View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21324_low_10 (Length: 380)

Name: NF21324_low_10
Description: NF21324
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21324_low_10
NF21324_low_10
[»] chr3 (45 HSPs)
chr3 (1-363)||(6110182-6110543)
chr3 (1-363)||(15600612-15600973)
chr3 (1-363)||(15607157-15607518)
chr3 (1-363)||(10572320-10572681)
chr3 (1-363)||(10579083-10579444)
chr3 (1-363)||(16482211-16482572)
chr3 (1-363)||(17780846-17781207)
chr3 (1-363)||(18522781-18523142)
chr3 (1-363)||(8490606-8490974)
chr3 (1-360)||(15357314-15357672)
chr3 (1-363)||(13211420-13211781)
chr3 (1-360)||(15341947-15342305)
chr3 (1-363)||(13248725-13249086)
chr3 (1-347)||(18520109-18520454)
chr3 (1-363)||(32056627-32056989)
chr3 (1-363)||(17199912-17200273)
chr3 (1-363)||(13516929-13517286)
chr3 (1-363)||(17136477-17136832)
chr3 (1-363)||(1647249-1647610)
chr3 (2-343)||(29925109-29925449)
chr3 (2-343)||(29974262-29974602)
chr3 (2-359)||(16200553-16200908)
chr3 (5-310)||(21034229-21034528)
chr3 (5-310)||(15846548-15846847)
chr3 (9-310)||(20147570-20147865)
chr3 (11-313)||(24253130-24253427)
chr3 (5-301)||(21398792-21399082)
chr3 (263-363)||(19089734-19089834)
chr3 (5-310)||(55427012-55427311)
chr3 (5-301)||(14890391-14890681)
chr3 (5-310)||(12299902-12300200)
chr3 (5-349)||(25978740-25979078)
chr3 (242-359)||(16200247-16200363)
chr3 (91-310)||(14147012-14147226)
chr3 (27-226)||(15526827-15527021)
chr3 (216-318)||(9504446-9504548)
chr3 (5-310)||(11787578-11787877)
chr3 (67-260)||(32280313-32280507)
chr3 (5-298)||(15317188-15317472)
chr3 (5-179)||(28088227-28088396)
chr3 (190-305)||(8251933-8252048)
chr3 (320-363)||(18640792-18640835)
chr3 (132-262)||(28953965-28954093)
chr3 (31-142)||(30464151-30464261)
chr3 (255-325)||(19345725-19345795)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (1-363)||(2049-2410)
scaffold0234 (1-363)||(10940-11301)
[»] chr8 (41 HSPs)
chr8 (1-363)||(21940783-21941144)
chr8 (1-363)||(22171605-22171966)
chr8 (1-363)||(6094241-6094602)
chr8 (1-363)||(24642767-24643127)
chr8 (1-257)||(15326422-15326677)
chr8 (1-257)||(15506791-15507046)
chr8 (60-359)||(14983710-14984004)
chr8 (1-134)||(28548393-28548526)
chr8 (5-310)||(8371265-8371564)
chr8 (5-310)||(21969324-21969623)
chr8 (108-306)||(24797224-24797419)
chr8 (9-359)||(38232115-38232462)
chr8 (5-310)||(12562114-12562413)
chr8 (9-310)||(27007533-27007828)
chr8 (9-310)||(27014676-27014971)
chr8 (9-310)||(27880503-27880798)
chr8 (9-310)||(28020684-28020979)
chr8 (9-310)||(22130625-22130920)
chr8 (9-310)||(25611186-25611481)
chr8 (5-300)||(22659506-22659795)
chr8 (9-310)||(21916667-21916962)
chr8 (5-310)||(45534285-45534584)
chr8 (280-363)||(28555001-28555084)
chr8 (5-310)||(26240475-26240774)
chr8 (90-310)||(18835341-18835556)
chr8 (174-343)||(32872741-32872910)
chr8 (5-233)||(6430953-6431176)
chr8 (78-225)||(8781959-8782102)
chr8 (158-278)||(2375214-2375332)
chr8 (3-100)||(24796731-24796826)
chr8 (5-310)||(2962944-2963247)
chr8 (204-298)||(29645537-29645631)
chr8 (20-143)||(29645674-29645797)
chr8 (194-301)||(36970265-36970371)
chr8 (227-325)||(24535471-24535569)
chr8 (5-106)||(36970439-36970539)
chr8 (202-254)||(10920427-10920479)
chr8 (168-227)||(34659059-34659118)
chr8 (1-106)||(2375411-2375516)
chr8 (5-53)||(41368106-41368154)
chr8 (5-53)||(41375077-41375125)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (1-363)||(17684197-17684558)
chr6 (1-363)||(27380980-27381341)
chr6 (1-363)||(27471363-27471724)
chr6 (1-363)||(29309008-29309369)
chr6 (1-363)||(29315968-29316328)
chr6 (1-363)||(17691168-17691529)
chr6 (1-363)||(11651841-11652202)
chr6 (1-363)||(188705-189066)
chr6 (1-233)||(27296877-27297108)
chr6 (1-267)||(16394173-16394438)
chr6 (1-235)||(25536919-25537152)
chr6 (1-216)||(16559200-16559414)
chr6 (10-352)||(13359010-13359347)
chr6 (211-363)||(16566257-16566409)
chr6 (9-310)||(16789062-16789357)
chr6 (9-310)||(22859904-22860199)
chr6 (5-310)||(27508359-27508658)
chr6 (7-310)||(27527947-27528244)
chr6 (5-310)||(1586120-1586419)
chr6 (263-363)||(25537148-25537248)
chr6 (3-298)||(2669476-2669768)
chr6 (172-359)||(27925876-27926062)
chr6 (37-310)||(18019885-18020152)
chr6 (5-310)||(14074471-14074770)
chr6 (15-310)||(10359073-10359360)
chr6 (171-361)||(17850392-17850581)
chr6 (5-310)||(8612906-8613209)
chr6 (178-325)||(28172712-28172859)
chr6 (177-359)||(20553492-20553672)
chr6 (78-349)||(20736413-20736678)
chr6 (62-248)||(8510155-8510338)
chr6 (166-287)||(19347092-19347212)
chr6 (206-310)||(13995151-13995254)
chr6 (90-233)||(21994655-21994794)
chr6 (8-233)||(17120520-17120740)
chr6 (90-303)||(19218427-19218630)
chr6 (121-302)||(22560311-22560487)
chr6 (5-106)||(33317055-33317155)
chr6 (71-134)||(28172899-28172963)
chr6 (167-226)||(5758650-5758709)
chr6 (10-143)||(28756145-28756277)
chr6 (90-303)||(4073574-4073781)
chr6 (96-141)||(17850321-17850366)
[»] chr4 (57 HSPs)
chr4 (1-363)||(18262330-18262691)
chr4 (1-363)||(18269191-18269552)
chr4 (1-363)||(868715-869076)
chr4 (1-363)||(55612801-55613162)
chr4 (1-363)||(19926488-19926849)
chr4 (1-363)||(26963758-26964119)
chr4 (1-363)||(26970581-26970942)
chr4 (1-363)||(5707438-5707799)
chr4 (1-363)||(5714066-5714427)
chr4 (1-363)||(10621061-10621422)
chr4 (1-363)||(8858285-8858646)
chr4 (1-363)||(10628140-10628501)
chr4 (1-363)||(28392862-28393223)
chr4 (1-363)||(8845321-8845682)
chr4 (1-362)||(4426344-4426692)
chr4 (2-359)||(35223682-35224038)
chr4 (2-343)||(5667858-5668194)
chr4 (2-340)||(20311433-20311768)
chr4 (1-226)||(10677311-10677534)
chr4 (1-226)||(10890951-10891174)
chr4 (5-310)||(15461488-15461787)
chr4 (5-310)||(34975542-34975841)
chr4 (9-310)||(2677004-2677299)
chr4 (9-310)||(15815012-15815307)
chr4 (9-310)||(18111059-18111354)
chr4 (11-310)||(17299977-17300270)
chr4 (169-312)||(56516225-56516368)
chr4 (5-310)||(3369035-3369334)
chr4 (5-310)||(18163153-18163452)
chr4 (5-310)||(20243928-20244227)
chr4 (9-310)||(26531604-26531899)
chr4 (5-310)||(4675995-4676294)
chr4 (94-245)||(21453961-21454110)
chr4 (9-301)||(19365519-19365806)
chr4 (5-300)||(5870419-5870708)
chr4 (5-310)||(1941715-1942014)
chr4 (6-319)||(32646536-32646846)
chr4 (9-359)||(5616335-5616681)
chr4 (10-233)||(19362477-19362695)
chr4 (95-310)||(32636475-32636685)
chr4 (9-310)||(5528495-5528790)
chr4 (219-297)||(24700213-24700291)
chr4 (257-359)||(10677538-10677638)
chr4 (257-359)||(10891178-10891278)
chr4 (5-226)||(9487625-9487841)
chr4 (5-214)||(30040501-30040705)
chr4 (78-310)||(4546071-4546298)
chr4 (9-226)||(9538033-9538244)
chr4 (71-121)||(24701361-24701411)
chr4 (90-245)||(33888594-33888743)
chr4 (172-254)||(34777893-34777975)
chr4 (4-211)||(11421096-11421298)
chr4 (264-344)||(39074190-39074270)
chr4 (243-325)||(9937933-9938015)
chr4 (21-102)||(9937745-9937826)
chr4 (265-310)||(11421007-11421052)
chr4 (265-310)||(30040740-30040785)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (1-363)||(18252148-18252509)
chr1 (1-363)||(18532242-18532603)
chr1 (1-363)||(27131138-27131498)
chr1 (1-363)||(27310305-27310666)
chr1 (1-363)||(16358763-16359124)
chr1 (2-359)||(36816363-36816718)
chr1 (1-343)||(3855647-3855988)
chr1 (121-363)||(21171081-21171322)
chr1 (1-359)||(27277286-27277642)
chr1 (2-275)||(22641603-22641871)
chr1 (161-342)||(22657108-22657289)
chr1 (5-310)||(19706451-19706750)
chr1 (1-325)||(23507056-23507377)
chr1 (5-310)||(43802377-43802676)
chr1 (5-310)||(28134735-28135034)
chr1 (71-347)||(12014084-12014357)
chr1 (9-310)||(9456107-9456402)
chr1 (5-310)||(20391251-20391550)
chr1 (9-310)||(20779661-20779956)
chr1 (9-310)||(22670273-22670568)
chr1 (9-310)||(42817005-42817300)
chr1 (2-186)||(9916506-9916688)
chr1 (192-359)||(9917837-9918003)
chr1 (5-310)||(22612483-22612782)
chr1 (13-301)||(633934-634216)
chr1 (5-310)||(8727658-8727957)
chr1 (5-310)||(47667497-47667785)
chr1 (169-310)||(35930573-35930713)
chr1 (196-344)||(12006461-12006609)
chr1 (9-233)||(29096789-29097008)
chr1 (93-226)||(21881475-21881604)
chr1 (167-293)||(26923553-26923678)
chr1 (5-106)||(28145735-28145835)
chr1 (173-226)||(51997353-51997406)
chr1 (60-140)||(12006332-12006413)
chr1 (80-246)||(24301691-24301855)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (1-363)||(6662-7023)
scaffold0390 (1-363)||(13678-14039)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (1-363)||(18406-18766)
[»] chr7 (47 HSPs)
chr7 (1-363)||(15152561-15152922)
chr7 (1-363)||(29327902-29328263)
chr7 (1-360)||(11535790-11536148)
chr7 (1-360)||(11542708-11543066)
chr7 (1-363)||(12750944-12751305)
chr7 (1-363)||(12738654-12739015)
chr7 (5-363)||(18561125-18561473)
chr7 (1-359)||(13392272-13392629)
chr7 (5-359)||(18257577-18257927)
chr7 (9-310)||(2204543-2204838)
chr7 (9-310)||(18400095-18400390)
chr7 (9-310)||(18407079-18407374)
chr7 (9-310)||(48808512-48808807)
chr7 (5-301)||(8464999-8465289)
chr7 (260-363)||(15148260-15148363)
chr7 (5-310)||(30254129-30254428)
chr7 (5-310)||(15729742-15730041)
chr7 (5-310)||(18139350-18139649)
chr7 (5-310)||(19230879-19231178)
chr7 (11-234)||(2365169-2365389)
chr7 (5-233)||(41680980-41681203)
chr7 (5-310)||(47166871-47167170)
chr7 (5-310)||(10668913-10669213)
chr7 (15-300)||(24443349-24443628)
chr7 (169-282)||(10235361-10235474)
chr7 (5-310)||(28130552-28130851)
chr7 (15-303)||(25845498-25845780)
chr7 (15-303)||(25845917-25846199)
chr7 (31-310)||(19393462-19393735)
chr7 (78-309)||(19388544-19388774)
chr7 (5-226)||(34128647-34128863)
chr7 (178-343)||(7662569-7662733)
chr7 (192-300)||(47833875-47833983)
chr7 (5-233)||(18259136-18259359)
chr7 (4-141)||(39112138-39112275)
chr7 (201-301)||(19859122-19859221)
chr7 (223-312)||(7396358-7396450)
chr7 (90-226)||(14591924-14592056)
chr7 (90-226)||(16011515-16011647)
chr7 (79-219)||(31190524-31190660)
chr7 (168-306)||(3132849-3132986)
chr7 (93-226)||(22969024-22969153)
chr7 (67-142)||(22948499-22948574)
chr7 (263-359)||(2365017-2365112)
chr7 (201-313)||(39111980-39112092)
chr7 (212-267)||(29983179-29983234)
chr7 (194-236)||(7396469-7396511)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (1-363)||(7225-7586)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (1-363)||(25718-26079)
[»] chr5 (36 HSPs)
chr5 (1-363)||(24695194-24695555)
chr5 (5-360)||(19714230-19714584)
chr5 (5-363)||(18569593-18569952)
chr5 (1-360)||(19706947-19707304)
chr5 (115-361)||(39538708-39538953)
chr5 (1-285)||(17298629-17298912)
chr5 (80-359)||(18806843-18807119)
chr5 (1-285)||(17285478-17285759)
chr5 (158-352)||(22546902-22547094)
chr5 (2-168)||(27347265-27347428)
chr5 (1-100)||(24701958-24702057)
chr5 (5-310)||(20941018-20941317)
chr5 (5-310)||(25805397-25805696)
chr5 (9-310)||(31890-32185)
chr5 (5-310)||(12789675-12789974)
chr5 (5-310)||(22941241-22941540)
chr5 (9-310)||(23545913-23546208)
chr5 (5-310)||(24933318-24933617)
chr5 (5-299)||(20100255-20100543)
chr5 (5-310)||(31096807-31097106)
chr5 (221-359)||(27347425-27347563)
chr5 (6-310)||(5097642-5097940)
chr5 (5-310)||(12765002-12765305)
chr5 (5-310)||(7865442-7865745)
chr5 (5-310)||(9811745-9812048)
chr5 (5-310)||(12703886-12704189)
chr5 (80-219)||(18806483-18806619)
chr5 (80-219)||(18806663-18806799)
chr5 (87-243)||(18829377-18829530)
chr5 (5-310)||(26245093-26245392)
chr5 (2-78)||(28719484-28719558)
chr5 (5-233)||(26129705-26129928)
chr5 (2-74)||(39538954-39539026)
chr5 (169-298)||(33477193-33477321)
chr5 (265-321)||(31267928-31267984)
chr5 (256-300)||(39535465-39535509)
[»] chr2 (29 HSPs)
chr2 (1-363)||(21329976-21330337)
chr2 (1-359)||(18796628-18796985)
chr2 (2-359)||(18619926-18620281)
chr2 (4-361)||(36270286-36270639)
chr2 (5-325)||(18822239-18822556)
chr2 (7-319)||(22183220-22183528)
chr2 (7-306)||(6991847-6992146)
chr2 (2-265)||(20978091-20978351)
chr2 (9-310)||(30174368-30174663)
chr2 (9-310)||(24250048-24250343)
chr2 (171-361)||(18851956-18852146)
chr2 (169-324)||(19279445-19279600)
chr2 (5-310)||(24229227-24229526)
chr2 (5-233)||(15342014-15342237)
chr2 (9-300)||(29800468-29800757)
chr2 (192-295)||(36801899-36802003)
chr2 (22-157)||(17241034-17241167)
chr2 (78-301)||(19616435-19616653)
chr2 (60-140)||(36799745-36799826)
chr2 (91-226)||(40301034-40301164)
chr2 (192-299)||(28741220-28741326)
chr2 (18-224)||(41316305-41316506)
chr2 (289-347)||(20978026-20978084)
chr2 (90-226)||(21626824-21626955)
chr2 (1-60)||(41661694-41661753)
chr2 (192-310)||(24763751-24763868)
chr2 (265-310)||(12098609-12098654)
chr2 (167-230)||(28718943-28719006)
chr2 (78-155)||(28740910-28740986)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (12-363)||(1111-1461)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (1-359)||(5651-6001)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (1-250)||(230119-230367)
scaffold0008 (298-363)||(230365-230430)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (5-310)||(174-473)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (9-310)||(3691-3986)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (9-310)||(119721-120016)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (5-310)||(12961-13260)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (31-310)||(130262-130535)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (5-310)||(67386-67685)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (90-310)||(8296-8511)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (17-301)||(40012-40290)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (178-324)||(90019-90166)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (4-233)||(26609-26833)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (21-310)||(8722-9005)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (5-184)||(102-276)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (90-226)||(83111-83243)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (5-226)||(11538-11758)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (5-300)||(53766-54054)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (171-262)||(45956-46051)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (265-310)||(15089-15134)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 45)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 6110543 - 6110182
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110543 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 6110444  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110443 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 6110345  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110344 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 6110245  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110244 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 6110182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 15600612 - 15600973
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600612 atggggtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 15600711  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600712 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 15600810  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600811 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 15600910  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600911 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 15600973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 15607157 - 15607518
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607157 atggggtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 15607256  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607257 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 15607355  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607356 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 15607455  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607456 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 15607518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 10572320 - 10572681
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10572320 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctacggtacatagtggttt 10572419  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572420 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacagttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 10572518  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572519 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 10572618  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572619 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 10572681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 10579083 - 10579444
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579083 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 10579182  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579183 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 10579281  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579282 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 10579381  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579382 ctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 10579444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 16482211 - 16482572
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482211 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 16482310  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482311 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 16482409  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482410 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 16482509  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16482510 ctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagagtagttt 16482572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 17780846 - 17781207
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17780846 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctattacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 17780945  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17780946 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataatttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 17781044  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781045 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatctatgatttgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 17781144  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781145 ctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagttt 17781207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18523142 - 18522781
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18523142 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 18523043  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18523042 caggtcgaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttcatggcggatcaatccaa 18522944  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522943 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 18522844  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18522843 ctatgcttaaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagttt 18522781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 8490974 - 8490606
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490974 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 8490875  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490874 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 8490776  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataa------ 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  8490775 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatcgtct 8490676  T
Q  295 -tagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8490675 gtagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacagatactttgagaatagttt 8490606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 15357314 - 15357672
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357314 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 15357413  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15357414 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaacccaa 15357512  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357513 tataaatattactcctaatttttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 15357612  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatag 360  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357613 ctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatag 15357672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 13211781 - 13211420
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  13211781 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctaggttacataatggttt 13211682  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13211681 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatata-ttatgacacttttcataacttttactatgtaatattctcatggcggatcaatccaa 13211583  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211582 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagttgtgatcatcagtctacctacataatagtct 13211483  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211482 ctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 13211420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 15341947 - 15342305
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15341947 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 15342046  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15342047 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataatttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaa 15342145  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342146 tataaatattactcctaatttttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 15342245  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatag 360  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342246 ctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatag 15342305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 13249086 - 13248725
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13249086 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctaggttacatagtggttt 13248987  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  13248986 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatata-ttatgacacttttcataacttttactatgtaatattctcatggcgaatcaatccaa 13248888  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248887 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagttgtgatcatcagtctacctacataatagtct 13248788  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13248787 ctatgctttaatgttatcccacttctcaacaaagcttgactacgaatactttgagaatagttt 13248725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18520454 - 18520109
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520454 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttatggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 18520355  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18520354 cagttcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatcaaa 18520256  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520255 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 18520156  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggat 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18520155 ctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggat 18520109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 32056627 - 32056989
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056627 atggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 32056726  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056727 caggttgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata-tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 32056825  T
Q  201 tataaatattactcctaata-tttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtc 299  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  32056826 tataaatattactcataatattttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcattagtctacccacataatagtc 32056925  T
Q  300 tctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32056926 tctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagtttgactacggacactttaagaatagttt 32056989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 17199912 - 17200273
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17199912 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgatacgaacaacatttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctaaggtacatagtggttt 17200011  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  17200012 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagcgggtcaatccaa 17200110  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17200111 tacaaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccacgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtct 17200210  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  17200211 ctatgctttaatgatatcacacatctcaataaagcttaactacggatactttaagaatagttt 17200273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 13517286 - 13516929
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13517286 atggagtacccatctaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgataaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 13517187  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  13517186 caggtcgaagggtgggg----ccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatttagtattctcatggaggatcaatccaa 13517092  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13517091 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtct 13516992  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  13516991 ctgtgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatcgttt 13516929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 17136832 - 17136477
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136832 atggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatgtttactaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 17136733  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17136732 caagtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata-tcttatgacactttcaataacttttactatgtagtattctcatggtgggtcaatccaa 17136634  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    |||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17136633 tataaatattactccta------atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaaatgtgatcatcagtctacccacataatagtct 17136540  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17136539 ctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagttt 17136477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 1647249 - 1647610
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1647249 atggagtactcatcaaccaaatttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtatatagtggttt 1647348  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  1647349 taggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgggaatat-cgtatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcgagtcaatcaaa 1647447  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1647448 tataaacattactcctaatatttatatctatgtgtagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatccacataatagtct 1647547  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  1647548 ctatgctttaattatatcccttttctcaataaagcttgattacggatactttaaaaatagttt 1647610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 2 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 29925449 - 29925109
Alignment:
Q  2 tggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttc 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  29925449 tggagtatccatcaaccaactttataatcatcttgttacagacaacgtttgattggtgacaaagcactcaactccaacgtctagggtacataatggtttc 29925350  T
Q  102 aggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaat 201  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || || ||||||||||    
T  29925349 aggtcaaatggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgcagtattctctaggtgggtcaatccaat 29925251  T
Q  202 ataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| | ||||||||| |||    
T  29925250 ataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttaatgactctttatccatgatctatgagatgtgatcatcgatctatccacataatagcctc 29925151  T
Q  302 tatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactac 343  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  29925150 catgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgactac 29925109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 2 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 29974602 - 29974262
Alignment:
Q  2 tggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttc 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  29974602 tggagtatccatcaaccaactttataatcatcttgttacagacaacgtttgattggtgacaaagcactcaactccaacgtctagggtacataatggtttc 29974503  T
Q  102 aggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaat 201  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || || ||||||||||    
T  29974502 aggtcaaatggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgcagtattctctaggtgggtcaatccaat 29974404  T
Q  202 ataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| | ||||||||| |||    
T  29974403 ataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttaatgactctttatccatgatctatgagatgtgatcatcgatctatccacataatagcctc 29974304  T
Q  302 tatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactac 343  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  29974303 catgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgactac 29974262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16200908 - 16200553
Alignment:
Q  2 tggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttc 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16200908 tggagtatccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacatttgaatggtgacaaagcactcgacttcaacatctagggtacatagtggtttc 16200809  T
Q  102 aggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaat 201  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16200808 aggtcaaagggttgaatacaccactatcactatgagaata-tcttatgatactttacataattttgactatgtagtattctcatggtgggtcaatccaat 16200710  T
Q  202 ataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 301  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  | ||| ||||||||     
T  16200709 atgaatattacacctaatatttgtatctatatgaatacttgataattctttatccatgatctgtaagatatgatcatcagtctctccaca-aatagtctt 16200611  T
Q  302 tatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 359  Q
     |||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  16200610 catgctttaatgacatcccacttcacaataaatcttgactacgaatactttaagaata 16200553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21034528 - 21034229
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||||||||||||    
T  21034528 agtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcagg 21034430  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  21034429 tctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatata 21034334  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |     
T  21034333 aatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgac 21034235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Original strand, 15846548 - 15846847
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  15846548 agtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 15846646  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  15846647 tctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatata 15846742  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |     
T  15846743 aatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgac 15846841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Original strand, 20147570 - 20147865
