View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21373_low_21 (Length: 229)

Name: NF21373_low_21
Description: NF21373
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21373_low_21
NF21373_low_21
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (35-212)||(26704351-26704528)
chr6 (35-212)||(2837563-2837740)
chr6 (35-212)||(6086611-6086788)
chr6 (35-212)||(30691869-30692046)
chr6 (35-212)||(26946888-26947065)
chr6 (39-212)||(3955782-3955955)
chr6 (35-212)||(21893473-21893650)
chr6 (35-212)||(3347535-3347712)
chr6 (35-212)||(17261085-17261262)
chr6 (35-212)||(9459581-9459758)
chr6 (35-212)||(18613556-18613733)
chr6 (35-212)||(34887304-34887481)
chr6 (38-212)||(16307023-16307197)
chr6 (35-212)||(1153611-1153788)
chr6 (35-212)||(11167258-11167435)
chr6 (35-212)||(20726809-20726982)
chr6 (35-212)||(30698941-30699118)
chr6 (35-212)||(28199520-28199698)
chr6 (44-212)||(35198302-35198469)
chr6 (67-212)||(52854-52999)
chr6 (35-160)||(33464399-33464524)
chr6 (35-137)||(53001-53103)
chr6 (152-212)||(33463719-33463779)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (35-212)||(14422721-14422898)
chr8 (35-212)||(18594555-18594732)
chr8 (35-212)||(39206604-39206781)
chr8 (38-212)||(10836770-10836944)
chr8 (35-212)||(2042536-2042713)
chr8 (35-212)||(13110422-13110599)
chr8 (35-212)||(22260642-22260819)
chr8 (35-212)||(29938079-29938256)
chr8 (35-212)||(144412-144589)
chr8 (35-212)||(24113178-24113355)
chr8 (38-212)||(35118046-35118220)
chr8 (35-212)||(4035865-4036042)
chr8 (35-212)||(7774782-7774959)
chr8 (35-212)||(38167167-38167344)
chr8 (35-212)||(6144285-6144462)
chr8 (35-212)||(33278418-33278595)
chr8 (35-212)||(34679469-34679646)
chr8 (35-212)||(34998908-34999085)
chr8 (35-212)||(7791429-7791606)
chr8 (35-212)||(34842377-34842554)
chr8 (35-212)||(39218795-39218972)
chr8 (38-212)||(41575531-41575705)
chr8 (35-212)||(44804956-44805133)
chr8 (38-212)||(7812013-7812187)
chr8 (38-212)||(36491175-36491349)
chr8 (35-212)||(5320582-5320759)
chr8 (35-212)||(28639296-28639475)
chr8 (74-212)||(40117903-40118041)
chr8 (67-212)||(33287069-33287214)
chr8 (35-212)||(66191-66369)
chr8 (39-212)||(8021737-8021902)
chr8 (38-212)||(42571612-42571783)
chr8 (91-212)||(26783801-26783922)
chr8 (35-151)||(9807339-9807455)
chr8 (79-173)||(2322068-2322162)
chr8 (79-212)||(39220274-39220407)
chr8 (102-205)||(5005191-5005294)
chr8 (143-212)||(9806891-9806960)
[»] chr3 (39 HSPs)
chr3 (35-212)||(37698141-37698318)
chr3 (38-212)||(42307906-42308080)
chr3 (39-212)||(25999401-25999574)
chr3 (35-212)||(21581055-21581232)
chr3 (38-212)||(38856106-38856280)
chr3 (35-212)||(25494283-25494460)
chr3 (38-212)||(15520143-15520317)
chr3 (35-212)||(8042620-8042797)
chr3 (35-212)||(22174988-22175165)
chr3 (35-212)||(29445501-29445678)
chr3 (35-212)||(32244133-32244310)
chr3 (35-208)||(46452160-46452333)
chr3 (35-212)||(50528942-50529119)
chr3 (38-212)||(12117659-12117833)
chr3 (35-212)||(20842346-20842523)
chr3 (35-212)||(35226460-35226637)
chr3 (35-212)||(15520649-15520826)
chr3 (35-212)||(20699162-20699339)
chr3 (35-212)||(42104969-42105146)
chr3 (35-212)||(54870172-54870349)
chr3 (38-212)||(44609334-44609508)
chr3 (35-212)||(24835697-24835874)
chr3 (35-212)||(38933959-38934135)
chr3 (35-212)||(54534326-54534501)
chr3 (35-212)||(2895198-2895379)
chr3 (33-212)||(34700354-34700533)
chr3 (35-212)||(32359272-32359449)
chr3 (36-180)||(16354391-16354535)
chr3 (41-212)||(26122827-26122998)
chr3 (35-204)||(44688782-44688950)
chr3 (35-212)||(53028238-53028407)
chr3 (74-212)||(35643230-35643368)
chr3 (35-162)||(48925001-48925128)
chr3 (91-212)||(50529827-50529948)
chr3 (35-198)||(12915934-12916096)
chr3 (97-212)||(49128062-49128177)
chr3 (35-111)||(24366143-24366219)
chr3 (28-104)||(13696914-13696990)
chr3 (38-71)||(50528883-50528916)
[»] chr1 (47 HSPs)
chr1 (35-212)||(25897390-25897567)
chr1 (35-212)||(29078532-29078709)
chr1 (28-212)||(1168519-1168703)
chr1 (35-212)||(39260358-39260535)
chr1 (35-212)||(20089487-20089664)
chr1 (35-212)||(26580282-26580459)
chr1 (35-212)||(52753159-52753336)
chr1 (35-212)||(29288165-29288340)
chr1 (35-212)||(26663274-26663451)
chr1 (35-212)||(33510500-33510677)
chr1 (28-212)||(8079714-8079898)
chr1 (37-212)||(38829085-38829260)
chr1 (35-212)||(12682836-12683013)
chr1 (35-212)||(16052112-16052289)
chr1 (35-212)||(19715173-19715350)
chr1 (35-212)||(43905670-43905847)
chr1 (35-212)||(970536-970715)
chr1 (35-212)||(1940759-1940936)
chr1 (39-212)||(40092507-40092680)
chr1 (39-212)||(41928511-41928684)
chr1 (35-212)||(42370807-42370984)
chr1 (35-212)||(52696807-52696984)
chr1 (35-213)||(17587517-17587695)
chr1 (35-212)||(1170456-1170633)
chr1 (35-212)||(2347672-2347850)
chr1 (35-212)||(5215401-5215578)
chr1 (35-208)||(17591709-17591881)
chr1 (35-212)||(32671595-32671772)
chr1 (35-212)||(46760982-46761159)
chr1 (35-212)||(2473738-2473915)
chr1 (35-212)||(8120885-8121062)
chr1 (41-212)||(49146188-49146359)
chr1 (39-212)||(15203128-15203301)
chr1 (35-212)||(46409451-46409630)
chr1 (35-210)||(7145226-7145400)
chr1 (38-212)||(13996738-13996912)
chr1 (35-212)||(51359229-51359405)
chr1 (35-194)||(40149497-40149656)
chr1 (38-212)||(23498476-23498650)
chr1 (35-180)||(15717833-15717977)
chr1 (35-192)||(6765495-6765652)
chr1 (35-208)||(15554164-15554329)
chr1 (62-212)||(29695691-29695842)
chr1 (35-193)||(38171867-38172012)
chr1 (99-212)||(52086283-52086396)
chr1 (80-212)||(23322897-23323029)
chr1 (79-161)||(5217840-5217921)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (35-212)||(36721-36898)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (35-212)||(12101180-12101357)
chr7 (35-212)||(30181026-30181203)
chr7 (35-212)||(42964998-42965175)
chr7 (38-212)||(7164201-7164375)
chr7 (35-208)||(24792334-24792507)
chr7 (35-212)||(33359092-33359269)
chr7 (35-212)||(3511340-3511517)
chr7 (35-192)||(25748524-25748681)
chr7 (35-212)||(43067975-43068152)
chr7 (38-212)||(22649699-22649873)
chr7 (35-212)||(42204171-42204349)
chr7 (35-212)||(4477323-4477500)
chr7 (35-212)||(5280877-5281054)
chr7 (35-212)||(20346505-20346682)
chr7 (35-212)||(933302-933479)
chr7 (35-212)||(1803043-1803220)
chr7 (35-212)||(38866561-38866738)
chr7 (35-209)||(36890832-36891006)
chr7 (35-212)||(6394768-6394945)
chr7 (35-208)||(12097592-12097765)
chr7 (35-212)||(15655929-15656106)
chr7 (39-212)||(32041559-32041732)
chr7 (35-212)||(33846531-33846703)
chr7 (35-212)||(43156730-43156907)
chr7 (40-212)||(4347290-4347462)
chr7 (35-212)||(42673482-42673655)
chr7 (42-212)||(8630683-8630853)
chr7 (35-212)||(9452607-9452784)
chr7 (38-212)||(46134309-46134483)
chr7 (35-173)||(48865689-48865827)
chr7 (35-194)||(17753635-17753794)
chr7 (35-212)||(46891341-46891519)
chr7 (35-194)||(16894509-16894668)
chr7 (35-212)||(43021582-43021755)
chr7 (84-212)||(19828287-19828415)
chr7 (79-212)||(37005857-37005990)
chr7 (79-212)||(43405037-43405170)
chr7 (134-212)||(37704997-37705075)
chr7 (140-197)||(27691433-27691490)
chr7 (86-173)||(36849590-36849677)
chr7 (79-180)||(15655458-15655559)
chr7 (95-162)||(20163886-20163953)
chr7 (79-162)||(30075277-30075357)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (39-212)||(9008073-9008246)
chr5 (35-212)||(24105683-24105860)
chr5 (35-212)||(27679181-27679358)
chr5 (35-212)||(1579055-1579232)
chr5 (35-212)||(1605583-1605760)
chr5 (35-212)||(16069372-16069549)
chr5 (35-212)||(16737459-16737636)
chr5 (35-212)||(33491208-33491385)
chr5 (35-212)||(3386498-3386675)
chr5 (35-212)||(20992158-20992335)
chr5 (38-212)||(27420877-27421051)
chr5 (35-212)||(3921600-3921777)
chr5 (35-212)||(31883163-31883340)
chr5 (28-212)||(4120956-4121140)
chr5 (35-212)||(1165613-1165790)
chr5 (35-212)||(19358545-19358722)
chr5 (38-212)||(33991159-33991333)
chr5 (39-212)||(5202991-5203164)
chr5 (35-212)||(8374351-8374527)
chr5 (38-212)||(35782659-35782833)
chr5 (39-209)||(38598466-38598636)
chr5 (38-194)||(26602957-26603113)
chr5 (35-212)||(31410495-31410672)
chr5 (35-186)||(27025001-27025152)
chr5 (96-197)||(20992354-20992455)
chr5 (90-212)||(33284642-33284764)
chr5 (35-81)||(35420436-35420482)
chr5 (95-180)||(31638196-31638281)
chr5 (112-165)||(41818552-41818605)
chr5 (79-162)||(25634651-25634732)
chr5 (97-180)||(19516044-19516127)
[»] chr4 (62 HSPs)
chr4 (35-212)||(54189561-54189738)
chr4 (35-212)||(28032712-28032889)
chr4 (35-212)||(15241028-15241205)
chr4 (35-212)||(19913630-19913807)
chr4 (39-212)||(23776463-23776636)
chr4 (35-212)||(31969697-31969874)
chr4 (35-212)||(37968757-37968934)
chr4 (35-212)||(50055101-50055278)
chr4 (37-212)||(38055173-38055348)
chr4 (38-212)||(1756767-1756941)
chr4 (35-212)||(8591092-8591269)
chr4 (35-212)||(14987808-14987985)
chr4 (35-212)||(16700797-16700974)
chr4 (35-212)||(20877063-20877240)
chr4 (35-208)||(27488648-27488821)
chr4 (35-212)||(52139219-52139396)
chr4 (35-212)||(53717464-53717641)
chr4 (35-212)||(54412644-54412821)
chr4 (28-212)||(11639571-11639755)
chr4 (35-212)||(19164973-19165149)
chr4 (35-212)||(1617100-1617277)
chr4 (35-212)||(6611360-6611537)
chr4 (35-212)||(40428720-40428897)
chr4 (35-212)||(43289960-43290137)
chr4 (35-212)||(45424534-45424711)
chr4 (35-212)||(50353817-50353994)
chr4 (35-212)||(2481408-2481585)
chr4 (35-212)||(44784917-44785094)
chr4 (35-212)||(48909862-48910039)
chr4 (28-212)||(23704202-23704386)
chr4 (35-212)||(6688627-6688798)
chr4 (35-212)||(8932178-8932355)
chr4 (35-212)||(30423565-30423741)
chr4 (35-212)||(33703857-33704034)
chr4 (35-212)||(35490773-35490950)
chr4 (35-212)||(37464737-37464914)
chr4 (35-197)||(53353090-53353256)
chr4 (35-212)||(47632050-47632228)
chr4 (35-212)||(15669199-15669376)
chr4 (35-212)||(27583632-27583809)
chr4 (35-212)||(53875673-53875850)
chr4 (35-187)||(27536104-27536256)
chr4 (38-212)||(40680041-40680215)
chr4 (35-212)||(44379187-44379364)
chr4 (39-212)||(38071327-38071497)
chr4 (57-212)||(28360446-28360602)
chr4 (28-212)||(55344818-55345002)
chr4 (35-212)||(30171596-30171773)
chr4 (35-212)||(44375861-44376038)
chr4 (35-151)||(23269046-23269162)
chr4 (35-206)||(16703843-16704014)
chr4 (79-212)||(50053459-50053592)
chr4 (80-162)||(51780763-51780845)
chr4 (35-110)||(53408137-53408213)
chr4 (79-212)||(44548185-44548318)
chr4 (143-212)||(23265865-23265934)
chr4 (79-191)||(17493370-17493482)
chr4 (35-86)||(23261886-23261937)
chr4 (35-126)||(9595902-9595982)
chr4 (35-72)||(50055301-50055338)
chr4 (84-141)||(55344724-55344781)
chr4 (35-89)||(48748197-48748251)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (35-212)||(22963-23140)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (35-212)||(33906059-33906236)
chr2 (38-212)||(26323201-26323375)
chr2 (35-212)||(31517227-31517404)
chr2 (38-212)||(3873259-3873433)
chr2 (43-212)||(1108295-1108464)
chr2 (35-212)||(2178781-2178958)
chr2 (35-212)||(18806896-18807073)
chr2 (38-212)||(4232157-4232331)
chr2 (35-212)||(28329851-28330026)
chr2 (35-212)||(5733415-5733592)
chr2 (35-212)||(16066306-16066483)
chr2 (35-212)||(39635468-39635645)
chr2 (35-212)||(4016055-4016232)
chr2 (35-212)||(19383947-19384124)
chr2 (35-212)||(42937735-42937913)
chr2 (35-212)||(1482915-1483091)
chr2 (35-212)||(6174840-6175017)
chr2 (37-212)||(16588790-16588965)
chr2 (35-212)||(851013-851190)
chr2 (38-212)||(19901153-19901326)
chr2 (79-212)||(30420223-30420356)
chr2 (35-192)||(30270691-30270848)
chr2 (38-192)||(429852-430006)
chr2 (35-212)||(44947561-44947731)
chr2 (79-193)||(42446625-42446739)
chr2 (86-180)||(22101210-22101304)
chr2 (79-170)||(3585348-3585439)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (35-197)||(18-180)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (28-212)||(3726-3910)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (35-212)||(145257-145434)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (35-212)||(307-484)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (35-212)||(10254-10431)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (35-212)||(18-196)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 26704351 - 26704528
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26704351 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 26704450  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26704451 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 26704528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2837740 - 2837563
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2837740 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatgagcagctcatgaaactatga 2837641  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2837640 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 2837563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 6086611 - 6086788
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6086611 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 6086710  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6086711 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 6086788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30692046 - 30691869
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30692046 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 30691947  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30691946 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 30691869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 26946888 - 26947065
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26946888 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 26946987  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26946988 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaata 26947065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 39 - 212
Target Start/End: Original strand, 3955782 - 3955955
Alignment:
Q  39 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3955782 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagtttatgaaactatgataag 3955881  T
Q  139 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3955882 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaata 3955955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21893650 - 21893473
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21893650 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 21893551  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21893550 taagctatttttatatatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaata 21893473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 3347535 - 3347712
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3347535 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 3347634  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3347635 taagctgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaata 3347712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 17261085 - 17261262
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  17261085 aaggaggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaaatatta 17261184  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17261185 taagctatttttatttatttacccaaacacctttagaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 17261262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9459758 - 9459581
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9459758 aaggaggatacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 9459659  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | | ||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  9459658 taagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatggaaatagataagctcacataaactcaaaata 9459581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18613733 - 18613556
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18613733 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatggaactatga 18613634  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  18613633 taagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccgcataagctcaaaata 18613556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 34887304 - 34887481
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34887304 aaggaggtcacataaattcattagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagcttatgaaactatga 34887403  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  34887404 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaggagataaacccacataagctcaaaata 34887481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Original strand, 16307023 - 16307197
Alignment:
Q  38 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16307023 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 16307122  T
Q  138 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  16307123 gctgtttttatttatttatccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaata 16307197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1153788 - 1153611
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1153788 aaggaggttacataaatacataagcaccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 1153689  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||| ||||||    
T  1153688 taatctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccaacataagcttaaaata 1153611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11167435 - 11167258
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11167435 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggtgggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 11167336  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | || |||||| ||| |||||||||||||    
T  11167335 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgaaaataaataagcacacataagctcaaaata 11167258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20726982 - 20726809
