View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2131_low_4 (Length: 682)

Name: NF2131_low_4
Description: NF2131
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2131_low_4
NF2131_low_4
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (17-677)||(1546666-1547328)
chr5 (76-151)||(1543317-1543392)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (339-677)||(39966-40304)
[»] chr1 (5 HSPs)
chr1 (339-676)||(24209162-24209499)
chr1 (348-676)||(45033799-45034127)
chr1 (339-676)||(45028943-45029276)
chr1 (557-670)||(19329440-19329553)
chr1 (339-474)||(9933100-9933235)
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (348-676)||(33165187-33165515)
chr6 (340-677)||(16593814-16594153)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (339-677)||(40271153-40271492)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (339-677)||(31048-31386)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (339-474)||(48100382-48100517)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 624; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 624; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 1547328 - 1546666
Alignment:
Q  17 aaatattccttcgagtgattcataaggtctgttactactactttatacaccacttcaacaattacattttccaactcatggtcaagagtccactagagcg 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1547328 aaatattcctttgagtgattcataaggtctgtcactactactttatacaccacttcaacaattacattttccaactcatggtcaagagtccactagagcg 1547229  T
Q  117 ccgagagtatggcacaagcctcgcattcaactgttggaagattacgaggaggagtacatagcgccacacaagcatattgagtctcaaatgcgcataccat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1547228 ccgagagtatggcacaagcctcgcattcaactgttggaagattacgaggaggagtacatagcgccacacaagcatattgagtctcaaatgcgcataccat 1547129  T
Q  217 aagaatatataaccatgttcctcagaaaactcagcatcattcttacacttaagagtgtctatcaaggaagaaacctactgatcttcaaaagcaactcgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1547128 aagaatatataaccatgttcctcagaaaactcagcatcattcttacacttaagagtgtctatcaaggaagaaacccactgatcttcaaaagcaactcgat 1547029  T
Q  317 ggattccacttttcagtgcagtgattatgtgtgtcgtttgaagaagtcactttatggtctcaagcaagcgcccagagc--atggtaccaacgttttgctg 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1547028 ggattccacttttcagtgcagtgattatgtgtgtcgtttgaagaagtcactttatggtctcaagcaagcgcccagagcatatggtaccaacgttttgctg 1546929  T
Q  415 actatgtatccaccaccggtttccgacatagcacatcataccactctctcttcatatatcaacaacagtctgacatggcctacagtcttctccatgtgga 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  1546928 actatgtatccaccaccggtttccgacatagcacatcataccactctctcttcatatatcaacaacagtctgacatcgcctacagtcttctctatgtgga 1546829  T
Q  515 cgacatcatacttatcacctcttctcatgcccttcacaaatcaattatgtcactcttagcatctgaatttgcgatgaaggacctggggcccttgagttat 614  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1546828 cgacatcatacttatcacctcttctcatgcccttcacaaatcaattatgtcactcttagcatctgaatttgcgatgaaggacctgggacccttgagttat 1546729  T
Q  615 tttttgggtattgttgtatctcatcatcctggtggcctttttcttagtcaaagcacctatgct 677  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1546728 gttttgggtattgttgtatctcatcatcctggtggcctttttcttagtcaaagcacctatgct 1546666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 1543392 - 1543317
Alignment:
Q  76 aattacattttccaactcatggtcaagagtccactagagcgccgagagtatggcacaagcctcgcattcaactgtt 151  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||| |||| |||| | | |||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  1543392 aattacattatccaactcatagtctagaatccattagaacactgagagtaacgcacaagccttgcattcaactgtt 1543317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 215; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 339 - 677
Target Start/End: Original strand, 39966 - 40304
Alignment:
Q  339 gattatgtgtgtcgtttgaagaagtcactttatggtctcaagcaagcgcccagagcatggtaccaacgttttgctgactatgtatccaccaccggtttcc 438  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  || || |    
T  39966 gattatgtttgtcgtttgaagaagtcactttatggtctcaagcaagcgcctcgagcatggtaccaacgctttgctgactatgtaactaccattgggtttc 40065  T
