtctgatgtaaatattgacaaaaatcctttttttgttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacttaactattatgtatcgttaatctg 19448097  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19448098 cacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttaaacaaaataaaacatgctcttttcc 19448193  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  19448194 tacagtaaatttttataatattttgataaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttatca 19448293  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||         |    
T  19448294 aataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaataggtataagtgtcgcttg---------a 19448384  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatg-ttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagaga 484  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19448385 agggagcaagttacaaaaaatatttaggcggccaatgattcaaattttgccaagaacatatgtttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagaga 19448484  T
Q  485 agccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagacta 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19448485 agccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgcttccaaataaaaatttggtgtttatgatctgcactttcagcagatcaccttaactctaatcctagacta 19448584  T
Q  585 gattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19448585 gattatcttcactcaccgatgctact 19448610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 33707003 - 33706378
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33707003 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtctatgacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 33706904  T
Q  101 cacattggt---------------tccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||||||| |               |||||||||| ||| ||||||| |||    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  33706903 cacattgttggttccttcattaattccaattagtttcaagttaattataa----tgttgttttccaaatctcttgaacaaaatagaacatgttcttttcc 33706808  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtac----atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcattt 281  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  33706807 cacaacaaatctttataatgctttggtaaaatttttagaaatgtacttatatatatataacatctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcactt 33706708  T
Q  282 ctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaa-tcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataac 380  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33706707 cccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacagggaaaaaaaatcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataac 33706608  T
Q  381 ggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatcta 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  33706607 ggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggtcaatgattcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaattttttatcta 33706508  T
Q  481 gagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctag 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33706507 gagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttcccaaataaagatttggtgttcatgattcgcaatttcaacagatcaccttaactctaatcctag 33706408  T
Q  581 actagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    || |||||||||||| |||| |||||||||    
T  33706407 acaagattatcttcaatcacatatgctact 33706378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 103 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 10512471 - 10511978
Alignment:
Q  103 cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttata 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  10512471 cattggtttcaattagtatcatgttaat----aataatgttgttttcttaatcttttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttata 10512376  T
Q  203 atgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgac 302  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  10512375 atgctttggtaaatgttttataaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgat 10512276  T
Q  303 atttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaa 402  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  10512275 agttctaaaaggaacacggaaaacaatcgcactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacgacaaagatagcaag-tacaaa 10512177  T
Q  403 aaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgc 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10512176 aaatacttaggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttaaaggtaggtgataagttaatttttgatttagagaagccacctaaaaatatgc 10512077  T
Q  503 acgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacc 601  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10512076 acgtttaagtcgttcccaaataaagatttggtattcatgatccgcactttcaacagattaccttaactctaatcctagactagattatctttactcacc 10511978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 35540109 - 35539531
Alignment:
Q  35 tttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattg---------------gttccaattagt 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||               ||||||||||||    
T  35540109 tttttagttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaattagt 35540010  T
Q  120 atcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgtt 219  Q
    |||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35540009 atcatgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgttcttttcttacaacaaatctttataatgctttggtaaatgtt 35539914  T
Q  220 ttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctag---catttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaa 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35539913 ttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctactaacacttttcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaa 35539814  T
Q  317 cacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcgg 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||      |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  35539813 cacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggtataaatgtcgctt------ggcaaagagagccagtta-taaaaatacttaggcgg 35539721  T
Q  417 ccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtt 516  Q
    |||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35539720 ccaatggttcaaatttt-ccgagaacagatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaaatcgtt 35539622  T
Q  517 ttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgct 607  Q
      ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  35539621 cccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatattaactcaccgatgct 35539531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 20349918 - 20350550
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20349918 cattttttctgatgtaaatattggcaaaaatcccattttggttagtttatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 20350017  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||| ||||||||||||||||||| |||    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350018 cacattgttggttccttcattggttctaattagtatcatgttaattataa----tgttgttt-cttaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 20350112  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatat------------atataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacc 273  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||            |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20350113 tacaacaaatctttataatgctttggtaaatattttagaaatgtatatatatatatatatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacc 20350212  T
Q  274 tagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgct 373  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20350213 tagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcaagcacaaacaagctcaaaaaaggtatgagtgtcgct 20350312  T
Q  374 tgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaa-ttt 472  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  20350313 tgataacgacaaagcgatcaagttacaaaaaatacttaggcggtcaacggttcaaattttgccgaaaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttt 20350412  T
Q  473 ttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactct 572  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  20350413 tttatctaaagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccacactttcaacaaatcactttaactct 20350512  T
Q  573 aatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  20350513 aatcctacactagattatcttcactcatcgatgctact 20350550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 232 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 20995878 - 20995501
Alignment:
Q  232 atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 331  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20995878 atatatataacatctaattaacactgcaatttgttttgtacctaacacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacgaaaaacaatca 20995779  T
Q  332 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20995778 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacgacaaagagagcaagttac-gaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 20995680  T
Q  432 ttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagattt 531  Q
    ||| || |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20995679 ttgccgagaacatatgttagaggtaagtgataagctattttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagattt 20995580  T
Q  532 ggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20995579 ggtgttcatgatcttcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcaccgatgctact 20995501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 232 - 610
Target Start/End: Original strand, 41781089 - 41781457
Alignment:
Q  232 atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 331  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41781089 atatatataacatctaactaacactgcaatttgttttgtacctatcacttttcaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 41781188  T
Q  332 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 431  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||          |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41781189 cactcatcgactaacaagct-aaaaaaggtataagtgtcg----------gcaaagagagcaagttatgaaaaatacttaggcggccaatggttcaactt 41781277  T
Q  432 ttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagattt 531  Q
    ||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  41781278 ttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgacctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttcccaaataaagactt 41781377  T
Q  532 ggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaat-cctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41781378 tgtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactctaatccctagactagattatcttcactcactgatgctact 41781457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 232 - 600
Target Start/End: Original strand, 33930061 - 33930419
Alignment:
Q  232 atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 331  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33930061 atatatataacatctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcactttccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 33930160  T
Q  332 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 431  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||          |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  33930161 cgctcatcgacaaacaagctcaaaaaatgtataagtgtcg----------gcaaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatggttcaactt 33930250  T
Q  432 ttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagattt 531  Q
    ||| || |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  33930251 ttgccgagaacatattttagaggtaggtgataagctaatttttgacctagagaagccgcctaaaaatatgcacgttcaagtcattcccaaataaagattt 33930350  T
Q  532 ggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcac 600  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  33930351 ggtattcatgatccgcacgttcaacatatcaccttaattttaatcatatactagattatcttcactcac 33930419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 41780823 - 41781073
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41780823 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 41780922  T
Q  101 ca---------------cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||               |||||||||||||||||||||||||||||    | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41780923 catattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaatt----ataacgttgttttcctaatctcttgaacaaaatagaacatgctcttttcc 41781018  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatata 240  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  41781019 tacagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatatatatatatata 41781073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20996168 - 20995918
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20996168 cattttgtctgatgtaagtattgtcaaaaatccctttttggttaatctttgacacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 20996069  T
Q  101 cacattggt---------------tccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||||||| |               ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  20996068 cacattgttggttccttcattgattccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgaataaaatagaacatgctctttttc 20995973  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatata 240  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20995972 tacagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacttatatata 20995918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 9702247 - 9702493
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9702247 cattttatctgatgtaaatattggcaaaaatctcttttttgttagtctatgacacttgtagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 9702346  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  9702347 cacattgttggttccttcgttggttccaattagtatcatgttaattataaa----gttgttttcctaatctcttgaacaaaatagaatatgctcttttcc 9702442  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 236  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9702443 cacatcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 9702493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 33929789 - 33930039
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33929789 cattttgtctgatgtaaatattgacaaaaattcctttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 33929888  T
Q  101 ca---------------cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||               |||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||| ||||||||    
T  33929889 cacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaatt----ataatgttgttttcccaatctcttgaataaaatagaccatgttcttttcc 33929984  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatata 240  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  33929985 tccagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatatatatatatata 33930039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3210424 - 3210178
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3210424 cattttgtctgatgtaaatattagcaaaaatcctttttttgttagtttatgacacttgcagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 3210325  T
Q  101 cac---------------attggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||               ||||||| ||||||||||||||||||||    | || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  3210324 cacattgttggttccttcattggtttcaattagtatcatgttaatt----ataacgttattttcctaatctcttgaacaaaatagaacgtgctcttttcc 3210229  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 236  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  3210228 tacatcaaatcttcataatgctttggtaaatgtttttgaaatatacatata 3210178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 19395351 - 19395572
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19395351 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatatctttttagttagtctttgacacttgaagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttagtctg 19395450  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||| |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  19395451 cacattgttggttctttcattggttcaaattagtatcatgttaatt----aaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaatagaacatgctctttttc 19395546  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttgg 211  Q
    || || | ||||||||||||||||||    
T  19395547 tagagcagatctttataatgctttgg 19395572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 31295898 - 31295677
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31295898 cattttgtctgatgtaaatattgacaaaaatctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 31295799  T
Q  101 cac---------------attggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||               |||||||| |||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  31295798 cacattgttggttctttcattggttcaaattagtatcatgttaatt----ataatgttgttttcctaatcttttgaacaaaatagaacatgctctttttc 31295703  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttgg 211  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||    
T  31295702 tacagcagatctttataatgctttgg 31295677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 1852154 - 1852047
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattgg-aaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatct 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  1852154 cattttgtctgatgtaaatattgacaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgtaaattt 1852055  T
Q  100 gcacattg 107  Q
    ||||||||    
T  1852054 gcacattg 1852047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 482 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 12420329 - 12420211
Alignment:
Q  482 agaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctaga 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12420329 agaagccacctaaaaatatgcacgtttaaatcgttcccaaataaagattcggtgttcatgatccacactttcaacagatcaccttaactctaatcctaga 12420230  T
Q  582 ctagattatcttcactcac 600  Q
    | |||||||||||||||||    
T  12420229 caagattatcttcactcac 12420211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 12588503 - 12588400
Alignment:
Q  2 attttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgc 101  Q
    ||||| ||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12588503 attttatctgatgtaaatattagcaaaa-tccctttttggttagtctatgacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgc 12588405  T
Q  102 acatt 106  Q
    |||||    
T  12588404 acatt 12588400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 10513325 - 10513253
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataa 73  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10513325 cattttgtctaatgtaaatattggcaaaaattcctctttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataa 10513253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 290546 - 290648
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     | | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  290546 cattttgtctgatgtaaatattggaaaaaattcctttttggttagtctatga----cggagtctcttttataaatctaactattatgtaatgttaatatg 290641  T
Q  101 cacattg 107  Q
    |||||||    
T  290642 cacattg 290648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 10512524 - 10512482
Alignment:
Q  65 cttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10512524 cttttataaacctaactattatgtaaccttaatctgcacattg 10512482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 168
Target Start/End: Original strand, 290659 - 290720
Alignment:
Q  103 cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaat 168  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  290659 cattggttctaattagtataatgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaat 290720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 338
Target Start/End: Original strand, 3028392 - 3028456
Alignment:
Q  274 tagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcat 338  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||  || ||||||||||| |||||    
T  3028392 tagcatttctcaaatgaggtgtcaaaaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcat 3028456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 460; Significance: 0; HSPs: 47)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 23522856 - 23522265
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23522856 cattttgtctaatgtaaatattggcaaaaatcactttttggttagtcaatgaaacttgcaatctcttttataaaccttactattatataacgttaatctg 23522757  T
Q  101 cacattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatcttta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23522756 cacattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatcttta 23522661  T
Q  201 taatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatg 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23522660 taatgctttggtaattgttttagaaatgtacatatatataacttttaattgacactgcaatttgttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatg 23522561  T
Q  301 acatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttaca 400  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23522560 acatttctaaaaggaatacgggaaacaatcacactcatcaacaaacaagctcaaaaaaggtataagtttcacttgataacggcaaagagagcaagttaca 23522461  T
Q  401 aaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatat 500  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23522460 aaaaatacttaggcggaaaatggttcaaattttgacgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttaatctagagaagccacctaaaaatat 23522361  T
Q  501 gcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactca 599  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23522360 gcacgttcaa---gtttccaaataaagaattggtgttcatgattcgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactca 23522265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 6477707 - 6477087
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6477707 cattttgtctggtgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaatgttaatctg 6477608  T
Q  101 cacat---------------tggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||               || |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6477607 cacatcattggttccttcattgattccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 6477512  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  6477511 tacaataaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttatacctaacacttctca 6477412  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6477411 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtacaagtgtcgcttgataacggcaa 6477312  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6477311 agagagtaatttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaa 6477212  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  6477211 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaacaaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacaaatcaccttaactctaatcctagattag 6477112  T