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  20147570 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 20147668  T
Q  109 agggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 208  Q
    || | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  20147669 agagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaata 20147764  T
Q  209 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  20147765 ttactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctt 20147863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 313
Target Start/End: Original strand, 24253130 - 24253427
Alignment:
Q  11 catcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaag 110  Q
    ||||||| |||||||| ||||  |||| |  ||||| ||||||| |   |||||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  24253130 catcaactaactttatggtcactctgtaattgacaatgtttgaacgacaacaaagtactcgagtcatacatctaaggtacatagtggttttaggtcgaat 24253229  T
Q  111 ggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatatt 210  Q
    | |||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||  |||   ||||| ||  ||||| | ||||||||||| || |||| |||||||||||||     
T  24253230 g-tggaatacaccgttatcactatgagaataa-cttatgatccttaa-ataacatt--ctatgcattattctcatggagggtcaaaccaatataaatata 24253324  T
Q  211 actcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 310  Q
    |||| |||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24253325 actcttaatgtttataagtatgtgaaaacttgataactctttatccataattcgtgagatatgatcattagtctaccgacataatagtctctatgcttta 24253424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 21399082 - 21398792
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  21399082 agtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagggatcatagtggtttcagg 21398984  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||  | ||||| | | |||||| ||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  21398983 tctaagagcgatatacattattatcattgtaagaata-tcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatata 21398888  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 301  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  21398887 aatattactcctaatatttatacctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgaggtcataagtctacatacataatagtctc 21398792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 263 - 363
Target Start/End: Original strand, 19089734 - 19089834
Alignment:
Q  263 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19089734 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgatttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtt 19089833  T
Q  363 t 363  Q
    |    
T  19089834 t 19089834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 55427311 - 55427012
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||||||||||||    
T  55427311 agtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcagg 55427213  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| |    |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||    
T  55427212 tctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatata 55427117  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |     
T  55427116 aatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgac 55427018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 14890681 - 14890391
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| ||||||| |  || |||| |||||||    
T  14890681 agtacccatcaaccaacgttataattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcacagtgctttcagg 14890583  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| |    |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  14890582 tctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatata 14890487  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14890486 aatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 14890391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12300200 - 12299902
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||||||||||||||    
T  12300200 agtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaatcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcagg 12300102  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||    
T  12300101 tctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatata 12300006  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |     
T  12300005 aatattactcctaacatttatatctatg-atagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgac 12299908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 349
Target Start/End: Original strand, 25978740 - 25979078
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  25978740 agtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 25978838  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||    
T  25978839 tctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatat-cttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtctatccagtata 25978934  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | | ||||||| || |||||||||||||| |     
T  25978935 aatattactcctaataattatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggttatcagtcaacatacataatagtctcgac 25979033  T
Q  305 gctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatac 349  Q
    |||||| |  ||||| | |||  |  |||||||||||||||||||    
T  25979034 gctttattattatcctaattcatattaaagcttgactacggatac 25979078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 242 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16200363 - 16200247
Alignment:
Q  242 gataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgact 341  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  16200363 gataactctttatccatgatctgtaagatatgatcatcagtctctccaca-aatagtctccatgctttaatgatatcccacttcacaataaatcttgact 16200265  T
Q  342 acggatactttgagaata 359  Q
    ||| ||||||| ||||||    
T  16200264 acgaatactttaagaata 16200247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 91 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14147226 - 14147012
Alignment:
Q  91 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 190  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  |||||||  ||||| | ||||||||| |||| |||| |||||||||| |  ||||||||| ||||||| ||| |    
T  14147226 atagtggtttcaggtctaagagtgatatacacctttatcaatgtgagaatat-cttacgaca-ttttcataacat--actatgtagcattctcacggcag 14147131  T
Q  191 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 290  Q
     |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  ||||||||| |  ||||||||| |||||||||||| ||     
T  14147130 gtcaatccagtataaatattcctcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatccatgacccatgagatgtggtcatcagtctacatat 14147032  T
Q  291 ataatagtctctatgcttta 310  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  14147031 ataatagtctctgtgcttta 14147012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15527021 - 15526827
Alignment:
Q  27 agtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact 126  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||| || ||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |    
T  15527021 agtcatgctgttacagacaacgtttgaatggttataaagcacttgagtcca-catgtatggatcatagtggtttcaggtctaagagtggtatacaccatt 15526923  T
Q  127 atcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 226  Q
    | || | | ||||||| ||||||||| |||||||| | |  ||||| ||||| ||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  15526922 aacattgtaagaatat-cttatgaca-ttttcatagcat--actatttagtactctcacgatgggtcaatccagtataaatattactcctaagatttata 15526827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 9504548 - 9504446
Alignment:
Q  216 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 315  Q
    |||||||| ||| ||||| || |||||||||||| |||||||||| | |||||||  ||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  9504548 taatatttttatgtatgttaatacttgataactccttatccatgacccgtgagataagattatcagtctacccacataatagtttctatcctttaaagat 9504449  T
Q  316 atc 318  Q
    |||    
T  9504448 atc 9504446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11787877 - 11787578
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |  |  ||||||||  |||| ||||||||||    
T  11787877 agtacccatcaaccaacgttatggttatccatttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgattatag-atctagggatcataatggtttcagg 11787779  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||| | | | ||||||||  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||    
T  11787778 tctaagagcgatatacaatattatcattgtgagaatat-cttatgaaaatat-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtctatccagtata 11787683  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | | ||||||| || |||||||||||||| |     
T  11787682 aatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataaccaatgagatgcggttatcagtcaacatacataatagtctcgac 11787584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 32280507 - 32280313
Alignment:
Q  67 actcgactccaacatctagggtacata----gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataa 162  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||| ||  || |||  |||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  32280507 actcgactcctacatctagggtacatatatagtggtttcaagtgaaaaggtaaaataaatcattatcactatgagaatat-cttatgacactttacatga 32280409  T
Q  163 cttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatga 260  Q
    ||   |||||||| ||||||||| | || |||| | | | ||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  32280408 ctc--actatgtattattctcattgtgggtcaaccgagtgtaaatattattcgtaatgattatacctatgtgaagattaaataactctttatccatga 32280313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 298
Target Start/End: Original strand, 15317188 - 15317472
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||| ||||||||| ||||  | ||||  |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  15317188 agtacccgtcaaccaacgttatgattatccgtttacagacaacgttagaatg---acaaagtacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 15317283  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |   ||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||| | | |||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||| | ||||    
T  15317284 tctaagagcgatttacactattatcattgtgagaatat-cttatgacaatct-cataacgt--actatgtagtattctcacggtgggtctatctagtata 15317379  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagt 298  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||    
T  15317380 aatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcaatctacatacataatagt 15317472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 28088396 - 28088227
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    |||| |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||||| || || ||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  28088396 agtatccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcccttgagtcc-acatctagggatcatagtggtttcagg 28088298  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtat 179  Q
    || ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||| ||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||    
T  28088297 tctaagagcgatatacactattatcattgtgagaata-tcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtat 28088227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 305
Target Start/End: Original strand, 8251933 - 8252048
Alignment:
Q  190 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccta 289  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||| || || ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||| |||||| | | |    
T  8251933 gatcaatcaaatataaatattactcgaaatatgtaaatttatgtaaagatttgataacattttattcatgatccgtaagatgtgatcttcagtccatcca 8252032  T
Q  290 cataatagtctctatg 305  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  8252033 catgatagtctatatg 8252048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 363
Target Start/End: Original strand, 18640792 - 18640835
Alignment:
Q  320 cacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640792 cacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagttt 18640835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 132 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 28954093 - 28953965
Alignment:
Q  132 tatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatat-aaatattactcctaatatttatatcta 230  Q
    ||||||||||| | |||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||  || | ||||||| |  |||||||||||||||| | ||||  ||    
T  28954093 tatgagaatat-catatgacactttaaataacttat--tatgtagtattctcatgatgggttaatccaacaacaaatattactcctaatgtgtatacata 28953997  T
Q  231 tgtgaagacttgataactctttatccatgatc 262  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  28953996 tgtgaagactttgtaactctttatcaatgatc 28953965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 30464261 - 30464151
Alignment:
Q  31 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatca 130  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||   | ||| |||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| |||||    
T  30464261 atccttttacagacaacgtttgaatgtcaataaaacacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtggtatagaccattatca 30464163  T
Q  131 ctatgagaatat 142  Q
     |||||||||||    
T  30464162 ttatgagaatat 30464151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19345795 - 19345725
Alignment:
Q  255 ccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttc 325  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||| || ||||||||| ||| |||||||    
T  19345795 ccatgatctatgagacgtgatcatcagtatacccacataatgatctttacgctttaatgttataccacttc 19345725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 351; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 2049 - 2410
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2049 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 2148  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2149 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 2247  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2248 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 2347  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2348 ctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagttt 2410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 10940 - 11301
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10940 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 11039  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11040 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 11138  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11139 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 11238  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11239 ctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagttt 11301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 351; Significance: 0; HSPs: 41)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 21941144 - 21940783
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941144 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 21941045  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941044 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 21940946  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940945 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 21940846  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940845 ctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagttt 21940783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 22171966 - 22171605
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171966 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 22171867  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171866 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 22171768  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171767 tataaatattactcataatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctatgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 22171668  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171667 ctatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagttt 22171605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 6094602 - 6094241
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094602 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacgaacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 6094503  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6094502 ctggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatatagtattctcatggcggatcaatccaa 6094404  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  6094403 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcactctacccatataatagtct 6094304  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  6094303 ctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaaaaatagttt 6094241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 24643127 - 24642767
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643127 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagaccacgtttgaatggtgacaaaacacttgactccaacatctagggtacatagtggttt 24643028  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24643027 cagttcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataa-ttttactatgtagtattctcatggaggatcaatccaa 24642930  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24642929 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtct 24642830  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24642829 ctatactttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaatagttt 24642767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15326677 - 15326422
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326677 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 15326578  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326577 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata-tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 15326479  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatcca 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15326478 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttctcca 15326422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15507046 - 15506791
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15507046 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 15506947  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506946 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata-tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 15506848  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatcca 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15506847 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttctcca 15506791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 60 - 359
Target Start/End: Original strand, 14983710 - 14984004
Alignment:
Q  60 acaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatattcttatgacacttttc 158  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  14983710 acaaagtactcgactcttacatctagggtacatagtgatttcaggtcgaaggacggaatacaccacttatcactatgagaataa-cttatgaca-tttac 14983807  T
Q  159 ataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccat 258  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  14983808 ataacttt--ctatgtagtattctcatggcgggtcattctaatataa-tattactcctaatatctacatctatgtgaagacttgataacactttttccat 14983904  T
Q  259 gatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaat 358  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||| ||| |||  |||| ||  |||||||| |||||    
T  14983905 gatccgtgagatatgatcattagtctacccacataatagtccctattc-ttaatgttatcccacttcacaataaattttgattatagatactttaagaat 14984003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 28548526 - 28548393
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548526 atggagtacccatcaaccaactttatagtcaccctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 28548427  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548426 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactat 28548393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Original strand, 8371265 - 8371564
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  8371265 agtacccatcaaccaacgttatgatcatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 8371363  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  8371364 tctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatata 8371459  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  8371460 aatattactcttaatatttatacctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgat 8371558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21969623 - 21969324
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||||||||||||    
T  21969623 agtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcagg 21969525  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  21969524 tctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatata 21969429  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| ||||||  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |     
T  21969428 aatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgatccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgac 21969330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 108 - 306
Target Start/End: Original strand, 24797224 - 24797419
Alignment:
Q  108 aagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaat 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24797224 aagggtggaatacaccac-atcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgggtcaatccagtataaat 24797321  T
Q  208 attactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgc 306  Q
     |||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||| | || ||||||||| |  ||||||||  |||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  24797322 tttactcataatatttatacctacgtgaagacatgatatc-ctatatccatgacccatgagatgtagtcatcaatatactcacataatagtctctatgc 24797419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 359
Target Start/End: Original strand, 38232115 - 38232462
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||| | |   |||||| |||||||| | ||||| |||||||| |    ||||| |||      
T  38232115 cccatcaaccaactttataaccatcatgtcacggacaacgtttgtacgacaacaaagtactcgacttctacatcaagggtacacatcaatttcaagtctg 38232214  T
Q  109 agggtggaatacaccact-atcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaat 207  Q
    ||| |||||||||||||| |||| |||| |||||  ||  ||||| ||| |||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38232215 aggatggaatacaccacttatcattatgcgaataacctg-tgaca-tttacataacttt--ctatgtagcattctcacggcggatcaatccaatataaat 38232310  T
Q  208 attactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgct 307  Q
    ||||| | |||||| | ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| | ||||||    
T  38232311 attacccataatatgtgtatctatgtcaagactggatcactctttatccatgatccgtgagatgtgattatcagtctacccacaaaatagtttttatgct 38232410  T
Q  308 ttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 359  Q
    ||||   |||| |||||  ||| |||| ||||||||  ||||||| ||||||    
T  38232411 ttaagactatctcactttacaataaagtttgactacaaatactttaagaata 38232462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12562413 - 12562114
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  12562413 agtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 12562315  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  12562314 tctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatata 12562219  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |     
T  12562218 aatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgac 12562120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Original strand, 27007533 - 27007828
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  27007533 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 27007631  T
Q  109 agggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 208  Q
    || | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  27007632 agagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaata 27007727  T
Q  209 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  27007728 ttactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctt 27007826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Original strand, 27014676 - 27014971
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  27014676 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 27014774  T
Q  109 agggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 208  Q
    || | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  27014775 agagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaata 27014870  T
Q  209 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  27014871 ttactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctt 27014969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Original strand, 27880503 - 27880798
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  27880503 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 27880601  T
Q  109 agggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 208  Q
    || | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  27880602 agagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaata 27880697  T
Q  209 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  27880698 ttactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctt 27880796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Original strand, 28020684 - 28020979
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  28020684 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 28020782  T
Q  109 agggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 208  Q
    || | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  28020783 agagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaata 28020878  T
Q  209 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  28020879 ttactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctt 28020977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Original strand, 22130625 - 22130920
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  22130625 cccatcaaccaacgttattgttatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcca 22130723  T
Q  109 agggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 208  Q
    || | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  22130724 agagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaata 22130819  T
Q  209 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  22130820 ttactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctt 22130918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25611481 - 25611186
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    |||||||||||||  |||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  25611481 cccatcaaccaacactatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 25611383  T
Q  109 agggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 208  Q
    || |||  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  25611382 agagtgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacagttt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaata 25611287  T
Q  209 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |||||||   |||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  25611286 ttactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcagtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctt 25611188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 22659506 - 22659795
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  22659506 agtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 22659604  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||    
T  22659605 tctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccagtata 22659700  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  |||||||   |||||||||||| |||||||||||||    
T  22659701 catattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcagtcatcagtctacatacataatagtct 22659795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21916962 - 21916667
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    ||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  21916962 cccatcaaccaaagttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 21916864  T
Q  109 agggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 208  Q
    || | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  || ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  21916863 agagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--acaatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaata 21916768  T
Q  209 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  21916767 ttactcctaatatttatatctatgcatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctt 21916669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Original strand, 45534285 - 45534584
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||||||||||||    
T  45534285 agtacccatcaaccaacgttattgttatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcagg 45534383  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| |    |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||    
T  45534384 tctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatata 45534479  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |     
T  45534480 aatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgac 45534578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 280 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 28555084 - 28555001
Alignment:
Q  280 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28555084 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatacttttagaatagttt 28555001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26240774 - 26240475
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||  |||||||| |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||| |||    
T  26240774 agtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacaaacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggttttagg 26240676  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||  |  |||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  26240675 tctaagagcgatatacattataatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatata 26240580  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||| | |||||||||||||| |     
T  26240579 aatattactcctaatatttatacctatgtatatacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtcttcatacataatagtctcgac 26240481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18835556 - 18835341
Alignment:
Q  90 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 189  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||||| || |||||| ||||||||| |||| | ||| |  ||||||||||||||||| || |    
T  18835556 cataatggtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcactgtgtgaatat-cttatgacatttttaa-aacat--actatgtagtattctcacggtg 18835461  T
Q  190 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccta 289  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||||| | |||||||||| ||    
T  18835460 ggtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacttatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgtggtaatcagtctacata 18835362  T
Q  290 cataatagtctctatgcttta 310  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  18835361 cataatagtctcgatgcttta 18835341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 174 - 343
Target Start/End: Original strand, 32872741 - 32872910
Alignment:
Q  174 tagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtg 273  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||  | |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |    
T  32872741 tagtattctcatgacagatcaattcaatataaatattattactaatacttatgccgatgtaaagacttgatacctctttattcatgatctgtgagataag 32872840  T
Q  274 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactac 343  Q
