View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21284_low_20 (Length: 473)

Name: NF21284_low_20
Description: NF21284
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21284_low_20
NF21284_low_20
[»] chr1 (110 HSPs)
chr1 (119-458)||(30790337-30790675)
chr1 (179-458)||(15669331-15669608)
chr1 (119-456)||(16561473-16561807)
chr1 (158-459)||(26613177-26613476)
chr1 (179-458)||(42922297-42922572)
chr1 (119-368)||(155712-155961)
chr1 (119-456)||(30738566-30738907)
chr1 (192-458)||(8347212-8347474)
chr1 (192-394)||(50076673-50076873)
chr1 (179-394)||(14183591-14183806)
chr1 (192-427)||(9241052-9241287)
chr1 (179-459)||(13125395-13125673)
chr1 (192-458)||(17186067-17186329)
chr1 (192-394)||(17324637-17324837)
chr1 (11-117)||(30791236-30791342)
chr1 (191-422)||(41646999-41647229)
chr1 (192-368)||(18307189-18307364)
chr1 (179-458)||(8348991-8349266)
chr1 (192-394)||(18839667-18839868)
chr1 (192-394)||(6756608-6756808)
chr1 (192-357)||(16428733-16428897)
chr1 (192-357)||(40134024-40134188)
chr1 (192-394)||(38925482-38925679)
chr1 (192-394)||(12302506-12302706)
chr1 (192-394)||(31425016-31425219)
chr1 (192-394)||(50078821-50079022)
chr1 (192-394)||(50307547-50307747)
chr1 (192-422)||(13215161-13215393)
chr1 (191-383)||(31489992-31490181)
chr1 (192-394)||(10399829-10400029)
chr1 (192-394)||(11457476-11457676)
chr1 (192-422)||(17324143-17324371)
chr1 (192-456)||(25127952-25128216)
chr1 (192-353)||(39932153-39932312)
chr1 (191-422)||(2949204-2949433)
chr1 (192-394)||(3579618-3579817)
chr1 (192-430)||(6115066-6115304)
chr1 (192-394)||(6823094-6823294)
chr1 (192-394)||(15294835-15295035)
chr1 (192-394)||(25248552-25248753)
chr1 (179-394)||(27916561-27916778)
chr1 (192-394)||(51750119-51750319)
chr1 (192-368)||(2617596-2617771)
chr1 (192-357)||(16432474-16432638)
chr1 (181-409)||(18800557-18800785)
chr1 (193-334)||(31422933-31423073)
chr1 (192-394)||(2510326-2510525)
chr1 (192-394)||(39462599-39462799)
chr1 (203-427)||(16429048-16429272)
chr1 (285-458)||(15916562-15916734)
chr1 (192-427)||(47906350-47906584)
chr1 (192-394)||(9459418-9459618)
chr1 (192-394)||(9463245-9463445)
chr1 (179-427)||(26520086-26520334)
chr1 (192-456)||(27336877-27337140)
chr1 (192-383)||(4131387-4131580)
chr1 (192-394)||(15823626-15823826)
chr1 (179-337)||(28279331-28279490)
chr1 (192-394)||(28840760-28840959)
chr1 (192-394)||(47179793-47179992)
chr1 (192-394)||(6995701-6995901)
chr1 (219-394)||(17318994-17319167)
chr1 (192-394)||(24325743-24325943)
chr1 (192-394)||(31735522-31735722)
chr1 (192-394)||(46431707-46431908)
chr1 (192-422)||(14097941-14098171)
chr1 (192-358)||(21948225-21948388)
chr1 (114-341)||(43104155-43104389)
chr1 (192-394)||(16226247-16226447)
chr1 (192-422)||(25251246-25251476)
chr1 (192-394)||(13761917-13762116)
chr1 (192-394)||(47177442-47177641)
chr1 (192-340)||(48665257-48665404)
chr1 (217-357)||(47451747-47451885)
chr1 (192-369)||(16231643-16231819)
chr1 (192-394)||(20302539-20302738)
chr1 (192-394)||(28842575-28842774)
chr1 (192-327)||(28998320-28998454)
chr1 (192-327)||(29004036-29004170)
chr1 (192-327)||(50248639-50248773)
chr1 (212-394)||(21353347-21353525)
chr1 (201-456)||(28207005-28207258)
chr1 (208-394)||(23785935-23786119)
chr1 (192-394)||(51752445-51752643)
chr1 (193-339)||(49495266-49495411)
chr1 (192-456)||(27339068-27339331)
chr1 (300-413)||(13127668-13127782)
chr1 (192-309)||(20291537-20291653)
chr1 (204-394)||(51757623-51757810)
chr1 (212-394)||(2393282-2393461)
chr1 (209-394)||(4144682-4144865)
chr1 (194-269)||(26332613-26332688)
chr1 (308-394)||(11693315-11693397)
chr1 (212-394)||(2401220-2401400)
chr1 (212-394)||(9526469-9526649)
chr1 (194-339)||(14353047-14353190)
chr1 (209-292)||(14997040-14997122)
chr1 (212-338)||(46783146-46783272)
chr1 (192-312)||(6823965-6824091)
chr1 (194-275)||(49959129-49959212)
chr1 (212-341)||(25134074-25134200)
chr1 (209-298)||(2232597-2232685)
chr1 (179-256)||(26332699-26332776)
chr1 (305-349)||(8213571-8213615)
chr1 (275-394)||(23816048-23816166)
chr1 (212-357)||(9521718-9521860)
chr1 (379-458)||(26332450-26332525)
chr1 (208-292)||(37990772-37990857)
chr1 (218-293)||(3091205-3091279)
chr1 (209-293)||(13785370-13785455)
[»] chr6 (84 HSPs)
chr6 (119-427)||(12186036-12186347)
chr6 (119-427)||(26945184-26945495)
chr6 (179-423)||(3027821-3028066)
chr6 (194-459)||(19696556-19696819)
chr6 (179-458)||(22857891-22858167)
chr6 (179-413)||(16455404-16455638)
chr6 (179-423)||(15367134-15367376)
chr6 (192-394)||(13039869-13040070)
chr6 (194-458)||(14466440-14466703)
chr6 (194-412)||(25078538-25078755)
chr6 (158-394)||(28037724-28037964)
chr6 (192-456)||(13057309-13057570)
chr6 (209-456)||(12937133-12937376)
chr6 (192-394)||(3629864-3630063)
chr6 (179-458)||(15719745-15720020)
chr6 (192-422)||(32280111-32280341)
chr6 (192-394)||(3631938-3632137)
chr6 (192-357)||(3390494-3390658)
chr6 (201-353)||(1069758-1069909)
chr6 (192-394)||(1230248-1230448)
chr6 (192-394)||(9020041-9020241)
chr6 (192-394)||(11983028-11983228)
chr6 (275-427)||(25465556-25465708)
chr6 (192-456)||(3233660-3233929)
chr6 (192-394)||(4816230-4816430)
chr6 (179-354)||(20526907-20527081)
chr6 (192-394)||(30967316-30967516)
chr6 (192-350)||(15530166-15530321)
chr6 (192-394)||(15532681-15532880)
chr6 (192-394)||(24338447-24338646)
chr6 (209-417)||(12911421-12911629)
chr6 (179-332)||(17012142-17012294)
chr6 (265-456)||(28078136-28078322)
chr6 (192-394)||(15541139-15541339)
chr6 (252-385)||(30445698-30445832)
chr6 (192-394)||(30728823-30729027)
chr6 (202-394)||(14458766-14458956)
chr6 (192-394)||(19704566-19704768)
chr6 (192-394)||(20915355-20915555)
chr6 (192-394)||(26065098-26065296)
chr6 (192-394)||(26085067-26085265)
chr6 (192-394)||(2628885-2629084)
chr6 (192-394)||(5273215-5273415)
chr6 (192-394)||(28241320-28241520)
chr6 (277-421)||(15346546-15346689)
chr6 (192-394)||(26932561-26932761)
chr6 (192-393)||(12195515-12195714)
chr6 (192-394)||(14507175-14507374)
chr6 (192-394)||(30034602-30034802)
chr6 (192-314)||(25477389-25477510)
chr6 (217-413)||(11262596-11262794)
chr6 (201-334)||(22490764-22490896)
chr6 (204-356)||(12161594-12161744)
chr6 (212-394)||(22351852-22352031)
chr6 (208-394)||(26066123-26066307)
chr6 (208-394)||(26068394-26068578)
chr6 (208-394)||(33308988-33309171)
chr6 (209-425)||(35201295-35201508)
chr6 (192-271)||(19227528-19227607)
chr6 (212-394)||(17694851-17695030)
chr6 (209-394)||(13878727-13878909)
chr6 (209-394)||(16785919-16786101)
chr6 (209-394)||(26887226-26887406)
chr6 (208-394)||(29754708-29754892)
chr6 (208-394)||(33311257-33311440)
chr6 (265-394)||(3577489-3577616)
chr6 (212-394)||(13467466-13467642)
chr6 (209-394)||(13883475-13883657)
chr6 (212-394)||(22342800-22342980)
chr6 (209-341)||(31248768-31248896)
chr6 (308-411)||(22870083-22870186)
chr6 (208-323)||(7542452-7542567)
chr6 (194-293)||(11138423-11138523)
chr6 (212-296)||(19701958-19702041)
chr6 (212-394)||(33215830-33216010)
chr6 (283-341)||(3833481-3833540)
chr6 (265-394)||(25465898-25466026)
chr6 (265-394)||(25941724-25941852)
chr6 (364-422)||(26455128-26455186)
chr6 (217-293)||(5165914-5165989)
chr6 (323-394)||(30443532-30443604)
chr6 (318-422)||(10584235-10584340)
chr6 (319-394)||(7294035-7294111)
chr6 (216-292)||(12166246-12166321)
[»] chr4 (129 HSPs)
chr4 (119-415)||(12102145-12102444)
chr4 (119-458)||(18534770-18535108)
chr4 (119-458)||(18537412-18537750)
chr4 (119-456)||(25357696-25358035)
chr4 (183-427)||(38890189-38890434)
chr4 (179-459)||(8756188-8756465)
chr4 (179-420)||(19322814-19323056)
chr4 (179-456)||(28453803-28454080)
chr4 (119-459)||(16185771-16186116)
chr4 (191-394)||(16455374-16455576)
chr4 (114-415)||(31983505-31983809)
chr4 (179-456)||(47150833-47151107)
chr4 (179-423)||(9863827-9864076)
chr4 (192-458)||(41997626-41997887)
chr4 (192-394)||(36380483-36380684)
chr4 (192-394)||(40637208-40637408)
chr4 (192-394)||(48486453-48486653)
chr4 (192-456)||(24879123-24879388)
chr4 (201-357)||(2891434-2891589)
chr4 (192-394)||(36378426-36378627)
chr4 (192-357)||(16453443-16453607)
chr4 (192-456)||(24880585-24880850)
chr4 (121-456)||(22295218-22295558)
chr4 (193-357)||(37313101-37313264)
chr4 (208-459)||(3982113-3982362)
chr4 (194-353)||(13544095-13544252)
chr4 (192-394)||(14633453-14633652)
chr4 (207-458)||(15032480-15032733)
chr4 (192-394)||(47274860-47275059)
chr4 (192-427)||(17662211-17662444)
chr4 (192-427)||(33415453-33415687)
chr4 (192-357)||(36921529-36921692)
chr4 (192-357)||(47868535-47868698)
chr4 (192-459)||(619384-619646)
chr4 (192-394)||(8631418-8631618)
chr4 (193-394)||(9174145-9174344)
chr4 (192-394)||(12395844-12396044)
chr4 (192-394)||(22800861-22801061)
chr4 (192-394)||(24888930-24889130)
chr4 (192-394)||(38928176-38928376)
chr4 (194-394)||(14787428-14787628)
chr4 (179-355)||(30136670-30136845)
chr4 (192-394)||(12400806-12401006)
chr4 (206-357)||(13547302-13547451)
chr4 (179-422)||(10112988-10113233)
chr4 (193-394)||(18709163-18709361)
chr4 (192-341)||(22802786-22802933)
chr4 (192-422)||(36919554-36919783)
chr4 (192-394)||(6764978-6765178)
chr4 (192-394)||(7941457-7941657)
chr4 (192-394)||(9148387-9148586)
chr4 (192-394)||(18847287-18847486)
chr4 (192-394)||(22046685-22046884)
chr4 (192-394)||(24348352-24348552)
chr4 (192-394)||(37089371-37089570)
chr4 (192-394)||(38409339-38409538)
chr4 (192-394)||(40091414-40091614)
chr4 (192-394)||(44599837-44600037)
chr4 (192-394)||(5198554-5198754)
chr4 (192-394)||(26085976-26086175)
chr4 (179-338)||(40999004-40999163)
chr4 (192-394)||(51015380-51015579)
chr4 (192-357)||(9176510-9176673)
chr4 (179-357)||(9022423-9022603)
chr4 (192-394)||(16931788-16931988)
chr4 (192-394)||(16934142-16934342)
chr4 (192-327)||(5637530-5637664)
chr4 (192-402)||(18409338-18409546)
chr4 (192-394)||(22044390-22044589)
chr4 (192-394)||(22132391-22132590)
chr4 (192-394)||(31849598-31849797)
chr4 (192-394)||(22134617-22134815)
chr4 (204-357)||(47210788-47210939)
chr4 (192-336)||(3824627-3824769)
chr4 (192-394)||(11006236-11006436)
chr4 (192-394)||(19096017-19096217)
chr4 (192-394)||(22780372-22780572)
chr4 (192-394)||(22782737-22782937)
chr4 (192-394)||(2484872-2485071)
chr4 (275-417)||(4215522-4215662)
chr4 (192-394)||(11435089-11435288)
chr4 (212-394)||(31300427-31300606)
chr4 (208-422)||(27499195-27499405)
chr4 (179-423)||(10114448-10114681)
chr4 (209-394)||(55822265-55822446)
chr4 (212-394)||(15316961-15317140)
chr4 (192-327)||(56030578-56030712)
chr4 (209-394)||(5336779-5336964)
chr4 (192-394)||(11008567-11008765)
chr4 (209-394)||(16638827-16639010)
chr4 (192-271)||(6133006-6133085)
chr4 (212-394)||(16489352-16489531)
chr4 (209-394)||(36769479-36769662)
chr4 (212-357)||(4558314-4558456)
chr4 (212-432)||(15831144-15831362)
chr4 (209-357)||(4570094-4570239)
chr4 (209-394)||(11853549-11853731)
chr4 (212-394)||(4884877-4885057)
chr4 (275-394)||(5635475-5635593)
chr4 (212-394)||(8529270-8529450)
chr4 (192-287)||(3937314-3937408)
chr4 (275-394)||(5101145-5101262)
chr4 (249-316)||(32274014-32274081)
chr4 (208-357)||(54906737-54906887)
chr4 (209-357)||(7050294-7050439)
chr4 (212-394)||(4556059-4556238)
chr4 (212-394)||(16688939-16689119)
chr4 (261-341)||(54928700-54928780)
chr4 (275-394)||(11437579-11437696)
chr4 (212-394)||(18586969-18587149)
chr4 (212-291)||(25699752-25699830)
chr4 (308-394)||(26557833-26557920)
chr4 (277-402)||(3578662-3578786)
chr4 (212-357)||(47566496-47566638)
chr4 (194-240)||(52942597-52942643)
chr4 (192-394)||(53405263-53405467)
chr4 (321-368)||(6133098-6133146)
chr4 (212-394)||(15312319-15312499)
chr4 (209-394)||(36771396-36771579)
chr4 (383-459)||(52043498-52043570)
chr4 (209-394)||(4874478-4874661)
chr4 (208-386)||(5516243-5516429)
chr4 (208-281)||(29609581-29609654)
chr4 (275-315)||(52942536-52942576)
chr4 (212-357)||(13072018-13072160)
chr4 (279-356)||(24446678-24446754)
chr4 (179-258)||(38208816-38208897)
chr4 (348-392)||(5350032-5350076)
chr4 (345-393)||(31985679-31985726)
[»] chr5 (102 HSPs)
chr5 (119-423)||(36208580-36208885)
chr5 (179-458)||(6661124-6661398)
chr5 (175-456)||(15143528-15143809)
chr5 (242-423)||(15445236-15445417)
chr5 (192-392)||(18596725-18596924)
chr5 (192-459)||(695958-696219)
chr5 (179-382)||(17413176-17413380)
chr5 (192-387)||(25804105-25804297)
chr5 (192-394)||(40221602-40221803)
chr5 (192-394)||(20505842-20506040)
chr5 (192-355)||(16092237-16092399)
chr5 (192-456)||(18511148-18511411)
chr5 (179-458)||(20053910-20054179)
chr5 (194-422)||(24126938-24127165)
chr5 (179-391)||(9020285-9020497)
chr5 (192-394)||(34477052-34477253)
chr5 (192-394)||(34479417-34479618)
chr5 (192-394)||(27910530-27910730)
chr5 (192-394)||(27912616-27912816)
chr5 (192-422)||(1189577-1189808)
chr5 (192-422)||(25904183-25904412)
chr5 (192-394)||(6745148-6745348)
chr5 (192-394)||(10529098-10529298)
chr5 (192-394)||(17072963-17073164)
chr5 (120-461)||(4897726-4898073)
chr5 (191-456)||(17818427-17818690)
chr5 (192-337)||(34530721-34530865)
chr5 (192-357)||(39854563-39854726)
chr5 (192-394)||(658355-658552)
chr5 (192-456)||(18509254-18509517)
chr5 (192-394)||(21948106-21948306)
chr5 (192-357)||(10474359-10474522)
chr5 (192-357)||(36402364-36402527)
chr5 (192-394)||(6747385-6747584)
chr5 (192-394)||(18466764-18466964)
chr5 (192-422)||(37705752-37705979)
chr5 (192-394)||(38882186-38882385)
chr5 (192-394)||(41585743-41585943)
chr5 (179-394)||(34033565-34033783)
chr5 (192-427)||(2954497-2954730)
chr5 (192-357)||(4236709-4236872)
chr5 (192-357)||(39798127-39798290)
chr5 (192-394)||(31179370-31179570)
chr5 (192-394)||(25921472-25921672)
chr5 (179-456)||(2144509-2144778)
chr5 (194-456)||(2818270-2818532)
chr5 (192-357)||(6756574-6756735)
chr5 (192-357)||(31472648-31472812)
chr5 (192-394)||(2174999-2175198)
chr5 (192-394)||(21684451-21684650)
chr5 (192-357)||(10586912-10587074)
chr5 (192-357)||(16776238-16776400)
chr5 (192-394)||(15552325-15552525)
chr5 (192-394)||(31545160-31545360)
chr5 (192-394)||(4410103-4410302)
chr5 (192-394)||(26097813-26098011)
chr5 (192-394)||(18469091-18469289)
chr5 (192-368)||(39398017-39398192)
chr5 (208-394)||(10749796-10749980)
chr5 (192-327)||(31466044-31466177)
chr5 (212-394)||(22672837-22673017)
chr5 (192-394)||(31542815-31543014)
chr5 (192-259)||(20043130-20043197)
chr5 (195-394)||(2723985-2724173)
chr5 (208-394)||(3373136-3373320)
chr5 (194-394)||(35430259-35430462)
chr5 (209-392)||(10627364-10627547)
chr5 (209-394)||(35385451-35385634)
chr5 (179-336)||(4754220-4754377)
chr5 (179-420)||(15224735-15224983)
chr5 (209-394)||(1170811-1170993)
chr5 (208-394)||(10757273-10757456)
chr5 (208-394)||(23665140-23665323)
chr5 (208-394)||(23793264-23793447)
chr5 (208-394)||(38960131-38960314)
chr5 (192-271)||(20045090-20045169)
chr5 (208-394)||(15354574-15354757)
chr5 (212-394)||(28786407-28786587)
chr5 (214-394)||(25445501-25445679)
chr5 (209-298)||(2298095-2298183)
chr5 (215-394)||(23741858-23742034)
chr5 (242-327)||(42770940-42771024)
chr5 (208-394)||(15356850-15357033)
chr5 (212-394)||(17841248-17841428)
chr5 (212-394)||(25452498-25452678)
chr5 (192-251)||(12556063-12556122)
chr5 (265-394)||(42238315-42238443)
chr5 (209-354)||(1240428-1240570)
chr5 (209-394)||(16093291-16093473)
chr5 (212-296)||(11962529-11962612)
chr5 (209-293)||(31782556-31782639)
chr5 (179-270)||(42770835-42770924)
chr5 (217-292)||(26406573-26406647)
chr5 (192-394)||(21288850-21289041)
chr5 (208-293)||(32520533-32520619)
chr5 (209-293)||(13295835-13295920)
chr5 (208-390)||(29748443-29748627)
chr5 (364-458)||(42771028-42771118)
chr5 (209-293)||(25562390-25562473)
chr5 (192-251)||(26098391-26098450)
chr5 (215-357)||(40222769-40222908)
chr5 (379-419)||(4754380-4754420)
[»] chr2 (87 HSPs)
chr2 (194-459)||(17897183-17897443)
chr2 (181-456)||(40699419-40699691)
chr2 (181-423)||(11578076-11578319)
chr2 (179-456)||(20146547-20146821)
chr2 (179-394)||(18800312-18800525)
chr2 (119-404)||(13828330-13828620)
chr2 (192-422)||(6258787-6259014)
chr2 (179-459)||(27136067-27136338)
chr2 (192-394)||(42452837-42453036)
chr2 (192-394)||(11739558-11739759)
chr2 (184-456)||(35107341-35107614)
chr2 (192-422)||(6264118-6264348)
chr2 (192-394)||(5375345-5375544)
chr2 (192-427)||(17848500-17848730)
chr2 (209-341)||(20589763-20589895)
chr2 (192-394)||(19502010-19502210)
chr2 (192-422)||(14837329-14837553)
chr2 (192-357)||(43623616-43623779)
chr2 (179-417)||(22874174-22874411)
chr2 (192-456)||(40031989-40032257)
chr2 (196-456)||(28459129-28459385)
chr2 (192-340)||(17849173-17849320)
chr2 (191-394)||(19504345-19504545)
chr2 (192-315)||(15539552-15539674)
chr2 (192-394)||(23452236-23452436)
chr2 (192-394)||(42064571-42064771)
chr2 (192-394)||(42923508-42923708)
chr2 (192-394)||(45279983-45280183)
chr2 (192-357)||(28196693-28196856)
chr2 (192-357)||(45239013-45239176)
chr2 (192-394)||(35215585-35215785)
chr2 (192-394)||(19007696-19007896)
chr2 (192-394)||(27104854-27105053)
chr2 (192-427)||(31732744-31732964)
chr2 (192-339)||(34979632-34979778)
chr2 (192-357)||(21520729-21520892)
chr2 (192-422)||(22287306-22287535)
chr2 (192-394)||(35217962-35218162)
chr2 (192-394)||(13910044-13910243)
chr2 (209-421)||(33603994-33604206)
chr2 (192-394)||(44289066-44289267)
chr2 (179-357)||(35028617-35028795)
chr2 (209-422)||(39680045-39680255)
chr2 (208-394)||(36558863-36559047)
chr2 (208-394)||(36561140-36561324)
chr2 (192-330)||(3022219-3022355)
chr2 (208-341)||(15693974-15694108)
chr2 (179-335)||(43139417-43139572)
chr2 (209-394)||(2736205-2736387)
chr2 (208-370)||(17921769-17921929)
chr2 (209-394)||(39686983-39687165)
chr2 (208-394)||(45332180-45332364)
chr2 (275-427)||(7462911-7463065)
chr2 (212-394)||(17943540-17943718)
chr2 (275-422)||(22407424-22407571)
chr2 (212-394)||(27517638-27517818)
chr2 (209-394)||(20054764-20054947)
chr2 (212-336)||(17932637-17932756)
chr2 (209-394)||(2740941-2741123)
chr2 (209-394)||(17462436-17462618)
chr2 (212-368)||(37170778-37170931)
chr2 (209-293)||(28458927-28459011)
chr2 (193-341)||(26345661-26345809)
chr2 (192-357)||(24162259-24162411)
chr2 (208-293)||(30720710-30720796)
chr2 (275-422)||(22707721-22707870)
chr2 (212-394)||(12781220-12781400)
chr2 (212-394)||(30478997-30479177)
chr2 (354-421)||(20592295-20592362)
chr2 (221-417)||(37962917-37963109)
chr2 (192-271)||(38414201-38414279)
chr2 (362-456)||(8173555-8173646)
chr2 (195-253)||(27583477-27583535)
chr2 (209-336)||(45567409-45567532)
chr2 (11-110)||(12924341-12924444)
chr2 (209-394)||(20050020-20050204)
chr2 (209-341)||(22712569-22712698)
chr2 (209-341)||(22717278-22717407)
chr2 (277-368)||(23870956-23871047)
chr2 (265-394)||(45679778-45679905)
chr2 (345-393)||(21629948-21629995)
chr2 (209-296)||(38190997-38191083)
chr2 (198-338)||(41303088-41303228)
chr2 (228-337)||(30261830-30261936)
chr2 (194-293)||(34575208-34575308)
chr2 (208-275)||(7502990-7503058)
chr2 (192-236)||(38020258-38020302)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (179-458)||(15759-16034)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (179-417)||(1617-1855)
[»] chr3 (139 HSPs)
chr3 (179-458)||(561710-561987)
chr3 (179-390)||(13420186-13420395)
chr3 (179-458)||(31151392-31151667)
chr3 (193-394)||(28761424-28761625)
chr3 (194-459)||(36871234-36871497)
chr3 (191-456)||(53915430-53915694)
chr3 (192-394)||(30005901-30006101)
chr3 (192-456)||(53917598-53917861)
chr3 (145-417)||(1620434-1620707)
chr3 (275-420)||(24181522-24181668)
chr3 (179-423)||(53597283-53597528)
chr3 (192-394)||(45882999-45883200)
chr3 (179-423)||(23633503-23633743)
chr3 (185-424)||(14634406-14634647)
chr3 (194-351)||(53468495-53468651)
chr3 (192-422)||(3314744-3314974)
chr3 (192-394)||(4308278-4308478)
chr3 (192-394)||(10956024-10956224)
chr3 (192-394)||(27101178-27101378)
chr3 (192-355)||(29956746-29956907)
chr3 (192-358)||(28102035-28102199)
chr3 (192-456)||(5926701-5926961)
chr3 (179-458)||(17795306-17795581)
chr3 (179-458)||(19103746-19104021)
chr3 (192-427)||(43226145-43226378)
chr3 (192-394)||(1313469-1313669)
chr3 (192-394)||(25533502-25533702)
chr3 (192-394)||(38890100-38890300)
chr3 (192-394)||(51727004-51727204)
chr3 (179-459)||(25635428-25635704)
chr3 (192-353)||(36011887-36012046)
chr3 (192-422)||(6231861-6232088)
chr3 (192-394)||(10958320-10958520)
chr3 (192-357)||(9604641-9604804)
chr3 (192-387)||(25688164-25688358)
chr3 (192-427)||(43423426-43423660)
chr3 (192-394)||(746817-747017)
chr3 (192-422)||(1626651-1626880)
chr3 (192-422)||(18099139-18099367)
chr3 (194-357)||(18162725-18162887)
chr3 (192-394)||(1321539-1321739)
chr3 (192-394)||(5522624-5522823)
chr3 (192-394)||(6484420-6484620)
chr3 (192-394)||(42990364-42990564)
chr3 (192-394)||(43228351-43228551)
chr3 (192-394)||(51943431-51943630)
chr3 (192-357)||(24979767-24979931)
chr3 (192-357)||(32264071-32264236)
chr3 (192-427)||(43421378-43421612)
chr3 (192-350)||(6561870-6562028)
chr3 (192-394)||(10084386-10084586)
chr3 (192-327)||(39715529-39715663)
chr3 (192-394)||(4666574-4666774)
chr3 (194-394)||(11170466-11170664)
chr3 (192-394)||(6065793-6065993)
chr3 (192-394)||(3859588-3859787)
chr3 (192-394)||(4103893-4104092)
chr3 (192-394)||(5191713-5191911)
chr3 (191-357)||(47148929-47149092)
chr3 (192-427)||(880414-880648)
chr3 (192-357)||(18096934-18097097)
chr3 (192-357)||(51674800-51674963)
chr3 (192-394)||(458344-458544)
chr3 (192-394)||(10621527-10621727)
chr3 (192-387)||(26720608-26720800)
chr3 (192-394)||(38210430-38210630)
chr3 (191-385)||(889779-889970)
chr3 (192-394)||(7606585-7606784)
chr3 (192-394)||(10191307-10191506)
chr3 (192-369)||(28413053-28413229)
chr3 (192-387)||(6063450-6063643)
chr3 (192-456)||(32219144-32219409)
chr3 (192-394)||(455967-456167)
chr3 (192-394)||(25388966-25389165)
chr3 (192-356)||(35917978-35918140)
chr3 (191-343)||(54884214-54884364)
chr3 (192-327)||(22114368-22114502)
chr3 (179-417)||(1674019-1674248)
chr3 (192-394)||(50494059-50494259)
chr3 (192-368)||(53591244-53591418)
chr3 (181-423)||(7768619-7768861)
chr3 (192-298)||(35777481-35777587)
chr3 (193-394)||(5886261-5886458)
chr3 (193-394)||(5899734-5899931)
chr3 (192-339)||(15780931-15781081)
chr3 (196-357)||(11168165-11168324)
chr3 (276-456)||(25634030-25634207)
chr3 (192-357)||(54691608-54691771)
chr3 (119-226)||(1618825-1618933)
chr3 (179-315)||(23637070-23637205)
chr3 (212-394)||(47878170-47878350)
chr3 (192-295)||(12268059-12268161)
chr3 (209-394)||(16996875-16997060)
chr3 (210-355)||(3306839-3306983)
chr3 (209-394)||(10100091-10100273)
chr3 (114-224)||(11007844-11007956)
chr3 (212-394)||(29913954-29914132)
chr3 (192-394)||(48361668-48361868)
chr3 (212-394)||(54188512-54188691)
chr3 (275-368)||(47701693-47701786)
chr3 (209-394)||(10094074-10094256)
chr3 (253-394)||(46966647-46966787)
chr3 (212-394)||(10897008-10897188)
chr3 (275-394)||(27635655-27635773)
chr3 (212-394)||(27761985-27762165)
chr3 (179-337)||(13419926-13420084)
chr3 (209-394)||(22625983-22626166)
chr3 (217-394)||(4535622-4535798)
chr3 (209-394)||(10200954-10201136)
chr3 (209-394)||(10208000-10208182)
chr3 (209-394)||(27544273-27544455)
chr3 (212-394)||(10595033-10595213)
chr3 (221-375)||(11007538-11007683)
chr3 (212-394)||(54193229-54193409)
chr3 (217-392)||(13893470-13893644)
chr3 (194-394)||(11066652-11066850)
chr3 (266-423)||(31021130-31021286)
chr3 (212-411)||(10612761-10612957)
chr3 (209-357)||(11079517-11079662)
chr3 (212-394)||(20031316-20031497)
chr3 (194-271)||(28137424-28137501)
chr3 (192-288)||(28100143-28100238)
chr3 (192-296)||(28181082-28181185)
chr3 (209-357)||(6303310-6303454)
chr3 (213-394)||(10949259-10949438)
chr3 (209-296)||(47882978-47883064)
chr3 (209-394)||(7418064-7418246)
chr3 (209-341)||(16462203-16462332)
chr3 (179-236)||(24177323-24177380)
chr3 (192-248)||(42992346-42992402)
chr3 (265-394)||(15823646-15823775)
chr3 (281-394)||(42992418-42992530)
chr3 (179-243)||(25633967-25634031)
chr3 (179-234)||(31021300-31021356)
chr3 (192-251)||(4560422-4560481)
chr3 (265-394)||(48390301-48390429)
chr3 (209-357)||(5858546-5858689)
chr3 (209-338)||(38002869-38002995)
chr3 (256-331)||(42297721-42297798)
[»] chr7 (105 HSPs)
chr7 (179-459)||(24817289-24817565)
chr7 (120-456)||(6332236-6332568)
chr7 (179-456)||(24813437-24813710)
chr7 (179-458)||(7188616-7188890)
chr7 (192-427)||(20137074-20137308)
chr7 (192-427)||(27832604-27832832)
chr7 (192-458)||(24748684-24748946)
chr7 (179-427)||(11081583-11081835)
chr7 (183-357)||(20091583-20091753)
chr7 (192-427)||(27306197-27306429)
chr7 (192-394)||(44724669-44724869)
chr7 (192-357)||(37412161-37412326)
chr7 (192-357)||(31435082-31435246)
chr7 (192-340)||(25276231-25276378)
chr7 (194-423)||(16296992-16297222)
chr7 (192-456)||(13099409-13099675)
chr7 (192-422)||(21990240-21990469)
chr7 (194-353)||(9679151-9679308)
chr7 (192-394)||(20626128-20626328)
chr7 (192-394)||(20630019-20630219)
chr7 (192-394)||(20642438-20642638)
chr7 (192-427)||(42330964-42331198)
chr7 (192-394)||(7092212-7092411)
chr7 (192-357)||(9680910-9681073)
chr7 (191-394)||(4295933-4296134)
chr7 (129-417)||(40281358-40281643)
chr7 (192-394)||(11355348-11355548)
chr7 (192-394)||(21592142-21592342)
chr7 (192-394)||(38394076-38394276)
chr7 (192-387)||(20297452-20297645)
chr7 (194-427)||(24465629-24465859)
chr7 (192-394)||(7470021-7470221)
chr7 (192-394)||(7471979-7472179)
chr7 (192-394)||(18345631-18345831)
chr7 (192-394)||(20299550-20299750)
chr7 (192-394)||(40836742-40836941)
chr7 (192-394)||(48457743-48457943)
chr7 (192-357)||(3878667-3878830)
chr7 (192-387)||(7094466-7094659)
chr7 (276-419)||(26295620-26295762)
chr7 (192-340)||(39146039-39146186)
chr7 (192-394)||(44654-44854)
chr7 (192-394)||(3035811-3036014)
chr7 (209-353)||(22828672-22828815)
chr7 (192-394)||(35719-35919)
chr7 (192-443)||(443685-443936)
chr7 (179-425)||(6048946-6049195)
chr7 (192-354)||(24258553-24258717)
chr7 (192-368)||(43253541-43253716)
chr7 (192-336)||(11757320-11757462)
chr7 (192-427)||(21678156-21678388)
chr7 (192-394)||(1046924-1047123)
chr7 (192-394)||(1049295-1049494)
chr7 (192-394)||(1850071-1850271)
chr7 (192-369)||(7349296-7349472)
chr7 (192-394)||(40946418-40946618)
chr7 (192-394)||(28485656-28485855)
chr7 (192-394)||(7351651-7351851)
chr7 (192-394)||(31155910-31156110)
chr7 (192-327)||(28487643-28487777)
chr7 (209-393)||(21369642-21369824)
chr7 (275-423)||(22393894-22394043)
chr7 (135-421)||(13290445-13290733)
chr7 (192-357)||(21680117-21680280)
chr7 (208-394)||(2935374-2935558)
chr7 (183-274)||(11084456-11084547)
chr7 (218-336)||(22251602-22251723)
chr7 (192-357)||(42223248-42223411)
chr7 (209-394)||(25351353-25351534)
chr7 (209-394)||(25410130-25410313)
chr7 (179-394)||(26210616-26210834)
chr7 (192-394)||(38396725-38396924)
chr7 (238-456)||(6046629-6046843)
chr7 (209-422)||(3320022-3320232)
chr7 (209-422)||(3324770-3324980)
chr7 (192-293)||(26804662-26804762)
chr7 (208-394)||(9027193-9027376)
chr7 (208-394)||(22108173-22108356)
chr7 (208-394)||(40549933-40550116)
chr7 (212-394)||(44010749-44010929)
chr7 (192-394)||(25542620-25542818)
chr7 (212-394)||(44512525-44512704)
chr7 (218-394)||(6067197-6067373)
chr7 (232-341)||(6348912-6349020)
chr7 (209-336)||(25357047-25357169)
chr7 (209-394)||(25405393-25405575)
chr7 (208-394)||(1606486-1606669)
chr7 (208-394)||(22137184-22137367)
chr7 (208-394)||(40552211-40552394)
chr7 (209-394)||(2120899-2121082)
chr7 (179-249)||(22392539-22392608)
chr7 (209-394)||(7069780-7069962)
chr7 (212-368)||(44143892-44144045)
chr7 (209-394)||(42006663-42006846)
chr7 (209-394)||(7074787-7074969)
chr7 (209-394)||(15540995-15541177)
chr7 (212-394)||(30246973-30247153)
chr7 (209-394)||(8378503-8378686)
chr7 (212-394)||(7464518-7464697)
chr7 (179-287)||(12310119-12310229)
chr7 (354-422)||(20091127-20091194)
chr7 (323-458)||(6349021-6349149)
chr7 (283-394)||(2075188-2075298)
chr7 (323-394)||(34546879-34546951)
chr7 (212-394)||(44016660-44016840)
[»] chr8 (78 HSPs)
chr8 (179-427)||(31035240-31035490)
chr8 (192-409)||(31162345-31162564)
chr8 (179-456)||(31578221-31578491)
chr8 (179-394)||(15956081-15956294)
chr8 (179-458)||(21482434-21482708)
chr8 (192-422)||(27911150-27911376)
chr8 (192-422)||(27957569-27957795)
chr8 (179-458)||(21480626-21480900)
chr8 (192-394)||(14419189-14419390)
chr8 (192-357)||(25952656-25952820)
chr8 (194-416)||(3005608-3005829)
chr8 (192-427)||(13858450-13858683)
chr8 (192-394)||(30480502-30480702)
chr8 (192-394)||(32339445-32339645)
chr8 (192-458)||(27106835-27107096)
chr8 (192-394)||(36865674-36865873)
chr8 (209-422)||(6376141-6376354)
chr8 (192-394)||(28283220-28283418)
chr8 (192-357)||(14807887-14808050)
chr8 (179-324)||(31573794-31573939)
chr8 (192-456)||(15072846-15073110)
chr8 (192-394)||(3874146-3874346)
chr8 (192-386)||(15068117-15068309)
chr8 (192-394)||(28251566-28251766)
chr8 (208-422)||(17847677-17847885)
chr8 (192-341)||(5372229-5372377)
chr8 (183-420)||(3895946-3896186)
chr8 (192-394)||(22684652-22684855)
chr8 (192-394)||(43530251-43530451)
chr8 (192-427)||(1225302-1225537)
chr8 (192-394)||(608870-609070)
chr8 (275-417)||(2468105-2468247)
chr8 (192-394)||(15809354-15809554)
chr8 (265-417)||(16833757-16833909)
chr8 (192-394)||(43079738-43079938)
chr8 (192-394)||(27829433-27829632)
chr8 (192-394)||(41384880-41385080)
chr8 (192-394)||(4424154-4424354)
chr8 (192-292)||(14477412-14477511)
chr8 (212-394)||(23179560-23179740)
chr8 (192-394)||(43082109-43082309)
chr8 (192-394)||(44720979-44721179)
chr8 (192-394)||(18810844-18811043)
chr8 (192-394)||(18813018-18813217)
chr8 (192-394)||(27827122-27827321)
chr8 (209-394)||(28332631-28332813)
chr8 (214-394)||(41382820-41382998)
chr8 (276-458)||(15185652-15185831)
chr8 (209-394)||(17799423-17799606)
chr8 (209-394)||(28327908-28328090)
chr8 (209-394)||(16752523-16752704)
chr8 (319-427)||(31566523-31566630)
chr8 (192-357)||(181635-181798)
chr8 (192-357)||(24873217-24873380)
chr8 (212-394)||(25684646-25684825)
chr8 (209-394)||(16757267-16757449)
chr8 (209-394)||(9021106-9021289)
chr8 (209-432)||(4812449-4812669)
chr8 (209-394)||(28895502-28895685)
chr8 (192-271)||(33541508-33541587)
chr8 (208-411)||(33838902-33839105)
chr8 (212-354)||(33032657-33032796)
chr8 (209-394)||(30423212-30423398)
chr8 (181-236)||(2468261-2468315)
chr8 (212-298)||(590797-590882)
chr8 (300-354)||(14419732-14419786)
chr8 (212-357)||(29554822-29554964)
chr8 (209-293)||(13985178-13985262)
chr8 (209-309)||(15949534-15949634)
chr8 (209-293)||(2267122-2267205)
chr8 (212-296)||(3276347-3276430)
chr8 (256-394)||(33020899-33021039)
chr8 (209-394)||(21033870-21034052)
chr8 (265-394)||(28890820-28890948)
chr8 (179-226)||(31035189-31035236)
chr8 (295-357)||(33541446-33541507)
chr8 (279-356)||(35872477-35872553)
chr8 (134-185)||(6376058-6376110)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (192-422)||(14354-14581)
scaffold0131 (192-357)||(15108-15271)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (179-417)||(16625-16863)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (192-394)||(85319-85520)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (179-427)||(4886-5132)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (192-394)||(183640-183839)
scaffold0005 (194-394)||(52102-52302)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (192-394)||(4085-4284)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (192-394)||(79274-79474)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (192-394)||(1452-1651)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (192-394)||(11472-11672)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (192-394)||(69291-69490)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (192-394)||(79949-80148)
scaffold0004 (209-296)||(188338-188424)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (192-394)||(6288-6488)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (192-394)||(130-330)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (192-394)||(29260-29459)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (192-394)||(41482-41682)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (209-458)||(57367-57613)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (192-358)||(2130-2294)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (208-394)||(22221-22404)
scaffold0140 (208-394)||(24496-24679)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (192-396)||(2969-3170)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (212-422)||(16328-16534)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (209-355)||(224819-224961)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (192-271)||(35728-35807)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 110)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 119 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 30790675 - 30790337
Alignment:
Q  119 aaaacaagagtttataaacaaacaataaactagggttttagagatttctctaagagagagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactatt 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30790675 aaaacaagagtttagaaacaaacaataaactagggttttagagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgtt 30790576  T
Q  219 aggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagct 318  Q
    ||||| || ||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  30790575 aggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtt 30790477  T
Q  319 actcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttc 418  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30790476 actcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttc 30790377  T
Q  419 tctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataact 458  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  30790376 tctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataact 30790337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 179 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 15669608 - 15669331
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||    
T  15669608 acactagggttggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggag 15669510  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggac 377  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  15669509 acttattcttgtaacccattgatatctctctcgtaaagctactcatcattatagtggaacggatggctgctctctccccgagactaggtcagttttagac 15669410  T
Q  378 tgaactgggtaaacaaaattcg-tgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataact 458  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||||||||    | || ||| |||||||||||||||||||    
T  15669409 tgaactgtgtaaacaaattttgttgtgttctctctttcttttctctcgctg----tgttatacttttgtttgtgtttataact 15669331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 119 - 456
Target Start/End: Original strand, 16561473 - 16561807
Alignment:
Q  119 aaaacaagagtttataaacaaacaataaactagggttt-tagagatttctctaagagagagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactat 217  Q
    |||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16561473 aaaacaagggattagaaacaaacaacaaactagggtttatagaggtttctctaagcgggagactctagggttg-ggttgattcaccttgggaaacactat 16561571  T
Q  218 taggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagc 317  Q
    ||||||| | ||||||||  |||  || |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||     
T  16561572 taggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagt 16561671  T
Q  318 tactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctt 416  Q
    |||||||||||| ||||||||  | |  |||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16561672 tactcatcattacagtggaacaaagggttgctctctcccatagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctt 16561771  T
Q  417 tctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataa 456  Q
    |||||||| |    |||||||| |||| ||||||||||||    
T  16561772 tctctcgccg----ttttctacttttgcttgtgtttataa 16561807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 158 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 26613476 - 26613177
Alignment:
Q  158 agagatttctctaagagagagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactt 257  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||  |||||||||||| |||    
T  26613476 agagatttctctaagcgggagacactagggttgggattgattcaccttgggaaacactattcggattgagtcacttggtcacaggaagagattgaggctt 26613377  T
Q  258 tgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccc 356  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||   || |||||| |||    
T  26613376 tgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttggaaagttactaatcattatagtggaacagagagcttctctctcccc 26613277  T
Q  357 cagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataa 456  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||| |||  ||||||| ||||    
T  26613276 cagattaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctctttctttctctcgttg---tttttctactttttcttgtgttaataa 26613180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 179 - 458
Target Start/End: Original strand, 42922297 - 42922572
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||    |||    
T  42922297 acactagggttgaggttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgagag 42922395  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggac 377  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||    
T  42922396 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggac 42922495  T
Q  378 tgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataact 458  Q
     |||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||| || ||    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  42922496 cgaactgggtaaacaaattttgtgtgttatctctttctttctcccgttg----ttttctacttttgtttgtgtttataact 42922572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 119 - 368
Target Start/End: Original strand, 155712 - 155961
Alignment:
Q  119 aaaacaagagtttataaacaaacaataaactagggtttt-agagatttctctaagagagagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactat 217  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  155712 aaaacaagggtttagaaacaaacaacaaactagggtttagagatatttctctaagtgggagacactacggttgagattgattcaccttgggaaacactat 155811  T
Q  218 taggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagc 317  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||  || ||||||||||| ||| | |||||||||||   ||  |||||| |||||||||     
T  155812 taggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattaggtttgaagagtaattcttgtaaccttttgttatctc-tttgtaaagt 155910  T
Q  318 tactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtca 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  155911 tactcatcattatagtggaacggatggctgctctctccccaaactaggtca 155961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 119 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 30738907 - 30738566
Alignment:
Q  119 aaaacaagagtttataaacaaacaat-aaactagggtttt-agagatttctctaagagagagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacacta 216  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||    
T  30738907 aaaacaagggtttagaaacaaaaaaacaaactagggtttagagagatttctctaagcgggagacactagggttgagattgattcaccttggaaaacacta 30738808  T
Q  217 ttaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaag 316  Q
    |||||||||| ||||||||| |   |||||||||| || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||    
T  30738807 ttaggattgagtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatgtctcttttgtaaag 30738708  T
Q  317 ctactcatc--attatagtggaacggatgactgctctctc-cccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctc-tt 412  Q
     ||||||||  ||||||||| |||||| |  ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||  |||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  30738707 ttactcatcatattatagtgaaacggagggatgctctctcacccatactaggtcagtattggaccaaacttggtaaacaaatttcgtgtgttctctcttt 30738608  T
Q  413 tctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataa 456  Q
    |||||||||| |  | ||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  30738607 tctttctctcac--tattttttctactcttgcttgtgtttataa 30738566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 192 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 8347474 - 8347212
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  8347474 ggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttgatcacgggaagagattgagactttgagtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 8347376  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||  || |||    
T  8347375 acccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtggaacggagggatgctctttcccctagactaggtcagttttggaccgaacaagggaaa 8347276  T
Q  391 caaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataact 458  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    |||||||| |||| || |||||||||||    
T  8347275 caaatttcgtgtgttctctctttctttctatcgctg----ttttctacttttgcttatgtttataact 8347212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 50076873 - 50076673
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||| ||| |||||||   ||| |||||||||||||    
T  50076873 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcg-ggaaacttattcttgta 50076775  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaac 391  Q
    |  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||| |||    
T  50076774 atccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagactatgtca-atttggaccgaactgggtcaac 50076676  T
Q  392 aaa 394  Q
    |||    
T  50076675 aaa 50076673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 179 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 14183806 - 14183591
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||   | |||| ||| |||||||   | ||    
T  14183806 acactagggttggggttgattcaccttggaaaacactattataattgagtctcttggttacgggaagagattagaattttgggtagaattaggcg-gaag 14183708  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggac 377  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14183707 acttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcagttttggac 14183608  T
Q  378 tgaactgggtaaacaaa 394  Q
     ||||||||||||||||    
T  14183607 cgaactgggtaaacaaa 14183591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 192 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 9241287 - 9241052
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||    |||||||||||||||||    
T  9241287 ggttgattcaccttggaaaacattattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagacg-ggagacttattcttgta 9241189  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | ||||||| ||| |||| |||||||| |||    
T  9241188 actcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaattt-ggaccgaactggggaaa 9241090  T
Q  391 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgt 427  Q
    |||| | |  | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9241089 caaattcttttttgttctctctttctttctctcgctgt 9241052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 179 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 13125673 - 13125395
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||| || ||||||||||  |||||||| | | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  13125673 acactagggttgaggttgattcacattgggaaacgctgttaggattgaggctcttggtcaagggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaag 13125574  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctct-ctccccagattaggtcagttttggac 377  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||| | ||||  | ||||||||| | ||||    
T  13125573 acttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagttgctctcccccccttactaggtcagtataggac 13125474  T
Q  378 tgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctc-tttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataactg 459  Q
     ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||    |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  13125473 cgaactaggtaaacaaatttcatgtgttctctcttttctttctctcgttg----ttttctacttttgcttgtgtttataactg 13125395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 192 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 17186329 - 17186067
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||   |||||| ||| ||||||    |||||||||||||||||    
T  17186329 ggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgaactttgggtagaattagaag-ggagacttattcttgta 17186231  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||    
T  17186230 acccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattataatggaacggagtgctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaattgggtaaa 17186132  T
Q  391 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataact 458  Q
    |||| | |  ||||| |||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  17186131 caaattcttttgtgttctctctttctttctctcgctg----ttttctacttttgtttgtgattataact 17186067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 17324837 - 17324637
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  17324837 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 17324739  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  17324738 actcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 17324641  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  17324640 caaa 17324637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 30791342 - 30791236
Alignment:
Q  11 catcatcaggagtgaagaaaagcatataatgctgcaatgaaccaaatgacacagaaacaaaaatggtttcttcttacctaaaagcacttgaggttgcgat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  30791342 catcatcaggagtgaagaaaagcatataatgctgcaatgaaccaaatgacacagaaacaaaaatggtttcttcttatccaaaagcacttgaggttgcgat 30791243  T
Q  111 cgcgtct 117  Q
    |||||||    
T  30791242 cgcgtct 30791236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 191 - 422
Target Start/End: Original strand, 41646999 - 41647229
Alignment:
Q  191 tggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  41646999 tggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattagg-ctggagacttattcttgt 41647097  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc-ccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||  |||| || ||||  ||||||| ||||||||| |    
T  41647098 aactcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccatcagactatgtca-atttggaccgaactgggtca 41647195  T
Q  390 acaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctc 422  Q
    ||||| | || ||||| ||||||| |||||||||    
T  41647196 acaaattctcttgtgttctctcttcctttctctc 41647229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Original strand, 18307189 - 18307364
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||    |||||||||||||||     
T  18307189 ggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgagagacttattcttgtg 18307287  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtca 368  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18307288 acgcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctccccagactaggtca 18307364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 179 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 8349266 - 8348991
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||| |||||||||  ||||||  ||| |||||||   || |    
T  8349266 acactagggttggggtttattcaccttgggaaacactattaggattgagtttgatggtcacgggaagagattaggactttaggtagaattaggcg-ggtg 8349168  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggac 377  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  || |  || ||||||||| ||| || ||||||||| |||    
T  8349167 acttattcttgtaactcattggtatctcttttgttaagttactcatcattatagtggaatagagggttgttctctccccaagactatgtcagttttagac 8349068  T
Q  378 tgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataact 458  Q
     |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||   ||    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  8349067 cgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctctttctttctctaattg----ttttctacttttgtttgtgtttataact 8348991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 18839667 - 18839868
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  18839667 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagaatgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 18839765  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| || | ||||||| | ||||| | |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  18839766 acccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctttcccccatactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 18839864  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  18839865 caaa 18839868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 6756608 - 6756808
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  6756608 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct--tgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 6756704  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct--ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| | |    
T  6756705 acctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaagactgctctctccccccagactaggtcag-tttggaccgaactggatca 6756803  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  6756804 acaaa 6756808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Original strand, 16428733 - 16428897
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  16428733 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgta 16428831  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||    
T  16428832 acccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattttagtgaaacggagggctgctctctcccc 16428897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Original strand, 40134024 - 40134188
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  40134024 ggttgattcaccttgggaaatactactaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggttttgggtaaaattaggcg-ggagacttattcttgta 40134122  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  40134123 acacattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctcccc 40134188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 38925679 - 38925482
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  38925679 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-ctggagacttattcttgta 38925581  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaac 391  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||   |||||  |||||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| || |||    
T  38925580 acccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtaaaacggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgagtcaac 38925485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 12302706 - 12302506
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| |||||||   |||||||||||||| ||    
T  12302706 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattagg-cgggagacttattcttata 12302608  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||||||| | ||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  12302607 actcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagattaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 12302510  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  12302509 caaa 12302506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 31425219 - 31425016
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattga---atctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattctt 288  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| |||||||   |||| |||||||||    
T  31425219 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggaggcttattctt 31425121  T
Q  289 gtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggta 388  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| | |||||||  ||||||| |||||||||     
T  31425120 gtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaaggctgctctctccccatactaggtca-atttggaccgaactgggtc 31425022  T
Q  389 aacaaa 394  Q
    ||||||    
T  31425021 aacaaa 31425016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 50079022 - 50078821
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  50079022 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggag-ggagacttattcttgta 50078924  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||| | ||||||    
T  50078923 acccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaatttggtaaa 50078825  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  50078824 caaa 50078821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 50307747 - 50307547
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  50307747 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 50307649  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||||||| | ||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  50307648 actcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 50307551  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  50307550 caaa 50307547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 192 - 422
Target Start/End: Original strand, 13215161 - 13215393
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  13215161 ggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 13215259  T
Q  292 actcattcata----tctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactggg 386  Q
    || |||| |||    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| |||||| |    
T  13215260 acccattgatatttttctcttttgtaaatttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgcg 13215358  T
Q  387 taaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctc 422  Q
    | ||| |||||| | ||| ||||||| |||||||||    
T  13215359 tcaac-aaattcttttgttctctcttcctttctctc 13215393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 191 - 383
Target Start/End: Original strand, 31489992 - 31490181
Alignment:
Q  191 tggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||   | ||||||||||||||    
T  31489992 tggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatttcttggttacgggaagagattgagactttggatagaattagg-cggaagacttattcttgt 31490090  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaact 383  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | || |||||| ||| ||| |||||| | |||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  31490091 aactcattgatatctcttttgtaaggttattcatca-tatggtgaaacggagggctgctctccccccagactaggtca-atttggactgaact 31490181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10400029 - 10399829
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  10400029 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttcggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 10399931  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  10399930 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 10399833  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  10399832 caaa 10399829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 11457676 - 11457476
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  11457676 ggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgcgaagagattgggggtttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 11457578  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||| ||    
T  11457577 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggatgtctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaacttggtcaa 11457480  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  11457479 caaa 11457476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 192 - 422
Target Start/End: Original strand, 17324143 - 17324371
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  || | ||||||||||  |||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  17324143 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattggaactttgggtaaaattaggcg-ggagacttattcttgta 17324241  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccca-gattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||| || |||||||  ||||||| ||||| ||| ||    
T  17324242 acccattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaacggaaggctggtctctccccatgactaggtca-atttggaccgaactaggtcaa 17324340  T
Q  391 caaaattcgtgtgtgctctctttctttctctc 422  Q
    | |||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  17324341 c-aaattcttgtgttctctcttcctttctctc 17324371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 192 - 456
Target Start/End: Original strand, 25127952 - 25128216
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  25127952 ggttgattcaccttgtgaaacactatttggattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttttggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 25128050  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctc-cccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    | ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||| | |||||||||| |||| | |||||||  || |||| ||||||||| ||    
T  25128051 attcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacggagggctgctctctctcccatactaggtca-attaggaccgaactgggtcaa 25128149  T
Q  391 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataa 456  Q
    |||| | |  ||||| ||||||| |||||| || ||  || |||||||| ||| |||||| ||||||    
T  25128150 caaattcttttgtgttctctcttcctttctttctctcgctgttttctacttttatttgtgattataa 25128216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 192 - 353
Target Start/End: Original strand, 39932153 - 39932312
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||   ||||||| |||||||||    
T  39932153 ggttgattaaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagactgagactttgggtagaattagg-cgggagactaattcttgta 39932251  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct 353  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  39932252 acccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggaacggagggctgctctct 39932312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 191 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 2949433 - 2949204
Alignment:
Q  191 tggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| | ||||| ||| |||||||   |||||||| |||||||    
T  2949433 tggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgtttacgagaatagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgt 2949335  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    |||||||| | ||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| || | ||||||||||||| || |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  2949334 aactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccgactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 2949237  T
Q  391 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctc 422  Q
    |||| | |  ||||| ||||||| |||||||||    
T  2949236 caaattcttttgtgttctctcttcctttctctc 2949204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 3579817 - 3579618
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||| | ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  3579817 ggttgattcaccttaggaaacacaattaggattgagtctcttgattacggaaagagattggggctttgggtaaaattaggcg-ggagacttattcttgta 3579719  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  3579718 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat--tagtgaaacggatgattgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 3579622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 192 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 6115304 - 6115066
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||||||   || ||||||||||||||    
T  6115304 ggttgattcaccttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggg-gacttattcttgta 6115206  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  6115205 accaattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtaaa 6115107  T
Q  391 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctt 430  Q
    |||| | |  ||||| |||||||  ||||||||| ||||||    
T  6115106 caaattattttgtgttctctcttcttttctctcgttgtctt 6115066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 6823094 - 6823294
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| | ||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  6823094 ggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 6823192  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||||||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  6823193 actcattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 6823290  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  6823291 caaa 6823294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 15295035 - 15294835
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||| ||||||| | ||||| |||||||||||    
T  15295035 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattagg-tgggagatttattcttgta 15294937  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||| | |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  15294936 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 15294839  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  15294838 caaa 15294835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 25248753 - 25248552
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  25248753 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 25248655  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  25248654 acccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtgaaacggaggactgctccctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 25248556  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  25248555 caaa 25248552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 179 - 394
Target Start/End: Original strand, 27916561 - 27916778
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    ||||||||||||   |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| ||    
T  27916561 acactagggttggaattgattcaccttggaaaacactattagaattgagtctcttggtcacatgaagagattgtgactttgggtggaattaggtttgaag 27916660  T
Q  279 acttattcttgtaac--tcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttgg 375  Q
    ||| |||||| ||||  || || ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  27916661 actaattcttttaaccttctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcgttatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattgg 27916759  T
Q  376 actgaactgggtaaacaaa 394  Q
    || ||| ||||||||||||    
T  27916760 accgaattgggtaaacaaa 27916778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 51750119 - 51750319
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  51750119 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 51750217  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  51750218 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 51750315  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  51750316 caaa 51750319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Original strand, 2617596 - 2617771
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  2617596 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-atggagacttattcttgta 2617694  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtca 368  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||||    
T  2617695 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtca 2617771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Original strand, 16432474 - 16432638
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| ||||| |   ||| | |||||||||||    
T  16432474 ggttgattcaccttgggaaacattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactttgggtagaattatg-cgggacaattattcttgta 16432572  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  16432573 acccattgatatctcttttgtaatgttactcatcattatagtgaaacggcggactgctctctcccc 16432638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 181 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 18800785 - 18800557
Alignment:
Q  181 actagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagac 280  Q
    |||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| | |||||||   |||||| ||| |||||||   ||| ||    
T  18800785 actagggttggggttgattcaccctgagaaacactattaggattgagtctctaggtcacgggtagagatttgaactttgggtagaattaggcg-ggacac 18800687  T
Q  281 ttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactg 379  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||      
T  18800686 ttattcttgtatcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaagcggagaactgctctctcccccaaactaggttagttttggacca 18800587  T
Q  380 aactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctct 409  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18800586 aacagggtaaacaaatttcgtgtgttctct 18800557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 31423073 - 31422933
Alignment:
Q  193 gttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaa 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  31423073 gttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 31422975  T
Q  293 ctcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtg 334  Q
    | |||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  31422974 cccattgacatctcttttgtaaggttactcatcattatagtg 31422933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 2510525 - 2510326
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||||    ||||||||||||||||    
T  2510525 ggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattagg--cagagacttattcttgta 2510428  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  2510427 acccattgatttctctcttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 2510330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 39462599 - 39462799
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||| |||||||||||    
T  39462599 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagaattattcttgta 39462697  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || | || |||||||||||| |||| || |||||| ||||||| ||||||   ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  39462698 accctttgatatctcttttgaaaagttattcatca-tatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 39462795  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  39462796 caaa 39462799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 203 - 427
Target Start/End: Original strand, 16429048 - 16429272
Alignment:
Q  203 cttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcata 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| || |||| ||| |||||||   | ||||||||||||||||| |||| |||    
T  16429048 cttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcg-gaagacttattcttgtaacccattgata 16429146  T
Q  303 tctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaat-tcgt 400  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||| |||||| | |  |    
T  16429147 tctcttttgtaaggttactcatcattatagcgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaattgggtcaacaaattctttt 16429245  T
Q  401 gtgtgctctctttctttctctcgctgt 427  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||    
T  16429246 gtgttctctcttcttttctctcgctgt 16429272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 285 - 458
Target Start/End: Original strand, 15916562 - 15916734
Alignment:
Q  285 tcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaact 383  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  15916562 tcttgtaacccattgatatctcttttataaagttactcgtcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttggaccgaact 15916661  T
Q  384 gggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgttt-gtttgtgtttataact 458  Q
    ||||||||||| || ||| || |||||||||||| ||||||||   ||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  15916662 gggtaaacaaattttgtgcgttctctctttctttttctcgctg---tttttctacttttggcttgtgtttataact 15916734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 192 - 427
Target Start/End: Original strand, 47906350 - 47906584
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  47906350 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 47906448  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||| | |||| | ||||||||| ||||||| | |||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  47906449 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagacttggtca-atttggaccgaactgggtcaa 47906546  T
