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Alignment Overview

Query: NF21265_low_8 (Length: 443)

Name: NF21265_low_8
Description: NF21265
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21265_low_8
NF21265_low_8
[»] chr3 (46 HSPs)
chr3 (72-284)||(9999261-9999473)
chr3 (72-277)||(10234280-10234485)
chr3 (72-263)||(10109472-10109663)
chr3 (72-277)||(10230688-10230892)
chr3 (81-284)||(37802930-37803130)
chr3 (81-276)||(47691887-47692079)
chr3 (81-278)||(15329742-15329938)
chr3 (81-278)||(11367494-11367690)
chr3 (81-263)||(50409033-50409212)
chr3 (81-260)||(10970076-10970252)
chr3 (81-277)||(10037492-10037687)
chr3 (81-278)||(10108827-10109023)
chr3 (81-278)||(11361105-11361301)
chr3 (81-278)||(27273253-27273449)
chr3 (81-278)||(10230066-10230264)
chr3 (81-278)||(41764541-41764738)
chr3 (81-263)||(41221070-41221248)
chr3 (81-262)||(31675-31855)
chr3 (81-278)||(10233661-10233857)
chr3 (89-278)||(23092391-23092579)
chr3 (81-250)||(52917633-52917798)
chr3 (301-410)||(9999163-9999272)
chr3 (301-410)||(10109343-10109452)
chr3 (301-410)||(10234174-10234283)
chr3 (301-410)||(10230582-10230691)
chr3 (120-277)||(10040923-10041079)
chr3 (301-423)||(37803119-37803243)
chr3 (301-424)||(10970273-10970396)
chr3 (313-410)||(10040818-10040914)
chr3 (301-410)||(50408905-50409014)
chr3 (301-394)||(11361018-11361111)
chr3 (301-423)||(11367378-11367500)
chr3 (301-376)||(52916744-52916819)
chr3 (301-425)||(46912087-46912213)
chr3 (301-389)||(41220963-41221051)
chr3 (308-394)||(10037404-10037490)
chr3 (301-394)||(15329932-15330024)
chr3 (301-383)||(41764732-41764815)
chr3 (302-383)||(23092314-23092396)
chr3 (358-426)||(31580-31649)
chr3 (15-45)||(10109693-10109723)
chr3 (15-45)||(10230920-10230950)
chr3 (15-45)||(10234518-10234548)
chr3 (358-394)||(10108780-10108816)
chr3 (358-394)||(10233614-10233650)
chr3 (358-394)||(27273206-27273242)
[»] scaffold0262 (2 HSPs)
scaffold0262 (72-278)||(17859-18065)
scaffold0262 (301-410)||(17756-17865)
[»] chr7 (14 HSPs)
chr7 (72-277)||(21071219-21071424)
chr7 (81-276)||(45122528-45122722)
chr7 (86-263)||(5829713-5829890)
chr7 (81-263)||(22843403-22843582)
chr7 (81-278)||(42231003-42231199)
chr7 (81-278)||(12787158-12787354)
chr7 (81-277)||(9002297-9002492)
chr7 (81-278)||(7035553-7035749)
chr7 (301-423)||(5829910-5830033)
chr7 (301-379)||(21071421-21071499)
chr7 (301-368)||(45122717-45122784)
chr7 (301-353)||(22843330-22843384)
chr7 (358-394)||(12787365-12787401)
chr7 (358-394)||(42230956-42230992)
[»] scaffold1424 (3 HSPs)
scaffold1424 (76-263)||(551-738)
scaffold1424 (313-410)||(417-514)
scaffold1424 (15-45)||(770-800)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (72-263)||(6397-6588)
scaffold0134 (301-423)||(6606-6729)
[»] chr5 (40 HSPs)
chr5 (72-263)||(26831498-26831689)
chr5 (86-284)||(15033760-15033955)
chr5 (81-277)||(6088068-6088260)
chr5 (81-263)||(14194048-14194227)
chr5 (72-278)||(25543907-25544115)
chr5 (81-278)||(4050655-4050850)
chr5 (81-263)||(17872076-17872255)
chr5 (81-266)||(30313243-30313427)
chr5 (81-278)||(10023980-10024176)
chr5 (81-281)||(18115654-18115850)
chr5 (81-278)||(24630976-24631172)
chr5 (81-281)||(43525056-43525252)
chr5 (81-263)||(2262164-2262346)
chr5 (81-258)||(37260185-37260362)
chr5 (81-278)||(8429751-8429947)
chr5 (81-278)||(26792659-26792855)
chr5 (89-252)||(3688820-3688982)
chr5 (89-252)||(3877803-3877965)
chr5 (89-271)||(43448336-43448517)
chr5 (81-278)||(30347656-30347852)
chr5 (91-278)||(27879934-27880121)
chr5 (81-238)||(39882072-39882228)
chr5 (81-284)||(37371756-37371973)
chr5 (301-424)||(14194248-14194373)
chr5 (301-410)||(18115554-18115662)
chr5 (301-394)||(15033944-15034037)
chr5 (301-410)||(43525244-43525352)
chr5 (301-380)||(2262364-2262443)
chr5 (301-410)||(6087963-6088071)
chr5 (301-423)||(17872274-17872401)
chr5 (301-383)||(25544109-25544191)
chr5 (309-389)||(4050573-4050653)
chr5 (307-383)||(43448253-43448329)
chr5 (358-410)||(26793170-26793222)
chr5 (347-394)||(3688775-3688822)
chr5 (347-394)||(3877963-3878010)
chr5 (15-45)||(26831717-26831747)
chr5 (358-394)||(8429958-8429994)
chr5 (358-394)||(10023933-10023969)
chr5 (358-394)||(27879887-27879923)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (72-263)||(40488856-40489047)
chr2 (72-263)||(24244735-24244923)
chr2 (81-284)||(17687526-17687728)
chr2 (81-263)||(2881649-2881828)
chr2 (81-263)||(3641932-3642111)
chr2 (81-263)||(27508245-27508424)
chr2 (81-278)||(39441846-39442041)
chr2 (89-278)||(36047878-36048066)
chr2 (81-278)||(28667352-28667549)
chr2 (81-278)||(37826186-37826383)
chr2 (81-199)||(2868541-2868659)
chr2 (89-278)||(21394213-21394401)
chr2 (81-276)||(41921349-41921544)
chr2 (139-278)||(24270184-24270322)
chr2 (299-424)||(40489064-40489191)
chr2 (303-423)||(24244597-24244718)
chr2 (147-278)||(26955164-26955294)
chr2 (301-429)||(3641784-3641914)
chr2 (301-389)||(35608664-35608752)
chr2 (199-283)||(35608742-35608826)
chr2 (301-426)||(2881847-2881967)
chr2 (301-408)||(27508120-27508227)
chr2 (302-394)||(24270317-24270409)
chr2 (81-136)||(35608837-35608892)
chr2 (301-363)||(17687717-17687779)
chr2 (302-383)||(21394136-21394218)
chr2 (358-394)||(26955305-26955341)
chr2 (358-394)||(36048077-36048113)
[»] chr4 (20 HSPs)
chr4 (81-284)||(618490-618690)
chr4 (81-263)||(37532582-37532761)
chr4 (81-278)||(31920318-31920514)
chr4 (81-278)||(786766-786960)
chr4 (81-278)||(35854756-35854951)
chr4 (89-278)||(49709025-49709213)
chr4 (81-278)||(55560143-55560339)
chr4 (81-278)||(49788004-49788201)
chr4 (89-238)||(1859565-1859713)
chr4 (301-394)||(37532779-37532872)
chr4 (301-423)||(618679-618802)
chr4 (301-394)||(49708938-49709031)
chr4 (301-423)||(786651-786772)
chr4 (139-245)||(38517436-38517541)
chr4 (81-183)||(9281828-9281929)
chr4 (202-278)||(6244770-6244846)
chr4 (301-383)||(31920241-31920324)
chr4 (308-348)||(42328860-42328900)
chr4 (358-423)||(55560350-55560415)
chr4 (358-394)||(6244723-6244759)
[»] scaffold0888 (2 HSPs)
scaffold0888 (81-284)||(901-1100)
scaffold0888 (301-406)||(1089-1197)
[»] chr1 (29 HSPs)
chr1 (81-284)||(2453928-2454128)
chr1 (81-283)||(48239965-48240164)
chr1 (81-281)||(7101817-7102013)
chr1 (81-284)||(28960917-28961115)
chr1 (81-278)||(25075031-25075226)
chr1 (81-278)||(48776502-48776698)
chr1 (86-284)||(16043207-16043402)
chr1 (81-278)||(36206067-36206261)
chr1 (84-278)||(18147537-18147730)
chr1 (81-278)||(16040873-16041069)
chr1 (81-278)||(37391320-37391515)
chr1 (81-278)||(52499580-52499776)
chr1 (81-278)||(36518787-36518983)
chr1 (89-278)||(16748848-16749036)
chr1 (81-262)||(6312167-6312347)
chr1 (301-404)||(48240154-48240257)
chr1 (301-383)||(12450740-12450822)
chr1 (301-410)||(16043109-16043218)
chr1 (301-425)||(28960802-28960928)
chr1 (301-402)||(36205972-36206073)
chr1 (131-263)||(12450841-12450961)
chr1 (309-394)||(25075228-25075313)
chr1 (315-394)||(16040788-16040866)
chr1 (301-383)||(16749030-16749112)
chr1 (301-383)||(48776692-48776774)
chr1 (301-362)||(2454117-2454179)
chr1 (301-376)||(7101746-7101825)
chr1 (358-394)||(6312374-6312410)
chr1 (358-394)||(18147490-18147526)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (72-263)||(185432-185626)
scaffold0017 (301-386)||(185329-185414)
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (81-263)||(13424496-13424675)
chr8 (81-263)||(14713145-14713324)
chr8 (81-278)||(14764478-14764671)
chr8 (81-278)||(31979699-31979895)
chr8 (89-278)||(21114858-21115047)
chr8 (81-278)||(25219743-25219940)
chr8 (81-271)||(7780600-7780789)
chr8 (81-271)||(7820690-7820879)
chr8 (81-246)||(33862559-33862724)
chr8 (144-278)||(37915275-37915408)
chr8 (81-190)||(30306105-30306214)
chr8 (301-394)||(14713033-14713126)
chr8 (301-401)||(13424377-13424477)
chr8 (301-394)||(14764392-14764484)
chr8 (201-278)||(30305992-30306069)
chr8 (301-394)||(31979889-31979982)
chr8 (302-394)||(21115042-21115134)
chr8 (301-383)||(33863106-33863189)
chr8 (301-383)||(37915402-37915485)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (81-263)||(97996-98174)
scaffold0012 (301-423)||(98192-98316)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (86-283)||(12518459-12518653)
chr6 (81-263)||(4221182-4221361)
chr6 (81-284)||(10186393-10186597)
chr6 (81-284)||(12516230-12516432)
chr6 (81-263)||(30880927-30881106)
chr6 (81-276)||(15330389-15330583)
chr6 (81-278)||(31512667-31512863)
chr6 (81-278)||(29642529-29642725)
chr6 (89-271)||(24195757-24195938)
chr6 (95-265)||(14906360-14906527)
chr6 (301-402)||(4221380-4221481)
chr6 (301-410)||(12518360-12518469)
chr6 (301-394)||(15330301-15330394)
chr6 (301-394)||(12516148-12516241)
chr6 (301-424)||(30880780-30880908)
chr6 (307-394)||(24195663-24195750)
chr6 (301-363)||(10186342-10186404)
chr6 (358-394)||(29642736-29642772)
chr6 (358-394)||(31512874-31512910)
[»] scaffold0073 (4 HSPs)
scaffold0073 (81-278)||(23442-23638)
scaffold0073 (81-278)||(18307-18503)
scaffold0073 (301-394)||(18220-18313)
scaffold0073 (301-394)||(23355-23448)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (81-284)||(13337-13536)
scaffold0025 (302-401)||(13248-13347)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (81-263)||(125091-125269)
scaffold0022 (301-424)||(124948-125072)
[»] scaffold0499 (1 HSPs)
scaffold0499 (81-271)||(10001-10190)
[»] scaffold0550 (2 HSPs)
scaffold0550 (81-278)||(4704-4900)
scaffold0550 (358-394)||(4911-4947)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (81-278)||(50115-50311)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (81-278)||(164375-164572)
scaffold0003 (81-278)||(172490-172687)
scaffold0003 (301-394)||(164288-164381)
scaffold0003 (301-394)||(172403-172496)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (89-278)||(133050-133238)
scaffold0029 (314-383)||(133245-133314)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (91-278)||(310880-311066)
scaffold0002 (301-371)||(331437-331507)
scaffold0002 (314-383)||(311073-311142)
[»] scaffold0532 (2 HSPs)
scaffold0532 (111-263)||(3522-3671)
scaffold0532 (301-423)||(3689-3815)
[»] scaffold0118 (2 HSPs)
scaffold0118 (81-278)||(29741-29940)
scaffold0118 (358-394)||(29951-29987)
[»] scaffold0472 (2 HSPs)
scaffold0472 (112-278)||(13312-13477)
scaffold0472 (358-394)||(13265-13301)
[»] scaffold1370 (2 HSPs)
scaffold1370 (112-276)||(1375-1538)
scaffold1370 (301-423)||(1533-1657)
[»] scaffold0196 (2 HSPs)
scaffold0196 (81-187)||(23283-23389)
scaffold0196 (301-423)||(23123-23247)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (112-277)||(44856-45020)
scaffold0107 (311-410)||(44752-44852)
[»] scaffold0636 (1 HSPs)
scaffold0636 (145-278)||(1-133)
[»] scaffold0582 (2 HSPs)
scaffold0582 (167-277)||(10269-10378)
scaffold0582 (358-394)||(10221-10257)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 46)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 72 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9999473 - 9999261
Alignment:
Q  72 atgattaatatacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatctt 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  9999473 atgattaatatacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacgatgagtacatctt 9999374  T
Q  172 atattacaaataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatat 271  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9999373 atactacaaataattagtataaatataataaatccaaatactttaatcgctatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatat 9999274  T
Q  272 gtttttccatatc 284  Q
     ||||||||||||    
T  9999273 ttttttccatatc 9999261  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 72 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10234485 - 10234280
Alignment:
Q  72 atgattaatatacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatctt 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10234485 atgattaatatacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatctt 10234386  T
Q  172 atattacaaataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatat 271  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10234385 atactacaaataattagtataaatataataaatccaaatactttaatcgctatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatat 10234286  T
Q  272 gttttt 277  Q
     |||||    
T  10234285 tttttt 10234280  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 72 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 10109663 - 10109472
Alignment:
Q  72 atgattaatatacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatctt 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10109663 atgattaatatacattatgtcaacaaataataatatacagtacatcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatctt 10109564  T
Q  172 atattacaaataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 263  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10109563 atactacaaataattagtataaatataataaatccaaatactttaatcgctatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 10109472  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 72 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10230892 - 10230688
Alignment:
Q  72 atgattaatatacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatctt 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  10230892 atgattaatatacattatgtcaacaaattataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctatgtttaacaatgagtacatctt 10230793  T
Q  172 atattacaaataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatat 271  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10230792 atactacaaataattagtataaatataataaatccaaatactttaatcgctatgtgcaa-gtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatat 10230694  T
Q  272 gttttt 277  Q
     |||||    
T  10230693 tttttt 10230688  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 81 - 284
Target Start/End: Original strand, 37802930 - 37803130
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  37802930 atacattatgtcaacaaataataatatacagtatgtcggagtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacattttatactacaa 37803029  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttcca 280  Q
    |||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  37803030 ataattagtataagt---ataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatctcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttcca 37803126  T
Q  281 tatc 284  Q
    ||||    
T  37803127 tatc 37803130  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 81 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 47692079 - 47691887
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  47692079 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacgtcttatactacaa 47691980  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttt 276  Q
    ||||||| |||| ||   |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  47691979 ataattaatataagt---ataaattcaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaattatatacaaaattaagatgatatctttt 47691887  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Original strand, 15329742 - 15329938
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||    
T  15329742 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacctcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttgacaaggagtacatcttatactacaa 15329841  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||| | ||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15329842 ataattagtacaagtataa-caatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagattatatttttttc 15329938  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 11367690 - 11367494
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||    
T  11367690 atacattttgtcaacaaatattattatacagtacgtcggcatatttttgcaaaaatattacatatgctaagtataacaatgagtgcatcttatactacaa 11367591  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  11367590 ataattagtacaagtataat-aatccaaataatttaatcgatatatgcaaagtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttc 11367494  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 81 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 50409212 - 50409033
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  50409212 atacattatgtcaactaataataatatatagtacgttggcgtattttttcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatcttatactacaa 50409113  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 263  Q
