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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF21366_high_8 (Length: 567)
Name: NF21366_high_8
Description: NF21366
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF21366_high_8 |
 | |
|
Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 4971673 - 4971158
Alignment:
| Q |
17 |
ggttggatgatttgtaggaatttgaagaatatgaaagccaatcaagtaacaacaccgaaaaatcagaacttgatacttatttagatgagttgcggatgcc |
116 |
Q |
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| T |
4971673 |
ggttggatgatttgtaggaatttgaagaatatgaaagccaatcaagtaacaacaccggaaaatcagaacttgatacttatttagatgagttgcggatgcc |
4971574 |
T |
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| Q |
117 |
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216 |
Q |
| |
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|
| T |
4971573 |
tctatctccagaatttgatgtcttagctttttggaaggaaagaagtcgtagaagtccaaatcttgcaaggatggcttgcgatatattgagtattccaata |
4971474 |
T |
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| Q |
217 |
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316 |
Q |
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| T |
4971473 |
acaacggtggcatcagaatctgcgtttagtattggcgcccgagttgtgaataagtatagaagttcaatgaaagatgattctgttcaggctctcttgtgcg |
4971374 |
T |
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| Q |
317 |
cacgtagctggttacatggttttgaaggtatggtttttatagttctatcatttttacaattgatttatattttatattgttgtcaaggttgcaacaattg |
416 |
Q |
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| T |
4971373 |
cacgtagctagttacatggttttgaaggtatgatttttatagttctatcatttttacaattgttttatagtttatattgttgtcaaggttgcaacagttg |
4971274 |
T |
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| Q |
417 |
tgaaagaatctgatatgttgctactcatatgctgatttgttagcctaaagaaataaaaagtagaatcctggaagtgtgtctcaggaaaattaaaatttta |
516 |
Q |
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| T |
4971273 |
tgaaagaatctgatatgttg---------------tttgttagcctaaaaaaataaaaagtagaatcttggaaatgtgtctcaggaaaattaaaacttta |
4971189 |
T |
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| Q |
517 |
gcctacaaaattacaacagcacatggtaaac |
547 |
Q |
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| T |
4971188 |
gcctacaaaattacaacagcacatggtaaac |
4971158 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 4697088 - 4696711
Alignment:
| Q |
17 |
ggttggatgatttgtaggaatttgaagaatatgaaagccaatcaagtaacaacaccgaaaaatcagaacttgatacttatttagatgagttgcggatgcc |
116 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
4697088 |
ggttggatgatttgtaggaatttgaagaatatgaaagccaatcaagtaacaacaccggaaaatcagaacttgatacttatttagatgagttgcggatgcc |
4696989 |
T |
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| Q |
117 |
tctatctccagaatttgatgtcttagctttttggaaggaaagaagtcgtagaagtccaaatcttgcaaggatggcttgcgatatattgagtattccaata |
216 |
Q |
| |
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| T |
4696988 |
tctatctcaagaatttgatgtcttagctttttggaaggaaagaagtcgtagaagtccaaatcttgcaaggatggcttgcgatatattgagtattccaata |
4696889 |
T |
|
| Q |
217 |
acaatggtggcatcagaatctgcgtttagtattggcgcccgaattgtaaataggtataaaagttcaatgaaagatgattctgttcaggctctcttgtgcg |
316 |
Q |
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| T |
4696888 |
acaacggtggcatcagaatctgcgtttagtattggcgcccgagttgtgaataggtatagaagttcaatgaaagatgattctgttcaggctctcttgtgcg |
4696789 |
T |
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| Q |
317 |
cacgtagctggttacatggttttgaaggtatggtttttatagttctatcatttttacaattgatttatattttatattgttgtcaa |
402 |
Q |
| |
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|
