View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21377_high_7 (Length: 237)

Name: NF21377_high_7
Description: NF21377
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21377_high_7
NF21377_high_7
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (1-229)||(15103-15340)
[»] chr7 (29 HSPs)
chr7 (1-197)||(17835432-17835628)
chr7 (1-197)||(10517336-10517532)
chr7 (1-229)||(39460884-39461120)
chr7 (1-197)||(47672606-47672802)
chr7 (1-201)||(15073746-15073945)
chr7 (1-197)||(27453140-27453336)
chr7 (1-201)||(42507545-42507744)
chr7 (1-197)||(47776690-47776886)
chr7 (1-197)||(36977954-36978150)
chr7 (1-197)||(37340660-37340856)
chr7 (1-197)||(9494317-9494512)
chr7 (1-197)||(34738722-34738918)
chr7 (1-197)||(14689579-14689775)
chr7 (31-164)||(556200-556333)
chr7 (31-162)||(5541096-5541227)
chr7 (31-150)||(48403743-48403862)
chr7 (31-150)||(41880876-41880995)
chr7 (31-143)||(17741023-17741135)
chr7 (31-150)||(35609984-35610103)
chr7 (31-162)||(46740103-46740234)
chr7 (45-162)||(16675186-16675303)
chr7 (45-162)||(17649554-17649671)
chr7 (31-150)||(45257374-45257492)
chr7 (31-150)||(9370958-9371073)
chr7 (31-110)||(17465329-17465408)
chr7 (31-110)||(17587806-17587885)
chr7 (41-92)||(41734559-41734610)
chr7 (113-150)||(17462862-17462899)
chr7 (113-150)||(17590315-17590352)
[»] chr3 (37 HSPs)
chr3 (1-197)||(42165518-42165714)
chr3 (1-229)||(4007804-4008040)
chr3 (1-197)||(3976062-3976258)
chr3 (1-197)||(47073728-47073924)
chr3 (1-197)||(44230069-44230265)
chr3 (1-197)||(50216399-50216595)
chr3 (1-197)||(50963310-50963505)
chr3 (1-195)||(20917540-20917734)
chr3 (1-195)||(20926502-20926696)
chr3 (1-197)||(30255523-30255719)
chr3 (1-197)||(49195968-49196164)
chr3 (2-197)||(42756510-42756703)
chr3 (1-197)||(42805783-42805979)
chr3 (19-197)||(48563301-48563479)
chr3 (1-197)||(48889099-48889286)
chr3 (1-153)||(597114-597266)
chr3 (1-133)||(3501477-3501609)
chr3 (31-162)||(16611463-16611594)
chr3 (31-162)||(22047659-22047790)
chr3 (31-164)||(17567618-17567751)
chr3 (31-162)||(41612753-41612884)
chr3 (31-150)||(52390964-52391083)
chr3 (31-162)||(20351030-20351161)
chr3 (1-89)||(51807325-51807413)
chr3 (31-150)||(2274482-2274601)
chr3 (31-150)||(29009245-29009364)
chr3 (31-162)||(36127822-36127953)
chr3 (31-150)||(42903758-42903877)
chr3 (31-150)||(46389347-46389466)
chr3 (31-150)||(50480352-50480471)
chr3 (31-150)||(54386509-54386628)
chr3 (31-150)||(49144031-49144149)
chr3 (31-150)||(34045762-34045880)
chr3 (31-150)||(46701593-46701712)
chr3 (41-143)||(4178199-4178301)
chr3 (33-143)||(31045169-31045279)
chr3 (41-143)||(4172201-4172303)
[»] chr2 (25 HSPs)
chr2 (1-197)||(39947956-39948152)
chr2 (1-201)||(28468997-28469196)
chr2 (1-197)||(45428947-45429142)
chr2 (1-201)||(17420923-17421122)
chr2 (15-193)||(21998560-21998737)
chr2 (1-197)||(32955880-32956071)
chr2 (1-133)||(25965176-25965308)
chr2 (31-162)||(29401160-29401291)
chr2 (1-97)||(7185385-7185481)
chr2 (31-162)||(25515366-25515496)
chr2 (31-162)||(36655906-36656037)
chr2 (31-156)||(45284558-45284683)
chr2 (31-156)||(45291921-45292046)
chr2 (31-162)||(10828581-10828712)
chr2 (31-150)||(20938282-20938401)
chr2 (54-197)||(45136824-45136956)
chr2 (31-150)||(3940297-3940416)
chr2 (31-150)||(5352351-5352470)
chr2 (31-150)||(15831514-15831633)
chr2 (31-150)||(30496515-30496634)
chr2 (31-150)||(43978906-43979025)
chr2 (31-150)||(43539306-43539425)
chr2 (124-201)||(22686858-22686934)
chr2 (1-47)||(45137103-45137149)
chr2 (33-119)||(31367427-31367513)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (1-197)||(43211861-43212057)
chr8 (1-197)||(5303742-5303938)
chr8 (1-186)||(39602071-39602256)
chr8 (1-197)||(39846507-39846703)
chr8 (1-197)||(39938737-39938933)
chr8 (1-197)||(43188405-43188601)
chr8 (1-197)||(15036249-15036445)
chr8 (1-201)||(489147-489346)
chr8 (1-197)||(34822538-34822734)
chr8 (1-162)||(39252367-39252528)
chr8 (1-201)||(42485047-42485255)
chr8 (1-201)||(45064597-45064786)
chr8 (1-162)||(40076806-40076967)
chr8 (31-197)||(2984508-2984674)
chr8 (1-197)||(41249610-41249790)
chr8 (25-154)||(37327163-37327292)
chr8 (31-162)||(35552051-35552182)
chr8 (31-162)||(20857671-20857802)
chr8 (31-162)||(24249868-24249999)
chr8 (31-157)||(45128135-45128261)
chr8 (31-150)||(25095-25214)
chr8 (31-150)||(1052910-1053029)
chr8 (31-150)||(23021889-23022008)
chr8 (31-150)||(26659832-26659951)
chr8 (59-162)||(34371450-34371553)
chr8 (31-162)||(5677456-5677587)
chr8 (1-49)||(25864609-25864657)
chr8 (33-143)||(22495305-22495415)
chr8 (165-197)||(39252522-39252554)
[»] chr1 (30 HSPs)
chr1 (1-197)||(31783249-31783445)
chr1 (5-197)||(35258394-35258586)
chr1 (1-197)||(45825232-45825429)
chr1 (1-197)||(51321070-51321266)
chr1 (1-201)||(19925098-19925297)
chr1 (1-201)||(30890417-30890616)
chr1 (1-197)||(19527064-19527260)
chr1 (1-197)||(49857467-49857660)
chr1 (1-197)||(23275625-23275821)
chr1 (1-197)||(52802487-52802683)
chr1 (1-229)||(47502671-47502895)
chr1 (31-162)||(21141413-21141544)
chr1 (31-162)||(50343525-50343656)
chr1 (31-162)||(97504-97635)
chr1 (31-150)||(2365622-2365741)
chr1 (31-150)||(19156401-19156520)
chr1 (31-162)||(47656256-47656386)
chr1 (31-162)||(2424924-2425053)
chr1 (31-162)||(22524521-22524650)
chr1 (31-150)||(3731949-3732068)
chr1 (31-150)||(13639591-13639710)
chr1 (31-142)||(17514272-17514383)
chr1 (31-150)||(26876043-26876162)
chr1 (41-155)||(38127045-38127160)
chr1 (31-119)||(8474171-8474259)
chr1 (33-102)||(23935581-23935650)
chr1 (1-37)||(29622105-29622141)
chr1 (74-133)||(16243106-16243165)
chr1 (72-119)||(25166976-25167023)
chr1 (41-119)||(25147698-25147776)
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (1-201)||(8580023-8580222)
chr5 (1-197)||(17658678-17658874)
chr5 (1-197)||(19228193-19228389)
chr5 (1-201)||(28876999-28877198)
chr5 (1-197)||(42537505-42537701)
chr5 (1-197)||(38968453-38968650)
chr5 (1-197)||(7757680-7757876)
chr5 (1-197)||(8701745-8701941)
chr5 (1-201)||(28241317-28241516)
chr5 (1-197)||(42942008-42942203)
chr5 (1-197)||(512293-512489)
chr5 (1-143)||(14264-14406)
chr5 (31-162)||(5197359-5197490)
chr5 (31-164)||(40624468-40624601)
chr5 (31-150)||(19040685-19040804)
chr5 (31-159)||(20422335-20422463)
chr5 (31-143)||(27673228-27673340)
chr5 (31-150)||(30705522-30705641)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (1-197)||(21022410-21022605)
chr4 (1-197)||(51683558-51683754)
chr4 (1-197)||(37021604-37021800)
chr4 (1-197)||(50275090-50275286)
chr4 (1-201)||(30726259-30726458)
chr4 (1-201)||(40357798-40357997)
chr4 (1-197)||(48256092-48256288)
chr4 (1-201)||(1089102-1089301)
chr4 (1-197)||(55407308-55407504)
chr4 (1-201)||(1308632-1308831)
chr4 (1-197)||(50901836-50902031)
chr4 (1-154)||(67947-68100)
chr4 (1-154)||(46436600-46436753)
chr4 (31-197)||(11050044-11050210)
chr4 (31-162)||(21538008-21538139)
chr4 (31-162)||(50023099-50023230)
chr4 (33-186)||(14315772-14315925)
chr4 (31-162)||(10752983-10753114)
chr4 (31-162)||(10966752-10966883)
chr4 (31-162)||(50030217-50030348)
chr4 (31-143)||(41798570-41798682)
chr4 (31-150)||(9892836-9892955)
chr4 (33-162)||(14297523-14297652)
chr4 (33-162)||(41933179-41933308)
chr4 (31-162)||(3184342-3184473)
chr4 (31-162)||(3185440-3185571)
chr4 (31-162)||(3185648-3185779)
chr4 (31-150)||(6181358-6181477)
chr4 (31-150)||(49090806-49090925)
chr4 (31-150)||(49165419-49165538)
chr4 (41-154)||(30704419-30704532)
chr4 (31-162)||(44679631-44679762)
chr4 (33-162)||(11083562-11083691)
chr4 (31-150)||(31422083-31422203)
chr4 (31-151)||(50193864-50193985)
chr4 (41-143)||(4719953-4720055)
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (1-197)||(6320084-6320280)
chr6 (1-197)||(31769061-31769257)
chr6 (1-197)||(24088303-24088499)
chr6 (31-162)||(24722314-24722445)
chr6 (31-143)||(21600990-21601102)
chr6 (31-162)||(3501555-3501686)
chr6 (32-162)||(26423384-26423514)
chr6 (31-150)||(6201534-6201653)
chr6 (31-150)||(11688501-11688620)
chr6 (31-150)||(22301566-22301685)
chr6 (31-150)||(30829220-30829339)
chr6 (31-150)||(27617101-27617220)
chr6 (43-186)||(3381182-3381313)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (1-201)||(246-445)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (1-152)||(7774-7925)
[»] scaffold0238 (1 HSPs)
scaffold0238 (32-162)||(18489-18619)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (52-154)||(10761-10863)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (31-162)||(4210-4341)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (71-119)||(246180-246228)
scaffold0007 (33-143)||(251051-251161)


Alignment Details
Target: scaffold0180 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15340 - 15103
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15340 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 15241  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgta---- 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  15240 tgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatatt 15141  T
Q  197 -----ttttggttagtttaggttacaagaatgatgatg 229  Q
         |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15140 gatttttttggttagtttaggttacaagaattatgatg 15103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 29)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 17835432 - 17835628
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17835432 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 17835531  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17835532 tgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 17835628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 10517336 - 10517532
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10517336 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 10517435  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10517436 tgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 10517532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 39460884 - 39461120
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39460884 aatgtagttgttgcctattttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 39460983  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgta---- 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  39460984 tgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggatatggtagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatatt 39461083  T
Q  197 ----ttttggttagtttaggttacaagaatgatgatg 229  Q
        |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39461084 gatgttttagttagtttaggttacaagaattatgatg 39461120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 47672802 - 47672606
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47672802 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 47672703  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47672702 tgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtat 47672606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15073945 - 15073746
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15073945 aatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 15073846  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatttt 200  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15073845 tgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttatttt 15073747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 27453336 - 27453140
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27453336 aatgtagttgttacctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 27453237  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27453236 tgataaaatgtctcattgacaattttattgattatttagtcagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 27453140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 42507744 - 42507545
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42507744 aatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 42507645  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatttt 200  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42507644 tgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttatttt 42507546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 47776690 - 47776886
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47776690 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtgacaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 47776789  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47776790 tgataaaatgtctcaatgacaaatttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtctggttaagtgtat 47776886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 36977954 - 36978150
