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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF2134_low_2 (Length: 446)
Name: NF2134_low_2
Description: NF2134
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF2134_low_2 |
 | |
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Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 405; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 16392338 - 16392769
Alignment:
| Q |
1 |
ttctcttatactgttatatttaaattgcatatacatatatattttatgaggaggatcttttcaaatgatcaatattacagataaataccctctcagtgtt |
100 |
Q |
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| T |
16392338 |
ttctcttatactgttatatttaaattgcatatacatatatattttatgaggaggatattttcaaatgatcaatattacaggtaaatacc---tcagtgtt |
16392434 |
T |
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| Q |
101 |
actaacacgtatggtgctacgaaaatgctgatcaatgctgatatatcccatatcaaaacgttcaaggaaaggcaagtattttaatagcacccatgcatct |
200 |
Q |
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| T |
16392435 |
actaacacgtatggtgctacgaaaatgctgatcaatgctgatatatcccatatcaaaacgttcagggaaaggcaagtattttaatagcacccatgcatct |
16392534 |
T |
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| Q |
201 |
cttacactacaaacatttgttgaatttaatactaattcatctataatactgtgcagcttgcccaagaatgatcagatgatgacccaaagccaagttatgt |
300 |
Q |
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| T |
16392535 |
cttacactacaaacatttgttgaatttaatactaattcatctataatactgtgcagcttgcccaagaatgatcagatgatgacccaaagccaagttatgt |
16392634 |
T |
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| Q |
301 |
gtacacaatcatcagctgggtcgcaatttagtacggatgatgacttgctatctaatccgttaatcatgccactgtctgatattctgcagcttgaacaggt |
400 |
Q |
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| T |
16392635 |
gtacacaatcatcagctgggtcgcaatttagtacggatgatgacttgctatctaatccgttaatcatgccactatctgatattctgcagcttgaacaggt |
16392734 |
T |
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| Q |
401 |
atatattttttcgtaatgttttttgcttatatatt |
435 |
Q |
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| T |
16392735 |
atatattttttcgtaatgttttttgcttatatatt |
16392769 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 379; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 19765017 - 19765451
Alignment:
| Q |
1 |
ttctcttatactgttatatttaaattgcatatacatatatattttatgaggaggatcttttcaaatgatcaatattacagataaataccctctcagtgtt |
100 |
Q |
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| T |
19765017 |
ttctcttatactgttatatttaaattgcatatacatatatattttatgaggaggatcttttcaaatgatcaatattacaggtaaataccctctcagtatt |
19765116 |
T |
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| Q |
101 |
actaacacgtatggtgctacgaaaatgctgatcaatgctgatatatcccatatcaaaacgttcaaggaaaggcaagtattttaatagcacccatgcatct |
200 |
Q |
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| T |
19765117 |
actaacacgtatggtgctacgaaaatgctattcaatgctgatatatcccatatcaaaacgttcagggaaaggcaagtattttaataggacccatgcatct |
19765216 |
T |
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| Q |
201 |
cttacactacaaacatttgttgaatttaatactaattcatctataatactgtgcagcttgcccaagaatgatcagatgatgacccaaagccaagttatgt |
300 |
Q |
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| T |
19765217 |
cttacaacacaaacatgtgttgaatttaatactaattcatctataatactgtgcagtttgcccaagaatgatcagatgatgacccaaagccaagttatgt |
19765316 |
T |
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| Q |
301 |
gtacacaatcatcagctgggtcgcaatttagtacggatgatgacttgctatctaatccgttaatcatgccactgtctgatattctgcagcttgaacaggt |
400 |
Q |
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| T |
19765317 |
gtacacaatcatcagctgggtcgcaatttagtacggatgatgacttgctatctaatccgttaatcatgccactatctgatattctgcaacttgaacaagt |
19765416 |
T |
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| Q |
401 |
atatattttttcgtaatgttttttgcttatatatt |
435 |
Q |
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| T |
19765417 |
atatcttttttcgtaatgttttttgcttatatatt |
19765451 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 14556387 - 14556821
Alignment:
| Q |
1 |
ttctcttatactgttatatttaaattgcatatacatatatattttatgaggaggatcttttcaaatgatcaatattacagataaataccctctcagtgtt |
100 |
Q |
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| T |
14556387 |
ttctcttatactgttatatttaaattgtatatacatatatattttatgaggatgatcttttcaaatgatcaatattacaggtaaataccctctcagtgtt |
14556486 |
T |
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| Q |
101 |
actaacacgtatggtgctacgaaaatgctgatcaatgctgatatatcccatatcaaaacgttcaaggaaaggcaagtattttaatagcacccatgcatct |
200 |
Q |
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| T |
14556487 |
actaacatgtatggtgctacgaaaatgttgatcaatgctgatatatcccatatcaaaacgttcagggaaaggcaagtattttaatagcacccatgcatct |
14556586 |
T |
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| Q |
201 |
cttacactacaaacatttgttgaatttaatactaattcatctataatactgtgcagcttgcccaagaatgatcagatgatgacccaaagccaagttatgt |
300 |
Q |
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14556587 |
cttacaccacaaacatgtgttgaatttaatactaattcatctataatattgtgcagtttgcccaagaatgatcagatgatgacccaaagccaagttatgt |
14556686 |
T |
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| Q |
301 |
gtacacaatcatcagctgggtcgcaatttagtacggatgatgacttgctatctaatccgttaatcatgccactgtctgatattctgcagcttgaacaggt |
400 |
Q |
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| T |
14556687 |
gtacacaatcatcagctgggtcgcaatttagtatggatgatgacttgctatctaatccgttaatcatgccactatctgatattctgtagcttgaacaagt |
14556786 |
T |
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| Q |
401 |
atatattttttcgtaatgttttttgcttatatatt |
435 |
Q |
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14556787 |
atatcttttttcgtaatgttttttgcttatatatt |
14556821 |
T |
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