View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21279_low_11 (Length: 504)

Name: NF21279_low_11
Description: NF21279
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21279_low_11
NF21279_low_11
[»] chr2 (48 HSPs)
chr2 (1-186)||(2294647-2294832)
chr2 (183-369)||(40613820-40614006)
chr2 (187-369)||(36168836-36169018)
chr2 (187-369)||(38273061-38273242)
chr2 (187-365)||(17473020-17473198)
chr2 (192-365)||(28863460-28863633)
chr2 (185-365)||(13438341-13438521)
chr2 (187-365)||(7465657-7465835)
chr2 (187-357)||(9058480-9058650)
chr2 (187-369)||(20700815-20700997)
chr2 (187-369)||(42257193-42257375)
chr2 (187-369)||(2533124-2533305)
chr2 (187-365)||(10249304-10249482)
chr2 (370-492)||(2294825-2294947)
chr2 (11-152)||(2322076-2322217)
chr2 (192-365)||(19930742-19930915)
chr2 (185-365)||(28381577-28381757)
chr2 (187-365)||(32505570-32505748)
chr2 (187-358)||(33436029-33436200)
chr2 (186-365)||(40701477-40701656)
chr2 (187-365)||(30915463-30915641)
chr2 (186-365)||(4060684-4060863)
chr2 (185-369)||(43490119-43490303)
chr2 (187-365)||(38882733-38882913)
chr2 (187-369)||(26891422-26891604)
chr2 (187-313)||(33436211-33436337)
chr2 (187-369)||(45097653-45097835)
chr2 (187-365)||(5574422-5574588)
chr2 (187-369)||(13365351-13365535)
chr2 (193-369)||(3439985-3440161)
chr2 (207-366)||(2997408-2997567)
chr2 (186-330)||(17819961-17820105)
chr2 (86-152)||(2304461-2304527)
chr2 (187-369)||(38732354-38732536)
chr2 (187-369)||(17823784-17823970)
chr2 (192-316)||(41575142-41575267)
chr2 (231-369)||(3737987-3738125)
chr2 (188-368)||(44151924-44152108)
chr2 (185-353)||(27864702-27864857)
chr2 (277-367)||(41758677-41758767)
chr2 (370-433)||(2304667-2304730)
chr2 (187-365)||(15428663-15428840)
chr2 (439-492)||(2310704-2310757)
chr2 (187-367)||(21301420-21301600)
chr2 (237-369)||(3034901-3035033)
chr2 (214-269)||(42849794-42849848)
chr2 (321-369)||(1750414-1750462)
chr2 (214-258)||(16096870-16096913)
[»] chr3 (49 HSPs)
chr3 (187-369)||(51419278-51419460)
chr3 (187-369)||(47531865-47532047)
chr3 (187-372)||(11347837-11348022)
chr3 (185-369)||(26141448-26141634)
chr3 (186-369)||(20764833-20765016)
chr3 (185-365)||(53982009-53982189)
chr3 (186-365)||(33644199-33644378)
chr3 (187-369)||(41189682-41189864)
chr3 (192-365)||(31456694-31456867)
chr3 (187-365)||(49607414-49607592)
chr3 (191-365)||(52629304-52629478)
chr3 (187-369)||(8076393-8076575)
chr3 (187-365)||(54868817-54868995)
chr3 (187-369)||(33118768-33118951)
chr3 (187-365)||(17470405-17470583)
chr3 (187-369)||(24699873-24700054)
chr3 (187-369)||(35536626-35536808)
chr3 (190-369)||(26754698-26754877)
chr3 (192-369)||(30801651-30801828)
chr3 (187-365)||(9562999-9563177)
chr3 (187-369)||(8956762-8956944)
chr3 (187-369)||(14623757-14623939)
chr3 (187-365)||(36707350-36707524)
chr3 (187-367)||(48375626-48375806)
chr3 (186-369)||(45058471-45058653)
chr3 (209-370)||(36331246-36331407)
chr3 (192-367)||(13897975-13898150)
chr3 (192-365)||(48587023-48587186)
chr3 (187-365)||(11095289-11095453)
chr3 (187-370)||(35965699-35965874)
chr3 (187-296)||(27714882-27714991)
chr3 (187-304)||(11907371-11907488)
chr3 (187-367)||(1758379-1758558)
chr3 (185-364)||(39670010-39670188)
chr3 (190-369)||(42823114-42823293)
chr3 (187-313)||(41080709-41080833)
chr3 (272-367)||(43746424-43746519)
chr3 (187-369)||(35093585-35093767)
chr3 (273-369)||(21746106-21746202)
chr3 (187-246)||(36331419-36331478)
chr3 (191-365)||(25395256-25395429)
chr3 (192-369)||(25407065-25407243)
chr3 (215-276)||(40480853-40480913)
chr3 (301-365)||(27714825-27714889)
chr3 (214-269)||(53581793-53581847)
chr3 (331-376)||(11140954-11140999)
chr3 (341-369)||(45127000-45127028)
chr3 (214-270)||(52629938-52629993)
chr3 (321-369)||(54246200-54246248)
[»] chr1 (40 HSPs)
chr1 (187-369)||(32813247-32813429)
chr1 (185-365)||(27564657-27564837)
chr1 (187-353)||(38632255-38632421)
chr1 (187-369)||(51898601-51898783)
chr1 (185-365)||(37649196-37649376)
chr1 (186-365)||(9474798-9474977)
chr1 (186-365)||(48716204-48716383)
chr1 (187-365)||(2581915-2582093)
chr1 (187-365)||(41758805-41758983)
chr1 (185-365)||(47452242-47452422)
chr1 (187-367)||(49811447-49811627)
chr1 (187-365)||(3000319-3000497)
chr1 (187-369)||(37926356-37926538)
chr1 (187-365)||(38595154-38595332)
chr1 (187-358)||(50630458-50630629)
chr1 (187-369)||(45044478-45044660)
chr1 (185-369)||(26440732-26440906)
chr1 (187-365)||(8346309-8346488)
chr1 (186-369)||(41608411-41608594)
chr1 (186-369)||(50590918-50591101)
chr1 (187-365)||(43132-43310)
chr1 (187-367)||(23597011-23597191)
chr1 (192-316)||(44548347-44548471)
chr1 (187-369)||(5958918-5959100)
chr1 (185-369)||(6260868-6261052)
chr1 (192-365)||(26274437-26274607)
chr1 (192-369)||(11152296-11152472)
chr1 (188-369)||(44453980-44454165)
chr1 (185-369)||(47748441-47748624)
chr1 (217-336)||(13414791-13414910)
chr1 (185-369)||(3302451-3302635)
chr1 (231-369)||(44332289-44332427)
chr1 (214-327)||(48489328-48489440)
chr1 (187-351)||(7740733-7740897)
chr1 (275-367)||(34339968-34340059)
chr1 (214-269)||(7447936-7447990)
chr1 (312-369)||(35003294-35003351)
chr1 (341-370)||(37814777-37814806)
chr1 (214-258)||(4401450-4401493)
chr1 (214-258)||(50448195-50448238)
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (185-369)||(43414499-43414683)
chr8 (187-369)||(4854781-4854963)
chr8 (186-369)||(15048099-15048282)
chr8 (194-365)||(14547929-14548100)
chr8 (187-365)||(12831047-12831225)
chr8 (187-369)||(37038479-37038661)
chr8 (185-365)||(504043-504223)
chr8 (192-368)||(5957835-5958011)
chr8 (185-365)||(23122519-23122699)
chr8 (185-365)||(34012218-34012398)
chr8 (185-365)||(15197331-15197511)
chr8 (186-366)||(40423864-40424044)
chr8 (187-372)||(10284546-10284731)
chr8 (187-347)||(44507027-44507187)
chr8 (187-349)||(1179878-1180040)
chr8 (207-369)||(8841350-8841512)
chr8 (189-327)||(10621047-10621185)
chr8 (187-369)||(15258847-15259029)
chr8 (187-365)||(34307216-34307394)
chr8 (187-366)||(16056322-16056501)
chr8 (231-365)||(9122229-9122363)
chr8 (187-365)||(24307715-24307893)
chr8 (187-331)||(16383377-16383521)
chr8 (187-365)||(30479396-30479574)
chr8 (187-369)||(32032725-32032906)
chr8 (280-353)||(42710228-42710301)
chr8 (187-369)||(42221515-42221697)
chr8 (185-313)||(20074916-20075036)
chr8 (187-368)||(25838197-25838370)
chr8 (187-367)||(17443825-17444005)
chr8 (242-369)||(40467755-40467882)
chr8 (275-369)||(42354506-42354600)
chr8 (231-369)||(32707921-32708061)
chr8 (187-347)||(14055532-14055692)
chr8 (187-260)||(24307629-24307702)
chr8 (185-306)||(38229427-38229547)
chr8 (214-276)||(29705466-29705527)
chr8 (275-369)||(30183794-30183887)
chr8 (214-258)||(2547118-2547161)
chr8 (214-258)||(42197370-42197413)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (187-369)||(31976248-31976430)
chr6 (185-365)||(32869676-32869856)
chr6 (187-369)||(31110679-31110859)
chr6 (192-365)||(22880580-22880753)
chr6 (185-365)||(17598552-17598732)
chr6 (187-365)||(29857827-29858005)
chr6 (187-365)||(11427616-11427796)
chr6 (187-369)||(15989960-15990142)
chr6 (187-369)||(30341278-30341460)
chr6 (186-369)||(15507942-15508125)
chr6 (186-369)||(4231547-4231730)
chr6 (187-365)||(6209388-6209565)
chr6 (187-353)||(15832577-15832743)
chr6 (183-369)||(31952948-31953134)
chr6 (186-336)||(31109351-31109501)
chr6 (218-347)||(23128067-23128196)
chr6 (192-367)||(28536408-28536581)
chr6 (185-367)||(30870018-30870193)
chr6 (194-331)||(946383-946520)
chr6 (191-339)||(9379660-9379808)
chr6 (187-309)||(12732482-12732604)
chr6 (323-369)||(22421997-22422043)
chr6 (318-369)||(26466799-26466850)
chr6 (214-267)||(26669944-26669996)
chr6 (341-369)||(3213400-3213428)
chr6 (214-258)||(7367671-7367714)
chr6 (341-369)||(21293749-21293777)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (188-369)||(35522877-35523058)
chr7 (183-365)||(19329838-19330020)
chr7 (187-365)||(8080305-8080483)
chr7 (185-369)||(31735882-31736059)
chr7 (187-365)||(38837217-38837395)
chr7 (187-369)||(46033719-46033901)
chr7 (185-369)||(21234399-21234583)
chr7 (187-365)||(4999436-4999614)
chr7 (187-365)||(7389389-7389566)
chr7 (192-365)||(32951415-32951588)
chr7 (187-369)||(26296644-26296826)
chr7 (187-360)||(19436114-19436287)
chr7 (185-339)||(35137531-35137685)
chr7 (192-349)||(3784000-3784157)
chr7 (186-347)||(38267039-38267200)
chr7 (187-365)||(40957707-40957885)
chr7 (187-367)||(41915741-41915921)
chr7 (187-365)||(3434562-3434730)
chr7 (186-369)||(41423681-41423864)
chr7 (187-369)||(22343361-22343543)
chr7 (192-340)||(3694372-3694520)
chr7 (187-369)||(46374742-46374902)
chr7 (187-369)||(35468773-35468955)
chr7 (187-369)||(38044197-38044379)
chr7 (185-369)||(8238210-8238395)
chr7 (187-367)||(18207180-18207359)
chr7 (217-368)||(16374743-16374894)
chr7 (186-339)||(32564374-32564527)
chr7 (186-367)||(39255844-39256024)
chr7 (221-369)||(27744227-27744375)
chr7 (187-313)||(36208173-36208299)
chr7 (187-296)||(36361904-36362013)
chr7 (187-365)||(36362026-36362192)
chr7 (187-367)||(7727906-7728086)
chr7 (187-365)||(11044188-11044356)
chr7 (187-369)||(40846031-40846213)
chr7 (187-369)||(12310906-12311086)
chr7 (192-368)||(2318160-2318338)
chr7 (187-319)||(10343531-10343663)
chr7 (273-366)||(1766702-1766795)
chr7 (187-367)||(45223042-45223222)
chr7 (214-269)||(32029752-32029806)
chr7 (231-368)||(32045881-32046018)
chr7 (324-365)||(36361847-36361888)
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (187-370)||(15409527-15409710)
chr5 (186-369)||(26720515-26720698)
chr5 (186-369)||(26990264-26990447)
chr5 (187-365)||(2740274-2740452)
chr5 (185-365)||(33149560-33149740)
chr5 (185-365)||(40145405-40145585)
chr5 (187-353)||(36732876-36733042)
chr5 (187-368)||(6679698-6679879)
chr5 (192-365)||(18520806-18520979)
chr5 (185-365)||(14831812-14831992)
chr5 (185-326)||(28177773-28177914)
chr5 (186-365)||(35785198-35785377)
chr5 (187-369)||(2252086-2252268)
chr5 (194-360)||(13811659-13811825)
chr5 (187-369)||(3921183-3921365)
chr5 (187-369)||(31008988-31009170)
chr5 (187-367)||(35943812-35943992)
chr5 (187-368)||(33825243-33825424)
chr5 (186-369)||(6259919-6260102)
chr5 (187-369)||(20073434-20073616)
chr5 (192-366)||(36875537-36875698)
chr5 (185-314)||(42414275-42414404)
chr5 (231-369)||(21370048-21370186)
chr5 (187-369)||(39688815-39688997)
chr5 (259-369)||(2177436-2177546)
chr5 (192-369)||(16327906-16328083)
chr5 (218-347)||(39557457-39557586)
chr5 (187-367)||(9603813-9603993)
chr5 (187-336)||(38296203-38296352)
chr5 (235-365)||(31132392-31132512)
chr5 (191-246)||(10356638-10356694)
chr5 (308-369)||(33855082-33855143)
chr5 (195-278)||(41470425-41470508)
chr5 (321-369)||(18033982-18034030)
chr5 (341-369)||(38470579-38470607)
[»] chr4 (44 HSPs)
chr4 (186-369)||(31910191-31910374)
chr4 (187-365)||(41236347-41236525)
chr4 (187-369)||(50052346-50052528)
chr4 (187-365)||(48182971-48183149)
chr4 (186-365)||(6034043-6034222)
chr4 (186-369)||(50526089-50526272)
chr4 (185-367)||(40574777-40574959)
chr4 (187-365)||(42044289-42044467)
chr4 (187-365)||(24995029-24995207)
chr4 (187-369)||(29239886-29240068)
chr4 (186-365)||(54473455-54473634)
chr4 (187-352)||(480382-480547)
chr4 (187-369)||(55475191-55475373)
chr4 (186-347)||(11511402-11511563)
chr4 (187-327)||(29234205-29234345)
chr4 (225-369)||(41823920-41824064)
chr4 (187-369)||(19670634-19670816)
chr4 (187-365)||(23608235-23608413)
chr4 (187-369)||(29547877-29548059)
chr4 (187-369)||(47986208-47986389)
chr4 (187-367)||(29977885-29978065)
chr4 (207-366)||(17983664-17983823)
chr4 (187-369)||(32766958-32767140)
chr4 (187-369)||(50813810-50813992)
chr4 (191-365)||(53352496-53352661)
chr4 (185-369)||(3481652-3481826)
chr4 (187-368)||(48647645-48647826)
chr4 (187-369)||(28480186-28480368)
chr4 (187-369)||(28481061-28481243)
chr4 (187-369)||(28481936-28482118)
chr4 (185-369)||(18924413-18924597)
chr4 (195-369)||(29589658-29589831)
chr4 (187-315)||(8343135-8343263)
chr4 (187-366)||(47104544-47104723)
chr4 (235-366)||(56300086-56300217)
chr4 (187-315)||(55079685-55079814)
chr4 (187-369)||(44536664-44536845)
chr4 (186-310)||(29535376-29535499)
chr4 (272-367)||(43487793-43487883)
chr4 (191-339)||(18769113-18769260)
chr4 (219-363)||(18768972-18769115)
chr4 (318-369)||(1771315-1771366)
chr4 (213-276)||(33703245-33703307)
chr4 (341-369)||(55966418-55966446)
[»] scaffold1268 (1 HSPs)
scaffold1268 (185-368)||(848-1031)
[»] scaffold1267 (1 HSPs)
scaffold1267 (185-368)||(848-1031)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (187-365)||(4029-4207)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (187-365)||(10031-10209)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (186-369)||(8781-8964)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (214-368)||(152525-152679)
[»] scaffold0316 (2 HSPs)
scaffold0316 (283-369)||(17199-17285)
scaffold0316 (185-296)||(17056-17163)
[»] scaffold0119 (1 HSPs)
scaffold0119 (214-267)||(798-850)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 48)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 2294647 - 2294832
Alignment:
Q  1 tcttggcggttatagattatgttttctccctaaacatctgtggtctttaattataggggtgtaacttgtaatttttagtgtgcagaagtgatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2294647 tcttggcggttatagattatgtttcctccctaaacatctgtggtcttaaattatagggttgtaacttgtaattttgagtgtgcagaagtgatgcatagaa 2294746  T
Q  101 tagagttatggccaaagtgaaatggtgcttcatgattttcttaataacaagagatctactaaaaagtaccataactatcaacacat 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2294747 tagagttatggccaaagtgaaatggtgcttcatgattttcttaataataagagatctactaaaaagtaccataactatcaacacat 2294832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 183 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 40614006 - 40613820
Alignment:
Q  183 acatgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacac 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  40614006 acatgagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatggaccccgcacaagcacac 40613907  T
Q  283 tttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40613906 tttctcttttctctcctattctttcttcataatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtaacattttcc 40613820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Original strand, 36168836 - 36169018
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  36168836 gagttatgatacatagacatccttagatgacaatacatcctttaactcccacacaaaaatttgacacgtggccacatggaccccgcacaagcatactttc 36168935  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36168936 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagagtgtatgagaataaagggtgtttatgtaacattttcc 36169018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 38273242 - 38273061
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  38273242 gagttatgatacatagacattcttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtagccacatggaccccgcactagcacactttc 38273143  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  38273142 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaa-gatgtatgagaataaatggtgtttatgtaatattttcc 38273061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Original strand, 17473020 - 17473198
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||    
T  17473020 gagtaatgatacatagacacccttagatggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 17473119  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17473120 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 17473198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 192 - 365
Target Start/End: Original strand, 28863460 - 28863633
Alignment:
Q  192 atgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttt 291  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28863460 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 28863559  T
Q  292 tctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    | |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28863560 tatctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 28863633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 185 - 365
Target Start/End: Original strand, 13438341 - 13438521
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13438341 atgagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 13438440  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13438441 tctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 13438521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 7465835 - 7465657
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||    
T  7465835 gagtaatgatacatagacacccttagatggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacactttc 7465736  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  7465735 tcttttatctcttcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 7465657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 187 - 357
Target Start/End: Original strand, 9058480 - 9058650
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||    
T  9058480 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcacactttc 9058579  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttat 357  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  9058580 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagagtgtatgggaataaagggtatttat 9058650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Original strand, 20700815 - 20700997
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  20700815 gagtaatgatacatagacatccttatgtggcaatacaccctttgactcctacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcataagcacactttc 20700914  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20700915 tctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtaacattttcc 20700997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Original strand, 42257193 - 42257375
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  42257193 gagttatgatacatagacatctttaggtggcaatacatcatttgacacccacataaaaatctgacacgtggccacatggaccccgcacaagcacactttc 42257292  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  42257293 tcttttctctcctcttctttcttcctaatgtatggggtgtacaagagtgtatagaaataaagggtgtctatgtaatattttcc 42257375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Original strand, 2533124 - 2533305
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||     
T  2533124 gagttatgatacatagacatccttaagtggcaatacatcctttgacacc-acacaaaaatctgacacgtagccacatagaccccgcacaagcacactttt 2533222  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  2533223 tcttttatctcctcttctctcttcccaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtatatataacattttcc 2533305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 10249482 - 10249304
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10249482 gagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 10249383  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  10249382 tcttttctctcctcttttctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 10249304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Original strand, 2294825 - 2294947
Alignment:
Q  370 caacacattgggaacttgaacagtttcacctttcatttgataggttaaattgaattcatacaaatactaatttctaattttttaatacttacaacaagta 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2294825 caacacattgggaacttgaacagtttcacctttcatttgataggttaaattgagttcatacaaatactaatttctaattttttaatacttacaacaagta 2294924  T
Q  470 tcctaaagacactctttaatatt 492  Q
    ||||||||| |||||||| ||||    
T  2294925 tcctaaagatactctttagtatt 2294947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Original strand, 2322076 - 2322217
Alignment:
Q  11 tatagattatgttttctccctaaacatctgtggtctttaattataggggtgtaacttgtaatttttagtgtgcagaagtgatgcatagaatagagttatg 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2322076 tatagattatgtttcctccctaaacatctgtggtcttaaattatagggttgtaacttgtaattttgagtgtgctgaagtgatgcatagaatagagttatg 2322175  T
Q  111 gccaaagtgaaatggtgcttcatgattttcttaataacaaga 152  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2322176 gccagaatgaaatggtacttcatgattttcttaataacaaga 2322217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 192 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 19930915 - 19930742
Alignment:
Q  192 atgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttt 291  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  19930915 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaaacacactttctcttt 19930816  T
Q  292 tctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  19930815 tctctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaaaggtgtctatgtatcatt 19930742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 185 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 28381757 - 28381577
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||    
T  28381757 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacacctttcgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacatggactccgcacaagcacactt 28381658  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28381657 tctcttttctctcatcttctctcttcctaatatatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 28381577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 32505748 - 32505570
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32505748 gagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 32505649  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    | ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||    
T  32505648 tattttctctcctcttctctcttcttaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagagtgtctatgtatcatt 32505570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 187 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 33436200 - 33436029
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33436200 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 33436101  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatg 358  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  33436100 tctttcctctcatcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatg 33436029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 186 - 365
Target Start/End: Original strand, 40701477 - 40701656
Alignment:
Q  186 tgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacacttt 285  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| |||||| ||||||||    
T  40701477 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggaccccgcacaatcacacttt 40701576  T
Q  286 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||    
T  40701577 ctcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatcgggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtctatgtatcatt 40701656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Original strand, 30915463 - 30915641
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  30915463 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacccccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacactttc 30915562  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||| ||||    
T  30915563 tcttttctctcatcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatggaaataatggatgtctatgtatcatt 30915641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 186 - 365
Target Start/End: Original strand, 4060684 - 4060863
Alignment:
Q  186 tgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacacttt 285  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||| |  ||||||| || ||| |||||||||||    