Q  586 attatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  6477111 attatcttcactcaccgatgctact 6477087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 14079044 - 14078434
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14079044 cattttgtctgatgtaagtattggcaaaaattcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 14078945  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
     ||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  14078944 tacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgagaaaaataaaacatgctattttcc 14078849  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14078848 tacagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctca 14078749  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14078748 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaa 14078649  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14078648 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatgtgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaa 14078549  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14078548 gccacctaaaaatatgtacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactag 14078449  T
Q  586 attatcttcactcac 600  Q
    |||||||| ||||||    
T  14078448 attatctttactcac 14078434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 33424472 - 33423855
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  33424472 cattttgtctaatgtaagtattggcaaaaattcctttttggttagtctatgaaacttgcagtctcttttataaacctaactattatgtaacct-aatctg 33424374  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
     ||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  33424373 tacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgagaaaaataaaacatgctattttcc 33424278  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  33424277 tacaataaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacaccgcaatttgttttgtagctagcacttctca 33424178  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  33424177 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcacttgataacggcaa 33424078  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33424077 agagagcaaattacaaaaaatacttaggcagccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaa 33423978  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33423977 gccacctaaaaatatgcatgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactag 33423878  T
Q  586 attatcttcactcacctatgcta 608  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  33423877 attatcttcactcaccgatgcta 33423855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 610
Target Start/End: Original strand, 38961954 - 38962562
Alignment:
Q  13 tgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattg----- 107  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||         
T  38961954 tgtaaatattggcaaaaattcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacttaactattatgtaacgttaatctgtacattgttggt 38962053  T
Q  108 ----------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatct 197  Q
              ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38962054 tccttcattggttccaatttgtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctgcagtaaatct 38962149  T
Q  198 ttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtca 297  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  38962150 ttataatgatttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattttttttgtacctatcacttctcaaatgagatatca 38962249  T
Q  298 atgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagtt 397  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  38962250 atgacatttataaaaggaacacggaaaacaatcacactaatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgtttgataacgacaaagagagcaagtt 38962349  T
Q  398 acaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaa 497  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38962350 acaaaaaatacttaggtggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttaaaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagtcacctaaaaa 38962449  T
Q  498 tatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcact 597  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38962450 tatgcacgttcaagtcatttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattaccttcact 38962549  T
Q  598 cacctatgctact 610  Q
    |||  ||||||||    
T  38962550 cactgatgctact 38962562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 610
Target Start/End: Original strand, 38992298 - 38992906
Alignment:
Q  13 tgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattg----- 107  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||         
T  38992298 tgtaaatattggcaaaaattcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacataactattatgtaacgttaatctgtacattgttggt 38992397  T
Q  108 ----------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatct 197  Q
              ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38992398 tccttcattggttccaatttgtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctgcagtaaatct 38992493  T
Q  198 ttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtca 297  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  38992494 ttataatgatttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattttttttgtacctatcacttctcaaatgagatatca 38992593  T
Q  298 atgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagtt 397  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  38992594 atgacatttataaaaggaacacggaaaacaatcacactaatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgtttgataacgacaaagagagcaagtt 38992693  T
Q  398 acaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaa 497  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38992694 acaaaaaatacttaggtggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttaaaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagtcacctaaaaa 38992793  T
Q  498 tatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcact 597  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38992794 tatgcacgttcaagtcatttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattaccttcact 38992893  T
Q  598 cacctatgctact 610  Q
    |||  ||||||||    
T  38992894 cactgatgctact 38992906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 610
Target Start/End: Original strand, 44599509 - 44600094
Alignment:
Q  35 tttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgca---------------cattggttccaattagt 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||||||||||    
T  44599509 tttttagttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcatattgttggttccttcattggttccaattagt 44599608  T
Q  120 atcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgtt 219  Q
    |||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44599609 atcatgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacatcaaatctttataatgctttggtaaatgtt 44599704  T
Q  220 ttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  44599705 ttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttttcaaatgagatatcaatgacatttttaaaaggaagac 44599804  T
Q  320 ggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggcca 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  44599805 ggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaaaaagagccagttataaaaaatacttaggcggcca 44599904  T
Q  420 atggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttc 519  Q
    |||||||||| |||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  44599905 atggttcaaa-tttgccgagaacagatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaaaccacctaaaaatatgcacgttcaaatcgttccc 44600003  T
Q  520 aaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  44600004 aaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatattcactcaccgatgctact 44600094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 42811148 - 42810527
Alignment:
Q  4 tttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcac 103  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  42811148 tttgtctggtgtaaatattggcaaaaactcctttttggttagcctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtgactttaatctgcac 42811049  T
Q  104 attg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctac 188  Q
    ||||               ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42811048 attgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatcccttgaacaaaataaaacatgctcttttcctac 42810953  T
Q  189 agtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgta--ccta--gcatttctc 284  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||  ||||  ||| |||||    
T  42810952 attaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacagtgcaattttttttttatacctatagcacttctc 42810853  T
Q  285 aaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggca 384  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  42810852 aaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacatggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacgaaa 42810753  T
Q  385 aagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagaga 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  42810752 aagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagggttaggtgataagttaatttttaatctagaga 42810653  T
Q  485 agccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagacta 584  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42810652 agccacctaaaaatatgcacattcaagtcgtttccaaataaatatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagacta 42810553  T
Q  585 gattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  42810552 gattatcctcactcaccgatgctact 42810527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 610
Target Start/End: Original strand, 38993490 - 38994077
Alignment:
Q  35 tttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgca---------------cattggttccaattagt 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||||||||||    
T  38993490 tttttagttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcatattgttggttccttcattggttccaattagt 38993589  T
Q  120 atcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgtt 219  Q
    |||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38993590 atcatgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacatcaaatctttataatgctttggtaaatgtt 38993685  T
Q  220 ttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgtttt-gtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttct-aaaaggaac 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||     
T  38993686 ttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgtttttgtacctagcacttttcaaatgagatatcaatgacattttttaaaaggaag 38993785  T
Q  318 acggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggc 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  38993786 acggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaaaaagagccagttataaaaaatacttaggcggc 38993885  T
Q  418 caatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttt 517  Q
    ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  38993886 caatggttcaaattt-gccgagaacagatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaaaccacctaaaaatatgcacgttcaaatcgttc 38993984  T
Q  518 tcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
     ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  38993985 ccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatattcactcaccgatgctact 38994077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 19395777 - 19395167
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19395777 cattttgtctggtgtaaatattggcaaaaatccctttttgattagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacttaactattatgtaacgttaatctg 19395678  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||     
T  19395677 cacattgttggttccttcattagttccaattagtatcatgttaattg----aaatgttgttttcctaacctcttgaataaaataaaacatgctcttttca 19395582  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatata--acttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttct 283  Q
     | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||  || |||||||||| ||||||||| ||||    
T  19395581 aa-agtaaatctttataatgctttgctaaatgttttataaatgtacatatatatataacttctaattaacattgtaatttgttttatacctagcacttct 19395483  T
Q  284 caaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggc 383  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  19395482 ccaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatccacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacgac 19395383  T
Q  384 aaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagag 483  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19395382 aaagagagaaagttacaaaaaatatttaggcggccaatggttcaaatttcgccgagaacatatgttagaggtaggtgataaattaatttttgatctagag 19395283  T
Q  484 aagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagact 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  19395282 aagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaaccaatcaccttaactctaatccttgact 19395183  T
Q  584 agattatcttcactca 599  Q
     |||||||||||||||    
T  19395182 cgattatcttcactca 19395167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 41628664 - 41629282
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41628664 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaagaccctttttcgttagtctatgacacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 41628763  T
Q  101 cacatt---------------ggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||||||               |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |    
T  41628764 cacattattggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctattgaacaaaataaaacatgttgtttttc 41628859  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  41628860 aacagtaaatctttataatgttttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgaaatttgttttgtacctatcacttctca 41628959  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  41628960 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacgaaaaacaatcacgctcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagt-tcgcttgataatggcaa 41629058  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcg-tgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagaga 484  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41629059 agagagcaagttac--aaaatacttaggcggccaatggttcaaactttgccgaagaatatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagaga 41629156  T
Q  485 agccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagacta 584  Q
    |||||| ||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41629157 agccacataaaagtatggatgttcaagtcgtttccaaataaagatctaatgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagacta 41629256  T
Q  585 gattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41629257 gattatcttcactcaccgatgctact 41629282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 164 - 610
Target Start/End: Original strand, 27273180 - 27273625
Alignment:
Q  164 aaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaattt 263  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27273180 aaaataaaacatgttattttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatatacatatatataacttctaattaacactgcaattt 27273279  T
Q  264 gttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 363  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27273280 gttttgtacctaacacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactaatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 27273379  T
Q  364 aagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgata 463  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  27273380 aagtgtcacttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaaaacttaggcggccaatggtttaaatttt-tcgagaacatatgttagaggtaggtgata 27273478  T
Q  464 agttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcac 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  27273479 agttaatttttgatctagagaagccacataaaaatatgcacgttcaattcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcac 27273578  T
Q  564 cttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27273579 cttaactctaattctagactagattatcttcactcactgatgctact 27273625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 45293791 - 45293165
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  45293791 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatccttttttggttagtctatgacacttgcagttttttttataaacctaactattatgcaacgttaatttg 45293692  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataa--aacatgctctttt 183  Q
    |||||||               |||| ||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||| |   |||||| || |||    
T  45293691 cacattgttgattccttcattggttctaattagtatcatgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaaaaaaaaattgaacatgttccttt 45293596  T
Q  184 cctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtac----atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcat 279  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||     
T  45293595 cctataacaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacttatatatatataacatctaactaacactgcaatt-gttttgtacctagcac 45293497  T
Q  280 ttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataa 379  Q
     || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  45293496 atcccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcatactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataaaggtcgcttgataa 45293397  T
Q  380 cggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatct 479  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | || ||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||    
T  45293396 cggcaaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggccaatggttcaacttttgctgagagcatatgttagaggtaggtgaaaagctcatttttgatct 45293297  T
Q  480 agagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaa-ctctaatcct 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  45293296 agagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttctcaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaatagatcaccttaatctctaatcct 45293197  T
Q  579 agactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  45293196 agacaagattatcttcactcaccgatgctact 45293165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 138 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 44382867 - 44382394
Alignment:
Q  138 aatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtac--atat 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  44382867 aatggtgttttcctaatctcttgaacaaaatagaacatgttcttttcctacaacaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacttatat 44382768  T
Q  236 atataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacact 335  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  44382767 atataacatctaattaacactgcaatttattttgtacctatcacttcccaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaaca-ggaaaaaaatcacact 44382669  T
Q  336 catcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgt 435  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||     
T  44382668 catcgacaaataaactcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacgaaaaatacctaggcggtcaatggttcaacttttgc 44382569  T
Q  436 cgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtg 535  Q
    |  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  44382568 caagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgatctatagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttactaaataaagatttggtg 44382469  T
Q  536 ttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  44382468 ttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagacaagattatattcactcaccgatgctact 44382394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 222 - 610
Target Start/End: Original strand, 9761273 - 9761661
Alignment:
Q  222 agaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacgg 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||     
T  9761273 agaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttttaaaaggaacacga 9761372  T
Q  322 aaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaat 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9761373 aaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaagtataagtgtcgcttgataaagacaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaat 9761472  T
Q  422 ggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaa 521  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9761473 ggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaa 9761572  T
Q  522 ataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9761573 ataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaatagatcaccttaactctaatcgtagactagattatcttcactcactgatgctact 9761661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 2 - 600
Target Start/End: Original strand, 19247886 - 19248498
Alignment:
Q  2 attttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgc 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||    
T  19247886 attttgtctgatgtaaatattggcaaaaatccttttttggttagtctatgatacttgcagttt-ttttataaac---actattatgtaacgttaatttgc 19247981  T
Q  102 acattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcct 186  Q
    ||||||               ||||||||||||||||||| |||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19247982 acattgttgattccttcattggttccaattagtatcatgtaaattttaa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaatagaacatgttcttttcct 19248077  T
Q  187 acagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtac------atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatt 280  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||      ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |    
T  19248078 acagcaaatcgttataatgttttggtaaatattttgaaaatgtacttatatatatatataacatctaattaacactacaatttgttttgtccctagcact 19248177  T
Q  281 tctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataac 380  Q
    || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  19248178 tcccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacacagaaaacaatcatactcatcgacaaacaagctaaaaaaaggtataagggtcgcttgataac 19248277  T
Q  381 ggcaaagagagcaagttacaaaa-aatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatct 479  Q
     ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||     
T  19248278 agcaaagagagcaatttacaaaaaaatacttaggcggccaatggttcaacttttgctgagaacatatgttagaggtaggtgagaaactaatttttgatca 19248377  T
Q  480 agagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatccta 579  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19248378 agagaaaccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccacactttcaacagatcaccttaactctaatccta 19248477  T
Q  580 gactagattatcttcactcac 600  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  19248478 gacgagattatcttcactcac 19248498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 2 - 600
Target Start/End: Original strand, 19321070 - 19321682
Alignment:
Q  2 attttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgc 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||    
T  19321070 attttgtctgatgtaaatattggcaaaaatccttttttggttagtctatgatacttgcagttt-ttttataaac---actattatgtaacgttaatttgc 19321165  T
Q  102 acattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcct 186  Q
    ||||||               ||||||||||||||||||| |||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19321166 acattgttgattccttcattggttccaattagtatcatgtaaattttaa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaatagaacatgttcttttcct 19321261  T
Q  187 acagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtac------atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatt 280  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||      ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |    
T  19321262 acagcaaatcgttataatgttttggtaaatattttgaaaatgtacttatatatatatataacatctaattaacactacaatttgttttgtccctagcact 19321361  T
Q  281 tctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataac 380  Q
    || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  19321362 tcccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacacagaaaacaatcatactcatcgacaaacaagctaaaaaaaggtataagggtcgcttgataac 19321461  T
Q  381 ggcaaagagagcaagttacaaaa-aatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatct 479  Q
     ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||     
T  19321462 agcaaagagagcaatttacaaaaaaatacttaggcggccaatggttcaacttttgctgagaacatatgttagaggtaggtgagaaactaatttttgatca 19321561  T
Q  480 agagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatccta 579  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19321562 agagaaaccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccacactttcaacagatcaccttaactctaatccta 19321661  T
Q  580 gactagattatcttcactcac 600  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  19321662 gacgagattatcttcactcac 19321682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 464
Target Start/End: Original strand, 30826224 - 30826702
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactat----tatgtaacgttaa 96  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| |||||    
T  30826224 cattttgtctgatgtaagtattggcaaaaattcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactatatattatgtaatgttaa 30826323  T
Q  97 tctgcacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctctt 181  Q
    | || ||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  30826324 tttgtacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgagaaaaataaaacatgctatt 30826419  T
Q  182 ttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcattt 281  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  30826420 ttcctacagtaaatctttacaatgctttgataaatattttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctatcactt 30826519  T
Q  282 ctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacg 381  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30826520 ctcaaatgagatatcaatgacatttctaataggaacacggaaaacaatcacactcatcggcaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacg 30826619  T
Q  382 gcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataa 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  30826620 gcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatgattcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataa 30826702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 512
Target Start/End: Original strand, 41156412 - 41156935
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  41156412 cattttgtctgatgtaaatattgtcaaaaatccctttttggttagtctatgacacttgcagtcttttttataaacctagctattatataacgttaatctg 41156511  T
Q  101 cacattggt---------------tccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||||||| |               | |||||||||||| ||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  41156512 cacattgttggtttcttcattgatttcaattagtatcaagttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaatagaacatgttcttttcc 41156607  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtac--atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttct 283  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  41156608 tacaacaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacttatatatataacatctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcatttcc 41156707  T
Q  284 caaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggc 383  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41156708 caaatgagatatcaaggacgtttctaaaaggaacagggaaaa-aatcacactcatcgacaaacaaactcagaaaaggtataagtgtcgcttgataacggc 41156806  T
Q  384 aaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagag 483  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  41156807 aaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatgattcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgatctagag 41156906  T
Q  484 aagccacctaaaaatatgcacgttcaagt 512  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  41156907 aaaccacctaaaaatatgcacgttcaagt 41156935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 103 - 610
Target Start/End: Original strand, 3751001 - 3751507
Alignment:
Q  103 cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctctttt-cctacagtaaatctttat 201  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||| ||| ||||||||||    
T  3751001 cattggttcaaataagtatcatgttaattataa----tgttgtttttctaatctcttgaacaaaatagaacatgttttttttccttcagcaaatctttat 3751096  T
Q  202 aatgctttggtaaatgttttagaaatgtac--atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagca-tttctcaaatgagatgtcaa 298  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||    
T  3751097 aatgctctggtaaatgttttagaaatatacttatatatataatatctaattaacactgcaatttgttttgtacctaacactttct-aaatgagatatcaa 3751195  T
Q  299 tgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcg-acaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagtt 397  Q
     ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  3751196 ggacatttctaaaaggaatagggaaaa-aatcacactcatcggacaaacaaactcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaaagggagcaagtt 3751294  T
Q  398 acaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaa 497  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3751295 acgaaaaatacttaggcggtcaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgatctagagaagccacctaaaaa 3751394  T
Q  498 tatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcact 597  Q
    |||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3751395 tatgcacgtttaattcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccacactttcaacatatcaccttaactctaatcctagacaagattatcttcact 3751494  T
Q  598 cacctatgctact 610  Q
    |||| ||||||||    
T  3751495 caccgatgctact 3751507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 232 - 610
Target Start/End: Original strand, 41977514 - 41977892
Alignment:
Q  232 atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 331  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || || ||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  41977514 atatatataacatctaattaacactgcaatttgttttgtacataacacttcccaaatgagatatcaagtacatttctaaaaggaacatggaaaaaaatca 41977613  T
Q  332 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 431  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  41977614 cactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatggttcaactt 41977713  T
Q  432 ttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagattt 531  Q
    |||  | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||    
T  41977714 ttgctgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgtacaagtcattcccaaataaagattt 41977813  T
Q  532 ggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  41977814 ggtgttcatgatccgcattttcaacagaccaccttaactctaatcctagagaagattatctccactcaccgatgctact 41977892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 305 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 36597934 - 36597629
Alignment:
Q  305 ttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaa 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36597934 ttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaaagagggcaagttacaaaaa 36597835  T
Q  405 atacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcac 504  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36597834 atacttaggcgggcaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaagtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcac 36597735  T
Q  505 gttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctat 604  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    
T  36597734 gttcaaggcgtttccaaataaagattgagtgttcatgatccgcactttcaacagagcaccttaactctaatcccatactagattatcttcactcactgat 36597635  T
Q  605 gctact 610  Q
    ||||||    
T  36597634 gctact 36597629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 232 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 22946758 - 22946394
Alignment:
Q  232 atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 331  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22946758 atatataaaacatctaattaacactacaatttgttttgtacctagcactttacaaatgagatatcaaagacatttctaaaaggaacacgaaaaacaatca 22946659  T
Q  332 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 431  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||          |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22946658 cactcaccgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcg----------gcaaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggccaatggttcaactt 22946569  T
Q  432 ttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagattt 531  Q
    ||| || |||||||||    ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  22946568 ttgccgagaacatatg----aggtaggtgataagctaatttttgacttagagaagccaccaaaaaatatgcacgttcaagtcattcccaaataaagattt 22946473  T
Q  532 ggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22946472 ggtattcatgatccgcacgttcaacatatcaccttaattctaatcatatactagattatcttcactcactgatgctact 22946394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 392 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 22332539 - 22332321
Alignment:
Q  392 caagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacc 491  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22332539 caagttagaaaaaatacttaggcagacaatggtttaaattttgtcgagaacatatgttagaggtatgtgataagttaatttttgatctagagaagccacc 22332440  T
Q  492 taaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatc 591  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22332439 taaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatc 22332340  T
Q  592 ttcactcacctatgctact 610  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  22332339 ttcagtcaccgatgctact 22332321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22333335 - 22333085
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22333335 cattttgtctggtgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactaatatgtaacgttaatctg 22333236  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22333235 cacattgttggttctttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 22333140  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatata 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22333139 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatata 22333085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22947016 - 22946778
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22947016 cattttgtctgatgtaaatattgacaaaaatccctttttggttagtctatgacacttgcattttcttttataaatctaactattatgtaacgttaatctg 22946917  T
Q  101 caca---ttggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatct 197  Q
    ||||   |||||| ||||||||||||||||||||    | ||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22946916 cacattgttggtttcaattagtatcatgttaatt----ataatgttgtttttccaatctcttgaataaaatagaacatgctcttttcctccagcaaatct 22946821  T
Q  198 ttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatata 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22946820 ttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtatatatatata 22946778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12250413 - 12250167
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12250413 cattttatctgatgtaaatattggcaaaaatcccttttttgttagtctatgacacttgtagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatatg 12250314  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               ||| |||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12250313 cacattgttggttccttcgttggtttcaattagtatcatgttaattataaa----gttgttttcctaatctcttgaacaaaatagaacatgctcttttcc 12250218  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 236  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12250217 tacatcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 12250167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 39444794 - 39445040
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39444794 cattttatctgatgtaaatattggcaaaaatcccttttttgttagtctatgacacttgtagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatatg 39444893  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               ||| |||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39444894 cacattgttggttccttcgttggtttcaattagtatcatgttaattataaa----gttgttttcctaatctcttgaacaaaatagaacatgctcttttcc 39444989  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 236  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39444990 tacatcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 39445040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 439 - 600
Target Start/End: Original strand, 5835818 - 5835979
Alignment:
Q  439 gaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttc 538  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5835818 gaacatatgttagaggtaggtgataaattaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttctaaataaagatttggtgttc 5835917  T
Q  539 atgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcac 600  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  5835918 atgatccgcactttcaacatatcaccttaactctaatcatagatcagattatcttcactcac 5835979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 232 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 22333047 - 22332887
Alignment:
Q  232 atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 331  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22333047 atatatataacttctaattaacactgaaatttgttttatatctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacagaaaacaatca 22332948  T
Q  332 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagc 392  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22332947 cattcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaaagagagc 22332887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 39204404 - 39204650
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39204404 cattttatctgatgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtttatgacacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 39204503  T
Q  101 ca---------------cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||               |||||||| ||||||||||||||||||||    | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  39204504 cacattgttggttccttcattggtttcaattagtatcatgttaatt----ataacgttgttttcctaatctcttgaacaaaatagaacgtgctcttttcc 39204599  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 236  Q
    ||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39204600 tacatcaaatcttcataatgttttggtaaatgttttagaaatgtacgtata 39204650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 41977232 - 41977482
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41977232 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctctttttggttagtctatgacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 41977331  T
Q  101 ca---------------cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||               ||||| ||||||||| ||||| |||||||    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |    
T  41977332 cacattgttagttccttcattgattccaattaatatcaagttaatt----ataatgttgttttcctaatctcttgaacaaaatagaacatgttatttttc 41977427  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatata 240  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41977428 tacagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacttatatata 41977482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 12760248 - 12760488
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12760248 cattttgtctgatataaatattggcaaaaatccctttttggttagtctatgacactagcagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 12760347  T
Q  101 caca---ttggttc------------caattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||||   |||||||            |||||||||||| |||||||    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12760348 cacattgttggttccttcattgattacaattagtatcaagttaatt----ataacgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgttcttttcc 12760443  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgta 230  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12760444 tacaacaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgta 12760488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 295 - 474
Target Start/End: Original strand, 12760495 - 12760672
Alignment:
Q  295 tcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaa 394  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12760495 tcaaggacatttcgaaaaggaacagggaaaa-aatcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaa 12760593  T
Q  395 gttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaattttt 474  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12760594 gttacgaaaaatacttagg-ggtcaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaattttt 12760672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 29433812 - 29434058
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||| | |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29433812 cattttgtttgatgtaaatatcgacaaaaatccctttttggttagtctatgactcttgcagtctcttttataaacctaactattatgtaatgttaatctg 29433911  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||||||||||||||||||||||| |||    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  29433912 cacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattataa----tgttgctttcctaatctcttgaacaaaatagaacatgctattttct 29434007  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 236  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29434008 tacaacaaatttttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 29434058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23626558 - 23626312
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  23626558 cattttatctgatgtaaatattgacaaaaatcacttttatgttagtctatgacacttgtaatctattttataaacctaactattatataacattaatctg 23626459  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23626458 cacattgttggttccttcgttggttccaattagtatcatgttaattataaa----gttgttttccaaatctcttgaacaaaatagaacatgctcttttcc 23626363  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 236  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23626362 cacatcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 23626312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23966734 - 23966513
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23966734 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 23966635  T
Q  101 cac---attggttcc------------aattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||   |||||||||            |||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  23966634 cacattattggttccttcattgattcaaattagtatcatgttaatt----ataatgttgttttcctaatcttttgaacaaaatagaacatgccctttttc 23966539  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttgg 211  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||    
T  23966538 tacagcagatctttataatgctttgg 23966513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 37029611 - 37029832
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37029611 cattttgtctgatgtaaatattgacaaaaatctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 37029710  T
Q  101 ca---------------cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||               ||||||||| |||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  37029711 cacattgttggttccttcattggttcaaattagtatcatgttaatt----ataatgttgttttcctaatcttttgaacaaaatagaacatgccctttttc 37029806  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttgg 211  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||    
T  37029807 tacagcagatctttataatgctttgg 37029832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 491 - 610
Target Start/End: Original strand, 42785443 - 42785562
Alignment:
Q  491 ctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattat 590  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42785443 ctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaatagatcaccttaactttaatcctagactagattat 42785542  T
Q  591 cttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||||||  ||||||||    
T  42785543 cttcactcactgatgctact 42785562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 6300831 - 6300610
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6300831 cattttgtctgaagtaaatattggcaaaaatctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 6300732  T
Q  101 cac---------------attggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||               |||||||| |||||||||||||||||||    | |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  6300731 cacattgttggtttcttcattggttcaaattagtatcatgttaatt----ataatgttgttttcataatcttttgaacaaaatagaacatgccctttttc 6300636  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttgg 211  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||    
