View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2125_low_104 (Length: 228)

Name: NF2125_low_104
Description: NF2125
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2125_low_104
NF2125_low_104
[»] chr6 (20 HSPs)
chr6 (23-228)||(1073497-1073702)
chr6 (23-228)||(17939330-17939535)
chr6 (23-228)||(18599220-18599425)
chr6 (23-228)||(15275466-15275671)
chr6 (23-228)||(22374075-22374280)
chr6 (24-228)||(11934914-11935118)
chr6 (23-228)||(34855763-34855968)
chr6 (23-228)||(14888171-14888376)
chr6 (23-228)||(4424294-4424499)
chr6 (23-228)||(14831293-14831498)
chr6 (43-228)||(18311635-18311819)
chr6 (23-228)||(2520971-2521177)
chr6 (43-228)||(35040936-35041121)
chr6 (23-228)||(33321687-33321892)
chr6 (28-228)||(13457078-13457278)
chr6 (27-228)||(34320904-34321105)
chr6 (85-228)||(25539943-25540086)
chr6 (26-149)||(28228824-28228947)
chr6 (111-227)||(4425403-4425519)
chr6 (23-164)||(1931841-1931975)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (23-228)||(3397362-3397567)
chr5 (23-228)||(21029898-21030103)
chr5 (23-228)||(7285467-7285672)
chr5 (23-228)||(10513325-10513530)
chr5 (27-228)||(1852154-1852355)
chr5 (23-228)||(3150828-3151033)
chr5 (23-228)||(20349713-20349918)
chr5 (23-228)||(26321299-26321504)
chr5 (23-228)||(33611364-33611569)
chr5 (23-228)||(2194955-2195160)
chr5 (23-228)||(19447793-19447998)
chr5 (43-228)||(17996390-17996575)
chr5 (23-228)||(20996168-20996373)
chr5 (23-228)||(30689099-30689304)
chr5 (43-228)||(38934287-38934472)
chr5 (24-228)||(4882064-4882267)
chr5 (23-228)||(3028541-3028749)
chr5 (23-228)||(9702042-9702247)
chr5 (43-228)||(20757771-20757956)
chr5 (24-228)||(41780619-41780823)
chr5 (27-227)||(12588505-12588705)
chr5 (28-228)||(31295898-31296098)
chr5 (23-228)||(3210424-3210627)
chr5 (28-228)||(19395151-19395351)
chr5 (48-228)||(33929609-33929789)
chr5 (23-173)||(27065690-27065838)
chr5 (133-228)||(290451-290546)
chr5 (145-228)||(33707003-33707086)
chr5 (23-85)||(287341-287403)
chr5 (23-78)||(290398-290453)
chr5 (196-228)||(27065835-27065867)
[»] chr4 (35 HSPs)
chr4 (23-228)||(34056804-34057009)
chr4 (23-228)||(33503239-33503444)
chr4 (23-228)||(39742987-39743192)
chr4 (23-228)||(54331884-54332089)
chr4 (23-228)||(37701840-37702045)
chr4 (23-227)||(19831639-19831843)
chr4 (23-227)||(28135308-28135512)
chr4 (23-228)||(17699019-17699224)
chr4 (23-228)||(23478753-23478958)
chr4 (23-228)||(35495784-35495989)
chr4 (23-228)||(55998938-55999143)
chr4 (19-228)||(13627891-13628100)
chr4 (23-228)||(36856931-36857136)
chr4 (27-228)||(38007691-38007892)
chr4 (36-228)||(7644033-7644225)
chr4 (27-228)||(5272516-5272717)
chr4 (23-228)||(14829752-14829957)
chr4 (23-228)||(53342251-53342457)
chr4 (23-228)||(1944334-1944540)
chr4 (43-228)||(2776155-2776340)
chr4 (43-228)||(22116281-22116466)
chr4 (43-228)||(21352961-21353147)
chr4 (27-228)||(574388-574589)
chr4 (23-228)||(47720310-47720515)
chr4 (23-228)||(3839612-3839817)
chr4 (27-228)||(40621995-40622195)
chr4 (28-228)||(15520564-15520764)
chr4 (27-228)||(35707869-35708070)
chr4 (23-228)||(41984474-41984679)
chr4 (28-228)||(740651-740851)
chr4 (23-228)||(26870530-26870730)
chr4 (23-228)||(17739882-17740088)
chr4 (23-228)||(8530673-8530864)
chr4 (145-228)||(47557666-47557749)
chr4 (175-228)||(53991488-53991541)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (23-228)||(34687419-34687624)
chr1 (23-228)||(18814051-18814256)
chr1 (23-228)||(34691947-34692152)
chr1 (23-228)||(41963143-41963348)
chr1 (23-228)||(31619521-31619726)
chr1 (23-228)||(52521781-52521986)
chr1 (26-228)||(41830262-41830464)
chr1 (23-228)||(48340161-48340366)
chr1 (43-228)||(44406227-44406412)
chr1 (24-228)||(16031818-16032022)
chr1 (23-228)||(38845446-38845642)
chr1 (27-228)||(10763218-10763419)
chr1 (23-228)||(51965946-51966150)
chr1 (27-228)||(52309670-52309871)
chr1 (24-228)||(15315083-15315287)
chr1 (28-228)||(18111423-18111623)
chr1 (28-228)||(43254898-43255098)
chr1 (28-228)||(50395312-50395512)
chr1 (23-228)||(50560874-50561079)
chr1 (24-228)||(17671140-17671343)
chr1 (24-228)||(36681077-36681281)
chr1 (24-228)||(45004566-45004770)
chr1 (27-228)||(29840900-29841101)
chr1 (48-228)||(12246054-12246234)
chr1 (23-228)||(13662619-13662824)
chr1 (23-224)||(28565936-28566137)
chr1 (56-228)||(24294394-24294566)
chr1 (27-227)||(42682226-42682422)
chr1 (23-228)||(12714309-12714514)
chr1 (140-228)||(39760363-39760451)
chr1 (152-228)||(47135361-47135437)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (23-228)||(14079044-14079249)
chr8 (19-228)||(33424472-33424681)
chr8 (23-228)||(30826019-30826224)
chr8 (23-228)||(22333335-22333540)
chr8 (23-228)||(41628459-41628664)
chr8 (23-228)||(6477707-6477911)
chr8 (23-228)||(42811150-42811354)
chr8 (23-228)||(19395777-19395982)
chr8 (43-228)||(23522856-23523041)
chr8 (27-228)||(45293791-45293992)
chr8 (23-228)||(38961743-38961942)
chr8 (23-228)||(38992087-38992286)
chr8 (23-228)||(41907426-41907630)
chr8 (23-228)||(41977027-41977232)
chr8 (23-228)||(12760043-12760248)
chr8 (23-228)||(23626558-23626763)
chr8 (27-227)||(19247684-19247884)
chr8 (27-227)||(19320868-19321068)
chr8 (28-228)||(23966734-23966934)
chr8 (28-228)||(6300831-6301031)
chr8 (28-228)||(44940015-44940215)
chr8 (23-228)||(41156207-41156412)
chr8 (24-228)||(29433608-29433812)
chr8 (28-228)||(37029411-37029611)
chr8 (23-228)||(39204199-39204404)
chr8 (23-228)||(12250413-12250613)
chr8 (23-228)||(39444594-39444794)
chr8 (36-228)||(42061008-42061200)
chr8 (76-228)||(22947016-22947168)
chr8 (25-74)||(44383308-44383357)
[»] chr7 (31 HSPs)
chr7 (23-228)||(17477717-17477922)
chr7 (23-228)||(17575292-17575497)
chr7 (23-228)||(23766669-23766874)
chr7 (23-228)||(17482164-17482369)
chr7 (23-228)||(17570845-17571050)
chr7 (23-228)||(8926121-8926326)
chr7 (23-228)||(42687380-42687585)
chr7 (23-228)||(33030624-33030829)
chr7 (23-228)||(5962525-5962729)
chr7 (23-208)||(14308758-14308943)
chr7 (27-228)||(9226451-9226652)
chr7 (23-228)||(9149189-9149394)
chr7 (30-228)||(47174310-47174508)
chr7 (27-228)||(27735279-27735480)
chr7 (26-228)||(42827605-42827807)
chr7 (23-228)||(38434780-38434985)
chr7 (43-228)||(17469594-17469780)
chr7 (43-228)||(17583434-17583620)
chr7 (27-228)||(3795342-3795543)
chr7 (28-228)||(47573683-47573883)
chr7 (27-228)||(33638905-33639106)
chr7 (35-228)||(6911705-6911898)
chr7 (55-228)||(11499718-11499891)
chr7 (23-228)||(47163783-47163987)
chr7 (60-228)||(4481617-4481785)
chr7 (23-228)||(42245086-42245291)
chr7 (23-228)||(42996281-42996481)
chr7 (23-222)||(23299956-23300155)
chr7 (97-228)||(42917696-42917827)
chr7 (151-228)||(19521082-19521159)
chr7 (27-110)||(19520998-19521081)
[»] chr3 (33 HSPs)
chr3 (23-228)||(31369243-31369448)
chr3 (26-228)||(52840759-52840961)
chr3 (23-228)||(6104352-6104557)
chr3 (23-228)||(35088064-35088269)
chr3 (23-228)||(51248184-51248389)
chr3 (26-228)||(48976511-48976712)
chr3 (23-228)||(50771473-50771678)
chr3 (23-228)||(52853668-52853873)
chr3 (23-228)||(21699799-21700002)
chr3 (23-228)||(50741176-50741381)
chr3 (23-228)||(54512602-54512806)
chr3 (23-227)||(23193285-23193489)
chr3 (23-212)||(11325886-11326075)
chr3 (23-228)||(48521248-48521453)
chr3 (23-228)||(49112898-49113094)
chr3 (27-227)||(32755313-32755513)
chr3 (23-228)||(40827261-40827466)
chr3 (23-228)||(55295005-55295210)
chr3 (23-228)||(36165237-36165442)
chr3 (23-228)||(8242523-8242728)
chr3 (23-228)||(52463158-52463363)
chr3 (28-228)||(39796699-39796899)
chr3 (23-228)||(11598190-11598395)
chr3 (27-228)||(22477535-22477736)
chr3 (23-228)||(54793191-54793396)
chr3 (28-228)||(5252600-5252800)
chr3 (27-228)||(11951201-11951402)
chr3 (23-228)||(16495713-16495918)
chr3 (23-196)||(2845115-2845288)
chr3 (133-228)||(35436772-35436867)
chr3 (23-126)||(19893699-19893802)
chr3 (85-222)||(11383004-11383140)
chr3 (23-78)||(35436719-35436774)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (23-228)||(16724577-16724782)
chr2 (23-228)||(26821479-26821684)
chr2 (24-228)||(33664023-33664227)
chr2 (23-228)||(45205246-45205451)
chr2 (23-228)||(21097558-21097763)
chr2 (23-228)||(30567093-30567298)
chr2 (23-228)||(30570778-30570983)
chr2 (23-228)||(1515218-1515423)
chr2 (23-228)||(19167871-19168076)
chr2 (23-227)||(42885250-42885454)
chr2 (23-228)||(14753041-14753246)
chr2 (23-228)||(36633314-36633519)
chr2 (23-228)||(17037128-17037333)
chr2 (23-228)||(17091636-17091841)
chr2 (23-228)||(17025451-17025656)
chr2 (27-228)||(4811411-4811612)
chr2 (23-228)||(10821432-10821637)
chr2 (27-228)||(45398605-45398806)
chr2 (27-228)||(9916917-9917118)
chr2 (27-228)||(28380231-28380432)
chr2 (28-228)||(6343071-6343271)
chr2 (28-228)||(1993283-1993483)
chr2 (24-228)||(16883784-16883988)
chr2 (24-228)||(17041474-17041678)
chr2 (28-228)||(28502015-28502215)
chr2 (55-228)||(18092950-18093123)
chr2 (28-228)||(14323555-14323755)
chr2 (48-228)||(35286568-35286748)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (23-228)||(26586-26791)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (23-228)||(9752-9957)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (23-228)||(242-447)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (23-228)||(64860-65066)
scaffold0006 (23-228)||(152381-152586)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (27-228)||(30223-30424)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (26-228)||(13157-13359)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (23-227)||(119864-120068)
[»] scaffold0385 (1 HSPs)
scaffold0385 (48-228)||(4405-4585)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (72-228)||(10836-10992)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (23-228)||(1163-1363)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (23-174)||(49873-50024)
scaffold0051 (170-228)||(61267-61325)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (69-228)||(53194-53348)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (26-149)||(29322-29445)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (96-228)||(100497-100629)
[»] scaffold1891 (1 HSPs)
scaffold1891 (185-228)||(3-46)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (184-228)||(26470-26514)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 20)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1073702 - 1073497
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1073702 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 1073603  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1073602 aagtagatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 1073503  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  1073502 cttttc 1073497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 17939330 - 17939535
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  17939330 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaataacttgcaaattcgagttgttcca 17939429  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17939430 aagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgttttggactttagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 17939529  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  17939530 cttttc 17939535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18599425 - 18599220
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18599425 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 18599326  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18599325 aagtagatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 18599226  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  18599225 cttttc 18599220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 15275466 - 15275671
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |    
T  15275466 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaaagtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcatatttgagttgttcga 15275565  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15275566 aagtagatctttgttgttgaactatttgaacttatattattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 15275665  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  15275666 cttttc 15275671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22374280 - 22374075
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22374280 gtggttcattttcagcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgttcca 22374181  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22374180 aagtagatcttttttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggattgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 22374081  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  22374080 cttttc 22374075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 24 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11935118 - 11934914
Alignment:
Q  24 tggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaa 123  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  11935118 tggttctatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcaaattcgagttgttccaa 11935019  T
Q  124 agtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttc 223  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11935018 agtaaatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttc 11934919  T
Q  224 ttttc 228  Q
    |||||    
T  11934918 ttttc 11934914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 34855763 - 34855968
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  34855763 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcattttttatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 34855862  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34855863 aagtagatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 34855962  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  34855963 cttttc 34855968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14888376 - 14888171
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14888376 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcatagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 14888277  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14888276 aagtagatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggattttattcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 14888177  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  14888176 cttttc 14888171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 4424294 - 4424499
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4424294 gtggttcaatttctgcatataacgagtgatagaagaaggtggtaagctcatctttgatctccaaaagttacaaaagaacttgcaaattcgagttgttcca 4424393  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4424394 aagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgatttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 4424493  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  4424494 cttttc 4424499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 14831293 - 14831498
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||    
T  14831293 gtggttcaatttcttcaaagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcatgttcgagttgttcca 14831392  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14831393 aagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgtt 14831492  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  14831493 cttttc 14831498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 43 - 228
Target Start/End: Original strand, 18311635 - 18311819
Alignment:
Q  43 aacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagtagatccttgttgttga 142  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18311635 aacgagtgatggaagaaggtggta-gctcatatttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttga 18311733  T
Q  143 actatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18311734 actatttgaacttctactattttgacgtaccgctttggactgtagtcgcaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 18311819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 2520971 - 2521177
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  2520971 gtggttcaatttctacagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacataagaacttgcaaattcgagttgttcca 2521070  T
Q  123 aagtagatc-cttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 221  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2521071 aaatagatcttttgttgttgaactattttaacttctattattttgatgtatcgttttggattgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 2521170  T
Q  222 tcttttc 228  Q
    |||||||    
T  2521171 tcttttc 2521177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 43 - 228
Target Start/End: Original strand, 35040936 - 35041121
Alignment:
Q  43 aacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagtagatccttgttgttga 142  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  35040936 aacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatatttgatctcgaaaagtcagagaagaacttgcaaatccgagttgttccaaagtagatctttgttgttga 35041035  T
Q  143 actatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35041036 actatttgaacttctactattttgacataccgctttggactgtagtcgcaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 35041121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33321892 - 33321687
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||    
T  33321892 gtggttcaatttctgcaaagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagttcatctttgatctcgagaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttcca 33321793  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33321792 aagtagatctttgttgctgaactatttgaacttctactattttgacgcatcgctttggactgtaatcataaactatcttgagtttgggatgtcatttgtt 33321693  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  33321692 cttttc 33321687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13457278 - 13457078
Alignment:
Q  28 tcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagta 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| || ||||||    
T  13457278 tcaatttctgcagagaacgtgtgatgatagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagta 13457179  T
Q  128 gatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttctttt 227  Q
    |||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13457178 gatatttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttctttt 13457079  T
Q  228 c 228  Q
    |    
T  13457078 c 13457078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Original strand, 34320904 - 34321105
Alignment:
Q  27 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagt 126  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  || |||||| |||| |||    
T  34320904 ttcaatttctgcatagaatgtgtgatggaagaaggtgataatctcatctttgatctcgaaaaatcaccaaagaacttgcatgttcgagttgttccatagt 34321003  T
Q  127 agatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 226  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  34321004 agatctttgttgctgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggattgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgatatttgttcttt 34321103  T
Q  227 tc 228  Q
    ||    
T  34321104 tc 34321105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 228
Target Start/End: Original strand, 25539943 - 25540086
Alignment:
Q  85 aaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggacta 184  Q
    ||||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||||||||| ||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||     
