View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21372_high_33 (Length: 301)

Name: NF21372_high_33
Description: NF21372
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21372_high_33
NF21372_high_33
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (4-292)||(39507-39795)
scaffold0010 (59-290)||(44656-44887)
scaffold0010 (34-179)||(4870-5015)
scaffold0010 (23-287)||(14271-14535)
[»] chr7 (50 HSPs)
chr7 (4-292)||(26091956-26092244)
chr7 (2-292)||(26115746-26116036)
chr7 (4-292)||(13965826-13966114)
chr7 (4-292)||(40924975-40925263)
chr7 (4-292)||(49155104-49155392)
chr7 (4-290)||(21755217-21755503)
chr7 (4-290)||(12459433-12459719)
chr7 (4-290)||(14283532-14283818)
chr7 (4-290)||(16947630-16947916)
chr7 (4-290)||(14140484-14140770)
chr7 (4-290)||(15343236-15343522)
chr7 (4-290)||(11385587-11385873)
chr7 (4-292)||(13024148-13024435)
chr7 (4-290)||(13676256-13676542)
chr7 (2-290)||(18051109-18051397)
chr7 (4-290)||(12798659-12798945)
chr7 (4-290)||(14261404-14261689)
chr7 (4-290)||(19149816-19150102)
chr7 (4-290)||(20749215-20749501)
chr7 (4-290)||(15099761-15100047)
chr7 (4-290)||(12203958-12204244)
chr7 (23-287)||(14957361-14957625)
chr7 (23-287)||(44788550-44788814)
chr7 (23-287)||(11550301-11550565)
chr7 (23-287)||(14335203-14335467)
chr7 (23-287)||(15146122-15146386)
chr7 (23-287)||(8710412-8710676)
chr7 (23-287)||(13688848-13689112)
chr7 (23-287)||(18180550-18180814)
chr7 (23-292)||(18587370-18587639)
chr7 (23-287)||(11234412-11234676)
chr7 (4-284)||(17703635-17703915)
chr7 (23-287)||(15158256-15158520)
chr7 (19-290)||(15627328-15627599)
chr7 (115-287)||(8200855-8201027)
chr7 (23-235)||(9591223-9591435)
chr7 (23-287)||(12690309-12690572)
chr7 (4-179)||(14042610-14042785)
chr7 (4-179)||(14352640-14352815)
chr7 (133-287)||(10873497-10873651)
chr7 (25-78)||(13459049-13459102)
chr7 (25-77)||(7826917-7826969)
chr7 (25-77)||(27104975-27105027)
chr7 (25-77)||(27173298-27173350)
chr7 (25-70)||(4442951-4442996)
chr7 (23-79)||(16726640-16726696)
chr7 (25-70)||(14207343-14207388)
chr7 (25-70)||(14216033-14216078)
chr7 (34-78)||(38356-38400)
chr7 (242-290)||(16069693-16069741)
[»] chr4 (47 HSPs)
chr4 (4-292)||(3261965-3262253)
chr4 (4-292)||(29450708-29450996)
chr4 (4-292)||(44659037-44659325)
chr4 (4-290)||(11204403-11204689)
chr4 (4-290)||(20892846-20893132)
chr4 (2-290)||(51603961-51604249)
chr4 (4-290)||(15073174-15073460)
chr4 (4-214)||(16150527-16150737)
chr4 (4-214)||(16154673-16154883)
chr4 (4-290)||(27903200-27903486)
chr4 (4-290)||(14993538-14993824)
chr4 (2-178)||(53750639-53750815)
chr4 (76-290)||(15354283-15354497)
chr4 (4-145)||(15266736-15266877)
chr4 (21-287)||(14696919-14697185)
chr4 (23-287)||(18224376-18224640)
chr4 (4-92)||(7357280-7357368)
chr4 (23-287)||(8389230-8389494)
chr4 (23-287)||(12479418-12479682)
chr4 (23-287)||(16233922-16234186)
chr4 (23-287)||(14162288-14162552)
chr4 (23-287)||(14683385-14683649)
chr4 (23-287)||(17092079-17092343)
chr4 (23-287)||(19634954-19635218)
chr4 (23-287)||(23958565-23958829)
chr4 (23-287)||(8050553-8050817)
chr4 (23-287)||(14300909-14301173)
chr4 (23-287)||(19775723-19775987)
chr4 (23-287)||(40475858-40476122)
chr4 (4-179)||(15946-16121)
chr4 (30-239)||(15144829-15145038)
chr4 (23-287)||(27714154-27714418)
chr4 (23-287)||(16250780-16251044)
chr4 (141-290)||(15258742-15258891)
chr4 (4-260)||(16350465-16350721)
chr4 (4-105)||(16219188-16219289)
chr4 (4-105)||(16222508-16222609)
chr4 (23-161)||(13513294-13513432)
chr4 (201-290)||(8708722-8708811)
chr4 (25-77)||(14999674-14999726)
chr4 (25-77)||(15290350-15290402)
chr4 (4-48)||(15354247-15354291)
chr4 (23-71)||(18604749-18604797)
chr4 (25-77)||(12340059-12340111)
chr4 (151-287)||(16219048-16219184)
chr4 (151-287)||(16222368-16222504)
chr4 (34-78)||(18546820-18546864)
[»] chr1 (39 HSPs)
chr1 (4-292)||(48425732-48426020)
chr1 (4-292)||(52988600-52988888)
chr1 (4-292)||(31537240-31537528)
chr1 (4-292)||(37679908-37680196)
chr1 (4-292)||(38910069-38910357)
chr1 (4-290)||(20297242-20297528)
chr1 (4-290)||(24096858-24097144)
chr1 (4-178)||(20074952-20075126)
chr1 (4-290)||(22015988-22016274)
chr1 (7-290)||(19857135-19857418)
chr1 (4-290)||(20833143-20833429)
chr1 (113-292)||(12200377-12200556)
chr1 (4-290)||(21739279-21739565)
chr1 (4-220)||(18710316-18710532)
chr1 (4-290)||(20854003-20854289)
chr1 (4-290)||(21742795-21743081)
chr1 (4-287)||(16378927-16379210)
chr1 (23-287)||(16347857-16348121)
chr1 (23-287)||(51330754-51331018)
chr1 (4-287)||(17042258-17042541)
chr1 (30-260)||(20081645-20081875)
chr1 (23-287)||(21833135-21833399)
chr1 (23-287)||(24785119-24785383)
chr1 (23-287)||(33388291-33388555)
chr1 (4-179)||(21751988-21752163)
chr1 (23-292)||(19109196-19109465)
chr1 (23-260)||(21842072-21842309)
chr1 (30-210)||(22496525-22496705)
chr1 (23-292)||(41350930-41351199)
chr1 (23-152)||(21228818-21228947)
chr1 (25-77)||(20828656-20828708)
chr1 (25-77)||(20928097-20928149)
chr1 (21-65)||(21045384-21045428)
chr1 (34-79)||(22401633-22401678)
chr1 (25-77)||(20528096-20528148)
chr1 (4-43)||(21961135-21961174)
chr1 (28-77)||(41215127-41215176)
chr1 (25-76)||(22133016-22133067)
chr1 (4-59)||(22435976-22436031)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (4-292)||(11651-11939)
[»] chr5 (43 HSPs)
chr5 (4-292)||(25850799-25851087)
chr5 (4-292)||(14884344-14884632)
chr5 (4-292)||(20345009-20345297)
chr5 (4-290)||(22505408-22505694)
chr5 (4-290)||(23078258-23078544)
chr5 (4-290)||(23563521-23563807)
chr5 (2-290)||(17266685-17266973)
chr5 (4-287)||(22464682-22464965)
chr5 (4-290)||(28892295-28892581)
chr5 (4-290)||(20778642-20778928)
chr5 (4-290)||(20824182-20824468)
chr5 (4-290)||(21561378-21561664)
chr5 (4-290)||(21983530-21983816)
chr5 (23-287)||(21882524-21882788)
chr5 (7-176)||(21631755-21631924)
chr5 (23-287)||(16359252-16359516)
chr5 (23-287)||(18781864-18782128)
chr5 (23-287)||(27521156-27521420)
chr5 (23-287)||(27613106-27613370)
chr5 (23-287)||(29473445-29473709)
chr5 (23-287)||(34569244-34569508)
chr5 (23-287)||(40711530-40711794)
chr5 (23-287)||(41773592-41773856)
chr5 (4-287)||(26736080-26736363)
chr5 (23-287)||(14997111-14997375)
chr5 (23-287)||(19772710-19772974)
chr5 (23-287)||(22330259-22330523)
chr5 (23-287)||(27665862-27666126)
chr5 (4-287)||(25429171-25429454)
chr5 (23-287)||(20803347-20803611)
chr5 (23-287)||(22350669-22350933)
chr5 (23-287)||(37288868-37289132)
chr5 (23-287)||(22137418-22137682)
chr5 (23-260)||(27682772-27683009)
chr5 (29-287)||(23473945-23474203)
chr5 (4-105)||(21332339-21332440)
chr5 (115-287)||(21342878-21343050)
chr5 (23-176)||(23460832-23460985)
chr5 (23-125)||(23525963-23526065)
chr5 (25-77)||(23508626-23508678)
chr5 (25-77)||(24584152-24584204)
chr5 (4-79)||(21410092-21410167)
chr5 (132-220)||(20311667-20311755)
[»] chr3 (68 HSPs)
chr3 (4-292)||(10408410-10408698)
chr3 (4-292)||(28756761-28757049)
chr3 (4-292)||(47126386-47126674)
chr3 (4-290)||(12509882-12510168)
chr3 (4-292)||(11958580-11958868)
chr3 (4-290)||(16831927-16832213)
chr3 (7-290)||(16327111-16327394)
chr3 (4-290)||(16378333-16378619)
chr3 (2-292)||(8744787-8745077)
chr3 (4-290)||(12357926-12358212)
chr3 (4-290)||(18131746-18132031)
chr3 (2-290)||(13944468-13944756)
chr3 (4-290)||(17494090-17494377)
chr3 (4-290)||(24189748-24190034)
chr3 (4-290)||(31692584-31692870)
chr3 (4-290)||(12180788-12181074)
chr3 (4-290)||(31941347-31941633)
chr3 (25-290)||(12272782-12273047)
chr3 (4-290)||(14290931-14291217)
chr3 (4-290)||(17188818-17189104)
chr3 (4-180)||(11949324-11949500)
chr3 (4-290)||(16825678-16825966)
chr3 (4-290)||(10417444-10417730)
chr3 (4-290)||(12857894-12858180)
chr3 (4-290)||(15230047-15230333)
chr3 (4-290)||(15235915-15236201)
chr3 (4-157)||(13317933-13318086)
chr3 (81-290)||(14575430-14575639)
chr3 (23-287)||(15065508-15065772)
chr3 (23-287)||(12889146-12889410)
chr3 (23-287)||(13255127-13255391)
chr3 (4-287)||(15262067-15262350)
chr3 (23-260)||(15358547-15358784)
chr3 (23-287)||(10008037-10008301)
chr3 (23-287)||(16638210-16638474)
chr3 (23-287)||(24185627-24185891)
chr3 (23-287)||(43165112-43165376)
chr3 (23-287)||(48427884-48428148)
chr3 (23-292)||(15586821-15587090)
chr3 (23-287)||(10908647-10908911)
chr3 (23-287)||(15399946-15400210)
chr3 (23-287)||(15713485-15713749)
chr3 (23-287)||(20059483-20059747)
chr3 (23-292)||(16754130-16754399)
chr3 (4-179)||(12843513-12843688)
chr3 (23-292)||(53382447-53382716)
chr3 (23-287)||(3688380-3688644)
chr3 (23-287)||(5422359-5422623)
chr3 (23-239)||(14873997-14874213)
chr3 (23-239)||(15345674-15345890)
chr3 (23-287)||(26790842-26791106)
chr3 (23-260)||(6603199-6603436)
chr3 (23-239)||(16694649-16694865)
chr3 (23-287)||(16804376-16804640)
chr3 (4-214)||(15013168-15013378)
chr3 (34-287)||(14578848-14579101)
chr3 (4-74)||(35982841-35982911)
chr3 (199-290)||(13318096-13318187)
chr3 (25-77)||(8271830-8271882)
chr3 (25-77)||(13964786-13964838)
chr3 (25-77)||(30150014-30150066)
chr3 (4-65)||(11861033-11861094)
chr3 (25-77)||(15944026-15944078)
chr3 (115-287)||(17492288-17492460)
chr3 (25-77)||(22150168-22150220)
chr3 (23-79)||(23079446-23079502)
chr3 (25-77)||(6150284-6150336)
chr3 (25-77)||(17201292-17201344)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (4-292)||(41577-41865)
[»] chr8 (41 HSPs)
chr8 (4-292)||(28983790-28984078)
chr8 (4-292)||(28989009-28989297)
chr8 (4-290)||(16268838-16269124)
chr8 (42-292)||(27357415-27357665)
chr8 (4-290)||(22053744-22054030)
chr8 (4-290)||(31414146-31414432)
chr8 (4-290)||(22027894-22028180)
chr8 (4-292)||(29301040-29301328)
chr8 (4-290)||(19985061-19985347)
chr8 (4-290)||(22373750-22374036)
chr8 (4-290)||(21928309-21928595)
chr8 (4-290)||(20390967-20391253)
chr8 (7-287)||(22375071-22375350)
chr8 (23-287)||(19115284-19115548)
chr8 (23-287)||(32603029-32603293)
chr8 (30-260)||(19980878-19981108)
chr8 (26-287)||(22523430-22523691)
chr8 (23-287)||(17671655-17671919)
chr8 (23-287)||(20015896-20016160)
chr8 (4-237)||(22421506-22421739)
chr8 (23-287)||(30310777-30311041)
chr8 (34-260)||(21391505-21391731)
chr8 (34-260)||(21780831-21781057)
chr8 (34-260)||(21785999-21786225)
chr8 (23-284)||(22042714-22042975)
chr8 (23-239)||(18859509-18859725)
chr8 (23-287)||(22126592-22126856)
chr8 (23-239)||(22117808-22118024)
chr8 (23-287)||(22129250-22129514)
chr8 (34-239)||(21253877-21254082)
chr8 (4-287)||(22030987-22031270)
chr8 (4-287)||(22989929-22990212)
chr8 (30-260)||(21164178-21164408)
chr8 (26-287)||(22246069-22246330)
chr8 (30-287)||(15536267-15536524)
chr8 (23-292)||(19481705-19481974)
chr8 (26-237)||(22245651-22245862)
chr8 (25-77)||(20649990-20650042)
chr8 (25-77)||(21847972-21848024)
chr8 (25-77)||(16415180-16415232)
chr8 (25-77)||(22437384-22437436)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (4-290)||(514527-514813)
scaffold0001 (28-237)||(441550-441759)
scaffold0001 (4-287)||(495867-496150)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (4-292)||(29776-30064)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (4-292)||(24367077-24367365)
chr6 (4-290)||(10466164-10466450)
chr6 (4-290)||(19455702-19455988)
chr6 (4-290)||(18797369-18797655)
chr6 (4-290)||(14377232-14377518)
chr6 (4-290)||(21567307-21567593)
chr6 (4-290)||(24515730-24516016)
chr6 (4-290)||(15462015-15462301)
chr6 (4-290)||(19437681-19437967)
chr6 (4-290)||(21474279-21474565)
chr6 (4-166)||(19465971-19466133)
chr6 (4-290)||(25770523-25770809)
chr6 (4-290)||(34642902-34643188)
chr6 (4-290)||(19486610-19486894)
chr6 (23-292)||(5836563-5836832)
chr6 (4-292)||(23081100-23081388)
chr6 (4-287)||(16924956-16925239)
chr6 (4-287)||(18405260-18405543)
chr6 (23-287)||(29589774-29590038)
chr6 (4-290)||(30678340-30678626)
chr6 (23-287)||(2872137-2872401)
chr6 (23-292)||(27190113-27190382)
chr6 (23-292)||(27258858-27259127)
chr6 (23-287)||(16574572-16574836)
chr6 (23-287)||(16620544-16620808)
chr6 (26-237)||(23085163-23085374)
chr6 (30-287)||(22436551-22436808)
chr6 (23-292)||(28260532-28260801)
chr6 (23-292)||(28285115-28285384)
chr6 (23-292)||(28312307-28312576)
chr6 (23-292)||(28339281-28339550)
chr6 (7-183)||(18182686-18182862)
chr6 (55-179)||(20010821-20010945)
chr6 (4-287)||(27559285-27559568)
chr6 (23-287)||(24293117-24293381)
chr6 (30-260)||(19867396-19867626)
chr6 (23-287)||(25115234-25115498)
chr6 (25-77)||(16379710-16379762)
chr6 (25-77)||(16647306-16647358)
chr6 (25-77)||(16100907-16100959)
chr6 (23-71)||(22829721-22829769)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (4-290)||(305-591)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (4-258)||(20848067-20848321)
chr2 (4-290)||(19716728-19717014)
chr2 (4-290)||(23274039-23274325)
chr2 (7-290)||(23097732-23098015)
chr2 (2-290)||(12576799-12577087)
chr2 (4-290)||(23113169-23113455)
chr2 (23-287)||(17001449-17001713)
chr2 (28-237)||(24817575-24817784)
chr2 (23-287)||(11351441-11351705)
chr2 (23-287)||(22323072-22323336)
chr2 (23-287)||(24712483-24712747)
chr2 (23-287)||(27220465-27220729)
chr2 (23-287)||(44383300-44383564)
chr2 (23-287)||(9338031-9338295)
chr2 (23-287)||(9486665-9486929)
chr2 (23-287)||(16983689-16983953)
chr2 (36-287)||(23074312-23074563)
chr2 (25-287)||(24677936-24678198)
chr2 (30-239)||(21323003-21323212)
chr2 (23-287)||(27373718-27373982)
chr2 (23-287)||(10871299-10871563)
chr2 (23-287)||(21142771-21143035)
chr2 (4-239)||(24705193-24705428)
chr2 (34-260)||(23105469-23105695)
chr2 (23-287)||(24657388-24657652)
chr2 (23-287)||(24874480-24874744)
chr2 (4-287)||(22733485-22733768)
chr2 (4-74)||(19721291-19721361)
chr2 (23-260)||(23029191-23029428)
chr2 (36-176)||(23064973-23065113)
chr2 (23-287)||(24264819-24265083)
chr2 (23-287)||(45673742-45674006)
chr2 (30-176)||(22742703-22742849)
chr2 (23-287)||(23204763-23205027)
chr2 (4-79)||(30208631-30208706)
chr2 (25-77)||(22739386-22739438)
chr2 (169-290)||(23279222-23279343)
chr2 (115-287)||(41606209-41606379)
chr2 (4-79)||(19817504-19817579)
chr2 (25-70)||(22280771-22280816)
chr2 (25-70)||(25131275-25131320)
chr2 (23-71)||(23676583-23676631)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (2-290)||(67280-67568)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (4-290)||(8458-8744)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (7-290)||(263070-263353)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (4-290)||(5319-5605)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (4-292)||(65472-65760)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (4-290)||(10821-11107)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (4-290)||(9960-10246)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (4-290)||(21966-22252)
[»] scaffold1530 (1 HSPs)
scaffold1530 (4-290)||(427-713)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (4-290)||(251466-251752)
scaffold0009 (23-71)||(230045-230093)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (4-290)||(30500-30779)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (4-290)||(964-1250)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (4-290)||(14967-15253)
scaffold0074 (7-286)||(5961-6240)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (4-290)||(6882-7168)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (4-290)||(20658-20944)
scaffold0222 (4-290)||(661-947)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (4-290)||(64776-65062)
scaffold0067 (4-290)||(49354-49640)
scaffold0067 (4-290)||(58388-58674)
scaffold0067 (4-290)||(29468-29754)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (7-269)||(203246-203508)
scaffold0003 (23-176)||(424266-424419)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (4-290)||(8-294)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (4-290)||(719-1005)
scaffold0476 (4-287)||(10633-10916)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (4-290)||(9946-10232)
scaffold0243 (4-287)||(24119-24402)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (4-290)||(98757-99043)
scaffold0020 (4-292)||(175830-176117)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (4-290)||(325551-325837)
scaffold0004 (4-290)||(200642-200928)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (4-292)||(36781-37069)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (7-290)||(151411-151694)
scaffold0011 (4-287)||(23707-23990)
scaffold0011 (25-77)||(73792-73844)
scaffold0011 (25-77)||(78173-78225)
scaffold0011 (25-77)||(182047-182099)
scaffold0011 (25-70)||(175708-175753)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (4-290)||(1485-1771)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (4-290)||(5383-5669)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (4-290)||(7588-7874)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (4-290)||(5023-5309)
scaffold0348 (4-292)||(17658-17946)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (4-290)||(1028-1314)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (4-290)||(42542-42828)
scaffold0102 (30-260)||(50545-50775)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (7-290)||(39902-40185)
scaffold0114 (4-236)||(17523-17754)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (4-290)||(11804-12090)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (4-290)||(1057-1343)
[»] scaffold0523 (2 HSPs)
scaffold0523 (7-290)||(2715-2998)
scaffold0523 (4-55)||(11917-11968)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (4-290)||(29371-29657)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (4-290)||(53597-53883)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (4-290)||(63693-63979)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (4-290)||(2126-2413)
scaffold0034 (4-290)||(70216-70502)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (4-290)||(29-315)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (4-290)||(94068-94354)
scaffold0029 (4-290)||(115406-115692)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (4-260)||(12601-12857)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (4-215)||(9401-9612)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (7-290)||(49949-50232)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (4-290)||(1446-1732)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (4-290)||(28459-28745)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (4-290)||(43593-43879)
scaffold0104 (134-290)||(25060-25216)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (4-290)||(53891-54177)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (4-290)||(164575-164861)
scaffold0023 (4-239)||(47157-47391)
scaffold0023 (30-176)||(30774-30920)
scaffold0023 (115-237)||(151978-152100)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (7-292)||(34179-34464)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (4-220)||(989-1205)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (18-290)||(60583-60855)
scaffold0046 (4-163)||(70079-70238)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (4-220)||(5719-5935)
scaffold0035 (199-290)||(5595-5686)
scaffold0035 (4-79)||(41282-41357)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (18-290)||(110454-110726)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (4-290)||(5025-5311)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (12-220)||(20710-20918)
scaffold0261 (12-220)||(12530-12738)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (4-220)||(8636-8852)
scaffold0235 (4-220)||(18850-19066)
[»] scaffold1056 (1 HSPs)
scaffold1056 (4-290)||(1565-1851)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (4-290)||(5446-5732)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (4-290)||(4263-4549)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (4-179)||(6431-6606)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (39-290)||(21695-21946)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (4-176)||(4478-4650)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (39-290)||(49086-49337)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (4-142)||(9195-9333)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (7-290)||(11674-11955)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (85-290)||(25956-26161)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (7-292)||(17720-18005)
scaffold0040 (4-160)||(111081-111237)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (4-292)||(10332-10620)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (7-290)||(4932-5215)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (4-290)||(23472-23758)
scaffold0018 (28-237)||(9549-9758)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (4-123)||(19143-19262)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (111-290)||(3451-3630)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (4-287)||(17240-17523)
scaffold0017 (7-221)||(24219-24433)
scaffold0017 (30-235)||(195038-195243)
[»] scaffold0079 (2 HSPs)
scaffold0079 (4-287)||(36345-36628)
scaffold0079 (244-290)||(3562-3608)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (29-287)||(6720-6978)
scaffold0270 (29-287)||(13850-14108)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (7-183)||(4069-4242)
scaffold0130 (23-260)||(7972-8211)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (26-290)||(15175-15439)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (4-287)||(29102-29385)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (23-287)||(22094-22358)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (26-290)||(26196-26460)
scaffold0042 (30-260)||(37020-37250)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (4-287)||(216594-216877)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (4-287)||(14440-14723)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (4-287)||(13653-13936)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (4-237)||(4331-4564)
scaffold0621 (4-150)||(1-147)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (4-237)||(57788-58021)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (23-287)||(1225-1489)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (23-287)||(10215-10479)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (4-220)||(1913-2129)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (31-287)||(13094-13350)
scaffold0080 (23-287)||(31730-31994)
scaffold0080 (31-287)||(10439-10695)
scaffold0080 (34-287)||(54484-54737)
scaffold0080 (23-287)||(37196-37460)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (23-287)||(17784-18048)
scaffold0028 (23-287)||(11316-11580)
scaffold0028 (23-79)||(55059-55115)
scaffold0028 (142-260)||(53601-53719)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (25-287)||(13931-14193)
scaffold0120 (4-105)||(11293-11394)
scaffold0120 (25-77)||(25235-25287)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (4-108)||(2022-2126)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (23-287)||(8105-8369)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (23-287)||(13317-13581)
scaffold0109 (23-287)||(41002-41266)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (23-287)||(3271-3535)
scaffold0044 (4-287)||(17007-17290)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (4-287)||(8070-8353)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (4-179)||(55644-55819)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (85-292)||(1061-1260)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (23-237)||(2456-2670)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (4-287)||(15269-15540)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (23-208)||(8336-8521)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (30-239)||(34915-35124)
scaffold0022 (4-287)||(41479-41762)
scaffold0022 (4-287)||(75199-75482)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (23-287)||(829-1093)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (4-237)||(1886-2119)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (4-161)||(3524-3681)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (4-287)||(18497-18780)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (34-237)||(24916-25119)
scaffold0218 (25-77)||(1147-1199)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (4-179)||(7913-8088)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (4-179)||(40681-40856)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (24-286)||(674-936)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (4-237)||(552-785)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (26-179)||(4538-4691)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (34-239)||(11084-11289)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (4-69)||(51716-51781)
scaffold0026 (244-290)||(51656-51702)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (23-287)||(11549-11813)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (34-161)||(14884-15011)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (23-260)||(15-252)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (23-176)||(7194-7347)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (26-179)||(104182-104335)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (30-161)||(13-144)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (34-237)||(8847-9047)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (23-260)||(21478-21715)
scaffold0081 (23-260)||(36902-37139)
[»] scaffold1426 (1 HSPs)
scaffold1426 (4-55)||(1781-1832)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (7-86)||(11076-11155)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (58-237)||(21413-21592)
scaffold0100 (4-61)||(16783-16840)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (23-176)||(962-1115)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (119-287)||(12510-12678)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (23-79)||(48720-48776)
[»] scaffold2062 (1 HSPs)
scaffold2062 (4-74)||(1051-1121)
[»] scaffold1517 (1 HSPs)
scaffold1517 (4-50)||(1661-1707)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (25-77)||(5499-5551)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (25-77)||(816-868)
scaffold0467 (25-77)||(13526-13578)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (115-287)||(3448-3620)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (25-77)||(26453-26505)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (25-77)||(35142-35194)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (25-77)||(24020-24072)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (25-77)||(8214-8266)
scaffold0021 (25-77)||(90559-90611)
scaffold0021 (25-77)||(21071-21123)
scaffold0021 (25-77)||(30647-30699)
[»] scaffold2165 (1 HSPs)
scaffold2165 (4-47)||(977-1020)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (4-79)||(15753-15828)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (4-75)||(2923-2994)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (25-77)||(2628-2680)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (25-77)||(7057-7109)
[»] scaffold0605 (2 HSPs)
scaffold0605 (4-50)||(1364-1410)
scaffold0605 (201-290)||(1266-1355)
[»] scaffold2111 (1 HSPs)
scaffold2111 (245-290)||(2-47)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (25-70)||(3563-3608)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (23-64)||(171188-171229)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (25-77)||(4097-4149)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (25-77)||(6199-6251)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (25-77)||(1268-1320)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (25-77)||(5000-5052)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (25-77)||(26833-26885)
scaffold0008 (25-77)||(131684-131736)
[»] scaffold0789 (1 HSPs)
scaffold0789 (23-71)||(1-49)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (25-77)||(15967-16019)


Alignment Details
Target: scaffold0010 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Original strand, 39507 - 39795
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  39507 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 39606  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39607 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 39706  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39707 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatc 39795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 59 - 290
Target Start/End: Original strand, 44656 - 44887
Alignment:
Q  59 gtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 158  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44656 gtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccaactaaggg 44755  T
Q  159 ttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggat 258  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | ||||||||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | ||||| |||||||||    
T  44756 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacaggtatggat 44855  T
Q  259 gttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  44856 gttatttttgggatgaactagttagagtataa 44887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 5015 - 4870
Alignment:
Q  34 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaa 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||| | | | ||  ||||||| || || |    
T  5015 cctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttatttctattgattgtgcttctaagttgggttttgttatgtcaaatatgaatggagaga 4916  T
Q  134 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 179  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  4915 tggttgtcgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgt 4870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14535 - 14271
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | | || || |  | |   |||||| | ||| | |||| |||    
T  14535 ttaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgctttattgctttcgattgcgtttctgctttgggtcttgatttgtctggtat 14436  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  14435 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatttttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 14336  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  14335 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 14271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 50)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Original strand, 26091956 - 26092244
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  26091956 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 26092055  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26092056 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 26092155  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26092156 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatc 26092244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Original strand, 26115746 - 26116036
Alignment:
Q  2 tcatcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagtt 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  26115746 tcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagtt 26115845  T
Q  102 gggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26115846 gggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatct 26115945  T
Q  202 atgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  26115946 atgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtttaatc 26116036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Original strand, 13965826 - 13966114
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13965826 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 13965925  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13965926 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctat 13966025  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13966026 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaattagttagaatataatc 13966114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Original strand, 40924975 - 40925263
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  40924975 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 40925074  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  40925075 gtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatccat 40925174  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  40925175 gtttggtagggattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatataatc 40925263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 49155392 - 49155104
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  49155392 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 49155293  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  49155292 gtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatctat 49155193  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49155192 gtttggtagagattttgtgattgatttggtttgcctgccgttgacgggtatggatgttatttttggtatgaattggttagagtataatc 49155104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21755503 - 21755217
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21755503 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 21755404  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21755403 gtttggatgtatctgatatggaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgaggtgtcctatatctat 21755304  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21755303 gtttggtagagatttcgtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaattggttagagtataa 21755217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12459719 - 12459433
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12459719 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgatgctactaattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 12459620  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |   ||||||  |||||||    
T  12459619 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtccgttatctat 12459520  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12459519 gtttggtagagactttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataa 12459433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 14283532 - 14283818
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14283532 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttcattgctattatagacattggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgg 14283631  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  14283632 gtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactctagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 14283731  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||||||| || | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14283732 gtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataa 14283818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 16947630 - 16947916
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16947630 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 16947729  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||   |||||  | |||||    
T  16947730 gtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctat 16947829  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| |||||  | || ||||||||  || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16947830 gtttggtagagactttgtagtcgacttagtttgcttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataa 16947916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14140770 - 14140484
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| ||||||||||    
T  14140770 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 14140671  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  14140670 gtttgagtgtatctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 14140571  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||| ||| || | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14140570 gtttggtagagattttgaggtagacttagtctgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaaatggttagagtataa 14140484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15343522 - 15343236
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| ||||||||||    
T  15343522 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 15343423  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  15343422 gtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtaaagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 15343323  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||||||| || | |||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15343322 gtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggacattatttttggaatgaattggttagagtataa 15343236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 11385587 - 11385873
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||    
T  11385587 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactgatgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 11385686  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||  ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  11385687 gtctgattgtatttgatatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcaggaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 11385786  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||||||| || | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  11385787 gtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataa 11385873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 13024435 - 13024148
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| ||||||||||    
T  13024435 atcagaggtacttgtttctttaatag-actcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgg 13024337  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||  ||||||  | |||||    
T  13024336 gtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgaggtgtccgttgtctat 13024237  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    ||||||||| |||||| || | || ||||| |||||  | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13024236 gtttggtagggattttttggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgttatttttggtatgaattggttagagtataatc 13024148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13676542 - 13676256
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  13676542 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacgctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 13676443  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||    
T  13676442 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctat 13676343  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||| ||| |  | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13676342 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataa 13676256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 290
Target Start/End: Original strand, 18051109 - 18051397
Alignment:
Q  2 tcatcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagtt 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| |||| |||    
T  18051109 tcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggtt 18051208  T
Q  102 gggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatct 201  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||  |||||| || |||    
T  18051209 gggtttgattgtgtctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctggtttgcttgaggtgtccaatttct 18051308  T
Q  202 atgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||||||||||   | |||||||| ||| |  | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18051309 atgtttggtagagattttgaagtagatttagtgtgtttaccgttgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataa 18051397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 12798659 - 12798945
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  12798659 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgg 12798758  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    ||||   | |||||    
T  12798759 gtctggttgtatctgatatgaaaggaaaaatggttgttgaaactcaagctaagggttcagtaactacttctcttatttgtctaagttgtctgttgtctat 12798858  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | ||| |||| ||| || | ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12798859 gtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataa 12798945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 14261404 - 14261689
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| || || ||||||||||    
T  14261404 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgagcatataagttgg 14261503  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  14261504 gtctggttgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 14261603  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||  |||   | ||| |||| |||||| | ||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14261604 gtttggtagaga-attgaagtcgatctagtatgtctgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataa 14261689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 19150102 - 19149816
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |    
T  19150102 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggttctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttag 19150003  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  19150002 gtctggttgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 19149903  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   |  || |||| ||| || | ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19149902 gtttggtagagactttgaagtcaatctagtatgtttgcctttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataa 19149816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20749501 - 20749215
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |    
T  20749501 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggttctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttag 20749402  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  20749401 gtctggttgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 20749302  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   |  || |||| ||| || | ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20749301 gtttggtagagactttgaagtcaatctagtatgtttgcctttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataa 20749215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 15099761 - 15100047
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  15099761 atcagatgtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgatactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 15099860  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||   | |||||    
T  15099861 gtctagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctat 15099960  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | ||  |||||||| |  | ||||||||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  15099961 gtttggtagagactttgaagtcgacctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttgggatgaactagttagagtataa 15100047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 12203958 - 12204244
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  12203958 atcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgg 12204057  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| | | ||   |||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  12204058 gtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactctagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 12204157  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||||||||    |||| | || ||| ||   || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12204158 gtttggtagagattttgaagatgatcttgtgtgtttgctgttaacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataa 12204244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14957625 - 14957361
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  14957625 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 14957526  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  14957525 gaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 14957426  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||||||||| |||||    
T  14957425 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaattggttggagta 14957361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 44788550 - 44788814
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| ||||||||||    
T  44788550 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatctgatat 44788649  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  44788650 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 44788749  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  44788750 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 44788814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 11550301 - 11550565
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  11550301 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcttttgattgtgtatctgccttgggtcttgatttgtctgatat 11550400  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  11550401 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 11550500  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||| |||||    
T  11550501 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagta 11550565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14335467 - 14335203
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  14335467 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 14335368  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  14335367 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 14335268  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  14335267 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 14335203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 15146122 - 15146386
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||| | | | | || |||||    
T  15146122 ttaatagaacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttgctttgtcggatat 15146221  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||  | | |||||| |||||||||||| |   ||||||| |    