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20726982 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 20726883  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20726882 taagttattttta----tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaata 20726809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 30698941 - 30699118
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  30698941 aaggaggttacataaattcataagctcattgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctaataaaactatga 30699040  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||| ||| |||| ||||    
T  30699041 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaataaataagctcacataaactcataata 30699118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 28199520 - 28199698
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28199520 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcatatgaaactatga 28199618  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagta---gataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||| |||| |||||||||||||    
T  28199619 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat-ggagtagatgataagtccacataagctcaaaata 28199698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 44 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 35198469 - 35198302
Alignment:
Q  44 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 143  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35198469 acataaattcataagttccttgttaagccggagagtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 35198370  T
Q  144 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  35198369 tttatttatttacccaaacacctttaaaaag-cttatggaagtagataagcccacataagttcaaaata 35198302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 67 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 52999 - 52854
Alignment:
Q  67 taagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacct 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52999 taagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacct 52900  T
Q  167 ttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||  |||||   ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52899 ttaaaaatgcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaata 52854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 35 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 33464524 - 33464399
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33464524 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 33464425  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaa 160  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  33464424 taaactatttttacttatttacccaa 33464399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 53103 - 53001
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53103 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 53004  T
Q  135 taa 137  Q
    |||    
T  53003 taa 53001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 33463779 - 33463719
Alignment:
Q  152 tttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  33463779 tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaata 33463719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14422898 - 14422721
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14422898 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 14422799  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14422798 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 14422721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18594732 - 18594555
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18594732 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 18594633  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18594632 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 18594555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 39206781 - 39206604
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206781 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 39206682  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39206681 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 39206604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Original strand, 10836770 - 10836944
Alignment:
Q  38 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10836770 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataa 10836869  T
Q  138 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10836870 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 10836944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 2042536 - 2042713
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2042536 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 2042635  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2042636 taagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaata 2042713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13110599 - 13110422
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13110599 aaggaggttacataaactcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttattaaactatga 13110500  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13110499 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcatatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 13110422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 22260642 - 22260819
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22260642 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactagga 22260741  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22260742 taagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagacttatgggagtagataagctcacataagctcaaaata 22260819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 29938256 - 29938079
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29938256 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 29938157  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  29938156 taagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaata 29938079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 144589 - 144412
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144589 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 144490  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  144489 taaactatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacatatgctcaaaata 144412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 24113178 - 24113355
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24113178 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 24113277  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24113278 taatctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagggttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 24113355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Original strand, 35118046 - 35118220
Alignment:
Q  38 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35118046 gaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 35118145  T
Q  138 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35118146 gctatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 35118220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4036042 - 4035865
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4036042 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 4035943  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  4035942 taagctatttttatttgtttacccaaacacctttaataaaacttatgggagtagataagcccatataagctaaaaata 4035865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7774959 - 7774782
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7774959 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttaataaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 7774860  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  7774859 taatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaacccgcataagctcaaaata 7774782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 38167167 - 38167344
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38167167 aaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 38167266  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  38167267 taaactagttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataagcccacataaactcaaaata 38167344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 6144285 - 6144462
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6144285 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 6144384  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6144385 taagctatttttatttatttacccaaacactgttaaaaaggcatatgggagtagataagcccatataagctcaaaata 6144462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 33278595 - 33278418
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33278595 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 33278496  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||  ||| |||||||||    
T  33278495 taaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgaaagtagataagtccatataaactcaaaata 33278418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 34679469 - 34679646
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34679469 aaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagcttatgaaactatga 34679568  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  34679569 taaactatttttatttatttattcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaata 34679646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 34998908 - 34999085
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34998908 aaggagattaaataaattcataagctccttgttaagccggagggcaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactaaga 34999007  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||    
T  34999008 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccgtataagctcaaaata 34999085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7791606 - 7791429
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7791606 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 7791507  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||| |||||||||    
T  7791506 taatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaata 7791429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 34842377 - 34842554
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34842377 aaggaggtcacataaattaataagctccttgttaagacggtgggtaagctggaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 34842476  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34842477 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 34842554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 39218972 - 39218795
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39218972 aaggaggtcacataaattcatcagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaagctatga 39218873  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39218872 taaaccatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaata 39218795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 41575705 - 41575531
Alignment:
Q  38 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41575705 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 41575606  T
Q  138 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||    
T  41575605 gcaatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtctacataagctcaaaata 41575531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 44804956 - 44805133
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44804956 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 44805055  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||    
T  44805056 taagctatttttatttatttatctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataaacctacataagctcaaaata 44805133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7812187 - 7812013
Alignment:
Q  38 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7812187 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 7812088  T
Q  138 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| | ||| ||| |||||||||    
T  7812087 tctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactaatggaagtagataaactcacataaactcaaaata 7812013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36491349 - 36491175
Alignment:
Q  38 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  36491349 gaggttacataaattcataagcttcttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaagttatgaaactatgataa 36491250  T
Q  138 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  36491249 gctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaagacttatgcgattagataatcccacataagcttaaaata 36491175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5320759 - 5320582
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  5320759 aaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagttgaaaatttaggcttattgaaacatgacataagcaacttatgaaactatga 5320660  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  5320659 taaattatttttatttatttaccaaaacaactttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaata 5320582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28639475 - 28639296
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28639475 aaggaggttacataa--tcataagctctatgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 28639378  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagact----tataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  28639377 taaactatttttatttatttaccaaaacacctttaaaaaagcttgtatataggagtagataagctcacataagcttaaaata 28639296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 74 - 212
Target Start/End: Original strand, 40117903 - 40118041
Alignment:
Q  74 gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 173  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40117903 gagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaa 40118002  T
Q  174 gacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  40118003 ggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaata 40118041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 67 - 212
Target Start/End: Original strand, 33287069 - 33287214
Alignment:
Q  67 taagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacct 166  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33287069 taagctagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacct 33287168  T
Q  167 ttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||  | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33287169 ttaaaaaagcatatgggagtagataaacccacataagctcaaaata 33287214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 66191 - 66369
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcc-agagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatg 133  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  66191 aaggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccgaaagggtaagctgaaaatttaaacttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatt 66290  T
Q  134 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||  || |||||||||    
T  66291 ataagttatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagacatatgggaatagataagcctacagaaactcaaaata 66369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 39 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8021902 - 8021737
Alignment:
Q  39 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 138  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  8021902 aggttatataaactcataagctccttgttaagccgga--------tgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaa 8021811  T
Q  139 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8021810 ctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaata 8021737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 42571783 - 42571612
Alignment:
Q  38 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 137  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42571783 gaggttgcataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggc--attgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 42571686  T
Q  138 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  42571685 gctattttta-ttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagctcaaaata 42571612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Original strand, 26783801 - 26783922
Alignment:
Q  91 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  26783801 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagat 26783900  T
Q  191 aagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  26783901 aagcccacataagctcaaaata 26783922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 35 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 9807455 - 9807339
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9807455 aaggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaagctatga 9807356  T
Q  135 taagctatttttattta 151  Q
    |||||||||||||||||    
T  9807355 taagctatttttattta 9807339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 173
Target Start/End: Original strand, 2322068 - 2322162
Alignment:
Q  79 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 173  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2322068 taagcttaaaatttaggcttatcaaaatatgatataagcagcttatgaaattgtgataagctgtttttattgatttacccaaacacctttaaaaa 2322162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 39220407 - 39220274
Alignment:
Q  79 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactt 178  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| |   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  39220407 taagctcaaaatttgagcttattaaaatatagtatgagcagcttatgaaattggaataagctatttttattgatttactcaaacacctttaaaaagacat 39220308  T
Q  179 ataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    || |  |||||||||  ||  |||||||||||||    