Q  439 gacatagcacatcataccactctctcttcatatatcaacaacagtctgacatggcctacagtcttctccatgtggacgacatcatacttatcacctcttc 538  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||| |    
T  40066 gacatagcacatcagaccactctctcttcatatatcgacaacactctgacatggcctacattcttctctatgtggatgacatcatccttattacctctac 40165  T
Q  539 tcatgcccttcacaaatcaattatgtcactcttagcatctgaatttgcgatgaaggacctggggcccttgagttattttttgggtattgttgtatctcat 638  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||      
T  40166 tcatgcccttcgcaaatcaattatgtcactcttagcatctgaatttgcaatgaaggatctgggtctcttaagttattttttgggtattgctgtctctcgc 40265  T
Q  639 catcctggtggcctttttcttagtcaaagcacctatgct 677  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  40266 catcctggtggcatttttctaagtcaaagcacctatgct 40304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 142; Significance: 4e-74; HSPs: 5)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 339 - 676
Target Start/End: Original strand, 24209162 - 24209499
Alignment:
Q  339 gattatgtgtgtcgtttgaagaagtcactttatggtctcaagcaagcgcccagagcatggtaccaacgttttgctgactatgtatccaccaccggtttcc 438  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||| |    
T  24209162 gattacgtttgtcgtttgaagaagtcgctttatggtctcaagcaagtgcctcgagcatggtaccaacgctttgctgactatgtaactaccattggttttc 24209261  T
Q  439 gacatagcacatcataccactctctcttcatatatcaacaacagtctgacatggcctacagtcttctccatgtggacgacatcatacttatcacctcttc 538  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||| | ||| || || ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| || ||||| || ||  |    
T  24209262 gacatagcacatcagatcattctctcttcatataccgacagcaatccgacatggcctacattctgctctatgtggacgacattatccttattacttccac 24209361  T
Q  539 tcatgcccttcacaaatcaattatgtcactcttagcatctgaatttgcgatgaaggacctggggcccttgagttattttttgggtattgttgtatctcat 638  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||  |||| ||| |||| ||||||||||||||||  || |||| |    
T  24209362 tcatgcccttcgccaatccattatgtccctcttggcatccgagtttgcaatgaaggatttgggtcccctgagctattttttgggtattgccgtctctcgt 24209461  T
Q  639 catcctggtggcctttttcttagtcaaagcacctatgc 676  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  24209462 catcctggtggtctctttctcagtcaaagcacctatgc 24209499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 348 - 676
Target Start/End: Original strand, 45033799 - 45034127
Alignment:
Q  348 tgtcgtttgaagaagtcactttatggtctcaagcaagcgcccagagcatggtaccaacgttttgctgactatgtatccaccaccggtttccgacatagca 447  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||  | ||| ||||||||||    
T  45033799 tgtcgtttgaagaagtcgctttatggtctcaagcaagcgcctcgagcatggtaccaacgctttgctgactatgtaattaccattgtttttcgacatagca 45033898  T
Q  448 catcataccactctctcttcatatatcaacaacagtctgacatggcctacagtcttctccatgtggacgacatcatacttatcacctcttctcatgccct 547  Q
    ||||| | || |||||||||||||| | ||| || || ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||| || ||  ||||||||||    
T  45033899 catcagatcattctctcttcatataccgacagcaatccgacatggcctacattctgctctatgtggacgacatcatccttattacttccactcatgccct 45033998  T
Q  548 tcacaaatcaattatgtcactcttagcatctgaatttgcgatgaaggacctggggcccttgagttattttttgggtattgttgtatctcatcatcctggt 647  Q
    || | |||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||  |||| ||| |||| ||||||||||||||||  || |||| ||||||||||    
T  45033999 tcgccaatccattatgtccctcttggcatccgagtttgcaatgaaggatttgggtcccctgagctattttttgggtattgccgtctctcgtcatcctggt 45034098  T
Q  648 ggcctttttcttagtcaaagcacctatgc 676  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||    
T  45034099 ggtctctttctcagtcaaagcacctatgc 45034127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 339 - 676
Target Start/End: Original strand, 45028943 - 45029276
Alignment:
Q  339 gattatgtgtgtcgtttgaagaagtcactttatggtctcaagcaagcgcccagagcatggtaccaacgttttgctgactatgtatccaccaccggtttcc 438  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||| |    
T  45028943 gattacgtttgtcgtttgaagaagtcgctttatggtctcaagcaagtgcctcgagcatggtaccaacgctttgctgactatgtaactaccattggttttc 45029042  T