T  4060684 tgagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccttttgacatccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgcataagcacacttt 4060783  T
Q  286 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    || ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||    
T  4060784 cttttttctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatggaaataaaagatgtttatgtatcatt 4060863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 185 - 369
Target Start/End: Original strand, 43490119 - 43490303
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||    
T  43490119 atgagttatgatacataaacacccttaggtgacaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactt 43490218  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    | |||||  ||| || |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  43490219 tatctttcttcttctcttctctcttcctaatacatagggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 43490303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 38882913 - 38882733
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccct---gcacaagcacact 283  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||    |||||||| ||||    
T  38882913 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaata-accctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggacccccccgcacaagcgcact 38882815  T
Q  284 ttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    |||||||||||||  | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||    
T  38882814 ttctcttttctcttatcttatctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtctctatgtatcatt 38882733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26891604 - 26891422
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||  | ||||||||| ||||    
T  26891604 gagttatgatacatagccacccttaggtggcaatacacccctagacacccacacaaaaatctgacatgtggtcacgtggacctcgaacaagcacattttc 26891505  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||| ||  ||||||| ||  |||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26891504 tctttcctcttctcttctctcttcctaatatacagggtgtaaaaatgtgtatgaaaattaagggtgtatatgtaacattttcc 26891422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 187 - 313
Target Start/End: Original strand, 33436211 - 33436337
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  33436211 gagtaatgatacatagacatccttagatggcaatacaccttttgacacccacataaaaatctgacacgtgaccatgtggactttgcacaagcacactttc 33436310  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttccta 313  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||    
T  33436311 tctttcctatcctcttctctcttccta 33436337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 45097835 - 45097653
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || || ||||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  45097835 gagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacatcccttgacacccatacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 45097736  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||  || || |||||||| |||||||  | |||| | |||||||||||||||||||    
T  45097735 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatcggatgtacaagagtgtatgcaattaaaagatgtttatgtaacattttcc 45097653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 5574588 - 5574422
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||    
T  5574588 gagtaatgatacatagacactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 5574489  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||            |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5574488 tctttt------------ctcttcctaatgcatggcgtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 5574422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Original strand, 13365351 - 13365535
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacat--ccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    ||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||| ||| |||  ||||||| ||||||| ||||||    
T  13365351 gagttatgatacataaacacacccttagatggcaatataccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtgaccatatggaccccgcacaagtacactt 13365450  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||||  ||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  13365451 tctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgaatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 13365535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 193 - 369
Target Start/End: Original strand, 3439985 - 3440161
Alignment:
Q  193 tgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctctttt 292  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||||||| | |  |||||||||||||||| | ||| |||   |||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  3439985 tgatacgtagacacccttaggtggcaatacactcctggacacccacacaaaaatctaacatgtgattacgtggaccccgcacaagcacattttctctttc 3440084  T
Q  293 ctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||||| ||||||||| |||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  3440085 ctctcctcttctctctttctagaatatagggtgtacaaaggtgtatggaaataaagggtgtctatgtaacattttcc 3440161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 207 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 2997567 - 2997408
Alignment:
Q  207 ccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttttctctcctattctct 306  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| || ||||||    
T  2997567 ccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctctttcttcttctcttctct 2997468  T
Q  307 cttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattt 366  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||  | ||||  |||| ||||||||||||    
T  2997467 cttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaagtgtctatgtaacattt 2997408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 186 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 17820105 - 17819961
Alignment:
Q  186 tgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacacttt 285  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||  ||||| |||| |||    
T  17820105 tgagttatgatacatagacaactataggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggttacgtggaccccacacaaacacatttt 17820006  T
Q  286 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaa 330  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  17820005 ctctttcatctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaa 17819961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 86 - 152
Target Start/End: Original strand, 2304461 - 2304527
Alignment:
Q  86 aagtgatgcatagaatagagttatggccaaagtgaaatggtgcttcatgattttcttaataacaaga 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2304461 aagtgatgcatagaatagagttatggccaaagtgaaatggtgcttcatgattttcttaataacaaga 2304527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Original strand, 38732354 - 38732536
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||  || ||||||| || || |||||||||||||||| ||||| |||| ||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  38732354 gagttatgatacataaacacccttatgtgacaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatatggaccccgcacaagtacactttc 38732453  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||  ||| | ||||||||| ||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  38732454 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgagatgtacaaggatgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 38732536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Original strand, 17823784 - 17823970
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgt----ggaccctgcacaagcacac 282  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||  | | ||||||||||||||||| ||||||||  | |  |    ||||||   ||||||||||    
T  17823784 gagtaatgatacatatacatccttaggtggcaatacattcctgaacacccacacaaaaatctgacacgtaactatatatatggaccccatacaagcacac 17823883  T
Q  283 tttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||||||  |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17823884 tttctctttcatctcatcttctctcttccaaatatatggggtgtacaagggtgtatgtaaataaaggatgtctatgtaacattttcc 17823970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 192 - 316
Target Start/End: Original strand, 41575142 - 41575267
Alignment:
Q  192 atgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtgga-ccctgcacaagcacactttctctt 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||| ||||| |||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  41575142 atgatacatagacatccttagatggtaatacaccctttgacattcacacaaaaatttgacatgtggtcatgtggacccctacacaagcacactttctctt 41575241  T
Q  291 ttctctcctattctctcttcctaatg 316  Q
    |  |||||| ||||||| ||||||||    
T  41575242 tcatctcctcttctctcgtcctaatg 41575267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 231 - 369
Target Start/End: Original strand, 3737987 - 3738125
Alignment:
Q  231 acacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaa 330  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||| ||||||||   ||| ||||||||||    
T  3737987 acacccacacaaaaatctgacatgtggtcatgtggaccccgcacaagcacattttctttttcctctcctcttctttcttcctagaatatagggtgtacaa 3738086  T
Q  331 gggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
     ||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  3738087 aggtgtatgaaaatatagggtgtctatgtaacattttcc 3738125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 188 - 368
Target Start/End: Original strand, 44151924 - 44152108
Alignment:
Q  188 agttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaa-tatgacacgtggccacgtgg---accctgcacaagcacact 283  Q
    |||||||||||||||||| |  ||| || |||||||| |||||||||| ||| ||||| | ||||||||||  | || |   | ||  ||||||||||||    
T  44151924 agttatgatacatagacaactataggtgacaatacactctttaacacctacaaaaaaaatctgacacgtggttatgtagtgaatcccacacaagcacact 44152023  T
Q  284 ttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 368  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44152024 ttctctttcatctcctcttctctcttcctaatgcatgagatatacaagggtgtatgcgaataaaaggtgtttatgtaacattttc 44152108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 353
Target Start/End: Original strand, 27864702 - 27864857
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||   ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27864702 atgagtaatgatacatagacacccttatgtggcaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtaatcacgtggaccccgcaaaagcacactt 27864801  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgt 353  Q
    ||||||             ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27864802 tctctt-------------tctcttcctaatacatgggatgtacaagggtgtatgagaataaagggtgt 27864857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 277 - 367
Target Start/End: Original strand, 41758677 - 41758767
Alignment:
Q  277 gcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 367  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| |||||||||||||    
T  41758677 gcacattttctcttttatctcctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaaggatgtatgagaataaaatgtgtctatgtaacatttt 41758767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 370 - 433
Target Start/End: Original strand, 2304667 - 2304730
Alignment:
Q  370 caacacattgggaacttgaacagtttcacctttcatttgataggttaaattgaattcatacaaa 433  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2304667 caacacattgggaacttgaacaatttcacctttcatttgataggttaaattgagttcgtacaaa 2304730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15428840 - 15428663
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||  | ||| |||| ||||    
T  15428840 gagttatgatacataaacatccttatgtggccatacaccccttaacactcacacaaaaatctgacatgtggccatgtaaaccccacgcaaacacattttc 15428741  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    |||||  |||||| || |||||| ||| |  || ||||||||||||||||||| |  |||| | ||| |||||||||||    
T  15428740 tctttcatctcctcttttctctttctagtacat-gggtgtacaagggtgtatgagggtaaatgatgtctatgtaacatt 15428663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 439 - 492
Target Start/End: Original strand, 2310704 - 2310757
Alignment:
Q  439 atttctaattttttaatacttacaacaagtatcctaaagacactctttaatatt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2310704 atttctaattttttaatacttacaacaagtatcctaaagacactctttagtatt 2310757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 21301600 - 21301420
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||  |||||||| || | |  | || |||||||||||  || |||||  || |||||| || ||||| |||||||||    
T  21301600 gagttacgatagatagacatctttaagtggcaatatactcctcgatactcacacaaaaatcagatacgtgatcatgtggactctacacaaacacactttc 21301501  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 367  Q
    |||||| ||| || |||| |||||||| || ||| |||||||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  21301500 tcttttatcttctcttctttcttcctagtgcatgaggtgtacatgagtgtatggaaataaagggtgtgtatctaacatttt 21301420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 3035033 - 3034901
Alignment:
Q  237 acacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgt 336  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||  ||||||| ||||||| | |||||||||||  ||| || |||||||||||||||  ||| ||||||| | |||||    
T  3035033 acacaaaaatctgacatgtggtcatatggaccccgcacaagtatactttctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtaccaaggtgt 3034934  T
Q  337 atgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  3034933 atgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 3034901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 269
Target Start/End: Original strand, 42849794 - 42849848
Alignment:
Q  214 tggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccc 269  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||    
T  42849794 tggcaatacacccttta-cacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccc 42849848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 321 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1750462 - 1750414
Alignment:
Q  321 gggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||||||| || || | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1750462 gggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 1750414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16096913 - 16096870
Alignment:
Q  214 tggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggc 258  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  16096913 tggcaatacacccttta-cacccacacaaaattctgacacgtggc 16096870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 49)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 51419460 - 51419278
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  51419460 gagttatgatacatagacatccttagatgacaatacatcctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatagaccccgcacaagcacactttc 51419361  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  51419360 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtttatgtaacattttcc 51419278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Original strand, 47531865 - 47532047
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||    
T  47531865 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccttttaacatccacacaagaatctgacacgtggccatatgaaccccgcacaagcacactttc 47531964  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47531965 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggaatgtacaagtgtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 47532047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 187 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 11348022 - 11347837
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11348022 gagttatgatacatagacatccttaggtgacaatacatcctttgacatccacacaaaaatctgacacgtggccacatggaccctgcataagcacactttc 11347923  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcccaa 372  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  11347922 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtataagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtaccattttcccaa 11347837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 185 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26141634 - 26141448
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  26141634 atgagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccacacaagcacactt 26141535  T
Q  285 tctcttttctctcctattc--tctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  26141534 tctcttttctctcctcttctttctcttcctaatgtatggggtgtacaagagtgtatggaaataaagggtgtctatgtaacattttcc 26141448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 186 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20765016 - 20764833
Alignment:
Q  186 tgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacacttt 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  20765016 tgagttatgagacatagacatccttaggtggtaatacactctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatggaccccgtacaagcacacttt 20764917  T
Q  286 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  20764916 ctcttttctctcatcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 20764833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 185 - 365
Target Start/End: Original strand, 53982009 - 53982189
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  53982009 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 53982108  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  53982109 tctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggttgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 53982189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 186 - 365
Target Start/End: Original strand, 33644199 - 33644378
Alignment:
Q  186 tgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacacttt 285  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  33644199 tgagtaatgatacatagacacccttgggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 33644298  T
Q  286 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  33644299 ctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtataagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 33644378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 41189864 - 41189682
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  41189864 gagttatgatacatatacatccttaggtggcaatacatcatttgacacccacataaaaatttgacacgtggccacatggaccccgcacaagcacactttc 41189765  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  41189764 tcttttctctcctcttctttcttcctaatgtatggagtgtacaagagtgtatggaaataaagggtgtctatgtaacattttcc 41189682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 192 - 365
Target Start/End: Original strand, 31456694 - 31456867
Alignment:
Q  192 atgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttt 291  Q
    |||||||||||||| || |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31456694 atgatacatagacacccataggcggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 31456793  T
Q  292 tctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31456794 tctctcctcttttctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgcatgggaataaagggtgtttatgtatcatt 31456867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Original strand, 49607414 - 49607592
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||  |||||||||||||||    
T  49607414 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccacacaagcacactttc 49607513  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  49607514 tcttttctctcctcttttctcttcctaatgcatgacgtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 49607592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 191 - 365
Target Start/End: Original strand, 52629304 - 52629478
Alignment:
Q  191 tatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctctt 290  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  52629304 tatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacactttctctt 52629403  T
Q  291 ttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||    
T  52629404 ttctctcatcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatggaaataatgggtgtctatgtatcatt 52629478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Original strand, 8076393 - 8076575
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8076393 gagtaatgatacataaacacccttaggtggcagtacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 8076492  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  8076493 tctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaaaagtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 8076575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 54868995 - 54868817
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| |||||| |||||||||    
T  54868995 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggaccccgcacaatcacactttc 54868896  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||    
T  54868895 tcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatagggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtctatgtatcatt 54868817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 33118951 - 33118768
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||  || || |||||||||    
T  33118951 gagttatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccctttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggatccctcagaaacacactttc 33118852  T
Q  287 tcttttctctcct-attctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||| |||||||  |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  33118851 tctttcctctcctccttctctctccctagtgcatggggtgtacaagggtgtatggaaataaagggtgtctacgtaacattttcc 33118768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Original strand, 17470405 - 17470583
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||    
T  17470405 gagtaatgatacatagacacctttaggtggcaatacaccttttaacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacactttc 17470504  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||   |||||| ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  17470505 tcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaaatatgtatgagaataaatggtgtctatgtatcatt 17470583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 24700054 - 24699873
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  24700054 gagtaatgatacatagacatccttagttggcaatacaccttttgacacccacataaaaatctggcacgtggccacgtggaccctgtacaaacacactttc 24699955  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| || | |||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  24699954 tctttcctctcctcttctctcttcctagtttatgaggtgtataa-gatgtatgagaataaaagatgtctatgtaacattttcc 24699873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Original strand, 35536626 - 35536808
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||| | ||||||||||||| |    
T  35536626 gagtaatgatacatagacatccttatgtggcaatacaccatttgacacccacataaaaatgtgacacgtggtcatgtggaccttacacaagcacacttcc 35536725  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||  ||| || ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  35536726 tctttcatcttctcttctctcttcctagtgcatggggtgtagaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 35536808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 190 - 369
Target Start/End: Original strand, 26754698 - 26754877
Alignment:
Q  190 ttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctct 289  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26754698 ttatgattcatagacacccttaggtggcaatacacccttggacatccacacaaaaatctgacatgtggtcacatggaccccgcacaagcacattttctct 26754797  T