T  15146222 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgttcgaaatgtcctttatctatgtttgatcttgattttgag 15146321  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    |||||| | |||||| |  | ||||  ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||    
T  15146322 attgatatggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatagttggtatgaactggttagagta 15146386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8710676 - 8710412
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  8710676 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 8710577  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  8710576 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 8710477  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  8710476 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 8710412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 13689112 - 13688848
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  13689112 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtgtctgctttgggtcttgatttgtctgatat 13689013  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  13689012 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 13688913  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  13688912 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 13688848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18180814 - 18180550
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  ||||||||||    
T  18180814 ttaataatactcctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttatctgatat 18180715  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  18180714 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 18180615  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  18180614 atggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 18180550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 292
Target Start/End: Original strand, 18587370 - 18587639
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  18587370 ttaataatactcctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 18587469  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  18587470 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 18587569  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  18587570 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatc 18587639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 11234412 - 11234676
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  11234412 ttaataatactcctttagttgctattattaatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttttctgatat 11234511  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  11234512 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 11234611  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  11234612 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 11234676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 284
Target Start/End: Original strand, 17703635 - 17703915
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   ||||    
T  17703635 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 17703734  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||| ||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||    
T  17703735 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagttaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctat 17703834  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttaga 284  Q
    ||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||    
T  17703835 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 17703915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 15158256 - 15158520
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  15158256 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 15158355  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||        
T  15158356 gaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcaaa 15158455  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  15158456 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 15158520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15627599 - 15627328
Alignment:
Q  19 ttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctg 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   |||| |||||   || ||||||| | ||| | ||      
T  15627599 ttctttgatagtactcctttaattactattattgatactggtgatacgcattgttttattgccgttgattgtgctcctatgttgggtcttgatatgtcga 15627500  T
Q  119 atatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattt 218  Q
     |||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||| || || |||||| | || |||||   |||| || |  | ||||||||| |||| ||    
T  15627499 gtatgaatgaggaaatggttttcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctttagtgtgtctaaggtgttctttgccgatgtttggtcgagactt 15627400  T
Q  219 tgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||  ||||||||||||||| ||   ||||  || |||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||    
T  15627399 tgaaattgatttagtttgtttgcatttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttggagtataa 15627328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8201027 - 8200855
Alignment:
Q  115 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagag 214  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |    
T  8201027 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 8200928  T
Q  215 attttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    ||||||  || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  8200927 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 8200855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9591435 - 9591223
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |  | ||||  | |   | |||| | ||| | ||||||||    
T  9591435 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcaattgtgtttctgcttcgggtcttgatttgtctgatat 9591336  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| |||||||||||||| | |||||||      
T  9591335 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgaa 9591236  T
Q  223 attgatttagttt 235  Q
    || ||||||||||    
T  9591235 atggatttagttt 9591223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12690572 - 12690309
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  12690572 ttaataatactcctttagttgctattatt-atactagtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 12690474  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||   | || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  12690473 gagttgagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 12690374  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||| |||||    
T  12690373 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagta 12690309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14042785 - 14042610
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||| | ||  ||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||    
T  14042785 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctattaagttgg 14042686  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 179  Q
    || | | | | ||  |||| || || || |||||||| ||||||| |||||||||||  || || |||||||||||    
T  14042685 gtcttgctatgtcaaatataaatggagagatggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgactacttctcttgt 14042610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14352815 - 14352640
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||| | ||  ||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||    
T  14352815 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctattaagttgg 14352716  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 179  Q
    || | | | | ||  |||| || || || |||||||| ||||||| |||||||||||  || || |||||||||||    
T  14352715 gtcttgctatgtcaaatataaatggagagatggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgactacttctcttgt 14352640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 10873651 - 10873497
Alignment:
Q  133 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttag 232  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || |||||||    
T  10873651 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttag 10873552  T
Q  233 tttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    |||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  10873551 tttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 10873497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 13459102 - 13459049
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttatt 78  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13459102 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatt 13459049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 7826969 - 7826917
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7826969 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 7826917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Original strand, 27104975 - 27105027
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27104975 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 27105027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 27173350 - 27173298
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27173350 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 27173298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 4442996 - 4442951
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcatt 70  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4442996 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 4442951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 79
Target Start/End: Original strand, 16726640 - 16726696
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattg 79  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  16726640 ttaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacacattgctttattg 16726696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 14207388 - 14207343
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcatt 70  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  14207388 aatagtactcctttaattgcaattattaatactggcgctactcatt 14207343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 14216078 - 14216033
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcatt 70  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  14216078 aatagtactcctttaattgcaattattaatactggcgctactcatt 14216033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 78
Target Start/End: Original strand, 38356 - 38400
Alignment:
Q  34 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttatt 78  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||    
T  38356 cctttaattgctattatagatactggagctacgcattcttttatt 38400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 290
Target Start/End: Original strand, 16069693 - 16069741
Alignment:
Q  242 cattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||| ||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16069693 cattgacgtgtatggatgtagtttttgggatgaattggttagagtataa 16069741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 47)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Original strand, 3261965 - 3262253
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  3261965 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 3262064  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3262065 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 3262164  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3262165 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatc 3262253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Original strand, 29450708 - 29450996
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29450708 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 29450807  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29450808 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 29450907  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29450908 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagtataatc 29450996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Original strand, 44659037 - 44659325
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  44659037 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 44659136  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44659137 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 44659236  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  44659237 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtttaatc 44659325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 11204403 - 11204689
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  11204403 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttag 11204502  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  11204503 gtttggatgtatctggtatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctaaatctat 11204602  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11204603 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataa 11204689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20893132 - 20892846
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| ||||||||||    
T  20893132 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 20893033  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  || ||||||||||||    
T  20893032 gtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtatcctatatctat 20892933  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||  || | ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20892932 gtttggtagagattttgtggttgatctagtttgcttgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaactggttagagtataa 20892846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 290
Target Start/End: Original strand, 51603961 - 51604249
Alignment:
Q  2 tcatcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagtt 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||  |    
T  51603961 tcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaact 51604060  T
Q  102 gggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatct 201  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||  |||||| || |||    
T  51604061 gggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttct 51604160  T
Q  202 atgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||||||||||   | || ||||||||| || |  ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  51604161 atgtttggtagagattttgaagtagacttagtttgtttgccgctgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataa 51604249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15073460 - 15073174
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||    
T  15073460 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcacataagttgg 15073361  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
     | ||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||   |||||| | |||||    
T  15073360 ctctggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtcagtttgagttgtcctttgtctat 15073261  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   ||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15073260 gtttggtagagactttgaagttgatcttgtatgtctgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataa 15073174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16150737 - 16150527
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16150737 atcagatgtacttgtttctttaatagtactcctttagttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgg 16150638  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||  | |||||    
T  16150637 gtttggttgtttctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctat 16150538  T
Q  204 gtttggtagag 214  Q
    |||||||||||    
T  16150537 gtttggtagag 16150527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16154883 - 16154673
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16154883 atcagatgtacttgtttctttaatagtactcctttagttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgg 16154784  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||  | |||||    
T  16154783 gtttggttgtgtctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctat 16154684  T
Q  204 gtttggtagag 214  Q
    |||||||||||    
T  16154683 gtttggtagag 16154673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 27903486 - 27903200
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||    
T  27903486 atcagaggtacatgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 27903387  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||  | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |   ||||||  | |||||    
T  27903386 gtctgattatatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctat 27903287  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||| |||||  | |||| ||| ||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  27903286 gtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggaatgaatgttattttagggatgaattggttagagtataa 27903200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 14993538 - 14993824
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  14993538 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctcttcattatttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 14993637  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    |||||  | |||||    
T  14993638 gtctagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcactaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctat 14993737  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||| |||  ||||   | ||  | |||||| |  | |||||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14993738 gtttggtggaggctttgaagtcgaccttgtttgtttaccgttgacgggtatgcatgtgatttttgggatgaactggttagagtataa 14993824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Original strand, 53750639 - 53750815
Alignment:
Q  2 tcatcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagtt 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||  |    
T  53750639 tcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaact 53750738  T
Q  102 gggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttg 178  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  53750739 gggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttg 53750815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 290
Target Start/End: Original strand, 15354283 - 15354497
Alignment:
Q  76 attgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctc 175  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15354283 attgatattgattgtgtatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctacgggttcagtaactacttctc 15354382  T
Q  176 ttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 275  Q
    ||||||||||    ||||   | ||||||||||||||||| |||    | || ||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15354383 ttgtttgtctaagatgtctgttgtctatgtttggtagagactttaaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaa 15354482  T
Q  276 ttggttagagtataa 290  Q
     || |||||||||||    
T  15354483 ctgattagagtataa 15354497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 15266877 - 15266736
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  15266877 atcagaggtagttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtactactcattgtttcattgatgttgattgtgcttataagttgg 15266778  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaa 145  Q
    || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15266777 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaa 15266736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14697185 - 14696919
Alignment:
Q  21 ctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgat 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  ||    
T  14697185 ctttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaat 14697086  T
Q  121 atgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcag-tgtcctatatctatgtttggtagagatttt 219  Q
    ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||  || |||||  | |||||||||||| ||||||||    
T  14697085 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtg-cttaagatgtcccttgtctatgtttggtcgagatttt 14696987  T
Q  220 gtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    |  ||||||||||||||| |  | ||||  || |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  14696986 gaaattgatttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 14696919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 18224376 - 18224640
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  18224376 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 18224475  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  18224476 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 18224575  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  18224576 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgttattttgggtatgaattggttagagta 18224640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 7357368 - 7357280
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgc 92  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7357368 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgc 7357280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8389494 - 8389230
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  8389494 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 8389395  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  8389394 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttcactcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 8389295  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  8389294 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggaatgaactggttagagta 8389230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12479682 - 12479418
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  12479682 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 12479583  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  12479582 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 12479483  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  12479482 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 12479418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 16233922 - 16234186
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  16233922 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 16234021  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  16234022 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 16234121  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  16234122 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 16234186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14162552 - 14162288
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| | |||| ||||| | |||||||| | | | | | ||||||||    
T  14162552 ttaataatactcctttagttgctattattgataccggtgctacgcatagttttattgctcttgattgtgcttctaagttggatcttgctatgtctgatat 14162453  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |   ||||||| | ||||||| || | | |||||||      
T  14162452 gaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtcctttgtctatgtatgatcgtgattttgaa 14162353  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || |||||||||||| |  | ||||  || |||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||    
T  14162352 atggatttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtgattcttggcatgaactggttagagta 14162288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14683649 - 14683385
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  14683649 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 14683550  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  14683549 gaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 14683450  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||   |||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||    
T  14683449 atggatttagtttgtctacctttgagcagtatggatgtgattctgggaatgaattggttggagta 14683385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 17092079 - 17092343
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  17092079 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgccttgggtcttgttttgtctgatat 17092178  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  17092179 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 17092278  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  17092279 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 17092343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 19635218 - 19634954
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  19635218 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 19635119  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||| ||| | |||||||      
T  19635118 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgttcggtcgtgattttgaa 19635019  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  19635018 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 19634954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23958829 - 23958565
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  23958829 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 23958730  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  23958729 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 23958630  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  23958629 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 23958565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 8050553 - 8050817
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  8050553 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 8050652  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | | |||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  8050653 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 8050752  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  8050753 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 8050817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 14300909 - 14301173
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  14300909 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 14301008  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | ||||| |||||| | ||||| |      
T  14301009 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgatttcgaa 14301108  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  14301109 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 14301173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 19775723 - 19775987
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  19775723 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 19775822  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||  | ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  19775823 gaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcatatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 19775922  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  19775923 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 19775987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 40476122 - 40475858
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  40476122 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 40476023  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || ||||| || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  40476022 gaatggagagatggtggtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 40475923  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  40475922 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 40475858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 179
Target Start/End: Original strand, 15946 - 16121
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||   ||||||||    
T  15946 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttattgctattgattgtgctactaagttgg 16045  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 179  Q
    || |   | | ||| ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  16046 gtcttactatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 16121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 239
Target Start/End: Original strand, 15144829 - 15145038
Alignment:
Q  30 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 129  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| ||     
T  15144829 tactcctttagttgctattattgatactggtgctaagcattgttttattgttttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 15144928  T
Q  130 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatt 229  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||    
T  15144929 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacgtctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatt 15145028  T
Q  230 tagtttgtct 239  Q
    ||||||||||    
T  15145029 tagtttgtct 15145038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27714418 - 27714154
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  27714418 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 27714319  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||| | | |||||||||||| | ||||| |      
T  27714318 gaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcttttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 27714219  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  27714218 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 27714154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 16250780 - 16251044
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  16250780 ttaataatactcatttagttgctattattgatactaatgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgccttgggtcttgatttgtctgatat 16250879  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  16250880 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 16250979  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || || ||||||||||||||    
T  16250980 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtataaattggttagagta 16251044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 141 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15258891 - 15258742
Alignment:
Q  141 tgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctg 240  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | ||||||||||||||||| |||||  | ||  | |||||| |     
T  15258891 tgaaactccagctaagagttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgtagtcgaccttgtttgttta 15258792  T
Q  241 tcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
     | ||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||    
T  15258791 ccgttgacgggtatggatgtcattttttggatgaattggttagagtataa 15258742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Original strand, 16350465 - 16350721
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| | | || ||||  | ||  ||||    
T  16350465 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctatgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgg 16350564  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | ||| | || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||    
T  16350565 gtcttgatttgtcggatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctat 16350664  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 260  Q
    || |||| | ||||| |  || ||| ||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  16350665 gtctggtcgtgatttcgaaatggatctagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 16350721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 16219289 - 16219188
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||| | ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  16219289 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacacactgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 16219190  T
Q  104 gt 105  Q
    ||    
T  16219189 gt 16219188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 16222609 - 16222508
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||| | ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  16222609 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacacactgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 16222510  T
Q  104 gt 105  Q
    ||    
T  16222509 gt 16222508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 13513432 - 13513294
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |  | ||||  | |   | |||| | ||| | ||||||||    
T  13513432 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcaattgtgtttctgcttcgggtcttgatttgtctgatat 13513333  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 161  Q
    ||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13513332 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 13513294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 201 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8708811 - 8708722
Alignment:
Q  201 tatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||    
T  8708811 tatgtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgtcgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttggcgtataa 8708722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 14999726 - 14999674
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14999726 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 14999674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Original strand, 15290350 - 15290402
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15290350 aatagtactcctttgattgcaattattgatagtggtgctactcattcttttat 15290402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 48
Target Start/End: Original strand, 15354247 - 15354291
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctatt 48  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15354247 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgatatt 15354291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 71
Target Start/End: Original strand, 18604749 - 18604797
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattg 71  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18604749 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 18604797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Original strand, 12340059 - 12340111
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  12340059 aatagtactcctttgattgcgattattgatattggtcctactcattcttttat 12340111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16219184 - 16219048
Alignment:
Q  151 gctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgg 250  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||||| | |||||||  |||||||| |||||| |  | ||||  |    
T  16219184 gctaagggttcaataactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtg 16219085  T
Q  251 gtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    | |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  16219084 gaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 16219048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16222504 - 16222368
Alignment:
Q  151 gctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgg 250  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||||| | |||||||  |||||||| |||||| |  | ||||  |    
T  16222504 gctaagggttcaataactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtg 16222405  T
Q  251 gtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    | |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  16222404 gaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 16222368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 78
Target Start/End: Original strand, 18546820 - 18546864
Alignment:
Q  34 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttatt 78  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||    
T  18546820 cctttaattgctattatagatactggagctacgcattcttttatt 18546864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 39)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 48426020 - 48425732
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  48426020 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 48425921  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48425920 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 48425821  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48425820 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatc 48425732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 52988888 - 52988600
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  52988888 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 52988789  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52988788 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 52988689  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52988688 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatc 52988600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Original strand, 31537240 - 31537528
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  31537240 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 31537339  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31537340 gtttggatgtgtctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 31537439  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  31537440 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctaccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatataatc 31537528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 37680196 - 37679908
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  37680196 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctattcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 37680097  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37680096 gtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 37679997  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  37679996 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtttaatc 37679908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Original strand, 38910069 - 38910357
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  38910069 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 38910168  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38910169 gtttggatgtatctgatatgaaagggaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 38910268  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38910269 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagtataatc 38910357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20297528 - 20297242
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20297528 atcagaggtactggtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 20297429  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  20297428 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatttat 20297329  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297328 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatctttggaatgaattggttagagtataa 20297242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 24096858 - 24097144
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24096858 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 24096957  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||   |||||  | |||||    
T  24096958 gtttggatgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctat 24097057  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| |||||  | || ||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24097058 gtttggtagagactttgtagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttagaatgaattggttagagtataa 24097144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 178
Target Start/End: Original strand, 20074952 - 20075126
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20074952 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 20075051  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20075052 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 20075126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 22015988 - 22016274
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  22015988 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgatactcattgtttcattgatgttgattgtgcatataagttgg 22016087  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||    
T  22016088 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctat 22016187  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | ||  |||||||| |  | ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22016188 gtttggtagagactttgaagtcgacctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataa 22016274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 19857418 - 19857135
Alignment:
Q  7 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||     
T  19857418 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaactgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgtgcttataagttgggta 19857319  T
Q  107 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtt 206  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||  | ||||||||    
T  19857318 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcctaaggtgtccgttgtctatgtt 19857219  T
Q  207 tggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  19857218 tggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgactggtatggatgatatttttgggatgaacttgttagagtataa 19857135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 20833143 - 20833429
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||    
T  20833143 atcagaggtacttgtttctttaatattattcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgttcttataagttgg 20833242  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||    
T  20833243 gtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagataagggttcattaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctat 20833342  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20833343 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataa 20833429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 113 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 12200556 - 12200377
Alignment:
Q  113 tatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12200556 tatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatctatgtttggtag 12200457  T
Q  213 agattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12200456 agattttgtgattgatttagtgtgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagtataatc 12200377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 21739279 - 21739565
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  21739279 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatttctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 21739378  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  21739379 gtcttgttttatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttttcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 21739478  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | ||| |||| ||| || | ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21739479 gtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataa 21739565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18710532 - 18710316
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||     
T  18710532 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattataaacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgc 18710433  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||    
T  18710432 gtctggttgtatctgatatgagaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctat 18710333  T
Q  204 gtttggtagagattttg 220  Q
    |||||||||||| ||||    
T  18710332 gtttggtagagactttg 18710316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 20854003 - 20854289
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||    
T  20854003 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 20854102  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |   ||||||  | |||||    
T  20854103 gcctaattgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctat 20854202  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||| |||||  | |||  ||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  20854203 gtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttgggaatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataa 20854289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 21742795 - 21743081
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  21742795 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgg 21742894  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||   ||||   | |||||    
T  21742895 gtctgattgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaactacgtctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctat 21742994  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | ||| |||| ||| || | ||| ||||| ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21742995 gtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgtcgggtgtggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataa 21743081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16379210 - 16378927
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||| | || |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  16379210 atcagaggtacatgttactttgatggtactcctttaattgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 16379111  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    ||   | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |    |||||| | |||||    
T  16379110 gtcatgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtttgtttaagatgtcctttgtctat 16379011  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||| |||||| |  | ||||  || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  16379010 gtttggtcgtgattttgagattgatttggtttgtttacctttgagcggaatggatgtaatcctgggtatgaattggttagagta 16378927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 16347857 - 16348121