T  39220307 atggatgtagataagttcatataagctcaaaata 39220274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5005294 - 5005191
Alignment:
Q  102 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgta 201  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| ||    
T  5005294 aaaatatagcataagcagtttatgagagtagcataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacata 5005195  T
Q  202 agct 205  Q
    ||||    
T  5005194 agct 5005191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9806960 - 9806891
Alignment:
Q  143 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  9806960 ttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcatatgggagtagataagcacatataaactcaaaata 9806891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 39)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 37698141 - 37698318
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37698141 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 37698240  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37698241 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 37698318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Original strand, 42307906 - 42308080
Alignment:
Q  38 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42307906 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 42308005  T
Q  138 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42308006 gctatttttatttatttacccaaacgcctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 42308080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 39 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25999574 - 25999401
Alignment:
Q  39 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25999574 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 25999475  T
Q  139 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25999474 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaata 25999401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21581232 - 21581055
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21581232 aaggatgttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 21581133  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21581132 taagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 21581055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38856280 - 38856106
Alignment:
Q  38 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38856280 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 38856181  T
Q  138 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  38856180 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaata 38856106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 25494283 - 25494460
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25494283 aaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagcaggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 25494382  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25494383 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataaacccacataagctcaaaata 25494460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Original strand, 15520143 - 15520317
Alignment:
Q  38 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  15520143 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaacgatgataa 15520242  T
Q  138 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15520243 gttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 15520317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8042797 - 8042620
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8042797 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 8042698  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  8042697 taaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaata 8042620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 22174988 - 22175165
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22174988 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 22175087  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22175088 taagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaata 22175165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 29445678 - 29445501
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  29445678 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataaacagcttatgaaactatga 29445579  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  29445578 taagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaata 29445501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32244310 - 32244133
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32244310 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 32244211  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||  |||| |||||||||||||    
T  32244210 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaatccacataagctcaaaata 32244133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 208
Target Start/End: Original strand, 46452160 - 46452333
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46452160 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtgagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatga 46452259  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaa 208  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  46452260 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaa 46452333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 50529119 - 50528942
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50529119 aaggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 50529020  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50529019 taagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaata 50528942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Original strand, 12117659 - 12117833
Alignment:
Q  38 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  12117659 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatgataa 12117758  T
Q  138 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  12117759 actatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaata 12117833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 20842346 - 20842523
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20842346 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcagcttatgaaactatga 20842445  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  20842446 taagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagctcacataagctcaaaata 20842523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 35226637 - 35226460
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35226637 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaggctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 35226538  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  35226537 taagctgattttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataagcccacataagctcaaaata 35226460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15520826 - 15520649
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15520826 aaggaggttacaaaaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 15520727  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15520726 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaata 15520649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20699339 - 20699162
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20699339 aaggaggttacaaaaattcctaagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 20699240  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20699239 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaata 20699162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 42104969 - 42105146
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42104969 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcatgagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 42105068  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42105069 taaactatttttatttttttatccaaacacctttaaaaatgtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 42105146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 54870172 - 54870349
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  54870172 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaacgatga 54870271  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  54870272 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataaactcaaaata 54870349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Original strand, 44609334 - 44609508
Alignment:
Q  38 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 137  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44609334 gaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 44609433  T
Q  138 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  44609434 gctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcaagtagataagtccacataagctcaaaata 44609508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 24835697 - 24835874
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24835697 aaggagtttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactataa 24835796  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | |  |||||||||||||    
T  24835797 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagttgataagtctatataagctcaaaata 24835874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38934135 - 38933959
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38934135 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactggaaatttagacttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 38934036  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  38934035 taagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataag-ccacataagctcaaaata 38933959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 54534326 - 54534501
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  54534326 aaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaa-tatggcataagcagcttat-aaaccatga 54534423  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54534424 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 54534501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2895379 - 2895198
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcata----agctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaact 130  Q
    |||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2895379 aaggaggttatataaattcatatataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaact 2895280  T
Q  131 atgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  2895279 atgataatttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaata 2895198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 33 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 34700533 - 34700354
Alignment:
Q  33 caaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 132  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34700533 caaaggaggttatataaattcataagcttcttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactat 34700434  T
Q  133 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  34700433 gataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatggaagtaaataaacccacataagctcaaaata 34700354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32359449 - 32359272
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32359449 aaggaggttacataaattcataagctctttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 32359350  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| | | |||||||  |||| |||||||||||||    
T  32359349 taaactatttttatttatttactcaaacacctttataaaagcttatggaaatagataaatccacataagctcaaaata 32359272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 36 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 16354535 - 16354391
Alignment:
Q  36 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16354535 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagcaggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaacatggcattagcagcttatgaaactatgat 16354436  T
Q  136 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttat 180  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16354435 aagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttat 16354391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 41 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26122998 - 26122827
Alignment:
Q  41 gttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagct 140  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26122998 gttacgtaaattcataagctacttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagct 26122899  T
Q  141 atttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26122898 atttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctcatgggaatagataaacccacataagctcaaaata 26122827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 44688950 - 44688782
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44688950 aaggaggttgcataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatg-cataagcagcttatgaaactatga 44688852  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagc 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| |||||    
T  44688851 taagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagc 44688782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 53028407 - 53028238
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  53028407 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaaatatga 53028308  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||        |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  53028307 taagctatttttatttattt--------acctctaaaaagacttatgggaatagataagcccacataagctcaaaata 53028238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 74 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 35643368 - 35643230
Alignment:
Q  74 gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 173  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35643368 gagggtaagctcaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaagcacctttaaaaa 35643269  T
Q  174 gacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    | ||||| | ||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  35643268 ggcttatggaagtagataagttcacataagctcaaaata 35643230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 162
Target Start/End: Original strand, 48925001 - 48925128
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  48925001 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctaaaaatttagacttattaaaatatgacataaacagcttatgaaactatga 48925100  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaac 162  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48925101 taaactatttttatttatttacccaaac 48925128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Original strand, 50529827 - 50529948
Alignment:
Q  91 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagat 190  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  50529827 ttaggctcattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagat 50529926  T
Q  191 aagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| |||| ||| |||||||||    
T  50529927 aagtccacataaactcaaaata 50529948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12916096 - 12915934
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| || |||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  12916096 aagggggttacataaattcataaactctttcttaaaccggagggtaagctgaaaacttaagcttatttaaatatgacataagcagtttatgaaattatga 12915997  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccac 198  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  12915996 taaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagatttat-ggagtaaataagcccac 12915934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 49128177 - 49128062
Alignment:
Q  97 ttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagccc 196  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49128177 ttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagttatttttattgatttacccaaacatctttaaaaagacttataggagtagataagccc 49128078  T
Q  197 acgtaagctcaaaata 212  Q
    || |||| | ||||||    
T  49128077 acataagtttaaaata 49128062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 24366219 - 24366143
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24366219 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggc 24366143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 13696990 - 13696914
Alignment:
Q  28 agaagcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaa 104  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13696990 agaatcaaaggaggttacacaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaa 13696914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 71
Target Start/End: Original strand, 50528883 - 50528916
Alignment:
Q  38 gaggttacataaattcataagctccttgttaagc 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50528883 gaggttacataaattcataagctccttgttaagc 50528916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 47)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25897567 - 25897390
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25897567 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 25897468  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25897467 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatatgcccacataagctcaaaata 25897390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 29078709 - 29078532
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29078709 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 29078610  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29078609 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 29078532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1168703 - 1168519