T  25539943 aaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaactttttaaacttctactattttgacacatcgctttggactg 25540042  T
Q  185 tagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25540043 taatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttc 25540086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 28228947 - 28228824
Alignment:
Q  26 gttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaag 125  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  || |||||| |||||||    
T  28228947 gttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtgataagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttatacgttcgagttgttccaaag 28228848  T
Q  126 tagatccttgttgttgaactattt 149  Q
    |||||| |||||| ||||||||||    
T  28228847 tagatctttgttgctgaactattt 28228824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 111 - 227
Target Start/End: Original strand, 4425403 - 4425519
Alignment:
Q  111 tgagttgctccaaagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttggg 210  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4425403 tgagttgttccaaagtagatctttgctactgaactatttgaactattactattttggcgtaccgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttggg 4425502  T
Q  211 atgtcatttgttctttt 227  Q
    |||||||||||||||||    
T  4425503 atgtcatttgttctttt 4425519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 164
Target Start/End: Original strand, 1931841 - 1931975
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||| |||||||||||       ||||||||||  ||||||||||||  || |||||| || |    
T  1931841 gtggttcaatttcagcagagaacatgtgatagaagaaggtggtaagctcatct-------cgaaaagtcatcgaagaacttgcacgttcgagttgttcaa 1931933  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattt 164  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1931934 aagtagatctttattgttgaactatttgaacttctactattt 1931975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3397567 - 3397362
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  3397567 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 3397468  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3397467 aagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttggaatgtcatttgtt 3397368  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  3397367 cttttc 3397362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 21029898 - 21030103
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||    
T  21029898 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcaagttcgagttgttcca 21029997  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21029998 aagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 21030097  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  21030098 cttttc 21030103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 7285467 - 7285672
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  7285467 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 7285566  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7285567 aagtagatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgacgtatcactttgaactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 7285666  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  7285667 cttttc 7285672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10513530 - 10513325
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10513530 gtggttcaatttttgcagagaacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacaaaagaacttgcaaattcgagttgttcca 10513431  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10513430 aagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggaatgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatctgtt 10513331  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  10513330 cttttc 10513325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1852355 - 1852154
Alignment:
Q  27 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagt 126  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  1852355 ttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacataagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 1852256  T
Q  127 agatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 226  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1852255 agatatttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcctt 1852156  T
Q  227 tc 228  Q
    ||    
T  1852155 tc 1852154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3151033 - 3150828
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  3151033 gtggttcaatttctgcagataaagagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 3150934  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  3150933 aagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctaccattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatattgactttgggatatcatttgtt 3150834  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  3150833 cttttc 3150828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 20349713 - 20349918
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20349713 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatagaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgttcca 20349812  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20349813 aaatagatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttaacatatcgctttgcactgtagtcataaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 20349912  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  20349913 cttttc 20349918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26321504 - 26321299
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  26321504 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatcccgaaaagtcatagaagaacttggaaattcgagttgttcca 26321405  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26321404 aagtagatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttaactttgggatgtcatttgtt 26321305  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  26321304 cttttc 26321299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33611569 - 33611364
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  33611569 gtggttcaatttctgtagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 33611470  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33611469 aagtagatctttgttgttgaactattttaacttctaatattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttggaatgtcatttgtt 33611370  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  33611369 cttttc 33611364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 2194955 - 2195160
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  2194955 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatcttggatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccg 2195054  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2195055 aagtagatctttattgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 2195154  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  2195155 cttttc 2195160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 19447793 - 19447998
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19447793 gtggttcaatttcggcagataacgagtgatggaagaaggtgataagctcatctttgatttcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 19447892  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  19447893 aagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctattattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttaattttgggatgccatttgtt 19447992  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  19447993 cttttc 19447998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 43 - 228
Target Start/End: Original strand, 17996390 - 17996575
Alignment:
Q  43 aacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagtagatccttgttgttga 142  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  17996390 aacgagtgatggaagaaggtggtaaactcatatttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttga 17996489  T
Q  143 actatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17996490 actatttgaacttctactattttgacgtaccgctttggactgtagtcgcaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 17996575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20996373 - 20996168
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  20996373 gtggttcaatttctgcaaataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcacgttcgagttgttcca 20996274  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20996273 acgtagatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttgaactgtaatcgtaaaccatcttgactttgggatgccatttgtt 20996174  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  20996173 cttttc 20996168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 30689099 - 30689304
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||    
T  30689099 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaaagtgcaaattcgagttgttcca 30689198  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30689199 aagtagatatttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggactgaagtcgtaaactatcttgattttgggatgtcatttgtt 30689298  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  30689299 cttttc 30689304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 43 - 228
Target Start/End: Original strand, 38934287 - 38934472
Alignment:
Q  43 aacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagtagatccttgttgttga 142  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  38934287 aacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatatttgatctcgaaaagtcatagaagaaattgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttga 38934386  T
Q  143 actatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38934387 actatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggattgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 38934472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 228
Target Start/End: Original strand, 4882064 - 4882267
Alignment:
Q  24 tggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaa 123  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  4882064 tggttcgatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgaaaattcgagttgttccaa 4882163  T
Q  124 agtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttc 223  Q
    | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  4882164 attagatctttgttgttaaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttgg-ctgtagtcgtaaactatcttgaatttggaatatcatttgttc 4882262  T
Q  224 ttttc 228  Q
    |||||    
T  4882263 ttttc 4882267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 3028541 - 3028749
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  3028541 gtggttcaatttttgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaag-cacagaagaacttgcaaattcgagttgttaca 3028639  T
Q  123 aagtagatcct----tgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatt 218  Q
    ||||||||  |    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3028640 aagtagatattaatttgttgttgaactatttgaacttctactattttgtcgtatcgttttggactgtagtcgtaaactatcttgactttggaatgtcatt 3028739  T
Q  219 tgttcttttc 228  Q
    ||||||||||    
T  3028740 tgttcttttc 3028749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 9702042 - 9702247
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||    
T  9702042 gtggttcaatttctgcagagaacgtgtcatggaagaagatggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttcca 9702141  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    || |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  9702142 aaatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgtt 9702241  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  9702242 cttttc 9702247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 43 - 228
Target Start/End: Original strand, 20757771 - 20757956
Alignment:
Q  43 aacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagtagatccttgttgttga 142  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  20757771 aacgagtgatgaaagaaggtggtaagatcatatttgatctcgaaaagtcacataagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttga 20757870  T
Q  143 actatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20757871 actatttgaacttctactattttggcgtactgctttggactgtagtcgcaaactatcttaactttgggatgtcatttgttcttttc 20757956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 228
Target Start/End: Original strand, 41780619 - 41780823
Alignment:
Q  24 tggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaa 123  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||  || |||||| |||||    
T  41780619 tggttcaatttctggagagagcgtgtgatggaataaggtggtaagctcatcttttatctcgaaaagtcatcgaagaactagcacgttcgagttgttccaa 41780718  T
Q  124 agtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttc 223  Q
    |||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41780719 agtagatctttgatactgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttc 41780818  T
Q  224 ttttc 228  Q
    |||||    
T  41780819 ttttc 41780823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12588705 - 12588505
Alignment:
Q  27 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagt 126  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||||    
T  12588705 ttcaatttctgcaaagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgattttgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagt 12588606  T
Q  127 agatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 226  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12588605 agatctttgctggtgaactatttgaacttttactattttgacgcatcactttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttt 12588506  T
Q  227 t 227  Q
    |    
T  12588505 t 12588505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31296098 - 31295898
Alignment:
Q  28 tcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagta 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| || ||||||    
T  31296098 tcaatttctgcagagaacgtgtgatgatagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagta 31295999  T
Q  128 gatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttctttt 227  Q
    |||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31295998 gatatttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttctttt 31295899  T
Q  228 c 228  Q
    |    
T  31295898 c 31295898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3210627 - 3210424
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||  || ||||||  |||    
T  3210627 gtggttcaatttctgcagagaaca--tgatggaagaatgtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcatcgaagaacttgcacgttcgagttgtccca 3210530  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    || |||||| ||| || | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3210529 aaatagatctttgctgctaaactatttgaacttctattattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 3210430  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  3210429 cttttc 3210424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 228
Target Start/End: Original strand, 19395151 - 19395351
Alignment:
Q  28 tcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagta 127  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||  |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||| || ||||||    
T  19395151 tcaatttctgcaaagcacgtgtgatgatagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcaagttgttctaaagta 19395250  T
Q  128 gatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttctttt 227  Q
    |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19395251 gatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttctttt 19395350  T
Q  228 c 228  Q
    |    
T  19395351 c 19395351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 48 - 228
Target Start/End: Original strand, 33929609 - 33929789
Alignment:
Q  48 gtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagtagatccttgttgttgaactat 147  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| || |||||||||| ||| || | ||||||    
T  33929609 gtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttcaaaagtagatctttggtgcttaactat 33929708  T
Q  148 ttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33929709 ttgaacatctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatattgactttgggatgccatttgttcttttc 33929789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 173
Target Start/End: Original strand, 27065690 - 27065838
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| | ||    
T  27065690 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagc--atctttgatctcgaaaagtcacagaagaatttacaaattcgagttgttgca 27065787  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatc 173  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27065788 aagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatc 27065838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Original strand, 290451 - 290546
Alignment:
Q  133 ttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  290451 ttgttgctgaactatttgaacttctacaattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcctttc 290546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33707086 - 33707003
Alignment:
Q  145 tatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33707086 tattttaacttctactattttgatgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttc 33707003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 287403 - 287341
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcga 85  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  287403 gtggttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcga 287341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 78
Target Start/End: Original strand, 290398 - 290453
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttg 78  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  290398 gtggttcaatttcagcagagaacatgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttg 290453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 228
Target Start/End: Original strand, 27065835 - 27065867
Alignment:
Q  196 tatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27065835 tatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 27065867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 35)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34057009 - 34056804
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  34057009 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 34056910  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34056909 aagtagatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 34056810  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  34056809 cttttc 34056804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33503444 - 33503239
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  33503444 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtgataagctcatctttgatttcgaaaagtcacataagaacttgcaaattcgagttgttcca 33503345  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33503344 aagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttaactttgggatgtcatttgtt 33503245  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  33503244 cttttc 33503239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39743192 - 39742987
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  39743192 gtggttcaatttctgcagataacgagtggtggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacaaaagaacttgcaaatttaagttgttcca 39743093  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39743092 aagtagatctttgttgttgaactgtttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 39742993  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  39742992 cttttc 39742987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 54332089 - 54331884