Q  391 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgt 427  Q
    |||| | |  ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  47906547 caaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgt 47906584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 9459618 - 9459418
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  9459618 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttatccttgt 9459520  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |    
T  9459519 aacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 9459423  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  9459422 acaaa 9459418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 9463445 - 9463245
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  9463445 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttatccttgt 9463347  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |    
T  9463346 aacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 9463250  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  9463249 acaaa 9463245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 179 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 26520334 - 26520086
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttac------gagaagagattgagactttgcgtaaaattaggt 272  Q
    |||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||      | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  26520334 acactaagattgaggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacagtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggt 26520235  T
Q  273 ttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagtt 371  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||        |||||| | || || |||||||||||||||| |  |||||| ||||| | ||||||||||||    
T  26520234 ttggaaacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccaaattaggtcagtt 26520143  T
Q  372 ttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgt 427  Q
    ||||||  |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  26520142 ttggaccaaactgggtaaacaaatatcgtgtgttctctctttcttttctctcgctgt 26520086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 27337140 - 27336877
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  || ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  27337140 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgggtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtaaaattagg-cgggagacttattcttgta 27337042  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  27337041 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 27336945  T
Q  391 caaaat-tcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtcttttttctacgttt-gtttgtgtttataa 456  Q
    |||| | |  ||||| ||||||| | ||||||||||||| | |||||||| ||| | ||||||||||||    
T  27336944 caaattcttttgtgttctctcttccttttctctcgctgt-tgttttctacttttggcttgtgtttataa 27336877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 4131580 - 4131387
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||  || ||||||| ||| |||||||   | | |||||||||||||    
T  4131580 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgagaa-acttattcttgta 4131483  T
Q  292 actcattcatatct----cttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaact 383  Q
    || |||| ||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  4131482 acccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggactgaact 4131387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 15823626 - 15823826
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  15823626 ggttgattcaccttgggaaacactattaatattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 15823724  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| ||||||| |||||||  ||| ||| ||||||||| ||    
T  15823725 acccattgatatctctattgtaacgttactcatca-tatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaa 15823822  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  15823823 caaa 15823826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 179 - 337
Target Start/End: Original strand, 28279331 - 28279490
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttgga 277  Q
    |||||||||||| | ||||||  |||||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |    
T  28279331 acactagggttgggattgattccccttggagaaacactattaggattgagcttcttggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggtttgaa 28279430  T
Q  278 gacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaa 337  Q
    |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28279431 gactaattcttgtaactcattggcatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 28279490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 28840760 - 28840959
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  28840760 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 28840858  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  28840859 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 28840955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 47179793 - 47179992
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  47179793 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 47179891  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||    
T  47179892 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaa 47179988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 6995901 - 6995701
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||   ||| |||| ||||||||    
T  6995901 ggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggatactttttcttgta 6995803  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc-ccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||||||| | ||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||| ||| ||    
T  6995802 actcattgacatctcttttataacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaa 6995705  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  6995704 caaa 6995701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 219 - 394
Target Start/End: Original strand, 17318994 - 17319167
Alignment:
Q  219 aggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagct 318  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||| |||||||   | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |    
T  17318994 aggattgagtctcttggttacgggaacagattgggactttgggtagaattaggcg-gaagacttattcttgtaacttattgatatctcttttgttaagtt 17319092  T
Q  319 actcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||||||    
T  17319093 actcatcattatagtaaaacggagggctgctctctccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 17319167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 24325743 - 24325943
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  24325743 ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 24325841  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||| | || ||| ||||||||| ||||||| || |||| |||| ||| ||||||||| ||    
T  24325842 acccattgatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaatcgaatggctgctctctcccccagactaagtcaatttt-gaccgaactgggtcaa 24325939  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  24325940 caaa 24325943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 31735722 - 31735522
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  31735722 ggttgattcaccttgggaaacactattaaggttgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 31735624  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    |  |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  31735623 atccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 31735526  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  31735525 caaa 31735522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 46431908 - 46431707
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  46431908 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 46431810  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct---ccccagattaggtcagttttggactgaactgggta 388  Q
    || |||| || |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||   ||||||| |||||||  ||||||| |||||||||     
T  46431809 acccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtc 46431713  T
Q  389 aacaaa 394  Q
    ||||||    
T  46431712 aacaaa 46431707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 14098171 - 14097941
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgaga-ctttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| ||||||    ||||||||||||||||    
T  14098171 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-agagctttgggtagaattagacg-ggagacttattcttgt 14098074  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaa-gctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtcagttttggactgaactgggta 388  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||| || | |||||||  ||||||| |||||||||     
T  14098073 aacccattgatatctcttttgtaaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccacaaactaggtca-atttggaccgaactgggtc 14097976  T
Q  389 aacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctc 422  Q
    |||||| | |  ||||| ||||||| |||||||||    
T  14097975 aacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctc 14097941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 21948388 - 21948225
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  21948388 ggttgattcaccttgg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagacgctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 21948291  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccca 358  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  21948290 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccca 21948225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 341
Target Start/End: Original strand, 43104155 - 43104389
Alignment:
Q  114 gtctcaaaacaagagtttataaacaaacaataaactagggtttt-agagatttctctaagagagagacactagggttgtggttgattt-----accttgg 207  Q
    |||| |||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||| | |||||| || ||||| | ||| |||     |||||||    
T  43104155 gtctgaaaacaatggtttagaaacaaacaacaaactagggtttggagaggtttctctaagcgggagacattatggttgagattgttttggttcaccttgg 43104254  T
Q  208 gaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttatt-cttgtaactcattcatatctc 306  Q
     |||||||||||| ||||| ||| ||||| ||  ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||| ||| || || |||||||| | || |||||||    
T  43104255 aaaacactattagaattgagtcttttggtcacaggaagacattgaaactttgggtagaattaggtttgaagatttttttcttgtaaccctttgatatctc 43104354  T
Q  307 ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacgga 341  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43104355 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgga 43104389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 16226247 - 16226447
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  16226247 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 16226345  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |    
T  16226346 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 16226442  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  16226443 acaaa 16226447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 25251476 - 25251246
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   | | |||||||||||||    
T  25251476 ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cggaaaacttattcttgta 25251378  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| |||| |||||||||| | |||| |||||||||||| ||| || |  |||||||||||| | | |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  25251377 acccattgatatatcttttgtaaggttacttatcattatagtgaaacagagggttgctctctccccaatactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 25251279  T
Q  391 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctc 422  Q
    |||| | |  ||||| ||||||| |||||||||    
T  25251278 caaattcttttgtgttctctcttcctttctctc 25251246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 13761917 - 13762116
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  13761917 ggttgattcaacttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtctgtgactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 13762015  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | || |||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  13762016 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggaccggagggcttctctctcccccagactaggtca-atttggactgaactgggtcaa 13762112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 47177442 - 47177641
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggat-tgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  47177442 ggttgattcaccttgggaaacactattaggatgggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgt 47177540  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||||||||| ||    
T  47177541 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccccagactaggtcag-attggatcgaactgggtcaa 47177637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 192 - 340
Target Start/End: Original strand, 48665257 - 48665404
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttac-gagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||  || ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  48665257 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttaccgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgt 48665355  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacgg 340  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  48665356 aacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacgg 48665404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 217 - 357
Target Start/End: Original strand, 47451747 - 47451885
Alignment:
Q  217 ttaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaag 316  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  47451747 ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtaaaattagg-cgggaaactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacg 47451845  T
Q  317 ctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
     ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  47451846 ttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgctctctcccc 47451885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 369
Target Start/End: Original strand, 16231643 - 16231819
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  16231643 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 16231741  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcag 369  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16231742 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag 16231819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 20302539 - 20302738
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |  ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  20302539 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagactaggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 20302637  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| ||||||| | |||||||||  |||||||| |||| |||| |||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||| ||    
T  20302638 acccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-gatagtggatcggaggactactctctcccccagactaggtca-atttggaccgaacttggtcaa 20302734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 28842575 - 28842774
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  |||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  28842575 ggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 28842673  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | ||  ||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||| ||    
T  28842674 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctaatctctcccccagactaggtca-atttggacagaactaggtcaa 28842770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 28998454 - 28998320
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||| |||||||   |||||||| ||||||||    
T  28998454 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgta 28998356  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcat 327  Q
    ||||||| | |||||||||| || | ||||||||||    
T  28998355 actcattgacatctcttttgcaacgttactcatcat 28998320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 29004170 - 29004036
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||| |||||||   |||||||| ||||||||    
T  29004170 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgta 29004072  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcat 327  Q
    ||||||| | |||||||||| || | ||||||||||    
T  29004071 actcattgacatctcttttgcaacgttactcatcat 29004036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 50248773 - 50248639
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||| |||||||    ||||||||||||||||    
T  50248773 ggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcgagactttgggtagaattagg-cgagagacttattcttgta 50248675  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcat 327  Q
    || |||| | ||||||||||||| | ||||||||||    
T  50248674 acccattgacatctcttttgtaaggttactcatcat 50248639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 21353525 - 21353347
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||| |    
T  21353525 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-g 21353431  T
Q  312 taaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||| |||||||  ||| ||| ||||||||||||||||    
T  21353430 taaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatctttagaccgaactgggtaaacaaa 21353347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 201 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 28207258 - 28207005
Alignment:
Q  201 accttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||| | |||||  || ||||| |   |||||||| ||||||||||||||| |    
T  28207258 accttgggaaacactattaggattgtgtctcttggttacaggaagagattggggctttgaatataattacgcg-ggagactttttcttgtaactcattga 28207160  T
Q  301 tatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaat-tc 398  Q
     ||||||||||||| | ||||||||   |||||| |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||| | |     
T  28207159 catctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 28207064  T
Q  399 gtgtgtgctctctt-tctttctctcgctgtcttttttctacgttt-gtttgtgtttataa 456  Q
     ||||| ||||||| | ||||||||||||| | |||||||| ||| | ||||||||||||    
T  28207063 ttgtgttctctcttctttttctctcgctgt-tgttttctacttttggcttgtgtttataa 28207005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 394
Target Start/End: Original strand, 23785935 - 23786119
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctc 306  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  23785935 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 23786033  T
Q  307 ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
     ||||||| | |||||||||  |||||||| |||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  23786034 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 23786119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 51752445 - 51752643
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  51752445 ggttgattcaccttgtgaaacactattag-attgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 51752542  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| ||||||| | |||||| || |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  51752543 acccattgatttctc-tttgtaacgatactcacca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 51752639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 193 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 49495411 - 49495266
Alignment:
Q  193 gttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaa 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||| |||  ||||||||| | ||||| ||| |||||||   ||||||| ||||||||||    
T  49495411 gttgattcaccttgggaaacactaataaaattgagtcttttggtcacggtaagagattggggctttgggtagaattaggcg-ggagactcattcttgtaa 49495313  T
Q  293 ctcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacg 339  Q
    | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  49495312 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacg 49495266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 192 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 27339331 - 27339068
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||  |||||||||| ||| |||||||   || ||||||||||||||    
T  27339331 ggttgattcaccttgggaaatactattacgattgagtctcttagttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggcgacttattcttgta 27339233  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||| ||    
T  27339232 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgatctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaa 27339136  T
Q  391 caaaat-tcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtcttttttctacgttt-gtttgtgtttataa 456  Q
    |||| | |  ||||| ||||||| | ||||||||||||| | |||||||| ||| | ||||||||||||    
T  27339135 caaattcttttgtgttctctcttccttttctctcgctgt-tgttttctacttttggcttgtgtttataa 27339068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 300 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 13127782 - 13127668
Alignment:
Q  300 atatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc-ccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattc 398  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||| |||| ||||||||||| |||    
T  13127782 atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcctccagactaggttagtattggaccgaaccgggtaaacaaatttc 13127683  T
Q  399 gtgtgtgctctcttt 413  Q
     ||||| ||||||||    
T  13127682 atgtgttctctcttt 13127668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 192 - 309
Target Start/End: Original strand, 20291537 - 20291653
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |  ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  20291537 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactaggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 20291635  T
Q  292 actcattcatatctcttt 309  Q
    || |||| || |||||||    
T  20291636 acccattgatttctcttt 20291653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 204 - 394
Target Start/End: Original strand, 51757623 - 51757810
Alignment:
Q  204 ttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||||  ||  || |    
T  51757623 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacctatcgattt 51757721  T
Q  304 ctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||| ||||||| | |||||| || |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||| ||||||    
T  51757722 ctc-tttgtaacgatactcacca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaa 51757810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 2393461 - 2393282
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||  || ||||| | ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||| |    
T  2393461 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagtctgggacttgg-gtagaattagatttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-g 2393367  T
Q  312 taaagctactcat--cattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  ||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||   || ||| ||||||| ||||||||    
T  2393366 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccccagactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaa 2393282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 4144865 - 4144682
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| || ||| ||| ||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||| | |||||   |    
T  4144865 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattaggtttgaagattgattcttgtaactcaat-atatc---t 4144771  T
Q  309 ttgtaaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  4144770 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagagtaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 4144682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332613
Alignment:
Q  194 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaatta 269  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgtgtagaatta 26332613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 308 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 11693397 - 11693315
Alignment:
Q  308 tttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  11693397 tttgaaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctccc----ttaggtcagtattgaactgaactgggtaaacaaa 11693315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 2401400 - 2401220
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||    
T  2401400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 2401306  T
Q  312 taaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||||| ||   || |||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  2401305 taaagaaactcatatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 2401220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Original strand, 9526469 - 9526649
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||   ||||||| ||||    
T  9526469 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctc-tttg 9526563  T
Q  312 taaagctact--catcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  |||   |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  9526564 taaagaaacttatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 9526649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 339
Target Start/End: Original strand, 14353047 - 14353190
Alignment:
Q  194 ttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagatt-gagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||  |||||||| ||||||||| ||| |||||||||| || || ||||||||||    
T  14353047 ttgattcaccttggagaaacactattaggatttagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattaggttt-gaaac-tattcttgta 14353144  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacg 339  Q
    || | || | |  |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  14353145 accctttgaaa--tcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacg 14353190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 292
Target Start/End: Original strand, 14997040 - 14997122
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaa 292  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14997040 aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagagattgagac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 14997122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 338
Target Start/End: Original strand, 46783146 - 46783272
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgaga-ctttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctttt 310  Q
    |||| ||||||| ||  |||||||| ||  ||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| | || |||||| ||||    
T  46783146 cactgttaggatagagactcttggtcacatgaagagattcagaactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatct-tttt 46783244  T
Q  311 gtaaagctactcatcattatagtggaac 338  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  46783245 gtaaagaaactcatcattatagtggaac 46783272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 312
Target Start/End: Original strand, 6823965 - 6824091
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctctt-------ggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttat 284  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||   | ||||||||    
T  6823965 ggttgattcaccttgggaaacactattacgattgaatctcttggttacgggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cggcagacttat 6824063  T
Q  285 tcttgtaactcattcatatctcttttgt 312  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||    
T  6824064 tcttgtaacccattgatttctcttttgt 6824091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 275
Target Start/End: Original strand, 49959129 - 49959212
Alignment:
Q  194 ttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagatt-gagactttgcgtaaaattaggtttg 275  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  49959129 ttgattcaccttggagaaacactattaggaatgagtctcttggtcatgagaagagattcgagactttggataaaattaggtttg 49959212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 341
Target Start/End: Original strand, 25134074 - 25134200
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||    
T  25134074 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 25134168  T
Q  312 taaagctactc--atcattatagtggaacgga 341  Q
    |||||  ||||  || ||||||||||||||||    
T  25134169 taaagaaactcatataattatagtggaacgga 25134200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 298
Target Start/End: Original strand, 2232597 - 2232685
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcatt 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  2232597 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt 2232685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26332776 - 26332699
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagact 256  Q
    |||||||| ||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||| || |||||||||||    
T  26332776 acactaggtttgggtttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgaaaatagattgagact 26332699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 8213615 - 8213571
Alignment:
Q  305 tcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgct 349  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8213615 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggataactgct 8213571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 394
Target Start/End: Original strand, 23816048 - 23816166
Alignment:
Q  275 ggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagtttt 373  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| | ||||||||| |||| |||| |||| |  |||||||| ||||| | |||||||  |||    
T  23816048 ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tataatggatcggagggatgctctctcccccatactaggtca-attt 23816145  T
Q  374 ggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||| ||||||||| ||||||    
T  23816146 ggaccgaactgggtcaacaaa 23816166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 357
Target Start/End: Original strand, 9521718 - 9521860
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||   ||||||| ||||    
T  9521718 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctc-tttg 9521812  T
Q  312 taaagctact--catcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    |||||  |||   |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  9521813 taaagaaacttatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccc 9521860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 379 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 26332525 - 26332450
Alignment:
Q  379 gaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataact 458  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||| || ||    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  26332525 gaactgggtaaacaaatttcgtgtgtcctctctctttttctcccgttg----ttttctacttttgtttgtgtttataact 26332450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 292
Target Start/End: Original strand, 37990772 - 37990857
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagatt-gagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaa 292  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| || | |||| ||| ||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  37990772 gaaacactattagaattgagtctcttgatcacgagaagagattcgaaattttgggtagaattaggtttgtagaccgattcttgtaa 37990857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 3091279 - 3091205
Alignment:
Q  218 taggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaac 293  Q
    ||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  3091279 taggattgagtctcttggtaacaggaagagattgagac-ttgagtagaattaagtttgaagactaattcttgtaac 3091205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13785455 - 13785370
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagatt-gagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaac 293  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||| || | |||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  13785455 aaacacaattaggattgagtttcttggtcacaaaaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaagactgattcttataac 13785370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 84)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 119 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 12186347 - 12186036
Alignment:
Q  119 aaaacaagagtttataaacaaacaataaactagggttttagaga--tttctctaagagagagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacacta 216  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||| |||| | |||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  12186347 aaaacaagggtttagaaacagacaacaaaccaaggttttagagagatttctctaagcgggagaaactagggttgttgttgattcaccttgggaaacacta 12186248  T
Q  217 ttaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaag 316  Q
    |||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12186247 ttaggattgagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaag 12186148  T
Q  317 ctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttc 414  Q
     |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || | || |||||||  |||| || |||||||||||||||| | |  ||||| |||||||||    
T  12186147 ttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctgcctcggactaggtca-atttgaaccgaactgggtaaacaaattattttgtgttctctctttc 12186049  T
Q  415 tttctctcgctgt 427  Q
    |||||||||||||    
T  12186048 tttctctcgctgt 12186036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 119 - 427
Target Start/End: Original strand, 26945184 - 26945495
Alignment:
Q  119 aaaacaagagtttataaacaaacaataaactagggtttt-agagatttctctaagagagagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactat 217  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26945184 aaaacaagggtttagaaacaaacaacaaactaggttttagagagatttctctaagcggaagacactaaggttgtggttgagtcaccttgggaaacactat 26945283  T
Q  218 taggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagc 317  Q
    ||||||| | ||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  26945284 taggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgtaactcattgatatctcttttgtaaagt 26945383  T
Q  318 tactcatcattatagtggaacggatgactgctct-ctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttc-t 415  Q
    |||||||||||||||| ||||| | | | ||||| | |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |    
T  26945384 tactcatcattatagtagaacgaagggcagctctcccccccagattatgtcaggtttggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtcttctctctttctt 26945483  T
Q  416 ttctctcgctgt 427  Q
    ||||||||||||    
T  26945484 ttctctcgctgt 26945495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 179 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 3028066 - 3027821
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||    
T  3028066 acactagggttggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgtgaagagattgagactttgagtagaattagg-ctggag 3027968  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctc--tctccccagattaggtcagttttgga 376  Q
    | ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||  || ||||||| |||||||||||| ||    
T  3027967 atttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttccccccagactaggtcagtttttga 3027868  T
Q  377 ctgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcg 423  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3027867 ccgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctctcg 3027821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 194 - 459
Target Start/End: Original strand, 19696556 - 19696819
Alignment:
Q  194 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaac 293  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||   |||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||     
T  19696556 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctctttgtcactgaaagagattgagactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaat 19696655  T
Q  294 tcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctc-cccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaaca 392  Q
     | || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  19696656 cctttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatagctgctctctctcccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 19696755  T
Q  393 aaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataactg 459  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19696756 aatttcgtgtgttctctctttctttctctcgctg---tttttctacttttgtttgtgtttataactg 19696819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 179 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 22858167 - 22857891
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||  ||| | ||||||||| ||    
T  22858167 acactagggttgagattgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagatttaggtttgaag 22858068  T
Q  279 acttattcttgtaactc-attcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttgga 376  Q
    ||| ||||||||||| |  || |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  22858067 actaattcttgtaacccttttgatatatc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcagtattgga 22857969  T
Q  377 ctgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataact 458  Q
    | |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    |||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  22857968 ccgaactgtgtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctctcgctg----ttttgtacttttgcttgtgtttataact 22857891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 179 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 16455638 - 16455404
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | |||  ||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||    
T  16455638 acactagggttgtggttgattcaccttgggaaacactgttaggattaagtctcttgctcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggag 16455540  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggac 377  Q
    | ||||||||||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||    
T  16455539 atttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagtattggac 16455440  T
Q  378 tgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctcttt 413  Q
     |||||| ||||||||| ||||||||| || |||||    
T  16455439 cgaactgagtaaacaaatttcgtgtgttctttcttt 16455404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 179 - 423
Target Start/End: Original strand, 15367134 - 15367376
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  || ||||||||||| |||||| |||||||||  |  ||||    
T  15367134 acactagggttg-ggttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctcttcgtcgcgggaagagattgaaactttgggtaaaatta-atcgggag 15367231  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactg--ctctctccccagattaggtcagttttgga 376  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| || |||||| ||||||| |||||| | |||  ||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  15367232 acttattcttgtaacccattaatatctctattgtaaagttattcatca-tatagtgaaacggaaggctgctctctctccccagactaggtca-atttgga 15367329  T
Q  377 ctgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcg 423  Q
    | |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  15367330 ccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctctttctttctctcg 15367376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 13039869 - 13040070
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||||||    
T  13039869 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgcgtagaattagg-cggaagacttattcttgta 13039967  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||| |||||||  ||| ||| ||||||||| ||    
T  13039968 acccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaa 13040066  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  13040067 caaa 13040070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 194 - 458
Target Start/End: Original strand, 14466440 - 14466703
Alignment:
Q  194 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaac 293  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || |||| ||| |||||||    ||||| ||||||||||||    
T  14466440 ttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggagtttgagtagaattagg-cgagagacatattcttgtaac 14466538  T
Q  294 tcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaaca 392  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |||||||||||| | | ||||| | |||||||  ||||||| ||||||||| | ||    
T  14466539 tcattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaccggatgactgctgtttcccccatactaggtca-atttggaccgaactgggtcagca 14466637  T
Q  393 aaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataact 458  Q
    || | || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  14466638 aattctcttgtgttctctctttctttctctcgctg-ctgttttctacttttgtttgtgattataact 14466703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 194 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 25078755 - 25078538
Alignment:
Q  194 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaac 293  Q
    |||||| ||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||| |||  |||||||||||| |||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25078755 ttgattcaccttggtaaacaccgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgaga-tttaagtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 25078657  T
Q  294 tcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaa 393  Q
     | || ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  25078656 cctttgatatctcttttgtaaagttactcgtcattacagtggaacggaggactgctttcttcccagtctaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaa 25078557  T
Q  394 aattcgtgtgtgctctctt 412  Q
    | || |||||| |||||||    
T  25078556 attttgtgtgttctctctt 25078538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 158 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 28037964 - 28037724
Alignment:
Q  158 agagatttctctaagagagagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactt 257  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||| | |||  || ||||||||||||    
T  28037964 agagatttctctaagcgggagacactagggttgtgagtgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtcccttgttcacggaaatagattgagactt 28037865  T
Q  258 tgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtgga---acggatgactgctctct- 353  Q
    || ||| ||||||||||  |  |||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||   ||| | | |||||||||     
T  28037864 tgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggacggacgaaaggctgctctctc 28037765  T
Q  354 ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28037764 ccccagtctaggtcagttttggaccgagctgggtaaacaaa 28037724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 192 - 456
Target Start/End: Original strand, 13057309 - 13057570
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  13057309 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 13057407  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||||| | |||||||  ||||||| ||||| ||| ||    
T  13057408 acccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctactctctcccccaaactaggtca-atttggaccgaactcggtcaa 13057506  T
Q  391 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataa 456  Q
    |||| | |  ||||| ||||||||||||   || || ||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  13057507 caaattcttttgtgttctctctttcttt---tctctatctgttttctacttttgtttgtgattataa 13057570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 209 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 12937376 - 12937133
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| || ||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||| || || |||||||||||   || |||||||||    
T  12937376 aaacactattaagattgagtctcttagtcacgagaatagattgaaacttttggtagaattaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctctt 12937277  T
Q  309 ttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctc 408  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||||| || |||||| ||     
T  12937276 t-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccccagactaggtctgttttggaacgaaccgggtaaacaaattttgtgtgttcta 12937178  T
Q  409 tctttc-tttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataa 456  Q
    |||||| ||||||||| ||    |||||||| |||| ||||||||||||    
T  12937177 tctttcttttctctcgttg----ttttctacttttgcttgtgtttataa 12937133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 3630063 - 3629864
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  3630063 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-agggagacttattcttgta 3629965  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaac 391  Q
    || |||| ||||||||||||||||| |||| || | ||||||| ||| || | |||||||||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||| |||    
T  3629964 acccattgatatctcttttgtaaagttactaat-aatatagtgaaactgagggctgctctctccccatactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 3629867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 179 - 458
Target Start/End: Original strand, 15719745 - 15720020
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||    
T  15719745 acactagggttgag-ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggag 15719842  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctc--tctccccagattaggtcagttttgga 376  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||    |||||  || ||||| | |||||||  ||||||    
T  15719843 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagagttgctctttccccccatactaggtca-atttgga 15719941  T
Q  377 ctgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataact 458  Q
    | ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  15719942 ccgaacttggtaaacaaatttcatgtgttctctctttcttttctctcgctg----ttttctatttttgtttgtgattataact 15720020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 192 - 422
Target Start/End: Original strand, 32280111 - 32280341
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||   ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  32280111 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttcaggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 32280209  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||| ||    
T  32280210 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaacttggtcaa 32280308  T
Q  391 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctc 422  Q
     ||| | || ||||| ||||||| |||||||||    
T  32280309 aaaattctcttgtgttctctcttcctttctctc 32280341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 3632137 - 3631938
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||| ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  3632137 ggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctttgttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggca-ggagacttattcttgta 3632039  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaac 391  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| | ||||||| | |||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||    
T  3632038 acccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctgt-cccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 3631941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Original strand, 3390494 - 3390658
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  3390494 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattggggctttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 3390592  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||    
T  3390593 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtgaaacggagggctgctctctcccc 3390658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 201 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 1069909 - 1069758
Alignment:
Q  201 accttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||| |||| |    
T  1069909 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattga 1069811  T
Q  301 tatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct 353  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||| | |||||||||    
T  1069810 tatctcttttgtaaggttactcatcattatagagaaacggagggctgctctct 1069758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 1230448 - 1230248
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  1230448 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttattggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 1230350  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  1230349 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 1230252  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  1230251 caaa 1230248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 9020041 - 9020241
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  9020041 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 9020139  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||| ||||| | |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  9020140 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggggggctgctctctcccccaaactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 9020237  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  9020238 caaa 9020241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 11983228 - 11983028
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  11983228 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 11983130  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  11983129 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 11983032  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  11983031 caaa 11983028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 275 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 25465708 - 25465556
Alignment:
Q  275 ggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctc-cccagattaggtcagtttt 373  Q
    ||||||||||||||||| | | || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | || |||||| ||    
T  25465708 ggagacttattcttgtacccctttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctctcccatactatgtcagtatt 25465610  T
Q  374 ggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgt 427  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25465609 ggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctctttctttctctcgctgt 25465556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 3233929 - 3233660
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||| |   |||||||||||||||||    
T  3233929 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatg-cgggagacttattcttgta 3233831  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagtttt----ggactgaactggg 386  Q
    ||||||| | ||||||||||||| | |||||| |  ||||||| |||||| | ||||||||| ||||| | ||||||| ||||    | |||||||||||    
T  3233830 actcattgacatctcttttgtaacgttactca-ccgtatagtgaaacggagggctgctctctcccccacactaggtcaattttgaccgaactgaactggg 3233732  T
Q  387 taaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtcttttttctacgttt-gtttgtgtttataa 456  Q
    | |||||| | |  ||||| ||||||| | ||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3233731 tcaacaaattcttttgtgttctctcttccttttctctcgctgt-tgttttctacttttggtttgtgtttataa 3233660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 4816430 - 4816230
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  4816430 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 4816332  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  4816331 acccattgatttctcttttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 4816234  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  4816233 caaa 4816230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 179 - 354
Target Start/End: Original strand, 20526907 - 20527081
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| ||    
T  20526907 acactagggttgagattgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaagaagagattaagacttttggtagaattaggtttgaag 20527006  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctc 354  Q
    ||| |||||||||||   || ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  20527007 actaattcttgtaaccttttgatatctc-tttgtaaagttattcatcattatagtggaacggagagctgctctctc 20527081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 30967316 - 30967516
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  30967316 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaaactttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgta 30967414  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||| ||||| | |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  30967415 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagagctgctctctcccccaaactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 30967512  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  30967513 caaa 30967516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 192 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15530321 - 15530166
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  |||||||   |||||||||||||||||    
T  15530321 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggttgaattagg-cgggagacttattcttgta 15530223  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctc 350  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  15530222 ac-cattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctc 15530166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 15532880 - 15532681
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||| ||||||  ||| |||||||    ||||||||||||||||    
T  15532880 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggacttttggtagaattagg-cgagagacttattcttgta 15532782  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaac 391  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||| |||| ||| ||||||| |||| ||||||||| ||| |||    
T  15532781 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctatccctagactaggtcaatttt-gactgaactaggtcaac 15532684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 24338646 - 24338447
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| |  |||||||| |||||||| ||| |||||| |  | |||||||||||||||    
T  24338646 ggttgatttaccttggaaaacactattaagattgagtcttttggttatggaaagagattaagactttgggtagaattag-tcagaagacttattcttgta 24338548  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaac 391  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||| || ||||  ||||||| ||||| |||||||    
T  24338547 acccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctc-ccccagactatgtca-atttggaccgaactaggtaaac 24338450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 209 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 12911629 - 12911421
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| || |||| || |||||||||||||  ||| | ||||||||| || || |||||||||||   || |||||||||    
T  12911629 aaacactattaagattgagtctcttagtcacgataatagattgagacttttggtagagttaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctctt 12911530  T
Q  309 ttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgct 407  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||||| || |||||| ||    
T  12911529 t-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtctgttttggaacgaaccgggtaaacaaattttgtgtgttct 12911431  T
Q  408 ctctttcttt 417  Q
     |||||||||    
T  12911430 atctttcttt 12911421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 179 - 332
Target Start/End: Original strand, 17012142 - 17012294
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||  |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||  ||| |||||||   ||||    
T  17012142 acactagggttgaggttgattcaccttctgaaacaatattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgatgcttttggtagaattagg-cgggag 17012240  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatag 332  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17012241 acttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatag 17012294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 265 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 28078322 - 28078136
Alignment:
Q  265 aattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagatta 363  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    | |||||||||||||| || | ||    
T  28078322 aattaggtttgaagacttattcttgtaac-ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggattataagactgctctctccctcatacta 28078224  T
Q  364 ggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataa 456  Q
    ||||| |||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||     ||||||| |||| ||||||||||||    
T  28078223 ggtcaattttagaccgaacagggtaaacaaatttcgtgtgttctctttttctttctctcgctg-----tttctacttttgcttgtgtttataa 28078136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 15541339 - 15541139
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  ||||||   |||||| ||||||||||    
T  15541339 ggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtaggattagg-cgggagacgtattcttgta 15541241  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc-ccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  15541240 acccattgatatctcttttgtaaagttattcatca-tatagtgaaacagaaagctgctctctcctccagactaggtta-atttggactgaactgggtcaa 15541143  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  15541142 caaa 15541139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 252 - 385
Target Start/End: Original strand, 30445698 - 30445832
Alignment:
Q  252 agactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctct 351  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30445698 agactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctct 30445797  T
Q  352 ctcc-ccagattaggtcagttttggactgaactgg 385  Q
    |||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  30445798 ctccaccatactaggtcagtattggactgaactgg 30445832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 30729027 - 30728823
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || | ||||| ||| |||||||   ||||||||||| |||||    
T  30729027 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttacgggaagaggctggggctttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgta 30728929  T
Q  292 actcattcata----tctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtcagttttggactgaactggg 386  Q
    ||||||| |||    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||  |||||||  |||||||    
T  30728928 actcattgatatctttctcttttgtaaagttactcat-attatagtggaacggaaggctgctctctcccgcagactaggtca-atttggaccaaactggg 30728831  T
Q  387 taaacaaa 394  Q
    | ||||||    
T  30728830 tcaacaaa 30728823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 202 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 14458956 - 14458766
Alignment:
Q  202 ccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcat 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||| |||| ||    
T  14458956 ccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 14458858  T
Q  302 atctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
     |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | || | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||||||    
T  14458857 ttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 14458766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 19704768 - 19704566
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  19704768 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 19704670  T
Q  291 aactcattcatatctct-tttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggta 388  Q
    ||| |||| || ||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| |||||||||     
T  19704669 aacccattgatttctctctttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtc 19704572  T
Q  389 aacaaa 394  Q
    ||||||    
T  19704571 aacaaa 19704566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20915555 - 20915355
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  20915555 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgagaagagattgggacttcgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 20915457  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |    
T  20915456 aacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 20915360  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  20915359 acaaa 20915355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 26065098 - 26065296
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  26065098 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 26065196  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaac 391  Q
    || |||| |  |||| ||||||| | ||||| | | ||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||    
T  26065197 acccattgacttctc-tttgtaacgttactcgtta-tatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 26065293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 26085067 - 26085265
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  26085067 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 26085165  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaac 391  Q
    || |||| |  |||| ||||||| | ||||| | | ||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||    
T  26085166 acccattgacttctc-tttgtaacgttactcgtta-tatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 26085262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 2629084 - 2628885
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag-acttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   |||| | ||||||||||    
T  2629084 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg--cggagaatttattcttgt 2628987  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||| |    
T  2628986 aacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaattgggtca 2628890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 5273415 - 5273215
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  5273415 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 5273317  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| |  ||||||| ||||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |    
T  5273316 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatc-ttatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 5273220  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  5273219 acaaa 5273215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 28241520 - 28241320
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||  ||| ||||| |   |||||||||||||||||    
T  28241520 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttcggtagaatta-gacgggagacttattcttgta 28241422  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||| | |||| | ||||||||| ||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||| ||    
T  28241421 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtga-atttggaccgaactgggtcaa 28241324  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  28241323 caaa 28241320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 277 - 421
Target Start/End: Original strand, 15346546 - 15346689
Alignment:
Q  277 agacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttgg 375  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| || ||||||| |||||| ||||||   ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||    
T  15346546 agacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagttattcatcat-atagtgaaacggaaagctgctctctcccccagactaggtcaattt-gg 15346643  T
Q  376 actgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctct 421  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15346644 accgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctct 15346689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 26932761 - 26932561
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  26932761 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 26932663  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| |  |||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |    
T  26932662 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 26932566  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  26932565 acaaa 26932561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 12195714 - 12195515
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||  |  ||||||||||||||||    
T  12195714 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaatta-atcgggagacttattcttgt 12195616  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |    
T  12195615 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 12195519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 14507374 - 14507175
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   | |||||||||||||||    
T  14507374 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cggaagacttattcttgta 14507276  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| ||||||| | |||| |||| ||||||| | |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  14507275 acccattgatttctc-tttgtaacgatacttatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 14507179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 30034802 - 30034602
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  30034802 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcaattggttaagggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 30034704  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||| |||| | ||||||||| ||||||| | |||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  30034703 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagcggatcggagggctgctctctcccccagactgggtca-atttggaccgaactgggtcaa 30034606  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  30034605 caaa 30034602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 192 - 314
Target Start/End: Original strand, 25477389 - 25477510
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| | ||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  25477389 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 25477487  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaa 314  Q
    || |||| |||||||||||||||    
T  25477488 acccattgatatctcttttgtaa 25477510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 217 - 413
Target Start/End: Original strand, 11262596 - 11262794
Alignment:
Q  217 ttaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaac-tcattc--atatctcttttgta 313  Q
    |||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||| || | ||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| || ||   |||||||||| |||    
T  11262596 ttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgagatttag-gtagaattaggtttgaagactaattcttataacctccttttgatatctcttt-gta 11262693  T
Q  314 aagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctt 412  Q
    |||  ||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  11262694 aagaaactcatcattatattgtaacggagaactgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaacggggtaaacaaatttcgtgtgttctctctt 11262793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 201 - 334
Target Start/End: Original strand, 22490764 - 22490896
Alignment:
Q  201 accttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattca 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| ||||| |    |||||||||||||||||| |||| |    
T  22490764 accttgcgaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattatg-cgagagacttattcttgtaacccattga 22490862  T
Q  301 tatctcttttgtaaagctactcatcattatagtg 334  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  22490863 tatctcttttgtaagattactcatcattatagtg 22490896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 204 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 12161744 - 12161594
Alignment:
Q  204 ttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatat 303  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||| | | ||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  12161744 ttgggaaacactattaagatcgagtctattggttacgggaagagattgagactttaggtataattaag-tgggagatttattcttgtaacccattgatat 12161646  T
Q  304 ctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc 356  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||  || ||||| ||| ||||||||    
T  12161645 ctcttttgtaaggttactcatca-tatagtaaaatggatggctgttctctccc 12161594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22352031 - 22351852