T  6300635 tacagcagatctttataatgctttgg 6300610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 41907630 - 41907800
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  41907630 cattttgtctgatgtaaatattgtcaaaaatctcttttcggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaacctaactattatgtaatgttaatatg 41907729  T
Q  101 cacattg-------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaat 168  Q
    |||||||       |||| |||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41907730 cacattgttggttcgttctaattagtatcatgttaatt----ataatgttgttttcctaatctcttgatcaaaat 41907800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 44940215 - 44940436
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44940215 cattttgtctgatgtaaatattgacaaaaatctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgtcaatctg 44940314  T
Q  101 ca---------------cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||               ||||||||| |||||||||||||||||||    | |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  44940315 cacattattggttccttcattggttcaaattagtatcatgttaatt----ataatgttattttcctaatcttttgaacaaaatagaacatgccctttttc 44940410  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttgg 211  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||    
T  44940411 tacagcagatctttataatgctttgg 44940436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 492 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 41533571 - 41533453
Alignment:
Q  492 taaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatc 591  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  41533571 taaaaatatgcacgttcaagtagttcccaaataaatatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactctaatcctagacaagattatt 41533472  T
Q  592 ttcactcacctatgctact 610  Q
    || ||||||| ||| ||||    
T  41533471 tttactcaccgatgttact 41533453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 42061008 - 42060788
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||  ||||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42061008 cattttgtctgatgtaaatattg-acaaaatctatttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 42060910  T
Q  101 ca---------------cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||               ||||| ||| |||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  42060909 cacattattgattccttcattgattcaaattagtatcatgttaatt----ataatgttgttttcctaatcttttgaacaaaatagaacatgccctttttc 42060814  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttgg 211  Q
    ||| | | ||||||||||||||||||    
T  42060813 tacggcagatctttataatgctttgg 42060788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 522 - 610
Target Start/End: Original strand, 30826699 - 30826787
Alignment:
Q  522 ataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30826699 ataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctatactagattatcttcactcactgatgctact 30826787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 195 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 36597982 - 36597929
Alignment:
Q  195 tctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  36597982 tctttataatgctttggtaaatgattaagaaatgtacatatatataacttctaa 36597929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16668838 - 16668790
Alignment:
Q  192 aaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatata 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16668838 aaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtatatatatata 16668790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 458; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 35088064 - 35087444
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35088064 cattttgtctgatgtaagtattggcaaaaattcatttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaacaattatgtaacgttaatctg 35087965  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||    
T  35087964 cacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgagaaaaataaaacatgttattttcc 35087869  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  35087868 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctatcacttctca 35087769  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  35087768 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgaaaacggcaa 35087669  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35087668 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaa 35087569  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35087568 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactag 35087469  T
Q  586 attatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||  ||||||||    
T  35087468 attatcttcactcactgatgctact 35087444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 50771473 - 50770853
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50771473 cattttttctgatgtaaatattggcaaaaatcccattttggttagtttatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatttg 50771374  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||||||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50771373 cacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 50771278  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50771277 tacaacaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctca 50771178  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||| |||||    
T  50771177 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagcttaaaaaaggtataagtgtcatttgataatggcaa 50771078  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50771077 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaa 50770978  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  50770977 gccaactaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcgtagactag 50770878  T
Q  586 attatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||  ||||||||    
T  50770877 attatcttcactcactaatgctact 50770853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 6104352 - 6103742
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6104352 cattttgtctgatgtaagtattggcaaaaattcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctctttgataaacctaactattatgtaacgttaatctg 6104253  T
Q  101 cacat--------------tggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcct 186  Q
     ||||              |||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  6104252 tacatgttggttccttcattggttcaaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgagaaaaataaaacatgctattttcct 6104157  T
Q  187 acagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaa 286  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6104156 atagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactccaatttgttttgtacctagcacttctcaa 6104057  T
Q  287 atgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaa 386  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  6104056 atgagatatcactaacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacgacaaa 6103957  T
Q  387 gagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggta-cgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6103956 gagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtagggtgataagttaattttttatctagagaa 6103857  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  6103856 gccacctaaaaatatgcacgttcaagttctttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacataccaccttaactttaatcctagactag 6103757  T
Q  586 attatcttcactcac 600  Q
    |||||||||||||||    
T  6103756 attatcttcactcac 6103742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 581
Target Start/End: Original strand, 48976712 - 48977303
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48976712 cattttgtctggtgtaaatattggcaaaaatctctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttatataaacctaactattatgtaacgttaatatg 48976811  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48976812 cacattgttggttccttcattggttctaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgtttttctaatatattgaacaaaataaaacatgctcttttcc 48976907  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  48976908 tacagtaaatttttataatgctttggtaaatgttttataaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttatacctagcacttctca 48977007  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48977008 aatgagatatcaatgacatttctaaaatgaactcggaaaacaatcacaccaatcgacaaataagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaa 48977107  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48977108 agagagcaagttacaaaaaatacttaggtggccaatggttcaaattttgtcgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaa 48977207  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctaga 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  48977208 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgtactttcaacagatcaccttaactataatcctaga 48977303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 31369243 - 31368621
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||  |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31369243 cattttgtctgatgtaagtattgacaaaaattcccttttagttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 31369144  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaa-catgctcttttc 184  Q
     ||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| | |||||    
T  31369143 tacattgttggttcattcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgagaaaaataaaaacatgttattttc 31369048  T
Q  185 ctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctc 284  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31369047 ctacagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctc 31368948  T
Q  285 aaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggca 384  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31368947 aaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacgaaaaacaatcatactcattgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggca 31368848  T
Q  385 aagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaat-ttttgatctagag 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  31368847 aagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggtcaatagttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttttatctagag 31368748  T
Q  484 aagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagact 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31368747 aagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccacactttcaacatatcaccttaactttaatcctagact 31368648  T
Q  584 agattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||    
T  31368647 agattatcttcactcactgatgctact 31368621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 32755544 - 32756162
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  32755544 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactactatgtaacgttaatttg 32755643  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||||||||| ||||||||||||| |||    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  32755644 cacattgttggttccttcattggttccaattaatatcatgttaattttaa----tgttattttcctaatctcttgaataaaataaaacatgctattttcc 32755739  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32755740 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatat--ataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctca 32755837  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  32755838 aatgagatatcaacgacatttttaaaaggaatacggaaaacaatcacattcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacgacaa 32755937  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  32755938 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttaccgagaacatatgttagaggtaggtgataatctaatttttgatctagagaa 32756037  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  32756038 gccacataaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccacactttcaacatatcactttaattctaatcctatactag 32756137  T
Q  586 attatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||  ||||||||    
T  32756138 attatcttcactcactgatgctact 32756162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 49113094 - 49113713
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    ||||||||||  ||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49113094 cattttgtctggtgtaattattgacaaaaatccctttttgtttagtctatgaaacttgcgatctcttatataaacctaactattatgtaacgttaatctg 49113193  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49113194 cacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttattttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 49113289  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  49113290 tacagtaaatctttataatgctt-ggtaaatattttaggaatgtacatatatataacttctaattaacagtgcaatttattttatacctagcacttctca 49113388  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  49113389 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcgtcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacgacaa 49113488  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  49113489 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatgattcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataaattaatttttgatatagagaa 49113588  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49113589 gtcacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccacacttgcaacaaatcaccttaactctaatcctagactag 49113688  T
Q  586 attatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||    
T  49113689 attatcttcaatcaccgatgctact 49113713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 610
Target Start/End: Original strand, 16341717 - 16342304
Alignment:
Q  35 tttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattg---------------gttccaattagt 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||               ||||||||||||    
T  16341717 tttttagttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatataacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaattagt 16341816  T
Q  120 atcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgtt 219  Q
    |||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  16341817 atcatgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctattttcctacagcaaatctttataatgcttttgtaaatgtt 16341912  T
Q  220 ttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgag--atgtcaatgacatttctaaaaggaac 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  16341913 ttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttttcaaatgagatatatcaatgacatttctaaaaggaac 16342012  T
Q  318 acggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggc 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  16342013 acggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaaagagaaccagttataaaaaatacttaggcggc 16342112  T
Q  418 caatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttt 517  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  16342113 caatggttcaaa-tttgccgagaacagatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaaatcgttc 16342211  T
Q  518 tcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  16342212 tcaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatattcactcaccgatgttact 16342304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 54512806 - 54513433
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54512806 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctctttttggttaatctatgaaactcgcagtctcttttataaatctaactattatgtaacgttaatctg 54512905  T
Q  101 ca---------------cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttg-----aacaaaataaaacatgctct 180  Q
    ||               |||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||     || |||| ||||||||||||    
T  54512906 cataatgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaatt----ataatgttgttttcctaatctcttgaagaaaagaaaaaaaaacatgctct 54513001  T
Q  181 tttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatt 280  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||| || |    
T  54513002 tttcctacatcaaatctttataatactttggtaaatgttttagaaatgtacgtatatataacatctaattaaaattgcaatttgttttgtacctaacact 54513101  T
Q  281 tctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataac 380  Q
    || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54513102 tcccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacacgaaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataac 54513201  T
Q  381 ggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatcta 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54513202 ggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaat-gatcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatcta 54513300  T
Q  481 gagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctag 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54513301 gagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttctcaattaaagatttcgtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactctaatcctag 54513400  T
Q  581 actag---attatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  54513401 actagattattatcttcactcaccgatgctact 54513433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 52463158 - 52462537
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52463158 cattttgtctgatgcaaatattggcaaaaatccctttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 52463059  T
Q  101 cacattg--------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcct 186  Q
    |||||||              |||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  52463058 cacattgttggtttcttcattgttccaattagtatcatgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaacatagaacatgctcttttcct 52462963  T
Q  187 acagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtac--atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctc 284  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  52462962 acaacaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacttatatatataacatccaattagcactgcaatttgttttgtacctagcacttccc 52462863  T
Q  285 aaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggca 384  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  52462862 aaattagatatcaaggacatttctaaaaggaacatggaaaacaatcacaatcgtcagcaaacaagctcaaaaaaggtataactgtcgcttgataacggca 52462763  T
Q  385 aagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagaga 484  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  52462762 aagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgatctagaga 52462663  T
Q  485 agccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagacta 584  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52462662 agccaccttaaaatatgcacgttcaagtcgttcccaaataaagattatgtgttcatgatccgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactg 52462563  T
Q  585 gattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||    
T  52462562 gattatcttcactcactgatgctact 52462537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 52853668 - 52853087
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52853668 cattttgtctgatgtaaatattggcgaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcagttt--tttataaacccaactattatgtaacgttaatctg 52853571  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  52853570 cacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacataatattttcc 52853475  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  52853474 tacggtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataagttctaattaacactgcaatttgttttgtacctaacacttctca 52853375  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52853374 aatgagatattaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaa 52853275  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52853274 agagagcaagttacaaaaaatagttaggcgatcaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaagtaggtgataaattaatttttgatctagagaa 52853175  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactcta 573  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||    
T  52853174 gtcatctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttctaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagattaccttaactcta 52853087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 21699799 - 21699193
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21699799 cattttgtctggtgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 21699700  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaa----taaaacatgctctt 181  Q
    |||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||| ||||    ||||||||||||||    
T  21699699 cacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcataatctcttgaagaaaaaaaataaaacatgctctt 21699604  T
Q  182 ttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcattt 281  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||||| ||    
T  21699603 ttcctatagtaaatctttataatgttttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgc---ttgttttatacctagcactt 21699507  T
Q  282 ctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacg 381  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        
T  21699506 ctcaaatgagatatcaatgacttttctaaaaggaacacggaaaacaatcacacgcattgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgat---- 21699411  T
Q  382 gcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctag 481  Q
               ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21699410 -----------aagttacaaaaaatatttaggcagccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctag 21699322  T
Q  482 agaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctaga 581  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21699321 agaagccacctaaaagtatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcataatccgcactttcagcatatcaccttaactctaatcttaga 21699222  T
Q  582 ctagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21699221 ctagattatcttcactcaccgatgctact 21699193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 55295005 - 55294387
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55295005 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtctatgacacttgcagttttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 55294906  T
Q  101 cacattggt---------------tccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||||||| |               |||||||||||||| ||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55294905 cacattgttggttacttcattgattccaattagtatcaagttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgttcttttcc 55294810  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  55294809 tacaacaaatctttata-tgctttggtaaatgttttagaaatgtacttatatataacatctaattaacactacaatttgttttgtacctagcacttccca 55294711  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  55294710 aatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacagggaaaaaattcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggtataagtgtcacttgataacggcaa 55294611  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  55294610 agagagcaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatggttcaacttttgccgagaatatatgttagaggtaggtgat-agctaattttttatctaaagaa 55294512  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  55294511 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagacaag 55294412  T