Alignment:
Q  28 agaagcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 127  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1168703 agaatcaaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 1168604  T
Q  128 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1168603 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 1168519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 39260358 - 39260535
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39260358 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatga 39260457  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39260458 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 39260535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20089664 - 20089487
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20089664 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 20089565  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20089564 taagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 20089487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 26580282 - 26580459
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26580282 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 26580381  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  26580382 taagctatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaata 26580459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 52753159 - 52753336
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52753159 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatga 52753258  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52753259 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 52753336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 29288340 - 29288165
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29288340 aaggaggttacata--ttcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 29288243  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29288242 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 29288165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26663451 - 26663274
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26663451 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacagcttatgaaactatga 26663352  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26663351 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 26663274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 33510677 - 33510500
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33510677 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 33510578  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  33510577 taaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaata 33510500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 212
Target Start/End: Original strand, 8079714 - 8079898
Alignment:
Q  28 agaagcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 127  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8079714 agaatcaaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccagagggtaagctgaaaacttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaa 8079813  T
Q  128 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8079814 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaata 8079898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 37 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38829260 - 38829085
Alignment:
Q  37 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgata 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38829260 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcacaagcagcttatgaaactatgata 38829161  T
Q  137 agctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  38829160 agctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccgacataagctcaaaata 38829085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12683013 - 12682836
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12683013 aaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctaaagatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 12682914  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12682913 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataaactcaaaata 12682836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16052289 - 16052112
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16052289 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 16052190  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16052189 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaata 16052112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 19715173 - 19715350
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19715173 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaacaatga 19715272  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19715273 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaata 19715350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 43905847 - 43905670
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43905847 aaggaggttacgtaaattcataagctccttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 43905748  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  43905747 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccaaataagctcaaaata 43905670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 970536 - 970715
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac--tat 132  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  970536 aaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatat 970635  T
Q  133 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  970636 gataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 970715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 1940759 - 1940936
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  1940759 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataaacaacttatgaaactatga 1940858  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1940859 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaata 1940936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 39 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 40092680 - 40092507
Alignment:
Q  39 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40092680 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 40092581  T
Q  139 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  40092580 atatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaata 40092507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 39 - 212
Target Start/End: Original strand, 41928511 - 41928684
Alignment:
Q  39 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41928511 aggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaa 41928610  T
Q  139 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  41928611 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagtccacataagttcaaaata 41928684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 42370807 - 42370984
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  42370807 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagcttatgaaactatga 42370906  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  42370907 taagttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaata 42370984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 52696984 - 52696807
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52696984 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 52696885  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52696884 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaata 52696807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 213
Target Start/End: Original strand, 17587517 - 17587695
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17587517 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaatatga 17587616  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaatat 213  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  17587617 taagctgtttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagctcacataagctcaaaatat 17587695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 1170456 - 1170633
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1170456 aaggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 1170555  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1170556 taagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacaaaagctcaaaata 1170633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2347850 - 2347672
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaa-tatggcataagcagcttatgaaactatg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  2347850 aaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaatatgacataagcagcttatgaaactatg 2347751  T
Q  134 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  2347750 ataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccgcataaactcaaaata 2347672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5215578 - 5215401
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5215578 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatga 5215479  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5215478 taagctatttttacttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgaaagtagataagcccacataagctcaaaata 5215401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 17591881 - 17591709
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17591881 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctggaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 17591782  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaa 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  17591781 taagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataag-ccacataagctcaa 17591709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32671772 - 32671595
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32671772 aagggggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatga 32671673  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  32671672 taagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaatccacataagctcaaaata 32671595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 46761159 - 46760982
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46761159 aaggaagttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatga 46761060  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| ||  |||| ||||||||    
T  46761059 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcaagtagataagctcatataagttcaaaata 46760982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2473915 - 2473738
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  2473915 aaggaggtaacataaattcataagctccttgttaagtaggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactataa 2473816  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  2473815 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggcgtagataagcccacataagctcaaaata 2473738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8121062 - 8120885
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8121062 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaaactgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 8120963  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  8120962 taaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagtccacataagctcaaaata 8120885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 41 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 49146359 - 49146188
Alignment:
Q  41 gttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagct 140  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49146359 gttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagatgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagct 49146260  T
Q  141 atttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  |||| |||||||||||||    
T  49146259 atttttatttatttatccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtatataaatccacataagctcaaaata 49146188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 39 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15203301 - 15203128
Alignment:
Q  39 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15203301 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggttggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataag 15203202  T
Q  139 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  ||||| ||||||    
T  15203201 ctatttttatttatttaccctaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacaaaagcttaaaata 15203128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 46409630 - 46409451
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaa--gccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46409630 aaggaggtcacataaattcataagctccttgttaattgtcgaagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactat 46409531  T
Q  133 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| |||| |||||||||||||    
T  46409530 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagattagataagtccacataagctcaaaata 46409451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7145400 - 7145226
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7145400 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 7145301  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaa 210  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||   ||| |||||||||||    
T  7145300 taaactatttttgtttatttaccc-aacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaatacacataagctcaaaa 7145226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Original strand, 13996738 - 13996912
Alignment:
Q  38 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 137  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  13996738 gaggttacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaccattataa 13996837  T
Q  138 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||||||    
T  13996838 gctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataatttcaaaata 13996912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 51359229 - 51359405
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51359229 aaggaggttacataaattcataaactccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaccttatgaaactatga 51359328  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| | |||| |||||||| | |||||||||||||    
T  51359329 taagctatttttaattatttacccaaa-acctttaagaaggcttatggcagtaaataagcccgcataagctcaaaata 51359405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 40149656 - 40149497
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  40149656 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttataaaactatga 40149557  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagc 194  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  40149556 taaattatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 40149497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23498650 - 23498476
Alignment:
Q  38 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |    
T  23498650 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcaacttatgaaactatgatga 23498551  T
Q  138 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  23498550 actatttttatttatttacccaaacaccttgaaaaaggcttgtggaagtagataagcccacataagcttaaaata 23498476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15717977 - 15717833
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15717977 aaggaggttacataaaatcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaattatggcataagcagcttatgaaactatga 15717878  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttat 180  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15717877 -aagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttat 15717833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 35 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 6765652 - 6765495
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  6765652 aaggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctcatgaaaatatga 6765553  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataa 192  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  6765552 taaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataaaagtagataa 6765495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 35 - 208
Target Start/End: Original strand, 15554164 - 15554329
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||           
T  15554164 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcatcagcagtttatgaa------- 15554256  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaa 208  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  15554257 -atgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaa 15554329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 62 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 29695842 - 29695691
Alignment:
Q  62 cttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaa 161  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  29695842 cttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaattatttttatttatttatccaaa 29695743  T
Q  162 caccttta-aaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29695742 cacctttaaaaaaaaattatgggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 29695691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 38172012 - 38171867
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||    
T  38172012 aaggaggttacataaattcataagctcattcttaagccggaggataagctgaaaatttaggca-------------cataagcagcttatgaaactatga 38171926  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataag 193  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||    