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  54332089 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 54331990  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54331989 aagtagatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgacgtatcgctttgaactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 54331890  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  54331889 cttttc 54331884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37702045 - 37701840
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  37702045 gtggttcaatttctgtagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 37701946  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37701945 aagtagatctttgttgttaaactatttgaacttctactattttgacgtattgctttggactgtagccgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 37701846  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  37701845 cttttc 37701840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19831843 - 19831639
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19831843 gtggttcaatttctgtagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatatttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 19831744  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19831743 aagtaaatctttgttgttgaactatttgaacttcttctattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 19831644  T
Q  223 ctttt 227  Q
    |||||    
T  19831643 ctttt 19831639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 28135512 - 28135308
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  28135512 gtggttcaatttctgcatataacgagtgatggaagaagttggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttacaaattcgagttgttcca 28135413  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28135412 aagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtattgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 28135313  T
Q  223 ctttt 227  Q
     ||||    
T  28135312 ttttt 28135308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 17699019 - 17699224
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||    
T  17699019 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatagaagaaggtagtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaaaaactagcaaattcgagttgttcca 17699118  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17699119 aagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttagactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 17699218  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  17699219 cttttc 17699224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 23478753 - 23478958
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  23478753 gtggttcaatttatgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacaaaagaacttgcaaattcgagttgttcca 23478852  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23478853 aagtagatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatctgtt 23478952  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  23478953 cttttc 23478958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35495989 - 35495784
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  35495989 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcaa 35495890  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35495889 aagtagatctttgttgttgaactatttaaacatctactattttgacgtatcgctttggaatgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 35495790  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  35495789 cttttc 35495784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 55999143 - 55998938
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  55999143 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatagaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 55999044  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  55999043 aagtagatctttgttgttgaactatttcaacttctactagtttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaattatcttgactttgggatgtcatttgct 55998944  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  55998943 cttttc 55998938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 228
Target Start/End: Original strand, 13627891 - 13628100
Alignment:
Q  19 ggcggtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||     
T  13627891 ggcggtggttcaatttctgcagataacaagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagacacagaagaacttgaaaattcgagttgt 13627990  T
Q  119 tccaaagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatt 218  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  13627991 tccaaggtagatctttgttcttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttaagatgtcatt 13628090  T
Q  219 tgttcttttc 228  Q
    ||||||||||    
T  13628091 tgttcttttc 13628100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 36856931 - 36857136
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  36856931 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaagtggtaagctcatctttgatatcgaaaagtcacaaaagaacttgcaaattcgagttgttcca 36857030  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  36857031 aagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcactttggactgtagttgtaaactatcttgactttgggatgtactttgtt 36857130  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  36857131 cttttc 36857136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Original strand, 38007691 - 38007892
Alignment:
Q  27 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagt 126  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  38007691 ttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 38007790  T
Q  127 agatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 226  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  38007791 agatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatctctctgtactgtagtcgtaaactatcttaacttagggatgtcatttgttcttt 38007890  T
Q  227 tc 228  Q
    ||    
T  38007891 tc 38007892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 36 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7644225 - 7644033
Alignment:
Q  36 tgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagtagatccttg 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  7644225 tgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttg 7644126  T
Q  136 ttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  7644125 ttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgcgatgtcatctgttcttttc 7644033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5272717 - 5272516
Alignment:
Q  27 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagt 126  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  5272717 ttcaatttctgcagataacgaatgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcgcagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagt 5272618  T
Q  127 agatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 226  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5272617 agatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttagactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttt 5272518  T
Q  227 tc 228  Q
    ||    
T  5272517 tc 5272516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14829957 - 14829752
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  14829957 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatgggagaaggtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcacagaagaacttgcaagttcgagttgttcca 14829858  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14829857 aagtagatatttgttgttgaactattttaacttttactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 14829758  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  14829757 cttttc 14829752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 53342251 - 53342457
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  53342251 gtggttcaatttccgcagataacgagtgatggaagaaggaggtaagctcatctttgatctcgagaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 53342350  T
Q  123 aagtagatccttg-ttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 221  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53342351 aagtagatctttgttttttgaactatttgaacttctactattttgacgcatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgt 53342450  T
Q  222 tcttttc 228  Q
    |||||||    
T  53342451 tcttttc 53342457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 1944334 - 1944540
Alignment:
Q  23 gtggttcaattt-ctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcc 121  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||    
T  1944334 gtggttcaattttctgcagaaaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcatcgaagaacttgcacgtttgagttgatcc 1944433  T
Q  122 aaagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 221  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1944434 aaaatagatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 1944533  T
Q  222 tcttttc 228  Q
    |||||||    
T  1944534 tcttttc 1944540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 43 - 228
Target Start/End: Original strand, 2776155 - 2776340
Alignment:
Q  43 aacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagtagatccttgttgttga 142  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  2776155 aacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatatttgatctcgaaaagtcacagaagaaattgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttga 2776254  T
Q  143 actatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2776255 actatttgaacttctactattttgacgtaccgctttggactgtagtcacaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 2776340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 43 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22116466 - 22116281
Alignment:
Q  43 aacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagtagatccttgttgttga 142  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  22116466 aacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatatttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatatttgttgttga 22116367  T
Q  143 actatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22116366 actatttgaacttctactattttgacgtaccgctttggactgtagtcacaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 22116281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 43 - 228
Target Start/End: Original strand, 21352961 - 21353147
Alignment:
Q  43 aacgagtgatggaa-gaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagtagatccttgttgttg 141  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21352961 aacgagtgatggaaagaaggtggtaagcccatatttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttg 21353060  T
Q  142 aactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21353061 aactatttgaaattctactattttgacgtaccgctttggactgtagtcacaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 21353147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 574589 - 574388
Alignment:
Q  27 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagt 126  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||  || |||||| ||||||||    
T  574589 ttcaatttctgcaaagaacatgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatttcgaaaaatcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagt 574490  T
Q  127 agatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 226  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  574489 agatctttgctggtgaactatttgaacttctactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatatcatttgttcttt 574390  T
Q  227 tc 228  Q
    ||    
T  574389 tc 574388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 47720515 - 47720310
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||  || |||||| || |    
T  47720515 gtggttcaatttcagcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctcgaaaagtcatcaaagaacttgcacgttcgagttgttcaa 47720416  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47720415 aagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttagcgtatcgctttggattgttatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgtt 47720316  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  47720315 cttttc 47720310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3839817 - 3839612
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| ||  || |||||| ||||    
T  3839817 gtggttcaatttctgcagagagcgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctggaaaattcaccgaaaaacttccacgttcgagttgttcca 3839718  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  3839717 aagtagatctttgctgctgaactatttaaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaattatcttgactttgggatgccatttgtt 3839618  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  3839617 cttttc 3839612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Original strand, 40621995 - 40622195
Alignment:
Q  27 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagt 126  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||||    
T  40621995 ttcaatttctgcacagaacatgtgatggaagaaggtggtaa-ctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagt 40622093  T
Q  127 agatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 226  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40622094 agatctttgctgctgaactatttgaactttttctattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgagtttgggatgtcatttgttcttt 40622193  T
Q  227 tc 228  Q
    ||    
T  40622194 tc 40622195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 228
Target Start/End: Original strand, 15520564 - 15520764
Alignment:
Q  28 tcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagta 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| || ||||||    
T  15520564 tcaatttctgcagagaacgtgtgatgatagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagta 15520663  T
Q  128 gatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttctttt 227  Q
    |||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15520664 gatatttgctgctgaactatttaaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttctttt 15520763  T
Q  228 c 228  Q
    |    
T  15520764 c 15520764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35708070 - 35707869
Alignment:
Q  27 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagt 126  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||||    
T  35708070 ttcaatttctgcaaagaacgtgtgatggaagaaggtggtatgctcatctttgatttcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagt 35707971  T
Q  127 agatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 226  Q
    ||||| ||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35707970 agatctttgctggtgaaatatttgaacttttactattttgacgcatcactttgaactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttt 35707871  T
Q  227 tc 228  Q
    ||    
T  35707870 tc 35707869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41984679 - 41984474
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||  |||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||  || |||||| ||||    
T  41984679 gtggttcaatttctgcagagaaagtgtgaaggaagaaggtagtaagctcatcattgatcttgaaaagtcaccgatgaacttgcacgttcgagttgttcca 41984580  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  41984579 aagtagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacatatcgctttggactgtaatcataaactatcttgacttttggatgccatttgtt 41984480  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  41984479 cttttc 41984474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 740851 - 740651
Alignment:
Q  28 tcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagta 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| || ||||||    
T  740851 tcaatttctgcagagaacgtgtgatgatagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagta 740752  T
Q  128 gatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttctttt 227  Q
     ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  740751 aatatttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcataaactattttgactttgggatgtcatttgttctttt 740652  T
Q  228 c 228  Q
    |    
T  740651 c 740651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26870730 - 26870530
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||     |    
T  26870730 gtggttcaatttctgcagagaacgtgtcatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcacattcgagtt-----a 26870636  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    || |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  26870635 aaatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcataccgttttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgtt 26870536  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  26870535 cttttc 26870530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 17739882 - 17740088
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||  || |||||| ||||    
T  17739882 gtggttcaatttctgcaaagaatgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatatttgatctggaaaagtcaccgaagaacatgcatgttcgagttgttcca 17739981  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttg-actttgggatgtcatttgt 221  Q
    ||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | || ||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||    
T  17739982 aagtatatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgcatctctttggaatgtaatcgtaaactatcttgaatttttggatgccatttgt 17740081  T
Q  222 tcttttc 228  Q
    |||||||    
T  17740082 tcttttc 17740088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 8530673 - 8530864
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  || |||||| ||||    
T  8530673 gtggttcaatttctgcaaagaacgtgtgatggaagaaagtggtaagttcatctttgatctcgaaaattcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttcca 8530772  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| |||               ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8530773 aagtagatctttg--------------caacttctactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaacaatcttgactttgggatgtcatttgtt 8530858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 47557749 - 47557666
Alignment:
Q  145 tatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47557749 tattttaacttctactattttgatgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttc 47557666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 53991541 - 53991488
Alignment:
Q  175 ctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  53991541 ctttggactgtaatcgtaaactatcttgattttggaatgccatttgttcttttc 53991488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 34687419 - 34687624
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  34687419 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 34687518  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34687519 aagtagatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 34687618  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  34687619 cttttc 34687624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 18814051 - 18814256
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18814051 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 18814150  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18814151 aagtagatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 18814250  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  18814251 cttttc 18814256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 34691947 - 34692152