Q  439 gacatagcacatcataccactctctcttcatatatcaacaacagtctgacatggcctacagtcttctccatgtggacgacatcatacttatcacctcttc 538  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||| | ||| || || ||||||||||||| ||| |    ||||||||||||||| ||||| || ||  |    
T  45029043 gacatagcacatcagatcattctctcttcatataccgacagcaatccgacatggcctacattctgc----tgtggacgacatcatccttattacttccac 45029138  T
Q  539 tcatgcccttcacaaatcaattatgtcactcttagcatctgaatttgcgatgaaggacctggggcccttgagttattttttgggtattgttgtatctcat 638  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||  |||| ||  |||| ||||||||||||||||  || |||| |    
T  45029139 tcatgcccttcgccaatccattatgtccctcttggcatccgagtttgcaatgaaggatttgggtcctctgagctattttttgggtattgccgtctctcgt 45029238  T
Q  639 catcctggtggcctttttcttagtcaaagcacctatgc 676  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  45029239 catcctggtggtctctttctcagtcaaagcacctatgc 45029276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 557 - 670
Target Start/End: Original strand, 19329440 - 19329553
Alignment:
Q  557 aattatgtcactcttagcatctgaatttgcgatgaaggacctggggcccttgagttattttttgggtattgttgtatctcatcatcctggtggccttttt 656  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||    
T  19329440 aattatgtcactcctagcatctgagtttgcattgaaggacttggggcccctgagttcttttttgggtattgctgtatctcgtcatcctggtgcaattttt 19329539  T
Q  657 cttagtcaaagcac 670  Q
    || |||||||||||    
T  19329540 ctcagtcaaagcac 19329553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 9933235 - 9933100
Alignment:
Q  339 gattatgtgtgtcgtttgaagaagtcactttatggtctcaagcaagcgcccagagcatggtaccaacgttttgctgactatgtatccaccaccggtttcc 438  Q
    |||||||||||||| |||   || ||||| |||||||| |||||||||||  | || |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||  || ||||    
T  9933235 gattatgtgtgtcgcttgcgaaaatcactgtatggtctaaagcaagcgcctcgtgcctggtaccagcgttttgcagactttgtctccaccattggattcc 9933136  T
Q  439 gacatagcacatcataccactctctcttcatatatc 474  Q
      |||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||    
T  9933135 agcatagcacttcagatcactcccttttcatctatc 9933100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 348 - 676
Target Start/End: Original strand, 33165187 - 33165515
Alignment:
Q  348 tgtcgtttgaagaagtcactttatggtctcaagcaagcgcccagagcatggtaccaacgttttgctgactatgtatccaccaccggtttccgacatagca 447  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||  | ||| ||||||||||    
T  33165187 tgtcgtttgaagaagtcgctttatggtctcaagcaagcgcctcgagcatggtaccaacgctttgctgactatgtaattaccattgtttttcgacatagca 33165286  T
Q  448 catcataccactctctcttcatatatcaacaacagtctgacatggcctacagtcttctccatgtggacgacatcatacttatcacctcttctcatgccct 547  Q
    ||||| | || |||||||||||||| | ||| || || ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| || ||||| || ||  ||||||||||    
T  33165287 catcagatcattctctcttcatataccgacagcaatccgacatggcctacattctgctctatgtggacgacattatccttattacttccactcatgccct 33165386  T
Q  548 tcacaaatcaattatgtcactcttagcatctgaatttgcgatgaaggacctggggcccttgagttattttttgggtattgttgtatctcatcatcctggt 647  Q
    || | |||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||  |||| ||| |||| ||||||||||||||||  || |||| ||||||||||    
T  33165387 tcgccaatccattatgtccctcttggcatccgagtttgcaatgaaggatttgggtcccctgagctattttttgggtattgccgtctctcgtcatcctggt 33165486  T
Q  648 ggcctttttcttagtcaaagcacctatgc 676  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||    
T  33165487 ggtctctttctcagtcaaagcacctatgc 33165515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 340 - 677
Target Start/End: Original strand, 16593814 - 16594153
Alignment:
Q  340 attatgtgtgtcgtttgaagaagtcactttatggtctcaagcaagcgcccagagcatggtaccaacgttttgctgactatgtatccaccaccggtttccg 439  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  || || ||    
T  16593814 attatgtctgtcgattaaagaagtccttgtatggtctcaagaaagcgcctagagcatggtaccaacgctttgctgactatgtcgccaccattggctttcg 16593913  T
Q  440 acatagcacatcataccactctctcttcatatatcaacaacagtctgacatggcctacagtcttctccatgtggacgacatcatacttatcacctcttct 539  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   || ||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||| || ||||||||  ||    