Q  290 tttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    || ||||||| |||||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  26754798 ttcctctcctcttctctcttcctagaatatagggtgtacaaaggtgtatggaaataaagagtgtctatgtaacattttcc 26754877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 192 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 30801828 - 30801651
Alignment:
Q  192 atgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttt 291  Q
    |||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||| || | ||  |||||||  |||||||||| |||||||||    
T  30801828 atgatacatagacacccttaggtgataatacaccctttgatacccacacaaaaatatgacatgtagtcatatggaccccacacaagcacattttctcttt 30801729  T
Q  292 tctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
     ||||| | ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  30801728 cctctcatcttctctcttcctagtacatggggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtaacattttcc 30801651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Original strand, 9562999 - 9563177
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||| ||| | ||||||| ||||||| ||||| ||| ||| | |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  9562999 gagtaatgatacataaacaccattagatgacaatacaacctttgacatccatataaaaatctgacacgtagtcacgtggatcctgcacaaacacactttc 9563098  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  9563099 tctcttctctcctcttctctcttcctaatgcatgagttgtacaaaggtgtatgggaataaagggtatctatgtatcatt 9563177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Original strand, 8956762 - 8956944
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||  || ||||||| | ||||||||||||| |    
T  8956762 gagtaatgatacatagacatccttatgtggcaatacatcctttgacacccacataaaaatgtgacacgtgttcatgtggaccttacacaagcacacttcc 8956861  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||  ||| || ||||||||||||| || |  ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  8956862 tctttcatcttctcttctctcttcctagtgcacagggtgtagaagggtgtatgagaataaatgctgtctatgtaacattttcc 8956944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14623939 - 14623757
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||| |||  || |||||||   |||||||||||||||    
T  14623939 gagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccccttgacacccacataaaaatctgacatgtgttcatgtggacctcacacaagcacactttc 14623840  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||  ||| || ||||||||| ||| || ||| |||||| |||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  14623839 tctttcatcttctcttctctctttctagtgcatgaggtgtagaaggatgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 14623757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 36707524 - 36707350
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||| | |||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |  ||||||| || ||    ||||||||||    
T  36707524 gagtaatgatacatagatacccttaggtgacaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgc----gcacactttc 36707429  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  36707428 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagaatgtatgggaataaaaggtgtctatgtatcatt 36707350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 187 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 48375806 - 48375626
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||| | || | ||| |||||||| ||||  |||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  48375806 gagttatgattcatagacacccttaggtgacaatacacccctgaaaatccatacaaaaatctgacgtgtggtcacatggaccccgcacaagcacattttc 48375707  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 367  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||   ||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  48375706 tctttcctctcctcttctctcttcctagaatatagggtgtacaaagatgtatggaaataaagggtgtctatgtaacatttt 48375626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 186 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 45058653 - 45058471
Alignment:
Q  186 tgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacacttt 285  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||| ||| |||  ||||||| ||||||| | |||||    
T  45058653 tgagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacacccttga-cacccacataaaaatctgacatgtgaccatatggaccccgcacaagtatacttt 45058555  T
Q  286 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||||  ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  45058554 ctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaatggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 45058471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 209 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 36331407 - 36331246
Alignment:
Q  209 ttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctct 308  Q
    |||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| || ||||||||    
T  36331407 ttaggtggcaatgcaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctctttcttcttctcttctctct 36331308  T
Q  309 tcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttccc 370  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||  | |||| | ||| ||||||||||||||||    
T  36331307 tcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaagatgtatatgtaacattttccc 36331246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 13898150 - 13897975
Alignment:
Q  192 atgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttt 291  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||   ||||||||||||||||||||    
T  13898150 atgatagataaacatccttaggtggcaatacaccccttgacacccacataaaaatctgacacgtgttcatgtggacctcacacaagcacactttctcttt 13898051  T
Q  292 tctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 367  Q
      ||| || |||||||| |||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  13898050 catcttctcttctctctccctagtgtatggggtgtagaaaagtgtatgagaataaatggtgtctatctaacatttt 13897975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 48587186 - 48587023
Alignment:
Q  192 atgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttt 291  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  48587186 atgatacatagatacccttaggtggcaatacaccctttgacacctacataaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagtacactttctcttt 48587087  T
Q  292 tctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||          ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  48587086 tc----------tctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtatatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 48587023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 11095453 - 11095289
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||  |||| ||| || |||||||||    
T  11095453 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgt--accccgcataaacacactttc 11095356  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    |||||            ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  11095355 tcttt------------tctcttcctaatgcatcgggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 11095289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 187 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 35965874 - 35965699
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  ||  |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||        | |||||||||||||||||||    
T  35965874 gagtaatgatacatatacatccttaagtgataatacatcctttgacacccacataaaaatctgacacgtgg--------atcctgcacaagcacactttc 35965783  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttccc 370  Q
    ||||| ||||||| || ||| ||| ||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  35965782 tctttcctctcctcttttcttttcttaattcatgaggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtaacattttccc 35965699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 27714991 - 27714882
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||    
T  27714991 gagtaatgatacatagacacctttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcacactttc 27714892  T
Q  287 tcttttctct 296  Q
    |||| |||||    
T  27714891 tcttctctct 27714882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 304
Target Start/End: Original strand, 11907371 - 11907488
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| | | ||||| ||||||||||| ||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  11907371 gagttatgatacatagacacccttaggtgacaatacacacctgaacactcacacaaaaatctgacatgtggtcatatggaccccgcacaagcacattttc 11907470  T
Q  287 tcttttctctcctattct 304  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  11907471 tcttttctctcctcttct 11907488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 1758558 - 1758379
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccct--ttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    |||||||||||||||| || || ||| | |||||||||||   || |||||||||||||||| |||||  |||  |||||||| |  ||||| |||| ||    
T  1758558 gagttatgatacatagtcaaccataggttgcaatacaccccccttgacacccacacaaaaatctgacatatggttacgtggactccacacaaacacattt 1758459  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 367  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||  |||||||  ||||||||||||||||||    
T  1758458 tctctttcatctcctcttctctcttcctaatgcat-gggtgtacaaaggtgtat--gaataaacagtgtttatgtaacatttt 1758379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 185 - 364
Target Start/End: Original strand, 39670010 - 39670188
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| | || || ||| | | | |||||| |||||||||  || |||||||  | ||| ||||||||    
T  39670010 atgagttat-atacatagacatccttatgtggcaatatatcccttgacatctatataaaaatttgacacgtgatcatgtggacctcgtacacgcacactt 39670108  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacat 364  Q
     |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || |||||| | ||| | ||||||||    
T  39670109 cctcttttctctcctcttctctcttcttaatgtatgagatgtacaagggtgtacggaaataaatgatgtctgtgtaacat 39670188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 190 - 369
Target Start/End: Original strand, 42823114 - 42823293
Alignment:
Q  190 ttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctct 289  Q
    |||||||||||| ||| | |||  ||| ||||||||| || ||||||||| |||||| ||||| |||| ||  ||||||| ||| ||| | |||||||||    
T  42823114 ttatgatacataaacaccattatgtggtaatacaccccttgacacccacaaaaaaatttgacatgtggtcatatggaccccgcataagtatactttctct 42823213  T
Q  290 tttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||  | | || |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  42823214 ttcttattctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 42823293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 187 - 313
Target Start/End: Original strand, 41080709 - 41080833
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||| | |||| || ||||||||  |||||||||| ||||    
T  41080709 gagtaatgatacatagacatccttag-tagcaaaacaccctttgacacccacgcaaaaatctgatatgtggtcatgtggaccca-cacaagcacattttc 41080806  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttccta 313  Q
    |||||  |||||| |||||||||||||    
T  41080807 tctttcatctcctcttctctcttccta 41080833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 272 - 367
Target Start/End: Original strand, 43746424 - 43746519
Alignment:
Q  272 cacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 367  Q
    ||||| |||| |||||||||  |||||| |||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  43746424 cacaaacacaatttctctttcatctcctcttctttcttcctagtgcatgaggtgtacaagggtgtatgacaacaaagggtgtttatgtaacatttt 43746519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Original strand, 35093585 - 35093767
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||||| |||||||||||| | |||| || ||||||| | ||| ||| |||| ||||||| ||||| |||| || ||| || |   ||||||||||||||    
T  35093585 gagttacgatacatagacaactttaggtgacaatacaacatttgacatccacgcaaaaatctgacatgtggtcatgtgaactccatacaagcacactttc 35093684  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||   |||  | ||||||||||||| || ||| | ||||||| |||||||| ||||||| | ||| || ||||||||||||    
T  35093685 tcttgcatctttttttctctcttcctagtgcatgagatgtacaaaggtgtatgagaataaatgatgtctaggtaacattttcc 35093767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21746202 - 21746106
Alignment:
Q  273 acaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | |||  |||||| |||||||    
T  21746202 acaagcacactttctctttcatctcatcttctctcttccaaatatatgaggtgtacaagggtgtatgtaaataaatgatgtccatgtaatattttcc 21746106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 36331478 - 36331419
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaat 246  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||    
T  36331478 gagttatgatacataaacacccttagatggcaatgcaccccttgacatccacacaaaaat 36331419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 25395429 - 25395256
Alignment:
Q  191 tatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctctt 290  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| ||||| |  | |||||  ||||| |||| ||||||||    
T  25395429 tatgatacataaacatccttatgtggccatacatcccttaatacccacacaaaaatctgacatgtggctatatagaccccacacaaacacattttctctt 25395330  T
Q  291 ttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    |  ||| || || |||||| ||| |  || |||||||||| | |||||| | ||||| | ||| |||||||||||    
T  25395329 tcatcttctcttttctctttctagtacat-gggtgtacaaagatgtatgaggataaaagatgtctatgtaacatt 25395256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 25407243 - 25407065
Alignment:
Q  192 atgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaa-tatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctctt 290  Q
    |||||||||| ||| || ||| |||||||| |||| || |||| |||||||||| | |||||||||  ||  |||| ||  ||||| |||||||||||||    
T  25407243 atgatacatacacaaccataggtggcaatataccccttgacacacacacaaaaaatctgacacgtgatcatatggatcccacacaaacacactttctctt 25407144  T
Q  291 ttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |  |||||| ||||||||  |||||||||  |||||| ||   | |||  ||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  25407143 tcatctcctcttctctctcactaatgtataaggtgtataaatatatataagaataaagggtgactatataacattttcc 25407065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 215 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 40480913 - 40480853
Alignment:
Q  215 ggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaa 276  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||| |||||    
T  40480913 ggcaatacacccttta-cacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccctacacaa 40480853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 27714889 - 27714825
Alignment:
Q  301 ttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||| ||||    
T  27714889 ttctctcttcccaatacatggggtgtacaagggtgtacgagaataaagagtgtatatgtatcatt 27714825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 269
Target Start/End: Original strand, 53581793 - 53581847
Alignment:
Q  214 tggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccc 269  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||    
T  53581793 tggcaatacacccttta-cacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccc 53581847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 331 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 11140999 - 11140954
Alignment:
Q  331 gggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcccaacaca 376  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  11140999 gggtgtatgagactaaagggtgtctatgtaacattttccaaacaca 11140954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 341 - 369
Target Start/End: Original strand, 45127000 - 45127028
Alignment:
Q  341 gaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45127000 gaataaagggtgtttatgtaacattttcc 45127028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 52629993 - 52629938
Alignment:
Q  214 tggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccct 270  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| || || ||||||||    
T  52629993 tggcaatacacccttta-cacccacacaaaattctgacacgtagcaacctggaccct 52629938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 321 - 369
Target Start/End: Original strand, 54246200 - 54246248
Alignment:
Q  321 gggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||||||| || || | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54246200 gggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 54246248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 40)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Original strand, 32813247 - 32813429
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  32813247 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccgcacaagcacactttc 32813346  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  32813347 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtaacattttcc 32813429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 185 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 27564837 - 27564657
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27564837 atgagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtaatcacgtggaccccgcacaagcacactt 27564738  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27564737 tctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 27564657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 187 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 38632421 - 38632255
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||     
T  38632421 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttaacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttt 38632322  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgt 353  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38632321 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgt 38632255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 51898783 - 51898601
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||    
T  51898783 gagtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 51898684  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51898683 tatttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatagaaataaagggtgtttatgtaacattttcc 51898601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 185 - 365
Target Start/End: Original strand, 37649196 - 37649376
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |  | ||||||||||||||    
T  37649196 atgagtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacgtgaattccgcacaagcacactt 37649295  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  37649296 tcccttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 37649376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 186 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 9474977 - 9474798
Alignment:
Q  186 tgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacacttt 285  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9474977 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacacttt 9474878  T
Q  286 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||    
T  9474877 ctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatgagaataaagagtgtctatgtatcatt 9474798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 186 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 48716383 - 48716204
Alignment:
Q  186 tgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacacttt 285  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  48716383 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccatttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 48716284  T
Q  286 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
     |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  48716283 atcttttctttcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 48716204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Original strand, 2581915 - 2582093
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2581915 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 2582014  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  2582015 ttttttctctcctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtattagaataaagggtgtttatgtatcatt 2582093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Original strand, 41758805 - 41758983
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| | ||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  41758805 gagtaatgatacatagacaccattaaatggcaatacaccctttgacaaccacacaaaaatctgacacgtagtcacatggaccccgcacaaacacactttc 41758904  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  41758905 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 41758983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 185 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 47452422 - 47452242
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| | |||||||| || ||||||||||||||    
T  47452422 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactt 47452323  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  47452322 tctcttttctctcctcttctctcttcctattgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagagtgtctatgtatcatt 47452242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 187 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 49811627 - 49811447
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||  | ||| | ||||||||||||||||    
T  49811627 gagttatgatagatagacatccttaggtgacaatacaccatttgacatccacacaaaaatctgacacgtagccatatagactccgcacaagcacactttc 49811528  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 367  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  49811527 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatgtggtgcacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatttt 49811447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Original strand, 3000319 - 3000497
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  3000319 gagtaatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacactttc 3000418  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||| ||||    
T  3000419 tcttttctctcatcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatggaaataatggatgtctatgtatcatt 3000497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 37926538 - 37926356
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| || | ||||| ||||||||    
T  37926538 gagttatgatacatagatatctttaggtggcaatacatcttttaacacccacataaaaatctgacacgtggccacatggatcccgtacaagtacactttc 37926439  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| ||| |||||||    
T  37926438 tcttttctcttctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaaggatgtatgtgaataaatggtgtctatataatattttcc 37926356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Original strand, 38595154 - 38595332
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  38595154 gagtaatgatacataaacacctttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacactttc 38595253  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||| ||||    
T  38595254 tcttttctctcatcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatggaaataatggatgtctatgtatcatt 38595332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 187 - 358
Target Start/End: Original strand, 50630458 - 50630629
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||   |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50630458 gagtaatgatacatagatacccttaggtggcaatacatcctttgttacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 50630557  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatg 358  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  50630558 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatagggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatg 50630629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 45044660 - 45044478