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  16347857 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 16347956  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  16347957 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 16348056  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  16348057 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 16348121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 51330754 - 51331018
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  51330754 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 51330853  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  51330854 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 51330953  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  51330954 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 51331018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 17042258 - 17042541
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   ||||    
T  17042258 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 17042357  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |  | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||    
T  17042358 gccttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctat 17042457  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    ||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  17042458 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 17042541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 260
Target Start/End: Original strand, 20081645 - 20081875
Alignment:
Q  30 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 129  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| ||     
T  20081645 tactcctttagttgctattattgatactggtactacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 20081744  T
Q  130 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatt 229  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||||| ||| ||||    
T  20081745 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatt 20081844  T
Q  230 tagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 260  Q
    ||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  20081845 tagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 20081875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21833399 - 21833135
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  21833399 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatggctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 21833300  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| |||||||||||||| | |||||        
T  21833299 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtctgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgatttcaaa 21833200  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  21833199 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 21833135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 24785119 - 24785383
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | |   |||||| | | | ||||||||||    
T  24785119 ttaataatactcctttagttgctattattgatacttgtgctacacattgttttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttatctgatat 24785218  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || ||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  24785219 gaatggagagatggtcgttgaaattccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 24785318  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||| | ||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  24785319 atggatctggtttgtctacctttgagcggtatggatgtaattatgggtatgaattggttagagta 24785383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 33388291 - 33388555
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  33388291 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 33388390  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  33388391 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 33388490  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  33388491 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 33388555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21752163 - 21751988
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||    
T  21752163 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 21752064  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 179  Q
    || | | | | ||| ||||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  21752063 gtcttgctatgtctaatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 21751988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 19109465 - 19109196
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    ||| ||||| | |   ||| || | ||| | ||||||||    
T  19109465 ttaataatactcctttagttgctattattgacactggtgctatgcattgttttattgcctatgattgtgcttctgctttgagtcttgatttgtctgatat 19109366  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | ||||||||||||   |||||||      
T  19109365 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcatgattttgaa 19109266  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||    
T  19109265 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaatc 19109196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21842309 - 21842072
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||  | |   || ||| | ||| | ||||||||    
T  21842309 ttaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgtttctgctttaggtcttgatttgtctgatat 21842210  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||| | | |||||||||||| | |||||||      
T  21842209 gaatggagagattgttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcatttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 21842110  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 260  Q
    || ||||||||||||||| | ||||  |||||||||||    
T  21842109 atggatttagtttgtctgcctttgagcggtatggatgt 21842072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 210
Target Start/End: Original strand, 22496525 - 22496705
Alignment:
Q  30 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 129  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| ||     
T  22496525 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctacattgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 22496624  T
Q  130 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggt 210  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | ||||||||||||    
T  22496625 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 22496705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 292
Target Start/End: Original strand, 41350930 - 41351199
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||    
T  41350930 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatat 41351029  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||    |||||||| || ||| || | |||||| | ||||||||| || | |||||||      
T  41351030 gaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgcttacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttagtcgtgattttgaa 41351129  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    || ||||||||||| ||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  41351130 atggatttagtttgcctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatc 41351199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 152
Target Start/End: Original strand, 21228818 - 21228947
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  21228818 ttaatattactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtcttgatttgtctgatat 21228917  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 152  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||    
T  21228918 gaatggagagatggttgtcgaaactccagc 21228947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Original strand, 20828656 - 20828708
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20828656 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 20828708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 20928149 - 20928097
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20928149 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 20928097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 65
Target Start/End: Original strand, 21045384 - 21045428
Alignment:
Q  21 ctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 65  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21045384 ctttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 21045428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 22401678 - 22401633
Alignment:
Q  34 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattg 79  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22401678 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattg 22401633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 20528148 - 20528096
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20528148 aatagtactcctttgattgcaattattgatcctggtgctactcattcttttat 20528096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 21961174 - 21961135
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattg 43  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21961174 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 21961135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 77
Target Start/End: Original strand, 41215127 - 41215176
Alignment:
Q  28 agtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41215127 agtactccttggattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 41215176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 76
Target Start/End: Original strand, 22133016 - 22133067
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttta 76  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  22133016 aatagtaatcctttgattgcaattattgataccggtgctactcattctttta 22133067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 59
Target Start/End: Original strand, 22435976 - 22436031
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactgg 59  Q
    ||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22435976 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactgg 22436031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11939 - 11651
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  11939 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 11840  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11839 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 11740  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11739 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagtataatc 11651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 43)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 25851087 - 25850799
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25851087 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 25850988  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25850987 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaaggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 25850888  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  25850887 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatgaatgttatttttggaatgaattggttagaatataatc 25850799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Original strand, 14884344 - 14884632
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14884344 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 14884443  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14884444 gtttagatgtgtctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 14884543  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  14884544 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtcttccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatataatc 14884632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20345297 - 20345009
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20345297 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 20345198  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  20345197 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatcttt 20345098  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  20345097 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagaatataatc 20345009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22505694 - 22505408
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22505694 atcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 22505595  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22505594 gtttggatgtatctaatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctat 22505495  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||  ||||||||||||| | |||||||||||| |  | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22505494 gtttcatagagattttgtggtggatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaattggttagagtataa 22505408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 23078258 - 23078544
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  23078258 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgcaattgaatgtgcttataagttgg 23078357  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||   |||||  | |||||    
T  23078358 gtttggatgtatctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctat 23078457  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| || ||||| || | ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23078458 gtttggtagagactttgtagttgatctaatttgtttgccgttgtcgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataa 23078544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 23563521 - 23563807
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23563521 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgatattatagaaactggtgctactcaatgtttaattgctattgaatgtgcatataagttgg 23563620  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||| |  | |||||    
T  23563621 gtatggatatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtacgttgtctat 23563720  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23563721 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccattgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataa 23563807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 290
Target Start/End: Original strand, 17266685 - 17266973
Alignment:
Q  2 tcatcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagtt 101  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| |||| |||    
T  17266685 tcatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggtt 17266784  T
Q  102 gggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatct 201  Q
    |||||||  ||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||  |||||| || |||    
T  17266785 gggtttgtttgtgtctaacatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttct 17266884  T
Q  202 atgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||||||||||   | || ||||||||| || | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  17266885 atgtttggtagagattttgaagtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataa 17266973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22464965 - 22464682
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||    
T  22464965 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 22464866  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |   ||||||  | |||||    
T  22464865 gcctaattgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctat 22464766  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||| |||||  | |||  ||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  22464765 gtttggtagagattttgaggtcgacttagtatgtctaccgttgttgggaatggatgttattttcgggatgaattggttagagta 22464682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 28892295 - 28892581
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||    
T  28892295 atcagaggtacttgtttctttaatggtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 28892394  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||   ||||||  | |||||    
T  28892395 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctat 28892494  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||||||||   | || ||||| |||||  | |||  ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  28892495 gtttggtagagattttgaagtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgtcatcttcgggatgaattggttagagtataa 28892581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20778928 - 20778642
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||    
T  20778928 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 20778829  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |  |   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |   ||||||  | |||||    
T  20778828 gcctaattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctat 20778729  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||| |||||  | |||  ||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  20778728 gtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataa 20778642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20824468 - 20824182
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | | || ||||| ||||||||||    
T  20824468 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcatataagttgg 20824369  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |   ||||||  | |||||    
T  20824368 gtctgattatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtttaaggtgtccgttgtctat 20824269  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||| | | | |||||||| |||||  | |||  ||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  20824268 gtttggtagagatttcgaggtcgatttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataa 20824182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 21561378 - 21561664
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |    
T  21561378 atcagaggtacttgtttctttaatagtacttctttaattgctattattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttag 21561477  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| | | ||   |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||   |||||  | |||||    
T  21561478 gtatggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtctat 21561577  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||||||||   ||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  21561578 gtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgccattgacgggtgtggatgtaatctttgggatgaactggttggagtataa 21561664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 21983530 - 21983816
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  21983530 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattactattattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 21983629  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| | | ||   |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||   |||||  | | |||    
T  21983630 gtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtttat 21983729  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||||||||   ||||| |||| ||| || | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  21983730 gtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttggagtataa 21983816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21882788 - 21882524
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||    
T  21882788 ttaataatactcctttagttggtattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgctatgtctgatat 21882689  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||||||| |    
T  21882688 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgag 21882589  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | || |  ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  21882588 atggatttagtttgtctacctttaagcggtatggatgtgattcttggtatgaattggttagagta 21882524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 21631755 - 21631924
Alignment:
Q  7 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 106  Q
    |||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| | ||||||||||     
T  21631755 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattaatactggtgctacgcattgttttattgctgttgattgtgcttctaagttgggtc 21631854  T
Q  107 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 176  Q
    | | | | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  21631855 ttgttatgtcgaatatgaatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21631924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16359516 - 16359252
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  16359516 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 16359417  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  16359416 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 16359317  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  16359316 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 16359252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18782128 - 18781864
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  18782128 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 18782029  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  18782028 gaatggagagatggttgttgaaactccagctaagggttccgtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 18781929  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || |||| |||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  18781928 atggattaagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 18781864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27521420 - 27521156
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  27521420 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttggtttgtctgatat 27521321  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  27521320 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 27521221  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  27521220 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 27521156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27613370 - 27613106
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  27613370 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 27613271  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  27613270 gaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 27613171  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  27613170 atggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 27613106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 29473445 - 29473709
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  29473445 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 29473544  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  29473545 gaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 29473644  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  29473645 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 29473709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 34569508 - 34569244
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  34569508 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 34569409  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  34569408 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 34569309  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  34569308 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 34569244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 40711794 - 40711530
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  40711794 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 40711695  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  40711694 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 40711595  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  40711594 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 40711530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 41773856 - 41773592
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  41773856 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 41773757  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | ||| || | |||||||||||| | |||||||      
T  41773756 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtactttgtctatgtttggtcgcgattttgaa 41773657  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  41773656 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 41773592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 26736080 - 26736363
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| | || |||||    
T  26736080 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttatttctattgattgtgcttctatgttgg 26736179  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | | | | ||  ||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||  || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||    
T  26736180 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggtttggtgactacttctcttgtatgtttaagatgtcctttgtctat 26736279  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    ||||| | | |||||||  |||||||| |||||| |  | ||||  ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  26736280 gtttgatcgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgatccttggaatgaactggttagagta 26736363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 14997111 - 14997375
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  14997111 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgcttttgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 14997210  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  14997211 gaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 14997310  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  14997311 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 14997375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 19772974 - 19772710
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  19772974 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 19772875  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  19772874 gaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 19772775  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  19772774 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgatcctgggtatgaactggttagagta 19772710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 22330259 - 22330523
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  22330259 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 22330358  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  22330359 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 22330458  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  22330459 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 22330523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 27665862 - 27666126
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  27665862 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 27665961  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| ||||||||  |||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  27665962 gaatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 27666061  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  27666062 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 27666126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 25429454 - 25429171
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||   || ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| | |||   ||||||||    
T  25429454 atcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattttgctactaagttgg 25429355  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | | | | | ||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||  | |||||    
T  25429354 gtcttgttatgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcccttgtctat 25429255  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    ||||| | | ||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||    
T  25429254 gtttgatcgtgattttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagta 25429171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20803611 - 20803347
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | ||  |||||| | | | | ||||||||    
T  20803611 ttaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgggtctcgctttgtctgatat 20803512  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  20803511 gaatggaaagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 20803412  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||    
T  20803411 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttggtatgaagtggttagagta 20803347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22350933 - 22350669
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  22350933 ttaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 22350834  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  22350833 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgcgattttgaa 22350734  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  22350733 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 22350669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 37288868 - 37289132
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  37288868 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttttctgatat 37288967  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | ||| |||||||| | ||||| |      
T  37288968 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctttgtttggtcgtgatttcgaa 37289067  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  37289068 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 37289132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22137682 - 22137418
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  22137682 ttaataatactcctttagttgctattattgataatggtgatacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 22137583  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | | |||||||||| | |||||||      
T  22137582 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtttatgtttggtcgtgattttgaa 22137483  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  22137482 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 22137418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 260
Target Start/End: Original strand, 27682772 - 27683009
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | | ||||||    
T  27682772 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtttgatat 27682871  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  27682872 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 27682971  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 260  Q
    || |||||||| |||||  | ||||  |||||||||||    
T  27682972 atggatttagtgtgtctacctttgagcggtatggatgt 27683009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23474203 - 23473945
Alignment:
Q  29 gtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagg 128  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | | |||||||||| ||| | |  |  ||||||| ||    
T  23474203 gtacacctttagttgctattattgataccggtgctacacattgttttattgctattgattgtacttctaagttgggtctggctatgacgaatatgaatgg 23474104  T
Q  129 ggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcag-tgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattga 227  Q
     || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| | | |  || |||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||    
T  23474103 agagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtat-taaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattga 23474005  T
Q  228 tttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
     || |||||| |  | ||||  || ||||| || ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  23474004 cttggtttgtttacctttgagtggaatggacgtaatccttggtatgaactggttagagta 23473945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 105
Target Start/End: Original strand, 21332339 - 21332440
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||| | ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  21332339 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 21332438  T
Q  104 gt 105  Q
    ||    
T  21332439 gt 21332440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 287
Target Start/End: Original strand, 21342878 - 21343050
Alignment:
Q  115 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagag 214  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||| | | |    
T  21342878 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttgatcgtg 21342977  T
Q  215 attttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    ||||||  || |||||||||||| |  ||||||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  21342978 attttgaaatggatttagtttgtataccattgaacggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 21343050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23460985 - 23460832
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  23460985 ttaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacccatgtttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgatttgtctgatat 23460886  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 176  Q
    ||| |  || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  23460885 gaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 23460832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 23526065 - 23525963
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | | || ||||| | || ||||||| | ||| | ||||||||    
T  23526065 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcaacacattgttttattgctttcgattgtgcttctacgttgggtcttgatatgtctgatat 23525966  T
Q  123 gaa 125  Q
    |||    
T  23525965 gaa 23525963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 23508678 - 23508626
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23508678 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 23508626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 24584204 - 24584152
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24584204 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 24584152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 21410167 - 21410092
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattg 79  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21410167 atcagaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactatcatagatactggtgctacatattgttttattg 21410092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20311755 - 20311667
Alignment:
Q  132 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 220  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||| || || |||||||| || ||  || |||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  20311755 aatggttgtcgaaaccccaactaagggttcggtgactacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttg 20311667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 68)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 10408698 - 10408410
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  10408698 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 10408599  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10408598 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtgtgcggtgtcctatatctat 10408499  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10408498 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagtataatc 10408410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 28757049 - 28756761
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28757049 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 28756950  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  28756949 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctacggtgtcctatatctat 28756850  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  28756849 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctaccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatataatc 28756761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 47126674 - 47126386
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  47126674 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 47126575  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47126574 gtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 47126475  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47126474 gtttggtagagattttgtaattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagtataatc 47126386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 12509882 - 12510168
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12509882 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 12509981  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||| ||  ||||| |||||||||    
T  12509982 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagatttcagcaaccacttctctggtttgtttggggtgtcttatatctat 12510081  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  12510082 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaattggttagagtataa 12510168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Original strand, 11958580 - 11958868
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| ||||||||||    
T  11958580 atcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 11958679  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  11958680 gtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 11958779  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  11958780 gtttggtagagactttgtggttgatttagtttgtttgtcgttgtcgggtatggatgttattttcggtatgaattggttagagtataatc 11958868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 16831927 - 16832213
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| ||||||||||    
T  16831927 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 16832026  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  16832027 gtttgattgtatctgatatgaaagaagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 16832126  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||||||| || | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16832127 gtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggacgttatttttggaatgaattggttagagtataa 16832213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 290
Target Start/End: Original strand, 16327111 - 16327394
Alignment:
Q  7 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| |||||||||||||    
T  16327111 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtt 16327210  T
Q  107 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtt 206  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  16327211 tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctatgtt 16327310  T
Q  207 tggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||  || | ||| |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  16327311 tggtagagatttcgtggttgatttagtttgcttgccgttgtcgggaatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataa 16327394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 16378333 - 16378619
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| ||||||||||    
T  16378333 atcagaggtgcttgtttctttaatagtactcctttaattgctatcatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 16378432  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||  |||||| ||||||||    
T  16378433 gtttgattgtatctgatattaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatatctat 16378532  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||||||| || | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16378533 gtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataa 16378619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Original strand, 8744787 - 8745077
Alignment:
Q  2 tcatcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagtt 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| |||| |||    
T  8744787 tcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggtt 8744886  T
Q  102 gggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatct 201  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||  |||||| || |||    
T  8744887 gggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttct 8744986  T
Q  202 atgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    |||||||||||||||||||   | || ||||||||| || |  ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8744987 atgtttggtagagattttgaagtagacttagtttgtttgccgctgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataatc 8745077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 12357926 - 12358212
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  12357926 atcagaggtacttgtttctttaatagtacacctttaattgctattatagacactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 12358025  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||    
T  12358026 gtctggttgtatctgatatgaaaggaaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctat 12358125  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  12358126 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttagcgttgacgggtatggatgttatttttgcgatgaactggttagagtataa 12358212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 18131746 - 18132031
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18131746 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagac-ctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 18131844  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||   | |||||    
T  18131845 gtctggttgtatctgatatgaaaggggaaacggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctat 18131944  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| | ||   | || ||||| ||| |  | |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  18131945 gtttggtagagactatgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggtatggatgttattttttggatgaattggttagagtataa 18132031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13944756 - 13944468
Alignment:
Q  2 tcatcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagtt 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||  |    
T  13944756 tcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaact 13944657  T
Q  102 gggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatct 201  Q
    |||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||  |||||| || |||    
T  13944656 gggtttgattgtgtctgatatggaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctagtttgcttgaggtgtccaatttct 13944557  T
Q  202 atgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||||||||||   | || |||||||||||  | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13944556 atgtttggtagagattttgaagtagacttagtttgtctaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataa 13944468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 17494377 - 17494090
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  17494377 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataaattgg 17494278  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttg-aaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatcta 202  Q
    || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    |||||  | ||||    
T  17494277 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaaactccagctaagggttcagtaactaattctcttgtttgtctaagatgtccgttgtcta 17494178  T
Q  203 tgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17494177 tgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatgtatgttatttttgggatgaactggttagagtataa 17494090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24190034 - 24189748
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||| ||||    
T  24190034 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataaattgg 24189935  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||  ||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  24189934 gtttgattgtatctgatatgaagggagagatggttgttgagactccagctaagggttcagtgactacttttctcgtttgtttgaggtgtcctatatctat 24189835  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||||| | |  |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  24189834 gtttggtagagattttgaggtagacttagtttttttaccgctgacgggaatggatgttatttttggaatgaattggttagaatataa 24189748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 31692584 - 31692870
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  31692584 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagtcgg 31692683  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||  | |||||    
T  31692684 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaacttcagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctat 31692783  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||| ||| |  | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  31692784 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactgattagagtataa 31692870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12181074 - 12180788
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  12181074 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttagttgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 12180975  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     |||||  | |||||    
T  12180974 gtctgtttgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgacactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtccaagatgtccgttgtctat 12180875  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||||| | |  | ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12180874 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttctttaccgttgacgggtatggttgttatctttgggatgaactggttagagtataa 12180788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 31941633 - 31941347
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  31941633 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgatgctactcattttttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 31941534  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||   ||| ||  | |||||    
T  31941533 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtctagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgcccgttgtctat 31941434  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||| ||||| ||||   | || ||||| ||| |  | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31941433 gtttggcagagactttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataa 31941347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12273047 - 12272782