|
| T |
4696788 |
cacgtagctggttacatggttttgaaggtat--------tagttctatcatttttacaattgttttatagtttatattattgtcaa |
4696711 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 402
Target Start/End: Original strand, 12748517 - 12748902
Alignment:
| Q |
17 |
ggttggatgatttgtaggaatttgaagaatatgaaagccaatcaagtaacaacaccgaaaaatcagaacttgatacttatttagatgagttgcggatgcc |
116 |
Q |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
12748517 |
ggttggatgatttgtaggaatttgaagaatatgaaagccaatcaagtaacaacaccggaaaatcagaacttgatacttatttagatgagttgcggatgcc |
12748616 |
T |
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| Q |
117 |
tctatctccagaatttgatgtcttagctttttggaaggaaagaagtcgtagaagtccaaatcttgcaaggatggcttgcgatatattgagtattccaata |
216 |
Q |
| |
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|
|
| T |
12748617 |
tctatctcaagaatttgatgtcttagctttttggaaggaaagaagtcgtagaagtccaaatcttgcaaggatggcttgcgatatattgagtattccaata |
12748716 |
T |
|
| Q |
217 |
acaatggtggcatcagaatctgcgtttagtattggcgcccgaattgtaaataggtataaaagttcaatgaaagatgattctgttcaggctctcttgtgcg |
316 |
Q |
| |
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| T |
12748717 |
acaacggtggcatcagaatctgcgtttagtattggcgcccgagttgtgaataggtatagaagttcaatgaaagatgattctgttcaggctctcttgtgcg |
12748816 |
T |
|
| Q |
317 |
cacgtagctggttacatggttttgaaggtatggtttttatagttctatcatttttacaattgatttatattttatattgttgtcaa |
402 |
Q |
| |
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|
| T |
12748817 |
cacgtagctggttacatggttttgaaggtatggtttttatagttctatcatttttacaattgttttatagtttatattattgtcaa |
12748902 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 24 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 24683798 - 24683429
Alignment:
| Q |
24 |
tgatttgtaggaatttgaagaatatgaaagccaatcaagtaacaacaccgaaaaatcagaacttgatacttatttagatgagttgcggatgcctctatct |
123 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
24683798 |
tgatttataggaatttgaagaatatgaaagccaatcgagtaacaacaccgaaaaatctgaacttgatacttatttagatgtgttgcggatgcctcaatct |
24683699 |
T |
|
| Q |
124 |
ccagaatttgatgtcttagctttttggaaggaaagaagtcgtagaagtccaaatcttgcaaggatggcttgcgatatattgagtattccaataacaatgg |
223 |
Q |
| |
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| T |
24683698 |
gcagaatttgatgtcttggctttttggaaggaaagaagtcgtataagtccaaatcctgcaaggatggcttgcaatatattgagtatttccataacaacgg |
24683599 |
T |
|
| Q |
224 |
tggcatcagaatctgcgtttagtattggcgcccgaattgtaaataggtataaaagttcaatgaaagatgattctgttcaggctctcttgtgcgcacgtag |
323 |
Q |
| |
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| T |
24683598 |
tggcatcagaatctacatttagtattggcgcccgagttgtgaataagtatagaaattcaatgaaagatgattttgttcaggctctcaagtgcgcacgtag |
24683499 |
T |
|
| Q |
324 |
ctggttacatggttttgaaggtatggtttttatagttctatcatttttacaattgatttatattttatat |
393 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |
|
|
| T |
24683498 |
ctggttacatggttttgaaggtatgatttttaaagttctatcatttttacaatggttttatagtttatat |
24683429 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 389 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 24683340 - 24683301
Alignment:
| Q |
389 |
tatattgttgtcaaggttgcaacaattgtgaaagaatctg |
428 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
24683340 |
tatatagttgtcaaggttgcaacaattgtgaaagaatctg |
24683301 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 37022858 - 37022814
Alignment:
| Q |
17 |
ggttggatgatttgtaggaatttgaagaatatgaaagccaatcaa |
61 |
Q |
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|||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |
|
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| T |