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  45044660 gagttatgatacatacatttccttaggtggcaatacaccatttgacacccatacaaaaatctgacatgtagccacatggaccccgcacaaacacattttc 45044561  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| || ||||||||||||    
T  45044560 tcttttctcttctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatgatgtctacgtaacattttcc 45044478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 185 - 369
Target Start/End: Original strand, 26440732 - 26440906
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||    
T  26440732 atgagttaggatagatagacatccttagatgacaatacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatggatcccgcataagcacactt 26440831  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||||          |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26440832 tctctt----------ttctctcttcgtaatgtatggaatgtacaagggtgtataggaataaaggatgtttatgtaacattttcc 26440906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 8346488 - 8346309
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| ||||||||||| || | |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8346488 gagtaatgatacatagtcacctttaggtggcaatacaccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccctgcacaagcacactttc 8346389  T
Q  287 tcttttctctcct-attctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  8346388 tcttttctctcctctttttctcttcctaatgcatggagtgtacaaaggtgtatgagaataaatggtatttatgtatcatt 8346309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 186 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 41608594 - 41608411
Alignment:
Q  186 tgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacacttt 285  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| | ||||| |||||||    
T  41608594 tgagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacaccccttgacactcacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgtacaagtacacttt 41608495  T
Q  286 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||||  ||| || |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||    
T  41608494 ctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatagggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtttatgtaacattttcc 41608411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 186 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 50591101 - 50590918
Alignment:
Q  186 tgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacacttt 285  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||| |||||||    
T  50591101 tgagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacacttt 50591002  T
Q  286 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||||  ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | |||| ||| | |||||||||||||||    
T  50591001 ctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtatctatgtaacattttcc 50590918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Original strand, 43132 - 43310
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||  | ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  43132 gagtaatgatacatagacagtcttaggagacaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggactccgcacaagcacactttc 43231  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||| | |||||| ||||    
T  43232 tcttttctctcctcctctctctttctaatgcatggggtgtacaagagtgtataagaataaagggtatctatgtatcatt 43310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 187 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23597191 - 23597011
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||     
T  23597191 gagtaatgatacatagacatcattaggtggcaatacactctttgatacccacataaaaatctgacacgtggccacgttgaccttgcacaaacacacttta 23597092  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 367  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  ||| ||||| ||||| |||||| |||||||   ||| |||||||||||||    
T  23597091 tcttttctctcctattctctattcctagttcatgaggtgtccaaggatgtatgagaataaaaaatgtctatgtaacatttt 23597011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 192 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 44548471 - 44548347
Alignment:
Q  192 atgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttt 291  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44548471 atgatacatagacatctttaggtggcaatacaccatttgatacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 44548372  T
Q  292 tctctcctattctctcttcctaatg 316  Q
    |||||| | ||||||||||||||||    
T  44548371 tctctcttcttctctcttcctaatg 44548347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 5959100 - 5958918
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||| |||| ||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  5959100 gagttatgatacataaacacccttaagtggcaatacacctcttgacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatatggaccccgcacaagtacactttc 5959001  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | ||||  |||| |||||||||||||||    
T  5959000 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaatgtgtctatgtaacattttcc 5958918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 185 - 369
Target Start/End: Original strand, 6260868 - 6261052
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||||||| |||||| | ||| |||| ||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  6260868 atgagttatgatagatagatatccttaggtggtaatacacccctgaacacccacataaaaatctaacatgtggtcacgtggaccccgcataagcacattt 6260967  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||| |||  |||||| ||||||||| ||| | ||| |||||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  6260968 tctatttcttctcctcttctctctttctagtatatagggtgtacaaaggtgtatgaaaataaatggtgtgtatgtaacattttcc 6261052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 365
Target Start/End: Original strand, 26274437 - 26274607
Alignment:
Q  192 atgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttt 291  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||| | ||| ||| ||||| |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  26274437 atgatacatagacacccttatgtggcaatacatcatttgacatccacagaaaaatctgacacatagtcacgtggatcctgcacaagtacactttttcttt 26274536  T
Q  292 tctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||   |||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26274537 tctctc---ttctctcttcctaatgcatgagatgcacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 26274607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 192 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 11152472 - 11152296
Alignment:
Q  192 atgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttt 291  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| | || || ||||| |||||||||| |||||| |||    
T  11152472 atgaaacatagaca-ccttaggtggcaatacacccttcgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtagaccccgcacaagcacgctttcttttt 11152374  T
Q  292 tctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
     ||||||| ||||||||||| | || |||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  11152373 cctctcctcttctctcttcccagtgcatggggtgtagaaggatgtatgagaataaatggtgtctatataacattttcc 11152296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 188 - 369
Target Start/End: Original strand, 44453980 - 44454165
Alignment:
Q  188 agttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttct 287  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||||| |  || | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||||| ||  |||||||||||||| |    
T  44453980 agttatgatacatagacacctttaagtggcaatacatctcttgatacccacacaaaaatctgacatgtggttacgtggatcccacacaagcacacttttt 44454079  T
Q  288 cttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggt----gtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||    ||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44454080 ctttcctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtcagagtataagggtgtataagaataaatggtgtttatgtaacattttcc 44454165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 185 - 369
Target Start/End: Original strand, 47748441 - 47748624
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||| | |||||| | |||||| ||||| |||||||  |||| || ||||||| | ||||    
T  47748441 atgagttatgatacataaatacccttaggtggcaatacacccttga-cacccatataaaaatctgacatgtggccatatggatcccgcacaagtatactt 47748539  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||||  ||| || |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  47748540 tctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagagtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 47748624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 217 - 336
Target Start/End: Original strand, 13414791 - 13414910
Alignment:
Q  217 caatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatg 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||  |||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  13414791 caatacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacattttctcttttctatcatcttctctcttcctaatg 13414890  T
Q  317 tatggggtgtacaagggtgt 336  Q
     |||| |||||| |||||||    
T  13414891 catggagtgtactagggtgt 13414910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 3302635 - 3302451
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||| |  | |  |||||||||||||||| ||||||||   ||  |||||||   ||||||||||||    
T  3302635 atgagtaatgatacatatacatccttaggtgacaatatattcctggacacccacacaaaaatctgacacgtaatcatatggaccccatacaagcacactt 3302536  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||| |||  |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  3302535 tctttttcatctcatcttctctcttccaaatatatagggtgtacaagggtgtatgttaataaaggatgtttatataacattttcc 3302451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 231 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 44332427 - 44332289
Alignment:
Q  231 acacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaa 330  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||   ||||||| ||||||| | |||||||||||  ||| || |||||||||||||||  || | ||||||||    
T  44332427 acacccacataaaaatctgacatgtggccctatggaccccgcacaagtatactttctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatagagtgtacaa 44332328  T
Q  331 gggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||||||  | |||| ||| | |||||||||||||||    
T  44332327 gggtgtatgcaattaaaaggtatctatgtaacattttcc 44332289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 214 - 327
Target Start/End: Original strand, 48489328 - 48489440
Alignment:
Q  214 tggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttccta 313  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||||||| ||||| |||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  48489328 tggcaatacaccctgga-catccacacaaaaatctgacatgtggtcacgtggatcccgcacaagcacattttctattttctcacctcttctctcttccta 48489426  T
Q  314 atgtatggggtgta 327  Q
     | ||| |||||||    
T  48489427 gtatatagggtgta 48489440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 351
Target Start/End: Original strand, 7740733 - 7740897
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||||||||||||| |||| |||||  || ||||||| || || ||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||  | | ||||    
T  7740733 gagttatgatacattgacaaccttatgtgacaatacatccattgacacctacataaaaatatgacacgtggctatgtggaccccacacaaatatattttc 7740832  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggt 351  Q
    | |||  |||||| ||||||||||||  || ||||| ||||||| | |||| | |||||||||||    
T  7740833 tttttcatctcctcttctctcttcctgttgcatgggatgtacaaagatgtacgagaataaagggt 7740897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 34340059 - 34339968
Alignment:
Q  275 aagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 367  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| | || || ||||||||||| |||| ||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  34340059 aagcacagtttcttttttctcttctcttctctcttccaagtgcatagggtgtacaagagtgt-tgaaaataaaaggtgtctatgtaacatttt 34339968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 7447990 - 7447936
Alignment:
Q  214 tggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccc 269  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||    
T  7447990 tggcaatacacccttta-cacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccc 7447936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 35003351 - 35003294
Alignment:
Q  312 taatgtatggggtgtacaa--gggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  35003351 taatgtatggggtgtacaatagggtgtatg--attaaagggtgttcatgtaacattttcc 35003294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 37814806 - 37814777
Alignment:
Q  341 gaataaagggtgtttatgtaacattttccc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37814806 gaataaagggtgtttatgtaacattttccc 37814777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 4401493 - 4401450
Alignment:
Q  214 tggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggc 258  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  4401493 tggcaatacacccttta-cacccacacaaaattctgacacgtggc 4401450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 258
Target Start/End: Original strand, 50448195 - 50448238
Alignment:
Q  214 tggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggc 258  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  50448195 tggcaatacacccttta-cacccacacaaaattctgacacgtggc 50448238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 185 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 43414683 - 43414499
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| |||| || ||||||||||||||    
T  43414683 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaacacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtggtcacatggatcccgcacaagcacactt 43414584  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  43414583 tctcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatggcaataaagggtgtctatgtaacattttcc 43414499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 4854963 - 4854781
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4854963 gagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacctacataaaaatctgatatgtggccacatggaccctgcacaagcacactttc 4854864  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  4854863 tcttttctctcctcttctctcttactaatgtatgggatgtacaagggtatatgagaataaagagtgtctatgtaacattttcc 4854781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 186 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15048282 - 15048099
Alignment:
Q  186 tgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacacttt 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15048282 tgagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacc-acacaaaaatctgacacgtagccacatggaccccgcacaagcacacttt 15048184  T
Q  286 ctcttttc-tctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15048183 ctctttttatctcctcttctctcttcctaatgtatgggatgtacaagggtgtatcggaataaagggtgtctatataacattttcc 15048099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 194 - 365
Target Start/End: Original strand, 14547929 - 14548100
Alignment:
Q  194 gatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttttc 293  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14547929 gatacatagacacccttaggtggcaatacaccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttc 14548028  T
Q  294 tctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14548029 tctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 14548100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Original strand, 12831047 - 12831225
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12831047 gagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 12831146  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  12831147 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtatcatt 12831225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Original strand, 37038479 - 37038661
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||    
T  37038479 gagtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 37038578  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37038579 tatttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatagaaataaagggtgtttatgtaacattttcc 37038661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 185 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 504223 - 504043
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |    
T  504223 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacat 504124  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  504123 tctcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 504043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Original strand, 5957835 - 5958011
Alignment:
Q  192 atgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttt 291  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  5957835 atgatacatagacattcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaatcacactttctcttt 5957934  T
Q  292 tctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 368  Q
     ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5957935 cctctcctcttctctcttcctagtgcatgaggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtttatgtaacattttc 5958011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 185 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 23122699 - 23122519
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23122699 atgagtaatgatacatagacacccttaagtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcataagcacactt 23122600  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  23122599 tctcttttctctcctgttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 23122519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 185 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 34012398 - 34012218
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||| || ||||||||||||||    
T  34012398 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactt 34012299  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||    
T  34012298 tctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtacgagaataaagggtgtctatgtatcatt 34012218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 185 - 365
Target Start/End: Original strand, 15197331 - 15197511
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15197331 atgagtaatgatacatagacactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 15197430  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||    
T  15197431 tctcttttctctcctcttttctcttccaaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaaaagtgtctatgtatcatt 15197511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 186 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 40424044 - 40423864
Alignment:
Q  186 tgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacacttt 285  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||||||    
T  40424044 tgagtaatgatacatagatacccttaggtggcaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcacacttt 40423945  T
Q  286 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattt 366  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  40423944 ctcttttctctcctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaaaggtgtctatgtatcattt 40423864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 187 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 10284731 - 10284546
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10284731 gagttatgatacatagacacccttaagtgacaatacactctttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 10284632  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcccaa 372  Q
    ||||| || || | ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  10284631 tctttcctttcatcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaaggttgtataagaataaaaggtgtctatgtaacattttcccaa 10284546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 187 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 44507187 - 44507027
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  44507187 gagtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacactctttaacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcatactttc 44507088  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaa 347  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44507087 tcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaa 44507027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 187 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 1180040 - 1179878
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | || |||||  | ||||||||||||||||    
T  1180040 gagtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggattccgcacaagcacactttc 1179941  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagg 349  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  1179940 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggatatatgggaataaagg 1179878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 207 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 8841512 - 8841350
Alignment:
Q  207 ccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttttctctcctattctct 306  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  8841512 ccttaggtggcagtacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctttcctctcctcttctct 8841413  T
Q  307 cttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
     |||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  8841412 tttcctagtgcatggggtgtacaagagtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 8841350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 189 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 10621185 - 10621047
Alignment:
Q  189 gttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctc 288  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| | || || ||||||||||||||||||    
T  10621185 gttatgatacatagacatccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagccacatcgatcccgcacaagcacactttctc 10621086  T
Q  289 ttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgta 327  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10621085 ttttctctcctcttctctcttcctaatatatgggatgta 10621047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15259029 - 15258847
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| || |  ||| ||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15259029 gagttatgatacatagatactcttagatggcaatacatccctggacatccacataaaaatctgacatgtggtcacgtggaccctgcacaagcacattttc 15258930  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||   ||| || |||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  15258929 tctttcctctcctcttctctcttcctagaatataggatgtacaaaagtgtatggaaataaagggtgtctatgtaacattttcc 15258847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Original strand, 34307216 - 34307394
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||| ||  || |||| ||||||| ||||||||    
T  34307216 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggacatatgaaccccgcacaagtacactttc 34307315  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    |||||  ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||    
T  34307316 tctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 34307394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16056501 - 16056322