    ||| | |||| | |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  32872841 atcgtgagtccagccgcataatagtctctatgctttgatgttatcccacttcacaataaatcttaactac 32872910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6431176 - 6430953
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || ||| ||||||||||  ||||||| |||||||    
T  6431176 agtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcatagtgatttcagg 6431078  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    ||  || | |  |||||| | ||||| | |||||||| ||||||||||  | |||||||  ||||||||||||||||||| || || || ||| | ||||    
T  6431077 tcttagagcgatatacactattatcattgtgagaata-tcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtctatctagtata 6430982  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgt 233  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6430981 aatattactcctaatatttatacctatgt 6430953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 78 - 225
Target Start/End: Original strand, 8781959 - 8782102
Alignment:
Q  78 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagt 177  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||    ||||||||||    
T  8781959 acatctagggatcatagtggtttcaagtctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatat-cttatgaca-ttttcataacag--actatgtagt 8782054  T
Q  178 attctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttat 225  Q
    ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  8782055 attctcacggtggatcaatcaagtataaatattagtcctaatatttat 8782102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 158 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 2375332 - 2375214
Alignment:
Q  158 cataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatcca 257  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| | |||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||    
T  2375332 cataactttt--tatgtagaattataatggagggtcaatccaatatacatattactcataatatttatatttatgtgaaaatttgataactcattatcca 2375235  T
Q  258 tgatctgtgagatgtgatcat 278  Q
    ||||  ||| |||||||||||    
T  2375234 tgatacgtgtgatgtgatcat 2375214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 100
Target Start/End: Original strand, 24796731 - 24796826
Alignment:
Q  3 ggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  | |||| ||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24796731 ggagtacccatcaaccaattttatagccattatattacaga--acgattgaatggtgataaagcactcgactccaacatctagggtatatagtggttt 24796826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Original strand, 2962944 - 2963247
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    |||| |||||||||||| |||| || ||||| || | ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| | |||||||  |||||||||||||||    
T  2962944 agtaaccatcaaccaacgttatggttatccttttgcagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-cgtctagggatcatagtggtttcagg 2963042  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttt---tcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaat 201  Q
    || ||| | |  |||| | | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||    ||||||  | |||||||||||||||||  ||  | || ||||| |    
T  2963043 tctaagagggatatacgctattatcattgtgagaatat-cttatgacaattaatctcataa--tgtactatgtagtattctcgcggtaggtctatccagt 2963139  T
Q  202 ataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||  || | |  ||||||  | |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  2963140 ataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatttataacccatgagatacggtcattagtctacatacataatagtctc 2963238  T
Q  302 tatgcttta 310  Q
    || ||||||    
T  2963239 tacgcttta 2963247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 29645631 - 29645537
Alignment:
Q  204 aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagt 298  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||| |||| || |||||||    
T  29645631 aaatattactcttaatgtttatatatatgtgaagagttgataaatctttatgcatgaaccatgagatgtggtcatcagtttacccacgtaatagt 29645537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 29645797 - 29645674
Alignment:
Q  20 actttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaata 119  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||| |||||| |   |||||| | | || ||| | ||||||| ||| |||  ||||||||||||| |||| | ||    
T  29645797 actttatagtcatccttttacaaacaacatttgaacgtctacaaagaaattgaatcctatatctaggatacgtagaagtttcaggtcgaatggtgaagta 29645698  T
Q  120 caccactatcactatgagaatatt 143  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  29645697 catcactatcactatgagaatatt 29645674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 36970371 - 36970265
Alignment:
Q  194 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 293  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||| ||||| |||||     
T  36970371 aatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcaatctacatacatg 36970273  T
Q  294 atagtctc 301  Q
    ||||||||    
T  36970272 atagtctc 36970265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24535569 - 24535471
Alignment:
Q  227 tctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttc 325  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || |||| ||||||||||| |||  ||| |||| |||| ||| || |||| |||| ||||||    
T  24535569 tctatgtgaaaacttgataactcattattcatgatccgtaagatatgatcatcagtgtactcacaaaataatctcgatgtttcaatgttatctcacttc 24535471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 36970539 - 36970439
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || | ||| ||||  | |||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  36970539 agtacccatcaaccaacgttattgttacccttttacatataacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 36970441  T
Q  105 tc 106  Q
    ||    
T  36970440 tc 36970439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10920479 - 10920427
Alignment:
Q  202 ataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttat 254  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||    
T  10920479 ataaatattactcataatatttatacatatgtgaatatttgataactctttat 10920427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34659118 - 34659059
Alignment:
Q  168 actatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatat 227  Q
    ||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  34659118 actatttagtatttgcatggtggataaatccaatataaatattagtcctaatatatatat 34659059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 2375516 - 2375411
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||  | ||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||| |||| ||| | ||||    
T  2375516 atggagcacccatcaaccgactttatagttatccaattgcggatgatgtttgtatagcaacaaagtactcgactcctacatctatggtaaataatagttt 2375417  T
Q  101 caggtc 106  Q
    ||||||    
T  2375416 caggtc 2375411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Original strand, 41368106 - 41368154
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttga 53  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  41368106 agtacctattaaccaactttatagttatcatgttacagacaacgtttga 41368154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Original strand, 41375077 - 41375125
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttga 53  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  41375077 agtacctattaaccaactttatagttatcatgttacagacaacgtttga 41375125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 351; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 17684197 - 17684558
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684197 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 17684296  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684297 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 17684395  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684396 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 17684495  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684496 ctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 17684558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 27380980 - 27381341
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27380980 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 27381079  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381080 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 27381178  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381179 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 27381278  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27381279 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactatggatactttgagaatagttt 27381341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 27471363 - 27471724
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471363 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 27471462  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471463 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 27471561  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471562 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 27471661  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27471662 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactatggatactttgagaatagttt 27471724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 29309369 - 29309008
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309369 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcacctgactccaacatctagggtacatagtggttt 29309270  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309269 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 29309171  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309170 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 29309071  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309070 ctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagttt 29309008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 29316328 - 29315968
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316328 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcact-gactccaacatctagggtacatagtggttt 29316230  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316229 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 29316131  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316130 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 29316031  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316030 ctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagttt 29315968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 17691168 - 17691529
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691168 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 17691267  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691268 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 17691366  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691367 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 17691466  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17691467 ttatgctttaatgatatcccacttctcactaaagcttgactacggatactttaagaatagttt 17691529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 11652202 - 11651841
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652202 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 11652103  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652102 caggtcgaagggtggaatacaccactatcattatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 11652004  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11652003 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtct 11651904  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11651903 ctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactactgatacttttagaatagttt 11651841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 188705 - 189066
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188705 atggagtatccatcaatcaactttatagtcattctgttacagacaatatttgaatgataacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 188804  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188805 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 188903  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  188904 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtct 189003  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  189004 ctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacaaatactttaagaatagttt 189066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27297108 - 27296877
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297108 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 27297009  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297008 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata-tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 27296910  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27296909 tataaatattactcctaatatttatatcaatgt 27296877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 16394173 - 16394438
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16394173 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgattccaacatctagggtacatagtggttt 16394272  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  16394273 caagtcaaagggtggaatacaccactatcactataagaata-tcttatgacacttttcataacttttactacgtagtattctcatggtgggtcaatccaa 16394371  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16394372 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactgtttatccatgatatgtga 16394438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 25536919 - 25537152
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25536919 atggagtacccatcaaccaactttataatcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtaaatagtggttt 25537018  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537019 caggtcgaagggtggaatacaccactgtcactatgagaata-tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 25537117  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtga 235  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25537118 tataaatatgacacctaatatttatatctatgtga 25537152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 16559200 - 16559414
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16559200 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctacggtacatagcggttt 16559299  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16559300 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata-tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtggatcaatccaa 16559398  T
Q  201 tataaatattactcct 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  16559399 tataaatattactcct 16559414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 352
Target Start/End: Original strand, 13359010 - 13359347
Alignment:
Q  10 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||  |||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13359010 ccatcaaccgactttatagtcatcctgttacggacgatgtttgtacggcaacaaaatactcgactcctacatctaaggtacatagtggtttcaggtcgaa 13359109  T
Q  110 gggtggaatacaccact-atcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||| |  |||||||||||  |||| |   |||| |||||||||||    
T  13359110 gggtggaatacaccacttatcactatgagaataat-ttatgaca-tttacataattttca--atgtagtattc--atggtgagacaattcaatataaata 13359203  T
Q  209 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 308  Q
     |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||    
T  13359204 ctacttctaatacttatatctaagtgaagatttgataactttttatccatgatttgcgagatgtgatcatcagtctatccatataatagtctctacgctt 13359303  T
Q  309 taatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatacttt 352  Q
    ||||| | ||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  13359304 taatgttgtcccatttcacaataaaggttgactacggatacttt 13359347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 211 - 363
Target Start/End: Original strand, 16566257 - 16566409
Alignment:
Q  211 actcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566257 actcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 16566356  T
Q  311 atgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16566357 atgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagttt 16566409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16789357 - 16789062
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  16789357 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 16789259  T
Q  109 agggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 208  Q
    || | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  16789258 agagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaata 16789163  T
Q  209 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  16789162 ttactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctt 16789064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Original strand, 22859904 - 22860199
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  22859904 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 22860002  T
Q  109 agggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 208  Q
    || | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  22860003 agagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaata 22860098  T
Q  209 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  22860099 ttactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctt 22860197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Original strand, 27508359 - 27508658
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||||||||||||    
T  27508359 agtacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcatagtggtttcagg 27508457  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||| |    
T  27508458 tctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgaca-ttttcataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaataca 27508553  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| |     
T  27508554 aatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataacagtctcgac 27508652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 310
Target Start/End: Original strand, 27527947 - 27528244
Alignment:
Q  7 tacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtc 106  Q
    ||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  27527947 tacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcatagtggtttcaggtc 27528045  T
Q  107 gaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaa 206  Q
     ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||| |||    
T  27528046 taagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgaca-ttttcataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatacaaa 27528141  T
Q  207 tattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||    
T  27528142 tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataacagtctcgacgc 27528240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Original strand, 1586120 - 1586419
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||||||||||||    
T  1586120 agtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcagg 1586218  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| |    |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||    
T  1586219 tctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatata 1586314  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |     
T  1586315 aatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgac 1586413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 263 - 363
Target Start/End: Original strand, 25537148 - 25537248
Alignment:
Q  263 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  25537148 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaatagtt 25537247  T
Q  363 t 363  Q
    |    
T  25537248 t 25537248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 2669768 - 2669476
Alignment:
Q  3 ggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttca 102  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  || ||| |||||| |   |||||| ||  |||||| |||||||| ||||||| || |||||    
T  2669768 ggagtaccaatcaactgactttatagtcatcctgttatagataacatttgaacgacaacaaagtaccggactcctacatctagagtacataatgatttca 2669669  T
Q  103 ggtcgaagggtggaatacaccacta-tcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaat 201  Q
    |||| ||  ||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||| ||||   | ||| ||  |||||||||||| |||||  |  |||||| |||    
T  2669668 ggtcaaatagtggaatacacaacttgtcactatgagaataa-cttatgatacttaa-acaacatt--ctatgtagtattttcatgatgtgtcaatcaaat 2669573  T
Q  202 ataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  2669572 ataaatattactcctaatatttatatctatgtgaatacatgataactcttaatcaatgattcatgagatgtgatcatcaatctacccatataatagt 2669476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 172 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27926062 - 27925876
Alignment:
Q  172 tgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatg 271  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27926062 tgtagtattatcatggcgagtcaattcaatataaatattattcctaat-ttaatatctatgtgaaaacttcataaatctttatccatgatccgtgagatg 27925964  T
Q  272 tgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 359  Q
     |||||||||| || | |||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||  || |||| |||||||  |||||||| ||||||    
T  27925963 agatcatcagtttatccacataatagtctttgtgcttcaatgctataccacttccaaataaagtttgactagagatactttaagaata 27925876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 310
Target Start/End: Original strand, 18019885 - 18020152
Alignment:
Q  37 ttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatga 136  Q
    |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || || | ||||||| |  ||||||| ||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||    
T  18019885 ttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcga-catctagagatcatagtgatttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtga 18019983  T
Q  137 gaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaa 236  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  18019984 gaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtata 18020079  T
Q  237 gacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 310  Q
    ||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  18020080 gacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 18020152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14074770 - 14074471
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||| ||  |||||||||| || || | |||||||||  |||||||||||||||    
T  14074770 agtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaaaggcaacaaagcacttgagtcta-catctagggatcatagtggtttcagg 14074672  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| |    ||||||   ||||| | ||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||    
T  14074671 tctaagagcaatatacacttttatcattgtgaaaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccattata 14074576  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |     
T  14074575 aatattactcccaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgac 14074477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Original strand, 10359073 - 10359360
Alignment:
Q  15 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 114  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||   | ||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||    
T  10359073 aaccaacttaatggttatcctgttacggacaatgtttgaatgacaataaagcacacgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaagtctaagagtg 10359171  T
Q  115 gaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactc 214  Q
    | |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||| |  ||||||||||||| ||| || || || ||||| ||||||||||||      
T  10359172 gtatacaccattatcattgtgagaatat-cttatgacactt--cataacat--actatgtagtattttcacggtgggtcgatccagtataaatattacct 10359266  T
Q  215 ctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 310  Q
     ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||   || ||||| |  ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  10359267 ataatatttatatctatgtatagacttaatatctc-acattcatga-ccatgagatgtggtcatcactctacatatataatagtctctacgcttta 10359360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 171 - 361
Target Start/End: Original strand, 17850392 - 17850581
Alignment:
Q  171 atgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagat 270  Q
    |||||||||||| | || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||||||| || || ||||||| | ||||    
T  17850392 atgtagtattcttaaggagggtcaatccaatatatatattactcataatatttatacctatgtgaatacacgataactcgttgtcaatgatctataagat 17850491  T
Q  271 gtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagt 361  Q
     |||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||| |||| |||   ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  17850492 atgatcatcagtctacccatataatagtctatatacttgaatgttatttgacttcacaa-aaagcttgactatggataatttaagaatagt 17850581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8613209 - 8612906
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||| ||  |||||  ||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  8613209 agtacccatcaaccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaagggaaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 8613111  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttt---tcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaat 201  Q
    || ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||    ||||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| |    
T  8613110 tctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatat-cttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacggtgggtctatccagt 8613014  T
Q  202 ataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  8613013 ataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 8612915  T
Q  302 tatgcttta 310  Q
     | ||||||    
T  8612914 gacgcttta 8612906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 178 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28172859 - 28172712
Alignment:
Q  178 attctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatca 277  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||    
T  28172859 attctcatggagggtcaatccaatataaacactacccttaatatttatatctatgtaaagacttgataactttttaacaatgatctgtaagatgtgatca 28172760  T
Q  278 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttc 325  Q
    |||||| |   |||||||| | ||||| ||| | || |||||||||||    
T  28172759 tcagtccattcacataataatttctattcttcagtgttatcccacttc 28172712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 359
Target Start/End: Original strand, 20553492 - 20553672
Alignment:
Q  177 tattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatc 276  Q
    ||||||||||  || |||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||   ||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20553492 tattctcatgatgggtcaatc-aatataaatattattcttaatatt-atatctatgtgaatgtttgatatttctttatcgatgatatgtgagatgtgatc 20553589  T
Q  277 atcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 359  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||  |||| |||||| ||| |||  || ||||||||| |||| ||||||    
T  20553590 atcagtctaccaacataaaaatctttatgctttaattttatctcacttcacaataaaaattcactacggatgctttaagaata 20553672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 78 - 349
Target Start/End: Original strand, 20736413 - 20736678
Alignment:
Q  78 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagt 177  Q
    ||||||||||  |||||| |||| ||||| ||| |||  |||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| | |  | ||||||||    
T  20736413 acatctagggatcatagtagttttaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatat-cttatgaca-ttttcatagcat--aatatgtagt 20736508  T
Q  178 attctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatca 277  Q
    ||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |  | |||| ||| |||  |||| || |    ||||||||| |||    
T  20736509 attctcacgatggatcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctat-tataaacttaatatctc-atatctataacacatgagatgtggtca 20736606  T
Q  278 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatac 349  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||| |  ||||||| |||| |  ||||||||||||| |||||    
T  20736607 tcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcccagttcttattaaagcttgactacagatac 20736678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8510338 - 8510155
Alignment:
Q  62 aaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcata 161  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||  || ||| |||||| |||||||||||| ||  || ||||||| || ||||    
T  8510338 aaagtactcgactcctacatctaaggtacatagtggttccaggccgaagcatgtaatgcaccaccatcactatgagagta-actaatgacac-ttacata 8510241  T
Q  162 acttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaata-tttatatctatgtgaagacttgataact 248  Q
    || ||  |||||||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||    
T  8510240 acatt--ctatgtagtattatcattgtaggtcaatcaaatataaatattacttctaatattttttatctatatgaagaaatgataact 8510155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 166 - 287
Target Start/End: Original strand, 19347092 - 19347212
Alignment:
Q  166 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 265  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| || |||||||| || |||| ||||||  |||||||| || ||| ||||||||||| ||||| |||    
T  19347092 ttactatgtagtattctaatggcagttcaatccattacaaatattattc-taatgtttatacttatgtgaaaacatgacaactctttatcaatgatatgt 19347190  T
Q  266 gagatgtgatcatcagtctacc 287  Q
    ||||| || |||||| ||||||    
T  19347191 gagatatggtcatcaatctacc 19347212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 310
Target Start/End: Original strand, 13995151 - 13995254
Alignment:
Q  206 atattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | |    
T  13995151 atattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacg 13995249  T
Q  306 cttta 310  Q
    |||||    
T  13995250 cttta 13995254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 90 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21994794 - 21994655
Alignment:
Q  90 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 189  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||  |||||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||||| |    
T  21994794 catagtcgtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcattgtgaaaatat-cttatgaca-ttttcataacat--actatttagtattctcatggtg 21994699  T
Q  190 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 233  Q
    | ||| |||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  21994698 ggtcattccagtataaatattactcgtaatgtttatagctatgt 21994655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 233
Target Start/End: Original strand, 17120520 - 17120740
Alignment:
Q  8 acccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcg 107  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||| | || ||||||||| |||||   |||||||||| || ||| |||| |||||  |||||||||||||||||     
T  17120520 acccatcaaccaacgttatggttatcctttgacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcc-acatatagggatcatagtggtttcaggtct 17120618  T
Q  108 aagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaat 207  Q
    ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||| ||||||||||  |||||||||   |||||| ||| |||||||  | || |||||||| |||||||    
T  17120619 aagagcgatatacattattatcattgtgagaata-tcttatgaca-atttcataac--atactatttagcattctcacagtgggtcaatccagtataaat 17120714  T
Q  208 attactcctaatatttatatctatgt 233  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||    
T  17120715 actactcctagtatttatacctatgt 17120740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 19218630 - 19218427
Alignment:
Q  90 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 189  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||| | || ||||| | ||||||||| ||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||||||| || |    