    |||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  50409112 ataattagtataagt---ataaattcaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttatatatttcaaaatatatacaatattaa 50409033  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 81 - 260
Target Start/End: Original strand, 10970076 - 10970252
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  10970076 atacattatgtcaacaagtaataatatacagtatgtcgacgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaagaatgactacatcttatactacaa 10970175  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaat 260  Q
    ||||||||||||   |  |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10970176 ataattagtata---actataactccaaatactttaatcgttgtgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaat 10970252  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 81 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10037687 - 10037492
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  10037687 atacattttgtcaacaaatattattatacagtacgtcagcatatttttgcaaaaatattacatatgctatgtttaacaatgagtgcatcttatactacaa 10037588  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgttttt 277  Q
    |||||||||| | ||||| | |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10037587 ataattagtacaagtatagt-aatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttggatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatattttttt 10037492  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 10109023 - 10108827
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||    
T  10109023 atacattttgtcaacaaatattattacacagtacgtcgacgtatttttgcaataaaattacatatgctaagtttaaaaatgagtgcatcttatactacaa 10108924  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  10108923 ataattagtacaagtataat-aatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttc 10108827  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 11361301 - 11361105
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  11361301 atacattttgtcaacaaatattattatacagtacgtcgacgtatttttgcaaaaatattacgtatgttaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaa 11361202  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||| |  |||||| |||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  11361201 ataattagtacaaatataat-aatccaaatacttttatggttatatgcaatgtttagatatttcaaattatatacaaaattaagatgatatttttttc 11361105  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 27273449 - 27273253
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  27273449 atacattttgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatactaagtttaacaatgaatgtatcttatactacaa 27273350  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  27273349 ataattagtacaagtataat-aatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatataaaattaagatgatatttttttc 27273253  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 10230264 - 10230066
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaa--aaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattac 178  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  10230264 atacattttgtcaacaaatattattacacagtacgtcgacgtatttttgcaagaaaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactac 10230165  T
Q  179 aaataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  10230164 aaataattagtacaagtataataa-tccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttc 10230066  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Original strand, 41764541 - 41764738
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttt-tgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattaca 179  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||    
T  41764541 atacattttgtcaacaaatattattatacattaagtcagcgtattttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatacaaca 41764640  T
Q  180 aataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  41764641 aataattagtacaagtataat-aatccaaatacttttatcgttatatacaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttc 41764738  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 81 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 41221248 - 41221070
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  41221248 atacattatgtcaaaaaataataatatatagtacgttcgcgtatttttgcaaaaatattacatatgttaaatttaacaatgagtacatcttatactacaa 41221149  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 263  Q
    ||||||||| || ||   ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41221148 ataattagt-taagt---ataaatccaaatactttaatatttatgtgcaatgtttaggtatttcaaaatatatacaaaattaa 41221070  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 81 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 31855 - 31675
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||    
T  31855 atacattttgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgaaagaaaattacatatgctaagtttaacaataagtgcatcttatactacaa 31756  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaatta 262  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31755 ataattagtacaagtataat-aatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaatta 31675  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 10233857 - 10233661
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||    
T  10233857 atacattttgtcaacaaatattattacacagtccgtcgacgtatttttgcaagaaaattgcatatgctaagtttaacaatgattgcatcttatactacaa 10233758  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    ||||||| || | ||||||| |||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10233757 ataattattacaagtataat-aatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatttttttc 10233661  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23092579 - 23092391
Alignment:
Q  89 tgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaaataattag 188  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  23092579 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagattaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag 23092480  T
Q  189 tataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    || | ||||||| |||||||||| ||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  23092479 tacaagtataat-aatccaaatatttttatcgttatatgcagtgtttagatatttcaaaatatatacaaaaataagattatatatttttc 23092391  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 81 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 52917798 - 52917633
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  52917798 atacattatgtcaacaagtaataata-acagtacgtaaacgtttttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaagaatgactaaatcttatactacaa 52917700  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaata 250  Q
    |||||||||||| ||   |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  52917699 ataattagtataagt---ataactccaaatactttaatcgttatgtccaatgtttagatattttaaaata 52917633  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 301 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 9999272 - 9999163
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaatttaccgtg 400  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  9999272 tttttccatatcaaatgtaaattataacaacacttataactttaagataacatagtataaaatctatacatttgatcaaaaaagttttttatttcccgtg 9999173  T
Q  401 cttggcacgg 410  Q
    ||||||||||    
T  9999172 cttggcacgg 9999163  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 301 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 10109452 - 10109343
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaatttaccgtg 400  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10109452 tttttccatatcaaatgtaaattataacaacacttataactttaagataacatagtataaaatctatacatttgatcaaaaaagttttttatttcccgtg 10109353  T
Q  401 cttggcacgg 410  Q
    ||||||||||    
T  10109352 cttggcacgg 10109343  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 301 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 10234283 - 10234174
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaatttaccgtg 400  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  10234283 tttttccatatcaaatgtaaattataacaacacttataactttaagataacatagtataaaatctatacatttgatcaaaaaagatttttatttcccgtg 10234184  T
Q  401 cttggcacgg 410  Q
    ||||||||||    
T  10234183 cttggcacgg 10234174  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 301 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 10230691 - 10230582
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaatttaccgtg 400  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||    
T  10230691 tttttccatatcaaatgtaaattataacaacacttataactttaagataacatggtataaaatctatacatttgatcaaaaaagttttttatttcccatg 10230592  T
Q  401 cttggcacgg 410  Q
    ||||||||||    
T  10230591 cttggcacgg 10230582  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 120 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10041079 - 10040923
Alignment:
Q  120 cgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaaataattagtataggtataataaatccaaatactttaatc 219  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||  |  |||| ||   |||||||||||||||||||||    
T  10041079 cgtatttttgccaaaatattacatatgctaagtttaacaataagtacatcttatactacagatatattttataagt---ataaatccaaatactttaatc 10040983  T
Q  220 ggtatgtgcaatgtttag--atatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgttttt 277  Q
      ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10040982 cttatgtgcaatgtttagacatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatattttttt 10040923  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 301 - 423
Target Start/End: Original strand, 37803119 - 37803243
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatata-tttgatcaaaaaagtttttaatttaccgt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  37803119 tttttccatatcaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacacaatataaaatctatatattttgatcaaaaaagtattttatttcccgt 37803218  T
Q  400 gcttggcacg-gtcagtatactagt 423  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||    
T  37803219 gcttagcacgagtcactatactagt 37803243  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 301 - 424
Target Start/End: Original strand, 10970273 - 10970396
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaatttaccgtg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||     
T  10970273 tttttccatatcaaatttaaattataaccatacttataactttaagataacataatataaaatctatatatttgat-aaaaaagttttttatttccggta 10970371  T
Q  401 cttggcac-ggtcagtatactagta 424  Q
     ||||||| ||||| ||||||||||    
T  10970372 attggcacgggtcactatactagta 10970396  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 313 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 10040914 - 10040818
Alignment:
Q  313 aaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaatttaccgtgcttggcacgg 410  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  10040914 aaatttaaattataaccacacttataattgtaagataacataatataaaatctatacatttgat-aaaaaagttttttatttcccgtgcttggcacgg 10040818  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 301 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 50409014 - 50408905
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaatttaccgtg 400  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||  ||||| ||||  ||||    
T  50409014 ttttttcatatcaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatatatacatttgatcaaaaatattttttatttcacgtg 50408915  T
Q  401 cttggcacgg 410  Q
    ||||||||||    
T  50408914 cttggcacgg 50408905  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 301 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 11361111 - 11361018
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  11361111 ttttttcatatcaaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaaaaagttttttattt 11361018  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 301 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 11367500 - 11367378
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaatttaccgtg 400  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| | || |||||    
T  11367500 ttttttcatatcgaatttaaattataacgacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaaaaagttttttacttcccgtg 11367401  T
Q  401 cttggcac-ggtcagtatactagt 423  Q
    | |||||| ||||| |||||||||    
T  11367400 c-tggcacgggtcattatactagt 11367378  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 301 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 52916819 - 52916744
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgat 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  52916819 tttttccatatcaaatttaaattataaccacacttataaatttaagataacataatataaaatctatacatttgat 52916744  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 301 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 46912213 - 46912087
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaa-aaagtttttaatttaccgt 399  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||| || ||||||| | | ||||    
T  46912213 ttttcccatatcaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatatatacattttatcaaagaaggtttttattgtcccgt 46912114  T
Q  400 gcttggca-cggtcagtatactagtat 425  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  46912113 gcttggcatgggtcactatactagtat 46912087  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 301 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 41221051 - 41220963
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagttttt 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  41221051 tttttccatatcaaatttaaattataaccgcacttataactttaatataacataatataaaatttatacatttgattaaaaaagttttt 41220963  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 308 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10037490 - 10037404
Alignment:
Q  308 atatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  10037490 atatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaaaaagttttttattt 10037404  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 301 - 394
Target Start/End: Original strand, 15329932 - 15330024
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  15329932 ttttttcacatcgaatttaaattataaca-caattataattttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaaaaagttttttattt 15330024  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 301 - 383
Target Start/End: Original strand, 41764732 - 41764815
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataa-ttttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaa 383  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  41764732 ttttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataacttttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaaaaa 41764815  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 23092396 - 23092314
Alignment:
Q  302 ttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataac-atagtataaaatctatatatttgatcaaaaaa 383  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| | | ||||||||||||| || |||| ||||||    
T  23092396 tttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacaaaaatataaaatctatacatatgataaaaaaa 23092314  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 31649 - 31580
Alignment:
Q  358 taaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt-accgtgcttggcac-ggtcagtatactagtatt 426  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  31649 taaaatctatacatttgatcaaaaaagttttttatttccccgtgc-tggcacaggtcactatactagtatt 31580  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 10109723 - 10109693
Alignment:
Q  15 agatgtatacatctgacactcactattatat 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10109723 agatgtatacatctgacactcactattatat 10109693  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 10230950 - 10230920
Alignment:
Q  15 agatgtatacatctgacactcactattatat 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10230950 agatgtatacatctgacactcactattatat 10230920  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 10234548 - 10234518
Alignment:
Q  15 agatgtatacatctgacactcactattatat 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10234548 agatgtatacatctgacactcactattatat 10234518  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10108816 - 10108780
Alignment:
Q  358 taaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  10108816 taaaatctatacatttgatcaaaaaagttttttattt 10108780  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10233650 - 10233614
Alignment:
Q  358 taaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  10233650 taaaatctatacatttgatcaaaaaagttttttattt 10233614  T