37022858 |
ggttggatcatttgtaggaatttgaagaataagacagcctatcaa |
37022814 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 349; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 402
Target Start/End: Original strand, 27971274 - 27971658
Alignment:
| Q |
18 |
gttggatgatttgtaggaatttgaagaatatgaaagccaatcaagtaacaacaccgaaaaatcagaacttgatacttatttagatgagttgcggatgcct |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27971274 |
gttggatgatttgtaggaatttgaagaatatgaaagccaatcaagtaacaacaccggaaaatcagaacttgatacttatttagatgagttgcggatgcct |
27971373 |
T |
|
| Q |
118 |
ctatctccagaatttgatgtcttagctttttggaaggaaagaagtcgtagaagtccaaatcttgcaaggatggcttgcgatatattgagtattccaataa |
217 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27971374 |
ctatctcaagaatttgatgtcttagctttttggaaggaaagaagtcgtagaagtccaaatcttgcaaggatggcttgcgatatattgagtattccaataa |
27971473 |
T |
|
| Q |
218 |
caatggtggcatcagaatctgcgtttagtattggcgcccgaattgtaaataggtataaaagttcaatgaaagatgattctgttcaggctctcttgtgcgc |
317 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
27971474 |
caacggtggcatcagaatctgcgtttagtattggcgcccgagttgtgaataggtatagaagttcaatgaaagatgattctgttcaggctctcttgtgcgc |
27971573 |
T |
|
| Q |
318 |
acgtagctggttacatggttttgaaggtatggtttttatagttctatcatttttacaattgatttatattttatattgttgtcaa |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
27971574 |
acgtagctggttacatggttttgaaggtatggtttttatagttctatcatttttacaattgttttatagtttatattattgtcaa |
27971658 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 6885900 - 6885515
Alignment:
| Q |
17 |
ggttggatgatttgtaggaatttgaagaatatgaaagccaatcaagtaacaacaccgaaaaatcagaacttgatacttatttagatgagttgcggatgcc |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6885900 |
ggttggatgatttgtaggaatttgaagagtatgaaagccaatcaagtagcaacaccggaaaatcagaacttgatacttatttagatgagttgcggatgcc |
6885801 |
T |
|
| Q |
117 |
tctatctccagaatttgatgtcttagctttttggaaggaaagaagtcgtagaagtccaaatcttgcaaggatggcttgcgatatattgagtattccaata |
216 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6885800 |
tctatctgcagaatttgatgtcttagctttttggaaggaaagaagtcgtagaagtccaaatcttgcaaggatggcttgcgatatattgagtattccaata |
6885701 |
T |
|
| Q |
217 |
acaatggtggcatcagaatctgcgtttagtattggcgcccgaattgtaaataggtataaaagttcaatgaaagatgattctgttcaggctctcttgtgcg |
316 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6885700 |
acaacggtggcatcagaatctgcgtttagtattggcgcccgagttgtgaataggtatagaagttcaatgaaagatgattctgttcaggctctcttgtgcg |
6885601 |
T |
|
| Q |
317 |
cacgtagctggttacatggttttgaaggtatggtttttatagttctatcatttttacaattgatttatattttatattgttgtcaa |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
6885600 |
cacgtagctggttgcatggttttgaaggtatggtttttatagttctatcatttttacaattgttttatagtttatattattgtcaa |
6885515 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 400
Target Start/End: Original strand, 33984886 - 33985269
Alignment:
| Q |
17 |
ggttggatgatttgtaggaatttgaagaatatgaaagccaatcaagtaacaacaccgaaaaatcagaacttgatacttatttagatgagttgcggatgcc |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33984886 |
ggttggatgatttgtaggaatttgaagaatatgaaagccaatcaagtaataacatcggaaaatcagaacttgatacttatttagatgagttgcggatgcc |
33984985 |
T |
|
| Q |
117 |
tctatctccagaatttgatgtcttagctttttggaaggaaagaagtcgtagaagtccaaatcttgcaaggatggcttgcgatatattgagtattccaata |
216 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33984986 |
tctatcttcagaatttgatgtcttagctttttggaaggaaagaagtcgtagaagtccaaatcttgcaaggatggtttgcgatatattgagtattccaata |
33985085 |
T |
|
| Q |
217 |
acaatggtggcatcagaatctgcgtttagtattggcgcccgaattgtaaataggtataaaagttcaatgaaagatgattctgttcaggctctcttgtgcg |