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36977954 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgactttgaatggtggtaaatgaacataatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 36978053  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36978054 tgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 36978150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 37340660 - 37340856
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37340660 aatgtacttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 37340759  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  37340760 tgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgctgttaattatagtttggttaagagtat 37340856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 9494512 - 9494317
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9494512 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 9494413  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9494412 tgatcaaatgcgtcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatgg-aatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtat 9494317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 34738722 - 34738918
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  34738722 aatgtagttgttacctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatgctttgctcacaaagtgtt 34738821  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34738822 tgataaaatgtctcgatgacaattttattgattatgtagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtat 34738918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14689775 - 14689579
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14689775 aatgtagttgttgtctatgttgtttaaatgataatgtagctttgaatagtggcaaataaacacaatttgaatatcttttatactttgcatacaaagtgtt 14689676  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14689675 tgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttatgttatggaaatgataaaaatgatgttaattattgtttggttaagtgtat 14689579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 556333 - 556200
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  556333 ataatgtggttttgaatggtggcaaatgaacatattttgagtatgtttgatactttgcatacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattt 556234  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgatat 164  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||    
T  556233 attatttagttagtttatgttatgaaaattatat 556200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 5541227 - 5541096
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| || || | ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5541227 ataacgtggttttgaatggtggcaaaagatcatattttgagtatgtttgatactttgcacacaaattgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 5541128  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  5541127 attatttagttagtttaggttatggatatgat 5541096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Original strand, 48403743 - 48403862
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  48403743 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgataattttattg 48403842  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  48403843 attatttagttagtttaggt 48403862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Original strand, 41880876 - 41880995
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  41880876 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 41880975  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  41880976 attatttagttagtttaggt 41880995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 17741135 - 17741023
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||| |||||    
T  17741135 ataatgtggttttgaatggtgccatatgaacacaatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaattcccaaatgagaattatattg 17741036  T
Q  131 attatttagttag 143  Q
    |||||||||||||    
T  17741035 attatttagttag 17741023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 35610103 - 35609984
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  35610103 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 35610004  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  35610003 attatttagttagtttaggt 35609984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 46740234 - 46740103
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  46740234 ataatgtgattttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgattgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 46740135  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||| |||||    
T  46740134 attatttaattagtttaggtcatggatatgat 46740103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 162
Target Start/End: Original strand, 16675186 - 16675303
Alignment:
Q  45 aatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagc 144  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  16675186 aatggtggcaaaagaatacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttaataaaatgtctcaatgacaattttattgattattttgttagt 16675285  T
Q  145 ttaggttatggaaatgat 162  Q
    |||||||||||| |||||    
T  16675286 ttaggttatggatatgat 16675303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 162
Target Start/End: Original strand, 17649554 - 17649671
Alignment:
Q  45 aatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagc 144  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  17649554 aatggtggcaaaagaatacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttaataaaatgtctcaatgacaattttattgattattttgttagt 17649653  T
Q  145 ttaggttatggaaatgat 162  Q
    |||||||||||| |||||    
T  17649654 ttaggttatggatatgat 17649671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Original strand, 45257374 - 45257492
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  45257374 ataatgtggttttgaatggtggtaaaa-aacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 45257472  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  45257473 attatttagttagtttaggt 45257492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 9371073 - 9370958
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  9371073 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatg----atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 9370978  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  9370977 attatttagttagtttaggt 9370958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 17465408 - 17465329
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatg 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17465408 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatg 17465329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 110
Target Start/End: Original strand, 17587806 - 17587885
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatg 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17587806 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatg 17587885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 92
Target Start/End: Original strand, 41734559 - 41734610
Alignment:
Q  41 tttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacac 92  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||    
T  41734559 tttgaatggtggcaaaagaacacatttttagtatgtttgatactttgcacac 41734610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 113 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 17462899 - 17462862
Alignment:
Q  113 tcaatgataattttattgattatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17462899 tcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggt 17462862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 113 - 150
Target Start/End: Original strand, 17590315 - 17590352
Alignment:
Q  113 tcaatgataattttattgattatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17590315 tcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggt 17590352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 37)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 42165518 - 42165714
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42165518 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatattttatactttgcacacaaagtgtt 42165617  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42165618 tgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 42165714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4008040 - 4007804
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4008040 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 4007941  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgta---- 196  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||        
T  4007940 tgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaaggatgttaattatagtttgattaagtgtatatt 4007841  T
Q  197 ----ttttggttagtttaggttacaagaatgatgatg 229  Q
        |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4007840 gattttttagttagtttaggttacaagaattatgatg 4007804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 3976062 - 3976258
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3976062 aatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 3976161  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3976162 tgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaaggatgttaattatagtttggttaagtgtat 3976258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 47073924 - 47073728
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47073924 aatgtagttgttgcctatattgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatattttatactttgcacacaaagtgtt 47073825  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47073824 tgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 47073728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 44230069 - 44230265
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44230069 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaaacataatgtggctttgaacggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaatgtgtt 44230168  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44230169 tgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttggtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 44230265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 50216595 - 50216399
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50216595 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggttttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatgctttgcacacaaagtgtt 50216496  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50216495 tgataaaatgcttcaatgacaattttattgattatgtggttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 50216399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 50963310 - 50963505
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50963310 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttacacacaaagtgtt 50963409  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50963410 tgataaaatgcctcagtgacaattttataaattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaa-tatagtttggttaagtgtat 50963505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20917734 - 20917540
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917734 aatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 20917635  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgt 195  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917634 tgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaagttatggaaatgattgaaatgatgttaattatagtttggttaagtgt 20917540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20926696 - 20926502
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20926696 aatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 20926597  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgt 195  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20926596 tgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaagttatggaaatgattgaaatgatgttaattatagtttggttaagtgt 20926502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 30255719 - 30255523
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30255719 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 30255620  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30255619 tgatcaaatgcctcaatgaaatttatattgattatttagttagttcaggttaaggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtat 30255523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 49196164 - 49195968