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| | ||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  12273047 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgactatgcatttaagttgggtctggttgtatctgatatga 12272948  T
Q  125 aaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgat 224  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | ||||||||||||||||| ||||   |    
T  12272947 aaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagt 12272848  T
Q  225 tgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
     ||| |||||||| |  | ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12272847 cgatctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataa 12272782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 14290931 - 14291217
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  14290931 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagacactagtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 14291030  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  14291031 gtctggttatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctat 14291130  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | ||| | || ||| || | ||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14291131 gtttggtagagactttgaagtcgatcttgtatgtttgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataa 14291217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 17189104 - 17188818
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||| ||||    
T  17189104 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacacgggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataaattgg 17189005  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||  ||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  17189004 gtttgattgtatctgatatggagggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtttgtttgaggtgtcctatatctat 17188905  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||||||||   | || ||||||||| |     ||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  17188904 gtttggtagagattttgaagtagacttagtttgtttactgctgacgggaatagatgttatttttagaatgaattggttagaatataa 17188818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 180
Target Start/End: Original strand, 11949324 - 11949500
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||    
T  11949324 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtggttataagttgg 11949423  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtt 180  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  11949424 gtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttttcttgtt 11949500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 16825678 - 16825966
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaata--gtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagtt 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||    
T  16825678 atcagaggtacttgtttctttaatatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagtt 16825777  T
Q  102 gggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatct 201  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||  | |||    
T  16825778 gggtctggttgtatctgatatgaaaggataaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtct 16825877  T
Q  202 atgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||  |||||||||| ||||   | ||| | |||||| |  | ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16825878 ataattggtagagactttgaagtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataa 16825966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 10417444 - 10417730
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||| | | || ||||| ||||||||||    
T  10417444 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacaccggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcatataagttgg 10417543  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||   ||||||  | |||||    
T  10417544 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtgactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctat 10417643  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||| | | | || ||||| |||||  | |||  ||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  10417644 gtttggtagagatttcgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataa 10417730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 12857894 - 12858180
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||| | | |  ||||| ||||||||||    
T  12857894 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctagttattgtttcattgctgtggtttgtgcatataagttgg 12857993  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
     | ||| | ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  12857994 ttctggttatatctgatatgaatggagaaacggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 12858093  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||| || ||||   ||||| | || ||| || | |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12858094 gtttggtagtgactttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgatgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataa 12858180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15230333 - 15230047
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | |||| | ||| ||||||||||    
T  15230333 atcataggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctgttgattttgcatataagttgg 15230234  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| | | ||   |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  15230233 gtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 15230134  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||| ||||||||||||   ||||| | || ||| || | || |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  15230133 gttttgtagagattttgaagttgatcttgtatgtttgccgttaacgggtatggatgtaatctttgggatgaactagttagagtataa 15230047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15236201 - 15235915
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | |||| | ||| ||||||||||    
T  15236201 atcataggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctgttgattttgcatataagttgg 15236102  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| | | ||   |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  15236101 gtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 15236002  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||| ||||||||||||   ||||| | || ||| || | || |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  15236001 gttttgtagagattttgaagttgatcttgtatgtttgccgttaacgggtatggatgtaatctttgggatgaactagttagagtataa 15235915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 157
Target Start/End: Original strand, 13317933 - 13318086
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||    
T  13317933 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 13318032  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagg 157  Q
    | |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318033 gcttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 13318086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 81 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14575639 - 14575430
Alignment:
Q  81 tattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtt 180  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14575639 tattgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtt 14575540  T
Q  181 tgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggt 280  Q
    |||||   ||||||  | ||||||||||||||||| ||||   | ||  |||||||| |  | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  14575539 tgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttggaatgaactggt 14575440  T
Q  281 tagagtataa 290  Q
    |||| |||||    
T  14575439 tagattataa 14575430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15065772 - 15065508
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  15065772 ttaataatactcatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttcttctttgggtcttgttttgtctgatat 15065673  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| ||| |||||||||||||||| || || |||||||| |||||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||||| |    
T  15065672 gaatggagagatggttgtcgaatctccagctaagggttcggtgactacttctctcgtttgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgag 15065573  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  15065572 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttggtatgaattggttagagta 15065508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12889410 - 12889146
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  12889410 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 12889311  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  12889310 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 12889211  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  12889210 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 12889146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 13255391 - 13255127
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  13255391 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 13255292  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  13255291 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 13255192  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  13255191 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 13255127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15262350 - 15262067
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||| | ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  15262350 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 15262251  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||    
T  15262250 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaatggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 15262151  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||| |||||| |  | ||||  || |||||||| ||| ||||  |||| |||||||||||    
T  15262150 gtttggtcgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtgtgaactggttagagta 15262067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15358784 - 15358547
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  15358784 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 15358685  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  15358684 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 15358585  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 260  Q
    || ||||||||||||||| | ||||  |||||||||||    
T  15358584 atggatttagtttgtctgcctttgagcggtatggatgt 15358547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 10008301 - 10008037
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  10008301 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 10008202  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  10008201 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgcgatttcgaa 10008102  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  10008101 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 10008037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16638474 - 16638210
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||| ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  16638474 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttttgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 16638375  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  16638374 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 16638275  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  16638274 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 16638210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24185891 - 24185627
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  24185891 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 24185792  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||  || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  24185791 gaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 24185692  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||| |||||    
T  24185691 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagta 24185627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 43165376 - 43165112
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  43165376 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 43165277  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  43165276 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 43165177  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  43165176 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 43165112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 48428148 - 48427884
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  48428148 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 48428049  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  48428048 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 48427949  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  48427948 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 48427884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 292
Target Start/End: Original strand, 15586821 - 15587090
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  15586821 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 15586920  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  15586921 gaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 15587020  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  15587021 atggatttagtttgtctacctttgaatggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatc 15587090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 10908911 - 10908647
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  10908911 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 10908812  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| |  |||| |      
T  10908811 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtcatttcgaa 10908712  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  10908711 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 10908647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 15399946 - 15400210
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  15399946 ttaataatactcctttggttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 15400045  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  15400046 gaatggagagatggttgtcgaaactccagcttagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 15400145  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  15400146 atggatttagtttgtctgcctttgagcggtatggatgtaattctgggtatgaactggttagagta 15400210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 15713485 - 15713749
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  15713485 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 15713584  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  15713585 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 15713684  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  15713685 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 15713749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 20059483 - 20059747
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||    
T  20059483 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatat 20059582  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  20059583 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 20059682  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  20059683 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 20059747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 292
Target Start/End: Original strand, 16754130 - 16754399
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||    
T  16754130 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatat 16754229  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  16754230 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctctgtctatgtttggtcgtgattttgaa 16754329  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  16754330 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatc 16754399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 179
Target Start/End: Original strand, 12843513 - 12843688
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  12843513 atcagaggtacttgttattttgatagtatacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 12843612  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 179  Q
     | | | | | ||  ||||||| || || ||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  12843613 atcttgctatgtcaaatatgaatggagagatgattgttgaaactccagctaatggttcagtgactacttctcttgt 12843688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 292
Target Start/End: Original strand, 53382447 - 53382716
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||    
T  53382447 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatat 53382546  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || ||| |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  53382547 gaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 53382646  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||    
T  53382647 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttggagtacaatc 53382716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3688644 - 3688380
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |   || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  3688644 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttccgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 3688545  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  3688544 gaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 3688445  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||| ||||    
T  3688444 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttacagta 3688380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 5422359 - 5422623
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || || |  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  5422359 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgcgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 5422458  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| ||||||||  |||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||| | | |||||||||||| | |||||||      
T  5422459 gaatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcttttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 5422558  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  5422559 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 5422623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 239
Target Start/End: Original strand, 14873997 - 14874213
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | ||| | ||| ||||    
T  14873997 ttaataatactcctttagttgctattattgatattggtgcaacacattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgatatgtctaatat 14874096  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || |  || || | |||||||||||| | ||||||| |    
T  14874097 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaaagttctttgtctatgtttggtcgtgattttgag 14874196  T
Q  223 attgatttagtttgtct 239  Q
    || ||||||||||||||    
T  14874197 atggatttagtttgtct 14874213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 239
Target Start/End: Original strand, 15345674 - 15345890
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  15345674 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 15345773  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  15345774 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 15345873  T
Q  223 attgatttagtttgtct 239  Q
    || ||||||||||||||    
T  15345874 atggatttagtttgtct 15345890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 26790842 - 26791106
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  |     |||||| | ||| | ||||||||    
T  26790842 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgttttcgattgtgtttccgctttgggtcttgatttgtctgatat 26790941  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  26790942 gaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 26791041  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  26791042 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 26791106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 6603436 - 6603199
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||    
T  6603436 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacccattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatat 6603337  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || ||||||||  ||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  6603336 gaatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 6603237  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 260  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  6603236 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 6603199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16694865 - 16694649
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |  ||||||| | ||| | ||||||||    
T  16694865 ttaataatactcccttagttgttattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgcgttgggtcttgatttgtctgatat 16694766  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  16694765 gaatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttctgtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 16694666  T
Q  223 attgatttagtttgtct 239  Q
    || ||||||||||||||    
T  16694665 atggatttagtttgtct 16694649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 16804376 - 16804640
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | | ||||||    
T  16804376 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtttgatat 16804475  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| || ||  |||  |||| | | |||||||||||| | |||||||      
T  16804476 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgcttgcgatgtcttctgtctatgtttggtcgtgattttgaa 16804575  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  16804576 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 16804640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 214
Target Start/End: Original strand, 15013168 - 15013378
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||| |||| |||||||| |  ||| |||||   ||||||||    
T  15013168 atcagaggtacatgtttcattaatagcactcctttaattactattatagatactagtgttacacatttttttattgttgctgattgtgctactaagttgg 15013267  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | | | | ||   |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| || ||  || |||||||| | || ||    
T  15013268 gtcttgttatgtcgtctatgaatggggaaatggttgtcgaaaccccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgat 15013367  T
Q  204 gtttggtagag 214  Q
    |||||||||||    
T  15013368 gtttggtagag 15013378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Original strand, 14578848 - 14579101
Alignment:
Q  34 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaa 133  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||| |     | ||  ||||||| || || |    
T  14578848 cctttagttactattattgatcctagtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttcccatgtcaaatatgaatggagaga 14578947  T
Q  134 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagt 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||| |    |||||| | |||||||||| | | |||||||  |||||||| ||    
T  14578948 tggttgtcgaaactccagctaagggttcagtaactacttctatagtatgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattgatttggt 14579047  T
Q  234 ttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    |||| || | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  14579048 ttgtttgcctttgagtggtatggatgtgattctaggtatgaactggttagagta 14579101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 35982911 - 35982841
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttt 74  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  35982911 atcagagatacttgtttctttaatagtactcttttaattgctattatagatactggtactactcattgttt 35982841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 199 - 290
Target Start/End: Original strand, 13318096 - 13318187
Alignment:
Q  199 tctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| | || |||||  | |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13318096 tctatgtttggtagagattttgaggttgatcttgtatgtctaccgttgatgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataa 13318187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Original strand, 8271830 - 8271882
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8271830 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 8271882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Original strand, 13964786 - 13964838
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13964786 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 13964838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 30150066 - 30150014
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30150066 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 30150014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 11861094 - 11861033
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 65  Q
    ||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11861094 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 11861033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Original strand, 15944026 - 15944078
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15944026 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactcattcttttat 15944078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 115 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17492460 - 17492288
Alignment:
Q  115 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagag 214  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||| ||| |    |||||  | | |||||||| | | |    
T  17492460 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcgaagagttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcccttgtttatgtttgatcgtg 17492361  T
Q  215 attttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||    
T  17492360 attttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagta 17492288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Original strand, 22150168 - 22150220
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22150168 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctagtcattcttttat 22150220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 79
Target Start/End: Original strand, 23079446 - 23079502
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattg 79  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  23079446 ttaataatactcctttagttgctattattgatacttgtgcaacacattgttttattg 23079502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Original strand, 6150284 - 6150336
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6150284 aatagtactcatttgattgcaattattgatattggtgctactcattcttttat 6150336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 17201344 - 17201292
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  17201344 aatagtactccattgattgcaattattgatactagtgctactcattcttttat 17201292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 41865 - 41577
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  41865 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 41766  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  41765 gtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatccat 41666  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  41665 gtttggtagggattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatataatc 41577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 41)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 28984078 - 28983790
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28984078 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcactgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 28983979  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28983978 gtttggatatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 28983879  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28983878 gtttggtagagattttgtgattgacttggtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatc 28983790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 28989297 - 28989009
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28989297 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcactgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 28989198  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28989197 gtttggatatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgatactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 28989098  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28989097 gtttggtagagattttgtgattgacttggtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatc 28989009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 16268838 - 16269124
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16268838 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 16268937  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  16268938 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgcttgtctggggtgtcctatatctat 16269037  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  16269038 gtttggtagagatttcgtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataa 16269124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 27357665 - 27357415
Alignment:
Q  42 tgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgtt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27357665 tgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgtt 27357566  T
Q  142 gaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  27357565 gaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtctgc 27357466  T
Q  242 cattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27357465 cgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagattataatc 27357415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22054030 - 22053744
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| ||||||||||    
T  22054030 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 22053931  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  22053930 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctgaggtgtcctacatctat 22053831  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22053830 gtttggtagagactttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataa 22053744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 31414146 - 31414432
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  31414146 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgctaatgaatgtgcttataagttgg 31414245  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||   |||||  | |||||    
T  31414246 gtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctat 31414345  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| |||||    || ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31414346 gtttggtagagactttgtagccgacttagtttgtttgtcgttgacgagtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataa 31414432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 22027894 - 22028180
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22027894 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgg 22027993  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |   ||||||  | |||||    
T  22027994 gtttggttttatcttatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccattgtctat 22028093  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||| ||| || | |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22028094 gtttggtagagattttgaggtcgacttagtatgtttgccgttgacgggtatgaatgttatttttgggatgaattggttagagtataa 22028180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Original strand, 29301040 - 29301328
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||    
T  29301040 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 29301139  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||  | |||||    
T  29301140 gtctgcttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctgagttgtccgttgtctat 29301239  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| || | ||  ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29301240 gtttggtagagactttgtggttgatttagtttgtttgccgttatcgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataatc 29301328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 19985347 - 19985061
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  19985347 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgg 19985248  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  19985247 gtttggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 19985148  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | ||| |||| ||| |||| ||||||  ||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  19985147 gtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgtcgttgacgaatatggatgtaatctttgggataaactggttagagtataa 19985061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22374036 - 22373750
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  22374036 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatagtttcattgatgttgattgtgcatataagttgg 22373937  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | | | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  22373936 gtctagttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 22373837  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||| |||||| ||||   ||||| | || ||| || ||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22373836 gtttgatagagactttgaagttgatcttgtatgtttgccatcgacaggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataa 22373750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21928595 - 21928309
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  21928595 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 21928496  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||| |  | |||||    
T  21928495 gtctggttatatctgatatgaatggcgaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagctgtgcgttgtctat 21928396  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | ||| |||| ||| || | ||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  21928395 gtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatataatttttgggatgaactggatagagtataa 21928309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20391253 - 20390967
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||| | || | ||||  ||||||||||    
T  20391253 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatttctattattgatactggtgctacacattgattcattgctgttaattgtgaatataagttgg 20391154  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| | | ||   ||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||   ||||   | |||||    
T  20391153 gtctggttatgtcaagtattagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtctgttgtctat 20391054  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||||||||   ||||| | || ||| || | |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  20391053 gtttggtagagattttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgatgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttggagtataa 20390967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 287
Target Start/End: Original strand, 22375071 - 22375350
Alignment:
Q  7 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 106  Q
    |||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||     
T  22375071 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgatattgattgtgcttctaagttgggtc 22375170  T
Q  107 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtt 206  Q
    | | | | ||  ||||||| || || ||||| || ||||||||| |||||||||| || || |||||||  || ||| |    |||||| | ||||||||    
T  22375171 ttgctatgtcgaatatgaatggagagatggtcgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctc-cgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtt 22375269  T
Q  207 tggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||| |  | ||||  || |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  22375270 tggtagagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 22375350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 19115548 - 19115284
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  19115548 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 19115449  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || ||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  19115448 gaatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 19115349  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  19115348 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 19115284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 32603293 - 32603029
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  32603293 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 32603194  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  32603193 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggttgtgattttgaa 32603094  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  32603093 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 32603029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19981108 - 19980878
Alignment:
Q  30 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 129  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| ||     
T  19981108 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 19981009  T
Q  130 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatt 229  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||||| ||| ||||    
T  19981008 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatt 19980909  T
Q  230 tagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 260  Q
    ||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  19980908 tagtttgtctacccttgagcggtatggatgt 19980878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22523691 - 22523430
Alignment:
Q  26 atagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaa 125  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  |||||||    
T  22523691 atagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaa 22523592  T
Q  126 aggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgatt 225  Q
     || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    ||| || | ||||||||||||   |||||||  |||    
T  22523591 tggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgttctttttctatgtttggtcttgattttgaaatt 22523492  T
Q  226 gatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    ||||| |||||| |  | ||||  ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  22523491 gatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 22523430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 17671655 - 17671919
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  17671655 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 17671754  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  17671755 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 17671854  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  17671855 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 17671919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 20015896 - 20016160
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  20015896 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 20015995  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  20015996 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 20016095  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || | ||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  20016096 atgggtttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 20016160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 237
Target Start/End: Original strand, 22421506 - 22421739
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  22421506 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagctgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 22421605  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| |||||||    
T  22421606 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttatctat 22421705  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 237  Q
    ||||| | | |||||||  ||||| || ||||||    
T  22421706 gtttgatcgtgattttgaaattgacttggtttgt 22421739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 30310777 - 30311041
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  30310777 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 30310876  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  30310877 gaatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 30310976  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  30310977 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 30311041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 34 - 260
Target Start/End: Original strand, 21391505 - 21391731
Alignment:
Q  34 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaa 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |  ||| |||||   |||||||||| | |   | ||||||||||| || ||||    
T  21391505 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 21391604  T
Q  134 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | ||||||| ||| ||||||||    
T  21391605 tggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagt 21391704  T
Q  234 ttgtctgtcattgacgggtatggatgt 260  Q
    || |||  | ||||  |||||||||||    
T  21391705 ttttctacctttgagtggtatggatgt 21391731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 34 - 260
Target Start/End: Original strand, 21780831 - 21781057
Alignment:
Q  34 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaa 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |  ||| |||||   |||||||||| | |   | ||||||||||| || ||||    
T  21780831 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 21780930  T
Q  134 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | ||||||| ||| ||||||||    
T  21780931 tggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagt 21781030  T
Q  234 ttgtctgtcattgacgggtatggatgt 260  Q
    || |||  | ||||  |||||||||||    
T  21781031 ttttctacctttgagtggtatggatgt 21781057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 34 - 260
Target Start/End: Original strand, 21785999 - 21786225
Alignment:
Q  34 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaa 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |  ||| |||||   |||||||||| | |   | ||||||||||| || ||||    
T  21785999 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 21786098  T
Q  134 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | ||||||| ||| ||||||||    
T  21786099 tggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagt 21786198  T
Q  234 ttgtctgtcattgacgggtatggatgt 260  Q
    || |||  | ||||  |||||||||||    
T  21786199 ttttctacctttgagtggtatggatgt 21786225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22042975 - 22042714
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  | |||| ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  22042975 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttatttcttttgattgtgtttctgctttgggtcttgatttttctgatat 22042876  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||  || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  22042875 gattggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 22042776  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttaga 284  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||    
T  22042775 atggatttagtttgtctacctttgaacggtatggatgtgattctaggtatgaattggttaga 22042714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18859725 - 18859509
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  18859725 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 18859626  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  18859625 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 18859526  T
Q  223 attgatttagtttgtct 239  Q
    || ||||||||||||||    
T  18859525 atggatttagtttgtct 18859509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 22126592 - 22126856
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  22126592 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 22126691  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  22126692 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgattacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 22126791  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  |  |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  22126792 atggatttagtttgtctacctctgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 22126856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 239
Target Start/End: Original strand, 22117808 - 22118024
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||  |||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  22117808 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatcgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 22117907  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  22117908 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 22118007  T
Q  223 attgatttagtttgtct 239  Q
    || ||||||||||||||    
T  22118008 atggatttagtttgtct 22118024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 22129250 - 22129514
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  22129250 ttaataatactgctttagttgctattattgatactggtgttacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 22129349  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  22129350 gaatggacagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 22129449  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  22129450 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 22129514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21254082 - 21253877
Alignment:
Q  34 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaa 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |  ||| |||||   |||||||||| | |   | ||||||||||| || ||||    