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||   |||||||||| |    
T  22352031 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgaga-tttgggtagaattaggtttgaagactgattcatgtaactca---atatctcttt-g 22351937  T
Q  312 taaagctactcat--cattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  ||||||  |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  22351936 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagaactgctctctcccccagactaggtcatcattagac-gaactgggtaaacaaa 22351852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 208 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 26066307 - 26066123
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctc 306  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| |||||||   ||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  26066307 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 26066209  T
Q  307 ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
     ||||||| | |||| ||||  |||||||| |||| | ||||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||||||    
T  26066208 -tttgtaacgttacttatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 26066123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 208 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 26068578 - 26068394
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctc 306  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||| ||||||  ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  26068578 gaaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc 26068480  T
Q  307 ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
     ||||||| | | |||||||  |||||||| |||| | ||||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||||||    
T  26068479 -tttgtaacgttgctcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 26068394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 208 - 394
Target Start/End: Original strand, 33308988 - 33309171
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctc 306  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   |||||| |||||||||||| |||| || ||||    
T  33308988 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc 33309085  T
Q  307 ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
     ||||||| | |||||||||  |||||||| |||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  33309086 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 33309171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 209 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 35201508 - 35201295
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||| |    
T  35201508 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 35201414  T
Q  309 ttgtaaagctactca-tcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgc 406  Q
    ||| ||||  ||| | ||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||| ||||||| | || ||| ||||||||||||||||  || ||||| |    
T  35201413 ttgaaaagaaactaattcattatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttc 35201314  T
Q  407 tctctttctttctctcgct 425  Q
    ||||| ||| |||||||||    
T  35201313 tctctctctctctctcgct 35201295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 192 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 19227607 - 19227528
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattagg 271  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||| |||||||    
T  19227607 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 19227528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 17695030 - 17694851
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||    
T  17695030 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 17694936  T
Q  312 taaagctact-catcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  |||  |||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  17694935 taaagaaactatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 17694851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Original strand, 13878727 - 13878909
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||| |    
T  13878727 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 13878821  T
Q  309 ttgtaaagctactca-tcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  13878822 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 13878909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Original strand, 16785919 - 16786101
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||| |    
T  16785919 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 16786013  T
Q  309 ttgtaaagctactca-tcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  16786014 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 16786101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 26887406 - 26887226
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||| |    
T  26887406 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 26887312  T
Q  309 ttgtaaagctactca-tcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||   |||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  26887311 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctc-ccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 26887226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 208 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 29754892 - 29754708
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctc 306  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||| ||||||  ||| |||||||   | ||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  29754892 gaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcg-gaagacttattcttgtaacccattgatttctc 29754794  T
Q  307 ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
     ||||||| | |||||||||  |||||||| |||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  29754793 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 29754708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 208 - 394
Target Start/End: Original strand, 33311257 - 33311440
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctc 306  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   |||||| |||||||||||| |||| || ||||    
T  33311257 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc 33311354  T
Q  307 ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
     ||||||| | |||||||||  |||||||| |||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  33311355 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctttctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 33311440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 3577616 - 3577489
Alignment:
Q  265 aattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcat--cattatagtggaacggatgactgctctctccccagatt 362  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |    
T  3577616 aattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccccagact 3577521  T
Q  363 aggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  3577520 aggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 3577489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 13467642 - 13467466
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||||| |  || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   |||||   ||||    
T  13467642 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgtgacttgg--tagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatc---tttg 13467551  T
Q  312 taaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||   || ||| ||||| ||||||||||    
T  13467550 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccccagactaggtcatgattagaccgaactaggtaaacaaa 13467466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Original strand, 13883475 - 13883657
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||   |||||| |    
T  13883475 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaattcat---tatctc-t 13883569  T
Q  309 ttgtaaagctactca-tcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  13883570 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 13883657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22342980 - 22342800
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||  || || |||| |||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||    
T  22342980 cactattaggattgcgtctcttggtcacgggaagaggctggga-tttgggtagtattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 22342886  T
Q  312 taaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||||| ||   ||||||||||||| ||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  22342885 taaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 22342800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31248896 - 31248768
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||| |    
T  31248896 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 31248802  T
Q  309 ttgtaaagctactca-tcattatagtggaacgga 341  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  31248801 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcgga 31248768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 308 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22870186 - 22870083
Alignment:
Q  308 tttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctc-cccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa-attcgtgtgtg 405  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||   || ||||||| |||||  ||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  22870186 tttgtaaagaaactcatcattatagtggaacggagagcttctctctctcccag--taggtcagtattggaccgaactgggtgaacaaatattcgtgtgtg 22870089  T
Q  406 ctctct 411  Q
     |||||    
T  22870088 atctct 22870083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 7542567 - 7542452
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaga-ttgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctc 306  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||  || ||||||||||| ||||| ||| ||||||| | || |||||||    
T  7542567 gaaacactattatgattgagtctcttggtcacgggaagagatttgggaatttggatagaattaggtttgaagactaatttttgtaaccctttgatatctc 7542468  T
Q  307 ttttgtaaagctactca 323  Q
     ||||||||| ||||||    
T  7542467 -tttgtaaagttactca 7542452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 293
Target Start/End: Original strand, 11138423 - 11138523
Alignment:
Q  194 ttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaa 292  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||| | ||||||  ||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||    
T  11138423 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagtcacttggtcacgggaagagatggggactttaggtagaattatgtttgaagactaattattgtaa 11138522  T
Q  293 c 293  Q
    |    
T  11138523 c 11138523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19702041 - 19701958
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactca 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  |||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19702041 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattatgtttgaagactgattcttgtaactca 19701958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Original strand, 33215830 - 33216010
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||  || ||||| |  || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||    
T  33215830 cactattaggattgagtctcttggtcacggcaagaggctgggacttgga-tagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 33215924  T
Q  312 taaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||||||||   ||||||| | ||||| | |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  33215925 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctatcccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 33216010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 283 - 341
Target Start/End: Original strand, 3833481 - 3833540
Alignment:
Q  283 attcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagcta-ctcatcattatagtggaacgga 341  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  3833481 attcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttaactcatcattatagtggaacgga 3833540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 25466026 - 25465898
Alignment:
Q  265 aattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagat 361  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| |||||||||  ||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||     
T  25466026 aattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagac 25465931  T
Q  362 taggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||| ||   || ||| ||||||||||||||||    
T  25465930 taggccatcattagaccgaactgggtaaacaaa 25465898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 394
Target Start/End: Original strand, 25941724 - 25941852
Alignment:
Q  265 aattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcat--cattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagat 361  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||   |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||||   ||||||||| |||||||     
T  25941724 aattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctcttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagac 25941819  T
Q  362 taggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  25941820 taggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 25941852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 26455186 - 26455128
Alignment:
Q  364 ggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctc 422  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  26455186 ggtcagtattggactgaactggataaacaaatttcatgtgttctctctttctttttctc 26455128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5165989 - 5165914
Alignment:
Q  217 ttaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaac 293  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  5165989 ttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggacttgg-gtagaattaggtttgaagaatgattcttgtaac 5165914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 323 - 394
Target Start/End: Original strand, 30443532 - 30443604
Alignment:
Q  323 atcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||||||||| ||||||   ||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  30443532 atcattatagtgtaacggagagctgctctctccccgagactaggtaagtattggaccgaactgggtaaacaaa 30443604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 318 - 422
Target Start/End: Original strand, 10584235 - 10584340
Alignment:
Q  318 tactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc-ccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa-attcgtgtgtgctctctttct 415  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| |||||| || ||||||  ||  ||||| ||||||| ||    
T  10584235 tactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtca-atttggaccgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttctctcttcct 10584333  T
Q  416 ttctctc 422  Q
    |||||||    
T  10584334 ttctctc 10584340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 319 - 394
Target Start/End: Original strand, 7294035 - 7294111
Alignment:
Q  319 actcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||  |||||| ||||||||    
T  7294035 actcatcattatagtggaacagagagttgctctctcccccagagtaggtcagtattggaccaaactggataaacaaa 7294111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 12166321 - 12166246
Alignment:
Q  216 attaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaa 292  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12166321 attaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaa 12166246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 129)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 119 - 415
Target Start/End: Original strand, 12102145 - 12102444
Alignment:
Q  119 aaaacaagagtttataaacaaacaataaactagggttttagag--atttctctaagagagagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacacta 216  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  12102145 aaaacaagggtttagaaacaaacaacaaactagggttttagagagatttctctaagcgggagaaactagggttgttgttgattcaccttgggaaacacta 12102244  T
Q  217 ttaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaag 316  Q
    |||||||||| | ||||||| | | ||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  12102245 ttaggattgagtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccactgatatctcttttgtaaag 12102344  T
Q  317 ctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttct 415  Q
     |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||  ||||||||||    
T  12102345 ttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaactaggtaaacaaatttcgtatgctctctctttct 12102444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 119 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 18535108 - 18534770
Alignment:
Q  119 aaaacaagagtttataaacaaacaataaactagggttt---tagagatttctctaagagagagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacact 215  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||   ||||| || ||||  |  | | |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  18535108 aaaacaagtgtttaaaaacaaacaacaaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttgagaaacact 18535009  T
Q  216 attaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaa 315  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18535008 attaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 18534910  T
Q  316 gctactcatcattatagtggaacggatgactgctct-ctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttc 414  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |  |||||| | ||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  18534909 actactcataattatagtggaacggaggggtgctctcccccccagactaggtaagttttggaccgaacagggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttc 18534810  T
Q  415 tttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataact 458  Q
    |||||||||    || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  18534809 tttctctcg----ctattttctacttttgtttgtgtttataact 18534770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 119 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 18537750 - 18537412
Alignment:
Q  119 aaaacaagagtttataaacaaacaataaactagggttt---tagagatttctctaagagagagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacact 215  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||   ||||| || ||||  |  | |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  18537750 aaaacaagggtttagaaacaaacaacaaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaccactagggttggggttgattcaccttaggaaacact 18537651  T
Q  216 attaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaa 315  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||   ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18537650 attaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 18537552  T
Q  316 gctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttc 414  Q
    | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| | ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| || ||| || |||||||||    
T  18537551 gttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccataataggtcattttttgaccgaactgggtaaacaaattttgtgcgttctctctttc 18537452  T
Q  415 tttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataact 458  Q
    ||||||||| ||    |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18537451 tttctctcgttg----ttttatacttttgtttgtgtttataact 18537412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 119 - 456
Target Start/End: Original strand, 25357696 - 25358035
Alignment:
Q  119 aaaacaagagtttataaacaaacaataaactagggtttt-agagatttctctaagagagagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactat 217  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  25357696 aaaacaagggtttagaaacaaacaacaaactagggtttagagagatttctctaagtgggagacactagggttgtgattgattcaccttgggaaatactat 25357795  T
Q  218 taggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttg----cgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgta 313  Q
    ||||||||| ||||||||| | | |||||||||| |||||||      || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  25357796 taggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttggatatatagaattaagtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgta 25357895  T
Q  314 aagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa-attcgtgtgtgctctct 411  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||  || |||||| |||||     
T  25357896 aagttactcatcattatagtagaacggatagctgctctctcccctagactaggtcagtattggacctaactgggtaaacaaatttttgtgtgttctctc- 25357994  T
Q  412 ttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataa 456  Q
    |||||||||||| ||    |||||||| |||| ||||||||||||    
T  25357995 ttctttctctcgttg----ttttctacttttgcttgtgtttataa 25358035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 183 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 38890434 - 38890189
Alignment:
Q  183 tagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagactt 282  Q
    |||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    ||||||||    
T  38890434 tagggttggggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattagaag-ggagactt 38890336  T
Q  283 attcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaa 381  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  38890335 attcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgctctctccccaagattaggtcagttttggaccgaa 38890236  T
Q  382 ctgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgt 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  38890235 ctgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttcttttctctcgctgt 38890189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 179 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 8756465 - 8756188
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctctt-ggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttgga 277  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    |||    
T  8756465 acactagggttggggttgattcaccttgggaaacactactaggattgagtctctttggtcacgggaagagattgagactttgagtagaattagacg-gga 8756367  T
Q  278 gacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc-ccagattaggtcagttttgga 376  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  8756366 gacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactaatcattatagtggaacggatggttgctctctcctccagactaggtcggttttgga 8756267  T
Q  377 ctgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataactg 459  Q
      |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||    |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  8756266 gcgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctctttctttctctcgttg----ttttttacttttgcttgtgtttataactg 8756188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 179 - 420
Target Start/End: Original strand, 19322814 - 19323056
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||    
T  19322814 acactagggtttgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggag 19322912  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggac 377  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  19322913 acttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggatgctctctcccccagactaggtcagttttggac 19323012  T
Q  378 tgaactgggtaaacaaaattcgt--gtgtgctctctttctttctc 420  Q
     ||||||| ||||| |||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  19323013 cgaactggataaac-aaattctttagtgttctctctttctttctc 19323056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 179 - 456
Target Start/End: Original strand, 28453803 - 28454080
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||| ||| ||| ||||||| ||| ||    
T  28453803 acactagggttgggattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggaccttgggtagaattagg-ttgaag 28453901  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggac 377  Q
    ||| ||||||||||    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||| ||||| ||| ||||||    
T  28453902 actaattcttgtaaacttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactactctctcccccagactaggttagtattggac 28454001  T
Q  378 tgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataa 456  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || | |  | |||||||| |||| ||||||||||||    
T  28454002 cgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctttctccggttgttttctacttttgcttgtgtttataa 28454080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 119 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 16186116 - 16185771
Alignment:
Q  119 aaaacaagagtttataaacaaacaataaactagggtttt-agagatttctctaagagagagacactagggttgtggttgattt-----accttggg--aa 210  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||| ||||| | ||| |||     ||||||    ||    
T  16186116 aaaacaagggtttagaaacaaacaacaaactagggtttagagagatttctctaagcgggagacactaaggttgggattgttttgattcaccttgaacaaa 16186017  T
Q  211 acactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctttt 310  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | || |||| || |||    
T  16186016 acactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgatatatc-ttt 16185918  T
Q  311 gtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctct 409  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16185917 gtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctct 16185818  T
Q  410 ctttctt-tctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataactg 459  Q
    |||| || | ||||| ||    |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  16185817 cttttttgtttctcgttg----ttttctacttttgcttgtgtttataactg 16185771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 191 - 394
Target Start/End: Original strand, 16455374 - 16455576
Alignment:
Q  191 tggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  16455374 tggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgt 16455472  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |    
T  16455473 aactcattgatatctcttttgtaaggttactcgtcattatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 16455571  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  16455572 acaaa 16455576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 114 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 31983809 - 31983505
Alignment:
Q  114 gtctcaaaacaagagtttataaacaaa---caataaactagggtttta-gagatttctctaagagagagacactagggttgtggttgatttaccttggga 209  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||   ||| |||||||||||| | ||| |||||| ||| | |||||| |||||||| | |||||| |||||||||    
T  31983809 gtctgaaaacaagggtttagaaacaaattacaacaaactagggtttaaagaggtttctccaagcgggagacattagggttgag-ttgattcaccttggga 31983711  T
Q  210 aacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttt 309  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||| | | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||| |||    
T  31983710 aacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaaccctttgatatcttttt 31983611  T
Q  310 tgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctct 409  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | | ||||| ||| || |||  ||||||||||||||| ||||||||| || |    
T  31983610 tgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccaatactaggtaagtattagaccaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttcttt 31983511  T
Q  410 ctttct 415  Q
    ||||||    
T  31983510 ctttct 31983505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 179 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 47151107 - 47150833
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    ||||||||||||   |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||    
T  47151107 acactagggttgaaattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaag 47151008  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggac 377  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||   || | ||||||| ||| ||||||| | ||||||    
T  47151007 acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttgctcatcattatagtggaacagatagatgttatctcccctagactaggtcaatattggac 47150908  T
Q  378 tgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataa 456  Q
     ||| ||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    |||||| |||||||||||||||||    
T  47150907 cgaattgggtaaactaatttcttgtgttctctctttctttctctcgttgtc----ttctacttttgtttgtgtttataa 47150833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 179 - 423
Target Start/End: Original strand, 9863827 - 9864076
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||| ||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||    
T  9863827 acactaaggttgggtttgattcaccttgggaaaccctattaggattgagtcttttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaagtttgaag 9863926  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctac---tcatcattatagtggaacggatgactgctctct---ccccagattaggtcagttt 372  Q
    ||| |||||||||||   || ||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||   |||||||||   ||||||| || |||||| |    
T  9863927 actaattcttgtaaccttttgatatctc-tttgtaaagttactcatcatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccccagactaagtcagtat 9864025  T
Q  373 tggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcg 423  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9864026 tggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctctcg 9864076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 192 - 458
Target Start/End: Original strand, 41997626 - 41997887
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| |||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  41997626 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggtg-ggagacttattcttgta 41997724  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaac 391  Q
    || | || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| | | |||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||| |||||    
T  41997725 accctttaatatctcttttgtaaagttactcatcatcatagtgaaacggagggccgctctctccccagactaggtta-atttggaccgaactggataaac 41997823  T
Q  392 aaaattcgtgtgtgctctctttcttt-ctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataact 458  Q
    ||| ||| |  || |||||||||||| |||||||||    |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  41997824 aaatttcataagttctctctttctttgctctcgctg----ttttctacttttgtttgtgattataact 41997887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 36380483 - 36380684
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  36380483 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 36380581  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||  ||||||||||||    
T  36380582 actcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattatagtggaactgagtgctgctctctcccccagactaggtca-atttggagcgaactgggtaaa 36380680  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  36380681 caaa 36380684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 40637208 - 40637408
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  40637208 ggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 40637306  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  40637307 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 40637404  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  40637405 caaa 40637408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 48486453 - 48486653
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  48486453 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 48486551  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| | ||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  48486552 acacattgaaatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtca-atttggactgaactgggtcaa 48486649  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  48486650 caaa 48486653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 192 - 456
Target Start/End: Original strand, 24879123 - 24879388
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  24879123 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 24879221  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaa-gctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    || |||| |||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |    
T  24879222 acccattgatatctcttttgtaaacgatacacatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 24879319  T
Q  390 acaaaat-tcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtcttttttctacgttt-gtttgtgtttataa 456  Q
    ||||| | || ||||| ||||||| | ||||||||||||| | |||||||| ||| | ||||||||||||    
T  24879320 acaaattctcttgtgttctctcttccttttctctcgctgt-tgttttctacttttggcttgtgtttataa 24879388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 201 - 357
Target Start/End: Original strand, 2891434 - 2891589
Alignment:
Q  201 accttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||||| |||||||||| |||| |    
T  2891434 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-caggagacttgttcttgtaacccattga 2891532  T
Q  301 tatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  2891533 tatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcccc 2891589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 36378426 - 36378627
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||| |   |||||||||||||||||    
T  36378426 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaagcg-ggagacttattcttgta 36378524  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  36378525 actcattgatatctctcttgtgaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtaaa 36378623  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  36378624 caaa 36378627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Original strand, 16453443 - 16453607
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||   |||||||||||||||||    
T  16453443 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggactttgggtagtattagg-cgggagacttattcttgta 16453541  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||    
T  16453542 acccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggttgctctctcccc 16453607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 192 - 456
Target Start/End: Original strand, 24880585 - 24880850
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  24880585 ggttggttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 24880683  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaa-gctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    || |||| |||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |    
T  24880684 acccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 24880781  T
Q  390 acaaaat-tcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtcttttttctacgttt-gtttgtgtttataa 456  Q
    ||||| | || ||||| ||||||| | ||||||||||||| | |||||||| ||| | ||||||||||||    
T  24880782 acaaattctcttgtgttctctcttccttttctctcgctgt-tgttttctacttttggcttgtgtttataa 24880850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 121 - 456
Target Start/End: Original strand, 22295218 - 22295558
Alignment:
Q  121 aacaagagtttataaacaaacaataaactagggttttagaga--tttctctaagagagagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactatt 218  Q
    |||||| |||||  ||||||||| || |||||||||||||||  | |||||||| | |||||||||||||||||  ||||| ||||| | ||||| | ||    
T  22295218 aacaagggtttaggaacaaacaacaagctagggttttagagagatatctctaagtgggagacactagggttgtgagtgattcaccttagtaaacattgtt 22295317  T
Q  219 aggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattca------tatctcttttgt 312  Q
    |||||| | ||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||| ||||||| ||| |||||||||| |||||| | || |      |     ||||||    
T  22295318 aggatttagtctcttggtcacggaaagagattgaaactttgagtataattagggttgaagacttattcctgtaaccctttgagtagaattaggattttgt 22295417  T
Q  313 aaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctct 411  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||| | | |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  22295418 aaagttactcatcattatagtggaatggagaattgctctctcccccacactagggcagtattggactgaactgggtaaacaaatttcatgtgttctctct 22295517  T
Q  412 ttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataa 456  Q
    | |||||||||||||    |||||||| |||| ||||||||||||    
T  22295518 tcctttctctcgctg----ttttctacctttgcttgtgtttataa 22295558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 193 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 37313264 - 37313101
Alignment:
Q  193 gttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaa 292  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || |||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  37313264 gttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggattttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaa 37313166  T
Q  293 ctcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  37313165 cccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttcccc 37313101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 208 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 3982362 - 3982113
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagatt-gagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctc 306  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| | || |||||||    
T  3982362 gaaacactattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaacactttgatatctc 3982263  T
Q  307 ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaa-aattcgtgtgt 404  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || | ||||||| | |||||| ||||  |||||||||   ||| |||||    
T  3982262 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcatactaggtcactattggaccgaacaaggtaaacaatttttcatgtgt 3982163  T
Q  405 gctctctttctttctctcgctgtcttttttcta-cgtttgtttgtgtttataactg 459  Q
      ||||| ||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3982162 --tctctctctttctctcgctg----ttttctatcgtttgtttgtgtttataactg 3982113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 194 - 353
Target Start/End: Original strand, 13544095 - 13544252
Alignment:
Q  194 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaac 293  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  13544095 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 13544193  T
Q  294 tcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct 353  Q
     |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||    
T  13544194 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagtactgctctct 13544252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 14633453 - 14633652
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  14633453 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg-gaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 14633550  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||| |||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  14633551 acccattgatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccctcagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 14633648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 207 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 15032733 - 15032480
Alignment:
Q  207 ggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctc 306  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||  ||||||  ||| |||||||   ||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  15032733 ggaaacactattaggattgagtctcttggacacgagaaaagatttggacttttggtagaattaggcg-ggagatttattcttgtaacccattgatatctc 15032635  T
Q  307 ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaact-gggtaaacaaaattcgtgtgt 404  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |   ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  15032634 ttttgtaaagttactcatcattacagtggaacgaagagctgctctctcccccaaactaggtcagtattggaccgaactagggtatacaaatttcgtgtgt 15032535  T
Q  405 gctctctttctttctctcgctgtct-tttttctacgtttgtttgtgtttataact 458  Q
     || ||||||||||| || ||  || ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15032534 tctttctttctttctttctctcgctgtttttctacttttgtttatgtttataact 15032480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 47274860 - 47275059
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  47274860 ggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 47274958  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaac 391  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||| |||| |||    
T  47274959 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaaccgggtcaac 47275056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 192 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 17662444 - 17662211
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  17662444 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 17662346  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  17662345 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 17662248  T
Q  391 caaaattcgtgtgtgctctct-ttctttctctcgctgt 427  Q
    | |||||| | |||| ||||| |||||| |||||||||    
T  17662247 c-aaattcttttgtgttctctcttctttttctcgctgt 17662211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 192 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 33415687 - 33415453
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  33415687 ggttgattcaccttgggaaacactattaagatcgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 33415589  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||| |||  |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  33415588 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccctcaggctaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 33415491  T
Q  391 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgt 427  Q
     ||| | |  ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  33415490 taaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgt 33415453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 36921692 - 36921529
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  36921692 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 36921594  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    |  |||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36921593 atccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccc 36921529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Original strand, 47868535 - 47868698
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  47868535 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 47868633  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47868634 acccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccc 47868698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 192 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 619646 - 619384
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||| | ||||| ||| |||||||   ||| | |||||||| ||    
T  619646 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgactgtcttggttaagggaagagattgggtctttgggtagaattagg-cgggaaaattattcttata 619548  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaac 391  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||  ||||||| ||||||||| |||    
T  619547 acccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatgactgctctctcccctaactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 619450  T
Q  392 aaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataactg 459  Q
    ||| | |  ||||| ||||||||| |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  619449 aaattattttgtgttctctctttc-ttctct-gctgt-tgttttctacttttgcttgtgattataactg 619384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 8631618 - 8631418
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  8631618 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 8631520  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  8631519 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 8631422  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  8631421 caaa 8631418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 193 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 9174344 - 9174145
Alignment:
Q  193 gttgatttaccttgggaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  9174344 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgta 9174246  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||||||| || |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  9174245 actcattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgttctctgccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 9174149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 12396044 - 12395844
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||| |||||    
T  12396044 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattagg-cgggagacttattgttgta 12395946  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| |||| |||| ||    
T  12395945 acccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggggggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaacagggtcaa 12395848  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  12395847 caaa 12395844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22801061 - 22800861
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  |||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  22801061 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 22800963  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  22800962 acccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 22800865  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  22800864 caaa 22800861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 24888930 - 24889130
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |  ||||||| ||| |||||||   |||||||||||| ||||    
T  24888930 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactaggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcatgta 24889028  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  24889029 acccattgatatctcttttgtaacgttacttatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 24889126  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  24889127 caaa 24889130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 38928376 - 38928176
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  38928376 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 38928278  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||||||| | ||||||||||||| | ||||||||| ||||||  |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  38928277 actcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 38928180  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  38928179 caaa 38928176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 194 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 14787628 - 14787428
Alignment:
Q  194 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaac 293  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  14787628 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattagg-tgggagactttttcttgtaac 14787530  T
Q  294 tcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct---ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||||| | ||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||   ||||||| |||||||  |||||||  |||||||| ||    
T  14787529 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtca-atttggaccaaactgggtcaa 14787432  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  14787431 caaa 14787428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 179 - 355
Target Start/End: Original strand, 30136670 - 30136845
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||  ||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||   | ||    
T  30136670 acactagggttggggttgattcaccttgggaaacactactatgattgggtctcttggtcacgagaagaaattgtgactttgggtagaattagg-cggaag 30136768  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc 355  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  30136769 acttattcttgtgactcatcgatatctcttttgtaaagttaatcatcattatagtgaaacagatggctgctctctcc 30136845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 12401006 - 12400806
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||| |||||    
T  12401006 ggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattagg-cgggagacttattgttgta 12400908  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| |||| |||| ||    
T  12400907 acccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggggggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaacagggtcaa 12400810  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  12400809 caaa 12400806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 206 - 357
Target Start/End: Original strand, 13547302 - 13547451
Alignment:
Q  206 gggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatct 305  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   | |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  13547302 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaactcattgatatat 13547400  T
Q  306 cttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| | |||||||||||||    
T  13547401 cttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaatggagggctgctctctcccc 13547451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 179 - 422
Target Start/End: Original strand, 10112988 - 10113233
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttac-gagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttgga 277  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| || | |||||||||  ||||||| ||| |||||| |||| |    
T  10112988 acactagggttgagattgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttggtcacggggaagagattaggactttgggtagaattagatttgaa 10113087  T
Q  278 gacttattcttgtaa-ctcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttgg 375  Q
    |||| |||||||||| ||  || ||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||    
T  10113088 gactaattcttgtaacctttttgatatctc-tttgtaatgttactaatcattatagtggaatggagagctgctctctccccaagactaggttagtattgg 10113186  T
Q  376 actgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctc 422  Q
    || |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  10113187 accgaactgggtaaaaaaaattcatgtgttctttctttctctctctc 10113233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 193 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 18709361 - 18709163
Alignment:
Q  193 gttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaa 292  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18709361 gttgattcaccttgggaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgtaa 18709263  T
Q  293 ctcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaac 391  Q
    | |||| || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |||    
T  18709262 cccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggaggactgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaac 18709166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 192 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22802933 - 22802786
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  22802933 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 22802835  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacgga 341  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  22802834 acccattgatatctcttttgtaatgttactcatca-tatagtggaacgga 22802786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 36919783 - 36919554
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||  ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  36919783 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggacttttggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 36919685  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    |  |||| ||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  36919684 atccattgatatctcttttgtaacgttattcatca-tatagtggaatagatggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 36919587  T
Q  391 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctc 422  Q
    |||| | |  ||||| ||||||| |||||||||    
T  36919586 caaattcttttgtgttctctcttcctttctctc 36919554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 6764978 - 6765178
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||  || ||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  6764978 ggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgta 6765076  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  6765077 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 6765174  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  6765175 caaa 6765178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 7941457 - 7941657
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  7941457 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 7941555  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  7941556 acccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 7941653  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  7941654 caaa 7941657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 9148387 - 9148586
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||  ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  9148387 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 9148485  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||    
T  9148486 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaa 9148582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 18847287 - 18847486
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  18847287 ggttgattcaccttgggaaacactattagcattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 18847385  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  18847386 aacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 18847482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22046884 - 22046685
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  22046884 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 22046786  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  22046785 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 22046689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 24348352 - 24348552
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   | |||||||||||||||    
T  24348352 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgta 24348450  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||| | |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  24348451 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 24348548  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  24348549 caaa 24348552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 37089570 - 37089371
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  37089570 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 37089472  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  37089471 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 37089375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 38409339 - 38409538
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  38409339 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-ctggagacttattcttgta 38409437  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||| | |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  38409438 acccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 38409534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 40091614 - 40091414
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  40091614 ggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 40091516  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| || | ||||||||| ||||| | |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  40091515 acccattgatatctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 40091418  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  40091417 caaa 40091414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 44600037 - 44599837
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  44600037 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 44599939  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    |||||||| || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |    
T  44599938 aactcattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 44599842  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  44599841 acaaa 44599837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 5198554 - 5198754
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  5198554 ggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggctttgtgtagaattagg-cgggagacttattcttgta 5198652  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| |||||| || ||    
T  5198653 acccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgtgtcaa 5198750  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  5198751 caaa 5198754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 26086175 - 26085976
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  26086175 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 26086077  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || ||||  | |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||||  ||||||| |||||| || ||    
T  26086076 acccattgttttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggaaggctgctctctccctcagactaggtca-atttggaccgaactgtgtcaa 26085980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 179 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 40999163 - 40999004
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||| ||| | |||||| |||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  40999163 acactaggattgagattgattcacctaggaaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatcgagactttgggtagaattaggtttggag 40999064  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaac 338  Q
    |||   | ||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  40999063 actgtgttttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatagtggaac 40999004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 51015380 - 51015579
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  51015380 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 51015478  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| |||||||   ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  51015479 acccattgatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggatcggaggtctgctctctccctcagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 51015575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 9176673 - 9176510
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  9176673 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 9176575  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||||    
T  9176574 aacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccc 9176510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 179 - 357
Target Start/End: Original strand, 9022423 - 9022603
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttgga 277  Q
    |||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |    
T  9022423 acactatggttgggattgattcaccttggagaaacagtattaggatagaatttcttggtcacgggaagagattgagactttgggttgaattaggtttgaa 9022522  T
Q  278 gacttattcttgtaa-ctc-attcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    |||| |||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  9022523 gactaattcttgtaacctctattgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacaaagggctgctctctcccc 9022603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16931988 - 16931788
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  16931988 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 16931890  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |    
T  16931889 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 16931793  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  16931792 acaaa 16931788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16934342 - 16934142
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  16934342 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 16934244  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |    
T  16934243 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 16934147  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  16934146 acaaa 16934142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 5637664 - 5637530
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  5637664 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgta 5637566  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcat 327  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||||    
T  5637565 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 5637530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 18409546 - 18409338
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||||  ||| |||||||   ||||| |||||||||||    
T  18409546 ggttgattaaccttcgggaacactattaggattgagtctcttagttataggaagagattgagacttttggtagaattagg-cgggagatttattcttgta 18409448  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| ||    ||||||||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||||||    
T  18409447 acccattgatatctcttttgt-aagttacccatcattatagtgaaacagagagttgctctctccctcagactaggtca-atttggattgaactgggtaaa 18409350  T
Q  391 caaaattcgtgt 402  Q
    |||| |||||||    
T  18409349 caaatttcgtgt 18409338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22044589 - 22044390
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   ||||||||||| |||||    
T  22044589 ggttgattccccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgta 22044491  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  22044490 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 22044394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22132590 - 22132391
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  22132590 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 22132492  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||||||| | | |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  22132491 acccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccctatactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 22132395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 31849797 - 31849598
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  |||||||||| ||| ||||| |   |||||||||||||||||    
T  31849797 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgcttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaag-cgggagacttattcttgta 31849699  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  |||| || ||||||||| ||    
T  31849698 acccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttgaaccgaactgggtcaa 31849602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22134815 - 22134617
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||  || ||| ||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  22134815 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 22134717  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaac 391  Q
    || |||| || |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||    
T  22134716 acccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 22134620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 204 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 47210939 - 47210788
Alignment:
Q  204 ttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||| |||| || |    
T  47210939 ttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgattt 47210841  T
Q  304 ctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  47210840 ctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccc 47210788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 3824769 - 3824627
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  3824769 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 3824671  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtgga 336  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  3824670 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 3824627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 11006436 - 11006236
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  11006436 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 11006338  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||| |    
T  11006337 aacccattgatttctc-tttgtaatggtactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtta 11006241  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  11006240 acaaa 11006236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 19096017 - 19096217
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagatt-gagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| |||||||   ||||||| ||||||||    
T  19096017 ggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagag-ctttgggtagaattagg-cgggagactaattcttgt 19096114  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| | |||| |||| ||||||| ||||||   ||||||||| ||||||| |||||||  |||||||  |||||||| |    
T  19096115 aacccattgatatctcttttgtaacgttacttatca-tatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccaaactgggtca 19096212  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  19096213 acaaa 19096217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22780572 - 22780372
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  22780572 ggttgattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 22780474  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |    
T  22780473 aacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 22780377  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  22780376 acaaa 22780372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22782937 - 22782737
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  22782937 ggttgattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 22782839  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||| | |    
T  22782838 aacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactggatca 22782742  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  22782741 acaaa 22782737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 2485071 - 2484872
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |  ||||   |||||||||||||||||    
T  2485071 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagagatagg-cgggagacttattcttgta 2484973  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||| | ||    
T  2484972 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactggatcaa 2484876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 275 - 417
Target Start/End: Original strand, 4215522 - 4215662
Alignment:
Q  275 ggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagtttt 373  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||  |||    
T  4215522 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtca-attt 4215619  T
Q  374 ggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttcttt 417  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||| | |||| |||||||||||    
T  4215620 ggaccgaactgggtcaac-aaattcttttgtgttctctttcttt 4215662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 11435089 - 11435288
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||  |  ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  11435089 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcctggttaccggaagagtctaggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 11435187  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  11435188 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 11435284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Original strand, 31300427 - 31300606
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||| |    
T  31300427 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-g 31300521  T
Q  312 taaagctactcat--cattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  ||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  31300522 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagggctgctctctccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 31300606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 422
Target Start/End: Original strand, 27499195 - 27499405