Q  586 attatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||    
T  55294411 attatcttcactcaccaatgttact 55294387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 50741381 - 50742021
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50741381 cattttttctgatgtaaatattggcaaaaatcccattttggttagtttatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatttg 50741480  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||||||||||||||||||||||| |||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50741481 cacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattataa----tgttgttt-cctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 50741575  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatg----------------------tacatatatataacttctaattaactctgcaattt 263  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||                      || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50741576 tacaacaaatctttataatgttttggtaaatgttttagaaatgtatatatatatatatatatatatatatatatataacttctaattaacactgcaattt 50741675  T
Q  264 gttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 363  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  50741676 gttttgtacctagcacttatcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatccacaaacaaactcaaaaa-ggtat 50741774  T
Q  364 aagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgata 463  Q
     |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||    
T  50741775 gagtgtcgcttgataacgacaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggtcaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata 50741874  T
Q  464 agttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcac 563  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  50741875 agttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagttttttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacaaatcac 50741974  T
Q  564 cttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  50741975 cttaactctaatcctagactagattatcttcactcatcgatgctact 50742021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 11598190 - 11597566
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacct-aactattatgtaacgttaatct 99  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  11598190 cattttgtctgatgtaaacattggcaaaaaaccattttttgttagtttatgacacttgcagtcttttttataaactttaactattatgtaacgttaatct 11598091  T
Q  100 gcacattggt---------------tccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttc 184  Q
    |||||||| |               |||||||| ||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  11598090 gcacattgttggttccttcattgattccaattactatcatgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaatagaacatgttcttttc 11597995  T
Q  185 ctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtac--atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttc 282  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||    
T  11597994 ctacagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagtaatgtacttatatatataatatctaattaacagtgcaatttgttttgtacctagaacttc 11597895  T
Q  283 tcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaag--gtataagtggcgcttgataac 380  Q
     |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  |||||||||||    
T  11597894 ccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacagggaaaa-aatcacactcatcgaaaaacaaactcaaaaaatatgtataagtttcgcttgataac 11597796  T
Q  381 ggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatcta 480  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  11597795 ggcaatgagagcaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatgattcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgatcta 11597696  T
Q  481 gagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctag 580  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  11597695 gagaagccacctaaaaatatgcacattcaagtcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcttag 11597596  T
Q  581 actagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  11597595 acaagattatcttcactcaccaatgctact 11597566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 48521248 - 48520646
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| ||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48521248 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaattctttttttggttagtatatgacacttgcagtcttttttagaaacctaactattatgtaacgttaatctg 48521149  T
Q  101 ca---------------cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||               ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  48521148 catattgttggttcattcattgattccaattagtatcaagttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaatagaagatgttcttttcc 48521053  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaat-gtac-atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttct 283  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||     
T  48521052 tacaacaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaattgtactatatatataacatctaattaacactgcaatttgttttgtacctaacacttcc 48520953  T
Q  284 caaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggc 383  Q
    ||| |                    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  48520952 caagt--------------------aaaaggaacagggaaaaaaatcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggtataagtgtcgcttaataacggc 48520873  T
Q  384 aaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagag 483  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  48520872 aaagagagcaagttacgaaaaatacttaagcggtcaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgatctagag 48520773  T
Q  484 aagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagact 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  48520772 aagccacctaaaaatatgcacgttcaagttgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatccaagaca 48520673  T
Q  584 agattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  48520672 agattatcttcactcaccaatgctact 48520646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 13 - 415
Target Start/End: Original strand, 51248401 - 51248802
Alignment:
Q  13 tgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattg----- 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||            ||||||||||||||| |||||||         
T  51248401 tgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtctatgaaactttcaatctcttttata------------atgtaacgttaatcttcacattgttggt 51248488  T
Q  108 ----------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatct 197  Q
              |||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51248489 tccttcattggttcaaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatcttttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtgaatct 51248584  T
Q  198 ttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtca 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||    
T  51248585 ttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttatacctagcacttctcaaatgagatatca 51248684  T
Q  298 atgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagtt 397  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51248685 atgacatttctaaaaggaatacggaaaacaatcacattcatcgacaaataagctctaaaaatgtataaatgtcgcttgataacggcaaagagagcaagtt 51248784  T
Q  398 acaaaaaatacttaggcg 415  Q
    | ||||||||||||||||    
T  51248785 ataaaaaatacttaggcg 51248802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 362 - 610
Target Start/End: Original strand, 8242891 - 8243139
Alignment:
Q  362 ataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtga 461  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  8242891 ataagtgtcgcttgataacgtcaaagagagcaagttaccaaaaatacttaggcggccaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtga 8242990  T
Q  462 taagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatc 561  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  8242991 taagctaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatacacgttcaagtcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatc 8243090  T
Q  562 accttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8243091 accttaactccaatcctagactagattatcttcactcactgatgctact 8243139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 297 - 610
Target Start/End: Original strand, 54934151 - 54934454
Alignment:
Q  297 aatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagt 396  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |           |||||||||||||||    
T  54934151 aatgacatttctaaaaggaacacagaaaaaaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtca----------gcaaagagagcaagt 54934240  T
Q  397 tacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaa 496  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54934241 tacgaaaaatacttaggcgaccaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtagatgataagctaatttttgacctagagaagccacctaaaa 54934340  T
Q  497 atatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcac 596  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  54934341 atatgcacgttcaagtcattcccaaataaagatttggtgttcatgatatgcactttcaacatattaccttaattctaatcatatactagattatcttcac 54934440  T
Q  597 tcacctatgctact 610  Q
    ||||  ||||||||    
T  54934441 tcactgatgctact 54934454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 342 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 18742103 - 18741834
Alignment:
Q  342 caaacaagctcaaaaaa-ggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtga 440  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  | | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||    
T  18742103 caaacaagctcaaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaaagagacaatggttcaaaaaatacttaggtggccaatggttcaaattttgctgaga 18742004  T
Q  441 acatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcat 540  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  18742003 acatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccatctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaatgaaggtttggtgttcat 18741904  T
Q  541 gattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||| || ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18741903 gatccgcacttttaacagatcaccttaactctaatcttagactagataatcttcactcaccgatgctact 18741834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 360 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 40824526 - 40824276
Alignment:
Q  360 gtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgt 459  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||    
T  40824526 gtataagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggt 40824427  T
Q  460 gataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacata 559  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |    
T  40824426 gataagctaatttttaatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttcccaaataaagatttggtgtttatgatccgcactttcaacaga 40824327  T
Q  560 tcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  40824326 tcaccttaactctaatctcagacaagattatcttcactcatcgatgctact 40824276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 16495918 - 16496164
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16495918 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatccatttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaacctgactattatataacgttaatctg 16496017  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  16496018 cacattgttggttgcttcattggttccaattagtatcatgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaaccaaatagaacatgctattttcc 16496113  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16496114 tacagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttaaaaatgtacatata 16496164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 54793191 - 54792945
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54793191 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctctttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaacttaactattatgtaacgttaatctg 54793092  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  54793091 cacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaaccaaatagaacatgttcttttcc 54792996  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 236  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  54792995 tacggtaaatctttataatgctttgataaatgctttcgaaatgtacatata 54792945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 11383146 - 11383386
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11383146 cattttgtcttatgtaaatattggtaaaaatcactttttggttagtctatgacactgacagactcttttataaacctaattattatgtaacattaatctg 11383245  T
Q  101 ca---------cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagt 191  Q
    ||         ||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||      
T  11383246 catggttgcttcattggttccaattagtatcatgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaatagaacatgttcttttcctacaac 11383341  T
Q  192 aaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 236  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  11383342 aaagctttataatgctttggtaaatattttagaatggtacatata 11383386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 40827261 - 40827021
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40827261 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatccttttttggttagtctatcacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 40827162  T
Q  101 caca---------------ttggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||||               ||| ||||||||||||||| |||||||    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  40827161 cacattgttggttccttcgttgattccaattagtatcaagttaatt----ataatgttgttttcctaatctcttgaacaaaatagaacatgttcttttcc 40827066  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgta 230  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40827065 tacaacaaatgtttataatgctttggtaaatgttttagaaatgta 40827021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 460 - 608
Target Start/End: Original strand, 51248802 - 51248950
Alignment:
Q  460 gataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacata 559  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |    
T  51248802 gataagttaatttttgatctagagaagtcacctaaaaataagcatgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacaga 51248901  T
Q  560 tcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgcta 608  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51248902 tcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcaccgatgcta 51248950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 39796699 - 39796478
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39796699 cattttgtctgatgtaaatattgacaaaaatctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 39796600  T
Q  101 cac---------------attggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||               |||||||| |||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  39796599 cacattgttggttccttcattggttcaaattagtatcatgttaatt----ataatgttgttttcctaatcttttgaacaaaatagaacatgccctttttc 39796504  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttgg 211  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||    
T  39796503 tacagcagatctttataatgctttgg 39796478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 5252600 - 5252379
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||| || |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5252600 cattttgtctgatgtaaatattgacaaaattctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 5252501  T
Q  101 cac---------------attggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||               |||||||| |||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  5252500 cacattgttggttccttcattggttcaaattagtatcatgttaatt----ataatgttgttttcctaatcttttgaacaaaatagaacatgccctttttc 5252405  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttgg 211  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||    
T  5252404 tacagcagatctttataatgctttgg 5252379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 23193496 - 23193602
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23193496 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtctatgacacttgaagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 23193595  T
Q  101 cacattg 107  Q
    |||||||    
T  23193596 cacattg 23193602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 8242728 - 8242834
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8242728 cattttgtctgatgtaaatattgacaaaaatccctttttggttagtctatgacacttacagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatatg 8242827  T
Q  101 cacattg 107  Q
    |||||||    
T  8242828 cacattg 8242834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 485 - 599
Target Start/End: Original strand, 23194712 - 23194826
Alignment:
Q  485 agccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagacta 584  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  23194712 agccacctaaaaatatgtacgatcaagtcgttcccaaataaatatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttatctctaatcctagatta 23194811  T
Q  585 gattatcttcactca 599  Q
    |||||||||||||||    
T  23194812 gattatcttcactca 23194826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 22477736 - 22477841
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22477736 cattttatctgatgtaaatattagcaaaaatccctttttggttggtctatgacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 22477835  T
Q  101 cacatt 106  Q
    ||||||    
T  22477836 cacatt 22477841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 11951190 - 11951096
Alignment:
Q  12 atgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacatt 106  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11951190 atgtaaatgttagcaaaaatccctttttggttagtctatgacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacatt 11951096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 512
Target Start/End: Original strand, 23936793 - 23937060
Alignment:
Q  244 tctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgaca 343  Q
    ||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||| |||| |||  ||||||||||||  || |||||  | ||| |||||||      
T  23936793 tctaattaacattgcaatttgtttcctacttagcatttccccaatgagatatcaaggacggttctaaaaggaaagcgaaaaacggtgacagtcatcgatg 23936892  T
Q  344 aacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaaca 443  Q
    | ||| ||||||  | ||||||||| |||||||| || ||  ||||||||||| |  |||| |||||||| |||||||||||||||||||  || | |||    
T  23936893 accaaactcaaaggaagtataagtgtcgcttgattaccgcggagagagcaagtcatgaaaagtacttaggtggccaatggttcaaatttttccgag-aca 23936991  T
Q  444 tatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagt 512  Q
    | |||||| |||  ||| |||  |||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23936992 tgtgttagtggtcggtggtaaactaatctttgatctggaaaagccacctaaaaacatgcacgttcaagt 23937060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 35436867 - 35436971
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||    
T  35436867 cattttgcctgatgtaaatattgggaaaaattcctttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaatct-actattatgtaatgttaatatg 35436965  T
Q  101 cacatt 106  Q
    ||||||    
T  35436966 cacatt 35436971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 36165237 - 36165130
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattgg-aaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatct 99  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |    
T  36165237 cattttgtctgatataaatattgggaaaaaattcttttttgattagtctatgacagttgcagtctcttttataaatctaactattatataatgttaatat 36165138  T
Q  100 gcacattg 107  Q
    ||||||||    
T  36165137 gcacattg 36165130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 537 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 50802879 - 50802806
Alignment:
Q  537 tcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  50802879 tcatgatccgtactttcaacaaatcaccttaactctaatcttagattagattatcttcactcaccgatgttact 50802806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 537 - 610
Target Start/End: Original strand, 50872998 - 50873071
Alignment:
Q  537 tcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  50872998 tcatgatccgtactttcaacaaatcaccttaactctaatcttagattagattatcttcactcaccgatgttact 50873071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 550 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 2843589 - 2843529
Alignment:
Q  550 tttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  2843589 tttcagcagatcaccttaactctaatcctagactagattgtcttcactcaccgatgctact 2843529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 168
Target Start/End: Original strand, 35436984 - 35437045
Alignment:
Q  103 cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaat 168  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35436984 cattggttctaattagtatcgtgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaat 35437045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 12158019 - 12157959
Alignment:
Q  103 cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaa 167  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12158019 cattggttctaattagtatcatgctaattataa----tgttgttttcctaatctgttgaacaaaa 12157959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 573 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 54648534 - 54648497
Alignment:
Q  573 aatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  54648534 aatcctagactagattatcttcattcaccgatgctact 54648497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 447; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 26586 - 25977
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26586 cattttgtctgatgtaagtattggcaaaaattcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 26487  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