T  21254082 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattattttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 21253983  T
Q  134 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagt 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | ||||||| ||| ||||| ||    
T  21253982 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttggt 21253883  T
Q  234 ttgtct 239  Q
    ||||||    
T  21253882 ttgtct 21253877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22031270 - 22030987
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   ||||    
T  22031270 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 22031171  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||    
T  22031170 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctat 22031071  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacg-ggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    |||||||   ||||| |  || ||||||||||||||  |||| | | ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  22031070 gtttggtcatgatttcgaaatggatttagtttgtct-acatttaagcggtatggatgtaattctgggtatgaattggttagagta 22030987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22990212 - 22989929
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||| | ||  ||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||| ||||| |  |||||||    
T  22990212 atcagaggtacatgttattttgacagtacacctttagttgctattattgatactagtgctaaacattgttttattgctattgattgtgcttcaaagttgg 22990113  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | | | | ||  ||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||  | |||||    
T  22990112 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcgaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttaagatgtcccttgtctat 22990013  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    ||||||| | |||||||  ||||| || |||||| |  | ||||  ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  22990012 gtttggtcgtgattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 22989929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 260
Target Start/End: Original strand, 21164178 - 21164408
Alignment:
Q  30 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 129  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |  | ||||| | |   |||||| | | | | ||||||||||| ||     
T  21164178 tactcctttagttgctattattgatactgatgctacgcattgttttattgctttcaattgtgcttcttctttgggtcttgttttgtctgatatgaatgga 21164277  T
Q  130 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatt 229  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||||| | ||| || |    
T  21164278 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggact 21164377  T
Q  230 tagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 260  Q
    ||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  21164378 tagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 21164408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 287
Target Start/End: Original strand, 22246069 - 22246330
Alignment:
Q  26 atagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaa 125  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  |||||||    
T  22246069 atagtacacctttaatttatattattcatattagtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaa 22246168  T
Q  126 aggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgatt 225  Q
     ||  | |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||  |    |||||| | |||||||||||| |||||||||  |||    
T  22246169 tggatagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgcttaatatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaatt 22246268  T
Q  226 gatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
     |||| |||||| |  | ||||  |  |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  22246269 aatttggtttgtttacctttgagtgaaatggatgtaatccttggtatgaattggttagagta 22246330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15536524 - 15536267
Alignment:
Q  30 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 129  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || | ||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||     
T  15536524 tactccgttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattatgtttctgccttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 15536425  T
Q  130 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatt 229  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| | |  |||||| | ||||| |||||| | |||||||  || ||||    
T  15536424 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttacgttgtcctttgtctatatttggtcgtgattttgaaatggatt 15536325  T
Q  230 tagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    ||||||||||  | ||||  |||||| |||| || || || | |||||||||||||||    
T  15536324 tagtttgtctacctttgagcggtatgaatgtgattttgggtacgaattggttagagta 15536267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 292
Target Start/End: Original strand, 19481705 - 19481974
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||    
T  19481705 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatat 19481804  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||    |||||||| || ||| || | |||||| | ||||||||| || | |||||||      
T  19481805 gaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgcttacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttagtcgtgattttgaa 19481904  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    || ||||||||||| ||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  19481905 atggatttagtttgcctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatc 19481974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 22245651 - 22245862
Alignment:
Q  26 atagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaa 125  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  |||||||    
T  22245651 atagtacacctttaatttatattattcatattagtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaa 22245750  T
Q  126 aggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgatt 225  Q
     ||  | |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||  |    |||||| | |||||||||||| |||||||||  |||    
T  22245751 tggatagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgcttaatatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaatt 22245850  T
Q  226 gatttagtttgt 237  Q
     |||| ||||||    
T  22245851 aatttggtttgt 22245862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Original strand, 20649990 - 20650042
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20649990 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 20650042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Original strand, 21847972 - 21848024
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21847972 aatagtactcttttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 21848024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 16415232 - 16415180
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16415232 aatagtattccattgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 16415180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 22437436 - 22437384
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  22437436 aatagtactcctttgattgcgattattgatactgatgttactcattcttttat 22437384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 514527 - 514813
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  514527 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 514626  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  514627 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctat 514726  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  514727 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaattggttagagaataa 514813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 441759 - 441550
Alignment:
Q  28 agtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaag 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||| ||||| | ||| |||||| |   | | ||  ||||||| |    
T  441759 agtactcctttagttgctattattgatactggtgctacggattgttttattgctcttgattgtgcttctaaattgggtcttactatgtcaaatatgaatg 441660  T
Q  128 gggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattga 227  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  441659 gagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagatttttagattga 441560  T
Q  228 tttagtttgt 237  Q
    ||| ||||||    
T  441559 tttggtttgt 441550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 496150 - 495867
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||| | ||  ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |  |||||||    
T  496150 atcagaggtacatgttattttgatagtagacctttagttgctattattgatactagtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttcgaagttgg 496051  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| | | |    ||| || | |||||    
T  496050 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtttttaagatgttctttgtctat 495951  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    ||||||| ||||||||   |||||||| |||||| |  | ||||  || |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  495950 gtttggtcgagatttttaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 495867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 30064 - 29776
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  30064 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 29965  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29964 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaagaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctat 29865  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29864 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtctgccgttgttgggtatggatgtgatttttggaatgaattggtcagagtataatc 29776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24367365 - 24367077
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  24367365 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattaatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatatcagttgg 24367266  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24367265 gtccggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggattcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 24367166  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  24367165 ctttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttcacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtttaatc 24367077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 10466164 - 10466450
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10466164 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgttgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 10466263  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |   |||||   |||||||    
T  10466264 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtctgttatctat 10466363  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  10466364 gtttggtagggactttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggataaattggttagagtataa 10466450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 19455988 - 19455702
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19455988 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 19455889  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||| |  | |||||    
T  19455888 gtctggttgtatctgatatgaaaggtgaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgttcgttgtctat 19455789  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19455788 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataa 19455702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18797655 - 18797369
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||    
T  18797655 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 18797556  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||  ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||  || ||||||||||||    
T  18797555 gtttgattgtatctgacatgaaaggagagatggttgttgaaactctagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtttcctatatctat 18797456  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||| ||||||| | | || ||||| ||| |  |  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18797455 gtttggtagggattttgaggtagacttagtgtgtttaccgctgacgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataa 18797369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 14377232 - 14377518
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14377232 atcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactggtgttactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 14377331  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||   |||||   | |||||    
T  14377332 gtttggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagcaaagggtttagtagctacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctat 14377431  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| || |   | || ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  14377432 gtttggtagagacttcgaagtcgacttagtttgtttgtcgttgatgggtatggatgttatttttggaatgaactagttagagtataa 14377518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 21567307 - 21567593
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||| ||| ||||||    
T  21567307 atcagaggtacttgtttctttaatagtacttattcaattgctattatagacactggtactactcattgtttcattgctttagaatgtgcatattagttgg 21567406  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||  |||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  21567407 gtttgattgtaactgacatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 21567506  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||| |||||  | ||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||    
T  21567507 gtttggtagagattttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgtcatttttggaatgaactagttagagtataa 21567593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 24515730 - 24516016
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24515730 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgtgcttataagttgg 24515829  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||    
T  24515830 gtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagttaagtgttcattaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctat 24515929  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | ||| |||| ||| |  | |||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24515930 gtttggtagagactttgaagtcgatctagtgtgtttaccgttgacgggaatggacattatttttgggatgaactggttagagtataa 24516016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15462301 - 15462015
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||    
T  15462301 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 15462202  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||   ||||||  |||||||    
T  15462201 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttatctat 15462102  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||| |||||  | |||  ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  15462101 gtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttatcttcgggatgaattggttagaatataa 15462015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 19437967 - 19437681
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||     
T  19437967 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttga 19437868  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||  | | |||    
T  19437867 gtctagttgtatctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtttat 19437768  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||| |||||| ||||   | || ||||||||| |  | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  19437767 gtttgttagagactttgaagtcgacttagtttgttttcctttgactggtatggatgttatttttgggatgaacttgttagagtataa 19437681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21474565 - 21474279
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  21474565 atcagaggtatttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttgattgttgttgattgtgcatataagttgg 21474466  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| | | |||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||   |||||  | |||||    
T  21474465 gtctggttatgtctgatatgaatagaaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcatgtttgtttgagttgtccattgtctat 21474366  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   ||||| | || ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21474365 gtttggtagagactttgaagttgatcttgtatgtttgtcgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataa 21474279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 19466133 - 19465971
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19466133 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 19466034  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaa 166  Q
    || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19466033 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaa 19465971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 25770809 - 25770523
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  25770809 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctattcattgtttcattgttgttgattgtgcttataagttgg 25770710  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| | | ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  25770709 gtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaatctccagcaaagggttcaatcactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 25770610  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   ||||  | || ||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  25770609 gtttggtagagactttgaagttgaccttgtatgtttgccattgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataa 25770523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 34642902 - 34643188
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | | || ||||| |||||  |||    
T  34642902 atcagaggtacttgtttctttaatagtatccctttaatcgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcttataaactgg 34643001  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||    
T  34643002 gtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccggctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgagatgtcctatatctat 34643101  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||| |||||||   | ||  |||||||  |  | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  34643102 gtttggtagggattttgaagtagacctagtttgcttacctttgacggggatggatgttatatttgggatgaattggttagagtataa 34643188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 19486610 - 19486894
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  19486610 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgttattattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 19486709  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || |||   | ||   |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||   ||||   | |||||    
T  19486710 gtctggtcatgtcaagtatgagtagagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctat 19486809  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||||||||   ||||| |||| ||| || |  |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  19486810 gtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgcc--tgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttggagtataa 19486894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 292
Target Start/End: Original strand, 5836563 - 5836832
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| ||||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  5836563 ttaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgcttatactttgggtcttgatttgtctgatat 5836662  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  5836663 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactaccactctagtatgtttgaaatgtcctttttctatgtttggtcgtgattttgaa 5836762  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||    
T  5836763 atggatttagtttgtctccctttgagcggtatggatgttattcttggtaggaattggttagagtacaatc 5836832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23081388 - 23081100
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||| | ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  23081388 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 23081289  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||| | | | ||  |||| || || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||    
T  23081288 gttttgctatgtcaaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 23081189  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    ||||| | | |||| ||  ||||| || |||||| |  | ||||  ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  23081188 gtttgatcgtgattatgaaattgacttggtttgtttacctttgattggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaatc 23081100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 16924956 - 16925239
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | ||  ||||    
T  16924956 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgg 16925055  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||    
T  16925056 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgtcgaaactccagctaagggatcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttttctat 16925155  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    ||||||| | |||||||  || |||||||||||| || | ||||  |||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||    
T  16925156 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtttgcctttgagtggtatggacgtcatccttggtatgaattggttagagta 16925239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 18405260 - 18405543
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||   ||||||||    
T  18405260 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagctgctattattgatactggtgctatgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 18405359  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| ||   |||||  | |||||    
T  18405360 gtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttgagatgtcccttgtctat 18405459  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    ||||| | | |||||||  ||| |||| ||||||||| | ||||  ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||    
T  18405460 gtttgattgtgattttgaaattaatttggtttgtctgcctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagta 18405543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 29589774 - 29590038
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  29589774 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 29589873  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  29589874 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 29589973  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  29589974 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 29590038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 30678340 - 30678626
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||| || ||| ||||| | ||||||||    
T  30678340 atcagaggtacatgtttctttaatagtacttctttaattgctattattgatatttgtgctacgcgttgttttattgctactgattgtgcttctaagttgg 30678439  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | | | | ||   |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| || |||||| ||||| |  | || ||    
T  30678440 gtcttgttatgtcatgtatggatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggttactacttctctagtgtgtctgaagtgttcgttgtcgat 30678539  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||| |||| ||||   |||||||||| ||| |  | ||||  || |||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||    
T  30678540 gtttggtcgagactttgaagttgatttagtctgttttcctttgagtggaatggatgtaatacttggtatgaattggttggagtataa 30678626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 2872137 - 2872401
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  2872137 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 2872236  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  2872237 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 2872336  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  2872337 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 2872401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 27190382 - 27190113
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  | || |||||    
T  27190382 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtcttgagttgtcagatat 27190283  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | ||||| |||||| | |||||||      
T  27190282 gaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgattttgaa 27190183  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  27190182 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatc 27190113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 292
Target Start/End: Original strand, 27258858 - 27259127
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  | || |||||    
T  27258858 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtcttgagttgtcagatat 27258957  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | ||||| |||||| | |||||||      
T  27258958 gaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgattttgaa 27259057  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  27259058 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatc 27259127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16574836 - 16574572
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  16574836 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 16574737  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  16574736 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 16574637  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||| ||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  16574636 atggatttagtttgcctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 16574572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 16620544 - 16620808
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  16620544 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 16620643  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  16620644 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 16620743  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||| ||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  16620744 atggatttagtttgcctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 16620808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 23085163 - 23085374
Alignment:
Q  26 atagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaa 125  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||| | ||| | |||||||||| |   | | ||   ||||||    
T  23085163 atagtactcctttagtttctattattgaaactggtgctacacattgttttattgttgttgattatgcttctaagttgggtcttactatgtcaagtatgaa 23085262  T
Q  126 aggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgatt 225  Q
     || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |    |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  23085263 tggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttgaaatt 23085362  T
Q  226 gatttagtttgt 237  Q
    ||||| ||||||    
T  23085363 gatttggtttgt 23085374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22436808 - 22436551
Alignment:
Q  30 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 129  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| ||     
T  22436808 tactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 22436709  T
Q  130 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatt 229  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | ||| || | |||||||||||| | ||||||| |||||||     
T  22436708 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgttctttgtctatgtttggtcgtgattttgagattgata 22436609  T
Q  230 tagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    | |||||  || | ||||  |||||||  || ||  |||| |||||||||||||||||    
T  22436608 tggtttgcttgcctttgagtggtatgggcgtcattcttggtatgaattggttagagta 22436551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 292
Target Start/End: Original strand, 28260532 - 28260801
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||    
T  28260532 ttaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatat 28260631  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  28260632 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 28260731  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||| |||| ||||    
T  28260732 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttaaagtacaatc 28260801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 28285384 - 28285115
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||    
T  28285384 ttaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatat 28285285  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  28285284 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 28285185  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||| |||| ||||    
T  28285184 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttaaagtacaatc 28285115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 28312576 - 28312307
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |  | ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||    
T  28312576 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcaattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatat 28312477  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  28312476 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatttttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 28312377  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||    
T  28312376 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaatc 28312307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 292
Target Start/End: Original strand, 28339281 - 28339550
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||    
T  28339281 ttaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatat 28339380  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  28339381 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 28339480  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||| |||| ||||    
T  28339481 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttaaagtacaatc 28339550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 18182686 - 18182862
Alignment:
Q  7 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 106  Q
    |||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||||| |||||| ||||| | ||||||||||     
T  18182686 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctacacatttccttattgctattgattgtgcttctaagttgggtc 18182785  T
Q  107 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 183  Q
    | | | | ||  ||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  18182786 ttgctatgtcaaatatgaatggagagatggtagtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtttgt 18182862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 55 - 179
Target Start/End: Original strand, 20010821 - 20010945
Alignment:
Q  55 actggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagcta 154  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||| |||||||||||  |    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20010821 actggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcttataagttgggcctaatcgtatctaatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagcca 20010920  T
Q  155 agggttcagtaaccacttctcttgt 179  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  20010921 agggttcagtaactacttctcttgt 20010945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 27559285 - 27559568
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||   |||||| |||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   ||||    
T  27559285 atcagaggtacttgttatattaataatactccatttgttgctattattgataatggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 27559384  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||    
T  27559385 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctat 27559484  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    ||||||| | |||||||  || ||||||||||||||    ||||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  27559485 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacttttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 27559568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 24293117 - 24293381
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  24293117 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcacggttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 24293216  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||        
T  24293217 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcaaa 24293316  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  24293317 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 24293381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19867626 - 19867396
Alignment:
Q  30 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 129  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||  | | | | ||| ||||||| |      
T  19867626 tactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctaccttgggccttgttatgtcttatatgaatgaa 19867527  T
Q  130 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatt 229  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| | ||| ||||    
T  19867526 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggatt 19867427  T
Q  230 tagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 260  Q
    ||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  19867426 tagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 19867396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 25115498 - 25115234
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   | |||| | ||| | ||||||||    
T  25115498 ttaataatactcctttagttgctattattgatattggtactacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgcttcgggtcttgatttgtctgatat 25115399  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || ||| |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  25115398 gaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 25115299  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  25115298 atggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 25115234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Original strand, 16379710 - 16379762
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16379710 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 16379762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Original strand, 16647306 - 16647358
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16647306 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 16647358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 16100959 - 16100907
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16100959 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactcatttttttat 16100907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 71
Target Start/End: Original strand, 22829721 - 22829769
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattg 71  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22829721 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 22829769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 591 - 305
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  591 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctagtcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 492  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  491 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctat 392  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  | |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  391 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggaggtgatttttggaatgaattggttagagtataa 305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 4 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20848321 - 20848067
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20848321 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 20848222  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20848221 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 20848122  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggat 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  20848121 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgatgggtatggat 20848067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 19716728 - 19717014
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19716728 atcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 19716827  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||   |||||  | |||||    
T  19716828 gtttagttgtatctgatttgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctat 19716927  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19716928 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataa 19717014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 23274325 - 23274039
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23274325 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacaccggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 23274226  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||    
T  23274225 gtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctat 23274126  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  23274125 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatggactggttagagtataa 23274039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 290
Target Start/End: Original strand, 23097732 - 23098015
Alignment:
Q  7 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 106  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| | ||||||||||     
T  23097732 agaggtacttgattctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatttaagttgggtc 23097831  T
Q  107 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtt 206  Q
    ||| |||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  23097832 tggttgtaactgacatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtt 23097931  T
Q  207 tggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||||||| | || ||||| |||||  | |||| |||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23097932 tggtagagattttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggtatggatgtcatttttggaatgaactgggtagagtataa 23098015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12577087 - 12576799
Alignment:
Q  2 tcatcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagtt 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||  |    
T  12577087 tcatcagaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcctataaact 12576988  T
Q  102 gggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatct 201  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||  ||  |||||| || |||    
T  12576987 gggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaatgactacttctctggtttgcttgaggtgtccaatttct 12576888  T
Q  202 atgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||||||||||   | || ||||| ||| |  | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12576887 atgtttggtagagattttgaagtagacttagtgtgtttaccgttgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataa 12576799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 23113455 - 23113169
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||| ||||| ||||    
T  23113455 atcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgtttcattgttgttgattgtgcatataaattgg 23113356  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| | | ||   |||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||   |||||  | |||||    
T  23113355 gtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtctat 23113256  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||||||||   ||||| |||| ||| || | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23113255 gtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataa 23113169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17001713 - 17001449
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| ||||||||||    
T  17001713 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatctgatat 17001614  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  17001613 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 17001514  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  17001513 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 17001449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 237
Target Start/End: Original strand, 24817575 - 24817784
Alignment:
Q  28 agtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaag 127  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||| |     | ||  ||||||| |    
T  24817575 agtactcctttagttgatattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttacaatgtcgaatatgaatg 24817674  T
Q  128 gggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattga 227  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24817675 gagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttgagattga 24817774  T
Q  228 tttagtttgt 237  Q
    ||| ||||||    
T  24817775 tttggtttgt 24817784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 11351441 - 11351705
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  11351441 ttaataatactcatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtctagatatgtctgatat 11351540  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  11351541 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 11351640  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  | ||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  11351641 atggatttagtttgtctacctttgagcgatatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 11351705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 22323072 - 22323336
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  22323072 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 22323171  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  22323172 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 22323271  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  22323272 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttaggtatgaactggttagagta 22323336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24712747 - 24712483
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  24712747 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 24712648  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  24712647 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 24712548  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  24712547 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 24712483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27220729 - 27220465
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  27220729 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 27220630  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  27220629 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 27220530  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  27220529 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 27220465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 44383300 - 44383564
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  44383300 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgttttgggtcttgatttgtctgatat 44383399  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  44383400 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 44383499  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  44383500 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 44383564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 9338295 - 9338031
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  9338295 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 9338196  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  9338195 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 9338096  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  9338095 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 9338031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 9486929 - 9486665
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  9486929 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 9486830  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  9486829 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 9486730  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  9486729 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 9486665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16983953 - 16983689
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  16983953 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 16983854  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  16983853 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 16983754  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  16983753 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 16983689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23074563 - 23074312
Alignment:
Q  36 tttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatg 135  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||   |||||||||| | | | | ||||||||||| || || |||    
T  23074563 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctattaagttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatg 23074464  T
Q  136 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagttt 235  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| |   ||||||| ||||||||| ||||    
T  23074463 gttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcttgattttgagattgatttggttt 23074364  T
Q  236 gtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    ||||  | ||||  ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  23074363 gtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaattggttagagta 23074312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24678198 - 24677936