T  19218630 catagtggtttcaggtctaagagtagtatatatcattatcattctgagaatat-cttatgaaa-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtg 19218535  T
Q  190 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccta 289  Q
    | |     |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  ||| ||||| |  |||| |||| |||||||||||| ||    
T  19218534 ggt-----caatataaattttactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atattcatgacccatgaggtgtggtcatcagtctacata 19218441  T
Q  290 cataatagtctcta 303  Q
    ||||||||||||||    
T  19218440 cataatagtctcta 19218427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 302
Target Start/End: Original strand, 22560311 - 22560487
Alignment:
Q  121 accactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaata 220  Q
    |||| ||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||| ||||||| |  | ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22560311 accattatcattgtgagaatat-cttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtgttctcatagtaggtcaatacagtataaatattactcctaata 22560406  T
Q  221 tttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctct 302  Q
    |||| | ||||||  | |||| ||| |||  ||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||    
T  22560407 tttaaacctatgtataaacttaatatctc-atatccatgacccatgagatgtggtcatcggtctacatgcataatagtctct 22560487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 33317155 - 33317055
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  33317155 agtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcatagtggtttcagg 33317057  T
Q  105 tc 106  Q
    ||    
T  33317056 tc 33317055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 28172963 - 28172899
Alignment:
Q  71 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactat 134  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28172963 gactcctatatctagggtacatactggtttccggtcgaagggtggaatacaccacttatcactat 28172899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Original strand, 5758650 - 5758709
Alignment:
Q  167 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 226  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5758650 tactatgtagtattctcacagtggatctatccagtataaatattactcctaatatttata 5758709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 143
Target Start/End: Original strand, 28756145 - 28756277
Alignment:
Q  10 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 109  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||| |||||| |||| ||  |||||| |||| || |||||| ||||||||||||||  |    
T  28756145 ccatcaaccgactttataggcatcttgttacatacaacatttga-tggtgataaagtacatgactcctacatatatggtacacagtggtttcaggtcata 28756243  T
Q  110 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatt 143  Q
    || ||  ||| | || ||||||||||||||||||    
T  28756244 ggatgagataaatcattatcactatgagaatatt 28756277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 4073781 - 4073574
Alignment:
Q  90 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 189  Q
    ||||||||||| ||||| |||  ||| ||||| |  ||||| ||||||||||| |||||||   |||||||||| | |  ||||||||||||||| ||      
T  4073781 catagtggttttaggtctaagattggtatacatcgttatcattatgagaatat-cttatgaa--ttttcataacatat--tatgtagtattctcacggta 4073687  T
Q  190 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccta 289  Q
    | |||||| ||||||||||||||  |||||||||| |  |||||  |||||| ||| |||  ||| ||||| || || ||||||||| ||| |||||  |    
T  4073686 ggtcaatcaaatataaatattacctctaatatttacacttatgtatagacttaatatctc-atattcatgacctatgggatgtgatcctcaatctacaaa 4073588  T
Q  290 cataatagtctcta 303  Q
    ||||||||||||||    
T  4073587 cataatagtctcta 4073574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 141
Target Start/End: Original strand, 17850321 - 17850366
Alignment:
Q  96 ggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 141  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  17850321 ggtttcaggtcaaagggtggtatacatcactatcactataagaata 17850366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 351; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18262691 - 18262330
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262691 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 18262592  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262591 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 18262493  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262492 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 18262393  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262392 ctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 18262330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18269552 - 18269191
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269552 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 18269453  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269452 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 18269354  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269353 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 18269254  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269253 ctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 18269191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 869076 - 868715
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  869076 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 868977  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868976 caggtcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 868878  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868877 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 868778  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868777 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 868715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 55613162 - 55612801
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613162 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 55613063  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613062 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 55612964  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612963 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 55612864  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55612863 ctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagagtagttt 55612801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 19926488 - 19926849
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926488 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 19926587  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926588 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 19926686  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926687 tataaatattactcctaatatttatatctatttgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 19926786  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926787 ctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagttt 19926849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 26964119 - 26963758
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964119 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 26964020  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964019 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 26963921  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963920 tataaatattactgctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 26963821  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963820 ctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacggatactttgagaatagttt 26963758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 26970942 - 26970581
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970942 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 26970843  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970842 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 26970744  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970743 tataaatattactgctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 26970644  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970643 ctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacggatactttgagaatagttt 26970581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 5707799 - 5707438
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707799 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 5707700  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707699 caggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 5707601  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707600 tataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 5707501  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707500 ctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagttt 5707438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 5714427 - 5714066
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714427 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 5714328  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714327 caggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 5714229  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714228 tataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 5714129  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714128 ctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagttt 5714066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 10621061 - 10621422
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621061 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 10621160  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621161 caggtcgaagggtggaaaacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 10621259  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621260 tataaatattactcctaaaatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 10621359  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10621360 ctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagttt 10621422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 8858646 - 8858285
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858646 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 8858547  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858546 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 8858448  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8858447 tataaatattactcctaatatttatatctatatgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagcctacccacataatagtct 8858348  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8858347 ctatgctttaatgatatccgacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagttt 8858285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 10628140 - 10628501
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628140 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 10628239  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628240 caggtcgaagggtggaaaacaccattatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 10628338  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628339 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 10628438  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10628439 ctatgctttaataatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagttt 10628501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 28392862 - 28393223
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28392862 atggagtactcatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 28392961  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28392962 caggttgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 28393060  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28393061 tataaatattacttctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtct 28393160  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  28393161 ctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagttt 28393223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 8845682 - 8845321
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845682 atggagtacccatcaaccaaatttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 8845583  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845582 caggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatata-ttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 8845484  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8845483 tataaatattactcctaatatttatatctatataaagaattgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagcctacccacataatagtct 8845384  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8845383 ctatgctttaatgatatccgacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagttt 8845321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 4426344 - 4426692
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426344 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctattacggacaatgtttgaatggtaacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 4426443  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426444 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaa-------------cttttcatagattttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 4426530  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4426531 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtct 4426630  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4426631 ctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtt 4426692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 35224038 - 35223682
Alignment:
Q  2 tggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttc 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  35224038 tggagtacacatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatgttgataaagcactcgactccaacatctaaggtacatcgtggtttc 35223939  T
Q  102 aggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaat 201  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  35223938 aggtcaaagggtggaatacaacactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatatagtattctcatggtggttcaatccagt 35223840  T
Q  202 ataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  35223839 ataaatattactcctaatatttatacatatgtaaagacatgataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatccgtctacccacataatagtcta 35223740  T
Q  302 tatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 359  Q
    |||||||||||| |||||   ||  ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  35223739 tatgctttaatgttatccttttttacaataaagcttgactacgaatactttaagaata 35223682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 343
Target Start/End: Original strand, 5667858 - 5668194
Alignment:
Q  2 tggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  5667858 tggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgac--caacatctagggtacatagtggtttc 5667955  T
Q  102 aggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaat 201  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |    
T  5667956 aggtctaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtgagtcaatccagt 5668054  T
Q  202 ataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  5668055 ataaatattactcctaatatttatacctacgtgaagatatgataactctttatctatgatccgtgaga--tgatcatcggtctatccacataatagtctc 5668152  T
Q  302 tatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactac 343  Q
    |||| ||||||| |||| |  ||| ||| |||||||||||||    
T  5668153 tatgatttaatgttatctcttttcacaataaagcttgactac 5668194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20311768 - 20311433
Alignment:
Q  2 tggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttc 101  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  20311768 tggagtaccgattaaccgactttatagtcatcctgctacggacaacgtttgtacgggaacaaagtactcgaatcctacatctagggtaaatagtggtttc 20311669  T
Q  102 aggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||| | ||  ||||||| |  |||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  20311668 aagtagaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataatgt-atgatagtta-cataactgt--ctatgtagtattctcatgacaggtcaatccaa 20311573  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  20311572 tataaaaattactcctaatatttacatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatccatgatatgtgatcatcaatctacccacaaaatagtct 20311473  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgac 340  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  20311472 ctatgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgac 20311433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 10677311 - 10677534
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  10677311 atggagtacccatctaccaactttat-gtcatcttattacaaacaacgtttaaatggtggtaaagcactcgactcctacatctaggatacatagtggttt 10677409  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||     
T  10677410 caagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaata-tcttatgacatttttcataacatttactatgtagtattctcatagtgggtcaatccag 10677508  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttata 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  10677509 tataaatattactcctaatatttata 10677534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 10890951 - 10891174
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  10890951 atggagtacccatctaccaactttat-gtcatcttattacaaacaacgtttaaatggtggtaaagcactcgactcctacatctaggatacatagtggttt 10891049  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||     
T  10891050 caagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaata-tcttatgacatttttcataacatttactatgtagtattctcatagtgggtcaatccag 10891148  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttata 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  10891149 tataaatattactcctaatatttata 10891174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15461787 - 15461488
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  15461787 agtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 15461689  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  15461688 tctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatata 15461593  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |     
T  15461592 aatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgac 15461494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 34975841 - 34975542
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  34975841 agtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 34975743  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||    
T  34975742 tctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatata 34975647  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |     
T  34975646 aatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgac 34975548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 2677299 - 2677004
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  2677299 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 2677201  T
Q  109 agggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 208  Q
    || | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  2677200 agagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaata 2677105  T
Q  209 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  2677104 ttactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctt 2677006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15815307 - 15815012
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  15815307 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 15815209  T
Q  109 agggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 208  Q
    || | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  15815208 agagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaata 15815113  T
Q  209 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  15815112 ttactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctt 15815014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Original strand, 18111059 - 18111354
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  18111059 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 18111157  T
Q  109 agggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 208  Q
    || | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  18111158 agagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaata 18111253  T
Q  209 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  18111254 ttactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctt 18111352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Original strand, 17299977 - 17300270
Alignment:
Q  11 catcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaag 110  Q
    ||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |||    
T  17299977 catcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaag 17300075  T
Q  111 ggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatatt 210  Q
     | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||    
T  17300076 agcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 17300171  T
Q  211 actcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 310  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  17300172 actcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 17300270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 169 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 56516368 - 56516225
Alignment:
Q  169 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 268  Q
    ||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  56516368 ctatgtagtgttctcatagcgagtcaatccaatataaatattactcatgatatttatacgtatgtgaagacttgataactctttatccattatctgtgag 56516269  T
Q  269 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaat 312  Q
    || ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  56516268 atttgatcattaatctacctacataatagtctctatgttttaat 56516225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Original strand, 3369035 - 3369334
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||| || |  |||||||||||||||    
T  3369035 agtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catcaagagatcatagtggtttcagg 3369133  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||| |    
T  3369134 tctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaataca 3369229  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |     
T  3369230 aatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgac 3369328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18163452 - 18163153
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||||||||||||    
T  18163452 agtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcagg 18163354  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| |    |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || | |||||||||||    
T  18163353 tctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtgaatccaatata 18163258  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |     
T  18163257 aatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcgatcatcagtctacatacataatagtctcgac 18163159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20244227 - 20243928
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||||||||||||    
T  20244227 agtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcagg 20244129  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| |    |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||    
T  20244128 tctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatata 20244033  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |     
T  20244032 aatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgac 20243934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26531899 - 26531604
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  26531899 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 26531801  T
Q  109 agggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 208  Q
    || | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  26531800 agagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaata 26531705  T
Q  209 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 308  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  || ||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  26531704 ttactcctaatatttatatttatgtatagccttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctt 26531606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Original strand, 4675995 - 4676294
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||||||  |||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||||||||||||    
T  4675995 agtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttataatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcagg 4676093  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| |    |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||    
T  4676094 tctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatata 4676189  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |     
T  4676190 aatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgac 4676288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 245
Target Start/End: Original strand, 21453961 - 21454110
Alignment:
Q  94 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 193  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| | ||| |||||||  || |||||||||||||||||| || ||    
T  21453961 gtggtttcaggtcgaagggtgacatacaccactatcacaatgaaaatat-cttatgatattttacataactcata-tatgtagtattctcatggtgggtc 21454058  T
Q  194 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 245  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21454059 aattcaatataaatattactcctaatatttatatgtatgtgaaaacttgata 21454110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 19365806 - 19365519
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||   | |||||||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||| |    
T  19365806 cccattaactaacgttatggtcatcctgttacagacaacgtttgaatgacaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtcta 19365708  T
Q  109 agggtggaatacaccactatcacta-tgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaat 207  Q
    || |||| |||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||    
T  19365707 agagtggtatacaccattatcattggtgagaatat-cttatgacacttt-cataacat--actatgtagtactctcacggtgggtcaatccagtataaat 19365612  T
Q  208 attactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||| || ||| |||  ||  ||||| |  ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  19365611 attactcctaatatttatacctatgtatagatttaatatctc-atactcatgacccatgagatgtggtcatcagtctacgtatataatagtctc 19365519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5870708 - 5870419
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||| ||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| |||||   ||||| |||| || ||| |||||||| |  |||||||||||||||    
T  5870708 agtactcatcaaccaacgttattgttatcctattatagacaacgttagaatgacaacaaaacacttgagtcc-acatctagagatcatagtggtttcagg 5870610  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||| || |||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || |||||||||||||    
T  5870609 tctaagagcgatatacattattatcattgtgagaata-tcatatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatata 5870514  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  5870513 aatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtct 5870419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1942014 - 1941715
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| || ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  1942014 agtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacattagaatggcaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcatagtggtttcagg 1941916  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||| ||| ||||||  | |||||||  ||||||||||||||||||| || || | |||||||||||    
T  1941915 tctaagagcgatatacactattatcattgtgagaata-tctcatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggttaatccaatata 1941820  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||  |||||||||||||| |     
T  1941819 aatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctatatacataatagtctcgac 1941721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 319
Target Start/End: Original strand, 32646536 - 32646846
Alignment:
Q  6 gtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggt 105  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||  ||||||| | |   |||||| || ||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||    
T  32646536 gtacccatcaaccgacttcataatcatcctgttatggatgacgtttgtacgacaacaaagtacccgactcatacatccaggatacagagttgtttcaggt 32646635  T
Q  106 cgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||| | |||| | | | ||||  | | |||||| |||  ||||||| ||||| ||||  | |||||||||| ||    
T  32646636 cgaagggtaaaatacaccacttatcactacgggaatgt-catgtgact-tatacataaccttt--tatgtagcattcttatggtaggtcaatccaatgta 32646731  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||| |||||||||||||||||   || | ||||||||||||  ||    
T  32646732 aatattattcctaatatttatatctatgtgaagactcgatattcctttatcaatgatccgtgagatgtgatcatcaacatatccacataatagtcttcat 32646831  T
Q  305 gctttaatgatatcc 319  Q
     |||||||| |||||    
T  32646832 tctttaatgttatcc 32646846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 5616681 - 5616335
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||  |||||||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||| || |    
T  5616681 cccattaaccaacgttacagttatcttgttacaaacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagatcta 5616583  T
Q  109 agggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 208  Q
    ||  ||| |||||||| ||||| | | ||||||| ||||||||||||| |||||  |  ||| ||||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||    
T  5616582 agattggtatacaccattatcattgtaagaatat-cttatgacacttt-cataa--taaactctgtagtattctcacggttggtcaatccagtataaata 5616487  T
Q  209 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 308  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||  | |||| | | |||  |||  |||| |  ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5616486 ttacttctaatatttatacctacgtatatacttaacatctc-atatttatgacccatgagatgtggtcatcaatctacatacataatagtctcaatgctt 5616388  T
Q  309 taatgatatcccacttctcaacaaagc--ttgactacggatactttgagaata 359  Q
    || | |||||||| |||  || ||| |  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  5616387 tattaatatcccaattcataataaaacctttgacaacggatactttaagaata 5616335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19362695 - 19362477
Alignment:
Q  10 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 109  Q
    |||| ||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||   | |||||| |  | |||| |||||| ||  ||||||||||||||||  ||    
T  19362695 ccattaaccaccgttatggtcatcctgttacagacaacgtttgaatgacaataaagcatttaagtcca-catctaaggatcatagtggtttcaggtttaa 19362597  T
Q  110 gggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatat 209  Q
    | |||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||  ||||| |  ||||||||||| ||||| |  || |||||||| |||||||||    
T  19362596 gagtggtatacaccattatcattgtgagaatat-cttatgacactttg-ataacat--actatgtagtactctcacgatgggtcaatccagtataaatat 19362501  T
Q  210 tactcctaatatttatatctatgt 233  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||    
T  19362500 tactcctaatattaatacctatgt 19362477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 95 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 32636685 - 32636475
Alignment:
Q  95 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatca 194  Q
    |||||||| |||| || |||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||    || |||    
T  32636685 tggtttcacgtcggagagtggtatacaccattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacattgggtca 32636590  T