T  38171925 taaactgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgtgagtagataag 38171867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 99 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 52086396 - 52086283
Alignment:
Q  99 attaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccac 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| |||||    
T  52086396 attaaattatggcataagcagcttatgaaattatgataagttatttttactgatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagcagataaacccac 52086297  T
Q  199 gtaagctcaaaata 212  Q
     |||||| ||||||    
T  52086296 ataagcttaaaata 52086283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 212
Target Start/End: Original strand, 23322897 - 23323029
Alignment:
Q  80 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactta 179  Q
    ||||| |||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  ||||| |||| |||||   |||    
T  23322897 aagcttaaaatttgcgcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaattatgataaactatttttattgatttattcaaacgccttaaaaaaagttta 23322996  T
Q  180 taggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    | |||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  23322997 tgggagtagataagcctatataagctcaaaata 23323029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 161
Target Start/End: Original strand, 5217840 - 5217921
Alignment:
Q  79 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaa 161  Q
    |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5217840 taagctcaaaattatggcttataaaaatatggtataagcggcttatgaaattggtataagctattttta-ttatttacccaaa 5217921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36898 - 36721
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36898 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 36799  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36798 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 36721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 12101180 - 12101357
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12101180 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccatagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 12101279  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12101280 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaata 12101357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 30181026 - 30181203
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30181026 aagggggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 30181125  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30181126 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 30181203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 42964998 - 42965175
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42964998 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 42965097  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42965098 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 42965175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7164375 - 7164201
Alignment:
Q  38 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7164375 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 7164276  T
Q  138 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  7164275 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccatataagctcaaaata 7164201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 35 - 208
Target Start/End: Original strand, 24792334 - 24792507
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792334 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 24792433  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  24792434 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaa 24792507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 33359092 - 33359269
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33359092 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 33359191  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33359192 taagctatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaata 33359269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3511517 - 3511340
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3511517 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 3511418  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3511417 taagctatttttatctatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaata 3511340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 25748681 - 25748524
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25748681 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 25748582  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25748581 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataa 25748524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 43067975 - 43068152
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  43067975 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagaagcttatgaaactatga 43068074  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  43068075 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaata 43068152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Original strand, 22649699 - 22649873
Alignment:
Q  38 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22649699 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataa 22649798  T
Q  138 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22649799 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 22649873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 42204349 - 42204171
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42204349 aaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 42204250  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacaccttta-aaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42204249 taagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgagagtagataagcccacataagctcaaaata 42204171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 4477323 - 4477500
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4477323 aaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatga 4477422  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4477423 taagctatttttatttatttacccaaacacctttgaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 4477500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5281054 - 5280877
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5281054 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 5280955  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  5280954 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgtgaatagataagctcacataagctcaaaata 5280877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20346682 - 20346505
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20346682 aaggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 20346583  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20346582 taatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaata 20346505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 933479 - 933302
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  933479 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 933380  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||| | |||||||||||    
T  933379 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacatgagctcaaaata 933302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1803220 - 1803043
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  1803220 aaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatcgtataagcagcttatgaaactatga 1803121  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1803120 taagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 1803043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38866738 - 38866561
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38866738 aaggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataaacagcttatgaaactatga 38866639  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  38866638 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaattatgggagtagataaacccacataagctcaaaata 38866561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 209
Target Start/End: Original strand, 36890832 - 36891006
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36890832 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaacttaggcttattgaaatatggcataagcaacttatgaaactatga 36890931  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaa 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  36890932 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctcaaa 36891006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6394945 - 6394768
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6394945 aaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatga 6394846  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  6394845 taaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaata 6394768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 208
Target Start/End: Original strand, 12097592 - 12097765
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12097592 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagtagcttatgaaactatga 12097691  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaa 208  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||  |||||||||    
T  12097692 taatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaa 12097765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15656106 - 15655929
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15656106 aaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 15656007  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  15656006 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagcagataagcccacataagctcaaaata 15655929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 39 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32041732 - 32041559
Alignment:
Q  39 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 138  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32041732 aggttacataaatttataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataag 32041633  T
Q  139 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32041632 ctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaata 32041559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 33846531 - 33846703
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  33846531 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccc-----taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaactatga 33846625  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33846626 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 33846703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 43156907 - 43156730
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  43156907 aaggaggttacataaattcataagttctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatttgccataaacagcttatgaaactatga 43156808  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  43156807 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaata 43156730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4347462 - 4347290
Alignment:
Q  40 ggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagc 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4347462 ggttacataaattcataagctccttgttaagctcgagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagc 4347363  T
Q  140 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  4347362 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagtttatgggagtagataagcccacataagcttaaaata 4347290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 42673655 - 42673482
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42673655 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 42673556  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  42673555 taagctgtt----tttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctccaaata 42673482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8630853 - 8630683
Alignment:
Q  42 ttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagcta 141  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8630853 ttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaacta 8630754  T
Q  142 tttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||||    
T  8630753 tttttatttatttacccgaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatcaacccacataacctcaaaata 8630683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9452784 - 9452607
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9452784 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatagacagcttatgaaactatga 9452685  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||  ||| |||||||||||||    
T  9452684 taaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagaatagataagttcacataagctcaaaata 9452607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Original strand, 46134309 - 46134483
Alignment:
Q  38 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 137  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  46134309 gaggttacataaattaataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcgtaaacagcttatgaaactataataa 46134408  T
Q  138 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  46134409 actatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagagttataggagtagataaactcacataagctcaaaata 46134483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 48865827 - 48865689
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48865827 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcctgatgttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 48865728  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 173  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48865727 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 48865689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 17753794 - 17753635
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17753794 aaggagattacataaattcataagctccttgttaagttgaagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgt 17753695  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  17753694 taagctatttttatttatttacccaaacaccttctaaaaggcttataggagtagataagc 17753635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 46891341 - 46891519
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  46891341 aaggaggttacataaactcataagctccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggctaattaaaatatgacataagcagcttataaaactatga 46891440  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacaccttt-aaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  46891441 caaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaggtttataggagtagataagcctatataagctcaaaata 46891519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 35 - 194
Target Start/End: Original strand, 16894509 - 16894668
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16894509 aaggatgttacataaattcataagctccctgttaagttgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 16894608  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagc 194  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  16894609 taaactatttttatttgtttacccaaatacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 16894668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 43021582 - 43021755
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |  |    |||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  43021582 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagagtaagctgaaaatttagaccga----aatatgccataagcagcttatgaaactataa 43021677  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||| || ||||||    
T  43021678 taagttatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagacttattgaagtagataagtccacataaacttaaaata 43021755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19828415 - 19828287
Alignment:
Q  84 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagg 183  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  19828415 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcaatttatgaaactatgataagctatttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatggg 19828316  T
Q  184 agtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||    
T  19828315 agtagataagccaacataaactcaaaata 19828287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 212
Target Start/End: Original strand, 37005857 - 37005990
Alignment:
Q  79 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactt 178  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  37005857 taagctaaaaaattagccttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagctatttttactgatttacccaaacgcctttaaaaaaactt 37005956  T
Q  179 ataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||| ||||||||| | ||| |||||| ||||||    
T  37005957 atagaagtagataaactcacataagcttaaaata 37005990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 43405170 - 43405037
Alignment:
Q  79 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactt 178  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||| | | || || ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  43405170 taagctaaaaaattgggcttattaaaatatagtagaaacaacttatgaaattacgataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagactt 43405071  T
Q  179 ataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  43405070 ataggagtagataagccaacataagcttaaaata 43405037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 37705075 - 37704997
Alignment:
Q  134 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37705075 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaata 37704997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 197
Target Start/End: Original strand, 27691433 - 27691490
Alignment:
