View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21328_high_16 (Length: 312)

Name: NF21328_high_16
Description: NF21328
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21328_high_16
NF21328_high_16
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (28-302)||(2041-2313)
scaffold0234 (28-302)||(10932-11204)
[»] chr6 (33 HSPs)
chr6 (28-302)||(17684189-17684461)
chr6 (28-302)||(27380972-27381244)
chr6 (28-302)||(27471355-27471627)
chr6 (28-302)||(11651938-11652210)
chr6 (28-302)||(17691160-17691432)
chr6 (28-302)||(29309105-29309377)
chr6 (28-302)||(29316065-29316336)
chr6 (28-261)||(27296883-27297116)
chr6 (28-302)||(188697-188969)
chr6 (28-302)||(16394165-16394437)
chr6 (32-261)||(25536915-25537144)
chr6 (29-250)||(16559193-16559414)
chr6 (45-176)||(13359010-13359142)
chr6 (28-261)||(27508347-27508576)
chr6 (43-261)||(27527948-27528162)
chr6 (28-261)||(1586108-1586337)
chr6 (44-261)||(16789144-16789357)
chr6 (44-261)||(22859904-22860117)
chr6 (50-261)||(10359073-10359279)
chr6 (28-260)||(8612989-8613221)
chr6 (28-260)||(14074554-14074782)
chr6 (169-261)||(18019981-18020070)
chr6 (38-297)||(2669513-2669768)
chr6 (245-302)||(16566257-16566312)
chr6 (28-141)||(33317055-33317167)
chr6 (113-260)||(20736413-20736557)
chr6 (201-260)||(5758650-5758709)
chr6 (106-161)||(28172908-28172963)
chr6 (97-257)||(8510181-8510338)
chr6 (28-141)||(17120505-17120617)
chr6 (32-182)||(28756132-28756281)
chr6 (125-260)||(21994662-21994794)
chr6 (206-298)||(27925973-27926062)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (28-302)||(24695186-24695458)
chr5 (28-302)||(19714218-19714490)
chr5 (28-290)||(18569581-18569841)
chr5 (28-302)||(19706939-19707210)
chr5 (28-296)||(17298621-17298885)
chr5 (24-202)||(27347252-27347428)
chr5 (28-135)||(24701950-24702057)
chr5 (28-302)||(17285470-17285740)
chr5 (150-302)||(39538803-39538953)
chr5 (115-297)||(18806843-18807021)
chr5 (28-261)||(22941323-22941552)
chr5 (28-261)||(20941100-20941329)
chr5 (28-261)||(25805385-25805614)
chr5 (44-261)||(31972-32185)
chr5 (28-261)||(12789663-12789892)
chr5 (44-261)||(23545995-23546208)
chr5 (28-261)||(24933306-24933535)
chr5 (28-260)||(31096890-31097118)
chr5 (192-302)||(22546902-22547008)
chr5 (28-265)||(12764990-12765227)
chr5 (43-256)||(20100258-20100467)
chr5 (28-265)||(9811733-9811970)
chr5 (28-265)||(12703874-12704111)
chr5 (28-260)||(7865430-7865662)
chr5 (24-113)||(28719471-28719558)
chr5 (115-253)||(18806483-18806619)
chr5 (115-253)||(18806663-18806799)
chr5 (43-260)||(5097725-5097938)
chr5 (24-265)||(26129689-26129926)
chr5 (122-265)||(18829377-18829518)
chr5 (28-109)||(39538954-39539035)
chr5 (265-302)||(27347433-27347470)
chr5 (28-68)||(17283176-17283216)
[»] chr4 (49 HSPs)
chr4 (28-302)||(8858382-8858654)
chr4 (28-302)||(18262427-18262699)
chr4 (28-302)||(18269288-18269560)
chr4 (28-302)||(55612898-55613170)
chr4 (28-302)||(26963855-26964127)
chr4 (28-302)||(26970678-26970950)
chr4 (28-302)||(868812-869084)
chr4 (28-302)||(19926480-19926752)
chr4 (28-302)||(5707535-5707807)
chr4 (28-302)||(5714163-5714435)
chr4 (28-302)||(10621053-10621325)
chr4 (28-302)||(10628132-10628404)
chr4 (28-302)||(28392854-28393126)
chr4 (28-302)||(8845418-8845690)
chr4 (28-302)||(4426336-4426596)
chr4 (28-298)||(5667849-5668115)
chr4 (28-298)||(35223779-35224047)
chr4 (28-265)||(10677303-10677539)
chr4 (28-265)||(10890943-10891179)
chr4 (24-298)||(20311511-20311781)
chr4 (28-261)||(15461570-15461799)
chr4 (28-261)||(34975624-34975853)
chr4 (28-261)||(3369023-3369252)
chr4 (44-261)||(2677086-2677299)
chr4 (44-261)||(15815094-15815307)
chr4 (44-261)||(18111059-18111272)
chr4 (44-260)||(19365593-19365806)
chr4 (44-261)||(26531686-26531899)
chr4 (129-281)||(21453961-21454110)
chr4 (46-261)||(17299977-17300188)
chr4 (28-261)||(20244010-20244239)
chr4 (28-260)||(1941798-1942026)
chr4 (28-261)||(4675983-4676212)
chr4 (28-261)||(18163235-18163464)
chr4 (28-260)||(9487625-9487853)
chr4 (28-261)||(5870491-5870720)
chr4 (44-260)||(5616469-5616681)
chr4 (45-256)||(19362488-19362695)
chr4 (203-302)||(56516271-56516368)
chr4 (44-260)||(5528495-5528707)
chr4 (28-248)||(30040489-30040705)
chr4 (113-260)||(4546154-4546298)
chr4 (130-260)||(32636558-32636685)
chr4 (28-245)||(11421096-11421309)
chr4 (106-156)||(24701361-24701411)
chr4 (44-260)||(9538033-9538244)
chr4 (43-161)||(32646538-32646656)
chr4 (56-137)||(9937745-9937826)
chr4 (206-290)||(34777893-34777975)
[»] chr3 (39 HSPs)
chr3 (28-302)||(6110279-6110551)
chr3 (28-302)||(8490710-8490982)
chr3 (28-302)||(16482203-16482475)
chr3 (28-302)||(10579075-10579347)
chr3 (28-302)||(15600604-15600876)
chr3 (28-302)||(15607149-15607421)
chr3 (28-302)||(10572312-10572584)
chr3 (28-302)||(32056619-32056892)
chr3 (28-302)||(15357306-15357578)
chr3 (28-302)||(18520190-18520462)
chr3 (32-302)||(18522878-18523146)
chr3 (28-302)||(13211517-13211789)
chr3 (28-302)||(13248822-13249094)
chr3 (28-302)||(15341939-15342211)
chr3 (28-302)||(17780838-17781110)
chr3 (24-302)||(17199900-17200176)
chr3 (28-302)||(13517026-13517294)
chr3 (28-302)||(1647241-1647513)
chr3 (28-302)||(17136574-17136840)
chr3 (28-299)||(29925189-29925458)
chr3 (28-299)||(29974342-29974611)
chr3 (28-301)||(16200646-16200917)
chr3 (28-261)||(21034311-21034540)
chr3 (28-261)||(15846536-15846765)
chr3 (28-260)||(21398866-21399094)
chr3 (28-260)||(25978728-25978956)
chr3 (44-261)||(20147570-20147783)
chr3 (28-261)||(12299983-12300212)
chr3 (28-261)||(55427094-55427323)
chr3 (28-261)||(14890464-14890693)
chr3 (62-260)||(15526827-15527021)
chr3 (46-294)||(24253130-24253372)
chr3 (28-213)||(28088227-28088408)
chr3 (28-260)||(11787661-11787889)
chr3 (28-260)||(15317176-15317401)
chr3 (126-265)||(14147090-14147226)
chr3 (66-181)||(30464147-30464261)
chr3 (167-298)||(28953965-28954093)
chr3 (102-219)||(32280388-32280507)
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (28-302)||(18252245-18252517)
chr1 (28-302)||(18532234-18532506)
chr1 (28-302)||(27131130-27131401)
chr1 (28-302)||(27310297-27310569)
chr1 (28-302)||(16358755-16359027)
chr1 (28-302)||(3855639-3855911)
chr1 (28-302)||(36816354-36816625)
chr1 (28-299)||(22641594-22641859)
chr1 (28-298)||(27277278-27277545)
chr1 (156-302)||(21171081-21171225)
chr1 (28-220)||(9916497-9916688)
chr1 (28-261)||(19706439-19706668)
chr1 (28-261)||(28134723-28134952)
chr1 (28-261)||(43802365-43802594)
chr1 (44-261)||(9456189-9456402)
chr1 (28-261)||(20391239-20391468)
chr1 (44-261)||(20779661-20779874)
chr1 (44-261)||(22670273-22670486)
chr1 (44-261)||(42817005-42817218)
chr1 (48-260)||(634008-634216)
chr1 (28-261)||(22612565-22612794)
chr1 (28-298)||(23507119-23507385)
chr1 (195-296)||(22657108-22657207)
chr1 (28-260)||(8727741-8727969)
chr1 (106-298)||(12014084-12014272)
chr1 (28-141)||(28145723-28145835)
chr1 (229-298)||(9917840-9917906)
chr1 (44-260)||(29096796-29097008)
chr1 (28-141)||(47667485-47667597)
chr1 (207-265)||(51997348-51997406)
chr1 (128-260)||(21881475-21881604)
chr1 (203-260)||(35930656-35930713)
chr1 (95-161)||(12006332-12006398)
[»] chr8 (35 HSPs)
chr8 (29-302)||(21940880-21941151)
chr8 (28-299)||(22171705-22171974)
chr8 (28-302)||(6094338-6094610)
chr8 (28-293)||(15326422-15326685)
chr8 (28-293)||(15506791-15507054)
chr8 (28-302)||(24642864-24643135)
chr8 (28-169)||(28548393-28548534)
chr8 (95-298)||(14983710-14983908)
chr8 (143-260)||(24797224-24797340)
chr8 (28-260)||(8371253-8371481)
chr8 (28-261)||(12562196-12562425)
chr8 (28-261)||(21969406-21969635)
chr8 (28-260)||(22659494-22659722)
chr8 (44-261)||(25611268-25611481)
chr8 (44-261)||(27007533-27007746)
chr8 (44-261)||(27014676-27014889)
chr8 (44-261)||(27880503-27880716)
chr8 (44-261)||(28020684-28020897)
chr8 (44-261)||(22130625-22130838)
chr8 (44-261)||(21916749-21916962)
chr8 (28-261)||(45534273-45534502)
chr8 (28-260)||(6430960-6431188)
chr8 (28-260)||(26240558-26240786)
chr8 (24-298)||(38232095-38232365)
chr8 (113-259)||(8781959-8782102)
chr8 (38-135)||(24796731-24796826)
chr8 (24-141)||(2375411-2375528)
chr8 (125-260)||(18835424-18835556)
chr8 (28-260)||(2962932-2963164)
chr8 (44-190)||(20535226-20535371)
chr8 (23-141)||(36970439-36970556)
chr8 (192-297)||(2375231-2375332)
chr8 (55-177)||(29645675-29645797)
chr8 (236-296)||(29645575-29645633)
chr8 (202-267)||(34659053-34659118)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (28-302)||(7322-7594)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (28-302)||(6654-6926)
scaffold0390 (28-302)||(13670-13942)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (24-302)||(25706-25982)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (32-302)||(15152658-15152926)
chr7 (28-302)||(29327999-29328271)
chr7 (28-302)||(11535782-11536054)
chr7 (28-302)||(12751041-12751313)
chr7 (28-302)||(11542700-11542972)
chr7 (28-302)||(12738751-12739023)
chr7 (28-302)||(18561222-18561485)
chr7 (28-298)||(13392369-13392637)
chr7 (22-302)||(18257559-18257834)
chr7 (28-261)||(2365176-2365407)
chr7 (28-261)||(18139338-18139567)
chr7 (43-261)||(30254211-30254425)
chr7 (44-261)||(2204625-2204838)
chr7 (28-261)||(8465072-8465301)
chr7 (44-261)||(18400177-18400390)
chr7 (44-261)||(18407161-18407374)
chr7 (44-261)||(48808512-48808725)
chr7 (28-260)||(41680968-41681196)
chr7 (28-261)||(15729824-15730053)
chr7 (28-261)||(19230961-19231190)
chr7 (43-260)||(47166874-47167087)
chr7 (28-260)||(34128647-34128875)
chr7 (28-260)||(18259124-18259352)
chr7 (50-256)||(24443349-24443551)
chr7 (50-256)||(25845498-25845700)
chr7 (50-256)||(25845917-25846119)
chr7 (28-260)||(10668901-10669130)
chr7 (28-260)||(28130635-28130863)
chr7 (47-176)||(39112138-39112267)
chr7 (66-260)||(19393462-19393652)
chr7 (113-260)||(19388626-19388774)
chr7 (125-260)||(14591924-14592056)
chr7 (125-260)||(16011515-16011647)
chr7 (102-177)||(22948499-22948574)
chr7 (128-260)||(22969024-22969153)
chr7 (203-302)||(10235377-10235474)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (28-302)||(18503-18774)
[»] chr2 (22 HSPs)
chr2 (28-302)||(21329968-21330240)
chr2 (28-302)||(18796721-18796993)
chr2 (22-298)||(18620023-18620296)
chr2 (28-301)||(20978091-20978360)
chr2 (28-258)||(36270423-36270650)
chr2 (44-260)||(29800545-29800757)
chr2 (43-260)||(6991848-6992064)
chr2 (43-298)||(18822302-18822553)
chr2 (44-261)||(30174450-30174663)
chr2 (57-191)||(17241034-17241167)
chr2 (43-302)||(22183221-22183475)
chr2 (44-261)||(24250048-24250261)
chr2 (43-260)||(15342017-15342230)
chr2 (28-260)||(24229215-24229443)
chr2 (229-298)||(18851980-18852047)
chr2 (113-265)||(19616504-19616653)
chr2 (95-175)||(36799745-36799826)
chr2 (203-297)||(19279508-19279600)
chr2 (28-95)||(41661694-41661761)
chr2 (126-260)||(40301034-40301164)
chr2 (232-302)||(36801905-36801974)
chr2 (113-189)||(28740910-28740986)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (47-302)||(1208-1461)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (28-286)||(230111-230367)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (24-302)||(5744-6013)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (43-260)||(12964-13177)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (28-261)||(256-485)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (28-260)||(67374-67602)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (44-261)||(3691-3904)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (44-261)||(119803-120016)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (28-260)||(26616-26844)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (66-261)||(130262-130453)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (28-218)||(102-288)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (56-258)||(8807-9005)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (169-261)||(8378-8467)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (52-260)||(40012-40216)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (28-265)||(11526-11763)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (28-141)||(53955-54066)


Alignment Details
Target: scaffold0234 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 2041 - 2313
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2041 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 2140  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2141 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 2240  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2241 aatccaatataaatattactcctaatatt--tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 2313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 10932 - 11204
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10932 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 11031  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11032 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 11131  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11132 aatccaatataaatattactcctaatatt--tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 11204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 33)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 17684189 - 17684461
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684189 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 17684288  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684289 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 17684388  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684389 aatccaatataaatattactcctaatatt--tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 17684461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 27380972 - 27381244
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27380972 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27381071  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381072 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27381171  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381172 aatccaatataaatattactcctaatatt--tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 27381244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 27471355 - 27471627
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471355 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27471454  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471455 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27471554  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471555 aatccaatataaatattactcctaatatt--tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 27471627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 11652210 - 11651938
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652210 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 11652111  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652110 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 11652011  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652010 aatccaatataaatattactcctaatattt--atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 11651938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 17691160 - 17691432
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691160 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 17691259  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691260 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 17691359  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17691360 aatccaatataaatattactcctaatatt--tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtg 17691432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 29309377 - 29309105
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29309377 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcacctgactccaacatctagggtacat 29309278  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309277 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 29309178  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29309177 aatccaatataaatattactcctaatattt--atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtg 29309105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 29316336 - 29316065
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29316336 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcact-gactccaacatctagggtacat 29316238  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316237 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 29316138  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29316137 aatccaatataaatattactcctaatattt--atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtg 29316065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27297116 - 27296883
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297116 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27297017  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297016 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27296917  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27296916 aatccaatataaatattactcctaatatttatat 27296883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 188697 - 188969
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188697 catgatttatggagtatccatcaatcaactttatagtcattctgttacagacaatatttgaatgataacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 188796  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188797 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 188896  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  188897 aatccaatataaatattactcctaatatt--tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtg 188969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 16394165 - 16394437
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16394165 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgattccaacatctagggtacat 16394264  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  16394265 agtggtttcaagtcaaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatgacacttttcataacttttactacgtagtattctcatggtgggtc 16394364  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16394365 aatccaatataaatattactcctaatatt--tatatctatgtgaagacttgataactgtttatccatgatatgtg 16394437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 32 - 261
Target Start/End: Original strand, 25536915 - 25537144
Alignment:
Q  32 attcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 131  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25536915 attcatggagtacccatcaaccaactttataatcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtaaatagtg 25537014  T
Q  132 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25537015 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactgtcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 25537114  T
Q  232 caatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  25537115 caatataaatatgacacctaatatttatat 25537144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 29 - 250
Target Start/End: Original strand, 16559193 - 16559414
Alignment:
Q  29 atgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacata 128  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16559193 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctacggtacata 16559292  T
Q  129 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatct 228  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  16559293 gcggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtggatca 16559392  T
Q  229 atccaatacaaatattactcct 250  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  16559393 atccaatataaatattactcct 16559414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 176
Target Start/End: Original strand, 13359010 - 13359142
Alignment:
Q  45 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||  |||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13359010 ccatcaaccgactttatagtcatcctgttacggacgatgtttgtacggcaacaaaatactcgactcctacatctaaggtacatagtggtttcaggtcgaa 13359109  T
Q  145 gggtggaatacaccac-tatccctatgagaata 176  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  13359110 gggtggaatacaccacttatcactatgagaata 13359142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Original strand, 27508347 - 27508576
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  27508347 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcat 27508445  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  27508446 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 27508542  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27508543 aatccaatacaaatattactcctaatatttatat 27508576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 43 - 261
Target Start/End: Original strand, 27527948 - 27528162
Alignment:
Q  43 acccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcg 142  Q
    |||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||||||||||||||     
T  27527948 acccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcatagtggtttcaggtct 27528046  T
Q  143 aagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaata 242  Q
    ||| | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  | || || ||||||||||||||    
T  27528047 aagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatacaaata 27528143  T
Q  243 ttactcctaatatttatat 261  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27528144 ttactcctaatatttatat 27528162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Original strand, 1586108 - 1586337
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  1586108 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 1586206  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||  | |||||||||||||| |||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  1586207 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 1586303  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
     |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  1586304 aatccaatataaatattacttctaatatttatat 1586337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16789357 - 16789144
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  16789357 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 16789259  T
Q  144 agggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatat 243  Q
    || | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || || |||||||| ||||||    
T  16789258 agagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatat 16789162  T
Q  244 tactcctaatatttatat 261  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16789161 tactcctaatatttatat 16789144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Original strand, 22859904 - 22860117
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  22859904 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 22860002  T
Q  144 agggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatat 243  Q
    || | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || || |||||||| ||||||    
T  22860003 agagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatat 22860099  T
Q  244 tactcctaatatttatat 261  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22860100 tactcctaatatttatat 22860117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 261
Target Start/End: Original strand, 10359073 - 10359279
Alignment:
Q  50 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 149  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||   | ||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||    
T  10359073 aaccaacttaatggttatcctgttacggacaatgtttgaatgacaataaagcacacgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaagtctaagagtg 10359171  T
Q  150 gaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatattactcc 249  Q
    | |||||||| ||||  | |||||||||||||| ||||  ||||||||   |||||||||||||| ||| || || || ||||| || |||||||||       
T  10359172 gtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacac--ttcataac--atactatgtagtattttcacggtgggtcgatccagtataaatattaccta 10359267  T
Q  250 taatatttatat 261  Q
    ||||||||||||    
T  10359268 taatatttatat 10359279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 8613221 - 8612989
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||| ||  |||||  ||| || |||| |||||||||  |||    