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatga 124  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | ||| | ||||||||||    
T  24678198 aataatactcctttagttgctattaatgatactggtgctaggcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtctagatatgtctgatatga 24678099  T
Q  125 aaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgat 224  Q
    | || || |||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||||||| |||    
T  24678098 atggagagatggttgtcgaaacttcagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagat 24677999  T
Q  225 tgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
     ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  24677998 ggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 24677936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 239
Target Start/End: Original strand, 21323003 - 21323212
Alignment:
Q  30 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 129  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||  ||     
T  21323003 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgattgga 21323102  T
Q  130 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatt 229  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| | ||| ||||    
T  21323103 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggatt 21323202  T
Q  230 tagtttgtct 239  Q
    ||||||||||    
T  21323203 tagtttgtct 21323212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27373982 - 27373718
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  27373982 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 27373883  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  27373882 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 27373783  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||| ||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  27373782 atggatttagtttgcctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 27373718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 10871563 - 10871299
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  10871563 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 10871464  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||| | | |||||||||||| | ||||| |      
T  10871463 gaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcgtttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 10871364  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  10871363 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 10871299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 21142771 - 21143035
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  21142771 ttaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgttttgggtcttgatttgtctgatat 21142870  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  21142871 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 21142970  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  21142971 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctaggtatgaactggttagagta 21143035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Original strand, 24705193 - 24705428
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | ||  ||||    
T  24705193 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgatattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgg 24705292  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | ||| | ||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||| ||   || ||| | |||||    
T  24705293 gtcttgatttgtctgatatgaatgcagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtaactacttctctcgtatgtttgagatgccctttgtctat 24705392  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtct 239  Q
    ||||||| | |||||||  || ||||||||||||||    
T  24705393 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtct 24705428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 260
Target Start/End: Original strand, 23105469 - 23105695
Alignment:
Q  34 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaa 133  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  ||| |||||   |||||||||| | |   | ||||||||||| || ||||    
T  23105469 cctttagttgctattattgttactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 23105568  T
Q  134 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagt 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | ||||||| ||| ||||||||    
T  23105569 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagt 23105668  T
Q  234 ttgtctgtcattgacgggtatggatgt 260  Q
    ||||||  | ||||  |||||||||||    
T  23105669 ttgtctacctttgatcggtatggatgt 23105695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 24657388 - 24657652
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| | | || ||||  | ||  |||| | | ||| | ||||||||    
T  24657388 ttaataatactccattagttgctattattgatacagctgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttggatcttgatttgtctgatat 24657487  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  24657488 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 24657587  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  |||  ||||||||| |||||||    
T  24657588 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttgatatgaattgggtagagta 24657652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 24874480 - 24874744
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  24874480 ttaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 24874579  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||| ||| || || |||||||| || ||| |  | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  24874580 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaggtttcggtgactacttctctcgtatgtttcaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 24874679  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  24874680 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 24874744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 22733485 - 22733768
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||   || ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| | |||| |||||   ||||||||    
T  22733485 atcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcgttgatttattgcttttgattgtgctactaagttgg 22733584  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | |   | ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||  | |||||    
T  22733585 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtataagatgtcccttgtctat 22733684  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    ||||| | | ||||||  ||||||||| ||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  |||| ||||  |||||||||||    
T  22733685 gtttgatcgtgattttcagattgatttggtttgtctagctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgacctggttagagta 22733768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 74
Target Start/End: Original strand, 19721291 - 19721361
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttt 74  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19721291 atcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttt 19721361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 260
Target Start/End: Original strand, 23029191 - 23029428
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  23029191 ttaataatactcccttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 23029290  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || |  |||||||| |||| ||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||||| | |    
T  23029291 gaatggagtgatggttgtcgaaaatccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgag 23029390  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 260  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  23029391 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 23029428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23065113 - 23064973
Alignment:
Q  36 tttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatg 135  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||   |||||||||| | | | | ||||||||||| || || |||    
T  23065113 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctattaagttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatg 23065014  T
Q  136 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 176  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  23065013 gttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 23064973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24265083 - 24264819
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  24265083 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 24264984  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||  ||  | |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | | |||||||||| | ||||| |      
T  24264983 gagtggatagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtttatgtttggtcgtgatttcgaa 24264884  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  24264883 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 24264819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 45673742 - 45674006
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  45673742 ttaataatactcctttagttgctattattgataatggagctacgcattgttttattgctttcgattgtgattctgctttgggtcttgttttgtctgatat 45673841  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||| | | |||||||||||| | |||||||      
T  45673842 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcttttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 45673941  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    ||  |||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  45673942 atgaatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 45674006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 176
Target Start/End: Original strand, 22742703 - 22742849
Alignment:
Q  30 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 129  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| ||     
T  22742703 tactcctttagttgctattattggtactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 22742802  T
Q  130 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 176  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  22742803 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22742849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23205027 - 23204763
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||  || ||| | |  | ||||  | |   |||||| | ||||| ||||||||    
T  23205027 ttaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgcatttttgctttccattgtgtttctgctttgggtcttgatgtgtctgatat 23204928  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||   ||  |||||| | ||||||  |||| | ||||||||     
T  23204927 gaatggagagatggttgtcgatactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgctcgcgatgtcctttgtctatggatggtcgtgattttgta 23204828  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  23204827 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 23204763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Original strand, 30208631 - 30208706
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattg 79  Q
    |||| |||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  30208631 atcaaaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactattatagatactggtgctacacattgttttattg 30208706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Original strand, 22739386 - 22739438
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22739386 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 22739438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 23279343 - 23279222
Alignment:
Q  169 acttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttg 268  Q
    |||||||||||||||||   ||||||  | ||||||||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |||||||| ||||||||||| ||||    
T  23279343 acttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttg 23279244  T
Q  269 gaatgaattggttagagtataa 290  Q
    | ||| | ||||||||||||||    
T  23279243 ggatggactggttagagtataa 23279222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 115 - 287
Target Start/End: Original strand, 41606209 - 41606379
Alignment:
Q  115 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagag 214  Q
    ||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |    
T  41606209 tctgatatgaatggagagatggt-gtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcct-tgtctatgtttggtcgtg 41606306  T
Q  215 attttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    |||| |  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  41606307 atttcgaaatggatttagtttgtctatctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 41606379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 19817579 - 19817504
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattg 79  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19817579 atcagaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactactacagatactggtgctacacattgctttattg 19817504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 22280816 - 22280771
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcatt 70  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22280816 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctagtcatt 22280771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 25131320 - 25131275
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcatt 70  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25131320 aatagtactcatttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 25131275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 23676631 - 23676583
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattg 71  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  23676631 ttaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattg 23676583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 290
Target Start/End: Original strand, 67280 - 67568
Alignment:
Q  2 tcatcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagtt 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| |||| ||||||||    
T  67280 tcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgccttagaaagtgcatataagtt 67379  T
Q  102 gggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatct 201  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  67380 gggtttgattgtatccgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatct 67479  T
Q  202 atgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  || | ||| |||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  67480 atgtttggtagagattttgtggttgatctagtttgcttgccgttgtcgggtatggacgttattttcgggatgaattggttagagtataa 67568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8744 - 8458
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  8744 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgg 8645  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||    
T  8644 gtttggttgtatctgatataaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctat 8545  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||| ||| || | |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8544 gtttggtagagattttgaggtcgacttagtatgtttgccgttgacgtgtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataa 8458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 263353 - 263070
Alignment:
Q  7 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| |||||||||||||    
T  263353 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtt 263254  T
Q  107 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtt 206  Q
    ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  263253 tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtt 263154  T
Q  207 tggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||||| | | || ||||||||| || | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  263153 tggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggacgttatttttggaatgaattggttagagtataa 263070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 5319 - 5605
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5319 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 5418  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||  ||||||  | | |||    
T  5419 gtatggatgtatctgatatgaaaagagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgaggtgtccattgtttat 5518  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5519 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtttgccgttgtcgcgtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataa 5605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Original strand, 65472 - 65760
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||| ||||||||||    
T  65472 atcagaggtacttgtttctttaatagtacacctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttccttgctttagaatgtgcatataagttgg 65571  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   |||||||||||| ||    
T  65572 gtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtcctatatccat 65671  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    |||||||||||||||||   |||| ||||| ||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  65672 gtttggtagagattttgaagttgacttagtatgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataatc 65760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 11107 - 10821
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  | | ||| |||| ||||||||||    
T  11107 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatttttttagaaagtgcatataagttgg 11008  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  11007 gtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatacttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctat 10908  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||  || | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10907 gtttggtagggactttgtggttgatttagtttgcttgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataa 10821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 9960 - 10246
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| ||||||||||    
T  9960 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 10059  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  10060 gtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtacagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 10159  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||||||| || | |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  10160 gtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggacgttattttttgaatgaattggttagagtataa 10246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22252 - 21966
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||    
T  22252 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattggtattatagatactggtgttactcattgtttcattgctattgaatgtgcatatatgttgg 22153  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||    
T  22152 gtttggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactttagctaagtgttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctat 22053  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||| || |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22052 gtttggtagagattttgaggtcgatttagtttgtttgccgctgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataa 21966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 713 - 427
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  713 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 614  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||    
T  613 gtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccatctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctat 514  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  513 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacaggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataa 427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 251752 - 251466
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  251752 atcagaggtacttgtttctttaatagtacttctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 251653  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||   |||||  | |||||    
T  251652 gtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctat 251553  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| |||||  | ||| |||||||| || | ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  251552 gtttggtagagactttgtagtcgatctagtttgtttgccgttgtcgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataa 251466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 71
Target Start/End: Original strand, 230045 - 230093
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattg 71  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  230045 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 230093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 30500 - 30779
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30500 atcagaggtacttgtttctttaaaagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgatattgaatgtgcatataagttgg 30599  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  30600 gtttggttgtatctgatatgaaaggggtaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctat 30699  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| || | ||| ||||||       ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30700 gtttggtagagactttgtggttgatttagtttgtttgccgttgtcgggta-------tatttttggaatgaattggttagagtataa 30779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 1250 - 964
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1250 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 1151  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||   | |||||    
T  1150 gtctggttgtatctgatatgaaaggggaaattgttgttgaaactccagttaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctat 1051  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1050 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataa 964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15253 - 14967
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15253 atcagaggtacttgtttcttttatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgg 15154  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||   ||||||  | |||||    
T  15153 gtttgattgtatttgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagcaactacttctctagtttgtctaaggtgtccattgtctat 15054  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||| ||||||||||||   | || ||||||||| || | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15053 gtttcgtagagattttgaagtcgacttagtttgtttgccgttgatgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataa 14967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 6240 - 5961
Alignment:
Q  7 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 106  Q
    |||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||| | ||||| | ||||||||||     
T  6240 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactgatgctacgcattgttttaatgctatttattgtgcttctaagttgggtc 6141  T
Q  107 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtt 206  Q
    |   | | ||  |||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |    |||||| | || |||||    
T  6140 ttactatgtcgaatatgaaaggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtcaatgtt 6041  T
Q  207 tggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagt 286  Q
    |||| ||||| |||  |||||||| |||||| |  | ||||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||    
T  6040 tggtcgagatgttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcctgggtatgaactggttagagt 5961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 7168 - 6882
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  7168 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 7069  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||  | |||||    
T  7068 gtttggttgtttctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctat 6969  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| |||    | || ||||| ||| |  | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6968 gtttggtagagactttaaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataa 6882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20944 - 20658
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20944 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 20845  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||  | |||||    
T  20844 gtctggtcgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctat 20745  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  20744 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactagttagagtataa 20658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 661 - 947
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||| ||| |||||||| |||||| |||    
T  661 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagaaactggtgctacacaatgtttaattgctatagaatgtgcatataagatgg 760  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || |  |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  | |||||  | |||||    
T  761 gtataaaaatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaaatgtccgttgtctat 860  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||| ||||||| ||||   | || |||||| || |  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  861 gtttagtagagactttgaagtcgacttagttggttttccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataa 947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 64776 - 65062
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||||||     
T  64776 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcgtataagttga 64875  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
     ||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||  | |||||    
T  64876 atttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagcaaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctat 64975  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||| |||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  64976 gtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccattgacgggtatggatgctatttttggaatgaattggttagagtataa 65062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 49354 - 49640
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||||||     
T  49354 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagaatgtgcgtataagttga 49453  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
     ||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||  | |||||    
T  49454 atttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctat 49553  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||| |||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49554 gtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccattgacgggtatggatgctatttttggaatgaattggttagagtataa 49640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 58388 - 58674
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||||||     
T  58388 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagaatgtgcgtataagttga 58487  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
     ||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||  | |||||    
T  58488 atttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctat 58587  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||| |||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  58588 gtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccattgacgggtatggatgctatttttggaatgaattggttagagtataa 58674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 29754 - 29468
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  29754 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcaatgtttgattgctgttgattgtgcatataagttgg 29655  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||    
T  29654 gtctagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctat 29555  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | ||  ||| |||| |  | |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29554 gtttggtagagactttgaagtcgacctagcttgtttaccgttgacgggtatggaggtgatttttgggatgaactggttagagtataa 29468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 203508 - 203246
Alignment:
Q  7 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| |||||||||||||    
T  203508 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgggtt 203409  T
Q  107 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtt 206  Q
    ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  203408 tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtt 203309  T
Q  207 tggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttgg 269  Q
    |||||||||||||| | | || ||||||||| || | |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  203308 tggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggacgttatttttgg 203246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 424419 - 424266
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||     || ||||  | |   ||| || | ||| | ||||||||    
T  424419 ttaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcctacgattgtgtttctgctttgagtcttgatttgtctgatat 424320  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 176  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  424319 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 424266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 8 - 294
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| | | ||| |||| |||||||||     
T  8 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctattcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttga 107  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  108 gtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctat 207  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||| ||| || |||||| | |||||||||||| || | ||| |||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  208 gtttgttagggactttgtggtggatttagtttgtttgccgttgtcgggtatgaatgtgatttttggtatgaattggttagagtataa 294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 719 - 1005
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||    
T  719 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 818  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  819 gtttgattgtatctgatatgaaaggagagatggttgttgaaacttcagctaagggttcagtgactacttcccttgtttgtttgaggtgtcctctatctat 918  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||| ||||||| | | || |||||||||||  | |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  919 gtttggtagggattttgaggtagacttagtttgtctaccgttgacgggaatggatgtcatttttgggatgaattggttagagtataa 1005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 10916 - 10633
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||    
T  10916 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgttattgattgtgctactaagttgg 10817  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | | | | ||| ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||  | |||||    
T  10816 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtccattgtctat 10717  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    ||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |  | ||||  || |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  10716 gtttggtcgtgattttgaaattgatttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 10633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 9946 - 10232
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  9946 atcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatttgcttataagttgg 10045  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    |||||  | |||||    
T  10046 gtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgtctaagatgtccgttgtctat 10145  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||| ||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10146 gtttagtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataa 10232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 24119 - 24402
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||| |    
T  24119 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttag 24218  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||  || ||   |||||| | |||||    
T  24219 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgcgtttgagatgtcctttgtctat 24318  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    ||||| | | ||||||  ||||||||| |||||| |  | ||||  ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||    
T  24319 gtttgatcgtgattttaggattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatgaactggttagagta 24402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 98757 - 99043
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||    
T  98757 atcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattactattgaatgtgcttataagttgg 98856  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   |||| |  | |||||    
T  98857 gtctggttgtatctaatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgttcgttgtctat 98956  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  98957 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataa 99043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 176117 - 175830
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  176117 atcagaggtacttatttcttta-tagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 176019  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  176018 gtctggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcactaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 175919  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    |||||||||||||||||   | ||| | || ||| || | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  175918 gtttggtagagattttgaagtcgatcttgtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagaataatc 175830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 325837 - 325551
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  325837 atcagaggtacttgtttctttaatattactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 325738  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||   | |||||    
T  325737 gtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtctgttgtctat 325638  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||| ||| |  | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  325637 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataa 325551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 200642 - 200928
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  200642 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactagtgctacacattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgg 200741  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| | | ||   |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||   ||||   | |||||    
T  200742 gtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgatttgtctgttgtctat 200841  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||||||||   ||||| |||| ||| || | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  200842 gtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttggagtataa 200928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 37069 - 36781
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||    
T  37069 atcataggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgatgttgattgtgcatacaagttgg 36970  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||    
T  36969 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctat 36870  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  36869 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgatatttttgggatgaactgtttagagtataatc 36781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 151694 - 151411
Alignment:
Q  7 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 106  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  151694 agaggtatttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtt 151595  T
Q  107 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtt 206  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||  | ||||||||    
T  151594 tggttgtatcttatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtt 151495  T
Q  207 tggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||  |||   | || ||||||||| |    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  151494 tggtagagacattgaagtcgacttagtttgtttacagttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataa 151411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 23707 - 23990
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||| | ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  23707 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 23806  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    ||| || | |||||    
T  23807 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgttctttgtctat 23906  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||| |||||| |  | ||||  || |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  23907 gtttggtcgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 23990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Original strand, 73792 - 73844
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73792 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattgttttat 73844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Original strand, 78173 - 78225
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78173 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattgttttat 78225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 182099 - 182047
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  182099 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 182047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 70
Target Start/End: Original strand, 175708 - 175753
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcatt 70  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  175708 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 175753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 1485 - 1771
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  1485 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgactgtgcatataagttgg 1584  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||   ||||||  | |||||    
T  1585 gtctggttgtatctgatacgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaattacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctat 1684  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | ||| | |||||| |  | ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1685 gtttggtagagactttgaagtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataa 1771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 5383 - 5669
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5383 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacgctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 5482  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||   | |||||    
T  5483 gtctggttgtatctaatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctat 5582  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| |||    | || ||||| ||| |  | ||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5583 gtttggtagagactttaaagtcgacttagtctgtttaccgttgacgggtatggatattatttttgggatgaactggttagagtataa 5669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 7874 - 7588
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  7874 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgactgtgcatataagttgg 7775  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||   ||||||  | |||||    
T  7774 gtctggttgtatctgatacgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaattacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctat 7675  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | ||| | |||||| |  | ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7674 gtttggtagagactttgaagtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataa 7588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 5023 - 5309
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | | ||| |||| ||||||||||    
T  5023 atcagaggtacttgtttctttaatactactcctttaattgatattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 5122  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | | |   ||||||  | |||||    
T  5123 gtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtctctttaaggtgtccgttgtctat 5222  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||| |||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5223 gtttggtagagattttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataa 5309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Original strand, 17658 - 17946
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||| |||| | | ||| |||| ||||||||||    
T  17658 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacattggtgctacttattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 17757  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |   | |||   |  ||||    
T  17758 gtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggagtcagttgactat 17857  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||| |||||  | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  17858 gtttggtagagattttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgttatttttggaataaattggttagagtataatc 17946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 1028 - 1314
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1028 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 1127  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||  | |||||    
T  1128 gtctggttgtatatgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctat 1227  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||| ||| |  | |||||| | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1228 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgagaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataa 1314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 42828 - 42542
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   |||| ||||| ||||||||||    
T  42828 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttatttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgtagttgattgtgcatataagttgg 42729  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||    
T  42728 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctat 42629  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  42628 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccattgacaggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataa 42542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 260
Target Start/End: Original strand, 50545 - 50775
Alignment:
Q  30 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 129  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| ||     
T  50545 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctaccttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 50644  T
Q  130 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatt 229  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||||| ||| ||||    
T  50645 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcatatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatt 50744  T
Q  230 tagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 260  Q
    ||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  50745 tagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 50775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 40185 - 39902
Alignment:
Q  7 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| | | ||| |||| ||||||||||| |    
T  40185 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacacaggtgctactcattgttttattgctttagaaagtgcatataagttggggt 40086  T
Q  107 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtt 206  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||| |   ||||||  | ||||||||    
T  40085 tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggtttagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtccgttgtctatgtt 39986  T
Q  207 tggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||||||| | || ||||| |||||  | ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  39985 tggtagagattttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacaggtatggatgttagttttggaatgaattggttagagtataa 39902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Original strand, 17523 - 17754
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||   |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||  |  ||| |||||   ||||||||    
T  17523 atcagaggtacttgttatattaataatacacctttagttgctattattgatacaggtgctacgcattgtttcatttcttatgattgtgctactaagttgg 17622  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || |     |  |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||    
T  17623 gtcttatcatgcctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggctcgctgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcct-tgtctat 17721  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttg 236  Q
    ||||| | | ||||||| ||| |||||||||||    
T  17722 gtttgatcgtgattttgagatggatttagtttg 17754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12090 - 11804
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  12090 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggcgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 11991  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| | | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  11990 gtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctat 11891  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||| | |||| | ||||| | |||||| || | ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11890 gtttggtagatactttgaggttgatcttgtttgtttgccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataa 11804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 1057 - 1343
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  |||||||||    
T  1057 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagctactggtgctactcattatttcattgttgttgattgtgcgcataagttgg 1156  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||  | |||||    