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctct 307  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||   ||||||||||| |||||||    | ||||||||    
T  27499195 gaaacactattaggattgagtctattggttacgataagagattgaggctttgggtataattagg-cgggagacttatttttgtaac---ctaatatctct 27499290  T
Q  308 tttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaat-tcgtgtgtgc 406  Q
    ||||||| | |||||||||||||| || |||| | | ||||||| |||||||| |||||||  |||||||  |||||||| |||||| | |  ||||| |    
T  27499291 tttgtaaggttactcatcattatattgaaacgaagggctgctctttccccagactaggtca-atttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 27499389  T
Q  407 tctctttctttctctc 422  Q
    |||||| |||||||||    
T  27499390 tctcttcctttctctc 27499405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 179 - 423
Target Start/End: Original strand, 10114448 - 10114681
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| | |||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||        || ||||| ||||  ||    
T  10114448 acactagggttgggattgattcactttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgataagagattgag--------tagaattatgtttaaag 10114539  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggac 377  Q
    ||| |||| ||||||    | |||||||||| |||||   ||||||||||||||| ||||| |   ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  10114540 actaattcatgtaacc---ttatatctcttt-gtaaattaactcatcattatagttgaacgaagagctgctctctcccccagactaggtcagtattggac 10114635  T
Q  378 tgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcg 423  Q
     ||| | |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  10114636 cgaattaggtaaacaaatttcatgtgttctctctttctttctctcg 10114681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Original strand, 55822265 - 55822446
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  |||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||| |    
T  55822265 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 55822359  T
Q  309 ttgtaaagctactca-tcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| | |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  55822360 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 55822446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Original strand, 15316961 - 15317140
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||| |    
T  15316961 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgg-gtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctcttt-g 15317055  T
Q  312 taaagctactcat--cattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  ||||||  |||||||||||||| ||   |||||||||||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  15317056 taaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 15317140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 192 - 327
Target Start/End: Original strand, 56030578 - 56030712
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||   ||||| ||| |||||||   |||||||| ||||||||    
T  56030578 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgta 56030676  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcat 327  Q
    ||||||| | || |||||||||| | || |||||||    
T  56030677 actcattgacatttcttttgtaacgttattcatcat 56030712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 5336964 - 5336779
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  |  | |||||||||    
T  5336964 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggacttgg-gtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctcttatatctctt 5336866  T
Q  309 ttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |   ||||  | |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | | ||||||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  5336865 tgtaaaagaaattcatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctatagtaggtcaatattggactgaactgattaaacaaa 5336779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 11008765 - 11008567
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  11008765 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 11008667  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| || ||   ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||| |    
T  11008666 aacccattgatttc---tttgtaatggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtca 11008572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Original strand, 16638827 - 16639010
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| | |  ||||||| |    
T  16638827 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgagac-ttgggtagaatgaggtttgaagactgattcttgtaac-cctcaatatctc-t 16638923  T
Q  309 ttgtaaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||||   || ||||||||||||||||||||    
T  16638924 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctct-cccagagtaggtcataattagactgaactgggtaaacaaa 16639010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 192 - 271
Target Start/End: Original strand, 6133006 - 6133085
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattagg 271  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  6133006 ggttgagtcaccctgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 6133085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Original strand, 16489352 - 16489531
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||    
T  16489352 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 16489446  T
Q  312 taaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  ||||  |||| ||||||||||||||   |||||||||||| ||| |||||||   || ||| ||||| ||||||||||    
T  16489447 taaagaaactcatatcaatatagtggaacggagagctgctctctccctagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaa 16489531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Original strand, 36769479 - 36769662
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||| ||| ||||||  |||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| |    
T  36769479 aaacactattaggatcgagtttcttggtcacgggaagaggctgagacttgg-gtaaaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 36769573  T
Q  309 ttgtaaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||| ||||||||    
T  36769574 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaa 36769662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 357
Target Start/End: Original strand, 4558314 - 4558456
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||| |    
T  4558314 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-g 4558408  T
Q  312 taaagctactcat--cattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    |||||  ||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4558409 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagaactgctctctcccc 4558456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 432
Target Start/End: Original strand, 15831144 - 15831362
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||   ||||||| ||||    
T  15831144 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgcgtagaattaggtttgaagactgattcttggaactca---atatctc-tttg 15831238  T
Q  312 taaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctc 408  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||| ||||||||  || ||||| ||     
T  15831239 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaatatcttgtgttctt 15831338  T
Q  409 tctttctttctctcgctgtctttt 432  Q
    ||| ||| |||||| || ||||||    
T  15831339 tctctctctctctctctttctttt 15831362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 209 - 357
Target Start/End: Original strand, 4570094 - 4570239
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| ||| ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| |    
T  4570094 aaacactattaggatcgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 4570188  T
Q  309 ttgtaaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  4570189 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccc 4570239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Original strand, 11853549 - 11853731
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||| |    
T  11853549 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 11853643  T
Q  309 ttgtaaagctactca-tcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  11853644 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 11853731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Original strand, 4884877 - 4885057
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  |||||| ||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||    
T  4884877 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtataatcaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 4884971  T
Q  312 taaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||   ||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  4884972 taaaaaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 4885057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 5635593 - 5635475
Alignment:
Q  275 ggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagtttt 373  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  |||    
T  5635593 ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-attt 5635496  T
Q  374 ggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||| ||||||||| ||||||    
T  5635495 ggaccgaactgggtcaacaaa 5635475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Original strand, 8529270 - 8529450
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||   ||||||| ||||    
T  8529270 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctc-tttg 8529364  T
Q  312 taaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  8529365 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 8529450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3937408 - 3937314
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattct 287  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||| ||||||| | |||||||||||||    
T  3937408 ggttgattcaccttgggaaacactattggaattgagtctcttggttacaggaagagattgaggctttgggtagaattagg-tgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 394
Target Start/End: Original strand, 5101145 - 5101262
Alignment:
Q  275 ggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttg 374  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||  ||||||||| ||||||  |||||| | ||||| |||||||||| |||||||  ||||    
T  5101145 ggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttactcatca-tatagtaaaacggagggctgctatctccccagactaggtca-atttg 5101242  T
Q  375 gactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||| ||||||||| ||||||    
T  5101243 gaccgaactgggtcaacaaa 5101262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 249 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 32274081 - 32274014
Alignment:
Q  249 ttgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaag 316  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32274081 ttgagactttgagtaaaattaggtttaaagactaattcttgtaactctttcatatctcttttgtaaag 32274014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 208 - 357
Target Start/End: Original strand, 54906737 - 54906887
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattga-gactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctc 306  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||  ||||||||| | ||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  54906737 gaaacactattagaattgagtctcttggtcactggaagagattcaagactttaggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactctttgatatctc 54906836  T
Q  307 ttttgtaaagctactcatca-ttatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
     ||||||||| ||||||  | ||||| |||||||||   |||||||||||||    
T  54906837 -tttgtaaagttactcaaaagttataatggaacggaaagctgctctctcccc 54906887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 7050439 - 7050294
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| |    
T  7050439 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 7050345  T
Q  309 ttgtaaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    ||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||   |||||||||||||    
T  7050344 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccc 7050294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 4556238 - 4556059
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||    
T  4556238 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 4556144  T
Q  312 taaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  ||||  || ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||   ||  || ||||||||||||||||    
T  4556143 taaag-aactcatatgattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattaaaccgaactgggtaaacaaa 4556059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16689119 - 16688939
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||  || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||    
T  16689119 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagaggctgggacttgg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 16689025  T
Q  312 taaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||||||||   |||||||||||| || | |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  16689024 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccacaaactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 16688939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 54928780 - 54928700
Alignment:
Q  261 gtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacgga 341  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  54928780 gtaaaattaagtttgaagactgattcttgtaacattttaatatctcttttgtaaagttactcatcactatagtggaacgga 54928700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 394
Target Start/End: Original strand, 11437579 - 11437696
Alignment:
Q  275 ggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagtttt 373  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| |||||||  |||    
T  11437579 ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtca-attt 11437675  T
Q  374 ggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||| ||||||||| ||||||    
T  11437676 ggaccgaactgggtcaacaaa 11437696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Original strand, 18586969 - 18587149
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| |||||  ||||||| |||||   ||||||| ||||    
T  18586969 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactggttcttgttactca---atatctc-tttg 18587063  T
Q  312 taaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  18587064 taaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 18587149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Original strand, 25699752 - 25699830
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  25699752 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggactttg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgta 25699830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 394
Target Start/End: Original strand, 26557833 - 26557920
Alignment:
Q  308 tttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||   ||||||||| ||||||| || |||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  26557833 tttgtaaagttactcatcgttatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaagtcagtattggaccgaactaggtaaacaaa 26557920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 277 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 3578786 - 3578662
Alignment:
Q  277 agacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactg-ctctctccccagattaggtcagttttgg 375  Q
    ||||| |||||||||||   || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||   ||| ||||| ||||||| |||| |||| || |    
T  3578786 agactaattcttgtaacattttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaatggagagctgtctctc-ccccagactaggccagtattag 3578689  T
Q  376 actgaactgggtaaacaaaattcgtgt 402  Q
    || |||||||||||||||| |||||||    
T  3578688 accgaactgggtaaacaaatttcgtgt 3578662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 357
Target Start/End: Original strand, 47566496 - 47566638
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||| || || |||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| |||||||   |||||||||| |    
T  47566496 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagactg-gaatttgggtagaattaggtttgaagaccgattcttttaactca---atatctcttt-g 47566590  T
Q  312 taaagctactcat--cattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    |||||  ||||||  ||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  47566591 taaagaaactcatatcattatagtggaacggatagctgatctctcccc 47566638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 194 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 52942643 - 52942597
Alignment:
Q  194 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacg 240  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52942643 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg 52942597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 53405263 - 53405467
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggaga------cttatt 285  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||  |||||||||  ||| ||||| |   |||||      ||||||    
T  53405263 ggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggaaagaggctgagactttaggtagaattaag-cgggagacttattcttatt 53405361  T
Q  286 cttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgg 385  Q
    |||||||| |||| || ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||   |||||||| ||||||| |||||||  ||||||| |||||||    
T  53405362 cttgtaacccattgatttctcttttgaaacgatactcatca-tatagtggaacagagagctgctctc-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgg 53405458  T
Q  386 gtaaacaaa 394  Q
     | ||||||    
T  53405459 atcaacaaa 53405467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 368
Target Start/End: Original strand, 6133098 - 6133146
Alignment:
Q  321 tcatcattatagtggaacggatgactgctctctc-cccagattaggtca 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  6133098 tcatcattatagtggaacggatgactgctctctcacccagactaggtca 6133146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Original strand, 15312319 - 15312499
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||| |||||   || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||    
T  15312319 cactattaggattgagtcgcttggtcacgggaagatgctgtgacttgg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 15312413  T
Q  312 taaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||| ||||||||||    
T  15312414 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctggtctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaa 15312499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Original strand, 36771396 - 36771579
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| | | ||||||  || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| |    
T  36771396 aaacactattatgattgagtctcttggtcatgggaagaggctgtgacttgg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 36771490  T
Q  309 ttgtaaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||   ||||||||| | ||||| |||||||   || ||| ||||| ||||||||||    
T  36771491 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctacgccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaa 36771579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 383 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 52043570 - 52043498
Alignment:
Q  383 tgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataactg 459  Q
    ||||| |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  52043570 tgggtgaacaaattccgtgagttctctctttctttctctcgctgt----tttctacgtttgcttgtgtttataactg 52043498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 4874661 - 4874478
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagatt-gagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctct 307  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||| ||| ||||||||| |  |||||| || || |||  |||| ||||| ||||||||||| | |  ||||| ||    
T  4874661 aaacactattaagatagagtctcttggtcacgggaagagattcgtaactttgggtgaa-ttatatttgaagactaattcttgtaacccttctatatcact 4874563  T
Q  308 tttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    || ||||||  ||||||| ||||| || |||||  | |||| ||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  4874562 tt-gtaaagaaactcatcgttataatgtaacgggag-ctgcgctctccccagagtaggtcaatattgaactgaactgggtaaacaaa 4874478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 5516429 - 5516243
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagatt-gagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactc----attcata 302  Q
    ||||||| |||||| |||  ||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||     || |||    
T  5516429 gaaacaccattaggtttgggtctcttgctcacgggaagagattcgagactttgcgtagaattaagtttgaagactaactcttgtaactcttttttttata 5516330  T
Q  303 tctct-tttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactg--ctctctccccagattaggtcagttttggactgaactggg 386  Q
      ||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||  ||||  ||||||||| ||| ||| ||||| |||||| ||||||||    
T  5516329 catctctttgtaaagttacccatcattattgtggaacagagaactgctctctctccctagactagatcagtattggaccgaactggg 5516243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 29609654 - 29609581
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagact 281  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| | |||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  29609654 gaaacactattagaattgagtctcttgatcacggcaagagattgagacttcgagtagaattaggtttgtagact 29609581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 52942576 - 52942536
Alignment:
Q  275 ggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaa 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  52942576 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 52942536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 13072160 - 13072018
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||  ||||||  || || |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||    
T  13072160 cactattatgattgagtctcttggtcactggaagaggctgtga-tttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 13072066  T
Q  312 taaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    |||||  ||||  ||||||||||| ||| |||   |||||||||||||    
T  13072065 taaagaaactcatatcattatagtagaatggagagctgctctctcccc 13072018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 24446754 - 24446678
Alignment:
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc 356  Q
    ||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  24446754 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 24446678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 38208897 - 38208816
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagatt-gagacttt 258  Q
    |||||||||||| | |||||| | ||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||    
T  38208897 acactagggttgagattgattcatcttggagaaacactattaagattgagtcttttggtcacaagaagagattcgagacttt 38208816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 348 - 392
Target Start/End: Original strand, 5350032 - 5350076
Alignment:
Q  348 ctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaaca 392  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  5350032 ctctctccccagagtaggtcattgttggactgaattgggtaaaca 5350076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 393
Target Start/End: Original strand, 31985679 - 31985726
Alignment:
Q  345 ctgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaa 393  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||    
T  31985679 ctgctctctccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 31985726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 102)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 119 - 423
Target Start/End: Original strand, 36208580 - 36208885
Alignment:
Q  119 aaaacaagagtttataaacaaacaataaactagggttttagaga--tttctctaagagagagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacacta 216  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  36208580 aaaacaagggtttagaaacaaacaacaaactagggttttagagagatttctctaagcgggagaaactagggttgttgttgattcaccttgggaaacatta 36208679  T
Q  217 ttaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaag 316  Q
     || |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  36208680 ctaagattgagtctcttggtaacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaag 36208779  T
Q  317 ctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtg-ctctctttct 415  Q
     ||||||||||||||||| |||||  | ||||||| |||||| | ||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||| | |||  ||||||||||    
T  36208780 ttactcatcattatagtgaaacggcgggctgctctttccccatactaggtcaattt-ggaccgaactgggtaaacaaa-ttcttttgtttctctctttct 36208877  T
Q  416 ttctctcg 423  Q
    ||||||||    
T  36208878 ttctctcg 36208885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 179 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 6661398 - 6661124
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||| |||||||   ||||    
T  6661398 acactagagttggggttgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaaattgagattttgggtacaattaggca-ggag 6661300  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtcagttttggac 377  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  6661299 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttgctcataattatagtggaacggatgactgctctctccctcagactaggtcagatttggac 6661200  T
Q  378 tgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataact 458  Q
     ||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| ||    |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  6661199 cgaactggataaacaaatttcgtgtgt--tctctttcttttctctcgttg----ttttctacttttgcttgtgtttataact 6661124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 175 - 456
Target Start/End: Original strand, 15143528 - 15143809
Alignment:
Q  175 agagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggttt 274  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  || |||| ||| ||||||||||    
T  15143528 agagacactagggttgagattgattcacctttggaagcactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggttt 15143627  T
Q  275 ggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagtttt 373  Q
    | ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||| ||| ||||||||| ||    
T  15143628 gaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggggagctgctttctcccctagactaggtcagtatt 15143727  T
Q  374 ggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctac-gtttgtttgtgtttataa 456  Q
     ||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15143728 tgaccgaaatgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctacttttctctcgc--tattttttctactttttgtttgtgtttataa 15143809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 242 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 15445417 - 15445236
Alignment:
Q  242 gaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacgga 341  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  15445417 gaagagattgagactttgagtagaattaggtttgaagaatgattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaa 15445318  T
Q  342 tgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcg 423  Q
     | ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  15445317 gggctgctctcttcccagactaggtcagtattggactgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttctctttctttctctcg 15445236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 192 - 392
Target Start/End: Original strand, 18596725 - 18596924
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||| |||||    
T  18596725 ggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcg-ggagacttatttttgta 18596823  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc-ccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  18596824 actcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcctccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 18596922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 192 - 459
Target Start/End: Original strand, 695958 - 696219
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  695958 ggttgattcaccttgg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 696055  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||  ||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  696056 acccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagacaaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 696154  T
Q  391 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataactg 459  Q
    |||| | |  ||||| ||||||||||||||    |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  696155 caaattattttgtgttctctctttctttct----ctgt-tgttttctacttttgtttgtgtttataactg 696219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 17413380 - 17413176
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |     
T  17413380 acactagggttgggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaaa 17413281  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggac 377  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||| | ||||||| ||||||    
T  17413280 acttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctctcccccagagttggtcagtgttggac 17413181  T
Q  378 tgaac 382  Q
     ||||    
T  17413180 cgaac 17413176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 192 - 387
Target Start/End: Original strand, 25804105 - 25804297
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  25804105 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 25804203  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggt 387  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||    
T  25804204 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggt 25804297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 40221602 - 40221803
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||  ||| |||||||   | |||||||||||||||    
T  40221602 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgggacttttggtagaattaggcg-gaagacttattcttgta 40221700  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  40221701 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 40221799  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  40221800 caaa 40221803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20506040 - 20505842
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  20506040 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 20505942  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaac 391  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||    
T  20505941 acacattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctc-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 20505845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16092399 - 16092237
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  16092399 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 16092301  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc 355  Q
    || |||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  16092300 acccattgagatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcc 16092237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 192 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 18511411 - 18511148
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||||   |||||||||||||||||    
T  18511411 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggatagaattagg-cgggagacttattcttgta 18511313  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || | || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||| ||| ||    
T  18511312 acccgttgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaa 18511215  T
Q  391 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctac-gtttgtttgtgtttataa 456  Q
    |||| | |  ||||| |||||||  ||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||    
T  18511214 caaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgt-tgttttctactttttgcttgtgtttataa 18511148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 179 - 458
Target Start/End: Original strand, 20053910 - 20054179
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||     ||| ||||||  ||| ||||||||  ||||    
T  20053910 acactagggttgaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtttggaga-----ttgggactttaagtagaattaggtg-ggag 20054003  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc-ccagattaggtcagttttggac 377  Q
    ||||||||||||||| |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  20054004 acttattcttgtaacccg---atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggaaggctgctctctcctccatactaggtcagttttggac 20054100  T
Q  378 tgaactgggtaaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataact 458  Q
     |||||| ||||||||| | |  ||||| |||||||||||| |||| || ||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20054101 cgaactgcgtaaacaaattcttttgtgttctctctttcttt-tctctct-tc-gttttctacttttgtttgtgtttataact 20054179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 194 - 422
Target Start/End: Original strand, 24126938 - 24127165
Alignment:
Q  194 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaac 293  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||     |||||||||||||||||    
T  24126938 ttgattgaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgat-agacttattcttgtaac 24127036  T
Q  294 tcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaaca 392  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||||    
T  24127037 tcattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaaca 24127134  T
Q  393 aaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctc 422  Q
    || | |  ||||| |||||||||||||||||    
T  24127135 aattcttttgtgttctctctttctttctctc 24127165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 179 - 391
Target Start/End: Original strand, 9020285 - 9020497
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||| ||| ||||||||||   ||||| ||| |||||||   | ||    
T  9020285 acactagggttgaagttgattcaccttggaaaacactattaagattgagtttcttggtcacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcg-gaag 9020383  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc-ccagattaggtcagttttggac 377  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  9020384 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggatcggatggctgctctctcctccaaattaggtctgttttggac 9020483  T
Q  378 tgaactgggtaaac 391  Q
     ||||||| |||||    
T  9020484 cgaactggataaac 9020497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 34477253 - 34477052
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34477253 ggttgattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgt 34477154  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |    
T  34477153 aacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 34477057  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  34477056 acaaa 34477052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 34479618 - 34479417
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34479618 ggttgattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgt 34479519  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |    
T  34479518 aacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 34479422  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  34479421 acaaa 34479417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 27910530 - 27910730
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  27910530 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 27910628  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  27910629 acccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tataatggaacggagagctgctctctcccccagattaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 27910726  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  27910727 caaa 27910730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 27912616 - 27912816
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  27912616 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 27912714  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  27912715 acccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggaacagagaactgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 27912812  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  27912813 caaa 27912816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 192 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 1189808 - 1189577
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  1189808 ggttgattcactttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 1189710  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctc--cccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    |  |||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||  |||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |    
T  1189709 atccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtggaacggagggatgctctctcctcccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 1189611  T
Q  390 acaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctc 422  Q
    ||||| | |  ||||| ||||||| |||||||||    
T  1189610 acaaattcttttgtgttctctcttcctttctctc 1189577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 192 - 422
Target Start/End: Original strand, 25904183 - 25904412
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | ||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  25904183 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagggctttgagtataattagg-cgggagacttattcttgta 25904281  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| |||||||| |||||| | |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||| ||    
T  25904282 acacattgatatctctattgtaacgttacttatca-tatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaa 25904379  T
Q  391 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctc 422  Q
    |||| | |  ||||| ||||||| |||||||||    
T  25904380 caaattattttgtgttctctcttcctttctctc 25904412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 6745148 - 6745348
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  6745148 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 6745246  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| |||||||  ||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  6745247 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagacaaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 6745344  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  6745345 caaa 6745348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10529298 - 10529098
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  10529298 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 10529200  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||| | |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  10529199 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcggaaggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 10529102  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  10529101 caaa 10529098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 17072963 - 17073164
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||   || |||||||   | |||||||||||||||    
T  17072963 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttaggggaagagattggggctttcgatagaattaggcg-gaagacttattcttgta 17073061  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||| | ||||||||| ||||||| | |||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  17073062 actcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactcggtca-atttggaccgaactgggtcaa 17073160  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  17073161 caaa 17073164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 120 - 461
Target Start/End: Original strand, 4897726 - 4898073
Alignment:
Q  120 aaacaagagtttataaacaaacaataaactagggtttt---agagatttctctaagagagagacactagggttgtggttgattt-----accttgggaaa 211  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||| | |||||| |||||||| | ||| |||     ||||||   ||    
T  4897726 aaacaagggtttagaaacaaacaacaaactagggtttagagagagatttctctaagcgggagacagtagggttgagattgttttcattcaccttgaacaa 4897825  T
Q  212 --cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttt 309  Q
      |||| |||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||   || |||||||| |    
T  4897826 atcactgttaggattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctat 4897925  T
Q  310 tgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctc 408  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  | ||||| ||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  ||||| | |    
T  4897926 tgtaaagttactcatcattatagcggaacagtgggctgctttctcccccatactaggtcagtattcgactgaactgggtaaacaaattttttgtgttc-c 4898024  T
Q  409 tctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataactgat 461  Q
    ||||||||||||||| ||    |||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  4898025 tctttctttctctcgttg----ttttctacttttgcttgtgtttataattgat 4898073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 191 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 17818690 - 17818427
Alignment:
Q  191 tggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||| |   ||||||||||||||||    
T  17818690 tggttgatttaccttgggaaacactattaagactgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatg-cgggagacttattcttgt 17818592  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || | || ||||| ||||| | |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  17818591 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tacagtggaacagagggcttctctc-ccccaaactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 17818495  T
Q  391 caaaattcgtgtgtgctctcttt--ctttctctcgctgtcttttttctacgttt-gtttgtgtttataa 456  Q
    | |||||| | |||| |||||||  ||||||||| ||  || |||||||| ||| | ||||||||||||    
T  17818494 c-aaattcttttgtgttctcttttcctttctctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataa 17818427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 192 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 34530865 - 34530721
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||| |||||||   ||||| |||||||||||    
T  34530865 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggctacgggaagagattaggactttgagtagaattagg-cgggagatttattcttgta 34530767  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaa 337  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  34530766 actcattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaa 34530721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Original strand, 39854563 - 39854726
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||  |||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  39854563 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcatggttacgggaagagactggaactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 39854661  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    || |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  39854662 acccattgatatctcttttgtaacgctactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccc 39854726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 658552 - 658355
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  658552 ggttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 658454  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaac 391  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||    
T  658453 acccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggctg--ctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 658358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 18509517 - 18509254
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||||| |   |||||||||||||||||    
T  18509517 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagaatgggactttgggtagaattaag-cgggagacttattcttgta 18509419  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    |||| || |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||| ||| |||||||  |||| || ||||| ||| ||    
T  18509418 actcgttgatatctattttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggtgggctgctctctcccctagactaggtca-atttgaaccgaactaggtcaa 18509321  T
Q  391 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgttt-gtttgtgtttataa 456  Q
    |||| | |  ||||| |||||||  ||||||||||||| | |||||||| ||| | ||||||||||||    
T  18509320 caaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgt-tgttttctacttttggcttgtgtttataa 18509254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 21948106 - 21948306
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||  || ||||||| ||  |||||||   |||||||||||||||||    
T  21948106 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtggaattagg-cgggagacttattcttgta 21948204  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || | || ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  21948205 accccttgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggactgaactgggtcaa 21948302  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  21948303 caaa 21948306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10474522 - 10474359
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||| |||||    
T  10474522 ggttgatacaccttgggaaacactattaagattgaatctcttggttacaggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttatttttgta 10474424  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    || |||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10474423 acccattgatatctcttttctaaggttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctcccc 10474359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 36402527 - 36402364
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  36402527 ggttgattcaccttggaaaatactattaggattgaatctcttggttacgggaggagattggaactttgggtaaaattagg-ctggagacttattattgta 36402429  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    |  |||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  36402428 atccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagatgtctgctctctcccc 36402364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 6747385 - 6747584
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  6747385 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 6747483  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctc-cccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||||||| || ||| |||||||| | ||||| ||| ||||||||| |||| | |||||||||| | |||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  6747484 actcattgatttct-ttttgtaacgttactcgtca-tatagtggatcggagggctgctctctctctcagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 6747580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 18466764 - 18466964
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  18466764 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 18466862  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  18466863 acccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tataatggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 18466960  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  18466961 caaa 18466964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 37705979 - 37705752
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |  ||||  || ||||||| | |||||||||||||||||    
T  37705979 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-tgggagacttattcttgta 37705881  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||| ||    
T  37705880 acccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatggctattctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaa 37705783  T
Q  391 caaaattcgtgtgtgctctctttctttctctc 422  Q
    | |||||| || || ||||||| |||||||||    
T  37705782 c-aaattcttgcgttctctcttcctttctctc 37705752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 38882186 - 38882385
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  38882186 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgta 38882284  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc-ccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  38882285 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcctccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 38882381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 41585943 - 41585743
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||   ||||||||||| |||||    
T  41585943 ggttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-caggagacttatttttgta 41585845  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    | ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  41585844 agtcattgatatctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 41585747  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  41585746 caaa 41585743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 179 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 34033783 - 34033565
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgag-actttgcgtaaaattaggtttgg 276  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| || | |||| ||| ||||| |||||     
T  34033783 acactagcgttgggattgatttaccttggagaaacactattaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattcaggattttgggtagaattaagtttga 34033684  T
Q  277 agacttattcttgtaactcattc-atatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttgg 375  Q
    |||||| || | ||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  |  |||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  34033683 agacttgttatggtaaccccttcgatatctcttttgtaaagttactcatcattactgtggaacatagaactgctctctcccctgactaggtcagtattgg 34033584  T
Q  376 actgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |  ||||||||||||||||    
T  34033583 atcgaactgggtaaacaaa 34033565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 192 - 427
Target Start/End: Original strand, 2954497 - 2954730
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||| ||||||||||    
T  2954497 ggttgattcactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgagaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacgtattcttgta 2954595  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| | |||| |  |||||||| ||||| | ||||||| |||| ||| ||||||||| ||    
T  2954596 acccattgatatctc-tttgtaaagttactcatca-tatagtgaagcggagggatgctctctcccccaaactaggtcaatttt-gaccgaactgggtcaa 2954692  T
Q  391 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgt 427  Q
    |||| | |  ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  2954693 caaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgt 2954730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Original strand, 4236709 - 4236872
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  4236709 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 4236807  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  4236808 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccc 4236872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Original strand, 39798127 - 39798290
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  39798127 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 39798225  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    || |||| || |||||||| ||| | ||||||||  ||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  39798226 acccattgatttctcttttataatgatactcatc-gtatagtggatcggagggctgctctctcccc 39798290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 31179570 - 31179370
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  31179570 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 31179472  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |    
T  31179471 aacccattcatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 31179375  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  31179374 acaaa 31179370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 25921672 - 25921472
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || |||| || ||| |||||||   | |||||||||||||||    
T  25921672 ggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactctgggtagaattagg-cggaagacttattcttgta 25921574  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  25921573 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 25921476  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  25921475 caaa 25921472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 179 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 2144778 - 2144509
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgag-actttgcgtaaaattaggtttgg 276  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||  || ||||||||| || |||||| ||  |||||||||||     
T  2144778 acactagggttgggattgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtcgcgggaagagattcaggactttgggtggaattaggtttga 2144679  T
Q  277 agacttattcttgtaac-tcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtcagttttg 374  Q
    ||||| ||||||||||| |  || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || | ||   |||| |||    
T  2144678 agactaattcttgtaaccttttttatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcaaactaaaccagtattg 2144580  T
Q  375 gactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataa 456  Q
    ||| ||||||       ||| || |||||| |||||||||||||||||||||    |||||||| |||| ||||||||||||    
T  2144579 gaccgaactg-------aaattttgtgtgttctctctttctttctctcgctg----ttttctacttttgcttgtgtttataa 2144509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 194 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 2818532 - 2818270
Alignment:
Q  194 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaac 293  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||| ||||||||||    
T  2818532 ttgattcaccttggaaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaac 2818434  T
Q  294 tcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaaca 392  Q
    ||||| | ||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||| ||||    
T  2818433 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaacttggtcaaca 2818336  T
Q  393 aaat-tcgtgtgtgctctctt-tctttctctcgctgtcttttttctacgttt-gtttgtgtttataa 456  Q
    || | |  ||||| ||||||| | ||||||||||||| | |||||||| ||| | ||||||||||||    
T  2818335 aattcttttgtgttctctcttctttttctctcgctgt-tgttttctacttttggcttgtgtttataa 2818270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Original strand, 6756574 - 6756735
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  6756574 ggttgattctccttgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 6756672  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    |  |||| |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| ||| || | |||||||||||||    
T  6756673 a--cattgatatcttttttgtaaggttacacatcattatagtgaaac-gagggctgctctctcccc 6756735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 31472812 - 31472648
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||| |||||||   |||  | | ||||| ||    
T  31472812 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattagg-cgggatgcatcttcttcta 31472714  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  31472713 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcccc 31472648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 2174999 - 2175198
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  2174999 ggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 2175097  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| ||||||| | |||| |||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  2175098 acccattgatttctc-tttgtaacgttacttatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 2175194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 21684650 - 21684451
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  21684650 ggttgattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattagg-caggagacttattcttgta 21684552  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||||||| || |||| |||||||   ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  21684551 actcattgatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 21684455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Original strand, 10586912 - 10587074
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||| ||    
T  10586912 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattcagtctcttgcttacggaaagagattgagactttgggtagaattagg-caggagacttattctttta 10587010  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    || |||| || |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  10587011 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccc 10587074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Original strand, 16776238 - 16776400
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  16776238 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 16776336  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    || |||| || |||||||||||| | |||| |||| ||||||||| |||| | ||||| |||||||    
T  16776337 ac-cattgatttctcttttgtaacgttacttatca-tatagtggatcggagggctgctatctcccc 16776400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 15552325 - 15552525
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  15552325 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 15552423  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |    
T  15552424 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 15552520  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  15552521 acaaa 15552525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 31545160 - 31545360
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  31545160 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattagagtctcttggttacgggaagaaattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 31545258  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| || |||| |||||||   ||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |    
T  31545259 aacccattgatttctc-tttgtaacagtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 31545355  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  31545356 acaaa 31545360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 4410103 - 4410302
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  4410103 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 4410201  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||  ||| || |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  |||   ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||    
T  4410202 acctattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaa 4410298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 26097813 - 26098011
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |   || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  26097813 ggttgattcaccttgg-aaacactattaggaatgagtctcttggttacgggaaaatgctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 26097910  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc-ccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||| ||||| |||||||  |||| || ||||||||| ||    
T  26097911 actcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacaga-ggctgctctctcctccagactaggtca-atttgaaccgaactgggtcaa 26098007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 18469091 - 18469289
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||  ||| |||||||   |||||||| ||||||||    
T  18469091 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattagg-cgggagactttttcttgta 18469189  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaac 391  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| | |||||||||| |   ||||||||| |||||| |||||||  ||||||| ||||||| | |||    
T  18469190 acccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tctagtggaacgaagagctgctctct-cccagactaggtca-atttggaccgaactggattaac 18469286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 39398192 - 39398017
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||  |||||| ||| |||||||   | |||||||||||||||    
T  39398192 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggaactttgggtagaattagg-cagtagacttattcttgta 39398094  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtca 368  Q
    || |||| ||||||||||||| | | |||  || | ||||||  |||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  39398093 acccattgatatctcttttgtgacgttaccaatta-tatagtaaaacggatggctgctctctcccacagactaggtca 39398017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 394
Target Start/End: Original strand, 10749796 - 10749980
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctc 306  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  10749796 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 10749894  T
Q  307 ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
     ||||||| | |||||||||  |||||||| |||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  10749895 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 10749980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 192 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 31466177 - 31466044
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||||   |||||| ||||||||||    
T  31466177 ggttgattcaccttgagaaacagtattaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattagg-cgggagac-tattcttgta 31466080  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcat 327  Q
    || |||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31466079 acccattgatatctattttgtaaagttactcatcat 31466044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Original strand, 22672837 - 22673017
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||    
T  22672837 cactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 22672931  T
Q  312 taaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  22672932 taaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 22673017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 31542815 - 31543014
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||| |     
T  31542815 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattctcg- 31542912  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| || |||| |||||||   ||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |    
T  31542913 aacccattgatttctc-tttgtaacagtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 31543009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 192 - 259
Target Start/End: Original strand, 20043130 - 20043197
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttg 259  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20043130 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttg 20043197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 195 - 394
Target Start/End: Original strand, 2723985 - 2724173
Alignment:
Q  195 tgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaact 294  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||         ||| |||||||   || || |||||||||||||     
T  2723985 tgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg---------gtagaattaggcg-ggtgatttattcttgtaacc 2724074  T
Q  295 cattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaa 393  Q
    |||| |||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||    
T  2724075 cattgatatctcttttgtaagattactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaa 2724172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 208 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 3373320 - 3373136
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctc 306  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  3373320 gaaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc 3373222  T
Q  307 ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
     ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| |  |||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  3373221 -tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 3373136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 194 - 394
Target Start/End: Original strand, 35430259 - 35430462
Alignment:
Q  194 ttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagatt-gagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||   | ||||||||| | | ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  35430259 ttgattcaccttggagaaacactattacaattgagtctcttggtctagggaagagattcgggtctttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 35430358  T
Q  292 actcattc-atatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc-ccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    | || ||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |||||   ||| ||||||||| |||||||||||||| |||    
T  35430359 attcttttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggaaagctcctatctcctttagagtaggtcagtattggactgaactggataa 35430457  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  35430458 acaaa 35430462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 392
Target Start/End: Original strand, 10627364 - 10627547
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| | | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| | |  ||||||| |    
T  10627364 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagac-tagggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac-cctgaatatctc-t 10627460  T
Q  309 ttgtaaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaaca 392  Q
    |||||||   ||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| |||||||   || ||||||||||||||||||    
T  10627461 ttgtaaataaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctagagtaggtcatcattagactgaactgggtaaaca 10627547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 35385634 - 35385451
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||| |    
T  35385634 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 35385540  T
Q  309 ttgtaaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  35385539 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 35385451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 179 - 336
Target Start/End: Original strand, 4754220 - 4754377
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||  |||||||||||| |||||  |||||||| ||  |||||||||| |||||||  || ||||||||||| ||    
T  4754220 acactagggttgagattgattcaccttgaaaaacactattagaattgagcctcttggtcactggaagagattgtgactttggatagaattaggtttgaag 4754319  T
Q  279 acttattcttgtaa-ctcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtgga 336  Q
     || |||||||||| ||  || ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  4754320 gctaattcttgtaaccttttttatatctc-tttgtaaagttactcatcaatatagtgga 4754377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 179 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 15224983 - 15224735
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagatt-gagactttgcgtaaaattaggtttgg 276  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||  ||||||||||||||||  | ||| ||||| | | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||     
T  15224983 acactagggttatgattgattcaccttgaagaaacactattaggataaagtcttttggtcatgggaagagattcgagactttgggtaaaattaggtttga 15224884  T
Q  277 agacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaa---gctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttt 372  Q
    ||||| ||| |||||||   || |||  |||||||||||    | ||||||||||||| |||||| | |  ||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  15224883 agactaatttttgtaaccatttgataattcttttgtaaacttacgactcatcattataatggaacagttagctgctctctgccccagactaggtcagtat 15224784  T
Q  373 tggactgaactgggtaaa-caaaattcgtgtgtgctctctttctttctc 420  Q
    || || ||||| |||||| ||| ||  |||||| |||||| ||||||||    
T  15224783 tgaaccgaactaggtaaaccaatatatgtgtgttctctctctctttctc 15224735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Original strand, 1170811 - 1170993
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||| |    
T  1170811 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 1170905  T
Q  309 ttgtaaagctactca-tcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  1170906 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 1170993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 208 - 394
Target Start/End: Original strand, 10757273 - 10757456
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctc 306  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||| |||| || | ||    