316 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33985086 |
acaacggtggcatcagaatctgcgtttagtattggcgcccgagttgtgaataggtatataagttcaatgaaagatgattctgttcaggctctcttgtgcg |
33985185 |
T |
|
| Q |
317 |
cacgtagctggttacatggttttgaaggtatggtttttatagttctatcatttttacaattgatttatattttatattgttgtc |
400 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
33985186 |
cacgtaactggttacatggttttgaaggtatggtttttatagttctatcatttttacaattgttttatagtttatattattgtc |
33985269 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 39490520 - 39490135
Alignment:
| Q |
17 |
ggttggatgatttgtaggaatttgaagaatatgaaagccaatcaagtaacaacaccgaaaaatcagaacttgatacttatttagatgagttgcggatgcc |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39490520 |
ggttggatgatttgtaggaatttgaagaatatgaaagccaatcaagtaacagcaccggaaaatcagaacttgatacttatttagatgagttgcggatgcc |
39490421 |
T |
|
| Q |
117 |
tctatctccagaatttgatgtcttagctttttggaaggaaagaagtcgtagaagtccaaatcttgcaaggatggcttgcgatatattgagtattccaata |
216 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39490420 |
tctatctcaagaatttgatgtcttagctttttggaaggaaagaagtcgtagaagtccaaatcttgcaaggatggcttgcgatatattgagtattccaata |
39490321 |
T |
|
| Q |
217 |
acaatggtggcatcagaatctgcgtttagtattggcgcccgaattgtaaataggtataaaagttcaatgaaagatgattctgttcaggctctcttgtgcg |
316 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39490320 |
acaacggtggcatcagaatctgcgtttagtattggcgcccgagttgtgaataggtatagaagttcaatgaaagatgattctgttcaggctctcttgtgcg |
39490221 |
T |
|
| Q |
317 |
cacgtagctggttacatggttttgaaggtatggtttttatagttctatcatttttacaattgatttatattttatattgttgtcaa |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
39490220 |
cacgtagctggttacatggttttgaaggtatggtttttatagttctatcatttttacaattgttttatagtttatattattgtcaa |
39490135 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 333 - 377
Target Start/End: Original strand, 7505396 - 7505440
Alignment:
| Q |
333 |
tggttttgaaggtatggtttttatagttctatcatttttacaatt |
377 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
7505396 |
tggttttgaaggcatggcttttaaagttctatcatttttataatt |
7505440 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 3411172 - 3410787
Alignment:
| Q |
17 |
ggttggatgatttgtaggaatttgaagaatatgaaagccaatcaagtaacaacaccgaaaaatcagaacttgatacttatttagatgagttgcggatgcc |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
3411172 |
ggttggatgatttgtaggaatttgaagaatatgaaagccaatcaagtaacaacaccggaaaatcagaacttgatacttatttagatgagttgtggatgcc |
3411073 |
T |
|
| Q |
117 |
tctatctccagaatttgatgtcttagctttttggaaggaaagaagtcgtagaagtccaaatcttgcaaggatggcttgcgatatattgagtattccaata |
216 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3411072 |
tctatctcaagaatttgatgtcttagctttttggaaggaaagaagtcgtagaagtccaaatcttgcaaggatggcttgcgatatattgagtattccaata |
3410973 |
T |
|
| Q |
217 |
acaatggtggcatcagaatctgcgtttagtattggcgcccgaattgtaaataggtataaaagttcaatgaaagatgattctgttcaggctctcttgtgcg |
316 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3410972 |
acaacggtggcatcagaatctgtgtttagtattggcgcccgagttgtgaataggtatagaagttaaatgaaagatgattatgttcaggctctcttgtgcg |
3410873 |
T |
|
| Q |
317 |
cacgtagctggttacatggttttgaaggtatggtttttatagttctatcatttttacaattgatttatattttatattgttgtcaa |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
3410872 |
cacgtagctggttacatggttttgaaggtatggtttttatagttctatcatttttacaattgttttatagtttatattattgtcaa |
3410787 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 1705043 - 1705014
Alignment:
| Q |
396 |
ttgtcaaggttgcaacaattgtgaaagaat |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1705043 |
ttgtcaaggttgcaacaattgtgaaagaat |