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49196164 aatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 49196065  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49196064 tgatcaaatgcttcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatgaaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaattgtat 49195968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 197
Target Start/End: Original strand, 42756510 - 42756703
Alignment:
Q  2 atgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgttt 101  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42756510 atgtagttgttgtctatgttgtttaaatcataatgtcgctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgttt 42756609  T
Q  102 gataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42756610 gatcaaatgcctcaatgaaaa--ttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtat 42756703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 42805979 - 42805783
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42805979 aatgtagttgttgtctatgttgtttaaatgataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaaatgtt 42805880  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  42805879 tgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaggtgtat 42805783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 197
Target Start/End: Original strand, 48563301 - 48563479
Alignment:
Q  19 gttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatg 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  48563301 gttgtttaaatcataatgtgtctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaaatgtttgatcaaatgcctcaatg 48563400  T
Q  119 ataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48563401 aaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 48563479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 48889099 - 48889286
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48889099 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgactttgaatggtggtaaatgaacataatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 48889198  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48889199 tgatcaaaggcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatgg---------aaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 48889286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 597114 - 597266
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  597114 aatgtagttgttgcccatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaaagaacacattttgattatgtttgatactttgcacacaaagtgtt 597213  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttat 153  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  597214 tgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagcttaggttat 597266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 3501609 - 3501477
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3501609 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 3501510  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgatt 133  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3501509 tgataaaatgtctcaatgacaattttattgatt 3501477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Original strand, 16611463 - 16611594
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16611463 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 16611562  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16611563 attatttagttagtttaggttatggatatgat 16611594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22047790 - 22047659
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22047790 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 22047691  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22047690 attatttagttagtttaggttatggatatgat 22047659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 31 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 17567751 - 17567618
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17567751 ataatgtggttttcaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 17567652  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgatat 164  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  17567651 attatttagttagtttaggttatggatatgatat 17567618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Original strand, 41612753 - 41612884
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41612753 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 41612852  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||    
T  41612853 attatctagttagtttagtttatggatatgat 41612884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 52391083 - 52390964
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  52391083 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacaatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaaatttattg 52390984  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  52390983 attatttagttagtttaggt 52390964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Original strand, 20351030 - 20351161
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgat-aaaatgcctcaatgataattttatt 129  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  20351030 ataatttggttttgaatggtggcaaaagaacaca-tttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgattaaaatgtctcaatgacaattttatt 20351128  T
Q  130 gattatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  20351129 gattatttagttagtttaggttatggatatgat 20351161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 51807325 - 51807413
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 89  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51807325 aatgtagttgttgtctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 51807413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 2274601 - 2274482
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  2274601 ataatgtggttttgaatggtgggaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 2274502  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  2274501 attatttagttagtttaggt 2274482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Original strand, 29009245 - 29009364
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  29009245 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 29009344  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  29009345 attatttagttagtttaggt 29009364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Original strand, 36127822 - 36127953
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||    
T  36127822 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttcttg 36127921  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||| |||||    
T  36127922 attatttggttagtttaggctatggatatgat 36127953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 42903877 - 42903758
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  42903877 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 42903778  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  42903777 attatttagttagtttaggt 42903758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Original strand, 46389347 - 46389466
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  46389347 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 46389446  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  46389447 attatttagttagtttaggt 46389466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 50480471 - 50480352
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  50480471 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 50480372  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  50480371 attatttagttagtttaggt 50480352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Original strand, 54386509 - 54386628
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  54386509 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 54386608  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  54386609 attatttagttagtttaggt 54386628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 49144149 - 49144031
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  49144149 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgaatat-tttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 49144051  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  49144050 attatttagttagtttaggt 49144031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Original strand, 34045762 - 34045880
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  34045762 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtat-tttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 34045860  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  34045861 attatttagttagtttaggt 34045880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 46701712 - 46701593
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  || ||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  46701712 ataatgtggttttgattggtggcaaaataagacattttgagcatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 46701613  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  46701612 attatttagttagtttaggt 46701593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 143
Target Start/End: Original strand, 4178199 - 4178301
Alignment:
Q  41 tttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagt 140  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4178199 tttgaatggtgtcaaatgaagataatttgaatacttttgatactttgcacacaaagtgtttgacaaaatgcccaaatgaaaattttattgattatttagt 4178298  T
Q  141 tag 143  Q
    |||    
T  4178299 tag 4178301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 33 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 31045279 - 31045169
Alignment:
Q  33 aatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgat 132  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||  ||| ||    
T  31045279 aatgtggttttgaatggtgtcaaaataacacaatgtgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgacaaaatgccaaaatgagaattgcatttat 31045180  T
Q  133 tatttagttag 143  Q
    |||||||||||    
T  31045179 tatttagttag 31045169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 143
Target Start/End: Original strand, 4172201 - 4172303
Alignment:
Q  41 tttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagt 140  Q
    |||||||||||  ||||||| | ||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4172201 tttgaatggtgttaaatgaagataatttgaatacttttgatactttgcacaaaaagtgtttgacaaaatgcccaaatgagaattttattgattatttagt 4172300  T
Q  141 tag 143  Q
    |||    
T  4172301 tag 4172303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 25)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 39947956 - 39948152
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39947956 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaaagaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 39948055  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39948056 tgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 39948152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 28468997 - 28469196
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28468997 aatgtaattgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 28469096  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatttt 200  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28469097 tgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatttt 28469195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 45428947 - 45429142
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45428947 aatgtagttgttgcctacgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 45429046  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45429047 tgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 45429142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 17420923 - 17421122
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17420923 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacatcaagtgtt 17421022  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatttt 200  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17421023 tgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttatttt 17421121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 193
Target Start/End: Original strand, 21998560 - 21998737
Alignment:
Q  15 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21998560 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctc 21998659  T
Q  115 aatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagt 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21998660 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagt 21998737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 32956071 - 32955880