Q  195 atccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataa 294  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    ||||| ||| |||  ||| ||||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  32636589 atccaatataaatattactcataatatttatacctatgcatggacttaatatctc-gtattcatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataa 32636491  T
Q  295 tagtctctatgcttta 310  Q
    ||||||| | ||||||    
T  32636490 tagtctccacgcttta 32636475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Original strand, 5528495 - 5528790
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||| || |||||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||||  |||||||||  |    
T  5528495 cccattaaccaacattatggttatcctgttacagataacgtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcatagcagtttcaggtata 5528593  T
Q  109 agggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 208  Q
    || |||  |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||  | ||||| || ||||||||| |  || | ||| |||||||||||    
T  5528594 agagtgttatacaccattatcattatgagaatat-cttatggca-ttttcataa--tatactacgtggtattctcacgttgggttaatacaatataaata 5528689  T
Q  209 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 308  Q
    | |||||||||||||||| ||||||  | || | ||| |||  ||| ||||| | |||||||||| |||| | |||||  |||||||||||| || ||||    
T  5528690 tcactcctaatatttatacctatgtatatacataatatctc-gtattcatgacccgtgagatgtggtcataattctacaaacataatagtctatacgctt 5528788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 219 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 24700291 - 24700213
Alignment:
Q  219 tatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatag 297  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24700291 tatttatatctatgtgaagacttaatatctctttatccaagatctgtaagatgtgattatcagtctacccacataatag 24700213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 257 - 359
Target Start/End: Original strand, 10677538 - 10677638
Alignment:
Q  257 atgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgaga 356  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  | |||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  10677538 atgatccgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctatatactttaatgttatctca--tttcactaaagcttgactacggatactttaaga 10677635  T
Q  357 ata 359  Q
    |||    
T  10677636 ata 10677638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 257 - 359
Target Start/End: Original strand, 10891178 - 10891278
Alignment:
Q  257 atgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgaga 356  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  | |||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  10891178 atgatccgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctatatactttaatgttatctca--tttcactaaagcttgactacggatactttaaga 10891275  T
Q  357 ata 359  Q
    |||    
T  10891276 ata 10891278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9487841 - 9487625
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| |||||||||  ||||   |||||  ||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  9487841 agtacccatcaaccaatgttatggttatcctattacagacaacgttataatgacaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 9487743  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |  || || ||||| ||||    
T  9487742 tctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatat-cttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacgatgggtctatccagtata 9487647  T
Q  205 aatattactcctaatatttata 226  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9487646 aatattactcctaatatttata 9487625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 30040501 - 30040705
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||| ||| ||||||| |||| || ||||| ||||  ||||| || |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  30040501 agtactcattaaccaacgttatggttatccttttacaaacaacattagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 30040599  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| |||  |||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||    
T  30040600 tctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatat-cttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtactctcatggtgggtcaatctagtata 30040695  T
Q  205 aatattactc 214  Q
    ||||||||||    
T  30040696 aatattactc 30040705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4546298 - 4546071
Alignment:
Q  78 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagt 177  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||| | | ||||||||  ||||||||||    
T  4546298 acatctagggatcatagtggttttaggtcaaagagcgatatacactattatcattgtgagaatat-cttatgacaatct-cataactt--actatgtagt 4546203  T
Q  178 attctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatca 277  Q
    ||||||| || || ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| ||| |    
T  4546202 attctcacggtgggtctgtccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcgatta 4546104  T
Q  278 tcagtctacctacataatagtctctatgcttta 310  Q
    |||||| || |||||||||||||| | ||||||    
T  4546103 tcagtcaacatacataatagtctcgacgcttta 4546071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9538244 - 9538033
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||| || |||| |||| | ||  ||| ||||||| ||||| |    
T  9538244 cccattaaccaacgttatggttatcctgttacggacaatgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catccaaggatcatggtggtttgaggtcta 9538146  T
Q  109 agggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 208  Q
    ||  ||||  || ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||    
T  9538145 agactggac-acgccattatcattgtgagaatat-cttatgacacttt-cataacatg--ctatgtagtattctcacgctgggtcaatccagtataaata 9538051  T
Q  209 ttactcctaatatttata 226  Q
    |||||||||| |||||||    
T  9538050 ttactcctaacatttata 9538033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 71 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 24701411 - 24701361
Alignment:
Q  71 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaataca 121  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24701411 gactcctacatctagggtacacagtggttttaggtcgaagggtggaataca 24701361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 33888743 - 33888594
Alignment:
Q  90 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 189  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||| ||| ||||| | ||| ||||| ||||||| ||||| |  |  ||||| ||||| |||||| |    
T  33888743 catagtgatttcaggtcgaaatgtggcatacaccactgtcaatatgatattat-cttatcacactttacataaatcat--tatgtggtattatcatggtg 33888647  T
Q  190 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 245  Q
    | ||||| ||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33888646 ggtcaattca---taaatattacacataatatttatatctatgtgaaaacttgata 33888594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 254
Target Start/End: Original strand, 34777893 - 34777975
Alignment:
Q  172 tgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttat 254  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||| | |||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||    
T  34777893 tgtagtattctcatggagggtcaatctaatacaaaaattactcattatatttatacatatttgaagacttgataactttttat 34777975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 11421298 - 11421096
Alignment:
Q  4 gagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcag 103  Q
    |||||||||| | ||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   | |||||||| || | || |||||| ||  ||||||||||||||    
T  11421298 gagtacccattagccaacattatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaataaagcacttgagtaca-catctacggatcatagtggtttcag 11421200  T
Q  104 gtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatat 203  Q
    ||| | | |||  |||||  | |||| || ||| |||| |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||| | || || ||||||||||||    
T  11421199 gtctatgagtgatatacattattatccctgtgataata-tcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattctaacggtgggtcaatccaatat 11421104  T
Q  204 aaatatta 211  Q
    ||||||||    
T  11421103 aaatatta 11421096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 264 - 344
Target Start/End: Original strand, 39074190 - 39074270
Alignment:
Q  264 gtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacg 344  Q
    |||||||||||||| || || ||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||  ||||||||    
T  39074190 gtgagatgtgatcaacaatcaacccacgtaatagtctccatgctttaatgatatctcacttcacaataaagtatgactacg 39074270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 325
Target Start/End: Original strand, 9937933 - 9938015
Alignment:
Q  243 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttc 325  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| |||||||  ||| |||| ||||||    
T  9937933 ataactctttattcatgatttatgagatgtgatcatgactctacccacacaatagtctatatgcttcgatgctatctcacttc 9938015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 102
Target Start/End: Original strand, 9937745 - 9937826
Alignment:
Q  21 ctttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttca 102  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  || |||| | |||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  9937745 ctttatagtcatccttttacgaacaatgtttgaacgacgataaagtattcgactcttacatctagggtacatagtgatttca 9937826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11421052 - 11421007
Alignment:
Q  265 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 310  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  11421052 tgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtctcgaagcttta 11421007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 310
Target Start/End: Original strand, 30040740 - 30040785
Alignment:
Q  265 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 310  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  30040740 tgagatgtggtcatcagtctatatacataatagtctcgatgcttta 30040785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 351; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18252509 - 18252148
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252509 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 18252410  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252409 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 18252311  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252310 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 18252211  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252210 ctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagttt 18252148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 18532242 - 18532603
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532242 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 18532341  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532342 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 18532440  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18532441 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatctacataatagtct 18532540  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532541 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 18532603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 27131138 - 27131498
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27131138 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagg-tacatagtggttt 27131236  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131237 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 27131335  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131336 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 27131435  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27131436 ttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacaaatactttgagaatagttt 27131498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 27310305 - 27310666
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310305 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 27310404  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310405 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactataagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 27310503  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27310504 tataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccataatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtct 27310603  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  27310604 ctatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactactgatactttaagaatagttt 27310666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 16358763 - 16359124
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16358763 atggagtacccatcaaccaactttaaagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatggtggttt 16358862  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358863 caagacgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttctcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 16358961  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16358962 tataaatattactcataatatttatatctatgtgaaggcttgataactctttatccattatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtct 16359061  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  16359062 ctatgctttaatgatattccatttctcaataaagcttgactagggttactttaagaatagttt 16359124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Original strand, 36816363 - 36816718
Alignment:
Q  2 tggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttc 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816363 tggagtacctatcaaccaactttatagttatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaaacgctcgactccaacatctagggtacatagtggtttc 36816462  T
Q  102 aggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaat 201  Q
    || || |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  36816463 agttcaaagggtggaatacaccaccatcactatgataatttt--tatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtgggtcaatccaat 36816560  T
Q  202 ataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  36816561 ataaatattactcctaatatttatatctatgtgtagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatccacataatagtctc 36816660  T
Q  302 tatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 359  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  36816661 tatgctttaatggtatcccacttctcaataaagcttgactatggatactttaagaata 36816718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 3855647 - 3855988
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3855647 atggagtaccggtcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgcttgaatggtgacaaagcgctcaactccaacatctagggtacatagtggttt 3855746  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  3855747 cgggtcgaatggtggaatacaccactatcactgtgagaatat-cttatgacacttttcataacctttactatgtagtattctcattgcgggtcaatccaa 3855845  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  3855846 tataaatattactcctaatatttatacctatgtgaagactttataactctttatccatgatttgtgagatgtgatcatcagtctacccacgtaatagtct 3855945  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactac 343  Q
    | |||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  3855946 ccatgctttaataatatcccacttcacaataaagtttgactac 3855988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 121 - 363
Target Start/End: Original strand, 21171081 - 21171322
Alignment:
Q  121 accactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaata 220  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171081 accactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaata 21171179  T
Q  221 tttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatccc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21171180 tttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgttatcatcagtctacccacataatagtctttatgctttaatgatatccc 21171279  T
Q  321 acttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21171280 acttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagttt 21171322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 27277286 - 27277642
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  |||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27277286 atggagtacccttcaaccaactttatggtcatcttgttacaaacaatgtttgaattatgataaagcactcgactccaacatccagggtacatagtggttt 27277385  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||| | |||||| |||| || |||||| |     
T  27277386 caggtcaaagggtggaatacaccactatcactataagaatat-cttatggcacttt-catgacttttactatgcaatattcttatggtgggtcaatctag 27277483  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  27277484 tataaatattactcctaatatttatacctatgtgaaaacatgataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatcggtctacccacataatagtct 27277583  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 359  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27277584 ctatgctttaatgttatcccttttcacaataaagcctgactacggatactttaagaata 27277642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 275
Target Start/End: Original strand, 22641603 - 22641871
Alignment:
Q  2 tggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttc 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22641603 tggagtacccatcgaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctacggtacatagtggtttc 22641702  T
Q  102 aggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| | |    
T  22641703 aggtcgaagggtggaatacaccactatcactgtgagaata-tcttatgacactttttataacttttactatgtagt-ttctcatggtgggtcaatctagt 22641800  T
Q  202 ataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgat 275  Q
    |||||||||| ||||||   ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22641801 ataaatattattcctaa---ttatatctatgtgaacacttaataactctttatccatgatctatgagatgtgat 22641871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Original strand, 22657108 - 22657289
Alignment:
Q  161 aacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatga 260  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22657108 aacttttactatgtagtattcacatggtgggtcaatctaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttaataactctttatctatga 22657207  T
Q  261 tctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgacta 342  Q
     || ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||||    
T  22657208 gctatgagatgtgatcatcagtctatccacatgatagtctctatgctttaatgatatctcatttcagaataaagcttgacta 22657289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Original strand, 19706451 - 19706750
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  19706451 agtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 19706549  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  19706550 tctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatata 19706645  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |     
T  19706646 aatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgac 19706744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23507377 - 23507056
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||| || | | |||||||||||||| |||| |||    |||| ||| | |||||| |||| | ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  23507377 atggagtacccataaatcgaatttatagtcatcctattacagacggtatttgtatgataacaaagtactcaaatcttacatctagggtacacagtggttt 23507278  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatcca 199  Q
    ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||||  |||||| |  ||| || ||| ||  || ||||| ||||| |||| || | ||||||    
T  23507277 caggtcgaaggatgacatactccacttatcactatgagaataa-cttatg-ctttttacacaacgtt--ctctgtagcattctaatggtgggttaatcca 23507182  T
Q  200 atataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtc 299  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || | ||| ||    
T  23507181 atataaatattactcctattatttatatctatgtgaaaacttgataactccttatccatgatccgtgagatgtgatcatcagtctatccaccttatattc 23507082  T
Q  300 tctatgctttaatgatatcccacttc 325  Q
    | ||| |||||||| |||||||||||    
T  23507081 tatatactttaatgctatcccacttc 23507056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Original strand, 43802377 - 43802676
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  43802377 agtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 43802475  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  43802476 tctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatata 43802571  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |     
T  43802572 aatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgac 43802670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Original strand, 28134735 - 28135034
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  28134735 agtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catttagggatcatagtggtttcagg 28134833  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28134834 tctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtggatcaatccaatata 28134929  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |     
T  28134930 aatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataattgtctcgac 28135028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 71 - 347
Target Start/End: Original strand, 12014084 - 12014357
Alignment:
Q  71 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttac 169  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||| |||   |||| | |  || | |    
T  12014084 gactcctacatctagagtacacagtgattttaggttgaagggtgaaatacaccacttatcactatgagaatga-cttgtga---tttttacatattgttc 12014179  T
Q  170 tatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaga 269  Q
    ||||||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  12014180 tatgtaacattctcatgccgggtcaatccaatattaatattactcttaatatttatatttatgtgaagacttgataactccttatcaatgatccgtgaga 12014279  T
Q  270 tgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggat 347  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||| || ||||||||  |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||    
T  12014280 tgtgatcatcattctacccacataatggtctttacgctttaatcgtatccctcttcacactaaagcttaactacggat 12014357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9456402 - 9456107
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  9456402 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 9456304  T
Q  109 agggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 208  Q
    || | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  9456303 agagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaata 9456208  T
Q  209 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  9456207 ttactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctt 9456109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Original strand, 20391251 - 20391550
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||||||||||||    
T  20391251 agtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcagg 20391349  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | || |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||    
T  20391350 tctaagagcggtatacattattatcattgtgagaatat-cttatgaaaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatata 20391445  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |     
T  20391446 aatattactcctaacatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgac 20391544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Original strand, 20779661 - 20779956
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  20779661 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 20779759  T
Q  109 agggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 208  Q
    || | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  20779760 agagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaata 20779855  T
Q  209 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  20779856 ttactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctt 20779954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Original strand, 22670273 - 22670568
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  22670273 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 22670371  T
Q  109 agggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 208  Q
    || | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  22670372 agagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaata 22670467  T
Q  209 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  22670468 ttactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctt 22670566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Original strand, 42817005 - 42817300
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  42817005 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 42817103  T
Q  109 agggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 208  Q
    || | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  42817104 agagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaata 42817199  T
Q  209 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  42817200 ttactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctt 42817298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 9916506 - 9916688
Alignment:
Q  2 tggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtgg-ttt 100  Q
    ||||| || ||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  9916506 tggagaactcataaactaactttatagtcaccttgttacggacaacgtttggacggtaacaaagtactcgactcctacatctagggtacatagtggtttt 9916605  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatg 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9916606 caggtcgaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataat-ttatgaca-tttacataacttt--ctatgtagtattctcatg 9916688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 192 - 359
Target Start/End: Original strand, 9917837 - 9918003
Alignment:
Q  192 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 291  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||| |||    
T  9917837 tcaatccaatataaatattactca-aatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatccacgagatgtgatcatcaacctaccgaca 9917935  T
Q  292 taatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 359  Q
    || || ||||||||||| |||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||  |||| ||| ||||||    
T  9917936 tagtattctctatgcttcaatgctatcccacttaacaataaagcttaactatagatattttaagaata 9918003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22612782 - 22612483
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    |||| |||||||||||| ||||  | ||||| |||  ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||||||||||||    
T  22612782 agtagccatcaaccaacgttatgattatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagtgatcatagtggtttcagg 22612684  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |    
T  22612683 tctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaataaa 22612588  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  ||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |     
T  22612587 aatattactcccaatatttatatctatgtatagacttgatatatc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgac 22612489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 634216 - 633934
Alignment:
Q  13 tcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaaggg 112  Q
    ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |    
T  634216 tcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagag 634118  T
Q  113 tggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattac 212  Q
     |  |||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || || | |||||| ||||||||||||    
T  634117 cgatatacactattatcattgtgagaatat-cttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggttaatccagtataaatattac 634022  T
Q  213 tcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 301  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  || | |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  634021 tcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atagctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 633934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8727957 - 8727658
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||| | ||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  8727957 agtacccattagccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtccg-catctagggatcatagtggttccagg 8727859  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| |||  ||||||   |||||||| |||||||| ||||||  | |||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  8727858 tctaagagtgatatacactcttatcactaagagaatat-cttatggta-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtggatcaatccagtata 8727763  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||  |||| |  ||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| |     
T  8727762 aatattacttctaatatttatacttatgtatagacttaatatctc-atatatatgacccatgagatgtagtcatcagtctacatagataatagtctcgac 8727664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Original strand, 47667497 - 47667785
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||||||||||||    
T  47667497 agtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcagg 47667595  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||           ||| || || |||||||||||||    
T  47667596 tctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--act-----------tcacggtgggtcaatccaatata 47667680  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |     
T  47667681 aatattactcataatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgac 47667779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 35930713 - 35930573
Alignment:
Q  169 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 268  Q
    |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||    
T  35930713 ctatgtagtattctcacggtaggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgag 35930615  T
Q  269 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 310  Q
    ||| | |||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  35930614 atgcggtcatcagtctatatacataatagtctcgacgcttta 35930573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 196 - 344
Target Start/End: Original strand, 12006461 - 12006609
Alignment:
Q  196 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 295  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||| |||||  || || ||||||||||||||||   ||||||     
T  12006461 tccagtataaatattactcttaatatttatatctgtgcgaacacttgataactccttatcaatgattcgtaagttgtgatcatcagtctatgcacataac 12006560  T
Q  296 agtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacg 344  Q
    | |||||| | ||||||| |||||| |||| ||  || |||||||||||    
T  12006561 aatctctaagttttaatgttatccctcttcacactaaggcttgactacg 12006609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29097008 - 29096789
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    ||||| ||||||| |||| || ||||| |||| || ||||||||||| |  | ||| |||| || ||||  ||||||||  ||||||||||||| ||| |    
T  29097008 cccattaaccaacgttatggttatcctattacagataacgtttgaatcgaaataaaacacttgagtccat-atctagggatcatagtggtttcatgtcta 29096910  T
Q  109 agggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 208  Q
    || |||  | |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||||||| || || ||||||||| | ||||||||    
T  29096909 agagtgtgaaacaccattatcattatgagaatat-cttatgaca-ttttcataacatg--ctatgtagtattcacacggtggatcaatctagtataaata 29096814  T
Q  209 ttactcctaatatttatatctatgt 233  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  29096813 ttattcctaatatgtatacctatgt 29096789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 226
Target Start/End: Original strand, 21881475 - 21881604
Alignment:
Q  93 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 192  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| || || |    
T  21881475 agtggcttcaggtctaagagtggtatacaccgttatcattgtgagaatat-cttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtgggt 21881570  T
Q  193 caatccaatataaatattactcctaatatttata 226  Q
    |||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  21881571 caatcttgtataaacattactcctaatatttata 21881604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 293
Target Start/End: Original strand, 26923553 - 26923678