Q  140 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagccca 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  27691433 tatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagatttatgggagtagataagccca 27691490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 173
Target Start/End: Original strand, 36849590 - 36849677
Alignment:
Q  86 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 173  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| | |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  36849590 aaaatttgagcttattaaaatatgacataaacagtttatgaaattgtgataagctgattttattgatttatccaaacacctttaaaaa 36849677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 180
Target Start/End: Original strand, 15655458 - 15655559
Alignment:
Q  79 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactt 178  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| | || ||||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||    
T  15655458 taagctcaaaatttgagcttattaaaatttggtataagcagtttataaaattgtggtaagctatttttattgatttatccaaatagttttaaaaagactt 15655557  T
Q  179 at 180  Q
    ||    
T  15655558 at 15655559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20163953 - 20163886
Alignment:
Q  95 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaac 162  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  20163953 gcttgttaaaatatgctataagcagcttatgaaactgtgataagctattttaattaattcacccaaac 20163886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 162
Target Start/End: Original strand, 30075277 - 30075357
Alignment:
Q  79 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaac 162  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30075277 taagctcaaaattatggcttattaaaatatggtataagcggtttatgaaa-tat-ataagctattttta-ttatttacccaaac 30075357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 39 - 212
Target Start/End: Original strand, 9008073 - 9008246
Alignment:
Q  39 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9008073 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 9008172  T
Q  139 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9008173 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 9008246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 24105683 - 24105860
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24105683 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgataatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 24105782  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24105783 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 24105860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 27679181 - 27679358
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679181 aaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 27679280  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27679281 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaata 27679358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1579232 - 1579055
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1579232 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 1579133  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1579132 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaata 1579055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 1605583 - 1605760
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1605583 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 1605682  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1605683 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaata 1605760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16069549 - 16069372
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16069549 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 16069450  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  16069449 taagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaata 16069372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 16737459 - 16737636
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16737459 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 16737558  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16737559 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccatataagctcaaaata 16737636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 33491208 - 33491385
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33491208 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcaaaagcagcttatgaaactatga 33491307  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33491308 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaata 33491385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 3386498 - 3386675
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386498 aaggaggttacataaattcataggctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 3386597  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3386598 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagtccacataagctcaaaata 3386675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 20992158 - 20992335
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20992158 aagggggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataatcagcttatgaaactatga 20992257  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  20992258 tatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagaccacataagctcaaaata 20992335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27421051 - 27420877
Alignment:
Q  38 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27421051 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 27420952  T
Q  138 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27420951 actatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaata 27420877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3921777 - 3921600
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3921777 aaggaggttacataaattcataagctcctttttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 3921678  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  3921677 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccatataaactcaaaata 3921600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 31883340 - 31883163
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31883340 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 31883241  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  31883240 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagagtagataagtccacataagctcaaaata 31883163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4121140 - 4120956
Alignment:
Q  28 agaagcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4121140 agaatcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 4121041  T
Q  128 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  4121040 actatgataaattatttttacttatttacccaaacacctttaaaagggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaata 4120956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 1165613 - 1165790
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1165613 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatga 1165712  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  1165713 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaata 1165790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19358722 - 19358545
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19358722 aaggagattacataaattcataagctccttgttaagttggagggtaagctgaaaatttaggcttactaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 19358623  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19358622 taagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaata 19358545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 33991333 - 33991159
Alignment:
Q  38 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33991333 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataa 33991234  T
Q  138 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  33991233 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacataaactcaaaata 33991159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 39 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5203164 - 5202991
Alignment:
Q  39 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 138  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5203164 aggtgacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaa 5203065  T
Q  139 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||||||||    
T  5203064 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaaccaacataaactcaaaata 5202991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 8374351 - 8374527
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8374351 aaggaggttacataaat-cataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 8374449  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  8374450 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagcttaaaata 8374527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Original strand, 35782659 - 35782833
Alignment:
Q  38 gaggttacataaattcataagctccttgttaagc-cagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgata 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35782659 gaggttacataaattcataagctccttgt-aagcacggagggtaggctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgata 35782757  T
Q  137 agctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35782758 agctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaata 35782833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Original strand, 38598466 - 38598636
Alignment:
Q  39 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38598466 aggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 38598565  T
Q  139 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaa 209  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||| ||| |||| |||||    
T  38598566 ctatttttacttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagctcacataagttcaaa 38598636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 38 - 194
Target Start/End: Original strand, 26602957 - 26603113
Alignment:
Q  38 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26602957 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagagtaaactgaaaaattatgcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataa 26603056  T
Q  138 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26603057 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagc 26603113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 31410672 - 31410495
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31410672 aaggaggtcacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttataaaactatga 31410573  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  31410572 taagctatttttatttgtttactcaaacacctttaaaaagacttatgggggtagataaacccatataaactcaaaata 31410495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 27025152 - 27025001
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27025152 aaggaggttacataaatttataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaaatggcataagcagcttatgaaactatga 27025053  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||    
T  27025052 taagctatttttatttatttacccgaacatctttaaaaagtcttatgggagt 27025001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 96 - 197
Target Start/End: Original strand, 20992354 - 20992455
Alignment:
Q  96 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcc 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20992354 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcc 20992453  T
Q  196 ca 197  Q
    ||    
T  20992454 ca 20992455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 90 - 212
Target Start/End: Original strand, 33284642 - 33284764
Alignment:
Q  90 tttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtaga 189  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  33284642 tttaggcttattgaaatatggtataagcagtttataaaactatgataagctatttttatttatttacttaaacacctttaaaaaggcttatgggagtaga 33284741  T
Q  190 taagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||  |||||||||||||    
T  33284742 taagcccatataagctcaaaata 33284764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 81
Target Start/End: Original strand, 35420436 - 35420482
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaa 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  35420436 aaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaa 35420482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 31638281 - 31638196
Alignment:
Q  95 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttat 180  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| | ||||||| |||||||||  ||||| |||||||| |||| |||| |||||    
T  31638281 gcttattaaaatatgacataagaagcttataaaattgtgataagttatttttatcgatttatccaaacacttttacaaaggcttat 31638196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 165
Target Start/End: Original strand, 41818552 - 41818605
Alignment:
Q  112 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacc 165  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  41818552 ataagcagcttataaaaatatgataagctatttttattaatttacctaaacacc 41818605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 25634732 - 25634651
Alignment:
Q  79 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaac 162  Q
    |||||| ||||||  || |||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||||||||||||   ||||||||||||||    
T  25634732 taagctcaaaattatggtttattaaaatatggtataagcggcttatgaaattgttataagctatttt--attatttacccaaac 25634651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Original strand, 19516044 - 19516127
Alignment:
Q  97 ttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttat 180  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |   ||||||||||||||||  |||  |||||| || ||||||||||||||    
T  19516044 ttattaaaatattacataagcagtttatgaaattgatataagctatttttattactttgtccaaacgccgttaaaaagacttat 19516127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 62)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 54189738 - 54189561
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54189738 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 54189639  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54189638 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaata 54189561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 28032712 - 28032889
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28032712 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgatactatga 28032811  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28032812 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 28032889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 15241028 - 15241205
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15241028 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 15241127  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15241128 taaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccacataagctcaaaata 15241205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 19913630 - 19913807
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19913630 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 19913729  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19913730 taagctgttttaatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 19913807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 39 - 212
Target Start/End: Original strand, 23776463 - 23776636
Alignment:
Q  39 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 138  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23776463 aggttacataaattcataagatccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 23776562  T
Q  139 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23776563 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 23776636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 31969874 - 31969697
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31969874 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatga 31969775  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31969774 taaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaata 31969697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 37968757 - 37968934
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37968757 aaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 37968856  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37968857 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 37968934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 50055101 - 50055278
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50055101 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaccatga 50055200  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50055201 taagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 50055278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 37 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38055348 - 38055173
Alignment:
Q  37 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgata 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055348 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgata 38055249  T
Q  137 agctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38055248 aaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 38055173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Original strand, 1756767 - 1756941
Alignment:
Q  38 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1756767 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 1756866  T
Q  138 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1756867 tctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaata 1756941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 8591092 - 8591269