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  34691947 gtggttcaatttctgtagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 34692046  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34692047 aagtagatctttgttgttgaactattttaacttctaatattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 34692146  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  34692147 cttttc 34692152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41963348 - 41963143
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  41963348 gtggttcaatttctgcagataaagagtgatggaagaaggagttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgatttgttcca 41963249  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41963248 aagtagatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 41963149  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  41963148 cttttc 41963143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 31619521 - 31619726
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  31619521 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaagttcgagttgttcca 31619620  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31619621 aagtagatctttgttgttgaactattttaacttttactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgattttgggatgtcatttgtt 31619720  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  31619721 cttttc 31619726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 52521986 - 52521781
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  52521986 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggcaaactcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 52521887  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52521886 aagtagatctttgttgttgaactattataacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 52521787  T
Q  223 cttttc 228  Q
     |||||    
T  52521786 attttc 52521781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41830464 - 41830262
Alignment:
Q  26 gttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaag 125  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  41830464 gttcaatttatgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaag 41830365  T
Q  126 tagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttctt 225  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41830364 tagatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcactttggtctgtagtcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttctt 41830265  T
Q  226 ttc 228  Q
    |||    
T  41830264 ttc 41830262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 48340161 - 48340366
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  || |||||| | ||    
T  48340161 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaaggtggtaagttcatctttgatctcaaaaagtcatagaagaacttgcacgttcgagttgtttca 48340260  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48340261 aagtagatcttagttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagttgtaaactatcttgactttgggatgccatttgtt 48340360  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  48340361 cttttc 48340366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 43 - 228
Target Start/End: Original strand, 44406227 - 44406412
Alignment:
Q  43 aacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagtagatccttgttgttga 142  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  44406227 aacgagtgatggaagaacgtggtaaactcatatttgatctcgaaaagtcacagaataacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttga 44406326  T
Q  143 actatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44406327 actatttgaacttctactattttgacgtaccgctttggactgtagtcgcaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 44406412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16032022 - 16031818
Alignment:
Q  24 tggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaa 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| |||||    
T  16032022 tggttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaa 16031923  T
Q  124 agtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttc 223  Q
    |||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16031922 agtagatcttttctactgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatattgactttgggatgccatttgttc 16031823  T
Q  224 ttttc 228  Q
    |||||    
T  16031822 ttttc 16031818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38845642 - 38845446
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  38845642 gtggttcaatttctgcagatagcgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctctgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttattcca 38845543  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  38845542 aagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggac---------aaaccatcttgattttgggatgtcatttgtt 38845452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Original strand, 10763218 - 10763419
Alignment:
Q  27 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagt 126  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||||    
T  10763218 ttcaatttctacaaagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatttcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagt 10763317  T
Q  127 agatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 226  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10763318 agatctttgctggtgaactatttgaacttttactattttgacgcatcattttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 10763417  T
Q  227 tc 228  Q
    ||    
T  10763418 tc 10763419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 51966150 - 51965946
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  || |||||  ||||    
T  51966150 gtggttcaatttctgcaaagaacgtgtgatggaa-aaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaaattgcatgttcgagtttttcca 51966052  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51966051 aagtagatctttgttgctgaactatttgaacttctactattttgacgcatcactttggattgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgtt 51965952  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  51965951 cttttc 51965946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Original strand, 52309670 - 52309871
Alignment:
Q  27 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagt 126  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||||    
T  52309670 ttcaatttctgcaaagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagt 52309769  T
Q  127 agatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 226  Q
     |||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  52309770 tgatatttgctgatgaactatttgaacttctactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttaagaagtcatttgttcttt 52309869  T
Q  227 tc 228  Q
    ||    
T  52309870 tc 52309871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 228
Target Start/End: Original strand, 15315083 - 15315287
Alignment:
Q  24 tggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaa 123  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  || |||||| |||||    
T  15315083 tggttcaatttctacagagaacgtgtgatggaagaaggtggaaagctcatctttgatctcgaaaagtcatcgaagaatttgcacgttcgagttgttccaa 15315182  T
Q  124 agtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttc 223  Q
    | |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15315183 aatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacatatcggtttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttc 15315282  T
Q  224 ttttc 228  Q
    |||||    
T  15315283 ttttc 15315287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 228
Target Start/End: Original strand, 18111423 - 18111623
Alignment:
Q  28 tcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagta 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| || ||||||    
T  18111423 tcaatttctgcagagaacgtgtgatgatagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagta 18111522  T
Q  128 gatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttctttt 227  Q
    |||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18111523 gatatttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttctttt 18111622  T
Q  228 c 228  Q
    |    
T  18111623 c 18111623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 43255098 - 43254898
Alignment:
Q  28 tcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagta 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| || ||||||    
T  43255098 tcaatttctgcagagaacgtgtgatgatagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagta 43254999  T
Q  128 gatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttctttt 227  Q
    |||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43254998 gatatttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttctttt 43254899  T
Q  228 c 228  Q
    |    
T  43254898 c 43254898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 50395512 - 50395312
Alignment:
Q  28 tcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagta 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| || ||||||    
T  50395512 tcaatttctgcagagaacgtgtgatgatagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagta 50395413  T
Q  128 gatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttctttt 227  Q
    |||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50395412 gatatttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttctttt 50395313  T
Q  228 c 228  Q
    |    
T  50395312 c 50395312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 50560874 - 50561079
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  |  |||||| || |    
T  50560874 gtggttcaatttctgcaaagaacgtgtgatggaagaagatggtaaactcatctttgatctcgaaaattcagcgaagaacttgcatgtccgagttgttcta 50560973  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50560974 aagtagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgtt 50561073  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  50561074 cttttc 50561079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 228
Target Start/End: Original strand, 17671140 - 17671343
Alignment:
Q  24 tggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaa 123  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| |||||    
T  17671140 tggttcaatttca-cagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcacattttatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaa 17671238  T
Q  124 agtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttc 223  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17671239 agtagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacatatcgctttggactgtaatcgtaaactatattgactttgggatgccatttgttc 17671338  T
Q  224 ttttc 228  Q
    |||||    
T  17671339 ttttc 17671343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 228
Target Start/End: Original strand, 36681077 - 36681281
Alignment:
Q  24 tggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaa 123  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||| |||||    
T  36681077 tggttcaatttctacggagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagttcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcaagttgttccaa 36681176  T
Q  124 agtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttc 223  Q
    |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  36681177 agtagatctttgctgctgaactattttaacttctactattttgatgtatctctttggactgtaatcgtaaactatattgactttggaatgtcatttgttc 36681276  T
Q  224 ttttc 228  Q
    |||||    
T  36681277 ttttc 36681281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 228
Target Start/End: Original strand, 45004566 - 45004770
Alignment:
Q  24 tggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaa 123  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||  ||||| |||||    
T  45004566 tggttcaatttctacagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagttcatctttgatctcgaaaagtcaccaaagaacttgcacgttcaagttgttccaa 45004665  T
Q  124 agtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttc 223  Q
    |||||||| ||| || |||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45004666 agtagatctttgctgctgaactattttaacttctactcttttgatgtatctctttggactgtaatcgtaaactatattgactttgggatgtcatttgttc 45004765  T
Q  224 ttttc 228  Q
    |||||    
T  45004766 ttttc 45004770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29841101 - 29840900
Alignment:
Q  27 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagt 126  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||  || |||||| ||||||||    
T  29841101 ttcaatttctgcaaagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatttcgaaaaatcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagt 29841002  T
Q  127 agatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 226  Q
    ||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  29841001 agatctttgctagtgaactatttgaacttttactattttgacgcatcactttggactgtaatcgtaaactattttgactttggtatgtcatttgttcttt 29840902  T
Q  227 tc 228  Q
    ||    
T  29840901 tc 29840900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 48 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12246234 - 12246054
Alignment:
Q  48 gtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagtagatccttgttgttgaactat 147  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| || |||||||||| ||| || | ||||||    
T  12246234 gtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttcaaaagtagatctttggtgcttaactat 12246135  T
Q  148 ttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12246134 ttgaacatctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatattgactttgggatgccatttgttcttttc 12246054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13662824 - 13662619
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  || ||| || ||||    
T  13662824 gtggtttaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagttatcgaagaacttgcacgttcgagctgttcca 13662725  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    || || ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13662724 aaatatatctttgctgttaaactatttgaacttctactattttggcgtatccctttggactgtaatcgtaacctatcttgactttggaatgtcatttgtt 13662625  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  13662624 cttttc 13662619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 28566137 - 28565936
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  || ||| || ||||    
T  28566137 gtggttcagtttcttcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagttattgaagaacttgcacgttcgagctgttcca 28566038  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    || || ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28566037 aaatatatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatctctttggactataatcgtaacctatcttgactttgggatgccatttgtt 28565938  T
Q  223 ct 224  Q
    ||    
T  28565937 ct 28565936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 56 - 228
Target Start/End: Original strand, 24294394 - 24294566
Alignment:
Q  56 agaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagtagatccttgttgttgaactatttgaactt 155  Q
    |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| || |||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  24294394 agaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaactt 24294493  T
Q  156 ctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24294494 ctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttaactttgggatgtcatttgttcttttc 24294566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Original strand, 42682226 - 42682422
Alignment:
Q  27 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagt 126  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||    ||| | |||||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||||    
T  42682226 ttcaatttctgcaaagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcat----gattttgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagt 42682321  T
Q  127 agatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 226  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  42682322 agatctttgctggtgaactatttgaacttttactattttgacgcatcactttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgtttttt 42682421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 12714309 - 12714514
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||  || ||| || ||||    
T  12714309 gtggttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaatttatcgaagaacttgcacgttcgagctgttcca 12714408  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    || || ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  | || ||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  12714409 aaatatatctttgatgctgaactatttgaacttctactattttttcgtattgctttgggatgtaatcgtaacttatcttgactttgggatgccatttttt 12714508  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  12714509 cttttc 12714514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 140 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39760451 - 39760363
Alignment:
Q  140 tgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39760451 tgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttaactttgggatgtcatttgttcttttc 39760363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 228
Target Start/End: Original strand, 47135361 - 47135437
Alignment:
Q  152 acttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  47135361 acttgtactattttgacgcatcgctttggaccgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttattcttttc 47135437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14079249 - 14079044
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14079249 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 14079150  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14079149 aagtagatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 14079050  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  14079049 cttttc 14079044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33424681 - 33424472
Alignment:
Q  19 ggcggtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgc 118  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  33424681 ggcggtgattcaatttctacagataacgagtgatggaagaaagtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgt 33424582  T
Q  119 tccaaagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatt 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33424581 tccaaagtagatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatt 33424482  T
Q  219 tgttcttttc 228  Q
    ||||||||||    
T  33424481 tgttcttttc 33424472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 30826019 - 30826224
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  30826019 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 30826118  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30826119 aagtagatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 30826218  T
Q  223 cttttc 228  Q
     |||||    
T  30826219 attttc 30826224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22333540 - 22333335
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22333540 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaaaaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 22333441  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22333440 aagtagttatttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcactttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 22333341  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  22333340 cttttc 22333335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 41628459 - 41628664