1705014 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 403
Target Start/End: Original strand, 20142360 - 20142746
Alignment:
| Q |
17 |
ggttggatgatttgtaggaatttgaagaatatgaaagccaatcaagtaacaacaccgaaaaatcagaacttgatacttatttagatgagttgcggatgcc |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20142360 |
ggttggatgatttgtaggaatttgaagaatatgaaagccaatcaagtaacaacaccggaaaatcagaacttgatacttatttagatgagttgcggatgcc |
20142459 |
T |
|
| Q |
117 |
tctatctccagaatttgatgtcttagctttttggaaggaaagaagtcgtagaagtccaaatcttgcaaggatggcttgcgatatattgagtattccaata |
216 |
Q |
| |
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||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20142460 |
tctatctccggaatttgatgtcttagctttttggaaggaaagaagtcgcagaagtccaaatcttgcaaggatggcttgcgatatattgagtattccaata |
20142559 |
T |
|
| Q |
217 |
acaatggtggcatcagaatctgcgtttagtattggcgcccgaattgtaaataggtataaaagttcaatgaaagatgattctgttcaggctctcttgtgcg |
316 |
Q |
| |
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|
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| T |
20142560 |
acaacagtggcattagaatctacgtttagtattggcgcccaagttgtgaataggtatagaagttcaatgaaagatgattctgttcaggctctcttgtgcg |
20142659 |
T |
|
| Q |
317 |
cacgtagctggttacatggttttgaaggtatggtttttatagttctatcatttttacaattgatttatattttatattgttgtcaag |
403 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |
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|
| T |
20142660 |
cacatagctggttacatggttttgaaggtatggtttttatagttctatcatttttacaattgttttatagtttatattattgtcaag |
20142746 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22190479 - 22190093
Alignment:
| Q |
17 |
ggttggatgatttgtaggaatttgaagaatatgaaagccaatcaagtaacaacaccgaaaaatcagaacttgatacttatttagatgagttgcggatgcc |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22190479 |
ggttggatgatttgtaggaatttgaagaatatgaaagccaatcaagtaacaacaccggaaaatcagaacttgatacttatttagatgagttgcggatgcc |
22190380 |
T |
|
| Q |
117 |
tctatctccagaatttgatgtcttagctttttggaaggaaagaagtcgtagaagtccaaatcttgcaaggatggcttgcgatatattgagtattccaata |
216 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22190379 |
tctatctcttgaatttgatgtcttagctttttggaaggaaagaagtcgcagaagtccaaatcttgcaaggatggcttgcgatatattgagtattccaata |
22190280 |
T |
|
| Q |
217 |
acaatggtggcatcagaatctgcgtttagtattggcgcccgaattgtaaataggtataaaagttcaatgaaagatgattctgttcaggctctcttgtgcg |
316 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22190279 |
acaacagtggcattagaatctacgtttagtattggcgcccaagttgtgaataggtatagaagttcaatgaaagatgattctgttcaggctctcttgtgcg |
22190180 |
T |
|
| Q |
317 |
cacgtagctggttacatggttttgaaggtatggtttttatagttctatcatttttacaattgatttatattttatattgttgtcaag |
403 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
22190179 |
cacatagctggttacatggttttgaaggtatggtttttatagttctatcatttttacaattgttttatagtttatattattgtcaag |
22190093 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 472 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 29879648 - 29879570
Alignment:
| Q |
472 |
aaaagtagaatcctggaagtgt--gtctcaggaaaattaaaattttagcctacaaaa-ttacaacagcacatggtaaac |
547 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
29879648 |
aaaagtagaatcctggaagcgtttgtcttaggaaaattaaaattttatcctacaaaatttacaacagcacatgataaac |
29879570 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 499
Target Start/End: Original strand, 29354144 - 29354187
Alignment:
| Q |
456 |
ttagcctaaagaaataaaaagtagaatcctggaagtgtgtctca |
499 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
29354144 |
ttagcctatggaaataaaaagtagaatcctggaagtgtgcctca |
29354187 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 333 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 27966700 - 27966656