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Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 27273242 - 27273206
Alignment:
Q  358 taaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27273242 taaaatctatacatttgatcaaaaaagttttttattt 27273206  T

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Target: scaffold0262 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 72 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18065 - 17859
Alignment:
Q  72 atgattaatatacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatctt 171  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18065 atgattaatatacattatgtcaataaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgaatacatctt 17966  T
Q  172 atattacaaataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatat 271  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17965 atactacaaataattagtataagtataataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttaaatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatat 17866  T
Q  272 gtttttc 278  Q
     ||||||    
T  17865 ttttttc 17859  T

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Target: scaffold0262; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 301 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 17865 - 17756
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaatttaccgtg 400  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||| |||||    
T  17865 ttttttcatatcaaattaaaattataacaacacttataactttaagataacatagtataaaatctatacatttgataaaaaaagtgttttatttcccgtg 17766  T
Q  401 cttggcacgg 410  Q
    ||||||||||    
T  17765 cttggcacgg 17756  T

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Target: chr7 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 72 - 277
Target Start/End: Original strand, 21071219 - 21071424
Alignment:
Q  72 atgattaatatacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatctt 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  21071219 atgattaatatacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatatt 21071318  T
Q  172 atattacaaataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatat 271  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21071319 atactacaaataattagtataagtataataaatccaaatactttaatcgttgtgtacaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatat 21071418  T
Q  272 gttttt 277  Q
     |||||    
T  21071419 tttttt 21071424  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 81 - 276
Target Start/End: Original strand, 45122528 - 45122722
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  45122528 atacattttgtcaacaaatattattatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatattacaa 45122627  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttt 276  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  45122628 ataattagtacaagtataat-aattcaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttt 45122722  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 86 - 263
Target Start/End: Original strand, 5829713 - 5829890
Alignment:
Q  86 ttatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaaataat 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||  |||||||||    
T  5829713 ttatgtcaacaaataataatatacagtacgttggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacgtcttatacgacaaataat 5829812  T
Q  186 tagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 263  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5829813 tagtataagtatagtaaatcaaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatttacaaaattaa 5829890  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 81 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22843582 - 22843403
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  22843582 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtccgcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgattacatcttatactacaa 22843483  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 263  Q
    ||||||||||||   |  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22843482 ataattagtata---aatataaatccaaatactttagtcgttatgtgcaatgtttagatatttttaaatatatacaaaattaa 22843403  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 42231199 - 42231003
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || ||    
T  42231199 atacattttgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgaatgcatcttatactaaaa 42231100  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  42231099 ataattagtacaagtataat-aatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttc 42231003  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Original strand, 12787158 - 12787354
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  12787158 atacattttgtcaacaaatattattacacagtaagtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgaatcttatactacaa 12787257  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    ||||| | || | ||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12787258 ataataaatacaagtataat-aatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttc 12787354  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 81 - 277
Target Start/End: Original strand, 9002297 - 9002492
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  9002297 atacattttgtcaacaaatattattacacagtacgtcgtcttatttttgcaataatattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaa 9002396  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgttttt 277  Q
    | |||||||| | ||||||| ||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  9002397 aaaattagtacaagtataat-aattcaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatattttt 9002492  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 7035749 - 7035553
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| || ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||    
T  7035749 atacattttgccaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaattttaacaatgaatgcatcttatactacaa 7035650  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  7035649 ataattagtacaagtataat-aatccaaatatttttatcgttatatgaaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttc 7035553  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 301 - 423
Target Start/End: Original strand, 5829910 - 5830033
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaatttaccgtg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  5829910 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataactttaagataacatagtataaaatctatacatttgatcataaaagttttttattttccgtg 5830009  T
Q  401 cttggcac-ggtcagtatactagt 423  Q
     ||||||| ||||| |||||||||    
T  5830010 tttggcacgggtcactatactagt 5830033  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 301 - 379
Target Start/End: Original strand, 21071421 - 21071499
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaa 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21071421 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataactttaagataacataatataaaatctatatatttgatcaa 21071499  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 368
Target Start/End: Original strand, 45122717 - 45122784
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctata 368  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  45122717 ttttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataatataatataaaatctata 45122784  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22843384 - 22843330
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacact--tataattttaagataacat 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||| |||||||||||||    
T  22843384 tttttccatatcaaatttaaattataaccatacttatataactttaagataacat 22843330  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 394
Target Start/End: Original strand, 12787365 - 12787401
Alignment:
Q  358 taaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12787365 taaaatctatacatttgatcaaaaaagttttttattt 12787401  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 42230992 - 42230956
Alignment:
Q  358 taaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  42230992 taaaatctatacatttgatcaaaaaagttttttattt 42230956  T

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Target: scaffold1424 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold1424
Description:

Target: scaffold1424; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 76 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 738 - 551
Alignment:
Q  76 ttaatatacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatat 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  738 ttaatatacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatac 639  T
Q  176 tacaaataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  638 tacaaataattagtataagtataataaattcaaatacttcaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 551  T

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Target: scaffold1424; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 313 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 514 - 417
Alignment:
Q  313 aaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaatttaccgtgcttggcacgg 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  514 aaatttaaattataacaacacttataactttaagataacataatataaaatctatatatttcttcaaaaaagtttttaattccccgtgcttggcacgg 417  T

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Target: scaffold1424; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 800 - 770
Alignment:
Q  15 agatgtatacatctgacactcactattatat 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  800 agatgtatacatctgacactcactattatat 770  T

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Target: scaffold0134 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 72 - 263
Target Start/End: Original strand, 6397 - 6588
Alignment:
Q  72 atgattaatatacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatctt 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6397 atgattaatatacattatgtcaacaaataataatatacagtacatcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatctt 6496  T
Q  172 atattacaaataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 263  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6497 atactacaaataattagtataagtataataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatataaaattaa 6588  T

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Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 301 - 423
Target Start/End: Original strand, 6606 - 6729
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt-accgt 399  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||  ||||    
T  6606 ttttttcatatcaaatttaaattataacaacacttataactttaagataacatagtataaaatctatacatttgat-aaaaaagttttttatttccccgt 6704  T
Q  400 gcttggcac-ggtcagtatactagt 423  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||    
T  6705 gcttggcacgggtcactatactagt 6729  T