T  8613221 catgattcatcaagtacccatcaaccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaagggaaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcat 8613123  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttt---tcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||  | |||||||||||||| ||| ||    ||||||| |  ||||||||||||||||| || ||    
T  8613122 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacggtgg 8613025  T
Q  225 atctatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
     |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  8613024 gtctatccagtataaatattactcctaatatttata 8612989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14074782 - 14074554
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||| ||  |||||||||| || | | ||||||||||  |||    
T  14074782 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaaaggcaacaaagcacttgagt-ctacatctagggatcat 14074684  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    ||||||   ||||  | ||| |||||||||| |||  |||||||||  ||||||||||||||||||| || || ||    
T  14074683 agtggtttcaggtctaagagcaatatacacttttatcattgtgaaaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 14074587  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
     ||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  14074586 aatccattataaatattactcccaatatttata 14074554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 169 - 261
Target Start/End: Original strand, 18019981 - 18020070
Alignment:
Q  169 tgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18019981 tgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatat 18020070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 2669768 - 2669513
Alignment:
Q  38 ggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttca 137  Q
    |||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||  || ||| |||||| |   |||||| ||  |||||| |||||||| ||||||| || |||||    
T  2669768 ggagtaccaatcaactgactttatagtcatcctgttatagataacatttgaacgacaacaaagtaccggactcctacatctagagtacataatgatttca 2669669  T
Q  138 ggtcgaagggtggaatacaccac-tatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaata 236  Q
    |||| ||  ||||||||||| || | || ||||||||||| ||||| | || ||  | ||| ||  |||||||||||| |||||  |  || ||| ||||    
T  2669668 ggtcaaatagtggaatacacaacttgtcactatgagaataacttatgatac-ttaaacaacatt--ctatgtagtattttcatgatgtgtcaatcaaata 2669572  T
Q  237 caaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgat 297  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||||    
T  2669571 taaatattactcctaatatt--tatatctatgtgaatacatgataactcttaatcaatgat 2669513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 302
Target Start/End: Original strand, 16566257 - 16566312
Alignment:
Q  245 actcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566257 actcctaatatttatatctat--gtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 16566312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 33317167 - 33317055
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  33317167 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 33317069  T
Q  128 agtggtttcaggtc 141  Q
    ||||||||||||||    
T  33317068 agtggtttcaggtc 33317055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 260
Target Start/End: Original strand, 20736413 - 20736557
Alignment:
Q  113 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagta 212  Q
    ||||||||||  |||||| |||| ||||| ||| |||  |||||| | |||| || |||||||||||||| ||| |||||||| | |  | |||||||||    
T  20736413 acatctagggatcatagtagttttaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcatagcat--aatatgtagta 20736509  T
Q  213 ttctcatggcggatctatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||||| |  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20736510 ttctcacgatggatcaatccagtataaatattactcctaatatttata 20736557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 260
Target Start/End: Original strand, 5758650 - 5758709
Alignment:
Q  201 tactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5758650 tactatgtagtattctcacagtggatctatccagtataaatattactcctaatatttata 5758709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 28172963 - 28172908
Alignment:
Q  106 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact 161  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28172963 gactcctatatctagggtacatactggtttccggtcgaagggtggaatacaccact 28172908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8510338 - 8510181
Alignment:
Q  97 aaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataa 196  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||  || ||| |||||| ||| |||||||| || || || |||| || |||||    
T  8510338 aaagtactcgactcctacatctaaggtacatagtggttccaggccgaagcatgtaatgcaccaccatcactatgagagtaactaatgacac-ttacataa 8510240  T
Q  197 cttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatattactcctaatattt 257  Q
    | ||  |||||||||||| |||| |  | || ||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  8510239 catt--ctatgtagtattatcattgtaggtcaatcaaatataaatattacttctaatattt 8510181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 141
Target Start/End: Original strand, 17120505 - 17120617
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| | || ||||||||| |||||   |||||||||| || ||| |||| |||||  |||    
T  17120505 catgattcatcaagcacccatcaaccaacgttatggttatcctttgacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcc-acatatagggatcat 17120603  T
Q  128 agtggtttcaggtc 141  Q
    ||||||||||||||    
T  17120604 agtggtttcaggtc 17120617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 182
Target Start/End: Original strand, 28756132 - 28756281
Alignment:
Q  32 attcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 131  Q
    ||||||| | || ||||||||| ||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||| |||||| |||| ||  |||||| |||| || |||||| ||||    
T  28756132 attcatgaaacaaccatcaaccgactttataggcatcttgttacatacaacatttga-tggtgataaagtacatgactcctacatatatggtacacagtg 28756230  T
Q  132 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttat 182  Q
    ||||||||||  ||| ||  ||| | || |||| |||||||||||| ||||    
T  28756231 gtttcaggtcataggatgagataaatcattatcactatgagaatattttat 28756281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21994794 - 21994662
Alignment:
Q  125 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||  |||||||| ||||  | ||| |||||||||| ||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||    
T  21994794 catagtcgtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcattgtgaaaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatttagtattctcatggtgg 21994698  T
Q  225 atctatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
     ||  |||| || ||||||||||| |||| ||||||    
T  21994697 gtcattccagtataaatattactcgtaatgtttata 21994662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27926062 - 27925973
Alignment:
Q  206 tgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 298  Q
    ||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||  ||| |||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  27926062 tgtagtattatcatggcgagtcaattcaatataaatattattcctaat--tta-atatctatgtgaaaacttcataaatctttatccatgatc 27925973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 24695186 - 24695458
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695186 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 24695285  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695286 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 24695385  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695386 aatccaatataaatattactcctaatatt--tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 24695458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 19714218 - 19714490
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714218 catgattcatgtagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 19714317  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714318 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacacaactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 19714417  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714418 aatccaatataaatattactcctaatatt--tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 19714490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 28 - 290
Target Start/End: Original strand, 18569581 - 18569841
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18569581 catgattcatgaagtacccatcaaccaattttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgataaagcactcgactccaacatgtagggtacat 18569680  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18569681 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgataatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgggtc 18569780  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttat 290  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  18569781 aatccaatataaatattactcctaatatt--tatatctatgtgaagacttgatatctctttat 18569841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 19706939 - 19707210
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19706939 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacggacaacgtttgaatggtgacagagcactcgactccaatatctagggtacat 19707038  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||  || |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19707039 agttatt-caggtcgaagggtggaatacacaattatcactatgagaaaatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 19707137  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19707138 aatccaatataaatattactcctagtatt--tatatctatgtgaagatttgataactctttatccatgatctgtg 19707210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 296
Target Start/End: Original strand, 17298621 - 17298885
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||| |||||||||| | | |||||||||||    
T  17298621 catgaatcatggagcacccatcaaccgattttatagtcatcctattacggacaacgtttgtacggaaacaaagtactcgactcctaaacctagggtacat 17298720  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 226  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| || |    
T  17298721 attggtttcaggttgaagggtggaatacgccacttatcactatgagaataacttatgaca-tttacataacttt--ctacgtagtattctcatggtgggt 17298817  T
Q  227 ctatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatga 296  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  17298818 caatccaatataaatattactcttaatatt--tatatctatgtgaagatttaataactctttatccatga 17298885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 27347252 - 27347428
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 123  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27347252 tcatcatgattcgtggagtacccatcaaccaactttat-gtcatcttgttaaagataacatttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggt 27347350  T
Q  124 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataactttta 202  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  27347351 acatagtggtttcgtgtcaaagggtggaatacacaactatcactatgagaatatcttatgacac-tttcataactttta 27347428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 135
Target Start/End: Original strand, 24701950 - 24702057
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24701950 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 24702049  T
Q  128 agtggttt 135  Q
    ||||||||    
T  24702050 agtggttt 24702057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 17285470 - 17285740
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||  |||||| |||||| ||| | | |||||||||||    
T  17285470 catgaatcatggagcacccatcaaccgattttatagtcatcctattacggacaaagtttgtacggaaacaaagtactcgaatcctaaacctagggtacat 17285569  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 226  Q
    | || ||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||| ||||| | | | | |||||||||  ||||||||||||||||| | || |    
T  17285570 attgatttcaggtcgaagagtggaatataccacttatcactatgataataacttatgata-tatacataacttt--ctatgtagtattctcattgtgggt 17285666  T
Q  227 ctatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17285667 caatccaatataaatattactcttaatatt--tatatctatgtaaagacttgataactctttatccatgacctgtg 17285740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 150 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 39538953 - 39538803
Alignment:
Q  150 gaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatattactcc 249  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  39538953 gaatataccactatcactatgagaatattttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttcatggtgggtcaatccaatataaatattactcc 39538854  T
Q  250 taatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39538853 taatattt--atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 39538803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 115 - 297
Target Start/End: Original strand, 18806843 - 18807021
Alignment:
Q  115 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtat 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |||  || || ||||||  |||||||  ||    
T  18806843 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatcat 18806939  T
Q  214 tctcatggcggatctatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgat 297  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18806940 tctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaatatt--tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgat 18807021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22941552 - 22941323
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  22941552 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 22941454  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  22941453 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 22941357  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22941356 aatccaatataaatattactcctaatatttatat 22941323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 20941329 - 20941100
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  20941329 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 20941231  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  20941230 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 20941134  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20941133 aatccaatataaatattactcctaatatttatat 20941100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Original strand, 25805385 - 25805614
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  25805385 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 25805483  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||  ||| | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  25805484 agtggtttcaggtgtaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 25805580  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25805581 aatccaatataaatattactcctaatatttatat 25805614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 32185 - 31972
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  32185 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 32087  T
Q  144 agggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatat 243  Q
    || | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || || |||||||| ||||||    
T  32086 agagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatat 31990  T
Q  244 tactcctaatatttatat 261  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31989 tactcctaatatttatat 31972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Original strand, 12789663 - 12789892
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  12789663 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 12789761  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |  | |||||  | ||||  | |||||||||||||| |||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  12789762 agtggtttcaggtctaagagcagtatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 12789858  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
     |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  12789859 aatccaatataaatattacttctaatatttatat 12789892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 23546208 - 23545995
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  23546208 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 23546110  T
Q  144 agggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatat 243  Q
    || | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || || |||||||| ||||||    
T  23546109 agagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatat 23546013  T
Q  244 tactcctaatatttatat 261  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23546012 tactcctaatatttatat 23545995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Original strand, 24933306 - 24933535
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  24933306 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 24933404  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||  | |||||||||||||| |||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  24933405 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 24933501  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
     |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  24933502 aatccaatataaatattacttctaatatttatat 24933535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31097118 - 31096890
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||  |||    
T  31097118 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgattcc-acatctagggatcat 31097020  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| |||  |||||||||  ||||||||||||||||||| || || ||    
T  31097019 aatggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 31096923  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
     |||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  31096922 aatccaatataaatattactcctataatttata 31096890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 192 - 302
Target Start/End: Original strand, 22546902 - 22547008
Alignment:
Q  192 cataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatc 291  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  22546902 cataactttt--tatgtagtattctcatggctggtcaatccaatataaatattactcataatatttatatctata--tgaaaacttgataactctttatc 22546997  T
Q  292 catgatctgtg 302  Q
    |||||| ||||    
T  22546998 catgatttgtg 22547008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 265
Target Start/End: Original strand, 12764990 - 12765227
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| |||| || |  |||    
T  12764990 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catcaagagatcat 12765088  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttt---tcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||  | ||||||| |||||| ||| ||    |||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  12765089 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatgtcttatgacaattaatctcataactt--actatgtagtattctcacggtgg 12765186  T
Q  225 atctatccaatacaaatattactcctaatatttatatatat 265  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12765187 gtctatccaatataaatattactcctaatatttatacatat 12765227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 256
Target Start/End: Original strand, 20100258 - 20100467
Alignment:
Q  43 acccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcg 142  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||  | |||||||| || ||| |||||| |||  ||||||||||||| |||     
T  20100258 acccatcaaccaacattatggttatccttttacagacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtcc-acatcttgggatcatagtggtttcatgtct 20100356  T
Q  143 aagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaata 242  Q
    ||| |||| |||||||| ||||  | |||||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||||||| |||||| |  || || | ||| || || ||    
T  20100357 aagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagttttctcacgttgggtcaagccagtataagta 20100453  T
Q  243 ttactcctaatatt 256  Q
    ||||||||||||||    
T  20100454 ttactcctaatatt 20100467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 265
Target Start/End: Original strand, 9811733 - 9811970
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| |||| || |  |||    
T  9811733 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catcaagagatcat 9811831  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttt---tcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||  | |||||| ||||||| ||| ||    ||||||| |  ||||||||||||||||| || ||    
T  9811832 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaaaatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacggtgg 9811929  T
Q  225 atctatccaatacaaatattactcctaatatttatatatat 265  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9811930 gtctatccaatataaatattactcctaatatttatacatat 9811970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 265
Target Start/End: Original strand, 12703874 - 12704111
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| |||| || |  |||    
T  12703874 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catcaagagatcat 12703972  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttt---tcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||  | |||||| ||||||| ||| ||    ||||||| |  ||||||||||||||||| || ||    
T  12703973 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaaaatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacggtgg 12704070  T
Q  225 atctatccaatacaaatattactcctaatatttatatatat 265  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12704071 gtctatccaatataaatattactcctaatatttatacatat 12704111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 7865430 - 7865662
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||| ||  |||||  ||| || |||| |||||||||  |||    
T  7865430 catgattcatcaagtacccatcaaccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaagggaaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcat 7865528  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttt---tcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||  | |||||||||||||| ||| ||    ||||||| |  ||||||||||||||||| || ||    
T  7865529 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacggtgg 7865626  T
Q  225 atctatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
     |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  7865627 gtctatccagtataaatattactcctaatatttata 7865662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 113
Target Start/End: Original strand, 28719471 - 28719558
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaa 113  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  28719471 tcatcatgattcgtggagtacccatcaaccaactttat-gtcatcttgttacagacaacgtttg-acggtgataaagcactcgactccaa 28719558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 253
Target Start/End: Original strand, 18806483 - 18806619
Alignment:
Q  115 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtat 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |||  || || ||||||  |||||||  ||    
T  18806483 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatcat 18806579  T
Q  214 tctcatggcggatctatccaatacaaatattactcctaat 253  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| |||||    
T  18806580 tctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaat 18806619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 253
Target Start/End: Original strand, 18806663 - 18806799
Alignment:
Q  115 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtat 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |||  || || ||||||  |||||||  ||    
T  18806663 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatcat 18806759  T
Q  214 tctcatggcggatctatccaatacaaatattactcctaat 253  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| |||||    
T  18806760 tctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaat 18806799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5097938 - 5097725
Alignment:
Q  43 acccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcg 142  Q
    |||||||||| ||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||| |||  |||||||||||||||||     
T  5097938 acccatcaacaaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctcgggatcatagtggtttcaggtct 5097840  T
Q  143 aagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaata 242  Q