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32956071 aatgtacttgttgcctatgttgtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacgcaaagtgtt 32955972  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32955971 tgataaaatgcctcaatgacaat----ttgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgg-taagtgtat 32955880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 25965176 - 25965308
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25965176 aatgtagttgtttcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatgttggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 25965275  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25965276 tgataaaatgtctcaatgataattttattgatt 25965308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 29401291 - 29401160
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29401291 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 29401192  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  29401191 attatttagttagtttagcttatggatatgat 29401160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 7185385 - 7185481
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagt 97  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7185385 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagt 7185481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 25515496 - 25515366
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  25515496 ataatgtggttttgaatggtggcaaa-gagcacgatttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgagaattatattg 25515398  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  25515397 attattgagttagtttaggttatggaaatgat 25515366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 36656037 - 36655906
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  36656037 ataatgtggttttcaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgaacattttattg 36655938  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  36655937 attatttagttagtttaggttatggatatgat 36655906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 156
Target Start/End: Original strand, 45284558 - 45284683
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  45284558 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttaagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatggctcaatgacaattttattg 45284657  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatgga 156  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||    
T  45284658 attatttagttagtttagattatgga 45284683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 156
Target Start/End: Original strand, 45291921 - 45292046
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  45291921 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttaagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatggctcaatgacaattttattg 45292020  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatgga 156  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||    
T  45292021 attatttagttagtttagattatgga 45292046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 10828712 - 10828581
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||| || ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  10828712 ataatgtggttttgaattgtggcaaaagaacgcattttgagtatgtttgatactttggacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 10828613  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10828612 attatttagttagtttaggttatggatatgat 10828581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Original strand, 20938282 - 20938401
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  20938282 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 20938381  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  20938382 attatttagttagtttaggt 20938401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 54 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 45136956 - 45136824
Alignment:
Q  54 aaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttat 153  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||           |||| |||||||||    
T  45136956 aaatgaacacaatttaaatatattttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttat-----------ttagtttaggttat 45136868  T
Q  154 ggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45136867 ggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaaatgtat 45136824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 3940416 - 3940297
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  3940416 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 3940317  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  3940316 attatttagttagtttaggt 3940297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Original strand, 5352351 - 5352470
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  5352351 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 5352450  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  5352451 attatttagttagtttaggt 5352470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Original strand, 15831514 - 15831633
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  15831514 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtctttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 15831613  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  15831614 attatttagttagtttaggt 15831633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 30496634 - 30496515
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  30496634 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 30496535  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  30496534 attatttagttagtttaggt 30496515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Original strand, 43978906 - 43979025
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  43978906 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 43979005  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  43979006 attatttagttagtttaggt 43979025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 43539425 - 43539306
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  43539425 ataatatggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaatgtttttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 43539326  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  43539325 attatttagttagtttaggt 43539306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 201
Target Start/End: Original strand, 22686858 - 22686934
Alignment:
Q  124 tttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttg 201  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22686858 tttagtgattatttagttagtttag-ttatggaaatggtagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttg 22686934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 45137149 - 45137103
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaat 47  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  45137149 aatgtagttcttgcctatgttatttaaatcataatgtggccttgaat 45137103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 119
Target Start/End: Original strand, 31367427 - 31367513
Alignment:
Q  33 aatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatga 119  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||   | || |||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  31367427 aatgtggttttgaatggtgtcaaatcaacataatgatattaagtttcatattttgcacaaaaagtgtttgttaaaatgcctaaatga 31367513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 43211861 - 43212057
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43211861 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtgggaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 43211960  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43211961 tgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttaaggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 43212057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 5303938 - 5303742
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5303938 aatgtagttgttgtctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 5303839  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5303838 tgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 5303742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 39602071 - 39602256
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39602071 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 39602170  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttg 186  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  39602171 tgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatattttg 39602256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 39846703 - 39846507
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39846703 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgtacacaaagtgtt 39846604  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    ||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39846603 tgataaactgtctccatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 39846507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 39938933 - 39938737
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  39938933 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatggggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaataagttttatactttgcacacaaagtatt 39938834  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39938833 tgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatgtagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtat 39938737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 43188405 - 43188601
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43188405 aatgtagttgttgtctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacgatttgaatatgttttatactttgcatacaaagtgtt 43188504  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43188505 tgataaaatgtttcaatgacaattttattgattatttagttagtttatgttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttgattaagtgtat 43188601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15036445 - 15036249
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15036445 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 15036346  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatga-tgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15036345 tgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaattagggttaattatagtttggttaagtgtat 15036249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 489346 - 489147
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  489346 aatgtagatgttgcctatgtagtttaaattataatgtggctttgaatggttgcaaatgaacacaatttaaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 489247  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatttt 200  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  489246 cgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttatttt 489148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34822734 - 34822538
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34822734 aatgtagttgttgcctatgttggttaaatcataatgtggctttgaatgactgcaaatgaacacaatttaaatatgttttatactctgcacacaaagtgtt 34822635  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34822634 tgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatattaattatagtttggttaagtgtat 34822538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 39252367 - 39252528
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39252367 aatgtagttgttgcatatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaatacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 39252466  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39252467 tgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgat 39252528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 42485255 - 42485047
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42485255 aatgtagatgttgcctatgtagtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 42485156  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatg---------gaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaa 191  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||         ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42485155 cgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaa 42485057  T
Q  192 gtgtattttg 201  Q
    || |||||||    
T  42485056 gtttattttg 42485047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 45064597 - 45064786
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          ||||||||||||||||    