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Target: chr5 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 40)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 72 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26831689 - 26831498
Alignment:
Q  72 atgattaatatacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatctt 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26831689 atgattaatatacattatgtcaacaaattataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatctt 26831590  T
Q  172 atattacaaataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 263  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26831589 atactacaaataattagtataaatataataaatccaaatactttaatcgctatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 26831498  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 86 - 284
Target Start/End: Original strand, 15033760 - 15033955
Alignment:
Q  86 ttatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaaataat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  15033760 ttatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatcttataatacaaataat 15033859  T
Q  186 tagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttccatatc 284  Q
    || |||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||    
T  15033860 taatataagt---ataaatccaaatactttgatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatattcaaaattaagatgaaatttttttcaatatc 15033955  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 81 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6088260 - 6088068
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6088260 atacattatgtcaacaaataataatatacaatacgtcggcgtatttttgtaaaa-tattacatatgctaagtttaacaatgagtacatcttatactacaa 6088162  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgttttt 277  Q
    |||||||||||| ||||||   || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  6088161 ataattagtataagtataa---attcaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaactatatacaaaattaagatgatattttttt 6088068  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 81 - 263
Target Start/End: Original strand, 14194048 - 14194227
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||    
T  14194048 atacattatttcaacaaataatgatatacagtacgtcggcgtatttttacaaaaatattacatatgctaagtttatcaatgggtacatcttatactacaa 14194147  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 263  Q
    |||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14194148 ataattagtataagt---ataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 14194227  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 72 - 278
Target Start/End: Original strand, 25543907 - 25544115
Alignment:
Q  72 atgattaatatacattatgtcaacaaata---ataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatat 168  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  25543907 atgattaatatagattatgtcaacaaataataataatatacagtacatcggcttatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtgcat 25544006  T
Q  169 cttatattacaaataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataa 268  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25544007 cttatactacaaataattagtacaagtataat-aatccaaatacttttatcgttatatgcgatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatga 25544105  T
Q  269 tatgtttttc 278  Q
    ||| ||||||    
T  25544106 tatttttttc 25544115  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 4050850 - 4050655
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |    
T  4050850 atacattttgtcaacaaatattattatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactac-a 4050752  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  4050751 ataattagtacaagtataat-aatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttc 4050655  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 81 - 263
Target Start/End: Original strand, 17872076 - 17872255
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Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||    
T  17872076 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtccgcgtatttttgcaaaaatattgcatatgctaagtttaacaataattacatcttatactacaa 17872175  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 263  Q
    |||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  17872176 ataattagtataagt---ataaatccaaatactttaatcgttatatgcaatgtttagatatttttaaatatatacaaaattaa 17872255  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 81 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 30313427 - 30313243
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||    
T  30313427 atacattttgtcaacaaatattattatacagtacatcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatgcgacaa 30313328  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat 266  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313327 ataattagtacaagtataat-aatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat 30313243  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 10024176 - 10023980
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||    
T  10024176 atacattttgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgaatgcatcttatactacaa 10024077  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  10024076 ataattagtacaagtataat-aatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttc 10023980  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 81 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 18115850 - 18115654
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||| |||||    
T  18115850 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcatatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagcaaccgttatactacaa 18115751  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttcca 280  Q
    |||  || | || | || |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  18115750 ata--tattttatg-attataaatccaaatactttaatcattaagtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatat-tttttcca 18115655  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Original strand, 24630976 - 24631172
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || ||    
T  24630976 atacattttgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgaatgcatcttatactataa 24631075  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  24631076 ataattagtacaagtataat-aatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttc 24631172  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 81 - 281
Target Start/End: Original strand, 43525056 - 43525252
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||| |||||    
T  43525056 atacattatgtcaacaaataataatatagagtacgtcgacacatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagcaactgttatactacaa 43525155  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttcca 280  Q
    |||  || | || | || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  43525156 ata--tattttatg-attataaatccaaatactttaatcattatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatat-tttttcca 43525251  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 81 - 263
Target Start/End: Original strand, 2262164 - 2262346
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacg---tcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatatta 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  2262164 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgacgtcggagtatttttgcaaaaatattacatatgttaagtttaacaatgagtacatcttatacta 2262263  T
Q  178 caaataa-ttagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 263  Q
    ||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2262264 caaataatttagt-taagt---ataaattcaaatactttaatcgttatctgcaatgtttagatatttcaaaatatatataaaattaa 2262346  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 81 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 37260362 - 37260185
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  37260362 atacattttgtcaacaaatattattatacagtacgtcggcatatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaa 37260263  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatat-ttcaaaatatatacaaa 258  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  37260262 ataattagtacaagtataat-aatccaaatacttttatcattatatgcaatgtttagatatatacaaaatatatacaaa 37260185  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Original strand, 8429751 - 8429947
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||  |||||    
T  8429751 atacattttgtcaacaaatattattacacagtacgtcgacgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcattttatgctacaa 8429850  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  8429851 ataattagtacaagtataat-aatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaatgaagatgatatttttttc 8429947  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26792855 - 26792659
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||    
T  26792855 atacattttgtcaacaaatattattacacagtacgtcgacgtatttttaaaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatacaacaa 26792756  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  26792755 ataattagtacaagtataat-aatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttc 26792659  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 89 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 3688982 - 3688820
Alignment:
Q  89 tgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaaataattag 188  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3688982 tgtcaacaaatattattatacagtacgtcgacgtatttttgcaaaaatattacgtatgttaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataattag 3688883  T
Q  189 tataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatata 252  Q
    || | ||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3688882 tacaagtataat-aatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaattata 3688820  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 89 - 252
Target Start/End: Original strand, 3877803 - 3877965
Alignment:
Q  89 tgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaaataattag 188  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3877803 tgtcaacaaatattattatacagtacgtcgacgtatttttgcaaaaatattacgtatgttaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataattag 3877902  T
Q  189 tataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatata 252  Q
    || | ||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3877903 tacaagtataat-aatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaattata 3877965  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 89 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 43448517 - 43448336
Alignment:
Q  89 tgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaaataattag 188  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  43448517 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggtgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag 43448418  T
Q  189 tataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatat 271  Q
    || | ||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43448417 tacaagtataat-aatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttaaatttttcaaaatatatacaaaattaagattatat 43448336  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Original strand, 30347656 - 30347852
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |  | |||||| || ||    
T  30347656 atacattttgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgcgaagtttaacaatgaatgcaccttatactataa 30347755  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  30347756 ataattagtacaagtataat-aatccaaatatttttatcattatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttc 30347852  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 91 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 27880121 - 27879934
Alignment:
Q  91 tcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaaataattagta 190  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  27880121 tcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaagttacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattagta 27880022  T
Q  191 taggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
     | |||||||||  | ||||| ||| |||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  27880021 caagtataataatccaaaatatttttatcgttatatggaatttttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttc 27879934  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 81 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 39882228 - 39882072
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||    
T  39882228 atacattttgtcaacaaatattattacacagtacgtcgacgtatttttgcaaaaaaattacatatgctaattttaacaatgagtgcatcttatactacaa 39882129  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttaga 238  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||| ||| ||| |||| ||| |||||||||||||    
T  39882128 ataattagtacaagtataat-aatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttaga 39882072  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 81 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 37371973 - 37371756
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaa--taataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattac 178  Q
    ||||||| ||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  37371973 atacattttgtcaacaaaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactac 37371874  T
Q  179 aaataattagtataggtataataaatccaaa----tacttta---------atcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaaga 265  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||    || ||||         |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37371873 aaataattagtacaagtataat-aatccaaataattagtttaacattgcatatcattatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaaga 37371775  T
Q  266 taatatgtttttccatatc 284  Q
    | |||| ||||| ||||||    
T  37371774 tgatattttttttcatatc 37371756  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 301 - 424
Target Start/End: Original strand, 14194248 - 14194373
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt-accgt 399  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||  ||||    
T  14194248 ttttttcatatcaaatttaaattataactacacttataactttaagataacataatataaaatctatacatttgattaaaaaagttttttatttccccgt 14194347  T
Q  400 gcttggcac-ggtcagtatactagta 424  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14194348 gcttggcacgggtcactatactagta 14194373  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 301 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 18115662 - 18115554
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaatttaccgtg 400  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  18115662 tttttccatgtcaaatttaaattaaaaccacacttataactttaagataacataatataaaatctatacacttgatca-aaaagttttttattttccgtg 18115564  T
Q  401 cttggcacgg 410  Q
    ||||||||||    
T  18115563 cttggcacgg 18115554  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 301 - 394
Target Start/End: Original strand, 15033944 - 15034037
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15033944 tttttcaatatcaaatttaaattataatcacacttttaactttaagataacataatataaaatctatacatttgatcaaaaaagttttttattt 15034037  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 301 - 410
Target Start/End: Original strand, 43525244 - 43525352
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaatttaccgtg 400  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  43525244 tttttccatgacaaatttaaattaaaaccacacttataactttaagataacataatataaaatctatacacttgatc-aaaaagttttttatttcccgtg 43525342  T
Q  401 cttggcacgg 410  Q
    ||||||||||    
T  43525343 cttggcacgg 43525352  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 301 - 380
Target Start/End: Original strand, 2262364 - 2262443
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaa 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2262364 tttttccatatcaaatttaaattataaccatacttataactttaagataacataatataaaatctatacatttgatcaaa 2262443  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 301 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 6088071 - 6087963
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaatttaccgtg 400  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||| ||  |||||    
T  6088071 tttttccatattaaatttaaattataaccacatttataactttaa-ataacataatataaaatctatatatttgatcaaatttttttttatttccccgtg 6087973  T
Q  401 cttggcacgg 410  Q
    ||||||||||    
T  6087972 cttggcacgg 6087963  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 301 - 423
Target Start/End: Original strand, 17872274 - 17872401
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttata--attttaagataacatagtataaaatctatatatttgatc-aaaaaagtttttaattt-ac 396  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||  |    
T  17872274 tttttccatatcaaattcaaattataaccatacttatataactttaagataacataatataaaatctatacacttgatcaaaaaaagttttttatttccc 17872373  T
Q  397 cgtgcttggcac-ggtcagtatactagt 423  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17872374 cgtgcttggcacaggtcactatactagt 17872401  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 301 - 383
Target Start/End: Original strand, 25544109 - 25544191
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaa 383  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  25544109 ttttttcataacgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaaaaa 25544191  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 309 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 4050653 - 4050573
Alignment:
Q  309 tatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagttttt 389  Q
    |||| ||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  4050653 tatcgaatttaaattataaacacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatgaaaaaagttttt 4050573  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 307 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 43448329 - 43448253
Alignment:
Q  307 catatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaa 383  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||    
T  43448329 catatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacaaaatataaaatctatacatatgatcaaaaaa 43448253  T

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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 26793222 - 26793170
Alignment:
Q  358 taaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaatttaccgtgcttggcacgg 410  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  26793222 taaaatctatacatttgatcaaaaaagttttttatttcccgtgcttggcacgg 26793170  T

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Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 3688822 - 3688775
Alignment:
Q  347 ataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  3688822 ataacataatataaaatctatacatatgatcaaaaaagttttttattt 3688775  T

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Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 394
Target Start/End: Original strand, 3877963 - 3878010
Alignment:
Q  347 ataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  3877963 ataacataatataaaatctatacatatgatcaaaaaagttttttattt 3878010  T

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Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 26831747 - 26831717
Alignment:
Q  15 agatgtatacatctgacactcactattatat 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26831747 agatgtatacatctgacactcactattatat 26831717  T

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Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 394
Target Start/End: Original strand, 8429958 - 8429994
Alignment:
Q  358 taaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  8429958 taaaatctatacatttgatcaaaaaagttttttattt 8429994  T

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Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10023969 - 10023933
Alignment:
Q  358 taaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  10023969 taaaatctatacatttgatcaaaaaagttttttattt 10023933  T