Alignment:
Q  167 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 266  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||| ||| | ||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||    
T  26923553 tactatgtagtattctcacggtgggtcaattcagtataaatattactcctaatattcataccaatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatg 26923651  T
Q  267 agatgtgatcatcagtctacctacata 293  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  26923652 agatgtggtcatcagtctacatacata 26923678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 106
Target Start/End: Original strand, 28145735 - 28145835
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  28145735 agtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagggatcatagtggtttcagg 28145833  T
Q  105 tc 106  Q
    ||    
T  28145834 tc 28145835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 51997406 - 51997353
Alignment:
Q  173 gtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 226  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51997406 gtagtattctcatggtgggtcaatctaatataaatattactcctaatatttata 51997353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 140
Target Start/End: Original strand, 12006332 - 12006413
Alignment:
Q  60 acaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaat 140  Q
    |||||| ||| |||| | |||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  12006332 acaaagtacttgacttctacatctagagtacacaatgatttcaggtcgaagggtggaaaacaccacttatcagtatgagaat 12006413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 246
Target Start/End: Original strand, 24301691 - 24301855
Alignment:
Q  80 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtat 179  Q
    ||||||||  |||| || ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||  | ||||||| ||||    
T  24301691 atctagggatcataatgattttaggtcaaagggttgtatacaccactatcactatgagaat-gtcttatgatacttaacataac--tcactatgtggtat 24301787  T
Q  180 tctcatggcggatcaatccaata-taaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataa 246  Q
    |||| ||  || |   || ||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||    
T  24301788 tctcgtgatgggtatttctaatagcaaatattactcctaatatgtatacctatgtgaaatcttgataa 24301855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 347; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 6662 - 7023
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6662 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttatggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 6761  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6762 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 6860  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6861 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 6960  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6961 ctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagttt 7023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 13678 - 14039
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13678 atggagtaaccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 13777  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13778 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 13876  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13877 tataaatattactcctaatatttatatctttgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 13976  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13977 ttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagttt 14039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 347; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18766 - 18406
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18766 atggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 18668  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18667 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 18569  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18568 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 18469  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18468 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 18406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 347; Significance: 0; HSPs: 47)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 15152922 - 15152561
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152922 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 15152823  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152822 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 15152724  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152723 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 15152624  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15152623 ctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagttt 15152561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 29328263 - 29327902
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328263 atggagtacccatcaagcaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 29328164  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328163 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 29328065  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328064 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 29327965  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327964 ctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagttt 29327902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 11535790 - 11536148
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535790 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 11535889  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535890 caggtcgaatgttggaatacatcactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 11535988  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535989 tataaatattactcctaatatttatatctttgtgaagactggataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 11536088  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatag 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11536089 ctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatag 11536148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 11542708 - 11543066
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11542708 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagacaacgtttgaatggtgacaaatcactcgactccagcatctagggtacatagtggttt 11542807  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542808 caggtcgaagggtggaatacatcactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacatttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 11542906  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542907 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 11543006  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatag 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11543007 ctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatag 11543066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 12751305 - 12750944
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12751305 atggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacctagtggttt 12751206  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751205 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 12751107  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  12751106 tataaatattactcataatatttatatctatgagaagaattgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatccacataatagtct 12751007  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12751006 ctatgctttaatgatatccaacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagttt 12750944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 12739015 - 12738654
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12739015 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacaaacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactacaacatctagggtacatagtagttt 12738916  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738915 caggtcgaacggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 12738817  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  12738816 tataaatattatgagtaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcttcagtctacccacataatagtct 12738717  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12738716 ctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagttt 12738654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 5 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18561473 - 18561125
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18561473 agtacctatcaatcaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaatcactcaactccaacatctagggtacatagtggtttcaag 18561374  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  18561373 tcgaagggtggaatacaccactatcactat----------ttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagagggtcaatccaatata 18561284  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18561283 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctat 18561184  T
Q  305 gctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18561183 gctttaatgatatcccacctctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagttt 18561125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 13392629 - 13392272
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  13392629 atggagtacccatcaaccaattttatagtcatcttgttacaaacaacgtttgtatggtgacaaagcacctgactccaacatctatggtacatagtgattt 13392530  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  13392529 taggtcaaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataaattttactatgtaatattcgcatggtgggtcaatccag 13392431  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| | | ||||||||    
T  13392430 tataaatatttctcctaatatttattcctatgtgaagacaggataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatcgatctaccaatacaatagtct 13392331  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 359  Q
    ||||| ||||||| ||||||  ||| ||| |||| |||||||  |||||||| ||||||    
T  13392330 ctatgttttaatgttatcccttttcacaataaagtttgactattgatactttaagaata 13392272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 359
Target Start/End: Original strand, 18257577 - 18257927
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  18257577 agtacccatcaaccaactttatagttatcttgttacacacaacgtttgaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 18257675  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| |||  |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||| |||||| | || || | |||||||||||    
T  18257676 tctaagagtgatatacaccattatcattgtgagaatat-cttatgacatttttcatgacat--actatgtaatattctgacggtgggttaatccaatata 18257772  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||    
T  18257773 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcaatctatccacataatagtctttat 18257872  T
Q  305 gctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 359  Q
    || ||| || ||||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  18257873 gcattattgttatcctacttaacaaaaaaacttgactacggatactttaagaata 18257927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 2204838 - 2204543
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  2204838 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 2204740  T
Q  109 agggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 208  Q
    || | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  2204739 agagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaata 2204644  T
Q  209 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  2204643 ttactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctt 2204545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18400390 - 18400095
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  18400390 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcca 18400292  T
Q  109 agggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 208  Q
    || | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  18400291 agagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaata 18400196  T
Q  209 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  18400195 ttactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctt 18400097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18407374 - 18407079
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  18407374 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcca 18407276  T
Q  109 agggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 208  Q
    || | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  18407275 agagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaata 18407180  T
Q  209 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  18407179 ttactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctt 18407081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Original strand, 48808512 - 48808807
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  48808512 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 48808610  T
Q  109 agggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 208  Q
    || | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  48808611 agagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaata 48808706  T
Q  209 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  48808707 ttactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctt 48808805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 8465289 - 8464999
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||| ||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  8465289 agtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctaaggatcatagtggtttcagg 8465191  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  8465190 tctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatata 8465095  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  8465094 aatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 8464999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 260 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 15148363 - 15148260
Alignment:
Q  260 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15148363 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaata 15148264  T
Q  360 gttt 363  Q
    ||||    
T  15148263 gttt 15148260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 30254428 - 30254129
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||| |    
T  30254428 agtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaag 30254330  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| ||   |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |    
T  30254329 tctaagagtaatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaataca 30254234  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |     
T  30254233 aatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgac 30254135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15730041 - 15729742
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||||||||||||    
T  15730041 agtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcagg 15729943  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| |    |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||    
T  15729942 tctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatata 15729847  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |     
T  15729846 aatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgac 15729748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Original strand, 18139350 - 18139649
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||||||||||||    
T  18139350 agtacccatcaaccaacgttattattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcatagtggtttcagg 18139448  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||| |    
T  18139449 tctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaataca 18139544  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |     
T  18139545 aatattactcctaatatttatatctatgtatagacctgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgac 18139643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19231178 - 19230879
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  19231178 agtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catttagggatcatagtggtttcagg 19231080  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||||||| || || |||||||| ||||    
T  19231079 tctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataacttat--tatgtagtattctcacggtgggtcaatccagtata 19230984  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |     
T  19230983 aatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgac 19230885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2365389 - 2365169
Alignment:
Q  11 catcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaag 110  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | |   |||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||     
T  2365389 catcaaccgactttatagtcaatctgttacggacgacgtttgtacgacaacaaagtacttgactccaaggtctagggtacatagtggctttaggtcgaat 2365290  T
Q  111 ggtggaatacaccact-atcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatat 209  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||| ||| ||||||||   |||||||| ||| |||||| || |||||||||| |||||||    
T  2365289 ggtgaaatacaccacttatcacaatgagaataa-cttatgaca-tttacataacttc--ctatgtagcattttcatggtgggtcaatccaatgtaaatat 2365194  T
Q  210 tactcctaatatttatatctatgtg 234  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  2365193 tactcctaatattgatatctatgtg 2365169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Original strand, 41680980 - 41681203
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    |||||| |||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  41680980 agtaccaatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 41681078  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||    
T  41681079 tctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccagtata 41681174  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgt 233  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  41681175 aatattactcataatatttatacctatgt 41681203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Original strand, 47166871 - 47167170
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  47166871 agtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 47166969  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || || || ||| | ||||    
T  47166970 tctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatat-cttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtctatctagtata 47167065  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |     
T  47167066 aatattactcataatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgac 47167164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Original strand, 10668913 - 10669213
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||| | || |||| ||| || ||  |||||||||||||||    
T  10668913 agtacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcatttgagtcca-catttacggatcatagtggtttcagg 10669011  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactat-gagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatat 203  Q
    || ||| | |  |||||| | ||||| |   |||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||| | |||    
T  10669012 tctaagagcgatatacactattatcaattgcgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatctagtat 10669107  T
Q  204 aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctcta 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |    
T  10669108 aaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcga 10669206  T
Q  304 tgcttta 310  Q
     ||||||    
T  10669207 cgcttta 10669213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 300
Target Start/End: Original strand, 24443349 - 24443628
Alignment:
Q  15 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||    | |||||||| || |||| |||||||||  |||| |||||||| ||| ||| |||    
T  24443349 aaccaacgttatggtcatcctgttacacacaacgtttgaataacaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaagtctaagagtg 24443447  T
Q  115 gaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactc 214  Q
      |||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||| || || | |||| | ||||||||||||||    
T  24443448 ttatacaccattatcactgtgagaataa-cttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtactctcacggtgggttaatctagtataaatattactc 24443543  T
Q  215 ctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    |||||||| ||| ||||||  | |||| ||| || | ||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24443544 ctaatattcatacctatgtataaacttaatatct-tatattcatgacccatgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtct 24443628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 169 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10235474 - 10235361
Alignment:
Q  169 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 268  Q
    |||||||  |||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10235474 ctatgtataattctcatggtgagtcaatccgatataaatattattcctaatatttatacatatgggaacacctgataactctttatcaatgatctgtgag 10235375  T
Q  269 atgtgatcatcagt 282  Q
    ||||||||||||||    
T  10235374 atgtgatcatcagt 10235361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 28130851 - 28130552
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| |||||| ||  ||||||| |||||||    
T  28130851 agtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctacggatcatagtgatttcagg 28130753  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || |||  ||  |||||| | ||| | | ||||||||| ||||||||| ||| |||||| |  |||||||| ||||||||  | || |||||||| ||||    
T  28130752 tctaagaatgatatacactattattattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataacat--actatgtaatattctcacagtgggtcaatccagtata 28130657  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||  |||| |  ||||||| | |||||||||||| | |||||||||||| |     
T  28130656 aatattactcctgatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatttatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatgcataatagtctcgac 28130558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Original strand, 25845498 - 25845780
Alignment:
Q  15 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 114  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||| || || ||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||    
T  25845498 aaccaacgttatagttatctttttacagataaggtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtctaagagtg 25845596  T
Q  115 gaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactc 214  Q
    | ||||| || ||| | | ||||||||| ||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||    
T  25845597 gtatacatcattattattttgagaatat-cttatgata-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtgtgtcaatccagtataaatattactc 25845692  T
Q  215 ctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctcta 303  Q
    |||||||| | |  || ||  |||||| ||| |||  ||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25845693 ctaatattgacacatacgtatagacttaatatctc-atattcatgagcaatgagatgtggtcatcagtctacatgcataatagtctcta 25845780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Original strand, 25845917 - 25846199
Alignment:
Q  15 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 114  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||| || || ||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||    
T  25845917 aaccaacgttatagttatctttttacagataaggtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtctaagagtg 25846015  T
Q  115 gaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactc 214  Q
    | ||||| || ||| | | ||||||||| ||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||    
T  25846016 gtatacatcattattattttgagaatat-cttatgata-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtgtgtcaatccagtataaatattactc 25846111  T
Q  215 ctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctcta 303  Q
    |||||||| | |  || ||  |||||| ||| |||  ||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25846112 ctaatattgacacatacgtatagacttaatatctc-atattcatgagcaatgagatgtggtcatcagtctacatgcataatagtctcta 25846199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 310
Target Start/End: Original strand, 19393462 - 19393735
Alignment:
Q  31 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatca 130  Q
    ||||| |||| |||||| || ||| ||| |||||||||| || || |||||||||||  |||| ||| |||||||| ||| |||  |||||| | |||||    
T  19393462 atccttttacagacaacattagaaaggtaacaaagcacttgagtc-aacatctagggatcatactggattcaggtctaagagtgatatacactattatca 19393560  T
Q  131 ctatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatcta 230  Q
     | ||||||||| ||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||  | |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19393561 ttgtgagaatat-cttatgaga-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtcggtcaatctagtataaatattactcctaatatttataccta 19393656  T
Q  231 tgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 310  Q
    |||  |||||| ||| |||  |||  |||| |  ||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  19393657 tgtatagacttaatatctc-atatttatgacccatgaaatgtggtcattagtctacatacataatagtctcgacgcttta 19393735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 19388774 - 19388544
Alignment:
Q  78 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataactt--ttactatgta 175  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  |   ||||||    
T  19388774 acatctagggctcataatggtttcaggtctaagagtggtatacactattaccactatgagaatat-cttatgacacttt-cataacatactatatatgta 19388677  T
Q  176 gtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgat 275  Q
    |||||||||||   |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||  | |||| ||| |||  ||| ||||| | ||||||| || |    
T  19388676 gtattctcatgattgggcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctttgtacaaacttaatatctc-atattcatgacccgtgagatatggt 19388578  T
Q  276 catcagtctacctacataatagtctctatgcttt 309  Q
    ||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  19388577 catcaatctatatacataataatctctatgcttt 19388544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 34128863 - 34128647
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  34128863 agtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcatagtggtttcagg 34128765  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||| | ||| | | |||||||| ||||||||||  | |||||||   ||||||||||||||||||    ||||| ||||| ||||    
T  34128764 tctaagagcgatatacactattataattgtgagaata-tcttatgaca-atctcataac--gtactatgtagtattctcacaatggatctatccagtata 34128669  T
Q  205 aatattactcctaatatttata 226  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34128668 aatattactcctaatatttata 34128647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 178 - 343
Target Start/End: Original strand, 7662569 - 7662733
Alignment:
Q  178 attctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatca 277  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||  || |||| ||||||    
T  7662569 attctcatggcgggtcaatctaataaaaatattacttataat-tttatatctatgtgaagacttgataagtttttatacatgattcgtaagatatgatca 7662667  T
Q  278 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactac 343  Q
    ||||| || | |||||||| ||  | | |||||||| ||||| ||||| ||  ||| |||||||||    
T  7662668 tcagtgtatccacataataatcaatgtactttaatgctatcctacttcacactaaatcttgactac 7662733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 300
Target Start/End: Original strand, 47833875 - 47833983
Alignment:
Q  192 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 291  Q
    |||||| |||||||||||||    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||     
T  47833875 tcaatcaaatataaatattatgagtaatatttatacctatgtgaaaacttggtaactctttattcatgatcggtgagatctgatcaccagcctacctacg 47833974  T
Q  292 taatagtct 300  Q
    |||||||||    
T  47833975 taatagtct 47833983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Original strand, 18259136 - 18259359
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  ||||  |||||||||    
T  18259136 agtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcataagggtttcagg 18259234  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||| ||||||||||  | |||||||  |||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||    
T  18259235 tctaagagcgatatacactattatcattgtgagaata-tcttatgaca-atctcataac--ttactatgcagtattctcacggtgggtctatccagtata 18259330  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgt 233  Q
    |||||||||   |||||||||| ||||||    
T  18259331 aatattactttcaatatttatacctatgt 18259359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 39112275 - 39112138
Alignment:
Q  4 gagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcag 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||| |   |||||  ||| || ||| |||||||| |||||||||| |||||     
T  39112275 gagtacctatcaaccaactttatagtcaccttattacagacaacgtttgaacgacaacaaaatacttgattcctacatctagagtacatagtgatttcat 39112176  T
Q  104 gtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 141  Q
    || |||   ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39112175 gttgaataatggaatacaccactatcactaagagaata 39112138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 201 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 19859221 - 19859122
Alignment:
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  19859221 tataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtct 19859123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 223 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 7396450 - 7396358
Alignment:
Q  223 tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc---tacataatagtctctatgctttaat 312  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||    ||||||||||||||||||||||||    
T  7396450 tatatttatgtgaatacttgataattctttattcatgatatgtgagatgtgatcatcagttcaccctgcacataatagtctctatgctttaat 7396358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 90 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14592056 - 14591924
Alignment:
Q  90 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 189  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||  |||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||    ||| ||||||||||||| || |    
T  14592056 catagtggtttcaagtctaagagtgatatacactattatcaatctgagaatat-cttatgaca-ttttcataacaa--actgtgtagtattctcacggtg 14591961  T
Q  190 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 226  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14591960 ggtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 14591924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 90 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16011647 - 16011515
Alignment:
Q  90 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 189  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||    ||| | |||||||||||||| |    
T  16011647 catagtggtttcaggtctaagagtgatatacattattatcaatgtgagaatat-cttatgaca-ttttcataacaa--actgtatagtattctcatggtg 16011552  T
Q  190 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 226  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16011551 ggtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 16011515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 79 - 219
Target Start/End: Original strand, 31190524 - 31190660
Alignment:
Q  79 catctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagta 178  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |  || ||||||||    
T  31190524 catctagggatcttagtggtttcaggtctaacagtgatatacaccattatcactatgagaatat-cttaagaca-tattcataacat--acaatgtagta 31190619  T
Q  179 ttctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaat 219  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  31190620 ttctcatggtgggtcaatccagtataaatattgctcctaat 31190660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 3132986 - 3132849
Alignment:
Q  168 actatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtga 267  Q