T  45064597 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcttaatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaattt----------ttgcacacaaagtgtt 45064686  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatttt 200  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45064687 tgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatttt 45064785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 40076967 - 40076806
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40076967 aatgtagctgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttataatttgcacacaaagtgtt 40076868  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  40076867 tgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttacagaaatgat 40076806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 197
Target Start/End: Original strand, 2984508 - 2984674
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  2984508 ataatgtggttttgaatgatgccaaataaacacaatttgaataagtttcatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaacgacaattatattg 2984607  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  2984608 attatttagttagtttaggttatggaaatgatgaaaatgatgttaattatagtttgataaagtgtat 2984674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 41249790 - 41249610
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||              
T  41249790 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgctttatactttgcac---------- 41249701  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
          | |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41249700 ------attgccgcaatgacaattttattgattatgtagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtat 41249610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 154
Target Start/End: Original strand, 37327163 - 37327292
Alignment:
Q  25 taaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataatt 124  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  37327163 taaatgataatgtgattttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaatt 37327262  T
Q  125 ttattgattatttagttagcttaggttatg 154  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37327263 ttattgattatttagttagtttaggttatg 37327292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Original strand, 35552051 - 35552182
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35552051 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 35552150  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  35552151 attatttagttagtttaggttatggatatgat 35552182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Original strand, 20857671 - 20857802
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20857671 ataatgtggttttgaatggttgcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaattgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 20857770  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  20857771 attatttagttagtttaggttatggatatgat 20857802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Original strand, 24249868 - 24249999
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  24249868 ataatgtggttttgaatggtgtcaaatgagcacattttgaatatgtttgatactttgcacataaagtatttgataaaatgccccaatgagaattatattg 24249967  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  24249968 attatttagtcagtttaggttatggaaatgat 24249999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 157
Target Start/End: Original strand, 45128135 - 45128261
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||    
T  45128135 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacgttttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgccccaatgtgaattgtattg 45128234  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaa 157  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||    
T  45128235 attattgagttagtttaggttatggaa 45128261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 25214 - 25095
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  25214 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 25115  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  25114 attatttagttagtttaggt 25095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Original strand, 1052910 - 1053029
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  1052910 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtatcaatgacaattttattg 1053009  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  1053010 attatttagttagtttaggt 1053029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 23022008 - 23021889
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  23022008 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 23021909  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  23021908 attatttagttagtttaggt 23021889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Original strand, 26659832 - 26659951
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  26659832 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 26659931  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  26659932 attatttagttagtttaggt 26659951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 59 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 34371553 - 34371450
Alignment:
Q  59 aacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaa 158  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  34371553 aacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaatttttttgattatttagttagtttaggttatggata 34371454  T
Q  159 tgat 162  Q
    ||||    
T  34371453 tgat 34371450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Original strand, 5677456 - 5677587
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  5677456 ataatgtggttttgaatggtagcaaaagaatacattttgagtatgtttgatgttttgcacagaaagtgtttgataaaatgccccaatgaaaattatattg 5677555  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    |||||  ||| || ||||||||||||||||||    
T  5677556 attatcgagtaagtttaggttatggaaatgat 5677587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 25864657 - 25864609
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatgg 49  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25864657 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatgg 25864609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 143
Target Start/End: Original strand, 22495305 - 22495415
Alignment:
Q  33 aatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgat 132  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| |   | ||||||||||||||  ||||| ||||  ||||||    
T  22495305 aatgtggttttgaatggtgtcaaattaacacaatgagaatatgtttgatactttgcacaaatgttttttgataaaatgcccaaatgaaaattgcattgat 22495404  T
Q  133 tatttagttag 143  Q
    |||||| ||||    
T  22495405 tatttacttag 22495415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 197
Target Start/End: Original strand, 39252522 - 39252554
Alignment:
Q  165 aaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39252522 aaatgatgttaattatagtttggtcaagtgtat 39252554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 30)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 31783445 - 31783249
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31783445 aatgtagttgttgcctatgttctttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 31783346  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31783345 tgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagattatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 31783249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 35258586 - 35258394
Alignment:
Q  5 tagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgat 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35258586 tagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgat 35258487  T
Q  105 aaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
     |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35258486 caaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatagaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtat 35258394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 45825232 - 45825429
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatacttt-gcacacaaagtgt 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45825232 aatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatacttttgcacacaaagtgt 45825331  T
Q  100 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45825332 ttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttaatttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 45825429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 51321070 - 51321266
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51321070 aatgtagttgttgcctatattgtttaaatcataatgtgactttgaatagtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatattttgcacacaaagtgtt 51321169  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51321170 tgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 51321266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 19925098 - 19925297
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19925098 aatgtagatgttgcctatgtagtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 19925197  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatttt 200  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19925198 cgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttatttt 19925296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 30890417 - 30890616
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30890417 aatgtagatgttgcctatgtagtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 30890516  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatttt 200  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30890517 cgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttatttt 30890615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19527260 - 19527064
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19527260 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatggacacaatttgaatatgttttatgttttgcacacaaagtgtt 19527161  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19527160 tgataaaatgcctcaataacaattttattgattatgtagttaatttaggttatgaaaatgatagaaatgatgttagttatagtttggttaagtgtat 19527064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 49857660 - 49857467
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49857660 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatgagaatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 49857561  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||| ||||||||||   | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49857560 tgatcaaatgcctca---aaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtat 49857467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23275821 - 23275625
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatgg-tggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23275821 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgactttgaatgggtgacaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 23275722  T
Q  100 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23275721 ttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtcagtttaagttatggaaatgatagaaatgatgttaa-tatagtttggttaagtgtat 23275625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 52802487 - 52802683
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52802487 aatgtagttgttgcttatgttgtttaagtcataatgtgattttgaatggtggcaaaataacacaatttgaatatcttttatactttgcacacaaagtgtt 52802586  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52802587 tgataaaatgtctcaatgacaattttattgattgtttagttagtttaggctatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 52802683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 47502671 - 47502895
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47502671 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 47502770  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgta---- 196  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  47502771 tggtaaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttag---aggtt---------atagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatatt 47502858  T
Q  197 ----ttttggttagtttaggttacaagaatgatgatg 229  Q
        |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47502859 gattttttagttagtttaggttacaagaattatgatg 47502895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Original strand, 21141413 - 21141544