    ||| | |  |||||| | ||||  | |||||||| ||||| |||  |||||||||   |||||||||||||||||| || || |  |||||||| |||||    
T  5097839 aagagcgatatacactattatcattgtgagaataacttatgaca-atttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggttaatccaatataaata 5097743  T
Q  243 ttactcctaatatttata 260  Q
    |||||| |||||||||||    
T  5097742 ttactcataatatttata 5097725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 265
Target Start/End: Original strand, 26129689 - 26129926
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 123  Q
    ||||||||||||||  || |||||| | ||||| |||| || ||| | |||  ||||| ||| ||||||  | |||||||| || |||| ||||||| |     
T  26129689 tcatcatgattcattaagtacccattagccaacgttatggttatctttttatagacaatgttagaatggcaataaagcacttgagtcca-catctagtga 26129787  T
Q  124 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 223  Q
     ||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||| ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| ||| || |    
T  26129788 tcatagtggtttcatgtctaagagtgatatacaccattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataac--atactatgtggtattttcacggtg 26129884  T
Q  224 gatctatccaatacaaatattactcctaatatttatatatat 265  Q
    | || ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  26129885 ggtcaatccagtataaatattactcataatatttgtatatat 26129926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 265
Target Start/End: Original strand, 18829377 - 18829518
Alignment:
Q  122 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatg 220  Q
    |||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||   ||||  |||||||||  |||||||  |||||||||    
T  18829377 gtacatagtggttttaggtcaaatgatggaatacaccacttatcattatgagaataacttatggaactta-cataacttt--ctatgtatcattctcatg 18829473  T
Q  221 gcggatctatccaatacaaatattactcctaatatttatatatat 265  Q
    | || || |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  18829474 gtgggtcaatccaatataaatattggtcctaatatttatatatat 18829518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 39539035 - 39538954
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgact 109  Q
    |||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||||||| || |  ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  39539035 catgattcgtggagtacctaccaaccaactttataatcatcctattccaaacaacatttgaatggtgataaagcactcgact 39538954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 302
Target Start/End: Original strand, 27347433 - 27347470
Alignment:
Q  265 tatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27347433 tatgtgaagacatgataactctttatctatgatctgtg 27347470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 68
Target Start/End: Original strand, 17283176 - 17283216
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatc 68  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  17283176 catgaatcatggagcacccatcaaccgattttatagtcatc 17283216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 49)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 8858654 - 8858382
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858654 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 8858555  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858554 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 8858455  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858454 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctata--tgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 8858382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18262699 - 18262427
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262699 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18262600  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262599 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18262500  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262499 aatccaatataaatattactcctaatattt--atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18262427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18269560 - 18269288
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269560 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18269461  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269460 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18269361  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269360 aatccaatataaatattactcctaatattt--atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18269288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 55613170 - 55612898
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613170 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 55613071  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613070 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 55612971  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612970 aatccaatataaatattactcctaatattt--atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 55612898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26964127 - 26963855
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964127 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 26964028  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964027 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 26963928  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963927 aatccaatataaatattactgctaatattt--atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 26963855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26970950 - 26970678
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970950 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 26970851  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970850 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 26970751  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970750 aatccaatataaatattactgctaatattt--atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 26970678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 869084 - 868812
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  869084 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 868985  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868984 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 868885  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  868884 aatccaatataaatattactcctaatattt--atatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 868812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 19926480 - 19926752
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926480 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 19926579  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926580 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 19926679  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926680 aatccaatataaatattactcctaatatt--tatatctatttgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 19926752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 5707807 - 5707535
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707807 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 5707708  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707707 agtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 5707608  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707607 aatccaatataaatattactcataatattt--atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 5707535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 5714435 - 5714163
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714435 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 5714336  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714335 agtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 5714236  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714235 aatccaatataaatattactcataatattt--atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 5714163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 10621053 - 10621325
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621053 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 10621152  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621153 agtggtttcaggtcgaagggtggaaaacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 10621252  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621253 aatccaatataaatattactcctaaaatt--tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 10621325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 10628132 - 10628404
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628132 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 10628231  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628232 agtggtttcaggtcgaagggtggaaaacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 10628331  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628332 aatccaatataaatattactcctaatatt--tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 10628404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 28392854 - 28393126
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28392854 catgattcatggagtactcatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 28392953  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28392954 agtggtttcaggttgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 28393053  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28393054 aatccaatataaatattacttctaatatt--tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtg 28393126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 8845690 - 8845418
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845690 catgattcatggagtacccatcaaccaaatttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 8845591  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845590 agtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 8845491  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8845490 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctata--taaagaattgataactctttatccatgatctgtg 8845418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 4426336 - 4426596
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426336 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctattacggacaatgtttgaatggtaacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 4426435  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||            ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426436 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga------------acttttcatagattttactatgtagtattctcatggcggatc 4426523  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426524 aatccaatataaatattactcctaatatt--tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 4426596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 5667849 - 5668115
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5667849 catgattcgtggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgac--caacatctagggtacat 5667946  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  5667947 agtggtttcaggtctaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtgagtc 5668046  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 298  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||||||  ||   |||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  5668047 aatccagtataaatattactcctaatatttatacctac--gtgaagatatgataactctttatctatgatc 5668115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 35224047 - 35223779
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35224047 catgattcgtggagtacacatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatgttgataaagcactcgactccaacatctaaggtacat 35223948  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  35223947 cgtggtttcaggtcaaagggtggaatacaacactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatatagtattctcatggtggttc 35223848  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 298  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  35223847 aatccagtataaatattactcctaatatt--tatacatatgtaaagacatgataactctttatctatgatc 35223779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 265
Target Start/End: Original strand, 10677303 - 10677539
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10677303 catggttcatggagtacccatctaccaactttat-gtcatcttattacaaacaacgtttaaatggtggtaaagcactcgactcctacatctaggatacat 10677401  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||    
T  10677402 agtggtttcaagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacatttactatgtagtattctcatagtgggtc 10677501  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatat 265  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10677502 aatccagtataaatattactcctaatatttatacatat 10677539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 265
Target Start/End: Original strand, 10890943 - 10891179
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10890943 catggttcatggagtacccatctaccaactttat-gtcatcttattacaaacaacgtttaaatggtggtaaagcactcgactcctacatctaggatacat 10891041  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||    
T  10891042 agtggtttcaagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacatttactatgtagtattctcatagtgggtc 10891141  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatat 265  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10891142 aatccagtataaatattactcctaatatttatacatat 10891179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20311781 - 20311511
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 123  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  20311781 tcatcatgattcgtggagtaccgattaaccgactttatagtcatcctgctacggacaacgtttgtacgggaacaaagtactcgaatcctacatctagggt 20311682  T
Q  124 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 222  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||   ||| | |  || ||||||| |  |||||||||||||||||| |    
T  20311681 aaatagtggtttcaagtagaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataatgtatgata-gttacataactgt--ctatgtagtattctcatgac 20311585  T
Q  223 ggatctatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 298  Q
     | || |||||||| ||| |||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20311584 aggtcaatccaatataaaaattactcctaatatt--tacatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 20311511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 15461799 - 15461570
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  15461799 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 15461701  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  15461700 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 15461604  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15461603 aatccaatataaatattactcctaatatttatat 15461570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 34975853 - 34975624
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||  |||    
T  34975853 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagcacttgagtcc-acatctagggatcat 34975755  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| |||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  34975754 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 34975658  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34975657 aatccaatataaatattactcctaatatttatat 34975624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Original strand, 3369023 - 3369252
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||| || |  |||    
T  3369023 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catcaagagatcat 3369121  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  3369122 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 3369218  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3369219 aatccaatacaaatattactcctaatatttatat 3369252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 2677299 - 2677086
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  2677299 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 2677201  T
Q  144 agggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatat 243  Q
    || | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || || |||||||| ||||||    
T  2677200 agagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatat 2677104  T
Q  244 tactcctaatatttatat 261  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2677103 tactcctaatatttatat 2677086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 15815307 - 15815094
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  15815307 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 15815209  T
Q  144 agggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatat 243  Q
    || | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || || |||||||| ||||||    
T  15815208 agagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatat 15815112  T
Q  244 tactcctaatatttatat 261  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15815111 tactcctaatatttatat 15815094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Original strand, 18111059 - 18111272
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  18111059 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 18111157  T
Q  144 agggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatat 243  Q
    || | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || || |||||||| ||||||    
T  18111158 agagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatat 18111254  T
Q  244 tactcctaatatttatat 261  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18111255 tactcctaatatttatat 18111272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19365806 - 19365593
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||   | |||||||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||| |    
T  19365806 cccattaactaacgttatggtcatcctgttacagacaacgtttgaatgacaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtcta 19365708  T
Q  144 agggtggaatacaccactatcccta-tgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaata 242  Q
    || |||| |||||||| ||||  |  |||||||||||||| ||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||| || || || ||||| || |||||    
T  19365707 agagtggtatacaccattatcattggtgagaatatcttatgacacttt-cataacat--actatgtagtactctcacggtgggtcaatccagtataaata 19365611  T
Q  243 ttactcctaatatttata 260  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19365610 ttactcctaatatttata 19365593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 26531899 - 26531686
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  26531899 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 26531801  T
Q  144 agggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatat 243  Q
    || | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || || |||||||| ||||||    
T  26531800 agagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatat 26531704  T
Q  244 tactcctaatatttatat 261  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26531703 tactcctaatatttatat 26531686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 129 - 281
Target Start/End: Original strand, 21453961 - 21454110
Alignment:
Q  129 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatct 228  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||| | | ||| |||||||  || |||||||||||||||||| || ||     
T  21453961 gtggtttcaggtcgaagggtgacatacaccactatcacaatgaaaatatcttatgatattttacataactcata-tatgtagtattctcatggtgggtca 21454059  T
Q  229 atccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgata 281  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||    
T  21454060 attcaatataaatattactcctaatatt--tatatgtatgtgaaaacttgata 21454110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 261
Target Start/End: Original strand, 17299977 - 17300188
Alignment:
Q  46 catcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaag 145  Q
    ||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |||    
T  17299977 catcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaag 17300075  T
Q  146 ggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatatta 245  Q
     | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || || |||||||| ||||||||    
T  17300076 agcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatta 17300172  T
Q  246 ctcctaatatttatat 261  Q
    ||||||||||||||||    
T  17300173 ctcctaatatttatat 17300188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 20244239 - 20244010
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  20244239 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 20244141  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||  | |||||||||||||| |||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  20244140 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 20244044  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
     |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  20244043 aatccaatataaatattacttctaatatttatat 20244010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1942026 - 1941798
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| || ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  1942026 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacattagaatggcaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 1941928  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||  | ||||||||||| || |||  | |||||||  ||||||||||||||||||| || || |     
T  1941927 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatctcatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtt 1941831  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1941830 aatccaatataaatattactcctaatatttata 1941798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Original strand, 4675983 - 4676212
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||||||  |||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  4675983 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttataatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 4676081  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||  | |||||||||||||| |||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  4676082 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 4676178  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
     |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4676179 aatccaatataaatattacttctaatatttatat 4676212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18163464 - 18163235
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  18163464 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 18163366  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||  | |||||||||||||| |||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || |     
T  18163365 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtg 18163269  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
     |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  18163268 aatccaatataaatattacttctaatatttatat 18163235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9487853 - 9487625
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||  |||| || ||||| |||| |||||||||  ||||   |||||  ||| || |||| |||||||||  |||    
T  9487853 catgattcatcaagtacccatcaaccaatgttatggttatcctattacagacaacgttataatgacaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcat 9487755  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||  | |||||||||||||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  9487754 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacgatgggtc 9487658  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  9487657 tatccagtataaatattactcctaatatttata 9487625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5870720 - 5870491
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || || ||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| |||||   ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  5870720 catgattcatcaagtactcatcaaccaacgttattgttatcctattatagacaacgttagaatgacaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcat 5870622  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||  | |||||||||| ||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  5870621 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcatatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 5870525  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5870524 aatccaatataaatattactcctaatatttatat 5870491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5616681 - 5616469