T  10757273 gaaacactattaggattggagtctcttggttacg-gaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttttc 10757370  T
Q  307 ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
     ||||||| | |||||||||  |||||||| |||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  || ||| ||||||||| ||||||    
T  10757371 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attagaccgaactgggtcaacaaa 10757456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 208 - 394
Target Start/End: Original strand, 23665140 - 23665323
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctc 306  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   | |||| |||||||||||| |||| || ||||    
T  23665140 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc 23665237  T
Q  307 ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctc-tccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
     ||||||| | |||||||||  |||||||| |||| | |||||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  23665238 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 23665323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 208 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 23793447 - 23793264
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctc 306  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   | |||| |||||||||||| |||| || ||||    
T  23793447 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc 23793350  T
Q  307 ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctc-tccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
     ||||||| | |||||||||  |||||||| |||| | |||||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  23793349 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 23793264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 208 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 38960314 - 38960131
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctc 306  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |   |||||| |||||||||||| |||| || ||||    
T  38960314 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaatta-gacgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc 38960217  T
Q  307 ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
     ||||||| | |||||||||  |||||||| |||| | ||||||||| ||||| | ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  38960216 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 38960131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 271
Target Start/End: Original strand, 20045090 - 20045169
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattagg 271  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  20045090 ggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttccgggaagagattgggactttgggtagaattagg 20045169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 208 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 15354757 - 15354574
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctc 306  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   | |||| |||||||||||| |||| || ||||    
T  15354757 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc 15354660  T
Q  307 ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
     ||||||| | ||||||| |  |||||||| |||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  15354659 -tttgtaacgttactcatta-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 15354574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Original strand, 28786407 - 28786587
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| | | ||||||||||| ||| | ||||||||||||||   ||||||| ||||    
T  28786407 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggcagaattaggtttgaagattgattcttgtaactca---atatctc-tttg 28786501  T
Q  312 taaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  ||||  ||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  28786502 taaagaaactcatatcattataatggaacggagaactgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 28786587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 394
Target Start/End: Original strand, 25445501 - 25445679
Alignment:
Q  214 ctattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgta 313  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||   ||||||| ||||||    
T  25445501 ctattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctc-tttgta 25445595  T
Q  314 aagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||  ||||  |||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  25445596 aagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 25445679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 2298183 - 2298095
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcatt 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  |||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  2298183 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt 2298095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 23742034 - 23741858
Alignment:
Q  215 tattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgta 313  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||   | ||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||    
T  23742034 tattaggattggagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcg-gaagact-attcttgtaacccattgatttctc-tttgta 23741938  T
Q  314 aagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctc-tccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    | | |||||||||  |||||||| |||| | |||||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  23741937 acgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 23741858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 327
Target Start/End: Original strand, 42770940 - 42771024
Alignment:
Q  242 gaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcat 327  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42770940 gaagagattgagactttgggtagaattagg-cgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 42771024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 15357033 - 15356850
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctc 306  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   | |||| |||||||||||| |||| || ||||    
T  15357033 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc 15356936  T
Q  307 ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
     ||||||| | ||||||| |  |||||||| |||| | ||||||||| |||| || ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  15356935 -tttgtaacgttactcatta-aatagtggatcggagggctgctctctcccccggactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 15356850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 17841428 - 17841248
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||  ||  |||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||    
T  17841428 cactattaggattgagtctctaggtcacgggaagaggctggaacttgg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 17841334  T
Q  312 taaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  17841333 taaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 17841248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Original strand, 25452498 - 25452678
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||   ||||||| ||||    
T  25452498 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctc-tttg 25452592  T
Q  312 taaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||| | ||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  25452593 taaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagaataggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 25452678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12556122 - 12556063
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattg 251  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||    
T  12556122 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggctacgggaagagattg 12556063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 394
Target Start/End: Original strand, 42238315 - 42238443
Alignment:
Q  265 aattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagat 361  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| |||||||||  ||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||     
T  42238315 aattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagac 42238410  T
Q  362 taggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  42238411 taggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 42238443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 354
Target Start/End: Original strand, 1240428 - 1240570
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |  ||| ||||||  || || |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| |    
T  1240428 aaacactattaggattgagtctcttaggcacgggaagaggctggga-tttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 1240522  T
Q  309 ttgtaaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctctc 354  Q
    ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  1240523 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctc 1240570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16093473 - 16093291
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||  || ||||| | ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| |    
T  16093473 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagtctgggacttag-gtagaattagatttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 16093379  T
Q  309 ttgtaaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||  ||||||||||||||||| |   ||||||||| |||| | |||||||   || ||| ||||||| ||||||||    
T  16093378 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacgaaaagctgctctcttcccatactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaa 16093291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 11962612 - 11962529
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactca 296  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||  |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11962612 cactattaggattgtgtctcttggtcacgggaagaggctgagacttgg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca 11962529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 31782639 - 31782556
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaac 293  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| || || | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  31782639 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggaattgg-gtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 31782556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 270
Target Start/End: Original strand, 42770835 - 42770924
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattag 270  Q
    |||||| ||||| |||| ||| ||| ||||||||  |||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  42770835 acactaaggttggggttcattcaccatgggaaac--tattaggactgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattag 42770924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 26406647 - 26406573
Alignment:
Q  217 ttaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaa 292  Q
    |||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26406647 ttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgagac-ttgagtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 26406573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 21288850 - 21289041
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||  || ||||| |   ||||| || ||||||||    
T  21288850 ggttgattcaccttga-aaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattaggactttggatagaattaag-cgggagattttttcttgta 21288947  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    |||||        |||||||||| | |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||| ||| ||||||||| ||    
T  21288948 actca--------tcttttgtaacgttactcatc-ttatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaa 21289037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 293
Target Start/End: Original strand, 32520533 - 32520619
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattga-gactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaac 293  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| | ||||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  32520533 gaaacactattaagattgagtctctcgattacgggaagagattcatgactttgggtagaattaggtttgaaaactgattcttgtaac 32520619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 293
Target Start/End: Original strand, 13295835 - 13295920
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagatt-gagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaac 293  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| | ||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  13295835 aaacacttttaggattgagtctcttgatcacatgaagagattcgagactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaac 13295920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 390
Target Start/End: Original strand, 29748443 - 29748627
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagatt-gagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactc-attcatatct 305  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||| | ||||||| ||| || ||  |||| ||||| |||||||||||||  || |||| |    
T  29748443 gaaacactaataggattgagtctcttggtcacgggaatagattcgggactttgggtagaactaaatttgaagactaattcttgtaactcttttgatatat 29748542  T
Q  306 cttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    | |||||||||  | |||| ||||| |||||||| |   ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  29748543 c-tttgtaaaggaattcattattatggtggaacgaagagctgctctctcccccaaagtaggtcagtattggaccgaacttggtaaa 29748627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 364 - 458
Target Start/End: Original strand, 42771028 - 42771118
Alignment:
Q  364 ggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataact 458  Q
    |||||||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||| ||||    |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  42771028 ggtcagttttgggccgaattgtgtaaacaaatttcgtgtgttctctcttcatttctcttgctg----ttttctacctttgcttgtgtttataact 42771118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 25562473 - 25562390
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaac 293  Q
    ||||||| |||||||| | | ||| ||| ||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  25562473 aaacactcttaggatttagtttctgggtcacgagaagagattgtaacttgg-gtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaac 25562390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26098450 - 26098391
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattg 251  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  26098450 ggttgattcaccttgacaaacactattatgattgagtctcttggttacggaaagagattg 26098391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 357
Target Start/End: Original strand, 40222769 - 40222908
Alignment:
Q  215 tattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaa 314  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||| ||||||  ||  |||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  40222769 tattaggattgagtctcttgatcacgggaagaggctggaacttgg-gtagaattatgtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-gtaa 40222863  T
Q  315 agctactcat--cattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    ||  ||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  40222864 agaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccc 40222908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 379 - 419
Target Start/End: Original strand, 4754380 - 4754420
Alignment:
Q  379 gaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttct 419  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  4754380 gaactgggtaaacaaatttcgtgttttctctctttctttct 4754420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 87)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 194 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 17897443 - 17897183
Alignment:
Q  194 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaac 293  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| |||| ||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  17897443 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaaaagattgagattttgagtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaac 17897345  T
Q  294 tcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaa 393  Q
     | || |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  17897344 cctttgatatctattttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatggctgctctctccccagactaggtcagtattggtccgaactgggtaaacaa 17897245  T
Q  394 aattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataactg 459  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||| ||    |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  17897244 atttcgtgtgttctctctttctttctctcgttg----ttttctacttttgcttgtgtttataactg 17897183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 181 - 456
Target Start/End: Original strand, 40699419 - 40699691
Alignment:
Q  181 actagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagac 280  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  40699419 actagggtt-tggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagac 40699517  T
Q  281 ttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactg 379  Q
    ||||| ||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| | ||||||| ||||||||| || ||| |    
T  40699518 ttatttttgtaatcctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctttcccccagactaggtcagtattagaccg 40699617  T
Q  380 aactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataa 456  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  40699618 aactaggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctctcgct---atttttctacttttgcttgtgtttataa 40699691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 181 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 11578319 - 11578076
Alignment:
Q  181 actagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagac 280  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||    
T  11578319 actagggttggggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagac 11578221  T
Q  281 ttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactg 379  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| | ||||||| | ||||||| ||| |||||||| ||| |    
T  11578220 ttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtcgaacggagggctgctctttcccccagactagatcagttttagaccg 11578121  T
Q  380 aactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctc-tttctttctctcg 423  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||    
T  11578120 aactaggtaaacaaatttcgtgtgttttctcttttctttctctcg 11578076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 179 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 20146821 - 20146547
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||| ||||| | |||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||| |||| ||| |||||||   ||||    
T  20146821 acactatggttgggattgattcaccttgggaaacaatagtaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggcg-ggag 20146723  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtcagttttggac 377  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| || |||||| ||||||    
T  20146722 acttattcttgtaactctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcagactaagtcagtattggac 20146623  T
Q  378 tgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataa 456  Q
     ||||||||||||| || ||||||||  ||||||||| ||||||||| ||    |||||||| |||| ||||||||||||    
T  20146622 cgaactgggtaaacgaatttcgtgtgatctctctttcttttctctcgttg----ttttctacttttgcttgtgtttataa 20146547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 179 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 18800525 - 18800312
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| | ||||| ||| |||||||   ||||    
T  18800525 acactagggttg-ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattggggctttgggtagaattaggag-ggag 18800428  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggact 378  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||  |||||||||||||||     
T  18800427 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcattatagtgaaacggagggctactctctccccagaccaggtcagttttggacc 18800328  T
Q  379 gaactgggtaaacaaa 394  Q
     |||||||||||||||    
T  18800327 aaactgggtaaacaaa 18800312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 119 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 13828620 - 13828330
Alignment:
Q  119 aaaacaagagtttataaacaaacaataaactagggttttagag--atttctctaagagagagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacact- 215  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||||||||     
T  13828620 aaaacaaggatttagaaacaaacaataaactagggttttagagggatttctctaagcgagagacattagggttgtgagtgattcaccttaggaaacactg 13828521  T
Q  216 ---attaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgt 312  Q
       ||||||| |   ||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | | || |||||||||||||    
T  13828520 ttaattaggagtc--tcttttggtcacgggaagagattcagactttgggtagaattatgtttgaagacttattcttgtagccctttgatatctcttttgt 13828423  T
Q  313 aaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgt 404  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||| | |  || |||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  13828422 aaaattactcataattatagtggaacagttagctactctctcccctagactaggtcagttctggaccgaactggataaacaaatttcgtgtgt 13828330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 192 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 6259014 - 6258787
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| | ||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  6259014 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga--ttggggctttgggtagaattaggtg-ggagacttattcttgta 6258918  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaac 391  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||| |||    
T  6258917 acccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtgaaacggagggctgctctctccccatactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 6258819  T
Q  392 aaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctc 422  Q
    ||| | |  ||||| ||||||| |||||||||    
T  6258818 aaattcttttgtgttctctcttcctttctctc 6258787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 179 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 27136338 - 27136067
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  27136338 acactagggttggggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaagaaattgggactttgagtagaattaggtttggag 27136239  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggac 377  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||       |||| |||| || |  || ||||||||| | | || |||||| ||||||    
T  27136238 acttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactc-------tagtagaacagagggttgttctctccccaaaactaagtcagtattggac 27136146  T
Q  378 tgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataactg 459  Q
     |||||| ||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||| ||  ||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  27136145 cgaactgagtaaacaaattttatgtgttctctttttctttctctcgttg--ttttttc-acttttgcttgtgtttataactg 27136067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 42452837 - 42453036
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  42452837 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 42452935  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaac 391  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||    
T  42452936 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 42453033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 11739759 - 11739558
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||| ||||||||| |    
T  11739759 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagaattattcttgga 11739661  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    |  |||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  11739660 atccattgatatctcttttgaaaggttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 11739562  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  11739561 caaa 11739558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 184 - 456
Target Start/End: Original strand, 35107341 - 35107614
Alignment:
Q  184 agggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattag-gtttggagactt 282  Q
    ||||||| | |||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||  |||| ||||||    
T  35107341 agggttgggattgattcaccttgagaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattagattttgaagactt 35107440  T
Q  283 attcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctc-tccccagattaggtcagttttggactgaa 381  Q
    ||||||||||| | ||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  || |||| | |||||| ||||||||| |||||| |||    
T  35107441 attcttgtaac-ctttgttatctcttttgtaatgttactcatcattatagtggaacggatggttgttctctttcccagactaggtcagtattggaccgaa 35107539  T
Q  382 ctgggtaaacaaa-attcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataa 456  Q
     | |||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||  || |||||||||    
T  35107540 ataggtaaacaaatatttttgtgttctctctttcttttctctcgctg--ttttttctacctttacttatgtttataa 35107614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 192 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 6264348 - 6264118
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||| | |||||  || ||||||    |||||||||||||||||    
T  6264348 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgataaaagattggggctttggatagaattagacg-ggagacttattcttgta 6264250  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  6264249 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 6264151  T
Q  391 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctc 422  Q
    |||| | |  ||||| ||||||| |||||||||    
T  6264150 caaattcttttgtgttctctcttcctttctctc 6264118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 5375544 - 5375345
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  5375544 ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg--cggagacttattcttgta 5375447  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  5375446 acccattgatatctcttttgtaacattactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 5375349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 192 - 427
Target Start/End: Original strand, 17848500 - 17848730
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||   ||    ||||||||||||||||    
T  17848500 ggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaaggcgg----gagacttattcttgta 17848595  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  17848596 ac-cattgatatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggatgactgctctctcccccatactaggtca-atttggactgaactgggtcaa 17848692  T
Q  391 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgt 427  Q
    |||| | |  ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  17848693 caaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgt 17848730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 209 - 341
Target Start/End: Original strand, 20589763 - 20589895
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  20589763 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctctt 20589862  T
Q  309 ttgtaaagctactcatcattatagtggaacgga 341  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20589863 ttgtgaagttactcatcattatagtgtaacgga 20589895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 19502210 - 19502010
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  19502210 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 19502112  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| || | | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  19502111 acccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcgaagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 19502014  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  19502013 caaa 19502010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 192 - 422
Target Start/End: Original strand, 14837329 - 14837553
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||      |||||||||||||||||  ||| |||||||   || ||||||||||||||    
T  14837329 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg------gaagagattgagactttaagtagaattaggcgggg-gacttattcttgta 14837421  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| |||||||  ||||||| |||||| || ||    
T  14837422 actcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggatggatgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgagtcaa 14837520  T
Q  391 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctc 422  Q
    |||| | |  ||||| ||||||| |||||||||    
T  14837521 caaattcttttgtgttctctcttcctttctctc 14837553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 43623779 - 43623616
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  43623779 ggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 43623681  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  43623680 acccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccc 43623616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 179 - 417
Target Start/End: Original strand, 22874174 - 22874411
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||||  ||||    
T  22874174 acactatggttg-ggttgattcaccttggaaaacagtattaggattgagtctcttagtcacgggaagagattgaggctttcggtagaattaggtg-ggag 22874271  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtcagttttggac 377  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||   |||||||||||| || | |||||||  |||||||    
T  22874272 acttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaactgagagctgctctctccctcatactaggtca-atttggac 22874370  T
Q  378 tgaactgggtaaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttcttt 417  Q
     ||| |||||||||||| | || ||||| ||||||||||||    
T  22874371 cgaattgggtaaacaaattctcttgtgttctctctttcttt 22874411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 192 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 40032257 - 40031989
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||  ||||||| ||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  40032257 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggttaggactttgggtagaattaggcgt-gagacttattcttgta 40032159  T
Q  292 actcattcata----tctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtcagttttggactgaactggg 386  Q
    || |||| |||    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||| |||| |||||||  ||||||| ||||||||    
T  40032158 acccattgatatctttctcttttgcaaagttactcatcattatagtgaaacggagggccgctctctccctcagactaggtca-atttggaccgaactggg 40032060  T
Q  387 taaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataa 456  Q
    | |||||| | |  ||| | ||||||| | ||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||    
T  40032059 tcaacaaattcttttgtattctctcttccttttctctcgctgt-tgttttctacatttgcttgtgtttataa 40031989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 196 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 28459385 - 28459129
Alignment:
Q  196 gatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactc 295  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | |||   ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  28459385 gattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtttggggcttcaggtataattaggtg-ggagacttattcttgtaaccc 28459287  T
Q  296 attcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaa 395  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||||| || ||| |||||||  ||||||  ||||| | ||||||||     
T  28459286 attgatatctcttttttaaagttactcatcattatagtgaaacggagggcttctctctacctagactaggtca-atttggatcgaactagataaacaaat 28459188  T
Q  396 t-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgttt-gtttgtgtttataa 456  Q
    | |  ||||| ||||||||||||||||| |||    |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  28459187 tcttttgtgttctctctttctttctctccctg----ttttctacttttggtttgtgtttataa 28459129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 340
Target Start/End: Original strand, 17849173 - 17849320
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||| |||||    
T  17849173 ggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggtaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgta 17849271  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacgg 340  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  17849272 acccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacgg 17849320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 191 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 19504545 - 19504345
Alignment:
Q  191 tggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  19504545 tggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg-gaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 19504448  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||| ||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |    
T  19504447 aacccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctatctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 19504350  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  19504349 acaaa 19504345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15539674 - 15539552
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  15539674 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 15539576  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaa 315  Q
    || |||| |||| |||||||||||    
T  15539575 acccattgatatatcttttgtaaa 15539552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 23452436 - 23452236
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || |||||||  || ||||||| | |||||||||||||||||    
T  23452436 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggatagaattagg-tgggagacttattcttgta 23452338  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  23452337 acccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 23452240  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  23452239 caaa 23452236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 42064571 - 42064771
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||  || |||||||   |||||||||||||||||    
T  42064571 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttggatagaattagg-cgggagacttattcttgta 42064669  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| |||||||   ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  42064670 acccattgatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaaatttggaccgaactgggtcaa 42064767  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  42064768 caaa 42064771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 42923708 - 42923508
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| | ||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  42923708 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 42923610  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    |  |||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| | ||||||||||||| | | |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  42923609 atccattgatatctcttttgtaaagttactcgtca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctatactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 42923512  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  42923511 caaa 42923508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 45280183 - 45279983
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  45280183 ggttgattcaccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 45280085  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  |||||||  |||||||| ||    
T  45280084 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccaaactgggtcaa 45279987  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  45279986 caaa 45279983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Original strand, 28196693 - 28196856
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||| |||||||   | ||| |||||||||||    
T  28196693 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgaggctttgggtagaattagg-cggaagatttattcttgta 28196791  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    || |||| |||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  28196792 acccattgatatctcttttgtaacattactcatca-tatagtgaaacgaatggctgctctctcccc 28196856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 45239176 - 45239013
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||  ||| ||||| |   ||| |||||||||||||    
T  45239176 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggtttttggtagaattaag-cgggatacttattcttgta 45239078  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  45239077 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 45239013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 35215785 - 35215585
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  35215785 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagtttgggactttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgt 35215687  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    |||||||| || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |    
T  35215686 aactcattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 35215590  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  35215589 acaaa 35215585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 19007696 - 19007896
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| | |||||||||| | ||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  19007696 ggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtttcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 19007794  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| | | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||| ||    
T  19007795 acccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacgaagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaa 19007892  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  19007893 caaa 19007896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 27104854 - 27105053
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  27104854 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 27104952  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| |||||||   ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  27104953 acccattgatttctc-tttgtaacattactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 27105049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 31732964 - 31732744
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||            ||| ||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  31732964 ggttgattcacgttgggaaacactgttaggattgagtctcttggt------------ttgggactttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgta 31732878  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| || |||||||||    
T  31732877 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattgtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgagctgggtaaa 31732779  T
Q  391 caaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgt 427  Q
    | |||||||||||| |||| | | |||||||||||||    
T  31732778 c-aaattcgtgtgttctctatct-tttctctcgctgt 31732744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 34979778 - 34979632
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||  ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  34979778 ggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattcggactttcggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 34979680  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacg 339  Q
    |  |||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  34979679 atccatttatatctcttttgtaaggttcctcatcattatagtggaacg 34979632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 21520892 - 21520729
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||  |  ||||||| ||| |||||||   ||||||| |||||||||    
T  21520892 ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctaggactttgggtagaattagg-cgggagactaattcttgta 21520794  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21520793 acccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctcccc 21520729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 22287535 - 22287306
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||| | ||| |||| ||   |||||||||||||||||    
T  22287535 ggttgattcaccttgggaaacggtattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgacacttcgggtagaatt-gggcgggagacttattcttgta 22287437  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || | || ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| || ||| | ||||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  22287436 acccgttgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 22287339  T
Q  391 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctc 422  Q
    |||| | |  ||||| ||||||| |||||||||    
T  22287338 caaattcttttgtgttctctcttcctttctctc 22287306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 35218162 - 35217962
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  35218162 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgt 35218064  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| | || || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |    
T  35218063 aacccgttgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 35217967  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  35217966 acaaa 35217962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 13910243 - 13910044
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||  |||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  13910243 ggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagagactggaactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 13910145  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| |||||||   ||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  13910144 acccattgatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggatcagatggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 13910048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 209 - 421
Target Start/End: Original strand, 33603994 - 33604206
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||  ||||| ||| ||||| | | |||| ||||||||||||  | | ||||||||||| ||||| |||||| ||||   || |||| ||||    
T  33603994 aaacactattataattgagtcttttggtcatgggaagtgattgagactttaggaagaattaggtttgaagactaattcttctaaccttttgatatatctt 33604093  T
Q  309 ttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc--agattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgc 406  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| || || |||||   ||||||||||||||| |||||||||      
T  33604094 t-gtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccccaaga-tagatcggtattggaacaaactgggtaaacaaatttcgtgtgtta 33604191  T
Q  407 tctctttctttctct 421  Q
    |||||||||||||||    
T  33604192 tctctttctttctct 33604206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 44289267 - 44289066
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||| | ||| ||||| | | | | |||||||||||||    
T  44289267 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgggacttagggtagaattaag-tggaaaacttattcttgta 44289169  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || | || |||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| ||||  |||||| | ||||| | |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  44289168 acccgttgatatctcttttgtaagattactcatcattatagtgaaacagatggttgctctttcccccaaactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 44289070  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  44289069 caaa 44289066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 179 - 357
Target Start/End: Original strand, 35028617 - 35028795
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| | ||||||  | |||| ||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||| |     
T  35028617 acactagggttgagattgattcgcattggaaaacactattatgattgagtctcttgatcacgagaagagattgacactttgggtagaattatgtttgaat 35028716  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    ||| |||||||||||   || ||||||||||| ||||  |||||||||||  |||||||||||   |||||||||||||    
T  35028717 actaattcttgtaaccttttaatatctcttttctaaaattactcatcattgcagtggaacggagagctgctctctcccc 35028795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 209 - 422
Target Start/End: Original strand, 39680045 - 39680255
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||| |||||||   |||||| |    
T  39680045 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagattgattcttgaaactcat---tatctc-t 39680139  T
Q  309 ttgtaaagctactca-tcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgc 406  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||  || ||||| |    
T  39680140 ttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttc 39680239  T
Q  407 tctctttctttctctc 422  Q
    ||||| ||| ||||||    
T  39680240 tctctctctctctctc 39680255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 36559047 - 36558863
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctc 306  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  36559047 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 36558949  T
Q  307 ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
     ||||||| | |||||||||  |||||||| |||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  36558948 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 36558863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 36561324 - 36561140
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctc 306  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  36561324 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 36561226  T
Q  307 ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
     ||||||| | |||||||||  |||||||| |||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  36561225 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 36561140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 192 - 330
Target Start/End: Original strand, 3022219 - 3022355
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||  ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  3022219 ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgaggttttaggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 3022317  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattat 330  Q
    || |||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  3022318 acccattaatatctc-tttataaagttactcatcattat 3022355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 208 - 341
Target Start/End: Original strand, 15693974 - 15694108
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagatt-gagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctc 306  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || |||||||    
T  15693974 gaaacactattaggataaagtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc 15694073  T
Q  307 ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacgga 341  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  15694074 ttttgtaaagttactcatcattttagtggaacgga 15694108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 179 - 335
Target Start/End: Original strand, 43139417 - 43139572
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||| |  ||    
T  43139417 acactagggttgagattgattcatcttgggaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagatattgagactttaggtagaattaggtctaaag 43139516  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtgg 335  Q
    ||| ||| |||||||   || || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43139517 actaattattgtaaccttttgatttctc-tttgtaaagttactcatcattatagtgg 43139572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Original strand, 2736205 - 2736387
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||| |    
T  2736205 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 2736299  T
Q  309 ttgtaaagctactca-tcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  2736300 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 2736387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 208 - 370
Target Start/End: Original strand, 17921769 - 17921929
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagatt-gagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctc 306  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||  | ||| ||||||| ||| | || ||   ||    
T  17921769 gaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggttttaaaactgattcttgcaaccctttgat---tc 17921865  T
Q  307 ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagt 370  Q
    |||  ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||    
T  17921866 tttcataaagttagtcatcattatagtggaacggagggctgctctctacccagactaggtcagt 17921929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Original strand, 39686983 - 39687165
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||| |    
T  39686983 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 39687077  T
Q  309 ttgtaaagctactca-tcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  39687078 ttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 39687165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 208 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 45332364 - 45332180
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctc 306  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||||   ||||||||||| ||||||| |||| || ||||    
T  45332364 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattagg-cgggagacttattattgtaacccattgatttctc 45332266  T
Q  307 ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
     ||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  45332265 -tttgtaaaggtactcatca-tatagtgaattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 45332180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 275 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 7463065 - 7462911
Alignment:
Q  275 ggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagtttt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||| ||| | ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  7463065 ggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttacccatta-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttt 7462967  T
Q  374 ggactgaactgggt-aaacaaaattcgtgtgtgctctctt-tctttctctcgctgt 427  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||    ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  7462966 ggaccgaactgggtcaaaaaaaaaaattgtgttctctcttctctttctctcgctgt 7462911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Original strand, 17943540 - 17943718
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||    
T  17943540 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctc-tttg 17943634  T
Q  312 taaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  |||||||||||||||||| | ||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||| ||||||||||    
T  17943635 taaagaaactcatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaa 17943718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 22407571 - 22407424
Alignment:
Q  275 ggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagtttt 373  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  |||    
T  22407571 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-attt 22407474  T
Q  374 ggactgaactgggtaaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctc 422  Q
    |||| ||||| ||| |||||| | |  ||||| ||||||| |||||||||    
T  22407473 ggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctc 22407424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 27517818 - 27517638
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||    
T  27517818 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 27517724  T
Q  312 taaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||| ||||||||||    
T  27517723 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaacttggtaaacaaa 27517638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20054947 - 20054764
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| |    
T  20054947 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 20054853  T
Q  309 ttgtaaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctctcc-ccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||  ||||||||||| || ||||   ||||||||||| ||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  20054852 ttgtaaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctccaccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 20054764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 336
Target Start/End: Original strand, 17932637 - 17932756
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||    
T  17932637 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 17932731  T
Q  312 taaagctactcatcattatagtgga 336  Q
    |||||  ||||||||||||||||||    
T  17932732 taaagaaactcatcattatagtgga 17932756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Original strand, 2740941 - 2741123
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||| ||| ||| ||| ||||||||||  ||||| ||||||| |||||||   |||||| |    
T  2740941 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattaggtttaaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 2741035  T
Q  309 ttgtaaagctactca-tcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||| ||||||||||    
T  2741036 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaa 2741123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Original strand, 17462436 - 17462618
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||   | |||||| |    
T  17462436 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---cttatctc-t 17462530  T
Q  309 ttgtaaagctactca-tcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  17462531 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 17462618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 37170931 - 37170778
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||  || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||   |||||||||| |    
T  37170931 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggacttgg-gtagaattaggtttgaagactgatttttgtaactca---atatctcttt-g 37170837  T
Q  312 taaagctactcat--cattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtca 368  Q
    |||||  ||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||    
T  37170836 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccccagactaggtca 37170778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 28459011 - 28458927
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaac 293  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28459011 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 28458927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 341
Target Start/End: Original strand, 26345661 - 26345809
Alignment:
Q  193 gttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagatt-gagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||| |    
T  26345661 gttgattcaccttagcaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgaa 26345760  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactc-atcattatagtggaacgga 341  Q
    || ||||   |  |||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  26345761 acccattggaa--tcttttataaagttactcaataattatagtggaacgga 26345809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 24162411 - 24162259
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |          || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  24162411 ggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttgc----------tgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 24162323  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    || |||| || |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  24162322 acccattgatttctc-tttgtaatgctactcatca-tatagtggattggatggctgctctctcccc 24162259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 30720796 - 30720710
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagatt-gagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaac 293  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30720796 gaaacactattaggattgagtctctttggcacgagaagagattcgtgactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 30720710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 22707870 - 22707721
Alignment:
Q  275 ggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct---ccccagattaggtcagtt 371  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| || | |||||||||   | ||||| |||||||  |    
T  22707870 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctctcctccagactaggtca-at 22707773  T
Q  372 ttggactgaactgggtaaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctc 422  Q
    |||||||||||| ||| |||||| | |  ||||| ||||||| |||||||||    
T  22707772 ttggactgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctc 22707721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 12781400 - 12781220
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||   ||||||| ||||    
T  12781400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaaaactgattcttggaactca---atatctc-tttg 12781306  T
Q  312 taaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||| ||||||||||    
T  12781305 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaa 12781220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Original strand, 30478997 - 30479177
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||| || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||   ||||||| ||||    
T  30478997 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctc-tttg 30479091  T
Q  312 taaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  ||||  ||||||||||| || ||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  30479092 taaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 30479177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 421
Target Start/End: Original strand, 20592295 - 20592362
Alignment:
Q  354 ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctct 421  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  20592295 ccccagactaggtcagtattggaccgaattggataaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctct 20592362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 37963109 - 37962917
Alignment:
Q  221 gattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctac 320  Q
    |||||| ||||||||| ||  |||||||||||| ||||| ||| ||||||    | ||||||||||||||||  |||| || |   |||||||||| ||     
T  37963109 gattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggctttgggtagaattagacgag-agacttattcttgtaatccattgattt---ttttgtaaagttat 37963014  T
Q  321 tcatcattatagtggaacggatgactgctctctc-cccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttcttt 417  Q
    |||||||||||||| ||| |  ||||| |||||| |||| | ||||| | ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  37963013 tcatcattatagtgaaacagtggactgatctctctcccacactaggttaattt-ggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctttttcttt 37962917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 38414279 - 38414201
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattagg 271  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||| ||||||  ||| |||||||    
T  38414279 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacg-gaaaagattgggacttttggtagaattagg 38414201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 362 - 456
Target Start/End: Original strand, 8173555 - 8173646
Alignment:
Q  362 taggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataa 456  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||| ||    |||| ||| |||||||||||||||||    
T  8173555 taggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttcactctttcttttctctcgttg----ttttttacctttgtttgtgtttataa 8173646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 195 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27583535 - 27583477
Alignment:
Q  195 tgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgag 253  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  27583535 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgag 27583477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 336
Target Start/End: Original strand, 45567409 - 45567532
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||| |    
T  45567409 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 45567503  T
Q  309 ttgtaaagctactca-tcattatagtgga 336  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  45567504 ttgtaaagaaactcattcattatagtgga 45567532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 110
Target Start/End: Original strand, 12924341 - 12924444
Alignment:
Q  11 catcatcaggagtgaagaaaagcata--taatgctgcaatgaaccaaatgacaca--gaaacaaaaatggtttcttcttacctaaaagcacttgaggttg 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||  |||||||||| |||||||| |  |||||| ||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||    
T  12924341 catcatcaggagtgaagaaaagaatagctaatagtgcaatgaacaaaatgacaaatagaaacagaaatggtttcttcttccgcgaaaccacttgaggttg 12924440  T
Q  107 cgat 110  Q
    ||||    
T  12924441 cgat 12924444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20050204 - 20050020
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||  |  ||||| |  || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| |    
T  20050204 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagaggctaggacttgga-tataattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 20050110  T
Q  309 ttgtaaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct--ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||   |||||||||  ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  20050109 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctccccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 20050020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22712698 - 22712569
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||   ||||||| |    
T  22712698 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttggaactca---atatctc-t 22712604  T
Q  309 ttgtaaagctactc--atcattatagtggaacgga 341  Q
    ||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||    
T  22712603 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcgga 22712569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22717407 - 22717278
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||   ||||||| |    
T  22717407 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttggaactca---atatctc-t 22717313  T
Q  309 ttgtaaagctactc--atcattatagtggaacgga 341  Q
    ||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||    
T  22717312 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcgga 22717278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 368
Target Start/End: Original strand, 23870956 - 23871047
Alignment:
Q  277 agacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtca 368  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||  |||||||||||    
T  23870956 agacttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttactcatca-tatagtgaaacggagggttgctctctcccttagattaggtca 23871047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 394
Target Start/End: Original strand, 45679778 - 45679905
Alignment:
Q  265 aattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactca-tcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagatt 362  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||| |    
T  45679778 aattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagact 45679873  T
Q  363 aggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  45679874 aggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 45679905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 21629995 - 21629948
Alignment:
Q  345 ctgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaa 393  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  21629995 ctgctctctccccagattaggtca-tattggactgaactgggtcaacaa 21629948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 296
Target Start/End: Original strand, 38190997 - 38191083
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactca 296  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  38190997 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgagtagaattaagtttgaagactgattcttgtaactca 38191083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 41303228 - 41303088
Alignment:
Q  198 tttaccttgg-gaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagatt-gagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactc 295  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||| | ||||||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |||| ||||||      
T  41303228 tttaccttggagaaaaattattaggattaagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattatgtttgaagactgattcatgtaacct 41303129  T
Q  296 attcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaac 338  Q
     ||   ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41303128 tttggaatct--tttgtaaagttactcatcattatagtggaac 41303088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 30261936 - 30261830
Alignment:
Q  228 tctcttggttacgagaagagattgag-actttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatca 326  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||| || |||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| || |||    ||||||||||  ||||||||    
T  30261936 tctcttgattacgggaagaaattcaggactttgggtagaattaggtttcaagactaattcttgtaactctttgata----ttttgtaaagaaactcatca 30261841  T
Q  327 ttatagtggaa 337  Q
    || ||||||||    
T  30261840 ttgtagtggaa 30261830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 34575308 - 34575208
Alignment:
Q  194 ttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagatt-gagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||  || ||| ||||| | ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  34575308 ttgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtctcgggaa-agattcgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttata 34575210  T
Q  292 ac 293  Q
    ||    
T  34575209 ac 34575208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 275
Target Start/End: Original strand, 7502990 - 7503058
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaga-ttgagactttgcgtaaaattaggtttg 275  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| | | ||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  7502990 gaaacactattaggattgagtatcttggtcaagggaagagatttgagactttgggtagaattatgtttg 7503058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 236
Target Start/End: Original strand, 38020258 - 38020302
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggt 236  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  38020258 ggttgattcaccatggtaaacactattaggattgagtctcttggt 38020302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 179 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 16034 - 15759
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||    |||    
T  16034 acactagggttgaggttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgagag 15936  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggac 377  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||    
T  15935 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggac 15836  T
Q  378 tgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataact 458  Q
     |||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||| || ||    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  15835 cgaactgggtaaacaaattttgtgtgttatctctttctttctcccgttg----ttttctacttttgtttgtgtttataact 15759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 179 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 1855 - 1617
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||    