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  41628459 gtggttcaatttctgcagattacgagagatggaagaaggtggtaagctcatccttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 41628558  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41628559 aagtagatctttgttattgaactatttgaacttttactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgagatgtcatttgtt 41628658  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  41628659 cttttc 41628664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6477911 - 6477707
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  || |    
T  6477911 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaaaaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcaagtta-tcta 6477813  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6477812 tagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgtgatgtcatttgtt 6477713  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  6477712 cttttc 6477707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 42811354 - 42811150
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42811354 gtggttcaatttc-gcagataacgagtgatggaagaaggtggtaaactcatctttgatatcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgttcca 42811256  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42811255 aagtagatctttgttgttgaattatttgaacttctactattttgacgtatcactttggattgtagtcgtaaactatcttcactttgggatgtcatttgtt 42811156  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  42811155 cttttc 42811150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19395982 - 19395777
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19395982 gtggttcaatttctacaaataacgaatgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 19395883  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  19395882 aagtagatctttgttgttgaactatttaaacttctaccattttgacgcatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttaactttgggatatcatttgtt 19395783  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  19395782 cttttc 19395777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 43 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23523041 - 23522856
Alignment:
Q  43 aacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagtagatccttgttgttga 142  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  23523041 aacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatatttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagctgttccaaagtagatctttgttgttga 23522942  T
Q  143 actatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23522941 actatttgaacttctactattttgacgtaccgctttggactgtagtcgcaaactatcaagactttgggatgtcatttgttcttttc 23522856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45293992 - 45293791
Alignment:
Q  27 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagt 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||  || |||||| ||||||||    
T  45293992 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatagaagaaagtggtaagctcatctttgatcttgaaaagtcactaaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagt 45293893  T
Q  127 agatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 226  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45293892 agatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgacatttgttcttt 45293793  T
Q  227 tc 228  Q
    ||    
T  45293792 tc 45293791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 38961743 - 38961942
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  38961743 gtggttcaatttatgcagataacgagtgatggaagaaggtggtgatctcatctttgatctcgaaaagtcacataagtacttgcaaattcgagttgttcca 38961842  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961843 aagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgttttg------agtcataaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 38961936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 38992087 - 38992286
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  38992087 gtggttcaatttatgcagataacgagtgatggaagaaggtggtgatctcatctttgatctcgaaaagtcacataagtacttgcaaattcgagttgttcca 38992186  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38992187 aagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgttttg------agtcataaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 38992280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 41907426 - 41907630
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||    
T  41907426 gtggttcaatttcagcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagttcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttcca 41907525  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  41907526 aagtagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggattgtaatcgtaaactatc-tgactttgggatgccatttgtt 41907624  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  41907625 cttttc 41907630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 41977027 - 41977232
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  41977027 gtggttcaatttctgcaaaggacgtgtgatggaagaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgtttgagttgttcca 41977126  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| || | ||||||||    
T  41977127 aagtagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgtgacgccatttgtt 41977226  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  41977227 cttttc 41977232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 12760043 - 12760248
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  12760043 gtggttcaatttctgcaaagaacctgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatttcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgtttgagttgttcca 12760142  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  12760143 aagtagatctttgttgctgaactatttgaacttatactattttgacgcattgttttggactgtaatcgtaaattatcttgactttgggatgccgtttgtt 12760242  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  12760243 cttttc 12760248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23626763 - 23626558
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||    
T  23626763 gtggttcaatttctgcagagaacgtgtcatagaagaaggtgataagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttcca 23626664  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    || |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23626663 aaatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatggctttggactgtaatagtaaactatcttgtctttgggatgccatttgtt 23626564  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  23626563 cttttc 23626558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Original strand, 19247684 - 19247884
Alignment:
Q  27 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagt 126  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||  || |||||| ||||||||    
T  19247684 ttcaatttctgcagagaacatgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcaccaaagaacttacatgttcgagttgttccaaagt 19247783  T
Q  127 agatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 226  Q
    ||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19247784 agatctttgctgctgaattatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaattgtaaactatcttgactttgggatgacatttgttcttt 19247883  T
Q  227 t 227  Q
    |    
T  19247884 t 19247884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Original strand, 19320868 - 19321068
Alignment:
Q  27 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagt 126  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||  || |||||| ||||||||    
T  19320868 ttcaatttctgcagagaacatgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcaccaaagaacttacatgttcgagttgttccaaagt 19320967  T
Q  127 agatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 226  Q
    ||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19320968 agatctttgctgctgaattatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaattgtaaactatcttgactttgggatgacatttgttcttt 19321067  T
Q  227 t 227  Q
    |    
T  19321068 t 19321068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23966934 - 23966734
Alignment:
Q  28 tcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagta 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| || ||||||    
T  23966934 tcaatttctgcagagaacgtgtgatgatagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagta 23966835  T
Q  128 gatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttctttt 227  Q
    |||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23966834 gatatttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttctttt 23966735  T
Q  228 c 228  Q
    |    
T  23966734 c 23966734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6301031 - 6300831
Alignment:
Q  28 tcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagta 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| || ||||||    
T  6301031 tcaatttctgcagagaacgtgtgatgatagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagta 6300932  T
Q  128 gatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttctttt 227  Q
    |||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6300931 gatatttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggtctgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttctttt 6300832  T
Q  228 c 228  Q
    |    
T  6300831 c 6300831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 228
Target Start/End: Original strand, 44940015 - 44940215
Alignment:
Q  28 tcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagta 127  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| || ||||||    
T  44940015 tcaatttctacagagaacgtgtgatgatagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagta 44940114  T
Q  128 gatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttctttt 227  Q
    |||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44940115 gatatttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttctttt 44940214  T
Q  228 c 228  Q
    |    
T  44940215 c 44940215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 41156207 - 41156412
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||| |||||||||| | |||||| ||| || ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||    
T  41156207 gtggctcaatttctgtaaagaacgtgtgttgaaagaaggtggtaagctcatttttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttcca 41156306  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    |||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41156307 aagtagatctatgttgctgaaatatttgaacttctactattttgacgcatcgttttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgtt 41156406  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  41156407 cttttc 41156412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 228
Target Start/End: Original strand, 29433608 - 29433812
Alignment:
Q  24 tggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaa 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  || |||||| |||||    
T  29433608 tggttcaatttctgcagagaacgtgtaatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctggaaaagtcaccgaagaatttccacgttcgagttgttccaa 29433707  T
Q  124 agtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttc 223  Q
    |||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| || || |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  29433708 agtagatctttgctgctgaactatttaaacttctactattttggcgtatcgctttcgactgtaatcataaattatcttgactttgggatgccatttgttc 29433807  T
Q  224 ttttc 228  Q
    |||||    
T  29433808 ttttc 29433812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 228
Target Start/End: Original strand, 37029411 - 37029611
Alignment:
Q  28 tcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagta 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| || ||||||    
T  37029411 tcaatttctgcagagaacgtgtgatgatagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagta 37029510  T
Q  128 gatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttctttt 227  Q
    |||  ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37029511 gatatttgctgctgaactatttaaacttctactattttgacgtatcgttttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttctttt 37029610  T
Q  228 c 228  Q
    |    
T  37029611 c 37029611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 39204199 - 39204404
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  || |||||| | ||    
T  39204199 gtggttcaatttctgtagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagtcatcgaagaacttgcacgttcgagttgttgca 39204298  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    || |||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39204299 aaatagatctttgttgctaaactatttgaacttctattattttggcgcatcgccttggactgtaatcgtaatctatcttgactttgggatgccatttgtt 39204398  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  39204399 cttttc 39204404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12250613 - 12250413
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||     |    
T  12250613 gtggttcaatttctgcagagaacgtgtcatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcacgttcgagtt-----a 12250519  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    || |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12250518 aaatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcataccgttttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgtt 12250419  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  12250418 cttttc 12250413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 39444594 - 39444794
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||     |    
T  39444594 gtggttcaatttctgcagagaacgtgtcatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcacgttcgagtt-----a 39444688  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    || |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  39444689 aaatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcataccgttttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgtt 39444788  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  39444789 cttttc 39444794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 36 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 42061200 - 42061008
Alignment:
Q  36 tgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagtagatccttg 135  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| || |||||||||  |||    
T  42061200 tgcagagaacgtgtgatgatagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttg 42061101  T
Q  136 ttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
     || |||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42061100 ctgctgaactatttaaacttctaataaattgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttc 42061008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22947168 - 22947016
Alignment:
Q  76 ttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgc 175  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| || |||||||||| ||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22947168 ttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttcaaaagtagatctttggtgcttaactatttgaacatctactattttgacgtatcgc 22947069  T
Q  176 tttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    |||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22947068 tttgcactgtaatcgtaaactatattgactttgggaagccatttgttcttttc 22947016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 44383357 - 44383308
Alignment:
Q  25 ggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatc 74  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44383357 ggttcaatttctgcaaaaaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatc 44383308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 31)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 17477717 - 17477922
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17477717 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaaggtgataagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 17477816  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17477817 aagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttaacatatcgctttggactgtagtcataaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 17477916  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  17477917 cttttc 17477922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17575497 - 17575292
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17575497 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaaggtgataagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 17575398  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17575397 aagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttaacatatcgctttggactgtagtcataaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 17575298  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  17575297 cttttc 17575292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23766874 - 23766669
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  23766874 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 23766775  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23766774 aagtagatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 23766675  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  23766674 cttttc 23766669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 17482164 - 17482369
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17482164 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaaggtgataagctcatctttgatctcgaaaagtcatagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 17482263  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17482264 aagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttaacatatcgctttggactgtagtcataaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 17482363  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  17482364 cttttc 17482369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17571050 - 17570845
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17571050 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaaggtgataagctcatctttgatctcgaaaagtcatagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 17570951  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17570950 aagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttaacatatcgctttggactgtagtcataaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 17570851  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  17570850 cttttc 17570845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8926326 - 8926121
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  8926326 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgtttca 8926227  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8926226 aagtagatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 8926127  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  8926126 cttttc 8926121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 42687380 - 42687585
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  42687380 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcggaaagtcacagaagaaattgcaaattcgagttgttcca 42687479  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42687480 aagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctaccattttgacgtatcgctttggacagtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 42687579  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  42687580 cttttc 42687585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 33030624 - 33030829
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  33030624 gtggttcaatttctgcagataacaagtgatggaagaaggtggtaagttcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 33030723  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33030724 aagtagatctttgttgttgaactaattgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaatcatcttgactttgggatgtcatttgtt 33030823  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  33030824 cttttc 33030829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 5962525 - 5962729