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||  |||||||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||| || |    
T  5616681 cccattaaccaacgttacagttatcttgttacaaacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagatcta 5616583  T
Q  144 agggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatat 243  Q
    ||  ||| |||||||| ||||  | | |||||||||||| ||||||| |||||  |  ||| ||||||||||||| ||  | || ||||| || ||||||    
T  5616582 agattggtatacaccattatcattgtaagaatatcttatgacacttt-cataa--taaactctgtagtattctcacggttggtcaatccagtataaatat 5616486  T
Q  244 tactcctaatatttata 260  Q
    |||| ||||||||||||    
T  5616485 tacttctaatatttata 5616469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19362695 - 19362488
Alignment:
Q  45 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 144  Q
    |||| ||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||   | |||||| |  | |||| |||||| ||  ||||||||||||||||  ||    
T  19362695 ccattaaccaccgttatggtcatcctgttacagacaacgtttgaatgacaataaagcatttaagtcca-catctaaggatcatagtggtttcaggtttaa 19362597  T
Q  145 gggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatatt 244  Q
    | |||| |||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||  ||||| |  ||||||||||| ||||| |  || || ||||| || |||||||    
T  19362596 gagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacactttg-ataacat--actatgtagtactctcacgatgggtcaatccagtataaatatt 19362500  T
Q  245 actcctaatatt 256  Q
    ||||||||||||    
T  19362499 actcctaatatt 19362488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 203 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 56516368 - 56516271
Alignment:
Q  203 ctatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
    ||||||||| ||||||| |||  || |||||||| ||||||||||| | |||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  56516368 ctatgtagtgttctcatagcgagtcaatccaatataaatattactcatgatatttatacgtat--gtgaagacttgataactctttatccattatctgtg 56516271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Original strand, 5528495 - 5528707
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||| || |||||||||||||  | |||||||| || ||| ||||||||||  |||||  |||||||||  |    
T  5528495 cccattaaccaacattatggttatcctgttacagataacgtttgaatggaaataaagcacttgagtcc-acatctagggatcatagcagtttcaggtata 5528593  T
Q  144 agggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatat 243  Q
    || |||  |||||||| ||||  ||||||||||||||||  || |||||||||  | ||||| || ||||||||| |  || |  || ||||| ||||||    
T  5528594 agagtgttatacaccattatcattatgagaatatcttatggca-ttttcataa--tatactacgtggtattctcacgttgggttaatacaatataaatat 5528690  T
Q  244 tactcctaatatttata 260  Q
     ||||||||||||||||    
T  5528691 cactcctaatatttata 5528707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 248
Target Start/End: Original strand, 30040489 - 30040705
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || || ||| ||||||| |||| || ||||| ||||  ||||| || |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  30040489 catgattcatcaagtactcattaaccaacgttatggttatccttttacaaacaacattagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 30040587  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||  | |||||||||||||| ||| ||||||||||   |||||||||||| |||||||| || ||    
T  30040588 agtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtactctcatggtgggtc 30040684  T
Q  228 tatccaatacaaatattactc 248  Q
     ||| | || |||||||||||    
T  30040685 aatctagtataaatattactc 30040705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4546298 - 4546154
Alignment:
Q  113 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagta 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| | |  |||||| | ||||  | |||||||||||||| ||| | | ||||||||  |||||||||||    
T  4546298 acatctagggatcatagtggttttaggtcaaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataactt--actatgtagta 4546202  T
Q  213 ttctcatggcggatctatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||||| || || ||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4546201 ttctcacggtgggtctgtccagtataaatattactcctaatatttata 4546154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 32636685 - 32636558
Alignment:
Q  130 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcta 229  Q
    |||||||| |||| || |||| |||||||| ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||    || || |    
T  32636685 tggtttcacgtcggagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacattgggtcaa 32636589  T
Q  230 tccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  32636588 tccaatataaatattactcataatatttata 32636558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11421309 - 11421096
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||| ||| |||||| | ||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   | |||||||| || | || |||||| ||  |||    
T  11421309 catgattcatcgagtacccattagccaacattatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaataaagcacttgagtaca-catctacggatcat 11421211  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| | | |||  |||||  | ||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||| |  ||||||||||||||| | || || ||    
T  11421210 agtggtttcaggtctatgagtgatatacattattatccctgtgataatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctaacggtgggtc 11421114  T
Q  228 tatccaatacaaatatta 245  Q
     |||||||| ||||||||    
T  11421113 aatccaatataaatatta 11421096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24701411 - 24701361
Alignment:
Q  106 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaataca 156  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24701411 gactcctacatctagggtacacagtggttttaggtcgaagggtggaataca 24701361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9538244 - 9538033
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||| || |||| |||| | ||  ||| ||||||| ||||| |    
T  9538244 cccattaaccaacgttatggttatcctgttacggacaatgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catccaaggatcatggtggtttgaggtcta 9538146  T
Q  144 agggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatat 243  Q
    ||  ||||  || ||| ||||  | |||||||||||||| ||||||| |||||| |   |||||||||||||||| |  || || ||||| || ||||||    
T  9538145 agactggac-acgccattatcattgtgagaatatcttatgacacttt-cataacatg--ctatgtagtattctcacgctgggtcaatccagtataaatat 9538050  T
Q  244 tactcctaatatttata 260  Q
    ||||||||| |||||||    
T  9538049 tactcctaacatttata 9538033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 161
Target Start/End: Original strand, 32646538 - 32646656
Alignment:
Q  43 acccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcg 142  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||  ||||||| | |   |||||| || ||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||    
T  32646538 acccatcaaccgacttcataatcatcctgttatggatgacgtttgtacgacaacaaagtacccgactcatacatccaggatacagagttgtttcaggtcg 32646637  T
Q  143 aagggtggaatacaccact 161  Q
    ||||||  |||||||||||    
T  32646638 aagggtaaaatacaccact 32646656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 137
Target Start/End: Original strand, 9937745 - 9937826
Alignment:
Q  56 ctttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttca 137  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  || |||| | |||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  9937745 ctttatagtcatccttttacgaacaatgtttgaacgacgataaagtattcgactcttacatctagggtacatagtgatttca 9937826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 290
Target Start/End: Original strand, 34777893 - 34777975
Alignment:
Q  206 tgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttat 290  Q
    |||||||||||||||| || || ||| |||||||| ||||||| | |||||  |||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  34777893 tgtagtattctcatggagggtcaatctaatacaaaaattactcattatatt--tatacatatttgaagacttgataactttttat 34777975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 39)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 6110551 - 6110279
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110551 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 6110452  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110451 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 6110352  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110351 aatccaatataaatattactcctaatattt--atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 6110279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 8490982 - 8490710
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490982 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 8490883  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490882 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 8490783  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490782 aatccaatataaatattactcctaatattt--atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 8490710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 16482203 - 16482475
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482203 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 16482302  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482303 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 16482402  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482403 aatccaatataaatattactcctaatatt--tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 16482475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 10579075 - 10579347
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579075 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 10579174  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10579175 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcggatc 10579274  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579275 aatccaatataaatattactcctaatatt--tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 10579347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 15600604 - 15600876
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600604 catgattcatggggtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15600703  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600704 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15600803  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600804 aatccaatataaatattactcctaatatt--tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 15600876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 15607149 - 15607421
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607149 catgattcatggggtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15607248  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607249 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15607348  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607349 aatccaatataaatattactcctaatatt--tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 15607421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 10572312 - 10572584
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10572312 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctacggtacat 10572411  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572412 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacagttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 10572511  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572512 aatccaatataaatattactcctaatatt--tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 10572584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 32056619 - 32056892
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056619 catgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 32056718  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056719 agtggtttcaggttgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 32056818  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056819 aatccaatataaatattactcataatattt-tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 32056892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 15357306 - 15357578
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357306 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15357405  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357406 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15357505  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     | |||||| ||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15357506 aacccaatataaatattactccta--atttttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtg 15357578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18520462 - 18520190
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520462 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttatggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18520363  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520362 agtggtttcagttcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18520263  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     ||| |||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520262 aatcaaatataaatattactcctaatattt--atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18520190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 32 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18523146 - 18522878
Alignment:
Q  32 attcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 131  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18523146 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 18523047  T
Q  132 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatc 231  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  18523046 gtttcaggtcgaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttcatggcggatcaatc 18522947  T
Q  232 caatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522946 caatataaatattactcctaatattt--atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18522878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 13211789 - 13211517
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13211789 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctaggttacat 13211690  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13211689 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtaatattctcatggcggatc 13211590  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211589 aatccaatataaatattactcctaatattt--atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 13211517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 13249094 - 13248822
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13249094 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctaggttacat 13248995  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  13248994 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtaatattctcatggcgaatc 13248895  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248894 aatccaatataaatattactcctaatattt--atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 13248822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 15341939 - 15342211
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15341939 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15342038  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15342039 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataatttttactatgtagtattctcatgacggatc 15342138  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15342139 aatccaatataaatattactccta--atttttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtg 15342211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 17780838 - 17781110
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17780838 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctattacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 17780937  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17780938 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataatttttactatgtagtattctcatggcggatc 17781037  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17781038 aatccaatataaatattactcctaatatt--tatatctatgtgaagacttgataactctttatctatgatttgtg 17781110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 24 - 302
Target Start/End: Original strand, 17199900 - 17200176
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 123  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  17199900 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgatacgaacaacatttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctaaggt 17199999  T
Q  124 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17200000 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagcg 17200099  T
Q  224 gatctatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
    | || |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17200100 ggtcaatccaatacaaatactactcctaatatt--tatatctatgtgaagacttgataactctttatccacgatctgtg 17200176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 13517294 - 13517026
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13517294 catgattcatggagtacccatctaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgataaagcactcgactccaacatctagggtacat 13517195  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||      |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  13517194 agtggtttcaggtcgaagggtgg----ggccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatttagtattctcatggaggatc 13517099  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13517098 aatccaatataaatattactcctaatatt--tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 13517026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 1647241 - 1647513
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1647241 catgattcatggagtactcatcaaccaaatttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtatat 1647340  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  1647341 agtggttttaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgggaatatcgtatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcgagtc 1647440  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     ||| |||| ||| |||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1647441 aatcaaatataaacattactcctaatatt--tatatctatgtgtagacttgataactctttatccatgatctgtg 1647513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 17136840 - 17136574
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136840 catgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatgtttactaagcactcgactccaacatctagggtacat 17136741  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  17136740 agtggtttcaagtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttcaataacttttactatgtagtattctcatggtgggtc 17136641  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| ||||||||||||||        |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136640 aatccaatataaatattactccta--------atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 17136574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 29925458 - 29925189
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29925458 catgattcgtggagtatccatcaaccaactttataatcatcttgttacagacaacgtttgattggtgacaaagcactcaactccaacgtctagggtacat 29925359  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || || ||    
T  29925358 aatggtttcaggtcaaatggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgcagtattctctaggtgggtc 29925259  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatct 299  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  29925258 aatccaatataaatattactcctaatattt--atatctatgtgaagacttaatgactctttatccatgatct 29925189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 29974611 - 29974342
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29974611 catgattcgtggagtatccatcaaccaactttataatcatcttgttacagacaacgtttgattggtgacaaagcactcaactccaacgtctagggtacat 29974512  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || || ||    
T  29974511 aatggtttcaggtcaaatggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgcagtattctctaggtgggtc 29974412  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatct 299  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  29974411 aatccaatataaatattactcctaatattt--atatctatgtgaagacttaatgactctttatccatgatct 29974342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16200917 - 16200646
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16200917 catgattcgtggagtatccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacatttgaatggtgacaaagcactcgacttcaacatctagggtacat 16200818  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  16200817 agtggtttcaggtcaaagggttgaatacaccactatcactatgagaatatcttatgatactttacataattttgactatgtagtattctcatggtgggtc 16200718  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 301  Q
     ||||||||  |||||||| |||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16200717 aatccaatatgaatattacacctaatatttgtatctata--tgaatacttgataattctttatccatgatctgt 16200646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 21034540 - 21034311
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  21034540 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 21034442  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  21034441 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 21034345  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21034344 aatccaatataaatattactcctaatatttatat 21034311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Original strand, 15846536 - 15846765
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  15846536 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagggatcat 15846634  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  15846635 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 15846731  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15846732 aatccaatataaatattactcctaatatttatat 15846765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21399094 - 21398866
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  21399094 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 21398996  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||  | | |||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  21398995 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtaagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 21398899  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21398898 aatccaatataaatattactcctaatatttata 21398866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 25978728 - 25978956
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| |||||||||  |||    
T  25978728 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcat 25978826  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||  | |||||||||||||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  25978827 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 25978923  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  25978924 tatccagtataaatattactcctaataattata 25978956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Original strand, 20147570 - 20147783
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  20147570 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 20147668  T
Q  144 agggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatat 243  Q
    || | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || || |||||||| ||||||    
T  20147669 agagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatat 20147765  T
Q  244 tactcctaatatttatat 261  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20147766 tactcctaatatttatat 20147783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 12300212 - 12299983
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  12300212 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaatcacttgagtcca-catctagagatcat 12300114  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  12300113 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 12300017  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
     |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  12300016 aatccaatataaatattactcctaacatttatat 12299983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 55427323 - 55427094