    ||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| |  ||  | |||| |||    
T  3132986 actatgtagtattcttatgacaggtcaatccaatataaatatta-acataataattatacatatgtgaagacttgatatctcatattcatttatctatga 3132888  T
Q  268 gatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgc 306  Q
    ||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||||    
T  3132887 gatgtgatcatcagtctaatcacattgtagtctctatgc 3132849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22969153 - 22969024
Alignment:
Q  93 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 192  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| || || |    
T  22969153 agtggcttcaggtctaagagtggtatacaccgttatcattgtgagaatat-cttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtgggt 22969058  T
Q  193 caatccaatataaatattactcctaatatttata 226  Q
    |||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  22969057 caatcttgtataaacattactcctaatatttata 22969024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 142
Target Start/End: Original strand, 22948499 - 22948574
Alignment:
Q  67 actcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 142  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  22948499 actcaactcctacatctaaggtacatagcggtttcatgtcgaagggtggcatacacgactattactacgagaatat 22948574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 263 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 2365112 - 2365017
Alignment:
Q  263 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 359  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| |||| || ||| |||  ||| ||||||||| ||| ||| ||||||    
T  2365112 tgtgagatgtgatcatcagtcgacccacatgatagtctctatgttttaatgttatctcatttcacaa-taaggttgactacgaatattttaagaata 2365017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 39112092 - 39111980
Alignment:
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||  |  ||||||||||||||||| || || ||| | | ||| ||||||||   ||||||||||    
T  39112092 tataaataatactcctaatatttatgtatatatgaagaaattgtaactctttatccatgacctatgtgatattaccattagtctacccttataatagtct 39111993  T
Q  301 ctatgctttaatg 313  Q
    ||||  |||||||    
T  39111992 ctatattttaatg 39111980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 212 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 29983234 - 29983179
Alignment:
Q  212 ctcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtga 267  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29983234 ctcctaatatttatacatatgtgaaaatttgttaactctttatccatgatccgtga 29983179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7396511 - 7396469
Alignment:
Q  194 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  7396511 aatccaatataaatattacccataatatttatatttatgtgaa 7396469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 7586 - 7225
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7586 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagttgttt 7487  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7486 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 7388  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7387 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 7288  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7287 ctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatacttttagaatagttt 7225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 25718 - 26079
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25718 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 25817  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25818 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 25916  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25917 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagtcttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtcg 26016  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26017 ctatgctttaatgatatcccacttttcaataaagcttgactacggatactttgagaatagttt 26079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 24695194 - 24695555
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695194 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 24695293  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695294 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 24695392  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695393 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 24695492  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24695493 ctatgctttattgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatacttttagaatagttt 24695555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
Target Start/End: Original strand, 19714230 - 19714584
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714230 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 19714329  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714330 tcgaagggtggaatacacaactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 19714428  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19714429 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctat 19714528  T
Q  305 gctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatag 360  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  19714529 gctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgacttcggatattttaagaatag 19714584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 5 - 363
Target Start/End: Original strand, 18569593 - 18569952
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18569593 agtacccatcaaccaattttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgataaagcactcgactccaacatgtagggtacatagtggtttcagg 18569692  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18569693 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgataata-tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgggtcaatccaatata 18569791  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctt--tatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctct 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  18569792 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgatatctctttatatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctaccaacataatagtcttt 18569891  T
Q  303 atgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  18569892 atgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagagtagttt 18569952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 19706947 - 19707304
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||     
T  19706947 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacggacaacgtttgaatggtgacagagcactcgactccaatatctagggtacatagttatt- 19707045  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19707046 caggtcgaagggtggaatacacaattatcactatgagaaaat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 19707144  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19707145 tataaatattactcctagtatttatatctatgtgaagatttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtct 19707244  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatag 360  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  19707245 ctatgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgacttcggatattttaagaatag 19707304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 115 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 39538953 - 39538708
Alignment:
Q  115 gaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactc 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  39538953 gaatataccactatcactatgagaatatt-ttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttcatggtgggtcaatccaatataaatattactc 39538855  T
Q  215 ctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  39538854 ctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaaatatgaccatcagtctacccacataatagtcttcatgctttaatga 39538755  T
Q  315 tatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagt 361  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||| ||| ||||||||    
T  39538754 tatcccacttcacaataaagcttaactatggatattttaagaatagt 39538708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 17298629 - 17298912
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||| |||||||||| | | |||||||||||| ||||||    
T  17298629 atggagcacccatcaaccgattttatagtcatcctattacggacaacgtttgtacggaaacaaagtactcgactcctaaacctagggtacatattggttt 17298728  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatcca 199  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  17298729 caggttgaagggtggaatacgccacttatcactatgagaataa-cttatgaca-tttacataacttt--ctacgtagtattctcatggtgggtcaatcca 17298824  T
Q  200 atataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaga--tgtgatcatcagtcta 285  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||| |  ||||||||||||||||    
T  17298825 atataaatattactcttaatatttatatctatgtgaagatttaataactctttatccatgacccgtgatatgtgtgatcatcagtcta 17298912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 80 - 359
Target Start/End: Original strand, 18806843 - 18807119
Alignment:
Q  80 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagta 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||  || ||||||  |||||||  |    
T  18806843 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataa-cttatgacagtta-caaaacttt--ctatgtatca 18806938  T
Q  179 ttctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 278  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  18806939 ttctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatatgaaatgtgatcat 18807038  T
Q  279 cagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 359  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||| || |||||||||  |||||||| ||||||    
T  18807039 cagtctacccgcataatagtctctatgctttattgttatcttacttcacaataacgcttgactatagatactttaagaata 18807119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 17285478 - 17285759
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||  |||||| |||||| ||| | | |||||||||||| || |||    
T  17285478 atggagcacccatcaaccgattttatagtcatcctattacggacaaagtttgtacggaaacaaagtactcgaatcctaaacctagggtacatattgattt 17285577  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatcca 199  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||  ||||||| | | | |||||||||  ||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  17285578 caggtcgaagagtggaatataccacttatcactatgataataa-cttatgata-tatacataacttt--ctatgtagtattctcattgtgggtcaatcca 17285673  T
Q  200 atataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtcta 285  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17285674 atataaatattactcttaatatttatatctatgtaaagacttgataactctttatccatgacctgtgatatgtgatcatcagtcta 17285759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 22546902 - 22547094
Alignment:
Q  158 cataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatcca 257  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22546902 cataactttt--tatgtagtattctcatggctggtcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatatgaaaacttgataactctttatcca 22546999  T
Q  258 tgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatacttt 352  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||| ||| |||| |||||| || |||||||    
T  22547000 tgatttgtgagatgtgatcatcggtctatccacataatagtctctatattttaatgttatctcacttcacaataaagtttgactgcgaatacttt 22547094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 168
Target Start/End: Original strand, 27347265 - 27347428
Alignment:
Q  2 tggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27347265 tggagtacccatcaaccaactttat-gtcatcttgttaaagataacatttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttc 27347363  T
Q  102 aggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataactttta 168  Q
      ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27347364 gtgtcaaagggtggaatacacaactatcactatgagaata-tcttatgacac-tttcataactttta 27347428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 24701958 - 24702057
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24701958 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 24702057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20941317 - 20941018
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  20941317 agtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 20941219  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  20941218 tctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatata 20941123  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |     
T  20941122 aatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgac 20941024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Original strand, 25805397 - 25805696
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  25805397 agtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 25805495  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    |  ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  25805496 tgtaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatata 25805591  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |     
T  25805592 aatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgac 25805690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 32185 - 31890
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  32185 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 32087  T
Q  109 agggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 208  Q
    || | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  32086 agagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaata 31991  T
Q  209 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  31990 ttactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctt 31892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Original strand, 12789675 - 12789974
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||||||||||||    
T  12789675 agtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcagg 12789773  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| |  | |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||    
T  12789774 tctaagagcagtatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatata 12789869  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |     
T  12789870 aatattacttctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgac 12789968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22941540 - 22941241
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  22941540 agtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 22941442  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  22941441 tctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatata 22941346  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||  |||| |||| |  ||||||  | |||||||||||| |||||||||||||| |     
T  22941345 aatattactcctaatatttatatctatgtataaacttgatatctc-atatctatgacccatgagatacggtcatcagtctacatacataatagtctcgac 22941247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23546208 - 23545913
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  23546208 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 23546110  T
Q  109 agggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 208  Q
    || | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  23546109 agagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaata 23546014  T
Q  209 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  23546013 ttactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctt 23545915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Original strand, 24933318 - 24933617
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||||||||||||    
T  24933318 agtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcagg 24933416  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| |    |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||    
T  24933417 tctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatata 24933512  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |     
T  24933513 aatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgac 24933611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Original strand, 20100255 - 20100543
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||  | |||||||| || ||| |||||| |||  ||||||||||||| |    
T  20100255 agtacccatcaaccaacattatggttatccttttacagacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtcc-acatcttgggatcatagtggtttcatg 20100353  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| |||| |||||||| ||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||| |  || |||| ||| ||||    
T  20100354 tctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaata-tcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagttttctcacgttgggtcaagccagtata 20100449  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtc 299  Q
    | |||||||||||||||| ||| |||| |  |||||| ||| |||  ||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20100450 agtattactcctaatattgatacctatctatagacttaatatctc-atattcatgacccatgagatgtgatcatcagtctacatacataatagtc 20100543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31097106 - 31096807
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||| ||||||||||    
T  31097106 agtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgattcca-catctagggatcataatggtttcagg 31097008  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  31097007 tctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatata 31096912  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |     
T  31096911 aatattactcctataatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgac 31096813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 221 - 359
Target Start/End: Original strand, 27347425 - 27347563
Alignment:
Q  221 tttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatccc 320  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27347425 tttatacctatgtgaagacatgataactctttatctatgatctgtgagatgtgatcatcggcctatccacaaaatagtctctatgctttaatgttatccc 27347524  T
Q  321 acttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 359  Q
      ||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  27347525 ttttcacaataaagcttgactacatatactttaagaata 27347563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5097940 - 5097642
Alignment:
Q  6 gtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggt 105  Q
    |||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||| |||  ||||||||||||||||    
T  5097940 gtacccatcaacaaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctcgggatcatagtggtttcaggt 5097842  T
Q  106 cgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataa 205  Q
    | ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||  ||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||    
T  5097841 ctaagagcgatatacactattatcattgtgagaataa-cttatgacaattt-cataacat--actatgtagtattctcacggtgggttaatccaatataa 5097746  T
Q  206 atattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatg 305  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| | |    
T  5097745 atattactcataatatttatacttatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgtagtcatcagtctacatacataatagtctcgacg 5097647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Original strand, 12765002 - 12765305
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| |||| || |  |||||||||||||||    
T  12765002 agtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catcaagagatcatagtggtttcagg 12765100  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttt---tcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaat 201  Q
    || ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||| | ||||||||| ||    |||||||||  ||||||||||||||||| || || || |||||||    
T  12765101 tctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatgt-cttatgacaattaatctcataactt--actatgtagtattctcacggtgggtctatccaat 12765197  T
Q  202 ataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  12765198 ataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtctc 12765296  T
Q  302 tatgcttta 310  Q
     | ||||||    
T  12765297 gacgcttta 12765305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Original strand, 7865442 - 7865745
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||| ||  |||||  ||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  7865442 agtacccatcaaccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaagggaaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 7865540  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttt---tcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaat 201  Q
    || ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||    ||||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| |    
T  7865541 tctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatat-cttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacggtgggtctatccagt 7865637  T
Q  202 ataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  7865638 ataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 7865736  T
Q  302 tatgcttta 310  Q
     | ||||||    
T  7865737 gacgcttta 7865745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Original strand, 9811745 - 9812048
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| |||| || |  |||||||||||||||    
T  9811745 agtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catcaagagatcatagtggtttcagg 9811843  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttt---tcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaat 201  Q
    || ||| | |  |||||| | ||||| | |||||| || ||||||||| ||    ||||||| |  ||||||||||||||||| || || || |||||||    
T  9811844 tctaagagcgatatacactattatcattgtgagaaaat-cttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacggtgggtctatccaat 9811940  T
Q  202 ataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  9811941 ataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgtggtcatcagtctacatacatagtagtctc 9812039  T
Q  302 tatgcttta 310  Q
     | ||||||    
T  9812040 gacgcttta 9812048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Original strand, 12703886 - 12704189
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| |||| || |  |||||||||||||||    
T  12703886 agtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catcaagagatcatagtggtttcagg 12703984  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttt---tcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaat 201  Q
    || ||| | |  |||||| | ||||| | |||||| || ||||||||| ||    ||||||| |  ||||||||||||||||| || || || |||||||    
T  12703985 tctaagagcgatatacactattatcattgtgagaaaat-cttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacggtgggtctatccaat 12704081  T
Q  202 ataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  12704082 ataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgtggtcatcagtctacatacatagtagtctc 12704180  T
Q  302 tatgcttta 310  Q
     | ||||||    
T  12704181 gacgcttta 12704189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 219
Target Start/End: Original strand, 18806483 - 18806619
Alignment:
Q  80 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagta 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||  || || ||||||  |||||||  |    
T  18806483 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaata-acttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatca 18806578  T
Q  179 ttctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaat 219  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18806579 ttctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaat 18806619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 219
Target Start/End: Original strand, 18806663 - 18806799
Alignment:
Q  80 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagta 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||  || || ||||||  |||||||  |    
T  18806663 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaata-acttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatca 18806758  T
Q  179 ttctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaat 219  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18806759 ttctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaat 18806799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 243
Target Start/End: Original strand, 18829377 - 18829530
Alignment:
Q  87 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcat 185  Q
    |||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||  ||||  |||||||||  |||||||  ||||||||    
T  18829377 gtacatagtggttttaggtcaaatgatggaatacaccacttatcattatgagaataa-cttatggaactta-cataacttt--ctatgtatcattctcat 18829472  T
Q  186 ggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttga 243  Q
    || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  18829473 ggtgggtcaatccaatataaatattggtcctaatatttatatatatgagaacacttga 18829530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26245392 - 26245093
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    |||||||||||||||||  ||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   ||||||||||  | ||||  |||||| |  |||| ||||||||||    
T  26245392 agtacccatcaaccaacgctatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttaagtccat-atctagagatcataatggtttcagg 26245294  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||| | || || | ||||||||| ||||||||| ||| |||||| |  |||||| |||||||| |  | ||||||||| | ||||    
T  26245293 tctaagagcgatatacactattaacattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataacat--actatgcagtattctgacagtggatcaatcaagtata 26245198  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||| |||  |||| |||| |  |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |     
T  26245197 aatattactcctaatatttatacctatgtataaacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcaatcatcagtctacatacataatagtctcgac 26245099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 78
Target Start/End: Original strand, 28719484 - 28719558
Alignment:
Q  2 tggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaa 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  28719484 tggagtacccatcaaccaactttat-gtcatcttgttacagacaacgtttg-acggtgataaagcactcgactccaa 28719558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Original strand, 26129705 - 26129928
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||| | ||||| |||| || ||| | |||  ||||| ||| ||||||  | |||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||| |    
T  26129705 agtacccattagccaacgttatggttatctttttatagacaatgttagaatggcaataaagcacttgagtcca-catctagtgatcatagtggtttcatg 26129803  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| |||  |||||||| ||||| | ||||||||| ||||| ||| |||||||||| |  ||||||| ||||| ||| || || |||||||| ||||    
T  26129804 tctaagagtgatatacaccattatcaatgtgagaatat-cttattaca-ttttcataacat--actatgtggtattttcacggtgggtcaatccagtata 26129899  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgt 233  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  26129900 aatattactcataatatttgtatatatgt 26129928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 39539026 - 39538954
Alignment:
Q  2 tggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgact 74  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| || |  ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  39539026 tggagtacctaccaaccaactttataatcatcctattccaaacaacatttgaatggtgataaagcactcgact 39538954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 298
Target Start/End: Original strand, 33477193 - 33477321
Alignment:
Q  169 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 268  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| || ||| ||||||  ||  ||||||||| || |||     
T  33477193 ctatgtagtattcttatggcagatcaattatgtataaatattactcttaatattaatatttatttgtagatttgatatttc-atatccatgacctttgat 33477291  T
Q  269 atgtgatcatcagtctacctacataatagt 298  Q
    ||||||| |||||| |||  ||||||||||    
T  33477292 atgtgattatcagtttactcacataatagt 33477321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 321
Target Start/End: Original strand, 31267928 - 31267984
Alignment:
Q  265 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatccca 321  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| | |||||| || |||||||    
T  31267928 tgagatgtggtcatccgtctacatacataatagtctccacgctttattgttatccca 31267984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 39535509 - 39535465
Alignment:
Q  256 catgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  39535509 catgacctatgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtct 39535465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 335; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 21329976 - 21330337
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329976 atggagtccccatcaacctactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 21330075  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330076 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 21330174  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21330175 tataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtccacctacataatagtct 21330274  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330275 ctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagttt 21330337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18796985 - 18796628
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18796985 atggtgtacccatcaacaaactttatagtcatcctgttacgtacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggttt 18796886  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18796885 caggtcgaagggtggaatacaccaccatcactatgagaatat-cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagaggatcaatccaa 18796787  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18796786 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtct 18796687  T
Q  301 ctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 359  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  18796686 caatgctttaatgatataccacttcacaataaagcttgactacagataatttaagaata 18796628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18620281 - 18619926
Alignment:
Q  2 tggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||   | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18620281 tggagtacccatcaaccaactttatggtcatcttgttacatacataatgtgaatggtgataaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttc 18620182  T
Q  102 aggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaat 201  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |    
T  18620181 aggtcaaagggtgggatacaccaatatcaccatgagaatat-cttatgacacttt-cataacttttactatgtagtattctcatggtgggtcaatctagt 18620084  T
Q  202 ataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||     
T  18620083 ataaatattactcctaatatttatacctatgtgaagacatgataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatcggcctacccacataatagtcta 18619984  T
Q  302 tatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 359  Q
    |||||||||||  ||||||  ||| ||| |||| ||||| || |||||||| ||||||    
T  18619983 tatgctttaatattatcccttttcacaataaagtttgaccacagatactttaagaata 18619926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 36270639 - 36270286
Alignment:
Q  4 gagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcag 103  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||| | ||  |||||| | |||||||  ||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  36270639 gagtacccaacaaccgactttatagtcatcctgttacgaacgacttttgtacggcaacaaagtattcgactcatacatctagggtgcatggtggttttag 36270540  T
Q  104 gtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaata 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||| |||| |||| ||||| |||  |||||||  ||||||||||||  |||||||||||    
T  36270539 gtcgaagggtg-aatacaccacttatcactatgagaatga-cttgtgac-ctttacataatttt--ctatgtaacattctcatggcgagtcaatccaata 36270445  T