     ||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  26486 tacattgttggtttcttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgtagttttcctaatctcttgagaaaaataaaacatgctattttcc 26391  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26390 tacagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatatacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctca 26291  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26290 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaa 26191  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26190 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgccgataacatgtgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaa 26091  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26090 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactag 25991  T
Q  586 attatcttcactca 599  Q
    ||||||||||||||    
T  25990 attatcttcactca 25977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 447; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 599
Target Start/End: Original strand, 9957 - 10566
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9957 cattttgtctgatgtaagtattggcaaaaattcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 10056  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
     ||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  10057 tacattgttggtttcttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgtagttttcctaatctcttgagaaaaataaaacatgctattttcc 10152  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10153 tacagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatatacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctca 10252  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10253 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaa 10352  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10353 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgccgataacatgtgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaa 10452  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10453 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactag 10552  T
Q  586 attatcttcactca 599  Q
    ||||||||||||||    
T  10553 attatcttcactca 10566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 438; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 26821684 - 26822304
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  26821684 cattttgtctgatgtaagtattggcaaaaattcatttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaaccaaacaattatgtaacgttaatcta 26821783  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  26821784 cacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgagaaaaataaaacatgctattttcc 26821879  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26821880 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctca 26821979  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||| |||||    
T  26821980 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagcttaaaaaaggtataagtgtcatttgataatggcaa 26822079  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26822080 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaa 26822179  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  26822180 gccaactaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcgtagactag 26822279  T
Q  586 attatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||  ||||||||    
T  26822280 attatcttcactcactaatgctact 26822304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 16724577 - 16723957
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16724577 cattttgtctgatgtaagtattggcaaaaattcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 16724478  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
     ||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  16724477 tacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgagaaaaataaaacatgctattttcc 16724382  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16724381 tacagtaaatccttacaatcctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctca 16724282  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16724281 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaataatcacactcatcgactaacaagctcaaaaaatgtataagtgtcgcttgataacggcaa 16724182  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16724181 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatgattcaaattttgacgagaacatgtgttagagataggtgataagttaattttttatctagagaa 16724082  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16724081 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaaaatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaacattaatcctagactag 16723982  T
Q  586 attatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||  ||||||||    
T  16723981 attatcttcactcactgatgctact 16723957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 30570766 - 30570156
Alignment:
Q  13 tgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattg----- 107  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         
T  30570766 tgtaaatattggcaaaaatctctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacccaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggt 30570667  T
Q  108 ----------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttc-ctacagtaaatc 196  Q
              ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  30570666 tccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataatacatgctcttttttctacagtaaatc 30570571  T
Q  197 tttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttg-tacctagcatttctcaaatgagatgt 295  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |    
T  30570570 tttataatgcttcggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaatttacactgcaatttttttttatacctagcacttctcaaatgagatat 30570471  T
Q  296 caatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaag 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  30570470 caatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtttaagtgttgcttgataacgataaagagagcaag 30570371  T
Q  396 ttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaa 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30570370 ttacaaaaaatacttaggcggccaatagttcaaattttgccgataacatatgttataggtatgtgataagttaatttttgatctagagaagccacataaa 30570271  T
Q  496 aatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttca 595  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30570270 aatatgcacgttcatgtcgtttccaaataaagatttggtgttcgtgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatcttca 30570171  T
Q  596 ctcacctatgctact 610  Q
    |||||  ||||||||    
T  30570170 ctcactgatgctact 30570156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 33664020 - 33663404
Alignment:
Q  3 ttttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgca 102  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33664020 ttttttctgatgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgtaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgca 33663921  T
Q  103 cattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttccta 187  Q
    |||||               ||||||||||||||||||||| ||    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33663920 cattgttggttcattcattggttccaattagtatcatgttagtt----ataatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttccta 33663825  T
Q  188 cagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaa 287  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33663824 cagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttttaattaacattgtaatttgttttgtacctagcacttctcaaa 33663725  T
Q  288 tgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaag 387  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |   ||||||||||||| ||||     
T  33663724 tgagatatcaatgacatttttaaaaggaacatggaaaacaatcacaatcatcgacaaacaagcttaaaaaaggtatga---gcgcttgataacgacaaaa 33663628  T
Q  388 agagcaagttacaaaaaatactt-aggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaag 486  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33663627 agagcaagttacaaaaaatacttaaggtggccaatgattcaaattttgccgagaacatatgttagaggtatgtgataagttaatttttgatctagagaag 33663528  T
Q  487 ccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactaga 586  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33663527 ccacctaaaaatatgcatgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcataatccgcactttcaacgaatcaccttaactctaatcctagactaga 33663428  T
Q  587 ttatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  33663427 ttatcttcactcaccgatgctact 33663404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 610
Target Start/End: Original strand, 42885474 - 42886058
Alignment:
Q  35 tttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgca---------------cattggttccaattagt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||| ||||||||    
T  42885474 tttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcatattgttggttccttcattggtttcaattagt 42885573  T
Q  120 atcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgtt 219  Q
    |||||||||||||     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42885574 atcatgttaattg----caatgttgttttcataatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttacaatgctttggtaaatgtt 42885669  T
Q  220 ttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacac 319  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42885670 ttagaaatgt--aaatatataacttctgattaacactgcaatttgttttatacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacac 42885767  T
Q  320 ggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggcca 419  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42885768 ataaaacaatcacactcatcgacaaacaagcttaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacagcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggcca 42885867  T
Q  420 atggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttc 519  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  42885868 atgattcaaattttgccgataacatatgttagaggtagatgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttct 42885967  T
Q  520 aaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42885968 aaataaagatttggtgttaatgattcacactttcaacagatcaccttaactctaatcctagattagattatcttcactcaccgatgctact 42886058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 610
Target Start/End: Original strand, 33907326 - 33907915
Alignment:
Q  35 tttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgca---------------cattggttccaattagt 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||||||||||    
T  33907326 tttttagttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcatattgttggttccttcattggttccaattagt 33907425  T
Q  120 atcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgtt 219  Q
    |||||||||||| |||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33907426 atcatgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttaaacaaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgctttggtaaatgtt 33907521  T
Q  220 ttagaaatgtacatat----atataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaagga 315  Q
    ||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33907522 ttagaaatgtacatatatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagaacttttcaaatgagatatcaatgacatttctaaaagga 33907621  T
Q  316 acacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcg 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33907622 acacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacgacaaagagagccagttataaaaaatacttaggcg 33907721  T
Q  416 gccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgt 515  Q
    ||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33907722 gccaatgattcaaa-tttgccgagaacagatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaaatcgt 33907820  T
Q  516 tttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  33907821 tcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatattcactcaccgatgctact 33907915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 610
Target Start/End: Original strand, 26827598 - 26828183
Alignment:
Q  35 tttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattg---------------gttccaattagt 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||               ||||||||||||    
T  26827598 tttttagttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacattaatctgcacattgttggttccttcattggttccaattagt 26827697  T
Q  120 atcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgtt 219  Q
    |||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  26827698 atcatgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagcaaatctttataatgttttggtaaatgtt 26827793  T
Q  220 ttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26827794 ttagaaatgtacatatatataacttctaattaacattgcaatttgttttgtacctaacacttttcaaatgagatatcaataacatttctaaaaggaacac 26827893  T
Q  320 ggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggcca 419  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  26827894 ggaaaacaatcacacccatcgacacgcaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaaagagagccagttataaaaaatacttaggcggcca 26827993  T
Q  420 atggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttc 519  Q
    |||||||||| |||| || ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  26827994 atggttcaaa-tttgccgagaacagatgttagaggtaggtgataagtttatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaaatcgttccc 26828092  T
Q  520 aaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  26828093 aaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactaaattatattcactcaccgatgctact 26828183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Original strand, 21097763 - 21098373
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21097763 cattttgtctgatgtaagtattgacaaaaattcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaaactaactattatgtaacgttaatctg 21097862  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
     ||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  21097863 tacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgagaaaaataaaacatgctattttcc 21097958  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21097959 tacaataaatatttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttttaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctca 21098058  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||         
T  21098059 aatgagatatcaatgacatttctaaaagaaacacagaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgtttgataac----- 21098153  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
           | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21098154 -----atatgttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataaattaattttttatctagagaa 21098248  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  21098249 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttctaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcacattaactttaatcctagactag 21098348  T
Q  586 attatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||  ||||||||    
T  21098349 attatcttcactcactgatgctact 21098373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 18092950 - 18092328
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18092950 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtctatgacacttgcaatattttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 18092851  T
Q  101 cacattggt---------------tccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||||||| |               |||||||||||||| ||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18092850 cacattgttggttccttcattgattccaattagtatcaagttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgttcttttcc 18092755  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtac--atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttct 283  Q
    ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||     
T  18092754 tacaacaaatctttataatgatttggtaaatgttttagaaatgtacttatatatataacatctaattaacacagcaatttgttttgtacctagcacttcc 18092655  T
Q  284 caaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggc 383  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18092654 caaatgagatatcaaagacatttctaaaaggaaaagagaaaaaaatcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggc 18092555  T
Q  384 aaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagag 483  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  18092554 aaagagaacaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgatctagag 18092455  T
Q  484 aagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagact 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  18092454 aagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttcccaaataaatatttagtgttcatgatccacactttcaacagatcaccttaactctaatcctagata 18092355  T
Q  584 agattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  18092354 agattatcttcactcaccgatgctact 18092328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 45205246 - 45204637
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  45205246 cattttgtctgatgtaaatattgacaaaaatacctttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaacctaattattatgtaacgttgatctg 45205147  T
Q  101 cacatt---------------ggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||||||               ||||||||||||||||||||||||| |||     ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45205146 cacattattggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattataac----gttgttttcataatctcttgaacaaaataaaacaagctcttttcc 45205051  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    ||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  45205050 tacaacaaatctttatgatgctttgataaatgttttagaaatgtacatatatataacatctaattaacactgcaatttgttttgtacctaacacttccca 45204951  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  45204950 aatgatatatcaaagacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataaggacaa 45204851  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||    
T  45204850 aaagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatagttcaaattttgccgagaa-atatgttagagggaggtggcaagttaatttttgatctagagaa 45204752  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactag 585  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  45204751 gccacctaaaaatatgcacgatcaagtcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttatctctaatcctagactgg 45204652  T
Q  586 attatcttcactcac 600  Q
    ||||||| |||||||    
T  45204651 attatctccactcac 45204637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 610
Target Start/End: Original strand, 11706711 - 11707298
Alignment:
Q  35 tttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgca---------------cattggttccaattagt 119  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||                 ||||||||| |||||||    
T  11706711 tttttagttagtcgatgaaacttgcaatcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatatgggtattgttggttccttcattggttcaaattagt 11706810  T
Q  120 atcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgtt 219  Q
    |||||||||||| |||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  11706811 atcatgttaattataa----tgttgttttactaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcatacagcaaatctttataatgttttggtaaatgtt 11706906  T
Q  220 ttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  11706907 ttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgtaatttgttttgtacctatcacttttcaaatgagatatcaatgaaatttctaaaaggaacac 11707006  T
Q  320 ggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctc-aaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagtta-caaaaaatacttaggcggc 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||    
T  11707007 ggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaaggtataagtgtcgtttgataacggcaaagagagtcagttataaaaaaatacttaggcggc 11707106  T
Q  418 caatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttt 517  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  11707107 caatggttcaaa-tttgccgagaacagatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaatatatgcacgttcaaatcgttc 11707205  T
Q  518 tcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
     |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  11707206 ccaaataaagattcggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatattcactcaccgatgctact 11707298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 1515218 - 1514595
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||| || ||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||    
T  1515218 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatccctttttgattagtctatgactcttacagtcttttttataaacctaactgttatttaatgttaatatg 1515119  T
Q  101 cacattggt---------------tccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||||||| |               |||||||||||||| ||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  1515118 cacattgttggttccttcattgattccaattagtatcaagttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaatagaacatgttcttttcc 1515023  T
Q  186 -tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatata----acttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatt 280  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    || |||||||||| || ||||||||||||||||||  | |    
T  1515022 ctacagcaaatctttataatgttttggtaaatgttttagaaatgtacttatatatatttaacatctaattaacactacaatttgttttgtacctattact 1514923  T
Q  281 tctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataac 380  Q
    || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1514922 tcccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacggggaaaaatatcacactcatctacaaacaaactcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataac 1514823  T
Q  381 ggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatcta 480  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  1514822 ggcaaagagagcaagttatgaaaaatacttaggcggtcaatggttcaacttttgtcgagaacatatgttaaaggtaggtgataagctaattttttatcta 1514723  T
Q  481 gagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctag 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||     
T  1514722 gagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccggactttcaacagatcaccttaactttaatcctaa 1514623  T
Q  581 actagattatcttcactcacctatgcta 608  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||    
T  1514622 acaaaattatcttcactcaccgatgcta 1514595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 232 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 36633036 - 36632658
Alignment:
Q  232 atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 331  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36633036 atatatataacatctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcgatgacatttctaaaaggaacacgaaaaacaatca 36632937  T