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  55427323 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 55427225  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||  | |||||||||||||| |||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  55427224 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 55427128  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
     |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  55427127 aatccaatataaatattacttctaatatttatat 55427094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 14890693 - 14890464
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| ||||| | ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| ||||||| |  ||     
T  14890693 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttataattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcac 14890595  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||| ||||||||| ||| |    |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  14890594 agtgctttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 14890498  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14890497 aatccaatataaatattactcctaatatttatat 14890464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15527021 - 15526827
Alignment:
Q  62 agtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact 161  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| |||| || ||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |    
T  15527021 agtcatgctgttacagacaacgtttgaatggttataaagcacttgagtcc-acatgtatggatcatagtggtttcaggtctaagagtggtatacaccatt 15526923  T
Q  162 atccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
    | |  | | |||||||||||| ||| |||||||| |   |||||| ||||| ||||| |  || || ||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  15526922 aacattgtaagaatatcttatgaca-ttttcatagc--atactatttagtactctcacgatgggtcaatccagtataaatattactcctaagatttata 15526827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 294
Target Start/End: Original strand, 24253130 - 24253372
Alignment:
Q  46 catcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaag 145  Q
    ||||||| |||||||| ||||  |||| |  ||||| ||||||| |   |||||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  24253130 catcaactaactttatggtcactctgtaattgacaatgtttgaacgacaacaaagtactcgagtcatacatctaaggtacatagtggttttaggtcgaa- 24253228  T
Q  146 ggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatatta 245  Q
     ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |  | ||  ||||| ||  ||||| | ||||||||||| || || | |||||| |||||| |    
T  24253229 tgtggaatacaccgttatcactatgagaataacttatga-tccttaaataacatt--ctatgcattattctcatggagggtcaaaccaatataaatataa 24253325  T
Q  246 ctcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccat 294  Q
    ||| |||| ||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24253326 ctcttaatgtt--tataagtatgtgaaaacttgataactctttatccat 24253372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28088408 - 28088227
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || | |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||||| || || ||| ||||||||||  |||    
T  28088408 catgattcatcaagtatccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcccttgagtcc-acatctagggatcat 28088310  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtat 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||  | |||||||||||||| |||  |||||||||  ||||||||||||||    
T  28088309 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtat 28088227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11787889 - 11787661
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |  |  ||||||||  |||    
T  11787889 catgattcattaagtacccatcaaccaacgttatggttatccatttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgattatag-atctagggatcat 11787791  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| | | | | ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  11787790 aatggtttcaggtctaagagcgatatacaatattatcattgtgagaatatcttatgaaaatat-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 11787694  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  11787693 tatccagtataaatattactcctaatatttata 11787661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 15317176 - 15317401
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||  | ||||  |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || |||| |||||||||  |||    
T  15317176 catgattcatcaagtacccgtcaaccaacgttatgattatccgtttacagacaacgttagaatg---acaaagtacttgagtcca-catctagggatcat 15317271  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |   ||||| | ||||  | |||||||||||||| ||| | | |||||| |  ||||||||||||||||| || || ||    
T  15317272 agtggtttcaggtctaagagcgatttacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataacgt--actatgtagtattctcacggtgggtc 15317368  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  15317369 tatctagtataaatattactcctaatatttata 15317401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14147226 - 14147090
Alignment:
Q  126 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgga 225  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  |||||||  ||||  | |||||||||||||  ||| |||||||||| |  ||||||||| ||||||| ||| |     
T  14147226 atagtggtttcaggtctaagagtgatatacacctttatcaatgtgagaatatcttacgaca-ttttcataacat--actatgtagcattctcacggcagg 14147130  T
Q  226 tctatccaatacaaatattactcctaatatttatatatat 265  Q
    || ||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14147129 tcaatccagtataaatattcctcctaatatttatacatat 14147090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 30464261 - 30464147
Alignment:
Q  66 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcc 165  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||   | ||| |||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||||     
T  30464261 atccttttacagacaacgtttgaatgtcaataaaacacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtggtatagaccattatca 30464163  T
Q  166 ctatgagaatatctta 181  Q
     |||||||||||||||    
T  30464162 ttatgagaatatctta 30464147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 28954093 - 28953965
Alignment:
Q  167 tatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaa-tacaaatattactcctaatatttatatatat 265  Q
    |||||||||||| ||| |||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||  || |  ||||||  ||||||||||||||||  || | |||| ||    
T  28954093 tatgagaatatcatatgacactttaaataacttat--tatgtagtattctcatgatgggttaatccaacaacaaatattactccta--atgtgtatacat 28953998  T
Q  266 atgtgaagacttgataactctttatccatgatc 298  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  28953997 atgtgaagactttgtaactctttatcaatgatc 28953965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 32280507 - 32280388
Alignment:
Q  102 actcgactccaacatctagggtacata----gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataac 197  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||| ||  || |||  |||| | || |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  32280507 actcgactcctacatctagggtacatatatagtggtttcaagtgaaaaggtaaaataaatcattatcactatgagaatatcttatgacactttacatgac 32280408  T
Q  198 ttttactatgtagtattctcat 219  Q
      | |||||||| |||||||||    
T  32280407 --tcactatgtattattctcat 32280388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18252517 - 18252245
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252517 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18252418  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252417 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18252318  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252317 aatccaatataaatattactcctaatattt--atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18252245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 18532234 - 18532506
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532234 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18532333  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532334 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18532433  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532434 aatccaatataaatattactcctaatatt--tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18532506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 27131130 - 27131401
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27131130 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagg-tacat 27131228  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131229 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27131328  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131329 aatccaatataaatattactcctaatatt--tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 27131401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 27310297 - 27310569
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310297 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27310396  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310397 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27310496  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27310497 aatccaatataaatattactcctaatatt--tatatttatgtgaagacttgataactctttatccataatctgtg 27310569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 16358755 - 16359027
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358755 catgattcatggagtacccatcaaccaactttaaagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 16358854  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
     ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358855 ggtggtttcaagacgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttctcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 16358954  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16358955 aatccaatataaatattactcataatatt--tatatctatgtgaaggcttgataactctttatccattatctgtg 16359027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 3855639 - 3855911
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3855639 catgattcatggagtaccggtcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgcttgaatggtgacaaagcgctcaactccaacatctagggtacat 3855738  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  3855739 agtggtttcgggtcgaatggtggaatacaccactatcactgtgagaatatcttatgacacttttcataacctttactatgtagtattctcattgcgggtc 3855838  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3855839 aatccaatataaatattactcctaatatt--tatacctatgtgaagactttataactctttatccatgatttgtg 3855911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 36816354 - 36816625
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  36816354 catgatttgtggagtacctatcaaccaactttatagttatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaaacgctcgactccaacatctagggtacat 36816453  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  36816454 agtggtttcagttcaaagggtggaatacaccaccatcactatgataat-ttttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtgggtc 36816552  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816553 aatccaatataaatattactcctaatatt--tatatctatgtgtagacttgataactctttatccatgatctgtg 36816625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 22641594 - 22641859
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22641594 catgattcgtggagtacccatcgaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctacggtacat 22641693  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  22641694 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactgtgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagt-ttctcatggtgggtc 22641792  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatct 299  Q
     ||| | || |||||||| |||||||     ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  22641793 aatctagtataaatattattcctaat-----tatatctatgtgaacacttaataactctttatccatgatct 22641859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 27277278 - 27277545
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||  |||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27277278 catgatttatggagtacccttcaaccaactttatggtcatcttgttacaaacaatgtttgaattatgataaagcactcgactccaacatccagggtacat 27277377  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||    
T  27277378 agtggtttcaggtcaaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatggcac-tttcatgacttttactatgcaatattcttatggtgggtc 27277476  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 298  Q
     ||| | || |||||||||||||||||||  ||||  |||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  27277477 aatctagtataaatattactcctaatatt--tatacctatgtgaaaacatgataactctttatctatgatc 27277545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 156 - 302
Target Start/End: Original strand, 21171081 - 21171225
Alignment:
Q  156 accactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatattactcctaatat 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21171081 accactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatat 21171180  T
Q  256 ttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171181 t--tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 21171225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Original strand, 9916497 - 9916688
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| ||||| || ||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  9916497 catgattcgtggagaactcataaactaactttatagtcaccttgttacggacaacgtttggacggtaacaaagtactcgactcctacatctagggtacat 9916596  T
Q  128 agtgg-tttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatg 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9916597 agtggttttcaggtcgaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataatttatgaca-tttacataacttt--ctatgtagtattctcatg 9916688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Original strand, 19706439 - 19706668
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  19706439 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 19706537  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  19706538 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 19706634  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19706635 aatccaatataaatattactcctaatatttatat 19706668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Original strand, 28134723 - 28134952
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| |||||  |||    
T  28134723 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catttagggatcat 28134821  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |||||    
T  28134822 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtggatc 28134918  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28134919 aatccaatataaatattactcctaatatttatat 28134952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Original strand, 43802365 - 43802594
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  43802365 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 43802463  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  43802464 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 43802560  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43802561 aatccaatataaatattactcctaatatttatat 43802594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 9456402 - 9456189
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  9456402 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 9456304  T
Q  144 agggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatat 243  Q
    || | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || || |||||||| ||||||    
T  9456303 agagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatat 9456207  T
Q  244 tactcctaatatttatat 261  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9456206 tactcctaatatttatat 9456189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Original strand, 20391239 - 20391468
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  20391239 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 20391337  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | || |||||  | ||||  | |||||||||||||| | | ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  20391338 agtggtttcaggtctaagagcggtatacattattatcattgtgagaatatcttatgaaaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 20391434  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
     |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  20391435 aatccaatataaatattactcctaacatttatat 20391468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Original strand, 20779661 - 20779874
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  20779661 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 20779759  T
Q  144 agggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatat 243  Q
    || | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || || |||||||| ||||||    
T  20779760 agagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatat 20779856  T
Q  244 tactcctaatatttatat 261  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20779857 tactcctaatatttatat 20779874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Original strand, 22670273 - 22670486
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  22670273 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 22670371  T
Q  144 agggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatat 243  Q
    || | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || || |||||||| ||||||    
T  22670372 agagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatat 22670468  T
Q  244 tactcctaatatttatat 261  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22670469 tactcctaatatttatat 22670486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Original strand, 42817005 - 42817218
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  42817005 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 42817103  T
Q  144 agggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatat 243  Q
    || | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || || |||||||| ||||||    
T  42817104 agagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatat 42817200  T
Q  244 tactcctaatatttatat 261  Q
    ||||||||||||||||||    
T  42817201 tactcctaatatttatat 42817218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 634216 - 634008
Alignment:
Q  48 tcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaaggg 147  Q
    ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |    
T  634216 tcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagag 634118  T
Q  148 tggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatattact 247  Q
     |  |||||| | ||||  | |||||||||||||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || || |  ||||| || ||||||||||    
T  634117 cgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggttaatccagtataaatattact 634021  T
Q  248 cctaatatttata 260  Q
    |||||||||||||    
T  634020 cctaatatttata 634008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22612794 - 22612565
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || | |||||||||||| ||||  | ||||| |||  ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  22612794 catgattcatcaagtagccatcaaccaacgttatgattatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagtgatcat 22612696  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  22612695 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 22612599  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
     |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22612598 aatccaataaaaatattactcccaatatttatat 22612565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 23507385 - 23507119
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||| |||||| |||||| || | | |||||||||||||| |||| |||    |||| ||| | |||||| |||| | ||  ||||||||||||||     
T  23507385 catgatttatggagtacccataaatcgaatttatagtcatcctattacagacggtatttgtatgataacaaagtactcaaatcttacatctagggtacac 23507286  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| |||| |||| ||||||||||| |||| | |  ||| || ||| ||  || ||||| ||||| |||| || |    
T  23507285 agtggtttcaggtcgaaggatgacatactccacttatcactatgagaataactta-tgctttttacacaacgtt--ctctgtagcattctaatggtgggt 23507189  T
Q  227 ctatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 298  Q
      |||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  23507188 taatccaatataaatattactcctattatt--tatatctatgtgaaaacttgataactccttatccatgatc 23507119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 195 - 296
Target Start/End: Original strand, 22657108 - 22657207
Alignment:
Q  195 aacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccat 294  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  22657108 aacttttactatgtagtattcacatggtgggtcaatctaatataaatattactcataatatt--tatatctatgtgaagacttaataactctttatctat 22657205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 8727969 - 8727741
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||| | ||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||  |||||||||  |||    
T  8727969 catgattcatcaagtacccattagccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtccg-catctagggatcat 8727871  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||| |||||| ||| |||  ||||||   |||| ||| |||||||||||||   | |||||||||| |  ||||||||||||||||| || |||||    
T  8727870 agtggttccaggtctaagagtgatatacactcttatcactaagagaatatcttatggta-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtggatc 8727774  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
     ||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  8727773 aatccagtataaatattacttctaatatttata 8727741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 298
Target Start/End: Original strand, 12014084 - 12014272
Alignment:
Q  106 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttact 204  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  ||| | |   |||| | |  || | ||    
T  12014084 gactcctacatctagagtacacagtgattttaggttgaagggtgaaatacaccacttatcactatgagaatgacttgtga---tttttacatattgttct 12014180  T
Q  205 atgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 298  Q
    |||||  ||||||||| ||| || ||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12014181 atgtaacattctcatgccgggtcaatccaatattaatattactcttaatatttatatttat--gtgaagacttgataactccttatcaatgatc 12014272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 141
Target Start/End: Original strand, 28145723 - 28145835
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||  |||    
T  28145723 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagggatcat 28145821  T
Q  128 agtggtttcaggtc 141  Q
    ||||||||||||||    
T  28145822 agtggtttcaggtc 28145835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 298
Target Start/End: Original strand, 9917840 - 9917906
Alignment:
Q  229 atccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 298  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9917840 atccaatataaatattactca-aatatttatatctat--gtgaagacttgataactctttatccatgatc 9917906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29097008 - 29096796
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||| ||||||| |||| || ||||| |||| || ||||||||||| |  | ||| |||| || ||||  ||||||||  ||||||||||||| ||| |    
T  29097008 cccattaaccaacgttatggttatcctattacagataacgtttgaatcgaaataaaacacttgagtccat-atctagggatcatagtggtttcatgtcta 29096910  T
Q  144 agggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatat 243  Q
    || |||  | |||||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||   | ||||||||||||| || || ||||| ||| | || ||||||    
T  29096909 agagtgtgaaacaccattatcattatgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atgctatgtagtattcacacggtggatcaatctagtataaatat 29096813  T
Q  244 tactcctaatatttata 260  Q
    || ||||||||| ||||    
T  29096812 tattcctaatatgtata 29096796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 141
Target Start/End: Original strand, 47667485 - 47667597
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  47667485 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 47667583  T
Q  128 agtggtttcaggtc 141  Q
    ||||||||||||||    
T  47667584 agtggtttcaggtc 47667597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 51997406 - 51997348
Alignment:
Q  207 gtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatattactcctaatatttatatatat 265  Q
    ||||||||||||||| || || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51997406 gtagtattctcatggtgggtcaatctaatataaatattactcctaatatttataaatat 51997348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 128 - 260
Target Start/End: Original strand, 21881475 - 21881604
Alignment:
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||||  ||||  | |||||||||||||| ||| ||||||||||   |||||||||||||||||| || || ||    
T  21881475 agtggcttcaggtctaagagtggtatacaccgttatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtc 21881571  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
     |||   || ||| |||||||||||||||||||    
T  21881572 aatcttgtataaacattactcctaatatttata 21881604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 35930713 - 35930656
Alignment:
Q  203 ctatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||||||||||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35930713 ctatgtagtattctcacggtaggtcaatccaatataaatattactcctaatatttata 35930656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 161
Target Start/End: Original strand, 12006332 - 12006398
Alignment:
Q  95 acaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact 161  Q
    |||||| ||| |||| | |||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12006332 acaaagtacttgacttctacatctagagtacacaatgatttcaggtcgaagggtggaaaacaccact 12006398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 35)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 29 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 21941151 - 21940880
Alignment:
Q  29 atgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacata 128  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941151 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacata 21941052  T
Q  129 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatct 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21941051 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatca 21940952  T
Q  229 atccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940951 atccaatataaatattactcctaatattt--atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 21940880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22171974 - 22171705
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171974 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 22171875  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171874 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 22171775  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatct 299  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171774 aatccaatataaatattactcataatattt--atatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatct 22171705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 6094610 - 6094338
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094610 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacgaacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 6094511  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6094510 agtggtttctggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatatagtattctcatggcggatc 6094411  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094410 aatccaatataaatattactcctaatattt--atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 6094338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 28 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 15326685 - 15326422
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326685 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15326586  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326585 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15326486  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatcca 293  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15326485 aatccaatataaatattactcctaatattt--atatctatgtgaagacttgataactctttctcca 15326422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 28 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 15507054 - 15506791
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15507054 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15506955  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506954 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15506855  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatcca 293  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15506854 aatccaatataaatattactcctaatattt--atatctatgtgaagacttgataactctttctcca 15506791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 24643135 - 24642864
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  24643135 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagaccacgtttgaatggtgacaaaacacttgactccaacatctagggtacat 24643036  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24643035 agtggtttcagttcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataa-ttttactatgtagtattctcatggaggatc 24642937  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642936 aatccaatataaatattactcctaatatt--tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 24642864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 28548534 - 28548393
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548534 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcaccctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 28548435  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctat 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28548434 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactat 28548393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 95 - 298
Target Start/End: Original strand, 14983710 - 14983908
Alignment:
Q  95 acaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatccctatgagaatatcttattacacttttca 193  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| ||| ||    
T  14983710 acaaagtactcgactcttacatctagggtacatagtgatttcaggtcgaaggacggaatacaccacttatcactatgagaataacttatgaca-tttaca 14983808  T
Q  194 taacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatcca 293  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||  || ||||  ||||||||||||||||  | || || ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14983809 taacttt--ctatgtagtattctcatggcgggtcattctaata-taatattactcctaata--tctacatctatgtgaagacttgataacactttttcca 14983903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 143 - 260
Target Start/End: Original strand, 24797224 - 24797340
Alignment:
Q  143 aagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaata 242  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||     
T  24797224 aagggtggaatacaccac-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgggtcaatccagtataaatt 24797322  T
Q  243 ttactcctaatatttata 260  Q
    |||||| |||||||||||    
T  24797323 ttactcataatatttata 24797340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 8371253 - 8371481
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||  |||    
T  8371253 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgatcatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagggatcat 8371351  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| |||  |||||||||  ||||||||||||||||||| || || ||    
T  8371352 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 8371448  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8371449 aatccaatataaatattactcttaatatttata 8371481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 12562425 - 12562196
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  12562425 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 12562327  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  12562326 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 12562230  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12562229 aatccaatataaatattactcctaatatttatat 12562196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 21969635 - 21969406
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  21969635 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 21969537  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  21969536 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 21969440  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21969439 aatccaatataaatattactcctaatatttatat 21969406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 22659494 - 22659722
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  22659494 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 22659592  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  22659593 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 22659689  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
     ||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  22659690 aatccagtatacatattactcctaatatttata 22659722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 25611481 - 25611268
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    |||||||||||||  |||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  25611481 cccatcaaccaacactatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 25611383  T
Q  144 agggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatat 243  Q
    || |||  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||||    
T  25611382 agagtgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacagttt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatat 25611286  T
Q  244 tactcctaatatttatat 261  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25611285 tactcctaatatttatat 25611268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Original strand, 27007533 - 27007746
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  27007533 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 27007631  T
Q  144 agggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatat 243  Q
    || | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || || |||||||| ||||||    
T  27007632 agagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatat 27007728  T
Q  244 tactcctaatatttatat 261  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27007729 tactcctaatatttatat 27007746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Original strand, 27014676 - 27014889
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  27014676 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 27014774  T
Q  144 agggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatat 243  Q
    || | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || || |||||||| ||||||    
T  27014775 agagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatat 27014871  T
Q  244 tactcctaatatttatat 261  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27014872 tactcctaatatttatat 27014889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Original strand, 27880503 - 27880716
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  27880503 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 27880601  T
Q  144 agggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatat 243  Q
    || | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || || |||||||| ||||||    
T  27880602 agagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatat 27880698  T
Q  244 tactcctaatatttatat 261  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27880699 tactcctaatatttatat 27880716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Original strand, 28020684 - 28020897
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  28020684 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 28020782  T
Q  144 agggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatat 243  Q
    || | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || || |||||||| ||||||    
T  28020783 agagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatat 28020879  T
Q  244 tactcctaatatttatat 261  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28020880 tactcctaatatttatat 28020897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Original strand, 22130625 - 22130838
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  22130625 cccatcaaccaacgttattgttatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcca 22130723  T
Q  144 agggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatat 243  Q
    || | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || || |||||||| ||||||    
T  22130724 agagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatat 22130820  T
Q  244 tactcctaatatttatat 261  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22130821 tactcctaatatttatat 22130838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 21916962 - 21916749
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  21916962 cccatcaaccaaagttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 21916864  T
Q  144 agggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatat 243  Q
    || | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  || ||||||||||||||  | || || |||||||| ||||||    
T  21916863 agagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--acaatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatat 21916767  T
Q  244 tactcctaatatttatat 261  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21916766 tactcctaatatttatat 21916749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Original strand, 45534273 - 45534502
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  45534273 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 45534371  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||  | |||||||||||||| |||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  45534372 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 45534468  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
     |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  45534469 aatccaatataaatattacttctaatatttatat 45534502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 6431188 - 6430960
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || |||| |||||||||  |||    
T  6431188 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcat 6431090  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||| |||||||||  || | |  |||||| | ||||  | |||||||||||||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  6431089 agtgatttcaggtcttagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 6430993  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  6430992 tatctagtataaatattactcctaatatttata 6430960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26240786 - 26240558
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| ||||  | ||||| ||||  |||||||| |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  26240786 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacaaacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 26240688  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||| ||||| ||| | |  |||||  |  |||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  26240687 agtggttttaggtctaagagcgatatacattataatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 26240591  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26240590 aatccaatataaatattactcctaatatttata 26240558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 298
Target Start/End: Original strand, 38232095 - 38232365
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 123  Q
    |||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||| | |   |||||| |||||||| | ||||| |||||    
T  38232095 tcataatgattcgtggaactcccatcaaccaactttataaccatcatgtcacggacaacgtttgtacgacaacaaagtactcgacttctacatcaagggt 38232194  T
Q  124 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 222  Q
    ||| |    ||||| |||  ||| |||||||||||||| |||  |||| ||||| | | | ||| ||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||    
T  38232195 acacatcaatttcaagtctgaggatggaatacaccacttatcattatgcgaataacctgtgaca-tttacataacttt--ctatgtagcattctcacggc 38232291  T
Q  223 ggatctatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 298  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | |||||| | ||| |||  || |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  38232292 ggatcaatccaatataaatattacccataatatgtgtatctat--gtcaagactggatcactctttatccatgatc 38232365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 259
Target Start/End: Original strand, 8781959 - 8782102
Alignment:
Q  113 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagta 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||  | |||||||||||||| ||| ||||||||||    |||||||||||    
T  8781959 acatctagggatcatagtggtttcaagtctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--agactatgtagta 8782055  T
Q  213 ttctcatggcggatctatccaatacaaatattactcctaatatttat 259  Q
    |||||| || ||||| ||| | || |||||||| |||||||||||||    
T  8782056 ttctcacggtggatcaatcaagtataaatattagtcctaatatttat 8782102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 135
Target Start/End: Original strand, 24796731 - 24796826
Alignment:
Q  38 ggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 135  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||  | |||| ||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24796731 ggagtacccatcaaccaattttatagccattatattacaga--acgattgaatggtgataaagcactcgactccaacatctagggtatatagtggttt 24796826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 24 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2375528 - 2375411
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||  | ||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  2375528 tcatcataattcatggagcacccatcaaccgactttatagttatccaattgcggatgatgtttgtatagcaacaaagtactcgactcctacatctatggt 2375429  T
Q  124 acatagtggtttcaggtc 141  Q
    | ||| | ||||||||||    
T  2375428 aaataatagtttcaggtc 2375411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18835556 - 18835424
Alignment:
Q  125 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||  |||||||| |||| || || ||||||||||| ||| |||| | ||| |  ||||||||||||||||| || ||    
T  18835556 cataatggtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcactgtgtgaatatcttatgacatttttaa-aacat--actatgtagtattctcacggtgg 18835460  T
Q  225 atctatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
     || ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18835459 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 18835424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 2962932 - 2963164
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || | |||||||||||| |||| || ||||| || | ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| | |||||||  |||    
T  2962932 catgattcatcaagtaaccatcaaccaacgttatggttatccttttgcagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-cgtctagggatcat 2963030  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttt---tcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||| | | ||||  | |||||||||||||| ||| ||    ||||||  | |||||||||||||||||  ||  |    
T  2963031 agtggtttcaggtctaagagggatatacgctattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataa--tgtactatgtagtattctcgcggtag 2963128  T
Q  225 atctatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
     |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  2963129 gtctatccagtataaatattactcctaatatttata 2963164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 190
Target Start/End: Original strand, 20535226 - 20535371
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||| || ||||  || || ||  |||||||||| |||||| |    
T  20535226 cccattaaccaacattatggttatcctgttatagacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtccat-atttaaggatcatagtggttccaggtcta 20535324  T
Q  144 agggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttt 190  Q
    || |||| |||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  20535325 agagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacacttt 20535371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 36970556 - 36970439
Alignment:
Q  23 atcatcatgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctaggg 122  Q
    |||| ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || | ||| ||||  | |||||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||    
T  36970556 atcagcatgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttacccttttacatataacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctaggg 36970458  T
Q  123 tacatagtggtttcaggtc 141  Q
      |||||||||||||||||    
T  36970457 atcatagtggtttcaggtc 36970439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 2375332 - 2375231
Alignment:
Q  192 cataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatc 291  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| | |||| || || |||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||  ||||| | |||||||||| |||||    
T  2375332 cataactttt--tatgtagaattataatggagggtcaatccaatatacatattactcataatatttatatttat--gtgaaaatttgataactcattatc 2375237  T
Q  292 catgat 297  Q
    ||||||    
T  2375236 catgat 2375231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 29645797 - 29645675
Alignment:
Q  55 actttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaata 154  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||| |||||| |   |||||| | | || ||| | ||||||| ||| |||  ||||||||||||| |||| | ||    
T  29645797 actttatagtcatccttttacaaacaacatttgaacgtctacaaagaaattgaatcctatatctaggatacgtagaagtttcaggtcgaatggtgaagta 29645698  T
Q  155 caccactatccctatgagaatat 177  Q
    || ||||||| ||||||||||||    
T  29645697 catcactatcactatgagaatat 29645675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 29645633 - 29645575
Alignment:
Q  236 acaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatga 296  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  29645633 acaaatattactcttaatgtttatatatat--gtgaagagttgataaatctttatgcatga 29645575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 34659118 - 34659053
Alignment:
Q  202 actatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatat 267  Q
    ||||| |||||||  ||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  34659118 actatttagtatttgcatggtggataaatccaatataaatattagtcctaatatatatatatatat 34659053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 7594 - 7322
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7594 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 7495  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7494 agttgtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 7395  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7394 aatccaatataaatattactcctaatattt--atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 7322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 6654 - 6926
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6654 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttatggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 6753  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6754 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 6853  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6854 aatccaatataaatattactcctaatatt--tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 6926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 13670 - 13942
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13670 catgattcatggagtaaccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 13769  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13770 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcggatc 13869  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13870 aatccaatataaatattactcctaatatt--tatatctttgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 13942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 24 - 302
Target Start/End: Original strand, 25706 - 25982
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 123  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25706 tcatcatgatttatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 25805  T
Q  124 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25806 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 25905  T
Q  224 gatctatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25906 gatcaatccaatataaatattactcctaatatt--tatatctatgtgaagtcttgataactctttatccatgatctgtg 25982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 32 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 15152926 - 15152658