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| || || |||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  16056501 gagttatgatacataaacatccttatgtgacaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 16056402  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattt 366  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||||||||    
T  16056401 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattt 16056322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 231 - 365
Target Start/End: Original strand, 9122229 - 9122363
Alignment:
Q  231 acacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaa 330  Q
    |||||||||||||||| ||||| || | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9122229 acacccacacaaaaatctgacatgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaa 9122328  T
Q  331 gggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    | ||||||||||||||||  ||| |||||| ||||    
T  9122329 gagtgtatgggaataaagaatgtctatgtatcatt 9122363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 24307893 - 24307715
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| || || |||||||||||||||| ||| | |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  24307893 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgatatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 24307794  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||    
T  24307793 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 24307715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 187 - 331
Target Start/End: Original strand, 16383377 - 16383521
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  16383377 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 16383476  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaag 331  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16383477 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaag 16383521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 30479574 - 30479396
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||| ||||| |  ||||||  ||||||| ||||||||    
T  30479574 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccctttgacatccacataaaaatctgacatgtggctatatggacctcgcacaagtacactttc 30479475  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||    
T  30479474 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 30479396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Original strand, 32032725 - 32032906
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||| | || |||||||||||| ||||| |||||||  |||| |||||||||| ||||||||    
T  32032725 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacatccttga-catccacacaaaaatctgacatgtggccatatggatcctgcacaagtacactttc 32032823  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||   || || |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  32032824 tctttctccttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 32032906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 280 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 42710301 - 42710228
Alignment:
Q  280 cactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgt 353  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42710301 cactttctcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgt 42710228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Original strand, 42221515 - 42221697
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| || |||||||  | |  |||||||||||||||| ||||||||   ||  |||||||   ||||||||||||||    
T  42221515 gagtaatgatacatatacatccttaggtgacaatacattcctggacacccacacaaaaatctgacacgtaatcatatggaccccatacaagcacactttc 42221614  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||  |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  42221615 tctttcatctcatcttctctcttccaaatatatagggtgtacaagggtgtatgtaaataaaggatgtttatataacattttcc 42221697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 185 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20075036 - 20074916
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||        ||||||||||||||||||||||||||    
T  20075036 atgagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacactctttgacacccacataaaaatgtga--------cacgtggaccctgcacaagcacactt 20074945  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttccta 313  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||    
T  20074944 tctctttcctcttctcttctctcttccta 20074916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 368
Target Start/End: Original strand, 25838197 - 25838370
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||        ||||| | ||| ||||| | | |||||||||||||     
T  25838197 gagttatgataaatagatatccttaggtggcaatacactttttgacatccacacaa--------cacgttgtcacatggactccgtacaagcacactttt 25838288  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 368  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| | | ||||||||||||||    
T  25838289 tcttttctctcctcttctcttttgctaatgtatagggtgtacaaggttgtatggcaataaaggatatctatgtaacattttc 25838370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 367
Target Start/End: Original strand, 17443825 - 17444005
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||| || | || ||||||||  |||||  ||||||||    
T  17443825 gagttatgatacatagacaaccttaggtgacaatacacttcttaacactcacacaaaaatctgacatgtagtcatgtggaccccacacaaagacactttc 17443924  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 367  Q
    |||||  ||| || ||||||||||| | || ||| | ||||||||| |||||    ||||||||||| |||||||||||||    
T  17443925 tctttcatcttctcttctctcttcccagtgcatgagttgtacaaggatgtattcttataaagggtgtctatgtaacatttt 17444005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 242 - 369
Target Start/End: Original strand, 40467755 - 40467882
Alignment:
Q  242 aaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatggg 341  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||   | ||||||    
T  40467755 aaaatctgacatgtgaccacgtggacttcgcacaagcacactttctctttcctctcatcttctctcttcctagtctatggggtgtacaaaaatttatggg 40467854  T
Q  342 aataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  40467855 gataaaaggtgtctatgtaacattttcc 40467882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 275 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 42354600 - 42354506
Alignment:
Q  275 aagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  42354600 aagcacactttctctttcatcttctcttctctcttcctagtgcatggggtgtagaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 42354506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 32708061 - 32707921
Alignment:
Q  231 acacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaag--cacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtac 328  Q
    ||||||| |||||||| ||| | ||||| |  ||||||| |||||||  ||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||  |||||||||||    
T  32708061 acacccatacaaaaatctgagatgtggctatatggaccccgcacaagtacacactttctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtac 32707962  T
Q  329 aagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  32707961 aagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 32707921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14055692 - 14055532
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtgga-ccctgcacaagcacacttt 285  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| | || ||| |||||||||||| | ||| || | |||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  14055692 gagttatgatacattgacacccttaggtgacaatacactccttgacatccacacaaaaatcttacatgtagtcacgtggacccctacacaagc-cacttt 14055594  T
Q  286 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaa 347  Q
     ||||| ||||  | |||||||||| ||||| ||| ||| ||||| |||||||| |||||||    
T  14055593 ttctttcctctgatcttctctcttcttaatgaatgaggtatacaaaggtgtatgagaataaa 14055532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 260
Target Start/End: Original strand, 24307629 - 24307702
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggcca 260  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| || || |||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  24307629 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacatccattgacacccacacaaaaatctgatatgtggcca 24307702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 306
Target Start/End: Original strand, 38229427 - 38229547
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    ||||||||||||||||  |||  ||||| ||||||||| | |  | |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||  ||| ||||||||| ||    
T  38229427 atgagttatgatacatgaacactcttaggtggcaatacgctc-ctgacacccacacaaaaatctgacatgtggtcacgtggattctgtacaagcacattt 38229525  T
Q  285 tctcttttctctcctattctct 306  Q
    ||||||| |||| || ||||||    
T  38229526 tctctttcctcttctcttctct 38229547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 29705527 - 29705466
Alignment:
Q  214 tggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaa 276  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  29705527 tggcaatacacccttta-cacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccgcacaa 29705466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 30183887 - 30183794
Alignment:
Q  275 aagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||||||||||||||  | || | |||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  30183887 aagcacactttctctttcat-tcatcttctttcttccaaatatatggggtgtacaagagtgtatgtaaataaaggatgtctatctaacattttcc 30183794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 2547161 - 2547118
Alignment:
Q  214 tggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggc 258  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  2547161 tggcaatacacccttta-cacccacacaaaattctgacacgtggc 2547118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 258
Target Start/End: Original strand, 42197370 - 42197413
Alignment:
Q  214 tggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggc 258  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  42197370 tggcaatacacccttta-cacccacacaaaattttgacacgtggc 42197413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Original strand, 31976248 - 31976430
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||    
T  31976248 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaatataccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatgaaccccgcacaagcacactttc 31976347  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  31976348 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 31976430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 185 - 365
Target Start/End: Original strand, 32869676 - 32869856
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  32869676 atgagtaaagatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 32869775  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  32869776 tctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 32869856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31110859 - 31110679
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31110859 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacactcaca--aaaatctgacacgtaaccacatggaccctgcacaagcacactttc 31110762  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  31110761 tcttttctctactcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaaaggtgtatggaaataaaggatgtctatgtaacattttcc 31110679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 192 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22880753 - 22880580
Alignment:
Q  192 atgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttt 291  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22880753 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaattctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 22880654  T
Q  292 tctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  22880653 tctctcctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtatatgtatcatt 22880580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 185 - 365
Target Start/End: Original strand, 17598552 - 17598732
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17598552 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacatcttttgacacccacacaaaaatctgacacgttgtcacgtggaccccgcacaagcacactt 17598651  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||    
T  17598652 tctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtctatgtatcatt 17598732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Original strand, 29857827 - 29858005
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| || ||| ||||||||||||    
T  29857827 gagtaatgatacatagacacctttagatggcaatacaccttttaacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgcataagcacactttc 29857926  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  29857927 tcttttctcttctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 29858005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Original strand, 11427616 - 11427796
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatcct--tagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||| || ||||||||||||||    
T  11427616 gagtaatgatacatagacaccctcttaggtggcaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactt 11427715  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  11427716 tctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 11427796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15990142 - 15989960
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  15990142 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 15990043  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||  ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  15990042 tctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 15989960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 30341460 - 30341278
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  30341460 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 30341361  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||  ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  30341360 tctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 30341278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 186 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15508125 - 15507942
Alignment:
Q  186 tgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacacttt 285  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||| |||||||    
T  15508125 tgagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacacttt 15508026  T
Q  286 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||||  ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  15508025 ctctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaaggatgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 15507942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 186 - 369
Target Start/End: Original strand, 4231547 - 4231730
Alignment:
Q  186 tgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacacttt 285  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||    
T  4231547 tgagttatgattcataaacatcattaggtggcaatacaccccttgccacccacacaaaaatctgacacgtggccatatggaccccgcacaagtacacttt 4231646  T
Q  286 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||||  ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  4231647 ctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 4231730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 6209565 - 6209388
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| |||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  6209565 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacactatttgacactcacacaaaaatctgtcacgtagtcacgtggaccccgcactagcacactttc 6209466  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||| ||||||||||||| | |||||| ||||    
T  6209465 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaaagatgta-gggaataaagggtatctatgtatcatt 6209388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 187 - 353
Target Start/End: Original strand, 15832577 - 15832743
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| | |||| || ||||| | | ||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||  ||| ||||    
T  15832577 gagtaatgatacatagacacctttaggtgacaataaatcatttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggatcctgcacaaatacattttc 15832676  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgt 353  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15832677 tcttttttctcctcttctatcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtattggaataaagggtgt 15832743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 183 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31953134 - 31952948
Alignment:
Q  183 acatgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacac 282  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||| |||  || |||||||   ||||| |||||    
T  31953134 acatgagtaatgatagatagacatccttaggtggcaatacaccccttgacacccacataaaaatctgacatgtgttcatgtggacctcacacaaacacac 31953035  T
Q  283 tttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||||||  ||| || ||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  31953034 tttctctttcatcttctcttctctcttcctagtgcatggggtgtagaaggatgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 31952948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 186 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 31109501 - 31109351
Alignment:
Q  186 tgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacacttt 285  Q
    ||||| |||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||| ||| |||||||    
T  31109501 tgagtaatgattaatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtagaccccgcaaaagtacacttt 31109402  T
Q  286 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgt 336  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31109401 ctcttttctctcctcttttctcttcctaatgcatggggtatacaagggtgt 31109351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23128196 - 23128067
Alignment:
Q  218 aatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgt 317  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  23128196 aatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccacacaagcacactttctcttttctctcctcttttctcttcctaatgc 23128097  T
Q  318 atggggtgtacaagggtgtatgggaataaa 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  23128096 atgggatgtacaagggtgtatggaaataaa 23128067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 28536581 - 28536408
Alignment:
Q  192 atgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttt 291  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||  | || ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  28536581 atgatacataaacatccttaggtggcaatacaacccttgacacccacacaaaaatctgacacg--gtcatgtggaccccacacaagcacactttctcttt 28536484  T
Q  292 tctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 367  Q
    | ||| || ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| | |||  ||||||||||||    
T  28536483 tatcttctcttccctcttcctactgcatggggtgtacaagggtgtatgaaaataaatgatgtcgatgtaacatttt 28536408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 185 - 367
Target Start/End: Original strand, 30870018 - 30870193
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||      |||||||| | |||||| | ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  30870018 atgagttatgatacacagatatccttagatggtaaaaca------aacacccatataaaaatctaacatgtggtcacatggaccccgcacaagcacattt 30870111  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 367  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||| | ||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  30870112 tctctttcctctcctcttctctctttctagtatatagggtgtacaaaggtgtatgaaaataaagggtgtctat-taacatttt 30870193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 194 - 331
Target Start/End: Original strand, 946383 - 946520
Alignment:
Q  194 gatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttttc 293  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| | | |||||  | || || | ||||||||||||||||||    
T  946383 gatacatagacatccttaggtgataatacaccctttgacacctacccaaaaatctgacacctagtcacgtaaatcccgctctagcacactttctcttttc 946482  T
Q  294 tctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaag 331  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  946483 tctcctcttctctcttcctaatgcatgagatgtacaag 946520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 191 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 9379808 - 9379660
Alignment:
Q  191 tatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctctt 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |   ||||| |||| ||||||||    
T  9379808 tatgatacatagacatccttagatgacaatacatcccttgacacccatacaaaaatttgacacgtggccatgtggatctcacacaaacacattttctctt 9379709  T
Q  291 ttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatg 339  Q
    |  ||| || || ||||||||||||| ||  ||| ||||||| ||||||    
T  9379708 tcatcttctcttttctcttcctaatgcataaggtatacaaggatgtatg 9379660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 309
Target Start/End: Original strand, 12732482 - 12732604
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||  |||||||| |  | || |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||  || ||||||| ||||    
T  12732482 gagtaatgatacatagacattcttaagtggcaatataatcattgacacccacacaaaaatctgacacgtggctatgtggatcccacataagcacattttc 12732581  T
Q  287 tcttttctctcctattctctctt 309  Q
    |||||  |||||| |||||||||    
T  12732582 tctttcatctcctcttctctctt 12732604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22422043 - 22421997
Alignment:
Q  323 gtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22422043 gtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 22421997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26466850 - 26466799
Alignment:
Q  318 atggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||| |||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26466850 atggagtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 26466799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 267
Target Start/End: Original strand, 26669944 - 26669996
Alignment:
Q  214 tggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggac 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || |||||    
T  26669944 tggcaatacacccttta-cacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggac 26669996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 341 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 3213428 - 3213400
Alignment:
Q  341 gaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3213428 gaataaagggtgtttatgtaacattttcc 3213400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 7367714 - 7367671
Alignment:
Q  214 tggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggc 258  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  7367714 tggcaatacacccttta-cacccacacaaaattctgacacgtggc 7367671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 341 - 369
Target Start/End: Original strand, 21293749 - 21293777
Alignment:
Q  341 gaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21293749 gaataaagggtgtttatgtaacattttcc 21293777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 188 - 369
Target Start/End: Original strand, 35522877 - 35523058
Alignment:
Q  188 agttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttct 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  35522877 agttatgatacatagacatccttaagtggcaatacaccatttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccatatggatcccgcacaagcacactttct 35522976  T