T  1855 acactagggttgtggttgattcaccttgggaaacacaattaggattgagtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggag 1757  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggac 377  Q
    | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||| | |||||||||||| |||    
T  1756 agttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgtagggctgctctctcccccatactaggtcagtttttgac 1657  T
Q  378 tgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttcttt 417  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1656 cgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttcttt 1617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 139)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 179 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 561987 - 561710
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||    
T  561987 acactagggttcaggttgattcacattgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggtg-ggag 561889  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc--ccagattaggtcagttttgga 376  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  561888 acttattcttgtaagtcattgatatcttttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctctccctccagactaggtcagttttgga 561789  T
Q  377 ctgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttct-ttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataact 458  Q
    | |||| ||||||||||| |||  |||| |||||||||| |||||||| ||    |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  561788 ccgaaccgggtaaacaaatttcacgtgttctctctttctcttctctcgatg----ttttctacttttgcttgtgtttataact 561710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 179 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 13420395 - 13420186
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||    
T  13420395 acactagggttgag-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-ggag 13420298  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggact 378  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  13420297 acttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcattattataatggaacggagagctgctctctcaccagactaggtcagttttggacc 13420198  T
Q  379 gaactgggtaaa 390  Q
    ||| ||||||||    
T  13420197 gaaatgggtaaa 13420186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 179 - 458
Target Start/End: Original strand, 31151392 - 31151667
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| |||||||   || |    
T  31151392 acaccagggttggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggtg 31151490  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggac 377  Q
    ||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  31151491 acttattcttgtaaccc--tgatatctcttttgtaaagttactcattgttatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagttttgggc 31151588  T
Q  378 tgaactgggtaaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataact 458  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||| |||||||  ||||||||||||   |||||||||  ||  ||||||||||||||    
T  31151589 tgaactgggtaaacaaattctcatgtgttctctcttcttttctctcgctg---tttttctactcttacttgtgtttataact 31151667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 193 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 28761625 - 28761424
Alignment:
Q  193 gttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaa 292  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||  ||| |||||||   ||| ||||||||||||||    
T  28761625 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagatattgagactttaggtagaattaggcg-ggatacttattcttgtaa 28761527  T
Q  293 ctcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaac 391  Q
    | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  28761526 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaattttggatcgaactgggtaaac 28761427  T
Q  392 aaa 394  Q
    |||    
T  28761426 aaa 28761424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 194 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 36871497 - 36871234
Alignment:
Q  194 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaac 293  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  36871497 ttgattcaccttggaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaac 36871398  T
Q  294 tcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaaca 392  Q
     | ||  |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  36871397 cctttgttatctc-tttgtaaagttaatcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacg 36871299  T
Q  393 aaattcgtgtgtgctctcttt-ctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataactg 459  Q
    || ||||||||| ||||||||  ||||||||||||| || | |||   |||| |||||||||||||||    
T  36871298 aatttcgtgtgttctctctttattttctctcgctgttttctatct---tttgcttgtgtttataactg 36871234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 191 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 53915694 - 53915430
Alignment:
Q  191 tggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  53915694 tggttgatttaccttgtgaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 53915596  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  53915595 aacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatt-tagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttt-gactgaactgggtca 53915498  T
Q  390 acaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgttt-gtttgtgtttataa 456  Q
    ||||| | |  ||||| |||||||  ||||||||||||| | |||||||| ||| | ||||||||||||    
T  53915497 acaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgt-tgttttctacttttggcttgtgtttataa 53915430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 30005901 - 30006101
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  30005901 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 30005999  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||||||| || |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||  ||||||| ||||||||| ||    
T  30006000 actcattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccctagattagatca-atttggaccgaactgggtcaa 30006097  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  30006098 caaa 30006101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 192 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 53917861 - 53917598
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  53917861 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 53917763  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||    
T  53917762 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaa 53917665  T
Q  391 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgttt-gtttgtgtttataa 456  Q
    |||| | |  ||||| |||||||  ||||||||||||| | |||||||| ||| | ||||||||||||    
T  53917664 caaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgt-tgttttctacttttggcttgtgtttataa 53917598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 145 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 1620707 - 1620434
Alignment:
Q  145 aaactagggtttt-agagatttctctaagagagagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgaga 243  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | | ||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| ||| ||    
T  1620707 aaactagggtttagagagatttctctaggcgggagacactagggttgggattgattcaccttggaaaacactattaggattaggtcttttggtcacggga 1620608  T
Q  244 agagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatg 343  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||  |||||||||| | || ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  1620607 agagattgggactttgggtagaattaggtttgaaggctagttcttgtaaccctttgatatctc-tttgtaaacttactcatcattatagtggaacggagg 1620509  T
Q  344 actgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttcttt 417  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  |||| ||| |||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  1620508 gctgctctctcccctagactaggtcagtattggaccaaactaggtgaacaaactttgtgtgttctctcattcttt 1620434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 275 - 420
Target Start/End: Original strand, 24181522 - 24181668
Alignment:
Q  275 ggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc-ccagattaggtcagtttt 373  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  24181522 ggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcctccaaactaggtcagtttt 24181621  T
Q  374 ggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctc 420  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  24181622 ggaccgaattgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctc 24181668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 179 - 423
Target Start/End: Original strand, 53597283 - 53597528
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| |||| ||| |||||||    |||    
T  53597283 acactagggttgaagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaatagattgagattttgagtagaattagg-caagag 53597381  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtcagttttggac 377  Q
    ||||||||||||||| | || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| || | ||||||||| ||||||    
T  53597382 acttattcttgtaacccgttgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagggttgctctctcccacaaactaggtcagtattggac 53597481  T
Q  378 tgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctct-ctttctttctctcg 423  Q
     ||| ||||||| | || ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  53597482 cgaattgggtaagctaatttcgtgtgttctctcctttctttctctcg 53597528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 45882999 - 45883200
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  45882999 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 45883097  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc--agattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||||||  ||||||| ||||||||| |    
T  45883098 actcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctccccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 45883195  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  45883196 acaaa 45883200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 179 - 423
Target Start/End: Original strand, 23633503 - 23633743
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   | ||    
T  23633503 acactagggttggggttgatttacc--gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cggaag 23633599  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggact 378  Q
    ||||||||||||||| |  | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||| |||     
T  23633600 acttattcttgtaacccgatgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtgaaaaggagggctgctctctccccagactaggtca-atttagacc 23633697  T
Q  379 gaactgggtaaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcg 423  Q
    ||| |||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  23633698 gaaatgggtaaacaaattcttttgtgttctctctttctttctctcg 23633743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 185 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 14634647 - 14634406
Alignment:
Q  185 gggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttat 284  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| ||    
T  14634647 gggttgagattgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggtagcattaggtttgaagactgat 14634548  T
Q  285 tcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctc-tccccagattaggtcagttttggactgaact 383  Q
    ||||||||  | || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  |||| ||  |||| ||||| ||| || ||| |||||    
T  14634547 tcttgtaaacctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggaacggatggctaatctcatcagcagactaggttagtattagaccgaact 14634448  T
Q  384 gggtaaacaaa-attcgtgtgtgctctctttctttctctcgc 424  Q
     ||||||||||  ||||| | | |||||||||||||||||||    
T  14634447 aggtaaacaaattttcgtattttctctctttctttctctcgc 14634406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 194 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 53468651 - 53468495
Alignment:
Q  194 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaac 293  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  53468651 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacggggagagattgggactttgggtaaaattagg-cgggagacttattcttgtaac 53468553  T
Q  294 tcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctct 351  Q
     |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  53468552 ccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctct 53468495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 192 - 422
Target Start/End: Original strand, 3314744 - 3314974
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  3314744 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtaaaattagg-cgggagacttattcttgta 3314842  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  3314843 acccattgatatctcttttgtaaaattattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 3314941  T
Q  391 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctc 422  Q
    |||| | |  ||||| ||||||| |||||||||    
T  3314942 caaattcttttgtgttctctcttcctttctctc 3314974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 4308478 - 4308278
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  4308478 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 4308380  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  4308379 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 4308282  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  4308281 caaa 4308278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10956224 - 10956024
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  10956224 ggttgattcaccttgggaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 10956126  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc-ccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||||||| || |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  10956125 actcattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 10956028  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  10956027 caaa 10956024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 27101378 - 27101178
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| || ||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  27101378 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagaatgggactttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgta 27101280  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| |||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||| | ||    
T  27101279 acccattgatatctcttttgcaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccagaataggtca-atttggaccgaactggatcaa 27101182  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  27101181 caaa 27101178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Original strand, 29956746 - 29956907
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  29956746 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 29956844  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc 355  Q
    ||||||| || |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  29956845 actcattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcc 29956907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 192 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 28102199 - 28102035
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  28102199 ggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 28102101  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccca 358  Q
    || |||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28102100 acccattgatatctcttttgtaaagttacttatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccca 28102035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 192 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 5926961 - 5926701
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  5926961 ggttgattcgccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 5926863  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| |||| |||||||||| | ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  5926862 acccatttatatatcttttgtaaggttactcatca-tataatgaaacggatgactgctctctcccgcagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 5926765  T
Q  391 caaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataa 456  Q
    |||| |   ||||| |||| || ||||||||| | || | |||||||| |||| ||||||||||||    
T  5926764 caaattctttgtgttctcttttcctttctctctc-gt-tgttttctacttttgcttgtgtttataa 5926701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 179 - 458
Target Start/End: Original strand, 17795306 - 17795581
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||| |||||||   | ||    
T  17795306 acactagggttg-ggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcg-gaag 17795403  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggac 377  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||| ||| |||||||  |||| ||    
T  17795404 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaaggctgctctctcccctagactaggtca-atttgaac 17795502  T
Q  378 tgaactgggtaaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataact 458  Q
     ||| | |||||||||| | || ||||| ||||||||| ||||||||| ||    |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  17795503 cgaattaggtaaacaaattctcttgtgttctctctttcttttctctcgttg----ttttctacttttgtttgtgattataact 17795581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 179 - 458
Target Start/End: Original strand, 19103746 - 19104021
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||| |||||||   | ||    
T  19103746 acactagggttg-ggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcg-gaag 19103843  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggac 377  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||| ||| |||||||  |||| ||    
T  19103844 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaaggctgctctctcccctagactaggtca-atttgaac 19103942  T
Q  378 tgaactgggtaaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataact 458  Q
     ||| | |||||||||| | || ||||| ||||||||| ||||||||| ||    |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  19103943 cgaattaggtaaacaaattctcttgtgttctctctttcttttctctcgttg----ttttctacttttgtttgtgattataact 19104021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 192 - 427
Target Start/End: Original strand, 43226145 - 43226378
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  43226145 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 43226243  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  43226244 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 43226341  T
Q  391 caaaattcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgt 427  Q
    | |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  43226342 c-aaattcttgtgttctctcttccttttctctcgctgt 43226378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 1313469 - 1313669
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  1313469 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 1313567  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    |  |||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  1313568 atccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 1313665  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  1313666 caaa 1313669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 25533502 - 25533702
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  |||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  25533502 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 25533600  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  25533601 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggactgaactgggtcaa 25533698  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  25533699 caaa 25533702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 38890100 - 38890300
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  38890100 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 38890198  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||| | | |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  38890199 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccctatactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 38890296  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  38890297 caaa 38890300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 51727204 - 51727004
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||  |||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  51727204 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggtaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 51727106  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||| ||    
T  51727105 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaa 51727008  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  51727007 caaa 51727004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 179 - 459
Target Start/End: Original strand, 25635428 - 25635704
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   | ||    
T  25635428 acactagggttgggattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cggaag 25635526  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggac 377  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||| || |  ||||||||||||  |  |||| ||  |||||||    
T  25635527 acttattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcattatggtgaaacagagggttgctctctcccctcggctaggcca-atttggac 25635625  T
Q  378 tgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctc-tctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataactg 459  Q
      ||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||| ||    |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  25635626 caaactgcgtaaacaaatttcgtgtgttctcttctttctttcactcgttg----ttttctacttttgcttgtgtttataactg 25635704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 192 - 353
Target Start/End: Original strand, 36011887 - 36012046
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  36011887 ggttgattcacgttgggaaacactattaggattgaatatcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaatta-gttgggagacttattcttgta 36011985  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct 353  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || | |||||||||    
T  36011986 acccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacagagggctgctctct 36012046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 192 - 422
Target Start/End: Original strand, 6231861 - 6232088
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| || |||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  6231861 ggttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 6231958  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  6231959 acccattgatatctcttttgtaaagctactcatcattacagt-gaacggagggctgctgtctccccccgattaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 6232056  T
Q  391 caaaattcgtgtgtgctctct-ttctttctctc 422  Q
    | |||||| | |||| ||||| |||||||||||    
T  6232057 c-aaattcttttgtgttctctcttctttctctc 6232088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10958520 - 10958320
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||  ||| |||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  10958520 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgacactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 10958422  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||||||| || |||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  10958421 actcattgatttctcttttgtaacgttactcttca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 10958324  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  10958323 caaa 10958320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 9604804 - 9604641
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  9604804 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 9604706  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  9604705 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccc 9604641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 192 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 25688358 - 25688164
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  25688358 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 25688260  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaa-gctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggt 387  Q
    || |||| |||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| |||||||||    
T  25688259 acccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggt 25688164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 192 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 43423660 - 43423426
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||   | |||||||||||||||    
T  43423660 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgta 43423562  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||  ||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  43423561 actcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaactgagagctgctctctccctgagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 43423464  T
Q  391 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgt 427  Q
    |||| | |  ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  43423463 caaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgt 43423426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 746817 - 747017
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  746817 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 746915  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |    
T  746916 aacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggaggactgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 747012  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  747013 acaaa 747017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 192 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 1626880 - 1626651
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||| ||||| |   |||||||||||||||||    
T  1626880 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggggagagattgggactttgggtagaattaag-cgggagacttattcttgta 1626782  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctc-cccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||| |||||| |||||| | ||||||| ||||| ||| ||    
T  1626781 acccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcgcccagactaggtc-gatttggaccgaactaggtcaa 1626684  T
Q  391 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctc 422  Q
    |||| | |  ||||| ||||||| |||||||||    
T  1626683 caaattcttttgtgttctctcttcctttctctc 1626651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 192 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 18099367 - 18099139
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  18099367 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 18099269  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || ||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||  | ||||| ||||||||| ||    
T  18099268 acccattgatttctcttttgtaacattactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atatggaccgaactgggtcaa 18099171  T
Q  391 caaaattcgtgtgtgctctc-tttctttctctc 422  Q
    | |||||| | |||| |||| ||||||||||||    
T  18099170 c-aaattcttttgtgttctcttttctttctctc 18099139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 194 - 357
Target Start/End: Original strand, 18162725 - 18162887
Alignment:
Q  194 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaac 293  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18162725 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgtaac 18162823  T
Q  294 tcattcatatctcttttgtaaa-gctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
     |||| |||| | ||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  18162824 ccattgatatttattttgtaaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 18162887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 1321539 - 1321739
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  1321539 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 1321637  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  1321638 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 1321735  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  1321736 caaa 1321739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 5522823 - 5522624
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  5522823 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 5522725  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  5522724 acccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccgcagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 5522628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 6484420 - 6484620
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||| ||| |||||||   ||| |||||||||||||    
T  6484420 ggttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggttacgggaagagattggggttttgggtagaattagg-cgggaaacttattcttgta 6484518  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  6484519 acccattgatatcttttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 6484616  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  6484617 caaa 6484620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 42990364 - 42990564
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  42990364 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 42990462  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||||||| || |||||||||||| | ||||||||| ||| ||| | |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  42990463 actcattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatggtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 42990560  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  42990561 caaa 42990564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 43228351 - 43228551
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  43228351 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgta 43228449  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||| | ||    
T  43228450 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactggatcaa 43228547  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  43228548 caaa 43228551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 51943431 - 51943630
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||  ||| |||||||   |||||||| ||||||||    
T  51943431 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-cgggagactt-ttcttgta 51943528  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||||||| |  |||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  51943529 actcattgacgtctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctcccccatactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 51943626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Original strand, 24979767 - 24979931
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  24979767 ggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgagactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgta 24979865  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaa-gctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    ||  ||| |||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24979866 acaaattaatatcttttttgtaaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctcccc 24979931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 32264236 - 32264071
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||  ||  |||||| ||| ||||| |   |||||||||||||||||    
T  32264236 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctggaactttgggtagaattatgcg-ggagacttattcttgta 32264138  T
Q  292 actcattcatatctctttt-gtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    || |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  32264137 acccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccc 32264071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 192 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 43421612 - 43421378
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| |  |||| ||| ||||||    |||||||||||||||||    
T  43421612 ggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaaaagattggggatttgggtagaattagacg-ggagacttattcttgta 43421514  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  43421513 acccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 43421416  T
Q  391 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgt 427  Q
    |||| | |  ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  43421415 caaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgt 43421378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 350
Target Start/End: Original strand, 6561870 - 6562028
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  6561870 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 6561968  T
Q  292 actcattcatatctc-ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctc 350  Q
    |  |||| ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  6561969 atccattgatatctctttttgtaaggtaactcatcattatagtggagcggagggctgctc 6562028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10084586 - 10084386
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  10084586 ggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-agggagacttattcttgta 10084488  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || | || || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  10084487 acccgttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccccaagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 10084390  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  10084389 caaa 10084386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 327
Target Start/End: Original strand, 39715529 - 39715663
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||| |    
T  39715529 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgca 39715627  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcat 327  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39715628 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 39715663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 4666574 - 4666774
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggaga--cttattcttg 289  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||  ||||||||||    
T  4666574 ggttgattcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagatccttattcttg 4666672  T
Q  290 taactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    |||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| | |||  ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| | |    
T  4666673 taatccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctg--ctctccccagactaggtca-atttggaccgaactggatca 4666769  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  4666770 acaaa 4666774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 194 - 394
Target Start/End: Original strand, 11170466 - 11170664
Alignment:
Q  194 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaac 293  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||  || ||||||  ||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  11170466 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 11170564  T
Q  294 tcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaaca 392  Q
     |||| || |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||| | ||||||||| ||||    
T  11170565 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttgggccgaactgggtcaaca 11170662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 6065993 - 6065793
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  6065993 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 6065895  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||| |    
T  6065894 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggatggctgctctctcccctagactaggtcag-attggacagaactgggtca 6065798  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  6065797 acaaa 6065793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 3859588 - 3859787
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  3859588 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 3859686  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| |||||||   ||||||||| ||||||||| || | | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  3859687 acacattgatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggatcgtagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 3859783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 4104092 - 4103893
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  4104092 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 4103994  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||| ||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  4103993 acccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctatctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 4103897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 5191713 - 5191911
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   ||||||| |||||||||    
T  5191713 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagactcattcttgta 5191811  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaac 391  Q
    || |||| || |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| | || | ||| |||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||    
T  5191812 acccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcagagggctgttctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 5191908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 191 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 47149092 - 47148929
Alignment:
Q  191 tggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  47149092 tggttgattcaccttgg-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggtctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 47148995  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    ||| |||| ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  47148994 aacccattgatatctcttttgtatcgttactcatca-tatagtgaaacagaggactgctctctcccc 47148929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 880648 - 880414
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||| ||||||    ||||| |||||||||||    
T  880648 ggttgattcaccttgggaaacactattagcattgagtctcttggttacggaaagagattggggctttgggtagaattagacg-ggagagttattcttgta 880550  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  || ||| | ||||||||||||| ||| |||||||  ||||||| || |||||| ||    
T  880549 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtaaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgagctgggtcaa 880452  T
Q  391 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgt 427  Q
    |||| | |  ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  880451 caaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgt 880414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18097097 - 18096934
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  18097097 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 18096999  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    ||  ||| || || ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||    
T  18096998 acctattgatttcccttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagagctgctctctcccc 18096934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 51674963 - 51674800
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||   |||||||||||||||||    
T  51674963 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggattttggatagaattagg-cgggagacttattcttgta 51674865  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    |  |||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||| || || ||| | |||||||||||||    
T  51674864 atccattgatatctcttttgtaatgttactcatca-tatactgaaatggagggctgctctctcccc 51674800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 458344 - 458544
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  458344 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 458442  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |    
T  458443 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-gttggaccgaactgggtca 458539  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  458540 acaaa 458544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10621727 - 10621527
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  10621727 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 10621629  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| ||| ||||  |||||| ||||||||| |    
T  10621628 aacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactagctcag-attggaccgaactgggtca 10621532  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  10621531 acaaa 10621527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 387
Target Start/End: Original strand, 26720608 - 26720800
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||  | |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||| ||    
T  26720608 ggttgattcaccttgggtta-actattaggattgagtttcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattctttta 26720705  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggt 387  Q
    || | || || |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  26720706 accctttgatttctcttttgtaacgatactcatcat-atagtggaacggatgactgctctctcccctagattaggtca-atttggaccgaactgggt 26720800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 38210430 - 38210630
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  38210430 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 38210528  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    |||||||| || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||   ||||||||| ||||| | ||||||||  |||||| ||||||||| |    
T  38210529 aactcattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagagctgctctctcccccatactaggtcag-attggaccgaactgggtca 38210625  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  38210626 acaaa 38210630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 191 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 889970 - 889779
Alignment:
Q  191 tggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||| |||||||   ||||| ||||||||||    
T  889970 tggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-ttggggctttgggtagaattagg-caggagagttattcttgt 889873  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtcagttttggactgaactgg 385  Q
    ||| || | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| | ||| | |||||| |||| |||||||  ||||||| |||||||    
T  889872 aacccactgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgatttctcccgcagactaggtca-atttggaccgaactgg 889779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 7606784 - 7606585
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  7606784 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 7606686  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||  ||||||| | ||||| ||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  7606685 acacattgatttct-atttgtaacgttactcgtca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 7606589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10191506 - 10191307
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  10191506 ggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacaggaagaggctg-gactttgggtagaattagg-agggagacttattcttgta 10191409  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || | ||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||  ||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  10191408 acccgttcatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccctaagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 10191311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28413229 - 28413053
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  28413229 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 28413131  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcag 369  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  28413130 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag 28413053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 192 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 6063643 - 6063450
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  6063643 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 6063545  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggt 387  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||    
T  6063544 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggt 6063450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 192 - 456
Target Start/End: Original strand, 32219144 - 32219409
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||| | | |||||||   | ||||||||| |||||    
T  32219144 ggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttgcgggaagagattgggactttgggcagaattagg-cggaagacttatttttgta 32219242  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaa-gctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctc-cccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    || |||| |||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || | ||  ||||||| ||||||||| |    
T  32219243 acccattgatatcttttttgtaaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctctcccagactatgcca-atttggaccgaactgggtca 32219340  T
Q  390 acaaaat-tcgtgtgtgctctctt-tctttctctcgctgtcttttttctacgttt-gtttgtgtttataa 456  Q
    ||||| | |  ||||| ||||||| | ||||||||||||| | |||||||| ||| | ||||||||||||    
T  32219341 acaaattcttttgtgttctctcttctttttctctcgctgt-tgttttctacttttggcttgtgtttataa 32219409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 455967 - 456167
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  455967 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 456065  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| |||||| |  |||||| ||||||||| |    
T  456066 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtc-gggttggaccgaactgggtca 456162  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  456163 acaaa 456167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 25388966 - 25389165
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   |||||| |||||||||    
T  25388966 ggttgattcaccttgg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacatattcttgt 25389063  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |    
T  25389064 aacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 25389160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 35918140 - 35917978
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||||   |||||||||||||||||    
T  35918140 ggttgattcaccttgcgaaacactattagaattgagtctcttggttacgagaagagactgggaatttgggtagaaatagg-agggagacttattcttgta 35918042  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc 356  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||   ||||||||||||    
T  35918041 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatta-tatagtggaacggagagctgctctctccc 35917978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 191 - 343
Target Start/End: Original strand, 54884214 - 54884364
Alignment:
Q  191 tggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||| ||||||  || |||||||   ||||||||||| ||||    
T  54884214 tggttgattcatcttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgaaactttgaatagaattaggag-ggagacttatt-ttgt 54884311  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatg 343  Q
    ||   ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54884312 aatctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatg 54884364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22114502 - 22114368
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || || |||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  22114502 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggattttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 22114404  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcat 327  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||||    
T  22114403 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 22114368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 179 - 417
Target Start/End: Original strand, 1674019 - 1674248
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||| ||||||| ||| || |||    ||||    
T  1674019 acactagggttaggattgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattgggactttgggtagaaatagacg-ggag 1674117  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc-ccagattaggtcagttttggac 377  Q
    |||||||| |||||| | || |||| |||||||||||| ||||     ||    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || |||    
T  1674118 acttattcgtgtaaccctttgatatgtcttttgtaaagttact-----tt----tggaacggatggctgctctctccaccagactaggtcagtattagac 1674208  T
Q  378 tgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttcttt 417  Q
     |||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||    
T  1674209 cgaactgggtaaacaaattttgtgtattctctctttcttt 1674248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 50494059 - 50494259
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||| |||||||   | ||||||||||||||    
T  50494059 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagggattgggactttgggtagaattagg-cggaagacttattcttgt 50494157  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |    
T  50494158 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 50494254  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  50494255 acaaa 50494259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Original strand, 53591244 - 53591418
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||| ||| |||||||   |||||||||||||| ||    
T  53591244 ggttgattcaccttgggaaacactattcgaattgagtctcttggttacgagaatagatttggattttgggtagaattagg-cgggagacttattcttcta 53591342  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtca 368  Q
    |  |||| ||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |||| | |  ||||||||||||||| |||||||    
T  53591343 atccattgatatctcatttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacgaagggatgctctctccccagactaggtca 53591418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 181 - 423
Target Start/End: Original strand, 7768619 - 7768861
Alignment:
Q  181 actagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagac 280  Q
    |||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||| |   | ||||  |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  7768619 actaaggttgagattgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgctcacgggctaaaattggaactttgagtagaattaggtttgaagac 7768718  T
Q  281 ttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactg 379  Q
    | |||||||||||   || ||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||||||| | |  | ||| |||||| | | ||||||||| |||||  |    
T  7768719 taattcttgtaaccttttaatataccttt-gtaaagttactcattattatagtggaacgaagggttactccctcccccatactaggtcagtattggatcg 7768817  T
Q  380 aactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcg 423  Q
    || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  7768818 aattgggtaaaaaaaattcgtgtcttctctctttctttctctcg 7768861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 192 - 298
Target Start/End: Original strand, 35777481 - 35777587
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  35777481 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 35777579  T
Q  291 aactcatt 298  Q
    ||||||||    
T  35777580 aactcatt 35777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 193 - 394
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886458
Alignment:
Q  193 gttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaa 292  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  5886261 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 5886358  T
Q  293 ctcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaac 391  Q
    | |||| || | || |||| || | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||    
T  5886359 cccattgatttgtc-tttgaaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 5886455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 193 - 394
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5899931
Alignment:
Q  193 gttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaa 292  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| | ||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  5899734 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 5899831  T
Q  293 ctcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaac 391  Q
    | |||| || |||| |||| || | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||    
T  5899832 cccattgatttctc-tttgcaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 5899928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 192 - 339
Target Start/End: Original strand, 15780931 - 15781081
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||  ||| |||||||   | |||||||||||||||    
T  15780931 ggttgattcaccttgggaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttcggtagaattagg-cggaagacttattcttgta 15781029  T
Q  292 actcattcata----tctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacg 339  Q
    || |||| |||    |||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  15781030 acccattgatatatttctcttttgtaaagttatttatcattatagtggaacg 15781081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 196 - 357
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168324
Alignment:
Q  196 gatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactc 295  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||  || || |||| ||| |||||||    |||||||||||||||||| |    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattagg-cgagagacttattcttgtaaccc 11168263  T
Q  296 attcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    ||| || |||||||||||| | |||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  11168264 attgatttctcttttgtaacgttacttatca-tatattggaacggagggctgctctctcccc 11168324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 276 - 456
Target Start/End: Original strand, 25634030 - 25634207
Alignment:
Q  276 gagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc-ccagattaggtcagttttg 374  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||  ||||    
T  25634030 gagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaatggctgctctctccaccagactaggaca-atttg 25634128  T
Q  375 gactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctct-ctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataa 456  Q
     || ||||| |||||||||| || |||||| |||| ||||||| |||| | ||    |||||||| |||| ||||||||||||    
T  25634129 caccgaactaggtaaacaaattttgtgtgttctctcctttcttactcttgttg----ttttctacttttgcttgtgtttataa 25634207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 54691771 - 54691608
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||  | ||||| ||  |||||||   |||||||||||||||||    
T  54691771 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaattttttggttatgggaagagattagggctttgagttgaattagg-cgggagacttattcttgta 54691673  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
      ||||| ||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||  |||||| | |||||||||||||    
T  54691672 tttcattgatatctcttttgtaacgttacccatca-tatagttaaacggagggctgctctctcccc 54691608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1618933 - 1618825
Alignment:
Q  119 aaaacaagagtttataaacaaacaataaactagggttt-tagagatttctctaagagagagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactat 217  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||    
T  1618933 aaaacaagggtttagaaacaaacaacaaactagggtttatagagatttctctaaacgggagacactagggttgggattgattcaccttggaaaacactat 1618834  T
Q  218 taggattga 226  Q
    || ||||||    
T  1618833 tatgattga 1618825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 179 - 315
Target Start/End: Original strand, 23637070 - 23637205
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | | | ||||| |||  ||||||| ||| |||||||   ||||    
T  23637070 acactagggtttgggttgatttaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgttcatgggaagatattaggactttgggtagaattagg-cgggag 23637168  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaa 315  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  23637169 acttattcttgtaacccattgatatctcttttataaa 23637205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 47878350 - 47878170
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||    
T  47878350 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 47878256  T
Q  312 taaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctctcc-ccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||||||    
T  47878255 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaa 47878170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 192 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12268161 - 12268059
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  12268161 ggttgattcaccttcggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 12268063  T
Q  292 actc 295  Q
    ||||    
T  12268062 actc 12268059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Original strand, 16996875 - 16997060
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| |||  |||| |||| || |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| ||  | |||||||||    
T  16996875 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacggaaagaaattggga-tttgggtagaattaggtttgaagactaattcttataattctctaatatctctt 16996973  T
Q  309 ttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |   ||||  || ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  16996974 tgtaaaagaaacacatcattatagtggaacggagaactgctcactcccccagactaggtaagtatgggactgaactgggtaaacaaa 16997060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 210 - 355
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3306983
Alignment:
Q  210 aacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttt 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||    |||| ||| |||||||   ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  3306839 aacactattaggattgagtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcg-ggagagttattcttgtaacccattgatatctcttt 3306937  T
Q  310 tgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc 355  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||    
T  3306938 tgtaaagttactcatcattatagtgaaaaggatggttgctctctcc 3306983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10100273 - 10100091
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||| |    
T  10100273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 10100179  T
Q  309 ttgtaaagctactca-tcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  10100178 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 10100091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11007956 - 11007844
Alignment:
Q  114 gtctcaaaacaagagtttataaacaaacaataaactagggttttagaga--tttctctaagagagagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaa 211  Q
    |||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||    
T  11007956 gtctgaaagcaagggtttagaaacaaacaacaaactagggttttagagagttttctctaagcgggagacacaagggttgtgagtgattcaccttgggaaa 11007857  T
Q  212 cactattaggatt 224  Q
    |||||| ||||||    
T  11007856 cactatcaggatt 11007844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 29914132 - 29913954
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||    
T  29914132 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 29914038  T
Q  312 taaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  |||||||||||||||||| || |   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  29914037 taaagaaactcatcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 29913954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 48361868 - 48361668
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| | ||||  ||| |||||||   | |||||| ||||||||    
T  48361868 ggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattggggcttttggtagaattagg-cggaagactttttcttgta 48361770  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||||||| | |||||||||| || | ||||||| | ||||||  ||||||   ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||  ||||||||| ||    
T  48361769 actcattgacatctcttttgcaacgttactcat-aatatagtaaaacggagagctgctctctcccccagactaggtca-atttggatcgaactgggtcaa 48361672  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  48361671 caaa 48361668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Original strand, 54188512 - 54188691
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||| |    
T  54188512 cactattagaattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-g 54188606  T
Q  312 taaagctactcat--cattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  ||||||  |||||||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  54188607 taaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 54188691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 275 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 47701786 - 47701693
Alignment:
Q  275 ggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtca 368  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  47701786 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagattaggtca 47701693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10094256 - 10094074
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||| |    
T  10094256 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 10094162  T
Q  309 ttgtaaagctactca-tcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  10094161 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 10094074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 253 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 46966787 - 46966647
Alignment:
Q  253 gactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctc 352  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||   || |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||   |||| |||    
T  46966787 gactttgggtagaattaggtttgaagactaattattgtaaccatttgatatctcttt-gtaaagaaactcatcattatagtggaacagagagctgccctc 46966689  T
Q  353 tccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||    
T  46966688 tccccagagtaggtcaatattggactgaattggataaacaaa 46966647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Original strand, 10897008 - 10897188
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||    
T  10897008 cactattaggattgattctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 10897102  T
Q  312 taaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  10897103 taaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 10897188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 27635773 - 27635655
Alignment:
Q  275 ggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagtttt 373  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  |||    
T  27635773 ggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-attt 27635676  T
Q  374 ggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||| ||||||||| ||||||    
T  27635675 ggaccgaactgggtcaacaaa 27635655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 27762165 - 27761985
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||| ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||    
T  27762165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 27762071  T
Q  312 taaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||||||||  || ||||| | ||||| | |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  27762070 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagaaccgctctatcccccaaactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 27761985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 179 - 337
Target Start/End: Original strand, 13419926 - 13420084
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||  |||||||| | | |||| ||| |||| |||| | ||    
T  13419926 acactagggttgggattgattcaccttgggaaacactattaggatcaagtctcttggtcacggaaagagattcaaattttgggtagaatttggttggaag 13420025  T
Q  279 acttattcttgtaac-tcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaa 337  Q
    | | ||| ||||||| |  || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13420026 aataatttttgtaacatttttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaa 13420084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22626166 - 22625983
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||   |||||| |    
T  22626166 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaaaactgattcttgaaactcat---tatctc-t 22626072  T
Q  309 ttgtaaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  22626071 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagaactgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 22625983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 217 - 394
Target Start/End: Original strand, 4535622 - 4535798
Alignment:
Q  217 ttaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaag 316  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| || || | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| |||||||||    
T  4535622 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggaattgg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttgtaaag 4535716  T
Q  317 ctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctctc--cccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
      ||||  |||||||||||||||| ||   ||||||||||  |||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  4535717 aaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcctcccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 4535798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10201136 - 10200954
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||| |    
T  10201136 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 10201042  T
Q  309 ttgtaaagctactca-tcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||| ||||  ||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  10201041 ttggaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 10200954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10208182 - 10208000
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||| |    
T  10208182 aaacactattacgattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 10208088  T
Q  309 ttgtaaagctactca-tcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||| |||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  10208087 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccgcagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 10208000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Original strand, 27544273 - 27544455
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||  ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||| |    
T  27544273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagcgtg-gaacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 27544367  T
Q  309 ttgtaaagctactca-tcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||| |||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  27544368 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccctcagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 27544455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10595213 - 10595033
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||  |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||   |||||||||| |    
T  10595213 cactattaggattaagtctcttggtcacgggaagaggctgagacttgg-gtagaattaggtttgaagactgattcttataactca---atatctcttt-g 10595119  T
Q  312 taaagctactcat--cattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  ||||||  |||||||||||||||||   ||||||||| ||||| | |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  10595118 taaagaaactcatgtcattatagtggaacggagagctgctctctcccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 10595033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 11007683 - 11007538
Alignment:
Q  221 gattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctac 320  Q