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Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 27879923 - 27879887
Alignment:
Q  358 taaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27879923 taaaatctatacatttgatcaaaaaagttttttattt 27879887  T

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Target: chr2 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 72 - 263
Target Start/End: Original strand, 40488856 - 40489047
Alignment:
Q  72 atgattaatatacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatctt 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40488856 atgattaatatacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgttaagtttaacaatgagtatatctt 40488955  T
Q  172 atattacaaataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 263  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40488956 atactacaaataattagtataagtataataaatctaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttaaaaatatatacaaaattaa 40489047  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 72 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24244923 - 24244735
Alignment:
Q  72 atgattaatatacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatctt 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24244923 atgattaatatacattatgtcaacaaataataatacacagtacctcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatttt 24244824  T
Q  172 atattacaaataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 263  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24244823 atactacaaataattagtataagt---ataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 24244735  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 81 - 284
Target Start/End: Original strand, 17687526 - 17687728
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  17687526 atacattatatcaacaaataataatatacagtacttcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgttaagtttaacaatgagtacatcttatagtacaa 17687625  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaatt---aagataatatgttttt 277  Q
    |||||||||||| ||   |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||| |||||    
T  17687626 ataattagtataagt---ataaatcc-aatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaacaagatgatattttttt 17687721  T
Q  278 ccatatc 284  Q
    |||||||    
T  17687722 ccatatc 17687728  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 81 - 263
Target Start/End: Original strand, 2881649 - 2881828
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  2881649 atacattatgtcaacaaataataatatacagtatgtcggagtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacattttatactacaa 2881748  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 263  Q
    |||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2881749 ataattagtataagt---ataaattcaaatactttaattgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 2881828  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 81 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 3642111 - 3641932
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3642111 atacattatgttaacaaataataatatacagtacgtcggagtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatcttatactacaa 3642012  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 263  Q
    ||||||| ||||   | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3642011 ataattaatata---agaataaatctaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttggatatttcaaaatatatacaaaattaa 3641932  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 81 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27508424 - 27508245
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  27508424 atacattatgtcaacaaataataatatacaatacgtcggcatatttttgcaaaaatattacatatgttaagtttaacaatgagtacatcttatactacaa 27508325  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 263  Q
    |||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27508324 ataattagtataagt---ataaattcaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaattaa 27508245  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Original strand, 39441846 - 39442041
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||     
T  39441846 atacattttgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaa-attacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacat 39441944  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||| | ||||||| | |||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  39441945 ataattagtacaagtataatga-tccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttc 39442041  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 278
Target Start/End: Original strand, 36047878 - 36048066
Alignment:
Q  89 tgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaaataattag 188  Q
    |||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||    
T  36047878 tgtcaacaaatattattacacagtacgttggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgactcttatactacaaataattag 36047977  T
Q  189 tataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    || | ||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  36047978 tacaagtataat-aatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttc 36048066  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Original strand, 28667352 - 28667549
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||    
T  28667352 atacattttgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatgctacaa 28667451  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaata-ctttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    ||||| |||| | ||||||| ||||||||||  ||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  28667452 ataatcagtacaagtataat-aatccaaatattttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaatgaagatgatatttttttc 28667549  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Original strand, 37826186 - 37826383
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||    
T  37826186 atacattttgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatgctacaa 37826285  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaata-ctttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    ||||| |||| | ||||||| ||||||||||  ||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  37826286 ataatcagtacaagtataat-aatccaaatattttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaatgaagatgatatttttttc 37826383  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 81 - 199
Target Start/End: Original strand, 2868541 - 2868659
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  2868541 atacattatgtcaacaaataataatatacagtatgtcggagtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacattttatactacaa 2868640  T
Q  181 ataattagtataggtataa 199  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  2868641 ataattagtataagtataa 2868659  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 89 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 21394401 - 21394213
Alignment:
Q  89 tgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaaataattag 188  Q
    |||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  21394401 tgtcaacaaatattattacacagtacatcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagattaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag 21394302  T
Q  189 tataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    || | ||||||| |||| ||||| ||| |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  21394301 tacaagtataat-aatctaaatatttttatcgttatatgcagtgtttagatattttaaaatatatacaaaaataagattatatatttttc 21394213  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 81 - 276
Target Start/End: Original strand, 41921349 - 41921544
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| | |||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||    
T  41921349 atacattctatcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttacaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatgctacaa 41921448  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaata-ctttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttt 276  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||  ||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  41921449 ataattagtacaagtataat-aatccaaatattttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaatgaagatgatatttttt 41921544  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 139 - 278
Target Start/End: Original strand, 24270184 - 24270322
Alignment:
Q  139 tacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaaataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttaga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||    
T  24270184 tacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattagtacaggtataataa-tccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttaga 24270282  T
Q  239 tatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  24270283 tatttcaaaatatatacaaaattaagattatatatttttc 24270322  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 299 - 424
Target Start/End: Original strand, 40489064 - 40489191
Alignment:
Q  299 tgtttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagat-aacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaatttacc 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  40489064 tgtttttccatatcaaatttaaattataataacacttataactttataattaacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaatttctc 40489163  T
Q  398 gtgcttggcac-ggtcagtatactagta 424  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  40489164 gtgtttggcacgggtcagtataccagta 40489191  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 303 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 24244718 - 24244597
Alignment:
Q  303 tttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagt-ttttaatttaccgtgc 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  24244718 tttccatatcaaatttaaattataaccacacttataattt-aagataacataatataaaatctatacatttgatcaaaaaagttttttattttcccgtgc 24244620  T
Q  402 ttggcacg-gtcagtatactagt 423  Q
    |||||||| |||| |||||||||    
T  24244619 ttggcacgtgtcactatactagt 24244597  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 147 - 278
Target Start/End: Original strand, 26955164 - 26955294
Alignment:
Q  147 ctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaaataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaa 246  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  26955164 ctaagtttaacaatgaatgcatcttatactacaaataattagtacaagtataataa-tctaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaa 26955262  T
Q  247 aatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  26955263 aatatatacaaaattaagatgatatttttttc 26955294  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 301 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 3641914 - 3641784
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagt-ttttaatttaccgt 399  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  3641914 tttttccttatcatatttaaattataaccacacttataactttaagataacacaatataaaatctatacatttaatcaaaaaagtattttatttccccgt 3641815  T
Q  400 gcttggcac-ggtcagtatactagtattgat 429  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  3641814 gcttggcacgggtcactatactagtagtgat 3641784  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 301 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 35608752 - 35608664
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagttttt 389  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  35608752 ttttttcatatgaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatttatacatttgatcaaaaaagttttt 35608664  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 199 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 35608826 - 35608742
Alignment:
Q  199 ataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttccatat 283  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||    
T  35608826 ataaatccagatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatcttttttttcatat 35608742  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 301 - 426
Target Start/End: Original strand, 2881847 - 2881967
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaatttaccgtg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||      ||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  2881847 tttttccatatcaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacacaatataaaatc------tttgatcaaaaaagtattttatttcccgtg 2881940  T
Q  401 cttggcac-ggtcagtatactagtatt 426  Q
    ||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  2881941 cttagcacgggtcactatactagtatt 2881967  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 301 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 27508227 - 27508120
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattta-ccgt 399  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  27508227 ttttttcatatcaaatttaaattataaccacaattataactttaa-ataacataatataaaatatatacatttgatcaaaaaagttatttatttacccgt 27508129  T
Q  400 gcttggcac 408  Q
    |||||||||    
T  27508128 gcttggcac 27508120  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 302 - 394
Target Start/End: Original strand, 24270317 - 24270409
Alignment:
Q  302 ttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||    
T  24270317 tttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacaaaatataaaatctatacatatgataaaaaaagttttttattt 24270409  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 35608892 - 35608837
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaat 136  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35608892 atacattatttcaacaaataatgatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaat 35608837  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 301 - 363
Target Start/End: Original strand, 17687717 - 17687779
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaat 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  17687717 tttttccatatcaaatttaaattataaccacagttataactttaagataacataatataaaat 17687779  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 21394218 - 21394136
Alignment:
Q  302 ttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataac-atagtataaaatctatatatttgatcaaaaaa 383  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| | | ||||||||||||| || |||| ||||||    
T  21394218 tttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacaaaaatataaaatctatacatatgataaaaaaa 21394136  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 394
Target Start/End: Original strand, 26955305 - 26955341
Alignment:
Q  358 taaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  26955305 taaaatctatacatttgatcaaaaaagttttttattt 26955341  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 394
Target Start/End: Original strand, 36048077 - 36048113
Alignment:
Q  358 taaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  36048077 taaaatctatacatttgatcaaaaaagttttttattt 36048113  T

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Target: chr4 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 20)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 81 - 284
Target Start/End: Original strand, 618490 - 618690
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  618490 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggagtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatcttatactacaa 618589  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttcca 280  Q
    |||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  618590 ataattagtataagt---ataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttcca 618686  T
Q  281 tatc 284  Q
    ||||    
T  618687 tatc 618690  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 81 - 263
Target Start/End: Original strand, 37532582 - 37532761
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  37532582 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggagtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatcttatactacaa 37532681  T
Q  181 ataa-ttagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 263  Q
    |||| ||||| || ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37532682 ataatttagt-taagt---ataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 37532761  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31920514 - 31920318
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  31920514 atacattttgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaa 31920415  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31920414 ataattagtacaagtataat-aatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttc 31920318  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 786960 - 786766
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  786960 atacattttgtcaacaaatattattatacagtacgtcagcgtatttttgcaaaaatattacgtatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaa 786861  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  786860 ataattagtacaagtataat-aatccaaatacttttatcgtta--tgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaagttaagatgatatttttttc 786766  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 35854951 - 35854756
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||    
T  35854951 atacattttgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaaaattacatatgctaagtttaacaatgaatgcatcttatactacaa 35854852  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  35854851 ataattagtacaagtataat-aatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatata-aaaattaagatgatatttttttc 35854756  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 89 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 49709213 - 49709025
Alignment:
Q  89 tgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaaataattag 188  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  49709213 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag 49709114  T
Q  189 tataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    || ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  49709113 tacaggtataat-aatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaattaaaattatatttttttc 49709025  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Original strand, 55560143 - 55560339
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||    
T  55560143 atacattttgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagtaaattacatatgctaagtttaacaatgaatgcatcttatactacaa 55560242  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  55560243 ataattagtacaagtataat-aatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttc 55560339  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Original strand, 49788004 - 49788201
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||    
T  49788004 atacattttgtcaacaaatattattacacagtatgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatgctacaa 49788103  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaata-ctttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||  ||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  49788104 ataattagtacaagtataat-aatccaaatattttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaatgaagatgatatttttttc 49788201  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 89 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1859713 - 1859565
Alignment:
Q  89 tgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaaataattag 188  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  1859713 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag 1859614  T
Q  189 tataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttaga 238  Q
    || | ||||||| |||||||||| ||| |||| ||| | |||| ||||||    
T  1859613 tacaagtataat-aatccaaatatttttatcgttatatacaatatttaga 1859565  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 301 - 394
Target Start/End: Original strand, 37532779 - 37532872
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  37532779 tttttccatatcaaatttaaattataaccatacttataactttaagataacataatataaaatctatacatttgatcaaaacagttttttattt 37532872  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 301 - 423
Target Start/End: Original strand, 618679 - 618802
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagt-ttttaatttaccgt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| | |||    
T  618679 tttttccatatcaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacacaatataaaatctatacatttgataaaaaaaatattttaattca-cgt 618777  T
Q  400 gcttggcac-ggtcagtatactagt 423  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||    
T  618778 gcttggcacgggtcactatactagt 618802  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 301 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 49709031 - 49708938
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  49709031 ttttttcatatcaaatttaaattataaccacaattataactttaagataacaaaatataaaatctatatatatgatcaaaaaagttttttattt 49708938  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 301 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 786772 - 786651
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaatttaccgtg 400  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  786772 ttttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatttatatttttgatcaaaaaagttttttattt-ccgtg 786674  T
Q  401 cttggcac-ggtcagtatactagt 423  Q
    | |||||| ||||| |||||||||    
T  786673 c-tggcacgggtcactatactagt 786651  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 38517541 - 38517436
Alignment:
Q  139 tacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaaataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttaga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||| ||| |||| ||| |||||||||||||    
T  38517541 tacatatgctaagtttaacaatgagtgaatcttatactacaaataattagtacaagtataat-aatccagatatttttatcgttatatgcaatgtttaga 38517443  T
Q  239 tatttca 245  Q
    |||||||    
T  38517442 tatttca 38517436  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 9281929 - 9281828
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||  |||  ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  9281929 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcagtgtatttttactaaaatatta-ttatattaaatttaataatgagtacatcttatactacaa 9281831  T
Q  181 ata 183  Q
    |||    
T  9281830 ata 9281828  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 202 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 6244846 - 6244770
Alignment:
Q  202 aatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||| ||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  6244846 aatccaaatatttttatcgttgtatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagattatatttttttc 6244770  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 301 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 31920324 - 31920241
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataa-ttttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaa 383  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  31920324 ttttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataacttttaagataaaataatataaaatctatacatatgatcaaaaaa 31920241  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 348
Target Start/End: Original strand, 42328860 - 42328900
Alignment:
Q  308 atatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagat 348  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  42328860 atatcaaatttaaattataactacacttataactttaagat 42328900  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 423
Target Start/End: Original strand, 55560350 - 55560415
Alignment:
Q  358 taaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaatttaccgtgcttggcac-ggtcagtatactagt 423  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  55560350 taaaatctatacatttgatcaaaaaagttttttgtttcccgtg-ttggcacgggtcactatactagt 55560415  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 6244759 - 6244723
Alignment:
Q  358 taaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  6244759 taaaatctatacatttgatcaaaaaagttttttattt 6244723  T