T  1157 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctat 1256  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1257 gtttggtagagactttgaagtggacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataa 1343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 2998 - 2715
Alignment:
Q  7 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| | |||  ||||| ||||||||||||     
T  2998 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggggctactcattgtttcattgttgttgcttgtgcatataagttgggtc 2899  T
Q  107 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtt 206  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | ||||||||    
T  2898 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtt 2799  T
Q  207 tggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||| ||||   | ||| |||| ||| || | ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  2798 tggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatagatgtaatttttgggatgaactggttagagtataa 2715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 55
Target Start/End: Original strand, 11917 - 11968
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgata 55  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11917 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgata 11968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 29657 - 29371
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||   |||| ||||| ||||||||||    
T  29657 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgcagttgattgtgcatataagttgg 29558  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| | | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  29557 gtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcacttgtttgtttgagttgtccattgtctat 29458  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| |||| | ||||| | || ||| || | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29457 gtttggtagagactttgaggttgatcttgtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataa 29371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 53597 - 53883
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | || ||| ||| |||| |||||||| |    
T  53597 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagaaactggtgctactcattgtttcaatgctatagaaagtgcatataagttag 53696  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    ||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||   |||||  | |||||    
T  53697 gtttaattgtatctgaaatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctat 53796  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  53797 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattagttagagtataa 53883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 63693 - 63979
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  63693 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcttttaattgctattatagatactggtgttactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgg 63792  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  63793 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctat 63892  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | ||| |||| ||| || | |||  |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  63893 gtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgttgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataa 63979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 2126 - 2413
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||    
T  2126 atcagaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgttcttataagttgg 2225  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||| |  | |||||    
T  2226 gtctggttgtatctgatatgaaaggggatatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgttcgttgtctat 2325  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttg-gaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||||||| |    ||||| | |||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||    
T  2326 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttactgttgaccgctatggatgttatttttgaggatgaactggttagagtataa 2413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 70502 - 70216
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||  ||| | | |||||||| ||||||||||    
T  70502 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgttactcattgtttctttgctttagaatgtgcatataagttgg 70403  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |   ||||||  | |||||    
T  70402 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaattgttgttgaaactctagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctat 70303  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||| |||||  | |||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  70302 gtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggaatgtatgttatttttgggatgaattggttagagtataa 70216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 29 - 315
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  29 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatacgggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 128  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    ||| |  | |||||    
T  129 gtctggttatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtataagatgtacgttgtctat 228  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  229 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagggtataa 315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 94068 - 94354
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||    
T  94068 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 94167  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||   ||||||  | |||||    
T  94168 gtctgcttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctat 94267  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||||||||   | |||||||| |||||  | |||  ||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  94268 gtttggtagagattttgaagtcgatttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagaatataa 94354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 115692 - 115406
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | | || ||||| |||||  | |    
T  115692 atcagaggtacttgtttctttaatagtatccctttaattgctattatagatactggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcatataaactag 115593  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||    
T  115592 gtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgatatgtcctatatctat 115493  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||| |||||||   | |||||||||||  |  || ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  115492 gtttggtagggattttgaagtagatttagtttgcttaccactgacggggatggatgttatatttgggatgaattggttagagtataa 115406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12857 - 12601
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  12857 atcaggggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 12758  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    |||||  | |||||    
T  12757 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaagttgtccattgtctat 12658  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 260  Q
    |||||||||||| ||||  ||  || | |||||| || | |||||||||||||||||    
T  12657 gtttggtagagactttgaaatcaatcttgtttgtttgccgttgacgggtatggatgt 12601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 9401 - 9612
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||    
T  9401 atcagaggtacttgtttcattaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtacttataagttgg 9500  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||    
T  9501 gtctggttgtatctgatatgaaacgggaaatagttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctat 9600  T
Q  204 gtttggtagaga 215  Q
    ||||||||||||    
T  9601 gtttggtagaga 9612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 50232 - 49949
Alignment:
Q  7 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||      
T  50232 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttggggc 50133  T
Q  107 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtt 206  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||  | ||||||||    
T  50132 tagttgtatctgatatgaaaggagaaattgttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctatgtt 50033  T
Q  207 tggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||| ||||   | ||| | |||||  |  | ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  50032 tggtagagactttgaagtcgatcttgtttgcttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaaatggttagagtataa 49949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 1446 - 1732
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | || | ||||| ||||||||||    
T  1446 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctacacattgtttcattgttgttaattgtgcatataagttgg 1545  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||  | | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  1546 gtctgattatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 1645  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   ||||| | || ||| || | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  1646 gtttggtagagactttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaattggttagaatataa 1732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 28459 - 28745
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | || | ||||| ||||||||||    
T  28459 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctacacattgtttcattgttgttaattgtgcatataagttgg 28558  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||  | | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  28559 gtctgattatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 28658  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   ||||| | || ||| || | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  28659 gtttggtagagactttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaattggttagaatataa 28745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 43593 - 43879
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  43593 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgg 43692  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| | | ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  43693 gtctggttatgtctgatatgaatggaaaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 43792  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||| | ||||   | ||| |||| ||| || |||||||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  43793 gtttggtagatactttgaactcgatctagtatgtttgccattgacgggtatgaatgtaatttttgggatgaactggttagagtataa 43879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 25216 - 25060
Alignment:
Q  134 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagt 233  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  |||| |||||| | |||||| ||   |||||  | ||||||| |||||||||||||| | || | || ||    
T  25216 tggttgtcgaaactcgagctaagggttcgataactacttctttggtttgtttgagttgtccgttgtctatgtatggtagagattttgaggttaacttggt 25117  T
Q  234 ttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||| |  | |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||||  |||||||    
T  25116 ttgtttaccgttgacgggaatggatgtaatccttggtatgaactggttgaagtataa 25060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 54177 - 53891
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||     
T  54177 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgttactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgt 54078  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||   ||||||  | |||||    
T  54077 gtctggttgtatctgatatgaatgtagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctat 53978  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| |||    | || ||||| ||| |  | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  53977 gtttggtagagacttttaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactagttagagtataa 53891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 164575 - 164861
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  164575 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgccattgaatgtgcttataagttgg 164674  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||| |||   |||||   | |||||    
T  164675 gtctggttatatctgataagaaaggggaaatggttgttgaaactccagcaaatggttcaataactacttctcttgtttatctaaggtgtctattgtctat 164774  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||| || |||  | | |||||||| ||| |  | |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  164775 gtttggtagggactttcaggtcgatttagtgtgtttaccgttgacgggaatagatgttatttttgggatgaactggttagagtataa 164861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Original strand, 47157 - 47391
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||    
T  47157 atcagaggtacttgttattttaatagtacacctttagttactattattgattctggtgctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 47256  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || |   | | ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||| |||| ||||| || || ||||||||||| ||| |   ||||| | | |||||    
T  47257 gtctttctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccatctaa-ggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaaggtgtcttttgtctat 47355  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtct 239  Q
    ||||| | | |||||||  |||||||| ||||||||    
T  47356 gtttgatcgtgattttgaaattgatttggtttgtct 47391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 176
Target Start/End: Original strand, 30774 - 30920
Alignment:
Q  30 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 129  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| | |   |||||| | | | | ||||||||||| ||     
T  30774 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatgga 30873  T
Q  130 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 176  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  30874 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 30920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 152100 - 151978
Alignment:
Q  115 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagag 214  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | |    
T  152100 tctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtg 152001  T
Q  215 attttgtgattgatttagtttgt 237  Q
    |||||| ||||||||| ||||||    
T  152000 attttgagattgatttggtttgt 151978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 34464 - 34179
Alignment:
Q  7 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||  ||||||||||||     
T  34464 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaactgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgaatatgtatataagttgggtc 34365  T
Q  107 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtt 206  Q
     || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||   ||||||  | ||||||||    
T  34364 cggttgtatctgatatgaaagtggaaatggttgttgaaattccagctaagggttcagtagctatttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtt 34265  T
Q  207 tggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    ||||| ||| ||||   | ||  |||||||| | || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  34264 tggtaaagactttgaagtcgacctagtttgtttatcgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtacaatc 34179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Original strand, 989 - 1205
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  989 atcaaaggtacttgtttctttaatagtactcccttaattgctattatagacactagtgctactcattgttttattgctattgattgtgcatataagttgg 1088  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    |||||  | |||||    
T  1089 gtctggctgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttttctaagatgtccgttgtctat 1188  T
Q  204 gtttggtagagattttg 220  Q
    |||||||||||| ||||    
T  1189 gtttggtagagactttg 1205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 60855 - 60583
Alignment:
Q  18 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatct 117  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| | | | |||||    
T  60855 tttctttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttatatct 60756  T
Q  118 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagatt 217  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | ||||||||||||||||| |    
T  60755 gatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagagact 60656  T
Q  218 ttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||   | ||| |||| ||| || | ||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  60655 ttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataa 60583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 70238 - 70079
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  70238 atcagaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 70139  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcag 163  Q
    || | | | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70138 gtctagttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcag 70079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5935 - 5719
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  5935 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgttattatagatactagtgctactcattgtttcattgctatttaatgtgcatataagttgg 5836  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    |||||  | |||||    
T  5835 gtctggttgtatctgatatgaaagaagaaatggttgttgaaactccagctatgggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctat 5736  T
Q  204 gtttggtagagattttg 220  Q
    |||||||||||| ||||    
T  5735 gtttggtagagactttg 5719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 199 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 5686 - 5595
Alignment:
Q  199 tctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5686 tctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataa 5595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Original strand, 41282 - 41357
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattg 79  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  41282 atcagaggtacatgttacattaatagtactcccttaattactattatagatactggtgctacacattgttttattg 41357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 110726 - 110454
Alignment:
Q  18 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatct 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| ||| |||    
T  110726 tttctttaatagtactcctttaattgctgttatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtgtct 110627  T
Q  118 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagatt 217  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  110626 gatatgaaaggagaaatggttgttaaaactccggctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagact 110527  T
Q  218 ttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||   |  |  |||||||| |  | ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  110526 ttgaagtcaacctagtttgtttacctttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataa 110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 5311 - 5025
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  5311 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 5212  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||    |||||  | || ||    
T  5211 gtctggttatgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctgaggtttcagtaactatttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtcaat 5112  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | ||| | |||||| |  | ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5111 gtttggtagagactttgaagtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataa 5025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Original strand, 20710 - 20918
Alignment:
Q  12 tacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggat 111  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||| |||||| ||| |    
T  20710 tacttgtttctttcatagtactcctttaaatgttattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataaattgggtctggtt 20809  T
Q  112 gtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggta 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||||||||||    
T  20810 gtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggta 20909  T
Q  212 gagattttg 220  Q
    |||| ||||    
T  20910 gagactttg 20918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Original strand, 12530 - 12738
Alignment:
Q  12 tacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggat 111  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||| |||| | ||| |    
T  12530 tacttgtttctttcatagtactcctttaaatgttattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataaattggatctggtt 12629  T
Q  112 gtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggta 211  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||||||||||    
T  12630 gtatcaaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggta 12729  T
Q  212 gagattttg 220  Q
    |||| ||||    
T  12730 gagactttg 12738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Original strand, 8636 - 8852
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |    
T  8636 atcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactagtgctactcaatgtttcattgctatcgaatgtgcttataagttag 8735  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||  | |||||    
T  8736 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctat 8835  T
Q  204 gtttggtagagattttg 220  Q
    |||||||||||| ||||    
T  8836 gtttggtagagactttg 8852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Original strand, 18850 - 19066
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |    
T  18850 atcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactagtgctactcaatgtttcattgctatcgaatgtgcttataagttag 18949  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||  | |||||    
T  18950 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctat 19049  T
Q  204 gtttggtagagattttg 220  Q
    |||||||||||| ||||    
T  19050 gtttggtagagactttg 19066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1056 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold1056
Description:

Target: scaffold1056; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 1851 - 1565
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  1851 atcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgg 1752  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| | | ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||   | |||  | |||||    
T  1751 gtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttcttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcttttctttgtttgagttttccactgtctat 1652  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   | ||| |||| ||| || | || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1651 gtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttaacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataa 1565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 5732 - 5446
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||  | ||| ||||||||||    
T  5732 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgtttatgcatataagttgg 5633  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || ||| | | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||   |||||  | |||||    
T  5632 gtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttatttgtttgacttgtccgttgtctat 5533  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   |  || |||| ||| || | ||| |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5532 gtttggtagagactttgaagtcaatctagtatgtttgccgttgtcgggcatggatgtaatttttgggatgaattggttagagtataa 5446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 4263 - 4549
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  4263 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 4362  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || |   | | ||   |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||   |||||| | |||||    
T  4363 gtctacttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcttttgtttgtttgagttgtcctttgtctat 4462  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||| ||||   ||||| | || ||| || | ||||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||| |||||    
T  4463 gtttggtagagactttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgacgggtttggatgtaatccttgggatgaactggttagaatataa 4549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 179
Target Start/End: Original strand, 6431 - 6606
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| ||||||||||    
T  6431 atcagaggtacttgtttctataatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgg 6530  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 179  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  6531 gtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccggctaagggttcagtgactacttctcttgt 6606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 39 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21946 - 21695
Alignment:
Q  39 aattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggtt 138  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| | | || ||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||     
T  21946 aattgctattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagagtgtgcatataaattgggtttgattatatctgatatgaaaggagaaatggtc 21847  T
Q  139 gttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtc 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || |||||||||     
T  21846 gttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgttcggtagggattttgaggtagacttagtttgtt 21747  T
Q  239 tgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |  |  ||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  21746 taccgctgacgggaatggatgttatttttgggattaattggttagagtataa 21695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 4478 - 4650
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  4478 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaatttctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 4577  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 176  Q
    ||  || | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4578 gtcgggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 4650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 39 - 290
Target Start/End: Original strand, 49086 - 49337
Alignment:
Q  39 aattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggtt 138  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  49086 aattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgatgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggtt 49185  T
Q  139 gttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtc 238  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||||   | ||||||||||||||||| ||||   | ||| |||| | |     
T  49186 gttgaaaatcaagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatatt 49285  T
Q  239 tgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    || | ||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  49286 tgccgttgtcgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataa 49337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 142
Target Start/End: Original strand, 9195 - 9333
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  9195 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 9294  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttg 142  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9295 gtcaggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttg 9333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 11955 - 11674
Alignment:
Q  7 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||     
T  11955 agagatacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagaccatggtgctacacattgtttcattgctattgattgtgcatataagttgggtc 11856  T
Q  107 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtt 206  Q
    ||  |||  | | |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||   |||||| | ||||||||    
T  11855 tgattgt--caggtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtttgagttgtcctttgtctatgtt 11758  T
Q  207 tggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||   ||||| | || ||| ||   ||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  11757 tggtagagattttgaagttgatcttgtatgtttgctgttgtcgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttggagtataa 11674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 26161 - 25956
Alignment:
Q  85 gaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtc 184  Q
    |||||||| |||||||||||  ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  26161 gaatgtgcatataagttgggcctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtt 26062  T
Q  185 tgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttaga 284  Q
    |   ||||||  | |||||||||||||||||||||| | | || ||||| |||||  | |||| ||| ||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  26061 taaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggaatggatgttattttcgggatgaattggttaga 25962  T
Q  285 gtataa 290  Q
    ||||||    
T  25961 gtataa 25956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 18005 - 17720
Alignment:
Q  7 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 106  Q
    |||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| | ||||||||||     
T  18005 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctgttgattgtgcgtctaagttgggtc 17906  T
Q  107 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtt 206  Q
    |   | | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || ||||||||||| ||| |    |||||| | ||||||||    
T  17905 ttactatgtcgaatatgaatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtt 17806  T
Q  207 tggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    |||| |||| ||||  |||||||| |||||| |  | ||||  || |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  17805 tggtcgagactttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaatc 17720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Original strand, 111081 - 111237
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||    
T  111081 atcagaggtacatgttattttaatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 111180  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggtt 160  Q
    || | | | | ||  ||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  111181 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagtgatggttgtcgaaactccagctaagggtt 111237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Original strand, 10332 - 10620
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | | || ||||| | ||  ||||    
T  10332 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgccacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 10431  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || |  || | |||| |||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || | |||||| | |||||    
T  10432 gtctacatatgtctggtatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 10531  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataatc 292  Q
    ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||    
T  10532 gtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtaattctgggtatgaattggttagagtacaatc 10620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 5215 - 4932
Alignment:
Q  7 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 106  Q
    |||||||| | || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| | ||||||||||     
T  5215 agaggtacatgttactttgatagtactcttttaattgctattattgatactggtgctacgcattgttttattggtgttgattgtgcttctaagttgggtc 5116  T
Q  107 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtt 206  Q
    | | | | |   ||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||   ||||||| | || |||||    
T  5115 ttgttatgttaaatatgaatggagatatggtcgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaaggtgtcctttgtcgatgtt 5016  T
Q  207 tggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||| |||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||||  || |||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||    
T  5015 tggtcgagactttgaaattgatttagtttgtttgtctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttggagtataa 4932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 23472 - 23758
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||| | ||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||  |||| | ||||||||    
T  23472 atcagaggtacgtgttattttgatagtactcctttagttgctattattgataatagtgctacgcattgttttattgctcttgatagtgcttctaagttgg 23571  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | | | | ||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||| |    |||| | |||||||    
T  23572 gtcttgctatgtctaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggcgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcatttatctat 23671  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || | ||||  || |||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||    
T  23672 gtttggtagagattttgagattgatttggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaattcttggtatgaactggttggagtataa 23758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 237
Target Start/End: Original strand, 9549 - 9758
Alignment:
Q  28 agtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaag 127  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||| |     | ||  ||||||| |    
T  9549 agtactcctttagttgatattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttacaatgtcgaatatgaatg 9648  T
Q  128 gggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattga 227  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9649 gagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttgagattga 9748  T
Q  228 tttagtttgt 237  Q
    ||| ||||||    
T  9749 tttggtttgt 9758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 123
Target Start/End: Original strand, 19143 - 19262
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19143 atcagaggtgcttgtttctttaatagtactcctttaattactattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 19242  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatg 123  Q
    |||||| |||||||| ||||    
T  19243 gtttggttgtatctgttatg 19262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 111 - 290
Target Start/End: Original strand, 3451 - 3630
Alignment:
Q  111 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggt 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||    
T  3451 tgtatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgagatgtcctatatctatgtttggt 3550  T
Q  211 agagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    || |||||||   | || ||||||||  |  || |||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3551 agggattttgaagtagacttagtttgcttaccactgacagggatggatgtgatatttgggatgaattggttagagtataa 3630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 17240 - 17523
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | ||  ||||    
T  17240 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgg 17339  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| |||||||    
T  17340 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctat 17439  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    ||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | ||||  | ||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  17440 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcgatatggatgtgattcttggtatgaattggttagagta 17523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24433 - 24219
Alignment:
Q  7 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 106  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| | |||| ||||  |  || |||| |     
T  24433 agaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactattatagatactagggctacacattgttttattgttgttgattgtgtttcgaaattggatc 24334  T
Q  107 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtt 206  Q
    | | | | ||  ||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||| || || ||| |||||||| | || |||||    
T  24333 ttgttatgtcatatatgaatggagaaatggttgtcgaaaccccggctaagggttcagtgactacttctctagtatgcctgaagtgtcctttgtcgatgtt 24234  T
Q  207 tggtagagattttgt 221  Q
    |||||||||||||||    
T  24233 tggtagagattttgt 24219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 235
Target Start/End: Original strand, 195038 - 195243
Alignment:
Q  30 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 129  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||  ||     
T  195038 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgattgga 195137  T
Q  130 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatt 229  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||  | ||||| | ||| ||||    
T  195138 gagatagttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggacgtgatttcgagatggatt 195237  T
Q  230 tagttt 235  Q
    ||||||    
T  195238 tagttt 195243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 36628 - 36345
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | | || ||||  | ||  ||||    
T  36628 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttcattgctttcgattgtgtttctactttgg 36529  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||    
T  36528 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctat 36429  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    ||||||| | |||||||  || ||| ||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  36428 gtttggtcgtgattttgaaatggatctagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttggtatgaattggttagagta 36345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 3608 - 3562
Alignment:
Q  244 ttgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3608 ttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataa 3562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 6978 - 6720
Alignment:
Q  29 gtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagg 128  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  ||||||| ||    
T  6978 gtactcctttaactgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatgg 6879  T
Q  129 ggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgat 228  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||  || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||     
T  6878 agaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgac 6779  T
Q  229 ttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || |||||| |  | ||||  || |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  6778 ttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 6720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14108 - 13850
Alignment:
Q  29 gtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagg 128  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  ||||||| ||    
T  14108 gtactcctttaactgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatgg 14009  T
Q  129 ggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgat 228  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||  || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||     
T  14008 agaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgac 13909  T
Q  229 ttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || |||||| |  | ||||  || |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  13908 ttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 13850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 4069 - 4242
Alignment:
Q  7 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||||     
T  4069 agaggtacttgtttctttaatagtactc---taattgctattattgacactggtgctacactttgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtc 4165  T
Q  107 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 183  Q
    ||| | | ||   |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4166 tggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttatcttgtttgt 4242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 260
Target Start/End: Original strand, 7972 - 8211
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||| || |  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  7972 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttttgattgggtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 8071  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccact--tctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 220  Q
    ||| || || |||||||| ||||||||||||||  |||| || || |||  ||||| || ||| |||  ||| || | |||||||||||| | |||||||    
T  8072 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaacgttcggtgactacttctctctcgtatgtttgcgatgttctttgtctatgtttggtcgtgattttg 8171  T
Q  221 tgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 260  Q
      || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  8172 aaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 8211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 290
Target Start/End: Original strand, 15175 - 15439
Alignment:
Q  26 atagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaa 125  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||| |   | | ||  |||||||    
T  15175 atagtactcctttagttgctattattaatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcaaatatgaa 15274  T
Q  126 aggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgatt 225  Q
     || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||| | || ||| |    | |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15275 tggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctttagtgtgtttaagatatcctttatctatgtttggtagatattttgagatt 15374  T
Q  226 gatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||| |||||| || | ||||  || |||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||    
T  15375 gatttggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaattcttggtatgaactggttggagtataa 15439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 29102 - 29385
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | ||  ||||    
T  29102 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgataatggtgctacgcattgatttattgctttcgattgtgtttctactttgg 29201  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | ||| ||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| |||||||    
T  29202 gtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctat 29301  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttgga-atgaattggttagagta 287  Q
    ||||||| | |||||||  || ||||||||||||||    ||||  ||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  29302 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacatttgagcggtatggatgtgat-tctggatatgaattggttagagta 29385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22358 - 22094
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  22358 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 22259  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  22258 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 22159  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  22158 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 22094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 26460 - 26196
Alignment:
Q  26 atagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaa 125  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | |||| ||||| | |||||||||| |   | | ||  |||||||    
T  26460 atagtactcttttagttgctattattgatattggtgctacgcaatgttttattgttgttgattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcgaatatgaa 26361  T
Q  126 aggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgatt 225  Q
     || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||    |||||| |||||||||||||| |||| ||||  |||    
T  26360 tggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtcgagactttgaaatt 26261  T
Q  226 gatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||| |||||| || | ||||  || |||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||    
T  26260 gatttggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttggagtataa 26196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 260
Target Start/End: Original strand, 37020 - 37250
Alignment:
Q  30 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 129  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| ||||||||||||| ||     
T  37020 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatctgatatgaatgga 37119  T
Q  130 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatt 229  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | |||||   ||| || |    
T  37120 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgatatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcaagatggact 37219  T
Q  230 tagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 260  Q
    ||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  37220 tagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 37250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 216594 - 216877
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||| | || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | |  ||||| |    
T  216594 atcagaggtacatgttactttgatagtactactttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgttattgattgtacttcaaagttag 216693  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcag-tgtcctatatcta 202  Q
    || | | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| | ||| |||||| | ||||    
T  216694 gtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtagaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgt-ttcagatgtcctttgtcta 216792  T
Q  203 tgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||| ||||||||   |||||||| |||||| |  | ||||  || |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  216793 tgattggtcgagattttaaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 216877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 14440 - 14723
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||| | || |||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||   ||||||||    
T  14440 atcagaggtacatgttactttgatattactcctttaatagcttttattgatactggtgctacacattgttttatttctattgattgtgctcctaagttgg 14539  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| | | |    |||||| | |||||    
T  14540 gtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtatttaagatgtcctttgtctat 14639  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||| |||||| |  | ||||  || ||||| || ||| |||||||||| |||||||||||    