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8591092 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaacatatggcataagcagcttatgaaactatga 8591191  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  8591192 taagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatagaagtagataaacccacataaactcaaaata 8591269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14987985 - 14987808
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14987985 aaggaggttacataaattcataagctcattgttaagcaagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 14987886  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  14987885 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaatggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaata 14987808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16700974 - 16700797
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16700974 aaggaggttacataaatttataagctccttgttaagctagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 16700875  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16700874 taagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 16700797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20877240 - 20877063
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20877240 aaggaggttacgtaaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 20877141  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20877140 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 20877063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 208
Target Start/End: Original strand, 27488648 - 27488821
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27488648 aaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 27488747  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  27488748 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaa 27488821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 52139396 - 52139219
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52139396 aaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 52139297  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  52139296 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaatagataaacccacataagttcaaaata 52139219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 53717464 - 53717641
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53717464 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataagcagcttatgaaactatga 53717563  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  53717564 taagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaata 53717641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 54412821 - 54412644
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54412821 aaggaggttacataaattcatatgctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattagaatatgacataagcagcttatgaaactatga 54412722  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54412721 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 54412644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 212
Target Start/End: Original strand, 11639571 - 11639755
Alignment:
Q  28 agaagcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 127  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11639571 agaatcaaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 11639670  T
Q  128 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  11639671 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaata 11639755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 19164973 - 19165149
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19164973 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcc-gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaa-tatggcataagcagcttatgaaactatga 19165070  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacaccttt-aaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19165071 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 19165149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1617277 - 1617100
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1617277 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagcttatgaaactatga 1617178  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  1617177 taagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcacataagctcaaaata 1617100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 6611360 - 6611537
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  6611360 aaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatgacataaacagcttatgaaactatga 6611459  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  6611460 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaata 6611537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 40428720 - 40428897
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40428720 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatggtataagcagcttatgaaactatga 40428819  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  40428820 taagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaata 40428897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 43289960 - 43290137
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43289960 aaggaggttacataaattcataagctccttattaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 43290059  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||   ||||||||||||    
T  43290060 taagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgtgagtagataagcacataaaagctcaaaata 43290137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 45424534 - 45424711
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45424534 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 45424633  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  45424634 taaactatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaata 45424711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 50353994 - 50353817
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50353994 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatca 50353895  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  50353894 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacagaagctcaaaata 50353817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 2481408 - 2481585
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2481408 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 2481507  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2481508 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaata 2481585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 44784917 - 44785094
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44784917 aaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaagtttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatga 44785016  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44785017 taagctatttttatttgtttacccaaacacttttacaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 44785094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 48910039 - 48909862
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48910039 aaggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggtttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 48909940  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  48909939 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataaacccacataagctcaaaata 48909862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 212
Target Start/End: Original strand, 23704202 - 23704386
Alignment:
Q  28 agaagcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 127  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23704202 agaatcaaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaa 23704301  T
Q  128 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  23704302 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgtgagtagataagctcatataagctcaaaata 23704386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 6688627 - 6688798
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||    
T  6688627 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagca------gaaactatga 6688720  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6688721 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataaactcaaaata 6688798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 8932178 - 8932355
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  8932178 aaggaggttacataaattcataagttccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgt 8932277  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  8932278 taagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccgcataagctcaaaata 8932355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 30423565 - 30423741
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30423565 aaggaggttacataaattc-taagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttatgcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 30423663  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  30423664 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaata 30423741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 33704034 - 33703857
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33704034 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 33703935  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  33703934 taagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataaactcacataagctcaaaata 33703857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 35490773 - 35490950
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35490773 aaggtggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatga 35490872  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  35490873 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatgagagtggataagcccatataagctcaaaata 35490950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 37464914 - 37464737
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37464914 aaggaggttacataaattcataagctctttgttaaaccggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 37464815  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  37464814 taaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagcccacataagctcaaaata 37464737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 53353256 - 53353090
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttat----taaaatatggcataagcagcttatgaaact 130  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53353256 aaggaggttacataaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatatattaaaatatggcataagcagcttatgaaact 53353157  T
Q  131 atgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagccca 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  53353156 atgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacatatgggagtagataagccca 53353090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 47632228 - 47632050
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47632228 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 47632129  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacc-tttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  47632128 gaagctatttttatttatttacccaaacaccttttaaaaaggtttatgagagtagataagtccacataaactcaaaata 47632050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15669376 - 15669199
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15669376 aaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggacggtaagctgaaaatttaggcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaactatga 15669277  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15669276 taagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagtcttatgtgattagataagctcacataagctcaaaata 15669199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 27583632 - 27583809
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27583632 aaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgcaactatga 27583731  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  27583732 taagttatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaata 27583809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 53875850 - 53875673
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  53875850 aaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttataaaactatga 53875751  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  53875750 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtatataagcccacataagcttaaaata 53875673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 187
Target Start/End: Original strand, 27536104 - 27536256
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27536104 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatga 27536203  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagta 187  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  27536204 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgggagta 27536256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Original strand, 40680041 - 40680215
Alignment:
Q  38 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40680041 gaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 40680140  T
Q  138 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||  ||||||||    
T  40680141 gctatttttatttatttatccaaatacctttaaaaagacttatggaagtagataagctcacataaattcaaaata 40680215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 44379187 - 44379364
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  44379187 aaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatga 44379286  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||| |  ||| |||||||||    
T  44379287 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatggaagtagataagcctatataaactcaaaata 44379364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 39 - 212
Target Start/End: Original strand, 38071327 - 38071497
Alignment:
Q  39 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38071327 aggttacataaattcataagctccttgttaagcccc---gtaaactgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaa 38071423  T
Q  139 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38071424 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggattatgagagtagataagcccacataagctcaaaata 38071497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 57 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28360602 - 28360446
Alignment:
Q  57 agctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaata-tggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttattta 155  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28360602 agctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttataaaaataatggcataagcagcttataaaactatgataaactatttttatttattta 28360503  T
Q  156 cccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  28360502 cccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagaaaagcccacataagctcaaaata 28360446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 212
Target Start/End: Original strand, 55344818 - 55345002
Alignment:
Q  28 agaagcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 127  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || || ||| |    
T  55344818 agaatcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggatggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggtataaacaactcatgca 55344917  T
Q  128 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  55344918 aatatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaata 55345002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30171773 - 30171596
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30171773 aaggaggttaaataaattcataagctccttgttaaaccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggtataagcagcttatgaaactatga 30171674  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||| | |  |||||||| ||| |||||||||||||    
T  30171673 taagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatggaataagataagctcacataagctcaaaata 30171596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 44376038 - 44375861
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  44376038 aaggaggttacataaattcataagctcttttttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaactatga 44375939  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    ||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  44375938 taaactatttttatttatttacccgaacacctataaaaatggctattggaatagataagcccacataagcttaaaata 44375861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 35 - 151
Target Start/End: Original strand, 23269046 - 23269162
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23269046 aaggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatga 23269145  T
Q  135 taagctatttttattta 151  Q
    |||||||||||||||||    
T  23269146 taagctatttttattta 23269162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 35 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16704014 - 16703843
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16704014 aagggggttacataaatttataggctccttgttaagccggaggataaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 16703915  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctc 206  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||  ||||| | ||||||||||  ||| |||||||    
T  16703914 taaactatttttatttatttattcaaacaactttaaaaaagcttatggaagtagataagttcacataagctc 16703843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 79 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 50053592 - 50053459
Alignment:
Q  79 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactt 178  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  50053592 taagatgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacatttaaaaaggctt 50053493  T
Q  179 ataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    || |||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  50053492 atgggagtagataagtccatataagctcaaaata 50053459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 80 - 162