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||| ||||    
T  5962525 gtggttcaatttctgcagataacaagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatcttgaaaagtcatagaagaagttgtaaattcgagttgttcca 5962624  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5962625 a-gtagatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 5962723  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  5962724 cttttc 5962729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 208
Target Start/End: Original strand, 14308758 - 14308943
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14308758 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 14308857  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttg 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14308858 aagtagatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttg 14308943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9226652 - 9226451
Alignment:
Q  27 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagt 126  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||| ||||||||    
T  9226652 ttcaatttcagtagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaaagaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagt 9226553  T
Q  127 agatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 226  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9226552 agatctttgttgcagaactatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 9226453  T
Q  227 tc 228  Q
    ||    
T  9226452 tc 9226451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 9149189 - 9149394
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  || |||||| ||||    
T  9149189 gtggttcaatttctgcaaagaacgtgtgattgaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcatcgaagaacttgcatgttcgagttgttcca 9149288  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9149289 aagtagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgtt 9149388  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  9149389 cttttc 9149394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 228
Target Start/End: Original strand, 47174310 - 47174508
Alignment:
Q  30 aatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagtaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  || |||||| |||||||||||    
T  47174310 aatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaaaaacttgcacgttcgagttgttccaaagtaga 47174409  T
Q  130 tccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    || ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47174410 tctttgctattgaactatttaaacttctactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttc 47174508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27735480 - 27735279
Alignment:
Q  27 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagt 126  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||||    
T  27735480 ttcaatttctgcaaagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagt 27735381  T
Q  127 agatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 226  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  27735380 agatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgcatcgctttgaactgtaatcgtaaactatcttaactttgggatgccatttgttcttt 27735281  T
Q  227 tc 228  Q
    ||    
T  27735280 tc 27735279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 42827807 - 42827605
Alignment:
Q  26 gttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaag 125  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| |||||||    
T  42827807 gttcaatttctgcagagaacatgtgatggaagaaggtgataagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaag 42827708  T
Q  126 tagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttctt 225  Q
    |||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  42827707 tagatctttgctactgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttgaactgtaatcgtaaactatattgactttgagatgccatttgttctt 42827608  T
Q  226 ttc 228  Q
    |||    
T  42827607 ttc 42827605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38434985 - 38434780
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||    
T  38434985 gtggttcaatttctgcagagaacgtgtcatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttcca 38434886  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    || |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  38434885 aaatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatagctttggactgtaatagtaaactatcttgtctttgggatgccatttgtt 38434786  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  38434785 cttttc 38434780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 43 - 228
Target Start/End: Original strand, 17469594 - 17469780
Alignment:
Q  43 aacgagtgatggaa-gaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagtagatccttgttgttg 141  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  17469594 aacgagtgatggaaagaaggtggtaagctcatattttatctcgaaaagtcacagaagaaatagcaaattcgagctgttccaaagtagatctttgttgttg 17469693  T
Q  142 aactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17469694 aactatttgaacttctactattttgacgtaccgctttggactgtagtcgcaaactatcatgactttgggatgtcatttgttcttttc 17469780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 43 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17583620 - 17583434
Alignment:
Q  43 aacgagtgatggaa-gaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagtagatccttgttgttg 141  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  17583620 aacgagtgatggaaagaaggtggtaagctcatattttatctcgaaaagtcacagaagaaatagcaaattcgagctgttccaaagtagatctttgttgttg 17583521  T
Q  142 aactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17583520 aactatttgaacttctactattttgacgtaccgctttggactgtagtcgcaaactatcatgactttgggatgtcatttgttcttttc 17583434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Original strand, 3795342 - 3795543
Alignment:
Q  27 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagt 126  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || |||||| |||||| |    
T  3795342 ttcaatttctgcaaagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatttcgaaaagtcaccgaagaacttgcattttcgagttgttccaaaat 3795441  T
Q  127 agatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 226  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3795442 agatctttgctggtgaactatttgaacttttactattttgacgcatcactttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttt 3795541  T
Q  227 tc 228  Q
    ||    
T  3795542 tc 3795543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 47573883 - 47573683
Alignment:
Q  28 tcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagta 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| || ||||||    
T  47573883 tcaatttctgcagagaacgtgtgatgatagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagta 47573784  T
Q  128 gatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttctttt 227  Q
    |||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47573783 gatatttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttctttt 47573684  T
Q  228 c 228  Q
    |    
T  47573683 c 47573683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33639106 - 33638905
Alignment:
Q  27 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagt 126  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||  || |||||| ||||||||    
T  33639106 ttcaatttctacaaagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcgccgaagaatttacatgttcgagttgttccaaagt 33639007  T
Q  127 agatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 226  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33639006 agatctttgctgctgaactatttgaacttctattattttgacgcatcgctttgaactataatcgtaaactatcttgactttggaatgtcatttgttcttt 33638907  T
Q  227 tc 228  Q
    ||    
T  33638906 tc 33638905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 35 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6911898 - 6911705
Alignment:
Q  35 ctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagtagatcctt 134  Q
    |||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| || |||||||||  ||    
T  6911898 ctgcagagaacgtgtgatgatagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatattt 6911799  T
Q  135 gttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6911798 gctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttc 6911705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 55 - 228
Target Start/End: Original strand, 11499718 - 11499891
Alignment:
Q  55 aagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagtagatccttgttgttgaactatttgaact 154  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  11499718 aagaaggtggtaagctcgtctttgatctcgaaaggtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaact 11499817  T
Q  155 tctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | | |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11499818 tctactattttgacgtatcgatttgcattgtagtggtaaactattttgactttgggatctcatttgttcttttc 11499891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 47163987 - 47163783
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||  || |||||| ||||    
T  47163987 gtggttcaatt-ctgcagagaacgtctgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcctcgaagaacttgcacgttcgagttgttcca 47163889  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    || |||||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47163888 aaatagatctttgctgctaaactatttgaacttcaactattttggcgtatcactttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 47163789  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  47163788 cttttc 47163783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 60 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4481785 - 4481617
Alignment:
Q  60 tgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctac 159  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  || |||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||     
T  4481785 tgtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaaattgcacgttcgagttgttccaaagtagacctttgttgctgaactatttgaacttctat 4481686  T
Q  160 tattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4481685 tattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 4481617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 42245291 - 42245086
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||  || |||||| ||||    
T  42245291 gtggttcaatttctgcagagaacgtctaatggaagaaggtggtaagctcatctttaatctggaaaagtcaccgaagaacttccacgttcgagttgttcca 42245192  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  |||||| | || | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  42245191 aagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctaatattttagcgtatctttttggattgtaattgtaaattatcttgactttgggatgccatttgtt 42245092  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  42245091 cttttc 42245086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 42996281 - 42996481
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||     |    
T  42996281 gtggttcaatttctgcagagaacgtgtcatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcacgttcgagtt-----a 42996375  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    || |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  42996376 aaatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcataccgttttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgtt 42996475  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  42996476 cttttc 42996481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23300155 - 23299956
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  || |||||| || |    
T  23300155 gtggttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaaatcatcgaagaacttgcatgttcgagttgttcga 23300056  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||  | || |||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  23300055 aagtagatctttgatgctgaactatttgaacttcaactattttgacgcatcgctttggattgtaaccatatactatcttaagtttgggatgccatttgtt 23299956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 42917696 - 42917827
Alignment:
Q  97 agaacttgcaaatttgagttgctccaaagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaact 196  Q
    ||||||||||  || |||||  ||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||    
T  42917696 agaacttgcattttcgagttcttccaaagtagatctttgctgctgaagtatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcacaaact 42917795  T
Q  197 atcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42917796 atcttgactttgggatgacatttgttcttttc 42917827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 151 - 228
Target Start/End: Original strand, 19521082 - 19521159
Alignment:
Q  151 aacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19521082 aacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagttgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 19521159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 110
Target Start/End: Original strand, 19520998 - 19521081
Alignment:
Q  27 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatt 110  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19520998 ttcaatttatgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttaatctcgaaaagtcatagaagaacttgcaaatt 19521081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 33)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31369448 - 31369243
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  31369448 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 31369349  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31369348 aagtagatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 31369249  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  31369248 cttttc 31369243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 52840961 - 52840759
Alignment:
Q  26 gttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaag 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  52840961 gttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaaggtggtaatctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaag 52840862  T
Q  126 tagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttctt 225  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52840861 tagatatttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttggaatgtcatttgttctt 52840762  T
Q  226 ttc 228  Q
    |||    
T  52840761 ttc 52840759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6104557 - 6104352
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  6104557 gtggttcaatttctgcaaataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 6104458  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6104457 aagtagatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 6104358  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  6104357 cttttc 6104352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35088269 - 35088064
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  35088269 gtggttcaatttctgtagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 35088170  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35088169 aagtagatatttgttgttgaactattttaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 35088070  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  35088069 cttttc 35088064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 51248184 - 51248389
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||    
T  51248184 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaatgtggtaagttcatctttgatctcaaaaagtcacagaagaactttcacattcgagttgttcca 51248283  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51248284 aagtagatctttgtcgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 51248383  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  51248384 cttttc 51248389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 228
Target Start/End: Original strand, 48976511 - 48976712
Alignment:
Q  26 gttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaag 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  48976511 gttcaatttctgcaga-aacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatatttgatctcgaaaagtcacagaagaagttgcaaattcgagttgttccaaag 48976609  T
Q  126 tagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttctt 225  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48976610 tagatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgagatgtcatttgttctt 48976709  T
Q  226 ttc 228  Q
    |||    
T  48976710 ttc 48976712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 50771678 - 50771473
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  50771678 gtggttcaatttctgcagagaatgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaaatcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 50771579  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50771578 aagtagatctttgttgttgaattatttaaacttctactattttaacatatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 50771479  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  50771478 cttttc 50771473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 52853873 - 52853668
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  52853873 gtggttcaatttctacagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatcttgaaaagtcgcagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 52853774  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52853773 aagtagatatttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtaccgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 52853674  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  52853673 cttttc 52853668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21700002 - 21699799
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  21700002 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtgg--agctcatctttgatctcgaaaagtcacagaaaaacttgcaaattcgagttgttcca 21699905  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21699904 aagtagatatttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgagatgtcatttgtt 21699805  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  21699804 cttttc 21699799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 50741176 - 50741381
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  50741176 gtggttcaatttctgcagataatgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaattcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 50741275  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50741276 aagtagatctttgttgttgaattatttaaacttctactattttaacatatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 50741375  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  50741376 cttttc 50741381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 54512602 - 54512806
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||| ||||    
T  54512602 gtggttcaatttctgcagagaacgaatgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcatagaagaacttgcacgttcgagttgttcca 54512701  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54512702 aggtagatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttg-cgtatcgctttggactgtagtcaaaaactatcttgattttgggatgtcatttgtt 54512800  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  54512801 cttttc 54512806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 227