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Target: scaffold0888 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0888
Description:

Target: scaffold0888; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 81 - 284
Target Start/End: Original strand, 901 - 1100
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  901 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaatgtattacatatgctaagtttcacaatgagtacatcttatactacaa 1000  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttcca 280  Q
    |||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  1001 ataattagtataagt---ataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatat-tttttcca 1096  T

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Target: scaffold0888; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 301 - 406
Target Start/End: Original strand, 1089 - 1197
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgat--caaaaaagtttttaattt-acc 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   |||||||||||| ||||  ||    
T  1089 tttttccatatcaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatctatacatttgatagaaaaaaagttttttatttcccc 1188  T
Q  398 gtgcttggc 406  Q
    |||||||||    
T  1189 gtgcttggc 1197  T

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Target: chr1 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 29)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 81 - 284
Target Start/End: Original strand, 2453928 - 2454128
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||    
T  2453928 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttatcaatgagtgcatcttatactacaa 2454027  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttcca 280  Q
    |||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  2454028 ataattagtataagt---ataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttaaatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtttttttcca 2454124  T
Q  281 tatc 284  Q
    ||||    
T  2454125 tatc 2454128  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 81 - 283
Target Start/End: Original strand, 48239965 - 48240164
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  48239965 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggagtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatcttatactacaa 48240064  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttcca 280  Q
    ||||||| |||| ||   ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  48240065 ataattaatataagt---ataaatccaaatagtttaatcgttatgtgcaatgtttatatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttcca 48240161  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 81 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 7102013 - 7101817
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  7102013 atacattatgtcaacaaataataatatacaatacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacgtcttatactacaa 7101914  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttcca 280  Q
    |||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  7101913 ataattagtataagt---ataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaattatatacaaaattaagatgatat-tttttcca 7101818  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 81 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28961115 - 28960917
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  28961115 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcagcgtatttttgcaaaaatattacatatattaagtttaacaatgagtacatcttatactacaa 28961016  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttcca 280  Q
    ||||||||| || ||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  28961015 ataattagt-taagt---ataaatccaaatactttaatcgttatttgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatat-tttttcca 28960921  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Original strand, 25075031 - 25075226
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |    
T  25075031 atacattttgtcaacaaatattattatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactac-a 25075129  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  25075130 ataattagtacaagtataat-aatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttc 25075226  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Original strand, 48776502 - 48776698
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  48776502 atacattttgtcaacaaatattattatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttataatacaa 48776601  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    ||||||| || | ||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  48776602 ataattaatacaagtataataaa-acaaatactttaatcgatatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaaaatgatatttttttc 48776698  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 86 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16043402 - 16043207
Alignment:
Q  86 ttatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaaataat 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16043402 ttatgtcaacaaataataatatacaatacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgttaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataat 16043303  T
Q  186 tagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttccatatc 284  Q
    || |||| ||    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  16043302 taatataagt---ttaaatccaaatactttgatcgttatgtgcaatggttacatatttcaaaatatagacaaaattaagatgatatttttttctatatc 16043207  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 36206261 - 36206067
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||    
T  36206261 atacattatgttaacaaataataatatacaatacgtcagagtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaataggtacatcatatatgacaa 36206162  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||||| ||   ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  36206161 ataattagtataagt---ataaatctaaatactttaatcattatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaaaatgatatttttttc 36206067  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 84 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18147730 - 18147537
Alignment:
Q  84 cattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaaata 183  Q
    |||| |||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  18147730 cattttgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcatatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaata 18147631  T
Q  184 attagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  18147630 attagtacaagtataat-aatccaaatatttttatcgctatgtgcaatgcttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttc 18147537  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 16041069 - 16040873
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  16041069 atacattttgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtaattttgcaaaaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaa 16040970  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  16040969 ataattagtacaagtataat-aatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatataaaattaagatgatatttttttc 16040873  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Original strand, 37391320 - 37391515
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||    
T  37391320 atacattttgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaaaattacatatgctaagtttaacaatgaatgcatcttatactacaa 37391419  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  37391420 ataattagtacaagtataat-aatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatata-aaaattaagatgatatttttttc 37391515  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 52499776 - 52499580
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || ||    
T  52499776 atacattttgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgaatgcatcttatactataa 52499677  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  52499676 ataattagtacaagtataat-aatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttc 52499580  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 36518983 - 36518787
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| |||||    
T  36518983 atacattttgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaaccatgaatgcatcttatactacaa 36518884  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  36518883 ataattagtacaagtataat-aatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaaaatgatatttttttc 36518787  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 278
Target Start/End: Original strand, 16748848 - 16749036
Alignment:
Q  89 tgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaaataattag 188  Q
    |||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  16748848 tgtcaacaaatattattacgcagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaataatgagtgcatcttatactacaaataattag 16748947  T
Q  189 tataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    || | ||||||| |||||||||| ||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  16748948 tacaagtataat-aatccaaatatttttatcgttatattcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaaaattatatttttttc 16749036  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 81 - 262
Target Start/End: Original strand, 6312167 - 6312347
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || || || |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||    
T  6312167 atacattttgtcaacaaatattattacacggtacgtcggcatatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgcgtgcatcttatactacaa 6312266  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaatta 262  Q
    |||||||||| |  |||||| |||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6312267 ataattagtacaaatataat-aatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaatta 6312347  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 301 - 404
Target Start/End: Original strand, 48240154 - 48240257
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaatttaccgtg 400  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  48240154 tttttccatataaaatttaaattataatcacacttataactttaagataacacaatataaaatctatacatttgatcaaaaaagtattttatttcccgtg 48240253  T
Q  401 cttg 404  Q
    ||||    
T  48240254 cttg 48240257  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 301 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 12450822 - 12450740
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaa 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12450822 tttttccatatcaaatttaaattatagccacacttataactttaagataacataatataaaatctatatatttgataaaaaaa 12450740  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 301 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 16043218 - 16043109
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaatttaccgtg 400  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||  |||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  16043218 tttttctatatcaaattgaaattataatcacacttttaactttaaaataacataatataaaatctatacattttatcaaaaaagttttttatttcccgtg 16043119  T
Q  401 cttggcacgg 410  Q
    ||||||||||    
T  16043118 cttggcacgg 16043109  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 301 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 28960928 - 28960802
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt-accgt 399  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    ||||| ||||  ||||    
T  28960928 tttttccatatcaaatttcaattataagtacacttataactttaagataacataatataaaatctatacatttgatcaaattttttttttatttccccgt 28960829  T
Q  400 gcttggcac-ggtcagtatactagtat 425  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28960828 gcttggcacgggtcactatactagtat 28960802  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 301 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 36206073 - 36205972
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaatttaccgtg 400  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  36206073 ttttttcatatcaaatttaaattatagctacatttataactttaagataatacaatataaaatctatatatttgatcaaaatagttttttatttcccgtg 36205974  T
Q  401 ct 402  Q
    ||    
T  36205973 ct 36205972  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 131 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12450961 - 12450841
Alignment:
Q  131 aaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaaataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaa 230  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||   ||||||||         ||||| || ||| ||    
T  12450961 aaaagtattacatatgctaagtttaaaaatgaatacatcttatactacaaataattagtataagt---ataaatcc---------aatcgttacgtggaa 12450874  T
Q  231 tgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12450873 tgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 12450841  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 309 - 394
Target Start/End: Original strand, 25075228 - 25075313
Alignment:
Q  309 tatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    |||| ||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  25075228 tatcgaatttaaattataatcacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaaaaagttttttattt 25075313  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 315 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16040866 - 16040788
Alignment:
Q  315 atttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  16040866 atttaaattataaccacagttataactttaagataacataatataaaatctatatatatgat-aaaaaagttttttattt 16040788  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 383
Target Start/End: Original strand, 16749030 - 16749112
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaa 383  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||| || | |||||||||    
T  16749030 ttttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacaaaatataaaatctatacatataatcaaaaaa 16749112  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 383
Target Start/End: Original strand, 48776692 - 48776774
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaa 383  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| || | |||||||||    
T  48776692 ttttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataatataatataaaatctatacatattatcaaaaaa 48776774  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 301 - 362
Target Start/End: Original strand, 2454117 - 2454179
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacac-ttataattttaagataacatagtataaaa 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||| |||||||    
T  2454117 tttttccatatcaaatttaaattataaccaccctttttaattttaagataacataatataaaa 2454179  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 301 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 7101825 - 7101746
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacactt----ataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgat 376  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  7101825 tttttccatgtcaaatttaaattataaccacacttataaataactttaaaataacataatataaaatctatacatttgat 7101746  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 394
Target Start/End: Original strand, 6312374 - 6312410
Alignment:
Q  358 taaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  6312374 taaaatctatacatttgatcaaaaaagttttttattt 6312410  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 18147526 - 18147490
Alignment:
Q  358 taaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18147526 taaaatctatatatttaatcaaaaaagttttttattt 18147490  T