    |||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||          ||||||||||| || | ||||||||||||||| |||    
T  11007683 gattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttgggtagaattaggttt----------tcttgtaactctttgacatctcttttgtaaagttac 11007594  T
Q  321 tcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttgg 375  Q
    ||||||||||||||||| ||  | || |||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  11007593 tcatcattatagtggaatggggggctcctctctcccctagactaggtcagtattgg 11007538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Original strand, 54193229 - 54193409
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||    
T  54193229 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 54193323  T
Q  312 taaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  || |  |||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  54193324 taaagaaacccatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 54193409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 392
Target Start/End: Original strand, 13893470 - 13893644
Alignment:
Q  217 ttaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaag 316  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |  ||||||| |||||||||    
T  13893470 ttagaattgagtctcttggtcacgggaagagattgagac-ttgggtaaaattaggtttgaagactgattcttgtaac-cctcaatatctc-tttgtaaag 13893566  T
Q  317 ctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaaca 392  Q
      ||||  |||||||||||||||| ||   || |||||| ||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||||    
T  13893567 aaactcatatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagagtaggtcattattagac-gaactgggtaaaca 13893644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 394
Target Start/End: Original strand, 11066652 - 11066850
Alignment:
Q  194 ttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagatt-gagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| || ||| |||||||||    
T  11066652 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgaatcttttgatcacgggaagagattcgggactttgggtagaattaggttt-gaaactgattcttgta 11066750  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaac 391  Q
    |  ||||   |  | ||||||| || |||||||||||||||||||||  |   |||||||||  ||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  11066751 a-acatttgga-atgttttgtatagttactcatcattatagtggaacatagagctgctctct-tccagagtaggtcagtattgaaccgaactgggtaaac 11066847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 31021286 - 31021130
Alignment:
Q  266 attaggtttggagacttattcttgtaactc-attcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattag 364  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |  || | ||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||| | |||||||| ||||||| |||    
T  31021286 attaggtttgaagactaattcttgtaacccttttaacatctc-tttgtaaagttactcatcattata-ttgaacggagggctgctctcaccccagactag 31021189  T
Q  365 gtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcg 423  Q
    |||||| | |||  ||||| |||||| |||||||||||   |||||| ||| |||||||    
T  31021188 gtcagtataggatcgaactaggtaaaaaaaattcgtgttctctctctctctctctctcg 31021130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 10612957 - 10612761
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    |||||||| |||||| | ||||||| ||| ||||||  || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||   |||||||||| |    
T  10612957 cactattaagattgagtttcttggtcacgggaagaggctgggacttgg-gtagaattaggtttgaagactgattcttataactca---atatctcttt-g 10612863  T
Q  312 taaagctactcat--cattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctc 408  Q
    |||||  ||||||  |||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  10612862 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaac-aaattcttgtgttctc 10612764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 357
Target Start/End: Original strand, 11079517 - 11079662
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||| ||  || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| |    
T  11079517 aaacactatcaggattgagtctcttggtcacgggaaaaggctgggacttag-gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 11079611  T
Q  309 ttgtaaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  11079612 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccc 11079662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20031497 - 20031316
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||   ||||||| ||||    
T  20031497 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgg-gtaaaattaggtttgaagaccgattcttgtaactca---atatctc-tttg 20031403  T
Q  312 taaagctactc--atcattatag-tggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  ||||  |||||||||| |||||||||   ||||||||||||| ||| |||||||   ||  || ||||||||||||||||    
T  20031402 taaagaaactcatatcattatagttggaacggagagctgctctctccccaagactaggtcatcattaaaccgaactgggtaaacaaa 20031316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 28137501 - 28137424
Alignment:
Q  194 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattagg 271  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||    
T  28137501 ttgattcaccttgggaaacactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 28137424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 28100238 - 28100143
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattctt 288  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||   ||||||||||||||    
T  28100238 ggttgattcaccttggaaaacgctattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 296
Target Start/End: Original strand, 28181082 - 28181185
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||||   |||||| ||||||| ||    
T  28181082 ggttgattcactttgggaaacaccattaggattgagtctattggttacgggaagagattgggactttggatagaattagg-cgggagacgtattcttata 28181180  T
Q  292 actca 296  Q
    |||||    
T  28181181 actca 28181185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 357
Target Start/End: Original strand, 6303310 - 6303454
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||| |    
T  6303310 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtatagttaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 6303404  T
Q  309 ttgtaaagctactca-tcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  6303405 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccc 6303454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10949438 - 10949259
Alignment:
Q  213 actattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgt 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||  |||| | ||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| |||||    
T  10949438 actattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggaacttgg-gttgaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttgt 10949344  T
Q  313 aaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||  ||||  ||||||||| |||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  10949343 aaagaaactcatatcattataatggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagactgaactggataaacaaa 10949259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 47883064 - 47882978
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactca 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  47883064 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca 47882978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Original strand, 7418064 - 7418246
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||| |||| |||||| ||| ||||| ||| |||||||||| ||||| || || | ||||||||| ||||| ||||||||| ||||   |||||||||    
T  7418064 aaacaccattatgattgagtctattggtcacgggaagagattgggacttggc-tagagttaggtttgaagactgattcttgtatctca---atatctctt 7418159  T
Q  309 ttgtaaagctactcat--cattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    | ||||||  ||||||  ||||| |||||||| ||   |||||||||||||| | |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  7418160 t-gtaaagaaactcatatcattagagtggaacagagagctgctctctccccatagtaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 7418246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 341
Target Start/End: Original strand, 16462203 - 16462332
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||   ||||||| |    
T  16462203 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttggaactca---atatctc-t 16462297  T
Q  309 ttgtaaagctactc--atcattatagtggaacgga 341  Q
    ||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||    
T  16462298 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcgga 16462332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 236
Target Start/End: Original strand, 24177323 - 24177380
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggt 236  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24177323 acactaaggttggggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggt 24177380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 248
Target Start/End: Original strand, 42992346 - 42992402
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaga 248  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  42992346 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaga 42992402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 15823775 - 15823646
Alignment:
Q  265 aattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctc-cccagatta 363  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| | || | ||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||| |   |||||||||| || ||| ||    
T  15823775 aattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgacatctc-tttgtaaagaaactcttcattatagtggaacgtagagctgctctctctccaagagta 15823677  T
Q  364 ggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
     |||| | |||||| ||| ||||||||||||    
T  15823676 agtcaatattggaccgaattgggtaaacaaa 15823646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 394
Target Start/End: Original strand, 42992418 - 42992530
Alignment:
Q  281 ttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactg 379  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| | || |||||| ||||||| | |||  | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| |    
T  42992418 ttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttagtcatca-tatagtgaatcggggggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccg 42992515  T
Q  380 aactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||||| ||||||    
T  42992516 aactgggtcaacaaa 42992530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 243
Target Start/End: Original strand, 25633967 - 25634031
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgaga 243  Q
    ||||||||| || | |||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  25633967 acactagggctgggattgattcaccttgggagacattattaggattgagtctcttggtcacgaga 25634031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31021356 - 31021300
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgaatctcttg 234  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  31021356 acactagggttgggattgattcaccttggagaaacactattaggattgagtctcttg 31021300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 4560481 - 4560422
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattg 251  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||  ||||||||||    
T  4560481 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagcctgttggttaccggaagagattg 4560422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 48390429 - 48390301
Alignment:
Q  265 aattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagat 361  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||| |||||  ||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||     
T  48390429 aattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttctaaagagactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagac 48390334  T
Q  362 taggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||||   ||  || ||||||||||||||||    
T  48390333 taggtcatcattaaaccgaactgggtaaacaaa 48390301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 357
Target Start/End: Original strand, 5858546 - 5858689
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||| ||| ||||||  || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| |    
T  5858546 aaacactattaggattgagtct--tggtcacgggaagaggctgggacttgg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 5858638  T
Q  309 ttgtaaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    ||||||||  ||||  |||||||||||||| | ||   |||||||||||||    
T  5858639 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgctctctcccc 5858689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 338
Target Start/End: Original strand, 38002869 - 38002995
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||| ||| ||||||  || ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| |    
T  38002869 aaacaccattaggtttgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgg-gtagaattaagtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 38002963  T
Q  309 ttgtaaagctactc--atcattatagtggaac 338  Q
    ||||||||  ||||  ||||||||||||||||    
T  38002964 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaac 38002995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 42297798 - 42297721
Alignment:
Q  256 tttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt--ttgtaaagctactcatcattata 331  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| | || |||||| ||  |||||||| ||||||||||||||    
T  42297798 tttgtgtagaattaggtttgaagactgattcttgtaaccctttgatatctttttgttgtaaagttactcatcattata 42297721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 126; Significance: 9e-65; HSPs: 105)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 179 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 24817565 - 24817289
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| || || |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||    
T  24817565 acactagggttg-ggttgattcaccttggaaagcagtattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-ggag 24817468  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggac 377  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  24817467 acttattcttgtaactcattgatgtctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccatactaggtcagttttggac 24817368  T
Q  378 tgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataactg 459  Q
     ||||| ||||||| |  ||||||||| || |||||| ||||||||| ||    |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24817367 cgaacttggtaaacgagtttcgtgtgttctgtctttcttttctctcgttg----ttttctaattttgtttgtgtttataactg 24817289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 120 - 456
Target Start/End: Original strand, 6332236 - 6332568
Alignment:
Q  120 aaacaagagtttataaacaaacaataaactagggttt-tagagatttctctaagagagagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactatt 218  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||| ||||| || ||||  |  | | |||||||| ||| | |||||| |  |||| ||||||||||    
T  6332236 aaacaagggtttataaacatacaacagactagggtttatagagtttactcttggcaacaaacactaggattgagattgattcagtttggaaaacactatt 6332335  T
Q  219 aggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagct 318  Q
    | |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |    
T  6332336 aagattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagtt 6332435  T
Q  319 actcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttcttt 417  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||    
T  6332436 actcatcattatagtggaacggaagactgttctctcccctagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct--cttt 6332533  T
Q  418 ctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataa 456  Q
    || ||||| |    ||||||| |||| ||||||||||||    
T  6332534 ctgtcgctat----tttctacttttgcttgtgtttataa 6332568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 179 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 24813710 - 24813437
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| ||||||| ||| |||||||   ||||    
T  24813710 acactagggttg-ggttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtctcttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcg-ggag 24813613  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggac 377  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24813612 acttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttactcatcattatagtggagcggatggctgctttctcccccagactaggtcagttttggac 24813513  T
Q  378 tgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataa 456  Q
     |||||||||||||||| || |||||| ||||||| | ||||||||| ||    |||||||| ||||||| |||||||||    
T  24813512 cgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctcttccttttctctcgttg----ttttctacttttgtttatgtttataa 24813437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 179 - 458
Target Start/End: Original strand, 7188616 - 7188890
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| |   ||||    
T  7188616 acactagggttggggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagattgagactttgggtagaattaag-cgggag 7188714  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctc-tccccagattaggtcagttttggac 377  Q
    ||||||| || |||| |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||  || |||||||||||||    
T  7188715 acttatttttataacccattgatatttcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacggaaggctgctctcttccccagtctatgtcagttttggac 7188814  T
Q  378 tgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataact 458  Q
    |||||| |||||||||| ||  || ||| |||||||| ||||||||||||    |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  7188815 tgaactaggtaaacaaattt--tgcgtgttctctttcttttctctcgctg----ttttctacttttgcttgtgtttataact 7188890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 192 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 20137308 - 20137074
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  20137308 ggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 20137210  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaac 391  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||    
T  20137209 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 20137111  T
Q  392 aaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgt 427  Q
    ||| | |  ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  20137110 aaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgt 20137074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 192 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 27832832 - 27832604
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  27832832 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtaaaattagg-cgggagacttattcttgta 27832734  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||| | || |||||| ||||||| ||||||| ||      |||||||||||||    
T  27832733 acccattgatatctcttctgtaaagttactcatcattatagtgaaatggagggcttctctctcccccagactaggtcaatt------tgaactgggtaaa 27832640  T
Q  391 caaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgt 427  Q
    | |||||| |||||  |||||||||||||||| ||||    
T  27832639 c-aaattcttgtgttatctctttctttctctcactgt 27832604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 192 - 458
Target Start/End: Original strand, 24748684 - 24748946
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  24748684 ggttgattcaccctgggaaacactattacgattgagtctcttggttccgggaagagattgggactttgggtagaattaggca-ggagacttattcttgta 24748782  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc-ccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| || ||    
T  24748783 acccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagattaggtca-atttggaccgaactgagtcaa 24748881  T
Q  391 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataact 458  Q
    |||| | |  ||||| |||||||| ||||||||| ||    |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  24748882 caaattcttttgtgttctctctttatttctctcgttg----ttttctacttttgtttgtgattataact 24748946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 179 - 427
Target Start/End: Original strand, 11081583 - 11081835
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||  || |||| ||||||||||||||| ||    
T  11081583 acactagggttgagattgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattaggtttgaag 11081682  T
Q  279 acttattcttgtaa--ctcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttgg 375  Q
    ||| ||||||||||  ||  || ||||||||| ||||||| |||||||| ||| | |||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||| | ||||    
T  11081683 actaattcttgtaaccctttttgatatctcttgtgtaaagttactcatctttaaaatggaacggatggttgctctctcccccagactaggtcaatattgg 11081782  T
Q  376 actgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttcttt-ctctcgctgt 427  Q
    || |||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  11081783 accgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctctttttttcctctcgctgt 11081835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 183 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20091753 - 20091583
Alignment:
Q  183 tagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagactt 282  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||    
T  20091753 tagggttggggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaatctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagactt 20091655  T
Q  283 attcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  20091654 attcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc---atagtggaacggagggctgctctctcccc 20091583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 192 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 27306429 - 27306197
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| |    
T  27306429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattagg-cgggagacttattcttgca 27306331  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||  |||||||  |||||||| ||    
T  27306330 acccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccaaactgggtcaa 27306233  T
Q  391 caaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgt 427  Q
    | |||||| ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  27306232 c-aaattcttgtgttctctcttcttttctctcgctgt 27306197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 44724669 - 44724869
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  44724669 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 44724767  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  44724768 acccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 44724865  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  44724866 caaa 44724869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 37412326 - 37412161
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  37412326 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 37412228  T
Q  292 actcattcatatctc-ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37412227 actcattgatatctctttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccc 37412161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 31435246 - 31435082
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||  |||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||    
T  31435246 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggtg-gaagacttattcttgta 31435148  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  31435147 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccc 31435082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 192 - 340
Target Start/End: Original strand, 25276231 - 25276378
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  25276231 ggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 25276329  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacgg 340  Q
    |  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25276330 aaccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgg 25276378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 194 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16296992
Alignment:
Q  194 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaac 293  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||| | |||||||||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagatttgaagattgattcttgtaac 16297123  T
Q  294 tc-attcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaac 391  Q
     |  || |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| ||| || |||||| |||||| |||||| ||||||    
T  16297122 ccttttaatatctcttttgcaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcccctagactatgtcagtattggaccgaactgtgtaaac 16297023  T
Q  392 aaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcg 423  Q
    ||| |||  ||||| ||||| |||||||||||    
T  16297022 aaatttc-cgtgtgttctctctctttctctcg 16296992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 192 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 13099675 - 13099409
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||   ||||| |||||||||||    
T  13099675 ggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagatttattcttgta 13099577  T
Q  292 actcattcatatctc-ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    || |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |    
T  13099576 acccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 13099478  T
Q  390 acaaaat-tcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtcttttttctacgttt-gtttgtgtttataa 456  Q
    ||||| | |  ||||| ||||||| | ||||||||||||| | |||||||| ||| | ||||||||||||    
T  13099477 acaaattcttttgtgttctctcttccttttctctcgctgt-tgttttctacttttggcttgtgtttataa 13099409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 192 - 422
Target Start/End: Original strand, 21990240 - 21990469
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||   |||||||| ||||||||    
T  21990240 ggttgattcaccttgagaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgagtagaattagg-cgggagactttttcttgta 21990338  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  21990339 actcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacagagggctgctctctccccaagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 21990436  T
Q  391 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctc 422  Q
    |||| | |  ||||| ||||||| |||||||||    
T  21990437 caaattcttttgtgttctctcttcctttctctc 21990469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 194 - 353
Target Start/End: Original strand, 9679151 - 9679308
Alignment:
Q  194 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaac 293  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  9679151 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 9679249  T
Q  294 tcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct 353  Q
     |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||    
T  9679250 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagtactgctctct 9679308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 20626128 - 20626328
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  20626128 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-atggagacttattcttgta 20626226  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  20626227 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 20626324  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  20626325 caaa 20626328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 20630019 - 20630219
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  20630019 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-atggagacttattcttgta 20630117  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  20630118 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 20630215  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  20630216 caaa 20630219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 20642438 - 20642638
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  20642438 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-atggagacttattcttgta 20642536  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  20642537 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 20642634  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  20642635 caaa 20642638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 192 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 42331198 - 42330964
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtt--acgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttg 289  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||    
T  42331198 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttg 42331100  T
Q  290 taactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggta 388  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| | ||  ||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||     
T  42331099 taacccattgatatctcttttgtaaagttactcatta-tatagtgaaacggagggctattctctcccccagattaggtca-atttggaccgaactgggtc 42331002  T
Q  389 aacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgt 427  Q
    ||| |||||| | |||| ||||| | | |||||||||||    
T  42331001 aac-aaattcttttgtgttctctctttctctctcgctgt 42330964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 7092411 - 7092212
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  7092411 ggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 7092313  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaac 391  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||| | |||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||    
T  7092312 acccattgatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 7092215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Original strand, 9680910 - 9681073
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   | |||||||||||||||    
T  9680910 ggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgta 9681008  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| | |||||||||||||    
T  9681009 actcattgatatatcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaatggagggctgctctctcccc 9681073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 191 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 4296134 - 4295933
Alignment:
Q  191 tggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  4296134 tggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 4296036  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    |||||||| | ||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| || | ||||| ||| ||||| | |||||||  ||||||| ||||||||| |    
T  4296035 aactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctatctcccccatactaggtca-atttggaccgaactgggtga 4295938  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  4295937 acaaa 4295933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 129 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 40281643 - 40281358
Alignment:
Q  129 tttataaacaaacaataaactagggtttt---agagatttctctaagagagagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattg 225  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  40281643 tttagaaacaaacaacaaactagggtttagagagatatttctctaagcgggagacactagggttgggattaattcaccttgggaaacaccgttaggattg 40281544  T
Q  226 aatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatc 325  Q
    | ||| ||||| ||| |||||||||||||||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| | || |       ||||||||| ||||||||    
T  40281543 agtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttga-------tttgtaaagttactcatc 40281451  T
Q  326 attatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttcttt 417  Q
     || | |||||||| | |  |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||| |||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  40281450 gttgttgtggaacgaagggatgctctctcccccagactagttcagtattggacagaactgtgtaaacaaattttgtgtgttctctctttcttt 40281358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 11355348 - 11355548
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  11355348 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 11355446  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||||||| |||||| |||||||| | | ||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||| ||| || ||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  11355447 actcattgatatcttttttgtaacgtttctcatca-tatagtggaacagagagctgctctctcccctagactatgtca-atttggaccgaactgggtcaa 11355544  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  11355545 caaa 11355548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 21592342 - 21592142
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  21592342 ggttgattcaccttggcaagcactattaggatttagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgta 21592244  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||||||| | ||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  21592243 actcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 21592146  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  21592145 caaa 21592142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 38394076 - 38394276
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  38394076 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 38394174  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  38394175 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 38394272  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  38394273 caaa 38394276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 192 - 387
Target Start/End: Original strand, 20297452 - 20297645
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| || |||| | |||||||||||||||||    
T  20297452 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaaatagg-tgggagacttattcttgta 20297550  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggt 387  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| |||||||||    
T  20297551 acccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggt 20297645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 194 - 427
Target Start/End: Original strand, 24465629 - 24465859
Alignment:
Q  194 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaac 293  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | | |||||||||| ||||||| ||| ||||||| | ||||| |||||||| ||||    
T  24465629 ttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-tgggagatttattcttttaac 24465727  T
Q  294 tcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaaca 392  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||  | || || |||||| |||||||    
T  24465728 tcattgatatgtcttttgtaaag-tactcatcattataatgaaacgggtgactgctctctcccccagactagatca-atatgaaccgaactgagtaaaca 24465825  T
Q  393 aaattcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgt 427  Q
    || |||  |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  24465826 aatttc--gtgttctctctttcttttctctcgctgt 24465859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 7470221 - 7470021
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  7470221 ggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 7470123  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | |||||| || ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  7470122 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctccctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 7470025  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  7470024 caaa 7470021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 7472179 - 7471979
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||  |||||| ||| |||||||   ||| |||||||||||||    
T  7472179 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattagg-cgggacacttattcttgta 7472081  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  7472080 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 7471983  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  7471982 caaa 7471979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 18345631 - 18345831
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  18345631 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 18345729  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||| || |||||| ||    
T  18345730 acccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgttctctcccccagactaggtca-atttggaccgagctgggtcaa 18345827  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  18345828 caaa 18345831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 20299550 - 20299750
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  20299550 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 20299648  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| |  |||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  20299649 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggttgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 20299746  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  20299747 caaa 20299750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 40836941 - 40836742
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  40836941 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 40836843  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  40836842 acccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 40836746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 48457743 - 48457943
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  48457743 ggttcattcacctagggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 48457841  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  48457842 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 48457939  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  48457940 caaa 48457943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Original strand, 3878667 - 3878830
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  3878667 ggttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 3878765  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  3878766 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccc 3878830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 7094659 - 7094466
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  7094659 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 7094561  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggt 387  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||| | |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  7094560 acccattgatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggactgaactgggt 7094466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 276 - 419
Target Start/End: Original strand, 26295620 - 26295762
Alignment:
Q  276 gagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc-ccagattaggtcagttttg 374  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||    
T  26295620 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcctccagactaggtca-atttg 26295718  T
Q  375 gactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttct 419  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||  |||||||||||||    
T  26295719 gactgaactggataaac-aaattcttgtgttatctctttctttct 26295762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 39146186 - 39146039
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  39146186 ggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggaactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 39146088  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacgg 340  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  39146087 acacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacgg 39146039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 44654 - 44854
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||| ||| ||||||| ||| ||||| | | |||||||||||||||||    
T  44654 ggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtcttttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattatg-tgggagacttattcttgta 44752  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  44753 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggatagctgctttctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 44850  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  44851 caaa 44854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 3035811 - 3036014
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacg---agaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattctt 288  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||  || ||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  3035811 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagaggctgggactttgggtagaattagg-tgggagacttattctt 3035909  T
Q  289 gtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggt 387  Q
    ||||| |||| || ||||||||| || | ||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| |||||||||    
T  3035910 gtaacccattgatttctcttttgcaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggt 3036007  T
Q  388 aaacaaa 394  Q
     ||||||    
T  3036008 caacaaa 3036014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 209 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22828815 - 22828672
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  22828815 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 22828717  T
Q  309 ttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct 353  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||| ||| || | |||||||||    
T  22828716 ttgtaaaattactcattattatagtgaaacagagggctgctctct 22828672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 35719 - 35919
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  35719 ggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 35817  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||   ||||| ||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||| | ||    
T  35818 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagagctgctttctcccctagactaggtca-atttggaccgaactggatcaa 35915  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  35916 caaa 35919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 443
Target Start/End: Original strand, 443685 - 443936
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||    ||||||||||||||||    
T  443685 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgagagacttattcttgta 443783  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct--ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    |  |||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||| | | |||||||||  |||| || |||||||  ||||||| ||||||||| |    
T  443784 atccattgatatctcttttataacgttactcatca-tatagtgaaacgaagggctgctctctcccccccgactaggtca-atttggaccgaactgggtca 443881  T
Q  390 acaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttg 443  Q
    ||||| | |  ||||| ||||||| ||||||||| ||  || |||||||| ||||    
T  443882 acaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctctcgctgttttctacttttg 443936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 179 - 425
Target Start/End: Original strand, 6048946 - 6049195
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttgga 277  Q
    |||||||| ||| | |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| |    
T  6048946 acactaggtttgggattgattcaccttgaagaaacactattaggattgaatctcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattaggtttgaa 6049045  T
Q  278 gacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcat--tatagtggaacggatgactgctc-tctccccagattaggtcagttttg 374  Q
    ||| ||||||| |||| | || ||||| | ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    ||||| || ||||| | ||| |||||  ||    
T  6049046 gacgtattcttataaccctttgatatc-cctttgtaaagttactcatcattatatagtggaacggagagttgctcttccccccatactagctcagtaatg 6049144  T
Q  375 gactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgct 425  Q
    ||| ||||| |||| ||||| | ||||||| |||||| | |||||||||||    
T  6049145 gaccgaactaggtagacaaattccgtgtgttctctctctttttctctcgct 6049195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 354
Target Start/End: Original strand, 24258553 - 24258717
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||  || |||||||   | | |||||||||||||    
T  24258553 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagactttggatagaattaggcg-gaaaacttattcttgta 24258651  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatc---attatagtggaacggatgactgctctctc 354  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24258652 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattatagtggaacggagggctgctctctc 24258717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 43253716 - 43253541
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||  ||||||||||  || |||||||   |||||||||||||||||    
T  43253716 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacggaaagaggctgagactttggatagaattagg-cgggagacttattcttgta 43253618  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtca 368  Q
    ||||||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | || | |||||||||||| |||| |||||||    
T  43253617 actcattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctccctcagactaggtca 43253541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 336
Target Start/End: Original strand, 11757320 - 11757462
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  11757320 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 11757418  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtgga 336  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  11757419 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 11757462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 427
Target Start/End: Original strand, 21678156 - 21678388
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||  ||||||   |||||| ||||||||||    
T  21678156 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagatattgggactttgggtagcattagg-cgggagacgtattcttgta 21678254  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| |||| |||||||||| | |||| |||| ||||||| ||| |  | ||||||||||||| ||| ||||| |  ||||||| ||||||||  ||    
T  21678255 acccattgatatatcttttgtaaggttacttatca-tatagtgaaacagtgggctgctctctcccctagactaggtta-atttggaccgaactgggacaa 21678352  T
Q  391 caaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgt 427  Q
    | |||||| ||||| |||||||  |||||| ||||||    
T  21678353 c-aaattcttgtgttctctcttcttttctcccgctgt 21678388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 1047123 - 1046924
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  1047123 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 1047025  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||| | |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  1047024 acccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccacactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 1046928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 1049494 - 1049295
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  1049494 ggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 1049396  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  1049395 acccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 1049299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 1850071 - 1850271
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  1850071 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgta 1850169  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||| | |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  1850170 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 1850267  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  1850268 caaa 1850271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 7349472 - 7349296
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  7349472 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 7349374  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcag 369  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7349373 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag 7349296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 40946418 - 40946618
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  40946418 ggttgatttactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 40946516  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||  ||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| || | | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  40946517 acctattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcgaagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 40946614  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  40946615 caaa 40946618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 28485656 - 28485855
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||   ||||| |||||||||||    
T  28485656 ggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgagtataattagg-cgggagatttattcttgta 28485754  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaac 391  Q
    |  |||| || |||||||||||| | ||||||||| |||| || | | || |  |||||||||| |||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||    
T  28485755 atccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tataatgaatcagagggttgctctctcctcagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 28485852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 7351851 - 7351651
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  7351851 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 7351753  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||| | ||||||||  |||||| ||||||||| |    
T  7351752 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcag-attggaccgaactgggtca 7351656  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  7351655 acaaa 7351651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 31156110 - 31155910
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  31156110 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgggtacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 31156012  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| | ||||||||  |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |    
T  31156011 aacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatc-ctatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 31155915  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  31155914 acaaa 31155910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 327
Target Start/End: Original strand, 28487643 - 28487777
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  28487643 ggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 28487741  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcat 327  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||||    
T  28487742 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 28487777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 209 - 393
Target Start/End: Original strand, 21369642 - 21369824
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||   ||||||| |    
T  21369642 aaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggac-ttgggtaaaattaggtttgaagactgattcatgtaactca---atatctc-t 21369736  T
Q  309 ttgtaaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctctcc-ccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaa 393  Q
    ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||| ||| | |||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  21369737 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccgccatagtaggtcatcattggaccgaactgggtaaacaa 21369824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 275 - 423
Target Start/End: Original strand, 22393894 - 22394043
Alignment:
Q  275 ggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagtttt 373  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  || ||||||||| ||| |||||||  |||    
T  22393894 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgttctctcccctagactaggtca-attt 22393992  T
Q  374 ggactgaactgggtaaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcg 423  Q
    ||||  ||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  22393993 ggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctctttctttctctcg 22394043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 135 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 13290733 - 13290445
Alignment:
Q  135 aacaaacaataaactagggttt-tagagatttctctaagagagagacactagggttgtggttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgaatctct 232  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||  |  | | |||||||| ||| |  ||||| ||||| | ||||||||||||| ||| | |||||    
T  13290733 aacaaacaacaaactagggtttgtagagttttctcttggcaacaaacactaggcttgggagtgattcaccttcgagaaacactattagaatttagtctct 13290634  T
Q  233 tggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatag 332  Q
    |||| ||  ||||| |||   ||| || ||| ||||||||||| ||| | |||||||||||   || |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  13290633 tggtcacaggaagatattagaactctgggtagaattaggtttgaagaataattcttgtaaccttttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatag 13290535  T
Q  333 tggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctct 421  Q
     ||||| ||   || | ||||||| |||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  13290534 cggaacagagagctacactctccctcagacttggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttccttctct 13290445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Original strand, 21680117 - 21680280
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||| ||||||    ||||| |||||||||||    
T  21680117 ggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgggactttgggtagaattagacg-ggagatttattcttgta 21680215  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    || || | ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||||    
T  21680216 acccaatgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacagagagctgctctctcccc 21680280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 394
Target Start/End: Original strand, 2935374 - 2935558
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctc 306  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  2935374 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 2935472  T
Q  307 ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
     ||||||| | |||||||||  |||||||| |||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  2935473 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 2935558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 274
Target Start/End: Original strand, 11084456 - 11084547
Alignment:
Q  183 tagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggttt 274  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   |||||| ||||||||||||||    
T  11084456 tagggttgagattgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattcgaactttgggtaaaattaggttt 11084547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 218 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 22251723 - 22251602
Alignment:
Q  218 taggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcata----tctcttttgta 313  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||| |||| |||    |||||||||||    
T  22251723 taggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgta 22251625  T
Q  314 aagctactcatcattatagtgga 336  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  22251624 aagttactcatcattatagtgga 22251602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Original strand, 42223248 - 42223411
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   |||||  || |||||||   | | ||||||||||| |    
T  42223248 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattagg-cggaaaacttattcttgaa 42223346  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    ||  ||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  42223347 acctattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaatggatggctgctctctcccc 42223411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Original strand, 25351353 - 25351534
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| |    
T  25351353 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 25351447  T
Q  309 ttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||   ||| ||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  25351448 ttgtaaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgttctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 25351534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Original strand, 25410130 - 25410313
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| |    
T  25410130 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 25410224  T
Q  309 ttgtaaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  25410225 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 25410313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 179 - 394
Target Start/End: Original strand, 26210616 - 26210834
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagatt-gagactttgcgtaaaattaggtttgg 276  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| | ||||||  ||| |||||||||||     
T  26210616 acactagggttgtgattgattcaccttggagaaatactattaggattgagtctcttggtaacggaaagagattcgggactttcggtagaattaggtttga 26210715  T
Q  277 agacttattcttgtaactc-attcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttg 374  Q
    ||||| ||||||||||| |  || ||| |   |||| |||| |||||||||||||| | |||||||   || ||||||||||  || ||||| ||| |||    
T  26210716 agactgattcttgtaacccttttgata-catgtttggaaagttactcatcattataatagaacggagagcttctctctcccctggagtaggttagtattg 26210814  T
Q  375 gactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26210815 gactgaactgggtaaacaaa 26210834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 38396725 - 38396924
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   ||||||||||| |||||    
T  38396725 ggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgta 38396823  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| |||||||   ||||||||| ||||||||| |||| | || ||||||||| |||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  38396824 acccattgatttctc-tttgtaactttactcatca-tatagtggatcggagggcttctctctccctcagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 38396920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 238 - 456
Target Start/End: Original strand, 6046629 - 6046843
Alignment:
Q  238 acgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaa 337  Q
    ||||||| ||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||  | || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6046629 acgagaaaagaatgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaacctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaa 6046727  T
Q  338 cggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttct 436  Q
     | |   ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| ||| || ||||| |  |  ||| |||||| | |||||||||     ||||||||    
T  6046728 tgaagagctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattggatagacaaattatgcatgttctctctctttttctctcg----tttttttct 6046823  T
Q  437 acgtttgtttgtgtttataa 456  Q
    || |||| ||||||||||||    
T  6046824 acttttgcttgtgtttataa 6046843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 209 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3320232 - 3320022
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||| |    
T  3320232 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 3320138  T
Q  309 ttgtaaagctactca-tcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgc 406  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||  || ||||| |    
T  3320137 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttc 3320038  T
Q  407 tctctttctttctctc 422  Q
    ||||| ||| ||||||    
T  3320037 tctctctctctctctc 3320022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 209 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3324980 - 3324770
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||| |    
T  3324980 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 3324886  T
Q  309 ttgtaaagctactca-tcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgc 406  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||  || ||||| |    
T  3324885 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttc 3324786  T
Q  407 tctctttctttctctc 422  Q
    ||||| ||| ||||||    
T  3324785 tctctctctctctctc 3324770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 192 - 293
Target Start/End: Original strand, 26804662 - 26804762
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  26804662 ggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 26804760  T
Q  292 ac 293  Q
    ||    
T  26804761 ac 26804762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 208 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 9027376 - 9027193
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctc 306  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||| |||||||||||| |||| || ||||    
T  9027376 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc 9027279  T
Q  307 ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
     ||||||| | |||||||||  ||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  9027278 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggataggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 9027193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 208 - 394
Target Start/End: Original strand, 22108173 - 22108356
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctc 306  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   | |||| |||||||||||| |||| || ||||    
T  22108173 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc 22108270  T
Q  307 ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
     ||||||| | |||||||||  |||||||| |||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  22108271 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 22108356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 208 - 394
Target Start/End: Original strand, 40549933 - 40550116
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctc 306  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   | |||| |||||||||||| |||| || ||||    
T  40549933 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc 40550030  T
Q  307 ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
     ||||||| | |||||||||  |||||||| |||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  40550031 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 40550116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 44010929 - 44010749
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| |||||| || | ||||||||  || ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||    
T  44010929 cactattaggattgagtctcttagtcatgagaagaggctgggactt-gtgtaaaattaggtttggagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 44010835  T
Q  312 taaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||| ||||||||||    
T  44010834 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaacttggtaaacaaa 44010749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 25542620 - 25542818
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| || ||||||| ||| ||||| |   |||||||||||||||||    
T  25542620 ggttgattcaccttgg-aaagactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattatg-cgggagacttattcttgta 25542717  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||||| ||| ||||| |  ||||||| ||||||||| ||    
T  25542718 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagagctgctctctcccctagactaggtta-atttggaccgaactgggtcaa 25542814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 44512704 - 44512525
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||| |    
T  44512704 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-g 44512610  T
Q  312 taaagctactcat--cattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  ||||||  |||||||| ||||||||   |||||||||||| ||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  44512609 taaagaaactcatatcattataggggaacggagagctgctctctccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 44512525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 218 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 6067373 - 6067197
Alignment:
Q  218 taggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagc 317  Q
    ||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |  | ||||||||||   ||||     
T  6067373 taggatttagtctcttggtcacgggaagagattgagactttg-atagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctctgatatctctttgtaaaagg 6067275  T
Q  318 tactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
     |||| ||||||||||| ||||||   ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  6067274 aactcgtcattatagtgaaacggagagctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccggactgggtaaacaaa 6067197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 232 - 341
Target Start/End: Original strand, 6348912 - 6349020
Alignment:
Q  232 ttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattata 331  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  6348912 ttggtcacgggaaaagattgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattattgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattaca 6349010  T
Q  332 gtggaacgga 341  Q
    ||||||||||    
T  6349011 gtggaacgga 6349020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 209 - 336
Target Start/End: Original strand, 25357047 - 25357169
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| |    
T  25357047 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 25357141  T
Q  309 ttgtaaagctactcatcattatagtgga 336  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25357142 ttgtaaagaaactcatcattatagtgga 25357169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Original strand, 25405393 - 25405575
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||| |    
T  25405393 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 25405487  T
Q  309 ttgtaaagctactca-tcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  25405488 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 25405575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 208 - 394
Target Start/End: Original strand, 1606486 - 1606669
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctc 306  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   |||||| |||||||||||| |||| || ||||    
T  1606486 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc 1606583  T
Q  307 ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
     ||||||| | |||||||||  |||||||| |||| | ||||||||| ||||||| ||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  1606584 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 1606669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 208 - 394
Target Start/End: Original strand, 22137184 - 22137367
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctc 306  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   | |||| |||||||||||| |||| || ||||    
T  22137184 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc 22137281  T
Q  307 ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
     ||||||| | |||||||||  |||||||| |||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  22137282 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 22137367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 208 - 394
Target Start/End: Original strand, 40552211 - 40552394
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctc 306  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   | |||| |||||||||||| |||| || ||||    
T  40552211 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc 40552308  T
Q  307 ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
     ||||||| | |||||||||  |||||||| |||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  40552309 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 40552394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Original strand, 2120899 - 2121082
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| |    
T  2120899 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 2120993  T
Q  309 ttgtaaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||| ||||||||||||    