Alignment:
| Q |
333 |
tggttttgaaggtatggtttttatagttctatcatttttacaatt |
377 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27966700 |
tggttttgaaggcatgacttttaaagttctatcatttttacaatt |
27966656 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 128; Significance: 7e-66; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 36 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 8097564 - 8097229
Alignment:
| Q |
36 |
atttgaagaatatgaaagccaatcaagtaacaacaccgaaaaatcagaacttgatacttatttagatgagttgcggatgcctctatctccagaatttgat |
135 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
8097564 |
atttgaagaatttaaaagccaagtaagtaccaacacccaaaaatatcaacttgatacttatttagatgagttgtagatgcctccattggtggaatttgat |
8097465 |
T |
|
| Q |
136 |
gtcttagctttttggaaggaaagaagtcgtagaagtccaaatcttgcaaggatggcttgcgatatattgagtattccaataacaatggtggcatcagaat |
235 |
Q |
| |
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|||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
8097464 |
atctttgcttattggaaggaaagaagtcgtagaagtcctaatcttacaaggatgacttgcgatatattgagtattccaataacaacggtggcatcagaat |
8097365 |
T |
|
| Q |
236 |
ctgcgtttagtattggcgcccgaattgtaaataggtataaaagttcaatgaaagatgattctgttcaggctctcttgtgcgcacgtagctggttacatgg |
335 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| || |||| ||| ||||||| | ||||||||| |
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|
| T |
8097364 |
atggttttagtattggctctcgagttctgaataagtatagtagttcaatgaaagatgaattggttccatctgtcttttgcacacgtagttagttacatgg |
8097265 |
T |
|
| Q |
336 |
ttttgaaggtatggtttttatagttctatcattttt |
371 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
8097264 |
ttttaaaggtaccatttttaatgttctatcattttt |
8097229 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 393
Target Start/End: Original strand, 12827701 - 12828065
Alignment:
| Q |
34 |
gaatttgaagaatatgaaagccaatcaagtaacaacaccgaaaaatcagaacttgatacttatttagatgagttgcggatgcctctatctccagaatttg |
133 |
Q |
| |
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||||||||||||| ||| || ||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||| |
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|
| T |
12827701 |
gaatttgaagaatttgagagtcaaccaagtaccaacactgaaaaatttgaacttgatacttatttagatgagttgcaaatgcctcagtcgacgaaatttg |
12827800 |
T |
|
| Q |
134 |
atgt----cttagctttttggaaggaaagaagtcgtagaagtccaaatcttgcaaggatggcttgcgatatattgagtattccaataacaatggtggcat |
229 |
Q |
| |
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| T |
12827801 |
atatatatcttggcttattggaacgaaagaagtcgttgaagtcctaatcttgtaaggatggcttgcgatatattgagtatttcaataaaaacagtggcat |
12827900 |
T |
|
| Q |
230 |
cagaatctgcgtttagtattggcgcccgaattgtaaataggtataaaagttcaatgaaagatgattctgttcaggctctcttgtgcgcacgtagctggtt |
329 |
Q |
| |
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|||||| | |||| ||||||| | ||| || |||| |||| |||||| ||||||||| | || ||||| ||||| ||||| ||||||| | ||| |
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| T |
12827901 |
aagaatcggtttttaatattggctctcgagttcggaataagtatgtaagttccatgaaagataaatcagttcaaactctcatgtgcacacgtagttagtt |
12828000 |
T |
|
| Q |
330 |
acatggttttgaaggtatggt-ttttatagttctatcatttttacaattgatttatattttatat |
393 |
Q |
| |
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||||| || ||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |
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|
| T |
12828001 |
acatgattgtgaaggtattttgttttgacgttctatcatttttaaaatggttttatagtttatat |
12828065 |
T |
|
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