T  14640 gtttggtcgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggaagtaatccttggaatgaactggttagagta 14723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 13653 - 13936
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  13653 atcagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattgatgctacacattgttctattgctattgattgtgcttctaagttgg 13752  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | | | | ||  ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||  |    |||||  | |||||    
T  13753 gtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagagttcggtgactacttctcttgtgtgattaagatgtccattgtctat 13852  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    ||||||| ||||||||   ||||||||||||||| |  | ||||  || |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  13853 gtttggtcgagattttaaaattgatttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 13936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4564 - 4331
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||    
T  4564 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 4465  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | | | | ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||    
T  4464 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccatctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 4365  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 237  Q
    ||||| | | ||||||| ||| ||||| ||||||    
T  4364 gtttgatcgtgattttgagatcgatttggtttgt 4331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 147 - 1
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||    
T  147 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 48  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcca 150  Q
    || | | | | ||| ||||||| || || |||||||| |||||||||    
T  47 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactcca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 237
Target Start/End: Original strand, 57788 - 58021
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||| | ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||| |    
T  57788 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgttattgattgtgcttctaagttag 57887  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | | | | ||  ||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||    
T  57888 gtcttgctatgtcgaatatgaatggaaagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 57987  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 237  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||    
T  57988 gtttggtcgagattttgaaattgatttggtttgt 58021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 1225 - 1489
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| | | || | ||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  1225 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgtattgctttattgctttcgactttgtttctactttgggtcttgatttttctgatat 1324  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||||| |    
T  1325 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgag 1424  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||| ||||    
T  1425 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttacagta 1489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 10479 - 10215
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  10479 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 10380  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  10379 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 10280  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  10279 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 10215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2129 - 1913
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||   ||||||||    
T  2129 atcagaggtacatgtttcattaatagtactcctttaattactattatagatactggtgctacgcattgttttattgttgctgattgtgctactaagttgg 2030  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || |   | | ||  ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||| | || ||  || |||||||| | || ||    
T  2029 gtcttattatgtcatatatgaatggggaaatggttgtcgaaaccccagctaagggttcggtgactacttctttagtatgcttgaagtgtcctttgtcgat 1930  T
Q  204 gtttggtagagattttg 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  1929 gtttggtagagattttg 1913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 13094 - 13350
Alignment:
Q  31 actcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggg 130  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||| || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || |    
T  13094 actcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgatttataaatatcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggag 13193  T
Q  131 aaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgattt 230  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| || ||||||||||| | |||||||  || |||||    
T  13194 agatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttaactatgtttggtcgtgattttgaaatggattt 13293  T
Q  231 agtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    |||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  13294 agtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattatgggtatgaattggttagagta 13350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 31994 - 31730
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | | || ||||| | |   |||||| | | | | | ||||||    
T  31994 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgttacgcattattttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtttgatat 31895  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  31894 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgat 31795  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||| ||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  31794 atggatttagtttgtctacctttgagcggtttggatgtgattctaggtatgaattggttagagta 31730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 10439 - 10695
Alignment:
Q  31 actcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggg 130  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || |    
T  10439 actcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattactttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggag 10538  T
Q  131 aaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgattt 230  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| || ||||||||||| | |||||||  || |||||    
T  10539 agatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttaactatgtttggtcgtgattttgaaatggattt 10638  T
Q  231 agtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    |||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  10639 agtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattatgggtatgaattggttagagta 10695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 54737 - 54484
Alignment:
Q  34 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaa 133  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||   |||||||||| |     | ||| ||||||| || ||||    
T  54737 cctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttttcatgtctaatatgaatggagaaa 54638  T
Q  134 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagt 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | ||||||| ||| ||||||||    
T  54637 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttttctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagt 54538  T
Q  234 ttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    |||| |  | ||||  ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||    
T  54537 ttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatgaactggttagagta 54484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 37460 - 37196
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | | || ||||| | |   |||||| | | | | | ||||||    
T  37460 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgttacgcattattttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtttgatat 37361  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||  | ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  37360 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttctgttactacttctctcttatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgat 37261  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||| ||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  37260 atggatttagtttgtctacctttgagcggtttggatgtgattctaggtatgaattggttagagta 37196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18048 - 17784
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    ||| ||||  | |   ||| || | ||| | ||||||||    
T  18048 ttaataatactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcctatgattgtgtttctgctttgagtcttgatttgtctgatat 17949  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  17948 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 17849  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||| ||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  17848 atggatttggtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 17784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11580 - 11316
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    ||| ||||  | |   ||| || | ||| | ||||||||    
T  11580 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcctatgattgtgtttctgctttgagtcttgatttgtctgatat 11481  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  11480 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 11381  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||| ||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  11380 atggatttggtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 11316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 55115 - 55059
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattg 79  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55115 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattg 55059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 53719 - 53601
Alignment:
Q  142 gaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgt 241  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||| ||||||||      
T  53719 gaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttggtttgtctac 53620  T
Q  242 cattgacgggtatggatgt 260  Q
    | ||||  |||||||||||    
T  53619 ctttgagcggtatggatgt 53601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14193 - 13931
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatga 124  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||   |||||||||| | | | | ||||||||||    
T  14193 aatagtacacctttagttgctattattgatagtggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctgatatga 14094  T
Q  125 aaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgat 224  Q
    | || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    ||| || | ||||| |||| | | || |||| |||    
T  14093 atggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttaagatgttctttgtctatttttgatcgtgactttgagat 13994  T
Q  225 tgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    |||||| ||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||    
T  13993 tgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagta 13931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 11394 - 11293
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||   ||||||||    
T  11394 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 11295  T
Q  104 gt 105  Q
    ||    
T  11294 gt 11293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 25287 - 25235
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25287 aatagtactcctttaattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 25235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Original strand, 2022 - 2126
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | || ||||| ||||||||||    
T  2022 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagagtgtgcatataagttgg 2121  T
Q  104 gtttg 108  Q
    |||||    
T  2122 gtttg 2126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8369 - 8105
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || ||||  | |   || ||| | ||  | ||||||||    
T  8369 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtatctgctttaggtcttgaattgtctgatat 8270  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||| |||||  | |||||||||||| | |||||||      
T  8269 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcattgtccgttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 8170  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||| |||||    
T  8169 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagta 8105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 13317 - 13581
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  13317 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtcttgatttgtctgatat 13416  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| |  || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| |||| ||| ||||| | |||||||      
T  13417 gaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttatcaatggttggtcgtgattttgaa 13516  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  | ||||||||| || || || |||||||||||||||||    
T  13517 atggatttagtttgtctacctttgagcgttatggatgtgattttgggtatgaattggttagagta 13581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 41266 - 41002
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| | | || | ||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  41266 ttaataatactcctttagttgctattattgacactggggctacgcattgctttattgctttggattatgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 41167  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  41166 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 41067  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  41066 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 41002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3535 - 3271
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  3535 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgccttgggtcttgatttgtctgatat 3436  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  3435 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 3336  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  3335 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17290 - 17007
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||   ||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   ||||    
T  17290 atcagaggtacttgttatattaataaaactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 17191  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||| || ||| |    || ||| |||||||    
T  17190 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttaagatgccctttatctat 17091  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    |||| || | |||||||  || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  17090 gtttagtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 17007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8353 - 8070
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||  | | ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||| |||||   | ||| ||    
T  8353 atcagaggtacttgttattgtgatagtacgcctttagttgctattattgatactagtgctacacattgttttattgcttttgattgtgctacttagtcgg 8254  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    |  | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||    
T  8253 gacttgatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 8154  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    ||||| | | ||||||| |||| |||| ||||||||  | ||||  | ||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||    
T  8153 gtttgatcgtgattttgagattcatttggtttgtctaccgttgagtgctatggatgtaattcttggtatgaactggttagagta 8070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 179
Target Start/End: Original strand, 55644 - 55819
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||   ||||||||    
T  55644 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttattgctattgattgtgctactaagttgg 55743  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 179  Q
    || |   | | ||| ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  55744 gtcttactatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 55819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 1260 - 1061
Alignment:
Q  85 gaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtc 184  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||    
T  1260 gaatgtgcatataagttgggtctggttgtatccgatatgaaaggataaatggttgttgaaactccagctaagggtt--------acttctcttgtttgtc 1169  T
Q  185 tgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttaga 284  Q
    |    ||||   | ||||||||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||    
T  1168 taagatgtctgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactagttaga 1069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 237
Target Start/End: Original strand, 2456 - 2670
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||   |||||||||| | | | | ||||||||    
T  2456 ttaataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattcttttattgcttatgaatgtgctactaagttgggtcttgttatgtctgatat 2555  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | ||||||| |    
T  2556 gaatggagacatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgag 2655  T
Q  223 attgatttagtttgt 237  Q
    || ||||| ||||||    
T  2656 atagatttggtttgt 2670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15540 - 15269
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||     
T  15540 atcagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttg- 15442  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
               ||  |||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | ||||     
T  15441 -----------tcaaatatgaaaggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctac 15353  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    | ||||| |||||||||  |||||||| |||||| |  | ||||  || |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  15352 gattggtcgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 15269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8521 - 8336
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||   |||||||||| | |   | ||||||||    
T  8521 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatat 8422  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttg 208  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| ||| ||   |||||| | ||||||||||    
T  8421 gaatggagaaatggttgtcgaaactccagttaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttgagatgtcctttgtctatgtttg 8336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 239
Target Start/End: Original strand, 34915 - 35124
Alignment:
Q  30 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 129  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| ||     
T  34915 tactcctttagttgctattattgatactggtgctaagcattgttttattgttttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 35014  T
Q  130 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatt 229  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||    
T  35015 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacgtctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatt 35114  T
Q  230 tagtttgtct 239  Q
    ||||||||||    
T  35115 tagtttgtct 35124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 41762 - 41479
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||| | ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||    
T  41762 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 41663  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | | | | |   |||||||  | || ||||||||  ||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |    |||||| | |||||    
T  41662 gtcttgctatgtaaaatatgaatagagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 41563  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    ||||| | | |||||||  ||||| ||||||||| |  | ||||  ||||||||||| ||| |||  ||||||| |||||||||    
T  41562 gtttgatcgtgattttgaaattgacttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttgatatgaatttgttagagta 41479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 75482 - 75199
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||| | ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||    
T  75482 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 75383  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | | | | |   |||||||  | || ||||||||  ||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |    |||||| | |||||    
T  75382 gtcttgctatgtaaaatatgaatagagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 75283  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    ||||| | | |||||||  ||||| ||||||||| |  | ||||  ||||||||||| ||| |||  ||||||| |||||||||    
T  75282 gtttgatcgtgattttgaaattgacttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttgatatgaatttgttagagta 75199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1093 - 829
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  1093 ttaatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgtttcttttttgggtcttgttttgtctgatat 994  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||| | || ||  |  |||||||| | |||||||||| | | ||||||| |    
T  993 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctgtcgtatgcttaaagtgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgag 894  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    ||||| || |||||| |    ||||  ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  893 attgaattggtttgtttacgtttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2119 - 1886
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    |||||| |||||| ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||||   ||||||||    
T  2119 atcagaagtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 2020  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || |   | | ||| ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||    
T  2019 gtctttctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 1920  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 237  Q
    ||||| | | ||||||| ||||||| | ||||||    
T  1919 gtttgatcgtgattttgagattgatatggtttgt 1886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 3681 - 3524
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||    
T  3681 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctatcattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 3582  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 161  Q
    || | | | | ||| ||||||| || || |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3581 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttc 3524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18780 - 18497
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   ||||    
T  18780 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgatattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 18681  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | ||  | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |    |||||| | |||||    
T  18680 gtcttgagttgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 18581  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    ||||| | | |||||||  |||||||| |||||| |  | ||||  ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  18580 gtttgattgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 18497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 237
Target Start/End: Original strand, 24916 - 25119
Alignment:
Q  34 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaa 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||   |||||  ||| | |   | ||||||||||| || ||||    
T  24916 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagtcaggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 25015  T
Q  134 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagt 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||| |    |||||| |||||||||||| | | ||||||| ||| ||||||||    
T  25016 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacatctcttgtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagt 25115  T
Q  234 ttgt 237  Q
    ||||    
T  25116 ttgt 25119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Original strand, 1147 - 1199
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1147 aatagtactcctttgattgcaattatagatactggtgctactcattcttttat 1199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 179
Target Start/End: Original strand, 7913 - 8088
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||   |||| |||    
T  7913 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctattgattgtgctactaaggtgg 8012  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 179  Q
    || | | | | ||| |||| || || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||    
T  8013 gtcttgctatgtctaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgaaaacttctcttgt 8088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 179
Target Start/End: Original strand, 40681 - 40856
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    |||||||||||||  |  ||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||   ||||||||    
T  40681 atcagaggtacttgctattttgatagtacacctttagttgccattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 40780  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 179  Q
    || | | | | ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||| || || |||||||||||    
T  40781 gtcttgttatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgt 40856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 286
Target Start/End: Original strand, 674 - 936
Alignment:
Q  24 taatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatg 123  Q
    ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | |||||||||    
T  674 taataatactcattaagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 773  T
Q  124 aaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtga 223  Q
    || || || |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||   | | |||||| ||| |||||||||| | |||||||  |    
T  774 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggtaactacttctctcgtatgatagaaatgtcctttatatatgtttggtcgtgattttgaaa 873  T
Q  224 ttgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagt 286  Q
    | ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||    
T  874 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagt 936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 237
Target Start/End: Original strand, 552 - 785
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||   || ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||   ||| ||||    
T  552 atcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaaattgg 651  T
Q  104 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 203  Q
    || | |   | ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |    |||||| | |||||    
T  652 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttctgtgactacttcacttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 751  T
Q  204 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 237  Q
    ||||| | | ||||||| ||||||| | ||||||    
T  752 gtttgatcgtgattttgagattgatatggtttgt 785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 4691 - 4538
Alignment:
Q  26 atagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaa 125  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||| | | | | ||| |||||||    
T  4691 atagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgttattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaa 4592  T
Q  126 aggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 179  Q
     || || |||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||||| |||||    
T  4591 tggagagatggttgtcgaaactccagctgagggttcggtgactacttcccttgt 4538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 239
Target Start/End: Original strand, 11084 - 11289
Alignment:
Q  34 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaa 133  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||   |||||||||| | |   | ||||||||||| || ||||    
T  11084 cctttagtttctattattgatactagtgctacacattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 11183  T
Q  134 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagt 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | ||||||| ||| ||||| ||    
T  11184 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttggt 11283  T
Q  234 ttgtct 239  Q
    ||||||    
T  11284 ttgtct 11289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 51781 - 51716
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcat 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  51781 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactcgtgctactcat 51716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 51702 - 51656
Alignment:
Q  244 ttgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  51702 ttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataa 51656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 11549 - 11813
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  11549 ttaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 11648  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||| || ||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| ||   |||||| ||||||||||| || | |||||||      
T  11649 gaatggagatatggttttttaaactccagctaagggttcggtgactacttgtctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttagtcgtgattttgaa 11748  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    ||  |||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  11749 atgaatttagtttgtctacccttgagcggtatggatgtgattatgggtatgaattggttagagta 11813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 15011 - 14884
Alignment:
Q  34 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaa 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||   |||||||||| | |   | ||||||||||| || ||||    
T  15011 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 14912  T
Q  134 tggttgttgaaactccagctaagggttc 161  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14911 tggttgtcgaaactccagctaagggttc 14884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 252 - 15
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  252 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttttttgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 153  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||  || || |||||||| || ||| ||   |||||| ||||||||||||||   |||||||      
T  152 gaatggagagatggtcgtcgaaacttcagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcatgattttgaa 53  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 260  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  52 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 15  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7347 - 7194
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  7347 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 7248  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 176  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  7247 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 7194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 104335 - 104182
Alignment:
Q  26 atagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaa 125  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||| ||||||   | | | ||  |||||||    
T  104335 atagtacacctttagtttctattattgataatggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaatttgggtcctgttatgtcaaatatgaa 104236  T
Q  126 aggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 179  Q
     || || |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  104235 tggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggtaactacttctcttgt 104182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 144 - 13
Alignment:
Q  30 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 129  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || | ||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| ||     
T  144 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattatgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 45  T
Q  130 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 161  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 13  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9047 - 8847
Alignment:
Q  34 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaa 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| |  | | |||||   |||||||||| | |   | ||||||||||| || ||||    
T  9047 cctttagttgctattattgatactggtgctacacatt---ttattgcttattattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 8951  T
Q  134 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagt 233  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | ||||||| ||| ||||||||    
T  8950 tggttgtcgaaactccagccaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgattgtgattttgagatggatttagt 8851  T
Q  234 ttgt 237  Q
    ||||    
T  8850 ttgt 8847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21715 - 21478
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | |||||| |    
T  21715 ttaataatactcccttagttgctattattgatatcggtgctacgcattattttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgattt 21616  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| || | | |||| | |||||||||||| | ||||| | |    
T  21615 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgag 21516  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 260  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  21515 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 21478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 37139 - 36902
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | |||||| |    
T  37139 ttaataatactcccttagttgctattattgatatcggtgctacgcattattttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgattt 37040  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 222  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| || | | |||| | |||||||||||| | ||||| | |    
T  37039 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgag 36940  T
Q  223 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 260  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  36939 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 36902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1426 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1426
Description:

Target: scaffold1426; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 55
Target Start/End: Original strand, 1781 - 1832
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgata 55  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1781 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgata 1832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 11155 - 11076
Alignment:
Q  7 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattga 86  Q
    |||||||| | || |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  11155 agaggtacatgttactttgatagtactcatttaattgttattattgatactggtactactcattgttttattgctattga 11076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 237
Target Start/End: Original strand, 21413 - 21592
Alignment:
Q  58 ggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagg 157  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||  | | | | ||   |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21413 ggtgctacgcattgttttattgctactgattgtgcttctaagttgggccttgttatgtcatgtatggatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagg 21512  T
Q  158 gttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 237  Q
    |||| || || |||||||| || |||||| |||||||  | || ||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||    
T  21513 gttcggtgactacttctctagtgtgtctgaagtgtccgttctcgatgtttggtcgagactttgaagttgatttagtttgt 21592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 16783 - 16840
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 61  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16783 atcagaggtacatgtttctttaattgtactcctttaattgctattattgatactggtg 16840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 176
Target Start/End: Original strand, 962 - 1115
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||| ||    
T  962 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgacat 1061  T
Q  123 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 176  Q
    ||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||| || || ||||||||    
T  1062 gaatggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttcggtgactacttctct 1115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12678 - 12510
Alignment:
Q  119 atatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattt 218  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||    
T  12678 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 12579  T
Q  219 tgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    || ||||||| | |||||  || | ||||  |||||||| || ||  ||||  ||||||||||||||||    
T  12578 tgagattgatatggtttgcttgcctttgagtggtatggacgtcattcttggtctgaattggttagagta 12510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 48776 - 48720
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattg 79  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48776 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattg 48720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2062 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold2062
Description:

Target: scaffold2062; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 74
Target Start/End: Original strand, 1051 - 1121
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttt 74  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||    
T  1051 atcagaggtacttgtttctttaataatacgcctttaattgctattatagacactagtgttactcattgttt 1121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1517 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1517
Description:

Target: scaffold1517; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Original strand, 1661 - 1707
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattat 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1661 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 1707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Original strand, 5499 - 5551
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5499 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 5551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Original strand, 816 - 868
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  816 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Original strand, 13526 - 13578
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13526 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 13578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3620 - 3448
Alignment:
Q  115 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagag 214  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | |    
T  3620 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactgcagctaaggtttcggtaactatttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtg 3521  T
Q  215 attttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 287  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||    
T  3520 attttgaaattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagta 3448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 26505 - 26453
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26505 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 26453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 35194 - 35142
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35194 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 35142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 24072 - 24020
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24072 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 24020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 8266 - 8214
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8266 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 8214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 90611 - 90559
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  90611 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 90559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Original strand, 21071 - 21123
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21071 aatagtactcctttgattgcaattattgatagtggtgctactcattcttttat 21123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Original strand, 30647 - 30699
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30647 aatagtactcctttgattgcaattattgatagtggtgctactcattcttttat 30699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2165 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold2165
Description:

Target: scaffold2165; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 47
Target Start/End: Original strand, 977 - 1020
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctat 47  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  977 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 1020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Original strand, 15753 - 15828
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattg 79  Q
    ||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15753 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgcaattattgatactggtgctacgcattgtttaattg 15828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 2994 - 2923
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttt 75  Q
    ||||||||||||| ||   |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2994 atcagaggtacttgttatattaataatactccattagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttt 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 2680 - 2628
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2680 aataatactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 2628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Original strand, 7057 - 7109
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  7057 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctacttattcttttat 7109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0605
Description:

Target: scaffold0605; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 1410 - 1364
Alignment:
Q  4 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattat 50  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1410 atcagaggtacttgtttcttgaatagtactcctttaatagctattat 1364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 1355 - 1266
Alignment:
Q  201 tatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    |||||||||||||||||||| | | || ||||| |||||  | |||  ||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  1355 tatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttgggaatggatgttattttcgggatgaattggttagattataa 1266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2111 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold2111
Description:

Target: scaffold2111; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 290
Target Start/End: Original strand, 2 - 47
Alignment:
Q  245 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtataa 290  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2 tgacggggatggatgttatatttgggatgaattggttagagtataa 47  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 3608 - 3563
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcatt 70  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  3608 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactcatt 3563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 171229 - 171188
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgcta 64  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  171229 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 171188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Original strand, 4097 - 4149
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4097 aatagtactccgttgattgcaattatcgatactggtgctactcattcttttat 4149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Original strand, 6199 - 6251
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6199 aatagtactactttgattgcaataattgatactggtgctactcattcttttat 6251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 1320 - 1268
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1320 aatagtactcttttgatttcaattattgatactggtgctactcattcttttat 1268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Original strand, 5000 - 5052
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  5000 aataatactcctttgattgcaattatcgatactggtgctactcattcttttat 5052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 26885 - 26833
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  26885 aatagtactcctttgattgcaattattgatactgttgctacttattcttttat 26833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Original strand, 131684 - 131736
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  131684 aatagaactcctttgattgcaattattgatacttgtgctactcattattttat 131736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0789 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0789
Description:

Target: scaffold0789; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 49 - 1
Alignment:
Q  23 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattg 71  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  49 ttaataatactcctttaagtgctataattgatagtggtgctacgcattg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 16019 - 15967
Alignment:
Q  25 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 77  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||    
T  16019 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgttacttattcttttat 15967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University