Q  288 cttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35522977 cttttctctcttcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtttatgtaacattttcc 35523058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 183 - 365
Target Start/End: Original strand, 19329838 - 19330020
Alignment:
Q  183 acatgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacac 282  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||||||    
T  19329838 acatgagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtaatcacgtggaccccgcacaagcacac 19329937  T
Q  283 tttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19329938 tttctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 19330020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 8080483 - 8080305
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8080483 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacctacataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 8080384  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  8080383 tcttttctctcctcttctctcttcctattgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 8080305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 185 - 369
Target Start/End: Original strand, 31735882 - 31736059
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  31735882 atgagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacactctttaacacccacacaaa-------cacgtggccacatggatcccgcacaagcacactt 31735974  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  31735975 tctcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaaaggtatctatctaacattttcc 31736059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Original strand, 38837217 - 38837395
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38837217 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacacccttgtacacctacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 38837316  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  38837317 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatggaaataaagggtgtctatgtatcatt 38837395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 46033901 - 46033719
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| || || | ||||||||| | ||||    
T  46033901 gagttatgatacatagatattcttaggtggcaatacaccctttaacacccacataaaaatctgacacgtggtcacatgaactccgcacaagcatattttc 46033802  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  46033801 tcttttctctcctcttctctattcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 46033719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 185 - 369
Target Start/End: Original strand, 21234399 - 21234583
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||||| ||    
T  21234399 atgagttatgatacatagacatccttaggtgacaatacaccctttgacactcacacaaaaatttgacacgtagccacatgtaccccgcacaagcacattt 21234498  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21234499 tctcttacctctcctttcctctcttcctaatgtatggggtgtacaatggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtaacattttcc 21234583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 4999614 - 4999436
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  4999614 gagtaatgatacatagacacccttagatggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgatacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacactttc 4999515  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  4999514 tcttttatctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtatcatt 4999436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Original strand, 7389389 - 7389566
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7389389 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 7389488  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  7389489 tcttttctctcctactctctcttcctaatacatggggtgtac-agggtgtatgggaataaaggatgtctatgtatcatt 7389566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 192 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 32951588 - 32951415
Alignment:
Q  192 atgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttt 291  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32951588 atgatacatagacactcttagatgacaatacatcctttaacatccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 32951489  T
Q  292 tctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||    
T  32951488 tctctcctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgagaataaggggtgtctatgtatcatt 32951415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Original strand, 26296644 - 26296826
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||| |||||||| || ||||    
T  26296644 gagttatgatacatagacatccttaggtgacaatataccctttaacatccacataaaaatctgatacgtggccatatggaccccgcacaagcgcattttc 26296743  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||| || ||||||||||||    
T  26296744 tcttttctctcctcttctctcttcttaatgtatgaggtgtacaagggtgtatggaaatatatggtgtctacgtaacattttcc 26296826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 187 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 19436287 - 19436114
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||| || ||| ||||||||||||    
T  19436287 gagtaatgatacatagacatccttaggtgacaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcataagcacactttc 19436188  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgta 360  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  19436187 tcttttctcttctcttttctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgta 19436114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 185 - 339
Target Start/End: Original strand, 35137531 - 35137685
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||| |||||||    
T  35137531 atgagtaatgataaatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacactt 35137630  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatg 339  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  35137631 tctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatg 35137685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 192 - 349
Target Start/End: Original strand, 3784000 - 3784157
Alignment:
Q  192 atgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttt 291  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  3784000 atgatacatagacacccttaggtggcaatacatcttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttctcttt 3784099  T
Q  292 tctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagg 349  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  3784100 tctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagaatgtatgtgaataaagg 3784157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 186 - 347
Target Start/End: Original strand, 38267039 - 38267200
Alignment:
Q  186 tgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacacttt 285  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  38267039 tgagtaatgatacatagacacccttatgtgacaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 38267138  T
Q  286 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaa 347  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||||    
T  38267139 ctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacgaaggtgtatggaaataaa 38267200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Original strand, 40957707 - 40957885
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||| | |||||||| || | ||||||||||||||    
T  40957707 gagtaatgatacatagacactcttaggtggcaatacactctttgatacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgtacaagcacactttc 40957806  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| ||||    
T  40957807 tcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgaaaataatgggtgtctatgtatcatt 40957885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 187 - 367
Target Start/End: Original strand, 41915741 - 41915921
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  41915741 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacctacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 41915840  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 367  Q
    |||||  ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||    
T  41915841 tctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatttt 41915921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Original strand, 3434562 - 3434730
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||    
T  3434562 gagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaaactgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 3434661  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||          |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  3434662 tctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggctgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 3434730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 186 - 369
Target Start/End: Original strand, 41423681 - 41423864
Alignment:
Q  186 tgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacacttt 285  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  || ||||  |||||||||| ||||| |||| ||||| || || | ||||||| | |||    
T  41423681 tgagttatgatacatagacatcattagatggtaatacacctcttgacacttacacaaaaatctgacatgtggtcacgtagatcccgtacaagcatatttt 41423780  T
Q  286 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41423781 ctctttcatctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtttatgtaacattttcc 41423864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Original strand, 22343361 - 22343543
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||| |||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  22343361 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtgaccatatggaccccgcacaagtacactttc 22343460  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  22343461 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 22343543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 192 - 340
Target Start/End: Original strand, 3694372 - 3694520
Alignment:
Q  192 atgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttt 291  Q
    |||||| ||| ||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  3694372 atgatatatacacacccttaggtgacaatacaccttttaacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggatcccgcacaagcacactttctcttt 3694471  T
Q  292 tctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgg 340  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  3694472 tctctcctcttctctcttcccaatgcatggggtgtacaagagtgtatgg 3694520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 46374902 - 46374742
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||         
T  46374902 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaacacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatggaccccgcacaagcaca----- 46374808  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  46374807 -----------------tctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtaacattttcc 46374742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 35468955 - 35468773
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||| | | | ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  35468955 gagtaatgatacatagacatccttagatggcaatacatcatttgacacccacataaaaatctaatatgtgaccatgtggaccctgcacaaacacactttc 35468856  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||| |  ||| | |||| |||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  35468855 tctttcctatcctcttctctcttcctagttcatgagatgtataaggatgtatgagaataaaaggtgtatatgtaacattttcc 35468773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Original strand, 38044197 - 38044379
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||| || ||||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  38044197 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacatccacacaaaaatctgacatgtagccatatggaccccgcacaagtacactttc 38044296  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||  ||| || || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  38044297 tctttcttcttctcttttctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 38044379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 185 - 369
Target Start/End: Original strand, 8238210 - 8238395
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatcct-tagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacact 283  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || | ||  ||||||| ||||||| |||||    
T  8238210 atgagttatgatacataaacaccctgtaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacatgtagtcatatggaccccgcacaagtacact 8238309  T
Q  284 ttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||||||  ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | |||| || || |||||||||||||||    
T  8238310 ttctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggcgtctatgtaacattttcc 8238395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 187 - 367
Target Start/End: Original strand, 18207180 - 18207359
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  || ||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||    
T  18207180 gagttatgatacatagacaaccttaggtggcaatacacctcttgacacccatacaaaaatctaacacgtggc-acgtgaaccccacacaagcacactttc 18207278  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 367  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||| || || | |||||||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||    
T  18207279 tctttcatctcctcttctctcttcctagtggatagagtgtacaagggtgtatgataataaagggtatctatctaacatttt 18207359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 217 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 16374894 - 16374743
Alignment:
Q  217 caatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatg 316  Q
    ||||||| || || ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |   ||||||||||| ||||||||  |||| | ||||||||||||||||    
T  16374894 caatacatcccttgacatccacacaaaaatctgacacgtggtcacgtggatctcacacaagcacacattctctttcatctctttttctctcttcctaatg 16374795  T
Q  317 tatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 368  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16374794 tatggagtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttc 16374743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 186 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 32564527 - 32564374
Alignment:
Q  186 tgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacacttt 285  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||| ||||||  |||||||    
T  32564527 tgagttatgatacataaacattcttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggctatatggaccccgcacaaatacacttt 32564428  T
Q  286 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatg 339  Q
    ||||||  ||| || |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  32564427 ctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatg 32564374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 186 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 39256024 - 39255844
Alignment:
Q  186 tgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacacttt 285  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  || | ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |  |||||| |||||||    
T  39256024 tgagttatgatacatagacaaccttaggtggcaatacaccacttgatacccatacaaaaatctgacacgtgg-cacgtggactccacacaagaacacttt 39255926  T
Q  286 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 367  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||   || || |  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  39255925 ctctttcatctcctcttctctcttcccggtggatagaatgtacaagggtgtatgataataaagggtgtctatgtaacatttt 39255844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 221 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27744375 - 27744227
Alignment:
Q  221 acaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatg 320  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||  || ||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |||    
T  27744375 acaccctttgatacccacacaaaaatctgacatgtggccacgtggatccctcataagcacattttctctatcctctcctcttctctcttcctagtgcatg 27744276  T
Q  321 gggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    || ||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  27744275 ggatgtacaaggatatatgggaataaatggtgtttatataacattttcc 27744227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 187 - 313
Target Start/End: Original strand, 36208173 - 36208299
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||  | || |||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36208173 gagttatgatacatagacacccttaggtggtaatacattcattgacacccacacaaaaagctgacatgtggtcacgtggaccctgcacaagcacattttc 36208272  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttccta 313  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  36208273 tctttcctctcctcttctctcttccta 36208299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 187 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 36362013 - 36361904
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||    
T  36362013 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacactttc 36361914  T
Q  287 tcttttctct 296  Q
    ||||||||||    
T  36361913 tcttttctct 36361904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Original strand, 36362026 - 36362192
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||    
T  36362026 gagtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacactttc 36362125  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    |||||            ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  36362126 tcttt------------tctcttcctaatacatgggatgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 36362192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 187 - 367
Target Start/End: Original strand, 7727906 - 7728086
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||  || |||  |||| |||||| ||||| |||| ||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  7727906 gagttatgatacataaacacccttaggtggtaatacacctcttgacattcacataaaaatctgacatgtggtcatatggaccccgcacaagtacactttc 7728005  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 367  Q
    | |||  ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||| |||||||||||||    
T  7728006 tgtttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaaggatgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatttt 7728086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Original strand, 11044188 - 11044356
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||           |||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11044188 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacatcctttgacacccc----------tgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagtacactttc 11044277  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||    
T  11044278 tctttcctctcatcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaaaggtgtatgaaaataaagagtgtctatgtatcatt 11044356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 40846213 - 40846031
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||| | ||| || |  |  ||||||| ||||||  ||||||||    
T  40846213 gagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacaccccttgacatccacacaaaaatctaacatgtagttatatggaccccgcacaaatacactttc 40846114  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||  ||| || ||||||||||||||   ||| | ||||||||||||||||  | |||| ||| | |||||||||||||||    
T  40846113 tctttcttcttctcttctctcttcctaaaagatgagatgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtatctatgtaacattttcc 40846031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Original strand, 12310906 - 12311086
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| | |  |  | | ||| |||||||| ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||| |||     
T  12310906 gagttatgatacatagacacccttaggtggaaatatatc--tggatatccatacaaaaatctgacatgtggtcacgtggatcctgaacaagcacatttta 12311003  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||| | ||   | ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12311004 tctttcctttcctcttctctcttcctagtatacaagatgtacaaaggtgtatggaaataaagggtgtctatgtaacattttcc 12311086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 2318338 - 2318160
Alignment:
Q  192 atgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttt 291  Q
    |||||||||  ||| || ||| |||||| |||||  || |||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||  || ||||| |||||||||||    
T  2318338 atgatacattaacaaccataggtggcaagacacctcttgacacccacacaaaaatctgacgtgtggtcacgtggacccgacataagcatactttctcttt 2318239  T
Q  292 tctctcctattctctct-tc-ctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 368  Q
      |||| | |||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2318238 catctcatcttctctctctctctaatgcatggagtgtacaaaggtgtatggaaataaagtgtgtctatgtaacattttc 2318160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 10343663 - 10343531
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||   || |||||||||||||||| |||||| ||    ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  10343663 gagtaatgatacatagacacccttaggtggaaatacacatcttgacacccacacaaaaatctgacacatgtttccgtggactctgcagacgcacactttc 10343564  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtat 319  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  10343563 tctttcctctcctcttctctcttcctagtgtat 10343531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 1766795 - 1766702
Alignment:
Q  273 acaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattt 366  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || | |||| ||| |||||| || |||| ||| |||| |||| ||||||||||||    
T  1766795 acaagcacactttctctttcctctcctcttctctcttcgtagtatatgaggtatacaagagtatatgagaacaaagtgtgtctatgtaacattt 1766702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 367
Target Start/End: Original strand, 45223042 - 45223222
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||| |||| | |||||||||| ||||||||   ||  |  |||    |||||| || ||||    
T  45223042 gagtaatgatatatatacatccttaggtggcaatacattcttgaacatctacacaaaaatctgacacgtaatcatattaacctcatacaagcgcattttc 45223141  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 367  Q
    |||||  |||| | ||||||||| | ||| |||||||||||||| | ||||||  |||||||| ||| ||||| |||||||    
T  45223142 tctttcatctcatcttctctctttcaaatatatggggtgtacaaagatgtatgtaaataaaggatgtctatgtgacatttt 45223222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 269
Target Start/End: Original strand, 32029752 - 32029806
Alignment:
Q  214 tggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccc 269  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||    
T  32029752 tggcaatacacccttta-cacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccc 32029806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 368
Target Start/End: Original strand, 32045881 - 32046018
Alignment:
Q  231 acacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaa 330  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||  |||  | |||||   || |||| ||||||| |||  |||| | ||||||||| | ||| |||| | |||||||    
T  32045881 acacccacataaaaatctgacacgtaaccatatagaccccatactagcatactttctttttcatctcatcttctctctttcaaatatatgagatgtacaa 32045980  T
Q  331 gggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 368  Q
    |||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||    
T  32045981 gggtgtatgtaaataaagaatgtctatgtaacattttc 32046018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 36361888 - 36361847
Alignment:
Q  324 tgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  36361888 tgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 36361847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 187 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15409710 - 15409527