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Target: scaffold0017 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 72 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 185626 - 185432
Alignment:
Q  72 atgattaatatacattatgtcaacaaataataata---tacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatat 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  185626 atgattaatatacattatgtcaacaaataataataatatacagtacgtcggcttatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgaatacat 185527  T
Q  169 cttatattacaaataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 263  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  185526 cttatactacaaataattagtataagtataataaatacaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaattaa 185432  T

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Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 301 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 185414 - 185329
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtt 386  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  185414 ttttttcatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacataatataaaatctatacatttgataaaaaaagtt 185329  T

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Target: chr8 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 81 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13424675 - 13424496
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||    
T  13424675 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttatcaatgagttcatcttatactacaa 13424576  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 263  Q
    |||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13424575 ataattagtataagt---ataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 13424496  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 81 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14713324 - 14713145
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  14713324 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggagtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaataagtacatcttatactacaa 14713225  T
Q  181 ataattagtataggtata-ataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 263  Q
    ||||||    ||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14713224 ataatt----tagttaaatataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 14713145  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14764671 - 14764478
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||    
T  14764671 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacctcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttgacaaggagtacatcttatactacaa 14764572  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||   || | ||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14764571 ataat---tacaagtataa-caatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagattatatttttttc 14764478  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Original strand, 31979699 - 31979895
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  31979699 atacattttgtcaacaaatattattatacagtaagtcggcgtatttttgcaaaaatataacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaa 31979798  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31979799 ataattagtacaagtataat-aatccaaatactttgatcgttatatgcaatgtttagctattttgaaatatatacaaaattaagattatatttttttc 31979895  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 89 - 278
Target Start/End: Original strand, 21114858 - 21115047
Alignment:
Q  89 tgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaaataattag 188  Q
    |||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  21114858 tgtcaacaaatattattacacaatacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag 21114957  T
Q  189 tataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatac-aaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  21114958 tataggtataat-aatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaaattaagattatatatttttc 21115047  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Original strand, 25219743 - 25219940
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaa-taataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattaca 179  Q
    ||||||| |||||||||| || || || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  25219743 atacattttgtcaacaaaatattattacatagtacgtcggcgtatttttgcaaaaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgaatcttatactaca 25219842  T
Q  180 aataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  25219843 aataattagtacaagtataat-aatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttc 25219940  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 81 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 7780789 - 7780600
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  7780789 atacattttgtcaataaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatactaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaa 7780690  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatat 271  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7780689 ataattagtaaaagtataat-aatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatat 7780600  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 81 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 7820879 - 7820690
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  7820879 atacattttgtcaataaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatactaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaa 7820780  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatat 271  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7820779 ataattagtaaaagtataat-aatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatat 7820690  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 81 - 246
Target Start/End: Original strand, 33862559 - 33862724
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttt-tgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattaca 179  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||    
T  33862559 atacattttgtcaacaaatattattatacattaagtcagcgtattttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatacaaca 33862658  T
Q  180 aataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaa 246  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  33862659 aataattagtacaagtataat-aatccaaatacttttatcgttatatacaatgtttagatatttcaa 33862724  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 144 - 278
Target Start/End: Original strand, 37915275 - 37915408
Alignment:
Q  144 atgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaaataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatattt 243  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||    
T  37915275 atgctaagtttaacaatgagtgcatcttatacaacaaataattagtacaagtataataa-tccaaatacttttatcgttatatacaatgtttagatattt 37915373  T
Q  244 caaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  37915374 caaaatatatacaaaattaagatgatatttttttc 37915408  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 30306214 - 30306105
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  30306214 atacattttgtcaacaaatattattacacagtacgtcagcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaa 30306115  T
Q  181 ataattagta 190  Q
    ||||||||||    
T  30306114 ataattagta 30306105  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 301 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 14713126 - 14713033
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  14713126 tttttccatatcaaatttaaattataaccatacttataactttaagataacataatataaaatctatacatttgatcaaaatagttttttattt 14713033  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 301 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 13424477 - 13424377
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaatttaccgtg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||| |||||    
T  13424477 tttttccatatcaaatttaaattataaccacacttttaactttaagataacataatataaaatctatacatttgattaaaaaagtgttttatttcccgtg 13424378  T
Q  401 c 401  Q
    |    
T  13424377 c 13424377  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 301 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 14764484 - 14764392
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  14764484 ttttttcacatcgaatttaaattataaca-caattataattttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaaaaagttttttattt 14764392  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 201 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 30306069 - 30305992
Alignment:
Q  201 aaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  30306069 aaatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttc 30305992  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 301 - 394
Target Start/End: Original strand, 31979889 - 31979982
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||| |||| ||||    
T  31979889 ttttttcatttcaaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatatataatctatatatataatcaaaaaagctttttattt 31979982  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 302 - 394
Target Start/End: Original strand, 21115042 - 21115134
Alignment:
Q  302 ttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||    
T  21115042 tttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacaaaatataaaatctatacatatgataaaaaaagttttttattt 21115134  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 301 - 383
Target Start/End: Original strand, 33863106 - 33863189
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataa-ttttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaa 383  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||    
T  33863106 ttttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataacttttaagataacataatataaaatctatacatatgataaaaaaa 33863189  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 301 - 383
Target Start/End: Original strand, 37915402 - 37915485
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataa-ttttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaa 383  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||    
T  37915402 ttttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataacttttaagataacataatataaaatctatacatatgataaaaaaa 37915485  T

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Target: scaffold0012 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 81 - 263
Target Start/End: Original strand, 97996 - 98174
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  97996 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacgtcttatactacaa 98095  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 263  Q
    ||||||||| || ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  98096 ataattagt-taagt---ataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 98174  T

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Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 301 - 423
Target Start/End: Original strand, 98192 - 98316
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt-accgt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||  ||||    
T  98192 tttttccatatcaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatctatacatttgatgaaaaaagttttttatttccccgt 98291  T
Q  400 gcttggcac-ggtcagtatactagt 423  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||    
T  98292 gcttggcacgggtcactatactagt 98316  T

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Target: chr6 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 86 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12518653 - 12518459
Alignment:
Q  86 ttatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaaataat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12518653 ttatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataat 12518554  T
Q  186 tagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttccatat 283  Q
    || |||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||| ||||    
T  12518553 taatataagt---ataaatccaaatactttgatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatttatacaaaattaggatgatatttttttctatat 12518459  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 81 - 263
Target Start/End: Original strand, 4221182 - 4221361
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  4221182 atacattatgtcaacaaataataatatacagtatgtcggagtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacattttatactacaa 4221281  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 263  Q
    |||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4221282 ataattagtataagt---ataaatacaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 4221361  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 81 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 10186597 - 10186393
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtattttt-gcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattaca 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  10186597 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacttcggcgtattttttgcaaaaatattacatatgttaagtttaacaatgagtacatcttatactaca 10186498  T
Q  180 aataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaatt---aagataatatgtttt 276  Q
    ||||||||||||| ||   ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||| ||||    
T  10186497 aataattagtataagt---ataaatccaaatattttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaacaagatgatatttttt 10186401  T
Q  277 tccatatc 284  Q
    ||||||||    
T  10186400 tccatatc 10186393  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 81 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12516432 - 12516230
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  12516432 atacattttgtcaacaaatattattttacagtacgtcggcgtatttctgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaa 12516333  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttcca 280  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  12516332 ataattagtacaagtataat-aatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatattttttttca 12516234  T
Q  281 tatc 284  Q
    ||||    
T  12516233 tatc 12516230  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 81 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 30881106 - 30880927
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||    
T  30881106 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtccgcgtatttttgcaaaaatattgcatatgctaagtttaacaataattacatcttatactacaa 30881007  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 263  Q
    |||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30881006 ataattagtataagt---ataaatccaaatactttaatcgttatatgcaatgtttagatatttttaaatatatacaaaattaa 30880927  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 81 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 15330583 - 15330389
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||| |||||    
T  15330583 atacattttgtcaacaaatattattatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatactaagtttaacaatgagtgcattttatactacaa 15330484  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttt 276  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15330483 ataattagtacaagtataat-aatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttaaatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttt 15330389  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Original strand, 31512667 - 31512863
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  31512667 atacattttgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaa 31512766  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31512767 ataattagtacaagtataat-aatccaaatatttttatcgttatatgcaacgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttc 31512863  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Original strand, 29642529 - 29642725
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  29642529 atacattttgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaa 29642628  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  29642629 ataattagtacaagtataat-aatccaaatatttttatcgttgtatgcaacgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatcatatttttttc 29642725  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 89 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 24195938 - 24195757
Alignment:
Q  89 tgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaaataattag 188  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||| |||||     
T  24195938 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagttttacaatgagtgcatcttatactacaaaaaattaa 24195839  T
Q  189 tataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatat 271  Q
    || | ||||||| |||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24195838 tacaagtataat-aatcaaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagattatat 24195757  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 95 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14906527 - 14906360
Alignment:
Q  95 caaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaaataattagtatagg 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||   ||| ||||||||   | |||| |    
T  14906527 caaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatactgagttgaacaatgagtacattacatactacaaatatacattataag 14906428  T
Q  195 tataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaaga 265  Q
    |   ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  14906427 t---atagatccaaatactttaatcattatgtgcaatatttagatatttcaaaatatttacagaattaaga 14906360  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 301 - 402
Target Start/End: Original strand, 4221380 - 4221481
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaatttaccgtg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  4221380 tttttccatatcaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatctatacatttgatcaaaaaagtattttatttcccgtg 4221479  T
Q  401 ct 402  Q
    ||    
T  4221480 ct 4221481  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 301 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 12518469 - 12518360
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaatttaccgtg 400  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  12518469 tttttctatattaaatttaaattataatcacacttttaactttaagataacataatataaaatctatacatttgatcaaaaaagttttttatttgtcgtg 12518370  T
Q  401 cttggcacgg 410  Q
    ||||||||||    
T  12518369 cttggcacgg 12518360  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 301 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 15330394 - 15330301
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  15330394 ttttttcatatccaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaaaaagttttttattt 15330301  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 301 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 12516241 - 12516148
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  12516241 ttttttcatatcgaatttaaattataaacacaattataactttaagatatcataatataaaatctatatatatgatcaaaaaagttttttattt 12516148  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 301 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 30880908 - 30880780
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttata--attttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaa-aaaagtttttaattt-ac 396  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||  |    
T  30880908 tttttccatatcaaattcaaattataaccatacttatataactttaagataacataatataaaatctatacacttgatcaaaaaaagttttttatttccc 30880809  T
Q  397 cgtgcttggcac-ggtcagtatactagta 424  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30880808 cgtgcttggcacgggtcactatactagta 30880780  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 307 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 24195750 - 24195663
Alignment:
Q  307 catatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  24195750 catatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacaaaatataaaatctatacatatgatcaaaaaagttttttattt 24195663  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 301 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 10186404 - 10186342
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaat 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  10186404 tttttccatatcaaatttaaattataaccacagttataactttaagataacataatataaaat 10186342  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 394
Target Start/End: Original strand, 29642736 - 29642772
Alignment:
Q  358 taaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  29642736 taaaatctatacatttgatcaaaaaagttttttattt 29642772  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 394
Target Start/End: Original strand, 31512874 - 31512910
Alignment:
Q  358 taaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  31512874 taaaatctatacatttgatcaaaaaagttttttattt 31512910  T