T  2120994 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaattgggtaaacaaa 2121082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 179 - 249
Target Start/End: Original strand, 22392539 - 22392608
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagat 249  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  22392539 acactagggttg-ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagat 22392608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Original strand, 7069780 - 7069962
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||| |    
T  7069780 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 7069874  T
Q  309 ttgtaaagctactca-tcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||| || |   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  7069875 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 7069962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 44144045 - 44143892
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||||||| | | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||    
T  44144045 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttg-gcagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 44143951  T
Q  312 taaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtca 368  Q
    ||||   ||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||    
T  44143950 taaaaaaactcatatcattatagtggaacggagagttgctctctccccagactaggtca 44143892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Original strand, 42006663 - 42006846
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||   ||||||| |    
T  42006663 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgatttttgtaactca---atatctc-t 42006757  T
Q  309 ttgtaaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctctc-cccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||  ||||||||||||||||| |   |||||||||| |||||| |||||||   || ||| |||||| |||||||||    
T  42006758 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacgaagagctgctctctctcccagactaggtcatcattagaccgaactgcgtaaacaaa 42006846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Original strand, 7074787 - 7074969
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||| |    
T  7074787 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 7074881  T
Q  309 ttgtaaagctactca-tcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||   |||| |||| ||||||| |||||||   || ||| |||| |||||||||||    
T  7074882 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgcactctcccccagactaggtcatcattagaccgaaccgggtaaacaaa 7074969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 15541177 - 15540995
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||| |    
T  15541177 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtataattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 15541083  T
Q  309 ttgtaaagctactca-tcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||| | || |   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  15541082 ttgtaaagaaactcattcattatagtgtatcgtagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 15540995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Original strand, 30246973 - 30247153
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||   ||||||| ||||    
T  30246973 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagaccgattcttgtaactca---atatctc-tttg 30247067  T
Q  312 taaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||||||||   ||||| ||| ||||||| |||||||   || |||  |||||||||||||||    
T  30247068 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctatctcccccagactaggtcatcattagaccaaactgggtaaacaaa 30247153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 8378686 - 8378503
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||| |    
T  8378686 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 8378592  T
Q  309 ttgtaaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  8378591 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagttgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 8378503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 7464697 - 7464518
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||| | ||||  || ||| ||| || |||||||||||| ||| | ||||||||||||||   ||||||| ||||    
T  7464697 cactattaggattgagtctctttgtcacggggagaggctgggac-ttgggt-aaattaggtttgaagagtgattcttgtaactca---atatctc-tttg 7464604  T
Q  312 taaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctc-tccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||||||||   |||||||| |||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  7464603 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctcttccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 7464518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12310229 - 12310119
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttggg-aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgag-actttgcgtaaaattaggtttgg 276  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||   |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  | |||||| ||| ||||| |||||     
T  12310229 acactagggttgggattgattcaccttgaacaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttcgaactttgggtataattatgtttga 12310130  T
Q  277 agacttattct 287  Q
    ||||| |||||    
T  12310129 agactgattct 12310119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 354 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 20091194 - 20091127
Alignment:
Q  354 ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctc 422  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  20091194 ccccagactaggtcagtattggaccgaactggataaataaa-ttcgtgtgttctctctttctttttctc 20091127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 458
Target Start/End: Original strand, 6349021 - 6349149
Alignment:
Q  323 atcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctc 422  Q
    ||||||| |||||||||||    ||||||||||||| | ||||| ||| || ||  |||||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||    
T  6349021 atcattacagtggaacggagagttgctctctcccca-actaggttagtattagatcgaactgggtaaacaaatttcctgtt--ctctctttctttctctc 6349117  T
Q  423 gctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataact 458  Q
    |    || |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  6349118 g----ctattttctacttttgcttgtgtttataact 6349149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 394
Target Start/End: Original strand, 2075188 - 2075298
Alignment:
Q  283 attcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcat--cattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactg 379  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| |    
T  2075188 attcttgtaactca---atatctcttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggaaagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccg 2075283  T
Q  380 aactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||||||||||||    
T  2075284 aactgggtaaacaaa 2075298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 323 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 34546951 - 34546879
Alignment:
Q  323 atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  34546951 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 34546879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 44016840 - 44016660
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| |||||| || | ||||||||  || || |||| | | ||||||||||| ||||  ||||||||||||||   ||||||| ||||    
T  44016840 cactattaggattgagtctcttagtcatgagaagaggctgggaatttg-gcagaattaggtttgaagaccgattcttgtaactca---atatctc-tttg 44016746  T
Q  312 taaagctact--catcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  |||  |||||||||| ||||||||    ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||| ||||||||||||    
T  44016745 taaagaaactcacatcattataatggaacggcgagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaattgggtaaacaaa 44016660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 78)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 179 - 427
Target Start/End: Original strand, 31035240 - 31035490
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||    
T  31035240 acactatggttggggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaag 31035339  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccaga--ttaggtcagttttgg 375  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||   ||||||||| ||||    
T  31035340 acttattcttgtaaccctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactataggtcagtattgg 31035438  T
Q  376 actgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgt 427  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31035439 accgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctctcgctgt 31035490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 192 - 409
Target Start/End: Original strand, 31162345 - 31162564
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||    
T  31162345 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaccggaagagattgggactttgggtagaattaggtg-gaagacttattcttgta 31162443  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct---ccccagattaggtcagttttggactgaactgggta 388  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || | |||||||||   ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  31162444 actcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccccagactaggtcagtattggaccgaactgggta 31162543  T
Q  389 aacaaaattcgtgtgtgctct 409  Q
    |||||| ||||||||| ||||    
T  31162544 aacaaatttcgtgtgttctct 31162564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 179 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 31578491 - 31578221
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  31578491 acactaaggttgagattgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaag 31578392  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggac 377  Q
    ||| |||||||||||   || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||    
T  31578391 actaattcttgtaaccttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctcccctagactaggtcagtataggac 31578292  T
Q  378 tgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataa 456  Q
     |||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||| ||    |||||||| |||| ||||||||||||    
T  31578291 cgaactgggtaaacaaattt--tgtgtgctctc--tctttctctcgttg----ttttctacttttgcttgtgtttataa 31578221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 179 - 394
Target Start/End: Original strand, 15956081 - 15956294
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||    
T  15956081 acactagggttg-ggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggag 15956178  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtcagttttggac 377  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  15956179 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggtttctctctccctcagattaggtca-atttggac 15956277  T
Q  378 tgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||||||| ||||||    
T  15956278 tgaactgggtcaacaaa 15956294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 179 - 458
Target Start/End: Original strand, 21482434 - 21482708
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||| | ||||| ||| |||||||   |  |    
T  21482434 acactagggttg-ggttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgagt-g 21482531  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggac 377  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  |||||||    
T  21482532 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataaagaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtca-atttggac 21482630  T
Q  378 tgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataact 458  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  21482631 cgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttcttttctctcgctg----ttttctacttttgtttgtgattataact 21482708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 192 - 422
Target Start/End: Original strand, 27911150 - 27911376
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||| |||||||||||    
T  27911150 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagagttattcttgta 27911248  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaac 391  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |  ||||||||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||| ||     
T  27911249 actcattgatatctctattgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggttgctctctccccagactaagtca-atttggaccgaactgggtcaa- 27911345  T
Q  392 aaaattcgtgtgtgctctctttctttctctc 422  Q
    ||||||| | |||||||||| ||| ||||||    
T  27911346 aaaattcttttgtgctctctctctctctctc 27911376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 192 - 422
Target Start/End: Original strand, 27957569 - 27957795
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||| |||||||||||    
T  27957569 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagagttattcttgta 27957667  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaac 391  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |  ||||||||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||| ||     
T  27957668 actcattgatatctctattgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggttgctctctccccagactaagtca-atttggaccgaactgggtcaa- 27957764  T
Q  392 aaaattcgtgtgtgctctctttctttctctc 422  Q
    ||||||| | |||||||||| ||| ||||||    
T  27957765 aaaattcttttgtgctctctctctctctctc 27957795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 179 - 458
Target Start/End: Original strand, 21480626 - 21480900
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| |  |||  ||| |||||||   || |    
T  21480626 acactaggtttg-ggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagatattggggtttttggtagaattaggcg-ggtg 21480723  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggac 377  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||     
T  21480724 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaa 21480822  T
Q  378 tgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataact 458  Q
     |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||    |||||| | |||||||||| ||||||||    
T  21480823 cgaactgggtaaaaaaaattcgtgtgttctctctttcttttctctcgttg----ttttcttcttttgtttgtgattataact 21480900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 14419390 - 14419189
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  14419390 ggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 14419292  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  14419291 acccattaatatgtcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 14419193  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  14419192 caaa 14419189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Original strand, 25952656 - 25952820
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||   | |||||||||||||||    
T  25952656 ggttgattcaccttggaaaacaatattaggattgagtctcttggttacgagaagaaattgagacattgggtagaattaggca-gaagacttattcttgta 25952754  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  25952755 actcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccc 25952820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 194 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 3005829 - 3005608
Alignment:
Q  194 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaac 293  Q
    |||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||     
T  3005829 ttgattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaat 3005731  T
Q  294 tcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaaca 392  Q
     |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||     
T  3005730 ccattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaacggaggggtgctctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactgggtaaac- 3005632  T
Q  393 aaattcgtgtgtgctctctttctt 416  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||    
T  3005631 aaattcttgtgttctccctttctt 3005608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 192 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 13858683 - 13858450
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| ||||| |   ||||||||||||||| |    
T  13858683 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaag-cgggagacttattcttgca 13858585  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
     | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  13858584 gcccatt-atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggacagaactgggtaaa 13858487  T
Q  391 caaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgt 427  Q
    |||| |   ||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  13858486 caaattctttgtgttctccctttctttctctcactgt 13858450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 30480702 - 30480502
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  30480702 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 30480604  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||| | || |||||| ||||||| || ||||| ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  30480603 acccattgatatctcttttgtaacgttagtcatca-tatagtgaaatggatggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 30480506  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  30480505 caaa 30480502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 32339445 - 32339645
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  32339445 ggttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 32339543  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  32339544 acccattgatatctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggttaa 32339641  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  32339642 caaa 32339645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 192 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 27107096 - 27106835
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  27107096 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 27106998  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc-ccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||  ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||  |||||||| ||    
T  27106997 acccatagatatctcttttgtagggttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctatctcctccagactaggtca-atttggaccaaactgggtcaa 27106900  T
Q  391 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataact 458  Q
    |||| | |  |||||  ||||||||||||||||| ||    |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  27106899 caaattattttgtgttttctctttctttctctcgttg----ttttctacttttgtctgtgattataact 27106835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 36865674 - 36865873
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  36865674 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttc---acgggaagagattggaactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 36865769  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc--agattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||  ||| |||||||  ||||||| |||||||||||    
T  36865770 acccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccaagactaggtca-atttggaccgaactgggtaa 36865868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 209 - 422
Target Start/End: Original strand, 6376141 - 6376354
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||   || ||||||| |    
T  6376141 aaacactgttaagattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttatgtagaattaggtttgaagactaattcttgttaccttttgatatctc-t 6376239  T
Q  309 ttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgct 407  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||  ||||||||| || |||||| ||    
T  6376240 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacagaaggctgctctctccctcagactaggtcagtattggaccgaacttagtaaacaaattttgtgtgttct 6376339  T
Q  408 ctctttctttctctc 422  Q
    |||| ||||||||||    
T  6376340 ctctctctttctctc 6376354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 28283418 - 28283220
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| ||||||| | | ||||||||||||| |    
T  28283418 ggttgattcacattgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-tggtagacttattcttgca 28283320  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaac 391  Q
    || |||| || |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||    
T  28283319 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 28283223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Original strand, 14807887 - 14808050
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  14807887 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 14807985  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  14807986 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccc 14808050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 179 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 31573939 - 31573794
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  31573939 acactatggttgggattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaag 31573840  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcat 324  Q
    ||| |||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||    
T  31573839 actaattcttgtaattctttgatatctcttttgtaaagttactcat 31573794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 192 - 456
Target Start/End: Original strand, 15072846 - 15073110
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaaga-gattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||   ||||| ||||||||||    
T  15072846 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagggttgggactttgggtagaattagg-cgggagatttattcttgt 15072944  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||| ||| ||||||||| |    
T  15072945 aacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tacagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtca 15073042  T
Q  390 acaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgttt-gtttgtgtttataa 456  Q
    ||||| | |  ||||| |||||||  ||||||||||||| | |||||||| ||| | ||||||||||||    
T  15073043 acaaattattttgtgttctctcttcttttctctcgctgt-tgttttctacttttggcttgtgtttataa 15073110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 3874146 - 3874346
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  3874146 ggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 3874244  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  3874245 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 3874342  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  3874343 caaa 3874346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 386
Target Start/End: Original strand, 15068117 - 15068309
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  15068117 ggttaattcaccttgggaaatactattaggattgagtcttttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 15068215  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactggg 386  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  15068216 acccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tataatggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggactgaactggg 15068309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 28251766 - 28251566
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| |||||||||||   |||||||||||||| ||    
T  28251766 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattagg-cgggagacttattcttata 28251668  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||| | |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  28251667 acccattgatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 28251570  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  28251569 caaa 28251566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 208 - 422
Target Start/End: Original strand, 17847677 - 17847885
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctct 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| | || ||||||||    
T  17847677 gaaacactattaggattgaatctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac-ctttgatatctct 17847775  T
Q  308 tttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaac-aaaattcgtgtgtg 405  Q
    ||||||||       ||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||  ||| |||||     
T  17847776 tttgtaaa-------atcattatagtggaatggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccaaactgggaaaactaattttcatgtgtt 17847868  T
Q  406 ctctctttctttctctc 422  Q
    |||||||| ||||||||    
T  17847869 ctctctttatttctctc 17847885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 192 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5372377 - 5372229
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||   | |||||||||||||||    
T  5372377 ggttaattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgggactttgagtataattagg-cggcagacttattcttgta 5372279  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacgga 341  Q
    ||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  5372278 actcattgatatcttttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacgga 5372229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 183 - 420
Target Start/End: Original strand, 3895946 - 3896186
Alignment:
Q  183 tagggttgtggttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagact 281  Q
    |||||||| | |||||| || |||| |||||||||||  |||||| |||||| || ||| ||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| | | |    
T  3895946 tagggttgggattgattcactttggagaaacactattgcgattgagtctcttcgtcacgggaagaaattgggactttgagtataattaggtttgaaaatt 3896045  T
Q  282 tattcttgtaactcat-tcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactg 379  Q
     ||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||| | ||| ||||| |||||  |    
T  3896046 aattcttgtaactcttatgatatctcttttgtaaagttactcatcattaaagtagaacggatggctgctctctcccccatagtagatcagtattggatcg 3896145  T
Q  380 aactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctc 420  Q
    || || ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  3896146 aattgagtaaacaaatttcgtgtgttctctatttctttctc 3896186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22684855 - 22684652
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  22684855 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 22684757  T
Q  292 actc---attcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggt 387  Q
    || |   ||| || ||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  22684756 acccaatattgatttctctattgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagattaggtca-atttggaccgaactgggt 22684659  T
Q  388 aaacaaa 394  Q
     ||||||    
T  22684658 caacaaa 22684652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 43530251 - 43530451
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||| ||||    
T  43530251 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcctgta 43530349  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctc-cccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| |||| |||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  43530350 acccattgatttctcttttgtaacgctactcatca-tatagtggatcggagggctgctgtctctcccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 43530447  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  43530448 caaa 43530451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 192 - 427
Target Start/End: Original strand, 1225302 - 1225537
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| ||||||    |||||||||||||||||    
T  1225302 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagacg-ggagacttattcttgta 1225400  T
Q  292 actcattcatatctc-ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||| || | |||||||  ||||||| ||||| ||| |    
T  1225401 actcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggccgctctctccctcatactaggtca-atttggaccgaactaggtca 1225498  T
Q  390 acaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgt 427  Q
    ||||| | |  ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  1225499 acaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgt 1225537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 608870 - 609070
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  608870 ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 608968  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| || ||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  608969 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtca-atttggaccgaactgggtcaa 609066  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  609067 caaa 609070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 275 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 2468247 - 2468105
Alignment:
Q  275 ggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctc-cccagattaggtcagtttt 373  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || | |||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  2468247 ggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaatagagggctgctctctctcccagattaggtca-attt 2468149  T
Q  374 ggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttcttt 417  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2468148 ggacagaactaggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttcttt 2468105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 15809354 - 15809554
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |  ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  15809354 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaactaggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 15809452  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctc-tccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | || | |||||||| |||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  15809453 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctcttccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 15809550  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  15809551 caaa 15809554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 265 - 417
Target Start/End: Original strand, 16833757 - 16833909
Alignment:
Q  265 aattaggtttggagacttattcttgtaactcattc-atatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagatt 362  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||| |||| |    
T  16833757 aattaggtttgaagacttactcttgtaa-tcatttgatatctcttttgtaaagttactcaacattatagtggaacgaaaggctgctctctcccacagact 16833855  T
Q  363 aggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttcttt 417  Q
    | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16833856 aagtcacttttggac-gaactgggtaaacaaaattcgtgtgttctctctctcttt 16833909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 43079738 - 43079938
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  43079738 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 43079836  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |    
T  43079837 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 43079933  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  43079934 acaaa 43079938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 27829433 - 27829632
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||| ||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  27829433 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggaccttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 27829531  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| |||||||   ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  27829532 acccattgatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 27829628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 41384880 - 41385080
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||  ||| ||||||| | ||||| || ||||||||    
T  41384880 ggttgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttaggtagaattagg-tgggagaatttttcttgta 41384978  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||||||| | ||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| || | ||||||||| ||||| | |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  41384979 actcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 41385076  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  41385077 caaa 41385080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 4424154 - 4424354
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   |||||  || |||||||   |||||||||||||||||    
T  4424154 ggttgattcaccgtgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattagg-cgggagacttattcttgta 4424252  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || | ||||||||||   ||||||||| ||||||||| | || | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  4424253 acccattgatttatcttttgtaacattactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 4424350  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  4424351 caaa 4424354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 192 - 292
Target Start/End: Original strand, 14477412 - 14477511
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  14477412 ggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 14477510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 23179740 - 23179560
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||  || ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||    
T  23179740 cactattaggattgagtctcttggtcaccggaagaggctgtgactttg-gtaaaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 23179646  T
Q  312 taaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  ||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  23179645 taaagaaactcatatcattatagtggaacggatagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 23179560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 43082109 - 43082309
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   | ||||||||||||||    
T  43082109 ggttgattcaccttgggaaacactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cggaagacttattcttgt 43082207  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |    
T  43082208 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 43082304  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  43082305 acaaa 43082309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 44720979 - 44721179
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaa-cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  44720979 ggttgattcaccttgggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 44721077  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  |||   |||||||||||| |||| |||||||  ||||||| ||||||||| |    
T  44721078 aacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagagctgctctctcccgcagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 44721174  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  44721175 acaaa 44721179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 18810844 - 18811043
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||  || ||||||  ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  18810844 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaataggctgggactttaggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 18810942  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| |||||||   ||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| |||||||||||||||  |||| || ||||||||| ||    
T  18810943 acccattgatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-atttgaaccgaactgggtcaa 18811039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 18813018 - 18813217
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  18813018 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgggtacgggaagaggctgtgactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 18813116  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| |||||||   ||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||| ||    
T  18813117 acccattgatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccatattaggtca-atttggaccgaactaggtcaa 18813213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 27827122 - 27827321
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||  || ||| ||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  27827122 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggaccttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 27827220  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| |||||||   ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| || ||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  27827221 acccattgatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtca-atttggaccgaactgggtcaa 27827317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Original strand, 28332631 - 28332813
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||| |    
T  28332631 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 28332725  T
Q  309 ttgtaaagctactca-tcattatagtggaacggatgactgctctctcc-ccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  28332726 ttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 28332813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 214 - 394
Target Start/End: Original strand, 41382820 - 41382998
Alignment:
Q  214 ctattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgta 313  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||   |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  41382820 ctattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcg-ggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgta 41382918  T
Q  314 aagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    | | ||||||||| ||||||| ||| || | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||| ||||||    
T  41382919 acgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaa 41382998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 276 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 15185831 - 15185652
Alignment:
Q  276 gagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttg 374  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||| ||| |    
T  15185831 gagacctattcttgtaacccattgatatctcttttttaaggttactcatcattatagtgaaacggaggactgttctctcccctagactaggtcaattt-g 15185733  T
Q  375 gactgaactgggtaaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataact 458  Q
    ||| ||||||||| |||||| | |  | ||| |||||||||||||||||| ||    |||||||| ||||||| || ||||||||    
T  15185732 gaccgaactgggtcaacaaattcttttttgttctctctttctttctctcgttg----ttttctacttttgtttatgattataact 15185652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 17799606 - 17799423
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  |||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||   ||||||| |    
T  17799606 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgagtataattaggtttgaagactgattcttataactca---atatctc-t 17799512  T
Q  309 ttgtaaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctctc-cccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||   |||||||||| |||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  17799511 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctctcccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 17799423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Original strand, 28327908 - 28328090
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||| |    
T  28327908 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 28328002  T
Q  309 ttgtaaagctactca-tcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  28328003 ttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 28328090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16752704 - 16752523
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||   |||||||    
T  16752704 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt---atctctt 16752609  T
Q  309 ttgtaaagctactcat-cattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||   || ||||||||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  16752608 t-gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctactctctccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 16752523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 319 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 31566630 - 31566523
Alignment:
Q  319 actcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttc 418  Q
    ||||||||||||| |||||| ||   |||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  31566630 actcatcattataatggaacagagagctgctctc-ccccatactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgagttctctctttctttc 31566532  T
Q  419 tctcgctgt 427  Q
    |||||||||    
T  31566531 tctcgctgt 31566523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Original strand, 181635 - 181798
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactatt-aggattgaatctcttggttacgag--aagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattctt 288  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||| |  |||||| || ||||||| ||| |||||||   | ||||||||||||    
T  181635 ggttgattcaccttgggaaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcg-gaagacttattctt 181733  T
Q  289 gtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||   |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  181734 gtaacccattgatatctc-tttgtaaagttactcatc---atagtgaaacagatgactgctctctcccc 181798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 24873380 - 24873217
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  24873380 ggttgattcacctttggaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 24873282  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    |||  ||| || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||||    
T  24873281 aaccgattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccc 24873217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Original strand, 25684646 - 25684825
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||| ||||    
T  25684646 cactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagacagggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-tttg 25684740  T
Q  312 taaagctactca-tcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  25684741 taaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 25684825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16757449 - 16757267
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||| |    
T  16757449 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 16757355  T
Q  309 ttgtaaagctactca-tcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  16757354 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 16757267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 9021289 - 9021106
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| |    
T  9021289 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 9021195  T
Q  309 ttgtaaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctctcc-ccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||  ||||||||||| || ||||   ||||||||||| ||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  9021194 ttgtaaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctccaccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 9021106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4812669 - 4812449
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||| |    
T  4812669 aaacactattaggattgagtcttttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 4812575  T
Q  309 ttgtaaagctactca-tcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgc 406  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||  || ||||| |    
T  4812574 ttgtaaagaaaatcattcattatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtcataattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttc 4812475  T
Q  407 tctctttctttctctcgctgtctttt 432  Q
    ||||| ||  |||||| || ||||||    
T  4812474 tctctctccctctctccctctctttt 4812449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Original strand, 28895502 - 28895685
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||   ||||||| |    
T  28895502 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctc-t 28895596  T
Q  309 ttgtaaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctctcc-ccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||   ||||||||||| | ||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  28895597 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcctctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 28895685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 33541587 - 33541508
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattagg 271  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| |||||||    
T  33541587 ggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattagg 33541508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 33839105 - 33838902
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattga-gactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctc 306  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||   |  ||    
T  33839105 gaaacactattaggattgagtctcttggtcagga--agagattcaagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttggaa--tc 33839010  T
Q  307 ttttgtaaagctactcatca-ttatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa-attcgtgtg 403  Q
    |||||||||| |||| |  | |||||||||||||||  |||||||||| ||||| | || |||||| || ||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  33839009 ttttgtaaagttacttaaaagttatagtggaacggagaactgctctctcccccataatatgtcagtattcgaccgaattgggtaaacaaattttcgtgtg 33838910  T
Q  404 tgctctct 411  Q
    | ||||||    
T  33838909 ttctctct 33838902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 354
Target Start/End: Original strand, 33032657 - 33032796
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||    
T  33032657 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 33032751  T
Q  312 taaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctctc 354  Q
    |||||  ||||  ||||||||||||||| |||   ||||||||||    
T  33032752 taaagaaactcatatcattatagtggaatggagagctgctctctc 33032796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Original strand, 30423212 - 30423398
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||  ||||||  || ||||||||||| ||||| ||| |||||| || |  ||||||| |    
T  30423212 aaacacttttaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattggaactttggatagaattaggtttgaagactaatttttgtaattc-tcaatatctc-t 30423309  T
Q  309 ttgtaaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctctcc-ccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||| |||||||   || ||| |||| |||||||||||    
T  30423310 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcctccagagtaggtcatcattagaccgaacagggtaaacaaa 30423398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 2468315 - 2468261
Alignment:
Q  181 actagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggt 236  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2468315 actagggttg-ggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 298
Target Start/End: Original strand, 590797 - 590882
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcatt 298  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  590797 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt 590882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 354
Target Start/End: Original strand, 14419732 - 14419786
Alignment:
Q  300 atatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctc 354  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  14419732 atatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggatggctgctctctc 14419786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 29554964 - 29554822
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||| ||||||   ||||||| ||||    
T  29554964 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattatgtttgaatacttattcttggaactca---atatctc-tttg 29554870  T
Q  312 taaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  29554869 taaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccc 29554822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13985262 - 13985178
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagatt-gagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaac 293  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| || ||| |||||||||||    
T  13985262 aaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggttt-gaaactgattcttgtaac 13985178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 309
Target Start/End: Original strand, 15949534 - 15949634
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagatt-gagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctct 307  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  | ||||||||    
T  15949534 aaacactattaggatatagtctcttggtcacgggaagagattcgggacttgg-gtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaattctctgatatctct 15949632  T
Q  308 tt 309  Q
    ||    
T  15949633 tt 15949634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 2267205 - 2267122
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaac 293  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| ||  |||||||||  ||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2267205 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattaggacttgg-gtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 2267122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 296
Target Start/End: Original strand, 3276347 - 3276430
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactca 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||  || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3276347 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggacttgg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca 3276430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 33021039 - 33020899
Alignment:
Q  256 tttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt-ttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctc 354  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| | || |||| | || |||||||| ||||||||||||||   ||||| |   ||||||||||    
T  33021039 tttgtgtagaattaggtttgaagactgattcttgtaaccctttgatattttttgttgtaaagttactcatcattataagtgaacgaaaagctgctctctc 33020940  T
Q  355 cc-cagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    || |||| ||||||||| |||||| ||| ||| | ||||||    
T  33020939 ccacagagtaggtcagtattggacagaattggattaacaaa 33020899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 394
Target Start/End: Original strand, 21033870 - 21034052
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||| | | | ||||| | ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| |    
T  21033870 aaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagggctgg-gacttgg-gtagaaataggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctc-t 21033963  T
Q  309 ttgtaaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctc-tctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||   |||||| | |||||| | |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  21033964 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagatctgctcttttccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 21034052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 394
Target Start/End: Original strand, 28890820 - 28890948
Alignment:
Q  265 aattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagat 361  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||   ||||||| |||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||     
T  28890820 aattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagac 28890915  T
Q  362 taggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
    |||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  28890916 taggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 28890948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 226
Target Start/End: Original strand, 31035189 - 31035236
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattga 226  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31035189 acactagggttgggattgattcaccttgggaaacaccattaggattga 31035236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 33541507 - 33541446
Alignment:
Q  295 cattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  33541507 cattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggaaggctgctctctcccc 33541446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 35872553 - 35872477
Alignment:
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc 356  Q
    ||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  35872553 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 35872477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 185
Target Start/End: Original strand, 6376058 - 6376110
Alignment:
Q  134 aaacaaacaataaactagggtttt-agagatttctctaagagagagacactag 185  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  6376058 aaacaaacaacaaactagggtttagagagatttctctaagcgggagacactag 6376110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 192 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 14581 - 14354
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  14581 ggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 14483  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  14482 acccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 14385  T
Q  391 caaaattcgtgtgtgctctctttctttctctc 422  Q
    | |||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  14384 c-aaattcttgtgttctctcttcctttctctc 14354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Original strand, 15108 - 15271
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||| ||||| |   |||||||||||||||||    
T  15108 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattcagactttgggtagaattatg-cgggagacttattcttgta 15206  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 357  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  15207 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtggaacggaaggctgctgtctcccc 15271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 179 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 16863 - 16625
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||    |||    
T  16863 acactagggttgggattgattcaccttaggaaacactattaggattgagtcacttggtgacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-ccagag 16765  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggac 377  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  | |  |  ||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  16764 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgggacaaagggtttatctctcccccagaccaggtcagttttggac 16665  T
Q  378 tgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttcttt 417  Q
     |||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||    
T  16664 cgaactgggtaaacaaattttgtgtgttttctctttcttt 16625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 85319 - 85520
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||    |||||||||||||||||    
T  85319 ggttgattcaccttggaaaacactactaggattgagtcttttggttacgagaagagattgtgactttgagtagaatcagacg-ggagacttattcttgta 85417  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||| |||||||  ||||||    
T  85418 acccattgatatctctttcgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccccagactaggtca-atttgaactgaaccaggtaaa 85516  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  85517 caaa 85520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 179 - 427
Target Start/End: Original strand, 4886 - 5132
Alignment:
Q  179 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggag 278  Q
    ||||||| |||| | |||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  ||||  ||| |||||||   ||||    
T  4886 acactagagttgagtttgattcatgttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaagagattgaagcttttggtagaattagg-cgggag 4984  T
Q  279 acttattcttgtaactcattcatatctc-ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttgga 376  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  4985 acttatttttgtaacccattgatatctctttttgtaaagatactcatcattatagtggaacatagaactgctctctgccccagactaggtcagtattgga 5084  T
Q  377 ctgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgt 427  Q
    | ||| |||||||| |||||   ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5085 ccgaattgggtaaaaaaaat---tgtgttctctctttcttcctctcgctgt 5132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 183839 - 183640
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  183839 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg-gaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 183742  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc-cagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||| |||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  183741 acccattgatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccctcagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 183644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 194 - 394
Target Start/End: Original strand, 52102 - 52302
Alignment:
Q  194 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaac 293  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  52102 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattagg-tgggagactttttcttgtaac 52200  T
Q  294 tcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct---ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||||| | ||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||   ||||||| |||||||  |||||||  |||||||| ||    
T  52201 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtca-atttggaccaaactgggtcaa 52298  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  52299 caaa 52302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 4085 - 4284
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  4085 ggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 4183  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaac 391  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||| |||| |||    
T  4184 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaaccgggtcaac 4281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 79274 - 79474
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  79274 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagaatttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 79372  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  |||||||  |||||||| ||    
T  79373 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccaaactgggtcaa 79470  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  79471 caaa 79474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 1651 - 1452
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  1651 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 1553  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  1552 acccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 1456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 11672 - 11472
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||| |||||||||||||    
T  11672 ggttgattttccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggatacttattcttgta 11574  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| |||||||||  |||   ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| |||| |||| ||    
T  11573 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaaccgggtcaa 11476  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  11475 caaa 11472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 69490 - 69291
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  69490 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 69392  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  69391 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 69295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 79949 - 80148
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| | |||||   |||||||||||| ||||    
T  79949 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtaga-ttaggca-ggagacttattcctgta 80046  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||||||| | ||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||||| ||    
T  80047 actcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggattgaactgggtcaa 80144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 188424 - 188338
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactca 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  188424 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca 188338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 6288 - 6488
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||| ||||||||||    
T  6288 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagatttattcttgt 6386  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| | |||||||||  |||||||| |||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||| || |    
T  6387 aacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgagtca 6483  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  6484 acaaa 6488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 130 - 330
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgt 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   ||| ||||||||||||    
T  130 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggaaacttattcttgt 228  T
Q  291 aactcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaa 389  Q
    ||| |||| || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |    
T  229 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 325  T
Q  390 acaaa 394  Q
    |||||    
T  326 acaaa 330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 29260 - 29459
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  29260 ggttgattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattagg-caggagacttattcttgta 29358  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    ||||||| || |||| |||||||   ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  29359 actcattgatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 29455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 41682 - 41482
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||  ||| ||||| |   |||||||||||||||||    
T  41682 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttcggtagaatta-gacgggagacttattcttgta 41584  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||| | |||| | ||||||||| ||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||| ||    
T  41583 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtga-atttggaccgaactgggtcaa 41486  T
Q  391 caaa 394  Q
    ||||    
T  41485 caaa 41482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 209 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 57613 - 57367
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagatt-gagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctct 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| | ||||||| ||  ||||||||||| |||  |||||||||||| | || |||||| |    
T  57613 aaacactattaggattgaatctcttggtcattggaagagattcgggactttgggtggaattaggtttgaagatctattcttgtaaccctttgatatctat 57514  T
Q  308 tttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgc 406  Q
    ||||||||| ||||||| | |||| |||||| ||   ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||| | || ||||||||      
T  57513 tttgtaaagttactcattaatataatggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcagtattggacggaactaggtaaaaacaaatcgtgtgt-- 57416  T
Q  407 tctctttctttctctcgctgtcttttttctacgtttgtttgtgtttataact 458  Q
    ||||| |||||||||| |||| || | |||   |||| ||||||||||||||    
T  57415 tctctctctttctctcactgttttctatct---tttgattgtgtttataact 57367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 192 - 358
Target Start/End: Original strand, 2130 - 2294
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||  || ||||||| ||| |||||||   ||| |||||||||||||    
T  2130 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattagg-cgggaaacttattcttgta 2228  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccca 358  Q
    || |||| || |||||||||||| | | ||||||| ||||||| | |||| | || |||||||||||    
T  2229 acccattaatttctcttttgtaacgttcctcatca-tatagtgaatcggagggctactctctcccca 2294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 208 - 394
Target Start/End: Original strand, 22221 - 22404
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctc 306  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   | |||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  22221 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cggaagac-tattcttgtaactcattgatttctc 22318  T
Q  307 ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
     ||||||| | |||||||||  |||||||| |||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  22319 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 22404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 208 - 394
Target Start/End: Original strand, 24496 - 24679
Alignment:
Q  208 gaaacactattaggattgaa-tctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctc 306  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||   | |||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  24496 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cggaagac-tattcttgtaactcattgatttctc 24593  T
Q  307 ttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaa 394  Q
     ||||||| | |||||||||  |||||||| |||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  24594 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 24679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 396
Target Start/End: Original strand, 2969 - 3170
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgta 291  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||  |  ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  2969 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggcttggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 3067  T
Q  292 actcattcatatctcttttgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc-agattaggtcagttttggactgaactgggtaaa 390  Q
    || |||| || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| | ||||| ||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||| || ||    
T  3068 acccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctatctccccgagactaggtca-atttggaccgaactgagtcaa 3164  T
Q  391 caaaat 396  Q
    ||||||    
T  3165 caaaat 3170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 422
Target Start/End: Original strand, 16328 - 16534
Alignment:
Q  212 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctcttttg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||   ||||||| ||||    
T  16328 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttggaactca---atatctc-tttg 16422  T
Q  312 taaagctactc--atcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagattaggtcagttttggactgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtgctc 408  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||  || |||||  ||    
T  16423 taaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgt--tc 16520  T
Q  409 tctttctttctctc 422  Q
    | ||||||||||||    
T  16521 tttttctttctctc 16534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 355
Target Start/End: Original strand, 224819 - 224961
Alignment:
Q  209 aaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattaggtttggagacttattcttgtaactcattcatatctctt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||| |    
T  224819 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 224913  T
Q  309 ttgtaaagctactca-tcattatagtggaacggatgactgctctctcc 355  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||    
T  224914 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcc 224961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 271
Target Start/End: Original strand, 35728 - 35807
Alignment:
Q  192 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagagattgagactttgcgtaaaattagg 271  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||    
T  35728 ggttaattcacctagggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 35807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University