Target Start/End: Original strand, 23193285 - 23193489
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  23193285 gtggttcaatttctatagagaacgagcgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcacgttcgagttgttcca 23193384  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23193385 aagtagatctttgatgttgaacaatttgaccttctactattttgacgtatcgctttagactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgtt 23193484  T
Q  223 ctttt 227  Q
     ||||    
T  23193485 ttttt 23193489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11326075 - 11325886
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |    
T  11326075 gtggttcaatttcagcagataacgagtgatggaagaaggtgataagcttatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgtttga 11325976  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggat 212  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  11325975 aagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctattattttgacatatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgacgttgggat 11325886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 48521453 - 48521248
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||    
T  48521453 gtggttcaatttctgcaaagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttcca 48521354  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48521353 aagtagatctttactactgaactatttgaacttctactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgtt 48521254  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  48521253 cttttc 48521248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 49112898 - 49113094
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  49112898 gtggttcaacttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatcttggatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 49112997  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||         | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49112998 aagtagatctttgttg---------tcgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 49113088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Original strand, 32755313 - 32755513
Alignment:
Q  27 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagt 126  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||||    
T  32755313 ttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatatttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagt 32755412  T
Q  127 agatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 226  Q
    | ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  32755413 acatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatattgactttgggatgccatttgtttttt 32755512  T
Q  227 t 227  Q
    |    
T  32755513 t 32755513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40827466 - 40827261
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||    
T  40827466 gtggttcaatttctgcaaagaacgtgtgatggaagaatgtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttcca 40827367  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  40827366 aagtagatctttgctgctgaactatttgaactttttctattttgacgcatctctttggactgtaatcgtaaactatcttgatttttggatgtcatttgtt 40827267  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  40827266 cttttc 40827261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 55295210 - 55295005
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||    
T  55295210 gtggttcaatttctgcaaagaacgtgcgatggaagaaggtggtaagcttatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttcca 55295111  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55295110 aagtagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgcatcgctttgaactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgtt 55295011  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  55295010 cttttc 55295005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36165442 - 36165237
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  36165442 gtggttcaattttagcatagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcatcgaagaacttgcacattcgagttgttcca 36165343  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  36165342 aagtagatctttgttgctgaacgatttgaacttctactattttggtgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggataccatttgtt 36165243  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  36165242 cttttc 36165237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 8242523 - 8242728
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||    
T  8242523 gtggttcaatttctgcagagaacgtgtaatggaagagggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttcca 8242622  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    |||| |||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  8242623 aagtggatcttttctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtatcggtttggactgtaatcgtaaacaatcttgcctttgggatgccatttgtt 8242722  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  8242723 cttttc 8242728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 52463363 - 52463158
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||| | || |||||||||  || |||||| ||||    
T  52463363 gtggttcaatttctgcaaagaaagtgtgaaggaagaaggtggtaagctcattattgatctcgaaaagtcgctgatgaacttgcacgttcgagttgttcca 52463264  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  52463263 aagtagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgacttagggatgccatttgtt 52463164  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  52463163 cttttc 52463158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39796899 - 39796699
Alignment:
Q  28 tcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagta 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| || ||||||    
T  39796899 tcaatttatgcagagaacgtgtgatgatagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagta 39796800  T
Q  128 gatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttctttt 227  Q
    |||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39796799 gatatttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttctttt 39796700  T
Q  228 c 228  Q
    |    
T  39796699 c 39796699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11598395 - 11598190
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  || |||||| || |    
T  11598395 gtggttcaatttctgcaaagaacgtgtaatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagtacttgcatgttcgagttgttcaa 11598296  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||  |  | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11598295 aagtagatcttttctactaaactatttgaacttctactattttgacgcattgctttggactgttatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 11598196  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  11598195 cttttc 11598190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Original strand, 22477535 - 22477736
Alignment:
Q  27 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagt 126  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||||    
T  22477535 ttcaatttctgcaaagaacgtgtgatggaagaaggtggtatgctcctctttgatttcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagt 22477634  T
Q  127 agatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 226  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22477635 agatctttgctggtgaactatttgaacttttattattttgacgcatcactttggactgtaaccgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 22477734  T
Q  227 tc 228  Q
    ||    
T  22477735 tc 22477736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 54793396 - 54793191
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  || ||| || ||||    
T  54793396 gtggttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagttatcgaagaacttgcacgttcgagctgttcca 54793297  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    || || ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||| |||||||     
T  54793296 aaatatatatttgttgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaatctatattgactttgggatgccatttgtg 54793197  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  54793196 cttttc 54793191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5252800 - 5252600
Alignment:
Q  28 tcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagta 127  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| || ||||||    
T  5252800 tcaatttctgcagagaacatgtgatgatagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagta 5252701  T
Q  128 gatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttctttt 227  Q
    |||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5252700 gatatttgctgctgaactatttaaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttctttt 5252601  T
Q  228 c 228  Q
    |    
T  5252600 c 5252600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11951402 - 11951201
Alignment:
Q  27 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagt 126  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |||||  || |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||  || |||||| ||||||||    
T  11951402 ttcaatttctgcaaagaacgtgtgatgaaagaagttggtaagctcatctttgatttcgaaaaatcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagt 11951303  T
Q  127 agatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 226  Q
     |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11951302 tgatctttgctggtgtactatttgaacttctactattttgacgcatcactttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgagatgtcatttgttcttt 11951203  T
Q  227 tc 228  Q
    ||    
T  11951202 tc 11951201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 16495713 - 16495918
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  || ||| || ||||    
T  16495713 gtggtttaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagttatcgaagaacttgcacgttcgagctgttcca 16495812  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    || || ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16495813 aaatatatctttgctgttaaactatttgaacttctactattttggcgtatccctttggactgtaatcgtaacctatcttgactttggaatgtcatttgtt 16495912  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  16495913 cttttc 16495918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 2845288 - 2845115
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||   | |||||| || |    
T  2845288 gtggttcaatttctgtcgagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcaccgaagaacttgcacgatcgagttgttcaa 2845189  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaact 196  Q
    ||||| ||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| || |||||||||    
T  2845188 aagtatatcttttgtgctgaactatttgaacttctactattttgatgtataactttggactgtaatcgtaaact 2845115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Original strand, 35436772 - 35436867
Alignment:
Q  133 ttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35436772 ttgttgctgaactatttgaacttctacaattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcctgactttgggatgtcatttgttcttttc 35436867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 19893802 - 19893699
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||    
T  19893802 gtggttcaatttctgcaaagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatcttggatctcgaaaagtcacagaagaactttcatgttcgagttgttcca 19893703  T
Q  123 aagt 126  Q
    ||||    
T  19893702 aagt 19893699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 222
Target Start/End: Original strand, 11383004 - 11383140
Alignment:
Q  85 aaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggacta 184  Q
    |||| |||| ||||||||||||  || |||||| ||||||||||| | ||  || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |     
T  11383004 aaaaatcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagtagacctttactgctgaactatttgaccttctactattttggcgtatcgc-ttggattg 11383102  T
Q  185 tagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    || || |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  11383103 taatcctaaactatcttgaccttgagatgtcatttgtt 11383140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 78
Target Start/End: Original strand, 35436719 - 35436774
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttg 78  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  35436719 gtggttcaatttcagcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttg 35436774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16724782 - 16724577
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16724782 gtggttcaatttctgcagataatgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 16724683  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16724682 aagtagatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 16724583  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  16724582 cttttc 16724577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 26821479 - 26821684
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  26821479 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaagtcgagttgttcca 26821578  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26821579 aagtagatctttgttgttgaactattttaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcataaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 26821678  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  26821679 cttttc 26821684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 24 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33664227 - 33664023
Alignment:
Q  24 tggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaa 123  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  33664227 tggttcaatttctacagagaacgagtgatggaagaaggtggtaaactcatccttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaa 33664128  T
Q  124 agtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttc 223  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33664127 agtagatctttgctgttgaactatttgaacttctactattttgacgaatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttc 33664028  T
Q  224 ttttc 228  Q
    |||||    
T  33664027 ttttc 33664023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45205451 - 45205246
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || |||||| ||||    
T  45205451 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaaggtggtaagttcatctttgatctcaaaaagtcacagaagaacttgcgcgttcgagttgttcca 45205352  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45205351 aagtagatctttgttgttaaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgtt 45205252  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  45205251 cttttc 45205246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 21097558 - 21097763
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21097558 gtggttcaaattctgcaaataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 21097657  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21097658 aagtagatctttgttgttgaagtattttaacttctactattttgacgtatcgctttggaatgtagtcgtaaactatctttactttgggatgtcatttgtt 21097757  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  21097758 cttttc 21097763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30567298 - 30567093
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  30567298 gtggttcaatttctgcagataacgagtgattgaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagacacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 30567199  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  30567198 aagtagatcttttttgttgaactatttgaacttctactattttgacgcatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgattttaggatgtcatttgtt 30567099  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  30567098 cttttc 30567093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30570983 - 30570778
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  30570983 gtggttcaatttctgcagataacgagtgattgaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagacacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 30570884  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  30570883 aagtagatcttttttgttgaactatttgaacttctactattttgacgcatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgattttaggatgtcatttgtt 30570784  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  30570783 cttttc 30570778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1515423 - 1515218
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  1515423 gtggttcaatttctgcaaagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcatgtttgagttgttcca 1515324  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1515323 aagtagatctttgctgctgaactatttgaacttatactattttgatgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgttatttgtt 1515224  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  1515223 cttttc 1515218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19168076 - 19167871
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19168076 gtggttcaatttatgcagataacgagtgacagaagaaggtggtaagctcatatttgatctcaaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcca 19167977  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19167976 aagtagatctttattgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagtcacaaactatcttgactttgggatgtcatttgct 19167877  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  19167876 cttttc 19167871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 227
Target Start/End: Original strand, 42885250 - 42885454
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  42885250 gtggttcaatttcggcagataacgagtgatggaagatggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcta 42885349  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42885350 aagtagatctttgttgtcgaactatctgaacttctactattttgacgtatcactttgcaatgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 42885449  T
Q  223 ctttt 227  Q
     ||||    
T  42885450 ttttt 42885454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 14753041 - 14753246
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  || |||||| ||||    
T  14753041 gtggttcaatttcagcagagaactagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcatcgaagaacttgcacgttcgagttgttcca 14753140  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14753141 aagtaaatctttgttgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgtgatgtcatttgtt 14753240  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  14753241 cttttc 14753246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36633519 - 36633314
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  36633519 gtggtttaatttctgcagataacaagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcacgttcgagttgttcca 36633420  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36633419 acgtagatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttgatgtatcactttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgtt 36633320  T
Q  223 cttttc 228  Q
     |||||    
T  36633319 attttc 36633314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 17037128 - 17037333
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||    
T  17037128 gtggttcaatttctgcagagaacgtgtcatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttcca 17037227  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    || |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  17037228 aaatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgtt 17037327  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  17037328 cttttc 17037333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 17091636 - 17091841
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||    