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  15409710 gagttatgatacatagacatccttaggtgacaatacattctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagccacatggaccccgcacaagcacactctc 15409611  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttccc 370  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15409610 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgcgaataaagggtgtttatgtaacattttccc 15409527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 186 - 369
Target Start/End: Original strand, 26720515 - 26720698
Alignment:
Q  186 tgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacacttt 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  26720515 tgagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacctacaaaaaaatctgacacgtggccacatggatcccgcacaagcacacttt 26720614  T
Q  286 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||| ||| |||||||||||    
T  26720615 ctcttttctcttctcttctctcttcctaatgtatggggtgtactagggtgtatgagaataaatgatgtctatataacattttcc 26720698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 186 - 369
Target Start/End: Original strand, 26990264 - 26990447
Alignment:
Q  186 tgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacacttt 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  26990264 tgagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacctacaaaaaaatctgacacgtggccacatggatcccgcacaagcacacttt 26990363  T
Q  286 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||| ||| |||||||||||    
T  26990364 ctcttttctcttctcttctctcttcctaatgtatggggtgtactagggtgtatgagaataaatgatgtctatataacattttcc 26990447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Original strand, 2740274 - 2740452
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||    
T  2740274 gagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 2740373  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  2740374 tcttttctctccccttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 2740452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 185 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 33149740 - 33149560
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||| || ||||||||||||||    
T  33149740 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactt 33149641  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||    
T  33149640 tctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtacgagaataaagggtgtctatgtatcatt 33149560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 185 - 365
Target Start/End: Original strand, 40145405 - 40145585
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  40145405 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttaacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 40145504  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  40145505 tctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcacgaggtgtacaagggtatatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 40145585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 187 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 36733042 - 36732876
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36733042 gagtaatgatacatagacacccttaggtagcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 36732943  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgt 353  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36732942 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgt 36732876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 187 - 368
Target Start/End: Original strand, 6679698 - 6679879
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  6679698 gagttatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccgcacaaacacattttc 6679797  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| | ||| ||||||||||||||    
T  6679798 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatagggtgtacaagggtgtatgacaataaatgatgtctatgtaacattttc 6679879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 192 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 18520979 - 18520806
Alignment:
Q  192 atgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttt 291  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18520979 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 18520880  T
Q  292 tctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    | |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||    
T  18520879 tatctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgaaaataaagggtgtctatgtatcatt 18520806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 185 - 365
Target Start/End: Original strand, 14831812 - 14831992
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| | |||||||| || ||||||||||||||    
T  14831812 atgagtaatgatacatagacactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactt 14831911  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14831912 tcttttttttctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 14831992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 185 - 326
Target Start/End: Original strand, 28177773 - 28177914
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  28177773 atgagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccgcacaaacacactt 28177872  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgt 326  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  28177873 tctcttttctctcctcttccctcttcctaatgtatggggtgt 28177914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 186 - 365
Target Start/End: Original strand, 35785198 - 35785377
Alignment:
Q  186 tgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacacttt 285  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| || |||||| ||||||||    
T  35785198 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgcacaatcacacttt 35785297  T
Q  286 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||    
T  35785298 ctcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtctatgtatcatt 35785377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2252268 - 2252086
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  2252268 gagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 2252169  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||  ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  2252168 tctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 2252086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 194 - 360
Target Start/End: Original strand, 13811659 - 13811825
Alignment:
Q  194 gatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttttc 293  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  13811659 gatacatagacacccttaggtggcaatacatcatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttctc 13811758  T
Q  294 tctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgta 360  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13811759 tctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaaggatgtatgggaataaatggtgtctatgta 13811825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 3921365 - 3921183
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  3921365 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 3921266  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||  ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  3921265 tctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 3921183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Original strand, 31008988 - 31009170
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||  |||  |||||||||||||||| |||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||    
T  31008988 gagttatgatacataaacatccttaggtgacaatacattcttccacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 31009087  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    | ||| |||| || ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31009088 tatttcctcttctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 31009170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 187 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 35943992 - 35943812
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||  |||||||||||||||    
T  35943992 gagttatgatacatagacacccttaggtggcaatacatcatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccacacaagcacactttc 35943893  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 367  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||    
T  35943892 tctttcctctcctcttttctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatggaaataaaatgtgtctatgtaacatttt 35943812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 187 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 33825424 - 33825243
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | || ||||||||| |||||| |||||||||  || ||| ||| | |||||||||||||||    
T  33825424 gagtaatgatgcatagacattcttaggtggcaatacactccttgacacccacataaaaatctgacacgtgttcatgtgaaccttacacaagcacactttc 33825325  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 368  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||||    
T  33825324 tcttttatcttctcttctctcttcctagtgcatggggtgtagaaggctgtatgagaataaatggtgtcaatgtaacattttc 33825243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 186 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 6260102 - 6259919
Alignment:
Q  186 tgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacacttt 285  Q
    ||||| |||||||||| ||| || ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||| ||| ||||||   || |||||||||||    
T  6260102 tgagtaatgatacatacacaaccataggtgacaatacaccctttaacacccacgcaaaaatctaacacatggtcacatggacctcacagaagcacacttt 6260003  T
Q  286 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||||  |||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | | |||||||||||||||    
T  6260002 ctctttcatctcctcttctctctcactaatgtatgggatgtacaagtgtgtataggaataaaggatatctatgtaacattttcc 6259919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20073616 - 20073434
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20073616 gagtaatgatatatagacatcattagatgacaatacaccctttgacactcacataaaaatcttgcacgtgaccacgtggaccctgcacaagcacactttc 20073517  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||| |  ||| | | ||||| |||||||| |||||||   ||| ||| |||||||||||    
T  20073516 tatttcctctcctcttctctcttcctagttcatgagatttacaaaggtgtatgagaataaaaaatgtctatctaacattttcc 20073434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 192 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 36875698 - 36875537
Alignment:
Q  192 atgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttt 291  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||         | |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  36875698 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaata---------gtcacgtggatcccgcacaagcacactttctcttt 36875608  T
Q  292 tctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattt 366  Q
    | |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    ||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  36875607 tttctcctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaaggg----tggaaataaatggtgtctatgtaacattt 36875537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 185 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 42414404 - 42414275
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    |||||| |||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||||||    
T  42414404 atgagtaatgatacatagacaccagtaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcacactt 42414305  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaa 314  Q
    | |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  42414304 tatcttttctttcctcttctctcttcctaa 42414275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 231 - 369
Target Start/End: Original strand, 21370048 - 21370186
Alignment:
Q  231 acacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaa 330  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||| | |||| |||||||| | |||  | |||||||    
T  21370048 acacccactcaaaaatctgacatgtggtcacgtggaccccgcacaaacacattttctctttcctctcatcttctttcttcctagtatataagatgtacaa 21370147  T
Q  331 gggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21370148 aggtgtatgaaaataaagggtgtttatgtaacattttcc 21370186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 39688997 - 39688815
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| || || |||||||||||||||| ||| | |||| ||  || |||| ||| ||| ||||||||    
T  39688997 gagttatgatacataaacacccttaagtggcaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgatatgtggtcatatgaaccccgcataagtacactttc 39688898  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||  |||  | |||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  39688897 tctttcttcttttcttctctcttcctaatacatagggtgtacaaaggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 39688815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 259 - 369
Target Start/End: Original strand, 2177436 - 2177546
Alignment:
Q  259 cacgtggaccctgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatg 358  Q
    |||||||| ||  |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| || || || |||||||||||||||| |||||||  |||| | ||    
T  2177436 cacgtggatcccacacaagcacattttctctttcctctcctcttctctcttcctagtgcattggatgtacaagggtgtatgagaataaaatgtgtctctg 2177535  T
Q  359 taacattttcc 369  Q
    |||||||||||    
T  2177536 taacattttcc 2177546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 369
Target Start/End: Original strand, 16327906 - 16328083
Alignment:
Q  192 atgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttt 291  Q
    |||||| ||| | |||||||| |||||||||| || || ||||||||| |||||| |||||||||  || ||| |||   |||||||||||||| |||||    
T  16327906 atgatagataaatatccttaggtggcaatacatccattgacacccacataaaaatctgacacgtgttcatgtgcacctcacacaagcacactttttcttt 16328005  T
Q  292 tctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
      | | || |||||||| |||||| ||||||||||| ||  || ||||  |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16328006 cattttctcttctctctccctaatatatggggtgtagaaaagtatatgaaaataaatggtgtttatctaacattttcc 16328083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 39557586 - 39557457
Alignment:
Q  218 aatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgt 317  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||  ||| |||||||   |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||      
T  39557586 aatacacctcttaacatccacacaaaaatctgacacgtgatcacatggaccccatacaatcacactttctcttttatctcctcttctctcttcctaatac 39557487  T
Q  318 atggggtgtacaagggtgtatgggaataaa 347  Q
    ||| |||||||| || | |||| |||||||    
T  39557486 atgaggtgtacatggatctatgagaataaa 39557457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 367
Target Start/End: Original strand, 9603813 - 9603993
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| ||  ||||||| | || ||||| |||||||||| |||||| ||| ||  |||||||   |||| |||||||||    
T  9603813 gagtaatgatacatatacatccttaggtgataatacactcattcacacctacacaaaaatctgacacatggtcatatggaccccatacaatcacactttc 9603912  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 367  Q
    |||||  | || | |||||||||| || ||  |||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||    
T  9603913 tctttcatttcgtcttctctcttcttagtgcttgggatgtacaaaggtgtatgagaataaatggtgtctacgtaacatttt 9603993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 336
Target Start/End: Original strand, 38296203 - 38296352
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||||||   ||||| || |||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||    
T  38296203 gagttatgatacatagactatcttaggtgtcaatacacctcttaatacccacacaaaaatcagacacgtagctacgtggatccaacacaagcacactttc 38296302  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgt 336  Q
    || ||  |||||| |||| ||||| || |  |||||||||| || |||||    
T  38296303 tcattcatctcctcttctttcttcttactacatggggtgtataaaggtgt 38296352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 235 - 365
Target Start/End: Original strand, 31132392 - 31132512
Alignment:
Q  235 ccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggt 334  Q
    |||||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||          || |||||| ||| |||||||||||||    
T  31132392 ccacacaaaaatctgacaagtagtcacgtggaccccgcacaagcatactttttcttttctctc----------tttctaatgcatgaggtgtacaagggt 31132481  T
Q  335 gtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  31132482 gtatgaaaataaagggtgtttatgtatcatt 31132512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 246
Target Start/End: Original strand, 10356638 - 10356694
Alignment:
Q  191 tatgatacatagacatccttagatggcaataca-ccctttaacacccacacaaaaat 246  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  10356638 tatgatacatagacatccttaggtggcaatacatcccattgacacccacacaaaaat 10356694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 308 - 369
Target Start/End: Original strand, 33855082 - 33855143
Alignment:
Q  308 ttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || || | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33855082 ttcctaatacatggggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 33855143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 41470508 - 41470425
Alignment:
Q  195 atacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagc 278  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||| |  || | |||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  41470508 atacatagacacctttaggtggcaatacatcctttaaaattcatataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagc 41470425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 321 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18034030 - 18033982
Alignment:
Q  321 gggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||||||| || || | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18034030 gggtgtacaatggagtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 18033982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 341 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 38470607 - 38470579
Alignment:
Q  341 gaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38470607 gaataaagggtgtttatgtaacattttcc 38470579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 44)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 186 - 369
Target Start/End: Original strand, 31910191 - 31910374
Alignment:
Q  186 tgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacacttt 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31910191 tgagttatgatacatagacatccttaggtgacaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagccacatggaccccgcacaagcacacttt 31910290  T
Q  286 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  31910291 ctcttttctctcatcttctctcttcctaatgtatgggatgtacaagagtgtatgggaataaatggtgtctatgtaacattttcc 31910374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Original strand, 41236347 - 41236525
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41236347 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 41236446  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  41236447 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 41236525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 50052528 - 50052346
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50052528 gagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 50052429  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50052428 tctttcctctcctcttctctcttcctagtgcataaggtgtacaaaggtgtatgggaataaagggtgtctatgtaacattttcc 50052346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 48183149 - 48182971
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48183149 gagtaatgatacatagacacccttacgtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 48183050  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  48183049 tcttttctctcctcttctctcttcttaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 48182971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 186 - 365
Target Start/End: Original strand, 6034043 - 6034222
Alignment:
Q  186 tgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacacttt 285  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || | |||||||| || |||||||||||||||    
T  6034043 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacatgtagtcacgtggatcccgcacaagcacacttt 6034142  T
Q  286 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  6034143 ctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtatcatt 6034222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 186 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 50526272 - 50526089
Alignment:
Q  186 tgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacacttt 285  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||||||||| ||||    
T  50526272 tgagtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacgtggattccgcacaagcacgcttt 50526173  T
Q  286 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    || ||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50526172 ctatttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatagaaataaagggtgtttatgtaacattttcc 50526089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 185 - 367
Target Start/End: Original strand, 40574777 - 40574959
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  || || |||| || | ||||||||||||    
T  40574777 atgagttatgatacatagacatccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgctgctacatggatcccgaacaagcacactt 40574876  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 367  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  40574877 tctcttttctctcctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatctaacatttt 40574959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 42044467 - 42044289
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42044467 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacatccttgtacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 42044368  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  42044367 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatggaaataaagggtgtctatgtatcatt 42044289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 24995207 - 24995029
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24995207 gagtaatgatatatggacacccttagatggcaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacattttc 24995108  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24995107 tcttttctctcctcttctctcttcttaatgcatggggtgtacaatggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 24995029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Original strand, 29239886 - 29240068
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||| | |||||| | |||||||||||  |||||||||||||||    
T  29239886 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccatttgacatccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacactttc 29239985  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29239986 tctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagagtgtatgggaataaagggtgtctatgtaacattttcc 29240068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 186 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 54473634 - 54473455
Alignment:
Q  186 tgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacacttt 285  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  54473634 tgagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccatttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 54473535  T
Q  286 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  54473534 atcttttctctcctcttctctcttcctaatacatggagtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgttcatgtatcatt 54473455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 187 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 480547 - 480382
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  480547 gagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacactttc 480448  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtg 352  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  480447 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaaggtgtatggaaataatgggtg 480382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Original strand, 55475191 - 55475373
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| ||| ||||||||    
T  55475191 gagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccctgcataagtacactttc 55475290  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  55475291 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 55475373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 186 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 11511563 - 11511402
Alignment:
Q  186 tgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacacttt 285  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11511563 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 11511464  T
Q  286 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaa 347  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  11511463 ctcttttctcttctcttctctcttcttaatgcatgaggtgtacaagggtgtatggaaataaa 11511402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 187 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 29234345 - 29234205
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29234345 gagtaatgatacatagacacccttagatggcaatacaccctttgataccttcacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 29234246  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgta 327  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29234245 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgta 29234205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 225 - 369
Target Start/End: Original strand, 41823920 - 41824064
Alignment:
Q  225 cctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggt 324  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||    
T  41823920 cctttaacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacatggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcttcttctctcttcctaatgcatgaggt 41824019  T
Q  325 gtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  41824020 gtacaaaggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 41824064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19670816 - 19670634
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  19670816 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacactcacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 19670717  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  19670716 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 19670634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Original strand, 23608235 - 23608413
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||| || |  |||||||||||||||    
T  23608235 gagtaatgatatatagacacccttagatgacaatacaccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtgaactccacacaagcacactttc 23608334  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  23608335 tcttttatctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacagggatgtatgggaataaaggatgtctatgtatcatt 23608413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 29548059 - 29547877
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| || ||| ||| |||||||     
T  29548059 gagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggatcccgcataagtacactttt 29547960  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  29547959 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 29547877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Original strand, 47986208 - 47986389
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| || || ||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  47986208 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacatcccttgacatccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 47986307  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||  | | || |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||||    
T  47986308 tctttcttattctcttctctcttcctaatacatgggatgtacaagggtgtat-gcaattaaaggtgtctatgtaacattttcc 47986389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 187 - 367
Target Start/End: Original strand, 29977885 - 29978065
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||| | | || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||  |||||||  |||||||||||||||    
T  29977885 gagtaatgatacatacagaaccataggtggcaatacaccccttaacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatatggaccccacacaagcacactttc 29977984  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 367  Q
    |||||  ||| || || |||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | | | |||||||||||||    
T  29977985 tctttcatcttctcttttctctcactaatgtatggggtgtacaagtgtgtataggaataaaagatatctatgtaacatttt 29978065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 207 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 17983823 - 17983664
Alignment:
Q  207 ccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttttctctcctattctct 306  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| || ||||||    
T  17983823 ccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctctttcttcttctcttctct 17983724  T
Q  307 cttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattt 366  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||  | ||||  |||| ||||||||||||    
T  17983723 cttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaagtgtctatgtaacattt 17983664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Original strand, 32766958 - 32767140
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  32766958 gagttatgatacataaacactcttaggtggcaatacaccccttgacacccatacaaaaatctgacatgtggccatatggaccctgcacaagtacactttc 32767057  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||  ||| ||  |||||||| |||||  || | |||||||||||||||||  | ||||  |||| |||||||||||||||    
T  32767058 tctttcttcttctcctctctctttctaatacatagagtgtacaagggtgtatgcaattaaaatgtgtctatgtaacattttcc 32767140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 50813992 - 50813810
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||| ||  || |||| ||||||| ||||||||    
T  50813992 gagttatgatacataaacactcttaggtggtaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatatgaaccccgcacaagtacactttc 50813893  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  50813892 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgagatgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 50813810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 191 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 53352661 - 53352496
Alignment:
Q  191 tatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctctt 290  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||| |  | |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  53352661 tatgatacatagacacccttaggtg-caatacattctttaacacctacacaaaaatctgacacgtagttaagtggaccccgcacaagcatactttctctt 53352563  T
Q  291 ttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||        ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||    
T  53352562 ttctctcctcttctctcttccta--------ggtgtacaagggtgtatgaaaataaagggtgtctatgtatcatt 53352496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 185 - 369
Target Start/End: Original strand, 3481652 - 3481826
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||  |||||||||||||    
T  3481652 atgagtaatgatacatagacacctttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccacacaagcacactt 3481751  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||||| ||| | | ||||||||| ||| || ||          |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3481752 tctctttcctcccatcttctctctttctagtgcat----------agggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 3481826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 187 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 48647826 - 48647645
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |  |||||||||  |||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  48647826 gagttatgacacataaacatccttaggtaacaatacacctcttaacacccacataaaaatctaacacgtggtcacgtggactccgcacaagcacaatttc 48647727  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 368  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| || || |  ||||||| | |||||   |||||| | ||| ||||||||||||||    
T  48647726 tctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatagaatgtacaaagatgtataaaaataaatgatgtctatgtaacattttc 48647645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28480368 - 28480186
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||| || | || ||||||||  ||||| |||||||||    
T  28480368 gagttataatacatagacaaccttaggtgacaatacacttcttaacactcacacaaaaatctgacatgtagtcatgtggaccccacacaaacacactttc 28480269  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||| || ||| | ||||||||| |||||    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  28480268 tccttcatctcctcttctctcttcctagtgcatgagttgtacaaggatgtattcttataaagggtgtctatgtaacattttcc 28480186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28481243 - 28481061
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||| || | || ||||||||  ||||| |||||||||    
T  28481243 gagttataatacatagacaaccttaggtgacaatacacttcttaacactcacacaaaaatctgacatgtagtcatgtggaccccacacaaacacactttc 28481144  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||| || ||| | ||||||||| |||||    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  28481143 tccttcatctcctcttctctcttcctagtgcatgagttgtacaaggatgtattcttataaagggtgtctatgtaacattttcc 28481061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28482118 - 28481936
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||| || | || ||||||||  ||||| |||||||||    
T  28482118 gagttataatacatagacaaccttaggtgacaatacacttcttaacactcacacaaaaatctgacatgtagtcatgtggaccccacacaaacacactttc 28482019  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||| || ||| | ||||||||| |||||    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  28482018 tccttcatctcctcttctctcttcctagtgcatgagttgtacaaggatgtattcttataaagggtgtctatgtaacattttcc 28481936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18924597 - 18924413
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    |||||||||||| |||| | | |||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||| ||||| ||||| |  || || | ||||||| ||||||    
T  18924597 atgagttatgatccataaatacccttaggtggcaatacaccccttgatatccacacaaaaatctgacatgtggcaatatgaactccgcacaagtacactt 18924498  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||||  ||| || |||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  18924497 tctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtaaaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 18924413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 29589831 - 29589658
Alignment:
Q  195 atacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttttct 294  Q
    ||||||| ||| |||||| || |||||||||| || |||||||||||||||| ||| | |||||||  |||||||  |||||| |||||||||||||  |    
T  29589831 atacataaacacccttagttg-caatacaccccttgacacccacacaaaaatctgatatgtggccatatggaccccacacaagtacactttctctttctt 29589733  T
Q  295 ctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    || || |||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||  | |||| ||||| ||||||| |||||||    
T  29589732 cttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagagtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaatattttcc 29589658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8343263 - 8343135
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||| |||||||  ||||||| ||| ||| | ||||||    
T  8343263 gagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacatcctttgacacctacataaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcataagtatactttc 8343164  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaat 315  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||    
T  8343163 tctttcttcttctcttctctcttcctaat 8343135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 187 - 366
Target Start/End: Original strand, 47104544 - 47104723
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||     | |||||  ||||| |||||||||    
T  47104544 gagtaatgatatatagacattcttagatgacaatacactctctgacacccacacaaaaatttgacacgtggttttattgaccccacacaaacacactttc 47104643  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattt 366  Q
    |||||  |||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||| ||  |||| | |||||||  |||| || |||||||||    
T  47104644 tctttcatctcctcttctctcttcttaatgcatgaggtgtactagaatgtacgagaataaaaagtgtctacgtaacattt 47104723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 235 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 56300217 - 56300086
Alignment:
Q  235 ccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggt 334  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||  || | ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||  |    
T  56300217 ccacacaaaaatctgacatgtggtcatatgaatcctgcacaaacacactttctctttcctctcctcttctctctttctaatgtatgagatgtacaagatt 56300118  T
Q  335 gtatgggaataaagggtgtttatgtaacattt 366  Q
    ||||| ||||||||  ||| || |||||||||    
T  56300117 gtatgagaataaagaatgtctacgtaacattt 56300086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 55079814 - 55079685
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtgga-ccctgcacaagcacacttt 285  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||| |||||||  |||| |||  |||||| |||||||    
T  55079814 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacacctcttgacacccatacaaaaatctgacatgtggccatatggacccccacacaagtacacttt 55079715  T
Q  286 ctcttttctctcctattctctcttcctaat 315  Q
    ||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  55079714 ctctttcttcttctcttctctcttcctaat 55079685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 44536845 - 44536664
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||| ||  | |||||  || ||| ||||||||    
T  44536845 gagttatgatacataaacacttttaggtggcaatacacccttga-catccacacaaaaatctgacatgtggtcatatagaccccacataagtacactttc 44536747  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||  | ||||  |||| |||||||||||||||    
T  44536746 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatagggtgtacaagaatgtatgcaattaaaatgtgtctatgtaacattttcc 44536664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Original strand, 29535376 - 29535499
Alignment:
Q  186 tgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacacttt 285  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||| |  ||   | ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||    
T  29535376 tgagttatgatacatagacaatcttaggtgacaatacatctcttggtatccacacaaaaatatg-cacatggccacgtggatcccacacaaacacacttt 29535474  T
Q  286 ctcttttctctcctattctctcttc 310  Q
    ||||||  |||| ||||||||||||    
T  29535475 ctctttcatctcttattctctcttc 29535499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 367
Target Start/End: Original strand, 43487793 - 43487883
Alignment:
Q  272 cacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 367  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     | || ||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||    
T  43487793 cacaagcacactttctctttgctct-----tttcacttcctagtgtatggggtgtaccagggtgtactgaaataaagggtgtttatgtgacatttt 43487883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 339
Target Start/End: Original strand, 18769113 - 18769260
Alignment:
Q  191 tatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctctt 290  Q
    ||||||||||| |||||||||  |  | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||  ||||  |||||  ||| ||||||||    
T  18769113 tatgatacataaacatccttatgtacccatacaccctctaacacccacacaaaaatctgacacgtggtcatgtaaaccccacacaaatacattttctctt 18769212  T
Q  291 ttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatg 339  Q
    |  |||||| || |||||| ||| |  || ||||||||||| |||||||    
T  18769213 tcatctccttttttctctttctagtacat-gggtgtacaagagtgtatg 18769260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18769115 - 18768972
Alignment:
Q  219 atacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgta 318  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||| || ||  | ||  ||||| |||| |||||||||  |||| | || ||||||||||||  |    
T  18769115 atacaccccctaacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatgtaaatcccacacaaacacattttctctttcatctcattttttctcttcctaataca 18769016  T
Q  319 tggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaaca 363  Q
    | |||||||||||| |||||| |  |||| | |||||||||||||    
T  18769015 t-gggtgtacaaggatgtatgagggtaaatgatgtttatgtaaca 18768972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 369
Target Start/End: Original strand, 1771315 - 1771366
Alignment:
Q  318 atggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1771315 atggggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 1771366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 33703307 - 33703245
Alignment:
Q  213 atggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaa 276  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || |||| || ||||||    
T  33703307 atggcaatacacccttta-cacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggatcccgcacaa 33703245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 341 - 369
Target Start/End: Original strand, 55966418 - 55966446
Alignment:
Q  341 gaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55966418 gaataaagggtgtttatgtaacattttcc 55966446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1268 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold1268
Description:

Target: scaffold1268; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 185 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 1031 - 848
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| | |||||| | || ||||||||||||||    
T  1031 atgagtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttaacatccacacaaaaaactgacacgtagtcacgtgaatcccgcacaagcacactt 932  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 368  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  931 tctctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagagtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1267 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold1267
Description:

Target: scaffold1267; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 185 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 1031 - 848
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| | |||||| | || ||||||||||||||    
T  1031 atgagtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttaacatccacacaaaaaactgacacgtagtcacgtgaatcccgcacaagcacactt 932  T
Q  285 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 368  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  931 tctctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagagtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Original strand, 4029 - 4207
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| || ||| ||||||||||||    
T  4029 gagtaatgatacatagacacctttagatggcaatacaccttttaacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgcataagcacactttc 4128  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  4129 tcttttctcttctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 4207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 10209 - 10031
Alignment:
Q  187 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttc 286  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  10209 gagttatgatacatagacacctttaggtggcaatacatcctttgacatccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccgcgtacaagcacactttc 10110  T
Q  287 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||    
T  10109 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatagggtgtacaagggtgtatggaaataatgggtgtctatgtatcatt 10031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 186 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 8964 - 8781
Alignment:
Q  186 tgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacacttt 285  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||  ||| ||| | |||||||||| |||||| | | |||||||||||  |||||| ||| |||    
T  8964 tgagttatgatatatagacatccttaagtgacaatacactatttgacatctacacaaaaatttgacacatagtcacgtggaccccacacaagtacatttt 8865  T
Q  286 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    |||||| ||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  8864 ctctttcctcccatcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtataagaataaaaggtgtctatgtaacattttcc 8781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 214 - 368
Target Start/End: Original strand, 152525 - 152679
Alignment:
Q  214 tggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttccta 313  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||| ||  |||| || ||||||  |||||||||||||  ||| || ||||||||| |||    
T  152525 tggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatatggatcccgcacaaatacactttctctttcttcttctcttctctctttcta 152624  T
Q  314 atgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 368  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||||||||||    
T  152625 atacatgggatgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttc 152679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0316 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0316
Description:

Target: scaffold0316; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 283 - 369
Target Start/End: Original strand, 17199 - 17285
Alignment:
Q  283 tttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 369  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||   |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  17199 tttctctttcctctcctcttctctcttcctagaatataaggtgtacaaaggtgtatggaaataaagggtgtctatgtaacattttcc 17285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0316; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 296
Target Start/End: Original strand, 17056 - 17163
Alignment:
Q  185 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggaccctgcacaagcacactt 284  Q
    |||||||||||| |||||||||    || | |||||||| || |  ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  17056 atgagttatgattcatagacat----aggttgcaatacatccctcgacatccacacaaaaatctgacatgtggtcacatggaccccgcacaagcacattt 17151  T
Q  285 tctcttttctct 296  Q
    ||||||| ||||    
T  17152 tctctttcctct 17163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 850 - 798
Alignment:
Q  214 tggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatatgacacgtggccacgtggac 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || |||||    
T  850 tggcaatacacccttta-cacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggac 798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University