Target Start/End: Original strand, 51780763 - 51780845
Alignment:
Q  80 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaac 162  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  51780763 aagcttaaaatttgggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataagctatttttattgatttatccaaac 51780845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 53408213 - 53408137
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccag-agggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53408213 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgg 53408137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 212
Target Start/End: Original strand, 44548185 - 44548318
Alignment:
Q  79 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactt 178  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| || ||||| ||| | ||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  44548185 taagcttaaaatttgggcttaataaaatagggcataaacaacttataaaattgtgataagatgtttttattgatttatccaaacacctttaaaaaggctt 44548284  T
Q  179 ataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||   ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  44548285 atgttagtagataagcccacataagctccaaata 44548318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 143 - 212
Target Start/End: Original strand, 23265865 - 23265934
Alignment:
Q  143 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23265865 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataagcccacataagctcaaaata 23265934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17493482 - 17493370
Alignment:
Q  79 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactt 178  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||  |||    
T  17493482 taagctcaaaatttgagcttattaaaacatggtataagcagcttataaaattagaataagatatttttattgatttactcaaacgcccttaaaaatgctt 17493383  T
Q  179 ataggagtagata 191  Q
    |||||||||||||    
T  17493382 ataggagtagata 17493370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 86
Target Start/End: Original strand, 23261886 - 23261937
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctga 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23261886 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctga 23261937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 126
Target Start/End: Original strand, 9595902 - 9595982
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||           | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9595902 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggag-----------agtttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatga 9595982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 50055338 - 50055301
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcc 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055338 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcc 50055301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 141
Target Start/End: Original strand, 55344724 - 55344781
Alignment:
Q  84 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagcta 141  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  55344724 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataaacaactcatgaaaatatgataagcta 55344781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 48748251 - 48748197
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaa 89  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||    
T  48748251 aaggagattacataaattcataagctccttattaagacggagggtatgctgaaaa 48748197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 22963 - 23140
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22963 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 23062  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23063 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccatataagctcaaaata 23140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 33906059 - 33906236
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906059 aaggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 33906158  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  33906159 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagttcaaaata 33906236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Original strand, 26323201 - 26323375
Alignment:
Q  38 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26323201 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 26323300  T
Q  138 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  26323301 gctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaagacttatgggagtagataagtccacataagctcaaaata 26323375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 31517227 - 31517404
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31517227 aaggaggttacataaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatga 31517326  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31517327 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccaaataagctcaaaata 31517404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Original strand, 3873259 - 3873433
Alignment:
Q  38 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 137  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3873259 gaggttatataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 3873358  T
Q  138 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3873359 gctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaata 3873433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 43 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1108464 - 1108295
Alignment:
Q  43 tacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctat 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1108464 tacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataaactat 1108365  T
Q  143 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1108364 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 1108295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 2178781 - 2178958
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2178781 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 2178880  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||| ||| || ||||||    
T  2178881 taagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgcgaatagataagtccacataaacttaaaata 2178958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 18806896 - 18807073
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18806896 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatga 18806995  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  18806996 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaaaata 18807073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Original strand, 4232157 - 4232331
Alignment:
Q  38 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4232157 gaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttgtgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 4232256  T
Q  138 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  4232257 gctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaata 4232331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 28329851 - 28330026
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28329851 aaggaggttacataaattcatatgctccttgttaagctag--ggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatga 28329948  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28329949 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggtgtagataagcccacataagctcaaaata 28330026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5733592 - 5733415
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5733592 aaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 5733493  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5733492 taagttgtttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggctgatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 5733415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 16066306 - 16066483
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16066306 aaggaggttacataaattcataagctccttattaaatcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 16066405  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   || |||||||||||| |||||||||||||    
T  16066406 taagctatttttatttatttacccaaacactttaaaaaagacttatgaaagcagataagcccacataagctcaaaata 16066483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 39635645 - 39635468
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39635645 aaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 39635546  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  39635545 taagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaata 39635468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4016232 - 4016055
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4016232 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 4016133  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  4016132 tacgttatttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaata 4016055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 19383947 - 19384124
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19383947 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaacttatgaaactatga 19384046  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  19384047 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcatataaactcaaaata 19384124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 42937913 - 42937735
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctt-attaaaatatggcataagcagcttatgaaactatg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42937913 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggctttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatg 42937814  T
Q  134 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||||    
T  42937813 ataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataaactcacataagctcaaaata 42937735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 1482915 - 1483091
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  1482915 aaggatgttacataaattcataagctccttgttaagtcgaagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacaataa 1483014  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1483015 taagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaagcttat-ggagtagataagcccacataagctcaaaata 1483091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 6174840 - 6175017
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6174840 aaggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaatgaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 6174939  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  6174940 taaaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagctcacataagctcaaaata 6175017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 212
Target Start/End: Original strand, 16588790 - 16588965
Alignment:
Q  37 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgata 136  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16588790 ggaggttacattaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactataata 16588889  T
Q  137 agctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  16588890 agctatttttatttatttacccaaacttctttaaaaagacttatgaaagtagataagcccacataaacacaaaata 16588965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 851190 - 851013
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  851190 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttataaaattatga 851091  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  851090 taagctctatttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagcttaaaata 851013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Original strand, 19901153 - 19901326
Alignment:
Q  38 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19901153 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtgggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataa 19901252  T
Q  138 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  19901253 gctattttta-ttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagagaagcccacataagctcaaaata 19901326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 79 - 212
Target Start/End: Original strand, 30420223 - 30420356
Alignment:
Q  79 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30420223 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaacctatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 30420322  T
Q  179 ataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30420323 atgggagtagataagcccacataagctcaaaata 30420356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 35 - 192
Target Start/End: Original strand, 30270691 - 30270848
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30270691 aaggagattacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 30270790  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataa 192  Q
    ||| |||||||  |||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30270791 taaactattttattttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataa 30270848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 38 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 430006 - 429852
Alignment:
Q  38 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  430006 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcgaattgtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatcgcataagcaacttatgaaattatgataa 429907  T
Q  138 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataa 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||    
T  429906 gctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataa 429852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 44947561 - 44947731
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44947561 aaggaggttacataaattcataaacttcttgttaagccggagggtaaactgaaaatttagc-------aaatatggcataagcagcttatgaaactatga 44947653  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| | | ||||||| | ||| |||| ||||||||    
T  44947654 taaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaatgcttatggcactagataaactcacataagatcaaaata 44947731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 193
Target Start/End: Original strand, 42446625 - 42446739
Alignment:
Q  79 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactt 178  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  42446625 taagcttaaaatttgatcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttacctaaacacctttaaaaaggctt 42446724  T
Q  179 ataggagtagataag 193  Q
    ||   ||||||||||    
T  42446725 atgttagtagataag 42446739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 180
Target Start/End: Original strand, 22101210 - 22101304
Alignment:
Q  86 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttat 180  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||    
T  22101210 aaaatttgggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttatacaaatacctttaaaaaggcttat 22101304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 3585439 - 3585348
Alignment:
Q  79 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaa 170  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  3585439 taagctcataattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataaattgtttttattaatttaccaaaacacatttaa 3585348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 35 - 197
Target Start/End: Original strand, 18 - 180
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggattattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 117  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagccca 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  118 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagccca 180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3910 - 3726
Alignment:
Q  28 agaagcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 127  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3910 agaatcaaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 3811  T
Q  128 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  3810 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaata 3726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 145257 - 145434
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  145257 aaggaggttacataaatttataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 145356  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  145357 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagtccacataaactcaaaata 145434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 307 - 484
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  307 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 406  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||| |||||||||    
T  407 taatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaata 484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10431 - 10254
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10431 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagcttatgaaactatga 10332  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  10331 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgagagtagataaacccatataagctcaaaata 10254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 18 - 196
Alignment:
Q  35 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcatatgaaactatga 116  T
Q  135 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagta---gataagcccacgtaagctcaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||| |||| |||||||||||||    
T  117 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat-ggagtagatgataagtccacataagctcaaaata 196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University