Q  203 taaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctct 302  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  36270444 taaatattactcctaatatttaaatcgaagtgaaaacttgataactctttctctatgactcgtgagatgtgatcatcagtctacccacacaatagtcttt 36270345  T
Q  303 atgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagt 361  Q
    || |||||||| |||||| |||| ||  ||||||||| |||||||  ||| ||||||||    
T  36270344 atactttaatgttatccctcttcacactaaagcttgattacggatgttttaagaatagt 36270286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18822556 - 18822239
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||  |||   | |||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18822556 agtacccattaaccaactttatagtcattgtgttacggatgacgtttatatgacaaaaaagtacttgactcctacatctagggtacacagtggtttcagg 18822457  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatat 203  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||   |||  ||  |||| |||||| |||  ||||||  | ||||||||| ||||||||||||||    
T  18822456 tcgaagggtggaatacaccacttatctatatgagaatga-cttgagat-ctttacataacgttt--tatgtaacaatctcatggcagatcaatccaatat 18822361  T
Q  204 aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctcta 303  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| |     
T  18822360 aaatattaccattaatatttatatctatgtgaaaagttgataactccttatcaatgatccgtgatatgtgatcatcagtctattgacataataatctatc 18822261  T
Q  304 tgctttaatgatatcccacttc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18822260 tgctttaatgatatcccacttc 18822239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 319
Target Start/End: Original strand, 22183220 - 22183528
Alignment:
Q  7 tacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtc 106  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||| |     |||||| |||||||||| ||||| || |||||   ||||||||||||    
T  22183220 tacccatcaatcgactttatagtcatcctgttacaaacaacgtttgtacaacaacaaagtactcgactcctacatcaagagtacacgttggtttcaggtc 22183319  T
Q  107 gaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataa 205  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||  ||||  ||| |||||| ||   ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22183320 aaagggtggaatacaccacttatcactatgagaatgacctg-tgact-tttacataacatta--tatgtaacattgtcatggcgggtcaatccaatataa 22183415  T
Q  206 atattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatg 305  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||     
T  22183416 -tattactcttaatatttatatctatgtgaagacttgataactccttatcaaagatctgtgagatttgatcatcaatctacccacgtaatagtctctata 22183514  T
Q  306 ctttaatgatatcc 319  Q
    |||||||| |||||    
T  22183515 ctttaatgttatcc 22183528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 306
Target Start/End: Original strand, 6991847 - 6992146
Alignment:
Q  7 tacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaa-gcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggt 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||  |  ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||     
T  6991847 tacccatcaaccgactttatagtcatcgtgtcatagacaacgtttaaacagaaacaaaagtactcgactcctacatctagggaacatagtgatttcaggc 6991946  T
Q  106 cgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||| |||  ||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||    
T  6991947 cgaagggtggaatacaccacttatcactatgagaatagt-ttatgtcactta-cataatttt--ctatgtagcgttcttatggaggatcaatccaatata 6992042  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaag--acttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctct 302  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||  || ||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||| ||| |    
T  6992043 aatattactcctgagatttatacctatgtgaagatacttgataaatctttatttataatctgtgagatatgatcattagtctacccatataataatcttt 6992142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20978351 - 20978091
Alignment:
Q  2 tggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttc 101  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||  |||    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| || ||    
T  20978351 tggagtatccatcaatcgactttatagttatcatgttacggactacgtttatatgacatcaaagtactcgaatcctacatctagggtacatagtagtgtc 20978252  T
Q  102 aggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    | ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||  | || ||  ||||||||||||| |||||||||    
T  20978251 atgtcaaagagtggaatacaccacttatcactacgagaataa-cttatgaca-ttttcataatttt--ccatataaaattctcatggcgggtcaatccaa 20978156  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 265  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20978155 tataaatattactcataataattatatctcggtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 20978091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 30174663 - 30174368
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  30174663 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 30174565  T
Q  109 agggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 208  Q
    || | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  30174564 agagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaata 30174469  T
Q  209 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  30174468 ttactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctt 30174370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Original strand, 24250048 - 24250343
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  24250048 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 24250146  T
Q  109 agggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 208  Q
    || | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  24250147 agagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaata 24250242  T
Q  209 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  24250243 ttactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctt 24250341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 171 - 361
Target Start/End: Original strand, 18851956 - 18852146
Alignment:
Q  171 atgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagat 270  Q
    ||||| |||||| || |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18851956 atgtaatattcttatagcgagtcaatccaatataaatattactcttaatatttatacatatttgaagacttgataactctttattcatgatccgtgagat 18852055  T
Q  271 gtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagt 361  Q
    | |||||| |||||||| |||||||||||| ||   ||||||| ||||| ||||| ||| |||| | ||||||  ||||||| ||||||||    
T  18852056 gggatcattagtctaccgacataatagtctatacaatttaatgttatcctacttcacaataaagttggactacatatactttaagaatagt 18852146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 169 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 19279600 - 19279445
Alignment:
Q  169 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 268  Q
    |||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  19279600 ctatgtggtattctcatgacgtgtcaatccaatataaatattactccaaatatctatatctatctgaaaacttgataactttttatccatgatacgtgag 19279501  T
Q  269 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccactt 324  Q
    |||||||||| |||| ||   ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  19279500 atgtgatcattagtcaactcgcataatagtctttatgctttaaagttatcccactt 19279445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Original strand, 24229227 - 24229526
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || || | |||||||||  ||||||||||||| |    
T  24229227 agtacccttcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcta-catctagggatcatagtggtttcaag 24229325  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
     | ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||    
T  24229326 gctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccagtata 24229421  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |     
T  24229422 aatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgaaccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgac 24229520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Original strand, 15342014 - 15342237
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||  ||||  ||||||| |  | |||||| | || | || |||||||||  |||||||||||||||    
T  15342014 agtacccattaaccaacgttatggtcatcctgttacaaacaatttttgaattgcaataaagcatttgagttca-catctagggatcatagtggtttcagg 15342112  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| |||| |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||| ||| || || | |||||| ||||    
T  15342113 tctaagagtggcatacaccactatcattgtgagactat-cttatgacacttt-cataacat--actatgtagtattttcacggtgggttaatccagtata 15342208  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgt 233  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15342209 aatattactcctaatatttatacctatgt 15342237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29800757 - 29800468
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    ||||| ||||||| ||||  | |||||||||| ||||| |||||||||   | |||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |    
T  29800757 cccattaaccaacattatgattatcctgttacagacaatgtttgaatgacaataaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaagtcta 29800659  T
Q  109 agggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 208  Q
    || |||| |||||||| ||||  | ||||||||| | | | |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  29800658 agagtggtatacaccattatccttgtgagaatat-catgttacactttt-ataacat--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccagtataaata 29800563  T
Q  209 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactcttt---atccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    |||||||||||||||||| | ||||  | |||| || | | | |   |||||||| |  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29800562 ttactcctaatatttatacccatgtatatacttaattaatatctcacatccatgacccatgggatgtgatcatcagtctacatacataatagtct 29800468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 295
Target Start/End: Original strand, 36801899 - 36802003
Alignment:
Q  192 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatct-atgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 290  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||    
T  36801899 tcaattcaatataaatattacccttaatatttatattttatgcgaagacttgataactcattatcaatgatttgtgaggtgtgatcatcagtctactcac 36801998  T
Q  291 ataat 295  Q
    |||||    
T  36801999 ataat 36802003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 17241167 - 17241034
Alignment:
Q  22 tttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaataca 121  Q
    ||||||| | || ||||||  |||||||||||  ||||| |||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  17241167 tttataggcttcatgttacacacaacgtttgagcggtgataaagtacttgactcctacatctacagtacatagtggttttaggtcgaa-ggtgaaataca 17241069  T
Q  122 ccactatcactatgagaatattcttatgacactttt 157  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  17241068 ccattatcactatgagaata-tcttattacactttt 17241034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 19616653 - 19616435
Alignment:
Q  78 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagt 177  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||  |  ||||||||||    
T  19616653 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatat-catatgaca-ttttcataaaat--actatgtagt 19616558  T
Q  178 attctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatca 277  Q
    ||||||| || || ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| ||   |||  ||||    ||||||||| |||    
T  19616557 attctcacggtgggtcaattcagaataaatgttactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatct-aatatttatgactcatgagatgtggtca 19616459  T
Q  278 tcagtctacctacataatagtctc 301  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  19616458 tcagtctacatacataatagtctc 19616435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 140
Target Start/End: Original strand, 36799745 - 36799826
Alignment:
Q  60 acaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaat 140  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  36799745 acaaagtacttgactcctacatctagggcgcatagtggtttcaggtcaaacggtagaatacaccacttatcactatgagaat 36799826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 226
Target Start/End: Original strand, 40301034 - 40301164
Alignment:
Q  91 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 190  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| | |  |||||||||||||||||| ||    
T  40301034 atagtggtttcatgtctaagagtggtatacatcattatcactatgagactat-cttatgacactt--cataacatgt--tatgtagtattctcatggtgg 40301128  T
Q  191 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 226  Q
     ||||||   ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  40301129 gtcaatctggtataaatattacttctaatatgtata 40301164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 299
Target Start/End: Original strand, 28741220 - 28741326
Alignment:
Q  192 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 291  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||| ||| | || |||||    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  28741220 tcaatccggtataaatattactcctaatatttatacctatgtacatacttaatatctcat-attcatgacgcatgagatgtgatcatcagtctacataca 28741318  T
Q  292 taatagtc 299  Q
    ||||||||    
T  28741319 taatagtc 28741326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Original strand, 41316305 - 41316506
Alignment:
Q  18 caactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||   | ||||| ||  | |||| |||||||||  |||||||| |||||||| |||  ||| |    
T  41316305 caactttatagttatcctgttacagataacgtttgaatgacaataaagcccttaagtcca-catctagggatcatagtggattcaggtctaagaatggta 41316403  T
Q  118 tacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactccta 217  Q
    | | ||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  ||||| || ||||||||||| || || ||  | |||||||||||||| ||    
T  41316404 ttctccgttatcagtatgagaatat-cttatgacacttt-cataacat--actatataatattctcatggtgggtcgattaagtataaatattactcata 41316499  T
Q  218 atattta 224  Q
    |||||||    
T  41316500 atattta 41316506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20978084 - 20978026
Alignment:
Q  289 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggat 347  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||    
T  20978084 acataatagtctctatgctttagtgatatctcacttcacattaaagcttgactacggat 20978026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21626955 - 21626824
Alignment:
Q  90 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 189  Q
    ||||||| ||||||||| ||  |||| | |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  |   |||||||||||||||| |    
T  21626955 catagtgatttcaggtctaacagtggtagacactattatcactatgagaatat-cttatgacacttt-cataacat--agcgtgtagtattctcatggtg 21626860  T
Q  190 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 226  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21626859 g-tcaattcaatataaatattactcatattatttata 21626824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 41661753 - 41661694
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtga 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||  |||||||||||||||||||    
T  41661753 atggagtacccatcaaccaactttatgatcatcttattatagacaacgtttgaatggtga 41661694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 310
Target Start/End: Original strand, 24763751 - 24763868
Alignment:
Q  192 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 291  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| | ||| |||  | || |||| |  ||||| ||| |||||||||||| || |    
T  24763751 tcaatccagtataaatattactcataatatttatacctatgtatagacgtaatatctc-atgtctatgacccatgagacgtggtcatcagtctacataaa 24763849  T
Q  292 taatagtctctatgcttta 310  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  24763850 taatagtctcgatgcttta 24763868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 310
Target Start/End: Original strand, 12098609 - 12098654
Alignment:
Q  265 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 310  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12098609 tgagatctgatcatcagtctacatacataatagtctctatgtttta 12098654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 230
Target Start/End: Original strand, 28718943 - 28719006
Alignment:
Q  167 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatcta 230  Q
    |||| ||||||||||||| |  |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28718943 tactgtgtagtattctcacgatgagtcaatcaagtataaatattactcctaatatttatatcta 28719006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 155
Target Start/End: Original strand, 28740910 - 28740986
Alignment:
Q  78 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacactt 155  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| || |||  ||| |||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  28740910 acatctagggatcatagtggtttcagatctaagaatggtatacaccattatcattatgagaat-gtcttatgacactt 28740986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 12 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 1461 - 1111
Alignment:
Q  12 atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagg 111  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1461 atcaaccaactttatatttatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagg 1362  T
Q  112 gtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatatta 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1361 gtggaatacaccactatcactatgagaatat-cttatgatacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcagatcaatccaatataaatatta 1263  T
Q  212 ctcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaa 311  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1262 ctcttaatatttatatctatggcaagacttgataactttttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaa 1163  T
Q  312 tgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1162 tgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagttt 1111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 6001 - 5651
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6001 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcacttgactccaacatctagggtacatagtggttt 5902  T
Q  101 caggtcgaaggg-tggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacactttt-cataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatcc 198  Q
    || |||||| || |||||| |||         ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5901 catgtcgaaaggatggaatgcac---------tatgagaatat-cttatgacactttttcataacttttactatgtagtattcacatggcggatcaatcc 5812  T
Q  199 aatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5811 aatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgacctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagt 5712  T
Q  299 ctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 359  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  5711 ctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacatatactttaagaata 5651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 230119 - 230367
Alignment:
Q  1 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 100  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  230119 atggtgtatccaccaaccaactttattgtcatcttgttacagacaacgtttgaatagtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacataatggttt 230218  T
Q  101 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaa 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  230219 caggtcgaagggtagaatacaccactatcactatgagaata-tcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcagatcaatccaa 230317  T
Q  201 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactct 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230318 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactct 230367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 363
Target Start/End: Original strand, 230365 - 230430
Alignment:
Q  298 tctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagttt 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||||| ||||    
T  230365 tctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacaaatactttaagaatggttt 230430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 473 - 174
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||||||||||||    
T  473 agtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcagg 375  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  374 tctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatata 279  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |     
T  278 aatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgtggtcatcagtcgacatacataatagtctcgac 180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Original strand, 3691 - 3986
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  3691 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 3789  T
Q  109 agggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 208  Q
    || | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  3790 agagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaata 3885  T
Q  209 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  3886 ttactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctt 3984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 120016 - 119721
Alignment:
Q  9 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 108  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  120016 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 119918  T
Q  109 agggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 208  Q
    || | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  119917 agagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaata 119822  T
Q  209 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  119821 ttactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacgtacataatagtctcgacgctt 119723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Original strand, 12961 - 13260
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||||| | || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  12961 agtacccatcaaccaactttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggcaacaaagcaattgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 13059  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| |||  |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||||  ||||    
T  13060 tctaagagtgatatacactattatcattatgagaatat-cttatgacaattt-cataacat--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccggtata 13155  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||  |||| |  ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |     
T  13156 aatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatatatgacccatgagatgtggtcatcggtctacatacataatagtctcgac 13254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 310
Target Start/End: Original strand, 130262 - 130535
Alignment:
Q  31 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatca 130  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | |||||    
T  130262 atccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatca 130360  T
Q  131 ctatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatcta 230  Q
     | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130361 ttgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatcta 130456  T
Q  231 tgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 310  Q
    |||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  130457 tgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 130535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Original strand, 67386 - 67685
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  67386 agtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcatagtggtttcagg 67484  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||| ||| ||||||  | |||||||  ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  67485 tctaagagcgatatacactattatcattgtgagaata-tctcatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatata 67580  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 304  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||  |||||||||||||| |     
T  67581 aatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctatatacataatagtctcgac 67679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8511 - 8296
Alignment:
Q  90 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 189  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |    
T  8511 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatat-cttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtg 8416  T
Q  190 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccta 289  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||    
T  8415 ggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacata 8317  T
Q  290 cataatagtctctatgcttta 310  Q
    |||||||||||| | ||||||    
T  8316 cataatagtctcgacgcttta 8296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 301
Target Start/End: Original strand, 40012 - 40290
Alignment:
Q  17 ccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtgga 116  Q
    |||||||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  | |||||||| || ||||  || |||||  ||||||||||||| ||| ||| ||       
T  40012 ccaactttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggaaataaagcacttgagtccat-atttagggatcatagtggtttcaagtctaagagttat 40110  T
Q  117 atacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcct 216  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||  | || |||||||  ||||||||||||||||    
T  40111 atacaccattatcactgtgagaatat-cttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccggtataaatattactcct 40206  T
Q  217 aatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 301  Q
    |||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  ||||||||| |  |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  40207 aatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatccatgacccatgagatgtggccatcagtctacatacataatagtctc 40290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 178 - 324
Target Start/End: Original strand, 90019 - 90166
Alignment:
Q  178 attctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactcttt-atccatgatctgtgagatgtgatc 276  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||     
T  90019 attctcatcgcgtgtcaatccaatataaatgttatacgtaatatttatatctatgtgaagtgttgataactcttttacccatgatccgtgagatgtgatt 90118  T
Q  277 atcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccactt 324  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  90119 atcagtctatctacatagtagtctttatgctttaatattatcccactt 90166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26833 - 26609
Alignment:
Q  4 gagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcag 103  Q
    |||||||||| | ||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||  ||||   | ||||||||||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||    
T  26833 gagtacccattatccaacgttatggttatccttttacagacaacattaaaatgacaataaagcactcgagtcca-catatagggatcatagtggtttcag 26735  T
Q  104 gtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatat 203  Q
    ||| ||| |||  |||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  26734 gtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatat-cttatgaca-ttttcataacat--actatatagtattctcaaggtgggtcaatccagtat 26639  T
Q  204 aaatattactcctaatatttatatctatgt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26638 aaatattactcctaatatttatacctatgt 26609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9005 - 8722
Alignment:
Q  21 ctttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatac 120  Q
    ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||   | ||| |||| ||||||| ||| || ||  ||| ||||||||||||| | | |||| ||||    
T  9005 ctttatagttatcatgttacagagaacgtttgaatgacaataaaacacttgactcca-catttaaggatcattgtggtttcaggtctaggagtggtatac 8907  T
Q  121 accactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaata 220  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |  |||| ||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  8906 accattatcactatgagaatat-cttatgaca-tcttcataacat--actaagtagtattctcattgggggtcaatctagtataaatattactcctaata 8811  T
Q  221 tttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 310  Q
    |||| |  ||||   |  ||| ||| |||  |||| ||||  ||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  8810 tttacacatatgcatatccttaatatctc-atatctatgacatgtgagacgtgatcatcaatctacatacatattagtctctacgcttta 8722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 276 - 102
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  || ||||||||||||    
T  276 agtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcagagtggtttcagg 178  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctca 184  Q
    || ||| |||  |||||| | ||||| | |||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  177 tctaagagtgatatacactattatcattgtgagaata-tcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctca 102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 90 - 226
Target Start/End: Original strand, 83111 - 83243
Alignment:
Q  90 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 189  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| || | |||| |  |||||||||||||||||| | |    
T  83111 catactggtttcaggtctaagagtggagtacaccaatatgactatgataatat-cttatgacacctt-cgtaacat--actatgtagtattctcattgtg 83206  T
Q  190 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 226  Q
    | |||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  83207 ggtcaatccagtataaatattacttctgatatttata 83243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 226
Target Start/End: Original strand, 11538 - 11758
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  || ||||||||||||    
T  11538 agtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcaaagtggtttcagg 11636  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacact---tttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaat 201  Q
    || ||| | |   |||||   ||||| | |||||||| |||||||||| |   |  ||||||   ||||||||||||||||||  | || || ||||| |    
T  11637 tctaagagcgatgtacactgttatcattgtgagaata-tcttatgacaattaatcacataac--gtactatgtagtattctcacagtgggtctatccagt 11733  T
Q  202 ataaatattactcctaatatttata 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11734 ataaatattactcctaatatttata 11758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 54054 - 53766
Alignment:
Q  5 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  | |||||||| || |||| || ||||||  |||||||||||||||    
T  54054 agtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatggc-ataaagcacttgagtcca-cacctagggatcatagtggtttcagg 53957  T
Q  105 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatattcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 204  Q
    || ||| |    ||| || | || ||   ||||||||| ||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||| || || |||| ||| | |     
T  53956 tctaagagcaatataaactattaacatgttgagaatat-cttatgacaattt-cataacat--actatgtagtattctcacggtgggtcaacccagtgtg 53861  T
Q  205 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 300  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||  ||| || ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||    
T  53860 aatattactcttaatatttatacctatgtatagaattaatacctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcaatctacatacataatagtct 53766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 46051 - 45956
Alignment:
Q  171 atgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactccta----atatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 262  Q
    |||||| ||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| |||| | |||| |||| |||||||||||||    
T  46051 atgtagcattctaatggtgggtcaattcaatataaatattactcataatatatatttatatctatatgaatatttgacaactttttatccatgatc 45956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 310
Target Start/End: Original strand, 15089 - 15134
Alignment:
Q  265 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 310  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15089 tgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgatgcttta 15134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University