Q  332 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaa-ggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaat 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36632936 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacgacaaagatagcaagttacgaaaa-tacttaggcggccaatggttcaaat 36632838  T
Q  431 tttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatt 530  Q
    |||| || |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36632837 tttgccgagaacatatgttagaggtaggtgacaagctaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatt 36632738  T
Q  531 tggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36632737 tggtgttcatgatcctcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcaccgatgctact 36632658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 303 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 19126598 - 19126302
Alignment:
Q  303 atttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaa 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19126598 atttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaa 19126499  T
Q  403 aaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19126498 aaatacttaggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacct-aaaatatgc 19126400  T
Q  503 acgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcac 600  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19126399 acgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcacgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagacaagattatcttcactcac 19126302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 515
Target Start/End: Original strand, 4811612 - 4812136
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4811612 cattttgtctaatgtagatattggcaaaaatccctttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaacctatttattatgtaacgttaatctg 4811711  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               ||| |||||||||||| ||||||| |||    ||||||||||| | |||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  4811712 cacattgttggttccttcattggtttcaattagtatcacgttaattataa----tgttgttttccca-tctcataaacaaaatagaacatgctcttttcc 4811806  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatat----------atataacttctaattaactctgcaatttgttttgtaccta 275  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||          ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  4811807 tacaacaaatctttataacgctttggtaaatgttgtagaaatgtatatatatatatatatatataacatctaattaacaccgcaatttgttttgtaccta 4811906  T
Q  276 gcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttg 375  Q
     || ||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  4811907 ccactttccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtg------- 4811999  T
Q  376 ataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttg 475  Q
        |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| || |||||  | |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  4812000 ---tcggcaaagagagcaagttacgaaaattacttaggcggtcaatggtttaacttttgctgagaacatttgttagaggtaggttataagctaatttttg 4812096  T
Q  476 atctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgt 515  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4812097 acctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgt 4812136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 232 - 610
Target Start/End: Original strand, 45399103 - 45399471
Alignment:
Q  232 atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 331  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45399103 atatataaaacatctaattaacactacaatttgttttgtacctagcacttttcaaatgagatatcaaagacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 45399202  T
Q  332 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||          |||||||||| ||||||| |||||||| |||| || ||||||||||| ||    
T  45399203 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcg----------gcaaagagagtaagttacgaaaaatacgtaggtggtcaatggttcaactt 45399292  T
Q  432 ttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagattt 531  Q
    ||| || |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  45399293 ttgccgagaacatatattagaggtaggtgataagctaatttttgacctagagaagccacccaaaaatatgcacgttcaagtcattcccaaataaagattt 45399392  T
Q  532 ggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
     ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  45399393 tgtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaattctaatcctatactagattatcttcactcactaatgctact 45399471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 246 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 35286249 - 35285899
Alignment:
Q  246 taattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaa 345  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35286249 taattaacactgcaatttgttttgtacctagcactttccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacacgaaaaacaatcacactcatcgacaaa 35286150  T
Q  346 caagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacata 445  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||          |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  35286149 caagctcaaaaaaggtataagtgtcg----------gcaaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggccaatggttcaacttttgccgagaacata 35286060  T
Q  446 tgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattc 545  Q
    ||    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| |    
T  35286059 tg----aggtaggtgataagctaatttttgacctagagaagccacccaaaaatatgcacgttcaagtcattcccaaataaagatttggtattcatgatcc 35285964  T
Q  546 gtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    | || |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  35285963 gcacgttcaacatatcaccttaattctaatcatatactagattatcttcactcactgatgctact 35285899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 62 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 30572597 - 30572285
Alignment:
Q  62 tctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgtt 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    
T  30572597 tctcttttataaacccaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgtt 30572502  T
Q  147 ttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttc-ctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttc 245  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30572501 ttcctaatctcttgaacaaaataatacatgctcttttttctacagtaaatctttataatgcttcggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttc 30572402  T
Q  246 taattaactctgcaatttgttttg-tacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaa 344  Q
    ||||| || ||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30572401 taatttacactgcaatttttttttatacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaa 30572302  T
Q  345 acaagctcaaaaaaggt 361  Q
    |||||||||||||||||    
T  30572301 acaagctcaaaaaaggt 30572285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 35286568 - 35286318
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35286568 cattttgtctgatgtaaatattgacaaaaatccctttttggttagtctatgacacttgcattctcttttataaatctaactattatgtaacgttaatctg 35286469  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||||||||||||||||||||||| |||    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  35286468 cacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattataa----tgttgttttcccaatctcttgaataaaatagaacatgctcttttcc 35286373  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatata 240  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35286372 tccagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatata 35286318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 419 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 19167657 - 19167477
Alignment:
Q  419 aatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttt 518  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19167657 aatggttcaaattttgtcgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaaaccacctaaaaatatacatgttcaagtcgtttt 19167558  T
Q  519 caaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactca 599  Q
    |||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  19167557 caaataaagatttggtgttcattatccgcactttcaacagatcaccttaactctaattctaggctagattatcttcactca 19167477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 17091841 - 17092087
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17091841 cattttatctgatgtaaatattggcaaaaatcccttttttgttagtctatgacacttgaaatctcttttataaacctaactattatataacgttaatctg 17091940  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17091941 cacattgttggttccttcgttggttccaattagtatcatgttaattataaa----gttgttttcctaatctcttgaacaaaatagaacatgctcttttcc 17092036  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 236  Q
    ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17092037 tacatcaaagctttataatgctttggtaaatgttctagaaatgtacatata 17092087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 388 - 600
Target Start/End: Original strand, 11448193 - 11448405
Alignment:
Q  388 agagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagc 487  Q
    |||||||| ||  ||||||| ||||| || || |||||||| || || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  11448193 agagcaagctatgaaaaatatttaggtgggcagtggttcaatttatgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagaaaagc 11448292  T
Q  488 cacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagat 587  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11448293 cacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccccactttcaacagatcaccttaactctaaccctagactagat 11448392  T
Q  588 tatcttcactcac 600  Q
    |||||||||||||    
T  11448393 tatcttcactcac 11448405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 17025656 - 17025902
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17025656 cattttatctgatgtaaatattggcaaaaatcccttttttgttagtctatgacacttgtaatctnttttataaacctaactattatataacgttaatctg 17025755  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17025756 cacattgttggttccttcgttggttccaattagtatcatgttaattataaa----gttgttttcctnatctcttgaacaaaatagaacatgctcttttcc 17025851  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 236  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17025852 cacatcaaatctttataatgctttggtaaatgttctagaaatgtacatata 17025902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 17037333 - 17037579
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17037333 cattttatctgatgtaaatattggcaaaaatcccttttttgttagtctatgacacttgtaatctattttataaacctaactattatataacgttaatctg 17037432  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17037433 cacattgttggttccttcgttggttccaattagtatcatgttaattataaa----gttgttttcctgatctcttgaacaaaatagaacatgctcttttcc 17037528  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 236  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17037529 cacatcaaatctttataatgctttggtaaatgttctagaaatgtacatata 17037579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28380228 - 28379990
Alignment:
Q  4 tttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcac 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28380228 tttgtctaatgtaaatattggcaaaaatccttttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaatctaactattatgtaacgttaatctgcac 28380129  T
Q  104 ---------------attggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctac 188  Q
                   ||||||| ||||||||||||||||||||    | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  28380128 attgttggttcattcattggtttcaattagtatcatgttaatt----ataatgttgttttcccaatctcttgaacaaaatagaacatgctcttttactac 28380033  T
Q  189 agtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtac 231  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  28380032 agcaaatctttataatgctttggtaaatattttagaaacgtac 28379990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 442 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 27364612 - 27364444
Alignment:
Q  442 catatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatg 541  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  27364612 catatgttagaggtaggtgataagctaatttttgacctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcattcccaaataaagatttggtgttcatg 27364513  T
Q  542 attcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    || || |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27364512 atccgcactttcaacagatcaccttaattctaatcctatactagattatcttcactcactaatgctact 27364444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 36633314 - 36633064
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||| ||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  36633314 cattctgtctgatgtaagtattggcaaaaatccatttttggttaatctttgacacttacaatctcttttataaacctaactactatataacgttaatctg 36633215  T
Q  101 cacattggt---------------tccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||||||| |               ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |    
T  36633214 cacattgttggttccttcattgattccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgaataaaatagaacatgctctttatc 36633119  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatata 240  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36633118 tacagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacttatatata 36633064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 1993283 - 1993075
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1993283 cattttgtcta-tgtaaatattggcaaaaatctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 1993185  T
Q  101 cac---attggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatct 197  Q
    |||   |||||||| |||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||| | ||||    
T  1993184 cacattattggttcaaattagtatcatgttaatt----ataatgttgttttcctaatcttttgaacaaaatagaacatgccctttttctacagcagatct 1993089  T
Q  198 ttataatgctttgg 211  Q
    ||||||||||||||    
T  1993088 ttataatgctttgg 1993075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 232
Target Start/End: Original strand, 45398809 - 45399048
Alignment:
Q  4 tttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgca- 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45398809 tttgtctaatgtaaatattggcaaaaattcttttttgattagtctatgacacttgcagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcac 45398908  T
Q  103 --------------cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctac 188  Q
                  |||||||| ||||||||||||||||||||    | ||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  45398909 attgttggttccttcattggtttcaattagtatcatgttaatt----ataatgttgtttttccaatcgcttgaacaaaatagaacatgctcttttactac 45399004  T
Q  189 agtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtaca 232  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  45399005 agcaaatctttataatgctttggtaaatattttagaaacgtaca 45399048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19167871 - 19167654
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaa--tccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatc 98  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19167871 cattttgtctggtgtaaatattggaaaaaaaatcccttttttgttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtatcgttaatc 19167772  T
Q  99 tgcac---------------attggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctctttt 183  Q
    |||||               |||| ||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19167771 tgcacattgttggttccttcattgcttccaattagtataatgttaattgt----aatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctctttt 19167676  T
Q  184 cctacagtaaatctttataatg 205  Q
    |||||| || ||||||||||||    
T  19167675 cctacattagatctttataatg 19167654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 14323555 - 14323334
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14323555 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 14323456  T
Q  101 ca---------------cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||               ||||||||| |||||||||||||||||||    | |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  14323455 catattattggttccttcattggttcaaattagtatcatgttaatt----ataatgttgttttcataatcttttgaacaaaatagaacatgccctttttc 14323360  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttgg 211  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||    
T  14323359 tacagcagatctttataatgctttgg 14323334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 28502215 - 28502436
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28502215 cattttgtctgatgtaaatattgacaaaaatctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 28502314  T
Q  101 cac---------------attggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||               |||||||| |||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  28502315 cacattgttggttcctttattggttcaaattagtatcatgttaatt----ataatgttgttttcctaatcttttgaacaaaatagaacatgccctttttc 28502410  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttgg 211  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||    
T  28502411 tacagcagatctttataatgctttgg 28502436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 493 - 610
Target Start/End: Original strand, 5252901 - 5253018
Alignment:
Q  493 aaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatct 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5252901 aaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgattcgcactttcaagagatcaccttaactctgatcctagactagattatct 5253000  T
Q  593 tcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  5253001 tcactcaccaatgttact 5253018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 10821432 - 10821234
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10821432 cattttgtctgatgtaaatattgacaaaaatccctttttggttagtttatgacacttgaagtctcttttataaacctaactattatgtagcgttaatctg 10821333  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               ||| ||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  10821332 cacattgttggttccttcattagtttcaattagtatcatgttaatt----ataatgttgttttcctaatctcttgaacaaaatagaacatgttcttttcc 10821237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 6343071 - 6342850
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6343071 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatcta 6342972  T
Q  101 ca---------------cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||               ||||||||| |||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||| |    
T  6342971 cacattgttggttccttcattggttcaaattagtatcatgttaatt----ataatgttgttttcctaatcttttgaacaaaatagaacattccctttttc 6342876  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttgg 211  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||    
T  6342875 tacagcagatctttataatgctttgg 6342850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 30567081 - 30566920
Alignment:
Q  13 tgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcac--------- 103  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||             
T  30567081 tgtaaatattggcaaaaatctctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacccaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggt 30566982  T
Q  104 ------attggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaac 163  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  30566981 tccttcattggttccaattagtatcatgttaattgt----aatgttgttttcctaatctcttgaac 30566920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 9916917 - 9916812
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9916917 cattttatctgatgtaaatattagcaaaaatctctttttggttagtctatgacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaatgttaatctg 9916818  T
Q  101 cacatt 106  Q
    ||||||    
T  9916817 cacatt 9916812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 14753246 - 14753423
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  14753246 cattttgtctgatgtaaatattgggaaaaattc-tttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaatctaactattatgtaatgttaatatg 14753344  T
Q  101 cacattg---gttcc------------aattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaat 168  Q
    |||||||   |||||            ||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14753345 cacattgttggttccttcattggttttaattagtatcatgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaat 14753423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 558 - 600
Target Start/End: Original strand, 4812146 - 4812188
Alignment:
Q  558 tatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcac 600  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4812146 tatcaccttaattctaatcctatactagattatcttcattcac 4812188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 16883988 - 16884033
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagt 46  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16883988 cattttgtctgatgtaagtattggcaaacatccctttttggttagt 16884033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 17041678 - 17041723
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagt 46  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  17041678 cattttgtctgatgtaagtattggcaaacatccctttttggttagt 17041723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18093292 - 18093228
Alignment:
Q  274 tagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcat 338  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  ||| ||||||||||||  || ||||||||||| |||||    
T  18093292 tagcatttcccaaacgagatgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcat 18093228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 388; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 49427 - 48842
Alignment:
Q  35 tttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattg---------------gttccaattagt 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||               ||| ||||||||    
T  49427 tttttagttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaaccgaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggtttcaattagt 49328  T
Q  120 atcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgtt 219  Q
    |||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  49327 atcatgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgcttttttcatacagcaaacctttataatactttggtaaatgtt 49232  T
Q  220 ttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  49231 ttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctaacacttttcaaatgagatatcaatgatatttctaaaaggaacac 49132  T
Q  320 ggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggcca 419  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  49131 agaaaacaatcacactcattgataaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacgacaaagagagccagttataaaaaatacttaggcggcca 49032  T