Alignment:
Q  32 attcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 131  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152926 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 15152827  T
Q  132 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15152826 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 15152727  T
Q  232 caatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152726 caatataaatattactcctaatattt--atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 15152658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 29328271 - 29327999
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328271 catgattcatggagtacccatcaagcaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 29328172  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328171 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 29328072  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328071 aatccaatataaatattactcctaatattt--atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 29327999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 11535782 - 11536054
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535782 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 11535881  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535882 agtggtttcaggtcgaatgttggaatacatcactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 11535981  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11535982 aatccaatataaatattactcctaatatt--tatatctttgtgaagactggataactctttatccatgatctgtg 11536054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 12751313 - 12751041
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12751313 catgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacct 12751214  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751213 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 12751114  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12751113 aatccaatataaatattactcataatattt--atatctatgagaagaattgataactctttatccatgatctgtg 12751041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 11542700 - 11542972
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11542700 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagacaacgtttgaatggtgacaaatcactcgactccagcatctagggtacat 11542799  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542800 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacatcactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacatttactatgtagtattctcatggcggatc 11542899  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11542900 aatccaatataaatattactcctaatatt--tatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtg 11542972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 12739023 - 12738751
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12739023 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacaaacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactacaacatctagggtacat 12738924  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738923 agtagtttcaggtcgaacggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 12738824  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| ||||||||    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738823 aatccaatataaatattatgagtaatatt--tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 12738751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18561485 - 18561222
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18561485 catgattcgtgcagtacctatcaatcaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaatcactcaactccaacatctagggtacat 18561386  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||         |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  18561385 agtggtttcaagtcgaagggtggaatacaccactatcactat---------ttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagagggtc 18561295  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561294 aatccaatataaatattactcctaatatt--tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18561222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13392637 - 13392369
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  13392637 catgattcatggagtacccatcaaccaattttatagtcatcttgttacaaacaacgtttgtatggtgacaaagcacctgactccaacatctatggtacat 13392538  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||    
T  13392537 agtgattttaggtcaaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataaattttactatgtaatattcgcatggtgggtc 13392438  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 298  Q
     ||||| || ||||||| |||||||||||  |||   |||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  13392437 aatccagtataaatatttctcctaatatt--tattcctatgtgaagacaggataactctttatctatgatc 13392369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 302
Target Start/End: Original strand, 18257559 - 18257834
Alignment:
Q  22 catcatcatgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagg 121  Q
    ||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||  |||||||||| || |||| ||||||||    
T  18257559 catcaacatgattcttcaagtacccatcaaccaactttatagttatcttgttacacacaacgtttgaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagg 18257657  T
Q  122 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatgg 221  Q
    |  ||||||||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||  | |||||||||||||| ||| ||||||| || |  |||||||| |||||| | ||    
T  18257658 gatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacatttttcatgacat--actatgtaatattctgacgg 18257755  T
Q  222 cggatctatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     || |  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18257756 tgggttaatccaatataaatattactcctaatatttatatctat--gtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18257834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 2365407 - 2365176
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | |   |||||| ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  2365407 catgattcgttgagcactcatcaaccgactttatagtcaatctgttacggacgacgtttgtacgacaacaaagtacttgactccaaggtctagggtacat 2365308  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 226  Q
    ||||| || |||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||| ||| ||||||  || |||||||| ||| |||||| || |    
T  2365307 agtggctttaggtcgaatggtgaaatacaccacttatcacaatgagaataacttatgaca-tttacataac--ttcctatgtagcattttcatggtgggt 2365211  T
Q  227 ctatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  2365210 caatccaatgtaaatattactcctaatattgatat 2365176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Original strand, 18139338 - 18139567
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  18139338 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcat 18139436  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  18139437 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 18139533  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18139534 aatccaatacaaatattactcctaatatttatat 18139567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 30254425 - 30254211
Alignment:
Q  43 acccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcg 142  Q
    |||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||| |||     
T  30254425 acccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaagtct 30254327  T
Q  143 aagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaata 242  Q
    ||| ||   |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||    
T  30254326 aagagtaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatacaaata 30254230  T
Q  243 ttactcctaatatttatat 261  Q
    |||||||||||||||||||    
T  30254229 ttactcctaatatttatat 30254211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 2204838 - 2204625
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  2204838 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 2204740  T
Q  144 agggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatat 243  Q
    || | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || || |||||||| ||||||    
T  2204739 agagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatat 2204643  T
Q  244 tactcctaatatttatat 261  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2204642 tactcctaatatttatat 2204625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 8465301 - 8465072
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||| ||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||| ||  |||    
T  8465301 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctaaggatcat 8465203  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  8465202 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 8465106  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8465105 aatccaatataaatattactcctaatatttatat 8465072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18400390 - 18400177
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  18400390 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcca 18400292  T
Q  144 agggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatat 243  Q
    || | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || || |||||||| ||||||    
T  18400291 agagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatat 18400195  T
Q  244 tactcctaatatttatat 261  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18400194 tactcctaatatttatat 18400177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18407374 - 18407161
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  18407374 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcca 18407276  T
Q  144 agggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatat 243  Q
    || | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || || |||||||| ||||||    
T  18407275 agagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatat 18407179  T
Q  244 tactcctaatatttatat 261  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18407178 tactcctaatatttatat 18407161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Original strand, 48808512 - 48808725
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  48808512 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 48808610  T
Q  144 agggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatat 243  Q
    || | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || || |||||||| ||||||    
T  48808611 agagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatat 48808707  T
Q  244 tactcctaatatttatat 261  Q
    ||||||||||||||||||    
T  48808708 tactcctaatatttatat 48808725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 41680968 - 41681196
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || ||| |||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  41680968 catgattcatcaagtaccaatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 41681066  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  41681067 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 41681163  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
     ||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  41681164 aatccagtataaatattactcataatatttata 41681196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 15730053 - 15729824
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  15730053 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 15729955  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||  | |||||||||||||| |||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  15729954 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 15729858  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
     |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  15729857 aatccaatataaatattacttctaatatttatat 15729824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 19231190 - 19230961
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||| |||||  |||    
T  19231190 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catttagggatcat 19231092  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| |||||||| |  ||||||||||||||| || || ||    
T  19231091 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataacttat--tatgtagtattctcacggtgggtc 19230995  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  19230994 aatccagtataaatattactcctaatatttatat 19230961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 260
Target Start/End: Original strand, 47166874 - 47167087
Alignment:
Q  43 acccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcg 142  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||||     
T  47166874 acccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtct 47166972  T
Q  143 aagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaata 242  Q
    ||| | |  |||||| | ||||  | |||||||||||||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||| | || |||||    
T  47166973 aagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtctatctagtataaata 47167069  T
Q  243 ttactcctaatatttata 260  Q
    |||||| |||||||||||    
T  47167070 ttactcataatatttata 47167087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 34128875 - 34128647
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  34128875 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 34128777  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | |||   | |||||||||||||| |||  | |||||||   ||||||||||||||||||    |||||    
T  34128776 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattataattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--gtactatgtagtattctcacaatggatc 34128680  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  34128679 tatccagtataaatattactcctaatatttata 34128647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 18259124 - 18259352
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  18259124 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 18259222  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |  ||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||  | |||||||||||||| |||  | |||||||  |||||||| |||||||||| || || ||    
T  18259223 aagggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgcagtattctcacggtgggtc 18259319  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||||| || ||||||||||   ||||||||||    
T  18259320 tatccagtataaatattactttcaatatttata 18259352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 256
Target Start/End: Original strand, 24443349 - 24443551
Alignment:
Q  50 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 149  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||    | |||||||| || ||| ||||||||||  |||| |||||||| ||| ||| |||    
T  24443349 aaccaacgttatggtcatcctgttacacacaacgtttgaataacaataaagcacttgagtcc-acatctagggatcataatggtttcaagtctaagagtg 24443447  T
Q  150 gaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatattactcc 249  Q
      |||||||| |||| || |||||||| ||||| ||| ||||||||||   |||||||||||| ||||| || || |  ||| | || ||||||||||||    
T  24443448 ttatacaccattatcactgtgagaataacttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtactctcacggtgggttaatctagtataaatattactcc 24443544  T
Q  250 taatatt 256  Q
    |||||||    
T  24443545 taatatt 24443551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 256
Target Start/End: Original strand, 25845498 - 25845700
Alignment:
Q  50 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 149  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||| || || ||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||    
T  25845498 aaccaacgttatagttatctttttacagataaggtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtctaagagtg 25845596  T
Q  150 gaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatattactcc 249  Q
    | ||||| || |||   | |||||||||||||| | | |||||||||| |  ||||||||||||||||| || |  || ||||| || ||||||||||||    
T  25845597 gtatacatcattattattttgagaatatcttatgata-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtgtgtcaatccagtataaatattactcc 25845693  T
Q  250 taatatt 256  Q
    |||||||    
T  25845694 taatatt 25845700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 256
Target Start/End: Original strand, 25845917 - 25846119
Alignment:
Q  50 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 149  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||| || || ||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||    
T  25845917 aaccaacgttatagttatctttttacagataaggtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtctaagagtg 25846015  T
Q  150 gaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatattactcc 249  Q
    | ||||| || |||   | |||||||||||||| | | |||||||||| |  ||||||||||||||||| || |  || ||||| || ||||||||||||    
T  25846016 gtatacatcattattattttgagaatatcttatgata-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtgtgtcaatccagtataaatattactcc 25846112  T
Q  250 taatatt 256  Q
    |||||||    
T  25846113 taatatt 25846119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 10668901 - 10669130
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||| | || |||| ||| || ||  |||    
T  10668901 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcatttgagtcca-catttacggatcat 10668999  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctat-gagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 226  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||  |   ||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |    
T  10669000 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcaattgcgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggt 10669096  T
Q  227 ctatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
    | ||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  10669097 caatctagtataaatattactcctaatatttata 10669130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 28130863 - 28130635
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || ||| ||||||| ||  |||    
T  28130863 catgattcattaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcc-acatctacggatcat 28130765  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||| ||||||||| |||  ||  |||||| | |||   | |||||||||||||| |||  |||||||||   ||||||||| ||||||||  | || ||    
T  28130764 agtgatttcaggtctaagaatgatatacactattattattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatgtaatattctcacagtgggtc 28130668  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
     ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  28130667 aatccagtataaatattactcctgatatttata 28130635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 39112267 - 39112138
Alignment:
Q  47 atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagg 146  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||| |   |||||  ||| || ||| |||||||| |||||||||| ||||| || |||      
T  39112267 atcaaccaactttatagtcaccttattacagacaacgtttgaacgacaacaaaatacttgattcctacatctagagtacatagtgatttcatgttgaata 39112168  T
Q  147 gtggaatacaccactatccctatgagaata 176  Q
     ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  39112167 atggaatacaccactatcactaagagaata 39112138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 260
Target Start/End: Original strand, 19393462 - 19393652
Alignment:
Q  66 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcc 165  Q
    ||||| |||| |||||| || ||| ||| |||||||||| || || |||||||||||  |||| ||| |||||||| ||| |||  |||||| | ||||     
T  19393462 atccttttacagacaacattagaaaggtaacaaagcacttgagtc-aacatctagggatcatactggattcaggtctaagagtgatatacactattatca 19393560  T
Q  166 ctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
     | |||||||||||||| | | |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||  | || ||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  19393561 ttgtgagaatatcttatgaga-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtcggtcaatctagtataaatattactcctaatatttata 19393652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19388774 - 19388626
Alignment:
Q  113 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataactt--ttactatgtag 210  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||| |||||| | || | ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |  |   |||||||    
T  19388774 acatctagggctcataatggtttcaggtctaagagtggtatacactattaccactatgagaatatcttatgacac-tttcataacatactatatatgtag 19388676  T
Q  211 tattctcatggcggatctatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
    ||||||||||   |  | ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19388675 tattctcatgattgggcaatccagtataaatattactcctaatatttata 19388626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 125 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14592056 - 14591924
Alignment:
Q  125 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||  |||||| | ||||  | |||||||||||||| ||| ||||||||||    ||| ||||||||||||| || ||    
T  14592056 catagtggtttcaagtctaagagtgatatacactattatcaatctgagaatatcttatgaca-ttttcataacaa--actgtgtagtattctcacggtgg 14591960  T
Q  225 atctatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
     || ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14591959 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 14591924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 125 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16011647 - 16011515
Alignment:
Q  125 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||||||||||    ||| | |||||||||||||| ||    
T  16011647 catagtggtttcaggtctaagagtgatatacattattatcaatgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacaa--actgtatagtattctcatggtgg 16011551  T
Q  225 atctatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
     || ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16011550 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 16011515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 177
Target Start/End: Original strand, 22948499 - 22948574
Alignment:
Q  102 actcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatat 177  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||  ||| ||||||||    
T  22948499 actcaactcctacatctaaggtacatagcggtttcatgtcgaagggtggcatacacgactattactacgagaatat 22948574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 128 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22969153 - 22969024
Alignment:
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||||  ||||  | |||||||||||||| ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| || || ||    
T  22969153 agtggcttcaggtctaagagtggtatacaccgttatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtgggtc 22969057  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
     |||   || ||| |||||||||||||||||||    
T  22969056 aatcttgtataaacattactcctaatatttata 22969024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 10235474 - 10235377
Alignment:
Q  203 ctatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
    |||||||  |||||||||| |  || |||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||  | ||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  10235474 ctatgtataattctcatggtgagtcaatccgatataaatattattcctaatatttatacatat--gggaacacctgataactctttatcaatgatctgtg 10235377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18774 - 18503
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18774 catgattcatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18676  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18675 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18576  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18575 aatccaatataaatattactcctaatattt--atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 22)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Original strand, 21329968 - 21330240
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329968 catgattcatggagtccccatcaacctactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 21330067  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330068 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 21330167  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330168 aatccaatataaatattactcataatatt--tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 21330240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18796993 - 18796721