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21141413 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 21141512  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21141513 attatttagttagtttaggttatggatatgat 21141544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 50343656 - 50343525
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50343656 ataatatggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 50343557  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  50343556 attatttagttagtttaggttatggatatgat 50343525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 97635 - 97504
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  97635 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgtacacaaagtgtttgagaaaatgcctcaatgataattttattg 97536  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
     |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  97535 tttatttagttagtttaggttatggatatgat 97504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Original strand, 2365622 - 2365741
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  2365622 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 2365721  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  2365722 attatttagttagtttaggt 2365741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Original strand, 19156401 - 19156520
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  19156401 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 19156500  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  19156501 attatttagttagtttaggt 19156520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Original strand, 47656256 - 47656386
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  47656256 ataatgtgattttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 47656355  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  47656356 attatttagttag-tttggttatggatatgat 47656386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 2425053 - 2424924
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| || |||||| | ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  2425053 ataatgtggtttggaatggagccaaataaacacaatttgaat--gttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaataacaattttattg 2424956  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  2424955 attatttatttagtttaggttatggatatgat 2424924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Original strand, 22524521 - 22524650
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| || |||||| | ||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22524521 ataatgtggtttggaatggagccaaataaacataatttgaat--gttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 22524618  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||| |||||    
T  22524619 attatttagttagtttagatcatggatatgat 22524650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 3732068 - 3731949
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  3732068 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 3731969  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  3731968 attatttagttagtttaggt 3731949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 13639710 - 13639591
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  13639710 ataatgtggttttgaattgtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 13639611  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  13639610 attatttagttagtttaggt 13639591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 17514383 - 17514272
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||| |||||    
T  17514383 ataatgtggttttgaatggtgccaaatgaacacaatttgaatatgtttgattctttgcacacaaagtgtttgataaaatgcccaaataaaaattatattg 17514284  T
Q  131 attatttagtta 142  Q
    ||||||||||||    
T  17514283 attatttagtta 17514272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Original strand, 26876043 - 26876162
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  26876043 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 26876142  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  26876143 attatttagttagtttaggt 26876162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 41 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 38127160 - 38127045
Alignment:
Q  41 tttgaatggtggcaaatgaa-cacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttag 139  Q
    ||||||||||||||||  || |||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  38127160 tttgaatggtggcaaaaaaaacacatttttagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgaaaattttattgattacttag 38127061  T
Q  140 ttagcttaggttatgg 155  Q
    |||| |||||||||||    
T  38127060 ttagtttaggttatgg 38127045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 119
Target Start/End: Original strand, 8474171 - 8474259
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatga 119  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  8474171 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatga 8474259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 23935650 - 23935581
Alignment:
Q  33 aatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttg 102  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||   |||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23935650 aatgtggttttgaatggtgtcaaattaacacaatggtaataagtttcatactttgcactcaaagtgtttg 23935581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 29622141 - 29622105
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgt 37  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29622141 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgt 29622105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16243165 - 16243106
Alignment:
Q  74 tgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgatt 133  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||    
T  16243165 tgttttatcttttgcatacaaagtgtttgataaaatgcctaaatgaatatttcattgatt 16243106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 119
Target Start/End: Original strand, 25166976 - 25167023
Alignment:
Q  72 tatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatga 119  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  25166976 tatgtttcatactttgcactcaaagtgtttgataaaattcctaaatga 25167023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 119
Target Start/End: Original strand, 25147698 - 25147776
Alignment:
Q  41 tttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatga 119  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  25147698 tttgaatggtgtccaattaacacaatgccaataagtttcatactttgcactcaaagtgtttgttaaaatacctaaatga 25147776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8580222 - 8580023
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8580222 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtagctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 8580123  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatttt 200  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8580122 tgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatttt 8580024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 17658678 - 17658874
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17658678 aatgtagttgtggcctatgttgtttaaatcataatgtggttttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcatacaaagtgtt 17658777  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17658778 tgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 17658874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19228389 - 19228193
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19228389 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacataatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 19228290  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19228289 tgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatgaaaatgataaaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtat 19228193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 28876999 - 28877198
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28876999 aatgtagttgttgcctatattgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtt 28877098  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatttt 200  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28877099 tgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttag-tttggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatttt 28877197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 42537505 - 42537701
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42537505 aatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacataatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 42537604  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42537605 tgatcaaatgcctcaatgaaatttatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 42537701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 38968453 - 38968650
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38968453 aatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 38968552  T
Q  100 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38968553 ttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 38968650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 7757680 - 7757876
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7757680 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaattataatgtggttttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaacatgttttatactttgcacacaaagtgtt 7757779  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  7757780 tgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatagaaattatagtttggttaagtgtat 7757876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 8701941 - 8701745
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8701941 aatgtagtagttgcatatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 8701842  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8701841 tgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtttgtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtat 8701745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 28241516 - 28241317
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241516 aatgtagatgttgcctatgtagtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 28241417  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatttt 200  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28241416 cgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttatttt 28241318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 42942203 - 42942008
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42942203 aatgtagttgttgcctatgctgtttaaatcataatatggctttgaattgtggcaaatgaacataatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 42942104  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42942103 tgataaaatgcctcaatgacaattttattgatt-tttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtctggttaagtgtat 42942008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 512489 - 512293
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  512489 aatgtagttgttgtctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacccaaagtgtt 512390  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  512389 tgatcaaatacctcaatgaaaattatattgcttatttagttagtttaggttatgaaaattatagaaatgatgttaattatagtttagttaagtgtat 512293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 14406 - 14264
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14406 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 14307  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14306 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttag 14264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Original strand, 5197359 - 5197490
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5197359 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 5197458  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  5197459 attatttagttagtttaggttatggatatgat 5197490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 31 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 40624601 - 40624468
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  40624601 ataatgtggttttgaatggtgacaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgccttaataacaattttattg 40624502  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgatat 164  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||    
T  40624501 attatttagttagtttagattatgaaaattatat 40624468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 19040804 - 19040685