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Target: scaffold0073 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 4)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23638 - 23442
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  23638 atacattttgtcaacaaatattattatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatattacaa 23539  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  23538 ataattagtacaagtataat-aatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttatatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttc 23442  T

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Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18503 - 18307
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  18503 atacattttgtcaacaaatattattatacagtaagtcggcgtatttttgcaaaaatataacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaa 18404  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  18403 ataattagtacaagtataat-aatccaaatactttgatcgttatatgcaatgtttagctattttgaaatatatacaaaattaagattatatttttttc 18307  T

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Target: scaffold0073; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 301 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 18313 - 18220
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||| |||| ||||    
T  18313 ttttttcatttcaaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatatataatctatatatataatcaaaaaagctttttattt 18220  T

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Target: scaffold0073; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 301 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 23448 - 23355
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||    
T  23448 ttttttcatatcgagtttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgattaaaaaagttttttattt 23355  T

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Target: scaffold0025 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 81 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 13536 - 13337
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  13536 atacattatgttaacaaataataatatacagtacgtcggcttatttttgcaaaaatattac-tatgctaagtttaacaatgagtacatcttatactacaa 13438  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttcca 280  Q
    |||||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  13437 ataattagtataagtataa---atccaaatattttaatcgttacgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatattgttttcca 13341  T

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Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 13347 - 13248
Alignment:
Q  302 ttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatc--aaaaaagtttttaatttaccgt 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||| |   ||||||||  ||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  13347 ttttccatatcaaatttaaattataacgacacttataactt--agataacataatcccaaatctattcatttgatcaaaaaaaagttttttatttcccgt 13250  T

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Target: scaffold0022 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 81 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 125269 - 125091
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  125269 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgttaagcttaacaatgagtacatcttatactacaa 125170  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 263  Q
    ||||||||| || ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  125169 ataattagt-taagt---ataaatccaaatactttaatcgctatgtgcaatgtttagatattgcaaaatatatacaaaattaa 125091  T

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Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 301 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 125072 - 124948
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaatttaccgtg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  125072 tttttccatatcaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatctatacatttgatcaaaaaagttttttattacccgtg 124973  T
Q  401 cttggcac-ggtcagtatactagta 424  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||    
T  124972 cttggcacagatcactatactagta 124948  T

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Target: scaffold0499 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0499
Description:

Target: scaffold0499; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 81 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 10190 - 10001
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||    
T  10190 atacattttgtcaacaaatattattatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtataacaatgagtgcatcttatactacaa 10091  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatat 271  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10090 ataattagtacaagtataat-aatccaaatactttcatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatat 10001  T

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Target: scaffold0550 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Original strand, 4704 - 4900
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  4704 atacattttgtcaacaaatattattacatagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaa 4803  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  4804 ataattagtacaagtataat-aatccaaatatttttatcgttatatgcaatgttttgatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttc 4900  T

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Target: scaffold0550; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 394
Target Start/End: Original strand, 4911 - 4947
Alignment:
Q  358 taaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  4911 taaaatctatacatttgatcaaaaaagttttttattt 4947  T

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Target: scaffold0090 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Original strand, 50115 - 50311
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  50115 atacattttgtcaacaaatattattacgcagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaa 50214  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  50215 ataattagtacaagtataat-aatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaataaagatgatatttttttc 50311  T

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Target: scaffold0003 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 164572 - 164375
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaa-tattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattaca 179  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  164572 atacattttgtcaacaaatattattatacagtacgtcgacgtatttttgcaaaaaatattacgtatgttaagtttaacaatgagtgcatcttatactaca 164473  T
Q  180 aataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  164472 aataattagtacaagtataataa-tccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaattatatacaaaattaagatgatatttttttc 164375  T

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Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 172687 - 172490
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaa-tattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattaca 179  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  172687 atacattttgtcaacaaatattattatacagtacgtcgacgtatttttgcaaaaaatattacgtatgttaagtttaacaatgagtgcatcttatactaca 172588  T
Q  180 aataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  172587 aataattagtacaagtataataa-tccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaattatatacaaaattaagatgatatttttttc 172490  T

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Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 301 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 164381 - 164288
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  164381 ttttttcatatcaaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatatatatgatcaaaaaagttttttattt 164288  T

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Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 301 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 172496 - 172403
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  172496 ttttttcatatcaaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatatatatgatcaaaaaagttttttattt 172403  T

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Target: scaffold0029 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 278
Target Start/End: Original strand, 133050 - 133238
Alignment:
Q  89 tgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaaataattag 188  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  133050 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaacttacgtatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag 133149  T
Q  189 tataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    || | ||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  133150 tacaagtataat-aatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagattatatatttttc 133238  T

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Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 383
Target Start/End: Original strand, 133245 - 133314
Alignment:
Q  314 aatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaa 383  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||| || |||| ||||||    
T  133245 aatttaaattataaccacaattataaatttaagataacaaaatataaaatctatacatatgataaaaaaa 133314  T

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Target: scaffold0002 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 91 - 278
Target Start/End: Original strand, 310880 - 311066
Alignment:
Q  91 tcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaaataattagta 190  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  310880 tcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaacttacgtatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattagta 310979  T
Q  191 taggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
     | ||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  310980 catgtataat-aatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagattatatatttttc 311066  T

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Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 301 - 371
Target Start/End: Original strand, 331437 - 331507
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatat 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  331437 ttttttcatatcaaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatatat 331507  T

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Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 383
Target Start/End: Original strand, 311073 - 311142
Alignment:
Q  314 aatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaa 383  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||| || |||| ||||||    
T  311073 aatttaaattataaccacaattataaatttaagataacaaaatataaaatctatacatatgataaaaaaa 311142  T

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Target: scaffold0532 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0532
Description:

Target: scaffold0532; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 111 - 263
Target Start/End: Original strand, 3522 - 3671
Alignment:
Q  111 gtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaaataattagtataggtataataaatccaaat 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| ||   |||||||||||     
T  3522 gtacgtcgccgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgaatacatcttatactacaaataattattataagt---ataaatccaaag 3618  T
Q  211 actttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 263  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3619 actttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 3671  T

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Target: scaffold0532; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 301 - 423
Target Start/End: Original strand, 3689 - 3815
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatc--aaaaaagtttttaatttac-c 397  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||  |||||||||||| |||| | |    
T  3689 ttttttcatatcaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatctacacattcgatcaaaaaaaagttttttattttctc 3788  T
Q  398 gtgcttggcac-ggtcagtatactagt 423  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  3789 gtgtttggcacgggtcactatactagt 3815  T

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Target: scaffold0118 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Original strand, 29741 - 29940
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| |  |||||||| |||||    
T  29741 atacattttgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatacaaagtttaacaatgaatgaatcttatactacaa 29840  T
Q  181 ataattagtataggtataataaatccaaatactttaatc---ggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgttttt 277  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29841 ataattagtacaagtataat-aatccaaatatttttatcattattatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatattttttt 29939  T

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Target: scaffold0118; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 394
Target Start/End: Original strand, 29951 - 29987
Alignment:
Q  358 taaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  29951 taaaatctatacatttgatcaaaaaagttttttattt 29987  T

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Target: scaffold0472 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 112 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 13477 - 13312
Alignment:
Q  112 tacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaaataattagtataggtataataaatccaaata 211  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||  |||||    
T  13477 tacgtcgacgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattagtacaagtataat-aatttaaata 13379  T
Q  212 ctttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
     ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  13378 tttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttc 13312  T

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Target: scaffold0472; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 13301 - 13265
Alignment:
Q  358 taaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  13301 taaaatctatacatttgatcaaaaaagttttttattt 13265  T

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Target: scaffold1370 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold1370
Description:

Target: scaffold1370; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 112 - 276
Target Start/End: Original strand, 1375 - 1538
Alignment:
Q  112 tacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaaataattagtataggtataataaatccaaata 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||  |  |||| ||   |||||||||||||    
T  1375 tacgtcggcgtatttttgccaaaatattacatatgctaagtttaacaataagtacatcttatactacaaatatattttataagt---ataaatccaaata 1471  T
Q  212 ctttaatcggtatgtgcaatgtttag--atatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgtttt 276  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1472 ctttaatctttatgtgcaatgtttagatatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttt 1538  T

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Target: scaffold1370; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 301 - 423
Target Start/End: Original strand, 1533 - 1657
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt-accgt 399  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||    
T  1533 ttttttcatgtcaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttcatttcttcgt 1632  T
Q  400 gcttggcac-ggtcagtatactagt 423  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||    
T  1633 gcttggcacgggtcactatactagt 1657  T

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Target: scaffold0196 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0196
Description:

Target: scaffold0196; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 81 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23389 - 23283
Alignment:
Q  81 atacattatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaa 180  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  23389 atacattatgtcagcaaataataatatacagtacgtcgccttatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatcttatactacaa 23290  T
Q  181 ataatta 187  Q
    |||||||    
T  23289 ataatta 23283  T

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Target: scaffold0196; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 301 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 23247 - 23123
Alignment:
Q  301 tttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagt-ttttaatttaccgt 399  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| ||| ||||    
T  23247 ttttttcatatgaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatctatacattcgattaaaaaagttttttattttcccgt 23148  T
Q  400 gcttggcac-ggtcagtatactagt 423  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||    
T  23147 gcttggcacgggtcactatactagt 23123  T

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Target: scaffold0107 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 112 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 45020 - 44856
Alignment:
Q  112 tacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaaataattagtataggtataataaatccaaata 211  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||  |  |||| ||   |||||||||||||    
T  45020 tacgtcggtgtatttttgccaaaatattacatatgctaagtttaacaataagtacatcttatactacaaatatattttataagt---ataaatccaaata 44924  T
Q  212 ctttaatcggtatgtgcaatgtttag--atatttcaaaatatatacaaaattaagataatatgttttt 277  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  44923 ctttaatctttatgtgcaatgtttagatatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatattttttt 44856  T

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Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 311 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 44852 - 44752
Alignment:
Q  311 tcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacatagtataaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt-accgtgcttggcacg 409  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  44852 tcaaatttaaattataatcagacttataactttaagataacataatataaaatcaatatatttgatcaaaaaagttttttatttccccgtgcttggcacg 44753  T
Q  410 g 410  Q
    |    
T  44752 g 44752  T

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Target: scaffold0636 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0636
Description:

Target: scaffold0636; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 145 - 278
Target Start/End: Original strand, 1 - 133
Alignment:
Q  145 tgctaagtttaacaatgagtatatcttatattacaaataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttc 244  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  1 tgctaagtttaacaatgaatgcatcttatactacaaataattagtacaagtataataa-tccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttc 99  T
Q  245 aaaatatatacaaaattaagataatatgtttttc 278  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  100 aaaatatatacaaaattaagatgatatttttttc 133  T

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Target: scaffold0582 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0582
Description:

Target: scaffold0582; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 167 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10378 - 10269
Alignment:
Q  167 atcttatattacaaataattagtataggtataataaatccaaatactttaatcggtatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat 266  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10378 atcttatactacaaataattagtacaagtataataa-tccaaatatttttatcgttatatgcaacgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat 10280  T
Q  267 aatatgttttt 277  Q
     |||| |||||    
T  10279 gatattttttt 10269  T

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Target: scaffold0582; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10257 - 10221
Alignment:
Q  358 taaaatctatatatttgatcaaaaaagtttttaattt 394  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  10257 taaaatctatacatttgatcaaaaaagttttttattt 10221  T

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