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18796993 catgattcatggtgtacccatcaacaaactttatagtcatcctgttacgtacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacat 18796894  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  18796893 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccaccatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagaggatc 18796794  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796793 aatccaatataaatattactcctaatattt--atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18796721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 22 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18620296 - 18620023
Alignment:
Q  22 catcatcatgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagg 121  Q
    ||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||   | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  18620296 catcagcatgattagtggagtacccatcaaccaactttatggtcatcttgttacatacataatgtgaatggtgataaagcactcgactccaacatttagg 18620197  T
Q  122 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatgg 221  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18620196 gtacatagtggtttcaggtcaaagggtgggatacaccaatatcaccatgagaatatcttatgacac-tttcataacttttactatgtagtattctcatgg 18620098  T
Q  222 cggatctatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 298  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18620097 tgggtcaatctagtataaatattactcctaatatt--tatacctatgtgaagacatgataactctttatctatgatc 18620023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 20978360 - 20978091
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||  ||||| | ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||  |||    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  20978360 catgatttgtggagtatccatcaatcgactttatagttatcatgttacggactacgtttatatgacatcaaagtactcgaatcctacatctagggtacat 20978261  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 226  Q
    ||| || ||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||| |||  | || ||  ||||||||||||| |    
T  20978260 agtagtgtcatgtcaaagagtggaatacaccacttatcactacgagaataacttatgaca-ttttcataatttt--ccatataaaattctcatggcgggt 20978164  T
Q  227 ctatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 301  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20978163 caatccaatataaatattactcataataattatatctcg--gtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 20978091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 36270650 - 36270423
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||| | ||  |||||| | |||||||  ||||||||||| |||    
T  36270650 catgattcattgagtacccaacaaccgactttatagtcatcctgttacgaacgacttttgtacggcaacaaagtattcgactcatacatctagggtgcat 36270551  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 226  Q
     ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||  ||| | || |||| |||||  ||| |||||||  ||||||||||||  |    
T  36270550 ggtggttttaggtcgaagggt-gaatacaccacttatcactatgagaatgacttgtgac-ctttacataa--ttttctatgtaacattctcatggcgagt 36270455  T
Q  227 ctatccaatacaaatattactcctaatattta 258  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36270454 caatccaatataaatattactcctaatattta 36270423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29800757 - 29800545
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||| ||||||| ||||  | |||||||||| ||||| |||||||||   | |||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |    
T  29800757 cccattaaccaacattatgattatcctgttacagacaatgtttgaatgacaataaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaagtcta 29800659  T
Q  144 agggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatat 243  Q
    || |||| |||||||| ||||| | |||||||||| | |||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| || ||||||    
T  29800658 agagtggtatacaccattatccttgtgagaatatcatgttacactttt-ataacat--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccagtataaatat 29800562  T
Q  244 tactcctaatatttata 260  Q
    |||||||||||||||||    
T  29800561 tactcctaatatttata 29800545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 260
Target Start/End: Original strand, 6991848 - 6992064
Alignment:
Q  43 acccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaa-gcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtc 141  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||  |  ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  6991848 acccatcaaccgactttatagtcatcgtgtcatagacaacgtttaaacagaaacaaaagtactcgactcctacatctagggaacatagtgatttcaggcc 6991947  T
Q  142 gaagggtggaatacaccac-tatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaa 240  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||  ||| || |||||  ||| ||||||||  |||| |||| ||||| |||||||| |||    
T  6991948 gaagggtggaatacaccacttatcactatgagaatagtttatgtcac-ttacataa--ttttctatgtagcgttcttatggaggatcaatccaatataaa 6992044  T
Q  241 tattactcctaatatttata 260  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  6992045 tattactcctgagatttata 6992064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18822553 - 18822302
Alignment:
Q  43 acccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcg 142  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||  |||   | |||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18822553 acccattaaccaactttatagtcattgtgttacggatgacgtttatatgacaaaaaagtacttgactcctacatctagggtacacagtggtttcaggtcg 18822454  T
Q  143 aagggtggaatacaccac-tatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaat 241  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||  |||   |  |||| |||||| |||  ||||||  | ||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  18822453 aagggtggaatacaccacttatctatatgagaatgacttgaga-tctttacataacgttt--tatgtaacaatctcatggcagatcaatccaatataaat 18822357  T
Q  242 attactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 298  Q
    |||||   |||||||  ||||| |||||||| | |||||||||| ||||| ||||||    
T  18822356 attaccattaatatt--tatatctatgtgaaaagttgataactccttatcaatgatc 18822302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 30174663 - 30174450
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  30174663 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 30174565  T
Q  144 agggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatat 243  Q
    || | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || || |||||||| ||||||    
T  30174564 agagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatat 30174468  T
Q  244 tactcctaatatttatat 261  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30174467 tactcctaatatttatat 30174450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17241167 - 17241034
Alignment:
Q  57 tttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaataca 156  Q
    ||||||| | || ||||||  |||||||||||  ||||| |||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  17241167 tttataggcttcatgttacacacaacgtttgagcggtgataaagtacttgactcctacatctacagtacatagtggttttaggtcgaagg-tgaaataca 17241069  T
Q  157 ccactatccctatgagaatatcttattacactttt 191  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17241068 ccattatcactatgagaatatcttattacactttt 17241034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 302
Target Start/End: Original strand, 22183221 - 22183475
Alignment:
Q  43 acccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcg 142  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||| |     |||||| |||||||||| ||||| || |||||   ||||||||||||     
T  22183221 acccatcaatcgactttatagtcatcctgttacaaacaacgtttgtacaacaacaaagtactcgactcctacatcaagagtacacgttggtttcaggtca 22183320  T
Q  143 aagggtggaatacaccac-tatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaat 241  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | | | ||  ||| |||||| ||   ||||||  ||| ||||||||| || ||||||||  |||    
T  22183321 aagggtggaatacaccacttatcactatgagaatgacctgtgac-ttttacataacatt--atatgtaacattgtcatggcgggtcaatccaata-taat 22183416  T
Q  242 attactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
    ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  22183417 attactcttaatatt--tatatctatgtgaagacttgataactccttatcaaagatctgtg 22183475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Original strand, 24250048 - 24250261
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  24250048 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 24250146  T
Q  144 agggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatat 243  Q
    || | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || || |||||||| ||||||    
T  24250147 agagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatat 24250243  T
Q  244 tactcctaatatttatat 261  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24250244 tactcctaatatttatat 24250261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 260
Target Start/End: Original strand, 15342017 - 15342230
Alignment:
Q  43 acccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcg 142  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||||||||||  ||||  ||||||| |  | |||||| | || | || |||||||||  |||||||||||||||||     
T  15342017 acccattaaccaacgttatggtcatcctgttacaaacaatttttgaattgcaataaagcatttgagttca-catctagggatcatagtggtttcaggtct 15342115  T
Q  143 aagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaata 242  Q
    ||| |||| |||||||||||||  | ||||| |||||||| |||| |||||||||   |||||||||||||| ||| || || |  ||||| || |||||    
T  15342116 aagagtggcatacaccactatcattgtgagactatcttatgacac-tttcataac--atactatgtagtattttcacggtgggttaatccagtataaata 15342212  T
Q  243 ttactcctaatatttata 260  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15342213 ttactcctaatatttata 15342230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 24229215 - 24229443
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||| ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || || | |||||||||  |||    
T  24229215 catgattcatcaagtacccttcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcta-catctagggatcat 24229313  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||| | | ||| | |  |||||| | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  24229314 agtggtttcaaggctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 24229410  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24229411 aatccagtataaatattactcctaatatttata 24229443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 298
Target Start/End: Original strand, 18851980 - 18852047
Alignment:
Q  229 atccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 298  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18851980 atccaatataaatattactcttaatatttatacatatttg--aagacttgataactctttattcatgatc 18852047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19616653 - 19616504
Alignment:
Q  113 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagta 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||  |||||| | |||| || |||||||||| ||| ||| |||||||||    ||||||||||||    
T  19616653 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcatatgaca-ttttcataa--aatactatgtagta 19616557  T
Q  213 ttctcatggcggatctatccaatacaaatattactcctaatatttatatatat 265  Q
    |||||| || || || || ||  | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  19616556 ttctcacggtgggtcaattcagaataaatgttactcctaatatttatacatat 19616504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 175
Target Start/End: Original strand, 36799745 - 36799826
Alignment:
Q  95 acaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatccctatgagaat 175  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  36799745 acaaagtacttgactcctacatctagggcgcatagtggtttcaggtcaaacggtagaatacaccacttatcactatgagaat 36799826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 19279600 - 19279508
Alignment:
Q  203 ctatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgat 297  Q
    |||||| ||||||||||| ||  || |||||||| |||||||||||| ||||  | ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19279600 ctatgtggtattctcatgacgtgtcaatccaatataaatattactccaaata--tctatatctatctgaaaacttgataactttttatccatgat 19279508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 41661761 - 41661694
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtga 95  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| | |||  |||||||||||||||||||    
T  41661761 catgtttcatggagtacccatcaaccaactttatgatcatcttattatagacaacgtttgaatggtga 41661694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 260
Target Start/End: Original strand, 40301034 - 40301164
Alignment:
Q  126 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgga 225  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| ||||| || |||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||| | |  |||||||||||||||||| ||     
T  40301034 atagtggtttcatgtctaagagtggtatacatcattatcactatgagactatcttatgacactt--cataacatgt--tatgtagtattctcatggtggg 40301129  T
Q  226 tctatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
    || |||   || |||||||||| ||||||| ||||    
T  40301130 tcaatctggtataaatattacttctaatatgtata 40301164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 302
Target Start/End: Original strand, 36801905 - 36801974
Alignment:
Q  232 caatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  36801905 caatataaatattacccttaatatttatattt-tatgcgaagacttgataactcattatcaatgatttgtg 36801974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 189
Target Start/End: Original strand, 28740910 - 28740986
Alignment:
Q  113 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacactt 189  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| || |||  ||| |||||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||    
T  28740910 acatctagggatcatagtggtttcagatctaagaatggtatacaccattatcattatgagaatgtcttatgacactt 28740986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 47 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 1461 - 1208
Alignment:
Q  47 atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagg 146  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1461 atcaaccaactttatatttatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagg 1362  T
Q  147 gtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatattac 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  1361 gtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgatacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcagatcaatccaatataaatattac 1262  T
Q  247 tcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
    || ||||||||  |||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1261 tcttaatattt--atatctatggcaagacttgataactttttatccatgatctgtg 1208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 28 - 286
Target Start/End: Original strand, 230111 - 230367
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230111 catgattcatggtgtatccaccaaccaactttattgtcatcttgttacagacaacgtttgaatagtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 230210  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  230211 aatggtttcaggtcgaagggtagaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcagatc 230310  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactct 286  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  230311 aatccaatataaatattactcctaatatt--tatatctatgtgaagacttgataactct 230367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 24 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 6013 - 5744
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 123  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6013 tcatcatgattgatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcacttgactccaacatctagggt 5914  T
Q  124 acatagtggtttcaggtcg-aagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacac-ttttcataacttttactatgtagtattctcatgg 221  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||| ||         ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5913 acatagtggtttcatgtcgaaaggatggaatgca---------ctatgagaatatcttatgacactttttcataacttttactatgtagtattcacatgg 5823  T
Q  222 cggatctatccaatacaaatattactcctaatatttatatatatatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5822 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatt--tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgacctgtg 5744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 43 - 260
Target Start/End: Original strand, 12964 - 13177
Alignment:
Q  43 acccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcg 142  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||||| | || |||| |||||||||  |||||||||||||||||     
T  12964 acccatcaaccaactttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggcaacaaagcaattgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtct 13062  T
Q  143 aagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaata 242  Q
    ||| |||  |||||| | ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||  || |||||    
T  13063 aagagtgatatacactattatcattatgagaatatcttatgacaattt-cataacat--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccggtataaata 13159  T
Q  243 ttactcctaatatttata 260  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13160 ttactcctaatatttata 13177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 485 - 256
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  485 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 387  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  386 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 290  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  289 aatccaatataaatattactcctaatatttatat 256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 67374 - 67602
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  67374 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 67472  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||  | ||||||||||| || |||  | |||||||  ||||||||||||||||||| || || ||    
T  67473 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatctcatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 67569  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  67570 aatccaatataaatattactcctaatatttata 67602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Original strand, 3691 - 3904
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  3691 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 3789  T
Q  144 agggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatat 243  Q
    || | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || || |||||||| ||||||    
T  3790 agagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatat 3886  T
Q  244 tactcctaatatttatat 261  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3887 tactcctaatatttatat 3904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 120016 - 119803
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  120016 cccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtcta 119918  T
Q  144 agggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatat 243  Q
    || | |  |||||  | ||||  | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || || |||||||| ||||||    
T  119917 agagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatat 119821  T
Q  244 tactcctaatatttatat 261  Q
    ||||||||||||||||||    
T  119820 tactcctaatatttatat 119803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26844 - 26616
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||| ||| |||||| | ||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||  ||||   | ||||||||||| |||| ||| |||||  |||    
T  26844 catgattcatcgagtacccattatccaacgttatggttatccttttacagacaacattaaaatgacaataaagcactcgagtcca-catatagggatcat 26746  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||| | |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| || || ||    
T  26745 agtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatatagtattctcaaggtgggtc 26649  T
Q  228 tatccaatacaaatattactcctaatatttata 260  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  26648 aatccagtataaatattactcctaatatttata 26616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 261
Target Start/End: Original strand, 130262 - 130453
Alignment:
Q  66 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcc 165  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||     
T  130262 atccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatca 130360  T
Q  166 ctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
     | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  130361 ttgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatat 130453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 288 - 102
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  ||     
T  288 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcag 190  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctca 218  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||  | |||||||||||||| |||  |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  189 agtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctca 102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 9005 - 8807
Alignment:
Q  56 ctttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatac 155  Q
    ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||   | ||| |||| ||||||| ||| || ||  ||| ||||||||||||| | | |||| ||||    
T  9005 ctttatagttatcatgttacagagaacgtttgaatgacaataaaacacttgactcca-catttaaggatcattgtggtttcaggtctaggagtggtatac 8907  T
Q  156 accactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatattactcctaatat 255  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||   ||||| ||||||||||||| | || || ||| | || ||||||||||||||||||    
T  8906 accattatcactatgagaatatcttatgaca-tcttcataac--atactaagtagtattctcattgggggtcaatctagtataaatattactcctaatat 8810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 169 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 8467 - 8378
Alignment:
Q  169 tgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatattactcctaatatttatat 261  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8467 tgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatat 8378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 260
Target Start/End: Original strand, 40012 - 40216
Alignment:
Q  52 ccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtgga 151  Q
    |||||||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  | |||||||| || ||||  || |||||  ||||||||||||| ||| ||| ||       
T  40012 ccaactttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggaaataaagcacttgagtccat-atttagggatcatagtggtttcaagtctaagagttat 40110  T
Q  152 atacaccactatccctatgagaatatcttattacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatctatccaatacaaatattactccta 251  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||| |  |||||||||||||||||  | || || ||||  || ||||||||||||||    
T  40111 atacaccattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccggtataaatattactccta 40207  T
Q  252 atatttata 260  Q
    |||||||||    
T  40208 atatttata 40216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 265
Target Start/End: Original strand, 11526 - 11763
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  ||     
T  11526 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcaa 11624  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatccctatgagaatatcttattacact---tttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    |||||||||||||| ||| | |   |||||   ||||  | |||||||||||||| ||| |   |  ||||||   ||||||||||||||||||  | ||    
T  11625 agtggtttcaggtctaagagcgatgtacactgttatcattgtgagaatatcttatgacaattaatcacataac--gtactatgtagtattctcacagtgg 11722  T
Q  225 atctatccaatacaaatattactcctaatatttatatatat 265  Q
     |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11723 gtctatccagtataaatattactcctaatatttatacatat 11763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 54066 - 53955
Alignment:
Q  28 catgattcatggagcacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  | |||||||| || ||| ||| ||||||  |||    
T  54066 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatgg-cataaagcacttgagtcc-acacctagggatcat 53969  T
Q  128 agtggtttcaggtc 141  Q
    ||||||||||||||    
T  53968 agtggtttcaggtc 53955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University