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  19040804 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaaatttattg 19040705  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  19040704 attatttagttagtttaggt 19040685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 159
Target Start/End: Original strand, 20422335 - 20422463
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||    
T  20422335 ataatgtagttttaaatggtgccaaatgaacacattttgaatatgtttgatacttttcacacaaagtgtttgataaaatgccccaatgacaattattttg 20422434  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaat 159  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20422435 attatttagttagtttaggttatggaaat 20422463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 27673340 - 27673228
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  27673340 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatattttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 27673241  T
Q  131 attatttagttag 143  Q
    |||||||||||||    
T  27673240 attatttagttag 27673228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Original strand, 30705522 - 30705641
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  30705522 ataatgtggttttcaatggtggcaaaagaacacatttttagtatgtttgatattttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 30705621  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  30705622 attatttagttagtttaggt 30705641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21022605 - 21022410
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21022605 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 21022506  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21022505 tgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 21022410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 51683558 - 51683754
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51683558 aatgtagttgttgtctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 51683657  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51683658 tgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 51683754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 37021800 - 37021604
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37021800 aatgtagttgttgcatatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatcttttatactttgcacacaaagtgtt 37021701  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37021700 tgataaaatgcttcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatgaaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 37021604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 50275090 - 50275286
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50275090 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcagaatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatgctttgcacacaaagtgtt 50275189  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50275190 tgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatgtagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaaatgtat 50275286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 30726458 - 30726259
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30726458 aatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 30726359  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatttt 200  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  30726358 tgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatactttggttaagtttatttt 30726260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 40357997 - 40357798
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40357997 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggatttgaatggtggcaaatgaacacagtttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtt 40357898  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatttt 200  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40357897 tgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatttt 40357799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 48256288 - 48256092
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48256288 aatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaaaacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 48256189  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48256188 tgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 48256092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1089301 - 1089102
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||| | |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1089301 aatgtagatgttgcatatgtagtttaaataataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 1089202  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatttt 200  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1089201 tgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttatttt 1089103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 55407504 - 55407308
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55407504 aatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaaatgtt 55407405  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    ||||  ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55407404 tgatcgaatgcctcattgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttcgttaagtgtat 55407308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1308831 - 1308632
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||| | |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1308831 aatgtagatgttgcatatgtagtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 1308732  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatttt 200  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1308731 cgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttatttt 1308633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 50901836 - 50902031
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50901836 aatgtagttgttgtctatgttgtttaattcataatgtggctttgaatggtgttaaatgaacacaatttgaatatgttttatattttgcacacaaagtgtt 50901935  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50901936 tgataaaatgtttcaatgacaattttattgatt-tttagttagtttaagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 50902031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 67947 - 68100
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  67947 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatgataatgtggctttgaatggtagcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacataaagtgtt 68046  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatg 154  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  68047 tgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatg 68100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 46436600 - 46436753
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46436600 aatgtagttgttgcttatgctgtttaaatgatattgtggttctgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 46436699  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatg 154  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46436700 tgatcaaatgcctcaatggcaattttattgattatttagttagtttaggttatg 46436753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11050210 - 11050044
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  11050210 ataatgtggttttgaatggtgccaaatgaacacaatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtatttgataaaatgcatcaatgaaaattatattg 11050111  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  11050110 attatttagttagtttaggttatggaaatgatggagaggatgttaatgatagtttgataaagtgtat 11050044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21538139 - 21538008
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21538139 ataatgtggttttgaatgatgccaaatgaacacaatttgaatctgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattatattg 21538040  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21538039 attatttagttagtttaggttatggaaatgat 21538008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 50023230 - 50023099
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50023230 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 50023131  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  50023130 attatttagttagtttaggttatggatatgat 50023099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 33 - 186
Target Start/End: Original strand, 14315772 - 14315925
Alignment:
Q  33 aatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgat 132  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||    
T  14315772 aatgtggttttgaatggtgccaaatgaacacattttgagtatgttttatactttgcacgcaaagtgtttgacaaaatgcccaaatgaaaattgtattgat 14315871  T
Q  133 tatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttg 186  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14315872 tattgagttagtttaggttatggaaatgattgaaatgatgttaattatagtttg 14315925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 10753114 - 10752983
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10753114 ataatgtggttttgaatggtggcaaatggacactctttaaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattatattg 10753015  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  10753014 attatttaattagtttaggttattgaaatgat 10752983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 10966883 - 10966752
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10966883 ataatgtggttttgaatggtggcaaatggacactctttaaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattatattg 10966784  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  10966783 attatttaattagtttaggttattgaaatgat 10966752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 50030348 - 50030217
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  50030348 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcatcaatgacaattttactg 50030249  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  50030248 attatttagttagtttaggttatggatatgat 50030217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 41798682 - 41798570
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || || |||||||    
T  41798682 ataatgtgggtttgaatggtagcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaacgacaaatttattg 41798583  T
Q  131 attatttagttag 143  Q
    |||||||||||||    
T  41798582 attatttagttag 41798570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 9892955 - 9892836
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  9892955 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 9892856  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  9892855 attatttagttagtttaggt 9892836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 33 - 162
Target Start/End: Original strand, 14297523 - 14297652
Alignment:
Q  33 aatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgat 132  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||    
T  14297523 aatgtggttttgaatggtgccaaatgaacacattttgagtatgttttatactttgcacgcaaagtgtttgacaaaatgcccaaatgaaaattgtattgat 14297622  T
Q  133 tatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  14297623 tattgagttagtttaggttatggaaatgat 14297652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 33 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 41933308 - 41933179
Alignment:
Q  33 aatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgat 132  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||    
T  41933308 aatgtggttttgaatggtgtcaaatgaagattatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaaagccccaatgaaaattatattgat 41933209  T
Q  133 tatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  41933208 tattgagttagtttagattatggaaatgat 41933179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Original strand, 3184342 - 3184473
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  3184342 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacccaaagtgtttgagaaaatgcctcaatgacaattttattt 3184441  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
     |||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  3184442 tttatttagttagtttgggttatggatatgat 3184473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 3185571 - 3185440
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  3185571 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacccaaagtgtttgagaaaatgcctcaatgacaattttattt 3185472  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
     |||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  3185471 tttatttagttagtttgggttatggatatgat 3185440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 3185779 - 3185648
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  3185779 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacccaaagtgtttgagaaaatgcctcaatgacaattttattt 3185680  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