T  17091636 gtggttcaatttctgcagagaacgtgtcatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttcca 17091735  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    || |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  17091736 aaatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgtt 17091835  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  17091836 cttttc 17091841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 17025451 - 17025656
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||    
T  17025451 gtggttcaatttctgcagagaacgtgtcatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttcca 17025550  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    || |||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  17025551 aaatagatctttgctgctgaacnatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgtt 17025650  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  17025651 cttttc 17025656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Original strand, 4811411 - 4811612
Alignment:
Q  27 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagt 126  Q
    |||||||||| || |||||| | |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| || |||||    
T  4811411 ttcaatttctacatagaacgtgcgatggaagaaggtggtaagctcatctctgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagt 4811510  T
Q  127 agatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 226  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4811511 agatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttt 4811610  T
Q  227 tc 228  Q
    ||    
T  4811611 tc 4811612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10821637 - 10821432
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  || |||||| || |    
T  10821637 gtggttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagttcatctttgatctcgaaaagtcatcgaagaacttgcacgttcgagttgttcta 10821538  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    || |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  10821537 aaatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactatgttggcgtatcgctttggactataatcgtaaattatcttgactctgggatgtcatttgtt 10821438  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  10821437 cttttc 10821432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Original strand, 45398605 - 45398806
Alignment:
Q  27 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagt 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||||    
T  45398605 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtacgctcaactttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagt 45398704  T
Q  127 agatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 226  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  45398705 agatctttgttgctgaactatttgaacttctagtattttgatgtatcgctttggactgtaatcgtaaattatattgactttgggatgccatttgttcttt 45398804  T
Q  227 tc 228  Q
    ||    
T  45398805 tc 45398806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9917118 - 9916917
Alignment:
Q  27 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagt 126  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||||    
T  9917118 ttcaatttctgcaaagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatttcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagt 9917019  T
Q  127 agatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 226  Q
    ||||| ||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9917018 agatctttgctggtgaagtatttgaacttttactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttaggatgccatttgttcttt 9916919  T
Q  227 tc 228  Q
    ||    
T  9916918 tc 9916917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28380432 - 28380231
Alignment:
Q  27 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagt 126  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||||    
T  28380432 ttcaatttctgcagagaaagtgtgatggaagaaggtggtacgctcaactttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagt 28380333  T
Q  127 agatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 226  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  28380332 agatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgcattggactgtaatcgtaaattatattgactttgggatgccatttgttcttt 28380233  T
Q  227 tc 228  Q
    ||    
T  28380232 tc 28380231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6343271 - 6343071
Alignment:
Q  28 tcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagta 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| || ||||||    
T  6343271 tcaatttctgcagagaacgtgtgatgatagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagta 6343172  T
Q  128 gatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttctttt 227  Q
    |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6343171 gatatttgctgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttgggctgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttctttt 6343072  T
Q  228 c 228  Q
    |    
T  6343071 c 6343071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1993483 - 1993283
Alignment:
Q  28 tcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagta 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| || ||||||    
T  1993483 tcaatttctgcagagaacgtgtgatgatagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagta 1993384  T
Q  128 gatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttctttt 227  Q
    |||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1993383 gatatttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacatatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttctttt 1993284  T
Q  228 c 228  Q
    |    
T  1993283 c 1993283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 228
Target Start/End: Original strand, 16883784 - 16883988
Alignment:
Q  24 tggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaa 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||     
T  16883784 tggttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcggaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccac 16883883  T
Q  124 agtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttc 223  Q
    | |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| || || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16883884 aatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcctatcactttggactgtaatcttaaaatatctcgactttgggatgtcatttgttc 16883983  T
Q  224 ttttc 228  Q
    |||||    
T  16883984 ttttc 16883988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 228
Target Start/End: Original strand, 17041474 - 17041678
Alignment:
Q  24 tggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaa 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||     
T  17041474 tggttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcggaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccac 17041573  T
Q  124 agtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttc 223  Q
    | |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| || || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17041574 aatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcctatcactttggactgtaatcttaaaatatctcgactttgggatgtcatttgttc 17041673  T
Q  224 ttttc 228  Q
    |||||    
T  17041674 ttttc 17041678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 228
Target Start/End: Original strand, 28502015 - 28502215
Alignment:
Q  28 tcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagta 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| || ||||||    
T  28502015 tcaatttctgcagagaacgtgtgatgatagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagta 28502114  T
Q  128 gatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttctttt 227  Q
    |||  ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28502115 gatatttgctgctgaactatttgaacttctattattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttctttt 28502214  T
Q  228 c 228  Q
    |    
T  28502215 c 28502215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 55 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18093123 - 18092950
Alignment:
Q  55 aagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagtagatccttgttgttgaactatttgaact 154  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  18093123 aagaaggtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgttgctgaactatttgaact 18093024  T
Q  155 tctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  18093023 tctactattttgacgcatcgttttggactgtaatcataaactatcttgacttcgggatgccatttgttcttttc 18092950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14323755 - 14323555
Alignment:
Q  28 tcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagta 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| || ||||||    
T  14323755 tcaatttttgcagagaacgtgtgatgatagaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagta 14323656  T
Q  128 gatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttctttt 227  Q
     ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14323655 tatatttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcataaactattttgactttgtgatgtcatttgttctttt 14323556  T
Q  228 c 228  Q
    |    
T  14323555 c 14323555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35286748 - 35286568
Alignment:
Q  48 gtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagtagatccttgttgttgaactat 147  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| || |||||||||| ||| || | ||||||    
T  35286748 gtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacggaagaacttgcacgttcgagttgttcaaaagtagatctttggtgcttaactat 35286649  T
Q  148 ttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35286648 ttgaacatcttttattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatattgactttgggatgccatttgttcttttc 35286568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26791 - 26586
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  26791 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatgggagaaggtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcacagaagaacttgcaagttcgagttgttcca 26692  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26691 aagtagatatttgttgttgaactattttaacttttactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 26592  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  26591 cttttc 26586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 9752 - 9957
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  9752 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatgggagaaggtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcacagaagaacttgcaagttcgagttgttcca 9851  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9852 aagtagatatttgttgttgaactattttaacttttactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 9951  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  9952 cttttc 9957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 242 - 447
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| | ||    
T  242 gtggttcaatttctgcagataacgagtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacataagaacttgaaaattcgagttgtttca 341  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  342 aagtagatctttgttgttgaactgttttaacttctactattttgatatatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgagatgtcatttgtt 441  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  442 cttttc 447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 65066 - 64860
Alignment:
Q  23 gtggttcaattt-ctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcc 121  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||    
T  65066 gtggttcaattttctgcagaaaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcatcgaagaacttgcacgtttgagttgatcc 64967  T
Q  122 aaagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 221  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64966 aaaatagatctttgttgttgaactatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgt 64867  T
Q  222 tcttttc 228  Q
    |||||||    
T  64866 tcttttc 64860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 152586 - 152381
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  || ||| || ||||    
T  152586 gtggtttaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagttatcgaagaacttgcacgttcgagctgttcca 152487  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    || || ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  152486 aaatatatctttgctgttaaactatttgaacttctactattttggcgtatccctttggactgtaatcgtaacctatcttgactttggaatgtcatttgtt 152387  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  152386 cttttc 152381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30424 - 30223
Alignment:
Q  27 ttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagt 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  30424 ttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtgataagctcatctttgatcttgaaaagtcaccaaagaacttgcatgtttgagttgttccaaagt 30325  T
Q  127 agatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttt 226  Q
    ||||| ||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30324 agatctttactgctaaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgacatttgttcttt 30225  T
Q  227 tc 228  Q
    ||    
T  30224 tc 30223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13359 - 13157
Alignment:
Q  26 gttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaag 125  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| |||||||    
T  13359 gttcaatttctgcaaagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttaatctcgaaaagtcactgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaag 13260  T
Q  126 tagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttctt 225  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13259 tagatctttgttgctgaactatttgagcttctactattttgacgcatcactttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttctt 13160  T
Q  226 ttc 228  Q
    |||    
T  13159 ttc 13157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 227
Target Start/End: Original strand, 119864 - 120068
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  119864 gtggttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacattcgagttgttcca 119963  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    ||||| ||  ||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  119964 aagtaaatttttgctactgaactatttgaacttctactattttaacgtatcgctttggaatctaatcgtaaactatcttgactttgggatgccgtttgtt 120063  T
Q  223 ctttt 227  Q
    |||||    
T  120064 ctttt 120068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4585 - 4405
Alignment:
Q  48 gtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagtagatccttgttgttgaactat 147  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  4585 gtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatttcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctggtgaactat 4486  T
Q  148 ttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4485 ttgaacttttactattttgacgcatctctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggataccatttgttcttttc 4405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 72 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10992 - 10836
Alignment:
Q  72 atctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgta 171  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  10992 atctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttacatattcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttaacgca 10893  T
Q  172 tcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10892 tcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttc 10836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 1163 - 1363
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||     |    
T  1163 gtggttcaatttctgtagagaacgtgtcatggaagaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcacgttcgagtt-----a 1257  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtt 222  Q
    || |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  1258 aaatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcataccgttttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgtt 1357  T
Q  223 cttttc 228  Q
    ||||||    
T  1358 cttttc 1363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 174
Target Start/End: Original strand, 49873 - 50024
Alignment:
Q  23 gtggttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctcca 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  || |||||| || |    
T  49873 gtggttcaatttcagcagagaacatgtgatggaagaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtaatcgaagaacttgcacgttcgagttgttcaa 49972  T
Q  123 aagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcg 174  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49973 aagtagatctttattgctgaactatttgaacttctactattttggcgtatcg 50024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 170 - 228
Target Start/End: Original strand, 61267 - 61325
Alignment:
Q  170 tatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  61267 tatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttc 61325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 69 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 53348 - 53194
Alignment:
Q  69 ctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgac 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||     ||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  53348 ctcatctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcacgttcgagtt-----aaaatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggc 53254  T
Q  169 gtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
     || || |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  53253 ataccgttttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgttcttttc 53194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 29445 - 29322
Alignment:
Q  26 gttcaatttctgcagagaacgagtgatggaagaatgtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgctccaaag 125  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  || |||||| |||||||    
T  29445 gttcaatttctgcagagaacgtgtgatggaagaaggtgataagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttatacgttcgagttgttccaaag 29346  T
Q  126 tagatccttgttgttgaactattt 149  Q
    |||||| |||||| ||||||||||    
T  29345 tagatctttgttgctgaactattt 29322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 96 - 228
Target Start/End: Original strand, 100497 - 100629
Alignment:
Q  96 aagaacttgcaaatttgagttgctccaaagtagatccttgttgttgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaac 195  Q
    |||||||||||  || |||||| |  |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  100497 aagaacttgcatgttcgagttgtttgaaagtagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtaccgctttggactgtaatcgtaaac 100596  T
Q  196 tatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  100597 tatattgactttgggatgcgatttgttcttttc 100629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1891 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1891
Description:

Target: scaffold1891; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 228
Target Start/End: Original strand, 3 - 46
Alignment:
Q  185 tagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3 tagtcgtaaactatcttgactttgtgatgtcatttgttcttttc 46  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 228
Target Start/End: Original strand, 26470 - 26514
Alignment:
Q  184 atagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttc 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  26470 atagtcgtaaactatcttaactttgggatgtcatttgatcttttc 26514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University