Q  420 atggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttc 519  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  49031 atggttcaaa-tttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccaccgaaaaatatgcacgttcaagtcgttccc 48933  T
Q  520 aaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  48932 aaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatattcactcaccgatgctact 48842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 383; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 543
Target Start/End: Original strand, 447 - 1000
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  447 cattttgtctgatgtaagtattggcaaaaattcctttttggttagtctatgaaacctgcgatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 546  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
     ||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| | ||||||    
T  547 tacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgagaaaattaaaacatgttattttcc 642  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctca 285  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  643 tacggtaaatctttacaatgctttgataaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctca 742  T
Q  286 aatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaa 385  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  743 aatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaatgtataagtgtcgcttgataacggcaa 842  T
Q  386 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  843 agagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaagtaggcgataagttaattttttatctagagaa 942  T
Q  486 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgat 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  943 gccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgat 1000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 562 - 610
Target Start/End: Original strand, 5099 - 5147
Alignment:
Q  562 accttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5099 accttaactttaatcctagactagattatcttcactcactgatgctact 5147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 381; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 13157 - 12535
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13157 cattttttctgatgtaaatattggcaaaaatccttttttggttagtctatgacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 13058  T
Q  101 ca---------------cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||               |||||||| |||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  13057 caaatagttggttccttcattggttacaattagtatcatgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaatagaacatgttcttttcc 12962  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacat--atatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttct 283  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||     
T  12961 tacagcaaatctttataatgttttggtaaatgttttagaaatgtacttgtatatataacatctaattaacactgcaatttgttttgtacccagcacttcc 12862  T
Q  284 caaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggc 383  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12861 caaatgagatatcaaagacatttgtaaaaggaacatggaaaaaaatcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggc 12762  T
Q  384 aaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagag 483  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  12761 aaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttaatatagag 12662  T
Q  484 aagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagact 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  12661 aagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttctcaaataaagatttggtgttcatgacccgcactttcaacatatcacattaactctaatcctagaca 12562  T
Q  584 agattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  12561 agattatcttcactcaccgatgctact 12535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0242
Description:

Target: scaffold0242; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 3490 - 3026
Alignment:
Q  145 ttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataactt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3490 ttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataactt 3391  T
Q  245 ctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaa 344  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  3390 ctaattaacactgcaatttgttttatacctagcacttttcaaatgagatatcaatgacatttttaaaaggaacacggaaaacaatcacacttatcgaaaa 3291  T
Q  345 acaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacat 444  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||     
T  3290 acaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaaagagagccagttataaaaaatacttaggcggccaatagttcaaa-tttgccgagaacag 3192  T
Q  445 atgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgatt 544  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||     
T  3191 atgttagaggtagatgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaaagcgttccaaaataaagatttggtgttcatgatc 3092  T
Q  545 cgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  3091 cgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatattcactcaccgatgctact 3026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 35 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 3646 - 3483
Alignment:
Q  35 tttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcac---------------attggttccaattagt 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||||||    
T  3646 tttttagttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaaccaaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggtttcttcattggttccaattagt 3547  T
Q  120 atcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttccta 187  Q
    ||||||||||||    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3546 atcatgttaatt----ataatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttccta 3483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 206 - 610
Target Start/End: Original strand, 190 - 596
Alignment:
Q  206 ctttggtaaatgttttagaaatgtac--atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgaca 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  190 ctttggtaaatgttttagaaatgtacttatatatataacatctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttcccaaatgagatatcaaggaca 289  T
Q  304 tttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaa 403  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  290 tttctaaaaggaacagggaaaataatcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggtataggtctcgcttgataacggcaaagagagcaagttacgaaa 389  T
Q  404 aatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgca 503  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  390 aatacttaggcggtcaatggttcaacttttaccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgta 489  T
Q  504 cgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcaccta 603  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  490 cgttcaagtctttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactctaatcctagacaagattatcttcactcaccga 589  T
Q  604 tgctact 610  Q
    |||||||    
T  590 tgctact 596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1634 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold1634
Description:

Target: scaffold1634; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 255 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 993 - 639
Alignment:
Q  255 ctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaa 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  993 ctgcaatttgttttatacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacgaaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctaaa 894  T
Q  355 aaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagagg 454  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  893 aaaaggtataagtgtcgtttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgccaagaacatatgttagagg 794  T
Q  455 tacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttca 554  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  793 taagtgataagttaatttttgatctagagtagccacttaaaaatatg-acgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttca 695  T
Q  555 acatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  694 acagatcaccttaactctaatgctagactagattatcttcactcacagatgctact 639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 234 - 610
Target Start/End: Original strand, 176734 - 177108
Alignment:
Q  234 atatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcaca 333  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  176734 atatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcactttttaaatga-atatcaataacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcaca 176832  T
Q  334 ctcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatttt 433  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  176833 cccatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacgacaaagagagccagttataaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattt- 176931  T
Q  434 gtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttgg 533  Q
    | || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  176932 gccgagaacagatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaaatcgttcccaaataaagatttgg 177031  T
Q  534 tgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  177032 tgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcttagactaaattatattcactcaccgatgctact 177108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 232 - 610
Target Start/End: Original strand, 120176 - 120554
Alignment:
Q  232 atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 331  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  120176 atatatataacttgtaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttcccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacacagaaaacaatca 120275  T
Q  332 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  120276 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcatgataacgacaaagagagcaagttgagaaaaatacttaggcggtcaatggttcaactt 120375  T
Q  432 ttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagattt 531  Q
    |||  | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  120376 ttgcagagaacatatgttagaggtatgtgataagctaatttttgatctagagaatccacctaaaaatatgcacgttcaaatcgttcccaaataaagattt 120475  T
Q  532 ggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
     |||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  120476 agtgttcatgatctgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctatactagattatcttcactcatcgatgctact 120554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 192 - 240
Target Start/End: Original strand, 120102 - 120150
Alignment:
Q  192 aaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatata 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  120102 aaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatatatatatatata 120150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 2)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10836 - 10430
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10836 cattttgtctgatgtaaatattggcgaaaatccctttttcgttagtctatgacacttgaagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatatg 10737  T
Q  101 cacattggtt---------------ccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||||||| ||               ||||||||||||| ||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  10736 cacattgtttgttccttcattgattccaattagtatcaagttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaatagaacatgttcttttcc 10641  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtac--atatatataacttctaattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttct 283  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10640 tataacaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacttatatatataacatctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttct 10541  T
Q  284 caaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggc 383  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10540 caaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacagggaaaaaaatcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggc 10441  T
Q  384 aaagagagcaa 394  Q
    |||||||||||    
T  10440 aaagagagcaa 10430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 519 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 10432 - 10351
Alignment:
Q  519 caaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcac 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10432 caaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacaaatcaccttaactctaatcctagacaagattatcttcactcac 10351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 246 - 600
Target Start/End: Original strand, 101005 - 101349
Alignment:
Q  246 taattaactctgcaatttgttttgtacctagcatttctcaaatgagatgtcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaa 345  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  101005 taattaacactacaatttgttttgtacctagcacttttcaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaa 101104  T
Q  346 caagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacata 445  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||          |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  101105 caaactcaaaaaaggtataagtgtcg----------gcaaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggccaatggttcaacttttgccgagaacata 101194  T
Q  446 tgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattc 545  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  101195 tgttagaggtaggtgataagctaatttttgacctagagaagccacctaaaaatatgcatgttcaagtcattcccaaataaagatttggtgttcatgatcc 101294  T
Q  546 gtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcac 600  Q
    | |||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  101295 gcactttcaaccgatcaccttaattctaatcctatactagattatcttcactcac 101349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 100629 - 100867
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  100629 cattttttctaatgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaacctaactattatgtaatgttaatctg 100728  T
Q  101 ca---------------cattggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||               ||||||||||||||||||||||| |||||    | ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  100729 cacattgttggttccttcattggttccaattagtatcatg-taatt----ataatgttgtttttccaatctcttgaacaaaatagaacatgctcttttcc 100823  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgt 229  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  100824 tacagcaaatctttataatgttttggtaaatgttttaaaaatgt 100867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 330 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 11299 - 11020
Alignment:
Q  330 cacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaa 429  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| ||     
T  11299 cacactcatcgacaa-caaactcaaaaaaggtataagtgtcgcttcataacggcaaagagagcaagttacgaaaaataattaggtggtcaatggttaaac 11201  T
Q  430 ttttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagat 529  Q
    ||||  || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  11200 ttttcccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgatctagagaagccacctaaaaatacgcacgttcaagtcgttaccaaataaagat 11101  T
Q  530 ttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  11100 ttggtgttcatgatccgcactttcaacaaatcaccttaactctaatcctagacaagattatcttcactcaccgatgctact 11020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 330 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 4850 - 4571
Alignment:
Q  330 cacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtggcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaa 429  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| ||     
T  4850 cacactcatcgacaa-caaactcaaaaaaggtataagtgtcgcttcataacggcaaagagagcaagttacgaaaaataattaggtggtcaatggttaaac 4752  T
Q  430 ttttgtcgtgaacatatgttagaggtacgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagat 529  Q
    ||||  || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4751 ttttcccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgatctagagaagccacctaaaaatacgcacgttcaagtcgttaccaaataaagat 4652  T
Q  530 ttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4651 ttggtgttcatgatccgcactttcaacaaatcaccttaactataatcctagacaagattatcttcactcaccgatgctact 4571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 153; Significance: 9e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 26514 - 26777
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  26514 cattttgtctggtgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtctttgaaacttgtaatatcttttataaacctaagtattatgtagcgttaatctg 26613  T
Q  101 cacattggt---------------tccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    ||||||| |               ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26614 cacattgttgattctttcattgattccaattagtatcatgttaattgtaa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 26709  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaac 253  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26710 tacggtaaatctttataatgctttgctaaatattttagaaatgtacatatatataacttctaattaac 26777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 152381 - 152135
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  152381 cattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatccatttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaacctgactattatataacgttaatctg 152282  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               |||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  152281 cacattgttggttgcttcattggttccaattagtatcatgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaaccaaatagaacatgctattttcc 152186  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  152185 tacagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttaaaaatgtacatata 152135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 64860 - 64662
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64860 cattttgtctgatgtaaatattgaaaaaaatccctttttggttagtatatgaaacttacaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 64761  T
Q  101 cac---------------attggttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||               ||||||| ||||||||||||||||||||    | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  64760 cacattgttggttctttcattggtttcaattagtatcatgttaatt----ataatgttgtttttctaatctcttgaacaaaatagaacatgctcttttcc 64665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 53194 - 52948
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  53194 cattttatctgatgtaaatattggcaaaaattctttttttgttagtctatgacacttgtagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatatg 53095  T
Q  101 cacattg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcc 185  Q
    |||||||               ||| |||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53094 cacattgttggttccttcgttggtttcaattagtatcatgttaattataaa----gttgttttcctaatctcttgaacaaaatagaacatgctcttttcc 52999  T
Q  186 tacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 236  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52998 tacatcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 52948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 466 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 15088 - 14944
Alignment:
Q  466 ttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaacatatcacct 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  15088 ttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcacct 14989  T
Q  566 taactctaatcctagactagattatcttcactcacctatgctact 610  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  14988 taactctaatcctagactagattatcttcagtcaccaattctact 14944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 117; Significance: 3e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 30220 - 29974
Alignment:
Q  4 tttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcac 103  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30220 tttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctttttttggttagtctatgacacttgcagtttttcttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcac 30121  T
Q  104 attg---------------gttccaattagtatcatgttaattgtaaaaaatgttgttttcctaatctcttgaacaaaataaaacatgctcttttcctac 188  Q
    ||||               |||||||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||    
T  30120 attgttgattccttcattagttccaattagtatcatgttaattataa----tgttgttttcctaatctcttgaacaaa-tagaacatgtttttttcctac 30026  T
Q  189 agtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatata 240  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30025 aggaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacttatatata 29974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 1363 - 1469
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1363 cattttatctgatgtaaatattggcaaaaatcccttttttgttagtctataacacttgtagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatatg 1462  T
Q  101 cacattg 107  Q
    |||||||    
T  1463 cacattg 1469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 61325 - 61431
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  61325 cattttgtctgatgtaaatattgggaaaattttctttttggttagtctatgacacttgtagtctcttttataaatctaactattatgtaatgttaatatg 61424  T
Q  101 cacattg 107  Q
    |||||||    
T  61425 cacattg 61431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 168
Target Start/End: Original strand, 61473 - 61503
Alignment:
Q  138 aatgttgttttcctaatctcttgaacaaaat 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61473 aatgttgttttcctaatctcttgaacaaaat 61503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1891 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1891
Description:

Target: scaffold1891; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 46 - 115
Alignment:
Q  1 cattttgtctaatgtaaatattggaaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctctttta 70  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46 cattttgtctgatgtaagtattggcaaaaattcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctctttta 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 4373 - 4301
Alignment:
Q  33 cctttttggttagtctatgaaacttgca--atctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcac 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4373 cctttttggttagtctatgacacttgcagttttttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcac 4301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University