     |||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  3185679 tttatttagttagtttgggttatggatatgat 3185648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 6181477 - 6181358
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  6181477 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 6181378  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  6181377 attatttagttagtttaggt 6181358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Original strand, 49090806 - 49090925
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  49090806 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 49090905  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  49090906 attatttagttagtttaggt 49090925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Original strand, 49165419 - 49165538
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  49165419 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatagtttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 49165518  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  49165519 attatttagttagtttaggt 49165538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 154
Target Start/End: Original strand, 30704419 - 30704532
Alignment:
Q  41 tttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagt 140  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30704419 tttgaatggtgggaaaagaacacatttttagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatatctcaatgacaattttattgattatttagt 30704518  T
Q  141 tagcttaggttatg 154  Q
    ||| ||||||||||    
T  30704519 tagtttaggttatg 30704532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 44679762 - 44679631
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| ||||    
T  44679762 ataatgtgattttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatattttgcacacaaagtgtttgataaaatgtttcaatgaccatttcattg 44679663  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  44679662 attatttagttagtttaggttatagatatgat 44679631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 11083691 - 11083562
Alignment:
Q  33 aatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgat 132  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| || ||||    
T  11083691 aatgtggttttgaatggtgtcaaatgaacacattttgagtatgtttgatgctttgcacacaaagtgtttgacaaaatgcccaaatgaaaattgtactgat 11083592  T
Q  133 tatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  11083591 tattgagttagtttaggttatgaaaatgat 11083562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Original strand, 31422083 - 31422203
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttg-ataaaatgcctcaatgataattttatt 129  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||    
T  31422083 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgaataaaatgtgtcaatgacaattttatt 31422182  T
Q  130 gattatttagttagcttaggt 150  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  31422183 gattatttagttagtttaggt 31422203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 151
Target Start/End: Original strand, 50193864 - 50193985
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaa-cacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttatt 129  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||  || |||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  50193864 ataatgtggttttgaatagtggcaaaaaaaacacattttgagtatgtttgatactttgcacataaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttatt 50193963  T
Q  130 gattatttagttagcttaggtt 151  Q
    ||||||||| |||| |||||||    
T  50193964 gattatttacttagtttaggtt 50193985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 4720055 - 4719953
Alignment:
Q  41 tttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagt 140  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||  |||||||||||| |    
T  4720055 tttgaatggtgtcaaattaacacaatgagaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgacaaaatgcccaaatgaaaattgcattgattatttact 4719956  T
Q  141 tag 143  Q
    |||    
T  4719955 tag 4719953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 6320280 - 6320084
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6320280 aatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagcgtt 6320181  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6320180 tgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 6320084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 31769061 - 31769257
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31769061 aatgtagttgttgcttatgttgtttaaatcataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 31769160  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31769161 tgataaaatgtctcaatgacaaatttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 31769257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24088499 - 24088303
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24088499 aatgtagttgttgtctatgttgtttaaatgataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgtacacaaagtgtt 24088400  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 197  Q
    |||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  24088399 tgatcaaatgtctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaatgatagtttgattaggtgtat 24088303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Original strand, 24722314 - 24722445
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24722314 ataatgtgtttttgaatggtgtcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcgtcaatgacaattttattg 24722413  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  24722414 attatttagttagtttaggttatggatatgat 24722445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 143
Target Start/End: Original strand, 21600990 - 21601102
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||    
T  21600990 ataatgtggttttgaatggtgacaaatgaacacaatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcccaaatgagaattatattg 21601089  T
Q  131 attatttagttag 143  Q
    |||||||||||||    
T  21601090 attatttagttag 21601102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Original strand, 3501555 - 3501686
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  3501555 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgagaaaatgcctcaaggacaattttattg 3501654  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
     |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  3501655 tttatttagttagtttaggttatggatatgat 3501686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 162
Target Start/End: Original strand, 26423384 - 26423514
Alignment:
Q  32 taatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattga 131  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  26423384 taatatggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgt 26423483  T
Q  132 ttatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  26423484 ttatttagttagtttatgttatggatatgat 26423514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Original strand, 6201534 - 6201653
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  6201534 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 6201633  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  6201634 attatttagttagtttaggt 6201653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Original strand, 11688501 - 11688620
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  11688501 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 11688600  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  11688601 attatttagttagtttaggt 11688620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Original strand, 22301566 - 22301685
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  22301566 ataatgtggttttgaattgtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 22301665  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  22301666 attatttagttagtttaggt 22301685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 30829339 - 30829220
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  30829339 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 30829240  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  30829239 attatttagttagtttaggt 30829220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Original strand, 27617101 - 27617220
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  27617101 ataatatggttttgaatggtggcaaaagaatacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaaatttattg 27617200  T
Q  131 attatttagttagcttaggt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  27617201 attatttagttagtttaggt 27617220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 43 - 186
Target Start/End: Original strand, 3381182 - 3381313
Alignment:
Q  43 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagtta 142  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||            |||||||||| |||    
T  3381182 tgaatggtgtcaaatgaacacaatttgaatatgttttatatattgcacacaaagtggttgataaaatgcctcaa------------tgattatttaatta 3381269  T
Q  143 gcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttg 186  Q
    | ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3381270 gtttatgttatggaaatgattaaaatgatgttaattatagtttg 3381313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 445 - 246
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  445 aatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaacgtgtt 346  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatttt 200  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  345 tgataaaatgtctcaatgacaattttattaattatttagttagttta-gttatgaaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatttt 247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 7774 - 7925
Alignment:
Q  1 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7774 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatgatggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtatt 7873  T
Q  101 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggtta 152  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  7874 tgataaaatgcctcaatgacaattttattgattttttagttagtttaggtta 7925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0238 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0238
Description:

Target: scaffold0238; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18619 - 18489
Alignment:
Q  32 taatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattga 131  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18619 taatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacgcaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattga 18520  T
Q  132 ttatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  18519 ttatttagttagtttaggttatggatatgat 18489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 154
Target Start/End: Original strand, 10761 - 10863
Alignment:
Q  52 gcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggtt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  10761 gcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttacacacaaagtgtttgaaaaaatgtctcaatgacaattatattgattatttagttagtttaggtt 10860  T
Q  152 atg 154  Q
    |||    
T  10861 atg 10863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 4341 - 4210
Alignment:
Q  31 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 130  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||    
T  4341 ataatgtggtttttaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatgttttgcacacaaagtgtttgataaagtgccccaatgagaattatattg 4242  T
Q  131 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 162  Q
    |||||| |||||| ||||| |||| |||||||    
T  4241 attattgagttagtttagggtatgaaaatgat 4210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 119
Target Start/End: Original strand, 246180 - 246228
Alignment:
Q  71 atatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatga 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  246180 atatgttttatactttgcacccaaagtgtttgataaaatgcctaaatga 246228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 251161 - 251051
Alignment:
Q  33 aatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgat 132  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||| |||| |||||| |||| |||||||   ||||| ||||  ||||||    
T  251161 aatgtggttttgaatggtgtcaaattaacacaataagaatatgtttgatattttacacataaagtgattgacaaaatgctcaaatgaaaattgcattgat 251062  T
Q  133 tatttagttag 143  Q
    |||||| ||||    
T  251061 tatttacttag 251051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University