T  16593914 ccatagcacatcagaccactctctcttcatatatcgacaaggttcagacatggcctacattctgctttatgtagacgacatcattctcatcacctccact 16594013  T
Q  540 catgcccttcacaaatcaattatgtcactcttagc--atctgaatttgcgatgaaggacctggggcccttgagttattttttgggtattgttgtatctca 637  Q
    || | ||| | |||||| |||||||| ||| ||||  |||||| ||||| ||||||||  |||| ||  | ||||| |||||||||||||  |||||||     
T  16594014 caggtcctccgcaaatccattatgtccctcctagcatatctgagtttgcaatgaaggatttgggtcctctaagttactttttgggtattgcagtatctcg 16594113  T
Q  638 tcatcctggtggcctttttcttagtcaaagcacctatgct 677  Q
    ||||| || |||  | ||||| ||||||||||| ||||||    
T  16594114 tcatcttgatggtatatttctcagtcaaagcacttatgct 16594153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 339 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 40271492 - 40271153
Alignment:
Q  339 gattatgtgtgtcgtttgaagaagtcactttatggtctcaagcaagcgcccagagcatggtaccaacgttttgctgactatgtatccaccaccggtttcc 438  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||  || || |    
T  40271492 gattatgtttgtcggttgaagaaatccttgtatggtctcaagcaagcgcctagagcatggtaccaacgctttgctgactatgtcgccatcattggctttc 40271393  T
Q  439 gacatagcacatcataccactctctcttcatatatcaacaacagtctgacatggcctacagtcttctccatgtggacgacatcatacttatcacctcttc 538  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||   || ||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||| || ||||||||  |    
T  40271392 gccatagcacatcagaccactccctcttcatatatcgacaaggttcagacatggcctacattctgctgtatgtagacgacatcatcctcatcacctccac 40271293  T
Q  539 tcatgcccttcacaaatcaattatgtcactcttagcatctga-atttgcgatgaaggacctggggcccttgagttattttttgggtattgttgtatctca 637  Q
    ||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||  |||| ||  ||||||| ||| |||||||||  |||||||     
T  40271292 tcaggtcctccgcaaatcaattatgtcactcttagcatctgagttttgcaatgaaggatttgggccctctgagttactttctgggtattgcagtatctcg 40271193  T
Q  638 tcatcctggtggcctttttcttagtcaaagcacctatgct 677  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||| || ||||||    
T  40271192 tcatcctgatggcatatttctcagtcaaagtacttatgct 40271153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 339 - 677
Target Start/End: Original strand, 31048 - 31386
Alignment:
Q  339 gattatgtgtgtcgtttgaagaagtcactttatggtctcaagcaagcgcccagagcatggtaccaacgttttgctgactatgtatccaccaccggtttcc 438  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||   | || |    
T  31048 gattatgtatgtcggctgaagaagtccttgtatggtctcaagcaagcgcctagagcatggtaccaacgtttcgctgactatgtcaccaccattcgctttc 31147  T
Q  439 gacatagcacatcataccactctctcttcatatatcaacaacagtctgacatggcctacagtcttctccatgtggacgacatcatacttatcacctcttc 538  Q
    | |||||||||||| || ||||  |||||||||||| ||||   |  ||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||| ||| || |||| |||  |    
T  31148 gccatagcacatcagacaactccatcttcatatatcgacaaggtttagacatggcctacattctgctgtatgtagacgacaccatcctcatcatctccac 31247  T
Q  539 tcatgcccttcacaaatcaattatgtcactcttagcatctgaatttgcgatgaaggacctggggcccttgagttattttttgggtattgttgtatctcat 638  Q
    ||| | |||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||  ||||||| ||| ||||||||  |||||||| |    
T  31248 tcaggtcctctgtaaatcaattatgtcactcttagcatctgagtttgcaatgaaggatttgggccctctgagttactttctgggtatttctgtatctcgt 31347  T
Q  639 catcctggtggcctttttcttagtcaaagcacctatgct 677  Q
    ||||||| |||| | ||||| ||||||||||| ||||||    
T  31348 catcctgatggcatatttctcagtcaaagcacttatgct 31386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 48100517 - 48100382
Alignment:
Q  339 gattatgtgtgtcgtttgaagaagtcactttatggtctcaagcaagcgcccagagcatggtaccaacgttttgctgactatgtatccaccaccggtttcc 438  Q
    |||||||||||||| |||   || ||||| |||||||| |||||||||||  | || |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||  || ||||    
T  48100517 gattatgtgtgtcgcttgcgaaaatcactgtatggtctaaagcaagcgcctcgtgcctggtaccagcgttttgcagactttgtctccaccattggattcc 48100418  T
Q  439 gacatagcacatcataccactctctcttcatatatc 474  Q
      |||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||    
T  48100417 agcatagcacttcagatcactcccttttcatctatc 48100382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University